Модуляция экспрессии генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода каскадами HIF1A и NF-kB и их агонистами и антагонистами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Чмыхало Виктор Константинович

• Чмыхало Виктор Константинович
• кандидат наук
• 2022

Оглавление диссертации кандидат наук Чмыхало Виктор Константинович

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Стволовые клетки рака

1.2 Эпительно-мезенхимальный переход

1.3 Роль ЭМП в эволюции онкологических заболеваний

1.4 Функционирование каскадов Wnt/бета-катенина и Hedgehog в неопластических клетках

1.5 Роль каскада NF-kB в процессах ЭМП

1.6 Роль каскада HIF1A в процессах ЭМП

2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Клетки линии HeLa и их культивирование

2.2 Оценка цитотоксического эффекта

2.3 Дизайн РНК-интерференционного исследования

2.4 Дизайн, модификации малых интерферирующих РНК, приготовление дуплексов

2.5 РНК-интерференционная трансфекция и обработка клеток куркумином и кверцетином

2.6 Выделение РНК, проверка целостности РНК и чистоты выделения, ДНКазная обработка и обратная транскрипция

2.7 Дизайн и синтез праймеров

2.8 Количественная ПЦР и оценка эффективности реакции

3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Исследование цитотоксического эффект низкомолекулярных агентов на культуру клеток HeLa

3.1.1 Оценка цитотоксического эффекта сульфорафана и берберина

3.1.2 Оценка цитотоксического эффекта куркумина

3.1.3 Оценка цитотоксического эффекта кверцетина

3.1.3 Оценка цитотоксического эффекта 8-хинолинола

3.2 Исследование экспрессии генов-мишеней сигнального каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии низкомолекулярными

агентами

3.2.1 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии сульфорафана

3.2.2 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии куркумина

3.2.3 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии кверцетина

3.2.4 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии берберина

3.2.5 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии 8-хинолинола

3.3 Исследование экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии низкомолекулярными агентами на фоне нокдауна генов RELA и HIF1A

3.3.1 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии куркумина на фоне нокдауна генов HIF1A и RELA

3.3.2 Результаты исследования экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt и Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП при воздействии куркумина на фоне нокдауна генов HIF1A и RELA

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

AKT - киназа Akt

AMPK - цАМФ-активируемая протеинкиназа

AP-1 - активирующий белок

CDH1 - E-кадгерин

CDH2 - N-кадгерин

CTNNB1 - бета-катенин

GLI1 - цинк-пальциевый белок GLI1

GLI2 - цинк-пальциевый белок GLI2

HIF1A - гипоксия-индуцибельный фактор 1 альфа

MAPK - митоген-активируемые киназы

MMP2 - матриксная металлопротеиназа

MMP9 - матриксная металлопротеиназа

MTOR - мишень рапамицина у млекопитающих

NF-kB - ядерный актор каппа би

NFE2L2 - фактор 2, родственный ядерному эритроидному фактору

PI3K - фосфотидилинтозитол-3-зависимая киназа

RELA - транскрипционный фактор p65

RISC - РНК-индуцированный комплекс выключения гена

SMAD - гомологи Mothers against decapentaplegic

SNAI1 - цинк-пальциевый белок SNAI1

SNAI2 - цинк-пальциевый белок SNAI2

TGFß - трансформирующий фактор роста бета

TWIST1 - белок 1, родственный Twist

Wnt - лиганд Wnt

7ЕВ1 - цинк-пальциевый гомеобокс 1, связывающийся с Е-боксом 7ЕВ2 - цинк-пальциевый гомеобокс 2, связывающийся с Е-боксом ИЦХ - иммуноцитохимия

ОТ-ПЦР - полимеразная цепная реакция с обратной транскприпцией

СКР - стволовые клетки рака

ЭМП - эпителиально-мезенхимальный переход

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность работы. Одной из наиболее острых проблем в современной онкологии остается рецидив онкологических заболеваний, который в долгосрочной перспективе связан с применением тех или иных химиотерапевтических агентов. Источником рецидива являются стволовые клетки рака (СКР), которые либо существовали в исходной опухоли, либо возникли из популяции транзитных амплификаторных раковых клеток в ответ на химиотерапию (Enderling et al., 2013). Одним из ключевых механизмов возникновения новых СКР является эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП), который также выступает в роли инструмента для приобретения свойств опухоли, обуславливающих неблагоприятный прогноз выздоровления пациента (Wang et al., 2015).

У человека запуск ЭМП, как и при эмбриональном развитии и регенерации повреждениях, так и при формировании фиброзов и опухолей, происходит при активации ряда транскрипционных факторов семейств Snail (SNAI1 и SNAI2), Twist (TWIST1 и TWIST2) и Zeb (ZEB1 и ZEB2) (Nieto et al., 2016). Мишенями данных белков являются гены, ответственные, как за смену клеточного фенотипа, так за секрецию факторов, ремодулирующих межклеточный матрикс. В свою очередь активность генов-регуляторов ЭМП находится под контролем сигнальных каскадов клеточной защиты и адаптации в ответ на стрессовое воздействие, среди которых главную роль играют гипоксия-индуцибельный фактор 1 альфа (HIF1A) и ядерный фактор каппа-би (NF-kB) (Cheng et al., 2014). Активация сигнальных каскадов HIF1A и NF-kB может способствовать возникновению СКР в ответ на химиотерапию не только посредством запуска ЭМП, но также и инициацией каскадов Wnt/B-катенина и Hedgehog, которые являются наиболее перспективными мишенями в терапии, направленной против СКР, и вовлечены в поддержании статуса "стволовости" в неопластических клетках (Zhang et al., 2016).

За последний десяток лет список перспективных агентов антистволовоклеточной терапии, а также модуляторов сигнальных каскадов HIF1A и NF-kB значительно пополнился низкомолекулярными агентами из природного сырья. Куркумин, берберин, сульфорафан, кверцетин и 8-хинолинол

воспринимаются как перспективные лекарственные средства против онкологических заболеваний (Avila-Carrasco et al., 2019; Ezzati et al., 2020; Reyes-Farias, Carrasco-Pozo, 2019). Однако для некоторых веществ, таких как кверцетин или 8-хинолинол, из ряда перечисленных агентов картина взаимодействия с сигнальными каскадами, вовлеченных в физиологию СКР и их образование, содержит много белых пятен, которые не позволяют с полной уверенностью оценить риски их химиотерапии. Выявление деталей вышеописанных взаимодействий поспособствует более быстрой трансляции данных агентов в практику и улучшению контроля возможных побочных эффектов в долгосрочной перспективе.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Модуляция экспрессии генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода каскадами HIF1A и NF-kB и их агонистами и антагонистами»

Цель работы.

Исследовать модуляцию экспрессии генов каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog и генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода сигнальными каскадами HIF1A и NF-kB и их агонистами и антагонистами в культуре опухолевых клеток человека.

Задачи исследования.

1. Установить паттерн экспрессии генов каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog и генов-регуляторов ЭМП в культуре клеток HeLa при РНК-интерференции против мРНК HIF1A и RELA.

2. Оценить экспрессию генов каскадов Wnt/B-катенина (CTNNB1), Hedgehog (GLI1, GLI2, MMP2 и MMP9) и генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода (SNAI1, SNAI2, TWIST1, ZEB1 и ZEB2) в культуре клеток HeLa при воздействии агонистами и антагонистами каскадов HIF1A и NF-kB.

3. Провести исследование экспрессии генов каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog и генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода в культуре клеток HeLa на фоне комбинированной РНК-интерференции против мРНК HIF1A и RELA совместно при воздействии исследуемых веществ.

4. Выявить характер взаимодействий между компонентами исследуемых каскадов на основе паттернов экспрессии вышеуказанных в зависимости от состояния каскадов HIF1A и NF-kB.

Научная новизна работы.

Впервые проведен комплексный анализ модуляции экспрессии генов-мишеней сигнальных каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog и генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода низкомолекулярными агонистами и антагонистами каскадов HIF1A и NF-kB в культуре клеток HeLa.

Впервые показано явление гиперактивации экспрессии генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода в ответ на воздействие сульфарафаном, куркумином, кверцетином, берберином и 8-хинолинолом.

Впервые установлена роль комплекса RISC в регуляции экспрессии TWIST1 как ингибитора его активности в базальных условиях.

Впервые продемонстрировано совместное влияние каскадов HIF1A и NF-kB на системы запуска регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода при обработке куркумином и кверцетином в исследованных концентрациях in vitro.

Положения, выносимые на защиту.

1. Подавление активности каскадов HIF1A и NF-kB, как за счет малых интерферирующих РНК, так и за счет введения куркумина и кверцетина, приводит к снижению экспрессии мРНК транскрипционных факторов сигнального каскада Hedgehog - GLI1 и GLI2 - и его мишени - MMP9. Это указывает на прямую зависимость активности Hedgehog от функционирования надкаскада HIF1A/NF-kB .

2. Базальная активность комплекса RISC необходима для подавления экспрессии TWIST1 , причем по типу микроРНК-зависимой деградации соответствующей мРНК. В изученной системе это уникальная черта данного транскприпционного фактора.

3. Ген SNAI1 является самым реактивным и гиперадаптивным фактором среди исследованных генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода, рост экспрессии которого происходит в ответ на все исследованные воздействия на активность каскадов HIF1A и NF-kB.

4. Каскады HIF1A и NF-kB обладают способностью и активировать, и подавлять экспрессию транскрипционных факторов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода. Конкретный характер взаимодействий элементов этой

надсистемы определяется статусом работы надкаскада HIF1A/NF-kB: базальным, активированным, супрессированным и гиперактивированным

функционированием.

Апробация работы. Материалы диссертации были представлены на VIII научно-практической конференции с международным участием «Генетика -фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции» (Ростов-на-Дону, Таганрог, 2019); на Международной научной конференции "Технические и естественные науки" (Санкт-Петербург, 2019); на XIII международной научно-практической конференции, посвященной 90-летию Донского государственного технического университета, в рамках XXIII Агропромышленного форума юга России и выставки "Интерагромаш" (Ростов-на-Дону, 2020), на XVII Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Проспект свободный" (Красноярск, 2021); на международной конференции "Медицинская наука в эру цифровой трансформации" (Курск, 2021).

Структура и объем работы. Диссертация изложена на 179 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, экспериментальной части и обсуждения результатов, выводов, списка литературы (215 источников). Иллюстрационный материал включает в себя 78 рисунков и 14 таблиц.

Публикации по теме диссертации.

По материалам диссертации опубликовано 19 работ, из которых 11 статей в журналах (8 из них входящих в перечень ВАК и международные базы цитирования), 6 тезисов конференций и 2 базы данных.

Научно-практическая ценность работы.

В результате проведенного исследования были подобраны оптимальные для модуляции каскадов HIF1A и NF-kB дозировки веществ: сульфорафан, куркумин, берберин, кверцетин и 8-хинолинол. Была произведена оценка токсического воздействия указанных соединений на культуру клеток HeLa.

Результаты данной работы позволили получить сведения об особенностях паттерна экспрессии ключевых генов каскадов Wnt/B-катенина и Hedgehog, а также

генов-регуляторов ЭМП при воздействии низкомолекулярными агентами растительного происхождения вышеуказанного перечня.

Установлена роль каскадов HIF1A и NF-kB в модуляции экспрессии генов, вовлеченных в инициацию ЭМП у человека, при воздействии куркумина и кверцетина.

