Нуклеотидные последовательности Linaria dalmatica (L.) P. Mill, приобретенные в результате горизонтального переноса тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат биологических наук Павлова, Ольга Андреевна

• Павлова, Ольга Андреевна
• кандидат биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Павлова, Ольга Андреевна

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. Обзор литературы

1. Горизонтальный перенос генов, определение, эволюционный аспект

2. Горизонтальный перенос генов в царстве прокариотов

3. Горизонтальный перенос генов у эукариотов

3.1. Горизонтальный перенос у протистов

3.2. Горизонтальный перенос у грибов

3.3. Горизонтальный перенос у насекомых и нематод

3.4. Горизонтальный перенос у позвоночных

3.5. Горизонтальный перенос у растений

4. Горизонтальный перенос генов между агробактериями и высшими растениями

4.1. Механизмы взаимодействия агробактерий и растений

4.2. Структурная организация Т-ДНК и у/>-области агробактерий, механизмы переноса Т-ДНК в растительные клетки

4.2.1. у/г-область

4.2.2. Т-нить

4.2.3. Интерация Т-ДНК в геном хозяина

4.2.4. Гены, входящие в состав Т-ДНК

4.3. Примеры ГПГ между агробактериями и растениями

4.4. Исследования, посвященные горизонтальному переносу генов, проводимые на кафедре генетики и биотехнологии СПбГУ

5. Заключение

Глава И. Материалы и методы

1. Материалы

1.1 Растительный материал

1.2. Условия выращивания растений

1.3. Условия хранения растительного материала

1.4. Бактериальный материал

1.5. Питательные среды

1.6. Вектора

2. Методы

2.1. Выделение ДНК

2.2. ПЦР

2.2.1. ПЦР в режиме реального времени: моноплекс

2.2.2. ПЦР в режиме реального времени: мультиплекс

2.2.3. Классические варианты ПЦР

2.3. Электрофоретические разделение, подготовка образца к клонированию

2.4. Клонирование

2.5. Определение нуклеотидной последовательности (секвенирование)

2.6. Интернет-ресурсы, используемые в работе

Глава III. РЕЗУЛЬТАТЫ и ОБСУЖДЕНИЯ

1. Характеристика нуклеотидных последовательностей в составе клТ-ДНК сіаітшіса

2. Создание генетических конструкций для изучения функциональности консервативных последовательностей клТ-ДНК Ь.сіаїтаїіса

3. Определение структуры вставки клТ-ДНК в геноме Ь. йаїтсііїса

4. Определение точки инсерции клТ-ДНК в геноме Ь. сіаітшіса

5. Поиск новых примеров горизонтального переноса генов между агробактериями и высшими растениям

Заключение

Список сокращений

Глава V. Выводы

Литература

Приложение №1

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Нуклеотидные последовательности Linaria dalmatica (L.) P. Mill, приобретенные в результате горизонтального переноса»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы. В настоящее время вопросы эволюционного происхождения и родства организмов становятся все более актуальными. Установление вертикальных связей (от родителей к потомкам) не представляется сложным. Однако, помимо вертикальных связей существуют еще и горизонтальные (латеральные). Горизонтальный перенос генов (ГПГ) - явление передачи генетической информации между организмами, которые не соотносятся как родитель и потомок. Способностью к латеральной передаче обладают многие организмы, например: бактерии, вирусы и некоторые виды грибов. Активный перенос генов может происходить в симбиотических, паразитарных или ассоциативных системах, где осуществляется физический контакт клеток. ГПГ может происходить как между близкородственными, так и между филогенетически отдалёнными видами. У прокариотов латеральный обмен широко распространен и является одним из механизмов комбинативной изменчивости. В царстве эукариотов в силу более сложной организации генетического аппарата горизонтальные переносы редки. ГПГ может происходить как между близкородственными, так и между филогенетически отдалёнными видами, например, между агробактериями и высшими рас гениями.

Агробактерии способны передавать и встраивать в геном растительной клетки фрагмент своей плазмиды. Передаваемый участок называется Т-ДНК (от англ. «transferred DNA») и клТДНК (клеточная Т-ДНК) - Т-ДНК в составе генома растения. Агробактерии являются патогенными бактериями по отношению к растениям. В природе вызывают заболевания «корончатый галл» пли «бородатый корень» в зависимости от штамма. За развитие заболевания отвечают гены, входящие в состав переносимой Т-ДНК. Опухоли (корончатый галл или бородатые корни) формируются на прикорневой шейке растения. Важно отметить, что в природе агроинфекция

не приводит к закреплению Т-ДНК и к ее передаче половому потомству. Однако было показано, что в геномах некоторых видов растений родов Nicotiana и Linaria, не подвергавшихся агроинфекции, содержатся последовательности, гомологичные Т-ДНК Agrobacterium rhizogenes. (White et al., 1983, Matvecva et al., 2012). Было показано, что актов трансформации в эволюции рода Nicotiana было несколько (Suzuki et al., 2002). Последовательности, входящие в состав клТ-ДЫК Nicotiana glauca и Linaria vulgaris, детально изучены, показано, что у данных видов Т-ДНК организована в виде повтора из двух копий и содержит гомологичные гены синтеза огшнов, некоторые из генов в составе клТ-ДНК Nicotiana glauca функционально активны (Aoki, Syono, 1994, Meyer A. et al, 1995). У нескольких исследованных видов Nicotiana и L. vulgaris наиболее консервативным является ген rolC (Intrieri, Buiatti, 2001; Suzuki et al., 2002, Matveeva et al., 2012). Эти факты говорят о том, что при становлении данных родов происходили неоднократные акты агротрансформации, и агробактериальные последовательности не только закрепились в геномах, но и были подхвачены в ходе эволюции. Изучение клТ-ДНК в геноме растений представляет собой фундаментальный интерес, поскольку поможет понять не только некоторые аспекты растительно-микробного взаимодействия, но и выяснить происхождение отдельных генов, организмов или видов, а также понять общие закономерности совместного эволюционирования организмов.

С практической точки зрения изучение горизонтального переноса генов между агробактериями и растениями также представляет несомненный интерес. Факт обнаружение новых примеров ГПГ (т.е. «природно-трансгенных» организмов) может быть востребован в качестве контраргумента при критике генно-модифицированных культур, используемых в современном сельском хозяйстве, медицине, ветеринарии. Степень разработанности проблемы.

До недавнего времени примеры горизонтального переноса генов между агробактериями и высшими растениями были известны для некоторых видов Nicotiana и для Linaria vulgaris. Последовательности клТ-ДНК детально изучены. Для части генов клТ-ДНК у видов Nicotiana показана экспрессия. Выявлено, что в эволюции рода Nicotiana было несколько независимых актов интеграции Т-ДНК. В пределах рода Linaria распространенность данного явления еще не изучена. Представленное исследование посвящено изучению последовательности клТ-ДНК у вида L. dalmatica.

Цель и задачи работы: Целью работы является - изучение агробактериальных нуклеотидных последовательностей, обнаруженных у Linaria dalmatica (L.) P. Mill. В работе были поставлены следующие задачи:

1. Характеристика нуклеотидных последовательностей (го/-генов и гена опин-синтазы), в составе вставки клТ-ДНК L. dalmatica.

2. Создание генетических конструкций с геном LdrolC для последующего изучения его функции.

3. Определение структуры вставки клТ-ДНК у L. dalmatica.

4. Идентификация точки инсерции клТ-ДНК в геноме L. dalmatica.

5. Поиск новых примеров горизонтального переноса в природе между агробактериями и высшими растениями.

Основные положения, выносимые на защиту:

Для вновь описного примера горизонтального переноса генов между агробактериями и растениям у L. dalmatica изучены нуклеотидные последовательности генов, входящих в Т-ДНК: LdrolC, Lc/rolB, L¿/ORF13-l, ¿¿/ORF13-2, UORF14 и Ldmis. Показано, что вставка клТ-ДНК организована в виде прямого повтора. Определен район интеграции клТ-

ДНК в геноме L. dalmatica, который имеет сходство с Ty3-gypsy-Iike транспозоном и соответствует месту интеграции у вида L. vulgaris.

Научная новизна диссертационной работы.

В ходе выполнения работы впервые были описаны полноразмерные последовательности генов, входящих в клТ-ДНК L. dalmatica: гены, гомологичные /-«/-генам Agrobacterium rhizogenes и гену микимопин-синтазы. Идентифицирована точка интеграции клТ-ДНК в геном растения. Определена структура вставки. Проведен массовый скрининг видов двудольных растений на наличие Т-ДНК-подобных последовательностей. Созданы генетические конструкции для изучения функций гена LdrolC.

Теоретическая и практическая ценность.

Показано, что в эволюции растений горизонтальный перенос генов протекал не однократно. Установлено, что у разных видов район интеграции совпадает. Этот факт указывает на то, что акт переноса Т-ДНК эволюционно более раннее событие, чем расхождение видов. В составе клТ-ДНК выявлены консервативные последовательности, дошедшие до наших дней без изменений, что может указывать на их значимость для растения. Полученные в работе генетические конструкции для трансформации растений могут быть использованы на практике широким кругом исследователей при работе с трансгенными растениями.

Результаты данной работы могут быть использованы в материалах курсов лекций «Генетика развития растений», «Симбиогенетика», «Экологическая генетика», читаемых на кафедре генетики и биотехнологии СПбГУ. Методические подходы, использованные в работе, могут быть использованы в курсе инструментального практикума по «Генной инженерии».

Степень достоверности и апробация результатов.

Степень достоверности результатов высокая. По результатам работы были сделаны сообщения на российских и зарубежных конференциях: 33rd Annual International Crown Gall (Agrobacterium) Conference, December 1-2, 2012, Hiram, Ohio, USA., II(X) Международной Ботанической Конференции молодых ученых в Санкт-Петербурге 11 - 16 ноября 2012 года., «Достижения и перспективы развития биотехнологии» г. Саранск, 3-5 октября 2012 г., XVIII Congress of the Federation of European Societies of Plant Biology (FESPB) Book of Abstracts 4-9 July 2010 Valencia, Spain, Adaptation to Climate Change in the Baltic Sea Region: Contributions from Plant and Microbial Biotechnology July 12-17, 2010 Mikkeli, Finland., "Ill Всероссийский с международным участием конгресс студентов и аспирантов-биологов "Симбиоз - Россия 2010",Нижний Новгород, 24-29 мая 2010г. The International Conference "Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology, Novosibirsk, June7-10, 2010, Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, 5 съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Москва, 21-28 июня 2009 г., Пятый Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, 16-20 марта 2009 г., V Съезд Общества Биотехнологов России. Москва, 2-4 декабря 2008 г., Международная научная школа-конференция молодых ученых «Генетика и селекция растений, основанная на современных генетических знаниях и 1ехнологиях», Москва, 8-12 декабря 2008 г., 12-я Международная Путинская школа-конференция для молодых ученых «Биология - наука XXI века», Пущино, 10-14 ноября 2008 г., The international scientific conference «S.P.Kostychev and modern agricultural microbiology» Yalta, Ukraine, October 8-12, 2007, 11-ая Международная Пущинская школа-конференция для молодых ученых «Биология - наука XXI века», Пущино, 29 октября - 2 ноября 2007 г.,«Современная биотехнология - защите окружающей среды», Пущино, 11-13 сентября 2006 г., Пущино, Международная конференция «Генетика в России и мире», посвященная 40-

jicTiiio Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва, 28 июня - 2 июля 2006 г., 10-я Пущинская школа-конференция молодых ученых, посвященная 50-летию Пущинского научного РАН, Пущино, 17-21 апреля 2006, 4-й съезд общества биотехнологов России им. Ю.А. Овчинникова, Пущино, 6-7 декабря 2006 г.

По результатам работы опубликованы статьи в рецензируемых журналах.

Список публикаций по теме диссертации;

статьи:

1. Матвеева Т.В., Павлова O.A., Иваницкий К.И., Лутова Л.А. Горизонтальный перенос генов от агробактерий к растениям рода Nicotiana: эволюционные предпосылки и последствия. Вестник Санкт-Петербургского университета. Серия 3: Биология, 2009, №4. С. 58-65.

