Синтез и изучение свойств хиральных пептидно-нуклеиновых кислот тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.10, кандидат химических наук Льянов, Махмуд Алиханович

• Льянов, Махмуд Алиханович
• кандидат химических наук
• 2011

Оглавление диссертации кандидат химических наук Льянов, Махмуд Алиханович

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1. Структура ПНК и ее особенности

2. Физико-химические свойства пептидно-нуклеиновых кислот

2.1. Растворимость

2.2. Химическая стабильность

2.3. Гибридизационные свойства

2.3.1. Образование дуплексов

2.3.2. Образование триплексов

2.3.3. Образование квадруплексов

3. Биологические свойства ПНК

4. Применение ПНК

4.1. Технология РБ-петли

4.1.1 Захват ДНК-дуплекса

4.1.2. Топологическое мечение ДНК

4.1.3. Секвенирование неденатурированной ДНК

4.1.4. Гибридизация «молекулярных маяков» с дцДНК

5. Подходы к синтезу ПНК

5.1. Синтез мономеров

5.1.1. Стратегии синтеза Aeg-ocтoвa

5.1.2. Стратегии синтеза карбоксиметилированных производных гетероциклических оснований

5.1.3. Синтез мономера Aeg-ПHK

6. Модифицированные ПНК (ПАНКМ)

ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ

1. Синтез хиральных незаряженных а- и у-метилзамещенных мономеров ПАНКМ, на основе С1у\|/А1а и А1а\|/С1у

1.1 Синтез псевдопептидов

1.2 Синтез а-мети л содержащих мономеров ПАНКМ

1.3 Синтез у-метилсодержащих хиральных мономеров ПАНКМ

2. ЯМР-эксперименты по доказательству структуры полностью защищенных мономеров а- и у-ПАНКМ.

2.1 Анализ спектров а-ПАНКМ

2.2 Анализ спектров у-ПАНКМ

3. Разработка теста для определения оптической чистоты мономеров ПАНКМ

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

ВЫВОДЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Синтез и изучение свойств хиральных пептидно-нуклеиновых кислот»

Полиамидные миметики нуклеиновых кислот (ПАНКМ), первоначально описанные как пептидно-нуклеиновые кислоты (ае^-ПНК) [1], нашли широкое применение в различных областях физико-химической биологии. В частности на основе ПАНКМ {aeg-ПHK) предложены и реализованы технологии биосенсеров и микрочипов, системы для селективного расщепления нуклеиновых кислот, определения генетических мутаций и др [2, 3].

По своей функции классические ПАНКМ {aeg-YШK) являются миметиками нуклеиновых кислот, а по структуре представляют собой олигомеры на основе 14-(2-аминоэтил)-глицина с присоединенными через карбоксиметилированный спейсер нуклеиновыми основаниями [4].

Большой интерес представляет исследование свойств хиральных ПАНКМ, содержащих различные заместители в а- и у-положениях псевдопептидного фрагмента. Как известно, введение заместителей различного строения оказывает влияние на свойства ПАНКМ: растворимость, прохождение через клеточную и ядерную мембраны, направление закручивания спирали олигомера и гибридизационные свойства при связывании с природными нуклеиновыми кислотами [45].

На кафедре биотехнологии и бионанотехнологии МИТХТ им. М.В. Ломоносова проводится систематическое изучение модификаций нуклеиновых кислот - хиральных отрицательно заряженных ПАНКМ и незаряженных а- и у-ПАНКМ. Ранее в нашей лаборатории были синтезированы в препаративных количествах и полностью охарактеризованы четыре тиминсодержащих мономера ОЗ-ПАНКМ, а также два новых тиминсодержащих декамера ОЗ-ПАНКМ на основе ¿-глутаминовой кислоты и глицина.

В данной работе представлен разработанный универсальный метод синтеза незаряженных хиральных мономеров полиамидных миметиков нуклеиновых

В руководстве работой принимала участие к.х.н., доц. Кириллова Ю.Г. кислот различного строения на примере а- и у-метилзамещенных мономеров ПАНКМ, а также подход к определению оптической чистоты данных мономеров.

ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

Разработка модифицированных олигонуклеотидов занимает одно из центральных мест в биотехнологии и медицинской химии ввиду использования их в качестве терапевтических агентов и инструментов молекулярной биологии. «Классические» пептидно-нуклеиновые кислоты (ПНК) представляют собой аналоги нуклеиновых кислот и являются полностью синтетическими ДНК/РНК-распознающими лигандами с нейтральным пептидо-подобным остовом и природными гетероциклическими основаниями. Такие свойства ПНК, как способность образовывать высокопрочные комплексы с нуклеиновыми кислотами даже при низкой ионной силе, биологическая и химическая устойчивость, могут служить основой для усовершенствования обычных, достаточно длительных и трудоемких методов диагностики нуклеиновых кислот.

Заключение диссертации по теме «Биоорганическая химия», Льянов, Махмуд Алиханович

выводы

1. Разработана и оптимизирована универсальная схема синтеза незаряженных хиральных мономеров ПАНКМ.

2. Синтезированы в препаративных количествах и полностью охарактеризованы четыре мономера хиральных а-ПАНКМ на основе псевдопептида 01уу/Ь-А1а и четырех нуклеиновых гетероциклических оснований, три из них получены впервые.

3. Синтезированы в препаративных количествах и полностью охарактеризованы четыре мономера хиральных у-ПАНКМ на основе Ь-А1ау/С1у и четырех гетероциклических оснований, три из них получены впервые.

4. Проведен анализ структуры полученных по разработанной схеме тимин-, аденин-, цитозин-, гуанинсодержащих мономеров на основе псевдопептидов С1уц/Ь-А1а и Ь-А1а\]/01у с помощью методов двумерной ЯМР-спектроскопии, который показал однозначность структуры выделенных продуктов реакции алкилирования гетероциклических нуклеиновых оснований бромацильными производными защищенных псевдопептидов 01уц/Ь-А1а и Ь-А1ац/01у.

5. Показано, что синтез незаряженных мономеров ПАНКМ идет энантиоселективно; разработанные нами подходы к определению энантиомерной чистоты мономеров с использованием ВЭЖХ позволяют однозначно подтвердить высокое значение энантиомерных избытков, достаточных для проведения последующих стадий олигомеризации.

Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Льянов, Махмуд Алиханович, 2011 год

1. Nielsen P.E., Egholm M., Berg R.H., Buchardt О. Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide. // Science. 1991. -V. 254. P. 1497-1500.

2. Ratilainen Т., Holmen A., Tuite E., Haaima G., Christensen L., Nielsen P. E., Norden В. Hybridization of peptide nucleic acid // Biochemistry, 1998. V. 37. - P. 12331-12342.

3. Demers D. В., Curry E. Т., Egholm M., Sozer A. C. Enhanced PCR amplification of VNTR locus D1S80 using peptide nucleic acid (PNA) // Nucleic Acids Res., 1995. V. 23. - P. 3050-3055.

4. Corradini R, Sforza S, Tedeschi T, Totsingan F, Marchelli R. Peptide nucleic acids with a structurally biased backbone: effects of conformational constraints and stereochemistry // Current Topics in Medicinal Chemistry 2007, V. 7. - P. 681-694.

5. Srinivas Rapireddy, Gaofei He, Subhadeep Roy, Bruce A. Armitage, and Danith H. Ly Strand Invasion of Mixed-Sequence B-DNA by Acridine-Linked, y-Peptide Nucleic Acid (y-PNA) // J. Am. Chem. Soc. 2007. V. 129. - P. 15596-15600.

6. Tackett A.J., Corey D.R., Raney K.R. Non-Watson-Crick interactions between PNA and DNA inhibit the ATPase activity of bacteriophage T4 Dda helicase. Nucleic Acid Res. 2002. V. 30. - P. 950-957.

