Взаимодействие компонентов системы инициации трансляции с цитоскелетом тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Иванов, Павел Александрович

• Иванов, Павел Александрович
• кандидат биологических наук
• 2003

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Иванов, Павел Александрович

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1. Иммобилизация и транспорт компонентов аппарата трансляции в цитоплазме.

Иммобилизация компонентов аппарата трансляции в цитоплазме.

Специфическая локализация мРНК в специализированных клетках.

Специфическая локализация мРНК в неспециализированных клетках.

Активный транспорт белковых компонентов аппарата трансляции.

2. Стрессовые гранулы.

3. Инициация трансляции.

Кэп-независимая инициация трансляции.

Регуляция инициации трансляции.

4. Фактор инициации трансляции 3 (eIF3).

Мотивы, содержащиеся в субъединицах eIF3.

Фактор инициации eIF3 почкующихся дрожжей S. cerevisia.

Фактор инициации eIF3 делящихся дрожжей S. pombe.

Фактор инициации eIF3 человека.

5. Большая субъединица фактора инициации 3 eIF3a.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

1. Работа с ДНК.

Бактериальные штаммы и среды.

Полимеразная цепная реакция.

Рестрикция и лигирование.

Приготовление компетентных клеток и трансформация клеток

Е. coli плазмидной ДНК.

Выделение плазмидной ДНК.

Электрофорез ДНК и элюция из геля.

2. Работа с белками.

Синтез белков в Е. coli.

Очистка рекомбинантных белков, трансляционно слитых с глютатион-Б-трансферазой (GST).

Очистка рекомбинантных белков, трансляционно слитых с 6 His.

Получение поликлональных антител.

Очистка поликлональных антител.

Другие использованные в работе антитела.

Электрофорез белков и иммуноблотинг.

Выделение тубулина из мозга крупного рогатого скота.

Получение МТ из раствора тубулина.

3. Работа с культивируемыми клетками млекопитающих.

Клеточные культуры.

Трансфекция культивируемых клеток.

Фиксация культивируемых клеток.

Непрямое иммунофлуоресцентное окрашивание клеток.

Прямое флуоресцентное окрашивание культивируемых клеток.

Количественные наблюдения клеток с стрессовыми гранулами и статистическая обработка результатов.

Преципитация белков из лизата клеток рекомбинантными фрагментами р170, иммобилизованными на в8Т-агарозе.

4. Буферные растворы.

РЕЗУЛЬТАТЫ.

1. Изучение формирования стрессовых гранул.

Качественные исследования стрессовых гранул.

Выявление стрессовых гранул с использованием антител к р170 и

РАВР.

Выявление РНК-связывающего белка р50 в составе стресс-гранул.

Изучение солокализации стрессовых гранул с актиновыми филаментами и микротрубочками.

Подавление образования стрессовых гранул в клетках с разрушенными микротрубочками.

Иммунофлуоресцентное окрашивание клеток с подавленным образованием стрессовых гранул на РАВР.

Разрушение микротрубочек не влияет на фосфорилирование е1Б2а при последующей индукции стрессовых гранул.

Образование стрессовых гранул при восстановлении

Микротрубочек в присутствии арсената натрия.

Предобработка клеток винбластином.

Предобработка клеток таксолом.

Предобработка клеток латранкулином В.

Количественные исследования стрессовых гранул.

30 минут инкубации с арсенатом.

Сравнение доли клеток со стрессовыми гранулами при различных условиях предобработки клеток

30 мин. инкубации с арсенатом).

Сравнение количества стресс-гранул в клетках при различных условиях предобработки клеток

30 мин. инкубации с арсенатом).

Сравнение относительного количества мелких стресс-гранул при различных условиях предобработки клеток (30 мин. инкубации с арсенатом).

Сравнение количества крупных стресс-гранул при различных условиях предобработки клеток (30 мин. инкубации с арсенатом).

120-минутная инкубация с арсенатом.

Сравнение доли клеток с стресс-гранулами при различных условиях предобработки (120 мин. инкубации с арсенатом).

Сравнение относительного количества стресс-гранул в клетках при различных условиях предобработки (120 минут инкубации с арсенатом).

Сравнение относительного количества мелких стресс-гранул при различных условиях предобработки клеток (120 мин. инкубации с арсенатом).

Сравнение количества крупных стресс-гранул при различных условиях предобработки клеток (120 мин. инкубации с арсенатом).

2. Изучение взаимодействия большой субъединицы е1РЗ р с микротрубочками.

Анализ первичной и предсказанной вторичной структуры белка р170.82 Клонирование полноразмерного р167 и его отдельных фрагментов

N-концевого, центрального, С-концевого и короткого С-концевого без аминокислотных повторов).

Характеристика антител к фрагменту р170Сс.

Установление идентичности белка, выявляемого антителами А170-Сс, и большой субъединицы фактора eIF3 pl 70.

Выявление р170 в препарате микротрубочек на различных стадиях очистки микротрубочек.

Иммунофлуоресцентное выявлние локализации белка pl в клетках CV-1.

