Взаимодействие нативного и химически модифицированного сывороточного альбумина человека с олиго- и полирибонуклеотидами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.10, кандидат химических наук Герасимова, Юлия Владимировна

• Герасимова, Юлия Владимировна
• кандидат химических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат химических наук Герасимова, Юлия Владимировна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

РАЗДЕЛ 1. СЫВОРОТОЧНЫЙ АЛЬБУМИН: ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С ЛИГАНДАМИ И КАТАЛИТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА обзор литературы)

1.1. Структура и взаимодействие сывороточного альбумина с лигандами

1.2. Каталитические свойства сывороточного альбумина

1.2.1. Сывороточный альбумин как гидролаза

1.2.1.1. Гидролиз сложных эфиров

1.2.1.2. Гидролиз тиоэфиров

1.2.1.3. Гидролиз производных фосфорной и фосфоновой кислот

1.2.1.4. Гидролиз амидов и амидофосфатов

1.2.1.5. Гидролиз Р-лактамных антибиотиков

1.2.1.6. Гидролиз бензизоксазола

1.2.2. Сывороточный альбумин как лиаза

1.2.3. Сывороточный альбумин как изомераза •

1.2.3.1. Кето-енольная таутомерия и структурная изомеризация эпоксисоединений

1.2.3.2. Перемещение двойной связи

1.2.4. Сывороточный альбумин как оксидоредуктаза

1.2.5. Роль лизина в реакциях, катализируемых сывороточным альбумином

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Взаимодействие нативного и химически модифицированного сывороточного альбумина человека с олиго- и полирибонуклеотидами»

Сывороточный альбумин — важнейший транспортный белок, осуществляющий депонирование и перенос многих эндогенных метаболитов и ксенобиотиков в плазме крови, межклеточной жидкости и лимфе [1]. Универсальность транспортной функции альбумина обеспечивается его уникальной способностью связывать лиганды различной химической природы: жирные и желчные кислоты, билирубин, стероидные и тиреоидные гормоны, а также многие лекарственные вещества.

Кроме низкомолекулярных лигандов, альбумин связывает также и биополимеры, например, пептиды [2] и нуклеиновые кислоты [1, 3,4]. На данный момент получены убедительные доказательства того, что альбумин не только связывает дезоксирибонуклеиновые кислоты, но и способствует их проникновению в клетки [5, 6]. В то же время взаимодействие человеческого сывороточного альбумина с РНК ограничено исследованиями на уровне определения констант связывания с тРНК [7].

Одной из важных функций, присущей сывороточному альбумину, является его способность катализировать многие химические реакции [1,8]. В последние годы было показано, что в присутствии бычьего сывороточного альбумина наблюдается деполимеризация РНК [9]. Что касается человеческого сывороточного альбумина, на момент выполнения настоящей работы данные по РНК-гидролизующей активности белка в литературе отсутствовали. Так как концентрация данного белка в плазме крови высока (~ 0,6 мМ), взаимодействие альбумина с внеклеточными РНК может существенно влиять на их стабильность в крови, биораспределение и метаболизм.

Фракция альбумина в сыворотке крови гетерогенна и содержит, наряду с нативпым белком, ряд пост-траисляционно модифицированных форм. Различные модифицированные формы человеческого сывороточного альбумина обнаруживаются, главным образом, при патологии. Так, например, альбумин в крови подвергается гликированию с образованием продуктов, ответственных за развитие осложнений при сахарном диабете [10]. Взаимодействие альбумина с циркулирующим в крови тиолактоном гомоцистеина приводит к образованию ТУ-гомоцистеинилированного белка, вызывающего аутоиммунный ответ и способствующего развитию атеросклероза и сердечно-сосудистых заболеваний [11]. Модификация альбумина может привести к изменению его структуры и, как следствие, лиганд-связывающей способности. Если для комплексов нативного альбумина с нуклеиновыми кислотами получены некоторые физико-химические характеристики, то в случае модифицированных альбуминов не исследована ни эффективность их связывания с нуклеиновыми кислотами, ни их способность гидролизовать данные лиганды. Развитие работ в этом направлении может не только привести к расширению знаний о роли и функции альбумин-нуклеиновых комплексов в процессах жизнедеятельности человека в норме и при патологии, но и представляет определенный клинический интерес, так как будет способствовать разработке новых диагностических и прогностических методов и созданию новых лекарственных средств.

Таким образом, для установления причин исключительной полифункциональности человеческого сывороточного альбумина, обуславливающего его биологическую роль в организме, а также в связи с перспективой использования антисмысловых олигонуклеотидов или иитерферирующих РНК в качестве терапевтических средств, детальное изучение процессов взаимодействия как нативного человеческого сывороточного альбумина, так и его клинически значимых химически модифицированных форм альбуминов с такими важными молекулами как РНК представляется актуальным.

Целью настоящей работы являлось исследование взаимодействия нативного и химически модифицированных форм (гликированного и тУ-гомоцистеинилированного) человеческого сывороточного альбумина с РНК, а также сравнительный анализ способности альбумина и других белков нефракционированной плазмы крови связывать гомополирибонуклеотиды и их комплементарные комплексы.

В ходе исследования решались следующие задачи:

• анализ эффективности и специфичности взаимодействия препарата альбумина и белков плазмы крови с полирибонуклеотидами (поли(А), поли(О), поли(и), и поли(С)) и их дуплексами (поли(А).поли(Ц) и поли(С).поли(С));

• исследование способности альбумина катализировать гидролиз олигорибонуклеотидов, полирибонуклеотидов, и РНК;

• изучение каталитических свойств (кинетических параметров реакции, влияния ионов металлов и рН на скорость реакции) и субстратной специфичности альбумина в реакции гидролиза РНК;

• изучение механизма деполимеризации нуклеиновых кислот под действием альбумина посредством определения структуры продуктов реакции методом 31Р-ЯМР спектроскопии;

• изучение влияния клинически значимых химических модификаций альбумина -гликирования и ТУ-гомоцистеинилирования — на связывание белка с олиго- и полирибонуклеотидами, а также на его РНК-гидролизующую активность;

• проведение аффинной модификации альбумина фосфорилирующим производным олигорибонуклеотидного субстрата и определение аминокислотных остатков альбумина, участвующих в связывании олигорибонуклеотидов, методом л 1

МА1Л)1-ТОР масс-спектрометрии и Р-ЯМР-спектроскопии.