7. Hyrup, В., Egholm, M., Nielsen, P.E., Wittung, P., Norden, В., Buchardt, О. Structure-Activity Studies of the Binding of Modified Peptide Nucleic Acids (PNAs) to DNA // J. Am. Chem. Soc. 1994. V. 116. - P. 7964-7970.

8. Uhlmann E., Peyman A., Breipohl G., Will D.W. PNA: Synthetic Polyamide Nucleic Acids with Unusual Binding Properties. // Angew. Chem. Int. Ed. 1998. V. 37. - P. 2796-2823.

9. Hyrup В., Nielsen P.E. Peptide nucleic acids (PNA): synthesis, properties and potential applications. // Bioorg. Med. Chem. 1996. V. 4. - P. 5-23.

10. Christensen L., Fitzpatrick R., Gildea В., Petersen; К. H., Hansen H.F., Egholm M., Buchardt O., Nielsen P.E., Coull J., Berg R.H. Solid-phase synthesis of peptide-nucleic acids. // J. Pept. Sei. 1995. V. 3. - P. 175-183.

11. Gambari R. Peptide-Nucleic Acids (PNAs): a tool for the development of gene expression modifiers. // Curr. Pharmaceutical Design. 2001. V. 7. - P. 18391862.

12. Анцыпович С. И. Пептидно-нуклеиновые кислоты: структура, свойства, применение, стратегии и практика химического синтеза. // Успехи химии. 2002. Т. 71, № 1. - С. 81-96.

13. Wittung P., Nielsen P.E., Buchardt О., Egholm М., Norden В. DNA-like double helix formed by peptide nucleic acid. // Nature. 1994. V. 368. - P. 561-563.

14. Wittung P., Eriksson M., Lyng R., Nielsen P.E., Norden В. Induced chirality in PNA-PNA duplexes. // J. Am. Chem. Soc. 1995. V.l 17. N 41. - P. 1068-1073.

15. Egholm M., Nielsen P.E., Buchardt O., Berg R.H. Recognition of guanine and adenine in DNA by cytosine and thymine containing peptide nucleic acids (PNA). // J. Am. Chem. Soc. 1992. V. 114. - P. 9677-9678.

16. Igloi G.L. Variability in the stability of DNA-peptide nucleic acid (PNA) single-base mismatched duplexes: real-time hybridization during affinity electrophoresis in PNA-containing gels. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1998. V. 95. -P. 8562-8567.

17. Ratilainen Т., Holmen A., Tuite E., Nielsen P.E., Norden В. Thermodynamics of sequence-specific binding of PNA to DNA. // Biochemistry. 2000. -V. 39.-P. 7781-7791.

18. Tomas S., Sarkar M., Ratilainen Т., Wittung P., Nielsen P.E., Norden В., Cräslund A. Ionic effects on the stability and conformation of peptide nucleic acid complexes. // J. Am. Chem. Soc. 1996. V. 118. - P. 5544-5552.

19. Pellestor F., Paulasova P. The peptide nucleic acids, efficient tools for molecular diagnostics. // Int. J. Mol. Medicine. 2004. V. 13. - P. 521-525.

20. Rastrup J.S., Pilgaard M., Jorgensen F.S., Nielsen P.E., Rasmussen H. Crystallization and preliminary X-ray analysis of PNA-DNA complex. // FEBS Lett. 1995.-V. 363.-P. 115-117.

21. Soliva R., Sherer E., Luque F.J., Laughton C.A., Orozco M. Molecular dynamics simulations of PNA-DNA and PNA-RNA duplexes in aqueous solution. // J. Am.Chem. Soc. 2000. V. 122. - P. 5997-6008.

22. Rasmussen H., Kustrup J.S., Nielsen J.N., Nielsen J.M., Nielsen P.E. Crystal structure of a peptide nucleic acid (PNA) duplex at 1.7 Ä resolution. // Nat. Struct. Biol. 1997.-V. 4.-P. 98-101.

23. Eriksson M., Nielsen P. PNA-nucleic acid complexes. Structure, stability and dynamics. // Quarterly Review of Biophysics. 1996. V. 29, N 4. - P. 369-394.

