Теоретические и экспериментальные основы микробиологической безопасности консервированных кормов для жвачных сельскохозяйственных животных тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.06, доктор наук Йылдырым Елена Александровна
- Специальность ВАК РФ03.01.06
- Количество страниц 469
Оглавление диссертации доктор наук Йылдырым Елена Александровна
2 ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ
2.1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1.1 Закономерность организации и функционирования бактериальных сообществ в силосной экосистеме и их роль в ферментационных процессах
2.1.2 Роль эпифитной микрофлоры кормовых культур как основы получения качественных и безопасных кормов
2.1.3 Проблема присутствия микроскопических грибов и микотоксинов в объемистых кормах
2.1.3.1 Биоразнообразие токсигенных микромицетов в кормовом травостое и силосе
2.1.3.2 Распространение микотоксинов в кормовом травостое и силосе
2.1.3.3 Метаболизм микотоксинов в организме КРС и их воздействие на состояние здоровья и молочную продуктивность
2.1.4 Структура и функции микробиоценозов организма жвачных животных и их роль в физиологических процессах
2.1.5 Современный подход к получению безопасных консервированных кормов
2.1.5.1 Биодеструкция микотоксинов штаммами бактерий: метаболические пути и генетические системы
2.1.5.2 Управление микробными популяциями в силосной экосистеме с помощью интродукции штаммов бактерий
2.1.5.3 Профилактика и лечение микотоксикозов КРС в животноводстве с помощью метода энтеросорбции
2.1.6 Разнообразие существующих методов исследования структуры микробных сообществ экосистем
2.1.7 Современные методы исследования содержания микотоксинов
2.2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЙ
2.2.1 Объекты исследований
2.2.2 Методика отбора образцов
2.2.3 Микробиологические методы культивирования, идентификации и исследования антимикробной активности микроорганизмов
2.2.4 Молекулярно-биологические методы анализа микрофлоры: T-RFLP, NGS-секвенирование, количественная ПЦР, секвенирование
2.2.5 Аналитические методы исследования
2.2.5.1 Биохимический анализ кормов, крови, молока
2.2.5.2 Анализ содержания микотоксинов методами ИФА и ВЭЖХ
2.2.5.3 Анализ спектра метаболитов штаммов бактерий методами ГЖХ-МС и HPLC153
2.2.5.4 Технология производства сорбента микотоксинов
2.2.5.5 Методика определения сорбционной емкости сорбента микотоксинов
2.2.6 Методика постановки лабораторных экспериментов по биодеструкции микотоксинов
2.2.7 Методика постановки модельных экспериментов по консервированию кормов158
2.2.8 Методики проведения научно-хозяйственных экспериментов
2.2.9 Математическая и статистическая обработка материалов исследований
2.3 РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.3.1 Результаты метагеномного анализа закономерностей организации комплексов микробиоты, важных для создания биологически безопасных кормов
2.3.1.1 Закономерности организации комплексов эпифитной микрофлоры
2.3.1.1.1 Разнообразие микрофлоры филлосферы в зависимости от вида кормовой культуры
2.3.1.1.2 Тенденции формирования структуры эпифитного метагенома кормовых культур под влиянием различных экологических факторов
2.3.1.1.3 Вклад состава ризосферной микрофлоры в формирование эпифитного микробиоценоза кормовых культур
2.3.1.2 Результаты изучения микроэкологии силосного микробиоценоза
2.3.1.2.1 Структура микробиома на разных этапах технологического процесса производства силоса
2.3.1.2.2 Особенности состава микробиоценоза сенажа и плющеного зерна
2.3.1.3 Связь состава микрофлоры кормов со структурой микробиома жвачных и состоянием здоровья
2.3.1.4 Влияние микотоксинов кормов на состав микрофлоры рубца жвачных
2.3.2 Результаты исследования содержания микотоксинов и микромицетов - их продуцентов - в травостое и силосе
2.3.2.1 Распространение микромицетов - продуцентов микотоксинов - в филлосфере кормового травостоя и силосе
2.3.2.2 Результаты анализа распространения микотоксинов в растениях в процессе вегетации
2.3.2.2.1 Распространение микотоксинов в фуражном травостое
2.3.2.2.2 Распространение микотоксинов в кормах жвачных Арктической зоны РФ
2.3.2.3 Мониторинг содержания микотоксинов в консервированных кормах
2.3.2.3.1 Распространение микотоксинов в силосах из животноводческих хозяйств
Российской Федерации
3.2.3.2. Содержание микотоксинов в зависимости от срока хранения и вида корма
2.3.2.3.3 Мониторинг содержания афлатоксина М1 в молоке коров
2.3.3 Разработка комплексной стратегии получения безопасных кормов
2.3.3.1 Создание коллекции перспективных биоконтролирующих агентов для подавления патогенных бактерий и микромицетов
2.3.3.2 Исследование способности штаммов-антагонистов к биодеструкции микотоксинов in vitro
2.3.3.3 Изучение спектра антимикробных метаболитов штаммов в составе заквасок методами ГЖХ-МС и HPLC
2.3.3.4 Применение биоконтроля для снижения микотоксикологической нагрузки в процессе вегетации кормовых культур
2.3.3.5 Результаты производственной проверки биоконтролирующих штаммов бактерий в процессе консервирования кормов
2.3.3.6 Экономическая эффективность применения силосных заквасок
2.3.3.7 Этапы разработки новой полиштаммовой закваски Биотроф2+
2.3.3.7.1 Лабораторные эксперименты по разработке закваски Биотроф2+
2.3.3.7.2 Физиолого-биохимические свойства и анализ токсичности штаммов в составе закваски Биотроф 2+
2.3.3.7.3 Молекулярно-генетическая идентификация штаммов в составе закваски Биотроф2+
2.3.3.7.4 Модельные эксперименты по силосованию с применением новой закваски Биотроф2+
2.3.3.7.5 Производственные испытания новой полиштаммовой закваски Биотроф2+
2.3.3.7.6 Разработка технологии производства закваски Биотроф2+
2.3.4 Разработка комплексных энтеросорбентов микотоксинов для молочного животноводства
2.3.4.1 Выбор носителя для энтеросорбентов микотоксинов на основе анализа сорбционой емкости
2.3.4.2 Выбор модификаторов и разработка технологических параметров процесса производства Заслона-Фито
2.3.4.3 Определение токсичности Заслона-Фито
2.3.4.4 Результаты производственных испытаний Заслона-Фито на КРС
2.3.4.4.2 Результаты исследования эффективности энтеросорбента фитобиотика Заслона-Фито в рационах дойных коров
2.3.4.5 Экономическая эффективность применения Заслона-Фито в животноводстве
2.3.4.6 Изучение эффективности нового комплексного энтеросорбента Заслон2+ в
молочном животноводстве
3 ЗАКЛЮЧЕНИЕ
3.1 ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.2 ВЫВОДЫ
3.3 РЕКОМЕНДАЦИИ ПРОИЗВОДСТВУ
3.4 ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
Приложение 1. Состав эпифитной микрофлоры кормовых культур с использованием
метода T-RFLP
Приложение 2. Метагеномный состав эпифитной микрофлоры кормовых культур с
использованием метода NGS-секвенирование
Приложение 3. Содержание лактобактерий в силосе из разнотравья методом T-
RFLP
Приложение 4. Идентификационные признаки полученных изолятов
Приложение 5. Гомология секвенированного фрагмента ДНК штамма B. subtilis 111 в
соответствии с базой данных GenBank
Приложение 6. Зоотехнические показатели молодняка КРС контрольной группы466 Приложение 7. Влияние кормовой добавки Заслон-Фито на рост и развитие молодняка
КРС опытной группы
Приложение 8. Результаты исследования Биотрофа 2+ методом ГЗТ на мышах... 468 Приложение 9. Результаты исследования Заслона-Фито методом ГЗТ на мышах
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биотехнология (в том числе бионанотехнологии)», 03.01.06 шифр ВАК
Повышение питательной ценности силоса и сенажа с использованием биоконсервантов2024 год, кандидат наук Биконя Светлана Николаевна
МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ ПРЕПАРАТ ДЛЯ БИОКОНСЕРВИРОВАНИЯРАСТИТЕЛЬНЫХ РЕСУРСОВ НА ОСНОВЕ НОВЫХ ШТАММОВLactobacillus plantarum, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ПРИРОДНЫХИСТОЧНИКОВ2016 год, доктор наук Шурхно Равиля Абдулловна
Микотоксины в силосованных кормах и методы их нейтрализации2018 год, кандидат наук Соколова Ольга Николаевна
Гетероферментативные молочнокислые бактерии и перспективы их использования в растениеводстве и кормопроизводстве2009 год, кандидат биологических наук Йылдырым, Елена Александровна
«Влияние энтеросорбентов на физиологическое состояние телят и коров в сухостойный период»2020 год, кандидат наук Бажинская Анастасия Андреевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Теоретические и экспериментальные основы микробиологической безопасности консервированных кормов для жвачных сельскохозяйственных животных»
1 ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования. Здоровье и продуктивность коров напрямую связаны с состоянием их рубцового пищеварения, которое невозможно оптимизировать без наличия в рационах безопасных консервированных кормов хорошего качества. Потребление животными силоса и сенажа оказывает стимулирующее воздействие на деятельности рубца, улучшая состав рубцовой микрофлоры, процессы пищеварения, состояние здоровья животных и поддержания на определенном уровне показателей молочной продуктивности. Клетчатка, содержащаяся в данных кормах, оказывает механическое воздействие на стенки рубца и кишечника, стимулируя моторную функцию и перистальтику ЖКТ, удлиняя процесс руминации, в результате чего происходит выделение значительных объемов слюны, создающей щелочную реакцию, что обеспечивает поддержание кислотности рубца на оптимальном уровне рН (не ниже 6,5 - 7,0).
Однако объемистые корма по сравнению с концентратами содержат относительно низкое количество обменной энергии (ОЭ), имеющей принципиальное значение в кормлении животных. Содержание ОЭ уменьшается пропорционально со снижением качества сырья в результате выбора кормовых культур без учета уровня силосуемости, несоблюдения правил агротехники, технологии закладки и хранения кормов, отказа от использования консервантов. Потребление кормов низкого качества ведет к снижению поедаемости, падению живой массы и уровня молочной продуктивности, раннему наступлению пика лактации и быстрому спаду лактационной кривой, что вынуждает компенсировать недостаток ОЭ в рационе с помощью введения дополнительного количества концентратов.
В последние годы в животноводческих хозяйствах Российской Федерации резкий скачок уровня молочной продуктивности коров за счет увеличения доли перенасыщенных энергией концентрированных кормов в рационе привел к серьезным
метаболическим расстройствам организма животных, таким как ацидоз, снижение переваримости питательных веществ, нарушение синтеза ЛЖК и др. По мнению различных исследователей (Nocek, 1997), данные нарушения состояния здоровья коров напрямую связаны с дисбиотическими явлениями в рубце, прежде всего падением численности целлюлозолитических микроорганизмов и увеличением содержания патогенов (прежде всего фузобактерий) вследствие снижения уровня рН.
Дисбиоз рубца и снижение переваримости питательных веществ влекут за собой целый каскад нарушений: снижение продуктивности, проблемы воспроизводства, заболевания конечностей, вымени, органов пищеварительной системы и др. Как результат, в высокопродуктивных стадах наблюдается сокращение продуктивного долголетия животных до 2-3 лактаций.
В сложившейся ситуации сохранение численности животных в стадах компенсируется засчет импорта телок или нетелей, что существенно удорожает молочную продукцию и делает ее неконкурентоспособной.
Высокий уровень продуктивности КРС на фоне снижения концентрированных кормов в рационе может быть достигнут исключительно за счет повышения качества кормов собственной заготовки.
Отечественная школа микробиологии силосования, ведущая начало с трудов Гардера (Гардер и др., 1935а, Гардер и др., 1935б, Мишустин, 1933, 1947, 1964 Федулина, 1965), много лет назад сформировала представление о том, что микроорганизмы, присутствующие в консервированных кормах, полностью определяют направленность ферментационных процессов при созревании силосной массы, оказывая непосредственное влияние на показатели качества и безопасности для жвачных животных и человека. Был опубликован ряд работ (Wiedmann et al., 1994, Fenlon, 1988, Sanaa et al., 1993, Buxton et al., 2003, Ho et al., 2007, Tasci et al., 2010, Driehuis, 2013, Muck, 2013), содержащих указание на то, что хранящийся силос, заложенный с нарушениями технологии, является одним из основных резервуаров и источников заражения сельскохозяйственных животных и человека патогенными микроорганизмами, поскольку ряд опасных бактерий, таких как Listeria monocytogenes (Sanaa et al., 1993, Tasci et al., 2010), Salmonella sp., энтерогеморрагическая E. coli (Lindgren, 1991) и др. -
способны выживать и увеличивать свою численность в консервированных объемистых кормах. При этом встречаются отдельные упоминания (Lindgren, 1991) того, что вспышки инфекционных заболеваний жвачных животных имеют связь с контаминацией скармливаемого им силоса патогенными бактериями. Таким образом, состав микрофлоры рубца, и как следствие, продуктивность и состояние здоровья КРС, находится в тесной зависимости от микробиоценоза потребляемых кормов (Vissers et al., 2007, Driehuis, 2013).
При этом силосная микробиоэкосистема представляет собой крайне интересный объект для исследования, поскольку она является искусственно созданной, непрерывно изменяющейся и подвергающейся анропогенному прессу, что делает ее уникальной микробиоэкологической нишей. Для нее характерны очень сложные внутренние связи и специфические закономерностями динамики. Резкая смена значений сукцессионных агентов (окислительно-восстановительного потенциала, температуры, влажности, уровня рН, порой достигающего экстремальных величин, и др.) определяет уникальность таксономического разнообразия микрообиоценоза, крайне гетерогенного и динамичного. В условиях, искусственно созданных или упрощенных человеком, регуляторные связи ослаблены и, следовательно, в них возможны как неконтролируемое размножение отдельных представителей естественных сообществ микробиоты, так и уменьшение численности других.
К сожалению, в России исследования микрофлоры силоса с использованием молекулярно-биологических методов практически не проводятся. Зарубежные исследования (McEniry et al., 2008, 2010, Eikmeyer et al., 2013, Ni et al., 2015), посвященные анализу микробиоценоза силоса с применением современных методов также носят фрагментарный характер. Это во многом объясняется возникающей на пути исследователей проблемой невозможности получения качественной тотальной ДНК, в связи с особенностями физико-химического состава силоса: наличием большого количества органических примесей (фенолов и их соединений, полисахаридов, органических кислот, нуклеаз и др.) (Buxton et al., 2003), которые могут снижать качество очистки ДНК (Tebbe, Vahjen, 1993, Zhou et al., 1996, Sylvia, 2005). Важно, что специфика технологического процесса кормопроизводства нашей страны: суровые климатические
условия, в некоторых случаях несоблюдение санитарно-гигиенических условий, достаточно низкая материально-техническая оснащенность и тд., - может оказать существенное влияние на состав микрофлоры кормов.
