Конформационные особенности молекулы рибулозо-1,5-дифосфаткарбоксилазы и её активного центра, модифицированных спиновой меткой тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.02, кандидат физико-математических наук Муллокандов, Эдуард Ашерович
- Специальность ВАК РФ03.00.02
- Количество страниц 115
Оглавление диссертации кандидат физико-математических наук Муллокандов, Эдуард Ашерович
ВВЕДЕНИЕ
Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Физико-химические свойства рибулозо-1,5-дифосфат-карбоксилазы
1.2. Каталитические свойства РДФ-азы
1.3. Химическая природа групп активного центра РДФ-азы.
1.4. Особенности метода спиновых меток
1.5. Зависимость параметров спектров ЭПР иминоксильных радикалов от полярности окружения
1.6. Исследование белков с помощью метода спиновых меток
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Выделение белка и его модификация спин-меткой
2.2. Получение спин-меченых субьединиц рибулозо-I,5-ди-фосфаткарбоксилазы
2.3. Методика обработки носителей для иммобилизации рибулозо-1,5-дифосфаткарбоксилазы
Глава 3. ИССЛЕДОВАНИЕ СПИН-МЕЧЕНОЙ РИБУЛ030-1,5-ДИФОСФАТ
КАРБОКСИЛАЗЫ
3.1. Идентификация места присоединения спин-меток на молекуле РДФ-азы
3.2. Анализ спектра ЭПР спин-меченой РДФ-азы. Измерение времени корреляции макромолекулы РДФ-азы
3.3 Изменение конформации молекулы РДФ-азы при взаимодействии с субстратами и активатором
3.3.1. Изменение конформации РДФ-азы при взаимодействии с рибулозо-I,5-дифосфатом (РДФ)
3.3.2. Изменение конформации молекулы РДФ-азы при взаимодействии с NaHCOg
3.3.3. Изменение конформации молекулы РДФ-азы при взаимодействии сМдС^
3.4. Изменение конформации субьединиц РДФ-азы при взаимодействии с субстратом и его аналогом
3.5. Избирательная модификация SH-групп РДФ-азы спин-меткой
3.5.1. Окисление нитроксильных радикалов на молекуле фермента после удаления восстановителя
3.5.2. Модификация активного центра РДФ-азы спин-меткой
3.5.3. Модификация РДФ-азы N-этилмалеинимидом с последующим спин-мечением
Глава 4. ИССЛЕДОВАНИЕ РИБУЛ030-1,5-ДИФ0СФАТКАРБ0КСИЛАЗЫ
ИММОБИЛИЗОВАННОЙ НА НЕОРГАНИЧЕСКИХ НОСИТЕЛЯХ
4.1. Исследование спин-меченой РДФ-азы иммобилизованной на силикагеле, активированном глутаровым альдегидом
4.2. Использование иммобилизованных препаратов РДФ-азы для поглощения COg из воздуха
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биофизика», 03.00.02 шифр ВАК
Изучение структуры и молекулярной динамики хлопковой целлюлозы и глобулярных белков методом спиновых меток и зондов2003 год, доктор химических наук Бободжанов, Пулат Хусейнович
Исследование внутри- и межмолекулярных взаимодействий в модельных нуклеотидных системах методом спиновых меток1984 год, кандидат биологических наук Петров, Александр Иванович
Исследование активных центров сериновых гидролаз методом спиновых меток1985 год, кандидат биологических наук Дорохов, Константин Евгеньевич
Быстрые движения боковых остатков в белках по данным методов молекулярной динамики и спин-метки2006 год, кандидат физико-математических наук Никольский, Дмитрий Олегович
Функциональные комплексы "гость-хозяин" спин-меченых молекул с циклодекстринами2010 год, кандидат химических наук Ионова, Ирина Владимировна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Конформационные особенности молекулы рибулозо-1,5-дифосфаткарбоксилазы и её активного центра, модифицированных спиновой меткой»
Центральную роль в процессе фиксации углекислого газа при фотосинтезе, как известно играет рибулозо-1,5-дифосфаткарбоксила-за ( РДФ-аза, КФ.4Л.1.39 ) - фермент осуществляющий две важнейшие реакции в метаболизме растений : реакцию карбоксилирования рибулозо-I,5-дифосфата ( РДФ ) до 2-х молекул 3-фосфорноглицери-новой кислоты ( 3-ФГК ) ( фотосинтез )-и окисление РДФ до одной молекулы 3-ФГК и одной молекулы 2-фосфогликолата ( фотодыхание )■ (9).
Изучение структуры активного центра РДФ-азы и механизма его действия позволит целенаправленно воздействовать на соотношение карбоксилазной и оксигеназной реакций этого бифункционального фермента. Несмотря на интенсивное изучение структурной организации РДФ-азы различными методами, до сих пор не выяснена роль малых субьединиц в ферментативной реакции (42). Остается неясным вопрос о конформационных изменениях активного центра в процессе катализа, то есть неизвестно изменяется ли структура активного центра при изменении четвертичной структуры РДФ-азы. Совершенно неисследовано взаимодействие субьединиц фермента с субстратами.
