Влияние мутантных аллелей генов CCR5, CCR2 и SDF1 человека на ВИЧ-инфекцию тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Рябов, Григорий Сергеевич

• Рябов, Григорий Сергеевич
• кандидат биологических наук
• 2004

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Рябов, Григорий Сергеевич

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Глава 1. Вирус иммунодефицита человека первого типа.

1.1. Строение вириона ВИЧ-1.

1.2. Вирусные белки и их роль в жизненном цикле ВИЧ-1.

1.3. Деление вируса на подтипы.

1.4. Эпидемия ВИЧ-1-инфекции в России.

Глава 2. Хемокиновые рецепторы как корецепторы проникновения

ВИЧ в клетку.

2.1. Взаимодействие ВИЧ-1 с клеткой.

2.2. Хемокиновая система регуляции.

2.2.1 Классификация хемокинов.

2.2.2. Роль хемокинов в организме человека.

2.2.3. Хемокиновые рецепторы используемые ВИЧ-1.

2.3. Хемокиновый рецептор CCR5.

2.3.1. Организация гена хемокинового рецептора CCR5.

2.3.2. Структура хемокинового рецептора CCR5.

2.3.3. Возможные варианты использования хемокинового рецептора CCR5 в терапии ВИЧ-инфекции.

Глава 3. Мутации генов хемокиновой системы регуляции, оказывающие влияние на ВИЧ-инфекцию.

3.1. Мутации в гене хемокинового рецептора CCR5, оказывающие влияние на ВИЧ-инфекцию.

3.1.1. Делеция в открытой рамке считывания гена хемокинового рецептора CCR5.

3.1.2. Другие мутации гена хемокинового рецептора CCR и его лигандов.

3.2. Мутации других генов хемокиновой системы регуляции, оказывающие влияние на ВИЧ-инфекцию.

3.3. Гаплотипы гена хемокинового рецептора CCR5.

3.4. Описание групп, исследовавшихся при изучении роли мутаций влияющих на вероятность заражения и развитие ВИЧ.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

Глава 1. Материалы и методы.

1.1. Метод получения «грубых» лизатов мононуклеарных клеток периферической крови.

1.2. Метод детекции мутантного аллеля гена CCR-5.

1.3. Метод детекции мутантного аллеля гена CCR-2.

1.4. Метод детекции мутантного аллеля гена SDF1.

1.5. Метод детекции полиморфизма CCR5-59029A/G, располагающегося в промоторной области гена CCR5.

1.6. Электрофоретический анализ препаратов ДНК.

1.7. Серологический метод определения подтипов вируса иммунодефицита человека первого типа.

1.8. Использование метода сравнительной электрофоретической подвижности гетеродуплексов для определения подтипа вируса.

1.9. Амплификация нуклеотидных последовательностей области р24 гена gag.

1.10. Определение и анализ нуклеотидной последовательности фрагментов ДНК.

1.11. Статистическая обработка данных.

1.12. Сбор эпидемиологических данных.

1.13. Формирование группы «контактных» наркоманов.

Глава 2. Изучение вспышки ВИЧ-инфекции в гЛысьва

Пермской области.

2.1. Необходимая информация о г. Лысьва.

2.2. Эпидемиологическая характеристика вспышки ВИЧ-инфекции в г. Лысьва, среди лиц практикующих внутривенное введение психоактивных препаратов.

2.3. Особенности употребления психоактивных препаратов в г.Лысьва.

2.4. Обнаружение и характеристика группы «контактных» наркоманов -наркоманов, неоднократно подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1 парентеральным путем, но оставшихся серонегативными.

2.5. Формирование двух контрольных групп: группы

ВИЧ-инфицированных и группы здоровых доноров.

Глава 3. Характеристика вируса, вызвавшего эпидемию в гЛысьва.

3.1. Анализ сывороток, полученных от ВИЧ-инфицированных наркоманов г.Лысьва, методом иммуноферментного анализа.

3.2. Генотипирование образцов ДНК, полученных от ВИЧ-инфицированных наркоманов г.Лысьва, методом сравнительной оценки электрофоретической подвижности гетеродуплексов для генов env и gag.

3.3. Анализ первичной структуры областей гена gag, кодирующих участок белка р24, вариантов ВИЧ-1, выделенных в г.Лысьва.

Глава 4. Изучение распространения мутантных аллелей генов

CCR2, CCR5 и SDF1 среди группы здоровых доноров.

Глава 5. Изучение распространения мутантных аллелей генов

CCR2, CCR5 и SDF1 среди ВИЧ-инфицированных наркоманов и группы «контактных».

5.1. Изучение распространения мутантных аллелей генов CCR2,

CCR5 и SDF1 среди ВИЧ-инфицированных наркоманов.

5.2. Изучение распространения мутантных аллелей генов CCR2,

CCR5 и SDF1 в группе «контактных».

5.2.1. Выделение двух подгрупп в группе «контактных» наркоманов.

5.2.2. Изучение распространения мутантных аллелей генов CCR2, CCR5 и SDF1 среди группы «контактных» наркоманов и двух выделенных подгрупп.

5.3. Сравнение распределений мутантных аллелей генов CCR2, CCR5 и SDF1 в группах ВИЧ-инфицированных, здоровых доноров и «контактных» наркоманов.

ОБСУЖДЕНИЕ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Влияние мутантных аллелей генов CCR5, CCR2 и SDF1 человека на ВИЧ-инфекцию»

Актуальность проблемы. Вирус иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1) активно изучается исследователями разных стран с момента его открытия в 1983 г. Однако, несмотря на это, на сегодняшний день эффективные способы борьбы с этим опасным заболеванием отсутствуют. В то же время, начиная с 1996 г., в литературе стали появляться данные о генетической устойчивости некоторых индивидов к заражению ВИЧ-1. Было показано, что мутации в генах хемокиновых рецепторов, используемых вирусом как корецепторы при проникновении в клетку, влияют на вероятность заражения. Первой обнаруженной мутацией была делеция в гене CCR5 (CCR5A32). Было установлено, что люди, гомозиготные по этому делеционному аллелю, обладают повышенной устойчивостью к заражению ВИЧ-1 (Dean et al. 1996; Liu et al., 1996; Samson et. al., 1996). Позднее появились сообщения о других мутациях, потенциально способных влиять не только на вероятность заражения, но и на течение заболевания (McDermott et al., 1998; Magierowska et al., 1999; Winkler et al., 1998). Однако необходимо отметить, что данные о возможной роли большинства мутаций (за исключением делеции CCR5A32) зачастую противоречивы. Более того, связь между сочетаниями мутантных аллелей в разных генах, отвечающих за функционирование иммунной системы человека, и возможностью инфицирования ВИЧ-1 практически не исследована.

