Влияние семафорина 3А на клетки тимуса мышей в норме и при опухолевом росте тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.03, кандидат наук Рутто Кристина Валерьевна

• Рутто Кристина Валерьевна
• кандидат наук
• 2019

Оглавление диссертации кандидат наук Рутто Кристина Валерьевна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Общая характеристика тимуса

1.2 Основные формы взаимодействий эпителиальных клеток и тимоцитов

1.2.1 Роль эпителиальных клеток в процессе миграции тимоцитов внутри тимуса

1.2.2 Адгезия тимоцитов к эпителиальным клеткам тимуса

1.2.3 Роль эпителиальных клеток в пролиферации и апоптозе тимоцитов

1.3 Функционирование тимуса организме

1.3.1 Роль эпителия в механизмах инволюции тимуса

1.3.2 Терапия для восстановления вилочковой железы

1.4 Семафорин ЗА

1.4.1 Общая характеристика и строение

1.4.2 Рецепторы

1.4.3 Функции семафорина ЗА

1.4.4 Семафорин ЗА в иммунной системе

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Животные

2.2 Клеточные линии

2.3 Изучение адгезии тимоцитов к эпителиальным клеткам тимуса мыши

2.4 Исследование пролиферативной активности клеток

2.5 Изучение апоптоза тимоцитов методом проточной цитометрии

2.6 Определение фенотипа клеток с помощью метода проточной цитометрии

2.7 Исследование экспрессии мРНК семафорина ЗА, ростовых факторов и

их рецепторов с помощью метода ОТ -ПЦР

2.8 Изучение структуры актинового цитоскелета

2.9 Выделение белка

2.10 Иммуноферментный анализ (ИФА)

2.11 Статистический анализ

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1 Характеристика линий эпителиальных клеток тимуса мыши

3.2 Синтез рецепторов семафорина 3A клеточными линиями эпителия тимуса и тимоцитами интактных мышей

3.3 Изучение пролиферативной активности клеточных линий эпителия тимуса мыши

3.3.1 Влияние семафорина 3A на пролиферативную активность эпителиальных клеток тимуса

3.3.2 Изучение способности семафорина 3A в комбинации с другими факторами влиять на пролиферативную активность эпителиальных клеток тимуса

3.4 Влияние семафорина 3A на функции тимоцитов интактных мышей in vitro

3.4.1 Разработка модели адгезии тимоцитов к клеточным линиям эпителия тимуса мыши

3.4.2 Влияние семафорина 3A на адгезию тимоцитов интактных мышей к клеточным линиям эпителия тимуса мыши

3.4.3 Влияние семафорина 3A на пролиферативную активность тимоцитов интактных мышей

3.4.4 Влияние семафорина 3А на клеточную гибель тимоцитов (апоптоз, некроз)

3.5 Влияние семафорина 3A на функции тимоцитов, полученных от мышей

с гепатомой 22а

3.5.1 Влияние опухолевого роста на пролиферативную активность

тимоцитов

3.5.2 Влияние опухолевого роста на адгезию тимоцитов к клеточным линиям эпителия тимуса мыши

3.5.3 Влияние опухолевого роста на синтез семафорина ЗА и его

рецепторов в тимоцитах мыши

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Влияние семафорина 3А на клетки тимуса мышей в норме и при опухолевом росте»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Рост многих опухолей человека и животных сопровождается инволюцией тимуса, механизмы развития которой до сих пор не ясны [10,46]. Связанное с ней нарушение тимопоэза приводит к снижению выхода Т-лимфоцитов из вилочковой железы на периферию и рассматривается в качестве одной из причин возникновения Т -клеточного иммунодефицита [156,179,212]. Известно, что у онкологических больных наблюдается снижение количества и функциональной активности периферических Т-лимфоцитов [115,168]. Инволюция тимуса и сопровождающий ее иммунодефицит усугубляются при химио-, гормоно- и рентгенотерапии, что может приводить к ослаблению противоинфекционной защиты и снижению выживаемости. Все вышесказанное делает изучение механизмов инволюции тимуса чрезвычайно актуальным, поскольку разработка способов, препятствующих этому процессу, могла бы существенно увеличить продолжительность жизни онкологических больных.

Для восстановления тимуса в экспериментах на животных применяют стимулирующие ростовые факторы, такие как фактор роста кератиноцитов (KGF) и фактор роста гепатоцитов (HGF) [29,101]. Однако опухолевые и нормальные клетки организма способны синтезировать иммунодепрессивные факторы, которые могут, как препятствовать восстановительной терапии, так и участвовать в развитии инволюции тимуса.

В настоящей работе в качестве одного из таких факторов рассматривается семафорин ЗА (Sema 3A), который по данным литературы обладает иммуносупрессивным действием в отношении периферических Т-лимфоцитов [187]. Изучение Sema ЗА как фактора, ингибирующего тимопоэз, вполне обосновано, поскольку он синтезируется внутри тимуса [119] и может быть причастен к механизмам развития инволюции тимуса. В связи с этим исследование действия этого фактора на клетки тимуса в норме и в условиях опухолевого роста является актуальной задачей.

Степень разработанности темы исследования. Sema 3А, первоначально названный коллапсином, представляет собой секретируемый гликопротеин, который был идентифицирован в нервной системе как фактор, направляющий рост аксонов [110,125]. Его основной хеморепеллентный эффект был показан не только в отношении нервных клеток, но и тимоцитов [119], что указывает на общность механизмов регуляции в нервной и иммунной системах. Sema ЗА также способен ингибировать пролиферативную активность периферических Т-лимфоцитов и продукцию ими цитокинов [47,120]. В последние годы было показано, что он является негативным регулятором функций лимфоцитов в патогенезе ряда аутоиммунных заболеваний, что позволило сформировать представления о Sema ЗА как о новом иммуносупрессорном факторе [123,198].

Sema 3А проявляет ряд ингибирующих эффектов не только на периферии, но и в центральном органе иммуногенеза - тимусе, а именно: подавляет миграцию тимоцитов, индуцированную фактором роста стромальных клеток (SDF-1a) [71,119], а также адгезию тимоцитов к эпителиальным клеткам тимуса [119] и субстрату [122]. Показано, что Sema ЗА конститутивно синтезируется тимоцитами и эпителиальными клетками тимуса [119]. Однако изучению роли Sema ЗА в тимусе посвящены лишь единичные работы, что требует более детального исследования.

При опухолевом росте Sema ЗА проявляет себя в основном как анти-ангиогенный фактор, а также в ряде случаев подавляет рост самих опухолевых клеток [49,144]. При этом о влиянии Sema ЗА на клетки иммунной системы при опухолевом росте имеются лишь единичные и противоречивые сведения. С одной стороны, этот фактор способен подавлять Т -клеточный иммунный ответ [47], а с другой - стимулировать противоопухолевую активность макрофагов [206]. Поскольку многие авторы рассматривают Sema ЗА в качестве перспективного фактора для лечения онкологических заболеваний [49,144], его негативное влияние на клетки иммунной системы требует более детального изучения. Действие Sema ЗА на клетки тимуса при опухолевом росте, как и его роль в развитии инволюции тимуса, не изучались.

Цель исследования. Оценка влияния нейронального фактора Sema ЗА на функции тимоцитов и эпителиальных клеток тимуса мыши in vitro в норме и при росте перевиваемой гепатомы 22а.

Задачи исследования:

1. Изучить экспрессию рецепторов Sema ЗА на тимоцитах и клеточных линиях эпителия тимуса мышей.

2. Исследовать влияние Sema ЗА и его комбинаций с KGF и HGF на пролиферативную активность эпителия тимуса мыши.

3. Исследовать влияние Sema ЗА на функциональную активность тимоцитов интактных мышей (уровни адгезии, пролиферативной активности и апоптоза).

4. Изучить влияние Sema ЗА на пролиферативную активность и адгезию к тимическому эпителию тимоцитов, полученных от мышей-опухоленосителей.

5. Оценить влияние опухолевой прогрессии на экспрессию Sema ЗА в строме тимуса и рецепторов Sema ЗА в тимоцитах мышей.

Научная новизна исследования. Впервые показано, что Sema 3A и его рецепторы синтезируются в линиях кортикального cTEC1-2 и медуллярного mTEC3-10 эпителия тимуса мыши; исследована экспрессия плексинов класса А в тимоцитах мышей. Показано, что Sema ЗА подавляет пролиферативную активность эпителия тимуса и тимоцитов мышей и не усиливает процесс апоптоза в тимоцитах in vitro. Данный результат носит приоритетный характер. Впервые показано, что Sema ЗА отменяет индуцированную HGF и KGF пролиферацию эпителиальных клеток тимуса in vitro. Ингибирующее действие Sema ЗА на адгезию тимоцитов к клеткам эпителия тимуса опосредовано через Nrp-1 на тимоцитах. Рост гепатомы 22а не влияет на процесс адгезии тимоцитов к клеткам тимического эпителия. Этот факт доказан впервые, а также приоритетной является разработанная модель. Показано, что при росте гепатомы 22а ингибирующий эффект Sema ЗА в отношении пролиферации тимоцитов сохраняется, а его действие на адгезию тимоцитов к клеточным линиям эпителия тимуса изменяется на противоположное. Впервые показано, что опухолевый рост

не влияет на содержание белка Sema 3A в строме тимуса и мембранную экспрессию рецепторов Nrp-1 и PlexAl на тимоцитах.

Теоретическая и практическая значимость результатов исследования.

Диссертационная работа является фундаментальным научным исследованием, результаты которого раскрывают характер действия Sema ЗА на центральный орган иммунной системы - тимус в норме и в условиях опухолевого роста. Работа носит экспериментально-теоретический характер. Полученные данные об ингибирующем действии Sema ЗА на пролиферативную активность эпителиальных клеток и тимоцитов, а также их адгезию расширяют представления о механизмах созревания и дифференцировки тимоцитов. Иммуносупрессорное действие данного фактора в отношении клеток тимуса необходимо принимать во внимание при использовании Sema ЗА в качестве потенциального средства для лечения аутоиммунных, аллергических, опухолевых заболеваний. Показанная возможность функционального антагонизма между Sema ЗА и ростовыми факторами (HGF, KGF) должна учитываться при разработке стратегий по восстановлению вилочковой железы после острой инволюции, вызванной циторедуктивной терапией.

Методология и методы исследования. Методологическая основа работы состояла в последовательном применении методов научного познания. Согласно поставленным задачам, выбраны современные высокоинформативные молекулярно-биологические, иммунологические и статистические методы.

Положения, выносимые на защиту:

1. Эпителиальные клетки тимуса и тимоциты мыши экспрессируют рецепторы Sema 3A и являются мишенями его действия.

2. Sema ЗА оказывает иммуносупрессорное действие в отношении клеток тимуса интактных мышей in vitro, подавляет пролиферативную активность тимоцитов и клеточных линий эпителия тимуса, а также адгезию тимоцитов к этим клеткам.

3. Sema 3A отменяет стимулирующее действие HGF и KGF на пролиферативную активность эпителиальных клеток тимуса in vitro и может

выступать функциональным антагонистом данных ростовых факторов в организме.

4. В ходе опухолевой прогрессии сохраняется ингибирующий эффект Sema ЗА в отношении пролиферативной активности тимоцитов, но в отношении их адгезии к клеткам эпителия ингибирующий эффект, напротив, сменяется стимуляцией.

Личный вклад в проведение исследования. Автором, совместно с научными руководителями, были спланированы и лично выполнены все экспериментальные исследования по проблеме, а также проведена статистическая обработка данных. В постановке и решении конкретных задач, организации и выполнении исследований, обработке и интерпретации полученных результатов автору принадлежит ведущая роль.

Степень достоверности и апробация результатов. Высокая степень достоверности полученных научных результатов подтверждается достаточным и репрезентативным объёмом выборки выполненных наблюдений и контрольных исследований и подтверждена адекватными методами статистической обработанных. Методы математической обработки полученных результатов соответствуют поставленным задачам. Материалы диссертационной работы были представлены в докладах на: V Международном симпозиуме «Взаимодействие нервной и иммунной системы в норме и патологии» (2015 г., Санкт-Петербург, Россия), XV и XVI Всероссийских научных форумах с международным участием имени академика В.И. Иоффе «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге» (2015, 2017 гг. Санкт-Петербург, Россия), XIX Международной медико-биологической конференции молодых исследователей "Фундаментальные науки и клиническая медицина - человек и его здоровье" (2016 г., Санкт-Петербург, Россия), III Всероссийской научной конференции молодых ученых «Проблемы биомедицинской науки третьего тысячелетия» (2016 г., Санкт-Петербург, Россия).

