Структура и биохимическая активность микробных сообществ нефтяных отходов при их ремедиации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.08, кандидат наук Бикташева Лилия Рамилевна

• Бикташева Лилия Рамилевна
• кандидат наук
• 2019

Оглавление диссертации кандидат наук Бикташева Лилия Рамилевна

Сокращения..............................................................................................................4

ВВЕДЕНИЕ.............................................................................................................5

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ..............................................................................10

1.2 Методы биоремедиации нефтяных отходов.........................................................12

1.2.1 Методы биостимуляции и биоаугментации..................................................16

1.3 Механизмы микробного разложения углеводородов.............................................22

1.4 Методы анализа микробного сообщества............................................................26

1.4.1. Анализ активности микробных сообществ..................................................26

1.4.2 Анализ микробного разнообразия сообществ...............................................28

1.5 Динамика микробного сообщества в процессе биоремедиации нефтезагрязненных объектов.........................................................................................................31

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ..............................................36

2.1 Подготовка компостов и ремедиационных смесей.................................................36

2.2. Методы химических исследований...................................................................37

2.3 Методы биохимических и молекулярно-биологических исследований......................40

2.4 Методы молекулярно-биологических исследований...............................................42

2.5 Статистическая обработка результатов..............................................................45

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ................................................................47

3.1 Компостирование органических отходов.............................................................47

3.1.1 Анализ физико-химических и биохимических характеристик компостов............47

3.1.2 Оценка изменения состава и структуры микробных сообществ в процессе компостирования смесей органических отходов.................................................56

3.1.2.1 Изменение структуры бактериального сообщества................................57

3.1.2.1.1 Динамика бактериального сообщества компоста пром. ОСВ.............59

3.1.2.1.2 Динамика бактериального сообщества компоста муниц. ФП............61

3.1.2.2 Изменение структуры грибного сообщества.......................................63

3.1.2.2.1 Изменение грибного сообщества компоста пром. ОСВ..................65

3.1.2.2.2 Динамика грибного сообщества компоста муниц. ФП.....................67

3.1.2.3 Патогенные микробы в компостах пром. ОСВ и муниц. ФП....................67

3.1.2.4 а- и Р-разнообразие бактериальных и грибных сообществ....................68

3.2 Оценка эффективности ремедиации нефтяного шлама с использованием компоста....72

3.2.1 Биохимические характеристики процесса ремедиации................................72

3.2.2 Динамика структуры микробного сообщества в процессе биоремедиации.......77

3.2.2.1 Динамика структуры бактериального сообщества в процессе биоремедиации...................................................................................77

3.2.2.2 Динамика структуры грибного сообщества в процессе биоремедиации......82

3.2.2.3 а- и Р-разнообразие бактериальных сообществ......................................85

3.3 Оценка эффективности ремедиации нефтяного шлама с использованием компоста и

дополнительной биоаугментации углеводородокисляющими микроорганизмами.............87

3.3.1 Выделение штаммов, обладающих углеводородокисляющей активностью..........87

3.3.2 Биохимические характеристики процесса биоремедиации...............................88

3.3.3 Оценка изменения состава и структуры микробных сообществ в процессе ремедиации нефтяных шламов с использованием интродуцированных микроорганизмов........................................................................................92

3.3.3.1 Изменение структуры бактериального сообщества ремедиационных смесей при интродукции углеводородокисляющих микроорганизмов...........................94

3.3.3.2 Изменение структуры грибного сообщества при ремедации нефтяного шлама с интродукцией углеводородокисляющих микроорганизмов..................101

3.3.3.3 а- и ß-разнообразие бактериального и грибного сообществ ремедиационныхсмесей при интродукции углеводородокисляющих микроорганизмов..................................................................................106

ВЫВОДЫ...........................................................................................................109

Список литературы................................................................................................112

Приложение 1. Таксономический состав бактериального сообщества компостов..................148

Приложение 2. Таксономический состав грибного сообщества компостов............................170

Приложение 3. Таксономический состав бактериального сообщества в процессе ремедиации с

использованием компоста........................................................................................174

Приложение 4. Таксономический состав грибного сообщества в процессе ремедиации с

использованием компоста........................................................................................197

Приложение 5.А. Таксономический состав бактериального сообщества в процессе ремедиации в

смеси 1...............................................................................................................208

Приложение 5.Б. Таксономический состав бактериального сообщества в процессе ремедиации в

смеси II................................................................................................................222

Приложение 5.В. Таксономический состав бактериального сообщества в процессе ремедиации в

смеси III..............................................................................................................235

Приложение 6.А. Таксономический состав грибного сообщества в процессе ремедиации в смеси

I........................................................................................................................246

Приложение 6.Б. Таксономический состав грибного сообщества в процессе ремедиации в смеси

I I......................................................................................................................269

Приложение 6.В. Таксономический состав грибного сообщества в процессе ремедиации в смеси

II I......................................................................................................................291

Сокращения

ТБО - твердые бытовые отходы

пром. ОСВ - промышленный осадок сточных вод

муниц. ФП - муниципальный осадок сточных вод, обезвоженный на фильтр-прессе

РОУ - растворимый органический углерод

ПАУ - полиароматические углеводороды

OTE - операционно-таксономические единица

ПЦР - полимеразная цепная реакция

УВ - углеводородокисляющие микроорганизмы

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

В настоящее время нефтяные отходы, образующиеся в процессе добычи, транспортировки и переработки нефти, в основном размещаются без переработки в окружающей среде, что вызывает серьезную обеспокоенность (Ha et al., 2014; Mrayyan and Battikhi, 2005; Zeneli et al., 2019). Такое размещение может привести к различным негативным эффектам, вызываемым углеводородами, радиоактивными элементами и тяжелыми металлами (Ramirez et al., 2019). В литературе широко представлены методы рекультивации нефтезагрязненных почв, однако, для нефтяных отходов информация ограничена. Среди методов утилизации нефтяных отходов все большее внимание привлекают биологические методы. Одним из таких методов является биоремедиация с помощью компостирования или добавления компоста (Huang et al., 2019; Sari and Trihadiningrum, 2019; Zeng et al., 2011). Другим эффективным методом биоремедиации считается биоаугментация, основанная на интродукции микроорганизмов, участвующих в деградации углеводородов (Tao et al., 2019; Tuhuloula et al., 2019; Tyagi et al., 2011). Основным ограничением этого метода является плохая способность интродуцированных микроорганизмов приживаться в новых условиях и конкурировать с аборигенными микроорганизмами (Al-Kharusi et al. 2016; Haleyur et al. 2019; Wozniak-Karczewska et al. 2019).

Наиболее важными факторами, регулирующими процесс биоремедиации являются активность бактерий и микроскопических грибов, разлагающих углеводороды (Chen et al., 2015). Так же эффективность процесса ремедиации определяется и структурой микробных сообществ, составом доминирующих таксонов, их обилием и биоразнообразием в целом (Morais et al., 2016). Однако данные о закономерностях формирования сообществ нефтяных отходов в процессе ремедиации ограничены, отсутствуют данные и о влиянии на сообщества интродуцированных микроорганизмов (Rezaei Somee et al., 2018; Roy et al., 2018). В тоже время необходимо отметить, что анализ изменений таксономического и функционального разнообразия микробных сообществ может определить направление и метод ремедиации применяемого метода, а также контролировать эффективность процесса (Круглов, 2016; Якушев, 2015).

Цель данной работы - оценка изменения структуры и биохимической активности микробных сообществ в процессе ремедиации нефтяных отходов

Задачи

1. Оценить в динамике процесса компостирования различных смесей органических отходов изменение температуры, содержания Сорг, растворимого органического углерода, респираторной активности, фитотоксичности и металлов (Л!, Cd, Со, Cr, Cu, Fe, Mn, №, РЬ, Zn) и установить параметры, позволяющие провести процесс компостирования с наибольшей эффективностью, а также оптимальный состав компостных смесей.

2. Определить, с использованием методов молекулярной биологии, закономерности формирования микробных сообществ зрелых компостов, получаемых из органических отходов в условиях различающихся исходных субстратов.

3. Выделить из нефтяного шлама и идентифицировать штаммы микроорганизмов, активно разлагающих углеводороды нефти, охарактеризовать их активность и оценить выживаемость в процессе ремедиации нефтяного отхода.

4. Провести лабораторное моделирование процесса ремедиации нефтяных шламов с использованием компоста из органических отходов, а также с дополнительной интродукцией углеводородокисляющих микроорганизмов и определить его эффективность на основе анализа динамики содержания растворимого углерода, общего содержания нефтепродуктов и фитотоксичности.

5. Определить изменение структуры и биохимической активности микробных сообществ в процессе ремедиации нефтяных шламов с использованием компоста из органических отходов

6. Установить влияние интродукции углеводородокисляющих микроорганизмов на структуру и биохимическую активность микробных сообществ нефтяных шламов в процессе ремедиации.

Научная новизна

На основе анализа структуры и индексов разнообразия микробных сообществ впервые установлено, что различия бактериальных сообществ зрелых компостов, полученных из различающихся субстратов, в меньшей степени отличаются друг от друга, по сравнению с различиями сообществ начальных этапов компостирования и сообществ зрелых компостов.

Впервые показано, что при ремедиации нефтяных шламов с использованием компостов из органических отходов, формируется бактериальное сообщество, основу которого в части доминирующих таксонов составляют таксоны сообщества компоста. Таксоны, присутствующие

в сообществе нефтяного шлама, снижают свое обилие уже на первом этапе ремедиации, что связано с изменяющимися абиотическими условиями среды. В свою очередь, в состав грибного сообщества, формируемого в процессе ремедиации, входят организмы, принадлежащие к обоим исходным сообществам. Компост может быть рассмотрен одновременно как структурирующий агент, так и источник микроорганизмов, интродуцируемых в нефтяной шлам.

Впервые установлено, что дополнительная интродукция консорциума углеводородокисляющих микроорганизмов (Rhodococcus jialingiae, Pseudomonas gessardii, Stenotrophomonas rhizophila) в ремедиационную смесь, содержащую нефтяной шлам и компост, приводит к изменению микробного сообщества, выраженного в снижении общей численности бактерий и грибов по сравнению с сообществом, осуществляющим ремедиацию без интродукции микроорганизмов, и увеличению его биоразнообразия.

Теоретическая значимость

Получены данные о закономерностях формирования микробных сообществ компостов из органических отходов и микробных сообществ нефтяных отходов в процессе их ремедиации. Проанализировано влияние абиотических факторов (состав исходных компонентов для компостирования) и биотических факторов (взаимодействие исходных сообществ компоста и нефтяного отхода) на формирование сообществ, а также влияние интродуцированных штаммов на структуру сообщества ремедиационной смеси. Указанные данные вносят вклад в развитие направления экологии сообществ в части изучения закономерностей их образования, а также прикладной экологии в части разработки принципов создания искусственных экосистем и управления их функционированием.

Информация о принципах составления компостных смесей, возможности и эффективности ремедиации нефтяных шламов с использованием компостов из органических отходов, отсутствии дополнительного эффекта в отношении снижения содержания нефтепродуктов при интродукции нефтеокисляющих бактерий, могут быть использованы при разработке проектов рекультивации нарушенных сред нефтедобывающими и нефтеперерабатывающими компаниями, а также компаниями по переработке коммунальных отходов. Материал, полученный в ходе метагеномного анализа отходов, используется в курсе «Методы молекулярной биологии в экологии и природопользовании» Института экологии и природопользования КФУ.

Положения на защиту

Бактериальные сообщества зрелых компостов, полученных из различающихся субстратов, в меньшей степени отличаются друг от друга, и достоверно отличаются от соответствующих сообществ начальных этапов компостирования.

При ремедиации нефтяных шламов с использованием компостов из органических отходов формируется бактериальное сообщество, основу которого представляют доминирующие таксоны сообщества компоста. Таксоны, присутствующие в сообществе нефтяного отхода, снижают свое обилие уже на первом этапе ремедиации. Грибное сообщество, формируемое в процессе ремедиации, представлено организмами, принадлежащими к обоим исходным сообществам. Компост может быть рассмотрен одновременно как структурирующий агент, так и источник микроорганизмов, интродуцируемых в нефтяной шлам.

При интродукции консорциума углеводородокисляющих микроорганизмов (Rhodococcus jialingiae, Pseudomonas gessardii, Stenotrophomonas rhizophila) в ремедиационную смесь, содержащую нефтешлам и компост, формируется сообщество, отличающееся по численности бактерий и грибов и биоразнообразию от сообществ ремедиационной смеси без интродукции. Снижение содержания нефтяного компонента и фитотоксичности в смесях сопоставимо при использовании двух вариантов ремедиации.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структура и биохимическая активность микробных сообществ нефтяных отходов при их ремедиации»

Апробация работы.

Материалы диссертации изложены на 19-й международной мультидисциплинарной научной конференции наук о Земле SGEM 2019 (Болгария, Албена, 2019), 12-й международной научной конференции «Геология в развивающемся мире» (Пермь, 2019), генеральной ассамблее 2019 Европейского Союза наук о Земле (Вена, Австрия, 2019), 18-й международной мультидисциплинарной научной конференции наук о Земле SGEM 2018 (Болгария, Албена, 2018), генеральной ассамблее 2018 Европейского Союза наук о Земле (Вена, Австрия, 2018), 16-й Международной научно-практической конференции International Waste Management and Landfill «Sardinia_2017» (Италия, Кальери, 2017), 10-й международной научной конференции «Геология в развивающемся мире» (Пермь, 2017), 16-й международной мультидисциплинарной научной конференции наук о Земле SGEM 2016 (Болгария, Албена, 2016), 16-й международной научной конференции «Экологические проблемы недропользования» (Санкт -Петербург, 2016), 15-й Международной научно-практической конференции International Waste Management and Landfill «Sardinia_2015» (Италия, Кальери, 2015), 1-й международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Биомедицина, материалы и технологии XXI века»,

(Казань, 2015), 7-й международной научной конференции «Геология в развивающемся мире» (Пермь, 2014).

Публикации. По материалам диссертации опубликована 9 работ в рецензируемых научных журналах, из списка определенных ВАК РФ, систем цитирований Web of Science и Scopus.

Место выполнения и личный вклад соискателя

Основные экспериментальные работы выполнены на кафедре прикладной экологии Казанского (Приволжского) федерального университета и Учебно-научной лаборатории «Экологические инновации». Автор принимал участие в планировании и осуществлении экспериментальной части работы. Автором был проведен анализ и интерпретация полученных результатов. Соавторами публикаций являются научный руководитель д.б.н. профессор кафедры прикладной экологии Селивановская С.Ю., к.б.н., доцент кафедры прикладной экологии Галицкая П.Ю., участвовавшие в обсуждении результатов. Статистическая обработка полученных данных осуществлялась совместно с д.б.н., профессором кафедры моделирования экологических систем Савельевым А.А. Метагеномные исследования с применением оборудования Illumina, выполнены совместно с Междисциплинарным центром протеомных исследований на базе Казанского (Приволжского) федерального университета.

Структура и объем диссертации. Диссертация изложена на 147 страницах, состоит из обзора литературы, описания материалов и методов исследований, раздела собственных исследований и обсуждения результатов, выводов и списка литературы. Работа содержит 21 рисунок, 18 таблиц. Список литературы содержит 31 отечественных и 383 зарубежных источников.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1 Нефтяные отходы: характеристика, токсичность, влияние на окружающую среду

Добыча, транспортировка и переработка нефти сопровождается образованием огромного количества нефтесодержащих отходов (Xu et al., 2018; Киреева с соавт., 2009; Ягафарова и Барахнина, 2006). Одними из наиболее трудно утилизируемых отходов являются нефтяные шламы, представляющие собой сложные смеси, состоящие из нефтепродуктов, механических примесей (глины, оксидов металлов, песка) и воды, находящиеся в форме стабильной эмульсии типа вода-масло (O'Rourke and Connolly, 2003). Объем образующихся ежегодно нефтяных шламов достигает по разным оценкам 60 миллионов тонн, на настоящий момент накоплено около 1 млрд тонн нефтяных шламов (BP, 2012; da Silva et al., 2012; Tahhan and Abu-Ateih, 2009).

В зависимости от условий образования, нефтяные шламы можно разделить на: грунтовые, образующиеся в результате аварийных разливов нефтепродуктов на почву; придонные, формирующиеся при оседании нефти на дно водоемов; отходы резервуарного типа, являющиеся результатом осаждения компонентов водно-нефтяной эмульсии на стенках резервуаров (Кузнецов с соавт., 2000; Гилязов с соавт., 2008; Hu et al., 2013). Последние шламы содержат большое количество смолисто-асфальтеновых и парафиновых соединений, образующихся в результате окисления нефтепродуктов и реакции с материалом стенок резервуаров (Ayotamuno et al., 2007).

По агрегатному состоянию нефтяные отходы делятся на твердые и жидкие (Al-Futaisi et al., 2007; Speight, 2002). Жидкие представляют собой - водонефтяные эмульсии с содержанием нефти до 90%, твердые же отличаются ее незначительным содержанием и большим количеством механических примесей (до 65 %). К твердым нефтяным отходам относятся отходы ремонта скважин, резервуаров, загрязненный нефтью грунт. Жидкие включают промежуточный слой нефтепереработки, буровой раствор, загрязнённые ливневые стоки и снег (O'Rourke and Connolly, 2003).

Фракционный и химический состав нефтяных шламов варьирует в зависимости от источника сырой нефти, схемы ее обработки, а также от промежутка времени взаимодействия образованного шлама с окружающей средой (Hu et al., 2013; Speight, 2002). Так, общее содержание углеводородов варьируется от 5 до 90 % (по массе), но чаще составляет 5 -50%, в то время как содержание воды и твердых частиц находится в диапазоне 30-85% и 5-46%, соответственно (Liu et al., 2012; Tahhan and Abu-Ateih, 2009).

