Характеристика нового ЦИС - элемента регуляции транскрипции генов млекопитающих вида (GCC)4 тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Орлов, Сергей Владимирович

• Орлов, Сергей Владимирович
• кандидат биологических наук
• 1999

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Орлов, Сергей Владимирович

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

1. ВВЕДЕНИЕ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- «

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1. Основные понятия об инициации траскрипции генов эукариот РЖ-полимеразой П.

2.2. сайг-сшщфические транскрипционные факторы.

2.3. ДНК-связьюающие белки, юаимодействующие с gc-богатыми цис-элементами.

2.3.1. Белки семейства Spl.

2.3.2. Белки семейства Egrl.

2.3:3. Белки семейства АР-2.

2.3.4. Белок CCGBP-20.

2.4. Структурно-функциональные свойства протяженных повтоюв (GCC\.

2.5. Промотор rpL32.

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.—

3.1. Материалы исследования.

3.2. Плазмйды.

3.3. Генно-инженерное конструирование.

3.4. Получение ядерных экстрактов.

3.5. Гель-ретардация.

3.6. лигандныйблоттинг.

3.7. Аффинная хроматография ядерных белков.

3.8. Препаративная гель-ретардация.

3.9. Генетическая трансформация клеток и анализ продуктов экспрессии генов-репортеров.

3.10. Выделение РНК и реакция обратной транскрипции.

3.11. полимеразная цепная реакция (PCR).*.

4. РЕЗУЛЬТАТЫ

4.1. GCC-элеменг промотора RPL32 специфически взаимодействует с ядерными белками мыши и человека.

4.2. область промотора гена RPL32 (-24. +11) содержит композитный цис-элеменг, состоящий из GCC-элемента (-19. .-4) иполипиримидиновогоблока (-4. .+11).

4.3. взаимодействие фрагмента промотора гена rpl32 (-24.+11) с ядерными белками тканеспецифично.

4.4. взаимодействие фрагмента промотора RPL32 (-24.+11) с ядерными белками фибюбластов легкого человека и клеток HEPG2 зависит от ионов ZN2+.

4.5. В состав ДНК-бежового комплекса, образуемого фрагментом промотораRPL32 (-24. .+11), входит несколько белков.

4.6. GCC-элемент может действовать как позитивный или негативный регулятор транскрипции в зависимости от его локализации относительно других регуляторных последовательностей.

4.7. GCC-фактор проявляет перекрестную специфичность с факторами семейства egr но не с белками группы SpI.

4.8. ДНК-связывающий белок CCGBP-20 угнетает активность промотора гена RPL32. ген CCGBP-20 экспрессируется в клетках HELA и HEPG2, но не активен в фибробластах легкого человека.

5. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

6. ВЫВОДЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Характеристика нового ЦИС - элемента регуляции транскрипции генов млекопитающих вида (GCC)4»

Актуальность проблемы Регуляция экспрессии генов эукариот в значительной мере осуществляется на стадии транскрипции, затрагивая отдельные гены, группы или множества генов, обусловливающих жизнедеятельность клеток на разных стадиях клеточного цикла, в процессах клеточной дифференецировки, морфогенеза и физиологической активности организма. Согласно современным представлениям, наиболее значимым уровнем регуляции транскрипции генов является инициация транскрипции.

Основными механизмами регуляции инициации транскрипции являются взаимодействия факторов белковой природы (транскрипционных факторов) со специфическими последовательностями ДНК (цис-элементами) в составе регуляторных районов генов (Mitchell P.J., 1989; Latchman D.S., 1991), изменение степени метилирования ДНК, в особенности промоторных областей (Bird А., 1992; Razin А., 1998), а также изменения структуры хроматина, связанные с модификациями гистонов (Steger D., 1998; Brownell J.E., 1996; Turner В.М., 1995). Детальный анализ модульной структуры регуляторных районов эукариотических генов является лидирующим направлением в изучении механизмов регуляции генной экспрессии. Работа в этом направлении, в значительной степени, сводится к выявлению цис-элементов, взаимодействующих с отдельными белками - факторами регуляции транскрипции, характеристике этих факторов, клонированию и изучению кодирующих эти факторы генов (Mitchell P.J., 1989). Описаны сотни факторов регуляции транскрипции (Вингендер Э., 1997), интенсивно ведутся поиски новых. Значительное внимание уделяется ДНК-белковым и белок-белковым взаимодействиям соответственно между цис-элементами в составе промоторов, энхансеров и транскрипционными факторами или между совместно связывающимися с ДНК факторами транскрипции (Carey М., 1998). Исследования в этой области привели к возникновению представлений об иерар-хичной организации цис-элементов в регуляторных районах генов эукариот. Близко расположенные сайты связывания транскрипционных факторов объединены в композитные цис-элементы, которые, в свою очередь, формируют энхансерные или промоторные области (Kel O.V., 1995). В связи с вышесказанным, весьма актуальным представляется поиск и описание новых цис-элементов эукариот, изучение транскрипционных факторов, взаимодействующих с ними, а также выяснение их возможного вклада в функционирование композитных цис-элементов в составе регуляторных областей генов, транскрибируемых РНК-полимеразой II.

Существенный прогресс в разработке алгоритмов компьтерного анализа последовательностей ДНК и накопление значительного объема известных нуклеотидных последовательностей в базах данных Gen bank и EMBL data base привели к появлению новых методов поиска и изучения регуляторных районов генов на основе статистического анализа их нуклеотидных последовательностей (Prestridge D. S., 1995; Prestridge D. S., 1996). Активность выявленных таким образом потенциальных цис-элементов необходимо подтверждать экспериментальными методами.

В результате компьютерного анализа банков генов приматов, грызунов и вирусов (EMBL data base, 1993, 1997) в регуляторных областях ряда генов млекопитающих и вирусов семейства Herpesviridae обнаружены триплетные повторы (GCC)n, где п=3-30, что позволило рассматривать последовательности (GCC)34 как потенциальные цис-элементы (GCC-элементы), способные взаимодействовать с ядерными белками млекопитающих и модулировать транскрипцию генов-мишеней (Perevozchikov А., 1993; Golubev D.B., 1996).

Дели и задачи исследования. Целью настоящей работы является изучение триплетных повторов (GCC)n (п>3) как цис-элементов регуляции транскрипции, а также исследование ядерных белков человека и мыши, способных специфично взаимодействовать с последовательностями (GCC)34- В качестве объекта экспериментальных исследований GCC-элемента выбран промотор гена рибосомного белка мыши L32 (rpL32), содержащий последовательность GC(GCC)4 вблизи точки инициации транскрипции (-19.-4) (см. обзор литературы).

Для достижения поставленной цели следовало решить следующие задачи:

1. Показать способность потенциального GCC-элемента промотора гена rpL32 связываться с ядерными белками мыши и человека и изучить роль контекстных последовательностей при этих взаимодействиях. Проанализировать белок-связывающие свойства GCC-элемента в сравнении с уже известными гомологичными цис-элементами для факторов транскрипции семейств Egr/Wtl и Spl.

