Характеристика ядерных белков млекопитающих, взаимодействующих с триплетными повторами (GCC) a регуляторных участков генов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Кутейкин-Тепляков, Константин Борисович

• Кутейкин-Тепляков, Константин Борисович
• кандидат биологических наук
• 2001

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Кутейкин-Тепляков, Константин Борисович

использованные сокращения.

1. введение.

2. обзор литературы.

2.1. Регуляция транскрипции: общие принципы.

2.2. Сайт-специфические транскрипционные факторы: взаимодействие с ДНК, доменная организация и классификация доменов.

2.3. Факторы транскрипции, взаимодействующие с GC-богатыми нуклеогидными последовательностями.

2.3.1. Семейство Spl-подобных факторов транскрипции.

2.3.2. ТФ семейства Egr.

2.3.3. Семейство Ар2.

2.3.4. (GCC)„-связывающий белок CGGBP-20.

2.4. структурно-фунциональные особенности (осс)„-последовательностей.

2.5. (ОСС)п-последовательности в регуляторных районах генов млекопитающих и человека.

2.5.1. Ген рецептора липопротеидов очень низкой плотности (vldl-r).

2.5.2. Промотор рибосомного белка мыши L32 (rpL32).

2.5.3. (GCC)„-последовательности в геноме герпесвирусов.

2.5.4. Область LAT в геноме вируса простого герпеса 1 типа и особенности ее регуляции.

3. материалы и методы.

3.1. материалы исследования.

3.2. плазмиды.

3.3. генно-инженерное конструирование.

3.4. получение ядерных экстрактов.

3.5. гель-ретардация.

3.6. SDS-электрофорез белков.

3.7. лигандный блоттинг.

3.8. Аффинная хроматография ядерных белков.

3.8.1. АХ на синтезированном сорбенте на основе целлюлозы.

3.8.2. АХ на стрептавидин-содержащих магнитных частицах.

3.9. Препаративная гель-ретардация.

3.10. Анализ ДНК-связывающей активности белков связыванием на нитро-целлюлозной мембране (дот-анализ).

3.11. Генетическая трансформация клеток и анализ продуктов экспрессии генов-репортеров

4. результаты исследований.

4.1. Изучение свойств белков, взаимодействующих с GCC-coдержащими цисэлементами.

4.1.1. Изучение специфичности ДНК-белкового взаимодействия.

4.1.2. Идентификация ДНК-связывающих белков, взаимодействующих с композитным цис-элементом промотора rpL32.

4.2. Исследование последовательности (GCC)8j локализованной в 5'

НЕТРАНСЛИРУЕМОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА vM-r ЧЕЛОВЕКА, КАК ПОТЕНЦИАЛЬНОГО ЦИС-ЭЛЕМЕНТА.

4.2.1. (GCQg-элемент гена vldl-r специфически взаимодействует с ядерными белками клеток ге-патомы человека HepG2.

4.2.2. (GCC) ^-элемент гена vldl-r проявляет перекрестную специфичность с GCC-элементом промотора гена rpL32.

4.2.3. Фрагмент 5 '-нетранслируемой области гена vldl-r вытесняется из комплексов с ядерными белками клеток HepG2 (GCC)rэлементом, но не вытесняется полипиримидиновым блоком (РРу) фрагмента промотора rpL32.

4.2.3. Взаимодействие (GCC)„-содержащих элементов в 5 '-нетранслируемом районе гена vldl-r с ядерными белками зависит от ионов Zn2+.

4.2.4. Делеция участка 5 '-регуляторной области (+384.+615) vldl-r, содержащего восемь триплетов GCC, значительно усиливает активность его промотора в клетках Hutu80.

4.3. ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ (GCC)3, ЛОКАЛИЗОВАННОЙ В

АССОЦИИРОВАННОМ С ЛАТЕНЦИЕЙ ВИРУСА HSV-1 ПРОМОТОРЕ LAP1.

4.4. Белок CGGBP-20, связывающийся с триплетными повторами (GCC)„, может

ДЕЙСТВОВАТЬ КАК РЕПРЕССОР ТРАНСКРИПЦИИ.

4.4.1. Белок CGGBP-20 способен функционировать как специфический регулятор (репрессор) транскрипции.

4.4.2. Белок CGGBP-20 способен функционировать как неспецифический регулятор (репрессор) транскрипции.

4.5. ВЫДЕЛЕНИЕ И ОЧИСТКА ЯДЕРНЫХ БЕЛКОВ ИЗ КЛЕТОК HEPG2, СВЯЗЫВАЮЩИХ (GCC)4

СОДЕРЖАЩИЙ КОМПОЗИТНЫЙ ЦИС-ЭЛЕМЕНТ ПРОМОТОРА rpL32.

4.5.1. Очистка исследуемых белков препаративной гель-ретардацией.

4.5.2. Аффинная хроматография исследуемых белков на ДНК-целлюлозе и на стрептавидин-содержащих магнитных частицах.

4.5.3. Очистка ДНК-связывающих белков с применением последовательной гель-ретардации и аффинной хроматографии (комбинированный способ очистки).

5. обсуждение результатов.

6. выводы.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Характеристика ядерных белков млекопитающих, взаимодействующих с триплетными повторами (GCC) a регуляторных участков генов»

Актуальность проблемы

К настоящему времени произведено секвенирование генома человека, расшифровываются геномы других организмов. Однако, для того, чтобы понимать, как функционируют гены, недостаточно одного лишь знания их нуклеотидной последовательности. Очень важной становится функциональная геномика, то есть информация о функциях тех или иных нуклеотидных последовательностей на уровне всего организма в целом. Одним из аспектов такого знания является сбор и анализ информации о регуляции действия генов. Изучение регуляции экспрессии генов - центральная проблема современной молекулярной биологии. Детальный анализ модульной структуры 5'-регуляторных районов эукариотических генов, включая участки энхансеров, промоторов, первого эк-зона и первого интрона, является лидирующим направлением в области изучения механизмов регуляции генной экспрессии. В частности, эта работа включает описание и характеристику цис-элементов регуляции транскрипции, взаимодействующих с отдельными белками - факторами регуляции транскрипции, характеристику этих факторов и клонирование кодирующих эти факторы генов (Mitchell and Tjian 1989). Описаны сотни факторов регуляции транскрипции, интенсивно ведутся поиски новых (Wmgender, Chen et al. 2001). Значительное внимание уделяется как ДНК-белковым взаимодействиям между транскрипционными факторами и цис-элементами в составе промоторов или энхансеров, так и белок-белковым взаимодействиям между совместно связывающимися с ДНК факторами транскрипции. В связи с вышесказанным, весьма актуальным представляется поиск и описание новых цис-элементов в геноме эукариот и изучение ядерных белков (транскрипционных факторов), взаимодействующих с ними.

Большое внимание исследователей привлекают участки ДНК, содержащие различные нуклеотидные триплетные повторы. Автономная экспансия (амплификация) три-нуклеотидных тандемных повторов в человеческом геноме является причиной ряда тяжелых наследственных заболеваний человека (Caskey, Pizzyti et al. 1992; Ashley and Warren 1995; Timchenko and Caskey 1999). Так, например, экспансия повторов GCC в лидерном районе гена FMR1 человека приводит к синдрому «хрупкости X-хромосомы», сопровождающемуся задержкой умственного развития новорожденных. Наряду с этим, имеются данные о связи триплетных повторов GCC в 5'-регуляторной области гена рецептора ЛПОНП человека с нарушениями памяти (Helbecque, Berr et al. 2001).

Молекулярные механизмы амплификации триплетных повторов недостаточно изучены. Существует ряд данных, полученных в экспериментах in vitro и в бактериальных системах, которые указывают на роль необычной вторичной структуры последовательностей (GCC)n в нарушениях репликации ДНК, приводящих к амплификации повторов (Ji, Clegg et al. 1996; Shimizu 1997). В 1996-1997 гг. группа немецких исследователей выделила из клеток HeLa ядерный белок молекулярной массой 20 кД (CGGBP-20), специфически взаимодействующий с протяженными участками GCC-повторов (8-50 по-следоваельных триплетов) гена FMR1 (Deissler, Behn-Krappa etal. 1996), и клонировала последовательность кДНК, кодирующую этот белок (Deissler, Wilm et al. 1997). В 2000 г. эта же группа исследователей показала, что (ОСС)п-связывающий белок CGGBP-20 может проникать в ядро и действовать как регулятор транскрипции гена FMR1 (Muller-Hartmann, Deissler et al. 2000). Триплетные повторы типа (GCC)n (где п=3-30) также входят в районы гомологии регуляторных областей ряда генов млекопитающих и вирусов семейства Herpes viridae (Perevozchikov, Orlov et al. 1993).

