Влияние природы заместителей в производных урацила на кислотно-основное равновесие тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.04, кандидат наук Ильина, Маргарита Григорьевна

• Ильина, Маргарита Григорьевна
• кандидат наук
• 2018

Оглавление диссертации кандидат наук Ильина, Маргарита Григорьевна

1. ХИМИЯ УРАЦИЛОВ: ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ).........10

1.1. Общая характеристика урацила и его производных.............................10

1.2. Строение и физические свойства урацилов...........................................12

1.3. Кето-енольная таутомерия урацилов. Экспериментальные и теоретические исследования явления.................................................................16

1.4. Биологическая активность производных урацила.................................24

1.5. Урацилы как причина спонтанных мутаций..........................................28

1.6. Экспериментальные и теоретические исследования кислотно-основного равновесия урацилов в растворах ..................................................... 35

1.7. Анионные формы урацилов в водных растворах..................................41

2. МЕТОДИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ........................................................................45

2.1. Квантово-химические расчеты................................................................45

2.2. Определение индекса делокализации PDI..............................................49

2.3. Определение индекса делокализации FLU............................................52

2.4. Определение индекса делокализации HOMED.....................................53

2.5. Определение эллиптичности s в критических точках связей...............56

2.6. Расчет pKa в приближении G3MP2B3 + DFT с неявным учетом растворителя..........................................................................................................57

2.7. Расчет pKa в приближении TPSS/aug-cc-pVTZ с явным учетом растворителя..........................................................................................................60

2.8. Расчет pKa в приближении CBS-QB3 с явным учетом растворителя. 62

3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.....................................................65

3.2. Относительная устойчивость ионизированных форм пиримидин-2,4-диона и его производных в газовой фазе и в водной оболочке

.....................................................................................................................70

3.2.1. Квантово-химический расчет энергии Гиббса анионов N1 и N3 .. 70

3.2.2. Определение индексов делокализации PDI и FLU, ароматичности HOMED в качестве одного из главных факторов стабилизации урацила и его производных..........................................................................................................73

3.2.3. Анализ топологии исследуемых структур (AIM), расчет эллиптичности связи в качестве определяющего параметра стабильности анионных форм урацила и его производных......................................................76

3.3. Оценка влияния природы заместителя на кислотно-основное равновесие урацила и его производных..............................................................79

3.3.1. NBO анализ.........................................................................................79

3.3.2. Корреляции Гаммета..........................................................................85

3.4. Теоретические модели для количественного описания кислотно-основного равновесия 5,6-замещенных урацилов.............................................96

ВЫВОДЫ............................................................................................................105

ЛИТЕРАТУРА...................................................................................................106

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Влияние природы заместителей в производных урацила на кислотно-основное равновесие»

Актуальность работы. В силу высокой биологической значимости производных пиримидина и урацилов в частности широко исследовалось образование активных интермедиатов из нейтральных молекул, что связано также с проблемой изучения радиационного повреждения ДНК и РНК. При изучении свойств или химических превращений 5,6-замещенных урацилов следует иметь в виду, что они представляют собой слабые двухосновные кислоты, диссоциирующие по связи При этом обе связи Ш-И и N3^ могут проявлять сходные кислотные свойства в зависимости от строения урацила и природы растворителя. Это обстоятельство затрудняет интерпретацию результатов исследования химических свойств урацилов, поскольку существуют альтернативные анионные состояния, обладающие различным строением и, следовательно, реакционной способностью. Ситуация еще более усложняется, если заместители способны к электролитической диссоциации. Диссоциация урацила и его производных по связям N-H является ключевым фактором, определяющим их реакционную способность, что важно как для биологических систем, так и при получении производных урацила, которые, в свою очередь, также проявляют заметную биологическую активность. Известно, что факторы, влияющие на механизм таутомерного и кислотно-основного равновесий, имеют принципиально важное значение при возникновении ошибок при репликации ДНК и РНК (спонтанных мутациях). По этой причине изучение образования анионных форм пиримидиновых оснований и влияние природы заместителей в положении 5 или 6 на образование этих самых форм представляет значительный интерес.

Работа выполнена при поддержке проекта №q4.299.2014.7К, исполняемого в рамках проектной части государственного задания Минобрнауки РФ в сфере научной деятельности.

Степень разработанности проблемы. Интерес к изучению образования анионных форм пиримидиновых оснований нашел свое отражение в

многочисленных исследованиях. Были изучены свойства радикальных частиц, генерируемых из урацила и его производных, а также последующие превращения радикалов и катионных интермедиатов. Изучение влияния природы заместителя в положении 5 или 6 пиримидинового кольца на направление диссоциации, а также разработка надежного теоретического метода прогнозирования значений рКа для урацила и его производных, несмотря на большое количество литературы, не получило до нашего времени подробного освещения ни в российских, ни в зарубежных работах. Причина недостаточного внимания исследователей к данной проблеме обусловлена тем, что экспериментальное изучение во многих случаях затруднено, а теоретическое исследование требует развития определенных концепций и ресурсов.

Цель работы. Установление связи между реакционной способностью и строением анионных форм N1 и N3 пиримидин-2,4-диона и его производных, изучение влияния природы заместителя в положении 5- и(или) 6-пиримидинового кольца на направление диссоциации, а также разработка надежного теоретического метода прогнозирования значений рКа в качестве меры количественной оценки кислотно-основного равновесия. В соответствие с поставленной целью основными задачами диссертационной работы явились:

• Квантово-химический расчет термодинамических характеристик, таких как, абсолютные энергии Гиббса молекулярных и ионизированных форм исследуемых соединений в газовой фазе и в водной оболочке

• Сопоставление полученных значений энергий Гиббса и получение рядов относительной устойчивости анионных форм производных пиримидин-2,4-диона

• Установление влияния природы заместителей в положении 5- и(или) 6-ом пиримидиндионового кольца на направление диссоциации пиримидин-2,4-диона и его производных

• Количественная оценка кислотно-основного равновесия в ряду производных пиримидин-2,4-диона

Научная новизна. Моделирование методами квантовой химии впервые позволило установить ряды относительной стабильности N1/N3 ионизированных форм, охарактеризованных разностью стандартных энергий Гиббса AG = AG°(N3) - AG°(N1) как в газовой фазе, так и в водной оболочке. Показано, что одним из главных факторов стабилизации анионов урацилов является эффективная делокализация отрицательного заряда по соседним кратным связям, охарактеризованная с помощью трёх различных индексов ароматичности (FLU, PDI, HOMED), а также при помощи эллиптичности в критических точках связей пиримидиндионового цикла. Также, в настоящей работе впервые проведен сравнительный анализ трех подходов к теоретической оценке pKa урацила и его производных в качестве меры количественной оценки кислотно-основного равновесия.

Теоретическая и практическая значимость. Совокупность установленных факторов, влияющих на относительную стабильность N1/N3 анионов урацила и его производных создает возможность направленного регулирования содержания анионов урацилов в реакционной системе. Результаты проведенных исследований могут быть использованы при изучении кислотных свойств урацилов, определении места отрыва протона при электролитической диссоциации в водных и органических средах. Полученные данные следует учитывать при проведении химических трансформаций урацилов, например, для их селективного алкилирования по N1 или N3 атому, что является актуальной научной проблемой в связи с известной биологической активностью урацилов. Также, предлагаемые расчетные схемы pKa урацилов с точностью в 0.25 единиц соответствуют ошибке квантово-химического расчета ~0.3 ккал/моль, что позволяет с высокой степенью надежности исследовать химические свойства урацилов в водных средах с учетом кислотно-основных и таутомерных превращений, характерных для этого класса соединений.

Методология и методы исследования. В диссертационной работе использовались научные исследования и обзоры, опубликованные в журналах ведущих химических сообществ как российских, так и зарубежных

исследовательских групп, а также материалы химических периодических изданий. При написании работы в методологическом плане применялась следующая совокупность квантово-химических подходов: расчеты многоуровневым композитным методом семейства G3, расчеты при помощи метода теории функционала плотности, базирующейся на теоремах Хоэнберга-Кона и Кона-Шама, а также расчеты многоуровневым композитным методом семейства CBS, в котором для получения точного значения энергии реализуется комбинация аддитивных и экстраполяционных схем и эмпирической поправки.

В настоящей работе выдвинута следующая гипотеза: совокупность факторов, влияющих на относительную устойчивость N1/N3 анионов производных урацила, в том числе варьирование заместителей создает возможность направленного регулирования содержания анионов урацилов в реакционной системе.

Положения, выносимые на защиту:

• Соотношение "структура-свойство", устанавливающие взаимосвязь между реакционной способностью и строением анионных форм N1 и N3 урацила и его производных

• Результаты квантово-химических расчетов термодинамических характеристик пиримидин-2,4-диона и его производных, согласно которым получены соответствующие ряды устойчивости анионов

• Методология, определяющая один из главных факторов стабилизации анионов урацилов, количественно описанный корреляцией между индексами делокализации по моделям PDI, FLU, HOMED и энергий Гиббса, а также корреляцией между эллиптичностью в критических точках связей и энергией Гиббса

• Основные факторы влияние природы заместителя в 5- и(или) 6-ом положении пиримидинового кольца на направление диссоциации урацила и его производных, установленные с помощью NBO-анализа и корреляции Гаммета

Достоверность результатов исследований. Научные положения и выводы диссертационного исследования обоснованы результатами квантово-химических расчетов методами теории функционала плотности и композитными методами, являющимися наиболее эффективными для расчета структур и физико-химических свойств производных пиримидин-2,4-диона, и использованием аддитивных схем. Согласие полученных результатов с известными экспериментальными данными и другими теоретическими концепциями указывает на достоверность и прогностическую ценность результатов исследований.

Апробация работы. Основные результаты диссертационной работы представлены на: VII Всероссийской молодежной школе-конференции Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул (Иваново 14-17 апреля, 2015); Всероссийской молодежной конференции "Достижения молодых ученых: химические науки" (Уфа, 24-27 мая, 2015) на секции Физическая химия; VIII Международной школе-конференции для студентов, аспирантов и молодых ученых "Фундаментальная математика и ее приложения в естествознании" в секции математическая и квантовая химия, (Уфа, 27 сентября - 1 октября, 2015); VI Всероссийской студенческой научно-практической конференции БашГУ - 2016 'Иностранный язык в профессиональной коммуникации" (Уфа); II Всероссийской молодежной конференции "Достижения молодых ученых: химические науки" (Уфа, 18-21 мая, 2016); XXVIII Симпозиуме Современная химическая физика (Туапсе, 20 сентября - 1 октября 2015); IX Международной школе-конференции для студентов, аспирантов и молодых ученых "Фундаментальная математика и ее приложения в естествознании" в секции математическая и квантовая химия (Уфа, 3-7 октября, 2016); Всероссийской конференции по квантовой и математической химии (Уфа, 13-17 ноября, 2017).

Публикации. По теме диссертационной работы опубликовано 43 научные работы, из них 6 статей в рецензируемых научных изданиях, в том числе, индексируемых в базах данных Web of Science, Scopus и 37 тезисов докладов.

Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, литературного обзора, обсуждения результатов, методической части и выводов. Материал работы изложен на 134 страницах машинописного текста, содержит 30 рисунков и 17 таблиц. Список литературы включает 278 наименований.

Тематика теоретических исследований, составивших основу данной работы, во многом определялась исследованиями, ведущимися в УФиХ УФИЦ РАН под руководством профессора Сергея Леонидовича Хурсана, которому автор выражает искреннюю благодарность за постоянный интерес и внимание к работе, благожелательное обсуждение и консультации.

Также автор выражает глубокую благодарность к.х.н., доценту Хамитову Э. М. за научные консультации, помощь и поддержку, оказанные при выполнении работы; лаборатории ФХМА УфИХ УФИЦ РАН, в частности к.х.н., с.н.с. Иванову С.П. и аспиранту Ахиярову А.А. за экспериментальное определение рКа некоторых урацилов; лаборатории окислительных процессов УфИХ УФИЦ РАН за предоставленные образцы некоторых урацилов для определения рКа.

Заключение диссертации по теме «Физическая химия», Ильина, Маргарита Григорьевна

ВЫВОДЫ

1. Установлены ряды относительной устойчивости с помощью теоретического моделирования в приближении TPSS/6-311+G(d, p) N1/N3 анионных состояний урацила и его производных, охарактеризованных разностью стандартных энергий Гиббса AG = AG°(N3) - AG°(N1) для газовой фазы (5OHU, 5OH6CH3U) > 5NH2U > (5FU, 5CH3U, 6CH3U, 5C1U, 5BrU, U) > (6C1U, 5NO2U) > 6FU и с учетом используемой модели гидратации: (5OH6CH3U, 5OHU) > (5NH2U, U, 5FU, 5CH3U, 6CH3U) > (5C1U, 5BrU) > 5NO2U > (6C1U, 6FU).

2. Установлено, что на относительную стабильность анионов урацилов в отсутствие внешнего воздействия влияет их способность к эффективной делокализации избыточного заряда. Показано количественное описание этого фактора с помощью корреляции между индексами делокализации по моделям PDI, FLU, HOMED и энергий Гиббса, а также корреляции между эллиптичностью в критических точках связей и энергией Гиббса.

4. Определено влияние природы заместителей в положении 5 или 6 пиримидинового кольца на направление диссоциации урацила и его производных. Количественно влияние природы заместителей описано с использованием метода Гаммета, при этом индуктивное влияние заместителей учитывалось с помощью набора констант aI, а мезомерный эффект - набором aR. Определен преимущественный механизм влияния для заместителей в положении 5 как резонансный, тогда как для положения 6 более существенен индуктивный механизм влияния заместителя

5. Количественно оценено кислотно-основное равновесие урацила и его производных. Установлено что, предлагаемые расчетные схемы pKa урацилов с точностью в ±0.3 ккал/моль позволяют с высокой степенью надежности исследовать химические свойства урацилов в водных средах с учетом кислотно-основных и таутомерных превращений, характерных для данного класса соединений.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Ильина, Маргарита Григорьевна, 2018 год

ЛИТЕРАТУРА

1. Шабарова З.А., Богданов А.А., Химия Нуклеиновых Кислот И Их Компонентов, Москва, 1978.

2. Грандберг И.И., Органическая Химия, Москва, 2001.

3. Daniels M. Tautomerism of Uracil and Thymine in Aqueous Solution: Spectroscopic Evidence // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1972. - V. 69. - №. 9.- P. 2488-2491.

4. Morgan J.P., Daniels M. Polarization Excitation Spectrum of Thymine Fluorescence in Neutral Aqueous Solution At ~300K. Evidence for an nn* Transition // J. Phys. Chem. - 1982. - V. 86. - №. 20.- P. 4004-4007.

5. Parkanyi C., Boniface C., Aaron J.-J., Gaye M.D., Ghosh R., Szentpaly L., RaghuVeer K.S. Electronic Absorption and Fluorescence Spectra and Excited Singlet-State Dipole Moments of Biologically Important Pyrimidines // Struct. Chem. - 1992. -V. 3. - №. 4.- P. 277-289.

6. Suwaiyan A., Morsy M.A., Odah K.A. Room Temperature Fluorescence of 5-Chlorouracil Tautomers // Chem. Phys. Lett. - 1995. - V. 237. - №. 3-4.- P. 349-355.

7. Morsy M.A., Al-Somali A.M., Suwaiyan A. Fluorescence of Thymine Tautomers at Room Temperature in Aqueous Solutions // J. Phys. Chem. B. - 1999. -V. 103. - №. 50.- P. 11205-11210.

8. Gustavsson T., Sarkar N., Lazzarotto E., Markovitsi D., Improta R. Singlet Excited State Dynamics of Uracil and Thymine Derivatives: A Femtosecond Fluorescence Upconversion Study in Acetonitrile // Chem. Phys. Lett. - 2006. - V. 429. - №. 4-6.- P. 551-557.

9. Gustavsson T., Sarkar N., Lazzarotto E., Markovitsi D., Barone V., Improta R., Solvent Effect on the Singlet Excited-State Dynamics of 5-Fluorouracil in Acetonitrile as Compared with Water // J. Phys. Chem. B. - 2006. - V. 110. - №. 26. -P. 12843-12847.

10. Перикалин В.В., Зонис С. А., Органическая Химия, Москва, 1977.

11. Tisler M., Stanovnik B., Pyridazines, in: A.R. Katritzky, A.J. Boulton (Eds.), Advances in Heterocyclic Chemistry, Academic Press, 1968. - P. 211-320.

12. Tisler M., Stanovnik B., Recent Advances in Pyridazine Chemistry, in: A.R. Katritzky, A.J. Boulton (Eds.), Advances in Heterocyclic Chemistry, Academic Press, 1979. - P. 363-456.

13. Tisler M., Stanovnik B., Advances in Pyridazine Chemistry, in: R.K. Alan (Ed.), Advances in Heterocyclic Chemistry, Academic Press, 1990. - P. 385-474.

14. Kwiatkowski J.S., Pullman B., Taulomerism and Electronic Structure of Biological Pyrimidines, in: A.R. Katritzky, A.J. Boulton (Eds.), Advances in Heterocyclic Chemistry, Academic Press, 1975. - P. 199-335.

15. Cheeseman J.R., Trucks G.W., Keith T.A., Frisch M.J. A Comparison of Models for Calculating Nuclear Magnetic Resonance Shielding Tensors // J. Chem. Phys. - 1996. - V. 104. - №. 14.- P. 5497-5509.

16. Белобородов В.Л., Зурабян С.Э., Лузин А.П., Тюкавкина Н.А., Органическая Химия, Москва, 2003.

17. Масунов А.Э., Грищенко С.И., Зоркий П.М. Влияние Специфических Межмолекулярных Взаимодействий На Кристаллическую Структуру, Производные И Аналоги Урацила //Журн. физ. химии. - 1993. - Т. 67. - №. 2.- С. 221-239.

18. Reck G., Kretschmer R.-G., Kutschabsky L., Pritzkow W. Posit - a Method for Structure Determination of Small Partially Known Molecules from Powder Diffraction Data.Structure of 6-Methyl-1,2,3,4-Tetrahydropyrimidine-2,4-Dione (6-Methyluracil) // Acta Crystallogr., Sect. A. - 1988. - V. 44. - №. 4.- P. 417-421.

19. Fallon L., III The Crystal and Molecular Structure of 5-Fluorouracil // Acta Crystallogr., Sect. B. - 1973. - V. 29. - №. 11.- P. 2549-2556.

20. Ozeki K., Sakabe N., Tanaka J. The Crystal Structure of Thymine // Acta Crystallogr., Sect. B. - 1969. - V. 25. - №. 6.- P. 1038-1045.

21. Portalone G., Bencivenni L., Colapietro M., Pieretti A., Ramondo F. The Effect of Hydrogen Bonding on the Structures of Uracil and Some Methyl Derivatives Studied by Experiment and Theory // Acta Chem. Scand. - 1999. - V. 53. - P. 57-68.

22. Sternglanz H., Bugg C.E. Relationship between the Mutagenic and Base-Stacking Properties of Halogenated Uracil Derivatives // Biochim. Biophys. Acta . -1975. - V. 378. - №. 1.- P. 1-11.

23. Лен Ж.-М., Супрамолекулярная Химия. Концепции И Перспективы., Новосибирск, 1998.

24. Горбунова В.Н., Баранов В.С., Введение В Молекулярную ДиагноСтику И Генотерапию Наследственных Заболеваний, Специальная литература, Санкт-Петербург, 1997.

25. Henderson J.P., Byun J., Takeshita J., Heinecke J.W. Phagocytes Produce 5-Chlorouracil and 5-Bromouracil, Two Mutagenic Products of Myeloperoxidase, in Human Inflammatory Tissue // J. Biol. Chem. - 2003. - V. 278. - №. 26.- P. 2352223528.

26. Watson J.D., Crick F.H.C. Genetical Implications of the Structure of Deoxyribonucleic Acid // Nature. - 1953. - V. 171. - P. 964.

27. Topal M.D., Fresco J.R. Complementary Base Pairing and the Origin of Substitution Mutations // Nature. - 1976. - V. 263. - P. 285.

28. Хамитов Э.М., Гимадиева А.Р., Фаттахов А.Х., Мустафин А.Г., Абдрахманов И.Б. Таутомерия 5-Амино-6-Метилурацила В Рамках Модели Неспецифической Гидратации // Вестник Башкирск. ун-та. - 2010. - Т. 4. - С. 1124-1126.

29. Markova N., Enchev V., Timtcheva I. Oxo-Hydroxy Tautomerism of 5-Fluorouracil: Water-Assisted Proton Transfer // J. Phys. Chem. A. - 2005. - V. 109. -№. 9.- P. 1981-1988.

30. Даутова И.Ф., Иванов С.П., Хурсан С.Л. Влияние Гидратации На Стабильность Кето-Енольных Таутомеров 5-Гидрокси-6-Метилурацила // Журн. структ. химии. - 2009. - Т. 50. - №. 6.- С. 1155-1165.

31. Лукманов Т.И., Абдрахимова Г.С., Хамитов Э.М., Иванов С.П. Квантово-Химический Расчет Относительной Устойчивости Кето-Енольных Таутомеров 5-Хлорурацила // Баш. Хим. Ж. - 2012. - Т. 86. - №. 7.- С. 1221-1225.

32. Даутова И.Ф., Хурсан С.Л. Реакционная Способность Таутомеров 5-Гидрокси-6-Метилурацила При Отрыве Атома Водорода Пероксильными Радикалами // Баш. Хим. Ж. - 2010. - Т. 17. - №. 1.- С. 49-54.

33. Haranczyk M., Gutowski M., Warshel A. Solvation Free Energies of Molecules. The Most Stable Anionic Tautomers of Uracil // Phys. Chem. Chem. Phys. -2008. - V. 10. - №. 30.- P. 4442-4448.

