Клинико-лабораторная характеристика инфекционных гемоколитов у детей тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.01.09, кандидат наук Климова Ольга Ивановна

• Климова Ольга Ивановна
• кандидат наук
• 2021

Оглавление диссертации кандидат наук Климова Ольга Ивановна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Этиологическая, клинико-лабораторная характеристика инфекционных гемоколитов

у детей и сложности дифференциальной диагностики

1.1.1. Этиология инфекционных гемоколитов у детей

1.1.2. Современные методы идентификации возбудителей инфекционных гемоколитов

1.1.3. Проблемы дифференциальной диагностики гемоколитов у детей

1.1.4. Клинические и лабораторные показатели при гемоколитах у детей

1.2. Состояние питания при инфекционных диареях у детей

1.3. Цитокиновый статус и реакции системного воспаления при гемоколитах

1.4. Состояние микробиоты кишечника при гемоколитах

1.5. Осложнения инвазивных форм острых кишечных инфекций

1.6. Заболевания пищеварительного тракта как неблагоприятные отдаленные исходы

инфекционных гемоколитов

ГЛАВА 2. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА БОЛЬНЫХ, ДИЗАЙНА И МЕТОДОВ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Общая характеристика больных и дизайна

2.2. Методы исследования

ГЛАВА 3. КЛИНИКО-ЛАБОРАТОРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ИНФЕКЦИОННЫХ ГЕМОКОЛИТОВ У ДЕТЕЙ

3.1. Особенности инфекционных гемоколитов в зависимости от этиологии

3.2. Клинические особенности инфекционных гемоколитов в зависимости от тяжести

3.3. Клинико-лабораторная характеристика инфекционных гемоколитов у детей разных возрастных групп

3.4. Клинико-лабораторные особенности инфекционных гемоколитов при наличии неспецифических осложнений

3.5. Связь изменений клинико-лабораторных показателей острого периода

инфекционных гемоколитов с отдаленными исходами

ГЛАВА 4 СОСТОЯНИЕ ПИТАНИЯ И ЕГО ДИНАМИКА ПРИ ИНФЕКЦИОННЫХ ГЕМОКОЛИТАХ У ДЕТЕЙ

ГЛАВА 5 ОСОБЕННОСТИ БАЛАНСА СЫВОРОТОЧНЫХ ЦИТОКИНОВ И ИХ ВЛИЯНИЯ НА КЛИНИКО-ЛАБОРАТОРНЫЕ ПОКАЗАТЕЛИ У ДЕТЕЙ С ИНФЕКЦИОННЫМИ ГЕМОКОЛИТАМИ

5.1. Особенности цитокинового статуса в зависимости от тяжести инфекционных гемоколитов

5.2. Особенности цитокинового статуса у больных инфекционными гемоколитами разных возрастных групп

5.3. Влияние этиологических факторов и наличия неспецифических осложнений на уровень сывороточных цитокинов у больных инфекционными гемоколитами

5.4. Цитокиновый статус при инвазивной форме кишечной инфекции, осложненной

гемолитико-уремическим синдромом

ГЛАВА 6. СОСТОЯНИЕ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ПРИ ИНФЕКЦИОННЫХ ГЕМОКОЛИТАХ

6.1. Изменения микробиоты кишечника у обследованных больных

6.2. Изменения микробиоты кишечника у больных инфекционными гемоколитами разного возраста

6.3. Изменения микробиоты кишечника в остром периоде инфекционных гемоколитов у детей с благоприятным отдаленным исходом и сформировавших в катамнезе

функциональные гастроинтестинальные расстройства

ГЛАВА 7 ПРОГНОСТИЧЕСКИЕ КРИТЕРИИ ТЕЧЕНИЯ И ОТДАЛЕННОГО ИСХОДА ИНФЕКЦИОННЫХ ГЕМОКОЛИТОВ У ДЕТЕЙ

7.1. Прогностические факторы течения инфекционных гемоколитов у детей

7.2. Результаты катамнестического наблюдения реконвалесцентов инфекционных гемоколитов

7.3. Факторы риска развития функциональных гастроинтестинальных расстройств

ОБСУЖДЕНИЕ

ВЫВОДЫ

РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АЛТ - аланинаминотрансфераза АСТ - аспартатаминотрансфераза БК - болезнь Крона

ВЗК - воспалительные заболевания кишечника ВОЗ - всемирная организация здравоохранения ГУС - гемолитико-уремический синдром ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

ДНКЦИБ ФМБА - Детский научно-клинический центр инфекционных болезней, Федерального медико-биологического агентства России. ЖКТ - желудочно-кишечный тракт ИГ - инфекционный гемоколит ИЛ - интерлейкин

ИМВП - инфекция мочевыводящих путей

ИМТ - индекс массы тела

ИФА - иммуноферментный анализ

КОЕ - колониеобразующие единицы

ЛДФ - линейная дискриминантная функция

ОКИ - острая кишечная инфекция

ОКИНЭ - острая кишечная инфекция неустановленной этиологии ОПН - острая почечная недостаточность ОРЗ - острое респираторное заболевание ПЦР - полимеразная цепная реакция

ПЦР-РВ - полимеразная цепная реакция в реальном времени

РА - реакция агглютинации

РВИ - ротавирусная инфекция

РНГА - реакция непрямой гемагглютинации

РСК - реакция связывания комплемента

СОЭ - скорость оседания эритроцитов

СРК - синдром раздраженного кишечника

УЗИ - ультразвуковое исследование

УПМ - условно-патогенные микроорганизмы

ФГИР - функциональное гастроинтестинальное расстройство

ФД - функциональная диспепсия

ФК - фекальный кальпротектин

ФНО-а - фактор некроза опухоли-альфа

ЦНС - центральная нервная система

ЯК - язвенный колит

CDS - Clinical Dehydration Scale

DAEC - диффузно-адгезивные кишечные палочки

EAgEC - энтероаггегативные кишечные палочки

EHEC - энтерогеморрагические кишечные палочки

EIEC - энтероинвазивные кишечные палочки

EPEC - энтеропатогенные кишечные палочки

ETEC - энтеротоксигенные кишечные палочки

SMAC - агар сорбита-MacConkey

STEC - Shiga-токсин-продуцирующие кишечные палочки stx - шига-токсин

TcdA - энтеротоскин, продуцируемый патогенными штаммами Clostridium difficile TcdB - цитотоксин, , продуцируемый патогенными штаммами Clostridium difficile VTEC - веротоксин-продуцирующие кишечные палочки

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Клинико-лабораторная характеристика инфекционных гемоколитов у детей»

ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы исследования

Проблема инфекционных гемоколитов (ИГ) у детей сохраняет научный и практический интерес во всем мире [239]. Это связано с высокой частотой спорадической заболеваемости и эпидемических вспышек инфекционных геморрагических колитов во многих странах, сложностью этиологической расшифровки, трудностями лечения, нередко обусловленными антибиотикорезистентностью возбудителей, высоким риском развития осложнений и неблагоприятных последствий в виде постинфекционных заболеваний желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) или отставания в развитии [14, 24, 49, 70, 80, 86, 241].

В настоящее время повышается актуальность изучения клинических проявлений инвазивных форм ОКИ в зависимости от этиологии у детей разного возраста, но число подобных исследований недостаточно [45, 127, 145]. Наряду с этиологическими и возрастными особенностями заслуживают внимания нарушения нутритивного статуса больных с ИГ, так как они во многом определяют активность воспалительного процесса, характеристики иммунного ответа и тяжесть заболевания [90, 174].

В современных условиях цитокины в качестве информативных маркеров и медиаторов воспалительного процесса и иммунитета могут иметь клиническое и прогностическое значение при инфекционных инвазивных диареях у детей, но эта проблема до сих пор недостаточно изучена [69, 135].

Имеющиеся представления о нарушениях микробиоценоза кишечника у детей с ОКИ, играющих ключевую роль в формировании постинфекционных поражений ЖКТ, требуют уточнения на основе молекулярно-генетических подходов оценки микробиоты [64, 72, 164].

Инфекционные инвазивные диареи опасны специфическими осложнениями, в частности, гемолитико-уремическим синдромом (ГУС) [99, 190]. Неспецифические осложнения ИГ у детей, в свою очередь, могут способствовать увеличению длительности лечения, поэтому прогнозирование данных осложнений ИГ у детей имеет практическое значение [118].

В последние годы определены факторы риска развития функциональных гастроинтестинальных заболеваний (ФГИР) у взрослых после ОКИ, но в педиатрической практике эти вопросы остаются в центре внимания [29, 37, 218, 222, 231].

Таким образом, изучение клинико-лабораторных особенностей ИГ у детей, нутритивного статуса пациентов, баланса цитокинов и нарушений микробиоты кишечника, определяющих течение и отдаленные исходы заболевания, следует признать актуальным и своевременным.

Степень разработанности темы исследования

Основанием для проведения диссертационного исследования послужили достижения в области изучения этиологии, эпидемиологии, диагностики, патогенеза воспалительных заболеваний кишечника инфекционной и неинфекционной этиологии и постинфекционных ФГИР [29, 100, 177, 182, 44, 94, 117, 190, 64, 72, 194]. Показана роль изменений состава и функций микробиоты кишечника в формировании патологии кишечника у взрослых [96, 124, 202].

В то же время у детей мало изучены характерные особенности клинико-лабораторных показателей ИГ, влияние их на состояние питания пациентов, изменения цитокинового статуса и содержание маркерных симбиотических микробов в составе микробиоты кишечника, возможно, предопределяющих течение и исходы заболевания.

Цель исследования

Изучить клинико-лабораторную характеристику инфекционных гемоколитов у детей и определить прогностические критерии течения и отдаленного исхода.

Задачи исследования

1. Охарактеризовать клинико-лабораторные показатели инфекционных гемоколитов у детей в зависимости от этиологии, степени тяжести, возраста пациентов, характера течения заболевания и при различных отдаленных исходах.

2. Оценить состояние питания при инфекционных гемоколитах у детей разного возраста.

3. Исследовать содержание цитокинов в сыворотке крови при инфекционных гемоколитах у детей в зависимости от степени тяжести, возраста и характера течения заболевания.

4. Выявить изменения микробиоты кишечника при инфекционных гемоколитах в зависимости от возраста детей и установить их связь с отдаленными исходами.

5. Разработать прогностические критерии течения и отдаленных исходов инфекционных гемоколитов у детей.

Гипотеза исследования

Клинико-лабораторная характеристика инфекционного гемоколита у детей зависит от возраста, этиологии и тяжести заболевания, отличается изменениями состояния питания, цитокинового статуса и микробиоты кишечника, которые могут стать информативными

предикторами особенностей течения и отдаленного исхода при их систематизации и статистической оценке на ранних стадиях заболевания.

Научная новизна исследования

Установлено, что этиология верифицированных ИГ в 82,3% случаев обусловлена бактериальными возбудителями, в 17,7% - вирусно-бактериальными. ИГ неуточненной этиологии сопоставимы с бактериальными ИГ по выраженности гематологических признаков системного воспалительного ответа, но отличались повышенной активностью тромбоцитарного звена системы гемостаза. ИГ у детей раннего и дошкольного возраста отличались более высокой тяжестью по индексу Кларка и более тяжелым обезвоживанием по шкале CDS по сравнению с детьми грудного возраста. При неспецифических осложнениях ИГ установлена корреляция уровня лейкоцитов в гемограмме с уровнем аланинаминотрансферазы (АЛТ) в сыворотке крови (r=0,55; p<0,05), отражающая токсическое воздействие на печень. У детей с менее выраженными реакциями системного воспаления в остром периоде ИГ чаще отмечали неблагоприятный отдаленный исход.

В периоде ранней реконвалесценции ИГ отрицательная динамика массы тела относительно исходных значений чаще отмечалась у детей дошкольного (62% случаев) и младшего школьного возраста (75%) по сравнению с детьми грудного возраста (44,5%; р<0,05), что коррелировало с тяжестью заболевания и исходом.

Показана связь уровня цитокина ФНО-а в крови с тяжестью ИГ по индексу Кларка. Уровни цитокинов ФНО-а и ИЛ-6 достоверно отличались при ИГ средней и легкой степени тяжести. Максимальные значения ИЛ-6 отмечали у детей раннего возраста, а ИЛ-10 - у детей грудного. Выявлены отрицательные корреляции ФНО-а и ИЛ-10 с уровнем мочевины.