Экспрессия в клетках полноразмерного pl70 и его фрагментов, трансляционно слитых с GFP.

Экспрессия полноразмерного pl70.

Экспрессия N-концевого фрагмента pl70N.

Экспрессия центрального фрагмента р170М.

Экспрессия С-концевого с повторами фрагмента р170С.

Экспрессия С-концевого без повторов фрагмента р170Сс.

Соосаждение тубулина с N-концевой областью р170, экспрессированной в E.coli, из лизата клеток Cos-1.

Соосаждение тубулина с N-концевой областью pl70, экспрессированной в E.coli, из раствора тубулина.

ОБСУЖДЕНИЕ.

ВЫВОДЫ.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Взаимодействие компонентов системы инициации трансляции с цитоскелетом»

Процесс трансляции является наиболее сложным и наименее изученным из всех процессов реализации генетической информации в клетке. Его расшифровка - одна из ключевых задач современной молекулярной и клеточной биологии. До последнего времени изучение процесса трансляции в основном проводилось на бесклеточных системах. Однако эти системы отличаются по своим свойствам от живых клеток. В частности, скорость общего синтеза белка в интактной клетке обычно в несколько раз выше, чем в бесклеточной системе. Данный феномен, скорее всего, связан с определенной пространственной организацией компонентов аппарата трансляции в цитоплазме, которая пока не была смоделирована в бесклеточной системе.

Очевидно, что пространственная организация аппарата трансляции возможна в случае иммобилизации компонентов аппарата трансляции в цитоплазме. Иммобилизация в цитоплазме может осуществляться за счет взаимодействия с какими-либо мембранными структурами (в частности, с эндоплазматическим ретикулумом) или за счет связывания с цитоскелетными элементами. Взаимодействие с эндоплазматическим ретикулумом транслирующих рибосом хорошо изучено. Существенно менее исследованным остается вопрос об иммобилизации аппарата трансляции за счет взаимодействия с цитоскелетом. Такое взаимодействие существует, поскольку при обработке клетки детергентами не происходит существенных потерь компонентов аппарата трансляции. Конкретные взаимодействия белковых или нуклеиновых компонентов аппарата трансляции с конкретными цитоскелетными структурами исследованы крайне слабо.

Цитоскелетные элементы, расположенные в цитоплазме, относятся к трем типам: это промежуточные филаменты, выполняющие структурную функцию, микрофиламенты, необходимые для движения и микротрубочки, функцией которых является чаще всего внутриклеточный транспорт. Для актиновых филаментов были показаны статические взаимодействия с факторами элонгации, связь с микротрубочками наблюдалась в случае активного транспорта по клеткам ряда мРНК.

Мы предположили, что перемещение по цитоплазме массивных компонентов аппарата трансляции возможно при активном транспорте по микротрубочкам или микрофиламентам. В качестве модели для изучения взаимодействия компонентов аппарата трансляции с цитоскелетом, нами было выбрано образование стрессовых гранул. При стрессорных воздействиях на клетку происходит резкое уменьшение общего белкового синтеза. На визуальном уровне, этот процесс сопровождается быстрым накоплением компонентов 48S инициаторного комплекса в нескольких десятках локусов в цитоплазме, называемых стрессовыми гранулами (Stress-granule). Предполагается, что в цитоплазме клетки конститутивно существуют определенные области, где происходит переход мРНК от стадии инициации трансляции к элонгации. При стрессорных воздействиях на клетку происходит ингибирование этого процесса, что приводит к накоплению в этих зонах компонентов 48S инициаторного комплекса (мРНК, малая рибосомальная субъединица, факторы инициации трансляции elFl, eIF4F и eIF3) и, соответственно, визуализации этих областей как стрессовых гранул (Kedersha and Anderson, 2001). Достаточно высокая скорость накопления компонентов 48S инициаторных комплексов в стрессовых гранулах позволяет предположить, что этот процесс может быть связан с цитоскелетными структурами. В частности, за счет активного транспорта могут перемещаться компоненты стрессовых гранул.

Изучению взаимосвязи между образованием стрессовых гранул и цитоскелетом посвящена первая часть нашей работы.

Вторым направлением нашей работы было исследование взаимодействия одного из компонентов стрессовых гранул - фактора eIF3 - с микротрубочками в норме. Первоначально в нашей лаборатории были получены данные, что большая субъединица этого фактора - белок pi 70 - находится в препарате микротрубочек, выделенных из мозгового слоя надпочечников крупного рогатого скота (Severin et al, 1999). Поэтому мы решили изучить, существует ли специфическое взаимодействие с микротрубочками этого белка и, если существует, чем оно может быть опосредовано.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Иванов, Павел Александрович

выводы

1. Для образования стрессовых гранул в клетках млекопитающих необходимы цитоплазматические микротрубочки. Экспериментальное разрушение микротрубочек приводит к ингибированию формирования стрессовых гранул. Экспериментальная стабилизация микротрубочек улучшает образование стрессовых гранул.

2. Ингибирующий эффект разборки микротрубочек на образование стрессовых гранул не связан с ингибированием фосфорилирования фактора е1Р2а.

