Разработка молекулярно-биологических методов диагностики реовирусной инфекции кур и изучение изолятов, выявленных на территории Российской Федерации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.06, кандидат биологических наук Андрейчук, Дмитрий Борисович
- Специальность ВАК РФ03.00.06
- Количество страниц 177
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Андрейчук, Дмитрий Борисович
1. ВВЕДЕНИЕ
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1. Реовирусные заболевания кур
2.1.1. Распространенность реовирусных заболеваний среди коммерческой птицы
2.1.2. Вирусный теносиновит
2.1.3. Малабсорбционный синдром
2.1.4. Патотипы реовируса кур
2.1.5. Возрастная и породная резистентность
2.1.6. Иммунный ответ при теносиновите и малабсорбционном синдроме
2.2. Эффективность вакцинопрофилактики против реовирусных инфекций
2.3. Методы диагностики реовирусных заболеваний и характеристика выделенных изолятов
2.4. Молекулярно-биологическая характеристика реовирусов рода Orthoreovirus
2.4.1. Краткая характеристика семейства Reoviridae
2.4.2. Структура вириона представителей рода Orthoreovirus
2.4.3. Сруктура генома ортореовирусов
2.4.4. Белки ортореовируса
2.4.5. Репликация ортореовирусов
2.4.6. Генетическая изменчивость реовируса
2.5. Выявление генома и дифференциация штаммов реовируса кур молекулярно-биологическими методами
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Вирусология», 03.00.06 шифр ВАК
Филогенетический анализ изолятов реовируса кур и изучение биологических свойств изолята ARV04/02rus, выделенного на территории РФ2012 год, кандидат биологических наук Зиняков, Николай Геннадьевич
Разработка методов диагностики микоплазмозов кур и изучение изолятов Mycoplasma gallisepticum, выявленных на территории Российской Федерации2009 год, кандидат биологических наук Спрыгин, Александр Владимирович
Изучение распространения и антигенных взаимоотношений штаммов реовируса теносиновита кур2001 год, кандидат ветеринарных наук Коровина, Виктория Васильевна
Первичная структура генов фибера и гексона аденовирусов птиц и разработка новых методов диагностики аденовирусной инфекции1999 год, кандидат биологических наук Лобанов, Владислав Анатольевич
Метод штаммовой дифференциации вируса инфекционного бронхита кур и анализ изолятов вируса, выделенных на территории России1999 год, кандидат биологических наук Бочков, Юрий Александрович
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка молекулярно-биологических методов диагностики реовирусной инфекции кур и изучение изолятов, выявленных на территории Российской Федерации»
Реовирусная инфекция широко распространена среди коммерческой птицы в птицеводческих хозяйств разных стран мира. Патогенные штаммы реовируса кур (РК) (род Orthoreovirus, сем. Reoviridae), как правило, ассоциированы с множеством заболеваний, экономическое значение среди которых имеют теносиновит и малабсорбционный синдром [173]. Реовирус также ассоциирован с респираторными заболеваниями, гепатитом, поражениями миокарда и перикардитом у молодых бройлеров, синдромом внезапной гибели [49,73].
Реовирусные заболевания протекают, как правило, в хронической форме. Экономический ущерб от реовирусных заболеваний обусловлен снижением прироста массы тела и отбраковкой тушек [41]. В некоторых птицеводческих хозяйствах европейских стран уменьшение прибыли по сравению с ожидаемой достигало 20% [176].
Диагностика заболеваний осложняется тем, что патолого-анатомические и клинические признаки не патогномоничны и могут вызываться другими патолого-анатомическими агентами (Mycoplasma synoviae, Staphylococcus aureus, E.coli, некоторые виды Eimeria), а также сопровождаться ассоциированной инфекцией вирусами инфекционной бурсальной болезни, анемии птиц, аденовирусами [12,73]. Как правило, ассоциированные патологические агенты усиливают проявление заболевания. Для постановки правильного диагноза необходимо выявление всего комплекса этиологических агентов при этих заболеваниях, что делает лабораторную ИФА- и ПЦР-диагностику достаточно актуальной [73].
Применение комплекса молекулярно-биологических методов обратной транскрипции, полимеразной цепной реакции, секвенирования амплифицированной кДНК и анализа подвижности рестрикционных фрагментов дает возможность провести быстрое выявление генома возбудителя, дифференциацию и генотипирование выявленных изолятов реовируса кур. Комплексный ПЦР-анализ проб позволяет выявить не только геном РК, но и ассоциированные вирусные и бактериальные инфектанты. Так, предложена мультиплекс-ПЦР для одновременной детекции реовируса кур, аденовируса, вирусов инфекционной бурсальной болезни и инфекционной анемии кур [26], что облегчает постановку окончательного диагноза при подозрении на малабсорбционный синдром. Однако, несмотря на разработанные в 1990-х годах ПЦР-методы индикации генома M.synoviae [90, 179], отсутствуют сообщения о комплексном ПЦР-исследовании патолого-анатомического материала от кур с признаками теносиновита на наличие микоплазмы и реовируса.
Среди реовирусов кур существуют штаммы и изоляты, занимающие промежуточное положение между серотипами. В настоящее время некоторые авторы предполагают отсутствие устойчивых серотипов при наличии многочисленных субтипов реовирса кур [1, 2, 13, 73, 185]. Четкие серотипические отличия выявлены лишь при сравнении реовирусов разных видов птиц - реовирусов кур, индеек, водоплавающих птиц (уток и гусей) [13,73]. Этот факт значительно осложняет серологическую классификацию вирусов определенного хозяина. Сложность серотипирования связана с положением эпитопов нейтрализации вируса на разных белках внешнего капсида - они располагаются на поверхности белков сигма-С, сигма-В и лямбда-С, которые кодируются разными сегментами генома [183]. Реассортация геномных сегментов при смешанной инфекции несколькими изолятами приводит к возникновению новых субтипов [125, 126]. Задача классификации реовирусов кур может быть решена с помощью генотипирования по разным сегментам генома и установления фактов реассортации.
В отличие от зарубежных стран, в России молекулярно-биологические исследования изолятов реовируса кур не проводились, что не позволяет сделать вывод о филогенетичеких отношениях и генетическом разнообразии штаммов этого вируса персистирующих на птицефабриках РФ.
Тем не менее, результаты серологического мониторинга, проведенного в 2000 - 2002г.г. Куприяновым А.И. и Шкирей В.И. [7, 11] свидетельствуют, что реовирус распространен повсеместно на территории РФ. В каждом птицеводческом хозяйстве, где не применялась вакцина против реовируса кур, у птицы регистрируются достаточно высокие титры специфических антител, что говорит о персистенции полевого изолята в птичьем стаде.
Таким образом, совершенствование методов выявления генома и дифференциации выявленных изолятов на основе ОТ-ПЦР и секвенирования, а так же генетический анализ выявленных изолятов по разным сегментам генома являются достаточно актуальными задачами.
Цель и задачи исследования
Главная цель исследований состояла в разработке методов выявления и дифференциации изолятов реовируса кур с помощью ОТ-ПЦР, нуклеотидного секвенирования амплифицированных фрагментов, а так же генетической характеристике выявленных на территории Российской Федерации изолятов реовируса кур.
Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи: разработать ПЦР-методы выявления реовируса кур в различных вируссодержащих образцах; определить распространение реовируса кур в птицеводческих хозяйствах Российской Федерации; оптимизировать молекулярно-биологические методы для дифференциации выявленных изолятов реовируса кур; провести анализ нуклеотидной последовательности участков высоковариабельных генов выявленных изолятов; создать банк нуклеотидных последовательностей участков генома выявленных изолятов реовируса кур.
Научная новизна исследования
Разработаны методы индикации генома реовируса кур на основе ОТ-ПЦР фрагментов генов S1 и S3.
