Таксономическая характеристика и биологические особенности новых таксонов морских аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, доктор биологических наук Романенко, Людмила Александровна

• Романенко, Людмила Александровна
• доктор биологических наук
• 2004

Оглавление диссертации доктор биологических наук Романенко, Людмила Александровна

ВВЕДЕНИЕ.

Обзор литературы

Глава 1. Таксономия прокариот, современное состояние и основные методы исследования.

Глава 2. Таксономическая структура класса "Саттарго1еоЬас1епа" тип Рго1еоЬас1епа.

2.1. Семейство ЛИеготопайасеае.

2.2. Семейство МогахеИасеае

2.3. Семейство На1отопайасеае.

2.4. Бактерии группы ОсеапоярМИит (семейство "ОсеапохртИасеае").

Глава 3. Бактерии рода Рзеи^аНеготопая и родственные бактерии - продуценты вторичных метаболитов.

Экспериментальная часть.

Глава 4. Объекты и методы исследования.

4.1. Источники выделения бактерий.

4.2. Состав сред и условия культивирования микроорганизмов.

4.3. Физиолого-биохимические тесты.

4.4. Методы изучения морфологии.

4.5. Получение экстрактов клеток.

4.6. Исследование липидного состава и полисахаридов.

4.7. Изучение геномных характеристик.

4.7.1. Выделение ДНК, определение нуклеотидного состава и ДНК-ДНК гибридизации.

4.7.2. Риботипирование.

4.8. Секвенирование 16S рибосомных ДНК генов.

4.9. Филогенетический анализ.

4.10. Методы определения активности ферментов

4.10.1. Определение нуклеазной активности.

4.10.2. Определение тирозиназной активности.

4.11. Определение антагонистических свойств.

Результаты и обсуждение.

Глава 5. Род Pseudoalteromonas и родственные бактерии семейства Alteromonadaceae.

5.1. Характеристика новых видов агаролитических бактерий Pseudoalteromonas agarivorans и Pseudoalteromonas mariniglutinosa.

5.2. Меланин-синтезирующие бактерии рода Pseudoalteromonas и их особенности

5.2.1. Реклассификация Alteromonas distincta как Pseudoalteromonas distincta.

5.2.2. Таксономические особенности вида иAlteromonas fuliginea".

5.3. Уровни ДНК-ДНК сходства и филогенетические связи непигментированных видов рода Pseudoalteromonas. Реклассификация Pseudoalteromonas haloplanktis subsp. tetraodonis как Pseudoalteromonas tetraodonis.

5.4. Бактерии рода Pseudoalteromonas — продуценты ферментов.

5.4.1. Бактерии рода Pseudoalteromonas - продуценты нуклеаз.

5.4.2. Таксономические особенности глубоководной бактерии "Alteromonas haloplanktis" КММ 223 - продуцента полиуридил-специфической эндорибону клеазы.

5.4.3. Тирозиназная активность бактерий рода Pseudoalteromonas.

5.4.4. Биологическая активность бактерий рода Pseudoalteromonas, ассоциированных с асцидией Halocynthia aurantium.

5.5. Психрофильные бактерии рода Glaciecola и особенности нового вида Glaciecola mesophila.

5.6. Глубоководные бактерии рода Idiomarina.

5.7. Характеристика полисахаридов штаммов бактерий рода

Pseudoalteromonas и Idiomarina zobellii.

Глава 6. Биологические особенности нового вида бактерий Halomonas halocynthiae - ассоцианта асцидии Halocynthia aurantium.

Глава 7. Психротолерантные бактерии рода Psychrobacter из морской среды и их особенности. t 7.1. Psychrobacter submarinus и Psychrobacter marineóla — новые галофильные бактерии рода Psychrobacter.

7.2. Видовое разнообразие и таксономическая характеристика бактерий рода Psychrobacter, изолированных из образцов морского льда и донных осадков Японского моря. щ

Глава 8. Новые таксоны бактерий группы Oceanospirillum.

8.1. Marinomonasprimoryensis - новый вид психрофильных бактерий рода Marinomonas.

8.2. Oceanisphaera litoralis gen. nov., sp. nov., галофильная гаммапротеобактерия из морских донных осадков.

Глава 9. Новые таксоны морских гаммапротеобактерий, не входящие в состав каких-либо известных семейств.

9.1. Новый род гамма-протеобактерий

Reinekea sedimentorum gen. nov., sp. nov.

9. 2. Новый вид глубоководных галотолерантных бактерий

Rheinheimera pacifica sp. nov.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Таксономическая характеристика и биологические особенности новых таксонов морских аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий»

Морские микроорганизмы являются важным компонентом экосистем Мирового океана и играют существенную роль в биологических процессах морской среды. Морфологические и физиолого-биохимические свойства и особенности микроорганизмов, обитающих в морской среде, могут быть обусловлены специфическими условиями среды обитания, такими, как высокая концентрация ионов натрия, кальция, калия, магния, гидростатическое давление, низкие температуры, изменения солености и неравномерное поступление/распределение питательных веществ. Наши знания в области биологии и экологии даже культурабельных морских микроорганизмов остаются весьма ограниченными. Недостаточно известно о специфических, естественных и необходимых факторах роста морских бактерий, что во многих случаях вызывает проблемы, связанные с культивированием бактерий из морских источников, выделением чистых культур микроорганизмов и изучением их характеристик. Отмечено, что большинство прокариот обитают в океанической среде, и эта часть является наименее изученной в сравнении с наземными микроорганизмами (Whitman et al., 1998). Несмотря на проводимые исследования, изучено менее 1% бактерий, изолированных из морской среды (Amann et al., 1995; Fenical, 1993). Изучение биологического разнообразия на основе анализа фено-и генотипических признаков и филогенетических связей морских протеобактерий с целью определения их систематического положения в системе микробного мира, а также исследования в области таксономии и систематики морских гаммапротеобактерий являются фундаментальными и имеют важное прикладное значение. Класс Proteobacteria был предложен в 1988 г. Stackebrandt et al. (1988) для грамотрицательных микроорганизмов на основании данных сравнительного анализа сиквенса 16S рРНК и представляет собой одну из основных филогенетических групп. Класс Proteobacteria включает пять подклассов: альфа-, бета-, гамма-, дельта-, и эпсилон- Proteobacteria

Stackebrandt et al., 1988). В настоящее время предлагается повысить таксономический ранг класса Proteobacteria до статуса тип "Proteobacteria" и подклассы Proteobacteria рассматривать как классы: "Alphaproteobacteria", "Betaproteobacteria", "Gammaproteobacteria", "Deltaproteobacteria", "Epsilonproteobacteria", соответственно (Ludwig, Klenk, 2001). Класс "Gammaproteobacteria" представлен разнообразными по физиологическим, метаболическим и экологическим характеристикам микроорганизмами и включает представителей 13 порядков и 20 семейств, которые в свою очередь содержат большое количество родов и видов бактерий.

Морские аэробные гетеротрофные гаммапротеобактерии в значительной мере представлены родами и видами семейств Alter omonadaceae, Moraxellaceae; Halomonadaceae; и группы Oceanospirillum, которые входят в состав класса "Gammaproteobacteria". Многие представители этих семейств, в том числе относящиеся к родам Alteromonas, Pseudoalteromonas, Glaciecola, Idiomarina, Colwellia, Marinomonas являются типичными или облигатными морскими прокариотами и составляют существенный компонент биоценозов морской среды. Исследование морских представителей галофильных/галотолерантных и психрофильных или психротолерантных бактерий родов Halomonas и Psychrobacter представляет интерес как в плане фундаментальных биологических исследований, так и в экологическом и практическом аспектах. Рутинная идентификация бактерий морской среды, в том числе представителей "Gammaproteobacteria", представляет трудности в связи с многообразием и изменчивостью их морфологических и биохимических свойств, необходимостью подбора сред и условий культивирования некоторых штаммов. В последние два десятилетия исследования в области систематики морских "Gammaproteobacteria" интенсивно развиваются благодаря широкому использованию молекулярных методов анализа и разработке полифазной таксономии бактерий (Colwell et al.t 1970; Vandamme et al., 1996), о чем свидетельствуют описание новых или реклассификация уже известных родов и видов семейств

Alteromonadaceae, Moraxellaceae\ Halomonadaceae; и группы Oceanospirillum, в связи с чем дальнейшее совершенствование систематики гаммапротеобактерий остается весьма актуальной задачей в настоящее время. Бактерии, изолированные из морской среды, способны синтезировать разнообразные биологически активные вещества (БАВ) и могут служить продуцентами ферментов, деградирующих полисахариды, белки, нуклеиновые кислоты (Austin, 19S8, 1989; Tsujibo et al., 1998; Михайлов и др., 1999; Holmstrom, Kjelleberg, 1999). Сохранение микробного разнообразия в коллекциях культур является базисом, который необходим для развития морской микробиологии, биотехнологии, химии морских соединений. Одним из перспективных направлений биотехнологии следует отметить исследования морских биополимеров — ферментов и полисахаридов морских протеобактерий. Фундаментальное изучение биологии и таксономии представителей морских микробных сообществ является важным для оценки и понимания экологической роли аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий в морских экосистемах.

Целью настоящей работы явилось выделение морских аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий и изучение их фенотипических свойств, геномных и филогенетических характеристик; изучение филогенетических взаимосвязей и установление таксономического статуса выделенных гаммапротеобактерий на основе метода полифазной таксономии; изучение физиологических свойств и биотехнологического потенциала морских бактерий, скрининг штаммов-продуцентов ферментов и других биологически активных веществ; создание и поддержание коллекции морских аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий в рамках Коллекции морских микроорганизмов ТИБОХ ДВО РАН как основы для фундаментального изучения микробного биоразнообразия и биотехнологического использования морских бактерий.

Основные задачи:

1. Выделение культур новых аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий из морских источников различных биотопов морской среды, включая не исследуемые ранее и малоизученные источники выделения микроорганизмов.

2. Изучение выделенных бактерий на основе полифазной таксономии с использованием фенотипических, хемотаксономических, генетических и филогенетических методов.

3. Изучение физиологических свойств и биотехнологического потенциала морских бактерий, скрининг штаммов-продуцентов ферментов и других биологически активных веществ

4. Анализ полученных результатов, выявление и описание новых таксонов.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Морские аэробные гетеротрофные гаммапротеобактерии, входящие в состав семейств

Аиеготопас1асеае, МогахеНасеае, На1отопас1асеае и группы ОсеапояркШит, широко распространены в морских экосистемах, и были изолированы из разнообразных биотопов Тихого и Индийского океанов, включая открытые океанические воды, прибрежные донные осадки и морской лед, и микробные сообщества, ассоциированные с беспозвоночными животными.