В состав нефтяных шламов входят углеводороды (алифатическая и ароматическая фракции), асфальтены, смолы, а также соединения серы и азота (Reddy et al., 2011). Алифатические и ароматические углеводороды, как правило, составляют до 75% углеводородов, наиболее распространенными соединениями являются алканы, циклоалканы, бензол, толуол, ксилолы, нафталин, фенолы, а также различные полициклические ароматические углеводороды (Ward et al., 2003). Нефтяные шламы содержат полярные соединения, такие как, нафтеновые кислоты, меркаптаны, тиофены и пиридины (Kriipsalu and Nammari, 2010). Азот в основном содержится в смолисто-асфальтеновой фракции и составляет менее 3%, содержание серы находится в диапазоне 0,3-10%, кислород составляет менее 4,8% (Kriipsalu and Nammari, 2010). По разным данным нефтяные шламы содержат 40-52% алканов, 28-31% ароматических веществ, 8-10% асфальтенов и 7-22,4% смол (Mishra et al., 2001; Van Hamme and Ward, 2000). Значение рН нефтяных шламов, как правило, находится в диапазоне от 6,5 до 7,5. В результате разных способов образования и разнообразного химического состава нефтяных шламов, его физические свойства, такие как плотность, вязкость и теплота сгорания могут существенно различаться (US EPA, 2010; Jean and Lee, 1999). Кроме органических компонентов нефтяные шламы также содержат тяжелые металлы, концентрация которых изменяется в широком диапазоне (Al-Mutairi et al., 2008; Hu et al., 2013; Trofimov and Rozanova, 2003). Согласно литературным источникам, содержание металлов в шламах нефтеперерабатывающих заводов может достигать 1299 мг/кг цинка, 60200 мг/кг железа, 500 мг/кг меди, 480 мг/кг хрома, 480 мг/кг никеля и 565 мг/кг свинца (Admon et al., 2001; Marin et al., 2005).

Размещение нефтяных шламов в окружающей среде может привести к различным токсическим эффектам, вызванным углеводородами и тяжелыми металлами. Нормальные алканы оказывают наркотическое и токсическое действие на живые организмы, легко проникают в клетки организмов через мембраны, дезорганизуют цитоплазматические структуры. Углеводороды могут оказывать мутагенное и канцерогенное действие (Propst et al., 1999; Ramirez et al., 2019), причем наиболее выраженный генотоксический эффект в отношении человека и животных оказывают полициклические ароматические углеводороды (ПАУ) (Robertson et al., 2007). При взаимодействии нефти с кислородом образуются инертные соединения, практически недоступные микроорганизмам, что затрудняет самоочищение природных объектов. Инертные соединения также образуются при взаимодействии органических соединений шлама с гуминовыми веществами (гумин, фульфокислоты и гуминовые кислоты) (Alexander, 1999; Certini, 2005). Поступление нефти приводит к нарушению

структуры и воздушного режима почвы и сильному закислению. Происходит массовая гибель мезофауны, наиболее токсичными оказываются легкие фракции. Pirhonen и Huhta (1984) отмечают, что среди мезофауны наиболее чувствительны членистоногие, энхитреиды и дождевые черви (Pirhonen and Huhta, 1984). Компоненты нефти могут мигрировать вниз по профилю почвы в грунтовые воды, которые связаны с другими водными системами, что приводит к серьезным негативным последствиям, таким как снижение разнообразия и обилия рыбы (Trofimov and Rozanova, 2003). Нефть, и в особенности ее смолисто-асфальтеновая фракция, оказывает негативное воздействие на агрохимические свойства почвы, обволакивая корни растений и ухудшая поступление влаги (Сергиенко с соавт. 1979).

Нефтяное загрязнение уменьшает разнообразие почвенной микробиоты, так, в работе Баландиной с соавторами (2013) показано, что через неделю после разлива нефти из загрязненной почвы исчезают бактерии родов Pseudomonas, Rhodococcus, Bacillus и Agrobactrium, а численность представителей родов Clavibacter и Xanthomonas уменьшается на четыре порядка (Баландина с соавт., 2013). Однако после начального ингибирования численности микроорганизмов следует ее повышение. Увеличивается со временем и количество углеводородокисляющих бактерий, оцениваемых по отношению к другим группам. В процессе разложения нефтепродуктов общее количество микроорганизмов приближается к фоновым значениям, но численность нефтеокисляющих бактерий долгое время остается высокой по сравнению с чистой почвой. Отмечено, что алканы С5-С10 оказывают ингибирующий эффект на большинство микроорганизмов, разрушая липидные мембраны. Углеводороды с цепью длиной С20-С40 являются гидрофобными твердыми веществами, что сильно сказывается на способности микроорганизмов к их деградации (Bartha and Atlas, 1977). Как и в случае с алканами, циклопентан, циклогексан и циклогептан также воздействуют на липидную мембрану как растворитель, и являются токсичными для большинства углеводородокисляющих микроорганизмов (Bartha, 1986).

1.2 Методы биоремедиации нефтяных отходов

Стратегия обращения с отходами нефтедобычи включает в себя три уровня: использование технологий, позволяющих уменьшить образование нефтяных шламов в процессе добычи и переработки; получение топлива и полезных продуктов из шламов, и наконец,

утилизации отходов, в случае если первые две стратегии неприменимы (da Silva et al., 2012; Pinheiro et al., 2008).

Наиболее предпочтительны для повторного использования шламы с содержанием нефти более 50% и с концентрацией твердых веществ менее 30% (Hahn et al., 1994). Выделение нефтепродуктов из отходов осуществляют с использованием растворителей, центрифугирования, электрокинетического метода, метода замораживания, сурфактантов и т.д. (Hu et al., 2013).

В случае невозможности использования нефтяных отходов для извлечения углеводородов применяют физико-химические (сжигание, стабилизация, окисление) и биологические (биоремедиация) методы.

Недостатками физических и химических методов утилизации являются их высокая стоимость, необходимость сложного оборудования и значительное количество энергии. В связи с этим, биологическая обработка отходов представляется наиболее перспективной, вследствие простоты и безопасности для окружающей среды (Li et al., 2015; Speight and Arjoon, 2012).

В основе технологии биоремедиации лежит преобразование микроорганизмами углеводородов в оксид углерода, воду и другие простые промежуточные компоненты (например, органические кислоты и альдегиды), не представляющие опасность для окружающей среды (De Gannes et al., 2013; Hu et al., 2013). К организмам способным осуществлять трансформацию компонентов нефти относятся бактерии, грибы, актиномицеты, цианобактерии и некоторые виды растений (Speight and Arjoon, 2012; US EPA, 2006). При биоремедиации реализуют два подхода: в основе первого лежит активизация потенциала аборигенной микрофлоры, во втором наряду с аборигенной в качестве агентов биодеградации нефтяных компонентов используется интродукция селекционированной микрофлоры - соответственно биостимуляция и биоаугментация.

С технической точки зрения биоремедиация может быть реализована тремя основными методами: ландфарминг, компостирование и использование биореакторов (Hu et al., 2013; Semple et al., 2001).

Ландфарминг представляет собой технику, в которой отходы смешиваются с чистой почвой и периодически вспахиваются (Hejazi et al., 2003). Marin с соавторами (2005) отмечают, что применение данного метода в засушливом климате, позволяет снизить содержание нефтепродуктов в отходе на 80% в течение 11 месяцев, причем в течение первых трех месяцев их содержание снижается на 50%. Admon с соавторами (2001) наблюдают аналогичную картину

- наиболее эффективны первые три недели ремедиации, в целом в течение двух месяцев общее содержание нефтепродуктов снижается на 70-90%. Эффективность данного метода может быть повышена путем поддержания оптимальной влажности, рН и численности микробной популяции. Преимуществами данного метода являются его низкая себестоимость, простота эксплуатации, небольшое потребление энергии и возможность утилизации большого количества отходов (Khan et al., 2004). К недостаткам можно отнести: необходимость больших площадей, трудозатратность, продолжительность времени утилизации, а также возможность миграции загрязняющих веществ в грунтовые воды и испарения в воздух (Bhattacharyya and Shekdar, 2003). Кроме того, значительное влияние имеет температура окружающей среды, вследствии чего, запахивание отходов в холодных регионах может быть неэффективно.

Компостирование представляет собой метод, который включает в себя объединение загрязненного грунта или нефтяных отходов с неопасными органическими отходами (навоз, сельскохозяйственные отходы, органическая фракция ТБО, осадки сточных вод) (Chen et al., 2015; Wu et al., 2013; Zhang et al., 2011). Благоприятное распределение воздуха и воды обеспечивается содержанием в компостных смесях наполнителей (солома, опилки, кора) которые увеличивают пористость смеси. Так, согласно данным, представленным в работе Gandolfi с соавторами (2010), использование метода компостирования позволило снизить содержание углеводородов в загрязненной почве на 60% по сравнению с контролем. Важными факторами, влияющими на эффективность процесса, являются - соотношение C: N: P, влажность и температура ремедиационных смесей (Ball et al., 2017; Epstein, 1997). Определяющим параметром является и содержание кислорода. Так Wang с соавторами (2012) обнаружили, что во время компостирования нефтяных шламов, микробная метаболическая активность и разнообразие были значительно повышены за счет добавления разрыхляющего агента, что способствовало насыщению смеси кислородом, и после 220 дней содержание нефтепродуктов снизилось до 49,6%.

Готовность компостов определяют согласно определенным критериям, таким как содержание патогенов, тяжелых металлов, органического вещества, стабильности и зрелости (Barral Silva et al., 2007; Tognetti et al., 2007). Наиболее широко для оценки эффективности процесса компостирования используют параметры стабильности и зрелости (Zmora-Nahum et al., 2005). Стабильность является мерой сопротивления органического вещества микробной деградации (Oviedo-Ocana et al., 2015). Зрелость описывает токсичность компоста по отношению к растениям и возможность использовать его в сельском хозяйстве. Эти два

критерия изменяются взаимозависимо, поскольку именно в процессе микробного разложения неустойчивого органического вещества образуются фитотоксические соединения, вследствие чего незрелый компост негативно влияет на растения, однако он может быть более эффективен в качестве агента биоремедиации (Aspray et al., 2015; Bernal et al., 2009).

Преимуществом компостирования по сравнению с ландфармингом являются контролируемые условия переработки отходов и безопасность для окружающей среды. Однако несмотря на достоинства (низкие капитальные и эксплуатационные расходы, простота конструкции) деградация углеводородов, может быть не достаточно эффективна (Ouyang et al., 2005a).

Метод утилизации с использованием биореакторов позволяет обеспечить быструю биодеградацию загрязняющих веществ, благодаря большой площади контакта микроорганизмов и отхода, обеспеченной постоянным перемешиванием. Существуют технологии, основанные на смешивании в реакторах твердых отходов с водой (5-50% вес/об), для того, чтобы получить большее количество растворимых загрязняющих веществ, и увеличить контакт между микроорганизмами, питательными веществами и водой (Weber and Kim, 2005). Ayotamuno с соавторами (2007) отмечают, что применение биореакторного метода утилизации совместно с биоаугментацией позволяет снизить содержание нефтепродуктов на 63,7-84,5 % в течение шести недель. В работе Machin-Ramirez с соавторами (2008) добавление коммерческого удобрения в процесс утилизации позволяет снизить содержание нефтепродуктов на 24% в течение первых 25 дней. Несмотря на высокую эффективность такого подхода, его проблемой является высокая стоимость, а также необходимость предварительной обработки и дальнейшей утилизации продуктов (обезвоживание, улавливание и очистка образованных летучих соединений) (Castaldi, 2003).

На заключительных этапах биоремедиации для достижения максимального снижения содержания нефтяных компонентов, рядом авторов рекомендуется использование приемов фиторемедиации (Peng et al., 2009). Так в работе Киреевой с соавторами (2009) ремедиация осуществляется путем компостирования нефтяных шламов совместно с целлюлозосодержащими отходами в течение 180 суток, а затем дополнительно проводится дальнейшая фиторемедиация с целью снижения токсичности отходов. При этом на первом этапе концентрация нефтепродуктов снижается с 227 до 60 г/кг, а фиторемедиация с помощью семян люцерны и костреца позволяет снизить их содержание до 20 г/кг на 360 сутки.

1.2.1 Методы биостимуляции и биоаугментации

Биостимуляция представляет собой активирование аборигенного сообщества микроорганизмов путем внесения или балансировки питательных веществ, регуляции воздушного режима, окислительно-восстановительного потенциала и оптимизации рН (Wang et al., 2010). Для этого чаще всего используют минеральные и органические удобрения (Wu et al., 2017a; Zhu et al., 2004). Органические удобрения можно разделить на традиционные (отходы животноводства и растениеводства) и нетрадиционные (сточные воды, компосты) (Juteau et al., 2003; Moorman et al., 2001). Органические удобрения используются для стимулирования роста аборигенной микрофлоры, за счет того, что они являются источником питательных веществ, улучшают физико-химические характеристики нефтезагрязненных почв, и связывают загрязняющие вещества, таким образом, снижая их токсичность. Так, Agamuthu с соавторами (2013) использовали в качестве агентов биостимуляции осадки сточных вод и коровий навоз. 10%-е внесение навоза в нефтезагрязненную почву позволило снизить содержание углеводородов на 94%, внесение осадка сточных вод - на 82%, в то время как в контрольной почве содержание углеводородов снижалось на 56%. Китайскими авторами показано, что использование для биостимуляции смеси зеленых отходов и отходов овощей позволил снизить концентрацию нефтепродуктов в почве на 50,5% (Zhang et al., 2011). Важным фактором при биостимуляции является качество используемого материала. Так, Sayara с соавторами (2010) отмечают, что применение зрелого и стабильного компоста наиболее эффективно, и позволяет снизить содержание нефтепродуктов до 92%, тогда как незрелый компост снижает содержание нефтепродуктов лишь на 40%.

Другим методом биоремедиации является биоаугментация, которая основана на внесении высоких концентраций углеводородокисляющих микроорганизмов (Agarwal and Liu, 2015; D'Annibale et al., 2006; Thompson et al., 2005). Наиболее часто при биоаугментации используют углеводородокисляющие микроорганизмы следующих таксономических групп: Mycobacterium, Sphingomonas, Pseudomonas, Acromobacter, Acinetobacter, Alcalogenes, Arthrobacter, Bacillus, Brevibacterium, Cornybacterium, Flavobacterium, Nocardia, Pseudomonas, Dietzia, Methylobacterium, Rhodococcus, Vibrio, а также микроскопические грибы: Chrysosporium, Bjerkandera, Irpex, Agrocybe, Lentinus, Trametes, Pleurotus, Botryosphaeria и другие (Al-Sulaimani et al., 2010; Hong et al., 2007; Silva et al., 2009; Varjani and Upasani, 2017a; Yu et al., 2005). Многие авторы сходятся во мнении, что, поскольку нефтяные шламы представляют собой сложную

смесь алканов, ароматических, азот-, серо-, кислородсодержащих соединений и асфальтеновых фракций, отдельные штаммы микроорганизмов не могут разложить все компоненты нефти, и в этом случае целесообразно применение микробных консорциумов (Cerqueira et al., 2011a; Das and Mukherjee, 2007). Так, Cerqueira с соавторами (2014) отмечают, что из группы выделенных штаммов (Stenotrophomonas acidaminiphila, Bacillus megaterium, Bacillus cibi, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus cereus) наиболее эффективно разлагают углеводороды штамм Pseudomonas aeruginosa и консорциум этих микроорганизмов. Pacwa-Plociniczak с соавторами (2016) для биоремедиации нефтезагрязненной почвы вносили Bacillus subtilis T0-1 или Pseudomonas sp. P-1, а также их консорциум. Снижение содержания нефтепродуктов было отмечено во всех вариантах, однако, эффективность консорциума оказалась в три раза выше по сравнению с внесением штаммов индивидуально. Некоторые авторы также отмечают, что многократная инокуляция позволяет увеличить эффективность действия биопрепарата (Gilbert and Crowley, 1998). Так, в Schwartz с соавторами (2001) отмечают, что двукратное и трехкратное внесение позволило повысить эффективность биодеградации фенантрена по сравнению с однократной, что может быть связано с тем, что повторное внесение увеличивает количество интродуцированных штаммов и усиливает их популяцию.

Многие авторы отмечают высокую эффективность интродукции микроскопических грибков. Так, Covino с соавторами (2016), при исследовании эффективности биоремедиации нефтезагрязненных почв с помощью грибов - Pleurotus ostreatus, Botryosphaeria rhodina, установил, что внесение B. rhodina не приводило к усилению степени биодеградации нефтепродуктов по сравнению с биостимулированным контролем, тогда как внесение P. ostreatus и консорциума двух этих видов привело к снижению содержания нефтепродуктов на 86,8 и 88,2 %, соответственно. В исследовании Shahi c соавторами (2016), изучалась способность грибов Trametes versicolor и Bjerkandera adusta разлагать углеводороды загрязненной нефтью почвы в качестве метода последующей обработки после биостимуляции. В результате авторами было установлено, что использование T. versicolor позволяет удалять нефтепродукты более эффективно, чем B. adusta. Куликова с соавторами (2016) отмечает, что внесение грибов Steccherinum murashkinskyi и Trametes maxima усиливает деградацию углеводородов в нефтезагрязненной почве эффективнее, чем внесение бактериальных штаммов Rhodococcus sp. Так, S. murashkinskyi отметился наибольшим потенциалом к деградации алифатических углеводородов, а T. maxima. - ароматических.