Основным подходом к изучению влияния мутаций или аллельных полиморфизмов на возможность заражения ВИЧ-1 служит анализ генотипов предварительно отобранных и тщательно охарактеризованных групп лиц, подвергавшихся опасности заражения, но оставшихся не зараженными. В настоящий момент существуют такие группы неинфицированных людей, вступавших в половые контакты с ВИЧ-инфицированными без использования презервативов (Aarons et al. 1997, Dean et al., 1996; Winkler et al., 1998), а также реципиентов крови или ее продуктов, контаминированных вирусом (Dean et al. 1996; Salkowitz et al., 2001; Wilkinson et al. 1998). Необходимо отметить, что во всех перечисленных выше работах исследовалось влияние мутаций в геноме человека на возможность заражения ВИЧ-1 подтипа В. В связи с этим, представляло интерес выяснить возможную роль мутаций в генах хемокиновой системы CCR5, CCR2 и SDF1 при парентеральном пути передачи вируса в среде лиц, практикующих внутривенное применение психоактивных препаратов. При этом изучаемая группа подвергалась риску заражения вирусом подтипа А, что особенно важно в условиях распространяющейся в Российской Федерации эпидемии ВИЧ-1 среди наркоманов, вызванной именно этим вариантом ВИЧ-1 (Бобков и др., 1998).

Цель и задачи исследования. Основной целью настоящей работы явилось изучение влияния мутаций генов CCR5, CCR2 и SDF1 и их сочетаний на возможность заражения ВИЧ-1 лиц, практикующих внутривенное введение психоактивных веществ.

В связи с этим в задачи исследования входило:

1. Выявление группы лиц с общим источником заражения, основным фактором риска заражения которых явилось внутривенное употребление психоактивных препаратов.

2. Генетическая характеристика вируса, вызвавшего эпидемию.

3. Наблюдение за ходом эпидемии, выделение группы наркоманов, неоднократно подвергавшихся риску заражения вирусом, но остававшихся не заразившимися («контактной» группы), и мониторинг этой группы на протяжении трех лет.

4. Изучение частот встречаемости аллельных состояний и сочетаний мутантных аллелей CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и полиморфизма CCR5-59029A/G в группе здоровых доноров.

5. Изучение частот встречаемости, аллельных состояний и сочетаний мутантных аллелей CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и полиморфизма CCR5-59029A/G среди «контактных» лиц и ВИЧ-инфицированных наркоманов.

6. Сравнение значений частот встречаемости, аллельных состояний и сочетаний мутантных аллелей CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и полиморфизма CCR5-59029A/G, полученных в группах ВИЧ-инфицированных и здоровых доноров, с аналогичными значениями, полученными для группы «контактных» наркоманов.

Научная новизна работы. В результате проведенной работы были определены частоты встречаемости аллелей CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и полиморфизма CCR5-59029A/G среди здоровых доноров жителей Российской Федерации. Была обнаружена и охарактеризована группа «контактных» наркоманов, неоднократно подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1 подтипа А парентеральным путем, но остававшихся не зараженными. Получены данные о влиянии мутаций CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и CCR5-59029A/G полиморфизма, а также их сочетаний на вероятность заражения при парентеральном пути передачи ВИЧ-1 подтипа А.

Практическая ценность.

1. Полученные частоты встречаемости мутаций CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и полиморфизма CCR5-59029A/G среди здоровых доноров могут быть использованы в качестве стандартных значений при дальнейшем изучении различных групп, подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1, а также для оценки генетической устойчивости популяции.

2. Обнаруженная и охарактеризованная группа наркоманов, неоднократно подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1, но оставшихся неинфицированными, может быть использована для дальнейшего изучения генетических факторов, влияющих на вероятность заражения ВИЧ-1.

3. Полученные данные о протективной роли гомозиготного состояния аллеля CCR5A32 и сочетаний мутантных аллелей CCR5A32 и CCR2-64I в гетерозиготном состоянии на фоне полиморфного варианта CCR5-59029A/CCR5-59029А при парентеральном пути передачи вируса на заражение ВИЧ-1 могут использоваться при оценке генетической устойчивости популяции при передаче ВИЧ-1 парентеральным путем.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Рябов, Григорий Сергеевич

выводы

1. Частота встречаемости аллелей CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и CCR5-59029G среди здоровых доноров составляет 0,100 (95% доверительный интервал ±0,031), 0,119 (±0,034), 0,204 (±0,044) и 0,400 (±0,051), соответственно.

2. Вспышка ВИЧ-инфекции в г.Лысьва среди лиц, практикующих внутривенное применение психоактивных препаратов, возникла из одного источника и была вызвана вариантом ВИЧ-1 подтипа А, характерным для этой группы риска в России.

3. Выявлена и охарактеризована для долговременного наблюдения группа лиц (п=75), подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1 парентеральным путем, но оставшихся не инфицированными.

4. Генотип CCR5A32/CCR5A32 сообщает высокий уровень устойчивости к заражению ВИЧ-1 подтипа А при парентеральном пути передачи.

5. Частота встречаемости сочетания мутаций CCR5A32 и CCR2-64I в гетерозиготном состоянии в группе «контактных» лиц была достоверно выше по сравнению с двумя контрольными группами здоровых доноров и ВИЧ-инфицированных наркоманов (р=0,049 и р=0,030, соответственно), что свидетельствует о протективном эффекте данного сочетания мутаций при заражении ВИЧ-1 подтипа А при парентеральном пути передачи.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Таким образом, в результате проведенных исследований была впервые обнаружена и охарактеризована группа «контактных» наркоманов, неоднократно подвергавшихся риску заражения вирусом, но остававшихся не заразившимися (п=75). От исследованных ранее групп, также состоящих из не заразившихся ВИЧ-1 людей, ее отличает ряд факторов.

В первую очередь это высокая степень гомогенности как по возрасту, так и по этнической принадлежности, что позволяет уменьшить как генетическую, так и социальную гетерогенность, препятствующую выявлению генетических признаков влияющих на заражение ВИЧ-1. Во-вторых, все члены группа «контактных» наркоманов, неоднократно подвергались риску заражения ВИЧ-1 парентеральным путем. В аналогичных работах исследовалась устойчивость к заражению ВИЧ-1 при риске заражения половым путем или при переливании контаминированной вирусом крови или ее компонентов. Также необходимо отметить, важность исследования устойчивости к ВИЧ-1 подтипу А, что особенно актуально, поскольку, не менее 93% всех случаев ВИЧ-инфекции в нашей стране вызваны именно этим подтипом. Более того, изучение представителей европеоидной расы, инфицированных штаммом ВИЧ-1, характерным для Африканского континента, представляет особый интерес, так как в последнее время отмечается резкий рост числа случаев ВИЧ-инфекции, вызванных вариантами ВИЧ-1 подтипов, отличных от В, в Европе и США. Можно предположить, что африканские варианты вскоре могут начать доминировать и в этих странах, в первую очередь, из-за массовой миграции населения в направлении Юг-Север. Все это делает изучение наследственных факторов, влияющих на инфицирование вариантами ВИЧ-1 подтипов, отличных от В, важным моментом исследования. Таким образом, обнаруженная и охарактеризованная группа наркоманов, неоднократно подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1, но оставшихся не инфицированными, является уникальной и может быть использована для дальнейшего изучения генетических факторов влияющих на вероятность заражения ВИЧ-1.