2. Морские аэробные гетеротрофные гаммапротеобактерии характеризуются таксономическим разнообразием. На основе метода полифазной таксономии среди выделеных бактерий идентифированы и описаны новые представители известных родов Psev.dolaterom.onas, С1аЫесо1а, Маг ¡по топая, На1о топая, РзускгоЪаМег, ЯкетИешега, и новых родов Ыютагта, Осеатяркаега и Кетекеа в структуре гаммапротеобактерий.

3. Морские бактерии рода Pseudoalteromonas проявляют высокий уровень гидролитической и тирозиназной активностей; являются продуцентами ферментов эндонуклеаз рестрикции и специфических рибонуклеаз.

Научная новизна работы. Показано, что изученные бактерии принадлежат к родам Pseudoalteromonas, Glaciecola, Alteromonas, Idiomarina, Halomonas, Psychrobacter, Marinomonas - представителям класса "Gammaproteobacteria", среди которых описано 13 новых видов и 3 новых рода в составе гаммапротеобактерий, что составляет вклад в таксономическую структуру этого класса. В составе семейства Alteromonadaceae описан новый род глубоководных бактерий Idiomarina, и два вида, I. zobellii и I. abyssalis. В составе рода Pseudoalteromonas описаны новые виды Р. agarivorans и Р. mariniglutinosa. Описан новый вид "Alteromonas distincta" и реклассифицирован как Pseudoalteromonas distincta. Показано, что штамм Р. distincta КММ 638Т проявляет высокий уровень тирозиназной активности и может быть использован как продуцент фермента тирозиназы. Вид Pseudoalteromonas haloplanktis subsp. tetraodonis (.Alteromonas tetraodonis Simidu et al. 1990) реклассифицирован как Pseudoalteromonas tetraodonis. Впервые выделена глубоководная бактерия "Alteromonas haloplanktis" КММ 223-продуцент фермента эндорибонуклеазы, специфически расщепляющая полиуридиловую кислоту. Впервые обнаружены мезофильные штаммы бактерий рода Glaciecola КММ 241 и КММ 642, которые были описаны как новый вид Glaciecola mesophila.

Впервые исследованы бактерии, ассоциированные с асцидией Hálocynthia aurantium, в числе которых впервые была обнаружена уникальная по морфологическим и молекулярным характеристикам галофильная бактерия, которая описана как новый вид бактерий рода Halomonas, Н. halocynthiae.

В составе рода Psychrobacter впервые описано два новых вида галофильных бактерий, способных расти при 15% хлористого натрия, Р. submarinus и Р. marineóla.

Исследования видового разнообразия и таксономии бактерий рода Psychrobacter, изолированных из образцов морского льда и грунта прибрежной зоны Японского моря, показали, что новые штаммы составляют филогенетически и генетически гетерогенную группу, которая включает известные антарктические виды и отличные между собой и от других валидных видов геномовиды, представляющие, по-видимому, новые виды рода Psychrobacter.

В составе бактерий группы Oceanospirillum обнаружены и описаны новые таксоны: новый вид психрофильных бактерий рода Marinomonas и новый род и вид морских галофильных бактерий Oceanisphaera litoralis gen. nov., sp. nov.

Новая бактерия описана как новый род и вид морских гаммапротеобактерий, Reinekea sedimentorum, который не входит в состав какого-либо известного семейства. Глубоководная галотолерантная бактерия КММ 1406т описана как новый вид рода Rheinheimera, R. pacifica.

Практическое значение. Создана и поддерживается коллекция детально охарактеризованных морских гаммапротеобактерий в рамках Коллекции морских микроорганизмов ТИБОХ ДВО РАН как фундаментальная база для изучения микробного разнообразия и биотехнологического потенциала гаммапротеобактерий - продуцентов физиологически активных соединений. Показано, что бактерии рода Pseudoalteromonas проявляют высокий уровень гидролитической и тирозиназной активностей; выделены и поддерживаются в рамках Коллекции Морских Микроорганизмов ТИБОХ ДВО РАН штаммы-продуценты ферментов эндонуклеаз рестрикции и специфических рибонуклеаз. Штамм Pseudoalteromonas sp. ("Alteromonas haloplanktis") КММ 223 запатентован в качестве продуцента полиуридил-специфической эндорибонуклеазы, механизм действия и свойства фермента изучены.

Апробация работы. Результаты работы были представлены на Всесоюзном совещании "Биологически активные вещества при комплексной утилизации гидробионтов", ТИНРО, Владивосток, (1988); International Science Conference "Bridges of Sience between North America and the Russian Far East", Anchorage -Vladivostok, (1994); 9-th European Carbohydrate Symposium, Utrecht, Netherlands, (1997); Conference Oceanology International 97 Pacific Rim., Singapore, (1997); Научной конференции ТИБОХ ДВО РАН "Исследования в области физико-химической биологии и биотехнологии", Владивосток, (1998); 8-th International Symposium on Microbial Ecology (ISME-8), Canada, (1998); 2-ом Международном симпозиуме "Химия и химическое образование", Владивосток, (2000); Научной конференции ТИБОХ ДВО РАН "Биоактивные вещества из морских макро- и микроорганизмов и наземных растений Дальнего Востока", Владивосток, (2001).

Публикации. По теме диссертации опубликовано 32 статьи, 17 тезисов докладов, 1 патент, 1 монография, Глава в электронной версии международного микробиологического руководства "The Prokaryotes" (Springer-Ver lag). Основные результаты исследований опубликованы в научных журналах: "Микробиология", "Прикладная биохимия и микробиология", "Биология моря", "Биоорганическая химия", "International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology", "Carbohydrate Research".

Объем и структура диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы (Главы 1-3), экспериментальной части: объектов и методов исследования (Глава 4), результатов и обсуждения (Главы 5-9), заключения и выводов. Материалы диссертации изложены на 221 странице машинописного текста и иллюстрированы 27 рисунками и 27 таблицами. Список литературы включает 263 источника.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Романенко, Людмила Александровна

Результаты исследования уровней ДНК-ДНК сходства среди непигментированных типовых штаммов псевдоальтеромонад (альтеромонад), проведенные в 1993 году и в последующие годы, не подтвердили результаты, полученные

Akagawa-Matsushita et al. (1993). Уровень ДНК-ДНК сходства типовых штаммов Р. haloplanktis и A. tetraodonis составил 48%, что свидетельствовало о том, что A. tetraodonis является самостоятельным видом рода Pseudoalteromonas и его таксономический статус должен быть восстановлен. Результаты были подтверждены повторными молекулярногенетическими экспериментами (Рис. 9) и изучением физиолого-биохимических свойств штаммов P. haloplanktis subsp. tetraodonis [Alteromonas] tetraodonis IAM 14160 (A-M) и

IAM 14160т, что позволило восстановить статус вида как Pseudoalteromonas tetraodonis comb. nov. В процессе изучения таксономического положения Alteromonas tetraodonis были использованы три штамма: КММ 458 , любезно предоставленный нам У. Симиду, т

IAM 14160 (А-М), который предоставила М. Акагава-Матсушита и LAM 14160 , присланный Коллекцией Культур Института молекулярной и клеточной биологии, Токио, Япония, первый из которых был получен как Alteromonas tetraodonis, остальные - как штаммы P. haloplanktis subsp. tetraodonis. Полученные нами данные ясно показали, что штаммы КММ 458т и IAM 14160т почти неразличимы и представляют собой самостоятельный вид, как и было описано первоначально (Simidu et dl., 1990) с типовым штаммом Р. tetraodonis IAM 14160т (Simidu, Kita-Tsukamoto, Yasumoto, Yotsu 1990). Таксономический статус типового вида Р. haloplanktis subsp. haloplanktis был восстановлен как Р. haloplanktis.

К оригинальному описанию Alteromonas tetraodonis (Simidu et al., 1990), реклассифицированному как Pseudoalteromonas tetraodonis comb. nov. были добавлены следующие характеристики. Бактерия Р. tetraodonis способна расти на средах, содержащих 1-7% NaCl. Утилизирует D-глюкозу, D-фруктозу, сахарозу, D-галактозу, DL-лактат, капроат, валерат, бутират, цитрат, фумарат, сукцинат, глутамат, ацетат, пируват, этанол, и L-тирозин; и неспособна утилизировать D-маннозу, лактозу, D-рибозу, D-ксилозу, D-арабинозу, D-рамнозу, глюконат, салицин, глицерин, а-кетоглутарат, мальтозу, маннит, L-гистидин, L-пролин, и D-малат. Чувствительна к ампициллину, бензилпенициллину, стрептомицину, эритромицину, гентамицину, ванкомицину, тетрациклину, и карбенициллину. Не чувствительна к 0/129, линкомицину, и оксациллину. Бактерия содержит основные клеточные жирные кислоты 16:1g>7c, 16:0, 17:liü8c. Минорные жирные кислоты 15:0, 15:g>8c, 17:0, 18:1о/7с. Фосфатидилэтаноламин и фосфатидилглицерин составляют 75,1 и 23,7 % от общего содержания фосфолипидов, соответственно. Бактерии не содержат кардиолипин и гликолипид.

В заключение следует отметить, что бактерии рода Pseudoalter omonas, охарактеризованные в Главе 5, представляют интерес не только как новые таксоны, но и как перспективные источники для биотехнологии, поскольку новые бактерии проявили высокий уровень ферментативной активности и могут использоваться как продуценты гликозидаз, тирозиназ, высокоспецифичных рибонуклеаз, а также эндонуклеаз рестрикции.

• * 41 « 4

82

- Заключение

Проведенные исследования показали, что аэробные гетеротрофные гаммапротеобактерии, относящиеся к семействам АкеготопаЛасеае, МогахеПасеае, На1отопас1асеае и группе ОсеапояртПит, широко распространены в морских экосистемах и характеризуются таксономическим разнообразием. Использование метода полифазной таксономии, что включает изучение фенотипических, хемотаксономических, генотипических свойств и филогенетических взаимосвязей исследуемых бактерий, позволило среди выделенных бактерий идентифицировать и описать новые виды и роды морских бактерий в структуре гаммапротеобактерий и реклассифицировать ранее известные виды

Исследованы разнообразные источники морской среды, включая глубоководные, прибрежные донные осадки и морской лед, и микробные сообщества, ассоциированные с асцидиями и губками. Впервые проведенные исследования образцов морского льда прибрежной зоны Японского моря показали, что морской'лед является источником видового разнообразия и выделения новых штаммов бактерий рода РзускгоЬаМег.