24. Zamechnik P.C., Stephenson M.L. Inhibition of Rous sarcoma virus replication and cell transformation by a specific oligodeoxyribonucleotide. // Proc. Natl. Acad. Sei.' USA. 1978. V. 75. - P. 280-284.

25. Nielsen P.E., Egholm M., Buchardt O. Evidence for (PNA)2/DNA triplex structure upon binding of PNA to dsDNA by strand displacement. // J. Mol. Recognition. 1994. V. 7, N 3. - P. 165-170.

26. Egholm M., Christensen L., Dueholm K.L., Buchardt O., Coull J., Nielsen P.E. Efficient pH independent sequence-specific DNA binding by pseudoisocytosine-containing bis-PNA. // Nucleic Acids Res. 1995. V. 23. N 2. - P. 217-222.

27. Kosaganov Yu.N., Stetsenko D.A., Lubyako E.N., Kvitko N.P., Lazurkin Yu.S., Nielsen P.E. Effect of temperature and ionic strength on the dissociation kinetics and lifetime of PNA-DNA triplexes. // Biochemistry. 2000. V. 39. - P. 11742-11747.

28. Wittung P., Nielsen P.E., Norden B. Extended DNA-recognition repertoire of PNA. // Biochemistry. 1997. V. 36. - P. 7973-7979.

29. Nielsen P.E., Christensen L. Strand1 displacement binding of a duplex forming homopurine PNA to a homopyrimidine duplex DNA target. // J. Am. Chem. Soc. 1996. V. 118. - P. 2287-2288.

30. Lohse J., Dahl O., Neilsen P.E. Double duplex invasion by peptide nucleic acid: a general principle for sequence-specific targeting of double-stranded DNA. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1999. V. 96. N 11. - P. 804-811.

31. Nielsen P.E., Egholm M. Strand displacement recognition of mixed adenine-cytosine sequences in double-stranded DNA by thymine-guanine PNA (Peptide nucleic acid). // Bioorg. & Med. Chem. 2002. V. 9. - P. 2429-2434.

32. Smolina I.V., Demidov V.V., Soldatenkov V.A., Chasovskikh S.G., Frank-Kamenetskii M.D. End invasion of peptide nucleic acids (PNA) with mixed-base composition into linear DNA duplexes. // Nucleic Acids Res. 2005. V. 33. N 17. - P. el46.

33. Datta B., Sehmitt C., Armituye B.A. Formation of a PNA2-DNA2 hybrid quadruplex. // J. Am. Chem. Soc. 2003. V. 125. - P. 4111-4118.

34. Krishnan-Ghosh Y., Stephens E., Balasubramanian S. A PNA4 Quadruplex. // J. Am. Chem. Soc. 2004. V. 126. N. 19. - P. 5944-45.

35. Dueholm K.L., Nielsen P.E. Chemistry, properties and applications of PNA (Peptide Nucleic Acids) // New J. Chem. 1997. V. 21. - P. 19-31.

36. Nielsen P.E., Haaima G. Peptide Nucleic acid (PNA). A DNA mimic with a pseudopeptide backbone // Chem. Soc. Rev. 1997. V 26. - P. 73-78.

37. Nielsen P.E. Peptide nucleic acid: a versatile tool in genetic diagnostics and molecular biology // Curr. Opin. Biotech. 2001. V. 12. - P. 16-20.

38. Demidov V.V. PNA and LNA throw light on DNA // Trends in Biotech. 2003.-V. 21.-P. 4-7.

39. Stender H., Fiandaca M., Hyldig-Nielsen J.J., Coull J. PNA for rapid microbiology // J. Microbiol. Meth. 2002. V. 48. - P. 1-17.

40. Lundin K.E., Good L., Stromberg R., Graslund A., Smith C.I.E. Biological activity and biotechnological aspects of peptide nucleic acid // Advances Genet. 2006. -V. 56.-P. 1-51.