В работе были получены значения частот встречаемости мутаций CCR5A32, CCR2-64I, SDFl-3'А и полиморфизма CCR5-59029A/G среди здоровых доноров, которые могут быть использованы в качестве стандартных значений при дальнейшем изучении различных групп, подвергавшихся риску заражения ВИЧ-1, а также для оценки генетической устойчивости популяции. Значения частот встречаемости мутантных аллелей трех последних мутантных аллелей были определены впервые на территории Российской Федерации.

Полученные данные о протективной роли гомозиготного состояния аллеля CCR5A32 и сочетаний мутантных аллелей CCR5A32 и CCR2-64I в гетерозиготном состоянии на фоне полиморфного варианта CCR5-59029A/CCR5-59029A могут использоваться при оценке генетической устойчивости популяции при передаче ВИЧ-1 парентеральным путем. Это особенно важно в условиях эпидемии ВИЧ-1-инфекции на территории Российской Федерации, где основным фактором риска заражения в настоящее время является практика внутривенного применения психоактивных препаратов.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Рябов, Григорий Сергеевич, 2004 год

1. Асеев М.В., Шави А., Дин М., Баранов B.C. Популяционные особенности частот мутации гена хемокинового рецептора CKR-5, определяющего чувствительность к вирусу СПИДа // Генетика. -1997. -Т.ЗЗ. -С. 1724-1726.

2. Бобков А.Ф., Покровский ВВ., Селимова Л.М. и др. Генетическое разнообразие вирусов иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1) на территории России//ДАН. -1997. -Т.353. -С.822-824.

3. Бобков А.Ф., Покровский В.В., Селимова Л.М. и др. Генетическая характеристика вариантов вируса иммунодефицита человека первого типа, вызвавших эпидемию среди наркоманов в странах СНГ// Вопр. Вирусол. -1998. -Т.43. -С.253-256.

4. Бобков АФ., Казеннова Е.В., Селимова Л.М. и др. Субтипы ВИЧ-1 в России// Журн. микробиол. -1999. -№ 1. -С.43-45.

5. Бобков АФ., Зверев С.Я., Бобкова М.Р. и др. Эпидемиологическая и генетическая характеристика первых 40 случаев ВИЧ-инфекции на территории пермской области// Вопр. вирусол. -2000. -Т.47 -С. 18-21.

6. Бобков А.Ф., Казеннова Е.В., Бобкова М.Р. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика ВИЧ-1 на территории России// Вестник Российской Академии Медицинских наук. -2002. -Т.8. -С. 18-20.

7. Бобкова М.Р., Бобков А.Ф., Буравцова Е.В. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика основных очагов эпидемии ВИЧ-инфекции среди наркоманов в России// Вопр. Вирусол. -1999. -Т.44. -С.220-224.

8. Бобкова MP., Самохвалов ЕИ., Кравченко АВ. и др. Генетические варианты вируса гепатита С циркулирующие в среде ВИЧ-инфицированных наркоманов в России// Вопр. Вирусол. -2002. -Т.47. -С. 15-20.

9. Галеева А.Р., Хуснутдинова Е.К., Сломинский П.А., Лимборская С.А. Распространенность делеции 32 пн в гене рецептора хемокинов CCR5 в популяциях волго-уральского региона// Генетика. -1998. -Т.34. -С.1160-1162.

10. Гланц С. Медицинская статистика. М.: Практика, 1999.

11. Казеннова Е.В., Аароне Э., Селимова Л.М. и др. Сравнительный анализ распространения мутантного аллеля гена, кодирующего хемокинов ый рецептор CCR5, среди инфицированных и не инфицированных ВИЧ-1 лиц в России // Вопр. вирусол. -1998. -Т.43. -С.30-32.

12. Соломинский ПА., Шадрина МИ., Спицин ВА. и др. Простой и быстрый способ диагностики делеции в 32 нуклеотида в гене хемокинового рецептора CCR5// Генетика. -1997. -Т.ЗЗ. -С. 1596-1598.

13. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование.- М.: Мир, 1984.

14. Научная деятельность ВОЗ. Вирус иммунодефицита человека// Бюллетень ВОЗ 1986,- Т.64, № I.-C.8-9.

15. Покровский В.В., Янкина З.К. Эпидемиологическое расследование первого случая СПИД, выявленного у гражданина СССР// Журнал микробиологии,-1987.- №12.- С.8-11.

16. Покровский В.В., Ладная Н.Н., Буравцова Е.В. ВИЧ-инфекция// Информационный бюллетень. -1999.-№ 15.

17. Покровский В В., Ладная Н.Н., Буравцова Е.В. и др. ВИЧ-инфекция// Информационный бюллетень. -2002.-№ 25.

18. Смольская Т.Т//Журн.микробиол.-1997.-№ 1.-С.45-48.

19. Шадрина МИ., Копылов ВМ., Милосердова ОВ. и др. Анализ делеции 32 пн в гене рецептора хемокинов CCR5 у лиц, инфицированных ВИЧ-1, из г.Москвы // Генетика. -2000. -Т.36 -С.718-720.

20. Aarons Е., Fernandez М., Rees A. et al. CC-chemokine receptor 5 genotypes and in vitro susceptibility to ШУ-1 of a cohort of British ШУ-exposed uninfected homosexual men // AIDS. -1997. -V.l 1. -P.688-689.

21. Aiken C, Konner J, Landau NR, et al. Nef induces CD4 endocytosis: Requirement for a critical dileucine motif in the membrane-proximal CD4 cytoplasmic domain// Cell -1994. V.76. -P.853-864

22. Ali S., Palmer AC., Baneijee В., et al. Examination of the function of RANTES, МПМ alpha, and MlP-lbeta following interaction with heparin-like glycosaminoglycans// J Biol Chem. -2000. -V.275. -P.l 1721-11727.

23. Alkhatib G., Combadiere C., Broder CC., et al. CC CKR5: A RANTES, MlP-la, MIP-ip receptor as a fusion cofactor for macrophage-tropic ШУ-1// Science. — 1996. -V.272. -P. 1955-1958.

24. Aramori I., Ferguson SS., Bieniasz PD., et al. Molecular mechanism of desensitization of the chemokine receptor CCR-5: receptor signaling and internalization are dissociable from its role as an ШУ-1 co-receptor// EMBO J. -1997. -V.16. -P.4606-4616.

25. Arya S.K., Ginsberg C.C., Davis-Warren A., D'Costa J. In vitro phenotype of SDF1 gene mutant that delays the onset of human immunodeficiency virus disease in vivo// J. Hum. Virol. -1999. -V.2. -P. 133-138.

26. Asante-Appiah E., Skalsa M. Molecular mechanisms in retrovirus DNA integration// Antiviral Res. -1997 .-V.36. -P. 139-156.

27. Ashom P, McQuade TJ, Thaisrivongs S, et al. An inhibitor of the protease blocks maturation of human and simian immunodeficiency viruses and spread of infection// Proc Natl Acad Sci USA -1990. V.87. -P.7472-7476.

28. Balotta C., Bagnarelli P., Violin M. et al. Homozygous delta 32 deletion of the CCR-5 chemokine receptor gene in an HIV-1-infected patient// AIDS. -1997. -V.ll. -P.F67-71.

