Пейзаж энтеровирусов у детей с острой кишечной инфекцией тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.02, кандидат наук Фомина, Светлана Григорьевна
- Специальность ВАК РФ03.02.02
- Количество страниц 142
Оглавление диссертации кандидат наук Фомина, Светлана Григорьевна
Оглавление
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
I ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1 Открытие энтеровирусов человека
2 Современная классификация энтеровирусов человека
3 Молекулярно-биологическая характеристика энтеровирусов
3.1 Структура вириона
3.2 Структура генома
3.3 Вирусные белки
3.4 Взаимодействие энтеровирусов с клеткой хозяина. Репликативный цикл
3.5 Эволюция энтеровирусов
4 Характеристика клинических и эпидемиологических проявлений энтеровирусной инфекции
4.1 Клинические проявления энтеровирусной инфекции
4.2 Эпидемиологические аспекты энтеровирусной инфекции
II МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1 Исследуемые объекты
2 Обнаружение и типирование РНК энтеровирусов методом ОТ-ПЦР
3 Определение нуклеотидной последовательности амплифицированных фрагментов кДНК
4 Статистический анализ результатов
III РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
1 Выявление энтеровирусов у детей, госпитализированных с
ОКИ
1.1 Разработка способа идентификации энтеровирусов геногрупп
I и II с использованием ОТ-ПЦР
1.2 Анализ частоты обнаружения энтеровирусов
1.3 Анализ циркуляции неполиомиелитных энтеровирусов в г. Н. Новгороде
1.3.1 Многолетняя динамика циркуляции
1.3.2 Годовая динамика циркуляции
1.4 Анализ частоты обнаружения неполиомиелитных энтеровирусов у детей с ОКИ разного возраста
2 Спектр неполиомиелитных энтеровирусов, выявленных у детей с ОКИ
2.1 Типовое разнообразие неполиомиелитных энтеровирусов
2.2 Видовое распределение неполиомиелитных энтеровирусов
3 Генетическое разнообразие и филогенетические взаимоотношения штаммов неполиомиелитных энтеровирусов, выявленных у детей с ОКИ и при других формах энтеровирусной инфекции
3.1 Энтеровирусы вида А
3.1.1 Вирус Коксаки А16
3.1.2 Вирус Коксаки А2
3.2 Энтеровирусы вида В
3.2.1 Вирус Коксаки А9
3.2.2 Вирус ЕСН06
3.3 Неполиомиелитные энтеровирусы вида С. Вирус Коксаки
А22
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
4 СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
а.о. - аминокислотные остатки
дНТФ - дезоксинуклеозидтрифосфаты
КА - вирус Коксаки А
KB - вирус Коксаки В
кДа - килодальтон
кДНК - комплементарная ДНК
и.о. - нуклеотидные основания
НПЭВ - неполиомиелитные энтеровирусы
НТР - нетранслируемый регион генома
ОГЭ - острый гастроэнтерит
овп - острый вялый паралич
ОКИ - острая кишечная инфекция
опв - оральная полиомиелитная вакцина
ОРС - открытая рамка считывания
ОТ-ПЦР - обратная транскрипция/полимеразная цепная реакция
пв - полиовирус
п.н. - пара нуклеотидов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РНК - рибонуклеиновая кислота
см - серозный менингит
т - триангуляционное число
эв - энтеровирус
эви - энтеровирусная инфекция
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
ECHO - (Enteric Cytopathogenic Human Orphans) - эховирус
IRES - (Internal Ribosomal Entry Site) - внутренний сайт связывания с
рибосомой
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Вирусология», 03.02.02 шифр ВАК
Молекулярно-генетический мониторинг носительства неполиомиелитных энтеровирусов в анализе и прогнозе уровня заболеваемости энтеровирусным менингитом в условиях мегаполиса2017 год, кандидат наук Устюжанин, Александр Владимирович
Характеристика энтеровирусов, циркулирующих среди населения и выделенных из объектов окружающей среды2021 год, кандидат наук Канаева Ольга Ильинична
Роль унифицированной системы вирусологического мониторинга в эпидемиологическом надзоре за полиомиелитом и энтеровирусными инфекциями в крупном промышленном регионе2013 год, кандидат наук Снитковская, Татьяна Эдуардовна
Роль рекомбинации и межвидового перехода в возникновении циркулирующих вариантов энтеровирусов2024 год, кандидат наук Шустова Елена Юрьевна
Молекулярная эволюция и сероэпидемиология энтеровируса 71-го типа на территории Российской Федерации2013 год, кандидат наук Ахмадишина, Людмила Васильевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Пейзаж энтеровирусов у детей с острой кишечной инфекцией»
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность проблемы. Энтеровирусы (род Enterovirus, семейство Picornaviridae, порядок Picornavirales) играют важную роль в инфекционной патологии человека, вызывая заболевания, различающиеся по клиническим проявлениям и тяжести течения: от бессимптомного носительства до тяжелых заболеваний, таких как полиомиелит, серозный менингит и энцефалит, геморрагический конъюнктивит, параличи и т. д. [205]. В последнее десятилетие активизация эпидемического процесса энтеровирусной (неполно) инфекции отмечается во многих странах мира. Нестабильная ситуация по заболеваемости ЭВИ в Российской Федерации обусловлена регистрацией эпидемических очагов с групповыми случаями заболеваний, сезонными эпидемическими подъемами заболеваемости, возможностью завоза энтеровирусов с сопредельных территорий и государств, а так же отсутствием специфических методов профилактики ЭВИ [29; 41].
Энтеровирусы человека представлены более чем 100 генетически гетерогенными серотипами, которые на основании молекулярно-биологических свойств разделены на 4 вида: ЭВ-А (Коксаки А 2-8, 10, 12, 14, 16; ЭВ 71, 76, 89-91, 114), ЭВ-В (Коксаки В1-6; Коксаки А9; ECHO 1-7, 9, 1121, 24-27, 29-33; ЭВ 69, 73-75, 77-88, 93, 97, 98, 100, 101, 106, 107, 110), ЭВ-С (полиовирусы типа 1-3; Коксаки А1, 11, 13, 17, 19-22, 24; ЭВ 95, 96, 99, 102, 104, 105, 109, 113, 116) и ЭВ-D (ЭВ 68, 70, 94, 111) [219]. Множество типов неполиомиелитных энтеровирусов, недостаток знаний о масштабах их распространения, спектре эпидемически значимых серотипов и генетических вариантов, доминирующих в определенное время в конкретном географическом районе, обуславливают актуальность постоянного слежения за циркуляцией ЭВ среди населения с использованием молекулярно-генетических технологий.
В зарубежных странах мира контроль распространения НПЭВ базируется на исследовании проб от больных со всеми клиническими формами ЭВИ, в том числе и с острой кишечной инфекцией [58; 60; 61; 80; 81; 131; 137; 201; 235; 259]. В Российской Федерации наблюдение за циркуляцией неполиомиелитных энтеровирусов проводят в рамках введенного в действие в 2006 г. эпидемиологического надзора за энтеровирусной (неполно) инфекцией. Контроль циркуляции осуществляют при анализе проб из объектов внешней среды и клинического материала от больных с ЭВИ и подозрением на ЭВИ с тяжелой специфической клиникой (в первую очередь с нейроинфекциями) [53]. Значимость обследования детей с диарейными заболеваниями для мониторинга циркуляции НПЭВ не показана. В связи с этим представляло научно-практический интерес проведение исследований, направленных на выявление и молекулярно-генетическую характеристику НПЭВ у детей с проявлениями ОКИ.
Цель исследования: изучение пейзажа энтеровирусов у детей с острой кишечной инфекцией в Нижегородской области с использованием молекулярно-генетических методов исследования.
Задачи исследования:
1. С использованием молекулярно-генетических методов детекции определить частоту обнаружения энтеровирусов (в том числе неполиомиелитных энтеровирусов и вирусов полиомиелита) у детей, госпитализированных с острой кишечной инфекцией в г. Н. Новгороде.
2. Провести анализ циркуляции неполиомиелитных энтеровирусов в многолетней и годовой динамике. Определить частоту их обнаружения у детей с острой кишечной инфекцией разного возраста.
3. Установить первичную структуру серотипового участка гена УР1 энтеровирусов.
р
\
7
4. Охарактеризовать спектр серотипов и видовое распределение неполиомиелитных энтеровирусов.
5. Изучить генетическое разнообразие и филогенетические взаимоотношения штаммов неполиомиелитных энтеровирусов одного типа, выявленных у детей с острой кишечной инфекцией и при других формах энтеровирусной инфекции.
Научная новизна работы:
Подобран и применен на практике оригинальный набор олигонуклеотидных праймеров, позволяющий проводить выявление РНК энтеровирусов методом ОТ-ПЦР с одновременной дифференциацией на 2 геногруппы по 5"-НТР генома. Новизна предложенного способа выявления и дифференциации энтеровирусов подтверждена патентом на изобретение № 2441917 от 10.02.2012. Способ используется при проведении научно-исследовательской работы по мониторингу энтеровирусов в ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора (Акт внедрения от 25.09.13).
Впервые с использованием молекулярно-генетических методов исследования на примере г. Н. Новгорода показана частота обнаружения энтеровирусов у детей с ОКИ, которая составила 8,0% (2,6-18,2%), из них НПЭВ были выявлены в 7,0% случаев (2,3-15,0%).
Установлены нуклеотидные последовательности области УР1 генома 72-х новых изолятов НПЭВ, которые депонированы в вепВапк под номерами 1X139774 - Ж139810, 1X139812 -Ж139815,1X139817 - Ж139827,1X139835, 1X139836, 1X139841 -1X139844, 10518447 - 10518448, 10518453, 1(^518455, 1К588564 - Ж588567, что расширяет международную базу нуклеотидных последовательностей гена, кодирующего белок капсида энтеровирусов.
Впервые охарактеризован пейзаж НПЭВ, обнаруженных у детей с ОКИ в Нижегородской области, представленный как минимум 29-ю типами вируса; показано их видовое распределение (ЭВ вида А - 37,3%, ЭВ вида В -
46,3% и ЭВ вида С - 16,4%). Впервые в г. Н. Новгороде идентифицирован ЭВ116.
Продемонстрирована генетическая гетерогенность вирусов КА2, КА16, КА9, ЕСН06, которая выразилась в каждом случае существованием нескольких филогенетических групп с уровнем различий в нуклеотидных последовательностях области VP1 генома, составившим 4,3-21,5%.
Получены новые знания о генетическом разнообразии вируса Коксаки А22, который представлен двумя геновариантами с уровнем дивергенции нуклеотидных последовательностей области VP1 генома 8,5-13,2%, аминокислотных последовательностей - 5,4-9,8%.
Практическая значимость работы:
Материалы диссертации использованы при подготовке информационных и методических документов:
1. Информационно-методическое письмо «Пейзаж неполиомиелитных энтеровирусов, циркулирующих среди населения ПФО» (письмо ФС Роспотребнадзора от 31.10.11 №01/13784-1-26).
2. Методические рекомендации «Молекулярно-генетические исследования при мониторинге энтеровирусной инфекции: III. Генотипирование энтеровирусов с использованием секвенирования области VP1 и 5'НТР генома», утвержденные на региональном уровне (письмо ФС Роспотребнадзора от 23.08.12 №01/9527-12-26).
3. Аналитический обзор «Энтеровирусы у детей с гастроэнтеритом». Рекомендован для использования в учреждениях Роспотребнадзора в разделе «Координационный центр профилактики полиомиелита и энтеровирусной (неполно) инфекции» (письмо ФЦГиЭ Роспотребнадзора от 20.12.11 №09ФЦ/6327 на №01/15759-1-26 от 14.12.11 ФС Роспотребнадзора).
4. Результаты исследований на энтеровирусы оперативно сообщались в инфекционный стационар и ежемесячно направлялись в Управление
Роспотребнадзора по Нижегородской области, где использовались в официальной статистике инфекционной заболеваемости в Нижегородской области (Акт внедрения 08/16051 от 25.09.13).
Основные положения, выносимые на защиту:
1. Энтеровирусы обнаруживаются у детей с ОКИ с частотой 2,6-18,0%, преимущественно в летне-осенние месяцы, достоверно чаще у детей в возрасте от 3 до 7 лет.
2. Пейзаж энтеровирусов, наблюдаемый у детей с ОКИ, включает вакцинные вирусы полиомиелита и множество генетически гетерогенных типов неполиомиелитных энтеровирусов видов А, В и С.
