Участие пептидил-пролил цис/транс измераз Arabidopsis Thaliana во взаимодействии растения-хозяина с патогеном тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Мокрякова, Мария Владимировна

• Мокрякова, Мария Владимировна
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Мокрякова, Мария Владимировна

ВВЕДЕНИЕ

РАЗДЕЛ 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Иммунная система растений

1.1.1 Основной иммунитет растений

1.1.2 Индуцируемый иммунитет

1.2. Пептидил-пролил цис/транс изомеразы (РР1азе) и их участие в патогенезе

1.2.1 Характеристика пептидил-пролил цис/транс изомераз

1.2.2 Функции пептидил-пролил цис/транс изомераз в патогенезе

1.3. Система секреции третьего типа и секретируемые ею белки-эффекторы

1.3.1 Система секреции третьего типа (ТЗСС)

1.3.2. Эффекторы третьей транспортной системы

РАЗДЕЛ 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Объекты исследования

2.2. Анализ видо- и расопринадлежности исследованных штаммов ХаЫкотопаз

2.3. Биоинформационный анализ генов-эффекторов

2.4. Получение гомозиготных линий инсерционных мутантов

МаИапа

2.5. Агробактериальная трансформация А МаИапа

2.6. Процедуры молекулярного клонирования. Векторные конструкции

2.7. Бактериальная инфильтрация растений

2.8. Анализ растительного материала

2.9. Определение нуклеотидной последовательности гена ХорАА

2.10. Статистическая обработка данных

РАЗДЕЛ 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ

3.1. Определение пептидил-пролил цис/транс-изомераз, вовлеченных в иммунный ответ АгаЫ^рБгБ ШаНапа

3.2. Изучение генов-эффекторов в естественной популяции ХаШкотопаз

3.2.1 Изучение генетического разнообразия генов-эффекторов в популяции ХаЫкотопав

3.2.2 Горизонтальный перенос гена-эффектора ТЗСС хорАА в геном ХаЫ1потопа$ сатреяМз

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Приложения

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Участие пептидил-пролил цис/транс измераз Arabidopsis Thaliana во взаимодействии растения-хозяина с патогеном»

ВВЕДЕНИЕ

Бактериальные болезни растений наносят огромный экономический ущерб, поражая ценные породы плодовых, эфиромасличных, технических и овощных культур. По данным FAO (продовольственная и сельскохозяйственная организация ООН) ежегодные потери урожая от бактериальных заболеваний в сельском хозяйстве составляют примерно 30% от общих потерь урожая по всему миру, причем бактериозы могут поражать растения на огромных площадях.

Важную роль в предотвращении заражения растения патогенами играет врожденный иммунитет растения, который включает в себя три барьера. Первый из них - структурный: многие патогены не способны преодолеть внешние поверхности растения. Второй - основывается на трансмембранных рецепторах, расположенных на поверхности клеток, которые распознают консервативные патоген-ассоциированные молекулы и индуцируют основной иммунный ответ растения. Третий барьер базируется на внутриклеточных R-белках (от англ. resistance - устойчивость) и направлен против патогенов, способных преодолеть второй барьер. Такой иммунитет получил название индуцируемого. Фитопатогенные бактерии способны подавлять как основной, так и индуцированный иммунитет за счет секреции факторов вирулентности внутрь растительной клетки. Механизм такого подавления начал изучаться сравнительно недавно и до сих пор точно не определен. Однако одним из главных инструментов патогенеза грамотрицательных бактерий являются белки-эффекторы, секретируемые при помощи транспортной системы третьего типа (ТЗСС) в клетки растения-хозяина. Белки-эффекторы важны для патогенности Pseudomonas, Xanthomonas, Ralstonia и Erwinia - бактерий, колонизирующих апопласт растений и способных вызывать гибель растительной клетки. Проникновение в клетку хозяина через ТЗСС сопряжено с полным или частичным разворачиванием белковой молекулы, что предполагает ее взаимодействие с шаперонами хозяина для восстановления структурной

конформации и активации глобулы. В качестве таких шаперонов могут выступать пептидил-пролил цис/транс изомеразы (PPIase, иммунофилины) клетки растения, которые обеспечивают цис/транс изомеризацию полипептидной связи, предшествующей остатку пролина.

PPIase широко распространены среди различных групп организмов. Открытые первоначально у млекопитающих как мишени циклоспорина А, они в дальнейшем были идентифицированы у бактерий, грибов и высших растений. PPIase вовлечены в различные процессы, происходящие в клетке и направленные на модифицирование белковых молекул (синтез и фолдинг, посттрансляционные модификации белковых молекул, восстановление денатурированных белков при стрессовых воздействиях). Несмотря на то, что в ряде работ отмечают участие отдельных PPIase млекопитающих, бактерий и грибов в иммунных процессах, участие PPIase растений в защитных процессах остается слабо исследованным. Кроме того, ряд патогенов - вирусов и бактерий - используют PPIase хозяина для обеспечения конформационных изменений полипептидных молекул, секретируемых внутрь клетки хозяина. Основываясь на имеющихся данных, было предположено, что PPIase, если не играют ключевую роль, то, по крайней мере, являются одними из важных элементов защитных процессов растения. В качестве объекта исследования нами были выбраны PPIase растения Arabidopsis thaliana, поскольку это модельное растение с полностью известной последовательностью генома. В геноме А. thaliana представлено 55 генов PPIase, для большинства из которых выполняемые функции остаются неизвестными.

Цель работы - изучение роли пептидил-пролил цис/транс изомераз растения Arabidopsis thaliana при взаимодействии с бактериями (Xanthomonas и Pseudomonas), в патогенезе которых участвуют белки-эффекторы, секретируемые транспортной системой третьего типа.

Для достижения поставленной цели необходимо решить следующие задачи:

1. Отобрать пептидил-пролил цис/транс изомеразы, вовлеченные в защитный ответ А. МаПапа при биотических стрессовых воздействиях, и оценить их роль в иммунном ответе на развития фитопатогенной бактериальной инфекции (ХаШкотопаБ и Рзеис1отопаБ)\

2. Проанализировать изменение уровня экспрессии отобранных генов пептидил-пролил цис/транс изомераз и установить активацию промоторных областей в норме и при заражении, а так же локализацию их белковых продуктов в клетке растения;

3. Определить механизм влияния изучаемых пептидил-пролил цис/транс изомераз на изменение устойчивости растений А. МаНапа к инвазии патогена;

4. Выявить закономерности между составом генов, кодирующих белки-эффекторы, и физиологическими признаками бактериальных штаммов (расой, патовариантом и реакцией на них растений с известными генами резистентности) в естественной популяции бактерий рода ХапЖотопаз. Научная новизна работы.

Впервые были получены экспериментальные данные, указывающие на непосредственное вовлечение в ответ на инвазию патогена иммунофилинов А. МаИапа At2gl6600, At4g33060 и At5g48570. В работе показано изменение их экспрессии при стрессовых воздействиях, активация данных иммунофилинов в защитном ответе и продемонстрирована клеточная локализация белковых продуктов трех исследованных РР1азе. Кроме того, изучено влияние данных РР1аБе на изменение устойчивости растения к бактериальной инвазии. Впервые показано, что снижение чувствительности к фитопатогенам трансгенных растений с повышенной экспрессией исследованных РР1аБе связано с активацией в их тканях таких метаболических процессов, как накопление активных форм кислорода и каллозы, а также с активацией каскадов салициловой кислоты.

Впервые определена корреляция между составом генов-эффекторов фитопатогенных бактерий рода Xanthomonas и возможной симптоматикой, расоспецифичностью бактерий, что не проводилось ранее. Был показан высокий уровень генетической изменчивости состава генов-эффекторов в пределах одного вида и его патовариантов, а также выявлена связь ряда генов-эффекторов с основными расами X. campes tris. У ряда штаммов были обнаружены гены-эффекторы несвойственные типовым штаммам этого вида. Для двух штаммов X. campestris pv. campestris (В-94 и Eruka-1) показано, что один из таких гомологичных генов (ХорАА), присутствуя в геноме, полностью сохраняет свою последовательность, промоторную область и сигнальные домены, необходимые для секреции с помощью ТЗСС.

Апробация результатов работы. Результаты работы были представлены:

на International Conference for young scientists, PhD students and students on

th

molecular biology and genetics, dedicated to 120 anniversary of N.I. Vavilov (Киев, Украина, 2007); The 22nd Nordic PhD Course in Plant Pathology (Hyytiälä, Финляндия, 2008); 8th Internetional Conference on Pseudomonas syringae and related pathogens (Оксфорд, Великобритания, 2010); 2-ой Международной школе-конференции молодых ученых "Генетика и селекция растений, основанная на современных генетических знаниях и технологиях" (Москва, Звенигород, Россия, 2011); XV International Congress IS-MPMI (Киото, Япония, 2012); на заседание профильного объединенного научного семинара по генетике растений Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН и на семинарах лаборатории функциональной геномики Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН.