Материалы работы могут быть использованы при исследовании активности генов сигнальных каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog, генов-регуляторов ЭМП, особенности регуляции экспрессии данных генов каскадами HIF1A и NF-kB и влияния низкомолекулярных соединений растительного происхождения на экспрессионный профиль различных неопластических клеток. Кроме этого, полученные данные о паттерне экспрессии исследованных генов могут быть использовано для разработки новых комплексных протоколов молекулярно-генетической диагностики и прогнозирования исхода терапии онкологических заболеваний с использованием модуляторов каскадов HIF1A и - NF-kB.

Личный вклад автора. В целях реализации исследования автором был освоен ряд методик по работе с культурами клеток человека, молекулярно-генетического анализа экспрессии генов, а также методы статистической обработки полученных данных.

Благодарности. Автор выражает глубокую благодарность за помощь, поддержку и ценные рекомендации своему научному руководителю д.б.н., профессору кафедры генетики Т.П. Шкурат; младшему научному сотруднику лаборатории биомедицины ЮФУ, к.б.н. П.В. Золотухину за ценные советы и рекомендации при написании диссертации.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Стволовые клетки рака

Согласно оценке рисков возникновения рецидивов онкологических заболеваний различной этиологии, данный фактор может варьировать от 9% при пролиферативных заболеваниях крови до практически 100% в случае глиобластом или сарком мягких тканей (Табл. 1).

Таблица 1 — Риски рецидива различных онкологических заболеваний (В^^ Рптеаи, 2018)

Онкологическое заболевание Риск рецидива

Рак мочевого пузыря 50% после цистектомии

Рак молочной железы 30 %

Рак прямой кишки 17 % после хирургического удаления

Глибластома Приблизительно 100%

Опухоли головы и шеи IV стадии 17-22% после химиотерапии

Лимфома Ходжкина 10-13% после первичного лечения 20-50% после вторичного лечения

Рак почек 13%, может возрасти до 49% после химиотерапии ингибиторами тирозиновых киназ)

Детская острая лимфобластическая лейкемия 15-20%

Детская острая миелобластическая лейкемия 9-29%

Диффузная В-крупноклеточная лимфома 30-40%

Периферическая Т-клеточная лимфома 75 %

Меланома 15-41% в зависимости от стадии, 87% при метастазах

Онкологическое заболевание Риск рецидива

Немелкоклеточный рак легких 26% после хирургического удаления, 27% после химиотерапии

Остеосаркома 11-12% локального рецидива, 5-45% - риск развития метастазов

Рак яичников 85 %

Рак поджелудочной железы 36% в течение года после хирургического удаления, 38% локального рецидицива и 46% риск метастазирования после адъювантной химиотерапии

Рак простаты 24% при низкорискованном заболевании, 40% среднерискованном заболевании, 48% при высокорискованном

Саркома мягких тканей 50% после адъювантной химиотерапии, до 100% при прогрессируюей болезни

Рак щитовидной железы До 30% для разных форм, 8-14% после хирургического удаления для медулярного рака щитовидной железы

В подавляющем большинстве случаев ключевую роль в рецидиве онкологических заболеваний играют стволовые клетки рака.

Стволовые клетки рака (СКР), обладающие способностью к самообновлению и дифференциации, были интенсифицированы на основе исследования значительного перечня видов онкологических заболеваний, основываясь на их способности к формированию опухолей in vivo (Yu et al., 2012, Рукша и др., 2015). Быстрая пролиферация минорных СКР с мутациями, обуславливающих хеморезистентность, приводит к раннему рецидиву онкологических заболеваний, в то время как реактивация "спящих" СКР или образование СКР de novo из популяции амплификаторных раковых клеток приводит к позднему рецидиву (Enderling et al., 2013).

Главная проблема при терапии, направленной против СКР, это химиорезистентность данных клеток. Химиорезистентность СКР обусловлена рядом особенностей, которые могут быть использованы в качестве основных характеристик данных клеточных популяций. СКР обладают низкой скоростью

пролиферации, что позволяет им избегать влияния цитостатических препаратов, как доксорубицин, темозоломид, цисплатин, паклитаксел, этопозид, метотрексат, что позволяет СКР восстанавливать опухоль после гибели амплификаторных клеток вследствие химиотерапии (Abdullah, Chow, 2013).

Значительный вклад в развитие химиорезистентности вносят транспортеры суперсемейства АТФ-связывающих кассет (ABC). Их способность к АТФ-зависимому переносу против градиента концентрации через мембрану разнообразных лекарственных агентов оказывает решающие значение для выживания СКР. Раковые клетки вне зависимости от генезиса экспрессируют различные ABC-транспортеры, однако СКР отличаются не только повышенным уровнем экспрессии отдельных транспортеров, но и совместной экспрессией нескольких генов ABC (Begicevic, Falasca, 2017).

Неотъемлемой частью химиорезистености у СКР является ферментная система детоксикации эндогенных и экзогенных альдегидных субстратов до карбоновые кислот. Ведущую роль в этих процессах играют ферменты альгедидгедидрогенезы (ALDH), экспрессия которых при некоторых видах рака ассоциирована с неблагоприятным прогнозом. Несмотря на это, детальный механизм их действия в развитии химиорезистентости у СКР пока неизвестен (Ginestier et al., 2007).

Стоит упомянуть, что СКР обладают также и устойчивостью к апоптозу вне зависимости от его варианта запуска. Например, СКР глиом и лейкемий на своей поверхности не имеют или почти не имеют рецепторов к Fas-лиганду, либо же они обладают мутациями в данных рецепторов, которые препятствуют возможности передачи сигнала на нижележащие компоненты сигнального каскада. Альтернативно, СКР могут экспрессировать внутриклеточные ингибиторы апоптоза, так и факторы выживаемости, которые, как правило, зависят от состояния сигнального каскада NF-kB (Barbato et al., 2019).

Как средство защиты против радиотерапии, СКР используют любые доступные системы репарации ДНК. В подтверждение данных явлений было

обнаружено, что в стволовых клетках глиомы, немелкоклеточного рака легкого, повышены уровень экспрессии чекпоинт протеинкиназы в ответ на повреждения ДНК (CHEK1) и сериновой протеинкиназы ATM, играющие ведущую роль в инициации систем репарации ДНК (Barbato et al., 2019).

Суммируя вышесказанное, можно утверждать, что химио- и радиорезинстность СКР обусловлена их особенностями, такие как низкая скорость пролиферации, сверхэкспрессия ABC-транспортеров и ALDH, устойчивость к апоптозу и повышенная активности систем репарации ДНК (Barbato et al., 2019). В дополнение к повышенной хеморезистентности, СКР имеют иной метаболический профиль, отличный от даже от других опухолевых клеток, который может характеризоваться как анаэробный, гликолитический. СКР активно потребляют глюкозу ввиду вышеуказанных механизмов лекарственной устойчивости. Осуществляется это за счет экспрессии таких ферментов как транспортера глюкозы 1 (GLUTI), гексокиназы 1 и пируватдегидрогеназы киназа 1 (Snyder et al., 2018).

Нельзя не упомянуть и особое опухолевое микроокружение, которое формирует нишу для СКР. Кроме неопластических клеток, его составляют опухоль-ассоциированные фибробласты, эндотелиальные клетки, мезенхимальные стволовые клетки и иммунные клетки. Их вклад в формирование нишей для СКР осуществляется посредством секреции сигнальных лигандов и синтеза межклеточного матрикса (Barbato et al., 2019).

Для формирования основных своих особенностей и адаптации в постоянно изменяющихся условий в опухолевом микроокружении СКР могут использовать процессы эпигенетического и метаболического репрограммирования, иммуноредактирования, эпителиально-мезехимального и мезенхимально-эпителиальных переходов (Katoh, 2017, Мнихович и др., 2018). Ведущую роль в реализации данных процессах в опухолевых клетках играет набор определенных сигнальных каскадов, к примеру, каскадов лиганда Wnt и бета-катенина, гомолога Hedgehog , ядерного фактора каппа би (NF-kB), гипоксия-индуцибельного фактора 1 альфа (HIF1A), мишени рапамицина (MTOR), композитного контуру активаторного белка 1 (AP1) и фактора 2, подобному ядерному эритроидному

фактору 2 (NFE2L2). Исходя из этого, необходимо оценить вклад данных систем в физиологии СКР, а также их происхождения. Поэтому далее вначале будет рассмотрены эпителиально-мезехимального перехода, его регуляция и роль в образовании новых СКР. Затем будут удостоены внимания сигнальные каскада Wnt/бета-катенин и Hedgehog, чтобы продемонстрировать их вклад в поддержание статуса "стволовости" при онкологических заболеваниях. И, наконец, повествование продолжится о роли важнейших каскадов в адаптации опухолевых клеток, а именно NF-kB и HIF1A, и их роли в запуск эпителиально-мезехимального перехода.

1.2 Эпительно-мезенхимальный переход

Эпительно-мезенхимальный переход (epithelial-mesenchymal transition или ЭМП для краткости) согласно определению MeSH NCBI это фенотипические изменения эпителиальных клеток в клетки мезенхимального типа, которые повышают клеточную мобильность и важны во многих процессах индивидуального развития, как например, образование нервного гребешка (NCBI MeSH). Важно, что при метастазировании раковых клеток и ряде других заболеваний может происходить активация данного перехода, что будет детальнее рассмотрено ниже. Впервые термин "эпительно-мезенхимальная трансформация" был использован в работе Элизабет Хай в 1995 году (Hay, 1995) по отношению к процессам закладки первичной бороздки у куриного зародыша. Для снижения путаницы в терминологической базе с течением временем "трансформация" была замена на "переход" ввиду обнаружения сходных фенотипических клеточных изменений и в злокачественных опухолях.

ЭМП - сложный и многоступенчатый процесс, приводящий к формированию во многом диаметрально противоположного клеточного фенотипа со всеми вытекающими из этого функциями. Не стоит упускать из внимания, что при ЭМП формируются несколько сменяющихся последовательно друг друга клеточных фенотипов, объединяющие в себе свойства, как и эпителиальной, так и мезенхимальной клеточной линии, что отображено на рисунке 1 (Jordan et al., 2011).

Рисунок 1 — Характеристика стадий эпителиально-мезенхимального перехода (Nieto et al.,

2016)

Фенотипически протекание ЭМП можно отследить по изменение соотношению маркеров эпителиальной ткани к маркерам мезенхимальной с последующим уменьшением первых и увеличением числа последних. Эпителиальные клетки обладают апикально-базальной полярностью, обеспечиваемой высоко упорядоченной организацией актиновых филаментов и структурами плотных и адгезивных межклеточных контактов и десмосом. Центральную роль в данных процессах играют такие молекулы, как кадгерины, интергины и другие белки поверхностного аппарата. Они же являются главными

маркерами эпителиальных клеток. К маркерам мезенхимального клеточного типа принято относить ряд молекул клеточной адгезии (N- и OB-кадгерин, фибронектин, a5b1 интегрин), белков цитоскелета (виментин), транскрипционных факторов (бета-катенин, гомологи белков Snail, Twist, Zeb, LEF-1, FOXC2) и регуляторных РНК (miR10b, miR21) (Jordan et al., 2011). Эти биологические молекулы используются и для описания стадий ЭМП, выделяемые при развитии онкологических заболеваний.

