Микробные процессы сульфатредукции, метаногенеза и метанокисления в донных осадках российского сектора Балтийского моря тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат биологических наук Канапацкий, Тимур Александрович

• Канапацкий, Тимур Александрович
• кандидат биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Канапацкий, Тимур Александрович

Содержание

Список используемых сокращений

ВВЕДЕНИЕ

Список основных научных работ, опубликованных по теме диссертации

ГЛАВА 1. МИКРОБНЫЕ ПРОЦЕССЫ ВОССТАНОВЛЕНИЯ СУЛЬФАТА В 15 МОРСКИХ ВОДОЕМАХ

1.1. Современные представления о сульфатредуцирующих микроорганизмах

1.2. Распространение и значение сульфатредуцирующих бактерий в природе

ГЛАВА 2. МИКРОБНЫЕ ПРОЦЕССЫ ЦИКЛА МЕТАНА В МОРСКИХ 23 ВОДОЕМАХ

2.1. Современные представления о метаногенных археях

2. 2. Распространение и значение метаногенов

2. 3. А. Аэробное окисление метана. Современные представления о 31 метанотрофии

2. 3. 1. Распространение и значение

2. 3. Б. Анаэробное окисление метана

2. 3. 2. Распространение и значение анаэробных метанотрофов

ГЛАВА 3. МИКРОБНЫЕ ПРОЦЕССЫ В БАЛТИЙСКОМ МОРЕ

3.1. Гидрология и гидрохимия Балтийского моря

3.2. Биогеохимические и микробиологические исследования в Балтийском 46 море

Заключение

ГЛАВА 4. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

4.1 Объекты и методы исследования

4.2. Методы отбора проб для исследований

4. 2. 1. Физико-химические методы

4. 2. 2. Биогеохимические методы

4. 2. 3. Определение стабильноизотопного (813С) состава метана, 65 растворимого минерального углерода и органического вещества осадков

4. 2. 4. Микробиологические методы

4. 2. 5. Методы молекулярной экологии 67 ГЛАВА 5. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

5.1. Физико-химическая характеристика донных осадков и придонной 74 воды российского сектора Балтийского моря

5.1.1. Гданьский бассейн

5. 1.2. Выборгский залив 84 5. 1.3. Вислинский и Куршский заливы

5.2. Общая численность микроорганизмов 93 5. 2. 1. Гданьская впадина 93 5. 2. 2. Выборгский залив 93 5. 2. 3. Вислинский и Куршский заливы

5.3. Интенсивности микробиологических процессов 95 5. 3. 1. Гданьский бассейн

5.3.2. Выборгский залив

5.3.3. Вислинский и Куршский заливы 103 5. 4. Изотопный состав углерода СН4, Сминер и Сорг 105 5. 4. 1. Гданьский бассейн 105 5. 4. 2. Выборгский залив 106 5. 4. 3. Вислинский и Куршский заливы 107 5.5. Молекулярная детекция сообществ микроорганизмов 108 ГЛАВА 6. ОБСУЖДЕНИЕ ПОЛУЧЕННЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ

6.1. Исследование Гданьской впадины Балтийского моря

6.2. Исследование заливов Балтийского моря (Выборгского, Куршского, 127 Вислинского)

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

Список литературы

Список используемых сокращений

АО ИО РАН - атлантическое отделение ИО РАН

АОМ - анаэробное окисление метана

АТФ - аденозинтрифосфорная кислота

АФК - активные формы кислорода

ВЦМ - внутрицитоплазматических мембран

ГЛБО - гидролокация бокового обзора

ГНО - газонасыщенные осадки

ДАФИ - 4,6-диамидино-2-фенилиндол

ИО РАН - институт океанологии российской академии наук

МГ - метаногенез

МГА - метаногенные археи

НСП - непрерывное сейсмоакустическое профилирование

OB - органическое вещество

ОМ - окисление метана

ОЧМ - общая численность микроорганизмов

ПМ - покмарк

ПЦР - полимеразная цепная реакция CP - сульфатредукция

РМФ - рибулозомонофосфатный путь ассимиляции С1-соединений

СО РАН - сибирское отделение РАН

СРБ - сульфатредуцирующие бактерии

СРП - сульфатредуцирующие прокариоты

ТАУ - темновая ассимиляция углекислоты

ТО - типичные осадки

ANME - the anaerobic methane oxidizers или anaerobic methanotrophs CARD-FISH - catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization FISH - флуоресцентная in situ гибридизация SMTZ - «methane sulfate transition zone»

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробные процессы сульфатредукции, метаногенеза и метанокисления в донных осадках российского сектора Балтийского моря»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы. Известно, что в процессах диагенетического преобразования морских осадков микроорганизмы циклов углерода и серы играют ключевую роль. В результате жизнедеятельности микроорганизмов различных физиологических групп происходит образование С02, H2S, других восстановленных соединений серы и метана, которые оказывают существенное влияние на трансформацию органического вещества (ОВ) осадков на ранних этапах диагенеза. Масштабы микробного образования восстановленных соединений серы и биогазов зависят, главным образом, от величины потока ОВ из водной толщи в осадочные отложения [Иванов, 1983].

Балтийское море представляет собой крупнейший в мире эстуарий нескольких полноводных рек, относящийся к типу мелководных мезотрофных морских бассейнов. При средней глубине 50 м море характеризуется сложным строением водной толщи. С одной стороны из-за наличия на дне порогов и впадин возникают застойные явления с появлением H2S и других восстановленных соединений. С другой стороны циркуляции вод мешает стратификация, образующаяся в результате контакта сильно распресненных поверхностных вод речного стока, с более солеными глубинными водами, поступающими из Северного моря. Эти два слоя разделены переходным слоем скачка солености, который действует как постоянный барьер, препятствующий полноценному обмену опресненных и соленых вод. К галоклину добавляется не менее отчетливый термоклин, формирующийся весной и разрушаемый осенними штормами [Экосистемы Балтики..., под ред. Кобленц-Мишке, 1987].

По данным Комиссии по защите экосистемы Балтийского моря среднегодовая

-у

величина первичной продукции достигла величины 188 гС/(м год), в Рижском заливе и Датских проливах превысила величину 200 гС/(м2 год) [HELCOM, 2006], а в российском секторе юго-восточной части Балтийского моря составила 231 гС/(м2 год) [Кудрявцева и др., 2012]. Высокая продуктивность Балтийских вод в сочетании со значительным поступлением аллохтонного ОВ способствует протеканию в осадочных отложениях интенсивных микробиологических процессов трансформации ОВ.

Первые масштабные исследования скоростей ключевых микробных процессов (сульфатредукции, метаногенеза и метанокисления) в восстановленных осадках открытого моря, в Рижском заливе, в илах Готландской и Арконской впадин были выполнены в 70-80-ые годы прошлого столетия под руководством М.В. Иванова [Lein at al., 1981; Леин и др., 19826]. Было показано, что максимальные скорости

о

сульфатредукции (до 150-200 мкмоль 8/(дм сут)) наблюдались в верхних горизонтах осадочной толщи мощностью 0-20 см. В более глубоких горизонтах голоценовых осадков интенсивность этого процесса, как правило, снижалась на 1-2 порядка. Образование метана в исследованных илах происходило преимущественно за счет восстановления углекислоты, причем наибольшие скорости образования метана наблюдались в относительно мелководных осадках Рижского залива. Расчет суммарного расхода Сорг на микробное образование метана составил 0,27-9,71 мг С\на кг влажного ила в год, что в 20 с лишним раз меньше расхода углерода на бактериальное восстановление сульфата в исследованных балтийских илах [Леин, Иванов, 2009].

В начале семидесятых годов прошлого столетия сотрудниками Института океанологии им. П.П. Ширшова АН СССР впервые были обнаружены аномалии в распределении углеводородных газов в придонных водах Балтийского моря [Геодекян и др., 1979]. Геофизические и геологические исследования, проведенные в серии экспедиций в Балтийском море, показали, что повышенное содержание метана в придонных слоях водной толщи, определяется разгрузкой газосодержащих флюидов, локализация которых приурочена к специфической геоморфологической картине дна (углубления, кратеры и т.д.). Позднее подобные метановые кратеры (покмарки) с характерными газонасыщенными осадками и повышенным содержанием метана в придонной воде были выявлены в различных районах Балтийского моря в пределах Гданьской, Арконской и Готландской впадин [Геоакустические..., под ред. Геодекяна, 1990; Геохимия вод..., под ред. Геодекяна, 1997]. Очевидно, что высокие концентрации метана в осадках и придонной воде должны оказывать влияние на структуру микробного сообщества, развивающегося в этих районах Балтики.

Первые детальные микробиологические и биогеохимические исследования мелководных газонасыщенных осадков были проведены немецкими исследователями в заливе Экернфьорде [Christopher et al., 1999]. Измерение скоростей

сульфатредукции, метанобразования и метанокисления позволило авторам сделать вывод о том, что наряду с сульфатредукцией в осадках залива происходят активные процессы анаэробного окисления метана (АОМ), в которых участвуют метанотрофные археи АЫМЕ-2 типа [Тгеиёе е1 а1., 2005].

В российском секторе Балтийского моря по данным эхолотного зондирования, выполненного сотрудниками ИО РАН и ВСЕГЕИ [Геохимия вод..., под ред. Геодекяна, 1997] на разных глубинах встречаются различные типы газонасыщенных осадков, как ассоциированных с покмарками, так и располагающиеся вне их зоны. Однако до сих пор не проводилось систематических исследований структуры и активности микробного сообщества донных осадков, приуроченного к зонам покмарков и геоакустических аномалий в Российском секторе Балтийского моря.

В 1990-х гг. сотрудниками ВСЕГЕИ им. А.П. Карпинского при проведении геофизических работ в Выборгском заливе с использованием метода непрерывного сейсмоакустического профилирования (НСП) было установлено широкое распространение газонасыщенных осадков. Также в разрезах локально были найдены воронкообразные структуры, либо выходящие на поверхность дна, либо захороненные в толще отложений. Позднее ОАО «Петротранс» на поверхности дна были обнаружены овальные и округлые структуры диаметром до 25 м. В 2007-2009 гг. эти кратероподобные структуры были исследованы ВСЕГЕИ им. А.П. Карпинского методом гидролокации бокового обзора (ГЛБО) [Атлас геологических..., 2010]. Никаких микробиологических и биогеохимических исследований в этом районе Балтики до сих пор не проводилось.

Куршский и Вислинский заливы (средние глубины 3,8 и 2,7 м соответственно) являются своеобразными промежуточными проточными бассейнами-отстойниками, принимающими жидкий и твердый сток с суши и взаимодействующие с открытым морем через узкие проливы [Пустельников, 1983]. Куршский залив в большей степени, чем Вислинский подвержен влиянию речного стока, поскольку основное количество (87%) терригенного материала в Куршский залив поступает с речным стоком и лишь 16% с морской водой. Тогда как в Вислинский залив со стороны моря поступает 25%, а на речной сток приходится не более 58% поставляемого в водоем терригенного материала. В среднем для Вислинского залива соленость составляет 3,80%о, а южная часть Куршского залива является практически пресноводной.

Различие речного или морского влияния сказывается на количестве осадочного материала, аккумулируемого в заливах. Непосредственно в бассейне Куршского залива (особенно в его южной части) осаждается 74% поступающего осадочного вещества, и лишь 26% выносится [Р^еЫкоуаБ, 1998]. На дне Вислинского залива накапливается всего 16% поступающего терригенного материала, а большая часть (84%) его выносится в море. Таким образом, современный этап осадконакопления в Вислинском заливе характеризуется преимущественным выносом осадочного материала, а в Куршском - его аккумуляцией [Чечко, 2004].

Значительные площади осадочных отложений в обоих заливах представлены заиленными песками и алевро-пелитовыми илами с достаточно высоким содержанием С0рГ. Среднее содержание Сорг в осадках Куршского залива составляет 1,7-2,4%, причем максимальные величины зафиксированы в южной части залива (более 7%), что может объясняться высокими скоростями осадконакопления и высокой продукцией ОВ. В осадках Вислинского залива содержание Сорг существенно ниже, чем в Куршском заливе, в котором даже в поверхностном слое значения Сорг редко превышают величину 2%. Долгосрочный мониторинг изменения содержания хлорофилла, биогенных элементов, биомассы фитопланктона в сочетании с измерением первичной продукции и минерализации органического вещества в Куршском и Вислинском заливах позволил отнести Куршский залив к гипертрофному водоему, а Вислинский залив - к евтрофному [Аккзапёгоу, 2010]. По ряду критериев можно считать, что эвтрофирование Вислинского залива не достигло критического уровня, а Куршского - превысило допустимые нормы.

