Участие альфа-актинина 4 в регуляции экспрессии генов и контроле сплайсинга мРНК тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.03.04, кандидат биологических наук Аксенова, Василиса Юрьевна

• Аксенова, Василиса Юрьевна
• кандидат биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Аксенова, Василиса Юрьевна

ОГЛАВЛЕНИЕ

1. ВВЕДЕНИЕ

1.1 Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

1.2 Цели и задачи работы

1.3 Научная новизна

1.4 Теоретическая и практическая значимость работы

1.5 Методы исследования

N

1.6 Основные положения, выносимые на защиту

1.7 Апробация работы

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1 Актиновый цитоскелет

2.1.1 Основные компоненты актинового цитоскелета

2.1.2 Типы структур, образуемые актиновым цитоскелетом

2.2 Актин и актин-связывающие белки в ядре

2.2.1 Открытие актина и его функций в ядре

2.2.2 Регуляция полимеризации цитоплазматического и ядерного актина

2.2.3 Актин как компонент оболочки ядра и элемент комплексов ремоделирования хроматина

2.3 Участие актина и актин-связывающих белков в регуляции транскрипции и контроле экспрессии генов

2.3.1 Взаимодействие с РНК-полимеразами

2.3.2 Взаимодействие актина и актин-связывающих белков с транскрипционными факторами

2.4 Участие актина и актин-связывающих белков в биогенезе пре-мРНК

2.5 Альфа-актинины 28 2.5.1 Альфа-актинин-4

2.6 АСТЫ4 в регуляции экспрессии генов и сплайсинге пре-мРНК

2.6.1 Взаимодействие АСТЫ4 и транскрипционного фактора ОТ-кВ

2.6.1.1 Пути активации транскрипционного фактора №-кВ

2.6.1.2 Гены-мишени Яе1А/р65 субъединицы ЫР-кВ

2.6.2 Альтернативный сплайсинг с участием белков семейства ИпЮЧР

2.6.2.1 Участие ИпИ^Р в альтернативном сплайсинге пре-мРНК гена РК

2.6.2.2 Участие ЬпИЛ^Р в альтернативном сплайсинге пре-мРНК гена БМЫ

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Материалы

3.1 Генетические конструкции

3.2 Клеточные культуры

3.3 Реактивы

3.4 Праймеры 51 Методы

3.5 Получение генетических конструкций

3.6 Секвенирование фрагментов кДНК гена АСТМ

3.7 Анализ экспрессии генов, регулируемых Яе1А/р65 субъединицей №-кВ

3.8 Иммунофлуоресценция

3.9 Люциферазный тест на активность Ле1А/р65

3.10 Выделение белков

3.11 Иммунопреципитация

3.12 БОЗ-электрофорез и иммуноблоттинг

3.13 Анализ влияния оверэкспрессии АСШ4 на процесс сплайсинга пре-мРНК генов РКМ1/РШ2 и 8Ш1/8Ш2

3.14 Статистическая обработка данных люциферазного теста, электрофореграмм, иммуноблоттинга

4. РЕЗУЛЬТАТЫ

4.1 Ядерно-цитоплазматический транспорт АСШ4

4.1.1 Делеционное картирование АСТЫ4

4.1.2 Ядерно-цитоплазматическое распределение экзогенных вариантов АСТЫ4

4.2 Участие АСТЫ4 в регуляции экспрессии генов

4.2.1 Влияние АСШ4 на степень активации минимального промотора мышиного гена с/ох 11е1А/р65 субъединицей №-кВ

4.2.2 Анализ воздействия оверэкспрессии АСТЖ и Яе1А/р65 субъединицы ЫР-кВ на экспрессию Яе1А/р65-зависимых генов

4.2.3 АСТТМ4 не влияет на перемещение Яе1А/р65 в ядро

4.2.4 Димеризация АСТЫ4 и его связывание с Р-актином не являются необходимыми для участия АСТЫ4 в регуляции работы Яе1А/р65

4.3 Участие АСТЖ в регуляции сплайсинга пре-мРНК

4.3.1 Исследование влияния АСТТЧ4 на процесс альтернативного сплайсинга пре-мРНК

гена РКМ1/РКМ2 76 4.3.2 Исследование влияния АСТТМ4 на процесс альтернативного сплайсинга пре-мРНК

генов 5'Л#///5Л#/2

4.4 Эндогенный вариант АСТТЧ4 с делецией кальпониновых доменов белка в нормальных

и злокачественных клетках человека

5. ОБСУЖДЕНИЕ

5.1 Ядерно-цитоплазматический транспорт АСТТЧ4

5.2 Участие АСТЖ в регуляции экспрессии 11е1А/р65-зависимых генов

5.3 Участие АСТЫ4 в регуляции сплайсинга пре-мРНК

5.4 Анализ изоформ АСТЫ4 в культурах клеток человека

ВЫВОДЫ

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ПРИЛОЖЕНИЕ

Приложение 1

Приложение 2

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Участие альфа-актинина 4 в регуляции экспрессии генов и контроле сплайсинга мРНК»

1. ВВЕДЕНИЕ

1.1 Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

Изучение роли актинового цитоскелета в регуляции экспрессии генов представляет собой одно из наиболее актуальных направлений в современных исследованиях механизмов передачи сигнала в клетке. За последние несколько лет появилось большое количество экспериментальных данных, описывающих ранее неизвестные функции белков актинового цитоскелета. Эти данные ставят по сомнение прежние представления о том, что цитоскелет выполняет лишь структурные функции. Тем не менее, механизмы, посредством которых белки цитоскелета вовлечены в регуляцию экспрессии генов и механизмы передачи сигнала в клетке, пока недостаточно хорошо изучены.

Актин и актин-связывающие белки, как основные компоненты цитоскелета, являются ключевыми элементами клетки, обеспечивающими поддержание формы клетки, клеточную адгезию, подвижность клетки, активность ионных каналов, секрецию, апоптоз и выживание клеток (Papakonstanti, Stournaras, 2008). К настоящему моменту многие из белков цитоскелета обнаружены в ядре. Показано, что актин принимает участие в процессе элонгации транскрипции, сборке пре-инициирующего комплекса, связывается с первичными транскриптами РНК и участвует в регуляции экспрессии генов (Percipalle, 2013). Актин-связывающие белки, такие как гельзолин, профилин, кофилин, спектрин, филамин, альфа-актинин 4 и некоторые другие, взаимодействуют с транскрипционными факторами и принимают участие в регуляции экспрессии генов, созревании и экспорте мРНК, репарации ДНК, митозе и реорганизации хроматина (Gettemans et al., 2005). Механизмы участия актина и актин-связывающих белков в данных процессах, протекающих в ядре, широко исследуются, что, в свою очередь, помогает продвинуться в понимании основных этапов передачи сигнала от поверхности клетки в ядро.

Альфа-актинин 4 (ACTN4) является актин-связывающим белком спектринового суперсемейства. Он принимает участие в формировании актинового цитоскелета и, как следствие, играет важную роль в формировании фокальных контактов, процессе миграции клеток и цитокинезе (Honda et al., 1998; Jayadev et al., 2012). Наследственные мутации в последовательности гена ACTN4 приводят к специфическому нарушению развития почек у человека (Weins et al., 2005). Наличие одного из сплайсинговых вариантов ACTN4 связывают с развитием мелкоклеточной формы рака легкого (Honda et al., 2004). Изменение уровня экспрессии ACTN4 отмечено в опухолевых клетках поджелудочной железы (Kikuchi et al., 2008), яичников (Barbolina et al., 2008), мочевого пузыря (Koizumi et al., 2010) и многих других типах раковых клеток.

