Полиморфизм ДНК микобактерий, вызывающих неспецифические туберкулиновые реакции у сельскохозяйственных животных тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 16.00.03, кандидат биологических наук Першикова, Наталья Леонидовна

• Першикова, Наталья Леонидовна
• кандидат биологических наук
• 2008

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Першикова, Наталья Леонидовна

ВВЕДЕНИЕ.

1. Обзор литературы.

1.1. Общие сведения о туберкулёзе.

1.1.1. Источники и пути передачи микобактерий.

1.2. Диагностика туберкулёза сельскохозяйственных животных.

1.2.1. Аллергический метод.

1.2.2. Патолого-анатомический метод.

1.2.3. Бактериологическое исследование.

1.2.4. Биологический метод (биопроба).

1.3. Методы молекулярной биологии и их использование в диагностике туберкулёза.

1.3.1. Полимеразная цепная реакция. Подбор праймеров.

1.3.2. Штаммовое типирование микобактерий.

1.3.3. Секвенирование.

1.3.4. Филогенетический анализ.

1.4. Особенности молекулярного строения и функционирования микобактерий.

1.4.1. Генетический полиморфизм.

1.4.2. Мобильные элементы генома микобактерий.

1.4.2.1. Инсерции М. paratuberculosis, М. avium и М. intracellulare: IS900, IS901, IS1141.

1.4.2.2. Инсерции М. tuberculosis complex: IS6110, IS 1081 и новая IS-подобная последовательность.

1.4.2.3. Инсерции М. smegmatis: IS6120, IS 1096 и IS 1137.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Полиморфизм ДНК микобактерий, вызывающих неспецифические туберкулиновые реакции у сельскохозяйственных животных»

Актуальность темы. Важным элементом в диагностике туберкулёза сельскохозяйственных животных является быстрая, чувствительная и специфическая идентификация этиологического фактора. До сих пор постановка диагноза в значительной степени базировалась на клинических признаках болезни, внутрикожной туберкулиновой пробе, результатах патологоанатомического вскрытия, культивировании микобактерий на специальных питательных средах, а также постановке биопробы на лабораторных животных (В.М. Авилов и др., 1997). Однако, так называемые, атипичные микобактерии усложняют постановку окончательной дифференциальной диагностики туберкулёза (А.И. Каграманов, 1964). Атипичные микобактерии, обитающие в окружающей среде и персистиругощие в организме животных, сенсибилизируют его к ППД туберкулину для млекопитающих, что объясняется их антигенным родством с возбудителем туберкулёза (Ю.Я. Кассич, 1990). В результате чего затрудняется профилактический контроль благополучия стад крупного рогатого скота при проведении внутрикожной туберкулиновой пробы (Р.В. Костюк, 2004; А.Х. Найманов и др., 2004).

Благодаря этому при организации эпидемиологического и эпизоотологического контроля различных инфекций, включая туберкулёз, важное место приобретают молекулярно-генетические данные (Г.Д. Каминский и др., 1989; В.В. Макаров и др., 1991; L.A. Sechi, 1999).

Значение молекулярных подходов определяется тем, что они: во-первых, предоставляют наиболее точные из возможных средств слежения за распространением возбудителя; во-вторых, позволяют отслеживать изменения в биологически важных участках генетического материала возбудителя туберкулёза, происходящие в процессе взаимодействия инфекционного агента с организмом чувствительного хозяина и со средой; в— третьих, способствуют описанию структуры популяции возбудителя и позволяют выявлять протекающие во времени изменения в популяционной структуре, которые могут вызвать эпизоотию.

Развитие молекулярной биологии в последние годы позволило значительно повысить эффективность индикации микобактерий туберкулёза в крови, биоматериале и культуре, выросшей на питательной среде, плевральной жидкости, мокроте, моче, ликворе, периферической крови, биопсийном материале, парафинированных тканях (Б.И. Вишневский, 1998; М.А. Владимирский, 2003; D.HPersing, 1991).

Базовым методом молекулярно-генетических исследований являются диагностические тест-системы, основанные на полимеразной цепной реакции (ПЦР) (А.Н. Шаров, 1999, 2000; Б. Глик и др., 2002; D. Cousins, 1998; R.K. Saiki, 1985; К. В. Mullis et al., 1987; R.K. Saiki, 1988), направленные на выявление ДНК микобактерий туберкулёза в диагностическом материале (A.JL Лазовская и др., 2004; А.А. Майорова и др., 2004; М.С. Калмыкова, 2007; Public Health Mycobacteriology, 1985). В настоящее время в ветеринарных лабораториях применяют ПЦР-тест-системы четырёх производителей, в том числе, три комплексные для выявления ДНК Mycobacterium bovis и Mycobacterium tuberculosis производства ФГУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора (ЦНИИЭ), ЗАО «ЛАГИС», ООО «Компания «БИОКОМ» и одну дифференцирующую Mycobacterium bovis от Mycobacterium tuberculosis производства НПО «НАРВАК». Для выявления ДНК Mycobacterium avium используют тест-систему «АВИУМ» производства ЦНИИЭ (М.А. Владимирский, 2003; А.Н.Шаров, 2003; М.С. Калмыкова, 2007).

Достоинства генодиагностики заключаются в высокой специфичности, быстром получении результатов анализа и возможности обнаружения единичных микобактериальных клеток в клиническом биоматериале (М.Ю. Аксёнов и др., 1993; Б. Блум, 2002; Т.А. Борисова, 2004; Т.В. Гребенникова и др., 2004; И.Н. Корнева и др., 2004; К.Э. Розанцев, 1991; A. Lassence et al, 1992). ПЦР даёт возможность диагностировать не только острые, но и латентные формы инфекции (А.А. Панин, 1999; В.Г. Жуховицкий, 2000). Метод особенно актуален для диагностики туберкулёза, поскольку эффективен в отношении возбудителей с высокой антигенной изменчивостью (в том числе L-форм), определение которых требует длительного культивирования или сложных питательных сред, а также внутриклеточных паразитов и персистирующих микроорганизмов (М.Ю. Аксёнов и др., 1993; М. Ю. Шестопалов и др., 1999; В.В. Макаров и др., 2005; Patel et al., 1990; М.М. Altamirano et al., 1992; Soini et al.,1992; Victor et al., 1992). Наряду с этим метод ПЦР перспективен при проведении межвидовой и штаммовой идентификации туберкулёзных и нетуберкулёзных микобактерий (A.JL Лазовская и др., 2007).