Принято диверсифицировать три различных субтипа ЭМП. Первый субтип ЭМП происходит на разных этапах эмбриогенеза и необходим для формирования, как и отдельных клеточных популяций, так и органов. Второй субтип относится к процессам регенерации, активирующиеся в ответ на ранения тканей, воспалительные сигналы, гипоксию и др. Данный субтип вовлечен в образование фиброзов, а также патологических изменений в тканях и органах при продолжительном периоде воспалительного процесса, что может осложняться при ряде заболеваний. Наконец, третий субтип ЭМП ассоциирован с развитием онкологических новообразований, позволяя им реализовывать метастазирование, лекарственную устойчивость, повышенную выживаемость, множественную пролиферацию и др. Именно данный субтип ЭМП находится в центре внимания молекулярной онкологии не только как одна из причин формирования сопутствующий агрессивного типа опухолей черт, но и как возможный механизм образования стволовых клеток рака (СКР) de novo (Фармаковскаяи др., 2015; Kim et al., 2017). Согласно современной точке зрения, второй и третий субтипы могут быть примерами частичного ЭМП, который может и не завершаться терминальной дифференцировкой клеток до мезенхимального фенотипа, а сохранения промежуточного эпителиально-мезенхимального гибридного фенотипа (Nieto et al., 2016).

В процессе эмбрионального развития ЭМП неизбежно сопряжен с обратным ему мезенхимально-эпителиальным переходом (MET), совместно с ним формируя многомерные структуры развивающегося организма. По мере эмбриогенеза плацентарных млекопитающих выделяют первичный, вторичный и

третичный ЭМП, характеризующиеся в первую очередь возникшими структурами. Первичный ЭМП наблюдается на самых ранних стадиях после имплантации и связан с формированием мезодермы, а также и клеток нервного гребешка из первичный эпидермы при гаструляции и направлен на генерацию мультипотентных мезенхимальных клеток путем деэпителизации и последующей ингрессией клеток. Вторичный ЭМП ориентирован на развитие более узко специализированных клеточных линий. Примерами такого могут служить дифференциация сомитов мезодермы, нотохорда, предшественников органов мочеполовой системы, диссоциация экзокринных клеток в поджелудочной железе и гепатобластов в печеночном дивертикуле. Третичный же ЭМП хорошо описан при органогенезе сердца, где неоднократно сменяющие друг друга процессы ЭМП и MET формируют столь сложный орган (Nakajima et al., 2000).

При эмбриогенезе формирование самых разных по своих возможностях стволовых клеток связано с различными участниками ЭМП, начиная от клеток внутренней массы бластоцисты и до отдельных мезенхимальных линий (Kim et al., 2017).

При регенерации тканевых повреждений ЭМП также сопряжен с MET, что в норме ведет к восстановлению ран. Сигналы запуска данных процессов ведут к активации ряда сигнальных каскадов, как например HIF1A, NF-kB, AP-1/NFE2L2, TGFp/SMAD, которые в дальнейшем инициируют ЭМП. Нарушения в регуляции функционального состояния вышеупомянутых сигнальных каскадов может приводит к аномальному процессу ЭМП, результирующий в развитии фиброза (Stone et al., 2016).

Исходя из вышеупомянутого, можно довольно ясно представить роль ЭМП в процессах генерации СКР. С одной стороны — это запуск процессов, приводящих к дедифференциации клеточных линий, что наблюдается при эмбриогенезе, а с другой - триггерами данных процессов являются элементы сигнальных каскадов, аномально активных в неопластических клетках. Сочетание данных аспектов, если кратко, и характеризует третий тип ЭМП.

1.3 Роль ЭМП в эволюции онкологических заболеваний

По мере развития опухолей происходит появления ряда популяций раковых клеток, способных к метастазированию. Ввиду гетерогенности неопластических клеток, обусловленной накоплением мутаций и естественным отбором внутри опухоли, характеристики, обеспечивающие способность к метастазировнию, у отдельных линий могут отличаться, однако чаще необходимые черты зависят от запуска процессов ЭМП. Разрушение жестких межклеточных контактов, повышение мобильности ввиду дезорганизации структуры цитоскелета, соответствующей апикально-базальной полярности, выделение внеклеточных ферментов, ремодулирующих тканевый матрикс, приобретение мезенхимального паттерна распределения молекул межклеточной адгезии на поверхности клеток -вот лишь ряд черт зависящих напрямую от активации процессов ЭМП в раковых клетках (Pastushenko et al., 2019).

ЭМП вовлекает в свои процессы системы репрограммирования и трансдифференцировки клеточных линий, что может приводить к последующему приобретению ключевых особенностей СКР при развитии опухоли (Фармаковская и др., 2015). Столь комплексные процессы требуют специализированной многоуровневой регуляции на разных этапах ЭМП (Nieto et al., 2016; Гапонова и др., 2020). У человека центральную роль в реализации запуска ЭМП играют транскрипционные факторы семейства основной структуры "спираль-петля-спираль" или bHLH, куда относят цинк-пальциевые белки SNAI1 и SNAI2, цинк-пальциевые гомеобоксы, связывающиеся с E -боксом, ZEB1 и ZEB2, и ортологи белка Twist D. melanogaster TWIST1 и TWIST2 (Gonzalez, Medici, 2014; Nieto et al., 2016).

Транскрипционные факторы ЭМП подавляют экспрессию генов, вовлеченных в поддержание эпителиального клеточного фенотипа (Е-кадгерин, клаудины, окклудины). В тоже время они активируют экспрессию генов-маркеров мезенхимального фенотипа (N-кадгерин, виментин, фибронектин) и

ремодуляторов межклеточного матрикса (коллагены 1 и 3 типа, матриксные металлопротеиназы) (Gonzalez, Medici, 2014) (Табл. 2).

Таблица 2 - Гены-мишени транскрипционных факторов ЭМП и характер их регуляции (https://www.grnpedia.org/trrust)

Ген-мишень Белковый продукт гена Регулятор ЭМП Характер регуляции

AKR1C2 Член С2 семейства 1 альфа- TWIST1 Активация

кеторедуктаз TWIST2 Активация

AKT2 Серин/треонин протеинкиназа AKT2 TWIST1 Активация

AR Андрогеновый рецептор ZEB1 Неизвестен

ATM Серин/треонин протеинкиназа TWIST1 Активация

ATM TWIST2 Активация

BCL2 Регулятор апоптоза BCL2 TWIST1 Неизвестен

ZEB1 Репрессия

BMI1 Белок BMI1 комплекса Polycomb TWIST1 Активация

SNAI2 Активация

CD44 Антиген CD44 TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

SNAI1 Репрессия

Неизвестен

SNAI2 Репрессия

Неизвестен

TWIST1 Репрессия

CDH1 E-кадгерин Неизвестен

Активация

ZEB1 Репрессия

Неизвестен

ZEB2 Репрессия

TWIST2 Неизвестен

CDH2 N-кадгерин SNAI1 Неизвестен

Ген-мишень Белковый продукт гена Регулятор ЭМП Характер регуляции

SNAI2 Неизвестен

TWIST1 Неизвестен

TWIST2 Репрессия

TWIST2 Неизвестен

CLDN3 Клаудин 3 SNAП Репрессия

COL4A3 Альфа-З(ГУ) цепь коллагена ZEB1 Неизвестен

CTPS1 ЦТФ-синтаза 1 TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

CXADR Рецептор к вирусам Коксаки и аденовирусам SNAП Репрессия

SNAI2 Репрессия

ZEB1 Репрессия

ZEB2 Репрессия

схси2 СХС хемокин 12 SNAI2 Активация

CXCR4 Рецептор 4 к СХС хемокину 12 SNAГ2 Активация

DKK1 Dickkopf-родственный белок 1 TWГST1 Неизвестен

TWГST2 Неизвестен

DNM3 Динамин 3 TWГST1 Активация

ЕРСАМ Молекула клеточной адгезии эпителия ZEB1 Репрессия

ЕШВ3 Рецептор тиразин протеинкиназы егЬВ-3 TWГST1 Репрессия

TWГST2 Репрессия

ESR1 Эстрогеновый рецептор TWГST1 Репрессия

F2R Рецептор 1, активируемый протеиназой TWГST1 Репрессия

TWIST2 Репрессия

FN1 Фибронектин SNAП Неизвестен

TWГST1 Активация

TWГST2 Активация

Ген-мишень Белковый продукт гена Регулятор ЭМП Характер регуляции

FOS Протоонкоген c-Fos TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

GDF15 Фактор 15 роста и дифференциации TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

GRHL2 Гомолог Grainyhead-подобного белка 2 ZEB1 Репрессия

HBEGF Прогепарин-связывающийся фактор, подобный эпидермальному ростовому фактору SNAI1 Активация

HPGD Простогландиндегидрогеназа 1 SNAI2 Репрессия

ICAM1 Молекула 1 межклеточной адгезии TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

ILK Интегрин-свзязанная протеинкиназы TWIST1 Репрессия

TWIST2 Репрессия

ITGA5 Интегрин альфа-5 ZEB2 Активация

ITGB1 Интегрин бета-5 TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

ITGB4 Интегрин бета-4 ZEB1 Неизвестен

JAG1 Ортолог белка jagged-1 SNAI2 Активация

KLF17 Белок 17, подобный Krueppel TWIST1 Неизвестен

LAMC2 Субъединица гамма-2 ламинина ZEB1 Неизвестен

LPAR2 Рецептор 2 к лизофосфатидиновой кислоте SNAI2 Репрессия

MAPK1 Митоген-активируемая киназа 1 TWIST1 Активация

MAPK3 Митоген-активируемая киназа 3 TWIST1 Активация

MEOX2 Гомеобоксный белок MOX-2 ZEB2 Репрессия

MMP1 Матриксная металлопротеиназа 1 TWIST1 Неизвестен

MMP2 Матриксная металлопротеиназа 1 TWIST1 Активация

Ген-мишень Белковый продукт гена Регулятор ЭМП Характер регуляции

Матриксная металлопротеиназа 2 TWIST2 Активация

MMP9 Матриксная металлопротеиназа 9 SNAI2 Активация

MMP17 Матриксная металлопротеиназа 17 SNAI2 Неизвестен

MUC1 Муцин-1 ZEB1 Репрессия

MYB Транскрипционный активатор Myb TWIST1 Репрессия

TWIST2 Репрессия

NF1 Нейрофибромин TWIST1 Репрессия

TWIST2 Репрессия

NR2F1 Транскрипционный фактор 1 COUP TWIST1 Активация

TWIST2 Активация

PEBP1 Белок 1, связывающийся с фосфатидилэтаноламином SNAI1 Репрессия

PFDN4 Субъединица 4 префолдина TWIST1 Репрессия

TWIST2 Репрессия

PKP3 Плакофилин 3 ZEB1 Репрессия

POSTN Периостин TWIST2 Неизвестен

POU5F1 Октамер-связывающий транскрипционный фактор 3 SNAI2 Активация

ZEB1 Активация

ZEB2 Активация

RAP1A Ras-родственный белок Rap-1A TWIST1 Репрессия

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Чмыхало Виктор Константинович, 2022 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1 Василец Ю.Д. Wnt-сигнальный каскад в патогенезе мультиформной глиобластомы / Василец Ю.Д., Арноцкая Н.Е., Кудрявцев И.А., Шевченко В.Е. // Успехи молекулярной онкологии. — 2018. — №4. — С.93 - 102.

2 Гапонова А.В. Эпителиально-мезенхимальный переход: злокачественная прогрессия и перспективы противоопухолевой терапии / Гапонова А.В., Родин С., Мазина А.А., Волчков П.В. // Acta Naturae (русскоязычная версия). — 2020. — №3. — C. 46.

3 Мнихович М.В. Эпителиально-мезенхимальный переход, трансдифференциация, репрограммирование и метаплазия: современный взгляд на проблему / Мнихович М.В., Вернигородский С.В., Буньков К.В., Мишина Е.С. //Вестник Национального медико-хирургического Центра им. Н. И. Пирогова. — 2018. — №2. — С. 145-152.

