Т-клеточный иммунитет у ВИЧ-инфицированных пациентов, коинфицированных вирусом гепатита С тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.09, доктор наук Шмагель Надежда Геннадьевна

• Шмагель Надежда Геннадьевна
• доктор наук
• 2018

Оглавление диссертации доктор наук Шмагель Надежда Геннадьевна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. СОСТОЯНИЕ Т-КЛЕТОЧНОГО ИММУНИТЕТА ПРИ ВИЧ МОНОИНФЕКЦИИ И ВИЧ-ИНФЕКЦИИ В СОЧЕТАНИИ

ГЕПАТИТОМ С (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1. Дефицит CD4+ T-клеток при ВИЧ-инфекции

1.2. Активация иммунной системы

1.3. Развитие хронического воспаления

1.3.1. TNF-a и растворимые рецепторы sTNFR-I и sTNFR-II

1.3.2. Интерлейкин-6

1.3.3. Растворимый рецептор sCD

1.3.4. Растворимый рецептор sCD163

1.3.5. Неоптерин

1.3.6. CXCL10 (№-10)

1.3.7. D-димеры

1.4. Иммунитет на фоне антиретровирусной терапии

1.5. Иммунитет при ВИЧ/ВГС коинфекции

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Пациенты

2.2. Взятие биологического материала и его обработка

2.3. Определение аналитов в плазме крови

2.4. Цитофлуориметрический анализ

2.5. Статистические методы исследования

ГЛАВА 3. АКТИВАЦИЯ ИММУННОЙ СИСТЕМЫ И РАЗВИТИЕ СИСТЕМНОГО ВОСПАЛЕНИЯ

ПРИ ВИЧ/ВГС КОИНФЕКЦИИ

3.1. Активация ^клеток

3.2. Маркеры воспаления

ГЛАВА 4. СУБПОПУЛЯЦИИ Т-ЛИМФОЦИТОВ КРОВИ И

ЛИМФАТИЧЕСКИХ УЗЛОВ ПРИ ВИЧ/ВГС КОИНФЕКЦИИ

4.1. ^лимфоциты крови

4.2. ^лимфоциты лимфатических узлов

4.3. Морфология лимфатических узлов

ГЛАВА 5. РАЗВИТИЕ ВИЧ/ВГС КОИНФЕКЦИИ НА ФОНЕ

НАРУШЕНИЯ ОТВЕТА CD4+ Т-ЛИМФОЦИТОВ

НА АНТИРЕТРОВИРУСНУЮ ТЕРАПИЮ

5.1. Т-лимфоциты крови

5.2. Системное воспаление

5.3. Апоптоз

5.4. Истощение

5.5. Пролиферация

5.6. Т-клетки лимфатических узлов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ

ЛИТЕРАТУРА

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Т-клеточный иммунитет у ВИЧ-инфицированных пациентов, коинфицированных вирусом гепатита С»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности.

Несмотря на многочисленные исследования в области изучения ВИЧ-инфекции [1, 2, 3, 4, 5, 323] проблема остается актуальной в связи с высоким уровнем заболеваемости и смертности. ВИЧ-инфекция больше, чем любое другое инфекционное заболевание претендует быть названной «болезнью коинфекций» [59]. Коинфекции могут существенно менять картину болезни и помимо усиления активации иммунитета [23 384, 560], как правило, приводят к росту заболеваемости и смертности [116, 145, 391]. Из всех коинфекций, сопутствующих ВИЧ-инфекции, ведущее место по частоте встречаемости занимает гепатит С. Это обусловлено широким распространением обеих инфекций (в мире насчитывается около 40 млн. зараженных ВИЧ и около 120 млн. зараженных вирусом гепатита С (ВГС)) и совпадением путей их передачи [468, 608]. В Западной Европе и США доля пациентов с хроническим гепатитом С среди ВИЧ-инфицированных людей составляет 25-30 % [12], в Восточной Европе - более 50 % [458]. В России неконтролируемое потребление инъекционных наркотиков привело к значительному росту ВИЧ/ВГС коинфицирования. Его уровень среди наркопотребителей может достигать 93% [488]. Важность проблемы определяется тем, что ВГС коинфекция вносит весомый вклад в увеличение СПИД-неассоциированной заболеваемости и смертности пациентов, инфицированных ВИЧ [93, 477].