Исходя из этого, целью данной работы явилось :
1. Исследование поведения РДФ-азы в растворе и в комплексе с субстратами и активатором, измерение времени корреляции макромолекулы фермента.
2. Изучение конформационной подвижности субьединиц РДФ-азы при взаимодействии с субстратами и активатором.
3. Селективная модификация S Н -групп белка спин-метками и определение с помощью метода ЭПР их чувствительности к связыванию субстрата и активатора ферментом.
4. Модификация активного центра РДФ-азы спин-меткой и изучение конформационных изменений в каталитическом центре при взаимодействии фермента с субстратом и активатором.
Для решения поставленных задач использовали метод спиновых меток (I), позволяющий следить за микроокружением модифицированных групп, а также за поведением самой макромолекулы.
Использованный метод позволил получить информацию о конформационных изменениях в макромолекуле РДФ-азы и её субьединиц при взаимодействии с субстратами и активатором. С помощью спин-меток было выявлено два типа SH~rPynn> отличающихся характером белкового окружения. По зависимости параметров спектров ЭПР спин-меченой РДФ-азы от вязкости среды было определено время корреляции белка. Показано, что отсутствие малых субьединиц приводит к образованию высокомолекулярных агрегатов больших субьединиц, что позволяет судить о роли малых субьединиц, как стабилизаторов четвертичной структуры фермента.
С помощью спин-метки, введенной в активный центр фермента были зарегистрированы конформационные перестройки активного центра РДФ-азы при взаимодействии фермента с субстратом и ионом М д^* результатом которых явилось изменение электронной структуры фрагмента иминоксильного радикала.
При анализе спектров ЭПР использовали модель анизотропного быстрого вращения радикала относительно макромолекулы белка или сравнивали экспериментальные спектры с расчетными теоретическими спектрами (б, 92). Использование модели анизотропного быстрого вращения радикала относительно макромолекулы белка позволило получить количественные характеристики, такие как угол переориентации нитроксильного радикала и время корреляции белка.
Изучение структуры и функции РДФ-азы имеет важное практическое значение, в связи с возможностью использования этого фермента, как активного элемента систем очистки воздуха от углекислого газа. Исходя из этого, исследовались с помощью метода спин-метки иммобилизованные на неорганическом носителе препараты РДФ-азы. Был подобран оптимальный носитель и условия для иммобилизации РДФ-азы и на основе иммобилизованного фермента создана долговременная система очистки воздуха от углекислого газа.
Похожие диссертационные работы по специальности «Биофизика», 03.00.02 шифр ВАК
Конформационный анализ Т2-ДНК в комплексах с РНК-полимеразой Е. coli1999 год, кандидат биологических наук Иванова, Наталья Николаевна
Конформационные и спиновые переходы в органических, элементоорганических и координационных парамагнитных зондах по данным спектроскопии ЯМР и ЭПР2009 год, кандидат химических наук Новиков, Валентин Владимирович
Исследование молекулярного механизма реакции ферментативного гидролиза триглицеридов2004 год, кандидат биологических наук Трофимова, Ольга Дмитриевна
Селективное моделирование эффектов быстрого вращательного движения нитроксила в спектрах ЭПР спин-меченых биомакромолекул2010 год, кандидат физико-математических наук Ткачев, Ярослав Владимирович
Исследование конформации ингибиторов протеиназ, выделенных из фасоли и картофеля, методами КД-спектроскопии и модификации функциональных групп1983 год, кандидат биологических наук Дронова, Лидия Александровна
Заключение диссертации по теме «Биофизика», Муллокандов, Эдуард Ашерович
ВЫВОДЫ
1. Молекула РДФ-азы при связывании с субстратами и активатором, изменяет свою конформацию. Эти изменения коррелируют с кинетикой активации и катализа фермента.
2. Время корреляции молекулы РДФ-азы, найденное из зависимости параметров спектров ЭПР спин-меченого фермента от вязкости и температуры раствора, используя модель анизотропного быстрого вращения спин-метки относительно макромолекулы белка, соответствует времени корреляции макромолекулы с жесткой структурой.
3. Сравнение экспериментальных спектров ЭПР спин-меченой РДФ-азы с теоретическими спектрами, позволило определить эффективные углы переориентации спин-меток связанных с различными типами S Н -групп. Спин-метки, дающие расторможенный спектр ЭПР, вращаются в эффективном конусе с углом полураствора о(^50°, а спин-метки, дающие сильно иммобилизованный спектр ЭПР,- в конусе с углом полураствора d = 25°. Следовательно, с помощью метода спин-метки, в молекуле РДФ-азы выявлено два типа сульфгидрильных групп, отличающихся по своему локальжщу окружению.
4. Обнаружены и исследованы изменения конформации больших и малых субьединиц РДФ-азы при связывании с субстратми, ингибитором и активатором. Большие субьединицы в отсутствии малых образуют высокомолекулярные агрегаты сравнимые по молекулярной массе с макромолекулой фермента. Показано, что связывание субстрата ( РДФ с большими субьединицами способствует этому процессу, но при повышении концентрации РДФ агрегаты теряют свою жесткость и становятся внутренне подвижными.