Для выявления ДНК микобактерий туберкулёза в пробах используют различные праймеры. Одни направлены на амплификацию фрагментов ДНК генов, кодирующих микобактериальные антигены; другие — на амплификацию повторяемых последовательностей у микобактерий туберкулёзного комплекса; третьи — на амплификацию рибосомальной РНК (Н.З Хазипов и др., 2002).

Таким образом, достижения современной биотехнологии позволяют, используя молекулярно-генетические подходы, разрабатывать сверхчувствительные способы диагностики инфекционных болезней человека и животных, в том числе туберкулёза крупного рогатого скота.

Цель исследования - изучить генетический полиморфизм и особенности филогенетических и популяционных взаимоотношений популяции микобактерий, циркулирующих среди сельскохозяйственных животных (на территории Новосибирской области) при помощи молекулярно-генетических методов исследования.

Для достижения цели были поставлены следующие задачи:

1. Провести подбор праймеров и оптимальных параметров проведения диагностической ПЦР, определить её чувствительность и специфичность. Тестировать референтные штаммы и изоляты микобактерий.

2. Изучить генетический полиморфизм культур, изолированных от животных, а также из объектов окружающей среды и грызунов благополучных и неблагополучных по туберкулёзу хозяйств.

3. Определить степень сходства изолированных культур микобактерий внутри изучаемой видовой выборки и в сравнении с прототипными штаммами.

Научная новизна. Разработана диагностическая ПЦР, использующая в качестве мишени mig-ген M.avium, систему senX3-regX3 для дифференциации M.tuberculosis от М. bovis. Изучено генетическое разнообразие микобактерий. Получены данные по нуклеотидным последовательностям фрагмента mig-гена М. avium, и системы senX3-regX3 М. tuberculosis complex. Определена степень сходства микобактерий с использованием популяционного и филогенетического методов исследования. Впервые от свиней на территории России выделен потенциально новый вид микобактерий М. arupense.

Теоретическая и практическая значимость работы. Результаты исследований представляют теоретическую и практическую ценность, поскольку позволяют расширить научные знания о генетическом полиморфизме и популяционных взаимоотношениях микобактерий, циркулирующих среди сельскохозяйственных животных и могут быть использованы при проведении дифференциально-диагностических исследований на туберкулёз сельскохозяйственных животных, а также при изучении молекулярной эпизоотологии болезни.

Проведены подбор и тестирование олигонуклеотидных праймеров для детекции и дифференциации М. tuberculosis, М. bovis, М. avium, а также атипичных микобактерий. Доказана их эффективность для видоспецифичной экспресс-диагностики туберкулёза и проверена на ДНК 95 штаммов и изолятов различных видов микобактерий. -------

Материалы диссертации использованы при составлении методических рекомендаций «Использование полимеразной цепной реакции со специфическими олигоиуклеотидными праймерами для определения видовой принадлежности микобактерий» (Утв. подсекцией «Инфекционная патология животных в регионе Сибири и Дальнего Востока» отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии, протокол № 4, 2007) и «Применение ДНК-маркеров при генетическом картировании культур Mycoplasma species, Fusobacterium neccrophorum и Mycobacterium avium» (Утв. подсекцией «Инфекционная патология животных в регионе Сибири и Дальнего Востока» отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии, протокол № 1, 2008).

Апробация работы. Результаты работы доложены на заседаниях Учёного совета ГНУ Институт экспериментальной ветеринарии Сибири и Дальнего Востока СО Россельхозакадемии (Новосибирск, 2003 - 2007 гг.), на науч.-практич. конф. «Информационные технологии, информационные измерительные системы и приборы в исследовании сельскохозяйственных процессов», (Новосибирск, 2003), II-й международ, науч.-практич. конф. молодых учёных (Новосибирск, 2006 г.), на Российской науч.-практич. конф., посвящённой 110-летию кафедры инфекц. Болезней Военно-медицинской академии им. С.М. Кирова (Санкт-Петербург, 2006), междунар. конф. молодых учёных (г. Омск, 2006 г), III Российской науч. конф. с международ, участием (Новосибирск, 2006), на междунар. конф. «Молекулярная биология 2007» (Москва, 2007).

По материалам диссертационной работы опубликованы 6 печатных работ, в том числе 1 статья в журнале, рекомендованном ВАК РФ.

Объём и структура диссертации. Работа изложена на 110 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов, выводов и списка литературы, включающего 190 источников, из них 108 на иностранных языках. Диссертация иллюстрирована 6 таблицами, 20 рисунками.

Заключение диссертации по теме «Ветеринарная эпизоотология, микология с микотоксикологией и иммунология», Першикова, Наталья Леонидовна

4. ВЫВОДЫ.

1. Разработанная тест-система на основе ПЦР с праймерами, комплементарными последовательности mig-гена, обладает высокой чувствительностью и специфичностью, что было подтверждено генотипированием выявленных изолятов М. avium. Реакция достоверно выявляет ДНК исследованных референтных штаммов и изолятов М. avium. ПЦР с праймерами на район mig-гена позволяет достоверно идентифицировать М. avium от других видов микобактерий.

2. Установлено, что в Новосибирской области в 63,2% случаях этиологическим фактором неспецифического реагирования крупного рогатого скота на ППД туберкулин для млекопитающих являются М. avium.

3. При генетическом изучении изолятов М. avium, выделенных от разных видов животных, не выявлено гостальной специфичности и генетической вариабельности.

4. М. avium, адаптируясь к организму несвойственных хозяев, приобретают несколько другие фенотипические характеристики, в основном у них изменяются культуральные свойства. На плотных питательных средах они проявляют фенотипические признаки типичных микобактерий.

5. На территории России установлена циркуляция потенциально нового вида микобактерий - М. arupense, относящихся к М. terrae complex. Впервые в мире М. arupense выделены от свиней, имеющих характерные для микобактериоза изменения лимфатических узлов.

6. В Новосибирской области отмечено широкое персистирование различных видов микобактерий в организме следующих видов грызунов: Apodemus agrarius (полевая мышь), Apodemus uralensis (малая лесная мышь), Clethryonomis gloreolus (рыжая полевка), Clethryonomis rutilus (красная полевка), Microtus arvalis (полевка обыкновенная), Microtus gregalis (узкочерепная полевка), Microtus oeconomus (полевка-экономка), Sorex araneus (обыкновенная бурозубка), Sorex caecutiens (средняя бурозубка).

5. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

По материалам диссертации разработаны:

1. Методические рекомендации «Использование полимеразной цепной реакции со специфическими олигонуклеотидными праймерами для определения видовой принадлежности микобактерий» (Утв. подсекцией «Инфекционная патология животных в регионе Сибири и Дальнего Востока» отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии, прот. № 4, 2007).

2. Методические рекомендации «Применение ДНК-маркеров при генетическом картировании культур Mycoplasma species, Fusobacterium neccrophorum и Mycobacterium avium» (Утв. подсекцией «Инфекционная патология животных в регионе Сибири и Дальнего Востока» отделения ветеринарной медицины Россельхозакадемии, прот. № 1,2008 г).

3. Учитывая высокую чувствительность ПЦР с праймерами на район mig-гена М. avium, считаем возможным включение данного метода в схему дифференциально-диагностических исследований на туберкулёз крупного рогатого скота и постановки предварительного диагноза на туберкулёз сельскохозяйственных животных.

4. При проведении лабораторной дифференциальной диагностики неспецифических туберкулиновых реакций у крупного рогатого скота целесообразна постановка ПЦР на спейсерную последовательность 16S-23S рРНК из биоматериала от животных реагирующих на ППД туберкулин для млекопитающих.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Першикова, Наталья Леонидовна, 2008 год

1. Авербах, М.М. Иммунологические основы противотуберкулёзной вакцинации / М.М. Авербах, В.И. Литвинов. М.: Медицина, 1970. - 220 с.

2. Аксёнов, М.Ю. Диагностика инфекционных заболеваний с помощью метода полимеразной цепной реакции / М.Ю. Аксёнов, А.Л. Гинцбург // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1993. - №4. — С. 17.

3. Алтухов, Ю.П. Генетический мономорфизм видов и его возможное биологическое значение/ Ю.П.Алтухов, Ю.Г. Рычков // Журнал общей биологии. 1972. - Т. 33. - С. 281 - 300.

4. Алтухов, Ю.П. Наследственное биохимическое разнообразие в процессах эволюции и индивидуального развития / Ю.П. Алтухов, Л.И. Корочкин, Ю.Г. Рычков // Генетика. 1996. - Т. 32. - №11. - С. 1450 - 1473.

5. Аляпкина, Ю.С. Количественный ПЦР-анализ: разработка системы определения содержания амплифицированного фрагмента ДНК / Ю.С. Аляпкина и др. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -1994.-№5.-С. 22-26.

6. Блум, Б. Туберкулёз. Патогенез, защита, контроль / Б. Блум. М.: Медицина, 2002. - 696 с.

7. Борисова, Т.А. ПЦР для индикации микобактерий с использованием различных тест-систем в животноводческих хозяйствах Республики Татарстан / Т.А. Борисова и др. // Генодинамика инфекционных болезней. -Москва, 2004. С. 205 - 208.

8. Бороздин, Э.К. Иммуногенетика инфекционных болезней крупного рогатого скота / Э. К. Бороздин, С. Д. Джахаев, В. М. Захаров и др. М.: 2001.- С.16.

9. Бравве, Ю.И. Инфекционные болезни и предиктивная геномная медицина / Ю.И. Бравве и др. // Генодиагностика инфекционных болезней: Материалы российской науч.-практ. конф. Новосибирск, 2005. - С. 18-21.

10. Вартапетян, А.Б. Полимеразная цепная реакция / А.Б. Вартапетян // Молекулярная биология. 1991. - Т. 25. - Вып. 4. - С. 926 - 936.

11. Василёв, В.Н. Микобактериозы и микозы лёгких / В.Н. Василёв. София, 1971.- С. 168.

12. Вишневский, Б.И. Чувствительность и специфичность теста. Основанного на полимеразной цепной реакции. При диагностике туберкулёза периферических лимфатических узлов / Б.И. Вишневский, Е.Д. Мирлина // Проблемы туберкулёза. 1998. - №4. - С. 25 - 28.

13. Владимирский, М.А. Эффективность обнаружения микобактерий туберкулёза методом ПЦР / М.А. Владимирский, JI.K. Шипина, М.В. Левченко // Проблемы туберкулёза и болезней лёгких. 2003. - №12. - С. 28 -30.

14. Глик, Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение / Б. Глик, Дж. Пастернак. М.: 2002. - С. 94.

15. Голышевская, В.И. Возбудитель туберкулёза: биохимические особенности и трудности микробиологической диагностики / В.И. Голышевская // Вестник РАМН. 1995. - № 7. - С. 13 - 15.

16. Голышевская, В.И. Микробиологическая диагностика туберкулёза / В.И. Голышевская и др. // Вестник РАМН. 1995. - № 7. - С. 16-18.

17. Гребенникова, Т.В. Молекулярные методы исследования в диагностике туберкулёза / Т.В. Гребенникова и др. // Ветеринарная патология. 2004. -№ 1. - С.92 - 93.

18. Гришина, Т.Д. Идентификация возбудителя туберкулёза в клиническом материале с помощью метода полимеразной цепной реакции / Т.Д. Гришина и др. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1995.- №1. -С.36-38.

19. Гущин, А.Е. Разработка и апробация тест-системы для диагностики Chlamydia trachomatis на основе технологии Nucleic Acid Sequence Based Amplification в реальном времени (NASBA-REAL-TIME) / А.Е. Гущин и др.

20. Генодиагностика инфекционных болезней: Материалы российской науч.-практ. конф. Новосибирск. - 2005. - С. 257 - 264.

21. Данко, Ю.Ю. Эпизоотологический надзор при туберкулёзе крупного рогатого скота: Автореф. дис.д-ра вет. наук. / Ю.Ю. Данко СПб., 2000. -46 с.

22. Донченко, А. С. Взаимосвязь туберкулёза человека и животных / А.С. Донченко, В.Н. Донченко // науч.-техн. бюл. / ВАСХНИЛ. Сиб. отд-ние. -Новосибирск, 1985. Вып. 32. - С. 5 - 8.

23. Донченко, А. С. Диагностика туберкулёза крупного рогатого скота / А.С. Донченко, Н.П. Овдиенко, Н.А. Донченко. Новосибирск, 2004 - С. 105 — 126.

24. Драбкина, P.O. Микробиология туберкулёза / P.O. Драбкина. М.: 1963.254 с.

