Эпидемиология нозокомиального туберкулеза тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Васильева Нэлия Рафаэлевна
- Специальность ВАК РФ14.02.02
- Количество страниц 159
Оглавление диссертации кандидат наук Васильева Нэлия Рафаэлевна
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1 НОЗОКОМИАЛЬНАЯ ТУБЕРКУЛЕЗНАЯ ИНФЕКЦИЯ:
ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ПРОФИЛАКТИКА (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1.1 Эпидемиология современного туберкулеза в Российской Федерации и Санкт-Петербурге
1.2 Факторы риска туберкулеза с множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя
1.3 Нозокомиальная туберкулезная инфекция
1.4 Пути и факторы передачи туберкулезной инфекции в лечебно-профилактических учреждениях
1.5 Меры борьбы и профилактики, противоэпидемические мероприятия в стационаре
ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ РЕТРОСПЕКТИВНОГО ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ЗАБОЛЕВАНИЙ ТУБЕРКУЛЕЗОМ ЛЕГКИХ
3.1 Ретроспективный эпидемиологический анализ заболеваний туберкулезом легких у больных, госпитализированных в противотуберкулезный стационар в период 2009 -2013 гг
3.2 Результаты молекулярно-генетического исследования серийных изолятов M. tuberculosis
3.3 Оценка лекарственной устойчивости изолятов M. tuberculosis
3.4 Выявление случаев подозрительных на внутрибольничное заражение
ГЛАВА 4 ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ
НОЗОКОМИАЛЬНОГО ТУБЕРКУЛЕЗА
4.1 Проспективное эпидемиологическое наблюдение за больными
туберкулезом легких в противотуберкулезном стационаре
4.2 Эпидемиологическое расследование случая нозокомиальной
туберкулезной инфекции
4.3 Контаминация внешней среды и предметов медицинского назначения
M. tuberculosis в противотуберкулезном стационаре
4.4 Эпидемиологическое значение бронхоскопов как фактора передачи туберкулезной инфекции
4.5 Предложения по совершенствованию системы инфекционного контроля
в противотуберкулезных учреждениях
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
ВВЕДЕНИЕ
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Эпидемиологический надзор за туберкулезом в условиях интенсификации эпидемического процесса ВИЧ-инфекции2019 год, доктор наук Пасечник Оксана Александровна
Современные подходы у управлению эпидемическим процессом туберкулеза в условиях патоморфоза инфекции2013 год, доктор медицинских наук Аксютина, Людмила Павловна
Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его значение в эпидемическом процессе2005 год, Нарвская, Ольга Викторовна
Эпидемиологические особенности туберкулеза и лекарственная устойчивость возбудителя на территориях Северо-Запада России2020 год, кандидат наук Ветров Вячеслав Вячеславович
Эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции, сочетанной с туберкулезом, и оптимизация клинико-микробиологической диагностики туберкулеза у коинфицированных2018 год, кандидат наук Микова Оксана Евстигнеевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиология нозокомиального туберкулеза»
Актуальность темы исследования
В настоящее время проблема туберкулеза в Российской Федерации входит в ранг проблем государственной важности, и в соответствии с резолюцией 67-й Всемирной Ассамблеи ВОЗ (Всемирная организация здравоохранения) поставлена задача ликвидации туберкулеза к 2050 году [91]. Несмотря на положительную динамику снижения важнейших эпидемиологических показателей (заболеваемости, распространенности, смертности), Российская Федерация остается в перечне стран с высоким бременем туберкулеза [210, 211]. Вместе с тем, ежегодно увеличивается доля больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) возбудителя. Формирование данной когорты происходит как за счет впервые выявленных больных, первично инфицированных МЛУ-штаммом Mycobacterium tuberculosis, так и больных с рецидивами туберкулеза (встречается в 2-2,5 раза чаще) [12, 99]. Данное обстоятельство может быть следствием приобретения штаммами возбудителя устойчивости к противотуберкулезным препаратам (ПТП) в процессе лечения или при заражении новым МЛУ-штаммом, возможно, в период госпитализации в противотуберкулезном стационаре [64, 72, 91, 162, 182].
Показано, что длительное пребывание пациентов в условиях вынужденного контакта c больными туберкулезом, отсутствие или неэффективность работы вентиляционных систем, изоляционных мероприятий, особенности биологических свойств штаммов возбудителя, могут способствовать внутрибольничной передаче штаммов M. tuberculosis, а также реализации искусственных путей передачи (бронхоскопия, спирометрия, ингаляции, сбор мокроты) [64, 84, 114]. Усугубляет ситуацию состояние многих противотуберкулезных стационаров, которое не соответствует санитарно-эпидемиологическим требованиям [87, 99]. Так, наблюдается несоответствие площади на 1 койку нормативным требованиям СанПиНа [83] (в
65,4% стационарах), не предусмотрены изоляционно-ограничительные мероприятия для больных с МЛУ возбудителя (43,3%) [99].
Установлено, что на течение инфекционного и эпидемического процессов оказывают влияние генотипические характеристики штамма возбудителя туберкулеза [4, 17, 18, 32, 37, 48, 61, 183]. В этой связи, особого внимания заслуживают данные о распространении МЛУ-штаммов микобактерий туберкулеза, с передачей которых связаны регистрируемые в мире внутрибольничные вспышки [52, 64, 66, 72, 76, 151, 158, 161, 162, 170, 182]. Примером служат «эпидемические» штаммы M. tuberculosis кластера B0/W148 генетического семейства Beijing, которые, по сравнению со штаммами других генотипов, характеризуются повышенной способностью к передаче, выживанию в макрофагах и высокой степенью ассоциации с МЛУ [3, 4, 11, 17, 18, 127, 152, 155].
Степень разработанности темы исследования
Перекрестная туберкулезная инфекция в противотуберкулезных учреждениях остается недостаточно изученным явлением. В связи с этим отсутствует официальная достоверная статистика, показывающая частоту повторных заражений туберкулезом пациентов. Не изучена клиническая значимость повторного инфицирования пациентов другим штаммом M. tuberculosis, отсутствует система их выявления. Не определены клинико-эпидемиологические критерии постановки данного диагноза [57, 64, 96].
В исследованиях отечественных и зарубежных авторов была показана возможность распространения штаммов M. tuberculosis среди больных туберкулезом легких и персонала, возникновение вспышек [52, 142, 151, 158, 160, 161, 162, 170, 173, 182]. Однако, неясными остаются механизм и факторы передачи возбудителя в противотуберкулезных учреждениях.
При этом роль окружающей среды (контаминация возбудителем поверхностей производственной среды) как фактора передачи туберкулеза оценивается не однозначно. В качестве противоэпидемических мероприятий на первый план вы-
двигаются меры, направленные на предотвращение воздушно-капельного механизма передачи [75, 79, 106], не отрицается возможность передачи микобактерий туберкулеза при проведении лечебно-диагностических процедур [110, 144, 146, 197, 198, 199]. Исследования отечественных авторов показывают, что возбудитель сохраняет свою жизнеспособность и вирулентность на поверхностях производственной среды, устойчив ко многим современным дезинфицирующим средствам, и постоянный производственный контакт с загрязненной возбудителем окружающей средой может иметь неблагоприятные эпидемические последствия [26, 27, 35, 39, 40, 53, 54, 68, 86, 193].
Таким образом, эпидемиология и профилактика нозокомиального туберкулеза являются актуальными вопросами современного здравоохранения. Существует необходимость изучения закономерностей эпидемического процесса, обоснования, разработки и внедрения эпидемиологической диагностики нозокомиаль-ного туберкулеза, основываясь на методах молекулярной генетики, разработки концепции инфекционного контроля для предотвращения случаев внутрибольнич-ного инфицирования в противотуберкулезных стационарах [51, 58, 61, 64, 73].
Цель исследования:
Выявить механизм развития эпидемического процесса нозокомиального туберкулеза в противотуберкулезном стационаре с использованием эпидемиологических и молекулярно-генетических методов исследования.
Задачи исследования:
1. Изучить клинико-эпидемиологические данные больных туберкулезом легких и выявить случаи с вероятным внутрибольничным заражением в противотуберкулезном стационаре.
2. Определить генотип и спектр лекарственной устойчивости штаммов МЛиЪегсиЪзгя, выделенных от больных туберкулезом легких, находящихся на лечении в противотуберкулезном стационаре.
3. Установить частоту случаев нозокомиального туберкулеза, используя эпидемиологические и молекулярно-генетические методы исследования.
4. Выявить факторы риска нозокомиальной передачи M. tuberculosis в противотуберкулезном стационаре.
5. Разработать предложения по совершенствованию системы инфекционного контроля в противотуберкулезных учреждениях.
Научная новизна исследования
Впервые c помощью комплекса эпидемиологических и молекулярно-генетических методов исследования выявлен механизм развития нозокомиального туберкулеза среди пациентов противотуберкулезного стационара. Впервые получены данные о частоте внутрибольничной передачи M. tuberculosis среди больных туберкулезом легких в противотуберкулезном учреждении Санкт-Петербурга. Доказаны актуальность и эпидемиологическое значение бронхоскопических процедур как фактора риска, а бронхоскопов как фактора передачи M. tuberculosis среди пациентов противотуберкулезного стационара.
