Эпидемиологическая характеристика туберкулеза в Кузбассе на фоне пандемии COVID-19 тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Лебедева Ирина Борисовна
- Специальность ВАК РФ00.00.00
- Количество страниц 171
Оглавление диссертации кандидат наук Лебедева Ирина Борисовна
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ХАРАКТЕРИСТИКА ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ТУБЕРКУЛЕЗА И COVID-19 (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1.1 Заболеваемость, распространенность, смертность от туберкулеза
1.2 Генетическая гетерогенность M. tuberculosis
1.3 Множественная лекарственная устойчивость M. tuberculosis
1.4 ВИЧ-инфекция в сочетании с туберкулёзом
1.5 COVID-19
1.6 Современные особенности туберкулеза на фоне COVID-19
1.7 Внутрибольничное распространение COVID-19
1.8 Современные технологии контроля эпидемического процесса инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Программа и план исследования
2.3 Характеристика территории наблюдения
2.4 Материалы исследования
2.5 Методы исследования
2.5.1 Эпидемиологические методы исследования
2.5.2 Клинико-лабораторные методы исследования
2.5.3 Микробиологические методы исследования
2.5.4 Определение лекарственной чувствительности M. tuberculosis
2.5.5 Молекулярно-генетические методы исследования
2.5.5.1 Определение генотипа и геноваринтов SARS-CoV-2
2.5.5.2 Определение генотипа и клональных линий M. tuberculosis
ГЛАВА 3. ОСОБЕННОСТИ ПРОЯВЛЕНИЙ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ТУБЕРКУЛЕЗА НА ТЕРРИТОРИИ КУЗБАССА В ПЕРИОД ПАНДЕМИИ COVID-19
3.1 Характеристика эпидемического процесса туберкулеза в допандемический период
3.2 Характеристика эпидемического процесса туберкулеза в пандемический период
ГЛАВА 4. ОСОБЕННОСТИ ПРОЯВЛЕНИИ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА COVID-19 В КУЗБАССЕ
4.1 Эпидемические циклы СOVID-19 в Кузбассе
4.2 Заболеваемость COVID-19 в различных группах наблюдения
4.3 Смертность и летальность от COVID-19
ГЛАВА 5. МОЛЕКУЛЯРНО- ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА M. TUBERCULOSIS НА ТЕРРИТОРИИ КУЗБАССА
5.1 Изучение роли различных клонов M. tuberculosis в распространении туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью
5.2 Лекарственная устойчивость M. tuberculosis
5.3 Основные клинико-диагностические характеристики туберкулеза, вызванного различными генотипами и субтипами M. tuberculosis
5.4 Распространение геновариантов SARS-CoV-2 на территории Кузбасса
ГЛАВА 6. КЛИНИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА COVID-19 У БОЛЬНЫХ ТУБЕРКУЛЕЗОМ
6.1 Характеристика COVID-19 в основной популяции и у больных туберкулезом
6.2. Характеристика COVID-19 среди больных ВИЧ-инфекцией, осложненной туберкулезом
ГЛАВА 7. ПРОФИЛАКТИКА ВНУТРИБОЛЬНИЧНОГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ SARS-CoV-2 И ПРОТИВОЭПИДЕМИЧЕСКИЕ МЕРОПРИЯТИЯ В ПРОТИВОТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МЕДИЦИНСКИХ ОРГАНИЗАЦИЯХ
7.1 Основные принципы профилактики
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
Приложение А
Приложение Б
Приложение В
ВВЕДЕНИЕ
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Эпидемиология нозокомиального туберкулеза2018 год, кандидат наук Васильева Нэлия Рафаэлевна
Эпидемиологический надзор за туберкулезом в условиях интенсификации эпидемического процесса ВИЧ-инфекции2019 год, доктор наук Пасечник Оксана Александровна
Эпидемиологические особенности туберкулеза и лекарственная устойчивость возбудителя на территориях Северо-Запада России2020 год, кандидат наук Ветров Вячеслав Вячеславович
Молекулярно-эпидемиологическое исследование распространения основных генотипов возбудителя туберкулеза в Северной Азии2018 год, доктор наук Жданова Светлана Николаевна
Эпидемиологический мониторинг и прогнозирование распространения туберкулеза2014 год, кандидат наук Огарков, Олег Борисович
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиологическая характеристика туберкулеза в Кузбассе на фоне пандемии COVID-19»
Актуальность проблемы
Несмотря на более, чем столетний опыт изучения и достигнутые успехи по борьбе с туберкулезом, заболеваемость, смертность и инвалидизация остаются высокими и определяют особую значимость этой проблемы [36,54]. Ежегодно более 10 млн. человек в мире заболевают туберкулезом и 1,6 млн. из них умирают. Туберкулез - 13-я по значимости причина смерти в мире и вторая в группе инфекционных болезней после COVID-19 [212]. Болезнь охватывает все сферы жизни человека и характеризуется неблагоприятной тенденцией к росту доли пациентов с лекарственно-устойчивым туберкулезом [23,97,141]. Среди всех случаев туберкулеза 6,3% приходится на людей, живущих с ВИЧ.
В Российской Федерации за десятилетие, предшествующее пандемии COVID-19, заболеваемость коинфекцией (ВИЧ/ТБ) возросла в 1,6 раза и в 2020 г. составила 6,7 на 100 тыс. населения. Доля пациентов с коинфекцией в структуре всех больных туберкулезом достигла 20,7%, то есть каждый пятый из них был ВИЧ-инфицирован [18,39].
Кузбасс относится к регионам с высокой пораженностью населения как туберкулезом, так и ВИЧ- инфекцией [7].
Глобализация эпидемического процесса - отличительная особенность современных условий [3]. Пандемия COVID-19 значительно повлияла на эпидемический процесс многих инфекций [34,56]. Mycobacterium tuberculosis и SARS-CoV-2 имеют общий аэрозольный механизм передачи инфекции [66, 98,133,209] и кумулятивные негативные эффекты на организменном и популяционном уровнях [54,125,208]. Синергия эпидемических процессов туберкулеза и COVID-19 к настоящему времени остается недостаточно изученной.
Длительное пребывание пациентов с туберкулезом на стационарном лечении и невозможность разобщения путем перевода на амбулаторное лечение опре-
делили высокий риск внутрибольничного распространения COVID-19 [199] и необходимость разработки дополнительных мер реагирования в противотуберкулезных учреждениях [176].
Выявление особенностей течения эпидемических процессов с аэрозольным механизмом передачи при одновременной циркуляции разных возбудителей лежит в основе совершенствования обеспечения эпидемиологической безопасности медицинских организаций и может помочь улучшить качество жизни больных туберкулезом [57,102].
Таким образом, изучение интенсивности проявлений эпидемического процесса туберкулеза на фоне распространения COVID-19 и высокой пораженности ВИЧ, циркуляции множественно-лекарственно устойчивых клональных линий M. tuberculosis, риска возникновения внутрибольничного инфицирования COVID-19 обусловливают необходимость совершенствования профилактических мероприятий. Учитывая высокую эффективность мультимодального подхода и риск-ориентированных технологий к решению проблем профилактики, применение их в условиях одновременного эпидемического распространения туберкулеза, ВИЧ-инфекции и COVID-19 может быть перспективным.
Степень разработанности темы
Несмотря на то, что пандемия коронавируса считается завершенной, циркуляция SARS-CoV-2 как сезонного респираторного вируса продолжается. Эпидемический процесс туберкулеза на фоне циркуляции SARS-CoV-2 изучен в немногочисленных работах. Эффекты взаимного влияния возбудителей COVID-19, туберкулеза и ВИЧ-инфекции на популяцию человека описаны преимущественно на африканском континенте. Возможность применения риск - ориентированных технологий и дифференциации профилактических и противоэпидемических мер в системе профилактики внутрибольничного инфицирования больных туберкулезом SARS-CoV-2 обсуждается в единичных исследованиях.
Цель исследования
Обоснование критериев дифференцированного подхода к проведению профилактических и противоэпидемических мер на основе характеристики эпидемического процесса в популяции больных туберкулезом для предупреждения распространения SARS-CoV-2.
Задачи исследования
1. Изучить уровни, динамику, структуру заболеваемости, распространенности и смертности от туберкулеза в допандемический и пандемический периоды.
2. Выявить клинико-эпидемиологические особенности течения COVID-19 в популяции больных туберкулезом.
3. Установить доминирующие и минорные клоны Mycobacterium tuberculosis, определяющие заболеваемость туберкулезом на территории Кузбасса.
4. Установить факторы риска COVID-19 в популяции больных туберкулезом.
5. Разработать комплекс дифференцированных профилактических и противоэпидемических мер внутрибольничного инфицирования COVID-19 в медицинских организациях фтизиопульмонологического профиля, направленных на минимизацию риска внутрибольничного распространения COVID-19.
Научная новизна исследования
В результате выполненного исследования получены новые данные об особенностях проявлений эпидемического процесса туберкулеза в условиях распространения COVID - 19 на территории с высокой пораженностью ВИЧ-инфекции.
Получены данные о доминирующих и минорных клональных линиях Mycobacterium tuberculosis, имеющие наибольшее эпидемиологическое значение для территории Кузбасса.
Выявлены клинико-эпидемиологические особенности течения и факторы риска заболеваемости COVID-19 в популяции больных туберкулезом.
Определены критерии риска COVID-19 и разработан дифференцированный комплекс профилактических и противоэпидемических мер внутрибольничного инфицирования COVID-19 в медицинских организациях противотуберкулезного профиля с позиций риск - ориентированного подхода.
Теоретическая и практическая значимость работы
Выявлены особенности эпидемического процесса туберкулеза в условиях высокой интенсивности сочетанных проявлений эпидемических процессов COVID-19 и ВИЧ-инфекции, имеющие важное теоретическое значение для разработки подходов к обеспечению эпидемиологической безопасности медицинских организаций противотуберкулезного профиля, в том числе изменению функциональной структуры противотуберкулезных организаций и маршрутизации больных туберкулезом, что в конечном итоге влияет на качество оказания медицинской помощи и сокращение финансовых потерь.
Результаты полученных исследований были использованы при подготовке методических рекомендаций «Мониторинг риска внутрибольничного распространения инфекций при угрозе эпидемий с аэрозольным механизмом передачи и противоэпидемические мероприятия в противотуберкулезных медицинских организациях» (утверждены 29 декабря 2023г. Министерством здравоохранения Кузбасса), методических рекомендаций «Аудит эпидемиологической безопасности медицинских технологий. Аудит технологии проведения дезинфекции» (утверждены 28 января 2021г. Министерством здравоохранения Кузбасса) и внедрены в практическую работу медицинских организаций Российской Федерации: акты внедрения в ГБУ РО «Дезинфекционная станция» (акт внедрения №01-03/67 от 08.04.2021г.), ГБУЗ «Санкт-Петербургская городская Дезинфекционная станция» (акт внедрения №01-01-23-236 от 15.12.2021г.), ГБУЗ «Кузбасский клинический фтизиопульмонологический медицинский центр имени И.Ф. Копыловой» (акт внедрения № б/н от 18.03.2024г.), ГБУЗ ТО «Областной клинический фтизио-пульмонологический центр» (акт внедрения №0730 от 29.03.2024г.), в учебный
процесс кафедры эпидемиологии, инфекционных болезней и дерматовенерологии ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (акт внедрения №299/1 от 12.03.2024г.).
Методология и методы исследования
Методологической основой диссертационного исследования послужили труды как отечественных, так и зарубежных авторов в области эпидемиологии, а также основные положения теорий эпидемического процесса. Для разработки дизайна исследования были использованы общенаучные подходы и комплекс эпидемиологических (описательных и аналитических типа «случай-контроль»), микробиологических, молекулярно-генетических, клинико-лабораторных и статистических методов исследования. Для исключения влияния вмешивающихся факторов применен метод метчированных пар.
Положения, выносимые на защиту
1. Эпидемический процесс туберкулеза в Кузбассе в период пандемии COVID-19 развивался в условиях высокой пораженности населения ВИЧ-инфекцией, был обусловлен циркуляцией доминирующей клональной линии Mycobacterium tuberculosis группы Beijing и ее эпидемических кластеров Beijing Central Asian Russian и B0/W148 с высокой лекарственной устойчивостью к противотуберкулезным препаратам и характеризовался высокой интенсивностью проявлений, их гетерогенностью в разных группах с сохраняющейся тенденцией к снижению заболеваемости.
