Антибиотикочувствительность и молекулярно-генетическая характеристика штаммов Corynebacterium diphtheriae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Чагина Ирина Алексеевна

• Чагина Ирина Алексеевна
• кандидат наук
• 2016

Оглавление диссертации кандидат наук Чагина Ирина Алексеевна

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

Степень разработанности темы исследования

Цель исследования

Задачи исследования

Научная новизна

Теоретическая и практическая значимость

Методология и методы исследования

Штаммы микроорганизмов

Микробиологические методы исследования

Молекулярно-генетические методы исследования

Биоинформационные и статистические методы исследования

Личное участие автора в получение результатов

Основные положения диссертации, выносимые на защиту

Степень достоверности и апробация результатов исследования

ГЛАВА 1. Обзор литературы

1.1. Характеристика С. ЖрЫНвпав

1.2. Особенности эпидемического процесса дифтерийной инфекции

1.3. Методы изучения и типирования С.&рЫЬвпав

1.3.1. Фенотипические методы типирования

1.3.2. Молекулярно-генотипические методы типирования

1.4. Применение антибактериальных препаратов при дифтерийной инфекции

1.4.1. Характеристика, молекулярный механизм действия макролидных и линкозамидных антибактериальных препаратов и формирование резистентности к ним

1.4.2. Характеристика, молекулярный механизм действия рифампицина и формирование резистентности к нему

1.4.3. Резистентность штаммов С.^рЫИвпав к антибактериальным

препаратам

РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

ГЛАВА 2. Антибиотикочувствительность штаммов С.ЖрЫИвпае, выделенных на территории России

2.1. Изучение антибиотикочувствительности штаммов С.ЖрЫИвпае с помощью диско-диффузионного метода Кирби-Бауэра и Е-теста

2.2. Изучение молекулярных механизмов резистентности к макролидным антибиотикам у штаммов С.ЖрЫИвпае

2.3. Изучение молекулярных механизмов антибиотикорезистентности у

штаммов С.ЖрЫИвпае к рифампицину

ГЛАВА 3. Полноразмерное секвенирование генома мультирезистентного

токсигенного штамма С.ШрЫИвпав

ГЛАВА 4. Мультилокусное секвенирование штаммов С.^рЫИвпав, выделенных в России

4.1. Генотипирование штаммов С.^рЫИвпае с помощью МЛСТ

4.2. Филогенетический анализ различных сиквенс-типов штаммов

С.ШрЫИвпае

ГЛАВА 5. Изучение особенностей структуры генов и ЛхК штаммов С.ШрЫИвпав

5.1. Изучение особенностей структуры гена о штаммов С.ШрЫИвпав

5.2. Изучение особенностей структуры гена штаммов С.ЖрЫИвпав

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Антибиотикочувствительность и молекулярно-генетическая характеристика штаммов Corynebacterium diphtheriae»

Актуальность темы исследования

Дифтерия является инфекцией, управляемой средствами массовой вакцинопрофилактики. Введенная с 1959 г. массовая иммунизация населения коренным образом изменила характер течения эпидемического процесса дифтерийной инфекции, что способствовало значительному снижению заболеваемости и летальности при ней. Достигнутые результаты подтвердили значимость проведения массовой иммунизации населения для поддержания санитарно-эпидемиологического благополучия страны [110]. Однако увеличение количества неиммунных лиц в различных слоях населения привело к активизации эпидемического процесса дифтерийной инфекции и подъемам заболеваемости дифтерией в 1980-е и 1990-е годы [45, 71, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 91, 132, 133, 134, 139, 142, 143]. Первый период эпидемического процесса включал 13 лет (1977 - 89 гг.) и характеризовался относительно невысокими показателями заболеваемости. В течение 1990 -1992 гг. число заболевших ежегодно увеличивалось в 1,5-2 раза. Пик второго периодического подъема заболеваемости был зарегистрирован в 1994 г., когда заболело около 40 тыс. человек. В результате принятых мер, в первую очередь, предусматривающих увеличение охвата населения профилактическими прививками, произошло снижение заболеваемости дифтерией, и к 1998 г. показатель заболеваемости снизился до 0,97. В течение первого десятилетия нынешнего столетия заболеваемость дифтерией на территории России оставалась на спорадическом уровне с ежегодным снижением числа заболевших. За последние 14 лет (2001 - 2014 гг.) показатели заболеваемости снизились в 63 раза (с 0,63 до 0,0007 случаев на 100 тыс. населения).

Однако, несмотря на очевидные успехи многолетней массовой иммунизации населения, актуальность проблемы дифтерийной инфекции в условиях спорадической заболеваемости сохраняется [72, 73, 81, 82, 83, 84, 142, 143]. Поддержанию эпидемического процесса способствует наличие

скрытых источников инфекции, когорты восприимчивых лиц, заболеваемость среди привитых, продолжающаяся регистрация тяжелых форм как среди неиммунных детей, так и среди взрослых, а также бактерионосительство. Поддержанию эпидемического процесса дифтерии способствует и то, что иммунизация не привела к ослаблению вирулентных свойств возбудителя, и высокая гетерогенность вида C.diphtheriae по ряду биологических свойств (биохимических, токсигенных, генетических) способствует формированию популяции со сложной клональной структурой [41, 43, 70].

Изучению штаммов возбудителя дифтерийной инфекции посвящено значительное число работ ученых разных стран мира. Биологические свойства оценивались с помощью классических микробиологических (удельных вес биоваров, антибиотикочувствительность) и молекулярно-генетических методов, таких как гибридизация ДНК, рестрикционный анализ, ПЦР с универсальными праймерами (УП-ПЦР, RAPD random amplified polimorphic DNA, RAPD), ПЦР-ПДРФ, RFLP analysis (Restriction Fragment Length Polymorphism), риботипирование, мультилокусный энзим электрофорез (МЭЭ), а также секвенирование отдельных генов. Многолетний микробиологический и молекулярно-генетический мониторинг штаммов C.diphtheriae, проводимый в ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора, позволил установить особенности биологических свойств штаммов и формирования структуры популяции C.diphtheriae в различные периоды эпидемического процесса дифтерийной инфекции [12, 15, 35, 41, 42, 43, 44, 64, 67, 68, 70, 217, 233, 234, 235]. Было показано, что популяция штаммов C.diphtheriae гетерогенна и по чувствительности к антибиотикам, которые применяются для санации дифтерийных бактерионосителей, в комплексной терапии отдельных форм дифтерии, а также для лечения инвазивных заболеваний, вызванных нетоксигенными C.diphtheriae [36, 53, 85, 147, 176, 185, 214, 224, 237, 255, 310]. В различные годы были выявлены

штаммы C.diphtheriae, обладающие резистентностью к макролидам и пенициллинам [24, 53, 174, 207, 214, 224, 237, 251, 255, 271, 310]

В настоящее время, благодаря появлению высокотехнологичных молекулярно-генетических технологий, высокопроизводительного секвенирования и развитию метагеномики и сравнительной геномики, стало возможным с новых позиций подойти к изучению биологических свойств и внутривидового разнообразия возбудителей инфекционных заболеваний, а также изучению молекулярных механизмов антибиотикорезистентности. Одним из таких методов является мультилокусное секвенирование ДНК (Multilocus sequence typing, MLST, МЛСТ), предложенное Maiden М.С. [222]. МЛСТ в последнее десятилетие стало одним из наиболее распространенных методов генотипирования возбудителей инфекционных заболеваний, которое дает возможность охарактеризовывать штаммы микроорганизмов с использованием ДНК-секвенирования внутренних фрагментов генов. К настоящему времени МЛСТ широко используется при мониторинге Neisseria meningitidis, Vibrio vulnificus, Staphylococcus aureus, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus haemolyticus, Bordetella pertussis и др. [3, 5, 7, 17, 18, 19, 22, 23, 31, 32, 47, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 106, 107, 131, 154, 158, 239, 280, 304]. Схема проведения МЛСТ для C.diphtheriae была разработана Bolt F. с соавторами [153] и включала штаммы 79 сиквенс-типов, объединенных в 11 клональных комлексов. К настоящему времени в международной базе данных PubMLST (http : //pubmlst. org/) представлено более 300 сиквенс-типов. Вместе с тем, данный метод еще не использовался для характеристики штаммов C.diphtheriae, циркулирующих в России.

Поэтому, появление новых биоинформационных технологий, подходов и концепций в области получения и анализа генетической информации позволит проводить более глубокое изучение токсигенных и нетоксигенных штаммов C.diphtheriae.

Степень разработанности темы исследования

К настоящему времени накоплен значительный научный потенциал знаний о биологических свойствах возбудителя дифтерии, который формировался несколькими поколениями ученых и основывался на уровне методологической, информационной и материально-технической оснащенности каждого временного периода [13, 15, 20, 21, 27, 41, 44, 45, 46, 49, 50, 51, 52, 55, 56, 62, 63, 64, 85, 86, 112, 113, 114, 115, 128, 129,132, 133, 134, 137, 233].

Учеными ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора разработана система эпидемиологического надзора за дифтерийной инфекцией, которая опирается на знание эпидемиологических закономерностей, особенности клинического течения заболевания и предусматривает наблюдение за фенотипическими и генотипическими свойствами штаммов C.diphtheriae [13, 15, 20, 34, 41, 64, 71, 72, 81, 112, 115, 132, 134]. И.К. Мазуровой в 1990-е годы разработана комлексная система наблюдения за возбудителем дифтерийной инфекции, основу которой составляли классические микробиологические, а также иммунохимические и молекулярно-генетические методы [13, 63, 64, 98, 99]. С.Ю. Комбарова [41] в дальнейшем расширила систему мониторинга за возбудителем дифтерийной инфекции с использованием высокоинформативных молекулярно-генетических технологий: риботипирование, МЭЭ, УП-ПЦР и секвенирование отдельных генов. В результате многолетних наблюдений за штаммами C.diphtheriae были определены «индикаторные» признаки, отражающие фенотипические и генотипические особенности популяции C.diphtheriae: удельный вес биоваров gravis и mitis, генетическая структура хромосомной ДНК и отдельных генов, патогенные свойства [112, 113, 115].

В связи с этим, учитывая результаты многолетних предыдущих исследований, проведенных в ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора, об изменчивости возбудителя дифтерии, большое значение приобретает постоянное наблюдение за биологическими

свойствами C.diphthвriaв при помощи развивающихся молекулярно-генетических технологий. Это позволит расширить знания о биологии возбудителя и формировании популяции циркулирующих штаммов C.diphthвriaв, которые могут оказывать влияние на течение эпидемического и инфекционного процессов.

Цель исследования - определение антибиотикочувствительности и молекулярно-генетических особенностей структуры токсигенных и нетоксигенных штаммов CorynвЪactвrium diphthвriaв для оптимизации мониторинга возбудителя в системе эпидемиологического надзора за дифтерийной инфекцией

Задачи исследования:

1. Оценить антибиотикочувствительность у штаммов C.diphthвriaв, выделенных на территории России.

2. Установить молекулярные механизмы резистентности у штаммов C.diphthвriaв к макролидам и рифампицину.

3. Провести полноразмерное секвенирование генома мультирезистентного токсигенного штамма C.diphthвriaв.

4. Провести генотипирование штаммов C.diphthвriaв, выделенных в России, с помощью метода мультилокусного секвенирования ДНК (МЛСТ).

5. Изучить особенности структуры генов tox и dtxR у современных штаммов С.diphthвriaв.

Научная новизна

Проведенный мониторинг антибиотикочувствительности штаммов C.diphthвriaв показал, что 5,6% штаммов C.diphthвriaв являются резистентными к антибактериальным препаратам пенициллинового ряда, 3,6

- 3,7% штаммов к макролидам и 4,7% - к рифампицину; множественной резистентностью обладают 3,8% штаммов.

Молекулярный механизм резистентности штаммов С.&рЫЬвпав к макролидам обусловлен наличием гена егт(Х), расположенного на плазмиде; резистентность к рифампицину заключается в наличии мутаций в трех позициях гена rpoB - 1291, 1307 и 1484, затрагивающих кодоны аминокислот Н43Ш, S436F, S436Y, P495L и P495Q в р субъединице РНК-полимеразы.

В результате впервые проведенного полноразмерного секвенирования получен драфтовый сиквенс генома мультирезистентного штамма C.diphtheriae, нуклеотидная последовательность которого депонирована в международную базу данных GenBank: JZUJ00000000 (http://www.ncbi.nlm.nih.gOv/nuccore/JZUJ00000000.1).

У токсигенных штаммов С.diphtheriae, выделенных в 2010-2015 гг., выявлены мутации в 6 позициях гена ^, из которых впервые показаны мутации в позиции (-19) в промоторной области и у четырех штаммов С.diphtheriae - в позиции 913 (А305Т) в Т домене В субъединицы дифтерийного токсина; в гене dtxR обнаружены мутации в 15 позициях, из которых новая мутация в позиции (-23) промоторной области и ранее описанные мутации 440 (А147У) и 640 (Ь2141) гена dtxR, что подтверждает нарастание у современных штаммов C.diphtheriae полиморфизма в генах, кодирующих дифтерийный токсин и регуляторный DtxR белок.

Расшифрован молекулярный механизм отсутствия экспрессии гена ^ у четырех НТТН-штаммов C.diphtheriae, выделенных в 2010 - 2015 гг., заключающийся в выпадении нуклеотида G в позиции 55 гена ^, приводящем к сдвигу рамки считывания и нефункциональности гена. В структуре гена dtxR впервые у НТТН-штаммов C.diphtheriae выявлено наличие двух мутаций, одна из которых была ранее описана у токсигенных штаммов и вторая новая мутация в позиции 126 гена dtxR.

Впервые с помощью мультилокусного секвенирования ДНК (МЛСТ) охарактеризована популяция циркулирующих штаммов C.diphtheriae в

России; идентифицировано 36 сиквенс-типов с доминированием штаммов двух сиквенс-типов - ST25 и ST8. Показаны взаимосвязи между фенотипическими свойствами (токсигенность и биовар) и принадлежностью штаммов С.diphtheriaе к определенному сиквенс-типу - токсигенные и нетоксигенные штаммы С.diphtheriaе различных биоваров, а также НТТН-штаммы С.diphtheriaе с различным механизмом отсутствия экспрессии гена дифтерийного токсина характеризовались определенными сиквенс-типами.

Теоретическая и практическая значимость

Полученные данные об антибиотикочувствительности штаммов С.diphtheriaе дополняют знания о биологических свойствах возбудителя дифтерии, а также расширяют представления о молекулярных механизмах, обуславливающих резистентность у возбудителей инфекционных заболеваний, подтверждающих возможность передачи генетической информации между микроорганизмами в одном биотопе макроорганизма и нарастающей тенденции роста антибиотикорезистентности возбудителей инфекций верхних дыхательных путей.

Проведение генотипирования с помощью мультилокусного секвенирования ДНК (МЛСТ) и полученные данные о сиквенс-типах циркулирующих штаммов С.diphtheriaе расширяют знания о клональной организации популяции, закономерностях циркуляции штаммов, степени их филогенетического родства и эволюции возбудителя дифтерии.

Своевременное выявление антибиотикорезистентных штаммов C.diphthвriaв и слежение за их распространением позволит проводить адекватную и своевременную антибиотикотерапию и ее коррекцию при санации дифтерийных бактерионосителей.

Определены возможности использования мультилокусного секвенирования для генотипирования штаммов C.diphthвriaв, что будет способствовать повышению эффективности эпидемиологического надзора за дифтерийной инфекцией при установлении источника и расшифровке очагов

инфекции, выявлении эпидемических клональных комплексов, слежении за появлением и распространением генотипов, и завозных случаев на территорию России.

Тринадцать штаммов С.diphtheriaе депонированы в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск» (В-7390, В-7389, В-7388, В-7387, В-4398, В-7391, В-7813, В-7815, В-7817, В-7816, В-7819, В-7818, В-7820) в качестве контрольных штаммов для проведения внешнего контроля качества бактериологических исследований при лабораторной диагностике дифтерийной инфекции, и для генотипирования С.diphtheriaе при проведении молекулярно-генетического мониторинга возбудителя дифтерийной инфекции и изучения антибиотикорезистентности в системе эпидемиологического надзора за дифтерийной инфекцией.