41. Nielsen P.E. Gene targeting using peptide nucleic acid // Methods Mol. Biol. 2005.-V. 288.-P. 343-358.

42. Nielsen PE (Ed.). Peptide Nucleic Acids: Protocols and Applications, Second Edition, Horizon Bioscience // Norfolk (UK). 2004.

43. Nielsen P.E., Egholm M., Berg R.H., Buchardt O. Peptide nucleic acids (PNAs): potential antisense and anti-gene agents // Anticancer Drug Des. 1993. V. 8. -P. 53-63.

44. Good L., Awasthi S. K., Dryselius R., Larsson O., Nielsen P. E. Bactericidal antisense effects of peptide-peptide nucleic acid conjugates // Nature Biotech. 2001. -V. 19.-P. 360-364.

45. Nielsen P. E., Good L. Peptide nucleic acids antisense to mRNA or rRNA as antibacterial or bacteriostatic antibiotics // U.S. patent application. 2004. P.2000-486623.

46. Kaushik N., Basu A., Pandey V.N. Inhibition of HIV-1 replication by anti-trans-activation responsive polyamide nucleotide analog // Antiviral Res. 2002. — V. 56. -P. 13-27.

47. Mc Mahon B.H., Stewart J.A., Bitter M.D., Fauq A., McCormick D.J., Richelson E. Peptide nucleic acids specifically cause antigene effects in vivo by systemic injection // Life Sci. 2002. V. 71. - P. 325-337.

48. Adlerz L., Soomets U., Holmlund L., Viirlaid S., Langel U., Iverfeldt K. Down-regulation of amyloid precursor protein by peptide nucleic acid oligomer in cultured rat primary neurons and astrocytes // Neurosci. Lett. 2003. V. 336. - P. 5559.

49. Shiraishi T., Nielsen P.E. Down-regulation of MDM2 and activation of p53 in human cancer cells by antisense 9-aminoacridine-PNA (peptide nucleic acid) conjugates // Nucleic Acids Res. 2004. V. 32. - P. 4893-4902.

50. Rasmussen F.W., Bendifallah N., Zachar V., Shiraishi T., Fink T., Ebbesen P., Nielsen P.E., Koppelhus U. Evaluation of Transfection Protocols for Unmodified and Modified Peptide Nucleic Acid (PNA) Oligomers // Oligonucleotides 2006. V. 16.-P. 43-57.

51. Koppelhus U., Nielsen P.E.Cellular delivery of peptide nucleic acid (PNA) // Adv. Drug Del. Rev. 2003. V. 55. - P. 267-280.

52. Doyle D.F., Braasch D.A., Simmons C.G., Janowski B.A., Corey D.R. Inhibition of Gene Expression Inside Cells by Peptide Nucleic Acids: Effect of mRNA Target Sequence, Mismatched Bases, and PNA Length // Biochemistry 2001. V. 40. — P. 53-64.

53. Braasch D.A., Corey D.R. Novel Antisense and Peptide Nucleic Acid Strategies for Controlling Gene Expression // Biochemistry 2002. V. 41. - P. 45034510.

54. Dykxhoorn D.M., Palliser D., Lieberman J. The silent treatment: siRNA as small molecule drugs // Gene Ther. 2006. V. 13. - P. 541-552.

55. Liu Y., Braasch D.A., Nulf C.J., Corey D.R. Efficient and Isoform-Selective Inhibition of Cellular Gene Expression by Peptide Nucleic Acids // Biochemistry 2004. -V. 43.-P. 1921-1927.

56. Karras J. G., Maier M.A., Lu T., Watt A., Manoharan M. Peptide nucleic acids are potent modulators of endogenous pre-mRNA splicing of the murine interleukin-5 receptor-R chain // Biochemistry 2001. V. 40. - P. 7853-7859.

57. Shiraishi T., Bendifallah N., Nielsen P. E. Cellular Delivery of Poly-heteroaromate-Peptide Nucleic Acid Conjugates Mediated by Cationic Lipids // Bioconj. Chem. 2006.-V. 17.-P. 189-194.