Полученные ранее данные свидетельствуют о том, что ACTN4 вовлечен в процесс

регуляции активности ряда транскрипционных факторов, таких как NF-кВ (Babakov et al.,

5

2008), MEF2 (Chakraborty et al., 2006) и NF-Y (Poch et al., 2004), а также играет роль коактиватора ядерных рецепторов эстрогена, рецептора активации пероксисом и рецептора ретиноивой кислоты (Khurana et al., 2011, 2012а, б). Эти транскрипционные факторы, в свою очередь, регулируют экспрессию больших групп генов и участвуют в таких процессах, как пролиферация, дифференцировка и апоптоз. Кроме того, ранее было показано, что ACTN4 входит в состав ядерных белковых комплексов, образованных белками рибонуклеопротеинового семейства hnRNP А2/В1, AI, К, Ml-4, С1/С2 (Khotin et al., 2010). Эти белки принимают участие во многих этапах процесса созревания пре-мРНК, таких как полиаденилирование, контроль сплайсинга, поддержание стабильности и экспорта мРНК из ядра, а также процессах рекомбинации, регуляции транскрипции и стабилизации структуры теломер (Dreyfuss et al., 2002).

На сегодняшний день остается открытым вопрос о роли ACTN4 в составе вышеуказанных белковых комплексов и участия в процессах, протекающих в ядре и контролируемых этими комплексами. Эти и многие другие вопросы, связанные с неканоническими функциями ACTN4, определили направление наших исследований.

В экспериментах in vitro по коиммунопреципитации было показано взаимодействие ACTN4 с RelA/p65 субъединицей NF-кВ (Babakov et al., 2008), а также, что он связывается с консенсусной последовательностью ДНК, регулируемой траскрипционным фактором NF-кВ (Большакова, 2009). Эти ранее полученные данные легли в основу более детального исследования функций ACTN4 в регуляции экспрессии генов, регулируемых RelA/p65.

Выявление ACTN4 в составе белковых комплексов с гетерогенными ядерными рибонуклеопротеинами инициировало исследования, связанные с идентификацией процесса, в котором ACTN4 может принимать участие вместе с данной группой белков.

Остается также нерешенным вопрос об импорте ACTN4 в ядро, ввиду отсутствия в структуре ACTN4 классического сигнала ядерной локализации. Это легло в основу третьего направления исследований этой работы, а именно, уточнения механизмов транспорта ACTN4 в ядро и из ядра.

1.2 Цели и задачи работы

Цель данной работы заключалась в выявлении роли ACTN4 в процессах, протекающих в ядре и регулируемых RelA/p65 субъединицей NF-кВ и гетерогенными ядерными рибонуклеопротеинами А2/В1 и AI.

Достижение поставленной цели предполагает решение следующих задач:

1. Создать экспрессионные конструкции, кодирующие варианты ACTN4 с делециями N-, С-концевых участков и спектриновых доменов белка.

2. Сравнить ядерно-цитоплазматическое распределение экзогенных вариантов

ACTN4 cN-и С-концевыми делециями и делецией спектриновых повторов в условиях длительного культивирования и при распластывании клеток на белке внеклеточного матрикса фибронектине.

3. Исследовать влияние ACTN4 на степень активации минимального промотора мышиного гена c-fos при взаимодействии с RelA/p65 субъединицей NF-kB.

4. Провести анализ экспрессии Яе!А/р65-зависимых генов при оверэкспрессии ACTN4 и RelA/p65 субъединицы NF-kB.

5. Определить влияние N-концевых делеций и делеции спектриновых повторов ACTN4 на регуляцию экспрессии генов, контролируемых RelA/p65 субъединицей NF-kB.

6. Исследовать влияние ACTN4 на процесс альтернативного сплайсинга мРНК генов РКМ1/РКМ2 и SMN1/SMN2.

7. Проверить наличие сплайсинговой изоформы ACTN4 с делецией кальпониновых доменов белка в нормальных и злокачественных клетках человека.

1.3 Научная новизна В настоящей работе впервые представлены данные о регуляции экспрессии Яе1А/р65-зависимых генов, таких как c-fos, металлопротеиназы 3-го (ММР-3) и 1-го (ММР-7) типов, посредством актин-связывающего белка альфа-актинина 4 (ACTN4). Проведен анализ влияния делеционных вариантов ACTN4 на экспрессию гена ММР-3 в сравнении с полноразмерным вариантом ACTN4. Показано, что ACTN4 с делецией спектриновых и кальпониновых доменов сохраняет способность регулировать экспрессию гена ММР-3, что, в свою очередь, позволяет сделать предположение о том, что ACTN4 в ядре потенциально может функционировать в виде мономера. Впервые проведен анализ влияния ACTN4 на процесс альтернативного сплайсинга генов РКМ1/РКМ2 и SMN1/SMN2, регуляция сплайсинга которых опосредована hnRNP А2/В1 и Al. Показано, что делеции спектриновых повторов белка и N-концевого участка, включающего домены связывания с актином, не препятствуют перемещению ACTN4 в ядро, а для экспорта ACTN4 из ядра достаточно одной из двух идентифицированных NES-последовательностей в ACTN4.

1.4 Теоретическая и практическая значимость работы Полученные результаты имеют фундаментальное значение для понимания механизмов участия белков цитоскелета в процессах, протекающих в ядре, таких как, регуляция транскрипции и сплайсинг пре-мРНК. В связи с тем, что мутации в гене ACTN4 приводят к развитию фокально-сегментарного гломерулосклероза - заболевания, связанного с нарушением нормального функционирования подоцитов, а оверэкспрессия ACTN4 отмечена при многих злокачественных заболеваниях, исследование функций ACTN4 приобретает не только фундаментальный, но и прикладной характер. Кроме того,

данные, полученные в ходе исследовательской работы, могут быть использованы для включения их в учебные пособия и курсы лекций Санкт-Петербургского государственного университета, Санкт-Петербургского государственного технологического университета, Санкт-Петербургского государственного политехнического университета и других вузов с факультетами биологического профиля.

1.5 Методы исследования В данной работе были использованы различные методы молекулярной и клеточной биологии, такие как культивирование клеточных линий, полимеразная цепная реакция и полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией, выделение РНК и белков, иммунопреципитация, разделение белков в денатурирующем полиакриламидном геле, иммуноблот анализ, получение генетических конструкций, иммунофлуоресцентный анализ, люциферазный тест и метод рестрикционного анализа.

1.6 Основные положения, выносимые на защиту

1. Ядерно-цитоплазматический транспорт ACTN4 определяется более чем одним доменом в структуре белка.

2. Спектриновые повторы, N- и С- концевые домены ACTN4 существенны для его взаимодействия со структурами актинового цитоскелета.

3. ACTN4 является коактиватором RelA/p65 субъединицы NF-kB.

4. Димеризация и взаимодействие ACTN4 с актином не является необходимым для его функций как коактиватора RelA/p65 субъединицы NF-kB.

5. ACTN4 не является необходимым элементом комплекса, регулирующего сплайсинг мРНК генов РКМ1/РКМ2 и SMN1/SMN2.

6. Изоформа ACTN4 с делецией кальпонин-гомологичных доменов белка является специфичной для клеток линии А431.

1.7 Апробация работы Материалы диссертации были представлены на V съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2009), VIII Международном конгрессе медицинских наук (ICMS) (София, 2009), Международном молодежном симпозиуме и конгрессе FEBS (Гетеборг, 2010), 2-ой Молодежной конференции Института цитологии РАН (Санкт-Петербург, 2010), XVI Всероссийском симпозиуме «Структура и функции клеточного ядра» (Санкт-Петербург, 2010), 3-ей Конференции молодых ученых Института цитологии РАН (Санкт-Петербург, 2012).

Заключение диссертации по теме «Клеточная биология, цитология, гистология», Аксенова, Василиса Юрьевна

выводы

1. Транспорт АСТЖ в ядро и из ядра регулируется наличием в аминокислотной последовательности белка, с 1-го по 753-й остаток, двух или более последовательностей, необходимых для его транспорта в ядро. Как для ядерной локализации, так и для цитоплазматической локализации АСТЖ наличие одной функциональной последовательности является достаточным.