Подобным же образом практически лишены заслуженного внимания и эпифитные микроорганизмы кормовых культур, которые, как известно, являются источником формирования микробиоценоза силоса. На фоне того, что отечественные работы по изучению микробно-растительных взаимодействий охватывают в полной мере различные аспекты взаимоотношений растений с фитопатогенами (Пересыпкин, 1989, Билай и др., 1988, Гагкаева, Гаврилова, 2011, Ганнибал, Орина, 2013, Орина и др., 2014), а также микроорганизмами почвы и ризосферной зоны (Андронов и др., 2009, Андронов и др., 2012, Дольник и др., 2012, Першина и др., 2011), монография Ю.М. Возняковской «Микрофлора растений и урожай» (Возняковская, 1969), опубликованная в 1969 году, является пожалуй единственным капитальным трудом, посвященным изучению состава и функций эпифитных микроорганизмов здоровых растений.
Некоторые представители микрофлоры, прежде всего, токсигенные микромицеты, развивающиеся в тканях кормовых растений (Mansfield, 2005, 2008, Boudra , Morgavi, 2008, Teller at al., 2012) и консервированном корме (Диаз и др., 2006, Безбородова, 2009, Бурдов, 2013, Кононенко, Буркин, 2014, Buxton et al., 2003, Mansfield, Kuldau, 2007, Richard et al., 2007, 2009, Gonzales Pereyra et al., 2008, Driehuis, 2013, Cheli et al., 2013, Muck, 2013 и др.), способны накапливать собственные вторичные метаболиты - токсины, вызывающие серьезные заболевания у млекопитающих, в т.ч., человека.
С отравлениями микотоксинами человечество познакомилось очень давно, и, пожалуй, наиболее ранние свидетельства таких отравлений, как отмечали в своих работах В.В. Солдатова (Солдатова и др., 2015) и Г.Ю. Лаптев (Лаптев, 2015), связаны с заболеваниями эрготизмом, бушевавшими наряду с чумой в Средние века в Европе. Это заболевание возникает в результате попадания в организм токсинов микромицета рода Claviceps, поражающего рожь в процессе вегетации. В нашей стране проблема микотоксикозов привлекла внимание ученых и практиков в 40-50-х годах прошлого века. Советские исследователи впервые обнаружили, что зерно, пораженное F. sporotrichioides, являлось причиной фузариотоксикозов кур и уток, а зернопродукты,
контаминированные этим микромицетом, - алиментарной токсической алейкии человека, унесшей жизни десятков тысяч людей в СССР (Mirocha, 1984).
Доказано, что микотоксины подавляют иммунную систему, нарушают работу рубца, кишечника, печени, почек, репродуктивной, нервной системы и пр (Диаз и др., 2006). По статистике 20-30% абортов у коров связано с потреблением токсичного корма, что влечет за собой серьезный экономический ущерб, поскольку на сегодняшний день средняя стоимость нетели составляет 2 500-3000 евро. Особенно опасно воздействие микотоксинов на коров в новотельном периоде, когда организм животных испытывает сильнейшее перенапряжение функции детоксикации, стресс эндоплазматического ретикулума в печени и ослабление иммунной системы. Не менее пагубно влияют микотоксины на телят, имеющих не сформировавшийся рубцовый микробиоценоз, но уже частично переведенных на рацион взрослого животного. У животных в другие физиологические периоды, способных частично компенсировать токсическую нагрузку силами организма, микотоксикозы часто переходят в хроническую форму с неявно выраженными симптомами и трудно поддающиеся диагностике. Микотоксины могут наносить ущерб здоровью КРС, присутствуя даже в следовых количествах.
Как показали результаты исследований (Диаз и др., 2006, Безбородова, 2009, Бурдов, 2013, Кононенко, Буркин, 2014, Лаптев, 2015, Солдатова и др., 2015, Buxton et al., 2003, Mansfield, Kuldau, 2007, Richard et al., 2007, 2009, Gonzales Pereyra et al., 2008, Driehuis, 2013, Cheli et al., 2013, Muck, 2013 и др.) чаще всего микотоксины в кормах присутствуют в сочетании, что приводит к увеличению их токсичного действия в результате синергетического эффекта. Даже в тех случаях, когда количество микотоксинов не превышает установленных уровней ПДК, наличие нескольких микотоксинов усиливает и пролонгирует их токсическое действие на животное, вызывая постепенную задержку роста и снижение продуктивности (Петрович С.В, 1991, Диаз и др., 2006).
Контаминация микотоксинами корма происходит уже в период роста сельскохозяйственных культур (Лаптев, 2015, Солдатова и др., 2015, Mansfield, 2005, 2008, Boudra , Morgavi, 2008, Teller at al., 2012). Поэтому отсутствие микроскопических грибов в корме не является гарантией того, что он не загрязнен микотоксинами. Кроме
того, как показано рядом авторов (Boysen et al., 2000; El-Shanawany et al., 2005, Richard et al., 2007, 2009, Mansfield, Kuldau, 2007, Gonzales Pereyra et al., 2008), такие микромицеты, как Aspergillus fumigatus, Byssochlamys nivea, Fusarium sp., Monascus sp. и Penicillium roqueforti способны размножаться в силосной экистеме, проявляя устойчивость к высоким уровням органических кислот и диоксида углерода, в дополнение к низкой доступности кислорода вопреки традиционным представлениям. В связи с этим силос является основным источником микотоксинов (Диаз, 2006, Лаптев, 2015, Солдатова и др., 2015, Cheeke, 1995, Driehuis et al., 2008, Mansfield, et al., 2008, Storm, 2008, Richard et al., 2009, Driehuis, 2013, Cheli et al., 2013, Skladanka, 2013, Gallo, 2015 и др.).
Необходимо отметить также сложную диагностику микотоксикозов жвачных и несовершенный контроль в животноводческих хозяйствах объемистых кормов на содержание микотоксинов.
Физиология другого вида жвачных, - Rangifer tarandus, - в том числе, состояние рубцовой микрофлоры, претерпевает гораздо меньшее антропогенное вмешательство в отличие от крупного рогатого скота. Однако, рядом исследователей отмечено возникновение интоксикации организма северных оленей вследствие потребления лишайников. Публикации, касающиеся содержания токсичных метаболитов микромицетов в составе летних пастбищных рационах северных оленей полностью отсутствуют как в отечественной, так и зарубежной литературе.
В связи с этим пристальное внимание исследователей привлекает способность микроорганизмов к осуществлению биодеструкции микотоксинов до нетоксичных соединений (Engler et al., 2000, Khan et al., 2001, Cavaglieri et al., 2004, Palumbo et al., 2006, Zhang et al., 2008, Cho et al., 2009, Reddy et al., 2009) с целью разработки биологических заквасок для силосования и комплексных энтеросорбентов. Предполагается (Takahashi-Ando et al., 2002, Abrunhosa et al., 2006, Schatzmayr et al., 2006), что эффективность биотрансформации обеспечивается большой лабильностью метаболизма микроорганизмов: огромным разнообразием ферментных систем, синтезом органических кислот и других разнообразных соединений.
Таким образом, анализ сложившейся ситуации показал, что изучению состава микрофлоры и микотоксинов в консервированных кормах, определяющих в конечном
итоге безопасность готового силоса и сенажа, в России не уделяется должного внимания, что делает исследования в данном направлении крайне актуальной задачей. Среди зарубежной литературы также не было выявлено аналогичных комплексных работ, направленных на изучение данных вопросов. Для интенсификации отрасли кормопроизводства в России, повышения конкурентоспособности, качества и безопасности продукции, требуется комплексный научный подход. Одним из таких подходов может стать применение совокупности молекулярно-биологических методов для анализа микробиоценоза, которые позволят продвинуться в направлении совершенствования кормовой базы, охраны здоровья жвачных животных, повышения природного потенциала микро- и макроорганизмов, поиска натуральных иммуномодулирующих средств как альтернативы антибиотикам, охраны окружающей
среды.
Степень разработанности темы исследования. Известно, что до 90-х годов прошлого столетия исследования эпифитных и силосных микроорганизмов были основаны на изучении культивируемых штаммов на искусственных питательных средах (Мишустин, 1933, 1947, 1964, Квасников, 1960, Мак-Дональд, 1985, Langston, Bouma, 1960, Lindgren et al., 1985, Weinberg, 1987, Jonsson, 1991, Lin et al., 1992). Использование данных методов сформировало устойчивое мнение о низком микробном разнообразии в данных биоэкосистемах.
Однако, появление по-настоящему революционного метода секвенирования нуклеиновых кислот, как способа изучения таксономической принадлежности микроорганизмов продемонстрировало, что все сведения, полученные с использованием традиционных микробиологических методов неточны. Так, в 1995 году было показано (Amann et al., 1995), что стандартные микробиологические методы позволяют изучить не более 0,1—15% микробиоразнообразия в большинстве природных экосистем.
Значительно позже рядом исследователей (Соколенко, 2000, Ekweozor et al., 1998, Alexander et al., 1999) было продемонстрировано, что многие грамотрицательные бактерии, способны к длительному переживанию неблагоприятных условий внешней среды в виде вегетативных клеток со значительно сниженной метаболической активностью и не обнаруживаемых традиционными методами лабораторного
культивирования. Другой причиной несоответствия результатов классических микробиологических и молекулярно-биологических методов является то, что значительная часть микроорганизмов относится к категории объектов, для которых в настоящее время не подобраны адекватные условия культивирования (Simu, Hagstrom, 2004).
В связи с этим, подход, основанный на традиционных микробиологических исследованиях (Мишустин, 1933, 1947, 1964, Квасников, 1960, Мак-Дональд, 1985, Langston, Bouma, 1960, Lindgren et al., 1985, Weinberg, 1987, Jonsson, 1991, Lin et al., 1992), помимо значительной трудоемкости, приводит в большинстве случаев к серьезной недооценке и пересмотру представлений об истинном биоразнообразии, взаимоотношениях и биологической роли микроорганизмов кормовых культур и получаемых консервированных кормов.
Тем не менее, изучение состава микроорганизмов силоса с применением анализа структуры нуклеотидных последовательностей ДНК представляется достаточно логичным в связи с тем, что ДНК в свободном виде (не заключенная в костную и др. ткань) - достаточно не стабильная молекула и претерпевает быструю деградацию под воздействием агрессивных факторов внешней среды, например, органических кислот. В связи с этим, использованием методики, основанной на данном принципе, достаточно эффективно отражает численность жизнеспособных представителей микробных экосистем.
Остается также в тени вопрос о токсинопродуцирующей роли представителей микробиоценоза консервированных кормов. Так, среди отечественной литературы существуют лишь единичные работы (Безбородова, 2009, Бурдов, 2013, Кононенко, Буркин, 2014, Лаптев, 2015, Солдатова и др., 2015), посвященные изучению содержания микотоксинов в силосе и кормовом травостое в период вегетации. Вероятно, это связано с традиционным мнением о том, что проблема микотоксикозов и зараженности кормов микотоксинами для крупного рогатого скота менее актуальна, чем для моногастричных животных и птиц (Kurmanov, 1978, Pasteiner, 1994, Fink-Gremmels, 2008). Однако это утверждение было справедливо для низкопродуктивных животных с уровнем удоя не более 5 тыс. кг в год. В настоящее время показано, что у высокопродуктивных
животных состав микрофлоры рубца существенно отличается от микрофлоры рубца коров с низкими показателями продуктивности (Ушакова и др., 2013). Микрофлора рубца «современной» коровы, особенно с продуктивностью от 5 тыс. кг/год и выше, испытывает серьезные дисбиотические нарушения и теряет способность к естественной детоксикации микотоксинов (Westlake et al., 1989, Escoula, 1992, Höhler et al., 1999, May et al., 2000, Mazumder, 2002). Кроме того, продукты распада микотоксинов, даже на фоне благоприятного состава микрофлоры, часто оказываются не менее или даже более токсичными, чем первоначальные вещества (Trucksess et al., 1983, Kiessling et al., 1984). Так, в организме коров происходит трансформация афлатоксина В1 до не менее токсичных афлатоксикола и афлатоксина M1, которые уже через несколько часов обнаруживаются в молоке (Polan et al., 1974).
При разработке профилактических мероприятий по повышению уровня гигиены консервированных кормов следует учитывать, что основой современной концепции борьбы с патогенами и их токсинами является оптимизация микроэкологических ниш агроэкосистем, которая должна учитывать принцип саморегуляции. Поиск новых штаммов бактерий для эффективного управления микробными сообществами силоса, а также натуральных энтеросорбентов токсинов, обладающих высокой и необратимой сорбционной емкостью при адекватной норме ввода в корма, а также отсутствием связывающей способности по отношению к незаменимым микро- и макроэлементам, витаминам и питательным веществам, является актуальной задачей.
Цель и задачи исследования. Цель настоящей работы - изучение закономерностей формирования и взаимосвязи естественных и искусственных сообществ микроорганизмов и продуцируемых ими токсичных метаболитов в консервированных кормах для жвачных сельскохозяйственных животных, поиск новых штаммов бактерий для эффективного управления микробными сообществами при силосовании, а также натуральных энтеросорбентов токсинов, обладающих высокой и необратимой сорбционной емкостью.
Для реализации цели поставлены следующие задачи:
- изучить с использованием молекулярно-биологического анализа состав и функционирование комплексов эпифитной (и ризосферной), а также силосной микробиоты, влияющих на безопасность кормов;
- установить связь структуры микробиома жвачных с составом микробиоты кормовых ресурсов и определить возможность коррекции микробиома жвачных посредством использования кормовых биодобавок;
- изучить закономерности накопления микромицетов и их токсичных метаболитов на фуражных сельскохозяйственных культурах и получаемых из них консервированных кормах для жвачных;
- осуществить мониторинг содержания афлатоксина М1 в молоке коров и сопоставить уровень его представленности с качеством потребляемых кормов и использованием кормовых биодобавок;
- исследовать влияние микотоксинов кормов на состав микрофлоры рубца жвачных;
- создать коллекцию штаммов бактерий, обладающих потенциалом биодеградации микотоксинов и антимикробными свойствами, исследовать механизмы биоконтролирующей активности, изучить физиологические и технологические характеристики;
- провести производственные эксперименты по изучению эффективности интродукции биоконтролирующих штаммов бактерий в процессе вегетации кормовых культур и консервирования кормов;
- разработать для силосования кормовых культур новый биопрепарат с антимикробной активностью в отношении патогенов и способностью к биодеструкции микотоксинов, провести модельные и производственные эксперименты по приготовлению силоса с новой закваской, научно-хозяйственные эксперименты по эффективности скармливания экспериментального силоса лактирующим коровам;
- разработать энтеросорбенты микотоксинов для крупного рогатого скота с полифункциональными свойствами и провести научно-хозяйственные эксперименты по эффективности их использования в рационах дойных коров;
- разработать и внедрить в производство научно-обоснованные практические рекомендации по приготовлению качественных и биологически безопасных кормов.
