Биологические свойства и принцины идентификации культур группы Burkholderia cepacia тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат медицинских наук Лобойко, Алексей Давидович
- Специальность ВАК РФ03.00.07
- Количество страниц 125
Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Лобойко, Алексей Давидович
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Экологические особенности и медицинское значение
В. cepacia
1.2. Основные фенотипические свойства и принципы идентификации В.cepacia
1.3. Таксономия и внутривидовое типирование бактерий группы В. cepacia.
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Штаммы
2.2. Питательные и селективные среды
2.3. Морфологические методы
2.4. Биохимические диагностические реакции
2.5. Методы выявления продукции цепациацинов и фагов и определения чувствительности к ним штаммов бурк- 44 хольдерий
2.6. Иммунологические реакции
2.7. Определение чувствительности к антибактериальным средствам
2.8. Постановка реакций в автоматических системах идентификации
2.9. Генетические методы диагностики
2.10. Статистическая обработка результатов
Глава 3. ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА В. CEPACIA
3.1. Изучение характера роста культур В. cepacia на различных средах
3.2. Особенности морфологии клеток
3.3. Биохимические свойства
3.4. Иммунологические реакции в идентификации культур
В. cepacia
3.5. Чувствительность штаммов В. cepacia к антибактериальным препаратам
3.6. Определение активности и специфичности продукции цепациацинов и фагов
3.7. Вирулентность В. cepacia в опытах in vivo и in vitro
Глава 4. ПОСТАНОВКА ТЕСТОВ ДЛЯ ПРЕДВАРИТЕЛЬНОЙ
ОРИЕНТИРОВОЧНОЙ) ИДЕНТИФИКАЦИИ В. CEPACIA
4.1. Отбор диагностических признаков для первичной идентификации штаммов В. cepacia
4.2. Оценка профилей в автоматических идентификационных системах
Глава 5. АЛГОРИТМ ОКОНЧАТЕЛЬНОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ И ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ В. CEPACIA
5.1. Генотипирование культур В. cepacia
5.2. Принципы полифазной таксономии и алгоритм иденти -фикации В. cepacia
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микробиология», 03.00.07 шифр ВАК
Биологические свойства и дифференциальная диагностика буркхольдерий, имеющих значение в медицинской практике2004 год, кандидат биологических наук Сенина, Татьяна Васильевна
Идентификация и внутривидовое типирование возбудителей сапа и мелиоидоза2010 год, доктор медицинских наук Антонов, Валерий Алексеевич
Электрофоретический анализ и иммуноблоттинг в идентификации и внутривидовой дифференциации буркхольдерий2011 год, кандидат медицинских наук Мазурова, Ирина Юрьевна
Фенотипическая и генотипическая характеристика мутантов патогенных видов рода Burkholderia с измененной чувствительностью к антибиотикам2010 год, кандидат биологических наук Молчанова, Елена Владимировна
Реализация патогенности бактерий Burkholderia cepacia при разных формах инфекции2008 год, доктор медицинских наук Чернуха, Марина Юрьевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биологические свойства и принцины идентификации культур группы Burkholderia cepacia»
В род Burkholderia в настоящее время входят более 30 видов грамотрицательных глюкозу неферментирующих бактерий, подавляющее большинство которых являются свободноживущими почвенными и водными микроорганизмами. Для медицинской практики имеют значение идентификация и биологические свойства 3-х видов буркхольдерий: В. mallei и В. pseudomallei, являющихся возбудителями особо опасных инфекций (сапа и мелиоидоза), а также В. cepacia, способной в определенных условиях вызывать оппортунистические и нозокомиальные инфекции у больных с иммунодефицитным состоянием [4].
В. cepacia является убиквитарным микроорганизмом, обладающим уникальным набором приспособительных механизмов, позволяющих ему занимать экологические ниши, как во внешней среде, так и в симбиотических состояниях с растениями и животными [4, 73, 168,176]. Учитывая способность утилизировать широкий набор простых и сложных химических соединений, в том числе и токсических, В. cepacia используется для биоремидиации почвы [106]. Однако при этом приходится считаться с тем, что В. cepacia способна вызывать патологические изменения у растений, животных и человека [160, 168, 171].
Наиболее остро стоит проблема инфекции В. cepacia для больных муковисцидозом, у которых возможно возникновение cepacia-синдрома, характеризующегося формированием некротической пневмонии и септицемии с неблагоприятным прогнозом [46, 101, 171]. Проблемы лечения больных с В. серас/а-инфекциями усложняются высокой устойчивостью этого микроорганизма к большинству современных антибиотиков, причем в ходе лечения возможно появление полирезистентных клонов, поэтому цикл химиотерапии этих пациентов длительный и базируется на комплексном сочетании антибиотиков с разным механизмом действия [75, 86].
Диагностика инфекций, вызванных В. cepacia, в настоящее время весьма несовершенна, идентификация культур и их внутривидовая дифференциация, как средство эпидемиологического анализа, требует высокого уровня подготовки специалистов и наличия специальных средств генетической диагностики. Это возможно обеспечить только в специализированных центрах, в обычных клинических лабораториях выделение и идентификация культур В. cepacia происходит довольно редко, чаще всего подобные культуры идентифицируются как «необычные» псевдомонады или глюкозу неферментирующий вид бактерий [4]. В лабораториях, располагающих полуавтоматическими системами идентификации типа API, Nefermtest, Vitek, культуры В. cepacia идентифицируются чаще, однако этим методом они не дифференцируются на геномовары (виды группы В. cepacia) и не позволяют отличить от В. cepacia ряд близкородственных видов буркхольдерий.
Особенно опасны случаи неточности определения вида на уровне идентификации филогенетически близких возбудителей особо опасных инфекций В. mallei и В. pseudomallei как В. cepacia, что приводит к нарушениям режима работы и внутрилабораторным инфекциям [166].
Цель работы: изучение культуральных, биохимических, патогенных свойств коллекции культур В. cepacia для установления набора тестов, имеющих принципиальное значение для разработки схемы идентификации и внутривидового типирования штаммов В. cepacia.
Задачи исследования:
1. Выявить фенотипические признаки, имеющие принципиальное значение для установления видовой принадлежности культур В. cepacia.
2. Отобрать тесты, необходимые для внутривидового типирования (эпидемиологические маркеры) штаммов В. cepacia.
3. Оценить диапазон чувствительности культур В. cepacia к антибактериальным препаратам с целью разработки терапевтических рекомендаций и создания селективных сред.
4. Разработать практическую схему лабораторной идентификации и дифференциации культур В. cepacia.
Научная новизна.
В результате исследования набора штаммов В. cepacia и филогенетически близких буркхольдерий отобраны основные фенотипиче-ские дифференциальные признаки и разработан алгоритм идентификации культур вида В. cepacia.
Показана перспективность использования иммунологических реакций (РДД, МФА), особенно на этапе предварительной идентификации.
Изучен спектр чувствительности штаммов В. cepacia к современным химиотерапевтическим препаратам, и даны рекомендации по их использованию в диагностических и лечебно-профилактических целях.
Выявлены фено- и генотипические признаки внутривидовой дифференциации штаммов В. cepacia как факторов эпидемиологического анализа. Приоритетность исследований подтверждается двумя патентами на изобретение, оформленными по материалам диссертационной работы.