Создана коллекция ДНК из штаммов С.diphtheriaе, обладающих различным уровнем антибиотикочувствительности и характеризующихся принадлежностью к разным сиквенс-типам, который можно использовать в дальнейших исследованиях для прогнозирования распространения эпидемически значимых штаммов возбудителя дифтерии, а также изучения у них молекулярно-генетических механизмов резистентности к антибактериальным препаратам.

Результаты микробиологического и молекулярно-генетического мониторинга штаммов С.diphtheriaе в рамках работы референс-центра по мониторингу возбудителей кори, краснухи, эпидемического паротита, коклюша и дифтерии были использованы для подготовки информационного-методического Письма Роспотребнадзора от 16.12.2015 № 01/15524-15-27 "О результатах проведения внешнего контроля качества исследований по диагностике дифтерии и качества питательных сред в Российской Федерации» и в лекционном материале на совещании с практическим семинаром по лабораторной диагностике дифтерии и коклюша для бактериологов Уральского Федерального Округа России (01.10.2012 -

05.10.2012 гг., Екатеринбург); на семинаре по лабораторной диагностике дифтерии и коклюша на курсах информации и стажировки для бактериологов филиалов ФБУЗ ЦГиЭ в административных округах г. Москвы (2011 г., 2012 г., 2013 г., 2014 г., 2015 г., Москва); на Региональных семинарах для специалистов лабораторной сети по диагностике дифтерии и коклюша для субъектов Дальневосточного федерального округа России (22.06.2013 -

29.06.2013 гг., Хабаровск); субъектов - Республики Горный Алтай, Алтайский край, Республики Хакассии, Республики Бурятии и Республики Тыва (23.06.2014 - 27.06.2014 гг., Горно-Алтайск); субъектов Южного и Северо-Кавказского федеральных округов (22.06.2015 - 26.06.2015 гг., Ростов-на-Дону) (акты внедрения от 28.01.2016 г., 02.02.2016 г.).

Методология и методы исследования

Методология диссертационной работы спланирована согласно поставленной цели исследования и включает последовательное применение методов научного познания для определения характеристик компонентов, необходимых для решения поставленных задач.

Предметом изучения явились биологические свойства штаммов C.diphtheriae. Анализ научной литературы, посвящённой оценке молекулярных маркеров, используемых для дифференциации штаммов C.diphtheriae, проведён на основе формально-логических методов исследования. Работа выполнена в формате сравнительного открытого исследования с использованием бактериологических, молекулярно-генетических и биоинформационных методов.

Штаммы микроорганизмов

В работе изучены фенотипические и генотипические свойства 912 штаммов C.diphtheriae, выделенных в период 1957 - 2015 гг. от больных дифтерией и бактерионосителей, обследованных с диагностической и профилактической целью (Таблица 1).

Таблица 1 - Регионы России, из которых были получены штаммы

С.diphtheriae

Федеральный округ Города, области, республики, автономные округа

1 Центральный г. Москва, Московская, Брянская, Владимирская, Тверская, Ивановская, Калужская, Рязанская, Смоленская, Тульская, Ярославская, Костромская, Белгородская, Воронежская, Курская, Липецкая, Орловская, Тамбовская области

2 Северо-Западный Республика Карелия, Республика Коми, г. Санкт-Петербург, Ленинградская, Архангельская, Мурманская, Вологодская, Новгородская, Псковская, Калининградская области

3 Приволжский Республика Мордовия, Республика Башкортостан, Республика Татарстан, Чувашская республика, Удмуртская республика, Кировская, Нижегородская, Пензенская, Самарская, Саратовская, Ульяновская, Оренбургская, Пермская области

4 Южный Краснодарский край, Ставропольский край, Ростовская, Астраханская, Волгоградская области

5 Уральский Курганская, Свердловская, Челябинская, Тюменская области

6 Сибирский Республика Тыва, Республика Бурятия, Кемеровская, Новосибирская, Омская, Томская, Иркутская области, Алтайский край, Красноярский край, Забайкальский край

7 Дальневосточный Хабаровский край, Приморский край, Амурская, Магаданская, Сахалинская, Камчатская области, Еврейская автономная область

Штаммы C.diphtheriae, выделенные в период 2010 - 2015 гг., получены из бактериологических лабораторий различных регионов России, а штаммы прошлых лет взяты из лабораторной коллекции микроорганизмов ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора. В работе также использованы коллекционные штаммы С.diphtheriae (Таблица 2). Объем изученых штаммов С.diphtheriae и проведенных исследований представлен в таблицах 3 и 4.

Таблица 2 - Коллекционные штаммы, используемые в работе

Вид микроорганизма и номер штамма Коллекция

1 Corynebacterium diphtheriae № 665 Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научный центр экспертизы средств медицинского применения» Минздрава РФ

2 Corynebacterium diphtheriae Park Williams 8 (PW 8)

3 Corynebacterium ulcerans № 675

4 Corynebacterium pseudodiphtheriticum «Соколов»

5 Staphylococcus aureus № 25923

6 Corynebacterium diphtheriae NCTC 10648 National Collection of Type Cultures

Таблица 3 - Объем изученых штаммов С.diphtheriae

Изучено с помощью различных методов исследования

Количество постановок Изучено количество штаммов

ПЦР Секвенирование ДНК МЛСТ Антибио-тикочув-ствительность Филогенетический анализ Полноразмерное секвенирование генома

1746 1650 148 888 55 1

Таблица 4 - Объем проведенных исследований

Методы Антибиотикочувствительность Изучение особенностей структуры генов патогенности Генотипирование с помощью МЛСТ

Диско-дифузионный метод E-тест Изучение молекулярно-генетических механизмов резистентности

dtrX tox

Количество штаммов 888 107 416 17 16 148

Микробиологические методы исследования

Идентификация С.diphtheriae

Выделение штаммов С.diphtheriae проводили согласно Методическим указаниям «Лабораторная диагностика дифтерийной инфекции» МУ 4.2.69898 и МУК 4.2.3065-13 [90, 91]: Исследуемый материал засевали на кровяно-

теллуритовую среду (КТА) на основе 2% агара (ГРМ-агар, ГНЦ ПМБ, пос. Оболенск или СПА, «Микроген», г. Махачкала) с добавлением 7% крови крупного рогатого скота (НПО «Лейтран», г. Москва) и 0,02 % теллурита калия (ГНЦ ПМБ, пос. Оболенск) и термостатировали в течение 24 - 48 часов при температуре 370С. Выросшие колонии C.diphtheriae оценивали по культурально-морфологическим, токсигенным и биохимическим свойствам.

Токсигенность штаммов C.diphtheriae оценивали в реакции преципитации (РП) в агаре с использованием питательного агара -Коринетоксагара (ГНЦ ПМБ, пос. Оболенск) с добавлением сыворотки крупного рогатого скота (НПО «Лейтран», г. Москва) и дисков, пропитанных дифтерийным антитоксином (НПО «Диагностические системы», г. Нижний Новгород). Питательный агар в количестве 10 мл (на одну чашку с пробой на токсигенность) расплавляли в водяной бане при 90°C, затем охлаждали до 50°C и добавляли 20% сыворотки крупного рогатого скота, перемешивали и выливали, соблюдая правила асептики, в стерильную чашку Петри, распределяя среду по дну осторожным вращением чашки. Чашку со средой подсушивали в термостате при 37°C в течение 15-20 мин. На поверхность среды помещали четыре бумажных диска с дифтерийным антитоксином. Вокруг каждого диска с антитоксином симметрично на расстоянии 0,7 см от края диска формировали 5 "бляшек": две "бляшки" - контрольного штамма и три - испытуемые. Диаметр каждой "бляшки" - 0,6-0,7 см. В качестве контрольного штамма для определения токсигенности использовали токсигенный штамм C.diphtheriae биовара gravis № 665. Чашки с посевами помещали в термостат при 37°C. Результат реакции учитывали через 24 - 48 часов. Наличие линий преципитации между диском с антитоксином и испытуемой культурой свидетельствовало об ее токсигенности. Исследуемая культура считалась токсигенной, если линия преципитации испытуемой культуры сливалась под углом с линией преципитации контрольного штамма. Отсутствие линий преципитации у культур через 48 часов, при наличии их у контрольных штаммов, указывало на отсутствие

токсигенности.

Биохимические свойства выделенных культур изучали по оценке цистиназной, уреазной, сахаролитической и нитратредуктазной активностей на средах, приготовленных в лабораторных условиях, согласно МУ 4.2.69898 и МУК 4.2.3065-13, а также с использование биохимической тест-системы «ДС-ДИФ-КОРИНЕ» (НПО «Диагностические системы», г. Нижний Новгород). Биовар устанавливали по способности штамма разлагать крахмал.

Определение цистиназной активности (проба Пизу) проводили на питательной среде Пизу (ГНЦ ПМБ, пос. Оболенск). Испытуемые культуры засевали строго в центре агарового столбика высотой 3-4 см "уколом" до дна пробирки. Если в процессе роста культура продуцировала цистиназу, расщепляющую цистин, то образующийся при этом сероводород вступал в реакцию с уксуснокислым свинцом, который превращался в сернокислый свинец - соединение темно-коричневого цвета, что проявлялось образованием вокруг «укола» облачка темно-коричневого цвета на глубине примерно 1 см от поверхности среды. Результат реакции учитывали после культивирования при 37C0 в течении 24 ч. В качестве положительного контрольного штамма использовали токсигенный штамм C.diphtheriae биовара gravis № 665, обладающий цистиназной активностью.

Определение уреазной активности проводили по методу Заксе. Для этого ex tempore смешивали 1 часть реактива А и 19 частей реактива В. Смесь разливали в узкие пробирки по 0,1 мл и вносили одну петлю испытуемой чистой культуры. Результат учитывали после инкубации в термостате при 37°C в течение 30 мин. Если микроорганизм обладал уреазной активностью, то продуцирующийся фермент уреаза расщеплял мочевину с образованием аммиака и углекислоты. При этом повышался pH среды, и происходило покраснение цвета индикатора. При отсутствии у исследуемой культуры этого фермента окрашивания среды не происходило. В качестве положительных контрольных штаммов для определения уреазной

активности использовали C.ulcerans № 675 и C.pseudodiphtheriticum «Соколов».

Определение сахаролитической активности у выделенных культур проводили на средах Гисса с углеводами - глюкозой, сахарозой, растворимым крахмалом, приготовленными в лабораторных условиях согласно МУК 4.2.3065-13. В каждую пробирку со средой Гисса инокулировали 1 петлю чистой испытуемой культуры и термостатировали при 37С0. Результат учитывали через 24 часа, в случае если проба на расщепление крахмала отрицательная, то культивирование продолжали до 48 часов. При сбраживании того или иного углевода образовывалась кислота, происходило восстановление обесцвеченного фуксина, и среда приобретала малиновую окраску. В качестве контрольного штамма для определения сахаролитической активности использовали токсигенный штамм C.diphtheriae биовара gravis № 665.

Определение нитратредуктазной активности проводили с использованием нитратного бульона, приготовленного в лабораторных условиях согласно МУК 4.2.3065-13. Суточную испытуемую культуру засевали в пробирку с нитратным бульоном, инкубировали в течение 24 часов при температуре 37°C. Затем добавляли 2-3 капли реактива Грисса. Если произошло образование нитритов, среда окрашивалась в красный цвет. Если микроорганизм не обладал нитратредуктазой, изменения окраски среды не происходило. В качестве положительного контрольного штамма для определения нитратредуктазной активности использовали токсигенный штамм C.diphtheriae биовара gravis № 665.

Для изучения биохимических свойств штаммов C.diphtheriae также была использована тест-система «ДС-ДИФ-КОРИНЕ» (НПО «Диагностические системы», г. Нижний Новгород). Принцип теста основан на определении ферментативной активности микроорганизмов рода Corynebacterium (утилизация глюкозы, сахарозы, крахмала, мальтозы, фруктозы, галактозы; наличие нитратредуктазы, уреазы, цистиназы).

Стерильной пипеткой отмеряли 3,0 мл 0,5% пептонной воды, входящей в состав набора, и разливали в стерильные пробирки по количеству культур. Затем делали микробную суспензию из суточной культуры C.diphtheriae в пептонной воде. Мутность суспензии доводили до 10 ед. по стандарту мутности бактерийных взвесей (производство ФГБУ «Научный центр экспертизы средств медицинского применения» Минздрава России). Вносили стерильной пипеткой по 0,15 мл микробной суспензии в каждую лунку стрипа. В лунку с тестом на уреазу поверх суспензии наносили 2-3 капли вазелинового масла для создания анаэробных условий. После чего рамку со стрипами накрывали крышкой и инкубировали при 370С в течение 24 часов. Через 24 часа в лунку для выявления нитратредуктазы добавляли пипеткой 1 каплю реактива Грисса. Учет результатов биохимической идентификации осуществляли по изменению цвета реакции относительно отрицательного контроля (0,5% пептонной воды) согласно инструкции к тест-системе по таблице цветовых показателей.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Чагина Ирина Алексеевна, 2016 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Акимкин, В. Г. Бактериофаги: исторические и современные аспекты их применения: опыт и перспективы / В. Г. Акимкин, О. С. Дарбеева, В. Ф. Колков // Клиническая практика. - 2010. - № 4. - С. 48 - 54.

2. Аковбян, В. А. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / В. А. Аковбян И. В. Андреева, А. С. Анкирская, А. В. Беденков, В. Б. Белобородов, Ю. Б. Белоусов, Т. М. Богданович, Н. Н. Володин, Б. Р. Гельфанд, Л. И. Дворецкий, А. А. Демин, А. В. Дехнич, Л. П. Жаркова, А. С. Забелин, А. А. Зайцев, М. Н. Зубков, А. П. Зузова, В. Т. Ивашкин, А. П. Казанцев, Е. И. Каманин, О. И. Карпов, Н. Н. Климко, Р. С. Козлов, С. Н. Козлов, А. В. Кравченко, А. А. Кубанова, Ю. В. Лобзин, О. Б. Лоран, Н. И. Львов, М. В. Маевская, Ю. Ф. Майчук, В. В. Малеев, С. А. Масюкова, А. П. Никонов, Е. Н. Падейская, В. В. Рафальский, С. А. Рачина, Г. К. Решедько, О. Л. Розенсон, В. А. Руднов, С. В. Сехин, С. В. Сидоренко, А. И. Синопальников, О. У. Стецюк, Л. С. Страчунский, А. К. Стрелис, Н. Н. Судиловская, А. К. Токмалаев, Е. А. Ушкалова, В. П. Фисенко, И. П. Фомина, А. Г. Чучалин, В. И. Шахгильдян, Г. В. Шашкова, С. В. Яковлев. // Под редакцией Л. С. Страчунского, Ю. Б. Белоусова, С. Н. Козлова - Москва, 2002. - С. 280 - 281.

3. Алешкин, В. А. Особенности генотипической изменчивости штаммов Б.рвНш818, выделенных от больных коклюшем в России / В. А. Алешкин, О. Ю. Борисова, Н. Т. Гадуа, И. К. Мазурова // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. -2012. - № 5 (87), Часть 1. - С. 177 - 183.

4. Алешкин, В. А. Бактериофаги в России - прошлое, настоящее и будущее / В. А. Алешкин, А. В. Алешкин, С. С. Афанасьев // Материалы 1 международной научно-практической конференции «Бактериофаги: теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности». Сборник конгресса. - Ульяновск, 2013. - Т. 1. - С. 139 - 144.

5. Алешкин, В. А. Клональный состав популяции штаммов Bordetella pertussis, выделенных в России / В. А. Алешкин, О. Ю. Борисова, А. В. Алешкин, Г. А. Ивашинникова, И. К. Мазурова, Л. И. Кафарская, Е. Е. Донских, А. С. Пименова // Инфекционные болезни. - 2013. - Т. 11, № 1. - С. 103 - 109.

6. Алтухов, Ю. П. Генетические процессы в популяциях. - М.: Академкнига, 2003. - 431 с.