В процессе изучения выделенных бактерий выявлены биологические особенности (что включает впервые выявленные особенности клеточной морфологии и жгутикования; культуральные свойства, хемотаксономические и физиолого-биологические характеристики) новых представителей родов РзеийоШеготопах, С1асгесо1а, Магтотопаз, На1отопа$, РзусИгоЬаМег, ЯкетИешега, и новых родов Мютагта, Осеатзркаега и Яетекеа. Впервые описан психрофильный вид рода Маг то то паз, а в составе рода Ыас1есо1а, включающего облигатно психрофильные бактерии, выявлен новый вид психротолерантных бактерий. Впервые описаны два вида галофильных бактерий рода РзусИгоЬас(ег, проявляющих в отличие от других видов толерантность к высокому содержанию хлористого натрия в среде.

Получены новые сведения в области экологии морских гаммапротеобактерий. В процессе изучение таксономического разнообразия микроорганизмов, изолированных из образцов морского льда прибрежной зоны Японского моря, были идентифицированы бактерии видов P. urativorans, P. fozii и P. glacincola, которые ранее были обнаружены только в образцах льда в районе Антарктики (Bowman et al., 1996; Bowman et al., 1997b; Bozal et al., 2003) и другие места обитания и источники выделения этих видов бактерий неизвестны.

Исследование углевод-содержащих полимеров клеточных стенок новых штаммов Pseudoalteromonas, P. haloplanktis АТСС 14393 и I. zobellii выявили многообразие структур О-специфических полисахаридов и ранее неизвестные структурные компоненты, что представляет фундаментальное значение для понимания строения, функций и взаимодействия клеток с окружающей средой. В структуре О-специфического полисахарида Р. haloplanktis АТСС 14393х впервые обнаружены D- и L-изомеры 2-ацетамидо-2- дезоксигалактуроновой кислоты. В структуре полисахарида бактерии нового вида P. agarivorans КММ 232 впервые для грамотрицательных бактерий обнаружена сульфатная группа.

В ходе проведения скрининга выделенных морских микроорганизмов, способных продуцировать биологически активные вещества, показано, что бактерии рода Pseudoalteromonas проявляют высокий уровень гидролитической и тирозиназной активностей; являются продуцентами ферментов эндонуклеаз рестрикции и специфических рибонуклеаз.

1. Выделены и охарактеризованы новые представители морских аэробных гетеротрофных гаммапротеобактерий, изолированные из различных источников морской среды: открытых океанических вод, прибрежных донных осадков и образцов льда, и беспозвоночных животных. Выявлено таксономическое разнообразие и биологические особенности исследуемых бактерий, получены новые знания в области биологии и экологии морских гаммапротеобактерий.

2. На основе метода полифазной таксономии среди выделенных бактерий описано 13 новых видов, относящихся к родам РзеийоШеготопаз, С1апесо1а, Магтотопаз, На1отопаз, РяусИгоЬаМег, ЯкетИетега, и 3 новых рода Мютагта, ОсеатзрИаега и Яетекеа в структуре гаммапротеобактерий. 2 вида рода РяеийоШеготопая реклассифицированы.

3. Создана коллекция детально охарактеризованных морских гаммапротеобактерий в рамках Коллекции морских микроорганизмов ТИБОХ ДВО РАН как фундаментальная база для изучения микробного биоразнообразия и биотехнологического потенциала гаммапротеобактерий как продуцентов физиологически активных соединений.

4. Поиск бактериальных продуцентов ферментов нуклеинового обмена и тирозиназ показал наличие штаммов, перспективных для биотехнологии. Бактерии рода Рзеи^аИеготопаз проявляют высокий уровень гидролитической и тирозиназной активностей; являются продуцентами ферментов эндонуклеаз рестрикции и специфических рибонуклеаз. Впервые выявлена глубоководная бактерия "Акеготопаз

На1ор1апЫ8" КММ 223-продуцент фермента эндорибонуклеазы, специфически расщепляющей полиуридиловую кислоту.

5. Впервые проведено изучение видового разнообразия и таксономии психротолерантных бактерий рода РзусИгоЬас(ег, изолированных из образцов морского льда и грунта прибрежной зоны Японского моря. Показано, что новые штаммы составляют филогенетически и генетически гетерогенную группу, которая включает известные антарктические виды рода РБускгоЬаМег и геномовиды, имеющие фенотипические различия и морфологические особенности, и представляющих, по-видимому, новые виды рода РзусИгоЬаШг.

Список публикаций по теме диссертации

Экспериментальные статьи

1. Романенко Л. А., Михайлов В. В. Нуклеазная активность микроорганизмов, ассоциированных с асцидиями. // Микробиология. 1992. т. 61, в. 1, с. 131-133. 2. Иванова Е. П., Бакунина И. Ю., Горшкова Н. М., Романенко Л. А., Михайлов В. В., Елякова Л. А., Парфенова В. В. Распространение хитин-разлагающих ферментов у морских и пресноводных микроорганизмов // Биология моря. 1992. № 3-4. С. 69-75.

3. Романенко Л. А., Зелепуга Е. А., Козловская Э. П., Михайлов В. В. Тирозиназная активность бактерий рода Alteromonas. II Биология моря. 1994. т. 63, № 4, с. 260-263.

4. Иванова Е. П., Романенко Л. А., Плисова Е. Ю., Федосов Ю. В., Михайлов В. В., Горшкова Н. М., Ивайловский В. В., Рассказов В. А. Распространение рибонуклеаз среди морских микроорганизмов. // Прикл. Биохим. Микробиол. 1994. т. 30, в. 3, с. 384-388.

5. Романенко Л. А., Иванова Е. П., Лысенко А. М., Михайлов В. В. Некоторые особенности грамотрицательных агарлитических бактерий из морской среды. // Микробиология. 1994. т. 63, в. 5, с. 940-944.

6. Романенко Л. А., Лысенко А. М., Михайлов В. В., Курика А. В. Новый вид буропигментированных агарлитических бактерий рода Alteromonas. II Микробиология. 1994.т.63,в.6,с. 1081-1087.

7. Романенко Л. А. Биологическая характеристика штаммов морских бактерий рода Alteromonas - источников некоторых ферментов // Автореф. диссертации канд. биол. наук. Владивосток. ВГМИ Мин. Здравоохр.РФ.1994. 23 С.

8. Романенко JI. А., Михайлов В. В., Лысенко А. М., Степаненко В. И. Новый вид меланин-синтезирующих бактерий рода Alteromonas II Микробиология. 1995. т. 64, № 1, с. 74-77.

9. Плисова Е. Ю., Романенко Л. А., Федосов Ю. В., Михайлов В. В., Рассказов В. А. Специфичность рибонуклеаз морских бактерий Alteromonas и Pseudomonas II Биология моря. 1996. Т. 22, №2. С. 110-113.

10. Горшкова Р. П., Назаренко Е. Л., Исаков В. В., Зубков В. А., Горшкова Н. М., Романенко Л. А., Иванова Е. П. Структура глицерофосфатсодержащего полисахарида Pseudoalteromonas sp. КММ 639 // Биоорганическая химия. 1998. Т. 24, № 11. С. 839841.

11. Терентьев Л. Л., Терентьева Н. А., Романенко Л. А., Михайлов В. В., Рассказов В. А. Распространение и свойства нуклеозидкиназ морских бактерий // Микробиология. 1998. Т. 67, №4. С. 496-504.

12. Командрова Н. А., Томшич С. В., Исаков В. В., Романенко Л. А. Структура сульфатированного О-специфического полисахарида морской бактерии Pseudoalteromonas marinoglutinosa КММ 232. // Биохимия. 1998. Т. 63, в. 10, с. 98-103.

13. Hanniffy О. М., Shashkov A. S., Senchenkova S. N., Tomshich S. V., Komandrova N. A., Romanenko L. A., Knirel Yu. A., Savage A. V. Structure of a highly acidic O-specific polysaccharide of lipopolysaccharide of Pseudoalteromonas haloplanktis KMM 223 (44-1) containing L-iduronic acid and D-QuiNHb4NHb // Carbohydrate Research. 1998. vol. 307, №2, p. 291-298.

14. Ivanova E. P., Chun J., Romanenko L. A., Matte M. E., Mikhailov V. V., Frolova G. M., Huq A., and Colwell R. R. Reclassification of Alteromonas distincta Romanenko et al. 1995 as Pseudoalteromonas distincta comb. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, vol. 50, part l,p. 141-144.

15. Ivanova E. P., Romanenko L. A., Chun J., Matte M. H., Matte G. R., Mikhailov V. V., Svetashev V. I., Huq A., Maguel Т., and Colwell R. R. Idiomarina gen. nov., comprising novel indigenous deep-sea bacteria from the Pacific Ocean, including descriptions of two species, Idiomarina abyssalis sp. nov. and Idiomarina zobellii sp. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, vol. 50, part 2, p. 901-907.

16. Командрова H. А., Томшич С. В., Исаков В. В., Романенко Л. А. О-специфический полисахарид морской бактерии "Alteromonas marinoglutinosa" NCIMB 1770 I I Биохимия. 2001. т. 66, в. 8, с. 1099-1103.

17. Ivanova Е. P., Romanenko L. A., Matte М. Е., Lysenko А. М., Simidu U., Kita-Tsukamoto К., Sawabe Т., Vysotskii М. V., Frolova G. М., Mikhailov V. V., Christen R., and Colwell R. R. Retrieval of the species Alteromonas tetraodonis Simidu et al., 1990 as Pseudoalteromonas tetraodonis comb. nov. and emendation description // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, vol. 51, pp. 1071-1078.

18. Романенко Л. А., Калиновская H. И., Михайлов В. В. Таксономический состав и биологическая активность микроорганизмов, ассоциированных с асцидией Halocynthia aurantium II Биология моря. 2001. т. 27, № 5, с. 334-339.

19. Muldoon, J., A. S. Shashkov, S. N. Senchenkova, S. V. Tomshich, N. A. Komandrova, L. A. Romanenko, Yu. A. Knirel, and A. V. Savage. Structure of an acidic polysaccharide from a marine bacterium Pseudoalteromonas distincta KMM 638 containing 5-acetamido-3,5,7,9-tetradeoxy-7-formamido-L-glycero-L-manno-nonulosonic acid // Carbohydrate Research. 2001. vol. 330, pp. 231-239.

20. Красикова И. H., Капустина Н. В., Светашев В. И., Горшкова Р. П., Томшич С. В., Назаренко Е. Л., Командрова Н. А., Иванова Е. П., Горшкова Н. М., Романенко Л. А., Михайлов В. В., Соловьева Т. Ф. Химическая характеристика липида А некоторых морских протеобактерий // Биохимия. 2001. т. 66, в. 9, с. 1286-1294.

