Фенотипические и генотипические особенности представителей группы STAPHYLOCOCCUS INTERMEDIUS, вызывающих гнойно-воспалительные заболевания животных и человека тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Балбуцкая Анна Александровна

• Балбуцкая Анна Александровна
• кандидат наук
• 2016

Оглавление диссертации кандидат наук Балбуцкая Анна Александровна

Оглавление

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Таксономическое положение и распространенность

стафилококков группы Staphylococcus intermedins (SIG)

1.2. Биохимическая активность и методы видовой идентификации

1.3. Экология, эпидемиологическое значение и роль представителей

группы SIG в патологии животных

1.4. Роль SIG в патологии человека

1.5. Биологические свойства возбудителей

1.5.1. Факторы патогенности SIG

1.5.2. Чувствительность к антибактериальным средствам

1.6. Популяционная структура S. pseudintermedius

Заключение

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Бактериальные штаммы

2.2. Фенотипические методы исследования

2.2.1. Изучение факторов патогенности SIG

2.2.2. Изучение биохимических свойств

2.2.3. Определение чувствительности к антибактериальным средствам

2.2.4. Идентификация изолятов SIG методом MALDI-TOF-MS

2.3. Генотипические методы исследования

2.3.1. Постановка ПЦР (выделение ДНК, амплификация, электрофорез)

2.3.2. Идентификация и дифференциация культур, методами ПЦР и секвенирования

2.3.3. Детекция генов, кодирующих детерминанты патогенности

2.3.4. Определение гена mecA и структурных компонентов кассет

2.4. Изучение патогенности S. pseudintermedius на экспериментальных

моделях

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1. Общая характеристика изолятов SIG

3.2. Морфологические и культурально-биохимические свойства представителей SIG

3.3. Протеомный анализ методом MALDI-TOF-MS

3.4. Дифференциация стафилококков SIG генотипическими

методами

3.5. Определение факторов патогенности

3.6. Чувствительность SIG к антибактериальным средствам

68

3.7. Определение гена mecA и структурных компонентов кассет SCC

3.8. Исследование структурного полиморфизма гена spa

3.9. Изучение патогенности S. pseudintermedius на экспериментальных моделях

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

Приложение 1. Спектр бактерий рода Staphylococcus, выделенных от больных

животных и птиц

Приложение 2. Изоляты SIG и S. schleiferi ssp. coagulans,

выделенные в России

Приложение 3. Изоляты SIG, выделенные в Германии

Приложение 4. Факторы патогенности изолятов SIG и

S. schleiferi ssp. coagulans

Приложение 5. Чувствительность к антимикробным препаратам

изолятов SIG и S. schleiferi ssp. coagulans

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) - Институт клинических и лабораторных стандартов

DSM (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen) - немецкая коллекция микроорганизмов

MALDI-TOF-MS (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Time Of Flight Mass-

Spectrometry) - матрично-активированная лазерная десорбционная/

ионизационная времяпролетная масс-спектрометрия

MLST (Multilocus Sequence Typing) - мультилокусное секвенирование

MRSA - метициллинустойчивые S. aureus

MSSP - метициллинчувствительные S. pseudintermedius

MRSP - метициллинустойчивые S. pseudintermedius

MRSIG - метициллинустойчивые представители S. intermedius группы

MSSIG - метициллинчувствительные представители S. intermedius группы

PFGE (Pulsed-Field-Gel-Electrophoresis) - гель-электрофорез в пульсирующем

поле

SCCmec (Staphylococcal Chromosome Cassette mec) - стафилококковая

хромосомная кассета mec

КОС - коагулазоотрицательные стафилококки

КПС - коагулазоположительные стафилококки

МГЭ - мобильный генетический элемент

МПК - минимальная подавляющая концентрация

М-ПЦР - мультипраймерная ПЦР

ПДРФ - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ПЦР - полимеразная цепная реакция ФНО-а - фактор некроза опухоли-альфа

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Фенотипические и генотипические особенности представителей группы STAPHYLOCOCCUS INTERMEDIUS, вызывающих гнойно-воспалительные заболевания животных и человека»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Подсчитано, что более 60% открытых в последние десятилетия инфекционных болезней человека по своему происхождению являются зоонозами. В 2004 г. ВОЗ было дано определение вновь возникающим возбудителям зоонозных заболеваний, как патогенам впервые открытым, впервые выделенным или встречавшимся прежде, но проявляющим повышенную способность вызывать заболевания или увеличившим ареал географического распространения, изменившим свою хозяйскую специфичность или механизм передачи [41].

Среди возбудителей гнойно-воспалительных заболеваний человека и животных ведущее место занимают представители рода Staphylococcus. В конце XX века развитие молекулярных методов исследования позволило значительно расширить номенклатуру видов, образующих род, в том числе наиболее патогенных его представителей - группы коагулазопозитивных стафилококков. Исследование биологических свойств изолятов золотистого стафилококка, выделенных от различных видов животных и птиц, позволило выделить еще 6 самостоятельных таксонов: S. intermedius, S. delphini, S. schleiferi ssp. coagulans, S. lutrae, S. hyicus и S. pseudintermedius [45; 61; 76; 84; 164]. Последний коагулазоположительный вид S. pseudintermedius был дифференцирован от близкородственных видов S. intermedius и S. delphini методом ДНК-ДНК гибридизации в 2005 г. [48].

Группа S. intermedius (SIG) включает три вида: S. intermedius, S. delphini и S. pseudintermedius [145]. Биологическими хозяевами микроорганизмов группы SIG являются дикие млекопитающие и птицы, а также домашние и сельскохозяйственные животные, экологически тесно связанные с человеком. Показана возможность передачи представителей вышеназванной группы как от животных к человеку, так и от человека к человеку [73; 162]. Ряд авторов указывает, что роль основного источника S. pseudintermedius для человека принадлежит мелким домашним животным, у которых он является не только

частью нормальной микрофлоры, но и возбудителем различных гнойно-воспалительных заболеваний [43; 75]. Недавно показано, что S. pseudintermedius может вести себя как типичный нозокомиальный патоген, вызывающий вспышки заболеваний среди животных в ветеринарных клиниках [146; 162]. Обнаружено, что у человека представители некоторых видов SIG могут являться возбудителями абсцесса мозга, бактериемии, инфекционного эндокардита, менингита, пневмонии, остеомиелита, инфекций мочевыделительной системы и других заболеваний [51; 133; 166]. Клинические признаки инфекций, вызванных S. pseudintermedius, сходны с клиническими проявлениями заболеваний, вызванных S. aureus. Показано, что возбудители SIG могут являться этиологическим агентом пищевых токсикоинфекций [93]. Тем не менее, реальный удельный вес этих видов стафилококка в патологии человека и животных неизвестен из-за отсутствия общепринятой схемы дифференциации коагулазоположительных видов стафилококка.

Представители группы, как и S. aureus, имеют разнообразный набор факторов патогенности, в том числе гемолизины, эксфолиатины и энтеротоксины. Некоторые представители SIG могут содержать стафилококковые хромосомные кассеты mec (SCCmec), несущие в своем составе mecA ген, oпределяющий устойчивость к Р-лактамным антибштикам, и гены резистентности к другим классам антимикробных средств. Полагают, что приобретение новых свойств позволило наиболее успешным эпидемическим клонам S. pseudintermedius получить широкое географическое распространение, циркуляция одного из которых, а именно ST 71, установлена на территории многих стран мира [128]. Как показали немногочисленные исследования, множественнорезистентные представители этого эпидемического клона чаще колонизируют организм человека и могут являться этиологическим агентом различных гнойно-воспалительных заболеваний [124; 152]. Накопленные данные по геномике микроорганизмов свидетельствуют о том, что большинство бактериальных эпидемий вызвано ограниченным числом клонов, обладающих специфическими

эпидемическими и патогенными свойствами, поэтому их идентификация имеет большое эпидемиологическое значение [136].

Целенаправленных исследований по изучению видов, входящих в группу intermedius, в РФ ранее не проводилось, за исключением цикла работ по изучению intermedius, выполненных в лаборатории стафилококковых инфекций НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи АМН под руководством профессора А.К. Акатова в 80-х гг. прошлого века с использованием фенотипических методов исследования [1].

Степень разработанности темы. До настоящего времени не существует общепринятых методов и схемы дифференциации группы 5. intermedius и других коагулазоположительных видов стафилококка, отсутствуют сведения о распространении этих микроорганизмов на территории РФ, неизвестен их удельный вес в инфекционной патологии животных и человека. Отсутствует информация о циркуляции метициллинустойчивых генетических линий представителей SIG на территории нашей страны и, соответственно, о частоте их выделения. Учитывая данные ряда иностранных публикаций, в которых отмечается быстрое приобретение изолятами SIG генов устойчивости к разным классам антибиотиков и быстрое распространение метициллинустойчивых клонов с множественной лекарственной устойчивостью в разных странах, можно предположить развитие подобного сценария и на территории РФ. Все эти обстоятельства определяют актуальность исследований данной работы, посвященной изучению биологических свойств представителей SIG, разработке методов их дифференциации, молекулярно-генетической характеристике представителей группы, выявлению циркулирующих в России эпидемических клонов метициллинустойчивых 5. pseudintermedius (МЯБР), исследованию факторов патогенности и разработке биологических моделей для их изучения.

Целью работы явилось изучение биологических свойств условно-патогенных микроорганизмов, входящих в группу 5. intermedius, для совершенствования методов микробиологической диагностики вызываемых ими

заболеваний и мониторинга эпидемически успешных генетических линий патогенов.

Задачи исследования:

1. Изучить видовой спектр микроорганизмов рода Staphylococcus, изолированных от различных видов домашних и сельскохозяйственных животных, а также птиц, находящихся в тесном контакте с человеком, в центральном регионе РФ.

2. Выявить частоту распространения представителей SIG среди животных-носителей и животных с различными формами стафилококковой инфекции, изучить их фенотипические свойства: биохимическую активность, наличие секретируемых факторов патогенности, чувствительность к антибактериальным средствам.

3. Сравнить дифференцирующую способность различных генетических локусов и определить оптимальные мишени для видовой идентификации представителей SIG.

4. Выявить клональность популяции SIG:

- определить наличие генов токсинов, обладающих суперантигенной активностью, специфичных для SIG и S. aureus: lukF/S-I, siet, se-int, sea, seb, sec, sed, see и tsst-1;

- определить наличие гена mecA и структурных компонентов кассет mec (SCCmec);

- исследовать структурный полиморфизм вариабельного фрагмента гена протеина А.

5. Разработать экспериментальную модель для изучения роли факторов патогенности в патогенезе различных нозологических форм заболеваний, вызванных SIG.

Научная новизна. Собрана коллекция представителей SIG, циркулирующих на территории центрального региона РФ и выделенных от животных и птиц со стафилококковой инфекцией различной локализации и от животных-носителей.

Получена комплексная микробиологическая, биохимическая и генетическая характеристика включенных в коллекцию изолятов.