Публикации результатов исследований. Основные положения диссертационного исследования опубликованы в 15 печатных работах, 6 из которых - статьи в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК РФ для

размещения материалов кандидатских диссертаций, З статьи в изданиях, индексируемых Scopus и Web of Science, а также 9 тезисов докладов на международных и всероссийских конференциях.

Объем и структура диссертации. Диссертация изложена на 130 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов работы, заключения, выводов, списка сокращений и списка используемой литературы, который содержит 221 наименований: 22 - на русском языке и 199 - на иностранных языках. Текст диссертации иллюстрирован 7 таблицами и 42 рисунками.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1 Общая характеристика тимуса

Тимус - центральный орган иммунной системы, в котором происходит созревание и дифференцировка Т-лимфоцитов.

Вилочковая железа человека состоит из двух долей, покрытых капсулой. От капсулы отходят перегородки, разделяющие тимус на дольки. В каждой доли выделяют корковое и мозговое вещество. Поддерживающий каркас органа образуется кортикальными и медуллярными эпителиальными клетками. В строме тимуса содержатся макрофаги, дендритные клетки и В-лимфоциты, а паренхима представлена незрелыми Т-лимфоцитами.

Кортикомедуллярная зона содержит артерии, которые делятся на большое количество артериол, а те в свою очередь распадаются до капилляров и распространяются в кору и медуллу. Кроме этого в кортикомедуллярной зоне сконцентрирована подавляющая часть нервных волокон.

Долгое время считалось, что кортикальные и медуллярные эпителиальные клетки тимуса происходят из эктодермы и энтодермы 3-его глоточного кармана. Однако в настоящее время доказано, что два типа эпителия имеют общего предшественника энтодермального происхождения [24,40,78]. Точный механизм дифференцировки бипотентного предшественника в кортикальный или медуллярный эпителий неизвестен. Однако, существует две модели развития эпителиальных клеток: синхронного и последовательного развития. Согласно модели синхронного развития из бипотентных предшественников идёт параллельное развитие предшественников кортикального или медуллярного эпителия, а потом уже появляются зрелые эпителиальные клетки обоих типов эпителия. В модели последовательного развития бипотентные предшественники вначале проходят переходную стадию с фенотипом (P5t+CD205+IL7YFP+) и только после этого развиваются либо в зрелые кортикальные эпителиальные клетки, либо происходит последовательное развитие в предшественников медуллярного эпителия, а затем и в зрелые медуллярные клетки. YFP маркер, находящийся на

поверхности бипотентных предшественников, указывает на способность клеток сильно экспрессировать IL-7. Показано, что IL-7WP+ эпителиальные клетки могут развиваться как в кортикальные (Ly51+CD205+), так и в медуллярные (CD80+) эпителиальные клетки [30]. Пролиферация эпителиальных клеток в процессе их развития регулируется факторами роста кератиноцитов FGF7 и FGF10, которые продуцируются мезенхимальными клетками [98]. Зрелые кортикальные эпителиальные клетки несут на своей поверхности следующие маркеры K8, CDR1, Ly51 (CD249), ER-TR4, CD205, Ccr1, MHC-II, ß5t, IL-7, DLL4, а медуллярные — K5, MTS10, ER-TR5, MHC-II, CD40, CD80, AIRE , CCL21 [24].

Эпителиальные клетки тимуса необходимы в процессе дифференцировки созревающих Т-лимфоцитов. Клетки кортикального эпителия участвуют в позитивной селекции, а медуллярного - негативной.

Ранние лимфоидные предшественники (ELP) из костного мозга выходят в кровоток, а затем поступают в тимус через посткапиллярные венулы, расположенные в кортикомедуллярной области. На раннем этапе созревающая клетка не содержит молекул CD4 и CD 8 и называется дважды негативной (DN). На этапах созревания DN1^DN3, которые характеризуются появлением и исчезновением маркеров CD44 и CD25, происходит интенсивная пролиферация клеток под действием разных ростовых факторов (см. раздел 1.4). Ключевым событием на стадиях DN1-DN4 является перестройка генов и экспрессия «зрелого» Т-клеточного рецептора (TCR) на поверхности клеток. На стадии DN3 начинается основное событие дифференцировки развивающихся Т-лимфоцитов -перестройка V-генов TCR, после чего развитие макрофагов и В-лимфоцитов становится невозможным. Так, при удачной перестройки ß-цепи, образуется пре-TCR, который содержит функциональную ß-цепь, инвариантную а-цепь (рТа) и CD3-комплекс. Инвариантная а-цепь необходима для агрегации пре-TCR и инициации внутриклеточного сигнала без участия лиганда. Клетки, в которых пре-TCR не смог инициировать сигнал, погибают путём апоптоза [94], а получившие адекватный стимул - активно пролиферируют и начинают экспрессировать обе молекулы - CD4 и CD8, т.е. становятся дважды позитивными

(DP). Затем начинается перестройка V-гена а-цепи, после которой на поверхности клеток экспрессируется уже «зрелый» TCR.

Основная задача позитивной селекции заключается в отборе только тех тимоцитов, которые экспрессируют TCR, обладающие сродством к молекулам MHC. При контакте развивающихся Т-лимфоцитов с кортикальными эпителиальными клетками, происходит взаимодействие TCR, экспрессирующихся на поверхности тимоцитов, с молекулами MHC I и II класса, экспрессирующимися на поверхности эпителиальных клеток и содержащими фрагменты различных эндогенных молекул. Тимоциты выживают в ходе позитивной селекции только в том случае, если их TCR обладают сродством к молекуле MHC. В этом случае происходит повышение экспрессии антиапоптотического фактора Bcl-2 и продолжение созревания тимоцитов [94]. Если TCR Т-лимфоцитов лишены сродства к молекулам MHC, то тогда тимоциты подвергаются апоптозу. В процессе позитивной селекции, которая происходит в кортикальной зоне, погибает около 90% всех CD4+CD8+ тимоцитов.

Параллельно с позитивной селекцией идет процесс разделения тимоцитов на субпопуляции и тимоциты приобретают либо фенотип CD4+CD8- (Т-хелперы), либо CD4-CD8+ (цитотоксические Т-лимфоциты).

После завершения позитивной селекции тимоциты мигрируют в кортикомедуллярную зону, которая служит васкуляризованной границей между кортексом и медуллой, а затем в медуллярную зону. Если в позитивной селекции участвовали только кортикальные эпителиальные клетки, то в негативной участвуют медуллярные эпителиальные клетки, которые экспрессируют ген AIRE, дендритные клетки и В-лимфоциты. Основной задачей негативной селекции является отбор тимоцитов, которые обладают промежуточным сродством к комплексу MHC-аутоантиген, иные же подвергаются апоптозу после получение сигнала на экспрессию ядерного белка Nur77 [94]. В процессе дифференцировки внутри тимуса гибнет 95% созревающих Т-лимфоцитов, а зрелые SP Т-клетки выходят в кровоток и заселяют периферические органы иммунной системы.

1.2 Основные формы взаимодействий эпителиальных клеток и

тимоцитов

Незрелые тимоциты в процессе созревания и дифференцировки активно мигрируют из одной зоны тимуса в другую, адгезируют на поверхности эпителиальных клеток и получают сигнал на пролиферацию или апоптоз. Все перечисленные процессы происходят при взаимодействии незрелых тимоцитов и эпителиальных клеток, либо путем непосредственного контакта с развивающимися Т-клетками, либо при помощи растворимых факторов.

1.2.1 Роль эпителиальных клеток в процессе миграции тимоцитов

внутри тимуса

Хемокины, продуцируемые эпителиальными клетками, играют ключевую роль в миграции тимоцитов на разных стадиях их развития. Эпителиальные клетки субкапсулярной и медуллярной зон экспрессируют фактор стромальных клеток CXCL12 (SDF-1a) [32]. Известно, что кортикальные эпителиальные клетки тимуса мыши способны экспрессировать мРНК SDF-1 а, что показано с помощью метода обратной траскрипции с последующей полимеразной цепной реакцией (ОТ-ПЦР) [158] и иммуногистохимией [183]. У человека, наоборот, синтезировать SDF-1a могут только медуллярные эпителиальные клетки тимуса, что показано с помощью иммуногистохимии [2017]. SDF-1a является одним из главных хемокинов, который регулирует как поступление пре-Т лимфоцитов из костного мозга в тимус для постоянного пополнения его клеточного состава, так и миграцию созревающих тимоцитов из одной области в другую внутри тимуса [97]. Данный фактор создает градиент для перемещения DN клеток из субкапсулярной области в кортико-медуллярную, а SP - в медуллярную за счёт экспрессии на их поверхности рецептора CXCR4 [183].

Кортикальные и медуллярные эпителиальные клетки, а также дендритные клетки медуллярной зоны, синтезируют и другой хемокин - TECK (CCL25). Его рецептор - CCR9 экспрессируется на поверхности тимоцитов на всех стадия

дифференцировки, а особенно в DP и CD8+ клетках [32]. Синтез CXCR4 и CCR9 снижается на заключительных стадиях созревания тимоцитов. На позднем этапе внутритимусного развития действует другой хемокин - CCL19 (ELC), под влиянием которого зрелые тимоциты мигрируют из медуллярной зоны в кортикомедуллярную; при этом происходит усиление экспрессии соответствующего рецептора CCR7 на их поверхности [183]. Также на поверхности Т-клеток экспрессируется рецептор для сфингозин-1-фосфата -S1PR1. Данный рецептор необходим для обеспечения выхода зрелых тимоцитов из тимуса в кровяное русло в ответ на сигнал от сфингозин-1-фосфата, присутствующего в сыворотке крови [57].

Используя метод прижизненного внутритканевого сканирования в реальном времени, показано, что тимоциты на разных стадиях развития мигрируют внутри определенных зон тимуса с разной скоростью. Так, DP клетки в процессе позитивной селекции мигрируют хаотично со средней скоростью - 3-8 мкм/мин, после чего миграция незрелых клеток в медуллярную зону приобретает целенаправленный характер. При негативной селекции средняя скорость хаотичной миграции SP клеток достигает - 10-25 мкм/мин. Развивающиеся тимоциты в медуллярной зоне осуществляют порядка 5 кратковременных контактов с антиген-презентирующими клетками за 1 час, сопровождающиеся последовательными процессами адгезии и деадгезии [117].

1.2.2 Адгезия тимоцитов к эпителиальным клеткам тимуса

Контакты между развивающимися тимоцитами и эпителиальными клетками тимуса необходимы для осуществления процессов позитивной и негативной селекции, передачи ростовых и дифференцировочных сигналов. Контактные взаимодействия осуществляются за счет наличия пар адгезионных молекул на поверхности тимоцитов и эпителиальных клеток (Таблица 1.1). На этих клетках экспрессируются адгезионные молекулы, принадлежащие к семействам иммуноглобулинов (LFA-2, LFA-3, ICAM-1, VCAM-1, ^у-1) и интегринов (LFA-

1, VLA-4). ^у-1, который экспрессируется на тимоцитах мыши и человека, участвует в адгезии тимоцитов к эпителиальным клеткам тимуса, но лиганд для данной молекулы пока неизвестен. Однако в нервной системе ^у-1 взаимодействует с в3-интегрином [93], а в сердечно-сосудистой и иммунной - 02-интегринами [167,209]. Так же в процессе адгезии принимают участие белки внеклеточного матрикса и их рецепторы, а именно: VLA-5 и VLA-4 - для взаимодействия с фибронектином, а VLA-3 и VLA-6 - для взаимодействия с ламинином. Предполагают, что данные белки образуют молекулярные мостики между тимоцитами и клетками внутритимусного микроокружения, которые обеспечивают передачу сигналов для обоих типов клеток [169].