Обнаружено частое снижение маркерных индигенных микробов B. thetaiotaomicron (в 93,3% случаев) и F. prausnitzii (в 60%), а также Lactobacillus spp. (в 66,7%) в микробиоте кишечника в остром периоде ИГ. У детей, сформировавших в катамнезе ФГИР, чаще выявляли повышенные значения отношения B. fragilis group/F. prausnitzii (83,3%), отражающего уровень анаэробного дисбаланса микробиоты, чем у детей с благоприятным исходом (64,3%),

Разработана дискриминантная модель прогноза течения ИГ, учитывающая эпидемические данные, перинатальный анамнез, тяжесть заболевания, гематокрит, количества палочкоядерных и сегментоядерных лейкоцитов. Определена частота развития постинфекционных ФГИР (26,2%), язвенного колита (4,6%) и целиакии (3,1%). Комплекс факторов, влияющих на манифестацию ФГИР: особенности пола и возраста, этиологии ИГ, выраженность местного и системного воспаления, наличие признаков токсического влияния инфекции на печень.

Теоретическая и практическая значимость работы

Установлено, что ИГ неуточненной этиологии по клинической картине заболевания и большинству лабораторных показателей, в том числе, гематологическим признакам системного воспалительного ответа, имели сходство с ИГ бактериальной этиологии, что подтверждает инфекционный генез гемоколита.

Клиническая картина гемоколита у детей раннего и дошкольного возраста отличалась более высокой тяжестью по индексу Кларка и более тяжелым обезвоживанием по шкале CDS по сравнению с детьми грудного возраста, что необходимо учитывать при назначении терапии.

Установлена связь уровня цитокинов провоспалительного действия ФНО-а и ИЛ-6 в сыворотке крови с тяжестью ИГ, что имеет диагностическое и прогностическое значение при угрозе нарастания тяжести заболевания.

В остром периоде ИГ у детей, сформировавших в катамнезе ФГИР, обнаружено более частое, чем при благоприятном исходе, повышение уровня анаэробного дисбаланса микробиоты кишечника, что необходимо учитывать при определении тактики пробиотической терапии.

Показано, что функциональные гастроинтестинальные расстройства после перенесенного ИГ чаще развивались у детей грудного и раннего возраста, поэтому эти дети нуждаются в диспансерном наблюдении не менее 6 месяцев.

Разработаны прогностические критерии течения и отдаленного исхода ИГ, способствующие совершенствованию тактики и стратегии ведения пациентов.

Методология и методы исследования

В работе используется методология научного познания с последовательными доказательствами, был применен аналитический (анализ литературы по исследуемому вопросу), эмпирический (анализ, сравнение и наблюдение) и прикладной методы научного познания. Представленное исследование является проспективным, динамическим (с точки зрения временных параметров) и обсервационным.

Положения, выносимые на защиту

1. Инфекционные гемоколиты у детей раннего и дошкольного возраста отличаются более высокой тяжестью по индексу Кларка, чем у детей грудного возраста, что обусловлено особенностями этиологии, состоянием питания и уровнем провоспалительного цитокина ИЛ-6.

2. В остром периоде инфекционного гемоколита у пациентов с неблагоприятными отдаленными исходами выявлены менее выраженные реакции системного воспалительного ответа и более частые признаки анаэробного дисбаланса микробиоты кишечника, чем у детей с благоприятным исходом заболевания.

3. Прогноз течения инфекционного гемоколита определяется значениями линейных дискриминантных функций и учитывает тяжесть заболевания, данные перинатального анамнеза, эпиданамнеза, уровень гематокрита, абсолютного количества палочкоядерных и сегментоядерных лейкоцитов в гемограмме. У 26,2% детей, перенесших ИГ, происходит формирование ФГИР. Комплекс взаимосвязанных факторов развития постинфекционных ФГИР включает: возраст, пол пациента, этиологию ИГ, тяжесть обезвоживания, клинико-лабораторные признаки местного и системного воспаления и биохимические маркеры токсического влияния инфекции на печень.

Степень достоверности и апробация результатов

Достоверность результатов исследования определяется достаточным количеством обследованных пациентов в остром периоде ИГ и в катамнезе 6 месяцев с использованием адекватных и точных современных методов диагностики и статистической обработки. Положения, выносимые на защиту, выводы и рекомендации обоснованы результатами выполненных исследований и их адекватной статистической обработкой.

Результаты исследований докладывались на ежегодных научно-практических конференциях: «Актуальные вопросы инфекционных заболеваний у детей» (СПб, 2018, 2019, 2020 гг.); VIII научно-практической конференции «Современные проблемы детской гастроэнтерологии. Апостоловские чтения» (СПб, 2018 г.); Всероссийском конгрессе «Инфекционные болезни у детей: диагностика, лечение и профилактика» (СПб, 2019 г.); XXIV Объединенной Российской гастроэнтерологической неделе (Москва, 2018 г.); Российском форуме «Педиатрия Санкт-Петербурга: опыт, инновации, достижения» (СПб, 2019 г.); 21-м Юбилейном международном медицинском Славяно-Балтийском научном форуме «Санкт-Петербург-Гастро-2018» и 21-м Съезде Научного общества гастроэнтерологов России (СПб, 2019 г.); XVI и XVII научно-практических конференциях «Современные проблемы педиатрии» (СПб, 2018, 2019 гг.); заседаниях Санкт-Петербургского отделения «Союза педиатров России» (май и октябрь 2019 г.). Получен диплом III степени за постерный доклад «Особенности реакций воспалительного ответа при острых кишечных инфекциях с синдромом гемоколита у детей» на конкурсе молодых ученых XXIV Объединенной Российской гастроэнтерологической недели (Москва, 2018 г.).

Основные результаты исследований внедрены в лечебно-диагностическую работу отделения кишечных инфекций клиники ФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней» ФМБА России, инфекционно-хирургического отделения СПб ГБУЗ «Детская городская больница №1», инфекционно-боксового отделения СПб ГБУЗ «Детская городская больница №22». Основные положения диссертации используются в лекциях, семинарах и практических занятиях на кафедре педиатрии и неонатологии ФГБОУ ВО «СевероЗападный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова» и кафедре детских болезней ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова Министерства обороны Российской Федерации».

По материалам диссертации опубликовано 5 статей в рецензируемых научных изданиях, рекомендованных Высшей аттестационной комиссией Министерства образования и науки Российской Федерации для опубликования основных результатов диссертаций на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. Получено приоритетное право на 1 изобретение.

Личный вклад автора в получение результатов

Автор лично участвовал в составлении плана диссертационного исследования, разработке компьютерной базы данных, сборе и обработке медицинской информации, статистической обработке и анализе полученных результатов; принимала участие в обследовании и лечении пациентов в остром периоде заболевания и наблюдении их в катамнезе.

Структура и объем диссертации

Диссертация изложена на 163 страницах машинописного текста и включает: введение, обзор литературы, главу материалов и методов исследования, 5 глав результатов собственных исследований, обсуждение, выводы, практические рекомендации. Диссертация иллюстрирована 28 таблицами и 22 рисунками. Список цитируемой литературы включает 242 источника, из них 154 отечественных и 88 иностранных.

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Этиологическая, клинико-лабораторная характеристика инфекционных гемоколитов у детей

и сложности дифференциальной диагностики

1.1.1 Этиология инфекционных гемоколитов у детей

Острые кишечные инфекции (ОКИ), протекающие по «инвазивному» типу диареи и характеризующиеся геморрагическими проявлениями в стуле, называемые геморрагическими энтероколитами, а также инфекционными гемоколитами (ИГ), представляют группу разных по этиологии и относительно опасных заболеваний [82, 163]. В последние годы отмечается относительное снижение смертности от «водянистых диарей», обусловленных в основном вирусными агентами, однако пока не удалось добиться подобных результатов в отношении ИГ [16, 34, 127, 172]. При этом значительному увеличению диапазона этиологических факторов бактериальных диарей способствовали успехи современной молекулярной микробиологии [190].

Кампилобактериоз. Кампилобактериоз является одним из ведущих агентов, вызывающих бактериальную диарею у детей [26, 81, 228]. В Западной Европе и Северной Америке показатели заболеваемости кампилобактериозом среди детей значительно выше, чем у взрослых [106]. В Российской Федерации официальные данные об уровне заболеваемости кампилобактериозом отсутствуют, поскольку он регистрируется вместе с другими ОКИ [77]. Преобладает пищевой путь передачи инфекции и спорадическая форма заболеваемости. К факторам передачи относят мясо птицы, реже - говядину, свинину, молоко и другие продукты, не прошедшие достаточную термическую обработку или вторично инфицированные кампилобактером [46].

Сальмонеллез. Ежегодно во всем мире регистрируется до 94 млн. случаев гастроэнтерита, вызванного нетифоидными сальмонеллами, при этом около 155 тыс. случаев сальмонеллеза заканчиваются фатально. В развитых государствах преимущественно нетифоидные сальмонеллы представлены серотипами Enteritidis, Typhimurium и Newport [205]. В большинстве регионов Российской Федерации заболеваемость сальмонеллезом обусловлена S. enteritidis, на долю которой в последние двадцать лет приходилось 84,3% зарегистрированных случаев. Общепризнанным источником сальмонеллеза у людей служит птица предприятий промышленного птицеводства (яйца и мясо бройлеров) [115]. Показано единство механизмов развития сальмонеллезного эпидемического процесса при спорадической и вспышечной заболеваемости [110].

Эшерихиоз. По антигенной структуре патогенные эшерихии делятся на шесть основных категорий: энтеропатогенные (EPEC); энтерогеморрагические (EHEC), они же Shiga-токсин-

продуцирующие (STEC) или веротоксин-продуцирующие (VTEC); энтероинвазивные (EIEC); энтеротоксигенные (ETEC); энтероаггрегативные (EAgEC); адгезивно-инвазивные или диффузно-адгезивные (DAEC). EAgEC и DAEC наименее изучены и в нашей стране стали диагностироваться в последние годы [27, 48].

Шигеллез. На сегодняшний день известны четыре вида шигелл, которые поражают только человека: Shigella dysenteriae, S. flexneri, S. Sonnei, S. boydii. Распространение и заражение происходит пищевым, водным, или контактным путями [169, 197]. Уровень заболеваемости шигеллезами в развитых странах достаточно низкая, в последнюю декаду она составляет от 1 до 7 на 100 тыс. населения [6, 225]. В экономически развивающихся государствах заболеваемость шигеллезами намного выше. В нашей стране в последние годы отмечена тенденция к снижению заболеваемости шигеллезами, в 2017 г. ее показатель составил 4,54 на 100 тыс. населения при среднем значении за последние 10 лет - около 11,59. В этиологической структуре заболеваемости до 2017 г. сохранялся равный вклад S. sonnei и S. flexneri, но с 2017 г. преобладали случаи, вызванные S. flexneri (более 70%). Доля случаев дизентерии в 2016 г., подтвержденной бактериологическим методом диагностики, составила около 91% [14].

Иерсиниоз и псевдотуберкулез - это кишечные сапрозоонозы, из 18 видов рода Yersinia только девять вызывают заболевание у человека. Вид Yersinia enterocolitica делится на два подвида: Y. enterocolitica subsp. paleartica и Y. enterocolitica subsp. enterocolitica [213], повсеместно доминирует энтеропатогенный возбудитель Y. enterocolitica subsp. paleartica O:3/4 [183]. Yersinia pseudotuberculosis кроме энтеропатогенного действия способна вызывать бактериемию. У человека также могут быть выделены менее патогенные иерсинии: Y. frederiksenii, Y. kristensenii, Y. intermedia, Y. mollarettii, Y. bercovieri, Y. rohdei [232]. Y. enterocolitica и Y. pseudotuberculosis выделяют из контаминированных продуктов питания домашнего приготовления, от домашних и диких животных (свиньи, кошки, собаки, зайцы, грызуны) и птиц, а также из почвы и сточных вод [178]. Во всем мире заболеваемость иерсиниозом Y. enterocolitica постепенно снижается и в последние годы составляет около 0,5 на 100 тыс. населения [180], причем большинство заболевших составляют дети младше 5 лет [217].

Инфекция Clostridium (Clostridioides) difficile. Патогенные штаммы Clostridium difficile продуцируют энтеротоксин токсин A (TcdA) и сильнодействующий цитотоксин B (TcdB). Токсинобразующие штаммы C. difficile являются причиной развития псевдомембранозного колита. Вызванные антибактериальной терапией тяжелые нарушения микробиоты сопровождаются выраженным системным воспалительным ответом и глубокими воспалительными изменениями слизистой кишечника. Патологический процесс развивается преимущественно у пациентов из групп высокого риска (с иммунодефицитами; находящихся в условиях госпитализации или в закрытых учреждениях долгосрочного ухода) [51, 185].