Заключение диссертации по теме «Биоорганическая химия», Герасимова, Юлия Владимировна

Выводы

1. Сравнительный анализ эффективности и специфичности связывания белков плазмы крови человека с полирибонуклеотидами (поли(А), поли(С), поли(и), и поли(С)) и их дуплексами (поли(А).поли(и) и поли(С).поли(С)) показал, что наиболее эффективно с гомополипуриновыми последовательностями как одноцепочечными, так и в составе комплементарных комплексов связывается белок, соответствующий, по данным гель-электрофоретического, МАЬ01-Т0Р масс-спектрометрического и иммуноферментного анализа, сывороточному альбумину.

2. Впервые показано, что человеческий сывороточный альбумин катализирует гидролиз РНК. На основании выполнения некоторых общепринятых критериев установлено, что РНК-гидролизующая активность является собственным свойством альбумииа. Каталитические свойства и субстратная специфичность альбумина в реакции гидролиза РНК отличаются от свойств секреторных РНКаз человека. Эффективность альбумина в реакции деполимеризации гомополирибонуклеотидов уменьшается в ряду поли(С) > поли(и) > поли(А). С наибольшей эффективностью альбумин расщепляет фосфодиэфирные связи ирА- и СрА-сайтов в гетерогенных олиго- и пол ирибону клеотидах.

3. Согласно данным 31Р-ЯМР спектроскопии и анионообменной хроматографии установлено, что гидролиз РНК под действием альбумина протекает по механизму внутримолекулярной траисэтерификации с образованием продуктов с 2',3'-циклофосфодиэфирной группировкой, которые далее медленно гидролизуюгея с образованием нуклеозид-3'- и нуклеозид-2'-фосфомоноэфиров. Анализ зависимости скорости расщепления альбумином фосфодиэфирных связей в РНК от рН свидетельствует о том, что гидролиз протекает по механизму кислотно-основного катализа.

4. Впервые обнаружено, что клинически значимые химические модификации человеческого сывороточного альбумина — гликирование и А^-гомоцистеинилирование - приводят к снижению эффективности гидролиза РНК более чем на порядок, в то время как сродство альбумина к нуклеиновым кислотам при модификации незначительно увеличивается.

5. Методами аффинной модификации альбумина фосфорилирующим производным гексауридилата МАЬОГ-ТОР масс-спектрометрии обнаружено, что в участке связывания альбумина с олигорибонуклеотидами локализованы остатки лизина как из субдомена ПА (Ьуз-205 и ЬуБ-212), так и из субдомена ША (Ьуз-432) белка.

Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Герасимова, Юлия Владимировна, 2009 год

1. Peters Jr. Т. All about albumin: biochemistry, genetics and medical applications. San Diego: Academic Press, 1996. pp. 432.

2. Власов В.В., Паутова J1.B., Рыкова Е.Ю., Якубов JI.A. Взаимодействие олигонуклеотидов с белками сыворотки крови // Биохимия. 1993. Т. 58. С. 1247—1251.

3. Лактионов П.П., Брыксин А.В., Рыкова Е.Ю., Власов В.В. Исследование олигонуклеотид-белковых взаимодействий в крови in vivo II Бюл. Эксп. Биол. Мед. 1999. Т. 127. С. 654-657.

4. Arnedo A., Irache J.M., Gonzalez Gaitano G., Valganon M., Espuelas S. Bovine serum albumin modified the intracellular distribution and improved the antiviral activity of an oligonucleotide // J. Drug Target. 2003. V. 11. P. 197-204.

5. Arnedo A., Irache J.M., Merodio M., Espuelas S., Millan M.S. Albumin nanoparticles improved the stability, nuclear accumulation and anticytomegaloviral activity of a phosphodiester oligonucleotide // J. Control Release. 2004. V. 94. P. 217-227.

6. Malonga H., Neault J.F., Tajmir-Riahi H.A. Transfer RNA binding to human serum albumin: a model for protein-RNA interaction // DNA Cell Biol. 2006. V. 25. P. 393-398.

7. Kragh-Hansen U., Chuang Victor T.G., Otagiri M. Practical aspects of the ligand -binding and enzymatic properties of human serum albumin // Biol. Pharm. Bull. 2002. V. 25. P. 695-704.

8. Ulrich P., Cerami A. Protein glycation, diabetes and aging // Recent Prog. Horm. Res. 2001. V. 56. P. 1-21.

9. Jakubowski H. Pathophysiological consequences of homocysteine excess // J. Nutr. 2006. V. 136. P. 1741S—1749S.

10. Carter D.C., Ho J.X. Structure of serum albumin // Adv. Protein. Chem. 1994. V. 45. P. 153-203.

11. Sugio S., Kashima A., Mochizuki S., Noda M., Kobayashi K. Crystal structure of human serum albumin at 2.5 A resolution // Protein. Eng. 1999. V. 12. P. 439^146.

12. Sudlow G., Birkett D. J., Wade D. N. The characterization of two specific drug binding sites on human serum albumin I I Mol. Pharmacol. 1975. V. 11. P. 824-832.

13. Petersen C.E., Ha C.-E., Harohalli K., Feix J.B., Bhagavan N. V. A dynamic model for bilirubin binding to human serum albumin // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. P. 20985-20995.

14. Adams P.A., Berman M.C. Kinetics and mechanism of the interaction between human serum albumin and monomeric haemin // Biochem. J. 1980. V. 191. P. 95-102.

15. Pearlman W.H., Crepy O. Steroid-protein interaction with particular reference to testosterone binding by human serum // J. Biol. Chem. 1967. V. 242. P. 182-189.

16. Petitpas I., Bhattacharaya A.A., Twine S., East M., Curry S. Crystal structure analysis of warfarin binding to human serum albumin: anatomy of drug site I // J. Biol. Chem. 2001. V 276. P.22804-22809.