Таким образом, выполненные ранее геохимические, химические и биологические исследования дают основание полагать, что в осадках Куршского и Вислинского заливов протекают активные микробиологические процессы деструкции органического вещества. Однако до сих пор, микробиологические и газогеохимические исследования осадочных отложений российских частей Куршского и Вислинского заливов не проводились. Цели и задачи исследования:

Целью нашей работы было проведение микробиологических и биогеохимических исследований активности микроорганизмов в осадочных отложениях российского сектора Балтийского моря.

Для достижения этой цели нами были поставлены следующие задачи:

1. Исследовать физико-химические характеристики осадочных отложений выбранных районов, а также определить содержание метана в илах и придонной воде.

2. Определить общую численность микроорганизмов и скорости ключевых микробных процессов: метанокисления, метанобразования и сульфатредукции в донных осадках.

3. Изучить состав микробного сообщества донных осадков покмарков Гданьской впадины молекулярно-биологическими методами.

4. На основании результатов измерения скоростей микробных процессов и

1 ^

данных изотопного состава углерода (8 С) метана и углекислоты оценить геохимическую роль сульфатредуцирующих, метанобразующих и метанокисляющих микроорганизмов в процессах круговорота углерода и трансформации основных биогенных газов - сероводорода и метана в газонасыщенных голоценовых осадках Балтийского моря.

Научная новизна работы. Установлено, что в осадках покмарков Гданьской впадины содержание метана, численность микроорганизмов и интенсивность микробных процессов существенно выше, чем в илах, отобранных вне этой зоны. Анализ данных интегральной скорости сульфатредукции (СР) в горизонте осадков 030 см показал, что средняя величина образования восстановленных соединений серы за счет разложения ОВ, поступающего из водной толщи в период наших исследований составила 5,2 ммоль/(м2 сут). В осадках покмарков, характеризующихся повышенным содержанием метана, заметный вклад в образование восстановленных соединений серы (до 70%) вносит процесс анаэробного окисления метана.

1 л

Результаты изучения изотопного состава углерода метана 8 С-СН4 (-68 -84%) осадочной толщи покмарков свидетельствуют о его биогенном происхождении. Однако низкие скорости метаногенеза, выявленные до глубин опробования ила (160— 200 см), указывают на то, что биогенный метан мигрирует из глубинных слоев осадочного чехла.

В отличие от Гданьской впадины, в Выборгском заливе Балтийского моря кратерообразные структуры не связаны с газовыделением, а образовались, по-видимому, вследствие разгрузки подземных вод. Газонасыщенные осадки залива

формируются в результате высокой активности современных процессов метаногенеза.

Впервые проведены микробиологические и газо-геохимические исследования в Вислинском и Куршском заливах. В осадках более соленого Вислинского залива интегральные скорости сульфатредукции были выше, чем в осадках Куршского залива. Меньшее содержание сульфатов и их быстрое исчерпание в поровых водах осадков Куршского залива по сравнению с Вислинским, способствует активизации процесса МГ, интенсивности которого в илах Куршского залива были заметно выше.

Проведены молекулярно-биологические исследования состава микробного сообщества восстановленных осадков покмарка Гданьской впадины. Детекция функционального гена, кодирующего а - субъединицу метил-коэнзим М редуктазы у метанотрофных архей показала, что в осадках исследованного нами покмарка Гданьской впадины обнаружены представители двух групп метанотрофных архей ANME-1 и ANME-2. Большее количество полученных последовательностей группы ANME-1 может указывать на доминирование микроорганизмов этой группы в газонасыщенных осадках покмарков Гданьской впадины.

Практическая значимость работы. Полученные данные по скоростям микробных процессов необходимы для моделирования динамики метана в Балтийском море в прошлом (Голоценовый период), настоящем и будущем (с прогнозом возможных сценариев). Результаты проведенной работы включены в европейскую базу данных районов скопления газа, созданную в рамках проекта BONUS. Эти данные стали основой разработки динамической модели процессов продукции и трансформации газов в Балтийском море в голоцене и прогнозирования возможных сценариев последствия изменения климата в 21-ом веке. Проведенные исследования расширяют фундаментальные знания о микробных сообществах и процессах, протекающих в голоценовых морских осадках и осадках покмарков.

Апробация работы. Основные положения диссертации были доложены на 9-ой международной конференции «Газ в морских осадках (Бремен, Германия, 14-20 сентября 2008); на международной конференции «Комплексное управление, индикаторы развития, пространственное планирование и мониторинг прибрежных районов Балтики» (Калининград, 26-30 марта 2008); на международной конференции «Балтийский газ» в рамках Европейской программы BONUS (Бремен, Германия, 03-

07 февраля 2009); на международной конференции «Геологические и биогеохимические процессы на холодных сипах - особенности современных и ископаемых систем» (Варна, Болгария, 28-30 сентября 2009); на 10-ой международной морской геологической конференции «Геология Балтийского моря -10» (Санкт-Петербург, 24-28 августа 2010); на 10-ой и 11-ой международных конференциях «Газ в морских осадках» (Листвянка, 6-12 сентября 2010; Франция, 2012).

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 8 статей и 8 тезисов.

Список основных научных работ, опубликованных по теме диссертации: Экспериментальные статьи:

1. Пименов Н.В., М.О. Ульянова, Т.А. Канапацкий, В.В. Сивков, М.В. Иванов. Микробиологические и биогеохимические процессы в районе покмарка в Гданьской впадине Балтийского моря. Микробиология. 2008. Т. 77. №5. С. 651-659.

2. Nikolay Pimenov, Marina О Ulyanova, Timur A Kanapatsky, Elena F Veslopolova, Pavel" A Sigalevich, Vadim V Sivkov. Microbially mediated methane and sulfur cycling in pockmark sediments of the Gdansk Basin, the Baltic Sea. Geo-Mar. Lett. 2010. V. 30. P.439-448.

3. Шубенкова O.B., A.B. Лихошвай, Т.А. Канапацкий, H.B. Пименов. Микробное сообщество восстановленных осадков покмарка Гданьской впадины Балтийского моря. Микробиология. 2010. Т. 79. С. 801-811.

4. Меркель А.Ю., H.A. Черных, Т.А. Канапацкий, Н.В. Пименов. Детекция метанотрофных архей в осадках покмарка (Гданьская впадина, Балтийское море) путем анализа последовательности гена, кодирующего а субъединицу метил-коэнзим М редуктазы. Микробиология. 2010. Т. 79. С. 852-855.

5. Пименов Н.В., Т.А. Канапацкий, П.А. Сигалевич, И.И. Русанов, Е.Ф. Веслополова, А. Г. Григорьев, В. А. Жамойда. Сульфатредукция, образование и окисление метана в голоценовых осадках Выборгского залива Балтийского моря. Микробиология. 2012. Т. 81. №1. С. 84-95.

6. Ulyanova М., Sivkov V., Kanapatskij Т., Sigalevich P., Pimenov N. Methane fluxes in the southeastern Baltic Sea. Geo-Mar. Lett. 2012. V. 32. Issue 5-6. P. 535-544.

7. Кудрявцева Е. А., А.С. Саввичев, С.В. Александров, Т.А. Канапацкий, Н.В. Пименов. Бактериопланктон Гданьского бассейна Балтийского моря. Микробиология. 2012. том 81. № 3. С. 377-388.

8. Пименов Н. В., М.О. Ульянова, Т.А. Канапацкий, И. Н. Мицкевич, П.А. Сигалевич, И.А. Немировская, В.В. Сивков. Сульфатредукция, образование и окисление метана в поверхностных осадках Вислинского и Куршского заливов Балтийского моря. Микробиология. 2013. Т. 82. №2. С. 228-238.

Тезисы конференций:

1. Пименов Н.В., Ульянова М.О., Канапацкий Т.А., Сивков В.В. Геохимические последствия микробных процессов в Российском секторе юго-восточной Балтики / Материалы международной конференции "Комплексное управление, индикаторы развития, пространственное планирование и мониторинг прибрежных регионов юго-восточной Балтики". Калининград, 26-30 марта 2008. Терра Балтика. С. 121122.

2. Pimenov N., Ulyanova М., Kanapatskiy Т., Veslopolova Е., Sivkov V. Microbial Activity in the South-Eastern Baltic Sea (Russian Sector) with Special Reference to the Methane and Sulfur Cycling / Abstracts of 9-th International Conference on Gas in Marine Sediments. 15-19 September 2008. University of Bremen. Germany. P. 51.

3. Pimenov N.V., Shubenkova O.V., Kanapatskiy T.A., Likhoshway A.B., Ulyanova M.O., Zemskaya T.I., Sivkov V.V. Activity and Structure of Microbial Communities of Pockmarks and Geoacoustic Anomalies in the Russian Sector of the Gdansk Deep / Abstracts of International Workshop meeting, Varna, Sept. 28-30. 2009. P.30.

4. Pimenov N.V., Kanapatskiy T.A., Sigalevich P.A., Grigoriev A.G., Zhamoida V.A. Microbial processes of carbon and sulfur cycling in the Holocene sediments of the Vyborg Bay (Finland Gulf, Baltic Sea) / Abstracts of 10-th International Marine Geological Conference "The Baltic Sea Geology - 10". 24-28 August, St.Petersburg, Russia. P. 96-98.

5. Pimenov N.V., Kanapatskiy T.A., Sigalevich P.A., Grigoriev A.G., Zhamoida V.A. Microbially mediated methane and sulfur cycling in gas-bearing sediments of the Vyborg Bay (Finland Gulf, Baltic Sea) / Abstracts of 10-th International Conference on Gas in Marine Sediments. Limnological Institute SB RAS (Listvyanka Lake Baikal), 06-12 September, 2010. P. 67-68.

6. Merkel A.Yu., Chernych N.A., Kanapatskiy T.A., Pimenov N.V. Detection of methanotrophic Archaea in pockmark sediments (Gdansk Deep, Baltic Sea) by sequence analysis of the gene encoding methyl-coenzyme M reductase A subunit / Abstracts of 10th International Conference on Gas in Marine Sediments. Limnological Institute SB RAS (Listvyanka Lake Baikal), 06-12 September, 2010. P. 128-129.

7. Ульянова M., Канапацкий Т. Потоки метана в осадках Гданьского бассейна, Балтийское море / Геология морей и океанов: Материалы XVIII международной научной конференции (Школы) по морской геологии. 2011. Т. 2. С. 116-117.

8. Ulyanova М., Sivkov V., Kanapatskiy Т., Pimenov N. Methane diffusive flux in the shallow lagoons of the SE Baltic Sea / Abstracts of 11th International Conference on Gas in Marine Sediments. 2012-09-04 r. - 2012-09-06 r. - Nice. - 2012. P. 85 - 86.

Место проведения работы. Экспериментальная часть работы выполнена в лаборатории микробиологии и биогеохимии водоемов в рамках плана научно-исследовательских работ ИНМИ РАН по теме «Изучение микробиологических и биогеохимических процессов циклов углерода и серы в водной толще и донных осадков водоемов» (Госрегистрация № 01200950958), а также при финансовой поддержке РФФИ (гранты № 07-04-00160, 10-04-00220 и РФФИ-БОНУС-08-04-92422).

Благодарности. Автор выражает искреннюю благодарность научному руководителю д.б.н. Н.В. Пименову и академику М.В. Иванову за внимание, поддержку и неоценимую помощь в формировании целостных представлений о геохимичесмкой роли микроорганизмов в морских водоемах. Автор благодарит канд. биол. наук И.И. Русанова за помощь в освоении методик и получении радиоизотопных данных, Т.С. Прусакову за определение изотопного состава углерода метана и карбонатов, канд. биол. наук О.В. Шубенкову (ЛИН СО РАН) и А.Ю. Меркеля за проведении молекулярных исследований, канд. биол. наук A.JI. Брюханова за помощь в освоении метода FISH, коллег лаборатории биогеохимии и микробиологии водоемов за помощь в освоении методик и ценные советы при обсуждении полученных данных, а также сотрудников ИНМИ РАН за отзывчивость и помощь. Особую благодарность автор выражает коллективу сотрудников Атлантического отделения Института океанологии им. П.П. Ширшова РАН под руководством канд. геол.-минер. наук В.В. Сивкова, и сотрудникам ВСЕГЕИ им. А.П.

Карпинского кандидатам геол-минер. наук А.Г. Григорьеву и В.А. Жамойда за неоценимую помощь при проведении экспедиционных исследований, выборе точек пробоотбора, отборе образцов воды и донных осадков, литологическом описании колонок и обсуждении полученных результатов.