2. Делеции с 1-го по 295-й, с 48-го по 273-й и с 293-го по 753-й аминокислотный остаток приводят к полному нарушению взаимодействия АСТЖ со структурами актинового цитоскелета и к перемещению белка в ядро. Делеции с 753-го по 911-й и с 806-го по 911-й аминокислотный остаток влияют на взаимодействие АСТЖ с Б-актином, но не существенны для импорта АСТЖ в ядро.

3. Внутриклеточное распределение вариантов АСТЖ при делеции с 1-го по 295-й, с 48-го по 273-й и с 293-го по 753-й аминокислотный остаток белка изменяется при длительном культивировании и при кратковременном распластывании клеток.

4. Актин-связывающий белок АСТЖ принимает участие в регуляции экспрессии генов с/05, ММР-3 и ММР-1 опосредованной Яе1А/р65 субъединицей №-кВ, и не принимает участия в регуляции экспрессии генов 1САМ-1, РСГ8, ТИС, РЫ1, РТ082, БАХ.

5. АСТЖ принимает участие в регуляции активности Ке1А/р65 субъединицы транскрипционного фактора №-кВ на уровне транскрипции, не влияя на ядерно-цитоплазматический транспорт 11е1А/р65. Димеризация и взаимодействие АСТЖ с актином в ядре не являются необходимыми для Яе1А/р65-опосредованной активации экспрессии гена ММР-3.

6. АСТЖ не является необходимым элементом комплексов, регулирующих сплайсинг генов РКМ и 8Ш1/8МИ2.

7. В клетках эпидермоидной карциномы А431 присутствует сплайсинговая изоформа АСТЖ с делецией кальпониновых доменов белка. Данная изоформа не выявляется в злокачественных клетках меланомы, рака мочевого пузыря, клетках рака легкого, поджелудочной железы и молочной железы, а также в нормальных фибробластах и кератиноцитах человека.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

1. Хотин М., Туроверова Л., Подольская Е., Краснов И., Соловьева А., Аксенова В., Магнуссон К.-Э., Пинаев Г., Тентлер Д. (2009) Исследование ядерных белковых комплексов альфа-актинина-4 методами двумерного электрофореза и масс-спектрометрии. Цитология.Т.51 (8): 684-690.

2. Aksenova V., Khotin М., Turoverova L., Pinaev G., Tentler D. (2009) Investigation of nuclear functions of actin-binding protein a-actinin-4. F///h International Congress of Medical Science (ICMS) for students and young doctors. 7-10 May, Sophia, Bulgaria. P.56.

3. Аксенова В.Ю., Хотин М.Г., Туроверова Л.В., Пинаев Г.П., Тентлер Д.Г. (2009) Исследование ядерных функций актин-связывающего белка альфа-актинина 4 и его участия в регуляции экспрессии генов. V Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров. 21-28 июня, Москва, Россия. Часть II, С.41.

4. Аксенова В., Хотин М., Туроверова Л., Пинаев Г., Тентлер Д. (2010) Изоформы актин-связывающего белка альфа-актинина 4 (ACTN4) в клетках эпидермоидной карциномы человека (А431). II Молодежная конференг(ия Института г(итологии РАН. 15-16 февраля, Санкт-Петербург, Россия. Т.52 (6): 493.

5. Aksenova V., Khotin М., Turoverova L., Pinaev G., Magnusson E.-E., Tentler D. (2010) Structure and functional specifity of alpha-actinin 4 (ACTN4) isoforms. Young Scientific Forum 23-26 June and FEBS Congress. 26 June - 01 July, Gothenburg, Sweden. FEBS Journal. T.277: 273.

6. Khotin M., Aksenova V., Turoverova L., Magnusson E.-E., Pinaev G., Tentler D. (2010) Alpha-actinin 4 interacts with nuclear proteins, involved in mRNA splicing, transport and stability. Young Scientific Forum 23-26 June and FEBS Congress. 26 June - 01 July, Gothenburg, Sweden. FEBS Journal. T.277: 287.

7. Аксенова В., Хотин M., Туроверова Л., Пинаев Г., Тентлер Д. (2010) Выявление доменов актин-связывающего белка альфа-актинина 4 (ACTN4), ответственных за его локализацию и функционирование в ядре. XVI Симпозиум структура и функции клеточного ядра. 5-7 октября, Санкт-Петербург, Россия. Т.52 (8): 693-694.

8. Khotin М, Turoverova L, Aksenova V, Barlev N, Borutinskaite VV, Vener A, Bajenova O, Magnusson KE, Pinaev GP, Tentler D. (2010). Proteomic analysis of ACTN4-interacting proteins reveals it's a putative involvement in mRNA metabolism. Biochem Biophys Res Commun 397 (2): 192-196.

9. Аксенова В., Хотин M., Туроверова J1.B., Юдинцева Н., Магнуссон К.-Э., Пинаев Г., Тентлер Д. (2012). Новая сплайсинговая изоформа актин-связывающего белка альфа-актинина 4 в клетках эпидермоидой карциномы А431. Цитология 54 (1): 25-32.

10. Аксенова В.Ю., Хотин М.Г., Туроверова J1.B., Барлев H.A., Пинаев Г.П., Тентлер Д.Г. (2013). Участие альфа-актинина 4 в регуляции экспрессии генов и контроле сплайсинга мРНК. Сборник трудов VI международной заочной научно-практической конференции. Научная дискуссия: вопросы физики, химии, биологии, Москва. С.91-101.

11. Aksenova V., Turoverova L., Khotin M., Magniisson K.-E., Tulchinsky E., Melino G., Pinaev G.P., Barlev N., Tentler D. (2013) Actin-binding protein alpha-actinin 4 (ACTN4) is a transcription co-activator of RelA/p65 sub-unit ofNF-кВ. Oncotarget 4 (2): 362-372.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Аксенова, Василиса Юрьевна, 2013 год

СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Албертс Б., Брей Д., Льюис Дж., Рэфф М., Роберте К., Уотсон Дж. Молекулярная биология клетки / под ред. Г.П.Георгиева и Ю.С.Ченцова,- М: Мир, 1994. - Т.2. - 539 с.

2. Бабаков В.Н., Бобков Д.Е., Петухова О.А., Туроверова Л.В., Кропачева И.В., Подольская Е.П., Пинаев Г.П. Альфа-актинин-4 и субъединица p65/RelA транскрипционного фактора NF-кВ в клетках А431 локализуются совместно и мигрируют в ядро при действии эпидермального фактора роста // Цитология. - 2004. - Т.46, №12. - С. 1065-1073.

3. Блинова М. И., Юдинцева Н. М., Калмыкова Н. В., Кузьминых Е. В., Юрлова Н. А., Овчинникова О. А. Действие меланинов из черных дрожжевых грибов на культивируемые клетки человека. I. Пролиферация кератиноцитов и фибробластов // Цитология. - 2002. -Т.44, №8. - С.780—787.

4. Большакова А. В. Распределение р65 субъединицы транскрипционного фактора NF-kB и изоформ а-актинина в связи с реорганизацией актинового цитоскелета: диссертация на соискание ученой степени канд. биол. наук: 03.03.04 / Большакова Анастасия Викторовна. -СПб., 2009.-130 с.

5. Хотин М.Г. Взаимодействие а-актинина 4 с ядерными белковыми комплексами, регулирующими экспрессию генов: диссертация на соискание ученой степени канд. биол. наук: 03.03.04/Хотин Михаил Георгиевич. - СПб., 2010. - 112 с.

6. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генной инженерии. Молекулярное клонирование / под ред. А.А. Баева и К.Г. Скрябина. - М: Мир, 1984. - 480 с.

7. Юдинцева Н.М., Блинова М.И., Пинаев Г.П. Особенности организации цитоскелета у фибробластов нормальной, рубцовой и эмбриональной кожи человека, распластанных на белках внеклеточного матрикса // Цитология. - 2008. - Т.50, №10. - С.861-867.