21. Romanenko L. A., Schumann P., Rohde М., Lysenko А. М., Mikhailov V. V., and Е. Stackebrandt. Psychrobacter submarinus sp. nov. and Psychrobacter marincola sp. nov., novel psychrotrophic halophiles from marine environments // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, vol. 52, pp. 1291-1297.

22. Бакунина И. Ю., Недашковская О. И., Алексеева С. А., Иванова Е. П., Романенко Л. А., Горшкова Н. М., Исаков В. В., Звягинцева Т. Н., Михайлов В. В. Особенности деградации фукоидана морскими протеобактериями Pseudoalteromonas citrea. Микробиология. 2002. Т. 71. № 1. С. 49-55.

23. Romanenko L. A., Schumann P., Rohde М., Mikhailov V. V., and Е. Stackebrandt. Halomonas halocynthiae sp. nov., a novel bacterium, isolated from the marine ascidian Halocynthia aurantium II Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, vol. 52, pp. 1773-1782.

24. Romanenko L. A., Uchino M., Mikhailov V. V., Zhukova N. V., and T. Uchimura. Marinomonas primoryensis sp. nov., a new psychrophilic bacterium isolated from coastal sea-ice of the Sea of Japan. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, vol. 53, pp. 829-832.

25. Romanenko L. A., Zhukova N. V., Rohde M., Lysenko A. M., Mikhailov V. V., and E. Stackebrandt. Glaciecola mesophila sp. nov., a novel marine agar-digesting bacterium // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, vol. 53, pp. 647-651.

26. Romanenko L. A., Zhukova N. V., Rohde M, Lysenko A. M., Mikhailov V. V., and E. Stackebrandt. Pseudoalteromonas agarivorans sp. nov., a novel marine agarolytic bacterium // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, vol. 53, pp. 125-131.

27. Romanenko L. A., Zhukova N. V., Lysenko A. M., Mikhailov V. V., and E. Stackebrandt. Assignment of 'Alteromonas marinoglutinosa' NCIMB 1770 to Pseudoalteromonas mariniglutinosa sp. nov., nom. rev., comb. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, vol. 53, pp. 1105-1109.

28. Romanenko L. A., Schumann P., Zhukova N. V., Rohde M., Mikhailov V. V., and E. Stackebrandt. Oceanisphaera litoralis gen. nov., sp. nov., a novel halophilic bacterium from marine bottom sediments // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, vol. 53, pp. 1885-1888.

29. Romanenko L. A., Uchino M., Falsen E., Zhukova N. V., Mikhailov V. V., and T. Uchimura.

Rheinheimera pacifica sp. nov., a novel halotolerant bacterium isolated from the Pacific deepseawater // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, vol. 53, pp. 1973-1977.

30. Romanenko L. A., Schumann P., Rohde M., Mikhailov V. V., and E. Stackebrandt. Reinekea sedimentorum gen. nov., sp. nov., a novel bacterium from marine coastal sediments // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004, in press.

Статьи в сборниках

31. Михайлов В. В., Потиевский Э. Г., Иванова Е. П., Романенко Л. А. 1987. Изучение бактериопланктона прибрежных и открытых вод Японского моря. // Труды ДВНИИ, вып. 131, Вопросы мониторинга природной среды (Ред. Беленький B.C., Ткалин А.В.), Л. Гидрометеоиздат, с. 41-47.

32. Потиевский Э. Г., Михайлов В. В., Иванова Е. П., Романенко Л. А. 1987. Микробиологическое изучение нефтяного загрязнения прибрежных и открытых вод Японского моря. // Ibidem, с. 21-24.

33. Еляков Г. Б., Кузнецова Т. А., Михайлов В. В., Мальцев И. И., Калиновская Н. И., Аффиятуллов Ш. ILL, Недашковская О. И., Шевченко Л. С., Сметанина О. Ф., Романенко Л. А. Распространение в морских симбионтных ассоциациях микроорганизмов, продуцирующих физиологически активные соединения. Сб. научных трудов «Морская микробиология», 1995, Изд-во Дальневосточного Ун-та, Владивосток (Ред. И. Е. Мишустина), с. 32-35.

34. Mikhailov V. V., Kuznetsova Т. A., Ivanova Е. P., Romanenko L. A., Shevchenko L. S., Nedashkovskaya О. I., Gorshkova N. М., Elyakov G. В. The Collection of Marine Microorganisms as a base for fundamental and applied studies in marine microbiology and biotechnology. // Proceeding of Conf. Oceanology International 97 Pacific Rim. Exhibition & Conference, 12-14 May, 1997, World Trade Centre, Singapore, v. 2 - Extending the Reach of Ocean Technologies, p. 77-92.

Монография.

35. Иванова Е. П., Романенко JI. А., Михайлов В. В., Морские протеобактерии семейства Alteromonadaceae. Владивосток: Дальнаука, 2001, 125 стр. + 7стр. вкл.

Глава в руководстве "The Prokaryotes"

36. Mikhailov V.V., Romanenko L.A., Ivanova E. P. The Genus Alteromonas and Related Proteobacteria. In M. Dworkin et al. The Prokaryotes. Release 3.10, September, 27, 2002, Springer-Verlag NY (http: //www.prokaryotes.com).

Патент РФ

37. Романенко Л.А., Плисова Е.Ю., Федосов Ю.В., Михайлов В.В., Рассказов В.А., Еляков Г.Б. Штамм бактерии Alteromonas haloplanktis - продуцент полиуридил-эндорибонуклеазы. // Патент Российской Федерации № 2026347. 1995. БИ № 139.

Тезисы докладов.

38. Федосов Ю.В., Михайлов В.В., Плисова Е.Ю., Романенко Л.А., Рассказов В.А., Еляков Г.Б. Уридил-специфическая РНК-аза из морской бактерии. // Тез. докл. Всесоюз. Совещ. "Биологически активные вещества при комплексной утилизации гидробионтов", 1988, ТИНРО, Владивосток, 24-26 мая, с. 19-20.

39. Plisova E.Yu., Romanenko L.A., Fedosov Yu.V., Mikhailov V.V., Rasskasov V.A. Bacteria of genus Alteromonas are promising sources of specific ribonucleases. //Abstr. Intern. Sci. Conf. "Bridges of Science between North America and the Russian Far East", Anchorage, Alaska, U.S.A., Aug. 25-27, Vladivostok, Russia, Aug. 29-Sept. 2, 1994, p. 295.

40. Romanenko L.A., Mikhailov V.V., Lysenko A.M., Stepanenko V.I. A new melanin-synthesizing bacterium of the genus Alteromonas from marine sponge. // 1994, Ibidem, p. 297.

41. Romanenko L.A., Zelepuga E.A., Kozlovskaya E.P., Mikhailov V.V. Tyrosinase activity of the melanin-synthesizing bacteria of the genus Alteromonas from marine animals. // 1994, Ibidem, p. 296.

42. Hanniffy O.M., Shashkov A.S., Knirel Yu.A., Senchenkova S.N., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Romanenko L.A., Savage A.V. Structural studies of the (3-specifIc polysaccharide from Pseudoalteromonas haloplanktis KMM 223 (44-1) by NMR spectroscopy. // Abstr. 9th European Carbohydrate Symposium eurocarbg Utrecht, Netherlands, July 6-11, 1997, p. 291.

43. Krasikova I.N., Tomshich S.V., Bakholdina S.I., Romanenko L.A. Lipid A fatty acids from the marine Pseudoalteromonas haloplanktis bacteria. // Abstr. East Sea Oceanography Conf. The 3rd Circum-Pacific International Symposium on Earth Environment, 14-15 October, 1997, Korea Inter-University Institute of Ocean Science, Pukyong National University, Pusan, Korea, p. 37.

44. Романенко Л.А., Вожжова Е.И., Монастырная M.M., Козловская Э.П. Протеолитическая активность морских бактерий. // Тез. докл. Научной конф. ТИБОХ ДВО РАН Исследования в области физико-химической биологии и биотехнологии. Владивосток: Дальнаука, 1998, с. 70-71.

45. Романенко Л.А., Лысенко A.M., Фролова Г.М., Михайлов В.В., Рассказов В.А. Физиолого-биохимические особенности глубоководной бактерии Pseudoalteromonas haloplanktis KMM 223, продуцирующей полиуридил-специфическую эндорибонуклеазу. // Ibidem, 1998, с. 71-72.

46. Романенко Л.А., Зелепуга Е.А., Козловская Э.П., Михайлов В.В. Поиск продуцентов тирозиназ среди бактерий рода Pseudoalteromonas. II Ibidem, 1998, с. 72-73.

47. Командрова Н.А., Томшич С.В., Романенко Л.А. Структурное исследование полисахаридов морской бактерии Pseudoalteromonas marinoglutinosa KMM 232. // Ibidem, 1998, с. 110-112.

48. Хоменко В.А, Фролова Г.М., Лихацкая Г.Н., Романенко Л.А., Соловьва Т.Ф. Порин-подобные белки из морских бактерий рода Pseudoalteromonas. И Ibidem, 1998, с. 136137.

49. Терентьев JI.JI., Терентьева Н.А., Романенко JI.A., Михайлов В.В., Рассказов В.А. Связь между скоростью синтеза ДНК и уровнем активности нуклезидкиназ у морских бактерий. // Ibidem, 1998, с. 155-156.

50. Mikhailov V.V., Romanenko L.A., Nedashkovskaya О.I., Gorshkova N.M., Ivanova E.P. Physiological peculiarities of microbial associations of Far-Eastern marine invertebrates. // Microbial Biosystems. New Frontiers. Program & Abstracts Eighth International Symposium on Microbial Ecology (ISME-8), 9-14 August, 1998, Halifax, Nova Scotia, Canada, p. 235-236.

51. Kuznetsova T.A., Mikhailov V.V., Kalinovskaya N.I., Afiyatullov Sh.Sh., Oleynikova G.K., Smetanina O.F., Ivanova E.P., Romanenko L.A., Shevchenko L.S., Pivkin M.V., Platunova O.M., Elyakov G.B. Marine heterotrophic microorganisms as the basis for the development of marine biotechnology. // Absrtacts. 2nd International Symposium Chemistry and Chemical Education. 26-39 September 2000, Vladivostok, Russia. Far-Eastern Univ. Press, p. 219.

52. Zelepuga E.A., Romanenko L.A., Kozlovskaya E.P., Mikhailov V.V. Bacteria from marine environment as a source of DOPA and tyrosinases. // Ibidem, 2000, p. 215.

53. Романенко JI.A., Лысенко A.M., Михайлов В.В. Особенности морского изолята Psychrobacter sp. КММ 225 // Тез. докл. конф. "Биоактивные вещества из морских макро- и микроорганизмов и наземных растений Дальнего Востока" Тихоокеанского института биоорганической химии ДВО РАН. Владивосток, Дальнаука, 2001, с. 172174.

