Молекулярная организация, функциональная и антигенная активность поринов наружной мембраны Yersinia enterocolitica и Y. enterocolitica-подобных видов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.10, кандидат химических наук Вострикова, Ольга Павловна

• Вострикова, Ольга Павловна
• кандидат химических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат химических наук Вострикова, Ольга Павловна

1. ВВЕДЕНИЕ.

2. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР. Неспецифические порообразующие белки наружной мембраны грамотрицательных бактерий.

2.1. Наружная мембрана грамотрицательных бактерий: структура и свойства.

2.2. Характеристика интегральных p-структурированных белков НМ грамотрицательных бактерий.

2.2.1. Асимметрия в распределении АК остатков.

2.2.2. Пространственная структура p-баррельных белков.

2.3. Структурные особенности поринов НМ грамотрицательных бактерий.

2.3.1. Основные элементы пространственной организации пориновых белков.

2.3.2. Геометрия поры.

2.4. Конформационная пластичность изолированных поринов.

2.4.1. Способы солюбилизации пориновых белков.

2.4.2. Влияние денатурирующих факторов / агентов на структуру и свойства поринов.

2.5. Функциональные свойства неспецифических поринов грамотрицательных бактерий.

2.5.1. Методы исследования функциональной активности поринов.

2.5.2. Модуляция функциональных свойства поринов: влияние структурной организации белков и компонентов мембраны (в экспериментах in vitro).

2.5.3. Экспрессия OmpF и ОшрС поринов под влиянием изменения условий среды.

2.6. Иммунохимические свойства неспецифических поринов грамотрицательных бактерий.

2.6.1. Иммуногенные свойства поринов.

2.6.2. Антигенные свойства поринов.

2.6.2.1. Особенности антигенной структуры поринов.

2.6.2.2. Методы идентификации антигенных детерминант поринов.

2.6.2.3. Порины как эффективные диагностические антигены.

2.7. Бактерии рода Yersinia: Y. enterocolitica и Y. enterocolitica-подобные виды.

2.7.1. Эколого-эпидемиологическая характеристика иерсиний.

2.7.2. Медицинское значение Y. enterocolitica и

Y. enterocolitica-подобных видов.

2.7.3. Особенности развития (патогенеза) иерсиниоза.

2.7.3.1. Клинические проявления иерсиниозной инфекции.

2.7.4. Диагностика иерсиниоза.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.

3.1. Выделение и характеристика белков-поринов НМ Y. enterocolitica и Y. enterocolitica-подобных видов иерсиний, культивируемых при разной температуре.

3.1.1. Выделение разных молекулярных форм поринов иерсиний.

3.1.2. Характеристика OmpF- и OmpC-подобных поринов НМ бактерий рода Yersinia (на примере Y. enterocolitica).

3.1.2.1. Сравнительный анализ первичной структуры OmpF- и ОтрС- подобных поринов НМ Y enterocolitica.

3.1.2.2. Вторичная структура и трансмембранная топология OmpF и ОтрС поринов Y. enterocolitica.

3.2. Порообразующая активность основных белков НМ бактерий рода Yersinia.

3.2.1. Порообразующие свойства изолированных белков НМ бактерий рода Yersinia.

3.2.2. Порообразующие активность OmpF и ОгпрС поринов НМ бактерий рода Yersinia в составе ПГ-белковых комплексов.

3.2.3. Влияние величины мембранного потенциала на порообразующую активность белков.

3.3. Пространственная структура поринов наружной мембраны бактерий рода Yersinia.

3.3.1. Физико-химическая характеристика различных молекулярных форм поринов.

3.3.2. Влияние способа экстракции на пространственную структуру поринов.

3.3.3. Влияние солюбилизирующего агента на пространственную структуру поринов.

3.3.4. Температурная денатурация поринов.

3.3.5. Теоретическая модель пространственных структур ОтрС и OmpF поринов Y. enterocolitica. Анализ локализации и ориентации остатков триптофана в белках методом молекулярной динамики.

3.4. Иммунохимические свойства поринов наружной мембраны бактерий рода Yersinia.

3.4.1. Иммуногенные свойства поринов иерсиний.

3.4.2. Антигенные свойства поринов иерсиний.

3.4.2.1 Видоспецифичность поринов НМ иерсиний.

3.4.2.2. Антигенное родство поринов иерсиний.

3.4.3. Использование порообразующего белка наружной мембраны Y. enterocolitica для диагностики иерсиниоза с помощью ИФА.

3.4.3.1. Разработка диагностической ИФА тест-системы.

3.4.3.2. Использование разных молекулярных форм порина наружной мембраны Y enterocolitica для диагностики иерсиниоза и оценки некоторых показателей гуморального иммунного ответа у больных иерсиниозом.

3.4.4. Антигенные свойства OmpF и ОтрС поринов НМ Y. enterocolitica.

3.4.5. Диагностика вторично-очаговых форм ерсиниозов с помощью ИФА тест-системы на основе порина из Y. enterocolitica.

3.4.5.1. Использование ИФА тест-системы на основе порина Y enterocolitica для оценки гуморального звена иммунитета у больных с поражением периферической нервной системы иерсиниозной этиологии.

4. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

5. ВЫВОДЫ.

6. СПИСИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АК - аминокислота/ аминокислотный;

БЛМ - бислойные липидные мембраны;

ИФА - иммуноферментный анализ;

КД - круговой дихроизм,

ЛПС - липополисахарид,

М- молекулярная масса;

НМ - наружная мембрана;

OG - р -D-октилгл юкозид;

ОКИ — острые кишечные инфекции;

ПГ - пептидогликан;

ПЦР - полимеразная цепная реакция;

РА - реакция агглютинации;

РНГА - реакция непрямой гемагглютинации;

TJI - термолабильная (-ные) и ТС - термостабильная (-ные) молекулярные формы порина;

SDS - додеци л сульфат натрия;

SDS,ПААГ-электрофорез - электрофорез в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярная организация, функциональная и антигенная активность поринов наружной мембраны Yersinia enterocolitica и Y. enterocolitica-подобных видов»

Удивительное совершенство, с которым клетка тонко реагирует не толко на факторы внешней среды, но и на изменения в других клетках данного организма, в значительной мере достигается за счет строго согласованной работы отдельных компонентов ее наружной мембраны (НМ) - рецепторов, ферментных комплексов и каналообразующих структур. Роль биологических мембран для сохранности клетки от внешнего воздействия уникальна, поскольку их функционирование является необходимым условием существования клетки как единого целого. Исследование структуры и функций биологических мембран важно для понимания общих принципов жизнедеятельности клетки, оно связано с выяснением организации мембранных структур и механизмов их действия. Успехи, достигнутые к настоящему времени в области изучения биомембран на молекулярном уровне, оказались значимыми для биологии и медицины.

Разнообразие функций, выполняемых биологическими мембранами, в большинстве случаев обусловлено содержащимися в них белками, среди которых интегральные мембранные белки составляют порядка 30% от общего числа протеинов [1]. Среди интегральных белков НМ грамотрицательных бактерий доминирующими в количественном отношении являются порообразующие белки, которые относятся к классу Р-структурированных белков. Эти белки НМ бактерий названы неспецифическими белками-поринами, так как они образуют трансмембранные водонаполненные каналы (или поры), предназначенные для пассивной диффузии гидрофильных молекул с небольшой молекулярной массой (не более 600 Да).

Благодаря поринам НМ грамотрицательных бактерий осуществляется обмен низкомолекулярными веществами между клеткой и внешним окружением. Особенности структуры и поверхностная локализация поринов в бактериальной клетке обусловливает наличие у них не только транспортной функции, но и ряда различных биологических свойств. Известно, что участки полипептидной цепи поринов, экспонированные на поверхности бактериальной клетки, так называемые петли, являются потенциальными сайтами взаимодействия с другими клетками. Благодаря этому, бактериальные порины участвуют в активации факторов немедленной защиты макроорганизма, включаясь в формирование специфического иммунного ответа, направленного на освобождение от патогена. С другой стороны, они подавляют отдельные стадии иммунной защиты организма хозяина, что обеспечивает выживание патогена в макроорганизме, т.е. выступают как эффекторы патогенеза. Многообразие свойств позволяет рассматривать порообразующие белки НМ грамотрицательных бактерий в качестве перспективных антигенов для решения ряда проблем инфекционной иммунологии, связанных как с разработкой эффективных диагностических и протективных препаратов, так и принципиально новых подходов к защите от возбудителей инфекционных заболеваний.