29. Barre-Sinussi F., Cherman J.C., Rey F. et al. Isolation of T-lymphotrofic retrovirus from patient at risk to AIDS// Science.-1983,- V.220.- P.868-871.

30. Bargatze RF., Butcher EC. Rapid G-protein related activation event involved in lymphocyte binding to high endothelial venules// J. Exp. Med. -1993. -V.178. -P. 367-372.

31. Benkirane M., Jin DY., Chun RF., et al. Mechanism of transdominant inhibition of CCR5-mediated HIV-l infection by ccr5delta32// J Biol Chem. -1997. -V.272. -P.30603-30606.

32. Berger EA., Murphy PM., Farber JM. Chemokine receptors as HIV-l coreceptors: role in viral entry, tropism and disease// Ann Rev Immunol. -1999. -V.17. -P.657-700.

33. Berson J., Doms RW. Structure-function of the HIV-l coreceptors// Semin.Immunol. -1998. V.10. -P.237-248.

34. Bleul CC., Wu L., Hoxie JA., et al. The HIV coreceptors CXCR4 and CCR5 are differentially expressed and regulated on human T lymphocytes// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1997. -V.94. -P. 1925-1930.

35. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Selimiva L., et al. An HIV type 1 epidemic among injecting drug users in the former Soviet Union caused by a homogeneous subtype A strain// AIDS Res.Hum.Retroviruses. -1997. -V.13. -P.1195-1201.

36. Bobkova M., Kazennova E., Selimova L., et al. Serological approaches to subtyping of HTV-1 in injecting drug users in Russia: evidence of subtype homogeneity at the main sites of the epidemic// Int J STD&AIDS. -2001. -V.12. -P.34-40.

37. Bowman EP. Developmental switches in chemokine response profiles during В cell differentiation and maturation// J. Exp. Med. -2000. -V.191. -P. 1303-1318.

38. Brambilla A, Villa C., Rizzardi G. et al. // J.Infect. Dis. -2000. -V.182. -P.311-315.

39. Brodine SK., Starkey MJ., Shaffer RA, et al. Diverse HIV-l subtypes and clinical, laboratory and behavioral factors in a recently infected US military cohort// AIDS. -2003. -V.17. -P.2521-2527.

40. Bryant M, Ratner L. Myristoylation-dependent replication and assembly of human immunodeficiency virus 1// Proc Natl Acad Sci USA -1990. V.87. -P.523-527

41. Bushman FD, Fujiwara T, Craigie R. Retroviral DNA integration directed by HIV integration protein in vitro// Science -1990. V.249. -P.1555-1558.

42. Campbel et al. Chemokines and the arrest of lymphocytes rolling under flow conditions// Science. -1998. -V.279. -P. 381-384.

43. Capon DJ, Ward RH. The CD4-gpl20 interaction and AIDS pathogenesis// Annu Rev Immunol-1991. V.9. -P.:649-678.

44. Carrington M., Kissner Т., Gerard В., et al. Novel alleles of chemokine receptor gene CCR5// Am. J. Hum. Genet. -1997. -V.61. -P. 1261-1267.

45. Cheingsong-Popov R., CallowD., Beddows S., et al. Serotyping HIV-l by antibody binding to the V3-loop: relationship to viral genotype// Ibid.- 1994,- Vol.- 10,-P. 1379-1386.

46. Chelli M., Alizon M. Determinants of the trans-dominant negative effect of truncated forms of the CCR5 chemokine receptor// J Biol Chem. -2001. -V.276. -P.46975-46982.

47. Choe H., Farzan M., Sun Y., et al. The beta chemokine receptors CCR3 and CCR5 facilitate infection by primary HIV-l isolates// Cell. -1996. -V.85. -P.621-628.

48. Clavel F., Guetard F., Brun-Vezinet S., et al. Isolation of a new human retrovirus from West African patients with AIDS// Science. -1986. -V.233. -P.343-346.

49. Cohen EA, Dehni G, Sodroski JG, et al. Human immunodeficiency virus vpr product is a virion-associated regulatory protein// J Virol -1990. V.64. -P.3097-3099.

50. Cudmore S., Reckman I., Way M. Viral manipulations of the actin cytoskeleton// Trends Microbiol. -1997. -V.5. -P. 142-148.

51. Darlix JL., Gabus C., Nugeyre M., et al. Cis elements and trans-acting factors involved in the RNA dimerization of the human immunodeficiency virus HIV-l//J.Mol.Biol.-1990.-V.216.-P.689-699.

52. Dean, M., Carrington, M., Winkler, C., et al. Genetic restriction of HIV infection and progression to AIDS by a deletion allele of the CKR5 structural gene// Science. -1996. -V.273. -P. 1856-1862.

53. Delwart E., Shpaer E.G., Louwagie J. Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay analysis of HIV-l env genes// Science. -1993. -V.262. -P. 1257-1261.

54. Delwart EL., Sheppard HW., Walker BD., et al. Human immunodeficiency virus type 1 evolution in vivo tracked by DNA heteroduplex mobility assays// J.Virol. -1994. -V.68. -P.6672- 6683.

55. Deng H., Liu R., Ellmier W., et al. Identification of a major co-receptor for primary isolates of HIV-l// Nature. -1996. -V.381. -P.661-666.

56. Deng HK., Unutmaz D., KewalRomani VN. & Littman DR. Expression cloning of new receptors used by simian and human immunodeficiency virus// Nature. -1997. -V.388. -P.296-300.

57. De Silva F., Venturini D., Wagner E., et al. CD4-independent infection of human В cells with HIV type 1: detection of unintegrated viral DNA// AIDS Res.Hum.Retroviruses. -2001. -V.17. -P.1585-1598.

58. Devreotes PN. & Zigmond SH. Chemotaxis in eukaryotic cells: a focus on leucocytes and dictyostelium// Ann. Rev. Biol. -1988. -V.4. -P.649-587.

59. Dieu MC., et al. Selective recruitment of immature and mature dendritic cells by distinct chemokine expressed in different anatomic sites// J. Exp. Med. -1998. -V.188.-P. 373-386.

60. Doranz, B.J., Rucker, J., Yi, Y., et al. A dual-tropic primary HTV-l isolate that uses fiisin and the (3-chemokine receptors CKR-5, CKR-3, and CKR-2b as fusion cofactors// Cell. -1996. -V.85. -P.1149-1158.

61. Dragic Т., Litwin V., Allaway G.P., et al. HIV-1 entry into CD4+cells is mediated by the chemokine receptor CC-CKR-5// Nature. -1996. -V.381. -P.667-673.

62. Dumonceaux J., Nosole S., Chanel L., et al. Spontaneous mutation in the env gene of the human immunodeficiency virus type 1 NDK isolate are associated with a CD4-independent entry phenotype// J.Virol. -1998. -V.72. -P.512-519.

63. Esser U., Speck RF., Deen КС., et al. Molecular function of the CD4 D1 domain in coreceptor-mediated entry by HIV type 1// AIDS Res Hum Retroviruses. -2000. -V.16. -P. 1845-1854.