4 Рукша Т.Г. Опухолевые стволовые клетки: меланома / Рукша Т.Г., Аксененко М.Б., Фефелова Ю.А. // Российский журнал кожных и венерических болезней. — 2015. — №4. — С. 12-16.

5 Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2022620360 Российская Федерация. Экспрессия генов каскадов стволовости и регуляторов эпителиальио-мезенхимального перехода в культуре клеток человека при модуляции низкомолекулярными агентами: № 2022620279: заявл. 21.02.2022: опубл. 28.02.2022 / В. К. Чмыхало, А. А. Беланова, П. В. Золотухин.

6 Фармаковская М.Д. Роль эпителиально-мезенхимального перехода в регуляции свойств раковых стволовых клеток солидных опухолей / Фармаковская М.Д., Хромова Н.В., Рыбко В.А., Копнин П.Б. // Российский биотерапевтический журнал. — 2015. — №4. — С. 3-6.

7 Чмыхало В.К., Взаимодействие каскада ядерного фактора каппа би и генов-регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода (обзор) // «Живые и биокосные системы». - 2021. - № 37.

8 Чмыхало В.К. Контуры обратных связей регуляции HIF1A при эпителиально-мезенхимальном переходе / Чмыхало В.К., Беланова А.А., Золотухин П.В. // Международная научная конференция "Технические и естественные науки", Санкт-Петербург, декабрь 2019. - СПб,: ГНИИ «Нацразвитие», 2020. — C. 15-20.

9 Чмыхало В.К., Шкурат Т.П. Кверцетин как модулятор экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog и регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода в культуре клеток человека / Чмыхало В.К., Шкурат Т.П. // Медицинская наука в эру цифровой трансформации. сборник научных трудов по материалам Международной научно-практической конференции. Курск, 2021. — Курск: КГМУ, 2021. — С. 349-352.

10 Чмыхало В.К., Шкурат Т.П. Кверцетин как модулятор экспрессии генов-мишеней каскадов Wnt/B-катенина, Hedgehog и регуляторов эпителиально-мезенхимального перехода в культуре клеток человека / Чмыхало В.К., Шкурат Т.П. // Медицинская наука в эру цифровой трансформации. сборник научных трудов по материалам Международной научно-практической конференции. Курск, 2021. — Курск: КГМУ, 2021. — С. 349-352.

11 Чмыхало В.К. Контуры обратных связей регуляции HIF1A при эпителиально-мезенхимальном переходе / Чмыхало В.К., Беланова А.А., Золотухин П.В. // Международная научная конференция "Технические и естественные науки", Санкт-Петербург, декабрь 2019. - СПб,: ГНИИ «Нацразвитие», 2020. — C. 15-20.

12 Asgarova A. PD-L1 expression is regulated by both DNA methylation and NF-kB during EMT signaling in non-small cell lung carcinoma / Asgarova A., Asgarov K., Godet Y. (et al.) // Oncoimmunology. — 2018. — Vol.7, №5. — e1423170.

13 Attar-Schneider O. Migration and epithelial-to-mesenchymal transition of lung cancer can be targeted via translation initiation factors eIF4E and eIF4GI / Attar-Schneider O., Drucker L., Gottfried M. // Lab Invest. — 2016. — Vol.96, №9. - P. 100415.

14 Avila-Carrasco L., Majano P., Sánchez-Toméro J.A., Selgas R., López-Cabrera M., Aguilera A., González Mateo G. Natural Plants Compounds as Modulators

of Epithelial-to-Mesenchymal Transition // Front Pharmacol. — 2019. — Vol. 10. — P. 715.

15 Balakrishnan S. Gold nanoparticle-conjugated quercetin inhibits epithelialmesenchymal transition, angiogenesis and invasiveness via EGFR/VEGFR-2-mediated pathway in breast cancer / Balakrishnan S., Bhat F.A., Raja Singh P., (et al.) // Cell Prolif.

— 2016. — Vol.49, №6. — P.678-697.

16 Barbato L. Cancer Stem Cells and Targeting Strategies / Barbato L., Bocchetti M., Di Biase A., Regad T. // Cells. — 2019. — Vol.8, №8. — P. 926.

17 Belanova A. Berberine Effects on NFkB, HIF1A and NFE2L2/AP-1 Pathways in HeLa Cells / Belanova A., Beseda D., Chmykhalo V., Stepanova A., Belousova M., Khrenkova V., Gavalas N., Zolotukhin P. // Anticancer Agents Med Chem. — 2019. — Vol.19, №4. — P. 487-501.

18 Bernkopf D.B. Sulforaphane inhibits growth and blocks Wnt/ß-catenin signaling of colorectal cancer cells / Bernkopf D.B., Daum G., Brückner M., Behrens J. // Oncotarget. — 2018. — Vol.9, №74. — P. 33982-33994.

19 Bhat F.A. Quercetin reverses EGF-induced epithelial to mesenchymal transition and invasiveness in prostate cancer (PC-3) cell line via EGFR/PI3K/Akt pathway / Bhat F.A., Sharmila G., Balakrishnan S., (et al.) // J Nutr Biochem. — 2014.

— Vol.25, №11. — P. 1132-1139.

20 BLAST nucleotide [Электронный ресурс] — NCBI. 2018. — Режим доступа — http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch &LINK_LOC=blasthome

21 Blevins Primeau A.S. Cancer Recurrence Statistics / Blevins Primeau A.S // CancerTherapyAdvisor — 2018. — [Электронный ресурс] . — Режим доступа — www.cancertherapyadvisor.com.

22 Cao L. Curcumin inhibits hypoxia-induced epithelial-mesenchymal transition in pancreatic cancer cells via suppression of the hedgehog signaling pathway / Cao L., Xiao X., Lei J., Duan W., (et al.) // Oncol Rep. — 2016. — Vol.35, №6. — P. 3728-34.

23 Cao M.T. Curcumin downregulates the expression of Snail via suppressing Smad2 pathway to inhibit TGF-ß1-induced epithelial-mesenchymal transitions in hepatoma cells / Cao M.T., Liu H.F., Liu Z.G., (et al.) // Oncotarget. — 2017. — Vol.8, №65. — P. 108498-108508.

24 Chae W.J. Bothwell ALM. Canonical and Non-Canonical Wnt Signaling in Immune Cells / Chae W.J. // Trends Immunol. — 2018. —Vol.39, №10. —P. 830-847.

25 Chang W.W. Quercetin in elimination of tumor initiating stem-like and mesenchymal transformation property in head and neck cancer / Chang W.W., Hu F.W., Yu C.C., (et al.) // Head Neck. — 2013. — Vol.35, №3. — P. 413-9.

26 Chang Y.H. Curcumin inhibited hypoxia induced epithelial-mesenchymal transition in hepatic carcinoma cell line HepG2 in vitro / Chang Y.H., Jiang M., Liu K.G., Li X.Q // Zhongguo Zhong Xi Yi Jie He Za Zhi. — 2013. — Vol. 33, №87 — P. 1102-6.

27 Chen K.C. Flavonoids Luteolin and Quercetin Inhibit RPS19 and contributes to metastasis of cancer cells through c-Myc reduction / Chen K.C., Hsu W.H., Ho J.Y., (et al.) // J Food Drug Anal. — 2018. — Vol.26, №3. — P. 1180-1191.

28 Chen S.F. Quercetin suppresses drug-resistant spheres via the p38 MAPK-Hsp27 apoptotic pathway in oral cancer cells / Chen S.F., Nieh S., Jao S.W. (et al.) // PLoS One. — 2012. — Vol.7, №11. — e49275.

29 Chen Y.C. Particulate matters increase epithelial-mesenchymal transition and lung fibrosis through the ETS-1/NF-KB-dependent pathway in lung epithelial cells / Chen Y.C., Chuang T.Y., Liu C.W., (et al.) // Part Fibre Toxicol. — 2020. — Vol.17, №1. — P.41.

30 Cheng Z.X. Effects of the HIF-1alpha and NF-kappaB loop on epithelialmesenchymal transition and chemoresistance induced by hypoxia in pancreatic cancer cells / Cheng Z.X., Wang D.W., Liu T. (et al.) // Oncol. Rep. — 2014. — Vol.31, №4. — P. 1891-8.

31 Chiang C. Snail/Gfi-1 (SNAG) family zinc finger proteins in transcription regulation, chromatin dynamics, cell signaling, development, and disease / Chiang C., Ayyanathan K. // Cytokine Growth Factor Rev. — 2013. — Vol.24, №2. — P. 123-31.

32 Chou C.C. A novel HIF-1a-integrin-linked kinase regulatory loop that facilitates hypoxia-induced HIF-1a expression and epithelial-mesenchymal transition in cancer cells / Chou C.C., Chuang H.C., Salunke S.B., (et al.) // Oncotarget. — 2015. — Vol.6, №10. — P. 8271-85.

33 Chowdhury P. Gamma ray-induced in vitro cell migration via EGFR/ERK/Akt/p38 activation is prevented by olaparib pretreatment / Chowdhury P., Dey P., De D., Ghosh U. // Int J Radiat Biol. — 2020. — Vol.96, №5. — P. 651-660.

34 Chu S.C. Berberine reverses epithelial-to-mesenchymal transition and inhibits metastasis and tumor-induced angiogenesis in human cervical cancer cells / Chu S.C., Yu C.C., Hsu L.S., (et al.) // Mol Pharmacol. — 2014. — Vol.86, №6. — P. 60923.

35 Dash R.C. Structure-based virtual screening identifies an 8-hydroxyquinoline as a small molecule GLI1 inhibitor / Dash R.C., Wen J., Zaino A.M., (et al.) // Mol Ther Oncolytics. — 2021. — Vol.20. — P. 265-276.

36 Dehghan Esmatabadi M.J. Dendrosomal curcumin inhibits metastatic potential of human SW480 colon cancer cells through Down-regulation of Claudin1, Zeb1 and Hef1-1 gene expression / Dehghan Esmatabadi M.J., Farhangi B., Safari Z., Kazerooni H., (et al.) // Asian Pac J Cancer Prev. — 2015. — Vol.16, №6. — P. 247381.

37 Deng S.J. Hypoxia-induced LncRNA-BX111 promotes metastasis and progression of pancreatic cancer through regulating ZEB1 transcription / Deng S.J., Chen H.Y., Ye Z. (et al.) // Oncogene. — 2018. — Vol.37, №44. — P. 5811-5828.

38 Deng X. Curcumin Inhibits the Migration and Invasion of Non-Small-Cell Lung Cancer Cells Through Radiation-Induced Suppression of Epithelial-Mesenchymal Transition and Soluble E-Cadherin Expression / Deng X., Chen C., Wu F., (et al.) // Technol Cancer Res Treat. — 2020. — Vol.19. — P. 1533033820947485.

39 Dinicola S. Inositol induces mesenchymal-epithelial reversion in breast cancer cells through cytoskeleton rearrangement / Dinicola S., Fabrizi G., Masiello M.G. (et al.) // Exp Cell Res. — 2016. — Vol.345, №1. — P. 37-50.

40 Du L. Quercetin inhibited epithelial mesenchymal transition in diabetic rats, high-glucose-cultured lens, and SRA01/04 cells through transforming growth factor-ß2/phosphoinositide 3-kinase/Akt pathway / Du L., Hao M., Li C., (et al.) / Mol Cell Endocrinol. — 2017. — Vol.452. — P. 44-56.

41 Du Y. Curcumin inhibits cancer-associated fibroblast-driven prostate cancer invasion through MAOA/mTOR/HIF-1a signaling / Du Y., Long Q., Zhang L., (et al.) // Int J Oncol. — 2015. — Vol.47, №6. — P. 2064-72.