В связи с вышесказанным, представляется интересным выделить ядерные белки человека, специфически взаимодействующие с GCC-повторами, и изучить их вклад в регуляцию экспрессии генов, содержащих GCC-триплеты.

Цели и задачи исследования

Целью настоящей работы является исследование ядерных белков различных типов клеток человека, способных специфично взаимодействовать с последовательностями (GCC)38, а также изучение триплетных повторов (GCC)n (п>3) как цис-элементов регуляции транскрипции.

Для достижения поставленной цели следовало решить следующие задачи:

1. Характеристика физико-химических свойств ДНК-белковых комплексов, образованных (ССС)п-содержащими регуляторными участками генов рибосомного белка мыши L32 (rpL32) и рецептора липопротеинов очень низкой плотности человека (vldl-r), и ядерными белками человека.

2. Изучение влияния GCC-связывающего белка CGGBP-20 на транскрипцию ряда генов вирусов и человека.

3. Выделение и очистка из различных линий клеток человека ядерных белков, взаимодействующих с содержащими триплетные повторы (GCC)n регуляторными участками генов млекопитающих.

4. Изучение функциональной активности (ССС)п-элементов в 5'-нетранслируемой области гена vldl-r и ассоциированного с латенцией промотора LAP1 вируса простого герпеса I типа.

Основные положения, выносимые на защиту

1. В состав ДНК-белковых комплексов, образованных с участием GCC-связывающих белков из ядер гепатомных клеток человека HepG2, входят по меньшей мере два ДНК-связывающих белка с молекулярными массами 56 и 68 кД.

2. Белок CGGBP-20, взаимодействующий с триплетными повторами (GCC)n, проявляет свойства репрессора транскрипции.

3. Установлено, что 5'-нетранслируемая область гена vldl-r человека содержит цис-элемент вида (GCQs, который специфически взаимодействует с ядерными белками гепатомных клеток человека HepG2, проявляет перекрестную специфичность с GCC-элементом промотора гена rpL32 и является функционально активным в регуляции транскрипции.

4. (ОСС)з4-элемент способен действовать как в составе композитного цис-действующего элемента транскрипции (в промоторе rpL32), так и независимо от других цис-элементов (в промоторе LAP1 и 5'-нетранслируемой области гена vldl-r).

Научная новизна работы.

Идентифицированы, выделены и очищены ядерные белки, взаимодействующие с композитным цис-действующим элементом транскрипции (-24.-Н 1) в промоторе гена rpL32 мыши, содержащем элемент (GCQ4. В 5'-регуляторной области гена vldl-r человека выявлен неописанный ранее цис-элемент, содержащий восемь триплетных повторов GCC, изучены свойства нуклеопротеидов, образуемых данным элементом и ядерными белками клеток HepG2. Впервые показано, что белок CGGBP-20, взаимодействующий с триплетными повторами типа (ОСС)з-зо, способен выступать как негативный регулятор транскрипции.

Полученные результаты указывают на существование в клетках человека, по меньшей мере, нескольких белков (CCGBP-20 и др.), которые взаимодействуют с триплетными повторами (GCC)n и модулируют активность промоторов, содержащих эти триплетные повторы.

Теоретическое и практическое значение работы

Изучение ДНК-белковых взаимодействий у млекопитающих позволило описать новый цис-действующий элемент регуляции транскрипции в 5'-нетранслируемой об

2. Обзор литературы

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Кутейкин-Тепляков, Константин Борисович

6. Выводы

1. Разработан новый метод очистки белков, специфически связывающих (GCC)n-содержащие нуклеотидные последовательности, включающий последовательное применение препаративного гель-электрофореза и аффинной хроматографии на сорбенте на основе стрептавидин-содержащих магнитных частиц.

2. Из клеток гепатомы человека HepG2 выделены и очищены ядерные белки, взаимодействующие с (ОСС)п-содержащим композитным элементом (-24.+11) промотора гена рибосомного белка мыши L32 (rpL32). Показано, что в состав нуклеопротеидов, образованных GCC-связывающими ядерными белками клеток HepG2 с композитным элементом rpL32, входят по меньшей мере два ДНК-связывающих белка, с молекулярными массами 56 и 68 кДа.

3. Установлено, что точечные замены нуклеотидов в полипиримидиновом блоке композитного цис-элемента (-24.+11) промотора rpL32 не влияют на его способность взаимодействовать с ядерными белками клеток гепатомы человека HepG2.

4. В 5'-нетранслируемой области гена vldl-r человека идентифицирован цис-действующий элемент регуляции транскрипции вида (GCC)g, проявляющий перекрестную специфичность с (GCC)4-элементом промотора гена rpL32.

5. Выявлено, что взаимодействие in vitro ядерных белков клеток HepG2 с цис-элементом, состоящим из восьми триплетных повторов вида GCC, в 5'-нетранслируемой области гена vldl-r, является цинк-зависимым, что указывает на отличие таких белков от описанного в литературе (ССС)п-связывающего белка CGGBP-20.

6. Установлено, что в клетках гепатомы HepG2 и аденокарциномы тонкого кишечника Hutu80 человека (ОСС)п-связывающий белок CGGBP-20, кодируемый экзогенной генетической конструкцией, может действовать как репрессор транскрипции.

7. Показано, что (ОСС)з-содержащий элемент ассоциированного с латенцией вируса HSV-1 промотора LAP1 в клетках гепатомы человека HepG2 может являться позитивным регулятором транскрипции.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Кутейкин-Тепляков, Константин Борисович, 2001 год

1. Горман К. (1988) Высокоэффективный перенос генов в клетки млекопитающих. //Клонирование ДНК (ред. Д.Гловер). М.: Мир.-С.463-495.

2. Дин П., Джонсон В., Мидл Ф. (1988). Аффинная хроматография: Методы. М.: Мир.-288 с.

3. Досон Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонс К. (1991). Справочник биохимика. М.: Мир.-544 с.

4. Маниатис Т., Фрич Э., Сембрук Дж. (1984). Молекулярное клонирование. -М.:Мир.-480 с.

5. Орлов С.В. (1999). Характеристика нового цис-элемента регуляции транскрипции генов млекопитающих вида (GCCV / Автореферат диссертации на соискание ученой степени канд.биол.наук. СПб.гИЭМ РАМН.-22 с.

6. Федоров С.Н., Татосян А.Г., Смирнова Т.А. и др. (1984). Выделение неинтег-рированных форм провирусной ДНК онкогенных вирусов методом препаративного электрофореза. // Экспериментальная онкология. -Т. 6, №2.-С.39-41.

7. Alam J. and Zhining D. (1992). Distal API binding sites mediate basal level enhancement and TP A induction of the mouse heme oxygenase-1 gene. // J Biol Chem 267:30. P.21894-21900.

8. Andrews N.C. and Faller D.V. (1991). A rapid micropreparation technique for extraction of DNA binding proteins from limiting numbers of mammalian cells. // Nucleic Acids Research 19:9. P.2499.

9. Angel P., Ymagawa M., and et al. (1987). Phorbol ester inducible genes contain a common cis-element recognized by a TPA-modulated trans-acting factor. // Cell 49. P.729-739.

10. Asano, H., X.S. Li, and G. Stamatoyannopoulos. (1999). FKLF, a novel Rruppel-like factor that activates human embryonic and fetal beta-like globin genes. // Mol Cell Biol 19:5. P.3571-3579.

11. Ashley C.T. and Warren S.T. (1995). Trinucleotide repeat expansion and human disease. //Ann.Rev.Genet. 29. P.703-728.

12. Atchson M.L., Meyuhas O., and Perry R. (1989). Localization of transcriptional regulatory elements and nuclear factor binding sites in mouse ribosomal protein gene rpL32. ПMol.Cell.Biol. 9:5. P.2067-2074.

13. Bacolla, A., R. Gellibolian, M. Shimizu, et al. (1997). Flexible DNA: genetically unstable CTG.CAG and CGG.CCG from human hereditary neuromuscular disease genes. U J Biol Chem 272:27. P.16783-16792.

14. Bai, L. and J.L. Merchant. (2000). Transcription factor ZBP-89 cooperates with histone acetyltransferase p300 during butyrate activation of p21wafl transcription in human cells. IIJ Biol Chem 275:39. P.30725-30733.

15. Baldi. P., S. Brunak, Y. Chauvin, and A.G. Pedersen. (1999). Structural basis for triplet repeat disorders: a computational analysis. // Bioinformatics 15:11. P.918-929.

16. Bar, E. (1999). Role of AP-2 in tumor growth and metastasis of human melanoma. // Cancer Metastasis Rev 18:3. P.377-385.

