Вопросы генотипирования и анализ генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.02, доктор биологических наук Демина, Татьяна Васильевна

• Демина, Татьяна Васильевна
• доктор биологических наук
• 2012

Оглавление диссертации доктор биологических наук Демина, Татьяна Васильевна

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. Таксономия и классификация вируса клещевого энцефалита

Глава 2. Характеристика различий штаммов вируса клещевого энцефалита на уровне геномов

2.1. Структура генома вируса клещевого энцефалита

2.2. Выявление внутривидовых различий вируса КЭ и других флавивирусов на основании анализа первичных структур геномов

2.3. Молекулярная гибридизация нуклеиновых кислот (МГНК)

с плазмидными и дезоксиолигонуклеотидными зондами

III. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава 3. Материалы и методы

Глава 4. Конструирование панели специфических дезоксиолигонуклеотидных зондов, предназначенной для анализа структуры геномов и генотипирования штаммов вируса клещевого энцефалита

4.1. Разработка дизайна дезоксиолигонуклеотидных зондов для формирования панели, дифференцирующей штаммы ВКЭ

4.2. Отбор фрагментов генома для расчета специфических дезоксиолигонуклеотидных зондов

4.3. Формирование дифференцирующей панели зондов для скрининга геномов ВКЭ

Глава 5. Результаты апробации сконструированных олигонуклеотидных зондов для генотипирования ВКЭ

5.1. Апробация панелей генотипспецифических зондов в опытах гибридизации с РНК прототипных штаммов ВКЭ

5.2. Тестирование коллекционных штаммов ВКЭ с помощью

2

дифференцирующей панели олигонуклеотидных зондов

вМГНК

5.3. Оценка эффективности гибридизации полученных зондов

Глава 6. Типирование штаммов вируса клещевого энцефалита с использованием панели молекулярных зондов

6.1. Географическое распространение генотипов ВКЭ на Территории Евроазиатского ареала

6.2. Некоторые региональные эколого-географические особенности особенности ВКЭ

6.3. Сравнение региональных популяций ВКЭ с помощью графического анализа

Глава 7. Дифференциация штаммов вируса клещевого энцефалита на основе сравнения геномов

7.1. Сравнение данных генотипирования штаммов с использованием панели специфических зондов и

секвенирования фрагментов вирусных геномов

7.2. Субгенотипическая идентификация штаммов урало-сибирского урало-сибирского генотипа с помощью двух подходов

7.3. Возможности применения метода МГНК с наборами генотипспецифических зондов для изучения генетической вариабельности ВКЭ

Глава 8. Генотипы вируса клещевого энцефалита

8.1. Генотипы вируса клещевого энцефалита в свете данных типирования штаммов с помощью панели специфических зондов

8.2. Своеобразие штаммов 178-79 и 886-84 и сопоставление полногеномных структур и фрагментов генома вируса КЭ

8.3. О выявлении штаммов «группы 886»

8.4. Своеобразие штаммов 178-79 и 886-84 и анализ

полипротеиновых структур штаммов ВКЭ

8.5. Предположения о происхождении штаммов 178-79 и 886-84

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ I

ПРИЛОЖЕНИЕ II

ПРИЛОЖЕНИЕ III

ПРИЛОЖЕНИЕ IV

ПРИЛОЖЕНИЕ V

РНК - рибонуклеиновая кислота

СПИСОК ОСНОВНЫХ СОКРАЩЕНИЙ

а.о. - аминокислотный остаток

ВКЭ - вирус клещевого энцефалита

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

КЭ - клещевой энцефалит

ККЭ - комплекс клещевого энцфалита

МГНК - молекулярная гибридизация нуклеиновых кислот

н.о. - нуклеотидное основание

ОГЛ - омская геморрагическая лихорадка

ОТ-ПЦР - обратная транскрипция-полимеразная цепная реакция

ПЦР - полимеразная цепная реакция

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Вопросы генотипирования и анализ генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность исследований Неблагоприятное развитие эпидемической обстановки по клещевому энцефалиту (КЭ) отмечается периодически на многих территориях в пределах ареала возбудителя - вируса клещевого энцефалита (ВКЭ). Заболеваемость КЭ регистрируется более чем в 25 европейских и 7 азиатских странах (Charrel R.N. at al., 2004) [146]. Заболеваемость КЭ в Российской Федерации и странах Европы в последнюю четверть XX века имела тенденцию увеличения случаев заболевания и на рубеже веков достигла своего исторического максимума (Злобна В.И. и др., 2003; Злобны В.И., Львов Д.К., 2008; Локтев В.Б. и др., 2007 и др.) [50, 58, 83]. Первое десятилетие XXI века ознаменовалось спадом заболеваемости с колебаниями по годам, связанными с известной цикличностью данного процесса.

Необходимость изучения генетической вариабельности вируса КЭ диктуется, прежде всего, разнообразием проявлений клещевого энцефалита. Известно, что штаммы разных генотипов различаются по патогенности для людей и что разные регионы внутри обширного ареала возбудителя отличаются друг от друга по показателям риска заражения, заболеваемости, летальности и клинической манифестации КЭ. Изучение генетической вариабельности необходимо и для понимания эволюционных взаимоотношений между вирусами и эволюции собственно ВКЭ.

Вирус КЭ является типовым представителем группы флавивирусов млекопитающих, переносимых клещами, куда входят несколько видов, распространенных в географически удалённых друг от друга районах Европы, Азии и Америки. Однако эволюционные и генетические взаимоотношения, как между этими вирусами, так и между штаммами собственно ВКЭ, остаются недостаточно ясными. По-видимому, причина противоречий - в недостатке знаний о фундаментальных свойствах

изучаемого объекта - о геноме вируса и его изменчивости.

5

После установления полной структуры геномов трех штаммов ВКЭ {Плетнев А.Г. и др., 1989; Mandl С. at al., 1989; Сафронов П.Ф. и др., 1991) [91, 95, 193, 113] для анализа генетической вариабельности вируса разработаны различные модификации молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот (МГНК). Цикл работ по изучению возможности применения дезоксиолигонуклеотидных зондов в МГНК для характеристики различных аспектов изменчивости ВКЭ как в природных, так и в лабораторных условиях, показал перспективность метода для решения проблем таксоиомии и классификации вирусов, а также изучения их эволюционных взаимоотношений.

В результате изучения генетической вариабельности штаммов ВКЭ на основе анализа гомологии небольшого участка гена Е (160 и.о.) 34 штаммов в 2001 г. сделано предположение о существовании шести генотипов вируса {Злобил В.И. и др., 2001) [56] . Три из них определены как основные: генотип 1 - дальневосточный (штамм SoJjin), генотип 2 - западный (штамм Neudoerß) и генотип 3 - урало-сибирский (штаммы Lesopark-11, Vasilchenko) {Злобны В.И. и др., 2003) [50]. В литературе также принято упомянутые генотипы обозначать как дальневосточный, европейский и сибирский субтипы (Ecker М. at al., 1999) [156]. Штамм Turkish, описанный ранее как штамм вируса КЭ {Whitby J.Е., et al. 1993) [228] и включенный нами вместе со штаммом Vergina (описан Погодиной В.В. и др., 1993) [98] в состав генотипа 6, зарубежными исследователями классифицирован как вариант вируса шотландского энцефаломиелита овец (LI) {Heinz F.X. et al., 2000) [174]. Генотипы 4 и 5 представлены не группами, а одиночными штаммами - 17879 и 886-84. Оба изолированы на территории Иркутской области и отвечают критериям выделения в самостоятельные генотипы, установленным на основании степени геномных отличий. Было высказано предположение, что другие представители этих двух генотипов пока не найдены.

В составе исследованного фрагмента гена Е определен вариабельный

штаммов, относящихся к разным генотипам (Газо М.Х., 1999; Злобин В.И. и др., 2001) [25, 53]. На основе этой вариабельной последовательности получены синтетические дезоксиолигонуклеотидные зонды, пригодные для генетического типирования ВКЭ методом МГНК. Однако дифференциация штаммов ВКЭ с помощью панели, содержащей по одному зонду на каждый генотип, не позволяет типировать штаммы, в геноме которых имеются «случайные» нуклеотидные замены на участке, гомологичном зонду. И, разумеется, такая панель не предназначена для выявления конкретных особенностей каждого из исследуемых штаммов, что совершенно необходимо для изучения генетической вариабельности.

Между тем, постоянно пополняющиеся данные вепВапк по нуклеотидным последовательностям, подтверждая концепцию трех основных генотипов ВКЭ, указывают на наличие вариаций внутри них, а также на существование еще, как минимум, двух генотипов вируса с неопределенным пока ареалом и эпидемическим потенциалом (генотип 4 с прототипным штаммом 178-79 и генотип 5 с прототипным штаммом 886-84). Ситуация требует расширения исследований генетической структуры и квалификации штаммов (изолятов) из разных участков ареала.

Описанные обстоятельства в деле изучения вируса КЭ позволяют прийти к заключению о том, что для исследования его генетической вариабельности, наряду с дешифровкой нуклеотидных последовательностей, целесообразно использовать МГНК с наборами генотипспецифических зондов, комплементарных различным участкам генома.