Интенсивное изучение структурной организации и биологичесих свойств поринов НМ Escherichia coli и специфических каналов (LamB) для осуществления транспорта мальтозы, а также исследования строения наружного липидного бислоя началось в середине 80-х годов прошлого столетия [2]. К этому времени было установлено, что НМ грамотрицательных бактерий обладает аномально низкой проницаемостью для липофильных веществ, поскольку ее внутренний слой состоит из фосфолипидов, а внешняя часть образована липополисахаридом (ЛПС). Последующие 20 лет были посвящены исследованиям взаимосвязи структуры и функций поринов и сопровождались стремительным ростом накопления знаний в этой области. В настоящее время неспецифические и специфические пориновые каналы охарактеризованы достаточно подробно на молекулярном уровне. Благодаря полученным результатам по установлению большого числа различных геномных последовательностей, порообразующие белки были идентифицированы, помимо энтеробактерий, во многих микроорганизмах. Это позволило выявить некоторые особенности физиологии различных микроорганизмов в естественных условиях обитания и оценить их влияние на взаимоотношения с макроорганизмом.

Настоящий обзор посвящен особенностям структуры и функции поринов НМ грамотрицательных бактерий.

Заключение диссертации по теме «Биоорганическая химия», Вострикова, Ольга Павловна

ВЫВОДЫ

1. Впервые из наружной мембраны 4-х видов бактерий рода Yersinia, патогенной для человека Y. enterocolitica и 3-х непатогенных видов (Y. intermedia, Y. frederiksenii, Y. kristensenii), культивируемых при температуре 6-8 и 37°С, выделены неспецифические порообразующие белки. Установлено, что изменение температуры культивирования приводит к экспрессии в НМ иерсиний разных типов (OmpF- и ОтрС-подобных) поринов.

2. Установлено, что функционально-активной формой OmpF и ОтрС поринов всех исследованных видов иерсиний является тример. Каналы, образованные поринами непатогенных видов иерсиний, по сравнению с Y. enterocolitica, отличаются значительно большей гетерогенностью по распределению уровней проводимости.

3. Определены физико-химические характеристики изолированных OmpF и ОтрС поринов из Y. enterocolitica, Y. intermedia, Y. kristensenii и Y. frederiksenii. Обнаружено, что исследованные порины, несмотря на высокую степень структурного подобия, имеют некоторые особенности на уровне вторичной и третичной структур. Показано, что порины в растворе детергентов могут существовать в виде тримеров и мономеров.

4. Показано, что способ извлечения белков из бактериальной мембраны и природа используемого для экстракции детергента влияют на стабильность третичной структуры и соотношение элементов регулярной вторичной структуры тримера порина.

5. Впервые установлены первичные структуры OmpF и ОтрС поринов из Y. enterocolitica и построены теоретические модели пространственных структур этих белков. Основные различия между OmpF и ОтрС поринами иерсиний наблюдаются в конформации "внешних" петель и расположении одного из трех остатков триптофана в различных структурных элементах р-барреля.

6. Установлено, что порины наружной мембраны бактерий рода Yersinia относятся к иммунодоминантным белкам этих микроорганизмов, являются видо- и родоспецифическим антигенами и могут быть использованы в качестве диагностических антигенов.

7. Впервые на основе порина НМ Y. enterocolitica разработана иммуноферментная тест-система для диагностики иерсиниоза. Предлагаемая тест-система обеспечивает диагностику иерсиниоза независимо от стадии инфекционного процесса и сероварианта возбудителя. Эффективность ИФА тест-системы в два раза выше используемого клиническими лабораториями коммерческого эритроцитарного кишечноиерсиниозного (0:3 и 0:9) диагностикума.

8. Впервые показано, что ИФА тест-система на основе разных молекулярных форм (тримера и мономера) порина из Y. enterocolitica в качестве диагностических антигенов отличается чувствительностью при верификации острой и вторично-очаговой форм иерсиниоза, а также специфичностью при оценке гуморального иммунного ответа больных с этими формами иерсиниозной инфекции.

Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Вострикова, Ольга Павловна, 2009 год

1. Lugtenberg В., Van Alphen L. Molecular architecture and functioning of the outer membrane of Escherichia coli and other Gram-negative bcteria. // Bochim. Biophys. Acta 1983. V. 37. N. 1. P. 51-115.

2. Bayer M.E. The fusion sites between outer membrane of bacteria: their role in membrane assembly and virus infection. In: Outer membrane. Biogenesis and function. // Ed. Inouye M. New York: Wiley-Interscience, 1979. P. 167-202.

3. Miura Т., Mizushuma S. Separation by density gradient centrifugation of two types of membranes from spheroplast membrane of Escherichia coli K-12. // Bochim. Biophys. Acta. 1969. V. 193. N. 2. P. 268-276.

4. Osborn M., Gander J.E., Parisi E., Carson J. Mechanism of assembly of the membrane of Salmonella typhimurium. Isolation and characterization of the cytoplasmic and outer membrane. // J. Biol. Chem. 1972. V. 247. N. 8. P. 3962-3972.

5. Schnaitman C.A. Solubilization of the cytoplasmic membrane of Escherichia coli by triton X100.//J. Bacteriol. 1971. V. 108. N. l.P. 545-552.

6. Nakae T. Outer membrane of Salmonella. Isolation of protein complex that producestransmembrane channels. //J. Biol. Chem. 1976. V. 251. N. 7. P. 2176-2178.

7. Schein S.J., Colombini M., Finkelstein A. Reconstitution in planar lipid bilayers of a voltage-dependent anion-selective channel obtained from Paramecium mitochondria. // J. Membr. Biol. 1976. V. 30. N. 2. P. 99-120.

8. Ulmschneider M.B., Sansom M.S. Amino acid distributions in integral membrane protein structure. //Biochim. Biophys. Acta. 2001. V. 1512. N. 1. P. 1-14.

9. Chamberlain A.K., Bowie J.U. Asymetric amino acid compositions of transmembrane p-strands. // Protein Science. 2004. V. 13. N. 8. P. 2270-2274.

10. Schulz G.E. The structure of bacterial outer membrane proteins. // Biochim. Biophys. Acta. 2002. V. 1565. N. 2. P. 308-317

11. Arora A., Abildgaard F., Bushweller J.H., Tamm J.H. Structure of outer membrane protein A transmembrane domain by NMR spectroscopy. // Nature Struct. Biol. 2001. V. 8. N. 4. P. 334-338.

12. Pautsch A., Schulz G.E. High-resolution structure of the OmpA membrane domain. // J. Mol. Biol. 2000. V. 298. N. 2. P. 273-282.

13. Conlan S., Zhang Y., Cheley S., Bayley H. Biochemical and biophysical characterization of OmpG: a monomeric porin. // Biochem. 2000. V. 39. N. 39. P. 11845-11854.

14. Cowan S.W., Garavito R.M., Jansonius J.N., Jenkins J.A., Karlsson R., Konig N., Pai E.F., Pauptit R.A., Rizkallah P.J., Rosenbusch J.P. The structure of OmpF porin in a tetragonal crystal form. // Struct. Fold. Design. 1995. V. 3. N. 10. P. 1041-1050.

15. Cowan S.W., Schirmer Т., Rummel G., Steiert M., Ghosh R., Pauptit R.A., Jansonius J.N., Rosenbusch J.P. Cristal structure explain functional properties of two Escherichia coli porins. //Nature. 1992. V. 258. N. 6359. P. 727-733.

16. Vandeputte-Rutten L., Kramer R.A., Kroon J., Dekker N., Egmond M.R., Gros P. Crystal structure of the outer membrane protease OmpT from Escherichia coli sugest a novel catalytic site. // EMBO J. 2001. V. 20. N. 18. P. 5033-5039.

17. Hwang P.M., Choy W.Y., Lo E.I., Chen L., Forman-Kay J.D., Raetz C.R., Prive G.G., Bishop R.E., Kay L.E. Solution structure and dynamics of the outer membrane enzyme PagP by NMR. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. V. 99. N. 21. P. 13560-13565.