Таблица 1. Молекулы адгезии, экспрессирующиеся на поверхности тимоцитов и эпителиальных клеток тимуса

Тип клеток

Тимоциты Эпителиальные клетки

LFA-2(CD2) LFA-3(CD58)

LFA-1 (аЦ32, CD11a/18) ICAM-1(CD54)

VLA-4 (а4в1, CD49d/CD29) VCAM-1(CD106)

^у-1 ^90) Лиганд не идентифицирован

Примечание. Таблица составлена по данным 85,90,177,213

В процессе адгезии идёт двухстороннее взаимодействие, где не только эпителиальные клетки оказывают влияние на тимоциты, но и наоборот. Так, блокирование ранних стадий тимопоэза DN1^DN2 в эмбриональном периоде у мышей ведёт к нарушению архитектуры в кортикальной и медуллярной зонах, а при блокировании на стадии DP или SP - только в медуллярной зоне. Эти данные свидетельствуют о том, что сигналы, полученные от тимоцитов на разных стадиях дифференцировки, важны для создания и поддержания нормального эпителиального компартмента [30].

Существует всего несколько работ о регуляции адгезии тимоцитов к клеткам эпителия тимуса, поэтому данный вопрос остается мало изученным.

Регуляция адгезии осуществляется с помощью цитокинов. Добавление нейронального фактора Sema ЗА in vitro снижает адгезию тимоцитов к эпителиальным клеткам [119], а одного из членов семейства факторов некроза опухоли - TNFSF11 (RANKL) индуцирует адгезию тимоцитов к эпителиальным клеткам и усиливает экспрессию ими ICAM-1 [118].

Кроме того, возможна регуляция и на генетическом уровне. Нокаут AIRE гена в медуллярных эпителиальных клетках мыши приводит к уменьшению адгезии тимоцитов к ним и снижению экспрессии адгезионных молекул VCAM-1 и ICAM-4 [157].

Некоторые катионы также способны усиливать адгезию тимоцитов к матриксу. Так, Mn2+ усиливает адгезию Т-клеток к матриксу, опосредованную ICAM-1 и VCAM-1; Mg2+ - ICAM-1; Ca2+ - VCAM-1 [174].

Созревание и дифференцировка тимоцитов происходит при их взаимодействии с эпителиальными клетками, после чего Т-клетка получает сигнал либо к пролиферации, либо к апоптозу.

1.2.3 Роль эпителиальных клеток в пролиферации и апоптозе тимоцитов

На ранних стадиях созревания незрелые DN Т-лимфоциты, пришедшие из костного мозга, активно пролиферируют под действием цитокинов, которые могут продуцироваться как эпителиальными клетками, так и самими тимоцитами [21,22].

Основными цитокинами, синтезируемыми эпителиальными клетками, являются фактор роста стволовых клеток (SCF) и IL-7 [118,218], рецепторы которых (c-kit и IL-7R) экспрессируются на DN тимоцитах. SCF работает синергично с IL-7: SCF в основном способствует пролиферации DN1, а IL-7 -DN2. Кроме этого, IL-7 является фактором выживания для DN тимоцитов, в которых происходит перестройка генов TCR. На этом этапе IL-7 индуцирует экспрессию антиапоптотического фактора Bcl-2 [219].

IL-1 (IL-1a, IL-1P) и фактор некроза опухоли (TNFa) также синтезируются

эпителиальными клетками тимуса и участвуют в индукции дифференцировки DN тимоцитов, так как оказывают влияние на перестройку TCR и способствуют созреванию DN1 в DN2 клетки [221]. IL-1а и IL-1ß являются костимуляторами для пролиферации и усиливают действие IL-2. TNFa индуцирует апоптоз DN и DP тимоцитов и подавляет их пролиферацию. Апоптотический сигнал от TNFa опосредуется через TNFR1, а пролиферативный сигнал через TNFR2 [ 36].

IL-6, фактор ингибирования лейкемии (LIF) и онкостатин М (OSM) также продуцируются эпителиальными клетками и играют важную роль в Т-лимфопоэзе. Известно, что нокаут гена IL-6 вызывает снижение количества тимоцитов на 20-40% [111], однако сам IL-6 не вызывает пролиферацию тимоцитов, а лишь усиливает пролиферацию CD4+ и CD8+ тимоцитов, индуцированную IL-2, IL-4 или IL-7. Таким образом, IL-6, выступает в роли костимулирующего цитокина для пролиферации тимоцитов на поздней стадии развития Т-клеток. Два других цитокина - LIF и OSM, напротив, ингибируют развитие Т-клеток в тимусе, так как их усиленная экспрессия приводит к изменению строения тимуса, разрушению кортико -медуллярной структуры и образованию эпителиальных клеточных фолликулов, заполненных В-лимфоцитами [195].

В процессе развития тимоцитов, включающего перестройку генов TCR, позитивную и негативную селекции, лишь небольшая часть разивающихся Т-лимфоцитов получают сигнал на выживание и пролиферацию, а подавляющее число клеток элиминируется путём апоптоза. Белки, участвующие в апоптозе, делят на антиапоптотические - Bcl-2, Bcl-xL, Bcl-w, Mcl-1, A1, Boo и проапоптотические - Bax, Bad, Bok, Bcl-xS, Bak, Bid, Bik, Bim, Krk и Mtd.

На ранних стадиях развития Т-клеток (DN1^DN3) в качества факторов выживания рассматриваются два антиапоптотических белка - Bcl-2 и Mcl-1, которые экспрессируются на незрелых DN тимоцитах [219]. Синтез данных белков контролируется IL-7, при дефиците которого наблюдается уменьшение числа зрелых тимоцитов [155]. В процессе ß-селекции участвует другой белок -Bcl2-A1 [130].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Рутто Кристина Валерьевна, 2019 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Алексанян, Ю. Т. Линия перевиваемых клеток, полученная из перевиваемой мышиной гепатомы / Ю. Т. Алексанян, М. Е. Басмаджян, К. С. Мовсенян, Л.

A. Манухян, С. К. Геворкян // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 1972. - № 5. - С.94-95.

2. Бобрышева, И. В. Морфологические изменения в тимусе крыс репродуктивного периода на фоне введения иммунодепрессанта циклофосфамида / И. В. Бобрышева // Казанский мед. ж. - 2016. - Т. 97, № 4.

- С.578-585.

3. Бородин, Ю. И. Тимус при экспериментальном канцерогенезе предстательной железы / Ю. И. Бородин, А. А. Лошмакова, В. В. Асташев, О.

B. Казаков, А. П. Майоров, М. П. Ларионов // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2014. - Т. 157, № 6. - С.692-695.

4. Гельштейн, В. И. Прогрессия перевиваемых мышинных гепатом / В. И. Гельштейн // Цитология. - 1971. - Т. 2З, № 1. - С.З-14.

5. Донецкова, А. Д. Т-рецепторные эксцизионные кольца и значимость их определения в клинике / А. Д. Донецкова, А. А. Ярилин // Иммунология. -201З. - Т. З4, № 4. - С.220-226.

6. Дроздова, Л. И. Влияние различных видов экспериментального хронического стресса на акцидентальную инволюцию тимуса лабораторных животных / Л. И. Дроздова, Л. И. Тимина, А. В. Самедова // Ветпатология. - 2016. - № З. -

C.46-53.

7. Исмайилова, М. А. Изучение инволюции тимуса при опухолевой прогрессии / М. А. Исмайилова // Интернаука. - 2017. - № 5. - С.17-18.

8. Казаков, О. В. Тимус при экспериментальном канцерогенезе молочной железы / О. В. Казаков, А. В. Кабаков, А. Ф. Повещенко, Т. В. Миллер, В. И. Чепик, Т. В. Райтер, Д. Н. Стрункин, П. М. Ларионов, В. И. Коненков // Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. - 2014. - Т. 12, № З.

- С.58-62.

9. Капитонова, М. Ю. Акцидентальная инволюция тимуса в растущем организме при воздействии различных видов стрессоров / М. Ю. Капитонова, С. Л. Кузнецов, С. В. Клаучек, З. И. Мохд Исмаил, М. Улла, О. В. Федорова // Морфология. - 2006. - Т. 130, № 6. - С.56-61.

10. Киселева, Е. П. Механизмы инволюции тимуса при опухолевом росте / Е. П. Киселева // Успехи современной биологии. - 2004. - Т. 124, № 6. - С.589-601.

11. Киселева, Е. П. Роль апоптоза в процессе инволюции тимуса при росте сингенной перевиваемой опухоли у мышей / Е. П. Киселева, А. Н. Суворов, Р. П. Огурцов // Изв. АН. Сер. Биология. - 1998. - Т. 22. - С.172-179.

12. Кострова, О. Ю. Акцидентальная инволюция тимуса крыс на фоне развития опухоли толстой кишки / О. Ю. Кострова, Г. Ю. Стручко, Л. М. Меркулова, М. Н. Михайлова // Морфология. - 2014. - Т. 145, № 3. - С.103.

13. Кузьменко, Л. Г. Старение и тимус / Л. Г. Кузьменко, Н. М. Киселева, А. В. Симонова // Журнал научных статей здоровье и образование в XXI веке. -2013. - Т. 15, № 1-4. - С.170-175.

14. Куклина, Е. М. Семафорин Бета4В в иммунной системе при рассеянном склерозе / Е. М. Куклина, Т. В. Байдина, И. Ю. Данченко, И. В. Некрасова // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2014. - Т. 157, № 2. -С.198-201.

15. Старская, И. С. Морфологические аспекты атрофии тимуса при стрессе / И. С. Старская, А. В. Полевщиков // Иммунология. - 2013. - Т. 34, № 5. - С.271-277.

16. Старская, И. С. Морфологический анализ и динамика гидрокортизон-индуцированной атрофии тимуса / И. С. Старская, И. В. Кудрявцев, А. В. Полевщиков // Мед. Акад. Журнал. - 2012. - Т. 12, № 3. - С.94-96.

17. Федорова, Е. С. Экспрессия серотонина и фактора роста сосудов (УЕОБ) в тимусе человека при возрастной инволюции / Е. С. Федорова, В. О. Полякова, С. С. Коновалов, И. М. Кветной // Усп. геронтол. - 2009. - Т. 22, № 1. - С.167-171.

18. Шарова, Н. И. Результаты взаимодействия лимфоидных и эпителиальных клеток тимуса человека in vitro. Активация и апоптоз / Н. И. Шарова, А. Х. Дзуцев, М. М. Литвина, Т. Ю. Харченко, А. А. Ярлини // Иммунология. -2000. - № 3. - C.7-11.

19. Ярилин, А. А. Апоптоз и развитие тимоцитов (эпителиальные клетки как индукторы апоптоза тимоцитов) / А. А. Ярилин, Е. Г. Буланова, Н. И. Шарова, В. М. Будагян // Изв. АН. Сер. Биология. - 1998. - № 2. - C.142-150.

20. Ярилин, А. А. Т-клетки - недавние эмигранты из тимуса / А. А. Ярилин // Иммунология. - 2012. - Т. 33, № 6. - С.326-334.

21. Ярилин, А. А. Цитокины в тимусе. Биологическая активность и функции цитокинов в тимусе / А. А. Ярилин // Цитокины и воспаление. - 2003. - Т. 2, № 2. - С.1-11.

22. Ярилин, А. А. Цитокины в тимусе. Выработка и рецепция цитокинов / А. А. Ярилин // Цитокины и воспаление. - 2003. - Т. 2, № 1. - С. 1-13.

23. Abo, T. Extrathymic pathways of T-cell differentiation and immunomodulation / T. Abo // Int. Immunopharmacol. - 2001. - V. 1, № 7. - P.1261-1273.

24. Abramson, J. Thymic epithelial cells / J. Abramson, G. Anderson // Annu. Rev. Immunol. - 2017. - V. 26. - P.85-118.

25. Acavedo, L. M. Semaphorin 3A suppresses VEGF-mediated angiogenesis yet acts as a vascular permeability factor / L. M. Acevedo, S. Barillas, S. M. Weis, J. R. Gothert, D. A. Cheresh // Blood. - 2008. - V. 111, № 5. - P.2674-2680.

26. Adkins, B. Total lymphoid irradiation leads to transient depletion of the mouse thymic medulla and persistent abnormalities among medullary stromal cells / B. Adkins, D. Gandour, S. Strober, I. Weissman // J. Immunol. - 1988. - V. 140, № 10. - P.3373-3379.

