Совершенствование эпидемиологического надзора за клещевыми риккетсиозами на территориях с различным риском заражения населения Rickettsia sibirica тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Штрек Сергей Владимирович

• Штрек Сергей Владимирович
• кандидат наук
• 2020

Оглавление диссертации кандидат наук Штрек Сергей Владимирович

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Основные этапы изучения клещевых риккетсиозов

1.2 Общая характеристика рода Rickettsia

1.3 Клинические проявления и распространение риккетсий и риккетсиозов на территории Российской Федерации

1.4 Методы лабораторной диагностики клещевых риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки

1.4.1 Выделение риккетсий из клинических образцов

1.4.2 Серологические методы исследования

1.4.3 Молекулярно-биологические методы исследования

1.4.4 Исследования системы гемостаза

1.5 Алгоритмы лабораторной диагностики клещевых риккетсиозов

группы клещевой пятнистой лихорадки

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Общая характеристика исследования

2.2 Эпидемиологические методы исследования

2.3 Риккетсиологические методы

2.3.1 Биопробы на морских свинках

2.3.2Методика приготовления корпускулярного антигена

2.4 Серологические методы исследования

2.4.1 Реакция связывания комплемента

2.4.2 Реакция непрямой иммунофлюоресценции

2.4.3 Иммуноферментный анализ

2.5 Молекулярно-биологические методы исследования

2.5.1 Экстракция нуклеиновых кислот

2.5.2 Полимеразная цепная реакция с электрофоретической детекцией ДНК риккетсий в переносчиках

2.5.3 Секвенирование по Сэнгеру

2.5.4 Полимеразная цепная реакция и секвенирование ДНК риккетсий в

секционном материале

2.6 Статистические методы

ГЛАВА 3. ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОЯВЛЕНИЯ СИБИРСКОГО КЛЕЩЕВОГО ТИФА НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

3.1 Многолетняя динамика и интенсивность эпидемического процесса сибирского клещевого тифа в федеральных округах и субъектах Российской Федерации в период 2002-2018 гг. и прогноз на 2019 г

3.2 Тенденции развития эпидемического процесса сибирского клещевого тифа в субъектах Российской Федерации в зависимости от степени

эпидемической опасности территорий в 2002-2018 гг

ГЛАВА 4. ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ СЕРОЛОГИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ДЛЯ ВЕРИФИКАЦИИ СИБИРСКОГО КЛЕЩЕВОГО ТИФА НА ТЕРРИТОРИЯХ РАЗЛИЧНОГО РИСКА ЗАРАЖЕНИЯ RICKETTSIA SIBIRICA

4.1 Клинико-лабораторная характеристика сибирского клещевого тифа у жителей Называевского района Омской области

4.2 Результаты лабораторного исследования сывороток пациентов исследуемой, опытной групп и группы сравнения в РСК, РНИФ и ИФА для выявления антител к антигенам риккетсий группы КПЛ

4.3 Возможности серологической верификации сибирского клещевого тифа с использованием тест-системы для выявления антител к Rickettsia

conorii

ГЛАВА 5. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ И МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В СОЧЕТАННЫХ ОЧАГАХ

КЛЕЩЕВЫХ РИККЕТСИОЗОВ

5.1 Изучение встречаемости и генетического разнообразия риккетсий в популяциях иксодовых клещей, обитающих на территории Омской области

5.1.1 Изучение видового разнообразия клещей, снятых с людей на территории Омской области

5.1.2 Инфицированность риккетсиями клещей, снятых с людей в Омской области

5.2 Идентификация риккетсий в новом очаге Называевского района Омской области

5.3 Характеристика биологических и молекулярно-генетических свойств штаммов риккетсий, выделенных в Алтайском и Хабаровском краях

5.4 Летальный случай клещевого риккетсиоза, вызванного Rickettsia

sibirica и «Candidatus Rickettsia tarasevichiae» в Красноярском крае

ГЛАВА 6. ОПТИМИЗАЦИЯ СИСТЕМЫ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАДЗОРА ЗА КЛЕЩЕВЫМ РИККЕТСИОЗОМ, ОСНОВАННАЯ НА ПРИМЕНЕНИИ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ И СЕРОЛОГИЧЕСКИХ МЕТОДОВ

6.1 Эпидемиологический надзор за клещевыми риккетсиозами

6.2 Микробиологический мониторинг в системе эпидемиолого-

эпизоотологического надзора за риккетсиозами группы КПЛ

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА

ПРИЛОЖЕНИЯ

Приложение

Приложение

Приложение

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Совершенствование эпидемиологического надзора за клещевыми риккетсиозами на территориях с различным риском заражения населения Rickettsia sibirica»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Клещевые риккетсиозы (КР), наряду с клещевым энцефалитом (КЭ) и иксодовыми клещевыми боррелиозами (ИКБ), входят в тройку наиболее распространенных передаваемых иксодовыми клещами инфекций в Российской Федерации. В отличие от КЭ и ИКБ, роль клещевых риккетсиозов в инфекционной патологии населения изучена значительно слабее. Существует необходимость разработки новых подходов к лабораторной верификации диагнозов КР. Для выявления антител к риккетсиям группы клещевой пятнистой лихорадки (КПЛ) могут быть использованы реакция непрямой иммунофлюоресценции (РНИФ) и иммуноферментный анализ (ИФА), однако сертифицированные препараты для этих методов в отечественной лабораторной практике отсутствуют. Для выявления и идентификации риккетсий группы КПЛ наиболее приемлема полимеразная цепная реакция (ПЦР) с последующим секвенированием, для изучения патогенных видов риккетсий оптимальны биологические методы исследования [24,73].

Степень разработанности темы исследования. Вопросами эпидемиологии риккетсиозов, микробиологии и генетики риккетсий активно занимаются в России и за рубежом [2, 12, 49, 53, 93, 112, 117, 119, 131, 132, 133, 141, 156, 177]. Значительное число публикаций посвящено лабораторной диагностике клещевых риккетсиозов с применением различных методов [4, 9, 13, 24, 50, 51, 52, 68, 69, 73, 79, 89, 123, 128, 140, 161]. Однако эпидемиологическое и молекулярно-биологическое изучение КР на эндемичных территориях с различным риском заражения населения R. sibirica с использованием современных методов микробиологического мониторинга не проводилось.

Цель исследования: совершенствование эпидемиологического надзора за клещевыми риккетсиозами на территориях с различным риском заражения населения Rickettsia sibirica на основе совершенствования тактики применения молекулярно-биологических и серологических методов микробиологического мониторинга природных очагов.

Задачи исследования:

1. Проанализировать интенсивность и динамику заболеваемости сибирским клещевым тифом на эндемичных административных территориях Российской Федерации за период 2002-2018 гг.

2. Провести лабораторное исследование молекулярно-биологическими и серологическими методами биологического материала от пациентов с присасыванием иксодовых клещей на территориях, отличающихся риском заражения Rickettsia sibirica, для верификации сибирского клещевого тифа.

3. Оптимизировать алгоритм лабораторной диагностики клещевых риккетсиозов на основе выявления антител к риккетсиям в РНИФ и ИФА с антигенами риккетсий различных видов, и ПЦР-секвенирование для анализа геновидовой структуры риккетсий в переносчиках и в биоматериале от пациентов.

4. Обосновать применение современных методов микробиологического мониторинга для совершенствования системы эпидемиологического надзора за риккетсиозами группы КПЛ.

Научная новизна и теоретическое значение работы. Выявлена тенденция к снижению заболеваемости сибирским клещевым тифом (СКТ) в Российской Федерации за период наблюдений с 2002 по 2018 гг., определена степень эпидемической опасности и разнонаправленная динамика изменения эпидемической активности природных очагов этой инфекции на отдельных эндемичных территориях.

Впервые осуществлена оценка эффективности различных серологических методов для выявления антител у больных клещевыми риккетсиозами на территориях различного риска инфицирования Rickettsia sibirica.

На основании биологических и молекулярно-генетических методов исследований получены новые данные о этиологическом спектре КР и генетическом разнообразии риккетсий, циркулирующих в сочетанных природных очагах. Впервые описан случай инфекции, ассоциированной с двумя видами риккетсий (Rickettsia sibirica и «Candidatus R. tarasevichiae») с летальным исходом.

С целью совершенствования микробиологического мониторинга в системе эпидемиологического надзора и ранней дифференциальной диагностики клещевых трансмиссивных инфекций разработаны рекомендации по алгоритму лабораторной верификации клещевых риккетсиозов с применением серологических и молекулярно-биологических методов.

На основе разработанного алгоритма лабораторной диагностики КР усовершенствована система эпидемиологического надзора за природными очагами этой инфекции. Разработан новый комплексный подход к диагностике КР в условиях сочетанных природных очагов, основанный на результатах экспресс-определения риккетсий в иксодовых клещах, снятых с пациентов, и серологического обследования заболевших.

Разработаны методические основы оценки индивидуального риска заражения людей возбудителями КР, которые базируются на результатах молекулярно-биологического исследования присосавшихся переносчиков.

Практическая значимость работы и внедрение результатов. Результаты работы нашли отражение в государственном докладе «О состоянии санитарно -эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2018 году» (М., Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2019. - С. 196), в информационном письме Роспотребнадзора № 02/8355-2019-32 от 11.06.2019 «Об эпидемической ситуации по сибирскому клещевому тифу, другим клещевым риккетсиозам в 2018 году и прогноз на 2019 год».

В ходе выполнения исследований получено 86 нуклеотидных последовательностей генов gltA, ompA и ompB риккетсий; из них 9 депонированы в базе данных GenBank, с присвоением соответствующих номеров.

Авторский штамм Rickettsia sibirica - «Хлебороб - 91/66» депонирован в ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» МЗ РФ под инвентарным номером 259 от 14 декабря 2018 года.