Теоретическая и практическая значимость исследования
С использованием эпидемиологических и молекулярно-генетических методов исследования доказана передача штаммов M. tuberculosis генотипов Beijing (SIT1) и LAM9 (SIT150, SIT252) среди пациентов и установлены ведущие факторы передачи возбудителя (многоместные палаты, бронхоскопы) в условиях противотуберкулезного стационара. Выявлены особенности развития эпидемического процесса нозокомиальной туберкулезной инфекции.
Предложена и внедрена схема эпидемиологической диагностики случаев нозокомиального туберкулеза с использованием совокупности эпидемиологических и молекулярно-генетических методов исследования штаммов возбудителя.
Методология и методы исследования
Исследование посвящено изучению эпидемического процесса нозокомиального туберкулеза среди больных туберкулезом легких в противотуберкулезном стационаре. В основу работы был положен анализ и синтез информации о внутрибольничных вспышках туберкулезной инфекции, эпидемиологии и профилактике нозокомиального туберкулеза. Структура работы включает в себя ретроспективный эпидемиологический анализ за 5 лет и проспективное эпидемиологическое наблюдение (17 месяцев), молекулярно-генетические исследования M. tuberculosis, исследования объектов окружающей среды.
В работе использованы современные эпидемиологические, молекулярно-генетические (ПЦР, сполиготипирование, MIRU-VNTR - типирование и IS6110-RFLP), бактериологические, статистические методы исследования.
Положения, выносимые на защиту:
1. Комплекс эпидемиологических и молекулярно-генетических методов исследования позволил установить факторы риска нозокомиального инфицирования микобактериями туберкулеза пациентов противотуберкулезного стационара.
2. Внедрение эпидемиологической диагностики с применением молекулярно-генетических методов исследования возбудителя позволяет выявлять случаи нозокомиального туберкулеза.
3. Нозокомиальная передача возбудителя в противотуберкулезном стационаре Санкт-Петербурга ассоциирована с штаммами M. tuberculosis генотипов Beijing и LAM9, обладающими множественной лекарственной устойчивостью к противотуберкулезным препаратам.
Степень достоверности результатов исследования
Степень достоверности полученных результатов исследований определяется достаточным объемом и репрезентативным материалом. Проанализированы 403
медицинские карты пациентов противотуберкулёзного стационара (от 196 пациентов с туберкулезом легких), проведены бактериологические и молекулярно-генетические исследования 143 культур M. tuberculosis и 182 смывов с объектов окружающей среды стационаров. Все исследования выполнены с использованием современных методов исследования, сбора и описания.
Основные положения диссертации, выводы и рекомендации аргументированы, и логически вытекают из системного анализа материала и результатов выполненных исследований. Достоверность полученных результатов и выводов обеспечена использованием адекватных и современных методов исследования, методик проведения расчетов, достаточным объемом анализируемых материалов, апробацией результатов и положений в рецензируемых журналах.
Организация и проведение диссертационного исследования одобрены Комитетом по вопросам этики при ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова» Минздрава России (протокол № 9 от 13.09.2017 г.)
Апробация результатов исследования
Материалы диссертации доложены и обсуждены на международных, Всероссийских и региональных научно-практических конференциях:
Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Профилактическая медицина - 2014», 26 ноября 2014 года, Министерство здравоохранения Российской Федерации, ФГБОУ ВО «СевероЗападный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова»; Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург;
Российско-Китайская научно-практическая конференция по медицинской микробиологии и клинической микологии (XIX Кашкинские чтения), 9-11 июня 2015 года, Министерство здравоохранения Российской Федерации, ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург;
Региональная ежегодная научно-практическая конференция эпидемиологов - 2015 «Актуальные вопросы профилактики инфекционных и неинфекционных заболеваний в Санкт-Петербурге», 24 июня 2015 года, Комитет по здравоохранению, Санкт-Петербург;
IV Конгресс Национальной ассоциации фтизиатров, 19-21 ноября 2015 года, Национальная ассоциация фтизиатров, ФГБУ «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург;
Ежегодная Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи», 23-24 ноября 2015 года, Министерство здравоохранения Российской Федерации, Федеральная служба по надзору сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Москва;
Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Профилактическая медицина - 2015», 25 ноября 2015 года, Министерство здравоохранения Российской Федерации, ФГБОУ ВО «СевероЗападный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург;
Российско-Китайская научно-практическая конференция по медицинской микробиологии и клинической микологии (XIX Кашкинские чтения), 14-16 июня 2016 года, Министерство здравоохранения Российской Федерации, ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург;
26-й Ежегодный Международный конгресс Европейского респираторного общества (ERS), 3-7 сентября 2016 года, Европейское респираторной общество, Лондон (Великобритания);
V-й Конгресс Национальной ассоциации фтизиатров, 17-19 ноября 2016 года, Национальная ассоциация фтизиатров, ФГБУ «Санкт-Петербургский
научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург;
У1-й Конгресс Национальной ассоциации фтизиатров, 23-25 октября 2017 года, Национальная ассоциация фтизиатров, ФГБУ «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург.
Апробация диссертационной работы проведена на заседании кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства Здравоохранения Российской Федерации (протокол совещания №16 от 26.10.2017 г.).
Личный вклад автора
Автором полностью выполнен сбор информации путем выкопировки данных из медицинской документации ФГБУ «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, проведено проспективное эпидемиологическое наблюдение в отделениях данного учреждения, ретроспективное эпидемиологическое исследование. Автор самостоятельно определяла объем и качество выборок клинических изо-лятов и штаммов МЛиЪетсЫозгя для молекулярно-генетических, бактериологических исследований, выполнила смывы с поверхностей окружающей среды и предметов медицинского назначения.
Автор непосредственно принимала участие в планировании, определении методов исследования, лично выполнила анализ литературы, провела формирование базы данных полученных результатов, анализ результатов исследования и статистическую обработку данных.
Молекулярно-генетические исследования выполнены при частичной поддержке Российского научного фонда (РНФ), грантовое соглашение № 14-14-00292 в лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики ФБУН
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера (Санкт-Петербург) совместно со старшим научным сотрудником к.б.н. А. А. Вязовой.
Реализация результатов исследования
Результаты работы внедрены в практическую деятельность специалистов федерального государственного бюджетного учреждения «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации (191036, Санкт-Петербург, Лиговский пр., д.2-4, тел: (812) 775-75-55) (Акт внедрения от 08.08.2017 г.).
Материалы диссертационного исследования использованы при подготовке учебно-методического пособия для врачей «Эпидемиология туберкулеза. Организация профилактических и противоэпидемических мероприятий в очагах туберкулеза» (Санкт-Петербург, 2016) (Акт внедрения от 09.11.2017 г.).
Результаты исследования используются в процессе обучения студентов и врачей эпидемиологов на кафедре эпидемиологии, паразитологии и дезинфектоло-гии федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации (191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41, тел: (812) 303-50-00). Материалы исследования внедрены в практические занятия и лекцию кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии для студентов VI курсов медико-профилактического и лечебного факультетов: «Организация и проведение профилактических и противоэпидемических мероприятий по борьбе с туберкулезом», «Эпидемиология и профилактика туберкулеза и меры борьбы с ним» (Акт внедрения от 16.06.2016 г.).
На основе результатов исследования разработан и опубликован «Проект методических рекомендаций «Противоэпидемический режим в противотуберкулезных медицинских организациях» (Санкт-Петербург, 2015).
Публикации
По материалам диссертации опубликовано 19 работ, в том числе 4 статьи в рецензируемых научных изданиях, журналах, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки Российской Федерации.
Объем и структура диссертации
Диссертация изложена на 154 страницах текста и состоит из введения, обзора литературы, главы материалов и методов, двух глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка сокращений, списка литературы, приложений. Работа иллюстрирована 15 рисунками и 20 таблицами. Список литературы включает 105 источник отечественных и 110 иностранных авторов.
Аналогичная динамика снижения показателей заболеваемости, бациллярно-сти и смертности наблюдается в Санкт-Петербурге. Заболеваемость снизилась на 25% (с 47,0 до 35,5 на 100 тысяч населения), показатель бациллярности - на 34,4% (с 38,0 до 24,9 на 100 тысяч населения), показатель смертности уменьшился на 50% (с 10,2 до 5,1 на 100 тысяч населения) с 2009 по 2015 года (рисунок 1) [63, 67, 77, 89, 90].
Показатель превалентности (распространенности) туберкулеза в РФ продолжает снижаться с 185,1 в 2009 г. до 129,1 в 2015 г. на 100 тысяч населения. Однако в структуре наряду с этим наблюдается очень неблагополучный фактор, а именно, рост сочетанной патологии туберкулеза и ВИЧ (вирус иммунодефицита человека) инфекции с 10,2 (2009 г.) до 19,7 (2015 г.) на 100 тысяч населения, рост распространенности туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя с 20,5 (2009 г.) до 25,5 (2015 г.) на 100 тысяч населения (рисунок 2).
Показатель распространенности туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя (МЛУ-ТБ) возрос в 1,2 раза с 2009 года, а за последнее десятилетие почти в два раза (14,2 в 2004 г. по сравнению с 25,5 на 100 тысяч населения в 2015 г.) [63, 67, 77, 89, 90, 104].