РАЗДЕЛ 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Иммунная система растений

Механизмы заражения растений в значительной степени отличаются у разных групп фитопатогенов. Фитопатогенные бактерии заселяют межклеточное пространство (апопласт) после проникновения через воздушные или водные поры (устьица и гидатоды) или через раневую поверхность; нематоды и тли вводят стилет непосредственно в клетку растения; грибы могут напрямую проникать под эпидермальные клетки растения или внедрять гифы между или напрямую в клетки растения. Для развития инфекции патоген должен преодолеть три барьера растительной клетки. Первый из них - структурный. Многие патогены не способны преодолеть внешние поверхности растения, поэтому развитие таких инфекций связано с проникновением через естественные отверстия или раневую поверхность. Второй - обусловлен способностью растений узнавать определенные молекулы, присутствующие на поверхности патогена (PAMPs - pathogen associated molecular patterns, MAMPs - microbe associated molecular patterns), такие как: липополисахаряды^-флагеллинт-белки холодового шока и т.д. В ответ на узнавание этих молекул специфичными рецепторами клетки (PRR - pattern recognition receptor) происходит запуск каскада реакций защитного ответа, так называемый основной иммунитет. Проявление основного иммунитета практически всегда выражается в накоплении антимикробных соединений, повышении экспрессии генов фенилпропаноидного пути и других генов, участвующих в ответе, а также в уплотнении стенок клетки за счет увеличения синтеза каллозы (Gomez-Gomez et al., 1999). Но в процессе эволюции патогены смогли преодолеть основной иммунитет растения за счет секреции внутрь растительной клетки факторов вирулентности (Avr белков или белков-эффекторов) (Chisholm et al., 2006), взаимодействие которых с генами резистентности (R гены), их продуктами и белками сигнальных каскадов обеспечивает вирулентность (таблица 1). Однако система защиты растения также

не остановилась в своем развитии. Молекулярное распознавание Avr-белков защищает окружающие ткани растения от проникновения инфекции. Такой, более специализированный, защитный ответ получил название индуцированного иммунитета (effector-triggered immunity) (Alfano and Collmer, 2004). Его проявление всегда более локально и представляет собой быстрое запрограммированное отмирание зараженных клеток (реакция гиперчувствительности), ограничивающее распространение возбудителей и приводящее к их последующей гибели.

Таблица 1. Некоторые из известных Avr/R-nap при взаимодействии хозяин-патоген (Chisholm et al., 2006)

Растение R-ген Патоген Avr-ген

Solanum Pto Pseudomonas syringae pv. tomato AvrPto

lycopersicum Cf-2 Clodosporium fulvum Avr2

Cf-4 C. fulvum Avr4

Cf-5 C. fulvum Avr5

Cf-9 C. fulvum Avr9

Arabidopsis RPW8 Erysiphe spp. AvrRPW8

thaliana RPM1 P.syringae pv.maculicola AvrRpml, avrB

RPP8 Peronosporaparasitica_ -AvrRpp8--

-RFS2 P. syringae pv. tomato AvrRpt2

RPS4 P. syringae pv. pisi AvrRps4

RPS5 P. syringae pv. tomato AvrPphB

RPP5 P. parasitica AvrRPP5

Solanum Rx Potato virus X Viral coat protein

tuberosum

Hordeum Mla6 Blumeria graminis Avr-Ml6

vulgare

Oryza sativa Pi-ta Magnaporte grisea AvrPita

Xa21 Xanthomonas oryzae pv. oryzae AvrXa21

Linum L6 Melampsora lini AvrL6

usitatissimum M M. lini AvrM

Nicotiana N Tobacco mosaic virus Replicase

tabacum

Впервые целостную концепцию взаимодействий между хозяином и патогеном предложил Flor H.H. (Flor, 1971). Она получила название взаимодействие по типу «ген-на-ген». Суть ее заключается в том, что ген устойчивости растения взаимодействует прямо или косвенно с геном авирулентности патогена (авирулентность - неспособность отдельных штаммов патогенных видов микроорганизмов вызывать заболевание). В дальнейшем эта модель претерпела ряд изменений и уточнений, но основные ее принципы остались неизменны.

1.1.1 Основной иммунитет растений

Первой защитной линией на пути патогенов, способных преодолеть структурные барьеры хозяина, является основной иммунитет. Его задача -распознать консервативные молекулы, ассоциированные с широким кругом патогенов. Впервые термин РАМР (молекулы, ассоциированные с патогеном) был предложен в исследованиях, посвященных изучению иммунного ответа млекопитающих в ответ на воздействие патогена. В дальнейшем было установлено, что непатогенные микроорганизмы тоже сласобны—вызывать иммунную реакцию, и термин был преобразован в МАМР (молекулы, ассоциированные с микроорганизмами). МАМР - это, в первую очередь молекулы, расположенные на поверхности бактериальной клетки. Они обладают высокой степенью постоянства в своей структуре и функционально необходимы для жизни широкого круга патогенов, кроме того, они обычно несвойственны клеткам растения (Nürnberger et al., 2004). Наиболее известные примеры МАМР - бактериальные липополисахариды (LPS) и гликолипидный компонент внешней мембраны грамотрицательных бактерий, а также флагеллин, как основной структурный компонент бактериального жгутика; хитин и эргостерол, основные компоненты клеточной стенки и мембраны грибов (Zipfel and Felix, 2005).

LPS представляет собой длинную полисахаридную цепь, значительно варьирующуюся на своем протяжении по составу, длине и ответвлениям своих

карбогидратных субъединиц (Рисунок 1, А). Такая вариабельная часть LPS получила название О-антигена, и она зачастую служит для определения внутри-и межвидовых различий бактериальных штаммов. В отличие от поверхностной части, коровое олигосахаридное ядро LPS и липид А отличаются высокой консервативностью у различных микроорганизмов. Именно эта часть является основной мишенью поверхностных рецепторов у клеток животных (Miyake et al., 2000). В ряде работ отмечается, что растения также способны узнавать консервативную часть LPS (Desaki et al., 2006; Erbs et al., 2010).

A LPS Б Мономер флагеллина

Рисунок 1. Схематическая структура липополисахарида и флагеллина (Zipfel and Felix, 2005)

Флагеллин - это белковая субъединица, которая является основным компонентом жгутика (флагеллы) бактериальной клетки. Терминальные области этого полипептида образуют внутреннее ядро флагеллы, а центральный участок, отличающийся высокой вариабельностью, расположен на поверхности, причем в качестве МАМР выступает консервативный фрагмент, расположенный внутри жгутика. Необходимо отметить, что рецепторы млекопитающих узнают домен D1 в коровой части флагеллина (Smith et al., 2003), в то время как большинство видов растений распознают участок 22 а.о., представляющий собой выступ («шип») полипептидной цепи (рисунок 1, Б) (Felix et al., 1999).

Хитин - основной общий компонент клеточной стенки и мембраны грибов, распознаваемый защитной системой хозяина при поражении. Во время инвазии

систем} растения рецептор FLS2

Антиген, распознаваемый имымшой системой

патогена клетки растения секретируют хитиназы, разрушающие хитин на фрагменты (N-ацетилолигосахариды и олигомеры хитина), которые распознаются клеточными рецепторами основного иммунитета. Стоит отметить, что разные виды растений воспринимают различные олигомеры хитина. Так, например, растения пшеницы и риса узнают в основном гепта- и октамеры, в то время как растения томата реагируют в основном на тетрамеры (Wan et al., 2008).

МАМР сильно консервативны и распознаются PRR рецепторами животных, насекомых и растений, имеющими общие характеристики. На рисунке 2 показаны основные рецепторы, распознающие МАМР у различных групп организмов.

Дрозофила Млекопитающие Растения

Рисунок 2. Сравнительная схема рецепторов МАМР у дрозофилы, млекопитающих и растений (Nürnberger et al., 2004)

У животных и насекомых за распознавание МАМР отвечает семейство консервативных То11-подобных рецепторов (TLR - Toll-like receptor). Узнавание определенного консервативного домена осуществляется внеклеточными повторами, богатыми лейцином (LRR - leucine-rich repeat), а передача сигнала осуществляется через цитоплазматический TIR домен (Toll и IL-1 рецепторный домен). Так, например, иммунная система млекопитающих распознает грамотрицательные бактерии с помощью TLR4 (липополисахариды) и TLR5 (флагеллин) (McGuinness et al., 2003). Запуск TLR сигнального каскада приводит к активации транскрипционных факторов и последующей защитной реакции (Nürnberger et al., 2004).

У растений, в отличие от животных, отсутствуют специализированные клетки, отвечающие за распознавание проникновения патогена. Однако каждая растительная клетка способна узнавать МАМР и реагировать автономно. Успех такой защиты во многом определяется разнообразием PRR, представленных в каждой растительной клетке, а также их высокой чувствительностью к соответствующим молекулам патогена. Все известные PRR растений, локализованные в мембране, можно разделить на два типа. Первые включают в себя три основных домена - внеклеточный (или узнающий), трансмембранный и внутриклеточный киназный (или сигнальный) домены. Вторые же имеют схожее строение, но внутриклеточная часть у них представлена коротким доменом, не обладающим очевидными сигнальными функциями. У PRR растений отмечают как структурное, так и функциональное сходство с TOLL и TLR рецепторами.

В 1999 году было показано, что в клетках растений, как и животных, возникает иммунный ответ при воздействии бактериальным флагеллином, а именно его 22 аминокислотным фрагментом (flg22) из N-концевой части пептида, причем за распознавание этого пептида отвечает рецептор FLS2 (Gomez-Gomez et al., 1999). На рисунке 3 приведено строение основного рецептора, отвечающего в клетке растения за распознавание бактерий - FLS2 (чувствительный к флагеллину, FL AGELLIN-SENSING 2).FLS2 обладает киназной активностью и несет повторяющиеся лейцин-богатые мотивы (LRR-RK). Ортологи FLS2 обладают высоким консерватизмом, что отражает высокую значимость сохранения такого строения (рисунок 3). Более того, рецепторы, чувствительные к flg22, присутствуют у всех высших растений (Boller and Felix, 2009).