17. Batsche, E. and C. Cremisi. (1999). Opposite transcriptional activity between the wild type c-myc gene coding for c-Mycl and c-Myc2 proteins and c-Mycl and c-Myc2 separately. // Oncogene 18:41. P.5662-5671.

18. Benson, L.Q., M.R. Coon, L.M. Krueger, et al. (1999). Expression of MXI1, а Мус antagonist, is regulated by Spl and AP2. U J Biol Chem 274:40. P.28794-28802.

19. Bickmore W.A., Oghene K., Little M.H., and et al. (1992). Modulation of DNA binding specificity by alternative splicing of the Wilms' tumor wtl gene transcript. // Science 251. P.235-237.

20. Bjorklung, S., G. Almouzni, Davidson I., et al. (1999). Global transcription regulators of eukaryotes. // Cell 96. P.759-767.

21. Block, T.M. and J.M. Hill. (1997). The latency associated transcripts (LAT) of herpes simplex virus: still no end in sight. // JNeurovirol 3:5. P.313-321.

22. Briggs, M.R., J.T. Kadonaga, S.P. Bell, and R. Tjian. (1986). Purification and biochemical characterization of the promoter- specific transcription factor, Spl. // Science 234. P.47-52.

23. Bujo, H. and T. Yamamoto. (1996). VLDL receptor in health and disease: interview with a receptor in avian oocytes and mammalian muscle and fat cells. // J Atheroscler Thromb2:2. P.71-75.

24. Call K.M., Glaser Т., Ito C.Y., et al. (1990). Isolation and characterization of a zinc finger polypeptide gene at the human chromosome 11 Wilms' tumor locus. // Cell 60. P.509-520.

25. Cao X.M., Koski R.A., Gashler A., et al. (1990). Identification and characterization of the Egr-1 gene product, a DNA-binding zinc finger protein induced by differentiation and growth signals. // MolCell.Biol. 10. P.1931-1939.

26. Caskey C.T., Pizzyti A., Fu Y.-H., and et al. (1992). Triplet repeat mutations in human diease. // Science 256:8. P.784-789.

27. Chalkley, G.E. and C.P. Verrijzer. (1999). DNA binding site selection by RNA polymerase II TAFs: a TAF(II)250-TAF(II)150 complex recognizes the initiator. // EMBOJ1SA7. P.4835-4845.

28. Chavrier P., Zerial M., Lemaire P., et al. (1988). A gene encoding a protein with zinc fingers is activated during G0/G1 transition in cultured cells. // EMBOJ. 7. P.29-35.

29. Chen H., Li В., and Workman J.L. (1994). A histone-binding protein, nucleoplasmin, stimulates transcription factor binding to nucleosomes and factor-induced nucleosome disassembly. II EMBOJ. 13.P.380-390.

30. Chen J.-L., Attardi L.D., Verrijzer C.P., et al. (1995). Assembly of recombinant TFIID reveals differential coactivator requirements for distinct transcriptional activators. // Celll9\l. P.93-105.

31. Chen, X., S.V. Mariappan, R.K. Moyzis, et al. (1998). Hairpin induced slippage and hyper-methylation of the fragile X DNA triplets. // J Biomol Struct Dyn 15:4. P.745-756.

32. Chiang C.M. and Roeder R.G. (1995). Cloning of an intrinsic human TFIID subunit that interacts with multiple transcriptional activators. II Science 267. P.531-536.

33. Christensen, J., S.F. Cotmore, and P. Tatter sail. (1999). Two new members of the emerging KDWK family of combinatorial transcription modulators bind as a heterodimer to flexibly spaced PuCGPy half-sites. // Mol Cell Biol 19:11. P.7741-7750.

34. Christy B.A., Lau L.F., and Nathans D. (1988). A gene activated in mouse 3T3 cells by serum growth factors encodes a protein with "zinc finger" sequences. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85. P.7857-7861.

35. Christy B. and Nathans D. (1989). Functional serum response elements upstream of the growth factor-inducible gene zi£268. //Mol.Cell.Biol. 9. P.4889-4895.

36. Chung S. and Perry R. (1989). Importance of introns for expression of mouse ribosomal protein gene rpL32. /1Mol.Cell.Biol. 9:5. P.2075-2082.

37. Colgan, J. and J.L. Manley. (1995). Cooperation between core promoter elements influences transcriptional activity in vivo. // Proc Natl Acad Sci USA 92:6. P. 19551959.

38. Cook, Т., В. Gebelein, M. Belal, et al. (1999). Three conserved transcriptional repressor domains are a defining feature of the TIEG subfamily of Spl-like zinc finger proteins. U J Biol Chem 274:41. P.29500-29504.

39. Cook, Т., В. Gebelein, and R. Urrutia. (1999). Spl and its likes: biochemical and functional predictions for a growing family of zinc fmger transcription factors. // Ann N Y Acad Sci 880. P.94-102.

40. Corden J.L. (1990). Tails of RNA polymerase II. // Trends Biochem.Sci. 15. P.383-387.

41. Courey A.J. and Tjian R. (1988). Analysis of Spl in vivo reveals multiple transcriptional domains including a novel glutamine-rich activation motif. // Cell 55. P.887-898.

42. Crosby S.D., Puetz J.J., Simburger K.S., et al. (1991). The early response gene NGFI-C encodes a zinc fmger transcriptional activator and is a member of the GCGGGGGCG (GSG) element-binding protein family. // Mol.Cell.Biol. 11. P.3835-3841.

43. Currie R.A. and Eckler R.H. (1992). Characterization of a high affinity octamer transcriptional factor binding site in the human lipoprotein lipase promoter. // Archives of Biochemistry and Biophysics 298:2. P.630-639.

44. Damberg, M., H. Garpenstrand, J. Alfredsson, et al. (2000). A polymorphic region in the human transcription factor AP-2beta gene is associated with specific personality traits. // Mol Psychiatry 5:2. P.220-224.

45. Darlow, J.M. and D.R. Leach. (1998). Evidence for two preferred hairpin folding patterns in d(CGG)/d(CCG) repeat tracts in vivo. // J Mol Biol 275:1. P. 17-23.

46. Darlow, J.M. and D.R. Leach. (1998). Secondary structures in d(CGG) and d(CCG) repeat tracts. HJMolBiol 275:1. P.3-16.

47. Datta P.K., Raychandhuri P., and Bagchi S. (1995). Association of pi07 with Spl: genetically separable regions of pi07 are involved in regulation of E2F- and Spl-dependent transcription. // Mol.Cell.BioL 15:10. P.5444-5452.

48. Day M.L., Fahrner T.J., Aykent S., and Milbrandt J. (1990). The zinc finger protein NGFI-A exists in both nuclear and cytoplasmic forms in nerve growth factor-stimulated PC12 cells. I/J Biol Chem 265. P.15253-15260.

49. Deissler, H., A. Behn-Krappa, and W. Doerfler. (1996). Purification of nuclear proteins from human HeLa cells that bind specifically to the unstable tandem repeat (CGG)n in the human FMR1 gene. II J.Biol.Chem. 271:8. P.4327-4334.

50. Desnoyers, S., G.M. Shah, S. Bourassa, and G.G. Poirier. (1995). Rapid removal of nonspecific background in silver-stained polyacrylamide gel. // Anal.Biochem. 232. P.l 38-140.

51. Diamond F.C., Miner I.N., Yoshimaga S.K., and Yamamoto K.R. (1990). Transcription factor interections: selectors if positive or negative regulation from a single DNA element. // Science 249. P.1266-1272.

52. Dudov K. and Perry R. (1984). The gene family encoding the mouse ribosomal protein L32 contains a uniquely expressed intron-containing gene and unmutated processed gene. // Cell 37:6. P.457-468.

53. Dudov K. and Perry R. (1986). Properties of a mouse ribosomal protein promoter. /lProc.Natl.Acad.Sci.USA 83:12. P.8545-8549.

54. Dynan W.S. (1983). Promoters for housekeeping genes. // Trends Genet. 2. P. 196-197.

55. Dynan W.S. and Tjian R. (1983). The promoter-specific transcription factor Spl binds to upstream sequences in the SV40 early promoter. II Cell 35. P.79-87.

56. Emami, K.H., A. Jain, and S.T. Smale. (1997). Mechanism of synergy between TATA and initiator: synergistic binding of TFIID following a putative TFIIA-induced isomerization. // Genes Dev 11:22. P.3007-3019.

57. Emili A., Greenblatt J., and Ingles C.J. (1994). Species-specific interaction of the glutamine-rich activation domains of Spl with the TATA box-binding protein. // Mol.Cell Biol. 14. P.1582-1593.