17. Viani A., Cappiello M., Silvestri D., Pacifici G.M. Binding of furosemide to albumin isolated from human fetal and adult serum //Dev. Pharmacol. Ther. 1991. V. 16. P. 33-40.

18. Montero M.T., Pouplana R., Vails O., Garcia S. On the binding of cinmethacin and indomethacin to human serum albumin // Pharm. Pharmacol. 1986. V. 38. P. 925-927.

19. Ghuman J., Zunszain P.A., Petitpas I., Bhattacharaya A.A., Otagiri M., Curry S. Structural basis of the drug-binding specificity of human serum albumin // J. Mol. Biol. 2005. V. 353. P.38-52.

20. Kragh-Hansen U. Evidence for a large and flexible region of human serum albumin possessing high affinity binding sites for salicylate, warfarin, and other Iigands // Mol. Pharmacol. 1988. V. 34. P. 160-171.

21. Walanabe H., Tanase S., Nakajou K., Maruyama T., Kragh-Hansen U., Otagiri M. Role of Arg-410 and Tyr-411 in human serum albumin for Iigand binding and esterase-like activity//J. Biochem. 2000. V. 349. P. 813-819.

22. Keire D.A., Mariappan S. V., Peng J., Rabenstein D.J. Nuclear magnetic resonance studies of the binding of captopril and penicillamine by serum albumin // Biochem. Pharmacol. 1993. V. 46. P. 1059-1069.

23. McMenamy R.H., Oncley J. L. The specific binding of Z-tryptophan to serum albumin // Biol. Chem. 1958. V. 223. P. 1436-1447.

24. Petitpas /., Petersen C.E., Ha C.E., Bhattacharaya A.A., Zunszain P.A., Ghuman J. Structural basis of albumin-thyroxine interactions and familial dysalbuminemic hyperthyroxinemia // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. V. 100. P. 6440-6445.

25. Wanwimolruk S., Birkett D. J., Brooks P. M. Structural requirements for drug binding to site II on human serum albumin // Mol. Pharmacol. 1983. V. 24. P. 458-463.

26. Irikura M., Takadate A., Goya S., Otagiri M. 7-Alkylaminocournarin-4-acetic acids as fluorescent probe for studies of drug-binding sites on human serum albumin // Chem. Pharm. Bull. 1991. V. 39. P. 724-728.

27. Nerli B., Romanini D., Pico G. Structural specificity requirements in the binding of p-lactam antibiotics to human serum albumin // Chem. Biol. Interact., 1997. V. 104. P.179-202.

28. Bhatacharya A. A., Curry S., Frank N. P. Crystallographic analysis reveals common modes of medium and long-chain fatty acids to human serum albumin // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. P. 38731-38738.

29. Sengupta S., Chen H., Tagawa T., DiBello P.M., Majors A.K., Budy B., Ketterer M.E., Jacobsen D.W. Albumin thiolate anion is an intermediate in the formation of albumin-S'-S'-homocysteine Hi. Biol. Chem. 2001. V. 276. P. 30111-30117.

30. Narazaki R., Otagiri M. Covalent binding of a bucillamine derivative with albumin in sera from healthy subjects and patients with various diseases // Pharm. Res. 1997. V.14. P.351-353.

31. Ivanov A. I., Christodoulou J., Parkinson J. A., Barnham K. J., Tuker A., Woodrow J., Sadler P. J. Cisplatin binding sites on human serum albumin I I J. Biol. Chem. 1998. V. 273. P.14721-14730.

32. Geselowitz D.A., Neckers L.M. Bovine serum albumin is a major oligonucleotide-binding protein found on the surface of cultured cells // Antisense Res. Dev. 1995. V. 5. P. 213-217.

33. Agrawal S. In vivo pharmacokinetics of oligonucleotides // Applied antisense oligonucleotide technology / Eds. Stein C.A., Krieg A.M. New York: Wiley-Liss, 1998. P. 365-386.

34. Srinivasan S.K., Tewary H.K., Iversen P.L. Characterization of binding sites, extent of binding, and drug interactions of oligonucleotides with albumin // Antisense Res. Dev. 1995. V. 5. P. 131-139.

35. Malonga H., Neault J.F., Tajmir-Riahi H.A. DNA interaction with human serum albumin studied by affinity capillary electrophoresis and FTIR spectroscopy // DNA Cell Biol. 2006. V. 25. P. 63-68.

36. Tiruppathi C., Finnegan A., Malik A.B. Isolation and characterization of a cell surface albumin-binding protein from vascular endothelial cells // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. V. 93. P. 250-254.

37. Li B., Sedlacek M., Manoharan I., Boopathy R., Duysen E. G., Masson P., Lockridge O. Butyrylcholinesterase, paraoxonase, and albumin esterase, but not carboxylesterasc, are present in human plasma // Biochem. Parmacol. 2005. V. 70. P. 1673-1684.

38. Wilde C.E., Kekwick G.O. The arylesterase of human serum // Biochem. J. 1964. V. 91. P. 297-307.

39. Casida J.E., Augustinsson K.-B. Reaction of plasma albumin with I-naphtyl iV-methylcarbamate and certain other esters // Biochim. Biophys. Acta. 1959. V. 36. P. 411^26.

40. Wolfbeis O.S., Gurakar A. The effect of fatty acid chain length on the rate of arylester hydrolysis by various albumins // Clin. Chim. Acta. 1987. V. 164. P. 329-337.

41. Matsushita S., Ishima Y., Chuang V. T. G., Watanabe II., Tanase S., Maruyama T., Otagiri M. Functional analysis of recombinant human serum albumin domains for pharmaceuticals applications // Pharm. Res. 2004. V. 21. P. 1924-1932.

42. Ozeki Y., Kurono Y., Yotsuyanagi T., Ikeda K. Effects of drug binding on the esterase activity of human serum albumin: inhibition modes and binding sites of anionic drugs // Chem. Pharm. Bull. 1980. V. 28. P. 535-540.

43. Ahmed N., Dobler D., Dean M., Thornalley P. J. Peptide mapping identifies hotspot site of modification in human serum albumin by methylglyoxal involved in ligand binding and esterase activity // J. Biol. Chem. 2005. V. 280. P. 5724-5732.