Научная новизна исследования. В ходе работы были модифицированы и внедрены собственные методики NGS-секвенирования и T-RFLP-анализа метагеномного сообщества консервированных кормов: силоса, сенажа, плющеного зерна. Новым является обнаружение в составе бактериального эпифитного сообщества кормовых культур в процессе вегетации представителей филума семейства Vibrionaceae, семейств Ruminococcaceae, Caulobacteraceae, порядков Rhodospirillales, Rickettsiales и Burkholderiales. В составе силосной экосистемы были выявлены новые таксоны: представители филума Bacteroidetes, порядка Selenomonadales, семейств Clostridiaceae, Ruminococcaceae, Lachnospiraceae, являющиеся типичными обитателями микрофлоры рубца жвачных. Впервые раскрыта роль не известных ранее бактерий в процессе силосования и установлено, что консервированные корма являются источником поступления данных микроорганизмов в рубец. Помимо этого, в составе микробиоценоза консервированных кормов были выявлены таксоны, среди которых нередко встречаются опасные патогены жвачных: представители семейства Fusobacteriaceae рода Staphylococcus, рода Candida и др. Выявлены новые маркерные микроорганизмы, указывающие на нежелательный ход процесса силосования. Впервые описан состав микрофлоры при ферментации сенажа с содержанием СВ более 50%. С использованием метода количественной ПЦР показано, что поступление афлатоксинов в организм новотельных коров вызывает дисбиотические нарушения микрофлоры рубца, что свидетельствует об их низкой защите от микотоксинов. Впервые показано, что консервированные корма в некоторых случаях являются источником заражения жвачных животных патогенами. Показано, что состав микробиоценоза рубца оказывает влияние на структуру других микробиотопов организма жвачных (например, половых путей). Проведение широкомасштабного мониторинга содержания микотоксинов в вегетирующем кормовом травостое животноводческих хозяйств Ленинградской
области, а также консервированных кормах из животноводческих хозяйств РФ выявило присутствие одновременно нескольких токсичных метаболитов микромицетов с высокими уровнями накопления. Впервые в России с применением метода жидкостной хроматографии в тандеме с масс-спектрометрией обнаружено присутствие микотоксинов в силосе. Разработан для силосования кормовых культур новый полиштаммовый биопрепарат с выраженной антимикробной активностью в отношении патогенов и способностью к биодеструкции микотоксинов. Разработаны 2 новых комплексных энтеросорбента микотоксинов с полифункциональными свойствами (один модифицирован эфирными маслами, придающими иммуномодулирующую активность другой - эфирными маслами и штаммами бактерии со свойствами биодеструкции и антимикробной активностью) для крупного рогатого скота.
Теоретическая и практическая значимость работы. В результате исследований найдено одно из решений крупной научной проблемы, имеющей народнохозяйственное значение, - получение экологически безопасных консервированных кормов и снижение импортозависимости за счёт разработки конкурентоспособных отечественных биопрепаратов. Данные о количественной представленности отдельных таксонов микроорганизмов могут быть использованы в качестве индикаторов для выявления изменений динамического равновесия бактериальной микрофлоры силосных экосистем с целью совершенствования приемов консервирования. Выявленный высокий уровень присутствия микотоксинов и патогенов на фуражных культурах и консервированных кормах в животноводческих хозяйствах РФ, а также высокий уровень содержания афлатоксина М1 в молоке демонстрируют существенную опасность введения в рацион жвачных животных силоса, пораженного афлатоксинами, свидетельствуют о необходимости строгого контроля уровня безопасности силоса и внедрения мер профилактики заболеваний жвачных. В результате проведенной работы создана коллекция из 350 штаммов молочнокислых бактерий и бацилл с антимикробной активностью и свойствами биодеструкции микотоксинов. Отобраны наиболее перспективные штаммы,
Похожие диссертационные работы по специальности «Биотехнология (в том числе бионанотехнологии)», 03.01.06 шифр ВАК
Эффективность скармливания коровам силоса, приготовленного с применением биоконсервантов в условиях Якутии2017 год, кандидат наук Миронов Михаил Михайлович
Физиолого-биохимическое обоснование прогрессивных технологий в кормопроизводстве и кормлении скота в условиях Северного Кавказа2015 год, доктор наук Казанцев Анатолий Александрович
Разработка биологических препаратов для повышения питательности и эффективности использования кормов2009 год, доктор биологических наук Лаптев, Георгий Юрьевич
Обоснование технологии двухфазного консервирования козлятника восточного2017 год, кандидат наук Косолапова, Елена Валентиновна
Доступность энергии и протеина силоса, полученного с применением нового химического консерванта, и эффективность его использования в рационах молодняка крупного рогатого скота1984 год, кандидат биологических наук Красноженова, Людмила Петровна
Список литературы диссертационного исследования доктор наук Йылдырым Елена Александровна, 2019 год
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
1. Амелин В.Г Хроматографические методы определения микотоксинов в пищевых продуктах / В.Г Амелин, Н.М. Карасева, А.В. Третьяков // Журнал аналитической химии. - 2013. - Т. 68, № 3. - С. 212-223.
2. Андронов Е. Изучение структуры микробного сообщества почв разной степени засоления с использованием T-RFLP и ПЦР с детекцией в реальном времени / Е. Андронов , С. Петрова, А. Пинаев, Е. Першина // Почвоведение. - №«2. 2012. - С. 173- 183.
3. Андронов Е. Влияние внесения генетически модифицированого штамма ЗтогЬкоЬшт теШоН АСН-5 на структуру почвенного сообщества микроорганизмов / Е. Андронов, С. Петрова, Е. Чижевская, Е. Коростик // Микробиология. - 2009. - Т. 78, №«4. -С. 1-10.
4. Безбородова Н.А. Мониторинг микотоксинов в кормах и кормовом сырье и клинико-иммунологические особенности микотоксикозов животных в Уральском регионе: дисс. ... канд. вет. наук : 16.00.03 / Безбородова Наталья Александровна. -Екатеринбург, 2009. - 157 с.
5. Бёккер Ю. Хроматография. Инструментальная аналитика: методы хроматографии и капиллярного электрофореза. Учебник. — М.: Техносфера, 2009. — 473 с.
6. Билай В.И., Гвоздяк Р.И., Скрипаль И.Г. и др. Микроорганизмы - возбудители болезней растений - Киев: Наукова думка, 1988. - 235 с.
7. Болотин Е.А., Зубрилин А.А. Силосование кормов. М.: Сельхозгиз, 1935. - 400 с.
8. Боярский Л.Г. Технология кормов и полноценное кормление сельскохозяйственных животных. - Ростов-Н /Д, 2001. - 215 с.
9. Брюханов А.Л., Рыбак К.В., Нетрусов А.И. Молекулярная микробиология М.: изд-во МГУ, 2012. — 474 с.
10. Бурдов Л.Г. Мониторинг микотоксинов, профилактика и лечение микотоксикозов в Удмуртской Республике: дисс. ... канд. биол. наук : 06.02.03, 06.02.02 / Бурдов Лев Геннадьевич. - Казань, 2013.- 173 с.
11. Буркин А.А. Особенности накопления микотоксинов в лишайниках / А.А. Буркин, Г.П. Кононенко // Прикладная биохимия и микробиология. - 2013. - №25(49). - С. 522-530.
12. Буркин А.А. Вторичные метаболиты грибов (микотоксины) в лишайниках разной таксономической принадлежности / А.А. Буркин, Г.П. Кононенко // Известия Российской Академии Наук. Серия Биологическая. - 2014. -№2 3. - С. 228.
13. Вайсбах Ф. Будущее консервирования кормов / Ф.Вайсбах // Проблемы биологии продуктивных животных. - 2012. - N2.- С. 49-70.
14. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика: Практический курс. - М.: ФАИР-ПРЕСС, 1999. - 720 с.
15. Васильева Е.А. Клиническая биохимия сельскохозяйственных животных. М: Агропромиздат, 2000. - 359 с.
16. Ветеринарно-санитарные требования Таможенного союза «О применении ветеринарно-санитарных мер в таможенном союзе». Утверждены решением КТС от 18.06.2010 № 317.
17. Возняковская Ю.М. Микрофлора растений и урожай. М.: Колос, 1969. - 240 С.
18. Гагкаева Т.Ю. Зараженность грибами рода Fusarium и контаминация микотоксинами зерна овса и ячменя на севере нечерноземья / Т.Ю. Гагкаева, О.П. Гаврилова, А.А. Буркин, Г.П. Кононенко //Сельскохозяйственная биология. - 2009. - N 6. - С. 89-93.
19. Гагкаева Т.Ю. Особенности поражения овса фузариозом (обзор) Т.Ю. Гагкаева, О.П. Гаврилова // Сельскохозяйственная биология. - 2011. - N 6. - С. 3-10
20. Ганнибал Ф.Б. Мониторинг альтернариозов сельскохозяйственных культур и идентификация грибов рода Alternaría. Методическое пособие. Под ред. М.М.Левитина. СПб.: ГНУ ВИЗР Россельхозакадемии, 2011. - 70 с
21. Ганнибал Ф.Б. Характеристика патогена томата, Alternaría tomatophila, ранее не идентифицированного в России / Ф.Б.Ганнибал, А.С. Орина // Микология и фитопатология. 2013. - Т. 47, вып. 1. - С. 51-55.
22. Гардер Л.А. Применение бактериальных заквасок из молочнокислых бактерий как метод регулирования бродильных процессов в силаже / Л.А. Гардер, Е.И. Балин, А.А.
Богданов, М.М. Макарова // Сборник «Труды Всесоюзного института сельскохозяйственной микробиологии». - Л., 1935а. VI (1). - С. 100.
23. Гардер Л.А. Силосование кормов с применением заквасок / Л.А. Гардер, М.М. Макарова, Е.И. Боровикова, Я.Е. Субботин // Проблемы животноводства. -19356. - №8. -С. 9-11.
24. Георгиевский В.И. Физиология сельскохозяйственных животных / М.: Агропромиздат, 1990. - 511 с.
25. Глушакова A.M. Сезонная динамика дрожжевого населения листьев Ох- alis acetosella L. / А.М.Глушакова, И.Ю. Чернов // Микробиология. - 2004. - Т. 73, №2.- С. 226-232.
26. Головлев E.JI. Биология сапротрофных микробактерий: Автореф. дис.... канд биол. наук. - Пущино, 1983. - 37 с.
27. Горячева И.Ю. Иммунохимические методы определения микотоксинов / И.Ю. Горячева, Т.Ю. Русанова, Н.А. Бурмистрова, С.Д. Саегер // Журнал аналитической химии. - 2009. -Т. 64, № 8. - С. 788-806.
28. Гродзинский A.M. Выделительные функции растений / A.M. Гродзинский // «Аллелопатия в жизни растений и их сообществ»- Киев: Изд-во «Наукова думка», 1965. — С.123-125.
29. Гузев B.C. Микробное сообщество микрофлоры ели / B.C. Гузев, С.А. Зайцев, И.П. Бабьева // Науч. доклады высш. школы биолог, науки. - 1980. - №2 2.- С. 93-95.
30. Диаз Д. Микотоксины и микотоксикозы. М.: Печатный город, 2006. - 382 С.
31. Дмитроченко А.П. Руководство к практическим занятиям по кормлению сельскохозяйственных животных. М.-Л.: с.-х. изд-во, 1936. - 15 с.
32. Добровольская Т.Г. Структура бактериальных сообществ почв. — М.: ИКЦ Академкнига, 2002. — 282 с.
33. Дольник А. Концепция универсальной таксономической системы 22 бактерий: эволюционное пространство гена 16S^PHK v.1.0. / А. Дольник, Г. Тамазян, Е. Першина, К. Вяткина // Сельскохозяйственная биология. - №25. - 2012. - С.111-120.
34. Доспехов Б.А. Методика полевого опыта. М.: Агропромиздат, 1985. - 351 с.
35. Доронина Н.В. Новые данные о способности аэробных метилотрофных бактерий синтезировать ауксины / Н.В. Доронина, Е.Г. Иванова, Ю.А. Троценко // Микробиология, 2002.-Т. 71, №>1.-С. 130-132.
36. Дюран Б., Оделл П. Кластерный анализ. - М.: Статистика, 1977. - 128 с.
37. Емцев В.Т., Мишустин Е.Н. Микробиология. М.: Дрофа, 2005. - 445 с.
38. Журбицкий В.И. Теория и практика вегетационного метода. М.: Наука, 1968. - 267 с.
39. Заикина И.А. Экологическая роль бактериального сообщества эпифитов филлосферы в жизнедеятельности растений : дисс. ... канд. биол. наук.: 03.00.07 / Заикина Ирина Аркадьевна - Ставрополь, 2008. - 150 с.
40. Зафрен С.Я. Технология приготовления кормов. Справочное пособие. — М.: Колос, 1977. — 239 с.
41. Звягинцев Д.Г. Вертикально-ярусная организация микробных сообществ лесных биогеоценозов / Д.Г. Звягинцев, И.П. Бабьева, Т.Г. Добровольская, Т.Г. Зенова // Микробиология, 1993. - Т. 62. - №№ 1. - С. 5-36.
42. Зубрилин A.A. Научные основы консервирования зелёных кормов. - М., 1947. - 253 с.
43. Иванов А.В., Тремасов М.Я., Папуниди К.Х., Чулков А.К. Микотоксикозы животных - М.: Колос, 2008. - 140 С.
44. Иванов А.В., Фисинин В.И., Тремасов М.Я., Папуниди К.Х. Микотоксины (в пищевой цепи) - М.: ФГБНУ «Росинформагротех», 2012. - 136 с.
45. Иванченко В.А., Гродзинский A.M., Черевченко Т.М. и др. Растения и работоспособность — М.: Знание, 1984. — 63 с.
46. Ильина Л.А. Изучение микрофлоры рубца крупного рогатого скота на основе молекулярно-биологического метода T-RFLP с целью разработки способов ее оптимизации : дисс. ... канд. биол. наук : 03.01.06 / Ильина Лариса Алексанровна. - Санкт-Петербург, 2012. - 197 с.
47. Йылдырым Е.А. Гетероферментативные молочнокислые бактерии и перспективы их использования в растениеводстве и кормопроизводстве. дисс. ... канд. биол. наук : 03.00.07 / Йылдырым Елена Алексанровна. - Санкт-Петербург. - 2009. -201 с.
48. Йылдырым Е.А. Изучение эпифитной микрофлоры как источника формирования микробиоценоза силоса методом NGS-секвенирования / Е.А. Йылдырым, Г.Ю. Лаптев, Л.А. Ильина, И.Н. Никонов // Сельскохозяйственная биология. - 2015. - Т. 50. № 6. - С. 832-838.
49. Йылдырым Е. Видовые и региональные особенности консервирования кормовых культур / Е. Йылдырым, Л. Ильина, С. Биконя, Г. Лаптев // Ценовик. - 2017.- №4. - . С. 48-51.