42 Duan W. Curcumin inhibits hypoxia inducible factor-1a-induced epithelial-mesenchymal transition in HepG2 hepatocellular carcinoma cells / Duan W., Chang Y., Li R., (et al.) / Mol Med Rep. — 2014. — Vol.10, №5. — P. 2505-10.

43 Duran A. The signaling adaptor p62 is an important NF-kB mediator in tumorigenesis / Duran A., Linares J.F., Galvez A.S., (et al.) // Cancer Cell. — 2008. — Vol.13, №4. — P. 343-54.

44 Durand J.K. Targeting IKK and NF-kB for Therapy / Durand J.K., Baldwin A.S. // Adv Protein Chem Struct Biol. — 2017. — Vol. 107. — P. 77-115.

45 Eckert M.A. Targeting invadopodia to block breast cancer metastasis / Eckert M.A., Yang J. // Oncotarget. — 2011. — Vol.2, №7. — P. 562-8.

46 Elumalai P. Quercetin Inhibits the Epithelial to Mesenchymal Transition through Suppressing Akt Mediated Nuclear Translocation of ß-Catenin in Lung Cancer Cell Line / Elumalai P., Ezhilarasan D., Raghunandhakumar S. // Nutr Cancer. — 2022.

— Vol.74, №5. — P. 1-13.

47 Enderling H. Cancer Stem Cells: A Minor Cancer Subpopulation that Redefines Global Cancer Features / Enderling H., Hlatky L., Hahnfeldt P. // Front Oncol.

— 2013. — Vol. 3. — P. 76.

48 Escors D. The intracellular signalosome of PD-L1 in cancer cells / Escors D., Gato-Cañas M., Zuazo M., (et al.) // Signal Transduct Target Ther. — 2018. — Vol.3. — P. 26.

49 Ezzati M. A review on anti-cancer properties of Quercetin in breast cancer / Ezzati M., Yousefi B., Velaei K., Safa A. // Life Sci. — 2020. — Vol.248 — P. 117463.

50 Fan J.J. Dietary Flavonoids Luteolin and Quercetin Inhibit Migration and Invasion of Squamous Carcinoma through Reduction of Src/Stat3/S100A7 Signaling / Fan J.J., Hsu W.H., Lee K.H., (et al.) // Antioxidants (Basel). — 2019. — Vol.8, №11.

— P. 557.

51 Fardi M. The crucial role of ZEB2: From development to epithelial-to-mesenchymal transition and cancer complexity / Fardi M., Alivand M., Baradaran B., (et al.) // J Cell Physiol. — 2019. — Vol.234, №9. — P. 14783-14799.

52 Fu J. The TWIST/Mi2/NuRD protein complex and its essential role in cancer metastasis / Fu J., Qin L., He T., (et al.) // Cell Res. — 2011. — Vol.21, №2. — P. 27589.

53 Gallardo M. Curcumin inhibits invasive capabilities through epithelial mesenchymal transition in breast cancer cell lines / Gallardo M., Calaf G.M. // Int J Oncol.

— 2016. — Vol.49, №3. — P. 1019-27.

54 Gamble C. Inhibitory kappa B Kinases as targets for pharmacological regulation / Gamble C., McIntosh K., Scott R., (et al.) // Br J Pharmacol. —2012. — Vol.165, №4. — P. 802-819.

55 Ginestier C. ALDH1 is a marker of normal and malignant human mammary stem cells and a predictor of poor clinical outcome / Ginestier C., Hur M.H., Charafe-Jauffret E., (et al.) // Cell Stem Cell. — 2007. — Vol.1, №5. — P. 555-67.

56 Gonçalves C.F.L. The flavonoid quercetin reduces cell migration and increases NIS and E-cadherin mRNA in the human thyroid cancer cell line BCPAP / Gonçalves C.F.L, Hecht F., Cazarin J., (et al.) // Mol Cell Endocrinol. — 2021. — Vol. 529. — P. 111266.

57 Gonzalez D.M. Signaling mechanisms of the epithelial-mesenchymal transition / Gonzalez D.M., Medici D. // Sci Signal. — 2014. — Vol.7, №344. — re8.

58 GPP Web Portal [Электронный ресурс] — Broad Institute. 2018. — Режим доступа — http://www.broadinstitute.org/rnai/public

59 Graham T.R. Insulin-like growth factor-I-dependent up-regulation of ZEB1 drives epithelial-to-mesenchymal transition in human prostate cancer cells / Graham T.R., Zhau H.E., Odero-Marah V.A., (et al.) // Cancer Res. — 2008. — Vol.68, №7. — P. 2479-88.

60 Guo Y. Quercetin suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression via inhibition of SHH and TGF-ß/Smad signaling pathways / Guo Y., Tong Y., Zhu H., (et al.) / Cell Biol Toxicol. — 2021. — Vol. 37, №3. — P. 479-496.

61 Guo Z. Proteomic Resistance Biomarkers for PI3K Inhibitor in Triple Negative Breast Cancer Patient-Derived Xenograft Models / Guo Z., Primeau T., Luo J. (et al.) // Cancers (Basel). — 2020. — Vol.12, №12. — P. 3857.

62 Gupta R. Insights of 8-hydroxyquinolines: A novel target in medicinal chemistry / Gupta R., Luxami V., Paul K. // Bioorg Chem. — 2021. — Vol. 108. — P. 104633.

63 Hay E.D. An overview of epithelio-mesenchymal transformation / Hay E.D. // Acta Anat (Basel). — 1995. — Vol.154, №1. — P. 8-20.

64 Hoca M. The Effect of Resveratrol and Quercetin on Epithelial-Mesenchymal Transition in Pancreatic Cancer Stem Cell / Hoca M., Becer E., Kabaday H., (et al.) / Nutr Cancer. — 2020. — Vol.72, №7. — P. 1231-1242.

65 Hong J. Phosphorylation of serine 68 of Twist1 by MAPKs stabilizes Twist1 protein and promotes breast cancer cell invasiveness / Hong J., Zhou J., Fu J., (et al.) // Cancer Res — 2011. — Vol.71, №11. — P. 3980-90.

66 Horak I. Nanocomplex of Berberine with C60 Fullerene Is a Potent Suppressor of Lewis Lung Carcinoma Cells Invasion In Vitro and Metastatic Activity In

Vivo / Horak I., Prylutska S., Krysiuk I., (et al.) // Materials (Basel). — 2021. — Vol.14, №20. — P. 6114.

67 Hu C. Anti-metastasis activity of curcumin against breast cancer via the inhibition of stem cell-like properties and EMT / Hu C., Li M., Guo T., (et al.) // Phytomedicine. — 2019. — Vol. 58. — P. 152740.

68 Hu H.J. Curcumin mediates reversion of HGF-induced epithelialmesenchymal transition via inhibition of c-Met expression in DU145 cells / Hu H.J., Lin X.L., Liu M.H., (et al.) // Oncol Lett. — 2016. — Vol.11, №2. — P. 1499-1505.

69 Huang C. Berberine inhibits epithelial-mesenchymal transition and promotes apoptosis of tumour-associated fibroblast-induced colonic epithelial cells through regulation of TGF-ß signalling / Huang C., Wang X.L., Qi F.F., Pang Z.L. // J Cell Commun Signal. — 2020. — Vol.14, №1. — P. 53-66.

70 Huang T. Curcumin inhibits LPS-induced EMT through downregulation of NF-KB-Snail signaling in breast cancer cells / Huang T., Chen Z., Fang L. // Oncol Rep. — 2013. — Vol.29, №1. — P. 117-24.

71 Huber M.A. NF-kB is essential for epithelial-mesenchymal transition and metastasis in a model of breast cancer progression / Huber M.A., Azoitei N., Baumann B., (et al.) // J Clin Invest. — 2004. —Vol.114, №4. — P. 569-81.

72 Iwasaki K. Chronic hypoxia-induced slug promotes invasive behavior of prostate cancer cells by activating expression of ephrin-B1 / Iwasaki K., Ninomiya R., Shin T., (et al.) // Cancer Sci. — 2018. — Vol.109, №10. — P. 3159-3170.

73 Jha H.C. KSHV-Mediated Regulation of Par3 and SNAIL Contributes to B-Cell Proliferation / Jha H.C., Sun Z., Upadhyay S.K., (et al.) // PLoS Pathog. — 2016. — Vol.12, №7. — e1005801.

74 Jiang X. Curcumin Inhibits Cell Viability and Increases Apoptosis of SW620 Human Colon Adenocarcinoma Cells via the Caudal Type Homeobox-2 (CDX2)/Wnt/ß-Catenin Pathway / Jiang X., Li S., Qiu X., Cong J., (et al.) // Med Sci Monit. — 2019. — Vol. 25. — P. 7451-7458.

75 Jin L. LncRNA HOTAIR recruits SNAIL to inhibit the transcription of HNF4a and promote the viability, migration, invasion and EMT of colorectal cancer / Jin L., Pan Y.L., Zhang J., Cao P.G. // Transl Oncol. — 2021. — Vol.14, №4. — P. 101036.

76 Jordan N.V. Tracking the intermediate stages of epithelial-mesenchymal transition in epithelial stem cells and cancer / Jordan N.V., Johnson G.L., Abell A.N. // Cell Cycle. — 2011. — Vol.10, №17. — P. 2865-73.

77 Joseph J.V. Hypoxia enhances migration and invasion in glioblastoma by promoting a mesenchymal shift mediated by the HIF1a-ZEB1 axis / Joseph J.V., Conroy S., Pavlov K., (er al.) // Cancer Lett. — 2015. — Vol.359, №1. — P. 107-16.

78 Jung H.Y. Unraveling the TWIST between EMT and cancer stemness / Jung H.Y., Yang J. // Cell Stem Cell. — 2015. — Vol.16, №1. — P. 1-2.

79 Kalluri R. Epithelial-mesenchymal transition and its implications for fibrosis / Kalluri R., Neilson E.G. // J Clin Invest. — 2003. — Vol.112, №12. — P. 1776-84.

80 Katoh M. Canonical and non-canonical Wnt signaling in cancer stem cells and their niches: Cellular heterogeneity, omics reprogramming, targeted therapy and tumor plasticity (Review) / Katoh M. // Int J Oncol. — 2017. — Vol. 51, №5. — P. 13571369.

81 Katoh M. Molecular genetics and targeted therapy of WNT-related human diseases (Review) / Katoh M., Katoh M // Int J Mol Med. — 2017. — Vol.40, №3. — P. 587-606.

82 Kee J.Y. Inhibitory effect of quercetin on colorectal lung metastasis through inducing apoptosis, and suppression of metastatic ability / Kee J.Y., Han Y.H., Kim D.S., (et al.) / Phytomedicine. — 2016. — Vol.23, №13. — P. 1680-1690.

83 Khan S. Superparamagnetic iron oxide nanoparticles of curcumin enhance gemcitabine therapeutic response in pancreatic cancer / Khan S., Setua S., Kumari S., (et al.) // Biomaterials. — 2019. — Vol. 208. — P. 83-97.

84 Khanbabaei H. The interplay between microRNAs and Twist1 transcription factor: a systematic review / Khanbabaei H., Teimoori A., Mohammadi M. // Tumour Biol. — 2016. — Vol.37, №6. — P. 7007-19.

85 Kim D.H. Epithelial Mesenchymal Transition in Embryonic Development, Tissue Repair and Cancer: A Comprehensive Overview / Kim D.H., Xing T., Yang Z., (et al.) // J Clin Med. — 2017. — Vol.7, №1 — P. 1.