2. Выявить функциональную активность GCC-элемента в регуляции транскрипции в зависимости от его локализации относительно других регуляторных участков.

3. Охарактеризовать белки, взаимодействующие с GCC-элементом промотора гена tpL32. Изучить их распределение в тканях млекопитающих

Основные положения, выносимые на защиту

1. В промоторе гена рибосомного белка мыши Ь32 идентифицирован и охарактеризован дис-элемент вида (ОСС)4, взаимодействующий с ядерными белками клеток млекопитающих и являющийся функционально активным в регуляции транскрипции.

2. Промотор гена грЬ32 содержит композитный цис-элемент в области -24.+11 н. п. относительно точки инициации транскрипции, состоящий из (ЮС-элемента и полипи-римидинового блока.

3. Охарактеризованы ядерные белки млекопитающих, взаимодействующие с композитным цис-элементом промотора грЬ32. Полученные данные свидетельствуют, что по меньшей мере, некоторые из них (<ХХЗВР-20), являются факторами транскрипции, специфически взаимодействующими с (ЗСС-элементом, и модулирующими транскрипцию с промоторов, содержащих этот элемент.

Научная новизна работы. Впервые показана функциональная активность последовательностей ((ЗСС)34 как цис-элементов регуляции транскрипции в клетках млекопитающих. В промоторе гена гр!32 охарактеризован композитный цис-элемент синергичного типа, состоящий из (ЮС-элемента и полипиримидиновой последовательности. Получены данные о ядерных белках, взаимодействующих с вСС-элементами. Изучено тканеспецифическое распределение белков, взаимодействующих с композитным цис-элементом промотора грЬ32. Полученные результаты указывают на существование в клетках человека, по меньшей мере, нескольких белков (СХХтВР-20 и др.), которые специфически взаимодействуют с триплетными повторами (СгСС)п и модулируют активность промоторов, содержащие эти триплетные повторы. Теоретическое и практическое значение работы. Изучение ДНК-белковых взаимодействий между ядерными белками млекопитающих и промотором гена грЬ32 позволило описать новые ОС-богатый и полипиримидиновый элементы регуляции транскрипции, образующие в промоторе гена грЬ32 композитный цис-элемент вблизи точки инициации транскрипции. Показана зависимость транскрипционных эффектов, опосредуемых (ЗСС-элементом, от его локализации относительно других регуляторных последовательностей. Полученные данные являются существенным вкладом в представления о роли кооперативных белок-белковых взаиодействий между транскрипционными факторами, связывающимися с близко расположенными регуляторными последовательностями, в формировании интегрального 6 транскрипционного ответа. Локализация вСС-элемента в регуляторных районах ряда генов человека указывает на возможное участие белков, взаимодействующих с СгСС-элементом, в координированной регуляции экспрессии этих генов.

Для выделения исследуемых ДНК-белковых комплексов предложен метод, основанный на последовательном применении аффинной хроматографии на ДНК-сорбенте и препаративной гель-ретардации. Данный подход является оригинальным и может быть рекомендован для выделения других-ДНК-связывающих белков.

Материалы диссертации используются в курсах лекций для магистрантов биолого-почвенного факультета Санкт-Петербургского государственного университета.

2. Обзор литературы

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Орлов, Сергей Владимирович

6. Выводы

1. В промоторе гена грЬ32 мыши идентифицирован новый ОС-богатый цис-элемент, вида (ОСС)4, отличающийся от известных цис-элементов регуляции транскрипции млекопитающих.

2. Установлено, что участок промотора гена грЬ32 -24.+11 н. п. относительно точки инициации транскрипции представляет собой композитный цис-элемент, состоящий из ОСС-элемента и полипиримидинового блока.

3. Выявлено тканеспецифическое распределение ядерных белков человека и мыши, взаимодействующих с участком промотора гена грЬ32 (-24.+11).

4. Показано, что ДНК-связьгоающая активность ядерных белков человека, взаимодействующих с фрагментом промотора грЬ32, зависит от ионов Ъй*.

5. Определены молекулярные массы ядерных белков из различных клеточных линий человека, взаимодействующих с участком промотора грЬ32 (-24 .+11). Показано, что в клетках НеЬа с ОСС-элементом взаимодействует белок молекулярной массой 18-20 кД.

6. Установлено, что ОСС-элемент действует как активатор или репрессор транскрипции в зависимости от локализации относительно других регуляторных районов генов. В промоторе грЬ32 ОСС-элемент функционирует как позитивный регулятор транскрипции.

7. Показано, что белок ССОВР-20 проявляет свойства фактора транскрипции и угнетает активность промотора гена грЬ32 в клетках мыши (№Н ЗТЗ) и человека (Нер02).

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Орлов, Сергей Владимирович, 1999 год

1. Вингендер Э. 1997. Классификация транскрипционных факторов. Молекулярная Биология 31, N.4:584-600.

2. Горман К. 1988. Высокоэффективный перенос генов в клетки млекопитающих, С. 403-463, в книге Клонирование ДНК, под ред. Д. Гловера, М. Мир, 1988.

3. Дин П., Джонсон В, Мидл Ф. Аффинная хроматография, методы. М. Мир, 1988.

4. Досон Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонс К. Справочник биохимика. М. Мир, 1991.

5. Маниатис Т., Френч Э., and Сембрук Дж. Молекулярное клонирование. М. Мир, 1984.

6. Орлов C.B., Кутейкин К.Б., Курышев В.Ю., Диже Э.Б., Перевозчиков А.П.

7. Характеристика нового GC-элемента в регуляторных районах гена аполипопро-теина A-I человека и гена рибосомного белка L32 мыши. // 2-й Симпозиум «Ли-попротеиды и атеросклероз», тезисы докладов, Санкт-Петербург, 1995, С. 74.

8. Федоров СЛ., Татосян А.Г., Смирнова Т.А., Калиновский В.П., Князев П.Г., Сейц И.Ф. 1984. Выделение неинтегрированных форм провирусной ДНК онкогенных вирусов методом препаративного электрофореза. Экспериментальная онкология 6, N.2:39-41.

9. Agellon L.B., Zhang P., Jiang С., et al. 1992. The CCAAT/enhancer binding protein trans-activates the human cholesteryl ester transfer protein gene promoter. Journal of Biological Chemistry 267, N.31:22336-22339.

10. Alam J., Zhining D. 1992. Distal API binding sites mediate basal level enhancement and TPA induction of the mouse heme oxygenase-1 gene. Journal of Biological Chemistry 267, N.30:21894-21900.

11. Amin C., Wagner A.J., Hay N. 1993. Sequence-specific transcriptional activation by Мус and repression by Max. Mol.Cell.Biol. 13, N.1:383-390.

12. Andrews N.C., Falier D.V. 1991. A rapid micropreparation technique for extraction of DNA binding proteins from limiting numbers of mammalian cells. Nucleic Acids Research 19, N.9:2499

13. Angel P., Ymagawa M., et al. 1987. Phorbol ester inducible genes contain a common cis-element recognized by a TPA-modulated trans-acting factor. Cell 49:729-739.