58. Emini E.A., Schleif W.A., Nunberg J.H., et al. (1992). Preventation of HIV-l infection in chimpanzees by gpl20 V3 domain-specific monoclonal antibody. // Nature 355. P.728-730.

59. Fraizer G.C., Wu Y-J., Hewitt S.M., and et al. (1994). Transcriptional regulation of the human Wilms' tumor gene (Wtl). Cell type-specific enhancer and promiscuous promoter. IIJ Biol Chem 269:12. P.8892-8900.

60. Francis, D., T. Burgess, J. Mitchell, and H. Slater. (2000). Identification of small FRAXA premutations. // MolDiagn 5:3. P.221-225.

61. Gabrielsen, O.S., E. Homes, L. Korsnes, et al. (1989). Magnetic DNA affinity purification of yeast transcription factor tau—a new purification principle for the ultrarapid isolation of near homogeneous factor. // Nucleic Acids Res 17:15. P.6253-6267.

62. Garcia, M.A., M. Campillos, S. Ogueta, et al. (2000). Identification of amino acid residues of transcription factor AP-2 involved in DNA binding. // J Mol Biol 301:4. P.807-816.

63. Garrison. P.M. and M.S. Denison. (2000). Analysis of the murine AhR gene promoter. II JBiochem Mol Toxicol 14:1. P. 1-10.

64. Gashler A.L., Swaminathan S., and Sukhatme V.P. (1993). A novel repression module, an extensive activation domain, and a bipartite nuclear localization signal defined in the immediate-early transcription factor Egr-1. // Mol.Cell.Biol. 13. P.4556-4571.

65. Gashler A. and Sukhatme V.P. (1995). Early growth response protein 1 (Egr 1): prototype of a zinc-finger family of transcription factors. // Progress in nucleic acids research and molecular biology. -V.50.-N.Y.: Academic Press, 1995. -P. 191-224.

66. Gecz, J., A.K. Gedeon, G.R. Sutherland, and J.C. Mulley. (1996). Identification of the gene FMR2, associated with FRAXE mental retardation. // Nat Genet 13:1. P. 105108.

67. Gellibolian, R., A. Bacolla, and R.D. Wells. (1997). Triplet repeat instability and DNA topology: an expansion model based on statistical mechanics. II J Biol Chem 272:27. P.16793-16797.

68. Gene, В., H. Muller-Hartmann, M. Zeschnigk, et al. (2000). Methylation mosaicism of 5'-(CGG)(n)-3' repeats in fragile X, premutation and normal individuals. // Nucleic Acids Res 28:10. P.2141-2152.

69. Gessler M., Poustka A., Cavenee W., et al. (1990). Homozygous deletion in Wilms tumours of a zinc-finger gene identified by chromosome jumping. // Nature 343. P.774-778.

70. Getman D.K., Mutero A., Inone K., and Taylor P. (1995). Transcription factor repression and activation of the human acetylcholin esterase gene. // J.Biol.Chem. 270:40. P.23511-23519.

71. Godde, J.S., S.U. Kass, M.C. Hirst, and A.P. Wolffe. (1996). Nucleosome assembly on methylated CGG triplet repeats in the fragile X mental retardation gene 1 promoter. К J.Biol.Chem. 271. P.24325-24328.

72. Golubev, D.B. and A.P. Perevozchikov. (1996). The role of herpes virus in etiopathogenesis of atherosclerosis. // Russian Medical Journal 1. P.8-15.

73. Greenblatt, J. (1997). RNA polymerase II holoenzyme and transcriptional regulation. // Curr Opin Cell Biol 9:3. P.310-319.

74. Haber D.A., Sohn R.L., Budkler A.J., et al. (1991). Alternative splicing and genomic structure of the Wilms' tumor gene WT1. / / Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88. P. 9618-9622.

75. Haeffler I.P., Meyer Т.Е., Yiin Y., and et al. (1988). cAMP responsive DNA binding protein: structure based on a cloned placental cDNA. // Science 242. P. 1430-1432.

76. Hagen G., Muller S., Beato M., and Suske G. (1992). Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins: a family of Spl related genes. // Nucleic Acids Research 20. P.5519-5525.

77. Hagen, G., S. Muller, M. Beato, and G. Suske. (1994). Spl-mediated transcriptional activation is repressed by Sp3. // EMBO J. 13. P.3843-3851.

78. Hagen G., Denning J., Preib A., et al. (1995). Functional analysis of the transcription factor Sp4 reveal properties distinct from Spl and Sp3. // J.Biol.Chem. 270:42. P.24989-24994.

79. Hamilton, T.B., K.C. Barilla, and P.J. Romaniuk. (1995). High affinity binding sites for the Wilms' tumour suppressor protein WT1. // Nucleic. Acids.Res. 23. P.277-284.

80. Hampsey, M. (1998). Molecular genetics of the RNA polymerase II general transcriptional machinery. // Microbiol MolBiol Rev 62:2. P.465-503.

81. Hanaka, S., Т. Abe, H. Itakura, and A. Matsumoto. (2000). Gene expression related to cholesterol metabolism in mouse brain during development. // Brain Dev 22:5. P.321 -326.

82. Hehl, R. and E. Wingender. (2001). Database-assisted promoter analysis. // Trends Plant Sci 6:6.P.251-255.

83. Heinemeyer, Т., E. Wingender, I. Reuter, et al. (1998). Databases on transcriptional regulation: TRANSFAC, TRRD and COMPEL.!/ Nucleic Acids Res 26:1. P.362-367.

84. Heitz, D., F. Rousseau, D. Devys, et al. (1991). Isolation of sequences that span the fragile X and identification of a fragile X-related CpG island published erratum appears in Science 1991 Apr 26; 252(5005):494., // Science 251. P. 1236-1239.

85. Helbecque:, F. Richard, D. Cottel, et al. (1998). The very low density lipoprotein (VLDL) receptor is a genetic susceptibility factor for Alzheimer disease in a European Caucasian population. П Alzheimer Dis Assoc Disord 12:4. P.368-371.

86. Helbecque:, C. Berr, D. Cottel, et al. (2001). VLDL receptor polymorphism, cognitive impairment, and dementia. // Neurology 56:9. P.1183-1188.

87. Herms J., U. Zurmohle, Schlingensiepen R., et al. (1994). Developmental expression of the transcription factor zif268 in rat brain. // Neurosci.Lett. 165. P.171-174.

88. Hewitt S. (1996). Differential function of Wilms' tumor gene WT1 splice isoforms in transcriptional regulation. /UBiol Chem 271:15. P.8588-8592.

89. Hirose, M. (1999). The role of Wilms' tumor genes. // J Med Invest 46:3-4. P. 130-140.

90. Holde, van K. and Zlatanova J. (1996). Chromatin architectural proteins and transcription factors: a structural connection. // BioEssays 18:9. P.697-700.

91. Holden, J.J., C. Julien-Inalsingh, M. Chalifoux, et al. (1996). Trinucleotide repeat expansion in the FRAXE locus is not common among institutionalized individuals with non-specific developmental disabilities. // Am J Med Genet 64:2. P.420-423.

92. Hosono, S., I. Gross, M.A. English, et al. (2000). E-cadherin is a WT1 target gene. // J Biol Chem 275:15. P.10943-10953.

93. Houbaviy, H.B., A. Usheva, T. Shenk, and S.K. Burley. (1996). Cocrystal structure of YY1 bound to the adeno-associated virus P5 initiator. // Proc Natl Acad Sci USA 93:24. P.13577-13582.

94. Huang H.-C., Sundseth R., and Hansen U. (1990). Transcription factor LSF binds two variant bipartite sites within the SV40 late promoter. // Genes&Dev. 4. P.287-298.

95. Huang R.P. and Adamson E.D. (1994), The phosphorylated forms of the transcription factor, Egr-1, bind to DNA more efficiently than non-phosphorylated. // Biochem.Biophys.Res.Commun. 200. P. 1271-1276.

96. Huff V. (1994). Parental origin of WT1 mutations and mental retardation in WAGR syndrome. // Nature Genetics 8:1. P.13-14.

97. Hussain, M.M. (2001). Structural, biochemical and signaling properties of the low-density lipoprotein receptor gene family. // Front Biosci 6. p.D417-D428

98. Ihn, H., Y. Ihn, and M. Trojanowska. (2001). Spl Phosphorylation Induced by Serum Stimulates the Human alpha2(I) Collagen Gene Expression. H J Invest Dermatol 117:2. P.301-308.

99. Imataka H., Sogawa K., Yasumoto K, et al. (1992). Two regulatory proteins that bind to the basic transcription element (BTE), a GC box sequence in the promoter region of the rat P-4501A1 gene. // EMBOJ. 11. P.3663-3671.