Впервые показано, что для улучшения качества идентификации представителей SIG методом MALDI-TOF-MS необходимо использовать в качестве метода пробоподготовки предварительную экстракцию белков с добавлением муравьиной кислоты и ацетонитрила, а также дополнить базу данных прибора масс-спектрами изолятов SIG различного происхождения.

Разработана схема видовой дифференциации коагулазоположительных стафилококков. Установлено, что наиболее эффективными генетическими мишенями для дифференциации представителей группы S. intermedius и других коагулазоположительных видов являются гены термонуклеазы (nuc) и каталазы (kat).

Обнаружено, что подавляющее большинство изолятов S. pseudintermedius несли, как минимум, три гена токсинов с суперантигенной активностью: lukF/S-I, siet и se-int. 6,4% изолятов S. pseudintermedius несли ген, кодирующий энтеротоксин С S. aureus и 10% - энтеротоксин Е S. aureus.

Впервые в центральном регионе РФ идентифицированы метициллинустойчивые изоляты S. pseudintermedius, принадлежащие к трём различным клонам, один из которых соответствует основному европейскому эпидемическому клону MRSP ST71, циркулирующему на территории многих стран мира.

Показано наличие внутривидовых различий у метициллинчувствительных изолятов S. pseudintermedius исследованной популяции на основании фенотипических и генетических исследований.

Впервые разработаны экспериментальные модели воспроизведения как локализованных, так и системных заболеваний, вызванных S. pseudintermedius, у белых мышей, кроликов 8-9 месячного возраста, 2-3 месячных щенков собак и цыплят различного возраста. На всех экспериментальных моделях показана зависимость тяжести течения инфекции от дозы возбудителя и набора факторов патогенности.

Теоретическая и практическая значимость работы.

Коллекция изолятов SIG может быть использована для дальнейших генетических исследований, детекции факторов патогенности и вирулентности этой группы микроорганизмов, расшифровки механизмов адаптации к новым хозяевам. Впервые доказано, что наиболее эффективным методом дифференциации представителей группы S. intermedius и других коагулазоположительных видов стафилококка является метод секвенирования katA гена, который позволяет достоверно идентифицировать 100% образцов.

Впервые на территории РФ показана циркуляция штаммов S. pseudintermedius, несущих гены энтеротоксинов С и Е, гомологичные генам соответствующих токсинов S. aureus.

Экспериментальные модели стафилококковых инфекций у различных видов животных, вызванных S. pseudintermedius, могут быть использованы для разработки схем лечения и испытания новых препаратов для терапии.

Результаты исследований нашли отражение в методических рекомендациях: «Методические наставления по идентификации, определению факторов патогенности и генов антибиотикорезистентности у Staphylococcus intermedius», одобренные секцией «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины РАСХН «27» апреля 2011 г. (протокол № 2). Методические наставления на ежегодной выставке ВВЦ удостоены серебряной медали в 2011 г.

«Методическое пособие по идентификации и видовой дифференциации коагулазоположительных стафилококков методом ПЦР» одобренное секцией «Инфекционная патология животных» Отделения ветеринарной медицины РАСХН «05» октября 2013 г. (протокол № 5).

Методология и методы исследования. Методологической основой диссертационного исследования послужили экспериментальные и специфические методы исследования: бактериологические, биохимические,

патологоанатомические, молекулярно-генетические, биоинформационный,

статистический, MALDI-TOF-MS. Исследования проводились на современном сертифицированном оборудовании.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. На территории центрального региона РФ среди коагулазоположительных стафилококков, изолированных от различных видов домашних и сельскохозяйственных животных и птиц, находящихся в тесном бытовом контакте с человеком, доминирующим видом является Staphylococcus pseudintermedius. Основным источником данного возбудителя для человека являются собаки. Главный экотоп в организме хозяина - слизистая оболочка ротовой полости.

2. Разработанная на основе молекулярно-генетических технологий схема идентификации и дифференциации представителей SIG и других коагулазоположительных видов стафилококка позволяет повысить качество диагностики стафилококковых инфекций.

3. Популяция вида S. pseudintermedius в центральном регионе России является гетерогенной. Представители вида отличаются наличием разнообразного набора факторов патогенности, 23% культур обладают множественной устойчивостью к антибиотикам.

4. Разработанные схема и модель генерализованной и локализованной экспериментальных инфекций для изучения патогенного потенциала S. pseudintermedius показали зависимость тяжести течения инфекции от дозы возбудителя и набора факторов патогенности.

Степень достоверности и апробация работы. Основные положения

диссертационной работы доложены на:

• XIII Международной научно-производственной конференции «Проблемы сельскохозяйственного производства на современном этапе и пути их решения», Белгород, Россия, 19-22 мая 2009 г.

• XV Международной научно-производственной конференции «Проблемы сельскохозяйственного производства на современном этапе и пути их решения», Белгород, Россия, 15-16 мая 2011 г.

• 22nd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, (ECCMID), London, United Kingdom, 31 March - 3 April 2012.

• VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2014», Москва, Россия, 18-20 марта 2014г.

• VI Ежегодном Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням, Москва, Россия, 24-26 марта 2014 г.

• XVIII Международной научно-производственной конференции «Проблемы и перспективы инновационного развития агроинженерии, энергоэффективности и IT-технологий», Белгород, Россия, 15-16 мая 2014 г.

• Российско-Китайская научно-практическая конференция по медицинской микробиологии и клинической микологии (XVIII Кашкинские чтения), Санкт-Петербург, Россия, 9-11 июня 2015 г.

По материалам диссертационной работы опубликовано 13 научных работ, в том числе 6 статей в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК РФ для публикации материалов диссертационного исследования.

Обсуждение диссертационной работы состоялось на заседании лабораторий микробиологии, молекулярной биологии, биохимии и иммунологии ФГБНУ «ВНИИЭВ им. Я.Р. Коваленко» 17.06.2015 г. и на совместной научной конференции отделов бактериальных инфекций и медицинской микробиологии ФГБУ «ФНИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава РФ 23.06.2015 г.

Личное участие автора в получении результатов. Все этапы диссертационной работы, подготовка основных публикаций по выполненной работе, оформление диссертации и автореферата выполнены самостоятельно. Отдельные этапы были проведены в сотрудничестве с ведущим научным сотрудником лаборатории анализа геномов Ворониной О.Л. ФГБУ «ФНИЦЭМ

им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России (Москва); с сотрудниками лаборатории микробиологии Научного центра акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова (Москва) Анкирской А.С. и Любасовской Л.; секвенирование выполнено на базе ЦКП «Геном» ИМБ РАН (Москва).

Объем и структура диссертации. Диссертационная работа изложена на 133 страницах машинописного текста и состоит из списка сокращений, введения, обзора литературы, материалов и методов исследования, результатов исследования, обсуждения результатов, выводов, практических предложений, списка литературы и 5 приложений. Список литературы включает 176 источников литературы, в том числе 18 отечественных, 148 иностранных и 10 ссылок на электронные ресурсы. Диссертация включает 16 таблиц и 17 рисунков.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. 1. Таксономическое положение и распространенность стафилококков группы Staphylococcus intermedius (SIG)

В соответствии с классификацией, представленной в 9-м издании «Определителя бактерий» D.H. Bergey [12], последнем из изданий, опубликованных в России, род Staphylococcus относится к 17 группе -грамположительные кокки, к подгруппе - факультативно анаэробные кокки. Кроме стафилококков в эту группу были включены роды Aerococcus, Enterococcus, Gemella, Lactococcus, Leuconostoc, Melissococcus, Pediococcus, Saccharococcus, Stomatococcus, Streptococcus, Trichococcus и Vagococcus, собранные в одну группу на основании только двух признаков - сферическая форма клеток и положительная реакция при окраске по Граму. Развитие молекулярных методов исследований в конце XX и начале XXI веков позволило пересмотреть таксономическое положение рода Staphylococcus. На основании результатов ДНК-ДНК гибридизации, определения величины геномов, а также сходства последовательностей гена рибосомной РНК (16S рРНК) род Staphylococcus был объединен вместе с родами Gamella, Macrococcus и Salinococcus в семейство Staphylococcaceae, которое в свою очередь относится к порядоку Bacillales, классу Bacilli, типу Firmicutes [31].

Современная номенклатура бактерий рода Staphylococcus представлена 51 видом и 27 подвидами [106].

Стафилококки распространены повсеместно (в воздухе, пыли, на поверхности различных объектов внешней среды). Для многих представителей рода характерен выраженный дуализм. С одной стороны - они комменсалы и являются представителями нормальной микрофлоры наружных покровов и слизистых оболочек домашних и диких млекопитающих, птиц и человека. С другой стороны - способны вызывать огромное многообразие гнойно-воспалительных заболеваний у животных и человека [7]. На основании способности коагулировать плазму крови путем продукции плазмокоагулазы,

которая активирует преобразование фибриногена в фибрин, род Staphylococcus делят на две группы: коагулазоположительные и коагулазоотрицательные стафилококки.

В конце XX века значительно изменилась номенклатура наиболее патогенных представителей рода - группы коагулазоположительных стафилококков (КПС). Изучение экологии золотистого стафилококка первого и главного представителя этой группы, исследование биохимических свойств изолятов стафилококка, выделенных от различных диких и домашних животных, позволило ряду исследователей выделить их в самостоятельные таксоны: S. intermedius, S. delphini, S. schleiferi ssp. coagulans, S. lutrae и S. hyicus.

Долгое время наиболее патогенным видом считался только S. aureus, характеризующийся выраженной полигостальностью. Было известно, что S. aureus способен вызывать заболевания не только у человека, но и широкого круга млекопитающих, птиц и земноводных, при этом все грамположительные кокки, изолированные от них и проявляющие диагностически важные характеристики, такие как продукция коагулазы, ДНК-зы или Р-гемолизина идентифицировали, как S. aureus. Но в 1976 г. Hajek V. обнаружил, что стафилококки, изолированные от голубей, собак, лисиц, норок и лошадей отличались от S. aureus и S. epidermidis биохимическими свойствами и строением клеточной стенки. Он предложил выделить эту группу микроорганизмов в самостоятельный вид S. intermedius, название которого было образовано из двух латинских слов: наречие inter -«между», «среди» и прилагательное mediums - «средний», в результате intermedius означает «промежуточный». Выделение S. intermedius в самостоятельный вид имело большое эпидемиологическое значение, так как позволило разделить наиболее значимые для патологии животных и человека коагулазоположительные виды стафилококка. Вместе с тем, Hajek V. [76], а вскоре после него и другие ученые [46], отмечали значительную фенотипическую гетерогенность изолятов S. intermedius, связывая это в той или иной степени с их происхождением. Несколько позднее был описан еще один коагулазоположительный вид - S. delphini, вызывавший гнойные поражения кожи

у дельфина [164]. И только в 2005 г. Devriese L. с соавторами, используя метод ДНК-ДНК гибридизации при анализе изолятов стафилококка, полученных от кошки, собаки, лошади и попугая, выделили в самостоятельный таксон -Staphylococcus pseudintermedius. Авторы дифференцировали данный вид от близкородственных ему видов S. intermedius и S. delphini [48].