Гипервирулентный штамм C. difficile NAP1/B1/027 связан с высокой смертностью и частотой рецидивов заболевания [162, 208]. Имеются данные, свидетельствующие о повышенной экспрессии токсинов и устойчивости к антибиотикам этого штамма, что объясняет его эпидемическое значение [204].

Кишечная форма инфекции, вызванная Clostridium perfringens. Clostridium perfringens -грамположительные строгие анаэробы, широко распространены в окружающей среде, выявляются в фекалиях человека и животных. C. perfringens разделяют на 6 типов (А, В, С, D, Е, F) по способности вырабатывать экзотоксины, а также ферменты с выраженными некротическими и цитолитическими свойствами. У детей кишечные формы инфекции преимущественно вызывают C. perfringens типа А, реже типов С и F [229]. Источник инфекции - человек и животные, заражение происходит алиментарным путем, причем дети раннего возраста инфицируются при употреблении контаминированного молока или творога, дети старшего возраста - при употреблении колбасных изделий.

Klebsiella oxytoca - антибиотико-ассоциированный геморрагический колит описан как спорадическое заболевание, возникающее на фоне лечения антибиотиками группы пенициллинов или нестероидными противоспалительными препаратами. В развитии заболевания имеют значение цитотоксин-продуцирующие штаммы K. oxytoca [41, 193], выделение которых осуществляется методом бакпосева на селективных питательных средах -SCITB (Simmons цитрат-инозитол-триптофан-желчные соли) или MacConkey (MAC) агар [193].

Листериоз. Listeria monocytogenes - грамположительные факультативно-анаэробные бактерии, вызывают заболевание с высоким уровнем летальности в группах риска (пациенты с воспалительными заболеваниями кишечника или иммунодефицитными состояниями) [93]. Заражение происходит алиментарным путем при употреблении в пищу загрязненных продуктов растительного или животного происхождения.

Таким образом, инфекционные диареи бактериальной этиологии нередко имеют инвазивный характер. Структура ИГ у детей представлена наиболее часто кампилобактериозом и сальмонеллезом, что существенно отличается от таковой в прежние годы. Появляется все больше данных о ИГ, обусловленных условно-патогенными бактериями, в том числе, у больных первых месяцев жизни и больных с иммунодефицитными состояниями.

1.1.2 Современные методы идентификации возбудителей инфекционных гемоколитов

Клинические рекомендации (протоколы лечения) оказания медицинской помощи детям определяют практические подходы к этиологической диагностике наиболее распространенных бактериальных диарей. В то же время, у больных ОКИ есть опасность развития ГУС и острой

почечной недостаточности (ОПН), поэтому в объем обследования пациентов с ИГ необходимо включать диагностику энтерогеморрагических эшерихий современными (молекулярно-генетическими) методами, что требует усовершенствования действующих рекомендаций [2, 105].

Золотой стандарт диагностики ОКИ - культуральный метод, к преимуществам которого относят высокую достоверность, возможность определения резистентности к используемым антибактериальным препаратам и изучения штаммовых особенностей патогенных бактерий. Чувствительность культурального метода довольно высокая - 103 КОЕ/мл [131]. В зависимости от цели исследования применение различных диагностических питательных сред позволяет выявлять широкий спектр патогенных микробов и добиваться высокой селективности идентификации возбудителей. Некоторые бактериальные возбудители ОКИ требуют высокоселективных сред для своего выделения. К ним относятся кампилобактерии, аэромонады, вибрионы, иерсинии. Экономическая эффективность регулярного культивирования этих микробов определяется конкретной эпидемической обстановкой.

Многие автоматизированные системы идентификации бактериальных возбудителей (Microscan, Siemens Healthcare Diagnostics; BD Phoenix Automated Microbiology System; VITEK, bioMeriex) используют для определение их биохимических особенностей, что лежит в основе фенотипической идентификации микробов. Время проведения исследования составляет от 4 до 18 час.

За последние десятилетия для диагностики этиологии ОКИ значительно увеличилась значимость молекулярно-генетических методов (ПЦР и ПЦР в режиме «реального времени» (ПЦР-РВ)) Это обусловлено их сравнительной дешевизны, высокой чувствительности и специфичности, быстроты проведения [56, 78, 148]. В крупных многоцентровых эпидемиологических исследованиях ВОЗ метод ПЦР используется в качестве основного диагностического инструмента [94, 236]. В повседневной этиологической диагностике инфекционных диарей ПЦР наиболее предпочтителен для идентификации Campylobacter spp., энтеротоксигенных E. coli (ETEC) и C. difficile [173]. Для методов ПЦР и ПЦР-РВ характерна высокая чувствительность - 102-103 КОЕ/мл и 100% специфичность. Время проведения анализа составляет 2-3 час.

В настоящее время широкое распространение получил физико-химический метод идентификации бактериальных возбудителей - матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация времяпролетная масс-спектрометрия (Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass spectrometry MALDI-TOF MS), который используется для ускорения идентификации бактериальных и некоторых других патогенов [224, 227]. Время анализа одной культуры микроорганизма занимает 6-8 мин. Внедрение масс-

спектрометрического анализа в практику лабораторий федерального уровня обеспечивает быструю идентификацию более 500 видов микроорганизмов. Но на сегодняшний день существует ограничение использования MALDI-TOF MS, в частности, данная технология не позволяет проводить дифференциацию между Shigella spp. и E. coli.

Последние годы активно внедряются методы автоматизированной этиологической диагностики инфекционных диарей с использованием биочипов. Преимущество данных систем состоит в их сравнительной простоте и более низкой себестоимости при обследовании большого количества образцов [83].

Кроме того, в современных условиях для этиологической диагностики инфекционных диарейных заболеваний применяется 16S-PHK секвенирование, отличающееся высокой достоверностью и способностью выявлять ассоциации возбудителей [173].

Разнообразие методов лабораторной диагностики этиологии ОКИ во многом обусловлено прогрессом технических возможностей и повышением доступности практического использования новейших методик [190]. Однако, несмотря на устойчивые тенденции к более полной верификации возбудителей ИГ, окончательный результат исследований всегда зависит от особенностей патогенеза и течения заболеваний.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Климова Ольга Ивановна, 2021 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Агафонова, Н.А. Особенности терапии больных с постинфекционным синдромом раздраженного кишечника/ Н.А. Агафонова, Э.П. Яковенко, А.Н. Иванов, А.В. Яковенко,

A.С. Прянишникова// Фарматека. 2011. - N 15. - С.50-55.

2. Агеева, М.Р. Молекулярная диагностика инфекционных болезней/ М. Р. Агеева,

B. С. Азарова, М. В. Альварес Фигероа и др.// — РИПОЛ классик Москва, 2018. — 654 с.

3. Айтбаев, К. А. Синдром раздражённого кишечника: патофизиологическая роль дисбиоза кишечника и возможности его модуляции/ К. А. Айтбаев, И. Т. Муркамилов, В. В. Фомин, Ф. А. Юсупов, Н. А. Реджапова, З. Р. Райимжанов, З. А. Айдаров // Медицинский вестник Северного Кавказа. 2018. - Т. 13. - № 1.1. - С. 114-119.

4. Акиньшина, А.И. Перспективы использования методов коррекции микробиоты при терапии воспалительных заболеваний кишечника. / А.И. Акиньшина, Д.В. Смирнова, А.В. Загайнова, В.В. Макаров, С.М. Юдин //Рос. журн. гастроэнтерол. гепатол. колопроктол. 2019.- №29(2) - С. 12-22.

5. Анушенко, А.О. Анемия при воспалительных заболеваниях кишечника у детей. / А. О. Анушенко, А. С. Потапов, Е. Г. Цимбалова, О. Б. Гордеева // Вопросы современной педиатрии. 2016. - №15 (2). - С. 128-140.

6. Апарин, П.Г. Заболеваемость шигеллезами в Российской Федерации в 2012-2013 гг. и вакцинопрофилактика дизентерии Зонне на территориях, пострадавших от наводнения. / В. А. Волков , М. В. Абрамцева, Т. И. Немировская, В. П. Ковтун, О. В. Фадейкина, Р. А. Волкова // Дальневосточный Журнал инфекционной патологии. 2014. - № 24. - С. 84-87.

7. Архипина, С.А. Ретроспективный анализ случаев сальмонеллеза у госпитализированных пациентов. / С.А. Архипина, Е.Ф. Мельникова // Ученые записки Орловского государственного университета. 2015. - №4 (67). - С. 288-291.

8. Бабаева, А.Р. Цитокиновая регуляция функциональных заболеваний желудочно-кишечного тракта. / А.Р. Бабаева, О.Н. Родионова, Р.В. Видикер //Вестник новых медицинских технологий. - 2011 - Т. XVIII, № 1 - С. 163

9. Бабик, Р.К. Оптимизация диагностики вирусных и бактериальных кишечных инфекций у детей и взрослых. / Р.К. Бабик, О.И. Сагалова //Инфекционные болезни. 2015. - №13(2). - С. 46-54.

10. Балабанцева, А.П. Современные подходы к диагностике синдрома избыточного бактериального роста. / А.П. Балабанцева, И.Л. Кляритская // Крымский терапевтический журнал. 2015. - № 4 (27). - С. 19-27.

11. Бельмер, С.В. Болезни кишечника у детей. / С.В. Бельмер, А.Ю. Разумовский,

A.И. Хавкин, А.Б. Алхасов, М.К. Бехтерева, Г.В. Волынец, В.А. Воронин, Л.В. Воронцова, Т.В. Гасилина, М.А. Голованев, Н.В. Гончар, А.И. Гуревич, А.Ф. Дронов, К.Д. Ермоленко, Д.В. Залихин, Д.О. Иванов, А.Л. Ионов, Е.Ю. Калинина, О.Н. Комарова и др. - Москва, 2018. - Том 1. - 496 с.

12. Бехтерева, М.К. Диагностика гемоколитов у детей./ М.К. Бехтерева, К.К. Тихомирова, А.М. Комарова // Медицина: теория и практика. - 2018. - Т. 3. - № 5. - С. 1923.

13. Бехтерева, М.К. Оценка эффективности желатина танната при острых инфекционных диареях у детей. / М. К. Бехтерева, А. М. Комарова, А. Н. Усков, И. В. Раздьяконова, Л.А. Алексеева, Т.В. Бессонова //Детские инфекции. 2017. - №16(4). - С.58-63.

14. Бехтерева, М.К. Существует ли проблема этиотропной терапии инвазивных диарей (клинический случай)? / М. К. Бехтерева, Ю. В. Лобзин, М. Я. Иоффе, И. В. Раздьяконова, И. В. Лазарева, К. Д. Ермоленко // Журнал инфектологии. 2019. - №11(1). -С.104-112.

15. Богданов, А.Н. Дифференциальная диагностика тромбоцитозов в клинической практике / А.Н. Богданов, В.В. Тыренко, Я.А. Носков, В.Н. Семелев // Вестн. Росс. Военно-медиц. акад. - 2014. - № 2 (46). - С. 44 - 50.

16. Бондарев, В.П. Эпидемиология ротавирусной инфекции и тактика вакцинопрофилактики. / В. П. Бондарев, В. А. Шевцов, И. Н. Индикова, Е. Э. Евреинова, Д.

B. Горенков // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. 2019. - №19(2). -

C.81-87.

17. Валишин, Д.А. Хирургическая патология органов брюшной полости или острые кишечные инфекции: трудности диагностики. / Д.А. Валишин, А.П. Мамон, Р.Т. Мурзабаева, М.А. Мамон // Креативная хирургия и онкология. 2019. - №9(3). - С.177-181.

18. Вълкова, Е.Д. Фекальный кальпротектин в дифференциальной диагностике острых кишечных инфекций у детей / Е. Д. Вълкова, М. Д. Господинова, И. Т. Тодоров // Журнал инфектологии. 2018. - № 2. - С. 117-122.

19. Габрусская Т.В. Поражения костной ткани у детей с воспалительными заболеваниями кишечника. / Т.В. Габрусская // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2016. - № 2(126). - С. 70-78.

20. Галкина, Л.А. Значение Yersinia enterocolitica в развитии болевого абдоминального синдрома у детей, находившихся в инфекционном стационаре / Л.А. Галкина, Е.Р. Мескина // Лечение и профилактика. 2018. - Т.8. № 4. - С. 23 - 30.

21. Галькевич, Н.В. Инвазивный (внекишечный) сальмонеллез у детей: серия клинических случаев / Н.В. Галькевич, Н.В. Голобородько, А.А. Астапов, Л.И. Матуш, Н.Л. Клюйко, А.В. Лазарев, И.А. Герасименко // Клиническая инфектология и паразитология. 2018. - № 2. - С. 211 - 223.