Результаты исследования и разработанные на их основе методические рекомендации «Алгоритм лабораторной диагностики риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки» (утвержденные 27.11.2019 г.) внедрены в учебный процесс ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, используется в учебном процессе в преподавании дисциплины «Бактериология» при чтении лекций, проведении семинарских занятий для врачей-бактериологов в цикле дополнительного профессионального образования. Так же внедрены в практику работы ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора. Алгоритм зарегистрирован в ЕГИСУ НИОКТР (номер государственного учёта АААА-Б19-219111890039-4).

Методология и методы исследования. Методологической основой диссертационной работы послужило последовательное использование программы исследования, включающей эпидемиологические (ретроспективный анализ с описательным и аналитическим типа «случай-контроль» исследованиями), микробиологические (культивирование риккетсий на биопробных животных, культурах клеток, развивающихся куриных эмбрионах), серологические методы (РСК, РНИФ, ИФА) и молекулярно-биологические методы (ПЦР, секвенирование по Сэнгеру), статистический анализ полученных данных.

Положения, выносимые на защиту.

1. В период 2002-2018 гг. в целом по Российской Федерации выявлена тенденция к снижению регистрируемой заболеваемости сибирским клещевым тифом, несмотря на различную направленность динамики эпидемического процесса на эндемичных территориях.

2. На территориях с низким риском заражения Я. sibirica и циркуляцией Я. гавп1Ш диагноз СКТ подтверждается лабораторно не у всех пациентов с клинико-эпидемиологической верификацией заболевания. В таких случаях указанный диагноз может быть выставлен на основании клинико-эпидемиологических данных.

3. Разработан алгоритм лабораторной диагностики случаев сибирского клещевого тифа, основанный на комплексном использовании серологических и молекулярно-биологических методов исследования с поэтапной оценкой риска заражения, риска заболевания и этиологической расшифровкой болезни. Алгоритм позволит повысить эффективность лабораторной верификации заболеваний и качество информационного обеспечения системы эпидемиологического надзора.

Степень достоверности и апробация результатов. Результаты исследований по теме диссертации были представлены на II Всероссийской конференции «Теория и практика Успеха» (Омск, 2014), научно-практической конференции с международным участием «Актуальные аспекты природной очаговости болезней», посвященной 75-летию теории академика Е.Н. Павловского о природной очаговости болезней (Омск, 2014), VII Всероссийской научно-практическая конференция молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора (Санкт-Петербург, 2015), научно-практической конференции с международным участием, посвященной 95-летию Омского научно-исследовательского института природно-очаговых инфекций «Актуальные проблемы эпидемиологии, микробиологии, природной очаговости болезней человека» (Омск, 2016), научно -практической конференции «Госсанэпидслужбе России 95 лет: история и перспективы в Омской области» (Омск, 2017), IX Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены» (Иркутск, 2017). IV национальном конгрессе бактериологов международного симпозиума «Микроорганизмы и биосфера» MICROBIOS - 2018 (Омск, 2018), Российской научно-практической конференции «Управляемые и другие социально-значимые инфекции: диагностика, лечение и профилактика» (Санкт-Петербург, 2019).

Объём и структура диссертации. Работа изложена на 142 страницах компьютерного текста иллюстрирована 19 таблицами, 15 рисунками. Диссертация состоит из введения, обзора литературы по теме исследования, главы, описывающей материалы и методы исследования, 4 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, 3 приложений.

Библиографический указатель содержит 181 литературный источник, в том числе 91 - зарубежных авторов. Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы ФГБОУ ВО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, номер государственной регистрации АААА-А19-119012190019-4 от 21.01.2019 года.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Основные этапы изучения клещевых риккетсиозов

Риккетсиология — как наука зародилась в начале XX века. Термин «риккетсии» («rickettsia») впервые применил исследователь H. da Rocha-Lima. Именно он обозначил возбудителя сыпного тифа в честь американского исследователя H.T. Ricketts, который погиб от сыпного тифа при его изучении.

Вероятно, первой выявленной риккетсиальной инфекцией является сыпной тиф (эпидемический вшивый тиф). Одна из крупнейших эпидемий сыпного тифа возникла в 1943 г. в Ливии, распространилась на Тунис и Алжир: в течение трех лет заболело около миллиона человек. В первую мировую войну только при отступлении сербской армии в Албанию от сыпного тифа погибло 135 000 сербских солдат и 35 000 пленных. За это же время в России и Польше сыпным тифом переболело около 30 млн. человек, из них 3,5 млн. умерло.

Слово "typhos" впервые употребил древнегреческий врач Гиппократ. Итальянский врач Фракасторо в 1546 г. дал очень точную характеристику сыпного тифа, что вызывается он специфическим заразным агентом. В 1903 г. испанский врач Cortezo, заявил, что инфекцию переносят вши [26].

В 1899 году Edward E. Maxey описал первый клинический случай пятнистой лихорадки Скалистых гор. В 1909 г H.T. Ricketts при изучении ПЛСГ обнаружил в крови больных и клещах-переносчиках возбудителя, оказавшегося первым известным представителем риккетсий. В 1910 году он погиб от сыпного тифа при его исследовании. Позднее в 1919 году Wolbach назвал возбудителя ПЛСГ Rickettsia rickettsi, а возбудителя сыпного тифа - Rickettsia prowazeki, в честь чешского исследователя Провачека погибшего от сыпного тифа [26]. В 1932 г. описали R. conorii как возбудителя марсельской лихорадки J. Caminopetros, B. Contos и E. Brumpt, что стало предпосылкой последующего выявления обширной группы клещевых пятнистых лихорадок.

В 1934-1935 гг. были выявлены следующие природно-очаговые заболевания в Приморье - «клещевая лихорадка Приморья» [48], в Хабаровском крае

«дальневосточная сыпная клещевая лихорадка» [3] ив Красноярском крае «клещевая сыпная лихорадка» [86]. Все случаи данных заболеваний связывали с присасыванием клещей, отмечали остроциклический характер клинической картины с высокой температурой тела и наличием розеолёзно -петехиальной сыпи, первичного аффекта в месте укуса клещей, регионарного лимфаденита и изменений со стороны ЦНС. В 1938 г. во главе с М.К. Кронтовской, была направлена экспедиция в Красноярский край. Где установили риккетсиозную этиологию заболевания, переносчиков - клещей Dermacentor nuttalli Ol. Возбудитель был выделен из крови больных в 1938 году. Указанное заболевание выделили в самостоятельную нозологическую единицу - клещевой сыпной тиф или сибирский клещевой риккетсиоз [38].

С 1939 по 1949 год были выявлены новые очаги в Приморье, Хабаровском и Алтайском краях, Иркутской, Читинской, Кемеровской, Новосибирской, Тюменской областях, Бурятии, Хакасии и Туве, Киргизии, Казахстане и других республиках Средней Азии. Параллельно выявлены новые виды переносчиков возбудителя - Dermacentor marginatus, Dermacentor reticulatus, Dermacentor silvarum, Haemaphysalis concinna, Haemaphysalis punctate [5, 6, 8, 10, 11, 25, 31, 36, 37, 38, 39, 40, 44, 60, 61, 62, 63, 67, 77, 81, 84].

Исключительно важными в этот период изучения болезни явились исследования Е.М. Голиневич, которая при идентификации алтайского и красноярского штаммов возбудителя в 1948 году установила принадлежность его к возбудителям пятнистых лихорадок в связи с внутриядерным паразитированием. Она же определила и иммунологическую близость (но не идентичность) его к возбудителю марсельской лихорадки - R. conorii [21]. В дальнейшем этот агент выделен П.Ф. Здродовским и Е.М. Голиневич в самостоятельный вид Dermacentroxenus sibiricus (в настоящее время - Rickettsia sibirica subsp. sibirica). Антигенную самостоятельность R. sibirica подтвердили впоследствии E.J. Bell и H.G. Stoenner (1960) [96].

В районах Дальнего Востока Г.М. Цыганков предположил существование особого риккетсиоза, схожего по клинике с сыпным тифом Западной Сибири [85].

Переносчиком по данным Р.Я. Киреевой являются клещи H. concinna [32]. Этиологическим агентом случаев клещевого риккетсиоза на юге Хабаровского края является R. heilongjingensis, обнаруженный О.Ю. Медянниковым в 2004 г. [92]. Циркуляция этого возбудителя так же установлена в Алтайском, Красноярском и Приморском краях, основные клещи-переносчики Haemaphisalis concinna [59, 111].

С 2001-2003 г. в клещах Dermacentor marginatus в Воронежской, Курганской областях и Ставропольском крае генотипировали R. slovaca [54, 87].

Астраханская пятнистая лихорадка по официальной статистике является вторым регистрируемым риккетсиозом группы КПЛ в России. Природный очаг АПЛ сформировался в 70 г. XX века на территории Астраханской области. Её этиология была уточнена в 1990 г. сотрудниками Всесоюзного центра по риккетсиозам совместно с астраханскими коллегами под руководством И.В. Тарасевич [171]. Возбудителя выделили из крови больных вирусными экзантемами на высоте лихорадки [19]. В 2013 году он был зарегистрирован как подвид R. conorii subsp. caspii. Выделена из нескольких видов клещей рода Rhipicephalus, включая Rh. sanguineus и Rh. pumilio, которые паразитируют не только на собаках, но и на кроликах, ежах и кошках [42, 43, 139].

В 2005 году С.Н. Шпыновым на территории Омской области в клещах I. persulcatus выявлена R. helvetica [18]. В 2008 году В.В. Нефёдовой удалось выявить этого возбудителя у пациентов с острыми лихорадочными заболеваниями после присасывания клещей в Пермском крае [47]. Циркуляция этого возбудителя установлена на территории Республики Коми [57], Хабаровского края и Сахалинской области [50]. R. helvetica распространена в Евразии в ареалах клещей I. persulcatus — I. ricinus [18].

Патогенная для человека R. aeschlimannii генотипирована в клещах Haemaphysalis punctata из Алма-Атинской области Казахстана, где в предыдущие десятилетия зарегистрированы случаи «клещевого риккетсиоза» [111]. В России R. aeschlimannii впервые выявлена в Ставропольском крае в клещах Hyalomma marginatum marginatum, в последние годы — в Крыму [15, 20, 110].