В литературе широко представлены данные о высокой эффективности приемов биоаугментации по сравнению с методами биостимуляции. Так, в работе Wu с соавторами (2017b), установлено, что биоаугментация нефтезагрязненных почв с помощью консорциума штаммов (KF453954 Pseudomonas stutzeri GQ-4, KF453956 Pseudomonas SZ-2, и KF453961 Bacillus SQ-2) более эффективна, чем биостимуляция. Снижение содержания углеводородов за 8 недель биоремедиации составляет 58% и 48% соответственно при начальной концентрации нефтепродуктов 20,2 г/кг. Высокая эффективность биоаугментации также подтверждается в работе Fan с соавторами (2014), где интродукция штаммов дрожжей привела к удалению 83% нефтепродуктов в загрязненных почвах за 120 дней, по сравнению с 61% при использовании метода биостимуляции. В работе Kuran с соавторами (2014) отмечается, что, несмотря на то, что биоаугментация с помощью внесения представителей Pseudomonas fluorescens и биостимуляция с помощью внесения гуматов и цеолита привели к одному уровню утилизации углеводородов, равному 60%, биоаугментация сокращала этот процесс до 28 дней по сравнению с 91 днем при биостимуляции. Alexander с соавторами (1999) отмечает, что биоаугментация эффективна лишь на начальных этапах процесса деградации углеводородов. Подтверждает это мнение и группа китайских авторов, которая продемонстрировала, снижение содержания углеводородов на 54,6% в течение 30 суток (Cai et al., 2016).

Другие авторы отмечают, что применение биостимуляции оказывает больший эффект по сравнению в биоаугментацией. Авторы предполагают, что такой эффект может быть вызван низкой конкурентоспособностью интродуцированных штаммов по сравнению с аборигенным сообществом и их гибелью (Dellagnezze et al., 2016; Tyagi et al., 2011). Так, в работе Fodelianakis с соавторами (2015) проведено сравнение эффективности биоремедиации нефтезагрязненных донных отложений внесенным консорциумом по сравнению со стимуляцией аборигенного сообщества. В оба образца были добавлены питательные вещества с целью ускорения процесса деградации нефти. Авторы пришли к выводу, что биодеградация в основном выполнялась аборигенным сообществом, в то время как биоаугментация, в отличие от биостимуляции, не улучшала процесс ремедиации. Большую эффективность биостимуляции продемонстрировали китайские авторы (Wu et al., 2016). Авторы отмечают, что бистимуляция позволяет снизить общее содержание углеводородов на 60%, тогда биоаугментация с помощью внесения штамма Acinetobacter SZ-1 только на 34%. Аналогичные результаты были получены Li с соавторами (2009). Несмотря на то, что внесение консорциума микроорганизмов 5 штаммов грибов -Phanerochaete chrysosporium, Cuuninghamella sp., Alternaria alternata, Penicillium chrysogenum,

Aspergillus niger; и 3 штамма бактерий - Bacillus sp., Zoogloea sp., and Flavobacterium sp. увеличивает разложение ПАУ, создание необходимых условий для аборигенной микрофлоры позволяет добиться сопоставимого уровня деградации ПАУ в почве.

Чаще всего приемы биостимуляции и биоаугментации применяются одновременно, а публикации посвящены сравнительной оценке этих приемов. В целом анализ литературы показывает отсутствие единого мнения относительно преимущественности того или иного подхода. Так, Jiang с соавторами (2016) отмечают отсутствие эффекта при применении биоаугментации совместно с биостимуляцией при ремедиации почвы, загрязненной нефтью в концентрации 31,5 и 50 г/кг. При анализе деградации нефти в микрокосме с помощью внесения бактериального консорциума и минеральных солей NH4CI и NaH2PÜ4 в качестве источников N и P, Abed c соавторами (2014) выявили, что применение биоаугментации совместно с биостимуляцией не позволяет добиться существенного увеличения эффективности биоремедиации по сравнению с одной лишь биостимуляцией. Схожие результаты получены Kauppi с соавторами (2011), которые отмечают, что совместное применение биостимуляции и биоаугментации (внесение консорциума Pseudomonas fluorescens rib, Bacteroides bacterium RD4, Acinetobacter sp., и штамма рода Acinetobacter calcoaceticus индивидуально) (63% деградации углеводородов) не превышают результаты применения только биостимуляции (55% углеводородов).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Бикташева Лилия Рамилевна, 2019 год

Список литературы

1. Алимова Ф.К. Методы определения гидролаз почв и почвенных микроорганизмов: Учебно-методическое пособие / Ф.К. Алимова., Р.И. Тухбатова, Д.И. Тазетдинова. - Казань: Казанский университет, 2010. - 67 с.

2. Антоненко, Д.А. Влияние сложного компоста на верхний слой чернозема обыкновенного и развитие сельскохозяйственных культур /Д. А. Антоненко, И.С. Белюченко, Л. Н Мельник, О. А. Никифоренко, Ю.Ю. Ткаченко//Экологический вестник Северного Кавказа - 2014. - т. 4. - С. 45-65.

3. База данных NCBI [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

4. Баландина, А.В. Применение штаммовых культур грибов-сапрофитов в методике рекультивации почв, загрязненных нефтью /А.В. Баландина, Т.Ф. Одегова, А.В. Казаков, Д.Б. Кузнецов//Экономические науки - 2013. - т 6. - С. 668-672.

5. Баринова С.С. Водоросли-индикаторы в оценке качества окружающей среды/ С.С. Баринова, Л.А. Медведева, О.В. Анисимова. - М.: ВНИИприроды, 2000. — 150 с.

6. Белюченко, И.С Анализ данных и математическое моделирование в экологии и природопользовании /И. С. Белюченко, А. В. Смагин, Л. Б. Попок, Л. Е. Попок. — Учебное пособие. — Краснодар: КубГАУ, 2015. - 313 а

7. Брюханов, А.Л. Молекулярная микробиология /А.Л. Брюханов, К.В. Рыбак, А.И. Нетрусов. - Москва: изд-во МГУ, 2012. - 480 с.

8. Ветрова, А.А. Биодеградация нефти консорциумом штаммов-нефтедеструкторов в лабораторных модельных системах /А.А. Ветрова, В.А. Забелин, А.А. Иванова, Л.А. Адаменко, Я.А. Делеган, К.В. Петриков//Юг России Экология, развитие - 2018. - т 13. - С. 184-198.

9. Гилязов, М.Ю. Нефтезагрязненные почвы Республики Татарстан и приемы их рекультивации /М.Ю. Гилязов, А.Х. Яппаров, Гайсин И.А. - Казань: Центр инновационных технологий, 2008. - 244 а

10. Глик, Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение /Б. Глик, Дж. Пастернак. - М: Мир, 2002. -589 а

11. ГН 2.1.7.2511-09 Ориентировочно допустимые концентрации (ОДК) химических веществ в почве: Гигиенические нормативы. - М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2009. - 10 с

12. Государственный доклад "О состоянии природных ресурсов и об охране окружающей среды Республики Татарстан в 2018 году". - Казань: Мир без границ, 2019. - 402

с.;

13. ГОСТ Р 51797-2001. Вода питьевая. Метод определения содержания нефтепродуктов - М.: Стандартинформ 2010.- 14 с.

14. ГОСТ Р 17.4.3.07-2001. Почвы. Требования к свойствам осадков сточных вод при использовании их в качестве удобрений. - М.: Стандартинформ 2008.- 5 с.

15. Горленко, М.В. Мультисубстратное тестирование природных микробных сообществ /М.В. Горленко. - М: Макс Пресс, 2005. - 88 с.

16. Иванов, А.И. Агроэкологические последствия неравномерного внесения навоза в овощном севообороте /А.И. Иванов, А.А. Конашенков//Агрохимия - 2012 .- т 6. - С. 66-72.

17. Киреева, Н.А. Комплексное биотестирование для оценки загрязнения почв нефтью /Н.А. Киреева, М.Д. Бакаева, Е.М. Тарасенко//Экология и промышленность России -2004 .- т 2. - С. 26-29.

18. Киреева, Н.А. Биоремедиация и детоксикация нефтешламов /Н.А. Киреева, А.А. Шамаева, А.С. Григоиади, В.В. Водопьянов, Е.И. Новоселова//Защита окружающей среды в нефтегазовом комплексе. - 2009 .- т 3. - С. 43-47.

19. Круглов, Ю.В. Микробное сообщество почвы: физиологическое разнообразие и методы исследования (обзор) /Ю.В. Круглов//Сельскохозяйственная биология- 2016.- т 51. - С. 46-59. https://doi.Org/10.15389/agrobiology.2016.1.46rus

20. Кузнецов, Ф.М. Рекультивация нефтезагрязненных почв /Ф.М. Кузнецов, С.А. Иларионов, В.В. Середин, С.Ю. Иларионова. - Пермь: Перм. гос.техн.ун-т., 2000. - 105 с.

21. Куликова, Н.А. Деградация нефти базидиальными грибами белой гнили в почве и торфе при пониженной температуре /Н.А. Куликова, О.И. Кляйн, Д.В. Пивченко, Е.О. Ландесман, Н.Н. Позднякова, О.В. Турковская//Прикладная биохимия и микробиология - 2016 .- т 52. - С. 599-608.

22. Онлайн-программа PRIMER [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.premierbiosoft.com/qOligo/Oligo .j sp?PID=1

23. ПНД Ф 14.1:2:4.5-95. Количественный химический анализ вод. Методика измерений массовой концентрации нефтепродуктов в питьевых, поверхностных и сточных водах методом ИК-спектрометрии. - Москва, 1995.- 18 с.

24. ПНД Ф 16.1:2.2.22-98. Количественный химический анализ почв. Методика выполнения измерений массовой доли нефтепродуктов в минеральных, органогенных, органоминеральных почвах и донных отложениях методом ИК-спектрометрии. - Москва, 2005 - 21 с.;

25. Рогозина, Е.А. Биопрепараты серии Нафтокс для очистки почвы от нефтяного загрязнения /Е.А. Рогозина, П.А. Моргунов, И.Ф. Тимергазина, А.И. Шапиро//Нефтегазовая

технология теория и практика - 2013. - т 8. - С. 14.

26. Сергиенко, С.Р. Высокомолекулярные неуглеводородные соединения нефти. Смолы и асфальтены /С.Р. Сергиенко, Б.А. Таиманова, Е.И. Талалаев. - М: Наука, 1979. - 269 c.

27. Хазиев Ф.Х. Методы почвенной энзимологии / Ф.Х. Хазиев. - М.:Наука, 2005.-

48с.;

28. Шлегель Г. Общая микробиология / Г. Шлегель. - М.: Мир, 1987. - 566 с.;

29. Ягафарова, Г.Г. Утилизация экологически опасных буровых отходов /Г.Г. Ягафарова, В.Б. Барахнина//Нефтегазовое дело - 2006. - С. 17.

30. Ягафарова, Г.Г. Биоремедиация грунтов, загрязненных тяжелой нефтью /Г.Г. Ягафарова, А.К. Мазитова, С.В. Лентьева, А.Х. Сафаров, Д.Р. Вахитова// SOCAR Proceedings. -2016. - С. 75-80.

31. Якушев, А.В. Комплексный структурно-функциональный метод характеристики микробных популяций /А. В. Якушев//Почвоведение - 2015. - т. 4. - С. 429-446.

32. Abbasian, F. A Comprehensive Review of Aliphatic Hydrocarbon Biodegradation by Bacteria /Firouz Abbasian, Robin Lockington, Megharaj Mallavarapu, Ravi Naidu//Appl. Biochem. Biotechnol. - 2015. - 30 p.

33. Abed, R.M.M. Characterization of hydrocarbon-degrading bacteria isolated from oil-contaminated sediments in the Sultanate of Oman and evaluation of bioaugmentation and biostimulation approaches in microcosm experiments /Raeid M.M. Abed, Jamal Al-Sabahi, Fatema Al-Maqrashi, Amal Al-Habsi, Manal Al-Hinai//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2014. - N 89. - P. 5866.

34. ABI PRISM ® 3100 Genetic Analyzer Sequencing Chemistry Guide. USA: Applied Biosystems, 2001. - 340 p.

35. Adessi, C.Solid phase DNA amplification: characterisation of primer attachment and amplification mechanisms. /C Adessi, G Matton, G Ayala, G Turcatti, J J Mermod, P Mayer, E Kawashima//Nucleic Acids Res. - 2000. - N 28. - P. E87.

36. Admon, S. Biodegradation kinetics of hydrocarbons in soil during land treatment of oily sludge /Smadar Admon, Michal Green, Yoram Avnimelech//Bioremediat. J. - 2001. - N 5. - P. 193209.

37. Agamuthu, P. Bioremediation of Hydrocarbon Contaminated Soil Using Selected Organic Wastes /P. Agamuthu, Y.S. Tan, S.H. Fauziah//Procedia Environ. Sci. - 2013. - N 18. - P. 694-702.

38. Agarwal, A. Remediation technologies for oil-contaminated sediments /Ashutosh Agarwal, Yu Liu//Mar. Pollut. Bull. - 2015. - N. 101(2). - P. 483-90.

39. Al-Futaisi, A. Assessment of alternative management techniques of tank bottom

petroleum sludge in Oman /Ahmed Al-Futaisi, Ahmad Jamrah, Basma Yaghi, Ramzi Taha//J. Hazard. Mater. - 2007. - N 141. - P. 557-564.

40. Al-Kharusi, S. Changes in respiration activities and bacterial communities in a bioaugmented oil-polluted soil in response to the addition of acyl homoserine lactones /Samiha Al-Kharusi, Raeid M M. Abed, Sergey Dobretsov//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2016. - N 107. - P. 165173.

41. Al-Kindi, S. Comparing Oil Degradation Efficiency and Bacterial Communities in Contaminated Soils Subjected to Biostimulation Using Different Organic Wastes /Sumaiya Al-Kindi, Raeid M M. Abed//Water. Air. Soil Pollut. - 2016a. - N 227.

42. Al-Kindi, S. Effect of biostimulation using sewage sludge, soybean meal, and wheat straw on oil degradation and bacterial community composition in a contaminated desert soil /Sumaiya Al-Kindi, Raeid M M. Abed//Front. Microbiol. - 2016b. - N 7.

43. Al-Mutairi, N. Ecorisk evaluation and treatability potential of soils contaminated with petroleum hydrocarbon-based fuels /N. Al-Mutairi, A. Bufarsan, F. Al-Rukaibi//Chemosphere -2008. - N 74(1). - P. 142-8.

44. Al-Sulaimani, H.S. Experimental Investigation of Biosurfactants Produced by Bacillus Species and their Potential for MEOR in Omani Oil Field /Hanaa Salim Al-Sulaimani, Yahya Mansoor Al-Wahaibi, Saif Al-Bahry, Abdulkadir Elshafie, Ali Soud Al-Bemani, Sanket Janakray Joshi, Saeed Zargari// SPE EOR Conference at Oil & Gas West Asia, Muscat, Oman 2010. - 9 p.

45. Alexander, M. Bioremediation and Biodegradation /M Alexander//Focus (Madison). -1999. - N 32. - P. 1126-1133.

46. Alvarez, C.R. Short-term effects of tillage systems on active soil microbial biomass /Carina Rosa Alvarez, Roberto Alvarez//Biol. Fertil. Soils - 2000. - N 31. - P. 157-161.

47. An Introduction to Next-Generation Sequencing Technology. Illumina, Inc., 2013. - 16

p.

48. Anaissie, E.J. Fusariosis Associated with Pathogenic Fusarium Species Colonization of a Hospital Water System: A New Paradigm for the Epidemiology of Opportunistic Mold Infections /Elias J. Anaissie, Robert T. Kuchar, John H. Rex, Andrea Francesconi, Miki Kasai, Frank-Michael C. Müller, Mario Lozano-Chiu, Richard C. Summerbell, M. Cecilia Dignani, Stephen J. Chanock, Thomas J. Walsh//Clin. Infect. Dis. - 2002. - N 33. - P. 1871-1878.

49. Angello, G. Making as the New Colored Pencil: Translating Elementary Curricula into Maker Activities /Genna Angello, Sharon Lynn Chu, Francis Quek//ACM SIGCHI Conf. Interact. Des. Child. 2016 - 2016. - P. 68-78.

50. Aprill, W. Evaluation of the use of prairie grasses for stimulating polycyclic aromatic hydrocarbon treatment in soil /Wayne Aprill, Ronald C. Sims//Chemosphere - 1990. - N 20(1-2). - P.

253-265.

51. Aspray, T.J. Static, dynamic and inoculum augmented respiration based test assessment for determining in-vessel compost stability /Thomas J. Aspray, Mary E. Dimambro, Phil Wallace, Graham Howell, James Frederickson//Waste Manag. - 2015. - N 42. - P. 3-9.

52. Ayotamuno, M.J. Bio-remediation of a sludge containing hydrocarbons /M. J. Ayotamuno, R. N. Okparanma, E. K. Nweneka, S O T. Ogaji, S. D. Probert//Appl. Energy- 2007. - N 84. - P. 936-943.

53. Bacaro, G. Measuring beta-diversity from taxonomic similarity /G Bacaro, C Ricotta, S Mazzoleni//J. Veg. Sci.- 2007. - N 18. - P. 793-798.

54. Ball, A.S. Biostabilization of municipal solid waste fractions from an Advanced Waste Treatment plant /Andrew S. Ball, Esmaeil Shahsavari, Arturo Aburto-Medina, Krishna K. Kadali, Amer A.J. Shaiban, Richard J. Stewart//J. King Saud Univ. - Sci. - 2017. - N 29 (2). - P. 145-150.

55. Banegas, V. Composting anaerobic and aerobic sewage sludges using two proportions of sawdust /V. Banegas, J. L. Moreno, J. I. Moreno, C. García, G. León, T. Hernández//Waste Manag.- 2007. - N 27. - P. 1317-1327.

56. Barral Silva, M.T. Assessment of municipal solid waste compost quality using standardized methods before preparation of plant growth media /María Teresa Barral Silva, Ana Moldes Menduíña, Yolanda Cendón Seijo, Francisco Díaz Fierros Viqueira//Waste Manag. Res. -2007. - N 25. - P. 99-108.