2. Матвеева Т.В., Павлова O.A., Богомаз Д.И., Демкович Е.А., Лутова Л.А. Молекулярные маркеры для видоидентификации и филогенетики растений. Экологическая генетика, 2011, T.IX, вып.1. - С.32-43

3. Matveeva T.V., Bogomaz D.I., Pavlova O.A., Nester E.W., Lutova L.A. Horizontal gene transfer from Agrobcicterium to the plant Linaria in nature. Molecular Plant-Microbe Interactions. - 2012. - V. 25. - I. 12. - P. 1542-1551.

4. Павлова O.A., Матвеева T.B., Лутова Л.А. /?о/-гены Agrobacterium rhizogenes. Экологическая генетика, - 2013. - Т. XI. - Вып. 1. - С. 59-68.

5. Павлова O.A., Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Linaria dalmatica содержит фрагмент Т-ДНК Agrobacterium rhizogenes. Экологическая генетика, 2013, в печати.

тезисы конференций:

1. Павлова О.И. (Павлова O.A.), Пигичка Т.Ю, Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Сравнительная характеристика регенерационной способности у Nicotiana rustica и Nicotiana langsdorffú. Материалы Международной конференции

«Генетика в России и мире», посвященной 400-летию Института общей генетики им. Ы.И. Вавилова РАН, Москва, 2006. с. 147.

2. Пигичка T.IO, Павлова О.И. (Павлова O.A.), Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Характеристика способности Nicoíiana langsdorffú к регенерации и трансформации invitro. 10-я Пущинская школа-конференция молодых ученых, посвященная 50-летию Пущинского научного РАН, сборник тезисов, Пущино, 2006. с.389.

3. Павлова O.A.. Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Характеристика способности к агротрансформации Nicoíiana rustica. Материалы конференции «Современная биотехнология - защите окружающей среды», электронная публикация, Пущино, 2006.

4. Матвеева Т.В., Пигичка Т.Ю., Павлова O.A., Лутова Л.А. Характеристика Nicoíiana langsdorffii и Nicoíiana rustica по способности к трансформации штаммами агробактерий дикого типа. Материалы четвертого съезда общества биотехнологов России им. Ю.А. Овчинникова, Пущино, 2006, с. 155-156.

5. Павлова O.A., Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Поиск примеров горизонтального переноса генов от агробактерий к древесным формам растений. 11-я международная Пущинская школа-конференция молодых ученых, сборник тезисов, Пущино, 2007, с. 212.

6. Павлова O.A., Матвеева Т.В. Характеристика способности Nicoíiana suaveolens к регенерации и агротрансформации in vitro.. Сборник тезисов 12-й Международной Пущинской школы-конференции для молодых ученых «Биология - наука XXI века» 10 - 14 ноября 2008 года, Пущино, 2008. с.217

7. Павлова O.A., Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Характеристика способности Nicoíiana gossei к регенерации и агротрансформации in vitro. Сборник тезисов Международной научной школы-конференции молодых ученых «Генетика и селекция растений, основанная на современных генетических знаниях и технологиях», Москва, 8-12 декабря 2008 года.

8. Матвеева Т.В., Богомаз Д.И., Павлова O.A. Иваницкий К.И., Лутова Л.А. Горизонтальный перенос генов от агробактерий в эволюции растений сем.

Solanacecie л Scrophiilariciceae. Материалы конгресса. Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва 16-20 марта 2009 г., с. 281

9. Павлова О.А., Матвеева Т.В., Лутова JI.A. Характеристика способности представителей рода Linaria к агротрансформации. Сборник тезисов Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, 5 съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, часть I, Москва, 21-28 июня 2009 г., с. 553.

Ю.Матвеева Т.В., Богомаз Д.И., Павлова О.А., Иваницкий К.И. Горизонтальный перенос генов от агробактерий к растениям: экологический аспект. Сборник тезисов Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, 5 съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, часть И, Москва, 21-28 июня 2009 г., с. 213.

П.Павлова О.А., Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Характеристика представителей рода Nicotiana по способностям к регенерации и трансформации. // Сборник тезисов "III Всероссийский с международным участием конгресс студентов и аспирантов-биологов "Симбиоз - Россия 2010", Нижний Новгород, 24-29 мая 2010 г., с.108

12. Pavlova О.A., Matveeva T.V. and Lutova L.A. Study of the regenerative ability of plants of the genera, which were found sequences homologous to the T-DNA of agrobacteria. // Abstract Book: Adaptation to Climate Change in the Baltic Sea Region: Contributions from Plant and Microbial Biotechnology July 1217, 2010 Mikkeli, Finland., P.67.

13.Matveeva T.V., Bogomaz D.I., Pavlova O.A., Nestcr E.W., Lutova L.A. Sequences, homologous to T-DNA of agrobacterium in plant genomes //Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology". Novosibirsk, 2010. P. 27

14.Matveeva T.; Bogomaz D., Pavlova O., Lutova L. Horizontal gene transfer from Agrobacterium to plant during their evolution // Abstracts of XVII Congress of FESPB Valencia, Spain, 2010, P. 195

15. Andreeva E., Matveeva Т., Bogomaz D., Pavlova O., Lutova L. Genetic engineering approaches for silencing of plant genes of different evolution origins // Abstracts of XVII Congress of FESPB Valencia, Spain, 2010, p. 163-164.

16.Павлова O.A., МатвееваТ.В., Богомаз Д.И., Лутова JI.A. Linaria dalmatica(h.) Mill. Содержит Т-ДНК подобные последовательности агробактерий. // Сборник тезисов «Достижения и перспективы развития биотехнологии» г. Саранск, 3-5 октября 2012 г., с. 80.

П.Павлова О.А., Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Новый молекулярный маркер для филогенетических исследований рода Linaria. // Сборник тезисов П(Х) Международной Ботанической Конференции молодых ученых в Санкт-Петербурге 11-16 ноября 2012 года, с. 20-21.

18.Matveeva T.V., Bogomaz D.I., Pavlova О.A., Nester E.W., Lutova L.A. Linaria vulgaris L. contains T-DNA Genes of Agrobacterium rhizogenes. // Abstracts of 33th International Crown Gall Conference, Decemder 1-2, 2012, Hiram College, Hiram, OH, USA.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Павлова, Ольга Андреевна

Заключение

В рамках данной работы, которая является частью большого исследования, посвященного изучению горизонтального переноса генов между агробактериями и растениями, были охарактеризованы последовательности клТ-ДНК, обнаруженных в геноме L. dalmatica.

Мы определили нуклеотидные последовательности генов, входящих в состав клТ-ДНК L. dalmatica: Ldra/B, Ldго/С, LdORF13-l, LdORF13-2, LdORF14 и Ld mis. Анализ нуклеотидной последовательности in sil ico показал, что у генов LdORF13-l, LdORF13-2, LdORF14 Ldro/B и Lámis рамки считывания прерываются дополнительными стоп-кодонами, содержат делеции и точковые замены, что свидетельствовать о том, что функциональные белковые продукты не могут образовываться.

Для гена Ldro/C показано, что его рамка считывания сохранилась интактной. Данный факт может говорить о его потенциальной функциональности. Важно отметить, что ген rol С является самым консервативным у всех изученных видов Nicotiana и Linaria. Можно предположить, этот ген оказался одним из ключевых для закрепления Т-ДНК у растений. Мы показали, что его регуляторные мотивы (мотив Козака) отличаются от канонических. Для изучения функций этого гена (и его возможной роли) нами были созданы генетические конструкции для трансформации растений, каждая их которых несет один из вариантов гена («real» «strong») под контролем конститутивного промотора и репортерный ген зеленого флуоресцентного белка. В дальнейшем эти конструкции могут быть использованы для трансформации растений.

Мы определили структуру вставки клТ-ДНК: копий не менее двух и они организованы в виде тандемного повтора. Присутствие двух копий, по-видимому, обусловлено механизмами интеграции.

Мы установили локализацию клТ-ДНК в растительном геноме, а также показали совпадение сайтов интеграции у разных видов (L. dalmatica и L. vulgaris). Данный факт указывает на то, что клТ-ДНК была подхвачена их общим предком. В пользу этих утверждений свидетельствуют и те факты, что уровень сходства нуклеотидных последовательностей онкогенов и гена синтеза опинов выше между льнянками (L.dalmatica и L.vulgaris) и чем между льнянками и соответствующими последовательностями у табака и агробактерий.

Для оценки распространенности ГПГ между агробактериями и высшими растениями нами был проведен скрининг 90 в отношении мотивов, гомологичных генам rolC, го/В, ORF13, ORF14 A. rhizogenes и tms 1, tmr (ipt) A. lumefaciens. Среди проанализированных 90 видов новых примеров ГПГ не обнаружено. Всего нашей группой проанализировано более 200 видов двудольных растений на наличие в их геномах последовательностей, гомологичных агробактериальным онкогенам и среди всех изученных только у некоторых льнянок обнаружены искомые последовательности (Matveeva el al., 2012). Явление ГПГ редко встречается в природе (помимо льнянок, известны примеры только у некоторых видов табака (White et al., 1983)). Однако, не смотря на редкость, горизонтальный перенос играл (и, возможно, играет до сих пор) важную роль в эволюции растений, поскольку акты переноса зарегистированы и встечаются у филогенетически отдаленных видов.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Павлова, Ольга Андреевна, 2013 год

Литература.

1. Биннс, А.Н., Константино П. Онкогены агробактерий / А.Н. Бинне // Rhizobiaceae. Молекулярная биология бактерий, взаимодействующих с растениями / Под. ред. Спайнк Г., Кондороши А., Хукас П. СПб, Бионт. 2002. С. 275-290.

2. Вьюгин, В.В., Любецкий В.А. Об одном алгоритме поиска горизонтального переноса гена на основе филогенетических деревьев белков / В.В. Вьюгин // Информационные процессы. - 2001. - Том 1. -№2.-С. 167-177.

3. Дессо, И., Пети, А., Фарранд, С.К., Марфи, П.Д. Опины и опин-подобные молекулы, вовлеченные во взаимодействия растений с бактериями семейства Rhizobiaceae // 2002. С. ... в Глава 9. Rhizobiaceae: молекулярная биология бактерий взаимодействующих с растениями. Под ред. Спайнк Г., Кандороши А., Хукас П., СПб,

4. Дрейпер Дж, Скотт Р., Армитидж Ф., Дьюри Г., Джэкоб JL, Уолден Р., Кумар А., Джефферсон Р.,.Хэмил Дж. Генная инженерия растений. Лабораторное руководство. Учебное издание. / под ред. Дрейпера Дж., Скотта Р., Армитиджа Ф., Уолдена Р.. пер. с англ. Г.И.Эйснер, В.М.Андрианов, М.: Мир, 1991. 408 с.

5. Матвеева, Т.В., Лутова, Л.А., Нестер Ю. Опухолеобразование у растений / Т.В. Матвеева // Генетика. - 2001. -Том 37,-№9.-С. 1188-1197.

6. Новиков B.C., Губанов И.А. Атлас-определитель высших растений, Москва, "Просвещение", 1991, 240 с.

7. Определитель высших растений Северо-Запада Европийской части РСФСР под ред. H.A. Миняева., Издательство Ленинградского Университета, Ленинград, 1981.

8. Павлова O.A., Матвеева Т.В. , Косачев П.А., Лутова Л.А. Новый молекулярный маркер для филогенетических исследований рода Linaria / O.A. Павлова // Сборник тезисов Н(Х) Международной Ботанической Конференции молодых ученых в Санкт-Петербурге 11 -16 ноября 2012 года. - 2012. - С. 20.

9. Павлова O.A., Матвеева Т.В., Лутова Л.А. Rol- гены Agrobacteriiim rhizogenes. / O.A. Павлова II Экологическая генетика. -2013.- T. XI. - Вып.1. - С. 59-68.

10. Э.С Пирузян. Основы генетической инженерии растений, Москва, «Наука», 1988.

11. Подгорная О.И., Галактионов Н.К. Мобильные элементы как потенциальные векторы горизонтального переноса генетической информации в системах паразит-хозяин. / О.И. Подгорная // Труды Зоологического института РАН. - 2009. - Том 313. - № 3. - С. 283296.

12. Шестаков, C.B. Роль горизонтального переноса генов в эволюции [Электронный ресурс] / C.B. Шестаков // 2003. Режйм доступа: http://evolbiol.ru/shestakov.htm

13. Шестаков, C.B., Как происходит и чем лимитируется горизонтальный перенос генов у бактерий / C.B. Шестаков // Экологическая генетика. - 2007. - Том.5. - №2. - С. 12-24.