В 2008 г. описан новый вид риккетсий группы КПЛ Rickettsia raoultii sp. nov., вид назван в честь руководителя лаборатории риккетсиозов Средиземноморского университета профессора Didier Raoult [155]. Установлено, что ареал R. raoultii (RpA4, DnS14, DnS28) занимает территории от азиатской части России до Северной Африки [109]. Патогенность для человека окончательно не установлена, но часть случаев синдрома TIBOLA/DEBONEL связывают с R. raoultii [157, 158].

Candidatus Rickettsia tarasevichiae отнесена к группе предшественников. Впервые генотипирована в 2003 году в клещах I. persulcatus собранных в Челябинской, Тюменской, Омской, Томской и Новосибирской областях, Алтайском, Красноярском и Приморском краях [99].

1.2 Общая характеристика рода Rickettsia

Риккетсиозы - распространенная группа заболеваний человека и животных, вызываемых представителями порядка Rickettsiales.

Термин «риккетсии» объединяет обширную группу грамотрицательных микроорганизмов, тесно связанных в своей жизнедеятельности с членистоногими и обладающих рядом общих свойств:

а) являются облигатными внутриклеточными паразитами;

б) не способны к росту на питательных средах;

в) их биология связана с паразитизмом у членистоногих (клещи, вши, блохи);

г) имеют ряд особенностей в строении, размножении, биохимических, генетических и иммунобиологических характеристиках;

д) вызываемые риккетсиями заболевания (риккетсиозы) характеризуются своеобразием клиники и эпидемиологии;

е) требуют специализированных методов изучения (риккетсиологических).

По существующей таксономической классификации риккетсии отнесены к

домену Bacteria типу Proteobaccteria, классу a1-proteobaccteria, порядку Rickettsiales семейства Rickettsiaceae, рода Rickettsia [75].

В составе рода Rickettsia выделяют три группы, которые в свою очередь подразделяются на подгруппы.

Группа клещевой пятнистой лихорадки включает четыре подгруппы:

A. R. rickettsii (R. conorii [98], R. rickettsii [180], R. peacockii [154], R. sibirica [181], R. africae [144], R. slovaca [159], R. japonica [153], R. heilongjiangensis [116], R. honei [151], R. parkeri [174]);

B. R. massiliae (R. massiliae [95], R. rhipicephali [175], R. montanensis [175], R. raoultii [155], R. aeschlimannii [143], R. gravesii [150], R. amblyommatis [145]);

C. R. helvetica (R. helvetica [104], R. asiatica [146], R. tamurae [160], R. monacensis, R. buchreri [148], R. montanensis);

D. R. akari (R. akari [124], R. australis [138], R. felis [149], R. hoogstraalii [152], R. asembonensis [126]).

Предковая группа:

E. R. canadensis (R. canadensis [129], R. tarasevichiae [9], R. bellii [147]). Группы сыпного тифа:

F. R. _prowazekii (R. prowazekii [107], R. typhi [179]).

К риккетсиям группы КПЛ относятся 16 видов патогенных риккетсий, 8 видов с недоказанной патогенностью и семь кандидатов в новые виды (два с доказанной патогенностью для человека). К основным классическим патогенам принадлежат возбудитель пятнистой лихорадки Скалистых гор -R. rickettsii, возбудитель марсельской (средиземноморской) лихорадки в странах Средиземноморского бассейна - R. conorii, возбудитель клещевого риккетсиоза (клещевого сыпного тифа) в азиатской части России, Казахстане, Монголии и Китае - R. sibirica, возбудитель синдрома TIBOLA (DEBONEL) в Европе -R. slovaca, возбудитель лихорадки острова Флиндерс - R. honei, возбудитель японской пятнистой лихорадки - R. japonica, возбудитель австралийского клещевого риккетсиоза - R. australis, возбудитель осповидного, или гамазового риккетсиоза - R. akari [75].

Риккетсии - грамотрицательные мелкие плеоморфные микроорганизмы от кокковидных до палочковидных, иногда нитевидных, клеток, однако чаще короткие палочки 03,-0,6 x 0,8-2,0 мкм. Размножение риккетсий осуществляется бинарным делением вегетативных форм [178]. Капсула и жгутики отсутствуют.

П.Ф. Здродовским и Е.М. Голиневич в 1972 описали морфологические типы на примере риккетсий Провачека: тип a - кокковидные, тип b - палочковидные, тип c - бациллярные, тип d - нитевидные [26]. Дифференциально-диагностический признак для риккетсий группы КПЛ характеризуется способностью размножаться в цитоплазме и ядре пораженной клетки [176]. В клетке риккетсий выделяют следующие структуры: снаружи микрокапсулярный слой толщиной 10-15 нм, трёхслойная мембрана клеточной стенки шириной 8 -12 нм, цитоплазма образуется рибосомоподобными гранулами, нити ДНК. Благодаря «актиновым хвостикам», волосовидные придатки или фимбрии, некоторые риккетсии обладают подвижностью. У ряда видов риккетсий отмечают наличие вегетативных и покоящихся форм [75].

Основными антигенными комплексами риккетсий группы КПЛ являются группоспецифический (отличающийся по антигенным эпитопам у риккетсий групп КПЛ и СТ) термостабильный липополисахаридный комплекс и два протективных поверхностных белка - rOmpA и rOmpB [115].

Культивирование риккетсий наблюдается в клетках позвоночных и членистоногих, в эпидермальных клетках, выстилающих желточный мешок развивающегося куриного эмбриона [105]. Хороший рост получен in vitro в клетках куриного эмбриона и в некоторых перевиваемых линиях клеточных культур млекопитающих (Vero, Hep-2) [27].

Риккетсии группы КПЛ - клещевые микроорганизмы с эффективной трансовариальной и трансфазовой передачей. Основными хозяевами риккетсий этой группы являются клещи родов Dermacentor, Rhipicephalis, Haemaphysalis, Ixodes, Amblyomma [75].

1.3 Клинические проявления и распространение риккетсии и риккетсиозов на территории Российской Федерации

Среди риккетсий группы КПЛ основное значение в инфекционной патологии человека на территории Российской Федерации имеют сибирский клещевой тиф и Астраханская пятнистая лихорадка. Возбудитель АПЛ - риккетсия, относящаяся к

генокомплексу R. conorii (в настоящее время - R. conorii subsp. caspii) из группы КПЛ, систематическое положение которой уточняется. Инфекцию регистрируют преимущественно в Астраханской области, переносчики-клещи Rhipicephalus pumilio [80].

Эпидемические очаги возбудителя СКТ - R. sibirica (генотип R. sibirica sensu stricto) распространены в Азиатской части России, переносчики - клещи рода Dermacentor и Haemaphysalis concinna. На Дальнем Востоке в клещах Dermacentor silvarum выявляют генотип R. sibirica BJ-90 [4].

R. conorii subsp. caspiensis — агент Астраханской пятнистой лихорадки, заболеваемость которой регистрируют в Астраханской области, генотипирован также в клещах Rh. pumilio на смежных территориях России (Калмыкия, Волгоградская область) [80].

Три новых генотипа риккетсий, имеющие генетическую схожесть с R. massiliae, выявлены в клещах рода Dermacentor в Астраханской области (R. sp. RpA4) и в республике Алтай (R. sp. DnS14, R. sp. DnS28) [134]. На сегодняшний день эти генотипы описаны как новый вид риккетсий группы КПЛ Rickettsia raoultii sp.nov [155].

В Воронежской области и Ставропольском крае в клещах рода Dermacentor в 2001 году генотипировали R. slovaca [54]. В 1969 году д.м.н. М.С. Шайманом в Мокроусовском районе Курганской области из клещей D. marginatus выделен штамм R. slovaca (штамм "Карпунино 19/69"), идентифицированный спустя 34 года С.Н. Шпыновым [51]. Наиболее распространенными в клещах рода Dermacentor риккетсиями в России оказались генотипы R. raoultii и R. slovaca.

В Ставропольском крае в клещах Hyalomma marginatum marginatum генотипирована R. aeschlimannii [15, 55].

В Хабаровском крае выявлены заболевания, вызванные R. heilongjiangensis [92]. Циркуляция этого возбудителя установлена на ряде удаленных друг от друга территорий Сибири и Дальнего Востока (Алтайский, Красноярский, Хабаровский и Приморский края), основным вектором являются клещи Haemaphysalis concinna [59, 92, 111].

В Омской области в клещах Ixodes persulcatus выявлены R. helvetica -подобные риккетсии, а в Пермском крае установлена этиологическая роль R. helvetica в развитии острых лихорадочных заболеваний [47].

На территории Южного Урала, Западной и Восточной Сибири в клещах Ixodes persulcatus обнаружен генотип, на 98%-96% гомологичный генотипу R. canadensis, который в последующем получил название Candidatus Rickettsia tarasevichiae [99].

В одних и тех же видах переносчиков выявлены различные виды патогенных для человека риккетсий: в H. concinna - R. sibirica subsp. sibirica и R. heilongjiangensis, в D. marginatus - R. sibirica subsp. sibirica и R. slovaca, в I. persulcatus - R. sibirica subsp. sibirica и R. helvetica.

В зависимости от этиологического агента и особенностей пациента (генетических, физиологических, физических) будет варьировать клиническая симптоматика. Инкубационный период в среднем длится 14 дней после укуса клеща. После могут появится неспецифические симптомы: повышение температуры, головная боль, недомогание и тошнота. На месте присасывания клеща первичный аффект, по внешнему виду представляет собой плотный инфильтрированный участок кожи коричневого или бурого цвета с некротическим участком или западающей язвочкой в центре, покрытой тёмно-коричневой корочкой. Ещё один симптом - сыпь, встречающийся в 98,2%, характер и локализация которой зависит от вида риккетсий. По форме полиморфная, состоящая из розеол и папул, до петехиальной. Наряду с сыпью встречается воспаление регионарных лимфоузлов, проявление которого так же отличается при различных риккетсиозах [71].