57. Barrena, R. Dehydrogenase activity as a method for monitoring the composting process. /Raquel Barrena, Felícitas Vázquez, Antoni Sánchez//Bioresour. Technol. - 2008. - N 99. - P. 905-8.

58. Bart, J.C.J. Biodiesel science and technology /Jan C. J. Bart, Natale Palmeri, Stefano Cavallaro. - Woodhead Publishing, 2010, - 864 p.

59. Bartha, R. Biotechnology of petroleum pollutant biodegradation /Richard Bartha//Microb. Ecol. - 1986. - N 12. - P. 155-172.

60. Bartha, R. The Microbiology of Aquatic Oil Spills /R. Bartha, R. M. Atlas//Adv. Appl. Microbiol.- 1977 .- N 22. - P. 225-266.

61. Bennett, L.T. Non-parametric multivariate comparisons of soil fungal composition: Sensitivity to thresholds and indications of structural redundancy in T -RFLP data /Lauren T. Bennett, Sabine Kasel, Josquin Tibbits//Soil Biol. Biochem. - 2008. - N 40. - P. 1601-1611.

62. Benyahia, F. Bioremediation of crude oil contaminated desert soil: Effect of biostimulation, bioaugmentation and bioavailability in biopile treatment systems /Farid Benyahia, Ahmed Shams Embaby//Int. J. Environ. Res. Public Health - 2016. - N 13.

63. Bernal, M.P. Composting of animal manures and chemical criteria for compost maturity assessment. A review /M. P. Bernal, J. A. Alburquerque, R. Moral//Bioresour. Technol.- 2009. - N

100. - P. 5444-5453.

64. Bernal, M.P. Maturity and stability parameters of composts prepared with a wide range of organic wastes /M. P. Bernal, C. Paredes, M. A. Sánchez-Monedero, J. Cegarra//Bioresour. Technol. - 1998. - N 63. - P. 91-99.

65. Bhattacharyya, J.K. Treatment and disposal of refinery sludges: Indian scenario /J. K. Bhattacharyya, A. V. Shekdar//Waste Manag. Res.- 2003. - N 21. - P. 249-261.

66. Bisswanger, H. Enzyme assays - Review /Hans Bisswanger//Perspect. Sci. - 2014. - N 1. - P. 41-55.

67. Bonito, G. Identification of fungi associated with municipal compost using DNA-based techniques /Gregory Bonito, Omoanghe S. Isikhuemhen, Rytas Vilgalys//Bioresour. Technol. - 2010. -N 101. - P. 1021-1027.

68. BP statistical review of world energy /BP. - London, 2012. - 45 p.

69. Brewer, L.J. Maturity and stability evaluation of composted yard trimmings /Linda J. Brewer, Dan M. Sullivan//Compost Sci. Util. - 2003. - N 11. - P. 96-112.

70. Bundy, J.G. Microbial communities in different soil types do not converge after diesel contamination /J. G. Bundy, G. I. Paton, C. D. Campbell//J. Appl. Microbiol. - 2002. - N 92. - P. 276-288.

71. Bustamante, M.A. Co-composting of distillery wastes with animal manures: Carbon and nitrogen transformations in the evaluation of compost stability /M. A. Bustamante, C. Paredes, F. C. Marhuenda-Egea, A. Pérez-Espinosa, M. P. Bernal, R. Moral//Chemosphere - 2008. - N 72. - P. 551-557.

72. Cai, B. Comparison of phytoremediation, bioaugmentation and natural attenuation for remediating saline soil contaminated by heavy crude oil /Bin Cai, Jie Ma, Guangxu Yan, Xiaoli Dai, Min Li, Shaohui Guo//Biochem. Eng. J. - 2016. - N 112. - P. 170-177.

73. Campos-Góngora, E. Determination of the effect of polyamines on an oil-degrading strain of Yarrowia lipolytica using an odc minus mutant /E. Campos-Góngora, A. S. Palande, C. León-Ramirez, E. K. Pathan, J. Ruiz-Herrera, M. V. Deshpande//FEMS Yeast Res. - 2018. - N 18.

74. Caporaso, J.G. QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data /J.G. Caporaso, J. Kuczynski, J. Stombaugh, K. Bittinger, F.D. Bushman, E.K. Costello, N. Fierer, A G. Peña, J.K. Goodrich, J.I. Gordon//Nat. Methods - 2010. - N 7. - P. 335-336.

75. Cappello, S. Microbial community dynamics during assays of harbour oil spill bioremediation: A microscale simulation study /S. Cappello, G. Caruso, D. Zampino, L. S. Monticelli, G. Maimone, R. Denaro, B. Tripodo, M. Troussellier, M. Yakimov, L. Giuliano//J. Appl. Microbiol.-2007 .- N 102. - P. 184-194.

76. Carvalho, F.M. Genomic and evolutionary comparisons of diazotrophic and pathogenic

bacteria of the order Rhizobiales /F.M. Carvalho, R.C. Souza, F.G. Barcellos, M. Hungria, A.T.R. Vasconcelos//BMC Microbiol.- 2010. - N 10. - P. 37.

77. Cases, I. The grammar of (micro)biological diversity /Ildefonso Cases, Victor De Lorenzo//Environ. Microbiol. - 2002. - N 4 (11). - P. 623-627.

78. Castaldi, F.J. Tank-based bioremediation of petroleum waste sludges /Frank J. Castaldi//Environ. Prog. - 2003 - N 22. - P. 25-36.

79. Category Assessment Document for Reclaimed Petroleum Hydrocarbons: Residual Hydrocarbon Wastes from Petroleum Refining. - USA: US EPA, American Petroleum Institute, 2010. - 59 p.

80. Cerqueira, V.S. Biodegradation potential of oily sludge by pure and mixed bacterial cultures /Vanessa S. Cerqueira, Emanuel B. Hollenbach, Franciele Maboni, Marilene H. Vainstein, Flâvio A O Camargo, Maria do Carmo R Peralba, Fâtima M. Bento//Bioresour. Technol. - 2011a. - N 102. - P. 11003-11010.

81. Cerqueira, V.S. Biodegradation potential of oily sludge by pure and mixed bacterial cultures /Vanessa S. Cerqueira, Emanuel B. Hollenbach, Franciele Maboni, Marilene H. Vainstein, Flâvio A.O. Camargo, Maria do Carmo R. Peralba, Fâtima M. Bento//Bioresour. Technol. - 2011b. -N 102. - P. 11003-11010.

82. Cerqueira, V.S. Comparison of bioremediation strategies for soil impacted with petrochemical oily sludge /Vanessa S. Cerqueira, Maria do Carmo R Peralba, Flâvio A O Camargo, Fâtima M. Bento//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2014. - N 95. - P. 338-345.

83. Certini, G. Effects of fire on properties of forest soils: a review. /Giacomo Certini//Oecologia - 2005. - N 143. - P. 1-10.

84. Chandran, P. Biosurfactant Production and Diesel Oil Degradation By Yeast Species Trichosporon Asahii Isolated From Petroleum Hydrocarbon Contaminated Soil /Preethy Chandran//Int. J. Eng. Sci. Technol. - 2010. - N 2. - P. 6942-6953.

85. Chemlal, R. Microbiological aspects study of bioremediation of diesel-contaminated soils by biopile technique /R. Chemlal, A. Tassist, M. Drouiche, H. Lounici, N. Drouiche, N. Mameri//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2012. - N 75. - P. 201-206.

86. Chen, B. Enhanced bioremediation of PAH-contaminated soil by immobilized bacteria with plant residue and biochar as carriers /Baoliang Chen, Miaoxin Yuan, Linbo Qian//J. Soils Sediments - 2012. - N 12. - P. 1350-1359.

87. Chen, M. Bioremediation of soils contaminated with polycyclic aromatic hydrocarbons, petroleum, pesticides, chlorophenols and heavy metals by composting: Applications, microbes and future research needs /Ming Chen, Piao Xu, Guangming Zeng, Chunping Yang, Danlian Huang, Jiachao Zhang//Biotechnol. Adv. - 2015. - N 33(6). - P. 745-755.

88. Chikere, C.B. Monitoring of microbial hydrocarbon remediation in the soil /Chioma Blaise Chikere, Gideon Chijioke Okpokwasili, Blaise Ositadinma Chikere//Biotech - 2011. - N 1. - P. 117-138.

89. Choi, K.H. Comparison of two kinds of Biolog microplates (GN and ECO) in their ability to distinguish among aquatic microbial communities /Keun Hyung Choi, Fred C. Dobbs//J. Microbiol. Methods - 1999. - N 36. - P. 203-213.

90. Clarke, K.R. Non-parametric multivariate analyses of changes in community structure /K. R. Clarke//Aust. J. Ecol. - 1993. - N 18. - P. 117-143.

91. Colombo, M. Bioremediation of polyaromatic hydrocarbon contaminated soils by native microflora and bioaugmentation with Sphingobium chlorophenolicum strain C3R: A feasibility study in solid- and slurry-phase microcosms /Milena Colombo, Lucia Cavalca, Silvana Bernasconi, Vincenza Andreoni//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2011. - N 65. - P. 191-197.

92. Cooperband, L.R. Relating compost measures of stability and maturity to plant growth /L. R. Cooperband, A. G. Stone, M. R. Fryda, J. L. Ravet//Compost Sci. Util.- 2003 .- N 11. - P. 113124.

93. Covino, S. Comparative assessment of fungal augmentation treatments of a fine -textured and historically oil-contaminated soil /Stefano Covino, Tatiana Stella, Alessandro D'Annibale, Salvador Llado, Petr Baldrian, Monika Cvancarova, Tomas Cajthaml, Maurizio Petruccioli//Sci. Total Environ. - 2016. - N 566-567. - P. 250-259.

94. Cunliffe, M. Effect of Sphingobium yanoikuyae B1 inoculation on bacterial community dynamics and polycyclic aromatic hydrocarbon degradation in aged and freshly PAH-contaminated soils /Michael Cunliffe, Michael A. Kertesz//Environ. Pollut. - 2006. - N 144. - P. 228-237.

95. Cytryn, E. Short-term structure and functional changes in bacterial community composition following amendment with biosolids compost /Eddie Cytryn, Larissa Kautsky, Maya Ofek, Raphi T. Mandelbaum, Dror Minz//Appl. Soil Ecol. - 2011. - N 48. - P. 160-167.

96. D'Annibale, A. Role of autochthonous filamentous fungi in bioremediation of a soil historically contaminated with aromatic hydrocarbons /A. D'Annibale, F. Rosetto, V. Leonardi, F. Federici, M. Petruccioli//Appl. Environ. Microbiol. - 2006. - N 72. - P. 28-36.

97. da Silva, L.J. A review of the technological solutions for the treatment of oily sludges from petroleum refineries /Leonardo Jordao da Silva, Flavia Chaves Alves, Francisca Pessoa de Fran9a//Waste Manag. Res. - 2012. - N 30. - P. 1016-1030.

98. Danon, M. Molecular analysis of bacterial community succession during prolonged compost curing /M. Danon, I.H. Franke-Whittle, H. Insam, Y. Chen, Y Hadar//FEMS Microbiol. Ecol. - 2008. - N 65. - P. 133-144.

99. Das, K. Crude petroleum-oil biodegradation efficiency of Bacillus subtilis and

Pseudomonas aeruginosa strains isolated from a petroleum-oil contaminated soil from North-East India /Kishore Das, Ashis K. Mukherjee//Bioresour. Technol. - 2007. - N 98. - P. 1339-1345.

100. Das, N. Microbial degradation of petroleum hydrocarbon contaminants: an overview. /Nilanjana Das, Preethy Chandran//Biotechnol. Res. Int. - 2011. - N 2011. - P. 941810.

101. Davies, J.S. Crude oil utilization by fungi /J. S. Davies, D.W.S. Westlake//Can. J. Microbiol. - 1979. - N 25. - P. 146-156.

102. De Gannes, V. Prokaryotic successions and diversity in composts as revealed by 454-pyrosequencing /Vidya de Gannes, Gaius Eudoxie, William J. Hickey//Bioresour. Technol. - 2013. -N 133. - P. 573-580.

103. De Gannes, V. Insights into fungal communities in composts revealed by 454-pyrosequencing: Implications for human health and safety /Vidya De Gannes, Gaius Eudoxie, William J. Hickey//Front. Microbiol. - 2013. - N 4. - P. 1-9.

104. Dellagnezze, B.M. Bioaugmentation strategy employing a microbial consortium immobilized in chitosan beads for oil degradation in mesocosm scale /B. M. Dellagnezze, S. P. Vasconcellos, A. L. Angelim, V. M M Melo, S. Santisi, S. Cappello, V. M. Oliveira//Mar. Pollut. Bull. - 2016. - N 107. - P. 107-117.

105. Di Martino, C. Isolation and characterization of benzene, toluene and xylene degrading Pseudomonas sp. selected as candidates for bioremediation /Carla D i Martino, Nancy I. López, Laura J. Raiger Iustman//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2012. - N 67. - P. 15-20.

106. Dionisi, H.M. Power Analysis for Real-Time PCR Quantification of Genes in Activated Sludge and Analysis of the Variability Introduced by DNA Extraction /Hebe M. Dionisi, Gerda Harms, Alice C. Layton, Igrid R. Gregory, Jack Parker, Shawn A. Hawkins, Kevin G. Robinson, Gary S. Sayler//Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - N 69. - P. 6597-6604.

107. Dong, Q. Analysis of Microbial Diversity of the Tomato Soil in Yunnan E'shan [Электронный ресурс] /Q. Dong. - 2014. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KM108770.1

108. Dörr de Quadros, P. Oily sludge stimulates microbial activity and changes microbial structure in a landfarming soil /Patrícia Dörr de Quadros, Vanessa Sacramento Cerqueira, Juciana Clarice Cazarolli, Maria do Carmo R. Peralba, Flávio A.O. Camargo, Adriana Giongo, Fátima Menezes Bento//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2016. - N 115. - P. 90-101.

109. Edgar, R.C. Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST /Robert C. Edgar//Bioinformatics- 2010. - N 26. - P. 2460-2461. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq461

110. Epstein, E. The Science of Composting /E. Epstein. - CRC Press Book, 1997. - 504 p.

111. Eskandari, S. Bioremediation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons by Bacillus Licheniformis ATHE9 and Bacillus Mojavensis ATHE13 as Newly Strains Isolated from Oil-

Contaminated Soil /Somayeh Eskandari, Mehran Hoodaji, Arezoo Tahmourespour, Atousa Abdollahi, Tahere Baghi, Saeid Eslamian, Kaveh Ostad-Ali-Askari//J. Geogr. Environ. Earth Sci. Int. - 2017. -N 11. - P. 1-11.

112. Evangelou, A. Monitoring the performances of a real scale municipal solid waste composting and a biodrying facility using respiration activity indices /Alexandras Evangelou, Spyridoula Gerassimidou, Nikitas Mavrakis, Dimitrios Komilis//Environ. Monit. Assess. - 2016. - N 188.

113. Faith, D.P. Compositional dissimilarity as a robust measure of ecological distance /D. P. Faith, PR. Minchin, L. Belbin//Vegetatio - 1987. - N 69. - P. 57-68.

114. Fan, M.Y. Bioremediation of petroleum-contaminated soil by a combined system of biostimulation-bioaugmentation with yeast /Mei Ying Fan, Rui Jie Xie, Gang Qin//Environ. Technol. (United Kingdom) - 2014. - N 35. - P. 391-399.

115. Felske, A. Direct ribosome isolation from soil to extract bacterial rRNA for community analysis /Andreas Felske, Bert Engelen, Ulrich Nübel, Horst Backhaus//Appl. Environ. Microbiol. -1996. - N 62. - P. 4162-4167.

116. Fodelianakis, S. Allochthonous bioaugmentation in ex situ treatment of crude oil-polluted sediments in the presence of an effective degrading indigenous microbiome /S. Fodelianakis, E. Antoniou, F. Mapelli, M. Magagnini, M. Nikolopoulou, R. Marasco, M. Barbato, A. Tsiola, I. Tsikopoulou, L. Giaccaglia, M. Mahjoubi, A. Jaouani, R. Amer, E. Hussein, F. A. Al-Horani, F. Benzha, M. Blaghen, H. I. Malkawi, Y. Abdel-Fattah, A. Cherif, D. Daffonchio, N. Kalogerakis//J. Hazard. Mater. - 2015. - N 287. - P. 78-86.

117. Franke-Whittle, I.H. Changes in the microbial communities during co-composting of digestates /Ingrid H. Franke-Whittle, Alberto Confalonieri, Heribert Insam, Mirko Schlegelmilch, Ina Körner//Waste Manag.- 2014 .- N 34. - P. 632-641. https://doi.org/10.1016/j.wasman.2013.12.009

118. Franke-Whittle, I.H. Design and application of an oligonucleotide microarray for the investigation of compost microbial communities /Ingrid H. Franke-Whittle, Susanne H. Klammer, Heribert Insam//J. Microbiol. Methods - 2005. - N 62. - P. 37-56.

119. Fukuhara, Y. Distribution of hydrocarbon-degrading bacteria in the soil environment and their contribution to bioremediation /Yuki Fukuhara, Sachie Horii, Toshihide Matsuno, Yoshiki Matsumiya, Masaki Mukai, Motoki Kubo//Appl. Biochem. Biotechnol. - 2013. - N 170. - P. 329-339.

120. Galitskaya, P. Biochar-carrying hydrocarbon decomposers promote degradation during the early stage of bioremediation /Polina Galitskaya, Leisan Akhmetzyanova, Svetlana Selivanovskaya//Biogeosciences - 2016a .- N 13. - P. 5739-5752.