Поскольку секвенирование гена 16S рРНК - генетической мишени, наиболее широко используемой для видовой идентификации многих бактерий, не позволило дифференцировать эти три близкородственных вида, они были объединены в "S. intermedius группу" (SIG) [23; 145]. Некоторые ученые полагают, что после таксономических изменений в классификации коагулазопозитивных стафилококков в 2005 г., основывающихся на молекулярно-генетических исследованиях, все изоляты, выделенные от собак (а, вероятно, и от кошек) и описанные до 2005 г., как S. intermedius, в настоящее время следуют считать S. pseudintermedius [34; 49; 59]. Молекулярно-генетические исследования и последующий филогенетический анализ коллекций изолятов SIG, выделенных до 2005 г., показали, что S. intermedius является доминирующим видом у диких голубей, а S. delphini является основным возбудителем инфекций у лошадей и домашних голубей [23; 145].

Учитывая изменения таксономического положения S. intermedius, при анализе данных литературы, опубликованных до 2005 г., мы позволили себе, как и некоторые другие авторы, для характеристики изолятов S. intermedius употреблять название вида S. (pseud)intermedius, ввиду того, что они могли бы быть переклассифицированы в S. pseudintermedius.

1.2. Биохимическая активность и методы видовой идентификации SIG

Исторически изучение этой группы микроорганизмов началось с изучения особенностей их биохимической активности. Было показано, что микроорганизмы SIG обладают высокой гликолитической активностью и способны ферментировать с образованием молочной кислоты сахарозу, маннит, мальтозу, маннозу, трегалозу, галактозу, глюкозу, лактозу, рибозу в аэробных условиях.

Они синтезируют аргинингидролазу, образуют пирролидониламидазу и ß-галактозидазу, интенсивно образуют уреазу, восстанавливают нитраты в нитриты. дают вариабельную реакцию в тесте на продукцию ацетоина (Фогес-Проскауэра) и отрицательную - на цитохромоксидазу. Большинство представителей группы не образуют ß-глюкозидазу и ß-глюкуронидазу, не ферментируют эскулин, арабинозу, ксилозу, целлобиозу, раффинозу, ксилитол, рамнозу, сорбит, салицин, целлобиозу, инулин, крахмал. Все представители SIG чувствительны к акрифлавину и новобиоцину [37; 48; 49;145].

В последние годы были предприняты многочисленные попытки разработки схемы дифференциации КПС на основании фенотипических признаков, однако разработать чёткие критерии идентификации так и не удалось. Наибольшие разногласия среди ученых вызывала биохимическая характеристика представителей SIG. При изучении различных коллекций изолятов этой группы выяснилось, что из-за вариабельной экспрессии ими биохимических признаков как в пределах одного вида, так и между видами невозможна их четкая дифференциация внутри группы [119; 145]. Вследствие чего до настоящего времени не существует коммерческих диагностических тест-систем, позволяющих дифференцировать эти виды SIG. Сходство биохимических и фенотипических свойств S. pseudintermedius и S. aureus при проведении дифференцирующих тестов в рутинной микробиологической практике может приводить к ошибочной идентификации S. pseudintermedius, как непигментированного S. aureus [170].

Рисунок 1. Особенности роста на кровяном агаре двух видов стафилококков: слева - непигментированный золотистый стафилококк, справа - S. pseudintermedius, имитирующий рост непигментированного S. aureus.

Согласно современной классификации к числу КПС относят и Staphylococcus schleiferi ssp. magulans, клиническая значимость которого возрастает. Исследователи выделяют представителей этого вида преимущественно при отитах наружного уха у собак [84;174]. По фенотипическим признакам S. schleiferi ssp. coagulans наиболее сходен со S. intermedius нежели с другими стафилококками.

В последние годы для идентификации микроорганизмов все чаще используется метод матрично-активированной лазерной

дезорбционной/ионизационной времяпролётной масс-спектрометрии (MALDI-TOF-MS), который на сегодняшний день является самым быстрым и малозатратным способом, используемым для этих целей. К моменту начала наших исследований данных по дифференциации представителей SIG с помощью MALDI-TOF-MS не было, а база данных прибора включала по одному масс-спектру каждого из представителей группы. Несколько научных групп, проводивших исследования параллельно с нами, получили противоречивые данные при попытке использовать данный метод для дифференциации коагулазоположительных видов стафилококка. А1са1а L. с соавторами [21] удалось дифференцировать S. aureus от представителей SIG, а также изоляты S. intermedius от S. pseudintermedius с использованием MALDI-TOF-MS фирмы

«Bruker» (Biotyper 3). По данным Murugaiyan J. с соавторами [121] MALDI-TOF-MS «Bruker» (Biotyper 3) имеет низкие дифференцирующие возможности, поскольку только 1,5% изолятов SIG были идентифицированы достоверно. Другие ученые смогли дифференцировать 77% изолятов SIG с помощью прибора «Bruker Daltonics» (Италия) и 72% при исследовании той же группы с помощью масс-спектрометра «Vitek MS» фирмы «bioMérieux» (Франция) [36]. Однако недостатками большинства исследований является ограниченность исследуемой выборки по числу изучаемых видов и количеству анализированных изолятов, а также использование авторами для подтверждения результатов MALDI-TOF-MS молекулярных методов, не позволяющих достоверно дифференцировать представителей SIG и другие КПС.

В последние годы для дифференциации КПС были предложены молекулярно-генетические методы. Сравнение полных нуклеотидных последовательностей гена 16S рДНК 46 наиболее значимых в патологии человека и животных видов стафилококка показало, что достоверная идентификация возможна не более чем для 2% представителей рода Staphylococcus; при этом гомология 16S рДНК у представителей SIG и S. schleiferi ssp. coagulans составляет 99-100% [97; 153; 173]. В связи с этим в качестве генетических мишеней были предложены гены домашнего хозяйства: gap (глицеральдегид-3-фосфат дегидрогеназа), hsp60 (шаперонин), tuf (фактор элонгации Tu). Однако секвенирование каждого из этих генов по отдельности не позволяет сделать однозначные выводы о точной видовой принадлежности исследуемых микроорганизмов из-за значительной степени гомологии у представителей SIG и некоторых других видов стафилококка. Кроме того, исследования были выполнены на малом числе изолятов того или иного вида SIG, в некоторые коллекции не был включен S. pseudintermedius [145; 147]. Наблюдалась перекрестная гибридизация клонированных участков ДНК hsp60 гена двух подвидов S. schleiferi, а также S. intermedius и S. delphini [69]. Не увенчались успехом и попытки использовать метод анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ-анализ), образовавшихся в результате

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Балбуцкая Анна Александровна, 2016 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Акатов, А.К. Классификация и биологическая характеристика коагулазоположительных стафилококков, выделенных от животных/ А.К. Акатов, Т.М. Самсонова, М.Л. Хатеневер, И.В. Кушко, В.И. Ширяева// ЖМЭИ. - 1983. -№ 1. - С. 29-33.

2. Акопова, И.С. Некоторые особенности внутрибольничных штаммов микроорганизмов рода Staphylococcus / И.С. Акопова, О.А. Коленчукова // Науки о человеке: сборник статей по материалам третьего конгресса молодых ученых и специалистов / Томск. - 2002. - № 3. - С. 4-5.

3. Белецкий, М. Общество: 60 процентов россиян держат домашних животных и больше всего любят кошек [Электронный ресурс] / М. Белецкий // Интернет-журнал о культуре Воронежа, России и мира. - 2014. - 5 апреля. - Режим доступа: http://culturavrn.ru/society/11926 (дата обращения: 03.10.2014).

4. Воробьева, О.Н. Этиология гнойно-септических процессов у ожоговых больных / О.Н. Воробьева, Л.И. Денисенко, Н.М. Жилина // Бюллетень СО РАМН, 2010. - Т. 30, № 6. - С. 57-63.

5. Гланц, С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. - М.: Практика, 1999. - 459 с.

6. Гордина, Е.М. Внутривидовые особенности бактерий рода Staphylococcus, изолированных в условиях промышленного птицеводства: дис. ... канд. мед. наук: 03.02.03 / Гордина Екатерина Михайловна. - Пермь, 2015 - 139 с.

7. Грамположительные бактерии [Текст]: руководство по медицинской микробиологии. Книга III. Том I. Оппортунистические инфекции: возбудители и этиологическая диагностика / О. А. Дмитренко [и др.]; составитель А. С. Лабинская; под общ. ред. Н.Н. Костюковой. - М.: БИНОМ, 2013. - С. 31-87.

8. Дмитренко, О.А. Исследование полиморфизма mec ДНК у метициллинрезистентных штаммов золотистого стафилококка, выделенных в стационарах разных регионов России / О.А. Дмитренко, И.А. Шагинян, А.Л.

Гинцбург // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2005. - № 3. - С. 11-17.

9. Практикум по ветеринарной микробиологии и иммунологии / Т.С. Костенко [и др.]. - М.: Агропромиздат, 1989. - 272с.

10. Медицинская микробиология. Учебное пособие / под ред. А.М. Королюка, В.Б. Сбойчакова. - СПб.: ЭЛБИ-СПб, 2002. - 267 с.

11. Методические указания 4.2.1890-04 Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: Методические указания. -М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. - 91 с.

12. Методы экспериментальной химиотерапии (практическое руководство) / под ред. Першина. - М.: Медгиз, 1959. - 502 с.

13. Определитель бактерий Берджи: в 2-х т. / под ред. Дж. Хоулта [и др]; пер. с англ. под ред. Г.А. Заварзина. - Изд. 9-е. - М.: Мир, 1997. - 800 с.

14. Реброва, О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ / О. Ю. Реброва. - М.: МедиаСфера, 2002. - 321 с.

15. Руководство по микробиологической диагностике инфекционных болезней / под ред. К.И. Матвеева. - Изд. 2-е, перераб. и доп. - М.: Медицина, 1973. - 624 с.

16. Скородумов, Д. И. Микробиологическая диагностика бактериальных болезней животных / Д. И. Скородумов, В. В. Субботин, М. А. Сидоров, Т. С. Костенко. - М.: Изограф, 2005. - 656 с.

17. Черкасский, Б.Л. Руководство по общей эпидемиологии / Б.Л. Черкасский. -М.: Медицина, 2001. - 560 с.

18. Шатохина, С.Н. Гетерорезистентность клеток метициллинустойчивых штаммов Staphylococcus aureus к метициллину (природа и роль в антимикробном действии метициллина): автореф. дис. ... канд. мед. наук: 03.00.07 / Светлана Николаевна Шатохина. - М., 1980. - 24 с.

19. Aarestrup, F. M. Comparative ribotyping of Staphylococcus intermedius isolated from members of the Canoidea gives possible evidence for host-specificity and co-evolution of bacteria and hosts / F. M. Aarestrup // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2001. - Vol. 51. - P. 1343-1347.