Клиническая картина сибирского клещевого тифа проявляется лихорадкой, первичным аффектом на месте присасывания клеща, регионарным лимфаденитом, розеолёзно-папулёзной полиморфной сыпью, относительной

доброкачественностью течения. Преимущественно поражаются сосуды кожи, деструкция эндотелиальных клеток которых менее выражена [75].

Астраханская пятнистая лихорадка клинически не отличается от марсельской лихорадки. В клинической картине АПЛ преобладают формы средней тяжести, лихорадка, выраженный токсикоз, первичный эффект выявлялся редко и с трудом, отмечается выраженная пятнисто-розеолёзно-папулёзная или геморрагическая сыпь [80].

1.4 Методы лабораторной диагностики клещевых риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки

Лабораторная диагностика клещевых риккетсиозов группы КПЛ включает в себя микробиологическую диагностику (выделение штаммов риккетсий и определение их принадлежности к группе КПЛ), серологическую диагностику (определение антигенов и выявление антител к риккетсиям соответствующих видов) и молекулярно-биологическую диагностику (выявление ДНК и молекулярная идентификация выделенных штаммов). Все исследования по выделению из клинических образцов проводят в лабораториях, имеющих санитарно-эпидемиологическое заключение и лицензию на работу с микроорганизмами II-III групп патогенности. Материалом для исследования на риккетсии группы КПЛ являются: кровь и биоптат с места присасывания клеща от больных и подозрительных на заболевание людей, трупный материал (кровь, экссудаты, кусочки органов), полевой материал (переносчики, органы мелких млекопитающих) [45, 46, 66].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Штрек Сергей Владимирович, 2020 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Актуальные аспекты изучения Candidatus Rickettsia tarasevichiae / Н.В. Рудаков [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2015. - № 6. - С. 14-19.

2. Актуальные аспекты изучения биоразнообразия риккетсий / Н.В. Рудаков [и др.] // KazNU Bulletin. Ecology series. - 2014. - № 1/1. - С. 383-386.

3. Антонов, Н.И. Сыпная клещевая лихорадка в ДВК / Н.И. Антонов, А.Г. Найштадт // Дальневосточный медицинский журнал. - 1936. -№5. -С. 77-86.

4. Апробация иммуноферментного анализа для серологической диагностики инфекций, вызываемых риккетсиями группы клещевой пятнистой лихорадки / Н.В. Абрамова [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. -2010. - № 1(50). - С. 17-21.

5. Архангельский Д.С. Некоторые вопросы этиологии и эпидемиологии клещевого риккетсиоза в Алма-Атинской области / Д.С. Архангельский // Изв. АН КазССР. Сер. Физиология и медицина. -1956. -№7. -С. 14-20.

6. Бартошевич Е.Н. О клещевом сыпном тифе в Казахстане / Е.Н. Бартошевич // Известия академии наук КазССР. - 1954. - № 2. - С. 87-91.

7. Бедлинская Н.Р. Роль функциональной активности тромбоцитов и фагоцитов крови в патогенезе астраханской риккетсиозной лихорадки: дис. ... канд. мед. наук / Бедлинская Надия Руслановна; Астраханская гос. мед. акад. -Астрахань, 2017. - 156 с.

8. Бердыев А. Экология иксодовых клещей Туркменистана и их роль в эпизоотологии природно-очаговых болезней / А. Бердыев. - Ашхабад, 1980. - 278 с.

9. Бесхлебова О.В. Лабораторная диагностика клещевых инфекций с природной очаговостью (клещевой риккетсиоз, иксодовый клещевой боррелиоз) / О.В. Бесхлебова, В.М. Гранитов, В.Г. Дедков // Бюллетень медицинской науки. -2017. - № 4 (8). -С. 50-54.

10. Вощакина Н.В. Дикие мелкие млекопитающие и клещи - резервуары риккетсий клещевого сыпного тифа Северной Азии в лесостепи Западно-

Сибирской низменности / Н.В. Вощакина // Материалы 10 совещания по паразитологическим проблемам и болезням. -М.-Л., 1959. -№1. -С. 84-86.

11. Вощакина Н.В. Материалы к характеристике вновь выявленного очага клещевого риккетсиоза в Армизонском районе Тюменской области / Н.В. Вощакина, М.С. Шайман // Труды Омского института эпидемиологии, микробиологии и гигиены. -Т. 5. - Омск, 1950. - С. 55-60.

12. Встречаемость и молекулярно-биологическая характеристика риккетсий из природных очагов Западной Сибири и Северного Урала / М.Ю. Карташов [и др.] // Молекулярная диагностика. Сборник трудов. Под редакцией В.И. Покровского. -2014. -С. 490-491.

13. Высокоэффективная детекция ДНК риккетсий методом ПЦР в реальном времени / М.Ю. Карташов [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. -2015. - Т. 60, № 12. -С. 39-43.

14. Выявление возбудителей клещевого риккетсиоза в клещах и крови пациентов на Дальнем Востоке с помощью ПЦР-анализа в режиме реального времени / Е.И. Бондаренко [и др.] // Поликлиника. - 2014. - № 4-1. -С. 44-48.

15. Выявление геноварианта Rickettsia aeschlimannii в клещах Hyalomma marginatum marginatum, собранных в очаге Крымской-Конго геморрагической лихорадки в Ставропольском крае / С.Н. Шпынов [и др.] // Омский научный вестник. - 2006. - № S1. - С. 101-103.

16. Выявление ДНК R. raoultii и R. sibirica в крови и ликворе пациентов в Западной Сибири / Я.П. Иголкина [и др.] // Национальные приоритеты России. -2016. - №4 (22). - С. 85-88.

17. Выявление нового очага клещевого риккетсиоза в Западной Сибири / И.Е. Самойленко [и др.] // ЗНиСО. - 2012. - № 1. - С. 14-15.

18. Выявление новых генотипов риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки на юге Урала, в Сибири, на Дальнем Востоке и в Казахстане / С.Н. Шпынов [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2005. - №1. - С. 23.

19. Галимзянов Х.М. Астраханская риккетсиозная лихорадка: Клиника, диагностика, лечение: автореф. дис. ... д-ра мед. наук. / Галимзянов Халил Мингалиевич; Астраханская гос. мед. акад. -Астрахань, 1997. - 38 с.

20. Генотипирование изолятов риккетсий, циркулирующих на территории полуострова Крым / М.Ю. Карташов [и др.] // Молекулярная генетика, микробиология и вирусологи. - 2018. - № 2(36). - С. 84-88.

21. Голиневич Е.М. К систематике возбудителей клещевых риккетсиозов / Е.М. Голиневич // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -1949. - № 10. - С. 28-36.

22. ГОСТ Р 53022.3-2008 "Требования к качеству клинических лабораторных исследований. Часть 3" от 18 декабря 2008 № 557-ст // Правила оценки клинической информативности лабораторных тестов. 2008 г.

23. Далматов В.В. Социально-гигиенический мониторинг в системе управления здоровьем населения / В.В. Долматов, В.Л. Стасенко, Т.М. Обухова // Материалы IV межрегиональной научно-практической конференции с международным участием, посвященная 60-летию кафедры эпидемиологии и 80-летию кафедры микробиологии Омской государственной медицинской академии. -2003. - С. 102-111.

24. Еремеева М.Е. Современные подходы к лабораторной диагностике риккетсиозов / М.Е. Еремеева, С.Н. Шпынов, Н.К. Токаревич // Инфекция и иммунитет. - 2014. - Т.4, №2. - С. 113-134.

25. Жмаева З. М. Эпидемиологическое значение клеща H. ConcinnaKoch. как нового для науки переносчика клещевого сыпного тифа в Приморской области / З.М. Жмаева // Вопр. краевой общей и эксперимент. паразитологии. - 1948. - № 5. -С. 39-45.

26. Здродовский П.Ф. Учение о риккетсиях и риккетсиозах / П.Ф. Здродовский, Е.М. Голиневич. - Москва, 1956. - 440 с.

27. Изучение биологических свойств риккетсий в культуре клеток / Л.В. Кумпан [и др.] // Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири: матер. 7 межрегионая науч.-практ. конференция с международным

участием, посвящённая 70-летию медико-профилактического. ф-та ОмГМА. -Омск, 2008. - Т.2. - С. 184-190.

28. Инструкция по применению колонок гель-фильтрующих для очистки продуктов секвенирования «Centri-Sep spin». - 4 с.

29. Инструкция по применению комплекта реагентов для экстракции РНК/ДНК из клинического материала «АмплиПрайм РИБО-преп». - 2012. - 9 с.

30. Инструкция по применению набора реагентов для выделения нуклеиновых кислот из клинических образцов «РеалБест экстракция 100». - 2012. -18 с.

31. Карулин Б.Е. Теплокровные животные - носители возбудителя клещевого сыпного тифа Северной Азии / Б.Е. Карулин, А.А. Пчелкина // Доклад академии наук СССР. - 1958. - Т. 120, № 1. - С. 223-224.

32. Киреева Р.Я. Клинико-лабораторная характеристика североазиатского клещевого сыпного тифа по материалам клиники инфекционных болезней Хабаровского медицинского института за 1938-1957 гг.: дис. ... канд. мед. наук / Р. Я. Киреева; -Хабаровск, 1958. -221 с.

33. Клещевой риккетсиоз у детей Иркутской области за период пяти эпидемических сезонов / К.В. Сидорова [и др.] // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. -2016. - Т.1, - № 5(111). - С. 49-53.

34. Коломеец А.Н. Молекулярно-генетические подходы к микробиологическому мониторингу в системе эпидемиологического надзора за риккетсиозами группы клещевой пятнистой лихорадки и бартонеллёзами: дис. ... кан. мед. наук / Коломеец Анна Николаевна; Омская гос. Мед. академия. - Омск, 2009. - 315 с.

35. Колпаков С.Л. О методологии оценки эпидемиологической ситуации / С.Л. Колпаков, А.А. Яковлев // Эпидемиология и инфекционные болезни. - Т.20, -№ 4. - С. 34-39.