18. Schirmer Т., Keller T.A., Wang Y.F., Rosenbusch J.P. Structural basis for sugar translocation through maltoporin channels at 3.1 A resolution. // Science. 1995. V. 267. N. 5197. P. 512-514.

19. Forst D., Welte W., Wacker Т., Diederichs K. Structure of the sucrose-specific porin SerY from Salmonella tuphimurium and its complex with sucrose. // Nat. Struct. Biol. 1998. V. 5. N. 1. P. 37-46.

20. Ferguson A.D., Hofmann E., Coulton J.W., Diederichs K., Welte W. Siderophore-mediated iron transport: crystal structure of Fhu A with bound lipopolysaccharide. // Science. 1998. V. 282. N. 5397. P. 2215-2220.

21. Chimento D.P., Monanty A.K., Kadner R.J, Wiener M.C. Crystallization and initial X-ray diffraction of BtuB, the integral membrane cobalamin transporter of Escherichia coli. // Acta Crystallogr. Sect. D Biol. Crystallogr. 2003. V. 59. N. 3. P. 509-511.

22. Murzin A.G., Lesk A.M., Chothia C. Principles determing of beta-sheet barrels in proteins. II. The observed structure. // J. Mol. Biol. 1994. V. 236. N. 5. P. 1382-1400.

23. Weiss M.S., Kreusch A., Schiltz E., Nestel U., Welte W., Weekesser J., Sehulz G.E. The structure of porin from Rhodobacter capsulatus at 1.8 A resolution. // FEBS Lett. 1991. V. 280. N. 2. P. 379-382

24. Weiss M.S., Wacker Т., Weekesser J., Welte W., Sehulz G.E. The three-dimensional structure of porin from Rhodobacter capsulatus at 3 A resolution. // FEBS Lett. 1990. V. 267. N. 2. P. 268-272.

25. Garavito R.M., Rosenbusch J.P. Three-dimensional crystals of an integral membrane protein: an initial X-ray analysis. // J. Cell Biol. 1980. V. 86. N. 1. P. 327-329.

26. Weiss M.S., Abele U„ Weekesser J., Welte W., Schiltz E., Sehulz G.E. Molecular architecture and electrostatic properties of a bacterial porin. // Science. 1991. V. 254. N. 5038. P. 1627-1630.

27. Jap B.K. High-resolution electron diffraction of reconstituted PhoE porin. // J. Mol. Biol. 1988. V. 199. N. 4. P. 407-420.

28. Jap B.K., Walian P.J. Structure and functional mechanism of porins. // Physiol. Rev. 1996. V. 76. N. 4. P. 1073-1088.

29. Koebnick R., Locher K.P., van Gelder P. Structure and function of bacterial outer membrane proteins: barrels in a nutshell. // Mol. Microbiol. 2000. V. 37. N. 2. P. 239-253.

30. Sehulz G.E. p-Barrel membrane proteins. // Curr. Opin. Struct. Biol. 2000. V. 10. N. 4. P. 443-447.

31. Phale P.S., Philippsen A., KiefhaberT., Koebnik R., Phale V.P., Schirmer T. and Rosenbusch J.P. Stability of trimeric OmpF porin: the contributions of the latching loop L2. // Biochemistry. 1998. V. 37. N. 45. P. 15663-15670.

32. Jeanteur D., Lakey J.H., Pattus F. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. // Mol. Microbiol. 1991. V. 5. N. 9. P. 2153-2164.

33. Delcour A.H. Functon and modulation of bacterial porins: insight from electrophysiology. // FEMS Microbiol. Lett. 1997. V. 151. N. 2. P. 115-125.

34. Palva E.T., Randall L.L. Arrangement of protein I in Escherichia coli outer membrane: cross-linking study. // J. Bacteriol. 1978. V. 133. N. 1. P. 279-286.

35. Jap B.K., Wallia P.J., Gehring K. on B.A. Structural architecture of an outer membrane channel as determined by electron crystallography. //Nature, 1991. V. 350. N. 6314. P. 167170.

36. Sipos L., von Heijne G., Prediction the topology of eucariotic membrane proteins. // Eur. J. Biochem. 1993. V. 213. N. 3. P.1333-1340.

37. Jaenicke R. Do ultrastable proteins from hyperthermophiles have high or low conformational rigidity? // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. N. 7. P. 2962-2964.

38. Jaenicke R. Protein stability and molecular adaptation to extreme conditions. // Eur. J. Biochem. 1991. V. 202. N. 3. P. 715-728.

39. Daggett V, Fersht AR. Is there a unifying mechanism for protein folding? // Trends Biochem. Sci. 2003. V. 28. N. 1. P. 18-25.

40. Garavito R.M., Rosenbusch J.P. Isolation and crystallization of bacterial porin. // Met. Enzym. 1986. V. 125. N. 2. P. 309-329.

41. Kleinschmidt J.H. Membrane proteins Introduction. // Cell Mol. Life Sci. 2003. V. 60. N. 8. P. 1527-1528.

42. Eriks L.R., Mayor J.A, Kaplan R.S. A strategy for identification and quantification of detergens frequently used in the purification of membrane proteins. // Anal. Biochem. 2003. V. 323. N. 2. P. 234-241.

43. Rosenbusch J.P. Characterization of the major envelope protein from Escherichia coli. Regular arrangement on the peptidoglycan and unusual dodecyl sulfate binding. // J. Biol. Chem. 1974. V. 249. N. 24. P. 8019-8029

44. Nurminen M. Isolation of porin trimers. In: Korhonen Т.К., Dawes E.A., Makela P.H. (eds) Enterobacterial Surface Antigen Methods for Molecular Characterization. N.-Y. Elsevier Science Publ. 1985. P. 293-300.

45. Sivaraman Т., Kumar T.K.S., Jayraman G., Han C.C., Yu C. Characterization of partially structured state in an all p-sheet protein. // Biochem. J. 1997. V. 321. N. 2. P. 457-464.

46. Pawar S.A., Deshpande V.V. Character. // Eur. J. Biochem. 2000. V. 232. N. 3. P. 63315338.

47. Rosenbusch J.P. Structural and functional properties of porin channels in E. coli outer membranes. // Experimentia. 1990. V. 46. N. 2. P. 167-173.

48. Bolla J.-M., Loret E., Zalewsky M., Pages J.-M. Conformational analysis of the Campylobacter jejuni porin. //J. Bacteriol. 1995. V. 177. N. 15. P. 4266-4271.

49. Eisele J.L, Rosenbusch J.P. In vitro folding and oligomerization of a membrane protein. Transition of bacterial porin from random coil to native conformation. // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. N. 18. P. 10217-10220.

50. Markovic-Housley Z., Garavito R.M. Effect of temperature and low pH of matrix porin in micellar detergent solutions. // Biochim. Biophys. Acta. 1986. V. 869. N. 2. P. 158-170.

51. Minetti C.A.S.M., Blake S., and Remeta D.P. Characterization of the Structure, Function, and Conformational Stability of PorB Class 3 Protein from Neisseria meningitides. II J. Biol. Chem. 1998. V. 273. N. 39. P. 25329-25338.

52. Schindler M., Rosenbusch J.P. Structural transition of porin, a transmembrane protein. // FEBS Lett. 1984. V. 173. N. 1. P. 85-89.

53. Sukuraman S., Hauser K., Maier E., Benz R., Mantele W. Tracking the unfolding and refolding pathways of outer membrane protein porin from Paraccocus denitrificans. II Biochemistry. 2006. V. 45. N. 12. P3972-3980.

54. Sukumaran S., Hauser K., Maier E., Benz R., Mantele W. Structure-function correlation of outer membrane protein porin from Paracoccus denitrificans. И Biopolymers. 2006. V. 82. N. 4. P. 344-348.

55. Мажуль В.М., Кананович С.Ж. О возможности белка существовать во множестве частично свернутых состояниях. // Биофизика. 2004. Т. 40. № 3. С. 413—423.

56. Nikaido Н. Molecular basis of bacterial outer membrane permeability revisited. // Microbiol. Mol. Biol. 2003. V. 676. N. 4. P. 593-656.

57. Nikaido H. Porins and specific diffusion channels in bacterial outer membranes. // J. Biol. Chem. 1994. V. 269. N. 6. P. 3905-3908.