34. Lukmanov T., Ivanov S.P., Khamitov E.M., Khursan S.L. Relative Stability of Keto-Enol Tautomers in 5,6-Substituted Uracils: Ab Initio, DFT and PCM Study // Comput. Theor. Chem. - 2013. - V. 1023. - P. 38-45.

35. Samijlenko S.P., Yurenko Y.P., Stepanyugin A.V., Hovorun D.M. Tautomeric Equilibrium of Uracil and Thymine in Model Protein-Nucleic Acid Contacts. Spectroscopic and Quantum Chemical Approach // J. Phys. Chem. B. - 2010. - V. 114. - №. 3.- P. 1454-1461.

36. Wierzchowski K.L., Litonska E., Shugar D. Infrared and Ultraviolet Studies on the Tautomeric Equilibria in Aqueous Medium between Monoanionic Species of Uracil, Thymine, 5-Fluorouracil, and Other 2,4-Diketopyrimidines // J. Am. Chem. Soc. - 1965. - V. 87. - №. 20.- P. 4621-4629.

37. Markova N., Enchev V., Ivanova G. Tautomeric Equilibria of 5-Fluorouracil Anionic Species in Water // J. Phys. Chem. A. - 2010. - V. 114. - №. 50.-P. 13154-13162.

38. Orozco M., Hernández B., Luque F.J. Tautomerism of 1-Methyl Derivatives of Uracil, Thymine, and 5-Bromouracil. Is Tautomerism the Basis for the Mutagenicity of 5-Bromouridine // J. Phys.Chem. B. - 1998. - V. 102. - №. 26.- P. 5228-5233.

39. Brovarets O.O. Mutagenic Properties of 5-Halogen Derivatives of Uracil: Quantum-Chemical Investigation // Ukr. Bioorg. Acta. - 2012. - V. 2. - P. 17-24.

40. Les A., Ortega-Blake I. Tautomerism of Uracil, Cytosine, Isocytosine, and Some of Their Thio-Derivatives // Int. J. Quantum Chem. - 1986. - V. 30. - №. 2.- P. 225-237.

41. Hanus M., Ryjácek F., Kabelác M., Kubar T., Bogdan T.V., Trygubenko S.A., Hobza P. Correlated Ab Initio Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in

the Gas Phase, in a Microhydrated Environment and in Aqueous Solution. Guanine: Surprising Stabilization of Rare Tautomers in Aqueous Solution // J. Am. Chem. Soc. -2003. - V. 125. - №. 25.- P. 7678-7688.

42. Hanus M., Kabelac M., Rejnek J., Ryjacek F., Hobza P. Correlated Ab Initio Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in the Gas Phase, in a Microhydrated Environment, and in Aqueous Solution. Part 3. Adenine // J. Phys. Chem. B. - 2004. - V. 108. - №. 6.- P. 2087-2097.

43. Laxer A., Major D.T., Gottlieb H.E., Fischer B. (15N5)-Labeled Adenine Derivatives: Synthesis and Studies of Tautomerism by 15N NMR Spectroscopy and Theoretical Calculations // J. Org. Chem. - 2001. - V. 66. - №. 16.- P. 5463-5481.

44. Kryachko E.S., Nguyen M.T., Zeegers-Huyskens T. Theoretical Study of Tautomeric Forms of Uracil. 1. Relative Order of Stabilities and Their Relation to Proton Affinities and Deprotonation Enthalpies // J. Phys. Chem. A. - 2001. - V. 105. -№. 8.- P. 1288-1295.

45. van Mourik T., Benoit D.M., Price S.L., Clary D.C. Ab Initio and Diffusion Monte Carlo Study of Uracil-Water, Thymine-Water, Cytosine-Water, and Cytosine-(Water)2 // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2000. - V. 2. - №. 6.- P. 1281-1290.

46. Gaigeot M.-P., Ghomi M. Geometrical and Vibrational Properties of Nucleic Acid Constituents Interacting with Explicit Water Molecules as Analyzed by Density Functional Theory Calculations. 1. Uracil + NwH2O (Nw = 1,...,7) // J Phys. Chem. B. - 2001. - V. 105. - №. 21.- P. 5007-5017.

47. Rejnek J., Hanus M., Kabelac M., Ryjacek F., Hobza P. Correlated Ab Initio Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in the Gas Phase, in a Microhydrated Environment and in Aqueous Solution. Part 4. Uracil and Thymine // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2005. - V. 7. - №. 9.- P. 2006-2017.

48. Tho Nguyen M., K. Chandra A., Zeegers-Huyskens T. Protonation and Deprotonation Energies of Uracil Implications for the Uracil-Water Complex // J. Chem. Soc., Faraday Trans. - 1998. - V. 94. - №. 9.- P. 1277-1280.

49. van Mourik T., Price S.L., Clary D.C. Ab Initio Calculations on Uracil-Water // J. Phys. Chem. A. - 1999. - V. 103. - №. 11.- P. 1611-1618.

50. van Mourik T. A Theoretical Study of Uracil-(H2O)N, N = 2 to 4 // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2001. - V. 3. - №. 14.- P. 2886-2892.

51. Broo A., Pearl G., Zerner M.C. Development of a Hybrid Quantum Chemical and Molecular Mechanics Method with Application to Solvent Effects on the Electronic Spectra of Uracil and Uracil Derivatives // J. Phys. Chem. A. - 1997. - V. 101. - №. 13.- P. 2478-2488.

52. Paglieri L., Corongiu G., Estrin D.A. Solvent Effects in Density Functional Calculations of Uracil and Cytosine Tautomerism // Int. J. Quantum Chem. - 1995. - V. 56. - №. 5.- P. 615-625.

53. Shishkin O., Gorb L., Leszczynski J. Modeling of the Hydration Shell of Uracil and Thymine // Int. J. Mol. Sci. - 2000. - V. 1. - №. 2.- P. 17.

54. Smets J., Smith D.M.A., Elkadi Y., Adamowicz L. Search for Stable Anions of Uracil-Water Clusters. Ab Initio Theoretical Studies // J. Phys. Chem. A. -1997. - V. 101. - №. 48.- P. 9152-9156.

55. Hu X., Li H., Liang W., Han S. Theoretical Study of the Proton Transfer of Uracil and (Water)N (N = 0-4): Water Stabilization and Mutagenicity for Uracil // J. Phys. Chem. B. - 2004. - V. 108. - №. 34.- P. 12999-13007.

56. Choi M.Y., Miller R.E. Infrared Laser Spectroscopy of Uracil and Thymine in Helium Nanodroplets: Vibrational Transition Moment Angle Study // J. Phys. Chem. A. - 2007. - V. 111. - №. 13.- P. 2475-2479.

57. Brown R.D., Godfrey P.D., McNaughton D., Pierlot A.P. Microwave Spectrum of Uracil // J. Am. Chem. Soc. - 1988. - V. 110. - №. 7.- P. 2329-2330.

58. Beak P., White J.M. Relative Enthalpies of 1,3-Dimethyl-2,4-Pyrimidinedione, 2,4-Dimethoxypyrimidine, and 4-Methoxy-1-Methyl-1-2-Pyrimidinone: Estimation of the Relative Stabilities of Two Protomers of Uracil // J. Am. Chem. Soc. - 1982. - V. 104. - №. 25.- P. 7073-7077.

59. Katritzky A.R., Baykut G., Rachwal S., Szafran M., Caster K.C., Eyler J. The Tautomeric Equilibria of Thio Analogues of Nucleic Acid Bases. Part 1. 2-Thiouracil: Background, Preparation of Model Compounds, and Gas-Phase Proton Affinities // J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2. - 1989. - №. 10.- P. 1499-1506.

60. Tsuchiya Y., Tamura T., Fujii M., Ito M. Keto-Enol Tautomer of Uracil and Thymine // J. Phys. Chem. - 1988. - V. 92. - №. 7.- P. 1760-1765.

61. Cavalieri L.F., Bendich A. The Ultraviolet Absorption Spectra of Pyrimidines and Purines // J. Am. Chem. Soc. - 1950. - V. 72. - №. 6.- P. 2587-2594.

62. Iza N., Gil M., Morcillo J. Identification of Ionic and Tautomeric Species of Uracil by Second Derivative UV Absorption Spectroscopy // J. Mol. Struct. - 1988. -V. 175. - P. 31-36.

63. Jonas J., J. G. Nucleic Acids Components and Their Analogues. XII. Electronic Absorption Spectra of 6-Azauracil and Related Compounds // Collect. Czech. Chem. Commun. - 1961. - V. 26. - №. 9.- P. 2155-2163.

64. Katritzky A.R., Waring A.J. 299. Tautomeric Azines. Part I. The Tautomerism of 1-Methyluracil and 5-Bromo-1-Methyluracil // J. Chem. Soc. (Resumed). - 1962. - №. 0.- P. 1540-1544.

65. Triplett J.W., Digenis G.A., Layton W.J., Smith S.L. Carbon-13 Chemical Shift Assignments for the Bisulfite Adducts of Uracil, 5-Deuterouracil, 5-Fluorouracil and 5-Chlorouracil // Spectrosc. Lett. - 1977. - V. 10. - №. 3.- P. 141-147.

66. Ellis P.D., Dunlap R.B., Pollard A.L., Seidman K., Cardin A.D. Carbon-13 Nuclear Magnetic Resonance of 5-Substituted Uracils // J. Am. Chem. Soc. - 1973. - V. 95. - №. 13.- P. 4398-4403.

67. Bednarek E., Dobrowolski J.C., Dobrosz-Teperek K., Kozerski L., Lewandowski W., Mazurek A.P. Theoretical and Experimental 1H, 13C, 15N, and 17O NMR Chemical Shifts for 5-Halogenouracils // J. Mol. Struct. - 2000. - V. 554. - №. 2.- P. 233-243.

68. Blicharska B., Kupka T. Theoretical DFT and Experimental NMR Studies on Uracil and 5-Fluorouracil // J. Mol. Struct. - 2002. - V. 613. - №. 1.- P. 153-166.

69. Beak P. Energies and Alkylations of Tautomeric Heterocyclic Compounds: Old Problems - New Answers // Acc. Chem. Res. - 1977. - V. 10. - №. 5.- P. 186-192.

70. Shugar D., Szczepaniak K. Tautomerism of Pyrimidines and Purines in the Gas Phase and in Low-Temperature Matrices, and Some Biological Implications // Int. J. Quantum Chem. - 1981. - V. 20. - №. 2.- P. 573-585.

71. Czermiinski R., Kuczera K., Rostkowska H., Nowak M.J., Szczepaniak K. Autoassociates and Tautomerism of 2-Oxo-5-Halogenopyrimidines: Theoretical and Experimental Investigations // J. Mol. Struct. - 1986. - V. 140. - №. 3.- P. 235-251.

72. Kuczera K., Szczesniak M., Szczepaniak K. Calculation of the Vibrational Spectra of Cytosine Derivatives by the CNDO/2 Force Method: Part II. Planar Vibrations of 5-Fluorocytosine // J. Mol. Struct. - 1988. - V. 172. - P. 89-99.

73. Nowak M.J., Szczepaniak K., Barski A., Shugar D. Tautomeric Equilibria of 2(4)-Monooxopyrimidines in the Gas Phase, in Low-Temperature Matrices and in Solution // J. Mol. Struct. - 1980. - V. 62. - P. 47-69.