36. Коршунова О.С. О природных очагах клещевого сыпного тифа Азии в Хакасии и центральной части Западного Саяна / О.С. Коршунова, С.П. Пионтковская, Н.А. Никитина // Зоол. журн. - 1959. - Т. 38, № 3. - С. 385-393.

37. Космачевский В.В. О весенне-летнем (клещевом) сыпном тифе / В.В. Космачевский // Сборник работ Минского мед. ин-та. - Минск, 1949. - Выпуск 2. - С. 186-187.

38. Кронтовская М.К. Клещевой сыпной тиф на Востоке СССР / М.К. Кронтовская, Е.П. Савицкая // Советская медицина. - 1946. - № 12. - С. 15-17.

39. Кулагин С.М. Клещевой сыпной тиф в Алтайском крае / С.М. Кулагин; дис. ... д-ра мед. наук. - М., 1953. - 859 с.

40. Кулагин С.М. Обнаруженный очаг клещевого сыпного тифа в Алтайском крае / С.М. Кулагин, О.С. Коршунова, Н.И. Алфеев // Новости медицины. - 1947. -№ 5. - С. 26-28.

41. Кумпан Л.В. Применение культур клеток для мониторинга природных очагов клещевых риккетсиозов: дис. ... кан. мед. наук / Кумпан Людмила Валерьевна; Омская гос. Мед. академия. - Омск, 2006. - 80 с.

42. Макарова В.А. Выделение штаммов риккетсий астраханской пятнистой лихорадки из клещей Rh. pumШo / В.А. Макарова, Н.Ф. Фетисова, И.В. Тарасевич // Вопросы риккетсиологии: сб. науч. тр. - М., 1994. - С. 70-73.

43. Макарова В.А. Предварительные результаты изучения заболеваний группы клещевой пятнистой лихорадки в Астраханской области / В.А. Макарова, И.В. Тарасевич // Вопросы риккетсиологии: матер. IV Все - союз. конф. - М., 1989. - С.75-77.

44. Мастеница М.А. Вирусологическая характеристика клещевого сыпного тифа Кемеровской области / М.А. Мастеница // Труды Томского НИИ эпидемиологии и микробиологии. - Томск, 1949. - Т.4. - С. 38-48.

45. Методические рекомендации. Эпидемиологический надзор за клещевым риккетсиозом. Иммунодиагностика заболевания и методы выявления возбудителя, утв. Минздравом СССР 22.10.91.

46. Методические указания 3.1.1755-03 «Организация эпидемиологического надзора за клещевым риккетсиозом». Москва: Федеральный центр госсанэпиднадзора России; 2004.

47. Микроорганизмы порядка Rickettsials у таежного клеща (Ixodes persulcatus sch.) в Предуралье / В.В. Нефедова [и др.] // Вестник РАМН. - 2008. - № 7. - С. 47-50.

48. Миль Е.И. Клещевая лихорадка в Приморье / Е.И. Милль // Дальневосточный медицинский журнал. - 1936. - № 3. - С. 54.

49. Молекулярная эпидемиология риккетсий и риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки в России и Казахстане / Н.В. Рудаков [и др.] // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2014. - № 25. - С. 28-30.

50. Молекулярно-генетический анализ риккетсий, переносимых клещами Ixodes persulcatus schulze на территории юга Западной Сибири и Дальнего Востока / Я.П. Иголкина [и др.] // Национальные приоритеты России. - 2014. - № 3(13). - С. 100-103.

51. Молекулярно-генетическое изучение штаммов риккетсий группы КПЛ, изолированных в очагах клещевого риккетсиоза / С.Н. Шпынов [и др.] // Актуальные проблемы обеспечения сан.-эпид. благополучия населения. - Омск, 2003. - Т.1. - С.168-173.

52. Молекулярное типирование риккетсий, анаплазм и эрлихий в иксодовых клещах в РФ и Республике Казахстан / С.Н. Шпынов [и др.] // Здоровье населения и среда обитания. - 2012. - № 1. - С. 33-35.

53. Новые данные о патогенности R. sibirica subsp. BJ90 / Н.В. Рудаков [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2014. - № 5. - С. 10-13.

54. Новые данные о распространении Rickettsia slovaca в Евразии / С.Н. Шпынов [и др.] // Природно-очаговые болезни человека: республ. сб. науч. раб., посвящ. 80-летию Омского НИИПИ. - Омск, 2001. - С. 80-83.

55. Новые методические подходы к изучению Rickettsiales / Н.В. Рудаков [и др.] // Уральский медицинский журнал. - 2006. - № 2. - С.16-18.

56. О роли Rickettsia raoultii в эпидемиологии клещевых риккетсиозов в России / Н.В. Рудаков [и др.] // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. - 2015. - № 3. - С. 17-21.

57. Обнаружение ДНК риккетсии Rickettsia helvetica и candidatus R. tarasevichiae в таёжных клещах, собранных на северо-востоке Европейской части России (Республика Коми) / М.Ю. Карташов [и др.] // Мат. XI съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - Москва, 2017. - С. 208.

58. Особенности эпидемической ситуации по сибирскому клещевому тифу и другим клещевым риккетсиозам в Российской Федерации, прогноз на 2019 г. / Н.В. Рудаков [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. - 2019. - № 1. - С. 8997.

59. Первое выявление Rickettsia heilongjangensis в клещах Haemaphisalis concinna в России / С.Н. Шпынов [и др.] // ЗНиСО. - 2003. - № 12(129). - С. 16-20.

60. Петряев Е.Д. Клещевой сыпной тиф в Забайкалье / Е.Д. Петряев // Мед. паразитология и паразитарные болезни. - 1946. - № 2. - С. 84-85.

61. Пионтковская С.П. О природном очаге клещевого сыпного тифа Азии в Тувинской автономной области / С.П. Пионтковская, О.С. Коршунова, Н.К. Мищенко // Десятое совещание по паразитологии и природно-очаговым болезням. - М.-Л., 1959. - № 1. - С. 92-93.

62. Платонов Н.В. Материалы к изучению эпидемиологии клещевого сыпного тифа в Новосибирской области / Н.В. Платонов // Тез. докл. конф. Новосиб. мед. ин-та и ин-та усовершенствования врачей. - Новосибирск, 1948. - С. 81-84.

63. Плецитый Д.Ф. Клещ D. silvarum как переносчик клещевого сыпного тифа в Западной Сибири / Д.Ф. Плецитый // Доклад академии наук СССР, 1947. -Т.55, №9. -С. 889-891.

64. Получение и экспериментальное изучение антигенов клещевых а -протеобактерий / Л.В. Кумпан [и др.] // Здоровье населения и среда обитания. -2014. -№12. -С. 36-39.

65. Применение методов математической статистики при проведении эпидемиологического анализа / ред. В.В. Далматов, Р.Н. Готвальд, В.Л. Стасенко. - Омск, 2002. - С. 3-80.

66. Профилактика клещевых риккетсиозов: методические указания / Рудаков Н.В. [и др.]; Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций. - Омск, 2014. - 42 с.

67. Пчелкина А.А. О сочетанных очагах Ку-риккетсиоза и клещевого сыпного тифа Северной Азии на территории Туркмении / А.А. Пчелкина [и др.] // Здравоохранение Туркменистана. - 1968. - № 12. - С. 18-22.

68. Ретроспективная серологическая диагностика риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки на территории высокого риска инфицирования Rickettsia conorii subsp. Caspia / Т.А. Чеканова [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2019. - № 64(6). - С. 354-359.

69. Рудаков Н.В. Алгоритмы выявления риккетсий в лабораторной диагностике риккетсиозов группы КПЛ в России / Н.В. Рудаков, И.Е. Самойленко, Л.В. Кумпан // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2015. - Т.14. - № 2. - С. 69.

70. Рудаков Н.В. Влияние патогенетических закономерностей инфекционного процесса на общность клинических и эпидемиологических проявлений клещевых риккетсиозов / Н.В. Рудаков // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2015. - № 3. - С. 68-71.

71. Рудаков Н.В. Клещевой риккетсиоз / Н.В. Рудаков, А.С. Оберт. - Омск, 2001. - 120 с.

72. Рудаков Н.В. Представители порядка Rickettsiales: учеб. пособие / Н.В. Рудаков. - Омск: Изд-во ОмГМА, 2007. - 76 с.

73. Рудаков Н.В. Проблемы лабораторной диагностики риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки в России / Н.В. Рудаков, И.Е. Самойленко, Т.А. Решетникова // Клиническая лабораторная диагностика, - 2015. - Т. 60, № 1. -С. 50-52.

74. Рудаков Н.В. Риккетсии и риккетсиозы группы клещевой пятнистой лихорадки в Сибири / Н.В. Рудаков [и др.]. - Омск, 2012. - 288 с.

75. Рудаков Н.В. Риккетсии и риккетсиозы: руководство для врачей / Н.В. Рудаков // ФБУН "Омский НИИ природно-очаговых инфекций" Роспотребнадзора. - Омск, 2016. - 424 с.

76. Рудаков Н.В. Эволюция учения о природной очаговости болезней человека / Н.В. Рудаков, В.К. Ястребов // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2014. - № 4: - С. 4 -38.

77. Савицкая, Е. П. К этиологии клещевого сыпного тифа в Хабаровском крае / Е.П. Савицкая // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -1943. - № 10 - 11. - С. 87.

78. Самойленко И.Е. Использование микрокультур клеток для культивирования R. sibirica / И.Е. Самойленко, Н.В. Рудаков // Вопросы риккетсиологии: сб. науч. тр. - М., 1994. - С. 83-86.

79. Сравнительный анализ ПЦР- и ИФА-методов в лабораторной диагностике риккетсиозов группы КПЛ на примере трехлетних исследований в республике Алтай и Хабаровском крае / Я.Е. Григорьева [и др.] // Молекулярная диагностика 2017. Том 2. - С. 192-194.

80. Тарасевич И.В. Астраханская пятнистая лихорадка / И.В. Тарасевич // Медицина. - М., 2002. -423 с.

81. Феоктистов Г.И. Клещевой сыпной тиф в Иркутской области / Г.И. Феоктистов // Мед. бюллетень. - Иркутск, 1948. - С. 196-202.