50. Йылдырым Е.А. Изучение распространения микотоксинов в силосе и разработка стратегии борьбы с ними / Е.А. Йылдырым, Л.А. Ильина, В.А. Филиппова, В.В. Солдатова // Кормопроизводство. - 2016. - №2 3. - С. 41-45.
51. Йылдырым Е.А. Механизмы действия заквасок для силосования / Е.А. Йылдырым, Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина // Ценовик. - 2015. - №7.-С. 58-61.
52. Имшенецкий А.А. Экология пигментных микроорганизмов. О защитной роли каратиноидов / А.А. Имшенецкий // Микробиология. - Т. XV, вып. - 1946. - С. 5.
53. Казарцев В.В. Унифицированная система биохимического контроля за состоянием обмена веществ коров / В.В. Казарцев , А.Н. Ратошный // Зоотехния. -1986. -Вып. 3.- С. 323-330.
54. Квасников Е.И. Биология молочнокислых бактерий. - Ташкент: Изд. Академии наук Узбекской ССР, 1960. - 351 с.
55. Колмакова О.В. Современные методы определения видоспецифичных биогеохимических функций бактериопланктона / О.В. Колмакова // Journal of Siberian Federal University. Biology 1. - 2013. - №26. - С. 73-95
56. Кондрахин И. П. Методы ветеринарной клинической лабораторной диагностики. М.: Колос, 2004. 520 С.
57. Кононенко Г.П. Фузариотоксины в зерне колосовых культур:региональные особенности / Г.П. Кононенко, А.А. Буркин // Успехи медицинской микологии. — Т. 1. — М. :Национальная академия микологии. — 2003. — С. 141-144.
58. Кононенко Г.П. О контаминации микотоксинами сенажа и силоса в животноводческих хозяйствах / Г.П. Кононенко, А.А. Буркин // Сельскохозяйственная биология. - 2014. - №26. - С. 116-122.
59. Кравченко Л.В. Видовые особенности состава корневых выделений растений и его изменение в ризосфере под влиянием почвенной микрофлоры / Л.В. Кравченко, А.И. Шапошников, Н.М. Макарова, Т.С. Азарова //Сельскохозяйственная биология. - 2011. -№ 3. - С. 71-75.
60. Краскел Дж.Б. Многомерное шкалирование и другие методы поиска структуры / Дж.Б Краскел // Статистические методы для ЭВМ. - М.: Наука, 1986. С. 301-347.
61. Ким Дж.О., Мьюллер Ч.У, Клекка У.Р. и др. Факторный, дискриминантный и кластерный анализ- М.: Финансы и статистика, 1989. - 215 с.
62. Крюков В.С. Оценка уровня контаминации кормов микотоксинами и эффективности адсорбентов / В.С. Крюков // Проблемы биологии продуктивных животных. - 2014. - №№3. - С. 37-50.
63. Кузнецов В.М. Основы научных исследований в животноводстве. Киров: Зональный НИИСХ Северо-Востока, 2006.- 568 с.
64. Лакин Г.Ф. Биометрия . - М.: Высшая школа, 1990. - 352 с.
65. Лаптев Г.Ю. Анаэробные грибы-хитридиомицеты в рубце жвачных животных / Г.Ю. Лаптев // Микология и фитопатология. - 1990. - Т. 24. - Вып. 4. - С. 372.
66. Лаптев Г.Ю. Разработка биологических препаратов для повышения питательности и эффективности использования кормов : дисс. ... доктора биол. наук : 03.00.23, 06.02.02 / Лаптев Георгий Юрьевич. - Санкт-Петербург, 2009. - 352 с.
67. Лаптев Г.Ю. Исследование бактериального сообщества рубца коров с помощью T-RFLP-анализа / Г.Ю. Лаптев // Молочное и мясное скотоводство.-2010. -.№3. - С. 16-18.
68. Лаптев Г.Ю. Микотоксины в отечественном силосе. - 2015. - https://www.apk-news.ru/mikotoksiny-v-otechestvennom-silose/
69. Лаптев Г.Ю. Сравнительный анализ микробиоценоза влагалища у коров методом REAL-TIME PCR / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Ветеринария. - 2014a. - № 8. - С. 33-37.
70. Лаптев Г.Ю., Новикова Н.И., Ильина Л.А., Йылдырым Е.А. и др. Нормы содержания микрофлоры в рубце крупного рогатого скота. Методические рекомендации / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // С-Пб: БИОТРОФ. - 2014b. - 32 с.
71. Лаптев Г.Ю. Исследование вагинальной слизи высокопродуктивных коров в послеотельный период посредством ПЦР в реальном времени / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Российский ветеринарный журнал. Сельскохозяйственные животные. - 2014с. - №2 3. - С. 10-12.
72. Лаптев Г.Ю. Влияние биологических и химических консервантов на накопление плесневых грибов и микотоксинов в силосе / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Зоотехния. - 20Ш. - №2 11. - С. 10-12.
73. Лаптев Г.Ю. Динамика накопления микотоксинов в силосе на разных этапах хранения/ Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Сельскохозяйственная биология. - 2014с. - №26. - С. 123-130.
74. Лаптев Г.Ю. Биологическая безопасность силоса / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Животноводство России. - 2015а. - №24. - С. 2-3.
75. Лаптев Г.Ю. Как заготовить силос без микотоксинов / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Сельскохозяйственные Вести. - 2015Ь. - №1. - С. 2425.
76. Лаптев Г.Ю. Есть ли разница между жидкими и сухими заквасками? / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Сельскохозяйственные вести. -№2. - 2016.
77. Лаптев Г.Ю. Эффективное консервирование плющеного зерна / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Сельскохозяйственные вести. - 2017. - №3. - С. 34-35.
78. Лаптев Г.Ю. Закваски: сухие или живые? / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Сельскохозяйственные вести. - 2017. - №21 - С. 12-14.
79. Лаптев Г. Промилк — биоконсервант, подавляющий накопление микотоксинов в силосе / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Л.А. Ильина, Е.А. Йылдырым // Ценовик. Сельскохозяйственное обозрение. 2014. - №24. - С. 40-41.
80. Лаптев Г. Сравнение способов консервирования корма / Г. Лаптев, В. Солдатова, В. Санец // - Молочное и мясное скотоводство. - 2004. - №22.
81. Лаптев Г.Ю. Интродукция целлюлозолитической бактерии в рубец крупного рогатого скота для повышения переваримости клетчатки / Г.Ю. Лаптев, Л.К. Эрнст, В.В. Солдатова // Сельскохозяйственная биология - 1994. - №2 4. -С. 34-39.
82. Лаптев Г.Ю. Новая закваска Биотроф 2+ для заготовки силоса / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Е.А. Йылдырым // Сельскохозяйственные вести. - 2018. - №1. - С. 50-51.
83. Лузина О.А. Биологическая активность усниновой кислоты и ее производных. Часть 2. Действие усниновой кислоты и ее производных на высшие организмы, молекулярные и физико-химические аспекты биологической активности (обзорная статья) / О.А. Лузина, Н.Ф. Салахутдинов // Биоорганическая химия. - 2016. - №3(42). -С. 276.
84. Лучка 1.В. Вплив карбонових кислот i спирпв на продукщю метану та легких жирних кислот в рубщ вели^ рогато¿ худоби в дослщах in vitro / 1.В. Лучка , Г.О. Б огданов , Р.О. Федяков , Л.1. Сологуб // НТБ 1нституту бiол. наук УААН. - 2005. - № 6(2). - С. 142-144.
85. Мак-Дональд П. Биохимия силоса. М.,: Агропромиздат, 1985. - 271 С.
86. Малашенко Ю.Р., Романовская В.А., Соколов И.Г. Роль розовоокрашенных факультативно метилотрофных бактерий (РМБ) в локальных экосистемах биосферы / Ю.Р. Малашенко, В.А. Романовская, И.Г. Соколов // Автотрофные микроорганизмы: конф. памяти E.H. Кондратьевой. - М.: Изд-во МГУ, 1996. - С. 23.
87. Мандель И.Д. Кластерный анализ. - М.: Финансы и статистика, 1988. - 176 с.
88. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984. -480 с.
89. Маркова Ю. А. Выделение бактерий семейства Enterobacteriaceae из растительных тканей / Ю. А. Маркова, А. С. Романенко, А. В. Духанина // Микробиология. - 2005. - № 5. - С. 663-666.
90. МДУ №434-17/89 от 01.02.89 г. Допустимые уровни содержания микотоксинов в сырье для сельскохозяйственных животных и птицы.
91. Методические указания по проведению полевых опытов с кормовыми культурами. Под ред. Ю.К. Новоселова. - М.: Изд-во ВНИИ кормов им. Вильямса, 1983. -197 с.
92. Методы микробиологических исследований и определения микроэлементов / Под ред. М.А. Белоусова. - Ташкент: Изд-во Всесоюзного ордена Ленина НИИ хлопководства, 1973. - 108 с.
93. Методы почвенной микробиологии и биохимии / Под ред. Д.Г. Звягинцева. - М.: Изд-во МГУ, 1991. - 304 с.
94. Миронов А.Н., Бунатян Н.Д. и др. Рокуводство по проведению доклинических исследований лекарственных средств. - М.: Гриф и К, 2012. - С. 13-25.
95. Мишустин E.H. Микробиология силоса. В сб.: Научные основы консервирования зеленых кормов. М.,1947. - С. 57-71.
96. Мишустин E.H. Микробиологические процессы при силосовании кормов. В сб.: Силосование и технология кормов. М., 1964. - С. 5-19.
97. Мишустин E.H. Научные основы силосования кормов. М.-Л.: «Сельхозизд.». 1933. - 221 с.
98. Молодкин В.Ю. Силосование: как избежать зоны риска / В.Ю. Молодкин, Н.Р. Хамитова // Ценовик. - 2012. - №№5. - С. 44-45.
99. Нагорнова К. Микотоксины в силосе? Значит, и в молоке / К. Нагорнова, Е. Йылдырым, Л. Ильина // Животноводство России. - 2014. - №«4. - С. 52-53.
100. Нгуен Т.Л.Х. Экологические особенности комплексов микромицетов травянистых растений семейства бобовые (Fabaceae Lindl.) в условиях юга Среднерусской возвышенности : дисс. ... канд. биол. наук: 03.02.08 / Нгуен Тхи Лан Хыонг. - Москва, 2016. - 207 с.
101. Неринг К., Люддекке Ф. Полевые кормовые культуры. М.: Колос, 1974.-527 с.
102. Нетрусов А.И., Егорова М.А., Захарчук Л.М., Колотилова Н.Н. и др. Практикум по микробиологии: учебное пособие для студентов высших учебных заведений - М.: Академия, 2005. - 608 с.
103. Нугматжанов К.Г. Микробиологические способы повышения качества кормов. Алма-Ата: Кайнар, 1984. - 120 с.
104. Определитель бактерий Берджи : в 2 томах / под. ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита и др. - 9е издание. - М.: Мир. - 1997.
105. Орина А.С. Сравнительный анализ молекулярно-биологических и физиологических признаков Alternaria solani и A. tomatophila / А.С. Орина, Ф.Б. Ганнибал, Н.В. Мироненко, М.М. Левитин // Микология и фитопатология. - 2014. - Т. 48, вып. 1. - С. 53-62.
106. Панкратов Т.А. Микробные сообщества лишайников / Т.А. Панкратов, А.В. Качалкин, Е.С. Корчиков, Т.Г. Добровольская // Микробиология - 2017. - №3(86). - С. 265-283.
107. Пересыпкин В.Ф. Сельскохозяйственная фитопатология. - 4-е изд. перераб. и доп. -М.: ВО «Агропромиздат», 1989. - 280 с.
108. Першина Е. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов ДНК для изучения динамики почвенных микроорганизмов в условиях воздействия ксенобиотиков / Е. Першина, Е. Андронов, А. Пинаев, Г. Ахтемова // Сельскохозяйственная биология. -2011. - №3. - С. 81-87
109. Першина Е.В. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования / Е.В.Першина, Г.С. Тамазян, А.С. Дольник, А.Г. Пинаев // Экологическая генетика. - 2012. - Т. 10, №2 2. - С. 32-40.
110. Петр Дж. С. Основы культивирования микроорганизмов и клеток (перевод с англ.). - М.: Издательство «Мир», 1978. - 331 с.
111. Петрович C.B. Микотоксикозьг животных. М. :Росагропромиздат. 1991.-238С.
112. Петухова Е.А., Бессарабова Р.Ф., Халенева Л.Д., Антонова О.А. Зоотехнический анализ кормов - М.: Колос, 1981. - 256 С.
113. Победнов Ю.А. Основы и способы силосования трав.- СПб «Биотроф», 2010. - 192 с.
114. Победнов Ю.А., Косолапов В.М., Бондарев В.А., Ахламов Ю.Д. и др. Силосование и сенажирование кормов: Рекомендации— М.: Издательство РГАУ-МСХА, 2012. - 22 с.
115. Победнов Ю.А. Физиолого-биохимические процессы, происходящие в кормовых травах при выращивании, как фактор, влияющий на их технологические свойства при силосовании и качество объёмистых кормов / Ю.А. Победнов, И.В. Кучин // Проблемы биологии продуктивных животных. - 2015. - № 1. - С. 70-83.
116. Победнов Ю.А. Сравнительная эффективность сенажирования и силосования провяленных злаковых трав с препаратами молочнокислых бактерий / Ю.А. Победнов, И.В. Кучин, В.В. Солдатова // Кормопроизводство. - 2016. - №23. - С. 36-40.
117. Подъяпольская О.П. Микрофлора пшеничного зерна и ее изменение под влиянием влажности и температуры / О.П. Подъяпольская, В.А. Мирзоева // Тр. / ВНИИ зерна, 1955. - С. 65-66.
118. Полонская М.С. Антибиотические вещества ацидофильных бактерий /М.С. Полонская // Микробиология. - №№3. - М., 1952. - С. 30-34.
119. Полонская М.С. Антибиотические вещества ацидофильных бактерий / М.С. Полонская, В.В. Леонович, М.П. Бибердиева // Микробиология. - №1. - М., 1953. - С. 1521.
120. Пронь В.А. Технология приготовления кукурузного и люцернового силоса с внесением электроактивированного раствора поваренной соли (ЭАР) и эффективность его использования в рационах крупного рогатого скота: Автореф. дис... канд. с.-х. -Ставрополь, 1998. - 22 с.
121. Равин Н.В. Метагеномика как инструмент изучения "некультивируемых" микроорганизмов / Н.В. Равин, А.В. Марданов, К.Г. Скрябин / Генетика. - 2015. - Т. 51, № 5. - С. 519-528.
122. Растениеводство. Под ред. П.П. Вавилова. М.: Колос, 1975. - 392 с.
123. Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю. ПЦР в реальном времени. 2-е изд., испр. и доп. М. БИНОМ. Лаб. знаний, 2009. - 223 с.