74. Person W.B., Szczepaniak K., Szczesniak M., Kwiatkowski J.S., Hernandez L., Czerminski R. Tautomerism of Nucleic Acid Bases and the Effect of Molecular Interactions on Tautomeric Equilibria // J. Mol. Struct. - 1989. - V. 194. - P. 239-258.

75. Wittenburg E. Alkyl- Und Silyl-Derivate Des Thymins // Ber. - 1966. - V. 99. - №. 7.- P. 2380-2390.

76. Nowak M.J. Matrix Isolation Studies of Nucleic Acid Constituents: The Spectrum of Monomeric Thymine // J. Mol. Struct. - 1989. - V. 193. - P. 35-49.

77. Wojcik M.J. Medium-Frequency Raman Spectra of Crystalline Uracil, Thymine and Their 1-Methyl Derivatives // J. Mol. Struct. - 1990. - V. 219. - P. 305310.

78. Graindourze M., Smets J., Zeegers-Huyskens T., Maes G. Fourier Transform—Infrared Spectroscopic Study of Uracil Derivatives and Their Hydrogen Bonded Complexes with Proton Donors: Part I. Monomer Infrared Absorptions of Uracil and Some Methylated Uracils in Argon Matrices // J. Mol. Struct. - 1990. - V. 222. - №. 3.- P. 345-364.

79. Ivanov A.Y., Plokhotnichenko A.M., Radchenko E.D., Sheina G.G., Blagoi Y.P. Spectroscopy of Uracil Derivatives Isolated in Kr, Ar and Ne Matrices: Matrix Effect and Fermi Resonance // J. Mol. Struct. - 1995. - V. 372. - №. 2.- P. 91-100.

80. Aamouche A., Ghomi M., Coulombeau C., Grajcar L., Baron M.H., Jobic H., Berthier G. Neutron Inelastic Scattering, Optical Spectroscopies, and Scaled Quantum

Mechanical Force Fields for Analyzing the Vibrational Dynamics of Pyrimidine Nucleic Acid Bases. 2. Thymine // J. Phys. Chem. A. - 1997. - V. 101. - №. 10.- P. 1808-1817.

81. Dobrosz-Teperek K., Zwierzchowska Z., Lewandowski W., Bajdor K., Dobrowolski J.C., Mazurek A.P. Vibrational Spectra of 5-Halogenouracils Part II— Solids Presented as a Poster at the 13th Summer School on Coordination Chemistry, Polanica-Zdroj, Poland, June 2-8, 1996.1 // J. Mol. Struct. - 1998. - V. 471. - №. 1.- P. 115-125.

82. Les A., Adamowicz L. Oxo-Hydroxy Tautomerism of Uracil and 5-Fluorouracil // J. Phys. Chem. - 1989. - V. 93. - №. 20.- P. 7078-7081.

83. Yekeler H., Özbakir D. Concerning the Solvent Effect in the Tautomerism of Uracil, 5-Fluorouracil, and Thymine by Density-Functional Theory and Ab Initio Calculations // Mol. Model. Annu. - 2001. - V. 7. - №. 4.- P. 103-111.

84. Иванов С.П., Хурсан С.Л. Относительная Стабильность Кето-Енольных Таутомеров 5-Гидрокси-6-Метилурацила: Неэмпирический Pасчет // Журн. Физ. Химии - 2004. - Т. 78. - №. 7.- P. 1283-1288.

85. Иванов С.П., Муринов Ю.И. Изучение Взаимодействия Водных РасТворов Урацила, Тимина, 6-Метилурацила И 5-Гидрокси-6 Метилурацила С Гидроксидом Натрия УФ-Спектороскопии И рН-Метрии // Баш. Хим. Ж. - 2006. -Т. 13. - №. 1.- С. 22-25.

86. Scanlan M.J., Hillier I.H. An Ab Initio Study of Tautomerism of Uracil, Thymine, 5-Fluorouracil, and Cytosine // J. Am. Chem. Soc. - 1984. - V. 106. - №. 13.-P. 3737-3745.

87. Marino T., Russo N., Toscano M. Density Functional Study of Oxo-Hydroxy Tautomerism of 5-Fluorouracil // Int. J. Quantum Chem. - 1997. - V. 62. - №. 5.- P. 489-494.

88. Kryachko E.S., Nguyen M.T., Zeegers-Huyskens T. Theoretical Study of Uracil Tautomers. 2. Interaction with Water // J. Phys. Chem. A. - 2001. - V. 105. - №. 10.- P. 1934-1943.

89. Машковский М.Д., Лекарственные Средства, ООО «Новая Волна», Москва, 2002.

90. Егоров Е.А., Влияние Метилурацила И Некоторых Других Медикаментозных Средств На Репаративную Регенерацию Роговицы Уфа, 1970, С. 18.

91. Еникеева З.Х., Алехин Е.К., Кривоногов В.П., Куватов Ю.Г., Батыршин P.A. Фармакокинетика Метилурацила И Оксиметилурацила При Использовании В Виде Глазной Мази // Баш. Хим. Ж. - 2000. - Т. 7. - №. 6.- С. 76-78.

92. Лазарева Д.Н., Алехин Е.К., Плечев В.В., Тимербулатов В.М., Плечева Д.В., Иммурег, Башкирский государственный медицинский университет, Уфа, 2004.

93. Плечева Д.В., Стимуляция Репаративной Регенерации Кожи Оксиметилурацилом Автореф. дисс. канд. мед. наук., Уфа, 2004, С. 27.

94. Лазарева Д.Н., Давыдова В.А. Противовоспалительное И Противоязвенное Действие Оксиметилурацила // Эксперим. и Клин. Фарм. - 2205. - Т. 68. - №. 4.- С. 53-55.

95. Савлуков А.И., Коррекция Химических Поражений Печени 1,3,6-Триметил-5-Гидроксиурацилом И Оксиметилурацилом, Автореф. дисс. канд. мед. наук., Уфа, 2000, С. 22.

96. Мирсаев Т.Р., Гепатопротекторная Активность Оксиметилурацила, Автореф. дисс. канд. мед. наук., Уфа, 2002, C. 22.

97. Мышкин В.А., Вакарица А.Ф., Башкатов С.А., Гизатуллин А.Г., Применение Антиоксидантов Для Повышения Резистентности Организма К Метанолу Тезисы докладов конференции «Актуальные проблемы физиологии, биохимии и фармакологии функциональных систем». , Уфа, 1985, C. 36-38.

98. Мышкин В.А., Бакиров А.Б., Оксиметилурацил. Очерки Экспериментальной Фармакологии, Уфа, 2001.

99. Мирсаева Ф.З., Патогенетическое Обоснование Комплексного Лечения Пародонтита, Автореф. дисс. докт. мед. наук. , Самара, 1997, C. 40.

100. Шикова Ю.В., Лиходед В.А., Плечев В.В., Плечева Д.В., Голубь А.А., Лазарев С.А., Чемикосова Т.С., Лазарева Е.А., Шиков А.Н., Лиходед Т.А.,

Стоматологический Гель Для Лечения Воспалительных Заболеваний Полости Рта: Пат. 2226383 Рос. Федерация: Мпк51 А 61 К 6/00, А 61 К 7/16, А 61 Р 1/00, 2004.

101. Folprecht G., Kohne C.-H. Drug Insight: Metastatic Colorectal Cancer— Oral Fluoropyrimidines and New Perspectives in the Adjuvant Setting // Nat. Clin. Pract. Oncol. - 2005. - V. 2. - P. 578.

102. Heidelberger C., Ansfield F.J., Experimental and Clinical Use of Fluorinated Pyrimidines in Cancer Chemotherapy, AACR, 1963.

103. Sanchiz F., Milla A. Tegafur-Uracil (Uft) Plus Folinic Acid in Advanced Rectal Cancer // Jpn. J. Clin. Oncol. - 1994. - V. 24. - №. 6.- P. 322-326.

104. Tolstikov G.A., Myshkin V.A., Baltina L.A., Murinov Y.I., Srubilin D.V., Vakaritsa A.F., Alekhin E.K. Antidotal and Antiradical Activity of Complexes of P-Glycyrrhizic Acid with Pyrimidine Derivatives // Pharm. Chem. J. - 1996. - V. 30. -№. 5.- P. 320-322.

105. Parker W.B., Cheng Y.C. Metabolism and Mechanism of Action of 5-Fluorouracil // Pharmaco. & Ther. - 1990. - V. 48. - №. 3.- P. 381-395.

106. Taverna P., Hwang H.-s., Schupp J.E., Radivoyevitch T., Session N.N., Reddy G., Zarling D.A., Kinsella T.J. Inhibition of Base Excision Repair Potentiates Iododeoxyuridine-Induced Cytotoxicity and Radiosensitization // Cancer Res. - 2003. -V. 63. - №. 4.- P. 838-846.

107. Turner D.P., Cortellino S., Schupp J.E., Caretti E., Loh T., Kinsella T.J., Bellacosa A. The DNA <Em>N</Em>-Glycosylase Med1 Exhibits Preference for Halogenated Pyrimidines and Is Involved in the Cytotoxicity of 5-Iododeoxyuridine // Cancer Res. - 2006. - V. 66. - №. 15.- P. 7686-7693.

108. Prachayasittikul S., Sornsongkhram N., Pingaew R., Worachartcheewan A., Ruchirawat S., Prachayasittikul V. Synthesis of N-Substituted 5-Iodouracils as Antimicrobial and Anticancer Agents // Mol. - 2009. - V. 14. - №. 8.- P. 2768.

109. Prusoff W.H. A Review of Some Aspects of 5-Iododeoxyuridine and Azauridine // Cancer Res. - 1963. - V. 23. - №. 8 Part 1.- P. 1246-1259.

110. Hong J.H. Synthesis of Novel 2'-Methyl Carbovir Analogues as Potent Antiviral Agents // Arch. Pharm. Res. - 2007. - V. 30. - №. 2.- P. 131-137.

111. Verheggen I., Van Aerschot A., Van Meervelt L., Rozenski J., Wiebe L., Snoeck R., Andrei G., Balzarini J., Claes P. Synthesis, Biological Evaluation, and Structure Analysis of a Series of New 1,5-Anhydrohexitol Nucleosides // J. Med. Chem. - 1995. - V. 38. - №. 5.- P. 826-835.

112. Yoshimura Y., Kitano K., Yamada K., Sakata S., Miura S., Ashida N., Machida H. Synthesis and Biological Activities of 2'-Deoxy-2'-Fluoro-4'-Thioarabinofuranosylpyrimidine and -Purine Nucleosides // Bioorg. & Med. Chem. -2000. - V. 8. - №. 7.- P. 1545-1558.

113. Кривоногов В.П., Толстиков Г.А., Муринов Ю.И. Синтез И Иммунотропная Активность Производных Пиримидина // Химико - фармацевтический журнал. - 1993. - Т. 11. - №. P. 41-44.