58. Ittig D., Liu S., Renneberg D., Schumperli D., Leumann C.J. Nuclear antisense effects in cyclophilin A pre-mRNA splicing by oligonucleotides: a comparison of tricyclo-DNA with LNA // Nucleic Acids Res. 2004. V. 32. - P. 346353.

59. Xodo L.E., Cogoi S., Rapozzi V. Anti-Gene Strategies to Down-Regulate Gene Expression in Mammalian Cells // Current Pharmaceutical Desig 2004. V. 10. -P. 805-819.

60. Cutrona G., Carpaneto E.M., Ulivi M., Rondella S., Landt O., Ferrarini M., Boffa L.C. Effects in live cells of a c-myc anti-gene PNA linked to a nuclear localization signal //Nat. Biotech. 2000. -V. 18. P. 300-303.

61. Kaihatsu K., Janowski B.A., Corey D.R. Recognition of Chromosomal DNA by PNAs // Chem. Biol. 2004. V. 11. - P. 749-758.

62. Pellestor F., Paulasova P. The peptide nucleic acids (PNAs), powerful tools for molecular genetics and cytogenetics. // Eur. J. of Human Genetics. 2004. V. 12. - P. 694-700.

63. Wilks S.A., Keevil C.W., Targeting species-specific low-affinity 16S rRNA binding sites by using peptide nucleic acids for detection of Legionellas in biofilms. // Appl. Env. Microbiol. 2006. V. 72. - P. 5453-5462.

64. Rufer N., Dragowska W., Thornbury G., Roosnek E., Lansdorp P.M., Telomere length dynamics in human lymphocyte subpopulations measured by flow cytometry. // Nature Biotechnol. 1998. -V. 16. P. 743-747.

65. Robertson K.L., Yu L., Armitage B.A., Lopez A.J., Peteanu L.A. Fluorescent PNA probes as hybridization labels for biological RNA. // Biochemistry 2006. V. 45. -P. 6066-6074.

66. Brandt O., Hoheisel J.D. Peptide nucleic acids on microarrays and other biosensors. // Trends in Biotechnology. 2004. V. 22. N 12. - P. 617-622.

67. Orum H., Nielsen P.E., Egholm M., Berg R.H., Buchardt O., Stanley C. Single base pair mutation analysis by PNA directed PCR clamping. // Nucleic Acids Res. 1993.-V. 21.-P. 5332-5336.

68. Popescu D-L., Parolin T.J., Achim C. Metal incorporation in modified PNA duplexes. // J. Am. Chem. Soc. 2003. V. 125. - P. 6354-6355.

69. Williams K.A., Veenhuizen P.T., de la Torre B.G., Eritja R., Dekker C. Carbon nanotubes with DNA recognition. // Nature 2002. V. 420. - P. 761.

70. Turner J.L., Becker M.L., Li X., Taylor J-Sa., Wooley K.L. PNAdirected solution- and surface-assembly of shell crosslinked (SCK) nanoparticle conjugates. // Soft Matter 2005. V. 1. - P. 69-78.

71. Cao R., Gu Z., Patterson G.D., Armitage B.A. A recoverable enzymatic microgel based on biomolecular recognition. // J. Am. Chem. Soc. 2004. V. 126. - P. 726-727.

72. Demidov V.V. PD-loop technology: PNA openers at work. // Expert Rev. Mol. Diagn. 2001. V. 1. N. 3. - P. 343-351.

73. Demidov V.V., Kuhn H., Lavrentieva-Smolina I.V., Frank-Kamenetskii M.D. Peptide nucleic acid-assisted topological labeling of duplex DNA // Methods. 2001.-V. 23. P.123-131.

74. Haaima G., Lohse A., Buchardt O., Nielsen P. E. Peptide Nucleic Acids (PNAs) containing Thymine monomers derived from chiral amino acids: hybridization and solubility properties of D-Lysine PNA // J. Chem. Int. Ed. 1996. V. 98. N 17. - P. 1939-1941.