Количество лейцин-богатых повторов у всех ортлогов составляет 28, за исключением растений риса, лишенных второго повтора. Эти повторы окружены доменами, несущими двуцистеиновый мотив, что типично для внеклеточных LRR белков, причем N-концевой домен обладает большим консерватизмом и, предположительно, имеет сигнал гликозилирования. Известно, что подобные

LRR домены образуют подковообразную структуру, в основе которой лежат а-спирали и ß-повороты с последовательностями LxxLxLxxN на внутренней стороне, в которых остатки х участвуют в распознавании лиганда. С-концевая область FLS2 известна как Сер/Тре-киназа, несущая каталитическую петлю, причем высокая консервативность этого домена указывает на значимость этого региона для выполняемых функций (Boller and Felix, 2009).

¿nqhtge: PÍA*»-NL?FI.;I -;FNH-PTGE:

■ LARNNP!

* JJT^tshs ptck: ЛГ'ивГ.Я'-Т.ЯЗТТаП :•: Lavu>-TSKSFT;;Ki I: LVLSLSSKSPTSH: j; ovh:TS?. —;k:

I" qv D:,t*it*FA; :: ■ ".-Qí-ilíLtSKPF^;:

PBSUiliTlBU.KLA-51»

прршфа ■•ж**1К PYSF«tisatKl|L|rm PS£Y«il|TUt. LKJnlC PD£LMLfTIX-iL»LT?№

PPAlAfÄi*

ß"Поворот о-спираль

PTTI

LVULT=»RITCEI l'abLAFURLTSiaPa HlVNISLAiTOlITOEIPa VLbLArTimTaiapH

:iatk;?nlfscpl?a

L fflASMG rWEFSGPLPJ

OLPKLTFI/JI.r.liltMSail OLHNtTRLS t/;PBK - KS5E : RLQSLM FL^ ЬЗ 3IS - LACT I P«itlQLeiLii?L.5LAb!IC!CLSODIP

LRR-15 23-25 AK

LRR-14

24 AK

LRR-16 25 AK

FLS2

TT II H M I II HU III 1 I ITTTT

28 LRR доменов

Двуцистеиновыл МОТИВ

LRR-1 23 AK

LRR-28 24 AK

ДвуцнстеиновыП мотив

Каталитическая петля

ÍLKGHV LCO£*KPbK?C7

JLÄ3HI LCOXX-FL»?0Н

'.Ч

¿LIGPV LCC7K FL C'r

1Ш601 Lea к - -:l y~-C-

-* ica.t iLA.PCr- LOOM* LLAPCr

)FSG?V

At Le

Pt Vv Rc O« 7M

FLKLCLFC7: r PEDRPZJC.'SXLTHLMXLF jKANSFREDRNED) LLHLALSCT . PFDRPriG . VLiSLHCLSKMD 7MPSHLVTO LFQIAFSC7Í. P¿DRP!3C IVLS L.KISAÄ

LbKLAL^CT ~P ¡DRPiaiNäVLSSLIJCLGAKIPPPLPSSS

LTKIALFCT!:PKP: DKP: * ZVLS ; Lr esrsgvl

VLA. VALSCAAEPADRPl* AVLS L JOC: KLVGED VLiLALiCAAUPADRP'JC VLSALlDf KV CGR!'

С термпнальныГ! домен

СерТре-киназа

ß-поворот

Рисунок 3. Схематическое строение FLS2. В центре представлено схематическое строение FLS2. В основе структуры LRR-домены, образующие a-спирали (остатки, расположенные на внешней поверхности, отмечены серым, а высоко консервативные из них зеленым) и ß-повороты (в последовательностях LxxLxLxxN, расположенных на внутренней стороне, остатки х отмечены голубым цветом). Приведены выравнивания ортологов FLS2: Vv, Vitis vinifera; Pt, Populus trichocarpa; Rc, Ricinus communis; Le, Lycopersicon esculentum; At, Arabidopsis thaliana; Os, Oryza sativa; Zm, Zea mays (Boller and Felix, 2009)

При активации основного иммунитета в клетках растений с участием разных рецепторов отмечают, что последовательность этапов развития защитных процессов консервативна (Boller and Felix, 2009). Для определения изменений,

происходящих в клетке растения после активации рецепторов, суспензию клеток растения или тонкий сегмент ткани обрабатывают химически чистыми МАМР. Такая обработка позволяет запустить защитную реакцию одновременно во всех клетках культуры и поэтапно отследить ее развитие во времени.

Этапы запуска основного иммунитета:

Ранняя передача сигнала (1-5 минут после добавления МАМР к культуре клеток). В первые минуты после инвазии патогена происходит изменение в обменных потоках ионов через мембрану клетки, в первую очередь, увеличение поступления ионов Н4" и Са2+ и отток К и анионов (Nürnberger et al., 2004). Еще один этап раннего реагирования - это развитие окислительного взрыва, который начинается уже через 2 минуты после инвазии, причем присутствие активного кислорода может выступать не только в качестве антимикробного агента, но и как компонент вторичного сигнального ответа, запускающего защитную реакцию в соседних клетках (Apel and Hirt, 2004). Уже через 10 минут начинают активироваться каскады MAP киназ, что сопровождается значительными изменениями в фосфорилировании белков клетки, приводящими к изменениям в их активности и способности к комплексообразованию. Кульминация раннего ответа связана с активированием через каскады MAP киназ факторов транскрипции WRKY типа, что приводит к изменению метаболизма клетки и первичным защитным процессам.

Ранний защитный ответ (5минут — 1 день). Уже через 10 минут после того, как рецепторы клетки определили присутствие патогена, происходит увеличение образования раннего стрессового гормона - этилена. Кроме того, уже в первые 30 минут после воздействия на клетки растения происходит активация более чем 1000 генов и подавление порядка 200 генов (Zipfel et al., 2004). Именно активность этих генов зачастую определяет успешность защиты клетки на раннем этапе. Немаловажным процессом, происходящим на ранних стадиях защитного ответа, считают эндоцитоз активированных рецепторов, что, по-

видимому, препятствует избыточной активации защитных механизмов (Robatzek et al., 2006).

Поздний защитный ответ (часы-дни). Поздний ответ начинается не ранее, чем через 16 часов после проникновения и сохраняется несколько дней. В первую очередь, это накопление вторичных метаболитов, например, каллозы. Кроме того, проникновение патогена тормозит ростовые и генеративные процессы (Boiler and Felix, 2009).

1.1.2 Индуцируемый иммунитет

Индуцируемый иммунитет направлен против патогенов, способных подавлять основной иммунитет за счет секреции белков-эффекторов внутрь клетки хозяина. Его основу составляют белки устойчивости (белки резистентности, R-белки). Еще в самом начале изучения R-белков была показана их высокая специфичность по отношению к определенным штаммам, а значит, и набору секретируемых белков патогена. R-гены в основном кодируют NB-LRR белки (Nucleotide Binding domain - Leucine Rich Repeat), включающие в свою структуру домен связывания с нуклеотидной последовательностью и повторы, богатые лейцинами, которых, например, у экотипа Col-0 A. thaliana около 125. Если происходит активация белков резистентности, то развивается быстрый и сильный иммунный ответ, зачастую выражающийся в отмирании части ткани в месте проникновения, что препятствует дальнейшему развитию патогена (реакция гиперчувствительности, HR - hypersensitivity reaction). Такая стратегия защиты эффективна против вирусов, бактерий, грибов и нематод, поражающих клетки растений.

В отличие от клеток животных, где известны последовательные стадии развития запрограммированной клеточной смерти (апоптоза), для растений до сих пор остаются неясными процессы, происходящие при реакции гиперчувствительности. Hatsugai N. с соавторами (Hatsugai et al., 2004) предположили возможный механизм развития реакции гиперчувствительности в

клетке растения (рисунок 4), основанный на слиянии мембраны центральной вакуоли с плазматической мембраной. В него вовлечены протеасомы растительной клетки, причем фермент, участвующий в преобразовании вакуоля VPE (vacuolar processing enzyme) и (3-субъединица 26S протеасомы (РВА1) выполняют функции, схожие с действием каспаз 1 и 2 при развитии апоптоза. В ходе такого процесса происходит поступление в апопласт антимикробных пептидов и гидролитических ферментов, что ускоряет гибель бактериальных клеток (Hatsugai et al., 2004).

Цитоплазма ^

Клеточная стемса Клеточная стенка

Развитие защитного ответа вакуоль —

Щ J-

■J

•aste

Бактериальная Слияние инвазия мембран

вак>'оля

ВМ - вакуолярная мембрана ПМ - плазматическая мембрана

Изливание содержимого

Гибель клетки

Рисунок 4. Модель реакции гиперчувствительности, происходящей в клетке растения в ответ на бактериальное заражение, основанной на слиянии мембраны центральной вакуоли с плазматической мембраной за счет активности протеасом. При этом происходит изливание в апопласт антимикробных пептидов и гидролитических ферментов, что ускоряет гибель бактериальных клеток (Hatsugai et al., 2004)

В ряде работ показано негативное влияние на развитие реакции гиперчувствительности и других белков, в основном ферментов, выполняющих различные функции, таких как: метакаспазы (Coll et al., 2010), рецептор-подобные киназы (Li et al., 2012), протеазы (Shindo et al., 2012), ABC транспортеры (Kobae et al., 2006) и т.п. Тем не менее, до сих пор остается полностью нерешенным вопрос, действительно ли клеточная смерть происходит

в результате защитной реакции или это только видимый результат стремительного подавления клетки растения патогеном, приводящего к ее гибели.