7. Алябьева, Н. М. Серотипы и устойчивость к антибиотикам штаммов Streptococcus pneumoniae, выделенных у детей при респираторных инфекциях: дис. ... канд. мед. наук : 03.02.03 / Алябьева Наталья Михайловна. - М., 2014.

8. Анпилов, Н. И. Профилактическая эффективность сухого поливалентного дизентерийного бактериофага в организованных коллективах / Н. И Анпилов, А. А Прокудин // Военно-медицинский журнал. - 1984. - № 5. - С. 39 - 40.

9. Барашкова, Л. Н. Разработка способов получения эритроцитарных диагностикумов из чистых антител для специфической индикации микробных антигенов и токсинов: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.00.07 / Барашкова Лидия Николаевна. - Ленинград, 1986.

10. Блюменталь, К. В. Клиника и диагностика дифтерии в период резкого снижения заболеваемости : дис. ... д-ра мед. наук / Блюменталь Калерия Вольфовна. - Москва, 1967.

11. Бондаренко, В. М. Общий анализ представлений о патогенных и условно патогенных бактериях / В. М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1999. - № 5. - С. 34 - 39.

12. Борисова, О. Ю. Патогенные свойства штаммов C.diphtheriae в различные периоды эпидемического процесса в России / О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, С. Ю. Комбарова, Т. В. Платонова, Л. Н. Барашкова, Т. Ф. Осипова, А. Б. Жебрун, И. К. Мазурова // Материалы международ. Конференции «Идеи Пастера в борьбе с инфекциями», 2 - 4 сентября, Санкт-Петербург. - С.-Петербург, 1998. - С. 177.

13. Борисова, О. Ю. Патогенные и молекулярно-генетические свойства штаммов С. diphtheriae, циркулирующих на территории России в течение 1994 - 1998

гг.: автореф. дис. ... канд. мед. наук: 03.00.07 / Борисова Ольга Юрьевна. - М., 1999.

14. Борисова, О. Ю. Антибиотикорезистентность штаммов Corynebacterium diphtheriae - новая проблема инфекционной патологии / О. Ю Борисова, И. К. Мазурова, В. Г. Мельников, С. Ю. Комбарова, Т. В. Платонова, Е. Э. Андрусенко // Материалы международной конференции «Антибиотики и антибиотикорезистентность на пороге XXI века», Москва. - Москва, 2000. -Т. 2. - С. 27 - 28.

15. Борисова, О. Ю. Молекулярно-генетические особенности структуры генов патогенности возбудителей коклюша и дифтерии; совершенствование лабораторной диагностики при этих инфекциях: дис. ... д-ра мед. наук: 03.00.07 / Борисова Ольга Юрьевна. - М., 2009.

16. Борисова, О. Ю. Антибиотикорезистентность циркулирующих штаммов B.pertussis / О. Ю. Борисова, Г. А. Ивашинникова, Н. Т. Гадуа, И. А. Рудакова, И. К. Мазурова // Материалы III Ежегодного Всеросс. конгресса по инфекционным болезням, 28 - 30 марта, Москва. - Москва, 2011. - С. 54.

17. Борисова, О. Ю. Генетическая характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в России / О. Ю. Борисова, И. К. Мазурова, Г. А. Ивашинникова, Н. Т. Гадуа, И. А. Рудакова, Н. Я. Салова, Ф. М. Абасова, И. П. Требунских, Н. Д. Наретя, Л. А. Алексеева, О. Ю. Якунина, F. Mooi, В. А. Алешкин // Медицинский альманах. - 2012. - № 2 (21). - С. 30 -34.

18. Борисова, О. Ю. Мониторинг штаммов B. pertussis, выделенных от больных коклюшем в России / О. Ю. Борисова, И. К. Мазурова, Н. Т. Гадуа, Г. А. Ивашинникова, И. А. Рудакова // Инфекция и иммунитет. - 2012. - Т. 2, № 1 . -2. - С. 245.

19. Борисова, О. Ю. Характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в г. Москве, с помощью мультилокусного секвенирования / О. Ю. Борисова, И. К. Мазурова, Г. А. Ивашинникова, Н. Т. Гадуа, И. А. Рудакова, Н. Я. Салова, И. П. Требунских, В. Г. Скачкова, Р. А.

Панферова, F. Mooi, В. А. Алешкин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2012. - № 2. - С. 28 - 34.

20. Борисова, О. Ю. Генотипические различия между штаммами Corynebacterium diphtheriae биоваров gravis и mitis / О. Ю. Борисова, Н. В. Воложанцев, В. Г. Мельников, И. К. Мазурова, С. Ю. Комбарова, В. А. Алешкин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2013. - № 3. - С. 24 - 31.

21. Бочкова, В. А. Антибактериальный иммунитет при дифтерийной инфекции: автореф. дис. ... д-ра мед. наук : 03.00.07 / Бочкова Валентина Алексеевна -М., 1978.

22. Воронина, О. Л. Разработка схемы мультилокусного секвенирования Staphylococcus haemolyticus и ее применение для молекулярно-эпидемиологического анализа штаммов, выделенных в стационарах Российской Федерации в 2009-2010 гг. / О. Л. Воронина, М. С. Кунда, О. А. Дмитренко, В. Г. Лунин, А. Л. Гинцбург // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. - № 5. - С. 62 - 67.

23. Воронина, О. Л. Особенности штаммов Pseudomonas aeruginosa, вызывающих госпитальные инфекции у пациентов хирургических отделений ФНЦТИО им. В. И. Шумакова / О. Л. Воронина, М. С. Кунда, Л. Р. Аветисян, М. Ю. Чернуха, Н. И. Габриэлян, И. А. Шагинян, В. Г. Лунин // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2012. - № 2. - С. 88 - 99.

24. Гладин, Д. П. Чувствительность к антибактериальным препаратам Corynebacterium diphtheriae, выделенных в Санкт-Петербурге / Д. П. Гладин, Н. С. Козлова, Т. К. Зайцева, А. С. Чередниченко, С. А. Хваль // Антибиотики и химиотерапия. - 1995. - № 5. - С. 17 - 21.

25. Гладин, Д. П. Чувствительность коринебактерий к антибактериальным препаратам / Д. П. Гладин, Н. С. Козлова, Т. К. Зайцева, А. С. Чередниченко, С. А. Хваль // Тезисы Второй международной конференции «Идеи Пастера в борьбе с инфекциями», Санкт-Петербург. - С.Петербург, 1998. - С. 179.

26. Гольдфарб, Д. М. Бактериофагия / Д. М. Гольдфарб; под ред. и с предисл. В. Д. Тимакова. - М.: Медгиз, 1961. - 297 с.

27. Дубровская, Н. В. Респираторные фторхинолоны, защищенные пенициллины и макролиды в лечении обострений хронического бронхита (ХБ) и хронический обструктивный болезни легких (ХОБЛ) / Н. В. Дубровская, Л. И. Дворецкий, С. В. Яковлев, С. А. Грудинина, О. Ю. Филимонова, С. В. Сидоренко // VII Российская конференция "Современные проблемы антимикробной химиотерапии", Москва. - Москва, 2005. - С. 22.

28. Жуковицкий, В. Г. Обоснование рациональной антибактериальной терапии в оториноларингологии с позиции бактериолога: Московский НИИ уха, горла, носа Минздрава РФ / Журнал «Consilium Medicum». - 2001. - Т. 3. - № 8. - С. 15 - 17.

29. Зайцев, Е. М. Антитоксические свойства моноклональных антител к дифтерийному токсину / Е. М. Зайцев, В. В. Свиридов, Н. Г. Титова, В. С. Лебедев, М. И. Гарипова, Г. М. Волгарева, Б. Ф. Семенов // Молекулярная генетика, микробиология вирусология. - 1985. - № 2. - С. 37 - 41.

30. Зайцев, Е. М. Применение моноклональных антител для изучения антигенного строения и выявления дифтерийного токсина: автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14.00.36 / Зайцев Евгений Михайлович - М., 1988.

31. Ивашинникова, Г. А. Применение метода мультилокусного секвенирования для наблюдения за циркулирующими штаммами B.pertussis / Г. А. Ивашинникова, О. Ю. Борисова, Н. Т. Гадуа, И. А. Рудакова, И. К. Мазурова // Здоровье населения и среда обитания. - 2012. - № 9. - С. 28 - 30.

32. Ивашинникова, Г. А. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Bordetella pertussis и совершенствование микробиологического мониторинга коклюшной инфекции: дис. ... канд. биол. наук : 03.02.03, 03.01.06 / Ивашинникова Галина Антоновна. - М., 2013.

33. Инфекционные болезни у детей. Под редакцией В. Н. Тимченко. - Санкт-Петербург: СпецЛит., 2008. - С. 73.

34. Информационное письмо для МЗ РФ «Характеристика штаммов C.diphtheriae, выделенных в России (1984 - 1995 гг.)» / И. К. Мазурова, С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова. - 1997. - 6 с.

35. Комбарова, С. Ю. Разработка и использование некоторых молекулярно-генетических методов для характеристики C.diphtheriae: дис. ... канд. биол. наук : 03.00.07 / Комбарова Светлана Юрьевна. - М. 1995.

36. Комбарова, С. Ю. Характеристика штаммов C.diphtheriae, циркулирующих в различные периоды эпидемического процесса дифтерийной инфекции / С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова, T. Popovic, И. К. Мазурова // В сборн. МНИИЭМ им.Г.Н.Габричевского «Вакцинопрофилактике - 200 лет». - 1997. - С. 27 - 32.

37. Комбарова, С. Ю. Применение ПЦР с универсальными праймерами, риботипирования и мультилокусного энзимного электрофореза для анализа штаммов C.diphtheriae, выделенных в России в 1995-1997 гг. / С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова, T. Popovic, M. W. Reeves, И. К. Мазурова // Материалы международ. Конференции «Идеи Пастера в борьбе с инфекциями», 2-4 сентября, Санкт-Петербург. - С.-Петербург, 1998. - С. 184.

38. Комбарова, С. Ю. Риботипирование штаммов Corynebacterium diphtheriae, выделенных в России / С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова, Н. Н. Костюкова, И. К. Мазурова // В сборнике научных трудов МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского "Проблемы инфекционных болезней (эпидемиология и профилактика)". - 2000. - С. 42 - 47.

39. Комбарова, С. Ю. Усовершенствование методики постановки полимеразной цепной реакции для выявления гена дифтерийного токсина / С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова, Т. В. Платонова, Б. Н. Соков, Г. Н. Смердов, Н. С. Ушакова, Н. И. Степанова, Е. А. Бугаев, И. К. Мазурова // В сборнике научных трудов МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского "Проблемы инфекционных болезней (эпидемиология и профилактика)". - 2000. - С. 47 -52.

40. Комбарова, С. Ю. Генетическая структура штаммов Corynebacterium diphtheriae, выделенных в России при разной интенсивности эпидемического процесса дифтерии / С. Ю. Комбарова, И. К. Мазурова, В. Г. Мельников, Н. Н. Костюкова, К. И. Волковой, О. Ю. Борисова, Т. В. Платонова, А. Efstratiou

// Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2001. - № 3. -С. 3 - 8.

41. Комбарова, С. Ю. Микробиологический и молекулярно-генетический мониторинг возбудителя дифтерийной инфекции: дис. ... д-ра биол. наук : 03.00.07 / Комбарова Светлана Юрьевна. - М., 2007.

42. Комбарова, С. Ю. Особенности структуры генов, ответственных за токсинообразование СогупеЪаМепыт ШрЫНепае / С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, Н. Т. Гадуа, Н. И. Губина, Л. В. Лосева, В. С. Савинкова, В. Г. Скачкова, И. К. Мазурова, В. А. Алешкин // Материалы IX съезда Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - 2007. - Т. 1. - С. 69 - 70.

43. Комбарова, С. Ю. Наблюдение за циркуляцией штаммов СогупеЪаМепыт ЖрЫНепав, различающихся по признаку токсигенности / С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, Л. С. Наумов, О. В. Нарвская, И. В. Мокроусов, Н. В. Воложанцев, И. В. Новокшонова, И. К. Мазурова // Медицинский альманах. - 2009. - № 2 (7). - С. 108 - 111.

44. Комбарова, С. Ю. Полиморфизм генов и ЛхК у циркулирующих штаммов СогупеЪаМепыт ШрЫНепае / С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, Н. И. Губина, Л. В. Лосева, И. К. Мазурова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2009. - № 1. - С. 7 - 11.

45. Корженкова, М. П. Клиника дифтерии в период высокой и низкой заболеваемости // Бюллетень «Вакцинация». - 2006. - № 14 (3). - С. 4 - 6.

46. Корженкова, М. П. Уроки дифтерии / М. П. Корженкова, Н. А. Малышев, Н. М. Максимова, С. С Маркина, В. В. Черкасова, О. М. Шестакова, М. В. Базарова // Биопрепараты. - 2011. - № 2. - С. 30 - 35.

47. Королева, М. А. Эпидемиологический мониторинг за гнойными бактериальными менингитами в Российской Федерации : дис. ... канд. мед. наук : 14.02.02 / Королева Мария Александровна. - М., 2014.

48. Костюкова, Н. Н. Патогенные свойства дифтерийных бактерий, выделенных в течение эпидемического процесса / Н. Н. Костюкова, Л. А. Фаворова //

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1968. - № 5. -С. 69 - 75.

49. Костюкова, Н. Н. Дифтерийное бактерионосительство (бактериологические и иммунологические исследования) : автореф. дис. ... докт. мед. наук: 03.00.07 / Костюкова Наталья Николаевна. - M., 1971.

50. Костюкова, Н. Н. Уроки дифтерии / Н. Н. Костюкова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1999. - № 2. - С. 92 - 96.

51. Краева, Л. А. К вопросу об этиологическом значении Corynebacterium non diphtheriae у больных с различной патологией / Л. А.Краева, Ж. Н. Манина, Г. Я. Ценева, А. Г. Радченко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2007. - № 5. - С. 3 - 7.

52. Краева, Л. А. Особенности биологических свойств C.diphtheriae, циркулирующих в постэпидемический период / Л. А. Краева, Г. Я. Ценева // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2009. - № 3. -С. 3 - 6.

53. Краева, Л. А. Изменение чувствительности к антибиотикам у микроорганизмов рода Corynebacterium в Санкт-Петербурге и Ленинградской области / Краева Л. А. // Здоровье населения и среда обитания. - 2011. - № 2. - С. 25 - 27.

54. Красильникова, В. М. Восстановление «молчащего» гена tox Corynebacterium diphtheriae в модельных эксперементах / В. М. Красильникова, Н. В. Воложанцев, В. А. Баннов, В. П. Мякинина // Идеи Пастера в борьбе с инфекциями: Материалы третьей международной конференции, посвященной 80-летию Института им. Пастера, 4 - 5 сентября, Санкт-Петербург. - С. - Петербург, 2003. - С. 27.

55. Крылова, М. Д. Вирусы коринебактерий дифтерии в генетическом маркировании и таксономии : автореф. дис. ... докт. мед. наук : 03.00.07 / Крылова Мария Дмитриевна - М., 1973.

56. Крылова, М. Д. Дифтерийная инфекция (биологические, генетические и эпидемиологические аспекты) / М. Д. Крылова. - М.: Медицина, 1976.

57. Крылов, В. Н. Фаготерапия с точки зрения генетики бактериофага / В. Н. Крылов // Генетика. - 2001. - Т. 37, № 7. - С. 869 - 887.

58. Лабинская, А. С. Руководство по медицинской микробиологии. Общая и санитарная микробиология / А. С. Лабинская. - М.: Бином, 2010. - С. 1080.

59. Лабинская, А. С. Руководство по медицинской микробиологии. Частная медицинская микробиология и этиологическая диагностика инфекций / А. С. Лабинская. - М.: Бином, 2010. - С. 1152.

60. Ланчини, Д. Антибиотики / Д. Ланчини, Ф. Паренти. - М.: Мир, 1985. - 272 с.

61. Литвинова, А. М. К оценке эффективности применения коли-протейного бактериофага при дисбактериозе кишечника у новорожденных недоношенных детей / А. М. Литвинова, В. М. Чтецова, И. Г. Кавтырева // Вопросы охраны материнства и детства. - 1978. - Т. 23. - С. 42 - 44.