Теоретическая и практическая значимость. Проведенные исследования по идентификации буркхольдерий показали необходимость комплексных исследований с применением морфологических, биохимических, иммунологических,и генетических методик, т. е. представлены доказательства необходимости использования принципов полифазной таксономии для идентификации и типирования бактерий рода Burkholderia.
Разработана схема идентификации В. cepacia, позволяющая определять вид, геномовары и биовары в условиях клинической бактериологической лаборатории. В лекционно-практический курс отдела подготовки специалистов по особо опасным инфекциям введен раздел принципов полифазной таксономии буркхольдерий, позволяющий на современном уровне устанавливать как видовую принадлежность, так и проводить инфравидовое разграничение исследуемых культур буркхольдерий.
На основании изучения спектра чувствительности культур В. cepacia к антибактериальным препаратам, предложен набор антибиотиков, пригодных для химиотерапии и разработки селективных сред.
Материалы диссертационной работы использованы при подготовке «Методических рекомендаций по приготовлению и использованию питательной среды для дифференциальной диагностики патогенных и близкородственных буркхольдерий», утвержденных директором Волгоградского НИПЧИ В.В.Алексеевым 12.12.07 г.
Штамм В. cepacia КМ 203 - авирулентный продуцент сапного бактериофага депонирован в государственной коллекции патогенных бактерий «Микроб» 27.12.2006 г. Получен патент на изобретение №2339690 от 27.11. 2008 г «Штамм бактерий Burkhoideria cepacia -авирулентный продуцент бактериофага, лизирующего культуры сапа». Получено решение о выдаче патента на изобретение от 05.05.2009 г «Питательная среда для выделения возбудителя сапа», заявка № 2007126294, дата подачи заявки 10.07.2007 г.
Положения, выносимые на защиту:
1) отобранные на основе изучения фенотипических свойств культур В. cepacia стабильные и вариабельные признаки позволили создать практическую схему идентификации с определением вида и биоваров штаммов В. cepacia;
2) иммунологические методы диагностики (РДД и МФА) позволяют исключать или отрицать принадлежность культур к виду В. cepacia на стадии предварительной идентификации;
3) изучение антибиотикочувствительности культур В. cepacia позволяет выявить препараты, рекомендуемые для лечения инфекций (карбапенемы, хинолоны, тетрациклины), а также применяемые при создании селективных сред (полимиксин В, гентамицин, ванкомицин).
4) идентификация культур вида В. cepacia с помощью автоматических тест-систем (API 20 NE или NEFERM-test) позволяет с высокой степенью достоверности (>90 %) установить видовую принадлежность исследуемых культур, однако с целью исключения гипердиагностики за счет филогенетически близких видов буркхольдерий, требует постановки дополнительных лабораторных тестов;
5) принцип полифазной таксономии требует для окончательной идентификации штаммов В. cepacia комбинированного исследования культур с применением методов генотипического, фенотипического, серологического исследования, позволяющих в конечном итоге установить принадлежность культур не только к виду, но и к определенному био- или геномовару), что имеет важное значение для эпидемиологического анализа инфекций В. cepacia.
Апробация работы.
Материалы диссертации были представлены на научно-практической конференции «Современные аспекты эпидемиологического надзора за особо опасными инфекционными заболеваниями на юге России» (Ставрополь, 2007), на VIII Межгосударственной научно-практической конференции государств-участников СНГ «Международные медико-санитарные правила и реализация глобальной стратегии борьбы с инфекционными болезнями в государствах-участниках СНГ» (Саратов, 2007), а также на научных межлабораторных конференциях Волгоградского научно-исследовательского противочумного института в 2007, 2008 гг.
Публикации результатов исследований.
По теме диссертации опубликовано 8 научных работ, в том числе одна издана в периодическом издании из перечня ведущих рецензируемых научных журналов, утвержденных ВАК Министерства образования и науки России и рекомендованных для публикации основных научных результатов диссертации на соискание искомой ученой степени, получен один патент на изобретение.
Структура и объем работы.
Диссертация изложена на 125 листах машинописного текста и состоит из введения, 3 глав обзора литературы, 4 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций и списка цитируемой литературы, включающего 194 источника, в том числе 47 отечественных и 147 иностранных авторов. Работа иллюстрирована 12 таблицами и 8 рисунками.
Похожие диссертационные работы по специальности «Микробиология», 03.00.07 шифр ВАК
Эпидемиологические и микробиологичесике особенности хронической инфекции, вызванной бактериями комплекса Burkholderia cepacia, у больных муковисцидозом2011 год, кандидат биологических наук Алексеева, Галина Вальтеровна
Генотипирование штаммов Burkholderia mallei и Burkholderia pseudomallei2008 год, кандидат медицинских наук Савченко, Сергей Сергеевич
Мелиоидоз - актуальные вопросы современной эволюции и разнообразия Burkholderia pseudomallei в аспектах совершенствования лабораторной диагностики2022 год, доктор наук Захарова Ирина Борисовна
Разработка основ молекулярно-генетического исследования возбудителя мелиоидоза и близкородственных буркхольдерий2005 год, доктор медицинских наук Замараев, Валерий Семенович
Ультраструктурно-функциональный анализ патогенных буркхольдерий и особенности их взаимодействия с макроорганизмом при развитии инфекционного процесса2004 год, доктор медицинских наук Попов, Сергей Федорович
Заключение диссертации по теме «Микробиология», Лобойко, Алексей Давидович
выводы
1. На основании исследования фенотипических свойств 25 музейных штаммов В. cepacia, установлен набор стабильных и вариабельных признаков для данного вида микроорганизма; на основании стабильных признаков разработана схема для практической, ориентировочной идентификации культур В. cepacia.
2. Определены уровни чувствительности штаммов В. cepacia к 18 химиотерапевтическим препаратам, показана перспективность использования для лечения карбапенемов, хинолонов и ко-тримаксазола. Для разработки селективных сред можно использовать сочетание полимиксинаВ, гентамицина и ванкомицина, к которым все культуры В. cepacia высоко резистентны.
3. Патогенность культур В. cepacia на лабораторных животных не коррелирует - с фитопатогенностью; • при оценке вирулентности штаммов В. cepacia, выделенных из внешней среды и клинического материала, чувствительность животных к инфекции повышается при введении иммуноблокаторов - актиномицина Д или четырех-хлористого углерода.
4. Иммунологические методы (РДД, МФА) показали перспективность их использования на этапах предварительной оценки, при этом показано, что в РДД происходит гипердиагностика за счет наличия у близкородственных буркхольдерий общих антигенов, а МФА-высокоспецифичен, нами не отменены случаи гипер- или ги-подиагностики.
5. Использование для постановки ПЦР праймеров на основе ДНК гесА гена В. cepacia позволили определять как видовую принадлежность исследуемых культур, так и их инфравидовую характеристику - геномовар. 1 '
6. Установлена способность штаммов В. cepacia к фаго- и бакте-риоцинопродукции, имеющаяся коллекция штаммов разграничена на группы по их способности быть продуцентами или индикаторами, тем самым являясь механизмом типирования культур этого вида. 7. Учитывая принципы полифазной таксономии, нам удалось выявить набор биохимических, иммунологических и генетических методов, который обеспечил разработку схемы идентификации культур В.cepacia с установлением не только видовой принадлежности, но и определение геномо- и биоваров исследуемых штаммов.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
1. Для идентификации культур, подозрительных на принадлежность к патогенным видам Burkholderia необходимо наряду с обязательными биохимическими тестами (декарбоксилазы, |3-галактоза, окисление Сахаров и оценка способности усваивать пентозы) проводить иммунологические исследования !(РДД, МФА).