58. Nakae T. Identification of the outer membrane proteins of Escherichia coli that produced transmembrane channels in reconstituted vesicle membrane. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1976. V. 71. N. 3. P.877-884.

59. Tokunaga M., Tokunaga H., Nakae T. The outer membrane permeability of Gram-negative bacteria. Determination of permeability rate in reconstituted membrane vesicles. // FEBS Lett. 1979. V. 106. N. 1. P. 85-88.

60. Nakae T. Outer membrane of Salmonella typhymurium: Reconstitution of sucroe-permeable membrane vesicles. //Biochem. Biophys. Res. Commun. 1975. V. 64. N. 4. P. 1224-1230.

61. Nikaido H., Rosenberg E.Y. Porin channels in Escherichia coli studies with liposomes reconstituted from purified proteins. // J. Bacteriol. 1983. V. 153. N. 1. P. 241-252.

62. Nikaido H., Rosenberg E.Y. Effect on solute size on diffusion rates through the transmembrane pores of the outer membrane of Escherichia coli. II J. Gen Physiol. 1981. V. 77. N. 2. P. 121-35.

63. Zimmermann W., Rosselet A. Function of the outer membrane of Escherichia coli as a permeability barrier to beta-lactam antibiotics. // Antimicrob. Agents Chemother. 1977. V. 12.N.3. P. 368-372.

64. Nikaido H., Song S.A., Shaltiel L., Nurminen M. Outer membrane of Salmonella XIV. Reduced transmembrane diffusion rate in porin-deficient mutants. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1977. V. 76. N. 2. P. 324-330.

65. Mueller P., Rudin D.O., Tien H.T., Wescott W.C. Reconstitution of cell membrane structure in vivo and its transformation into an excitable system. // Nature. 1962. V. 194. N. 4832. P. 979-980.

66. Montal M., Muller P. Formation of biomolecular membranes from lipid bilayers and study of their electrical properties. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1972. V. 69. N. 12. P. 3561-3566.

67. Schindler H. Formation of planar bilayer from artificial or native membrane vesicles. // FEBS Lett. 1980. V. 122. N. 1. P. 77-79.

68. Schindler H., Rosenbusch J. Matrix protein from Escherichia coli outer membranes forms voltage-controlled chanells in lipid bilayers. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1978. V. 75. N. 8. P.3751-3755.

69. Benz R., Schmid A., Hancock R.E. Ion selectivity of gram-negative bacterial porins. // J. Bacteriol. 1985. V. 162. N. 2. P. 722-727.

70. Dargent В., Hofmann W., Pattus F., Rosenbusch J.P. The selectivity filter of voltage-dependent channels formed by phosphoporin (PhoE) from E. coli. II EMBO J. 1986. V. 5. N. 4. P. 773-778.

71. Hamill O.P., Marty A., Neher E., Sakmann В., Sigworth F.J. Improved patch-clamp techniques for high-resolution current recordings from cells and cell-free membrane patches. //Pflugers Arch. 1981. V. 391. N. 2. P. 85-100.

72. Martinac В., Buechner M., Delcour A.H., Adler J., Kung C. Pressure-sensitive ion channel in Escherichia coli. II Proc. Nat. Acad. Sci USA. 1987. V. 84. N. 8. P. 2297-2301.

73. Buechner M., Delcour A.H., Martinac В., Adler J., Kung C. Ion channel activity in the Escherichia coli outer membrane. // Biochim. Biophys. Acta. 1990. V. 1024. N. 1. P. 111121.

74. Delcour A.H., Martinac В., Kung С., Adler J. A modified reconstitution method used in patch-clamp studies of Escherichia coli ion channels. // Biophys. J. 1989. V. 56. N. 3. P. 631-636.

75. Berrier C., Coulombe A., Houssin C., Ghazi A. A patch-clamp study of ion channels of inner and outer membranes and of contact zones of E. coli fused into giant liposomes. // FEBS LEtt. 1989. V. 259. N. 1. P. 27-32.

76. Delcour A.H., Martinac В., Kung C., Adler J. Voltage-sensitive ion channel of Escherichia coli. // J. Memb. Biol. 1989. V. 112. N. 3. P. 267-275.

77. Delcour A.H. Solute uptake throught general porins. // Front. Biosci. 2003. V. 8. N. 3. P. 1055-1071.

78. Benz R., Janko K., and Lauger P. Ionic selectivity of pores formed by the matrix protein (porin) of Escherichia coli. II Biochim. Biophys. Acta. 1979. V. 551. N. 2. P 238-247.

79. Nestorovich E.M., Rostovtseva Т.К., and Bezrukov S.M. Residue Ionization and Ion ' Transport through OmpF Channels. // Biophys. J. 2003. V. 85. N. 6. P. 3718-3729.

80. Buehler L.K., Kusumoto S., Zhang H., Rosenbusch J.P. Plasticity of Escherichia coli porin channels. Dependence of their conductance on strain and lipid environment. // J. Biol. Chem. 1991. V. 266. N. 36. P. 24446-24450.

81. Schirmer T. General and specific porins from bacterial outer membrane. // J. Struct. Biol. 1998. V. 121. N. 2. P. 101-109.

82. Muller D.J., Engel A. Voltage and pH-induced channel closure of porin OmpF visualized by atomic force microscopy. // J. Mol. Biol. 1999. V. 285. N. 4. P. 1347-1351.

83. Todt J.C., Roque W.J., McGroarty E.J. Effects of pH on bacterial porin function. // Biochemistry. 1992. V. 31. N. 43. P. 10471-10478.

84. Xu G., Shi В., McGroarty E.J., Tien H.Y. Channel-closing activity of porins from E. coli in bilayer lipid membranes. // Biochim. Biophys. Acta. 1986. V. 862. N. 1. P. 57-64.

85. Ashish A., Rinehart D., Szabo G., Tamm L.K. Refolded outer membrane protein A of Escherichia coli forms ion channels with two conductance states in panar lipid bilayers. // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. N. 3. P. 1594-1600.

86. Schindler H., Rosenbusch J.P. Matrix protein in planar membranes: Clusters of channels in native invironment and functional reassembly. // Proc. Natl. Acad. Sci. 1981. V. 78. N. 4. P. 2302-2306.

87. Alcaraz A., Nestorovich E.M., Aguilella-Arzo M., Aguilella V.M., Bezrukov S.M. Salting Out the Ionic Selectivity of a Wide Channel: The Asymmetry of OmpF. // Biophys. J. 2004. V. 87. N. 2. P. 943-957.

88. Eppens E.F., Saint N., Van Gelder P., van Boxtel R., and Tommassen J. Role of the constriction loop in the gating of outer membrane porin PhoE of Escherichia coli. II FEBS Lett. 1997. V. 415. N. 3. P. 317-320.

89. Phale P.S., Philippsen A., Widmer C., Phale V.P., Rosenbusch J.P., Schirmer T. Role of charged residues at the OmpF porin channel constriction probed by mutagenesis and simulation. // Biochemistry. 2001. V. 40. N. 21. P. 6319-6325.

90. Bainbridge G., Mobasheri H., Armstrong G.A., Lea E.J., and Lakey J.H. Voltage-gating of Escherichia coli porin: a cystine-scanning mutagenesis study of loop 3. // J. Mol. Biol. 1998. V. 275. N. 2. P. 171-176.

91. Liu N., Delcour A. The spontaneous gating activity of OmpC porin is affected by mutation of putative hydrogen bond network or of a salt bridge between the L3 loop and the barrel. // Protein Eng. 1998. V. 11. N. 9. P. 797-802.

92. Arbing M.A., Dahan D., Boismenu D., Mamer O.A., Hanrahan J.W. and Coulton J.W. Charged residues in surface-located loops influence voltage gating of porin from Haemophilus influenzae type b. // J. Membr. Biol. 2000. V. 178. N. 3. P. 185-193.

93. Tomassen J., van der Ley P., van Zzeiji M., Agterberg M. Localization of functional domains in E. coli outer membrane porins. // EMBO J. 1985. V. 4. N. 6. P. 1583-1587.

94. Pratt L.A., Hsing W., Gibson K.E., Silhavy T.J. From acids to osmZ multiple factors influence synthesis of OmpF and OmpC porin in Escherichia coli. II Mol. Microbiol. 1996. V. 20. N. 5. P. 911-917.