Цель исследования - выявление природного генетического разнообразия возбудителя клещевого энцефалита для уточнения его внутривидовой классификации и совершенствования средств идентификации.

Для достижения этой цели поставлены следующие задачи:

1. Разработать панель генотипспецифических дезоксиолигонуклеотидных зондов для дифференциации штаммов ВКЭ на основе выявления вариабельных участков всех структурных и неструктурных генов вируса.

2. Показать возможность использования результатов гибридизационных опытов с наборами генотипспецифических дезоксиолигонуклеотидных зондов для популяционного анализа и скрининга геномов возбудителя КЭ.

3. Исследовать структуры геномов штаммов ВКЭ из разных частей ареала с помощью дифференцирующей панели дезоксиолигонуклеотидных зондов методом молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот (МГНК).

4. Осуществить анализ генетической вариабельности возбудителя КЭ.

5. Уточнить географическое распространение генотипов ВКЭ.

6. Сопоставить результаты генотипической дифференциации штаммов ВКЭ, выполненной разными способами.

7. Выявить генотипспецифические маркеры ВКЭ.

Заключение диссертации по теме «Вирусология», Демина, Татьяна Васильевна

выводы

1. Разработана панель дезоксиолигонуклеотидных зондов, пригодная для геногипирования и изучения генетической вариабельности ВКЭ.

2. Метод МГНК с предложенным набором зондов позволяет получать специфическую характеристику (паттерн гибридизации) каждого образца вирусной РНК и пригоден для целенаправленного скрининга геномов ВКЭ. Гибридизация с зондами, комплементарными специфическим участкам всех 10 генов вируса КЭ, дает информацию, соответствующую результатам полногеномного секвенирования, что позволяет формировать единый массив данных для популяционного анализа на основе использования обоих методов.

3. Метод МГНК с дифференцирующей панелью зондов позволил: а) установить гепотипспецифическую принадлежность каждого из 273 исследованных коллекционных штаммов; б) подтвердить уникальность строения генетической структуры штамма 178-79 - единственного известного представителя генотипа 4; в) впервые выявить изоляты вируса, гомологичные штамму 886-84 (генотип 5); г) обнаружить политиповые штаммы.

4. В очагах евроазиатского ареала циркулируют, по меньшей мере, 5 генотипов ВКЭ. Представители генотипов 1, 2 и 3, в отличие от штаммов генотипов 4 и 5, соответствуют трем официально признанным субтипам вируса КЭ (дальневосточному, западному и сибирскому). При сопоставлении нуклеотидной (кодирующей) и аминокислотной последовательностей 32 штаммов ВКЭ между генотипами выявлены сложные филогенетические отношения. Штамм 178-79 - прототип генотипа 5 - по уровню гомологии нуклеотидного состава наиболее близок генотипу 1 (11,2% различий). Штамм

886-84 — представитель генотипа 5 - в меньшей степени, чем генотип 4 родствен генотипу 1 (12,6%) и имеет больше общего с генотипами 3 (13,8%)

175 и 2 (15,5%), чем штамм 178-79 (14,4% и 16,1 соответственно). При этом тесней всего штаммы 178-79 (генотип 4) и 886-84 (генотип 5) связаны между собой (11,8%).

5. С помощью метода МГНК установлено географическое распространение генотипов возбудителя КЭ. Генотип 1 преобладает на Дальнем Востоке. Представители генотипа 2 выявляются преимущественно в Восточной Европе, встречаются на Алтае, редко - в Восточной Сибири и не обнаружены на Дальнем Востоке. Генотип 3 доминирует повсюду, исключая Дальний Восток и некоторые территории Восточной Европы. Генотип 4 представлен единственным изолятом из Восточной Сибири (нггамм 178-79). Генотип 5 обнаруживается на территории Восточной Сибири.

6. Результаты генотипирования 100 штаммов с применением разных подходов (МГНК с зондами разных поколений, секвенирования и ПЦР в режиме реального времени) в основном совпадают. Несовпадения в 9 случаях, возможно, являются следствием гетерогенности исходных изолятов ВКЭ и использованием для анализа образцов РНК, полученных на разных пассажах.

7. При сравнении полных аминокислотных последовательностей 32 штаммов ВКЭ для каждого из 5 генотипов выявлены специфические маркеры, расположенные по всему полипротеину. Наибольшее количество гснотипспецифических замен обнаружено у генотипа 2 (87), а наименьшее у штамма 178-79 (21) - единственного представителя генотипа 4. Генотипспецифическим признаком ВКЭ является определенное сочетание аминокислот в следующих 22 позициях: С-3, С-108, Е-206, Е-317, NS1-54, NS1-141, NS1-285, NS2A-100, NS2A-127, NS2A-174, NS2A-175, NS2A-225, NS3-126, NS3-258, NS3-376, NS4B-21, NS4B-28, NS4B-96, NS5-18, NS5-297, NS5-671, NS5-832.

8. Сравнительный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, а также исходы гибридизационных тестов, позволяют

176 предложить гипотезу, объясняющую происхождение штаммов 178-79 и 88684: структура их геномов - результат ряда последовательных множественных рекомбинаций между геномными молекулами трех основных генотипов вкэ.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Предварительно выполненный нами анализ данных вепВапк (2004 г.) показал, что существует, по меньшей мере, 5 генотипов ВКЭ и, что для дальнейшего изучения его генетической вариабельности целесообразно использовать метод МГНК с панелью из генотипспецифических наборов дезоксиолигонуклеотидных зондов, комплементарных всем десяти генам вируса.

Для выведения консенсусов зондов, дифференцирующих штаммы ВКЭ, нами были разработаны критерии, в соответствии с которыми рассчитано 40 олигонуклеотидных последовательностей (синтезированны фирмой «Синтол»). В состав панели вошли три генотипспецифических набора по 12 зондов каждый (на генотипы 1, 2 и 3), один зонд на генотип 4, два зонда на субгенотипы Васильченко и Заусаев и один видоспецифичный (универсальный) зонд. Наборы специфических зондов для генотипов 4 и 5 не представлялось возможным подобрать, поскольку отсутствовали данные по их полногеномным последовательностям.

С помощью разработанной панели исследовано 273 штамма ВКЭ и установлена генотипическая принадлежность каждого из них. Обработка полученных результатов позволила:

- идентифицировать представителей каждого из 5 известных генотипов;

- уточнить географическое распространение генотипов и субгенотипов генотипа 3 ВКЭ;

- показать возможность использования результатов гибридизационных тестов для популяционного анализа; выявить некоторые эколого-географические особенности региональных популяций вируса;

- подтвердить уникальность строения генетической структуры штамма 178-79 - единственного известного представителя генотипа 4;

- выявить изоляты вируса, гомологичные штамму 886-84, который был известен ранее как единственный представитель генотипа 5;

- обнаружить штаммы, представляющие собой смеси генотипов (или политиповые штаммы).

Результаты сравнения данных генотипирования штаммов с использованием панели специфических зондов и секвенирования фрагментов вирусных геномов, в основном, идентичны. Выявленные случаи несовпадений, вероятнее всего, являются следствием того, что образцы РНК таких штаммов, исследованых в различных лабораториях, получены на разных пассажах из гетерогенных (политиповых) природных изолятов (т.е., из изолятов, исходно являющихся смесями клонов разных генотипов).

Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей 32 штаммов вируса, относящихся к разным генотипам, показал, что на всем протяжении полипротеина наблюдается чередование аминокислот, как уникальных для каждого из пяти генотипов, так и характерных одновременно для двух, трех или четырех генотипов. Позиции мутаций, дифференцирующих основные генотипы и штаммы 178-79 и 886-84 (являющиеся типовыми представителями генотипов 4 и 5 соответственно) отобраны и сведены в таблицы. Установлено, что определенное сочетание аминокислот в 22 позициях, расположенных по всему полипротеину, является надежным генотипспецифическим признаком ВКЭ. Такие позиции выявлены в аминокислотных последовательностях белков С, Е, NSI, NS2A, NS3, NS4B, NS5. Наибольшее их количество (5) находится в последовательности белка NS2A. По общему количеству уникальных генотипспецифических аминокислотных замен «лидирует» генотип 2 (87), а наименьшее их число обнаружено у штамма 178-79 (21). Неравномерное распределение таких замен по последовательностям разных белков вируса указывает, вероятно, на различия их эволюционных историй.

Весьма важным представляется вопрос о происхождении штаммов 17879 и 886-84. Результаты исследований филогенетических отношений на основании различных фрагментов генома, сравнительного анализа полногеномных и полипротеиновых последовательностей, а также данные гибридизационных тестов позволяют сделать предположение о том, что геномы штаммов генотипов 4 и 5 представляют собой два варианта «переплетений» из последовательностей, характерных для генотипов 1, 2 и 3. Естественно также предположить, что «переплетение» или «мозаичность» из последовательностей, характерных для трех общепризнанных генотипов, является следствием рекомбинационных событий. Представляется, что в данном случае мы имеем дело с рядом последовательных множественных рекомбинаций между геномными молекулами трех генотипов ВКЭ.