22. Голубев А.О. Клинико-иммунологические особенности сочетанных сальмонеллезов у детей и иммунотерапия постинфекционного бактерионосительства: Автореф. дисс. ...канд. мед. наук. М., 2013. - 22 с.

23. Гончар, Н.В. Взаимное влияние нарушений питания и неблагоприятного течения кишечных инфекций у детей: как выйти из замкнутого круга? / Н.В. Гончар, Н.П. Шабалов, О.И. Ныркова // Вопросы детской диетологии, 2014. - Т. 12. - №5. - С. 28 - 38.

24. Гончар, Н.В. Заболеваемость детей сальмонеллезом и уровень резистентности клинических штаммов сальмонелл к антибактериальным препаратам в Санкт-Петербурге / Н.В. Гончар, И.В. Лазарева, С.В. Рычкова, А.С. Кветная, Л.П. Альшаник , Ю.В. Фомичева, О.И. Ныркова, Л.А. Кириленко // Журнал инфектологии. - 2015. - № 1. - С. 80-86.

25. Гончар, Н.В. Клинические маски осложненного течения сальмонеллеза у детей. / Н. В. Гончар, С. В. Александров, Н. М. Беззатеева, И. Л. Ковалева, И. А. Гарапач // Детская Медицина Северо-Запада. 2013. - № 4 (4). - С 30-35.

26. Горелов, А.В. Диарейные заболевания у детей с точки зрения педиатра и инфекциониста / А.В. Горелов, И.Н. Захарова // Эффективная фармакотерапия. 2017. № 11. С. 34-40.

27. Горелов, А.В. Клинико-эпидемиологическая характеристика энтероаггрегативного эшерихиоза у детей / А.В. Горелов, А.В. Бондарева, А.Т. Подколзин // Инфекционные болезни. - 2013. - Т. 11. - № 3. - С. 22-26

28. Горелов, А.В. Особенности течения острых кишечных инфекций у детей с паратрофией/ А.В. Горелов, М.Е. Жупарова, Д.В. Усенко, И.Ш. Трефилова //Инфекционные болезни. - 2008. - Т. 6. - № 3. - С. 87 - 90.

29. Григорович, М.С. Функциональное состояние желудочно-кишечного тракта и особенности исходов при острых кишечных инфекциях / М.С. Григорович // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2012. - № 3. - С. 56-59.

30. Гуарино, А. Ведение детей с острым гастроэнтеритом на педиатрическом участке. (Рекомендации ESPGHAN-2014.) / А. Гуарино, И.Н. Захарова, н.Г. Сугян // Медицинский совет. - 2016. - № 1. - С. 148-156.

31. Гунькова, Е.В. Особенности гемолитико-уремического синдрома у детей различного возраста / Е.В. Гунькова, И.В. Зорин, А.А. Вялкова // Педиатр. - 2017. - Т. 8. № S. - С. М103-М104.

32. Данилова, Н.А. Роль микробиоты в формировании аутоиммунного воспаления при воспалительных заболеваниях кишечника / Н. А. Данилова, А. Р. Валеева, С. Р. Абдулхаков, О. В. Скороходкина, Р. А. Абдулхаков // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология 2017. - №143 (7). - С. 121-125.

33. Денисюк, Н.Б. Этиологическая структура и некоторые клинические особенности кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционный стационар г. Оренбурга / Н.Б. Денисюк, Ю.Д. Каган // Медицинский альманах. 2013. - № 6 (30). - С. 143 - 146.

34. Ермоленко, К.Д. Вирусные гастроэнтериты у детей: современные представления об эпидемиологии и профилактике / К.Д. Ермоленко, Ю.В. Лобзин, Н.В. Гончар // Журнал инфектологии. 2015. - № 3. - С. 22-32.

35. Ермоленко, К.Д. Клинико-патогенетическая характеристика вирусных кишечных инфекций и их роль в развитии функциональных расстройств желудочно-кишечного тракта у детей. Автореф. дисс. к.м.н., СПб. - 2017. - 23 с.

36. Ермоленко, К.Д. Нарушение микробиоценоза кишечника как фактор формирования постинфекционной патологии органов пищеварения у детей после вирусных кишечных инфекций. / К.Д. Ермоленко, Н.В. Гончар, Е.И. Ермоленко и др. // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2017. - Т.131, № 1. - С. 53-57.

37. Ермоленко, К.Д. Структура функциональной патологии органов пищеварения у детей после вирусных кишечных инфекций / К.Д. Ермоленко // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. 2017. - №1. - С. 59-63.

38. Железникова, Г.Ф. Калицивирусная инфекция и цитокиновый статус у детей / Г.Ф. Железникова, И.В. Раздьяконова, О.В. Тихомирова , М.К. Бехтерева, Н.Е. Монахова // Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2009. - №6. - С. 82-87.

39. Жилин, И.В. Роль полиморфизма гена TNFa в положениях 238G/A и 308G/A в этиопатогенезе воспалительных заболеваний кишечника у различных этнических групп / И. В. Жилин, Е. Ю. Чашкова, А. А. Жилина, Б. С. Пушкарев, Н. С. Коротаева //Альманах клинической медицины. 2019. - №47 (6). - С. 548-558

40. Залетова, Н.К. Генетические факторы, влияющие на эффективность терапии глюкокортикостероидами при хронических воспалительных заболеваниях кишечника у детей / Н.К. Залетова, А.Б. Чухловин, А. Т. Третьяк, Л. П. Востокова, Е. А. Корниенко // Педиатр. 2015. - Т. 6. № 3. - С. 91-97.

41. Захаренко С.М. Токсин-продуцирующие Klebsiella oxytoca как причина антибиотик-ассоциированного колита / С.М. Захаренко // Альманах клинической медицины. - 2018. - №46(5). - С. 497-503.

42. Земляной, В.П. Сравнительные особенности клиники и диагностики желудочно-кишечных кровотечений у больных с острыми инфекционными заболеваниями / В.П. Земляной, А.Б. Сингаевский, Ю.В. Летина, Д.В. Третьяков // Вестник Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова. - 2016. - Т.8. - № 1. -С. 87-91.

43. Зернова, Н.И. Роль иерсиниозной инфекции в развитии геморрагического васкулита у детей / Н.И. Зернова, Т.В. Головешкина, Е.М. Плешкова, О.И. Удовикова // Смоленский медицинский альманах. - 2017. - № 3. - С. 33 - 36.

44. Иванов, И.В. Синдром гемоколита при острых кишечных инфекциях у детей: клинико-лабораторные особенности / И.В. Иванов, О.С. Сидорова, Г.М. Филиппова и др. // Бюлл. медиц. науки. - 2017. - No 2 (6). - С. 34 - 37.

45. 1ванова, Л.А. Особливосп переб^у швазивних дiарей у д^ей на сучасному етат / Л.А. 1ванова, М.Н. Гарас, У.1. Марусик, А.А. Болтенкова // Актуальная инфектология. 2015. - № 3. - C. 34-37.

46. Кампилобактериоз [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/campylobacter (дата обращения: 24.03.2020).

47. Каротам, П.А. Значение белков острой фазы воспаления в патогенезе острых кишечных инфекций / П.А. Каротам, Л.Н. Мазанкова, Т.Э. Боровик, М.И. Баканов // Детские инфекции. - 2005. - Т. 4. - № 4. - С. 24 - 28.

48. Карцев, Н.Н. Выделение диареегенных эшерихий от детей в возрасте до 5 лет / Н.Н. Карцев , М.Г. Ершова , А.С. Пинчук , Е.С. Леонова, Г.Н. Абросимова, Н.К. Фурсова, Э.А. Светоч //Материалы II Национального конгресса бактериологов. Ж. Инфекция и иммунитет. - № 1. г. Ярославль 2016. - С. 38

49. Карцев, Н.Н. Эпидемиология, свойства и лабораторная диагностика шига-токсин-продуцирующих Escherichia coli / Н.Н. Карцев , Э.А. Светоч // Бактериология. 2018.

- Т. 3. № 1. - С. 7-12

50. Касымов, И.А. Клинико-иммунологические аспекты сальмонеллеза typhimurium у детей / И.А. Касымов, Г.М. Шарапова // Инфекционные болезни. - 2011. - Т. 9, №1. - С. 42 - 46.

51. Кветная, А.С. Clostridium difficile-ассоциированная инфекция у детей с диареей: эпидемиология, клиника и диагностика. / А.С. Кветная, Л.И. Железова // Педиатрия. - 2019.

- №98 (1). - С. 35 -40.

52. Кветная, А.С. Клинико-лабораторная характеристика Clostridium difficile -ассоциированной инфекции у детей с острыми кишечными инфекциями. / А.С. Кветная, Л.И. Железова // Медицинский алфавит. 2016. - Т.2. № 32. - С. 37-40.

53. Кессаева, И.К. Информативность фекального кальпротектина в диагностике острых кишечных инфекций у детей. / И.К. Кессаева, З.Д. Калоева, Л.Ю. Барычева, М.В. Голубева // Фундаментальные исследования. - 2015. - № 1-1. - С. 87-91

54. Кессаева, И.К. Сравнительная эпидемиологическая характеристика острых кишечных инфекций на отдельных территориях Северо-Кавказского федерального округа / И.К. Кессаева, З.Д. Калоева, М.В. Голубева, Л.Ю. Барычева // Современные проблемы науки и образования. 2015. - № 2. - С. 3.

55. Климова, О.И. Как влияют кишечные инфекции с синдромом гемоколита на антропометрические показатели состояния питания у детей? / О.И. Климова, Н.В. Гончар, И В. Раздьяконова, Ю.В. Лобзин // Педиатр. - 2019. - Т. 10. № 2. - С. 13-20.

56. Климова, О.И. Необходимость использования ПЦР диагностики в эпидемических очагах кишечных инфекций / О.И. Климова, Н.В. Гончар, И.В. Раздьяконова, Э.А. Мартенс // Журнал инфектологии. 2018. №4. Приложение 1. Мат-лы Всеросс. ежегодн. конгр. «Инфекционные болезни у детей: диагностика, лечение и профилактика». С. 84.

57. Клинические рекомендации (протокол лечения) оказания медицинской помощи детям больным ротавирусной инфекцией. 2015 г. http://niidi.ru/dotAsset/91e2802d-ed31-40a1-b32b-c888f12c196c.pdf.

58. Клинические рекомендации (протокол лечения) оказания медицинской помощи детям больным шигеллезом // http://niidi.ru/dotAsset/a7b20eaa-13b3-4444-a2b9-0bfaafa17cf7.pdf.

59. Кожухова, Е.А. Характеристика случаев острой диареи у взрослых больных с позитивной реакцией клинического материала на норовирус / Е. А. Кожухова, И. В. Горбова // Инфекция и иммунитет. -2019. - Т. 9. № 2. - С. 375-380.

60. Козлова, И. В. Кандидоз желудочно-кишечного тракта / И.В. Козлова, Л.И. Лекарева, А.П. Быкова, Ю.Н. Мялина, Л. Ю. Островская // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2016. № 3 (127). С. 40-46.

61. Комарова, А.М. Синдром гемоколита: трудности дифференциальной диагностики в практике врача / А.М. Комарова, К.Д. Ермоленко, И.В. Раздьяконова //Здоровье - основа человеческого потенциала: проблемы и пути их решения. - 2018. - Т.13. - № 1. - С. 244-253.

62. Константинова, Ю.В. Клинико-лабораторные особенности течения инвазивных диарей у детей раннего возраста / Ю.В. Константинова, А.У. Сабитов, С.Е. Чащина // Инфекционные болезни. - 2015. - № 4 (127). - С. 30-32.

63. Корниенко, Е.А. Значение кишечной микробиоты и пробиотиков при воспалительных заболеваниях кишечника / Е.А. Корниенко // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2015. - № 1-2. - С. 6-9.

64. Корниенко, Е.А. Нецелиакийная чувствительность к глютену / Е.А. Корниенко // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2017. - Выпуск 139. № 3. - С. 8998.

65. Корниенко, Е.А. Проект рекомендаций российского общества детских гастроэнтерологов, гепатологов и нутрициологов по диагностике и лечению болезни Крона у детей / Е.А. Корниенко, А.И. Хавкин, Е.Н. Федулова, Г.В. Волынец, Т.В. Габрусская, Т.А. Скворцова, А.В. Никитин, Т.Н. Сорвачева, Е.Г. Цимбалова, О.В. Щербакова // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2019. - Выпуск 171. № 11. - С. 101 -134.