62. Мазурова, И. К. Разработка и применение реакции пассивной гемагглютинации для обнаружения дифтерийных противомикробных антител у больных дифтерией : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 03.00.07 / Мазурова Изабелла Константиновна. - М., 1971.

63. Мазурова, И. К. Детекция токсина и оценка степени токсинообразования с помощью иммуноферментного анализа / И. К. Мазурова, Е. Е. Потемкина, В. В. Свиридов, Е. М. Зайцев // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1989. - № 6. - С. 66 - 71.

64. Мазурова, И. К. Комплексная система лабораторной диагностики и наблюдения за возбудителем дифтерии : автореф. дис. ... докт. мед. наук: 03.00.07 / Мазурова Изабелла Константиновна. - М., 1993.

65. Мазурова, И. К. Наблюдение за нетоксигенными штаммами С.^рЫИепае в период снижения заболеваемости дифтерией в России / И. К. Мазурова, С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, Т. В. Платонова // Материалы международной Конференции «Идеи Пастера в борьбе с инфекциями», 2 - 4 сентября, Санкт-Петербург. - С. - Петербург, 1998. - С. 186.

66. Мазурова, И. К. Антибиотикорезистентность штаммов Corynebacterium diphtheriae - новая проблема инфекционной патологии / И. К. Мазурова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, С. Ю. Комбарова, Т. В. Платонова, Е. Э. Андрусенко, А. Эфстратиоу, К. Энглер // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2000. - Т. 2, Приложение 1. - С. 27 - 28.

67. Мазурова, И. К. Молекулярно-биологические свойства Corynebacterium diphtheriae и их влияние на клинику дифтерии у непривитых детей в периоды различной интенсивности эпидемического процесса / И. К. Мазурова, Т. В. Платонова, С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова, Н. Н. Костюкова // Материалы научно-практической конференции «Инфекционные болезни на рубеже XXI века», 24 - 26 мая, Москва. - Москва, 2000. - С. 75.

68. Мазурова, И. К. Некоторые особенности циркуляции биоваров gravis и mitis токсигенных и нетоксигенных штаммов Corynebacterium diphtheriae / И. К. Мазурова, О. Ю. Борисова, С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, С. В. Герасимова, Е. Э. Андрусенко, Э. Д. Цепляева, Л. П. Калугина // В сборнике научных трудов МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского "Проблемы инфекционных болезней (эпидемиология и профилактика)". - 2000. - С. 52 -55.

69. Мазурова, И. К. Микробиологический и молекулярно-генетический мониторинг дифтерийной инфекции / И. К. Мазурова, С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, В. А. Алешкин // Материалы IX съезда Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. -2007. - Т. 1. - С. 78 - 79.

70. Мазурова, И. К. Мониторинг возбудителя дифтерийной инфекции / И. К. Мазурова, С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, В. Г. Мельников, Н. М. Максимова, Н. Т. Гадуа, Л. С. Наумов, Н. В. Воложанцев // Журнал эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2009. - № 3 (46). - С. 17 - 22.

71. Максимова, Н. М. Дифтерия / Н. М. Максимова, С. С. Маркина, Костюкова Н. Н. // В кн. Покровский В. В., Онищенко Г. Г., Черкасский В. Л. «Эволюция

инфекционных болезней в России в XX веке». - М. : Медицина, 2003. - С. 214

- 236.

72. Максимова, Н. М. Развитие эпидемического процесса дифтерии в России в условиях высокого уровня специфического иммунитета / Н. М. Максимова, С. С. Маркина, К. А. Яцковский, Н. А. Кошкина // Медицинский альманах. -2009. - № 2. - С. 105 - 108.

73. Максимова, Н. М. Дифтерия в России в 2005 - 2009 годах / Н. М. Максимова, С. С. Маркина, К. А. Яцковский, В. В. Черкасова, М. П. Корженкова, А. В. Сафронова, Н. А. Кошкина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2010.

- № 3. - С. 31 - 36.

74. Маниатис, Т. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук. // М.: Мир, 1984. - 459 с.

75. Маркина, С. С. Метод фаготипирования токсигенных коринебактерий дифтерии типа gravis и его применение в эпидемиологии дифтерийной инфекции : автореф. дис. ... канд. мед. наук : 14780 / Маркина Светлана Сергеевна. - М., 1971.

76. Маркина, С. С. Эпидемический процесс дифтерийной инфекции в РСФСР в условиях внедрения эпидемиологического надзора / С. С. Маркина, И. М. Тымчаковская, Н. М. Максимова, Н. Л. Сухорукова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1989. - № 5. - С. 38 - 40.

77. Маркина, С. С. Заболеваемость дифтерией в России в 1992 г. / С. С. Маркина, Н. М. Максимова, Э. Я. Богатырева // Здоровье населения и среда обитания. Ежемесячный информационный бюллетень. - 1993. - № 1. - С. 3 - 8.

78. Маркина, С. С. Дифтерия в России в 1990 - 1994 гг. / С. С. Маркина, А. А. Монисов, Н. М. Максимова, Э. Я. Богатырева // В сборн. научн. трудов «Проблемы эпидемиологии, микробиологии и клиники капельных и кишечных инфекций», Москва. - 1996. - Часть 1. - С. 18 - 20.

79. Маркина, С. С. Заболеваемость дифтерией в России в 1993 - 1995 гг. / С. С. Маркина, Н. М. Максимова, Е. А. Котова, Н. Я. Жилина // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 1997. - № 4. - С. 8 - 10.

80. Маркина, С. С. Эпидемиологическая ситуация по дифтерии в России / С. С. Маркина, Н. М. Максимова, В. С. Петина, Н. И. Кошкина, В. А. Фисенко // В сборн. научн. трудов «Проблемы инфекционных болезней». - 2000. - Часть 1. - С. 4 - 10.

81. Маркина, С. С. Характеристика эпидемического процесса дифтерии в начале нового тысячелетия / С. С. Маркина, Н. М. Максимова // Матер. VIII Всерос. съезда эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - 2002. - Т. 1. - С. 81.

82. Маркина, С. С. Заболеваемость дифтерией в настоящее время / С. С. Маркина, Н. М. Максимова, Г. Ф. Лазикова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2005. - № 1. - С. 31 - 37.

83. Маркина, С. С. Заболеваемость дифтерией в России в настоящее время / С. С Маркина, Н. М. Максимова, К. А. Яцковский, В. В. Черкасова, Н. И. Кошкина // Тезисы Всеросс. научно-практ. конф. «Вакцинология-2006. Совершенствование иммунобиологических средств профилактики, диагностики и лечения инфекционных болезней», 21-22 ноября, Москва. -Москва, 2006. - С. 62.

84. Маркина, С. С. Эпидемиологическая ситуация по дифтерии в настоящее время / С. С. Маркина, Н. М. Максимова, В. В. Черкасова, Н. И. Кошкина // Бюллетень «Вакцинация». - 2006. - № 1. - С. 7 - 11.

85. Мельников, В. Г. Микрофлора ротоглотки дифтерийных бактерионосителей до и после антибиотикотерапии / В. Г. Мельников, И. К. Мазурова, Т. В. Платонова, С. Ю. Комбарова, Г. Н. Феоктистова, С. В. Звонарева, М. В. Кузнецова, О. Ю. Борисова, Е. И. Лиханская // В сборн. научных трудов МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского «Вакцинопрофилактике - 2000». - 1997. -С. 32 - 35.

86. Мельников, В. Г. Характеристика нетоксигенных штаммов СогупеЪа^вгтт ЖрЫквпав, несущих ген дифтерийного токсина / В. Г. Мельников, С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, Н. В. Воложанцев, В. В. Веревкин, К. И. Волковой, И. К. Мазурова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2004. - № 1. - С. 3 - 7.

87. Методические рекомендации «Индикация дифтерийного токсина методом иммуноферментного анализа и в реакции непрямой гемагглютинации» / И. К. Мазурова, Е. Е. Потемкина, С. Ю. Комбарова, А. Б. Жебрун, В. В. Свиридов, Е. М. Зайцев, И. М. Тымчаковская // М.: МЗ ЗСФСР. - 1991. - 27 с.

88. Методические рекомендации № 27 Часть 2. Дифтерия (клиника, диагностика, лечение) / М. П. Корженкова, Н. А. Малышев, А. И. Берко, В. А. Арсеньев // Москва. - 2008. - 19 с.

89. Методические указания «Индикация дифтерийного токсина методами иммуноферментного анализа и реакции непрямой гемагглютинации» / И. К. Мазурова, Е. Е. Потемкина, А. Б. Жебрун, Л. А. Барашкова, В. В. Свиридов, Е. М. Зайцев, И. М. Тымчаковская // М., Интерсэн. - 1998. - 47 с.

90. Методические указания «Лабораторная диагностика дифтерийной инфекции. МУ 4.2.698 - 98» / И. К. Мазурова, В. Г. Мельников, С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, Н. Я. Жилина // МЗ России. - 1998. - 48 с.

91. Методические указания «Лабораторная диагностика дифтерийной инфекции. МУК 4.2.3065-13» / Е. Б. Ежлова, А. А. Мельникова, Н. А. Кошкина, М. В. Зароченцев, И. В. Новокшонова, И. К. Мазурова, О. Ю. Борисова, С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, Н. М. Максимова, Т. Н. Якимова, Н. Я. Салова, И. П. Требунских // Москва : Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. - 2013. - 63 с.

92. Миронов, К. О. Метод мультилокусного секвенирования-типирования N.meningitidis и H.influenzae серотипа b в эпидемиологическом надзоре за бактериальными менингитами : дис. ... канд. мед. наук: 14.00.30 / Миронов Константин Олегович. - М., 2004.

93. Миронов, К. О. Генетическое субтипирование Neisseria meningitidis / К. О. Миронов, А. Е. Платонов, Г. А. Шипулин, van der Ende Ari, И. С. Королева // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2005. - № 3. - С. 23 - 28.

94. Миронов, К. О. Анализ московской популяции Neisseria meningitidis методом мультилокусного секвенирования-типирования / К. О. Миронов, А. Е.

Платонов, И. С. Королева, Г. А. Шипулин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - № 2. - С. 31 - 36.

95. Миронов, К. О. Генетическая характеристика штаммов Haemophilus influenzae серотипа В, изолированных в регионах России / К. О. Миронов, А. Е. Платонов, М. К. Николаев, И. С. Королева, Г. А. Шипулин // Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - № 6. - С. 24 - 28.

96. Миронов, К. О. Генетическая субгруппы бактерий Neisseria meningitidis серогруппы А, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Москвы в 1969 - 2006 годы / К. О. Миронов, А. Е. Платонов, И. С. Королева, И. М. Закроева, В. Л. Заикин, Л. Я. Соловьева, С. И. Браславская, Г. А. Шипулин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2008. - № 1. - С. 7 - 12.

97. Миронов, К. О. Генотипирование Neisseria meningitidis / К. О. Миронов, Г. А. Шипулин, И. С. Королева, А. Е. Платонов // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2009. - № 4. - С. 14 - 18.

98. Михайлович, В. М. Использование метода ДНК-ДНК гибридизации для изучения штаммов Corynebacterium diphtheriae / В. М. Михайлович, В. Л. Заикин, И. К. Мазурова // Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. - 1994. - № 6. - С. 27 - 29.

99. Михайлович, В. М. Разработка и адаптация молекулярно-биологических технологий для диагностики дифтерийной инфекции и изучения штаммов Corynebacterium diphtheriae: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.00.07 / Михайлович Владимир Михайлович. - М., 1995.

100. Мокроусов, И. В. Генетическое типирование штаммов Corynebacterium diphtheriae, с помощью полимеразной цепной реакции с универсальными праймерами / И. В. Мокроусов, О. В. Нарвская, Г. Я. Ценева, Н. В. Михайлов, И. Р. Попель // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -1996. - № 5. - С. 73 - 75.

101. Наносова, В. А. Антибактериальная терапия стрептококкового тонзиллита (ангины и фарингита) / В. А. Наносова, Б. С. Белов, Л. С. Страчунский, Н. Н.

Судиловская, Е. И. Каманин, Т. М. Богданович, О. И. Кречикова, М. Р. Богомильский, Ю. М. Овчинникова // Антибиотики и химиотерапия. - 1999. -№ 9. - С. 19 - 23.

102. Ноников, В. Е. Атипичные пневмонии / В. Е. Ноников // Антибиотики и химиотерапия. - 2001. - Т. 6. - С. 32 - 37.

103. Носов, С. Д. Учебник детских инфекционных болезней / С. Д. Носов. -Государственное издательство медицинской литературы, 1957. - 82 с.

104. Панферцев, Е. А. Использование ПЦР - секвенирования для экспресс -идентификации рифампицин - резистентности клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis / Е. А. Панферцев, Г. Н. Митрофанова, В. Н. Степаншина, И. Г. Шемякин // Материалы II Всероссийской конференции «Полимеразная цепная реакция в диагностике и контроле лечения инфекционных заболеваний». - Москва, 1998. - С. 107 - 108.

105. Парнес, Я. А. История биологии. С начала ХХ века до наших дней / Я. А. Парнес. - М. : Наука, 1975. - 660 с.

106. Платонов, А. Е. Мультилокусное секвенирование - новый метод генотипирования бактерий и первые результаты его применения / А. Е. Платонов, Г. А. Шипулин, О. В. Платонова // Генетика. - 2000. - Т. 36, № 5. -С. 597 - 605.

107. Платонов, А. Е. Характеристика Московских штаммов Haemophilus influenzae типа b методом мультилокусного секвенирования - типирования / А. Е. Платонов, К. О. Миронов, С. Б. Яцышина, И. С. Королева, О. В. Платонова, А. Е. Гущин, Г. А. Шипулин // Молекулярная генетика микробиология и вирусология. - 2003.- № 2. - С. 21 - 25.

108. Платонова, Т. В. Биологические свойства Corynebacterium diphtheriae и их влияние на клинику дифтерии у непривитых детей в условиях различной интенсивности эпидемического процесса / Т. В. Платонова, И. К. Мазурова, О. Ю. Борисова, С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников // Проблемы инфекционных болезней. Часть 1: Сборн. научн. трудов Московского НИИ

эпидемиологии и микробиологии им. Г. Н. Габричевского / под ред. В. А. Алешкина - Москва, 2000. - С. 55 - 59.

109. Погорельская, С. А. Коли-протейный бактериофаг. Принципы его приготовления и применения для терапии и профилактики кишечных заболеваний детей ясельного возраста : автореф. дис. ... докт. мед. наук : / Погорельская Светлана Аркадьевна. - Горький, 1969.

110. Покровский, В. В. Эволюция инфекционных болезней в России в XX веке / В. И. Покровский, Г. Г. Онищенко, Б. Л. Черкасский. - М. : Медицина. - 2003. - 664 с.

111. Пособие для врачей «Применение полимеразной цепной реакции для диагностики дифтерии и изучения возбудителя» / О. В. Нарвская, И. В. Мокроусов // С.Петербург. - 1995.

112. Пособие для врачей «Характеристика СогупеЪа^вгтт ШрЫНвпав, циркулирующих в России в период 1984 - 1998 гг. (микробиологический мониторинг в системе эпиднадзора за дифтерийной инфекцией)» / И. К. Мазурова, С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова // Москва. -1999. - 26 с.

113. Пособие для врачей «Нетоксигенные штаммы СогупеЪа^вгтт ЖрЫНвпав, несущие ген дифтерийного токсина» / В. Г. Мельников, С. Ю. Комбарова, О. Ю. Борисова, И. К. Мазурова // Москва. - 2002. - 12 с.

114. Пособие для врачей «Особенности клиники дифтерии в условиях циркуляции возбудителя дифтерии высокой степени токсигенности» / М. П. Корженкова, Т. В. Платонова, В. В. Черкасова, Н. А. Малышев, О. В. Кудряшова, А. И. Берко, В. А. Арсеньев // Москва. - 2002. - 31 с.

115. Пособие для врачей «Комплексная система наблюдения за циркулирующими штаммами СогупеЪа^епит ЖрЫНвпав» / С. Ю. Комбарова, В. Г. Мельников, О. Ю. Борисова, И. К. Мазурова // Москва. - 2004. - 34 с.