2. К группам высокого риска заболеваемости COVID-19 в популяции больных туберкулезом относились лица с коинфекцией ВИЧ-туберкулез, больные туберкулезом с МЛУ, лица с перенесенным туберкулезом, состоящие на диспансерном учете, пациенты, находящиеся на стационарном лечении. Риск развития вирусной пневмонии, вызванной SARS-CoV-2, у больных туберкулезом был в 2 раза ниже, чем в основной популяции, не болеющей туберкулезом.
3. Для минимизации риска внутрибольничного инфицирования СОУГО-19 в медицинских организациях противотуберкулезного профиля необходим дифференцированный подход к профилактическим и противоэпидемическим мероприятиям в зависимости от значений критериев риска.
Степень достоверности и апробация результатов
Достоверность результатов исследования, выводов и положений, выносимых на защиту, основывается на достаточном по объему репрезентативном материале, использовании современных методов исследования и статистической обработки данных. Комиссия, сформированная в соответствии с приказом ректора ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации №878 от 11.04.2024г., подтвердила подлинность первичных материалов, а также личный вклад автора. Диссертационная работа апробирована на совместном заседании кафедр эпидемиологии и инфекционных болезней; микробиологии и вирусологии, фтизиатрии ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации от 25.06 2024, протокол №14. Результаты работы обсуждены и доложены на конференциях:
• XIX-ой Международной научно-практической конференции «Современный мир: природа и человек» (г. Кемерово, 2020 г.);
• Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы эпидемиологии инфекционных и неинфекционных болезней» (г. Москва, 2020 г.);
• Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Эпидемиологическая безопасность медицинской деятельности» (г. Уфа, 2021 г.);
• Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные вопросы профилактики инфекционных и неинфекционных болезней: эпидемиологические, организационные и гигиенические аспекты» (г. Москва, 2021г.);
• Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Эпидемиологическая безопасность медицинской деятельности
в условиях пандемии COVID-19» (г. Севастополь, 2022г.);
• Межрегиональной научно-практической конференции «Обеспечение эпидемиологической безопасности больничной среды» (г. Кемерово, 2022г.);
• Межрегиональной научно-практической конференции «Эпидемиологические чтения - 2022» (г. Кемерово, 2022г.);
• Межрегиональной научно-практической конференции «Туберкулез как междисциплинарная проблема: коморбидность и химиотерапия» (г. Кемерово, 2023г.);
• Межрегиональной научно-практической конференции «Эпидемиологические чтения - 2023» (г. Кемерово, 2023г.);
• Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные вопросы профилактики инфекционных и неинфекционных болезней: эпидемиологические, организационные и гигиенические аспекты» (г. Москва, 2023г.);
• Региональной юбилейной научно-практической конференции «140 лет со дня основания СПБ ГБУЗ «Санкт- Петербургская городская дезинфекционная станция» (г. Санкт- Петербург, 2023г.);
• III Региональной научно-практической конференции «Современная медицина: новые подходы и актуальные исследования» (г. Кемерово, 2024г.).
Результаты данного исследования опубликованы в 11 печатных работах, в том числе в 4 изданиях, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ для публикации основных положений диссертаций на соискание ученой степени кандидата медицинских наук, в том числе 2 - в изданиях, входящих в базу Scopus.
Объём и структура диссертации
Диссертационная работа изложена на 171 страницах компьютерного текста и включает в себя 32 таблицы и 37 рисунков и состоит из введения, обзора литературы по теме исследования, главы, описывающие материалы и методы исследования, 5 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, 3 приложений. Библиографический указатель содержит 219 источников литературы, в том числе 159 - зарубежных авторов.
Личный вклад автора
Автором была сформулирована цель исследования, определены задачи, объем и программа, объекты и методы исследований, собраны исходные данные. Автор применила совокупность статистических методов, провела детальный анализ лабораторных и эпидемиологических данных, на основании которых разработала методические рекомендации для оптимизации системы мониторинга риска внутрибольничного распространения COVID-19, обосновала поэтапное введение противоэпидемических мероприятий в противотуберкулезных медицинских организациях. Диссертант сформулировала основные положения, выводы диссертации, подготовила публикации и диссертационную работу. В целом, личный вклад в выполнение творческой части исследования - в пределах 90%.
ГЛАВА 1. ХАРАКТЕРИСТИКА ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА ТУБЕРКУЛЕЗА И COVID-19 (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1.1 Заболеваемость, распространенность, смертность от туберкулеза
Туберкулез (ТБ) остается серьезной проблемой общественного здоровья. По оценкам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) в 2022 году в мире ТБ заболели 10,6 млн. человек, в том числе 5,8 млн. мужчин, 3,5 млн. женщин и 1,3 млн. детей. В 2022 году от ТБ умерло 1,3 млн. человек, в том числе 167 тыс. людей, живущих с ВИЧ (ЛЖВ). Каждый день ТБ на Планете заболевает 30 тыс. и умирает 3560 человек [214]. Туберкулез легких - наиболее распространенное проявление заболевания [112]. Совокупное действие человеческого фактора, условий окружающей среды и бактериальной вирулентности определяют тяжесть и форму заболевания человека [97,175]. К основным видам патогенных микобактерий относятся M. tuberculosis, M. bovis, M. africanum, M. microti, M. caprae, M. pinnipedii и M. canettii. Среди них M. tuberculosis является ведущим патогеном, вызывающим ТБ у человека, который был впервые обнаружен Робертом Кохом в 1822 году [190]. Инфицированный человек может выделять M. tuberculosis в окружающую среду до наступления симптомов заболевания [118]. Люди, подвергшиеся воздействию микобактерий туберкулеза (МБТ), остаются клинически бессимптомными из-за развития иммунного ответа, который контролирует репликацию МБТ [94, 189].
Известно, что в конце XIX века ТБ в России был эпидемическим заболеванием, а смертность от ТБ была очень высокой (500 на 100 тыс. населения). Но 100 лет назад в городах Сибири (XVIII в. - первая четверть XIX в.) эпидемическое распространение ТБ было маловероятным, так как этот регион характеризовался
низкой плотностью населения и низким уровнем промышленного развития [78,79].
В начале 90-х годов XX в. после двух десятилетий контролируемой заболеваемости ТБ на территории государств, входивших в состав СССР до его распада, произошел быстрый рост числа случаев ТБ и широкомасштабное распространение ТБ с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ). Основной причиной ухудшения эпидемиологической ситуации были социально-экономические потрясения в стране и нарушение поставок противотуберкулезных препаратов (ПТП) [193]. Эти же факторы способствовали возникновению широкой лекарственной устойчивости ТБ (ШЛУ-ТБ) [116, 152, 174].
По данным Росстата, Кузбасс входит в число 10 субъектов Российской Федерации (РФ), где регистрируются наиболее высокие показатели заболеваемости ТБ, превышающие средние российские в 1,9-3,5 раза и смертности от ТБ - в 2,27,0 раза [51]. ТБ является не только производным уровня жизни населения, но и маркером состояния общества [52, 183].
1.2 Генетическая гетерогенность M. tuberculosis
C развитием методик генотипирования с 1995 года был сделан огромный прогресс в изучении генетических характеристик M. tuberculosis. Анализ данных различных регионов мира позволяет проводить сравнительные исследования и выявлять особенности генетического разнообразия M. tuberculosis. Продолжают развиваться исследования с использованием полногеномного секвенирования [121].
Традиционно считалось, что ТБ является зоонозом, но молекулярно-биологические данные, полученные различными группами исследователей, позволяют предположить, что M. tuberculosis не произошла от M. bovis, а имеет
сложную эволюционную историю. M. tuberculosis эволюционировала вместе с людьми на протяжении тысячелетий, взаимно влияя на их эволюцию [67, 80, 163].
Методы генотипирования, такие как IS6110 - RFLP (IS6110-Restriction Fragment Length Polymorphism, полиморфизм длины рестрикционных фрагментов), сполиготипирование (типирование спейсерных олигонуклеотидов, которое распознается как использование спейсеров массива CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) и MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units- Variable Number of Tandem Repeats, тандемный повтор с повторяющимися микобактериальными единицами с переменным числом) типирование, позволили обнаружить более 2000 генотипов M. tuberculosis. [138, 160].
M. tuberculosis была классифицирована на девять линий, в основном на основе крупномасштабных геномных вариаций, которые по-разному описываются как области различий (RD, Region of Difference) или полиморфизмы больших последовательностей (LSPs, Large Sequence Polymorphisms) [157]. Наиболее распространенные генетические профили были обозначены условными названиями, такими как Beijing, LA-M, Harlem, N, Madrid, T1, Ural и другие. Две филогенетические линии МБТ широко представлены на территории РФ [41]. Одна из них, во-сточноазиатская линия, включает МБТ Beijing, которые широко распространены во многих регионах мира и обладают рядом специфических свойств, таких как высокая трансмиссивность и повышенная выживаемость в макрофагах [171]. Евро-американская линия возникла в бассейне Средиземного моря, а затем миграция людей привела к ее глобальному и подавляющему распространению в Америке и Африке [180]. Для ряда регионов стран Латинской Америки и Африки МБТ этой линии имеют наибольшую эпидемиологическую значимость [151, 172, 207].
Массовая миграция людей, по-видимому, является основным фактором, сформировавшим глобальную филогеографию M. tuberculosis на протяжении длительного периода времени [140]. Ключевыми отличиями территории бывшего СССР от соседних стран являются однородность на всем протяжении и относительная «молодость» основных эпидемических генотипов МБТ [25].
Разнообразие линий M. tuberculosis влияет на исход и тяжесть заболевания, участвуя в адаптации патогенов к иммунному ответу на лечение [191]. Понимание гетерогенности M. tuberculosis необходимо для разработки профилактических мероприятий в рамках борьбы с ТБ [164]. При сравнении популяции M. tuberculosis на территории Западной Сибири, Вязова А.А. с соавт. обнаружили, что в период пандемии COVID-19 в 2020-2021 гг. по сравнению с допандемийным периодом не наблюдалось кардинальных изменений в структуре популяции, тем не менее, было отмечено некоторое снижение Beijing генотипа и увеличение доли и разнообразия non-Beijing изолятов. В целом, высокий уровень распространенности Beijing генотипа и его тесная связь с МЛУ как до, так и во время пандемии являются тревожными особенностями региона Западной Сибири в России [165]. За последние 20 лет была собрана единая картина распространения и эволюции ТБ на территории Российской империи, Советского Союза и стран постсоветского пространства путем филогенетической реконструкции движения современных эпидемических генотипов MBT [25].
Системный подход и совместные усилия исследователей в этой области могут привести к более полному пониманию динамики распространения ТБ и эффективным мерам по его контролю [196, 200].
1.3 Множественная лекарственная устойчивость M. tuberculosis
МЛУ-ТБ является серьезной проблемой, так как усложняет лечение ТБ, снижает его эффективность, приводит к инвалидизации и смертности от ТБ, увеличивает риск распространения инфекции. В докладе ВОЗ отмечается, что лекарственно-устойчивый ТБ в 2022г. составил 18% [185, 201, 215]. К странам с самым высоким бременем МЛУ-ТБ относятся многие страны бывшего Советского Союза (Казахстан, Азербайджан, Беларусь, Молдова, Узбекистан, Таджикистан, Украи-
на, Кыргызстан), несколько стран Африки (Ангола, Демократическая Республика Конго, Мозамбик, Нигерия, Южная Африка, Сомали, Замбия и Зимбабве) и несколько азиатских стран (Индонезия, Пакистан, Монголия, Непал, Филиппины и Бангладеш). В 2022 году у 410 тыс. человек в мире развился устойчивый к ри-фампицину туберкулез (РУ-ТБ). Странами с наибольшей долей впервые выявленных случаев заболевания, у которых развился МЛУ/РУ-ТБ в 2022 году, были Индия - 27%, Филиппины - 7,5% и РФ - 7,5% [212]. Стандартное лечение лекарственно-чувствительного ТБ состоит из комбинации четырех препаратов (изони-азид [INH], рифампицин [RIF], этамбутол [EMB] и пиразинамид [PZA]) в течение 2 месяцев, за которыми следуют INH и RIF в течение 4 месяцев [181].