8. Abrass С.К., Hansen К.М. Insulin-like growth factor-binding protein-5-induced laminin gamma 1 transcription requires filamin A // J. Biol. Chem. - 2010. - V.285, № 17. - P. 12925-34.

9. Are A.F., Galkin V.E., Pospelova T.V., Pinaev G.P. The p65/RelA subunit ofNF-kappaB interacts with actin-containing structures // Exp. Cell Res. - 2000. - V.256, №2. -P.533-44.

10. Alge-Prigliner C.S., Kreutzer Т., Obholzer K., Wolf A., Mempl M., Kernt M., Kampik A., Priglinger S.G. Oxidative Stress-Mediated Induction of MMP-1 and MMP-3 in Human RPE Cells // Inv. Ophtalmol. Vis. Sci. - 2009. - V.50. - P. 5495-5503.

11. An J.H., Kim J.W., Jang S.M., Kim C.H., Kang E.J., Choi K.H. Gelsolin negatively regulates the activity of tumor suppressor p53 through their physical interaction in hepatocarcinoma

HepG2 cells // BBRC. - 2011. - V.412, №1. - P.44-49.

12. Ananthakrishnan R., Ehrlicher A. The forces behind cell movement // Int. J. Biol. Sci. -2007. - V.3. - P.303-317.

13. Archer S.K., Claudianos C., Campbell H.D. Evolution of the gelsolin family of actin-binding proteins as novel transcriptional coactivators // BioEssays. - 2005. - V.27. - P.388-396.

14. Armstrong K., Robson C.N., Leung H.Y. NF-kB Activation Upregulates Fibroblast Growth Factor 8 Expression in Prostate CancerCells // The Prostate. - 2006. - V.66. - P. 1223-1234.

15.Babakov V.N., Petukhova O.A., Turoverova L.V., Kropacheva I.V., Tentler D.G., Bolshakova A.V., Podolskaya E.P., Magnusson K.-E., Pinaev G.P. RelA/NF-KB transcription factor associates with a-actinin-4 // Exper.Cell Res. - 2008. - V.314. - P. 1030-1038.

16. Barbolina M.V., Adley B.P., Kelly D.L., Fought A.J., Scholtens D.M., Shea L.D., Stack M.S. Motility-related actinin alpha-4 is associated with advanced and metastatic ovarian carcinoma // Lab. Invest. - 2008. - V.88, №6. - P.602-14.

17. Bauer K., Kratzer M., Otte M., Luber K., Hagmann J., Georg J.A., Eckerskorn C., Lottspeich F., Siess W. Human CLP36, a PDZ-domain and LIM-domain protein, binds to alpha-actinin-1 and associates with actin filaments and stress fibers in activated platelets and endothelial cells // Blood. - 2000. - V.96. - P.4236-4245.

18. Bentires-Alj M., Dejardin E., Viatour P., Van Lint C., Froesch B., Reed J.C., Merville M.P., Bours V. Inhibition of the NF-kB transcription factor increases Bax expression in cancer cell lines // Oncogene. - 2001. - V.20. - P. 2805-2813.

19. Bertram J.S., Libby P.R., LeStourgeon W.M.Changes in nuclear actin levels with changes in growth state of C3H/10T1/2 cells and the lack of response in malignantly transformed cells // Cancer Res. - 1977. - V.37. - P.4104-4111.

20. Bissell M. J., Hall H. G., Parry G. How does the extracellular matrix direct gene expression? // J. Theor. Biol. - 1982. - V. 99. - P.31-68.

21. Bolshakova A., Petukhova O., Turoverova L., Tentler D., Babakov V., Magnusson K.-E., Pinaev G. Extra-cellular matrix proteins induce re-distribution of a-actinin-1 and a-actinin-4 in A431 cells // Cell Biol. Inter. - 2007. - V.31. - P.360-365.

22. Bolshakova A., Magnusson K-E., Pinaev G., Petukhova O. Functional compartmentalization of NF-kB - associated proteins in A431 cells // Cell Biol. Inter. - 2013. - doi: 10.1002/cbin. 10053.

23. Broderick M.J., Winder S.J. Towards a complete atomic structure of spectrin family proteins Hi. Struct. Biol.-2002.-V.137, №1-2.-P.184-93.

24. Broderick M.J., Winder S.J. Spectrin, a-actinin, and dystrophin // Adv.Prot.Chem. - 2005. -V.70. - P.203-233.

25. Burgueno J., Blake D.J., Benson M.A., Tinsley C. L., Esapa C.T., Canela E.I., Penela P., Mallol J., Mayor F., Lluis C., Franco R., Ciruela F. The adenosine A2A receptor interacts with the actin-binding protein a-actinin Hi. Biol. Chem. - 2003. - V.278, №39. - P.37545-37552.

26. Burridge K., Feramisco J.R. Non-muscle alpha actinins are calcium-sensitive actin-binding proteins // Nature. - 1981. - V.294. - P.565-567.

27. Celli L., Ryckewaert J.-J., Delachanal E., Duperray A. Evidence of a functional role for interaction between ICAM-1 and nonmuscle a-actinins in leukocyte diapedesis // J. Immunol. -2006. - V.177. - P.4113-4121.

28. Chakraborty S, Reineke E.L., Lam M., Li X., Liu Y., Gao C., Khurana S., Kao H.Y. Alpha-actinin 4 potentiates myocyte enhancer factor-2 transcription activity by antagonizing histone deacetylase 7//J. Biol. Chem. - 2006. - V.281.-P.35070-35080.

29. Chhabra D., Bao S., Remedios C.G. The distribution of cofilin and DNase I in vivo // Cell Res. - 2002. - V.12. - P.207-214.

30. Chen M. Regulation of alternative splicing and its connections to cancer: thesis for the degree of Doctor of Philosophy / Mo Chen. - Columbia Univ., 201 1. - 189 p.

31. Chen M., David C.J., Manley J.L. Tumor metabolism hnRNP proteins get in on the act // Cell Cycle. - 2010. - V.9, № 10. - P. 1863-1864.

32. Chen M., Shen X. Nuclear actin and actin-related proteins in chromatin dynamica // Curr.Opin.Cell Biol. - 2007. - V.19. - P.326-330.

33. Chen M, Zhang J, Manley JL. Alternative Splicing of Pyruvate Kinase mRNA Turning on a Fuel Switch of Cancer: hnRNP Proteins Regulate // Cancer Res. - 2010. - V.70. - P.8977-8980.

34. Christerson L.B., Vanderbilt C.A., Cobb M.H. MEKK1 interacts with alpha-actinin and localizes to stress fibers and focal adhesions // Cell Motil.Cytoskeleton. - 1999. - V.43. - P. 186198.

35. Cianfrocca R., Muscolini M., Marzano V., Annibaldi A., Marinari B., Levrero M., Costanzo A., Tuosto L. RelA/NF-kappaB recruitment on the bax gene promoter antagonizes p73-dependent apoptosis in costimulated T cells // Cell Death. Differ. - 2008. - V.15, №2. - P.354-363.

36. Clark T.G., Merriam R.W. Diffusible and bound actin nuclei of Xenopus laevis oocytes // Cell.- 1977,-V.12.-P.883-891.

37. Clark T.G., Rosenbaum J.L. An actin filament matrix in hand-isolated nuclei of X.laevis oocytes // Cell. - 1979. - V.l 8. - P.l 101-1108.

38. Corgan A.M., Singleton C.-A., Santoso C.B., Greenwood J.A. Phosphoinositides defferentially regulate a-actinin flexibility and function // Biochem. J. - 2004. - V.378. -P.1067-1072.

39. Crisp M., Burke B. The nuclear envelope as an integrator of nuclear and cytoplasmic architecture // FEBS Letters. - 2008. - V.582. - P.2023-2032.

40. Dahl K.N., Ribeiro A.J.S., Lammerding J. Nuclear shape, mechanics, and mechanotransduction // Circ. Res. - 2008. - V. 102, № 11. - P. 1307-1318.