121. Galitskaya, P. Shifts in Bacterial Community Structure in the Process of Composting of Organic Wastes 1* /Polina Galitskaya, Liliya Biktasheva, Tatyana Grigoryeva, Svetlana

Selivanovskaya//Int. J. Adv. Biotechnol. Res. - 2016b. - N 7. - P. 976-2612.

122. Gandolfi, I. Influence of compost amendment on microbial community and ecotoxicity of hydrocarbon-contaminated soils /Isabella Gandolfi, Matteo Sicolo, Andrea Franzetti, Eleonora Fontanarosa, Angela Santagostino, Giuseppina Bestetti//Bioresour. Technol. - 2010. - N 101. - P. 568-575.

123. Gao, M. Evaluation of stability and maturity during forced-aeration composting of chicken manure and sawdust at different C/N ratios. /Mengchun Gao, Fangyuan Liang, An Yu, Bing Li, Lijuan Yang//Chemosphere - 2010. - N 78. - P. 614-9.

124. García-Gómez, A. Composting of the solid fraction of olive mill wastewater with olive leaves: Organic matter degradation and biological activity /A. García-Gómez, A. Roig, M. P. Bernal//Bioresour. Technol. - 2003. - N 86. - P. 59-64.

125. Garland, J.L. Classification and characterization of heterotrophic microbial communities on the basis of patterns of community-level sole-carbon-source utilization. /J.L. Garland, A.L. Mills//Appl. Environ. Microbiol. - 1991. - N 57. - P. 2351-9.

126. Gertler, C. Microbial consortia in mesocosm bioremediation trial using oil sorbents, slow-release fertilizer and bioaugmentation /Christoph Gertler, Gunnar Gerdts, Kenneth N. Timmis, Peter N. Golyshin//FEMS Microbiol. Ecol.- 2009.

127. Ghosal, D. Current state of knowledge in microbial degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs): A review /Debajyoti Ghosal, Shreya Ghosh, Tapan K. Dutta, Youngho Ahn//Front. Microbiol. - 2016.

128. Gilbert, E.S. Repeated application of carvone-induced bacteria to enhance biodegradation of polychlorinated biphenyls in soil /E. S. Gilbert, D. E. Crowley//Appl. Microbiol. Biotechnol. - 1998. - N 50. - P. 489-494.

129. Gómez-Brandón, M. The evaluation of stability and maturity during the composting of cattle manure /María Gómez-Brandón, Cristina Lazcano, Jorge Domínguez// Chemosphere - 2008. -N 70. - P. 436-444.

130. Guan, J. Diversity and distribution of sulfate-reducing bacteria in four petroleum reservoirs detected by using 16S rRNA and dsrAB genes /Jing Guan, Li Ping Xia, Li Ying Wang, Jin Feng Liu, Ji Dong Gu, Bo Zhong Mu//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2013. - N 76. - P. 58-66.

131. Guo, G. Effect of a bacterial consortium on the degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons and bacterial community composition in Chinese soils /Guang Guo, Fang Tian, Keqiang Ding, Lihong Wang, Tingfeng Liu, Feng Yang//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2017. - N 123. - P. 5662.

132. Gupta, A. Gluconobacter oxydans: Its Biotechnological Applications /A. Gupta, V.K. Singh, G.N. Qazi, A Kumar//J. Mol. Microbiol. Biotechnol. - 2001. - N 3. - P. 445-456.

133. Gutierrez, T. Hydrocarbon-degrading bacteria enriched by the Deepwater Horizon oil spill identified by cultivation and DNA-SIP /Tony Gutierrez, David R. Singleton, David Berry, Tingting Yang, Michael D. Aitken, Andreas Teske//ISME J. - 2013. - N 7. - P. 2091-2104.

134. Ha, H. Analysis of heavy metal sources in soil using kriging interpolation on principal components /Hoehun Ha, James R. Olson, Ling Bian, Peter A. Rogerson//Environ. Sci. Technol. -2014. - N. 48(9) - P. 4999-5007.

135. Habtom, H. Soil characterisation by bacterial community analysis for forensic applications: A quantitative comparison of environmental technologies /Habteab Habtom, Sandrine Demaneche, Lorna Dawson, Chen Azulay, Ofra Matan, Patrick Robe, Ron Gafny, Pascal Simonet, Edouard Jurkevitch, Zohar Pasternak//Forensic Sci. Int. Genet. - 2017. - N 26. - P. 21-29.

136. Hachicha, S. Biological activity during co-composting of sludge issued from the OMW evaporation ponds with poultry manure-Physico-chemical characterization of the processed organic matter. /Salma Hachicha, Fatma Sellami, Juan Cegarra, Ridha Hachicha, Noureddine Drira, Khaled Medhioub, Emna Ammar//J. Hazard. Mater. - 2009. - N 162. - P. 402-9.

137. Hagn, A. Microbial community shifts in Pythium ultimum-inoculated suppressive substrates /A. Hagn, M. Engel, B. Kleikamp, J. C. Munch, M. Schloter, C. Bruns//Biol. Fertil. Soils-2008. - N 44. - P. 481-490.

138. Hahn, S.K. Optimization of microbial poly(3-hydroxybutyrate) recover using dispersions of sodium hypochlorite solution and chloroform /Sei Kwang Hahn, Yong Keun Chang, Beom Soo Kim, Ho Nam Chang//Biotechnol. Bioeng. - 1994. - N. 44(2). - P. 256-61.

139. Hamamura, N. Assessing soil microbial populations responding to crude-oil amendment at different temperatures using phylogenetic, functional gene (alkB) and physiological analyses /Natsuko Hamamura, Manabu Fukui, David M. Ward, William P. Inskeep//Environ. Sci. Technol.- 2008. - N 42. - P. 7580-7586.

140. Hamamura, N. Microbial population dynamics associated with crude-oil biodegradation in diverse soils /Natsuko Hamamura, Sarah H. Olson, David M. Ward, William P. Inskeep//Appl. Environ. Microbiol. - 2006. - N 72. - P. 6316-6324.

141. Hanc, A. Effect of composting and vermicomposting on properties of particle size fractions /Ales Hanc, Marketa Dreslova//Bioresour. Technol. - 2016. - N. 70(4). - P.583-589.

142. Handley, K.M. Biogeochemical implications of the ubiquitous colonization of marine habitats and redox gradients by Marinobacter species /Kim M. Handley, Jonathan R. Lloyd//Front. Microbiol. - 2013. - N. 4. - 10 p.

143. Hannula, S.E. In situ dynamics of soil fungal communities under different genotypes of potato, including a genetically modified cultivar /S.E. Hannula, W. de Boer, J.a. van Veen//Soil Biol. Biochem. - 2010. - N 42. - P. 2211-2223.

144. Hansgate, A.M. Molecular characterization of fungal community dynamics in the initial stages of composting /A. M. Hansgate, P.D. Schloss, A. G. Hay, L.P. Walker//FEMS Microbiol. Ecol. - 2005. - N 51. - P. 209-214.

145. Haritash, A.K. Biodegradation aspects of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs): a review. /A K Haritash, C P Kaushik//J. Hazard. Mater. - 2009. - N 169. - P. 1-15.

146. Harms, G. Anaerobic oxidation of the aromatic plant hydrocarbon p-cymene by newly isolated denitrifying bacteria /Gerda Harms, Ralf Rabus, Friedrich Widdel//Arch. Microbiol. - 1999. -N. 172(5). - P. 303-12.

147. Haruta, S. Microbial diversity in biodegradation and reutilization processes of garbage /Shin Haruta, Toru Nakayama, Kohei Nakamura, Hisashi Hemmi, Masaharu Ishii, Yasuo Igarashi, Tokuzo Nishino//J. Biosci. Bioeng. - 2005. - N 99. - P. 1-11.

148. Hassanshahian, M. Isolation and characterization of alkane degrading bacteria from petroleum reservoir waste water in Iran (Kerman and Tehran provenances) /Mehdi Hassanshahian, Mohammad Ahmadinejad, Hamid Tebyanian, Ashraf Kariminik//Mar. Pollut. Bull. - 2013. - N 73. -P. 300-305.

149. Hassanshahian, M. Isolation and characterization of two crude oil-degrading yeast strains, Yarrowia lipolytica PG-20 and PG-32, from the Persian Gulf /Mehdi Hassanshahian, Hamid Tebyanian, Simone Cappello//Mar. Pollut. Bull. - 2012. - N 64. - P. 1386-1391.

150. Heather, J.M. The sequence of sequencers: The history of sequencing DNA /James M. Heather, Benjamin Chain//Genomics - 2016. - N. 1 07(1). - P. 1-8.

151. Hedlund, B.P. Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation by a new marine bacterium, Neptunomonas naphthovorans gen. nov., sp. nov. /Brian P. Hedlund, Allison D. Geiselbrecht, Timothy J. Bair, James T. Staley//Appl. Environ. Microbiol. - 1999. - N 65. - P. 251259.

152. Hejazi, R.F. Landfarming operation of oily sludge in arid region - Human health risk assessment /Ramzi F. Hejazi, Tahir Husain, Faisal I. Khan//J. Hazard. Mater. - 2003. - N 99. - P. 287-302.

153. Heuer, H. Analysis of actinomycete communities by specific amplification of genes encoding 16S rRNA and gel-electrophoretic separation in denaturing gradients /Holger Heuer, Martin Krsek, Paul Baker, Kornelia Smalla, Elizabeth M H Wellington//Appl. Environ. Microbiol. - 1997. -N 63. - P. 3233-3241.

154. Hill, G.T. Methods for assessing the composition and diversity of soil microbial communities /G. T. Hill, N. A. Mitkowski, L. Aldrich-Wolfe, L. R. Emele, D. D. Jurkonie, A. Ficke, S. Maldonado-Ramirez, S. T. Lynch, E. B. Nelson//Appl. Soil Ecol.- 2000 .- N 15. - P. 25-36.

155. Hong, Q. A microcosm study on bioremediation of fenitrothion-contaminated soil using

Burkholderia sp. FDS-1 /Qing Hong, Zhonghui Zhang, Yuanfan Hong, Shunpeng Li//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2007 - N 59. - P. 55-61.

156. Hu, G. Recent development in the treatment of oily sludge from petroleum industry: A review /Guangji Hu, Jianbing Li, Guangming Zeng//J. Hazard. Mater. - 2013. - N 261. - P. 470-490.

157. Huang, J. Chemical structures and characteristics of animal manures and composts during composting and assessment of maturity indices /Jieying Huang, Zixuan Yu, Hongjian Gao, Xiaoming Yan, Jiang Chang, Chengming Wang, Jingwei Hu, Ligan Zhang//PLoS One - 2017 .- N 12.

158. Huang, Y. Enrichment of the soil microbial community in the bioremediation of a petroleum-contaminated soil amended with rice straw or sawdust /Yongjie Huang, Huan Pan, Qingling Wang, Yanyan Ge, Wuxing Liu, Peter Christie//Chemosphere - 2019. - N. 224. - P. 265271.

159. Hultman, J. Determination of fungal succession during municipal solid waste composting using a cloning-based analysis /J. Hultman, T. Vasara, P. Partanen, J. Kurola, M.H. Kontro, L. Paulin, P. Auvinen, M. Romantschuk//J Appl Microbiol - 2010. - N 108. - P. 472-487.

160. Iffis, B. Petroleum Contamination and Plant Identity Influence Soil and Root Microbial Communities While AMF Spores Retrieved from the Same Plants Possess Markedly Different Communities /Bachir Iffis, Marc St-Arnaud, Mohamed Hijri//Front. Plant Sci. - 2017. - N 8.

161. Imhoff, J.F. The Family Ectothiorhodospiraceae In: The Prokaryotes/ Dworkin M., Falkow S., Rosenberg E., Schleifer KH., Stackebrandt E. (eds). - New York: Springer, 2006. - 1155 pp. 874-886.

162. In situ and ex situ biodegradation technologies for remediation of contaminated sites (engineering issue) / Rawe, J., V. Hodge, C. M. Acheson, C. Lutes, D. Liles. - USA, US EPA, 2006. -22 p.

163. Insam, H. A New Set of Substrates Proposed for Community Characterization in Environmental Samples. In: Microbial Communities /H.Insam, A. Rangger. - Berlin: Springer, 1997. -pp. 259-260.

164. Insam, H. Microbiology of the composting process /H. Insam, M. de Bertoldi// Compost Science and Technology. Waste Management Series. - 2007. - N 8. - P. 25-48.

165. Insam, H. Microbes at work: From wastes to resources /H. Insam, I. Franke-Whittle, M.Goberna. - Berlin: Springer, 2010. - 329 p.

166. ISO 11261:1995Soil quality — Determination of total nitrogen — Modified Kjeldahl method, 11p;

167. ISO 11269-1 Soil quality - Determination of the effects of pollutants on soil flora -Part 1: Method for measurement of inhibition of root growth. - 2012. - 16p.

168. ISO 14235:1998 Soil quality - Determination of organic carbon by sulfochromic

oxidation.-1998. - 10p.

169. ISO 14240-2 Soil quality - Determination of soil microbial biomass — Part 2: Fumigation-extraction method. - 1998. - 12 p.

170. ISO 16072:2002 Soil quality — Laboratory methods for determination of microbial soil respiration. - 2002. -19 p.

171. Izquierdo, J.A. Diversity of bacteria and glycosyl hydrolase family 48 genes in cellulolytic consortia enriched from thermophilic biocompost /Javier A. Izquierdo, Maria V. Sizova, Lee R. Lynd//Appl. Environ. Microbiol. - 2010. - N 76. - P. 3545-3553.

172. Jadhav, S.U. Decolorization of brilliant blue G dye mediated by degradation of the microbial consortium of Galactomyces geotrichum and Bacillus sp. /Sheetal U. Jadhav, Mital U. Jadhav, Anuradha N. Kagalkar, Sanjay P. Govindwar//J. Chinese Inst. Chem. Eng. - 2008. - N 39. - P. 563-570.

173. Jaekel, U. Anaerobic degradation of propane and butane by sulfate-reducing bacteria enriched from marine hydrocarbon cold seeps /Ulrike Jaekel, Niculina Musat, Birgit Adam, Marcel Kuypers, Olav Grundmann, Florin Musat//ISME J.- 2013. - N. 7(5). - P. 885-95.

174. Jean, D.S. Expression deliquoring of oily sludge from a petroleum refinery plant /D. S. Jean, D. J. Lee//Waste Manag. - 1999. - N. 19. - P. 349-354.

175. Jia, J. The Dynamic Change of Microbial Communities in Crude Oil-Contaminated Soils from Oil Fields in China /Jianli Jia, Shuang Zong, Lei Hu, Shaohe Shi, Xiaobo Zhai, Bingbing Wang, Guanghe Li, Dayi Zhang//Soil Sediment Contam. - 2017. - N 26. - P. 171-183.

176. Jiang, Y. Insights into the biodegradation of weathered hydrocarbons in contaminated soils by bioaugmentation and nutrient stimulation /Ying Jiang, Kirsty J. Brassington, George Prpich, Graeme I. Paton, Kirk T. Semple, Simon J T Pollard, Fridric Coulon//Chemosphere - 2016. - N 161. -P. 300-307.

177. Jindou, S. Novel architecture of family-9 glycoside hydrolases identified in cellulosomal enzymes of Acetivibrio cellulolyticus and Clostridium thermocellum /S Jindou, Qi Xu, Rina Kenig, Michal Shulman, Yuval Shoham, Edward A. Bayer, Raphael Lamed//FEMS Microbiol. Lett. - 2006. - N 254. - P. 308-316.

178. Juhanson, J. Survival and catabolic performance of introduced Pseudomonas strains during phytoremediation and bioaugmentation field experiment /Jaanis Juhanson, Jaak Truu, Eeva Heinaru, Ain Heinaru//FEMS Microbiol. Ecol. - 2009. - N 70. - P. 446-455.

179. Juhasz, A.L. Microbial degradation and detoxification of high molecular weight polycyclic aromatic hydrocarbons by Stenotrophomonas maltophilia strain VUN 10,003 /A. L. Juhasz, G. A. Stanley, M. L. Britz//Lett. Appl. Microbiol. - 2000.

180. Juteau, P. Improving the biotreatment of hydrocarbons-contaminated soils by addition

of activated sludge taken from the wastewater treatment facilities of an oil refinery /Pierre Juteau, Jean Guy Bisaillon, François Lépine, Valérie Ratheau, Réjean Beaudet, Richard Villemur//Biodegradation-2003. - N 14. - P. 31-40.

181. Juvonen, R. A battery of toxicity tests as indicators of decontamination in composting oily waste /Risto Juvonen, Esko Martikainen, Eija Schultz, Anneli Joutti, Jukka Ahtiainen, Markku Lehtokari//Ecotoxicol. Environ. Saf. - 2000. - N 47. - P. 156-166.

182. Kadarmoidheen, M. Effect of Cellulolytic Fungi on the Degradation of Cellulosic Agricultural Wastes /M. Kadarmoidheen, P. Saranraj, D. Stella//Int. J. Appl. Microbiol. Sci. - 2012. -N 1. - P. 13-23.

183. Kahng, H.Y. Genetic and Functional Analysis of the tbc Operons for Catabolism of Alkyl- and Chloroaromatic Compounds in Burkholderia sp. Strain JS150 /Hyung Yeel Kahng, Juliana C. Malinverni, Michelle M. Majko, Jerome J. Kukor//Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - N. 77(22). -P.12336-45.

184. Kanaly, R.A. Biodegradation of high-molecular-weight polycyclic aromatic hydrocarbons by bacteria /Robert A. Kanaly, Shigeaki Harayama//J. Bacteriol. - 2000. - N. 182(8). -P.2059-2067.