75. Dueholm K.L., Egholm M., Buchardt O. An efficient synthesis of Boc-aminoacetaldehyde and its application to the synthesis of N-(2-Boc-aminoethyl)glycine esters // Organic preparations and procedures int. 1993. V. 25. N. 4. - P. 457-461.

76. Agami C., Couty F. The reactivity of the N-Boc protectinc group: an anderrated feature // Tetrahedron. 2002. V. 58. - P. 2701-2724.

77. Thomson S. A., Josey J. A., Cadilla R., Gaul M. D., Hassman C. F., Luzzio M. J., Pipe A. J. Reed K. L., Ricca D. J., Wiethe R. W., Noble S. A. Fmoc mediated synthesis of peptide nucleic acids. // Tetrahedron 1995. -V. 51. — P. 6179-6194.

78. Ferrer E., Eisenhut M., Eritia R. A convenient route for the preparation nucleic acid monomers carrying acid-labile groups for the protection of the amino function // LUWER/ESCOM. Letters in peptide science. 1999. V. 6. - P. 209-219.

79. Sforza S., Galaverna G., Dossena A., Corradini R., Marchelli R. Role of Chirality and Optical Purity in Nucleic Acid Recognition by PNA and PNA analogs // Chirality 2002. V. 14. - P. 591-598.

80. Ganesh K.N., Nielsen P.E. Peptide Nucleic Acids: analogs and derivatives // Curr. Org. Chem. 2000. V. 4. - P. 931-943.

81. Falkiewicz B. Peptide nucleic acids and their structural modifications // Acta Chem. Polonica 1999. V. 46. - P. 509-529.

82. Sforza S., Corradini R., Ghirardi S., Dossena A., Marchelli R. DNA binding of a D-lysine-based chiral PNA: direction control and mistmatch recognition. // Eur. J. Org. Chem. 2000. P. 2905-2913.

83. Puschl A., Sforza S., Haaima G., Dahl O., Nielsen P.E. Peptide nucleic acids (PNAs) with a functional backbone // Tetrahedron Lett. 1998. V. 39. - P. 711714.

84. Dueholm K.L., Petersen K.H., Jensen D.K., Egholm M., Nielsen P.E., Buchardt O. Peptide nucleic acid (PNA) with a chiral backbone based, on alanine // Bioorg. Med. Chem. Lett 1994. -V. 4. P. 1077-1080.

85. Sforza S., Haaima G., Marchelli R., Nielsen P.E. Chiral peptide nucleic acids (PNAs): Helix handedness and DNA recognition // Eur. J. Org. Chem. 1999. P. 197-204.

86. Tedeschi T., Sforza S., Corradini R., Dossena A., Marchelli R. Lysine-based peptide nucleic acids (PNAs) with strong chiral constraint: control of the helix handedness and DNA binding by chirality // Chirality 2005. V 1. - P. 196-S204.

87. Sforza S., Tedeschi T., Corradini R., Ciavardelli D., Dossena A., Marchelli R. Fast Solid-Phase Synthesis of Chiral Peptide Nucleic Acids with a High Optical Purity by a Submonomeric Strategy // Eur. J. Org. Chem. 2003. P. 1056-1063.

88. Bentin T., Nielsen P.E. Superior Duplex DNA Strand Invasion by Acridine Conjugated Peptide Nucleic Acids // J. Am. Chem. Soc. 2003. V.125. - P. 6378-6379.

89. Sforza S., Tedeschi T., Corradini R., Dossena A., Marchelli R. Direction control in DNA binding of chiral D-lysine-based peptide nucleic acid (PNA) probed by electrospray mass spectrometry // Chem. Commun. 2003. P. 1102- 1103.

90. Corradini R., Feriotto G., Sforza S., Marchelli R., Gambari R. Enhanced Recognition of Cystic Fibrosis W1282X DNA Point Mutation by Chiral Peptide Nucleic Acids Probes by a Surface Plasmon Resonance Biosensor // J. Mol. Ree. 2004. -V. 17.-P. 76-84.