5. Из сравнения экспериментальных спектров ЭПР больших и малых субьединиц с теоретическими спектрами, были определены параметры Z6 и о , характеризующие вращение молекул ;белка. Время корреляции больших субьединиц оказалось равным ^£400 нсек,а локальное окружение спин-меток таким, что они вращаются в конусе с углом полураствора cfe80°. В случае малых субьединиц, время корреляции равно £=40 нсек,а угол полураствора конуса вращения метки о(~70°.
6. Показано, что малые субьединицы выполняют роль стабилизаторов четвертичной структуры РДФ-азы, а также выполняют функции регу-ляторных центров.
7. Проведена модификация активного центра РДФ-азы спин-меткой и обнаружено значительное изменение конформации активного центра при изменении конформации всей макромолекулы белка при связывании его с субстратом и активатором. Таким образом выявлен третий тип^Н-групп локализованных в активном центре фермента.
8. Теоретическое моделирование изменений, происходящих в спектрах ЭПР спин-метки в активном центре фермента при связывании фермента с субстратом и активатором показало, что эти изменения вызваны появлением сильного электронно-акцепторного окружения метки, что приводит к переходу неспаренного электрона фрагмента радикала с я-разрыхляющей орбитали на о-разрыхляющую орбиталь и проявляется в появлении нового сигнала ЭПР с меньшей изотропной константой СТС и с меньшим изотропным 5-фактором.
9. Получены иммобилизованные на 5-ти неорганических носителях препараты РДФ-азы. Подобраны оптимальные условия иммобилизации РДФ-азы и показана конформационная стабильность иммобилизованного фермента. Разработан способ поглощения углекислого газа на основе иммо билизованной на неорганических носителях РДФ-азы. Исследовано влияние иммобилизации на параметры спектров ЭПР спин-меченой РДФ-азы. Показано, что иммобилизация приводит к разрыхлению непосредственног окружения спин-меток.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Хорошо известно, что рибулозо-I,5-дифосфаткарбоксилаза обладает сложной четвертичной структурой и является ключевым в процессе фиксации углекислого газа при фотосинтезе. Основная трудность в получении подробной информации о строении и механизме действия РДФ-азы по-видимому заключается в сложности организации самого фермента и ограниченности биохимических методов, применяемых для его исследования. Сложный характер кинетики активации и катализа РДФ-азы, вероятно объясняет тот факт, что до настоящего времени не выяснена роль малых субьединиц в активации фермента.
Используемый в настоящей работе метод спиновых меток позволил получить такие количественные характеристики описывающие кон-формационные свойства макромолекулы белка, как время корреляции макромолекулы и конкретные углы переориентации спин-меток, зависящие от их локального окружения. Для этого использовалась схема анализа спектров ЭПР спин-меченых белков и экспериментальная методика описанная в работах ( 5,6 ) и основанная на модели быстрого анизотропного движения спин-метки относительно макромолекулы белка. В рамках этой модели вводится три динамических параметра >
S и , которые описывают динамические свойства системы.
Для экспериментального определения значений параметров Тв и S макромолекулы РДФ-азы мы использовали зависимости параметров спектров ЭПР от вязкости растворов. В случае изучения субьединиц фермента, когда такая методика неприменима, сравнивали экспериментальные спектры спин-меченых субьединиц с теоретическими спектрами, рассчитанными для различных значений Tg- и S . При этом, время вращательной корреляции макромолекулы дает информацию о кон-формационной подвижности общей структуры белка, а параметр S о локальной структуре белка в районе присоединения спин-метки.
Выполненные экспериментальные исследования показали, что молекула РДФ-азы при связывании с субстратами и активатором ферментативной реакции претерпевает значительные конформационные изменения, коррелирующие с кинетикой активации фермента.
Связывание РДФ-азы с субстратом ( РДФ ) приводит к тому, что макромолекула фермента становится более "рыхлой". В результате, часть спин-меток, вращающихся в эффективном конусе с углом полураствора oi = 25 градусов, начинают вращаться в конусе с углом полураствора d ^ 50 градусов. Это соответствует неактивной конформации фермента ( 15,16,24 ). Связывание РДФ-азы с NC1HCO3 и 2+
М g приводит к совершенно противоположному эффекту. При связыл вании с NaHCO^nMg + структура белка становится "жесткой" и количество спин-меток, вращающихся в конусе с углом полураствора cL = 25 градусов увеличивается по сравнению с исходным состоянием, то есть локальная подвижность полипептидов в непосредственном окружении спин-меток изменяется одновременно с конформацион-ным изменением всей макромолекулы РДФ-азы. Эти экспериментальные данные коррелируют с кинетикой активации фермента, а именно с пе
9 + реходом макромолекулы РДФ-азы при связывании с N a Н С О3 и М gz в активную форму ( 54 ).