64. Esteves A., Parreira R, Venenno Т., et al. Molecular epidemiology of HTV type 1 infection in Portugal: high prevalence of non-B subtypes// AIDS Res Hum Retroviruses. -2002. -V.18. -P.313-325.

65. Fauci, A. Host factors and the pathogenesis of HIV-induced disease// Nature. -1996. -V. 384. -P. 529-534.

66. Feng S, Holland EC. HIV-l tat trans-activation requires the loop sequence within tar// Nature -1988. V.334. -P. 165-167.

67. Feng Y., Broder C., Kennedy P., et al. HIV-l entry cofactor:Functional cDNA cloning of a seven-transmembrane G protein-coupled receptor// Science. -1996. -V.272. -P.872-877.

68. Fouchier R, Groenink N., Kootstra A., et al. Phenotype-associated sequence variation in the third variable domain of the human immunodeficiency virus type 1 gpl20 molecule// J.Virol.- 1992. -V.66. -P.3183-3187.

69. Franke EK, Yuan HE, Luban J. Specific incorporation of cyclophilin A into HIV-l virions// Nature -1994. V.372. -P.359-362.

70. Franke EK, Luban J. Inhibition of HIV-l replication by cyclosporine A or related compounds correlates with the ability to disrupt the Gag-cyclophilin A interaction// Virology -1996. V.222. -P.279-282.

71. Gabuzda DH., Lawrence K., LanghofF E., et al. Role of vif in replication of human immunodeficiency virus type 1 in CD4+ T lymphocytes// J Virol. -1992. -V.66. -P.6489-6495.

72. Gallo R.C. Frequent detection and isolation of cytopathic retroviruses (HTLV-Ш) from patient with AIDS and at risk for AIDS// Science. -1984. -V.224. -P.500-503.

73. Ganju RK., Dutt P., Wu L., et al. Beta-chemokine receptor CCR5 signals via the novel tyrosine kinase RAFTK// Blood. -1998. -V. 91. -P.791-797.

74. Gao F. Origin of HIV-l in the chimpanzee Pan troglodytes troglodytes!I Nature. -1999. -V.397. -P.436-441.

75. Gao F., Vidal N., Li Y., et al. Evidence of two distinct subsubtypes within the HIV-1 subtype A radiation// AIDS Res Hum Retroviruses. -2001. -V.17. -P.675-688.

76. Garred P. Chemokine-receptor polymorphisms: clarity or confusion for HIV-l prognosis?// Lancet. -1998. -V.351. -P.2-3.

77. Garcia-Albert L., Ortiz M., Garcia-Saiz A., et al. HIV type 1 non-B subtype prevalence in Spain, 1997-1998// AIDS Res Hum Retroviruses. -2001. -V.17. -P. 1317-1320.

78. Geijtenbeek ТВ., Kwon DS., Torensma R., et al. DC-SIGN, a dendritic cell-specific HIV-l-binding protein that enhances trans-infection of T cells// Cell. -2000. -100. -P.587-597.

79. Gerderblom Hans R. Assembly and morphology of HIV: potential effect of structure on viral function//AIDS.- 1991.- V.5.- P.617-638.

80. Gong W., Howard OM., Turpin JA., et al. Monocyte chemotactic protein-2 activates CCR5 and blocks CD4/CCR5-mediated HIV-l entry/replication// J Biol Chem. -1998. -V.273. -P. 4289-4292.

81. Gonzalez MA, Serrano F., Llorente M., et al. A hammerhead ribozyme targeted to the human chemokine receptor CCR5// Biochem Biophys Res Commun. -1998. — V.251. -P. 592-596.

82. Gonzalez E., Dhanda R., Bamshad M., et al. Global survey of genetic variation in CCR5, RANTES, and MDMA: impact of the epidemiology of the HTV-1 pandemic//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2001. -V.98. -P.5199-5204.

83. Guignard F, Combadiere C, Tiffany HL, Murphy PM. Gene organization and promoter function for CC chemokine receptor 5 (CCR5)// J Immunol. -1998. — V.160. -P.985-992.

84. Hamm Т., Rekosh D., Hammarskjold M. Selection and characterisation of Human immunodeficiency virus type 1 mutants tha are resistant to inhibition by the transdominant negative RevMlO protein// J.Virol. -1999. -V.73. -P.5741-5747.

85. Harrison GP, Lever AM. The human immunodeficiency virus type 1 packaging signal and major splice donor region have a conserved stable secondary structure// J Virol -1992. V.66. —P.4144-4153.

86. He J, Choe S, Walker R, et al. Human immunodeficiency virus type 1 viral protein R (Vpr) arrests cells in the G2 phase of the cell cycle by inhibiting p34cdc2 activity// J Virol -1995. V.69. -P.6705-6711.

87. He J., Chen Y., Farzan M., et al. CCR3 and CCR5 are coreceptors for HIV-l infection of microglia// Nature. -1997. -V.385. -P.645-649.

88. Heinzinger NK, Bukinsky MI, Haggerty SA, et al. The Vpr protein of human immunodeficiency virus type 1 influences nuclear localization of viral nucleic acids in nondividing host cells// Proc Natl Acad Sci USA -1994. V.91. -P.7311-7315.

89. Helga-Maria C., Hammarskjold M., Rekosh D. An intact TAR element and cytoplasmic localisation are necessary for efficient packing of human immunodeficiency virus type 1 genomic RNA// J.Virol.-1999,- V.73.- P.4127-4135.

90. Heyndrickx L., Janssens W., Zekeng L., et al. Simplified Strategy for detection of recombinant human immunodeficiency virus type 1 Group M isolates by gag/env heteroduplex mobility assay// J. Virol. -2000. -Vol.74. -P. 363-370.

91. Hofman В., Hasetline W.A. Molecular biology of the AIDS virus: ten years of discovery hope for the future// Science Challenging AIDS, Basel, Karger. -1992 -V.l. -P.71-106.

92. Hoglund S., Ohagen A., Goncalves J., et al. Ultrastructure of HIV-l genomic RNA// Virol.-1997.- V.233.-P.271-279.

93. Hope TJ, McDonald D, Huang XJ, et al. Mutational analysis of the human immunodeficiency virus type 1 Rev transactivator: Essential residues near the amino terminus// J Virol -1990. V.64. -P.5360-5366.

94. Huang L., Bosch I., HofmannW., et al. Tat protein induces human immunodeficiency virus type 1 (HIV-l) coreceptors and promotes infection with both macrophage-tropic and T-lymphotropic HTV-1 strain//J.Virol. -1998. -V.72. -P.8952-8960.

95. Ioannidis JP., Rosenberg PS., Goedert JJ., et al. Effects of CCR5A32, CCR2-641, and SDF1-3'A alleles on HIV-l disease progression: an international metaanalysis of individual-patient data// Ann. Intern. Med. -2001. -V.136. -P.782-795.

96. Jacks T, Power MD, Masiarz FR, et al. Characterization of ribosomal frameshifting in HIV-l Gag-Pol expression// Nature -1988. V.331. -P.280-283.