О процессах, происходящих при запуске индуцируемого иммунитета непосредственно после активации NB-LRR белка, известно немного. Лишь за небольшим исключением, активация большинства R-белков происходит не за счет непосредственного взаимодействия с белком-эффектором, а в результате изменений, происходящих в клетке (Spoel and Dong, 2012). Одна из наиболее изученных мишеней белков-эффекторов, которую распознают R-белки, - RIN4 (RPM1 interacting protein 4). Известно, что на данный белок оказывают воздействие как минимум 3 белка-эффектора из P. syringae, вызывающие его деградацию (AvrRpt2) или фосфорилирование (AvrRpml, AvrB). Кроме того, присутствие фосфорилированного RIN4 или его полное отсутствие сопровождается возникновением иммунной реакции даже в отсутствие белков-эффекторов патогена (Mackey et al., 2003; Chung et al., 2011). Однако до сих пор остается невыясненным вопрос, почему RIN4 является такой распространенной мишенью. Одно из последних предположений основано на его ассоциации с мембранными Н+-АТФазами, участвующими в регуляции работы устьиц, через которые проникают патогены внутрь растения (Liu et al., 2009). Предполагается, что такая стратегия защиты позволяет иммунной системе растения реагировать не на отдельные штаммы/виды патогенов, а на группы, включающие неродственные организмы, но обладающие схожей стратегией проникновения и заражения за счет воздействия функционально близких белков-эффекторов на ключевые компоненты клетки растения.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Мокрякова, Мария Владимировна, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Ahmad, S. Genetic dissection of basal defence responsiveness in accessions of Arabidopsis thaliana [Текст] / Ahmad, S., Van Hulten M., Martin J., Pieterse С. M., et al. // Plant Cell Environ. - 2011. - 34. - 7. - 1191-1206.

2. Ahn, J. C. Classification of rice (Oryza sativa L. Japonica nipponbare) immunophilins (FKBPs, CYPs) and expression patterns under water stress [Текст] / Ahn, J. C., Kim D. W., You Y. N., Seok M. S., et al. // BMC Plant Biol. - 2010. - 10. - - 253.

3. Alfano, J. R. The type III (Hrp) secretion pathway of plant pathogenic bacteria: trafficking harpins, Avr proteins, and death [Текст] / Alfano, J. R. and Collmer A. // J Bacterid. - 1997.- 179.- 18.- 5655-5662.

4. Alfano, J. R. Type III secretion system effector proteins: double agents in bacterial disease and plant defense [Текст] / Alfano, J. R. and Collmer A. // Annu Rev Phvtopathol. - 2004. - 42. - - 385-414.

5. Apel, K. Reactive oxygen species: metabolism, oxidative stress, and signal transduction [Текст] / Apel, K. and Hirt H. // Annu Rev Plant Biol. - 2004. -55. - - 373-399.

6. Arie, J. P. Chaperone function of FkpA, a heat shock prolyl isomerase, in the periplasm of Escherichia coli [Текст] / Arie, J. P., Sassoon N. and Betton J. M. // Mol Microbiol. - 2001. - 39. - 1.- 199-210.

7. Arnold, D. L. Highly conserved sequences flank avirulence genes: isolation of novel avirulence genes from Pseudomonas syringae pv. pisi [Текст] / Arnold, D. L., Jackson R. W., Fillingham A. J., Goss S. C., et al. // Microbiology.-2001,- 147. - Pt 5.- 1171-1182.

8. Atlas, R. M. Handbook of Microbiological Media [Текст] / Atlas, R. M. // CRC Press. - 2004. - - Issue. -

9. Aumuller, T. Role of prolyl cis/trans isomers in cyclophilin-assisted Pseudomonas syringae AvrRpt2 protease activation [Текст] / Aumuller, Т., Jahreis G., Fischer G. and Schiene-Fischer C. // Biochemistry. - 2010. - 49. - 5. -1042-1052.

10.Aviezer-Hagai, K. Arabidopsis immunophilins ROFl (AtFKBP62) and ROF2 (AtFKBP65) exhibit tissue specificity, are heat-stress induced, and bind HSP90 [Текст] / Aviezer-Hagai, K., Skovorodnikova J., Galigniana M., Farchi-Pisanty O., et al. // Plant Mol Biol. - 2007. - 63. - 2. - 237-255.

11.Bang, H. Prolyl isomerases in a minimal cell. Catalysis of protein folding by trigger factor from Mycoplasma genitalium [Текст] / Bang, H., Pecht A., Raddatz G., Scior Т., et al. // Eur J Biochem. - 2000. - 267. - 11. - 3270-3280.

12.Baram, D. Structure of trigger factor binding domain in biologically homologous complex with eubacterial ribosome reveals its chaperone action [Текст] / Baram, D., Pyetan E., Sittner A., Auerbach-Nevo Т., et al. // Proc Natl Acad Sci USA. - 2005. - 102. - 34. - 12017-12022.

13.Baranski, R. Enhancing resistance of transgenic carrot to fungal pathogens by the expression of Pseudomonas fluorescence microbial factor 3 (MF3) gene [Текст] / Baranski, R., Klocke E. and Nothnagel T. // Physiological and Molecular Plant Pathology. - 2007. - 71. - 1-3. - 88-95.

14.Barik, S. Immunophilins: for the love of proteins [Текст] / Barik, S. // Cell Mol Life Sci. - 2006. - 63. - 24. - 2889-2900.

15.Behrens, S. The SurA periplasmic PPIase lacking its parvulin domains functions in vivo and has chaperone activity [Текст] / Behrens, S., Maier R., de Cock H., Schmid F. X., et al. // EMBO J. - 2001. - 20. - 1-2. - 285-294.

16.Boiler, T. A renaissance of elicitors: perception of microbe-associated molecular patterns and danger signals by pattern-recognition receptors [Текст] / Boiler, T. and Felix G. // Annu Rev Plant Biol. - 2009. - 60. - - 379406.

17.Bouzar, H. Physiological, chemical, serological, and pathogenic analyses of a worldwide collection of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria strains [Текст] / Bouzar, H., Jones J. В., Stall R. E., Hodge N. C., et al. // Phytopathology. - 1994. - 84. - 7. - 663-671.

18.Braaten, D. Cyclophilin A regulates HIV-1 infectivity, as demonstrated by gene targeting in human T cells [Текст] / Braaten, D. and Luban J. // EMBO J.-2001.-20.-6.- 1300-1309.

19.Brooks, D. M. The Pseudomonas syringae phytotoxin coronatine promotes virulence by overcoming salicylic acid-dependent defences in Arabidopsis thaliana [Текст] / Brooks, D. M., Bender C. L. and Kunkel B. N. // Molecular Plant Pathology. - 2005. - 6. - 6. - 629-639.

20.Buttner, D. Port of entry—the type III secretion translocon [Текст] / Buttner, D. and Bonas U. // Trends Microbiol. - 2002. - 10. - 4. - 186-192.

21.Buttner, D. Who comes first? How plant pathogenic bacteria orchestrate type III secretion [Текст] / Buttner, D. and Bonas U. // Curr Opin Microbiol. -2006.-9.-2.- 193-200.

22.Buttner, D. Type III protein secretion in plant pathogenic bacteria [Текст] / Buttner, D. and He S. Y. // Plant Physiol. - 2009. - 150. - 4. - 1656-1664.

23.Castañeda, A. Mutagenesis of all eight avr genes in Xanthomonas campestris pv. campestris had no detected effect on pathogenicity, but one avr gene affected race specificity [Текст] / Castañeda, A., Reddy J. D., El-Yacoubi B. and Gabriel D. W. // Mol Plant Microbe Interact. - 2005. - 18,- 12.- 1306-1317.

24.Chang, J. H. Wake of the flood: ascribing functions to the wave of type III effector proteins of phytopathogenic bacteria [Текст] / Chang, J. H., Goel A. K., Grant S. R. and Dangl J. L. // Curr Opin Microbiol. - 2004. - 7. - 1. - 11-18.

25.Chen, A. P. Ectopic expression of ThCYPl, a stress-responsive cyclophilin gene from Thellungiella halophila, confers salt tolerance in fission yeast and tobacco cells [Текст] / Chen, A. P., Wang G. L., Qu Z. L., Lu С. X., et al. // Plant Cell Rep. - 2007. - 26. - 2. - 237-245.

26.Chen, P.-Y. Complete sequence of the binary vector pBI121 and its application in cloning T-DNA insertion from transgenic plants [Текст] / Chen, P.-Y., Wang C.-K., Soong S.-C. and To K.-Y. // Molecular Breeding. -2003.- 11.-4.-287-293.

27.Chen, W. Expression profile matrix of Arabidopsis transcription factor genes suggests their putative functions in response to environmental stresses [Текст] / Chen, W., Provart N. J., Glazebrook J., Katagiri F., et al. // Plant Cell. - 2002. - 14. - 3. - 559-574.

28.Cheng, H. N. Cis-trans equilibrium and kinetic studies of acetyl-L-proline and glycyl-L-proline [Текст] / Cheng, H. N. and Bovey F. A. // Biopolymers. -1977.- 16.-7.- 1465-1472.

29.Chisholm, S. T. Host-microbe interactions: shaping the evolution of the plant immune response [Текст] / Chisholm, S. Т., Coaker G., Day B. and Staskawicz B. J. // СеИ. - 2006. - 124. - 4. - 803-814.