27. Agreste, F. R. VEGF system in dog's thymus - temporal expression / F. R. Agreste, P. P. Bombonato, K. Nogueira, A. C. dos Santos, A. R. da Cuncha Barreto-Vianna, E. M. Mendes de Lima // Open J. Vet. Med. - 2015. - V. 5. -P.211-217.

28. Aiello, S. Thymic dendritic cells express inducible nitric oxide synthase and generate nitric oxide in response to self- and alloantigens / S. Aiello, M. Noris, G. Piccinini, S. Tomasoni, F. Casiraghi, S. Bonazzola, M. Mister, M. H. Sayegh, G. Remuzzi // J. Immunol. - 2000. - V. 164, № 9. - P.4649-4658.

29. Alpdogan, O. Keratinocyte growth factor (KGF) is required for postnatal thymic regeneration / O. Alpdogan, V. M. Hubbard, O. M. Smith, N. Patel, S. Lu, G. L. Goldberg, D. H. Gray, J. Feinman, A. A. Kochman, J. M. Eng, D. Suh, S. J. Muriglan, R. L. Boyd, M. R. van den Brink // Blood. - 2006. - V. 107, № 6. -P.2453-2460.

30. Alves, N. L. Serial progression of cortical and medullary thymic epithelial microenvironments / N. L. Alves, Y. Takahama, I. Ohigashi, A. R. Ribeiro, S. Baik, G. Anderson, W. E. Jenkinson // Eur. J. Immunol. - 2014. - V. 44, № 1. -P.16-22.

31. Alves, N. L. Thymic epithelial cells: the multi-tasking framework of the T cell «cradle» / N. L. Alves, N. D. Huntington, H. R. Rodewald, J. P. Di Santo // Trends. Immunol. - 2009. - V. 30, № 10. - P.468-474.

32. Annunziato, F. Chemokines and lymphopoiesis in human thymus / F. Annunziato, P. Romagnani, L. Cosmi, E. Lazzeri, S. Romagnani // Trends Immunol. - 2001. -V. 22, № 5. - P.277-281.

33. Aw, D. The origin and implication of thymic involution / D. Aw, D. B. Palmer // Aging Dis. - 2011. - V. 2, № 5. - P.437-443.

34. Bachelder, R. E. Competing autocrine pathways involving alternative neuropilin-1 ligands regulate chemotaxis of carcinoma cells / R. E. Bachelder, E. A. Lipscomb, X. Lin, M. A. Wendt, N. H. Chadborn, B. J. Eickholt, A. M. Mercurio // Cancer Res. - 2003. - V. 63, № 17. - P.5230-5233.

35. Bagnard, D. Semaphorin 3A-vascular endothelial growth factor-165 balance mediates migration and apoptosis of neural progenitor cells by the recruitment of shared receptor / D. Bagnard, C. Vaillant, S. T. Khuth, N. Dufay, M. Lohrum, A. W. Puschel, M. F. Belin, J. Bolz, N. Thomasset // J. Neurosci. - 2001. - V. 21, № 10. - P.3332-3341.

36. Baseta, J. G. TNF regulates thymocyte production by apoptosis and proliferation of the triple negative (CD3-CD4-CD8-) subset / J. G. Baseta, O. Stutman // J. Immunol. - 2000. - V. 165, № 10. - P.5621-5630.

37. Bechara, A. Modulation of semaphorin signaling by Ig superfamily cell adhesion molecules / A. Bechara, J. Falk, F. Moret, V. Castellani // Adv. Exp. Med. Biol. -2007. - V. 600. - P.61-72.

38. Belaid, Z. Differential expression of vascular endothelial growth factor and its receptors in hematopoietic and fatty bone marrow: evidence that neuropilin-1 is produced by fat cells / Z. Belaid, F. Hubint, J. Biniver, B. Nusgens, M. P. Defresne // Heamatologica. - 2005. - V. 90, № 3. - P.400-401.

39. Berzins, S. P. The role of the thymus and recent thymic migrants in the maintenance of the adult peripheral lymphocyte pool / S. P. Berzins, R. L. Boyd, J. F. Miller // J. Exp. Med. - 1998. - V. 187, № 11. - P.1839-1848.

40. Blackburn, C. C. Developing a new paradigm for thymus organogenesis / C. C. Blackburn, N. R. Manley // Nat. Rev. Immunol. - 2004. - V. 4, № 4. - P.278-289.

41. Bouvree, K. Semaphorin3A, Neuropilin-1, and PlexinA1 are required for lymphatic valve formation / K. Bouvree. I. Brunet, R. Del Toro, E. Gordon, C. Prahst, B. Cristofaro, T. Mathivet, Y. Xu, J. Soueid, V. Fortuna, N. Miura, M. S. Aigrot, C. H. Maden, C. Ruhrberg, J. L. Thomas, A. Eichmann // Circ. Res. -2012. - V. 111, № 4. - P.437-445.

42. Bredenkamp, N. Regeneration of the aged thymus by a single transcription factor / N. Bredenkamp, C. S. Nowell, C. C. Blackburn // Development. - 2014. - V. 141, № 8. - P.1627-1637.

43. Calnan, B. J. A role for the orphan steroid receptor Nur77 in apoptosis accompanying antigen-induced negative selection / B. J. Calnan, S. Szychowski, F. K. Chan, D. Cado, A. Winoto // Immunity. - 1995. - V. 3, № 3. - P.273-282.

44. Capparuccia, L. Semaphorin signaling in cancer cells and in cells of the tumor microenvironment - two sides of a coin / L. Capparuccia, L. Tamagnone // J. Cell. Sci. - 2009. - V. 122, № 11. - P.1723-1735.

45. Carrio, R. Impaired thymopoiesis occurring during thy thymic involution of tumor-bearing mice is associated with a down-regulation of the antiapoptotic proteins Bcl-XL and A1 / R. Carrio, D. M. Lopez // Int. J. Mol. Med. - 2009. - V. 23, № 1. - P.89-98.

46. Carrio, R. Insights into thymic involution in tumor-bearing mice / R. Carrio, D. M. Lopez // Immunol. Res. - 2013. - V. 57. - P.106-114.

47. Catalano, A. Semaphorin-3A is expressed by tumor cells and alters T-cell signal transduction and function / A. Catalano, P. Caprari, S. Moretti, M. Faronato, L. Tamagnone, A. Procopio // Blood. - 2006. - V. 107, № 8. - P.3321-3329.

48. Catalano, A. The neuroimmune semaphorin-3A reduces inflammation and progression of experimental autoimmune arthritis / A. Catalano // J. Immunol. -2010. - V. 185, № 10. - P.6373-6383.

49. Chapoval, S. P. Neuroimmune semaphorins as costimulatory molecules and beyond / S. P. Chapoval // Mol. Med. - 2018. - V. 24, № 13. - P.1-20.

50. Chaudhary, B. Neuropilin 1: function and therapeutic potential in cancer / B. Chaudhary, Y. S. Khaled, B. J. Ammori, E. Elkord // Cancer Immunol. Immunother. - 2014. - V. 63, № 2. - P.81-99.

51. Cicin-Sain, L. Loss of naive T cells and repertoire constricrion predict poor response to vaccination in old primates / L. Cicin-Sain, S. Smyk-Pearson, N. Currier, L. Byrd, C. Koudelka, T. Robinson, G. Swarbrick, S. Tackitt, A. Legasse, M. Fischer, D. Nikolich-Zugich, B. Park, T. Hobbs, C. J. Doane, M. Mori, M. K. Axthelm, D. A. Lewinsohn, J. Nikolich-Zugich // J. Immunol. - 2010. - V. 184, № 12. - P.6739-6745.

52. Cimpean, A. M. Immunohistochemical expression of vascular endothelial growth factor A (VEGF), and its receptors (VEGFR1, 2) in normal and pathologic conditions of the human thymus / A. M. Cimpean, M. Raica, S. Encica, R. Cornea, V. Bocan // Ann. Anat. - 2008. - V. 190, № 3. - P.238-245.

53. Cohen, O. Nitric oxide cooperates with glucocorticoids in thymic epithelial cellmediated apoptosis of double positive thymocytes / O. Cohen, S. Kfir-Erenfeld, R.

Spokoini, Y. Zilberman, E. Yefenof, R. V. Sionov // Int. Immunol. - 2009. - V. 21, № 10. - P.1113-1123.

54. Colic, M. Bidirectional interactions between thymocytes and thymic epithelial cell lines in vitro / M. Colic, D. Vucevic, P. Popovic, A. Dujic // Dev. Immunol. -1998. - V. 6. - P.71-79.

55. Comeau, M. R. A poxvirus-encoded semaphorin induces cytokine production from monocytes and binds to a novel cellular semaphorin receptor, VESPR / M. R. Comeau, R. Johnson, R. F. DuBose, M. Peterson, P. Gearing, T. VandenBos, L. Park, T. Farrah, R. M. Buller, J. I. Cohen, L. D. Strockbine, C. Rauch, M. K. Spriggs // Immunity. - 1998. - V. 8, № 4. - P.473-482.

56. Corbel, C. Neuropilin 1 and CD25 co-regulation during early murine thymic differentiation / C. Corbel, V. Lemarchandel, V. Thomas-Vaslin, A. S. Pelus, C. Agboton, P. H. Romeo // Dev. Comp. Immunol. - 2007. - V. 31, № 11. - P.1082-1094.

57. Cyster, J. G. Sphingosine-1-phosphate and lymphocyte egress from lymphoid organs / J. G. Cyster, S. R. Schwab // Annu. Rev. Immunol. - 2012. - V. 30. -P.69-94.

58. De Winter, F. Injury-induced class 3 semaphorin expression in the rat spinal cord / F. De Winter, M. Oudega, A. J. Lankhorst, F. P. Hamers, M. J. Ruitenberg, R. J. Pasterkamp, W. H. Gispen, J. Verhaagen // Exp. Neurol. - 2002. - V. 175, № 1. -P.61-75.

59. Delaire, S. Biological activity of soluble CD100. II. Soluble CD100, similarly to H-SemaIII, inhibits immune cell migration / S. Delaire, C.Billard, R. Tordjman, A. Chedotal, A. Elhabazi, A. Bensussan, L. Boumsell // J. Immunol. - 2001. - V. 166, № 7. - P.4348-4354.

60. Den Braber, I. Maintenance of peripheral naive T cells is sustained by thymus output in mice but not humans / I. den Braber, T. Mugwagwa, N. Vrisekoop, L. Westera, R. Mogling, A. B. de Boer, N. Willems, E. H. Schrijver, G. Spierenburg, K. Gaiser, E. Mul, S. A. Otto, A. F. Ruiter, M. T. Ackermans, F. Miedema, R. J. de Boer, K. Tesselaar // Immunity. - 2012. - V. 36, № 2. - P.288-297.

61. Dent, M. F. The methylene blue colorimetric microassay for determining cell line response to growth factors / M. F. Dent, L. Hubbold, H. Radford, A. P. Wilson // Cytotechnology. - 1995. - V. 17, № 1. - P.27-33.

62. Dudakov, J. A. Interleukin-22 drives endogenous thymic regeneration in mice / J. A. Dudakov, A. M. Hanash, R. R. Jeng, L. F. Young, A. Ghosh, N. V. Singer, M. L. West, O. M. Smith, A. M. Holland, J. J. Tsai, R. L. Boyd, M. R. van den Brink // Science. - 2012. - V. 336, № 6077. - P.91-95.

63. Dumont-Lagace, M. Sec hormones have pervasive effects on thymic epithetlial cells / M. Dumont-Lagace, C. St-Pierre, C. Perreault // Sci. Rep. - 2015. - V. 5. -P.12895

64. Erickson, M. Regulation of thymic epithelium by keratinocyte growth factor / M. Erickson, S. Morkowski, S. Lehar, G. Gillard, C. Beers, J. Dooley, J. S. Rubin, A. Rudensky, A. G. Farr // Blood. - 2002. - V. 109, № 9. - P.3269-3278.

65. Eysteinsdottir, J. H. The influence of partial or total thymectomy during open heart surgery in infants on the immune function later in life / J. H. Eysteinsdottir, J. Freysdottir, A. Haraldsson, J. Stefansdottir, I. Skaftadottir, H. Helgason, H. M. Ogmundsdottir // Clin. Exp. Immunol. - 2004. - V. 136, № 2. - P.349-355.