95. Mizuno Т., Mizushima S. Signal transduction and gene regulation through phosphorylation of two regulatory components: the molecular basis of the osmotic regulationof the porin genes. II Mol. Microbiol. 1990. V. 4. N. 7. P. 1077-1082.

96. Lan C.Y., Igo M.M. Differential expression of the OmpF and OmpC porin proteins in Escherichia coli K-12 depends upon the level of active OmpR. // J. Bacteriol. 1998. V. 180. N. l.P. 171-174.

97. Slauch M., Garrett S. Jackson D.E., and Silhavy T.J. EnvZ functions through OmpR to control porin gene expression in Escherichia coli K-12.1 I J. Bacteriol. 1988. V. 170. N. 1. P. 439-441.

98. Batchellor E., Walthers D., Kenney L.J., Goulian M. The Escherichia coli CpxA-CpxR envelope stress response system regulate expression of the porins Omp F and Omp C. // J. Bacteriol. 2005. V. 187. N. 16. P. 5723-5731.

99. Achouak W., Heulin Т., Pages J.-P. Multiple facets of bacterial porins. // FEMS Microbiol. Lett. 2001. V. 199. N. l.P. 1-7.

100. Rawling E.G., Martin N.L., Hancock R.E.W. Epitope mapping of the Pseudomonas aeruginosa major outer membrane porin protein OprF. // Infect. Immun. 1995. V. 63. N. 1. P. 38-42.

101. Lupi N., Bourgois A., Bernadac A., Laboucarie S., Pages J.M. Immunological analysis of porin polymorphism in Escherichia coli В and K-12. // Mol. Immunol. 1989. V. 26. N. 11. P.1027-1036.

102. Hedstrom R.C., Pavlovskis O.R., Galloway D.R. Antibody response of infected mice to outer membrane proteins of Pseudomonas aeruginosa. II Infect. Immun. 1984. V. 43. N. 1. P. 49-53.

103. Chin J.C., Dai J., Watts J.E. Antibody response against Pseudomonas aeruginosa membrane proteins in experimentally infected sheep. // Vet. Microbiol. 1995. V. 43. N. 1. P. 21-32.

104. Wiertz E.J., Delvig A., Donders E.M., Brugghe H.F., van Unen L.M., Timmermans H.A., Achtman M., Hoogerhout P., Poolman J.T. T-cell responses to outer membrane proteins of

105. Neisseria meningitidis: comparative study of the Opa, Opc, and PorA proteins. // Infect. Immun. 1996. V. 64. N. 1. P. 298-304.

106. Henrilsen A.Z., Maeland J.A. Enhancement by a serum factor of the immunoaccessibility of an enterobacterial porin protein domain. // APMIS. 1991. V. 99. N. 8. P. 49-57.

107. Elkins C., Barkley K.B., Carbonetti N.H., Coimbre H.J., Sparling P.F. Immunobiology of purified recombinant outer membrane porin protein I of Neisseria gonorrhoeae. II Mol. Microbiol. 1994. V. 14. N. 2. P.1059-1075.

108. Nandakumar K.S., Muthukkaruppan V.R. Influence of immunopotentiators on the antiporin immunoglobulin G subclass: distribution and protective immunity against murine salmonellosis. // Scand. J. Immunol. 1999. V. 50. N. 2. P. 188-194.

109. Peeters C.C., Claassen I.J., Schuller M., Kersten G.F., van der Voort E.M., Poolman J.T. Immunogenicity of various presentation forms of PorA outer membrane protein of Neisseria meningitidis in mice. // Vaccine. 1999. V. 17. N. 20. P. 2702-2712.

110. Jansen C., Kuipers В., van der Biezen J., de Cock H., van der Ley P., Tomassen J. Immunogenicity of in vitro folded outer membrane protein PorA of Neisseria meningitides. //FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2000. V. 27. N. 3. P. 227-233.

111. Singh S.P., Singh S.R., Williams Y.U., Jonnes L., Abdullach T. Antigenic determinants of the OmpC porin from Salmonella typhimurium. II Infect. Immun. 1995. V. 63. N. 12. P. 4600-4605.

112. Дельвиг А.А., Семенов Б.Ф. Механизмы формирования иммунного ответа к пориновым белкам наружной мембраны менингококков серогруппы В. // Журн. микробиол. 1997. № 6. С. 92-96.

113. Henriksen A.Z., Maeland J.A. Immunogenicity expressed in patients with bacteraemia of an epitope shared by enterobacterial and neisserial porin proteins. // APMIS. 1995. V. 103. N. 5. P. 388-394.

114. Arockiasamy A., Murthy G.S., Rukmini M.R., Baalaji S.N., Katpally U.C., Krishnaswamy S. Conformational epitope mapping of OmpC, a major cell surface antigen from Salmonella typhi. II J. Struct. Biol. 2004. V. 148. N. 1. P. 22-33.

115. Волышна О.М., Титова М.А., Жмак М.Н., Короев Д.О., Обозная М.Б., Волкова Т.Д., Иванов В.Т. Предсказание структуры пептидов, способных индуцировать образование антител у мышей. // Биоорган, химия. 2002. Т. 28. № 5. С. 387-395.

116. Портнягина О.Ю., Новикова О.Д., Вострикова О.П., Хоменко В.А., Соловьева Т.Ф. Бактериальные порины как перспективные антигены для диагностики и вакцинопрофилактики. // Вестник ДВО РАН. 2004. №3. С. 35—44.

117. Jofre S. Evaluation of the immunospecificity of the porin Oml of Vibrio anguillarum serotype Ol. // J. Appl. Microbiol. 1998. V. 84. N. 5. P. 709-714.

118. Muthukkumar S., Muthukkaruppan V.R. Detection of porin antigen in serum for early diagnosis of mouse infections with Salmonella typhimurium. // FEMS Microbiol. Lett. V. 89. N. 3. P. 147-154.

119. Sheikhian A., Mustafaie Z.M.H.A., Shokri F., Malekzadeh R., Siavoshi F. Extraction of the Outer Membrane Proteins of H. pylori and Evaluation of Their Presence in Stool of the Infected Individuals. // Iran. Biomed. J. 2004. V. 8. N. 2. P. 83-88.

120. Jossens S., Colombel J.-F., Landers C., Poulain D., Geboes K., Bossuyt X., Targan S., Rutgeerts P., Reinisch W. Anti-outer membrane of porin С and anti-I2 antibodies in indeterminate colitis. // Gut. 2006. V. 55. N. 11. P. 1667-1669.

121. Определитель бактерий Берджи. Пер. с англ. Г.А. Заварзина. Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита, ДЖ. Стейли, С. Уильямса. В. 2т. М.: Мир, 1997.

122. Смирнов И.В. Возбудитель иерсиноза и близкие к нему микроорганизмы. // Клин, микробиол. антимикроб, химотер. 2004. Т. 6. № 1. С. 10-21.

123. Sulakvelidze A. Yersinia other than Y. enterocolitica, Y. pseudotuberculosis, and Y. pestis: the ignored species. // Microb. Infect. 2000. V. 2. N. 5. P. 497-513.

124. Martinez R.J. Plasmid-mediated and temperature-regulated surface properties of Yersinia enterocolitica. //Infect. Immun. 1983. V. 41. N. 3. P. 921-930.

125. Portnoy D.A., Wolf-Watz H., Bolin I., Beeder А.В., Falkow S. Characterization of common virulence plasmids in Yersinia species and their role in the expression of outer membrane proteins. // Infect. Immun. 1984. V. 43. N. 1. P. 108-114.

126. Bottone E.J. Yersinia enterocolitica overier and epidemiologic correlates. // Microbiol. Infect. 1999. V. 1. N. 4. P. 323-333.

127. Schleifstein J.I., Coleman M.B. An indentified microorganism resembling В lignieri and Pasterella pseudotuberculosis and pathogenic for man. // N-Y State J. Med. 1939. V. 39. P. 1749-1753.

128. Schleifstein J.I., Coleman M.B. Bacterium enterocoliticum. // Ann. Rep. Div. Lab. Res. NY State Dept. Health, Albany. 1943. P 56.