114. Кривоногов В.П., Толстиков Г.А., Муринов Ю.И. Синтез, Иммунотропная И Противовоспалительная Активность Некоторых Производных Пиримидина. // Хим. - Фарм. Журн. - 1997. - Т. 7. - С. 24-27.

115. Кривоногов В.П., Толстиков Г.А., Козлова Г.Г., Синтез И Биологическая Активность Производных Пиримидина, Тезисы докл. 1 международной конф. «Химия и биологическая активность азотистых гетероциклов и алкалоидов», 2001, C. 373-377.

116. Кривоногов В.П., Мышкин В.А., Сивкова Г.А. Синтез И Антиоксидантная Активность Пиримидиновых Ациклонуклеозидов // Хим. -Фарм. Журн. - 2001. - Т. 8. - №. P. 8-10.

117. Yu H., Eritja R., Bloom L.B., Goodman M.F. Ionization of Bromouracil and Fluorouracil Stimulates Base Mispairing Frequencies with Guanine // J. Biol. Chem. - 1993. - V. 268. - №. 21.- P. 15935-15943.

118. Heidelberger C., Chaudhuri N.K., Danneberg P., Mooren D., Griesbach L., Duschinsky R., Schnitzer R.J., Pleven E., Scheiner J. Fluorinated Pyrimidines, a New Class of Tumour-Inhibitory Compounds // Nature. - 1957. - V. 179. - P. 663.

119. Javaid Z.Z., Kouni M.H., Iltzsch M.H. Pyrimidine Nucleobase Ligands of Orotate Phosphoribosyltransferase from Toxoplasma Gondii // Biochem. Pharm. -1999. - V. 58. - №. 9.- P. 1457-1466.

120. Krivonogov V.P., Tolstikov G.A., Murinov Y.I., Zarudii F.S., Lazareva D.N., Ismagilova A.F., Volkova S.S., Sakhautdinova G.M., Afzaletdinova N.G., Khisamutdinov R.A., Spirikhin L.V., Krivonogova I.I. Synthesis and Immunotropic Activity of Pyrimidine Derivatives. 2 // Pharm. Chem. J. - 1993. - V. 27. - N. 11.- P. 776-779.

121. Löwdin P.-O. Proton Tunneling in DNA and Its Biological Implications // Rev. Mod. Phys. - 1963. - V. 35. - №. 3.- P. 724-732.

122. Waters S.B., Akman S.A. A New Assay to Quantify in Vivo Repair of G:T Mispairs by Base Excision Repair // Mut. Res./DNA Repair. - 2001. - V. 487. - №. 3.-P. 109-119.

123. Grem J.L. 5-Fluorouracil: Forty-Plus and Still Ticking. A Review of Its Preclinical and Clinical Development // Invest. New Drugs. - 2000. - V. 18. - №. 4.- P. 299-313.

124. Lasken R.S., Goodman M.F. The Biochemical Basis of 5-Bromouracil-Induced Mutagenesis. Heteroduplex Base Mispairs Involving Bromouracil in GXC-aXT and aXT-GXC Mutational Pathways // J. Biol. Chem. - 1984. - V. 259. - №. 18.- P.

11491-11495.

125. Morris S.M., The Genetic Toxicology of 5-Fluoropyrimidines and 5-Chlorouracil, 1993.

126. Porter D.J., Chestnut W.G., Taylor L.C., Merrill B.M., Spector T. Inactivation of Dihydropyrimidine Dehydrogenase by 5-Iodouracil // J. Biol. Chem. -1991. - V. 266. - №. 30.- P. 19988-19994.

127. Vora M.R., Tamhane D.V. Metabolic Studies with Neurospora: Action of 5-Bromo- and 5-Nitrouracils // Arch. Mikrobiol. - 1966. - V. 54. - №. 3.- P. 237-245.

128. Boisdron-Celle M., Remaud G., Traore S., Poirier A.L., Gamelin L., Morel A., Gamelin E. 5-Fluorouracil-Related Severe Toxicity: A Comparison of Different Methods for the Pretherapeutic Detection of Dihydropyrimidine Dehydrogenase Deficiency // Cancer Lett. - V. 249. - №. 2.- P. 271-282.

129. Ferrer E., Wiersma M., Kazimierczak B., Müller C.W., Eritja R. Preparation and Properties of Oligodeoxynucleotides Containing 5-Iodouracil and 5-Bromo- and 5-Iodocytosine // Bioconjugate Chem. - 1997. - V. 8. - №. 5.- P. 757-761.

130. Parker J.B., Stivers J.T. Dynamics of Uracil and 5-Fluorouracil in DNA // Biochem. - 2011. - V. 50. - №. 5.- P. 612-617.

131. Sowers L.C., Goodman M.F., Eritja R., Kaplan B., Fazakerley G.V. Ionized and Wobble Base-Pairing for Bromouracil-Guanine in Equilibrium under Physiological Conditions: A Nuclear Magnetic Resonance Study on an Oligonucleotide Containing a Bromouracil-Guanine Base-Pair as a Function of pH // J. Mol. Biol. -1989. - V. 205. - №. 2.- P. 437-447.

132. Theruvathu J.A., Kim C.H., Darwanto A., Neidigh J.W., Sowers L.C. pH-Dependent Configurations of a 5-Chlorouracil-Guanine Base Pair // Biochem. - 2009. -V. 48. - №. 47.- P. 11312-11318.

133. Willmore E., Durkacz B.W. Cytotoxic Mechanisms of 5-Fluoropyrimidines: Relationships with Poly Polymerase Activity, DNA Strand Breakage and Incorporation into Nucleic Acids // Biochem. Pharm. - 1993. - V. 46. -№. 2.- P. 205-211.

134. Theruvathu J.A., Kim C.H., Rogstad D.K., Neidigh J.W., Sowers L.C. Base Pairing Configuration and Stability of an Oligonucleotide Duplex Containing a 5-Chlorouracil-Adenine Base Pair // Biochem. - 2009. - V. 48. - №. 31.- P. 7539-7546.

135. Driggers P.H., Beattie K.L. Effect of Ph on the Base-Mispairing Properties of 5-Bromouracil During DNA Synthesis // Biochem. - 1988. - V. 27. - №. 5.- P. 17291735.

136. Benzer S., Freese E. Induction of Specific Mutations with 5-Bromouracil // Proc. Natl. Acad. Sci. - 1958. - V. 44. - №. 2.- P. 112-119.

137. van Mourik T., Danilov V.I., Dailidonis V.V., Kurita N., Wakabayashi H., Tsukamoto T. A DFT Study of Uracil and 5-Bromouracil in Nanodroplets // Theor. Chem. Acc. - 2010. - V. 125. - №. 3.- P. 233-244.

138. Hu X., Li H., Zhang L., Han S. Tautomerism of Uracil and 5-Bromouracil in a Microcosmic Environment with Water and Metal Ions. What Roles Do Metal Ions Play? // J. Phys. Chem. B. - 2007. - V. 111. - №. 31.- P. 9347-9354.

139. Hu X., Li H., Ding J., Han S. Mutagenic Mechanism of the A-T to G-C Transition Induced by 5-Bromouracil: An Ab Initio Study // Biochem. - 2004. - V. 43. - №. 21.- P. 6361-6369.

140. Hu X., Li H., Liang W. Reaction Mechanism of Uracil Bromination by Hbro: A New Way to Generate the Enol-Keto Form of 5-Bromouracil // J. Phys. Chem. A. - 2006. - V. 110. - №. 38.- P. 11188-11193.

141. Hanus M., Kabelac M., Nachtigallova D., Hobza P. Mutagenic Properties of 5-Halogenuracils: Correlated Quantum Chemical Ab Initio Study // Biochem. -2005. - V. 44. - №. 5.- P. 1701-1707.

142. Lawley P.D., Brookes P. Ionization of DNA Bases or Base Analogues as a Possible Explanation of Mutagenesis, with Special Reference to 5-Bromodeoxyuridine // J. Mol. Biol. - 1962. - V. 4. - №. 3.- P. 216-219.

143. Sowers L.C., Eritja R., Kaplan B., Goodman M.F., Fazakerly G.V. Equilibrium between a Wobble and Ionized Base Pair Formed between Fluorouracil and Guanine in DNA as Studied by Proton and Fluorine NMR // J. Biol. Chem. - 1988. - V. 263. - №. 29.- P. 14794-14801.

144. Patel D.J., Kozlowski S.A., Marky L.A., Rice J.A., Broka C., Dallas J., Itakura K., Breslauer K.J. Structure, Dynamics, and Energetics of Deoxyguanosine-Thymidine Wobble Base Pair Formation in the Self-Complementary D (CGTGAATTCGCG) Duplex in Solution // Biochem. - 1982. - V. 21. - №. 3.- P. 437444.

145. von Borstel R.C., Origins of Spontaneous Base Substitutions, 1994.

146. Neill J.P., Heartlein M.W., Preston R.J., Sister-Chromatid Exchanges and Gene Mutations Are Induced by the Replication of 5-Bromo- and 5-Chloro-Deoxyuridine Substituted DNA, 1983.

147. Gukovskaya A.S., Sukhorukov B.I., Prokop'eva T.M., Antonovskii V.L. Spectrophotometric Investigation of the Protonation and Deprotonation of Thymine, Uracil, and Its 5-Haloderivatives // Bull. Acad. Sci. USSR, Div. Chem. Sci. - 1972. - V. 21. - №. 12.- P. 2614-2619.

148. Ganguly S., Kundu K.K. Protonation/Deprotonation Energetics of Uracil, Thymine, and Cytosine in Water from E.M.F./Spectrophotometric Measurements // Can. J. Chem. - 1994. - V. 72. - №. 4.- P. 1120-1126.

149. Chen E.C.M., Herder C., Chen E.S. The Experimental and Theoretical Gas Phase Acidities of Adenine, Guanine, Cytosine, Uracil, Thymine and Halouracils // J. Mol. Struct. - 2006. - V. 798. - №. 1-3.- P. 126-133.

150. Miller T.M., Arnold S.T., Viggiano A.A., Stevens Miller A.E. Acidity of a Nucleotide Base: Uracil // J. Phys. Chem. A. - 2004. - V. 108. - №. 16.- P. 3439-3446.

151. Kurinovich M.A., Lee J.K. The Acidity of Uracil and Uracil Analogs in the Gas Phase: Four Surprisingly Acidic Sites and Biological Implications // J. Am. Soc. Mass Spectrom. - 2002. - V. 13. - №. 8.- P. 985-995.

152. Abdrakhimova G.S., Ovchinnikov M.Y., Lobov A.N., Spirikhin L.V., Ivanov S.P., Khursan S.L. 5-Fluorouracil Solutions: NMR Study of Acid-Base Equilibrium in Water and Dmso // J. Phys. Org. Chem. - 2014. - V. 27. - №. 11.- P. 876-883.

153. Abdrakhimova G.S., Ovchinnikov M.Y., Lobov A.N., Spirikhin L.V., Khursan S.L., Ivanov S.P. 5-Chlorouracil and 5-Bromouracil Acid-Base Equilibrium Study in Water and Dmso by NMR Spectroscopy // J. Mol. Struct. - 2018. - V. 1158. -P. 51-56.