3. Система актиновых филаментов не является необходимой для формирования стрессовых гранул.

4. взаимодействует с микротрубочками в клетках млекопитающихю.

5. Большая субъединица еШЗ р 170 может взаимодействовать с тубулином напрямую. Последовательность, взаимодействующая с тубулином, расположена в Ы-концевой части молекулы р170.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Иванов, Павел Александрович, 2003 год

1. Anderson J, Phan L, Hinnebusch AG. The Gcdl0p/Gcdl4p complex is the essential two-subunit tRNA( 1-methyladenosine) methyltransferase of Saccharomyces cerevisiae. //Proc Natl Acad Sci U S A 2000 Vol.97(10). p. 5173-8

2. Arrigo AP, Suhan JP, Welch WJ. Dynamic changes in the structure and intracellular locale of the mammalian low-molecular-weight heat shock protein. //Mol Cell Biol 1988 Vol. 8(12). p. 5059-71

3. Aronov S, Aranda G, Behar L, Ginzburg I. Visualization of translated tau protein in the axons of neuronal P19 cells and characterization of tau RNP granules. //J Cell Sci. 2002 Vol. 115(Pt 19). p. 3817-27.

4. Asano K, Phan L, Anderson J, and Hinnebusch AG. Complex Formation by All Five Homologues of Mammalian Translation Initiation Factor 3 Subunits from Yeast Saccharomyces cerevisiae. //J Biol Chem 1998 273, No. 29. p. 18573-18585.

5. Asano K, Clayton J, Shalev A, Hinnebusch AG. //Genes Dev 2000 Vol. 14(19). p. 2534-46

6. Bachmann F, Banziger R, Burger MM. Cloning of a novel protein overexpressed in human mammary carcinoma. //Cancer Res 1997 Vol. 57(5). p. 988-94

7. Ballestra J. Ihibitors of Eucaryotic Protein Synthesis. H. Trachseh, editor. CRC Press, London, 1991.

8. Bandyopadhyay A, Maitra U. Cloning and characterization of the p42 subunit of mammalian translation initiation factor 3 (eIF3): demonstration that eIF3 interacts with eIF5 in mammalian cells. //Nucleic Acids Res 1999. Vol. 27(5). p. 1331-7

9. Barbarese E, Koppel DE, Deutscher MP, Smith CL, Ainger K, Morgan F, Carson JH. Protein translation components are colocalized in granules in oligodendrocytes. //J Cell Sci. 1995 Vol.l08( Pt 8). p.2781-90.

10. Bassell GJ, Powers CM, Taneja KL, Singer RH. Single mRNAs visualized by ultrastructural in situ hybridization are principally localized at actin filament intersections in fibroblasts. //J Cell Biol. 1994 Vol. 126(4). p. 863-76.

11. Bektas M, Nurten R, Gurel Z, Sayers Z, Bermek E. Interactions of eukaryotic elongation factor 2 with actin: a possible link between protein synthetic machinery and cytoskeleton. //FEBS Lett. 1994 Vol. 356(1). p. 89-93.

12. Benne R, Hershey JW. The mechanism of action of protein synthesis initiation factors from rabbit reticulocytes. //J Biol Chem 1978 Vol. 253(9). p. 3078-87

13. Block KL, Vornlocher HP, Hershey JW. Characterization of cDNAs encoding the p44 and p35 subunits of human translation initiation factor eIF3. //J Biol Chem 1998 Vol. 273(48). p. 31901-8

14. Broadus J, Doe CQ. Extrinsic cues, intrinsic cues and microfilaments regulate asymmetric protein localization in Drosophila neuroblasts. //Curr Biol. 1997 Vol.7(11). p. 827-35.

15. Browning KS, Gallie DR, Hershey JW, Hinnebusch AG, Maitra U, Merrick WC, Norbury C. Unified nomenclature for the subunits of eukaryotic initiation factor 3. //Trends Biochem Sci 2001 Vol.26(5). p. 284

16. Burgin KE, Waxham MN, Rickling S, Westgate SA, Mobley WC, Kelly PT. In situ hybridization histochemistry of Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase in developing rat brain. //J Neurosci 1990 Vol. 10(6). p. 1788-98

17. Burks EA, Bezerra PP, Hahn Le, Gallie DR, Browning KS. Plant Initiation Factor 3 Subunit Composition Resembles Mammalian Initiation Factor 3 and Has a Novel Subunit. //JBC Vol. 276, No. 3 pp. 2122-2131

18. Bushell M, Wood W, Clemens MJ, Morley SJ. Changes in integrity and association of eukaryotic protein synthesis initiation factors during apoptosis. //Eur J Biochem 2000 Vol. 267(4). p. 1083-91

19. Carson JH, Worboys K, Ainger K, Barbarese E. (1997) Translocation of myelin basic protein mRNA in oligodendrocytes requires microtubules and kinesin. //Cell Motil Cytoskeleton. 1997 Vol. 38(4). p. 318-28

20. Chaudhuri J, Chowdhury D, Maitra U. Distinct functions of eukaryotic translation initiation factors elFIA and eIF3 in the formation of the 40 S ribosomal preinitiation complex. //J Biol Chem 1999 Vol. 274(25). p.17975-80