3. Вирус Коксаки А22 имеет как минимум два генетических варианта с уровнем дивергенции нуклеотидных последовательностей области VP1 генома 8,5-13,2%, аминокислотных последовательностей - 5,4-9,8%.
Апробация работы:
Основные положения диссертации доложены и обсуждены:
• на научно-практической конференции молодых ученых и специалистов научно-исследовательских учреждений Роспотребнадзора «Биологическая безопасность в современном мире» (п. Оболенск, Московской области, 2009 г.).
• на научно-практической конференции молодых ученых «Инновационные технологии в противоэпидемической защите населения», посвященной 90-летнему юбилею академика РАМН И.Н. Блохиной в рамках 12-го международного медицинского форума «Модернизация здравоохранения - основа повышения качества и доступности медицинской помощи», Нижний Новгород, 19-21 апреля 2011 г., H.H., выставка «Медицина+».
• на IV Ежегодном Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням, Москва, 26-28 марта 2012 г.
• на научно-практической конференции Роспотребнадзора «Научное обеспечение противоэпидемической защиты населения», Региональное совещание «Программное обеспечение учета, анализа и контроля инфекционной заболеваемости в Приволжском федеральном округе» (в рамках 13-го международного медицинского форума «Стандарты и порядки медицинской помощи - основа повышения эффективности здравоохранения»), Нижний Новгород, 11 апреля 2012 г.
• на Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Фундаментальные и прикладные аспекты риска здоровью населения», г. Пермь, 16-18 мая 2012 г.
• на заседаниях Ученого Совета Нижегородского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. Блохиной и проблемных научно-практических семинарах института.
• на заседаниях Совета молодых ученых Нижегородского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. Блохиной.
Объем и структура диссертации:
Материалы диссертации изложены на 142 страницах машинописного текста. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, собственных результатов и их обсуждения, заключения, выводов и указателя литературы, включающего 284 источников литературы отечественных и зарубежных авторов. Диссертация иллюстрирована 19 рисунками и 10 таблицами.
По результатам диссертации опубликовано 11 печатных работ, в том числе 4 в ведущих рецензируемых научных журналах, рекомендованных ВАК.
Работа выполнена в качестве фрагментов двух научных тем Нижегородского НИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной: 1. «Этиология вирусных кишечных инфекций у детей» (per. № 01.2.003 12243) к договору с Роспотребнадзором № 82-Д от 31 декабря 2005 г.
«Разработка комплексных мероприятий по диагностике, профилактике, лечению и эпиднадзору за актуальными инфекциями» (2006-2010 гг.); 2. «Молекулярно-генетический мониторинг циркуляции энтеровирусов и вирусов, ассоциированных с острым гастроэнтеритом» (per. № 01.2.011 75711 от 05.10.2011 г.), выполняемой в рамках отраслевой научно-исследовательской программы «Научные исследования и разработки с целью обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия и снижения инфекционной заболеваемости в Российской Федерации» (2011-2015 гг.).
На разных этапах в работе приняли участие JI.H. Голицына, Л.Б. Луковникова, Н.В. Епифанова, О.В. Парфенова - автор приносит им искреннюю благодарность. Автор выражает глубокую признательность за неоценимую помощь в выполнении работы научному руководителю д.б.н., профессору H.A. Новиковой.
I ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1 Открытие энтеровирусов человека
Более ста лет назад в официальном протоколе заседания Общества венских врачей от 18 декабря 1908 г. было опубликовано сообщение доктора Landsteiner о том, что ему совместно с доктором Popper удалось воспроизвести паралитическое заболевание у двух обезьян, введя им фекальный фильтрат от больного человека. В статье с подробным описанием опытов по выделению возбудителя было сделано предположение о вирусной природе заболевания, однако название «полиовирус» вошло в употребление лишь примерно с 1955 г. С помощью нейтрализующих антисывороток было установлено существование трех серотипов полиовирусов [5; 205].
Изучение НПЭВ началось после 1948 г., когда Dalldorf и Sikles выделили на мышах-сосунках новый вирус из кала двух детей с параличами во время эпидемии полиомиелита в г. Коксаки (Coxsackie), штат Нью-Йорк, США. Этот вирус и сходные с ним вирусы были классифицированы как вирусы группы Коксаки А. Почти одновременно была открыта группа вирусов Коксаки В, также выделенных первоначально на мышах-сосунках от детей с непаралитическим полиомиелитом и СМ [5; 25; 205].
В 1955 г. на культурах клеток из фекалий здоровых детей были выделены ЭВ, составившие еще одну группу. Новые вирусы были названы кишечными цитопатогенными человеческими сиротскими (Enteric Cytopathogenic Human Orphans - ECHO), поскольку связь этих НПЭВ с заболеваниями в то время не была установлена [5; 205].
2 Современная классификация энтеровнрусов человека
ЭВ входят в род Enterovirus, семейство Picornaviridae, порядок Picornavirales и в настоящее время представлены более чем 100 серотипами [219].
Первоначально ЭВ были классифицированы на основе их антигенных свойств и патогенности для человека и лабораторных животных на ПВ, КА и KB, и ECHO. Однако вскоре стало ясно, что такая классификация не совершенна. Некоторые штаммы ЭВ отклонялись от основной характеристики прототипных штаммов, обладали промежуточной характеристикой. Во избежание путаницы было предложено новые серотипы ЭВ не относить к какой-либо группе, а присваивать им последующий порядковый номер, начиная с ЭВ68 [5; 77; 130; 180; 192; 196]. Кроме того, с использованием вирусологических методов было выяснено, что некоторые вирусы, отнесенные к ЭВ, являются представителями других родов и семейств. Вирус ECHO 10 является реовирусом; вирус ЕСН028 -риновирусом; вирус ЕСН034 - вариантом вируса КА24. Вирус гепатита А, классифицировавшийся некоторое время как ЭВ72, выделен в самостоятельный род Hepatovirus. КА23 был реклассифицирован как ЕСН09, ECHO типов 1 и 8 признаны разными штаммами одного серотипа [130].
В 90-х годах прошлого века с развитием молекулярной биологии была предложена новая классификация ЭВ, базирующаяся на молекулярно-биологических свойствах вирусов [78; 130; 224]. На основе сравнения нуклеотидных и аминокислотных последовательностей капсидных белков VP1 и VP2 ЭВ были разделены на четыре генетических кластера: кластер А (КА16-подобные вирусы: вирусы Коксаки А типов 2-8, 10, 12, 14, 16 и ЭВ71), кластер В (КВ-подобные вирусы: вирусы КА9, Коксаки В типов 1-6, все ECHO), кластер С (ПВ-подобные вирусы: ПВ типов 1-3, вирусы КА типов 1, 11, 13, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 24) и кластер D (ЭВ68 и ЭВ70). Попарное выравнивание и филогенетический анализ последовательностей VP2, проведенные внутри этих групп, показали не абсолютную корреляцию
капсидного белка VP2 с серотипом вируса (вирусы, принадлежащие к одному серотипу, часто кластеризовались раздельно) [195]. В тоже время сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей VP1 ЭВ известных серотипов показало полную корреляцию последовательностей капсидного белка с серотипом вируса, причем разные штаммы одного и того же серотипа всегда являются монофилетичными и имеют явные отличия от штаммов гетерологичных серотипов [192]. Основываясь на знаниях того, что VP1 является главным иммунодоминантным капсидным белком и содержит важные серотип-специфические сайты нейтрализации, Oberste с соав. в 1999 году предложили для идентификации энтеровирусных изолятов метод «молекулярного серотипирования». Метод базируется на ОТ-ПЦР амплификации участка гена VP1 с последующим определением его нуклеотидной последовательности, которая затем сопоставляется с доступными в GenBank последовательностями гена VP1 всех серотипов ЭВ. Несомненно, этот метод с успехом может заменить классический метод типирования ЭВ на основе реакции нейтрализации. Молекулярное типирование серологически нетипируемых штаммов ЭВ привело к открытию большого числа новых типов ЭВ. С 2001 года было выявлено 29 новых энтеровирусных типов (ЭВ 73-91, 92-102) [193; 197]. Количество новых серотипов ЭВ продолжает расти.
На сегодняшний день к ЭВ относят 3 серотипа ПВ (1-3), 6 серотипов вирусов Коксаки В (1-6), 21 серотип вирусов Коксаки А (1-14, 16, 17, 19-22, 24), 28 серотипов ECHO (1-7, 9, 11-21, 24-27, 29-33) и 43 серотипа ЭВ (68-71, 73-91, 93-102, 104-107, 109-111, 113, 114, 116). Вирус КА15 был реклассифицирован как штамм серотипа вируса KAI 1, а вирус КА18 признан штаммом серотипа вируса КА13. Вирусы ECHO 22 и 23, относившиеся ранее к ЭВ, на основании структурно-функциональных особенностей генома, выделены в самостоятельный род Parechovinis и названы парэховирус 1 и 2, соответственно [219].
Таблица 1
Генетическая классификация энтеровирусов человека
[130; 219; 224]
Вид энтеровируса Геногруппа по 5'-НТР генома Представители
А I Коксаки А 2-8, 10, 12, 14, 16 ЭВ 71, 76, 89-91, 114
В I Коксаки В1-6 Коксаки А9 ECHO 1-7, 9, 11-21, 24-27, 29-33 ЭВ 69, 73-75, 77-88, 93, 97, 98, 100, 101, 106, 107, 110
С II ПВ 1-3 Коксаки А1, 11, 13, 17, 19-22, 24 ЭВ 95, 96, 99, 102, 104, 105, 109, 113, 116
D II ЭВ 68, 70, 94, 111
На основании молекулярно-биологических свойств ЭВ были разделены на 4 вида: А, В, С и Б (табл. 1).
Три серотипа ПВ, ранее выделявшихся в отдельный вид, теперь относят к виду С [219]. При анализе нуклеотидных последовательностей 5"- НТР генома ЭВ были разделены на 2 геногруппы. Геногруппа I включает вирусы вида А и В, геногруппа II - вирусы вида С и Б [130; 224].
3 Молекулярно-биологнческая характеристика энтеровирусов
3.1 Структура внриона
Вирионы ЭВ, так же как и у всех пикорнавирусов, представляют собой сферу диаметром приблизительно 30 нм, лишены внешней оболочки и обладают икосаэдрической симметрией. Частицы очень просты в строении, они состоят из белковой оболочки, окружающей геномную РНК. ЭВ кислотоустойчивы и сохраняют инвазионную способность при pH 3.0 и ниже, что обеспечивает им выживание в желудочно-кишечном тракте и внешней среде [225].
Капсид ЭВ состоит из 60 белковых структурных субъединиц, образующих поверхностную решетку с Т=1 (псевдо Т=3). Базовая структурная единица капсида полного, или «зрелого», вириона ЭВ — протомер, который содержит по одной копии белков VP1, VP2, VP3 и VP4 [225; 246].
Белки VP1, VP2 и VP3 формируют оболочку вириона, а белок VP4 лежит внутри вирусной частицы и тесно контактирует с геномной РНК. VP1, VP2 и VP3 не имеют гомологичных последовательностей, однако все три белка имеют одну и ту же топологию: восьмискрученная антипараллельно-уложенная нить белка формирует b-бочонок, представляющий собой клиновидную структуру, сделанную из двух четырехскрученных антипараллельно-уложенных b-нитей (рис. 1). Одна b-нить формирует стенку этой структуры, а вторая, изгибающаяся в центре, формирует стенку и дно. Форма клина облегчает упаковку основных элементов конструкции, формируя плотную, твердую белковую оболочку. Главные отличия между VP1, VP2 и VP3 находятся в петлях, которые соединяют b-нити, и в последовательности N- и С-концов белков, вытягивающихся от Ь-бочонка. Эти аминокислотные последовательности определяют антигенные свойства ЭВ [140; 153; 225].
N-концы VP1, VP2 и VP3 вместе с VP4 выстилают внутреннюю поверхность белковой оболочки, образуя сложную сеть, обеспечивающую стабилизацию капсида за счет белок-белковых взаимодействий [87; 104].
На внешней поверхности капсида ЭВ расположены соединяющие петли и С-концы белков, которые формируют уникальную топографическую структуру вириона вируса. Наружная поверхность ЭВ имеет выраженное звездообразное плато около осей 5-го порядка и трехлопастную пропеллерообразную структуру около осей 3-го порядка (рис. 2). Эти выступы перемежаются углублениями, окружающими оси 5-го порядка и пересекающие оси 2-го порядка [125]. Впадины, окружающие звезднообразное плато, образуют каньон, внутри которого расположен рецептор-связывающий участок у ПВ [68; 122; 276], КА [272] и КВ [123].