66. Fletcher, A. L. Ablation and regeneration of tolerance-inducing medullary thymic epithelial cells after cyclosporine, cyclophosphamide, and dexamethasone treatment / A. L. Fletcher, T. E. Lowen, S. Sakkal, J. J. Reiseger, M. V. Hammett, N. Seach, H. S. Scott, R. L. Boyd, A. P. Chidgey // J. Immunol. - 2009. - V. 183, № 2. - P.823-831.

67. Foster, A. D. The aging immune system and its relationship with cancer / A. D. Foster, A. Sivarapatna, R. E. Gress // Aging health. - 2011. - V. 7, № 5. - P.707-718.

68. Fu, Y. Thymic involution and thymocyte phenotypic alterations induced by murine mammary adenocarcinomas / Y. Fu, R. D. Paul, Y. Wang, D. M. Lopez // J. Immunol. - 1989. - V. 143, № 12. - P.4300-4307.

69. Fujisawa, H. Discovery of semaphorin receptors, neuropilin and plexin, and their functions in neural development / H. Fujisawa // J. Neurobiol. - 2004. - V. 59, № 1. - P.24-33.

70. Furumatsu, T. Vascular endothelial growth factor principally acts as the main angiogenic factor in the early stage of human osteoblastogenesis / T. Furumatsu, Z. N. Shen, A. Kawai, K. Nishida, H. Manabe, T. Oohashi, H. Inoue, Y. Ninomiya // J. Biochem. - 2003. - V. 133, № 5. - P.633-639.

71. Garcia, F. Inhibitory effect of semaphorin-3A, a known axon guidance molecule in the human thymocyte migration induced by CXCL12 / F. Garcia, Y. Lepelletier, S. Smaniotto, R. Hadj-Slimane, M. Dardenne, O, Hermine, W. Savino // J. Leukoc. Biol. - 2012. - V. 91, № 1. - P.7-13.

72. George, A. J. Thymic involution with ageing: obsolescence or good housekeeping / A. J. George, M. A. Ritter // Immunol. Today. - 1996. - V. 17, № 6. - P.267-272.

73. Gherardi, E. The sema domain / E. Gherardi, C. A. Love, R. M. Esnouf, E. Y. Jones // Curr. Opin. Struct. Biol. - 2004. - V. 14, № 6. - P.669-678.

74. Giger, R. J. Anatomical distribution of the chemorepellent semaphorin III/collapsin-1 in the adult rat and human brain: predominant expression in structures of the olfactory-hippocampal pathway and the motor system / R. J. Giger, R. J. Pasterkamp, S. Heijnen, A. J. Holtmaat, J. Verhaagen // J. Neurosci. Res. - 1998. - V. 52, № 1. - P.27-42.

75. Giordano, A. Sema3A and neuropilin-1 expression and distribution in rat white adipose tissue / A. Giordano, P. Cesari, L. Capparuccia, S. Cinti // J. Neurocytol. -2003. - V. 32, № 4. - P.345-352.

76. Glinka, Y. Neuropilin-1 exerts co-receptor function for TGF-beta-1 on the membrane of cancer cells and enhances responses to both latent and active TGF-beta / Y. Glinka, S. Stoilova, N. Mohammed, G. J. Prudhomme // Carcinogenesis. - 2011. - V. 32, № 4. - P.613-621.

77. Goodman, C. S. Unified nomenclature for the Semaphorins/Collapsins / C. S. Goodman // Cell. - 1999. - V. 97. - P.551-552.

78. Gordon, J. Mechanisms of thymus organogenesis and morphogenesis / J. Gordon, N. R. Manley // Development. - 2011. - V. 138, № 18. - P.3865-3878.

79. Gray, D. H. Developmental kinetics, turnover, and stimulatory capacity of thymic epithelial cells / D. H. Gray, N. Seach, T. Ueno, M. K. Milton, A. M. Lew, C. C. Goodnow, R. L. Boyd // Blood. - 2006. - V. 108, № 12. - P.3777-3785.

80. Griffith, A. V. Persistent degenerative changes in thymic organ function revealed by an inducible model of organ regrowth / A. V. Griffith, M. Fallahi, T. Venables, H. T. Petrie // Aging Cell. - 2012. - V. 11, № 1. - P.169-177.

81. Gu, C. Semaphorin 3E and plexin-D1 control vascular pattern independently of neuropilins / C. Gu, Y. Yoshida, J. Livet, D. V. Reimert, F. Mann, J. Merte, C. E. Henderson, T. M. Jessell, A. L. Kolodkin, D. D. Ginty // Science. - 2005. - V. 307, № 5707. - P.265-268.

82. Gudmundsdottir, J. Early thymectomy leads to premature immunologic ageing: an 18-year follow-up / J. Gudmundsdottir, S. Oskarsdottir, G. Skogberg, S. Lindgren, V. Lundberg, M. Berglund, A. C. Lundell, H. Berggren, A. Fasth, E. Telemo, O. Ekwall // J. Allergy Clin. Immunol. - 2016. - V. 138, № 5. - P.1439-1443.

83. Gudmundsdottir, J. Long-term clinical effects of early thymectomy: associations with autoimmune diseases, cancer, infections, and atopic diseases / J. Gudmundsdottir, J. Soderling, H. Berggren, S. Oskarsdottir, M. Neovius, O. Stephansson, O. Ekwall // J. Allergy Clin. Immunol. - 2018. - V. 141, № 6. -P.2294-2297.

84. Guttmann-Raviv, N. Semaphorin-3A and semaphorin-3F work together to repel endothelial cells and to inhibit their survival by induction of apoptosis / N. Guttmann-Raviv, N. Shraga-Heled, A. Varshavsky, C. Guimaraes-Sternberg, O. Kessler, Neufeld G. // J. Biol. Chem. - 2007. - V. 282, № 36. - P.26294-26305.

85. Haeryfar, S. M. Thy-1: more than a mouse pan-T cell marker / S. M. Haeryfar, D. W. Hoskin // J. Immunol. - 2004. - V. 173, № 6. - P.3581-3588.

86. Hansen, M. B. Re-examination and further development of a precise and rapid dye method for measuring cell growth/cell kill / M. B. Hansen, S. E. Nielsen, K. Berg // J. Immunol. Methods. - 1989. - V. 119, № 2. - P.203-210.

87. Hauri-Hohl, M. A regulatory role for TGF-P signaling in the establishment and function of the thymic medulla / M. Hauri-Hohl, S. Zuklys, G. A. Hollander, S. F. Ziegler // Nat. Immunol. - 2014. - V. 15, № 6. - P.554-561.

88. Hayashi, M. Osteoprotection by semaphorin 3A / M. Hayashi, T. Nakashima, M. Taniguchi, T. Kodama, A. Kumanogoh, H. Takayanagi // Nature. - 2012. - V. 485, № 7396. - P.69-74.

89. Haynes, L. Why aging T cells fail: implications for vaccination / L. Haynes, S. L. Swain // Immunity. - 2006. - V. 24, № 6. - P.663-666.

90. He, H. T. Thy-1 supports adhesion of mouse thymocytes to thymic epithelial cells through a Ca -independent mechanism / H. T. He, P. Naquet, D. Caillol, M. Pierres // J. Exp. Med. - 1991. - V. 173. - P.515-518.

91. He, Z. Neuropilin is a receptor for the axonal chemorepellent Semaphorin III / Z. He, M. Tessier-Lavigne // Cell. - 1997. - V. 90, № 4. - P.739-751.

92. Herman, J. G. Increased class 3 semaphorin expression modulates the invasive and adhesive properties of prostate cancer cells / J. G. Herman, G. G. Meadows // Int. J. Oncol. - 2007. - V. 30, № 5. - P.1231-1238.

93. Hermosilla, T. Direct thy-1/avp3 integrin interaction mediates neuron to astrocyte communication / T. Hermosiila, D. Munoz, R. Herrera-Molina, A. Valdivia, N. Munoz, S.-U. Nham, P. Schneider, K. Burridge, A. F. G. Quest, L. Leyton // Biochim. Biophys. Acta. - 2008. - V. 1783. - P.1111-1120.

94. Hernandez, J. B. Life and death in the thymus - cell death signaling during T cell development / J. B. Hernandez, R. H. Newton, C. M. Walsh // Curr. Opin. Cell Biol. - 2010. - V. 22, № 6. - P.865-871.

95. Holder, A. Perturbation of the T cell receptor repertoire occurs with increasing age in dogs / A. Holder, S. M. Mirczuk, R. C. Fowkes, D. B. Palmer, R. Aspinall, B. Catchpole // Dev. Comp. Immunol. - 2018. - V. 79. - P.150-157.

96. Imado, T. Hepatocyte growth factor preserves graft-versus-leukemia effect and T-cell reconstitution after marrow transplantation / T. Imado, T. Iwasaki, Y. Kataoka, T. Kuriowa, H. Hara, J. Fujimoto, H. Sano // Blood. - 2004. - V. 104, № 5. -P.1542-1549.

97. Janowski, M. Functional diversity of SDF-1 splicing variants / M. Janowski // Cell. Adh. Migr. - 2009. - V. 3, № 3. - P.243-249.

98. Jenkinson, W. E. Differential requirement for mesenchyme in the proliferation and maturation of thymic epithelial progenitors / W. E. Jenkinson, E. J. Jenkinson, G. Anderson // J. Exp. Med. - 2003. - V. 198, № 2. - P.325-332.

99. Ji, J. D. Expression and function of semaphorin 3A and its receptors in human monocyte-derived macrophages / J. D. Ji, K. H. Park-Min, L. B. Ivashkiv // Hum. Immunol. - 2009. - V. 70, № 4. - P.211-217.

100. Jin, J. In vivo administration of the recombinant IL-7/hepatocyte growth factor P hybrid cytokine efficiently restores thymopoiesis and naive T cell generation in lethally irradiated mice after syngeneic bone marrow transplantation / J. Jin, I. Goldschneider, L. Lai // J. Immunol. - 2011. - V. 186, № 4. - P.1915-1922.

101. Jung, W. S. Stimulatory effect of HGF-overexpressing adipose tissue-derived mesenchymal stem cells on thymus regeneration in a rat thymus involution model / W. S. Jung, S. M. Han, S. M. Kim, M. E. Kim, J. S. Lee, H. Y. Youn, H. W. Lee // Cell. Biol. Int. - 2014. - V. 38, № 10. - P. 1106-1117.

102. Just, N. Keratinocyte growth factor (KGF) decreases ICAM-1 and VCAM-1 cell expression on bronchial epithelial cells / N. Just, I. Tillie-Leblond, B. P. Guery, C. Fourneau, A. B. Tonnel, P. Gosset // Clin. Exp. Immunol. - 2003. - V. 132, № 1. -P.61-69.

103. Kasai, M. Derivation, culture, and characterization of thymic epithelial cell lines / M. Kasai, T. Mizuochi // Methods Mol. Biol. - 2007. - V. 380. - P.107-123.

104. Kasai, M. Difference in antigen presentation pathways between cortical and medullary thymic epithelial cells / M. Kasai, K. Hirokawa, K. Kajino, K. Ogasawara, M. Tatsumi, E. Hermel, J. J. Monaco, T. Mizuochi // Eur. J. Immunol.

- 1996. - V. 26, № 9. - P.2101-2107.

105. Kashiwagi, H. Negative regulation of platelet function by a secreted cell repulsive protein, semaphorin 3A / H. Kashiwagi, M. Shiraga, H. Kato, T. Kamae, N. Yamamoto, S. Tadokoro, Y. Kurata, Y. Tomiyama, Y. Kanakura // Blood. - 2005.

- V. 106, № 3. - P.913-921.

106. Kigel, B. Successful inhibition of tumor development by specific class-3 semaphorins is associated with expression of appropriate semaphorin receptors by tumor cells / B. Kigel, A. Varshavsky, O. Kessler, G. Neufeld // PLoS One. -2008. - V. 3, № 9. - P.1-14.

107. Kohler, S. Post-thymic in vivo proliferation of naive CD4+ T cells constrains the TCR repertoire in healthy human adults / S. Kohler, U. Wagner, M. Pierer, S. Kimmig, B. Oppmann, B. Mowes, K. Julke, C. Romagnani, A. Thiel // Eur. J. Immunol. - 2005. - V. 35, № 6. - P.1987-1994.