124. Ребриков Д.В., Коростин Д.О., Шубина Е.С., Ильинский В.В. N08: высокопроизводительное секвенирование. - 2-е изд. - М.: БИНОМ.Лаборатория знаний. - 2015. - 232 с.
125. Романович Т.Г. Антибиотические свойства молочнокислых бактерий /Т.Г. Романович // Молочная промышленность. - М., 1954. - №2 4. - С. 16-21.
126. Рощина В.Д., Рощина В.В. Выделительная функция высших растений. - М.: Наука, 1989. - 214 с.
127. Сернов Л.Н., Гацура В.В. Элементы экспериментальной фармакологии. М. : Всерос. науч. центр по безопасности биол. актив. веществ, 2000. - 351 с.
128. Смирнов В.В., Резник СР., Василевская И.А. Спорообразующие аэробные бактерии-продуценты биологически активных веществ. - Киев: Нукова Думка, 1982. -278 с.
129. Смирнов В.В. Дискуссионные вопросы создания и применения бактериальных препаратов для коррекции микрофлоры теплокровных / В.В. Смирнов, С.Р. Резник, И.Б. Сорокулова // Микробиол. журн.- 1992. - №6. - С. 82-94.
130. Соколенко А.В. Морфология, ультраструктура, метаболизм некультивируемых форм холерных вибрионов. Автореф... канд. биол. наук. 2000. Ростов-на-Дону. - 21 с.
131. Соколова О.Н. Микотоксины в силосованных кормах и методы их нейтрализации: дис. ... канд. с.-х. наук. Москва, 2018. - 26 с.
132. Солдатова В.В. Почему высокопродуктивные коровы восприимчивы к микотоксинам? /
B.В. Солдатова, Е.А. Йылдырым, Л.А. Ильина, И.Н. Никонов // Сельскохозяйственные Вести. Корма. - 2015. - №№4.
133. Солдатова В.В. Можно ли силосовать люцерну? / В.В. Солдатова, Е.А. Йылдырым, Л.А. Ильина, В.А. Филлипова // Сельскохозяйственные Вести. - 2016. - .№1. -
C. 48-51.
134. Сычев С.Н. Методы совершенствования хроматографических систем и механизмы удерживания в ВЭЖХ. Орел: ОГТУ, 2000. - 212 с.
135. Тараканов Б.В. Методы исследования микрофлоры пищеварительного тракта сельскохозяйственных животных и птицы. М.: «Научный мир», 2006. - 188 С.
136. Тихонович И.А. Создание высокоэффективных микробно-растительных систем // Сельскохозяйственная биология. - СПб., 2000. - №1. - С.28-33.
137. Троценко Ю.А. Аэробные метилотрофные бактерии как фитосимбионты / Ю.А. Троценко, Е.Г. Иванова, Н.В. Доронина // Микробиология, 2001. - Т.70. - В. 6. - С. 725736.
138. Толпышева Т.Ю. Биотические связи лишайников в лесных и болотных экосистемах. Автореф. канд. дис. Петрозаводск, 2005.
139. Толпышева Т.Ю. Микотоксины, усниновая кислота и их распределение в лишайниках родов Cetraria, Flavocetraria, Cladonia. Вестник Московского Университета. Серия 16: Биология. 2014. - №3. - С. 37-41.
140. Тужикова Т. ИФА-наборы для определения микотоксинов / Т. Тужикова, М. Титова // Комбикорма №№ 1. - 2011. - С. 45-48.
141. Ушакова Н.А. Влияние Bacillus subtilis на микробное сообществ о рубца и его членов, имеющих высокие коэффициенты корреляции с показателями пищеварения, роста и развития хозяина / Н.А. Ушакова, Р.В. Некрасов, Н.А. Мелешко, Г.Ю. Лаптев и др. // Микробиология. - 2013. - Т.82, №№4. - С. 456- 563.
142. Федулина Н.Н. Дрожжи силоса и пути их использования: автореф. дисс. ... канд. с.-х. наук. / Федулина Нина Никандровна. -Л., 1965. - 23 с.
143. Фирсов И.П., Солоавтерьев А.М., Раскутин О.А., Курочкин К.И. и др. Технология производства продукции растениеводства - М.: Агропромиздат, 1989. -432 с.
144. Хохрин С.Н. Кормление сельскохозяйственных животных - М., Колос, 2004. - 692 с.
145. Худяков Я.П. Управление эпифитной микрофлорой культур. ДАН СССР - Киев, 1953. - Т. ХСШ, №№5. - С. 289-305.
146. Цавкелова Е.А. Микроорганизмы - продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение (обзор) / Е.А. Цавкелова, С.Ю. Климова, Т.А. Чердынцева, А.И. Нетрусов // Прикладная биохимия и микробиология. - М., 2006. - Т. 42, .№2. - С. 133143.
147. Чуканов Н.К., Попенко А.К. Микробиология консервирования трудносилосуемых растений. - Алма-Ата: Наука, 1986. - 198 с.
148. Шестаков С.В. Вклад метагеномики в развитие биотехнологии / С.В. Шестаков // Биотехнология. - 2011. - №2 6. - C. 8-22.
149. Широких А.А., Широких И.Г. Изучение полезных для растений свойств метилотрофных бактерий / А. А. Широких,И.Г. Широких // Агрохимия. - 2007. - N 9. - С. 53-57.
150. Шлегель Г. Общая микробиология - М.,Мир, 1987 - 567 с.
151. Шмидт В., Веттерау Г. Производство силоса / Пер. с нем. -М.: Колос, 1975. - 352 с.
152. Шпаар Д. Кормовые культуры. - М.: ИД ООО «ДЛВ АГРОДЕЛО», 2009. -784 С.
153. Якушев А.В. Комплексный структурно-фукциональный метод характеристики микробных популяий / А.В. Якушев // Почвоведение. - 2015. -.№4. - С. 429-446
154. Abdulhafid M., Eldernawi M., Rious J. Chemical, physical and mineralogical characterization of Al-Hishah Diatomite at Subkhat Ghuzayil Area, Libya // Impact Journals. - V 2 (4). - 2014. - P. 165-174.
155. Abrunhosa L., Ines A., Rodrigues A. I. et al. Biodegradation of ochratoxin A by Pediococcus parvulus isolated from Douro wines // Int. J. Food Microbiol. - 2014. -V.188. -P. 45-52.
156. Abrunhosa L., Santos L., Venancio A. Degradation of ochratoxin A by proteases and by a crude enzyme of Aspergillus niger // Food Biotechnology. - V. 20. - P. 231-242.
157. Adil S., Magray S.N. Impact and manipulation of gut microflora in poultry: A review. J. Anim Vet. Adv. 2012;11:873-877
158. Alexander E., Pham D., Steck T.R. The viable-but-nonculturable condition is induced by copper in Agrobacterium tumefaciens and Rhizobium leguminosarum // Appl. Environ. Microbiol. - 1999. - V. 65(8). - P. 3754-3756.
159. Ali-Yrkko S., Korhonen H., Antila M. The species of clostridia in feed and cow manure. Finn. 1. // Dairy Sci. - 1978. - V 36. - P. 35-4l.
160. Allison M. J., Bryant M. P., Doetsch R. N. Studies on the metabolic function of branched-chain volatile fatty acids, growth factors for Ruminocci // J. Gen. Microbiol. - 1961.- V. 5. - P. 869-879.
161. Altalhi A. D. Plasmid-mediated mycotoxin zearalenone in Pseudomonas putida ZEA-1.Am // J. Biotechnol. Biochem. - 2007. -V. 3. - P. 150-158.
162. Amann R.I., Ludwig W., Schleifer K.H. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation // Microb. Rev. - 1995. - V. 59. - P. 143-169.
163. Anderson H. W., Nehring E. W., Wichser W. R. Aflatoxin contamination of corn in the field // J. Agric. Food Chem - 1975. - V. 23. - P. 775-782.
164. Altalhi A. D., El-Deeb B. Localization of zearalenone detoxification gene(s) in pZEA-1 plasmid of Pseudomonas putida ZEA-1 and expressed in Escherichia coli. // J. Hazard. Mater. -2009. - V. 161 - P. 1166-1172.
165. Andrews J.H., Harris R.F. The ecology and biogeography of microorganisms on plant surfaces // Annu. Rev. Phytopathol. - 2000. - V. 38. - P. 145-180.
166. Applebaum R.S. Responses of dairy cows to dietary aflatoxin, methods to eliminate aflatoxin Ml from milk and fate of aflatoxin Ml in cottage cheese // University of Wisconsin-Madison. - 1981. - 558 P.
167. Aschenbach J.R., Penner G.B., Stumpff F. et al. Ruminant nutrition symposum: Role of fermentation acid absorption in the regulation of ruminal pH //J. Anim Sci. - 2011.- V. 89. - P. 1092-1107.
168. Auerbach H., Oldenburg E., Weissbach F. Incidence of Penicillium roqueforti and roquefortine C in silages // J. Sci. Food Agr. - 1998. - V. 76. - P. 565-572
169. Axelsson L., Salminen S., von Wright A. et al. Lactic acid bacteria: Classification and Physiology. In Lactic Acid Bacteria: Microbiology and functional aspects // N-Y, 2004. - P. 172.
170. Baath H., Knabe O., Lepom P. Occurrence of Fusarium species and their mycotoxins in maize silage. Studies on the Fusarium infestation of maize silage plants // Arch. Anim. Nutr. - 1990. - V. 40. - P. 397-405.
171. Bakker M.G., Manter D.K., Sheflin A.M., Weir T.L., Vivanco J.M. Harnessing the rhizosphere microbiome through plant breeding and agricultural management // Plant Soil. - V. 360. - 2012. - P. 1-13.
172. Balandreau J., Viallard V., Cournoyer B. et al.Burkholderia cepaciagenomovar LH is a common plant-associated bacterium. // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - V. 67. - P. 982-985.
173. Bannink A., Tamminga S. Rumen function. In: Quantitative aspects of ruminant digestion and metabolism. Dijkstra J, Forbes JM, France J.(eds). - 2005. - 2 ed. pp. 263-288.
174. Barnett A.J.G. Silage fermentation . Butterworths Sci. Publ., London. - 1954. - 208 P.
175. Basso F.C., Bernardes T.F., Roth A.P.D.T.P. et al. Fermentation and aerobic stability of corn silage inoculated with Lactobacillus buchneri // R Bras Zootec. - 2012. -V. 41. - P. 17891794.
176. Beck T. Investigations on the ecology and physiology of the silage microflora. Landwirtsch. Forsch. - 1965. - V. 18. - P. 243-250.
177. Beck T. The microbiology of silage fermentation. In M.E McCullough (ed.) Fermentation of silage-A review. NFIA, West Des Moines. IA. - 1978.- p. 63-115 .
178. Beckman J.L. The effects of feeding mycotoxin binding products on the performance of lactating dairy cows // The Ohio State University. College of Food, Agricultural, and Environmental Sciences Honors Theses. - 2001. - 38 P.
179. Beeton S., Bull A.T. Biotransformation and detoxification of T-2 toxin by soil and freshwater bacteria. Applied and Envionmental Microbiology. - 1989. - V. 55. - P. 190-197.
180. Benedetti R., Nazzi F., Locci R. et. al. Degradation of fumonisin B1 by a bacterial strain isolated from soil // Biodegradation 2006. - V. 17. - P. 31-38.
181. Binder E.M., Binder J. Strain of Eubacterium that Detoxifies Trichothecenes. US Patent 6 (Original patent owner: Erber Aktiengesell Schaft). Washington, DC: United States Patent and Trademark Office, 2004. - 794-175.
182. Bolsen K.K., Heidker J.L. Silage Additives USA. Chalcombe. - 1985.
183. Boudra H., Morgavi D.P. Mycotoxin risk evaluation in feeds contaminated by Aspergillus fumigatus. Animal Feed Sci Technol. - 2005. - V. 120. - P. 113-123.
184. Boudra H., Morgavi D.P. Reduction in fusarium toxin levels in corn silage with low dry matter and storage time // Agric Food Chem. - 2008. - V. 56(12). - P. 4523-4528.
185. Brandl M. T., Mandrell R. E. Fitness of Salmonella enterica serovar Thompson in the cilantro phyllosphere // Appl. Environ. Microbiol - 2002. - V. 68. - P. 3614-3621.
186. Brenes A., Roura E. Essential oils in poultry nutrition: Main effects and modes of action. Anim Feed Sci. Technol. 2010;158:1-14.
187. Brenner DJ. Section 5. Facultative anerobic Gram-negative rods, Family I. Enterobacteriaceae In N.R Krieg and J.G. Holt. (ed. ) Bergey 's manual of systematic bacteriology. V. I. Williams and Wilkins, Baltimore, MD. 1984. - p. 409-498 .
188. Bruinink A., Sidler C. The neurotoxic effects of ochratoxin-A are reduced by protein binding but are not affected by I-phenylalanine // Toxicol. Appl. Pharmacol. - 1997. - V. 146. -P. 173-179.
189. Brusetti L., Borin S., Mora D. et al. Daffonchio Usefulness of length heterogeneity-PCR for monitoring lactic acid bacteria succession during maize ensiling // - 2006. - V 56(1). - P. 154-64.
190. Bourhis A. L., Saunier K., Doré J. et al. Development and Validation of PCR Primers To Assess the Diversity of Clostridium spp. in Cheese by Temporal Temperature Gradient Gel Electrophoresis //Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - V.71(1). - P.29-38.
191. Boysen M.E., Jacobsson K.G., Schnurer J. 2000. Molecular identification of species from the Penicillium roqueforti group associated with spoiled animal feed // Appl. Environ. Microb. - V. 66. - P. 1523-1526.
192. Brulc J.M., Antonopoulos D.A., Miller M.E. et al. Genecentric metagenomics of the fiber-adherent bovine rumen microbiome reveals forage specific glycoside hydrolases // Proc. Natl Acad. Sci. USA. - 2009. - V. 106. - P. 1948-1953.
193. Brock F.M., Forsberg C.W., Buchanan-Smith J.G. Proteolytic activity of rumen microorganisms and effects of proteinase inhibitors // Appl Environ Microbiol. - 1982. - V. 44. - P. 561-569.
194. Brown M.S., Ponce C.H., Pulikanti R. Adaptation of beef cattle to high-concentrate diets: performance and ruminal metabolism // J. Anim Sci. - 2006. - V. 84. - P. 25-33.
195. Brod D.L., Bolsen K.K., Brent B.E. Effect of water temperature on rumen temperature, digestion and rumen fermentation in sheep // J. Anim Sci. - 1982. - V. 54. - P. 179-182.
196. Metabolite profiles of lactic acid bacteria in grass silage / Broberg A.K., Jacobsson K. , Strom et al. // Applied and Environmental Microbiology. - 2007. - V. 73. - P. 5547-5552.
197. Bryan-Jones D.J. Some aspects of the microbiology of silage / PhD Thesis. University of Edinburgh. - 1969.
198. Burns J.C. ASAS Centennial Paper: utilization of pasture and forages by ruminants: a historical perspective // J Anim Sci. - 2008. -V. 86. - P. 3647-3663.