154. Baboul A.G., Curtiss L.A., Redfern P.C., Raghavachari K. Gaussian-3 Theory Using Density Functional Geometries and Zero-Point Energies // J. Chem. Phys. - 1999. - V. 110. - №. 16.- P. 7650-7657.

155. Curtiss L.A., Raghavachari K., Redfern P.C., Rassolov V., Pople J.A. Gaussian-3 (G3) Theory for Molecules Containing First and Second-Row Atoms // J. Chem. Phys. - 1998. - V. 109. - №. 18.- P. 7764-7776.

156. Curtiss L.A., Redfern P.C., Raghavachari K., Rassolov V., Pople J.A. Gaussian-3 Theory Using Reduced Mo/Ller-Plesset Order // J. Chem. Phys. - 1999. -V. 110. - №. 10.- P. 4703-4709.

157. Petersson G.A., Bennett A., Tensfeldt T.G., Al-Laham M.A., Shirley W.A., Mantzaris J. A Complete Basis Set Model Chemistry. I. The Total Energies of Closed-

Shell Atoms and Hydrides of the First-Row Elements // J. Chem. Phys. - 1988. - V. 89.

- №. 4.- P. 2193-2218.

158. Petersson G.A., Al-Laham M.A. A Complete Basis Set Model Chemistry. Ii. Open-Shell Systems and the Total Energies of the First-Row Atoms // J. Chem. Phys.

- 1991. - V. 94. - №. 9.- P. 6081-6090.

159. Ilyina M.G., Khamitov E.M., Ivanov S.P., Mustafin A.G., Khursan S.L. Anions of Uracils: N1 or N3? That Is the Question // Comput. Theor. Chem. - 2016. -V. 1078. - P. 81-87.

160. Deeble D.J., Das S., Von Sonntag C. Uracil Derivatives: Sites and Kinetics of Protonation of the Radical Anions and the UV Spectra of the C(5) and C(6) H-Atom Adducts // J. Phys. Chem. - 1985. - V. 89. - №. 26.- P. 5784-5788.

161. Chandra A.K., Uchimaru T., Zeegers-Huyskens T. Theoretical Study on Protonated and Deprotonated 5-Substituted Uracil Derivatives and Their Complexes with Water // J. Mol. Struct. - 2002. - V. 605. - №. 2-3.- P. 213-220.

162. Dunning T.H. Gaussian Basis Sets for Use in Correlated Molecular Calculations. I. The Atoms Boron through Neon and Hydrogen // J. of Chem. Phys. -1989. - V. 90. - №. 2.- P. 1007-1023.

163. Bachrach S.M., Dzierlenga M.W. Microsolvation of Uracil and Its Conjugate Bases: A DFT Study of the Role of Solvation on Acidity // J. Phys. Chem. A.

- 2011. - V. 115. - №. 22.- P. 5674-5683.

164. Tomasi J., Persico M. Molecular Interactions in Solution: An Overview of Methods Based on Continuous Distributions of the Solvent // Chem. Rev. - 1994. - V. 94. - №. 7.- P. 2027-2094.

165. Pavel I., Cota S., Cintä-Pinzaru S., Kiefer W. Raman, Surface Enhanced Raman Spectroscopy, and Dft Calculations: A Powerful Approach for the Identification and Characterization of 5-Fluorouracil Anticarcinogenic Drug Species // J. Phys. Chem. A. - 2005. - V. 109. - №. 44.- P. 9945-9952.

166. Koji N., Noboru S., Futaba Y. Ultraviolet Spectra of N-Heterocyclic Systems. I. The Anions of Uracils // Bull. Chem. Soc. Jpn. - 1961. - V. 34. - №. 1.- P. 53-57.

167. Mori M., Teshima S.-i., Yoshimoto H., Fujita S.-i., Taniguchi R., Hatta H., Nishimoto S.-I. Oh Radical Reaction of 5-Substituted Uracils: Pulse Radiolysis and Product Studies of a Common Redox-Ambivalent Radical Produced by Elimination of the 5-Substituents // J. Phys. Chem. B. - 2001. - V. 105. - №. 10.- P. 2070-2078.

168. Privat E.J., Sowers L.C. A Proposed Mechanism for the Mutagenicity of 5-Formyluracil // Mutat. Res. - 1996. - V. 354. - №. 2.- P. 151-156.

169. Wempen I., Fox J.J. Spectrometric Studies of Nucleic Acid Derivatives and Related Compounds. VI. On the Structure of Certain 5- and 6-Halogenouracils and -Cytosines // J. Am. Chem. Soc. - 1964. - V. 86. - №. 12.- P. 2474-2477.

170. Jonas J., J. G. Nucleic Acids Components and Their Analogues. XVI. Dissociation Constants of Uracil, 6-Azauracil and Related Compounds // Collect. Czech. Chem. Commun. - 1962. - V. 27. - №. 3.- P. 716-723.

171. Wittenburg E. Untersuchung Der Tautomeren Struktur Von Thymin Und Seinen Alkylderivaten Mit Hilfe Von UV-Spektren // Ber. - 1966. - V. 99. - №. 7.- P. 2391-2398.

172. Nakanishi K., Suzuki N., Yamazaki F. Ultraviolet Spectra of <I>N</I>-Heterocyclic Systems. I. The Anions of Uracils // Bull. Chem. Soc. Jpn. - 1961. - V. 34. - №. 1.- P. 53-57.

173. Shugar D., Fox J.J. Spectrophotometric Studies of Nucleic Acid Derivatives and Related Compounds as a Function of pH. I. Pyrimidines // Biochim. Biophys. Acta. - 1952. - V. 9. - №. 2.- P. 199-218.

174. Levene P.A., Bass L.W., Simms H.S. The Ionization of Pyrimidines in Relation to the Structure of Pyrimidine Nucleosides // J. Biol. Chem. - 1926. - V. 70. -№. 1.- P. 229-241.

175. Dawson R.M.C., Data for Biochemical Research, Clarendon Press, 1989.

176. Blagoy Yu.P., Sheina G.G., Luzanov A.V., Silina L.K., Pedash V.F., Rubin Yu.V., Leibina E.A. Effect of Substituents on Electron Energy Redistribution in Uracil Derivatives and Their Ionization in Polar Solvents // Int. J. Quantum Chem. - 1980. -V. 18. - №. 4.- P. 913-919.

177. Станкевич Э.И., Попелис Ю.Ю., Гринштейн А.Я., Я. О.А., Дубур Г.Я. Констатнты Кислотной Диссоциации Некоторых Азотсодержащих Многоядерных Систем // ХГС. - 1970. - Т. 1. - P. 122-124.

178. Piskala A., Gut J. Nucleic Acid Components and Their Analogues. XIII. Synthesis of 5-Azauracil (Allantoxaidin) and Its N-Methyl Derivatives // Collect. Czech. Chem. Commun. - 1961. - V. 26. - №. 10.- P. 2519-2529.

179. Albert A., Phillips J.N. Ionization Constants of Heterocyclic Substances. Part II. Hydroxy-Derivatives of Nitrogenous Six-Membered Ring-Compounds // J. Chem. Soc. (Resumed). - 1956. - №. 0.- P. 1294-1304.

180. Jang Y.H., Sowers L.C., Qagin T., Goddard W.A. First Principles Calculation of pKa Values for 5-Substituted Uracils // J. Phys. Chem. A. - 2001. - V. 105. - №. 1.- P. 274-280.

181. Matsui T., Oshiyama A., Shigeta Y. A Simple Scheme for Estimating the pKa Values of 5-Substituted Uracils // Chem. Phys. Lett. - 2011. - V. 502. - №. 4-6.-P. 248-252.

182. Verdolino V., Cammi R., Munk B.H., Schlegel H.B. Calculation of pKa Values of Nucleobases and the Guanine Oxidation Products Guanidinohydantoin and Spiroiminodihydantoin Using Density Functional Theory and a Polarizable Continuum Model // J. Phys. Chem. B. - 2008. - V. 112. - №. 51.- P. 16860-16873.

183. Thapa B., Schlegel H.B. Calculations of P pKa's and Redox Potentials of Nucleobases with Explicit Waters and Polarizable Continuum Solvation // J. Phys. Chem. A. - 2015. - V. 119. - №. 21.- P. 5134-5144.

184. Khursan S.L., Ovchinnikov M.Y. The pKa Theoretical Estimation of C-H, N-H, O-H and S-H Acids in Dimethylsulfoxide Solution // J. Phys. Org. Chem. - 2014. - V. 27. - №. 12.- P. 926-934.

185. Klamt A., Eckert F., Diedenhofen M., Beck M.E. First Principles Calculations of Aqueous pKa Values for Organic and Inorganic Acids Using Cosmo-RS Reveal an Inconsistency in the Slope of the pKa Scale // J. Phys. Chem. A. - 2003. - V. 107. - №. 44.- P. 9380-9386.

186. Chen E.C., Wiley J.R., Chen E.S. The Electron Affinities of Deprotonated Adenine, Guanine, Cytosine, Uracil, and Thymine // Nucleos. Nucleot. Nucl. - 2008. -V. 27. - №. 5.- P. 506-524.

187. Huang Y., Kenttämaa H. Theoretical Estimations of the 298 K Gas-Phase Acidities of the Pyrimidine-Based Nucleobases Uracil, Thymine, and Cytosine // J. Phys. Chem. A. - 2003. - V. 107. - №. 24.- P. 4893-4897.

188. Taqui Khan M.M., Satyanarayana S., Jyoti M.S., C.A. L. Thermodynamic Quantities Associated with Interaction of Thymine, Uracil, Cytosine, Adenine and Hypoxantine with Metal Ions // Ind. J. Chem. - 1983. - V. 22. - №. 5.- P. 357-363.

189. Srivastava R.C., Srivastava M.N. Formation, Stability and Thermodynamic Functions of Beryllium(II) and Mercury(II) Complexes of Uracil and Thymine // J. Inorg. Nucl. Chem. - 1978. - V. 40. - №. 7.- P. 1439-1442.

190. Tyagi S., Kumar R., Singh U.P. Solution Studies of Some Binary and Ternary Lanthanide Complexes // J. Chem. Eng. Data. - 2005. - V. 50. - №. 2.- P. 377382.

191. Tucci E.R., Doody B.E., Li N.C. Acid Dissociation Constants and Complex Formation Constants of Several Pyrimidine Derivatives // J. Phys. Chem. - 1961. - V. 65. - №. 9.- P. 1570-1574.

192. Amorati R., Valgimigli L., Pedulli G.F., Grabovskiy S.A., Kabal'nova N.N., Chatgilialoglu C. Base-Promoted Reaction of 5-Hydroxyuracil Derivatives with Peroxyl Radicals // Org. Lett. - 2010. - V. 12. - №. 18.- P. 4130-4133.

193. Бузланова М.М. Потенциометрическое Исследование Некоторых Имидов И Замещенного Урацила С Использованием Ион-Селективных Электродов //Журн. аналит. химии. - 1988. - V. 43. - №. 8.- P. 1515-1517.