Структура и объем диссертации. Диссертационная работа состоит из введения, 6 глав, заключения и выводов, изложенных на 165 страницах машинописного текста и содержит 24 таблиц, 37 рисунков и список литературы из 316 наименований, из них 95 отечественных и 223 иностранных работ.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Канапацкий, Тимур Александрович

выводы

1. В российском секторе Балтийского моря наибольшие величины содержания СН4 (до 1039 ммоль/м ) обнаружены в илах покмарков Гданьской впадины и в газонасыщенных осадках Выборгского залива (до 549 ммоль/м ). В остальных исследованных илах разброс значений содержания метана составил от 3,7 до 276 ммоль/м2.

2. В поверхностных осадках большинства станций Гданьской впадины выявлено существенное (на 2-3 порядка величин) превышение скорости процесса анаэробного окисления метана по сравнению с метаногенезом, что может быть обусловлено поступлением СН4 из глубинных слоев осадочного чехла. Исключение составляют осадки Выборгского залива, где скорость метаногенеза на 25% превышала скорость его окисления.

3. Величины изотопного состава углерода метана (513С от -63,3%о до -97,5%о) позволяют предполагать его микробное происхождение как в илах Гданьской впадины, так и в осадках Балтийских заливов.

4. В осадках Балтийского моря основным процессом терминального разложения органического вещества является сульфатредукция, интенсивность л которой изменялась от 7 до 46,4 ммоль/(м сут).

5. В илах покмарков Гданьской впадины обнаружены наибольшие скорости л анаэробного окисления метана (до 15 ммоль/(м сут)). В газонасыщенных осадках и покмарках вклад анаэробного окисления метана в суммарный процесс сульфатредукции в среднем составлял 50%, достигая на некоторых станциях 7282%, в то время как в остальных осадках эта величина не превышала 6%.

6. Молекулярно-биологическими методами изучен состав микробного сообщества донных осадков покмарка Гданьской впадины. Определена численность архей и эубактерий, выявлены сульфатредуцирующие бактерии разных филогенетических групп, метаногены и анаэробные метанокисляющие археи АИМЕ-1 и АКМЕ-2.

7. Невысокое содержание метана в осадках кратерообразной структуры в Выборгском заливе в сочетании с низкими интенсивностями микробных процессов указывает на то, что формирование данной структуры не связано с современным газопроявлением.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

По данным полученным совместно с АО ИО РАН площадь покмарков, выявленных в российском секторе Гданьского бассейна составляет -1,7 км2 и л газонасыщенных осадков -300 км [Шуапоуа е1 а1., 2012]. Предварительные оценки дна акватории Выборгского залива, проведенные сотрудниками ВСЕГЕИ, показали, что современные илы, в том числе газонасыщенные, покрывают не менее его трети. Поэтому результаты проведенных нами микробиологических и биогеохимических исследований могут быть распространены на значительные площади российского сектора Балтийского моря.

Наши расчеты для верхних 50 см осадков Гданьской впадины показали, что в ПМ интегральные значения содержания метана достигали величины 1476

2 л ммоль/м , в ГНО с характерными геоакустическими аномалиями - 650 ммоль/м , тогда как в ТО глубже 80 метров - 313 ммоль/м .

Высокие содержания метана в исследуемых илах не подтверждаются значительными интенсивностями процесса МГ в верхних горизонтах осадков. Однако интенсивность процесса ОМ в большинстве исследованных илов была значительно выше МГ. Заметное превышение интенсивности ОМ над МГ возможно за счет дополнительного поступления метана из нижележащих осадочных горизонтов.

Как и в илах Гданьской впадины в осадках заливов процессы микробного окисления метана доминировали над его образованием. Единственным исключением, где интенсивность процесса МГ превышала ОМ оказались газонасыщенные илы ст. Л-3 Выборгского залива (табл. 24).

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Канапацкий, Тимур Александрович, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Aiyer P.A.S. The gases of swamp rice soils. Part V. A methane oxidizing bacterium from rice soils // Mem. Depth. Agr. India, Chem. Ser. 1920. V. 5. P. 173-180.

2. Aleksandrov S.V. Biological production and eutrophication of Baltic Sea estuarine ecosystems: the Curonian and Vistula Lagoons // Mar Pollut Bull. 2010. V.61. N. 4-6. P. 205-210.

3. Alperin M.J., Blair N.E., Albert D.B., Hoehler T.M., Martens C.S. Factors that control the stable carbon isotopic composition of methane produced in an anoxic marine sediment // Global Biogeochem. Cycles. 1992. V. 6. P. 271-291.

4. Alperin M.J., Reeburgh W.S. Geochemical observation supporting anaerobic methane oxidation // Microbial Growth on Ci Compounds. App. Soc. Microbial. Wash. (D. C.). 1984. P. 282-289.

5. Amann R.I., Binder B.J., Olson R.J., Chisholm S.W., Devereux R., Stahl D.A. Combination of 16S ribosomal-RNA-targeted oligonucleotide probes with flow-cytometry for analyzing mixed microbial populations // Appl. Environ. Microbiol. 1990. V. 56. P.1919-1925.

6. Amann R.I., Zarda B., Stahl D.A., Schleifer K.H. Identifi cation of individual prokaryotic cells by using enzymela beled, rRNA targeted oligonucleotide probes // Appl. Environ. Microbiol. 1992. V. 58. No 9. P. 3007-3011.

7. Anthony C. Bacterial oxidation of methane and methanol // Adv. Microb. Physiol. 1986. V. 27. P.113-210.

8. Anthony C. The Biochemistry of Methylotrophs. New York: Academic Press, 1982.431 p.

9. Baars J.K. PhD thesis. University of Delft. 1930.

10. Badziong W., Thauer R.K., Zeikus I.G. Isolation and characterization of Desulfovibrio growing on hydrogen plus sulfate as the sole energy sources // Arch. Microbiol. 1978. V. 116. № LP. 41-47.

11. Barker H.A. Biological formation of methane // Industrial a. Engineering Chemistry. 1956. V. 48. №9. P. 1438.

12. Barton L.L., Tomei F.A. Characteristics and activities of sulfate-reducing bacteria. In Sulfate-Reducing Bacteria. Barton, L.L. (ed.). New York, NY, USA: Peplum Press, 1995. P. 1-179.

13. Beal E.J., House C.H., Orphan V.J. Manganese- and Iron-Dependent Marine Methane Oxidation // Science. 2009. V. 325. 184-187.

14. Beijerinck W.M. Ueber Spirillum desulfuricans als Ursache von Sulfatreduktion // Zbl. Bakt. II. Abt.l. 1895. P. 49, 110.

15. Blodau Ch. A review of acidity generation and consumption in acidic coal mine lakes and their watersheds // Sci. Total Environ. 2006. V. 369. P. 307-332.

16. Bobrov M.N., Harris T.D., Saughnessy K.J., Litt G.J. Catalyzed reporter deposition, a novel method of signal amplification // J. Immunol. Methods. 1989. V. 125. P. 279 - 285.

17. Boetius A., Ravenschlag K., Schubert C.J. et. al. A marine microbial consortium apparently mediating anaerobic oxidation of methane // Nature. 2000. V. 407. P. 623-626.

18. Bolle H.-J., Seiler W., Bolin B. Other greenhouse gases and aerosols. Assessing their role for atmospheric radiative transfer. In: The Greenhouse Effect. Climatic Change, and Ecosystems / Eds.: B.Bolin et al. SCOPE, 1986. V. 29. P. 157-203.

19. Bolliger M.E., Schroth M.H., Bernasconi S.M., Kleikemper J., Zeyer J. Sulfur isotope geochemistry during microbial sulfate-reduction by toluene-degrading bacteria // Geochim. Cos- mochim. 2001. V. 65. P. 3289-3298.

20. Bowman J.P., McCammon S.A., Skerratt J.H. Methylosphaera hansonii gen. nov., sp. nov., a psychrophilic, group I methanotroph from Antarctic marine salinity, meromictic lakes//Microbiology. 1997. V. 143. P. 1451-1459.

21. Bowman J.P, Sly L.I, Nichols P.D., Hayward A.C. Revised taxonomy of the methanotrophs: description of Methylobacter gen. nov., emendation of Methylococcus, validation of Methylosinus and Methylocystis species, and a proposal that the family Methylococcaceae includes only the group I methanotrophs // Int. J. Syst. Bacteriol. 1993. V. 43. P. 735-753.

22. Brioukhanov A.L., Netrusov A.I. Catalase and superoxide dismutase: distribution, properties and physiological role in cells of strict anaerobes // Biochemistry (Moscow). 2004. V. 69. P. 949-962.

23. Brown L.R., Strawinski R.J. The bacterial metabolism of methane // Bact. Proc. 1957. V. 10. P. 18.

24. Bryukhanov A.L., Netrusov A.I. Aerotolerance of strictly anaerobic microorganisms and factors of defense against oxidative stress: a review // Appl. Biochem. Microbiol. 2007. V. 43. P.567-582.

25. Buckley D.H., Schmidt T.M. Exploring the diversity of soil: a microbial rainforest. Biodioversity of Microbial Life (Staley J.T., Reysenbach A-L, eds). New York, NY: Wiley-Liss Inc., 2002. P. 183-208.

26. Bussman I., Suess E., Ground-Water Seepage in Eckernforde Bay (Western Baltic Sea): Effect on Methane and Salinity Distribution of the Water Column // Continental Shelf Res. 1998. V. 18. P. 1795-1806.

27. Caldwell S.L., Laidler J.R., Brewer E.A., Eberly J.O., Sandborgh S.C., Colwell F.S. Anaerobic Oxidation of Methane: Mechanisms, Bioenergetics, and the Ecology of Associated Microorganisms // Environ. Science and Technology. 2008. V. 42 (18). P. 6791-6799.

28. Capone D.G., Kiene R.P. Comparison of microbial dynamics in marine and fresh-water sediments - contrasts in anaerobic carbon catabolism // Limnology and Oceanography. 1988. V. 33. P. 725-749.

29. Caumette P., Cohen Y., Matheron R. Isolation and characterization of Desulfovibrio halophilus sp. nov., a halophilic sulfate- reducing bacterium isolated from Solar Lake (Sinai) // System. Appl. Microbiol. 1991. P. 14. P. 33-38.

30. Chartrain M., Zeikus J.G. Microbial ecophysiology of whey biomethanation: characterization of bacterial trophic populations and prevalent species in continuous culture // Appl. Environ. Microbiol. 1986. V. 51. P. 188-196.

31. Childress J.J., Fisher C.R., Brooks J.M., Kennicutt M.C., Bidigare R., Anderson A.E. A methanotrophic marine molluscan (Bivalves, Mytillidae) symbiosis: Mussels fueled by gas // Science. 1986. V. 233. P. 1306-1308.

32. Chistoserdova L., Vorholt J.A., Thauer R.K., Lidstrom M.E. C-l transfer enzymes and coenzymes linking methylotrophic bacteria and methanogenic archaea // Science. 1998. V. 281. P. 99-102.

33. Christopher S.M., Daniel B.A., Alperin M.J. Stable isotope tracing of anaerobic methane oxidation in the gassy sediments of Eckernforde Bay, German Baltic sea // American journal of science. 1999. V. 299. P. 589-610.

34. Conrad R. The global methane cycle: recent advances in understanding the microbial processes involved // Environ. Microb. Reports. 2009. V. l.P. 285-292.

35. Crowe S.A., Katsev S., Leslie K., Sturm A., Magen C., Nomosatryo S., Pack M.A., Kessler J.D., Reeburgh W.S., Roberts J.A., Gonza' Lez L., Haffner G.D., Mucci A.,

Sundby B., Fowle D.A. The methane cycle in ferruginous Lake Matano // Geobiology. 2010. P. 1-18.

36. Cypionka H. Oxygen respiration by Desulfovibrio species // Annu. Rev. Microbiol. 2000. V. 54. P. 827-848.

37. Daniels L., Belay N., Rajagopal B.S., Weimer P.S. Bacterial methanogenesis and growth from C02 with elemental iron as the sole source of electrons // Science. 1987. V. 237. P. 509-511.

38. Dannenberg S., Kroder M., Dilling W., Cypionka H. Oxidation of H2, organic compounds and inorganic sulfur compounds coupled to reduction of 02 or nitrate by sulfate-reducing bacteria // Arch. Microbiol. 1992. V. 158. P. 93-99.