30 - 185,1 -
§ 20 д 22,5 23,6 24,3 ------,-^
1 1ге В Е ш 1111
2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015
МЛУ-туберкулез I I ВИЧ+туберкулез
—^ распространенность ™ ™ • Линейная (ВИЧ+туберкулез)
Рисунок 2 - Динамика показателей распространенности туберкулеза в РФ на 100
тысяч населения
200 180 160 140 120 100 80 60 40 20 0
с а
к
о т
о о
а н
Отмечается рост показателя заболеваемости МЛУ-ТБ как среди впервые выявленных больных туберкулезом легких, так и среди больных с рецидивом туберкулеза легких [77, 104]. Среди впервые выявленных больных показатель вырос с 4,0 в 2009 г. до 5,2 в 2015 г. на 100 тысяч населения в, а за десять лет (2,4 в 2004 г.) увеличился в 2,2 раз. Существенный рост частоты рецидивов туберкулеза легких с МЛУ возбудителя среди населения наблюдался в 2014 и 2015 гг. (2013 г. -38,7%, 2014 г. -44,9%, 2015 г. -45,8%) [67].
Данные показатели отражают масштабность эпидемии распространения штаммов M. tuberculosis с лекарственной устойчивостью и отсутствие эффективных мер борьбы и профилактики. Таким образом, создаются условия для накопления источников туберкулезной инфекции с МЛУ возбудителя.
В Санкт-Петербурге и в Северо-Западном федеральном округе (СЗФО) также наблюдается рост показателей МЛУ-ТБ как среди впервые выявленных больных, так и среди больных с рецидивом [67, 77, 90, 104]. В Санкт-Петербурге наблюдается увеличение доли случаев МЛУ-ТБ среди вновь заболевших в 1,5 раза (19,3% в 2010 г., 28,1% в 2014 г.) и в 1,2 раза среди пациентов с рецидивами до начала приема химиотерапии (29,1% в 2010 г., 34,9% в 2014 г.). В СЗФО доля МЛУ-ТБ среди вновь заболевших увеличилась в 1,3 (24,8% в 2010 г., 32,0% в 2014 г.), среди рецидивов - в 1,2 (49,9% в 2010 г. и 59,7% в 2014 г.) раза. На территории СЗФО отмечается высокий уровень МЛУ-ТБ среди впервые выявленных больных по сравнению с другими федеральными округами России [67, 77, 90].
В настоящее время проблема резистентности микобактерий туберкулёза (МБТ) к противотуберкулезным препаратам актуальна не только в России, но и во всем мире. По данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) циркуляция таких штаммов возбудителя туберкулеза представляет собой настоящую угрозу эпидемического распространения среди населения и резко увеличивает затраты на лечение МЛУ-ТБ [90, 99].
Уменьшение резервуара источников туберкулезной инфекции с множественной лекарственной устойчивостью является важной составляющей мероприятий по борьбе с туберкулезом. Однако, достижение стойкого абациллирования у больных
с МЛУ возбудителя и клиническое излечение МЛУ-ТБ остается низким по сравнению с уровнем клинического излечения туберкулеза с сохраненной лекарственной чувствительностью (ЛЧ) возбудителя. Риск летального исхода у таких больных значительно выше (35%), чем у больных с ЛЧ возбудителя [98, 99]. В 2014 г. показатель абациллирования больных туберкулезом органов дыхания составил 45,7% по сравнению с 2009 г. (39,6%), за пять лет увеличился в 1,2 раз [91]. Результаты клинического излечения впервые выявленных больных с МЛУ в 2013 г. были в 2,1 раза ниже, чем больных без МЛУ возбудителя (23,6% и 49,6 % соответственно). Среди рецидивов в случае МЛУ-ТБ в 2013 г. клинического излечения достигли 19,7% больных, в 1,2 раза больше, чем в 2010 г. (16,3%) [99].
Противотуберкулёзные лекарственные препараты (ПТП) второго ряда для лечения больных с лекарственной устойчивостью (ЛУ) возбудителя являются более дорогостоящими и более токсичными. Сроки лечения больных МЛУ-ТБ превышают таковые для больных лекарственно-чувствительным туберкулёзом более чем в два раза, поскольку требуется больше времени для лечения в противотуберкулёзном стационаре. Это, несомненно, повышает риск перекрестного инфицирования пациентов противотуберкулезного стационара.
По данным М.В. Шиловой (2014), среди причин формирования МЛУ-ТБ вну-трибольничное инфицирование лекарственно-устойчивыми штаммами имеет существенное значение [99]. В качестве основных причин МЛУ-ТБ автор называет неудачное лечение в отчетном году (2013 г.) и внутрибольничную инфекцию в 14,1% случаев всего, в 63,5% неудачное лечение в предыдущие годы, в том числе и внутрибольничная инфекция, в 16,7% впервые выявленные больные с МЛУ, 5,7% - рецидивы.
По данным ВОЗ, ежегодно увеличивается и доля штаммов M. tuberculosis с ШЛУ (широкой лекарственной устойчивостью), однако данные официальной статистики в РФ отсутствуют. В 2013 г. среди больных МЛУ-ТБ в мире диагностировано около 9 % случаев с ШЛУ-ТБ [209]. Имеются отдельные данные о доле ШЛУ-ТБ в некоторых областях РФ: Архангельской - 7,3 %, Орловской -5,6 %, Самарской
-5,6%, Владимирской -4,9% [13, 33, 177]. В 2011 году 10,2 % ШЛУ МБТ регистрировались в Санкт-Петербурге и 3,3 % в СЗФО [14, 177].
В РФ наиболее часто встречаются штаммы нескольких генетических семейств Beijing, LAM и Ural [20, 36, 46, 92, 100, 153, 201]. Основным этиологическим агентом МЛУ-ТБ РФ являются M. tuberculosis широко распространенного генетического семейства Beijing [16, 17, 43, 47, 92, 100, 155, 156, 182, 201]. Лекарственно-устойчивые штаммы M. tuberculosis данного генотипа характеризуется высокой заразностью (transmissibility1) и вирулентностью [11, 17, 18, 19, 46, 48, 120, 127, 129, 157, 167], вследствие чего способны вызывать вспышки МЛУ-ТБ, в особенности, в условиях стационара.
Повысить эффективность мер по контролю туберкулеза невозможно без знания особенностей популяционной структуры возбудителя, понимания молеку-лярно-генетических механизмов изменчивости и формирования лекарственной устойчивости M. tuberculosis [15, 17, 61].
1.2 Факторы риска развития туберкулеза с множественной и широкой лекарственной устойчивостью возбудителя
Увеличение показателей заболеваемости и распространенности туберкулеза, вызванного возбудителями с множественной и широкой лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ, ШЛУ-ТБ) представляет серьезную угрозу, в особенности в связи с ростом эпидемии вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). По данным ВОЗ, ВИЧ инфекция является одной из причин способствующей заболеваемости туберкулезом в мире [99, 208, 209, 210, 211]. В РФ наблюдается значительный рост показателя распространенности сочетанной патологии туберкулеза с ВИЧ-инфекцией, который в 2015 г. составил 19,7 на 100 тысяч населения по сравнению с 10,3 в 2009 г. [63, 99]. По данным официальной статистики общее количество зарегистрированных ВИЧ-инфицированных в РФ за 2015 год составило 1 008 675 человек, прирост
1 transmissibility (англ.) - «трансмиссивность», здесь и далее - способность к передаче.
за год составил 10 % (в 2014 г. - 907,607 человек) [88]. В Санкт-Петербурге наблюдается один из самых высоких показателей заболеваемости ВИЧ-инфекцией в Северо-Западном федеральном округе - 42,5 в 2015 г., в 2014 г. - 45,6 на 100 тысяч населения [10].
Лечение ВИЧ-инфицированных пациентов с МЛУ- и ШЛУ-ТБ является серьезной проблемой, поскольку больным приходится принимать большое количество препаратов длительное время, не исключены дополнительные побочные эффекты от взаимодействия между лекарствами [212]. Прогноз таких больных, в особенности ШЛУ-ТБ с ко-инфекцией ВИЧ, остается до сих пор неблагоприятным и является одной из причин ранней смерти. Среди больных туберкулезом с ВИЧ-инфекцией наблюдается высокая летальность от туберкулеза. Результаты лечения в Южной Африке, показали, что летальный исход в процессе лечения имел место у 32% ВИЧ-инфицированных против 20% у неинфицированных ВИЧ больных [125, 134, 142].
Похожие диссертационные работы по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Эпидемиологический мониторинг и прогнозирование распространения туберкулеза2014 год, кандидат наук Огарков, Олег Борисович
Молекулярно-генетическая характеристика клинических изолятов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом в Уральском федеральном округе Российской Федерации2014 год, кандидат наук Умпелева, Татьяна Валерьевна
Молекулярно-эпидемиологическое исследование распространения основных генотипов возбудителя туберкулеза в Северной Азии2018 год, доктор наук Жданова Светлана Николаевна
Рольгенотипа инфицирующего штамма Vycobacterium tuberculosis в иммунопатогенезе туберкулёза лёгких2009 год, кандидат медицинских наук Хасанова, Резеда Рахматулловна
Латентная туберкулезная инфекция у сотрудников противотуберкулезной медицинской организации: диагностика, факторы риска, профилактика2015 год, кандидат наук Зорина Марина Михайловна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Васильева Нэлия Рафаэлевна, 2018 год
- С. 51.
104. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в России. Противотуберкулезные мероприятия [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://mednet.ru/images/stories/files/CMT/epid_situaciya_2014.pdf. - (Дата обращения: 06.03.2016).
105. Яблонский, П. К. Табакокурение и туберкулез (обзор литературы) / П. К. Яблонский, О. А. Суховская // Туберкулез и болезни легких. - 2012. - .№12.
- С. 51-56.
106. A Guide to Infection control in the hospital / G. Bearman [et al.] // International Society for Infectious Diseases. - Boston, MA, USA, 2014. - P. 1-400.
107. A new method of classifying prognostic comorbidity in longitudinal studies: development and validation / M.E. Charlson [et al.] // Journal of Chronic Diseases.
- 1987. - Vol. 40 (5). - P. 373-383.
108. A pilot study on using chlorine dioxide gas for disinfection of gastrointestinal endoscopes / Y.I. Ying [et al.] / Journal of Zhejiang University-SCIENCE B -(Biomed & Biotechnol). - 2016. - Vol. 17 (7). - P. 526-536.
109. Administrative measures for preventing Mycobacterium tuberculosis infection among healthcare workers in a teaching hospital in Rio de Janeiro, Brazil / P.A. da Costa [ et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2009. - Vol. 72 (1). - P. 5764.
110. An outbreak of bronchoscopy-related Mycobacterium tuberculosis Infections due to lack of bronchoscope leak testing / A.H. Ramsey [et al.] // Chest. - 2002.
- Vol. 121 (3). - P. 976-981.
111. An outbreak of Pseudomonas aeruginosa because of inadequate disinfection procedures in a urology unit: a pulsed-field gel electrophoresis-based epidemiologic study / U. Kayabas [et al.] // American Journal of Infection Control. - 2008.
- Vol. 36. - P. 33-38.
112. An outbreak of Pseudomonas aeruginosa infections associated with flexible bronchoscopes / A. Srinivasan [et al.] // The New England Journal of Medicine.
- 2003. - Vol. 348. - P. 221-227.
113. Averting epidemics of extensively drug-resistant tuberculosis / S. Basu [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences USA. - 2009. - Vol. 106. -P. 7672-7677.
114. Barriers to successful tuberculosis treatment in Tomsk, Russian Federation: non-adherence, default and the acquisition of multidrug resistance / I.Y. Gelmanova [et al.] // Bull. World Health Organ. - 2007. - Vol. 85 (9). - P. 703-711. doi: 10.2471/BLT.06.038331.
115. Borrell, S. Infectiousness, reproductive fitness and evolution of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis / S. Borrell, S. Gagneux // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2009. - Vol. 13 (12). - P. 1456-1466.
116. Caminero, J.A. Likelihood of generating MDR-TB and XDR-TB under adequate National Tuberculosis Programme implementation / J.A. Caminero // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2008. - Vol.12. - P. 869-877.
117. Caminero, J.A. Multidrug-resistant tuberculosis: epidemiology, risk factors and case finding / J.A. Caminero // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2010. - Vol. 14 (4). - P. 382-390.
118. Catanzaro, A. Nosocomial tuberculosis / A. Catanzaro // American Review of Respiratory Disease. - 1982. - Vol. 125 (5). - P. 559-562.
119. Comparison of low-temperature hydrogen peroxide gas plasma sterilization for endoscopes using various Sterrad models / J. Okpara-Hofmann [et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2005. - Vol. 59 (4). - P. 280-285.
120. Consequenses of non compiliance for therapy efficacy and emergence of resistance in murine tuberculosis caused by the Beijing genotype of M. tuberculosis / J. De Steenwinkel [et al.] // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. -2012. - Vol. 56, № 9. - P. 4937-4944.
121. Double infection with a resistant and a multidrug-resistant strain of Mycobacterium tuberculosis / S. Niemann [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2000.
- Vol. 6. - P. 548-551.
122. Drug-resistant tuberculosis in Shanghai, China, 2000-2006: prevalence, trends and risk factors / X. Shen [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2009. - Vol. 13. - P. 253-259.
123. Drug-resistant tuberculosis: laboratory issues / B. P. Vareldzis [et al.] // World Health Organization recommendations. Tubercle and Lung Disease. - 1994. -Vol.75 (1). - P.1-7.
124. Dye, C. Doomsday postponed? Preventing and reversing epidemics of drug-resistant tuberculosis (Perspectives) / C. Dye // Nature Reviews Microbiology. -2009. - Vol. 7. - P. 81-87.
125. Early outcomes of MDR-TB treatment in a high HIV-prevalence setting in Southern Africa / K .J. Seung [et al.] // PLoS One. - 2009. - Vol. 4 (9): e7186.
126. Effect of cigarette smoking on sputum smear conversion in adults with active pulmonary tuberculosis / A.T. Abal [et al.] // Respiratory Medicine. - 2005. -Vol. 99. - P. 415-420.
127. Emerging multi-drug resistante M. tuberculosis strains of the Beijing genotype circulating in Russia express a pattern of biological properties associated with enchanced virulence / E. Lasunskaia [ et al.] // Microbes and Infection. - 2010.
- Vol. 12 (6). - P. 467-475.
128. Evidence of exogenous reinfection and mixed infection with more than one strain of Mycobacterium tuberculosis among Spanish HIV-infected inmates / F. Chaves [et al.] // AIDS. - 1999. - Vol. 13. - P. 615-620.
129. Evolution and transmission of drug resistant tuberculosis in a Russian population / N. Casali [et. al.] // Nature Genetics. - 2014. - Vol. 46, № 3. - P. 279-286.
130. Evolution of extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis from a susceptible ancestor in a single patient / V. Eldholm [et al.] // Genome Bi-ology. -
2014. - Vol. 15 (11):490 doi: 10.1186/s13059-014-0490-3.
131. Exogenous reinfection as a cause of late recurrent tuberculosis in the United States / J.D. Interrante [et al.] // Annals of the American Thoracic Society. -
2015. - Vol. 12 (11). - P. 1619-1626.
132. Exogenous reinfection of tuberculosis in a low-burden area / C. Schiroali [et al.] // Infection. - 2015. - Vol. 43 (6). - P. 647-653.
133. Extensive nosocomial transmission of tuberculosis in a low-incidence country / J. Jonsson [et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2013. - Vol. 83 (4). - P. 321-326.
134. Extensively drug-resistant tuberculosis as a cause of death in patients co-infected with tuberculosis and HIV in a rural area of South Africa / N.R. Gandhi [et al.] // The Lancet. - 2006. - Vol. 368. - P. 1575-1580.
135. Extensively drug-resistant tuberculosis in South Korea: risk factors and treatment outcomes among patients at a tertiary referral hospital / C. Y. Jeon [et al.] // Clinical Infectious Diseases. - 2008. - Vol. 46. - P. 42-49.
136. Gastroscopy-associated transmission of extended-spectrum beta-lactamase-pro-ducing Pseudomonas aeruginosa / O. Bajolet [et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2013. - Vol. 83. - P. 341-343.
137. General considerations for lung function testing / M.R. Miller [et al.] // European Respiratory Journal. - 2005. - Vol. 26. - P.153-61.
138. Genotypic and phenotypic heterogeneity among Mycobacterium tuberculosis isolates from pulmonary tuberculosis patients / I. Shamputa [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2004. - Vol. 42(12). - P. 5528-5536.
139. Guideline for processing flexible endoscopes. In: Guidelines for Perioperative Practice / S. A. Van Wicklin [et al.] // Denver, CO: AORN Journal. - 2017. -Vol. 105, № 3. - P. 326-328.
140. Guidelines for preventing the transmission of Mycobacterium tuberculosis in health care settings, 2005 / P.A. Jensen [et al.] // Centers for Disease Control and
Prevention, MMWR Recommendations and Reports. - 2005. - Vol. 54, № RR-17. - P. 1-141.
141. High genotypic discordance of concurrent Mycobacterium tuberculosis isolates from sputum and blood of HIV-infected individuals / W. Ssengooba [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10 (7): 0132581. doi:10.1371/journal.pone.0132581.
142. HIV-coinfection in multidrug-resistant- and extensively drug-resistant tu-ber-culosis results in high early mortality / N.R. Gandhi [et al.] // American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. - 2010. - Vol. 18. - P. 80-86.
143. Impact of infection control measures to control an outbreak of multidrug-re-sistant tuberculosis in a Human Immunodeficiency Virus Ward, Peru / E. Ticona [et al.] // American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. - 2016. - Vol. 95 (6). - P. 1247-1256.
144. Infection risks associated with spirometry // D.R. Rutala [et al.] // Infection Control & Hospital Epidemiology.- 1991. - Vol.12. - P. 89-92.
145. Infectious diseases linked to cross-contamination of flexible endoscopes / N. Kenters [et al.] // Endoscopy International Open. - 2015. - Vol. 3 (4). - P. E259-E265.
146. Johns, D.P. Spirometry: the measurement and interpretation of ventilatory function in clinical practice / D.P. Johns, R. Pierce // The Thoracic Society of Australia and New Zealand. - 2008; p. 14.