По сравнению с ВГС моноинфекцией при ВИЧ/ВГС коинфекции наблюдается ускоренное фиброзирование [118, 360] и развитие цирроза печени [118, 245]. Кроме того, больные с коинфекцией имеют повышенный относительно ВГС-моноинфицированных субъектов риск развития гепатоцеллюлярной карциномы, которая возникает у них в более раннем возрасте и через более короткий промежуток времени после инфицирования ВГС [61, 192, 476]. Низкий уровень CD4+ Т-лимфоцитов у

ВИЧ/ВГС коинфицированных пациентов является негативным фактором в развитии фиброза печени [48, 410, 484]. Опираясь на результаты различных исследователей и позицию ведущих специалистов, Европейское клиническое общество СПИДа (European AIDS Clinical Society) рекомендует раннее назначение антиретровирусной терапии (АРТ) пациентам с ВИЧ-инфекцией, коинфицированным ВГС, не только для оптимизации лечения гепатита, но и для замедления развития фиброза [364].

Сложнее выглядит ситуация с оценкой влияния гепатита C на течение ВИЧ-инфекции, при которой основным объектом поражения являются T-лимфоциты. Одним из параметров, характеризующих такое влияние, является регенерация CD4+ T-клеток при назначении АРТ. К настоящему времени представлено немало работ, результаты которых свидетельствуют о нарушении процесса восстановления численности CD4+ T-лимфоцитов у ВИЧ-инфицированных субъектов с гепатитом C [216, 474, 514, 568, 611]. Однако не все исследователи согласны с тем, что ВГС-коинфекция оказывает негативное влияние на индуцированный лечением ответ CD4+ T-клеток [492, 625]. Еще одним фактором, характеризующим ВИЧ/ВГС коинфекцию является иммунная активация. Ее уровень обычно превышает таковой при ВИЧ моноинфекции [206, 317] и ВГС моноинфекции [121, 164, 256]. Важную роль в развитии ВИЧ/ВГС коинфекции может играть системное воспаление, характерное, как для ВИЧ- [247, 478,], так и для ВГС-инфекции [163, 380]. Вместе с тем, механизмы влияния гепатита C на дисфункцию T-клеточного иммунитета и развитие системного воспаления у ВИЧ-инфицированных пациентов остаются малоизученными.

Цель исследования: исследование T-клеточного иммунитета у ВИЧ-инфицированных пациентов, коинфицированных вирусом гепатита C.

Задачи исследования:

1) оценить у ВИЧ-инфицированных пациентов влияние коинфицирования вирусом гепатита С на активацию Т-клеток и ее связь с другими параметрами иммунной системы;

2) дать характеристику развития системного воспаления у ВИЧ инфицированных пациентов при коинфекции вирусом гепатита С;

3) изучить изменения субпопуляционного состава CD4+ и CD8+ ^ лимфоцитов крови ВИЧ инфицированных лиц коинфицированных вирусом гепатита С;

4) исследовать сдвиги субпопуляционного состава CD4+ и CD8+ ^клеток лимфатических узлов ВИЧ инфицированных пациентов коинфицированных вирусом гепатита С, и сравнить их с соответствующими изменениями в крови;

5) провести гистологическое и иммуноморфологическое исследование лимфатических узлов коинфицированных вирусом гепатита С субъектов и сравнить выявленные изменения с таковыми у ВИЧ моноинфицированных;

6) исследовать развитие системного воспаления у коинфицированных вирусом гепатита С пациентов с дискордантным ответом CD4+ ^ лимфоцитов на терапию;

7) дать характеристику процессам апоптоза и истощения Т-клеток у коинфицированных вирусом гепатита С лиц с дискордантным ответом CD4+ ^клеток на лечение;

8) оценить процессы активации и воспаления в лимфатических узлах коинфицированных вирусом гепатита С субъектов с нарушением восстановления CD4+ T-лимфоцитов;

9) исследовать связь между количеством CD4+ ^клеток крови и уровнем развития системного воспаления при коинфекции вирусом гепатита С и при ВИЧ моноинфекции.