Как показало исследование зависимостей параметров спектров ЭПР 2 А,| спин-меченой РДФ-азы от вязкости раствора, время корреляции макромолекулы оказалось равным 400 нсек , что соответствует расчетному времени корреляции по соотношению Стокса-Эйнштейна, а это, в свою очередь, свидетельствует о жесткой структуре макромолекулы.
Измеренное время корреляции больших субьединиц РДФ-азы ( при-i близительно равное 400 нсек ) и исследование взаимодействия больших и малых субьединиц с субстратом, его аналогом и активатором, позволяет сделать заключение, что большие субьединицы в отсутствии малых субьединиц агрегируют и образуют высокомолекулярные конгломераты по размерам близкие к нативному ферменту. Отсюда можно сделать вывод о роли малых субьединиц, как стабилизаторах четвертичной структуры РДФ-азы, а обнаруженное изменение конформации малых субьединиц при взаимодействии с субстратом свидетельствует в пользу предположения о регуляторной роли малых субьединиц в ферментативной реакции ( 66 ).
Избирательная модификация сульфгидрильных групп РДФ-азы спин-меткой, позволила выявить два типа SH -групп, отличающихся по своему белковому окружению. Путем избирательной блокировки SH -групп иминоксильным радикалом с последующим его восстановлением обнаружен факт частичного повторного окисления восстановленных спин-меток за счет белкового окружения. После блокировки, в присутствии субстрата ( РДФ ) и активатора была проведена модификация активного центра РДФ-азы спин-меткой. Оказалось, что при изменении конформации всей макромолекулы РДФ-азы, активный центр претерпевает значительные перестройки. Это в свою очередь вызывает изменения в электронной структуре ^N-0' фрагмента иминоксильного радикала связанного в активном центре фермента. При этом, наблюдается уменьшение константы сверхтонкого расщепления от величины а0 = 17,1 гс до величины 16,0 гс и уменьшение g - фактора на величину Дд = 0,0021. Это вероятно объясняется тем, что при связывании РДФ-азы с РДФ и МдС12 фрагмент спин-метки оказывается в сильном электронно-акцепторном окружении и неспаренный электрон переходит с jTT-связывающей ор-битали на rf -разрыхляющую ( 9 ). Следовательно, это значит, что в данном случае спин-метка выступает в роли субстрата оксигеназной реакции РДФ-азы. Таким образом, при изменении конформа-ции всей макромолекулы фермента, активный центр изменяет свою структуру так, что создаются условия близкие к условиям разрыва
N-0' связи. Такие же эффекты наблюдаются и в том случае, когда в качестве блокирующего S Н -группы реагента использовали
N - этилмалеинимид. Все эти экспериментальные данные показывают, что при изменении конформации всей макромолекулы РДФ-азы происходит сильное изменение конформации её активного центра и имеет место связь между структурой фермента и его функцией.
Для того, чтобы непосредственно из эксперимента определить, характеризующие вращение белка, величины параметров спектров ЭПР спин-меченой РДФ-азы 2АП- 2АМ и 2 Azz - 2 А„ , получали иммобилизованные на неорганических носителях препараты фермента. Оказалось, что при связывании с носителем, угол полураствора эффективного конуса вращения радикала увеличивается приблизительно на 7 градусов по сравнению с белком в растворе. Однако, спектр ЭПР спин-меченого фермента при иммобилизации трансформируется в спектр сильно заторможенной спин-метки. Иммобилизованная РДФ-аза оказалась конформационно стабильной. Это следует из того факта, что при замене окружающей среды от водного буфера до толуола, спектр ЭПР спин-меченой РДФ-азы, иммобилизованной на носителе, претерпевает незначительные изменения.
Иммобилизованные на неорганических носителях препараты РДФ-азы сохранили способность фиксировать углекислый газ, но естественно с меньшей эффективностью. Активность фермента, иммобилизованного на пористом стекле, активированном глутаровым альдегидом, составляла 13 % от активности фермента в растворе. Этот факт, наряду с высокой стабильностью иммобилизованного фермента к изменению окружающей среды, позволил исследовать возможность использования иммобилизованной РДФ-азы в качестве активного элемента системы очистки воздуха от углекислого газа. Как показали результаты этих экспериментов, наилучшей активностью и кинетикой карбок-силазной реакции обладают препараты РДФ-азы иммобилизованной на пористом стекле, активированном глутаровым альдегидом.
Испытания иммобилизованной на этом носителе РДФ-азы на поглощение углекислого газа из воздуха, показали достаточно высокую эффективность поглощения С0<р. При прокачке через реактор атмосферного воздуха ( 0,03 объемных % С0£ ) со скоростью 30 литров в час, поглощалось 20 % углекислого газа.
Система очистки воздуха от С0^ на основе иммобилизованной РДФ-азы имеет ряд важных, на наш взгляд, преимуществ, по сравнению с используемыми системами. Активный элемент системы не расходуется, не нуждается в регенерации и не выделяет при работе токсичных веществ. Испытания этой системы в лабораторных условиях показали, что она работает с практически неизменной эффективностью в течение 12 месяцев. Это дает возможность рекомендовать разработанный способ поглощения С0£ к использованию в качестве подсистемы очистки воздуха в различных устройствах.