194. Альберт А., Сержент Е., Константы Ионизации Кислот И Оснований., Ленинград, 1964.

195. Lukmanov T.I., Abdrakhimova G.S., Khamitov E.M., Ivanov S.P. Quantum-Chemical Calculations of the Relative Stability of the Keto-Enol Tautomers of 5-Chlorouracyl // Russ. J. Phys. Chem. - 2012. - V. 86. - №. 7.- P. 1104-1108.

196. Watson J.D., Crick F.H.C. Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid // Nature. - 1953. - V. 171. - №. 4356.- P. 737-738.

197. Orozco M., Hernández B., Luque F.J. Tautomerism of 1-Methyl Derivatives of Uracil, Thymine, and 5-Bromouracil. Is Tautomerism the Basis for the Mutagenicity of 5-Bromouridine? // J. Phys. Chem. B. - 1998. - V. 102. - №. 26.- P. 5228-5233.

198. Frisch M.J., Trucks G.W., Schlegel H.B., Scuseria G.E., Robb M.A., Cheeseman J.R., Scalmani G., Barone V., Mennucci B., Petersson G.A., Nakatsuji H., Caricato M., Li X., Hratchian H.P., Izmaylov A.F., Bloino J., Zheng G., Sonnenberg J.L., Hada M., Ehara M., Toyota K., Fukuda R., Hasegawa J., Ishida M., Nakajima T., Honda Y., Kitao O., Nakai H., Vreven T., Montgomery J., J. A., Peralta J.E., Ogliaro F., Bearpark M., Heyd J.J., Brothers E., Kudin K.N., Staroverov V.N., Kobayashi R., Normand J., Raghavachari K., Rendell A., Burant J.C., Iyengar S.S., Tomasi J., Cossi M., Rega N., Millam J.M., Klene M., Knox J.E., Cross J.B., Bakken V., Adamo C., Jaramillo J., Gomperts R., Stratmann R.E., Yazyev O., Austin A.J., Cammi R., Pomelli C., Ochterski J.W., Martin R.L., Morokuma K., Zakrzewski V.G., Voth G.A., Salvador P., Dannenberg J.J., Dapprich S., Daniels A.D., Farkas Ö., Foresman J.B., Ortiz J.V., Cioslowski J., Fox D.J., Gaussian 09, Revision D.1, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.

199. Tao J., Perdew J.P., Staroverov V.N., Scuseria G.E. Climbing the Density Functional Ladder: Nonempirical Meta Generalized Gradient Approximation Designed for Molecules and Solids // Phys. Rev. Lett. - 2003. - V. 91. - №. 14.- P. 146401.

200. Krishnan R., Binkley J.S., Seeger R., Pople J.A. Self-Consistent Molecular Orbital Methods. Xx. A Basis Set for Correlated Wave Functions // J. Chem. Phys. -1980. - V. 72. - №. 1.- P. 650-654.

201. Humphrey W., Dalke A., Schulten K. Vmd: Visual Molecular Dynamics // J. Mol. Graph. - 1996. - V. 14. - №. 1.- P. 33-38.

202. Pople J.A., Head-Gordon M., Raghavachari K. Quadratic Configuration Interaction. A General Technique for Determining Electron Correlation Energies // J. Chem. Phys. - 1987. - V. 87. - №. 10.- P. 5968-5975.

203. Dautova I.F., Ivanov S.P., Khursan S.L. Hydration Effect on the Stability of the Keto-Enol Tautomers of 5-Hydroxy-6-Methyluracil // J. Struct. Chem. - 2009. -V. 50. - №. 6.- P. 1104-1113.

204. Marenich A.V., Cramer C.J., Truhlar D.G. Universal Solvation Model Based on Solute Electron Density and on a Continuum Model of the Solvent Defined by the Bulk Dielectric Constant and Atomic Surface Tensions // J. Phys. Chem. B. - 2009. - V. 113. - №. 18.- P. 6378-6396.

205. Güell M., Matito E., Luis J.M., Poater J., Solà M. Analysis of Electron Delocalization in Aromatic Systems: Individual Molecular Orbital Contributions to Para-Delocalization Indexes (PDI) // The Journal of Physical Chemistry A. - 2006. - V. 110. - №. 40.- P. 11569-11574.

206. Poater J., Fradera X., Duran M., Solà M. The Delocalization Index as an Electronic Aromaticity Criterion: Application to a Series of Planar Polycyclic Aromatic Hydrocarbons // Chem. Eur. J. - 2003. - V. 9. - №. 2.- P. 400-406.

207. Matito E., Duran M., Solà M. The Aromatic Fluctuation Index (FLU): A New Aromaticity Index Based on Electron Delocalization // J. Chem. Phys. - 2005. - V. 122. - №. 1.- P. 014109.

208. Matito E., Salvador P., Duran M., Solà M. Aromaticity Measures from Fuzzy-Atom Bond Orders (FBO). The Aromatic Fluctuation (FLU) and the Para-Delocalization (PDI) Indexes // J. Phys. Chem. A. - 2006. - V. 110. - №. 15.- P. 51085113.

209. Kruszewski J., Krygowski T.M. Definition of Aromaticity Basing on the Harmonic Oscillator Model // Tetrahedron Lett. - 1972. - V. 13. - №. 36.- P. 38393842.

210. Lu T., Chen F. Multiwfn: A Multifunctional Wavefunction Analyzer // J. Comput. Chem. - 2012. - V. 33. - №. 5.- P. 580-592.

211. Poater J., Fradera X., Duran M., Solà M. The Delocalization Index as an Electronic Aromaticity Criterion: Application to a Series of Planar Polycyclic Aromatic Hydrocarbons // Chem. Eur. J. - 2003. - V. 9. - №. 2.- P. 400-406.

212. Matito E., Duran M., Solà M. The Aromatic Fluctuation Index (FLU): A New Aromaticity Index Based on Electron Delocalization // J. Chem. Phys. - 2004. - V. 122. - №. 1.- P. 014109.

213. Bultinck P., Ponec R., Damme S.V. Multicenter Bond Indices as a New Measure of Aromaticity in Polycyclic Aromatic Hydrocarbons // J. Phys. Org. Chem. -2005. - V. 18. - №. 8.- P. 706-718.

214. Howard S.T., Krygowski T.M. Benzenoid Hydrocarbon Aromaticity in Terms of Charge Density Descriptors // Can. J. Chem. - 1997. - V. 75. - №. 9.- P. 1174-1181.

215. Jug K. A Bond Order Approach to Ring Current and Aromaticity // J. Org. Chem. - 1983. - V. 48. - №. 8.- P. 1344-1348.

216. Matta C.F., Hernandez-Trujillo J. Bonding in Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in Terms of the Electron Density and of Electron Delocalization // J. Phys. Chem. A. - 2003. - V. 107. - №. 38.- P. 7496-7504.

217. Matta C.F., Hernandez-Trujillo J. Bonding in Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in Terms of the Electron Density and of Electron Delocalization // J. Phys. Chem. A. - 2005. - V. 109. - №. 47.- P. 10798-10798.

218. Santos J.C., Andres J., Aizman A., Fuentealba P. An Aromaticity Scale Based on the Topological Analysis of the Electron Localization Function Including S and П Contributions // J. Chem. Theor. Comput. - 2005. - V. 1. - №. 1.- P. 83-86.

219. Santos J.C., Tiznado W., Contreras R., Fuentealba P. Sigma-Pi Separation of the Electron Localization Function and Aromaticity // J. Chem. Phys. - 2004. - V. 120. - №. 4.- P. 1670-1673.

220. Bader R.F.W., Streitwieser A., Neuhaus A., Laidig K.E., Speers P. Electron Delocalization and the Fermi Hole // J. Am. Chem. Soc. - 1996. - V. 118. - №. 21.- P. 4959-4965.

221. Fradera X., Austen M.A., Bader R.F.W. The Lewis Model and Beyond // J. Phys. Chem. A. - 1999. - V. 103. - №. 2.- P. 304-314.

222. Schleyer P.v.R. Introduction: Aromaticity // Chem. Rev. - 2001. - V. 101. - №. 5.- P. 1115-1118.

223. von Schleyer P.R., Jiao H., What Is Aromaticity?, Pure and Applied Chemistry, 1996, P. 209.

224. Krygowski T.M., Cyranski M.K. Structural Aspects of Aromaticity // Chem. Rev. - 2001. - V. 101. - №. 5.- P. 1385-1420.

225. Kruszewski J., Krygowski T. Harmonic Oscillator Approach to Definition of Aromaticity // Bull. Acad. Pol. Sci. Chim. - 1972. - V. 20. - №. 9.- P. 907-912.

226. Krygowski T., Kruszewski J. Bond Reactivity Index (Bri) in Terms of Simple Harmonic Oscillator Theory // Bull. Acad. Pol. Sci. Chim. - 1973. - V. 21. - №. 5.- P. 409-412.

227. Krygowski T., Kruszewski J. Aromaticity of Thiophene, Pyrrole and Furan in Terms of Aromaticity Indices and Hammett Pi Constants // Chem. Inform. - 1975. -V. 6. - №. 10.- P.

228. Krygowski T.M. Crystallographic Studies of Inter- and Intramolecular Interactions Reflected in Aromatic Character Of .Pi.-Electron Systems // J. Chem. Inform. Comp. Sci. - 1993. - V. 33. - №. 1.- P. 70-78.

229. Raczynska E.D., Krygowski T.M., Duczmal K., Hallmann M., On Geometry-Based Homed (a Measure of Hyperconjugation, nn, and nn Conjugation) and Homa Index (a Measure of Aromaticity), XVIII International Conference on Physical Organic Chemistry, Warsaw (Book of abstracts, P. 31), 2006.

230. Bader R.F.W., Slee T.S., Cremer D., Kraka E. Description of Conjugation and Hyperconjugation in Terms of Electron Distributions // J. Am. Chem. Soc. - 1983. -V. 105. - №. 15.- P. 5061-5068.

231. Merino G., Vela A., Heine T. Description of Electron Delocalization Via the Analysis of Molecular Fields // Chem. Rev. - 2005. - V. 105. - №. 10.- P. 3812-3841.

232. Keith T.A., Aimall, 2008.

233. Lim C., Bashford D., Karplus M. Absolute pKa Calculations with Continuum Dielectric Methods // J. Phys. Chem. - 1991. - V. 95. - №. 14.- P. 56105620.

234. Topol I.A., Tawa G.J., Burt S.K., Rashin A.A. Calculation of Absolute and Relative Acidities of Substituted Imidazoles in Aqueous Solvent // J. Phys. Chem. A. -1997. - V. 101. - №. 51.- P. 10075-10081.

235. Ho J., Coote M.L. A Universal Approach for Continuum Solvent pKa Calculations: Are We There Yet? // Theor. Chem. Acc. - 2009. - V. 125. - №. 1.- P. 321.

236. Klicic J.J., Friesner R.A., Liu S.-Y., Guida W.C. Accurate Prediction of Acidity Constants in Aqueous Solution Via Density Functional Theory and Self-Consistent Reaction Field Methods // J. Phys. Chem. A. - 2002. - V. 106. - №. 7.- P. 1327-1335.