В основании каньона есть отверстие, ведущее в гидрофобный туннель, находящийся в центре капсидного белка VP1. У ПВ типа 1 и 3 это пространство содержит сфингозин [104], у КВЗ - С16 жирную кислоту [118; 179], у КА21 это пространство занято миристиновой кислотой [273]. Данные, полученные Filman с соав. [104] и Macadam с соав. [163] показывают, что гидрофобный туннель может регулировать термическую стабильность вирионов. Гидрофобный туннель так же является местом взаимодействия с антивирусными средствами, чья противовирусная активность основана на
звезднообразное плато
трехлопастная пр о пеллеро образная структура
каньон
Рис. 2. Модель полиовируса (штамм МаЬопеу), построенная на основе рентгено-кристаллографического анализа [225].
способности предотвращать конформационные изменения структурных белков вируса, необходимые для входа в клетку [113; 245].
3.2 Структура генома
Геном ЭВ представляет собой молекулу РНК позитивной полярности размером приблизительно 7400-7500 и.о., содержащую единственную открытую рамку считывания, фланкированную двумя нетранслируемыми регионами: 5'-НТР (приблизительно 742 н.о.) и З'-НТР (около 65 н.о.) (рис. 3). 3х- конец полиаденилирован, а к 5'-концу вирусной РНК ковалентно присоединен низкомолекулярный белок VPg (20-25 а.о.), выполняющий роль белок-нуклеотидной затравки при репликации РНК и не требующийся для ее инфекционной активности [57; 205; 225].
5Л-НТР вирусной РНК является высоко консервативным регионом генома, для которого характерна стабильная вторичная структура, представленная в виде шести доменов [220; 244]. Консервативность 5Л-НТР обусловлена важными функциями, которые выполняет этот регион генома в процессе репликации РНК [57; 64] и инициации трансляции вирусных белков [212]. Кроме этого, 5-НТР ответственен за усиление вирулентности некоторых ЭВ [100; 114]. Функционально 5-НТР можно разделить на два
\
5-НТР
Структ>рнын регион
Неструктурный регион Р2 РЗ
\<- -->-Ч— ->\
VP2 VP3 VP1 2 А 2В 2С ЗА ЗС 3D
VP4 VPg
Рис. 3. Схема структурной организации генома ЭВ [57; 205; 225].
3-НТР
региона: «cloverleaf» (лист клевера, домен I, 1-89 н.о.) и Internal Ribosomal Entry Site (IRES, внутренний сайт связывания рибосом, домены II-VI, 123-602 н.о.) [267]. «Cloverleaf» является первым структурным доменом 5'-НТР. Он имеет форму трехлистника и выполняет важные функции в процессе репликации вирусной РНК, участвует в формировании кольцевого репликативного комплекса и инициации синтеза негативной цепи РНК с 3'-конца, а так же содействует эффективной работе IRES [64; 181; 242; 256]. Соединяющий домены I и II регион богат пиримидином и является высоко консервативным участком. Он поддерживает структурную организацию 5'-НТР и обеспечивает взаимодействие «cloverleaf» и IRES [62]. Кроме этого, как показали исследования De Jesus с соав. [95], этот участок генома является критическим в аттенуации нейровирулентности ПВ. Известно, что домены II-VI являются элементами IRES, хотя для работы требуются только домены II, IV и V [119; 186]. Домен II является важным регионом для ЭВ. Изучение природных и лабораторных изолятов показало, что нуклеотидная последовательность этого участка генома содержит детерминанты вирулентности у вируса КВЗ [73; 99; 150] и у ПВ [95]. Домен III не нужен для вирусной репликации [119], однако содержит третичную структуру, называемую петлей Е, которая найдена во всех молекулах РНК. Так, эта структура в рРНК участвует во взаимодействии с белковыми факторами
трансляции. Возможно, петля Е у ЭВ играет схожую роль [62]. Домен IV имеет сложную крестообразную структуру, состоящую из длинного спирально-скрученного региона, заканчивающийся тремя петлями (А, В и С). На примере ПВ показано, что петля А играет важную роль в функционировании IRES, поскольку содержит участок, который узнают поли(С) связывающие белки и последовательность З'-АСССС-З", консервативную среди всех ЭВ [106]. Домен V является хорошо изученным, поскольку именно этот участок генома играет критическую роль в определении нейровирулентности ПВ и кардиовирулентности вирусов KB [100]. У всех трех серотипов ПВ найдены специфичные мутации, которые определяют аттенуацию вирулентности. Описаны случаи, когда РНК аттенуированного и вирулентного штаммов ПВ отличались только одной нуклеотидной заменой, расположенной в этой области генома [102; 165; 175; 266]. Пара 523C-528G формирует канонический мотив GNRA, консервативный среди всех ЭВ. Домен VI содержит два важных для инициации трансляции элемента: богатый пиримидином регион и следующий за ним кодон AUG. Эти два участка разделены спейсером длиной примерно 15-25 н.о. Богатый пиримидином участок расположен в соединяющем домены V и VI регионе, а кодон AUG в домене VI [62]. Наличие IRES обеспечивает ЭВ реализацию кэп-независимого механизма трансляции мРНК.
Структура ОРС. РНК ЭВ содержит одну протяженную рамку считывания длинной около 6,5 тыс. нуклеотидов, которая начинается с триплета AUG, и кодирует полипротеин размером приблизительно 2200 а.о., который расщепляется в процессе трансляции, поэтому полноразмерный белок обычно не образуется (рис. 4). В результате каскада расщеплений, катализируемых вирусными протеазами 2Арго, ЗСрго и 3CDpro, в конце расщепления образуется 10 продуктов. ОРС делят на три области: PI, Р2, РЗ. Область Р1 расположена на 5'-конце ОРС и кодирует белки капсида (VP1-VP4). Находящиеся в центральной части генома и на 3 - конце ОРС, области
5"-НТР
VPg.
ЧРА УР2
УРЗ
УРЛ.
2А
2В
2С
ЗАЭВ
ЗС | ЗР {—
^ трансляция полцпротеин ——.
Р1
Р2
РЗ
УР4
Рис. 4. Схема процессинга вирусных белков [225].
адов
О/Рд)
З'-НТР
УРО УРЗ II УР1 2А 2ВС ¡ЗАВ гсо
УР2 2В 20 ЗС 1 30
Р2 и РЗ кодируют неструктурные белки, участвующие в расщеплении полипротеина, репликации вирусной РНК и выключении синтеза белков клетки-хозяина [225].
3 Л-НТР играет важную роль в инициации синтеза минус-нити вирусной РНК и является высоко консервативным регионом генома, состоящим из двух шпилек (X и У), которые взаимодействуя друг с другом формируют высоко упорядоченную третичную РНК структуру - домен К [170; 221]. Точечные мутации, приводящие к дестабилизации этого взаимодействия, приводят к образованию летальных фенотипов вируса [170; 261]. Мутанты с полностью удаленным З'-НТР жизнеспособны, но ограничены в росте. 3'-НТР ЭВ вида В содержит дополнительную петлю {Ъ домен), функция которого до сих пор неизвестна. Исследования Мегк1е с соав. [171] показали, что полное удаление Ъ домена приводит к снижению кардиовирулентности вируса КВЗ, что говорит о роли данного участка в патогенезе КВ инфекции. 3"-конец вирусной РНК содержит полиаденилатный хвост размером приблизительно 75 н.о. Вирусная РНК, у которой удален полиаденилатный блок, не способна инфицировать клетки [225].
Похожие диссертационные работы по специальности «Вирусология», 03.02.02 шифр ВАК
Роль рекомбинации в эволюции неполиомиелитных энтеровирусов2006 год, доктор медицинских наук Лукашев, Александр Николаевич
Вирусологическая характеристика энтеровирусов и особенности эпидемического процесса энтеровирусной инфекции (на примере Архангельской области)2017 год, кандидат наук Шишко Лариса Александровна
Идентификация и биохимическая характеристика геновариантов парэховирусов человека2012 год, кандидат биологических наук Зверев, Владимир Владимирович
Структурно-функциональный анализ генетических полиморфизмов вируса ECHO11, связанных с изменчивостью рецепторной специфичности2014 год, кандидат наук Резайкин, Алексей Васильевич
Обнаружение и дифференциация энтеровирусов человека на основе анализа 5'-НТР генома2003 год, кандидат биологических наук Голицына, Людмила Николаевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Фомина, Светлана Григорьевна, 2013 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ:
1. Алиев H.H., Рустамова Л.И., Азаев М.Ш. и др. Изучение молекулярно-биологических и вирусологических маркеров как важный компонент организации эпидемиологического надзора за энтеровирусными инфекциями // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2009. - № 1. -С. 12-14.
2. Алиев H.H., Рустамова Л.И., Алиев К.Н. и др. Выявление энтеровирусов у пациентов с острыми кишечными инфекциями на территории Азербайджанской Республики в 1995-2004 гг. // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2008. - № 4. - С. 45-46.
3. Анкудинова Л.А. Циркуляция энтеровирусов групп Коксаки и ECHO среди здоровых детей Кыргызстана // Труды научной конференции с международным участием «Достижения отечественной эпидемиологии в XX веке. Взгляд в будущее», С.-Петербург, 15-16 ноября 2001 г. - СПб. -
2001.-С. 143.
4. Белецкая Т.С., Самойлович Е.О., Короткова Е.А. и др. Мутационная и рекомбинационная изменчивость вакцинных полиовирусов, изолированных в Беларуси (1960-1999 гг.) // Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. - 2002. - №1. - С. 24-30.
5. Ворошилова М.К. Энтеровирусные инфекции человека. - М.: Медицина, 1979.-360 с.
6. Гмыль А.П., Агол В.И. Многообразие механизмов РНК-рекомбинации // Молекул, биол. - 2005. - Т. 39. - С. 618-632.
7. Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Нижегородской области в 2012 году». [Электронный ресурс]. - URL: http://www.52.rospotrebnadzor.ni/s/52/files/SLDQK00 /DOKNNOO /98541 .pd f (дата обращения 02.08.2013).
8. Грачев В.П. Полиомиелит // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. -
2002.-№5.-С. 14-21.
9. Григорьян И.П., Слонова Р.А, Румянцева Н.П. Материалы о роли энтеровирусов в этиологии острых кишечных заболеваний у детей младшего возраста // Труды ИПВЭ АМН СССР. Энтеровирусные инфекции. - Москва. - 1970. - Т. XIV. - С. 142-148.
Ю.Демина A.B., Нетесов С.В. Энтеровирусы. Часть 2. Энтеровирусные инфекции: многообразие клинических проявлений // Бюллетень СО РАМН. - 2009. - № 6 (140). - С. 116-125.
П.Демина A.B., Терновой В.А., Дарижапов Б.Б. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вспышки острой кишечной инфекции в Сахалинской области // Материалы IV Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням, Москва, 26-28 марта2012 г.-Москва. - 2012.-Т. 10, № 1.-С. 116.
12.Денисюк Н.Б., Каган Ю.Д. Вирусные диареи у детей: некоторые эпидемиологические и клинические особенности // Инфекционные болезни.-2012.-Т. 10, № 1.-С. 118.
13.Дроздов С.Г., Покровский В.И., Шекоян JI.A. и др. Ротавирусный гастроэнтерит. - М., 1982. - С. 9-12.
14-Захарова С.Ю., Власова Л.В., Степанова Г.П. К вопросу о роли вирусов Коксаки группы В в гастроэнтерологической патологии у детей раннего возраста // Респ. сб. науч. трудов СНИИВИ «Актуальные вопросы медицинской вирусологии». - Свердловск. - 1989. - С. 87-90.
15.Инфекционная заболеваемость в Российской Федерации за январь-декабрь 2011 г. [Электронный ресурс]. - URL: http://rospotrebnadzor.ru/epidemiologic_situation/-
/asset риЬНзЬег/СХх^/со^еп^инфекционная-заболеваемость-в-россиискои-федерации-за-январь-декабрь-2011-года (дата обращения 17.10.2012).
16.Инфекционная заболеваемость в Российской Федерации за январь-ноябрь 2012 года (по данным формы № 1 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях»). [Электронный ресурс]. - URL:
http://rospotrebnadzor.ru/epidemiologic situation/— /asset publisher/Xd6d/content/инфeкциoннaя-зaбoлeвaeмocть-в-россиискои-федерации-за-январь-ноябрь-2012-г (дата обращения 19.12.12).