Рифампицин является одним из ключевых препаратов в рекомендованной ВОЗ схеме лечения ТБ первой линии, а устойчивость к рифампицину представляет собой серьезную проблему для эффективного лечения ТБ [108, 113]. К факторам риска развития лекарственной устойчивости относятся неадекватный курс химиотерапии [65, 90,145], индивидуальные различия в фармакокинетике [161], штаммовые характеристики M. tuberculosis [71, 193].
В 2022 году были разработаны новые методы оценки глобального распространения штаммов с МЛУ на основе устойчивости к рифампину [32].
Россия является страной с высоким уровнем распространения впервые выявленного МЛУ-ТБ. Лечение является эмпирическим и учитывает вероятность МЛУ-ТБ для некоторых генотипов у лиц с впервые в жизни установленным диагнозом [134]. Динамика распространения лекарственно-устойчивого ТБ зависит от того, МБТ каких филогенетических линий преобладают в региональной популяции и от того, какие в генах, ассоциированных с лекарственной устойчивостью, имеются мутации [1].
Важнейшими факторами предотвращения возникновения устойчивости к новым и перепрофилируемым препаратам являются надлежащая поддержка пациентов для обеспечения приверженности лечению, эффективная комбинированная
терапия, включающая несколько классов активных препаратов, и раннее выявление устойчивости для предотвращения дальнейшего распространения [107, 153].
За последние 25 лет был достигнут прогресс в улучшении диагностики лекарственно-устойчивого ТБ и доступа к его лечению. Тем не менее, распространение лекарственно-устойчивого ТБ остается угрозой, а пандемия COVID-19 может обратить вспять многолетний прогресс [58, 61]. По данным Васильевой И.В. и соавт. с 2018 по 2021гг. на территории РФ отмечалось снижение числа больных с МЛУ-ТБ и распространенности МЛУ-ТБ (ежегодный темп снижения - 9,1%). Одновременно в период с 2019-2020 гг. на 20,5% снизилось число ко-инфицированных вирусом иммунодефицита человека и туберкулезом (ВИЧ-ТБ). Тенденция к снижению заболеваемости среди ВИЧ - инфицированных в 2021г. сохранялась, но не была столь выражена - 3,3% [5]. Исследователи считают, что необходимо на основе эпидемиологического мониторинга резистентности M. tuberculosis разрабатывать новые подходы для диагностики и лечения туберкулеза с лекарственной устойчивостью возбудителя и обеспечить эффективную персонифицированную терапию [46].
1.4 ВИЧ-инфекция в сочетании с туберкулёзом
ВИЧ-инфекция считается основным предрасполагающим фактором риска для пациентов, заболевающих ТБ, и увеличивает вероятность прогрессирования заболевания в активную стадию в 18 раз [65]. В то же время исследование, проведенное в 11 странах при участии 9615 пациентов, не установило тесной связи между ВИЧ-инфекцией и устойчивостью к противотуберкулезным препаратам [109]. Факторами риска по данным исследования Хи J. и соавт. для развития ТБ у ЛЖВ, служат- низкое количество CD4 Т-клеток < 200/мкл ^=3,06; 95% ДИ [1,999,- 4,125]), курение ^=1,581; 95% ДИ [1,299- 1,864]),
внутривенное употребление наркотиков (OR=1,862; 95% ДИ [1,521-2,202]), безработица (OR= 1,720; 95% ДИ [1,428-2,013]), мужской пол (OR= 1,623; 95% ДИ [1,395-1,850]), пожилой возраст (OR= 1,517; 95% ДИ [1,319-1,714]), низкий уровень образования (OR= 1,737; 95% ДИ [1,205-2,268]), наличие других оппортунистических инфекций (OR=2,191; 95% ДИ [1,666-2,716]), наличие ТБ в анамнезе (OR=1,669; 95% ДИ [0,674,-2,663]), вовлеченность в коммерческий секс (OR=2,414; 95% ДИ [1,855- 2,972]), возраст 30-45 лет (OR=1,377; 95% ДИ [1,037-1,717]) и длительный анамнез ВИЧ-инфекции (OR= 2,411, 95% ДИ [1,766-3,056]) [169].
Предполагается, что ВИЧ-инфекция также влияет на развитие приобретенной лекарственной устойчивости [140]. Вероятно, иммуносупрессия может изменить частоту бактериальных мутаций in vivo. Этому могут способствовать снижение концентрации лекарств из-за мальабсорбции и приверженности к комплексной множественной лекарственной терапии.
Лица с ВИЧ-инфекций, осложнённой ТБ, получавшие антиретровирусную терапию (АРТ), с большей вероятностью имели благоприятный исход по ТБ в сравнении с лицами, не получавшими АРТ (OR=2,29; 95% ДИ [1,13-4,63], p=0,01). Благоприятный исход заболевания у больных ТБ без ВИЧ - инфекции по сравнению с ВИЧ - инфекцией, осложнённой ТБ, получавших АРТ, наблюдался в 2 раза чаще [75]. Удержание пациентов на АРТ является важным приоритетом [170].
Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Генетическая структура популяции и множественная лекарственная устойчивость Mycobacterium tuberculosis2023 год, доктор наук Вязовая Анна Александровна
Эпидемиологические особенности и совершенствование мер профилактики туберкулеза у ВИЧ-инфицированных2023 год, кандидат наук Тукачёва Ольга Владимировна
Характеристика эпидемического процесса новой коронавирусной инфекции у медицинских работников и эффективность специфической и неспецифической профилактики2024 год, кандидат наук Репин Тимофей Максимович
Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его значение в эпидемическом процессе2005 год, Нарвская, Ольга Викторовна
Эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции, сочетанной с туберкулезом, и оптимизация клинико-микробиологической диагностики туберкулеза у коинфицированных2018 год, кандидат наук Микова Оксана Евстигнеевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Лебедева Ирина Борисовна, 2025 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Андреевская, С. Н. Сравнительная молекулярно-генетическая характеристика культур Mycobacterium tuberculosis, выделенных в Европейской части Российской Федерации в 1998-2003 гг. и 2016-2021 гг. / С. Н. Андреевская, Е. Е. Ларионова, Е. А. Киселева // Туберкулез и болезни легких. - 2023. - Т. 101, № 3. - С. 27-36.
2. Аэрогенный механизм передачи инфекции / Е. Б. Брусина, Е. А. Шишкина, З. Р. Исмагилов [и др.]; под ред. Е. Б. Брусиной. - Кемерово : ФГБОУ ВО «Кемеровский государственный медицинский университет» МЗ РФ, 2022. -171 с.
3. Брико, Н. И. Глобализация и эпидемический процесс / Н. И. Брико, В. И. Покровский // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2010. - № 4. - С. 4-10.
4. Брусина, Е. Б. Аэрогенный механизм передачи больничных патогенов / Е. Б. Брусина, Е. А. Чезганова, О. М. Дроздова // Фундаментальная и клиническая медицина. - 2020. - Т. 5, № 4. - С. 97-103.
5. Васильева, И. А. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в годы пандемии COVID-19 - 2020-2021 гг. / И. А. Васильева, В. В. Тестов, С. А. Стерликов // Туберкулез и болезни легких. - 2022. - Т. 100, № 3. - С. 6-12.
6. Вирусная нагрузка у больных ВИЧ-ассоциированным туберкулёзом при разных генотипах M. tuberculosis / А. А. Герасимова, И. В. Мокроусов, А. М. Пантелеев, А. А. Вязовая // Молекулярная диагностика и биобезопасность-2022: сборник материалов Конгресса с международным участием (Москва, 27-28 апреля 2022 года). - Москва : ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. - С. 53.
7. ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2018 г. / Н. Н. Ладная, В. В. Покровский, Л. А. Дементьева [и др.] // Актуальные вопросы ВИЧ-инфекции: материалы Международной научно-практической конференции (Санкт-
Петербург, 10-11 июня 2019 года). - Санкт-Петербург : Санкт-Петербургская общественная организация «Человек и его здоровье», 2019. - С. 3-12.
8. Гепатотоксические реакции при лечении впервые выявленных больных туберкулезом легких с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя / Р. Ю. Абдуллаев, О. Г. Комиссарова, Е. С. Чумакова [и др.] // Туберкулез и болезни легких. - 2019. - Т. 97, № 7. -С. 21-27.
9. Динамика заболеваемости и этиологической структуры острых респираторных инфекций накануне и в первый год распространения СОУГО-19 в Иркутской области / Н. А. Кравченко, В. Б. Казанова, М. И. Хакимова [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2022. - Т. 21, № 3. -С. 50-62.
10. Измерение рисков причинения вреда здоровью при оказании первичной медико-санитарной помощи / Н. В. Михно, Ю. В. Евстафьева, О. В. Ходакова, Ю. А. Поликарпова // Проблемы социальной гигиены, здравоохранения и истории медицины. - 2023. - Т. 31, № 6. - С. 1384-1389.
11. Как снизить риск появления СОУГО-19 в медорганизации. Чек-лист Национального института качества Росздравнадзора для оценки системы эпидемиологической безопасности стационаров и амбулаторно-поликлинических учреждений / И. В. Иванов, О. В. Ковалишена, О. Р. Швабский [и др.] // Менеджмент качества в медицине. - 2020. - № 2. -С. 24-28.
12. Клинико-лабораторные особенности СОУГО-19 у пациентов с сочетанием ВИЧ-инфекция + туберкулез / Р. С. Альжанов, А. В. Пятибратова, Д. В. Краснов [и др.] // Туберкулез и болезни легких. - 2022. - Т. 100, № 4. - С. 1421.
13. Клинико-лабораторный профиль пациентов с СОУГО-19, госпитализированных в инфекционный стационар г. Москвы в период с мая по июль 2020 года / Л. В. Колобухина, О. А. Бургасова, Л. А. Краева [и др.] // Инфекционные болезни. - 2021. - Т. 19, № 2. - С. 5-15.
14. Клиническая характеристика пациентов с COVID-19, поступающих в отделение интенсивной терапии. Предикторы тяжелого течения / Т. В. Клыпа, М.
B. Бычинин, И. А. Мандель [и др.] // Клиническая практика. - 2020. - Т. 11, № 2. -
C. 6-20.
15. Ковалишена, О. В. Возможности программы Whonet для обеспечения эпидемиологической безопасности медпомощи / О. В. Ковалишена, Д. В. Квашнина, Н. В. Саперкин // Менеджмент качества в медицине. - 2023. - № 3. -С. 53-60.
16. Коморбидные заболевания и прогнозирование исхода COVID-19: результаты наблюдения 13 585 больных, находившихся на стационарном лечении в больницах Московской области / А. В. Молочков, Д. Е. Каратеев, Е. Ю. Огнева [и др.] // Альманах клинической медицины. - 2020. - Т. 48, № S1. - С. 1-10.
17. Кузьменко, С. А. Факторы риска инфицирования Klebsiella pneumoniae пациентов детских медицинских организаций / С. А. Кузьменко, М. А. Шмакова, Е. Б. Брусина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2020. - Т. 19, № 2. - С. 40-47.
18. Лапшина, И. С. Эпидемиология туберкулеза, сочетанного с ВИЧ-инфекцией, в субъектах Российской Федерации с низким уровнем распространенности туберкулеза / И. С. Лапшина, Э. Б. Цыбикова, М. А. Кульпесова // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2022. - № 2. - С. 55-61.
19. Многоцентровое наблюдательное неинтервенционное исследование применения комбинированных противотуберкулезных препаратов при лечении больных туберкулезом легких / Т. Е. Тюлькова, Л. В. Мохирева, А. А. Старшинова [и др.] // Туберкулёз и болезни лёгких. - 2020. - Т. 98, № 8. - С. 4656.
20. МР 3.1.0229-21. Профилактика инфекционных болезней. Рекомендации по организации противоэпидемических мероприятий в медицинских организациях, осуществляющих оказание медицинской помощи пациентам с новой коронавирусной инфекцией (COVID-19) (подозрением на заболевание) в стационарных условиях : методические рекомендации
[Электронный ресурс] // СПС «КонсультантПлюс». - Москва, 2021. - URL: https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_392180/ (дата обращения: 10.05.2024).
21. Мультидисциплинарный подход к оценке рисков возникновения инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в контексте пандемии COVID-19 / Э. В. Жукова, Г. Ю. Никитина, А. В. Ноздрачева [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2021. -Т. 12, № 1. - С. 25-34.