86 Kim H.J. Constitutively active type I insulin-like growth factor receptor causes transformation and xenograft growth of immortalized mammary epithelial cells and is accompanied by an epithelial-to-mesenchymal transition mediated by NF-kB and snail / Kim H.J., Litzenburger B.C., Cui X, (et al.) // Mol Cell Biol. — 2007. — Vol.27, №8. — P.3165-75.

87 Kim J.Y. The Hsp27-Mediated IkBa-NFKB Signaling Axis Promotes Radiation-Induced Lung Fibrosis / Kim J.Y., Jeon S., Yoo Y.J., (et al.) // Clin Cancer Res. — 2019. — Vol.25, №17. — P. 5364-5375.

88 Kim K. The Role of TWIST in Ovarian Epithelial Cancers / Kim K., Park E.Y., Yoon M.S., (et al.) // Korean J Pathol. — 2014. — Vol.48, №4. — P. 283-91.

89 Kim S.M. Epstein-Barr virus-encoded latent membrane protein 1 induces epithelial to mesenchymal transition by inducing V-set Ig domain containing 4 (VSIG4) expression via NF-kB in renal tubular epithelial HK-2 cells / Kim S.M., Oh S.W., Park S.H., (et al.) // Biochem Biophys Res Commun. — 2017. — Vol.492, №3. — P. 316-322.

90 Kim S.R. Quercetin Inhibits Cell Survival and Metastatic Ability via the EMT-mediated Pathway in Oral Squamous Cell Carcinoma / Kim S.R., Lee E.Y., Kim D.J. (et al.) // Molecules. — 2020. — Vol.25, №3. — P. 757.

91 Kotelevets L. Rac1 Signaling: From Intestinal Homeostasis to Colorectal Cancer Metastasis / Kotelevets L., Chastre E. // Cancers (Basel). — 2020. — Vol.12, №3. — P. 665.

92 Kötting C. Immune-Stimulatory Effects of Curcumin on the Tumor Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma / Kötting C., Hofmann L., Lotfi R., (et al.) // Cancers (Basel). — 2021. — Vol.13, №6. — P. 1335.

93 Kumar P.A. Carboxymethyl lysine induces EMT in podocytes through transcription factor ZEB2: Implications for podocyte depletion and proteinuria in diabetes mellitus / Kumar P.A., Welsh G.I., Raghu G., (et al.) // Arch Biochem Biophys. — 2016.

— Vol. 590. — P. 10-19.

94 Kundur S. Synergistic anticancer action of quercetin and curcumin against triple-negative breast cancer cell lines / Kundur S., Prayag A., Selvakumar P. (et al.) // J Cell Physiol. — 2019. — Vol.234, №7. — P.11103-11118.

95 Kwok W.K. Role of p14ARF in TWIST-mediated senescence in prostate epithelial cells / Kwok W.K., Ling M.T., Yuen H.F. (et al.) // Carcinogenesis. — 2007.

— Vol.28, №12. — P. 2467-75.

96 Lee A.Y. Curcumin Inhibits Invasiveness and Epithelial-Mesenchymal Transition in Oral Squamous Cell Carcinoma Through Reducing Matrix Metalloproteinase 2, 9 and Modulating p53-E-Cadherin Pathway / Lee A.Y., Fan C.C., Chen Y.A. (et al.) // Integr Cancer Ther. — 2015. — Vol.14, №5. — P. 484-90.

97 Lee J.W. Hypoxia signaling in human diseases and therapeutic targets / Lee J.W., Ko J., Ju C., Eltzschig H.K. // Exp Mol Med. — 2019. — Vol.51, №6. — P. 1-13.

98 Lee S.S. Elevated snail expression mediates tumor progression in areca quid chewing-associated oral squamous cell carcinoma via reactive oxygen species / Lee S.S., Tsai C.H., Yu C.C., Chang Y.C // PLoS One. — 2013. — Vol.8, №7.— P. e67985.

99 Lehman H.L. Twist2 is NFkB-responsive when p120-catenin is inactivated and EGFR is overexpressed in esophageal keratinocytes / Lehman H.L., Kidacki M., Stairs D.B. // Sci Rep. — 2020. — Vol.10, №1. — P. 18829.

100 Lei J. Hedgehog signaling regulates hypoxia induced epithelial to mesenchymal transition and invasion in pancreatic cancer cells via a ligand-independent manner / Lei J., Ma J., Ma Q., (et al.) // Mol Cancer. — 2013. — Vol. 12. — P. 66.

101 Lewinska A. Sulforaphane-Induced Cell Cycle Arrest and Senescence are accompanied by DNA Hypomethylation and Changes in microRNA Profile in Breast Cancer Cells / Lewinska A., Adamczyk-Grochala J., Deregowska A., Wnuk M. // Theranostics. - 2017. - Vol.7, №14. - P. 3461-3477.

102 Li C.H. Berberine hydrochloride impact on physiological processes and modulation of twist levels in nasopharyngeal carcinoma CNE-1 cells / Li C.H., Wu D.F., Ding H., (et al.) // Asian Pac J Cancer Prev. — 2014. — Vol.15, №4. — P. 1851-7.

103 Li C.W. Epithelial-mesenchymal transition induced by TNF-a requires NF-KB-mediated transcriptional upregulation of Twist1 / Li C.W., Xia W., Huo L., (et al.) // Cancer Res. — 2012. — Vol.72, №5. — P. 1290-300.

104 Li H. NF-KB/Twist axis is involved in chysin inhibition of ovarian cancer stem cell features induced by co-treatment of TNF-a and TGF-ß / Li H., Chen A., Yuan Q., (et al.) // Int J Clin Exp Pathol. — 2019. — Vol.12, №1. — P. 101-112.

105 Li J. Zipper-interacting protein kinase promotes epithelial-mesenchymal transition, invasion and metastasis through AKT and NF-kB signaling and is associated with metastasis and poor prognosis in gastric cancer patients / Li J., Deng Z., Wang Z., (et al.) // Oncotarget. — 2015. — Vol.6, №10. — P. 8323-38.

106 Li S. Molecular mechanism of proinflammatory cytokine-mediated squamous metaplasia in human corneal epithelial cells / Li S., Gallup M., Chen Y.T., McNamara N.A. // Invest Ophthalmol Vis Sci. — 2010. — Vol.51, №5. — P. 2466-75.

107 Li W. Curcumin inhibits pancreatic cancer cell invasion and EMT by interfering with tumor-stromal crosstalk under hypoxic conditions via the IL-6/ERK/NF-kB axis / Li W., Sun L., Lei J., (et al.) // Oncol Rep. — 2020. — Vol.44, №1. — P. 382-392.

108 Li Y. Ezrin/NF-KB activation regulates epithelial- mesenchymal transition induced by EGF and promotes metastasis of colorectal cancer / Li Y., Lin Z., Chen B., (et al.) // Biomed Pharmacother. — 2017. — Vol. 92. — P. 140-148.

109 Liang S. A novel role of snail in regulating tuberin/AMPK pathways to promote renal fibrosis in the new mouse model of type II diabetes / Liang S., Yadav M., Vogel K.S., Habib S.L. // FASEB Bioadv. — 2021. — Vol. 3. — №9. — P. 730-743.

110 Liu C.H. Berberine inhibits the metastatic ability of prostate cancer cells by suppressing epithelial-to-mesenchymal transition (EMT)-associated genes with predictive and prognostic relevance / Liu C.H., Tang W.C., Sia P., (et al.) // Int J Med Sci. — 2015. — Vol.12, №1. — P. 63-71.

111 Liu K.H. Hypoxia Stimulates the Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Lung Cancer Cells Through Accumulation of Nuclear ß-Catenin / Liu K.H., Tsai Y.T., Chin S.Y., (et al.) // Anticancer Res. — 2018. — Vol.38, №11. — P. 6299-6308.

112 Liu L. Berberine modulates Keratin 17 to inhibit cervical cancer cell viability and metastasis / Liu L., Sun L., Zheng J., Cui L. // J Recept Signal Transduct Res. 2021— Vol.41, №6. — P. 521-531.

113 Liu W.H. Curcumin inhibits proliferation, migration and invasion of gastric cancer cells via Wnt3a/ß-catenin/EMT signaling pathway / Liu W.H., Yuan J.B., Zhang F., Chang J.X. // Zhongguo Zhong Yao Za Zhi. — 2019. —Vol.44, №14. — P. 31073115.

114 Lu Q. Quercetin inhibits the mTORC1/p70S6K signaling-mediated renal tubular epithelial-mesenchymal transition and renal fibrosis in diabetic nephropathy / Lu Q., Ji X.J., Zhou Y.X., (et al.) // Pharmacol Res. — 2015. — Vol.99. — P. 237-47.

115 Lu X. Quercetin Inhibits Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT) Process and Promotes Apoptosis in Prostate Cancer via Downregulating lncRNA MALAT1 / Lu X., Chen D., Yang F., Xing N. // Cancer Manag Res. — 2020. — Vol. 12. — P. 1741-1750.

116 Lu X. Quercetin reverses docetaxel resistance in prostate cancer via androgen receptor and PI3K/Akt signaling pathways / Lu X., Yang F., Chen D., (et al.) // Int J Biol Sci. — 2020. — Vol.16, №7. — P. 1121-1134.

117 Luo D. Mouse snail is a target gene for HIF / Luo D., Wang J., Li J., Post M. // Mol Cancer Res. — 2011. — Vol. 9, №2. — P. 234-45.

118 Luo Q. Curcumin suppresses invasiveness and migration of human glioma cells in vitro by inhibiting HDGF/ß-catenin complex / Luo Q., Luo H., Fu H., (et al.) // Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao. — 2019. — Vol.39, №8. — P. 911-916.

119 Ma C. PAFAH1B2 is a HIF1a target gene and promotes metastasis in pancreatic cancer / Ma C., Guo Y., Zhang Y., (et al.) // Biochem Biophys Res Commun. — 2018. — Vol.501, №3. — P. 654-660.

120 Ma L. Tumour invasion and metastasis initiated by microRNA-10b in breast cancer / Ma L., Teruya-Feldstein J., Weinberg R.A. // Nature. — 2007. — Vol.449, №7163. — P. 682-8.

121 Majumder M. COX-2 induces oncogenic microRNA miR655 in human breast cancer / Majumder M., Dunn L., Liu L., (et al.) // Sci Rep. — 2018. — Vol.8, №1. — P. 327.

122 Marsigliante S. Paracrine CCL20 loop induces epithelial-mesenchymal transition in breast epithelial cells / Marsigliante S., Vetrugno C., Muscella A. // Mol Carcinog. —2016. — Vol.55, №7. — P. 1175-86.

123 McMahon S. Transforming growth factor beta1 induces hypoxia-inducible factor-1 stabilization through selective inhibition of PHD2 expression / McMahon S., Charbonneau M., Grandmont S., (et al.) // J Biol Chem. — 2006. — Vol.281, №34. — P. 24171-81.

124 Meng X. Curcumin increases efficiency of y-irradiation in gliomas by inhibiting Hedgehog signaling pathway / Meng X., Cai J., Liu J., (et al.) // Cell Cycle. —

2017. — Vol.16, №12. — P. 1181-1192.

125 MeSH term, NLM Controlled Vocabulary [Электронный ресурс] — NCBI.

2018. — Режим доступа — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/68058750

126 Mishra R. Berberine reverses epithelial-mesenchymal transition and modulates histone methylation in osteosarcoma cells / Mishra R., Nathani S., Varshney R., (et al.) // Mol Biol Rep. — 2020. — Vol.47, №11. — P. 8499-8511.