116. Раутенштейн, Я. И. Бактериофагия: общие сведения о явлении фагии и его значении в ряде производств / Я. И. Раутенштейн. - М. : Изд-во Акад. наук СССР, 1955. - 144 с.

117. Руководство по инфекционным болезням у детей / под редакцией С. Д. Носов // М. : Медицина. - 1980. - С. 66.

118. Савинова, Т. А. Генетическое разнообразие пенициллинустойчивых Streptococcus pneumoniae / Т. А. Савинова, О. Ю. Филимонова, С. А. Грудинина, C. B. Сидоренко // Журнал инфектологии. - 2010. - Т. 1, № 4. - С. 66 - 71.

119. Савинова, Т. А. Перспективы применения антипневмококковой вакцинации для сдерживания распространения антибактериальной резистентности среди пневмококков / Т. А. Савинова, Е. Н. Ильина, С. В. Сидоренко // Антибиотики и химиотерапия. - 2011. - № 56. - С. 5 - 6.

120. Саммерс, У. Бактериофаги: биология и практическое применение / У. Саммерс, Э. Каттер, А. Сулаквелидзе; под общ. ред. Э. Каттер и А. Сулаквелидзе (пер. с англ. коллектив переводчиков; науч. ред. А.В. Летаров). - М. : Научный мир, 2012. - С. 28 - 29.

121. Сидоренко, С. В. Антибиотикограмма: Диско-диффузионный метод. Интерпретация результатов / С. В. Сидоренко, В. Е. Колупаев // Москва. -2003. - С. 59.

122. Сидоренко, С. В. Антибактериальная терапия синусита: современный взгляд на проблему / С. В. Сидоренко, И. А. Гучев // Consilium Medicum. - 2004. - Т. 6, № 1. - С. 4 - 5.

123. Сидоренко, С. В Молекулярные основы резистентности к антибиотикам / С.

B. Сидоренко, В. И. Тишков // Успехи биологической химии. - 2004. - Т. 44. -

C. 263 - 306.

124. Сидоренко, С. В. Тонзиллофарингит: вопросы диагностики и антибактериальной терапии / С. В. Сидоренко, И. А. Гучев // Consilium Medicum. - 2004. - Т. 6, № 4. - С. 8 - 9.

125. Сингер, М. Гены и геномы / М. Сингер, П. Берг. - М. : Мир, 1998. - Т. 1 - 2.

126. Супотницкий, М. В. Механизмы развития резистентности к антибиотикам у бактерий / М. В. Супотницкий // Биопрепараты. - 2011. - № 2. - С. 4 - 11.

127. Страчунский, Л. С. Чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных от здоровых детей из организованных коллективов. / Л. С. Страчунский, О. И. Кречикова, Г. К. Решедько, О. У. Стецюк, Р. С. Козлов, Г. Д. Тарасова, Б. М. Блохин, О. А. Егорова, Л. М. Бойко // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 1999. - Т. 1, № 1. - С. 31 -39.

128. Суслова, В. С. Серологический типаж дифтерийных бактерий, выделенных на территории Советского Союза. / В. С. Суслова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1964. - № 9. - С. 13 - 16.

129. Сухорукова, Н. Л. Эпидемиологическая оценка дифтерийной инфекции в условиях высокого уровня противодифтерийного иммунитета: дис. ... докт. мед. наук : 14.02.02 / Сухорукова Нила Леонтьевна - М., 1978.

130. Санитарно-эпидемиологические правила. Профилактика дифтерии. СП 3.1.2.3109-13 / Н. М. Максимова, С. С.Маркина, Т. Н. Якимова, М. П. Корженкова, О. С. Орлова, К. А. Яцковский, И. К. Мазурова, О. Ю. Борисова, С. Ю. Комбарова, Г. Ф. Лазикова, Е. Б. Ежлова, А. А. Мельникова, Н. А. Кошкина, Н. Ф. Соколова, Л. И.Анисимова // Москва: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. - 2015. - 27 с.

131. Урбан, Ю. Н. Определение фенотипических и молекулярно-генетических характеристик штаммов Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae и Streptococcus pneumoniae, выделенных из ликвора детей, больных гнойным бактериальным менингитом: дис. ... канд. канд. биол. наук : 03.02.03 / Урбан Юлия Николаевна. - М., 2014.

132. Фаворова, Л. А. Об эпидемиологическом надзоре / Л. А. Фаворова, Н. Л. Сухорукова, Л. М. Иванова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1981. - № 8. - С. 8 - 13.

133. Фаворова, Л. А. Дифтерия: монография / Л. А. Фаворова, Н. В. Астафьева, М. П. Корженкова, Л. С. Кузнецова, Н. М. Максимова, В. В. Михайлов, Н. Л. Сухорукова, В. В. Черкасова, Е. А. Шмелёва - М.: Медицина, 1988. - С. 187 -195.

134. Фаворова, Л. А. Дифтерия / Л. А. Фаворова, Н. В. Астафьева, М. П. Корженкова, В. В. Черкасова, Е. А. Шмелева. - М.: Медицина, 1988. - 208 с.

135. Филимонова, О. Ю. Распространение и молекулярные механизмы резистентности к макролидным антибактериальным препаратом микроорганизмов рода Streptococcus в Российской Федерации: дис. ... канд. мед. наук: 03.02.03 / Филимонова Ольга Юрьевна. - М., 2010.

136. Хрущева, В. А. Микробиологическая характеристика возбудителя дифтерии в послевоенные годы / В. А. Хрущева, С. С. Меклер // В кн. Дифтерия. -Казань, 1964. - С. 45 - 48.

137. Ценева, Г. Я. Применение полимеразной цепной реакции в диагностике дифтерийной инфекции / Г. Я. Ценева, Е. Е. Щедеркина // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2000. - № 5. - С. 72 - 74.

138. Черкасова, В. В. Возбудитель дифтерии и его свойства / В. В. Черкасова, Л. А. Фаворова, Н. В. Астафьева, М. П. Корженкова, Е. А. Шмелева // В кн. Дифтерия. - М. : Медицина, 1988. - С. 6 - 29.

139. Чистякова, Г. Г. Крупная эпидемия дифтерии в Москве в последние годы: закономерности развития / Г. Г. Чистякова, Н. Н. Филатов, М. П. Корженкова, Ю. П. Солодовников, И. Н. Лыткина, Н. М. Максимова, С. С. Маркина // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2001. - № 1. - С. 18 - 21.

140. Шемякин, И. Г. Молекулярно-биологическая характеристика и методы идентификации клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis : дис. ... д-ра биол. наук : 03.00.07 / Шемякин Игорь Георгиевич. - М., 2007.

141. Щелкунов, С.Н. Генетическая инженерия / С. Н. Щелкунов. - Новосибирск: Изд-во Новосибирского ун-та, 1994. - 304 с.

142. Якимова, Т. Н. Эпидситуация по дифтерии в России и в субъектах Российской Федерации с 2005 - 2011 гг. / Т. Н. Якимова, С. С. Маркина, Н. М. Максимова // Бюллетень восточно-сибирского научного центра сибирского отделения Российской академии медицинских наук. - 2012. - № 5 (87). - С. 151 - 154.

143. Якимова, Т. Н. Дифтерия сегодня / Т. Н. Якимова, С. С. Маркина, Н. М. Максимова // Здоровье населения и среда обитания. - 2013. - № 12. - С. 18 -19.

144. Adone, R. Protective properties of rifampin-resistant rough mutants of Brucella melitensis / R. Adone, F. Ciuchini, C. Marianelli, M. Tarantino, C. Pistoia, G. Marcon, P. Petrucci, M. Francia, G. Riccardi, P. Pasquali // Infection and Immunity. - 2005. - № 73. - Р. 4198 - 4204.

145. Ardanuy, C. Epidemiology of invasive pneumococcal disease among adult patients in Barcelona before and after pediatric 7-valent pneumococcal conjugate vaccine introduction, 1997-2007 / C. Ardanuy, F. Tubau, R. Pallares, L. Calatayud, M. A. Domínguez, D. Rolo, I. Grau, R. Martín, J. Liñares // Clinical Infectious Diseases. - 2009. - Vol. 48. - P. 57 - 64.

146. Ashworth, L. A. E. Antigenic relationship between serotype-specific agglutinogen and fimbriae of Bordetella pertussis / L. A. E. Ashworth, L. I. Irons, A. B. Dowsett // Infection and Immunity. - 1982. - Vol. 37. - № 3. - P. 1278 - 1281.

147. Barraud, O. Antimicrobial drug resistance in Corynebacterium diphtheriae mitis // O. Barraud, E. Badell, F. Denis, N. Guiso, M. C. Ploy // Emerging Infectious Diseases. - 2011. - Vol. 17. - № 11. - P. 2078 - 2080.

148. Bergman, M. Macrolide and azithromycin use are linked to increased macrolide resistance in Streptococcus pneumoniae / M. Bergman, S. Huikko, P. Huovinen, P. Paakkari, H. Seppala // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2006. - № 50. -P. 3646 - 3650.

149. Bergval, I. L. Specific mutations in the Mycobacterium tuberculosis rpoB gene are associated with increased dnaE2 expression / I. L. Bergval, P. R. Klatser, A. R. J. Schuitema, L. Oskam, R. M. Anthony // FEMS Microbiology Letters. - 2007. - № 275. - P. 338 - 343.

150. Björkman, J. Virulence of antibiotic-resistant Salmonella typhimurium / J. Björkman, D. Hughes, D. I. Andersson // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1998. - Vol. 95. - № 95. - Р. 3949 - 3953.

151. Blackman Northwood J. Characterization of Macrolide Efflux Pump mef Subclasses Detected in Clinical Isolates of Streptococcus pyogenes Isolated between 1999 and 2005 / J. Blackman Northwood, M. Del Grosso, L. R. Cossins, M. D. Coley, R. Creti, A. Pantosti, D. J. Farrell // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2009. - Vol. 53. - № 5. - P. 1921 - 1924.

152. Blanke, S. R. Active site mutations of the diphtheria toxin catalytic domain: role of histidine-21 in nicitinamide adenine dinucleotide binding and ADP-ribosylation of elongation factor 2 / S. R. Blanke, K. Huang, B. A. Wilson, E. Papini, A. Covacci, R. J. Collier // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33. - № 17. - P. 5155 - 5161.

153. Bolt, F. Multilocus sequence typing identifies evidence for recombination and two distinct lineages of Corynebacterium diphtheriae / F. Bolt, P. Cassiday, M. Tondella, A. de Zoysa, A. Efstratiou, A. Sing, A. Zasada, K. Bernard, N. Guiso, E. Badell, M. L. Rosso, A. Baldwin, C. Dowson // Journal of Clinical Microbiology. - 2010. - Vol. 48. - № 11. - P. 4177 - 4185.

154. Borisova, O. Antigenic divergence between Bordetella pertussis clinical isolates from Moscow, Russia and vaccine strains / O. Borisova, S. Y. Kombarova, N. S. Zakharova, van Gent Marjolein, V. A. Aleshkin, I. K. Mazurova, F. Mooi // Clinical and Vaccine Immunology. - 2007. - Vol. 14. - № 3. - P. 234 - 238.

155. Brenciani, A. Distribution and molecular analysis of mef(A) - containing elements in tetracycline-susceptible and - resistant Streptococcus pyogenes clinical isolates with efflux-mediated erythromycin resistance / A. Brenciani, K. K. Ojo, A. Monachetti, S. Menzo, M. C. Roberts, P. E. Varaldo, E. Giovanetti // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2004. - № 54. - P. 991 - 998.

156. Bruynoghe, R. Essais de therapeutigue au moyen du bacteriophage du Staphylocogue / R. Bruynoghe, J. Maisin // Compt. Rend. Soc. Biol. - 1921. - № 85. - P. 1120 - 1121.

157. Campbell, E. A. Structural mechanism for rifampicin inhibition of bacterial RNA polymerase / E. A. Campbell, N. Korzheva, A. Mustaev, K. Murakami, S. Nair, A. Goldfarb, S. A. Darst // Cell. - 2001. - Vol. 104. - № 6. - P. 901 - 912.

158. Caro, V. Temporal analysis of Bordetella pertussis isolates by comparative whole-genome hybridization / V. Caro, D. Hot, G. Guigon, C. Hubans, M. Arrive, G. Soubigou, G. Renauld-Mongenie, R. Antoine, C. Locht, Y. Lemoine, N. Guiso // Microbes and Infection. - 2006. - Vol. 8. - № 8. - P. 2228 - 2235.

159. Cerdeno-Tarraga, A. M. The complete genome sequence and analysis of Corynebacterium diphtheriae NCTC 12129 / A. M. Cerdeno-Tarraga, L. G. Dover, M. T. G. Holden, M. Pallen, S. D. Bentley, G. S. Besra, C. Chrucher, K. D. James, A. de Zoysa, T. Chillingworth, A. Cronin, L. Dowd, T. Feltwell, N. Hamlin, S. Holroyd, K. Jages, S. Moule, M. A. Quail, E. Rabinowitsch, K. M. Rutherford, N. R. Thompson, L. Unwin, S. Whitehead, B. G. Barrel, J. Parkhile // Nucleic Acids Research - 2003. - Vol. 31. - № 22. - P. 6516 - 6523.

160. Chaussee, M. S. Rgg influences the expression of multiple regulatory loci to coregulate virulence factor expression in Streptococcus pyogenes / M. S. Chaussee, Sylva, D. E. Sturdevant, L. M. Smoot, M. R. Graham, R. O. Watson, J. M. Musser // Infection and Immunity. - 2002. - № 70. - P. 762 - 770.

161. Cianciotto, N. P. Characterization of bacteriophages from tox-containing non-toxigenic isolates of Corynebacterium diphtheriae // N. P. Cianciotto, N. B. Groman // Microbial Pathogenesis. - 1997. - Vol. 22. - № 6. - P. 343 - 351.

162. Clancy, J. Molecular cloning and functional analysis of a novel macrolide-resistance determinant, mefA, from Streptococcus pyogenes / J. Clancy, J. Petitpas, F. Dib-Hajj, W. Yuan, M. Cronan, A. V. Kamath, J. Bergeron, J. A. Retsema // Molecular Microbiology. - 2002. - № 22. - P. 867 - 879.

163. Clarridge, J. E. Diphtheria and other corynebacterial and coryneform infections / J. E. Clarridge, T. Popovic, T. J. Inzana In: Collier L, Balows A, Sussman M, editors. // Topley and Wilson's Microbiology and Microbial Infections. London: Arnold, 1998. - P. 347 - 371.

164. Collier, R. J. Structure and activity of diphtheria toxin. I. Thiol-dependent dissociation of a fraction of toxin into enzymically active and inactive fragments / R. J. Collier, J. Kandej // The Journal of Biological Chemistry. - 1971. - Vol. 246. -№ 5. - P. 1453 - 1496.

165. Combrink, K. D. New C25 carbamate rifamycin derivatives are resistant to inactivation by ADP-ribosyl transferases / K. D. Combrink, D. A. Denton, S. Harran, Z. Ma, K. Chapo, D. Yan, E. Bonventre, E. D. Roche, T. B. Doyle, G. T. Robertson, A. S. Lynch // Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. - 2007. -Vol. 17. - № 2. - P. 522 - 526.

166. Coyle, M. B. Erythromycin and clindamycin resistance in Corynebacterium diphtheriae from skin lesions / M. B. Coyle, B. H. Minshew, J. A. Bland, P. C. Hsu // Antimicrob Agents Chemother. - 1979. - Vol. 16. - № 4. - P. 525 - 527.

167. Coyle, M. B. The molecular epidemiology of three biotypes of Corynebacterium diphtheriae in the Seatle outbreak, 1972-1982 / M. B. Coyle, N. B. Groman, J. Q. Russell, J. R. Harnishch, M. Rabin, R. Holmes // The Journal of Infectious Diseases. - 1989. - Vol. 159. - № 4. - 670 - 679.