14. Шестаков, C.B., Горизонтальный перенос генов у эукариот / C.B. Шестаков // Вестник ВОГиС. - 2009. - Том 13. - № 2. - С. 345354.

15. Akiyoshi, D.E., Klee, H., Amasino R.M., Nester E.W., Gordon M.P. T-DNA of Agrobacteriiim tumefaciens encodes an enzyme of

112

cytokinin biosynthesis / D.E. Akiyoshi // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. -1984. - V. 81. - I. 19. - P. 5994-5998.

16. Albach, D.C., Meudt, H.M., Oxelman, B. Piecing together the "new" Plantaginaceae / D.C. Albach // Am. J. Bot. - 2005 - V. 92. - I. 2. -P. 297-315.

17. Altamura, M.M., Archilletti, T., Capone, I., Constantino, P. Histological analysis of the expression of Agrobacterium rhizogenes rolB-GUS gene fusions in transgenic tobacco / M.M. Altamura // New Phytol. -1991,-V. 118.-P. 69-78.

18. Altamura, M.M., Capitani, F., Gazza, L., Capone, I., Costantino, P. The plant oncogene rolB stimulates the formation of flower and root meristemoids in tobacco thin cell layers / M.M. Altamura // New Phytol. - 1994. - V. 126. - P. 283-293.

19. Altamura, M.M. Agrobacterium Rhizogenes rolB and rolD Genes: Regulation and Involvement in Plant Development / M.M. Altamura // Plant Cell Tiss. Org. - 2004. - V. 77. -1. 1. - P. 89-101.

20. Andersson, J.O. Lateral gene transfer in eukaryotes / J.O. Andersson // Cell Mol. Life Sci. - 2005. - V. 62. -1. 11. - P. 1182-1197.

21. Andersson, J.O. Gene transfer and diversification of microbial eukaryotes / J.O. Andersson // Annu. Rev. Microbiol. - 2009. - V. 63. - P. 177-193.

22. Ankenbauer, R.G., Ncster, E.W. Sugar-mediated induction of Agrobacterium tumefaciens virulence genes: structural specificity and activities of monosaccharides / R.G. Ankenbauer // J. Bacteriol. - 1990. -V. 172. -1. 11. - P. 6442-6446.

23. Aoki, S., Kawaoka, A., Sekine, M., Ichikawa, Т., Fujita, Т., Shinmyo, A., Syono, K. Sequence of the cellular T-DNA in the untranaformed genome of Nicotiana glanca that is homologous to ORFs 13 and 14 of the Ri plasmid and analysis of its expression in genetic tumors of N. glauca x N. langsdorffii / S. Aoki // Mol. Gen. Genet. - 1994. - V. 243. -I. 6. - P. 706-710.

24. Aoki, S., Syono, K. Horizontal gene transfer and mutation: Ngrol genes in the genome of Nicotiana glauca / S. Aoki // Proc. Natl. Acad. Sci. - 1999. - V. 96. - I. 23. - P. 13229-13234.

25. Aoki, S., Syono, K. Synergistic function of rolB, rolC, ORF13 and ORF14 of TL-DNA of Agrobacterium rhizogenes in hairy root induction in Nicotiana tabacum / S. Aoki // Plant Cell Physiol. - 1999a, -V. 40.-I. 2,-P. 252-256.

26. Aoki, S., Syono, K. Function of Ngrol genes in evolution of Nicotiana glauca: conservation of the function of NgORF13 and NgORF14 after ancient infection by an Agrobacterium rhizogenes ancestor / S. Aoki // Plant Cell Physiol. - 1999b. - V. 40. -1. 2. - P. 222-230.

27. Aoki, S., Syono, K. A comparision of the function of hairy root induction between Ngrol and Ri rol genes in Nicotiana debneyi /S. Aoki // Plant Sci. - 2000. - V. 59 - P.183-189.

28. Aoki, S. Resurrection of ancestral gene: functional and evolutionary analyses of the Ngro/ genes transferred from Agrobacterium to Nicotiana / S. Aoki // J. Plant. Res. - 2004. - V. 117. - P. 329-337.

29. Archibald, J.M., Rogers, M.B., Toop. M. Ishida, K.-I., Keeling, P.-J. Lateral gene transfer and evolution of plastid-targeted proteins in the

secondary plastid-containing alga Bigelowiella natans. // Proc. Natl Acad. Sci. USA. - 2003. - V. 100. - P. 7678-7683.

30. Astot, C., Dolezal, K., Nordstrom, A., Wang, Q., Kunkel, T., Moritz, T., Chua, N.-H., Sandberg, G. An alternative cytokinin biosynthesis pathway / C. Astot // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2000. - V. 97. - P. 14778-14783.

31. Bako, L., Umeda, M., Tiburcio, A.F., Schell, J., Koncz, C. The VirD2 pilot protein of Agrobacterium-trnnsferrQd DNA interacts with the TATA box-binding protein and a nuclear protein kinase in plants / L. Bako // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2003. - V. 100. - 1.17. - P. 10108-10113.

32. Ballas, N., Citovsky, V. Nuclear localization signal binding protein from Arabidopsis mediates nuclear import of Agrobacterium VirD2 protein / N. Ballas // Proc. Natl. Acad. Sci. USA - 1997. - V. 94. - P. 10723-10728.

33. Barry, G.F., Rogers, S.G., Fraley, R.T., Brand, L. Identification of a cloned cytokinin biosynthetic gene / G.F. Barry // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1984. - V. 81. - I. 15. - P. 4776-4780.

34. Barton, K.A., Binns, A.N., Matzke, A.J., Chilton, M.D. Regeneration of intact tobacco plants containing full length copies of genetically engineered T-DNA, and transmission of T-DNA to R1 progeny / K.A. Barton//Cell.-1983.-V. 32. - I. 4. - P. 1033-1043.

35. Baumann, K., De Paolis, A., Costantino, P., Gualberti, G. The DNA binding site of the Dof protein NtBBFl is essential for tissue-specific and auxin-regulated expression of the rolB oncogene in plants / K. Baumann //The Plant Cell. - 1999. - V. 11. - P. 323-333.

36. Bergthorsson, U., Adams, K.L., Thomason, B., Palmer, J.D. Widespread horizontal transfer of mitochondrial genes in flowering plants / U. Bergthorsson // Nature. - 2003. - V. 424. - I. 6945. - P. 197-201.

37. Bergthorsson, U., Richardson, A.O., Young, G.J., Gocrtzcn, L.R., Palmer, J.D. Massive horizontal transfer of mitochondrial genes from diverse land plant donors to the basal angiosperm Amborellci / U. Bergthorsson // Proc. Natl. Acad. Sei., 2004. - V. 101. - I. 51. - P. 1774717752.

38. Berriman, M., Ghedin, E., Hertz-Fowler, C., Blandin, G., Renauld, H., Bartholomen, D.C., Lennard, N.J., Caler, E., Hamlin, N.E., Haas, B., Böhme, U., Hannick, L., Aslett, M.A., Shallom, J., Marcello, L., Hou, L., Wickstead, B., Aismark, U.C., Arrowsmith, C., Atkin, R.J., Barron, A.J., Bringaud, F., Brooks, K., Carrington, M., Cherevach, I., Chillingworth, T.J., Churcher, C., Clark, L.N., Corton, C.H., Cronin, A., Davies, R.M., Doggett, J., Djikeng, A., Feldblyum, T., Field, M.C., Fraser, A., Goodhead, I., Hance, Z., Harper, D., Harris, B.R., Hauser, H., Hostetler, J., Ivens, A., Jagels, K., Johnson, D., Johnson, J., Jones, K., Kerhornou, A.X., Koo, H., Larke, N., Landfear, S., Larkin, C., Leech, V., Line, A., Lord, A., Macleod, A., Mooney, P.J., Moule, S., Martin, D.M., Morgan, G.W., Mungall, K., Norbertczak, IL, Ormond, D., Pai, G., Peacock, C.S., Peterson, J., Quail, M.A., Rabbinowitsch, E., Rajandream, M.A., Reitter, C., Salzberg, S.L., Sanders, M., Schobel, S., Sharp, S., Simmonds, M., Simpson, A.J., Tallon, L., Turner, C.M., Tait, A., Tivey, A.R., Van Aken, S., Walker, D., Wanless, D., Wang, S., White, B., White, O., Whitehead, S., Woodward, J., Wortman, J., Adams, M.D., Emblcy, T.M., Gull, K., Ullu, E., Barry, J.D., Fairlamb, A.H., Opperdoes, F., Barrell, B.G., Donelson, J.E., Hall, N., Fraser, C.M., Melville, S.E., El-Sayed, N.M. The genome of the African trypanosome Trypanosoma brucei / M. Berriman // Science. -2005. - V. 309. - P. 416-422.

39. Binns, A.N., Thomashow , M.F. Cell biology of Agrobacterium infection and transformation of plants / A.N. Binns // Annu. Rev. Microbiol. - 1988.-V. 42. - P. 575-606.

40. Bianco-Pastor, J.L., Vargas, P., Pfeil, B.E. Coalescent simulations reveal hybridization and incomplete lineage sorting in Mediterranean Linaria / J.L. Bianco-Pastor // PLoS One. - 2012. - V. 7. - I. 6. - e39089. - P. 1-16.

41. Bogani, P., Lio, P., Intrieri, M.C., Buiatti, M. A physiological and molecular analysis of genus Nicotiana / P. Bogani // Mol. Phylogenet. Evol. - 1997. - V. 7. - I. - 1. - P. 62-69.

42. Bouchez, D., Camilleri. C. Identification of a putative rolB gene on the TRDNA of the Agrobacterium rhizogenes A4 Ri plasmid / D. Bouchez // Plant Mol. Biol. - 1990. - V. 14. - P. 617-619.

43. Braun, A.C. A physiological basis for autonomous growth of the crown-gall tumor cell / A.C. Braun // Proc. Natl. Acad. Sei. US A.-1958. - V. 44. - I. 4. - P. 344-349.

44. Braun, A.C., Laskaris, T. Tumor formation by attenuated crown-gall bacteria in the presence of growth-promoting substances / A.C. Braun // Proc. Natl. Acad. Sei. USA.- 1942. - V. 28. - I. 11. - P. 468477.

45. Bettini, P., Michelotti, S., Bindi, D., Giannini, R., Capuana, M., Buiatti, M.. Pleiotropic effect of the insertion of the Agrobacterium rhizogenes rolD gene in tomato (Lycopersicon esciilentum Mill.) /P. Bettini // Theor. Appl. Genet. - 2003. - V. 107. - I. 5. - P. 831-836.

46. Britton, M., Escobar, M.A., Dandecar, A.M. The oncogenes of Agrobacterium tamefaciens and Agrobacterium rhizogenes // 2007. - P.

523-563 in: Chapter 14. Agrobacterium: From Biology to Biotechnology. T. Tzifra and V. Citovsky, eds. Springer, New York.

47. Buchmann, I., Marner, F.J., Schroder, G., Waffenschmidt, S., Schroder, J. Tumour genes in plants: T-DNA encoded cytokinin biosynthesis / I. Buchmann // EMBO J. - 1985. - V.4. - 1.4, - P. 853-859.

48. Bulgakov, V.P., Kiselev, K.V, Yakovlev, K.V., Zhuravlev, Y.N., Gontcharov, A.A., Odintsova, N.A. Agrobacterium-mediatcd transformation of sea urchin embryos / V.P. Bulgakov // Biotechnol. J. -2006. - V. 1. - I. 4, - P. 454-461.

49. Bulgakov, V.P., Tchernoded, G.K., Mischenko, N.P., Shkryl, Y.N., Glazunov, V.P., Fedoreyev, S.A., Zhuravlev, Y.N. Effects of Ca(2+) channel blockers and protein kinase/phosphatase inhibitors on growth and anthraquinone production in Rubia cordifolia callus cultures transformed by the rolB and rolC genes / V.P. Bulgakov // Planta. - 2003. - V. 217. - I. 3. - P. 349-355.