Таким образом, полученные результаты показывают, что: 1) в масштабах всего обследованного ареала циркулирует стабильный набор генетических вариантов ВКЭ; 2) возможно, в эволюции вируса важную роль играет множественная гомологичная рекомбинация, и, при условии высокой частоты встречаемости, она же служит стабилизирующим фактором; 3) возможно, рекомбинационные события являются причиной противоречивости классификационных схем флавивирусов млекопитающих, переносимых клещами; 4) предложенный подход для скрининга геномов вируса - МГНК с панелью из наборов генотипспецифических олигозондов пригоден как для генотипической идентификации, так и для исследования генетической вариабельности вируса КЭ.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Демина, Татьяна Васильевна, 2012 год

Список литературы

1. Адельшин Р.В. Генетическая вариабельность вируса клещевого энцефалита на территории Европейской части Российской федерации и некоторых стран Восточной и Юго-Восточной Европы: Дис. канд. мед. наук. -Москва, 2006.- 136 с.

2. Адельшин Р.В., Злобин В.И., Беликов С.И. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита в европейской части России и некоторых странах Балтии, Восточной и Юго-Восточной Европы // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. - 2006. - № 2. - С. 27-34.

3. Адельшин Р.В., Злобин В.И., Вотяков В.И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных в республике Беларусь и на территориях сопредельных государств. // Здравоохранение. - Минск. - 2005. - № 11. - С. 18-22.

4. Алексеев А. Н. Система клещ-возбудитель и ее эмерджентные свойства // РАН, Зоол. Ин-т. - СПб, 1993.- С.200.

5. Андаев Е.И. Научно-организационные основы эпидемиологического надзора за природно-очаговыми и особо опасными вирусными инфекциями в Восточной Сибири: Дис. ... докт. мед. наук. -Иркутск, 2009. - 273 с.

6. Андаев Е.И., Трухина А.Г., Борисова Т.И. Изучение клещевого энцефалита и других арбовирусных инфекций в Иркутском противочумном институте // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2007. - № 3 (55). Прил. - С. 74-78.

7. Андаев Е. И., Трухина А. Г., Карань Л. С. и др. Клещевой энцефалит в Читинской области и этиология очаговых форм с летальным исходом // Бюл. СО РАМН. — 2007. — № 4 (126). — С. 60—65.

8. Андаев Е.И., Трухина А.Г., Карань Л.С. и др. Этиология очаговых форм клещевого энцефалита с летальными исходами в Читинской области // Мед. вирусология. М., 2006. - Т. 23. - С. 75-77.

9. Бахвалова B.II. Эпизоотическое состояние природного очага клещевого энцефалита и особенности вирусной популяции в лесостепном Приобье (Западная Сибирь): Автореф. дис. ... канд. биол. наук. Кольцово, 1994.-23 с.

10. Бахвалова В.Н., Морозова О.В., Морозов И.В. Свойства популяции вируса клещевого энцефалита в период 1980-2006 гг. на территории Новосибирской области // Дальневосточ. журн. инфекц. патологии. - Хабаровск, 2007. - № 11. - С. 118.

11. Бахвалова В.Н., Pap В.А., Ткачев С.Е. и др. Характеристика штаммов вируса клещевого энцефалита Западной Сибири. Сообщ. 1. Генетический анализ штаммов вируса клещевого энцефалита Западной Сибири // Вопр. вирусол. - 2000. - №5. - С. 11-13.

12. Безрукова (Гамова) Е.Г, Погодина В.В., Левина Л.С., Карань Л.С., Маленко Г.В. Изучение штаммов вируса клещевого энцефалита различных генотипов, выделенных от больных с хроническим течением болезни // Медицина в Кузбассе. Актуальные проблемы клещевых нейроинфекций. Материалы межрегиональной науч.- практич. конф. с междунар. уч. -Кемерово: ИД «Медицина и Просвещение», 2008. - С. 21-28.

13. Беликов С.И. Молекулярно-генетические подходы к изучению РНК-содержащих вирусов на моделях морбилливируса байкальской нерпы и вируса клещевого энцефалита: Автореф. дис. докт. биол. наук.- Владивосток,

2000.-38с.

14. Беликов С.И., Бутина Т.В., Демина Т.В., Злобин В.И. Генотипирование вируса клещевого энцефалита // Бюлл. ВСНЦ, Иркутск, 2002. - Т.2. - N4. - С.9-13.. - С.36-39.

15. Беликов С.И., Леонова Г.Н., Джиоев Ю.П., Злобин В.И. Анализ гетерогенности популяции вируса клещевого энцефалита на основе гибридизации РНК с олигонуклеотидными зондами и построения топологических деревьев // Тихоокеанский медицин, журнал. Владивосток,

2001. - N2. - С.43-46.

16. Беликов С.И., Леонова Г.Н., Кондратов И.Г. и др. Анализ полногеномных последовательностей штаммов вируса клещевого энцефалита дальневосточного субтипа, выделенных от больных с различной тяжестью заболевания // Вест. Рос. Воен.-мед. акад.: Тр. Всерос. науч. конф. «Теоретические основы эпидемиологии. Современные эпидемиологические и профилактические аспекты инфекционных и массовых неифекционных заболеваний». - СПб, 2008. - Прил. 2, №2 (22). - С. 591-592.

17. Бочкова Н.Г., Жезмер В.Ю., Трухина А.Г. и др. Серотип Айна/1448 вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 1985. - № 5. - С. 572-575.

18. Бочкова Н.Г., Погодина В.В., Левина Л.С. Серотип Айна/1448 вируса КЭ // Вирусы и вирусные инфекции человека. - М., 1981. - С.66-67.

19. Верхозина М.М. Молекулярно-эпидемиологическая и генетическая характеристика региональной популяции вируса клещевого энцефалита Восточной Сибири: Дис. ... канд. биол. наук. - Иркутск. - 2000. -163 с.

20. Верхозина М.М., Злобин В.И., Козлова И.В. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика региональной популяции вируса клещевого энцефалита Восточной Сибири // Бюлл. ВСНЦ СО РАМН. - 2002. - № 4, Т. 2. - С.46-49.

21. Верхозина М.М., Злобин В.И., Горин О.З. и др. Характеристика генетического состава природной популяции вируса клещевого энцефалита юга Восточной Сибири // Тез. докл. междунар. научн. конф. «Вирусные, риккетсиозные и бактериальные инфекции, переносимые клещами». -Иркутск, 1996.-С. 56-58.

22. Вирусология. Методы: Пер. с англ. / Под ред. Мейхи Б. - 1988.

172 с.

23. Вотяков В.И., Злобин В.И., Мишаева Н.П. Клещевые энцефалиты Евразии. - Новосибирск: Наука, 2002. - 438 с.

24. Вотяков В.И., Протас И.И., Жданов В.М. Западный клещевой энцефалит. - Минск, 1978 - 256 с.

25. Газо М.Х. Вопросы молекулярной эпидемиологии и молекулярной диагностики эпидемически значимых для России вирусов комплекса клещевого энцефалита: Дис. ... канд. биол. наук. - Иркутск. -1999.- 125 с.

26. Гайдамович С.Я. Арбовирусы: классификация и таксономия .. Арбовирусы. -М., 1986.-С. 5-15.

27. Гайдамович С.Я., Логинова Н.В. Семейство Togaviridae // Общая и частная вирусология. - M., 1982. - Т. 2. - С. 49-94.

28. Горин О.З., Злобин В.И. Современные аспекты проблемы КЭ в Восточной Сибири // Вост-Сиб. журн. инфекц. патол. - Иркутск, 1994. - № 1. -С. 11-15.

29. Горин О.З., Мунгалова Н.П., Леонов В.А. и др. Ситуация по клещевому энцефалиту на западе Читинской области // Этиология, эпидемиология и диагностика инфекционных заболеваний Восточной Сибири: Сб. науч. работ ИЭМ СО РАМН к 80-летию. - Иркутск, 1992. С. 44 -53.

30. Данчинова Г.А., Хаснатинов М.А., Абмэд Д. и др. Иксодовые клещи - переносчики клещевых инфекций на приграничных с Россией территориях Монголии // Current issues of zoonotic infections diseases. Reports. - Ulaanbaatar. - 2008. - P. 151-158.

31. Демина T.B. Характеристика генетической вариабельности штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии участков вирусного генома: Дис. ...канд. биол. наук. - Иркутск, 1999. - 157 с.

32. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М. и др. Изучение возбудителя клещевого энцефалита с помощью зондирования генома // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2007. - № 3. - С. 94-98.

33. Джиоев Ю.П. Молекулярно-эпидемиологический и

филогенетический анализ генетической гетерогенности популяций вируса

181

клещевого энцефалита на азиатской территории России: Дис. ... канд. биол. паук. - Иркутск, 2000. - 155 с.

34. Джиоев Ю. П., Беликов С. И., Каня О. В. И др. Молекулярная гибридизация т вки как метод изучения патоморфогенеза вируса клещевого энцефалита в нервной системе человека // Материалы расширенного пленума проблемной комиссии клещевой и другие вирусные энцефалиты. - М., 2003. — С. 57—58.

35. Джиоев Ю.П., Злобин В.И., Беликов С.И. и др. Степень вариабельности геномных структур штаммов региональных популяций вируса клещевого энцефалита // Тихоокеанск. мед. журн. - 2001. - № 2. -С.119.