147. Leers, W.D. Disinfecting endoscopes: how not to transmit Mycobacterium tuberculosis by bronchoscopy / W.D. Leers // Canadian Medical Association Journal. - 1980. - Vol. 123 (4). - P. 275-280, 283.
148. Mixed infection and clonal representativeness of a single sputum sample in tuberculosis patients from a penitentiary hospital in Georgia / I. Shamputa [et al.] // Respiratory Research. - 2006; 7: 99 doi: 10.1186/1465-9921-7-99.
149. Mixed infections and rifampin heteroresistance among Mycobacterium tu-ber-culosis clinical isolates / C. Zheng [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. -2015. - Vol. 53 (7). - P. 2138-2147.
150. Mixed tuberculosis infections in rural South Vietnam / M.N. Huyen [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2012. - Vol. 50 (5). - P. 1586-1592.
151. Mixed-strain infection with a drug-sensitive and multidrug-resistant strain of Mycobacterium tuberculosis / A. Theisen [et al] // Lancet. - 1995. - Vol. 345. -P. 1512 - 1513.
152. Mokrousov, I. Insights into the origin, emergence, and current spread of a successful Russian clone of Mycobacterium tuberculosis // I. Mokrousov // Clinical Microbiology Reviews. - 2013. - Vol. 26(2):342-60. doi:10.1128/CMR.00087-12.
153. Mokrousov, I. Mycobacterium tuberculosis Latin American-Mediterranean family and its sublineages in the light of robust evolutionary markers / I. Mokrousov, A. Vyazovaya, O. Narvskaya // Journal of Bacteriology. - 2014. - Vol. 196, № 10. - P. 1833-1841.
154. Molecular epidemiological analysis of cases of pulmonary tuberculosis in patients with multiple admissions to TB hospital / N.R. Vasileva, A.A. Vyazovaya, A.I. Inozemceva, O.V. Narvskaya, E.B. Myasnikova, I.V Vasilev // European Respiratory Journal. - 2016. - Vol. 48, Supplement 60; doi: 10.1183/13993003.congress-2016.PA4252.
155. Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype in Russia: in search of in-formative Variable-Number Tandem-Repeat Loci / I. Mokrousov [et.al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2008. - Vol. 46 (11). - P. 3576-3584.
156. Mycobacterium tuberculosis population in northwestern Russia: an update from Russian-EU/Latvian border region / I. Mokrousov [et al.] // PLoS One. - 2012. - Vol. 7, № 7: e41318.
157. Mycobacterium tuberculosis strains of the modern sublineages of the Beijing family are more likely to display increased virulence that strains of the ancient sublineages / S.C. Ribeiro [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2014. -Vol. 52, № 7. - P. 2615-2624.
158. Nosocomial outbreak of multidrug-resistant tuberculosis caused by a strain of M. tuberculosis W-Beijing family in St. Petersburg, Russia / O. Narvskaya [et
al.] // European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. - 2002.
- Vol.21. - P. 596-602.
159. Nosocomial outbreak of Pseudomonas aeruginosa infections related to a flexible bronchoscope / R. Bou [et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2006. - Vol. 64.
- P. 129-135.
160. Nosocomial transmission of extensively drug-resistant tuberculosis in a rural hospital in South Africa / N.R. Gandhi [et al.] // The Journal of Infectious Diseases. - 2013. - Vol. 207(1). - P. 9-17.
161. Nosocomial transmission of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis. A risk to patients and health care workers / M. L. Pearson [et al.] // Annals of Internal Medicine. - 1992. - Vol. 117. - P.191-196.
162. Nosocomial transmission of multidrug-resistant tuberculosis / V. Crudu [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2015. - Vol. 19 (12). - P. 1520-1523.
163. Outbreak of ertapenem-resistant Enterobacter cloacae urinary tract infections due to a contaminated ureteroscope / C.L. Chang [et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2013. - Vol. 85. - P. 118-124.
164. Outbreak of multidrug-resistant tuberculosis at a methadone treatment program / C. Conover [et al.] // International Journal of Tuberculosis and Lung Disease.
- 2001. - Vol. 5 (1). - P. 59-64.
165. Outbreak of multidrug-resistant tuberculosis in a New York State prison, 1991 / S.E. Valway [et al.] // American Journal of Epidemiology. - 1994. - Vol. 140 (2). - P. 113-122.
166. Outbreak of Pseudomonas aeruginosa infection associated with contamination of a flexible bronchoscope / C.A. Granados [et al.] // Infection Control & Hospital Epidemiology. - 2009. - Vol. 30. - P. 550-555.
167. Parvati, I. Possible underlying mechanisms for successful emergence of the M. tuberculosis Beijing genotype strains / I. Parvati, R. van Crevel, D. van Soolingen // The Lancet Infectious Diseases. - 2010. - Vol.10, № 2. - P. 103111.
168. Penitentiary population of Mycobacterium tuberculosis in Kyrgyzstan: exceptionally high prevalence of the Beijing genotype and its Russia-specific subtype / I. Mokrousov [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2009. - Vol. 9 (6).
- P. 1400-1405.
169. Persistent contamination on colonoscopes and gastroscopes detected by biologic cultures and rapid indicators despite reprocessing performed in accordance with guidelines / C.L. Ofstead [et al.] // American Journal of Infection Control. -2015. - Vol. 43 (8). - P. 794-801.
170. Pillay, M. Nosocomial transmission of the F15/LAM4/KZN genotype of Myco-bacterium tuberculosis in patients on tuberculosis treatment / M. Pillay, A. W. Sturm // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2010. -Vol. 14(2). - P. 223-230.
171. Plazzotta, G. Magnitude and sources of bias in the detection of mixed strain M. tuberculosis infection / G. Plazzotta, T. Cohen, C. Colijn // Journal of Theoretical Biology. - 2015. - Vol. 7 (368). - P. 67-73.
172. Potential nosocomial exposure to Mycobacterium tuberculosis from a bronchoscope / J.L. Larson [et al.] // Infection Control & Hospital Epidemiology. - 2003.
- Vol. 24 (11). - P. 825-830.
173. Pozniak, A. Nosocomial transmission of tuberculosis in AIDS care centres / A. Pozniak, J.M. Watson // Communicable disease report. CDR review. - 1992. -Vol. 2(6): R71-2.
174. Prevalence and risk factors for drug resistance among hospitalized tuberculosis patients in Georgia / L. Vashakidze [et al.] // International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2009. - Vol. 13 (9). - P. 1148-1153.
175. Prevalence and risk factors for multidrug-resistant tuberculosis in the Re-public of Georgia: a population-based study / N. Lomtadze [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2009. - Vol. 13. - P. 68-73.
176. Prevalence and risk factors of mixed Mycobacterium tuberculosis complex infections in China / Y. Pang [et al.] // Journal of Infection. - 2015. - Vol. 71. - P. 231-237.
177. Prevalence of extensively drug-resistant tuberculosis in Vladimir and Orel regions, Russia / V.V. Punga [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2009. - Vol.13, №10. - P. 1309-1312.
178. Prevention of nosocomial transmission extensively drug-resistant tuberculosis in rural South African district hospitals: an epidemiological modeling study / S. Basu [et al.] // The Lancet. - 2007. - Vol. 370, № 9597. - P. 1500-1507.
179. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing / P. Supply [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2006. - Vol. 44. - P. 4498-4510.
180. Pseudomonas aeruginosa and Serratia marcescens contamination associated with a manufacturing defect in bronchoscopes / D.L. Kirschke [et al.] // The New England Journal of Medicine. - 2003. - Vol. 348. - P. 214-222.
181. Rasam, S.A. Infection control in the pulmonary function test laboratory / S.A. Rasam, K.K. Apte, S.S. Salvi // Lung India. - 2015. - Vol. 32 (4). - P. 359-366.
182. Recent nosocomial transmission and genotypes of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis / A. Nodieva [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. -2010. - Vol. 14 (4). - P. 427-433.
183. Risk factors and clinical phenotypes of Beijing genotype strains in tuberculosis patients in China / Y. Pang [et al.] //BMC Infectious Disease. - 2012. - Vol. 12: 354 doi: 10.1186/1471-2334-12-354.
184. Risk factors for acquired multidrug-resistant tuberculosis / E.C. Barroso [et al.] // J. Pneumologia. - 2003. - Vol. 29, № 2. - P. 89-97.
185. Risk factors for multidrug-resistant tuberculosis in Hong Kong / W.S. Law [et al.] // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. - 2008. -Vol. 12/ - P. 1065-1070.
186. Rutala, W.A. Gastrointestinal endoscopes a need to shift from disinfection to sterilization / W.A. Rutala, D.J. Weber // JAMA. - 2014. - Vol. 312 (14). - P. 1405-1406.
187. Rutala, W.A. New disinfection and sterilization methods / W.A. Rutala, D.J. Weber // Emerging Infectious Diseases. - 2001. - Vol. 7, № 2. - P. 348-353.
188. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuber-culo-sis for diagnosis and epidemiology / J. Kamerbeek [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 1997. - Vol. 35 (4). - P. 907-914.
189. Simultaneous infection with multiple strains of Mycobacterium tuberculosis / C. Braden [et al.] // Clinical Infectious Diseases. - 2001. - Vol. 33. - P. 42-47.