50. Bundock, P„ den Dulk-Ras, A., Beijersbergen, A., Hooykaas, P.J. Trans-kingdom T-DNA transfer from Agrobacterium tumefaciens to Saccharomyces cerevisiae / P. Bundock // EMBO J. - 1995. - V. 3. - V. 14. -I. 13.-P. 3206-3214.

51. Cangelosi G.A., Ankenbauer, R.G., Nester E.W. Sugars induce the Agrobacterium virulence genes through a periplasmic binding protein and a transmembrane signal protein / G.A. Cangelosi // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1990.-V. 87.-1.17. - P. 6708-6712.

52. Carmi, N., Salts, Y., Dedicova, B., Shabtai, S., Barg, R. Induction of parthenocarpy in tomato via specific expression of the rolB gene in the ovary / N. Carmi // Planta. - 2003. - V. 217. - I. 5. - P. 726735.

53. Carneiro, M., Vilaine, F. Differential expression of the rolA plant oncogene and its effect on tobacco development / M. Carneiro // The Plant J. - 1993. - V. 3. - I. 6. - P. 785-792.

54. Caponc, I., Frugis, G., Costantino, P., Cardarelli, M. Expression in different populations of cells of the root meristem is controlled by different domains of the rolB promoter / I. Capone // Plant Mol. Biol. -1994. - V. 25. - I. 4. - P. 681-691.

55. Capone, I., Spano, L., Cardarelli, M., Bellincampi, D., Petit, A., Costantino, P. Induction and growth properties of carrot roots with different complements of Agrobacterium rhizogenes T-DNA / I. Capone // Plant Mol. Biol. - 1989. - V.13. - P. 43-52.

56. Cecchetti, V., Pomponi, M., Altamura, M.M., Pezzotti, M., Marsilio, S., D'Angeli, S., Tornielli, G.B., Costantino, P., Cardarelli, M. Expression of rolB in tobacco flowers affects the coordinated processes of anther dehiscence and style elongation / V. Cecchetti // Plant J. - 2004. - V. 38.-1.3.-P. 512-525.

57. Chang, C.H., Winans, S.C. Functional roles assigned to the periplasmic, linker, and receiver domains of the Agrobacterium tumefaciens VirA protein /C.H. Chang // J. Bacteriol. - 1992. - V. 174. - 1.21. - P. 7033-7039.

58. Chen, I., Dubnau, D. DNA uptake during bacterial transformation /1. Chen // Nature Rev. Microbiol. - 2004. - V.2. - P. 241249.

59. Chilton, M.D., Drummond, M.H., Merio, D.J., Sciaky, D., Montoya, A.L., Gordon, M.P., Nester E.W. Stable incorporation of plasmid DNA into higher plant cells: the molecular basis of crown gall tumorigenesis /M.D. Chilton // Cell. - 1977. - V. 11. - I. 2. - P. 263-271.

60. Chilton, M.D., Que, Q. Targeted integration of T-DNA into the tobacco genome at double-strand breaks: new insights on the mechanism of T-DNA integration / M.D. Chilton // Plant Physiol. - 2003. - V. 133. - P. 956-965.

61. Chilton, W.S., Petit, A., Chilton, M.D., Dessaux, Y. Structure and characterization of the crown gall opines heliopine, vitopine and rideopine / W.S. Chilton // Phytochemistry. - 2001. - V. 58. - P. 137-142.

62. Christie, P.J., Atmakuri, K., Krishnamoorthy, V., Jakubowski, S., Cascales, E. Biogenesis, architecture, and function of bacterial type IV secretion systems / P.J. Christie // Annu. Rev. Microbiol. - 2005. - V. 59. -P. 451-485.

63. Citovsky, V., Wong, M.L., Zambryski, P. Cooperative interaction of Agrobacterium VirE2 protein with single-stranded DNA: implications for the T-DNA transfer process / V. Citovsky // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1989. - V. 86. -1. 4. -P. 1193-1197.

64. Citovsky, V., Zupan, J., Warnick, D., Zambryski, P. Nuclear localization of Agrobacterium VirE2 protein in plant cells / V. Citovsky // Science. - 1992. - V. 256. - P. 1802-1805.

65. Copley, S.D., Dhillon, J.K., Lateral gene transfer and parallel evolution in the history of glutathione biosynthesis genes /S.D. Copley // Genome Biol. - 2002. - V.3. - I. 5. - research 0025.

66. Davis, C.C., Anderson, W.R., Wurdack, K.J. Gene transfer from a parasitic flowering plant to a fern / C.C. Davis // Proc. Biol. Sci. - 2005. -V. 272. - I. 1578. - P. 2237-2242.

67. Davis, C.C., Wurdack, K.J. Host-to-parasite gene transfer in flowering plants: phylogenetic evidence from Malpighiales / C.C. Davis // Science. - 2004. - V. 305. - 1. 5684. - P. 676-678.

68. De Clecne, M., De Lay, J. The host range of crown gall / M. De Cleene // Bot. Rev. - 1976. - V. 42. - P. 389^66.

69. De Neve, M., De Buck, S., Jacobs, A., Van Montagu, M., Depicker, A. T-DNA integration patterns in co-transformed plant cells suggest that T-DNA repeats originate from co-integration of separate T-DNAs/M. De Neve//Plant J. - 1997. - V. 11.-P. 15-29.

70. De Paolis, A., Mauro, M.L., Pomponi, M., Cardarelli, M., Spano, L., Costantino, P. Localization of agropine-synthesizing functions in the TR region of the root-inducing plasmid of Agrobacterium rhizogenes 1855 / A. Dc Paolis // Plasmid. - 1985. - V. 13. -1. 1. - P. 1-7.

71. Dehesh, K., Bruce, W.B., Quail, P.H. A trans-acting factor that binds to a GT-motif in a phytochrome gene promoter / K. Dehesh // Science. - 1990. - V. 250. - I. 4986. - P. 1397-1399.

72. Dehio, C., Grossmann, K., Schell, J., Schmulling, T. Phenotype and hormonal status of transgenic tobacco plants overexpressing the rolA gene of Agrobacterium rhizogenes T-DNA / C. Dehio // Plant Mol. Biol. -1993. V.23.-I.6.-P. 1199-1210.

73. Dellaporta, S.L., Wood, J., Hicks, J.B. Plant DNA mini preparation. Molecular biology of plants. A laboratory course manual / S.L. Dellaporta // Plant Mol. Biol. Rep. - 1983. - V. 1. - P. 19-21.

74. Deng, W., Chen, L., Peng, W.T., Liang, X., Sekiguchi, S., Gordon, M.P., Comai, L., Nester, E.W. VirEl is a specific molecular chaperone for the exported singlestranded- DNA-binding protein VirE2 in Agrobacterium / W. Deng // Mol. Microbiol. - 1999. - V. 31. - P. 17951807.

75. Derelle, E., Ferraz, C., Rombauts, S., Rouze, P, Worden, A.Z., Robbens, S., Partensky, F., Degroeve, S., Echeynie, S., Cooke, R., Saeys, Y., Wuyts, J., Jabbari, K., Bowler, C., Panaud, O., Piegu, B., Ball, S.G., Rai, J.P., Bouget, F.Y., Piganeau, G., De Baets, B., Picard, A., Delseny, M., Demaille, J., Van de Peer, Y., Moreau, H. Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features / E. Derelle // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2006. - V. 103. - I. 31. - P. 1164711652.

76. Dessaux, Y., Petit, A., Tempe, J., Demarez, M., Legrain, C., Wiame, J.M. Arginine catabolism in Agrobacterium strains: role of the Ti Plasmid/Y. Dessaux//J. Bacteriol. - 1986. - V. 166.-I. l.-P. 44-50.

77. Dumas, F., Duckely, M., Pelczar, P., Van Gelder, P., Hohn, B. An Agrobacterium VirE2 channel for transferred-DNA transport into plant cells / F. Dumas // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2001. - V. 98. - P. 485490.

78. Dunning-Hotopp, J.C., Clark, M.E., Oliveira, D.C.S.G., Foster, J.M., Fischer, P., Munoz Torres, M. C., Giebel, J.D., Kumar, N., Ishmael, N., Wang, S, Ingram, J, Nene, R.V., Shepard, J., Tomkins, J., Richards, S., Spiro, D.J., Ghcdin, E., Slatko, B.E., Tettclin, H.,. Werren, J.H. Widespread Lateral Gene Transfer from Intracellular Bacteria to Multicellular Eukaryotes / J.C. Dunning-Hottop // Science. - 2007. - V. 317. - P. 17531756.

79. Dunoyer, P., Himber, C., Voinnet, O. Induction, suppression and requirement of RNA silencing pathways in virulent Agrobacterium tumefaciens infections / P. Dunoyer // Nature Genet. - 2006. - V. 38. - P. 258-263.

80. Estruch, J.J., Chriqui, D., Grossmann, K., Schell, J., Spena, A.

The plant oncogene rolC is responsible for the release of cytokinins from

122

glucoside conjugates / J.J. Estruch // The EMBO Journal. - 1991a. - V. 10.

-I. 10.-P. 2889-2895.

81. Estruch, J.J., Parets-Soler, A., Schmulling, T., Spena, A. Cytosolic localization in transgenic plants of the rolC peptide from Agrobacterium rhizogenes / J.J. Estruch // Plant Mol. Biol. - 1991b. - V. 17.-P. 547-550.

82. Estruch, J.J., Prinscn, E., van Onckelen, H., Schell, J., Spena, A. Viviparous leaves produced by somatic activation of an inactive cytokinin-synthesizing gene / J.J. Estruch // Science. - 1991c. - V. 254. - P. 13641367.

83. Faiss, M., Strnad, M., Redig, P., Dolezal, K., Hanus, J., van Onckelen, H., Schmulling, T. Chemically induced expression of the rolC-encoded beta-glucosidase in transgenic tobacco plants and analysis of cytokinin metabolism: rolC does not hydrolyze endogenous cytokinin glucosides in planta / M. Faiss // The Plant J. - 1996. - V. 10. - I. 1. - P. 33-46.

84. Falasca, G., Altamura, M.M., D'Angeli, S., Zaghi, D., Costantino, P., Mauro, M.L. The rolD oncogene promotes axillary bud and adventitious root meristems in Arabidopsis / G. Falasca // Plant Physiol Biochem. - 2010. - V. 48. - P. 797-804.

85. Fenn, K., Conlon, C., Jones, M., Quail, M.A., Holroyd, N.E., Parkhill, J., Blaxter, M. Phylogenetic relationships of the Wolbachici of Nematodes and Arthropods / K. Fenn // PLoS Pathogens. - 2006. - V.2. -1.10,-P. 0887-0889.

86. Fernandez-Mazuecos, M., Vargas, P. Historical isolation versus recent long-distance connections between Europe and Africa in bifid

Toadflaxes (Lincirici sect. Versicolores) / M. Fernandez-Mazuecos // Plos One. -2011. - V. 6.-I. 7. - e22234.

87. Filetici, P., Moretti, F., Camilloni, G., Mauro, M.L. Specific interaction between a Nicotiana tabacum nuclear-protein and the Agrobacterium rhizogenes rolB promoter / P. Filetici // Journal of plant physiology. - 1997.-V. 151.-I. 2. - P. 159-165.

88. Filippini, F., Rossi, V., Marin, O. A plant oncogene as a phosphatase / F. Filippini // Nature. - 1996. -. V. 379. - P. 499-500.

89. Friesner, J., Britt, A.B. Ku80- and DNA ligase IV-deficient plants are sensitive to ionizing radiation and defective in T-DNA integration / J. Friesner // Plant J. - 2003. - V. 34. - P. 427-440.

90. Frundt, C., Meyer, A.D., Ichikawa, T., Meins, F. Jr. A tobacco homologue of the Ri-plasmid orfl3 gene causes cell proliferation in carrot root discs / C. Frundt // Mol. Gen. Genet. - 1998. - V. 259. - I. 6. - P. 559568.

91. Furner, I.J., Huffman, G.A., Amasino, R.M., Garfinkel, D.J., Gordon, M.P., Nester, E.W. An Agrobacterium transformation in the evolution of the genus Nicotiana. // Nature. - 1986. - V. 319. - P. 422-427.

92. Garfinkel, D.J., Nester, E.W. Agrobacterium tumefaciens mutants affected in crown gall tumorigenesis and octopine catabolism / D.J. Garfinkel // J. Bacleriol. - 1980. - V. 144. - I. 2. - P. 732-743.