39. Davies J.B., Yarbrough H.F. Anaerobic oxidation of hydrocarbons by Desulfovibrio desulfiiricans // Chem. Geol. 1966. V. 1. P. 137-144.

40. Davies S.L., Whittenbury R. Fine structure of methane and other hydrocarbon-utilizing bacteria // J. Gen. Microbiol. 1970. V. 61. P. 227-232.

41. Davis J.B., Coty V.F., Stanley J.P. Atmospheric nitrogen fixation by methaneoxidizing bacteria Ps. Methanitrificans // J. Bacteriol. 1964. V. 83. P. 468-472.

42. Dedysh S.N., Belova S.E., Bodelier P.L.E., Smirnova K.V., Khmelenina V.N., Chidthaisong A., et al. Methylocystis heyeri sp. nov., a novel type II methanotrophic bacterium possessing 'signature' fatty acids of type I methanotrophs // Int J Syst Evol Microbiol. 2007. V. 57. P. 472-479.

43. Dedysh S.N., Khmelenina V.N., Suzina N.E., Trotsenko Y.A., Semrau J.D., Liesack W., Tiedje J.M. Methylocapsa acidiphila gen nov. sp. nov., a novel methaneoxidizing and dinitrogen-fixing acidophilic bacterium from Sphagnum bog // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002. V. 52. P. 251-261.

44. Dedysh S.N., Knief C., Dunfield P.F. Methylocella species are facultatively methanotrophic // J Bacteriol 2005. V. 187. P. 4665^1670.

45. Dedysh S.N., Liesack W., Khmelenina V.N., Suzina N.E., Trotsenko Y.A., Semrau J.D., Bares A.M., Panikov N.S., Tiedje J.M. Methylocella palustris gen. nov., sp. nov., a new methane-oxidizing acidophilic bacterium from peat bogs, representing a novel subtype of serine-pathway methanotrophs // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000. V. 50. P. 955-969.

r

v

46. Devereux R., Kane M.D., Winfrey J., Stahl D.A. Genus and group specific hybridization probes for determinative and environmental studies of sulfate reducing bacteria // Syst. Appl. Microbiol. 1992. V. 15. P. 601-609.

47. DeWeerd K.A., Mandelco L., Tanner R.S., Woese C.R., Suflita J.M. Desulfomonile tiedjei gen. nov. and sp. nov., a novel anaerobic, dehalogenating, sulfate- reducing bacterium // Arch Microbiol. 1990. V. 154. P. 23-30.

48. Dodonov A.E., Namestnikov Yu.G., Yakushova A.F. Neotectonics of southeastern part of the Baltic syncline. Moscow State Univ, Moscow. 1976.

49. Dunfield P.F., A. Yuryev., Senin P., Smirnova A.V., Stott M.B., Hou S., Ly B., Saw J.H., Zhou Z., Ren Y., Wang J., Mountain B.W., Crowe M.A., Weatherby T.M., Bodelier P.L.E., Liesack W., Feng L., Wang L., Alam M. Methane oxidation by an extremely acidophilic bacterium of the phylum Verrucomicrobia II Nature. 2007. V. 450. P. 879882.

50. Dunfield P.F., Khmelenina V.N., Suzina N.E., Trotsenko Y.A., Dedysh S.N. Methylocella silvestris sp. nov., a novel methanotrophic bacterium isolated from an acidic forest cambisol // Int J Syst Evol Microbiol. 2003. V. 53. P. 1231-1239.

51. Dunfield P.F., Yuryev A, Senin P. et al. Methane oxidation by an extremely acidophilic bacterium of the phylum Verrucomicrobia // Nature. 2007. V. 450. P. 879-883.

52. Dunnette D. A. Chemical ecology of hydrogen sulfide production in freshwater lake sediment. Ph.D. Dissertation, University of Michigan. 1973. 123 p.

53. Dworkin M., Foster J.M. Studies of Pseudomonas methanica (Soungen) // Bacteriol. 1956. V.72. P.646-659.

54. Elion L. A thermophilic sulphate-reducing bacterium // Zentralb Bakteriol II Abt. 1925. V. 63. P. 58-67.

55. Eller G., Känel L., Krüger M. Cooccurrence of aerobic and anaerobic methane oxidation in the water column of Lake Plußsee // Appl Environ Microbiol. 2005. V. 71. P. 8925-8928.

56. Elvert M., Suess E., Whiticar M.J. Anaerobic methane oxidation associated with marine gas hydrates: superlight C-isotopes from saturated and unsaturated C20 and C25 irregular isoprenoids //Naturwissenschaften. 1999. V. 86. P. 295-300.

57. Erkel C., Kube M., Reinhardt R., Liesack W. Genome of Rice Cluster I archaea - the key methane producers in the rice rhizosphere // Science. 2006. V. 313. P. 370-372.

58. Eschemann A., Kühl M., Cypionka H. Aerotaxis in Desulfovibrio // Environ. Microbiol. 1999. V. l.P. 489-494.

59. Eschemann A., Kühl M., Cypionka H. Aerotaxis in Desulfovibrio // Environmental Microbiology. 1999. V. 1. P. 489-494.

60. Ettwig K.F., van Alen T., van de Pas-Schoonen K.T., Jetten M.S.M., Strous M. Enrichment and molecular detection of denitrifying methanotrophic bacteria of the NC 10 phylum // Appl Environ Microbiol. 2009. V. 75. P. 3656-3662.

61. Ettwig K.F., Butler M.K., Le Paslier D., Pelletier E., Mangenot S., Kuypers M.M.M., et al. Nitrite-driven anaerobic methane oxidation by oxygenic bacteria // Nature. 2010. V. 464. P. 543-548.

62. Fardeau M.L., Ollivier B., Patel B.R.C., Dwivedi P., Ragot M., Garcia K.L. Isolation and characterization of a thermophilic sulfate-reducing bacterium Desulfotomaculum thermosopovorans sp. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1995. V. 45(2). P. 218-221.

63. Fiebig K., Gottschalk G. Metanogenesis from choline by a coculture of Desulfovibrio sp. and Metanosarcina barkeri II Appl. Environ. Microbiol. 1983. V. 45. P. 161-168.

64. Foster J.W., Davis R.H. Methane dependents coccus with notes on classification and nomenclature of obligate methane-utilizing bacteria // Bacteriol. 1966. V. 91. P. 1926-1931.

65. Franzmann P.D., Liu Y., Balkwill D.L., Aldrich H.C., Conway de Macario E., Boone D.R. Methanogenium frigidum sp. nov., a psychrophilic, H2-using methanogen from Ace Lake, Antartica // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. V. 47. P. 1068-1072.

66. Franzmann P.D., Springer N., Ludwig W., Conway de Macario E., Rohde M. A methanogenic archaeon from Ace Lake, Antarctica: Methanococcoides burtonii sp. nov. // System. Appl. Microbiol. 1992. V. 15. P. 573-581.

67. Glockner F.O., Amann R., Alfreider A., Pernthaler J., Psenner R., Trebesius K., Schleifer K.H. An in situ hybridization protocol for detection and identification of planctonic bacteria // Syst. Appl. Microbiol. 1996. V. 19. № 3. P. 403^106.

68. Hallam S.J., Girguis P.R., Preston C.M., Richardson P.M., DeLong E.F. Identification of methyl coenzyme M reductase A (mcrA) genes associated with methane-oxidizing archaea // Appl. Environ. Microbiol. 2003. V. 69. P. 5483-5491.

69. Hamilton W.A. Sulfate-reducing bacteria and anaerobic corrosion // Annu. Rev. Microbiol. 1985. V.39. P. 195-217.

70. Han J-I., Semrau J.D. Chloromethane stimulates growth of Methylomicrobium album BG8 on methanol // FEMS Microbiol Lett. 2000. V. 187. P. 77-81.

71. Hansen T.A. Carbon metabolism of sulfate-reducing bacteria. In: The sulfate-reducing bacteria: contemporary perspectives / Eds.: Odom J.M. Singleton R. New York: Springer-Verlag, 1993. P. 21-40.

72. HansonRS, HansonTE.Methanotrophic bacteria //Microbiol. Rev. 19%. V. 60. №2. P. 39-471.

73. Hardy J.A., Hamilton A. The oxygen tolerance of sulfate-reducing bacteria isolated from North Sea waters // Curr. Microbiol. 1981. V. 136. P. 1025-1030.

74. Harriss R.C., Gorham E., Sebacher D.I., Bartlett K.B., Flebbe P.A. Methane flux from northenpeatlands //Nature. 1985. V. 315. P. 652-654.

75. Hedderich R., Whitman W.B. Physiology and Biochemistry of the Methane-Producing Archaea // Prokaryotes. 2006. V. 2. P. 1050-1079.

76. HELCOM. Stakeholder Conference on the Baltic Sea Action Plan // Baltic Sea Environ. Proc. 2006. P. 34, 64.

77. Heyer B.Y., Berger U., Suckow R. Methanogenesis in different parts of a brackish water ecosystem // Limnologica. 1990. Bd. 20 (1). P. 135-139.

78. Hines M.E., Duddleston K.N., Rooney-Varga J.N., Fields D., Chanton J.P. Uncoupling of acetate degradation from methane formation in Alaskan wetlands: connections to vegetation distribution // Global Biogeochem. 2008. Cycle 22. P. 1029.

79. Hinrichs K.-U., Hayes J.M., Sylva S.P., Brewer P.G., DeLong E.F. Methane-consuming Archaebacteria in marine sediments // Nature. 1999. V. 398. P. 802-805.

80. Hinrichs K.U., Summons R.E., Orphan V., Sylva S.P., Hayes J.M. Molecular and isotopic analysis of anaerobic methane-oxidizing communities in marine sediments // Org Geochem. 2000. V. 31. P. 1685-1701.

81. Hoehler T.M., Alperin M.J., Albert D.B., Martens C.S. Field and laboratory studies of methane oxidation in an anoxic marine sediment-evidence for a methanogen-sulfate reducer consortium // Glob. Biogeochem. Cycle. 1994. V. 8 (4). P. 451—463.

82. Hristova K.R., Mau M., Zheng D., Aminov R.I., Mackie R.I., Gaskins H.R., Raskin L. Desulfotomaculum genus and subgenus specific 16S rRNA hybridization probes for environmental studies // Environ. Microbiol. 2000. V. 2. № 2. P. 143-159.

83. Hungate R.E. A roil tube method for cultivation of strict anaerobes. / In: Methods in microbiology // Ed. J.R. Norris a. D.W. Ribbons, N.Y., Acad. Press. 1969. V. 3b. 117 p.

84. Inoue H., Nojima H., Okayama H. High efficiency transformation of E. coli with plasmids // Gene. 1990. V. 26. P. 23-28.

85. Isaksen M.F., Teske A. Desulforhopalus vacuolatus gen nov., sp. nov., a new moderately psychrophilic sulfate-reducing bacterium with gas vacuoles isolated from a temperature estuary // Arch. Microbiol. 1996. V. 166. P. 160-168.

86. Ishii K., MuBmann M., MacGregor B.J., Amann R. Animproved fluorescence in situ hybridization protocol for the identification of bacteria and archaea in marine sediments // FEMS Microbial. Ecol. 2004. V. 50. P. 203-212.

87. Ishimoto N., Koyama J., Nagai Y. Biochemical studies on sulfate-reducing bacteria. IV. The cytochrome system of sulfate-reducing bacteria //J.BioLChem. 1954. V. 41. P. 763-770.

88. Islam T., Jensen S., Reigstad L.J., Larsen 0., Birkeland N-K. Methane oxidation at 55 1C and pH 2 by a thermoacidophilic bacterium belonging to the Verrucomicrobia phylum. P Natl Acad Sci USA. 2008. V.105. P. 300-304.

89. Ivanov M.V., Beljaev S.S., Laurinavichus K.S. Methods of quantitative investigation of microbiological production and utilization of methane // Proc. Intern. Sympos. Microbial Production and Utilization of Gases. Gottingen. 1976. P. 63-67.

90. Iversen N., J0rgensen B.B. Anaerobic methane oxidation rates at the sulfate-methane transition in marine sediments from Kattegat and Skagerrak (Denmark) // Limnol. Oceanogr. 1985. V. 30. P. 944-55.

91. Janssen P.H., Schink B. Catabolic and anabolic enzyme activities and energetics of acetone metabolism of the sulfate-reducing bacterium Desulfococcus biacutus II J. Bacteriol. 1995. V. 177. P. 277-282.

92. Jianga H., Chenb Y., Jianga P., Zhanga C., Smithc T.J., Murrellb J.C., Xinga X-H. Methanotrophs: Multifunctional bacteria with promising applications in environmental bioengineering // Biochemical Engineering Journal. 2010. V. 49. P. 277-288.