22. Новая коронавирусная инфекция: аспекты комплексной коморбидности / В. В. Шкарин, О. В. Ковалишена, А. А. Муртаева, А. В. Сергеева // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2022. - Т. 21, № 2. -С. 98-107.
23. Новое определение и эпидемиология туберкулеза с широкой лекарственной устойчивостью микобактерий туберкулеза в 2020 году / С. А. Стерликов, И. А. Васильева, Ю. В. Михайлова [и др.] // Туберкулез и болезни легких. - 2023. - Т. 101, № 2. - С. 14-19.
24. Обеспечение эпидемиологической безопасности при катетеризации мочевого пузыря / И. А. Касьянова, Д. В. Квашнина, О. В. Ковалишена, О. М. Сутырина // Журнал МедиАль. - 2020. - № 1 (25). -С. 10-15.
25. Огарков, О. Б. Эпидемиологический надзор за туберкулезом: от молекулярных методов к геномным исследованиям / О. Б. Огарков, Е. Д. Савилов, С. Н. Жданова // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2023. - Т. 22, № 6. -С. 155-161.
26. Олигонуклеотидные праймеры, флуоресцентные ДНК-зонды и способ выявления Mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2-W148 генотипа Beijing в клинических образцах : патент EA032489B1 / Огарков О. Б., Синьков В. В., Жданова С. Н., Рычкова Л. В.; заявитель ФГБУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека». -№ 201700085; заявление 03.02.2017; опубликован 28.06.2019. - 8 с.
27. Оптимизация системы мер борьбы и профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в Российской Федерации / Н. Б. Найговзина, А. Ю. Попова, Е. Е. Бирюкова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2018. - № 1. - С. 6-14.
28. Особенности течения СОУГО-19 у пациентов с коморбидной патологией / М. М. Шарипова, М. В. Ивкина, А. Н. Архангельская [и др.] // Медицинский совет. - 2022. - № 6. - С. 44-49.
29. Особенности течения сочетанной инфекции СОУГО-19 и ВИЧ / Я. М. Еремушкина, Т. К. Кускова, П. Г. Филиппов [и др.] // Врач. - 2022. -Т. 33, № 5. - С. 18-23.
30. Оценка эффективности использования средств индивидуальной защиты персоналом медицинских организаций различного профиля при оказании медицинской помощи пациентам с СОУГО-19 / Е. В. Крюков, Г. Г. Марьин, А. А. Кузин [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2023. - Т. 22, № 5. - С. 33-39.
31. Пандемия СОУГО-19: новый виток нарастания антибиотикорезистентности / В. Г. Акимкин, А. В. Тутельян, Н. И. Шулакова, Е. М. Воронин // Инфекционные болезни. - 2021. - Т. 19, № 3. - С. 133-138.
32. План действий по борьбе с туберкулезом для Европейского региона ВОЗ на 2023-2030 гг. / под ред. : Всемирная организация здравоохранения. Европейское региональное бюро. - Копенгаген: Европейское региональное бюро ВОЗ, 2023. - 112 с.
33. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (СОУГО19) : временные методические рекомендации. Версия 18 (26.10.2023) / сост.: С. Н. Авдеев, Л. В. Адамян, Е. И. Алексеева [и др.]. - Москва, 2023. - 250 с.
34. Профилактическая эффективность отечественных вакцин против новой коронавирусной инфекции при иммунизации сотрудников медицинских организаций / И. В. Фельдблюм, Т. М. Репин, М. Ю. Девятков [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2023. - Т. 22, № 1. - С. 22-27.
35. Ресурсы и деятельность противотуберкулёзных организаций Российской Федерации в 2020-2021 гг.: статистические материалы / И. А. Васильева, С. А. Стерликов, В. В. Тестов [и др.] - Москва: ФГБУ Национальный медицинский исследовательский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний Минздрава РФ, 2022. - 92 с.
36. Ресурсы и деятельность противотуберкулёзных организаций Российской Федерации в 2021-2022 гг.: статистические материалы / И. А. Васильева, С. А. Стерликов, В. В. Тестов [и др.] - Москва: ФГБУ Национальный исследовательский медицинский центр фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний Минздрава РФ, 2023. - 94 с.
37. Риски инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи: проблемы и подводные камни / Н. И. Шулакова, А. В. Тутельян, В. В. Малеев, В. Г. Акимкин // Анализ риска здоровью. - 2023. - № 2. - С. 104-114.
38. Риск-ориентированный подход в системе информационного обеспечения эпидемиологического надзора учреждений родовспоможения / Н. И. Шулакова, А. В. Тутельян, О. А. Квасова [и др.] // Вопросы практической педиатрии. - 2021. - Т. 16, № 6. - С. 161-166.
39. Сергевнин, В. И. Проявления эпидемического процесса туберкулеза среди ВИЧинфицированных в сравнении с общей популяцией населения / В. И. Сергевнин, О. В. Тукачёва // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2023. - № 2. - С. 79-85.
40. Солдатова, С. С. Экономические последствия пандемии «COVID-19» для России / С. С. Солдатова, К. Р. Пивкина // StudNet. - 2020. - Т. 3, № 2. - С. 260-265.
41. Сравнительная молекулярно-генетическая характеристика культур Mycobacterium tuberculosis, выделенных в Европейской части Российской Федерации в 1998-2003 гг. и 2016-2021 гг. / С. Н. Андреевская, Е. Е. Ларионова, Е. А. Киселева [и др.] // Туберкулез и болезни легких. - 2023. -Т. 101, № 3. - С. 27-36.
42. Сравнительный анализ разнообразия линий SARS-CoV-2, циркулирующих в Омской области в 2020-2022 годах / Е. А. Градобоева,
Ж. С. Тюлько, А. В. Фадеев [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. -2022. - Т. 21, № 6. - С. 24-33.
43. Торчинский, Н. В. Доказательная сестринская практика: основы статистического анализа результатов исследований когортных и «случай-контроль» / Н. В. Торчинский, А. Ю. Бражников // Медицинская сестра. - 2009. -№ 7. - С. 33-38.
44. Туберкулез в России [Электронный ресурс] // Эпидемическая ситуация по туберкулезу. - URL: https: //mednet.ru/images/materials/CMT/tuberkulez-2019 .pdf (дата обращения: 10.05.2024).
45. Туберкулез и COVID-19 у детей и подростков - две волны пандемии: опыт и выводы / Е. С. Овсянкина, Л. В. Панова, М. Ф. Губкина [и др.] // Туберкулез и болезни легких. - 2022. - Т. 100, № 2. - С. 6-12.
46. Туберкулез с лекарственной устойчивостью возбудителя: механизмы формирования и методы молекулярно-генетической диагностики / А. Э. Эргешов, С. Н. Андреевская, Т. Г. Смирнова, Л. Н. Черноусова // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2023. - Т. 78, № 6. -C. 609-620.
47. Туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя в странах мира и в Российской федерации / И. А. Васильева, Е. М. Белиловский, С. Е. Борисов, С. А. Стерликов // Туберкулез и болезни легких. - 2017. - Т. 95, № 11. - С. 5-17.
48. Хвостова, М. А. Течение новой коронавирусной инфекции COVID-19 у пациентов с хорошо контролируемой ВИЧ-инфекцией / М. А. Хвостова // Молодежный инновационный вестник. - 2022. - Т. 11, № S1. -С. 217-221.
49. Цыбикова, Э. Б. Смертность от туберкулеза и ВИЧ-инфекции в России в период до и во время пандемии COVID-19 / Э. Б. Цыбикова, И. С. Лапшина // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2023. - Т. 15, № 2. -С. 90-99.
50. Чернявская, О. П. Сходства и различия проявлений эпидемического процесса COVID-19 в России, КНР, США, Беларуси и Швеции / О. П. Чернявская, Д. В. Колодина, Т. Р. Белова // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2023. -Т. 22, № 5. - С. 96-109.
51. Шелкова, Е. С. Ситуация по туберкулезу в мире и России на современном этапе. Перспективы совершенствования мероприятий по ликвидации бремени туберкулеза, с точки зрения эпидемиолога / Е. С. Шелкова // Медицинский алфавит. - 2021. - № 18. - С. 34-46.
52. Шилова, М. В. Распространенность туберкулеза в Российской Федерации в 1970-2019 годах и факторы, оказывающие влияние на ее уровень / М. В. Шилова // Медицинский алфавит. - 2021. - № 18. - С. 23-33.
53. Шкарин, В. В. Новая эра в эволюции инфекционной патологии / В. В. Шкарин, О. В. Ковалишена // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2018. - № 4. - С. 6-16
54. Шкарин, В. В. Роль оппортунистических инфекций в формировании комплексной коморбидности / В. В. Шкарин, Н. В. Саперкин, О. В. Ковалишена // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2019. - Т. 24, № 5-6. - С. 240-248.
55. Эпидемиологическая диагностика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, на современном этапе / О. А. Орлова, А. В. Тутельян, М. Н. Замятин, В. Г. Акимкин // Медицинский алфавит. - 2019. -Т. 3, № 32. - С. 5-10.
56. Эпидемиология и течение инфекционных заболеваний на фоне пандемии COVID-19. Сообщение 1. ВИЧ-инфекция, хронический гепатит с и туберкулез / Н. А. Беляков, Е. В. Боева, З. М. Загдын [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2022. - Т. 12, № 4. - C. 639-650.
57. Яковлев, А. А. О возможных механизмах саморегуляции паразитарных систем в биогеоценозе / А. А. Яковлев, Е. С. Поздеева // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2018. - Т. 73, № 3. - C. 195-205.
58. 25 years of surveillance of drug-resistant tuberculosis: achievements, challenges, and way forward / A. S. Dean, O. Tosas Auguet, P. Glaziou [et al.] // The Lancet Infectious Diseases. - 2022. - Vol. 22, № 7. - P. e191-e196.
59. A new Coronavirus associated with human respiratory disease in China / F. Wu, S. Zhao, B. Yu [et al.] // Nature. - 2020. - Vol. 579, № 7798. - P. 265-269.
60. Abdool Karim, S. S. New SARS-CoV-2 variants - clinical, public health, and vaccine implications / S. S. Abdool Karim, T. de Oliveira // The New England journal of medicine. - 2021. - Vol. 384, № 19. - P. 1866-1868.
61. Accelerating development of new shorter TB treatment regimens in anticipation of a resurgence of multi-drug resistant TB due to the COVID-19 pandemic / S. Tiberi, M. J. Vjecha, A. Zumla [et al.] // International journal of infectious diseases. -2021. - Vol. 113, Suppl 1. - P. S96-S99.
62. Acinetobacter spp.: региональные особенности эпидемиологии / М. А. Шмакова, Н. А. Ефремова, А. Е. Гончаров [и др.] // Медицинский альманах. -2019. - № 1 (58). - С. 23-28.
63. Active tuberculosis, sequelae and COVID-19 co-infection: first cohort of 49 cases / M. Tadolini, L. R. Codecasa, J. M. Garcia-Garcia [et al.] // The European respiratory journal. - 2020. - Vol. 56, № 1. - 2001398.
64. Adeyemo, S. Modeling transmission dynamics of Tuberculosis-HIV Co-Infection in South Africa / S. Adeyemo, A. Sangotola, O. Korosteleva // Epidemiologia (Basel, Switzerland). - 2023. - Vol. 4, № 4. - P. 408-419.
65. Advances in diagnosis of Tuberculosis: an update into molecular diagnosis of Mycobacterium tuberculosis / B. Acharya, A. Acharya, S. Gautam [et al.] // Molecular Biology Reports. - 2020. - Vol. 47, № 5. - P. 4065-4075.
66. Akimkin, V. G. COVID-19 Epidemiology and Diagnosis: Monitoring Evolutionary Changes in the SARS-COV-2 Virus 221 / V. G. Akimkin // Herald of the Russian Academy of Sciences. - 2022. - Vol. 92, № 4. - P. 392-397.
67. Allison, M. J. Documentation of a case of tuberculosis in Pre-Columbian America / M. J. Allison, D. Mendoza, A. Pezzia // The American review of respiratory disease. - 1973. - Vol. 107, № 6. - P. 985-991.
68. An Evaluation of Hospital Practices using Swot Analysis during Covid-19 / M. E. Demirkol, S. Yorgun, H. Esen [et al.] // JAREN. - 2020. -Vol. 6, № 2. - P. 341-351.