93. Garfinkel, D.J., Simpson, R.B., Ream, L.W., White, F.F., Gordon, M.P., Nester, E.W. Genetic analysis of crown gall: fine structure map of the T-DNA by site-directed mutagenesis / D.J. Garfinkel // Cell. -1981. - V. 27.1. 1 Pt 2. - P. 143-153.

94. Garrity G. - Editor-in-chief; Brenner, D. J.; Krieg, N.R.; Staley, J.T. (Eds.) BERGEY'S MANUAL OF Systematic Bacteriology Second

Edition Volume Two The Proteobacteria Part C The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria, Published by Williams & Wilkins, 1984, Springer, New York, (2005). 2nd ed., 2005, XXVIII, 1388 p.

95. Garcia-Vallve, S., Romeu, A., Palau, J. Horizontal gene transfer of glycosyl hydrolases of the rumen fungi / S. Garcia-Vallve // Mol. Biol. Ecol. - 2000. - V. 17. - P. 352-361.

96. Gheysen, G., Villarroel, R., Van Montagu, M. Illegitimate recombination in plants: a model for T-DNA integration / G. Gcysen // Genes Dev. - 1991, - V. 5. - P. 287-297.

97. Giulietti, A., Overbergh, L., Valckx, D. An overview of RealTime Quantitative PCR: applications to quantify cytokine gene expression / A. Giulietti // Methods. - 2001. - V. 25. - P. 386-401.

98. Gladyshev, E.A., Meselson, M., Arkhipova, I.R. Massive horizontal gene transfer in bdelloid rotifers / E.A. Gladyshev // Science. -2008. - V. 320. - I. 5880. - P.1210-1213.

99. Gogarten, J.P., Doolittle, W.F., Lawrencc, J.G. Prokaryotic evolution in light of gene transfer / J.P. Gogarten // Mol. Biol. Evol. - 2002. - V. 19.-P. 2226-2238.

100. Gomis-Ruth, F.X., Sola, M., de la Cruz, F., Coll, M. Coupling factors in macromolecular type-IV secretion machineries / F.X. Gomis-Ruth // Curr Pharm. - 2004. - V. 10. -P. 1551-1565.

101. Goodman, J.L., Wang, S., Alam, S., Ruzicka, F.J., Frey, P.A., Wedekind, J.E. Ornithine cyclodeaminase: structure, mechanism of action, and implications for the mu-crystallin family / J.L. Goodman // Biochemistry. - 2004. - V. 43. - I. 44. - P. 13883-13891.

102. Gorbunova, V., Levy, A.A. Non-homologous DNA end joining in plant cells is associated with deletions and filler DNA insertions / V. Gorbunova // Nucleic Acids Res. - 1997. - V. 25. - P. 4650-4657.

103. Gouka, R. Transformation of Aspergillus awamori by Agrobacterium tumefaciens-mediated gomologous recombination / R. Gouka // Nat. Biotechnol. - 1999. - V. 17. - P. 598-601.

104. Gremillon, L., Heifer, A., Clement, B., Otten, L. New plant growth-modifying properties of the Agrobacterium T-6b oncogene revealed by the use of a dexamethasone-inducible promoter / L. Gremillon // Plant J. - 2004. - V. 37.-P. 218-228.

105. Guivarc'h, A., Spena, A., Noin, M., Besnard, C., Chriqui, D. The pleiotropic effccts induced by the rolC gene in transgenic plants are caused by expression restricted to protophloem and companion cells / A. Guivarc'h // Transgen. Res. - 1996. - V. 5. - P. 3-11.

106. Hansen, G., Vaubert, D., Clerot, D., Tempe, J., Brevet, J. A new open reading frame, encoding a putative regulatory protein, in Agrobacterium rhizogenes T-DNA / G. Hansen // C. R. Acad. Sci. III. -1994. - V. 317. -1. 1. - P. 49-53.

107. Hansen, G., Vaubert, D., Clerot, D., Brevet, J. Wound-inducible and organ-specific expression of ORF13 from Agrobacterium rhizogenes 8196 T-DNA in transgenic tobacco plants / G. Hansen // Mol. Gen. Genet. - 1997. - V. 254. - I. 3. - P. 337-343.

108. Hansen, G., Vaubert, D., Heron, J.N., Clerot, D., Tempe, J., Brevet, J. Phenotypic effects of overexpression of Agrobacterium rhizogenes T-DNA ORF13 in transgenic tobacco plants are mediated by diffusible factor(s) / G. Hansen // Plant J. - 1993. - V. 4. - P. 581-585.

109. Heidekamp, F., Dirksc, W.G., Hille, J., van Ormondt, H. Nucleotide sequence of the Agrobacterium tumefaciens octopine Ti plasmid-encoded tmr gene / F. Heidekamp // Nucleic Acids Res. - 1983. -V. II.-I. 18.-P. 6211-6223.

110. Herrera-Estrella, A., Chen, Z., Van Montagu, M., Wang, K. VirD proteins of Agrobacterium tumefaciens are required for the formation of a covalent DNA protein complex at the 5' terminus of T-strand molecules / A. Herrera-Estrella // EMBO J. - 1988. - V. 7. -P. 4055-4062.

111. Holland, P.M., Abramson, R.D., Watson, R., Gelfand, D.H. Detection of specific polymerase chain reaction product by utilizing the 5'— —3' exonuclease activity of Thermus aquaticus DNA polymerase / P. M. Holland I I Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1991. - V. 88. - I. 16. -P. 72767280.

112. Hooykaas, P.J.J., den Dulk-Ras, H., Schilperoort, R.A. The Agrobacterium tumefaciens T-DNA gene 6b is an one gene / P.J.J Hooykaas i I Plant Mol. Biol. - V. 11. -1. 6. - P. 791-794.

113. Huang, J., Mullapudi, N., Lancto, C.A., Scott, M., Abrahamsen, M.S., Kissinger, J.C. Phylogenomic evidence supports past endosymbiosis, intracellular and horizontal gene transfer in Cryptosporidium parvum / J. Huang // Genome Biol. - 2004. - V. 5. - I. 11. - Article R88.

114. Huffman, G.A., White, F.F., Gordon, M.P., Nester, E.W. Hairy root inducing plasmid: physical map and homology to tumorinducing plasmids / G.A. Huffman // J. Bact. - 1984. - V. 157. - P. 269-276.

115. Hu, Y., Chen, B., Ni, T., Li, N., Lin, Z. Promoter of the rolC gene of Agrobacterium rhizogenes can be strongly regulated in glandular cell of transgenic tobacco / Y. Hu // Mol. Biotechnol. - 2003. - V. 24. - I. 2.-P. 121-125.

116. Ichikawa, T., Ozeki, Y., Syono, K. Evidence for the expression of the rol genes of Nicotiana glauca in genetic tumors of N. glauca X N. langsdorffii / T. Ichikawa // Mol. Gen. Genet. - 1990. - V. 220. - I. 2. -P. 177-180.

117. Inoue, H., Nojima, H., Okayama, H. High efficiency transformation of Escherichia coli with plasmids / H. Inoue // Gene. - 1990. - V. 96.-I. l.-P. 23-28.

118. Intrieri, M.C., Buiatti, M. The horizontal transfer of Agrobacterium rhizogenes genes and the evolution of the genus Nicotiana. / M.C. Intrieri // Mol. Phylogenet. Evol. - 2001. - V. 20. - I. 1. - P. 100-110.

119. Iskandar, H.M., Simpson, R.S., Casu, R.E., Bonnett, G.D., Maclean, D.J., Manners, J.M. Comparison of reference genes for quantitative real-time polymerase chain reaction analysis of gene expression in sugarcane / H.M. Iskander // Plant Mol. Biol. Rep. - 2004. - V. 22. - P. 325-337.

120. Isogai, A., Fukuchi, N., Hayashi, M., Kamada, H., Harada, H., Suzuki, A. Mikimopine, an opine in hairy roots of tobacco induced by Agrobacterium rhizogenes / A. Isogai // Phytochemistry. - 1990. - V. 29. -I. 10.-P. 3131-3134.

121. Jain, R., Rivera, M.C., Lake, J.A. Horizontal gene transfer among genomes: the complexity hypothesis / R. Jain // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1999 - V. 96. - I. 7. - P. 3801-3806.

122. Jain, R., Rivera, M.C., Moore, J.E., Lake, J.A. Horizontal gene transfer accelerates genome innovation and evolution / R. Jain // Mol. Biol. Evol. - 2003. - V. 20. -1. 10. - P. 1598-1602.

123. Janssen, B.J., Gardner, R.C. Localized transient expression of GUS in leaf discs following cocultivation with Agrobacterium / B.J. Janssen // Plant. Mol. Biol. -1990. - V. 14. -P. 61-72.

124. Jin, S.G., Roitsch, T., Ankenbauer, R.G., Gordon, M.P., Nester, E.W. The VirA protein of Agrobacterium tumefaciens is autophosphorylated and is essential for vir gene regulation /S.G. Jin // J. Bacteriol. - 1990a. - V. 172. - 1. 2. - P. 525-530.

125. Jin, S.G., Roitsch, T., Christie, P.J., Nester, E.W. The regulatory VirG protein specifically binds to a c/s-acting regulatory sequence involved in transcriptional activation of Agrobacterium tumefaciens virulence genes / S.G. Jin // J. Bacteriol. - 1990b. - V. 172. - I. 2.-P. 531-537.

126. Johanson, U., Karlsson, M., Johansson, I., Gustavsson, S., Sjôvall, S., Fraysse, L., Weig, A.R., Kjellbom, P. The complete set of genes encoding major intrinsic proteins in Arabidopsis provides a framework for a new nomenclature for major intrinsic proteins in plants / U. Johanson // Plant Physiol. - 2001. - V. 126. - I. 4. - P. 1358-1369.

127. Joos, H., Inze, D., Caplan, A., Sormann, M., Van Montagu, M., Schell, J. Genetic analysis of T-DNA transcripts in nopaline crown galls / H. Joos // Cell. - 1983. - V. 32. - 1. 4. - P. 1057-1067.

128. Keeling, P.J., Palmer, J.D. Horizontal gene transfer in eukaryotic evolution / P.J. Keeling // Nat. Rev. Genet. - 2008. - V. 8. - P. 605-618.

129. Kitakura, S., Fujita, T., Ueno, Y., Terakura, S., Wabiko, H., Machida, Y. The protein encoded by oncogene 6b from Agrobacterium tumefaciens interacts with a nuclear protein of tobacco / S. Kitakura // Plant Cell. -2002. - V. 14. -P. 451-463.

130. Klee, H., Montoya, A., Horodyski, F., Lichtenstein, C., Garfinkel, D., Fuller, S., Flores, C., Peschon, J., Nester, E., Gordon, M. Nucleotide sequence of the tms genes of the pTiA6NC octopine Ti plasmid:

two gene products involved in plant tumorigenesis / H. Klee // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1984. - V. 81. - P. 1728-1732.

131. Klee, H.J., Horsch, R.B., Hinchee, M.A., Hein, M.B., Hoffmann, N.L. The effects of overproduction of two Agrobacterium tumefciciens T-DNA auxin biosynthetic gene products in transgenic petunia plants/H.J. Klee //Genes Dev. - 1987. - V. l.-P. 86-96.

132. Koltunow, A.M., Johnson, S.D., Lynch, M., Yoshihara, Т., Costantino, P. Expression of rolB in apomictic Hieracium piloselloides Vill. causes ectopic meristems in planta and changes in ovule formation, where apomixis initiates at higher frequency / A.M. Koltunow // Planta. - 2001. -V. 214.-I. 2.-P. 196-205.

133. Kondo, N., Nikoh, N., Ijichi, N., Shimada, M., Fukatsu, T. Genome fragment of Wolbachia endosymbiont transferred to X chromosome of host insect / N. Kondo // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2002. - V. 99. - I. 22. - P. 14280-14285.

134. Korber, H., Strizhov, N., Staiger, D., Feldwisch, J., Olsson, O., Sandberg, G., Palme, K., Schell, J., Koncz, C. T-DNA gene 5 of Agrobacterium modulates auxin response by autoregulated synthesis of a growth hormone antagonist in plants / H. Korber // EMBO J. - 1991. - V. 10.-P. 3983-3991.