20. Abraham, J.L. Surveillance of healthy cats and cats with inflammatory skin disease for colonization of the skin by methicillin-resistant coagulase-positive staphylococci and Staphylococcus schleiferi ssp. schleiferi / J.L. Abraham, D.O. Morris, G.C. Griffeth [et al.] // Vet. Dermatol. - 2007. - Vol. 18. - P. 252-259.

21. Alcalá, L. Suitability of MALDI-TOF MS for the identification of Staphylococcus aureus, and members of the Staphylococcus intermedius group (SIG) complex [Электронный ресурс] / L. Alcalá, M.C. Simón, A.I. Lopez-Calleja [et al.] // Abstracts of the 24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2014. - № P474. - Режим доступа: https: //www.escmid.org/escmid_library/online_lecture_library.

22. Al-Tarazi, Y.H. Biotyping and enterotoxigenicity of staphylococci isolated from fresh and frozen meat marketed in Jordan / Y.H. Al-Tarazi, M.A. Albetar, A.R. Alaboudi // Food Research International. - 2009. - Vol. 42. - P. 374-379.

23. Bannoehr, J. Population genetic structure of the Staphylococcus intermedius group: insights into agr diversification and the emergence of methicillin-resistant strains / J. Bannoehr, N. L. Ben Zakour, A. S. Waller [et al.] // Journal of Bacteriology. - 2007. - Vol. 189. - P. 8685-8692.

24. Bannoehr, J. Molecular diagnostic identification of Staphylococcus pseudintermedius / J. Bannoehr, A. Franco, M. Iurescia, A. Battisti, J. R. Fitzgerald // Journal of Clinical Microbiology. - 2009. - Vol. 47. - P. 469-471.

25. Bannoehr, J. Genomic and surface proteomic analysis of the canine pathogen Staphylococcus pseudintermedius reveals proteins that mediate adherence to the extracellular matrix / J. Bannoehr, N.L. Ben Zakour, M. Reglinski [et al.] // Infect. Immun. - 2011. - Vol. 79. - Р. 3074-3086.

26. Bannoehr, J. Staphylococcus pseudintermedius in the dog: taxonomy, diagnostics, ecology, epidemiology and pathogenicity / J. Bannoehr, L. Guardabassi // Vet. Dermatol. - 2012. - Vol. 23. - P. 253-e52.

27. Basic Local Alignment Search Tool [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov (дата обращения: 03.05.2014).

28. Becker, P. Detection of differential gene expression in biofilm-forming versus planktonic populations of Staphylococcus aureus using micro-representational-difference analysis / P. Becker, W. Hufnagle, G. Peters, M. Herrmann // Applied and Environmental Microbiology. - 2001. - Vol. 67. - P. 2958-2965.

29. Ben Zakour, N.L. Complete genome sequence of the canine pathogen Staphylococcus pseudintermedius / N.L. Ben Zakour, J.R. Fitzgerald, J. Bannoehr [et al.] // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193. - P. 2363-2364.

30. Ben Zakour, N.L. Comparative genomic study of the Staphylococcus intermedius group of animal pathogens / N.L. Ben Zakour, S.A. Beatson, A.H. van den Broek [et al.] // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2012. - Vol. 2. - P. 1-15.

31. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology / G. Garrity, D.R. Boone, R.W. Castenholz// Springer, 2001. - Vol. 1. - 721 p.

32. Black, C.C. Identification of a predominant multilocus sequence type, pulsed-field gel electrophoresis cluster, and novel staphylococcal chromosomal cassette in clinical isolates of mecA-containing, methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius / C.C. Black, S.M. Solyman, L.C. Eberlein [et al.] // Vet. Microbiol. -2009. - Vol. 139. - P. 333-338.

33. Blaiotta, G. Diversity of Staphylococcus species strains based on partial kat (catalase) gene sequences and design of a PCR-restriction fragment length polymorphism assay for identification and differentiation of coagulase-positive species (S. aureus, S. delphini, S. hyicus, S. intermedius, S. pseudintermedius, and S. schleiferi subsp. coagulans) / G. Blaiotta, V. Fusco, D. Ercolini [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2010. - Vol. 48, № 1. - P. 192-201.

34. Bond, R. What's happened to Staphylococcus intermedius? Taxonomic revision and emergence of multi-drug resistance / R. Bond, A. Loeffler // Journal of Small Animal Practice. - 2012. - Vol. 53. - P. 147-154.

35. Boost, M.V. Low rate of methicillin-resistant coagulase-positive staphylococcal colonization of veterinary personnel in Hong Kong / M.V. Boost, S.Y. So, V. Perreten // Zoonoses Public Health. - 2011. - Vol. 58. - P. 36-40.

36. Carretto, E. Usefulness of MALDI-TOF technology for identification of microorganisms belonging to the Staphylococcus intermedius group [Электронный ресурс] / E. Carretto, D. Barbarini, F. Brovarone [et al.] // Abstracts of the 24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2014. - № P465. - Режим доступа: https://www.escmid.org/escmid_library/online_lecture_library.

37. Chanchaithong, P. Biochemical markers and protein pattern analysis for canine coagulase-positive staphylococci and their distribution on dog skin / P. Chanchaithong, N. Prapasarakul // J. Microbiol. Methods. - 2011. - Vol. 86. - P. 175-181.

38. Cheng , A.G. Contribution of coagulases towards Staphylococcus aureus disease and protective immunity / A.G. Cheng, M. McAdow, H.K. Kim [et al.] // PLoS Pathogens. - 2010. - Vol. 6, № 8. - Р. 1-18.

39. Couto, N. Prevalence of meticillin-resistant staphylococci among dogs and cats at a veterinary teaching hospital in Portugal / N. Couto, C. Pomba, A. Moodley, L. Guardabassi // Vet. Rec. - 2011. - Vol. 169. - Р. 72-79.

40. Cox, H.U. Temporal study of staphylococcal species on healthy dogs / H.U. Cox, J.D. Hoskins, S.S. Newman [et al.] // Am. J. Vet. Res. - 1988. - Vol. 49. - P. 747-751.

41. Cutler, S.J. Public health threat of new, reemerging, and neglected zoonoses in the industrialized world / S.J. Cutler, A.R. Fooks, W.H. van der Poel // Emerging Infect. Dis. - 2010. - Vol. 16. - P. 1-7.

42. Davis, J.A. Carriage of methicillin-resistant staphylococci by healthy companion animals in the US / J.A. Davis, C.R. Jackson, P.J. Fedorka-Cray [et al.] // Letters in Applied Microbiology. - 2014. - Vol. 59. - P. 1-8.

43. De Lucia, M. Prevalence of canine methicillin resistant Staphylococcus pseudintermedius in a veterinary diagnostic laboratory in Italy / M. De Lucia, A. Moodley, F. Latronico [et al.] // Research in Veterinary Science. - 2011. - Vol. 91. - P. 346-348.

44. Descloux, S. Characterization of new staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) and topoisomerase genes in fluoroquinolone- and methicillin-resistant

Staphylococcus pseudintermedius/ S. Descloux, A. Rossano, V. Perreten // Journal of Clinical Microbiology. - 2008. - Vol. 46. - P. 1818-1823.

45. Devriese, L.A. Staphylococcus hyicus comb. nov. and Staphylococcus hyicus supsp. chromogenes supsp. nov. / L.A. Devriese, V. Hajek, P. Oeding [et al.] // Intern. J. Syst. Bacteriol. - 1978 - V. 28. - P. 482-490.

46. Devriese, L.A. A comparison of methods and the validity of deoxyribonuclease tests for the characterization of staphylococci isolated from animals / L.A. Devriese, A. van de Kerckhove // Journal of Applied Bacteriology. - 1979. - Vol. 46. - P. 385-393.

47. Devriese, L.A. The anal region as a main carrier site of Staphylococcus intermedius and Streptococcus canis in dogs / L.A. Devriese, K. De Pelsmaecker // Vet. Rec. - 1987. - Vol. 121. - P. 302-303.

48. Devriese, L.A. Staphylococcus pseudintermedius sp. nov., a coagulase-positive species from animals / L.A. Devriese, M. Vancanneyt, M. Baele [et al.] // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2005. - Vol. 55. - P. 1569-1573.

49. Devriese, L.A. Staphylococcus pseudintermedius versus Staphylococcus intermedius. Letter to editor / L.A. Devriese, K. Hermans, M. Baele, F. Haesebrouck // Veterinary Microbiology. - 2009. - Vol. 133. - P. 206-207.

50. Dufour, P. High genetic variability of the agr locus in Staphylococcus species / P. Dufour, S. Jarraud, F. Vandenesch [et al.] // Journal of Bacteriology. - 2002. - Vol. 184. - P. 1180-1186.

51. Durdik, P. Staphylococcus intermedius - rare pathogen of acute meningitis / P. Durdik, M. Fedor, M. Jesenak [et al.] // Int. J. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 14. - P. 236238.

52. Dziewanowska, K. Comparison of the beta-toxins from Staphylococcus aureus and Staphylococcus intermedius / K. Dziewanowska, V.M. Edwards, J.R. Deringer [et al.] // Archives of Biochemistry and Biophysics. - 1996. - Vol. 335. - P. 102-108.

53. Edwards, V.M. Characterization of the canine type C enterotoxin produced by Staphylococcus intermedius pyoderma isolates / V.M. Edwards, J.R. Deringer, S.D. Callantine [et al.] // Infection and Immunity. - 1997. - Vol. 65. - P. 2346-2352.

54. Eissa, N.M.B. Molekularbiologischer Nachweis mutmaßlicher Virulenzfaktoren bei Staphylococcus aureus-Kulturen, isoliert von Rinder Mastitiden: Dissertation Dr. med. vet. / Eissa Nawara M.B. - Gießen, 2007. - 187 s.

55. Erne, B.V. A curious case of convulsion / B.V. Erne, C. Exner, T. Frauenfelder [et al.] // Lancet. - 2010. - Vol. 375. - P. 2050.

56. Fazakerley, J. Staphylococcal colonization of mucosal and lesional skin sites in atopic and healthy dogs / J. Fazakerley, T. Nuttall, D. Sales [et al.] // Vet. Dermatol. -2009. - Vol. 20. - P. 179-184.

57. Fazakerley, J. Heterogeneity of Staphylococcus pseudintermedius isolates from atopic and healthy dogs / J. Fazakerley, N. Williams, S. Carter [et al.] // Vet. Dermatol. - 2010. - Vol. 21. - P. 578-585.

58. Feng, Y. Prevalence and characterization of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in pets from South China / Y. Feng, W. Tian, D. Lin [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2012. - Vol. 160. - P. 517-524.

59. Fitzgerald, J.R. The Staphylococcus intermedius group of bacterial pathogens: species re-classification, pathogenesis and the emergence of meticillin resistance / J.R. Fitzgerald // Veterinary Dermatology. - 2009. - Vol. 20. - P. 490-495.

60. Fluit, A.C. Livestock-associated Staphylococcus aureus / A.C. Fluit // Clin. Microbiol. Infect. - 2012. - Vol. 18. - P. 735-744.

61. Foster, G. Staphylococcus lutrae sp. nov., a new coagulase-positive species isolated from otters / G. Foster, H.M. Ross, R.A. Hutson, M.D. Collins // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1997. - V. 65. - P 1571-1578.