14. Ashley C.T., Warren S.T. 1995. Trinucleotide repeat expansion and human disease. Ann.Rev.Genet. 29:703-728.

15. Atchson M.L., Meyuhas O., Perry R. 1989. Localization of transcriptional regulatory elements and nuclear factor binding sites in mouse ribosomal protein gene rpL32. Mol.Cell.Biol. 9, N.5:2067-2074.

16. Ben-Hattar J., Beard P., Jiricny J. 1989. Cytosine methylation in CTF and Spl recognition sites of an HSV tk promoter, effects on transcription in vivo and on factor binding in vitro. Nucleic Acids Research 17:10179-10190.

17. Bickmore W.A., Oghene 1С, Little M.H., et al. 1992. Modulation of DNA binding specificity by alternative splicing of the Wilms' tumor wtl gene transcript. Science 257:235-237.

18. Bird A. 1992. The essentials of DNA methylation. Cell 70:5-8.

19. Brandeis M., Frank D., Keshet I., Siegfried Z., et al. 1994. Spl elements protect a CpG island from de novo methylation. Nature 371:435-438.

20. Briggs M. R., Kadonaga J. Т., Bell S. P., Tjian R. 1986. Purification and biochemical characterization of the promoter- specific transcription factor, Spl. Science 234:47-52.

21. Brownell J.E. 1996. Linking histone acetylation to chromatin assembly and gene activation. Curr.Opin.Genet.Dev. 6:176-184.

22. C.Kingsley, A.Winoto. 1992. Cloning of GT-box binding protein: a novel Spl multigene family regulating T-cell receptor gene expression. Mol.Cell.Biol. 12, N.10:4251-4261.

23. Call KM., Glaser T., Ito C.Y., Buckler A.J., et aL 1990. Isolation and characterization of a zinc finger polypeptide gene at the human chromosome 11 Wilms'tumor locus. Cell 60:509-520.

24. Cao X.M., Koski R.A., Gashler A., McKiernan M., et aL 1990. Identification and characterization of the Egr-1 gene product, a DNA-binding zinc finger protein induced by differentiation and growth signals. Mol.Cell.Biol. 10:1931-1939.

25. Carey M. 1998. The enhanceosome and transcriptional synergy. Cell 92:5-8.

26. Caskey C.T., Pizzyti A., Fu Y.-H., et al. 1992. Triplet repeat mutations in human diease. Science 256, N.8:784-789.

27. Chavrier P., Zerial M., Lemaire P., Almendral J., et al. 1988. A gene encoding a protein with zinc fingers is activated during G0/G1 transition in cultured cells. EMBO J. 7:29-35.

28. Chen J.-L., Attardi L.D., Verrijzer C.P., Yokomori K., et al. 1995. Assembly of recombinant TFHD reveals differential coactivator requirements for distinct transcriptional activators. Cell 79, N.1:93-105.

29. Chen H., Li B., Workman J. L. 1994. A histone-binding protein, nucleoplasmin, stimulates transcription factor binding to nucleosomes and factor-induced nucleosome disassembly. EMBO J. 13:380-390.

30. Chen X., Mariappan S. V., Catasti P., Ratliff R., et al. 1995. Hairpins are formed by the single DNA strands of the fragile X triplet repeats: structure and biological implications. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 92:5199-5203.

31. Chiang C. M., Roeder R. G. 1995. Cloning of an intrinsic human TFIID subunit that interacts with multiple transcriptional activators. Science 267:531-536.

32. Chiang S. Y., Welch J. J., Rauscher F. J. 3., Beerman T. A. 1996. Effect of DNA-binding drugs on early growth response factor-1 and TATA box-binding protein complex formation with the herpes simplex virus latency promoter. J Biol Chem 271:23999-24004.

33. Christy B., Nathans D. 1989. Functional serum response elements upstream of the growth factor-inducible gene zif268. Mbl.Cell.Biol. 9:4889-4895.

34. Christy B.A., Lau L.F., Nathans D. 1988. A gene activated in mouse 3T3 cells by serum growth factors encodes a protein with "zinc finger" sequences. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:7857-7861.

35. Chung S., Perry R. 1989. Importance of introns for expression of mouse ribosomal protein gene rpL32. Mol.Cell.Biol. 9, N.5:2075-2082.

36. Corden J.L. 1990. Tails of RNA polymerase II. Trends Biochem.Sci. 15:383-387.

37. Courey A.J., Tjian R. 1988. Analysis of Spl in vivo reveals multiple transcriptional domains including a novel glutamine-rich activation motif. Cell 55:887-898.

38. Crosby S.D., Puetz J.J., Simburger K.S., Fahrner T.J., et al. 1991. The early response gene NGFI-C encodes a zinc finger transcriptional activator and is a member of the GCGGGGGCG (GSG) element-binding protein family. Mol.Cell.Biol. 11:38353841.

39. Currie R.A., Eckler R.IL 1992. Characterization of a high affinity octamer transcriptional factor binding site in the human lipoprotein lipase promoter. Archives of Biochemistry and Biophysics 298, N.2:630-639.

40. Darlow J. M., Leach D. R. 1998. Evidence for two preferred hairpin folding patterns in d(CGG).d(CCG) repeat tracts in vivo. J.Mol.Biol. 275:17-23.

41. Darlow J. M., Leach D. R. 1998b. Evidence for two preferred hairpin folding patterns in d(CGG).d(CCG) repeat tracts in vivo. J Mol Biol 275:17-23.

42. Darlow J. M., Leach D. R. 1998a. Secondary structures in d(CGG) and d(CCG) repeat tracts. J Mol Biol 275:3-16.

43. Day M.L., Fahrner T.J., Aykent S., Milbrandt J. 1990. The zinc finger protein NGFI-A exists in both nuclear and cytoplasmic forms in nerve growth factor-stimulated PC12 cells. Journal of Biological Chemistry 265:15253-15260.

44. Deissler H., Behn-Krappa A., Doerfler W. 1996. Purification of nuclear proteins from human HeLa cells that bind specifically to the unstable tandem repeat (CGG)n in the human FMR1 gene. Journal of Biological Chemistry 271, N.8:4327-4334.

45. Deseombes P., Schibler H. 1990. A liver-enriched transcriptional inhibitory protein, LIP, are translated from the same mRNA. Cell 67, N.3:569-580.

46. Deshamps B.J., Lawless D.E., Carr F.E., Wang C.W. 1992. Rat hepatonuclear factor PS1 regulates tissue-specific activity of the S14 promoter in vitro. Journal of Biological Chemistry 267, N.35:25167-25171.

47. Diamond F.C., Miner I.N., Yoshimaga S.K., Yamamoto K.R. 1990. Transcription factor interactions: selectors if positive or negative regulation from a single DNA element. Science 249:1266-1272.