54. Романенко Л.А., Калиновская Н.И., Михайлов В.В. Характеристика микроорганизмов, ассоциированных с морской асцидией Halocynthia aurantium. // Ibidem, 2001, с. 174176.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Романенко, Людмила Александровна, 2004 год

1..Безбородова С. И. Рибонуклеазы и родственные им белки, а также ингибиторы рибонуклеаз белковой природы // Прикл. биохим. микробиол. 1991. Т. 27, №3. С. 308-329.

2. Бриттон Г. Биохимия природных пигментов. М.: Мир. 1986. 422 с.

3. Горбенко Ю. А. О наиболее благоприятном количестве "сухого питательного агара" в средах для культивирования морских гетеротрофных микроорганизмов // Микробиология. 1961. Т. 25, № 1. С. 168-172.

4. Дедков В. С., Зернов Ю. П., Речкунова И. А., Дегтярев С. X. Выявление водных микроорганизмов Черного моря — продуцентов эндонуклеаз рестрикции // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1990. № 12. С. 17-19.

5. Методы общей бактериологии // Под ред. Ф. Герхардта. М.: Мир. 1984. Т. 1. 535 е., Т. 3.263 с.

6. Михайлов В. В., Кузнецова Т. А., Еляков Г. Б. Морские микроорганизмы и их вторичные метаболиты // Владивосток. Дальнаука. 1999. 132 с.

7. Иванова Е. П., Романенко Л. А., Плисова Е. Ю., Федосов Ю. В., Михайлов В. В., Горшкова Н. М., Ивайловский В. В., Рассказов В. А. Распространение рибонуклеаз среди морских микроорганизмов // Прикл. биохим. микробиол. 1994. Т. 30, вып. 3. С. 384-388.

8. Иванова Е. П., Михайлов В. В. Новое семейство АиеготопснЗасеае Гат. поу., объединяющее группу морских аэробных протеобактерий // Микробиология. 2001. Т. 70. С. 15-23.

9. Иванова Е. П., Романенко Л. А., Михайлов В. В. Морские протеобактерии семейства Аиеготопас1асеае II Владивосток. Дальнаука. 2001. 125 с. + 7 с вкл.

10. Нуклеазы микроорганизмов // Ред. А. М. Безбородое. М.: Наука, 1974. 328 с.

11. Плисова Е. Ю., Романенко JI. А., Федосов Ю. В., Михайлов В. В., Рассказов В. А. Специфичность рибонуклеаз морских бактерий Alteromonas и Pseudomonas II Биология моря. 1996. Т. 22, № 2. С. 110-113.

12. Пширков С. Ю., Бойко О. И., Киприанова Е. А., Старовойтов И. И. Трансформация L-тирозина в L-диоксифенилаланин культурами Pseudomonas // Микробиология. 1982. Т. 51, № 2. С. 272-274.

13. Романенко JI. А., Михайлов В. В. Нуклеазная активность микроорганизмов, ассоциированных с морскими асцидиями // Микробиология. 1992. Т. 61, вып. 1. С. 131134.

14. Романенко JI. А., Иванова Е. П., Лысенко А. М., Михайлов В. В. Некоторые особенности грамотрицательных агарлитических бактерий из морской среды // Микробиология. 1994а. Т. 63, вып. 5. С. 940-944.

15. Романенко JI. А., Лысенко А. М., Михайлов В. В., Курика А. В. Новый вид • буропигментированных агарлитических бактерий рода Alteromonas II Микробиология.19946. Т. 63, вып. 6. С. 1081-1087.

16. Романенко Л. А., Зелепуга Е. А., Козловская Э. П., Михайлов В. В. Тирозиназная активность бактерий рода Alteromonas II Биология моря. 1994в. Т. 63, № 4. С. 260-263.

17. Фролова Г. М., Куриленко В. В., Иванова Е. П., Горшкова Н. М., Михайлов В. В. Особенности фосфолипидного состава морских протеобактерий рода Pseudoalteromonas И Микробиология. 2000. Т. 69, № 4. С. 506-510.

18. Янулайтис А. А. Ферменты рестрикции и их применение. М.: Наука. 1989. 203с.

19. Akagawa-Matsushita М., Yamada Y., Yamasato К. Characterization and identification of a restriction enzyme producing marine bacterium Deleya marina I AM 14114// Bull. JFCC. 1991. V. 7. P. 28-32.

20. Akagawa-Matsushita M., Itoh Т., Katayama Y., Kuraishi H., Yamasato K. Isoprenoid quinone composition of some marine Alteromonas, Marinomonas, Deleya, Pseudomonas and Shewanella species //J. Gen. Microbiol. 1992a. V. 138. P. 2275-2281.

21. Akagawa-Matsushita M., Matsuo M., Koga Y., Yamasato K. Alteromonas atlantica sp. nov. and Alteromonas carrageenovora sp. nov., bacteria that decompose algal polysaccharides // Int. J. Syst. Bacterid. 1992b. V. 42. P. 621-627.

22. Akagawa-Matsushita M., Koga Y, Yamasato K. DNA relatedness among nonpigmented species of Alteromonas and synonymy of Alteromonas haloplanktis (ZoBell and

23. Upham 1944) Reichelt and Baumann 1973 and Alteromonas tetraodonis Simidu et al. 1990 II Int. J. Syst. Bacterid. 1993. V. 43. P. 500-503.

24. Amann R. I., Ludwig W., Schleifer K.-H. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation // Microbiol. Reviews. 1995. V. 59, № l.P. 143-169.

25. Anderson R. J., Wolfe M. S., Faulkner D. J. Autotoxic antibiotic production by a marine Chromobacterium II Marine Biol. 1974. V. 27. P. 281-285.

26. AustinB. Marine Microbiology. Cambridge: Cambridge Univ. Press, 1988. 222 p.

27. Austin B. Novel pharmaceutical compounds from marine bacteria // J. Appl. Bacterid. 1989. V. 67. P. 461-470.

28. Ballester M., Ballester J. M., Belaich J. P. Isolation and characterization of a high molecular weight antibiotic produced a marine bacterium // Microb. Ecol. 1977. V. 3. P. 289303.

29. Baumann L, Baumann P., Mandel M., Allen R. D. Taxonomy of aerobic marine eubacteria // J. Bacteriol. 1972. V. 3. P. 402-429.

30. Baumann L., Bowditch R. D., Baumann P. Description of Deleya gen. nov. created to accommodate the marine species Alcaligenes aestus, A. pacificus, A. cupidus, A. venustus, and Pseudomonas marina II Int. J. Syst. Bacteriol. 1983. V. 33. P. 793-802.

31. Baumann P., Baumann L. Genus Photobacterium, Beijerinck 1889. In Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 1, pp. 539-544. Edited by N. R. Krieg & J. G. Holt. 1984. Baltimore: Williams & Wilkins.

32. Baumann P., Furniss A. L., Lee J. V. Genus Vibrio, Pacini 1854. In Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 1, pp. 518-538. Edited by N. R. Krieg & J. G. Holt. 1984a. Baltimore: Williams & Wilkins.

33. Baumann P., Baumann L., Bowditch R. D., Beaman B. Taxonomy of Alteromonas: A. nigrifaciens sp. nov. nom. rev.; A. macleodii; and A. haloplanktis I I Int. J. Syst. Bacteriol. 1984b. V. 34. P. 145-149.

34. Baumann P., Gauthier M. J., Baumann L. Genus Alteromonas Baumann, Baumann, Mandel and Allen 1972 11 Bergey's manual of systematic bacteriology / Eds. N. R. Krieg, J. G. Holt. 1984c. Baltimore: Williams & Wilkins Co. P. 343-352.

35. Bein S. J. A study of certain chromogenic bacteria isolated from "Red Tide" water with a description of anew species // Bull. Mar. Sci. Gulf Carrib. 1954. V 4. P. 110-119.

36. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology // Eds N. R. Krieg, J. G. Holt. Baltimore/London: Williams&Wilkins Co. 1984. V. 1. 964 p.

37. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology // Eds P. Sneath, N. Mair, M. E. Sharpe, J. G. Holt. Baltimore/London: Williams&Wilkins Co. 1986. V. 2. P. 965-1599.

38. Berland B. R., Bianchi M. G., Maestrini S. Y. Etude des bacteries associees aux Algues maries en culture. I. Determination preliminaire des especes // Marine Biol. 1969. V. 2. P. 350-355.

39. Bonar D. B., Weiner R. M., Colwell R. R. Microbial-invertebrate interactions and potential for biotechnology // Microb. Ecol. 1986. V. 12, № 1. P. 101-110.

40. Bowman J. P., Cavanagh J., Austin J. J., Sanderson K. Novel Psychrobacter species from Antarctic ornithogenic soils // Int. J. Syst. Bacteriol. 1996. V. 46. P. 841-848.

41. Bowman J. P., McCammon S. A., Brown M. V., Nichols D. S., McMeekin T. A. Diversity and association of psychrophilic bacteria in Antarctic sea ice // Appl. Environ. Microbiol. 1997a. V. 63. P. 3068-3078.

42. Bowman J. P., Nichols D. S., McMeekin T. A. Psychrobacter glacincola sp. nov., a halotolerant, psychrophilic bacterium isolated from Antarctic sea ice // Syst. Appl. Microbiol. 1997b. V. 20. P. 209-215.

43. Bowman J. P. Pseudoalteromonasprydzensis sp. nov., a psychrotrophic, halotolerant bacterium from Antarctic sea ice // Int. J. Syst. Bacteriol. 1998. V. 48. P. 1037-1041.

44. Bozal N., Tudela E., Rossello-Mora R., Lalucat J., Guinea J. Pseudoalteromonas antarctica sp. nov., isolated from an Antarctic coastal environment // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. V. 47. P. 345-351.

45. Bradford M. M. A rapid and sensitive method to the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding // Anal. Biochem. 1976. V. 72. N 2. P. 248-254.

46. Brettar I., Christen R., Hofle M. G. Rheinheimera baltica gen. nov., sp. nov., a blue-coloured bacterium isolated from the central Baltic Sea // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002. V. 52. P.1851-1857.

47. O.Brettar I., Christen R., Höfle M. G. Idiomarina baltica sp. nov., a marine bacterium with a high optimum growth temperature isolated from surface water of the central Baltic Sea // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V.53. P. 407-413.

48. Buck J. D., Meyers S. P. "In vitro" inhibition of Rhodotorula minuta by variant of the marine bacterium Pseudomonas piscicida II Helgoland. Meeresuntersuch. 1966. V. 13. P. 171177.

49. Buck J. D., Meyers S. P., Leifson E. Pseudomonas (Flavobacterium) piscicida Bein comb. nov. //J. Bacteriol. 1963. V. 86. P. 1125-1126.