62. Fournier, B. Recognition of Staphylococcus aureus by the innate immune system / B. Fournier, D.J. Philpott // Clin. Microbiol. Rev. - 2005. - Vol .18, № 3. - P. 521540.

63. Futagawa-Saito, K. Prevalence and characterization of leukotoxin-producing Staphylococcus intermedius in isolates from dogs and pigeons / K. Futagawa-Saito, T. Sugiyama, S. Karube [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2004. - Vol. 42. - P. 5324-5326.

64. Futagawa-Saito, K. Identification of first exfoliative toxin in Staphylococcus pseudintermedius / K. Futagawa-Saito, S. Makino, F. Sunaga [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2009. - Vol. 301. - P. 176-180.

65. Geoghegan, J.A. Staphylococcus pseudintermedius expresses surface proteins that closely resemble those from Staphylococcus aureus / J.A. Geoghegan, E.J. Smith, P. Speziale [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2009. - Vol. 138. - P. 345-352.

66. Gerstadt, K. Methicillin-resistant Staphylococcus intermedius pneumonia following coronary artery bypass grafting / K. Gerstadt, J.S. Daly, M. Mitchell [et al.] // Clin. Infect. Dis. - 1999. - Vol. 29. - P. 218-219.

67. Gharsa, H. Antimicrobial resistance, virulence genes, and genetic lineages of Staphylococcus pseudintermedius in healthy dogs in Tunisia / H. Gharsa, K.B. Slama, E. Gomez-Sanz [et al.] // Microb. Ecol. - 2013. - Vol. 66. - P. 363-368.

68. Gharsa, H. Characterization of nasal Staphylococcus delphini and Staphylococcus pseudintermedius isolates from healthy donkeys in Tunisia / H. Gharsa, K.B. Slama, E. Gomez-Sanz [et al.] // Equine Vet. J. - 2015. - Vol. 47, № 4. - P. 463-466.

69. Goh, S.H. Identification of Staphylococcus species and subspecies by the chaperonin 60 gene identification method and reverse checkerboard hybridization / S.H. Goh, Z. Santucci, W.E. Kloos [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1997. - Vol. 35. - P. 31163121.

70. Gortel, K. Methicillin resistance among staphylococci isolated from dogs / K. Gortel, K.L. Campbell, I. Kakoma [et al.] // Am. J. Vet. Res. - 1999. - Vol. 60, № 12. -P. 1526-1530.

71. Greene, R.T. Staphylococcus intermedius: current knowledge on a pathogen of veterinary importance / R.T. Greene, C. Lämmler // J. Vet. Med. Serie B. - 1993. - Vol. 40. - P. 206-214.

72. Greiner, M. Bacteraemia in 66 cats and antimicrobial susceptibility of the isolates (1995-2004) / M. Greiner, G. Wolf, K. Hartmann // J. Feline Med. Surg. - 2007. - Vol. 9, № 5. - P. 404-410.

73. Guardabassi, L. Transmission of multiple antimicrobial-resistant Staphylococcus intermedius between dogs affected by deep pyoderma and their owners / L.

Guardabassi, M.E. Loeber, A. Jacobson // Veterinary Microbiology. - 2004a. - Vol. 98. - P. 23-27.

74. Guardabassi, L. Pet animals as reservoirs of antimicrobial-resistant bacteria / L. Guardabassi, S. Schwarz, D.H. Lloyd // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. -2004b. - Vol. 54. - P. 321-332.

75. Hanselman, B. A. Coagulase positive staphylococcal colonization of humans and their household pets / B.A. Hanselman, S.A. Kruth, J. Rousseau, J.S. Weese // Canadian Veterinary Journal. - 2009. - Vol. 50. - P. 954-958.

76. Hajek, V. Staphylococcus intermedius, a new species isolated from animals / V. Hajek // International Journal of Systematic Bacteriology. - 1976. - Vol. 26, № 4. - P. 401-408.

77. Hajek, V. Biochemical properties and differentiation of coagulase-positive staphylococci from rooks and gulls / V. Hajek, J. Balusek // Res. Vet. Sci. - 1988. -Vol. 44. - P. 242-246.

78. Hájek, V. Characterization of coagulase-positive staphylococci isolated from free-living birds / V. Hájek, J. Balusek, V. Horák [et al.] // J. Hyg. Epidemiol. Microbiol. Immunol. - 1991. - Vol. 35. - P. 407-418.

79. Hartmann, F.A. Molecular characterization of Staphylococcus intermedius carriage by healthy dogs and comparison of antimicrobial susceptibility patterns to isolates from dogs with pyoderma / F.A. Hartmann, D.G. White, S.E. West [et al.] // Vet. Microbiol. - 2005. - Vol. 108. - P. 119-131.

80. Hendricks, A. Frequency of superantigen-producing Staphylococcus intermedius isolates from canine pyoderma and proliferation-producing potential of superantigens in dogs / A. Hendricks, H.J. Schuberth, K. Schueler [et al.] // Research in Veterinary Science. - 2002. - Vol. 73. - P.273-277.

81. Himsworth, C.G. Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in rats / C.G. Himsworth, D.M. Patrick, K. Parsons [et al.] // Emerg. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 19, № 1. - P. 169-170.

82. Hirooka, E.Y. Enterotoxigenicity of Staphylococcus intermedius of canine origin / E.Y. Hirooka, E.E. Müller, J.C. Freitas [et al.] // Int. J. Food Microbiol. - 1988. - Vol. 7, № 3. - Р. 185-191.

83. Holm, B.R. Antimicrobial resistance in staphylococci from canine pyoderma: a prospective study of first-time and recurrent cases in Sweden / B.R. Holm, U. Petersson, A. Mörner [et al.] // Vet. Rec. - 2002. - Vol. 151. - P. 600-605.

84. Igimi, S. Staphylococcus schleiferi subsp. coagulans subsp. nov., isolated from the external auditory meatus of dogs with external ear otitis / S. Igimi, E. Takahashi, T. Mitsuoka // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1990. - V. 40. - P. 409 - 411.

85. Igimi, S. Characterization of the most frequently encountered Staphylococcus spp. in cats / S. Igimi, H. Atobe, Y. Tohya, A. Inoue [et al.] // Vet. Microbiol. - 1994. -V. 39. - Р. 255-260.

86. International Working Group on the Staphylococcal Cassette Chromosome elements [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.sccmec.org/Pages/SCC_TypesEN.html (дата обращения: 05.10.2014).

87. Iyori, K. Identification of a novel Staphylococcus pseudintermedius exfoliative toxin gene and its prevalence in isolates from canines with pyoderma and healthy dogs / K. Iyori, J. Hisatsune, T. Kawakami [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2010. - Vol. 312. - P. 169-175.

88. Jee, H. Pyelonephritis associated with Staphylococcus intermedius in a Siberian tiger (Panthera tigris altaica) / H. Jee, B. Pakhrin, I-H. Bae [et al.] // J. Vet. Med. Sci. -2007. - Vol. 69. - P. 851-852.

89. Kadlec, K. Molecular analysis of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius of feline origin from different European countries and North America / K. Kadlec, S. Schwarz, V. Perreten [et al.] // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2010. - Vol. 65. - P. 1826-1828.

90. Kanbar, T. Molekulare Untersuchungen an mutmasslichen Virulenzmechanismen und Antibiotikaresistenzen von Bakterien der Gattung Staphylococcus: Dissertation Dr. med. vet. / Kanbar Talah. - Gießen, 2009. - 187s.

91. Kelesidis, T. Staphylococcus intermedius is not only a zoonotic pathogen, but may also cause skin abscesses in humans after exposure to saliva / T. Kelesidis, S. Tsiodras // Int. J. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 14. - P. 838-841.

92. Kempker, R. Beware of the pet dog: a case of Staphylococcus intermedius infection / R. Kempker, D. Mangalat, T. Kongphet-Tran [et al.] //Am. J. Med. Sci. -2009. -Vol. 338. - P. 425-427.

93. Khambarty, F.M. Application of pulsed-gel electrophoresis to the epidemiological in a food-related outbreak / F.M. Khambarty, R.W. Bennett, D.B. Shah // Epidemiol. Infect. - 1994. - Vol. 113. - P. 75-81.

94. Kikuchi, K. Molecular confirmation of transmission route of Staphylococcus intermedius in mastoid cavity infection from dog saliva / K. Kikuchi, T. Karasawa, C. Piao [et al.] // J. Infect. Chemother. - 2004. - Vol. 10. - P. 46-48.

95. Komori, Y. Characterization of coagulase from Staphylococcus intermedius / N. Iimura, R. Yamashita, H. Sugihara, T. Nikai // J. Nat. Toxins. - 2001. - Vol. 10. - P. 111-118.

96. Kondo, Y. Combination of multiplex PCRs for staphylococcal cassette chromosome mec type assignment: rapid identification system for mec, ccr, and major differences in junkyard regions / Y. Kondo, T. Ito, X.X. Ma [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. - 2007. - Vol. 51, № 1. - P. 264-274.

97. Kwok, A.Y. Species identification and phylogenetic relationships based on partial HSP60 gene sequences within the genus Staphylococcus / A.Y. Kwok, S.C. Su, R.P. Reynolds [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1999. - Vol. 49. - P. 1181-1192.

98. Laarhoven, L.M. Longitudinal study on methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in households / L.M. Laarhoven, P. de Heus, J. van Luijn [et al.] // PLoS One. - 2011. - Vol. 6, № 11. - P. 1-6.

99. Lamers, R.P. Phylogenetic relationships among Staphylococcus species and refinement of cluster groups based on multilocus data / R.P. Lamers, G. Muthukrishnan, T.A. Castoe [et al.] // BMC Evolutionary Biology. - 2012. - Vol. 12. - P. 1-15.

100. Latronico, F. Outbreak of meticillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in a litter of puppies: evidence of vertical perinatal and horizontal transmission / F.

Latronico, A. Moodley, M.D. Abramo [et al.] // Abstract book of the ASM Conference on Meticillin-resistant Staphylococci in Animals: Vet. and Public Health Implications / London, united Kingdom. - 2009. - Vol. 1. - P. 58-59.

101. Lautz, S. Dissemination of the gene encoding exfoliative toxin of Staphylococcus intermedius among strains isolated from dogs during routine microbiological diagnostics / S. Lautz, T. Kanbar, J. Alber [et al.] // J. Vet. Med. B Infect. Dis. Vet. Public Health. - 2006. - Vol. 53. - P. 434-438.

102. Lee, J. Staphylococcus intermedius isolated from dog-bite wounds / J. Lee // J. Infect. - 1994. - Vol. 29. - P. 105.

103. Lee, J. Staphylococcus pseudintermedius not as rare a zoonosis as previously reported [Электронный ресурс] / J. Lee, A. Murray, R.P. Bendall [et al.] // Abstracts of the 24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2014.

- № Р 1815. - Режим доступа: https://www.escmid.org/escmid_library/online_lecture_library.