36. Джиоев Ю.П., Злобин В.И., Беликов С.И. и др. Параметрический кластерный анализ штаммовых генетических вариаций в природных популяциях вируса клещевого энцефалита. Сообщение 2. Кластерный анализ Амуро-Сахалинской региональной популяции вируса клещевого энцефалита // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2002. - Т.2, № 4. - С. 5760.

37. Джиоев Ю.П., Злобин В.И., Беликов С.И. и др. Параметрический кластерный анализ штаммовых генетических вариаций в природных популяциях вируса клещевого энцефалита. Сообщение 1. Разработка кластерного анализа генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита на основе результатов гибридизационных тестов (математический расчет параметров штаммовой гетерогенности) // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2002. - Т. 2, № 4. - С. 55-57.

38. Джиоев Ю.П., Злобин В.И., Беликов С.И., Адельшин Р.В. Эволюционный возраст популяции вируса клещевого энцефалита на азиатской территории России // Бюл. ВСНЦ СО РАМН. - 2002. - Т. 2, № 4. -С. 60-63.

39. Джиоев Ю.П., Злобин В.И., Демина Т.В. и др. Генетическая

вариабельность вируса клещевого энцефалита в азиатской части России //

182

Тез. докл. междунар. науч. конф. «Вирусные, риккетсиозные и бактериальные инфекции, переносимые клещами». - 1996, Иркутск. - С. 5960.

40. Добрикова Е.Ю., Плетнев А.Г., Шаманин В.А. Обнаружение вируса клещевого энцефалита в крови людей и в индивидуальных клещах методом молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот // Вопр. вирусол. - 1986.-№6.-С. 739-742.

41. Дрокин Д.А. Индикация и идентификация флавивирусов методом молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот: Автореф. дис. канд. биол., наук. - Томск, 1993. - 19 с.

42. Дрокин Д.А., Злобин В.И., Карганова Г.Г., Вихорева Т.В. и др. Изменение геномов штаммов вируса клещевого энцефалита в результате пассажей на мышах // Вопр. вирусол. - 1994. - № 4. - С. 160-162.

43. Дрокин Д. А., Злобин В. И., Шаманин В. А. Выбор оптимальных олигонуклеотидных зондов для идентификации флавивирусов // Итоги науки и техники. Вирусология. - М., 1991. - Т.24. - С. 59-60.

44. Зильбер Л.А. Весенний (весеннее-летний) эпидемический клещевой энцефалит // Архив биол. наук. - 1939. - Т. 56. - Вып. 2. - С. 9-37.

45. Зильбер Л.А. Сравнительное изучение штаммов дальневосточного и западного клещевых энцефалитов на обезьянах // Журн. гигиены, эпидемиол., микробиол. и иммунол. - Прага, 1962. - № 4, вып.1. - С. 57-64.

46. Зильбер Л.А. Эпидемические энцефалиты. - М.: Медгиз, 1945. -

255 с.

47. Злобин В.И. Молекулярная эпидемиология - новый подход к анализу вариабельности вируса клещевого энцефалита // Журн. микробиол. -1991.-№ 7.-С. 80-82. ......

48. Злобин В.И. Молекулярно-биологическое определение и генотипическая дифференциация вируса клещевого энцефалита: Дис. ... докт. мед. наук. - М., 1992. - 67 с.

49. Злобин В.И. Природно-очаговые трансмиссивные инфекции Сибири и Дальнего Востока // Журн. инф. патол. - Иркутск, 1998. - Т.5, №2 -3.-С.-3-8. .....

50. Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.ГТ. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. - Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003.-271 с.

51. Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Новая концепция природной генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита // Тихоокеанск. мед. журн. - 2001. - № 2. - С. 75-78.

52. Злобин В.И., Борисов В.А., Верхозина М.М. и др. Клещевой энцефалит в Восточной Сибири. - Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2002. -183 с.

53. Злобин В.И., Газо М.Х., Беликов С.И. и др. Молекулярные зонды для генетического типирования вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 43 - 47.

54. Злобин В.И., Горин О.З. Клещевой энцефалит: этиология. Эпидемиология и профилактика в Сибири. - Новосибирск: Цаука, 1996. - 177 с.

55. Злобин В.И., Демина Т.В., Беликов С.И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. -С. 16-21.

56. Злобин В.И., Демина Т.В., Мамаев Л.В. и др. Анализ генетической вариабельности штаммов вируса клещевого энцефалита по первичной структуре фрагмента гена белка оболочки Е // Вопр. вирусол.-2001.-№ 1.-С. 12-16.

57. Злобин В.И., Дрокин Д.А., Мансуров П.Г. и др. Типирование штаммов вируса клещевого энцефалита по растворимому антигену // Вопр. вирусол. - 1991. - № 1. - С. 24-27.

58. Злобин В.И., Львов Д.К. Клещевой энцефалит // Медицинская вирусология: руководство. -М.: МИА, 2008. - С. 548-553.

59. Злобин В.И., Мамаев Л.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В. Генетические типы вируса клещевого энцефалита // Журн. инф. патол. -Иркутск, 1996. - Т. 3, № 4. - С. 13-17.

60. Злобин В.И., Мамаев Л.В., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Верхозина М.М. Молекулярно-биологические данные подтверждают

1 генетическую самостоятельность восточно-сибирского подтипа вируса

клещевого энцефалита (прототипный штамм Айна/1448) // Тез. докл. междунар. науч. конф. "Вирусные, риккетсиозные и бактериальные инфекции, переносимые клещами". - Иркутск, 1996. - С. 61-62.

61. Злобин В.И., Погодина В.В., Дрокин Д.А. и др. Специфическое определение флавивирусов методом молекулярной гибридизации с синтетическими дезоксиолиго-нуклеотидными зондами // Вопр. вирусологии -2003. - № 3. - С. 23-27.

62. Злобин В.И., Шаманин В.А., Дрокин Д.А. и др. Географическое распространение генетических вариантов вируса клещевого энцефалита. // Вопр. Вирусол. - 1992. - № 5-6. - С. 252 - 256

63. Злобин В.И., Шаманин В.А., Плетнев А.Г. и др. Специфическая реактивность кДНК- и дезоксиолигонуклеотидных зондов, комплементарных геному вируса клещевого энцефалита, с РНК штаммов различного географического происхождения // Вопр. вирусол. - 1992. - № 5-6. - С. 248252.

64. Исаева М.П. Молекулярно-генетическая характеристика популяции вируса клещевого энцефалита Южно-Сихотэ-Алиньского очагового региона: Дис. канд. мед. наук. - Владивосток, 1998. - 24 с.

65. Исаева М.П. Кожемяко В.Б., Леонова Г.Н., Майстровская О.С. Изучение дальневосточных штаммов вируса клещевого энцефалита с помощью метода молекулярной гибридизации // Проблемы инфекционной

патологии в Сибири, на Дальнем Востоке и Крайнем Севере. - Новосибирск, 1996.-С. 9-10.

66. Калишер 4.X.(Calisher С.Н.). Антигенная классификация и таксономия флавивирусов (семейство Flaviviridae). Создание универсальной системы для таксономии вирусов, вызывающих клещевой энцефалит // Acta virol. - 1988. - Т. 32. - С. 464-473.

67. Карань JT.C., Браславская С.И., Мязин А.Е. Развитие методов детекции и генотипирования вируса клещевого энцефалита на основе амплификационных технологий // Вопр. вирусол. - 2007. - № 6. - С. 17-22.

68. Карань JT.C., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г. и др. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4. - С. 34-40.

69. Карань JT.C., Погодина В.В., Фролова Т.В., Платонов А.Е. Генотипические различия восточно-европейской и азиатской популяций вируса клещевого энцефалита сибирского подтипа // Бюл. сиб. мед. - 2006. -Т.5, прил. 1.-С. 24-27.

70. Кларк Д.Х. (Clark D.H.). Дальнейшие исследования антигенных связей между арбовирусами группы В // Бюл. ВОЗ. - 1964. - Т. 31, № 1. - С. 50-66.

71. Ковалёв С.Ю., Умпелева Т.В., Снитковская Т.Э. и др. Молекулярно- эпидемиологическая характеристика вируса клещевого энцефалита на территории Свердловской области на основе генотипспецифической ОТ-ПЦР // Вопр. вирусол. - 2008. - № 2. - С. 27 - 31.

72. Козлова И.В. Молекулярная эпидемиология и антигенная характеристика урало-сибирского генотипа вируса клещевого энцефалита: Дис. ... канд. мед. наук. - Иркутск, 2000. - 156 с.

73. Козлова В.И., Злобин В.И., Верхозина М.М. и др. Молекулярная эпидемиология и генетическая характеристика урало-сибирского генотипа вируса клещевого энцефалита // Бюл. ВСНЦ РАМН. - 2002 . - Т. 2, № 4. - С. 70-73.