17.Информационный бюллетень №114 [Электронный ресурс]. - URL: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fsll4/ru (дата обращения 23.03.2013).
18.Клиндухов В.П., Шевырева Т.В., Рафеенко Г.К. и др. Мониторинг энтеровирусных инфекций на территории Краснодарского края в 2011 г. // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 529-530.
19.Ковальчук И.В., Романова Т.И., Соломащенко Н.И. и др. О показателях чувствительности эпиднадзора за полиомиелитом и острыми вялыми параличами в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах в период 2007-2011 гг. // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. -С. 530.
20.Ковальчук И.В., Соломащенко Н.И., Романенко E.H. и др. О проведении дополнительного надзора за циркуляцией полиовирусов в постсертификационном периоде // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. -Т. 2,№ 1-2.-С. 531.
21.Кожевникова Н.В., Резник В.И., Воронкова Г.М. и др. Использование метода ПЦР для изучения циркуляции энтеровирусов среди населения Хабаровского края в период повышенной заболеваемости СВМ в 2007 г. // Сб. трудов 6-ой Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика - 2007». - Москва. - 2007. - Т. III. - С. 257-259.
22.Колесников Г.Ф. Заболевания, вызываемые вирусами Коксаки и ECHO. -М., 1966.-259 с.
23.Колпаков С.Л., Миргородская Н.В., Приходченко Т.О. и др. Клинико-эпидемиологические аспекты изучения энтеровирусной неполиомиелитной инфекции в Приморском крае // Материалы X съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов «Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации», Москва, 12-13 апреля 2012. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2.-С. 531.
24.Королева Г.А., Лукашев А.Н., Худякова Л.В. и др. Энцефаломиелит, вызываемый энтеровирусом типа 71 у детей // Вопросы вирусологии. -2010.- Т. 55,№6.-С. 4-10.
25.Лабораторная диагностика вирусных и риккетсионных заболеваний / под ред. Э. Леннета, Н. Шмидта. - М.: Медицина, 1974. - 775 с.
26.Лесников Н.Т., Днепровская Л.Г., Емакова Е.В., Бондарева О.П. Организация мониторинга за циркуляцией полио/энтеровирусов в Забайкальском крае // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. -С. 532.
27.Литяева Л.А., Ковалева О.В. Энтеровирусная инфекция у детей на этапе подъема заболеваемости // Материалы II Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням, Москва, 29-31 марта 2010 г. -Москва.-2010.-С. 177.
28.Лукашев А.Н. Роль рекомбинации в эволюции энтеровирусов // Вопросы вирусологии. - 2005. - №3. - С. 46-52.
29.Лукашев А.Н., Иванова O.E., Худякова Л.В. Социально-экономическая значимость энтеровирусной инфекции и ее роль в структуре инфекционной патологии в мире // Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. - 2010. - № 5. - С. 113-120.
30.Лукашев А.Н., Резник В.И., Иванова O.E. и др. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 - возбудителя вспышки серозного
менингита в Хабаровске в 2006 г. // Вопросы вирусологии. - 2008. - № 1. -С. 16-21.
31.Марова A.A., Океании A.C., Каира А.Н. и др. Этиологическая диагностика острых кишечных инфекций методом мультиплексной ПЦР-РВ // Материалы X съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов «Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации», Москва, 12-13 апреля 2012. Инфекция и иммунитет. -Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 298.
32.Марова A.A., Оксанич A.C., Каира А.Н. и др. Применение метода мультиплексной ПЦР-РВ для дифференциальной диагностики кишечных вирусных инфекций // Журн. микробиологии. - 2012. - №6. - С. 39-45.
33. Новикова H.A., Голицына JI.H., Епифанова Н.В. и др. Способ выделения РНК кишечных вирусов для анализа методом обратной транскрипции/полимеразной цепной реакции. Автор, свид. № 2313792. Госреестр изобретений РФ 10.04.2006.
34.Новикова H.A., Голицына Л.Н., Фомина С.Г. Способ идентификации 5"— НТР генома энтеровирусов геногруппы ЭВ1 и геногруппы ЭВП с использованием полимеразной цепной реакции. Автор, свид. № 2441917. Госреестр изобретений РФ 10.02.2012.
35.Новикова H.A., Голицына Л.Н., Фомина С.Г. и др. Молекулярный мониторинг неполиомиелитных энтеровирусов на территории России в 2008-2011 гг. // Материалы X съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов «Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации», Москва, 12-13 апреля 2012. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 533.
Зб.Онищенко Г.Г., Дроздов С.Г., Лялина Л.В. и др. Проблемы ликвидации полиомиелита. - Санкт-Петербург, 2008. - 304 с.
37.0нищенко Г .Г., Новикова H.A., Ефимов Е.И. и др. Сезон энтеровирусного серозного менингита в Нижнем Новгороде в 2007 году: молекулярно-эпидемиологические аспекты // Журн. микробиологии. - 2009. - № 2. - С. 24-30.
38.0сипова Т.В., Феклина Т.Ю., Дерябина О.И. и др. Характеристика заболеваемости энтеровирусными инфекциями в Нижегородской области в период их регистрации // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 1213 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. -С. 533-534.
39.Попов А.Ф., Король A.A. Энтеровирусная инфекция в г. Владивостоке // Материалы II Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням, Москва, 29-31 марта 2010 г. - Москва. - 2010. - С. 249.
40.Попов А.Ф., Король A.A. Энтеровирусная инфекция в Приморском крае // Материалы III Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням, Москва, 28-30 марта 2011 г. - Москва. - 2011. - Т. 9, № 1. - С. 296.
41.Программа "Эпидемиологический надзор и профилактика энтеровирусной инфекции на 2012-2014 гг.". [Электронный ресурс]. - URL: http://rospotrebnadzor.ru/documen/other/-
/asset риЬНзЬег/1е7Н/соп1еп1Упрограмма-эпидемиологическии-надзор-и-профилактика-энтеровируснои-инфекции-на-2012-2014-гг (дата
обращения 15.01.2012).
42.Пушкарева В.И., Ермолаева С.А., Литвин В.Ю. Патогенные листерии и почвенные простейшие: сопряженность жизненных циклов // Успехи современной биологии. - 2008. - Т. 128, № 3. - С. 245 -251.
43. Респираторные вирусные и энтеровирусные инфекции у детей / под ред. С.Д. Носова, В.Д. Соболевой. - М., 1965. - С. 219-223.
44.Романенкова Н.И., Бичурина М.А., Розаева Н.Р. Частота выделения полиовирусов и неполиомиелитных энтеровирусов у больных острыми
вялыми параличами, энтеровирусной инфекцией и у детей из групп риска // Журнал инфектологии. - 2012. - Т. 4, № 2. - С. 15-19.
45.Сапега Е.Ю., Троценко O.E., Резник В.И. и др. Эпидемический процесс энтеровирусной инфекции в Дальневосточном Федеральном округе в 2011 г. // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 536.
46.Скачков М.В., Альмишева А.Ш., Плотников А.О. и др. Эпидемиологические и экологические аспекты энтеровирусной инфекции // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2008. - № 6. - С. 29-35.
47.Тевеленок О.Г., Замятина Е.П., Кузнецова H.H., Далматов В.В. Проблемы актуальных энтеровирусных инфекций в Красноярском крае // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. - Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 538.
48.Трофимова Л.И., Когут Е.П. Клинико-вирусологическая характеристика двух локальных вспышек энтеровирусной инфекции одинаковой этиологии (ЕСНО-7) // Материалы Проблемной комиссии АМН СССР «Полиомиелит и вирусные энцефалиты», Выпуск 1, «Энтеровирусы». -Москва.-1967.-С. 111-113.
49. Устюжанин A.B., Резайкин A.B., Сергеев А.Г. и др. Молекулярно-генетический анализ энтеровирусов, выделенных от больных в 2008-2011 гг. на территории Уральского Федерального округа // Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г. Инфекция и иммунитет. -Москва. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С. 539-540.
50.Фадеев Ф.А. Рецепторная специфичность энтеровирусов человека // Вопросы Вирусологии. - 2008. - №1. - С. 4-9.
51.Фисенко Е.Г., Амвросьева Т.В., Поклонская Н.В., Безручко A.A. Особенности проявлений эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Минске // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2007. -№2.-С. 8-11.
52.Хотько Н.И., Дмитриев А.П. Водный фактор передачи инфекций. - Пенза, 2002.-232 с.
53.Эпидемиологический надзор и профилактика энтеровирусной (неполно) инфекции. Методические указания (МУ 3.1.1.2363-08). - М. - 2008. - с.
54.Яковенко M.JL, Короткова Е.А. Эволюция вакцинных штаммов полиовируса // Вопросы вирусологии. - 2008. - Т. 53, № 3. - С. 45-49.
55.Abe О., Kimura Н., Minakami Н. et al. Outbreak of gastroenteritis caused by echovirus type 6 in an orphanage in Japan // J. Infect. - 2000. - Vol. 41, No. 3. -P. 285-286.
56.Amero C.D., Arnold J .J., Moustafa I.M. et al. Identification of the oril-binding site of poliovirus 3C protein by nuclear magnetic resonance spectroscopy // J. Virol. - 2008. - Vol. 82, No. 9. - P. 4363-4370.
57.Andino R., Rieckhof G.E., Achacoso P.L., Baltimore D. Poliovirus RNA synthesis utilizes an RNP complex formed around 5'- end of viral RNA // Cell. -1993.-No. 12.-P. 3587-3598.
58.Antona D., Leveque N., Chomel J.J. et al. Surveillance of enteroviruses in France, 2000-2004 // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2007. - Vol. 26, No. 6.-P. 403-412.
59.Apostol L.N., Suzuki A., Bautista A. et al. Detection of non-polio enteroviruses from 17 years of virological surveillance of acute flaccid paralysis in the Philippines // J. Med. Virol. - 2012. - Vol. 84, No. 4. - P. 624-631.
60.Ваек К., Park К., Jung E. et al. Molecular and epidemiological characterization of enteroviruses isolated in Chungnam, Korea from 2005 to 2006 // J. Microbiol. Biotechnol. - 2009. - Vol. 19, No. 9. - P. 1055-1064.
61.Bahri O., Rezig D., Nejma-Oueslati B.B. et al. Enteroviruses in Tunisia: virological surveillance over 12 years (1992-2003) // J. Med. Microbiol. -2005.-Vol. 54 (Pt. 1).-P. 63-69.
62.Bailey J.M., Tapprich W.E. Structure of the 5' nontranslated region of the coxsackievirus B3 genome: Chemical modification and comparative sequence analysis // J. Virol. - 2007. - Vol. 81, No. 2. - P. 650-668.
63.Banta J.E., Akers T.G., Arm H.G., Freeman N.L. An epidemiologic study of diarrhea in an alien student population in Cairo, Egypt // Am J. Public Health Nations Health. - 1964. - Vol. 54. - P. 940-946.
64.Barton D.J., O'Donnell B.J., Flanegan J.B. 5" cloverleaf in poliovirus RNA is a c/s-acting replication element required for negative-strand synthesis // J. EMBO-2001.-Vol. 20.-P. 1439-1448.
65.Basic Local Alignment Search Tool. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/.
66.Baxter N.J., Roetzer A., Liebig H.D. et al. Structure and dynamics of coxsackievirus B4 2A proteinase, an enyzme involved in the etiology of heart disease // J. Virol. - 2006. - Vol. 80, No. 3. - P. 1451-1462.
67.Beard C.W., Mason P.W. Genetic determinants of altered virulence of Taiwanese foot-and-mouth disease virus // J. Virol. - 2000. - Vol. 74. - P. 987-991.
68.Belnap D.M., McDermott B.M. Jr., Filman D.J. et al. Three-dimensional structure of poliovirus receptor bound to poliovirus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2000. -Vol. 97. - P. 73-78.
69.Beuret C. Simultaneous detection of enteric viruses by multiplex real-time RT-PCR // J. Virol. Methods. - 2004. - Vol. 115, No. 1. - P. 1-8.
70.Bingjun T., Yoshida H., Yan W. et al. Molecular typing and epidemiology of non-polio enteroviruses isolated from Yunnan Province, the People's Republic of China // J. Med. Virol. - 2008. - Vol. 80, No. 4. - P. 670-679.
71.Blair W.S., Parsley T.B., Bogerd H.P. et al. Utilization of a mammalian cell-based RNA binding assay to characterize the RNA binding properties of picornavirus 3C proteinases // RNA. - 1998. - Vol. 4, No. 2. - P. 215-225.