2. При эпидемиологическом анализе нозокомиальных вспышек инфекции В.cepacia в качестве эпидемиологического маркирования нужно применять метод ПЦР для разграничения культур на геномовары.
3. В программу курсов отдела подготовки специалистов по особо опасным инфекциям рекомендуем ввести лекционно-практический раздел по принципам полифазной таксономии буркхольдерий, позволяющий на современном уровне устанавливать как видовую принадлежность, так и проводить инфравидовое разграничение исследуемых культур буркхольдерий.
Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Лобойко, Алексей Давидович, 2009 год
1. Авроров, В.П. К вопросу об инактивации чумного мышиного токсина печенью и лейкоцитами белых крыс / В.П. Авроров, В.И. Илюхин // Бюлл. эксперим. биол. мед. 1970. - № 9. - С. 27 - 28.
2. Антонов, Ю.В. Чувствительность псевдомонад к современным антибактериальным препаратам / Ю.В. Антонов, В.И. Илюхин, Л.Д. По-повцева//Антибиотики и химиотерапия. -1991. № 1. - С. 14-16.
3. Ашмарин, И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях / И.П. Ашмарин, А.А. Воробьев М.: Медгиз. - 1962. -180с.
4. Беляков, В.Д. Псевдомонады и псевдомонозы / В.Д. Беляков, Л.А. Ряпис, В.И. Илюхин М.: Медицина. -1990. -224 с.
5. Блинкова, Л.П. Бактериоцины: критерии, классификация, свойства, методы выявления / Л.П. Блинкова // Журн. микробиол. эпидемиол. иммунобиол:- —2003, № 3. - С. 109 - 113. ■
6. Блохина, И.Н. Систематика бактерий (с основами геносистематики) / И.Н. Блохина, Г.Ф. Леванова, А.С. Антонов Нижний Новгород, 1992. -170 с.
7. Будченко, А.А. Сравнительный анализ электрофореграмм суммарных клеточных белков патогенных буркхольдерий / А.А. Будченко, В.И. Илюхин, Д.В. Викторов // Мол. генет. микробиол. вирусол. -2005. № 2. - С. 24 - 28.
8. Додатко, Т.А., Бактериоцинотипирование штаммов Pseudomonas cepacia, выделенных от-больных и ризосферы растений / Т.А. Додатко, Е.А. Киприанова, В.В. Смирнов II Журн. микробиол. эпидемиол. иммунобиол. 1989. - № 1. - С. 21 - 26.
9. Додатко, Т.А. Биологическая активность и физико-химические свойства нового бактериоцина из штамма Pseudomonas cepacia 5779 / Т.А. Додатко, Е.А. Киприанова, В.В. Смирнов // Микробиол. журн.1989.-№ 4.-С. 68-74.
10. Ильина, Т.С. Биопленки как способ существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина: феномен, генетический контроль и системы регуляции их развития / Т.С. Ильина, Ю.М. Романова,
11. A.Л. Гинцбург II Генетика. 2004. - № 11. - С. 1 - 12.
12. Илюхин, В.И. Псевдомонадные инфекции в патологии человека /
13. B.И. Илюхин //Журн. микробиол. эпидемиол. иммунобиол. 1985. - № 2.-С. 110-114.
14. Илюхин, В.И. Влияние актиномицинаД на чувствительность белых мышей к чумной интоксикации и инфекции / В.И. Илюхин, Н.П. Нико-лаенко, В.П. Авроров // Пробл. особо опасн. инфекций Саратов. -1972. -Вып.2.-С.124 -127.
15. Илюхин, В.И. Burkholderia thailandensis: биологические свойства, идентификация и таксономическая позиция / В.И. Илюхин, Т.В. Сени-на, Н.Г. Плеханова // Мол. генет. микробиол. вирусол. 2002. - № 1.1. C. 7-11.
16. Исхакова, Х.И Неферментирующие грамотрицательные бактерии и дифференциация их от Pseudornonas aeruginosa /Х.И. Исхакова, Л.Г. Баженов, Н.Г. Шабанова //Журн. гигиены эпидемиол. микробиол и иммунол.-1982.-Т. 26. С. 403-413.
17. Капранов,-НИ:' Антибиотикотерапия'муковисцидоза у детей / Н.И. Капранов, Л.А. Шабалова, Н.Ю. Каширская // Антибиот. химиотер. -2001. №2. - С. 26-32.
18. Капранов, Н.И. Муковисцидоз. Достижения и проблемы на современном этапе / Н.И. Капранов, Н.Ю. Каширская, Н.В. Петрова // Мед. генетика. 2004. - № 9. - С. 398 - 412.
19. Лабораторная-диагностика, лечение и профилактика мелиоидоза (методические рекомендации). 1.10.94. / Утверждено Г.Г.Онищенко / -Волгоград, 1994. -62 с.
20. Литвин, В.Ю. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий / В.Ю. Литвин, А.Л. Гинцбург, В.И. Пушкарева М., 1998. - 256 с.
21. Медников, Б.М. Молекулярные-основы концепции биологического вида / Б.М. Медников // Рос. хим. журн. -1995. Т. 39, № 2. - С. 30 -38.
22. Мерков, A.M. Санитарная статистика / A.M. Мерков, Л.Е. Поляков. -Л., 1974.- — 384- с.» -.• '
23. Методы общей бактериологии / под ред. Ф. Герхарда. М. - 1983. -Т. 1.-536 с.
24. Опасные инфекционные заболевания / под ред. В.В. Алексеева. -Волгоград, 2006. 368 с.
25. Определитель грамотрицательных потенциально патогенных бактерий возбудителей внутрибольничных инфекций. Методические рекомендации. - М, 1986. - 36 с.
26. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Методические указания МУК 4.2.1890 04. - М., 2004. - 90 с.
27. Определитель бактерий Берджи: в 2 т. М.: Мир, 1997. - 2 т.
28. Патент 2144079 РФ. Штамм бактерий Pseudomonas cepacia ВДК ВКПМ В-7559-деструкгор фенола и формальдегида / И. И. Денисов, Н.Г. Тихонов, В.И. Илюхин. № 98110597/13; заявл. 4.06.98; опубл. 10.01.2000, Бюл. № 1.-4 с.
29. Пивень, Н.Н. Антигенный анализ возбудителей мелиоидоза и сапа в аспектах идентификации, диагностики и патогенности: дис.докт.мед. наук: 03.00.07 / Н.Н. Пивень Волгоград, 1997. - 296 с.t
30. Пивень, Н.Н. Перспективы исследования общих, перекрестнореа-гирующих и видовых антигенов у некоторых видов бактерий рода Pseudomonas /Н.Н. Пивень // Микробиол. журн.,1987. № 3. - С. 6 -10.
31. По'повцева, Л.Д.* Поиск оптимальной схемы идентификации возбудителя мелиоидоза: дис.канд. мед. наук: 03.00.07 / Л.Д. Поповцева -Волгоград, 1985. 115 с.
32. Пушкарева, В.И. Burkholderia cepacia в разных экологических условиях: численность и изменчивость бактериальной популяции / В.И. Пушкарева, В.В. Величко, А.А. Каминская // Журн. микробиол. эпиде-миол. иммунобиол. 2005. - № 3. - С. 39. - 44.