91. Ficht S., Dose C., Seitz O. As fast and selective as enzymatic ligations: unpaired nucleobases increase the selectivity of DNA-controlled native chemical PNA ligation // Chem. Bio. Chem. 2005. V. 6. - P. 2098-2103.

92. Englund E.A., Appella D.H. Synthesis of gamma-substituted peptide nucleic acids: a new place to attach fluorophores without affecting DNA binding // Org. Lett. 2005.-V. 7.-P. 3465-3467.

93. Tedeschi T., Sforza S., Corradini R., Marchelli R. Synthesis of new chiral PNAs bearing a dipeptide-mimic monomer with two lysine-derived stereogenic centres // Tetrahedron Lett. 2005. V. 46. - P. 8395-8399.

94. Falkiewicz В., Kowalska К., Kolodziejczyk A.S., Wisniewski К., Lankiewicz L. Synthesis of new chiral Peptide Nucleic Acid (PNA) monomers by simplified-reductive amination method. //Nucleosides & Nucleodites. 1999. — V. 18'. N 3.-P. 353-361.

95. Kosynkina L., Wang W., Chyau Liang T. A convenient synthesis of chiral Peptide Nucleic Acid (PNA) monomers. // Tetrahedron Letters. 1994. V. 35. - P. 5173-5176.

96. Falkiewicz В., Kolodziejczyk A.S., Liberek В., Wisniewski K. Synthesis of achiral and chiral Peptide Nucleic Acid (PNA) monomers using Mitsunobu reaction. // Tetrahedron Letters. 2001. -V. 57. P. 7909-7917.

97. T. Ishizuka, J. Yoshida, Y. Yamamoto, J. Sumaoka, T. Tedeschi, R. Corradini, S. Sforza and M. Komiyama. Chiral introduction of positive charges to PNA for double-duplex invasion to versatile sequences // Nucleic Acids Research. 2008. P. 1-8

98. Zhou P., Wang M.M., Fisher G.W., Waggoner A., Ly. D.H. Novel Binding and efficient Cellular Uptake of Guanidine-Based Peptide Nucleic Acids (GPNA) // J. Am. Chem. Soc. 2003. V. 125. - P. 6878-6879.

99. Dragulescu-Andrasi A., Zhou P., He G.F., Ly D.H. Cell-permeable GPNA with appropriate backbone stereochemistry and spacing binds sequence-specifically to RNA // Chem.' Comm. 2005. P. 244-246.

100. Dragulescu-Andrasi A., Rapireddy S., Frezza B.,Gayathri C., and Ly D.H. A Simple y-Backbone Modification Preorganizes Peptide Nucleic Acid into a Helical Structure//J. Am.Chem. Soc. 2006. -Vol. 128. N. 31. -P. 10258-10267.

101. Боярская, H. П. Синтез тиминсодержащих отрицательно заряженных пептидно-нуклеиновых кислот различного строения иисследование их гибридизационных характеристик // дис. канд. хим. наук : 02.00.10 : защищена 12.11.07. -М., 2007. С. 127.

102. Friedrich-Bochnitschek, S. Allyl esters as carboxy protecting groups in the synthesis of O-glycopeptides // S. Friedrich-Bochnitschek, H. Waldmann, H. Kunz//J. Org. Chem. 1989. V. 54. - P. 751-756.

103. Баранов A.B., Цвид H.C., Лукьяненко В.И., Прохоров Д.И., Кириллова Ю.Г., Швец В.И. Исследование путей синтеза цитозинового мономера отрицательно заряженных пептидно-нуклеиновых кислот. // Вестник МИТХТ. 2007. Т. 2. № 5 - С. 28-32.

104. Кузнецов М.А., Нестеренко П.Н., Васияров Г.Г., Староверов С.М. Высокоэффективная жидкостная хроматография энантиомеров а-аминокислот на силикагеле с иммобилизованным эремомицином // Журн. аналит. хим. -2008.-Т. 63. № 1.-С. 64-72.