72.Bouchard M.J., Lam D. H., Racaniello V. R. Determinants of attenuation and temperature sensitivity in the type 1 poliovirus Sabin vaccine // J. Virol. - 1995. -Vol. 69.-P. 4972-4978.
73.Bradrick S.S., Lieben E. A., Carden B. M., Romero J. R. A predicted secondary structure domain within the internal ribosome entry site of echovirus 12
mediates a cell-type specific block to viral replication // J. Virol. - 2001. - Vol. 75.-P. 6472-6481.
74.Brown B., Oberste M. S., Maher K., Pallansch M. A. Complete genomic sequencing shows that polioviruses and members of human enterovirus species C are closely related in the noncapsid coding region // J. Virol. - 2003. - Vol. 77.-P. 8973-8984.
75.Caggana M., Chan P., Ramsingh A. Identification of a single amino acid residue in the capsid protein VP1 of coxsackievirus B4 that determines the virulent phenotype // J. Virol. - 1993. - Vol. 67. - P. 4797-4803.
76.Campagnola G., Weygandt M., Scoggin K., Peersen O. Crystal structure of coxsackievirus B3 3Dpol highlights the functional importance of residue 5 in picornavirus polymerases // J. Virol. - 2008. - Vol. 82, No. 19. - P. 9458-9464.
77.Caro V., Guillot S., Delpeyroux F., Crainic R. Molecular strategy for 'serotyping' of human enteroviruses // J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82, No. 1. -P. 79-91.
78.Casas I., Palacios G.F., Trallero G. et al. Molecular characterization of human enteroviruses in clinical samples: comparison between VP2, VP1, and RNA polymerase regions using RT nested PCR assays and direct sequencing of products//J. Med. Virol.-2001.-Vol. 65, No. l.-P. 138-148.
79.Castello A., Alvarez E., Carrasco L. The Multifaceted Poliovirus 2A Protease: Regulation of Gene Expression by Picornavirus Proteases // J. Biomed. Biotechnol. - 2011. - P. 369-648.
80.Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Enterovirus Surveillance — United States, 1970-2005 // MMWR Surveill Summ. - 2006. - Vol. 15, No. 55(8).-P. 1-20.
81.Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Nonpolio enterovirus and human parechovirus surveillance - United States, 2006-2008 // Morb. Mortal. Wkly Rep. - 2010. - Vol. 59, No. 48. - P. 1577-1580.
82.Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Notes from the field: severe hand, foot, and mouth disease associated with coxsackievirus A6 - Alabama,
Connecticut, California, and Nevada, November 2011-February 2012 // Morb. Mortal. Wkly. Rep. -2012. - Vol. 30, No. 61(12). - P. 213-214.
83.Chambon M., Archimbaud C., Bailly J.L. et al. Circulation of enteroviruses and persistence of meningitis cases in the winter of 1999-2000 // J. Med. Virol. -2001. - Vol. 65, No. 2. - P. 340-347.
84.Chang K.H., Day C., Walker J. et al. The nucleotide sequences of wild-type coxsackievirus A9 strains imply that an RGD motif in VP1 is functionally significant // J. Gen. Virol. - 1992. - Vol. 73. - P. 621-626.
85.Chen S.P., Huang Y.C., Li W.C. et al. Comparison of clinical features between coxsackievirus A2 and enterovirus 71 during the enterovirus outbreak in Taiwan, 2008: a children's hospital experience // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2010. - Vol. 43, No. 2. - P. 99-104.
86.Chevaliez S., Szendroi A., Caro V. et al. Molecular comparison of echovirus 11 strains circulating in Europe during an epidemic of multisystem hemorrhagic disease of infants indicates that evolution generally occurs by recombination // Virology. - 2004. Vol. 325. - P. 56-70.
87.Chow M., Newman J.F., Filman D. et al. Myristylation of picornavirus capsid protein VP4 and its structural significance // Nature. - 1987. - Vol. 327. - P. 482-486.
88.Christensen A., Nordbo S.A. Enterovirus infections diagnosed in middle Norway during the period 1992-2001 // Tidsskr. Nor. Laegeforen. - 2003. -Vol. 123, No. 22. -P. 3180-3183.
89.Chu P.Y., Lu P.L., Tsai Y.L. et al. Spatiotemporal phylogenetic analysis and molecular characterization of coxsackievirus A4 // Infect. Genet. Evol. - 2011. -Vol. 11, No. 6.-P. 1426-1435.
90.Combelas N., Holmblat B., Joffret M.L. et al. Recombination between poliovirus and coxsackie A viruses of species C: a model of viral genetic plasticity and emergence // Viruses. - 2011. - Vol. 3, No. 8. - P. 1460-1484.
91.Cordey S., Petty T.J., Schibler M. et al. Identification of Site-Specific Adaptations Conferring Increased Neural Cell Tropism during Human
Enterovirus 71 Infection // PLoS. Pathog. - 2012. - Vol. 8, No. 7 (el002826). -P. 1-12.
92.Cuervo N.S., Guillot S., Romanenkova N. et al. Genomic features of intertypic recombinant Sabin poliovirus strains excreted by primary vaccines // J. Virol. -2001. - Vol. 75,No. 13.-P. 5740-5751.
93.Cui A., Yu D., Zhu Z., Meng L. et al. An outbreak of aseptic meningitis caused by coxsackievirus A9 in Gansu, the People's Republic of China // J.Virol. -2010. - Vol. 7, No. 72. - P. 1-9.
94.Deitz S.B., Dodd D. A., Cooper S. et al. MHC I-dependent antigen presentation is inhibited by poliovirus protein 3A // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2000. -Vol. 97.-P. 13790-13795.
95.De Jesus N., Franco D., Paul A. et al. Mutation of a single conserved nucleotide between the cloverleaf and internal ribosome entry site attenuates poliovirus neurovirulnece // J. Virol. - 2005. - Vol. 79. - P. 14235-14243.
96.Ding Z.R., Tang J.J., Tian B.J. et al. Status of enterovirus infection and molecular identification among healthy children at the areas bordering Myanmar, in Yunnan province, China // Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. -2010.-Vol. 31, No. 2.-P. 185-188.
97.Dodd D.A., Giddings T.H. Jr., Kirkegaard K. Poliovirus 3A protein limits interleukin-6 (IL-6), IL-8, and beta interferon secretion during viral infection // J. Virol.-2001.-Vol. 75.-P. 8158-8165.
98.Doedens J.R., Kirkegaard K. Inhibition of cellular protein secretion by poliovirus proteins 2B and 3A // J. EMBO. - 1995. - Vol. 14. - P. 894-907.
99.Dunn J.J., Bradrick S.S., Chapman N.M. et al. The stem loop II within the 5" nontranslated region of clinical coxsackievirus B3 genomes determines cariovirulence phenotype in a murine model // J. Infect. Dis. - 2003. - Vol.187. -P. 1552-1561.
100. Dunn J.J., Chapman N.M., Tracy S.M., Romero J.R. Genomic determinants of cardiovirulence in coxsackievirus B3 clinical isolates: localization to the 5' nontranslated region // J. Virol. - 2000. - Vol. 74. - P. 4787-4794.
101. Eichenwald H.F., Ababio A., Arky A.M., Hartman A.P. Epidemic diarrhea in premature and older infants caused by ECHO virus type 18 // J. Am. Med. Assoc.- 1958.-Vol. 166, No. 13.-P. 1563-1566.
102. Evans D., Dunn G., Minor P. D. et al. Increased neurovirulence associated with a single nucleotide change in a noncoding region of the Sabin type 3 poliovaccine genome // Nature. - 1985. - Vol. 314. - P. 548-550.
103. Fan X., Jiang J., Liu Y. et al. Detection of human enterovirus 71 and Coxsackievirus A16 in an outbreak of hand, foot, and mouth disease in Henan Province, China in 2009 //Virus. Genes. -2013. - Vol. 46, No. 1. - P. 1-9.
104. Filman D.J., Syed R., Chow M. et al. Structural factors that control conformational transitions and serotype specificity in type 3 poliovirus // J. EMBO.- 1989.-Vol. 8.-P. 1567-1579.
105. Gaaloul I., Riabi S., Harrath R. et al. Sudden unexpected death related to enterovirus myocarditis: histopathology, immunohistochemistry and molecular pathology diagnosis at post-mortem // BMC. Infect. Dis. - 2012. - Vol. 11, No. 12.-P.212.
106. Gamarnik A.V., Andino R. Interactions of viral protein 3CD and poly(rC) binding protein with the 5" untranslated region of the poliovirus genome // J. Virol. - 2000. - Vol. 74. - P. 2219-2226.
107. Gangaramani D.R., Eden E.L., Shah M., Destefano J.J. The twenty-nine amino acid C-terminal cytoplasmic domain of poliovirus ЗАВ is critical for nucleic acid chaperone activity // RNA. Biol. - 2010. - Vol. 7, No. 6. - P. 820829.
108. Gavrilin G.V., Cherkasova E.A., Lipskaya G.Y. et al. Evolution of circulating wild poliovirus and of vaccine-derived poliovirus in an immunodeficient patient: a unifying model // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, No. 16.-P. 7381-7390.
109. Giachetti C., Hwang S. S., Semler B. L. Cis-acting lesions targeted to the hydrophobic domain of a poliovirus membrane protein involved in RNA replication // J. Virol. - 1992. - Vol. 66. - P. 6045-6057.
110. Gmyl A.P., Korshenko S.A., Belousov E.V. et al. Nonreplicative homologous RNA recombination: promiscuous joining of RNA pieces? // RNA. -2003.-Vol. 9,No. 10.-P. 1221-1231.
111. Gohara D.W., Arnold J.J., Cameron C.E. Poliovirus RNA-dependent RNA polymerase (3Dpol): kinetic, thermodynamic, and structural analysis of ribonucleotide selection // Biochemistry. - 2004. - Vol. 11, No. 43(18). - P. 5149-5158.
112. Gradi A., Svitkin Y.V., Imataka H., Sonenberg N. Proteolysis of human eukaryotic translation initiation factor eIF4GII, but not eIF4GI, coincides with the shutoff of host protein synthesis after poliovirus infection // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1998.-Vol. 15,No. 95(19). P. 11089-11094.
113. Grant R.A., Hiremath C., Filman D.J. et al. Structures of poliovirus complexes with antiviral drugs: implications for viral stability and drug design // Curr. Biol. - 1994. - Vol. 4. - P. 784-797.
114. Gromeier M., Alexander L., Wimmer E. Internal ribosome entry site substitution eliminates neurovirulence in intergeneric poliovirus recombinants // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1996. - Vol. 93. - P. 2370-2375.
115. Gruez A., Selisko B., Roberts M. et al. The crystal structure of coxsackievirus B3 RNA-dependent RNA polymerase in complex with its protein primer VPg confirms the existence of a second VPg binding site on Picornaviridae polymerases // J. Virol. - 2008. - Vol. 82, No. 19. - P. 95779590.
116. Guerrier G., Goyet S., Chheng E.T. et al. Acute viral lower respiratory tract infections in Cambodian children: clinical and epidemiologic characteristics // J. Pediatr. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 32, No. 1. - P. 8-13.
117. Guillot S., Caro V., Cuervo N. et al. Natural genetic exchanges between vaccine and wild poliovirus strains in humans // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, No. 18.-P. 8434-8443.
118. Hadfield A.T., Lee W., Zhao R. et al. The refined structure of human rhinovirus 16 at 2.1 5 A resolution: implications for the viral life cycle // Structure. - 1997. - Vol. 5. - P. 427-441.
119. Haller A.A., Nguyen J. H., Semler B. L. Minimum internal ribosome entry site required for poliovirus infectivity // J. Virol. - 1993. - Vol. 67. - P. 74417471.
120. Harris K.S., Reddigari S.R., Nicklin M.J. et al. Purification and characterization of poliovirus polypeptide 3CD, a proteinase and a precursor for RNA polymerase // J. Virol. - 1992. - Vol. 66, No. 12. - P. 7481-7489.
121. Harris K.S., Xiang W., Alexander L. et al. Interaction of poliovirus polypeptide 3CDpro with the 5' and 3" termini of the poliovirus genome. Identification of viral and cellular cofactors needed for efficient binding // J. Biol. Chem. - 1994. - Vol. 269. - P. 27004-27014.
122. He Y., Bowman V.D., Mueller S. et al. Interaction of the poliovirus receptor with poliovirus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2000. - Vol. 97. - P. 79-84.