74. Козлова И.В., Злобин ■ В.И., Мамаев JI.B., Джиоев Ю.П. и др. «Лесопарк-11» прототипный шгамм урало-сибирского подтипа вируса клещевого энцефалита // Тез. докл. междунар. науч. конф. «Вирусные, риккетсиозные и бактериальные инфекции, переносимые клещами». -Иркутск, 1996. - С. 62-64

75. Краминская H.H., Живоляпина Р.Р., Мейерова P.A., Перевозников В.А. Своеобразный штамм вируса клещевого энцефалита. Выделенный от больного с прогредиентным течением заболевания // Актульные проблемы вирусных инфекций. -М., 1965. - С. 190-191.

76. Краминская H.H., Живоляпина Р.Р., Перевозникова В.А. К вирусологической и иммунологической характеристике некоторых очагов КЭ в Восточной Сибири // Клещевой энцефалит. - Минск, 1965. - С. 211-212.

77. Кулакова Н.В. Молекулярно-генетическая характеристика дальневосточных штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных от людей с различными формами инфекционного процесса: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. - Владивосток, 2003. - 22 с.

78. Кулакова PI.B., Беликов С.И., Леонова Т.Н., Борисевич В.Г. Определение генотипа штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных от больных людей с различной степенью тяжести инфекции на территории юга Дальнего Востока России // Клещевой энцефалит. - Владивосток: ГУП «Приморский полиграфкомбинат», 2002. - С. 60-71.

79. Леонова Г.В. Клещевой энцефалит в Приморском крае. -Владивосток: Дальнаука, 1997. - 187 с.

80. Леонова Г.Н., Беликов С.И., Борисевич В.Б., Кожемяко В.В. Новые перспективы в изучении клещевого энцефалита //Тихоокеанск. мед. жури. - 2001. - Т. 7. - № 2. - С. 17-22.

81. Леонова Г.Н., Кожемяко В.Б., Исаева М.И., Майстровская О.С. Молекулярная характеристика популяции вируса клещевого энцефалита Южно-Сихотэ-Алиньского очагового региона // Вопр. вирусол. - 1996. - № 4. -С. 154-158.

82. Леонова Г.Н., Мураткина С.М., Кругляк С.П. Изучение вирулентности штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на юге Советского Дальнего Востока // Вопр. вирусол. - 1990. - № 5. - С. 399401.

83. Локтев В.Б., Терновой В.А., Нетесов C.B. Молекулярно-генетическая характеристика вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. -2007. -№ 5.-С. 10-16.

84. Лохов М.Г., Блинникова И.А. К структурно-функциональной характеристике очагов клещевого энцефалита в Бичурском районе Бурятской АССР // Природноочаговые инфекции Восточной Сибири. Сб. науч. тр. -Иркутск: Иркутский мединститут, 1986. - С. 44 - 52.

85. Львов Д.К., Дерябин П.Г. Флавивирусы (Flaviviridae) // Медицинская вирусология: руководство. - М.: МИА, 2008. — С. 228-235.

86. Ляпина О.В., Прилипов А.Г., Громашевский В.Л. Структура и анализ генома вируса Карши //Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции».- Астрахань, 2006. - С. 62-68.

87. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. -М.: Мир, 1984. - 477с

88. Молекулярная клиническая диагностика. Методы: Пер. с англ. / Под ред. С. Херрингтона, Дж. Макги. - М.: Мир, 1999. - 558 с.

89. Морозова О.В. Свойства некоторых белков вируса клещевого энцефалита: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. - Кольцово, 2001. - 40 с.

90. Морозова О.В., Бахвалова В.Н., Добрикова ЕЛО., Максимова Т.Г. Клеточные белки взаимодействуют с РНК вируса клещевого энцефалита // Журн. инф. патол. - 1996. - Т. 3, № 4. - С. 44-46.

91. Плетнев А.Г. Структура и организация генома вируса клещевого энцефалита // Арбовирусы и арбовирусные инфекции: Тез. докл. междунар.симп. — М., 1989. - С. 25 - 26.

92. Плетнев А.Г. Структура, организация и детекция генома вируса клещевого энцефалита. Дис. ... докт. хим. наук. - М., - 1990. - 304с.

93. Плетнев А.Г., Ямщиков В.Ф. Ы-концевые аминокислотные последовательности структурных белков вируса клещевого энцефалита // Биоорг. химия. - 1985.-Т. 11,№ 12.-С. 1681-1684.

94. Плетнев А.Г., Ямщиков В.Ф., Блинов В.М. Нуклеотидная последовательность участка генома вируса клещевого энцефалита, кодирующего структурные белки вириона // Биоорган, химия. - 1986. - Т. 12, №9.-С. 1189-1202.

95. Плетнев А.Г., Ямщиков В.Ф., Блинов В.М. Нуклеотидная последовательность генома и полная аминокислотная последовательность полипротеина вируса клещевого энцефалита // Биоорган, химия. - 1989. -Т. 15,№ 11.-С. 1504-1521.

96. Погодина В.В. Мониторинг популяций вируса клещевого энцефалита и этиологической структуры заболеваемости за 60-летний период // Вопр. вирусол. - 2005. - № 3. - С. 7-13.

97. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Злобин В.И и др. Вергинаподобные штаммы вируса клещевого энцефалита в России // Вопр. вирусол. - 1995. - № 6. - С. 260-264.

98. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Злобин В.И. и др. Генетическая характеристика серотипа Вергина вируса клещевого энцефалита и особенности его // Вопр. вирусол. - 1993. - № 4. - С. 158-163.

99. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Мониторинг популяции вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России. Практические аспекты проблемы // Биопрепараты. - 2004. -№2 (14).-С. 7-13.

100. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сибирский и дальневосточный подтипы вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России: генетическая и антигенная характеристика штаммов // Вопр. вирусол. - 2004. - № 3. - С .20-25.

189

101. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Корешкова Г.В. Свойства штаммов серотипа Айна/1448 вируса КЭ // Вопр. вирусол. - 19816. - № 6. - С. 741-746.

102. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С. и др. Иммунологические и некоторые этиологические аспекты изучения серотипа Айна/1448 вируса КЭ // Вопр. вирусол. - 1981. - № 6. - С. 735-741.

103. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С. и др. Комплексная характеристика сибирского подтипа вируса клещевого энцефалита // "Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)". - Владивосток, 2002. - С. 7287.

104. Погодина В.В., Карань Л.С., Колясникова Н.М. и др. Эволюция клещевого энцефалита и проблема эволюции возбудителя // Вопр. вирусол. -2007.-№5.- С. 16-21.

105. Погодина В.В., Трухина А.Г., Шаманин и др. Дезоксиолигонуклеотидные зонды, дифференцирующие антигенные и патогенетические варианты вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. -1992.-№ 1.-С. 53-56.

106. Погодина В.В., Фролова М.П., Ермап Б.А. Хронический клещевой энцефалит. - Новосибирск: Наука, 1986. - 233 с.

107. Пуховская Н.М. Изучение природных популяций вируса клещевого энцефалита методом молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. -М., 1994.-24 с.

108. Пуховская Н.М., Верета Л.А., Островская О.В., Шаманин В.А., Плетнев А.Г. Обнаружение вируса клещевого энцефалита в клещах гибридизацией нуклеиновых кислот // Мед. паразит. - 1989. - Т. 3. - С. 11-14.

109. Пуховская Н, М., Верета Л.А., Шаманин В.А., Плетнев А.Г. Диагностические возможности метода молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот для обнаружения вируса клещевого энцефалита. // Вопр. вирусол. - 1991.-Т. 36. - С. 250-253.

110. Романова Л. Ю., Гмыль Л. В., Локтев В. Б. и др. Изменение

антигенной структуры поверхностного гликопротеина Е вируса клещевого

190

энцефалита при его адаптации к клещам и млекопитающим // Вопр. вирусол. -2006.-№51 (6).-С. 31-34.

111. Рубин С.Г., Чумаков М.П., Пападопулос О. Антигенный тип штамма Вергина вируса клещевого энцефалита, выделенного в Греции в 1969 г. от больного козленка // Вопр. мед. вирусол. — М., 1975. - С. 353-354.

112. Рубин С.Г., Чумаков М.П., Семашко И.В. Антигенные типы и подтипы штаммов вируса КЭ из различных регионов (вопросы классификации, географического распространения) // Вирусы и вирусные инфекции человека: Тез. конф. - М., 1981. - С. 63-64.

113. Сафронов П.Ф., Нетесов C.B., Микрюкова Т.П. и др. Нуклеотидная последовательность генов и полная аминокислотная последовательность полипротеина вируса клещевого энцефалита штамма 205 // Молек. генет. микробиол. вирусол. - 1991 - № 4. - С. 23-29.

114. Смородинцев A.A.,Дубов A.B. Клещевой энцефалит и его вакцинопрофилактика. - Л., 1986. - 232 с.

115. Стефенсон Дж. P. (Stephenson J.R.). Классификация флавивирусов, передающихся клещами // Acta virol. - 1989. - T. 33. - С. 471.

116. Терновой В.А., Протопопова Е.В., Чаусов Е.В., Бондаренко Т.Ю.,Новиков Д.В., Леонова Г.Н., Нетесов C.B., Локтев В.Б. Нуклеотидная последовательность генома нового варианта вируса клещевого энцефалита, изолированного в Приморском крае // Дальневосточ. журн. инфекц. патологии. - Хабаровск, 2007. - № 11. - С. 119.