Разработаны методы дифференциации выявленных изолятов реовируса кур на основе секвенирования амплифицированных в ОТ-ПЦР кДНК фрагментов генома.
Проведено генотипирование и определен спектр генотипических групп выявленных изолятов, циркулирующих на территории Европейской части РФ.
Создан банк нуклеотидных последовательностей участков генов S1 и S3 выявленных изолятов.
Практическая значимость исследования
Разработаны следующие методы индикации и дифференциации изолятов реовируса кур: «Методика индикации генома птичьего ортореовируса с использованием полимеразной цепной реакции» (2000г.), «Методика индикации генома и дифференциации штаммов и изолятов птичьего ортореовируса с испрользованием полимеразной цепной реакции» (2002г.), «Методические указания по выделению, титрованию и идентификации авиреовирусов птиц» (2002г.). Данные методики и методические указания одобрены ученым советом и утверждены директором ФГУ ВНИИЗЖ.
Разработанный метод выявления и дифференциации изолятов реовируса кур с помощью ОТ-ПЦР и секвенирования участка гена S3 (634878 н.) в настоящее время применяется в диагностических целях.
Предложенные методы позволили выявить геном реовируса кур в различных вируссодержащих образцах.
С помощью разработанных методов проведен анализ участков генов S1 и S3 у 61-го изолята, выявленного на территории РФ в 1999-2004г.г., 5-и изолятов, выделенных на территории Италии в 1998г., референтного штамма Fachey-Crowley и вакцинного штамма ВНИВИП-РЕО. Созданный банк полученных нуклеотидных последовательностей участков генома реовируса кур используется для генотипирования и дифференциации выявляемых изолятов.
Публикация научных работ
По теме диссертации опубликовано 6 научных работ. Апробация работы
По основным результатам диссертации представлены доклады на Всероссийской научно - практической конференции молодых ученых «Достижения молодых ученых в ветеринарную практику» (Владимир, 2000г.), Международной научно - практической конференции «Современные проблемы селекции, ветеринарной генетики и защиты животных от болезней» (Витебск, 2001г.), V Всероссийской научно-практической конференции «Генодиагностика инфекционных заболеваний» (Москва, 2004г.).
Структура и объем работы
Диссертация изложена на 177 страницах и содержит следующие разделы: введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты собственных исследований и их обсуждение, заключение выводы, практические предложения. Список литературы включает 188 источников. Работа иллюстрирована 27 рисунками и 28 таблицами.
Похожие диссертационные работы по специальности «Вирусология», 03.00.06 шифр ВАК
Течение реовирусного теносиновита кур в ассоциации с кокковыми инфекциями2005 год, кандидат ветеринарных наук Пругло, Владимир Владимирович
Идентификация вируса болезни Марека методом полимеразной цепной реакции2002 год, кандидат биологических наук Полехин, Сергей Владимирович
Выделение, идентификация и характеристика изолятов вирусов инфекционного бронхита кур и инфекционного ларинготрахеита птиц2004 год, кандидат биологических наук Батченко, Галина Владимировна
Методы выявления и изучение молекулярно-генетических свойств изолятов вирусов оспы птиц2013 год, кандидат биологических наук Елаткин, Николай Павлович
Выявление возбудителя вирусной диареи КРС с помощью полимеразной цепной реакции и генотипирование изолятов, циркулирующих на территории Российской Федерации2004 год, кандидат биологических наук Шульпин, Михаил Иванович
Заключение диссертации по теме «Вирусология», Андрейчук, Дмитрий Борисович
6. Выводы
1. Разработаны и оптимизированы методы выявления и дифференциации изолятов реовируса кур с помощью амплификации с использованием системы внутреннего контрольного образца и секвенирования участков генов S3 и S1.
2. Установлено, что наибольшей аналитической и диагностической чувствительностью обладает метод ОТ-ПЦР PK-S35. Данный метод предложен как основной для индикации генома реовируса кур, а методы PK-S3A и PK-S1 как вспомогательные для генетического анализа выявленных изолятов.
3. Исследована 151 проба патологического материала, поступившего из 105 птицеводческих хозяйств Центрального федерального округа Российской Федерации за период с 1999 по 2004 г.г. Геном реовируса кур выявлен в 56% проб.
4. Установлено, что максимальный уровень отличий по последовательностям фрагментов гена S3 выявленных изолятов вируса составлял 21-24%. Уровень отличий выявленных изолятов по участку гена S1 был гораздо выше - до 60%.
5. Показано, что все выявленные изоляты реовируса кур генетически отличались от вакцинного штамма S1133 и формировали отдельные группы. Выявлены факты одновременной циркуляции в птицеводческом хозяйстве вируса, близкого к вакцинному штамму S1133, и полевого вируса, а также полевых вирусов, принадлежащих к одной или к разным генетическим группам.
6. Создан банк данных нуклеотидных последовательностей генов S1 и S3, позволяющий проводить сравнительный генетический анализ и устанавливать групповую принадлежность вновь выявляемых изолятов.
7. Оптимизирован метод анализа подвижности гетеродуплексов кДНК для быстрой дифференциации изолятов реовируса кур.
7. Практические предложения
Для практического использования предлагаются «Методика индикации генома и дифференциации штаммов и изолятов птичьего ортореовируса с использованием полимеразной цепной реакции» (2002г.), и «Методика индикации генома птичьего ортореовируса с использованием полимеразной цепной реакции» (2000г.) которые используются в ФГУ ВНИИЗЖ для выявления и штаммовой дифференциации реовируса кур с помощью амплификации и секвенирования участков гена S3.
Для практического использования также предлагаются «Методические указания по выявлению, титрованию и идентификации авиреовирусов птиц» (2002г.), которые используются в ФГУ ВНИИЗЖ при выделении изолятов реовируса кур.
Созданный банк нуклеотидных последовательностей участков генов S1 и S3 изолятов реовируса кур, выявленных на территории РФ и Италии, используется для изучения генома реовируса кур и дифференциации новых изолятов.
5. Заключение
В качестве объектов для ПЦР-исследования были выбраны наиболее частые этиологические агенты теносиновита/артрита - реовирус кур и Mycoplasma synoviae.
Выбор праймеров для индикации и дифференциации изолятов реовируса кур с помощью ОТ-ПЦР осуществлялся по последовательностям наиболее вариабельных сегментов генома - S1 и S3. Для проведения двухстадийной гнездовой ОТ-ПЦР были выбраны 3 системы праймеров: система праймеров S3A, фланкирующих 5'-концевой регион сегмента S3 (40-442 н.), система праймеров S3B, фланкирующих З'-концевой регион сегмента S3 (634-878 н.) и система для амплификации участка сегмента S1, фланкирующая 90% последовательности гена S1 (672-1584 н.).
Наиболее удачной оказалась система праймеров S3B. При исследовании патолого-анатомического материала с помощью данной системы были выявлены изоляты, которые не удалось выявить другими системами праймеров. Метод ОТ-ПЦР на основе системы S3B показал максимальную аналитическую чувствительность по сравнению с другими предложенными системами.
Для повышения надежности разработанной ОТ-ПЦР-системы индикации генома реовируса кур S3B предложена оригинальная система внутреннего контрольного образца, защищенного от действия РНК-аз, включающая тест-объект - вакцинный штамм вируса инфекционной бурсальной болезни Winterfield-2512 и систему праймеров для амплификации участка гена VP-1 данного вируса в первой стадии ПЦР.
С помощью внутреннего контрольного образца удалось идентифицировать ложноотрицательные результаты при исследовании проб в 2002 году. При повторном исследовании этих проб после десятикратного разбавления суспензии тканей и однократной обработки хлороформом ложноотрицательных результатов не отмечено.
Для индикации генома М. synoviae был использован разработанный в 1993 г. Lauerman L.H. ПЦР-метод.