Методология и методы исследования. Из 3696 ВИЧ-инфицированных пациентов, получающих лечение, было сформировано 4 клинические группы с подавленной репликацией ВИЧ (2 группы ВГС коинфицированных лиц без интерферонотерапии и 2 группы с нарушением восстановления CD4+ T-клеток):

1. ВИЧ+/ВГС+ ИО: коинфицированные лица; >350 CD4+ T-клеток/мкл;

2. ВИЧ+/ВГС+ ИН: коинфицированные лица; <350 CD4+ T-клеток/мкл;

3. ВИЧ+/ВГС- ИО: моноинфицированные лица; >350 CD4+ T-клеток/мкл;

4. ВИЧ+/ВГС- ИН: моноинфицированные лица; <350 CD4+ T-клеток/мкл. Контролем служили показатели неинфицированных добровольцев. Методом проточной цитофлуориметрии оценивали численность субпопуляций T-лимфоцитов крови и лимфатических узлов, их функциональные характеристики. Проводили гистологическое и иммуноморфологическое исследование л/узлов, на основе биохимических параметров тестировали состояние печени, определяли маркеры системного воспаления и выраженность микробной транслокации из кишечника в общий кровоток. Применяли статистические методы исследования.

Степень достоверности, апробация результатов, личное участие автора. Достоверность результатов работы, обоснованность выводов и практических рекомендаций базируется на достаточном числе наблюдений и экспериментальных данных, использовании современных методов биологического исследования и применении статистического анализа материалов исследования с использованием пакета программ Microsoft Office 2007.

Результаты диссертации представлены и обсуждены на III Конференции по вопросам ВИЧ/СПИДа в Восточной Европе и Центральной Азии (28-30 октября 2009, Москва); XVIII International AIDS Conference (July 18-23, 2010, Vienna, Austria); IV Всероссийской конференции «Иммунология репродукции с элементами научной школы

для молодежи» (5-8 декабря 2010 г., Пермь); Международной конференции «Brokerage Event» ERA.Net RUS, (28 февраля - 2 марта 2011, Екатеринбург); 6th International AIDS Society Conference on HIV pathogenesis, treatment and prevention (July 17-20 2011, Rome, Italy); Объединенном иммунологическом форуме (30 июня - 4 июля 2013 г., Нижний Новгород); 2nd Annual bilateral meeting on collaborative research partnerships on the prevention and treatment of HIV/AIDS and co-morbidities (July 18-19, 2013, Moscow); VI Ежегодном Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням (24-26 марта 2014 г., Москва); Российском научном форуме на Урале «Актуальные вопросы фундаментальной медицины» (23-25 октября 2014 г., Екатеринбург); Пермском научном форуме (2-4 июля 2015 г., Пермь); V Конференции по ВИЧ/СПИДу в Восточной Европе и Центральной Азии (23-25 марта 2016 г., Москва); Калининградском научном форуме (27-30 июня 2016 г., Калининград); 9th International AIDS Society Conference on HIV Science (July 23-26 2017, Paris, France); XIV Конференции иммунологов Урала (27-29 августа 2017 г., Челябинск).

Личный вклад автора состоит в непосредственном участии на всех этапах диссертационного исследования. Основная идея, планирование научной работы, включая формулировку рабочей гипотезы, определение методологии и общей концепции диссертационного исследования проводились совместно с научным консультантом, академиком РАН и РАМН, доктором медицинских наук, профессором Черешневым Валерием Александровичем. Анализ современной отечественной и зарубежной литературы по изучаемой проблеме проведен лично диссертантом. Получение и интерпретация клинико-анамнестических данных осуществлялись лично диссертантом. Стандартные лабораторные исследования, определенные методическими документами Минздрава РФ для ВИЧ-инфицированных лиц, проводились сотрудниками диагностической лаборатории «ГКУЗ ПКЦ СПИД и ИЗ» (главный врач

Сармометов Е.В., зав лабораторией д.м.н. Зверев С.Я.) Экспериментальные исследования выполнены совместно с сотрудниками лаборатории экологической иммунологии ИЭГМ УрО РАН к.м.н., м.н.с. Сайдаковой Е.В. и к.м.н., н.с. Королевской Л.Б. Статистическая обработка первичных данных, интерпретация и анализ полученных результатов, написание и оформление рукописи диссертации, осуществлялись соискателем лично. Представление результатов работы в научных публикациях и в виде докладов осуществлялись соискателем лично и в соавторстве с научным коллективом, лаборатории экологической иммунологии ИЭГМ УрО РАН.

Положения, выносимые на защиту:

1. При ВИЧ-инфекции коинфекция вирусом гепатита С в большей степени, чем ВИЧ моноинфекция, вызывает активацию CD8+ ^лимфоцитов и макрофагов, а также индуцирует развитие более выраженного системного воспаления.