69. An Overview of SARS-CoV-2 Etiopathogenesis and recent developments in COVID-19 Vaccines / D. S. Mathew, T. Pandya, H. Pandya [et al.] // Biomolecules. -2023. - Vol. 13, № 11. - P. 1565.
70. An updated meta-analysis on the association between HIV infection and COVID-19 mortality / Y. Wang, R. Feng, J. Xu [et al.] // AIDS. - 2021. - Vol. 35, № 11. - P. 1875-1878.
71. Analysis of Drug-Resistance characteristics and genetic diversity of multi-drug-resistant tuberculosis based on Whole-Genome Sequencing on the Hainan Island, China / J. Wang, C. Yu, Y. Xu [et al.] // Infection and Drug Resistance. - 2023. - Vol. 16. - P. 5783-5798.
72. Analysis of the risk factors for nosocomial bacterial infection in patients with COVID-19 in a tertiary hospital / K. Cheng, M. He, Q. Shu [et al.] // Risk management and healthcare policy. - 2020. - Vol. 13. - P. 2593-2599.
73. Artificial intelligence-based tools to control healthcare associated infections: A systematic review of the literature / A. Scardoni, F. Balzarini, C. Signorelli [et al.] // Journal of infection and public health. - 2020. - Vol. 13, № 8. - P. 1061-1077.
74. Association between tuberculosis and COVID-19 severity and mortality: A rapid systematic review and meta-analysis / Y. Gao, M. Liu, Y. Chen [et al.] // Journal of medical virology. - 2021. - Vol. 93, № 1. - P. 194-196.
75. Association of HIV infection and antiretroviral therapy with the occurrence of an unfavorable TB treatment outcome in a rural district hospital in Eastern Cape, South Africa: A retrospective cohort study / B. J. van de Water, I. Fulcher, S. Cilliers [et al.] // PLoS One. - 2022. - Vol. 17, № 4. - P. e0266082.
76. BA.2 and BA.5 omicron differ immunologically from both BA.1 omicron and pre-omicron variants / A. Rôssler, A. Netzl, L. Knabl [et al.] // Nature communications. - 2022. - Vol. 13, № 1. - P. 7701.
77. Bhargava, A. The potential impact of the COVID-19 response related lock-down on TB incidence and mortality in India / A. Bhargava, H. D. Shewade // The Indian journal of tuberculosis. - 2020. - Vol. 67, № 4S. - P. S139-S146.
78. Bioarchaeological and molecular evidence of tuberculosis in human skeletal remains from 18th-19th century orthodox cemeteries in Irkutsk, Eastern Siberia / N.
Kharlamova, O. Ogarkov, I. Berdnikov [et al.] // Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). -2023. - Vol. 143S. - P. 102368.
79. Blaser, M. J. The equilibria that allow bacterial persistence in human hosts / M. J. Blaser, D. Kirschner // Nature. - 2007. - Vol. 449, № 7164. -P. 843-849.
80. Buzic, I. The paleopathological evidence on the origins of human tuberculosis: a review / I. Buzic, V. Giuffra // Journal of preventive medicine and hygiene. -2020. - Vol. 30, № 1 Suppl 1. - P. E3-E8.
81. Characteristics and outcomes of COVID-19 among people living with HIV at Eka Kotebe General Hospital, Addis Ababa, Ethiopia / N. S. Ahmed, S. S. Nega, N. Deyessa [et al.] // IJID regions. - 2022. - Vol. 5. - P. 124-129.
82. Characteristics and outcomes of COVID-19 in patients with HIV: a multicentre research network study / Y. B. Hadi, S. F. Z. Naqvi, J. T. Kupec, A. R. Sarwari // AIDS. - 2020. - Vol. 34, № 13. - P. F3-F8.
83. Clinical characteristics of 138 hospitalized patients with 2019 novel Coro-navirus-Infected pneumonia in Wuhan, China / D. Wang, B. Hu, C. Hu [et al.] // JAMA.
- 2020. - Vol. 323, № 11. - P. 1061-1069.
84. Clinical characteristics of Coronavirus disease 2019 in China / W. J. Guan, Z. Y. Ni, Y. Hu [et al.] // The New England journal of medicine. - 2020. - Vol. 382, № 18. - P. 1708-1720.
85. Clinical characteristics of COVID-19 and active tuberculosis co-infection in an Italian reference hospital / C. Stochino, S. Villa, P. Zucchi [et al.] // The European respiratory journal. - 2020. - Vol. 56, № 1. - P. 2001708.
86. Clinical characteristics, diagnosis, treatment, and mortality rate of TB/COVID-19 Coinfectetd patients: a systematic review / M. Koupaei, A. Naimi, N. Moafi [et al.] // Frontiers in medicine (Lausanne). - 2021. - Vol. 8. - P. 740593.
87. Clinical course and outcomes of critically ill patients with SARS-CoV-2 pneumonia in Wuhan, China: a single-centered, retrospective, observational study / X. Yang, Y. Yu, J. Xu [et al.] // The Lancet. Respiratory medicine. - 2020. - Vol. 8, № 5.
- P. 475-481.
88. Clinical virology and effect of Covid-19 vaccination and monoclonal antibodies against highly infectious SARS-CoV-2 omicron sub variant BF.7 (BA.5.2.1.7): A systematic review / S. Chenchula, K. C. Amerneni, M. K. Ghanta [et al.] // Virology.
- 2023. - Vol. 584. - P. 38-43.
89. Coexistence of tuberculosis and COVID-19 pneumonia: A presentation of 16 patients from Turkey with their clinical features / §. Gül, E. S. Akalin Karaca, E. Y. Özgün Niksarlioglu [et al.] // Tüberküloz ve toraks. - 2022. - Vol. 70, № 1. - P. 8-14.
90. Combination antituberculosis therapy: Opportunities and challenges to combat drug-resistant tuberculosis / Sudarkodi Sukumar, Md. Zafaryab, Md. Khurshid Alam Khan [et al.] // Combination Therapy Against Multidrug Resistance / editors: Mohmmad Younus Wani, Aijaz Ahmad. - London: Academic Press, 2020. - Chapter 6.
- P. 111-127.
91. Comparison of outcomes in HIV-positive and HIV-negative patients with COVID-19 / J. Venturas, J. Zamparini, E. Shaddock [et al.] // The Journal of infection.
- 2021. - Vol. 83, № 2. - P. 217-227.
92. Contact investigation for tuberculosis: a systematic review and meta-analysis / G. J. Fox, S. E. Barry, W. J. Britton, G. B. Marks // The European respiratory journal. - 2013. - Vol. 41, № 1. - P. 140-156.
93. Convergence of infectious and non-communicable disease epidemics in rural South Africa: a cross-sectional, population-based multimorbidity study / E. B. Wong, S. Olivier, R. Gunda [et al.] // The Lancet. Global health. - 2021. - Vol. 9, № 7. - P. e967-e976.
94. Cooper, A. M. Cell-mediated immune responses in tuberculosis / A. M. Cooper // Annual review of immunology. - 2009. - Vol. 27. - P. 393-422.
95. Corman, V. M. Coronaviren als Ursache respiratorischer Infektionen [Coronaviruses as the cause of respiratory infections] / V. M. Corman, J. Lienau, M. Witzenrath // Der Internist. - 2019. - Vol. 60, № 11. - P. 1136-1145.
96. Coronavirus disease 2019 with comorbid pulmonary tuberculosis: a case report / B. Cao, M. Wei, Y. Du [et al.] // Iranian Red Crescent Medical Journal. - 2020.
- № 22. - P. 22.
97. Coscolla, M. Biological and epidemiological consequences of MTBC Diversity / M. Coscolla // Advances in Experimental Medicine and Biology. - 2017. -Vol. 1019. - P. 95-116.
98. Cough-independent production of viable Mycobacterium tuberculosis in bioaerosol / B. Patterson, W. Bryden, C. Call [et al.] // Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). - 2021. - Vol. 126. - P. 102038.
99. COVID-19 among adults living with HIV: correlates of mortality among public sector healthcare users in Western Cape, South Africa / R. Kassanjee, M. A. Davies, O. Ngwenya [et al.] // Journal of the International AIDS Society. - 2023. - Vol. 26, № 6. - P. e26104.
100. COVID-19 and comorbidities: Deleterious impact on infected patients / H. Ejaz, A. Alsrhani, A. Zafar [et al.] // Journal of infection and public health. - 2020. -Vol. 13, № 12. - P. 1833-1839.
101. COVID-19 and Tuberculosis Coinfection: An Overview of Case Reports/Case Series and Meta-Analysis / W. M. Song, J. Y. Zhao, Q. Y. Zhang [et al.] // Frontiers in Medicine (Lausanne). - 2021. - № 8. - P. 657006.
102. COVID-19 and tuberculosis-threats and opportunities / A. Zumla, B. J. Marais, T. D. McHugh [et al.] // The international journal of tuberculosis and lung disease.
- 2020. - Vol. 24, № 8. - P. 757-760.
103. COVID-19 lung pathogenesis in SARS-CoV-2 autopsy cases / S. Valdebenito, S. Bessis, D. Annane [et al.] // Frontiers in immunology. - 2021. -Vol. 12. - P. 735922.
104. COVID-19/ВИЧ - коинфекция: характеристика пациентов Московского мегаполиса / А. И. Мазус, М. В. Нагибина, Т. П. Бессараб [и др.] // Терапия. - 2021. - Т. 7, № 4. - С. 18-24.
105. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение I: проявления эпидемического процесса COVID-19 / В. Г. Акимкин, А. Ю. Попова, А. А. Плоскирева [и др. ]// Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии.
- 2022. - Т. 99, № 3. - С. 269-286.
106. Daily fluctuations in COVID-19 infection rates under Tokyo's epidemic prevention measures - new evidence from adaptive Fourier decomposition / G. Lu, Z. Yang, W. Qu [et al.] // Frontiers in public health. - 2023. - Vol. 11. - P. 1245572.
107. Defining Bedaquiline Susceptibility, Resistance, Cross-Resistance and Associated Genetic Determinants: A Retrospective Cohort Study / N. A. Ismail, S. V. Omar, L. Joseph [et al.] // EBioMedicine. - 2018. - Vol. 28. - P. 136-142.
108. Definitions and guidelines for research on antibiotic persistence / N. Q. Balaban, S. Helaine, K. Lewis [et al.] // Nature Reviews Microbiology. - 2019. -Vol. 17, № 7. - P. 441-448.
109. Determinants of drug-resistant tuberculosis: analysis of 11 countries / M. A. Espinal, K. Laserson, M. Camacho [et al.] // The international journal of tuberculosis and lung disease. - 2001. - Vol. 5, № 10. - P. 887-893.
110. Development of a knowledge-based healthcare-associated infections surveillance system in China / Y. Cao, Y. Niu, X. Tian [et al.] // BMC medical informatics and decision making. - 2023. - Vol. 23, № 1. - P. 209.
111. Dispersal of Mycobacterium tuberculosis Driven by Historical European Trade in the South Pacific / C. V. Mulholland, A. C. Shockey, H. L. Aung [et al.] // Frontiers in microbiology. - 2019. - Vol. 10. - P. 2778.
112. Donoghue, H. D. Paleomicrobiology of HUMAN TUBERCULOSIS / H. D. Donoghue // Microbiology spectrum. - 2016. - Vol. 4, № 4. - P. 447.
113. Drug resistant TB - latest developments in epidemiology, diagnostics and management / S. Tiberi, N. Utjesanovic, J. Galvin [et al.] // International journal of infectious diseases. - 2022. - Vol. 124, Suppl 1. - P. S20-S25.
114. Early mortality among adults accessing antiretroviral treatment programmes in sub-Saharan Africa / S. D. Lawn, A. D. Harries, X. Anglaret [et al.] // AIDS. - 2008. - Vol. 22, № 15. - P. 1897-1908.
115. Effect of concomitant tuberculosis infection on COVID-19 disease in children: a matched, retrospective cohort study / S. B. Mathur, R. Saxena, P. Pallavi [et al.] // Journal of tropical pediatrics. - 2022. - Vol. 68, № 4. - fmac056.
116. Emergence of Mycobacterium tuberculosis with extensive resistance to second-line drugs // The Annals of pharmacotherapy. - 2006. - Vol. 40, № 5. - P. 10071008.
117. Epidemiology and outcomes of COVID-19 in HIV-infected individuals: a systematic review and meta-analysis / P. Ssentongo, E. S. Heilbrunn, A. E. Ssentongo [et al.] // Scientific reports. - 2021. - Vol. 11, № 1. - P. 6283.