С использованием культуральных препаратов штаммов реовируса кур S1133, Fachey-Crowley, изолята 04/02 и штамма М. synoviae WVU-1853 постановка ПЦР была оптимизирована по температуре отжига праймеров. Для достижения максимальной аналитической чувствительности ОТ-ПЦР был найден оптимальный способ выделения дцРНК.
С помощью предложенных методов в период с 1999 по 2004 г.г. была исследована 151 проба патолого-анатомического материала, поступившего из 105 птицеводческих хозяйств центральной части Российской Федерации. Геном реовируса кур удалось выявить в 56% проб из 58 прицеводческих хозяйств 31 региона РФ.
Анализ результатов показал, что общее количество положительных проб на реовирус и микоплазму примерно одинаково - 84 (56%) и 74 (49%) пробы, соответственно, что говорит о значительном распространении как реовирусной инфекции, так и микоплазмоза. Ассоциированная инфекция реовирусом и микоплазмой встречалась достаточно часто - в 44 случаях (29%). Наличие реовируса без ассоциированный патологический агента у больной теносиновитом птицы установлено в 40 случаях. Инфекция микоплазмой без ассоциированной инфекции реовирусом зарегистрирована в меньшем числе случаев (32 случая), что подтверждает важную роль реовируса как этиологического агента теносиновита кур в птицеводческих хозяйствах РФ.
В 35 случаях (23%) данных патолого-анатомических агентов не выявлено. Очевидно, в этих случаях патолого-анатомические изменения, характерные для реовирусных заболеваний, вызваны другими патолого-анатомическими агентами, т.к. сопутствующие патолого-анатомические изменения не патогномоничны.
Наибольшее число случаев теносиновита сопровождалось энтеритами, гепатитами, нефритами и респираторными заболеваниями (38 случаев). Теносиновит при отсутствии других патолого-анатомических изменений встречался гораздо реже (7 случаев). Значительное количество случаев выявления реовируса (39 случаев) не было связано с развитием теносиновита и сопровождалось другими патолого-анатомическими изменениями.
Наиболее часто у несушек и бройлеров встречалась легкая форма теносиновита, которая не сопровождалась микоплазменной инфекцией и была характерна для птицы возрастом до 40 дней. Более тяжелые формы синовита встречаются реже и характерны для птицы старшего возраста. Как правило эти формы сопровождались смешанной инфекцией реовируса и микоплазмы.
Наиболее часто вместе с РК выявлялись Mycoplasma synoviae, М. gallisepticum и вирус инфекционного бронхита кур. В 22% случаев не установлено наличия ассоциированный патологический агентов в патолого-анатомическом материале. Достаточно высокая встречаемость реовируса с вирусом ИБК и микоплазмами объясняет частую респираторную клинику при выявлении реовирусов.
Для 44% поступившей на исследование птицы не установлено наличие реовирусной инфекции. M.synoviae выявлена у 48% реовирус-негативной птицы. При этом в 60% случаев микоплазмоз сопровождался синовитом разной степени тяжести. Таким образом 13% случаев теносиновита от общего числа исследованных проб было связано с инфекцией M.synoviae без ассоциированный патологический агентов.
В результате выделения реовируса кур из проб положительного в ОТ-ПЦР патолого-анатомического материала были получены 12 изолятов. Изоляты отличались по вирулентности для куриных эмбрионов. Были выделены как низковирулентные, так и высоковирулентные изоляты. Вирулентность для куриных эмбрионов коррелировала с вирулентностью для однодневных SPF-цыплят, что доказано при экспериментальном заражении SPF-цыплят.
При заражении однодневных SPF-цыплят низковирулентным и высоковирулентным изолятами перорально и инъекцией в подушку лапы показано, что низковирулентный изолят не вызывал значительных патолого-анатомических и клинических изменений в органах, однако достоверно снижал прирост зараженных цыплят на 15-20%. Во втором случае наблюдали сильные поражения разных органов (печени, почек, селезенки, сердца, тканей кишечника, бурсы, суставной сумки), высокую раннюю смертность при любом способе заражения, клинические признаки теносиновита и выраженную редукцию прироста массы тела на 40-60%. Таким образом, низковирулентный изолят проявлял патотип синдрома малабсорбции, а высоковирулентный - смешанный патотип, который характерен для большинства высоковирулентных изолятов реовируса кур.
Был проведен сравнительный анализ последовательностей участков генов S1 и S3 выявленных изолятов. Уровень отличий последовательностей S3A и S35 был примерно одинаков - 21,4 и 24,3%. Уровень отличий выявленных изолятов по участку гена S1 был гораздо выше - до 59,4%.
Отсеквенированы полные последовательности гена S1 у трех выявленных в 2002 году изолятов. Размер гена был одинаков - 975 н. По сравнению с вакцинным штаммом S1133 (978 н.) наблюдалась делеция одного триплета в гене S1 в области хвостового домена во всех трех случаях. В целом, данные изоляты отличались на 45-48% от штамма S1133 по гену S1 и на 59-69% по белку сигма-С. Белок сигма-С демонстрирует относительно высокую структурную консервативность регионов Т1 и Н и низкую консервативность последовательности хвостового домена.
Все выявленные изоляты отличались от вакцинного штамма на 8,519% по последовательности участка S3B гена S3 и более чем на 30% по участку гена S1 (700-850 н.).
С использованием двух систем праймеров на ген S3 выявлена одновременная циркуляция как вакцинного штамма, так и полевого изолята в птицеводческих хозяйствах. Показано, что обратные «Fb-праймеры системы S3A в этом случае не имеют гомологии с соответствующими подпраймерными областями гена S3 полевого изолята и выявляют только геном вакцинного штамма S1133, коциркулирующий с полевым вирусом.
Большинство выявленных изолятов на дендрограммах S3A и S3B образуют несколько генетических групп. В группы входит по 2-6 изолятов.
Группа изолятов, выделенных на территории Италии, наиболее близка из зарубежных штаммов к выявленным изолятам. Не исключено существование общих предковых форм выявленных российских и европейских штаммов.
Корреляция между топологией изолятов на дендрограммах S3A и S3B и датой выявления отсутствует.
При исследовании участка гена S1 большинство выявленных на территории РФ изолятов формировали четыре отдельные генетические группы с высокой статистический вероятностью топологии (значение bootstrap-показателя 84-100%). Внутригрупповые отличия составляют 725%. Однако, уровень отличий от вакцинного штамма S1133 достигает 45%. Выделялись как гомогенные группы, представленные только российскими изолятами, так и группы, включающие изоляты, выделенные на территории Австралии, Германии и Нидерландов. Не исключено общее происхождение этих штаммов и изолятов.
При анализе дендрограмм S3B и S1 выявленных изолятов установлено, что генетические группы, выявленные по одному сегменту, для другого сегмента не сохраняются, что может быть следствием либо реассортации S1 и S3 сегментов либо коциркуляции генетически отличных по генам S1 и S3 изолятов. Так, изоляты с уровнем отличий менее 10% по гену S3 отличаются друг от друга более чем на 40% по гену S1.
Случаи реассортации/коциркуляции для реовируса кур по видимому встречаются достаточно часто и были отмечены ранее при выявлении изолятов реовируса в птицеводческих хозяйствах на территории Тайваня.
При анализе последовательностей фрагментов S3A и S3B сегмента S3 установлена генетическая близость штамма 138, выделенного на территории США, и некоторых российских изолятов. Однако, при анализе участка гена S1 данный штамм был близок к lijt.S1133 и имел значительные отличия (более 30%) от выявленных изолятов. Не исключено, что часть РФ-изолятов являются дериватами одного или нескольких штаммов, близких к штамму 138, которые могли быть завезены при импорте репродуктивного стада или эмбрионов из США и Европы в птицеводческие хозяйства России.