30.Cho, E. K. A cyclophilin from Griffithsia japónica has thermoprotective activity and is affected by CsA [Текст] / Cho, E. K., Lee Y. K. and Hong С. B. //Mol Cells. - 2005. - 20. - 1.- 142-150.

31.Chung, E. H. Specific threonine phosphorylation of a host target by two unrelated type III effectors activates a host innate immune receptor in plants [Текст] / Chung, E. H., da Cunha L., Wu A. J., Gao Z., et al. // Cell Host Microbe. - 2011. - 9. - 2. - 125-136.

32.Coaker, G. Eukaryotic cyclophilin as a molecular switch for effector activation [Текст] / Coaker, G., Zhu G., Ding Z., Van Doren S. R., et al. // Mol Microbiol. - 2006. - 61. - 6. - 1485-1496.

33.Coll, N. S. Arabidopsis type I metacaspases control cell death [Текст] / Coll, N. S., Vercammen D., Smidler A., Clover C., et al. // Science. - 2010. -330.-6009.- 1393-1397.

34.Collmer, A. Genomic mining type III secretion system effectors in Pseudomonas syringae yields new picks for all TTSS prospectors [Текст] / Collmer, A., Lindeberg M., Petnicki-Ocwieja Т., Schneider D. J., et al. // Trends Microbiol. - 2002. - 10. - 10. - 462-469.

35.Comas, I. The evolutionary origin of Xanthomonadales genomes and the nature of the horizontal gene transfer process [Текст] / Comas, I., Moya A., Azad R. K., Lawrence J. G., et al. // Mol Biol Evol. - 2006. - 23. - 11. - 20492057.

36.Cornelis, G. R. Yersinia type III secretion: send in the effectors [Текст] / Cornelis, G. R. // J Cell Biol. - 2002. - 158. - 3. - 401-408.

37.Cornelis, G. R. The Yersinia Ysc-Yop 'type III' weaponry [Текст] / Cornelis, G. R. // Nat Rev Mol Cell Biol. - 2002. - 3. - 10. - 742-752.

38.Cornelis, G. R. The type III secretion injectisome [Текст] / Cornelis, G. R. // Nat Rev Microbiol. - 2006. - 4. - 11.- 811-825.

39.Cornelis, G. R. Assembly and function of type III secretory systems [Текст] / Cornelis, G. R. and Van Gijsegem F. // Annu Rev Microbiol. - 2000. - 54. - -735-774.

40.da Silva, A. C. Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities [Текст] / da Silva, A. C., Ferro J. A., Reinach F. C., Farah C. S., et al. //Nature. - 2002. - 417. - 6887. - 459-463.

41.Desaki, Y. Bacterial lipopolysaccharides induce defense responses associated with programmed cell death in rice cells [Текст] / Desaki, Y., Miya A., Venkatesh В., Tsuyumu S., et al. // Plant Cell Physiol. - 2006. - 47. -11.- 1530-1540.

42.Deslandes, L. Physical interaction between RRS1-R, a protein conferring resistance to bacterial wilt, and PopP2, a type III effector targeted to the plant nucleus [Текст] / Deslandes, L., Olivier J., Peeters N., Feng D. X., et al. // Proc Natl Acad Sci USA. - 2003. - 100. - 13. - 8024-8029.

43.Deuerling, E. Trigger factor and DnaK cooperate in folding of newly synthesized proteins [Текст] / Deuerling, E., Schulze-Specking A., Tomoyasu Т., Mogk A., et al. // Nature. - 1999. - 400. - 6745. - 693-696.

44.Dolinski, K. All cyclophilins and FK506 binding proteins are, individually and collectively, dispensable for viability in Saccharomyces cerevisiae [Текст] / Dolinski, K., Muir S., Cardenas M. and Heitman J. // Proc Natl Acad Sci USA. - 1997. - 94. - 24. - 13093-13098.

45.Duan, Y. P. Expression of a single, host-specific, bacterial pathogenicity gene in plant cells elicits division, enlargement, and cell death [Текст] / Duan, Y. P., Castaneda A., Zhao G., Erdos G., et al. // Molecular Plant-Microbe Interactions. - 1999. - 12. - 6. - 556-560.

46.Dwivedi, R. S. Differential distribution of the cognate and heat-stress-induced isoforms of high Mr cis-trans prolyl peptidyl isomerase (FKBP) in the cytoplasm and nucleoplasm [Текст] / Dwivedi, R. S., Breiman A. and Herman E. M. // J Exp Bot. - 2003. - 54. - 393. - 2679-2689.

47.Engleberg, N. C., DNA sequence of mip, a Legionella pneumophila gene associated with macrophage infectivity [Текст] / Engleberg, N. C., Carter C., Weber D. R., Cianciotto N. P., et al. // Infect Immun. - 1989. - 57. - 4. - 12631270.

48.Erbs, G. Lipopolysaccharides and plant innate immunity [Текст] / Erbs, G., Molinaro A., Dow J. M. and Newman M. A. // Subcell Biochem. - 2010. - 53. - -387-403.

49.Espinosa, A. The Pseudomonas syringae type Ill-secreted protein HopPtoD2 possesses protein tyrosine phosphatase activity and suppresses programmed cell death in plants [Текст] / Espinosa, A., Guo M., Tarn V. C., Fu Z. Q., et al. // Mol Microbiol. - 2003. - 49. - 2. - 377-387.

50.Felix, G. Plants have a sensitive perception system for the most conserved domain of bacterial flagellin [Текст] / Felix, G., Duran J. D., Volko S. and Boiler T. // Plant J. - 1999. - 18.-3.-265-276.

51.Fischer, G. Mip protein of Legionella pneumophila exhibits peptidyl-prolyl-cis/trans isomerase (PPlase) activity [Текст] / Fischer, G., Bang H., Ludwig В., Mann K., et al. // Mol Microbiol. - 1992. - 6. - 10. - 1375-1383.

52.Fischer, G. Cyclophilin and peptidyl-prolyl cis-trans isomerase are probably identical proteins [Текст] / Fischer, G., Wittmann-Liebold В., Lang K., Kiefhaber Т., et al. // Nature. - 1989. - 337. - 6206. - 476-478.

53.Flor, H. H. Current Status of the Gene-For-Gene Concept [Текст] / Flor, H. H. // Annual Review of Phytopathology. - 1971.-9.- 1.-275-296.

54.Foultier, B. Characterization of the ysa pathogenicity locus in the chromosome of Yersinia enterocolitica and phylogeny analysis of type III secretion systems [Текст] / Foultier, В., Troisfontaines P., Muller S., Opperdoes F. R., et al. // J Mol Evol. - 2002. - 55. - 1. - 37-51.

55.Fouts, D. E. Genomewide identification of Pseudomonas syringaepv. tomato DC3000 promoters controlled by the HrpL alternative sigma factor [Текст] / Fouts, D. E., Abramovitch R. В., Alfano J. R., Baldo A. M., et al. // Proc Natl Acad Sci USA. - 2002. - 99. - 4. - 2275-2280.

56.Fruman, D. A. Immunophilins in protein folding and immunosuppression [Текст] / Fruman, D. A., Burakoff S. J. and Bierer В. E. // FASEB J. - 1994. - 8. -6.-391-400.

57.Galan, J. E. Protein delivery into eukaryotic cells by type III secretion machines [Текст] / Galan, J. E. and Wolf-Watz H. // Nature. - 2006. - 444. -7119. - 567-573.

58.Gasser, C. S. Structure and expression of cytosolic cyclophilin/peptidyl-prolyl cis-trans isomerase of higher plants and production of active tomato cyclophilin in Escherichia coli [Текст] / Gasser, C. S., Gunning D. A., Budelier K. A. and Brown S. M. // Proc Natl Acad Sci USA. - 1990. - 87. - 24. - 9519-9523.

59.Gemmill, T. R. Vanishingly low levels of Essl prolyl-isomerase activity are sufficient for growth in Saccharomyces cerevisiae [Текст] / Gemmill, T. R., Wu X. and Hanes S. D. // J Biol Chem. - 2005. - 280. - 16. - 15510-15517.

60.Ghosh, P. Process of protein transport by the type III secretion system [Текст] / Ghosh, P. // Microbiol Mol Biol Rev. - 2004. - 68. - 4. - 771-795.

61.Gleave, A. A versatile binary vector system with a T-DNA organisational structure conducive to efficient integration of cloned DNA into the plant genome [Текст] / Gleave, A. // Plant Molecular Biology. - 1992. - 20. - 6. -1203-1207.

62.Godoy, A. V. Expression of a Solanum tuberosum cyclophilin gene is regulated by fungal infection and abiotic stress conditions [Текст] / Godoy, A. V., Lazzaro A. S., Casalongue C. A. and San Segundo B. // Plant Science. -2000,- 152.-2.- 123-134.

63.Gollan, P. J. The FKBP families of higher plants: Exploring the structures and functions of protein interaction specialists [Текст] / Gollan, P. J., Bhave M. and Aro E. M. // FEBS Lett. - 2012. - 586. - 20. - 3539-3547.

64.Gomez-Gomez, L. A single locus determines sensitivity to bacterial flagellin in Arabidopsis thaliana [Текст] / Gomez-Gomez, L., Felix G. and Boiler T. // Plant J. - 1999. - 18. - 3. - 277-284.

65.Grant, S. R. Subterfuge and manipulation: type III effector proteins of phytopathogenic bacteria [Текст] / Grant, S. R., Fisher E. J., Chang J. H., Mole В. M., et al. // Annu Rev Microbiol. - 2006. - 60. - - 425-449.