168. Dabbs, E. Rifampicin inactivation by Bacillus species / E. Dabbs, K. Yazawa, Y. Tanaka, Y. Mikami, M. Miyaji, S. Andersen, N. Morisaki, S. Iwasaki, O. Shida, H. Takagi, K. Kadowaki // The Journal of Antibiotics. - 1995. - Vol. 48. - № 8. - P. 15 - 9.

169. Damian, M. Study of Corynebacterium diphtheriae strains isolated in Romania, northwest Russia and republic of Moldova / M. Damian, F. Grimont, O. Narvskaya, M. Staut, M. Surdeanu, R. Cojocaru, I. Mokrousov, A. Diadonescu, C. Andronescu, L. Melnik, P. A. D. Grimont // Research in Microbiology. - 2002. -Vol. 153 - №. 2. - P. 99 - 96.

170. Damian, M. Molecular comparison of non-toxigenic, toxigenic and converted Corynebacterium diphtheriae strains with respect to the Ins. Sites / M. Damian, C. R. Ucein, B. Luca, M. Florea, A. Diadonescu // Abstr. 8th International Meeting of the European Working Group on Diphtheria, Denmark, Copenhagen, 16-18 June. -2004. - P. 40.

171. d' Herelle, F. The Bacteriophage and its Behavior / F. d'Herelle, G. H. Smith. -Baltimore: The Williams &Wilkins Co, OCLC 2394374,1926.

172. Doern, G. V. Antimicrobial resistance among Streptococcus pneumoniae in the United States: have we begun to turn the corner on resistance to certain

antimicrobial classes? / G. V. Doern, S. S. Richter, A. Miller, N. Miller, C. Rice, K. Heilmann. S. Beekmann // Clinical Infectious Diseases. - 2005. - № 41. - P. 139 - 148.

173. Egorov, A. M. Four-Year Surveillance- of Antibiotic Resistance in Streptococcus pneumoniae in Moscow 2001 / A. M. Egorov, S. V. Sidorenko, S. A. Grudinina // 43rd ICAAC September 14-17, Chicago, Illinois, 2003. - C2-945.

174. Engler, K. H. In vitro sensitivity of C.diphtheriae to antimicrobial agents / K. H. Engler, M. Warner, R. C. George // Fifth International meeting of the European laboratory working group on diphtheria, 1998. - P. 36.

175. Enne, V. I. Rifampicin resistance and its fitness cost in Enterococcus faecium / V. I. Enne, A. A. Delsol, J. M. Roe, P. M. Bennett // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2004. - Vol. 53. - P. 203 - 207.

176. Fafour, E. Characterization and comparison of invasive C.diphtheriae isolates from France and Poland / E. Fafour, E. Badell, A. Zasada, H. Hotzel, H. Tomaso, S. Guillot, N. Guiso // Journal of Clinical Microbiology. - 2012. - Vol. 50. - № 1. -P. 173 - 175.

177. Fernandes, P. Solvent tolerance in bacteria: role of efflux pumps and cross-resistance with antibiotics / P. Fernandes, B. S. Ferreira, J. M. S. Cabral // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2003. - Vol. 22. - № 3. - P. 211 -216.

178. Flatten, I. DnaA protein interacts with RNA polymerase and partially protects it from the effect of rifampicin / I. Flatten, K. Morigen, S. Morigen // Molecular Microbiology. - 2009. - Vol. 71. - № 4. - P. 1018 - 1030.

179. Florey, M. E. Diphtheria and carriers of C. diphtheria : The clinical application of antibiotics (penicillin) / M. E. Florey. - Oxford University Press : London, 1952. -P. 205 - 211.

180. Floss, H. G. Rifamycin-mode of action, resistance, and biosynthesis / H. G. Floss, T. W. Yu // Chemical Reviews. - 2005. - Vol. 105. - № 2. - P. 621 - 632.

181. Gagneux, S. The competitive cost of antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis / S. Gagneux, C. D. Long, P. M. Small, T. Van, G. K. Schoolnik, B. J. M. Bohannan // Science. - 2006. - Vol. 312. - P. 1944 - 1946.

182. Gardner, M. J. A circular DNA in malaria parasites encodes an RNA polymerase like that of prokaryotes and chloroplasts / M. J. A Gardner, D. H. Williamson, R. J. M. Wilson // Molecular and Biochemical Parasitology. - 1991. - Vol. 44. - № 1. -P. 115 - 123.

183. Gill, D. M. Observations on the structure of diphtheria toxin / D. M. Gill, L. L. Dinius // The Journal of Biological Chemistry. - 1971. - Vol. 246. - №. 5. - P. 1485 - 1491.

184. Gill, D. M. Structure-activity relationships in diphtheria toxin / D. M. Gill, A. M. J. Pappenheimer // The Journal of Biological Chemistry. - 1971. - Vol. 246. - № 5. -1492 - 1495.

185. Gladin, D. P. Sensitivity of C.diphtheriae isolated in Saint-Petersburg to antibacterial drugs / D. P. Gladin, N. S. Kozlova, T. K. Zaitseva, A. S. Cherednichenko, S. A. Khval' // Antibiotiki i Khimioterapiia. - 1999. - Vol. 44. -№ 5. - P. 17-21.

186. Glushkevich, T. G. The etiology of diphtheria in the Ukraina / T. G. Glushkevich, L. S. Nekrasova, N. N. Zherebko // Abstr. 6th International Meeting of the European Working Group on Diphtheria, 21-24 June, Brussel, Belgium, 2000. - P. 37.

187. Grimont, F. Ribosomal ribonucleic acid gene restriction patterns as potential taxonomic tools / F. Grimont, P. Grimont // Annales de Institut Pasteur Microbiology. - 1986. - Vol. 137 B. - № 2. - P. 165 - 175.

188. Grimont, P. A. D. The Corynebacterium diphtheria ribotype database project / P. A. D. Grimont, F. Grimont, M. Colin, C. Ruckly, S. Martin-Delautre // Abstr. 6th International Meeting of the European Working Group on Diphtheria, 21-24 June, Brussel, Belgium, 2000. - P. 55.

189. Grimont, P. A. D. Regnault B. International nomenclature for Corynebacterium diphtheria ribotypes. / P. A. D. Grimont, F. Grimont, A. Efstratiou, A. Zoysa, I.

Mazurova, C. Ruckly, M. Lejy-Collin, S. Martin- Delautre // Research in Microbiology. - 2004. - Vol. 155. - № 3. - P. 162 - 166.

190. Groman, N. B. Detection and expression of DNA homologous to the toxin nontoxigenic isolates of Corynebacterium diphtheriae / N. B. Groman, N. Cianciotto, M. Bjorn, M. Rabin // Infection and Immunity. - 1983. - Vol. 42. - № 1. - P. 48 - 56.

191. Gzyl, A. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) versus randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) as new tools for inter- and intra-species differentiation within Bordetella / A. Gzyl, E. Augustynowicz, E. Mosiej, M. Zawadka, G. Gniadek, A. Nowaczek, J. Slusarczyk // Journal Medical Microbiology. - 2005. - Vol. 54. - P. 333 - 346.

192. Hagman, K. Resistance of Neisseria gonorrhoeae to antimicrobial hydrophobic agents is modulated by the mtrRCDE efflux system / K. Hagman, W. Pan, B. Spratt, J. Balthazar, R. Judd, W. Shafer // Microbiology. - 1995. - Vol. 141. - P. 611 - 622.

193. Heep, M. Mutations at four distinct regions of the rpoB gene can reduce the susceptibility of Helicobacter pylori to rifamycins / M. Heep, S. Odenbreit, D. Beck, J. Decker, E. Prohaska, U. Rieger, N. Lehn // Antimicrobial Agents and Chemother. - 2000. - Vol. 44. - P. 1713 - 1715.

194. Heep, M. Mutations in the beginning of the rpoB gene can induce resistance to rifamycins in both Helicobacter pylori and Mycobacterium tuberculosis / M. Heep, U. Rieger, D. Beck, N. Lehn // Antimicrob Agents Chemother. - 2000. - Vol. 44. -P. 1075 - 1077.

195. Heep, M. Frequency of rpoB mutations inside and outside the cluster I region in rifampin-resistant clinical Mycobacterium tuberculosis isolates / M. Heep, B. Brandstatter, U. Rieger, N. Lehn, E. Richter, S. Rusch-Gerdes, S. Niemann // Journal of Clinical Microbiology. - 2001. - Vol. 39. - P. 107 - 110.

196. Hirano, K. Mutations in the rpoB gene of rifampin - resistant Mycobacterium tuberculosis strain isolated mostly in Asian countries and their rapid detection by

line probe assay / K. Hirano, C. Abe, M. Takahashi // Journal of Clinical Microbiology. - 1999. - Vol. 37. - № 8. - P. 2663 - 2666.

197. Holmes, R. Biology and molecular biology of diphtheria toxin and tox gene / R. Holmes // The Journal of Infectious Diseases. - 2000. - Vol. 5. - № 6. - P. 156 -167.

198. Hu, H. Activation of antibiotic biosynthesis by specified mutations in the rpoB gene (encoding the RNA polymerase subunit) of Streptomyces lividans / H. Hu, Q. Zhang, K. Ochi // Bacteriology. - 2002. - Vol. 184. - P. 3984 - 3991.

199. Hu, Y. Detection of mRNA transcripts and active transcription in persistent Mycobacterium tuberculosis induced by exposure to rifampin or pyrazinamide / Y. Hu, J. A. Mangan, J. Dhillon, K. M. Sole, D. A. Mitchison, P. D. Butcher, Anthony R. M. Coates // Bacteriology. - 2000. - Vol. 182. - P. 6358 - 6365.

200. Hui, J. Permeability barrier to rifampin in mycobacteria / J. Hui, N. Gordon, R. Kajioka // Antimicrobial Agents and Chemother. - 1977. - Vol. 11. - P. 773 - 779.

201. Imai, T. Identification and characterization of a new intermediate in the ribosylative inactivation pathway of rifampin by Mycobacterium smegmatis / T. Imai, K. Watanabe, Y. Mikami, K. Yazawa, A. Ando, Y. Nagata, N. Morisaki, Y. Hashimoto, K. Furihata, E. R. Dabbs // Microbial Drug Resistance. - 1999. -Vol. 5. - P. 259 - 264.

202. Inaoka, T. RNA polymerase mutation activates the production of a dormant antibiotic 3,3 -neotrehalosadiamine via an autoinduction mechanism in Bacillus subtilis / T. Inaoka, K. Takahashi, H. Yada, M. Yoshida, K. Ochi // The Journal of Biological Chemistry. - 2004. - Vol. 279. - P. 3885 - 3892.

203. Ishikawa, J. The complete genomic sequence of Nocardia farcinica IFM 10152 / J. Ishikawa, A. Yamashita, Y. Mikami, Y. Hoshino, H. Kurita, K. Hotta, T. Shiba, Hattori. M // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. -2004. - Vol. 101. - P. 14925 - 14930.

204. Ishikawa, J. Contribution of rpoB2 RNA polymerase subunit gene to rifampin resistance in Nocardia species / J. Ishikawa, K. Chiba, H. Kurita, H. Satoh // Antimicrobial Agents and Chemother. - 2006. - Vol. - 50. P. 1342 - 1346.

205. Isozumi, R. Genotypes and related factors reflecting macrolide resistance in pneumococcal pneumonia infections in Japan / R. Isozumi, Y. Ito, T. Ishida // Journal of Clinical Microbiology. - 2007. - № 45. - P. 1440 - 1446.

206. Jansen, R. J. Identification of genes that are associated with DNA repeats in procaryots / R. J. Jansen, J. D. A. van Enbden, W. Gpastia, L. M. Schonls // Molecular Microbiology. - 2002. - Vol. 43. - P. 1565 - 1575.

207. Jellard, C. H. C.diphtheriae resistant to erythromycin and lincomycin. / C. H. Jellard, A. E. Lipinski // Lancet. - 1973. - Vol. 1. - P. 156.

208. Jin, D. J. Characterization of the termination phenotypes of rifampicin-resistant mutants / D. J. Jin, W. A. Walter, C. A. Gross // Journal of Molecular Biology. -1988. - Vol. 202. - P. 245 - 253.

209. Jin, D. J. RpoB8, a rifampicin-resistant termination-proficient RNA polymerase, has an increased Km for purine nucleotides during transcription elongation / D. J. Jin, C. A. Gross // The Journal of Biological Chemistry. - 1991. - Vol. 266. - P. 14478 - 14485.

210. Jung, S-O. Multilocus Sequence analysis of housekeeping genes and antigenic determinant genes in B. pertussis strains isolated in Korea / S-O. Jung, Y. M. Moon, H. Y. Sung, J. Y. Yu // Public Health Research Perspect. - 2011. - Vol. 2. -P. 115 - 126.

211. Kageyama, A. Nocardial infections in Japan from 1992 to 2001, including the first report of infection by Nocardia transvalensis / A. Kageyama, K. Yazawa, J. Ishikawa, K. Hotta, K. Nishimura, Y. Mikami // European Journal of Epidemiology. - 2004. - Vol. 19. - P. 383 - 389.

212. Kawamura, N. Participation of Rho-dependent transcription termination in oxidative stress sensitivity caused by an rpoB mutation / N. Kawamura, K. Kurokawa, T. Ito, H. Hamamoto, H. Koyama, C. Kaito, K. Sekimizu // Genes Cells. - 2005. - Vol. 10. - P. 477 - 487.

213. Kneen, R. The in-vitro susceptibilities of 88 toxigenic strains of C.diphtheriae isolated at the centre of tropical diseases between 1992 and 1996 / R. Kneen, N. T.

T. Hoa, C. Parry // Fourth International meeting of the European Laboratory working group on diphtheria, 1997. - P. 35.

214. Kneen, R. Penicillin vs. erythromycin in the treatment of diphtheria / R. Kneen, N. G. Pham, T. Solomon, T. M. Tran, T. T. Nguyen, B. L. Tran, J. Wain, N. P. Day, T. H. Tran, C. M. Parry, N. J. White // Journal of Clinical Microbiology. - 1998. -Vol. 27. - P. 845 - 850.

215. Kombarova, S. Rapid identification of Corynebacterium diphtheriae clonal group associated with diphtheria epidemic, Russian Federation / S. Kombarova, C. Kim, V. Melnikov, M. Reeves, O. Borisova, I. Mazurova, T. Popovic // Journal Infectious Diseases. - Vol. 7. - № 1. - 2001. - P. 133 - 136.

216. Kombarova, S. Monitoring the genes responsible for Сorynebacterium diphtheriae toxin production / S. Kombarova, O. Borisova, V. G. Melnikov, I. K. Mazurova // Proceedings of the Ninth international meeting of the European laboratory working group on diphtheria, ELWGD and Diphtheria surveillance network (DIPNET), 15 - 17 November 2006, Voliagmeni, Greece, 2006. - P. 65.

217. Kombarova, S. Diphtheria tox gene polymorphism in C diphtheriae strains isolated in Russia during 2002 - 2000 / S. Kombarova, I. Mazurova, O. Borisova, N. Gadua, T. Kornienko // Journal of Infectious Diseases. - 2010. - Vol. 14. - P. 396 - 397.

218. Leclercq, R. Mechanisms of Resistance to Macrolides and Lincosamides: Nature of the Resistance Elements and Their Clinical Implications / R. Leclercq // Clinical Infectious Diseases. - 2002. - № 34. - P. 482 - 492.

219. Lee, J. H. Identification and characterization of three new promotor/operators from Corynebacterium diphtheriae that are regulated by diphtheria toxin repressor (DtxR) and iron / J. H. Lee, T. Wang, K. Ault, J. Liu, M. P. Schmitt, R. K. Holmes // Infection and Immunity. - 1997. - Vol. 65. - № 10. - P. 4273 - 4280.

220. Linares, J. Changes in antimicrobial resistance, serotypes and genotypes in Streptococcus pneumoniae over a 30-year period / J. Linares, C. Ardanuy, R. Pallares, A. Fenoll // Clinical Microbiology and Infection. - 2010. - Vol. 16. - P. 402 - 410.

221. Maguire, B. A. Identification of a mutation conferring antibiotic dependence in Escherichia coli. // B. A. Maguire, D. G. Wild / In: 48th Annual Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC), 25-28 October 2008, Washington, DC. Washington, DC: ASM Press; 2008. - P. 124.