Список литературы диссертационного исследования кандидат физико-математических наук Муллокандов, Эдуард Ашерович, 1985 год
1. Берлинер Л. Метод спиновых меток. Теория и применение. - М.: Мир, 1979. - 639 с.
2. Бучаченко А.Л., Вассерман A.M. Стабильные радикалы. М.: Химия, 1973. - 408 с.
3. Голубев В.А., Розанцев Э.Г., Нейман М.Б. 0. некоторых реакциях свободных иминоксильных радикалов с участием неспаренного электрона. Изв. АН СССР, сер. хим., 1965, № II, с. 1927-1936.
4. Диксон М., Уэбб Э. Ферменты. М.: Мир, 1966. - 816 с.
5. Дудич И.В. Исследование динамических и структурных свойств глобулярных белков методом спиновой метки. Дис. . канд. физ.-мат. наук. - Москва, 1979. - 145 с.
6. Дудич И.В., Тимофеев В.П., Волькенштейн М.В., Мишарин АЛО. Измерение времени вращательной корреляции макромолекул методом ЭПР в случае ковалентно связанной спин-метки. Молекулярная биология, 1977, т. II, с. 685-693.
7. Керрингтон А., Мак-Лечлан Э. Магнитный резонанс и его применение в химии. М.: Мир, 1970. - 447 с.
8. Кузнецов А.Н. Метод спинового зонда. М.: Наука, 1976. -210 с.
9. Ленинджер А. Биохимия. М.: Мир, 1976. - 957 с.
10. Лихтенштейн Г.И. Метод спиновых меток в молекулярной биологии. М.: Наука, 1974. - 256 с.
11. Мишарин А.Ю., Ажаев А.В., Поляновский О.Л. Спин-меченые производные витамина Bg. Изв. АН СССР, сер. хим., 1975, № 5,с. II85-II88.
12. Розанцев Э.Г. Свободные иминоксильные радикалы. М.: Химия, 1970. - 216 с.
13. Романова А.К. Биохимические методы изучения автотрофии у микроорганизмов. М.: Наука, 1980. - 159 с.
14. Торчинский Ю.М. Сульфгидрильные и дисульфидные группы белков.- М.: Наука, 1971. 229 с.
15. Andrews T.J., Badger M.R. and Lorimer G.H. Factors affectinginterconvertion between kinetic forms of ribulose diphosphate carboxylase-oxygenase from spinach. Arch. Biochem. Biophys., 1975, v. 171, p. 93-103.
16. Bahr J.T. and Jensen E.G. Ribulose diphosphate carboxylase from freshly ruptured spinach chloroplasts having in vivo Km(C02). Plant Physiol., 1974, v. 53, p. 39-44'.
17. Baker T.S., Eisenberg D., Eiserling E.A. and Weissman L. The structure of form I crystals of D-ribulose I,5-diphosphate carboxylase. J.Mol. Biol., 1975, v. 91, p. 391-399.
18. Berliner L.J., Wong S.S. Spin labeled sulfonyl fluorides as active site probes of protease structure. Comparison of the active site environments in A-chymotrypsin and trypsin. -J. Biol. Chem., 1974, v. 249, p. 1668-1677.
19. Berliner L.J. Applications of spinlabeling to structure-conformation studies of Enzymes. Prog. Bioorg. Chem., 1975, v. 3, p. 1—80.
20. Berliner L.J. A 6 5 Crystallographyc study of a spin-labeled Inhibitor Complex with Lysozyme. J. Mol. Biol., 1971,v. 61, p. 189-194.
21. Birchmeier W., Wilson K.J. and Christen P. Cytoplasmic Aspartate Aminotransferase: Syncatalytic Sulfhydryl Group Modification. J. Biol. Chem., 1973, v. 248, p. I75I-I759.
22. Branden R. Ribulose I,5-diphosphate carboxylase and oxygenase from green plants are two different enzymes. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1978, v. 81, N 2, p. 539-546.
23. Chollet R., Anderson L.L. and Hovsepian L.C. The absence oftightly "bound copper, iron and flavin nucleotide in cristalline ri"bulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from tobacco. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1975, v. 64, p. 97—107.
24. Chu Б.К. and Bassham J.A. Regulation of ribulose 1,5-diphos-phate carboxylase by substrates and other metabolites. Plant Physiol., 1975, v. 55, p. 720-726.
25. Chu Б.К. and Bassham J.A. Activation of ribulose' 1,5-diphos-phate carboxylase by nicotinamide: adenine dinucleotide phosphate and other chloroplast metabolites. Plant Physiol., 1974, v. 54, p. 556-559.
26. Cleland Yf.W. Bithiothreitol, a new protective reagent for sulfhydryl groups. Biochemistry, 1964, v. 3, p. 480—481.
27. Christen R. and Riordan J.P. Syneatalitic Modification of a Functional Tyrosyl Residue in Aspartate Aminotransferase. -Biochemistry, 1970, v. 9, p. 3025-3034.