135. Kozak, M. Point mutations close to the AUG initiator codon affect the efficiency of translation of rat preproinsulin in vivo / M. Kozak // Nature. - 1984. - V. 308. - P. 241 - 246.

136. Kunik, Т., Genetic transformation of He La cells by Agrobacterium. / T. Kunik // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2001. - V. 98. -P. 1871-1818.

137. Lacroix, B., Tzifira, T., Vainstcin, A., Citovsky, V. A case of promiscuity: Agrobacterium's endless hunt for new partners / B. Lacroix // Trends Genet. - 2006. - V. 22. - 1.1. - P. 29-31.

138. Leemans, J., Deblaere, R, Willmitzer, L., Greve, H.D., Hernalsteens, J.P., Montagu, M.V., Schell, J. Genetic Identification of functions of TL-DNA transcripts in octopine crown galls / J. Leemans // EMBO J. - 1982. - V. l.-I. l.-P. 147-152.

139. Lemcke, K., Schmiilling, T. A putative rolB gene homologue of the Agrobacterium rhizogenes TR-DNA has different morphogenetic activity in tobacco than rolB / K. Lemcke // Plant Mol. Biol. - 1998a. - V. 36.-I. 5.-P. 803-808.

140. Lemcke, K., Schmulling, T. Gain of function assays identify non-rol genes from Agrobacterium rhizogenes TL-DNA that alter plant morphogenesis or hormone sensitivity / K. Lemcke 11 Plant J. - 1998b. - V. 15.-1.3.-P. 423-433.

141. Li, J., Vaidya, M., White, C., Vainstein, A., Citovsky, V., Tzfira, T. Involvement of KU80 in T-DNA integration in plant cells / J. Li // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2005. - V. 102. - P.l9231-19236.

142. Lutcke, H.A., Chow, K.C., Mickel, F.S, Moss, K.A., Kern, H.F., Scheele, G.A. Selection of AUG initiation codons differs in plants and animals / H.A. Lutcke // EMBO J. - 1987. -V. 6. - I. 1. - P. 43-48.

143. Mc Adams, H.H., Srinivasan, B.S., Arkin, A.P. The evolution of genetic regulatory systems in bacteria / H.H. Mc Adams // Nature Rev. Genet., - 2004. - V. 5. - P. 169-178.

144. Matveeva, T.V., Lutova, L.A., Bogomaz, D.I., 2006. Search for T-DNA-Like Sequences in Plant Genomes, Using Real-Time PCR with Degenerate Primers and Probe / T.V. Matveeva // Biotechnology in the

Agriculture and Food Industry. New York, Nova Science Publishers, P. 101-104.

145. Matveeva T.V., Bogomaz D.I., Pavlova O.A. Nester EW, Lutova LA. 2012. Horizontal Gene Transfer from Agrobacterium to the Plant Linciria in Nature / T.V. Matveeva // Mol. Plant-Microbe Interact. -2012.-V. 25.1. 12.-P. 1542-1551.

146. Mattioli, R., Costantino, P., Trovato, M. Proline accumulation in plants. Not only stress / R. Mattioli // Plant Signal Behav. - 2009. - V. 4. -I. 11.-P. 1016-1018.

147. Maeda, Y., Moriguchi, K., Kataoka, M., Satou, M., Satutui, N., Tanaka, N. Yoshida, K. Genome structure of Ri plasmid. Sequencing analysis of T-DNA and its flanking regions of pRil724 in Japanese Agrobacterium rhizogenes / Y. Maeda // Nucleic Acids Symp. - 1999. -Ser. 42. - P. 67-68

148. Magrelli, A., Langenkemper, K., Dchio, C., Schell, J., Spena, A. Splicing of the rolA transcript of Agrobacterium rhizogenes in Arabidopsis / A. Magrelli // Science. - 1994. - V. 266. - I. 5193. - P. 19861988.

149. Maurel, C., Leblanc, N., Barbier-Brygoo, H., Perrot-Rcchenmann, C., Bouvier-Durand, M., Guern, J. Alterations of Auxin Perception in ro£-Transformed Tobacco Protoplasts. Time Course of rolB mRNA Expression and Increase in Auxin Sensitivity Reveal Multiple Control by Auxin / C. Maurel // Plant Physiol. - 1994. - V. 105. - P. 12091215.

150. Mauro, M.L., Trovato, M., De Paolis, A. Gallelli, A., Costantino, P., Altamura, M.M. The plant oncogene rolD Stimulates

flowering in transgenic tobacco plants / M.L. Mauro // Dev. Biol. - 1996. -V. 180.-P. 693-700.

151. Mayerhofer, R., Koncz-Kalman, Z., Nawrath, C., Bakkeren G., Crameri, A., Angelis, K., Redei, G.P., Schell, J., Hohn, B., Koncz, C. T-DNA integration: a mode of illegitimate recombination in plants / R. Mayerhofer // EMBO J. - 1991. - V. 10. - P. 697-704.

152. McBride, K. E., Knauf, V.C. Genetic analysis of the virE operon of the Agrobacterium Ti plasmid pTiA6 / K.E. McBride // J. Bacteriol. - 1988. - V. 170. - I. 4. - P. 1430-1437

153. McClure, B.A., Hagcn, G., Brown, C.S., Gee, M.A., Guilfoyle, T.J. Transcription, organization, and sequence of an auxin-regulated gene cluster in soybean / B.A. McClure // The Plant Cell. - 1989. - V. 1. - P. 229-239.

154. Melchers, L.S., Maroney, M.J., den Dulk-Ras, A. Thompson, D.V., van Vuuren, H.A., Schilperoort, R.A., Hooykaas, P.J. Octopine and nopaline strains of Agrobacterium tumefaciens differ in virulence; molecular characterization of the virF locus / L.S. Melchers // Plant Mol. Biol. - 1990. - V. 14. - I. 2. - P. 249-259.

155. Messens, E., Lenaerts, A., van Montagu, M., Hedges, R.W. () Genetic basis for opine secretion from crown gall tumor cells / E. Messens // Mol. Gen. Genet. - 1985. - V. 199. - P. 344-348.

156. Meyer, A.D., Ichikawa, T., Meins, F. Horizontal gene transfer: regulated expression of a tobacco homologue of the Agrobacterium rhizogenes rolC gene / A.D. Meyer // Mol.Gen.Genet. - 1995. - V. 249. -P. 265-273.

157. Milazzo, M.C, Zheng, Z., Kellett, G., Haynesworth, K., Shetty, K. Stimulation of benzyladenine-induced in vitro shoot organogenesis and endogenous proline in melon (Cucumis melo L.) by fish protein hydrolysates in combination with proline analogues / M.C. Milazzo // J. Agric. Food Chem. - 1999. - V. 47. - I. 4. - P. 1771-1775.

158. Miranda, A., Janssen, G., Hodges, L., Peralta, E, G., Ream, W. Agrobacterium tumefaciens transfers extremely long T-DNAs by a unidirectional mechanism / A. Miranda // J. Bacteriol. - 1992. - V. 174. - I. 7. - P. 2288-2297.

159. Mohajjel-Shoja, H., Clément, В., Perot, J., Alioua, M., Otten, L. Biological Activity of the Agrobacterium rhizogenes-Dzxxvzà. trolC Gene of Nicotiana tabacum and Its Functional Relation to Other plast Genes / H. Mohajjel-Shoja // Mol. Plant-Microbe Interact. - 2011 - V. 24. -N. 1.- P. 44-53.

160. Moore, L.W., Chilton, W.S., Canfield, M.L. Diversity of opines and opine-catabolizing bacteria isolated from naturally occurring crown gall tumors / L.W. Moore // Appl. Environ. Microbiol. - 1997. - V. 63. - I. 1. -P. 201-207.

161. Moriguchi, K., Maeda, Y., Satou, M., Hardayani, N.S., Kataoka, M., Tanaka, N., Yoshida, K. The complete nucleotide sequence of a plant root-inducing (Ri) plasmid indicates its chimeric structure and evolutionary relationship between tumor-inducing (Ti) and symbiotic (Sym) plasmids in Rhizobiaceae / K. Moriguchi // J. Mol. Biol. - 2001. - V. 307. -P.771-784.

162. Moriguchi, K., Nishida, T., Maeda, Y., Tanaka, N., Yoshida, K. Genome structure of Ri plasmid: Construction of linking library and

physical map of pRil724 in Japanese Agrobacterium / K. Morigu // Nucleic Acids Symp. Ser. 39. - 1998. - P. 189-190.

163. Moriuchi, H., Okamoto, C., Nishihama, R., Yamashita, I., Machida, Y., Tanaka, N. Nuclear localization and interaction of RolB with plant 14-3-3 proteins correlates with induction of adventitious roots by the oncogene rolB / H. Moriuchi // Plant J. Vol. 2004. - V. 38. - I. 2. - P. 260275.

164. Mower, J., Stefanovic, S., Young, G, Palmer, J. Gene transfer from parasitic to host plants / J. Mower // Nature. - 2004. - V. 432. - P. 165-166.

165. Murashige, T., Skoog, F. A revised medium for rapid growth and bioassay with tobacco tissue culture / T. Murashige // Physiol. Plant. -1962,-V. 15.-P. 165-170.

166. Murray, M.G., Thompson, W F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA / M.G. Murray // Nuclcic Acids Res. - 1980. -V.8.-P. 4321-4325.

167. Nilsson, O., Moritz, T., Imbault, N., Sandberg, G., Olsson, O. Hormonal Characterization of Transgenic Tobacco Plants Expressing the rolC Gene of Agrobacterium rhizogenes TL-DNA / O. Nilsson // Plant Physiol. - 1993. - V. 102. - N. 2. - P. 363-371.

168. Nilsson, O., Olssen, O. Getting to the root: The role of the Agrobacterium rhizogenes rol genes in the formation of hairy roots / O. Nilsson // Physiologia Plantarum. - 1997. - V. 100. - P. 463-473.

169. Ooms, G., Hooykaas, P.J., Moolenaar, G., Schilperoort, R.A. Crown gall plant tumors of abnormal morphology, induced by Agrobacterium tumefaciens, carrying mutated octopine Ti plasmids: analysis ofT-DNA functions / G. Ooms//Gene. - 1981.-V. 14.-I. l.-P. 33-50.

170. Oono, Y., Kanaya, K., Uchimiya, H. Early flowering in transgenic tobacco plants possessing the rolC gene of Agrobacterium rhizogenes Ri plasmid / Y. Oono // Japanese Journal of Genetics. - 1990. -V. 65.-I. l.-P. 7-16.

171. Otten, L., Heifer, A. Biological activity of the rolB-like 5' end of the A4-or/8 gene from the Agrobacterium rhizogenes TL-DNA / L. Otten // Mol. Plant-Microbe Interact. - 2001. - V. 14. -P. 405-411.

172. Ouartsi, A., Clerot, D., Meyer, A.D. Dessaux, Y., Brevet, J., Bonfill, M. The T-DNA ORF8 of the cucumopine-type Agrobacterium rhizogenes Ri plasmid is involved in auxin response in transgenic tobacco / A. Ouartsi // Plant Science. - 2004. - V. 166. - P. 557-567.

173. Palazon, J., Cusidl, R.M., Roig, C., Pinol, M.T. Expression of the rolC gene and nicotine production in transgenic roots and their regenerated plants / J. Palazon // Plant Cell Rep. - 1988. - V. 17. - P. 384390.

174. Pandolfini, T., Storlazzi, A., Calabria, E., Defez, R., Spena, A. The spliceosomal intron of the rolA gene of Agrobacterium rhizogenes is a prokaryotic promoter / T. Pandolfini // Mol. Microbiol. - 2000. - V. 35. - I. 6.-P. 1326-1334.

175. Park, S., Vaghchhipawala, Z.E., Vasudevan, B., Waterworth, W.M., West, C.E., Gelvin, S.B., Mysore, K.S. "Classical" non-homologous end-joining proteins limit T-DNA integration into the plant genome / S. Park // In 32th International Crown Gall Conference. - 2011. - P. 18

176. Pazour, G.J., Das, A. virG, an Agrobacterium tumefaciens transcriptional activator, initiates translation at a UUG codon and is a sequence-specific DNA-binding protein /G.J. Pazour // J. Bacteriol. - 1990. -V. 172.- 1.3.-P. 1241-1249.