48. Donaldson L.W., Petersen J.M., Graves B.J., et al. 1994. Secondary structure of the ETS domain places murine Ets-1 in the superfamily of winged helix-turn-helix DNA-binding proteins. Biochemistry 33, N.46:13509-13516.

49. Dudov K., Perry R. 1984. The gene family encoding the mouse ribosomal protein L32 contains a uniquely expressed intron-containing gene and unmutated processed gene. Cell 37, N.6:457-468.

50. Dudov K., Perry R. 1986. Properties of a mouse ribosomal protein promoter. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83, N.12:8545-8549.

51. Dynan W.S. 1983. Promoters for housekeeping genes. Trends Genet. 2:196-197.

52. Dynan W.S., Tjian R, 1983. The promoter-specific transcription factor Spl binds to upstream sequences in the SV40 early promoter. Cell 35:79-87.

53. Emili A., Greenblatt J., Ingles C. J. 1994. Species-specific interaction of the glutamine-rich activation domains of Spl with the TATA box-binding protein. Mol.Cell Biol. 14 :1582-1593.

54. Faisst S., Meyer S. 1992. Compilation of vertebrate encoded transcription factors. Nucleic Acids Research 20:3-26.

55. Farnham P.J., Schimke R.T. 1986. In vitro transcription and delimination of promoter elements of the murine dihydrofolate reductase gene. Mol.Cell.Biol. 6:23922401.

56. Felsenfeld G. 1992. Chromatin as an essetial part of transcriptional mechanism. Nature 355:219-224.

57. Flanagan J.R., Becker K.G., Ennist K.L., et al. 1992. Cloning of a negative transcription factor that binds to the lupstream conserveed region of Moloney murine leukemia virus. Mol.Cell.Biol. 12:38-44.

58. Fraizer G.C., Wu Y-J., Hewitt S.M., et al. 1994. Transcriptional regulation of the human Wilms' tumor gene (Wtl). Cell type-specific enhancer and promiscuous promoter. Journal of Biological Chemistry 269, N.12:8892-8900.

59. Fu Y. H., Kuhl D. P., Pizzuti A., Pieretti M., et al. 1991. Variation of the CGG repeat at the fragile X site results in genetic instability: resolution of the Sherman paradox. Cell 67:1047-1058.

60. Gashler A.L., Swaminathan S., Sukhatme V.P. 1993. A novel repression module, an extensive activation domain, and a bipartite nuclear localization signal defined in the immediate-early transcription factor Egr-1. Mol.Cell.Biol. 13:4556-4571.

61. Gashler, A. and V.P. Sukhatme. 1995. Early growth response protein 1 (Egr 1): prototype of a zinc-finger family of transcription factors., p. 191-224. In AnonymousProgress in nucleic acids research and molecular biology, Vol.50, academic press,

62. Gessler M., Poustka A., Caveiiee W., Neve R.L., et al. 1990. Homozygous deletion in Wilms tumours of a zinc-finger gene identified by chromosome jumping. Nature 343:774-778.

63. Gill G., Pascal E., Tseng Z. H., Tjian R. 1994. A glutamine-rich hydrophobic patch in transcription factor Spl contacts the dTAFIIl 10 component of the Drosophila TFHD complex and mediates transcriptional activation. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:192-196.

64. Godde J. S., Kass S. U., Hirst M. C., Wolffe A. P. 1996. Nucleosome assembly on methylated CGG triplet repeats in the fragile X mental retardation gene 1 promoter. J Biol Chem 271:24325-24328.

65. Golubev D.B., Perevozchikov A.P. 1996. The role of herpes virus in etiopathogenesis of atherosclerosis. Russian Medical Journal 1:8-15.

66. Haber D.A., Sohn R.L., Budkler A.J., Pelletier J., et al. 1991. Alternative splicing and genomic structure of the Wilms' tumor gene WT1. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:9618-9622.

67. Haeffler LP., Meyer T.E., Yun Y., et al. 1988. cAMP responsive DNA binding protein: structure based on a cloned placental cDNA. Science 242:1430-1432.

68. Hagen G., Mutter S., Beato M., Suske G. 1992. Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins: a family of Spl related genes. Nucleic Acids Research 20:5519-5525.

69. Hagen G., Denning J., Preib A., Beato M., et al. 1995. Functional analysis of the transcription factor Sp4 reveal properties distinct from Spl and Sp3. Journal of Biological Chemistry 270, N.42:24989-24994.

70. Hagen G., Muller S., Beato M., Suske G. 1994. Spl-mediated transcriptional activation is repressed by Sp3. EMBO J. 13:3843-3851.

71. Hamilton T. B., Barilla K. C., Romaniuk P. J. 1995. High affinity binding sites for the Wilms' tumour suppressor protein WT1. Nucleic.Acids.Res. 23:277-284.

72. Hansen R. S., Gartler S. M., Scott C. R., Chen S. H., et al. 1992. Methylation analysis of CGG sites in the CpG island of the human FMR1 gene. Hum Mol Genet 1:571-578.

73. Hariharan N., Kettey D.E., Perry R.P. 1991. d, a transcription factor that binds to downstream elements in several polymerase II promoters, is a functionally versatile zinc finger protein. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:9799-9803.

74. Harrington M.A., Jones P.A., Hasayashi I., Karin M. 1988. Cytosine methylation does not effect binding of transcription factor Sp-1. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:20662070.

75. Heitz D., Rousseau F., Devys D., Saccone S., et al. 1991. Isolation of sequences that span the fragile X and identification of a fragile X-related CpG island published erratum appears in Science 1991 Apr 26;252(5005):494., Science 251:1236-1239.

76. Herms J., Zurmohle U., Schlingensiepen R., Brysch W., et al. 1994. Developmental expression of the transcription factor zif268 in rat brain. Neurosci.Lett. 165:171-174.

77. Hewitt S. 1996. Differential function of Wilms' tumor gene WT1 splice isoforms in transcriptional regulation. Journal of Biological Chemistry 271 (15):8588-8592.

78. Hoeller M., Westin G., Jiricny J., Schaffner W. 1988. SP1 transcription factor binds DNA and activates transcription even when the binding site is CpG methylated. Genes&Dev. 2:1127-1135.

79. Hornstra L K., Nelson D. L., Warren S. T., Yang T. P. 1993. High resolution methylation analysis of the FMR1 gene trinucleotide repeat region in fragile X syndrome. Hum Mol Genet 2:1659-1665.

80. Huang H.-C., Sundseth R., Hansen Ü. 1990. Transcription factor LSF binds two variant bipartite sites within the SV40 late promoter. Genes&Dev. 4:287-298.

81. Huff V. 1994. Parental origin of WT1 mutations and mental retardation in WAGR syndrome. Nature Genetics 8, N.1:13-14.

82. Imataka H., Sogawa K., Yasumoto K,, Kikuchi Y., et al. 1992. Two regulatory proteins that bind to the basic transcription element (BTE), a GC box sequence in the promoter region of the rat P-4501Al gene. EMBO J. 11:3663-3671.