118. Esmail, H. Tuberculosis transmission during the subclinical period: could unrelated cough play a part? / H. Esmail, P. J. Dodd, R. M. G. J. Houben // The Lancet Respiratory Medicine. - 2018. - Vol. 6, № 4. - P. 244-246.
119. Evaluation of manual and electronic healthcare-associated infections surveillance: a multi-center study with 21 tertiary general hospitals in China / W. S. Chen, W. H. Zhang, Z. J. Li [et al.] // Annals of translational medicine. - 2019. - Vol. 7, № 18. - P. 444.
120. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis / E. Shitikov, S. Kolchenko, I. Mokrousov [et al.] // Scientific reports. - 2017. - Vol. 7, № 1. - P. 9227.
121. Eyre, D. W. Infection prevention and control insights from a decade of pathogen whole-genome sequencing / D. W. Eyre // The Journal of hospital infection. -2022. - Vol. 122. - P. 180-186.
122. Factors associated with SARS-CoV-2-related hospital outcomes among and between persons living with and without diagnosed HIV infection in New York State / E. M. Rosenthal, E. S. Rosenberg, W. Patterson [et al.] // PLoS One. - 2022. - Vol. 17, № 5. - P. e0268978.
123. From Alpha to Omicron: how different variants of concern of the SARS-Coronavirus-2 impacted the world / M. Andre, L. S. Lau, M. D. Pokharel [et al.] // Biology (Basel). - 2023. - Vol. 12, № 9. - P. 1267.
124. Genomic analysis of smooth tubercle bacilli provides insights into ancestry and pathoadaptation of Mycobacterium tuberculosis / P. Supply, M. Marceau, S. Mangenot [et al.] // Nature genetics. - 2013. - Vol. 45, № 2. -P. 172-179.
125. George, J. A. COVID-19 and vulnerable populations in Sub-Saharan Africa / J. A. George, M. R. Maphayi, T. Pillay // Advances in experimental medicine and biology. - 2021. - Vol. 1321. - P. 147-162.
126. Glaziou, P. Predicted impact of the COVID-19 pandemic on global tuberculosis deaths in 2020 / P. Glaziou // medRxiv [website]. - 2020. - URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.28.20079582v2 (дата обращения 10.05.2024).
127. Grimes, D. A. An overview of clinical research: the lay of the land / D. A. Grimes, K. F. Schulz // Lancet. - 2002. - Vol. 359, № 9300. - P. 57-61.
128. Hematologic changes predict clinical outcome in recovered patients with COVID-19 / J Mao, R Dai, RC Du [et al.] // Annals of hematology. - 2021. - Vol. 100, № 3. - P. 675-689.
129. Hematological Profiles and Clinical Outcome of COVID-19 Among Patients Admitted at Debre Markos Isolation and Treatment Center, 2020: A Prospective Cohort Study / A. Atnaf, A. A. Shiferaw, W. Tamir [et al.] // Journal of Blood Medicine. - 2022. - Vol. 13. - P. 631-641.
130. Heterogeneous effects of COVID-19 control measures on tuberculosis in South Korea: an analysis of case notification data / H. Kim, Y. A. Kang, H. J. Kim, H. Choi // Respiratory research. - 2022. - Vol. 23, № 1. - P. 56.
131. High resolution discrimination of clinical Mycobacterium tuberculosis complex strains based on single nucleotide polymorphisms / S. Homolka, M. Projahn, S. Feuerriegel [et al.] // PLoS One. - 2012. - Vol. 7, № 7. - P. e39855.
132. Höft, M. A. The immune response to SARS-CoV-2 in people with HIV / M. A. Höft, W. A. Burgers, C. Riou // Cellular & molecular immunology. - 2024. -Vol. 21, № 2. - P. 184-196.
133. Hopewell, P. C. Parallels and mutual lessons in tuberculosis and COVID-19 transmission, prevention, and control / P. C. Hopewell, L. B. Reichman, K. G. Castro // Emerging infectious diseases. - 2021. - Vol. 27, № 3. - P. 681-686.
134. Human immunodeficiency virus and mortality from coronavirus disease 2019: A systematic review and meta-analysis / T. I. Hariyanto, J. Rosalind, K. Chris-
tian, A. Kurniawan // Southern African Journal of HIV Medicine. - 2021. - Vol. 22, № 1. - P. 1220.
135. Hyperinflammatory response in COVID-19: a systematic review / M. J. A. Silva, L. R. Ribeiro, M. I. M. Gouveia [et al.] // Viruses. - 2023. -Vol. 15, № 2. - P. 553.
136. Impact of pathobiological diversity of Mycobacterium tuberculosis on clinical features and lethal outcome of tuberculosis / I. Mokrousov, O. Pasechnik, A. Vyazovaya [et al.] // BMC Microbiology. - 2022. - Vol. 22, № 1. - P. 50.
137. Impact of the COVID-19 pandemic on tuberculosis management in Spain / M. L. Aznar, J. Espinosa-Pereiro, N. Saborit [et al.] // International journal of infectious diseases. - 2021. - Vol. 108. - P. 300-305.
138. Koleske, B. N. The Mycobacterium tuberculosis genome at 25 years: lessons and lingering questions / B. N. Koleske, W. R. Jacobs Jr., W. R. Bishai // The Journal of Clinical Investigation. - 2023. - Vol. 133, № 19. - P. e173156.
139. Lai, J. M. L. Treating More with Less: Effectiveness and Event Outcomes of Antituberculosis Fixed-dose Combination Drug versus Separate-drug Formulation (Ethambutol, Isoniazid, Rifampicin and Pyrazinamide) for Pulmonary Tuberculosis Patients in Real-world Clinical Practice / J. M. L. Lai, S. L. Yang, R. Avoi // Journal of Global Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 11, № 1. - P. 2-6.
140. Latin-American-Mediterranean lineage of Mycobacterium tuberculosis: Human traces across pathogen's phylogeography / I. Mokrousov, A. Vyazovaya, T. Iwamoto [et al.] // Molecular Phylogenetics and Evolution. - 2016. - Vol. 99. - P. 133143.
141. Long-term outcomes of the global tuberculosis and COVID-19 co-infection cohort / Global Tuberculosis Network and TB/COVID-19 Global Study Group; N. Casco, A. L. Jorge, D. J. Palmero [et al.] // The European respiratory journal. - 2023. - Vol. 62, № 5. - P. 2300925.
142. Lv C. R. Epidemiological survey and treatment compliance analysis of AIDS with tuberculosis in Chengdu from 2011 to 2017 / C. R. Lv, C. X. Tang // Chin Nurs Res. - 2019. - Vol. 33. - P. 1508-1513.
143. Major genotype families and epidemic clones of Mycobacterium tuberculosis in Omsk region, Western Siberia, Russia, marked by a high burden of tuberculosis-HIV coinfection / O. Pasechnik, A. Vyazovaya, S. Vitriv [et al.] // Tuberculosis (Edinb). - 2018. - Vol. 108. - P. 163-168.
144. Major Mycobacterium tuberculosis lineages associate with patient country of origin / M. B. Reed, V. K. Pichler, F. Mcintosh [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47, № 4. - P. 1119-1128.
145. Management of patients with multidrug-resistant tuberculosis / C. Lange, R. E. Aarnoutse, J. W. C. Alffenaar [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2019. - Vol. 23, № 6. - P. 645-662.
146. Mitigating SARS-CoV-2 transmission in hospitals: A Systematic Literature Review / C. Y. H. Ng, N. A. Lim, L. X. Y. Bao [et al.] // Public Health Reviews. -2022. - Vol. 43. - P. 1604572.
147. Mokrousov, I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen's pathobiology: Insights from Beijing and Ural families / I. Mokrousov // Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). - 2015. - № 95 (Suppl 1). -P. S167-76.
148. Molecular characteristics of Mycobacterium tuberculosis in the "closed" Russian town with limited population migration / T. Umpeleva, K. Belousova, L. Golu-beva [et al.] // Infection, genetics and evolution. - 2020. - Vol. 79. - P. 104174.
149. Moradi, N. Successful experiences of Hospital Services Quality Resilience during the COVID-19 Pandemic in Iran / N. Moradi, A. Aghaei Hashjin, A. Aryank-hesal // Medical journal of the Islamic Republic of Iran. - 2022. - Vol. 36. - P. 162.
150. Mortality due to TB-COVID-19 coinfection in India / M. S. Kumar, D. Surendran, M. S. Manu [et al.] // The international journal of tuberculosis and lung disease. - 2021. - Vol. 25, № 3. - P. 250-251.
151. Most LAM Mycobacterium tuberculosis strains in Venezuela, but not SIT605, belong to the RDRio subfamily / M. V. Méndez, E. Abadía, M. Sequera [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2020. - Vol. 84. - P. 104380.
152. Multidrug-resistant tuberculosis in Russia: clinical characteristics, analysis of second-line drug resistance and development of standardized therapy / Y. Balabano-
va, M. Ruddy, J. Hubb [et al.] // European journal of clinical microbiology infectious diseases. - 2005. - Vol. 24, № 2. - P. 136-139.
153. Ndjeka, N. Bedaquiline and clofazimine: successes and challenges / N. Ndjeka, N. A. Ismail // The Lancet Microbe. - 2020. - Vol. 1, № 4. - P. e139-e140.
154. Nosocomial infections among patients with COVID-19, SARS and MERS: a rapid review and meta-analysis / Q. Zhou, Y. Gao, X. Wang [et al.] // Annals of trans-lational medicine. - 2020. - Vol. 8, № 10. - P. 629.
155. Oh, T. K. Impact of coronavirus disease-2019 on chronic respiratory disease in South Korea: an NHIS COVID-19 database cohort study / T. K. Oh, I. A. Song // BMC pulmonary medicine. - 2021. - Vol. 21, № 1. - P. 12.
156. Omicron: What makes the latest SARS-CoV-2 variant of concern so concerning? / C. Jung, D. Kmiec, L. Koepke [et al.] // Journal of virology. - 2022. - Vol. 96, № 6. - P. e0207721.
157. Origin and Global Expansion of Mycobacterium tuberculosis Complex Lineage 3 / Y. A. Shuaib, C. Utpatel, T. A. Kohl [et al.] // Genes (Basel). - 2022. - Vol. 13, № 6. - P. 990.
158. Oxford, J. Human Virology. Fifth Edition / J. Oxford, P. Kellam, L. Collier. - Great Britain : Oxford University Press, 2016. - 368 pp.
159. Personal protective equipment doffing practices of healthcare workers / L. T. Phan, D. Maita, D. C. Mortiz [et al.] // Journal of Occupational and Environmental Hygiene. - 2019. - Vol. 16, № 8. - P. 575-581.
160. Perspectives for systems biology in the management of tuberculosis / I. Kontsevaya, C. Lange, P. Comella-Del-Barrio [et al.] // European Respiratory Review. - 2021. - Vol. 30, № 160. - P. 200377.
161. Pharmacokinetic features of dolutegravir with rifampicin and rifabutin among patients coinfected with human immunodeficiency virus and tuberculo-sis/mycobacterium avium complex / X. Le, X. Guo, J. Sun [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2022. - Vol. 116. - P. 147-150.
162. Pititto, B. A. Diabetes and covid-19: more than the sum of two morbidities / B. A. Pititto, S. R. G. Ferreira // Revista de saúde pública. - 2020. - Vol. 54. - P. 54.
163. Polymerase chain reaction amplification of a repetitive DNA sequence specific for Mycobacterium tuberculosis / K. D. Eisenach, M. D. Cave, J. H. Bates, J. T. Crawford // The Journal of infectious diseases. - 1990. - Vol. 161, № 5. - P. 977-981.
164. Poonawala, H. A review of published spoligotype data indicates the diversity of Mycobacterium tuberculosis from India is under-represented in global databases / H. Poonawala, N. Kumar, S. J. Peacock // Infection, Genetics and Evolution. - 2020. -Vol. 78. - P. 104072.
165. Population structure of mycobacterium tuberculosis from referral clinics in Western Siberia, Russia: Before and during the Covid-19 pandemic / A. Vyazovaya, I. Felker, Y. Schwartz, I. Mokrousov // Infection, Genetics and Evolution. - 2022. - Vol. 103. - P. 105343.