117. Ткачев С.Е., Ливанова Н.Е., Ливанов С.Г. Исследование генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита сибирского генетического типа, выявленного в клещах Ixodes persulcatus на Северном Урале в 2006 году // Дальневосточ. журн. инфекц. патологии. - Хабаровск, 2007. -№ 11.-С. 119-120.

118. Ткачев С.Е., Ливанова H.H., Ливанов С.Г. Исследование генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита сибирского

генетического типа, выявленного в клещах Ixodes persulcatus на Северном Урале в 2006 году // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). — С. 49-52.

119. Трухина А.Г. Особенности циркуляции возбудителя КЭ в зоне распространения двух серотипов вируса на территории Прибайкалья: Дис. ... канд. мед. наук. - Иркутск, 1989. - 176 с.

120. Трухина А.Г., Чипанин В.И., Васенин A.A., Воронко И.В., Арбатская Е.В. Экологические особенности сочетанных очагов двух серотипов вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Деп. во ВНИИМИ, 1988. -Д-16114. - 16 с.

121. Трухина А.Г., Чипанин В.И., Воронко И.В. Результаты изучения биологических свойств и особенностей циркуляции вируса КЭ серотипа Айна/1488 в Прибайкалье // Этиология, эпидемиология и диагностика инфекционных заболеваний Восточной Сибири. - Иркутск, 1992. — С. 84-91.

122. Хаснатинов М.А., Данчинова Г.А., Н. В. Кулакова Н.В. и др. Генетическая характеристика возбудителя клещевого энцефалита в Монголии // Вопр. вирусол. - 2010. - № 3. - С. 27-32.

123. Хозинская Г.А. Изучение экологических и вирусологических аспектов смешанной инфекции вирусами Повассан и клещевого энцефалита иксодовых клещей, позвоночных животных и культур клеток: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. - М., 1986. - 22 с.

124. Чаусов Евгений Владимирович. Генетическое разнообразие вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) и других инфекционных агентов у иксодовых клещей в городских и пригородных биотопах г. Томска. Секвенирование и молекулярно-биологический анализ генома штамма ВКЭ Глубинное/2004 : Дис.... канд. биол. наук. - Кольцово, 2009.- 143 с.

125. Чумаков М.П., Кусов Ю.Ю., Рубин С.Г. и др. Клонирование и изучение первичной структуры ДНК-копий участков генома вируса клещевого энцефалита // Биоорган, химия. - 1983. - Т. 9, № 2. - С. 276-279.

126. Чумаков М.П., Рубин С.Г., Линев М.Б. Три антигенных типа

вируса клещевого энцефалита, их зависимость от основных видов клещей-

192

переносчиков и географическое распространение // Вопр. мед. вирусол. - М., 1975.-С. 371-372.

127. Чунихин С.П., Дживанян Т.Н. Экологические маркеры арбовирусов: ДС-маркер вируса клещевого энцефалита // Вестн. АМН СССР. - 1977.-№5.-С. 17-21.

128. Чунихин С.П., Леонова Г.Н. Экология и географическое распространение арбовирусов. - М:: Медицина, 1985. - 126 с.

129. Шаманин В.А. Детекция штаммов вируса клещевого энцефалита методом молекулярной гибридизации нуклеиновых кислот // Автореф. дис. ... канд. биол. наук. - Новосибирск, 1990. - 24 с.

130. Шаманин В.А., Злобин В.И., Плетнев А.Г. Фрагмент нуклеиновой кислоты - зонд для выявления и идентификации флавивирусов / Патент № 1678835. Роспатент. -1993.

131. Шаманин В.А., Злобин В.И., Плетнев А.Г. Фрагмент нуклеиновой кислоты - зонд для выявления и идентификации флавивирусов, переносимых комарами / Патент № 1678837.-Роспатент. 1993.

132. Шаманин В.А., Плетнев А.Г., Злобин В.И. Применение молекулярной гибридизации с синтетическими дезоксиолигонуклеотидами для дифференциации штаммов вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 1990. - № 6. - С. 474-478.

133. Шаманин В.А., Плетнев А.Г., Рубин С.Г., Злобини В.И. Дифференциация вирусов комплекса клещевого энцефалита методом РНК-ДНК гибридизации//Вопр. вирусол. - 1991. -№ 1.- С. 27-31.

134. Шасаитов Ш.Ш., Домаев Ю.А К вопросу о клещевом энцефалите в Читинской области // Тез. докл. зональн. конф. МЗ РСФСР «Влияние природно-климатических факторов на функциональное состояние человека». -Чита, 1980. С.-97-99.

135. Якименко В.В., Дрокин Д.А., Калмин О.Б., и др. К вопросу о влиянии ИоБ^эффекта на штаммовую изменчивость вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол.- 1996. - № 3. - С. 112-117.

193

136. Ямщиков В.Ф. Нуклеотидная последовательность участка генома вируса клещевого энцефалита, кодирующего вирионные белки С, М, Е и неструктурный белок NS1: Дис. ... канд. хим. наук. - Новосибирск, 1989. -170 с.

137. Bakhvalova V.N., Rar V.A., Tkachev S.E. et al. Tick-borne encephalitis virus strains of Western-Siberia // Virus Res. - 2000. - 70 (1-2). - P. 1-12.

138. Block J. Genetic relationships of Dengue virus serocomplex // J. Gen. Virol. 1985. - Vol. 66. - P. 1323-1325.

139. Block J., Kay B.H., Hall R.A., Gorman B.M. Isolation and characterization of Dengue serotype 1 from an endemic in northern Queensland, Australia // Arch. Virol. - 1988. - Vol. 100. - № 3-4. - P. 213-220.

140. Blok J., Hechal E.A., Gorman B.N. Comparison of dengue viruses and some other flaviviruses by cDNA-RNA hybridization analysis and detection of aclose relationship between denge virus serotype 2 and Edge Hill virus // J. Gen. Virol. - 1984. - Vol. 65. - P. 2173-2181.

141. Blok J., Samuel S., Gibbs A.J., Vitarana U.T. Variation of the nucleotide and encoded amino acid sequences of the envelope gene from eight dengue-2 virus // Arch. Virol. - 1989. - Vol. 105. - P. 39-53.

142. Brinton M. Replication of flaviviruses // The Togaviridae and Plaviviridae / Ed. By S. Schlesinger, M.J. Schlesinger. - N.Y.: Plenum Press, 1986.-P. 327-374.

143. Brinton M.A., Dispoto J.H. Sequence and secondary structure analysis of 5-terminal region of flavivirus genome RNA // Virology. - 1988. - Vol. 162. -P. 290-299.

144. Calisher C.H., Carabatsos N., Dalrymple J.M. et al. Antigenic Relationships between Plaviviruses as Determined by Cross-neutralization Tests with Polyclonal Antisera // J. Gen. Virol. - 1989. - Vol. 70. - P. 37-43.

145. Castle E. & Wengler G. Nucleotide sequence of the 5'-terminal untranslated part of the genome of the flavivirus West Nile virus // Arch. Virol. -1987.-Vol. 92.-P. 309-313.

146. Castle E., Leidner U. , Nowak Th. et al. Primary structure of the Uest Nile flavivirus genome regions coding for all nonstructural proteins // Virology. — 1986.-Vol. 149.-P. 10-26.

147. Chen W.-R., Tesh R.B., Rico-Gesse R. Genetic variation of Japanese encephalitis virus in nature//J. Gen. Virol. - 1990. - Vol. 71. - P. 2915-2922.

148. Chumakov M.P., Kusov Yu.Yu., Rubin S.G. et al. Cloning and primary structure of DNA copies of genome fragments of the tick-borne encephalitis virus. // Acta Virol. - 1985. - Vol.6. - P. 694 - 701.

149. Chungue E., Cassar O., Druet M.T. et al. Molecular epidemiology of dengue-1 and dengue-4 viruses // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76. - P. 1877-1884.

150. Clark D.H. Further studies on antigenic relationship among the viruses of the group B tick-borne complex // Bull. Wld. Hlth. Org. - 1964. - Vol. 31. - P. 45-56.

151. Clarke D.H. Antigenic analysis of certain group B arthropod-borne viruses by antibody absorption // J. Exp. Med. - 1960. - Vol. 111. - P. 25-36.

152. Coelen R.G., Flynn L.M. & Mackenzie J.S. Two-dimensional gel electrophoresis of RNase T1 resistant oligonucleotides of flavivirus RNA using ultrathin gelsV/ Journal of Virological Methods. - 1989. - Vol. 23. - P. 71-76.

153. Coelen R.J., Mackenzie J.S. Genetic variation of Murray Valley encephalitis virus // J. Gen. Virol. - 1988. - Vol. 69. - P. 1903-1912.

154. De Madrid A.T., Porterfield. The Flviviruses (group B arboviruses): a cross neutralization study // J. Gen. Virol. - 1974. - Vol. 23. - P. 91-96.

155. Deubel V., Digoutte J.P., Monath T.P., Girard M. Genetic heterogeneity of Yellow fever virus strains from Africa and Americas // J. Gen. Virol. - 1986.-Vol. 67.-P. 209-213.