97. Janssens W., Buve A., Nkengasong JN. The puzzle of HIV-l subtypes in Africa//AIDS.-1997.- V.11.-P.705-711.

98. Jowett JB, Planelles V, Poon B, et al. The human immunodeficiency virus type 1 vpr gene arrests infected T cells in the G2 + M phase of the cell cycle// J Virol -1995. V.69. -P.6304-6313.

99. Kolchinsky P., Mirzabekov Т., Farzan M., et al. Adaptation of a CCR5-using, primary human immunodeficiency virus typel isolate for CD4-independent replication//J.Virol. -1999. -V.73. -P.8120-8126.

100. Kolchinsky P., Kiprilov E., Bartley P., et al. Loss of single N-linked glycan allows CD4-independent human immunodeficiency virus type 1 infection by altering the position of the gpl20 V1/V2 variable loops// J.Virol. -2001. -V.75. -P.343 5-3443.

101. Kondo E., Mammano F., Cohen E., et al. The p6Gas domain of human immunodeficiency virus type 1 is sufficient for the incorporation of Vpr into heterologous viral particles//J.Virol.-1995.-V.69.-P.2759-2764.

102. Kim SY, Byrn R, Groopman J, et al. Temporal aspects of DNA and RNA synthesis during human immunodeficiency virus infection: Evidence for differential gene expression// J Virol -1989. V.63. -P.3708-3713.

103. Kitayama J., Mackay CR., Ponath PD„ Springer ТА. The C-C chemokine receptor CCR3 participates in stimulation of eosinophil arrest on inflammatory endothelium in shear flow// J. Clin. Invest. -1998. -V.101. -P. 2017-2024.

104. Klimkait T, Strebel K, Hoggan MA, et al. The human immunodeficiency virus type 1-specific protein vpu is required for efficient virus maturation and release// J Virol -1990. V.64. -P.621-629.

105. Kraft K., Olbrich H., Majoul I., et al. Characterization of sequence determinants within the carboxyl-terminal domain of chemokine receptor CCR5 that regulate signaling and receptor internalization// J Biol Chem. -2001. -V. 276. — P. 34408-34418.

106. Krogstad P, Eshleman SH, Geng Y., et al. Mother-to-child transmission in the United States of subtypes D and A/G human immunodeficiency virus type 1// AIDS Res Hum Retroviruses. -2002. -V.18. -V.413-417.

107. Kwong P.D., Wyatt R, Robinson J., et al. Structure of an HIV gp 120 envelope glycoprotein I complex with the CD4 receptor and neutralizing human antibody//Nature. -1998. -V.393. -P.648-659.

108. Lapadat-Tapolsky M, De Rocquigny H, Van Gent D, et al. Interactions between HIV-l nucleocapsid protein and viral DNA may have important functions in the viral life cycle// Nucleic Acids Res -1993. V.21. -P.831-839.

109. Levy J., Hoffman S., Kramer J., et al. Isolation of lymphocytopathic retroviruses from San Francisco patients with AIDS// Science. -1984. -V.225. -P. 840-842.

110. Lewis P, Hensel M, Emerman M. Human immunodeficiency virus infection of cells arrested in the cell cycle// EMBO J -1992. V.l 1. -P.3053-3058

111. Liao Z., Cimakasky LM., Hampton R, et al. Lipid rafts and HIV pathogenesis: host membrane cholesterol is required for infection by HTV type 1// AIDS Res Hum Retroviruses. -2001. -V.17. -P. 1009-1019.

112. Libert F., Cochaux P., Beckman GE., et al. The deltaccr5 mutation conferring protection against HTV-1 in Caucasian populations has a single and recent origin in Northeastern Europe // Hum. Mol. Genet. -1998. -V.7. -P.399-406.

113. Liu H., Chao D., Nakayama E.E. et al. Polymorphism in RANTES chemokine promoter affects HIV-l disease progression // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1999. -V.96. -P.4581-4585.

114. Liu, R, Paxton, W.A., Choe, S., et al. Homozygous defect in HIV-l coreceptor accounts for resistance of some multiply-exposed individuals to HIV-l infection// Cell. -1996. -V.86. -P.367-377.

115. Lu M., Blackow S., Kim P. A trimeric structural domain of the HIV-l transmembrane glycoprotein//Nature Struct.Biol. -1995. -V.2. -P. 1075-1082.

116. Lu M., Ji H., Shen S. Subdomain folding and biological activity of the core structure from human ummunodeficiency virus type 1 gp41 amplications for viral membrane fusion//J.Virol. -1999. -V.73. -P.4433-4438.

117. Luria S, Chambers I, Berg P. Expression of the type 1 human immunodeficiency virus Nef protein in T cells prevents antigen receptor-mediated induction of interleukin 2 mRNA// Proc Natl Acad Sci USA -1991. V.88. -P.5326-5330.

118. Mackay CR. Chemokines: immunology's high impact factors// Nat. Immun. -2001. -V.2. -P.95-101.

119. Magierowska M, Theodorou I, Debre P,. et al. Combined genotypes of CCR5, CCR2, SDF1, and HLA genes can predict the long-term nonprogressor status in human immunodeficiency virus-1-infected individuals// Blood. -1999. — V.93. -P. 936-941.

120. Malim MH, Hauber J, Le SY, et al. The HIV-l rev trans-activator acts through a structured target sequence to activate nuclear export of unspliced viral mRNA//Nature -1989. V.338. -P.254-257.

121. Manes S, Mira E, Gomez-Mouton C,. et al. Membrane raft microdomains mediate front-rear polarity in migrating cells// EMBO J. -1999. -V.18. -P.6211-6220.

122. Mangano А., Корка J., Batalla M. et al. Protective effect of CCR2-64I and not of CCR5-delta32 and SDFl-3'А in pediatric HIV-l infection// J. Acquir. Immune Defic. Syndr. -2000. -V.23. -P.52-57.

123. Mas A, Espanol Т., Heredia A. et al. CCR5 genotype and HIV-l infection in perinatally-exposed infants // J. Infect. -1999. -V.38. -P.9-11.

124. Martin M.P., Dean M., Smith M.W. et al. Genetic acceleration of AIDS progression by a promoter variant of CCR5// Science. -1998. -V.282. -P. 19071911.

125. Martinson JJ., Chapman NH., Rees DC., et al. Global distribution of the CCR5 gene 32-basepair deletion//Nat. Genet. -1997. -V.16. -P. 100-103.

126. Mastro T.D., Kitayaporn D. HIV type 1 transmission probabilities: estimates from epidemiological studies// AIDS Res. Hum. Retroviruses. -1998. -V.14. -P.223-227.

127. Masur H., Michelis M.A., Greene J.B. et al. An outbreak of community-acquired Pneumocystis carinii pneumonia: initial manifestation of cellular immune dysfunction//N. Eng. J. Med. -1981. -V.305. -P. 1431-1438.

128. McDermott, D.H., Zimmerman, P. A., Guignard, F., et al. CCR5 promoter polymorphism and HIV-l disease progression// Lancet. -1998. -V.352. -P.866-870.