66.Gurlebeck, D. Dimerization of the bacterial effector protein AvrBs3 in the plant cell cytoplasm prior to nuclear import [Текст] / Gurlebeck, D., Szurek B. and Bonas U. // Plant J. - 2005. - 42. - 2. - 175-187.

67.Hajheidari, M. Proteome analysis of sugar beet leaves under drought stress [Текст] / Hajheidari, M., Abdollahian-Noghabi M., Askari H., Heidari M., et al. // Proteomics. - 2005. - 5. - 4. - 950-960.

68.Hajri, A. A "repertoire for repertoire" hypothesis: repertoires of type three effectors are candidate determinants of host specificity in Xanthomonas [Текст] / Hajri, A., Brin C., Hunault G., Lardeux F., et al. // PLoS One. - 2009. -4. - 8. - e6632.

69.Harrar, Y. FKBPs: at the crossroads of folding and transduction [Текст] / Harrar, Y., Bellini C. and Faure J. D. // Trends Plant Sci. - 2001. - 6. - 9. - 426431.

70.Hatsugai, N. A plant vacuolar protease, VPE, mediates virus-induced hypersensitive cell death [Текст] / Hatsugai, N., Kuroyanagi M., Yamada K., Meshi Т., et al. // Science. - 2004. - 305. - 5685. - 855-858.

71.Hauck, P. A Pseudomonas syringae type III effector suppresses cell wall-based extracellular defense in susceptible Arabidopsis plants [Текст] / Hauck, P., Thilmony R. and He S. Y. // Proc Natl Acad Sci USA. - 2003. - 100. - 14. - 8577-8582.

72.He, P. Activation of a COIl-dependent pathway in Arabidopsis by Pseudomonas syringae type III effectors and coronatine [Текст] / He, P., Chintamanani S., Chen Z., Zhu L., et al. // Plant J. - 2004. - 37. - 4. - 589-602.

73.He, Y. Q. Comparative and functional genomics reveals genetic diversity and determinants of host specificity among reference strains and a large collection of Chinese isolates of the phytopathogen Xanthomonas campestris pv. campestris [Текст] / He, Y. Q., Zhang L., Jiang B. L., Zhang Z. C., et al. // Genome Biol. - 2007. - 8. - 10. - R218.

74.He, Z. Immunophilins and parvulins. Superfamily of peptidyl prolyl isomerases in Arabidopsis [Текст] / He, Z., Li L. and Luan S. // Plant Physiol. -2004,- 134.-4.- 1248-1267.

75.Horne, S. M. Decreased intracellular survival of an fkpA mutant of Salmonella typhimurium Copenhagen [Текст] / Home, S. M., Kottom T. J., Nolan L. K. and Young K. D. // Infect Immun. - 1997. - 65. - 2. - 806-810.

76.Hou, S. The multilevel and dynamic interplay between plant and pathogen [Текст] / Hou, S., Yang Y. and Zhou J. M. // Plant Signal Behav. - 2009. - 4. -4. - 283-293.

77.Humphreys, S. Role of periplasmic peptidylprolyl isomerases in Salmonella enterica serovar Typhimurium virulence [Текст] / Humphreys, S., Rowley

G., Stevenson A., Kenyon W. J., et al. // Infect Immun. - 2003. - 71. - 9. - 53865388.

78.Hur, S. The mechanism of cis-trans isomerization of prolyl peptides by cyclophilin [Текст] / Hur, S. and Bruice Т. C. // J Am Chem Soc. - 2002. - 124. -25.-7303-7313.

79.Hutcheson, S. W. Enhancer-binding proteins HrpR and HrpS interact to regulate hrp-encoded type III protein secretion in Pseudomonas syringae strains [Текст] / Hutcheson, S. W., Bretz J., Sussan Т., Jin S., et al. // J Bacteriol. - 2001. - 183. - 19. - 5589-5598.

80.1gnatov, A. Genetic Diversity in Populations of Xanthomonas campestris pv. campestris in Cruciferous Weeds in Central Coastal California [Текст] / Ignatov, A., Sechler A., Schuenzel E. L., Agarkova I., et al. // Phytopathology. -2007.-97.- 7.- 803-812.

8 Linnes, R. W. Molecular analysis of avirulence gene avrRpt2 and identification of a putative regulatory sequence common to all known Pseudomonas syringae avirulence genes [Текст] / Innes, R. W., Bent A. F., Kunkel В. N., Bisgrove S. R., et al. // J Bacteriol. - 1993. - 175. - 15. - 48594869.

82. Jakobek, J. L. Generalized Induction of Defense Responses in Bean Is Not Correlated with the Induction of the Hypersensitive Reaction [Текст] / Jakobek, J. L. and Lindgren P. B. // Plant Cell. - 1993. - 5. - 1. - 49-56.

83.Jana, В. The helix located between the two domains of a mip-like peptidylprolyl cis-trans isomerase is crucial for its structure, stability, and protein folding ability [Текст] / Jana, В. and Sau S. // Biochemistry. - 2012. - 51. - 40. -7930-7939.

84. Jones, J. B. Reclassification of the xanthomonads associated with bacterial spot disease of tomato and pepper [Текст] / Jones, J. В., Lacy G. H., Bouzar

H., Stall R. E., et al. // Syst Appl Microbiol. - 2004. - 27. - 6. - 755-762.

85.Justice, S. S. Periplasmic peptidyl prolyl cis-trans isomerases are not essential for viability, but SurA is required for pilus biogenesis in Escherichia coli [Текст] / Justice, S. S., Hunstad D. A., Harper J. R., Duguay A. R., et al. // J Bacteriol. - 2005. - 187. - 22. - 7680-7686.

86.Kamoun, S. Incompatible interactions between crucifers and Xanthomonas campestris involve a vascular hypersensitive response: role of the hrpX locus [Текст] / Kamoun, S., Kamdar H. V., Tola E. and Kado С. I. // Molecular plant-microbe interactions. - 1992. - 5. - 1. - 22-33.

87.Kamphausen, Т. Characterization of Arabidopsis thaliana AtFKBP42 that is membrane-bound and interacts with Hsp90 [Текст] / Kamphausen, Т., Fanghanel J., Neumann D., Schulz В., et al. // Plant J. - 2002. - 32. - 3. - 263276.

88.Kang, С. В. FKBP family proteins: immunophilins with versatile biological functions [Текст] / Kang, С. В., Hong Y., Dhe-Paganon S. and Yoon H. S. // Neurosignals. - 2008. - 16. - 4. - 318-325.

89.Kay, S. Characterization of AvrBs3-like effectors from a Brassicaceae pathogen reveals virulence and avirulence activities and a protein with a novel repeat architecture [Текст] / Kay, S., Boch J. and Bonas U. // Mol Plant Microbe Interact. - 2005. - 18. - 8. - 838-848.

90.Kay, S. A bacterial effector acts as a plant transcription factor and induces a cell size regulator [Текст] / Kay, S., Hahn S., Marois E., Hause G., et al. // Science. - 2007. - 318. - 5850. - 648-651.

91.Kent, S. J. Gallic acid production protects Xanthomonas campestris pv. pruni from cytotoxic effects of hydrogen peroxide. [Текст] / Kent, S. J., Daub M. E. and Ritchie D. F. // Phytopathology. - 1996. - 86. - - 16.

92.Kielbowicz-Matuk, A. The abundance of a single domain cyclophilin in Solanaceae is regulated as a function of organ type and high temperature and not by other environmental constraints [Текст] / Kielbowicz-Matuk, A., Rey P. and Rorat T. // Physiol Plant. - 2007. - 131. - 3. - 387-398.

93.Kjemtrup, S., Nimchuk Z. and Dangl J. L. Effector proteins of phytopathogenic bacteria: bifunctional signals in virulence and host recognition [Текст] / Kjemtrup, S., Nimchuk Z. and Dangl J. L. // Curr Opin Microbiol. - 2000. - 3. - 1. - 73-78.

94.Knight, H. Abiotic stress signalling pathways: specificity and cross-talk [Текст] / Knight, H. and Knight M. R. // Trends Plant Sci. - 2001. - 6. - 6. - 262267.

95.Kobae, Y. Loss of AtPDR8, a plasma membrane ABC transporter of Arabidopsis thaliana, causes hypersensitive cell death upon pathogen infection [Текст] / Kobae, Y., Sekino Т., Yoshioka H., Nakagawa Т., et al. // Plant Cell Physiol. - 2006. - 47. - 3. - 309-318.

96.Koncz, C. A simple method to transfer, integrate and study expression of foreign genes, such as chicken ovalbumin and alpha-actin in plant tumors [Текст] / Koncz, C., Kreuzaler F., Kalman Z. and Schell J. // EMBO J. - 1984. -3. - 5. - 1029-1037.

97.Kong, H. Y. Expression of pepper cyclophilin gene is differentially regulated during the pathogen infection and abiotic stress conditions

[Текст] / Kong, H. Y., Lee S. C. and Hwang В. K. // Physiological and Molecular Plant Pathology. - 2001. - 59. - 4. - 189-199.

98.Konno, M. Escherichia coli cyclophilin В binds a highly distorted form of trans-prolyl peptide isomer [Текст] / Konno, M., Sano Y., Okudaira K., Kawaguchi Y., et al. // Eur J Biochem. - 2004. - 271. - 18. - 3794-3803.

99.Kubori, T. Molecular characterization and assembly of the needle complex of the Salmonella typhimurium type III protein secretion system [Текст] / Kubori, Т., Sukhan A., Aizawa S. I. and Galan J. E. // Proc Natl Acad Sci USA. -2000.- 97.- 18,- 10225-10230.