83. Imataka H., Nakayama K., Yasumoto K., Mizuno A., et al. 1994. Cell-specific translational control of transcription factor BTEB expression. The role of an upstream AUG in the 5'-untranslated region. J.Biol.Chem. 269:20668-20673.

84. Ionat C., Rahmsdorf H.I., Park K-K., et al. 1990. Antitumor promotion and antiinflammation: down-modulation of API (Fos/Jun) activity by glucocorticoid hormone. Cell 62:1189-1204.

85. Jackson S.P., Tjian R. 1988. O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. Cell 55:125-133.

86. Jackson S.P., Tjian R. 1989. Purification and analysis of RNA polymerase II transcription factors by using wheat germ agglutinin affinity chromatography. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:1781-1785.

87. Ji J., Clegg N. J., Peterson K. R., Jackson A. L., et al. 1996. In vitro expansion of GGC:GCC repeats: identification of the preferred strand of expansion. Nucleic Acids Res 24:2835-2840.

88. Johnson J. L., McLachlan A. 1994. Novel clustering of Spl transcription factor binding sites at the transcription initiation site of the human muscle phosphofractokinasePl promoter. Nucleic.Acids.Res. 22:5085-5092.

89. Jones C., Penny L., Mattina T., et al. 1995. Association of a chromosome deletion syndrome with a fragile site within the proto-oncogene CBL2. Nature 376, N.6536:145-149.

90. Joseph L.J., Le Beau M.M., Jamieson G.A., Acharya S., et al. 1988. Molecular cloning, sequencing, and mapping of EGR2, a human early growth response gene encoding a protein with "zinc-binding finger" structure. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:7164-7168.

91. Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., Tjian R. 1987. Isolation of cDNA encoding transcription factor Spl and functional analysis of the DNA binding domain. Cell 51:1079-1090.

92. Kadonaga J.T., Courey A.J., Ladika J., Tjian R. 1988. Distinct regions of Spl modulate DNA binding and transcriptional activation. Science 242:1566-1570.

93. Kageyama R., Merlino G.T., Pastan L 1989. Nuclear factor ETF specifically stimulates transcription from promoters without a TATA box. Journal of Biological Chemistry 264, N.26:15508-15514.

94. Kageyama R., Pastan I. 1989. Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that repress transcription. Cell 59, N.5:815-825.

95. Kaizumi S., Suzuki K., Otsuka F. 1992. A nuclear factor that recognizes the metal responsive elements of human metallothionein Ha gene. Journal of Biological Chemistry 267, N.26:18659-18664.

96. Kang S., Ohshima K., Shimizu M., Amirhaeri S., et al. 1995. Pausing of DNA synthesis in vitro at specific loci in CTG and CGG triplet repeats from human hereditary disease genes. J Biol Chem 270:27014-27021.

97. Karin M. 1991. Signal transduction and gene control. Current Opinion in Cell Biology 3:467-473.

98. Karlseder J. 1996. Interaction of Spl with growth- and cell cycle-regulated transcription factor E2F. Moll.Cell Biol. 16:1659-1667.

99. Keinberg J.A., Sariola H.» Loring J.H., et al. 1993. WT-1 is required for early kidney development. Cell 74:679-691.

100. Kel O.V., Romaschenko A.G., Kel A.E., Wingender E., et al. 1995. A compilation of composite regulatory elements affecting gene transcription in vertebrates. Nucleic Acids Research 23, N.20:4097-4103.

101. Kettani A., Kumar R. A., Patel D. J. 1995. Solution structure of a DNA quadruplex containing the fragile X syndrome triplet repeat. J Mol Biol 254:638-656.

102. Kikuchi Y., Sogawa K., Watanabe N., Kobayashi A., et al. 1996. Purification and characterization of the DNA-binding domain of BTEB, a GC box-binding transcription factor, expressed in Escherichia coli. JJBiochem. 119, N.2:309-313.

103. Knight S. J., Flannery A. V., Hirst M. C., Campbell L., et al. 1993. Trinucleotide repeat amplification and hypermethylation of a CpG island in FRAXE mental retardation. Cell 74:127-134.

104. Kobayashi A., et al. 1995. Analysis of functional domains of GC-box-binding protein, BTEB. J.Biochem. 117:91-95.

105. Koyano-Nakagawa N., Nishida J., Baldwin D., et al. 1994. Molecular cloning a novel human cDNA encoding a zinc finger protein that binds to the interlenkin-3 promoter. Mol.Cell.Biol. 14, N.8:5099-5107.

106. Kunsch C., Lang R. K., Rosen C. A., Shannon M. F. 1994. Synergistic transcriptional activation of the IL-8 gene by NF- kappa B p65 (RelA) and NF-IL-6. J Immunol 153:153-164.

107. Kutoh E., Schwander J. 1993. Sp-1 interacts with the consensus sequence for EGR-1 gene product with a cellular factor(s) and activates the transcription through this element. Biochemical and Biophysical Research Communications 194, N.3:1475-1482.

108. Laemmli U.K. 1970. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature 227:680-685.

109. Larsson S.H., Charlien J.-P., Migagawa K., Engelkamp D., et al. 1995. Subnuclear localization of WT1 in splicing or transcription factor domains is regulated by alternative splicing. Cell 81, N.3:391-401.

110. Latchutan D.S. 1991. Eukariotic transcription factors. Acad. Press., Cambridge.

111. Lavedan C., Grabczyk E., Usdin K., Nussbaum R. L. 1998. Long uninterrupted CGG repeats within the first exon of the human FMR1 gene are not intrinsically unstable in transgenic mice. Genomics 50:229-240.

112. Lavrovsky I., Schwartzman MX., Abraham N.G. 1993. Novel regulatory sites of the human heme oxygenase 1 promoter region. Biochemical and Biophysical Research Communications 196, N.1:336-341.

113. Lemaire P., Revelant O., Bravo R., Charnay P. 1988. Two mouse genes encoding potential transcription factors with identical DNA- binding domains are activated by growth factors in cultured cells. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:4691-4695.

114. Lemaire P., Vesque C., Schmitt J., Stunnenberg H., et at. 1990. The serum-inducible mouse gene Krox-24 encodes a sequence-specific transcriptional activator. Mol.Cell.Biol. 10, N.7:3456-3467.

115. Levi G., Topilko P., Schneider-Manoury S., Lasagna M., et al. 1996. Defective bone formation in Krox-20 mutant mice. Development 122, N.l: 113-120.

116. Li B., Adams C. C., Workman J. L. 1994. Nucleosome binding by the constitutive transcription factor Spl. J.Biol.Chem. 269:7756-7763.

117. Lim R.W., Varaum B.C., Herschman H.R. 1987. Cloning of tetradecanoyl phorbol ester-induced 'primary response' sequences and their expression in density-arrested Swiss 3T3 cells and a TPA non-proliferative variant. Oncogene 1:263-270.

118. Liu F., Green M.R. 1994. Promoter targeting by adenovirus E1A through interaction with different cellular DNA-binding domains. Nature 368:520-525.