25. Душкин, В.А. Опыт работы по использованию метода ПЦР в диагностике туберкулёза КРС в Нижегородской области / В.А. Душкин, О.В. Воинова, И.В. Ефимичев // Ветеринарная патология. 2004. - № 1. - С. 99 - 103.

26. Егоров, A.M. Некоторые проблемы химиотерапии туберкулёза с учётом новых данных о его возбудителе / A.M. Егоров, Ю.О. Сазыкин // Антибиотики и химиотерапия. — 2000. №5. — С.З — 5.

27. Жумаш, А.С. Пути оздоровления хозяйств от туберкулёза крупного рогатого скота / А.С. Жумаш, К.А. Тургенбаев.- Алматы, 2005.- С. 59.

28. Журнакова, М.А. Современное состояние вопроса диагностики туберкулёза крупного рогатого скота / М.А. Журнакова // Проблемы борьбы с туберкулёзом и паратуберкулёзом сельскохозяйственных животных. — Воронеж, 1965. С. 47 - 49.

29. Жуховицкий, В.Г. Принцип безусловной необходимости и разумной достаточности в планировании лабораторных помещений для постановки полимеразной цепной реакции / В.Г. Жуховицкий // Лаборатория. 2000. -№4. - С. 3 - 5.

30. Завгородний, А. И. Виды микобактерий и их эпизоотическое значение для крупного рогато скота / А.И. Завгородний // Вет. медицина. Харьков, 2000. -Вып. 78.-Т.1.-С. 108-113.

31. Ильина, Е.Н. Актуальные аспекты типирования микробов и вирусов: сб. тр. 5-й Всероссийской науч.-практ. конф. «Генодиагностика инфекционных болезней». М. 2004. - Т. II. - С. 34 - 35.

32. Использование полимеразной цепной реакции (ПЦР) в клинической практике: Метод. Рекомендации / Министерство здравоохранения Кыргызской Республики; Сост. А.А. Бонецкий и др. Бишкек, 2000.- С. 3 — 4.

33. Каграманов, А.И. Легочной микобактериоз / А.И. Каграманов // Руководство по микробиологической клинике и эпидемиологии инфекционных болезней. Т. IV. - М.: Медицина, 1964. - С. 611 - 614.

34. Калмыкова, М.С. Диагностическая ценность ПЦР-тест-систем при туберкулёзе животных: Автореф. дис.канд. ветеринар, наук. / М.С. Калмыкова. — Москва, 2007. 27 с.

35. Каминский, Г.Д. Молекулярная эпидемиология / Г.Д. Каминский. В.Д. Беляков, Р.Х. Яфаев // Эпидемиология. М., 1989. - С. 84 - 92.

36. Кассич, Ю.Я. Туберкулёз животных и меры борьбы с ним / Ю.Я. Кассич. -Киев, 1990.-С.15.

37. Корнева, И.Н. Конструирование ПЦР-тест-систем для обнаружения и идентификации микобактерий туберкулёза у животных / И.Н. Корнева, В.В. Дёмкин // Ветеринарная патология.- 2004. № 1. - С. 95 - 96.

38. Костюк, Р.В. ПЦР при контроле благополучия скота по туберкулёзу / Р.В. Костюк // Ветеринарная патология. 2004. - № 1. - С. 105.

39. Кузин, А.И. Вопросы диагностики латентного микробизма при туберкулёзе крупного рогатого скота / А.И. Кузин // Матер. Всесоюзной науч. конф. Омск, 1980.- С. 113-115.

40. Ладыгина, В.А. Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции / В.А. Ладыгина, О.А. Карпова, Е.Т. Староверова// Современные технологии в лабораторной диагностике. 2001. -№3.-С. 59-60.

41. Лазовская, А.Л. Генетическое типирование штаммов M.bovis / А.Л. Лазовская, З.Г. Воробьёва// Ветеринария. 2004. - № 7. - С.26 - 28.

42. Льюин, Б. Гены / Б. Льюин; под ред. Г.П. Георгева. 1987. - С. 458 - 481.

43. Мазин, А.В. Методы молекулярной генетики и генетической инженерии / А.В. Мазин и др.. Новосибирск; Наука, 1990. - 248с.

44. Макаров, В.В. ПЦР в диагностике лейкоза крупного рог атого скота / В.В. Макаров, Д.П. Гринишин // Ветеринария. 2005.- №4. - С. 9 - 10.

45. Макаров, В.В. Рестрикционный анализ вирусных ДНК и вопросы эпизоотологии / В.В. Макаров. Е.К. Сенечкина // Вестник с.-х. науки. 1991. - №3. - С. 143-146.

46. Маниатис, Т. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э.Фрич, Дж. Сэмбрук. М.: Мир, 1984. - 112 с.

47. Матракшин, А.Г. Генотипическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis из Республики Тыва / А.Г. Матракшин и др. // Проблемы туберкулёза и болезней лёгких. 2004. - №3. - С. 37 - 40.

48. Маянский, А.Н. Микобактерии: туберкулёз и микобактериозы / А.Н. Маянский. — Изд-во Нижегородской государственной медицинской академии, 2000. - 74 с.

49. Момыналиев, К.Т. Перспективы применения методов ДНК-диагностики в * лабораторной службе / К.Т. Момыналиев, В.М. Говорун // Клиническая лабораторная диагностика. 2000. - №4. - С. 25 — 32.

50. Найманов, А.Х. ПЦР при диагностике туберкулёза крупного рогатого скота / А.Х. Найманов и др. // Ветеринария. 2004. - № 10. - С. 19-23.

51. Наставление по диагностике туберкулёза животных : офиц. текст. М.: 2002 г. - 69 с.

52. Новак, Д.Д. Туберкулёз крупного рогатого скота / Д.Д. Новак. Алма-Ата: Кайнар, 1984.- 158 с.

53. Нуратинов, Р.А. Вопросы микобактерий и родственных им микроорганизмов / Р.А. Нуратинов // Ветеринария. 1999. - №9. - С. 27 - 30.

54. Нуратинов, Р.А. Питательные среды для индикации и культивирования микобактерий / Р.А. Нуратинов // Ветеринария. — 2004.- №3. С. 24 - 27.

55. Овдиенко, Н.П. Бактериологическая диагностика туберкулёза животных / Н.П. Овдиенко и др. // Ветеринария. — 2006. № 12. - С. 3 - 5.

56. Оттен, Т.Ф. Возможности и перспективы бактериологической диагностики микобактериоза / Т.Ф. Оттен и др. // Проблемы туберкулёза и болезней лёгких. 2004.- №5. - С. 32 - 35.