100. Kumari, S. Cyclophilins: Proteins in search of function [Текст] / Kumari, S., Roy S., Singh P., Singla-Pareek S. L., et al. // Plant Signal Behav. -2012. - 8. - 1. -

101. Kurek, I. Deletion of the C-terminal 138 amino acids of the wheat FKBP73 abrogates calmodulin binding, dimerization and male fertility in transgenic rice [Текст] / Kurek, I., Dulberger R., Azem A., Tzvi В. В., et al. // Plant Mol Biol. - 2002. - 48. - 4. - 369-381.

102. Lahaye, T. Molecular secrets of bacterial type III effector proteins [Текст] / Lahaye, T. and Bonas U. // Trends in Plant Science. - 2001. - 6. - 10. -479-485.

103. Laxa, M. Role of the cysteine residues in Arabidopsis thaliana cyclophilin CYP20-3 in peptidyl-prolyl cis-trans isomerase and redox-related functions [Текст] / Laxa, M., Konig J., Dietz K. J. and Kandlbinder A. // Biochem J. - 2007. - 401. - 1. - 287-297.

104. Lee, M. Transient Expression Assay by Agroinfiltration of Leaves [Текст] / Lee, M. and Yang Y//Arabidopsis Protocols. - 2006. - 323. - P. 225229.

105. Leuzzi, R. Ng-MIP, a surface-exposed lipoprotein of Neisseria gonorrhoeae, has a peptidyl-prolyl cis/trans isomerase (PPIase) activity and is involved in persistence in macrophages [Текст] / Leuzzi, R., Serino L., Scarselli M., Savino S., et al. // Mol Microbiol. - 2005. - 58. - 3. - 669-681.

106. Li, J. Cell-Death Control by Receptor Kinases in Arabidopsis thaliana. [Текст] / Li, J., Du J., He K. and Gou X.// Receptor-like Kinases in Plants. -2012. - 13.-P. 79-91.

107. Liu, J. RIN4 functions with plasma membrane H+-ATPases to regulate stomatal apertures during pathogen attack [Текст] / Liu, J., Elmore J. M., Fuglsang А. Т., Palmgren M. G., et al. // PLoS Biol. - 2009. - 7. - 6. -el000139.

108. Livak, K. J. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method [Текст] / Livak, K. J. and Schmittgen T. D. // Methods. - 2001. - 25. - 4. - 402-408.

109. Logemann, E. An improved method for preparing Agrobacterium cells that simplifies the Arabidopsis transformation protocol [Текст] / Logemann, E., Birkenbihl R. P., Ulker B. and Somssich I. E. // Plant Methods. -2006. -2. -- 16.

110. Luan, S. Immunophilins in animals and higher plants [Текст] / Luan, S. // Bot. Bull. Acad. Sin. - 1998. - 39. - - 217-223.

111. Mackey, D. Arabidopsis RIN4 is a target of the type III virulence effector AvrRpt2 and modulates RPS2-mediated resistance [Текст] / Mackey, D., Belkhadir Y., Alonso J. M., Ecker J. R., et al. // СеЦ. - 2003. - 112. - 3. - 379-389.

112. Magiri, E. N. The expression of the large rice FK506 binding proteins (FKBPs) demonstrate tissue specificity and heat stress responsiveness

[Текст] / Magiri, Е. N., Farchi-Pisanty О., Avni A. and Breiman A. // Plant Science. - 2006. - 170. - 4. - 695-704.

113. Mahfouz, M. M. Arabidopsis TARGET OF RAPAMYCIN interacts with RAPTOR, which regulates the activity of S6 kinase in response to osmotic stress signals [Текст] / Mahfouz, M. M., Kim S., Delauney A. J. and Verma D. P. // Plant Cell. - 2006. - 18. - 2. - 477-490.

114. Maleszka, R. The dodo gene family encodes a novel protein involved in signal transduction and protein folding [Текст] / Maleszka, R., Lupas A., Hanes S. D. and Miklos G. L. // Gene. - 1997. - 203. - 2. - 89-93.

115. Marivet, J. Bean cyclophilin gene expression during plant development and stress conditions [Текст] / Marivet, J., Margis-Pinheiro M., Frendo P. and Burkard G. // Plant Mol Biol. - 1994. - 26. - 4. - 1181-1189.

116. Marois, E. The xanthomonas type III effector protein AvrBs3 modulates plant gene expression and induces cell hypertrophy in the susceptible host [Текст] / Marois, E., Van den Ackerveken G. and Bonas U. // Mol Plant Microbe Interact. - 2002. - 15. - 7. - 637-646.

117. McGuinness, D. H. Pattern recognition molecules and innate immunity to parasites [Текст] / McGuinness, D. H., Dehal P. K. and Pleass R. J. // Trends Parasitol. - 2003. - 19.- 7.- 312-319.

118. Meiri, D. Involvement of Arabidopsis ROF2 (FKBP65) in thermotolerance [Текст] / Meiri, D., Tazat K., Cohen-Peer R., Farchi-Pisanty O., et al. // Plant Mol Biol. - 2010. - 72. - 1-2. - 191-203.

119. Miyake, K. Innate recognition of lipopolysaccharide by Toll-like receptor 4/MD-2 and RP105/MD-1 [Текст] / Miyake, K., Ogata H., Nagai Y., Akashi S., et al. // J Endotoxin Res. - 2000. - 6. - 5. - 389-391.

120. Mudgett, M. B. New insights to the function of phytopathogenic bacterial type III effectors in plants [Текст] / Mudgett, M. B. // Annu Rev Plant Biol. - 2005. - 56. - - 509-531.

121. Nakagami, H. A Mitogen-activated protein kinase kinase kinase mediates reactive oxygen species homeostasis in Arabidopsis [Текст] / Nakagami, H., Soukupova H., Schikora A., Zarsky V., et al. // J Biol Chem. -2006. - 281. - 50. - 38697-38704.

122. Nigam, N. SUMO-conjugating enzyme (See) and FK506-binding protein (FKBP) encoding rice (Oryza sativa L.) genes: genome-wide analysis, expression studies and evidence for their involvement in abiotic stress response [Текст] / Nigam, N., Singh A., Sahi C., Chandramouli A., et al. // Mol Genet Genomics. - 2008. - 279. - 4. - 371-383.

123. Nürnberger, Т. Innate immunity in plants and animals: striking similarities and obvious differences [Текст] / Nürnberger, Т., Brunner F., Kemmerling B. and Piater L. // Immunol Rev. - 2004. - 198. - 249-266.

124. Orth, К. Disruption of signaling by Yersinia effector YopJ, a ubiquitin-like protein protease [Текст] / Orth, К., Xu Z., Mudgett M. В., Bao Z. Q., et al. // Science. - 2000. - 290. - 5496. - 1594-1597.

125. Pemberton, Т. J. Identification and comparative analysis of sixteen fungal peptidyl-prolyl cis/trans isomerase repertoires [Текст] / Pemberton, T. J. // BMC Genomics. - 2006. - 7. - - 244.

126. Pratt, W. B. Hsp90-binding immunophilins in plants: the protein movers [Текст] / Pratt, W. В., Krishna P. and Olsen L. J. // Trends Plant Sci. -2001.-6.-2.- 54-58.

127. Preston, G. M. Profiling the secretomes of plant pathogenic Proteobacteria [Текст] / Preston, G. M., Studholme D. J. and Caldelari I. // FEMS Microbiol Rev. - 2005. - 29. - 2. - 331-360.

128. Qian, W. Comparative and functional genomic analyses of the pathogenicity of phytopathogen Xanthomonas campestris pv. campestris [Текст] / Qian, W., Jia Y., Ren S. X., He Y. Q., et al. // Genome Res. - 2005. -15. - 6. - 757-767.

129. Reimer, U. Local structural changes caused by peptidyl-prolyl cis/trans isomerization in the native state of proteins [Текст] / Reimer, U. and Fischer G. // Biophvs Chem. - 2002. - 96. - 2-3. - 203-212.

130. Reuber, T. L. Isolation of Arabidopsis genes that differentiate between resistance responses mediated by the RPS2 and RPM1 disease resistance genes [Текст] / Reuber, T. L. and Ausubel F. M. // Plant Cell. -1996.- 8.-2.-241-249.

131. Ritter, C. Interference between Two Specific Pathogen Recognition Events Mediated by Distinct Plant Disease Resistance Genes [Текст] / Ritter, C. and Dangl J. L. // Plant Cell. - 1996. - 8. - 2. - 251-257.

132. Robatzek, S. Ligand-induced endocytosis of the pattern recognition receptor FLS2 in Arabidopsis [Текст] / Robatzek, S., Chinchilla D. and Boiler T. // Genes Dev. - 2006. - 20. - 5. - 537-542.

133. Romano, P. Plant immunophilins: functional versatility beyond protein maturation [Текст] / Romano, P., Gray J., Horton P. and Luan S. // New Phvtol. - 2005. - 166. - 3. - 753-769.

134. Romano, P. G. The Arabidopsis cyclophilin gene family [Текст] / Romano, P. G., Horton P. and Gray J. E. // Plant Physiol. - 2004. - 134. - 4. -1268-1282.

135. Rouviere, P. E. SurA, a periplasmic protein with peptidyl-prolyl isomerase activity, participates in the assembly of outer membrane porins [Текст] / Rouviere, P. E. and Gross C. A. // Genes Dev. - 1996. - 10. - 24. -3170-3182.