190. SITVITWEB- a publicly available international multimarker database for studying Mycobacterium tuberculosis genetic diversity and molecular epi-demiol-ogy / C. Demay [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2012. - Vol. 12 (4). - P. 755-766.
191. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology / J.D. van Embden [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 1993. - Vol. 31 (2). - P. 406-409.
192. Suchindran, S. Is HIV infection a risk factor for multidrug-resistant tuberculosis? A systematic review // S. Suchindran, E.S. Brouwer, R.A. Van // PLoS One. -2009. - Vol. 4: e5561.
193. Survival of Mycobacterium tuberculosis on model surfaces / N.I. Eremeeva [et al.] // European Respiratory Journal. - 2012. - Vol. 40. - Supplement 56. -P2641.
194. Systematic survey of clonal complexity in tuberculosis at a populational level and detailed characterization of the isolates involved / Y. Navarro [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2011. - Vol. 49 (12). - P. 4131- 4137.
195. Top 10 Health Technology Hazards for 2016. Executive Brief / ECRI Institute, 2015 www.ecri.org/2016hazards.
196. Translating basic science insight into public health action for multidrug- and extensively drug-resistant tuberculosis / N. Walter [et al.] // Respirology. - 2012. - Vol.17 (5). - P. 772-791.
197. Transmission of a highly drug-resistant strain (strain W1) of Mycobacterium tuberculosis. Community outbreak and nosocomial transmission via a contaminated bronchoscope / T. Agerton [et al.] // JAMA. - 1997. - Vol. 278(13). - P. 1073-1077.
198. Transmission of infection by flexible gastrointestinal endoscopy and bronchoscopy / J. Kovaleva [et al.] // Clinical Microbiology Reviews. - 2013. - Vol. 26 (2). - P. 231-254.
199. Transmission of Mycobacterium tuberculosis by a fiberoptic bronchoscope. Identification by DNA fingerprinting / T.M. Michele // JAMA. - 1997. - Vol. 278(13). - P. 1093-1095.
200. Transmission of Mycobacterium tuberculosis from Medical waste / K.R. Johnson [et al.] // JAMA. - 2000. - Vol. 284 (13). - P. 1683-1688.
201. Trends in molecular epidemiology of drug-resistant tuberculosis in Republic of Karelia, Russian Federation / I. Mokrousov [et. al.] // BMC Microbiology. -2015. - Vol. 15:279 doi 10.1186/s12866-015-0613-3.
202. Tuberculosis infection control in resource-limited settings in the era of expanding HIV care and treatment / N.N. Bock [et al.] // The Journal of Infectious Diseases. - 2007. - Vol. 196 (Suppl 1). - P.108-113.
203. Tuberculosis recurrence after completion treatment in a European city: re-infection or relapse? / J. Millet [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol. 8 (6): e64898.
204. Undetected multidrug-resistant tuberculosis amplified by first-line therapy in mixed infection / S.M. Hingley-Wilson [et al.] // Emerging Infectious Dis-eases. - 2013. - Vol. 19. - P. 1138-1141.
205. Unusual implication of biopsy forceps in outbreaks of Pseudomonas aeruginosa infections and pseudo-infections related to bronchoscopy / P. Corne [et al.] // Journal of Hospital Infection. - 2005. - Vol. 61. - P. 20-26.
206. Whole genome sequencing reveals complex evolution patterns of multi-drug-resistant Mycobacterium tuberculosis Beijing strains in patients / M. Merker [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol. 8(12). - P. e82551.
207. Within patient microevolution of Mycobacterium tuberculosis correlates with heterogeneous responses to treatment / Q. Liu // Scientific Reports 5. - 2015; 5:17507. doi: 10.1038/srep17507.
208. World Health Organization. Anti-tuberculosis drug resistance in the world. Report № 4. WHO/HTM/TB/2008.394 / WHO, Geneva, 2008. http: //www.who. int/tb/publications/ 2008/drs_report4_26feb08. pdf.
209. World Health Organization. Global tuberculosis report 2014. WH0/HTM/TB/2014.08 / WHO, Geneva, 2014. URL:apps.who.int/iris/bis-tream/10665/137094/1/9789241564809_eng.pdf.
210. World Health Organization. Global tuberculosis report 2015. WH0/HTM/TB/2015.22 / Geneva, World Health Organization, 2015. http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/191102/1/9789241565059_eng. pdf.
211. World Health Organization. Global tuberculosis report 2016. WHO/HTMyTB/2016.13 / Geneva, World Health Organization, 2016. http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/250441/1/9789241565394-eng.pdf.
212. World Health Organization. Guidelines for the programmatic management of drug-resistant tuberculosis. Emergency update 2008. WHO/HTM/TB/2008.40 / Geneva, Switzerland: WHO, 2008. http://apps.who.int/iris/bitstream/ 10665/43965/ 1/9789241547581_eng. pdf.
213. World Health Organization. Report on the burden of endemic health care associated infection Worldwide. A systematic review of the literature. / Geneva, World Health Organization, 2011. http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/ 80135/1/9789241501507_eng.pdf.
214. World Health Organization. WHO Policy on tuberculosis Infection Control in Health-Care Facilities, Congregate Settings and Households. WHO/HTM/tuber-culosis/2009.419 / Geneva, Switzerland: World Health Organization, 2009. http: //apps.who. int/iris/bitstream/10665/ 44148/1/9789241598323_eng.pdf.
215. Zhang, Y. Mechanisms of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis / Y. Zhang, W.W. Yew // The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. -2009. - Vol. 13 (11). - P. 1320-1330.
ПРИЛОЖЕНИЯ
Приложение 1 - Характеристика изолятов M. tuberculosis, использованных в настоящем исследовании
Код больного № изо-лята Дата посева Дата выделения чистой культуры Материал Профиль ЛУ Тип ЛУ Споли-готип (SIT) Генетическое семейство (согласно*) IS6770-RFLP вариант (для Beijing)
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Р1 5829 10.10.2006 16.11.2006 смыв с бронхов HREEthKmOflCm ШЛУ 560 unKnown
6993 19.09.2011 18.10.2011 смыв с бронхов SHREEthOflPASCmAmZ ШЛУ nd
210 14.01.2014 25.02.2014 мокрота SHREthKmOflCmAmPASZ ШЛУ 252 LAM9
Р2 75 10.01.2008 11.02.2008 смыв с бронхов OfxPASCmAm ШЛУ 1 Beijing В0 +
5647 25.07.2012 22.08.2012 смыв с бронхов SHREEthKmOflCmAmZ ШЛУ 1 Beijing В0
Р3 7620 20.10.2010 02.12.2010 мокрота SHREEthKm МЛУ 1 Beijing А3+
5481 17.07.2012 22.08.2012 мокрота SHREEthOflZ МЛУ 1 Beijing A3
Р4 7000 30.10.2008 03.12.2008 смыв с бронхов - ЛЧ 1 Beijing A5
2115 01.04.2009 28.04.2009 смыв с бронхов SHREEthKmOflPASZ ШЛУ 150 LAM9
Р5 2463 14.04.2009 05.05.2009 смыв с бронхов SHREthKmZ МЛУ 1 Beijing A0
2970 29.04.2009 09.06.2009 мокрота SHREEthKmOflPAS ШЛУ 252 LAM9
4147 22.06.2009 11.08.2009 легкое SHREthKmOflPAS ШЛУ 252 LAM9
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Р5 1869 11.03.2012 12.04.2012 мокрота SHREEthKmOflPASCmAmZ ШЛУ 252 LAM9
Р6 3585 24.04.2013 25.05.2013 мокрота SHREKmOflAm ШЛУ 119 X1
5584 20.06.2015 15.07.2015 мокрота SHREEthKmOfl ШЛУ 1 Beijing nd
8204 30.10.2012 30.11.2012 мокрота HREKmOfl МЛУ 1 Beijing A3
Р7 9598 11.12.2012 24.01.2013 каверна SHREKmOfl ШЛУ 1 Beijing A3
2600 25.03.2015 14.04.2015 мокрота SHREthKmOflPASCmAm ШЛУ 252 LAM9
Р8 1652 03.03.2010 10.04.2010 легкое SHREKmZ МЛУ 1 Beijing nd
Р9 8267 31.10.2011 22.11.2011 мокрота SHREEthKmOflCm ШЛУ 1 Beijing В0
4266 28.05.2012 19.06.2012 легкое SHREEthKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
1963 15.03.2010 12.04.2010 легкое SHREEthOflCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