2. При коинфекции вирусом гепатита С развивается более глубокий, чем при ВИЧ моноинфекции дефицит наивных CD4+ T-клеток, что обусловлено нарушением процесса их регенерации.

3. Формирование у коинфицированных вирусом гепатита С пациентов дискордантного ответа CD4+ ^лимфоцитов на антиретровирусную терапию связано с усилением деструкции печени и усилением системного воспаления.

4. При коинфекции вирусом гепатита С системное воспаление тесно связано с уровнем CD4+ T-клеток, чего не наблюдается при ВИЧ моноинфекции.

Научная новизна исследования. Впервые у ВИЧ/ВГС коинфицированных пациентов в условиях вирусологически эффективной АРТ выполнено комплексное исследование T-клеточного иммунитета с анализом качественных изменений субпопуляционного состава CD4+ и CD8+ ^лимфоцитов крови и лимфатических узлов. Проведен учет их активации, регенерации, истощения, старения и гибели на фоне усиления

микробной транслокации из кишечника и развития системного воспаления. Выявлено отягощающее влияние гепатита C на формирование дефицита CD4+ ^клеток, основной мишенью которого оказались наивные элементы. Впервые показано, что происходящие в крови ВИЧ/ВГС коинфицированных субъектов сдвиги субпопуляционного состава CD4+ и CD8+ ^лимфоцитов являются отражением структурных и функциональных изменений всей иммунной системы организма. И в крови, и в лимфатических узлах зафиксировано уменьшение содержания наивных CD4+ T-клеток, увеличение количества CD8+ T-лимфоцитов памяти, усиление иммунной активации. При этом как у ВИЧ/ВГС коинфицированных, так и ВИЧ моноинфицированных пациентов отмечено выраженное развитие склероза в л/узлах, сокращение и опустошение паракортикальной зоны, увеличение содержания апоптотически измененных клеток. Эти изменения, главным образом, обусловлены ВИЧ инфекцией. Влияния гепатита C на структурные изменения лимфатических узлов, вызванные ВИЧ инфекцией, выявлено не было.

Впервые установлено, что важной особенностью ВИЧ/ВГС коинфекции, отличающей ее от ВИЧ моноинфекции является более интенсивное развитие системного воспаления, которое достигает максимального проявления на фоне дискордантного ответа CD4+ ^клеток на АРТ. Оно обусловлено деструкцией печеночной ткани и поступлением бактериальных продуктов из кишечника в кровь. Последнее определяется нарушением как кишечного, так и печеночного барьеров. В отличие от ВИЧ моноинфекции при ВИЧ/ВГС коинфекции число CD4+ ^ лимфоцитов тесно связано с проявлением системного воспаления.

Впервые показано, что ослабление регенерации CD4+ ^клеток на фоне вирусологически эффективной АРТ при ВИЧ/ВГС коинфекции определяется преимущественно формированием состояния истощения как CD4+, так и CD8+ ^ лимфоцитов, что реализуется в уменьшении концентрации ГЬ-2 в крови и сокращении темпа пролиферации CD8+ ^

лимфоцитов эффекторной памяти. В отличие от ВИЧ моноинфекции нарушение ответа на терапию при ВИЧ/ВГС коинфекции не сопровождается усилением апоптоза CD4+ T-клеток.

Теоретическая и практическая значимость работы. Полученные результаты имеют как фундаментальное, так и прикладное значение. С фундаментальных позиций важным является установление основной мишени усугубления иммунодефицита при ВИЧ/ВГС коинфекции -уменьшение численности наивных CD4+ ^лимфоцитов, что, вероятно, связано с конкуренцией двух процессов: регенерацией, вызванной CD4+ ^ лимфопенией и мобилизацией CD4+ ^клеток в анти-ВГС иммунный ответ. Этот вопрос требует дальнейшей разработки.

В практическом плане большое значение имеет факт установления при сочетанной инфекции развития выраженного системного воспаления. С одной стороны, оно прямо связано с дефицитом CD4+ ^лимфоцитов, что требует максимально раннего начала антиретровирусной терапии для сохранения клеток, с другой - свидетельствует о высоком риске развития у этих больных сердечно-сосудистых осложнений. Эти сведения о патогенезе развития заболевания, на наш взгляд, являются весомым дополнением известных данных об увеличении СПИД-неассоциированных заболеваний на фоне АРТ и смертности ВИЧ-инфицированных индивидуумов при наличии у них ВГС коинфекции. С патогенетических позиций становится очевидной необходимость изменения стратегии ведения пациентов с ВИЧ/ВГС коинфекцией: назначение антиретровирусной терапии на ранних этапах ВИЧ инфекции, не допуская развития иммунодефицита; проведение профилактических мероприятий, направленных на минимизацию сосудистых и коронарных рисков; широкое применение противовирусной терапии гепатита.