82. Филиппова, Н. А. Фауна СССР / Н. А. Филиппова. - Т. IV, вып. 4: Паукообразные. - Л.: Наука, 1977. - С. 396.

83. Флетчер Р. Клиническая эпидемиология. Основы доказательной медицины / Р. Флетчер, С. Флетчер, Э. Вагнер. - Москва, 1998. - 352 с.

84. Характеристика природного очага клещевого риккетсиоза на юге Средней Азии / З.М. Жмаева [и др.] // Природная очаговость болезней человека и краевая эпидемиология. - М., 1955. - С. 225-235.

85. Цыганков Г.М. Клиника дальневосточного клещевого сыпного тифа / Г.М. Цыганков // Клиническая медицина. - 1948. - № 6. - С. 69-76.

86. Шматиков М.Д. Клещевая сыпная лихорадка / М.Д. Шматиков, М.А. Велик // Клиническая медицина. - 1939. № 17. - С. 124-126.

87. Шпынов С.Н. Генотипирование риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки, выявленных в России и Казахстане / С.Н. Шпынов // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. - М., 2003. - № 3. - С. 20-24

88. Шпынов С.Н. Выявление новых генотипов риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки на юге Урала, в Сибири, на Дальнем Востоке и в Казахстане / С.Н. Шпынов // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2005. - № 1. - С. 2327.

89. Щучинова Л.Д. Принципы лабораторной диагностики клещевых инфекций в республике Алтай / Л.Д. Щучинова // ЗНИСО. - 2012. - № 9(234). - С. 34-34.

90. Якименко В.В. Иксодовые клещи Западной Сибири: фауна, экология, основные методы исследования / В.В. Якименко, М.Г. Малькова, С.Н. Шпынов. -Омск, 2013. - 240 с.

91. A protective protein antigen of Rickettsia rickettsii has tandemly repeated, near-identical sequences / B.E. Anderson [et al.] // Infect. Immun. - 1990. - Vol.58. - P. 2760-2769.

92. Acute tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis in Russian Far East / O.Y. Mediannikov [et al.] // Emerg Infect Dis. - 2004. - № 10(5). - P. 810-817.

93. Angelakis E. Rickettsia and Rickettsia-Like Organisms / E. Angelakis, D. Raoult // Clinical Microbiology: Bacteria. - 2017. - P. 1667-75.

94. Astrakhan fever rickettsia: antigenic and genotypic analysis of isolates obtained from human and Rhipicephalus pumilio ticks / M.E. Eremeeva [et al.] // Am. J. Trop. Med. Hyg. - 1994. - Vol.51. - P. 697-706.

95. Beati L. Rickettsia massiliae sp. nov., a new spotted fever group rickettsia / L. Beati, D. Raoult // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1993. - № 43. - P. 839-840.

96. Bell E.J. Immunologic relationships among the spotted fever group of rockettsias determined by toxin neutralization tests in mice with convalescent animal serums / E.J. Bell, H.G. Stoenner // J. Immunol. - 1960. - Vol.84. - P. 174-182.

97. BigDye™ Terminator vl.1 Cycle Sequencing Kit User guide / Publication Number 4337036 Revision B. - 48 p.

98. Brumpt E. Longevite du virus de la fievre boutonneuse (Rickettsia conori, n. sp.) chez la Tique, Rhipicephalus sanguineus / E. Brumpt // Comptes Rendus des Séances de la Société de Biologie Filiales. - 1932. - № 110. - P. 1199-1202

99. Candidatus Rickettsia tarasevichiae in Ixodes persulcatus ticks collected in Russia / S. Shpynov [et al.] // Ann. NY Acad. Sci. - 2003. - Vol.990. - P. 162-172.

100. Candidatus Rickettsia tarasevichiae Infection in Eastern Central China: A Case Series / W. Liu [et al.] // Annals of Internal Medicine. - 2016. - Vol.146, № 10. -P. 641-8.

101. Characterization of the gene encoding the protective paracrystalline-surface-layer protein of Rickettsia prowazekii: presence of a truncated identical homolog in Rickettsia typhi / M. Carl [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1990. - Vol.87. - P. 8237-8241.

102. Citrate synthase gene comparison, a new tool for phylogenetic analysis, and its application for the Rickettsiae / V. Roux [et al.] // J. Syst. Bacteriol. - 1997. - Vol.47. - P. 252-261.

103. Comparison of serologic typing, sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis protein analysis, and genetic restriction fragment length polymorphism analysis for identification of rickettsiae: characterization of two new rickettsial strains / L. Beati [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1992. - Vol.30. - P. 1922-30.

104. Confirmation that Rickettsia helvetica sp. nov. is a distinct species of the spotted fever group of Rickettsiae / L. Beati [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1993. - № 43. - P. 521-526.

105. Cox H.R. Cultivation of rickettsiae of the rocky mountain spotted fever, typhus and Q fever groups in the embryonic tissues of developing chicks / H.R. Cox // Science. - 1941. - № 94(2444). - P. 399-403.

106. Cox H.R. Growth of viruses and rickettsiae in the developing chick embryo / H.R. Cox // Ann. N Y Acad. Sci. - 1952. - Vol.55, № 2. - P. 236-247.

107. Da Rocha-Lima H. Zur Aetiologie des Fleckfeibers / H. da Rocha-Lima // Berliner Klinische Wochenschrift. - 1916. - № 53. - P. 567-569.

108. Detection and genetic characterization of a wide range of infectious agents in Ixodes pavlovskyi ticks in Western Siberia / V. Rar [et al.] // Parasit & Vectors. - 2017.

- Vol.10 (258). - №1.

109. Detection of Members of the Genera Rickettsia, Anaplasma and Rhrlichia in Ticks Collected in the Asiatic Part of Russia / S. Shpynov [et al.] // Ann. N.Y. Acad. Sci.

- 2006. - Vol.1087. - P. 378-383.

110. Detection of Rickettsia aeschlimannii in Hyalomma marginatum ticks in western Russia / S. Shpynov [et al.] // Clinical, microbiology and infection. - 2009. - № 2(17). - P. 215-316

111. Detection of Rickettsia Closely Related to Rickettsia aeschlimannii, "Rickettsia heilongjiangensis", Rickettsia sp. Strain RpA4, and Ehrlichia muris in Ticks Collected in Russia and Kazakhstan / S. Shpynov [et al.] // Journal of Clinical microbiology. - 2004. - Vol.42, № 5. - P. 2221-2223.

112. Diop A. Rickettsial genomics and the paradigm of genome reduction associated with increased virulence // A. Diop, D. Raoult, P.E. Fournier // Microbes and Infection. - 2018. - № 20. - P. 401-9.

113. Diversity of spotted fever group Rickettsia infection in hard ticks from Suifenhe, Chinese-Russian border / C. Cheng [et al.] // Ticks Tick Borne Diseases. -2016. - № 7. - P. 715-9.

114. Elghetany M.T. Hemostatic changes in Rocky Mountain spotted fever and Mediterranean spotted fever / M.T. Elghetany, D.H. Walker // Am. J. Clin. Pathol. - 1999.

- № 112(2). - P. 159-68.

115. Fournier P.E. Phylogenetic analysis of spotted fever group rickettsiae by study of the outer surface protein rOmpA / P.E. Fournier, V. Roux, D. Raoult // Int J. Syst. Bacteriol. - 1998. - № 48. - P. 839-49.

116. Gene Sequence Based Criteria for Identification of New Rickettsia Isolates and Description of Rickettsia heilonjiangensis sp. nov. / P.-E.Fournier [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2003. - Vol. 41, № 12. - P. 5456-5465.

117. Genetic variability of Rickettsia spp. in Dermacentor and Haemaphysalis ticks from the Russian Far East / Y. Igolkina [et al.] // Ticks and Tick-borne Diseases. -2018. - №9. - P. 1594-1603.

118. Genetic variability of Rickettsia spp. in Ixodes persulcatus/Ixodes trianguliceps sympatric areas from Western Siberia, Russia: Identification of a new Candidatus Rickettsia species / Y. Igolkina [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. -2015. - № 34. - P.88-93.

119. Genome Sequence of the Tick-Borne Pathogen Rickettsia raoultii / K.E. Karkouri [et al.] // Genome Announcements. - 2016. - № 4. - P. 1-2.

120. Genotype characterization of the bacterium expressing the male-killing trait in the ladybird beetle Adalia bipunctata with specific rickettsial molecular tools / N.M. Balayeva [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 1995. - Vol.61. - P. 1431-1447.

121. Genotypic and antigenic identification of two new strains of spotted fever group rickettsiae isolated from China / X. Yu [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. - 1993. -Vol.31. - P. 83-8.

122. Genotypic evaluation of rickettsial isolates recovered of various species of ticks in Portugal / F. Bacellar [et al.] // Epidemiol. Infect. - 1995. - Vol.114. - P. 169178.

123. Guidelines for the diagnosis of tick-borne bacterial diseases in Europe / P. Brouqui [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2004. - № 10(12). - P. 1108-32.

124. Huebner R.J. Rickettsialpox, newly recognized rickettsial disease. Isolation of a rickettsia apparently identical with the causative agent of Rickettsialpox from Allodermanyssus sanguineus, a rodent mite / R.J. Huebner, W.L. Jellison, C. Pomerantz // Public Health Report. - 1946. - № 61. - P. 1677-1682.

125. Human infection with Candidatus Rickettsia tarasevichiae / N. Jia [et al.] // New england journal of medicine. - 2013. - Vol.369, № 12. - P. 1178-1180.

126. Isolation and characterization of a novel Rickettsia species (Rickettsia asembonensis sp. nov.) obtained from cat fleas (Ctenocephalides felis) / A.N. Maina [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2016. - № 66. - P. 4512-4517.

127. Isolation of Rickettsia akari from eschars of patients with rickettsialpox / C.D. Paddock [et al.] // Am. J. Trop. Meg. Hyg. - 2006. - Vol.75, № 4. - P. 732-738.