57. Розанцев, К.Э. Полимеразная цепная реакция in vitro новый подход в диагностике / К.Э. Розанцев // Бюл. ВИЭВ. - 1991. - вып. 75 - 76. С. 47 - 50.

58. Романенко, В.Ф. Генетическая обусловленность адаптивной изменчивости микобактерий туберкулёза / В.Ф. Романенко // Ветеринария. -2006. -№ 12.-С. 23-25.

59. Саики, Р. Полимеразная цепная реакция / Р. Саики, У. Гиленстен, Г. Эрлих // Анализ генома. Методы: под ред. К.Дейвиса. — М.: Мир, 1990. С. 176-190.

60. Сурикова, О. В. Дифференциация микобактерий туберкулеза семейства W-Beijing, распространенных на территории Российской Федерации, на основе VNTR-типирования / О. В. Сурикова и др. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. — 2005. №3.

61. Урбан, В.П. Современные проблемы эпизоотологической науки в связи со специализацией, концентрацией и переводом животноводства на промышленную основу / В.П. Урбан // Актуальные проблемы эпизоотологии.- Казань, 1983. С. 3 - 4.

62. Хазипов, Н.З. Молекулярная генодиагностика в ветеринарии / Н.З. Хазипов, А.Н. Аскарова. Казань, 2002. - С.44.

63. Харазишвили, Д.В. Принципы лабораторной диагностики туберкулёза в гематологии / Д.В. Харазишвили, А.В. Пивник // Проблемы гематологии и переливания крови. 1998. № 3. - С. 50-55.

64. Чан, В. Т.-В. Выделение нуклеиновых кислот из клинических образцов и клеточных культур / Т.-В. В. Чан // Молекулярная клиническая диагностика. Методы: под ред. С. Херрингтона, Дж. Макги. М.: Мир, 1999. - С. 302 -328.

65. Чередник, Ю.А. Молекулярно-генетическое типирование клинических изолятов М. tuberculosis в Украине / Ю.А. Чередник, О.В. Аноприенко, Ю.И. Фещенко // Украинский пульмонологический журнал. — 2005. № 4. - С.66 -68.

66. Черноусова, J1.H. Роль ПЦР-анализа в комплексных бактериологических анализах во фтизиатрии / Л.Н. Черноусова и др. // Проблемы туберкулёза. -2001. № 3. - С.58 - 60.

67. Шагинян, И.А. Геномный полиморфизм возбудителей бактериальных инфекций / И.А. Шагинян, А.Л. Гинцбург // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -1991.-№12.-С.З—9.

68. Шаров, А.Н. Тест-системы при туберкулёзе / А.Н. Шаров, В.А. Седов // Ветеринария. 1998. - № 3. - С. 20 - 22.

69. Шаров, А.Н. Эффективность методов прижизненной диагностики туберкулёза / А.Н. Шаров и др. // Ветеринария. 2000. - №2. - С. 16-18.

70. Шаров, А.Н. ПЦР при диагностике туберкулёза / А.Н. Шаров и др. // Ветеринария. № 10. - С. 19 - 20.

71. Шаров, А.Н. Проблемы ПЦР диагностики туберкулёза / А.Н. Шаров // Ветер, консультант. 2003, - № 21 - 22. - С. 14 - 15.

72. Шемякин, И.Г. Характеристика клинических изолятов Mycobacterium tuberculosis с использованием молекулярно-биологических методов / И.Г. Шемякин и др. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. — 2003.- №1. С.32 - 40.

73. Шибата, Д. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов / Д. Шибата // Молекулярная клиническая диагностика. Методы: под ред. С. Херрингтона, Дж. Макги. М.: Мир, 1999. - С 395 - 398.

74. Шульц, Г . Принципы молекулярной организации белков / Г.Шульц, Р. Ширмер. -М.: Мир, 1982. 354 с.

75. Ablordey, A. PCR Amplification with Primers Based on IS2404 and GC-Rich Repeated Sequence Reveals Polymorphism in Mycobacterium ulcerans / A. Ablordey, R. Kotlowski, J. Swings et al. // J. Clin. Microbiol. 2005. - Vol. 43 -P. 448-451.

76. Agerton, Т. B. Spread of strain W, a hingly drug-resistant strain of Mycobacterium tuberculosis, across the United States / T.B. Agerton, S.E. Valway, R.J. Blinkhorn et al. // Clin. Infect. Dis. 1999. - V.29. - P. 85 - 92.

77. Ahn. C.H. Demographic study of disease due to Mycobacterium kansasii or M. intracellulare — avium in Texas / C.H. Ahn, J.R. Lowell, G.D. Onstand et al. // Chest. 1979. - Vol. 75. - P. 120 - 125.

78. Alix, E. Identification of a Haarlem Genotype Specific Single Nucleotide Polymorphism in the mgtC Virulence Gene of Mycobacterium tuberculosis / E. Alix, S. Godreuil, A.-B. Blanc-Potard // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - P. 2093 - 2098.

79. Altamirano, M. Characterization of a DNA probes for detection of Mycobacterium tuberculosis complex in clinical samples by polymerase chain reaction / M. Altamirano, M.T. Kelly, A. Wong et al. // J. Clin. Microbiol. 1992. -Vol. 30.-P. 2173-21.

80. Autschbach, F.S. High prevalence of Mycobacterium avium subsp. Paratuberculosis IS900 DNA in gut tissues from individuals with Crohn's disease / F.S. Autschbach, U. Eisold, S. Hinz et al. // Gut. 2005. - Vol. 54. - P. 944 - 949.

81. Banu, S. Genotypic Analysis of Mycobacterium tuberculosis in Bangladesh and Prevalence of the Beijing Strain / S. Banu, S.V. Gordon, S. Palmer et al. // J. Clin. Microbiol. 2004. - Vol. 42. - P. 674 - 682.

82. Beggs, M. Specific Identification of Mycobacterium avium Complex Isolates by a Variety of Molecular Technigues / M. Beggs, R. Stevanova, K.D. Eisenach // J. Clin. Microbiol. 2000. - V. 38. - P.508 - 512.

83. Behr, M. A. Crohn's disease, mycobacteria, and NOD2 / M. A. Behr, M. Semret, A. Poon et al. // Lancet Infect. Dis. 2004. Vol. 4. - P. 136 - 137.