Установлен факт одновременной циркуляции двух разных изолятов у птицы, поступившей с одного цеха птицефабрики «Владимировская» Астраханской области. При секвенировании 10 клонов фрагмента S1 было обнаружено, что популяция изолята 02/00, первоначально выявленного в птицехозяйстве, гетерогенна и представлена как минимум двумя субпопуляциями (02/00а и 02/006), отличающимися по гену S1 на 21%.
При исследовании с помощью системы ОТ-ПЦР PK-S3B проб, поступавших с одной и той же птицефабрики в течение 2-3 лет, выявлялись разные циркулирующие изоляты. Наибольшее количество изолятов было выявлено в пробах с птицефабрик «Кировоградская» (3 изолята) и «Ярославский бройлер» (5 изолятов). В каждом случае формировалась группа близкородственных изолятов, выявленных в 1999-2001 годах с уровнем внутригрупповых отличий, не превышающими 5%.
Установленные факты могут подтверждать как длительную совместную персистенцию близкородственных изолятов так и изменение генома в результате многолетней циркуляции вируса в птицехозяйстве.
Однако, выявлялись изоляты, попадающие в разные генетические группы. При этом изоляты с одной птицефабрики отличались более чем на 8%. В этом случае разные циркулирующие изоляты возможно были занесены при комплектации родительского стада из разных источников или при смене племрепродуктора при поставках цыплят. В двух случаях изоляты с разных птицефабрик принадлежали к одной группе. Генетическая близость изолятов с разных птицефабрик, вероятно, связана с поступлением эмбрионов или цыплят, зараженных определенным изолятом, из одного источника.
При генетическом анализе последовательностей изолятов с определенными биологическими свойствами не установлено закономерности в их генетической группировке и отнесением к определенному патотипу.
Однако, установлена связь между генетической группировкой 14 изолятов и патолого-анатомическими изменениями у кур, инфицированных данными изолятами. Эти изоляты формировали отдельную генетическую группу. Каждый изолят был выделен от птицы с респираторной клиникой. При этом в большинстве случаев отсутствовала ассоциированная инфекция ВИБК. При анализе аминокислотных позиций участка S3B, выявлена одна замена, уникальная для всех 14-и изолятов, формирующих данную группу - наличие пролина в позиции 229 белка сигма-В. Указанная замена отсутствует у остальных российских изолятов. На основании полученных результатов можно предположить, что в пределах участка S3B имеются генетические маркеры, характерные для изолятов реовируса кур, вызывающих комплекс респираторных патолого-анатомических изменений. Возможно, пролин в позиции 229 является одним из таких маркеров.
Случаи выделения генетической группы изолятов реовируса кур, выявленных у птиц с респираторной клиникой ранее не описывалось.
На основе анализа гетеродуплексов кДНК разработан метод быстрой дифференциации штаммов и изолятов, отличающихся друг от друга более чем на 2,7%. Хотя метод не является полной заменой секвенированию кДНК, но с его помощью можно дифференцировать полевые изоляты реовируса кур от вакцинного штамма, поскольку, по результатам секвенирования, все выявленные изоляты при использовании системы РК-S3B отличались от вакцинного штамма более чем на 5%.
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Андрейчук, Дмитрий Борисович, 2005 год
1. Абдилазиз Ф. А. Биологические свойства авиреовирусов, диагностика вызываемых ими заболеваний // автореф. канд. дис. на соиск. уч. ст. канд. вет. наук.- Киев.- 1990.
2. Абдилазиз Ф. А. Изучение биологических свойств реовирусов, выделенных от кур и индеек // Ветеринария.- 1990.- вып.65.- с.104-107
3. Абдильазиз Ф., Герман В.В. Изучение в реакции диффузной преципитации в геле реовирусов, выделенных от кур и индеек // Современные средства и методы борьбы с разными болезнями сельскохозяйственных птиц: Сб. Науч. Тр.- Л.:1988.- ч.1с.64-69.
4. Грибанов О.Г., Щербаков А.В., Перевозчикова Н.А., Гусев А.А. Использование Аэросила А-300 и фильтров GF/F (GF/C) Для очистки ДНК-фрагментов, плазмидной ДНК и РНК//Биохимия.- 1996.- вып. 61(6).-с.1064-1070.
5. Жбанова С.Ю. Эпизоотология инфекционной бурсальной болезни и реовирусного теносиновита кур на птицефабрике яичного направления // автореф. канд. дис. на соиск. уч. ст. канд. вет. наук.- СПб.- 2003.
6. Коровина В.В. Изучение распространения и антигенных взаимоотношений штаммов реовируса теносиновита кур // автореф. канд. дис. на соиск. уч. ст. канд. вет. наук.- СПб.- 2001.
7. Куприянов А.И., Волкова И.А., Шкиря В.В. и др. Серологический мониторинг птицехозяйств Российской Федерации по авиреовирусной инфекции и синовиальному микоплазмозу // Аграрн. Россия.- 2002.- №2.-с.20-24
8. Нваджей Б. Свойства реовирусов, изолированных при теносиновите птиц и смешанной инфекции с Mycoplasma synoviae // Автореф. дисс. На соиск. уч.степ, кандидата вет. наук.- Москва, 1991.
9. Сарбаева Н.В. Сравнительная характеристика вакцинного и эпизоотических штаммов реовируса теносиновита кур // автореф. канд. дис. на соиск. уч. ст. канд. вет. наук.- М.-1997.
10. Шкиря В.И., Куприянов А.И., Старов С.К., Маркина М.И. Эпизоотический мониторинг авиреовирусной инфекции в птицеводческих хозяйствах Российской Федерации // Достижения молодых ученых в вет. практику.- Владимир: 2000.- с. 70-74
11. Abbas A., Amer М., Bastami М., El Mahdi S.A. Detection of infectious causes of arthritis in breeder chicken flocks // in Book of Abstracts "XXII World's poultry congress, 8-13 june 2004, Istanbul, Turkey".- Istanbul, 2004,-p.775
12. Adair B.M., Burns K., McKillop E.R. Serological studies with reoviruses in chickens, turkeys and ducks. // J Comp Pathol.- 1987.- v.97.- p.495-501.
13. Agwale S.M., Robbins K.E., Odama L., et al. Development of an env gp41-based heteroduplex mobility assay for rapid human immunodeficiency virus type 1 subtyping//J.Clin.Microbiol.-2001.-v.39.-p.2110-2114.
14. Al Afaleq A.I., Jones R.C. Localisation of avian reovirus in the hock joints of chicks after entry through broken skin. // Res Vet Sci.- 1990.- v.48.- p.381-382.
15. Al-Afaleq A., Jones R.C. Pathogenicity of three turkey and three chicken reoviruses for poults and chicks with particular reference to artritis/tenosynovitis //Avian pathol.- 1989,- v. 18.- p.433-440
16. Alderson M., Nade S. Natural history of acute septic arthritis in an avian model // J.Orthop. Res.-1987.- v.5.- p.261-274
17. Ballagi-Pordany A., Belak S. The use of mimics as internal standards to avoid false negatives in diagnostic PCR // Mol. Cell. Probes. 1996. -v.10. -p.159-64.
18. Bartlett N.M., Joklik W.K. The sequence of the reovirus serotype 3 L3 genome segment which encodes the major core protein A1 // Virology. 1988. - v.167. - p.31-37.
19. Berinstein A., Sellers H.S., King D.J., Seal B.S. Use of a heteroduplex mobility assay to detect differences in the fusion protein cleavage site codingsequence among newcastle disease virus isolates // J.Clin.Microbiol. 2001.-Vol. 39.- P. 3171-3178.
20. Bisaillon M., Bergeron J., Lemay G. Characterization of the nucleoside triphosphate phosphohydrolase and helicase activities of the reovirus lambdal• protein. // J Biol Chem.- 1997.- v.272.-p.18298-18303.