44. Means G.E., Bender M.L. Acetylation of human serum albumin by p-nitrophenyl acetate // Biochemistry 1975. V. 14. P. 4989-4994.

45. Masson P., Froment M. T., Darvesh S., Schopfer L. M., Lockridge O. Aryl acylamidase activity of human serum albumin with o-nitrotrifluoroacetanilide as the substrate // J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2007. V. 22. P. 463^69.

46. Branden C., Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York: Garland Publishing Inc., 1991. P. 205-222.

47. He X.M., Carter D.C. Atomic structure and chemistry of human serum albumin // Nature. 1992. V. 358. P. 209-215.

48. Salvi A., Corrupt P.-A., Mayer J. M., Teste B. Esterase-like activity of human serum albumin toward prodrug esters of nicotinic acid' // Drug Metab. Dispos. 1997. V. 25. P. 395-398.

49. Dubois-Presle N., Lapicque F., Maurice M. II, Fournel-Gigleux S., Magdalou J., Abiteboul M., Siest G,, Netter P. Stereoselective esterase activity of human serum albumin toward ketoprofen glucuronide // Mol. Pharmacol. 1995. V. 47. P. 647-653.

50. Aso Y, Yoshioka S., Takeda Y. Epimerization and racemization of some chiral drugs in the presence of human serum albumin // Chem. Pharm. Bull. 1990. V. 38. P. 180-184.

51. Kurono Y., Kondo T., Ikeda K. Esterase-like activity of human scrum albumin: enantioselectivity in the burst phase of reaction with p-nitrophenyl alpha-methoxyphenyl acetate //Arch. Biochem. Biophys. 1983. V. 227. P. 339-341.

52. Hawkins D, Pinckard R.N., Farr R.S. Acetylation' of human serum albumin by acetylsalicylic acid // Science. 1968. V. 160. P. 780-781.

53. Pinckard R.N., Hawkins D., Farr R.S. In vitro acetylation of plasma proteins, enzymes and DNA by aspirin //Nature. 1968. V. 219. P. 68-69.

54. Hawkins D., Pinckard R.N., Crawford I.P., Farr R.S. Structural changes in human serum albumin induced by ingestion of acetylsalicylic acid // J. Clin. Invest. 1969. V. 48. P. 536-542.

55. Walker J. E. Lysine residue 199 of human serum albumin is modified by acetylsalicylic acid // FEBS Lett. 1976. V. 66. P. 173-175.

56. Yang F., Bian C., Zhu L., Zhao G., Huang Z., Huang M. Effect of human serum albumin on drug metabolism: structural evidence of esterase activity of human serum albumin // J. Struct. Biol. 2007. V. 157. P. 348-355.

57. Gerig J.T., Reinheimer J.D. Modification of HSA with trifluoromethyl-substituted aryl halides and sulfonates // J. Am. Chem. Soc. 1975. V. 97. P. 168-173.

58. Gerig J.T., Katz K.E., Reinheimer J.D. Reaction of 2,6-dinitro-4-trifluoromethylbenzenesulfonate with HSA // Biochim. Biophys. Acta. 1978. V. 534. P. 196-209.

59. Diaz N. Suarez D., Sordo T.L., Merz K.M. Molecular dynamics study of the IIA binding site in human serum albumin: influence of protonation state of Lysl95 and Lysl99 // J. Med. Chem. 2001. V. 44. P. 250-260.

60. Honma K.N.M., Ishikawa Y. Acetylsalicylate-human serum albumin interaction as studied by NMR spectroscopy antigenicity-producing mechanism of acetylsalicylic acid // Mol. Immunol. 1991. V. 28. P. 107-113.

61. Sogorb M. A., Carrera V., Benabent M., Vilanova E. Rabbit serum albumin hydrolyzes the carbamate carbaryl // Chem. Res. Toxicol. 2002. V. 15. P. 520-526.

62. Sogorb M. A., Carrera V., Vilanova E. Hydrolysis of carbaryl by human serum albumin //Arch. Toxicol. 2004. V. 78. P. 629-634.

63. Kurooka S., Yoshimura Y. Mercaptoethanol release upon interaction of S-lauroylmercaptoethanol with serum albumin // J. Biochem. 1973. V. 74. P. 785-795.

64. Agarwal R. P., Phillips M., McPherson R. A., Hensley P. Serum albumin and the metabolism of disulfiram // Biochem. Pharmacol. 1986. V. 35. P. 3341-3347.

65. Mourik J., de Jong L. P. Binding of the organophosphated parathion and paraoxon to bovine and human serum albumin // Arch. Toxicol. 1978. V. 41. P. 43^8.

66. Sultatos L. G., Basker K. M., Shao M., Murphy S. D. The interaction of the phosphorothioate insecticides chlorpyrifos and parathion and their analogues with bovine serum albumin // Mol. Pharmacol. 1984. V. 26. P. 99-104.

67. Ortigoza-Ferado J., Richter R.J., Hornung S.K., Motulsky A.G., Furlong C.E. Paraoxon hydrolysis in human serum mediated by a genetically variable arylesterase and albumin // Am. J. Hum. Genet. 1984. V. 36. P. 295-305.

68. Means G.E., Wu H.L. The reactive tyrosine residue of human serum albumin: characterization of its reaction with diisopropylfluorophosphate // Arch. Biochem. Biophys. 1979. V. 194. P. 526-530.

69. Li B., Schopfer L.M.,< Hinrichs S.H., Masson P., Lockridge O. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass apectrometry assay for organophosphorus toxicants bound to human albumin at Tyr411 // Anal. Biochem. 2007. V. 361. P. 263-272.

70. Black R.M., Harrison J.M., Read R. W. The interaction of sarin and soman with plasma proteins: the identification of a novel phosphonylation site // Arch. Toxicol. 1999. V. 73. P. 123-126.

71. Williams NH., Harrison J.M., Read R.W., Black R.M. Phosphylated tyrosine in albumin as a biomarker of exposure to organophosphorus nerve agents // Arch. Toxicol. 2007. V. 81. P. 627-639.