84. Bifani, P.J. Clobal dissemination of the Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family strains / P.J. Bifani, B. Mothemo, B.N. Kreiswirth // Trends Microbiol. -2002.-V. 10. -№ l.-p. 45-52.

85. Bifani, P.J. Origin and interstate spread of a New York City multi drug-resistant Mycobacterium tuberculosis clone family / P.J. Bifani, B.B. Plikaytis, V. Kapur et al. // JAMA. 1996. - V. 275 - P. 452 - 457.

86. Bono, M.T. Genotypic characterization of Mycobacterium avium strains recovered from animals and their comparison to human strains / M.T. Bono, C. Jemmi, D. Bernasconi et al. // Scand. Sect. В Microboil. 1995. - Vol. 61. - P. 371 -373.

87. Boom, R. Rapid and simple method for purification of nucleic acids / R. Boom, C.J.A. Sol, M.M. Salimans et al. // J. Clin. Microbiol. 1990. - Vol. 28. -P. 495-503.

88. Bruton, C.J. Nucleotide sequence of IS 110, an insertion sequence of Streptomyces coelicolor A3(2) / C.J. Bruton, K.F. Chater // Nucleic Acids Res. -Vol. 15.-P. 7053-7056.

89. Cirillo, J. D. A novel transposon trap for mycobacteria: isolation and characterization of IS1096 / J. D. Cirillo, R.G. Barletta, B.R. Bloom et al. // J. Bacterid. 1991. -Vol. 173.-P. 7772-7780.

90. Chiodini, R.J. Crohn's disease and the mycobacterioses: a review and comparison of two disease entities / R.J. Chiodini // Clin. Microbiol. Rev. 1989. -V. 2.-P. 90-177.

91. Chiodini, R.J. Characterization of Mycobacterium paratuberculosis and Organisms of the Mycobacterium avium Complex by Restriction Polymorphism of the rRNA Gene Region / R.J. Chiodini // J. Clin. Microbiol. 1990. - Vol. 28. - P. 489 - 494.

92. Cloud, J.L. Identification of Mycobacterium spp. By Using a Commercial 16S Ribosomal DNA Sequencing Kit and Aditional Sequencing Libraries / J.L. Cloud, H. Neal, R. Rosenberry et al. // J. Clin. Microbiol. 2002. - Vol. 40.- P. 400 -406.

93. Cloud, J.L. Mycobacterium arupense sp. nov., a non-chromogenic bacterium isolated from clinical specimens / J.L. Cloud, J.J. Meyer, J.L Pounder et al. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. - Vol.56. - P. 1413 - 1418.

94. Cole, S.T. Analysis of the genome of Mycobacterium tuberculosis H37RV / S.T. Cole, B.G. Barrell // Novartis Found Symp. 1998. - V. 217. - P. 160 - 172.

95. Collins, D.M. Identification of an insertion sequence, IS 1081, in Mycobacterium bovis / D.M. Collins, D.M. Stephens // FEMS Microbiol. Lett. -Vol. 83.-P. 11-16.

96. Cosivi, O. Zoonotic tuberculosis due to Mycobacterium bovis in developing countries / O.Cosivi, J.M. Grange, C.J. Daborn et al. // Emerg. Infect.Dis. 1998. -Vol. 4.-P. 59-70.

97. Cousisns, D. Evaluation of four DNA typing techniques in epidemiological investigations of Bovine Tuberculosis / D. Cousins, S. Williams, E. Liebana et al. // J. Clin. Microbiol. 1998. - Vol. 36,- P. 8 - 88.

98. Durnez, L. First findings of mycobacteria in African rodents and insectivores using stratified pool screening / L. Durnez, M. Eddyani, G.F. Mgode et al. // Appl.Envirol. Microbiol. 2007.

99. Eisenach, K.D. Repetitive DNA sequences as probes for Mycobacterium tuberculosis / K.D. Eisenach, J.T. Crawfort, J.H. Bates // J. Clin. Microbiol. -1988. Vol. 26. - P.2240- 2245.

100. Eisenach, K.D. Polymerase chain reaction amplification of a repetitive DNA sequence specific for Mycobacterium tuberculosis / K.D. Eisenach, M.D. Cave, J.N. Bates et al. // J. Infect. Dis. Vol. 161. - P. 977 - 981.

101. Eisenstein, B.J. The polymerase chain reaction: a new method of using molecular genetics for medical diagnosis / B.J. Eisenstein // N. Engl. J. Med. -1990.-Vol. 322.-P. 178- 183.

102. Fayet, O. Functional similarities between retroviruses and the IS3 family of bacterial insertion sequences / O. Fayet, P. Ramond, P.Polard et al. // Mol. Microbiol. 1990. - Vol. 4. - P. 1771 - 1777.

103. Felsenstein, J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap / J. Felsenstein // Evolution.- 1985. Vol. 39. - P. 787-791.

104. Fleischmann, R.D. Whole-genome comparison of Mycobacterium tuberculosis clinical and laboratory strains / R.D. Fleischmann, D.Alland, J.A. Eisen et al. // J. Bacteriol. 2002. - V. 184. - P. 5,479 - 5490.

105. Frothingham, R. Sequence-Based Differentiation of Strains in the Mycobacterium avium Complex / R. Frothingham, K.H. Wilson // J. Bacteriol. -1993.-Vol. 175.-P. 2818-2825.

106. Frothingham, R. Molecular phylogeny of the Mycobacterium avium complex demonstrates clinically meaningful divisions / R. Frothingham, K.H. Wilson //J. Infect. Dis. 1994. - Vol. 169. - №2. - P. 305 - 312.

107. Gopaul, C.C. Progression Toward an Improved DNA Amplification-Based Typing Technique in the Mycobacterium tuberculosis Epidemiology / C.C. Gopaul, T.J. Brown, A.L. Gibson et al. // J. Clin. Microbiol. 2006. - Vol. 44. - P. 2492 - 2498.

108. Green, E.P. Sequence and characteristics of IS900, an insertion element identified in a human Crohn's disease isolate of Mycobacterium paratuberculosis / E.P. Green, M.L.V. Tizard, M.T. Moss et al. // Nucleic Acids Res. 1989. - Vol. 17.-P. 9063-9073.

109. Guilhot, C. Isolation and analysis of IS6120, a new insertion sequence from Mycobacterium smegmatis / C. Guilhot, B. Gicquel, J. Davies et al. // Mol. Microbiol. 1992.-Vol. 6. - P. 107 - 113.