28. Ellman G.L. Tissue Sulfhydryl Groups. Arch. Biochem. Biophys., 1959, v. 82, N I, p. 70-81.
29. Preiden C. Kinetic aspects of regulation of metabolic processes. The hysteretic enzyme concept. J. Biol. Chem., 1970, v. 245, p. 5788-5799.
30. Preer S.T., Kraut J., Robertus J.В., Wright H.T. and Xuong N.H. Chymotrypsinogen. 2.5 Ang. crystal structure, comparison with A-chymotrypsin and implications for zymogen activation» Biochemistry, 1970, v. 9, p. 1997-2009.
31. Preed J.H., Bruno G.Y., Polnaszek C.F. Electron spin resonance line shapes and saturation in the: slow motional region. —
32. J. Phys. Chem., 1971, v. 75, p. 3385-3399.
33. Gordon G.L.R., Lawlis V.R. and McPadden B.A. 2-Carboxy-D-he xito! 1,6-bisphosphate: an inhibitor of B-ribulose I,5-bisphosphatecarboxylase/oxygenase. Arch. Biochem. Biophys., 1980, v.199, p.400-412.
34. Goldman S.A., Bruno G.V., Polnaszeck C.F. and Freed J.H. Electron spin resonance study of anisotropic rotational reorientation and slow tumbing in liquid and frozen media.- J. Сhem. Phys., 1972, v. 56, p. 716-735.
35. Goldman S.A., Bruno G.V. and Freed J.H. Estimating slow motional rotational correlation times for nitroxides Ъу electron spin resonance. J. Phys. Chem., 1972, v. 76, p. 1858-I860.
36. Green D.W., Ingram V.M. and Perutz M.K. The structure of haemoglobin. IV. Sign determination by the isomorphous replacement method. Proc. Roy. Soc. Lond., 1954, v. 225, N II24,p.287-296.
37. Griffith O.H., Dehlinger P.J. and Van S.P. Shape of the Hydrophobic Barrier of Phospholipid Bilayer (Evidence; for VJater Penetration in Biological Membranes). J. Membrane Biology, 1974, v. 15, p. 159-19:2.
38. Griffith O.H., Cornell D.W. and McConnel H.M. Nitrogen hyper-fine tensor and g-tensor of nitroxide radicals. J. Chem. Phys. 1965, v. 43, p. 2909-2910.
39. Haselkorn R., Fernandez-Moran H., Kieras F.J. and van Bruggen E.F.J. Electron microscopic and biochemical characterization of fraction I protein. Science, 1965, v. 150, p.I598-I60I.
40. Hartman F.C., Welch M.H. and Norton J.L. 3-bromo-2-butanone-I,4-bisphosphate as a affinity label for ribulose bisphosphate carboxylase. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S., 1973, v. 70, N 12,p. 3721-3724.
41. Hsia T.C. and Piette L.H. Spin-labeling as a general methods in studing antibody active-site. Arch. Biochem. Biophys.,1969, v. 129, p. 296-307.
42. НиЪЪе1 W.L. and McConnell H.M. Molecular motion in spin labeled phospholipids and membranes. J. Am. Chem. Soc., 1971, v. 93, p. 314-326.
43. Jensen R.G., and Bahr J.T. Ribulose I,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase. Ann. Rev. of Plant Physiology, 1977, v. 28, p. 379-400.
44. Kawashima N. Comparative studies on fraction I protein from spinach and tobacco leaves. Plant and Cell Physiol», I969-, v. 10, p. 31-40.
45. Kawashima N. and Wildman S.G. Fraction I protein. Ann. Rev. of Plant Physiology, 1970, v. 21, p. 325-358.
46. Kornberg R.D. and McConnell H.M. Inside-outside transitions of phospholipids in vesicle membranes. Biochemistry, 1971, v. 10, p. IIII-II20.
47. Kung S.D. Tobacco fraction I protein: A unique genetic marker.- Science, 1976, v. 191, p. 429-434.
48. Kuznetsov A.N., Wasserman A.M., Volkov A.U. and Korst N.M. Determination of rotational correlation time of nitric oxide; radicals in a viscous medium. Chem. Phys.Lett., 1971, v. 12, p. 103-106.
49. Lawlis V.B. and McFadden B.A. Modification of ribulose bispho-sphate carboxylase by 2,3-butadion. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1978, v. 80, p. 580-585.
50. Laskowsky M. Mesurement of accessibility of protein chromopho-res by solvent perturbation of their ultraviolet spectra.- Fed. Proc., 1966, v. 25, p. 20-27.
51. Lee; J.C., Frigon R.P., Hirsh J., Thomas J. and Timasheff S.N. Mechanism of protein stabilization by sucrose. Fed. Proc.,1973, v. 32, p. 4961973, v. 32, p. 496-499.
52. Libert ini L.J. and Griffith O.H. Orientation dependence of the the electron spin resonance of di-tret-butylnitroxide .