128. La Scola B. Laboratory Diagnosis of Rickettsioses: Current Approaches to Diagnosis of Old and New Rickettsial Diseases / B. la Scola, D. Raoult // Journal of Clinical Microbiology. - 1997. - Vol. 35, № 11. - P. 2715-2727.

129. Mckiel J.A. Rickettsia canada: A new member of the typhus group of rickettsiae isolated from Haemaphysalis leporispalustris ticks in Canada / J.A. Mckiel, E.J. Bell, D.B. Lackmann // Canadian Journal of Microbiology. - 1967. - № 13. - P. 503510.

130. Microimmunofluorescence test for the serological study of Rocky Mountain spotted fever and typhus / R.N. Philip [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1976. - Vol.3, № 1. -P. 51-61.

131. Molecular prevalence of spotted fever group rickettsiae in ticks from Qinghai Province, northwestern China / R. Han [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2018. - № 57. - P. 1-7.

132. Neglected aspects of tick-borne rickettsioses / L. Tomassone [et al.] // Parasit Vectors. - 2018. - № 11(1):263.

133. New approaches in the systematics of rickettsiae / S.N. Shpynov [et al.] // New Microbes New Infections. - 2018. - № 23. - P. 93-102.

134. New Rickettsiae in ticks collected in territories of the former soviet union / E. Rydkina [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 1999. - Vol.5, № 6. - P. 811-814.

135. No visible dental staining in children treated with doxycycline for suspected Rocky Mountain Spotted Fever / S.R. Todd [et al.] // J. Pediatrics. - 2015. - Vol.166, № 5. - P. 1246-51.

136. Nucleotide sequence of the Ricketsia prowazekii citrate synthase gene / D.O. Wood [et al.] // J. Bacteriol. - 1987. - Vol.169. - P. 3564-3572.

137. Parola P. Tick-Borne Rickettsioses around the World: Emerging Diseases Challenging Old Concepts / P. Parola, C. D. Paddock, D. Raoult // Clinical Microbiology Reviews. - 2005. - Vol.18, № 4. - P. 719-756.

138. Philip C.B. Miscellaneous human rickettsioses / C.B. Philip // In: Communicable Diseases, Lea and Febiger Co. - Philadelphia, 1950. - P. 781-788.

139. Proposal to create subspecies of Rickettsia conorii based on multi-locus sequence typing and an emended description of Rickettsia conorii / Y. Zhu [et al.] // BMC Microbiol. - 2005. - Vol.5. - P. 11.

140. Proteinic and Genomic Identification of Spotted Fever Group Rickettsiae Isolated in the Former USSR / M.E.Eremeeva [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 1993. - Vol. 31, № 10. - P.2625-2633.

141. Raoult D. Rickettsioses as Paradigms of New or Emerging Infectious Diseases / D. Raoult, V. Roux // Clinical Microbiology Reviews. - 1997. - № 10(4). - P. 694-719.

142. Renaud C. Human Parechovirus 3: The most common viral cause of meningoencephalitis in young infants / C. Renaud, C.J. Harrison // Infectious Disease Clinics of North America. - 2015. - № 29. - P. 415-28.

143. Rickettsia aeschlimannii sp. nov., a new spotted fever group rickettsia associated with Hyalomma marginatum ticks / L. Beati [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. -1997. - № 47. - P. 548-554.

144. Rickettsia africae sp. nov., the etiological agent of African tick bite fever / P.J. Kelly [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1996. - № 46. - P. 611-614.

145. Rickettsia amblyommatis sp. nov., a spotted fever group Rickettsia associated with multiple species of Amblyomma ticks in North, Central and South America / S.E. Karpathy [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2016. - № 66. - P. 523643.

146. Rickettsia asiatica sp. nov., isolated in Japan / H. Fujita [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2006. - № 56. - P. 2365-2368.

147. Rickettsia bellii sp. nov.: a tick-borne rickettsia, widely distributed in the United States, that is distinct from the spotted fever and typhus biogroups / R.N. Philip [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1983. - № 33. - P. 94-106.

148. Rickettsia buchneri sp. nov., a rickettsial endosymbiont of the blacklegged tick Ixodes scapularis / T.J. Kurtti [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2015. - № 65. - P. 965-70.

149. Rickettsia felis: molecular characterization of a new member of the spotted fever group / D.H. Bouyer [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2001. - № 51. - P. 339347.

150. Rickettsia gravesii sp. nov.: a novel spotted fever group rickettsia in Western Australian Amblyomma triguttatum triguttatum ticks / M.Y. Abdad [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2017. - № 67. - P. 3156-3161.

151. Rickettsia honei sp. nov., the aetiological agent of Flinders Island spotted fever in Australia / J. Stenos [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1998. - № 48. - P. 13991404.

152. Rickettsia hoogstraalii sp. nov., isolated from hard- and soft-bodied ticks / D. Duh [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2010. - № 60. - P. 977-984.

153. Rickettsia japonica sp. nov., the etiological agent of spotted fever group rickettsiosis in Japan / T. Uchida [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1992. - № 42. - P. 303305.

154. Rickettsia peacockii sp. nov., a new species infecting wood ticks, Dermacentor andersoni, in Western Montana / M.L. Niebylski [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1997. - № 47. - P. 446-452.

155. Rickettsia raoultii sp. nov., a spotted fever group rickettsia associated with Dermacentor ticks in Europe and Russia / O. Mediannikov [et al.] // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2008. - Vol.58, № 7. - P. 1635-1639.

156. Rickettsia sibirica mongolitimonae human infection: A diagnostic challenge / P. Rajoelison [et al.] // Travel Medicine and Infectious Disease. - 2018. - № 26. - P. 723.

157. Rickettsia slovaca and R. raoultii in Tick-borne Rickettsioses. / P. Parola [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2009. - Vol.15, № 7. - P. 1105-1108.

158. Rickettsia slovaca infection DEBOTEL/TIBOLA / V. Ibarra [et al.] // Ann. N.Y. Acad. Sci. - 2006. - Vol. 1087. - P. 206-214.

159. Rickettsia slovaca sp. nov., a member of the spotted fever group rickettsiae / Z. Sekeyova [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1998. - № 48. - P. 1455-1462.

160. Rickettsia tamurae sp. nov., isolated from Amblyomma testudinarium ticks / P.-E. Fournier [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2006. - № 56. - P. 1673-1675.

161. Roux V. Differentiation of Spotted Fever Group Rickettsiae by Sequensing and Analysis of Restriction Fragment Length Polymorphism of PCR-Amplified DNA of the Gene Encoding the Protein rOmpA / V.Roux, P.-E.Fournier, D.Raoult // Journal of Clinical Microbiology. - 1996. - Vol.34, № 9. - P. 2058-2065.

162. Roux V. Phylogenetic analysis of the genus Rickettsia by 16S rDNA sequencing / V. Roux, D. Raoult // Res. Microbiol. - 1995. - Vol.146. - P. 385-396.

163. Sequence analysis of the 17-kilodalton-antigen gene from Rickettsia ricketsii / B.E. Anderson [et al.] // J. bacteriol. - 1987. - Vol.169. - P. 2385-2390.

164. Sequential changes in hematologic and biochemical parameters in African tick bite fever / M. Jensenius [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. -2003. -№9(7). -P. 678-83.

165. Seroepidemiology of Spotted Fever Rickettsiosis in Uttar Pradesh: A Prospective Study / C.D.P.Tripathi [et ai.] // Journal of Clinical and Diagnostic Research. - 2017. - № 11(6). - P. 4-9.

166. Seroprevalence of risk factors associated with rickettsiosis (Rickettsia rickettsii) in humans in Baja California, Mexico / Field-Cortazares J [et al.] // Gaceta medica de mexico. - 2015. - № 151. - P. 38-42.

167. Seroprevalence of spotted fever group and typhus group rickettsiae in individuals with acute febrile illness from Gorakhpur, India / A. Mane [et ai.] // Journal of Infectious Diseases. - 2019. - № 79. - P. 195-198.

168. Severe clinical forms of Mediterranean Spotted Fever: A case series from an endemic area in Bulgaria / M. Baymakovaa [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2016. - Vol. 53, № S. - P. 150-151.

169. Stothard D.R. Ancestral divergence of Rickettsia bellii from the spotted fever and typhus groups of Rickettsia and antiquity of the genus Rickettsia / D.R. Stothard, J.B. Clark, P.A. Fuerst // J. Syst. Bacteriol. - 1994. - Vol. 44. - P. 798-804.

170. Stothard D.R. Evolutionary analysis of the spotted fever and typhus groups of Rickettsia using 16S rRNA gene sequences / D.R. Stothard, P.A. Fuerst // Syst. Appl. Microbiol. - 1995. - Vol.18. - P. 52-61.

171. Studies of a "new" rickettsiosis "Astraktan" spotted fever / I. V. Tarasevich [et al.] // Eur. J. Epidemiol. - 1991. - № 7. - P.294-298.

172. Systemic inflammatory responses in African tick-bite fever / M. Jensenius [et al.] // J. Infect. Dis. - 2003. - № 187(8). - P. 1332-6.

173. The 120 kilodalton outer membrane protein (rOmpB) of Rickettsia rickettsii is encoded by an unusually long open reading frame. Evidence for protein processing from a large precursor / R.D. Gilmore [et al.] // Mol. Microbiol. - 1991. - Vol.5. - P. 2361-2370.

174. The Rocky Mountain spotted fever group of rickettsias / D.B. Lackman [et al.] // Health Laboratory Science. - 1965. - № 2. - P. 135-141.

175. Weiss E. Genus I. Rickettsia da Rocha-Lima 1916, 567AL (Nom. gen. cons. Opin 19, Jud. Comm. 1958, 158) / E. Weiss, J.W.Moulder // In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 1, The Williams & Wilkins Co. -Baltimore, 1984. - P. 688698.

176. Weiss E. Order I Rickettsiales, Gieszczkiewicz 1939 / E. Weiss, J. W. Moulder // Bergey's manual of systematic bacteriology. - Baltimore, 1984. - P. 687-703.