Внедрение результатов исследования в практику. Материалы диссертации используются в работе клинико-экспертной комиссии ГУЗ «Пермского краевого центра СПИД и инфекционных заболеваний» при

назначении АРТ и интерферонотерапии ВИЧ/ВГС коинфицированным пациентам. Полученные данные включены в лекционные курсы кафедры иммунологии и кафедры инфекционных болезней ГБОУ ВПО «Пермский государственный медицинский университет им. ак. Е.А. Вагнера» министерства здравоохранения и социального развития (614000, г. Пермь, ул. Петропавловская, 26), а также в курс лекций «Фундаментальная иммунология» кафедры микробиологии и иммунологии биологического факультета ГОУ ВПО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» (614600, г. Пермь, ул. Букирева, 15).

Конкурсная поддержка исследования. Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (№ 12-04-91441-НИЗ_а), US Civilian Research & Development Foundation (CRDF Global; № RUB1-31089-PE-12), программы Уральского отделения РАН (№ 12-С-4-1033), Российского научного фонда (проект № 15-15-00016).

ГЛАВА 1.

СОСТОЯНИЕ Т-КЛЕТОЧНОГО ИММУНИТЕТА ПРИ ВИЧ МОНОИНФЕКЦИИ И ВИЧ-ИНФЕКЦИИ В СОЧЕТАНИИ ГЕПАТИТОМ C (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

До конца ХХ века предполагалось, что генез ВИЧ-инфекции обусловлен исключительно вирусной деструкцией CD4+ хелперных T-клеток. Действительно, острая стадия заболевания характеризуется высоким уровнем репликации вируса и массовой потерей CD4+ T-клеток, особенно в lamina propria кишечника [101, 102, 550]. Однако в хроническую стадию, когда в отсутствие лечения длительное время сохраняются высокие темпы репликации ВИЧ, уменьшение численности CD4+ T-лимфоцитов происходит достаточно медленно [451, 646]. Было также установлено, что не все CD4+ T-клетки могут инфицироваться. Для проникновения вируса в клетку на ее поверхности помимо корецепторной молекулы CD4 должен присутствовать хемокиновый рецептор CCR5 [269, 350]. Его экспрессия подавлена на наивных T-лимфоцитах и наблюдается, главным образом, на клетках эффекторной памяти, расположенных в различных органах и тканях, преимущественно в кишечнике [63, 324]. Кроме того, важным открытием явилось выявление роли иммунной активации в прогрессировании заболевания. Прогностическое значение параметров активации оказалось существенно выше, чем показатель вирусной нагрузки [114, 197, 239]. Приведенные выше факты опровергают гипотезу прямого вирусного поражения клеток иммунной системы как единственного фактора развития болезни и требуют более комплексного подхода в оценке патогенеза ВИЧ-инфекции и механизмов ее прогрессирования в СПИД.

Изучение развития аналогичной инфекции у приматов, вызываемой вирусом иммунодефицита обезьян (ВИО), показало, что ВИО также обладает цитопатическими свойствами в отношении CD4+ T-лимфоцитов.

Однако, несмотря на высокий уровень виремии, у природных хозяев -дымчатых мангобеев и зеленых африканских мартышек - дефицит CD4+ T-клеток не прогрессирует, а заболевание не переходит в стадию СПИДа [84, 539]. У инфицированных животных также нет проявлений иммунной активации [21, 539], не поражается мукозальный иммунитет и не страдает проницаемость кишечника [65, 450], сохраняется структура лимфатических узлов [539]. При этом необходимо отметить, что инфицирование ВИО макак-резус приводит к формированию тяжелого иммунодефицита схожего по механизмам развития и клинической картине с таковым при ВИЧ-инфекции у человека [646]. Эти данные свидетельствуют тонких особенностях реакции иммунной системы на патоген у разных видов приматов и разнообразии механизмов развития заболеваний, индуцируемых родственными лентивирусами. Даже внутри одного вида наблюдаются различные варианты течения инфекции: так среди людей, инфицированных ВИЧ, выделяются «прогрессоры» и «нонпрогрессоры» (больные, отличающиеся по темпам прогрессирования заболевания), «контроллеры» (субъекты с низким уровнем репликации вируса при отсутствии лечения), иммунные «респондеры» и «нонреспондеры» (пациенты, отвечающие и не отвечающие приростом численности CD4+ T-лимфоцитов на назначение антиретровирусной терапии (АРТ).