72. Li B., Nachon F., Froment M.-T., Verdier L., Debouzy J.-C., Brasme B., Gillon E., Schopfer L. M., Lockridge O., Masson P. Binding and hydrolysis of soman by human serum albumin//Chem. Res. Toxicol/2008. V. 21. P. 421^31.

73. Manoharan I., Boopathy R. Diisopropylfluorophosphate-sensitive aryl acylamidase activity of fatty acid free human serum albumin // Arch. Biochem. Biophys. 2006. V. 452. P. 186-188.

74. Ohta N., Kurono Y., Ikeda K. Esterase-like activity of human serum albumin. 11: Reaction with iV-trans-cinnamoylimidazoles // J. Pharm. Sei. 1983. V. 72. P. 385-388.

75. Kwon C.-H., Maddison K., LoCastro L., Borch R. F. Accelerated decomposition of 4-hydroxycyclophosphamide by human serum albumin // Cancer Res. 1987. V. 47. P. 1505-1508.

76. Nerli B., Pico G. Evidence of human serum albumin ß-lactamase activity // Biochem. Mol. Biol. Int. 1994. V. 32. P. 789-795.

77. Nerli B., Garcia F., Pico C. An unknown hydrolase activity of human serum albumin: ß-lactamase activity // Biochem. Mol. Biol. Int. 1995. V. 37. P. 909-915.

78. Bruderlein H., Daniel R., Perras D., DiPaola A., Fidelia A., Belleau B. An investigation of,the destruction of the ß-lactame ring of penems by the albumin drug-binding site //Can. J. Biochem. 1981. V. 59. P. 857-866.

79. Tsuda Y., Tsunoi Т., Watanabe N., Ishida M., Yamada II, Itoh T. Stereoselective binding and degradation of sulbenicillin in the presence of human serum albumin // Chirality. 2001. V. 13. P. 236-243.

80. Yvon M., Wal J.-M. Identification of lysine residue 199 of human serum albumin as a binding site for benzylpenicilloyl groups // FEBS Lett. 1988. V. 239. P. 237-240.

81. Yvon M., Anglade P., Wal J. M. Binding of benzyl penicilloyl to human serum albumin. Evidence of a highly reactive region at the junction of domains 1 and 2 of the albumin molecule // FEBS Lett. 1989. V. 247. P. 273-278.

82. Yvon M., Anglade P., Wal J. M. Identification of the binding sites of benzyl penicilloyl, the allergenic metabolite of penicillin, on the serum albumin molecule // FEBS Lett. 1990. V. 263. P. 237-240.

83. Kikuchi K, Thon S. N., Hilvert D. Albumin-catalyzed proton transfer // J. Am. Chem. Soc. 1996. V. 118. P. 8184-8185.

84. Gueriguian J. Prostaglandin-macromolecule interactions. I. Noncovalent binding of prostaglandins Al, El, F2a, and E2 by human and bovine serum albumins // J. Pharmacol. Exp. Ther. 1976. V. 197. P. 391-401.

85. Filzpatrick F. A., Wynalda M. A. Albumin-lipid interactions: prostaglandin stability as a probe for characterizing binding sites on vertebrate albumins // Biochemistry. 1981. V. 20. P. 6129-6134.

86. Granstrom E., Hamberg M., Hansson G., Kindahl II. Chemical instability of 15-keto-13,14-dihydro-PGE2: the reason for low assay reliability // Prostaglandins. 1980. V. 19. P. 933-957.9 1 ^

87. Kikawa Y., Narumiya S., Fukushima M., Wakatsuka II, Hayaishi O. 9-Deoxy-A ,A 13,14-dihydroprostaglandin D2, a metabolite of prostaglandin D2 formed in human plasma // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1984. V. 81. P. 1317-1321.

88. Filzpatrick F. A., Wynalda M. A. Albumin-catalyzed metabolism of prostaglandin D2. Identification of products formed in vitro //J. Biol. Chem. 1983. V. 258. P. 11713-11718.

89. Буко В.У., Заводник И.Б., Степуро И.И. Взаимодействие простагландина Е2 с сывороточным альбумином человека//Биохимия. 1987. Т. 52. С. 891-895.

90. Folco G,C., Granstrom Е., Kindahl Н. Albumin stabilizes thromboxane A2 // FEBS Lett. 1977. V. 82. P. 321-324.

91. Wynalda M. A., Filzpatrick F. A. Albumins stabilize prostaglandin I2 // Prostaglandins. 1980. V. 20. P. 853-861.

92. Filzpatrick F. A., Morton D. R., Wynalda M. A. Albumin stabilizes leukotriene A4 I I J. Biol. Chem. 1982. V. 257. P. 4680^1683.

93. Haeggstrom J., Fitzpatrick F., Radmark O., Samuelsson B. Albumin stabilizes 14,15-leukotriene A4//FEBS Lett. 1983. V. 164. P. 181-184.

94. Hamberg M., Fredholm B.B. Isomerization of prostaglandin H2 into prostaglandin D2 in the presence of serum albumin // Biochim. Biophys. Acta. 1976. V. 431. P. 189-193.

95. Watanabe T., Narumiya S., Shimizu T. Hayaishi O. Characterization of the biosynthetic pathway of prostaglandin D2 in human platelet-rich plasma // J. Biol. Chem. 1982. V. 257. P. 14847-14853.

96. Stehle R.G., Oesterling TO. Stability of prostaglandin El and dinoprostone (prostaglandin E2) under strongly acidic and base conditions // J. Pharm. Sci. 1977. V. 66. P.1590-1595.

97. Fitzpatrick F. A., Liggett W. F., Wynalda M. A. Albumin-eicosanoid interaction. A model system to determine their attributes and inhibition // J. Biol. Chem. 1984. V. 259. P. 2722-2727.

98. Polet H., Levine L Metabolism of prostaglandins E, A, and C in serum // J. Biol. Chem. 1975. V. 250. P. 351-357.

99. Hurst R., Bao Y., Ridley S., Williamson G. Phospholipid hydroperoxide cysteine peroxidase activity of human serum albumin // Biochem. J. 1999. V. 338. P. 723-726.