123. He Y., Chipman P.R., Howitt J. et al. Interaction of coxsackievirus B3 with the full length coxsackievirus-adenovirus receptor // Nat. Struct. Biol. - 2001. -Vol. 8.-P. 874-878.
124. Hobson S.D., Rosenblum E.S., Richards O.C. et al. Oligomeric structures of poliovirus polymerase are important for function // J. EMBO. - 2001. - Vol. 1, No. 20(5).-P. 1153-1163.
125. Hogle J.M. Poliovirus cell entry: common structural themes in viral cell entry pathways // Annu. Rev. Microbiol. - 2002. Vol. 56. - P. 677-702.
126. Hsu C.H., Lu C.Y., Shao P.L. et al. Epidemiologic and clinical features of non-polio enteroviral infections in northern Taiwan in 2008 // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2011. - Vol. 44, No. 4. - P. 265-273.
127. Huang X.Y., Kang K., Xu Y.L. et al. Etiology surveillance of hand-foot-mouth disease in Henan province between 2008 and 2011 // Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi. - 2012. - Vol. 46, No. 10. - P. 883-887.
128. Hughes P.J., North C., Minor P.D., Stanway G. The complete nucleotide sequence of coxsackievirus A21 // J. Gen. Virol. - 1989. - Vol. 70 ( Pt 11). - P. 2943-2952.
129. Hu Y.F., Yang F., Du J. et al. Complete genome analysis of coxsackievirus A2, A4, A5, and A10 strains isolated from hand, foot, and mouth disease patients in China revealing frequent recombination of human enterovirus A // J. Clin. Microbiol. - 2011. - Vol. 49, No. 7. - P. 2426-2434.
130. Hyypia T., Hovi T., Knowles N., Stanway G. Classification of enteroviruses based on molecular and biological properties // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78. -P. 1-11.
131. Kapusinszky B., Szomor K.N., Farkas A. et al. Detection of non-polio enteroviruses in Hungary 2000-2008 and molecular epidemiology of enterovirus 71, coxsackievirus A16, and echovirus 30 // Virus. Genes. - 2010. -Vol. 40, No. 2.-P. 163-173.
132. Kargar M., Sadeghipour S., Nategh R. Environmental surveillance of NonPolio Enteroviruses in Iran // J. Virol. - 2009. - Vol. 25, No. 6. - P. 149.
133. Kennett M.L., Donaldson A., Marshall J.A., Williamson H.G. Echovirus type 11 infection in Melbourne - 1953 to 1980 // J. Hyg. (Lond). - 1981. - Vol. 87,No 2.-P. 305-312.
134. Kew O.M., Pallansch M.A. The mechanism of poliovirus eradication // In: Semler B.L., Wimmer E., eds. Molecular biology of picornaviruses. -Washington, DC: ASM Press. -2002. - P. 481-491.
135. Kew O.M., Wright P.F., Agol V.I. et al. Circulating vaccine-derived polioviruses: current state of knowledge // Bulletin of the WHO. - 2004. - Vol. 82.-P. 16-23.
136. Khamrin P., Okame M., Thongprachum A. et al. A single-tube multiplex PCR for rapid detection in feces of 10 viruses causing diarrhea // J. Virol. Methods. - 2011. - Vol. 173, No. 2. - P. 390-393.
137. Khetsuriani N., Kutateladze T., Zangaladze E. et al. High degree of genetic diversity of non-polio enteroviruses identified in Georgia by environmental and
clinical surveillance, 2002-2005 // J. Med. Microbiol. - 2010. - Vol. 59 (Pt 11). -P. 1340-1347.
138. Khetsuriani N., Lamonte-Fowlkes A., Oberste S., Pallansch M.A. Enterovirus surveillance - United States, 1970-2005 // MMWR Surveill. Summ. - 2006. - Vol. 55, No. 8. - P. 1-20.
139. Kim H.J., Kang B., Hwang S. et al. Epidemics of viral meningitis caused by echovirus 6 and 30 in Korea in 2008 // J. Virol. - 2012. - Vol. 9, No. 38. - P. 1-7.
140. Kim S.S., Smith T.J., Chapman M.S. et al. Crystal structure of human rhinovirus serotype 1A (HRV1A) // J. Mol. Biol. - 1989. - Vol. 210. - P. 91111.
141. Knowlton K.U., Jeon E. S., Berkley N. et al. A mutation in the puff region of VP2 attenuates the myocarditic phenotype of an infectious cDNA of the Woodruff variant of coxsackievirus B3 // J. Virol. - 1996. - Vol. 70. - P. 78117818.
142. Kobayashi K., Haruta T., Kubota M. et al. Clinical spectrum in hospitalized children with echovirus type 13 infection // Pediatr. Int. - 2005. - Vol. 47, No. 2.-P. 185-189.
143. Kumar A., Shukla D., Kumar R. et al. Molecular identification of enteroviruses associated with aseptic meningitis in children from India // Arch. Virol.-2013.-Vol. 158, No. 1.-P. 211-215.
144. Kuo R.L., Kung S.H., Hsu Y.Y., Liu W.T. Infection with enterovirus 71 or expression of its 2A protease induces apoptotic cell death // J. Gen. Virol. -2002. - Vol. 83 (Pt 6). - P. 1367-1376.
145. Kuramitsu M., Kuroiwa C., Yoshida H. et al. Non-polio enterovirus isolation among families in Ulaanbaatar and Tov province, Mongolia: prevalence, intrafamilial spread, and risk factors for infection // Epidemiol. Infect.-2005.-Vol. 133, No. 6.-P. 1131-1142.
146. Kyriakopoulou Z., Pliaka V., Tsakogiannis D. et al. Genome analysis of two type 6 echovirus (E6) strains recovered from sewage specimens in Greece in 2006 // Virus. Genes. - 2012. - Vol. 44, No. 2. - P. 207-216.
147. Lama J., Sanz M.A., Carrasco L. Genetic analysis of poliovirus protein 3A: characterization of a non-cytopathic mutant virus defective in killing Vero cells // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 79 (Pt 8). - P. 1911-1921.
148. Lawson M.A., Semler B.L. Poliovirus thiol proteinase 3C can utilize a serine nucleophile within the putative catalytic triad // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1991. - Vol. 88, No. 22. - P. 9919-9923.
149. Lee B.E., Davies H.D. Aseptic meningitis // Curr. Opin. Infect. Dis. - 2007. -Vol. 20, No. 3. - P. 272-277.
150. Lee C.K., Kono K., Haas E. et al. Characterization of an infectious cDNA copy of the genome of a naturally occurring, avirulent coxsackievirus B3 clinical isolate // J. Gen. Virol. - 2005. - Vol. 86. - P. 197-210.
151. Lee M.H., Huang L.M., Wong W.W. et al. Molecular diagnosis and clinical presentations of enteroviral infections in Taipei during the 2008 epidemic // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2011. - Vol. 44, No. 3. - P. 178-183.
152. Lepine P., Samaille J., Maurin J. et al. Isolation of the ECHO 14 virus in the course of a nursery epidemic of gastroenteritis // Ann. Inst. Pasteur (Paris). -1960.-Vol. 99.-P. 161-166.
153. Levy H.C., Bostina M., Filman D.J., Hogle J.M. Catching a virus in the act of RNA release: a novel poliovirus uncoating intermediate characterized by cryo-electron microscopy // J. Virol. - 2010. - Vol. 84, No. 9. - P. 4426-4441.
154. Lindberg M. A., Andersson P., Savolainen C. et al. Evolution of the genome of Human enterovirus B: incongruence between phylogenies of the VP1 and 3CD regions indicates frequent recombination within the species // J. Gen. Virol. - 2003. - Vol. 84 (Pt 5). - P. 1223-1235.
155. Li R., Zou Q., Chen L. et al. Molecular analysis of virulent determinants of enterovirus 71 // PLoS. One. - 2011. - Vol. 6, No. 10 (e26237). - P. 1-9.
156. Li W., Ross-Smith N., Proud C.G., Belsham G.J. Cleavage of translation initiation factor 4AI (eIF4AI) but not eIF4AII by foot-and-mouth disease virus 3C protease: identification of the eIF4AI cleavage site // FEBS Lett. - 2001. -Vol. 507, No. l.-P. 1-5.
157. Ljubin-Sternak S., Vilibic-Cavlek T., Kaie B. et al. Virologie and epidemiological characteristics of non-polio infection in Croatia over a ten-year period (2000-2009) // Acta Med. Croatica. - 2011. - Vol. 65, No. 3. - P. 237-242.
158. Lu J., Yi L., Zhao J. et al. Enterovirus 71 disrupts interferon signaling by reducing the level of interferon receptor 1 // J. Virol. - 2012. - Vol. 86, No. 7. -P. 3767-3776.
159. Lukashev A. N., Lashkevich V. A., Ivanova O. E. et al. Recombination in circulating enteroviruses // J. Virol. - 2003. - Vol. 77. - P. 10423-10431.
160. Lukashev A.N., Lashkevich V.A., Ivanova O.E. et al. Recombination in circulating Human enterovirus B: independent evolution of structural and nonstructural genome regions // J. Gen. Virol. - 2005. - Vol. 86 (Pt 12). - P. 32813290.
161. Lukashev A. N., Lashkevich V. A., Koroleva G. A. et al. Recombination in uveitis-causing enterovirus strains // J. Gen. Virol. - 2004. - Vol. 85. - P. 463470.
162. Lu Q.B., Zhang X.A., Wo Y. et al. Circulation of Coxsackievirus A10 and A6 in hand-foot-mouth disease in China, 2009-2011 // PLoS One. - 2012. -Vol. 7, No. 12 (e52073). - P. 1-8.
163. Macadam A.J., Arnold C., Howlett J. et al. Reversion of the attenuated and temperature-sensitive phenotypes of the Sabin type 3 strain of poliovirus in vaccines // Virology. - 1989. - Vol. 172. - P. 408^114.
164. Macadam A.J., Ferguson G., Fleming T. et al. Role for poliovirus protease 2A in cap independent translation // J. EMBO. - 1994. - Vol. 13, No. 4. - P. 924-927.
165. Macadam A.J., Pollard S. R., Ferguson G. et al. The 5" noncoding region of the type 2 poliovirus vaccine strain contains determinants of attenuation and temperature sensitivity//Virology. - 1991. - Vol.181. - P. 451-458.
166. Ma J.T., Chen H., Yuan F. et al. Typing and identification of non-polio enterovirus from acute flaccid paralysis cases in Ningxia, 1997-2011 // Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. - 2012. - Vol. 33, No. 11. - P. 11631166.
167. Mao N., Zhao L., Zhu Z. et al. An aseptic meningitis outbreak caused by echovirus 6 in Anhui province, China // J. Med. Virol. - 2010. - Vol. 82, No. 3. _p. 441-445.
168. Martínez-Gil L., Bañó-Polo M., Redondo N. et al. Membrane integration of poliovirus 2B viroporin // J. Virol. - 2011. - Vol. 85, No. 21. - P. 1131511324.
169. McLean D.M., Chatiyanonda K., Ladyman S.R., Brownlee J.E. Gastroenteritis of infants in two Canadian communities // J. Can. Med. Assoc. -1970.-Vol. 102, No. 12.-P. 1247-1251.
170. Melchers W.J.G., Hoenderop J. G. J., Bruins Slot H. J. et al. Kissing of two predominant hairpin loops in the coxsackievirus B virus 3" untranslated region is the essential structural feature of the origin of replication required for negativestrand RNA synthesis // J. Virol. - 1997. - Vol. 71. - P. 686-696.
171. Merkle I., van Ooij M.J., van Kuppeveld F.J. et al. Biological significance of a human enterovirus B-specific RNA element in the 3' nontranslated region // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, No. 19. - P. 9900-9909.
172. Minor P.D. Attenuation and reversion of the Sabin vaccine strains of poliovirus // Dev. Biol. Stand. - 1993. - Vol. 78. - P. 17-26.
173. Minor P.D., Ferguson M., Evans D.M. et al. Antigenic structure of polioviruses of serotypes 1, 2 and 3 // J. Gen. Virol. - 1986. - Vol. 67 (Pt 7). -P. 1283-1291.
174. Minor P.D. Polioviruses. General Features // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 73.-P. 1-19.
175. Minor P.D. The molecular biology of poliovaccines // J. Gen. Virol. -1992. - Vol. 73. - P. 3065-3077.
176. Mirand A., Henquell C., Archimbaud C. et al. Outbreak of hand, foot and mouth disease/herpangina associated with coxsackievirus A6 and A10 infections in 2010, France: a large city wide, prospective observational study // Clin. Microbiol. Infect.-2012.-Vol. 18, No. 5.-P. 110-118.