108. Kolodkin, A. L. Fasciclin IV: sequence, expression, and function during growth cone guidance in the grasshopper embryo / A. L. Kolodkin, D. J. Matthes, T. P. O'Connor, N. H. Patel, A. Admon, D. Bentley, C. S. Goodman // Neuron. - 1992. - V. 9, № 5. - P.831-845.

109. Kolodkin, A. L. Neuropilin is a Semaphorin III receptor / A. L. Kolodkin, D. V. Levengood, E. G. Rowe, Y. T. Tai, R. J. Giger, D. D. Ginty // Cell. - 1997. - V. 90, № 4. - P.753-762.

110. Kolodkin, A. L. The semaphorin genes encode a family of transmembrane and secreted growth cone guidance molecules / A. L. Kolodkin, D. J. Matthes, C. S. Goodman // Cell. - 1993. - V. 75, № 7. - P.1389-1399.

111. Kopf, M. Impaired immune and acute-phase responses in interleukin-6-deficient mice / M. Kopf, H. Baumann, G. Freer, M. Freudenberg, M. Lamers, T. Kishimoto, R. Zinkernagel, H. Bluethmann, G. Kohler // Nature. - 1994. - V. 368, № 6469. - P.339-342.

112. Koppel, A. M. A 70 amino acid region within the semaphorin domain activates specific cellular response of semaphorin family members / A. M. Koppel, L. Feiner, H. Kobayashi, J. A. Raper // Neuron. - 1997. - V. 19, № 3. - P.531-537.

113. Kowitz, A. Expression and function of the neural cell adhesion molecule L1 in mouse leukocytes / A. Kowitz, G. Kadmon, M. Eckert, V. Schirrmacher, M. Schachner, P. Altevogt // Eur. J. Immunol. - 1992. - V. 22, № 5. - P.1199-1205.

114. Kumanogoh, A. Immune semaphorins: a new area of semaphorin research / A. Kumanogoh, H. Kikutani // J. Cell Sci. - 2003. - V. 116, № 17. - P.3463-3470.

115. Kuss, I. Decreased absolute counts of T lymphocyte subsets and their relation to disease in squamous cell carcinoma of the head and neck / I. Kuss, B. Hathaway, R. L. Ferris, W. Gooding, T. L. Whiteside // Clin. Cancer Res. - 2004. - V. 10, № 11. - P.3755-3762.

116. Lai, L. Generation of thymic epithelial cell progenitors by mouse embryonic stem cells / L. Lai, J. Jin // Stem. Cells. - 2009. - V. 27, № 12. - P.3012-3020.

117. Le Borgne, M. The impact of negative selection on thymocyte migration in the medulla / M. Le Borgne, E. Ladi, I. Dzhagalov, P. Herzmark, Y. F. Liao, A. K. Chakraborty, E. A. Robey // Nat. Immunol. - 2009. - V. 10, № 8. - P.823-830.

118. Lee, H. W. RANKL stimulates proliferation, adhesion and IL-7 expression of thymic epithelial cells / H. W. Lee, H. K. Park, Y. J. Na, C. D. Kim, J. H. Lee, B. S. Kim, J. B. Kim, C. W. Lee, J. O. Moon, S. Yoon // Exp. Mol. Med. - 2008. - V. 40, № 1. - P.59-70.

119. Lepelletier, Y. Control of human thymocytes migration by Neuropilin-1/Semaphorin-3A-mediated interaction / Y. Lepelletier, S. Smaniotto, R. Hadj-Slimane, D. M. Villa-Verde, A. C. Nogueira, M. Dardenne, O. Hermine, W. Savino // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2007. - V. 104, № 13. - P.5545-5550.

120. Lepelletier, Y. Immunosuppressive role of semaphorin-3A on T cell proliferation is mediated by inhibition of actin cytoskeleton reorganization / Y. Lepelletier, I. C. Moura, R. Hadj-Slimane, A. Renand, S. Fiorentino, C. Baude, A. Shirvan, A. Barzilai, O. Hermine // Eur. J. Immunol. - 2006. - V. 36, № 7. - P.1782-1793.

121. Lepletier, A. Inflammation and thymus ageing / A. Lepletier, A. Alsharif, A. P. Chidgey // Front. Horm. Res. - 2017. - V. 48. - P.19-35.

122. Lins, M. P. Association between biomechanical alterations and migratory ability of semaphorin-3A-treated thymocytes / M. P. Lins, E. C. O. Silva, G. R. Silva, S. T. Souza, N. C. Medeiros, E. J. S. Fonseca, S. Smaniotto // Biochim. Biophys. Acta. -2018. - V. 1862, № 4. - P.816-824.

123. Liu, L. N. Emerging role of semaphorin-3A in autoimmune diseases / L. N. Liu, X. M. Li, D. Q. Ye, H. F. Pan // Inflammapharmacology. - 2018. - V. 26, № 3. -P.655-665.

124. Liu, Y. Q. Wedelolactone enhances osteoblastogenesis but Inhibits osteoclastogenesis through Sema3A/NRP1/PlexinA1 pathway / Y. Q. Liu, X. F. Han, J. X. Bo, H. P. Ma // Front. Pharmacol. - 2016. - V. 7, № 375. - P.1-10.

125. Luo, Y. Collapsin: a protein in brain that induces the collapse and paralysis of neuronal growth cones / Y. Luo, D. Raible, J. A. Raper // Cell. - 1993. - V. 75, №

2. - P.217-227.

126. Mackall, C. L. Age, thymopoiesis, and CD4+ T-lymphocyte regeneration after intensive chemotherapy / C. L. Mackall, T. A. Fleisher, M. R. Brown, M. P. Andrich, C. C. Chen, I. M. Feuerstein, M. E. Horowitz, I. T. Magrath, A. T. Shad, S. M. Steinberg, L. H. Wexler, R. E. Gress // N. Engl. J. Med. - 1995. - V. 332, №

3. - P.143-149.

127. Maione, F. Semaphorin 3A is an endogenous angiogenesis inhibitor that blocks tumor growth and normalizes tumor vasculature in transgenic mouse models / F. Maione, F. Molla, C. Meda, R. Latini, L. Zentilin, M. Giacca, G. Seano, G. Serini, F, Bussolino, E. Giraudo // J. Clin. Invest. - 2009. - V. 119, № 11. - P.3356-3372.

128. Maione, F. Semaphorin 3A overcomes cancer hypoxia and metastatic dissemination induced by antiangiogenic treatment in mice / F. Maione, S. Capano, D. Regano, L. Zentilin, M. Giacca, O. Casanovas, F. Bussolino, G. Serini, E. Giraudo // J. Clin. Invest. - 2012. - V. 122, № 5. - P.1832-1848.

129. Man, X. Y. Immunolocalization and expression of vascular endothelial growth factor receptors (VEGFRs) and neuropilins (NRPs) on keratinocytes in human epidermis / X. Y. Man, X. H. Yang, S. Q. Cai, Y. G. Yao, M. Zheng // Mol. Med. -2006. - V. 12. - P.127-136.

130. Mandal, M. The BCL2A1 gene as a pre-T cell receptor-induced regulator of thymocyte survival / M. Mandal, C. Borowski, T. Palomero, A. A. Ferrando, P. Oberdoerffer, F. Meng, A. Ruiz-Vela, M. Ciofani, J. C. Zuniga-Pflucker, I. Screpanti, A. T. Look, S. J. Korsmeyer, K. Rajewsky, H. von Boehmer, I. Aifantis // J. Exp. Med. - 2005. - V. 201, № 4. - P.603-614.

131. Marlin, S. D. Purified intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1) is a ligand for lymphocyte function-associated antigen 1 (LFA-1) / S. D. Marlin, T. A. Springer // Cell. - 1987. - V. 51, № 4. - P.813-819.

132. Mendes-da-Cruz, D. A. Neuropilins, semaphorins, and their role in thymocyte development / D. A. Mendes-da-Cruz, Y. Lepelletier, A. C. Brignier, S. Smaniotto, A. Renand, P. Milpied, M. Dardenne, O. Hermine, W. Savino // Ann. N. Y. Acad. Sci. - 2009. - V. 1153. - P.20-28.

133. Mendes-da-Cruz, D. A. Semaphorins and neuropilins: new players in the neuroendocrine control of the intrathymic T-cell migration in humans / D. A. Mendes-da-Cruz, L. Linhares-Lacerda, S. Smaniotto, M. Dardenne, W, Savino // Exp. Physiol. - 2012. - V. 97, № 11. - P.1146-1150.

134. Miao, H. Q. Neuropilin-1 mediates collapsin-1/semaphorin III inhibition of endothelial cell motility: functional competition of collapsin-1 and vascular endothelial growth factor-165 / H. Q. Miao, S. Soker, L. Feiner, J. L. Alonso, J. A. Raper, M. Klagsburn // J. Cell. Biol. - 1999. - V. 146, № 1. - P.233-242.

135. Milpied, P. Neuropilin-1 is not a marker of human Foxp3+ Treg / P. Milpied, A. Renand, J. Bruneau, D. A. Mendes-da-Cruz, S. Jacquelin, V. Asnafi, M. T. Rubio, E. Maclntyre, Y. Lepelletier, O. Hermine // Eur. J. Immunol. - 2009. - V. 39, № 6. - P.1466-1471.

136. Min, D. Sustained thymopoiesis and improvement in functional immunity induced by exogenous KGF administration in murine models of aging / D. Min, A. Panoskaltsis-Mortari, M. Kuro-O, G. A. Hollander, B. R. Blazar, K. I. Weinberg // Blood. - 2007. - V. 109, № 6. - P.2529-2537.

137. Mishra, R. The potential of class 3 semaphorins as both targets and therapeutics in cancer / R. Mishra, D. Kumar, D. Tomar, G. Chakraborty, S. Kumar, G. C. Kundu // Expert. Opin. Ther. Targets. - 2015. - V. 19, № 3. - P.427-442.

138. Moulian, N. In vivo and in vitro apoptosis of human thymocytes are associated with nitrotyrosine formation / N. Moulian, F. Truffault, Y. M. Gaudry-Talarmain, A. Serraf, S. Berrih-Aknin // Blood. - 2001. - V. 97, № 11. - P.3521-3530.

139. Muller, M. W. Association of axon guidance factor semaphorin 3A with poor outcome in pancreatic cancer / M. W. Muller, N. A. Giese, J. M. Swiercz, G. O. Ceyhan, I. Esposito, U. Hinz, P. Buchler, T. Giese, M. W. Buchler, S. Offermanns, H. Friess // Int. J. Cancer. - 2007. - V. 121, № 11. - P.2421-2433.

140. Muller, S. M. Gene targeting of VEGF-A in thymus epithelium disrupts thymus blood vessel architecture / S. M. Muller, G. Terzowski, C. Blum, C. Haller, V. Anquez, S. Kuschert, P. Carmeliet, H. G. Augustin, H. R. Rodewald // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2005. - V. 102, № 30. - P.10587-10592.

141. Nakamura, F. Neuropilin-1 extracellular domains mediate semaphorin D/III-induced growth cone collapse / F. Nakamura, M. Tanaka, T. Takahashi, R. G. Kalb, S. M. Strittmatter // Neuron. - 1998. - V. 21, № 5. - P.1093-1100.

142. Narazaki, M. Ligand-induced internalization selects use of common receptor neuropilin-1 by VEGF165 and semaphorin3A / M. Narazaki, G. Tosato // Blood. -2006. - V. 107, № 10. - P.3892-3901.

143. Naylor, K. The influence of age on T cell generation and TCR diversity / K. Naylor, G. Li, A. N. Vallejo, W. W. Lee, K. Koetz, E. Bryl, J. Witkowski, J. Fulbright, C. M. Weyand, J. J. Goronzy // J. Immunol. - 2005. - V. 174, № 11. -P.7446-7452.

144. Neufeld, G. The semaphorins and their receptors as modulators of tumor progression / G. Neufeld, Y. Mumblat, T. Smolkin, S. Toledano, I. Nir-Zvi, K. Ziv, O. Kessler // Drug. Resist. Updat. - 2016. - V. 29. - P.1-12.