127 Mousavi N. The Effect of Quercetin Nanosuspension on Prostate Cancer Cell Line LNCaP via Hedgehog Signaling Pathway / Mousavi N., Rahimi S., Emami H., (et al.) // Rep Biochem Mol Biol. — 2021. — Vol.10, №1. — P. 69-75.

128 Muscella A. CCL20 promotes migration and invasiveness of human cancerous breast epithelial cells in primary culture / Muscella A., Vetrugno C., Marsigliante S // Mol Carcinog. — 2017. — Vol.56, №11. — P. 2461-2473.

129 Nakajima Y. Mechanisms involved in valvuloseptal endocardial cushion formation in early cardiogenesis: roles of transforming growth factor (TGF)-beta and bone morphogenetic protein (BMP) / Nakajima Y., Yamagishi T., Hokari S., Nakamura H. // Anat Rec. — 2000. — Vol.258, №2. — P. 119-27.

130 Naveen C.R. Berberine induces neuronal differentiation through inhibition of cancer stemness and epithelial-mesenchymal transition in neuroblastoma cells / Naveen C.R., Gaikwad S., Agrawal-Rajput R. // Phytomedicine. — 2016. — Vol.23, №7. —P. 736-44.

131 Nieto M.A. EMT: 2016 / Nieto M.A., Huang R.Y., Jackson R.A., Thiery J.P. // Cell. — 2016. — Vol.166, №1. — P. 21-45.

132 Oshi M. Annexin A1 Expression Is Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT), Cell Proliferation, Prognosis, and Drug Response in Pancreatic Cancer / Oshi M., Tokumaru Y., Mukhopadhyay S. (et al.) // Cells. — 2021. — Vol.10, №3. — P. 653.

133 Palmer H.G. The transcription factor SNAIL represses vitamin D receptor expression and responsiveness in human colon cancer / Palmer H.G., Larriba M.J., Garcia J.M., (et al.) // Nat Med. — 2004. — Vol.10, — №9. — P. 917-9.

134 Pappa G. Quantitative combination effects between sulforaphane and 3,3'-diindolylmethane on proliferation of human colon cancer cells in vitro / Pappa G.,

Strathmann J., Löwinger M., (et al.) // Carcinogenesis. - 2007 - Vol.28, №7. - P. 14717.

135 Pastushenko I. EMT Transition States during Tumor Progression and Metastasis / Pastushenko I., Blanpain C. //Trends Cell Biol. — 2019. — Vol.29, №3. — P.212-226.

136 Pei Y. On the art of identifying effective and specific siRNAs / Pei Y., Tuschl T. // Nat Methods. 2006. — №9. — P. 670-6.

137 Peng J. Hypoxia-Inducible Factor 1a Regulates the Transforming Growth Factor ß1/SMAD Family Member 3 Pathway to Promote Breast Cancer Progression / Peng J., Wang X., Ran L., (et al.) // J Breast Cancer. — 2018. — Vol.21, №3. — P. 259266.

138 Pflug K.M., Sitcheran R. Targeting NF-KB-Inducing Kinase (NIK) in Immunity, Inflammation, and Cancer / Pflug K.M., Sitcheran R. // Int J Mol Sci. — 2020. — Vol.21, №22. - P. 8470.

139 Prusty B.K. Constitutive activation of transcription factor AP-1 in cervical cancer and suppression of human papillomavirus (HPV) transcription and AP-1 activity in HeLa cells by curcumin / Prusty B.K., Das B.C. // Int J Cancer. — 2005. — Vol.113, №6. — P. 951-60.

140 Qi H.W. Epithelial-to-mesenchymal transition markers to predict response of Berberine in suppressing lung cancer invasion and metastasis / Qi H.W., Xin L.Y., Xu X., (et al.) // J Transl Med. — 2014. — Vol. 12. — P. 22.

141 Qiang L. Regulation of cell proliferation and migration by p62 through stabilization of Twist1 / Qiang L., Zhao B., Ming M., (et al.) // Proc Natl Acad Sci U S A. — 2014. — Vol.111, №25. — P. 9241-6.

142 Rada P., Rojo A.I., Offergeld A., Feng G.J., Velasco-Martín J.P., González-Sancho J.M., Valverde A.M., Dale T., Javier Regadera, and Antonio Cuadrado // Antioxidants & Redox Signaling.Mar. — 2015. — Vol. 22. — №7 — P. 555-571.

143 Ramirez D. Toward Modeling Context-Specific EMT Regulatory Networks Using Temporal Single Cell RNA-Seq Data / Ramirez D., Kohar V., Lu M. // Front Mol Biosci. — 2020. — Vol. 7. — P. 54.

144 Reyes-Farias M. The Anti-Cancer Effect of Quercetin: Molecular Implications in Cancer Metabolism / Reyes-Farias M., Carrasco-Pozo C. // Int J Mol Sci. — 2019. — Vol.20, №13. — P. 3177.

145 RNAfold WebServer [Электронный ресурс] — ViennaRNA Web Services. 2018. — Режим доступа — http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

146 Saleh R. PD-L1 Blockade by Atezolizumab Downregulates Signaling Pathways Associated with Tumor Growth, Metastasis, and Hypoxia in Human Triple Negative Breast Cancer / Saleh R., Taha R.Z., Sasidharan Nair V., (et al.) // Cancers (Basel). — 2019. — Vol.11, №8. — P. 1050.

147 Salnikov A.V. Hypoxia induces EMT in low and highly aggressive pancreatic tumor cells but only cells with cancer stem cell characteristics acquire pronounced migratory potential / Salnikov A.V., Liu L., Platen M., (et al.) // PLoS One. — 2012. — Vol.7, №9. — P. e46391.

148 Sangaletti S. SPARC Is a New Myeloid-Derived Suppressor Cell Marker Licensing Suppressive Activities / Sangaletti S., Talarico G., Chiodoni C., (et al.) // Front Immunol. — 2019. — Vol. 10. — P. 1369.

149 Saxena M. Transcription factors that mediate epithelial-mesenchymal transition lead to multidrug resistance by upregulating ABC transporters / Saxena M., Stephens M.A., Pathak H., Rangarajan A. // Cell Death Dis. — 2011. — Vol.2, №7. — P. e179.

150 Scholz B. Endothelial RSPO3 Controls Vascular Stability and Pruning through Non-canonical WNT/Ca(2+)/NFAT Signaling / Scholz B., Korn C., Wojtarowicz J., (et al.) // Dev Cell. — 2016. — Vol. 36, №1. — P. 79-93.

151 Sethi G. Nuclear factor-kappaB activation: from bench to bedside / Sethi G., Sung B., Aggarwal B.B. // Exp Biol Med (Maywood). — 2008 — Vol.233, №1. — P. 21-31.

152 Sharma N. Combination of quercetin and 2-methoxyestradiol inhibits epithelial-mesenchymal transition in PC-3 cell line via Wnt signaling pathway / Sharma N., Raut P.W., Baruah M.M., Sharma A. // Future Sci OA. — 2021. — Vol.7, №9. — FSO747.

153 Shen Z.Q. Berberine inhibits colorectal tumor growth by suppressing SHH secretion / Shen Z.Q., Wang J., Tan W.F., Huang T.M. // Acta Pharmacol Sin. — 2021.

— Vol. 42, №7. — P. 1190-1194.

154 Shim J.H. TAK1, but not TAB1 or TAB2, plays an essential role in multiple signaling pathways in vivo / Shim J.H., Xiao C., Paschal A.E., (et al.) // Genes Dev. — 2005. — Vol.19, №22. — P. 2668-81.

155 Siddiqui I. Differential role of Interleukin-1 and Interleukin-6 in K-Ras-driven pancreatic carcinoma undergoing mesenchymal transition / Siddiqui I., Erreni M., Kamal M.A. (et al.) // Oncoimmunology. — 2017. — Vol.7, №2. — e1388485.

156 siRNA Wizard Software [Электронный ресурс] — Invitrogene. 2022. — Режим доступа — https://www.invivogen.com/sirnawizard/

157 Skoda A.M. The role of the Hedgehog signaling pathway in cancer: A comprehensive review / Skoda A.M., Simovic D., Karin V., (et al.) // Bosn J Basic Med Sci. — 2018. — Vol.18, №1. — P. 8-20.

158 Slusarz A. Common botanical compounds inhibit the hedgehog signaling pathway in prostate cancer / Slusarz A., Shenouda N.S., Sakla M.S., (et al.) // Cancer Res.

— 2010. — Vol. 70, №8. — P.3382-90.

159 Snyder V. Cancer Stem Cell Metabolism and Potential Therapeutic Targets / Snyder V., Reed-Newman T.C., Arnold L. (et al.) // Front Oncol. — 2018. — Vol. 8. — P. 203.

160 Srinivasan A. Quercetin regulates P-catenin signaling and reduces the migration of triple negative breast cancer / Srinivasan A., Thangavel C., Liu Y., (et al.) // Mol Carcinog. — 2016. — Vol.55, №5. — P. 743-56.

161 Srivastava N.S. Curcumin and quercetin synergistically inhibit cancer cell proliferation in multiple cancer cells and modulate Wnt/p-catenin signaling and apoptotic pathways in A375 cells / Srivastava N.S., Srivastava R.A.K // Phytomedicine. — 2019. — Vol.52. — P. 117-128.

162 Stone R.C. Epithelial-mesenchymal transition in tissue repair and fibrosis / Stone R.C., Pastar I., Ojeh N., (et al.) // Cell Tissue Res. — 2016. — Vol.365, №3. — P. 495-506.

163 Sun S.C. The non-canonical NF-kB pathway in immunity and inflammation / Sun S.C. // Nat Rev Immunol. — 2017. — Vol.17, №9. — P.545-558.

164 Sun X.D. Curcumin reverses the epithelial-mesenchymal transition of pancreatic cancer cells by inhibiting the Hedgehog signaling pathway / Sun X.D., Liu X.E., Huang D.S // Oncol Rep. — 2013. — Vol.29, №6. — P. 2401-7.

165 Takebe N. Targeting Notch, Hedgehog, and Wnt pathways in cancer stem cells: clinical update / Takebe N., Miele L., Harris P.J., (et al.) // Nat Rev Clin Oncol. — 2015. — Vol.12, №8. — P. 445-64.

166 Taki M. Snail promotes ovarian cancer progression by recruiting myeloid-derived suppressor cells via CXCR2 ligand upregulation / Taki M., Abiko K., Baba T., (et al.) // Nat Commun. — 2018. — Vol.9, №1. - C. 1685.

167 Tam S.Y. Hypoxia-Induced Epithelial-Mesenchymal Transition in Cancers: HIF-1a and Beyond / Tam S.Y., Wu V.W.C., Law H.K.W. // Front Oncol. — 2020. — Vol.10. — P. 486.

168 Tang C. Transcriptional regulation of FoxM1 by HIF-1a mediates hypoxia-induced EMT in prostate cancer / Tang C., Liu T., Wang K., (et al.) // Oncol Rep. — 2019. — Vol.42, №4. — P. 1307-1318.

169 Tao Z. Role of methyltransferase-like enzyme 3 and methyltransferase-like enzyme 14 in urological cancers / Tao Z., Zhao Y., Chen X. // PeerJ. — 2020. — Vol.8. —e9589.

170 Terry S. New insights into the role of EMT in tumor immune escape / Terry S., Savagner P., Ortiz-Cuaran S., (et al.) // Mol Oncol. — 2017. — Vol.11, №7. — P. 824-846.

171 Terzuoli E. ALDH3A1 Overexpression in Melanoma and Lung Tumors Drives Cancer Stem Cell Expansion, Impairing Immune Surveillance through Enhanced PD-L1 Output / Terzuoli E., Bellan C., Aversa S., (et al.) // Cancers (Basel). — 2019. — Vol.11, №12. — P. 1963.