1.1. Дефицит CD4+ T-клеток при ВИЧ-инфекции. Среди причин развития дефицита CD4+ T-клеток при ВИЧ-инфекции выделяют их гибель, повышенный оборот и нарушение процессов регенерации. Действительно, исследования in vitro показали, что ВИЧ может непосредственно убивать CD4+ T-лимфоциты через индукцию апоптоза [402]. Основным объектом при этом являются CD4+ CCR5+ T-клетки. Значение поражения данных элементов в развитии СПИДа было продемонстрировано в модельных опытах с использованием CCR5-тропного ВИО на макаках-резус. У животных в течение 2-3 недель от

момента инфицирования отмечалось широкое распространение инфекции и массивная деструкция CD4+ T-лимфоцитов в lamina propria кишечника и других слизистых [343, 390, 462]. Гибель клеток реализовалась двумя путями: прямым цитолизом и Fas/Fas-лиганд-индуцированным апоптозом [343]. Однако при переходе заболевания в хроническую фазу ситуация существенно меняется. Так, цитопатические свойства вируса не коррелируют с их способностью опустошать пул CD4+ T-клеток у «гуманизированных» SCID мышей [420]. Кроме того, известно, что количество зараженных клеток у ВИЧ-инфицированных субъектов во много раз меньше числа апоптотирующих элементов, что свидетельствует о том, что гибель лимфоцитов не связана с деструктивными свойствами вируса [165]. Следует также подчеркнуть, что при ВИЧ-инфекции апоптозу в большей степени подвержены не CD4+, а CD8+ T-клетки [402].

Таким образом, если поражение вирусом CD4+ T-клеток слизистых (наличие CCR5) является главной причиной, приводящей их к смерти, то большая часть гибнущих иммуноцитов лимфоидных органов является «сторонними» (не производящими вирус) клетками. Механизмы, вызывающие гибель «сторонних» CD4+ T-лимфоцитов, могут быть различны. Эту негативную роль способны исполнить белки ВИЧ. Еще в 1993 г. было продемонстрировано, что вирусный гликопротеин Env, экспрессированный на поверхности клетки, вызывает апоптоз соседних CD4+ T-лимфоцитов [332]. Высвобождение Nef, Tat, Vpr из инфицированных клеток может индуцировать программную смерть непораженных клеточных элементов [414, 521, 613]. В этом процессе могут также участвовать молекулярные факторы хозяина: Fas-лиганд, TRAIL [243, 294].

Одним из выдающихся открытий в области исследований, изучающих причины и механизмы потери «сторонних» CD4+ T-лимфоцитов, стало установление важной роли пироптоза в этом процессе. Внесение ВИЧ в тканевые культуры человеческих миндалин, показало

[131], что основная масса клеток погибает в результате абортивной (без репликации ВИЧ) инфекции. Эти клетки, как отмечено авторами, до заражения находились в состоянии покоя, поэтому активация не могла быть причиной их смерти. Блокирование препаратами проникновения вируса или подавление ранних этапов обратной транскрипции сохраняло им жизнь. Абортивная инфекция характеризовалась накоплением в цитоплазме неполных ДНК-транскриптов, которые вызывали активацию каспазы-1, каспазы-3 и обильную продукцию ГЬ-1. Позднее теми же исследователями было установлено [132], что гибель непродуктивно инфицированных клеток реализуется через каспазо-1-зависимый пироптоз с вовлечением инфламмасом. Проведение иммуноморфологических работ на срезах лимфатического узла, где активированные и покоящиеся клетки занимают раздельные ниши, позволило авторам сделать следующие выводы. Активация каспазы-3 происходит преимущественно в ^клетках, производящих вирус, и завершается апоптозом (гибель без воспаления). Находящиеся в состоянии покоя абортивно инфицированные Т-лимфоциты погибают путем пироптоза: они содержат каспазу-1, которая нарушает целостность клеточной мембраны и вызывает некротическую смерть клетки. Каспаза-1 также высвобождает ГЬ-1 из про- ГЬ-1. Это приводит не только к потере большого числа CD4+ ^лимфоцитов, но и развитию воспаления.