177. Miyoshi M., Komagome R., Ishida S. et al. Genomic characterization of echovirus 6 causing aseptic meningitis in Hokkaido, Japan: a novel cluster in the nonstructural protein coding region of human enterovirus B // Arch. Virol. -2013. - vol. 158, No. 4. - P. 775-784.
178. Momoki S.T. Surveillance of enterovirus infections in Yokohama city from 2004 to 2008 // Jpn. J. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 62, No. 6. - P. 471-473.
179. Muckelbauer J.K., Kremer M., Minor I. et al. The structure of coxsackievirus B3 at 3.5 A resolution // Structure. - 1995. - Vol. 3. - P. 653667.
180. Muir P., Kämmerer U., Korn K. et al. Molecular typing of enteroviruses: current status and future requirements // Clin. Microbiol. Rev. - 1998. - Vol. 11, No. 1. - P. 202-227.
181. Murray K.E., Steil B. P., Roberts A. W., Barton D. J. Replication of poliovirus RNA with complete internal ribosome entry site deletions // J. Virol. - 2004. - Vol. 78. - P. 1393-1402.
182. Murray M.G., Bradley J., Yang X.-F. et al. Poliovirus host range is determined by a short amino acid sequence in neutralization antigenic site I // Science. - 1988. - Vol. 241. - P. 213-215.
183. Nairn C., Clements G.B. A study of enterovirus isolations in Glasgow from 1977 to 1997 // J. Med. Virol. - 1999. - Vol. 58, No. 3. - P. 304-312.
184. National Center for Biotechnology Information. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/.
185. Neznanov N., Kondratova A., Chumakov K. M. et al. Poliovirus protein 3A inhibits tumor necrosis factor (TNF)-induced apoptosis by eliminating the TNF receptor from the cell surface // J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 10409-10420.
186. Nicholson R., Pelletier J., Le S. Y., Sonenberg N. Structural and functional analysis of the ribosome landing pad of poliovirus type 2: in vivo translation studies // J. Virol. - 1991. - Vol. 65. - P. 5886-5894.
187. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all Enterovirus serotypes from original clinical specimens // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44, No. 8. - P. 2698-2704.
188. Nunez J.I., Baranowski E., Molina N. et al. A single amino acid substitution in nonstructural protein 3A can mediate adaptation of foot-and-mouth disease virus to the guinea pig // J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 3977-3983.
189. Nyangao J.W., Kingori P., Okoth F.A. Detection and identification of echovirus 7 from a child with gastro-enteritis // East Afr. Med. J. - 2006. - Vol. 83, No. 12.-P. 666-669.
190. Oberste M.S., Maher K., Kennett M.L. et al. Molecular epidemiology and genetic diversity of echovirus type 30 (E30): genotypes correlate with temporal dynamics of E30 isolation // J. Clin. Microbiol. - 1999. - Vol. 37, No. 12. - P. 3928-3933.
191. Oberste M.S., Maher K., Kilpatrick D.R. et al. Typing of human enteroviruses by partial sequencing of VP1 // J. Clin. Microbiol. - 1999. - Vol. 37,No. 5.-P. 1288-1293.
192. Oberste M.S., Maher K., Kilpatrick D.R., Pallansch M.A. Molecular evolution of the human enteroviruses: correlation of serotype with VP1 sequence and application to picornavirus classification // J. Virol. - 1999. -Vol. 73, No. 3. - P. 1941-1948.
193. Oberste M.S., Maher K., Nix W.A. et al. Molecular identification of 13 new enterovirus types, EV79-88, EV97, and EV100-101, members of the species Human Enterovirus B // Virus. Res. - 2007. - Vol. 128. - P. 34-42.
194. Oberste M.S., Mäher K., Pallansch M. A. Evidence for frequent recombination within species Human enterovirus B based on complete genomic sequences of all thirty-seven serotypes // J. Virol. - 2004. - Vol. 78. - P. 855867.
195. Oberste M.S., Mäher K., Pallansh M.A. Molecular phylogeny of all human enterovirus serotypes based on comparison of sequences of the 5' and of the region encoding VP2 // Virus. Res. - 1998. - Vol. 58. - P. 35-43.
196. Oberste M.S, Mäher K., Schnurr D. et al. Enterovirus 68 is associated with respiratory illness and shares biological features with both the enteroviruses and the rhinoviruses // J. Gen. Virol. - 2004. - Vol. 85, No. 9. - P. 2577-2584.
197. Oberste M.S., Mäher K., Williams A.J. et al. Species-specific RT-PCR amplification of human enteroviruses: a tool for rapid species identification of uncharacterized enteroviruses // J. Gen. Virol. - 2006. - Vol. 87, No. 1. - P. 119-128.
198. Oberste M.S., Peñaranda S., Mäher K., Pallansch M. A. Complete genome sequences of all members of the species Human enterovirus A // J. Gen. Virol. -2004.-Vol. 85.-P. 1597-1607.
199. Oberste M.S., Peñaranda S., Pallansch M. A. RNA recombination plays a major role in genomic change during circulation of Coxsackie B viruses // J. Virol. - 2004. - Vol. 78. - P. 2948-2955.
200. Oprisan G., Combiescu M., Guillot S. et al. Natural genetic recombination between co-circulating heterotypic enteroviruses // J. Gen. Virol. - 2002. - Vol. 83.-P. 2193-2200.
201. Ortner B., Huang C.W., Schmid D. et al. Epidemiology of enterovirus types causing neurological disease in Austria 1999-2007: detection of clusters of echovirus 30 and enterovirus 71 and analysis of prevalent genotypes // J. Med. Virol. - 2009. - Vol. 81, No. 2. - P. 317-324.
202. Outbreak of diarrhea in a day nursery in Ontario. Epidemiologic report // Can. Med. Assoc. J. - 1985. - V. 132, No. 10. - P. 1171-1172.
203. Pabbaraju К., Wong S., Chan E.N., Tellier R. Genetic characterization of a Coxsackie A9 virus associated with aseptic meningitis in Alberta, Canada in 2010//Virol. J.-2013.-Vol. 10, No. 93.-P. 1-9.
204. Palacios G., Casas I., Cisterna D. et al. Molecular epidemiology of echovirus 30: temporal circulation and prevalence of single lineages // J. Virol. - 2002. -Vol. 76, No. 10. - P. 4940-4949.
205. Pallansch M., Roos R. Enteroviruses: Polioviruses, Coxsackieviruses, Echoviruses, and Newer Enteroviruses // In: Knipe D.M., Howley P.M., eds. Fields Virology, 5th Edition. - Philadelphia PA: Lippincott Williams & Wilkins. - 2007. - P. 840-893.
206. Papa A., Skoura L., Dumaidi K. et al. Molecular epidemiology of Echovirus 6 in Greece // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 28, No. 6. - P. 683-687.
207. Park K., Lee В., Baek K. et al. Enteroviruses isolated from herpangina and hand-foot-and-mouth disease in Korean children // Virol. J. - 2012. - Vol. 9, No. 205.-P. 1-6.
208. Park S.H., Choi S.S., Oh S.A. et al. Detection and characterization of enterovirus associated with herpangina and hand, foot, and mouth disease in Seoul, Korea // Clin. Lab. - 2011. - Vol. 57, No. 11-12. - P. 959-967.
209. Parsley T.B., Cornell C.T., Semler B.L. Modulation of the RNA binding and protein processing activities of poliovirus polypeptide 3CD by the viral RNA polymerase domain // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, No. 18. - P. 1286712876.
210. Paul A.V., Cao X., Harris K. S. et al. Studies with poliovirus polymerase 3Dpol. Stimulation of poly(U) synthesis in vitro by purified poliovirus protein ЗАВ //J. Biol. Chem. - 1994. - Vol. 269. - P. 29173-29181.
211. Paul A.V., van Boom J.H., Filippov D., Wimmer E. Protein-primed RNA synthesis by purified poliovirus RNA polymerase // Nature. - 1998. - Vol. 393, No. 6682. - P. 280-284.
212. Pelletier J., Sonenberg N. Internal initiation of translation of eukaryotic mRNA directed by a sequence derived from poliovirus RNA // Nature. - 1988. -Vol. 334. P. 320-325.
213. Perera D., Yusof M.A., Podin Y. et al. Molecular phylogeny of modern coxsackievirus A16 // Arch. Virol. - 2007. - Vol. 152, No. 6. - P. 1201-1208.
214. Perevoscikovs J., Brila A., Firstova L. et al. Ongoing outbreak of aseptic meningitis in South-Eastern Latvia, June - August 2010 // Euro Surveill. -2010.-Vol. 15, No. 32.-P. 19639.
215. Perona J.J., Craik C.S. Structural basis of substrate specificity in the serine proteases // Protein Sci. - 1995. - Vol. 4, No. 3. - P. 337-360.
216. Pham N.T., Trinh Q.D., Chan-It W. et al. A novel RT-multiplex PCR for detection of Aichi virus, human parechovirus, enteroviruses, and human bocavirus among infants and children with acute gastroenteritis // J. Virol. Methods.-2010.-Vol. 169, No. l.-P. 193-197.
217. Phan T.G., Nguyen T.A., Shimizu H. et al. Identification of enteroviral infection among infants and children admitted to hospital with acute gastroentritis in Ho Chi Minh City, Vietnam // J. Med. Virol. - 2005. - Vol. 77, No. 2.-P. 257-264.
218. Phan T.G., Nguyen T.A., Yan H. et al. A novel RT-multiplex PCR for enteroviruses, hepatitis A and E viruses and influenza A virus among infants and children with diarrhea in Vietnam // Arch. Virol. - 2005. -Vol. 150, No. 6. -P. 1175-1185.
219. Picornaviridae Home Page. Available from: http://www.picornaviridae.com/.
220. Pilipenko E.V., Blinov V.M., Romanova L.I. et al. Conserved structural domains in the 5'-untranslated region of picornaviral genomes: an analysis of the segment controlling translation and neurovirulence // Virology. - 1989. -Vol.165.-P. 42-50.
221. Pilipenko E.V., Poperechny K. V., Maslova S. V. et al. C/s-element, 0/7'R, involved in the initiation of (-) strand poliovirus RNA: a quasi-globular multi-
domain RNA structure maintained by tertiary ('kissing') interactions // EMBO J. - 1996. - Vol. 15. - P. 5428-5436.
222. Plotch S.J., Palant O. Poliovirus protein 3AB forms a complex with and stimulates the activity of the viral RNA polymerase, 3Dpol // J. Virol. - 1995. -Vol. 69.-P. 7169-7179.
223. Polio global eradication initiative. Available from: http://www.polioeradication.org.
224. Poyry T., Kinnunen L., Hyypia T. et al. Genetic and phylogenetic clustering of enteroviruses // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77, No. 8. - P. 1699-1717.
225. Racaniello V.R. Picornaviridae: The Viruses and Their Replication // In: Knipe D.M., Howley P.M., eds. Fields Virology, 5th Edition. - Philadelphia PA: Lippincott Williams & Wilkins. - 2007. - P. 796-839.
226. Rakoto-Andrianarivelo M., Guillot S., Iber J. et al. Co-circulation and evolution of polioviruses and species C enteroviruses in a district of Madagascar // PLoS Pathog. - 2007. - Vol. 3, No. 12. - P. 191.
227. Ramos-Alvarez M., Sabin A.B. Enteropathogenic viruses and bacteria // L. A. M. A. - 1958.-Vol. 167, No. 2.-P. 147-156.
228. Ramsingh A.I., Collins D. N. A point mutation in the VP4 coding sequence of coxsackievirus B4 influences virulence // J. Virol. - 1995. - Vol. 69. - P. 7278-7281.
229. Reimann B.Y., Zell R., Kandolf R. Mapping of a neutralizing antigenic site of Coxsackievirus B4 by construction of an antigen chimera // J. Virol. - 1991. - Vol. 65, No. 7. - P. 3475-3480.
230. Reuer Q., Kuhn R.J., Wimmer E. Characterization of poliovirus clones containing lethal and nonlethal mutations in the genome-linked protein VPg // J. Virol. - 1990. - Vol. 64, No. 6. - P. 2967-2975.
231. Rico-Hesse R., Pallansch M.A., Nottay B.K., Kew O.M. Geographic distribution of wild poliovirus type 1 genotypes // Virology. - 1987. - Vol. 160, No. 2.-P. 311-322.