33. Рубан, Е.Л. Физиология и биохимия представителей рода Pseudomonas / Е.Л. Рубан М.,1986. - 200 с.
34. Ряпис/ Л.А* Лабораторная диагностика Клинически значимых видов псевдомонад / Л.А. Ряпис, В.И. Илюхин, Е.И. Вострова // Лаб. дело. -1988.-№12.-С. 66-71.
35. Сенина, Т.В. Биологические свойства и дифференциальная диагностика буркхольдерий, имеющих значение в медицинской практике: дис.канд. биол. наук: 03.00.07 / Т.В. Сенина. Волгоград, 2004. -124с.
36. Смирнов, В.В. Pseudomonas / В.В. Смирнов, Е.А. Киприанова. -Киев: Наукова думка, 1990. 264 с.
37. Специфическая" индикация патогенных биологических агентов / под ред. Г.Г.Онищенко. М, 2006. - 288 с.
38. Студеникин, М.Я. Актуальные проблемы муковисцидоза / М.Я.
39. Студеникин, В. Чупиг М, 1977. - 196 с.
40. Тарасов, В.Н. Автоматизация диагностики бактериальных и вирусных инфекций / Итоги науки и техники, серия «Микробиология» // В.Н. Тарасов. М. - 1987. - Т. 18. - 244 с.
41. Ткаченко, Г.А. Идентификация возбудителей сапа и мелиоидоза с помощью полимеразной цепной реакции / Г.А. Ткаченко, В.А. Антонов, B.C. Замараев // Мол. генет. 2003, - № 3. - С. 18 - 22.
42. Чернуха, М.Ю. Исследование вирулентных свойств госпитальных штаммов бактерий комплекса Burkholderia cepacia, выделенных в стационарах города Москвы / М.Ю. Чернуха, Г.В. Алексеева, И.А. Шаги-нян //Журн. микробиол. 2005. - № 6. - С. 46-51.
43. Чернуха, М.Ю. Изучение молекулярно-генетических механизмов патогенности бактерий родов Pseudomonas и Burkholderia / М.Ю. Чернуха, В.П. Ковтун, Т.Н. Николаева, И.А. Шагинян // Клин. лаб. диагн. -2001.-№11.-С. 40-41.
44. Шагинян, И.А. Бактерии комплекса Burkholderia cepacia: особенности диагностики, организации генома и метаболизма / И.А. Шагинян, М.Ю. Чернуха // Мол. генет. 2003. - № 2. - С. 3 - 10.
45. Шендеров, Б.А. Простые схемы идентификации неферментирую-щих грамотрицательных бактерий / Б.А. Шендеров, Г.П. Серкова // Вопросы биохимии и физиологии микроорганизмов. Саратов. - 1980. -вып. 8. - С. 60-71.
46. Aaron, S.D. Multiple combination bactericidal antibiotic testing for patients with cystic fibrosis infected by Burkholderia cepacia / S.D. Aaron, W. Ferris, D.A. Henry et al. //Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2000. - Vol.161. -P. 1206-1212.
47. Abe, K. Outbreak of Burkholderia cepacia bloodstream infection at an outpatient hematology and oncology practice / K. Abe, M.T. D'Angelo, R. Sunenshine // Infect. Control. Hosp. Epidemiol. 2007. - Vol. 11. - P. 1311 -1313.
48. Agodi, A. Burkholderia cepacia complex infection in Italian patients with cystic fibrosis: prevalence, epidemiology and genomovar status / A. Agodi, E. Mahenthiralingam, M. Barchitta // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39. -P. 2891 -2896.
49. API 20 NE. Analytical profile index/Bio Merieux S.A., 6 edition, 1997. -254 p.
50. Ashdown,4 L:R: An improved screening-technique for isolation of Pseu-domonas pseudomallei from clinical specimens / L.R. Ashdown // Pathology. -1979. Vol. 11, N2.-P. 293-297.
51. Aygencel, G. Burkholderia cepacia as a cause of ecthyma gangreno-sum-like lesion / G. Aygencel, M. Dizbay, G. iSahin // Infection. 2007. -oct 25. - P. 124-128.
52. Baldwin, A. Multilocus sequence typing scheme that provides both species and strain differentiation for the Burkholderia cepacia complex / A. Baldwin, E. Mahenthiralingam, K. Thickett et al. // J. Clin. Microbiol. 2005.-Vol. 43.-P. 4665-4673.
53. Baldwin, A. Elucidating the global epidemiology of Burkholderia multi-vorans in cystic fibrosis by multilocus sequence typing / A. Baldwin, E. Ma-henthiralingam, P. Drevinek // J. Clin. Microbiol. 2007. - Vol. 45. - P. 3645 - 3649.
54. Ballard, R.W. Taxonomy of aerobic pseudomonads: Pseudomonas cepacia, P.marginata, P.alliicola and P.caryophilli / R.W. Ballard, N.J. Palle-roni, M. Doudoroff//J. Gen. Microbiol. 1970.-Vol. 60. - P. 199-214.
55. Bauernfield, A. Discrimination of Burkholderia gladioli from other Burkholderia species detectable in cystic fibrosis patients by PCR / A. Bauernfield, I. • Schneider,-R. Jungwirth, C. Roller//!J. Clin. Microbiol. 1998. -Vol. 36.-P. 2748-2751.
56. Baxter, I.A. Isolation from clinical sources of Burkholderia cepacia possessing characteristics of Burkholderia gladioli/ I.A. Baxter, P.A. Lambert, I.N. Simpson // J. Antimicrob. Chemother. 1997. - Vol. 39. - P. 169 -175.
57. Beckman, W. Response of Pseudomonas cepacia to £ lactam antibiotic: utilization of penicillin G as carbon source / W. Beckman, T.G. Lessie^ //J. Bacteriol. - 1979. - Vol. 140. - P.'1126 - 1128.
58. Bergan*T. Human and animal pathogenic member of the genus pseudomonas/Т. Bergan // In: Procariotes. Berlin, 1981. - Vol. 1. - P. 666 -700.
59. Bernier, S.P. Comparative analysis of plant and animal models for characterization of-Burkholderia cepacia virulence / S.P. Bernier, L. Silo-Suh, D.E.Woods//Infect. Immun. -2003.-Vol. 71.-P. 5306-5313.
60. Berriatua, E. Outbreak of subclinical mastitis in a flock of diary sheepassociated with Burkholderia cepacia complex infection / E. Berriatua, J.
61. Ziluaga, C. Miguel-Virto // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39. - P. 990 -994 - т.,-.-.
62. Bremmelgaard, A. Differentiation between Pseudomonas cepacia and Pseudomonas pseudomallei in clinical bacteriology / A. Bremmelgaard // Acta Pathol. Microbiol. Scand. 1975. - Vol. - 83. - P. 65 - 70.
63. Burkholder, W.H. Sour skin, a bacterial rot of onion bulbs / W.H. Burk-holder //-Phytopathology. 1950. - Vol. 64. - P. 468 - 475.
64. Brisse, S. Comparative evaluation of the BD Phoenix and Vitek 2 automated instruments for identification of isolates of the Burkholderia cepacia complex / S. Brisse, S. Stefani, J. Verhoef et al. // J. Clin. Microbiol. -2002. Vol. 40. - P. 1743 - 1748.