104. Lilenbaum, W. Prevalence and antimicrobial susceptibility of staphylococci isolated from the skin surface of clinically normal cats / W. Lilenbaum, E.L. Nunes, M.A. Azeredo // Lett. Appl. Microbiol. - 1998. - Vol. 27. - Р. 224-228.

105. Lilenbaum, W. Prevalence and antimicrobial susceptibility of staphylococci isolated from saliva of clinically normal cats / W. Lilenbaum, A.L. Esteves, G.N. Souza // Lett. Appl. Microbiol. - 1999. - Vol. 28. - Р. 448-452.

106. List of prokaryotic names with standing in nomenclature [Электронный ресурс].

- Режим доступа: http://www.bacterio.net/staphylococcus.html (дата обращения: 23.11. 2014).

107. Llorca, I. Endocarditis infecciosa por Staphylococcus intermedius en paciente infectado por VIH. / I. Llorca, S. Gago, J. Sanmartin [et al.] // Enf. Infec. Microbiol. Clin. - 1992. - Vol. 10. - P. 317-318.

108. Lloyd, D.H. Sensitivity to antibiotics amongst cutaneous and mucosal isolates of canine pathogenic staphylococci in the UK, 1980-1996 / D.H. Lloyd , A.I. Lamport, C. Feeney // Vet. Dermatol. - 1996. - Vol. 7. - P. 171-175.

109. Loeffler, A. First report of multiresistant, mecA-positive Staphylococcus intermedius in Europe: 12 cases from a veterinary dermatology referral clinic in Germany / A. Loeffler, M. Linek, A. Moodley [et al.] // Vet. Dermatol. - 2007. - Vol. 18, № 6. - P. 412-421.

110. Lowy, F.D. How Staphylococcus aureus adapts to its host / F.D. Lowy //N. Engl. J. Med. - 2011. - Vol. 364, № 21. - P. 1987-90.

111. Maggs, A. Temporal study of staphylococcal species on the skin of human subjects in isolation and clonal analysis of Staphylococcus capitis by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis / A. Maggs, T. Pennington // J. Clin. Microbiol. - 1989. - Vol. 27. - P. 2627-2632.

112. Magiorakos, A.P. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance // A.P. Magiorakos, A. Srinivasan, R.B. Carey [et al.] / Clin. Microbiol. Infect. - 2012. - Vol. 18, № 3. - P. 268-281.

113. Martins, P.D. Coagulase-positive staphylococci isolated from chicken meat: pathogenic potential and vancomycin resistance / P.D. Martins, T.T. de Almeida, A.P. Basso [et al.] // Foodborne Pathog. Dis. - 2013. - Vol. 10. - P. 771-776.

114. Meerburg, B.G. Rodent-borne diseases and their risks for public health / B.G. Meerburg, G.R. Singleton, A. Kijlstra // Crit. Rev. Microbiol. - 2009. - Vol. 35. - P. 221-270.

115. Miedzobrodzki, J. The first case of a Staphylococcus pseudintermedius infection after joint prosthesis implantation in a dog / J. Miedzobrodzki, A. Kasprowicz, A. Bialecka [et al.] // Pol. J. Microbiol. - 2010. - Vol. 59. - P. 133-135.

116. Moodley, A. Tandem repeat sequence analysis of staphylococcal protein A (spa) gene in methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius / A. Moodley, M. Stegger, N.L. Ben Zakour [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2009. - Vol. 135. - P. 320-326.

117. Moodley, A. Genome sequence of Staphylococcus pseudintermedius strain E140, an ST71 European-associated methicillin-resistant isolate / A. Moodley, M.C. Riley, S.A. Kania [et al.] // Genome Announc. - 2013. - Vol. 1, № 2. - e00207-12.

118. Moodley, A. Antimicrobial resistance in methicillin susceptible and methicillin resistant Staphylococcus pseudintermedius of canine origin: literature review from 1980 to 2013 / A. Moodley, P. Damborg, S.S. Nielsen // Vet. Microbiol. - 2014. - Vol. 171, № 3-4. - P. 337-341.

119. Moon, B.Y. Genetic and phenotypic characterization of methicillin-resistant staphylococci isolated from veterinary hospitals in South Korea / B.Y. Moon, J.H. Youn, S. Shin [et al.] // J. Vet. Diagn. Invest. - 2012. - Vol. 24. - P. 489-498.

120. Morris, D.O. Screening of Staphylococcus aureus, Staphylococcus intermedius, and Staphylococcus schleiferi isolates obtained from small companion animals for antimicrobial resistance: a retrospective review of 749 isolates (2003-04) / D.O. Morris, K.A. Rook, F.S. Shofer [et al.] // Veterinary Dermatology. - 2006. - Vol. 17. - Р. 332337.

121. Murugaiyan, J. Species differentiation within the Staphylococcus intermedius group using a refined MALDI-TOF MS database / J. Murugaiyan, B. Walther, I. Stamm [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. - 2014. - Vol. 20, № 10. - P. 1007-1015.

122. National Center for Biotechnology Information Search database [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov (дата обращения: 09.11.2013).

123. Ohara-Nemoto, Y. Occurrence of staphylococci in the oral cavities of healthy adults and nasal oral trafficking of the bacteria / Y. Ohara-Nemoto, H. Harag, S. Kimura [et al.] // Journal of Medical Microbiology. - 2008 - Vol. 57. - P. 95-99.

124. Paul, N.C. Carriage of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in small animal veterinarians: indirect evidence of zoonotic transmission / N.C. Paul, A. Moodley, G. Ghibaudo [et al.] // Zoonoses Public Health. - 2011a. - Vol. 58. - P. 533539.

125. Paul, N.C. Lack of MRSP detection in healthy dogs attending a Danish referral hospital / N.C. Paul, S.C. Bargman, A. Moodley, L. Guardabassi // Abstract book of the 2nd ASM-ESCMID Conference on Methicillin-resistant Staphylococci in Animals: Vet. and Public Health Implications/ Washington, USA. - 2011b. - Vol. 2. - P. 61-62.

126. Pellerin, J.L. Epidemiosurveillance of antimicrobial compound resistance of Staphylococcus intermedium clinical isolates from canine pyodermas / J.L. Pellerin, P. Bourdeau, H. Sebbag [et al.] // Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. - 1998. - Vol. 21, № 2. - P. 115-133.

127. Performance Standards for Antimicrobial Disk and Dilution Susceptibility Tests for Bacteria Isolated From Animals; Approved Standard - Third Edition. CLSI document M31-A3. - 2010. - Vol. 28. - №8.

128. Perreten, V. Clonal spread of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in Europe and North America: an international multicentre study / V. Perreten, K. Kadlec, S. Schwarz [et al.] // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. -2010. - Vol. 65. - P. 1145-1154.

129. Pilla, R. Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius as causative agent of dairy cow mastitis / R. Pilla, C. Bonura, M. Malvisi [et al.] // Vet. Rec. - 2013. - Vol. 173, № 1. - P. 75-77.

130. Pinchbeck, L.R. Pulsed-field gel electrophoresis patterns and antimicrobial susceptibility phenotypes for coagulase-positive staphylococcal isolates from pustules and carriage sites in dogs with superficial bacterial folliculitis / L.R. Pinchbeck, L.K. Cole, A. Hillier [et al.] // Am. J. Vet. Res. - 2007. - Vol. 68. - Р. 535-542.

131. Pinto, T.S. Evidence for production of a bacteriocin-like substance by Staphylococcus pseudintermedius, inhibitory to Staphylococcus aureus from foods / T.S. Pinto, C.P. de Oliveira, A.C. da Costa [et al.] // Nat. Prod. Res. - 2013. - Vol. 27. -Р. 1098-1101.

132. Pompilio, A. New insights in Staphylococcus pseudintermedius pathogenicity: antibiotic-resistant biofilm formed by a human wound-associated strain [Электронный ресурс] / A. Pompilio, S. De Nicola, V. Crocetta [et al.] // Abstracts of the 24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2014. -№R025. - Режим доступа: https://www.escmid.org/escmid_library/online_lecture_library.

133. Pottumarthy, S. Clinical isolates of Staphylococcus intermedius masquerading as methicillin-resistant Staphylococcus aureus / S. Pottumarthy, J.M. Schapiro, J.L. Prentice [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol. 42. - Р. 5881-5884.

134. Prevost, G. Characterisation of a synergohymenotropic toxin produced by Staphylococcus intermedius / G. Prevost, T. Bouakham, Y. Piemont [et al.] // FEBS Letters. - 1995. - Vol. 376. - P. 135-140.

135. Quitoco, I.M. First report in South America of companion animal colonization by the USA1100 clone of community-acquired meticillin-resistant Staphylococcus aureus (ST30) and by the European clone of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius (ST71) / I.M. Quitoco, M.S. Ramundo, M.C. Silva-Carvalho [et al.] // BMC Res. Notes. - 2013. - Vol. 6, № 336. - P. 1-7.

136. Raoult, D. Emerging clones of bacterial epidemics in the genomic area / D. Raoult // Clinical microbiology and infection. - 2014. - Vol. 20, № 5. - P. 371-372.

137. Rantala, M. Antimicrobial resistance in Staphylococcus spp., Escherichia coli and Enterococcus spp. in dogs given antibiotics for chronic dermatological disorders, compared with non-treated control dogs / M. Rantala, E. Lahti, J. Kuhalampil [et al.] // Acta Vet. Scand. - 2004. - Vol. 45, № 1-2. - P. 37-45.

138. Rubin, J.E. Prevalence, sites of colonization, and antimicrobial resistance among Staphylococcus pseudintermedius isolated from healthy dogs in Saskatoon, Canada / J.E. Rubin, M. Chirino-Trejo // J. Vet. Diagn. Invest. - 2011a. - Vol. 23. - P. 351-354.

139. Rubin, J.E. Urinary tract infection caused by methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in a dog / J.E. Rubin, M.C. Gaunt // Can. Vet. J. - 2011b. - Vol. 52. -P. 162-164.

140. Ruscher, C. Prevalence of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius isolated from clinical samples of companion animals and equidaes / C. Ruscher, A. Lübke-Becker, C.G. Wleklinski [et al.] // Vet. Microbiol. - 2009. - Vol. 136. - P. 197201.

141. Ruscher, C. Widespread rapid emergence of a distinct methicillin- and multidrug-resistant Staphylococcus pseudintermedius (MRSP) genetic lineage in Europe / C. Ruscher, A. Lubke-Becker, T. Semmler [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2010. -Vol. 144. - P. 340-346.

142. Saijonmaa-Koulumies, L.E. Colonization of neonatal puppies by Staphylococcus intermedius / L.E. Saijonmaa-Koulumies, D.H. Lloyd // Vet. Dermatol. - 2002. - Vol. 13. - P. 123-130.

143. Saijonmaa-Koulumies, L.E. Diversity and stability of the Staphylococcus intermedius flora in three birches and their puppies / L.E. Saijonmaa-Koulumies, V. Myllys, D.H. Lloyd // Epidemiol. Infect. - 2003. - Vol. 131. - P. 931-937.