129. Knapp W. Mesenteric adenitis due to Pasteurella pseudotuberculosis in young people. // N. Engl. J. Med. 1958. V. 259. P. 776-778.

130. Ценева Г.Я. Иерсинии и иерсиниозы. СПб.: Медмассмедиа, 2006. 168 с.

131. Bottone E.J. Yersinia enterocolitica: the charisma continues. // Clin. Microbiol. 1997. V. 10. N. 2. P. 257-276.

132. Kotetishvili M., Kreger A., Wauters G., Morris J.G.Jr., Sulakvelidze A., and Stine О. C. Multilocus Sequence Typing for Studying Genetic Relationships among Yersinia Species. I I J. Clin. Microbiol. 2005. V. 43. N. 6. P. 2674-2684.

133. Siriken B. The presence of Yersinia enterocolitica and Other Yersinia Species in Ground Beef in Aydin, Turkey. // Turk. J. Vet. Anim. Sci. 2004. V. 28. N. 4. P. 489-495.

134. Prpic J.K., Robins-Browne R.M., Davey A.B. In vitro Assessment of virulence in Yersinia enterocolitica and Related Species. // J. Clin. Microbiol. 1985. V. 22. N. 1. P. 105-110.

135. Старостина Н.В., Ющенко Г.В. Распространение иерсиний малоизученных видов в окружающей среде и их роль в патологии человека. // Актуальные вопросы эпидемиологии. 1997. Вып. 2. С. 48-51.

136. Okwori A.E.J., Agada G.O.A., Olabode A.O., Agina S.E., Okpe E.S., Okopi J. The prevalence of pathogenic Yersinia enterocolitica among diarrhea patients in Jos, Nigeria // African J. Biotechnology. 2007. V. 6. N. 8. P. 1031-1034.

137. Asplund K., Johansoion Т., Siiton A. Evolution of pulsed-field gel electroforesis of genomic restriction fragment in the discrimination of Yersinia enterocolitica 0:3. // Epidemiol. Infect. 1998. V. 121. N. 3. P. 579-586.

138. Смирнов И.В., Ценева Г.Я. Фенотип возбудителя иерсниоза и его значение для диагностики. // Журн. микробиол., эпидемиол., и иммунологии. 1992. № 1. С. 60-65.

139. Ценева Г.Я., Солодовникова Н.Ю., Воскресенская Е.А. Молекулярные аспекты вирулентности иерсиний. // Клин, микробиол. и антимикроб, химиотерапия. 2002. Т. 4. № 3. С. 248-266.

140. Carniel Е. Plasmids and Pathogenicity Islands of Yersinia. II Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2002. V. 264. N. 3. P. 89-108.

141. Koornhof H.J. « Yersiniosis II: The pathogenesis of Yersinia Infections». // Eur. J. Clin. Infect. Dis. 1999. V. 18. N. 2. P. 87-112.

142. Pepe J.C., Miller V.L. Yersinia enterocolitica invasion: a primaryroly in the infection. // ProssidingNat. Acad. Sci. USA. 1993. V. 90. N. 3. P. 6473-6477.

143. Mikulskis A.V., Delor I., Thi V.H., Cornelis G.R. Regulation of the Yersinia enterocolitica enterotoxin yst gene. Influence of growth phase, temperature, osmolarity, pH and bacterial host factors. // Mol. Microbiol. 1994. V. 14. N. 5. P. 905-915.

144. Vishnubhatla A., Fung D.Y.C., Oberst R.D., Hays M.P., Nagaraja T.G., Flood S.J.A. Rapid 5' Nuclease (TaqMan) Assay for Detection of Virulent Strains of Yersinia enterocolitica II Appl. Envirom. Microbiol. 2000. V. 66. N. 9. P. 4131-4135.

145. Thisted Lambertz S., Danielsson-Tham M.-L. Identification and Characterization of Pathogenic Yersinia enterocolitica Isolates by PCR and Pulsed-Field Gel Electrophoresis. // Appl. Enviroment. Microbiol. 2005. V. 71. N. 7. P. 3674-3681

146. Cherkassky B.L., Podounova L.G., Akuolova N.K. Food-related zoonosis in people in Russia.//Ditto. P. 18-19.

147. Fredriksson-Ahomaa M., Korkeala H. Low Occurrence of Pathogenic Yersinia enterocolitica in Clinical, Food, and Environmental Samples: a Methodological Problem. // Clin. Microbiol. 2003. V. 16. N. 2. P. 220-229.

148. Agbonlahor D.E. Characteristics of Yersinia intermedia-like, bacteria isolated from patients with diarrhea in Nigeria. // J. Clin. Microbiol. 1986. V. 23. N. 5. P. 891-896.

149. Kapperud G. Yersinia enterocolitica and Yersinia-like microbes isolated from mammals and water in Norway and Denmark. // Acta Pathol. Microbiol. Immunol. Scand. (Sect. B). 1977. V. 85. N. l.P. 129-135.

150. Nesbakken Т., Kapperud G. Yersinia enterocolitica and Yersinia enterocolitica-Wke bacteria in Norwegian slaughter pigs. // Int. J. Food Microbiol. 1985. V. 1. N. 2. P. 301-309.

151. Sinha I., Choudhary I., and Virdi J.S. Isolation of Yersinia enterocolitica and Yersinia intermedia from waste waters and their biochemical and serological characteristics. // Curr. Sci. 2000. V. 79. N. 5. P. 510-513.

152. Старостина H.B. Эпидемиологические и экологические особенности заболеваний, вызываемых Yersinia frederiksenii, Yersinia kristensenii и Yersinia intermedia. / Автореф. дис. .канд. биол. наук. Москва. 2000. 25 с.

153. Старостина. Н.В., Ющенко Г.В., Зайцев Б.Е. Некоторые особенности эпидемического процесса иерсиниозов на современном этапе. // Актуальные вопросы эпидемиологии инфекционных болезней. 1999. Вып. 3. С. 78-81.

154. Ющенко Г.В., Старостина Н.В., Саргсян С.С. Частота встречаемости Yersinia frederiksenii в различных объектах в сравнении с другими видами иерсиний. // Актуальные вопросы эпидемиологии. 1997. Вып. 2. С. 51-58.

155. Сомов Г.П. Беседнова H.H., Дзадзиева М.Ф., Тимченко Н.Ф. Иммунология псевдотуберкулеза. Новосибирск: Наука, 1985. 182 с.

156. Кононова Д.Г., Шарапова Т.А. Кишечный иерсиниоз и его значение в патологии человека. Инфромационное письмо. Владивосток. 1980. С. 1-15.

157. Wenzel В.Е., Heeseman J., Heufelder A., Franke T.F., Grammerstorf S., Stemerowicz R., Hopf U. Enteropathogenic Yersinia enterocolitica and organ-specific autoimmune diseases in man. // Contrib. Microbiol. Immunol. 1991. V. 12. N. 3. P. 80-88.

158. Бениова C.H, Гордеец A.B., Малашенкова В.Г., Ященя O.B., Седулина О.Ф. Иммунопатологические аспекты иерсиниозных инфекций у детей. // Педиатрия. 2001. №2. С. 111-112.

159. Малый В.П. Аутоиммунные процессы при псевдотуберкулезе. / Автореф. дисс. канд. мед. наук. Владивосток. 1975. 28 с.

160. Шанина Л.Н., Беседнова Н.Н. Аутосенсибилизация организма при псевдотуберкулезной инфекции // Клиническ. медицина. 1980. № 2. С. 44-49.

161. Ламберт И.М., Данилова Т.А. Перекрестно-реагирующие антигены микроорганизмов и тканей млекопитающих. // Успехи совр. биологии. 1974. Т. 75. Вып. 2. С. 183-202.

162. Saario R., Leino R., Lahesmaa R., Granfors K., Toivanen A. Function of terminal ileum in patients with Yersinia-triggered reactive arthritis. // J. Int. Med. 1992. V. 232. N. 5. P. 7376.

163. Гордеец А.В., Бениова C.H., Шуматова Т.А. Этапное лечение и диспансеризация больных иерсиниозами. // Клиническая медицина. 1994. Т. 72. N. 2. С. 42-44.

164. Попова О.В., Шепелева Г.К., Шестокова И.В., Андреев И.В., Попова Т.И., Ющук Н.Д. Клинико-иммунологическая характеристика иерсиниозной инфекции. // Инфекционные болезни. 2006. Т. 4. № 3. С. 51-55.