166. Population structure of mycobacterium tuberculosis in Russian regions bordering EU countries / A. Vyazovaya, N. Solovieva, A. Gerasimova [et al.] // Russian Journal of Infection and Immunity. - 2018. - Vol. 8, № 4. - P. 585.
167. Potential impact of the COVID-19 pandemic on HIV, tuberculosis, and malaria in low-income and middle-income countries: a modelling study / A. B. Hogan, B. L. Jewell, E. Sherrard-Smith X [et al.] // The Lancet. Global health. - 2020. - Vol. 8, № 9. - P. e1132-e1141.
168. Practical strategies to reduce nosocomial transmission to healthcare professionals providing respiratory care to patients with COVID-19 / R. Kaur, T. T. Weiss, A. Perez [et al.] // Critical care (London, England). - 2020. - Vol. 24, № 1. - P. 571.
169. Prevalence and predictors of HIV among Chinese tuberculosis patients by provider-initiated HIV testing and counselling (PITC): a multisite study in South Central of China / J. Xu, W. Tang, S. Cheng [et al.] // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 2. - P. e89723.
170. Prevalence and trends of advanced HIV disease among antiretroviral therapy-naive and antiretroviral therapy-experienced patients in South Africa between 20102021: a systematic review and meta-analysis / M. K. Kitenge, G. Fatti, I. Eshun-Wilson et al. // BMC Infectious Diseases. - 2023. - Vol. 23, № 1. - P. 549.
171. Rapid assay for detection of the epidemiologically important central Asian/Russian Strain of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype / I. Mokrousov, E. Chernyaeva, A. Vyazovaya [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2018. - Vol. 56, № 2. - P. e01551-17.
172. RDRioMycobacterium tuberculosis strains associated with isoniazid resistance in Northern Mexico / V. Bocanegra-García, L. J. Cortez-de-la-Fuente, Y. Nakamura-López [et al.] // Enfermedades infecciosas y microbiología clínica (English ed.). - 2021. - Vol. 39, № 8. - P. 399-402.
173. Research roadmap for tuberculosis transmission science: where do we go from here and how will we know when we're there? / S. C. Auld, A. G. Kasmar, D. W. Dowdy [et al.] // The Journal of infectious diseases. - 2017. - Vol. 216, suppl_6. - P. S662-S668.
174. Resistance of multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis from the Archangel oblast, Russia, to second-line anti-tuberculosis drugs / O. S. Toungoussova, A. O. Mariandyshev, G. Bjune [et al.] // European journal of clinical microbiology infectious diseases. - 2005. - Vol. 24, № 3. - P. 202-206.
175. Risk factors for infectiousness of patients with tuberculosis: a systematic review and meta-analysis / Y. A. Melsew, T. N. Doan, M. Gambhir [et al.] // Epidemiology Infection. - 2018. - Vol. 146, № 3. - P. 345-353.
176. Risks of HAIs: problems and pitfalls / N. I. Shulakova, A. V. Tutelyan, V. V. Maleev, V. G. Akimkin // Health Risk Analysis. - 2023. - № 2. - P. 104-114.
177. Role of MIRU-VNTR and spoligotyping in assessing the genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis in Henan Province, China / J. Shi, D. Zheng, Y. Zhu [et al.] // BMC infectious diseases. - 2018. - Vol. 18, № 1. -P. 447.
178. Roopashree, M. R. To Analyze and Evaluate the Rate of Compliance of Hand Hygiene Practices in a Tertiary Care Hospital: Initiation of Quality Improvement Program and Clinical Audit / M. R. Roopashree // Hospital Topics. - 2024. - Vol. 102, № 1. - P. 52-60.
179. Routine survey of Mycobacterium tuberculosis isolates reveals nosocomial transmission / C. Genestet, R. Paret, C. Pichat [et al.] // The European respiratory journal. - 2020. - Vol. 55, № 3. - P. 1901888.
180. Shin, H. J. Treatment of drug susceptible pulmonary tuberculosis / H. J. Shin, Y. S. Kwon // Tuberculosis and respiratory diseases. - 2015. - Vol. 78, № 3. - P. 161-167.
181. Shortened treatment regimens versus the standard regimen for drug-sensitive pulmonary tuberculosis / A. G. Grace, A. Mittal, S. Jain [et al.] // Cochrane Library: Cochrane Reviews. - 2019. - Vol. 12, № 12. - P. CD012918.
182. Skhairia, M. A. Evolutionary history and spread of the Mycobacterium tuberculosis Latin American and Mediterranean (L4.3/LAM) sublineage, Tunisia / M. A. Skhairia, N. Dekhil, H. Mardassi // Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). - 2023. - Vol. 138. - P. 102297.
183. Social determinants of adherence to treatment for tuberculosis infection and disease among children, adolescents, and young adults: a narrative review / A. M. Led-dy, D. Jaganath, R. Triasih [et al.] // Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society. - 2022. - Vol. 11, Supplement_3. - P. S79-S84.
184. Successes and challenges towards improving quality of primary health care services: a scoping review / A. Endalamaw, R. B. Khatri, D. Erku [et al.] // BMC health services research. - 2023. - Vol. 23, № 1. - P. 893.
185. Surveillance of adverse events in the treatment of drug-resistant tuberculosis: first global report / S. Borisov, E. Danila, A. Maryandyshev [et al.] // European Respiratory Society. - 2019. - Vol. 54, № 6. - P. 1901522.
186. Sy, K. T. L. Previous and active tuberculosis increases risk of death and prolongs recovery in patients with COVID-19 / K. T. L. Sy, N. J. L. Haw, J. Uy // Infectious diseases (London, England). - 2020. - Vol. 52, № 12. -P. 902-907.
187. The association of SARS-CoV-2 infection and tuberculosis disease with unfavorable treatment outcomes: A systematic review / N. K. Vadlamudi, C. A. Basham, J. C. Johnston [et al.] // PLOS global public health. - 2023. - Vol. 3, № 7. - P. e0002163.
188. The COVID-19, tuberculosis and HIV/AIDS: Ménage à Trois / A. J. Udoakang, A. L. Djomkam Zune, K. Tapela [et al.] // Frontiers in immunology. - 2023.
- Vol. 14. - P. 1104828.
189. The immune response in tuberculosis / A. O'Garra, P. S. Redford, F. W. McNab [et al.] // Annual review of immunology. - 2013. - Vol. 31. - P. 475-527.
190. The impact of Mycobacterium tuberculosis complex in the environment on one health approach / H. Zhang, M. Liu, W. Fan [et al.] // Frontiers in Public Health. -2022. - Vol. 10. - P. 994745.
191. The Importance of Heterogeneity to the Epidemiology of Tuberculosis / J. M. Trauer, P. J. Dodd, M. G. M. Gomes [et al.] // Clinical Infectious Diseases. - 2019. -Vol. 69, № 1. - P. 159-166.
192. The intersecting pandemics of tuberculosis and COVID-19: populationlevel and patient-level impact, clinical presentation, and corrective interventions / K. Dheda, T. Perumal, H. Moultrie [et al.] // The Lancet. Respiratory medicine. - 2022. -Vol. 10, № 6. - P. 603-622.
193. The MtZ Strain: molecular characteristics and outbreak investigation of the most successful Mycobacterium tuberculosis Strain in Aragon Using Whole-Genome Sequencing / J. Comin, J. Madacki, I. Rabanaque [et al.] // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. - 2022. - Vol. 12. - P. 887134.
194. The potential impact of the COVID-19 pandemic on the tuberculosis epidemic a modelling analysis / L. Cilloni, H. Fu, J. F. Vesga [et al.] // EClinicalMedicine.
- 2020. - Vol. 28. - P. 100603.
195. Toungoussova, O. S. Epidemic of tuberculosis in the former Soviet Union: social and biological reasons / O. S. Toungoussova, G. Bjune, D. A. Caugant // Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). - 2006. - Vol. 86, № 1. - P. 1-10.
196. Towards reliable whole genome sequencing for outbreak preparedness and response / D. F. Nieuwenhuijse, A. van der Linden, R. H. G. Kohl [et al.] // BMC genomics. - 2022. - Vol. 23, № 1. - P. 569.
197. Transborder molecular analysis of drug-resistant tuberculosis in Mongolia and Eastern Siberia, Russia / S. Zhdanova, I. Mokrousov, E. Orlova [et al.] // Trans-boundary and emerging diseases. - 2022. - Vol. 69, № 5. - P. e1800-e1814.
198. Transformative approach to investigate the Microphysical factors influencing airborne transmission of pathogens / M. Otero Fernandez, R. J. Thomas, H. Oswin [et al.] // Applied and environmental microbiology. - 2020. - Vol. 86, № 23. - P. e01543-20.
199. Transmission of community- and hospital-acquired SARS-CoV-2 in hospital settings in the UK: A cohort study / Y. Mo, D. W. Eyre, S. F. Lumley [et al.] // PLOS Medicine. - 2021. - Vol. 18, № 10. - P. e1003816.
200. Transmission of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in Wuhan, China: A retrospective molecular epidemiological study / Q. Duan, Z. Zhang, D. Tian [et al.] // Medicine (Baltimore). - 2022. - Vol. 101, № 4. - P. e28751.
201. Treatment of Drug-Resistant Tuberculosis. An Official ATS/CDC/ERS/IDSA Clinical Practice Guideline / P. Nahid, S. R. Mase, G. B. Migliori [et al.] // American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. - 2019. - Vol. 200, № 10. - P. e93-e142.
202. Tuberculosis after initiation of antiretroviral therapy in low-income and high-income countries / Antiretroviral Therapy in Low-Income Countries Collaboration of the International epidemiological Databases to Evaluate AIDS (IeDEA); ART Cohort Collaboration ; M. W. Brinkhof, M. Egger, A. Boulle [et al.] // Clinical infectious diseases. - 2007. - Vol. 45, № 11. - P. 1518-1521.
203. Tuberculosis and COVID-19 interaction: A review of biological, clinical and public health effects / D. Visca, C. W. M. Ong, S. Tiberi [et al.] // Pulmonology. -2021. - Vol. 27, № 2. - P. 151-165.
204. Tuberculosis caused by Mycobacterium africanum: Knowns and unknowns / M. L. Silva, B. Ca, N. S. Osorio [et al.] // PLoS pathogens. - 2022. - Vol. 18, № 5. -P. e1010490.
205. Tuberculosis, COVID-19 and migrants: Preliminary analysis of deaths occurring in 69 patients from two cohorts / I. Motta, R. Centis, L. D'Ambrosio [et al.] // Pulmonology. - 2020. - Vol. 26, № 4. - P. 233-240.
206. Turner, R. D. Cough and the transmission of tuberculosis / R. D. Turner, G. H. Bothamley // The Journal of infectious diseases. - 2015. - Vol. 211, № 9. - P. 13671372.
207. Value of urine-based lipoarabinomannan (LAM) antigen tests for diagnosing tuberculosis in children: systematic review and meta-analysis / G. Seid, A. Alemu, T. Tsedalu, B. Dagne // IJID Regions. - 2022. - Vol. 4. - P. 97-104.
208. Viable Mycobacterium tuberculosis in sputum after pulmonary tuberculosis cure / A. Ambreen, M. Jamil, M. A. U. Rahman, T. Mustafa // BMC Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 19, № 1. - P. 923.
209. Wang, J. COVID-19 may transmit through aerosol / J. Wang, G. Du // Irish journal of medical science. - 2020. - Vol. 189, № 4. - P. 1143-1144.
210. Western Cape Department of Health in collaboration with the National Institute for Communicable Diseases, South Africa. Risk factors for Coronavirus disease 2019 (COVID-19) death in a population cohort study from the Western Cape Province, South Africa / Western Cape Department of Health in collaboration with the National Institute for Communicable Diseases, South Africa // Clinical infectious diseases. -2021. - Vol. 73, № 7. - P. e2005-e2015.
211. What we know about tuberculosis transmission: an overview / G. Churchyard, P. Kim, N. S. Shah [et al.] // The Journal of infectious diseases. - 2017. - Vol. 216, suppl_6. - P. S629-S635.
212. World Health Organization. Drug-resistant TB / World Health Organization // Global Tuberculosis Report 2023. - 2023. - URL: https://www.who.int/teams/global-tuberculosis-programme/tb-reports/global-tuberculosis-report-2023/tb-disease-burden/1-3-drug-resistant-tb (дата обращения 10.05.2024).