65. Burns; ii:'Burkholderia cepacia infection in cystic fibrosis / J. Burns, L. Saimon//Pediatr. Infect. Dis. 1999.-Vol. 15.-P. 155-156.
66. Chiu, C.H. Adherence of Burkholderia cepacia to respiratory tract epithelial cells and inhibition with dextrans / C.H. Chiu, S. Wong, R.E. Hancock, D.P. Speert// Microbiol. -2001. Vol. 147. - P. 2551 -2558.
67. Coenye, T. Taxonomy and identification of the Burkholderia cepacia complex / T. Coenye, P. Vandamme, J.R.W. Govan, J.J. Li Puma//J. Clin. Microbiol.-2001.-Vol.39, N10.-P. 3427-3436.
68. Coenye, T. Updated version of the Burkholderia cepacia complex expe-rimentarstrain;pan§l7T."Coenye,"P. Vandamme, J.J. Li Puma//J. Clin. Microbiol. 2003. - Vol. 41. - P. 2797 - 2798.
69. Colwell, R.R. Polyphasic taxonomy of the genus vibrio: numerical taxonomy of vibrio cholerae, vibrio parahaemolyticus and related vibrio species/R.R. Colwell // J. Bacteriol. 1970. - Vol. 104. - P. 410-433.
70. Colwell, R.R. The microbial species concept and biodiversity / R.R. Colwell, R.A. Clayton, B.A. Ortiz-Conde // In: "Microbial diversity and ecosystem function", ed. By D.Colwell, DJ. Hawsworth // Oxon. 1995. - P. 3 -15.
71. Conway, B.A. Biofilm formation and acyl homoserine lactone production in the Burkholderia cepacia complex / B.A. Conway, V. Venu, D.P. Speert // J. Bacteriol. 2002. - Vol. 184. - P. 5678 - 5685.
72. Conway, S.P. Antibiotic treatment of multidrug-resistant organisms in cystic fibrosis / S.P. Conway, R.G. Brownlee, M. Denton, D.G. Peckham // Am. J. Respir. Med. 2003. - Vol. 2. - P. 321 - 332.
73. Corey, M. Determinants of mortality from cystic fibrosis in Canada, 1970 1989. I M. Corey, V. Farewell II Am. J. Epidemiol. - 1996. - Vol. 143.-P. 1007-1017.
74. Di Cello, F. Biodiversity of a Burkholderia cepacia popylation isolated from the maize rhizosphere at different plant growth stades / F.A. Di Cello, A. Bevivino, L. Chiarini // Appl. Envir. Microbiol. 1997. - Vol. 63. - P. 4485-4493.
75. Difco manual // Detroit, 9-th ed, 1985. 1155 p.
76. Dijkshoorn, L. Strain, clone, and species: comments on three basic concepts of bacteriology / L. Dijkshoorn, B.M. Ursing, J.B. Ursing //J. Med. Microbiol. 2000. - Vol. 49. - P. 397 - 401.
77. Drevinek/P. Genomovar distribution of the Burkholderia cepacia complex differs significantly between Czech and Slovak patients with cystic fibrosis / P. Drevinek, O. Cinek, J. Melter // J. Med. Microbiol-2003. Vol. 52. - P. 603 - 604.
78. Esanu, J.G. Zur Taxonomic und Nomenclatur von Pseudomonas cepacia /J.G. Esanu, R.H.W. Schubert//Zentr. Bakteriol. Parasit. Infect. Hyg. -1973. Vol. 224. - P. 478 - 483.
79. Estivariz, C.F. An outbreak of Burkholderia cepacia associated withcontamination of albuterol and nasal spray / C.F. Estivariz, L.I. Bhatti, R. Pati//Chest. 2006. - Vol. 130.-P. 1293-1296.
80. Faure, R. En route to a carbohydrate based vaccine against Burkholderia cepacia / R. Faure, T.C. Shiao, D. Lagnoux // Org. Biomol. Chem. -2007.-Vol. 16.-P. 2704-2708.
81. Fiore, A. Burkholderia cepacia complex: distribution of genomovars among isolates from the maize rhizosphere in Italy / A. Fiore, S. Laevens, A. Bevevino // Environ. Microbiol. 2001. - Vol. 3. - P. 137 - 143.
82. Garrity, G.M. Taxonomic outline of the prokaryotes. Bergeys manyal of systematic bacteriology / G.M. Garrity, K.L. Johnson, J. Bell, D.B. Searles // New York, Springer-Verlag. 2002. - 2-nd ed. - P. 58 - 60.
83. Gibson, R.L. Pathophysiology and management of pulmonary infections in cystic fibrosis / R.L. Gibson, J.L. Burns, B.W. Ramsey // Am. J. Resp. Crit. Care Med. -2003. Vol. 168. - P. 918 - 951.
84. Gilardi, G.L. Characterization of Pseudomonas species / G.L. Gilardi II Appl. Microbiol. 1971. - Vol. 21. - P. 414-419.
85. Gilardi, G.\E: Pseudomonas species in clinical microbiology / G.L. Gilardi // Mount Sinai. J. Med. 1976. - Vol. 43. - P. 710 - 726.
86. Gilardi, G.L. Identification of Pseudomonas and related bacteria / G.L. Gilardi // In: Glucose nonfermenting Gramnegative bacteria in clinical microbiology ed. by G.Gilardi. 1978. - P. 16— 44.
87. Gonzales,'C^F.' Bacteriocin, plasmid and1 pectolytic diversity in Pseudomonas cepacia of clinical and plant origin / C.F. Gonzales, A.K. Vidover //J. Gen. Microbiol. 1979. - Vol. 110. - P. 161 - 170.
88. Govan, J.R.W. Burkholderia cepacia friend and foe / J.R.W. Govan, J. Balendreau, P.- Vandamme // ASM News. - 2000. - Vol. 66. - P. 124
89. Govan, J.R.W. Evidence for transmission of Pseudomonas cepacia by social contact in cystic fibrosis / J.R.W. Govan, P.H. Brown, J. Maddison // Lancet. 1993. - Vol. 342. - P. 15 - 19.
90. Govan, J.R.W. Microbial pathogenesis in cystic fibrosis: mucoid Pseudomonas aeruginosa and Burkholderia cepacia /J.R.W. Govan, V. Deretic // Microbiol. Rev. 1996. - Vol. 60. - P. 539 - 574.
91. Govan, J.R.W. Typing of Pseudomonas cepacia by bacteriocin susceptibility and production / J.R.W. Govan, G. Harris // J. Clin. Microbiol. -1985. Vol. 22, N 4. - P. 490 - 494.
92. Govan, J.R.W. Burkholderia cepacia: medical, taxonomic and ecological issues / J.R.W. Govan, J.E. Hughes, P. Vandamme //J. Med. Microbiol. 1996. - Vol. 45. - P. 395 - 407.
93. Hadrys, H'/Applications of random amplified polymorphic DNA (RAPD) in molecular ecology / H. Hadrys, M. Balick, B. Schrierwater // Mol Ecol. -1992.-Vol. 1.-P. 55-63.
94. Hamil, R. An ontbreak of Burkholderia cepacia respiratory tract colonization and infection associated with nebulized, albuterol therapy / R. Hamil, E. Houston, P. Georghion et al. // Ann: Intern. Med. 1995. - Vol. 15 - P. 762 - 766.