177. Pazour, G.J., Ta, C.N., Das, A. Mutants of Agrobacterium tumefaciens with elevated vir gene expression / G.J. Pazour // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1991. - V. 88. - I. 16. - P. 6941-6945.

178. Peralta, E.G., Hellmiss, R., Ream, W. Overdrive, a T-DNA transmission enhancer on the A. tumefaciens tumour-inducing plasmid / E.G. Peralta // EMBO J. - 1986. - V. 5. - P. 1137-1142.

179. Piers, K., Heath, J., Liang, X., Stephens, K., Nester, E. Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of yeast / K. Piers // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1996. - V. 93. - P. 1613-1618.

180. Pionnat, S., Keller, H., Hericher, D., Bettachini, A., Dessaux, Y., Nesme, X., Poncet, C. Ti plasmids from Agrobacterium characterize rootstock clones that initiated a spread of crown gall disease in Mediterranean countries / S. Pionnat // Appl. Environ. Microbiol. - 1999. -V.65.-P. 4197-4206.

181. Petit, A., David, C., Dahl, G.A., Ellis, J.G., Guyon, P., Casse-Delbart, F., Tempé, J. Further extension of the opine concept: plasmids in Agrobacterium rhizogenes cooperate for opine degradation / A. Petit // Mol. Gen. Genet.-1983.-V. 190.-P. 204-214.

182. Ream L.W., Gordon M.P., Nester E.W. Multiple mutations in the T-region of the Agrobacterium tumefaciens tumor-inducing plasmid / L.W. Ream // Proc. Natl Acad. Sci. USA. - 1983. - V. 80. - P. 1660-1664.

183. Ream, W. 2007. Production of a mobile T-DNA by Agrobacterium tumefaciens. .Pages 316-350 in: Chapter 8. Agrobacterium'. From Biology to Biotechnology. T. Tzifra and V. Citovsky, eds. Springer, New York.

184. Ricard, G., McEwan, N.R., Dutilh, B.E., Jouany, J.P., Macheboeuf, D., Mitsumori, M., Mcintosh, F.M., Michalowski, T., Nagamine, T., Nelson, N., Newbold, C.J., Nsabimana, E., Takenaka, A.,

Thomas, N.A., Ushida, K., Hackstein, J.H., Huynen, M.A. Horizontal gene transfer from Bacteria to rumen Ciliates indicates adaptation to their anaerobic, carbohydrates-rich environment / G. Ricard // BMC Genomics. -2006.-V. 7.-I. 22.-P. 1-13.

185. Richards, T.A., Dack, J.B., Jenkinson, J.M.,Thornton, C.R., Talbot, N.J. Evolution of filamentous plant pathogens: gene exchange across eukaryotic kingdoms / T.A. Richards // Current Biol. - 2006. - V. 16.-P.l857-1864.

186. Richardson, A.O., Palmer, J.D. Horizontal gene transfer in plants / A.O. Richardson // J. Exp. Bot. - 2007, - V. 58. - I. 1. - P. 1-9.

187. Riker, A.J., Banfield, W.M., Wright, W.H. et al., 1930. Studies on infectious hairy root of nursery apple trees / A.J. Riker // J. Agr. Res. -1930.-V. 41.-P. 507-540.

188. Robinette, D., Matthysse, A.G. Inhibition by Agrobacterium tumefaciens and Pseduomonas scivastanoi of development of the hypersensitive response elicited by Pseudomoncis syringae pv. Phaseolicola / D. Robinette // J. Bact. - 1990. - V. 172. - P. 5742-5749.

189. Rodenburg, K.W., De Groot, M.J., Schilperoort, R.A., Hooykaas, P.J. Singlestranded DNA used as an efficient new vehicle for transformation of plant protoplasts / K.W. Rodenburg // Plant Mol. Biol. -1989.-V. 13.-P. 711-719.

190. Saitou, N., Nei, M. 1987. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees / N. Saitou // Mol. Biol. Evol. - V. 4. - P. 406-425.

191. Salomon, F., Deblaere, R., Leemans, J., Hernalsteens, J-P., Van Montagu, M., Schell, J. Genetic identification of functions of TR-DNA transcripts in octopine crown galls / F. Salomon // The EMBO J. - 1984. -V. 3.-I. l.-P. 141-146.

192. Salzberg, S.L., White, O., Peterson J., Eisen, J.A. Microbial genes in the human genome: lateral transfer or gene loss / S.L. Salzberg // Science. - 2001. - V. 292. - P. 1903-1906.

193. Sambrook, J., Russell, D.W., 2001. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed. // New York Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2344 p.

194. Scheiffele, P., Pansegrau, W., Lanka, E. Initiation of Agrobacterium tumefaciens T-DNA processing: purified proteins VirDl and VirD2 catalyze siteand strand-specific cleavage of superhelical T-border DNA in vitro / P. Scheiffele // J. Biol. Chem. - 1995. - V. 270. - P. 1269-1276.

195. Schmulling T., Schell J., Spena A. Single genes from Agrobacterium rhizogenes influence plant development / T. Schmulling // The EMBO J. - 1988. - V.7. -1. 9. - P. 2621-2629.

196. Schmulling, T., Fladung, M., Grossmann, K., Schell J., 1993. Hormonal content and sensitivity of transgenic tobacco and potato plants expressing single rol genes of Agrobacterium rhizogenes T-DNA / T. Schmulling // The Plant J. - V. 3. - I. 3. - P. 371 -382.

197. Scholl, E.H., Thorne, J.L., Mc Carter, J.P., Bird, D.M. Horizontally transferred genes in plant-parasitic nematodes: a high-throughput genomic approach. / E.H. Scholl // Genome Biol. - 2003. - V. 4. - 1.6. - Article R39.

198. Serino G., Clerot D., Brevet J., Costantino, P., Cardarelli, M. Rol genes of Agrobacterium rhizogenes cucumopine strain: sequence, effects and pattern of expression / G. Serino // Plant Mol. Biol. - 1994. - V. 26.-I. l.-P. 415-422.

199. Shimoda, N., Toyoda-Yamamoto, A., Aoki, S., Machida, Y. Genetic evidence for an interaction between the VirA sensor protein and the ChvE sugar-binding protein of Agrobacterium / N. Shimoda // J. Biol. Chem. 1993. - V. 268. - I. 35. - P. 26552-26558.

200. Shimoda, N., Toyoda-Yamamoto, A., Nagamine, J., Usami, S., Katayama, M., Sakagami, Y., Machida, Y. Control of expression of Agrobacterium vir genes by synergistic actions of phenolic signal molecules and monosaccharides / N. Shimoda 11 Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1990. -V. 87.-I. 17.-P. 6684-6688.

201. Shirasu, K., Kado, C.I. Membrane location of the Ti plasmid VirB proteins involved in the biosynthesis of a pilin-like conjugative structure on Agrobacterium tumefaciens / K. Shirasu I I FEMS Microbiol. Lett. - V. 111. - I. 2-3. P. 287-293.

202. Shkryl, Y.N., Veremeichik, G.N., Bulgakov, V.P, Tchernoded, G.K., Mischenko, N.P., Fedoreyev, S.A., Zhuravlev, Y.N. Individual and combined effects of the rolA, B, and C genes on anthraquinone production in Rubia cordifolia transformed calli / Y.N. Shkryl // Biotechnol. Bioeng. -2008.-V. 100.-I. l.-P. 118-125.

203. Shuman, S. Recombination mediated by vaccinia virus DNA topoisomerase I in Escherichia coli is sequence specific / S. Shuman // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1991. - V. 88. - P. 10104-10108.

204. Simpson, R.B., O'Hara, P.J., Kwok, W., Montoya, A.L., Lichtenstein, C., Gordon, M.P., Nester, E.W. DNA from the A6S/2 crown gall tumor contains scrambled Ti-plasmid sequences near its junctions with plant DNA / R.B. Simpson // Cell. - 1982. - V. 29. - I. 3. - P. 1005-1014.

205. Sing, S.E., Peterson, R.K. Assessing environmental risks for established invasive weeds: Dalmatian (Linaria dalmatica) and yellow (L. vulgaris) toadflax in North America / S.E. Sing // Int. J. Environ. Res. Public Health. - 2011. - V. 8. - I. 7. - P. 2828-2853.

206. Singer, K., Shiboleth, Y.M., Li, J., Tzfira, T. Formation of complex extrachromosomal T-DNA structures in Agrobacterium tumefaciens-infected plants / K. Singer // Plant Physiol. - 2012. - V. 160. -P. 511-522.

207. Sinkar, V.P., Pythoud, F., White, F.F., Nester, E.W., Gordon, M.P. rolA locus of the Ri plasmid directs developmental abnormalities in transgenic tobacco plants / V.P. Sinkar // Genes Dev. - 1988. - V. 2. - I. 6. - P. 688-697.

208. Slightom, J.L., Durand-Tardif, M., Jouanin, L., Tepfer, D., Nucleotide sequence analysis of TL-DNA of Agrobacterium rhizogenes agropine type plasmid. Identification of open reading frames / J.L. Slightom //J. Biol. Chem.- 1986.-V. 261.-I. l.-P. 108-121.

209. Spanier, K., Schell, J., Schreier, P.H. A functional analysis of T-DNA gene 6b: the fine tuning of cytokinin effects on shoot development / K. Spanier // Mol Gen Genet. - 1989. - V. 219. - I. 1-2. - P. 209-216.

210. Specq, A., Hansen, G., Vaubert, D., Clerot, D., Heron, J.N., Tempe, J., Brevet, J. Studies on hairy root T-DNA: regulation and properties of ORF13 from Agrobacterium rhizogenes 8196 / A. Specq // In Plant Pathogenic Bacteria. International Conference, Versailles (France). -1994.-P. 465-468.

211. Spena, A., Langenkemper, K. Mutational analysis of the rolA gene of Agrobacterium rhizogenes in tobacco: function of the rolA pre-

mRNA intron and rolA proteins defective in their biological activity / A. Spena // Genet. Res. - 1997. - V. 69. - I. 1. - P. 11-15.

212. Stachel, S.E., Messens, E., Van Montagu, M., Zambryski, P. Identification of the signal molecules produced by wounded plant cells that activate T-DNA transfer in Agrobacterium tumefaciens / S.E. Stachel // Nature. - 1985. - V. 318. - P. 624-629.

213. Stachel, S.E., Nester, E.W. The genetic and transcriptional organization of the v/V-region of the A6 Ti plasmid of Agrobacterium tumefaciens / S.E. Stachel // EMBO J. - 1986. - V. 5. - I. 7. - P. 14451454.

214. Stachel, S.E., Timmerman, B., Zambryski, P.C. Generation of single-stranded T-DNA molecules during the initial stages of T-DNA transfer for Agrobacterium tumefaciens to plant cells / S.E. Stachel // Nature. - 1986. - V. 322. -1. 706-712.

215. Stieger, P. A., Meyer, A.D., Kathmann, P., Frundt, C., Niederhauser, I., Barone, M., Kuhlemeier, C. The orfl3 T-DNA gene of Agrobacterium rhizogenes confers meristematic competence to differentiated cells / P.A. Stieger // Plant Physiol. - 2004. - V. 135. - I. 3. -P. 1798-1808.

216. Strabala, T.J., Crowell, D.N., Amasino, R.M. Levels and location of expression of the Agrobacterium tumefaciens pTiA6 ipt gene promoter in transgenic tobacco / T.J. Strabala // Plant Mol. Biol. - 1993. -V. 21.-P. 1011-1021.

217. Sue, J.P. Origin and evolution of the Mediterranean vegetation and climate in Europe / J.P. Sue // Nature. - 1984. - V. 307. - P. 429-432.

218. Sugaya, S., Hayakawa, V., Handa, T., Uchimiya, H. Cell-Specific Expression of the rolC Gene of the TL-DNA of Ri Plasmid in

Transgenic Tobacco Plants / S. Sugaya // Plant Cell Physiol. - 1989. - V. 30.-I. 5.-P. 649-653.

219. Sundberg, C., Meek, L., Carrol, K., Das, A, Ream, W. VirEl protein mediates export of single-stranded DNA binding protein VirE2 from Agrobacterium tumefaciens into plant cells / C. Sundberg // J. Bacterid. -1996. - V. 178. - P. 1207-1212.