93. Jones W.J., Leigh J.A., Mayer F., Woese C.R., Wolfe R.S. Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent II Arch. Microbiol. 1983. V. 136. P. 254-261.

94. Jorgensen B.B. Mineralization of organic matter in the sea bed - the role of sulfate reduction // Nature. 1982. V. 296. P. 643-645.

95. Jorgensen B.B. The sulfur cycle of a coastal marine sediment (Limfjorden, Denmark) // Limnol. and Oceanogr. 1977. Vol. 22. N 5. P. 814-832.

96. J0rgensen B.B., Kuenen J.G., Cohen Y. Microbial transformation of sulfur compounds in a stratified lake (Solar Lake, Sinai) // Limnol. and Oceanogr. 1979. V. 24. №5. P. 799-822.

97. Joye S.B., Boetius A., Orcutt B.N., Montoya J.P., Schulz H.N. et al. Theanaerobic oxidation of methane and sulfate reduction in sediments from Gulf of Mexico cold seeps // Chem. Geol. 2004. V. 205. P. 219-38.

98. Judd A., Hovland M. Seabed fluid flow. The impact on Geology, Biology and the Marine Environment. Cambridge: Cambridge University Press. 2007. P. 475.

99. Juottonen H., Galand P.E., Yrjälä K. Detection of methanogenic Archaea in peat: comparison of PCR primers targeting the mcrA gene // Research in Microbiology. 2006. V. 157. P. 914-921.

100. Kaiser D.E., Klauser L., Wehrli B., Schubert C. Evidence of intense archaeal and bacterial methanotrophic activity in the Black Sea water column // Appl. Environ. Microbiol. 2005. V. 71. № 12. P. 8099-8106.

101. Kalyuzhnaya M., Khmelenina V., Eshinimaev B., Suzina N., Nikitin D., Solonin A., Lin J-L., McDonald I., Murrell C., Trotsenko Y. Taxonomic characterization of new alkaliphilic and alkalitolerant methanotrophs from soda lakes of the Southeastern Transbaikal region and description of Methylomicrobium buryatense sp. nov. // Syst. Appl. Microbiol. 2001. V. 24. P. 166-176.

102. Kalyuzhnaya M.G., Khmelenina V.N., Kotelnikova S., Holmquist L., Pedersen K., Trotsenko Y.A. Methylomonas scandinivica sp. nov., a new methanotrophic psychrotrophic bacterium isolated from deep igneous rock ground water of Sweden // Syst Appl Microbiol. 1999. V. 22. P. 565-572.

103. Karnachuk O.V., Sasaki K., Gerasimchuk A.L., Sukhanova O., Ivasenko D.A., Kaksonen A.H., Puhakka J.A., Tuovinen O.H. Precipitation of Cu-sulfides by copper-tolerant Desulfovibrio isolates // Geomicrobiol. 2008. V. 25. № 5. P. 219-227.

104. Kaserer H. Uber die Oxidation des Methane durch Microorganismes // Ztsch. Landw. Versuchsw. In Osterreich. 1905. V. 8. P. 789-792.

105. Kent H.M., Buck M., Evans D.J. Cloning and sequencing of the nifH gene of Desulfovibrio gigas II FEMS Microbiol. Lett. 1989. V. 61. P. 73-78.

106. Khmelenina V.N., Kalyuzhnaya M.G., Sakharovsky V.G., Suzina N.E., Trotsenko Y.A., Gottschalk G. Osmoadaptation in halophilic and alkaliphilic methanotrophs // ArchMicrobiol. 1999. V. 172. P. 321-329.

107. Kiene R.P. Production and consumption of methane in aquatic systems // In J.E. Rogers and W.B. Whitman [eds.], Microbial production and consumption of greenhouse gases: methane, nitrogen oxides and halomethanes / Am. Soc. Microbiol. 1991. P. 111-146.

108. Kiener A., Leisinger T. Oxygen's sensitivity of methanogenic bacteria // Syst. Appl. Microbiol. 1983. V. 4. № 3. P. 305-312.

109. Kluyver A.I., van Niel C. Prospects for a natural system of classification of bacteria // Cbl. Bacteriol. 1936. Abt. II. Bd. 94.

110. Knab N.J., Dale A.W., Lettmann K., Fossing H., Jorgensen B.B. Thermodynamic and kinetic control on anaerobic oxidation of methane in marine sediments // Geochim. Cosmochim. Acta. 2008. V. 72. P. 3746-57.

111. Knittel K., Boetius A. Anaerobic Methane Oxidizers. In Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology. KJsf. Timmis (ed.). Berlin Heidelberg: Springer-Verlag, 2010. P. 2024-2030.

112. Knittel K., Boetius A. Anaerobic Oxidation of Methane: Progress with an Unknown Process // Annu. Rev. Microbiol. 2009. V. 63. P. 311-334.

113. Knittel K., Losekann T., Boetius A., Kort R., Amann R. Diversity and distribution of methanotrophic archaea at cold seeps // Appl. Environ. Microbiol. 2005. V.71. P. 467-479.

114. Kolmert A., Johnson D.B. Remediation of acidic waste waters using immobilized, acidophilic sulfate-reducing bacteria // J. Chan. Technol. BiotechnoL 2001. V. 76. P. 836-843.

115. Kowalchuk G.A., Stephen J.R., De Boer W., Prosser J.I., Embley T.M., Woldendorp J.W. Analysis of ammonia-oxidizing bacteria of the beta subdivision of the class Proteobacteria in coastal sand dunes by denaturing gradient gel electrophoresis and sequencing of PCR-amplified 16S ribosomal DNA fragments // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V. 63. №. 4. P. 1489-1497.

116. Kurr M., Huber R., Knig H., Jannasch H.W., Fricke H., Trincone J.K., Kristjansson, Stetter K.O. Methanopyrus kandleri, gen. and sp. nov. represents a novel group of hyperthermophilic methanogens, growing at 110 °C //Arch. Microbiol 1991. V. 156. P. 239-247.

117. Lamontagne R.A., Swinnerton J.W., Linnenbom V.J. Methane concentrations in various marine environments // J. Geophys. Res. 1973. V. 78. P. 5317-5324.

118. Lawrence A.J., Quayle J.R. Alternative carbon assimilation pathways in methane-utilizing bacteria // J. Gen. Microbiol. 1970. V. 63. P. 371-374.

119. Lehman R.M., Roberto F.F., Earley D, Bmhn DP, Brink SE, QConnell SP, Dehviche ME, Cohvell F.S. Attached and unattached bacterial communities in a 120-meter corehole in an acidic, crystalline rock aquifer // Appl Environ Microbiol. 2001. V. 67. R 2095-2106.

120. Lein A. Anaerobic consumption of organic matter in modern marine sediments // Nature. 1984. V. 312. P. 148-150.

121. Lein A., Pimenov N., Guillou C., Martin J.-M., Lancelot C., Rusanov I., Yusupov S., Miller Yu., Ivanov M. Seasonal dynamic of the sulphate reduction rate on the northwestern Black sea shelf// Estuarine, Coastal and Shelf Science. 2002. V. 54. P. 385-401.

122. Lein A.Yu., Namsaraev B.B., Trotsyuk V.Ya., Ivanov M.V. Bacterial metanogenesis in holocen sediments of the Baltic Sea // Geomicrobiol. J. 1981. V. 2. № 4. P. 299-317.

123. Lelieveld J., Crutzem P.J., C. Bruhl. Climate effects of atmospheric methane // Chemosphere. 1993. V. 26. P. 739-768.

124. Lipmann F. Biological sulfate activation and transfer // Science. 1958. V. 128. P. 575-580.

125. Lipscomb J. Biochemistry of the soluble methane monoxygeanse // Ann. Rev. Microbiol. 1994. V. 48. P. 371-399.

126. Losekann T., Knittel K., Nadalig T., Fuchs B., Niemann H., et al. Diversity and abundance of aerobic and anaerobic methane oxidizers at the Haakon Mosby Mud Volcano, Barents Sea // Appl. Environ. Microbiol. 2007. V. 73. P. 3348-3362.

127. Loy A. PhD thesis. University of Munich. DNA Microarray Technology for Biodiversity Inventories of Sulfate-Reducing Prokaryotes. 2003. 141 p.

128. Lticker S., Steger D., Kjeldsen K.U., MacGregor B.J., Wagner M., Loy A. Improved 16S rRNA targeted probe set for analysis of sulfatereducing bacteria by fluorescence in situ hybridization // J. Microbiol. Methods. 2007. V. 69. № 3. P. 523-528.

129. Manz W., Eisenbrecher M., Neu T.R., Szewzyk U. Abundance and spatial organization of Gram-negative sulfate-reducing bacteria in activated sludge investigated by in situ probing with specific 16S rRNA targeted oligonucleotides // FEMS Microbiol. Ecol. 1998. V. 25. P. 43-61.

130. Marmur J. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms // J. Mol. Biol. 1961. V. 3. P. 208-218.

131. Martens C.S., Albert D.B., Alperin M.J. Stable isotope tracing of anaerobic methane oxidation in the gassy sediment of Ekernford Bay, German Baltic sea // Am. J. Sci. 1999. V. 299. P. 589-610.

132. Martens C.S., Berner R.A. Methane production in the interstitial waters of sulfate-depleted marine sediments // Science. 1974. V. 185. P. 1167-1169.

133. Michaelis W., Seifert P., Nauhaus K., Treude T., Thiel V., et al. Microbial reefs in the Black Sea fuelled by anaerobic oxidation of methane // Science. 2002. V. 297. P. 1013-1015.

134. Moran J.J., Beal E.J., Vrentas J.M., Orphan V.J., Freeman K.H., House C.H. Methyl sulfides as intermediates in the anaerobic oxidation of methane // Environ. Microbiol. 2008. V. 10 (1). P. 162-173.

135. Munz E. Zur Physiologie den Methanbakterien. (Physiology of methane bacteria) Thesis, Friedrichs-Universitat, Halle. 1915. P. 1-61.

136. Musat F., Galushko A., Jacob J., Widdel F., Kube M., Reinhardt R., Wilkes H., Schink B., Rabus R. Anaerobic degradation of naphthalene and 2- methylnaphthalene by strains of marine sulfat-reducing bacteria // Environ Microbiol. 2009. V. 11. № 1. P. 209-219.

137. Nakagawa T., Nakagawa S., Inagaki F., Takai K., Horikoshi K. Phylogenetic diversity of sulfate-reducing prokaryotes in active deep-sea hydrothermal vent chimney structures // FEMS Microbiol. Lett. 2004. V. 232. P. 145-152.

138. Nauhaus K., Albrecht M., Elvert M., Boetius A., Widdel F. In vitro cell growth of marine archaeal-bacterial consortia during anaerobic oxidation of methane with sulfate // Environ. Microbiol. 2007. V. 9. P. 187-196.

139. Nedwell D.B. The input and mineralization of organic carbon in anaerobic aquatic sediments // Advances in Microbial Ecology. N. Y.: Plenum Press, 1984. V. 7. P. 93-132.

140. Niemann H., Duarte J., Hensen C., Omoregie E., Magalhaes V.H., et al. 2006a. Microbial methane turnover at mud volcanoes of the Gulf of Cadiz // Geochim. Cosmochim. Acta. V. 70.P. 5336-5355.

141. Niemann H., Losekann T., DeBeer D., Elvert M., Nadalig T., et al. Novel microbial communities of the Haakon Mosby mud volcano and their role as a methane sink // Nature. 2006.V. 443. P. 854-858.

142. Ollivier B., R. Cord-Ruwisch, Hatchikian E.C., Garcia J.L. Characterization of Desulfovibrio fructosovorans sp. nov// Arch. Microbiol. 1988. V. 149. P. 447-450.

143. Omoregie E.O., Mastalerz V., de Lange G., Straub K.L., Kappler A., et al. Biogeochemistry and community composition of iron- and sulfur-precipitating microbial mats at the Chefren Mud volcano (Nile Deep Sea Fan, Eastern Mediterranean) // Appl. Environ. Microbiol. 2008. V. 74. P. 3198-3215.

144. Oremland R.S. Methanogenic activity in plankton samples and fish intestines: A mechanism for in situ methanogenesis in oceanic surface waters // Limnol. Oceanogr. 1979. V. 24. P. 1136-1141.

145. Oremland R.S. The biogeochemistry of methanogenic bacteria // In A.J.B. Zehnder (ed.). Biology of anaerobic microorganisms, John Wiley & Sons. 1988. P. 641-705.