95. Heidt, А. О and H serotyping of Pseudomonas cepacia /А. Heidt, H. Monteil, C. Richard // J. Clin. Microbiol. 1983. - Vol. 18. - P. 738 - 740.
96. Hendry, J. Antibody response to Burkholderia cepacia in patients with cystic fibrosis colonized with Burkholderia cepacia and Pseudomonas aeruginosa / J. Hendry, S. Butler, J.S. Elborn // J. Infect. 2000. - Vol. 40. -P. 164-170.
97. Henry, D.A. Identification of Burkholderia cepacia isolates from patients with cystic fibrosis and use of a simple new selective medium / D.A. Henry, M.E. Campbell, J.J. Li Puma //J. Clin. Microbiol. 1997. - Vol. 35, N3.-P. 614-619.
98. Henry, D. Comparison of isolation media for recovery of Burkholderia cepacia complex from respiratory secretions of patients with cystic fibrosis / D. Henry, M. Campbell, C. McGimpsey // J. Clin. Microbiol. 1999. - Vol. 37, N4.-P. 1004-1007.
99. Henry, D.A. Phenotipic methods for determining genomovar status of the Burkholderia cepacia complex / D.A. Henry, E. Manenthiralingam, P. Vandamme//J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39, N 3. - P. 1073- 1078.
100. Herasimenka, G. Macromolecular properties of cepacian in water and in dimethylsulfonide / G. Herasimenka, P. Cescutti, N. Sampaio // Carbo-hydr. Res. 2007. - N 10. - P. 570 - 575.
101. Holmes, A. Agricultural use of Burkholderia (Pseudomonas) cepacia: a threat to human health? / A. Holmes, J.R.W. Govan, R. Goldstein // Emerg. Infect. Dis. 1998. - Vol. 4, N 2. - P. 221 - 227.
102. Holmes, A. An epidemic of Burkholderia cepacia transmitted between patients with and without cystic fibrosis / A. Holmes, R. Nolan, R. Taylor // J. Infect. Dis. 1999. - Vol. 179.-P. 1197- 1205.
103. Homma, I. Production of antibiotic of Pseudomonas cepacia as an agent for biological control of soil borne pathogens /1. Homma, Z. Sato, F. Hioyama // Soil Biol. Biochem. 1989. -Vol. 21. - P. 723 - 728.
104. Hu, F.P. Biocidal activity in plant pathogenic Acidovorax, Burkholderia, Herbaspirillum, Ralstonia and Xanthomonas spp. / F.P. Hu, L.M. Young // J. Appl. Microbiol. 1996. - Vol. 84. - P. 263-271.
105. Hutchison, M.L. Burkholderia cepacia produces a hemolysin that is capable of inducing apoptosis and degranulation of mammalian phagocytes / M.L. Hutchison, I.R. Poxton, J.R.W. Govan // Infect. Immun.1998. Vol. 66. - P. 2033 - 2039. .
106. Isles, A. Pseudomonas cepacia infection in cystic fibrosis: an emerging problem / A. Isles, M. Maclusky, M. Corey // J. Pediatr. 1984. - Vol. 104.-P. 206-210.
107. Janda, J.M. Bacterial identification for publication: When is enough enough? / J.M. Janda, S.L. Abbot И J. Clin. Microbiol. 2002. - Vol. 40, N6.-P. 1887-1891.
108. Jones, A.M. Burkholderia cepacia: current clinical issues, environmental controversies and ethical dilemms / A.M. Jones, M.E. Dodd, A.K. Webb //Eur. Respir. J. 2001.-Vol. 17.-P. 295-301.
109. Jhons, P.A. Characterization of pseudomonas species for identification in the clinical laboratory / P.A. Jhons, R.G. Tisher // Amer. J. Med. Technol. 1973. - Vol. 39. - P. 495 - 500.
110. Keig, P.M. Differential invasion of respiratory epithelial cells by members of the Burkholderia cepacia complex / P.M. Keig, E. Ingham, P. Vandamme, K.G. Kerr // J. Clin. Microbiol. Infect. 2002. - Vol. 8. - P. 47 -49.
111. Keith, K.E Burkholderia cenocepacia С 5424 produces a pigment with antioxidant properties using a homogentisate / K.E. Keith, L. Killip, P. He // J. Bacteriol. 2007. - N. 10-P. 565-571.
112. Kenna, D.T. Lack of correlation between O-serotype, bacteriophage susceptibility and genomovar status in the Burkholderia cepacia / D.T. Kenna, V.A. Barcus, R.L. Langley // Immunol. Med. Microbiol. 2003. -Vol.35. - N 2. - P. 87 - 92.
113. Kenny, D.L. In vitro susceptibilities of Burkholderia mallei in comparison to those of other patogenic Burkholderia spp / D.L. Kenny, P. Russell, D. Rogers //Antimicr. Agents and Chemotherapy. 1999. - Vol. 43, N 11. -P. 2773 - 2775.
114. Kilian, K., Novel therapeutic possibilities in cystic fibrosis / K. Kilian, B.M. Kisiel // Pol. Merkur. Lekarski. 2006. - Vol. 119. - P. 586 - 590.
115. King, A. The identification of pseudomonads and related bacteria in a clinical laboratory I A. King, I. Phillips // J. Med. Microbiol. 1978. - Vol. 11, N 2. - P.165 - 176.
116. King, E. Population density of the biocontrol agent Burkholderia cepacia AMMDR 1 on four pea cultivars / E. King, J. Parke // Soil Biol. Biochem. 1996. - Vol. 28. - P. 306 - 312.
117. Kiratisin, P. Accuracy of commercial systems for identification of Burkholderia pseudomallei versus Burkholderia cepacia / P. Kiratisin, P. Santa-nirand, S. Kaewdaeng // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2007. - Vol.59. -P.277 — 281.
118. Koh, Т.Н.- Automated identification systems and Burkholderia pseudomallei /Т.Н. Koh, Ng L.S.Y., J.L.F. Ho et al. // J. Clin. Microbiol. 2003. -Vol. 41.-P. 1809.
119. Krueger, T.S. In vitro susceptibility of Stenothrofomonas maltophilia to various antimicrobial combination / T.S. Krueger, E.A. Clark, D.B. Nix // Diagn: Microbiol. Infect. Dis. 2001. - Vol. 41.! - P. 71 -78.
120. Kutty, P.K. Multi-state outbreak of Burkholderia cenocepacia colonization and infection associated with the use of intrinsically contaminated alcohol-free mouthwash / P.K. Kutty, B. Moody, G. Smartt // Chest. 2007. -Vol. 132.-P. 754-761.
121. Langleey/"R. Lysogeny and bacteriophage host range within the Burkholderia cepacia complex / R. Langleey, D.T. Kenna, P. Vandamme // J.
122. Med. Microbiol: 2003. - Vol. 52. - P. 483 - 490.
123. Lee, C.H. Cepacidine A, a novel antifungal antibiotic produced by Pseudomonas cepacia / C.H. Lee,; S. Kim, B. Hyun // J. Antibiotics. -1994. Vol. 47. - P. 1402 - 1405.
124. Lennon, E.PIasmids of Pseudomonas cepacia of diverse origins / E. Lennon, B.T. De Cicco // Appl. Envir. Microbiol. 1991. - Vol. 57. - P. 2345 - 2350.