100. Christodoulou J., Sadler P. J., Tucker A. *H NMR of albumin in human blood plasma: drug binding and redox reactions at Cys 34 // FEBS Lett. 1995. V. 376. P. 1-5.

101. Cha M.-K., Kim I.-H. Glutathione-linked thiol peroxidase activity of human serum albumin: a possible antioxidant role of serum albumin in blood plasma // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996. V. 222. P. 619-625.

102. Cha M.-K., Kim I.-H. Disulfide between Cys392 and Cys438 of human serum albumin is redox-active, which is responsible for the thioredoxin-supported lipid peroxidase activity // Arch. Biochem. Biophys. 2006. V. 445. P. 19-25.

103. Kurono Y., Ichioka K., Ikeda K. Kinetics of the rapid modification of human serum albumin with trinitrobenzensulfonate and localization of its site // J. Phar. Sci. 1983. V. 72. P. 432—435.

104. Taylor R. P., VatzJ. B. Bovine serum albumin as a catalyst. Accelerated decomposition ofaMeisenheimer complex//J. Am. Chem. Soc. 1973. V. 95. P. 5819-5820.

105. Taylor R.P., Chau V., Bryner C., Berga S. Bovine serum albumin as a catalyst. II. Characterization of the kinetics // J. Am. Chem. Soc. 1975. V. 97. P. 1934-1943.

106. БурДж. Методы введения нитрозогруппы, реакции нитрозосоединений // Химия нитро- и нирозогрупп / Под ред. Фойера Г. М.: Мир, 1972. Т. С. 194.

107. Бобик Т.В., Воробьев И.И., Пономаренко Н.А., Габибов А.Г., Мироишиков A.PI. Экспрессия человеческого сывороточного альбумина в метилотрофных дрожжах Pichia pastoris и его структурно-функциональный анализ // Биоорган. Химия. 2008. Т. 34. С. 56-62.

108. Гордон А., Форд Р. Спутник химика. М.: Мир. 1976. С. 437-444.121 .Досои Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонс К. Справочник биохимика. М.: Мир. 1991. С. 32-34.

109. Handbook of biochemistry and molecular biology: nucleic acids / Ed. Fasman Т.Е. Cleveland: CRC Press. 1975. P. 589.

110. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 //Nature. 1970. V. 227. P. 680-685.

111. Westermeirer R., Naven T. Proteomics in practice: a laboratory manual of proteome analysis. Weinheim: Wiley-VCH. 2002. P. 233-237.

112. Sreerama N., Woody R.W. Estimation of protein secondary structure from circular dichroism spectra: comparison of CONTIN, SELCON, and CDSSTR methods with an expanded reference set // Anal. Biochem. 2000. V. 287. P. 252-260.

113. Скоупс P. Методы очистки белков. M.: Мир. 1985. С. 342.

114. Towbin Н., Staehelin Т., Gordon J. Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1976. V. 9. P. 4350-4356.

115. Chen R.F. Removal of fatty acids from serum albumin by charcoal treatment // J. Biol. Chem. 1967. V. 242. P. 173-181.

116. Schmitt A., Schmitt J., Munch G., Gasic-Milencovich J. Characterization of advanced glycation end products for biochemical studies: side chain modifications and fluorescence characteristics // Anal. Biochem. 2005. V. 338. P. 201-215.

117. Glowacki R., Jakubowski H. Cross-talk between Cys34 and lysine residues in human serum albumin revealed by iV-homocysteinylation // J. Biol. Chem. 2004. V. 279. P. 10864-10871.

118. Janatova J., Fuller J.K., Hunter M.J. The heterogeneity of bovine serum albumin with respect to sulfhydryl and dimer content // J. Biol. Chem. 1968. V. 243. P. 3612-3622.

119. Lehrer S.S. Solute perturbation of protein fluorescence. The quenching of the tryptophan fluorescence of model compounds and of lysozyme by iodide ion // Biochem. 1971. V. 10. P.3254-3263.

120. Rosental A.L., Lack S.A. Nuclease detection in SDS-polyacrilamide gel electrophoresis //Anal. Biochem. 1977. V. 80. P. 76-90.

121. Маниатис Дж., Фрич О., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 1984. С. 132-134.

122. Власов А.В., Власов В.В., Жъеже Р. Катализируемый имидазолом гидролиз РНК как реакция для исследования вторичной структуры РНК и комплексов РНК с олигонуклеотидами // Докл. РАН. 1996. Т. 349. С. 411-413.

123. Donis-Keller Н., Махат А.М\ Gilbert W. Mapping adenines, guanines, and pyrimidines in RNA //Nucleic Acids Res. 1977. V. 4. P. 2527-2538.

124. Mironova N.L., Pyshnyi D.V., Ivanovo E.M., Zenkova M.A., Gross H.J., Vlassov V.V. Covalently attached oligodeoxyribonucleotides induce RNase activity of a short peptide and modulate its base specificity //Nucleic Acids Res. 2004. V. 32. P. 1928-1936.

125. Репкова M.H., Иванова T.M., Филиппов P.В., Венъяминова А.Г. Фотоактивируемые перфторарилазидные производные олигорибонуклеотидов: синтез и свойства // Биоорган. Химия. 1996. Т. 22. С. 342^40.

126. Gattiker A., Bienvenut W.V., Bairoch A., Gasteiger Е. FindPept, a tool to identify unmatched masses in peptide mass fingerprinting protein identification //Proteomics. 2002. V. 2. P. 1435-1444.

127. Yakubov L., Khaled Z„ Zhang L.M., Truneh A., Vlassov V., Stein C.A. Oligodeoxynucleotides interact with recombinant CD4 at multiple sites // J. Biol. Chem. 1993. V. 268. P.18818-18823.

128. Chen Z., Fadiel A., Naftolin F, Eichenbaum K.D., Xia Y. Circulation DNA: biological implications for cancer metastasis and immunology // Medical Hypothesis. 2005. V. 65. P. 956-961.

129. Benimetscaya L., Loike J.D., Khakled Z., Loike G., Silverstein S.C., Cao L., Elkhoury R.Y., Cai J., Stein C.A. Mac-1 (CDllb/CD18) is an oligodeoxynucleotide-binding protein // Nature Med. 1997. V. 2. P. 414-420.