119. Logan T., Pyre J., Hall D.J. 1993. Physical characteristics of a factor related to the c-myc/insulin promoter binding protein ZF87/PUR-1. Biochemical and Biophysical Research Communications 192, N.3:1204-1209.

120. Lucibello F.C., Slater E.P., Joass K.H., et al. 1990. Mutual transrepression of c-Fos and the glucocorticoid receptor involvement of a functional domain in Fos which in absent in FosB. EMBO J. 9:2827-2834.

121. Macleod D., Charlton J., Mullins J., Bird A. P. 1994. Spl sites in the mouse aprt gene promoter are required to prevent methylation of the CpG island. Genes Dev. 8:2282-2292.

122. Majello B., De Luca P., Hagen G-, Suske G., et al. 1994. Different members of the Spl multigene family exert opposite transcriptional regulation of the long terminal repeat of HIV-1. Nucleic.Acids.Res. 22:4914-4921.

123. Majello B., De Luca P., Suske G., Lania L. 1995. Differential transcriptional regulation of c-myc promoter through the same DNA binding sites targeted by Spl-like proteins. Oncogene 10:1841-1848.

124. Majumdar K. C., Shetty S., Wadhwa R., Bhaskar S., et al. 1996. Detection and purification of sequence-specific DNA binding protein. Anal.Biochem. 241:23-29.

125. Malik K.T.A., Poirier V., Ivins S.M., Brown K.W. 1994. Autoregulation of the human WT1 gene promoter. FEBS Letters 349, N.1:75-78.

126. Mariappan S. V., Catasti P., Chen X., Ratliff R., et al. 1996. Solution structures of the individual single strands of the fragile X DNA triplets (GCC)n.(GGC)n. Nucleic.Acids.Res. 24:784-792.

127. Masquilier D., Sassone-Corsi P. 1992. Transcriptional cross-talk: nuclear factors CREM and CREB bind to API sites and inhibit activation by Jun. Journal of Biological Chemistry 267, N31:22460-22466.

128. Milbrandt J. 1987. A nerve growth factor-induced gene encodes a possible transcriptional regulatory factor. Science 238:797-799.

129. Mitchell P.J., Timmons P.M. 1991. Transcriptin factor AP-2 is expressed in neural crest cell lineages during mous embriogenesis. Genes Dev. 5:105-119.

130. Mitchell P.J., Tjian R. 1989. Transcriptional regulation in mammalian cells by sequence- specific DNA binding proteins. Science 245:371-378.

131. Moffett P., Bruening W., Nakagama H., Bardeesy N., et al. 1995. Antagonism of WT1 activity by protein self-association. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92, N.24:11105-11109.

132. Montalvo E. A., Cottam M., Hill S., Wang Y. J. 1995. YY1 binds to and regulates cis-acting negative elements in the Epstein-Barr virus BZLF1 promoter. J.Virol. 69, N.7:4158-4165.

133. Morris J.F., Madden S.L., Tounay O.E., Cook D.M., et al. 1991. Characterization of the zinc finger protein encoded by the WT-1 Wilms' tumor locus. Oncogene 6, N.12:2339-2348.

134. Moser M., Imhof A., Pscherer A., Bauer R, et al. 1995. Cloning and characterization of a second AP-2 tanscription factor: AP-2 beta. Development 121, N.9:2779-2788.

135. Moura-Neto R., Dudov K., Perry R. 1989. An element downstream of the cap-site is required for transcription of the gene encoding mouse ribosomal protein L32. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:3997-4001.

136. Muller H.J., Skerka C., Bialonski A., Zipfel P.F. 1991. Clone pAT 133 identifies a gene that encodes another human member of a class of growth factor-induced genes with almost identical zinc-finger domains. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:10079-10083.

137. Murata Y., Kim H. G., Rogers K. T., Udvadia A. J., et al. 1994. Negative regulation of Spl trans-activation is correlated with the binding of cellular proteins to the amino terminus of the Spl trans-activation domain. J.Biol.Chem. 269:20674-20681.

138. Nagaoka M., Kuwahara J., Sugiura Y. 1993. Alteration of DNA binding specifity by nickel (II) substitution in three zinc(II) fingers of transcription factor Sp-1. Biochemical and Biophysical Research Communications 194, N.3:1515-1520.

139. Nakagama H., Heinrich G., Pelletier J., Housman D. E. 1995. Sequence and structural requirements for high-affinity DNA binding by the WT1 gene product. Mol.Cell.Biol. 15, N.3:1489-1498.

140. Nancarrow J. K., Kremer E., Holman K,, Eyre H., et al. 1994. Implications of FRA16A structure for the mechanism of chromosomal fragile site genesis. Science 264:1938-1941.

141. Nardelli J., Gibson T., Charnay P. 1992. Zinc finger-DNA recognition: analysis of base specificity by site-directed mutagenesis. Nucleic Acids Research 20:4137-4144.

142. Nardelli J., Gibson T.J., Vesque C., Charnay P. 1991. Base sequence discrimination by zinc-finger DNA-binding domains. Nature 349:175-178.

143. Nguyen H. Q., Hoffman Liebermann B., Liebermann D. A. 1993. The zinc finger transcription factor Egr-1 is essential for and restricts differentiation along the macrophage lineage. Cell 72:197-209.

144. NgY V., Laverrikre J.-N., Gourdji D. 1993. Binding capacity and cw-acting efficiency of DNA regulatory sequences can be distinguished in an in vivo competition assay. Nucleic Acids Res. 21:5795-5796.

145. Nicolas, R.H. and G.H. Goodwin. 1993. Purification and cloning of transcription factors, p. 81-104. In D.S. Latchman (ed.), Transcription factors. A practical approach. Oxford University Press, Oxford.

146. Oberl I., Rousseau F., Heitz D., Kretz C., et al. 1991. Instability of a 550-base pair DNA segment and abnormal methylation in fragile X syndrome. Science 252:10971102.

147. Oostra B. A., Hoogeveen A. T. 1997. Animal model for fragile X syndrome. Ann Med 29:563-567,

148. Oulad Abdelghani M., BouiUet P., Chazaud C., DollO P., et al. 1996. AP-2.2: a novel AP-2-related transcription factor induced by retinoic acid during differentiation of P19 embryonal carcinoma cells. Exp.Cell Res. 225:338-347.

149. Pardy K., Adan R.A.H., Carter D.A., et al. 1992. Identification of a cis-acting element involved in cyclic 3',5-adenosine monophosphate regulation of bovine vasopressin gene expression. Journal of Biological Chemistry 267, N.30:21746-21752.

150. Park K., Atchison M.L. 1991. Isolation of candidate repressor/activator, NF-E1 (YY1, d), that binds the immunoglobulin k 3'enhancer and the immunoglobulin heavy-chain m El site. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:9804-9808.

151. Parrish J. E., Oostra B. A,, Verkerk A. J., Richards C. S., et al. 1994. Isolation of a GCC repeat showing expansion in FRAXF, a fragile site distal to FRAXA and FRAXE see comments. Nat.Genet. 8:229-235.