213. World Health Organization. Global tuberculosis report 2021 / World Health Organization. - Geneva : World Health Organization, 2021. - 57 p.
214. World Health Organization. Global tuberculosis report 2023 / World Health Organization. - Geneva : World Health Organization, 2023. - 75 p.
215. World Health Organization. Guidance for the surveillance of drug resistance in tuberculosis, sixth edition / World Health Organization. - Geneva : World Health Organization, 2020. - 105 p.
216. World Health Organization. WHO COVID-19 dashboard / World Health Organization // World Health Organization : [website]. - 2024. - URL: http s://covid19. who .int/ (дата обращения: 10.05.2024).
217. World Health Organization. World Health Organization (WHO) Information Note. Tuberculosis and COVID-19. COVID-19: Considerations for tuberculosis (TB) care / World Health Organization // World Health Organization : [website]. -2020. - URL: https://www.who.int/docs/default-source/documents/tuberculosis/infonote-tb-covid-19.pdf (дата обращения: 10.05.2024).
21S. Yuki, K. COVID-19 pathophysiology: A review / K. Yuki, M. Fujiogi, S. Koutsogiannaki // Clinical immunology (Orlando, Fla.). - 2020. - Vol. 215. - P. 10S427.
219. Zhang, C. Liver injury in COVID-19: management and challenges / C. Zhang, L. Shi, F. S. Wang // The lancet. Gastroenterology & hepatology. - 2020. - Vol. 5, № 5. - P. 42S-430.
ПРИЛОЖЕНИЯ
Приложение А
Таблица А.1 - Заболеваемость туберкулезом городского и сельского населения
Кемеровской области с 1960 по 2022 гг.
Годы Численность городского населения Абсолютное число заболеваний городские жители Показатель заболеваемости на 100000 населения городского населения Численность сельского населения Абсолютное число заболеваний сельские жители Показатель забо-леваемо-сти на 100000 населения сельского населения
1960 2247800 5165 229,78 621000 822 132,37
1961 2301100 5110 222,07 611900 952 155,58
1962 2310500 5249 227,18 620300 923 148,80
1963 2340500 5325 227,52 619200 784 126,61
1964 2387300 5724 239,77 601600 739 122,84
1965 2403100 5087 211,68 596200 820 137,54
1966 2413800 4118 170,60 584000 608 104,11
1967 2416200 3043 125,94 561500 515 91,72
1968 2407200 2368 98,37 551700 435 78,85
1969 2402100 2451 102,04 539100 433 80,32
1970 2401100 2015 83,92 517000 502 97,10
1975 2490300 1669 67,02 428200 372 86,88
1980 2573200 1307 50,79 399800 307 76,79
1981 2596100 1359 52,35 394300 265 67,21
1985 2721300 1317 48,40 380500 244 64,13
1991 2780600 954 34,31 399600 157 39,29
1992 2706800 1042 38,50 416000 171 41,11
1993 2697400 1227 45,49 405200 185 45,66
1994 2678700 1371 51,18 405000 223 55,06
1995 2574669 1508 58,57 403438 259 64,20
1996 2659200 1643 61,79 404300 294 72,72
1997 2641100 1685 63,80 401900 266 66,19
Годы Численность городского населения Абсолютное число заболеваний городские жители Показатель заболеваемости на 100000 населения городского населения Численность сельского населения Абсолютное число заболеваний сельские жители Показатель забо-леваемо-сти на 100000 населения сельского населения
1998 2600197 2033 78,19 402100 347 86,30
1999 2584510 2413 93,36 400882 401 100,03
2000 2562676 2693 105,09 400763 450 112,29
2001 2545500 2787 109,49 396764 440 110,90
2002 2529145 2847 112,57 388624 494 127,12
2003 2495796 2774 111,15 381980 533 139,54
2004 2446710 3006 122,86 400824 604 150,69
2005 2399608 3090 128,77 419844 774 184,35
2006 2381457 3048 127,99 414513 678 163,57
2007 2371628 2925 123,33 411487 646 156,99
2008 2368085 2871 121,24 410209 666 162,36
2009 2365612 2996 126,65 409049 632 154,50
2010 2360878 2713 114,91 406231 575 141,55
2011 2353871 2761 117,30 402171 479 119,10
2012 2350460 2472 105,17 400369 471 117,64
2013 2345054 2372 101,15 397396 469 118,02
2014 2339804 2243 95,86 394271 428 108,55
2015 2335522 2315 99,12 389468 415 106,56
2016 2330942 2121 90,99 386685 383 99,05
2017 2325436 1980 85,15 383408 319 83,20
2018 2316706 1976 85,29 378171 311 82,24
2019 2300911 1980 86,05 373345 296 79,28
2020 2287237 1462 63,92 370617 258 69,61
2021 2266449 1428 63,01 366997 236 64,31
2022 2242798 1537 68,53 349215 262 75,03
114957061 121580 105,76 20697121 21843 105,54
Таблица А.2 - Заболеваемость туберкулезом мужского и женского населения Кузбасса с 1970 по 2022 гг.
Годы Численность мужчин Абсолютное число заболеваний среди мужчин Показатель забо-леваемо-сти на 100000 мужчин Численность женщин Абсолютное число за-болева-ний среди женщин Показатель за-болева-емости на 100000 женщин
1970 1364695 1569 114,97 1548820 948 61,21
1991 1473322 738 50,09 1436197 374 26,04
1992 1471685 833 56,60 1446087 403 27,87
1993 1467536 990 67,46 1457456 457 31,36
1994 1448509 1123 77,53 1465293 492 33,58
1995 1461107 1263 86,44 1611191 554 34,38
1996 1452632 1292 88,94 1605269 620 38,62
1997 1441836 1324 91,83 1595564 587 36,79
1998 1430245 1605 112,22 1586960 730 46,00
1999 1421659 1870 131,54 1580455 905 57,26
2000 1409935 2138 151,64 1571684 965 61,40
2001 1398205 2188 156,49 1563886 1015 64,90
2002 1385657 2203 158,99 1554864 1102 70,87
2003 1338071 2229 166,58 1544680 1257 81,38
2004 1331588 2445 183,62 1540476 1327 86,14
2005 1307737 2499 191,09 1588283 1432 90,16
2006 1310192 2385 182,03 1528341 1391 91,01
2007 1302664 2219 170,34 1523631 1399 91,82
2008 1301747 2250 172,84 1521792 1346 88,45
2009 1300622 2308 177,45 1521237 1360 89,40
2010 1300345 1989 152,96 1520291 1299 85,44
2011 1265545 2097 165,70 1489741 1219 81,83
2012 1261078 1825 144,72 1489751 1118 75,05
2013 1257442 1754 139,49 1485008 1087 73,20
2014 1254000 1636 130,46 1480100 1035 69,93
2015 1250100 1729 138,31 1474900 1001 67,87
2016 1247016 1599 128,23 1470611 905 61,54
Годы Численность мужчин Абсолютное число заболеваний среди мужчин Показатель забо-леваемо-сти на 100000 мужчин Численность женщин Абсолютное число за-болева-ний среди женщин Показатель за-болева-емости на 100000 женщин
2017 1243543 1439 115,72 1465301 860 58,69
2018 1237413 1455 117,58 1457464 832 57,09
2019 1228157 1477 120,26 1446099 799 55,25
2020 1221648 1139 93,23 1436206 581 40,45
2021 1210004 1065 88,02 1423442 596 41,87
2022 1197707 1147 95,77 1406565 652 46,35
43993642 55822 126,89 51244210 30648 59,81
Таблица А.3 - Заболеваемость туберкулезом детей до 14 лет в Кузбассе с 1981 по
2022 гг.
Годы Численность детского населения до 14 лет Абсолютное число заболеваний среди детей до 14 лет Показатель заболеваемости на 100 тыс. детского населения
1981 646300 105 16,25
1985 701500 69 9,84
1991 715966 89 12,43
1992 706162 93 13,17
1993 706126 110 15,62
1994 684164 116 16,78
1995 656123 135 20,57
1996 646050 118 18,26
1997 616714 110 17,84
1998 592568 133 22,50
1999 564993 155 27,43
2000 536506 163 30,40
Годы Численность детского населения до 14 лет Абсолютное число заболеваний среди детей до 14 лет Показатель заболеваемости на 100 тыс. детского населения
2001 512910 143 28,30
2002 477257 165 34,60
2003 461040 135 29,28
2004 451657 144 31,88
2005 437862 200 45,68
2006 427992 214 50,00
2007 423473 271 63,99
2008 425077 229 53,90
2009 434149 210 48,37
2010 444036 202 45,50
2011 449538 199 43,50
2012 457603 145 31,70
2013 478483 160 33,40
2014 469860 211 44,90
2015 469860 168 35,80
2016 501741 122 24,60
2017 501741 78 15,50
2018 500491 69 13,80
2019 495441 48 9,69
2020 488634 45 9,21
2021 479640 62 12,93
2022 479640 64 13,34
18041297 4680 25,94
Таблица А.4 - Заболеваемость и распространенность множественной лекарственной устойчивости (МЛУ) среди больных туберкулезом в Кузбассе за
период 2009 -2022 гг.
Абсолютное
число Абсолютно Абсолютн ое число больных туберкуле зом органов дыхания, выделяю щих МБТ
Годы больных туберкулезом органов дыхания, выделяющих МБТ с впервые в жизни установленны м диагнозом е число больных туберкулез ом с МЛУ с впервые в жизни установлен ным диагнозом Доля МЛУ (%) 95% ДИ Абсолю тное число больны х туберку лезом с МЛУ Доля МЛУ(%) 95% ДИ
2005 2032 261 12,85 [11,46-14,371 5004 1292 25,84 [24,63-27,05]
2006 1962 265 13,58 [12,06-15,091 4516 1362 30,18 [28,84-31,51]
2007 1831 266 14,60 [12,99-16,221 4094 1503 36,72 [35,25-38,20]
2008 1820 263 14,53 [12,93-16,14] 3929 1434 36,51 [35,01-38,02]
2009 1886 363 19,31 [17,53-21,09] 3869 1620 41,88 [40,33-43,43]
2010 1754 419 23,95 [21,95-25,94] 3928 1772 45,12 [43,56-46,67]
2011 1718 380 22,18 [20,22-24,14] 3985 1823 45,75 [44,20-47,30]
2012 1546 387 25,09 [22,94-27,25] 3782 1744 46,12 [44,53-47,71]
2013 1381 399 28,95 [26,56-31,34] 3564 1597 44,81 [43,18-46,85]
2014 1263 368 29,20 [26,70-31,70] 3282 1667 51,10 [49,39-52,80]
2015 1281 315 24,67 [22,31-27,02] 3121 1631 52,26 [50,50-54,01]
2016 1251 369 29,56 [27,03-30,08] 2879 1615 56,09 [54,28-57,90]
2017 1198 427 35,69 [32,98-38,40] 2745 1581 57,59 [55,74-59,43]
Годы Абсолютное число больных туберкулезом органов дыхания, выделяющих МБТ с впервые в жизни установленны м диагнозом Абсолютно е число больных туберкулез ом с МЛУ с впервые в жизни установлен ным диагнозом Доля МЛУ (%) 95% ДИ Абсолютн ое число больных туберкуле зом органов дыхания, выделяю щих МБТ Абсолю тное число больны х туберку лезом с МЛУ Доля МЛУ(%) 95% ДИ
2018 1342 436 32,54 [30,04-35,04] 2873 1564 54,43 [52,61-56,25]
2019 1399 442 31,64 [29,21-34,08] 2710 1472 54,31 [52,44-56,19]
2020 1079 393 36,47 [33,60-39,34] 2305 1426 61,85 [59,86-63,83]
2021 1019 351 34,50 [31,59-37,42] 2040 1257 61,60 [59,49-63,70]
2022 1141 379 33,27 [30,54-36,00] 1974 1113 56,37 [54,18-58,56]
Всег о 26903 6483 24,10 [23,59-24,61] 60600 27473 45,34 [44,94-45,73]
Таблица А.5 - Заболеваемость ВИЧ - инфекцией населения Кузбасса с 2015 по
2022 гг.
Годы Численность населения Абсолютное число заболеваний ВИЧ -инфекцией Показатель заболеваемости на 100 тыс.населения
2015 2724990 5718 209,84
2016 2717627 5133 188,88
2017 2708844 4605 170,00
2018 2694877 4447 165,02
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.