232. Rogers S.L., Nix W.A., Oberste M.S. et al. Hand, foot, and mouth disease caused by coxsackievirus A6 // Emerg. Infect. Dis. - 2012. - Vol. 18, No. 10. -P. 1702-1704.
233. Roivainen M., Hyypia T., Piirainen L. et al. RGD-dependent entry of coxsackievirus A9 into host cells and its bypass after cleavage of VP1 protein by intestinal proteases // J. Virol. - 1991. - Vol. 65. - P. 4735-4740.
234. Romero J.R., Price C., Dunn J. J. Genetic divergence among the group B coxsackieviruses // Curr. Top. Microbiol. Immunol. - 1997. - Vol. 223. - P. 97-152.
235. Roth B., Enders M., Arents A. et al. Epidemiologic aspects and laboratory features of enterovirus infections in Western Germany, 2000-2005 // J. Med. Viro. - 2007. - Vol. 79, No. 7. - P. 956-962.
236. Sadeuh-Mba S.A., Bessaud M., Massenet D. et al. Enteroviruses in Cameroon and neighbouring countries: high frequency and diversity of species C enteroviruses // J. Clin. Microbiol.-2013.-Vol. 51, No. 3.-P. 759-770.
237. Santti J., Harvala H., Kinnunen L., Hyypia T. Molecular epidemiology and evolution of coxsackievirus A9 // J. Gen. Virol. - 2000. - Vol. 81 (Pt 5). - P. 1361-1372.
238. Santti J., Hyypia T., Kinnunen L., Salminen M. Evidence of recombination among enteroviruses // J. Virol. - 1999. - Vol. 73, No. 10. - P. 8741-8749.
239. Savolainen C., Hovi T., Mulders M.N. Molecular epidemiology of echovirus 30 in Europe: succession of dominant sublineages within a single major genotype // Arch. Virol. - 2001. - Vol. 146, No. 3. - P. 521-537.
240. Shen M., Reitman Z.J., Zhao Y. et al. Picornavirus genome replication. Identification of the surface of the poliovirus (PV) 3C dimer that interacts with PV 3Dpol during VPg uridylylation and construction of a structural model for the PV 3C2-3Dpol complex // J. Biol. Chem. - 2008. - Vol. 283, No. 2. - P. 875-888.
241. Silva P.A., Stark K., Mockenhaupt F.P. et al. Molecular characterization of enteric viral agents from children in northern region of Ghana // J. Med. Virol. -2008.-Vol. 80, No. 10.-P. 1790-1798.
242. Simoes E.A., Sarnow P. An RNA hairpin at the extreme 5' end of the poliovirus RNA genome modulates viral translation in human cells // J. Virol. -1991.-Vol. 65.-P. 467-470.
243. Simonen-Tikka M.L., Hiekka A.K., Klemola P. et al. Early human enterovirus infections in healthy Swedish children participating in the PRODIA pilot study // J. Med. Virol. - 2012. - Vol. 84, No. 6. - P. 923-930.
244. Skinner M.A., Racaniello V.R., Dunn G. et al. New model for the secondary structure of the 5' non-coding RNA of poliovirus is supported by biochemical and genetic data that also show that RNA secondary structure is important in neurovirulence // J. Mol. Biol. - 1989. - Vol. 207. - P. 379-392.
245. Smith T.J., Kremer M.J., Luo M. et al. The site of attachment in human rhinovirus 14 for antiviral agents that inhibit uncoating // Science. - 1986. -Vol. 233.-P. 1286-1293.
246. Smyth M.S., Martin J.H. Picornavirus uncoating // J. Clin. Pathol.: Mol. Pathol. - 2002. - Vol. 55. - P. 214-219.
247. Sommergruber W., Ahorn H., Zoephel A. et al. Cleavage specificity on synthetic peptide substrates of human rhinovirus 2 proteinase 2A // J. Biol. Chem. - 1992. - Vol. 267. - P. 22639-22644.
248. Stadnick E., Dan M., Sadeghi A., Chantler J.K. Attenuating mutations in coxsackievirus B3 map to a conformational epitope that comprises the puff region of VP2 and the knob of VP3 // J. Virol. - 2004. - Vol. 78, No. 24. - P. 13987-14002.
249. Stanway G., Joki-Korpela P., Hyypia T. Human parechoviruses - biology and clinical significanse // Med. Virol. - 2000. - Vol. 10, No. 1. - P. 57-69.
250. Stirk H.J., Thornton J.M. The BC loop in poliovirus coat protein VP1: an ideal acceptor site for major insertions // Protein Eng. - 1994. - Vol. 7, No. 1. -P. 47-56.
251. Syriopoulou V.P., Hadjichristodoulou Ch., Daikos G.L. et al. Clinical and epidemiological aspects of an enterovirus outbreak in a neonatal unit // J. Hosp. Infect. - 2002. - Vol. 51, No. 4. - P. 275-280.
252. Tam P.E., Weber-Sanders M.L., Messner R.P. Multiple viral determinants mediate myopathogenicity in coxsackievirus Bl-induced chronic inflammatory myopathy // J. Virol. - 2003. - Vol. 77, No. 21. - P. 11849-11854.
253. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods // Mol. Biol. Evol. - 2011. - Vol. 28, No. 10. -P. 2731-2739.
254. Tao Z.X., Li Y., Wang H.Y. et al. Genotype distribution of enterovirus A species isolated in Shandong Province, China // Bing Du Xue Bao. - 2009. -Vol. 25,No. 6.-P. 410^114.
255. Tao Z.X., Song Y., Wang H. et al. Intercity spread of echovirus 6 in Shandong Province, China: application of environmental surveillance in tracing circulating enteroviruses // Appl. Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78, No. 19. -P. 6946-6953.
256. Teterina N.L., Egger D., Bienz K. et.al. Requirements for assembly of poliovirus replication complexes and negative-strand RNA synthesis // J. Virol. -2001.-Vol. 75, No. 8.-P. 3841-3850.
257. Teterina N.L., Rinaudo M. S., Ehrenfeld E. Strand-specific RNA synthesis defects in a poliovirus with a mutation in protein 3A // J. Virol. - 2003. - Vol. 77.-P. 12679-12691.
258. Thompson A.A., Peersen O.B. Structural basis for proteolysis-dependent activation of the poliovirus RNA-dependent RNA polymerase // EMBO J. -2004. - Vol. 23. - P. 3462-3471.
259. Trallero G., Avellon A., Otero A. et al. Enteroviruses in Spain over the decade 1998-2007: virological and epidemiological studies // J. Clin. Virol. -2010. - Vol. 47, No. 2. - P. 170-176.
260. van Ooij M.J., Vogt D.A., Paul A. et al. Structural and functional characterization of the coxsackievirus B3 CRE(2C): role of CRE(2C) in negative- and positive-strand RNA synthesis // J. Gen. Virol. - 2006. - Vol. 87 (Ptl).-P. 103-113.
261. Wang J., Bakkers J. M. J. E., Galama J. M. D. et al. Structural requirements of the higher order RNA kissing element in the enteroviral 3"UTR // Nucleic Acids Res. - 1999. - Vol. 27. - P. 485^190.
262. Weidman M.K., Yalamanchili P., Ng B. et al. Poliovirus 3C protease-mediated degradation of transcriptional activator p53 requires a cellular activity // Virology. - 2001. - Vol. 291, No. 2. - P. 260-271.
263. Wells V.R., Plotch S. J., De Stefano J. J. Determination of the mutation rate of poliovirus RNA-dependent RNA polymerase // Virus. Res. - 2001. - Vol. 74, No. 1-2.-P. 119-132.
264. Wessels E., Duijsings D., Niu T.-K. et al. A viral protein that blocks Arfl-mediated COP-I recruitment by inhibiting the guanine nucleotide exchange factor GBF1 //Dev. Cell. -2006. -Vol. 11.-P. 191-201.
265. Wessels E., Duijsings D., Notebaart R. A. et al. A proline-rich region in the coxsackievirus 3A protein is required for the protein to inhibit endoplasmic reticulum-to-Golgi transport // J. Virol. - 2005. - Vol. 79. - P. 5163-5173.
266. Willian S., Tracy S., Chapman N. Mutations in a conserved enteroviral RNA oligonucleotide sequence affects positive strand viral RNA synthesis // Arch. Virol.-2000.-Vol. 145, No. 10.-P. 2061-2086.
267. Wimmer E., Hellen C.U.T., Cao X.M. Genetics of poliovirus // Annu. Rev. Genet. - 1993. - Vol. 27. - P. 353-436.
268. Witso E., Palacios G., Cinek O. et al. High prevalence of human enterovirus A infections in natural circulation of human enteroviruses // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44, No. 11. - P. 4095-4100.
269. Wong J., Zhang J., Yanagawa B. et al. Cleavage of serum response factor mediated by enteroviral protease 2A contributes to impaired cardiac function // Cell Res. - 2012. - Vol. 22, No. 2. - P. 360-371.
270. Wright P.W., Strauss G.H., Langford M.P. Acute hemorrhagic conjunctivitis // Am Fam. Physician. - 1992. - Vol. 45, No. 1. - P. 173-178.
271. Wu P.C., Huang L.M., Kao C.L. et al. An outbreak of coxsackievirus A16 infection: comparison with other enteroviruses in a preschool in Taipei // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2010. - Vol. 43, No. 4. - P. 271-277.
272. Xiao C., Bator C.M., Bowman V.D. et al. Interaction of coxsackievirus A21 with its cellular receptor, ICAM-1 // J. Virol. - 2001. - Vol. 75. - P. 24442451.
273. Xiao C., Bator-Kelly C.M., Rieder E. et al. The crystal structure of coxsackievirus A21 and its interaction with ICAM-1 // Structure. - 2005. -Vol. 13.-P. 1019-1033.
274. Xiao D. L. Strategy of prevention and control for HFMD in China // APEC conference for the surveillance, treatment, laboratory diagnostics and vaccine development of enteroviruses. - Taipei. - 2009. - P. II-1-3.
275. Xie S., Wang K., Yu W. et al. DIDS blocks a chloride-dependent current that is mediated by the 2B protein of enterovirus 71 // Cell Res. - 2011. - Vol. 21, No. 8.-P. 1271-1275.
276. Xing L., Tjarnlund K., Lindqvist B. et al. Distinct cellular receptor interactions in poliovirus and rhinoviruses // EMBO J. - 2000. - Vol. 19. - P. 1207-1216.
277. Yalamanchili P., Datta U., Dasgupta A. Inhibition of host cell transcription by poliovirus: cleavage of transcription factor CREB by poliovirus-encoded protease 3Cpro // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, No. 2. - P. 1220-1226.
278. Yamashita T., Ito M., Taniguchi A., Sakae K. Prevalence of coxsackievirus A5, A6, and A10 in patients with heipangina in Aichi Prefecture, 2005 // Jpn. J. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 58, No. 6. - P. 390-391.
279. Yin H., Berg A. K., Westman J. et al. Complete nucleotide sequence of a coxsackievirus B^l strain capable of establishing persistent infection in human pancreatic islet cells: effects on insulin release, proinsulin synthesis, and cell morphology // J. Med. Virol. - 2002. - Vol. 68. - P. 544-557.
280. Yin-Murphy M., Almond J.W. Picornaviruses // In: Baron S., editor. Medical Microbiology, 4th edition. - Galveston (TX): University of Texas Medical Branch at Galveston. - 1996. - Chapter 53.
281. Yip C.C., Lau S.K., Woo P.C. et al. Complete genome sequence of a coxsackievirus A22 strain in Hong Kong reveals a natural intratypic recombination event // J. Virol. - 2011. - Vol. 85, No. 22. - P. 12098-12099.
282. Zavate O., Avram G., Constantiniu S., Ivan A. Mixed viral-bacterial infections in infants with gastroenteritis // Virology. - 1988. - Vol. 39, No. 2. -P. 131.
283. Zhang Y., Wang D., Yan D. et al. Molecular evidence of persistent epidemic and evolution of subgenotype B1 coxsackievirus A16-associated hand, foot, and mouth disease in China // J. Clin. Microbiol. - 2010. - Vol. 48, No. 2. - P. 619-622.
284. Zong W., He Y., Yu S. et al. Molecular phylogeny of Coxsackievirus A16 in Shenzhen, China, from 2005 to 2009 // J. Clin. Microbiol. - 2011. - Vol. 49, No. 4.-P. 1659-1661.
\
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.