50. Burkholder P. R., Pfister R. M., Leitz F. H. Production of a pyrrole antibiotic by a marine bacterium // Appl. Microbiol. 1966. V. 14. P. 649-653.

51. Carr E. L., Kämpfer P., Patel B. K. C., Gürtler V., Seviour R. J. Seven novel species of Acinetobacter isolated from activated sludge // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. P.953.963.

52. Catlin B. W. Branhamaceae fam. nov., a proposed family to accommodate the genera Branhamella and Moraxella II Int. J. Syst. Bacteriol. 1991. V. 41. P. 320-323.

53. Chan K. Y., Baumann L., Garza M. M., Baumann P. Two new species of Alteromonas: Alteromonas espejiana and Alteromonas undina II Int. J. Syst. Bacteriol. 1978. V. 28. P. 217-222.

54. Colwell R. R. Polyphasic taxonomy of the genera Vibrio: numerical taxonomy of Vibrionaceae, Vibrio parahaemolyticus, and related Vibrio species // J. Bacteriol. 1970. V. 104. P. 410-433.

55. Cowan D. A. The marine biosphere: a global resource for biotechnology // TIBTECH. 1997. V. 15. P. 129-131.

56. D'Aoust J. Y., Kushner D. J. Vibrio psychroerythrus sp. nov.: classification of the psychrophilic marine bacterium, NRC 1004 //J. Bacteriol. 1972. V. 111. P. 340-342.

57. De Ley J., Cattoir H., Reynaerts A. The quantitative measurement of DNA hybridization from renaturation rates // Eur. J. Biochem. 1970. V. 12 P.133-142.

58. Deming J. W. Bacterial growth in deep-sea sediment trap and boxcore samples // Mar. Ecol. Prog. Ser. 1985. V. 25. P. 305-312.

59. Deming J. W., Col well R. R. Barophilic bacteria associated with digestive tracts of abyssal holothurians//Appl. Environ. Microbiol. 1982. V. 50. P. 1002-1006.

60. Deming J. W., Somers L. K., Straube W. L., Schwartz D. G., MacDonnel M. T. Isolation of an obligately barophilic bacterium and description of a new genus, Colwellia gen. nov. // Syst. Appl. Microbiol. 1988. V. 10. P. 152-160.

61. Deng J., Hamada Y., Shioiri T. Total synthesis of alterobactin A, a super siderophore from an open-ocean bacterium // J. Am. Chem. Soc. 1995. V. 117. P. 7824-7825.

62. DeSoete G. A least square algorithm for fitting additive trees to proximity data // Psychrometrika. 1983. V. 48. P. 621-626.

63. Desnottes J.-F. New targets and strategies for the development of antibacterial agents //TIBTECH. 1996. V. 14. P. 134-140.

64. Donachie S. P., Hou S., Gregory T. S., Malahoff A., Alam M. Idiomarina loihiensis sp. nov., a halophilic gamma-Proteobacterium from the Lo'ihi submarine volcano, Hawai'i // Int. J. Evol. Syst. Microbiol. 2003. V. 53. P. 1873-1879.

65. Donis-Keller H. PhyM: an RNase activity specific for U and A residues useful in RNA sequence analysis // Nucl. Acids Res.1980. V. 8, № 14. P. 3133-3142.

66. Duckworth A. W., Grant W. D., Jones B. E., Meijer D., Marquez M. C., Ventosa A. Halomonas magadii sp. nov., a new member of the genus Halomonas, isolated from a soda lake of the East African Rift Valley // Extremophiles. 2000. V. 4. P. 53-60.

67. Egan E., Holmstrom C., Kjelleberg S. Pseudoalteromonas ulvae sp. nov., a bacterium with antifouling activities isolated from the surface of a marine alga // Int. J. Evol. Syst. Microbiol. 2001. V. 51. P. 1499-1504.

68. Elyakov G. B., Kuznetsova T. A., Mikhailov V. V., Maltsev I. I., Voinov V. G., Fedoreyev S. A. Brominated diphenyl ethers from a marine bacterium associated with the sponge Dysidea sp. // Experientia. 1991. V. 47. P. 632-633.

69. Enger O., Nygaard H., Solberg M., Schei G., Nielsen J. Characterization of Alteromonas denitrificans sp. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1987. V. 37. P. 416-421.

70. Euzeby J. P. Taxonomic note: necessary correction of specific and subspecific epithets according to Rules 12c and 13b of the International Code of Nomenclature of Bacteria (1990 Revision) // Int. J. Syst. Bacteriol. 1998. V. 48. P. 1073-1075.

71. Faulkner D. J. Marine natural products // Nat Prod. Rep. 1999. V. 16. P. 155-198.

72. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap // Evolution. 1985. V. 39. P. 783-791.

73. Felsenstein J. PHYLIP (Phylogenetic Inference Package) version 3.5.1. Department of Genetics. University of Washington. 1993. Seattle, USA.

74. Fenical W. Chemical studies of marine bacteria: developing a new resource // Chem. Rev. 1993. V. 93. P. 1673-1683.

75. Fischer-Romero C., Tindall B. J., Jiittner F. Tolumonas auensis gen. nov., sp. nov., a toluene-producing bacterium from anoxic sediments of a freshwater lake // Int. J. Syst. Bacteriol. 1996. V. 46. P. 183-188.

76. Fox G. E., Wisotzkey J. D., Jurtshuk P., JR. How close is close: 16S rRNA sequence identity may not be sufficient to gaurantee species identity // Int. J. Syst. Bacteriol. 1992. V. 42. P. 166-170.

77. Franzmann P. D., Burton H. R., McMeekin T. A. Halomonas subglaciescola, a new species of halotolerant bacteria isolated from Antarctica // Int. J. Syst. Bacteriol. 1987. V. 37. P. 27-34.

78. Franzmann P. D., Wehmeyer U., Stackebrandt E. Halomonadaceae fam. nov., a new family of the class Proteobacteria to accommodate the genera Halomonas and Deleya II Syst. Appl. Microbiol. 1988. V. 11. P. 16-19.

79. Garriga M., Ehrmann M. A., Arnau J., Hugas M., Vogel R. F. Carnimonas nigrificans gen. nov., sp. nov., a bacterial causative agent for black spot formation on cured meat products // Int. J. Syst. Bacteriol. 1998. V. 48. P. 677-686.

80. Gauthier M. J. Alteromonas rubra sp. nov., a new marine antibiotic-producing bacterium // Int. J. Syst. Bacteriol. 1976a. V. 26. P. 459-466.

81. Gauthier M. J. Morphological, physiological, and biochemical characteristics of some violet-pigmented bacteria isolated from seawater // Can. J. Microbiol. 1976b. V. 22. P. 138-149.

82. Gauthier M. J. Alteromonas citrea, a new Gram-negative, yellow-pigmented species from seawater // Int. J. Syst. Bacteriol. 1977. V. 27. P. 349-354.

83. Gauthier M. J. Validation of the name Alteromonas luteoviolacea II Int. J. Syst. Bacteriol. 1982. V. 32. P. 82-86.

84. Gauthier M. J., Breittmayer V. A. A new antibiotic-producing bacterium from seawater: Alteromonas aurantia sp. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1979. V. 29. P. 366-372.

85. Gauthier M. J., Flatau G. N. Antibacterial activity of marine violet-pigmented Alteromonas with special reference to the productions of brominated compounds // Can. J. Microbiol. 1976. V. 22. P. 1612-1619.

86. GÍ11ÍS M., Vandamme P., De Vos P., Swings J., Kersters K. Polyphasic taxonomy. In: D. R. Boone, and R. W. Castenholz (Eds). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 1.2001. Springer-Verlag, New York.

87. Gil-Turnes M. S., Hay M. E., Fenical W. Symbiotic marine bacteria chemically defend crustacean embryos from a pathogenic fungus // Science. 1989. V. 246. P. 117-118.

88. Gil-Turnes M. S., Fenical W. Embrios of Homarus americanus are protected by epibiotic bacteria // Biol. Bull. 1992. V. 182, № 1. P. 105-108.

89. Gürtler V., Mayall B. C. Genomic approaches to typing, taxonomy and evolution of bacterial isolates // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001. V. 51. P. 3-16.

90. Hamato N., Takano R., Kamei-Hayashi K., Imada C., Hara S. Leupeptins produced by the marine Alteromonas sp. B-10-31 // Biosci. Biotech. Biochem. 1992. V. 56, № 8. P. 1316318.

91. Hebert A. M., Vreeland R. H. Phenotypic comparison of halotolerant bacteria: Halomonas halodurans sp. nov., nom. rev., comb. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1987. V. 37. P. 347-350.

92. Hedlund B. P., Geiselbrecht A. D., Bair T. J., Staley J. T. Polycyclic aromatic hydrocarbon degradation by a new marine bacterium, Neptunomonas naphthovorans gen. nov., sp. nov. // Appl. Environ. Microbiol. 1999. V. 65. P. 251-259.

93. Holland G. S., Jamieson D. D., Reicheldt J. L., Viset G., Wells R. J. Aromatic acids from Alteromonas rubra II Chemistry and Industry. 1984. № 3. P. 3-8.

94. Holmström C., James S., Neilan B. A., White D. C., Kjelleberg S. Pseudoalteromonas tunicata sp. nov., a bacterium that produces antifouling agents // Int. J. Syst. Bacteriol. 1998. V. 48. P. 1205-1212.

95. Holmström C., Kjelleberg S. Marine Pseudoalter omonas species are associated with higher organisms and produce biologically active extracellular agents // FEMS Microbiol. Ecol. 1999. V. 30. P. 285-293.

96. Hugenholtz R., Pace N. R. Identifying microbial diversity in the natural environment: a molecular phylogenetic approach // Trends in Biotechnology. 1996. V. 14, № 6. P. 190-197.

97. Hugenholtz R., Goebel B. M., Pace N. R. Impact of culture-independent studies on the emerging phylogenetic view of bacterial diversity // J. Bacteriol. 1998. V. 180. P. 4765-4774.

98. Isnansetyo A., Kamei Y. Pseudoalteromonas phenolica sp. nov., a novel marine bacterium that produces phenolic anti-methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) substances // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. P. 583-588.

99. Jannasch H. W., Wirsen C. O., Taylor C. D. Deep-sea bacteria: isolation in the absence of decompression// Science. 1982. V. 126. P. 1315-1317.

100. Jones D., Krieg N. R. Serology and chemotaxonomy // Bergey's manual of systematic bacteriology / Eds. N. R. Krieg, J. G. Holt. Baltimore: The Williams & Wilkins Co. 1984. V. l.P. 15-19.