146. Oremland R.S., Marsh L., DesMarais D.J. Methanogenesis in Big Soda Lake Nevada: an alkaline, moderately hypersaline desert lake // Applied and Environmental Microbiology. 1982. V. 43. P. 462-463.

147. Orphan V.J, House C.H, Hinrichs K-U, McKeegan K.D, DeLong E.F. Methane-consuming archaea revealed by directly coupled isotopic and phylogenetic analysis // Science. 2001. V. 293. P. 484-87.

148. Orphan V.J., House C.H., Hinrichs K-U., McKeegan K.D., DeLong E.F. Multiple archaeal groups mediate methane oxidation in anoxic cold seep sediments // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002. V. 99. P.7663-7668.

149. Pancost R.D., Damstre J.S.S., de Lint S., van der Maarel M.J.E.C., Gottschal J.C. Biomarker evidence for widespread anaerobic methane oxidation in Mediterranean sediments by a consortium of methanogenic archaea and bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V. 66. P. 1126-1132.

150. Panganiban A.T., Patt T.E., Hard W., Hanson R.S. Oxidation of methane in the absence of oxygen in lake water samples // Appl. Envir. Microbiol. 1979. V. 37. P. 303-309.

151. Parkes R.J., Cragg B.A., Banning N., Brock F., Webster G., et al. Biogeochemistry and biodiversity of methane cycling in subsurface marine sediments (Skagerrak, Denmark) // Environ. Microbiol. 2007. V. 9. P. 1146-1161.

152. Pernthaler A., Pernthaler J., Amann R. Fluorescence in situ hybridization and catalyzed reporter deposition for the identification of marine bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V. 68. № 6. P. 3094-3101.

153. Pfennig N., WiddelF. The bacteria of the sulfur cycle // Phil. Trans. R. Soc. 1982. P. 433441.

154. Pfennig N., Widdel F., Triiper H.G. The dissimilatory sulfur-reducing bacteria. M.P. Starr, H. Stolp, H. G. Triiper, A. Balows, H. G. Schlegel. The Prokaryotes. Springer. Berlin. 1981. l.P. 926-940.

155. Pimenov N.V., Sawichev A., Rusanov I., Lein A, Ivanov M. Microbial processes of carbon cycle as the base of the food chain of Haakon Mosby mud volcano benthic community // Geo-Mar. Lett. 1999. Vol. 19. P. 89-96.

156. Plugge C.M., Zhang W., Scholten J-C.M., Stams A-J.M. Metabolic flexibility of sulfate-reducing bacteria // Frontiers in microbiology. Microbial Physiology and Metabolism. 2011. V. 2. P. 1-8.

157. Pol A., Heijmans K., Harhangi H.R., Tedesco D., Jetten M.S.M., Op den Camp H.J.M. Methanotrophy below pH 1 by a new Verrucomicrobia species // Nature. 2007. V. 450. P. 874-878.

158. Postgate J.A. Cytochrome c3 and Desulphoviridin; Pigments of the anaerobe Desulphovibrio desulphuricans // J. Gen. Microbiol. 1956. V. 14. P. 545-572.

159. Postgate J.R. The sulphate-reducing bacteria. Great Britain: Cambridge University Press, 1984. 200 p.

160. Postgate J.R., Kent H.M., Robson R.L. DNA from diazotrophic Desulfovibrio strains is homologous to Klebsiella pneumoniae structural nif DNA and can be chromosomal or plasmid-borne // FEMS Microbiol. Lett. 1986. V. 33.P. 159-163.

161. Pustelnikovas O. The geochemistry of sediments of the Curonian Lagoon (Baltic Sea). Vilnius, 1998. 236 p.

162. Rabus R., Hansen T.A., Widdel F. Dissimilatory Sulfate- and Sulfur-Reducing Procaryotes // In: M. Dworkin, S. Falkow, E. Rosenberg, K.-H. Schleifer, E. Stackebrandt (Eds). The Prokaryotes. 3rd ed. Springer. New York. 2006. V. 2. P. 659-768.

163. Raghoebarsing A.A., Pol A., van de Pas-Schoonen K.T., Smolders A.J.P., Ettwig K.F., Rijpstra W.I.C., Schouten S., Damste J.S.S., Op den Camp H.J.M., Jetten M.S.M., Strous M. A microbial consortium couples anaerobic methane oxidation to denitrification // Nature. 2006. V. 440 (7086). P. 918-921.

164. Raskin L., Stromely J.M., Rittmann B.E., Stahl D.A. Group-specific 16S ribosomal-RNA hybridization probes to describe natural communities of methanogens // Appl. Environ. Microbiol. 1994. V. 60. P. 1232-1240.

165. Ravenschlag K., Sahm K., Knoblauch Ch., J0rgensen B.B., Amann R. Community structure, cellular rRNA content, and activity of sulfate-reducing bacteria in marine arctic sediments // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V. 66. P. 3592-3602.

166. Reeburgh W.S. Oceanic methane biogeochemistry // Chem. Rev. 2007. 107:486-513.

167. Reeburgh W.S., Alperin M.J. Field observations of anaerobic methane oxidation. /193rd ACS National Meeting // Division of Geochemistry. Denver, Colorado. 1987. № 44.

168. Reeburgh W.S., Heggie D.T. Depth distribution of gases in shallow water sediments. /In: Natural gases in marine sediments // (Kaplan, ed.), New Yak Plenum Press, 1975. P. 27-32.

169. Reitner J., Peckmann J., Blumenberg M., Michaelis W., Reimer A., Thiel V. Concretionary methaneseep carbonates and associated microbial communities in Black Sea sediments // Palaegeogr. Paleoclimatol. Paleoecol. 2005. V. 227. P. 18-30.

170. Rochelle P.A., Ery J.C., Parkers R.J., Weightman A.J. DNA extraction for 16S rRNA gene analysis to determine genetic diversity in deep sediment communities // FEMS Microbiol. Lett. 1992. V.100. P. 59-66.

171. Romanovskaya V.A., Lyudvichenko E.S., Kryshtab T.P., Zhukov V.G., Sokolov I.G., Malashenko Yu.R. Role of exogenous carbon dioxide in metabolism of methane-oxidizing bacteria // Microbiologiya. 1980. V. 49. P. 687-693 (Engl. Transl., P. 566-571).

172. Rosnes J.T., Torsvik T., Lien T. Spore-forming thermophilic sulfate-reducing bacteria isolated from North Sea oil field waters // Appl Environ Microbio. 1991. V. 157. P. 2302-2307.

173. Rubentschik L. 1928. Uer Sulfatreduktion durch Baterien bei Zellulosegrungsprodukten als Energiequelle // Zentralbaltt fur Bakteriologie, Parasitenkunde und Infektionkrankheiten. V. 73. P. 483-496.

174. Sakai S., Imachi H., Hanada S., Ohashi A., Harada H., Kamagata Y. Methanocella paludicola gen. nov., sp. nov., a methane-producing archaeon, the first isolate of the lineage 'Rice Cluster I', and proposal of the new archaeal order Methanocellales ord. nov. // Int J Syst Evol Microbiol. 2008. V. 58. P. 929-936.

175. Sangwan P., Kovac S., Davis K.E.R., Sait M., Janssen P.H. Detection and cultivation of soil Verrucomicrobia // Appl. Environ. Microb. 2005. V. 71. P. 8402-8410.

176. Scheid D, Stubner S. Structure and diversity of Gram-negative sulfate-reducing bacteria on rice roots // FEMS Microbiol. Ecol. 2001. V. 36. P. 175-183.

177. Schouten S., Wakeham S.G., Sinninghe Damste J.S. Evidece for anaerobic methane by archaea in euxinic waters of Black Sea// Organic Geochem. 2001. V. 32. P. 1277-1281.

178. Shishkina V.N., Trotsenko Y.A. The levels of carbon dioxide assimilation by methanotrophic bacteria // Mikrobiologiya. 1986. V. 55. P. 377-382.

179. Sivan O., Schrag D.P., Murray R.W. Rates of methanogenesis and methanotrophy in deep-sea sediments // Geobiology. 2007. V. 5. P. 141-151.

180. Smemo К.A., Yavitt J.B. Evidence for Anaerobic CH4 Oxidation in Freshwater Peatlands // Geomicrobiology Journal. 2007. V. 24. P. 583-597.

181. Smith T.J., Murrell J.C. Methanotrophs. In: Encyclopaedia of Industrial Biotechnology, Bioprocess, Bioseparation and Cell Technology M Flickinger, (ed.). Wiley, 2010. P. 1-13.

182. Söderberg P., Floden T. Gas seepages, gas eruption and degassing structures in the seafloor along the Strömma tectonic linea ment in the crystalline Stockholm Archipelago, east Sweden // Contin. Shelf. Res. 1992. № 12. P. 1157-1171.

183. Söhngen N.L. Sur le role du methane dans la vie organique, 1910. Цитировано по Г.А. Заварзину. Литотрофные микроорганизмы // M., Наука, 1972. 323 с.

184. Söhngen N.L. Uber Bacteria welche Methan als Kohlenstoffnahrung und Energiequelle gebrauchen // Zentr. Bakteriol. Parasitenk. 1906. Abt. II. Bd. V. 15. s. 513-517.

185. Sorokin D.Y, Jones B.E., Kuenen J.G. An obligate methylotrophic, methane-oxidizing Methylomicrobium species from a highly alkaline environment // Extremophiles. 2000. V.4.P. 145-155.

186. SorokinY.I. Radioisotopic mrthods in hydrobiology / Verlag Berlin Heidelberg New York: Springer, 1999. 321 p.

187. Stahl A.L., Puzzanchera C., Livsey S., Finnegan Т. A., Tierney N., Snyder H.N. Juvenile Court Statistics 2003-2004. Washington, D.C.: U.S. Department of Justice, Office of Justice Programs, Office of Juvenile Justice and Delinquency Prevention. 2007.

188. Stahl D.A., Amann R.I., Poulsen L.K., Raskin L., Capman W.C. Use of fluorescent probes for determinative microscopy of methanogenic Archaea // Archaea: methanogens a laboratory manual / Eds. Sowers K.R., Schreier H.J. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1995. P. 111-121.

189. Steinberg L.M., Regan J.M. mcrA-Targeted Real-Time Quantitative PCR Method To Examine Methanogen Communities // Appl. Environ. Microbiol. 2009. V. 75. P. 4435-4442.

190. Strom Т., Ferency Т., Quayle J.R. The carbon assimilation pathway of Methylococcus capsulatus, Pseudomonas methanica and Methylosinus trichosporium (OB3b) // Biochem. J. 1974. V. 144. P. 465-476.

191. Strous M., Jetten M.S.M. Anaerobic oxidation of methane and ammonium // Annu. Rev. Microbiol. 2004. V. 58. P. 99-117.

192. Taupp M., Constan L., Hallam S.J. The Biochemistry of Anaerobic Methane Oxidation. In Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology K.N. Timmis (ed.). Berlin Heidelberg: Springer-Verlag, 2010. P. 890-905.

193. Teaske A., Hinrichs K., Edgcomb V., Comez A., Kysela D., Sylva S.P., Sogin M.L., Jannasch H.W. Microbial diversity of hydrothermal sediments in the Guaymas Basin: evidence for anaerobic methanotrophic communities // Appl. Environ. Microbiolol. 2002. V. 68. №4. P. 1994-2007.

194. Thauer R.K., Kaster A.K., Goenrich M., Schick M., Hiromoto T., Shima S. Hydrogenases from methanogenic archaea, nickel, a novel cofactor, and H2 storage // Annu Rev Biochem. 2010. V. 79. P. 507-536.

195. Thauer R.K., Shima S. Methane as fuel for anaerobic microorganisms // Ann NY Acad Sci. 2008. V. 1125. P. 158-170.

196. Tolokonnikova L.I. Rate of sulphate reduction in the Azov Sea // Microbiologiya. 1977. V. 46. P. 352-357.

197. Treude T., Kriiger M., Boetius A., J0rgensen B.B. Environmental control on anaerobic oxidation of methan in the gassy sediments of Eckernforde Bay (German Baltic) // Limnol. Oceonogr. 2005. V. 50. P. 1771-1786.

198. Treude T., Orphan V., Knittel K., Gieseke A., House C., Boetius A. Consumption of methane and C02 by methanotrophic microbial mats from gas seeps of the anoxic Black Sea // Appl. Environ. Microbiol. 2007. V. 73. P. 2271-2283.