222. Maiden, M. C. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms / M. C. Maiden, J. A. Bygraves, E. Feil, G. Morelli, J. E. Russell, R. Urwin, Q. Zhang, J. Zhou, K. Zurth, D. A. Caugant, I. M. Feavers, M. Achtman, B. G. Spratt. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1999. - Vol. 95. - P. 3140 - 3145.

223. Maness, M. Multiple antibiotic resistance due to a single mutation in Neisseria gonorrhoeae / M. Maness, P. Sparling // The Journal of Infectious Diseases. -1973. - Vol. 128. - P. 321 - 330.

224. Maple, P. A. In vitro susceptibilities of toxigenic strains of C.diphtheriae isolated in northwestern Russia and surrounding areas to ten antibiotics / P. A. Maple, A. Efstratiou, G. Tseneva, Y. Rikushin, S. Deshevoi, M. Jahkola, J. Vuopio-Varkila, R. C. George // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 1994. - Vol. - 34. - № 6.

- P. 1037 - 1040.

225. Marston, Ch. Persistence of distinct Corynebacterim diphtheriae clonal group within two communities in the United States and Canada where diphtheria is endemic / Ch. Marston, F. Jameson, F. Cahoon, G. Lesaik, A. Golaz, M. Reeves, T. Popovic // Journal of Clinical Microbiology. - 2001. - Vol. 39. - № 4. - P. 1586

- 1590.

226. Mattos-Guaraldi, A. L. Cell surface components and adhesion in C.diphtheriae / A. L. Mattos-Guaraldi, L. C. D. Formiga, G. A. Pereira // Microbes and Infection. -2000. - Vol. 2. - P. 1507 - 1512.

227. Mattos-Guaraldi, A. L. Diphtheria remains a threat to health in developing world -an overview / A. L. Mattos-Guaraldi, L. O. Moreira, P. V. Damasco, Júnior R. Hirata // Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. - 2003. - Vol. 98. - P. 987 - 993.

228. Mazurova, I. K. Throat microflora in diphtheria carriers before and after antibiotic therapy / I. K. Mazurova, V. G. Melnikov, T. V. Platonova, S. J. Kombarova, O. J. Borisova, M. V. Kuznetsova // in abst. Fourth International meeting of the European Laboratory working group on diphtheria, 1997. - P. 28-29.

229. Mazurova, I. K. Characterization of non-toxigenic tox-bearing Corynebacterium diphtheriae the waning Russian epidemic / I. K. Mazurova, O. J. Borisova, S. J. Kombarova, V. G. Melnikov, T. V. Platonova, J. Reiss, C. Kim, T. Popovic // in abst. Fifth International meeting of the European Laboratory working group on diphtheria, 1998. - P. 33.

230. McEllistrem, M. C. Erythromycin-nonsusceptible Streptococcus pneumoniae in children, 1999-2001 / M. C. McEllistrem, J. M. Adams, K. Shutt, L. T. Sanza, R. R. Facklam, C. G. Whitney, J. H. Jorgensen, L. H. Harrison // Emerging Infections Diseases. - 2005. - Vol. 11. - P. 969 - 972.

231. McGee, L. Nomenclature of major antimicrobial-resistant clones of Streptococcus pneumoniae defined by the pneumococcal molecular epidemiology network / L. McGee, L. Mcdougal, J. Zhou, B. G. Spratt, F. C. Tenover, R. George, R. Hakenbeck, W. Hryniewicz, J. C. Lefevre, A. Tomasz, K. P. Klugman // Journal of Clinical Microbiology. - 2001. - Vol. 39. - P. 2565 - 2571.

232. McLauhlin, J. Antibiotic susceptibility patterns of recent isolates of C.diphtheriae / J. McLauhlin, S. Bickham, G. Wiggins, S. A Larsen, A. Balows, W. L. Jones // Applied Micribiology. - 1971. - Vol. 21. - № 5. - P. 844 - 851.

233. Melnikov, V. G. Molecular screening for the 'identification' of non-toxigenic tox bearing strains of Corynebacterium diphtheriae from the Russian Federation / V. G. Melnikov, A. De Zoysa, I. K. Mazurova, S. J. Kombarova, O. J. Borisova, K. H. Engler, A. Efstratiou // Proceedings of the Sixth International Meeting of the European Laboratory Working Group on Diphtheria, 21 - 24 June, Brussels, Belgium, 2000. - P. 60 - 61.

234. Melnikov, V. Etiological value of non-toxigenic tox-bearing (NTTB) Corynebacterium diphtheriae strains / V. Melnikov, S. Kombarova, O. Borisova,

I.K. Mazurova // Proceedings of the Seventh International meeting of the European Laboratory working group on diphtheria, Vienna, Austria. - 2002. - P. 80.

235. Melnikov, V. G. Kombarova S.Yu., Borisova O.Yu., Mazurova I.K. Etiological value of non-toxigenic tox bearing (NTTB) Corynebacterim diphtheriae strains. Programme and abstracts book of the seventh international meeting of the European laboratory working group on diphtheria, 12-14 June 2002: ed. by A. Efstratiou. - Vienna, 2002. - P. 80.

236. Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically // approved standard M7-A7, 7th ed., vol.26.-Clinical Laboratory Standards Institute. CLSI. - Wayne. - PA. - 2006. - 135p.

237. Mina, N. Canadian's first case of multi-drug resistant C.diphtheriae isolated from a skin abscess / N. Mina, T. Burdz, D. Wiebe, J. S. Rai, T. Rahim, F. Shing, L. Hoang, K. Bernard // Journal of Clinical Microbiology. - 2011. - Vol. 49. - № 11. P. 4003 - 4005.

238. Mokrousov, I. Efficent discrimination within Corynebacterim diphtheria clonal group by a noval macroarray-based method / I. Mokrousov, O. Narvskaya, E. Limeshenko, A. Vyazovaya // Journal of Clinical Microbiology. - 2005. - Vol. 43. -№ 4. - P. 662 - 668.

239. Mooi, F. R. Bordetella pertussis and vaccination: the persistence of a genetically monomorphic pathogen / F. R. Mooi // Infection Genetics and Evolution. - 2010. -Vol. 10. - № 1. - P. 36 - 49.

240. Moore, M. R. Population snapshot of emergent Streptococcus pneumoniae serotype 19A in the United States, 2005 / M. R. Moore, R. E. Jr. Gertz, R. L. Woodbury, G. A. Barkocy-Gallagher, W. Schaffner, C. Lexau, K. Gershman, A. Reingold, M. Farley, L.H. Harrison, J.L. Hadler, N.M. Bennett, A.R. Thomas, L. McGee, T. Pilishvili, A.B. Brueggemann, C.G. Whitney, J.H. Jorgensen, B. Beall // The Journal of Infectious Diseases. - 2008. - Vol. 197. № 7. - P. 1016 - 1027.

241. Mueller, U. G. AFLP genotyping and fingerprinting / U. G. Mueller, L. L. Wolfenbarger // Trends in Ecology s Evolution. - 1999. - Vol. 14. - № 10. - P. 389 - 394.

242. Nakao, H. Heterogeneity of diphtheria toxin gene, tox, and its regulatory element, dtxR, in Corynebacterim diphtheriae strains cousing epidemic diphtheria in Russia and Ukraine / H. Nakao, J. M. Pruckler, I. K. Mazurova, O. V. Narvskaya, T. Gushkevich, V. F. Marievski, A. N. Kravetz, B. S. Fields, I. K. Wachsmuth, T. Popovic // Journal of Clinical Microbiology. - 1996. - Vol. 34. - № 7. - P. 1711 -1716.

243. Nakao, H. Analysis of heterogeneity Corynebacterim diphtheriae toxin gene, tox, and its regulatory element, dtxR, by direct sequencing / H. Nakao, I. K. Mazurova, T. Glushkevich, T. Popovic // Research in Microbiology. - 1997. - Vol. 148. - № 1.

- P. 45 - 54.

244. Nakao, H. Development of a direct PCR assay for detection of the diphtheria toxin gene / H. Nakao, T. Popovic // Journal of Clinical Microbiology. - 1997. - Vol. 35.

- № 7. - P. 1651 - 1655.

245. Nash, K. A. Detection of rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis by use of a rapid, simple, and specific RNA/RNA mismatch assay / K. A. Nash, A. Gaytan, C.B. Inderlied // The Journal of Infectious Diseases. - 1997. - Vol. 176. -№ 2. - P. 533 - 536.

246. Newell, K. V. The RNA polymerase-binding protein RbpA confers basal levels of rifampicin resistance on Streptomyces coelicolor / K. V. Newell, D. P. Thomas, D. Brrekasis, M. S. Paget // Molecular Microbiology. - 2006. - Vol. 60. - P. 687 - 696.

247. Oh, K. J. Translocation of the catalytic domain of diphtheria toxin gene across planar phospholipids bilayers by its own T domain / K. J. Oh, L. Scnzel, R. J. Collier, A. Finkerlshtein // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1999. - Vol. 96. - № 15. - P. 8467 - 8470.

248. Okitsu N. Characterization of ermB Gene Transposition by Tn1545 and Tn917 in Macrolide-Resistant Streptococcus pneumoniae Isolates / N. Okitsu, S. Kaieda, H. Yano, R. Nakano, Y. Hosaka, R. Okamoto, T. Kobayashi, M. Inoue // Journal of Clinical Microbiology. - 2005. Vol. 43. - № 1. - P. 168 - 173.

249. Olive, D. M. Principles and application of methods for DNA-based typing of microbial organisms / D. M. Olive, P. Bean // Journal of Clinical Microbiology. -1999. - Vol. 37. - № 6. - P. 1661 - 1669.

250. Pallen, M. J. Polymerase chain reaction for screening clinical isolates of corynebacteria for the production of diphtheria toxin / M. J. Pallen, A. J. Hay, L. H. Puckey, A. Efstration // Journal of Clinical Pathology. - 1994. - Vol. 47. -№ 4. -P. 353 - 356.

251. Patey, O. Antibiotic susceptibilities 38 nontoxigenic strains of C.diphtheriae / O. Patey, F. Bimet, J. P. Emond, E. Estrangin, P. H. Riegel, B. Halioua, S. Dellion, M. Kiredjian // Third International meeting of the European Laboratory working group on diphtheria. Paris, 1996.

252. Patey, O. Clinical and molecular study of C.diphtheriae systemic infectious in France / O. Patey, F. Bimet, P. Riegel, B. Halioua, J. P. Emond, E. Estrangin, S. Dellion, J. M. Alonso, M. Kiredjian, A. Dublanchet, C. Lafaix // Journal of Clinical Microbiology. - 1997. - Vol. 35. - № 2. - p. 441 - 445.

253. Pedersen, A. H. Diphtheria on skid road, Seattle, Washington, 1972 - 1975 / A. H. Pedersen, J. Spearman, E. Troca, M. Bader, J. Harnisch // Public Health Reports. -1977. - Vol. 92. - № 4. - P. 336 - 342.

254. Perkins, A. E. Uncovering new metabolic capabilities of Bacillus subtilisusing phenotype profiling of rifampin-resistant rpoBmutants / A. E. Perkins, W. L. Nicholson // Bacteriology. - 2008. - Vol. 190. - P. 807 - 814.

255. Pereira, G. Antimicrobial resistance among Brazilian C.diphtheriae strains / G. Pereira, F. Pimenta, F. R. Santos, P. V. Damasco, Júnior R. Hirata, A. L. Mattos-Guaraldi // Memorias do Instuto Oswaldo Cruz. - 2008. - Vol. 103. - № 5. - P. 507 - 510.

256. Pihlajamaki, M. Macrolide-resistant Streptococcus pneumoniae and use of antimicrobial agents / M. Pihlajamaki, P. Kotilainen, T. Kaurila, T. Klaukka, E. Palva, P. Huovinen // Clinical Infectious Diseases. - 2001. - №33. - P. 483 - 488.

257. Pitt, T. L. Molecular bacteriology: a diagnostic tool for the millennium / T. L. Pitt, N.A. Saunders // Journal of Clinical Pathology. - 2000. - №53. - P. 71 - 75.

258. Podgorska, B. A rapid and simple method for detection of type II restriction endonucleases in cells of bacteria with high activity of nonspecific nucleases / B. Podgorska, G. Kujawska // Acta Biochimica. - 2012. - Vol. 12. - P. 5546 - 5548.

259. Pomerantz, R. T. The replisome uses mRNA as a primer after colliding with RNA polymerase / R. T. Pomerantz, M. O'Donnell // Nature. - 2008. - Vol. 456. - P. 762

- 766.

260. Popovic, T. Molecular epidemiology of diphtheria in Russia / T. Popovic, S. J. Kombarova, M. W. Reeves, H. Nakao, I. K. Mazurova, M. Wharton, I. K. Wachsmuth, J. D. Wenger // The Journal of Infectious Diseases. - 1997. - Vol. 174. - P. 1064 - 1072.

261. Popovic, T. Use of molecular subtyping to document long-term persistence of Corynebacterim diphtheriae in South Dakota / T. Popovic, Ch. Kim, J. Ries, M. Reeves, H. Nakao, A. Golaz // Journal of Clinical Microbiology. - 1999. - Vol. 37.

- № 4. - P. 1092 - 1099.

262. Popovic, T. Molecular epidemiology of diphtheria / T. Popovic, I. K. Mazurova, A. Efstratiou, J. Vuopio-Varkila, M. Reeves, A. Zoysa, T. Glushkevich, P. Grimont // The Journal of Infectious Diseases. - 2000. - Vol. 181. - P. 168 - 177.

263. Powis, J. In vitro antimicrobial susceptibilities of Streptococcus pneumoniae clinical isolates obtained in Canada in 2002 / J. Powis, A. McGeer, K. Green // Antimicrobial Agents and Chemother. - 2004. - №48. - P. 3305 - 3311.

264. Preziozi, M. P. Epidemiology of pertussis in a West African community before and after introduction of a widespread vaccination program / M. P. Preziozi, A. Yam, S. G. Wassilak, L. Chabirand, A. Simaga, M. Ndiaye, M. Dia, F. Dabis, F. Simondon // American Journal Epidemiology. - 2002. - Vol. 155. - № 10. - P. 891 -896.

265. Pukrittayakamee, S. Antimalarial effects of rifampin in Plasmodium vivax malaria / S. Pukrittayakamee, C. Viravan, P. Charoenlarp, C. Yeamput, R. J. Wilson, N. J. White // Antimicrobial Agents and Chemother. - 1994. - Vol. 38. - P. 511 - 514.

266. Ramaswamy, S. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis: 1998 update / S. Ramaswamy, J. M. Musser // Tuberculosis and Lung Disease. - 1998. - Vol. 79. - P. 3 - 29.

267. Ramdani-Bouguessa, N. Serotype distribution and antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae isolated in Algiers, Algeria // N. Ramdani-Bouguessa, K. Rahal // Antimicrobial Agents and Chemother. - 2003. - № 47. - P. 824 - 826.

268. Rappuoli, R. Molecular epidemiology of the 1984-1986 outbreak of diphtheria in Sweden / R. Rappuoli, M. Perugini, F. Enevold // The New England Journal of Medicine. - 1988. - Vol. 318. - № 1. - P. 12 - 14.

269. Regnault, B. Universal ribotyping method using a chemically labeled oligonucletide prope mixture / B. Regnault, F. Grimont, P. A. D. Grimont // Research Microbiology. - 1997. - Vol. 148. - № 8. - P. 649 - 659.

270. Roberts, M. C. Update on macrolide-lincosamide-streptogramin, ketolide, and oxazolidinone resistance genes / M. C. Roberts // FEMS Microbiology Letters. -2008. - Vol. 282. - P. 147 - 159.

271. Rockhill, R. Tetracycline resistance of C.diphtheriae isolated from diphtheria patients in Jakarta, Indonesia / R. Rockhill, Sumarmo, H. Hadiputranto, S. P. Siregar, B. Muslihun // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 1982. - Vol. 21.

- № 5. P. 842 - 843.

272. Rosato, A. Inducible macrolide resistance in C.jeikeium / A. Rosato, B. Lee, K. Nash // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2001. - Vol. 45. - № 7. - P. 1982

- 1989.