66. Круглова, Л.С. Псориаз и воспалительные заболевания кишечника: пути патогенеза и вопросы выбора генно-инженерных препаратов (обзор литературы) / Л.С. Круглова, А.Н. Львов, А.В. Каграманова, О.В. Князев // Альманах клинической медицины. - 2019. - №47(6). - С.568-78.

67. Кузнецова, Д.А. Исследование скрытой крови в комплексной диагностике гастроинтестинальной формы пищевой аллергии у младенцев / Д.А. Кузнецова, Н.М. Богданова, П.В. Воронцов // Медицина: теория и практика. - 2019. - Т.4.№ 1. - С. 178-182.

68. Куприенко, Н. Б. Метаболические основы профилактики инфекции мочевой системы у детей. /Н.Б. Куприенко, З.В. Светлова, Н.Н. Смирнова // Ученые записки СПбГМУ им. акад. И. П. Павлова. - 2017 - 24(1) - С.22-27.

69. Лиознов, Д.А. Опыт применения растительного энтеросорбента в комплексной терапии острых кишечных инфекций / Д.А. Лиознов, С.К. Сайфуллина, И.Н. Кузнецова, С.Л. Николаенко, А.Т. Журкин // Клиническая инфектология и паразитология. 2015 - № 3 (14) - С.57-63.

70. Лобзин, Ю.В. Дисбаланс кишечной микробиоты как факторов риска кардиометаболических заболеваний / Ю.В. Лобзин, М.В. Авдеева , С.В. Сидоренко , В.С. Лучкевич //Журнал инфектологии. - 2014. - 6(4). - 5-12.

71. Магомедов, Г.М. Проблемы диагностики и лечения перфораций полых органов у больных, страдающих острыми кишечными инфекциями / Г.М. Магомедов, В.П. Земляной, М.М. Нахумов, Б.Б. Намазов // Вестник Российской военно-медицинской академии. - 2018. - 1(61). - С. 145-148.

72. Мазанкова, Л.Н. Междисциплинарный взгляд на инфекционные болезни у детей / Л.Н. Мазанкова, А.А. Чебуркин //Эффективная фармакотерапия. - 2018. - № 1 (15). - С. 412.

73. Мазанкова, Л.Н. Особенности течения Clostridia difficile-инфекции у детей раннего возраста / Л.Н. Мазанкова, С.Г. Перловская, И.С. Курохтина, С.В. Лебедева // Педиатрия. - 2016. - Т. 95. № 6. - С. 122-130.

74. Мазанкова, Л.Н. Совершенствование патогенетической терапии острых кишечных инфекций у детей раннего возраста / Л.Н. Мазанкова, С.Г. Горбунов, Л.А. Павлова // Лечение и профилактика. - 2013. - № 4 (8). - C. 54-57.

75. Макарова, М.А. Молекулярно-генетическая характериска штаммов Escherichia coli серогруппы O26, вызывающих диарейные заболевания у детей / М.А. Макарова, А.В. Дмитриев, З.Н. Матвеева, Л.А. Кафтырева// Медицинский академический журнал. - 2018.

- Т. 18.№ 3. - С. 85-90.

76. Макарова, С.Г. Гастроинтестинальная пищевая аллергия у детей / С.Г. Макарова, Л.С. Намазова-Баранова, Е.А. Вишнёва, О.А. Ерешко, И.Г. Гордеева // Вопросы современной педиатрии. - 2017. - Т. 16. № 3. - С. 202-212.

77. Маркова, Ю.М. Проблемы и задачи изучения пищевого кампилобактериоза в Российской Федерации / Ю.М. Маркова, И.Б. Быкова, Ю.В. Короткевич // Современные технологии продуктов питания: сб. науч.статей. 2 - й Международ. науч. - практич. конф. 3

- 4 дек. 2015 г. - Курск, 2015. - С.99 - 103.

78. Матвеева, И.Ю. Применение метода ПЦР в диагностике острых кишечных инфекций у детей. / И.Ю. Матвеева, В В. Безик // НАЦИОНАЛЬНЫЕ ПРОЕКТЫ -ПРИОРИТЕТ РАЗВИТИЯ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РЕГИОНОВ. Материалы 54 межрегиональной научно-практической медицинской конференции. Ульяновск. - 2019. -С. 200-201 с.

79. Матиев, Б. Острое почечное повреждение как осложнение кишечной инфекции у детей / Б. Матиев, Ж. Байтокова, М.К. Мамбетова, М.К. Беделбаев, Н.К. Алмереков // Вестник КГМА им. И.К. Ахунбаева. - 2017. - № 2. - С. 127-130.

80. Мескина, Е.Р. Обоснование иммунотерапии острой кишечной инфекции инвазивного типа с использованием альфа-интерферона у детей первых месяцев жизни с кишечными дисфункциями / Е.Р. Мескина, Е.В. Русанова //Альманах клинической медицины. - 2015. - № 42. - С. 87-95.

81. Молочкова, О.В. Бактериальные диареи у госпитализированных детей / О. В. Молочкова, О. Б. Ковалев, О. В. Шамшева, Н. В. Соколова, А. А. Сахарова, Н. И. Крылатова,

Е. В. Галеева, А. А. Корсунский, О. А. Кащенко // Детские инфекции. - 2019. - 18(4). - С. 12-18.

82. Молочкова, О.В. Клинико-эпидемиологическая характеристика кампилобактериоза у детей / О.В. Молочкова, О.Б. Ковалев, А.А. Новокшонов, Е.В. Новосад, А Л Россина, О.В. Шамшева // Педиатрия. - 2017. - №96 (6). - С. 53-56.

83. Молочный, В.П. Этиология острых кишечных инфекций у детей г. Хабаровска / В.П. Молочный, Л.И. Заварцева, А.Т. Подколзин, В.И.Резник // Дальневосточный медицинский журнал. - 2014. - № 4. - С. 23-26.

84. Морозов, Д.А. Гиршпрунг-ассоциированный энтероколит у детей / Д.А. Морозов, Е.С. Пименова, Г.А. Королёв // Вопросы практической педиатрии. - 2019. - Т. 14. № 2. - С. 35-42.

85. Нагоева, М.Х. Оценка состояния провоспалительных и противовоспалительных циткинов у больных бактериальной ангиной / М.Х. Нагоева //Вестник новых медицинских технологий. - 2009. - №Х1У(1). -С. 85-88.

86. Намазова-Баранова, Л.С. Антибиотикорезистентность в современном мире / Л.С. Намазова-Баранова, А.А. Баранов // Педиатрическая фармакология. 2017. - №14(5). - С.341-354.

87. Насонов, Е.Л. Новые возможности фармакотерапии иммуновоспалительных ревматических заболеваний: фокус на ингибиторы интерлейкина 17 / Е.Л. Насонов // Научно-практическая ревматология. -2017. - №55(1). -С. 68-86.

88. Никитин, А. В. Неинвазивные маркёры активности воспалительных заболеваний кишечника / А.В. Никитин, Л.В. Васильева, А.А. Матюхин // Рос журн гастроэнтерол гепатол колопроктол. - 2016. - №26(6). - С. 106-111.

89. Николаева, С.В. Клинические особенности острых кишечных инфекций сочетанной этиологии у детей / С.В. Николаева, А.В. Горелов // Педиатрия. - 2019. - Т. 98, № 1. - С. 174 - 177.

90. Новокшенов, А.А. Клинические рекомендации по диагностике и лечению ОКИ у детей критериями в зависимости от типа диареи / А.А. Новокшенов, Л.Н. Мазанкова, В.Ф. Учайкин // Лечение и профилактика. - 2013. - № 4 (8). - С. 62-73.

91. Новокшенов, А.А. Лечебное питание при острых кишечных инфекциях /А.А. Новокшенов, Л.Н. Мазанкова // Эффективная Фармакотерапия. - 2014. - №42. - С.14-25.

92. Огошкова, Н.В. Клинико-иммунологические аспекты острого периода псевдотуберкулеза и его исходов у детей / Н.В. Огошкова, Э.А. Кашуба, Т.Г. Дроздова, О.А.Любимцева, Л.В. Ханипова, М.В. Антонова // Медицинская наука и образование Урала. - 2015. - Т. 16. № 1 (81). - С. 130 - 136.

93. Одинцова, А.Х. Клинический случай листериоза у пациентки с болезнью Крона / А.Х. Одинцова, Л.Р. Садыкова, Е.Н. Белоусова, Д.И. Абдулганиева // Практическая медицина. - 2014. - № 4-1 (80). - С. 88-90.

94. Онищенко, Г.Г. Молекулярно-генетическая характеристика шига-токсинпродуцирующих Escherichia coli, выделенных при вспышке пищевой инфекции в Санкт-Петербурге в 2013 году / Г.Г. Онищенко, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, Н.В. Воложанцев, В.А. Баннов, Н.Н. Карцев, и др. // Вестник Российской академии медицинских наук . - 2015 . - Т .70 .- №1 .- С .70-81.

95. Орадова, А.Ш. Лабораторная диагностика цитокинов (обзорная статья) / А.Ш. Орадова, З.К. Канжигалина, Р.К. Касенова // Вестник КазНМУ. - 2015. - №1. - С. 357-360.

96. Орешко, Л.С. Клинический опыт применения кишечного антибиотика рифаксимин при целиакии / Л.С. Орешко, Е.А. Семенова // Медицинский совет. - 2019. -№ 14. - С. 94-98.

97. Осадчук, М.А. Синдром перекреста функциональной диспепсии, гастроэзофагеальной рефлюксной болезни и синдрома раздраженного кишечника: оптимизация терапии / М.А. Осадчук, М.М. Осадчук //РМЖ. - 2015. - № 28. - С. 1690-1692.

98. Педиатрия: учебник для мед. вузов / под ред. Н. П. Шабалова. — 7е изд., испр. и доп. — Санкт-Петербург: СпецЛит, 2019.— 943 с.

99. Печкуров, Д.В. Принципы терапии острых кишечных инфекций на современном этапе / Д.В. Печкуров, Н.М. Бочкарева, Е.С. Гасилина // Фарматека. - 2017. - № 11 (344). -С. 57-62.

100. Пиманов, С.И. Римский IV консенсус по функциональным пищеварительным расстройствам: от классификации общих положений к диагностике и лечению функциональной диспепсии / С.И. Пиманов // Лечебное дело. - 2017. - № 3 (55). - С. 57-67.

101. Плоскирева, А.А. Диетотерапия (нутриентная поддержка) острых кишечных инфекций у детей / А.А. Плоскирева, А.В. Горелов // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2015. - №1(113). - С. 62-65.

102. Плоскирева, А.А. Острые кишечные инфекции вирусной этиологии у детей: клиника, диагностика и терапии: Автореф. дисс. ... докт. мед. наук. М., 2016. - 43 с.

103. Плоскирева, А.А. Ротавирусная инфекция у детей и ее сочетанные формы / А.А. Плоскирева // Экспер. и клин. гастроэнтерол. - 2017. - Т. 142, No 6. - С. 26-30.

104. Плоскирева, А.А. Тактика терапии при острых кишечных инфекциях / А.А. Плоскирева // Терапия. - 2015. - № 2. - С. 43-55.

105. Подколзин, А.Т. Анализ структуры летальных исходов у детей младшего возраста при острых кишечных инфекциях / А.Т. Подколзин, О.А. Веселова, М.Л.

Яковенко, Т.А. Коновалова, Д.Н. Петухов, С.Б. Яцышина, Н.С. Воробьева, Г.А. Шипулин // Инфекц. болезни. - 2013. - Т. 11. № 2. - С. 38-44.

106. Поздеева, М.А. Кампилобактериоз среди жителей преарктической зоны Европейского Севера /М.А. Поздеева, Г.Ш. Османова, И.Е. Ирхина // Вестник науки и образования. - № 1(55). Часть 2. 2019. - С. 75-78.

107. Попова, О.П. Клинико-иммунологические особенности сочетанного течения коклюша и респираторного микоплазмоза у детей / О.П. Попова, М.С. Петрова, И.М. Фёдорова, С.И. Котелева, Е.Н. Абрамова// Инфекционные болезни. - 2012. - Т. 10. №2. - С. 43-48.

108. Потапова, Т.В. Эпидемиологические и клинико-лабораторные аспекты кампилобактериоза/ Т.В. Потапова, Д.А. Лиознов, А.С. Драп, К.Д. Ермоленко // Фарматека.

- 2017. - № 13 (346). - С. 40-43.

109. Прилепина, М.А. Энергодефицитное состояние у детей с гипотрофией / М.А. Прилепина, Ф.Н. Гильмиярова, Д.В. Печкуров // Вопросы детской диетологии. - 2015. - Т. 13. №6. - С. 10-17.