156. Ecker M., Allison S.L., Meixner T., Heinz F.X. Sequence analysis and genetic classification of tick-borne encephalitis viruses from Europe and Asia // J. Gen. Virol. - 1999.-Vol. 80.-P. 179-185.

157. Fenner F. Classification and nomenclature of viruses (Second Report of the ICTV) // Intervirology. - 1976. - № 7. - P. 1-115.

158. Flynn L.M., Coelen R.J., Mackenzie J.S. Kunjin virus isolates of Australia are genetically homogeneus // J. Gen. Virol. - 1988. - Vol. 69, № 8. - P. 1903-1912.

159. Francki R.I.B., Fauquet C.M., Knudson D.L., Brown F. (eds) Classification and nomenclature of viruses. Fifth report of the International Committee on Taxonomy of viruses // Arch. Virol. - 1991. - Supplem. 2. - P. 290299.

160. Gao G. F., Hussain M. H., Reid H. W. & Gould E. A. Classification of a new member of the TBE flavivirus subgroup by its immunological, pathogenetic and molecular characteristics: identification of subgroup-specific pentapeptides // Virus Res. - 1993 .-Vol. 30.-P. 129- 144.

161. Golovljova I, Katargina O, Geller J, Tallo T, Mittzenkov V, et al. Unique signature amino acid substitution in Baltic tick-borne encephalitis virus (TBEV) strains within the Siberian TBEV subtype / Int. J. Med. Microbiol. -2008. - Vol. 298. - P. 108-120.

162. Golovljova I, Vene S, Sjolander KB. et al. Characterization of tickborne encephalitis virus from Estonia // J/ Med. Virol. - 2004. - Vol. 74(4). - P. 580-588.

163. Grard G., Moureau G., Charrel R.N. et al. Genetic characterization of tick-borne flaviviruses: new insights into evolution, pathogenetic determinants and taxonomy // Virology. - 2007. - Vol. 361. - P. 80-92.

164. Gritsun T.S., Frolova T.V., Pogodina V.V. et al. Nucleotide and deduced amino acid sequence of the envelope gene of the Vasilchenko strain of TBE virus; comparison with other flaviviruses // Virus Res. - 1993. - Vol. 27. - P. 201-209.

165. Gritsun T.S., Frolova T.V., Zhankov A.I. et al. Characterization of a Siberian virus isolatied from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. - 2003. - Vol. 77, № 1. - P. 25-36.

166. Gritsun T.S., Lashkevich V.A., Gould E.A. Nucleotide and deduced amino acid sequence of the envelope glycoprotein of Omsk haemorrhagic fever virus; comparison with other flaviviruses // J. Gen. Virol. - 1993. - Vol. 74 ( Pt 2). -P. 287-91.

167. Gritsun T.S., Venugopal K., Zanotto P.M., Mikhailov M.V. et al. Complete sequence of two tick-borne flaviviruses isolated from Siberia and the UK: analysis and significance of the 5' and 3'-UTRs // Virus Res. - 1997. -Vol. 49(1).-P. 27-39.

168. Guirakhoo F., Heinz F.X., Mandl C.W. et al. The relationship between the flaviviruses Scalica and Langat as reveald by monoclonal antibodies, peptide mapping and RNA sequence analysis // J. Gen. Virol. - 1991. - Vol. 72. - P. 333338.

169. Hahn C.S., Galler R., Hunkapiller T. et al. Nucleotide sequence of Dengue 2 RNA and comparison of the encoded proteins with those of other flaviviruses//Virology.- 1988.-Vol. 162.-P. 167-180.

170. Hahn C.S., Dalrimple J. M., Strauss J.H., Rice C.M. Comparison of the virulent Asibi strain of yellow fever virus with the 17 D vaccine strain derived from it // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1987. - Vol. 84. - P. 2019-2023.

171. Hayasaka D., Ivanov L., Leonova G.N. et al. Distribution and characterization of tick-borne encephalitis viruses from Siberia and far-eastern Asia//J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82.-P. 1319-1328.

172. Hayasaka D., Suzuki Y., Kariva H. et al. Phylogenetic and virulence ahalysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and far-eastern Russia // J. Gen. Virol. - 1999.-Vol. 80.-P. 3127-3135.

173. Heinz F.X., Ecker M., Mandle C.W., Holzmann H. The molecular epidemiology of tick-borne encephalitis virus in Europe and Asia // 4-th

International Potsdam Symposium "Tick-borne encephalitis and Lyme borrelliosis". - 1997. - P. 27-33.

174. Heinz F.X., Collett M.S., Purcell R.H. et al. Family Flaviviridae // Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. - San Diego: Acad. Press, 2000. -P.-858-878.

175. Hori H. Oligonucleotide fingerprint analysis on Japanese encephalitis (JE) virus strains of different geographic origin // Trop. Med. - 1986. - Vol. 28. -179-190.

176. Hori H., Igarashi A., Youshida I., Takagi M. Oligonucleotide fingerprint analysis on Japanese encephalitis virus strains in Japan and Thailand // Acta Virol. - 1986. - Vol. 30. - P. 353-359.

177. Hori H., Morita K., Igarashi A. Oligonucleotide fingerprint analysis on Japanese encephalitis virus strains after passage histories // Acta virol. - 1986. -Vol. 30.-P. 428-431.

178. Innis M.A. Gel fand D.H. Optimization of PCRs. // PCR Protocols / Eds. M.A. Innis, D.H. Gelfand, Sninsky and White. -N.Y.: Acad. Press, 1990. - P. -3-12.

179. Jääskeläinen A.E., Tikkakoski T, Uzcätegui N.Y. et al. Siberian subtype tickborne encephalitis virus, Finlan // Emerg. Infect. Dis. - 2006. - Vol. 12(10).-P. 1568-1571.

180. Kaarinen L., Soderlund H. Structure and replication of alphaviruses // Curr. Trop Microbiol. Immunol. - 1978. - Vol. 82. - P. 15-69.

181. Karabatsos N. International catalogue of arboviruses // 3 ed. American Society of tropical medicine and hygiene. - San Antonio, Tex., 1985.

182. Kerschner J.H., Vonrdäm A.V., Monath T.P., Trent D.W. Genetic and epidemiological studies of Dengue type 2 viruses by hybridization using synthetic deoxyoligonucleotides as probes // J. Gen. Virol. - 1986. - Vol. 67. - P. 26452661.

183. Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Unursaikhan U. et al. Chracterization of tick-borne encephalitis virus that caused the lethal meningoencephalitis human in Mongolia // Inter. Conference Zoonotic infections desease and tourism. - Ulaanbaatar, 2009. - P. 88-93.

184. Kovalev S.Y., Chernykh D.A., Kokorev V.S. et al. Origin and distribution of tick-borne encephalitis virus strains of the Siberian subtype in the Middle Urals, the north-west of Russia and the Baltic countries // J. Gen. Virol. -2009. - Vol. 90 (Pt 12). - P. 2884-2892.

185. Kovalev S.Y. Kokorev V.S., Belyaeva I.V. Distribution of Far-Eastern tick-borne encephalitis virus subtype strains in the former Soviet Union // J. Gen. Virol.-2010.-Vol. 91 (Pt 12).-P. 941-946.

186. Kuno G., Chang G-JJ., Tsuchiya K.R. et al. Phylogeny of genus Flavivirus // J. Virol. - 1998. - Vol. 72. - P. 73-83.

187. Lanciotti R.S., Lewis J.G., Gubler D.J., Trent D.W. Molecular evolution and epidemiology of dengue-3 viruses // J. Gen. Virol. — 1994. — Vol. 75. -P. 65-75.

188. Lobigs M., Marshall I.D., Weir R.C., Dalgarno L. Genetic differentiation of Murrey Valley encephalitis virus in Australia and Papua New Guinea // Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. - 1986. - Vol. 64. - P. 571-585.

189. Lobigs M., Marshall I.D., Weir R.C., Dalgarno L. Murrey Valley encephalitis virus field strains Australia and Papua New Guinea studies on the sequence of the major envelope protein gene and virulence for mice // Vorology. -1988.-Vol. 165.-P. 245-255.

190. Lobigs M ., Weir R.C., Dalgarno L. Genetic analysis of Kanjin virus isolates using Hae III and Taq 1 restriction digest of single stranded cDNA to virion RNA//Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. - 1986. - Vol. 64.-P. 185-196.

191. Mandl C.W., Guirakhoo F., Holsmann PI. et al. Antigenic structure of the flavivirus envelope protein E at the molecular level, using tick-borne encephalitis virus as model//J. Virol. - 1989.-Vol. 63.-P. 564-571.

192. Mandl C.W., Heinz P.X., Kunz Ch. Sequence of structural proteins of tick-borne encephalitis virus (western subtype) and comparative analysis with other flaviviruses // Virology. - 1988. - Vol. 166. - P. 197 - 205.

193. Mandl C.W., Heinz F.X., Stockl E, Kunz C. Genome sequence of tick-borne encephalitis virus (Western subtype) and comparative analysis of nonstructural proteins with other flaviviruses // Virology. - 1989. - Vol. 173(1). -P. 291-301.