21. Bodelon G., Labrada L., Martinez- Costas J., Benavente J. The avian reovirus genom segment S1 is a functionally tricistronic gene that express one structural and two nonstructural proteins in infected cells // Virology. 2001. -v.290. - p.181- 191.
22. Bodelon G., Labrada L., Martinez-Costas J., Benavente J. Modification of late membrane permeability in avian reovirus-infected cells: viroporin activity of the S1-encoded nonstructural p10 protein. // J Biol Chem.- 2002.- v.277.-p.17789-17796.
23. Braunius W.W. Respiratory problems in reovirus infection in broiler chicks // Tijdschr Diergeneeskd.- 1992.- v. 117.- p.390-391.
24. Bustin S.A. Quantification of mRNA using real- time reverce transcription PCR (RT-PCR): trends and problems // J. Mol. Endocrinol. 2002. - v.29 - p. 23-39.
25. Caterina K.M., Frasca S Jr, Girshick Т., Khan M.I. Development of a multiplex PCR for detection of avian adenovirus, avian reovirus, infectious bursal disease virus, and chicken anemia virus. // Mol Cell Probes.- 2004.-v.18.- p.293-298.
26. Chappel J.D., Goral M.I., Rodgers S.E., et al. Sequence diversity within the reovirus S2 gene: reovirus genes reassort in nature, and their termini are predicted to form a panhandle motif//J. Virol. -1994. v.68. - p.750-756.
27. Clark F. D., Ni Y., Collisson E.W., Kemp M.C., Characterization of avian reovirus strain specific polimorphisms // Avian Dis. 1990. - v.34. - p.304-314.
28. Cook M.E., Springer W.T. Effect of reovirus infection and dietary levels of selected vitamins on immunocompetence of chickens. // Avian Dis.- 1983,-v.27.- p.367-377.
29. Cook M.E., Springer W.T., Hebert J.A. Enhanced incidence of leg abnormalities in reovirus WVU 2937-infected chickens fed various dietary levels of selected vitamins. //Avian Dis.- 1984.- v.28.- p.548-561.
30. Cook M.E., Springer W.T., Kerr K.M., Hebert J.A. Severity of tenosynovitis in reovirus-infected chickens fed various dietary levels of choline, folic acid, manganese, biotin, or niacin. //Avian Dis.- 1984.- v.28.- p.562-573.
31. Coombs K.M. Stoichiometry of reovirus structural proteins in virus, ISVP, and core particles. //Virology.- 1998.- v.243.- p.218-28.
32. Czekaj H., Samorek-Salamonovicz E., Koizdrun W. Properties of avian reoviruses isplated from chickens in Poland // Bull. Vet. Inst. Pulawy.- 1999.-v.43.- p.3-10
33. Decaesstecker M., Charlier G., Meulemans G. Significance of parvoviruses, entero-like viruses and reoviruses in the aetiology of the chicken malabsorption syndrome //Avian Pathol.- 1986.- v.15.- p.769-782
34. Dermody T.S., Nibert M.L., Bassel-Duby R., Fields B.N. Sequence diversity in S1 genes and S1 translation products of 11 serotype 3 reovirus strains. // J Virol.- 1990.- v.64.- p.4842-4850.
35. Dhillon A.S., Kibenge F.S., Page R.K. Viral arthritis in fryers related to reovirus infection in breeders. //Avian Dis.- 1986.- v.30.- p.613-616.
36. Dingle K.E., Crook D., Jeffry K. Stable and noncompetitive RNA internal control for routine clinical diagnostic reverce transcription- PCR // J. Clin. Microbiol.- 2004.- v.42.- p.1003-1011.
37. Dobson K.N., Glisson J.R. Economic impact of a documented case ofreovirus infection in broiler breeders. //Avian Dis.- 1992.- v.36.- p.788-791.
38. Drosten C., Seifried E., Roth W. K. TaqMan 5'-Nuclease Human Immunodeficiency Virus Type 1 PCR Assay with Phage-Packaged Competitive Internal Control for High-Throughput Blood Donor Screening // J.
39. Clin. Microbiol.- 2001v.39.- p.4302-4308.
40. Duncan R. Extensive sequence divergence and filogenetic relationships between fusogenic and nonfusogenic orthoreoviruses: a special proposal // Virology.- 1999.- v.260.- p.316- 328.
41. Duncan R., Corcoran J., Shou J., Stoltz D. Reptilian reovirus: a new fusogenic orthoreovirus species //Virology.- 2004.- v.319.- p. 131-140.
42. G.S., Dermody T.S. Adaptation of reovirus to growth in the presence of protease inhibitor E64 segregates with a mutation in the carboxy terminus of viral outer-capsid protein sigma3. // J Virol.- 2001.- v.75.- p.3197-3206.
43. Ellis J.S., Zambon M.C. Combined PCR-heteroduplex mobility assay for detection and differentiation of influenza A viruses from different animal species // J.Clin.Microbiol. 2001.- v. 39.- p.4097-4102.
44. Elmubarak A.K., Kheir S.A., Abuelgasim A.I. Occurrence of runting and stunting syndrome in broiler chickens in the Sudan. // Rev Elev Med Vet Payse Trop.- 1990.- v.43.- p.317-322.
45. Fachey J.E., Crowley J.F. Studies of cronic respiratory disease of chickens. II Isolation of a virus//Can. J. Сотр. Med -1954.-v.18.- p.13-21.
46. Farsetta D.L., Chandran KM Nibert M.L. Transcriptional activities of reovirus RNA polymerase in recoated cores. Initiation and elongation are regulated by separate mechanisms. // J Biol Chem.- 2000.- v.275.- p.39693-39701.
47. Georgiades G., lordanidis P., Koumbati M. Cases of swollen headsyndrome in broiler chickens in Greece. // Avian Dis.- 2001.- v.45.- p.745-750.
48. Gerganov G, Veselinova A, Popov G, Markarian M. Demonstration of a reovirus in helicopter disease of broilers // Vet Med Nauki.- 1987.- v.24.- p.21
49. Giambrone J.J., Solano W. Serologic comparison of avian reovirus isolates using virus neutralization and an enzyme-linked immunosorbent assay. // Avian Dis.- 1988,- v.32.- p.678-680.
50. Glavits R., Molnar E., Ratz F., Saghy E., Fehervari Т., Meder M. Pathological studies in chicken embryos and day-old chicks experimentally infected with avian reovirus. // Acta Vet Hung.- 1984.- v.32.- p.23-37.
51. Gouvea V.S., Schnitzer T.J. Polimorphism of the migration of double-stranded RNA genome segments of avian reoviruses // J.Virol.- 1982.- v.43.-p.465-471.
52. Grande A., Benavente J. Optimal conditions for the growth, purification and storage of the avian reovirus S1133. // J Virol Methods.- 2000.- v.85.- p.43-54.
53. Grande A., Rodriguez E., Costas C., Everitt E., Benavente J. Oligomerization and cell-binding properties of the avian reovirus cell-attachment protein sigmaC. //Virology.- 2000.- v.274.- p.367-377.
54. Hazelton P.R., Coombs K.M. The reovirus mutant tsA279 L2 gene is associated with generation of a spikeless core particle: implications for capsid assembly. // J Virol.- 1999.- v.73.- 2298-2308.
55. Heggen-Peay C.L., Cheema M.A., Ali R.A., et al. Interactions of poult enteritis and mortality syndrome-associated reovirus vith various cell types in vitro // Poult Sci.- 2002.- v.81.- p.1661-1667
56. Hieronimus D.R.K., Villegas P., Kleven S.H. Characteristics and pathogenicity of two avian reoviruses isolated from chickens with leg problems //Avian dis.- 1982.- v.27.-p.255-260
57. Hieronymus D.R., Villegas P., Kleven S.H. Identification and serological differentiation of several reovirus strains isolated from chickens with suspected malabsorption syndrome. //Avian Dis.-1983.- v.27.- p.246-254.