21. Chen CR, Li YC, Chen J, Hou MC, Papadaki P, Chang EC. Moel, a conserved protein in Schizosaccharomyces pombe, interacts with a Ras effector, Scdl, to affect proper spindle formation. //Proc Natl Acad Sci U S A 1999 Vol. 19. p. 96

22. Chen RH, Miettinen PJ, Maruoka EM, Choy L, Derynck R. A WD-domain protein that is associated with and phosphorylated by the type II TGF-beta receptor. //Nature 1995 Vol. 377(6549). p. 548-52

23. Chen, J.-J. Heme-regulated eIF-2alpha kinase, p. 529-546. In N. Sonenberg, J. W. B. Hershey, and M. B. Mathews (ed.), Translational control of gene expression. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.

24. Cohen CM, Foley SF, Korsgren C. A protein immunologically related to erythrocyte band 4.1 is found on stress fibres on non-erythroid cells. //Nature 1982 Vol. 299(5884). p.648-50

25. Collier, N. C., Heuser, J., Levy, M. A. and Schlesinger, M. J. Ultrastructural and biochemical analysis of the stress granule in chicken embryo fibroblasts. //J. Cell Biol. Vol. 106. p. 1131-1139.

26. Collier AJ, Gallego J, Klinck R, Cole PT, Harris SJ, Harrison GP, Aboul-Ela F, Varani G, Walker S. A conserved RNA structure within the HCV IRES eIF3-binding site. //Nat Struct Biol. 2002 Vol. 9(5). p.375-80.

27. Conboy JG. Structure, function, and molecular genetics of erythroid membrane skeletal protein 4.1 in normal and abnormal red blood cells. //Semin Hematol 1993 Vol. 30(1). p.58-73

28. Crosby, J. S., K. Lee, I. M. London, and J.-J. Chen. Erythroid expression of the heme-regulated eIF-2alpha kinase. //Mol. Cell. Biol. Vol. 14. p. 3906-3914

29. Danaie P, Wittmer B, Altmann M, Trachsel H. Isolation of a protein complex containing translation initiation factor Prtl from Saccharomyces cerevisiae. //J Biol Chem 1995 Vol. 270(9). p.4288-92

30. Dasso MC, Milbura SC, Hershey JW, Jackson RJ. Selection of the 5'-proximal translation initiation site is influenced by mRNA and eIF-2 concentrations. //Eur J Biochem 1990 Vol. 187(2). p.361-71

31. Fletcher CM, Pestova TV, Hellen CU, Wagner G. Structure and interactions of the translation initiation factor elFl. //EMBO J 1999 Vol. 18(9). p. 2631-7

32. Furukawa R, Jinks TM, Tishgarten T, Mazzawi M, Morris DR, Fechheimer M. Elongation factor lbeta is an actin-binding protein. //Biochim Biophys Acta. 2001 Vol. 1527(3). p. 130-40.

33. Fusco D, Accornero N, Lavoie B, Shenoy SM, Blanchard JM, Singer RH, Bertrand E. Single mRNA molecules demonstrate probabilistic movement in living Mammalian cells. //Curr Biol. 2003 Vol. 13(2). p. 161-7

34. Gaba A, Wang Z, Krishnamoorthy T, Hinnebusch AG, Sachs MS. Physical evidence for distinct mechanisms of translational control by upstream open reading frames. //EMBO J 2001 Vol. 20(22). p. 6453-63

35. Gallouzi IE, Brennan CM, Stenberg MG, Swanson MS, Eversole A, Maizels N, Steitz JA. HuR binding to cytoplasmic mRNA is perturbed by heat shock. //Proc Natl Acad Sci U S A 2000 Vol. 97(7). p. 3073-8

36. Garcia-Barrio MT, Naranda T, Vazquez de Aldana CR, Cuesta R, Hinnebusch AG, Hershey JW, Tamame M. GCD10, a translational repressor of GCN4, is the RNA-binding subunit of eukaryotic translation initiation factor-3. //Genes Dev 1995 Vol. 9(14). p. 781-96

37. Garcia-Mata R, Bebok Z, Sorscher EJ, Sztul ES. Characterization and dynamics of aggresome formation by a cytosolic GFP-chimera. //J Cell Biol. 1999 Vol. 146(6). p. 1239-54.

38. Garner CC, Tucker RP, Matus A. Selective localization of messenger RNA for cytoskeletal protein MAP2 in dendrites. //Nature 1988 Vol. 336(6200). p. 674-7

39. Gilbert SP, Webb MR, Brune M, Johnson KA. Pathway of processive ATP hydrolysis by kinesin. //Nature. 1995 Vol. 373(6516). p. 671-6.