194. Mandl C.W., Holzmann H., Kunz C., Heinz F. Complete genomic sequence of powassan virus evaluation of genetic elements in tick-borne versus mosquito-borne flaviviruses // Virology. - 1993. - Vol. 194. - P. 173-184.

195. Mandl C.W., Iacono-Connoris L., Wallner G. et al. Sequence of the low-virulence tick-borne flavivirus Langat TP21 and Yelantsev // Virology. -1991.-Vol. 185.-P. 891-895.

196. Marin M.S., Zanotto P.M., Gritsun T.S., Gould E.A. Phylogeny of TYU, SRE, and SFA virus different evolutionary rates in the genus flavivirus // Virology. - 1995.-Vol. 206, №2.-P. 1133-1139.

197. Mayo M.A., Pringle C.R. Virus Taxonomy-1997 // J. Gen. Virol. -1998.-Vol. 79.-P. 649-657.

198. Monath T.P., Wands J.R., Hill L.J. et al. Geographic classification of dengue-2 virus strains by antigen signature analysis // Virology. - 1986. - Vol. 154(2).-P. 313-324.

199. Papa A., Pavlidou V., Antoniadis A. Greek goat encephalitis virus strain isolated from Ixodes ricinus, Greece // Emerg. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 14(2).-P. 330-332. .....

200. Papadopoulos O, Paschaleri-Papadopoulou E, Deligaris N, Doukas G. Isolation of tick-borne encephalitis virus from a flock of goats with abortions and fatal disease (preliminary report) // Veterinary News Greece. - 1971. - Vol. 3. - P. 112-114.

201. Pletnev A.G., Yamshchikov V.F., Blinov V.M. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-borne encephalitis virus // Virology. - 1990. - Vol. 174. - P. 250-263.

202. Pletnev A.G., Yamshchikov V.F., Blinov V.M. Tick-borne encephalitis virus genome // FEBS Lett. - 1986. - Vol. 200. - P. 317-321.

203. Pogodina V.V., Frolova T.V., Frolova M.P. et al. Molecular hybridization with cloned fragments of tick-borne encephalitis (TBE) virus cDNA in acute and chronic TBE infection // Acta Virol. - 1991. - Vol.35 (1). - P.71-80.

204. Porter K.R., Summers P.L., Dubois D. et al. Detection of West Nile virus by polymerase chain reaction and analysis of nucleotide sequence variation // Amer. J. Trap. Med. Hyg. - 1993. - Vol. 43. - P. 440-446.

205. Repic P.M., Dalrimple J. M. , Brandt Id. E. et al. RNA fingerprinting as a method for distinguishing dengue I virus strains // Amer. J. Trop. Med. Hyg. -1983.-Vol.32.-P. 577-589.

206. Rice C.M., Lenches E.M., Eddy S.R. et al. Nucleotide sequence of yellow fever virus: implications for flavivirus gene expressions // Science. - 1985. -Vol. 229.-P. 726-733.

207. Rice C.M., Strauss E.G., Strauss J.H. In Togaviridae and Flaviviridae (S. Schlesingher, M.J. Schlesingher., eds.) -N.Y.: Plenum Press, 1986. - P. 279326.

208. Romanova L. Iu., Gmyl A.P., Dzhivanian T.I. et al. Microevolution of tick-borne encephalitis virus in course of host alternation // Virology. - 2007. -Vol. 362.-P. 75-84.

209. Rubin S.G, Chumakov M.P. New data on the antigenic types of tickborne encephalitis virus. In: Arboviruses in the Mediterranean countries (Veseniak-Hirjan J, Porterfield JS, Arslanagic E, eds.). - Stuttgart and New York: Gustav Fischer, 1980. - P. 231-236.

210. Shamanin V.A., Pletnev A.G., Rubin S.G., Zlobin V.I. Differentiation of strains of tick-borne encephalitis virus by means of RNA-DNA hybridization //

J. Gen. Virol. - 1990 . - Vol. 71. - P. 1505-1515.

201

211. Shiu S.Y.W., Aires M.D., Gould F.A. Genomic sequence of the structural proteins of Louping ill virus: comparative analysis with tick-borne encephalitis virus//Virology. - 1991.-Vol. 180. - P. 411-415.

212. Strauss J.H., Strauss E.G. Togaviruses // The Molecular Biology of Animal Viruses / Ed. By D.P. Nayak. - N. Y.: Decker, 1977. - P. 111 -166.

213. Svitkin Y.V., Ugarova T.Y., Chernovskaya T.V. et al. Translation of tick-borne EV genome, in vitro synthesis of two structural polypeptides // Virology. - 1981. - Vol. '110. - P. 26-34.

214. Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol. Biol. Evol. -2007. - Vol. 24. - P. 1596-1599.

215. Tanaka M., Aira Y., Igarashi A. Comparative nucleotide and amino acid sequence of five Japanese virus strains isolated in Japan and China // Trop. Med. - 1991.-Vol. 33.-P. 15-21.

216. Ternovoi V.A., Protopopova E.V., Chausov E.V. et al. Novel variant of tick-borne encephalitis virus, Russia // Emerg. Infect. Dis. - 2007. - Vol. 13(10).-P. 1574-1578.

217. Ternovoy V.A., Kurzhukov G.P., Sokolov Y.V. et al. Tick-borne encephalitis with hemorrhagic syndrome, Novosibirsk Region, Russia, 1999 // Emerg. Infect. Dis. - 2003. - Vol. 9. - P. 743-746.

218. Thiel, H.-J., Collett, M.S., Gould, E.A. et al. Family Flaviviridae // Virus taxonomy. Eighth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. - San Diego: Acad. Press, 2005. - P. 981-998.

219. Trent D.W., Grant J.A., Rosen L., Monath T.P. Genetic variation among dengue 2 viruses of different geographic origin // Virology. - 1983. - Vol. 128.-P. 271-284.

220. Trent D.W., Grant J.A., Vorndam A.V., Monath T.P. Genetic heterogeneity among Saint Louis encephalitis virus isolates of different geographic origin //Virology. - 1981. -Vol. 114. - P. 319-332.

221. Van de Peer Y., De Wachter R. TREECON for Windows: A software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment // Comput. Appl. Biosci. - 1994. - Vol. 10. - P. 569-570.

222. Venugopal K., Gritsun T., Lashkevich V.A., Gould F.A. Analysis of the structural proteins gene sequence shows Kyasanur-forest disease virus as a distinct member in the tick-borne encephalitis virus comple[ // J. Gen. Virol. -1994. - Vol. 75. - P. 227-232.

223. Venugopal K., Shiu S.Y.W., Gritsun T., Gould E.A. Nucleotide sequence comparisons of the viral envelope gene of geographically separate tickborne Flaviviruses // Abstr. Book.: 2nd International Symposium on Tick-Borne Encephalitis. - Baden near Vienna, 1991. - P. 54.

224. Wallner G., Mandl C.W., Ecker M. Characterization and complete genome sequences of high- and low- virulence variants of tick-borne encephalitis virus // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77. - P. 1035-1042.

225. Wengler G., Beato M., Wengler G. In vitro translation of 42S virus specific RNA from cells infected with flavivirus West Nile virus // Virology. -1979.-Vol. 96.-P. 516-529.

226. Westaway E.G., Brinton M.A., Gaidamovich S.Y. et al. Flaviviridae // Intervirology. - 1985. -Vol.24. -P. 183-192.

227. Westaway E.G., Shew M. Proteins and glycoproteins specified by the flavivirus Kunjin // Virology. - 1977. - Vol. 80. - P. 309-319.

228. Whitby J.E., Whitby S.N., Jennings A.D. et al. Nucleotide sequence of the envelope protein of a Turkish isolate of tick-borne encephalitis (TBE) virus is distinct from other viruses of the TBE virus complex // J. Gen. Virol. - 1993. -Vol.74.-P. 921-924.

229. Zanotto P.M., Gao G.F., Gritsun T. et al. An arbovirus cline across the northern hemisphere//Virology. - 1995.-Vol. 210.-P. 152-159.

230. Zanotto P.M.A, Gould E.A, Gao G.F, Harvey P.H, Holmes E.C. Population dynamics of flaviviruses revealed by molecular phylogenies // Proc. Nath. Acad. Sci. USA. - 1996. -Vol. 93.-P. 548-553.

203

231. Zlobin V.I., Drokin D.A., Shamanin V.A. Synthetic deoxyoligonucleotide probes for identification of flaviviruses. // Nucl. Acids Symp. Ser.- 1991 . - Vol. 24. - P. 280.

232. Zlobin V.I., Mamaev L.V., Dzhioev Yu. P. et al. Molecular biological data confirm the genetic independence of East Siberian subtype of tick borne encephalitis virus (prototype strain Aina/1448) // Tick-borne viral, rickettsial and bacterial infections. Int. sci. conf. Abstract book. - Irkuts, 1996. — P. 58-59.

233. Zlobin V.I., Shamanin V.A., Drokin D.A., Pletnev A.G. Use of synthetic oligonucleotide probes for investigation of tick-borne encephalitis virus genetic variability. //Nucl. Acids Symp. Ser. 1991. - Vol. 24. -P.220.