125. Lessie, T.G. Genomic complexity and plasticity of Burkholderia cepacia /Т.G. Lessie, W. Hendrickson, B.D. Manning, R. Deveruex // FEMS Microbiol. Let. 1996! - Vol. 144. - P. 117 - 128.
126. Li, X. Antifungal activity of a novel compound from Burkholderia cepacia against plant pathogenic fungi / X. Li, C.S. Quan, S.D. Fan // Lett. Appl. Microbiol. 2007. - Vol. 5. - P. 508 - 514.
127. Liou, T.G: Lung transplantation and survival in children with cystic fibrosis / T.G. Liou, F.R. Adler, D.R. Cox, B.C. Cahill // N. Engl. J. Med. -2007. Vol. 21. - P. 2143 - 2152.
128. LiPuma, J.J. Person-to-person transmission of Pseudomonas cepacia between patients with cystic fibrosis / J.J. LiPuma, S.E. Dasen, D.W. Niel-son // Lancet. 1990. - Vol. 336. - P. 1094 - 1096.
129. LiPuma, J.J. Commercial use of Burkholderia cepacia / J.J. LiPuma J.J., E. Mahenthiralingam // Emerg. Infect. Dis. 1999. - Vol. 5, N 2. - P. 305 - 306.
130. LiPuma;?J.J.-Isolation of soil-borne genomovar III Burkholderia cepacia and lytic phages with interspecies host range / J.J. LiPuma, E. Mahenthiralingam, G.L. Mark, C.F. Gonzales // Pediatr. Pulmonol. 2000. - Vol. 20. - P. 288 - 289.
131. Liu, P.V= Analytical serology of pseudomonadaceae / P.V. Liu II Analytical serology of microorganisms. Interscience Publishers, ed. J. Kwa-pinski. 1969. - Vol. 2. - P. 1 - 44.
132. Lu, D. Burkholderia cepacia bacteria: a retrospective analysis of 70118w . J -I.-.: - .-i, , '„' .' - < i-i i .-*episodes / D. Lu, S. Chang, I. Chen // J. Formos. Med. Assoc. 1997. -Vol. 96. - P. 972 - 978.
133. Mack, K. The detection of insertion sequences within the human pathogen Burkholderia pseudomallei which have been identified previously in Burkholderia cepacia / K. Mack, R.W. Titball // FMS Microbiol. Let. 1998. -Vol. 162.-P. 69-74.
134. Mariappan V. Identification of common immunodominant secretory antigens between Burkholderia cepacia and Burkholderia pseudomallei / V. Mariappan, K.M. Vellosamy, J. Suppiah // The 5-th world melioidosis congress, Khon Kaen, Thailand, 2007. P. 153.
135. Martin, D.W. Invasion and intracellular survival of Burkholderia cepacia /D.W. Martin, C.D. Mohr// Infect.' Immun.- 2000. Vol. 68. - P. 24-29.
136. Molin, G. Numerical taxonomy of psychrotrophic Pseudomonas / G. Molin, A. Ternstrom // J. Gen Microbiol. 1982. - Vol. 128. - P. 1249 -1264.
137. Monteil, H. Pseudomonas cepacia: intered epidemiologique de la de-terminantion des serogroups О des souches hospitalieres / H. Monteil, C. Richard, A. Heidt//Med. Mai. Infect. 1981.-Vol. 11. - P. 544-547.
138. Nzula, S. Sensitivity of the Burkholderia cepacia complex and Pseudomonas aeruginosa to transducing bacteriophages / S. Nzula, P. Van-damme, J.R.W. Govan // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2000. - Vol. 26.-P. 307-312.
139. Nzula, S. Influence of taxonomic status on the vitro antimicrobial susceptibility Burkholderia cepacia complex / S. Nzula, P. Vandamme, J.R.W. Govan // J. Antimicrob. Chemother. 2002. - Vol. 50 - P. 265 - 269.
140. OToole.-G. Biofilm- formation as microbial development / G. OToole, H.B. Kaplan, R. Kolter // Ann. Rev. Microbiol. 2000. - Vol. 54. - P. 49 -79.
141. Otterbein, C.K. Development and characterization of a murine monoclonal antibody reactive with a 64 kDa somatic antigen of Burkholderia cepacia /С.К. Otterbein, W.D. Splettstoesser// Hibridoma. 1998. - Vol. 17, N2.-P. 143-150.
142. Palleroni, N.J. Family of Pseudomonadaceae / N.J. Palleroni // Ber-geys manual of systematic bacteriology. Baltimore, 1984. - Vol. 1. - P. 141 -199.^ . 1 r. . ,, .
143. Palleroni, N.J. Pseudomonas cepacia sp. nov., nom. rev. / N.J. Palleroni, B. Holmes //Int. J. Syst. Bacteriol. 1981. - Vol. 31. - P. 479-481.
144. Parke, G.L. Diversity of the Burkholderia cepacia complex and implications for risk assessment of biological control strains / G.L. Parke, D. Gu-rian-Sherman // Ann. Rev. Phytopathol. 2001. - Vol. 39. - P. 225 - 258.
145. Payne, G.W. Development of a rec A Gene-based identification approach for the entire Burkholderia genus / G.W. Payne, P. Vandamme, S.H. Morgan //Appl. Envir. Microbiol. 2005.-Vol.71. - P.3917 - 3927.
146. Pegues, D.A. Acquisition of Pseudomonas cepacia at summer camps for patients with cystic fibrosis / D.A. Pegues, L.A. Carson, O.C. Tablaer //
147. J. Pediatr. 1994. - Vol. 124. - P. 694 - 702.
148. Petrucca, A. Burkholderia cenocepacia vaginal infection in patient with smoldering myeloma and chronic hepatitis С / A. Petrucca, P. Cipriani, R. Sessa // Emerg. Infect. Dis. 2004. - Vol. 10. - P. 1957 - 1959.
149. Pickett, M. Q. Characterization of saccharolytic nonfermentive bacteria associated withman / M.Q. Pickett, M.M. Pedersen // Can. J. Microbiol. -1970.-Vol. 16.-P. 401 -409.
150. Pitt, T.L. Bacteriocin typing /T.L. Pitt, M.A. Gaston // Methods Molecular Biol. 1995. - Vol. 46. - P. 5 - 14.
151. Rabkin, C.S. Pseudomonas cepacia typin systems: collaborative study to assess their potential in epidemiologic investigations / C.S. Rabkin, W.R. Garvis, R.L. Anderson // Rev. Infect. Dis. 1989. - Vol. 11. - P. 600 - 607.
152. Rahme, L.G. Plants and animal share functionaly common bacterial virulence factors / L.G.^Rahme, F.M. Ausubel, H. Cao // Proc. Natl. Acad. Sci. 2000. - Vol. 97. - P. 8815 - 8821.
153. Rosenfeld, M. Early pulmonary infection, inflammation and clinical outcomes in infant with cystic fibrosis / M. Rosenfeld, R.L. Gibson, S. Mc Namara // Pediatr. Pulmonol. 2001. - Vol. 32. - P. 356 - 366.
154. Rosenstein, B.J. Cystic fibrosis foundation consensus panel: the diagnosis of cystic fibrosis: a consensus statement / B.J. Rosenstein, G.R. Cutting//J. Pediatr.-1998.-Vol. 132.-P. 589-595.