В зависимости от локализации CD4+ ^лимфоциты обладают различной чувствительностью к негативным эффектам ВИЧ-инфекции. Наибольшему опустошению подвержены CD4+ ^клетки желудочно-кишечного тракта [67, 222, 396]. Потери наблюдаются, главным образом, среди элементов, несущих CCR5 [67, 396]. Восстановление энтеральных CD4+ ^лимфоцитов даже на фоне АРТ происходит очень медленно. Как уже отмечалось выше, экспрессия CCR5 наблюдается преимущественно на клетках эффекторной памяти, расположенных за пределами лимфоидной ткани [469, 597]. Выбор патогеном этих клеток в качестве объекта

инфицирования, по-видимому, не случаен. Они происходят из CD4+CCR5-^лимфоцитов центральной памяти, локализованных в лимфатических узлах и обладающих высоким регенераторным потенциалом [67, 440, 461, 463]. Постоянная репродукция утраченных клеток эффекторной памяти и миграция их на периферию позволяет длительное время поддерживать репликацию вируса.

Следует отметить, что при ВИЧ-инфекции страдают не только CD4+ ^клетки памяти. У зараженных пациентов наблюдается снижение численности и функции наивных CD4+ ^лимфоцитов [30, 136, 238, 435, 643]. Уменьшение количества наивных ^клеток может определяться целым рядом факторов: нарушением продуктивной функции вилочковой железы, ростом иммунной активации, повышением уровня пролиферации и прямым инфицированием ВИЧ [64, 136, 238, 643]. Еще одним явлением, негативно влияющим на наивные ^лимфоциты, может быть формирование фиброза лимфатических узлов. Было установлено, что отложение коллагена в паракортикальных зонах прямо коррелирует с дефицитом CD4+ ^клеток у ВИЧ-инфицированных субъектов, при этом больше всего страдают лимфоциты, относящиеся к наивной субпопуляции [517, 518]. Позднее у зараженных ВИО макак и пациентов с ВИЧ-инфекцией в лимфоидной ткани был обнаружен высокий уровень продукции TGF-P, что сопровождалось усилением синтеза проколлагена и отложением коллагеновых волокон [640]. В результате этого ^лимфоциты оказываются лишенными доступа к сети фибробластических ретикулярных клеток - основных продуцентов №-7. Данный цитокин необходим для развития и выживания ^лимфоцитов и играет незаменимую роль в их гомеостазе [76]. Исходом процесса фиброзирования лимфатических узлов является апоптоз и утрата наивных CD4+ ^лимфоцитов - главного источника лимфотоксина-Р, дефицит которого приводит к потере уже самих фибробластических ретикулярных клеток [640].

Существующие результаты исследований показывают, что ВИЧ может нарушать самые ранние этапы формирования T-лимфоцитов, начиная с уровня CD34+ клеток и ранних предшественников тимопоэза [100, 366, 433]. При ВИЧ-инфекции наблюдаются выраженные изменения в вилочковой железе сходные по своим проявлениям с возрастной атрофией органа [236]. Вирус инфицирует и убивает развивающиеся CD4+ тимоциты [35] и поражает стромальные клетки, в первую очередь, макрофаги [195, 505]. Инфицирование макрофагов сопровождается существенным подавлением продукции цитокинов [505], что ведет к нарушению созревания тимоцитов и сокращению продуктивной функции тимуса.

T-лимфоциты, поступающие из вилочковой железы в кровоток, получили название ранних тимических мигрантов (recent thymic emigrants (англ.) - RTE). О продуктивной функции тимуса можно судить по численности RTE в крови. Эти клетки содержат эписомальные кольцевые ДНК, которые образуются при реарранжировке генов, кодирующих цепи T-клеточного рецептора. Их называют TREC (T cell receptor excision circles (англ.)). Так как TREC стабильны и не дуплицируются при митозе, каждый цикл деления клетки сопровождается «разбавлением» колец [62, 238, 352]. Их баланс будет определяться частотой деления наивных T-лимфоцитов и темпами поступления RTE из вилочковой железы. Таким образом, зная долю пролиферирующих наивных T-клеток и уровень TREC в крови можно оценить продуктивную функцию тимуса. Другие работы, связанные с разделением наивных CD4+ T-клеток здоровых людей на основе маркера CD31 (PECAM-1) показали, что CD31+ субпопуляция содержит значительно больше TREC по сравнению с CD31- субпопуляцией [64, 286, 302, 304]. Позднее было установлено, что CD31 может применяться в качестве индикатора RTE для наивных CD4+, но не CD8+ T-лимфоцитов [565]. Поэтому ряд исследователей при оценке CD4+ RTE определяют экспрессию CD31+ на наивных CD4+ T-лимфоцитах [328, 453, 631]. Такой