136. Salanoubat, M. Genome sequence of the plant pathogen Ralstonia solanacearum [Текст] / Salanoubat, M., Genin S., Artiguenave F., Gouzy J., et al. //Nature. - 2002. - 415. - 6871. - 497-502.

137. Sambrook, J. J. Molecular cloning: a laboratory manual. Vol. 2

[Текст] / Sambrook, J. J. and Russell D. D. W. // Cold Spring Harbor Laboratory Press. - 2001. - - Issue. -

138. Saul, F. A. Structural and functional studies of FkpA from Escherichia coli, a cis/trans peptidyl-prolyl isomerase with chaperone activity [Текст] / Saul, F. A., Arie J. P., Vulliez-le Normand В., Kahn R., et al. // J Mol Biol. - 2004. - 335. - 2. - 595-608.

139. Schiene-Fischer, C. Receptor accessory folding helper enzymes: the functional role of peptidyl prolyl cis/trans isomerases [Текст] / SchieneFischer, C. and Yu C. // FEBS Lett. - 2001. - 495. - 1-2. - 1-6.

140. Schmid, F. X. Catalyzed and assisted protein folding of ribonuclease T1 [Текст] / Schmid, F. X., Freeh C., Scholz C. and Walter S. // Biol Chem. -1996.-377.-7-8.-417-424.

141. Sekhar, K. Isolation and characterization of a pigeonpea cyclophilin (CcCYP) gene, and its over-expression in Arabidopsis confers multiple abiotic stress tolerance [Текст] / Sekhar, K., Priyanka В., Reddy V. D. and Rao К. V. // Plant Cell Environ. - 2010. - 33. - 8. - 1324-1338.

142. Shaw, P. E. Peptidyl-prolyl isomerases: a new twist to transcription [Текст] / Shaw, P. E. // EMBO Rep. - 2002. - 3. - 6. - 521-526.

143. Shen, H. Characterization of the promoter of avirulence gene D from Pseudomonas syringae pv. tomato [Текст] / Shen, H. and Keen N. T. // J Bacterio!. - 1993. - 175. - 18. - 5916-5924.

144. Shindo, T. A role in immunity for Arabidopsis cysteine protease RD21, the ortholog of the tomato immune protease C14 [Текст] / Shindo, Т., Misas-Villamil J. C., Horger A. C., Song J., et al. // PLoS One. - 2012. - 7. - 1. -e29317.

145. Shumilina, D. MF3 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase of FKBP type from Pseudomonas fluorescens) - an elicitor of non-specific plant resistance against pathogens [Текст] / Shumilina, D., Kramer R., Klocke E. and Dzhavakhiya V. // Phytopathologia Polonica. - 2006. - 41. - - 39-49.

146. Siebert, P. D. An improved PCR method for walking in uncloned genomic DNA [Текст] / Siebert, P. D., Chenchik A., Kellogg D. E., Lukyanov K. A., et al. // Nucleic Acids Res. - 1995. - 23. - 6. - 1087-1088.

147. Smith, K. D. Toll-like receptor 5 recognizes a conserved site on flagellin required for protofilament formation and bacterial motility [Текст] / Smith, K. D., Andersen-Nissen E., Hayashi F., Strobe K., et al. // Nat Immunol. - 2003. - 4. - 12. - 1247-1253.

148. Spoel, S. H. How do plants achieve immunity? Defence without specialized immune cells [Текст] / Spoel, S. H. and Dong X. // Nat Rev Immunol. - 2012. - 12. - 2. - 89-100.

149. Stewart, C. N. A rapid СТАВ DNA isolation technique useful for RAPD fingerprinting and other PCR applications [Текст] / Stewart, C. N., Jr. and Via L. E. // Biotechniques. - 1993. - 14. - 5. - 748-750.

150. Swanson, J. Cloned avirulence gene of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria complements spontaneous race-change mutants. [Текст] /

Swanson, J., Kearney В., Dahlbeck D. and Staskawicz B. // Molecular plant-microbe interactions -1988. - 1. - - 5-9.

151. Swords, К. M. Spontaneous and induced mutations in a single open reading frame alter both virulence and avirulence in Xanthomonas campestris pv. vesicatoria avrBs2 [Текст] / Swords, К. M., Dahlbeck D., Kearney В., Roy M., et al. // J Bacteriol. - 1996. - 178. - 15. - 4661-4669.

152. Takahashi, N. Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase is the cyclosporin A-binding protein cyclophilin [Текст] / Takahashi, N., Hayano T. and Suzuki M. // Nature. - 1989. - 337. - 6206. - 473-475.

153. Thieme, F. Insights into genome plasticity and pathogenicity of the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. vesicatoria revealed by the complete genome sequence [Текст] / Thieme, F., Koebnik R., Bekel Т., BergerC., et al. // J Bacteriol. - 2005. - 187. - 21. - 7254-7266.

154. Tseng, Т. T. Protein secretion systems in bacterial-host associations, and their description in the Gene Ontology [Текст] / Tseng, Т. Т., Tyler B. M. and Setubal J. С. // BMC Microbiol. - 2009. - 9 Suppl 1. - - S2.

155. Van den Mooter, M. Numerical analysis of 295 phenotypic features of 266 Xanthomonas strains and related strains and an improved taxonomy of the genus [Текст] / Van den Mooter, M. and Swings J. // Int J Syst Bacteriol. -1990. - 40. - 4. - 348-369.

156. Van der Horst, A. Peptidyl-prolyl isomerization for cytokinetic abscission: fold and cut [Текст] / Van der Horst, A. and Khanna К. K. // Cell Cycle. -2012. - 11.-9.- 1754.

157. Vauterin, L. Synopsis on the taxonomy of the genus xanthomonas [Текст] / Vauterin, L., Rademaker J. and Swings J. // Phytopathology. - 2000. -90. - 7. - 677-682.

158. Vespa, L. The immunophilin-interacting protein AtFIP37 from Arabidopsis is essential for plant development and is involved in trichome endoreduplication [Текст] / Vespa, L., Vachon G., Berger F., Perazza D., et al. // Plant Physiol. - 2004. - 134. - 4. - 1283-1292.

159. Viprey, V. Symbiotic implications of type III protein secretion machinery in Rhizobium [Текст] / Viprey, V., Del Greco A., Golinowski W., Broughton W. J., et al. // Mol Microbiol. - 1998. - 28. - 6. - 1381-1389.

160. Wadsworth, S. The Immunophilin Ligand Rapamycin: A Probe for the Analysis of the Relationship of Apoptosis to the Cell Cycle [Текст] / Wadsworth, S. and Siekierka J. J. // Methods. - 1996. - 9. - 2. - 160-164.

161. Wan, J. Chitin signaling and plant disease resistance [Текст] / Wan, J., Zhang X. C. and Stacey G. // Plant Signal Behav. - 2008. - 3. - 10. - 831-833.

162. Wang, P. Two cyclophilin A homologs with shared and distinct functions important for growth and virulence of Cryptococcus neoformans [Текст] / Wang, P., Cardenas M. E., Cox G. M., Perfect J. R., et al. // EMBO Rep.-2001.-2.- 6.- 511-518.

163. Wesley, S. V. Construct design for efficient, effective and high-throughput gene silencing in plants [Текст] / Wesley, S. V., Helliwell C. A., Smith N. A., Wang M. В., et al. // Plant J. - 2001. - 27. - 6. - 581-590.

164. Yang, B. The virulence factor AvrXa7 of Xanthomonas oryzae pv. oryzae is a type III secretion pathway-dependent nuclear-localized double-stranded DNA-binding protein [Текст] / Yang, В., Zhu W., Johnson L. B. and White F. F. // Proc Natl Acad Sci USA. - 2000. - 97. - 17. - 9807-9812.

165. Young, G. M. A new pathway for the secretion of virulence factors by bacteria: the flagellar export apparatus functions as a protein-secretion system [Текст] / Young, G. M., Schmiel D. H. and Miller V. L. // Proc Natl Acad Sci USA.- 1999.-96.- 11.-6456-6461.

166. Young, J. M. A multilocus sequence analysis of the genus Xanthomonas [Текст] / Young, J. M., Park D. C., Shearman H. M. and Fargier E. // Syst Appl Microbiol. - 2008. -31.- 5.- 366-377.

167. Yurchenko, V. Active site residues of cyclophilin A are crucial for its signaling activity via CD147 [Текст] / Yurchenko, V., Zybarth G., O'Connor M., Dai W. W., et al. // J Biol Chem. - 2002. - 277. - 25. - 22959-22965.

168. Zhang, S. Activation of salicylic acid-induced protein kinase, a mitogen-activated protein kinase, induces multiple defense responses in tobacco [Текст] / Zhang, S. and Liu Y. // Plant Cell. - 2001. - 13. - 8. - 18771889.

169. Zhu, S. SAG101 forms a ternary complex with EDS1 and PAD4 and is required for resistance signaling against turnip crinkle virus [Текст] / Zhu, S., Jeong R. D., Venugopal S. C., Lapchyk L., et al. // PLoS Pathog. - 2011. -7.- 11.-el002318.

170. Zipfel, C. Plants and animals: a different taste for microbes? [Текст] / Zipfel, C. and Felix G. // Curr Opin Plant Biol. - 2005. - 8. - 4. - 353-360.

171. Zipfel, C. Bacterial disease resistance in Arabidopsis through flagellin perception [Текст] / Zipfel, C., Robatzek S., Navarro L., Oakeley E. J., et al. // Nature. - 2004. - 428. - 6984. - 764-767.