199. Burt S. Essential oils: Their antibacterial properties and potential applications in foods— A review. Int. J. Food Microbiol. 2004;94:223-253.
200. Burri R. Die Bacterienvegetation auf der Oberflache normal entwickelter Pflanzen / R. Burri // Zentrbl. fur Bakt. - 1903. - Abt. II. Bd. X.
201. Butkevich N.V., Butkevich aVS Multiplication of sea bacteria depending on the composition of the medium and on temperature. Microbiology (Moscow). - 1936. - V.5 -P. 322-342.
202. Buxton D.R., Richard E. Muck, Joseph H. Harrison. Silage Science and Technology // Madison: American Society of Agronomy, Incorporated, 2003. - 927 P.
203. Caloni F., Spotti M., Auerbach H. et al. In vitro metabolism of fUmonisin B1 by ruminal microflora // Vet Res Commun. - 2000. - V. 24(6). - P. 379-87.
204. Calsamiglia S., Busquet M., Cardozo P.W., Castillejos L., Ferret A. Invited review: Essential oils as modifiers of rumen microbial fermentation. J. Dairy Sci. 2007;90:2580-2595.
205. Cavaglieri L., Passone A., Etcheverry M. Screening procedures for selecting rhizobacteria with biocontrol effects upon Fusarium verticillioides growth and fumonisin B1 production // Res. Microbiol. - 2004. - V. 155. - P. 747-754.
206. Ceuppens S., Delbeke S., De Coninck D. et al.Characterization of the Bacterial Community Naturally Present on Commercially Grown Basil Leaves: Evaluation of Sample Preparation Prior to Culture-Independent Techniques // Int J Environ Res Public Health. - 2015. - V. 21;12(8). - P. 10171-10197.
207. Chang X., Wu Z., Wu S., Dai Y. et al.Degradation of ochratoxin A by Bacillus amyloliquefaciens ASAG1 // Food Addit. Contam. Part A-Chem. Anal. Control Expos. Risk Assess. -2015. - V. 32. - P. 564-571.
208. Charmley E., Trenholm H.L., Thompson B.K. et al. Influence of level of deoxynivalenol in the diet of dairy cows on feed intake, milk production and its composition // J. Dairy Sci. - 1993. - V. 6. - P. 3580-3587.
209. Cheeke P. R. Endogenous toxins and mycotoxins in forage grasses and their effects on livestock. // J . Anim Sci. -1995. - V. 73. - P. 909-918.
210. Cheli F., Campagnoli A., Dell'Orto V. Fungal populations and mycotoxins in silages: From occurrence to analysis // Animal Feed Science and Technology. 2013. -V. 183, Issues 1-2. - P. 1-16.
211. Cho K.M., Math R.K., Hong S.Y. et al. Iturin produced by Bacillus pumilusHY1 from Korean soybean sauce (kanjang) inhibits growth of aflatoxin producing fungi // Food Control. -2009. - V. 20. - P. 402-406.
212. Christensen C. M., Kaufmann H.H. Storage of cereal grains and their products // 2nd ed. American Association of Cereal Chemists, St. Paul, Minnesota. - 1974. - P. 158-192.
213. Chu F. S., Chang F. C. C., Hinsdill R. D. Production of antibody against ochratoxin A, Appl. Environ. Microbiol. - 1976. - V. 31(6). - P. 831.
214. Chung T.C., Axelsson L., Dobrogosz W.J., Lindgren S.E. Production of a broad spectrum antimicrobial substance by Lactobacillus reuteri // Microb. Ecol. Health Dis. - 1989. -V. 2. - P. 131-136.
215. Church D.C. Ruminant Animal: Digestive Phisiology and nutrition / New Jersey: Prentice Hall, 1993.
216. Ciegler A., Lillehoj E.B., Peterson R.E., Hall H.H. Microbial detoxification of aflatoxin. Applied microbiology. - 1966. - V. 14. - P. 934-939.
217. Cole R.J., Dorner J.W. Extraction of aflatoxins from naturally contaminated peanuts with different solvents and solvent/peanut ratios.// J. AOAC Int. - 1994. - V. 77(6). - P. 1509-1511.
218. Cole R.J., Kirksey J.W., Dorner J.W. et al.Mycotoxins produced by Aspergillus fumigates species isolated from molded silage // J. Agr. Food Chem. - 1977. - V. 25. - P. 826-830
219. Coleman G.S., Laurie L., Bailey J.E. et al. The Cultivation of Cellulolytic Protozoa Isolated from the Rumen // J Gen Microbiol. - 1976. - V. 95, 144-150.
220. Condon S. Responses of lactic acid bacteria to oxygen // FEMS Microbiol. Rev. - 1987. - V. 46. - P. 269- 280
221. Corsetti A., Gobbetti M., Rossi J. et al.Antimould activity of sourdough lactic acid bacteria: identification of a mixture of organic acids produced by Lactobacillus sanfrancisco CB1 // J. of Applied Microbiol. and Biotechnol. - 1998. - V. 50. - P. 253-256.
222. Coppock R.W., Mostrom M.S., Sparling C.G. et al. Apparent zearalenone intoxication in a dairy herd from feeding spoiled acid-treated corn // Vet. Hum. Toxicol. - 1990. - V. 32. - P. 246-248.
223. Cotta M.A. Amylolytic activity of selected species of ruminal bacteria //Appl Environ Microbiol. - 1988.- V. 54. - P. 772-776.
224. Cotta M.A. Interaction of ruminal bacteria in the production and utilization of maltooligosaccharides from starch // Appl Environ Microbiol . - 1992. - V. 58. - P. 48-54.
225. Cserhati M., Kriszt B., Krifaton C. et al. Mycotoxin-degradation profile of Rhodococcus strains // Int. J. Food Microbiol. - 2013. - V. 166. - P. 176-185.
226. Cvek D., Markov K., Frece J. et al. Adhesion of zearalenone to the surface of lactic acid bacteria cells // Croatian J. for Food Technology, Biotechnology and Nutrition, special Issue. 2012. - V. 7. - P. 49.
227. Daeschel M.A., Andersson R.E., Fleming H.P. Microbial ecology of fermenting plant materials // FEMS Microbiol. Rev. - 1987. - V. 46. - P. 357-367
228. Damoglou A.P., Shannon W., Downey G.A. The interaction between Fusaria and their mycotoxins in grass silage // J. Sci. Food Agric. - 1984. - V. 35. - P. 279-284.
229. Dänicke S., Matthäus K., Lebzien P. et al. Effects of Fusarium toxin-contaminated wheat grain on nutrient turnover, microbial protein synthesis and metabolism of deoxynivalenol and zearalenone in the rumen of dairy cows // J. Anim Physiol. Anim Nutr. Berl. - 2005. - V. 89. -P. 303-315.
230. Dashtban M., Schraft H., Qin W. Fungal bioconversion of lignocellulosic residues; opportunities & perspectives // Int J. Biol Sci . - 2009. - V. 5. - P. 578-595.
231. Dehority B.A. Pectin-fermenting bacteria isolated from the bovine rumen // J Bacteriol 1969. - V. 99. - P. 189-196.
232. De. C., A.I., De. S. et al. // Microbiol. Res. - 2005. - V.159. - P. 339-346.
233. De Saeger S. Determining Mycotoxins and Mycotoxigenic Fungi in Food and Feed // Woodhead Publishing. - 2011. - 456 P.
234. Diaz D.E., Hagler W.M. Jr., Blackwelder J.T., Eve J.A. et al. Aflatoxin binders II: reduction of aflatoxin M1 in milk by sequestering agents of cows consuming aflatoxin in feed // Mycopathologia. - 2004. - V. 157(2). - P. 233-241.
235. Diaz D.E., Hopkins B.A., Leonard L.M., Hagler W.M. et al.Effect of fumonisin on lactating dairy cattle // J. Dairy Sci. - 2000. - V. 83(abstr.). - P. 1171.
236. Dohmen M.J., Joop K., Sturk A., Bols P.E. et al.Relationship between Intra-uterine Bacterial Contamination, Endotoxin Levels and the Development of Endometritis in Postpartum Cows with Dystocia or Retained Placenta // Theriogenology. - 2000. - V. 54. - P. 1019-1032.
237. Dogi C.A., Pellegrino M., Poloni V., Poloni L. et al. Efficacy of corn silage inoculants on the fermentation quality under farm conditions and their influence on Aspergillus parasitucus, A. flavus and A. fumigatus determined by q-PCR // Food Additives & Contaminants: Part A 2015. -V. 32, Issue 2. - P. 229-235.
238. Done D.L. Silage inoculants - a review of experimental work //Research and Development in Agriculture. - 1986. - V. 3. - P. 83-87.
239. Donell A.G., Horis I.R., Clans D. Characterization of Bacillus subtilis. Bacillus pumillis.Bacillus licheniformis and Bacillus amylaliquefaciens by pyrolisis, gas liquid chromatography DNA-DNA hybridization, biochemical test and PPI system //Isyst Bacteriol@. - 1980. - P.-448-459.
240. Dorman H.J.D., Deans S.G. Antimicrobial agents from plants: Antibacterial activity of plant volatile oils. J. Appl. Microbiol. 2000;88:308-316.
241. dos Santos V.M., Dorner J.W., Carreira F. Isolation and toxigenicity of Aspergillus fumigatus from moldy silage // Mycopathologia. - 2002. - V. 156. - P. 133-138.
242. Doyle M.P., Applebaum R.S., Brackett R.E., Marth H. Physical, Chemical and Biological Degradation of Mycotoxins. Foods and Agricultural Commodities // J. of Food Protection. - 1982. - V. 45. - P. 964-971.
243. Dridi F., Marrakchi M., Gargouri M., Saulnier J. et al. Comparison of carboxypeptidase Y and thermolysin for ochratoxin A electrochemical biosensing // Anal. Methods. - 2015. -V. 7. - P. 8954-8960.
244. Driehuis, F., Oude Elferink S. J. W. H., Spolestra S. F. Anaerobic lactic acid degradation during ensilage of whole-crop maize inoculated with Lactobacillus buchneri inhibits yeast growth and improves aerobic stability // J. Appl. Microbiol. - 1999. - V. 87(4). - P. 583-594.
245. Driehuis F., Elferink O., Van Wikselaar P. G. Lactobacillus buchneri improves the aerobic stability of laboratory and farm-scale whole-crop maize silage but does not affect feed intake and milk production of dairy cows. In Proc. Xllth Int'l Silage Conf, 264-265. Uppsala, Sweden: Swedish University of Agricultural Sciences. 1999.
246. Driehuis F., Spanjer M.C., Scholten J.M., Te Gifffel M.C. Occurrence of mycotoxins in maize, grass and wheat silage for dairy cattle in the Netherlands' // Food Addit. Contam. - 2008. -V. 1. - P. 41-50.
247. Driehuis F. Silage and the safety and quality of dairy foods: a rewiew // Agricultural and Food Sci. - 2013. - V. 22. - P. 16-34.
248. Duskova D., Marounek M. Fermentation of pectin and glucose, and activity of pectin-degrading enzymes in the rumen bacterium Lachnospira multiparus // Lett Appl Microbiol. -2001. - V. 33. - P. 159-163.
249. Duvick J., Rood T., Maddox J., Gilliam J. Detoxification of mycotoxins in planta as a strategy for improving grain quality and disease resistance: identification of fumonisin-degrading microbes from maize, in Molecular Genetics of Host-Specific Toxins in Plant Disease, eds Kohmoto K., Yoder O., editors. (Dordrecht: Kluwer Academic Publishers; ). 1998. - P. 369-381.
250. Dvorak M. The ability of bentonite and natural zeolite to adsorb aflatoxins from liquid media // Czech Vet. Med. (Pharma). - 1989. - V. 34. - P. 307-316.
251. Incidence of Fusarium species and mycotoxins in silage maize / Eckard S., Wettstein F.E., Forrer H., Vogelgsang S // Toxins. - 2011. - V. 3. - P. 949-967.
252. Edwards S.G., Pirgozliev S.R., Hare M.C., Jenkinson P Quantification of trichothecene-producing Fusarium species in harvested grain by competitive PCR to determine the efficacy of fungicides against Fusarium head blight of winter wheat // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - V. 67. - P. 1575-1580.
253. Eid J., Fehr A., Gray J. et al Real-time DNA sequencing lrom single polymerase molecules. // Science. - 2009. - V. 323(5910). - P. 133-138.
254. Eikmeyer F.G., Kofinger P., Poschenel A., Junemann S. et al.Metagenome analyses reveal the influence of the inoculant Lactobacillus buchneri CD034 on the microbial community involved in grass ensiling // J. Biotechnol. - 2013. - V. 167, №23. - P. 334-43.
255. Ekweozor C.C., Nwoguh C.E., Barer M.R. Transient increases in colony counts observed in declining populations of Campylobacter jejuni held at low temperature // FEMS Microbiol. Lett. - 1998. - V. 158 (2). - P. 267-72.
256. El-Nezami H., Kankaanpaa P., Salminen S., Ahokas Ability of dairy strains of lactic acid bacteria to bind a common food carcinogen, aflatoxin B1 // J. Food ChemToxicol. - 1998. - V. 36. - P. 321-326.
257. El-Shanawany A.A., Mostafa M.E., Barakat A. Fungal population and mycotoxins in silage in Assiut and Sohag governorates in Egypt, with a special reference to characteristic Aspergilli toxins // Mycopathologia. - 2005. - V. 159. - P. 281-289.
258. Engler K.H., Coker D., Raymond, Evans et al. Uptake of aflatoxin B1 and T-2 toxin by two mycotoxin bioassay microorganisms: Kluyveromyces marxianus and Bacillus megaterium // Arch. Microbiol. - 2000. - V. 174. - P. 381-385.
259. Ercolani G. L. Distribution of epiphytic bacteria on olive leaves and the influence of leaf age and sampling time // Microb. Ecol. - 1991.- V. 21. - P. 35-48.
260. Escoula L. Patulin production by Penicillium granulatum and inhibition of ruminal flora // J. Environ. Pathol. Toxicol. Oncol. - 1992.- V. 11. - P. 45-48.
261. Fadrosh D. W., Ma B., Gajer P., Sengamalay N., Ott S., Brotman R. M., Ravel J. An improved dual-indexing approach for multiplexed 16S rRNA gene sequencing on the Alumina MiSeq platform. (англ.) // Microbiome. — 2014. — V. 2, №2 1. — P. 6.
262. Fenlon D.R. Listeriosis. In: Stark B.A., Wilkinson J.M. (eds.) Silage and health. Marlow, Bucks, UK: Chalcombe Publikations. - 1988. - P. 7-18.
263. Fenlon D.R., Wilson J. Growth of Escherichia coli O157 in poorly fermented laboratory silage: a possible environmental dimension in the epidemiology of E. coli O157 // Lett Appl Microbiol. - 2000. - V. 30(2). -P. 118-21.