177. Wholly Rickettsia! Reconstructed Metabolic Profile of the Quintessential Bacterial Parasite of Eukaryotic Cells / T.P. Driscoll [et al.] // mBio. - 2017. - № 8(5). -p. 1-27.

178. Wisseman C.L. In vitro studies on rickettsia-host cell interactions: intracellular growth cycle of virulent and attenuated Rickettsia prowazeki in chicken embryo cells in slide chamber cultures / C.L. Wisseman, A.D. Waddell // Infecto Immun. - 1975. - № 11(6). - P. 1391-404.

179. Wolbach S.B. Note sur letiologie et lanatomie pathologique du typhus exanthématique au Mexique / S.B. Wolbach, J.L. Todd // Annales de l'Institut Pasteur. -Paris, 1920. - № 34. - P. 153-158.

180. Wolbach S.B. Studies on Rocky Mountain spotted fever / S. Wolbach // Journal of Medical Research. - 1919. - № 41. - P. 1-197

181. Zdrodovskii P.F. Rickettsiae and rickettsioses / P.F. Zdrodovskii // Academy of Medical Science. -Moscow, 1948.

СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА

1 Рисунок 1 - Схема диагностических инструментов для диагностики риккетсиозных заболеваний, передаваемых при укусе клеща, в Европе...................................................... С. 26

2 Рисунок 2 - Динамика развития клинических симптомов при риккетсиозах и рекомендуемые оптимальные сроки лабораторной диагностики................................................................................................С. 27

3 Рисунок 3 - Ранжирование федеральных округов Российской Федерации по количеству случаев в 2002-2018 гг..................... С. 46

4 Рисунок 4 - Кумулятивное количество случаев и общие закономерности чередования подъемов и спадов заболеваемости СКТ в федеральных округах Российской Федерации в 2002 -2018

гг.................................................................................. С. 47

5 Рисунок 5 - Динамика заболеваемости СКТ в Российской Федерации за период 2002-2018 гг. и прогноз на 2019 год............ С. 49

6 Рисунок 6 - Ранжирование субъектов РФ по среднемноголетним показателям заболеваемости за период 2002-2018 гг.................. С. 50

7 Рисунок 7 - Динамика заболеваемости СКТ в УФО в период 20022018 гг. и прогноз на 2019 год.............................................. С. 52

8 Рисунок 8 - Динамика заболеваемости СКТ в ДФО в период 20022018 гг. и прогноз на 2019 год............................................... С. 53

9 Рисунок 9 - Динамика заболеваемости СКТ в СФО в период 20022018 гг. и прогноз на 2019 год.............................................. С. 53

10 Рисунок 10 - Распределение значений ИАТ ^М в сыворотках крови здоровых пациентов и больных СКТ на 2-5 день (ранние сроки) и 10-14 день (поздние сроки) от начала заболевания......... С. 70

11 Рисунок 11 - Распределение значений ИАТ IgG в сыворотках крови здоровых пациентов и больных СКТ на 2-5 день (ранние сроки) и 10-14 день (поздние сроки) от начала заболевания.......... С. 71

12 Рисунок 12 - Соотношение между чувствительностью (Se) и специфичностью (Sp) серологической верификации СКТ по обнаружению антител классов M и G к риккетсиям с применением тест-системы «Rickettsia conorii ELISA IgM/IgG» (Vircell)............ С. 72

13 Рисунок 13 - Видовой состав клещей, снятых с людей в Омской области в весенне-летние периоды 2014-2016 гг....................... С. 79

14 Рисунок 14 - Динамика температуры морских свинок, зараженных суспензией из клещей D. marginatus собранных в окрестностях деревни Кисляки Называевского района............... С. 83

15 Рисунок 15 - Алгоритм серологического исследования сывороток крови от пациентов с подозрением на клещевые риккетсиозы...... С. 115

16 Таблица 1 - Данные об использованных методах и объеме исследованного материала................................................. С. 30

17 Таблица 2 - Олигонуклеотидные праймеры для обнаружения риккетсий группы КПЛ в клещах.......................................... С. 40

18 Таблица 3 - Олигонуклеотидные праймеры для обнаружения риккетсий в секционном материале....................................... С. 42

19 Таблица 4 - Заболеваемость населения СКТ на 100 тысяч населения в РФ за период с 2002 по 2018 гг............................ С. 48

20 Таблица 5 - Тенденции эпидемического процесса в федеральных округах РФ в 2002-2018 гг. и прогноз на 2019 г....................... С. 51

21 Таблица 6 - Тенденции эпидемического процесса СКТ в субъектах РФ с очень высоким и высоким уровнем заболеваемости в 2002-2018 гг............................................. С. 54

22 Таблица 7 - Тенденции эпидемического процесса СКТ в субъектах РФ с выше среднего и средним уровнем заболеваемости в 2002-2018 гг............................................. С. 55

23 Таблица 8 - Тенденции эпидемического процесса СКТ в субъектах РФ с низким уровнем заболеваемости в 2002-2018 гг... С. 56

24 Таблица 9 - Сравнительная характеристика клинико-лабораторных показателей у больных с клинической картиной клещевого риккетсиоза в зависимости от серологической верификации диагноза...................................................... С. 62

25 Таблица 10 - Диагностическая эффективность серологических методов для обнаружения антител к риккетсиям...................... С. 65

26 Таблица 11 - Частота обнаружения методом ИФА антител к антигену R. sibirica в сыворотках крови пациентов исследуемой группы и группы сравнения................................................ С. 66

27 Таблица 12 - Анализ совпадений результатов серологической верификации диагноза СКТ у больных исследуемой группы при использовании ИФА и РСК................................................. С. 67

28 Таблица 13 - Анализ совпадений результатов серологической верификации диагноза СКТ у больных исследуемой группы при использовании РНИФ с антигенами R. sibirica и R. raoultii, ИФА

и РСК........................................................................... С. 68

29 Таблица 14 - Операционные характеристики серологической верификации СКТ по выявлению IgM к риккетсиям в разные сроки от начала заболевания с применением тест-системы «Rickettsia conorii ELISA IgM/IgG» (Vircell)............................ С. 75

30 Таблица 15 - Интерпретация результатов ИФА с применением тест-системы «Rickettsia conorii ELISA IgM/IgG» (Vircell) для серологической верификации СКТ....................................... С. 77

31 Таблица 16 - Номера доступа гомологичных нуклеотидных последовательностей задепонированных в базе данных NSBI...... С. 79

32 Таблица 17 - Консенсусные нуклеотидные последовательности фрагментов генов 16S rRNA, gltA и ompB секвенированные из образца яичка морской свинки .№63....................................... С. 84

33 Таблица 18 - Консенсусные нуклеотидные последовательности фрагментов генов gltA и отрА секвенированные из штаммов «Хлебороб - 91/66» и «Георгиевка - 40/81».............................. С. 87

34 Таблица 19 - Система управления инфекционной заболеваемостью населения (эпидемиологический контроль)...... С. 93

ПРИЛОЖЕНИЯ

Приложение 1 Паспорт штамма «107/ 87 - Баево» Штамм «107/ 87 - Баево» вид R. siЫrica, был изолирован из иксодовых клещей В. ша^тМш (собранных в Алтайском крае, Баевском районе, с. Плотива). Штамм выделен на седьмом пассаже, на куриных эмбрионах в 1988г. Рудаковым Н.В.

Штамм дает хорошее накопление риккетсий при культивировании на 5-6 дневных куриных эмбрионах на 4-6 день после заражения при разведении культуры 1:20-1:100. МИДЭ соответствует разведению не менее 10-5.

При внутрибрюшинном заражении морских свинок самцов 1 мл яичной культурыв разведении до 10-4 штамм воспроизводит лихорадочную реакцию продолжительностью от двух до шести суток, с выраженным периорхитом у части животных. МИД ИД для морских свинок составляет 10-5.

Приложение 2 Паспорт штамма «7/98 - Караганда» Штамм «7/98 - Караганда» генотип ЯрА4 R. гаои1Ш, был изолирован из иксодовых клещей D. та^та^, собранных в Карагандинской области республика Казахстан. Штамм был выделен и изучен с использованием клещевой экспериментальной модели Самойленко И.Е. в 1998 г. и поступил в музей в 1999 г.

При моделировании естественного цикла метаморфоза в первом поколении переносчиков ^1) уровень трансовариальной передачи риккетсий составил 99%, уровень трансфазовой передачи - 100%. Средний уровень накопления риккетсий в голодных личинках - 7, после кровопитания личинок на сосунках белых мышей -49 риккетсий в поле зрения (тотальные мазки исследованы в МФА с поликлональными антителами к риккетсиям группы КПЛ). Средний уровень накопления риккетсий в голодных нимфах составил - 46, после кровопитания нимф - 53 риккетсий в поле зрения.

Приложение 3

Номера доступа нуклеотидных последовательностей в международной

базе данных генетических последовательностей GenBank.

Номер доступа Название

MK048467 Rickettsia sibirica subsp. sibirica isolate Hum_br citrate synthase (gltA) gene, partial cds.

MK048468 Rickettsia sibirica subsp. sibirica isolate Hum_bl citrate synthase (gltA) gene, partial cds.

MK048469 Candidatus Rickettsia tarasevichiae isolate Hum_br citrate synthase (gltA) gene, partial cds.

MK048470 Candidatus Rickettsia tarasevichiae isolate Hum_bl citrate synthase (gltA) gene, partial cds.

MK048471 Rickettsia sibirica subsp. sibirica isolate Hum_br outer membrane protein B (ompB) gene, partial cds.

MK048472 Rickettsia sibirica subsp. sibirica isolate Hum_bl outer membrane protein B (ompB) gene, partial cds.

MK048473 Candidatus Rickettsia tarasevichiae isolate Hum_br outer membrane protein B (ompB) gene, partial cds.

MK048474 Rickettsia sibirica subsp. sibirica isolate Hum_br outer membrane protein A (ompA) gene, partial cds.

MK048475 Rickettsia sibirica subsp. sibirica isolate Hum_bl outer membrane protein A (ompA) gene, partial cds.