144. Sasaki, A. Characteristics of Staphylococcus intermedius isolates from diseased and healthy dogs / A. Sasaki, A. Shimizu, J. Kawano [et al.] // J. Vet. Med. Sci. - 2005. - Vol. 67. - P. 103-106.

145. Sasaki, T. Reclassification of phenotypically identified Staphylococcus intermedius strains / T. Sasaki, K. Kikuchi, Y. Tanaka [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2007a. - Vol. 45. - P. 2770-2778.

146. Sasaki, T. Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in a veterinary teaching hospital / T. Sasaki, K. Kikuchi, Y. Tanaka [et al.] // J. Clin. Microbiol. -2007b. - Vol. 45. - P. 1118-1125.

147. Sasaki, T. Multiplex-PCR method for species identification of coagulase-positive staphylococcoci / T. Sasaki, S.T. Tsubakishita, Y. Tanaka [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2010. - Vol. 48, № 3. - P. 765-769.

148. Schissler, J.R. Evaluation of Clinical Laboratory Standards Institute interpretive criteria for methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius isolated from dogs / J.R. Schissler, A. Hillier, J.B. Daniels [et al.] // J. Vet. Diagn. Invest. - 2009. - Vol. 21, №5. - P. 684-688.

149. Slettemeas, J. S. Further diversity of the Staphylococcus intermedius group and heterogeneity in the Mbol restriction site used for Staphylococcus pseudintermedius species identification / J.S. Slettemeas, J. Mikalsen, M. Sunde // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. - 2010. - Vol. 22. - P. 756-759.

150. Solyman, S.M. Multilocus sequence typing (MLST) for characterization of methicillin-resistant and methicillin-susceptible clones of Staphylococcus pseudintermedius / S.M. Solyman, C.C. Black, B. Duim [et al.] / Abstract book of the

2nd ASM-ESCMID Conference on Methicillin-resistant Staphylococci in Animals: Vet. and Public Health Implications / Washington, USA. - 2011. - Vol. 2. - P. 17-18.

151. Starlander, G. Cluster of infections caused by methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in humans in a tertiary hospital / G. Starlander, S. Borjesson, U. Gronlund-Andersson [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2014. - Vol. 52. - P. 3118-3120.

152. Stegmann, R. Human infection associated with methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius ST71 / R. Stegmann, A. Burnens, C.A. Maranta, V. Perreten // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2010. - Vol. 65. - P. 2047-2048.

153. Takahashi, T. Phylogenetic relationships of 38 taxa of the genus Staphylococcus based on 16S rRNA gene sequence analysis / T. Takahashi, I. Satoh, N. Kikuchi // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 1999. - Vol. 49. - P. 725-728.

154. Talan, D.A. Frequency of Staphylococcus intermedius as human nasopharyngeal flora / D.A. Talan, D. Staatz, A. Staatz [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. -1989a. - Vol. 27. - P. 2393.

155. Talan, D.A. Staphylococcus intermedius in canine gingiva and canine-infected human wound infections: laboratory characterization of a newly recognized zoonotic pathogen / D.A. Talan, D. Staatz, A. Staatz [et al.] // Clinical Microbiology. - 1989b. -Vol. 27, № 10. - P. 78-81.

156. Talan, D.A. Bacteriologic analysis of infected dog and cat bites / D.A. Talan, D.M. Citron, F.M. Abrahamian [et al.] // N. Engl. J. Med. - 1999. - Vol. 340. - P. 8592.

157. Tanner, M. A. Molecular phylogenetic evidence for noninvasive zoonotic transmission of Staphylococcus intermedius from a canine pet to a human / M.A. Tanner, C.L. Everett, D.C. Youvan // Clinical Microbiology. - 2000. - Vol. 38, № 4. -P. 1628-1631.

158. Terauchi, R. Isolation of exfoliative toxin from Staphylococcus intermedius and its local toxicity in dogs / R. Terauchi, H. Sato, T. Hasegawa [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2003. - Vol. 94. - P. 19-29.

159. The European Bioinformatics Institute [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html (дата обращения: 11.02.2014).

160. Tse, H. Complete genome sequence of the veterinary pathogen Staphylococcus pseudintermedius strain HKU10-03, isolated in a case of canine pyoderma / H. Tse,

H.W. Tsoi, S.P. Leung [et al.] // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193. - Р. 1783-1784.

161. Vandenesch, F. Catheter-related bacteremia associated with coagulase-positive Staphylococcus intermedius / F. Vandenesch, M. Celard, D. Arpin [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 1995. - Vol. 33, № 9. - P. 2508-2510.

162. Van Duijkeren, E. Transmission of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius between infected dogs and cats and contact pets, humans and the environment in households and veterinary clinics / E. van Duijkeren, M. Kamphuuis,

I.C. van der Mije [et al.] // Vet. Microbiol. - 2011. - Vol. 150. - P. 338-343.

163. Van Hoovels L. First case of Staphylococcus pseudintermedius infection in a human / L. Van Hoovels, A. Vankeerberghen, A. Boel [et al.] // J. Clin. Microbiol. -2006. - V. 44, № 12. - Р. 4609-4612.

164. Varaldo, P.E. Staphylococcus delphini sp. nov., a coagulase-positive species isolated from dolphins / P.E. Varaldo, R. Kilpper-Baelz, F. Biavasco [et al.] // Int. J. of Syst. Bact. - 1988. - Vol. 38. - P. 436-439.

165. Wagenaar, J.A. Methicillin-resistant Staphylococcus intermedius (MRSI) infections in dogs and cats; zoonotic potential and environmental contamination / J.A. Wagenaar, M. Kamphuis, C. Van der Mije [et al.] // Abstract book of the ASM Conferences on Antimicrobial Resistance in Zoonotic Bacteria and Foodborne Pathogens / Copenhagen, Denmark. - 2008. - Vol. 1. - Р. 94.

166. Wang, N. Staphylococcus intermedius infections: case report and literature review / N. Wang, A.M. Neilan, M. Klompas // Infectious Disease Reports. - 2013. -Vol. 5. - P. 6-11.

167. Watanabe, S. Genetic diversity of staphylocoagulase genes (coa): insight into the evolution of variable chromosomal virulence factors in Staphylococcus aureus / S. Watanabe, T. Ito, T. Sasaki [et al.] // PLoS One. - 2009. - Vol. 27, № 5. - P. 1-11.

168. Wedley, A. L. Carriage of Staphylococcus species in the veterinary visiting dog population in mainland UK: molecular characterization of resistance and virulence / A.L. Wedley, S. Dawson, T.W. Maddox [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2014. -Vol. 170. - P. 81-88.

169. Weese, J.S. Staphylococcus pseudintermedius necrotizing fasciitis in a dog / J.S. Weese, R. Poma, F. James [et al.] // Can. Vet. J. - 2009. - Vol. 50. - P. 655-656.

170. Weese, J.S. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus and Staphylococcus pseudintermedius in veterinary medicine / J.S. Weese, E. van Duijkeren // Vet. Microbiol. - 2010. - Vol. 140. - P. 418-429.

171. Wertheim, H.F. The role of nasal carriage in Staphylococcus aureus infections / H.F. Wertheim, D.C. Melles, M.C. Vos [et al.] // Lancet Infect. Dis. - 2005. - Vol. 5. -P. 751-762.

172. Windahl, U. Carriage of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in dogs-a longitudinal study / U. Windahl, E. Reimegard, B.S. Holst [et al.] // BMC Vet. Res. - 2012. - Vol. 34. - P. 367-371/

173. Woo, P.C. Guidelines for interpretation of 16S rRNA gene sequence-based results for identification of medically important aerobic Gram-positive bacteria / P.C. Woo, J.L. Teng, J.K. Wu [et al.] // J. Med. Microbiol. - 2009. - Vol. 58. - P.1030-1036.

174. Yamashita, K. Isolation and characterization of Staphylococci from external auditory meatus of dogs with or without otitis externa with special reference to Staphylococcus schleiferi subsp. coagulans isolates / K. Yamashita, A. Shimizu, J. Kawano [et al.] // Vet. Med. Sci. - 2005. - Vol. 67, № 3. - P. 263-268.

175. Youn, J.H. Determination of staphylococcal exotoxins, SCCmec types, and genetic relatedness of Staphylococcus intermedius group isolates from veterinary staff, companion animals, and hospital environments in Korea / J.H. Youn, H.C. Koo, K.J. Ahn [et al.] // J. Vet. Sci. - 2011. - Vol. 12, № 3. - P. 221-226.

176. Yugueros, J. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-encoding gene as a useful taxonomic tool for Staphylococcus spp. / J. Yugueros, A. Temprano, B. Berzal [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2000. - Vol. 38, № 12. - P. 4351-4355.

ПРИЛОЖЕНИЯ

Спектр бактерий рода Staphylococcus, выделенных от больных животных и птиц

№ Вид Собака n=87 Кошка n=29 Свинья n=22 Корова n=92 Курица n=17 Голубь n=1

1 S. intermedius группа (SIG) 53 4 2 - - 1

2 S. schleiferi ssp. Coagulans 5 - - - - -

3 S. aureus - 4 - 4 8 -

4 S. xylosus 4 3 1 9 2 -

5 S. gallinarum - - 4 2 1 -

6 S. schleiferi ssp. Schleiferi 5 1 - - - -

7 S. chromogenes 1 - - 1 - -

8 S. epidermidis 3 - - 4 - -

9 S. haemolyticus - - - 3 - -

10 S. saprophyticus - - - - 1 -

11 S. sciuri - 1 - 3 - -

12 S. caprae 3 - - - - -

13 S. felis - 2 - 1 - -

14 S. lugdunensis - 2 - - - -

15 S. simulans 1 - 2 - - -

16 S. lentus 1 - 1 - - -

17 S. kloosii - - 1 - - -

18 S. piscifermentans 1 - - - - -

19 S. equorum - - - - 1 -

Всего: 77 17 11 27 17 1

Изоляты 8Ю и & БеНШ/вп ээр. coagulans, выделенные в России

№ Штамм Год выделения Место выделения Животное Биохимический набор «STAPHY test 24» Мультипраймерная ПЦР Амплификация и секвенирование ка1 гена Амплификация и секвенирование gap гена

1 D 208 2008 А Собака S. intermedins S. psendintermedins

2 D 408 А Собака S. intermedins S. psendintermedins

3 D 608 А Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

4 D 1008 В Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

5 D 708 А Собака S. intermedins S. psendintermedins

6 D 1108 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

7 D 508 А Собака S. intermedins S. psendintermedins

8 D 1608 2009 В Собака S. intermedins S. schleiferi ssp. coagnlans 8. schleiferi ББр. coagulans S. schleiferi ssp. coagnlans

9 D 1408 А Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

10 D 2009 В Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

11 D 2309 В Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius

12 D 2409 В Собака S. schleiferi ssp. coagnlans S. schleiferi ssp. coagnlans 8. schleiferi ББр. coagulans S. schleiferi ssp. coagnlans