152. Pascal E., Tjian R. 1991. Different activating domains of Spl govern formation of multimers and mediate transcriptional synergism. Genes&Dev. 5:1646-1656.

153. Patwardhan S., Gashler S., Siegel M„ Chang L., et al. 1991. EGR3, a novel member of the Egr family of genes encoding immediate-early transcription factors. Oncogene 6:917-928.

154. Pavletich N.P., Pabo C.O. 1990. Zinc finger DNA recognition: crystal structure of a zif268-DNA complex at 2.1 A. Science 252:809-817.

155. Perevozchikov A., Orlov S., and Golubev D. 1993. The homology of herpesviruses and human genes probably is involved in the formation of atherosclerotic plaques. IX Intern. Congress of Virology, Abstracts W12-4, Glasgow, Scotland, 8-13 August.

156. Persengiev S.P., Saffer J.D., Kilpatrick D.L. 1995. An alternatively spliced form of the transcription factor Spl containing only a single glutamine-rich transactivation domain. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92, N.20:9107-9111.

157. Pieretti M., Zhang F. P., Fu Y. H., Warren S. T., et al. 1991. Absence of expression of the FMR-1 gene in fragile X syndrome. Cell 66:817-822.

158. Pondel M.D., Murphy S., Pearson L., Craddock C., et al. 1995. Spl functions in a chromatin-dependent manner to augment human alpha-globin promoter activity. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92, N.16:7237-7241.

159. Postel E.H., Berberich S.J., Flint S.J., Ferrone C.A. 1993. Human c-myc transcription factor PuF identified as nm23-H2 nucleoside diphosphate kinase, a candidate suppressor of tumor metastasis. Science 261, N.5120:478-480.

160. Postel E.H., Mango S.E., Flint S.J. 1989. A nuclease-hypersensitive element of the human c-myc promoter interacts with a transcription initiation factor. Mol.Cell.Biol. 9, N.11:5123-5133.

161. Predki P. F., Sarkar B. 1992. Effect of replacement of zinc finger zinc on estrogen receptor DNA interactions. J Biol Chem 267:5842-5846.

162. Prestridge D. S. 1995. Predicting Pol II promoter sequences using transcription factor binding sites. J Mol Biol 249:923-932.

163. Prestridge D. S. 1996. SIGNAL SCAN 4.0: additional databases and sequence formats. Comput Appl Biosci 12:157-160.

164. Pritchard-Jones K., Fleming S., Davidson D., et al. 1990. The candidate Wilms' tumour gene is involved in genitourinary development. Nature 346:194-197.

165. Pugh B.F., Tjian R. 1990. Mechanism of transcriptional activation by Spl : evidence for coactivators. Cell 61:1187-1197.

166. Punturieri A., Shirakata Y., Bovolenta C., et al. 1993. Multiple cis-acting elements required for,proper transcription of the mouse V delta IT cell receptor promoter. J.Immunol. 150, N.1:139-150.

167. Raj G.V., Khalili K. 1994. Identification and characterization of a novel GCA/C-binding protein, GBP-i, that is rapidly inducible by cytokines. Mol.Cell.Biol. 14, N.12:7770-7781.

168. Rauscher HI F. J., Morris J. F., Tournay O. E., et aL 1990. Binding of the Wilms' tumor locus zinc finger protein to the EGR-1 consensus sequence. Science 250:259262.

169. Razin A. 1998. CpG methylation, chromatin structure and gene silencing-a three- way connection. EMBOJ 17:4905-4908.

170. Razin A. 1998. CpG methylation, chromatin structure and gene silencing a three-way connection. EMBO J. 17:4905-4908.

171. Richards R. L, Holman K., Yu S., Sutherland G. R. 1993. Fragile X syndrome unstable element, p(CCG)n, and other simple tandem repeat sequences are binding sites for specific nuclear proteins. Hum.Mol.Genet. 2:1429-1435.

172. Roy A.L., Roeder R.G. 1994. Initiator element binding protein TKI1-I: a tale of two sites. Indian Journal of Biochemistry & Biophysics 31:14-19.

173. Roy R. J., Gosselin P., Guerin S. L. 1991. Biotechniques 11:770-777.

174. Rupprecht H.D., Drummond J.A., Madden S.L., et al. 1994. The Wilms' tumor suppressor gene Wtl is negatively autoregulated. Journal of Biological Chemistry 269, N.8:6198-6206.

175. Russo M.W., Matheny C., Milbrandt J. 1993. Transcriptional activity of the zinc finger protein NGFI-A is influenced by its interaction with a cellular factor. Mol.Cell.Biol. 13:6858-6865.

176. Russo M.W., Sevetson B.R., Milbrandt J. 1995. Identification of NAB1, a repressor of NGFI-A- and Krox20-mediated transcription. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92, N.15:6873-6877.

177. Schneider-Maunoury S., Topilko P., Seitandou T., Levi G., et al. 1993. Disruption of Krox-20 results in alteration of rhombomeres 3 and 5 in the developing hindbrain. Cell 75:1199-1214.

178. Schreiber E., Matthias P., Muller M.M., Schaffner W. 1989. Rapid detection of octamer binding proteins with "mini-extracts", prepared from small number of cells. Nucleic Acids Research 17:6419

179. Schule R., Rangazajan P., et al. 1990. Functional antagonism between oncoprotein c-Jun and the glucococorticoid receptor. Cell 62:1217-1226.

180. Sengupta P. K., Lavelle D., DeSimone J. 1994. Increased binding of Spl to the gamma-globin gene promoter upon site-specific cytosine methylation. Am. J.Hematol. 46:169-172.

181. Shao Z., Robbins P. D. 1995. Differential regulation of E2F and Spl-mediated transcription by G1 cyclins. Oncogene 10:221-228.

182. Shevchenko A., Wilm M., Vorm O., Mann M. 1996. Mass spectrometric sequencing of proteins from silver stained polyacrylamide gels. Anal.Biochem. 68:850-858.

183. Shi Y., Berg J.M. 1996. DNA unwinding induced by zinc finger protein binding. Biochemistry 35:3845-3848.

184. Shi Y., Seto E., Chang L.S., Shenk T. 1991. Transcriptional repression by YY1, a human GLI-Kruppel-related protein, and relief of repression by adenovirus El A protein. Cell 67:377-388.

185. Shimizu M., Gellibolian R., Oostra B. A., Wells R. D. 1996. Cloning, characterization and properties of plasmids containing CGG triplet repeats from the FMR-1 gene. J Mol Biol 258:614-626.

186. Siomi H., Siomi M. C., Nussbaum R L., Dreyfuss G. 1993. The protein product of the fragile X gene, FMR1, has characteristics of an RNA-binding protein. Cell 74:291298.

187. Smale S.T., Baltimore D. 1989. The initiator as a transcriptional control element. Cell 57:103-113.

188. Sogawa K., Imataka H., Yamasaki Y., Kusume H., et al. 1993. cDNA cloning and transcriptional properties of a novel GC box-binding protein, BTEB2. Nucleic Acids Research 21:1527-1532.