145. Neufeld, G. The semaphorins: versatile regulators of tumour progression and tumour angiogenesis / G. Neufeld, O. Kessler // Nat. Rev. Cancer. - 2008. - V. 8, № 8. - P.632-645.

146. Nikolich-Zugich, J. Ageing and life-long maintenance of T-cell subsets in the face of latent persistent infections / J. Nikolich-Zugich // Nat. Rev. Immunol. - 2008. -V. 8, № 7. - P.512-522.

147. Ohta, K. Plexin: a novel neuronal cell surface molecule that mediates cell adhesion via a homophilic binding mechanism in the presence of calcium ions / K. Ohta, A.

Mizutani, A. Kawakami, Y. Murakami, Y. Kasuya, S. Takagi, H. Tanaka, H. Fujisawa // Neuron. - 1995. - V. 14, № 6. - P. 1189-1199.

148. Ortman, C. L. Molecular characterization of the mouse involuted thymus: aberrations in expressions of transcription regulators in thymocyte and epithelial compartments / C. L. Ortman, K. A. Dittmar, P. L. Witte, P. T. Le // Int. Immunol.

- 2002. - V. 14, № 7. - P.813-822.

149. Pan, B. Acute ablation of DP thymocytes induces up-regulation of IL-22 and Foxn1 in TECs / B. Pan, J. Liu, Y. Zhang, Y. Sun, Q. Wu, K. Zhao, L. Zeng, K. Xu // Clin. Immunol. - 2014. - V. 150, № 1. - P.101-108.

150. Pan, H. Autocrine semaphorin 3a stimulates eukaryotic initiation factor 4e-dependent rhoa translation in breast tumor cells / H. Pan, R. E. Bachelder // Exo. Cell. Res. - 2010. - V. 316, № 17. - P.2825-2532.

151. Parent, A. V. Generation of functional thymic epithelium from human embryonic stem cells that supports host T cell development / A. V. Parent, H. A. Russ, I. S. Khan, T. N. LaFlam, T. C. Metzger, M. S. Anderson, M. Hebrok // Cell Stem. Cell.

- 2013. - V. 13, № 2. - P.219-229.

152. Park, H. J. Up-regulation of VEGF expression by NGF that enhances reparative angiogenesis during thymic regeneration in adult rat / H. J. Park, M. N. Kim, J. G. Kim, Y. H. Bae, M. K. Bae, H. J. Wee, T. W. Kim, B. S. Kim, J. B. Kim, S. K. Bae, S. Yoon // Biochim. Biophys. Acta. - 2007. - V. 1773, № 9. - P.1462-1472.

153. Pearse, G. Normal structure, function and histology of the thymus / G. Pearse // Toxicol. Pathol. - 2006. - V. 34, № 5. - P.504-514.

154. Perry, S. W. Simultaneous in situ detection of apoptosis and necrosis in monolayer cultures by TUNEL and trypan blue staining / S. W. Perry, L. G. Epstein, H. A. Gelbard // Biotechniques. - 1997. - V. 22, № 6. - P. 1102-1106.

155. Peschon, J. J. Early lymphocyte expansion is severely impaired in interleukin 7 receptor-deficient mice / J. J. Peschon, P. J. Morrissey, K. H. Grabstein, F. J. Ramsdell, E. Maraskovsky, B. C. Gliniak, L. S. Park, S. F. Ziegler, D. E. Williams, C. B. Ware, J. D. Meyer, B. L. Davison // J. Exp. Med. - 1994. - V. 180, № 5. -P.1955-1960.

156. Petridou, E. Recent thymic emigrants and prognosis in T- and B-cell childhood hematopoietic malignancies / E. Petridou, A. E. Klimentopoulou, M. Moustaki, L. G. Kostrikis, A. Hatzakis, D. Trichopoulos // Int. J, Cancer. - 2002. - V. 101, № 1. - P.74-77.

157. Pezzi, N. Aire knockdown in medullary thymic epithelial cells affects Aire protein, deregulates cell adhesion genes and decreases thymocyte interaction / N. Pezzi, A. F. Assis, L. C. Cotrim-Sousa, G. S. Lopes, M. S. Mosella, D. S. Lima, K. F. Bombonato-Prado, G. A. Passos // Mol. Immunol. - 2016. - V. 77. - P.157-173.

158. Plotkin, J. Critical role for CXCR4 signaling in progenitor localization and T cell differentiation in the postnatal thymus / J. Plotkin, S. E. Prockop, A. Lepique, H. T. Petrie // J. Immunol. - 2003. - V. 171, № 9. - P.4521-4527.

159. Potiron, V. A. Semaphorins and their receptors in lung cancer / V. A. Potiron, J. Roche, H. A. Drabkin // Cancer Lett. - 2009. - V. 273, № 1. - P. 1-14.

160. Prelog M. Aging of the immune system: a risk for autoimmunity? / M. Prelog // Autoimmun. Rev. - 2006. - V. 5, № 2. - P.136-139.

161. Prelog, M. Thymectomy in early childhood: significant alterations of the CD4+CD45RA+CD62L+ T cell compartment in later life / M. Prelog, M. Keller, R. Geiger, A. Brandstatter, R. Wurzner, U. Schweigmann, M. Zlamy, L. B. Zimmerhackl, B. Grubeck-Loebenstein // Clin. Immunol. - 2009. - V. 130, № 2. -P.123-132.

162. Raper, J. A. The enrichment of a neuronal growth cone collapsing activity from embryonic chick brain / J. A. Raper, J. P. Kapfhammer // Neuron. - 1990. - V. 4, № 1. - P.21-29.

163. Robinson, S. D. av^3 integrin limits the contribution of neuropilin-1 to vascular endothelial growth factor-induced angiogenesis / S. D. Robinson, L. E. Reynold, V. Kostourou, A. R. Reynolds, R. G. da Silva, B. Tavora, M. Baker, J. F. Marshall, K. M. Hodivala-Dilke // J. Biol. Chem. - 2009. - V. 284, № 49. - P.33966-33981.

164. Rossi, S. Keratinocyte growth factor preserves normal thymopoiesis and thymic microenvironment during experimental graft-versus-host disease / S. Rossi, B. R.

Blazar, C. L. Farrell, D. M. Danilenko, D. L. Lacey, K. I. Weinberg, W. Krenger, G. A. Hollander // Blood. - 2002. - V. 100, № 2. - P.682-691.

165. Rossi, S. W. Keratinocyte growth factor (KGF) enhances postnatal T-cell development via enhancement in proliferation and function of thymic epithelial cells / S. W. Rossi, L. T. Jeker, T. Ueno, S. Kuse, M. P. Keller, S. Zuklys, A. V. Gudkov, Y. Takahama, W. Krenger, B. R. Blazar, G. A. Hollander // Blood. -2007. - V. 109, № 9. - P.3803-3811.

166. Roy, S. Multifaceted role of neuropilins in the immune system: potential targets for immunotherapy / S. Roy, A. K. Bag, R. K. Singh, J. E. Talmadge, S. K. Batra, K. Datta // Front. Immunol. - 2017. - V. 8. - P.1-27.

167. Saalbach, A. Dermal fibroblasts induce maturation of dendritic cells / A. saalbach, C. Klein, J. Sleeman, U. Sack, F. Kauer, C. Gebhardt, M. Averbeck, U. Anderegg, J. C. Simon // J. Immunol. - 2007. - V. 178, № 8. - P.4966-4974.

168. Saito,T. Spontaneous apoptosis of CD8+ T lymphocytes in peripheral blood of patients with advanced melanoma / T. Saito, G. Dworacki, W. Gooding, M. T. Lotze, T. L. Whiteside // Clin. Cancer Res. - 2000. - V. 6, № 4. - P.1351-1364.

169. Savino,W. Intrathymic T-cell migration: a combinatorial interplay of extracellular matrix and chemokines / W. Savino, D. A. Mendes-da-Cruz, J. S. Silva, M. Dardenne, V. Cotta-de-Almeida // Trends Immunol. - 2002. - V. 23, № 6. - P.305-313.

170. Savino,W. Thymic epithelium in AIDS. An immunohistologic study // W. Savino, M. Dardenne, C. Marche, D. Trophilme, J. M. Dupuy, D. Pekovic, N. Lapointe, J. F. Bach // Am. J. Pathol. - 1986. - V. 122, № 2. - P.302-307.

171. Schreiber, L. Induction of apoptosis and p53 expression in immature thymocytes by direct interaction with thymic epithelial cells / L. Schreiber, Y. Sharabi, D. Schwartz, N. Goldfinger, C. Brodie, V. Rotter, J. Shoham // Scand. J. Immunol. -1996. - V. 44, № 4. - P.314-322.

172. Serini, G. Class 3 semaphorins control vascular morphogenesis by inhibiting integrin function / G. Serini, D. Valdembri, S. Zanivan, G. Morterra, C. Burkhardt, F. Caccavari, L. Zammataro, L. Primo, L. Tamagnone, M. Logan, M. Tessier-

Lavigne, A. W. Puschel, F. Bussolino // Nature. - 2003. - V. 424, № 6947. -P.391-397.

173. Shanker, A. Impairment of T-cell functions with the progressive ascitic growth of a transplantable T-cell lymphoma of spontaneous origin / A. Shanker, S. M. Singh, A. Sodhi // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2000. - V. 27, № 3. - P.247-255.

174. Shimizu, Y. Distinct divalent cation requirements for integrin-mediated CD4+ T lymphocyte adhesion to ICAM-1, fibronectin, VCAM-1, and invasin / Y. Shimizu, J. L. Mobley // J. Immunol. - 1993. - V. 151, № 8. - P.4106-4115.

175. Shirvan, A. Semaphorins as mediators of neuronal apoptosis / A. Shirvan, I. Ziv,

G. Fleminger, R, Shina, Z. He, I. Brudo, E. Melamed, A. Barzilai // J. Neurochem.

- 1999. - V. 73, № 3. - P.961-971.

176. Singer, K. H. Human thymocytes bind to autologous and allogeneic thymic epithelial cells in vitro / K. H. Singer, L. S. Wolf, D. F. Lobach, S. M. Denning, D. T. Tuck, A. L. Robertson, B. F. Haynes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1986. - V. 83, № 17. - P.6588-6592.

177. Singer, K. H. Interactions between epithelial cells and T lymphocytes: role of adhesion molecules / K. H. Singer // J. Leukoc. Biol. - 1990. - V. 48, № 4. -P.367-374.

178. Soker, S. Neuropilin-1 is expressed by endothelial and tumor cells as an isoform-specific receptor for vascular endothelial growth factor / S. Soker, S. Takashima,

H. Q. Miao, G. Neufeld, M. Klagsburn // Cell. - 1998. - V. 92, № 6. - P.735-745.

179. Song, Y. Disruption of thymic microenvironment is associated with thymic involution of transitional cell cancer / Y. Song, R. Yu, C. Wang, F. Chi, Z. Guo, X. Zhu // Urol. Int. - 2014. - V. 92, № 1. - P.104-115.

180. Stemberger, J. Novel single-platform multiparameter FCM analysis of apoptosis: significant differences between wash and no-wash procedure / J. Stemberger, V. Witt, D. Printz, R. Geyeregger, G. Fritsch // Cytometry A. - 2010. - V. 77, № 11.

- P.1075-1081.

181. Su, M. Efficient in vitro generation of functional thymic epithelial progenitors from human embryonic stem cells / M. Su, R. Hu, J. Jin, Y. Yan, Y. Song, R. Sullivan, L. Lai // Sci. Rep. - 2015. - V. 5. - P.9882.

182. Sulpice, E. Neuropilin-1 and neuropilin-2 act as coreceptors, potentiating proangiogenic activity / E. Sulpice, J. Plouet, M. Berge, D. Allanic, G. Tobelem, T. Merkulova-Rainon // Blood. - 2008. - V. 114, № 4. - P.2036-2045.

183. Suzuki, G. Pertussis toxin-sensitive signal controls the trafficking of thymocytes across the corticomedullary junction in the thymus / G. Suzuki, H. Sawa, Y. Kobayashi, Y. Nakata, K. Nakagawa, A. Uzawa, H. Sakiyama, S. Kakinuma, K. Iwabuchi, K. Nagashima // J. Immunol. - 1999. - V. 162, № 10. - P.5981-5985.