199. Triiper H.G., Schlegel H.G. Sulfur metabolism in Thiorhodaceae. I. Quantitative measurements in growing cells of Cromatium okenii II Antonie van Leeuwenhoek. J. Microbiol. Serol. 1964. V. 30. P. 225-238.

200. Tsubota J., Eshinimaev B.T., Khmelenina V.N., Trotsenko Y.A. Methylothermus thermalis gen. nov., sp. nov. - a novel moderately thermophilic obligate methanotroph from a hot spring in Japan // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005. V. 55. P. 1877-1884.

201. Ulyanova M., Sivkov V., Kanapatskij T., Sigalevich P., Pimenov N. Methane fluxes in the southeastern Baltic Sea // Geo-Mar. Lett. 2012. V. 32. Issue 5-6. P. 535-544.

202. Valentine D.L., Reeburgh W.S. Newperspectives on anaerobic methane oxidation // Environ. Microbiol. 2000. V. 2 (5). P. 477-484.

203. Van Delden A., Beitrag zur Kenntnis der Sulfatreduktion durch Bakterien // Zbl. Bakt. II. Abt.ll. 1904. P. 81, 113.

204. Videla H.A. An overview of mechanisms by which sulphate-reducing bacteria influence corrosion of steel in marine environments // Biofouling. 2000. V. 15. P. 37-47.

205. Wallner G., Amann R., Beisker W. Optimizing fluorescent in situ hybridization with ribosomal RNA targeted oligonucleotide probes for flow cytometric identification of microorganisms // Cytometry. 1993. V. 14. P. 136-143.

206. Warmihg E. Om nogle ved Danmarks Kyster levende bacterier. Vidensk Möddel, fra der naturhistor. Forening i Kjobenhavn. 1876. 183 p.

207. Werner F. Depressions in mud sediments (Ekernforde Bay, Baltic Sea), related to sub-bottom and currents // Meyniana. 1978. № 30. P. 99-104.

208. Whiticar M.J., Werner F. Pockmarks: submarine vents of natural gas or freshwater seep? // Geo-Marine Lett. 1981. № 1. P. 193-199.

209. Whitman W., Bowen T., Boone D. The methanogenic bacteria. In The Prokaryotes, 3rd edn. M Dworkin, S Falkow, E Rosenberg, K-H Schleifer, E Stackebrandt (eds.), New York: Springer-Verlag, 2006. P. 165-207.

210. Whitman W.B., Boone D.R., Koga Y., Keswani J. Taxonomy of methanogenic archaea. In Bergey's Mannual of Systematic Bacteriology, 2nd edn. D.R. Boone, R.W. Castenholtz, G.M. Garrity (eds.). New York: Springer-Verlag. 2001.

211. Whittenbury R., Colby H., Dalton H., Reed H. Biology and ecology of methane oxidizers // Proc. Symp. «Microbial production and utilization of gases». Gottingen. 1976. P. 281292.

212. Widdel F., Boetius A., Rabus R. Anaerobic biodégradation of hydrocarbons including methane. In The Prokaiyotes, ed. M Dworkin, S Falkow, E Rosenberg, K-H Schleifer, E Stackebrandt, New York: Springer-Verlag, 2006. P. 1028^9.

213. Widdel F., Bäk F. Gram-negative mesophilic sulfate-reducing bacteria, In K.-H. Schleifer (ed.), The prokaryotes. New York, N.Y.: Springer-Verlag, 1992. P. 3352-3378.

214. Widdel F., Pfenning N. Studies of dissimilatory sulfate-reducing bacteria that decompose fatty acids. I. Isolation of new sulfate-reducing bacteria enriched with acetate from saline environments. Description of Desulfobacter Postgatei gen. nov., sp. nov. // Arch. Microbiol. 1981. V. 129. P. 395-400.

215. Woese C.R., Fox G.E. Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms, Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1977. V. 74. P. 5088-5090.

216. Wolin M.J., Miller. Т. L. Bioconversion of organic carbon to CH4 and C02 11 Geomicrobial J. 1987. V. 5. P. 239-259.

217. Zehnder A., Huser В., Brock Т., Nuhrmann K. Characterization of an acetate-decarboxylating, non-hydrogen-oxiding methane bacterium //Arch.Microbiol. 1980. V.124.P.1.

218. Zehnder A.J.B., Brock T.D. Anaerobic methane oxidation: occurrence and ecology // Appl. Environ. Microbiol. 1980. V. 39. P. 194-204.

219. Zehnder A.J.B., Brock T.D. Methane formation and methane oxidation by methanogenic bacteria // J. Bacteriol. 1979. V.137. № 1. P. 420-432.

220. Zhilina T.N., Zavarzin G.A., Rainey F.A., Pikuta E.V., Osipov G.A., Kostrikina N.A. Desulfonatrovihrio hydrogenovorans gen. nov., sp. nov., an alkaliphilic sulfate-reducing bacterium // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. V. 47. P. 144-149.

221. Zhilina, T.N., Zavarzin G.A. Methanohalobium evestigatus, gen. nov. sp. nov., the extremely halophilic methanogenic archaebacterium. Dokl. Akad. Nauk. SSSR. 1987. V. 293. P. 464-468.

222. Атлас геологических и эколого-геологических карт Российского сектора Балтийского моря / Гл. ред.О.В. Петров. СПб.: Изд-во ВСЕГЕИ, 2010. 78 с.

223. Баас-Бекинг JI.T.M., Каплан И.Ф., Мур Д. Пределы колебаний рН и окислительно-восстановительных потенциалов природных сред. В кн.: Геохимия литогенеза. М.: Изд-во иностр. лит., 1963. С. 11-84.

224. Беляев С.С., Лауринавичус К.С., Иванов М.В. Определение интенсивности процесса микробиологического окисления метана с использованием ИСН4 // Микробиология. 1975. Т. 44. № 3. С. 542-545.

225. Блажчишин А.И., Ланге Д., Свинаренко В.К., Троцюк В.Я. Газотурбированные осадки Балтийского моря // Литология и полезные ископаемые. 1987. №5. С. 126-132.

226. Богданова В.Е. Физиологические свойства микроорганизмов, выделенных в атмосфере метана и пропана // Микробиология. 1966. Т. 35. С. 234-239.

227. Большаков A.M., Егоров А.В. Об использовании методики фазово-равновесной дегазации при газометрических исследованиях. // Океанология. 1987. Т. 27. Вып. 5. С. 861-862.

228. Вайнпггейн М.Б., Готова Г.И. Влияние окислительно-восстановительного потенциала на образование сероводорода сульфатредуцирующими бактериями // Микробиология. 1987. Т. 56. С. 31-35.

229. Волков И.И. Тр. Ин-та океанологии АН СССР. 1961. Т. 50. С. 29-67.

230. Гальченко В.Ф. Использование силикагеля для выделения чистых культур метанокисляющих микроорганизмов // Прикл. биохим. микроб. 1975. Т. 11. С. 447-450.

231. Гальченко В.Ф. Метанотрофные бактерии водных экосистем: Дисс. док. биол. наук; М., 1989. 380 с.

232. Гальченко В.Ф. Метанотрофные бактерии. М.: ГЕОС, 2001. 500 с.

233. Гальченко В.Ф. Новые виды метанотрофный бактерий // Тезисы докл. междунар. сипмоз. Рост микроорганизмов на С1-соединених. Пущино:Изд.НЦБИ, 1977. С. 10-12.

234. Гальченко В.Ф. Сульфатредукция, метанобразование и метанокисление в различных водоемах оазиса Бангер Хиллс, Антарктида // Микробиология. 1994. Т. 63. №4. С. 388-396.

235. Гальченко В.Ф., Абрамочкина Ф.Н., Безрукова JI.B., Соколова E.H., Иванов М.В. Видовой состав аэробной метанотрофной микрофлоры Черного моря // Микробиология. 1988а. Т. 57. С. 305-311.

236. Гальченко В.Ф., Андреев JI.B., Троценко Ю.А. Таксономия и идентификация облигатных метанотрофных бактерий / Пущино.: Изд. НЦБИ, 1986а. 96 с.

237. Гальченко В.Ф., Горлатов С.Н., Токарев В.Г. Микробиологическое окисление метана в осадках Берингова моря // Микробиология. 19866. Т. 55. С. 669-673.

238. Гальченко В.Ф., Пименов Н.В. Метанотрофные симбионты морских животных // Труды Института микробиологии им. С.Н. Виноградского. К 100-летию открытия метанотрофии / Ред. Гальченко В.Ф., М.: Наука, 2006. С. 225-262.

239. Гальченко В.Ф., Шишкина В.Н., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А. Выделение чистых культур метанотрофов и их свойства // Микробиология. 1977. Т. 44. С. 844-850.

240. Геоакустические и газо-литогеохимические исследования в Балтийском море. Геологические особенности районов разгрузки флюидных потоков / Под ред. Геодекяна A.A., Троцюка В.Я., Блажчишина А.И. М.: ИО АН СССР, 1990. 164 с.

241. Геодекян A.A., Берлин Ю.М., Большаков A.M., Троцюк В.Я. Особенности распределения метана в осадках и придонной воде Южной Балтики // Океанология. 1991. Т. 31. № 1.С. 76-83.

242. Геодекян A.A., Троцюк В.Я., Авилов В.И., Берлин Ю.М., Большаков A.M., Житинец Р.П. Углеводородные газы в водах Балтийского моря // Океанология. 1979. Т. 19. №4. С. 638-643.

243. Геохимия вод и донных осадков Балтийского моря в районах развития газовых кратеров и геоакустических аномалий / Под ред. Геодекяна A.A., Романкевича Е.А., Троцюка В .Я. М.: ИО РАН, 1997. 150 с.

244. Геохимия осадочного процесса в Балтийском море / Под ред. Емельянова Е.М., Лукашина В.Н. М.: Наука, 1986. 221 с.

245. Гоготова Г.И., Вайнштейн М.Б. Темновое окисление тиосульфата пурпурными серными бактериями Ectothiorhodospira shaposhnikovii // Микробиология. 1981. Т. 50 (6). С. 960-963.

246. Горленко В.М. Экология водных микроорганизмов / В.М. Горленко, Г.А. Дубинина, С.И. Кузнецов. М.: Наука, 1977. - 288 с.

247. Дзюбан А.Н., Крылова И.Н., Кузнецова И.А. Особенности распределения бактерий и газовый режим в водной толще Балтийского моря в зимний период // Океанология. 1999. Т. 39. № 3. С. 383-386.

248. Дзюбан А.Н., Кузнецова И.А., Пименов Н.В. Микробиологические процессы деструкции органического вещества в донных осадках Балтийского моря // Океанология. 2001. Т. 41. № 2. С. 217-223.

249. Жилина Т.Н., Заварзин Г.А. Образование метана при низкой температуре чистой культурой метаносарцины // ДАН СССР. 317. С. 1242-1245.

250. Заварзин Г.А. Микробный цикл метана в холодных условия // Природа. 1995. №6. С. 3-14.

251. Заварзин Г.А. Эмиссия метана с территории России // Микробиология. 1997. Т. 66. С. 669-673.

252. Заварзин Г.А., Васильева Л.В. Цикл метана на территории России // Глобальные изменения природной среды и климата: Избр. науч. тр. по проблеме "Глобальная эволюция биосферы. Антропогенный вклад". Отд. вып.: Круговорот углерода на территории России / Моск. фил. ГНИЦ прогнозирования и предупреждения геоэкол. и техноген. катастроф при КубанГУ. М.: Б.и., 1999. С. 202-230.

253. Заварзин Г.А., Колотилова H.H. Введение в природоведческую микробиологию. -М.: Книжный дом «Университет», 2001. - 256 с.

254. Зелинский Н.Д., Брусиловский Е.М. О сероводородном брожении в Черном море и одесских лиманах.- Южнорусская мед. газета, № 18-19. 1893.

255. Иванов М.В. Глобальный биогеохимический цикл серы и влияние на него деятельности человека / Отв. Ред. Дж.Р. Френей. М.: Наука, 1983. 422 с.

256. Иванов M.B. Применение изотопов для изучения интенсивности процесса редукции сульфатов в озере Беловодь // Микробиология. 1956. Т. 25. №3. С. 305-309.

257. Иванов М.В. Роль микробиологических процессов в генезисе месторождений самородной серы. М.: Наука, 1964. 354 с.

258. Иванов М.В., Беляев С.С., Лауринавичус К.С., Образцова А.Я., Горлатов С.Н. Распространение и геохимическая деятельность микроорганизмов в заводняемом нефтяном месторождении // Микробиология. 1982. Т. 51. № 2. С. 336-341.