13 D 1909 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

14 D 2109 А Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius

15 D 1709 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

16 D 1208 Нет данных Собака S. intermedins S. psendintermedins

17 D 4110 В Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

18 D 4010 С Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

19 D 4210 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

20 D 4310 С Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius S. psendintermedins

21 D 4510 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

22 D 4810 А Собака S. intermedins S. psendintermedins 8. pseudintermedius

23 D 4910 C Собака S. intermedins S. pseudintermedius

24 D 5910 A Собака S. intermedius S. schleiferi ssp. coagulans S. schleiferi ssp. coagulans S. schleiferi ssp. coagulans

25 D 6210 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

26 D 6510 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius S. pseudintermedius

27 D 3310 C Собака S. intermedius S. pseudintermedius

28 D 3410 A Собака S. intermedius Нет ампликона S. pseudintermedius S. pseudintermedius

29 D 3810 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

30 D 5310 2010 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

31 D 6010 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

32 D 6310 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

33 D 6710 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

34 D 6811 B Собака S. intermedius S. pseudintermedius S. pseudintermedius

35 D 2610 B Собака S. intermedius S. pseudintermedius S. pseudintermedius

36 D 2710 B Собака S. intermedius S. pseudintermedius S. pseudintermedius

37 D 2810 B Собака S. intermedius S. pseudintermedius

38 D 2910 B Собака S. intermedius S. pseudintermedius

39 D 3010 B Собака S. intermedius S. pseudintermedius

40 D 3110 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

41 D 3510 C Собака S. intermedius S. pseudintermedius

42 D 3610 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

43 D 3710 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

44 D 3910 C Собака S. intermedius S. pseudintermedius

45 D 4410 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

46 D 4710 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

47 D 2510 B Собака S. schleiferi spp. Coagulans S. pseudintermedius

48 D 6910 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

49 D 4610 A Кошка S. intermedius Нет ампликона S. pseudintermedius S. pseudintermedius

50 D 6411 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

51 D 3210 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

52 D 5110 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

53 D 5710 A Собака S. intermedius S. pseudintermedius

54 D 7011 В Собака S. schleiferi ssp. coagnlans S. schleiferi ssp. coagnlans S. schleiferi ssp. coagnlans S. schleiferi ssp. coagnlans

55 D 7111 В Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins

56 729 Е Собака S. schleiferi ssp. coagnlans S. intermedins S. schleiferi ssp. coagnlans

57 D 7611 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

58 720 Е Кошка S. intermedins S. psendintermedins

59 D 7311 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

60 728 Е Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins

61 KDH- Е Кошка S. intermedins Нет ампликона S. warneri

62 KDH+ 2011 Е Кошка S. intermedins S. psendintermedins

63 D 7211 В Собака S. intermedins S. psendintermedins

64 D 7411 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

65 D 7511 Нет данных Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. psendintermedins

66 Щ 7 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins

67 щ 11 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

68 d 5 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

69 d 7 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

70 d 8 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

71 d 10 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

72 d 13 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

73 d 14 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

74 d 15 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

75 d 16 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

76 d 50 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

77 d 54 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. psendintermedins

78 d 55 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

79 d 65 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

80 d 66 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

81 d 67 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

82 d 75 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

83 d 85 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

84 d 86 Б Собака S. intermedins S. psendintermedins

85 ё 88 2011 Б Собака Шегте&т 8. р8еиё1Мегтеё1т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

86 ё 51 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

87 ё 72 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

88 ё 52 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

89 ё 58 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

90 ё 76 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

91 ё 81 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

92 ё 87 Б Собака 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

93 10/06 2006 Свинья 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

94 14/06 2006 Свинья 8. Шегте&т 8. р8еиё1Ыегтеё1т

95 1081 2008 Голубь 8. Шегте&т 8. ёе1рЫт 8. ёе1рЫт

96 6829/10 2010 Лошадь 8. Шегте&т 8. ёе1рЫт 8. ёе1рЫт 8. р8еиё1Ыегтеё1т

Условные обозначения: Ветеринарная клиника «4 с хвостиком», Белгород=А;

Ветеринарная клиника, Белгородский ГАУ=В; Ветеринарная клиника «Фауна», Белгород=С; Приют для бездомных животных, Белгород=Б; Ветеринарная клиника, Москва =Е.

Изоляты SIG, выделенные в Германии

Биохимический

№ Штамм Животное набор «STAPHY test 24» Мультиплексная ПЦР Амплификация и секвенирование kat гена Амплификация и секвенирование gap гена

1 1743 Собака S. intermedins S. psendintermedins

2 1745 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. schleiferi ssp. coagulans

3 P 4243 Собака S. intermedins S. psendintermedins

4 P 4363 Собака S. intermedins S. psendintermedins

5 P 4385 Собака S. schleiferi ssp. coagnlans S. psendintermedins S. psendintermedins S. pseudintermedius

6 P 4583 Собака S. intermedins S. psendintermedins

7 P 4283 Собака S. intermedins S. psendintermedins

8 P 4386 Собака S. intermedins S. psendintermedins

9 P 4282 Собака S. intermedins S. psendintermedins

10 P 4474 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. pseudintermedius

11 P 4586 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. pseudintermedius

12 P 4390 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. aureus

13 P 4466 Собака S. intermedins S. psendintermedins

14 P 4528 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. pseudintermedius

15 P 4186 Собака S. intermedins S. psendintermedins

16 P 4191 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins S. pseudintermedius

17 P 4432 Собака S. intermedins S. psendintermedins

18 P 4246 Собака S. intermedins S. psendintermedins

19 P 4204 Собака S. intermedins S. psendintermedins S. psendintermedins

20 P 4242 Собака S. intermedins S. psendintermedins

21 P 4219 Собака S. intermedins S. psendintermedins

Факторы патогенности изолятов 8Ю и & БеНШ/вп ээр. coagulans

№ Изолят Гемолиз а-, Р-, 5- Стафило-коагулаза Фибринолизин Фактор слипания ДНК-аза Лецитиназа LukF LukS н Й со SE-INT SEA SEB SEC SED SEE TSST-1 Протеин А

1 1743 Р + + + + + + + + + - - - - - - -

2 1745 Р + + - + + + + + + - - - - - - +

3 Р 4386 а - - + + + + + + + - - - - - - -

4 Р 4186 а+р - + + + + + + + + - - - - - - -

5 Р 4191 - - - + + + + + + + - - - - - - -

6 Р 4204 а - - - + + + + + + - - - - - - -

7 Р 4219 Р - - + + +/- + + + + - - - - - - -

8 Р 4242 а+р - + + + + + + + + - - - - - - -

9 Р 4243 а - - + + + + + + + - - - - - - -

10 Р 4282 а+р - - - + + + + + + - - - - - - -

11 Р 4283 а+р - - - + + + + + + - - - - - - -

12 Р 4246 +/- - - + + + + + + + - - - - - - -

13 Р 4363 а + + + + + + + + + - - - - - - +

14 Р 4385 а + - - + +/- + + + + - - - - - - -

15 Р 4390 а + - - + + + + + + - - - - - - -

16 Р 4432 - + + + + + + + + + - - - - - - -

17 Р 4474 а + - - + + + + + + - - - - - - -

18 Р 4466 а+р - + + + + + + + + - - - - - - -

19 Р 4583 а+р + - + + + + + + + - - - - - - -

20 Р 4528 а+р + - + + - + + + + - - - - - - -

On LtJ to О LtJ VO LtJ 00 LtJ LtJ On LtJ LtJ LtJ LtJ LtJ to LtJ LtJ О to VO to 00 to to On to to to LtJ to to to

D 3110 D 3010 D 2910 D 2810 D 2710 D 2610 D 2510 D 1709 D 2409 D 2309 D 2109 D 2009 D 1909 D 1608 D 1408 D 1208 D 1108 D 1008 D 708 809 a D 508 Д 408 Д 208 14/06 10/06 P 4586 Изолят

p + "CD p p p + "CD p p + "CD p "CD "CD p + "CD p p + "CD p + "CD + p p + "CD ■ p + "CD p + "CD p + ■CD ■ p + "CD "CD p + "CD p + "CD p Гемолиз a-, ß-, 5-

+ + + + ■ + ■ + + + + + ■ + + + + + + + + ■ Стафило-коагулаза

+ ■ + ■ ■ + + ■ ■ ■ + ■ + + ■ ■ Фибринолизин

+ + + + + + + + + + + ■ + + ■ + + + + Фактор слипания

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + ДНК-аза

+ + ■ + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + ■ Лецитиназа

+ + + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + LukF

+ + + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + EukS

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + SIET

+ + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + SE-INT

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ SEA

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ SEB

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ + ■ ■ SEC

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ SED

+ ■ + ■ + + ■ ■ ■ + ■ ■ SEE

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ TSST-1

■ ■ ■ ■ + + ■ ■ ■ ■ ■ Протеин А

ю О On VO On 00 On On On On On On LtJ On to On On О VO 00 On LtJ to о VO 00

D 6411 D 6310 D 6210 D 6010 D 5910 D 5710 D 5310 D 5110 D 4910 D 4810 D 4710 D 4610 D 4510 D 4410 D 4310 D 4210 D 4010 D 4110 D 3910 D 3810 D 3710 D 3310 D 3610 D 3510 D 3410 D 3210 Изолят

р "CD ■ p p + "CD "CD p + "CD p + "CD p p p p + "CD p + "CD p + "CD p p "CD p + "CD p p "CD "CD p + "CD p + "CD Гемолиз a-, ß-, 5-

+ + + + + + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + Стафило-коагулаза

■ ■ + ■ + ■ ■ ■ ■ ■ + + ■ ■ + Фибринолизин

+ + ■ + + + + + + + + + + + + + + + + + + Фактор слипания

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + ДНК-аза

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Лецитиназа

+ + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + + + LukF

+ + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + + + LukS

+ + + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + + + SIET

+ + + + + + + + + + ■ + + + + + + + + + + + + + + SE-INT

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ SEA

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ SEB

■ ■ ■ + ■ + ■ ■ + + ■ ■ ■ ■ + SEC

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ SED

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ + ■ + + + + SEE

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ TSST-1

■ ■ ■ + + ■ + ■ + + + ■ ■ + ■ + Протеин А

vo vo on vo vo vo ltj vo to vo vo о 00 vo 00 00 00 00 on 00 00 00 ltj 00 to 00 00 о vo 00 on 4^ ltj

4^ to о on ltj о 00 в в D 7611 D 7511 D 7411 D 7311 D 7211 D 7111 D 7011 D 6910 D 6811 D 6710 D 6510 Изолят

p + "cd p + "cd p p + ■cd "cd p + "cd p p + "cd ■cd ■cd p + ■cd p + ■cd p + ■cd p p + "cd p + "cd p + "cd p + "cd p p + "cd "cd p + "cd "cd p + "cd p Гемолиз a-, ß-, 5-

+ + + + + + + + + + ■ + + + + + Стафило-коагулаза

+ + + + + + ■ + + + + ■ Фибринолизин

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Фактор слипания

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + ДНК-аза