165. Hoogkamp-Korstanje J.A., de Koning J. Clinical aspects, diagnosis and therapy of Yersinia enterocolitica infections. // Immun. Infekt. 1990. V. 18. N. 6. P. 192-197.

166. Бениова C.H, Гордеец A.B. Динамическое наблюдение детей, перенесших иерсиниозную инфекцию. // Педиатрия. 2002. № 2. С. 44-48.

167. Abdel-Haq N.M., Asmar B.I., Abuhammour W.M., Brown W.J. Yersinia enterocolitica infection in children. // Pediatr. Infect. Dis. J. 2000. V. 19. N. 10. P. 954-958.

168. Саатова Г.М., Яковлева A.A. Клинические особенности иерсиниозного артрита у детей. // Педиатрия. 2001. № 2. С. 107-108.

169. Акбаров С.В., Султанов Х.К., Маткаримов Б.Д., Балтабаева М.А. Клинические варианты иерсиниозного реактивного артрита у детей. // Педиатрия. 1993. № 6. С. 54-56.

170. Каманцев В.Н., Скрипченко Н.В., Тихомирова О.В., Бехтерова М.К. Поражения периферической нервной системы при иерсиниозной инфекции у детей. // Российский мед. журн. 2003. № 2. С. 27—29.

171. Challa Y.R., Marx R.S. Pathology of Yersinia enterocolitica meningitis. // J. Neurol. Neurosurg Psychiatry. 1980. V. 43. N. 1. P. 455-457.

172. Sotaniemi K.A. Neurologic complications associated with yersiniosis. // Neurology. 1983. V. 33. N. 3. P. 95-97.

173. Вяльба E.B., Ющук Н.Д., Белая Ю.А. Определение антигена иерсиний в биологических субстратах у взрослых. // Советская медицина. 1989. № 4. С. 96-97.

174. Климанова Е. М., Белая О.Ф., Лаврова К.В. Использование реакции коагглютинации в диагностике иерсиниозов у детей. // Педиатрия. 1993. № 4. С. 48-49.

175. Королюк A.M. Использование реакции коагглютинации для определения и быстрой идентификации возбудителей иерсиниоза и псевдотуберкулеза. // Лаб. дело. 1984. № 4. С. 250-252.

176. Аксенов М.Ю., Гинзбург А.Л. Диагностика инфекционных заболеваний с помощью метода полимеразной цепной реакции. // Мол. генетика. 1993. № 4. С. 3-9.

177. Королюк A.M., Головачева С.Н., Дулатова М.В. Выбор рациональных методов определения антител к Yersinia enterocolitica. Реакция агглютинации. // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунологии. 1988. № 9. С. 45-47.

178. Александер С.К., Лукин Ю.В., Фидлер Л.М. Приготовление IgG диагностикума на основе окрашенных полиакролеиновых латексов для применения в реакции латексной агглютинации. // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунологии. 1990. № 6. С. 84-88.

179. Яшина Н.В., Дулатова М.В., Фиш Н.Г. Прокопов Н.И., Черкасов В.П., Кравцов Э.Г., Янина Т.Н., Грицкова И.А. Способ дифференциальной диагностики иерсиниоза: А.с. Р.Ф. 2087913 // Б. И. 1997. № 27. С. 371.

180. Granforst К. Measurement of Immunoglobulin М (IgM), IgG and IgA Antibodies Against Yersinia enterocolitica by Enzyme-Linked Immunosorbent Assay: Persistence of Serum Antibodies During Disease. // J. Clin. Microbiol. 1979. V. 9. N. 3. P. 336-341.

181. Малов И.В., Рубцов И.В., Ющенко Г.В., Леоненко В.В. Способ иммуноферментной диагностики иерсиниозов: А.с. РФ 1767435 // Б.И. 1992. № 37. С. 192.

182. Богаутинов З.Ф., Вылегжанина Е.С., Кузьмина В.Б., Астахова Т.С., Ниязов У.Э., Шумилов К.В. Способ диагностики иерсиниозов: А.с. РФ 2152037 // Б.И. 2000. № 18. С. 427.

183. Королюк A.M., Головачева С.Н., Дулатова М.В. Серодиагностика кишечного иерсиниоза. // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунологии. 1990. № 3. С. 30-34.

184. Гузев К.В., Исаева М.П., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф., Рассказов В.А. Молекулярная характеристика OmpF-подобных поринов патогенных Yersinia. // Биохимия. 2005. Т. 70. Вып. 10. С. 1338-1345.

185. Reithmeier R.A.F., Bragg P.D. Purification and characterization of heat-modifiable protein from outer membrane of Escherichia coli. // FEBS Lett. 1974. V. 41. N. 2. P. 195-198.

186. Benson S.A., Occi J.L., Sampson B.A. Mutations that alter the pore function of the OmpF porin of Escherichia coli K12. // J. Mol. Biol. 1988. V. 203. N. 4. P. 961-970.

187. Tsai C-M., Frasch C.E. A Sensitive silver stain for detecting lipopolysaccharides in polyacrilamide gels. // Anal. Biochem. 1982. V. 119. P. 115-119.

188. Yoshimura F, Zalman LS, Nikaido H. Purification and properties of Pseudomonas aeruginosa porin. // J. Biol. Chem. 1983. V. 258. N. 4. P. 2308-2314.

189. Weckesser J., Zalman L.S., Nikaido H. Porin from Rhodopseudomonas sphaeroides. II J. Bacteriol. 1984. V. 159. N. 2. P. 199-205.

190. Гааль Э., Медьеши Г., Верецкеи J1. Электрофорез в разделении биологических макромолекул. М.: Мир, 1982. 157 с.

191. Inouye M. What is the bacterial outer membrane? // Ed. Inouye M. New York: Wiley-Interscience Pub., 1979. P. 5-12.

192. Capaldi R.A., Vandercooi G. The polarity of many membrane proteins. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1972. V. 69. N. 4. P. 930-932.

193. Kyte J., Doolittle R.F: A simple method for displaying the hydropathic character of a protien. //J. Mol. Biol. 1982. V. 157. N. 1. P. 105-108.

194. Alurcar V., Kamat R. Immunomodulatory properties of porins of some members of the family Enterobacteriaceae. II Infect Immun.1997. V. 65. N. 6. P. 2382-2388.

195. Simonet V., Mallea M., Pajes J.M. Substitutions in the eyelet region disrupt cefepime diffusion through the Escherichia coli OmpF channel. // Antimicrob. Agents Chemother. 2000. V. 44. N. 2. P. 311-315.

196. Wong R.S.Y., Wirtz R.A., Hancock R.E.W. Pseudomonas aeruginosa outer membrane protein OprF as an expression vector for foreign epitopes: the effects of positioning and length on the antigenicity of the epitope. // Gene. 1995. V. 158. N. 1. P. 55-60

197. Singh S.P., Miller S., Williams Y.U., Rudd K.E., Nikaido H. Immunochemical structure of the OmpD porin from Salmonella typhimurium, II Microbiology. 1996. V.142. N. 11. P. 3201-3210

198. Норр T.P., Woods K.R. A computer program for predicting protein antigenic determinants. // Mol. Immunol. 1983. V. 20. N. 4. P. 483-489.

199. Karplus P., Schulz G. Prediction of chain flexibility in proteins. // Naturwissenschaften. 1985. V. 72. P. 212-213.

200. Frommel C. Use of averaged mutation rate in pieces of protein sequences to predict the location of antigenic determinations. //J. Theor. Biol. 1988. V. 132. 171-177

201. Carplus P., Wejer W., Zee R., Welling-Wester S. Prediction of sequential antigenic regions in proteins.//FEBS Lett. 1985. V. 188. P. 215-218.

202. Вострикова О.П., Лихацкая Г.Н., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Антигенное родство и функциональные свойства поринов рода Yersinia. II Биол. мембраны. 2000. Т. 17. № 4. С. 399-409.

203. Vostrikova О. P., Kim N.Yu., Likhatskaya G. N., Novikova O. D., Solov'eva T. F. Pore-forming proreins of genus Yersinia. II Adv. Exp. Med. Biol. 2003. V. 51. N. 1. P. 261-263.