129. Mellado M., Rodriguez-Frade J.M., Vila-Coro A.J. et al. Chemokine control of HIV-l infection//Nature. -1999. -V.400. -P.723-724.

130. Milich 1., Margolin В., Swanstrom R. Patterns of amino acid variability in NSI-like and Si-like V3 sequences and a linked change in the CD4 binding domain of the HIV-l env protein// Virology. -1997. -V.239. -P.108-118.

131. Miller MD, Warmerdam MT, Gaston I, et al. The human immunodeficiency virus-1 nef gene product: A positive factor for viral infection and replication in primary lymphocytes and macrophages//J Exp Med -1994. V.179. -P.101-113.

132. Miller R, Sarver N. HIV accessory proteins as therapeutic targets// Nat.Med. -1997. -V.3. -P.389-394.

133. Muesing MA, Smith DH, Cabradilla CD, et al. Nucleic acid structure and expression of the human AIDS/lymphadenopathy retrovirus// Nature. -1985. -V. 313. -P.450-458.

134. Nath A., Conant K., Chen P., et al. Transient exposure to HIV-l Tat protein results in cytokine production in macrophages and astrocytes// J.Biol.Chem. -1999. -V.274.-P. 17098-17102.

135. Nieto M., Frade JM., Sancho D., et al. Polarization of chemokine receptors to the leading edge during lymphocyte chemotaxis// J Exp Med. -1997. -V.186. -P.153-158.

136. Nieto M., Navarro F., Perez-Villar JJ., et al. Roles of chemokines and receptor polarization in NK-target cell interactions// J Immunol. -1998. -V.161. — P.3330-3339.

137. O'Brien TR, Winkler C., Dean M., et al. HIV-l infection in a man homozygous for CCR5 delta 32// Lancet.-1997.-V.349.-P. 1219-1224.

138. Papa, A., Papadimitriou, E., Adwan, G., et al. HIV-l co-receptor CCR5 and CCR2 mutations among Greeks// FEMS Microbiol. Lett. -2000. -V.28. -P.87-89.

139. Parkin NT, Chamorro M, Varmus HE. Human immunodeficiency virus type 1 gag-pol frameshifting is dependent on mRNA secondary structure: Demonstration by expression in vivo// J Virol -1992. V.66. -P.5147-5151.

140. Pastinen, Т., Liitsola, K., Niini, P., et al. Contribution of the CCR5 and MBL genes to susceptibility to HIV type 1 infection in the Finnish population// AIDS Res. Hum. Retroviruses. -1998. -V.14. -P.695-698.

141. Paxton W., Connor RL, Landau NR. Incorporation of Vpr into human immunodeficiency virus type 1 virions: requirement for the рб region of gag and mutational analysis// J Virol. -1993. -V.67. -P.7229-7237.

142. Paxton WA, Martin SR., Tse D., et al. Relative resistance to HIV-l infection of CD4 lymphocytes from persons who remain uninfected despite multiple high-risk sexual exposures // Nat. Med. -1996. -V.2. -P.412-417.

143. Piot P., Bartos M., Ghys P., et al. The global impact of HIV/AIDS// Nature. -2001.-V.410. -P.968-973.

144. Poon D., Li G., Aldovini A Nucleocapsid and matrix protein contributions to selective human immunodeficiency virus type 1 genomic RNA packaging// J.ViroL -1998. -V.72. -P. 1983-1993.

145. Poulin L., Evans L., Tang S., et al. Several CD4 domains can play a role in human immunodeficiency virus infection of cells// J. Virol. -1991. -V.65. -P.4893-4901.

146. Poznansky M, Lever A, Bergeron L, et al. Gene transfer into human lymphocytes by a defective human immunodeficiency virus type 1 vector// J Virol -1991. V.65. -P.532-536.

147. Proost P., De Meester L, Schols D., et al. Ammo-terminal truncation of chemokines by CD26/dipeptidyl-peptidase IV. Conversion of RANTES into a potent inhibitor of monocyte chemotaxis and HTV-1-infection// J Biol Chem. -1998. -V.273. -P.7222-7227.

148. Raport CJ., Gosling J., Schweickart VL., et al. Molecular cloning and functional characterization of a novel human CC chemokine receptor (CCR5) for

149. RANTES, MlP-lbeta, and MIP-lalpha// J Biol Chem. -1996. -V.271. -P.17161-17166.

150. Rasola A., Gramaglia D., Baccaccio C., et al. Apoptosis enhancement by the HIV-l Nef protein//J.Immunol. -2001. -V.166. -P.81-88.

151. Robertson DL., Anderson JP., Bradac JA., et al. HIV-l nomenclature proposal// Science. -2000. -V.288. -P.55-56.

152. Rodriguez-Frade JM., Vila-Coro AJ., Martin A., et al. Similarities and differences in RANTES- and (AOP)-RANTES-triggered signals: implications for chemotaxis// J Cell Biol. -1999. -V.144. -P.755-765.

153. Romano-Spica, V., Ianni, A., Arzani, D., et al. Allelic distribution of CCR5 and CCR2 genes in an Italian population sample// AIDS Res. Hum. Retroviruses. -2000. —V.16. -P.99-101.

154. Roy S, Delling U, Chen CH, et al. A bulge structure in HIV-l TAR RNA is required for Tat binding and Tat-mediated trans-activation// Genes Dev -1990. V.4. -P. 1365.

155. Ruben S, Perkins A, Purcell R, et al. Structural and functional characterization of human immunodeficiency virus tat protein// J Virol -1989. V.63. -P. 1-8.

156. Ruffing N., Sullivan N., Sharmeen L., et al. CCR5 has an expanded ligand-binding repertoire and is the primary receptor used by MCP-2 on activated T cells// Cell Immunol. -1998. -V. 189. -P. 160-168.

157. Samson, M., Libert, F., Doranz, B.J., et al. Resistance to HIV-l infection in Caucasian individuals bearing mutant alleles of the CCR-5 chemokine receptor gene//Nature. -1996. -V.382. -P.722-725.

158. Salkowitz JR., Purvis SF., Meyerson H., et al. Characterization of high-risk HIV-l seronegative hemophiliacs// Clin. Immunol. -2001. -V.98. -P.200-201.

159. Sallusto F., et al. Rapid and coordinated switch in chemokine receptor expressing during dendritic cell maturation// Eur. J. Immunol. -1998. -V.28. -P. 2760-2769.

160. Sallusto F., Mackay CR. & Lanzavecchia A. The role of chemokine receptors in primary, effector, and memory immune response// Annu. Rev. Immunol. -2000. -V.18. -P.593-620.

161. Sato A, Igarashi H, Adachi A, et al. Identification and localization of vpr gene product of human immunodeficiency virus type 1// Virus Genes -1990. V.4. -P.303-312.

162. Sattentau QJ., Weiss RA. The CD4 antigen: physiological ligand and HIV receptor//Cell.-1988. -V.52. -P.631-633.

163. Scarlatti G., Tresoldi E., Bjorndal A, et al. In vivo evolution of HIV-l co-receptor usage and sensitivity to chemokine-mediated suppression// Nat Med. -1997.-V.3.-P. 1259-1265.