172 Thacker P.C. Curcumin and emodin down-regulate TGF-ß signaling pathway in human cervical cancer cells / Thacker P.C., Karunagaran D. // PLoS One. — 2015. — Vol.10, №3. — e0120045.

173 TRRUST v2: an expanded reference database of human and mouse transcriptional regulatory interactions [Электронный ресурс]. Nucleic Acids Research.

— 2017 — Режим доступа — https://www.grnpedia.org/trrust

174 Tsai Y.P. Hypoxia-regulated target genes implicated in tumor metastasis / Tsai Y.P., Wu K.J. // J Biomed Sci. — 2012. — Vol.19, №1. — P. 102.

175 Türk D. Identification of compounds selectively killing multidrug-resistant cancer cells / Türk D., Hall M.D., Chu B.F., (et al.) // Cancer Res. — 2009. — Vol. 69.

— №21. — P. 8293-301.

176 Wang D. The eradication of breast cancer cells and stem cells by 8-hydroxyquinoline-loaded hyaluronan modified mesoporous silica nanoparticle-supported lipid bilayers containing docetaxel / Wang D., Huang J., Wang X., (et al.) // Biomaterials.

— 2013. — Vol.34, №31. — P. 7662-73.

177 Wang D. Berberine enhances the radiosensitivity of osteosarcoma by targeting Rad51 and epithelial-mesenchymal transition / Wang D., Zhang K.F., Du G., (et al.) // J Cancer Res Ther. — 2020. — Vol.16, №2. — P. 215-221.

178 Wang J. Berberine sensitizes nasopharyngeal carcinoma cells to radiation through inhibition of Sp1 and EMT / Wang J., Kang M., Wen Q., (et al.) // Oncol Rep. — 2017. — Vol.37, №4. — P. 2425-2432.

179 Wang L. Chlorquinaldol targets the ß-catenin and T-cell factor 4 complex and exerts anti-colorectal cancer activity / Wang L., Deng K., Gong L., (et al.) // Pharmacol Res. — 2020. — Vol.159. — P. 104955.

180 Wang S.S. Links between cancer stem cells and epithelial-mesenchymal transition / Wang S.S., Jiang J., Liang X.H., Tang Y.L. // Onco Targets Ther. — 2015. — №8. — P. 2973-80.

181 Wang X. Emodin Inhibits ATP-Induced Proliferation and Migration by Suppressing P2Y Receptors in Human Lung Adenocarcinoma Cells / Wang X., Li L., Guan R., Zhu D., (et al.) // Cell Physiol Biochem. — 2017. — Vol.44, №4. — P. 13371351.

182 Wang X. Upregulation of miR-382 contributes to renal fibrosis secondary to aristolochic acid-induced kidney injury via PTEN signaling pathway / Wang X., Xue N., Zhao S., (et al.) // Cell Death Dis. — 2020. — Vol.11, №8. — P. 620.

183 Wang Y. The Anti-Cancer Mechanisms of Berberine: A Review / Wang Y., Liu Y., Du X., (et al.) // Cancer Manag Res. — 2020. — Vol. 12. — P. 695-702.

184 Wang Y. Autophagy inhibition specifically promotes epithelial-mesenchymal transition and invasion in RAS-mutated cancer cells / Wang Y., Xiong H., Liu D., (et al.) // Autophagy. — 2019. — Vol.15, №5. — P. 886-899.

185 Wang Y. Inhibition of migration and invasion by berberine via inactivation of PI3K/Akt and p38 in human retinoblastoma cell line / Wang Y., Yuan J., Yang L. (et al.) // Adv Clin Exp Med. — 2018. — Vol.27, №7. — P. 899-905.

186 Wang Z. Demethyleneberberine promotes apoptosis and suppresses TGF-ß/Smads induced EMT in the colon cancer cells HCT-116 / Wang Z., Wang L., Shi B., (et al.) // Cell Biochem Funct. 2021. — Vol.39, №6. — P. 763-770.

187 Wilson W.R. Targeting hypoxia in cancer therapy / Wilson W.R., Hay M.P. // Nat Rev Cancer. — 2011. — Vol.11, №6. — P. 393-410.

188 Wu H.T. Oncogenic functions of the EMT-related transcription factor ZEB1 in breast cancer / Wu H.T., Zhong H.T., Li G.W., (et al.) // J Transl Med. — 2020. — Vol.18, №1. — P. 51.

189 Wu J. Wnt/PCP Instructions for Cilia in Left-Right Asymmetry / Wu J., Mlodzik M. // Dev Cell. — 2017. — Vol.40, №5. — P. 423-424.

190 Wu J.B. Monoamine oxidase A inhibitor-near-infrared dye conjugate reduces prostate tumor growth / Wu J.B., Lin T.P., Gallagher J.D., (et al.) // J Am Chem Soc. — 2015. — Vol.137, №6. — P .2366-74.

191 Wu L. IL-33 Can Promote the Process of Pulmonary Fibrosis by Inducing the Imbalance Between MMP-9 and TIMP-1 / Wu L., Luo Z., Zheng J., (et al.) // Inflammation. — 2018. — Vol.41, №3. — P. 878-885.

192 Xiong X. Sensitization of ovarian cancer cells to cisplatin by gold nanoparticles / Xiong X., Arvizo R.R., Saha S., (et al.) // Oncotarget. — 2014. — Vol.5, №15. — P. 6453-65.

193 Yang L. Inhibition of epidermal growth factor receptor signaling elevates 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase in non-small-cell lung cancer / Yang L., Amann J.M., Kikuchi T., (et al.) // Cancer Res. — 2007. — Vol.67, №12. — P. 5587-93.

194 Yang M.H. TWIST activation by hypoxia inducible factor-1 (HIF-1): implications in metastasis and development / Yang M.H., Wu K.J. // Cell Cycle. — 2008. — Vol.7, №14. — P. 2090-6.

195 Yang M.H. Direct regulation of TWIST by HIF-1alpha promotes metastasis / Yang M.H., Wu M.Z., Chiou S.H., (et al.) // Nat Cell Biol. — 2008. — Vol.10. №3. — P. 295-305.

196 Yang W.H. RAC1 activation mediates Twist1-induced cancer cell migration / Yang W.H., Lan H.Y., Huang C.H., (et al.) // Nat Cell Biol. — 2012. — Vol.14, №4. — P. 366-74.

197 Yeh B.W. The protoapigenone analog WYC0209 targets CD133+ cells: A potential adjuvant agent against cancer stem cells in urothelial cancer therapy / Yeh B.W., Yu L.E., Li C.C., (et al.) // Toxicol Appl Pharmacol. —2020. — Vol. 402. — P.115-129.

198 Yu D. miR-106b modulates cancer stem cell characteristics through TGF-ß/Smad signaling in CD44-positive gastric cancer cells / Yu D., Shin H.S., Lee Y.S., Lee Y.C. // Lab Invest. — 2014. — Vol.94, №12. — P. 1370-81.

199 Yu D. Quercetin inhibits epithelial-mesenchymal transition, decreases invasiveness and metastasis, and reverses IL-6 induced epithelial-mesenchymal transition, expression of MMP by inhibiting STAT3 signaling in pancreatic cancer cells / Yu D., Ye T., Xiang Y., (et al.) // Onco Targets Ther. — 2017. — Vol.10. — P. 47194729.

200 Yu H. Targeting NF-kB pathway for the therapy of diseases: mechanism and clinical study / Yu H., Lin L., Zhang Z. (et al.) // Signal Transduct Target Ther. — 2020. — Vol.5, №1. — P. 209.

201 Yu S.L. A Synthetic CPP33-Conjugated HOXA9 Active Domain Peptide Inhibits Invasion Ability of Non-Small Lung Cancer Cells / Yu S.L., Koo H., Lee S.I., (et al.) // Biomolecules. — 2020. — Vol.10, №11. — P. 1589.

202 Yu Z. Cancer stem cells / Yu Z., Pestell T.G., Lisanti M.P., Pestell R.G. // Int J Biochem Cell Biol. — 2012. — Vol.44, №12. — P. 2144-51.

203 Zhang J. Signal Transduction Pathways of EMT Induced by TGF-ß, SHH, and WNT and Their Crosstalks / Zhang J., Tian X.J., Xing J. // J Clin Med. — 2016. — Vol.5, №4. — P.41.

204 Zhang Y. Hypoxia induces epithelial-mesenchymal transition via activation of SNAI1 by hypoxia-inducible factor -1a in hepatocellular carcinoma / Zhang L., Huang G., Li X., (et al.) // BMC Cancer. — 2013. — Vol.13. — P. 108.

205 Zhang Q. Wnt/ß-catenin signaling enhances hypoxia-induced epithelialmesenchymal transition in hepatocellular carcinoma via crosstalk with hif-1a signaling /

Zhang Q., Bai X., Chen W., (et al.) // Carcinogenesis. — 2018. — Vol.34, №5. — P. 96273.

206 Zhang W. HIF-1a Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition and Metastasis through Direct Regulation of ZEB1 in Colorectal Cancer / Zhang W., Shi X., Peng Y., (et al.) // PLoS One. — 2015. — Vol.10, №6. — e0129603.

207 Zhao Y. Berberine inhibits chemotherapy-exacerbated ovarian cancer stem cell-like characteristics and metastasis through GLI1 / Zhao Y., Yang X., Zhao J., (et al.) // Eur J Pharmacol. — 2021. — Vol.895. — P. 173887.

208 Zhao Z. Multiple biological functions of Twist1 in various cancers / Zhao Z., Rahman M.A., Chen Z.G., Shin D.M // Oncotarget. — 2017. — Vol.8, №12. — P. 2038020393.

209 Zheng F. Novel regulation of miR-34a-5p and HOTAIR by the combination of berberine and gefitinib leading to inhibition of EMT in human lung cancer / Zheng F., Li J., Ma C. (et al.) // J Cell Mol Med. — 2020. — Vol.24, №10. — P. 5578-5592.

210 Zheng X. The transcription factor GLI1 mediates TGFß1 driven EMT in hepatocellular carcinoma via a SNAI1-dependent mechanism / Zheng X., Vittar N.B., Gai X., (et al.) // PLoS One. — 2012. — Vol.7, №11. — P. e49581.

211 Zheng X. Biomimetic co-assembled nanodrug of doxorubicin and berberine suppresses chemotherapy-exacerbated breast cancer metastasis / Zheng X., Zhao Y., Jia Y., (et al.) // Biomaterials. — 2021. — Vol.271. — P. 120716.

212 Zhou J. Cancer stem/progenitor cell active compound 8-quinolinol in combination with paclitaxel achieves an improved cure of breast cancer in the mouse model / Zhou J., Zhang H., Gu P., (et al.) // Breast Cancer Res Treat. — 2009. — Vol.115, №2. — P. 269-77.

213 Zhou W. Molecular regulation of Snai2 in development and disease / Zhou W., Gross K.M., Kuperwasser C. // J Cell Sci. — 2019. — Vol.132, №23. — jcs235127.

214 Zhou Y. miR-33a is up-regulated in chemoresistant osteosarcoma and promotes osteosarcoma cell resistance to cisplatin by down-regulating TWIST / Zhou Y., Huang Z., Wu S., (et al.) // J Exp Clin Cancer Res. — 2014. — Vol. 33. — №1. — P.12.

215 Zhu J. HIF-1a promotes ZEB1 expression and EMT in a human bladder cancer lung metastasis animal model / Zhu J., Huang Z., Zhang M., (et al.) // Oncol Lett. — 2018. — Vol. 15, №3. — P. 3482-3489.