110. Раков, А.В. Микробиологическая и эпидемиологическая оценка вспышки сальмонеллеза в детском дошкольном учреждении Мурманска. Здоровье. Медицинская экология / А.В. Раков, Ф.Н. Шубин, Н.А. Кузнецова, Н.Г. Передерий // Наука. - 2016. - № 4 (67). - С. 26-30.

111. Руженцова, Т.А. Коррекция дисбиотических нарушений, развивающихся при острых кишечных инфекциях у детей / Т.А. Руженцова, А.А. Плоскирева, А.В. Горелов // РМЖ. - 2017. - № 5. - С. 362-366.

112. Руженцова, Т.А. Особенности применения антибактериальной терапии у детей при острых кишечных инфекциях / Т.А. Руженцова, А.А. Плоскирева, Л.Н. Милютина, А.В. Горелов // Медицинский совет. - 2016. - № 01. - С. 98-101.

113. Руженцова, Т.А. Распространенность сердечно-сосудистых осложнений при острых кишечных инфекциях вирусно-бактериальной этиологии у детей / Т.А. Руженцова // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. - 2014. - № 3-1.

- С. 136-137.

114. Сагынбаева, В.Э. Иерсиниоз - причина развития внекишечных воспалительных заболеваний кишечника или признак реактивации оппортунистических инфекций на фоне биологической терапии? / В. Э. Сагынбаева, Е. В. Голованова, Л. Б. Лазебник, С. А. Бойцов // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2018. - № 5 (153). - С. 78-85.

115. Сальмонелла (небрюшнотифозная) [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/salmonella-(non-typhoidal) (дата обращения: 24.03.2020).

116. Сахаутдинова, Г.М. Современные представления об этиологии синдрома раздраженного кишечника / Г. М. Сахаутдинова, Р. Р. Нагаева, К. Э. Асанбаева // Медицинский совет. - 2019. - №3. - С. 152-155.

117. Светоч, Э.А. Специфичность и чуствительность отечественной латексной тест-системы для идентификации Listeria monocytogenes / Э.А. Светоч, Б.В. Ерусланов, В.Н. Борзенков, Е.И. Асташкин, Н.М. Хаптанова, Н.Н. Карцев, Н.К. Фурсова // Дальневосточный Журнал Инфекционной Патологии. - 2019. - №37. - С. 81-82.

118. Сергеева, К.М. Вторичные нефропатии у детей. / К.М. Сергеева, Н.Н. Смирнова // Нефрология. - 2002 - №6 (3). - С.87-92.

119. Серебряная, Н.Б. Роль тромбоцитов в патогенезе бактериальных инфекций / Н. Б. Серебряная, П. П. Якуцени, Н. Н. Климко // Журнал инфектологии. - 2017. - № 9(4). - С. 5—13.

120. Симбирцев, А.С. Достижения и перспективы использования рекомбинантных цитокинов в клинической практике / А.С. Симбирцев // Медицинский Академический Журнал. - 2013. - Т.13. № 1. - C. 7-22.

121. Симбирцев, А.С. Цитокины в патогенезе инфекционных и неинфекционных заболеваний человека / А.С. Симбирцев //Медицинский Академический Журнал. - 2013. -Т. 13. № 3. - С. 18-41.

122. Ситкин, С.И. Дисбиоз кишечника при язвенном колите и целиакии и его терапевтическая корреция с помощью масленой кислоты в сочетании с инулином / С.И. Ситкин, Т.Я. Вахитов, Е.И. Ткаченко, Л.С. Орешко и др. // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2017. - № 6 (142). - С. 77-98.

123. Ситкин, С.И. Метаболический дисбиоз кишечника и его биомаркеры / С.И. Ситкин, Е.И. Ткаченко, Т.Я. Вахитов // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2015. - № 12 (124). - C. 6-29.

124. Ситкин, С.И. Микробиом, дисбиоз кишечника и воспалительные заболевания кишечника: когда функция важнее таксономии / С.И. Ситкин, Т.Я. Вахитов, Е.В. Демьянова // Альманах клинической медицины. - 2018. - Т. 46. № 5. - С. 396-425.

125. Ситкин, С.И. Микробиота кишечника при язвенном колите и целиакии / С.И. Ситкин, Т.Я. Вахитов, Е.И. Ткаченко, Л.С. Орешко и др. // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2017. - № 1 (137). - С. 8-30.

126. Ситкин, С.И. Нарушение микробного и эндогенного метаболизма язвенном колите и целиакии: метаболомный подход к выявлению потенциальных биомаркеров хронического воспаления в кишечнике, связанного с дисбиозом / С.И. Ситкин, Т.Я. Вахитов, Е.И. Ткаченко, Л.Б. Лазебник и др. // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2017. - № 7 (143). - С. 4-50.

127. Смолянкин, Н.Н. Клиническая и микробиологическая эффективность антибактериальной терапии острых кишечных инфекций с инвазивным типом диареи у детей / Н.Н. Смолянкин, А.И. Грекова, Л.П. Жаркова // Детские инфекции. - 2015. - № 1. -С. 27-30.

128. Совалкин, В.И. Современный взгляд на патогенез и лабораторную диагностику язвенного колита (обзор литературы) / В.И. Совалкин, Г.Р. Бикбавова, Ю.А. Емельянова // Архивъ внутренней медицины. - 2017. - № 4. - С. 252-259.

129. Соколова, Е.Д. Полимеразная цепная реакция в диагностике острых кишечных инфекций в детском инфекционном стационаре: возможности и проблемы / Е.Д. Соколова, А.М. Галтаева, О.Ю. Замурий, О.В. Дидиченко, Ю.В. Соколова, В.А. Муратова, О.Ю. Лигорова, И.Н. Журавлева, М.А. Макарова, Л.А. Кафтырева // Инфекция и иммунитет. -

2016. - Т. 6. № 3. - С. 225-231.

130. Сорокина, А.А. Герпетические поражения органов полости рта при бактериальных острых кишечных инфекциях / А.А. Сорокина, Б.П. Богомолов // Кремлевская медицина. Клинический вестник. - 2013. - № 2. - С. 139-143.

131. Спицын, А.Н. Применение МЛЬВ1 масс-спектрометрии в диагностике особо опасных инфекционных болезней: современное состояние и перспективы / А.Н. Спицын, Д.В. Уткин, В.Е. Куклев, С.А. Портенко // Проблемы особо опасных инфекций. - 2014. - № 3. - С. 77-82.

132. Стандарты лечебного питания. Методическое руководство МЗ РФ (МР100).

2017.

133. Степанов, Ю.М. Функциональная диспепсия и синдром раздраженного кишечника: что общего? / Ю.М. Степанов, И.Я. Будзак // Гастроентеролопя. - 2016. - № 1 (59). - С. 100-104.

134. Суворов, А.Н. Микробиота детей / А.Н. Суворов // Природа. - 2011. - № 8 (1152). - С. 14-21.

135. Тагирова, З.Г. Уровень и динамика цитокинов у больных острой бактериальной дизентерией / ЗГ Тагирова, ДР Ахмедов, СМ Омарова, АС Абусуева // Вестник Дагестанской Государственной Медицинской Академии. - 2016. - №2 (19). - С.21-25.

136. Тарасова, Л. В. Дифференциальная диагностика при диарее / Л.В. Тарасова, Д.И. Трухан // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2015. - №124 (12). - 105— 110.

137. Тихомирова, О.В. Эффективность лечебного питания при острых кишечных инфекциях у детей / О.В. Тихомирова, М.К. Бехтерева, С.Г. Семенова // Вопросы детской диетологии. - 2005. - Т. 3. - № 6. - С. 20 - 25.

138. Туманян, Т.С. Клинико-эпидемиологические особенности реактивных артритов, вызванных кишечной инфекцией у детей / Т.С. Туманян, Т.М. Чачия, Е.Г. Чистякова, Е.В. Кондрикова, А.А. Корсунский, С.Г. Гадецкая, Н.В. Авдеенко, И.О. Скугаревская, Ю.В. Иванова // Педиатрия. - 2019. - №98(3). - С. 150-156.

139. Тхакушинова, Н.Х. Повторные острые кишечные инфекции ротавирусной этиологии у детей: особенности течения, факторы риска, условия развития и исходы / Н.Х. Тхакушинова, А.В. Горелов // Инфекционные болезни. - 2017. - Т.15. № 1. - С. 29-34.

140. Усенко, Д.В.Острые кишечные инфекции у детей в практике педиатра: возможности диагностики и терапии /Д.В. Усенко, А.А. Плоскирева, А.В. Горелов // Вопросы современной педиатрии. - 2014. - Т. 13. № 3. - С. 12-20.

141. Фоминых, Ю.А. Инфекционные агенты - кишечная микробиота - нарушение моторики кишечника - метаболический: причинно-следственные взаимоотношения / Ю.А. Фоминых, С.М. Захаренко, Е.В. Балукова // Профилактическая и клиническая медицина. -2011. - № 3 (40). - С. 317-321.

142. Фоминых, Ю.А. Синдром разраженного кишечника и инфекционные агенты / Ю.А. Фоминых, Ю.П. Успенский, С.М. Захаренко // Дневник Казанской медицинской школы. - 2016. - № 1 (11). - С. 58-61.

143. Хавкин, А.И. Особенности пищевого поведения ребенка на разных этапах онтогенеза / А.И. Хавкин, М.М. Гурова, С.В. Гречаный, О.Н. Комарова, Е.Е. Балакирева // Вопросы детской диетологии. - 2015. - Т. 13. - № 6. С. 32 - 40.

144. Хаертынов, Х.С. Клинико-эпидемиологические кишечных инфекций, протекающих с синдромом гемоколита, у детей / Х.С. Хаертынов, Д.Р. Семенова, К.В. Сушников // Казанский медицинский журнал. - 2013. - №2. - 208-211.

145. Халиулина, С.В. Особенности диагностики и терапевтическая тактика при острых кишечных инфекциях неустановленной этиологии / С.В. Халиулина, В.А. Анохин // Инфекц. бол. - 2015. - Т. 13, N0 2. - С. 55-60.

146. Халиулина, С.В. Острые инфекционные диареи у детей. Принципы диагностики / С.В. Халиулина, В.А. Анохин, З.Т. Мухамердиева, Е.С. Пашанина // Практическая медицина. - 2016. № 8 (100). - С. 42-47.

147. Цинзерлинг, В.А. Клинико-морфологические подходы к дифференциальной диагностике дифтеритических колитов / В.А. Цинзерлинг, Е.И. Белинская, В.В. Свистунов //Журнал инфектологии. - 2015. - Т. 7. № 2. - С. 5 - 13.

148. Шаяхметов, Л.К. Методы экспрессной диагностики острых кишечных инфекций в организованных коллективах детей и взрослых / Л.К. Шаяхметов, В.В. Малышев // Медицина: теория и практика. - 2019. - Т. 4. №S. - C. 611 - 613.

149. Шептулин, А.А. Новое в этиологии и патогенезе синдрома раздраженного кишечника / А.А, Шептулин, М.А. Визе-Хрипунова // Клиническая медицина. - 2016. -№94(2). - С.92-96.

150. Шкарин, В.В. Проблемные вопросы сочетанности кишечных инфекций / В.В. Шкарин, О.А. Чубукова, А.С. Благонравова, А.В. Сергеева// Журнал инфектологии. - 2016. - №8 (4). - С. 11 -19.

151. Шумилов, П.В. Современные представления о патогенетических механизмах целиакии: определяющая роль в клинических вариантах течения / П.В. Шумилов, Ю.Г. Мухина, О.К. Нетребенко, О.В. Рязанова, Н.Е. Щигалева, А.А. Коваленко, Е.Е. Левина, А.П. Пономарева // Педиатрия. - 2016. - №95 (6). - С. 110-121.

152. Яблокова, Е.А. Внекишечные проявления воспалительных заболеваний кишечника у детей / Е.А.Яблокова, А.В.Горелов, Г.В.Шевцова, Е.Ю.Полотнянко, М.И. Грамматопуло, Е.В.Борисова, А.А.Каншина // Вопросы практической педиатрии. - 2015. -Т. 10. № 3. - С. 65-74.

153. Яковлев, А.А. Моно- и коинфицированные с вирусами формы сальмонеллеза у взрослых / А.А. Яковлев, Э.Н. Иванова, С.И. Котлярова, Е.В. Карнаухов, И.В. Горбова // Журнал инфектологии. - 2013. - №5 (3). - С. 13-18.

154. Ярошевская, Т.В. Значение исследования фекального кальпротектина в диагностике хронических воспалительных заболеваний кишечника у детей / Т.В. Ярошевская, Е.В. Скрябина, Н.Б. Сапа // Zdorov'e Rebenka. - 2018. - №13(2). - С.171-175.