237. Ho J. Predicting pKa in Implicit Solvents: Current Status and Future Directions // Aust. J. Chem. - 2014. - V. 67. - №. 10.- P. 1441-1460.

238. Ho J. Are Thermodynamic Cycles Necessary for Continuum Solvent Calculation ofpKa>s and Reduction Potentials? // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2015. - V. 17. - №. 4.- P. 2859-2868.

239. Tomasi J., Mennucci B., Cammi R. Quantum Mechanical Continuum Solvation Models // Chem. Rev. - 2005. - V. 105. - №. 8.- P. 2999-3094.

240. Ribeiro R.F., Marenich A.V., Cramer C.J., Truhlar D.G. Use of Solution-Phase Vibrational Frequencies in Continuum Models for the Free Energy of Solvation // J. Phys. Chem. B. - 2011. - V. 115. - №. 49.- P. 14556-14562.

241. Tao J., Perdew J.P., Staroverov V.N., Scuseria G.E. Climbing the Density Functional Ladder: Nonempirical Meta Generalized Gradient Approximation Designed for Molecules and Solids // Phys. Rev. Lett. - 2003. - V. 91. - №. 14.- P. 146401.

242. Kendall R.A., Dunning T.H., Harrison R.J. Electron Affinities of the First-Row Atoms Revisited. Systematic Basis Sets and Wave Functions // J. Chem. Phys. - 1992. - V. 96. - №. 9.- P. 6796-6806.

243. Woon D.E., Dunning T.H. Gaussian Basis Sets for Use in Correlated Molecular Calculations. III. The Atoms Aluminum through Argon // J. Chem. Phys. -1993. - V. 98. - №. 2.- P. 1358-1371.

244. Peterson K.A., Woon D.E., Dunning T.H. Benchmark Calculations with Correlated Molecular Wave Functions. IV. The Classical Barrier Height of the H+H2^H2+H Reaction // J. Chem. Phys. - 1994. - V. 100. - №. 10.- P. 7410-7415.

245. Wilson A.K., van Mourik T., Dunning T.H. Gaussian Basis Sets for Use in Correlated Molecular Calculations. VI. Sextuple Zeta Correlation Consistent Basis Sets for Boron through Neon // THEOCHEM. - 1996. - V. 388. - P. 339-349.

246. Papajak E., Leverentz H.R., Zheng J., Truhlar D.G. Efficient Diffuse Basis Sets: cc-pVXZ+ and maug-cc-pVXZ // J. Chem. Theor. Comput. - 2009. - V. 5. - №. 12.- P. 3330-3330.

247. Tissandier M.D., Cowen K.A., Feng W.Y., Gundlach E., Cohen M.H., Earhart A.D., Coe J.V., Tuttle T.R. The Proton's Absolute Aqueous Enthalpy and Gibbs Free Energy of Solvation from Cluster-Ion Solvation Data // J. Phys. Chem. A. - 1998. - V. 102. - №. 40.- P. 7787-7794.

248. Donald W.A., Williams E.R. An Improved Cluster Pair Correlation Method for Obtaining the Absolute Proton Hydration Energy and Enthalpy Evaluated with an Expanded Data Set // J. Phys. Chem. B. - 2010. - V. 114. - №. 41.- P. 13189-13200.

249. Asthagiri D., Pratt L.R., Ashbaugh H.S. Absolute Hydration Free Energies of Ions, Ion-Water Clusters, and Quasichemical Theory // J. Chem. Phys. - 2003. - V. 119. - №. 5.- P. 2702-2708.

250. Pliego J.R., Riveros J.M. The Cluster-Continuum Model for the Calculation of the Solvation Free Energy of Ionic Species // J. Phys. Chem. A. - 2001. -V. 105. - №. 30.- P. 7241-7247.

251. Bryantsev V.S., Diallo M.S., Goddard Iii W.A. Calculation of Solvation Free Energies of Charged Solutes Using Mixed Cluster/Continuum Models // J. Phys. Chem. B. - 2008. - V. 112. - №. 32.- P. 9709-9719.

252. Zhan C.-G., Dixon D.A. Absolute Hydration Free Energy of the Proton from First-Principles Electronic Structure Calculations // J. Phys. Chem. A. - 2001. - V. 105. - №. 51.- P. 11534-11540.

253. Himmel D., Goll S.K., Leito I., Krossing I. Anchor Points for the Unified Br0nsted Acidity Scale: The Rccc Model for the Calculation of Standard Gibbs Energies of Proton Solvation in Eleven Representative Liquid Media // Chem. Eur. J. -2011. - V. 17. - №. 21.- P. 5808-5826.

254. Fawcett W.R. The Ionic Work Function and Its Role in Estimating Absolute Electrode Potentials // Langmuir. - 2008. - V. 24. - №. 17.- P. 9868-9875.

255. Donald W.A., Leib R.D., Demireva M., O'Brien J.T., Prell J.S., Williams E.R. Directly Relating Reduction Energies of Gaseous Eu(H2O)N , N = 55-140, to Aqueous Solution: The Absolute She Potential and Real Proton Solvation Energy // J. Am. Chem. Soc. - 2009. - V. 131. - №. 37.- P. 13328-13337.

256. Donald W.A., Leib R.D., O'Brien J.T., Bush M.F., Williams E.R. Absolute Standard Hydrogen Electrode Potential Measured by Reduction of Aqueous Nanodrops in the Gas Phase // J. Am. Chem. Soc. - 2008. - V. 130. - №. 11.- P. 3371-3381.

257. Donald W.A., Leib R.D., O'Brien J.T., Williams E.R. Directly Relating Gas-Phase Cluster Measurements to Solution-Phase Hydrolysis, the Absolute Standard Hydrogen Electrode Potential, and the Absolute Proton Solvation Energy // Chem. Eur. J. - 2009. - V. 15. - №. 24.- P. 5926-5934.

258. Kallies B., Mitzner R. pKa Values of Amines in Water from Quantum Mechanical Calculations Using a Polarized Dielectric Continuum Representation of the Solvent // J. Phys. Chem. B. - 1997. - V. 101. - №. 15.- P. 2959-2967.

259. Shapley W.A., Bacskay G.B., Warr G.G. Ab Initio Quantum Chemical Studies of the pKa's of Hydroxybenzoic Acids in Aqueous Solution with Special Reference to the Hydrophobicity of Hydroxybenzoates and Their Binding to Surfactants // J. Phys. Chem. B. - 1998. - V. 102. - №. 11.- P. 1938-1944.

260. Magill A.M., Cavell K.J., Yates B.F. Basicity of Nucleophilic Carbenes in Aqueous and Nonaqueous Solventstheoretical Predictions // J. Am. Chem. Soc. - 2004. - V. 126. - №. 28.- P. 8717-8724.

261. Magill A.M., Yates B.F. An Assessment of Theoretical Protocols for Calculation of the pKa Values of the Prototype Imidazolium Cation // Aust. J. Chem. -2004. - V. 57. - №. 12.- P. 1205-1210

262. Topol I.A., Burt S.K., Rashin A.A., Erickson J.W. Calculation of Substituent Effects on pKa Values for Pyrone and Dihydropyrone Inhibitors of HIV-1 Protease // J. Phys. Chem. A. - 2000. - V. 104. - №. 4.- P. 866-872.

263. Topol I.A., Tawa G.J., Caldwell R.A., Eissenstat M.A., Burt S.K. Acidity of Organic Molecules in the Gas Phase and in Aqueous Solvent // J. Phys. Chem. A. -2000. - V. 104. - №. 42.- P. 9619-9624.

264. Tawa G.J., Topol I.A., Burt S.K., Caldwell R.A., Rashin A.A. Calculation of the Aqueous Solvation Free Energy of the Proton // J. Chem. Phys. - 1998. - V. 109.

- №. 12.- P. 4852-4863.

265. Liptak M.D., Shields G.C. AccuratepKa Calculations for Carboxylic Acids Using Complete Basis Set and Gaussian-N Models Combined with Cpcm Continuum Solvation Methods // J. Am. Chem. Soc. - 2001. - V. 123. - №. 30.- P. 7314-7319.

266. Liptak M.D., Gross K.C., Seybold P.G., Feldgus S., Shields G.C. Absolute pKa Determinations for Substituted Phenols // J. Am. Chem. Soc. - 2002. - V. 124. - №. 22.- P. 6421-6427.

267. Pliego Jr J.R., Riveros J.M. Gibbs Energy of Solvation of Organic Ions in Aqueous and Dimethyl Sulfoxide Solutions // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2002. - V. 4.

- №. 9.- P. 1622-1627.

268. Kelly C.P., Cramer C.J., Truhlar D.G. Aqueous Solvation Free Energies of Ions and Ion-Water Clusters Based on an Accurate Value for the Absolute Aqueous Solvation Free Energy of the Proton // J. Phys. Chem. B. - 2006. - V. 110. - №. 32.- P. 16066-16081.

269. Camaioni D.M., Schwerdtfeger C.A. Comment on "Accurate Experimental Values for the Free Energies of Hydration of H+, OH-, and H3O+" // J. Phys. Chem. A. -2005. - V. 109. - №. 47.- P. 10795-10797.

270. Chipman D.M. Computation ofpKa from Dielectric Continuum Theory // J. Phys. Chem. A. - 2002. - V. 106. - №. 32.- P. 7413-7422.

271. Ben-Naim A., Marcus Y. Solvation Thermodynamics of Nonionic Solutes // J. Chem. Phys. - 1984. - V. 81. - №. 4.- P. 2016-2027.

272. Reed C.A. Myths About the Proton. The Nature of H+ in Condensed Media // Acc. Chem. Res. - 2013. - V. 46. - №. 11.- P. 2567-2575.

273. Marenich A.V., Ho J., Coote M.L., Cramer C.J., Truhlar D.G. Computational Electrochemistry: Prediction of Liquid-Phase Reduction Potentials // Phys. Chem. Chem. Phys. - 2014. - V. 16. - №. 29.- P. 15068-15106.

274. Isse A.A., Gennaro A. Absolute Potential of the Standard Hydrogen Electrode and the Problem of Interconversion of Potentials in Different Solvents // J. Phys. Chem. B. - 2010. - V. 114. - №. 23.- P. 7894-7899.

275. Trummal A., Rummel A., Lippmaa E., Burk P., Koppel I.A. IEF-PCM Calculations of Absolute pKa for Substituted Phenols in Dimethyl Sulfoxide and Acetonitrile Solutions // J. Phys. Chem. A. - 2009. - V. 113. - №. 21.- P. 6206-6212.

276. Hammett L.P., Physical Organic Chemistry. Reaction Rates, Equilibria and Mechanisms, McGraw-Hill, New York 1970.

277. Flynn G.L. Substituent Constants for Correlation Analysis in Chemistry and Biology // J. Pharm. Sci. - 1980. - V. 69. - №. 9.- P. 1109-1109.

278. Cheshmedzhieva D., Ilieva S., Galabov B. Computational Evaluation of Si and Sr Substituent Constants // J. Mol. Struct. - 2010. - V. 976. - №. 1-3.- P. 427-430.