40. Gingras AC, Raught B, Sonenberg N. eIF4 initiation factors: effectors of mRNA recruitment to ribosomes and regulators of translation. //Annu Rev Biochem 1999 Vol. 68. p. 913-63

41. Guo J, Hui DJ, Merrick WC, Sen GC. A new pathway of translational regulation mediated by eukaryotic initiation factor 3. //EMBO J 2000 Vol. 19(24). p. 6891-9

42. Hanachi P, Hershey JW, Vornlocher HP. Characterization of the p33 subunit of eukaryotic translation initiation factor-3 from Saccharomyces cerevisiae. //J Biol Chem 1999 Vol. 274(13). p. 8546-53

43. Harding HP, Zhang Y, Ron D. Protein translation and folding are coupled by an endoplasmic-reticulum-resident kinase. //Nature 1999 Vol. 397(6716). p. 271-4

44. Harding HP, Novoa I, Zhang Y, Zeng H, Wek R, Schapira M, Ron D. Regulated translation initiation controls stress-induced gene expression in mammalian cells. //Mol Cell 2000 Vol. 6(5). p. 1099-108

45. Hasek J, Kovarik P, Valasek L, Malinska K, Schneider J, Kohlwein SD, Ruis H. Rpglp, the subunit of the Saccharomyces cerevisiae eIF3 core complex, is a microtubule-interacting protein. //Cell Motil Cytoskeleton 2000 Vol. 45(3). p. 235-46

46. Heuijeijans JH, Pieper FR, Ramaekers FC, Timmermans LJ, Kuijpers H, Bloemendal H, Van Venrooij WJ. Association of mRNA and eIF-2 alpha with the cytoskeleton in cells lacking vimentin. //Exp Cell Res. 1989 Vol. 181(2). p. 317-30.

47. Hoareau Alves K, Bochard V, Rety S, Jalinot P. Association of the mammalian proto-oncoprotein Int-6 with the three protein complexes eIF3, COP9 signalosome and 26S proteasome. //FEBS Lett 2002 Vol. 527(1-3). p. 15-21

48. Hofmann K, Bucher P. The PCI domain: a common theme in three multiprotein complexes. //Trends Biochem Sci 1998 Vol. 23(6). p. 204-5

49. Hou CL, Tang C, Roffler SR, Tang TK. Protein 4.1R binding to eIF3-p44 suggests an interaction between the cytoskeletal network and the translation apparatus. //Blood 2000 Vol. 96(2). p. 747-53

50. Howe JG, Hershey JW. Translational initiation factor and ribosome association with the cytoskeletal framework fraction from HeLa cells. //Cell. 1984 Vol. 37(1). p. 85-93

51. Humphrey T, Enoch T. Suml, a highly conserved WD-repeat protein, suppresses S-M checkpoint mutants and inhibits the osmotic stress cell cycle response in fission yeast. //Genetics 1998 Vol. 148(4). p. 1731-42

52. Ingelfmger D, Arndt-Jovin DJ, Luhrmann R, Achsel T. The human LSml-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcpl/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci. //RNA 2002 Vol. 8(12). p. 1489-501

53. Jansen RP. RNA-cytoskeletal associations. //FASEB J. 1999 Vol. 13(3). p. 455-66.

54. Johnstone O, Lasko P. Translational regulation and RNA localization in Drosophila oocytes and embryos. //Annu Rev Genet. 2001 Vol. 35. p. 365-406.

55. Johnston J, Ward L, Kopito R. Aggresomes: A cellular response to misfolded proteins. //J. Cell Biol. Vol. 143. p. 1883-1898

56. Kedersha, N. L., Gupta, M., Li, W., Miller, I., and Anderson, P. RNA-binding proteins TIA-1 and TIAR link the phosphorylation of eIF-2 alpha to the assembly of mammalian stress granules. //J Cell Biol. Vol. 147. p. 1431-1442.

57. Kedersha, N., Cho, M. R., Li, W., Yacono, P. W., Chen, S., Gilks, N., Golan, D. E., and Anderson, P. Dynamic shuttling of TIA-1 accompanies the recruitment of mRNA to mammalian stress granules. //J Cell Biol. Vol. 151. p. 1257-1268.

58. Kimball SR, Everson WV, Flaim KE, Jefferson LS. Initiation of protein synthesis in a cell-free system prepared from rat hepatocytes. //Am J Physiol. 1989 Vol. 256(11). p. C28-34.

59. Kimball SR, Horetsky RL, Ron D, Jefferson LS, Harding HP. Mammalian stress granules represent sites of accumulation of stalled translation initiation complexes. //Am J Physiol Cell Physiol. 2003 Vol. 284(2). p. 273-84.

60. Kopito RR. Aggresomes, inclusion bodies and protein aggregation. //Trends Cell Biol. 2000 Vol. 10(12). p. 524-30.

61. Knowles RB, Sabry JH, Martone ME, Deerinck TJ, Ellisman MH, Bassell GJ, Kosik KS. Translocation of RNA granules in living neurons. //J Neurosci. 1996 Vol. 16(24). p. 7812-20.