58. Hill J.E., Rowland G.N., Glisson J.R., Villegas P. Comparative microscopiclesions in reoviral and staphylococcal tenosynovitis. //Avian Dis.- 1989.- v.33.-p.401-410.
59. Hill J.E., Rowland G.N., Steffens W.L., Ard M.B. infrastructure of the gastrocnemius tendon and sheath from broilers infected with reovirus. // Avian• Dis.- 1989.- v.33.-p.79-85.
60. Hsiao J., Martinez- Costas J., Benavente J., Vakharia V.N. Cloning, expression and characterization of avian reovirus guanililtransferase // Virology.- 2002.- v.296.- p.288-299.
61. Ide P.R. Avian reovirus antibody assay by indirect immunofluorescence using plastic microculture plates. // Can J Comp Med.- 1982.- v.46.- p.39-42.
62. Ide P.R. Sensitivity and specificity of the fluorescent antibody technique for detection of infectious laryngotracheitis virus. // Can J Comp Med.- 1978.-v.42.- p.54-62.
63. Ide P.R., Dewitt W. Serological incidence of avian reovirus infection inbroiler-breeders and progeny in Nova Scotia. // Can Vet J.- 1979.- 20.- 348353.
64. Islam M.R., Jones R.C., Kelly D.F. Pathogenesis of experimental reovirus tenosynovitis in chickens: influence of the route of infection. // J Comp Pathol.-1988.-v.98.- p.325-336.
65. Jane-Valbuena J., Breun L.A., Schiff L.A., Nibert M.L. Sites and determinants of early cleavages in the proteolytic processing pathway of reovirus surface protein sigma3. // J Virol.- 2002.- v.76.- p.5184-5197.
66. Joklik W.K., Roner M.R. What reassorts when reovirus genome segments reassort?//J Biol Chem.- 1995.-v.270.- p.4181-4184.
67. Joklik W.K.The Members of the family reoviridae // in: Joklik W.K. The Reoviridae.- New York: Plenum Press.- 1983,- p. 1-6.
68. Jones R.C. Avian reovirus infections // Rev. sci. tech. Off. Int. Epiz.- 2000.-v.19.- p.614-625
69. Jones R.C., Georgiou K., Guneratne J.R. Rupture of digital flexor tendons ф of chickens after infection with reovirus. // Vet Rec.- 1980.- v.107.- p.180.
70. Jones R.C., Guneratne J.R., Georgiou K. Isolation of .viruses from outbreaks of suspected tenosynovitis (viral arthritis) in chickens. // Res Vet
71. Sci.-1981.- v.31.- p.100-103.
72. Jones R.C., Nwajei B.N. Reovirus-induced tenosynovitis: persistence of homologous challenge virus in broiler chicks after vaccination of parents. // Res Vet Sci.- 1985.- v.39.- p.39-41.
73. Jones R.S., Islam M.R., Kelly D.F. Early pathogenesis of experimental reovirus infection in chickens. //Avian pathol.- 1989.- v.18.- p.239- 253.
74. Jordan F.T. Mycoplasma-induced arthritis in poultry // Isr. J. Med. Sci.-1981.- v.17.- p.622-625
75. Kaji Т., Nonomura I., Sato S., Kobayashi H., Shoya S. Pathogenicity of avian reovirus and its influence on the infection of Mycoplasma gallisepticum in chickens. // Natl Inst Anim Health Q (Tokyo).- 1970,- v.10.- p.49-57.
76. Kant A., Balk F., Born L., van Roozelaar D., Heijmans J., Gielkens A., ter Huurne A. Classification of Dutch and German avian reoviruses by sequencing the sigma С protein. //Vet Res.- 2003.- v.34.- p.203-212.
77. Kapczynski D.R., Sellers H.S., Simmons V., Schultz-Cherry S. Sequence analysis of the S3 gene from a turkey reovirus. // Virus Genes.- 2002.- v.25.-p.95-100.
78. Kedl R., Schmechel S., Schiff L. Comparative sequence analysis of the reovirus S4 genes from 13 serotype 1 and serotype 3 field isolates. // J Virol.-1995.- v.69.- p.552-559.
79. Kibenge F.S.B., Dhillon A.S. A comparison of the pathogenicity of four avian reoviruses in chickens //Avian Dis.- 1986.- v.31.- p.39-42
80. Kovarova M., Draber P. New specificity and yield enhancer of polymerase % chain reactions // Nucl.ac.res.- 2000.- v.28.- p.70-74
81. Kumar R., Singhal L.K., Singh A.K., Chauhan R.S. Seroprevalence of reovirus infection in poultry in Uttaranchal // J. Immunol. Immunopathol.2002.- v.4.- р.62-63
82. Gruys E. The role of various agents in chicken amyloid arthropathy. // Amyloid.- 1998.- v.5.- p.266-278.
83. Lauerman L.H., Hoerr R.J., Sharpton A.R. et al. Development and application of polimerase chain reaction assay for Mycoplasma synoviae // Avian dis.- 1993.- v.37- p.829-834
84. Le Gall-Recule G., Cherbonnel M., Arnauld C., Blanchard P., Jestin A., Jestin V. Molecular characterization and expression of the S3 gene of muscovy duck reovirus strain 89026. // J Gen Virol.-1999.- v.80.- p.195-203.
85. Lee L.H., Shien J.H., Shieh H.K. Detection of avian reovirus RNA and comparison of a portion of genome segment S3 by polymerase chain reaction and restriction enzyme fragment length polymorphism. // Res Vet Sci.- 1998.-v.65.- p.11-15.
86. Lee L.H., Wang Y.H., Shien J.H. Comparison of the labeled avidin-biotin and the conventional enzyme-linked immunosorbent assay for detecting antibody to reovirus in chickens. // J Virol Methods.- 1994.- v.48.- p.343-347.
87. Lin Yu-Wen, Wang Kuan-Ju, Lei Huan-Yao et all. Virus Replication and
88. Cytokine Production in Dengue Virus-Infected Human В Lymphocytes // J Virol.- v.76.- p.12242-12249.
89. Liu H.J., Chen J.H., Liao M.H., Lin M.Y., Chang G.N. Identification of thesigma C-encoded gene of avian reovirus by nested PCR and restriction endonuclease analysis. //J Virol Methods.-1999.- v.81.- p.83-90.
90. Liu H.J., Giambrone J.J., Nielsen B.L. Molecular characterization of avian reoviruses using nested PCR and nucleotide sequence analysis. // J Virol Methods.- 1997.- v.65.- p.159-167.
91. Liu H.J., Huang P.H. Sequence and phylogenetic analysis of the sigmaA-encoding gene of avian reovirus. // J Virol Methods.- 2001.- v.98.- p.99-107.
92. Liu H.J., Lee L.H., Hsu H.W., Kuo L.C., Liao M.H. Molecular evolution of avian reovirus: evidence for genetic diversity and reassortment of the S-class genome segments and multiple cocirculating lineages. // Virology.- 2003.-v.314.- p.336-349.
93. Luongo C.L., Dryden K.A., Farsetta D.L., Margraf R.L., Severson T.F., Olson N.H., Fields B.N., Baker T.S., Nibert M.L. Localization of a C-terminal region of Iambda2 protein in reovirus cores. // J Virol.- 1997.- v.71.- p.8035-8040.
94. Mabrouk Т., Danis C., Lemay G. Two basic motifs of reovirus sigma 3 protein are involved in double-stranded RNA binding. // Biochem Cell Biol.-1995.- v.73.- p.137-145.
95. Mabrouk Т., Lemay G. Mutations in a CCHC zinc-binding motif of the reovirus sigma 3 protein decrease its intracellular stability. // J Virol.- 1994.-v.68.- p.5287-5290.