41.Daniliuc S., Bitterman H., Rahat M., Kinarty A., Rosenzweig D., Nitza L. Hypoxia inactivates inducible nitric oxide synthase in mouse macropages by disrupting its interaction with a-actinin-4 // J. Immunol. - 2003. - V.171. - P.3225-3232.

42. David C. J., Chen M., Assanah M., Canoll P., Vanley J. HhRNP proteins controlled by c-Myc deregulate pyruvate kinase mRNA splicing in cancer // Nature. - 2010. - V.463. - P.365-369.

43. Delanote V., Impe K.V., De Corte V., Bruyneel E., Vetter G., Boucherie C., Mareel M., Vandekerckhove J., Friederich E., Gettemans J. Molecular basis for dissimilar nuclear trafficking of the actin-bunding protein isoforms T- and L-plastin // Traffic. - 2005. - V.6. - P.335-345.

44. Dijak R., Yildirim S., Kahle M., Novak P., Hnilicova J., Venit T., Hozak P. Specific nuclear localizing sequence directs two myosin isoforms to the cell nucleus in calmodulin-sensitive manner // Plos One. - 2012. - V.7, №1. - P.e30529.

45. Djinovic-Carugo K., Gautel M., Ylanne J., Young P. The spectrin repeat: a structural platform for cytoskeletal protein assemblies // FEBS Letters. - 2002. - V.513. - P.l 19-123.

46. Dreyfuss G., Kim V.N., KataokaN. Messenger-RNA-binding proteins and the messages they carry //Mol. Cell Biol. - 2002. - V.2. - P. 195-205.

47. El-Husseini A.E., Kwasnicka D., Yamada T., Hirohashi S., Vincent S.R. BERP, a novel ring finger protein, binds to alpha-sctinin-4 // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 2000. - V.267, №3. - P. 906-911.

48. Endo T., Masaki T. Molecular properties and functions in vitro of chicken smooth-muscle alpha-actinin in comparison with those of striated-muscle alpha-actinins // J. Biochem. - 1982. -V.92. - P.1457-1468.

49. Fazal F., Minhajuddin M., Bijli K.M., McGrath J.L., Rahman A. Evidence for actin cytoskeleton-dependent and - independent pathways for RelA/p65 nuclear translocation in endothelial cells // J. Biol Chem. - 2006. - V.282, №6. - P.3940-3950.

50. Farina A.R., Tacconelli A., Vacca A., Maroder M., Gulino A., Mackay A.R. Transcriptional Up-Regulation of Matrix Metalloproteinase-9 Expression during Spontaneous Epithelial to Neuroblast Phenotype Conversion by SK-N-SH Neuroblastoma Cells, Involved in Enhanced Invasivity, Depends upon GT-Box and Nuclear Factor kB Elements 1 // Cell Growth Differ. -1999. - V.10.-P.353-367.

51. Farrants A.-K.O. Chromatin remodeling and actin organization // FEBS Letters. - 2008. -V.582.-P.2041-2050.

52. Fisette J.F., Toutant J., Dugre-Brisson S., Desgroseillers L., Chabot B. hnRNP A1 and hnRNP H can collaborate to modulate 5' splice site selection // RNA. - 2010. -V. 16, № 1. - P.228-238.

53. Fomproix N., Percipalle P. An actin-myosin complex on actively transcribing genes // Exp. Cell Res. - 2004. - V.294. - P. 140-148.

54. Fraley T.S., Pereira C.B., Tran T.C., Singleton C., Greenwood J.A. Phosphoinositide binding regulates alpha-actinin dynamics: mechanism for modulating cytoskeletal remodeling // J. Biol. Chem. - 2005. - V.280, №15. - P.15479-82.

55. Fukami K., Furuhashi K., Inagaki M., Endo T., Hatano S., Takenawa T. Requirement of phosphatidylinositol 4,5-biphosphate for a-actinin function // Nature. - 1992. - V.359. - P. 150152.

56. Gettemans J., Van Impe K., Delanote V., Hubert T., Vandekerckhove J., De Corte V. Nuclear actin-binding proteins as modulators of gene transcription // Traffic. - 2005. - V.6, №10. - P.847-57.

57. Gieni R.S., Hendzel M.J. Actin dynamics and functions in the interphase nucleus: moving toward an understanding of nuclear polymeric actin // Biochem.Cell Biol. - 2009. - V.87. -P.283-306.

58. Grisendi S., Pandolfi P.P. NPM mutations in acute myelogenous leukemia // N. Engl. J. Med.

- 2005. - V.352, №3. - P.291-292.

59. Gonzalez A.M., Otey C., Edlund M., Jones J.C. Interactions of hemidesmosome component and actinin family members // J.Cell Sci. - 2001. - V.l 14. - P.4197-4206.

60. Gupta S., Marcel N., Sarin A., Shivashankar G.V. Role of actin dependent nuclear deformation in regulating early gene expression // Plos One. -2012.-V.7,№12.-P.e53031.

61. Hayashida Y., Honda K., Idogawa M., Ino Y., Ono M., Tsuchida A., Aoki T., Hirohachi S., Yamada T. E-cadherins regulates the association between (3-catenin and actinin-4 // Cancer Res.

- 2005. - V.65. - P.8836-8845.

62. Hayden M.S., Ghosh S. Signaling to NF-kB. Genes Dev. - 2004. - V. 18. - P.2195-2224.

63. Han S.P., Tang Y.H., Smith R. Functional diversity of the hnRNPs: past, present and perspectives // Biochem. J. - 2010. - V.430. - P.379-392.

64. Hara T., Honda K., Shitashige M., Ono M., Matsuyama H., Naito K., Hirohashi S., Yamada T. Mass Spectrometry Analysis of the Native Protein Complex Containing Actinin-4 in Prostate Cancer Cells // Mol. Cel. Prot. - 2007. - V.6. - P.479-491.

65. Hatano S., Oosawa F. Isolation and characterization of Plasmodium actin // Biochim. Biophys. Acta. - 1966. - V. 127. - P.488-498.

66. Hatano S., Tazawa M. Isolation, purification and characterization of myosin B from myxomyceta Plasmodium // Biochim. Biophys. Acta. - 1986. - V.154. - P.507-519.

67. Hasler U. An example of functional interaction between NFAT5/TonEBP and nuclear factor-kB by hypertonic stress: aquaporin-2 transcription // Cell Cycle. - 2011. - V. 10. - P.364-5.

68. Hofmann W.A., Johnson T., Klapczynski M., Fan J.-L., Lanerolle P. From transcription to transport: emerging roles for nuclear myosin I // Biochem. Cell Biol. - 2006. - V.84. - P.418-426.

69. Hofmann W. Cell and molecular biology of nuclear actin // Int. Rev. Cell Mol. Biol. - 2009. - Ch.6. - P.219-263.

70. Honda K., Yamada T., Endo R., Ino Y„ Gotoh M., Tsuda H., Yamada Y., Chiba H., Hirohashi S. Actinin-4, a novel actin-bundling protein associated with cell motility and cancer invasion//J. Cell Biol. - 1998. - V. 140, №6. - P.l 383-1393.

71. Honda K., Yamada T., Seike M., Hayashida Y., Idogawa M., Kondo T., Ino Y., Hirohashi S. Alternative splice variant of actinin-4 in small cell lung cancer // Oncogene. - 2004. - V.23. -P.5257-5262.

72. Howell M., Borchers C., Milgram L. Heterogeneous nuclear ribonuclear protein U associates with YAP and regulates its co-activation of Bax transcription // J. Biol. Chem. - 2004. - V.279, №25. - P.26300-26306.

73. Hu P., Wu S., Hernandez N. A minimal RNA polymerase III transcription system from human cell reveals positive and negative regulatory roles for CK.2 // Mol.Cell. - 2003. - V.12. -P.699-709.