204. Туроверов K.K., Кузнецова И.М. Собственная флуоресценция глобулярного белка актина. Особенности локализации триптофановых остатков. // Биоорган, химия. 1998. Т. 24. № 12. С. 893-898.

205. Manavalan P., Jonson J.W.C. Sensitivity of circular dichroism to protein tertiary structure class. //Nature. 1983. V. 305. N. 5937. P. 831-832.

206. Provencher C.W., Glockner J. Estimation of globular protein secondary structure from circular dichroism. // Biochemistry. 1981. V. 20. N. 1. P. 34-37.

207. Sreerama N., Woody R.W. Estimation protein secondary structure from circular dichroism spectra: comparison of CONTIN, SELCON and CDSSTR methods with an expanded reference set. // Anal. Biochem. 2000. V. 287. N. 2. P. 252-260.

208. Лакович Д. Основы флуоресцентной спектроскопии. М.: Мир. 1986. С. 262—305.

209. Safar J., Roller P.P., Gajdusek D.C., Gibbs Jr. J.C. Scrapie Amyloid (Prion) Protein Has the Conformational Characteristics of an Aggregated Molten Globule Folding Intermediate. // Biochemistry. 1994. V. 33. N. 27. P. 8375-8383.

210. Jeanteur D., Lakey J. H., Pattus F. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. // Mol. Microbiol. 1991. V. 5. N. 9. P. 2153-2164.

211. Guex N., Peitsch M.C. SWISS-MODEL and the Swiss-PdbViewer: An environment for comparative protein modeling. // J. Electrophoresis. 1997. V. 18. N. 15. P. 2714-2723.

212. Dutzler R., Schirmer T. Crystal structure and functional characterization of OmpK 36, the osmoporin of Klebsiella pneumoniae. II J. Structure. 1999. V. 7. N. 4. P. 425-434.

213. Berman H.N., Westbrook K.J., Feng Z., Gilliland G.L., Bhat T.N., Weissing H., Shindyalov I.J., Bourne P.E. The protein data bank. // J. Nucl. Acids Res. 2000. V. 28. N. 21. P. 235242.

214. Sussman J.L., Abola E.E., Lin D., Jiang J., Manning N.O., Prilusky J. The protein data bank. // J. Genetica. 1999. V. 106. N. 1-2. P. 149-158.

215. Arnold K., Bordoli L., Kopp J., Schwede T. The SWISS-MODEL Workspace: A web-based environment for protein structure homology modeling. // Bioinformatics. 2006. V. 22. N. 15. P. 195-201.

216. Schwede Т., Kopp J., Guex N. and Peitsch M.C. SWISS-MODEL: an automated protein homology-modeling server. // J. Nucl. Asid Research. 2003. V. 31. N. 13. P. 3381-3385.

217. Spoel D.V., Lindahl E., Hess В., Groenhof G., Mark A.E., Berendsen H.J.C. GROMACS: fast, flexible and free. // J. Comput. Chem. 2005. V. 26. N. 16. P. 1701-1718.

218. Pedretti L., Villa K., Vistoli G. « Vega: a versatile program to convert, handle and visualize molecular structure on windows-based PCs» // J. Mol. Graph. 2002. V. 21. P. 47-49.

219. Пермяков E.A. Метод собственной люминесценции белка. М.: Наука, 2003. 189 с.

220. Towbin Н., Stackelin Т., Gordon J. Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1979. V. 76. N. 9. P. 4350-4354.

221. Егоров A.M., Осипов А.П., Дзантиев Б.Б, Гаврилова Е.М. Теория и практика иммуноферментного анализа. М.: Высшая школа, 1991. 288 с.

222. Новикова О.Д., Вострикова О.П., Хоменко В.А., Портнягина О.Ю., Соловьева Т.Ф., Оводов Ю.С. Антигенные свойства поринов наружной мембраны рода иерсиний. // Бюлл. эксп. биол. и медицины. 1996. Т. 122. № 6. С. 657-660.

223. Вострикова О.П., Хоменко В.А., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Антигенные свойства порина наружной мембраны Yersinia enterocolitica. II Русский журн. иммунологии. 2004. Т. 9. С. 65.

224. Greenberg R., Daniels S., Flanders D. Medical Epidemiology. N.Y.: Lange Medical Books, 2001.215 р.

225. Ашмарин И.П., Воробьев A.A. Статистические методы в микробиологических исследованиях. М.: Мир, 1962. С. 30-66.

226. Вострикова О.П., Новикова О.Д., Малашенкова В.Г., Гордеец А.В., Соловьева Использование порина наружной мембраны Yersinia enterocolitica для диагностики кишечного иерсиниоза с помощью ИФА. // Биол. мембраны. 2009. Т. 26. № 5. С. 419-428.

227. Гордеец А.В., Портнягина О.Ю., Вострикова О.П., Малашенкова В.Г., Бениова С.Н.,п

228. Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Патент 2153172 Российская Федерация, МПК G 01 N 33/53, 33/569. Способ диагностики псевдотуберкулеза; заявители и патентообладатели ВГМУ и ТИБОХ ДВО РАН. № 98122085/14; Заявл. 02.12.98; Опубл. 20.07.00, Бюлл. № 20. 8 с.

229. Вострикова О.П., Портнягина О.Ю., Хоменко В.А., Малашенкова В.Г., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Новый подход в диагностике иерсиниозов. // Цитокины и воспаление. 2005. Т. 4. №. 3. С. 132-133.

230. Дранник Г.И., Ярилин А.А. Основы иммунологии. М.: Медицина, 1999. 608 с.

231. Портнягина О.Ю., Вострикова О.П., Хоменко В.А., Малашенкова В.Г., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Опыт диагностики вторично-очаговых форм иерсиниозов. // Цитокины и воспаление. 2005. Т. 4. №. 3. С. 143.

232. Вострикова О.П., Портнягина О.Ю., Горбач Т.А., Малашенкова В.Г., Хоменко В.А., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Опыт диагностики поражения нервной системы при иерсиниозной инфекции. // Русский журн. иммунологии. 2006. Т. 9. № 3. С. 168.

233. Вострикова О.П., Портнягина О.Ю., Малашенкова В.Г., Горбач Т.А., Хоменко В.А., Новикова О.Д., Соловьева Т.Ф. Вторично-очаговые формы иерсиниозов и их верификация. // Российский аллерг. журн. 2007. № 3, прил. 1. С. 261.

234. Ogita Z., Markert C.L. A miniturized system for electrophoresis on polyacrylamide gels. // Anal. Biochem. 1979. V. 99. N. 2. P. 233-241.

235. Markwell M.A.K., Haas S.M., Bieber L.L., Tolbert N.E. A modification of the Lowry procedure to simply protein determination in membrane and lipoprotein samples. // Anal. Biochem. 1978. V. 87. N. 1. P. 206-210.

236. Dubois M., Gilles K.A., Hamilton J.K., rebera P.A., Smit F. Colometric metod for determinated sugar and related substances. // Anal. Chem. 1956. V. 28. P. 350-356.

237. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 //Nature. 1970. V. 227. N. 5259. P. 680-685.

238. Grey W.R. End-group analysis using dansyl chloride // Methods in Enzymology / Hirs C.H.W., Timasheff S.N., eds. N.Y., London: Acad. Press, 1972. V. 25B. P. 121-139.

239. Беленький Б.Г., Ганкина Е.С., Нестеров В.В. Экспрессный ультра-чувствительный метод идентификации N-концевых аминокислот в белках и пептидах с помощью тонкослойной хроматографии. //ДАН СССР. 1967. Т. 172. № 1. С. 91-93.

240. Allen G. Amino acid analyses. // In: Laboratory techniques in biochemistry and molecular biology. Sequencing of proteins and peptides. Burdon R.H., van Knippenberg P.H., eds. Amsterdam, N.Y., Oxford: Elsevier, 1989. P. 40.

241. Ichikawa T, Terada H. Second derivative spectrophotometry as an effective tool for examining phenylalanine residues in proteins. // Biochim. Biophys. Acta. 1977. V. 494. N. 1. P. 267-270.

242. Eftink M.R., Ghiron C.A. Fluorescence quenching studies with proteins. // Anal. Biochem. 1981. V. 114. N. 2. P. 199-227.