96. Marquardt J., Hermanns W., Schulz L.C., Leibold W. A persistent reovirus infection of chickens as a possible model of human rheumatoid arthritis (RA). // Zentralbl Veterinarmed В.- 1983.- v.30.- p.274-282.
97. Martinez-Costas J., Gonzalez-Lopez C., Vakharia V.N., Benavente J. Possible involvement of the double-stranded RNA-binding core protein sigmaA in the resistance of avian reovirus to interferon. // J Virol.- 2000.- v.74.- p.1124-1131.
98. Martinez-Costas J., Grande A., Varela R., Garcia-Martinez C., Benavente J. Protein architecture of avian reovirus S1133 and identification of the cell attachment protein. // J Virol.-1997.- v.71.- p.59-64.
99. Mayerat C., Rgisser Ph. B.U., Lavanchy D. et all. Comparison of a Competitive Combined Reverse Transcription-PCR Assay with a Branched-DNA Assay for Hepatitis С Virus RNA Quantitation // J Clin Microbiol.- 1996.-p.2702-2706.
100. McNamee P.T., Smith J.A. Bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (femoral head necrosis) of broiler chickens: a review // Avian pathol.- 2000.-v.29.- p.477-495
101. Meanger J., Wickramasinghe R., Enriquez C.E., Wilcox G.E. Immune response to avian reovirus in chickens and protection against experimental infection. // Aust Vet J.-1997.- v.75.- p.428-432.
102. Mochow- Grundy M., Dermody T.S. The reovirus S4 gene 3' nontranslated region contains a translational operator sequence // J.Virol.- 2001.-v.75.-p.6517-6526.
103. Montgomery R.D., Villegas P., Dawe D.L., Brown J. A comparison between the effect of an avian reovirus and infectious bursal disease virus on selected aspects of the immune system of the chicken. // Avian Dis.- 1986.- v.30.-p.298-308.
104. Montgomery R.D., Villegas P., Dawe D.L., Brown J. Effect of avian reoviruses on lymphoid organ weights and antibody response in chickens. // Avian Dis.- 1985.- v.29.- p.552-560.
105. Montgomery R.D., Villegas P., Kleven S.H. Role of route of exposure, age,sex, and type of chicken on the pathogenicity of avian reovirus strain 81-176. // Avian Dis.- 1986.- v.30.- p.460-467.
106. Moradian A., Thorsen J., Julian R.J. Single and combined infections of specific-pathogen-free chickens with infectious bursal disease virus and an intestinal isolate of reovirus. //Avian Dis.- 1990.- v.34.- p.63-72.
107. Morris M.P., Fletcher O.J. Diagnostic summary of 1986 turkey, broiler breeders, and layer necropsy cases at the University of Georgia // Avian Dis.-1988.- v.32.- p.391-403
108. Mukiibi-Muka G., Jones R.C. Local and systemic IgA and IgG responses of chicks to avian reoviruses: effects of age of chick, route of infection and virus strain //Avian Pathol.- 1999.- v.28.- p. 54-60
109. Murphy G., Belda F.J., Chou-Pong P., et al. Discrimination of subtype В and non-subtype В strains of human immunodeficiency virus type 1 by serotyping: correlation with genotyping // J.Clin.Microbiol.- 1999.- v.37.-p.1356-1360.
110. Mustaffa-Babjee A., Spradbrow P.В., Omar A.R. Characterization of an avian reovirus isolated in Queensland. // J Comp Pathol.- 1973.- v.83.- p.387-400.
111. Nersessian B.N., Lukert P.D., Goodwin M.A. Antigenic comparisons of selected avian reoviruses by use of the plaque-reduction neutralization assay. //Am J Vet Res.-1989.- v.50.- p. 1475-1480.
112. Ni Y., Kemp M.C. A comparative study of avian reovirus pathogenicity: virus spread and replication and induction of lesions. // Avian Dis.- 1995.- v.39.-p.554-566.
113. Ni Y., Kemp M.C. Selection of genome segments following coinfection of chicken fibroblasts with avian reoviruses // Virology.- 1990.- v. 177.- p.625-633
114. Ni Y., Kemp M.C. Strain-specific selection of genome segments in avian reovirus coinfections. // J Gen Virol.-1992.- v.73.- p.3107-3113.
115. Ni Y., Ramig R.F., Kemp M.C. Identification of proteins encoded by avian reoviruses and evidence for post-translational modification. //Virology.- 1993.-v.193.- p.466-469.
116. Nibert M.L., Margraf R.L., Coombs K.M. Nonrandom segregation of parental alleles in reovirus reassortants. // J Virol.- 1996.- v.70.- p.7295-7300.
117. Nibert M.L., Schiff L.A., Fields B.N. Reoviruses and their replication // in Fields B.N. Fields virology. Vol.2.- Philadelphia: Lippincott-Raven.- 1995.-p.1557-1596.
118. Noble S., Nibert M.L. Core protein mu2 is a second determinant of nucleoside triphosphatase activities by reovirus cores. // J Virol.- 1997.- v.71.-p.7728-7735.
119. Odegard A.L., Chandran K., Liemann S., Harrison S.C., Nibert M.L. Disulfide bonding among micro 1 trimers in mammalian reovirus outer capsid: a late and reversible step in virion morphogenesis. // J Virol.- 2003.- v.77.-p.5389-5400.
120. O'Hara D., Patrick M., Cepica D., Coombs K.M., Duncan R. Avian reovirus major mu-class outer capsid protein influences efficiency of productive macrophage infection in a virus strain-specific manner. // J Virol.- 2001.- v.75.-p.5027-5035.
121. Olland A.M., Jane-Valbuena J., Schiff L.A., Nibert M.L., Harrison S.C. Structure of the reovirus outer capsid and dsRNA-binding protein sigma3 at 1.8 A resolution. // EMBO J.- 2001.- v.20.- p.979-989.
122. Page R.K., Fletcher O.J., Rowland G.N. Malabsorption syndrome in broiler chickens // Avian Dis.- 1982.- v.26.- p.618-624
123. D.B. Armored RNA Technology for Production of Ribonuclease-Resistant Viral RNA Controls and Standards. // J. Clin. Microbiol.- 1998.- v.36.- p.3590-3594.
124. Patel H., Nade S. Acute staphylococcal septic arthritis: the effect of cloxacillin therapy in an avian model //J.Orthop. Res.- 1988.- v.6.- p.63-72
125. Pertile T.L., Karaca K., Walser M.M., Sharma J.M. Suppressor macrophages mediate depressed lymphoproliferation in chickens infected with avian reovirus. //Vet Immunol Immunopathol.- 1996.- v.53.- p.129-145.
126. Pertile T.L., Sharma J.M., Walser M.M. Reovirus infection in chickens primes splenic adherent macrophages to produce nitric oxide in response to T cell-produced factors. // Cell Immunol.-1995,- v. 164,- p.207-216.
127. Pertile T.L., Walser M.M., Sharma J.M., Shivers J.L. Immunohistochemical detection of lymphocyte subpopulations in the tarsal joints of chickens with experimental viral arthritis. //Vet Pathol.- 1996.- v.33.- p.303-310.
128. Pringle C.R. Virus taxonomy- 1999//Arch.Virol.- 1999,-v.144.-p.421-429.
129. Reoviridae // in: Murphy F.A. Veterinary Virology.- London:Academic Press.-1999.- p.391-398.
130. Robertson M.D., Wilcox G.E., Kibenge F.S. Prevalence of reoviruses in commercial chickens. // Aust Vet J.- 1984.- v.61.- p.319-322.
131. Roessler D.E., Rosenberger J.K. In vitro and in vivo characterization of avian reoviruses. III. Host factors affecting virulence and persistence. //Avian
132. Dis.- 1989.- v.33.- p.555-565.
133. Rosenberger J.K., Olson N.O. Viral arthritis // Calnek B.W., et.al., Diseases of poultry, 10th ed. Mousby-Wolfe. - London.- 1997. - v.711-720.