220. Sundberg, C.D., Ream, W. The Agrobacterium tumefaciens chaperone-like protein, VirEl, interacts with VirE2 at domains required for single-stranded DNA binding and cooperative interaction / C.D. Sundberg // J. Bacteriol. - 1999. - V. 181.-I. 21.-P. 6850-6855.

221. Suzuki, K., Tanaka, N., Kamada, H., Yamashita, I. Mikimopine synthase (mis) gene on pRil724 / K. Suzuki // Gene. - 2001. - V. 263. - I. 1-2.-P. 49-58.

222. Suzuki, K., Yamashita, I., Tanaka, N. Tobacco plants were transformed by Agrobacterium rhizogenes infection during their evolution / K. Suzuki // Plant J. - 2002. - V. 32. -1. 5. - P. 775-787.

223. Szegedi, E., Czako, M., Otten, L., Koncz, C. Opines in crown gall tumors induced by biotype 3 isolates of Agrobacterium tumefaciens / E. Szegedi // Physiol. Mol. Plant Pathol. - 1988. - V. 32. - P. 237-247.

224. Tantikanjana, T., Mikkelsen, M.D., Hussain, M. Halkier, B.A., Sundaresan, V. Functional Analysis of the Tandem-Duplicated P450 Genes SPS/BUS/CYP79F1 and CYP79F2 in Glucosinolate Biosynthesis and Plant Development by Ds Transposition-Generated Double Mutants / T. Tantikanjana // Plant Physiol. - 2004. - V. 135. - I. 2. - P. 840-848.

225. Tao, Y., Rao, P.K., Bhattacharjee, S., Gelvin, S.B. Expression of plant protein phosphatase 2C interferes with nuclear import of the Agrobacterium T-complex protein VirD2 / Y. Tao // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2004. - V. 101. - 1. 14. - P. 5164-5169.

226. Thomashow, L.S., Reeves, S., Thomashow, M.F. Crown gall oncogenesis: evidence that a T-DNA gene from the Agrobacterium Ti plasmid pTiA6 encodes an enzyme that catalyzes synthesis of indoleacetic acid / L.S. Thomashow // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1984. - V. 81. -P. 5071-5075.

227. Thomashow, M.F., Nutter, R., Montoya, A.L., Gordon, M.P., Nester, E.W. Integration and organization of Ti plasmid sequences in crown gall tumors / M.F. Thomashow // Cell. - 1980. - V. 19. - I. 3. - P. 729-739.

228. Thompson, D.V., Melchers, L.S., Idler, K.B., Schilperoort, R.A., Hooykaas, P.J. Analysis of the complete nucleotide sequence of the Agrobacteriwn tumefaciens virB operon / D.V. Thompson // Nucleic Acids Res. - 1988. - V. 16. -1. 10. - P. 4621-4636.

229. Tinland, B., Hohn, B. Recombination between prokaryotic and eukaryotic DNA: integration of Agrobacterium tumefaciens T-DNA into the plant genome / B. Titland // Genet. Eng. - 1995. - V. 17. - P. 209-229.

230. Trovato, M., Mauro, M.L., Costantino, P., Altamura, M.M. The rolD gene from Agrobacterium rhizogenes is developmentally regulated in transgenic tobacco / M. Trovato // Protoplasma. - 1997. - V. 197. - P. 111120.

231. Trovato, M., Maras, B., Linharcs, F., Costantino, P. The plant oncogene rolD encodes a functional ornithine cyclodeaminase / M. Trovato // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. - V. 98. -1. 23. - P. 13449-13453.

232. Tzfira, T., Frankman, L.R., Vaidya, M., Citovsky, V. Site-spccific integration of Agrobacterium tumefaciens T-DNA via double-stranded intermediates / T. Tzfira // Plant Physiol. - 2003. - V. 133. - P. 1011-1023.

233. Umber, M., Clément, B., Otten, L. The T-DNA oncogene A4-orjS from Agrobacterium rhizogenes A4 induces abnormal growth in

144

tobacco / M. Umber // Mol. Plant-Microbe Interact. - 2005. - V. 18. -P. 205-211.

234. Umber, M., Voll, L., Weber, A., Michler, P., Otten, L. The rolB-like part of the Agrobacterium rhizogenes or/8 gene inhibits sucrose export in tobacco / M. Umber // Mol. Plant-Microbe Interact. - 2002. - V. 15.-P. 956-962.

235. van Larebeke, N., Genetello, C., Schcll, J., Schilpcroort, R.A., Hermans, A.K., Van Montagu, M., Hernalsteens, J.P. Acquisition of tumour-inducing ability by non-oncogenic agrobacteria as a result of plasmid transfer / N. van Larebeke // Nature. - 1975. - V. 255. - I. 5511. -P. 742-743.

236. van Onckelen, H., Prinsen, E., Inze, D., Rudelsheim, P., Van Lijsebcttens, M., Follin, A., Schell, J., Van Montagu, M., De Greef, J. Agrobacterium T-DNA gene I codes for tryptophan 2-monooxygenasc activity in tobacco crown gall cells / H. van Onckelen // FEBS Lett. - 1986. - V. 198.-P. 357-360.

237. Vargas, P., Rossello, J.A., Oyama, R., Guemes, J. Molecular evidence for naturalness of genera in the tribe Antirrhineae {Scrophulariaceae) and three independent evolutionary lineages from the New World and the Old / P. Vargas // Plant Syst. Evol. - 2004. - V. 249. -P. 151-172.

238. Veremeichik, G. N., Shkryl, Y. N., Bulgakov, V. P., Avramenko, T.V., Zhuravlev, Y.N. Molecular cloning and characterization of seven class III peroxidases induced by overexpression of the agrobacterial rolB gene in Rubia cordifolia transgenic callus cultures / G.N. Veremeichik // Plant Cell Rep. - 2012. - V. 31. - I. 6. - P.10009-10019.

239. Vergunst, A.C., van Lier, M.C.M., den Dulk-Ras, A., Stuve, T.A.G., Ouwehand, A., Hooykaas, P.J.J. Positive charge is an important

feature of the C-terminal transport signal of the VirB/D4-translocated proteins of Agrobacterium / A.C. Vergunst //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2005.-V. 102. -P. 832-837.

240. Vilaine, F., Rembur, J., Chriqui, D., Tepfer, M. Modified development in transgenic tobacco plants expressing a ro//i::GUS translational fusion and subcellular localization of the fusion protein / F. Vilaine // Mol. Plant-Microbe Interact. - 1998. - V. 11. - I. 9. - P. 855859.

241. Vogel, A.M., Das, A. Mutational analysis of Agrobacterium tumefaciens virD2: tyrosine 29 is essential for endonuclease activity / A.M. Vogel // J. Bacteriol. - 1992. - V. 174. -P. 303-308.

242. Wang, K., Herrera-Estrella, A., Van Montagu, M. Overexpression of virDl and virD2 genes in Agrobacterium tumefaciens enhances T-complex formation and plant transformation / K. Wang // J. Bacteriol. - 1990. - V. 172. - P. 4432-4440.

243. Wang, K., Stachel, S.E., Timmerman, B., Van Montagu, M., Zambryski, P.C. Sitespecific nick in the T-DNA border sequence as a result of Agrobacterium vir gene expression / K. Wang // Science. - 1987. - V. 235.-P. 587-591.

244. Wang, M., Soyano, T., Machida, S., Yang, J.-Y., Jung, C., Chua, N.-H., Yuan, Y.A. Molecular insights into plant cell proliferation disturbance by Agrobacterium protein 6b / M. Wang // Genes Dev. - 2011.

- V. 25.-I. l.-P. 64-76.

245. Ward, J.E., Akiyoshi, D.E., Regier, D., Datta, A., Gordon M.P., Nester, E.W. Correction: characterization of the virB operon from Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid / J.E. Ward // J. Biol. Chem. - 1990.

- V. 265. - I. 8. - P. 4768.

246. Weiler, E.W., Spanier, K. Phytohormones in the formation of crown gall tumors / E. W. Weiler // Planta. - 1981. - V. 153. - P. 326-337.

247. White, P.R., Braun, A.C. A cancerous neoplasm of plants autonomous bacteria-free crown-gall tissue / P.R. White // Cane. Res. -1942. - V. 2. - I. 9. - P. 597-617.

248. White, F.F., Garfinkel, DJ., Huffman, G.A., Gordon, M.P., Nester E.W. Sequence homologous to Agrobacterium rhizogenes T-DNA in the genome of uninfected plants / F.F. White // Nature. - 1983. - V. 301. -1.5898.-P. 348-350.

249. Willmitzer L., De Beuckeleer M., Lemmers M., J. Schell, Van Montagu M. DNA from Ti plasmid present in nucleus and absent from plastids of crown gall plant cells / L. Willmitzer // Nature. - 1980. - V. 287. -I. 5780.-P. 359-361.

250. Winans, S.C., Allenza, P., Stachel, S.E., Mc Bride, K.E., Nester, E.W. Characterization of the virE operon of the Agrobacterium Ti plasmid pTiA6 / S.C. Winans // Nucleic Acids Res. - 1987. - V. 15. - I. 2. - P. 825837.

251. Winans, S.C., Mantis, N.J., Chen, C.Y., Chang, C.H., Han, D.C. Host recognition by the VirA, VirG two-component regulatory proteins of Agrobacterium tumefaciens / S.C. Winans // Res. Microbiol. - 1994. - V. 145.-I. 5-6.-P. 461-473.

252. Wise, A.A., Fang, F., Lin, Y.H., He, F., Lynn, D.G., Binns, A.N. The receiver domain of hybrid histidine kinase VirA: an enhancing factor for vir gene expression in Agrobacterium tumefaciens / A.A. Wise // J. Bacterid.-2010.-V. 192.-I. 6.-P. 1534-1542.

253. Won, H., Renner, S.S. Horizontal gene transfer from flowering plants to Gnetum / H. Won // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2003. - V. 100. -1.19.-P. 10824-10829.

254. Yanagisawa, S., Dof domain proteins: plant-specific transcription factors associated with diverse phenomena unique to plants / S. Yanagisawa // Plant Cell Physiol. - 2004. - V. 45. - 1.4. - P. 386-391.

255. Yanofsky, M., Lowe, B., Montoya, A., Rubin, R., Krul, W., Gordon, M., Nester E. Molecular and genetic analysis of factors controlling host range in Agrobacterium tumefaciens. / M.F. Yanofsky // Mol. Gen. Genet. - 1985, V. 201. - I. 2. - P. 237-246.

256. Yanofsky, M.F., Porter, S.G., Young, C., Albright, L.M., Gordon, M.P., Nester, E.W. The virD operon of Agrobacterium tumefaciens encodes a site-specific endonuclease / M.F. Yanofsky // Cell. - 1986. - V. 47.-P. 471-477.

257. Yokoyama, R., Hirose, T., Fujii, N., Aspuria, E.T., Kato, A., Uchimiya, H. The rolC promoter of Agrobacterium rhizogenes Ri plasmid is activated by sucrose in transgenic tobacco plants / R. Yokoyama // Mol. Gen. Genet. - 1994. - V. 244. - P. 15-22.

258. Zaenen, I., Van Larebeke, N., Van Montagu, M., Schell, J.J. Supercoiled circular DNA in crown-gall inducing Agrobacterium strains /1. Zaenen // Mol. Biol. - 1974. - V. 86. - I. 1. - P. 109-127.

259. Zambryski, P., Joos, H., Genetello, C., Leemans, J., Montagu, M.V., Schell, J. Ti plasmid vector for the introduction of DNA into plant cells without alteration of their normal regeneration capacity / P. Zambryski // EMBO. - 1983. - V. 2. -1. 12. - P. 2143-2150.

260. Zardoya, R., Ding, X., Kitagawa, Y., Chrispeels, M.J. Origin of plant glycerol transporters by horizontal gene transfer and functional recruitment / R. Zardoya // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 2002. - V. 99. - I. 23.-P. 14893-14896.

261. Ziemienowicz, A., Tinland, B., Bryant, J., Gloeckler, V., Hohn, B. Plant enzymes but not Agrobacterium VirD2 mediate T-DNA ligation in vitro / A. Ziemienowicz // Mol. Cell. Biol. - 2000. - V. 20. -P. 6317-6322.