185. Kao, C.M. Application of real-time PCR, DGGE fingerprinting, and culture-based method to evaluate the effectiveness of intrinsic bioremediation on the control of petroleum-hydrocarbon plume /Chih Ming Kao, Colin S. Chen, Fu Yu Tsa, Kai Hsing Yang, Chih Ching Chien, Shih Hsiung Liang, Chin an Yang, Ssu Ching Chen//J. Hazard. Mater. - 2010. - N 178. - P. 409-416.

186. Kasai, Y. Bacteria belonging to the genus Cycloclasticus play a primary role in the degradation of aromatic hydrocarbons released in a marine environment /Yuki Kasai, Hideo Kishira, Shigeaki Harayama//Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - N 68. - P. 5625-5633.

187. Kauppi, S. Enhancing bioremediation of diesel-fuel-contaminated soil in a boreal climate: Comparison of biostimulation and bioaugmentation /Sari Kauppi, Aki Sinkkonen, Martin Romantschuk//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2011. - N 65. - P. 359-368.

188. Khan, F.I. An overview and analysis of site remediation technologies /Faisal I. Khan, Tahir Husain, Ramzi Hejazi//J. Environ. Manage. - 2004. - N 71. - P. 95-122.

189. Khan, N. Maturity indices in co-composting of chicken manure and sawdust with biochar /Naser Khan, Ian Clark, Miguel A Sánchez-Monedero, Syd Shea, Sebastian Meier, Nanthi Bolan//Bioresour. Technol. - 2014. - N 168. - P. 245-51.

190. Khan, S.T. Members of the family Comamonadaceae as primary poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate)-degrading denitrifiers in activated sludge as revealed by a polyphasic approach /Shams Tabrez Khan, Yoko Horiba, Masamitsu Yamamoto, Akira Hiraishi//Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - N 68. - P. 3206-3214.

191. Kim, E. Functional analysis of genes involved in biphenyl, naphthalenes, phenanthrene, and m-xylene degradation by Sphingomonas yanoikuyae B1 /E. Kim, G. J. Zylstra//J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 1999. - N. 23(4-5). - P. 294-302.

192. Kim, J.S. Microbial diversity in natural asphalts of the Rancho La Brea Tar Pits /Jong Shik Kim, David E. Crowley//Appl. Environ. Microbiol. - 2007. - N 73. - P. 4579-4591.

193. Kirk, J.L. Methods of studying soil microbial diversity /Jennifer L. Kirk, Lee A. Beaudette, Miranda Hart, Peter Moutoglis, John N. Klironomos, Hung Lee, Jack T. Trevors//J. Microbiol. Methods - 2004. - N. 58(2). - P. 169-88.

194. Koljalg, U. UNITE: a database providing web-based methods for the molecular identification of ectomycorrhizal fungi /U. Koljalg, K. H. Larsson, K. Abarenkov, R.H. Nilsson, I.J. Alexander, U. Eberhardt, S. Erland, K Hoiland, R. Kjoller, E. Larsson, T. Pennanen, R. Sen, A.F. Taylor, L. Tedersoo, T. Vralstad, B.M. Ursing//New Phytol. - 2005. - N 166. - P. 1063-1068.

195. Kostka, J.E. Hydrocarbon-degrading bacteria and the bacterial community response in Gulf of Mexico beach sands impacted by the deepwater horizon oil spill /Joel E. Kostka, Om Prakash, Will A. Overholt, Stefan J. Green, Gina Freyer, Andy Canion, Jonathan Delgardio, Nikita Norton, Terry C. Hazen, Markus Huettel//Appl. Environ. Microbiol. - 2011 .- N 77. - P. 7962-7974.

196. Kriipsalu, M. Monitoring of biopile composting of oily sludge /Mait Kriipsalu, Diauddin Nammari//Waste Manag. Res. - 2010. - N 28. - P. 395-403.

197. Kuever, J. Reclassification of Desulfobacterium phenolicum as Desulfobacula phenolica comb. nov. and description of strain SaxT as Desulfotignum balticum gen. nov., sp. nov. /J. Kuever, M. Könneke, A. Galushko, O. Drzyzga//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2001. - N. 51(Pt 1). - P. 171177.

198. Kumar, M. Co-composting of green waste and food waste at low C/N ratio. /Mathava Kumar, Yan-Liang Ou, Jih-Gaw Lin//Waste Manag. - 2010. - N 30. - P. 602-9.

199. Kuran, P. Biodegradation of spilled diesel fuel in agricultural soil: Effect of humates, zeolite, and bioaugmentation /Pavel Kuran, Josef Trögl, Jana Novakova, Vera Pilarova, Petra Danova, Jana Pavlorkova, Josef Kozler, Frantisek Novak, Jan Popelka//Sci. World J. - 2014. - 8 p.

200. Kuryntseva, P. Changes in the ecological properties of organic wastes during their biological treatment /P. Kuryntseva, P. Galitskaya, S. Selivanovskaya//Waste Manag. - 2016. - N 58. - P. 90-97.

201. LaMontagne, M.G. Evaluation of extraction and purification methods for obtaining PCR-amplifiable DNA from compost for microbial community analysis /M. G. LaMontagne, F. C. Michel, P. A. Holden, C. A. Reddy//J. Microbiol. Methods - 2002. - N. 49(3). - P. 255-64.

202. Lang, E. Extractable organic carbon and counts of bacteria near the lignocellulose-soil interface during the interaction of soil microbiota and white rot fungi /Elke Lang, Ilona Kleeberg,

Frantisek Zadrazil//Bioresour. Technol. - 2000. - N 75. - P. 57-65.

203. Langarica-Fuentes, A. An investigation of the biodiversity of thermophilic and thermotolerant fungal species in composts using culture-based and molecular techniques /A. Langarica-Fuentes, P.S. Handley, A. Houlden, G. Fox, G.D. Robson//Fungal Ecol. - 2014a. - N 11. -P. 132-144.

204. Langarica-Fuentes, A. Fungal succession in an in-vessel composting system characterized using 454 pyrosequencing /A. Langarica-Fuentes, U. Zafar, A. Heyworth, T. Brown, G. Fox, G.D. Robson//FEMS Microbiol. Ecol. - 2014b. - N 88. - P. 296-308.

205. Lazzari, L. Correlation between inorganic (heavy metals) and organic (PCBs and PAHs) micropollutant concentrations during sewage sludge composting processes /L. Lazzari, L. Sperni, P. Bertin, B. Pavoni//Chemosphere - 2000. - N 41. - P. 427-435.

206. Le-tien, C. Modified alginate and chitosan for lactic acid bacteria immobilization /Canh Le-tien, Mathieu Millette, Mircea-Alexandru Mateescu, Monique Lacroix//Biotechnol. Appl. Biochem - 2004. - N. 39(Pt 3). - P. 347-54

207. Lee, E.H. Characterization of cyclohexane and hexane degradation by Rhodococcus sp. EC1 /Eun Hee Lee, Kyung Suk Cho//Chemosphere - 2008. - N 71. - P. 1738-1744.

208. Levy, S.E. Advancements in Next-Generation Sequencing /Shawn E. Levy, Richard M. Myers//Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. - 2016. - N 17. - P. 95-115.

209. Li, H. Molecular detection, quantification and distribution of alkane-degrading bacteria in production water from low temperature oilfields /Hui Li, Xiao Li Wang, Bo Zhong Mu, Ji Dong Gu, Yong Di Liu, Kuang Fei Lin, Shu Guang Lu, Qiang Lu, Bing Zhi Li, Yang Yang Li, Xiao Ming Du//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2013. - N 76. - P. 49-57.

210. Li, H. Dynamic changes in microbial activity and community structure during biodegradation of petroleum compounds: A laboratory experiment /Hui Li, Ying Zhang, Irina Kravchenko, Hui Xu, Cheng Gang Zhang//J. Environ. Sci. - 2007. - N 19. - P. 1003-1013.

211. Li, J. Biodegradation of Phenanthrene in Polycyclic Aromatic Hydrocarbon-Contaminated Wastewater Revealed by Coupling Cultivation-Dependent and -Independent Approaches /Jibing Li, Chunling Luo, Mengke Song, Qing Dai, Longfei Jiang, Dayi Zhang, Gan Zhang//Environ. Sci. Technol. - 2017. - N 51. - P. 3391-3401.

212. Li, X. Biodegradation of the low concentration of polycyclic aromatic hydrocarbons in soil by microbial consortium during incubation /Xiaojun Li, Xin Lin, Peijun Li, Wan Liu, Li Wang, Fang Ma, K. S. Chukwuka//J. Hazard. Mater. - 2009. - N 172. - P. 601-605.

213. Li, X.W. Microbial biodegradation of petroleum hydrocarbon. Acta Microbiol. Sin. 42, 764-767. /X.W. Li, Z.P. Liu//Acta Microbiol. Sin. - 2002. - N 42. - P. 764-767.

214. Li, Y. Enhancement of sludge granulation in anaerobic acetogenesis by addition of

nitrate and microbial community analysis /Y. Li, Y. Zhang, Z. Xu, X. Quan, Sh. Chen//Biochem Eng J - 2015. - N 95. - P. 104-111.

215. Li, Y.F. Spatial and temporal variations of microbial community in a mixed plug-flow loop reactor fed with dairy manure /Yueh Fen Li, Po Hsu Chen, Zhongtang Yu//Microb. Biotechnol. -2014. - N. 7(4). - P. 332-346.

216. Li, Z. Experimental and modeling approaches for food waste composting: A review /Z. Li, H. Lu, L. Ren, L. He//Chemosphere - 2013. - N 93. - P. 1247-1257.

217. Liu, C.M. FungiQuant: a broad-coverage fungal quantitative real-time PCR assay. /Cindy M. Liu, Sergey Kachur, Michael G. Dwan, Alison G. Abraham, Maliha Aziz, Po Ren Hsueh, Yu Tsung Huang, Joseph D. Busch, Louis J. Lamit, Catherine A. Gehring, Paul Keim, Lance B. Price//BMC Microbiol.- 2012 .- N 12.

218. Liu, P.W.G. Bioaugmentation efficiency investigation on soil organic matters and microbial community shift of diesel-contaminated soils /Pao Wen Grace Liu, Tsung Chain Chang, Chih Hung Chen, Ming Zhi Wang, Han Wei Hsu//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2014. - N 95. - P. 276-284.

219. Liu, Y.C. Isolation of an alkane-degrading Alcanivorax sp. strain 2B5 and cloning of the alkB gene /Yi Chen Liu, Ling Zhi Li, Ying Wu, Wei Tian, Li Ping Zhang, Lian Xu, Qi Rong Shen, Biao Shen//Bioresour. Technol. - 2010. - N 101. - P. 310-316.

220. Lladó, S. Pyrosequencing reveals the effect of mobilizing agents and lignocellulosic substrate amendment on microbial community composition in a real industrial PAH-polluted soil /S. Lladó, S. Covino, A. M. Solanas, M. Petruccioli, A. D'annibale, M. Viñas//J.Hazard.Mater. - 2014. -N 283. - P. 35-43.

221. Lladó, S. A diversified approach to evaluate biostimulation and bioaugmentation strategies for heavy-oil-contaminated soil /S. Lladó, A. M. Solanas, J. de Lapuente, M. Borràs, M. Viñas//Sci.TotalEnviron. - 2012. - N 435-436. - P. 262-269.

222. López-González, J.A. Biodiversity and succession of mycobiota associated to agricultural lignocellulosic waste-based composting /Juan Antonio López-González, María del Carmen Vargas-García, María José López, Francisca Suárez-Estrella, Macarena del Mar Jurado, Joaquín Moreno//Bioresour. Technol. - 2015. - N 187. - P. 305-313.

223. Maarit Niemi, R. Extraction and purification of DNA in rhizosphere soil samples for PCR-DGGE analysis of bacterial consortia /R. Maarit Niemi, Ilse Heiskanen, Kaisa Wallenius, Kristina Lindstrom//J.Microbiol.Methods - 2001. - N 45. - P. 155-165.

224. Machín-Ramírez, C. Slurry-phase biodegradation of weathered oily sludge waste /C. Machín-Ramírez, A. I. Okoh, D. Morales, K. Mayolo-Deloisa, R. Quintero, M. R. Trejo-Hernández//Chemosphere - 2008. - N 70. - P. 737-744.

225. Makinen, A.E. Bioelectricity production on xylose with a compost enrichment culture /Annukka E. Makinen, Chyi How Lay, Marika E. Nissila, Jaakko A. Puhakka// International Journal of Hydrogen Energy. - 2013. - N 38 (35). - P. 15606-15612.

226. Mancera-López, M.E. Bioremediation of an aged hydrocarbon-contaminated soil by a combined system of biostimulation-bioaugmentation with filamentous fungi /M. E. Mancera-López, F. Esparza-García, B. Chávez-Gómez, R. Rodríguez-Vázquez, G. Saucedo-Castañeda, J.Barrera-Cortés // Int.Biodeterior.Biodegrad. - 2008. - N 61(2). - P. 151-160.

227. Mansur, A.A. An effective soil slurry bioremediation protocol for the treatment of Libyan soil contaminated with crude oil tank bottom sludge /Abdulatif A. Mansur, Mohamed Taha, Esmaeil Shahsavari, Nagalakshmi Haleyur, Eric M. Adetutu, Andrew S. Ball//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2016. - N 115. - P. 179-185.

228. Margalef, R. Regularities in distribution of phytoplankton diversity in a caribbean area /R Margalef//Investig. Pesq. - 1972. - N 36. - P. 241-.

229. Mariano, A.P. Biodegradability of diesel and biodiesel blends /Adriano Pinto Mariano, Richard Clayton Tomasella, Luciano Marcondes De Oliveira//African J Biotech - 2008. -N 7(9). - P. 1323-1328

230. Marin, J.A. Bioremediation of oil refinery sludge by landfarming in semiarid conditions: Influence on soil microbial activity /J. A. Marin, T. Hernandez, C. Garcia // Environ.Res. -

2005. - N 98. - P. 185-195.

231. Martins, V.G. Solid state biosurfactant production in a fixed-bed column bioreactor /Vilásia Guimaraes Martins, Susana Juliano Kalil, Telma Elita Bertolin, Jorge Alberto Vieira Costa//Zeitschrift fur Naturforsch. - Sect. C J. Biosci. - 2006.- N 61. - P. 721-726.

232. McDonald, I.R. Diversity of soluble methane monooxygenase-containing methanotrophs isolated from polluted environments /Ian R. McDonald, Carlos B. Miguez, Gerlinde Rogge, Denis Bourque, Karin D. Wendlandt, Denis Groleau, Jcolin Murrell//FEMS Microbiol.Lett. -

2006. - N 255. - P. 225-232.

233. Meckenstock, R.U. Anaerobic degradation of non-substituted aromatic hydrocarbons /Rainer U. Meckenstock, Housna Mouttaki//Curr. Opin. Biotechnol. - 2011. - N. 49. - P. 27-36.

234. Meng, L. Microbial community structure shifts are associated with temperature, dispersants and nutrients in crude oil-contaminated seawaters /Long Meng, Han Liu, Mutai Bao, Peiyan Sun//Mar.Pollut.Bull. - 2016. - N 111. - P. 203-212.

235. Microbiological methods for assessing soil quality/ Jaap Bloem, David W. Hopkins, and Anna Benedetti. - London: CABI Publishing, 2009. - 307 p.

236. Mishra, S. In situ bioremediation potential of an oily sludge-degrading bacterial consortium /Sanjeet Mishra, Jeevan Jyot, Ramesh Chander Kuhad, Banwari Lal//Curr.Microbiol. -

2001. - N 43. - P. 328-335.

237. Mohamed, M.E. Isolation and characterization of indigenous thermophilic bacteria active in natural attenuation of bio-hazardous petrochemical pollutants /M. E. Mohamed, M. Al-Dousary, R. Y. Hamzah, G. Fuchs//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2006. - 12 p.

238. Moldes, A. Evaluation of municipal solid waste compost as a plant growing media component, by applying mixture design /A. Moldes, Y. Cendón, M. T.Barral//Bioresour. Technol. -2007. - N 98. - P. 3069-3075.

239. Monard, C. Utilizing ITS1 and ITS2 to study environmental fungal diversity using pyrosequencing /Cécile Monard, Stephan Gantner, Jan Stenlid//FEMS M icrobiol. Ecol. - 2013. - N 84. - P. 165-175.

240. Moorman, T.B. Organic amendments to enhance herbicide biodegradation in contaminated soils /Thomas B. Moorman, Jennifer K. Cowan, Ellen L. Arthur, Joel R. Coats//Biol. Fertil. Soils- 2001. - N 33. - P. 541-545.

241. Morais, D. Responses of microbial community from tropical pristine coastal soil to crude oil contamination /Daniel Morais, Victor Pylro, Ian M. Clark, Penny R. Hirsch, Marcos R. Tótola//PeerJ - 2016. - N 4. - P. 1733 p.

242. Morelli, I.S. Laboratory study on the bioremediation of petrochemical sludge-contaminated soil /Irma Susana Morelli, María Teresa Del Panno, Graciela Liliana De Antoni, María Teresa Painceira//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2005. - N 55. - P. 271-278.

243. Morelli, I.S. Effect of petrochemical sludge concentrations on changes in mutagenic activity during soil bioremediation process /Irma Susana Morelli, Graciela Isabel Vecchioli, María Teresa Del Panno, María Teresa Painceira//Environ. Toxicol. Chem. - 2001. - N 20. - P. 2179-2183.

244. Morey, M. A glimpse into past, present, and future DNA sequencing /Marcos Morey, Ana Fernández-Marmiesse, Daisy Castiñeiras, José M. Fraga, María L. Couce, José A. Cocho//Mol. Genet. Metab. - 2013. - N 110 (1-2). - P. 3-24.

245. Mrayyan, B. Biodegradation of total organic carbons (TOC) in Jordanian petroleum sludge /Bassam Mrayyan, Mohammed N. Battikhi//J. Hazard. Mater. - 2005. - N 120. - P. 127-134.