62. Korneeva NL, Lamphear BJ, Hennigan FL, Rhoads RE. Mutually cooperative binding of eukaryotic translation initiation factor (elF) 3 and eIF4A to human eIF4G-l. //J Biol Chem 2000 Vol. 275(52). p. 41369-76

63. Kozak M The scanning model for translation: an update. //J Cell Biol 1989 Vol. 108. p. 229-241

64. Krauss SW, Chasis JA, Rogers C, Mohandas N, Krockmalnic G, Penman S. Structural protein 4.1 is located in mammalian centrosomes. //Proc Natl Acad Sci U S A 1997 Vol. 94(14). p. 7297302

65. Kurasawa Y, Watanabe Y, Numata O. Characterization of F-actin bundling activity of Tetrahymena elongation factor 1 alpha investigated with rabbit skeletal muscle actin. //Zoolog Sci. 1996 Vol. 13(3). p. 371-5.

66. Latham VM, Yu EH, Tullio AN, Adelstein RS, Singer RH. A Rho-dependent signaling pathway operating through myosin localizes beta-actin mRNA in fibroblasts. //Curr Biol. 2001 Vol. 11(13). p. 1010-6.

67. Lawrence JB, Singer RH. Intracellular localization of messenger RNAs for cytoskeletal proteins. //Cell. 1986 Vol. 45(3). p. 407-15.

68. Lenk R, Ransom L, Kaufmann Y, Penman S. A cytoskeletal structure with associated polyribosomes obtained from HeLa cells. //Cell. 1977 Vol. 10(1). p. 67-78.

69. Leto TL, Pratt BM, Madri JA. Mechanisms of cytoskeletal regulation: modulation of aortic endothelial cell protein band 4.1 by the extracellular matrix. //J Cell Physiol 1986 Vol. 127(3). p. 423-31

70. Li D. And Roberts R. WD-repeat proteins: structure characteristics, biological function, and their involvement in human diseases. //Cell. Mol. Life Sci. 2001 Vol. 58. p. 2085-2097

71. Li P, Yang X, Wasser M, Cai Y, Chia W. Inscuteable and Staufen mediate asymmetric localization and segregation of prospero RNA during Drosophila neuroblast cell divisions. /Cell. 1997 Vol. 90(3). p. 437-47.

72. Lin L, Holbro T, Alonso G, Gerosa D, Burger MM. Molecular interaction between human tumor marker protein pi50, the largest subunit of eIF3, and intermediate filament protein K7. //J Cell Biochem 2001 Vol. 80(4). p. 483-90

73. Lu L, Han A and Chen J Translation Initiation Control by Heme-Regulated Eukaryotic Initiation Factor 2alpha Kinase in Erythroid Cells under Cytoplasmic Stresses. //Molecular and Cellular Biology 2001 Vol. 21. p. 7971-7980,

74. Luby-Phelps K, Castle PE, Taylor DL, Lanni F. Hindered diffusion of inert tracer particles in the cytoplasm of mouse 3T3 cells. //Proc Natl Acad Sci USA. 1987 Vol. 84(14). p. 4910-3.

75. Mallardo M, Schleich S, Krijnse Locker J. (2001) Microtubule-dependent organization of vaccinia virus core-derived early mRNAs into distinct cytoplasmic structures. //Mol Biol Cell. 2001 Vol. 12(12). p. 3875-91.

76. Mathews, M. B. //Semin. Virol. 1984 Vol. 4. p. 247-257

77. Mayeur GL, Hershey JW. Malignant transformation by the eukaryotic translation initiation factor 3 subunit p48 (eIF3e). //FEBS Lett 2002 Vol. 514(1). p. 49-54

78. Medrano S, Steward O. Differential mRNA localization in astroglial cells in culture. //J Comp Neurol. 2001 Vol. 430(1). p. 56-71.

79. Methot N, Song MS, Sonenberg N. A region rich in aspartic acid, arginine, tyrosine, and glycine (DRYG) mediates eukaryotic initiation factor 4B (eIF4B) self-association and interaction with eIF3. //Mol Cell Biol 1996 Vol. 16(10). p. 5328-34

80. Methot N, Rom E, Olsen H, Sonenberg N. The human homologue of the yeast Prtl protein is an integral part of the eukaryotic initiation factor 3 complex and interacts with pi70. //J Biol Chem 1997 Vol. 272(2). p. 1110-6

81. Meyer LJ, Brown-Luedi ML, Corbett S, Tolan DR, Hershey JW. The purification and characterization of multiple forms of protein synthesis eukaryotic initiation factors 2, 3, and 5 from rabbit reticulocytes. //J Biol Chem 1981 Vol. 256(1). p. 351-6

82. Moriya M, Tanaka S. Prominent expression of protein kinase C (gamma) mRNA in the dendriterich neuropil of mice cerebellum at the critical period for synaptogenesis. //Neuroreport 1994 Vol. 5(8). p. 929-32

83. Morris EJ, Evason K, Wiand C, L'Ecuyer TJ, Fulton AB. Misdirected vimentin messenger RNA alters cell morphology and motility. //J Cell Sci. 2000 Vol. 113. p. 2433-43.