110. Guilhot, C. Temperature-sensetive mutants of the Mycobacterium plasmidn pAL5000 / C. Guilhot, B. Gicquel, C. Martin // FEMS Microbiol. Lett. 1992. -Vol. 98.-P. 181-186.

111. Hillis, D.M. An empirical test of bootstrapping as a method for assessing confidence in phylogenetic analysis / D.M. Hillis, J.J. Bull // Systematic Biology. -1993. Vol. 42. - P. 182 - 192.

112. Huang, Z. H. Identification of Mycobacterium kansasii by DNA Hybridization / Z. Huang, B.C. Ross, B. Dwyer // J. Clin. Microbiol. 1991. -Vol. 29.-P. 2125-2129.

113. Huard, R.C. PCR-Based Method To Differentiate the Subspecies of the Mycobacterium tuberculosis Complex on the Basis of Genomic Deletions /R.C. Huard, L.C. Lazarinni, W.R. Butler et al. // J. Clin. Microbiol. 2003. - Vol. 41. -P. 1637- 1650.

114. Huebner, R.E. Current practices in mycobacteriology: results of a survey of state public health laboratories / R.E. Huebner, R.C. Good, J.I. Tokars // J. Clin. Microbiol. 1993. - Vol. 31. - P. 771-775.

115. Inderlied, C.B. The Mycobacterium avium Complex / C.B. Inderlied, C.A. Kemper, L.E.M. Bermudez // Clin. Microbiol. Rev. 1993. - Vol. 6. - P. 266 -310.

116. Ingram, C.W. Disseminated infection with rapidly growing mycobacteria / C.W. Ingram, D.C. Tanner, D.T. Durack et al. // Clin. Infect. Dis. 1993. - Vol. 16.-P. 463-471.

117. Khorana, H.G. Total synthesis of the structural gene for the precursor of a tyrosine suppressor transfer RNA from E. coli / H.G. Khorana, K.L. Agarval, P. Besmer et al. // J. Biol. Chem. 1976. - V. 251. - P. 565 - 570.

118. Kim, T.C. Atypical mycobactererial infections: a clinical study of 92 patients / T.C. Kim, N.S. Arora, Т.К. Aldrich et al. // South. Med. J. 1981. - Vol. 74. - P. 1304- 1308.

119. Kapur, V. Is Mycobacterium tuberculosis 15,000 years old? / V. Kapur, T.S. Whittam, J. Musser // J. Infect. Dis. 1994. V. 170. - P. 1348 - 1349.

120. Kumar, S. MEGA2: molecular evolutionary genetics analysis software / S.Kumar, K. Tamura, I.B. Jakobsen et al. // Bioinformatics. 2001. - Vol. 17. - P. 1244-1245.

121. Kunze, Z.M. IS901 , a new member of a widespread class of atypical insertion sequences, is associated with pathogenicity in Mycobacterium avium / Z.M. Kunze, S. Wall, R. Appelberg et al. // Mol. Microbiol. 1991.- Vol. 5. - P. 2265 -2272.

122. Lassence, A. Detection of mycobacterial DNA from patients with tuberculosis pleurisy by means of the PCR: comarison of two protocols / A. Lassence // Thorax. 1992. - V. 47. - P. 265 - 269.

123. Li, L. The complete genome sequence of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis /L. Li, J.P. Bannantine, Q. Zhang et al. // Proc Natl Acad Sci USA. 2005. - Vol. 30. - P. 12344 - 12349.

124. Magdalena, J. Identification of a New DNA Region Specific for Members of Mycobacterium tuberculosis Complex / J. Magdalena, A.Vachee, Ph. Supply et al. // J. Clin. Microbiol. 1998. - Vol.36. - P. 937 -943.

125. Mariani, F. Characterization of an IS-like element from Mycobacterium tuberculosis / F. Mariani, E. Piccolella, V. Colizzi et al. // J. Gen. Microbiol. -2000.-Vol. 139.-P. 1767-1772.

126. Martin, C. Transposition of an antibiotic resistance element in mycobacteria / C. Martin, J. Timm, J. Rauzier et al. // Nature. 1990. - Vol. 345. - P. 739 - 743.

127. Middlebrook, G. Automatable radiometric detection of growth of M. tuberculosis in selective media / G. Middlebrook, Z. Riggiardo, W. D. Tigertt // Am. Rev. Respir. Dis. 1977. - Vol. 115.-P. 1066- 1069.

128. Middlebrook, G. Bacteriology of tuberculosis: laboratory methods / G. Middlebrook, M.L. Cohn // Am. J. Public Health. 1958. - Vol. 48. - P. 844 -853.

129. Moore, D.F. Detection and identification of Mycobacterium tuberculosis directly from sputum sediments by Amplicor PCR / D.F. Moore, J.I. Curry // J. Clin. Microbiol. 1995. - Vol. 33. - P. 2686- 2691.

130. Mullis, K.B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction / K.B. Mullis, F.A. Faloona // Methods Enzymol. 1987. - Vol. 155. -P. 335 - 350.

131. Murray, A. Expression of Escherichia coli b-galactosidase in Mycobacterium bovis BCG using an expression systemisolated from Mycobacterium paratuberculosis which induced humoral and cellular immune responses / A.

132. Murray, N. Winter, M. Langardeni et al. // Mol. Microbiol. Vol. 6. - P. 3331 -3342.

133. Musser, J.M. Negligible genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis host immune system protein targets: evidence of limited selective pressure / J.M. Musser, A. Amin, S. Ramaswamy // Genetics. 2000. - Vol. 155. - P. 7 - 16.

134. Pao, C.C. Detection and Identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA Amplification / C.C. Pao, T.S.B. Yen, Y.-B. You et al. // J. Clin. Microbiol. 1990.-Vol. 28.-P. 1877- 1880.

135. Patel, R.J. Sequence analysis and amplification by polymerase chain reaction of a cloned DNA fragment of Mycobacterium tuberculosis / R.J. Patel, J.W.U. Fries, W.F. Piessens et al. // J. Clin. Microbiol. 1990. - Vol. 28. - P. 513-518.

136. Persing, D. H. Polymerase chain reaction: trenches to benches / D. H. Persing //J. Clin. Microbiol. 1991. - Vol. 29.-P. 1281- 1285.

137. Public Health Mycobacteriology. A Guide For The Level III Laboratory. Centers for Disease Control Atlanta, Georgia 30333, 1985.