264. Fink-Gremmels J. The role of mycotoxins in the health and performance of dairy cows // Vet. J. - 2008. - V. 176 . - P. 84-92.
265. Fokkema N. J., Schippers B. Phyllosphere vs rhizosphere as environments for saprophytic colonization // Cambridge University Press - London, 1986. - P. 137-159.
266. Földi J., Kulcsar M., Pecsi A., Huyghe B. et al.Bacterial Complications of Postpartum Uterine Involution in Cattle // Anim. Reprod. Sci. - 2006. - V. 96. - P. 265-81.
267. Föllmann W., Hillebrand I. E., Creppy E. E., Bolt H. M. Sister chromatid exchange frequency in cultured isolated porcine urinary bladder epithelial cells (PUBEC) treated with ochratoxin A and alpha // Arch. Toxicol. - 1995. - V. 69. - P. 280-286.
268. Forsberg C.W., Lovelock L.K., Krumholz L., Buchanan-Smith J.G. Protease activities of rumen protozoa // Appl Environ Microbiol . 1984.- V. 47. - P. 101-110.
269. Frevel H.-J., Engel G., Teuber M. Schimmelpilze in Silage und Rohmilch. Milchwissenschaft. - 1985. - V. 40. - P. 129-132.
270. Frumholtz P.P., Newbold C.J., Wallace R.J. Influence ofAspergillus oryzae fermentation extract on the fermentation of a basal ration in the rumen simulation technique (Rusitec) // J. Agric. Sci. (Camb.). - 1989. - V. 113. - P. 169-172.
271. Fuentes M.C., Calsamiglia S., Cardozo P.W., Vlaeminck B. Effect of pH and level of concentrate in the diet on the production of biohydrogenation intermediates in a dual-flow continuous culture // J Dairy Sci. - 2009.- V. 92. - P. 4456-4466.
272. Fuchs E., Binder E.M., Heidler D., Krska RStructural characterization of metabolites after the microbial degradation of type A trichothecenes by the bacterial strain BBSH 797 // Food Additives and Contaminants. - 2002. - V. 19. - P. 379-386.
273. Gallo A., Giuberti G., Frisvad G.C., Bertuzzi T., Nielsen K.F. Review on Mycotoxin Issues in Ruminants: Occurrence in Forages, Effects of Mycotoxin Ingestion on Health Status and Animal Performance and Practical Strategies to Counteract Their Negative Effects // Toxins (Basel). - 2015. - V. 7(8). - P. 3057-3111.
274. Galvano F., Galofaro V., Galvano G. Occurrence and stability of aflatoxin M1in milk and milk products: A worldwide review // J. of Food Protec. - 1996. - V. 59. - P. 1079-1090.
275. Garon D., Richard E., Sage L., Bouchart V. et al.Mycoflora and multimycotoxin detection in maize silage: Experimental study // J. Agric. Food Chem. - 2006. - V. 54. - P. 3479-3484.
276. Gentry P.A., Ross M.L., Chan P.K-C. Effect of T-2 toxin on bovine hematological and serum enzyme parameters // Vet. Hum. Toxicol. - 1984. - V. 26. - P. 24-24.
277. Girlanda M., Isocrono D., Bianco C., Luppi-Mosca A.M. Two foliose lichens as microfungal ecological niches // Mycologia. - 1997. - V. 89(4). - P. 531-536.
278. Gollop N.1., Zakin V., Weinberg Z.G. Antibacterial activity of lactic acid bacteria included in inoculants for silage and in silages treated with these inoculants. // J Appl Microbiol. - 2005. - V. 98(3). - P. 662-666.
279. Gonzales Pereyra M.L., Alonso V.A., Sager R., Morlaco M.B. et al Fungal and selected mycotoxins from pre- and postfermented maize silage. . //J. Appl. Microbiol. -2008.- V. 104. - P. 1034-1041.
280. Gouet P., Contrepois M. Comportement des spores de bacteries anaerobies fermentant Ie lactate dans Ie tractus digestif du ruminant. r. Introduites au niveau du rumen, au cours du
transit digestif chez Ie ruminant. Ann. BioI. Anim. Biochim. Biophys. II: 1971. - P. 129138.
281. Grenet E., Barry P. Colonization of thick walled plant tissues by anaerobic fungi. Anim. Feed Sci. Technol. -1998. - V. 19(1). - P. 25-31.
282. Grenet E., Breton A., Barry P., Fonty G. et al. Rumen anaerobic fungi and plant substrate colonization as affected by diet composition // Anim Feed Sci Tech 1989. - V. 26. - P. 55-70.
283. Gressley T.F., Hall M.B., Armentano L.E. Ruminant nutrition symposium: Productivity, digestion, and health responses to hindgut acidosis in ruminants // J Anim Sci 2011. - V. 89. - P. 1120-1130.
284. Grishkan I., Temina M. Basaltic stones with epilithic lichens as a novel substrate for an osmotolerant fungus, Aspergillus glaucus // Acta Mycologica. -2017. - V.52(1).-P. 1091.
285. Guan S., He J.W., Young J.C., Zhu H.H. et al. Transformation of trichothecene mycotoxins by microorganisms from fish digesta // Aquaculture. - 2009. - V. 290. - P. 290295.
286. Gudding R., McDonald J.S., Cheville N.F. Pathogenesis of Staphylococcus aureus: bacteriological, histologic, and ultrastructural pathologic findings // Am. J. Vet. Res. - 1984. - V. 45. - P. 2525-2531
287. Guimaraes A.A., Jaramillo P.M.D., Nobrega R.S.A., Florentino L.A. et al. Genetic and symbiotic diversity of nitrogen-fixing bacteria isolated from agricultural soils in the western Amazon by using cowpea as the trap plant. // Appl Environ Microbiol - 2012. - V. 78. - P. 6726-6733.
288. Guo X, Li D, Lu W, Piao X, Chen X. Screening of Bacillus strains as potential probiotics and subsequent confirmation of the in vivo effectiveness of Bacillus subtilis MA139 in pigs. Antonie Van Leeuwenhoek. 2006; 90(2): 139-46.
289. Handelsman J. Metagenomics: application of genomics to uncultured microorganisms // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2004. - V. 68. - P. 669-685.
290. Handelsman J., Rondon M. R., Brady S. F., Clardy J., Goodman R. M. Molecular biological access to the chemistry of unknown soil microbes: a new frontier for natural products. (англ.) // Chemistry & biology. — 1998. — Vol. 5, no. 10. — P. 245—249.
291. Hartinger D., Heinl S., Grabherr R., Schatzmayr G. et al. Heterologous expression of genes from the fumonisin degradation gene cluster of Sphingomonas spp. MTA144 and activity of the catabolic enzymes // New Biotechnol. -2009. - V. 25.- P. 132-133.
292. Hasenstein J. & LamontS. Chicken Gallinacin Gene Cluster Associated with Salmonella Colonization in Two Advanced intercross Lines / Iowa State University Animal Industry Report,2007
293. Hatch R.C., Clark J.D., Jain A.V., Weiss R.Induced acute aflatoxicosis in goats: treatment with activated charcoal or dual combinations of oxytetracycline, stanozol, and activated charcoal // Am. J. Vet. Res. - V. 43. - P. 644-648.
294. Hawkes C.V., DeAngelis K.M., Firestone M.K. Root interactions with soil microbial communities and processes. The Rhizosphere (Cardon Z & Whitbeck J eds), pp. 1-3. Elsevier, New York. 2007
295. He J.W. Detoxification of Deoxynivalenol by a Soil Bacterium Devosia mutans 17-2-E-8. Ph.D. thesis, The University of Guelph. 2015.
296. Heinl S., Hartinger D., Moll W.D., Schatzmayr G. et al. Identification of a fumonisin B1 degrading gene cluster in Sphingomonas spp. MTA144 // New Biotechnol. -2009. - V. 25. - P. 61-62.
297. Heinl S., Hartinger D., Thamhesl M., Vekiru E. et al.Degradation of fumonisin B-1 by the consecutive action of two bacterial enzymes // J. Biotechnol. - 2010. - V. 145. - P. 120129.
298. Hernandez-Mendoza A., Garcia H.S., Steele J.L. Screening of Lactobacillus casei strains for their ability to bind aflatoxin B1 // Food Chem. Toxicol. - 2009. - V.47, №26. -P. 1064-1068.
299. Heron Sh.J.E., Wilkinson J.F., Carol M. Duffus.Enterobacteria associated with grass and silages // J. of Applied Microbiology. - V. 75, Issue 1. - 1993. - P. 13-17.
300. Hespell R.B., Akin D.E., Dehority B.A. Bacteria, fungi, and protozoa of the rumen. In: Mackie, R. I., B. A. White & R. E. Isaacson (eds) Gastrointestinal Microbiology /New York: Chapman and Hall, - 1997. - V. 2. - P.59-141
301. Hirsch A., Grinsted E., Chapman H.R., Mattick A. A note on the inhibition of an anaerobic sporeformer in Swiss - type cheese by a nisin - producing Streptococcus // J. Dairy Res. - 1951a. - V.18. N2. - P. 43-44.
302. Hirsch A., Wheater D. The production of antibiotics by streptococci // J. Dairy Res. -1951b. - V. 18. - P. 2.
303. Hirsch A. Various Antibiotics from one strain of Streptococcus lactis // Nature. - 1951c. - V. 167. - P. 4260.
304. Hirsch A. The evolution of the lactic streptococci // J. Dairy Res. - 1952. - V. 19. - P. 3.
305. Ho A.J., Ivanek R., Grohn Y.T., Nightingale K.K. et al. Listeria monocytogenes fecal shedding in dairy cattle shows high levels of day-to-day variation and includes outbreaks and sporadic cases of shedding of specific L. monocytogenes subtypes // Prev Vet Med. 2007. - V. 16;80(4). - P. 287-305
306. Hohler D., Sudekum K.H., Wolffram S., Frohlich A.A. et al Metabolism and excretion of ochratoxin A fed to sheep. //J Anim Sci. - 1999. - V. 77(5). - P. 1217-23.
307. Holland M.A. Methylobacterium and plants // Rec. Res. Dev. Plant Physiol., 1997. - Vol. 1. - Jfel. - P. 207-213.
308. Honig H., Woolford M K. Changes in silage on exposure to air. In C. Thomas (ed.) Forage conservation in the 80s. Occasional Symposium No. 11 . British Grassland Society, Hurley, Berkshire, UK. - 1980. - p. 76-87.
309. Hodrova B., Kopecny J., Petr O. Interaction of the rumen fungus Orpinomyces joyonii with Megasphaera elsdenii and Eubacterium limosum Lett Appl Microbiol - 1995. - V. 21. - P. 34-37.
310. Hoffman P.C., Ocher S.M. Quantification of milk yield losses associated with aerobically unstable high moisture corn // J. Dairy Sci. - 1997. - V. 80(Suppl. 1). - P. 234.
311. Honig H., Woolford M.K. Changes in silage on exposure to air. In C. Thomas (ed.) Forage conservation in the 80s. Occasional Symposium No. 11. British Grassland Society, Hurley, Berkshire, UK. - 1980. - P. 76-87.
312. Hook S.E., Wright A.D., McBride B.W. Methanogens: methane producers of the rumen and mitigation strategies // Archaea 2010. - V. 10. - P. 1-11.
313. Hosotani K., Kitagawa M. Improved simultaneous determination method of beta-carotene and retinol with saponification in human serum and rat liver // J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. - 2003. V. 5;791(1-2). - P. 305-13.
314. Hsu I.C., Smalley C.B., Strong F.M., Ribelin W.E. Identification of T-2 toxin in moldy corn associated with a lethal toxicosis in dairy cattle // Appl. Microbiol. -1972. - V. 24. - P. 684690.
315. Hungate R.E. Studies on cellulose fermentation. I. The culture and physiology of an anaerobic cellulose-digesting bacterium // J. Bacteriol. 1944. - V. 48. - P. 499-512.
316. Hungate R.E. The anaerobic mesophilic cellulolytic bacteria // Bacterial Rev. - 1950. - V. 14. P. 1-49.
317. Hungate R.E. Kinds of cellulolytic cocci in the rumen of cattle and sheep // Bacteriol Proc. 1952. P. 16.
318. Hungate R.E. The Rumen and its Microbes / NewYork: Academic Press, 1966
319. Hungate R.E., Fletcher D.W., Dougherty R.W., Barrentine B.F. Microbial activity in the bovine rumen: Its measurement and relation to bloat // Appl. Microbiol. - 1955. V. 3. - P. 161173.
320. Hunter P.J., Hand P., Pink D., Whipps J.M., Bending G.D.Both leaf properties and microbe-microbe interactions influence within-species variation in bacterial population diversity and structure in the lettuce (Lactuca Species) phyllosphere //Appl Environ Microbiol. - 2010. -V. 76(24). - P. 8117-25.
321. Huszenicza G., Fodor M., Gacs M., Kulscar M. et al Uterine Bacteriology, Resumption of Ovarian Activity and Fertility in Postpartum Cows Kept in Large-scale Dairy Herds. // Reprod. Domest. Anim. - 1999. - V.34. - P.237-45.
322. Huws Sh.A., Chiariotti A., Sarubbi F., Carfi F. et al. Effects of feeding Mediterranean buffalo sorghum silage versus maize silage on the rumen microbiota and milk fatty acid content // J. Gen. Appl. Microbiol. - 2012. - V. 58. P. 107-112
323. Ikunaga Y., Sato I., Grond S., Numaziri N. et al.Nocardioides sp. strain WSN05-2, isolated from a wheat field, degrades deoxynivalenol, producing the novel intermediate 3-epi-deoxynivalenol // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2011. - V. 89. - P. 419-427.
324. Ivan M., Neill L., Entz T. Ruminal fermentation and duodenal flow following progressive inoculations of fauna-free wethers with major individual species of ciliate protozoa or total fauna // J Anim Sci . - 2000. - V. 78. - P. 750-759.
325. Ivan M., Petit H.V., Chiquette J., Wright A.D.Br Rumen fermentation and microbial population in lactating dairy cows receiving diets containing oilseeds rich in C-18 fatty acids // J Nutr. - 2012.- V. 31. - P. 1-8.
326. Jacobs J. L., Sundin G. W. Effect of solar UV-B radiation on a phyllosphere bacterial community // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - V. 67. - P. 5488-5496.
327. Jamroz D., Wiliczkiewicz A., Wertelecki T., Orda J., Skorupinska J. Use of active substances of plant origin in chicken diets based on maize and locally grown cereals. Br. Poult. Sci. 2005;46:485-493.
328. Jang I.S., Ko Y.H., Kang S.Y., Lee C.Y. Effect of a commercial essential oil on growth performance, digestive enzyme activity and intestinal microflora population in broiler chickens. Anim. Feed Sci. Technol. 2007;134:304-315.
329. Johnson H.E., Merry R.J., Davies D.R., Kell D.B. et al. Vacuum packing: A model system for laboratory-scale silage fermentations // Journal of Applied Microbiology. - 2005. - V. 98(1). - P. 106-113.