74. Irimura S., Kitamura K., Kato N., Saiki K., Takeuchi A., Gunadi, Matsuo M., Nishio H., Lee M.J. HnRNP C1/C2 May Regulate Exon 7 Splicing in the Spinal Muscular Atrophy Gene SMN1 // Kobe J. Med. Sci. - 2009. - V.54, №5. - P.E227-E236.

75. Iwanaga N., Kamachi M., Aratake K., Izumi Y., Ida H., Tanaka F., Tamai M., Arima K., Nakamura H., Origuchi T., Kawakami A., Eguchi K. Regulation of alternative splicing of caspase-2 through an intracellular signaling pathway in response to pro-apoptotic stimuli // J. Lab. Clin. Med.-2005.-V.145.- 105-110.

76. Jayadev R, Kuk CY, Low SH, Hori MM. Calcium sensitivity of a-actinin is required for equatorial actin assembly during cytokinesis // Cell Cycle. - 2012. - V.l 1. - P. 1929-1937.

77. Jeong K^W., Lee Y.H., Stallcup M.R. Recruitment of the SWI/SNF Chromatin Remodeling Complex to Steroid Hormone-regulated Promoters by Nuclear Receptor Coactivator Flightless-I Hi. Biol. Chem. - 2009. - V.284, №43. - P. 29298 -29309.

78. Jodelka F.M., Ebert A.D., Duelli D.M., Hastings M.L. A feedback loop regulates splicing of the spinal muscular atrophy-modifying gene, SMN2 // Hum. Mol. Genet. - 2010. - V. 19, №24. -P.4906^1917.

79. Kandasamy M.K., McKinney E.C., Meagher R.B. Differential sublocalization of actin variants within the nucleus // Cytoskeleton. - 2010. - V.67, №11.- P.729-43.

80. Kikuchi S., Honda K., Tsuda H., Hiraoka N., Imoto I., Kosuqe T., Umaki T., Onozato K., Shitashiqe M., Yamaguchi U., Ono M., Tsuchida A., Aoki T., Inazawa J., Hirohashi S., Yamada T. Expression and gene amplification of actinin-4 in invasive ductal carcinoma of the pancreas // Clin. Cancer Res. - 2008. - V.14, №17. - P.5348-56.

81. Kim J.H., Lee-Kwon W., Park J.B., Ryus S.H., Chris Yun C.H, Donowitz M. Ca2+-dependent inhibition of Na+/H+ exchanger 3(NHE3) requires an NHE3-E3KARP-a-actinin-4 complex for oligomerization and endocytosis // J. Biol. Chem. - 2002. - V.277, №26. - P.23714-23724.

82. Koizumie T., Nakatsuji H., Fukawa T., Avirmed S., Fukumori T., Takahashi M., Kanayama H. The role of actinin-4 in bladder cancer invasion // Urology. - 2010. - V.75. - P.357-364.

83. Kos C.H., Le T.C., Sinha S., Henderson J.M., Kim S.H., Sugimoto H., Kalluri R., Gerszten R.E., Pollak M.R. Mice deficient in alpha-actinin-4 have severe glomerular disease // J. Clin. Invest. - 2003. - V. 111, № 11. - P. 1683-1690.

84. Khurana S., Chakraborty S., Cheng X., Su Y.T., Kao H.Y. The actin-binding protein, actinin alpha 4 (ACTN4), is a nuclear receptor coactivator that promotes proliferation of MCF-7 breast cancer cells // J. Biol. Chem. - 2011. - V. 286, №3. - P. 850-859.

85. Khurana S., Chakraborty S., Lam M., Liu Y., Su Y.T., Zhao X., Saleem M.A., Mathieson P.W., Bruggeman L.A., Kao H.Y. Familial focal segmental glomerulosclerosis (FSGS)-linked a-actinin 4 (ACTN4) protein mutants lose ability to activate transcription by nuclear hormone receptors // J. Biol. Chem. - 2012. - V.287, №15. - P. 12027-35.

86. Khurana S., Chakraborty S., Zhao X., Liu Y., Guan D., Lam M., Huang W., Yang S., Kao H.Y. Identification of a novel LXXLL motif in a-actinin 4-spliced isoform that is critical for its interaction with estrogen receptor a and co-activators // J. Biol. Chem. - 2012. - V.287, №42. -P.35418-29.

87. Kukalev A., Nord Y., Palmberg C., Bergman T., Percipalle P. Actin and hnRNP U cooperate for productive transcription by RNA polymerase II // Nat. Struct. Mol. Biol. - 2005. - V.12. -P.238-244.

88. Kumeta M., Yoshimura S.H., Harata M., Takeyasu K. Molecular mechanisms underlying nucleocytoplasmic shuttling of actinin-4 // J. Cell Sci. - 2010. - V.123, №7. - P. 1020-1030.

89. Kustermans G., Piette J., Legrand-Poels S. Actin-targeting natural compounds as tools to study the role of actin cytoskeleton in signal transduction // Biochem. Pharmacol. - 2008. -V.76, №11,- P. 1310-22.

90. Lane N.J. Intranuclear fibrillar bodies in actinomycin D-treated oocytes // J.Cell Biol. -1969. - V.40.-P.286-291.

>

/

91. Lanzetti L., Palamidessi A., Areces L., Scita G., Di Fiore P.P. Rab5 is a signaling GTPase involved in actin remodeling by receptor tyrosine kinases // Nature. - 2004. - V.429, №6989. -P.309-14.

92. Lee Y.H., Campbell H.D, Stallcup M.R. Developmental^ essential protein flightless I is a nuclear receptor coactivator with actin binding activity // Mol. Cell. Biol. - 2004. - V.24. -P.2103-2117.

93. Lee B.H., Park S.Y., Kang K.B., Park R.W., Kim I.S. NF-kappaB activates fibronectin gene expression in rat hepatocytes // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 2002. - V.297, №5. -P.1218-24.

94. Lee Y.H., Stallcup M.R. Interplay of Fli-I and FLAP1 for regulation of beta-catenin dependent transcription // Nucleic Acids Res. - 2006. - V.34. - P.5052-5059.

95. Lewit-Bentley A., Rety S. EF-hand calcium-binding proteins // Curr. Opin. Struct. Biol. -2000. - V. 10, №6. - P.637-43.

96. Liu Q.Y., Lei J.X., LeBlank J., Sodja C., Ly D., Chariebois C., Walker P.R., Yamada T., Hirohachi S., Sikorska M. Regulation of DNaseY activity by actinin-cc4 during apoptosis // Cell Death Differ. - 2004. - V. 11. - P.645-654.

97. Loy C.J., Sim K.S., Yong E.L. Filamin-A fragment localizes to the nucleus to regulate androgen receptor and coactivator functions // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2003. - V.100, №8. - P.4562-7.

98. Magdolen U., Schroeck F., Creutzburg S., Schmitt M., Magdolen V. Non-muscle alpha-actinin-4 interacts with plasminogen activator inhibitor type-1 (PAI-1) // Biol. Chem. - 2004. -V.385. - P.801-808.

99. Maniotis A. J., Chen C. S., Ingber D. E. Demonstration of mechanical connections between integrins, cytoskeletal filaments, and nucleoplasm that stabilize nuclear structure // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1997. - V.94. - P.849-854.

100. Mettouchi A., Cabon F., Montreau N., Dejong V., Vernier P., Gherzi R., Mercier G., Binetruy B. The c-Jun-Induced Transformation Process Involves Complex Regulation of Tenascin-C Expression // Mol. Cell Biol. - 1997. - V. 17, №6. - P.3202-9.

101. Miralles F., Visa N. Actin in transcription and transcription regulation // Curr. Opin. Chem. Biol. - 2006. - V.18.-P.261-266.

102. Mitsuzawa H., Kanda E., Ishihama A. Rpb7 subunit of RNA polymerase II interacts with an RNA-binding protein involved in processing of transcripts // Nucleic Acids Res. - 2003. -V.31. - P.4696-4701.