130. Hanss В., Leal-Pinto E., Bruggeman L.A., Copeland T.D., Klotman P.E. Identification and charactcrization of a cell membrane nucleic acid channel // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. P. 1921-1926.

131. Челобанов Б.П., Лактионов П.П., Харькова M.B., Рыкова Е.Ю., Пышный Д.В., Пышная И.А., Маркус К., Мейер Г.Е., Власов В.В. Взаимодействие кератина К1 с нуклеиновыми кислотами на поверхности клеток // Биохимия. 2003. Т. 68. С. 1540-1549.

132. Chelobanov B.P., Laktionov P.P., Kharkova M.V., Rykova E.Y., Vlassov V.V. Isolation of nucleic acid binding proteins: an approach for isolation of cell surface, nucleic acid binding proteins // Ann. N.Y. Acad. Sci. 2004. V. 1022. P.239-243.

133. Nevinsky G.A., Buneva V.N. Natural catalytic antibodies-abzymes // Catalytic antibodies / Ed. Keinan E. Weinheim: Wiley-VCH, 2005. P. 534-542.

134. Паутова JI.B., Лактионов П.П., Рыкова Е.Ю., Якубов Л.А., Власов В.В. Исследование сайтов связывания олигонуклеотидов в молекуле иммуноглобулина // Мол. Биол. 1994. Т. 28. С. 1106-1112.

135. Rykova E.Yu., Pautova L.V., Yakubov L.A., Karamyshev V.N., Vlassov V.V. Serum immunoglobulins interact with oligonucleotides // FEBS Lett. 1994. V. 344. P. 96-98.

136. Hollams E.M., Giles KM., Thompson A.M., Leedman P.J. mRNA stability and the control of gene expression: implications for human disease // Neurochcm. Res. 2002. V. 27. P. 957-980.

137. Burd C., Matunis E., Dreyfuss G. The multiple RNA-binding domains of the mRNA poly(A) binding protein have RNA-binding activities // Mol. Cell. Buiol. 1991. V. 11. P. 3419-3424.

138. Gahan P.В., Swaminathan R. Circulating nucleic acids in plasma and serum. Recent developments //Ann. N.Y. Acad. Sci. 2008. V. 1137. P. 1-6.

139. Loke S.L., Stein C.A., Zhang X., Mori K, Nakanishi M., Subasinghe C., Cohen J.S., Neckers L.M. Characterization of oligonucleotide transport into living cells // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989. V. 86. P. 6474-6479.

140. Leimoni I.D., Sideris D.C., Fragoulis E.G. Purification from normal human plasma and biochemical characterization of a ribonuclease specific for poly(C) and poly(U) // Arch. Biochem. Biophys. 2003. V. 413. P. 83-90.

141. Shariat-Madar Z., Mahdi F., Schmaier A.H. Mapping binding domains of kininogenes on endothelial cell cytokeratin 1 // J. Biol. Chem. 1999. V. 274. P. 7137-7145.

142. Gonias S.L., Hembrough T.A., Sankovic M. Cytokeratin 8 functions as a major plasminogen in select epithelial and carcinoma cell lines // Front Biosci. 2001. V. 6. P. 1403-1411.

143. Wells M.J., Hatton M.W., Hewlett В., Podor T.J., Sheffield W.P., Blajchman M.A. Cytokeratin 18 is expressed on the hepatocyte plasma membrane surface and interacts with thrombin-antithrombin complexes // J. Biol. Chem. 1997. V. 272. P. 28574-28581.

144. Ramirez P., Del Razo L.M., Gutierrez-Ruiz M.C., Gonsebatt M.E. Arsenite induces DNA-protein crosslinks and cytokeratin expression in the WRL-68 human hepatic cell line // Carciogenesis. 2000. V. 21. P. 701-706.

145. Acosta J., Hettinga J., Fluckiger R., Krumrei N., Goldjine A., Angarita L., Halperin J. Molecular basis for a link between complement and the vascular complications of diabetes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. P. 5450-5455.

146. Thornalley P. J., Langborg A., Minhas H.S. Formation of glyoxal, methylglyoxal and 3-deoxyglucosone in the glycation of proteins by glucose // Biochem. J. 1999. V. 344. P. 109-116.

147. Ahmed N., Frye E.B., Degenhardt T.P., Thorpe S.R., Baynes J.W. iV-Epsilon-(carboxyethyl)lysine, a product of the chemical modification of proteins by methylglyoxal, increases with age in human lens proteins // Biochem. J. 1997. V. 324. P. 565-570.

148. Paul R.G., Avery N.C., Slatter D.A., Sims T.J., Bailey A. J. Isolation and characterization of advanced glycation end products derived from the in vitro reaction of ribose and collagen // Biochem. J. 1998. V. 330. P. 1241-1248.

149. Hayase F., Nagaraj R.H., Miyata S., Njoroge F.G., Monnier V.M. Aging of proteins: immunological detection of a glucose-derived pyrrole formed during Maillard reaction in vivo II J. Biol. Chem. 1989. V. 264. P. 3758-3764.

150. Wilker S.C., Chellan P., Arnold B.M., Nagaraj R.H. Chromatograhic quantification of argpyrimidine, a methylglyoxal-derived product in tissue proteins: comparison with pentosidine //Anal. Biochem. 2001. V. 290. P. 353-358.

151. Sell D.R., Monnier V.M. End-stage renal disease and diabetes catalyze the formation of a pentose-derived crosslink from aging human collagen // J. Clin. Invest. 1990. V. 85. P.380-384.

152. Schmitt A., Gasic-Milencovich J., Schmitt J. Characterization of advanced glycation end products: Mass changes in correlation to side chain modification // Anal. Biochem. 2005. V. 338. P. 201-215.

153. Shaklai N., Garlick R.L., Bunn H.F. Nonenzymatic glycosylation of human serum albumin alters its conformation and function Hi. Biol. Chem. 1984. V. 259. P. 3812-3817.