164. Schwartz S, Felber BK, Fenyo EM, et al. Env and Vpu proteins of human immunodeficiency virus type 1 are produced from multiple bicistronic mRNAs// J Virol -1990. V.64. -P.5448-5456.

165. Schwartz O., Marechal O., Danos O., et al. Human immunodeficiency virus type 1 Nef increases the efficiency of reverse transcriptation i the infected eel// J.Virol. -1995. -V.69. -P.4053-4059.

166. Signoret N., Rosenkilde MM., Klasse PJ., et al. Differential regulation of CXCR4 and CCR5 endocytosis// J Cell Sci. -1998. -V.lll. -P.2819-2830.

167. Simmons G., Wilkinson J., Reeves M., et al. Primary , syncytium-inducing human immunodeficiency virus type 1 isolates are dual-tropic and most can use either Lestr or CCR5 as coreceptors for virus entry// J.Virol. -1996. -V.70. -P.8355-8360.

168. Simon F., Mauclure P., Roques P., et al. Identification of a new human immunodeficiency virus type 1 distinct from group M and group O// Nature.-1998. -V.4. -P. 1032-1037.

169. Simon J., Sheeny A., Carpenter E., et al. Mutational analyses of the human immunodeficiency virus type 1 Vif protein// J.Virol -1999. -V.73. -P.2675-2681.

170. Skowronski J, Parks D, Mariani R. Altered T cell activation and development in transgenic mice expressing the HIV-l nef gene// EMBO J -1993. V.12. —P.703-713.

171. Smith MW., Dean M., Carrington M., et al. Contrasting genetic influense of CCR2 and CCR5 variants on HIV-l infection and disease progression // Science. -1997. -V.277. -P.959-965.

172. Staudinger R., Wang X., Bandres JC. Allosteric regulation of CCR5 by guanine nucleotides and HIV-l envelope// Biochem Biophys Res Commun. -2001. -V.286. -P. 41-47.

173. Starcich B.R., et al. Identification and characterization of conserved and variable regions of the envelope gene HTLV-m/LAV, the retrovirus of AIDS// Cell. -1986. -V.45. -P.637-648.

174. Strebel K, Daugherty D, Clouse K, et al. The HIV 'A' (sor) gene product is essential for virus infectivity// Nature -1987. V.328. -P.728-730.

175. Struyf F., Thoelen I., Charlier N., et al. Prevalence of CCR5 and CCR2 HTV-coreceptor gene polymorphisms in Belgium// Hum. Hered. -2000. -V.50. -P.304-307.

176. Tanaka Y., et al. T-cell adhesion induced by proteoglikan-immobilised cytokine MIP-IB//Nature. -1993. -V.361. -P.79-82.

177. Temin HM. Retrovirus variation and reverse transcription: abnormal strand transfers result in retrovirus genetic variation//Proc.Natl.Acad.Sci.USA. -1993. -V90. -P.6900-6903.

178. Thali M, Bukovsky A, Kondo E, et al. Functional association of cyclophilin A with HIV-l virions// Nature -1994. V.372. -P.363-365.

179. Thomson MM. & Najera R. Travel and the introduction of human immunodeficiency virus type 1 non-B subtype genetic forms into Western countries// Clin Infect Dis. -2001. -V.32. -P. 1732-1747.

180. Turville SG., Cameran PU., Handley A., et al. Diversity of receptors binding HIV on dendritic cell subsets// Nat Immunol. -2002. -V.10. -P.975-983.

181. Venkatesan S., Petrovic A., Locati M., et al. A membrane proximal basic domain and cysteine cluster in the C-terminal tail of CCR5 constitute a bi-partite motif critical for cell surface expression// J Biol Chem. -2001. -V.276. -P.40133-40145.

182. Wei P, Garber ME, Fang SM, Fischer WH, Jones К A. A novel CDK9-associated C-type cyclin interacts directly with HIV-l Tat and mediates its high-affinity, loop-specific binding to TAR RNA// Cell. -1998. V.92. -P.451-62.

183. Wen W, Meinkoth JL, Tsien RY, et al. Identification of a signal for rapid export of proteins from the nucleus// Cell -1995. V.82. -P.463-473.

184. Willey RL., Rutledge RA., Dias S., et al. Identification of conserved and divergent domains within the envelope gene of the acquired immunodeficiency syndrome retrovirus// Proc Natl Acad Sci U S A. -1986. -V.83. -P.5038-5042.

185. Willey R.L., Maldarelli F., Martin M.A., et al. Human immunodeficiency virus type 1 Vpu protein induces rapid degradation of CD4// J.Virol. -1992. -V.66. -P.7193-7200.

186. Winkler C., Modi W., Smith MW., et al. Genetic restriction of AIDS pathogenesis by an SDF-1 chemokine gene variant // Science. -1998. -V.279. -P.389-393.

187. Womack C., Roth W., Newman C., et al. Identification of non-B human immunodeficiency virus type 1 subtypes in rural Georgia// J Infect Dis. -2001. -V. 183.-P. 138-142.

188. Wong M. & Fish EN. RANTES and МПМ alpha activate stats in T cells// J Biol Chem. -1998. -V.273. -P.309-314.

189. Wong M., Uddin S., Majchrzak В., et al. Rantes activates Jak2 and Jak3 to regulate engagement of multiple signaling pathways in T cells// J Biol Chem. -2001. -V.276. -P. 11427-11431.

190. Wyatt R. & Sodorski J. The HIV-l envelope glycoproteins: fusogens, antigens, and immunogens// Sciense. -1998. -V.280. -P. 1884-1888.

191. Xiao X., Wu L., Stantchev TS., et al. Constitutive cell surface association between CD4 and CCR5// Proc Natl Acad Sci USA. -1999. -V.96. -P.7496-7501.

192. Yoshimura Т., et al. Purification of a human monocyte derived neutrophil chemotactic factor thet has peptide sequence similarity to other host defense cytokines// Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1987. -V.84. -P.9233-9237.

193. Yudin NS., Vinogradov SV., Potapova ТА., Distribution of CCR5-delta 32 gene deletion across the Russian part of Eurasia// Hum. Genet. -1998. -V.102. — P.695-698.

194. Zapp ML, Green MR. Sequence-specific RNA binding by the HIV-l Rev protein//Nature -1989. V.342. -P.714-716.

195. Zapp ML, Hope TJ, Parslow TG, et al. Oligomerization and RNA binding domains of the type 1 human immunodeficiency virus Rev protein: A dual function for an arginine-rich binding motif// Proc Natl Acad Sci USA -1991. V.88. -P.7734-7738.

196. Zhou C, Rana TM. A bimolecular mechanism of HIV-l Tat protein interaction with RNA polymerase II transcription elongation complexes// J Mol Biol.- 2002,- V.320.-P.925-942.

197. Zou YR, Kottmann AH., Kuroda M., et al. Function of the chemokine receptor CXCR4 in hematopoesis and in cerebellar development// Nature. -1998. -V.393. -P. 595-599.