101. Jukes T. H., Cantor C. R. Evolution of protein molecules // Mammalian Protein Metabolism / Ed. H. N. Munro. 1967. New York: Academic Press. P. 21-132.

102. Juni E., Heym G. A. Psychrobacter immobilis gen. nov., sp. nov.: genospecies composed of gram-negative, aerobic, oxidase-positive coccobacilli // Int. J. Syst. Bacteriol. 1986. V. 36. P. 388-391.

103. Kampfer P., Albrecht A., Buczolits S., Busse H. J. Psychrobacter faecalis sp. nov., a new species from a bioaerosol originating from pigeon faeces // Syst. Appl. Microbiol. 2001. V. 25. P. 31-36.

104. Kameyama T., Takahashi A., Karasawa S., Ishizuka M., Okami Y., Takeuchi T., Umezawa H. Bisucaberin, a new siderophore, sensitizing tumor cells to macrophage-mediated cytolysis. I. // J. Antibiotics. 1987. V. 40. P. 1664-1670.

105. Kelley S. K., Coyne V. E., Sledjeski D. D., Fuqua W. C., Weiner R. M. Identification of tyrosinase from a periphytic marine bacterium // FEMS Microbiol. Lett. 1990 V. 67, № 3. P. 275-280.

106. Kim D.-S., Kim C.-H. Reply. No ability to produce tetrodotoxin in bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V. 67. P. 2393-2394.

107. Kobayashi T., Imada C., Hiraishi A., Tsujibo H., Miyamoto K., Inamori Y., Hamada N., Watanabe E. Pseudoalteromonas sagamiensis sp. nov., a marine bacterium that produces protease inhibitors // Int. J. Evol. Syst. Microbiol. 2003. V. 53. P. 1807-1811.

108. Kodama M., Ogata T., Sato S. Saxitoxin producing bacterium isolated from Protogonyaulax tamarensis II Red Tide. Biology, Environmental Science and Toxicology / Eds. T Okaichi., D.M. Anderson, T. Nemoto. Amsterdam: Elsevier, 1989. P. 363-366.

109. Kodama K., Shiozawa H., Ishii A. Alteromonas rava sp. nov., a marine bacterium that produces a new antibiotic, thiomarinol // Annu. Rep. Sankyo Res. Lab. 1993. V. 45. P. 131136.

110. Kodjo A., Tounjum T., Richard Y., Bouvre K. Moraxella caprae sp. nov., a new member of the classical moraxellae with very close affinity to Moraxella bovis II Int. J. Syst. Bacteriol. 1995. V. 45. P. 467-471.

111. Kodjo A., Richard Y., Tounjum T. Moraxella boevrei sp. nov., a new Moraxella species found in goats// Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. V. 47. P. 115-121.

112. Kon-ya K., Shimidzu N., Otaki N., Yokoyama A., Adachi K., Miki. W. Inhibitory effect of bacterial ubiquinones on the settling of barnacle, Baianus amphitrite II Experientia. 1995. V. 51. P.153-155.

113. Krieg N. R. Genus Oceanospirillum Hylemon, Wells, Krieg and Jannasch 1973 // Bergey's manual of systematic bacteriology / Eds. N. R. Krieg, J. G. Holt, 1984. Baltimore: Williams & Wilkins Co. P. 104-110.

114. Leifson E. Determination of carbohydrate metabolism of marine bacteria // J. Bacteriol. 1963. V. 85. P. 1183-1184.

115. Lemos M. L., Toranzo A. E., Baija J. L. Antibiotic activity of epiphytic bacteria isolated from intertidal seaweeds // Microb. Ecol. 1985. V. 11. P. 149-163.

116. Ludwig W., Schleifer K.-H. Bacterial phylogeny based on 16S and 23S rRNA sequence analysis//FEMS Microbiol. Rev. 1994. V. 15. P. 155-173.

117. Ludwig W., Schleifer, K.-H. Phylogeny of Bacteria beyond the 16S rRNA standard // ASM News. 1999. V. 65. P. 752-757.

118. Ludwig W., Klenk H.-P. Overview: A phylogenetic backbone and taxonomic framework for prokaryotic systematic. In: D. R. Boone, R. W. Castenholz (Eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 1. 2001. Springer-Verlag, New York.

119. MacDonell M. T., Colwell R. R. Phylogeny of the Vibrionaceae, and recommendation for two new genera, Listonella and Shewanella II Syst. Appl. Microbiol. 1985. V. 6. P. 171-182.

120. Maciän M. C., Ludwig W., Schleifer K.-H., Garay E., Pujalte M. J. Thalassomonas viridans gen. nov., sp. nov., a novel marine y-proteobacterium // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001. V.51.P. 1283-1289.

121. Maidak B. L., Olsen G. J., Larsen N., Overbeek R., McCaughey M. J., Woese C. R. A new version of RDP (Ribosomal Database Project) // Nucleic Acids Res. 1997. V. 25. P. 109110.

122. Marmur J. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms //J. Mol. Biol. 1961. V. 3. P. 208-218.

123. Marmur J., Doty P. Determinative of the base composition of deoxyribonucleic acid from its thermal denaturation temperature // J. Mol. Biol. 1962. V. 5, № 1. P. 109-118.

124. Matsumura K. No ability to produce tetrodotoxin in bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 2001. V. 67. P. 2393.

125. McLean M. W., Williamson F. B. Chi-carrageenase from Pseudomonas carrageenovora II Eur. J. Biochem. 1979. V. 93, N 3. P. 553-558.

126. Mesbah M., Premachandran U., Whitman W. B. Precise measurement of the G+C content of deoxyribonucleic acid by high-performance liquid chromatography // Int. J. Syst. Bacteriol. 1989. V. 39. P. 159-167.

127. Morita R. Y. Psychrophilic bacteria // Bacteriol. Rev. 1975. V. 39. P. 144-167.

128. Mormile M. R., Romine M. F., Garcia M. T., Ventosa A., Bailey T. J., Peyton B. M. Halomonas campisalis sp. nov., a denitrifying, moderately haloalkaliphilic bacterium // Syst. Appl. Microbiol. 1999. V. 22. P. 551-558.

129. Muller W. Endoribonuclease IV. A poly(A)-specific ribonucleases from chick oviduct. 1. Purification of the enzyme // Eur. J. Biochem. 1976. V. 70. P. 241-248.

130. Nair S., Simidu U. Distribution and significance of heterotrophic marine bacteria with antibacterial activity // Appl. Environ. Microbiol. 1987. V. 53. P. 2957-2962.

131. Pace N. R. A molecular view of microbial diversity and the biosphere. Science. 1997. V. 276. P. 734-740.

132. Pace N. R. Microbial ecology and diversity // ASM News. 1999. V. 65, № 5. P. 328333.

133. Popoff M. Genus Aeromonas, Kluyver and Van Niel 1936. In Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 1984. Vol. 1, pp. 545-548. Edited by N. R. Krieg & J. G. Holt. Baltimore: Williams & Wilkins.

134. Potin P., Barbeyron T., Bouget F. Y., Rochas C., Kloareg B. Biochemical characterization and molecular cloning of phycocolloid-modifying enzymes from marine bacteria and alga // Intern. Marine Biotechnol. Conf. Baltimore. 1991. P. 68.

135. Priest F. G., Goodfellow M., Shute L. A., Berkeley R. C. W. Bacillus amyloliquefaciens sp. nov., nom. rev. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1987. V. 37. P. 69-71.

136. Quesada E., Ventosa A., Ruiz-Berraquero F., Ramos-Cormenzana A. Deleya halophila a new species of moderately halophilic bacteria // Int. J. Syst. Bacteriol. 1984. V. 34. P. 287-292.

137. Quintanilla M., Renart J. Purification and characterization of a novel UpN-specific . endoribonuclease VI from Artemia larvae // J. Biol. Chem. 1982. V. 257, № 21. P. 12594-12599.

138. Rinehart K. L., Gloer J. B., Huges R. G., Renis H. G. et al. Didemnins — antiviral and antitumor depsipeptides from a caribean tunicate 11 Science. 1981. V. 212, № 4497. P. 933-935.

139. Rossellö-Mora R. A., Ludwig W., Kämpfer P., Amann R., Schleifer K. H. Ferrimonas balearica gen. nov., spec, nov., a new marine facultative Fe(III)-reducing bacterium // Syst. Appl. Microbiol. 1995. V. 18. P. 196-202.

140. Rossellö-Mora R., Amann R. The species concept for prokaryotes // FEMS Microbiol. Rev. 2001. V. 25. P. 39-67.

141. Rouhi A. M. Chemistry from unknown microbes // C&EN. 1999. Jan. 4. P. 21-23.

142. Saitou N., Nei M. The neighbor joining method: a new method for constructingphylogenetic trees // Mol. Biol. Evol. 1987. V. 4. P. 406-425.

143. Marinobacterium as Marinibacterium jannaschii comb. nov. and Marinibacterium stanieri comb. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002. V. 52. P. 739-747.

144. Shigemori H., Bae M.-A., Yazawa K., Sasaki T., Kobayashi Y. Alteramide A, a new tetracyclic alkaloid from a bacterium Alteromonas sp. associated with the marine sponge Halichondria okadai II J. Org. Chem. 1992. V. 57. P. 4320-4323.

145. Shiozawa H., Takahashi S. Configuration studies on thiomarinol // J. Antibiotics.1994. V. 47, №7. P. 851-853.

146. Shiozawa H., Kagasaki T., Torokata A., Tanaka N., Fujimoto K., Hata T., Furukawa Y., Takahashi S. Thimarinols B and C, antimicrobial antibiotics produced by a marine bacterium // J. Antibiotics. 1995. V. 48, № 8. P. 907-909.

147. Simidu U., Kita-Tsukamoto K., Yasumoto T., Yotsu M. Taxonomy of four marine bacterial strains that produce tetrodotoxin // Int. J. Syst. Bacteriol. 1990. V. 40. P. 331-336.

148. Skerman V. B. D., McGowan V., Sneath P. H. A. (Editors): Approved Lists of Bacterial Names. Int. J. Syst. Bacteriol. 1980. V. 30. P. 225-420.

149. Sleigh M.A. Microbes in the Sea. Chichester, London: Wiley & Sons. 1987.264 P.

150. Schumann P., Prauser H., Rainey F. A., Stackebrandt E., Hirsch P. Friedmanniella antarctica gen. nov., sp. nov., an LL-diaminopimelic acid-containing actinomycete from Antarctic sand-stone // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. V. 47. P. 278-283.

151. Smibert R. M., Krieg N. R. Phenotypic characterization. In: Methods for General and Molecular Bacteriology, pp. 607-655. Edited by P. Gerhardt, R. G. E. Murray, W. A. Wood, N. R. Krieg. 1994. Washington, DC: American Society for Microbiology.