100. Imataka, H., K. Nakayaraa, K. Yasumoto, et al. (1994). Cell-specific translational control of transcription factor BTEB expression. The role of an upstream AUG in the 5'-untranslated region. II J.Biol.Chem. 269. P.20668-20673.

101. Imhof, A., M. Schuierer, O. Werner, et al. (1999). Transcriptional regulation of the AP-2alpha promoter by BTEB-1 and AP-2rep, a novel wt-l/egr-related zinc finger repressor. // Mol Cell Biol 19:1. P. 194-204.

102. Ionat C., Rahmsdorf H.I., Park K.-K., and et al. (1990). Antitumor promotion and antiinflammation: down-modulation of API (Fos/Jun) activity by glucocorticoid hormone. // Cell 62. P. 1189-1204.

103. Jackson S.P. and Tjian R. (1988). O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. // Cell 55. P. 125-133.

104. Javahery, R., A. Khaclii, K. Lo, et at. (1994). DNA sequence requirements for transcriptional initiator activity in mammalian cells. I/ Mol Cell Biol 14:1. P.116-127.

105. Jenster G., Spencer Т.Е., Burcin M.M., et al. (1997). Steroid receptor induction of gene transcription: A two-step model. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA 94. P.7879-7884.

106. Ji, J.:J. Clegg, K.R. Peterson, et al. (1996). In vitro expansion of GGC:GCC repeats: identification of the preferred strand of expansion. // Nucleic Acids Res 24:14. P.2835-2840.

107. Jiang, J.G., M.C. DeFrances, J. Machen, et al. (2000). The repressive function of AP2 transcription factor on the hepatocyte growth factor gene promoter. // Biochem Biophys Res Commun 272:3. P.882-886.

108. Jiang, M.S. and M.D. Lane. (2000). Sequential repression and activation of the CCAAT enhancer-binding protein-alpha (C/EBPalpha ) gene during adipogenesis. // Proc Natl Acad Sci USA 97:23. P.12519-12523.

109. Jingami, H. and T. Yamamoto. (1995). The VLDL receptor: wayward brother of the LDL receptor. // Curr Opin Lipidol 6:2. P.104-108.

110. Jones, C., L. Penny, T. Mattina, and et al. (1995). Association of a chromosome deletion syndrome with a fragile site within the proto-oncogene CBL2. // Nature 376. P.145-149.

111. Joseph L.J., Le Beau M.M., Jamieson G.A., et al. (1988). Molecular cloning, sequencing, and mapping of EGR2, a human early growth response gene encoding a protein with "zinc-binding finger" structure. II Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85. P.7164-7168.

112. Kadonaga J.T and Tjian R. (1986). Affinity purification of sequence-specific DNA-binding proteins. //Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83. P.5889-5893.

113. Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., and Tjian R. (1987). Isolation of cDNA encoding transcription factor Spl and functional analysis of the DNA binding domain. // Cell 51. P. 1079-1090.

114. Kadonaga J.T., Courey A.J., Ladika J., and Tjian R. (1988). Distinct regions of Spl modulate DNA binding and transcriptional activation. // Science 242. P. 1566-1570.

115. Kageyama R., Merlino G.T., and Pastan I. (1989). Nuclear factor ETF specifically stimulates transcription from promoters without a TATA box. // J.Biol. Chem. 264:26. P.15508-15514.

116. Kageyama R. and Pastan I. (1989). Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that repress transcription. // Cell 59:5. P.815-825.

117. Kannan. P., Y. Yu, S. Wankhade, and M.A. Tainsky. (1999). PolyADP-ribose polymerase is a coactivator for АР-2-mediated transcriptional activation. // Nucleic Acids Res 27:3. P.866-874.

118. Karjalainen, J.M., J.K. Kellokoski, A.J. Mannermaa, et al. (2000). Failure in post-transcriptional processing is a possible inactivation mechanism of AP-2alpha in cutaneous melanoma. // Br J Cancer 82:12. P.2015-2021.

119. Kawanishi, Y., S. Harada, H. Tachikawa, et al. (2000). Novel polymorphisms of the AP-2 gene (6p24): analysis of association with schizophrenia. // J Hum Genet 45:1. P.24-30.

120. Kaytor, E.N., J.L. Zhu, C.I. Pao, and L.S. Phillips. (2001). Physiological concentrations of insulin promote binding of nuclear proteins to the insulin-like growth factor I gene. // Endocrinology 142:3. P.1041-1049.

121. Keinberg J.A., Sariola H., Loring J.H., and et al. (1993). WT-1 is required for early kidney development. // Cell 74. P.679-691.

122. Kel, ML, A.G. Romashchenko:A. Kolchanov, et al. (2000). COMPEL: a database on composite regulatory elements providing combinatorial transcriptional regulation. // Nucleic Acids Res 28:1. P.311-315.

123. Kikuchi Y., Sogawa K., Watanabe N., et al. (1996). Purification and characterization of the DNA-binding domain of BTEB, a GC box-binding transcription factor, expressed in Escherichia coli. // J.Biochem. 119:2. P.309-313.

124. Kingsley, C. and A. Winoto. (1992). Cloning of GT-box binding protein: a novel Spl multigene family regulating T-cell receptor gene expression. // Mol.Cell.Biol. 12:10. P.4251-4261.

125. Kobayashi A. and et al. (1995). Analysis of functional domains of GC-box-binding protein, BTEB. //J.Biochem. 117. P.91-95.

126. Kraus, R.J., E.E. Murray, S.R. Wiley, et al. (1996). Experimentally determined weight matrix definitions of the initiator and TBP binding site elements of promoters. // Nucleic Acids Res 24:8. P. 1531-1539.

127. Kreuter, R., A.K. Soutar, and D.P. Wade. (1999). Transcription factors CCAAT/enhancer-binding protein beta and nuclear factor-Y bind to discrete regulatory elements in the very low density lipoprotein receptor promoter. // J Lipid Res 40:3. P.376-386.

128. Kriwacki R.W., Schultz S.C., Steitz T.A., and Caradonna J.P. (1992). Sequence-specific recognition of DNA by zinc-finger peptides derived from the transcription factor Spl. HProc.Natl.Acad.Sci.USA 89. P.9759-9763.

129. Laemmli U.K. (1970). Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. // Nature 111. P.680-685.

130. Larsson S.H., Charlien J.-P., Migagawa K., et al. (1995). Subnuclear localization of WT1 in splicing or transcription factor domains is regulated by alternative splicing. // Cell 81:3. P.391-401.

131. Latchman D.S. Eukariotic transcription factors. Acad. Press., Cambridge, 1991. 322 p.

132. Lemaire P., Revelant O., Bravo R., and Charnay P. (1988). Two mouse genes encoding potential transcription factors with identical DNA- binding domains are activated by growth factors in cultured cells. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85. P.4691-4695.

133. Lemaire P., Vesque C., Schmitt J., et al. (1990). The serum-inducible mouse gene Rrox-24 encodes a sequence-specific transcriptional activator. // Mol.Cell.Biol 10:7. P.3456-3467.

134. Lemon, B. and R. Tjian. (2000). Orchestrated response: a symphony of transcription factors for gene control. // Genes Dev 14:20. P.2551-2569.

135. Levi G., Topilko P., Schneider-Manoury S., et al. (1996). Defective bone formation in Krox-20 mutant mice. // Development 122:1. P.113-120.

136. Li, В., C.C. Adams, and J.L. Workman. (1994). Nucleosome binding by the constitutive transcription factor Spl. // J.Biol.Chem. 269. P.7756-7763.

137. Li, R., Z. Hodny, A. Zaid, et al. (1999). AP-2 enhances Spl-dependent activation of the growth-regulated human ATP/ADP translocator. // JBiochem (Tokyo) 126:1. P. 130136.

138. Lim R.W., Varnum B.C., and Herschman H.R. (1987). Cloning of tetradecanoyl phorbol ester-induced 'primary response' sequences and their expression in density-arrested Swiss 3T3 cells and a TPA non-proliferative variant. // Oncogene 1. P.263-270.

139. Lisowsky, Т. P.L. Polosa, A. Sagliano, et al. (1999). Identification of human GC-box-binding zinc finger protein, a new Kr+-ppel-like zinc finger protein, by the yeast one-hybrid screening with a GC-rich target sequence. // FEBS Lett 453:3. P.369-374.

140. Liu F. and Green M.R. (1994). Promoter targeting by adenovirus El A through interaction with different cellular DNA-binding domains. // Nature 368. P. 5 20-525.

141. Lo, K. and S.T. Smale. (1996). Generality of a functional initiator consensus sequence. // Gene 182:1-2. P.13-22.

142. Logan Т., Pyre J., and Hall D.J. (1993). Physical characteristics of a factor related to the c-myc/insulin promoter binding protein ZF87/PUR-1. // Biochemical and Biophysical Research Communications 192:3. P.1204-1209.