155. Andersson, M. Coinfection with Enteric Pathogens in East African Children with Acute Gastroenteritis-Associations and Interpretations/ M. Andersson, J.C. Kabayiza, K. Elfving, S. Nilsson// The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. - 2018. - №98(6). -P.1566-1570.

156. Arslan, F. Innate immune signaling in cardiac ischemia/ F. Arslan, D.P. De Kleijn, G. Pasterkamp// Nature Reviews Cardiology.— 2011.— Vol. 8.— P. 292-300.

157. Aujnarain, A. The role of the environment in the development of pediatric inflammatory bowel disease/ A. Aujnarain, D.R. Mack, E.I. Benchimol// Current gastroenterology reports. - 2013. - Vol. 15/ - N 6. - P. 326. Review.

158. Azghari, I. Ileocecal resection for massive rectal bleeding due to Yersinia enterocolitica: a case report and review of the literature/ I. Azghari, A. Bargach, N.M. Billah, M.A. Essaoudi, A. Jahid, N. Kabbaj// Journal of Medical Case Reports. - 2016 - №10. - C6.

159. Bacci, S. Binary toxin and death after Clostridium difficile infection / S. Bacci, K. Milbak, M. K. Kjeldsen, K.E.P. Olsen // Emerging infections diseases. — 2011. — V. 17, No. 6. — P.976-982.

160. Bagci, S. Clinical characteristics of viral intestinal infection in preterm and term neonates/ S. Bagci, A. M. Eis-Hübinger, A. F. Yassin, A. Simon, P. Bartmann, A.R. Franz, A. Mueller// European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases.- 2010. - Vol. 29, N 9. - P.1079-84.

161. Bartelt,L.A. Disentangling Microbial Mediators of Malnutrition: Modeling Environmental Enteric Dysfunction/ L.A. Bartelt, D.T. Bolick, R.L. Guerrant// Cellular and molecular gastroenterology and pepatology. - 2019. - №7(3). - P. 692-707.

162. Bauer, K.A. Impact of the NAP-1 strain on disease severity, mortality, and recurrence of healthcare-associated Clostridium difficile infection/ K.A. Bauer, J.E.W. Johnston, E. Wenzler, D A. Goff, C.H. Cook , J-M. Balada-Llasat, P. Pancholi, J.E. Mangino// Anaerobe. - 2016. - V. 48. - P. 1-6

163. Bawankule, R. Epidemiological investigation and management of bloody diarrhea among children in India/ R. Bawankule, S. Shetye, A. Singh, A. Singh, K. Kumar// PLoS ONE. -2019. - V.14(9). - P.e0222208.

164. Bellavia, M. Gut microbiota imbalance and chaperoning system malfunction are central to ulcerative colitis pathogenesis and can be counteracted with specifically designed probiotics: a working hypothesis/ M. Bellavia, G. Tomasello, M. Romeo, P Damiani et al.// Medical Microbiology and Immunology. - 2013. - №202(6). - P. 393-406.

165. Biesiada, G. Expression and release of leptin and proinflammatory cytokines in patients with ulcerative colitis and infectious diarrhea/ G. Biesiada, J. Czepiel, A. Ptak-Belowska, S. J. Konturek, T. Brzozowski, T. Mach //Journal of physiology and pharmacology: an official journal of the Polish Physiological Society. - 2012. - V. 63(5). - P.471-81.

166. Bona, M. Virulence-related genes are associated with clinical and nutritional outcomes of Shigella/Enteroinvasive Escherichia coli pathotype infection in children from Brazilian semiarid region: A community case-control study/ M. Bona, P.H. Medeiros, A.K. Santos, T. Freitas, M. Prata, H. Veras, M. Amaral, D. Oliveira, A. Havt, A.A. Lima // International Journal of Medical Microbiology. - 2019. - №309(2). - P.151-158.

167. Bonardi, S. Shiga toxin-producing Escherichia coli O157, O26 and O111 in cattle faeces and hides in Italy/ S. Bonardi, I. Alpigiani, R. Tozzoli, A. Vismarra, V. Zecca// Veterinary record open. - 2015. - № 2(1). P.e000061.

168. Boo, Y.L. Guillain-Barre syndrome complicating dengue fever: two case reports/ Y.L. Boo, M.A.M. Aris, P.W. Chin, W.A.W. Sulaiman, H. Basri// Tzu Chi Medical Journal. -2016. - P.2(4). - P.157-59.

169. Centers for Disease Control and Prevention. [Surveillance for Foodborne Disease Outbreaks — United States, 2009-2010]. Morbidity and Mortality Weekly Report. - 2013. - Vol. 62. No. 3. - P. 41-47.

170. Chen, B. Prevalence and predictors of small intestinal bacterial over-growth in irritable bowel syndrome: a system-atic review and meta-analysis/ B. Chen, J.J.W. Kim, Y. Zhang, L. Du, N. Dai // Journal of gastroenterology. - 2018. - May 14.

171. Conte, M.P. Gut-associated bacterial microbiota in pediatric patients with inflammatory bowel disease/ M.P. Conte, S. Schippa, I. Zamboni, M. Penta, F. Chiarini// Gut. -2006. - Vol. 55. - P. 1760-1767.

172. Cummings, P.L. Salmonellosis Hospitalizations in the United States: Associated Chronic Conditions, Costs, and Hospital Outcomes, 2011, Trends 2000-2011/ P.L. Cummings, T. Kuo, M. Javanbakht, S. Shafir, M. Wang// Foodborne Pathogens and Disease. - 2016. - V.13 (1). - P. 40-48.

173. Cunningham, S.A. Three-hour molecular detection of Campylobacter, Salmonella, Yersinia, and Shigella species in feces with accuracy as high as that of culture/ S.A. Cunningham, L.M. Sloan, L.M. Nyre, E.A. Vetter et al.// Journal Clinical Microbiology. - 2010. - № 48. - P. 2929-2933.

174. Dewey, K.G. Early child growth: how do nutrition and infection interact?/ K.G. Dewey, D R. Mayers// Maternal & child nutrition. - 2011. - №7(3). - P.129-42.

175. Diaz-Ochoa, V.E. Salmonella mitigates oxidative stress and thrives in the inflamed gut by evading calprotectin-mediated manganese sequestration/ V.E. Diaz-Ochoa, D. Lam, C.S. Lee, S. Klaus, J. Behnsen// Cell host & microbe. - 2016. -№19(6). - P.14-825

176. Drossman D.A. Functional gastrointestinal disorders: history, pathophysio-logy, clinical features and Rome IV/ D.A. Drossman // Gastroenterology. - 2016. - №150. - P. 12621279

177. Drossman, D.A. Rome IV-Functional GI Disorders: Disorders of Gut-Brain Interaction/ D.A. Drossman, W.L. Hasler// Gastroenterology. - 2016. - №150. - P. 1257-1261.

178. Drummond, N. Yersinia enterocolitica: a brief review of the issues relating to the zoonotic pathogen, public health challenges, and the pork production chain/ N. Drummond, B.P.

Murphy, T. Ringwood, M.B. Prentice// Foodborne Pathogens and Disease. - 2012. - № 9. - P. 179-189.

179. Fagundes-Neto, U. The gut at war: the consequences of enteropathogenic Escherichia coli infection as a factor of diarrhea and malnutrition/ U. Fagundes-Neto, I.C.A. Scaletsky// Sao Paulo Medical Journal. - 2000. - №118(1). - P.21-29.

180. Foodborne Diseases Active Surveillance Network (FoodNet): FoodNet surveillance report for 2011 (final report). CDC. - 2012. - Atlanta, GA.

181. Frank, D.N. Molecular-phylogenetic characterization of microbial community imbalances in human inflammatory bowel diseases/ D.N. Frank, A.L.S. Amand, R.A. Feldman, E.C. Boedeker// Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2007. - №104(34). -P.13780-5.

182. Futagami, S. Systematic review with meta-analysis: postinfectious functional dyspepsia / S. Futagami, T. Itoh, C. Sakamoto // Alimentary pharmacology & therapeutics. - 2015.

- № 41(2). - P. 177-88.

183. Garzetti, D. Tracing genomic variations in two highly virulent Yersinia enterocolitica strains with unequal ability to compete for host colonization/ D. Garzetti, H. Bouabe, J. Heesemann, A. Rakin// BMC Genomics. - 2012. - №13. - P.467.

184. Grzybowska-Chlebowczyk, U. Eosinophilic colitis in children/ U. Grzybowska-Chlebowczyk, S. Horowska-Ziaja, M. Kajor, et al. // Postepy Dermatologii i Alergologii. - 2017.

- №34(1). - P.52-59.

185. Guerrero, D.M. Asymptomatic carriage of toxigenic Clostridium difficile by hospitalized patients/ D.M. Guerrero, J.C. Becker, E.C. Eckstein, S. Kundrapu et al. // Journal of Hospital Infection. - 2013. - № 85. - P. 155-158.

186. Hashavya, S. Rotavirus-associated colitis in a six-month-old baby/ S. Hashavya, M. Wilscrhanski, D. Averbuch, D. Arbell, O. Pappo, E. Shteyer// Pediatr Int. 2010. - №52(4).

187. Hensgens, M. P. Time interval of increased risk for Clostridium difficile infection after exposure to antibiotics / M. P. Hensgens, A. Goorhuis, O. M. Dekkers, E. J. Kuiper // J. Antimicrob. Chemother. — 2012. — V. 67, № 3. — P. 742-748.

188. Hill, D.A. Intestinal bacteria and regulation of immune cell homeostasis/ D.A. Hill, C. Hoffmann, M C. Abt, Y. Du, D. Kobuley, T.J. Kirn// Mucosal immunology. - 2010. - Vol. 8.

- P.411-420.

189. Holtmann, G.J. Pathophysiology of irritable bowel syndrome/ G.J. Holtmann, A.C. Ford, N.J. Talley// The Lancet Gastroenterology & Hepatology. - 2016. - № 2 (1). - P. 133-146.

190. Humphries, R.M. Laboratory diagnosis of bacterial gastroenteritis/ R.M. Humphries, A.J. Linscott// Clinical Microbiology Reviews. - 2015. - № 28(1). - P. 3-31.

191. Ibrahim, M.K. Impact of Childhood Malnutrition on Host Defense and Infection/ M.K. Ibrahim, M. Zambruni, C.L. Melby, P.C. Melby// Clinical microbiology reviews. - 2017. -№30(4). - P. 919-971.

192. Inflammatory Bowel Disease — Diagnostic and Therapeutic Strategies. Adler G. [et al.]., Dordrecht: Springer Netherlands, 2007

193. Joainig, M.M. Cytotoxic effects of Klebsiella oxytoca strains isolated from patients with antibiotic-associated hemorrhagic colitis or other diseases caused by infections and from healthy subjects/ M.M. Joainig, G. Gorkiewicz, E. Leitner, P. Weberhofer et al. // Journal Clinical Microbiology. - 2010. - № 48. - P. 817-824.

194. Kalliomaki, M. Expression of microbiota, toll-like receptors, and their regulators in the small intestinal mucosa in celiac disease/ M. Kalliomäki, R. Satokari, H. Lähteenoja, S. Vähämiko et al.// J. Pediatric Gastroenterol., - 2012. - V.54. - P.727-732.

195. Kawaguchi, T. Food antigen-induced immune responses in Crohn's disease patients and experimental colitis mice/ T. Kawaguchi, M. Mori, K. Saito, Y. Suga, M. Hashimoto, M. Sako, N. Yoshimura, M. Uo, K. Danjo, Y. Ikenoue, K. Oomura, J. Shinozaki, A. Mitsui, T. Kajiura, M. Suzuki, M. Takazoe // Journal of Gastroenterology. - 2015. - V. 50. - P.394-405.

196. Kim, J. Fecal Calprotectin Level Reflects the Severity of Clostridium Difficile Infection/ J. Kim, H. Kim, H.J. Oh, H.S. Kim, Y.J. Hwang, D. Yong// Annals of Laboratory Medicine. - 2017. - № 1 (37). - P. 53-57.

197. Kotloff, K.L. Shigellosis/ K.L. Kotloff, M.S. Riddle, J.A. Platts-Mills, P. Pavlinac// The Lancet. - 2018. - V. 391. I. 10122.- P. 801-812

198. Kruger, A. Genetic characterization of Shiga toxin-producing Escherichia coli O26:H11 strains isolated from animal, food, and clinical samples/ A. Krüger, P. Lucchesi, A.M. Sanso, A.I. Etcheverria et al.// Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. - 2015. - V5. -P.74.