184. Takagi, S. Expression of a cell adhesion molecule, neuropilin, in the developing chick nervous system / S. Takagi, Y. Kasuya, M. Shimizu, T. Matsuura, M. Tsuboi, A. Kawakami, H. Fujisawa // Dev. Biol. - 1995. - V. 170, № 1. - P.207-222.

185. Takagi, S. Specific cell surface labels in the visual centers of Xenopus laevis tadpole identified using monoclonal antibodies / S. Takagi, T. Tsuji, T. Amagai, T. Takamatsu, H. Fujisawa // Dev. Biol. - 1987. - V. 122, № 1. - P.90-100.

186. Takagi, S. The A5 antigen, a candidate for the neuronal recognition molecule, has homologies to complement components and coagulation factors / S. Takagi, T. Hirata, K. Agata, M. Mochii, G. Eguchi, H. Fujisawa // Neuron. - 1991. - V. 7, № 2. - P.295-307.

187. Takamatsu, H. Diverse roles for semaphorin-plexin signaling in the immune system / H. Takamatsu, A. Kumanogoh // Trends. Immunol. - 2012. - V. 33, № 3. - P.127-135.

188. Talaber, G. Wnt-4 protects thymic epithelial cells against dexamethasone-induced senescence / G. Talaber, K. Kvell, Z. Varecza, F. Boldizsar, S. M. Parnell, E. J. Jenkinson, G. Anderson, T. Berki, J. E. Pongracz // Rejuvenation Res. - 2011. - V. 12, № 3. - P.214-248.

189. Tang, C. Decreased expression of SEMA3A is associated with poor prognosis in gastric carcinoma / C. Tang, X. Gao, H. Liu, T. Jiang, X. Zhai // Int. J. Clin. Exp. Pathol. - 2014. - V. 7, № 8. - P.4782-4794.

190. Tessier-Lavigne, M. The molecular biology of axon guidance / M. Tessier-Lavigne, C. S. Goodman // Science. - 1996. - V. 274, № 5290. - P.1123-1133.

191. Tibbetts, T. A. Progesterone receptors in the thymus are required for thymic involution during pregnancy and normal fertility / T. A. Tibbetts, F. DeMayo, S. Rich, O. M. Conneely, B. W. Omalley // Proc. Natl. Acad, Sci. USA. - 1999. - V. 96, № 21. - P.12021-12026.

192. Togari, A. Expression of mRNA for axon guidance molecules, such as semaphorin-III, netrins and neurotrophins, in human osteoblasts and osteoclasts / A. Togari, M. Mogi, M. Arai, S. Yamamoto, Y. Koshihara // Brain Res. - 2000. -V. 878. - P.204-209.

193. Tordjman, R. A neuronal receptor, neuropilin-1, is essential for the initiation of the primary immune response / R. Tordjman, Y. Lepelletier, V. Lemarchandel, M. Cambot, P. Gaulard, O. Hermine, P. H. Romeo // Nat. Immunol. - 2002. - V. 3, № 5. - P.477-482.

194. Tordjman, R. Neuropilin-1 is expressed on bone marrow stromal cells: a novel interaction with hematopoietic cells? / R. Tordjman, N. Ortega, L. Coulombel, J. Plouet, P. H. Romeo, V. Lemarchandel // Blood. - 1999. - V. 94, № 7. - P.2301-2309.

195. Towle, M. F. Deprivation of leukemia inhibitory factor by its function-blocking antibodies augments T cell activation / M. F. Towle, M. Mondragon-Escorpizo, A. Norin, K. Fukada // J. Interferon Cytokine Res. - 1998. - V. 18. - P.387-392.

196. Toyofuku, T. FARP2 triggers signals for Sema3A-mediated axonal repulsion / T. Toyofuku, J. Yoshida, T. Sugimoto, H. Zhang, A. Kumanogoh, M. Hori, H. Kikutani // Nat. Neurosci. - 2005. - V. 8, № 12. - P.1712-1719.

197. Trusolino, L. HGF/scatter factor selectively promotes cell invasion by increasing integrin avidity / L. Trusolino, S. Cavassa, P. Angelini, M. Ando, A. Bertotti, P. M. Comoglio, C. Boccaccio // FASEB J. - 2000. - V. 14, № 11. - P.1629-1640.

198. Vadasz, Z. Semaphorin3A: A potential therapeutic tool in immune-mediated diseases / Z. Vadasz, E. Toubi // Eur. J. Rheumatol. - 2018. - V. 5, № 1. - P.58-61.

199. Vaidya, H. J. FOXN1 in thymus organogenesis and development / H. J. Vaidya, A. Briones Leon, C. C. Blackburn // Eur. J. Immunol. - 2016. - V. 46, № 8. - P.1826-1837.

200. Valentin, H. Measles virus infection induces terminal differentiation of human thymic epithelial cells / H. Valentin, O. Azocar, B. Horvat, R. Williems, R. Garrone, A. Evlashev, M. L. Toribio, C. Rabourdin-Combe // J. Virol. - 1999. - V. 73, № 3. - P.2212-2221.

201. Van der Voort, R. Paracrine regulation of germinal center B cell adhesion through the c-met-hepatocyte growth factor/scatter factor pathway / R. Van der Voort, T. E. Taher, R. M. Keehnen, L. Smit, M. Groenink, S. T. Pals // J. Exp. Med. - 1997. -V. 185, № 12. - P.2121-2131.

202. Van Gils, J. M. Endothelial expression of guidance cues in vessel wall homeostasis dysregulation under proatherosclerotic conditions / J. M. van Gils, B. Ramkhelawon, L. Fernandes, M. C. Stewart, L. Guo, T. Seibert, G. B. Menezes, D. C. Cara, C. Chow, T. B. Kinane, E. A. Fisher, M. Balcells. J. Alvarez-Leite, A. Lacy-Hulbert, K. J. Moore // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. - 2013. - V. 33, № 5. - P.911-919.

203. Van Vliet, E. The influence of dexamethasone treatment on the lymphoid and stromal composition of the mouse thymus: a flowcytometric and immunohistological analysis / E. van Vliet, M. Melis, W. van Ewijk // Cell Immunol. - 1986. - V. 103, № 2. - P.229-240.

204. Villegas, G. Ontogeny of semaphorins 3A and 3F and their receptors neuropilins 1 and 2 in the kidney / G. Villegas, A. Tufro // Gene Expr. Patterns. - 2002. - V. 2, № 1-2. - P.151-155.

205. Vucevic, D. Different roles of a rat cortical thymic epithelial cell line in vitro on thymocytes and thymocyte hybridoma cells: phagocytosis, induction of apoptosis,

nursing and growth promoting activities / D. Vucevic, M. Colic, P. Popovic, S. Gasic // Dev. Immunol. - 2002. - V. 9, № 2. - P.63-72.

206. Wallerius, M. Guidance molecule SEMA3A restricts tumor growth by differentially regulating the proliferation of tumor-associated macrophages // M. Wallerius, T. Wallmann, M. Bartish, J. Ostling, A. Mezheyeuski, N. P. Tobin, E. Nygren, P. Pangigadde, P. Pellegrini, M. L. Squadrito, F. Ponten, J. Hartman, J. Bergh, A. De Palma, A. Ostman, J. Andersson, C. Rolny // Cancer Res. - 2016. -V. 76, № 11. - P.3166-3178.

207. Weiss, J. M. Neuropilin 1 is expressed on thymus-derived natural regulatory T cells, but not mucosa-generated induced Foxp3+ T reg cells / J. M. Weiss, A. M. Bilate, M. Gobert, Y. Ding, M. A. Curotto de Lafaille, C. N. Parkhurst, H. Xiong, J. Dolpady, A. B. Frey, M. G. Ruocco, Y. Yang, S. Floess, J. Huehn, S. Oh, M. O. Li, R. E. Niec, A. Y. rudensky, M. L. Dustin, D. R. Littman, J. J. Lafaille // J. Exp. Med. - 2012. - V. 209, № 10. - P.1723-1742.

208. West, D. C. Interactions of multiple heparin binding growth factors with neuropilin-1 and potentiation of the activity of fibroblast growth factor-2 / D. C. West, C. G. Rees, L. Duchesne, S. J. Patey, C. J. Terry, J. E. Turnbull, M. Delehedde, C. W. Heegaard, F. Allain, C. Vanpouille, D. Ron, D. G. Fernig / J. Biol. Chem. - 2005. - V. 280, № 14. - P.13457-13464.

209. Wetzel, A. Human Thy-1 (CD90) on activated endothelial cells is a counterreceptor for the leukocyte integrin Mac-1 (CD11b/CD18) / A. Wetzel, T. Chavakis, K. T. Preissner, M. Sticherling, U. F. Haustein, U. Anderegg, A. Saalbach // J. Immunol. - 2004. - V. 172, № 6. - P.3850-3859.

210. Wong, A. W. CIITA-regulated plexin-A1 affects T-cell-dendritic cell interactions / A. W. Wong, W. J. Brickey, D. J. Taxman, H. W. van Deventer, W. Reed, J. X. Gao, P. Zheng, Y. Liu, P. Li, J. S. Blum, K. P. McKinnon, J. P. Ting // Nat. Immunol. - 2003. - V. 4, № 9. - P.891-898.

211. Yager, E. J. Age-associated decline in T cell repertoire diversity leads to holes in the repertoire and impaired immunity to influenza virus / E. J. Yager, M. Ahmed,

K. Lanzer, T. D. Randall, D. L. Woodland, M. A. Blackman // J. Exp. Med. -2008. - V. 205, № 3. - P.711-723.

212. Yamanaka, K. Decreased T-cell receptor excision circles in cutaneous T-cell lymphoma / K. Yamanaka, N. Yawalkar, D. A. Jones, D. Hurwitz, K. Ferenczi, S. Eapen, T. S. Kupper // Clin. Cancer Res. - 2005. - V. 11, № 16. - P.5748-5755.

213. Yarilin, A. A. Interaction between T lymphocytes and epithelial cells in thymus / A. A. Yarilin, N. I. Sharova, A. K. Dzutzev // Russ. J. Immunol. - 1999. - V. 4, № 3. - P.224-228.

214. Ye, P. Measuring emigration of human thymocytes by T-cell receptor excision circles / P. Ye, D. E. Kirschner // Crit. Rev. Immunol. - 2002. - V. 22. - P.483-497.

215. Yla-Herttuala, S. Vascular endothelial growth factors: biology and current status of clinical applications in cardiovascular medicine / S. Yla-Herttuala, T. T. Rissanen, I. Vaianto, J. Hartikainen // J. Am. Coll. Cardiol. - 2007. - V. 49, № 10. - P.1015-1026.

216. Youm, Y. H. Prolongevity hormone FGF21 protects against immune senescence by delaying age-related thymic involution / Y. H. Youm, T. L. Horvath, D. J. Mangelsdorf, S. A. Kliewer, V. D. Dixit // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2016. -V. 1134, № 4. - P.1026-1031.

217. Zaitseva, M. Stromal-derived factor 1 expression in the human thymus / M. Zaitseva, T. Kawamura, R. Loomis, H. Goldstein, A. Blauvelt, H. Golding // J. Immunol. - 2002. - V. 168, № 6. - P.2609-2617.

218. Zamisch, M. Ontogeny and regulation of IL-7-expressing thymic epithelial cells / M. Zamisch, B. Moore-Scott, P. J. Lucas, N. Manley, E. R. Richie // J. Immunol. -2005. - V. 174, № 1. - P.60-67.

219. Zhang, N. The role of apoptosis in the development and function of T lymphocytes / N. Zhang, H. Hartig, I. Dzagalov, D. Draper, Y. W. He // Cell Res. - 2005. - V. 15, № 10. - P.749-769.

220. Zilberman, Y. The glucocorticoid receptor mediates the thymic epithelial cell-induced apoptosis of CD4+8+ thymic lymphoma cells / Y. Zilberman, E. Zafrir, H.

Ovadia, E. Yefenof, R. Guy, R. V. Sionov // Cell Immunol. - 2004. - V. 227, № 1. - P.12-23.

221. Zuniga-Pflicker, J. C. Requirement for TNF-alpha and IL-1 alpha in fetal thymocyte commitment and differentiation / J. C. Zuniga-Pflicker, D. Jiang, M. J. Lenardo // Science. - 1995. - V. 268, № 5219. - P.1906-909.