143. Lycke, E. (1990). Biological and molecular aspects on herpes simplex virus latency. // Scand J Infect Dis Suppl 69. P. 113 -119.

144. Majello В., De Luca P., Hagen G., et al. (1994). Different members of the Spl multigene family exert opposite transcriptional regulation of the long terminal repeat of HIV-1. /I Nucleic.Acids.Res. 22. P.4914-4921.

145. Majello, В., G. Napolitano, L. De, and L. Lania. (1998). Recruitment of human TBP selectively activates RNA polymerase II TATA-dependent promoters. // J Biol Chem 273:26. P.16509-16516.

146. Majumdar K.C., Shetty S., Wadhwa R., et al. (1996). Detection and Purification of Sequence-Specific DNA Binding Protein. // Anal.Biochem. 241. P.23-29.

147. Malik K.T.A., Poirier V., Ivins S.M., and Brown K.W. (1994). Autoregulation of the human WT1 gene promoter. // FEBS Letters 349:1. P.75-78.

148. Martin, K.M., W.N. Cooper, J.C. Metcalfe, and P.R. Kemp. (2000). Mouse BTEB3, a new member of the basic transcription element binding protein (BTEB) family, activates expression from GC-rich minimal promoter regions. // Biochem J 345:3. P.529-533.

149. McPherson, L.A. and R.J. Weigel. (1999). AP2alpha and AP2gamma: a comparison of binding site specificity and trans-activation of the estrogen receptor promoter and single site promoter constructs. // Nucleic Acids Res 27:20. P.4040-4049.

150. Merchant, J.L., M. Du, and A. Todisco. (1999). Spl phosphorylation by Erk 2 stimulates DNA binding. // Biochem Biophys Res Commun 254:2. P.454-461.

151. Mikhailenko, I., W. Considine, K.M. Argraves, et al. (1999). Functional domains of the very low density lipoprotein receptor: molecular analysis of ligand binding and acid-dependent ligand dissociation mechanisms. // J Cell Sci 112:19. P.3269-3281.

152. Milbrandt J. (1987). A nerve growth factor-induced gene encodes a possible transcriptional regulatory factor. II Science 238. P.797-799.

153. Mitchell P.J. and Tjian R. (1989). Transcriptional regulation in mammalian cells by sequence- specific DNA binding proteins. // Science 245. P.371-378.

154. Moffett P., Bruening W., Nakagama H., et al. (1995). Antagonism of WT1 activity by protein self-association. И Proc.Natl.Acad.Sci. USA 92:24. P.11105-11109.

155. Mohibullah:, A. Donner, J.A. Ippolito, and T. Williams. (1999). SELEX and missing phosphate contact analyses reveal flexibility within the AP-2alpha. protein: DNA binding complex. 17 Nucleic Acids Res 27:13. P.2760-2769.

156. Montalvo, E.A., M. Cottam, S. Hill, and Y.J. Wang. (1995). YY1 binds to and regulates cis-acting negative elements in the Epstein-Barr virus BZLF1 promoter. II J.Virol. 69:7. P.4158-4165.

157. Morris J.F., S.L.Madden, OJE.Tounay, et al. (1991). Characterization of the zinc finger protein encoded by the WT-1 Wilms' tumor locus. // Oncogene 6:12. P.2339-2348.

158. Moser M., Imhof A., Pscherer A., et al. (1995). Cloning and characterization of a second AP-2 tanscription factor: AP-2 beta. //Development 121:9. P.2779-2788.

159. Muller-Hartmann, H., H. Deissler, F. Naumann, et al. (2000). The human 20-kDa 5'-(CGG)(n)-3'-binding protein is targeted to the nucleus and affects the activity of the FMR1 promoter. IIJ Biol Chem 275:9. P.6447-6452.

160. Nagaoka, M., J. Kuwahara, and Y. Sugiura. (1993). Alteration of DNA binding specifity by nickel (II) substitution in three zinc(II) fingers of transcription factor Sp-1. II Biochemical and Biophysical Research Communications 194:3. P.1515-1520.

161. Nagaoka, M., W. Nomura, Y. Shiraishi, and Y. Sugiura. (2001). Significant effect of linker sequence on DNA recognition by multi-zinc finger protein. // Biochem Biophys Res Commun 282:4. P.1001-1007.

162. Nakagama, H., G. Heinrich, J. Pelletier, and D.E. Housman. (1995). Sequence and structural requirements for high-affinity DNA binding by the WT1 gene product. // Mol.Cell.Biol. 15:3. P. 1489-1498.

163. Nakamura, Y., M. Yamamoto, and E. Kumamaru. (2000). Very low-density lipoprotein receptor in fetal intestine and gastric adenocarcinoma cells. II Arch Pathol Lab Med 124:1. P. 119-122.

164. Nardelli J., Gibson T.J., Vesque C., and Charnay P. (1991). Base sequence discrimination by zinc-finger DNA-binding domains. U Nature 349. P. 175-178.

165. Nardelli J., Gibson Т., and Charnay P. (1992). Zinc finger-DNA recognition: analysis of base specificity by site-directed mutagenesis. // Nucleic Acids Research 20. P.4137-4144.

166. Newman, S.P.:P. Bates, D. Vernimmen, et al. (2000). Cofactor competition between the ligand-bound oestrogen receptor and an intron 1 enhancer leads to oestrogen repression of ERBB2 expression in breast cancer. // Oncogene 19:4. P.490-497.

167. Ngo, У., J.-N. Laverriere, and D. Gourdji. (1993). Binding capacity and cis-acting efficiency of DNA regulatory sequences can be distinguished in an in vivo competition assay. // Nucleic Acids Res. 21. P.5795-5796.

168. Nguyen, H.Q., B. Hoffman-Liebermann, and D.A. Liebermann . (1993). The zinc fmger transcription factor Egr-1 is essential for and restricts differentiation along the macrophage lineage. // Cell 72. P. 197-209.

169. Nicolas, M., V. Noe, K.B. Jensen, and C.J. Ciudad. (2001). Cloning and characterization of the 5'-flanking region of the human transcription factor spl gene. II J Biol Chem 276:25. P.22126-22132.

170. Nicolas, R.H. and G.H. Goodwin. Purification and cloning of transcription factors. // Transcription factors. A practical approach. (Edit. D.S. Latchman), Oxford University Press, Oxford.1993. P. 81-104.

171. Nimpf, J. and W.J. Schneider. (2000). From cholesterol transport to signal transduction: low density lipoprotein receptor, very low density lipoprotein receptor, and apolipoprotein E receptor-2. // Biochim Biophys Acta 1529:1-3. P.287-298.

172. Ogra, Y., K. Suzuki. P. Gong, et al. (2001). Negative regulatory role of Spl in metal responsive element-mediated transcriptional activation Л J Biol Chem 276:19. P. 1653416539.

173. Outram, S.V., D. Grimwade, and T. Crompton. (2001). Repression of CD2 gene expression is mediated by an AP-2 related factor. // Biochem Biophys Res Commun 281:2. P.409-415.

174. Oyama:, K. Iwatsuki, Y. Homma, and Г. Kaneko. (1999). Induction of transcription factor AP-2 by inflammatory cytokines in human keratinocytes. II J Invest Dermatol 113:4. P.600-606.

175. Ozyhar, A., M. Gries, H.H. Kiltz, and O. Pongs. (1992). Magnetic DNA affinity purification of ecdysteroid receptor. // J Steroid Biochem Mol Biol 43:7. P.629-634.

176. Pagliuca, A. P. Gallo, and L. Lania. (2000). Differential role for Spl/Sp3 transcription factors in the regulation of the promoter activity of multiple cyclin-dependent kinase inhibitor genes. IIJ Cell Biochem 76:3. P.360-367.

177. Pardy K., Adan R.A.H., Carter D.A., and et al. (1992). Identification of a cis-acting element involved in cyclic 3',5'-adenosine monophosphate regulation of bovine vasopressin gene expression. IIJ Biol Chem 267:30. P.21746-21752.

178. Parrish, J.E., B.A. Oostra, A.J. Verkerk, et al. (1994). Isolation of a GCC repeat showing expansion in FRAXF, a fragile site distal to FRAXA and FRAXE. // Nat Genet 8:3. P.229-235.

179. Pascal E. and R. Tjian. (1991). Different activating domains of Spl govern formation ofmultimers and mediate transcriptional synergism. И Genes&Dev. 5. p.1646-1656.

180. Patwardhan S., Gashler S., Siegel M., et al. (1991). EGR3, a novel member of the Egr family of genes encoding immediate-early transcription factors. // Oncogene 6. P.917-928.