152. Solano F., Garcia E., Perez de Egea E., Sanchez-Amat A. Isolation and characterization of strain MMB-1, a novel melanogenic marine bacterium // Appl. Environ. Microbiol. 1997. V. 63. P. 3499-3506.

153. Solano F., Sanchez-Amat A. Studies on the relationships of melanogenic marine bacteria: proposal of Marinomonas mediterranea sp. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1999. V. 49. P. 1241-1246.

154. Stackebrandt E., Murray R. G. E., Truper H. G. Proteobacteria classis nov., a name for the phylogenetic taxon that includes the purple bacteria and their relatives // Int. J. Syst. Bacteriol. 1988. V. 38. P. 321-325.

155. Stackebrandt E., Goebel B. M. Taxonomic Note: a place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology // Int. J. Syst. Bacteriol. 1994. V. 44. P. 846-849.

156. Stierle D. B, Stierle A. A. Pseudomonic acid derivatives from a marine bacterium // Experientia. 1992. V. 48. P. 1165-1169.

157. Sugahara I., Kohhashi K., Kimura T. Isolation and properties of a bacterium capable of inhibiting the growth of red tide plankton // 6th Inter. Symp. Microbiol. Ecol. Barcelona: Spain, 1992. P. 173.

158. Svetashev V. I., Vysotskii M. V., Ivanova E. P., Mikhailov V. V. Cellular fatty acids of Alteromonas species // Syst. Appl. Microbiol. 1995. V. 18. P. 37-43.

159. Takada Y., Ochiai T., Okuyama H., Nishi K., Sasaki S. An obligately psychrophilic bacterium isolated on the Hokkaido coast // J. Gen. Appl. Microbiol. 1979. V. 25. P. 11-19.

160. Takahashi A., Nakamura H., Kameyama T., Kurasawa S., Naganawa H., Okami Y., Takeuchi T., Umezawa H., Iitaka Y. Bisucaberin, a new siderophore, sensitizing tumor cells to macrophage-mediated cytolysis. II. // J. Antibiotics. 1987. V. 40. P. 1671-1676.

161. Takami H., Kobata K., Nagahama T., Masui N., Kobayashi H., Inoue A., Horikoshi K. Biodiversity in deep-sea sites located near the south part of Japan // Extremophiles. 1999. V. 3. P. 97-102.

162. The Prokaryotes. A Handbook on the biology of bacteria: ecophysiology, isolation, identification, applications / Eds. A. Balows, H. G. Truper, M. Dworkin, H. Harber, K.-H. Schleifer. Berlin: Springer Verlag, 1992. V. II-III. P. 2111-3130.

163. Valderrama M. J., Quesada E., Bejar V., Ventosa A., Gutierrrez M. C., Ruiz-Berraquero F., Ramos-Cormenzana A. Deleya salina sp. nov., a moderately halophilic Gramnegative bacterium. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1991. V. 34. P. 287-292.

164. Vandamme P., Pot B., Gillis M., De Vos P., Kersters K., Swings J. Polyphasic taxonomy, a consensus approach to bacterial systematics // Microbiol. Reviews. 1996. V. 60, № 2. P. 407-438.

165. Van Landschoot A., De Ley J. Intra- and intergeneric similarities of the rRNA cistrons of Alteromonas, Marinomonas (Gen. nov.) and some other Gram-negative bacteria // J. Gen. Microbiol. 1983. V. 129. P. 3057-3974.

166. Vela A. I., Collins M. D., Latre M. V., Mateos A., Moreno M. A., Hutson R., Dominguez L., Fernandez-Garayzabal J. F. Psychrobacter pulmonis sp. nov., isolated from the lungs of lambs // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. P. 415-419.

167. Venkateswaran K., Dollhopf M. E., Aller R., Stackebrandt E., Nealson K. H. Shewanella amazonensis sp. nov., a novel metal-reducing facultative anaerobe from Amazonian shelf muds // Int. J. Syst. Bacteriol. 1998.V.48. P. 965-972.

168. Venkateswaran K., Moser D. P., Dollhopf M. E. & 10 other authors. Polyphasic taxonomy of the genus Shewanella and description of Shewanella oneidensis sp. nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1999. V. 49. P.705-724.

169. Venkateswaran K., Dohmoto N. Pseudoalteromonas peptidolytica sp. nov., a novel marine mussel-thread-degrading bacterium isolated from the Sea of Japan // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000. V. 50. P. 565-574.

170. Ventosa A., Gutierrez M. C., Garcia M. T., Ruiz-Berraquero F. Classification of "Chromobacterium marismortui" in a new genus, Chromohalobacter gen. nov., as

171. Chromohalobacter marismortui comb, nov., nom. rev. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1989. V. 39. P. 382-386.

172. Vera J., Alvarez R., Murano E., Slebe J. C., Leon J. Identification of a marine agarolytic Pseudoalteromonas isolate and characterization of its extracellular agarase // Appl. Environ. Microb. 1998. V. 64. P. 4378-4383.

173. Vreeland R. H., Litchfield C. D., Martin E. L., Elliot E. Halomonas elongata, a new genus and species of extremely salt-tolerant bacteria. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1980. V. 30. P. 485-495.

174. Weiner R. M., Coyne V. E., Brayton P., West P., Raiken S. F. Alteromonas colwelliana sp. nov., an isolate from oyster habitats // Int. J. Syst. Bacteriol. 1988. V. 38. P. 240244.

175. Weiner R. M., Fuqua W. C., Coon S. L., Walch M., Colwell R. R. Tyrosinases, biofilms and oyster set // Abstr. Intern. Marine Biotechnol. Gonf. Baltimor, Maryland, U.S.A. 1991. P. 66.

176. Westphal O., Jann K. Methods Carbohydrate Chemistry. 1965. V. 5. P. 83-89.

177. White A. H. A bacterial discoloration of print butter // Sci. Agr. 1940. V. 20. P. 638645.

178. Whitman W. B., Coleman D. C., Wiebe W. J. Prokaryotes: the unseen majority. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. P. 6578-6583.

179. Wick M. M. L-DOPA methyl ester: prolongation of survival of neuroblastoma -bearing mice after treatment// Science. 1978. V.199,N. 4330. P. 775-776.

180. Woese C. R. Bacterial evolution // Microbiol. Rev. 1987. V. 51. P. 221-271.

181. Woese C. R., Kandler O., Wheelis M. L. Towards a natural system of organisms: proposal for domains Archaea, Bacteria, and Eucarya 11 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990. V. 87. P. 4576-4579.

182. Woese C. R. Prokaryote systematics: the evolution of a science. In: The Prokaryotes. Second Edition. / Eds. A. Balows, H. G. Truper, M. Dworkin, H. Harber, K.-H. Schleifer. 1992. V. 1. P. 3-18. Berlin. Springer-Verlag.

183. Woese C. R. There must be a prokaryote somewhere: microbiology's search for itself // Microbiol. Reviews. 1994. V. 58, № 1. P. 1-9.

184. Woodruff H. B. Natural products from microorganisms // Science. 1980. V. 208. N. 4449. P. 1225-1229.

185. Wratten S., Wolf M., Anderson R., Faulkner D. Antibiotic metabolites from a marine pseudomonad // Antimicrob. Agents Chemotherapy. 1977. V. 11. P. 411-414.

186. Yaphe W. The use of agarase from Pseudomonas atlantica in the identification of agar in marine algae (Rhodophyceae) // Can. J. Microbiol. 1957. V. 3, № 8. P. 987-993.

187. Yaphe W. Detection of marine alginolyticus bacteria // Nature. 1962. V.196, № 4859. P. 1120-1121.

188. Yaphe W., Baxter B. The enzymic hydrolysis of carrageenan // Appl. Microbiol. 1955. V.3. P. 380-383.

189. Yasumoto T., Yasumura D., Yotsu M., Michishita T., Endo A., Kotaki Y. Bacterial production of tetrodotoxin and anhydrotetrodotoxin // Agric. Biol. Chem. 1986. V. 50. P. 793795.

190. Yayanos A. A., Dietz A. S., Van Boxtel R. Isolation of a deep-sea barophilic bacterium and some of its growth characteristics // Science. 1979. V. 205. P. 808-810.

191. Yi H., Bae K. S., Chun J. Thalassomonas ganghwensis sp. nov., isolated from tidal flat sediment // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. IJSEM Papers in Press, published online 15 August 2003. DOI 10.1099/ijs.0.02748-0

192. Yoon J.-H., Choi S. H„ Lee K.-C., Kho Y. H., Kang K. H., Park Y.-H. Halomonas marisflavae sp. nov., a halophilic bacterium isolated from the Yellow Sea in Korea // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001. V. 51. P. 1171-1177.

193. Yoon J.-H., Kim I.-G., Kang K. H., Oh T.-K., Park Y.-H. Alteromonas marina sp. nov., isolated from sea water of the East Sea in Korea // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003a. V. 53, pp. 1625-1630.

194. Yoon J.-H., Kang K. H., Park Y.-H. Psychrobacter jeotgali sp. nov., isolated from jeotgal, a traditional Korean fermented seafood // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003b. V. 53. P. 449-454.

195. Yoshida H., Tanka Y., Nakayama K. Properties of tyrosinases from Pseudomonas melanogenum II Agr. Biol. Chem. 1974. V. 38, N. 3. P. 627-632.

196. Yoshimoto T., Yamamoto K., Tsuru D. Extracellular tyrosinase from Streptomyces sp. KY-543: purification and enzymatic properties // J. Biochem. 1985. V. 97. N. 6. P. 17471754.

197. Youshimizu M., Kimura T. Study of intestinal microflora of salmonids // Fish Pathol. 1976. V. 10, N. 2. P. 243-259.

198. Yumoto I., Kawasaki K., Iwata H., Matsuyama H., Okuyama H. Assignment of Vibrio sp. strain ABE-1 to Colwellia maris sp. nov., a new psychrophilic bacterium I I Int. J. Syst. Bacteriol. 1998. V. 48. P. 1357-1362.

199. Zeigler D. R. Gene sequences useful for predicting relatedness of whole genomes in bacteria // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. P. 1893-1900.

200. ZoBell C. E. Marine Microbiology // Chronica Botanica Company. Waltham, USA, 1946.240p.

201. ZoBell C. E., Allen E. C. The significance of marine bacteria in the fouling of submerged surfaces //J. Bact. 1935. V. 29. P. 239-251.

202. ZoBell C. E., Upham H. C. A list of marine bacteria including descriptions of sixty new species // Bull. Scripps Inst. Oceanogr. Univ. Calif. Tech. Ser. 1944. V. 5. P. 239-292.