246. Muyzer, G. Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain /G Muyzer, EC de Waal, Andre G Uitterlinden//Appl. Environ. Microbiol. - 1993. - N 59. - P. 695-700.

247. Muyzer, G. Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA /G. Muyzer, E. C. De Waal, A. G. Uitterlinden//Appl. Environ. Microbiol. - 1993. - N 59. - P. 695-700.

248. Muyzer, G. Application of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in microbial ecology /Gerard Muyzer, Kornelia

Smalla//, in: Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology.

- 1998. - N 73 (1). - P. 127-141.

249. Namkoong, W. Bioremediation of diesel-contaminated soil with composting /Wan Namkoong, Eui Young Hwang, Joon Seok Park, Jung Young Choi//Environ. Pollut. - 2002. - N 119.

- P. 23-31.

250. Nie, Y. Diverse alkane hydroxylase genes in microorganisms and environments /Yong Nie, Chang Qiao Chi, Hui Fang, Jie Liang Liang, She Lian Lu, Guo Li Lai, Yue Qin Tang, Xiao Lei Wu//Sci. Rep. - 2014. - N 4.

251. Nigussie, A. Earthworms change the quantity and composition of dissolved organic carbon and reduce greenhouse gas emissions during composting /Abebe Nigussie, Sander Bruun, Andreas de Neergaard, Thomas W. Kuyper//WasteManag. - 2017. - N 62. - P. 43-51.

252. Nkwelang, G. Studies on the diversity, abundance and succession of hydrocarbon utilizing micro organisms in tropical soil polluted with oily sludge /G. Nkwelang, H. Kamga//African J. Biotecnol. - 2008. - N 7. - P. 1075-1080.

253. Nohit, A.-M. Bacterial community diversity in oil polluted soil from Romania [Электронный ресурс] / A.-M. Nohit, T. Vassu, R. Amann, I. Stoica. - 2006. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/DQ378270.2

254. Nubel, U. Sequence heterogeneities of genes encoding 16S rRNAs in Paenibacillus polymyxa detected by temperature gradient gel electrophoresis /Ulrich Nubel, Bert Engelen, Andreas Felsre, Jiri Snaidr, Alois Wieshuber, Rudolf I. Amann, Wolfgang Ludwig, Horst Backhaus//J. Bacteriol. - 1996. - N 178. - P. 5636-5643.

255. Nucci, M. Fusarium infections in immunocompromised patients /Marcio Nucci, Elias Anaissie//Clin. Microbiol. Rev. - 2007. - N. 20(4). - P. 695-704.

256. O'Rourke, D. Just Oil? The Distribution of Environmental and Social Impacts of Oil Production and Consumption /Dara O'Rourke, Sarah Connolly//Annu. Rev. Environ. Resour. - 2003.

- N 28. - P. 587-617.

257. Obire, O. Fungi in Bioremediation of Oil Polluted Environments /Omokaro Obire, Ramesh R Putheti. - Sigma, 2009. - 10 p.

258. Ommedal, H. Desulfotignum toluenicum sp. nov., a novel toluene-degrading, sulphate-reducing bacterium isolated from an oil-reservoir model column /Hege Ommedal, Terje Torsvik//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2007. - N 57(12). - P. 2865-9.

259. Onwosi, C.O. Composting technology in waste stabilization: On the methods, challenges and future prospects /Chukwudi O. Onwosi, Victor C. Igbokwe, Joyce N. Odimba, Ifeanyichukwu E. Eke, Mary O. Nwankwoala, Ikemdinachi N. Iroh, Lewis I. Ezeogu//J. Environ. Manage. - 2017. - N. 190. - P. 140-157.

260. Ortega-Larrocea, M. del P. Plant and fungal biodiversity from metal mine wastes under remediation at Zimapan, Hidalgo, Mexico /María del Pilar Ortega-Larrocea, Beatriz Xoconostle-Cázares, Ignacio E. Maldonado-Mendoza, Rogelio Carrillo-González, Jani Hernández-Hernández, Margarita Díaz Garduño, Melina López-Meyer, Lydia Gómez-Flores, Ma del Carmen A González-Chávez//Environ. Pollut. - 2010. - N 158. - P. 1922-1931.

261. Ouyang, W. Comparison of bio-augmentation and composting for remediation of oily sludge: A field-scale study in China /Wei Ouyang, Hong Liu, V. Murygina, Yongyong Yu, Zengde Xiu, S. Kalyuzhnyi//Process Biochem. - 2005a. - N 40. - P. 3763-3768.

262. Ouyang, W. Comparison of bio-augmentation and composting for remediation of oily sludge: A field-scale study in China /Wei Ouyang, Hong Liu, V. Murygina, Yongyong Yu, Zengde Xiu, S. Kalyuzhnyi//Process Biochem. - 2005b. - N 40. - P. 3763-3768.

263. Oviedo-Ocaña, E.R. Stability and maturity of biowaste composts derived by small municipalities: Correlation among physical, chemical and biological indices /E. R. Oviedo-Ocaña, P. Torres-Lozada, L. F. Marmolejo-Rebellon, L. V. Hoyos, S. Gonzales, R. Barrena, D. Komilis, A. Sanchez//Waste Manag. - 2015. - N 44. - P. 63-71.

264. Pace, N.R. A molecular view of microbial diversity and the biosphere /Norman R. Pace//Science. - 1997. - N 276. - P. 734-740.

265. Pacwa-Plociniczak, M. Monitoring the changes in a bacterial community in petroleum-polluted soil bioaugmented with hydrocarbon-degrading strains /Magdalena Pacwa-Plociniczak, Grazyna Anna Plaza, Zofia Piotrowska-Seget//Appl. Soil Ecol. - 2016. - N 105. - P. 76-85.

266. Pareek, C.S. Sequencing technologies and genome sequencing /Chandra Shekhar Pareek, Rafal Smoczynski, Andrzej Tretyn//J. Appl. Genet. - 2011. - N 52(4). - P. 413-435.

267. Partanen, P. Bacterial diversity at different stages of the composting process. /Pasi Partanen, Jenni Hultman, Lars Paulin, Petri Auvinen, Martin Romantschuk//BMC Microbiol. - 2010. -N 10. - P. 94.

268. Pathak, H. Alcaligenes-The 4T Engine Oil Degrader /Hardik Pathak, Kamna Bhatnagar//J. Bioremediation Biodegrad. - 2011. - N 2. - P. 4.

269. Pelletier, E. Crude oil bioremediation in sub-Antarctic intertidal sediments: Chemistry and toxicity of oiled residues /E. Pelletier, D. Delille, B. Delille//Mar. Environ. Res. - 2004. - N 57. -P. 311-327.

270. Peng, S. Phytoremediation of petroleum contaminated soils by Mirabilis Jalapa L. in a greenhouse plot experiment /Shengwei Peng, Qixing Zhou, Zhang Cai, Zhineng Zhang//J. Hazard. Mater. - 2009. - N 168. - P. 1490-1496.

271. Phrommanich, S. Quantitative detection of the oil-degrading bacterium Acinetobacter sp. strain MUB1 by hybridization probe based real-time PCR /Seksan Phrommanich, Sudarat Suanjit,

Suchart Upatham, Suksiri Vichasri Grams, Maleeya Kruatrachue, Prayad Pokethitiyook, Günter Korge, Annemarie Hofmann//Microbiol. Res. - 2009. - N 164. - P. 486-492.

272. Pinheiro, T. da L.F. Production and partial characterization of lipase from Penicillium verrucosum obtained by submerged fermentation of conve ntional and industrial media /Thaís da Luz Fontoura Pinheiro, Silvana Menoncin, Natália Molossi Domingues, Débora de Oliveira, Helen Treichel, Marco Di Luccio, Denise Maria Guimaräes Freire//Ciencia e Tecnol. Aliment. - 2008. - N 28. - P. 444-450.

273. Pino, N.J. Bioaugmentation with Immobilized Microorganisms to Enhance Phytoremediation of PCB-Contaminated Soil /Nancy J. Pino, Luisa M. Muñera, Gustavo A. Peñuela//Soil Sediment Contam. - 2016. - N 25. - P. 419-430.

274. Pirhonen, R. Petroleum fractions in soil: Effects on populations of nematoda, enchytraeidae and microarthropoda /Raili Pirhonen, V. Huhta//Soil Biol. Biochem. - 1984. - N. 16(4). - P. 347-350.

275. Propst, T.L. In situ (mesocosm) assessment of immunotoxicity risks to small mammals inhabiting petrochemical waste sites /Timothy L. Propst, Robert L. Lochmiller, C. W. Qualls, Karen McBee//Chemosphere- 1999 .- N 38. - P. 1049-1067.

276. Qazi, M.A. Isolation and characterization of a biosurfactant-producing Fusarium sp. BS-8 from oil contaminated soil /Muneer A. Qazi, Tayyaba Kanwal, Muniba Jadoon, Safia Ahmed, Nighat Fatima//Biotechnol. Prog. - 2014. - N 30. - P. 1065-1075.

277. R Development Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing /R Development Core Team, 2013. [Элетронный ресурс]. - Режим доступа: https://scholar.google.ca/citations?user=yvS 1 QUEAAAAJ&hl=en

278. Raj, D. Evaluation of maturity and stability parameters of composts prepared from agro-industrial wastes /Dev Raj, R.S. Antil//Bioresour. Technol. - 2010. - N 102. - P. 2868-2873.

279. Ramadass, K. Bioavailability of weathered hydrocarbons in engine oil-contaminated soil: Impact of bioaugmentation mediated by Pseudomonas spp. on bioremediation /Kavitha Ramadass, Mallavarapu Megharaj, Kadiyala Venkateswarlu, Ravi Naidu//Sci. Total Environ. - 2018. -N 636. - P. 968-974.

280. Ramette, A. Multivariate analyses in microbial ecology /Alban Ramette//FEMS Microbiol. Ecol. - 2007. - N 62(2). - P. 142-160. https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2007.00375.x

281. Ramirez, D. Characterisation of oil sludges from different sources before treatment: High-field nuclear magnetic resonance (NMR) in the determination of oil and water content /Diego Ramirez, Radoslaw M. Kowalczyk, Chris D. Collins//J. Pet. Sci. Eng. - 2019. - N 174. - P. 729-737.

282. Ranjard, L. Sequencing bands of ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints for characterization and microscale distribution of soil bacterium populations responding to mercury

spiking. /L Ranjard, E Brothier, S Nazaret//Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - N 66. - P. 5334-9.

283. Reddy, M.V. Aerobic remediation of petroleum sludge through soil supplementation: Microbial community analysis /M. Venkateswar Reddy, M. Prathima Devi, K. Chandrasekhar, R. Kannaiah Goud, S. Venkata Mohan//J. Hazard. Mater. - 2011. - N 197. - P. 80-87.

284. Rezaei Somee, M. Bioremediation of oil-based drill cuttings by a halophilic consortium isolated from oil-contaminated saline soil /Maryam Rezaei Somee, Mahmoud Shavandi, Seyed Mohammad Mehdi Dastgheib, Mohammad Ali Amoozegar//3 Biotech - 2018. - N 8 (229). - 13 p.

285. Robertson, S.J. Petroleum hydrocarbon contamination in boreal forest soils: A mycorrhizal ecosystems perspective /Susan J. Robertson, William B. McGill, Hugues B. Massicotte, P. Michael Rutherford//Biol. Rev. - 2007. - N 82(2). P. 213-240.

286. Rockne, K.J. Anaerobic naphthalene degradation by microbial pure cultures under nitrate-reducing conditions /Karl J. Rockne, Joanne C. Chee-Sanford, Robert A. Sanford, Brian P. Hedlund, James T. Staley, Stuart E. Strand//Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - N 66(4). - P. 15951601.

287. Rodriguez, R.J. Stress tolerance in plants via habitat-adapted symbiosis /Rusty J. Rodriguez, Joan Henson, Elizabeth Van Volkenburgh, Marshal Hoy, Leesa Wright, Fleur Beckwith, Yong Ok Kim, Regina S. Redman//ISME J. - 2008. - N 2. - P. 404-416.

288. Rojo, F. Degradation of alkanes by bacteria: Minireview /Fernando Rojo//Environ. Microbiol. - 2009. - N 11(10). - P. 2477-2490

289. Romanenko, L.A. Marinobacter bryozoorum sp. nov. and Marinobacter sediminum sp. nov., novel bacteria from the marine environment /Lyudmila A. Romanenko, Peter Schumann, Manfred Rohde, Natalia V. Zhukova, Valery V. Mikhailov, Erko Stackebrandt//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2005. - N 55(1). - P. 143-148.

290. Ros, M. Long-term effects of compost amendment of soil on functional and structural diversity and microbial activity /M. Ros, S. Klammer, B. Knapp, K. Aichberger, H. Insam//Soil Use Manag. - 2006a. - N 22. - P. 209-218.

291. Ros, M. Hydrolase activities, microbial biomass and bacterial community in a soil after long-term amendment with different composts /M. Ros, J. A. Pascual, C. Garcia, M. T. Hernandez, H. Insam//Soil Biol. Biochem. - 2006b. - N 38. - P. 3443-3452.

292. Ros, M. Microbial communities involved in the bioremediation of an aged recalcitrant hydrocarbon polluted soil by using organic amendments /M. Ros, I. Rodríguez, C. García, T. Hernández//Bioresour. Technol. - 2010. - N 101. - P. 6916-6923.

293. Rosen, C.J. Horticultural Uses of Municipal Solid Waste Composts /Carl J. Rosen, Thomas R. Halbach, Bert T. Swanson//Horttechnology - 2018. - P. 167-173.

294. Rosenberg, E. The prokaryotes: Alphaproteobacteria and betaproteobacteria /Eugene

Rosenberg. - Berlin: Springer, 2014. - 768 p.

295. Roy, A. Biostimulation and bioaugmentation of native microbial community accelerated bioremediation of oil refinery sludge /Ajoy Roy, Avishek Dutta, Siddhartha Pal, Abhishek Gupta, Jayeeta Sarkar, Ananya Chatterjee, Anumeha Saha, Poulomi Sarkar, Pinaki Sar, Sufia K. Kazy//Bioresour. Technol. - 2018. - N 252 - P. 22-32.

296. Ruan, M.Y. Molecular diversity of bacterial bamA gene involved in anaerobic degradation of aromatic hydrocarbons in mesophilic petroleum reservoirs /Meng Ya Ruan, Bo Liang, Serge Maurice Mbadinga, Lei Zhou, Li Ying Wang, Jing Feng Liu, Ji Dong Gu, Bo Zhong Mu//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2016. - N 114. - P. 122-128.

297. Ryckeboer, J. A survey of bacteria and fungi occurring during composting and self-heating processes /J. Ryckeboer, J. Mergaert, K. Vaes, S. Klammer, D. De Clercq, J. Coosemans, H. Insam, J Swings//Ann. Microbiol. - 2003. - N 53. - P. 349-410.

298. Sadaie, T. Reducing sludge production and the domination of Comamonadaceae by reducing the oxygen supply in the wastewater treatment procedure of a food -processing factory /T. Sadaie, A. Sadaie, M Takada, K. Hamano, J. Ohnishi, N. Ohta, K. Matsumoto, Y. Sadaie//Biosci Biotechnol Biochem - 2007. - N 71. - P. 791-799.

299. Sakai, N. Identification of putative benzene-degrading bacteria in methanogenic enrichment cultures /Nahoko Sakai, Futoshi Kurisu, Osami Yagi, Fumiyuki Nakajima, Kazuo Yamamoto//J. Biosci. Bioeng. - 2009. - N 108. - P. 501-507.

300. Salehizadeh, H. Microbial enhanced oil recovery using biosurfactant produced by Alcaligenes faecalis /Hossein Salehizadeh, Saleh Mohammadizad//Iran. J. Biotechnol. - 2009. - N 7. -P. 216-223.

301. Salleh, A.B. Bioremediation of Petroleum Hydrocarbon Pollution /Abu Bakar Salleh, Farinazleen Mohamad Ghazali, Raja Noor Zaliha Abd Rahman, Mahiran Basri//Indian J. Biotechnol. -2003. - N 2(3). - P. 411-425.

302. Samanta, S.K. Polycyclic aromatic hydrocarbons: environmental pollution and bioremediation. /Sudip K Samanta, Om V Singh, Rakesh K Jain//Trends Biotechnol. - 2002. - N 20. -P. 243-248.

303. Sari, G.L. Bioremediation of Petroleum Hydrocarbons in Crude Oil Contaminated Soil from Wonocolo Public Oilfields using Aerobic Composting with Yard Waste and Rumen Residue Amendments /Gina L. Sari, Yulinah Trihadiningrum//J. Sustain. Dev. Energy, Water Environ. Syst. -2019. - N 7(3). - P. 482-492.

304. Sarma, P.M. Degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by a newly discovered enteric bacterium, Leclercia adecarboxylata /Priyangshu Manab Sarma, Dhruva Bhattacharya, S. Krishnan, Banwari Lal//Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - N 70. - P. 3163-3166.

305. Saterbak, A.N.N. Ecotoxicological and analytical assessment of effects of bioremediation on hydrocarbon-containing soils /A.N.N Saterbak, R. Obin J. Toy, B. Ruce J. McMain, M.P. Williams, P. Hilip B Dorn//Environ. Toxicol. Chem. - 2000. - N 19. - P. 2643-2652.

306. Sayara, T. Effects of compost stability and contaminant concentration on the bioremediation of PAHs-contaminated soil through composting /Tahseen Sayara, Montserrat Sarra, Antoni Sanchez//J. Hazard. Mater. - 2010. - N 179. - P. 999-1006.