84. Morris-Desbois C, Bochard V, Reynaud C, Jalinot P. Interaction between the Ret finger protein and the Int-6 gene product and co-localisation into nuclear bodies. //Journal of Cell Science Vol. 112.p.3331-3342

85. Morris-Desbois C, Rety S, Ferro M, Garin J, Jalinot P. The human protein HSPC021 interacts with Int-6 and is associated with eukaryotic translation initiation factor 3. //J Biol Chem 2001 Vol. 276(49). p. 45988-95

86. Miyazaki S, Kozak CA, Marchetti A, Buttitta F, Gallahan D, Callahan R. The chromosomal location of the mouse mammary tumor gene Int6 and related pseudogenes in the mouse genome. //Genomics 1995 Vol. 27(3). p. 420-4

87. Naranda T, MacMillan SE, Hershey JW. Purified yeast translational initiation factor eIF-3 is an RNA-binding protein complex that contains the PRT1 protein. //J Biol Chem 1994 Vol. 269(51). p. 32286-92

88. Negrutskii BS, Stapulionis R, Deutscher MP. Supramolecular organization of the mammalian translation system. //Proc Natl Acad Sci USA. 1994 Vol. 91(3). p. 964-8.

89. Nover, L., Scharf, KD., and Neumann, D. Formation of cytoplasmic heat shock granules in tomato cell cultures and leaves. //Mol. Cell. Biol. Vol. 3. p. 1648-1655.

90. Nover, L., Scharf, KD. and Neumann, D. Cytoplasmic heat shock granules are formed from precursor particles and are associated with a specific set of mRNAs. //Mol. Cell. Biol. Vol.9, p. 1298-1308.

91. Oleynikov Y, Singer RH. Real-time visualization of ZBP1 association with beta-actin mRNA during transcription and localization. //Curr Biol. 2003 Vol. 13(3). p. 199-207.

92. Ong LL, Er CP, Ho A, Aung MT, Yu H. Kinectin anchors the translation elongation factor-1 delta to endoplasmic reticulum. //J Biol Chem. 2003 Vol.28

93. Pestova TV, Lomakin IB, Lee JH, Choi SK, Dever TE, Hellen CU. The joining of ribosomal subunits in eukaryotes requires eIF5B. //Nature 2000 Vol. 403(6767). p. 332-5

94. Pestova TV, Kolupaeva VG, Lomakin IB, Pilipenko EV, Shatsky IN, Agol VI, Hellen CU. Molecular mechanisms of translation initiation in eukaryotes. //Proc Natl Acad Sci U S A 2001 Vol. 98(13). p. 7029-36

95. Phan L, Schoenfeld LW, Valasek L, Nielsen KH, Hinnebusch AG. A subcomplex of three eIF3 subunits binds elFl and eIF5 and stimulates ribosome binding of mRNA and tRNA(i)Met. //EMBO J 2001 Vol. 20(11). p. 2954-65

96. Pincheira R, Chen Q, Zhang JT. Identification of a 170-kDa protein over-expressed in lung cancers. //Br J Cancer 2001 Vol.84(l 1). p. 1520-7

97. Piron M, Vende P, Cohen J, Poncet D Rotavirus RNA-binding protein NSP3 interacts with eIF4GI and evicts the poly(A) binding protein from elF4F. //EMBO J 1998 Vol 1. p. 17

98. Racca C, Gardiol A, Triller A. Dendritic and postsynaptic localizations of glycine receptor alpha subunit mRNAs. //J Neurosci. 1997 Vol. 17(5). p. 1691-700.

99. Ruzanov PV, Evdokimova VM, Korneeva NL, Hershey JW, Ovchinnikov LP. Interaction of the universal mRNA-binding protein, p50, with actin: a possible link between mRNA and microfilaments. //J Cell Sci. 1999 Vol. 112. p. 3487-96

100. Saramaki 0, Willi N, Bratt O, Gasser TC, Koivisto P, Nupponen NN, Bubendorf L, Visakorpi T. Amplification of EIF3S3 gene is associated with advanced stage in prostate cancer. //Am J Pathol 2001 Vol. 159(6). p. 2089-94

101. Scholler JK, Kanner SB. The human pl67 gene encodes a unique structural protein that contains centrosomin A homology and associates with a multicomponent complex. //DNA Cell Biol 1997 Vol. 16(4). p. 515-31

102. Shestakova EA, Motuz LP, Minin AA, Gelfand VI, Gavrilova LP. Some of eukaryotic elongation factor 2 is colocalized with actin microfilament bundles in mouse embryo fibroblasts. //Cell Biol Int Rep. 1991 Vol. 15(1). p. 75-84

103. Sheth U, Parker R. Decapping and decay of messenger RNA occur in cytoplasmic processing bodies. //Science 2003 Vol. 300(5620). p. 805-8

104. Shi J, Feng Y, Goulet AC, Vaillancourt RR, Sachs NA, Hershey JW, Nelson MA. The p34cdc2-related Cyclin-dependent kinase 11 Interacts with the p47 Subunit of Eukaryotic Initiation Factor 3 during Apoptosis. //J Biol Chem 2003 Vol. 278(7). p. 5062-71

105. Smith KE, Henshaw EC. Binding of Met-tRNA-f to native and derived 40S ribosomal subunits. //Biochemistry 1975 Vol. 14(5). p. 1060-7