Р10 5702 02.08.2010 06.09.2010 рана SHREEthKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
6166 30.08.2010 04.10.2010 легкое SHREEthKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
4248 30.05.2012 26.07.2012 смыв с бронхов SHREEthOflCmAmZ ШЛУ 42 LAM9
Р11 9390 05.12.2012 23.01.2013 рана SHRKmOflCm ШЛУ 42 LAM9
8454 28.10.2013 26.12.2013 рана SHRKmOfl PASCm ШЛУ 42 LAM9
Р12 9622 28.12.2010 21.01.2011 мокрота SHREKmOfl ШЛУ 1 Beijing В0
3466 28.04.2011 30.05.2011 мокрота SHREEthKmOflZ ШЛУ 1 Beijing nd
7
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Р13 7928 21.10.2010 16.12.2010 мокрота SHOfl ПОЛИ 1 Beijing М12
6532 31.08.2011 04.10.2011 смыв с бронхов SHREOfx PASCm ШЛУ 1 Beijing М12
Р14 7136 18.10.2005 14.11.2005 мокрота SHRPAS МЛУ 1 Beijing В0
5114 26.06.2010 03.08.2010 легкое SHREKm OflCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
Р15 8400 06.11.2012 13.12.2012 смыв с бронхов SHREEthKmOfxPASCm Am ШЛУ 1 Beijing В34
8400 06.11.2012 13.12.2012 смыв с бронхов SHREEthKmOfxPASCm Am ШЛУ 1 Beijing В34
Р16 9606 05.12.2013 20.01.2014 мокрота SHROflPASCm ШЛУ 1 Beijing В0
1355 14.02.2013 06.03.2013 мокрота SHREKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
Р17 2931 21.04.2008 16.05.2008 мокрота SREEthKmOfl МЛУ 1 Beijing A0
2448 05.03.12 28.03.12 мокрота SHREKmOfl ШЛУ 1 Beijing A0
4092 24.05.2012 14.06.2012 легкое SHREKmOfl ШЛУ 1 Beijing nd
Р18 7050 20.09.2011 15.11.2011 мокрота SHREthKmOflPASAm ШЛУ 190 Beijing C31
4653 07.06.2013 08.08.2013 смыв с бронхов SHREEthKmOflCmAm ШЛУ 190 Beijing C31
Р19 8531 09.11.2011 07.12.2011 смыв с бронхов SHREKmOflPASCm ШЛУ 1 Beijing В0
9783 21.12.2011 27.01.2012 смыв с бронхов SHREKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing В0
852 03.02.2012 23.03.2012 смыв с бронхов SHREKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
7540 09.10.2012 21.11.2012 рана SHREKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing В0
4
оо
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Р20 1604 03.03.2010 30.03.2010 мокрота SHRKmCmAm МЛУ 1 Beijing В0
663 01.02.2011 10.03.2011 смыв с бронхов SHRKmOflPASCmAmZ ШЛУ 1 Beijing nd
Р21 9298 06.12.2011 13.01.2012 смыв сбронхов SHREOflPAS МЛУ 1 Beijing В0
9452 07.12.2012 08.01.2013 легкое SHREEthKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing В0
Р22 2168 20.03.2012 26.04.2012 смыв с бронхов SHREEthKmOflPASCmAmZ ШЛУ 1 Beijing L5
9898 13.12.2012 29.01.2013 гной SHREKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing L5
10276 25.12.2013 05.02.2014 отдел. п\пол SHREthKmOflPASAm ШЛУ 1 Beijing L5
Р23 6007 13.08.2012 12.09.2012 мокрота SHROflPAS МЛУ 1 Beijing L20
9250 03.12.2012 20.02.2013 мокрота SHREthOflPAS МЛУ 1 Beijing L20
Р24 7779 27.10.2010 02.12.2010 смыв с бронхов SHREthCmAmZ МЛУ 1 Beijing nd
9438 22.12.2010 15.03.2011 экссудат SHREthEOflCmAmZ ШЛУ 1 Beijing nd
Р25 343 19.01.2012 08.02.2012 мокрота SHREEthKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing А0
3038 02.04.2014 28.04.2014 смыв с бронхов SHREEthKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing А0
Р26 7347 12.10.2010 09.11.2010 мокрота SHREthKmAm МЛУ 42 LAM9
640 31.01.2011 28.04.2011 смыв с бронхов SHRKmOflPASAm ШЛУ 42 LAM9
Р27 5583 20.07.2012 22.08.2012 мокрота SHREEthKmOflCmAmZ ШЛУ 1 Beijing В0
1903 04.03.2013 10.04.2013 экссудат SHREEthKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
9
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Р28 9357 05.12.2012 11.01.2013 мокрота SHREthKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing С3
968 05.02.2013 19.03.2013 мокрота SHREEthKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
Р29 4182 09.06.2008 30.06.2008 мокрота SHREEthKmOfx ШЛУ 1 Beijing В0
1980 26.03.2009 21.04.2009 мокрота SHREEthKmAmCm МЛУ 1 Beijing В0
Р30 5637 08.10.2007 30.10.2007 мокрота SHREEth МЛУ 1 Beijing В0
2534 15.04.2009 15.05.2009 мокрота SHRE МЛУ 1 Beijing В0
Р31 5478 20.07.2011 16.08.2011 мокрота SHREEthOflPASZ МЛУ 1 Beijing L3
7705 11.10.2011 08.11.2011 мокрота SHREEthOflPASCmZ ШЛУ 1 Beijing L3
2689 04.04.2012 12.05.2012 экссудат SHREEthOflPASZ МЛУ 1 Beijing L3
5640 17.06.2014 10.07.2014 экссудат SHREEthOflZ МЛУ 1 Beijing L3
Р32 4955 11.08.2009 02.09.2009 мокрота SHREEthKm МЛУ 42 LAM9
7479 19.11.2009 16.12.2009 мокрота SHREEthKmOflCm ШЛУ 42 LAM9
Р33 3772 21.05.2008 24.06.2008 мокрота SHREEthKmOfl ШЛУ 1 Beijing В0
4458 03.06.2010 07.07.2010 мокрота SHREEthKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing В0
Р34 2197 22.03.2010 21.04.2010 смыв SHREEthKmAmZ МЛУ 1 Beijing A0
4774 16.06.2010 03.08.2010 легкое SHREEthOfl ШЛУ 1 Beijing A0
9164 01.12.2011 13.01.2012 смыв с бронхов SHREEthKmOflPASCm AmZ ШЛУ 1 Beijing A0
Lfy 0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Р35 492 22.01.2013 01.03.2013 смыв с бронхов SHREEthKmOflPASCaCm AmZ ШЛУ 1 Beijing В21
7545 28.08.2014 24.09.2014 смыв с бронхов SHREEthKmOflPASCa CmAmZ ШЛУ 1 Beijing В21
Р36 2344 17.03.2014 08.04.2014 мокрота - ЛЧ 47 Haarlem1
3485 15.04.2014 27.05.2014 мокрота HRE МЛУ 47 Haarlem1
Р37 8680 16.11.2011 13.01.2012 смыв с бронхов HREEthOfxZ МЛУ 1 Beijing А0
9584 14.12.2011 11.03.2012 каверна SHREEthKmOfxCmAmZ ШЛУ 1 Beijing А0
Р38 4398 30.05.2013 03.07.2013 мокрота SREKmOfxCmAm МЛУ 1 Beijing Р0
5629 17.07.2013 27.08.2013 легкое SHREEthKmOFxCmAm ШЛУ 1 Beijing Р0
П1 4054 08.05.2015 11.06.2015 каверна SHREthKmOflPASCm Am ШЛУ 252 LAM9
2600 25.03.2015 14.04.2015 мокрота SHREthKmOflPASCmAm ШЛУ 252 LAM9
П2 10362 12.11.2014 03.12.2014 экссудат SHREthKmOflPASCsCmAm ШЛУ 1 Beijing C30
644 27.01.2015 24.02.2015 экссудат - - 1 Beijing A0
П3 4453 13.05.2014 17.06.2014 экссудат SHREKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing A0
1216 10.02.2015 16.03.2015 экссудат SHREEtKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing A0
9369 03.11.2015 12.01.2016 экссудат SHREKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
Lfy
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
П4 3038 02.04.2014 28.04.2014 смыв с бронхов SHREEthKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing A0
3230 14.04.2015 18.05.2015 мокрота SHREEthKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing A0
П4 5909 16.06.2015 27.07.2015 экссудат SHREEthKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing nd
П5 10276 11.11.2014 23.12.2014 мокрота SHREEtOflCmZ ШЛУ 1 Beijing nd
5721 02.07.2015 04.08.15 мокрота SHROfl МЛУ 1 Beijing nd
П6 2584 25.03.2015 14.04.2015 опер.материал SHREEthKmOflPASAm ШЛУ 1 Beijing nd
П7 3007 07.04.2015 28.04.2015 мокрота SHREKmPASCsZ МЛУ 1 Beijing nd
5121 11.06.2015 09.07.2015 каверна SHREKmOfl ШЛУ 1 Beijing nd
П8 1911 03.03.2015 25.03.2015 мокрота SHREKmOflPASCm ШЛУ 1 Beijing B0
6402 28.07.2015 02.09.2015 смыв с бронхов SHREKmOflPASCm ШЛУ 1 Beijing L21
П9 1693 28.02.2015 25.03.2015 мокрота SHRKmZ МЛУ 1 Beijing A0
2240 03.04.2015 16.04.2015 мокрота SHRKmZ МЛУ 1 Beijing nd
П10 9202 28.10.2015 24.11.2015 смыв с бронхов SHREthKmOflPASCsCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
10220 23.01.2015 23.12.2015 легкое SHREthKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
П11 3021 02.04.2015 28.04.2015 каверна SHREEthOflPASCs ШЛУ 1 Beijing nd
10032 24.11.2015 21.12.2015 экссудат HREEthOflPAS МЛУ 1 Beijing nd
П12 6247 21.07.2015 18.08.2015 мокрота HRKmCmAm МЛУ 1 Beijing nd
Lfi 2
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
П12 8922 20.10.2015 24.11.2015 смыв с бронхов HRKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