103. Miyamoto K., Gurdon J.B. Transcriptional regulation and nuclear reprogramming: roles of nuclear actin and actin-binding proteins // Cell Mol. Life Sci. - 2012. - [Epub ahead of print].

104. Munsie L.N., Desmond C.R., Truant R. Cofilin nuclear-cytoplasmic shuttling affects cofilin-actin rod formation during stress // J. Cell Sci. - 2012. - V. 125, №17. - P.3977-88.

105. Ohnishi T., Kawamura H., Tanaka Y. Actin and myosin-like proteins in the calf thymus cell nucleus Hi. Biochem. - 1964. - V.56. -P.6-15.

106. Otey C.A., Carpen O. Alpha-actinin revisited: A fresh look at an old player // Cell Motil. Cytosk. - 2004. - V.58. - P. 104-111.

107. Nemeth Z.H., Deitch E.A., Davidson M.T., Szabo C., Vizi E.S., Hasko G. Distribution of the actin cytoskeleton results in nuclear factor-kappaB activation and inflammatory mediator production in cultured human intestinal epithelial cells // J.Cell.Physiol. - 2004. - V.200. - P.71-81.

108. Nemethova M., Auinger S., Small J.V. Buiding the actin cytoskeleton: filopodia contribute to the construction of contractile bundles in the lamella // J. Cell Biol. - 2008. - V.180, №6. -P.1233-1244.

109. Nikolopoulos S.N., Spengler B.A., Kisselbach K., Evans A.E., Biedler J.L., Ross R.A. The human non-muscle alpha-actinin ptrotein encoded by the ACTN4 gene suppresses tumorigenicity of human neuroblastoma cells // Oncogene - 2000. - V.19, №3. - P.380-6.

110. Nishida T„ Yabe Y., Fu H. Y., Hayashi Y., Asahi K., Eguchi H., Tsuji S., Tsujii M„ Hayashi N., Kawano S. Geranylgeranylacetone Induces Cyclooxygenase-2 Expression in Cultured Rat Gastric Epithelial Cells Through NF-kB // Dig. Dis. Sci. - 2007. - V.52. - P. 18901896.

111. Nishimura K., Ting H.-J., Harada Y., Tokizane T., Nonomura N., Kang H.-Y., Chang H.-C., Yeh S., Miyamoto H., Shin M., Aozasa K., Okuyama A., Chang C. Modulation of androgen receptor transactivation by gelsolin: a newly identified androgen receptor coregulator // Cancer Res. - 2003. - V.63. - P.4888-4894.

112. Obrdlik A., Percipalle P. The F-actin severing protein cofilin-1 is required for RNA polymerase II transcription elongation // Nucleus. -2011.- V.2, № 1. - P.72-79.

113. Papakonstanti E.A., Stournaras C. Cell responses regulated by early reorganization of actin cytoskeleton // FEBS Letters. - 2008. - V.528. - P.2120-2127.

114. Park C-H, Lee MJ, Ahn J, Kim S, Kim HH, Kim KH, Eun HC, Chung JH. Heat Shock-Induced Matrix Metalloproteinase (MMP)-l and MMP-3 Are Mediated through ERK and JNK Activation and via an Autocrine Interleukin-6 Loop // J. Invest Dermatol. - 2004. - V.12. -P.31012-1019.

1 15. Park M.H., Ahn B-H., Hong Y-K., Min D.S. Overexpression of phospholipase D enhances matrix metalloproteinase-2 expression and glioma cell invasion via protein kinase C and protein kinase A/NF-icB/Spl -mediated signaling pathways // Carcinogenesis. - 2009. - V.30, №2. -P.356-365.

116. Patrie K.M., Drescher A.J., Welihinda A., Mundel P., Margolis B. Interaction of two actin-binding proteins, synaptopodin and a-actinin-4, with the tight junction protein MAGl-1 // J. Biol. Chem. - 2002. - V.277, №33. - P.30183-30190.

117. Pellegrin S„ MellorH. Actin stress fibres Hi. Cell. Sci. - 2007. - V. 120. - P.3491-3499.

118. Percipalle P. Genetic connections of the actin cytoskeleton and beyond // BioEssays. -2007.- V.29.-P.407-411.

119. Percipalle P. Co-transcriptional nuclear actin dynamics // Nucleus. - 2013. - V.4, №1. -P.43-52.

120. Perkins ND, Gilmore TD. Good cop, bad cop: the different faces of NF-kB // Cell Death. Differ. - 2006. - V.13. - P.759-772.

121. Pestonjamasp K.N., Pope R.K., Wulfkuhle J.D., Luna E.J. Supervillin (p205): a novel membrane-associated, F-actin-binding protein in the villin/gelsolin superfamily // J. Cell' Biol. -1997. - V. 139, №5. - P. 1255-1269.

122. Philimonenko V.V., Zhao J., Iben S., Dingova H., Kysela K., Kahle M., Zentgraf H., Hofmann W.A. de Lanerolle P., Hozak P., Grummt I. Nuclear actin and myosin I are required for RNA Polymerase I transcription // Nat. Cell Biol. - 2004. - V.6. - P. 1165-1172.

123. Poch M. T., Al-Kassim L., Smolinski S.M., Hines R.N. Two distinct classes of CCAAT box elements that bind nuclear factor-Y/a-actinin-4: potential role in human CYP1A1 regulation // Toxicol. App. Pharmacol. - 2004. - V. 199. - P.239-250.

124. Poole L.B., Hall A., Nelson K.J. Overview of peroxiredoxins in oxidant defense and redox regulation // Curr. Protoc. Toxicol. - 2011. - Ch.7. - doi: 10.1002/0471140856.tx0709s49.

125. Quick Q., Skalli O. Alpha-actinin 1 and alpha-actinin 4: contrasting roles in the survival, motility, and RhoA signaling of astrocytoma cells // Exp. Cell Res. - 2010. - V.316, JV°6. -P. 1137-47.

126. Rahman A., Anwar K.N., True A.L., Malik A.B. Thrombin-Induced p65 Homodimer Binding to Downstream NF-kB Site of the Promoter Mediates Endothelial ICAM-1 Expression and Neutrophil Adhesion // J. Immunol. - 1999. - V.162. - P.5466-5476.

127. Ridley A.J. Membrane ruffling and signal transduction // BioEssays. - 1994. - V.16, №5. -P.321-327.

128. Saksela K, Baltimore D. Negative Regulation of Immunoglobulin Kappa Light-Chain Gene Transcription by a Short Sequence Homologous to the Murine Bi Repetitive Element // Mol. Cell Biol. - 1993,- V.13. - P.3698-3705.

129. Schleicher M., Jockusch B.M. Actin: its cumbersome pilgrimage through cellular compartments // Histochem. Cell Biol. - 2008. - V.129. - P.695-704.

130. Shih V.F., Tsui R., Caldwell A., Hoffmann A. A single NFkB system for both canonical

and non-canonical signaling//Cell Res. - 2011. - V.21, №1. - P.86-102.

105

131. Silacci P., Mazzolai L., Gauci C., Stergiopulos N., Yin H.I., Hayoz D. Gelsolin superfamily proteins: key regulators of cellular functions // Cell. Mol. Life Sci. - 2004. - V.61. -P.2614-2623.

132. Simard L.R., Belanger M.C., Morissette S., Wride M., Prior T.W., Swoboda K.J. Preclinical validation of multiplex real-time assay to quantify SMN mRNA in patients with SMA // Neurology. - 2007. - V.68, №6. - P.451 -456.

133. Simon D.N., Wilson K.L. The nucleoskeleton as a genome-associated dynamic 'network of networks' // Mol. Cell Biol. - 2011. - V. 12. - P. 695-708.

134. Sjolinder M., Bjork P., Soderberg E., Sabri N., Farrants A.K., Visa N. The growing pre-mRNA recruits actin and chromatin-modifying factors to transcriptionally active genes // Genes Dev.-2005,- V. 19, №16,- P.l871-84.