138. Ralph, D. Arbitrary Primed PCR Methods for Studying Bacterial Diseases / D. Ralph, M. McCelland // Molecular Bacteriology. Protocols and Clinical Applications. Totowa: Humana Press. 1998. - P. 83 - 102.

139. Remic, D.G. Theory and applications of the polymerase chain reaction / D.G. Remic, S.L. Kunkel, E.A. Holbrook et al. // Am. J. Clin. Pathol. 1990. - Vol. 93. -P. S.49-S.54.

140. Ridley, A.M. Genomic Fingerprinting by Application of rep-PCR / A.M. Ridley // Molecular Bacteriology. Protocols and Clinical Applications. Totowa: Humana Press. 1998. - P. 103- 117.

141. Prammananan, T. Distribution of hsp65 PCR-Restriction Enzyme Analysis Patterns among Mycobacterium avium Complex Isolates in Thailand / T. Prammananan, S. Phunpruch, N. Tingtoy et al. // J. Clin. Microbiol. 2006. - Vol. 44.-P. 3819-3821.

142. Ruf, B. Mycobacteremia in AIDS patients / B. Ruf, D. Schurman, W. Brehmer et al. // Klin. Wochenschr. 1989. - Vol. 67. - P. 717 - 722.

143. Rzhetsky, A. A simple method for estimating and testing minimum evolution trees / A.A. Rzhetsky, M.A. Nei // Mol. Biol. Evol. 1992. - Vol. 9. - P. 945 -967.

144. Saiki, R.K. Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia / R.K. Saiki, S. Scharf, F. Faloona//Science. 1985.-Vol. 230.-P. 1350- 1354.

145. Saiki, R.K. Primer-direct enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase / R.K. Saiki, D.H. Gelfand, S Stoffel et al. // Science. 1988. - Vol. 239. - P. 487 - 491.

146. Saitou, N. The Neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // N. Saitou, M. Nei / Mol. Biol. Evol. 1987. - V. 4. - P. 406 -425.

147. Savelkoul, P.N. Amplified-Fragment Length Polymorphism Analysis: the State of an Art./ P.N. Savelkoul, H.J. Aarts, J. de Haas et al. // J. Clin. Microbiol. -1999-Vol. 37. P. 3083-3091.

148. Schliesser, Th. Tuberculose bei Flutz, Hein- und Zootieren / Th. Schliesser // Fortechr. Vet. Med. 1982. - V. 11 - № 3. - S. 254 - 280.

149. Sechi, L.A. Different strategies for molecular differentiation of Mycobacterium bovis strains isolated in Sardinia, Italy / L.A. Sechi, G. Lori, S.A. Lollai et al. // Applied and environmental microbiology. 1999. - V. 65. - P. 1781 - 1785.

150. Shimodaira, H. Multiple comparisons of log-likelihoods with applications to phylogenetic inference // H. Shimodaira, M. Hasegawa // Mol. Biol. Evol. 1999. -Vol. 16.-P. 1114-1116.

151. Shah, N. P. Occurrence of Overlooked Zoonotic Tuberculosis: Detection of Mycobacterium bovis in Human Cerebrospinal Fluid / N. P. Shah, A. Singhal, A. Jain et al. // J. Clin. Microbiol. 2006. - Vol. 44. - P. 1352-1358.

152. Shinnick, T. The 65-kilodalton antigen of Mycobacterium tuberculosis / T. Shinnick// J. Bacteriol. Vol. 169.-P. 1080- 1088.

153. Sjobring, U. Polymerase Chain Reaction for Detection of Mycobacterium tuberculosis / U. Sjobring, M. Mecklenburg, A. B. Andersen et al. // J. Clin. Microbiol. 1990. - Vol. 28. - P. 2200-2204.

154. Soini H. Detection and identification of mycobacteria by amplification of a segment of the gene coding for the 32-kDa protein / H. Soini, M. Skurnik, K. Liippo et al. // J. Clin. Microbiol. 1992. - Vol. 30. - P. 2025-2028.

155. Springer B. Mycobacterium interiectum, a new species isolated from a patient with chronic lymphadenitis / B. Springer, P. Kirschner, G. Rost-Meyer et al.// J. Clin. Microbiol. 1993. - Vol. 37. - P. 3083-3091.

156. Supply P. Variable human minisatellite-like regions in the Mycobacterium tuberculosis genome / P. Supply, E. Mazars, S. Lesjeanet al. // Mol. Microbiol. 2000.-V. 36.-P.762-71.

157. Swaminathan B. Molecular Typing Methods. Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Application. Washington / B. Swaminathan, G.M. Matar. ASM Press, 1993.- P. 26-50.

158. Thierry D. A. Characterization of a Mycobacterium tuberculosis insercion sequence, IS6110, and its application in diagnosis / D. A. Thierry, V. Brisson-Noel, V. Vincent-Levy-Frebault // J. Clin. Microbiol. 1990. - Vol. 28.- P. 26682673.

159. Tsukamura M. Epidemiologic studies of lung disease due to mycobacteria other than mycobacterium tuberculosis in Japan / M. Tsukamura, N. Kita, H. Shimoide et al. //Rev. Infect. Dis. 1981. - Vol. 3. - P. 997 - 1007.

160. Tsukamura M. Studies of the epidemiology of nontuberculous mycobacteriosis in Japan / M. Tsukamura, N. Kita, H. Shimoide et al. // Am. Rev. Respir. Dis. 1988. - Vol. 137. - P. 1280 - 1284.

161. Via L.E., and J.O. Falkinham III. 1993. GenBank, LI0 239.

162. Victor T. Purification of sputum samples through sucrose improves detection of Mycobacterium tuberculosis by polymerase chain reaction / T. Victor, R. DuToit, P.D. VanHeiden // J. Clin. Microbiol. 1992. - Vol. 30. - P. 1514- 1517.

163. Wallace R.J. Human disease due to Mycobacterium smegmatis / R.J. Wallace, D.R. Nach, M. Tsukamura et al. // J. Infect. Dis. 1988. - Vol. 158. - P. 52 - 59.

164. Wolinsky E. Nontuberculous mycobacteria and associated diseases // Am. Rev. Respir. Dis. 1979.-Vol. 119.-P. 107- 159.

165. Yuen L.K. Characterization of Mycobacterium tuberculosis strains from Vietnamese patient by Southern blot hybridization / L.K. Yuen, B.C. Ross, K.M. Jackson etal. //J. Clin. Microbiol. -1993.- V. 131,- P.1615 1618.