53. J. Ghem. Phys., 1970, v. 53, p. 1359-1367.
54. Livshits V.A. Slow anisotropic tumbling in the ESR spectra of nitroxyl radicals. J. Magn. Res., 1976, v. 24, p.307-313.
55. Lorimer G.H. and Miziorko H.M. Carbamate formation on the-aminogroup of a lysyl residue as the basis for the acti2+vation of ribulosebisphosphate carboxylase by COg and Mg .- Biochemistry, 1980, v. 19, p. 5321-5328.
56. Lorimer G.H., Badger M.R. and Andrews T.J. The activation of ribulose If 5-bisphosphate carboxylase by carbon dioxide' and magnesium ions. Ibid., 1976, v. 15, p. 529-536.
57. Mason R. and Freed J.H. Estimating microsecond rotational correlation times from lifetime broadening of nitroxide electron spin resonance spectra near the rigid limit. — J. Phys. Chem., 1974, v. 78, p. 1321-1323'.
58. McFadden B.A. and Tabita P.R. D-ribulose I,5-diphosphate carboxylase and the evolution of autotrophy. Biosystems, 1974, v. 6, P. 93-112.
59. McConne11 H.M. and McFarland B.G. Physics and chemistry of Spin Labelis. — Quart. Rev. Biophys., 1970, v. 3, N I,p. 91-136.
60. McCalley R.C., Shimshick E.F. and McConnell H.M. Effect of slow rotational motion on paramagnetic resonance spectra.- Ghem. Phys. Lett., 1972, v. 13, p. II5-II9*
61. Zaborsky 0. Immobilized Enzymes. Cleveland, Ohio : GRS Press. 1973, - 232 p.
62. Miziorko Н.М. and Mildvan А.С. Electron Paramagnetic reso1. T ТЯnance, H, and С Nuclear Magnetic Resonance Studies of the Interaction of Manganese and Bicarbonate with Ribulose I,5-Diphosphate Carboxylase. J. Biol. Chera., 1974, v. 249, p. 2743-2750.
63. Morriset J.D. and Broomfield G.A. Comparative study of spin labeled serine enzymes. Acetyl cholin esterase, trypsin, A-chymotrypsin, elastase and subtilisin. J. Biol. Chem», 1972, v. 247, p. 7224-7231.
64. Morriset; J.D* and Broomfield C.A. Active site spin labeled A-Chymotrypsin. Guanidine hydro chloride denaturation studies using electron para magnetic resonance and circular dichroism. J. Am. Chem. Soo., 1971, v. 93, p. 7297-7304.
65. Morriset J.B. and Brott H.R. Oxydation of the sulfhydryland disulfide groups by the nitroxyl radical. J. Biol.Chem,, 1969, v» 244, p. 5083-5084.
66. Nishimura M. and Akazawa T. Puther proof for the catalitic role of the larger subuni.fr in the spinach leaf ribulose 1,5-diphosphate carboxylase, Biochem. Biophys. Res. Commun,,1973, v. 54, p. 842-848.
67. Nishimura M. and Akazawa T. Re constitution of spinach ribulose I,5-diphosphate carboxylase from separated subunits.- Biochem. Biophys. Res. Commun., 1974, v. 59, p. 584-590.
68. Ogren W.L. and Bowes G. Ribulose diphosphate carboxylase regulates soybean photorespiration. Nature, 1971, v. 230,p. 159-160.
69. Paech C., Ryan P.J. and Tolbert N.E. Essential primary amino groups of ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase indicated by reaction with pyridoxal-5'-phosphate. Arch. Biochem. Biophys., 1977, v. 179, p. 279-288.
70. Paulsen J.M. and Lane M.D. Spinach ribulose diphosphate carboxylase. I. Purification and properties of the enzyme.: -Biochemistry, 1966, v. 5, p. 2350-2357.
71. Polnaszek G.F., Bruno G.Y. and Freed J.H. Electron spin resonance line shapes in the slow motional region. Anisotropic liquids-. J. Chem. Phys., 1973, v. 58, p. 3185-3199).
72. Polgar L. and Bender M.L. Reactivity of thiol-subtilisin, enzyme containing a synthetic functional group. Biochemistry, 1967, v. 6, p. 610-620.
73. Robinson P.D. and Tabita F.R. Modification of ribulose bis-phosphate carboxylase from Rhodospirillum rubrum with tetra-nitromethane. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1979, v. 88, p. 85-91.
74. Rosen G.M. and Rauchman E.J. Formation and reduction of nit-roxide radical by liver microsomes. Biochem. Pharmacol., 1977, v. 26, p. 675-678.
75. Rutner A.C. and Lane M.D. Nonidentical subunits of ribulose diphosphate carboxylase. Biochem. Biophys. Res. Commun.,1967, v. 28, p. 531-537.
76. Saluia A. and McFadden B.A. Modification of histidine at the active site of spinach ribulose diphosphate carboxylase. -Biochem. Biophys. Res. Gommun., 1980, v. 94, p. Ю91-Ю97.