330. Jones M.G., Ewart J.M. Effects on milk production associated with consumption of decorticated extracted groundnut meal contaminated with aflatoxin // Veterinary Record. -1979. - V. 105:21. - P. 492-493
331. Jones B. A., Hatfield R. D., Muck R. E. Effects of fermentation and bacterial inoculation on lucerne cell walls. Journal of the Science of Food and Agriculture. - 1992. - V. 60. - P. 147155.
332. Jonsson A., Pahlow G. Systematic classification and biochemical characterization of yeasts growing in grass silage inoculated with Lactobacillus cultures // Anim. Res . Develop. 1984. - V. 20. - P. 7-22.
333. Jonsson A. Growth of Clostridium tyrobutyricum during fermentation and aerobic deterioration of grass silage // J. Sci. Food Agric. - 1991. - V. 54. - P. 557-568.
334. Kalac P., Woodford M.K. A review of some aspects of possible associations between the feedings of silage and animal health // Br. Vet. J. - 1982. - V. 138. - P. 305309.
335. Kalaivani C.S., Sathish S.S., Janakiraman N., Johnson M. GC-MS studies on Andrographis paniculata (Burm . f.) Wall. Ex Nees—a medicinally important plant // International Journal of Medicinal and Aromatic Plants. - 2012. - V. 2. - P. 69-74.
336. Kandler 0., Weiss N. 1986. Genus Lactobacillus Beijerinck 1901, 212AL p. 1209-1234. In P.H.A. Sneath et al. (ed.) Bergey's manual of systematic bacteriology. Vol. 2. Williams and Wilkins , Baltimore, MD.
337. Kandler O. Carbohydrate metabolism in lactic acidbacteria // Ant. v. Leeuwenhoek. -1983. - V. 49. - P. 209-224.
338. Karlovsky P. Biological detoxification of fungal toxins and its use in plant breeding, feed and food production // NAT. Toxins. - 1999. - V. 7. - P. 1-23.
339. KhamisA., Raoult D., La Scola B. rpoB Gene Sequencing for Identification of Corynebacterium Species // J.Clin.Microbiol. - 2004. -V.42(9). - P.3925-3931.
340. Khan N.I., Schisler D.A., Boehm M.J., Slininger P.J., et al. Selection and evaluation of microorganisms for biocontrol of Fusarium head blight of wheat incited by Gibberella zeae // Plant Dis. - 2001. - V. 85. - P. 1253-1258.
341. Khan N.I., Schisler D.A., Boehm M.J., Slininger P.J. et al. Selection and evaluation of microorganisms for biocontrol of Fusarium head blight of wheat incited by Gibberella zeae // Plant Dis. - 2001. - V. 85. - P. 1253-1258.
342. Kiessling K-H., Pettersson H., Sandholm K., Olsen M Metabolism of aflatoxin, ochratoxin, zearalenone and three trichothecenes by intact rumen fluid, rumen protozoa and rumen bacteria. // Appl. En-viron. Microbiol. - 1984. - V. 47. - P. 1070-1073.
343. Kim E.K., Maragos C.M., Kendra D.F. Liquid chromatographic determination of fumonisins B1, B2, and B3 in maize silage // J. Agric. Food Chem. - 2004. - V. 52/ - P. 196-200.
344. Kim H., Nishiyama M., Kunito T., Senoo K. et al.High population of Sphingomonas species on plant surface // Journal of Applied Microbiology. - 1998. - V. 85.- P. 731-736.
345. Kim H., Nishiyama M., Kunito T., Senoo K. et al.High population of Sphingomonas species on plant surface // Journal of Applied Microbiology. - 1998. - V. 85. - P. 731-736.
346. Kim J. J., Sundin G. W. Regulation of the rulAB mutagenic DNA repair operon of Pseudomonas syringae by UV-B (290- to 320-nanometers) radiation and analysis of rulAB-mediated mutability in vitro and in planta // J. Bacteriol. - 2000. - V. 182- P. 6137-6144.
347. Kingsbury J.M. Poisonous Plants of the United States and Canada. NJ, 1964.
348. Klich M. A., Tiffany L. H., Knaphus G. Ecology of the aspergilli of soils and litter // Aspergillus Biology and Industrial Applications. Butterworth-Heineman, Boston. - 1994. - P. 329-353.
349. Kosloski G.V. Bioquímica de ruminantes. - 2002. - 140 p.
350. Krause D.O., Denman S.E., Mackie R.I., Morrison M. et al. Opportunities to improve fiber degradation in the rumen: microbiology, ecology, and genomics // FEMS Microbiol. Rev. -2003. - V. 27. - P. 663-693
351. Krause D.O., Denman S.E., Mackie R.I., Morrison M. et al. Opportunities to improve fiber degradation in the rumen: microbiology, ecology, and genomics // FEMS Microbiol. Rev. -2003. - V. 27. - P.663-693
352. Krause K.M., Oetzel G.R. Understanding and preventing subacute ruminal acidosis in dairy herds: A review //Anim Feed Sci Tech 2006. - V. 126. - P. 215-236.
353. Kriszt R., Krifaton C., Szoboszlay S., Cserháti M. et al. A new zearalenone biodegradation strategy using non-pathogenic rhodococcus pyridinivorans K408 strain // 2012. PLoS ONE 7:e43608. 10.1371/journal.pone.0043608
354. Ksouri S., Djebir S., Hadef Y., Benakhla A.Survey of bovine mycotic mastitis in different mammary gland statuses in two north-eastern regions of Algeria // Mycopathologia. -2015. - V. 179. - P. 327-331.
355. Kuilman M.E.M., Maas R.F.M., Judah D.J., Gremmels J. Bovine hepatic metabolism of aflatoxin B1 // J. Agric. Food. Chem. - 1998. - V. 46. - P. 2707-2713.
356. Kung Jr., L., Shaver R. Interpretation and use of silage fermentation analysis reports. Focus on Forage . - 2001. - V. 3. - P. 1-5.
357. Kung Jr., L., Sheperd A. C., Smagola A. M., Endres K. M. et al The effect of preservatives based on propionic acid on the fermentation and aerobic stability of corn silage and a total mixed ration. // J. Dairy Sci. - 1998. - V. 81. - P. 1322-1330.
358. Kurmanov I.A. Fusariotoxicosis in cattle and sheep // In: Mycotoxic Fungi, Mycotoxins, Mycotoxicoses (An Encyclopedic Handbook). - 1978. - V. 2. - P. 85-110.
359. Lavermicocca P., Valerio F., Visconti A. Antifungal activity of phenyllactic acid against molds isolated from bakery products // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - V. 69(1). - P. 634640.
360. Labots H., Hup G. , Galesloot Th.E . Bacillus cereus in raw and pasteurized milk . LH. The contamination of raw milk with B. cereus spores during its production // Neth. Milk Dairy J. 1965. - V. 19. - P. 191 - 221.
361. Langone J.J., van Vunakis H. Aflatoxin B1: specific antibodies and their use in radioimmunoassay. Journal of the National Cancer Institute. - 1976. - V. 56. - P. 591-595.
362. Langston C. W., Bouma C. A. Study of the microorganisms from grass silage // Appl. Microbiol. - 1960. - V. 8, №№4. - P. 223-234.
363. Laserson J., Jojic V., Koller D. Genovo: de novo assembly for metagenomes // J. Comput. Biol. - 2011. - V. 8. - P. 429-443.
364. Purification and characterization of novel antifungal compounds from the sourdough Lactobacillus plantarum strain 21B / Lavermicocca P., Valerio F., Evidente A., Lazzaroni S., Corsetti A., Gobbetti M. // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - V. 66. - P. 4048-4090.
365. Lawellin D.W., Grant D.W., Joyce B.K. Enzyme-linked immunsorbent analysis for aflatoxin B1 // Applied and Environmental Microbiology. - 1977. - V. 34. - P. 9496.
366. Leahy S.C., Kelly W.J., Altermann E., Ronimus R.S. et al. The genome sequence of the rumen methanogen Methanobrevibacter ruminantium reveals new possibilities for controlling ruminant methane emissions // PLoS ONE. - 2010. - V. 5. - P. 8926-8943.
367. Leisova L., Kucera L., Chrpova J., Sykorova S. et al. Quantification of Fusarium culmorum in wheat and barley tissues using real-time PCR in comparison with DON content // J. Phytopathol. - 2006. - V. 154. - P. 603-611.
368. Lepom P., Baath H., Knabe O. Occurrence of Fusarium species and their mycotoxins in maize. 3. The influence of silaging on the zearalenone content of CCM maize // Arch. Anim. Nutr. - 1988. - V. 38. - P. 817-823.
369. Lepom P., Baath H., Knabe O. Occurrence of Fusarium species and their mycotoxins in maize. 3. The influence of silaging on the zearalenone content of CCM maize // Arch. Anim. Nutr. - 1988. - V. 38. - P. 817-823.
370. Leslie J. F., Bandyopadhyay R., Visconti A. Mycotoxins: Detection Methods, Management, Public Health and Agricultural // Department of Plant Pathology, Kansas State University (KSU), Manhattan, Kansas, USA. - 2008. - 476 P.
371. Li D., Ni K., Pang H., Wang Y. et al Identification and Antimicrobial Activity Detection of Lactic Acid Bacteria Isolated from Corn Stover Silage. // Asian-Australas J Anim Sci. - 2015. - V. 28(5). - P. 620-631.
372. Li Y., Nishino N. Bacterial and fungal communities of wilted Italian ryegrass silage inoculated with and without Lactobacillus rhamnosus or Lactobacillus buchneri /Letters in Applied Microbiology. - V. 52, Issue 4, Version of Record online: 2011. - p. 314-321.
373. Li Y., Nishino N. Effects of Ensiling Fermentation and Aerobic Deterioration on the Bacterial Community in Italian Ryegrass, Guinea Grass, and Whole-crop Maize Silages Stored at High Moisture Content // Australas J Anim Sci. - 2013. -V. 26(9). -P. 1304-1312.
374. Lillehoj E. B., Kwolek W. F., Horner E. S., Widstrom N. W. et al. Aflatoxin Contamination of Preharvest Corn: Role of Aspergillus flavus Inoculum and Insect Damage //Cereal Chem.- 1980. - V. 57. - P. 255 - 257.
375. Limtong S., Kaewwichian R., Yongmanitchai W., Kawasaki H. Diversity of culturable yeasts in phylloplane of sugarcane in Thailand and their capability to produce indole-3-acetic acid // World J Microbiol Biotechnol. - 2014.- V. 30. - P. 1785-1796.
376. Lin C., Bolsen K.K., Brent B.E., Hart R.A. et al.Epiphytic microflora on alfalfa and whole-plant corn // J. Dairy Sci. - 1992. - V. 75. - P. 2484-2493.
377. Lindgren S., Lingvall P., Petterson K.L. Relation between chemical quality and microbial composition in silages . In 8th Silage Conference, Summary of Papers, Hurley, UK.-1987. - p. 11-12.
378. Lindgren S. Hygienic problems in conserved forage. p. 177-190. In G. Pahlow and H. Honig (ed.) Forage conservation towards 2000. Proc. Eur. Grassl. Fed., Braunschweig, Germany. 1991. Landbauforschung Völkenrode Sonderheft 123. Bundesforschungsanstalt für Landwirtschaft Braunschweig-Völkenrode, Braunschweig, Germany.
379. Lindgren S., Petterson K., Kaspersson A. , Jonsson A. et al. Microbial dynamics during aerobic deterioration of silages // J. Sci. Food Agric. - 19856. - V. 36. - P. 765-774.
380. Lindgren S., Petterson K.L., Jonsson A., P. Lingvall et al.Silage inoculation: Selected strains, temperature, wilting and practical application // Swed. J. Agric. Res. - 1985a. - V. 15. -P. 9-18.
381. Lindow S.E., Brandl M.T. Microbiology of the Phyllosphere // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - V. 69 (4). - P. 1875-1883.
382. Lindsey J. R., Kung Jr.L. Effects of combining Lactobacillus buchneri 40788 with various lactic acid bacteria on the fermentation and aerobic stability of corn silage// Animal Feed Science and Technology. - 2010. - V. 159(3-4). - P. 105-109.
383. Line J.E., Brackett R.E. Factors affecting aflatoxin B1 removal by Flavobacterium aurantiacum. Journal of Food Protection, 1995. - V. 58. - P. 91-94.
384. Liu W.-T., Marsh T.L., Cheng H., Forney L.J.Characterization of microbial diversity by determining terminal restriction fragment length polymorphisms of genes encoding 16SrRNA // Appl. Environ. Microbiol. - 1997.- V. 63. - P. 4516-4522.
385. Liu Y., Whitman W.B. Metabolic, phylogenetic, and ecological diversity of the methanogenic archaea // Ann N Y Acad Sci 2008. - V. 1125. - P. 171-189.
386. Logue J.B., Burgmann H., Robinson C.T. Progress in the ecological genetics and biodiversity of freshwater bacteria // BioScience . -2008. - V. 58 (2). - P. 103-113
387. Mackie R.I., White B.A. Symposium: Rumen microbial ecology and nutrition: Potencial impact on nutrient output // J. Dairy Sci. 1990. - V. 73. - P. 2971-2995.
388. Mackie R.I., White B.A. Recent advances in rumen microbial ecology and metabolism: potential impact on nutrient output // J Dairy Sci. -1990. - V. 73(10). - P. 2971-95.
389. Mansfield M., Jones A., Kuldau A.D.G.A. Contamination of fresh and ensiled maize by multiple penicillium mycotoxins // Phytopathology . - 2008. - V. 98. - P. 330336.
390. Mansfield M.A., De Wolf E.D., Kuldau G.A. Relationships between weather conditions, agronomic practices, and fermentation characteristics with deoxynivalenol content in fresh and ensiled maize // Plant Dis. - 2005. - V. 89. - P. 1151-1157.
391. Mansfield M.A., Kuldau G.A. Microbiological and molecular determination of mycobiota in fresh and ensiled maize silage // Mycologia. - 2007. - V. 99. - P. 269-278
392. Mansfield M.A., Jones A.D., Kuldau G.A. Contamination of fresh and ensiled maize by multiple penicillium mycotoxins // Phytopathology. - 2008. - V. 98. -P. 330-336.
393. Marcinakova M., Strompfova V., Laukova A., Simonova M. Occurrence of the structural enterocin A, P, B, L50B genes in enterococci of different origin //Vet Microbiol. - 2008. - V. 132(3-4). - P. 293-301.
394. Margulies M., Egholm M., Altman W.E. et al. Genome sequencing in microfabricated high density picolitre reactors // Nature. - 2005. - V. 437(7057). - P. 376-380.
395. Mateus L., da Costa L.L., Bernardo F., Silva J.R. Influence of Puerperal Uterine Infection on Uterine Involution and Postpartum Ovarian Activity in Dairy Cows // Reprod. Domest. Anim. -2002. - V. 37. - P. 31-35.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.