181. Pavletich N.P. and Pabo C.O. (1990). Zinc finger DNA recognition: crystal structure of a zif268-DNA complex at 2.1 A. II Science 252. P.809-817.

182. Pearson, C.E. and R.R. Slnden. (1996). Alternative structures in duplex DNA formed within the trinucleotide repeats of the myotonic dystrophy and fragile X loci. // Biochemistry 35:15. P.5041-5053.

183. Pearson, C.E., E.E. Eichler, D. Lorenzetti, et al. (1998). Interruptions in the triplet repeats of SCA1 and FRAXA reduce the propensity and complexity of slipped strand DNA (S-DNA) formation. II Biochemistry 37:8. P.2701-2708.

184. Perevozchikov, A.P., S.V. Orlov, and D.B. Golubev. (1993). The homology of herpesviruses and human genes probably is involved in the formation of atherosclerotic plaques. // IXIntern.Congress of Virology, Glasgow. Abstracts 32.

185. Persengiev S.P., Saffer J.D., and Kilpatrick D.L. (1995). An alternatively spliced form of the transcription factor Spl containing only a single glutamine-rich transactivation domain. II Proc.Natl.Acad.Sci. USA 92:20. P.9107-9111.

186. Pintado, E., D. de, A. Hmadcha, et al. (1995). Instability of the CGG repeat at the FRAXA locus and variable phenotypic expression in a large fragile X pedigree. // J Med Genet 32:11. P.907-908.

187. Postel E.H., Mango S.E., and Flint S.J. (1989). A nuclease-hypersensitive element of the human c-myc promoter interacts with a transcription initiation factor. // Mol.Cell.Biol. 9:11. P.5123-5133.

188. Postel E.H., Berberich S.J., Flint S.J., and Ferrone C.A. (1993). Human c-myc transcription factor PuF identified as nm23-H2 nucleoside diphosphate kinase, a candidate suppressor of tumor metastasis. II Science 261:5120. P.478-480.

189. Pritchard-Jones K., Fleming S., Davidson D., and et al. (1990). The candidate Wilms' tumour gene is involved in genitourinary development. // Nature 346. P. 194197.

190. Pugh B.F. and Tjian R. (1990). Mechanism of transcriptional activation by Spl: evidence for coactivators. II Cell 61. P.1187-1197.

191. Raj G.V. and Khalili K. (1994). Identification and characterization of a novel GCA/C-binding protein, GBP-i, that is rapidly inducible by cytokines. II Mol.Cell.Biol. 14:12. P.7770-7781.

192. Rajcani, J. and V. Durmanova. (2000). Early expression of herpes simplex vims (HSV) proteins and reactivation of latent infection. // Folia Microbiol (Praha) 45:1. P.7-28.

193. Ranish, J.A.: Yudkovsky, and S. Hahn. (1999). Intermediates in formation and activity of the RNA polymerase II preinitiation complex: holoenzyme recruitment and a postrecruitment role for the TATA box and TFIIB. // Genes Dev 13:1. P.49-63.

194. Rauscher III, F.J., J.F. Morris, O.E. Tournay, and et al. (1990). Binding of the Wilms' tumor locus zinc finger protein to the EGR-1 consensus sequence. // Science 250. P.259-262.

195. Reeves, R. and L. Beckerbauer. (2001). HMGI/Y proteins: flexible regulators of transcription and chromatin structure. // Biochim Biophys Acta 1519:1-2. P.13-29.

196. Ren, Y. and W.S. Liao. (2001). Transcription factor AP-2 functions as a repressor that contributes to the liver-specific expression of serum amyloid Al gene. // J Biol Chem 276:21. P.17770-17778.

197. Richards, R.I., K. Holman, S. Yu, and G.R. Sutherland. (1993). Fragile X syndrome unstable element, p(CCG)n, and other simple tandem repeat sequences are binding sites for specific nuclear proteins. // Hum.Mol.Genet. 2. P.1429-1435.

198. Ritchie, S. and K. Bonham. (1998). The human c-Src proto-oncogene promoter contains multiple targets for triplex-forming oligonucleotides. // Antisense Nucleic Acid Drug Dev 8:5. P.391-400.

199. Ritchie, S., F.M. Boyd, J. Wong, and K. Bonham. (2000). Transcription of the human c-Src promoter is dependent on Spl, a novel pyrimidine binding factor SPy, and can be inhibited by triplex-forming oligonucleotides. // J Biol Chem 275:2. P. 847-854.

200. Roos, M.D., K. Su, J.R. Baker, and J.E. Kudlow. (1997). О glycosylation of an Spl-derived peptide blocks known Spl protein interactions. // Mol Cell Biol 17:11. P.6472-6480.

201. Rotheneder, H., S. Geymayer, and E. Haidweger. (1999). Transcription factors of the Spl family: interaction with E2F and regulation of the murine thymidine kinase promoter. IIJ Mol Biol 293:5. P.1005-1015.

202. Roy A.L. and Roeder R.G. (1994). Initiator element binding protein TFII-I: a tale of two sites. // Indian Journal of Biochemistry & Biophysics 31 P.14-19.

203. Rupprecht H.D., Drummond J.A., Madden S.L., and et al. (1994). The Wilms' tumor suppressor gene Wtl is negatively autoregulated. // J Biol Chem 269:8. P.6198-6206.

204. Russo M.W., Matheny C., and Milbrandt J. (1993). Transcriptional activity of the zinc finger protein NGFI-A is influenced by its interaction with a cellular factor. // Mol.Cell.Biol. 13. P.6858-6865.

205. Russo M.W., Sevetson B.R., and Milbrandt J. (1995). Identification of NAB1, a repressor of NGFI-A- and Krox20-mediated transcription. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:15. P.6873-6877.

206. Ryu, S., S. Zhou, A.G. Ladurner, and R. Tjian. (1999). The transcriptional cofactor complex CRSP is required for activity of the enhancer-binding protein Spl. H Nature 397:6718. P.446-450.

207. Sakai, J., A. Hoshino, S. Takahashi, et al. (1994). Structure, chromosome location, and expression of the human very low density lipoprotein receptor gene. // J Biol Chem 269:3. P.2173-2182.

208. Sakai, J. and T. Yamamoto. (1994). VLDL receptor. // Nippon Rinsho 52:12. P.3184-3190.

209. Saluja, D., M.F. Vassallo, and N. Tanese. (1998). Distinct subdomains of human TAFII130 are required for interactions with glutamine-rich transcriptional activators. // Mol Cell Biol 18:10. P.5734-5743.

210. Schneider-Maunoury S., Topilko P., Seitandou Т., et al. (1993). Disruption of Krox-20 results in alteration of rhombomeres 3 and 5 in the developing hindbrain. // Cell 75. P.l 199-1214.

211. Schreiber E., Matthias P., Muller M.M., and Schaffner W. (1989). Rapid detection of octamer binding proteins with "mini-extracts", prepared from small number of cells. I/ Nucleic Acids Research 17. P.6419

212. Scouten W.H. Affinity chromatography : Bioselective adsoption on inert matrices. Wiley:Y.1981

213. Shi Y. and Berg J.M. (1996). DNA unwinding induced by zinc finger protein binding. // Biochemistry 35. P.3845-3848.

214. Shimada, M., Y. Konishi: Ohkawa, et al. (1999). Distribution of AP-2 subtypes in the adult mouse brain. // Neurosci Res 33:4. P.275-280.

215. Soares, K., D.Y. Hwang, R. Ramakrishnan, et al. (1996). cis-acting elements involved in transcriptional regulation of the herpes simplex virus type 1 latency-associated promoter 1 (LAP1) in vitro and in vivo. // J Virol 70:8. P.5384-5394.

216. Sogawa K., Imataka H., Yamasaki Y., et al. (1993). cDNA cloning and transcriptional properties of a novel GC box-binding protein, BTEB2. // Nucleic Acids Research 21. P.1527-1532.

217. Song, J., M. Mangold, G. Suske, et al. (2001). Characterization and promoter analysis of the mouse gene for transcription factor Sp4. // Gene 264:1. P.19-27.

218. Song, J., H. Ugai, I. Kanazawa, et al. (2001). Independent repression of a GC-rich housekeeping gene by Spl and MAZ involves the same cis-elements. // J Biol Chem 276:23. P.19897-19904.

219. Spencer, V.A. and J.R. Davie. (1999). Role of covalent modifications of histones in regulating gene expression. // Gene 240:1. P.1-12.

220. St-Arnaud R. and Moir J.M. (1993). Wnt-1-inducing factor-1: a novel G/C box-binding transcription factor regulating the expression of Wnt-1 during neuroectodermal differentiation. // Mol.Cell.Biol. 13:3. P.1590-1598.