259. Иванов М.В., Леин А.Ю., Гальченко В.Ф. Глобальный метановый цикл в океане // Геохимия. 1992. № 7. С. 1035-1044.

260. Иванов М.В., Леин А.Ю., Кашпарова Е.В. Интенсивность образования и диагенетического преобразования восстановленных соединений серы в осадках Тихого океана // Биогеохимия диагенеза осадков океана. М.: Наука, 1976. С. 179-186.

261. Иванов М.В., Леин А.Ю., Миллер Ю.М., Юсупов С.К., Пименов Н.В., Верли Б., Русанов И.И., Зендер А. Влияние микроорганизмов и сезонных факторов на изотопный состав органического углерода взвеси Черного моря // Микробиология. 2000. Т. 69. №4. С. 541-552.

262. Иванов М.В., Пименов Н.В., Саввичев A.C. Микробиологические процессы образования сероводорода в реке Преголе (Калининград) // Микробиология. 1995. Т. 64. № 1.С. 112-118.

263. Иванов М.В., Русанов И.И., Пименов Н.В., Байрамов И.Т., Юсупов С.К., Саввичев A.C., Леин А.Ю., Сапожников В.В. Микробные процессы цикла углерода и серы в озере Могильном // Микробиология. 2001. Т. 70. № 5. С. 675-686.

264. Израэль Ю.А., Цыбань A.B. Антропогенная экология океана. Л.: Гидрометиздат, 1989. С. 528.

265. Каравайко Г.И., Кузнецов С.И., Голомзик А.И. Роль микроорганизмов в выщелачивании металлов из руд. М.: Наука, 1972. 248 с.

266. Карначук О.В., Пименов Н.В., Юсупов С.К., Франк Ю.А., Пухакка Я.А., Иванов М.В. Распределение, разнообразие и активность сульфатредуцирующих бактерий в водной толще озера Гёк-Гёль, Азербайджан // Микробиология. 2006. Т. 75. № 1. С. 101-109.

267. Козлова Е.И., Воробьева Л.И., Аркадьева З.А., Розанова Л.И. и Джавахия Г.Я. Микроорганизмы, окисляющие метан // Микробиология. 1969. Т. 38. С. 252-257.

268. Количественный химический анализ вод. Методика выполнения измерений массовых концентраций ионов NO2, N03, Cl, F, SO4, Р04 в пробах природной питьевой и сточной воды методом ионной хроматографии / М., 1998. 15 с. Авторский экземпляр

269. Кондратьева E.H. Хемолитотрофы и метилотрофы. М.: изд-во МГУ, 1983. 176 с.

270. Кудрявцева Е. А., A.C. Саввичев, C.B. Александров, Т.А. Канапацкий, Н.В. Пименов. Бактериопланктон Гданьского бассейна Балтийского моря. Микробиология. 2012. том 81. № 3. С. 377-388.

271. Кузнецов С.И. Микрофлора озер и ее геохимическая деятельность. Л: Наука, 1970.440с.

272. Кузнецов С.И. Роль микроорганизмов в круговороте веществ в озерах М.: Изд. Академии наук СССР, 1952. 278 с.

273. Кузнецов С.И., Саралов А.И., Назина Т.Н. Микробиологические процессы круговорота углерода и азота в озерах. М.: Наука, 1985. 181 с.

274. Леин А.Ю. Потребление Сорг при процессах минерализации органического вещества в современных океанических осадках // Геохимия. 1983. № 11. С. 1634-1639.

275. Леин А.Ю., Вайнштейн М.Б., Кашпарова Е.В. и др. Биогеохимия анаэробного диагенеза и материально-изотопный баланс серы и углерода в осадках Балтийского моря // Геохимия осадочного процесса в Балтийском море. М: Наука, 1986. С. 155-177.

276. Леин А.Ю., Вайнштейн М.Б., Намсараев Б.Б., Кашпарова Е.В., Матросов А.Г., Бондарь В.А., Иванов М.В. Геохимия анаэробного диагенеза современных осадков Балтийского моря // Геохимия. 19826. № 3. С. 428-440.

277. Леин А.Ю., Гриценко В.А., Матросов А.Г. Фракционирование изотопов серы и углерода в современных океанических осадках с различной скоростью процесса бактериальной сульфатредукции // Геохимическая деятельность микроорганизмов в осадках Тихого океана. Пущино, 1981а. С.134-146.

278. Леин А.Ю., Гричук Д.В., Гурвич Е.Г., Богданов Ю.А. Новый тип гидротермальных растворов, обогащенных водородом и метаном, в рифтовой зоне Срединно-Атлантического хребта // Докл. АН. 2000. Т. 375. № 3. С. 380-383.

279. Леин А.Ю., Иванов М.В., Биогеохимический цикл метана в океане / Отв Ред. А.П. Лисицын. М.: Наука, 2009. 546 с.

280. Леин А.Ю., Пименов H.B. Роль бактериальной продукции на активных полях в общем балансе органического углерода в океане // Биология гидротермальных систем. М.: КМК Press, 2002. С. 320-329.

281. Малашенко Ю.Р., Романовская В.А., Богаченко В.Н., Швед А.Д. Термофильные и термотолерантные бактерии ассимилирующие метан // Микробиология. 1975. Т. 44. С. 855-862.

282. Назина Т.Н., Иванова А.Е., Кончавели Л.П., Розанова Е.П. Новая спорообразующая термофильная метилотрофная сульфатвосстанавливающая бактерия Desulfotomaculum kuznetsovii sp. nov. II Микробиология. 1988. Т. 57. вып. 5. С. 823-827.

283. Намсараев Б.Б. Микробная деструкция органического вещества в анаэробных зонах водоемов // Автореф. дис. док. биол. наук, М., 1992. 55 с.

284. Намсараев Б.Б., Дулов Л.Е., Земская Т.И., Иванов М.В. Антропогенная активация бактериальной деятельности в донных осадках озера Байкал // Микробиология. 1995. Т. 64. № 4. С. 548-552.

285. Нечаева Н. 1933. Микробиологические исследования Финского залива. Исследование морей СССР. Вып. 18. С. 145-164.

286. Омельченко М.В., Васильева Л.В., Заварзин Г.А., Савельева Н.Д., Лысенко A.M., Митюшина Л.Л., Хмеленина В.Н. и Троценко Ю.А. Новый психрофильный метанотроф рода Methylobacter//Микробиология. 1996. Т. 65. С. 384-389.

287. Омелянский В.Л. Избранные труды. М.: Изд-во АН СССР, 1953. Т.1. (цит. по Беляев С.С. Метанобразующие бактерии: биология, систематика, применение в биотехнологии // Успехи микробиологии. 1988. Т.22. С. 169-206.

288. Осадкообразование в Балтийском море / Под ред. А. П. Лисицина, Е. М.Емельянова. М.: Наука, 1981. 248 с.

289. Пашкаускас Р., Кучинскене А., Жвикас А. Сульфатредуцирующие бактерии в озерах гипсового карста на севере Литвы // Микробиология. 2005. Т. 74. № 6. С. 823-830.

290. Перевалова A.A., Лебединский A.B., Бонч-Осмоловская Е.А., Черных H.A. Детекция гипертермофильных архей рода Desulfurococcus путем гибридизации с олигонуклеотидными зондами // Микробиология. 2003. Т. 72 №. 3. С. 383-389.

291. Пименов Н.В. Микробные процессы цикла углерода на гидротермальных полях и холодных метановых сипах. 2006. Автореф. дисс. док. наук.

292. Пименов Н.В., Давыдова И.А., Русанов И.И., Леин А.Ю., Беляев С.С., Иванов М.В. Микробиологические процессы круговорота углерода и серы в донных осадках района выноса реки Конго // Микробиология. 1994а. Т. 63. С. 353-369.

293. Пименов Н.В., Русанов И.И., Юсупов С.К., Фридрих Я., Леин А.Ю., Верли Б., Иванов М.В. Микробиологические процессы на границе аэробных и анаэробных вод в глубоководной зоне Черного моря // Микробиология. 2000. Т. 69. № 4. С. 527540.

294. Поглазова М.Н., Мицкевич И.Н. Применение флуорескамина для определения количества микроорганизмов в морской воде эпифлуоресцентным методом // Микробиология. 1984. Т. 53. Вып. 5. С. 850-858.

295. Пустельников О.С. Условия современной седиментации в Куршском заливе // В сб.: Биогеохимия Куршского залива / Под ред. Гудялиса В.К. и Пустельникова О.С. Вильнюс. 1983. С. 18-65.

296. Русанов И.И., Леин А.Ю., Пименов Н.В., Юсупов С.К., Иванов М.В. Биогеохимический цикл метана на северо-западном шельфе Черного моря // Микробиология. 2002. Т. 71. № 4. С. 558-566.

297. Русанов И.И., Юсупов С.К., Саввичев A.C., Леин А.Ю., Пименов Н.В., Иванов М.В. Микробное образование метана ваэробной водной толще Черного моря // Докл. АН. 2004. Т. 399. № 4. С. 71-573.

298. Саввичев A.C., Русанов И.И., Рогозин Д.Ю., Захарова Е.Е., Лунина О.Н., брянцева И.А., Юсупов С.К., Пименов Н.В., Дегерменджи А.Г., Иванов М.В. Микробиологические и изотопно-геохимические исследования меромиктических озер Хакассии в зимний сезон // Микробиология. 2005. Т. 74. № 4. С. 552-261.

299. Саввичев A.C., Русанов И.И., Юсупов С.К., Байрамов И.Т., Пименов Н.В., Леин А.Ю., Иванов М.В. Процесс микробной сульфатредукции в осадках литорали Кандалакшского залива Белого моря // Микробиология. 2003. Т. 72. № 3. С. 1-12.

300. Свиридов Н.И. Строение верхней части осадочного чехла Балтийского моря // Геологическая история и геохимия Балтийского моря. М.: Наука, 1984. С. 86-99.

301. Славнина Г.П. Микобактерии, выделенные из майкопских отложений Ставрополя и использующие углеводороды парафинового ряда // Микробиология. 1964. Т. 33. С. 851-857.

302. Смирнова А.И., Савчук О.П. Физико-географическая характеристика моря // Проект «Балтика»: Проблема исследования и математического моделирования экосистемы Балтийского моря. Вып. I. Экосистема и ее компоненты. Л, 1983. С. 6-11.

303. Сорокин Ю.И. Черное море. М.: Наука, 1982, 216 с.

304. Соскин И.М., Михайлов А.Е. Соленость воды // Проект «Балтика»: Проблема исследования и математического моделирования экосистемы Балтийского моря. Вып. I. Экосистема и ее компоненты. JL, 1983. С. 92-98.

305. Толоконникова Л.И. Интенсивность процесса сульфатредукции в Азовском море // Микробиология. 1977. Т. 46. Вып. 2. С. 352-358.

306. Троценко Ю.А., Хмеленина В.Н. Экстремофильные метанотрофы. Пущино: ОНТИ ПНЦ РАН, 2008. 206.

307. Троцюк В .Я., Авилов В.И., Большаков A.M. Особенности генетического состава газообразных углеводородов в водах и осадках Балтийского моря. - в кн.: Геологическая история и геохимия Балтийского моря. М., Наука. 1984. С. 144-151.

308. Чечко В.А. Особенности седиментации в эстуариях лагунного типа (на примере Вислинской и Куршской лагун Балтийского моря) // В кн.: Закономерности гидробиологического режима водоемов разного типа / Под ред. Алимова А.Ф. и Ивановой М.Б. М.: Научный мир, 2004. С. 172-175.

309. Шишкина О.В., Павлова Г.А., Исаева А.Б., Шевченко А.Н. Основной солевой состав иловых вод Балтийского моря // Осадкообразование в Балтийском море / Ред. А.П. Лисицын, Е.М. Емельянов. М.: Наука, 1981. С. 191-207.

310. Шубенкова О.В., Земская Т.И., Черницына С.М., Хлыстов О.М., Трибой Т. И. // Микробиология. 2005. Т. 74. № 3. С. 370-377.

311. Экосистемы Балтики в мае - июне 1984 года / Отв. Ред. О.И. Кобленц-Мишке. М.: ИО АН СССР, 1987.438 с.

312. Электронный ресурс для расчета степени гомологий последовательностей ДНК -http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast.

313. Электронный ресурс для расчета степени гомологий последовательностей ДНК -http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.

314. Электронный ресурс http://align.bmr.kyushu-u.ac.jp/mafft/online/server.

315. Электронный ресурс http://biocwww.uia.ac.be/u/yvdp/treeconw.httml.

316. Электронный ресурс http://www.microbial-ecology.net/probebase.