106. St Johnston D, Brown NH, Gall JG, Jantsch M. A conserved double-stranded RNA-binding domain. //Proc Natl Acad Sci USA. 1992 Vol. 89(22). p. 10979-83

107. St Johnston D, Beuchle D, Nusslein-Volhard C. Staufen, a gene required to localize maternal RNAs in the Drosophila egg. //Cell. 1991 Vol. 66(1). p. 51-63

108. Stapulionis R, Kolli S, Deutscher MP. Efficient mammalian protein synthesis requires an intact F-actin system. //J Biol Chem. 1997 Vol. 272(40). p. 24980-6

109. Tang SJ, Meulemans D, Vazquez L, Colaco N, Schuman E. A role for a rat homolog of staufen in the transport of RNA to neuronal dendrites. //Neuron. 2001 Vol. 32(3).p. 463-75.

110. Taupin JL, Tian Q, Kedersha N, Robertson M, Anderson P. The RNA-binding protein TIAR is translocated from the nucleus to the cytoplasm during Fas-mediated apoptotic cell death. //Proc Natl Acad Sci U S A 1995 Vol. 92(5). p. 1629-33

111. Tiwari,R.K., Kusari,J. and Sen,G.C. Functional equivalents of interferon-mediated signals needed for induction of an mRNA can be generated by double-stranded RNA and growth factors. //EMBO J. Vol. 6. p. 3373-3378.

112. Tourriere H, Chebli K, Zekri L, Courselaud B, Blanchard JM, Bertrand E, Tazi J. The RasGAP-associated endoribonuclease G3BP assembles stress granules. //J Cell Biol 2003 Vol. 160(6). p. 823-31

113. Trachsel H, Erni B, Schreier MH, Staehelin T. Initiation of mammalian protein synthesis. II. The assembly of the initiation complex with purified initiation factors. //J Mol Biol 1977 Vol. 116(4). p. 755-67

114. Trachsel H, Staehelin T, Initiation of mammalian protein synthesis. The multiple functions of the initiation factor eIF-3. //Biochim Biophys Acta 1979 Vol. 565(2). p. 305-14

115. Valasek L, Trachsel H, Hasek J, Ruis H. Rpgl, the Saccharomyces cerevisiae homologue of the largest subunit of mammalian translation initiation factor 3, is required for translational activity. //J Biol Chem 1998 Vol. 273(33). p. 21253-60

116. Valasek L, Phan L, Schoenfeld LW, Valaskova V, Hinnebusch AG. Related eIF3 subunits TIF32 and HCR1 interact with an RNA recognition motif in PRT1 required for eIF3 integrity and ribosome binding. //EMBO J 2001 Vol. 20(4). p. 891-904

117. Valasek L, Hasek J, Nielsen KH, Hinnebusch AG. Dual function of eIF3j/Hcrlp in processing 20 S pre-rRNA and translation initiation. Hi Biol Chem 2001 Vol. 276(46). p. 43351-60

118. Valasek L, Nielsen KH, Hinnebusch AG. Direct eIF2-eIF3 contact in the multifactor complex is important for translation initiation in vivo. //EMBO J 2002 Vol. 21(21). p. 5886-98

119. Wells SE, Hillner PE, Vale RD, Sachs AB. Circularization of mRNA by eucaryotic translation initiation factors. //Mol Cell Vol. 2. p. 135-40

120. Wickham L, Duchaine T, Luo M, Nabi IR, DesGroseillers L. Mammalian staufen is a double-stranded-RNA and tubulin-binding protein which localizes to the rough endoplasmic reticulum. //Mol Cell Biol. 1999 Vol. 19(3). p. 2220-30.

121. Wu S, Kaufman R J. Double-stranded (ds) RNA Binding and Not Dimerization Correlates with the Activation of the dsRNA-dependent Protein Kinase (PKR). //JBC 1996 Vol. 271. p. 1756-1763

122. Wu S, Hu Y, Wang JL, Chattel.ee M, Shi Y, Kaufman RJ. Ultraviolet light inhibits translation through activation of the unfolded protein response kinase PERK in the lumen of the endoplasmic reticulum. //J Biol Chem 2002 Vol. 277(20). p. 18077-83

123. Yen HC, Chang EC. Yin6, a fission yeast Int6 homolog, complexes with Moel and plays a role in chromosome segregation. //Proc Natl Acad Sci U S A 2000 Vol. 97(26). p. 14370-5

124. Yen HC, Gordon C, Chang EC. Schizosaccharomyces pombe Int6 and Ras homologs regulate cell division and mitotic fidelity via the proteasome. //Cell 2003 Vol. 112(2). p. 207-17

125. Yisraeli JK, Sokol S, Melton DA. A two-step model for the localization of maternal mRNA in Xenopus oocytes: involvement of microtubules and microfilaments in the translocation and anchoring of Vgl mRNA. //Development. 1990 Vol. 108(2). p. 289-98.

126. Zhou Y, King ML. RNA transport to the vegetal cortex of Xenopus oocytes. //Dev Biol. 1996 Vol. 179(1). p. 173-83.