134. Rosenberger J.К., Sterner F.J., Botts S., Lee K.P., Margolin A. In vitro and in vivo characterization of avian reoviruses. I. Pathogenicity and antigenic relatedness of several avian reovirus isolates. // Avian Dis.- 1989.- v.33.-p.535-544.
135. Rosenstraus M., Wang Z., Chang S.-Y., DeBonville D., Spadoro I.P. An internal control for routine diagnostic PCR: desighn, properties, and effect on clinical performance. // J. Clin. Microbiol.-1998.- v.36.- p.191-197.
136. Rozinov M.N., Fields B.N. Evidence for phenotypic mixing with reovirus in cell culture. //Virology.- 1996.- v.215.- p.207-210.
137. Sahu S.P., Olson N.O. Comparison of the characteristics of avian reoviruses isolated from the digestive and respiratory tract, with viruses isolated from the synovia. //Am J Vet Res.- 1975.- v.36.- p.847-850.
138. Seliger L.S., Zheng K., Shatkin A.J. Complete nucleotide sequence of reovirus L2 gene and deduced amino acid sequence of viral mRNA guanililtransferase // J.Biol.Chem.- 1987.- v.262.- p.16289-16293.
139. Sellers H.S., Linnemann E.G., Pereira L., Kapczynski D.R. Phylogenetic analysis of the sigma 2 protein gene of turkey reoviruses. //Avian Dis.- 2004.-v.48.- p.651-657.
140. Sharma J.M., Karaca K., Pertile T. Virus-induced immunosuppression in chickens. // Poult Sci.- 1994.- v.73.- p.1082-1086.
141. Shatkin A.J., Kozak M. Biochemical aspects of reovirus transcription and translation // in Joklik W.K. The Reoviridae.- New York: Plenum Press.- 1983.-p.79-100.
142. Shepard D.A., Ehnstrom J.G., Skinner P.J., Schiff L.A. Mutations in the zinc-binding motif of the reovirus capsid protein delta 3 eliminate its ability to associate with capsid protein mu 1. // J Virol.- 1996.- v.70.- p.2065-2068.
143. Shmulevitz M., Duncan R. A new class of fusion-associated small transmembrane (FAST) proteins encoded by the non-enveloped fusogenic reoviruses. // EMBO J.- 2000.- v.19.- p.902-912.
144. Enteropathogenicity of Dutch and German avian reoviruses in SPF white leghorn chickens and broilers. //Vet Res.- 2003.- v.34.- p.285-295.
145. Spinner M.L., Di Giovanni G.D. Detection and identification of mammalian reoviruses in surface water by combined cell culture and reverse transcription
146. PCR. // Appl Environ Microbiol.- 2001.- v.67.- p.3016-3020.
147. Sterner F.J., Rosenberger J.K., Margolin A., Ruff M.D. In vitro and in vivo characterization of avian reoviruses. II. Clinical evaluation of chickens infected with two avian reovirus pathotypes. //Avian Dis.- 1989.- v.33.- p.545-554.
148. Takase K., Nishikawa H.( Nonaka F., Yamada S. Pathogenic characteristics of highly virulent avian reovirus, strain 58-132, isolated from a chicken with tenosynovitis. // Nippon Juigaku Zasshi.- 1985.- v.47.- p.567-574.
149. Takehara K., Kiuchi H., Kuwahara M., Yanagisawa F., Mizukami M., Matsuda H., Yoshimura M. Identification and characterization of a plaque forming avian rotavirus isolated from a wild bird in Japan. // J Vet Med Sci.-1991.- v.53.- p.479-486.
150. Tang K.N., Fletcher O.J. Application of the avidin-biotin-peroxidase complex (ABC) technique for detecting avian reovirus in chickens. // Avian Dis.- 1987.- v.31.- p.591-596.
151. Tang K.N., Fletcher O.J., Villegas P. Comparative study of the pathogenicity of avian reoviruses. //Avian Dis.- 1987.- v.31.- p.577-583.
152. Tang K.N., Fletcher O.J., Villegas P. The effect on newborn chicks of oralinoculation of reovirus isolated from chickens with tenosynovitis. // Avian Dis.-1987.- v.31.- p.584-590.
153. Tantawi H.H., Amina N. Youssef Y.I., Fawzia M., Al-Abdulla J.M., el-Batrawi A., el-Ghawas A., Nasser A.A., Reda I.M. Infectious tenosynovitis in broilers and broiler breeders in Egypt. //Vet Res Commun.- 1984.- v.8.- p.229-235.
154. Upchurch D.A., Shankarappa R., Mullins J.I. Position and degree of mismatches and the mobility of DNA heteroduplexes // Nucl.ac.res.- 2000.-v.28.- p.69-74.
155. Van der Heide L. The history of avian reovirus. // Avian Dis.- 2000.- v.44.-p.638-641.
156. Van Loon A.A., Koopman H.C., Kosman W., Mumczur J., Szeleszczuk O., Karpinska E., Kosowska G., Lutticken D. Isolation of a new serotype of avian reovirus associated with malabsorption syndrome in chickens. //Vet Q.- 2001.-v.23.- p.129-133.
157. Van Loon A.A., Suurland В., van der Marel P. A reovirus challenge model applicable in commercial broilers after live vaccination. // Avian Pathol.- 2002.-v.31.- p.13-21.
158. Van Loon A.A.W.M. Novel antigenic class of avian reoviruses // Eur. Patent № EP 1 024 189 A1, Application, # 00200256.6, date of filling: 25.01.2000
159. Vasserman Y., Eliahoo D., Hemsani E., Kass N., Ayali G., Pokamunski S., Pitcovskiad J. The influence of reovirus sigma С protein diversity on vaccination efficiency. //Avian Dis.- 2004.- v.48.- p.271-278.
160. Vielitz E., Conrad C., Voss M. The occurrence of a reovirus variant in a German broiler flock // Dtsch Tierarztl Wochenschr.- 1989.- v.96.- p.380-382.
161. Wang H., Fadl A.A., Khan M.I. Multiplex PCR for avian patogenic micoplasmas//Molecular and cellular probes.- 1997.- v.11.- p.211-216
162. White P.A., Zhai X., Carter I., et al. Simplified hepatitis С virus genotyping by heteroduplex mobility analysis // J.Clin.Microbiol.- 2000.- v.38.- p.477- 482.
163. Wiener J.R., Bartlett N.M., Joklik W.K. The sequences of reovirus serotype3 genome segments M1 and M3 encoding the major protein p2 and the major nonstructural protein pNS, respectively // Virology.- 1989.- v.169.- p.293-304.
164. Wiener J.R., Joklik W.K. Evolution of reovirus genes: a comparison of serotype 1, 2 and 3 M2 genome segments which encode the major structural capside protein p1C //Virology.- 1988.- v. 163.- p.603-613.
165. Wiener J.R., Joklik W.K. The sequences of the reovirus serotype 1, 2 and 3 L1 genome segments and analysis of the mode of divergence of the reovirus serotypes //Virology.- 1989.- v.169.- p. 194-203.
166. Wood G.W., Nicholas R.A.J., Hebert C.N., Thornton D.H. Serological comparison of avian reovirus // J.comp.path.- 1980.- v.90.- p.29-38.
167. Xie Z., Fade A.A., Girshik Т., Khan M.I. Amplification of avian reovirus RNA using the reverse transcriptase- polymerase chain reaction // Avian Dis.-1997.-v.41.- p.654- 660.
168. Zou S., Brown E.G. Identification of sequence elements containing signals for replication and encapsidation of the reovirus M1 genome segment // Virology.- 1992.- v. 186.- p.377-388.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.