273. Saiki, R. K. Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia / R. K. Saiki, S. Scharf, F. Faloona, K. B. Mullis, H. A. Erlich, N. Arnheim // Science. - 1985. - Vol. 230. -№ 4732. - P. 1350 - 1354.

274. Sanger, F. DNA sequencing with chain terminating inhibitors / F. Sanger, S. Nicklen, A. R. Coulson // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1977. - № 74. - P. 5463 - 5467.

275. Saragea, A. Nouveal types phagoques dans le shema de lysotyple de C. diphtheriae / A. Saragea, P. Maximescu // Archives Romaines de patholgie Experimentale et de microbial. - 1969. - Vol. 28. - P. 1053 - 1058.

276. Savelkoul, P. H. M. Amplified-fragment length polymorphism analysis: the state of art / P. H. M. Savelkoul, H. J. M. Aarts, J. Haas, L. Dykshoorn, B. Duim, M. Otsen, W. Rademarker, L. Schoults, J.A. Lentstra // Journal of Clinical Microbiology. - 1999. - Vol. 37. - № 10. - P. 1661 - 1669.

277. Schaal, K. P. Actinomycete infections in humans - a review / K. P. Schaal, H-J. Lee // Gene. - 1992. - Vol. 115. - № 2 - 2. - P. 201 - 211.

278. Schiller, J. Plasmids in C.diphtheriae mediating erythromycin resistance / J. Schiller, N. Groman, M. Coyle // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 1983. -Vol. 18. - P. 814 - 821.

279. Schmitt, M. P. Cloning, sequencie, and footprint analysis of two promoter/operators from Corynebacterim diphtheriae that are regulated by the diphtheria toxin repressor (DtxR) and iron / M. P. Schmitt, R. K. Holmes // Bacteriology. - 1994. - Vol. 176. - № 4. - P. 1141 - 1149.

280. Schouls, L. M. Multiple-Locus Variable-Number Tandem Repeat analysis of Neisseria meningitidis yields groupings similar to those obtained by Multilocus Sequence Typing / L. M. Schouls, A. Van der Ende, M. Damen, I. Van de Pol // Journal of Clinical Microbiology. - 2006.- Vol. 44. - P. 1509 - 1518.

281. Sensi, P. Isolation and properties of rifomycin B and rifomycin complex / P. Sensi, A. M. Greco, R. Ballotta, I. Rifomycin // Antibiotics Annual. - 1959. - № 7. - P. 262 - 270.

282. Sensi, P. A new antibiotic of the rifomycin family / P. Sensi, R. Ballotta, M. Greco // Farmaco Scientifica. - 1960. - Vol. 15. - P. 228 - 234.

283. Severinov, K. Rifampicin region revisited. New rifampicin-resistant and streptolydigin-resistant mutants in the subunit of Escherichia coli RNA polymerase / K. Severinov, M. Soushko, A. Goldfarb, V. Nikiforov // The Journal of Biological Chemistry. - 1993. - Vol. 268. - P.14820 - 14825.

284. Severinov, K. RifR mutations in the beginning of the Escherichia coli rpoB gene / K. Severinov, M. Soushko, A. Goldfarb, V. Nikiforov // Molecular General Genetics. - 1994. - Vol. - 244. - № 2. - P. 120 - 126.

285. Siddiqi, N. Mycobacterium tuberculosis isolate with a distinct genomic identity overexpresses a tap-like efflux pump / N. Siddiqi, R. Das, N. Pathak, S. Banerjee, N. Ahmed, V.M. Katoch, S.E. Hasnain, S. E. Hasnain // Infection. - 2004. - Vol. 32. - № 2. - P. 109 - 111.

286. Silva, P. E. Characterization of P55, a multidrug efflux pump in Mycobacterium tuberculosis / P. E. Silva, F. Bigi, M. de la Paz Santangelo, M. I. Romano, C. Martin, A. Cataldi, J. A. Ainsa // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2001. - Vol. 45. - № 3. - P. 800 - 804.

287. Sola, C. Phylogeny reconstruction based on combained numerical analysis with IS 1081, IS 6110, VNTR, DR-based spoligotyping gugests the existence of two new phylogeographical clades / C. Sola, I. Filliol, E. Legrand, I. Mokrousov, N. Rastogi // Journal of Molecular Evolution. - 2002. - Vol. 53. - № 10. - P. 680 - 689.

288. Sonenshein, A. L. Isolation and characterization of rifampin-resistant and streptolydigin-resistant mutants of Bacillus subtilis with altered sporulation properties / A. L. Sonenshein, B. Cami, J. Brevet, R. Cote // Journal of Bacteriology. - 1974. - Vol. 120. - № 1. - P. 253 - 265.

289. Song, J. H. High prevalence of antimicrobial resistance among clinical Streptococcus pneumoniae isolates in Asia (an ANSORP study) / J. H. Song, S. I. Jung, K. S. Ko, N. Y. Kim, J. S. Son, H. H. Chang, H. K. Ki, W. S. Oh, J. Y. Suh, K. R. Peck, N. Y. Lee, Y. Yang, Q. Lu, A. Chongthaleong, C. H. Chiu, M. K. Lalitha, J. Perera, T. T. Yee , G. Kumarasinghe, F. Jamal, A. Kamarulzaman, N. Parasakthi, P. H. Van, C. Carlos, T. So , T. K. Ng, A. Shibl // Antimicrobial Agents and Chemother. - 2004. - Vol. 48. - № 6. - P. 2101 - 2107.

290. Spratt, B. G. A multilocus sequence typing sheme for Streptococcus pneumoniae: identification of clones associated with serious invasive disease / B. G. Spratt, M. C. Enright // Microbiology. - 1998. - Vol. 144. - P. 3049 - 3060.

291. Spratt, B. G. Bacterial population genetics, evolution and epidemiology / B. G. Spratt, M. C. Maiden // Philosophical Transactions of the Royal Society B. - 1999. Vol. - 354. - P. 701 - 710.

292. Summers, W. C. Bacteriophage discovered, in Felix d'Herelle and the Origins of Molecular Biology / W. C. Summers // Yale University Press, New Haven. - 1999.

- P. 47 - 59.

293. Tanaka, Y. Different rifampicin inactivation mechanisms in Nocardia and related taxa / Y. Tanaka, K. Yazawa, E. Dabbs, K. Nishikawa, H. Komaki, Y. Mikami, M. Miyaji, N. Morisaki, S. Iwasaki // Microbiology and Immunology. - 1996. - Vol. 40. - № 1. - P. 1 - 4.

294. Tao, X. Determination of the minimal essential nucleotide sequence for diphtheria tox repressor binding by in vitro affinity selection / X. Tao, J. R. Murphy // Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. - 1994. - Vol. 91. -№ 20. - P. 9646 - 9650.

295. Telenti, A. Detection of rifampin - resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis / A. Telenti, P. Imboden, F. Marchesi, D. Lowrie, S. Cole, M. J. Colston, L. Matter, K. Schopfer, T. Bodmer // The Lancet. - 1993. - Vol. 341. - P. 647 - 650.

296. Telenti, A. Genetics of drug resistance in tuberculosis / A. Telenti // Clinics in Chest Medicin. - 1997. - Vol. 18. - P. 55 - 64.

297. Tenover, F. C. How to select and interpret molecular strain typing methods for epidemiological studies of bacterial infections: a review for healthcare epidemiologists / F. C. Tenover, R. D. Arbeit, R. V. Goering // Infection Control and Hospital Epidemiology. - 1997. - Vol. 18. - № 6. - P. 426 - 439.

298. Tiemei, Z. Resistance phenotypes and genotypes of erythromycin-resistant Streptococcus pneumoniae isolates in Beijing and Shenyang, China / Z. Tiemei, F. Xiangqun, L. Youning // Antimicrob Agents Chemother. - 2004. - № 48. - P. 4040

- 4041.

299. Titov, L. Biological properties of non-toxigenic Corynebacterim diphtheriae isolates circulating in Belarus (1996-1997) / L. Titov, V. Kolodkina, A. Dronina,

P. Grimont, C. Andronescu // Programme and abstracts book of the sixth international meeting of the European laboratory working group on diphtheria, 2124 June, 2000, Brussels, 2000. - P. 59.

300. Titov, L. Genotypic and phenotypic characterizations of Corynebacterim diphtheriae starins isolated from Belarus during an epidemic period / L. Titov, V. Kolodkina, A. Dronina, F. Grimont, P. Grimont, M. Lejay-Collin, A. Zoysa, C. Andronescu, A. Diadonescu, M. Byanca, A. Efstratiou // Journal of Clinical Microbiology. - 2003. - Vol. 41. - № 3. - P. 1285 - 1288.

301. Tupin, A. Resistance to rifampicin: at the crossroads between ecological, genomic and medical concerns / A. Tupin, M. Gualtieri, F. Roquet-Baneres, Z. Morichaud, K. Brodolin, J. P. Leonetti // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2010. - Vol. 35. - 6. P. 519 - 523.

302. Tyler, K.D. Factors affecting reliability and reproducibility of amplification-based DNA fingerprinting of representative bacterial pathogens / K. D. Tyler, G. Wang, S. D. Tyler, W. M. Jonson // Journal of Clinical Microbiology. - 1997. - Vol. 35. -№ 2. - P. 339 - 346.

303. van der Zee, A. Dynamics of the population structure of Bordetella pertussis as measured by IS1002-associated RFLP: comparison of pre- and post-vaccination strains and global distribution / A. van der Zee, S. Vernooij, M. Peeters, J. van Embden, F. R. Mooi // Microbiology. - 1996. - Vol. 142. - P. 3479 - 3485.

304. van Loo, I. H. M. Multilocus sequence typing of Bordetella pertussis based on surface protein genes / I. H. M. van Loo, K. J. Heuvelman, A. J. King, F. R. Mooi // Journal of Clinical Microbiology. - 2002. - Vol. 40. - P.1994 - 2001.

305. Vassylyev, D. G. Structural basis for transcription elongation by bacterial RNA polymerase / D. G. Vassylyev, M. N. Vassylyeva, A. Perederina, T. H. Tahirov, I. Artsimovitch // Nature. - 2007. - Vol. 448. - P. 157 - 162.

306. Vigliotta, G. Natural merodiploidy involving duplicated rpoB alleles affects secondary metabolism in a producer actinomycete / G. Vigliotta, S. M. Tredici, F. Damiano, M. R. Montinaro, R. Pulimeno, R. di Summa, D. R. Massardo, G. V. Gnoni, P. Alifano // Molecular Microbiology. - 2005. - Vol. 55. - P. 396 - 412.

307. Viguetti, S. Multilocus sequence types of invasive C. diphtheria isolated in the Rio de Janeiro urban area, Brazil / S. Viguetti, L. Pacheco, L. Santos S.C. Soares, F. Bolt, A. Baldwin, C. G. Dowson, M. L. Rosso, N. Guiso, A. Miyoshi, R. Jr. Hirata, A. L. Mattos-Guaraldi, V. Azevedo // Epidemiology and Infection. - 2012. - Vol. 140. - № 4. - P. 617 - 620.

308. Villain-Guillot, P. Progress in targeting bacterial transcription / P. Villain-Guillot, L. Bastide, M. Gualtieri, J-P. Leonetti // Drug Discovery Today. - 2007. - Vol. 12. - № 5 - 6. - P. 200 - 208.

309. Volozhantsev, N. V. Mechanism of blockage of tox gene expression in NTTB Corynebacterim diphtheriae strains and reactivation of the 'silent' tox gene / N. V. Volozhantsev, V. M. Bannov, V. M. Krasilnikova, A. Efstratiou // Programme and abstracts book of the eighth international meeting of the European laboratory working group on diphtheria, ELWGD and Diphtheria surveillance network (DIPNET), 16-18 June 2004: ed. by A. Efstratiou, Copenhagen, 2004. - P. 41.

310. von Hunolstein, C. Penicillin tolerance amongst non-toxigenic C. diphtheriae isolated from cases of pharyngitidis / C. von Hunolstein, F. Scopetti, A. Efstratiou, K. Engler // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2002. - Vol. 50. - № 1. - P. 125 - 128.

311. von Hunolshtein, C. Molecular epidemiology Corynebacterium diphtheriae and Corynebacterium ulcerans strains isolated in Italy during the 1993 / C. von Hunolshtein, G. Alborone, F. Scopetti, M. Pataracchia, R. La Valle, F. Franchi, L. Paccaiani, A. Mancra, A. Giammanco, S. Farinelli, K. Engler, A. Zoysa, A. Efstratiou // Molecular Microbiology. - 2003. - Vol. 52. - P. 181 - 188.

312. Vos, P. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting / P. Vos, R. Hogers, M. Bleeker // Nucleic Acids Research. - 1995. - Vol. 23. - № 21. - P. 4407 - 4414.

313. Wagner, K. Diphtheria in postepidemic period, Europe, 2000 - 2009 / K. Wagner, J. White, I. Lucenko, D. Mercer, N. S. Crowcroft, S. Neal, A. Efstratiou // Emerging Infectious Diseases. - 2012. - Vol. 18. - № 2. - P. 217 - 225.

314. Wang, Z. Characterization of mutations that inactivate the diphhthera toxin repressor gene (dtxR) / Z. Wang, M. P. Schmitt, R. K. Holmes // Infection and Immunity. - 1994. - Vol. 62. - № 5. - P. 1600 - 1608.

315. Wauters, G. Distribution of Nocardia species in clinical samples and their routine rapid identification in the laboratory / G. Wauters, V. Avesani, J. Charlier, M. Janssens, M. Vaneechoutte, M. Delmee // Journal of Clinical Microbiology. - 2005.

- Vol. 43. - № 6. - P. 2624 - 2628.

316. A. Wegrzyn, Differential inhibition of transcription from sigma70- and sigma32-dependent promoters by rifampicin / A. Szalewska-Palasz, A. Blaszczak, K. Liberek, G. Wegrzyn // FEMS Microbiology Letters. - 1998. - Vol. 440. - № 1 - 2.

- P. 172 - 174.

317. Welsh, J. Fingerprintig genomes using PCR with arbitrary primers / J. Welsh, M. F. McClelland // Nucleic Acids Research. - 1990. - Vol. 18. - № 24. - P. 7213 -7218.

318. Weiss, M. S. Structure of the isolated catalytic domain of diphtheria toxin / M. S. Weiss, S. R. Dlanke, R. J. Collier, D. Eisenberg // Biochemistry. - 1995. - Vol. 34.

- № 3. - P. 773 - 781.

319. Welch, H. Penicillin : A guide to antibiotic therapy. Medical Encyclopedia / H. Welch. - Inc : New York, 1959. - 48 p.

320. Wierzbowski, A. K. Molecular epidemiology and prevalence of macrolide efflux genes mef(A) and mef(E) in Streptococcus pneumoniae obtained in Canada from 1997 to 2002 / A. K. Wierzbowski, D. Swedlo, D. Boyd, M. Mulvey, K. A. Nichol, D. J. Hoban, G. G. Zhanel // Antimicrobial Agents and Chemother. - 2005. - Vol. 49. - № 3. - P. 1257 - 1261.

321. Williams, J. G. K. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers / J. G. K. Williams, A. R. Hubelic, K. J. LiVar, J. A. Rafalski, S.V. Tunsey // Nucleic Acids Research. - 1990. - Vol. 18. - P. 6531 - 6535.

322. Windorfer, A. Diphtherie eine schwelende Gefahr / A. Windorfer // Therapiewoche. - 1976. - Vol. 26. - № 47. - P. 7894 - 7904.

323. Zakikhany, K. Diphtheria in Europe: current problems and new challenges / K. Zakikhany, A. Efstratiou // Future Microbiology. - 2012. - Vol. 7. - № 5. - P. 595 -607.

324. Zoysa, A. Molecular characterization of diphtheria toxin repressor (dtxR) genes present in nontoxigenic Corynebacterim diphtheriae strains isolated in the United Kingdom / A. Zoysa, A. Efstratiou, P. H. Hawkey // Journal of Clinical Microbiology. - 2005. - Vol. 43. - № 1. - P. 223 - 228.