П13 8140 28.05.2015 26.06.2015 смыв с бронхов SHROfl МЛУ 3781 Haarlem3
507 26.01.2016 23.02.2016 смыв с бронхов SHREOflCm ШЛУ 3781 Haarlem3
П14 10217 10.11.2014 23.12.2014 смыв с бронхов SHREEtKmPASCmAmZ МЛУ 1 Beijing В0
П15 6047 02.07.2014 23.07.2014 мокрота SHREEtKm МЛУ 283 Haarlem1
2258 16.03.2015 14.04.2015 мокрота SHREtOflCm ШЛУ 283 Haarlem1
П16 9673 22.10.2014 18.11.2014 смыв с бронхов SHREEtKmAmZ МЛУ 1 Beijing A0
П17 2604 18.03.2015 28.04.2015 мокрота SHREKmCmAm МЛУ 1 Beijing nd
П18 3622 24.04.2015 18.05.2015 смыв с бронхов SHRKmPASAmZ МЛУ 1 Beijing nd
8709 13.10.2015 09.11.2015 мокрота SHREEthKmOflPASCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
П19 7131 14.08.2014 09.09.2014 мокрота SHE ПОЛИ 161 LAM9
П20 10853 25.11.14 23.12.2014 мокрота SHEthPAS ПОЛИ 1 Beijing В0
П21 965 04.02.2015 05.03.2015 мокрота SHREPASZ МЛУ 1 Beijing В0
6289 27.07.2015 02.09.2015 смыв с бронхов SHREKmOflPAS ШЛУ 1 Beijing В0
П22 2007 14.03.2012 12.05.2012 мокрота SHREEtKmOflCmAmZ ШЛУ 1 Beijing В0
3326 15.04.2015 07.05.2015 мокрота SHREEtKmOflCmAmZ ШЛУ 1 Beijing В0
6320 20.08.2015 29.09.2015 мокрота SHREEtKmOflCmAmZ ШЛУ 1 Beijing nd
Lfy 3
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
П23 1569 18.02.2015 16.03.2015 смыв с бронхов SHREEthKmOflPASZ ШЛУ 265 Beijing C3
3018 07.04.2015 19.05.2016 мокрота SHREEthKmOflPASZ ШЛУ 265 Beijing nd
П24 1570 19.02.2015 16.03.2015 смыв с бронхов SHREEtKmOflZ ШЛУ 1 Beijing В0
П25 9616 10.11.2015 08.12.2015 смыв с бронхов - - 1 Beijing nd
9503 09.11.2015 08.12.2015 рана SHREthKmOflPASCmAmZ ШЛУ 1 Beijing nd
1160 29.01.2015 03.02.2016 рана - - 1 Beijing nd
П26 358 20.01.2015 12.02.2015 мокрота SHR МЛУ 1 Beijing C8
2543 24.03.2015 02.06.2015 мокрота - - 1 Beijing C8
П27 100 13.01.2015 02.02.2015 смыв с бронхов SHREOflZ МЛУ 1 Beijing C8
П28 10712 20.11.2014 23.12.2014 мокрота - ЛЧ 1 Beijing nd
П29 394 20.01.2015 24.02.2015 смыв с бронхов SHRKmOflCmAm ШЛУ 1 Beijing В35
2019 05.03.2015 21.04.2015 мокрота - - 1 Beijing В35
П30 6541 04.08.2015 02.09.2015 мокрота SHREEthOflCmAm ШЛУ 1 Beijing nd
10208 27.11.2015 12.01.2016 каверна SHREEthKmOflPASCm ШЛУ 1 Beijing nd
Смыв 557 01.07.2015 02.08.2015 смыв с канала бронхоскопа - - 1 Beijing nd
Примечания: *- SITVITWEB (URL:http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_ONLINE/); Р- ретроспективное исследование; П -проспективное исследование; nd -не определяли.
ПРИЛОЖЕНИЯ
Документы о внедрении
Федеральное государственное бюджетное учреждение «Санкт-Петербургскнн научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ «СПб НИМФ» Минздрава России) Место нахождения: 191036, Российская Федерация, Санкт-Петербург, Литовский пр., д.2-4 ИНН 7815022288 КПП 784201001 ОКПО 01425536 ОГРН 1037843004870
о внедрении результатов кандидатской диссертационной работы
Результаты диссертационной работы «Эпидемиология нозокомиального туберкулеза», представленной на соискание ученой степени кандидата наук по специальности 14.02.02 - эпидемиология, внедрены в практическую деятельность специалистов федерального государственного бюджетного учреждения «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии» МЗ РФ.
При выполнении диссертационного исследования была предложена и внедрена в практику методика исследования каналов бронхоскопов на М tuberculosis (ДНК \S6110, посев на Левенштейна-Йенсена), изменен алгоритм обработки эндоскопов. Предложена и внедрена схема эпидемиологической диагностики случаев нозокомиального туберкулеза с применением методов молекулярной эпидемиологии для выявления и предотвращения случаев внутрибольничного инфицирования.
Использование указанных результатов позволило выявить факторы риска и провести меры профилактики.
УТВЕРЖДАЮ
Директор
федерального государственного бюджетного учреждения «Санкт-Петербургский научно-исследовательский
институт фтизиопульмонологии» Министерства здравоохранения
АКТ
Васильевой Нелии Рафаэлевны
Заместитель главного врача по медицинской части
Министерство здравоохранения Российской Федерации
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
(ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России)
191015, Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д.41 ОКПО 30625447, ОКАТО 40298564000, ОГРН 1117847434990, ИНН 7842461679, КПП 784201001 ОКВЭД 85.22; 86; 72.19; 84.21 тел.: (812)303-50-00, факс: (812)303-50-35, e-mail: rectorat@szgmu.ni www.szgmu.ru
_№ __
На .
_от
УТВЕРЖДАЮ
И.о. проректора по учебной работе, науке и инновационной деятельности федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова»
Министер ст.ва;5дравоо хранения
Российс,
доктор щ
офессор.
A.B. Силин 2017 г.
АКТ ВНЕДРЕНИЯ
в учебный процесс кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии медико-профилактического факультета федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации результатов научной работы по результатам кандидатской диссертации на тему: «Эпидемиология нозокомиального туберкулеза» аспиранта Васильевой Нелии Рафаэлевны.
Мы, нижеподписавшиеся, комиссия в составе: проректора медико-профилактического факультета профессора, д.м.н. Мельцера A.B., заведующего кафедрой з.д.н. РФ, профессора, д.м.н. Зуевой Л.П. и заведующего учебной частью кафедры доцента, к.м.н. Ивановой Т.Г. удостоверяем, что результаты диссертационного исследования на тему: «Эпидемиология нозокомиального туберкулеза» аспиранта Васильевой Н.Р. кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии внедрены в практическое занятие (семинары) для врачей и использованы при подготовке учебно-методического пособия для врачей «Эпидемиология туберкулеза. Организация профилактических и противоэпидемических мероприятий в очагах туберкулеза».
Проректор медико-профилактического факультета профессор, д.м. н.
Заведующий кафедрой профессор, д.м.н.
Заведующий учебной
частью кафедры доцент, к.м.н.
Мельцер A.B. Зуева Л.П.
Иванова Т.Г.
МЕДИЦИНСКОЕ ОБРАЗОВАНИЕ
Кафедра эпидемиологии паразитологии и дсзннфсктолопш
ЭПИДЕМИОЛОГИЯ ТУБЕРКУЛЕЗА. ОРАНИЗАЦИЯ ПРОФИЛАКТИЧЕСКИХ И ПРОТИВОЭПИДЕМИЧЕСКИХ МЕРОПРИЯТИЙ В ОЧАГАХ ТУБЕРКУЛЕЗА
00 1Г1
^ Учебное пособие
Под редакцией з. д. н., профессора Л.П. Зуевой
<о К К
О
ч к
Рч
С
Санкт-Петербург 2016
УДК 614.4.616.988:616.831 -002:576.895.42(07) ББК 55.144.Я7
Эпидемиология туберкулезной инфекции. Организация профилактических и противоэпидемических мероприятий:
учебное пособие./ под ред. проф. Л.П. Зуевой. - СПб.: Изд-во СЗГМУ им. И.И. Мечникова, 2016.-72 с.
Рецензент: V
Нечаев В.В - д.м.н., проф. кафедры инфекционных болезней Се-веро-Западного Государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова
Учебное пособие составили преподаватели кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии Северо-Западного Государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова к.м.н. доцент Мясникова Е.Б., к.м.н., доцент Иванова Т.Г, Васильева Н.Р.
В учебном пособии рассматриваются вопросы эпидемиологии туберкулеза в современный период и принципы организации профилактических и противоэпидемических мероприятий в системе борьбы с туберкулезом.
Учебное пособие предназначено для врачей
Утверждено в качестве учебно-методического пособия методическим советом ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России протокол № 6 от «26» июня 2015 г.
О Коллектив авторов, 2016 О Издательство СЗГМУ им. И.И. Мечникова, 2016
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.