199. Kurbatova, A. Cytokines and Tight Junction Proteins Expression Changes in Patients With Irritable Bowel Syndrome/ A. Kurbatova, E. Polouektova, T. Demura, S. Kuchumova, M. Konkov, M. Gorev, A. Sheptulin, V. Ivashkin// Gastroenterology. - 2012. - № 5 (142). - P.S-807.

200. Lahoute, C. Adaptive immunity in atherosclerosis: mechanisms and future therapeutic targets/ C. Lahoute, O. Herbin, Z. Mallat, A. Tedgui// Nature Reviews Cardiology.— 2011.— Vol. 8.— P. 348-358.

201. Leke, A. Insights in the human bifidobacterial flora through culture-dependent and independent techniques communicating current research and educational topics and trends in applied microbiology/ A. Leke, M.B. Romond, C. Mullie// Ed. A.Mendez-Vilas. Formatex, -2007. - P.758—765.

202. Levine, A. Combined azithromycin and met-ronidazoletherapy is eff ective in inducing remission in pediatric Crohn'sdisease/ A Levine, D Turner// Journal of Crohn's and Colitis. - 2011. - V.5(3). - P.222-6.

203. Lewis, J.D. Nutrition, Gut Microbiota and Immunity: Therapeutic targets for IBD// J.D. Lewis, F.M. Ruemmele, G.D. Wu// Nestle Nutrition Institute workshop series. - 2014. V.79.

- P .165.

204. Loo, V.G. A predominantly clonal multi-institutional outbreak of Clostridium difficile-associated diarrhea with high morbidity and mortality/ V.G. Loo, L. Poirier, M.A. Miller, M. Oughton et al. // The New England Journal of Medicine. - 2005. - № 353. - P. 2442-2449.

205. Majowicz, S.E. International Collaboration on Enteric Disease "Burden of Illness" Studies. The global burden of nontyphoidal Salmonella gastroenteritis/ S.E. Majowicz, J. Musto, E. Scallan, F.J. Angulo et al.// Clinical Infectious Diseases. - 2010. - № 50. - P. 882-889

206. Maloy K.J. Intestinal homeostasis and its breakdown in inflammatory bowel disease/ K.J. Maloy, F. Powrie// Nature. - 2011. - Vol. 474, No. 7351. - P .298-306.

207. Maranhao, H.S. The epidemiological and clinical characteristics and nutritional development of infants with acute diarrhoea, in north-eastern Brazil/ H.S. Maranhao, M.C. Medeiros, I.C. Scaletsky, Fagundes-U. Neto, M B. Morais // Ann Trop Med Parasitol. - 2008. -V.102(4). - P.357-65.

208. Marsh, J.W. Association of relapse of Clostridium difficile disease with BI/NAP1/027/ J.W. Marsh, R. Arora, J.L. Schlackman, K.A. Shutt et al. // Journal Clinical Microbiology. - 2012. - № 50. P. 4078-4082.

209. Martínez, C. Cellular and molecular basis of intestinal barrier dysfunction in the irritable bowel syndrome/ C. Martínez, A. González-Castro, M. Vicario, J. Santos// Gut and liver.

— 2012 Jul. — № 6(3). — P. 305-15.

210. Matsuda, K. Establishment of an analytical system for the human fecal microbiota, based on reverse transcriptionquantitative PCR targeting of multicopy rRNA molecules/ K. Matsuda, H. Tsuji, T. Asahara, K. Matsumoto, T. Takada// Applied and Environmental Microbiology. - 2009. - V.75. №7. - P.1961—1969.

211. McCormick, B.J.J. Intestinal permeability and inflammation mediate the association between nutrient density of complementary foods and biochemical measures of micronutrient status in young children: results from the MAL-ED study/ B.J.J. McCormick, L.E. Murray-Kolb, G O. Lee, K.J. Schulze// The American Journal of Clinical Nutrition. 2019. - V.110(4). -P.1015-1025.

212. Mirsepasi-Lauridsen, H.C. Escherichia coli pathobionts associated with inflammatory bowel disease/ H.C. Mirsepasi-Lauridsen, B.A. Vallance, K.A. Krogfelt, A.M. Petersen // Clinical Microbiology Reviews. - 2019. - №2(32) - P.e00060-18

213. Neubauer, H. Yersinia enterocolitica 16S rRNA gene types belong to the same genospecies but form three homology groups/ H. Neubauer, S. Aleksic, A. Hensel, E.J. Finke, H. Meyer// International Journal of Medical Microbiology. - 2000. - № 290. - P. 61-64.

214. Nie, H. Phosphorylation of FOXP3 controls regulatory T cell function and is inhibited by TNF-a in rheumatoid arthritis/ H. Nie, Y. Zheng, R. Li, T.B. Guo, D. He, L. Fang, X. Liu, L. Xiao, X. Chen, B. Wan, Y.E. Chin, J.Z. Zhang// Nature Medicine. - 2013. - №19. - P. 322-328.

215. Nowak-Wegrzyn, A. International consensus guidelines for the diagnosis and management of food protein-induced enterocolitis syndrome: Executive summary-Workgroup Report of the Adverse Reactions to Foods Committee, American Academy of Allergy, Asthma & Immunology/ A. Nowak-W^grzyn, M. Chehade, M.E. Groetch et al.// Journal of Allergy and Clinical Immunology. - 2017. - V.139(4) - P.1111-1126.e4.

216. O'Malley, D. Immunomodulation of enteric neural function in irritable bowel syndrome/ D. O'Malley// World Journal of Gastroenterology: WJG. - 2015. - №21(24). - P. 73627366

217. Ong, K.L. Changing epidemiology of Yersinia enterocolitica infections: markedly decreased rates in young black children, Foodborne Diseases Active Surveillance Network (FoodNet), 1996-2009/ K.L. Ong, L.H. Gould, D.L. Chen, T.F. Jones, J. Scheftel et al.// Clinical Infectious Diseases. - 2012. - № 54 (Suppl 5). - P. S385-S390.

218. Oswi^cimska J. New insights into the pathogenesis and treatment of irritable bowel syndrome / J. Oswi^cimska, A. Szymlak, W. Roczniak et al. // Advances in medical sciences. — 2017. — Vol. 62, № 1. — P. 17-30.

219. Peretz, A. Correlation between fecal calprotectin levels, disease severity and the hypervirulent ribotype 027 strain in pa-tients with Clostridium difficile infection/ A. Peretz, L. Tkhawkho, N. Pastukh, D. Brodsky// BMC Infectious Diseases. - 2016. - V.16. -P.309.

220. Pike, B.L. Acute gastroenteritis and the risk of functional dyspepsia: a systematic review and meta-analysis/ B.L. Pike, C.K. Porter, T.J. Sorrell, M.S. Riddle// American Journal of Gastroenterology. - 2013. - №108(10). - P.1558-63.

221. Pittayanon, R. Gut Microbiota in Patients With Irritable Bowel Syndrome—A Systematic Review/ R. Pittayanon, J.T. Lau, Y. Yuan, G.I. Leontiadis, F. Tse// Gastroenterology. - 2019. - № 1 (157). - P. 97-108.

222. Plotnikova E.Y. Post-infectious irritable bowel syndrome/ E.Y. Plotnikova// Herald of Pancreatic Club. - 2018. - № 2 (39). - P. 61-67.

223. Poulsen, C.H. Irritable bowel symptoms, use of healthcare, costs, sickness and disability pension benefits: A long-term population-based study/ C.H. Poulsen, L.F. Eplov, C. Hjorth0j, L.H. Hastrup et al.// Scandinavian Journal of Public Health. - 2019. - №47(8). - P.867-875/

224. Psaroulaki, A. Use of MALDI-TOF mass spectrometry in the battle against bacterial infectious diseases: recent achievements and future perspectives/ A. Psaroulaki, D. Chochlaki// Expert Review of Proteomics. - 2018. - №7 (15). - P.537-539.

225. Ranjbar, R. Shigella: Antibiotic-Resistance Mechanisms And New Horizons For Treatment/ R. Ranjbar, A. Farahani // Infection and Drug Resistance. - 2019. - V.12. - P. 31373167.

226. Rice, A.L. Malnutrition as an underlying cause of childhood deaths associated with infectious diseases in developing countries/ A.L. Rice, L. Sacco, A. Hyder, R.E. Black //Bull World Health Organ. - 2000. - V.78(10). - P.1207-21.

227. Ruiz de Alegría-Puig C. Correlation between MALDI-TOF Vitek-MSTM system and conventional identification methods of gastrointestinal infection causing bacteria/ C.A.P. Ruiz, A. Aguirre-Quinonero, J. Agüero-Balbín et al.// Revista Espanola de Quimioterapi: Publicacion Oficial de la Sociedad Espanola de Quimioterapia. - 2016. - № 5 (29). - C. 265-268.

228. Scallan, E. Hospitalisations due to bacterial gastroenteritis: A comparison of surveillance and hospital discharge data/ E. Scallan, P.M. Griffin, H.Q. McLean, B.E. Mahon// Epidemiology and Infection. - 2018. - №146(8). - P. 954-960.

229. Smedley, J.G. The enteric toxins of Clostridium perfringens/ J.G. Smedley, D.J. Fisher, S. Sayeed, G. Chakrabarti et al.// Reviews of Physiology, Biochemistry and Pharmacology. - 2004. - № 152. P. - 183-204.

230. Sokol, H. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients/ H. Sokol, B. Pigneur, L. Watterlot, O. Lakhdari et al.// Proceedings of the National Academy of Sciences - 2008. - V.105(43). -P.16731-6.

231. Spiller, R. Postinfectious irritable bowel syndrome/ R Spiller, K Garsed // Gastroenterology. -2009. - № 136. - P. 1979-1988.

232. Sulakvelidze, A. Yersiniae other than Y. enterocolitica, Y pseudotuberculosis, and Y pestis: the ignored species/ A. Sulakvelidze // Microbes and Infection. - 2000. - № 2. - P. 497513.

233. Tulu, B. Intestinal Parasitic Infections and Nutritional Status among Primary School Children in Delo-mena District, South Eastern Ethiopia/ B. Tulu, S. Taye, Y. Zenebe, E.Amsalu // Iran J Parasitol. - 2016. - V.11(4). -P.549-558.

234. Tuompo, R. Reactive arthritis and other musculoskeletal symptoms associated with acquisition of diarrhoeagenic Escherichia coli (DEC)/ R. Tuompo, T. Lääveri, T. Hannu, S.H. Pakkanen// Annals of the rheumatic diseases. - 2020. - V.0 - P.1-7

235. Vanheel, H. Impaired duodenal mucosal integrity and low-grade inflammation in functional dyspepsia/ H. Vanheel, M. Vicario, T. Vanuytsel, L. Van Oudenhove et al.// Gut. — 2014 Feb. — № 63(2). — Р . 262-71.

236. Veras H. do N. Combination of different methods for detection of Campylobacter spp. in young children with moderate to severe diarrhea/ H. do N. Veras, J.. da Silva Quetz, I.F.N. Lima et al.// Journal of Microbiological Methods. - 2016. - V.128. - P. 7-9.

237. Vygen-Bonnet S. Ongoing haemolytic uraemic syndrome (HUS) outbreak caused by sorbitol-fermenting (SF) Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) O157, Germany, December 2016 to May 2017/ S. Vygen-Bonnet, B. Rosner, H. Wilking, A. Fruth et al.// Euro Surveill. 2017. - V.22(21).

238. Warmy, M. Toxin production by an emerging strain of Clostridium difficile-associated with outbreaks of severe disease in North America and Europe/ M. Warny, J. Pepin, A. Fang, G. Killgore, A. Thompson et al.// Lancet. 2005. - V.366. - P. 1079-1084.

239. World Gastroenterology Organisation [Электронный ресурс]. URL: https://www.worldgastroenterology.org/guidelines/global-guidelines/acute-diarrhea/acute-diarrhea-english (дата обращения: 05.04.2020)

240. Wouters, M.M. The role of mast cells in functional GI disorders / M.M. Wouters, M. Vicario, J. Santos // Gut. — 2016. — № 65(1). — Р . 155-68.

241. Yang, S.C. Current pathogenic Escherichia coli footborne outbreak cases and therapy development/ S.C. Yang, C.H. Lin, I.A. Aljuffali, J.Y. Fang// Archives of microbiology. - 2017 -V.199(6). -P. 811-25.

242. Yeh, H.W. Risk of psychiatric disorders in irritable bowel syndrome-A nationwide, population-based, cohort study/ H.W. Yeh, W.C. Chien, C.H. Chung, J.M. Hu, N.S. Tzeng// International journal of clinical practice. - 2018. - V.72(7).