307. Schleheck, D. Complete genome sequence of Parvibaculum lavamentivorans type strain (DS-1(T)). /David Schleheck, Michael Weiss, Sam Pitluck, David Bruce, Miriam L Land, Shunsheng Han, Elizabeth Saunders, Roxanne Tapia, Chris Detter, Thomas Brettin, James Han, Tanja Woyke, Lynne Goodwin, Len Pennacchio, Matt Nolan, Alasdair M Cook, Staffan Kjelleberg, Torsten Thomas//Stand. Genomic Sci. - 2011. - N 5. - P. 298-310.

308. Schwartz, E. Repeated inoculation as a strategy for the remediation of low concentrations of phenanthrene in soil /Egbert Schwartz, Kate M. Scow//Biodegradation - 2001. - N 12. - P. 201-207.

309. Selim, S.M. Evaluation of phytotoxicity of compost during composting process /Sh. M. Selim, Mona S. Zayed, Houssam M. Atta//Nat. Sci. - 2012. - N 10. - P. 70-77.

310. Селивановская С.Ю. Влияние нетрадиционных почвоулучшителей на нитрогеназную и респираторную активности серой лесной почвы /Селивановская С.Ю. Курицин И. Н., Шнель С.// сб. статей Фундаментальные достижения в почвоведении, экологии, сельском хозяйстве на пути к инновациям - Москва, 2008. - С. 82-85.

311. Semple, K.T. Impact of composting strategies on the treatment of soils contaminated with organic pollutants /K.T. Semple, B. J. Reid, T. R. Fermor//Environ. Pollut. - 2001. - N. 112(2). -P. 269-283.

312. Sengupta, A. Methanotrophic bacterial diversity in two diverse soils under varying land-use practices as determined by high-throughput sequencing of the pmoA gene /Aditi Sengupta, Warren A. Dick//Appl. Soil Ecol. - 2017. - N 119. - P. 35-45.

313. Shahi, A. The effects of white-rot fungi Trametes versicolor and Bjerkandera adusta on microbial community structure and functional genes during the bioaugmentation process following biostimulation practice of petroleum contaminated soil /Aiyoub Shahi, Sevcan Aydin, Bahar Ince, Orhan Ince//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2016. - N 114. - P. 67-74.

314. Shendure, J. Review: Next-generation DNA sequencing /Jay Shendure, Hanlee Ji//Dna Seq. - 2008 .- N 26. - P. 1-11.

315. Sheng, Y. X. Tian G. Wang C. Hao F. Liu,Bacterial Diversity and Biogeochemical Processes of Oil-Contaminated Groundwater, Baoding, North China /Yizhi Sheng, Xiaowei Tian, Guangcai Wang, Chunbo Hao, Fei Liu//Geomicrobiol. J. - 2016. - 15 p.

316. Short, D.P.G. Widespread occurrence of diverse human pathogenic types of the fungus Fusarium detected in plumbing drains /Dylan P.G. Short, Kerry O'Donnell, Ning Zhang, Jean H. Juba, David M. Geiser//J. Clin. Microbiol. - 2011. - N 49. - P. 4264-4272.

317. Shrestha, K. Microbial enhancement of compost extracts based on cattle rumen content compost - Characterisation of a system /K. Shrestha, P. Shrestha, K.B. Walsh, K.M. Harrower, D.J. Midmore//Bioresour. Technol. - 2011. - N 102. - P. 8027-8034.

318. Shrestha, R.K. Soil carbon fluxes and balances and soil properties of organically amended no-till corn production systems /Raj K. Shrestha, Rattan Lal, Basant Rimal//Geoderma -2013. - N 197-198. - P. 177-185.

319. Siles, J.A. Effects of "alpeorujo" transformed by Coriolopsis rigida on the distribution and dynamics of a culturable fungal soil community /J.A. Siles, V. Gonzalez-Menendez, G. Platas, I. Sampedro, I. Garcia-Romera, G.F. Bills// Soil Microbiology. - 2012. - N. 67. - P. 648-658.

320. Silva, I.S. M. Grossman L.R. Durrant,Degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons (2-7 rings) under microaerobic and very-low-oxygen conditions by soil fungi /Isis S. Silva, Matthew Grossman, Lucia R. Durrant//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2009. - N 63. - P. 224-229.

321. Simons, K.L. Carrier mounted bacterial consortium facilitates oil remediation in the marine environment /Keryn L. Simons, Petra J. Sheppard, Eric M. Adetutu, Krishna Kadali, Albert L. Juhasz, Mike Manefield, Priyangshu M. Sarma, Banwari Lal, Andrew S. Ball//Bioresour. Technol. -2013. - N 134. - P. 107-116.

322. Speight, J.G. Petroleum Refinery Processes /J.G. Speight, B. Ozum. - Marcel Dekker, Inc., 2002. - 722 p.

323. Speight, J.G. and Arjoon K.K. Bioremediation of Petroleum and Petroleum Products /James G. Speight, Karuna K. Arjoon. - Scrivener Publishing LLC, 2012. - 570 p.

324. Steel, H. Nematode and microbial communities in a rapidly changing compost environment: How nematode assemblages reflect composting phases /Hanne Steel, David Buchan, Stefaan De Neve, Marjolein Couvreur, Tom Moens, Wim Bert//Eur. J. Soil Biol. - 2013. - N 56. - P. 1 -10.

325. Stefani, F.O.P. Culture-Dependent and -Independent Methods Capture Different Microbial Community Fractions in HydrocarbonContaminated Soils /Franck O. P. Stefani, Terrence H. Bell, Charlotte Marchand, Ivan E. de la Providencia, Abdel El Yassimi, Marc St-Arnaud, Mohamed Hijri//PLoSOne - 2015. - N 10. - P. 16.

326. Stenberg, B. Microbial biomass and activities in soil as affected by frozen and cold storage /B. Stenberg, M. Johansson, M. Pell, K. Sjodahl-Svensson, J. Stenstrom, L. Torstensson//Soil Biol. Biochem. - 1998. - N 30. - P. 393-402.

327. Storey, S. Comparison of bacterial succession in green waste composts amended with

inorganic fertiliser and wastewater treatment plant sludge /Sean Storey, Dearbhâil Ni Chualain, Owen Doyle, Nicholas Clipson, Evelyn Doyle//Bioresour. Technol. - 2015. - N 179. - P. 71-77.

328. Straathof, A.L. Input materials and processing conditions control compost dissolved organic carbon quality /Angela L. Straathof, Rob N J Comans//Bioresour. Technol. - 2015. - N 179. -P. 619-623.

329. Sullivan, D.M. Compost quality attributes, mesuremens and variability. In.: Compost utilization in horticultural cropping systems / Peter J. Stoffella, Brian A. Kahn. - USA: CRC Press, 2001. - pp. 96-111.

330. Sun, L. The microbial community Structure in industrial biogas plants influences the degradation rate of Straw and cellulose in batch tests /Li Sun, Tong Liu, Bettina Müller, Anna Schnürer//Biotechnol. Biofuels - 2016. - N 9. - P. 128.

331. Suthersan, S.S. In situ bioremediation /S.S. Suthersan. - Boca Raton: CRC Press LLC, 1999. - 36 p.

332. Tabacchioni, S. Bias Caused by Using Different Isolation Media for Assessing the Genetic Diversity of a Natural Microbial Population. /S. Tabacchioni, L. Chiarini, A. Bevivino, C. Cantale, C. Dalmastri//Microb. Ecol. - 2000. - N 40. - P. 169-176.

333. Taccari, M. Effects of biostimulation and bioaugmentation on diesel removal and bacterial community /Manuela Taccari, Vesna Milanovic, Francesca Comitini, Cristiano Casucci, Maurizio Ciani//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2012. - N 66. - P. 39-46.

334. Tahhan, R.A. Biodegradation of petroleum industry oily-sludge using Jordanian oil refinery contaminated soil /Ragheb A. Tahhan, Rouba Youssef Abu-Ateih//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2009. - N 63. - P. 1054-1060.

335. Tahhan, R.A. Enhancing the biodegradation of total petroleum hydrocarbons in oily sludge by a modified bioaugmentation strategy /Ragheb A. Tahhan, Tarek G. Ammari, Saba J. Goussous, Hend I. Al-Shdaifat//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2011. - N 65. - P. 130-134.

336. Tâncsics, A. Applicability of the functional gene catechol 1,2-dioxygenase as a biomarker in the detection of BTEX-degrading Rhodococcus species /A. Tâncsics, S. Szoboszlay, B. Kriszt, J. Kukolya, E. Baka, K. Mârialigeti, S. Révész//J. Appl. Microbiol. - 2008. - N 105. - P. 10261033.

337. Tao, K. Biodegradation of crude oil by a defined co-culture of indigenous bacterial consortium and exogenous Bacillus subtilis /Kaiyun Tao, Xiaoyan Liu, Xueping Chen, Xiaoxin Hu, Liya Cao, Xiaoyu Yuan//Bioresour. Technol. - 2017. - N 224. - P. 327-332.

338. Tao, K. Response of soil bacterial community to bioaugmentation with a plant residue-immobilized bacterial consortium for crude oil removal /Kaiyun Tao, Xinying Zhang, Xueping Chen, Xiaoyan Liu, Xiaoxin Hu, Xiaoyu Yuan//Chemosphere - 2019. - N 222. - P. 831-838.

339. Tardif, S. The willow microbiome is influenced by soil petroleum-hydrocarbon concentration with plant compartment-specific effects /Stacie Tardif, Étienne Yergeau, Julien Tremblay, Pierre Legendre, Lyle G. Whyte, Charles W. Greer//Front. Microbiol. - 2016. - N 7.

340. Tedersoo, L. 454 Pyrosequencing and Sanger sequencing of tropical mycorrhizal fungi provide similar results but reveal substantial methodological biases /Leho Tedersoo, R. Henrik Nilsson, Kessy Abarenkov, Teele Jairus, Ave Sadam, Irja Saar, Mohammad Bahram, Eneke Bechem, George Chuyong, Urmas Koljalg//New Phytol. - 2010. - N 188. - P. 291-301.

341. Tejada, M. Relationships between biological and chemical parameters on the composting of a municipal solid waste. /Manuel Tejada, Ana María García-Martínez, Juan Parrado//Bioresour. Technol. - 2009. - N 100. - P. 4062-5.

342. Teng, Y. Effect of bioaugmentation by Paracoccus sp. strain HPD-2 on the soil microbial community and removal of polycyclic aromatic hydrocarbons from an aged contaminated soil /Ying Teng, Yongming Luo, Mingming Sun, Zengjun Liu, Zhengao Li, Peter Christie//Bioresour. Technol. - 2010. - N 101. - P. 3437-3443.

343. The Dictionary of Cell & Molecular Biology/ Lackie, J.M. - Academic Press, 2013. -

750 p.

344. Thomas, J.M. Subsurface microbial ecology and bioremediation /J. M. Thomas, C.H. Ward//J. Hazard. Mater. - 1992. - N 32(2-3). - P. 179-194.

345. Thompson, I.P. Bioaugmentation for bioremediation: The challenge of strain selection /Ian P. Thompson, Christopher J. Van Der Gast, Lena Ciric, Andrew C. Singer//Environ. Microbiol. -2005. - N 7(7). - P. 909-915.

346. Tiquia, S.M. Evolution of extracellular enzyme activities during manure composting /S. M. Tiquia//J. Appl. Microbiol. - 2002. - N 92. - P. 764-775.

347. Tognetti, C. Improving the quality of municipal organic waste compost /C. Tognetti, M. J. Mazzarino, F. Laos//Bioresour. Technol. - 2007. - N 98. - P. 1067-1076.

348. Toledo, F.L. Selection and identification of bacteria isolated from waste crude oil with polycyclic aromatic hydrocarbons removal capacities /F. L. Toledo, C. Calvo, B. Rodelas, J. González-López//Syst. Appl. Microbiol. - 2006. - N 29(3). - P. 244-252.

349. Tonin, C. Assessment of arbuscular mycorrhizal fungi diversity in the rhizosphere of Viola calaminaria and effect of these fungi on heavy metal uptake by clover /C. Tonin, P. Vandenkoornhuyse, E. J. Joner, J. Straczek, C. Leyval//Mycorrhiza - 2001. - N 10. - P. 161-168.

350. Torres, A.Y.L. Soil mycobiota in agroecosystem: influence of land use and management /A Y L. Torres. - Pavia (Italy), 2017. - 294 p.

351. Trautmann, N.M. Composting in the classroom - Scientific Inquiry for high school students /Nancy M Trautmann, Marianne E Krasny. - Hunt Publishing Company, 1998. - 116 p.

352. Trevors, J.T. Bacterial biodiversity in soil with an emphasis on chemically-contaminated soils /J.T. Trevors//Water. Air. Soil Pollut. - 1998. - N 101(1). - P. 45-67

353. Trofimov, S.Y. Transformation of soil properties under the impact of oil pollution /M.S. Trofimov, S.Y., Rozanova//Eurasian Soil Sci. - 2003. - N 36. - P. 82-87.

354. Tuhuloula, A. Biodegradation of Extractable Petroleum Hydrocarbons by Consortia Bacillus cereus and Pseudomonas putida in Petroleum Contaminated-Soil /Abubakar Tuhuloula, Suprapto Suprapto, Ali Altway, Sri Rachmania Juliastuti//Indones. J. Chem. - 2019. - N 19(2). - P. 347-355.

355. Tunali, B. Fitness of three Fusarium pathogens of wheat /Berna Tunali, Friday Obanor, Gul Erginba§, Rhyannyn A. Westecott, Julie Nicol, Sukumar Chakraborty//FEMS Microbiol. Ecol. -2012. - N 81. - P. 596-609.

356. Tyagi, M. Bioaugmentation and biostimulation strategies to improve the effectiveness of bioremediation processes /Meenu Tyagi, M. Manuela R da Fonseca, Carla C.C. R de Carvalho//Biodegradation - 2011. - N 22(2). - P. 231-241.

357. Ubani, O. Identification and characterisation of oil sludge degrading bacteria isolated from compost /Onyedikachi Ubani, Harrison Ifeanyichukwu Atagana, Mapitsi Silvester Thantsha, Adeleke Rasheed//Arch. Environ. Prot. - 2016. - N 42. - P. 67-77.

358. Uyttebroek, M. Characterization of cultures enriched from acidic polycyclic aromatic hydrocarbon-contaminated soil for growth on pyrene at low pH /Maarten Uyttebroek, Steven Vermeir, Pierre Wattiau, Annemie Ryngaert, Dirk Springael//Appl. Environ. Microbiol. - 2007. - N 73. - P. 3159-3164. https://doi.org/10.1128/AEM.02837-06

359. van Elsas, J.D. A review of molecular methods to study the microbiota of soil and the mycosphere /J. D. van Elsas, F. G H. Boersma//Eur. J. Soil Biol. - 2011. - N. 47(2). P. 77-87.

360. Van Hamme, J.D. Development of a method for the application of solid-phase microextraction to monitor biodegradation of volatile hydrocarbons during bacterial growth on crude oil /J. D. Van Hamme, O. P. Ward//J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 2000. - N 25. - P. 155-162.

361. Vancov, T. Amplification of soil fungal community DNA using the ITS86F and ITS4 primers /Tony Vancov, Brad Keen//FEMS Microbiol. Lett. - 2009. - N 296. - P. 91-96.

362. Varjani, S. Comparative studies on bacterial consortia for hydrocarbon degradation /Sj Varjani, Vn Upasani//Int. J. Innov. Res. Sci. Eng. Technol. (An) - 2013. - N 2. - P. 5377-5383.

363. Varjani, S.J. A new look on factors affecting microbial degradation of petroleum hydrocarbon pollutants /Sunita J. Varjani, Vivek N. Upasani//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2017a. - N 120. - P. 71-83

364. Varjani, S.J. Microbial degradation of petroleum hydrocarbons /Sunita J. Varjani//Bioresour. Technol. - 2017b. - N. 223. - P. 277-286.

365. Verma, S. Oily sludge degradation by bacteria from Ankleshwar, India /Shuchi Verma, Renu Bhargava, Vikas Pruthi//Int. Biodeterior. Biodegrad. - 2006. - N 57. - P. 207-213.

366. Villar, I. Evolution of microbial dynamics during the maturation phase of the composting of different types of waste /Iria Villar, David Alves, Josefina Garrido, Salustiano Mato//Waste Manag. - 2016. - N 54. - P. 83-92.

367. von der Weid, I. Identification and biodegradation potential of a novel strain of Dietzia cinnamea isolated from a petroleum-contaminated tropical soil /Irene von der Weid, Joana M. Marques, Claudia D. Cunha, Ralph K. Lippi, Silvia C.C. dos Santos, Alexandre S. Rosado, Ulysses Lins, Lucy Seldin//Syst. Appl. Microbiol. - 2007. - N. 30(4). - P. 331-339

368. Wachowska, U. Microbial inhibition of Fusarium pathogens and biological modification of trichothecenes in cereal grains /Urszula Wachowska, Danuta Packa, Marian Wiwart//Toxins (Basel). - 2017. - N. 9(12). - 14 p.

369. Wald, J. Pseudomonads rule degradation of polyaromatic hydrocarbons in aerated sediment /Jiri Wald, Miluse Hroudova, Jan Jansa, Blanka Vrchotova, Tomas Macek, Ondrej Uhlik//Front. Microbiol. - 2015. - N 6.

370. Wang, C. New insights into the structure and dynamics of actinomycetal community during manure composting /Cheng Wang, Xiaohui Guo, Hui Deng, Da Dong, Qiaoping Tu, Weixiang Wu//Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2014. - N 98. - P. 3327-3337.

371. Wang, H. Effects of Aged Oil Sludge on Soil Physicochemical Properties and Fungal Diversity Revealed by High-Throughput Sequencing Analysis /Huihui Wang, Shaoping Kuang, Qiaolin Lang, Wenjuan Yu//Archaea - 2018. - N 2018. - P. 9264259.