77. Saluia A. and McFadden B. Inhibition of ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase by sedoheptulose-I,7-bisphosphate. -FEBS Latt., 1978, v. 96, p. 361-363.
78. Schloss 1.У. and Hartman P.O. Reaction of ribulose bisphosphate carboxylase from Rhodospirillum rubrum with the potential affinity label 3-bromo-I,4-dihydroxy-2-butanone 1,4-bisphosphate. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1977, v. 75, p. 320-328.
79. Shapira J., Wanson C.L. and Lyding J-M. Properties of Ribulose Diphosphate Carboxylase Immobilized on Porous Glass. -Biotechnology and Bioengineering, 1974, v. 16, p.I507-I5I6.
80. Siege 1 M.J. and Lane M.D. Interaction of Ribulose diphosphate carboxylase with 2-carboxyribitol diphosphate, an analoque of the; proposed carboxylated intermediate in the C02 fixation reaction. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1972, v. 48, p. 508-516.
81. Smith J.C.R. Study of the conformational properties of bovine pancreatic ribo nuclease a by electron paramagnetic resonance. Biochemistry, 1968, v. 7, p. 745-757.
82. Stier A. and SackmanE. Spin-labels as enzyme substrates.
83. Heterogenous lipid distribution in liver microsomal membranes. Biochim. Biophys. Acta, 1973, v.311, p. 400-408.
84. Stier A. and Reitz I. Radical production in amine oxidation by liver microsomes. Xe;nobiotica, 1971, v.I, p.499-500.
85. Sugiyama T. and Akazawa T» Structure and function of chloroplast proteins. I. Subunit structure of wheat fraction I protein. J. Biochem., 1967, v. 62, p. 474-482.
86. Tabita P.P. and McPadden B.A. B-ribulose I,5-diphosphate carboxylase from Rhodospirillum rubrum. II. Quarternary structure, compasition, catalitic and immunological properties. J. Biol. Chem., 1974, v. 249, p. 3459-3464.
87. Tabita P.P., McPadden B.A. and Pfenning N. B-ribulose 1,5-diphosphate carboxylase in Chlorobium thiosulfatophilum Tas-sajard. Biochim. Biophys. Acta, 1974, v.341, p.187-19'4.
88. Takabe T. and Akazawa T. Molecular evolution of ribulose I,5-bisphosphate carboxylase. Plant Cell Physiol., 1975, v. 16, p. 1049-1050.
89. Tanford C.J., Buckley C.E. and De P.K. Effect of ethylene glycol on the conformation of A-globulin and B-lactoglobu-lin. J. Biol. Chem., 1962, v. 237, p. II68-II7I.
90. Timofeev V.P., Dudich I.V., Sykulev Y.K. and Ifezlin R.S. Rotational correlation times of Ig G and its fragments spin-labeled at carbohydrate or protein moieties. PEBS Lett.,1978, v. 89, p. I9I-I95.
91. Weissbach A., Horecker B.L. and Hurwitz I. The enzymatic formation of phosphoglyceric acid from ribulose diphosphate and carbon dioxide. J. Biol. Chem., 1956, v. 218, p.795-810.
92. Weber G. Polarization of the Fluorescence of labelled Protein Molecules. Discuss. Faraday Soc., 1953, N13, p. 33-39.
93. Wildman S.G. and Bonner I. The properties of green leaves.
94. Isolation, enzymic properties and auxin content of spinach cytoplasmic proteins. Arch. Biochem., 1947, v.14, p.381-413.
95. Wishnick M., Lane M.D., Scrutton M.C. and Mildvan A.S. The;presence of tightly bound copper in ribulose diphosphate carboxylase from spinach. J. Biol. Chem., 1969, v. 244, p.5761-5763.
96. Wishnick M., Lane M.D. and Scrutton M.C. The interaction of metall ions with ribulose I,5-diphosphate carboxylase from spinach. J. Biol. Chem., 1970, v. 245, p. 4939-4947.
97. Wildner G.F. and Henkel J. The effect of divalent metal ions on the activity of Mg depleted ribulose I,5-bisphosphate oxygenase. Planta, 1979, v.146, p. 223-228.
98. Willan K.J., Marsh D„,Sunderland C.S., Sutton B.J., Wain
99. Hobson S., Dwek R.A. and Givolt B. Comparison of the dimensions of the combining sites of the di-nitrophenyl-bin-ding immunoglobulin A myeloma proteins MOPC 315, MOPC 4:60 and XRPC 25 by spin-label mapping. Biochem. J., 1977, v. 165, p. 199-206.
100. Withman J.K., Edelman C.M. and Wettman J.K. Fluorescence polarization of human gamma G—immunoglobulins. Biochemistry, 1967, v. 6, p. 1437-1447.
101. Y/hitman Y/.B. and Tabita F.R. Modification of Rhodospirillum rubrum ribulose bisphosphate carboxylase with pyridoxal phosphate. 2. Stoichiometry and kinetics of inactivation. Biochemistry, 1978, v. 17, p. 1282-1287.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.