155. Rossello Mora, R. The species concept for prokaryotes / R. Rossello - Mora,"R. Amann'// FEMS Microbiol. Rev. - 2001. - Vol. 25. - P. 39 - 67.
156. Saiman, L. Infection control in cystic fibrosis / Saiman L., Siegel J.// J. Clin. Microbiol. Rev. 2004. - Vol. 17.-P. 57-71.
157. Sajjan, U. Preferential adherence of cablepiliated Burkholderia cepacia to respiratory epithelia of CF knockout mice and human cystic fibrosis lung explants / U. Sajjan, Y. Wu, G. Kent, J. Forstner// J. Med. Microbiol-2000. Vol. 49. - P. 875 - 885.
158. Schlech, W.F. Laboratory-acquired infection with Pseudomonaspseudomallei (melioidosis) /W.F. Schlech, J.B. Turchik, R.E. Westlake// N. Engl. J. Med. 1981. - Vol.305. - P.1133- 1135.
159. Schwab, U. Patterns of epithelial cell invasion by different species of the Burkholderia cepacia complex in we 11-differentiated human airway epi-thelia / U. Schwab, M. Leigh, C. Ribero // Infect. Immunol. 2002. - Vol. 70.-P. 4547-4555.
160. Segonds, C. Burkholderia cepacia: les dangers d un microorganism phytopathogene pour les patients atteints de mucoviscidose / C. Segonds, G. Chabanon // Ann. Biol. Clin. 2001. - Vol. 59. - P.259 - 269.
161. Shaw, D. Biological activity of Burkholderia cepacia lipopolysaccharide / D. Shaw, I.R. Poxton, J.R.W. Govan // FEMS Immunol. Med. Microbiol. -1995.-Vol: 11.-P. 99-106.
162. Shelly, D.B. Utility of commercial systems for identification of Burkholderia cepacia complex from cystic fibrosis sputum culture / D.B. Shelly, T. Spilker, E.J. Gracely // J. Clin. Microbiol. 2000. - Vol. 38. - P. 3112 -3115.
163. Speert, D.P. Epidemiology of Burkholderia cepacia complex in patients with cystic fibrosis, Canada / D.P. Speert, D. Henry, P. Vandamme // Emerg. Infect. Dis. 2002. - Vol. 8. - P. 181 - 187.
164. Summer, E.J. Burkholderia cenocepacia phage BcepMu and a family of Mu-like phages encoding potential pathogenesis factors / E.J. Summer, C.F. Gonzalez, T. Carlisle // J. Mol. Biol. 2004. - Vol. 340 - P. 49 - 65.
165. Suppiah, G. Development of polymerase chain reaction assay to detect Burkholderia genus and to differentiate the species in clinical specimens / G. Suppiah, P.G. Bagali, G. Vadivelu // the 5-Th world melioidosis congress, Khon Kaen. 2007. - P.245.
166. Thomassen, M.J. Pseudomonasf,cepacia colonization among patients in cystic fibrosis: a new opportunist /.M.J. Thomassen, C.A. Demko, J.D. Klinger, R.C. Stern // Am. Rev. Respir. Dis. 1985. - Vol. 131. - P. 791 -796.
167. Ursing, J.В. Taxonomic note: a pragmatic approach to the nomenclature of phenotypically similar genomic groups / J.B. Ursing, R.A. Rossello-Mora, E. Garcia-Valdes, J. Lalucat // Int. J. Syst. Bacteriol. 1995. - Vol. 45. - P. 604.
168. Vandamme, P. Polyphasic taxonomy in practice: the Burkholderia cepacia challenge / P. Vandamme // Newsletter. 2001. - Vol. 34. - P. 17 -24.
169. Vandamme, P. Burkholderia cenocepacia sp. nov. A new twist to an old story / P. Vandamme, B. Holmes, T. Coenye // Res. Microbiol. -2003. -Vol.154.-P. 91 -96.
170. Vandamme, P. Occurrence of multiple genomovars of Burkholderia cepacia in cystic fibrosis patients and proposal of Burkholderia multivorans sp. nov. / P. Vandamme, B. Holmes, M. Vancanneyt // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. - Vol. 47. - P. 1188 - 1200.
171. Vandamme, P. Polyphasic taxonomy,- a consensus approach to bacterial systematics / P. Vandamme, B. Pot, M. Gillis // Microbiol. Rev-1996.-Vol.60.-P. 407 438.
172. Van Pelt, C. Identification of Burkholderia spp. in the clinical microbiology laboratory: comparison of conventional and molecular methods / C. Van Pelt,*C:Mr Verduin,- W.H.F. Goessens //rj. Clin. Microbiol. 1999. -Vol. 37, N7.-P. 2158-2164.
173. Vermis, K. Proposal to accommodate Burkholderia cepacia genomo-var VI as Burkholderia dolosa sp. nov. / K. Vermis, T. Coenye, J.J. LiPuma // Int. J. Evol. Microbiol. -2004. Vol. 54. - P.-689 -691.
174. Vermis, K. Evalution of species-specific rec A-based PCR tests forgenomovar level identification within the Burkholderia cepacia complex / K. Vermis, Т. Coenye, E. Mahenthiralingam // J. Med. Microbiol. 2002. -Vol. 51. -P. 937-940.
175. Vinion-Dubiel, A.D. Correlation of wbil genotype, serotype, and isolated source within species of the Burkholderia cepacia complex / A.D. Vinion-Dubiel, T. Spilker, C.R. Dean // J. Clin. Microbiol. 2004. - Vol. 42. -P. 4121 -4126.
176. Wang, G. Horizontal transfer of genetic determinants of phenol between bacteria living in plant and its rhizosphere / G. Wang, M. Xiao, X. Geng // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007. - Vol. 77. - P. 733 - 739.
177. Welsh, J. Fingerprinting genoms using PCR with arbitrary primers / J. Welsh, M. McClelland // Nucleic Acids Res. 1990. - Vol. 18. - P. 7213 -7218.
178. Werneburg, B. New serotypes of Pseudomonas cepacia / B. Werne-burg, H. Monteil//Res. Microbiol. 1989. - Vol. 140. - P. 17-20.
179. Whitby, P.W. Species-specific PCR as a tool for the identification of Burkholderia gladioli /P.W. Whitby, L.C. Pope, K.B. Carter // J. Clin. Microbiol. 2000. -Vol. 38. - P. 282 - 285.
180. Wigley, P. Genotipic and phenotypic relationships in Burkholderia cepacia isolated from cystic fibrosis patients and the environment / P. Wigley, N.E. Burton I I J. Appl. Microbiol. 1999. - Vol. 86. - P. 460 - 468.
181. Wigley, P. Multiple chromosomes in Burkholderia cepacia and B. gladioli and their distribution in clinical and environment strains of B. cepacia / P. Wigley, N.E. Burton II J. Appl. Microbiol. 2000. - Vol. 88. - P. 914 -918.
182. Wilcox, W.R. A review of numerical methods in bacterial identification / W.R. Wilcox, S.P. Lapage, B. Holmes // Antonie Leeuwenhoek. 1980. -Vol. 46. - P. 233-299.
183. Zanetti, F. Recovery of Burkholderia pseudomallei and B. cepacia from drinking water / F. Zanetti, G. De Luca, S. Stampi // Int. J. Food Microbiol. 2000. - Vol. 59 - P. 67 - 72
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.