189. St-Arnaud R., Moir J.M. 1993. Wnt-1-inducing factor-1: a novel G/C box-binding transcription factor regulating the expression of Wnt-1 during neuroectodermal differentiation. Mol.Cell.Biol. 13, N.3:1590-1598.

190. Steger D., Workman J.L. 1998. Remodeling chromatin structures for transcription: what happens to the histones? BioEssays 18 (11):875-884.

191. Stern S., Tanaka M., Herr W. 1989. The Oct-1 homoeodomain directs formation of a multiprotein- DNA complex with the HSV transactivator VP16. Nature 341:624-630.

192. Suggs S.V., Katzowitz J.L., Tsai-Morris C., Sukhatme V.P. 1990. cDNA sequence of the human cellular early growth response gene Egr-1. Nucleic Acids Research 18:4283

193. Sukhatme V.P., Cao X.M., Chang L.C., Tsai-Morris C.H., et al. 1988 A zinc finger-encoding gene coregulated with c-fos during growth and differentiation, and after cellular depolarization. Cell 53:37-43.

194. Sutcliffe J. S., Nelson D. L., Zhang F., Pieretti M., et al. 1992. DNA methylation represses FMR-1 transcription in fragile X syndrome. Hum Mol Genet 1:397-400.

195. Sutherland G. R. 1979. Heritable fragile sites on human chromosomes I. Factors affecting expression in lymphocyte culture. Am J Hum Genet 31:125-135.

196. Swiatek P.J., Gridley T. 1993. Perinatal lethality and defects in hidbrain development in mice homozygous for a target mutation of the zinc finger gene Krox 20. Genes&Dev. 7, N.11:2071-2084.

197. Swimoff A.H., Milbrandt J. 1995. DNA-binding specificity of NGFI-A and related zinc finger transcription factors. Mol.Cell.Biol. 15, N.4:2275-2287.

198. Trifonov E.N. 1996. Interfering contexts of regulatory sequence elements. International Workshop on Computational Analysis of Eukaryotic Transcriptional Regulatory Elements, p. 26. Deutsches Krebsforschungszentrum, Heidelberg.

199. Tsai-Morris C.H., Cao X.M., Sukhatme V.P. 1988. 5' flanking sequence and genomic structure of Egr-1, a murine mitogen inducible zinc finger encoding gene. Nucleic Acids Research 16:8835-8846.

200. Tsukiyama T., Becker P.B., Wu C. 1994. ATP-dependent nucleosome disruption at a heatshock promoter mediated by binding of GAGA transcription factor. Nature 367:525-531.

201. Turner B.M. 1995. Histone acetylation in chromatin and chromasomes. Semin.Cell Biol. 6:229-236.

202. Verkerk A. J., Pieretti M., Suteliffe J. S., Fu Y. H., et al. 1991. Identification of a gene (FMR-1) containing a CGG repeat coincident with a breakpoint cluster region exhibiting length variation in fragile X syndrome. Cell 65:905-914.

203. Vlach J., Garcia A., Jacque J. M., Rodriguez M. S., et al. 1995. Induction of Spl phosphorylation and NF-kappa B-independent HIV promoter domain activity in T lymphocytes stimulated by okadaic acid. Virology 208:753-761.

204. Wang Z.Y., Qiu Q.Q., Deuel T.F. 1993. The Wilms' tumor gene product WT1 activates or suppresses transcription through separate functional domains. Journal of Biological Chemistry 268, N.13:9172-9175.

205. Wang Z-Y., Qiu Q-Q., Enger K.T., Deuel T.F., 1993. A second transcriptionally active DNA-binding site for the Wilms tumor gene product, wtl. Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90, N.19:8896-8900.

206. Wang Z.-Y., Madden S. L., Denel T. F., Rauscher mF. J. 1992. The Wilms' tumor gene product Wt-1, represses transcription of the platelet-derived growth factor A-chain gene. Journal of Biological Chemistry 267, N.31:21999-22002.

207. Waters C.M., Hancock D.C., Evan G.I. 1990. Identification and characterisation of the egr-1 gene product as an inducible, short-lived, nuclear phosphoprotein. Oncogene 5:669-674.

208. Weinmann R. 1992. The basic RNA polymerase II transcriptional machinery. Gene Expression 6:3300-3309.

209. Weis L., Reinberg D. 1992. Transcription by RNA polymerase II: initiator-directed formation of transcription-competent complexes. FASEB J. 6:3300-3309.

210. Wilkinson D.G., Bhatt S., Chavrier P., Bravo R., et al. 1989. Segment-specific expression of a zinc-finger gene in the developing nervous system of the mouse. Nature 337:461-464.

211. Williams J.L., Garcia J., Harrich D., et al. 1990. Lymphoid specific gene expression of the adenovirus early region 3 promoter is mediated by NFl-kB binding motifs. EMBO J. 9, N.13:4435-4442.

212. Williams T. 1988. Cloning and expression of AP-2, a cell-typr-specific transcription factor that activates inducible enchancer elements. Genes Dev. 2:1557-1569.

213. Williams T., Tjian R. 1991. Analysis of the DNA-binding and activation properties of the human transcription factor AP-2. Genes Dev. 5 (4):670-682.

214. Williams T., Tjian R. 1991. Analysis of the DNA binding and activation properties of the human transcription factor AP2. Genes&Dev. 5:670-682.

215. Wingender E., Dietze P., Karas H., Knoppel R. 1996. TRANSFAC: a database on transcription factors and their DNA binding sites. Nucleic Acids Research 24:238-241.

216. Worrad D. M., Ram P. T., Schultz R, M. 1994. Regulation of gene expression in the mouse oocyte and early preimplantation embryo: developmental changes in Spl and TATA box- binding protein, TBP. Development 120:2347-2357.

217. Yang-Yen H.-F., Chambard I.-L., et al. 1990. Transcriptional interference between c-Jun and glucocorticoid receptor: mutual inhibition of DNA-binding due to direct protein-protein interection. Cell 62:1205-1215.

218. Yano-Yanagisawa H., Li Y., Wang H., Kohwi Y. 1995. Single-stranded DNA binding proteins isolated from mouse brain recognize specific trinucleotide repeat sequences in vitro. Nucleic Acids Research 23:2654-2660.

219. Zerler 1VL, Christy R.J., Uang R.C.C. 1992. Nuclear protein binding to the 5'enhancer region of the intracisternal particle long terminal repeat. Journal of Biological Chemistry 267, N.29:21200-21206.

220. Zhao Y., Cheng W., Gibb C. L., Gupta G., et al. 1996. HMG box proteins interact with multiple tandemly repeated (GCC)n (GGC)m DNA sequences. J.Biomol.Struct.Dyn. 14:235-238.

221. Zhu Q. S., Heisterkamp N., Groffen J. 1990. Unique organization of the human BCR gene promoter. Nucleic Acids Research 18:7119-7125.