135. Skare P., Kreivi J-P., Bergstrom A., Karlsson R. Profilin colocalizes with speckles and Cajal bodies: a possible role in pre-mRNA splicing // Exper.Cell Res. - 2003. - V.286. - P.12-21.

136. Small J.V., Rottner K., Kaverina I., Anderson K.I. Assembling an actin cytoskeleton for cell attachment and movement//Biochim. Biophys. Acta.- 1998. - V.1404. - P.271-281.

137. Smith T.C., Fang Z., Luna E.J. Novel interactors and a role for supervillin in early cytokinesis // Cytoskeleton. - 2010. - V.61, №6. - P.346-64.

138. Soderberg E., Hessle V., von Euler A., Visa N. Profilin is assaociated with transcriptionally active genes // Nucleus. - 2012. - V.3, №3. - P.290-9.

139. Straub F.B., Feuera G. Adenosinetriphospate the functional group of actin // Biochem. Biophys. Acta. - 1950. - V.4. - P.455-470.

140. Stuven T., Harmann E., Gorlich D. Exportin 6: a novel export receptor that is specific for profiling:actin complexes // EMBO J. - 2003. - V.22, №21. - P.5928-40.

141. Talukdar I., Sen S., Urbano R„ Thompson J., Yates J.R., Webster N.J. hnRNP A1 and hnRNP F Modulate the Alternative Splicing of Exon 11 of the Insulin Receptor Gene // Plos One. -2011.-V.6, №11.-P. e27869.

142. Tanabe T., Tohnai N. Cyclooxygenase isozymes and their gene structures and expression // Prostaglandins Other Lipid Mediat. - 2002. - V.68-69. - P.95-114.

143. Ting H.-J., Yeh S., Nishimura K., Chang C. Supervillin associates with androgen receptor and modulates its transcriptional activity // PNAS. - 2002. - V.99, №2. - P.661-666.

144. Togashi M., Okuyama S., Wakui H., Komatsuda A., Suzuki D., Toyoda M., Sawada K. Interaction of alpha-actinin-4 with class I PxxP motif-containing OK/SW-CK.16 protein // Nephron Exp.Nephrol. - 2007. - V.107. - P.65-72.

145. Vartiainen M.K. Nuclear actin dynamics - from form to function // FEBS Letters. - 2008. - V.582.-P.2033-2040.

\

\

146. Virel A., Backman L. Molecular evolution and structure of apha-actinin // Mol. Biol. Evol. - 2004. - V.21. - P. 1024-1031.

147. Visa N., Percipalle P. Nuclear functions of actin // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. -2010. - V.2, №4. - P. a000620.

148. Voraberger G., Schafer R., Stratowa C. Cloning of the human gene for intercellular adhesion molecule 1 and analysis of its 5'-regulatory region. Induction by cytokines and phorbol ester // J. Immunol. - 1991. - V. 147, №8. - P.2777-86.

149. Walikonis R.S., Oguni A., Khorosheva E.M., Jeng C.-J., Asuncion F.J., Kennedy M.B. Densin-180 forms a ternary complex with the a-subunit of Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase II and a-actinin //J. Neurosci. - 2001. - V.21, №2. - P.423-433.

150. Weins A., Schwarz K., Faul C., Barisoni L., Linke W., Mundel P. Differentiation- and stress-dependent nuclear cytoplasmic redistribution of myopodin, a novel actin-bundling protein // J.Cell Biol. - 2001. - V. 155, №3. - P.393-403.

151. Weins A., Kenlan P., Herbert S., Le T.C., Villegas I., Kaplan B.S., Appel G.B., Pollak M.R. Mutational and biological analysis of a-actinin04 in focal segmental glomerulosclerosis // J. Am. Soc. Nephrol. - 2005. - V.16. - P.3694-3701.

152. Winder S.T., Ayscough K.R. Actin-binding proteins // J. Cell Sci. - 2005. - V.118. -P.651-654.

153. Wu J.I., Crabtree G.R. Nuclear actin as choreographer of cell morphology and transcription // Science. - 2007. - V.316. - P. 1710-1711.

154. Xu Z.S. Does a loss of TDP-43 function cause neurodegeneration? // Mol. Neurodegener. -2012. - V.7, №27. - doi: 10.1186/1750-1326-7-27.

155. Yamada S., Yanamoto S., Yoshida H., Yoshitomi I., Kawasaki G., Mizuno A., Nemoto T. K.. RNAi-mediated down-regulation of a-actinin-4 decreases invasion potential in oral squamous cell carcinoma // Int. J. Oral Maxillofac. Surg. - 2010. - V. 39. - P.61-67.

156. Yan C., Boyd D.D. Regulation of matrix metalloproteinase gene expression // J. Cell Physiol. - 2007. - V.211, № 1. - P. 19-26.

157. Yan Q, Sun W., Kujala P., Lotfi Y., Vida T.A., Bean A.J. CART: An Hrs/Actinin-4/BERP/Myosin V protein complex required for efficient receptor recycling // Mol. Biol. Cel. -2005,-V.16.-P.2470-2482.

158. Yamamoto S., Tsuda H., Honda K., Kita T., Takano M., Tamai S., Inazawa J., Yamada T., Matsubara O. Actinin-4 expression in ovarian cancer: a novel prognostic indicator independent of clinical stage and histological type // Modern Pathology. - 2007. - V.20. - P. 1278-1285.

159. Young K.G., Kothary R. Spectrin repeat proteins in the nucleus // BioEssays. - 2005. -V.27. - P.144-152.

160. Yue J., Wang Q., Lu H., Brenneman M., Fan F., Shen Z. The cytoskeleton protein filamin-A is required for an efficient recombinational DNA double strand break repair // Cancer Res. -2009. - V.69, №20. - P.7978-85.

161. Zheng B.. Han M., Bernier M., Wen J-K. Nuclear actin and actin-binding proteins in the regulation of transcription and gene expression // FEBS Journal. - 2009. - V.276. - P.2669-2685.

162. Zheng C., Yin Q., Wu H. Structural studies of NF-kB signalling // Cell Res. - 2011. -V.21. - P.183-367.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ACTN4 - alpha-actinin 4 (ген)

ACTN4 - alpha-actinin 4 (белок)

ACTN4F1 - full-length alpha-actinin 4

ACTN4Iso - isoform of alpha-actinin 4 (делеция 48-273 a.o.)

BAF - barrie-to-autointegration factor

DAPI - 4',6-Diamin-2-phenyindole

DMEM - Dulbecco's Modified Eagle Medium

cNLS - classical nuclear localization signal CMV - cytomegalovirus promoter CH - calponin homology domain EF - EF-hands

ECL- enhanced luminol-based chemiluminiscence

HEPES -4-(2-hydroxyethyl)-l-piperazineethanesulfonic acid

hnRNP - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein

MMP - metalloproteinase

NLS - nuclear localization signal

NES - nuclear export signal

PIP2 -phosphatidylinositol 4',5-biphosphate

PIP3 - phosphatidylinositol 3\4',5-triphosphate

PI3(K) - phosphoinositide 3-kinases

PBS - фосфатно-солевой буфер

PMSF - phenylmethanesulphonylfluoride

PVDF - polyvinylidene difluoride (membrane)

SDS - sodium dodecyl sulfate

SR - spectrin repeats

snRNP - small nuclear ribonucleoprotein

TAE - tris-acetate -EDTA buffer

a.o. - аминокислотный остаток

ДТТ - дитиотреитол

мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота (зрелая мРНК)

пре-мРНК- предшественник мРНК

рРНК - рибосомная РНК

ОТ-ПЦР - полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией

ПААГ - полиакриламидный гель

п.н.(о.) - пар нуклеотидов (оснований)

ЭДТА - этилендиаминтетраацетат

ЭФР - эпидермальный фактор роста