221. Strobl, L.J. and S. Zimber. (2001). Magnetic DNA affinity purification of a cellular transcription factor. // Methods Mol Biol 174. P.271-277.

222. Suggs S.V., Katzowitz J.L., Tsai-Morris C., and Sukhatme V.P. (1990). cDNA sequence of the human cellular early growth response gene Egr-1. // Nucleic Acids Research 18. p.4283

223. Sukhatme Y.P., Cao X.M., Chang L.C., et al. (1988). A zinc finger-encoding gene coregulated with c-fos during growth and differentiation, and after cellular depolarization. II Cell53. P.37-43.

224. Suske, G. (1999). The Sp-family of transcription factors. // Gene 238:2. P.291-300.

225. Sutherland, G.R. (1979). Heritable fragile sites on human chromosomes I. Factors affecting expression in lymphocyte culture. II Am J Hum Genet 31. P. 125-135.

226. Swain, M.G. and N.W. Ross. (1995). A silver stain protocol for proteins yielding high resolution and transparent background in sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gels. // Electrophoresis 16. P.948-951.

227. Swiatek P.J. and Gridley T. (1993). Perinatal lethality and defects in hidbrain development in mice homozygous for a target mutation of the zinc finger gene Krox 20. // Genes&Dev. 7:11. P.2071-2084.

228. Takahashi, S., Y. Kawarabayasi, T. Nakai, et al. (1992). Rabbit very low density lipoprotein receptor: a low density lipoprotein receptor-like protein with distinct ligand specificity. // Proc Natl Acad Sci USA 89:19. P.9252-9256.

229. Tanese N., Saluja D., Vassallo M.F., et al. (1996). Molecular cloning and analysis of two subunits of the human TFIID complex: hTAFiil30 and hTAFiilOO. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93. P. 13611-13616.

230. Thornborrow, E.C. and J.J. Manfredi. (2001). The tumor suppressor protein p53 requires a cofactor to activate transcriptionally the human BAX promoter. // J Biol Chem 276:19. P. 15598-15608.

231. Thottassery, J.V., D. Sun, G.P. Zambetti, et al. (1999). Spl and egr-1 have opposing effects on the regulation of the rat Pgp2/mdrlb gene. // J Biol Chem 274:5. P.3199-3206.

232. Tiebel, О., К. Oka, K. Robinson, et al. (1999). Mouse very low-density lipoprotein receptor (VLDLR): gene structure, tissue-specific expression and dietary and developmental regulation. II Atherosclerosis 145:2. P.239-251.

233. Timchenko, L.T. and C.T. Caskey. (1999). Triplet repeat disorders: discussion of molecular mechanisms. // Cell Mol Life Sci 55:11. P. 1432-1447.

234. Tsai-Morris C.H., Cao X.M., and Sukhatme V.P. (1988). 5' flanking sequence and genomic structure of Egr-1, a murine mitogen inducible zinc finger encoding gene. // Nucleic Acids Research 16. P.8835-8846.

235. Usheva A.A. and Shenk T. (1996). YY1 transcriptional initiator: Protein interactions and association with a DNA site containing unpaired strands. II Proc.Natl.Acad.Sci. USA 93. P.13571-13576.

236. Vaziri D. and K. Liang. (1997). Down-regulation of VLDL receptor expression in chronic experimental renal failure. I/ Kidney Int 51:3. P.913-919.

237. Vergeer, W.P., J.M. Sogo. P.J. Pretorius, and V. de. (2000). Interaction of Apl, Ap2, and Spl with the regulatory regions of the human pro-alphal(I) collagen gene. // Arch Biochem Biophys 377:1. P.69-79.

238. Vesque C. and Charnay P. (1992). Mapping functional regions of the segment-specific transcription factor Krox-20. // Nucleic Acids Research 20. P.2485-2492.

239. Wang Z.Y., Qiu Q.Q., and Deuel T.F. (1993). The Wilms' tumor gene product WT1 activates or suppresses transcription through separate functional domains. // J Biol Chem 268:13.P.9172-9175.

240. Wang, W., L. Dong, B. Saville, and S. Safe. (1999). Transcriptional activation of E2F1 gene expression by 17beta-estradiol in MCF-7 cells is regulated by NF-Y-Spl/estrogen receptor interactions. // Mol Endocrinol 13:8. P.1373-1387.

241. Wang, Z.-Y., Qiu Q.Q., K.T. Enger, and T.F. Deuel. (1993). A second transcriptionally active DNA-binding site for the Wilms tumor gene product, wtl. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:19 P.8896-8900.

242. Waters C.M., Hancock D.C., and Evan G.I. (1990). Identification and characterisation of the egr-1 gene product as an inducible, short-lived, nuclear phosphoprotein. // Oncogene 5 P.669-674.

243. Webb, J.C., D.D. Patel, M.D. Jones, et al. (1994). Characterization and tissue-specific expression of the human 'very low density lipoprotein (VLDL) receptor' mRNA. // Hum Mol Genet 3:4. P. 531-537.

244. Weis, L. and D. Reinberg. (1997). Accurate positioning of RNA polymerase II on a natural TATA-less promoter is independent of TATA-binding-protein-associated factors and initiator-binding proteins. H Mol Cell Biol 17:6. P.2973-2984.

245. Wilkinson D.G., Bhatt S., Chavrier P., et al. (1989). Segment-specific expression of a zinc-finger gene in the developing nervous system of the mouse. // Nature 337 P.461-464.

246. Williams T. (1988). Cloning and expression of AP-2, a cell-type-specific transcription factor that activates inducible enchancer elements. // Genes Dev. 2 P. 1557-1569.

247. Williams T. and Tjian R. (1991). Analysis of the DNA binding and activation properties of the human transcription factor AP2. // Genes&Dev. 5 P.670-682.

248. Wingender, E., X. Chen, R. Hehl, et al. (2000). TRANSFAC: an integrated system for gene expression regulation. // Nucleic Acids Res 28:1. P.316-319.

249. Wingender, E., X. Chen, E. Fricke, et al. (2001). The TRANSFAC system on gene expression regulation. II Nucleic Acids Res 29:1. P.281-283.

250. Wolner, B.S. and J.D. Gralla. (2000). Roles for non-TATA core promoter sequences in transcription and factor binding. H Mol Cell Biol 20:10. P.3608-3615.

251. Wu, X.:H. Bishopric, D.J. Discher, et al. (1996). Physical and functional sensitivity of zinc finger transcription factors to redox change. // Mol Cell Biol 16:3. P. 1035-1046.

252. Yamagata, T. (1999). FRAXE mental retardation. // Nippon Rinsho 57:4. P.955-959.

253. Yamauchi, M., S. Tsuji, K. Mita, et al. (2000). A novel minisatellite repeat expansion identified at FRA16B in a Japanese carrier. // Genes Genet Syst 75:3. P.149-154.98

254. Yang-Yen H.-F., Chambard I.-L., and et al. (1990). Transcriptional interference between c-Jun and glucocorticoid receptor: mutual inhibition of DNA-binding due to direct protein-protein interection. // Cell 62 P.1205-1215.

255. Yang W.-M., Inouye С., Вearss D., and Seto E. (1996). Transcriptional repression by YY1 is mediated by interaction with a mammalian homolog of the yeast global regulator RPD3. // Proc.Natl.Acad.Sci. USA 93 P. 12845-12850.

256. Yeh W.C., Hou J., and McKnight S.L. (1996). Purification and characterization of gene-specific transcription factors: C/EBP, GABP, and IL-4 stat. // Methods Enzymol. 274 P.101-112.

257. Yu, A., M.D. Barron, R.M. Romero, et al. (1997). At physiological pH, d(CCG)15 forms a hairpin containing protonated cytosines and a distorted helix. // Biochemistry 36:12. P.3687-3699.

258. Zerler M., Christy R.J., and Uang R.C.C. (1992). Nuclear protein binding to the 5'-enhancer region of the intracisternal particle long terminal repeat. II J Biol Chem 267:29 P.21200-21206.

259. Zhao, Y., W. Cheng, C.L. Gibb, et al. (1996). HMG box proteins interact with multiple tandemly repeated (GCC)n (GGC)m DNA sequences. // J Biomol Struct Dyn 14:2. P.235-238.

260. Zhou, T. and C.M. Chiang. (2001). The intronless and tata-less human tafii55 gene contains a functional initiator and a downstream promoter element. // J Biol Chem 276:27. P.25503-25511.

261. Zhu Q.S., Heisterkamp N., and Groffen J. (1990). Unique organization of the human BCR gene promoter. // Nucleic Acids Research 18 P.7119-7125.