154. Mendez D.L., Jensen R.A., McElroy L.A., Pena J.M., Esquerra R.M. The effect of non-enzymatic glycation on the unfolding of human serum albumin II Arch. Biochem. Biophys. 2005. V. 444. P. 92-99.

155. Lapolla A., Fedele D., Traldi P. Diabetes and mass spectrometry // Diabetes. Metab. Res. Rev. 2001. V. 17. P. 99-112.

156. Lapolla A., Fedele D., Seraglia R., Catinella S., Baldo L., Aronica R., Traldi P. A new effective method for the evaluation of glycated intact plasma proteins in diabetic subjects // Diabetologia. 1995. V. 38. P. 1076-1081.

157. Jakubowski H. Protein homocysteinylation: possible mechanism underlying pathological consequences of elevated homocysteine levels // FASEB J. 1999. V. 13. P. 2277-2283.

158. Sikora M., Marczak L., Stobiecki M., Twardowski Т., Jakubowski H. Determination of 7V-homocysteinylated albumin in human serum // FEBS J. 2007. V. 274 (supplement 1). P. 295.

159. N'soukpoe-Kossi C.N., St-Louis C., Beauregard M., Subirade M, Carpenter R., Hotchandani S., Tajmir-Riahi H.A. Reservatrol binding to human serum albumin // J. Biomol. Struc. Dyn. 2006. V. 24. P. 277-283.

160. Dockal M., Carter D.C., Riiker F. The three recombinant domains of human serum albumin. Structure, characterization and ligand binding properties // J. Biol. Chem. 1999. V. 274. P. 29303-29310.

161. Али Хан M.B., Рашид 3., Али Хан В., Али Р. Биохимический, биофизический и термодинамический анализ сывороточного альбумина человека, гликозилированного in vivo // Биохимия. 2007. Т. 72. С. 175-183.

162. Coussons P.J., Jacoby J., McKay A., Kelly S.M., Price N.C., Hunt J.V. Glucose modification of human serum albumin: a structural study // Free Radical Biol. Med. 1997. V. 22. P. 1217-1227.

163. Nevinsky G.A., Kanyshkova T.G., Semenov D.V., Vlassov A.V., Gal'vita A.V., Buneva V.N. Secretory immunoglobulin A from healthy human mothers' milk catalyzes nucleic acid hydrolysis // Appl. Biochem. Biotechnol. 2000. V. 83. P. 115-129.

164. Buneva V.N., Kanyshkova Т.О., Vlassov А. V., Semenov D. V., Khlimankov D., Breusova L.R., Nevinsky G.A. Catalytic DNA- and RNA-hydrolyzing antibodies from milk of healthy human mothers //Appl. Biochem. Biotechnol. 1998. V. 75. P. 63-76.

165. Krasnorutski M.A., Buneva V.N., Nevinsky G.A. Immunization of rabbits with DNase I produces polyclonal antibodies with DNase and RNase activities // J. Mol. Recognit. 2008. V.21.P. 233-242.

166. Бабина C.E., Канышкова C.E., Бунева B.H., Невинский Г.А. Лактоферрип — дезоксирибонуклеаза человеческого молока// Биохимия. 2004. Т. 69. С. 1239-1250.

167. Takahashi Н., Sawa Н., Hasegawa Я, Sata Т., Hall W. W., Nagashima К., Kurala Т. Reconstitution of cleavage of human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) RNAs // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002. V. 293. P. 1084-1091.

168. Jarvinen P., Oivanen M., Lonnberg H. Interconversion and phosphoester hydrolysis of 2',5'- and 3',5'-dinucleoside monophosphates: kinetics and mechanisms // J. Org. Chem. 1991. V. 56. P.5396-5401.

169. Oivanen M., Schnell R., Pfleiderer W., Lonnberg H. Interconversion and hydrolysis of monomethyl and monoisopropyl esters of adenosine 2'- and З'-monophosphates: kinetics and mechanisms // J. Org. Chem. 1991. V. 56. P. 3623-3628.

170. Kierzek R. Nonenzymatic hydrolysis of oligoribonucleotides // Nucleic Acids Res. 1992. V. 20. P. 5079-5084.

171. Riepe A., Beier H., Gross H.J. Enhancement of RNA self-cleavage by micellar catalysis // FEBS Lett. 1999. V. 457. P. 193-199.

172. Bar bier В., Brack A. Conformation-controlled hydrolysis of polyribonucleotides by equential basic polypeptides//J. Am. Chem. Soc. 1992. V. 114. P. 3511-3515.

173. Raines R.T. Ribonuclease A // Chem. Rev. 1998. V. 98. P. 1045-1065.

174. Loverix S., Winqvist A., Stromberg R., Steyaert J. Mechanism of RNase Tl: concerted triester-like phosphoryl transfer via a catalytic three-centered hydrogen bond // Chem. Biol. 2000. V. 7. P. 651-658.

175. Lebedev A.V., Rezvukhin A.I. Tendencies of 3IP chemical shifts changes in NMR spectra of nucleotide derivatives //Nucleic Acids Res. 1984. V. 12. P. 5547-5566.

176. Sorrentino S., Libonati M. Human pancrcatic-type and non-pancreatic-type ribonucleases: a direct side-by-side comparison of their catalytic properties // Arch. Biochem. Biophys. 1994. V. 312. P. 340-348.

177. Kierzek R. Hydrolysis of oligoribonucleotides: influence of sequence and length // Nucleic Acids Res. 1992. V. 20. P. 5073-5077.

178. Isel C., Ehresmann C., Keith G., Ehresmann В., Marquet R Initiation of reverse transcription of H1V-1: secondary structure of the HIV-1 RNA/tRNA3Lys (template/primer) // J. Mol. Biol. 1995. V. 247. P. 236-250.

179. Варфоломеев С.Д., Гуревич КГ. Биокинетика: практический курс. М.: ФАИР-ПРЕСС. 1999. С. 60-67.

180. Herries D.G., Mathias А.Р. Rabin B.R. The activc site and mechanism of action of bovine pancreatic ribonuclease // Biochem. J. 1962. V. 85. P. 127—134.

181. Автор глубоко благодарен научному руководителю д.х.н. Т.С. Годовиковой за постоянную помощь и поддержку на всех этапах работы.