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Шмагель Надежда Геннадьевна, 2018 год

ЛИТЕРАТУРА

1. Карамов, Э.В. Фармакологическая профилактика ВИЧ-инфекции / Э.В. Карамов, Ю.В. Жернов, Р.М. Хаитов // Физиол. и патол. иммунной системы. - 2015. - Т. 19. № 6. - С. 3-15.

2. Онищенко, Г.Г. Противодействие эпидемии ВИЧ/СПИД в восточной Европе и центральной Азии / Г.Г. Онищенко // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2009. - № 1. - С. 16-21.

3. Покровский, В.В. Манифестация СПИДа в России / В.В. Покровский // Эпидемиол. и инф. болезни. Актуальные вопросы. - 2015. - № 1. -С. 42-47.

4. Сидорович, И.Г. Иммунотерапия ВИЧ-инфекции и СПИДа / И.Г. Сидорович, И.А. Николаева, Г.О. Гудима и соавт. // Физиол. и патол. иммунной системы. - 2005. - Т. 9. № 8. - С. 80-89.

5. Хаитов, М.Р. Анти-ВИЧ-активность новых ациклических нуклеозидных фосфонатов / М.Р. Хаитов, Г.В. Корнилаева, М.К. Куханова, Э.В. Карамов // Иммунология. - 2009. - Т. 30. № 6. - С. 336337.

6. Abbas, W. Plasma membrane signaling in HIV-1 infection / W. Abbas, G. Herbein // Biochim. Biophys. Acta. - 2014. - Vol. 1838, No 4. - P. 11321142.

7. Aberg, J.A. Aging, inflammation, and HIV infection / J.A. Aberg // Top. Antivir. Med. - 2012. - Vol. 20, No 3. - P. 101-105.

8. Adam, S.S. D-dimer antigen: current concepts and future prospects / S.S. Adam, N.S. Key, C.S. Greenberg // Blood. - 2009. - Vol. 113, No 13. - P. 2878-2887.

9. Aggarwal, B.B. Tumor necrosis factors: developments during the last decade / B.B. Aggarwal, K. Natarajan // Eur. Cytokine Netw. - 1996. -Vol. 7, No 2. - P. 93-124.

10. Ahlenstiel, G. Natural killer cells are polarized toward cytotoxicity in chronic hepatitis C in an interferon-alfa-dependent manner / G. Ahlenstiel, R.H. Titerence, C. Koh et al. // Gastroenterology. - 2010. - Vol. 138, No 1.

- P. 325-335 e321-322.

11. Akila, P. CD163 and its expanding functional repertoire / P. Akila, V. Prashant, M.N. Suma et al. // Clin. Chim. Acta. - 2012. - Vol. 413, No 7-8.

- P. 669-674.

12. Alter, M.J. Epidemiology of viral hepatitis and HIV co-infection / M.J. Alter // J. Hepatol. - 2006. - Vol. 44, No 1 Suppl. - P. S6-S9.

13. Amadei, B. Activation of natural killer cells during acute infection with hepatitis C virus / B. Amadei, S. Urbani, A. Cazaly et al. // Gastroenterology. - 2010. - Vol. 138, No 4. - P. 1536-1545.

14. Amirayan-Chevillard, N. Highly active antiretroviral therapy (HAART) and circulating markers of immune activation: specific effect of HAART on neopterin / N. Amirayan-Chevillard, H. Tissot-Dupont, Y. Obadia et al. // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2000. - Vol. 7, No 5. - P. 832-834.

15. Ananworanich, J. Soluble CD163 and monocyte populations in response to antiretroviral therapy and in relationship with neuropsychological testing among HIV-infected children / J. Ananworanich, S.J. Kerr, T. Jaimulwong et al. // J. Virus Erad. - 2015. - Vol. 1, No 3. - P. 196-202.

16. Anatol, P. Effect of interferon alpha2b plus ribavirin treatment on selected growth factors in respect to inflammation and fibrosis in chronic hepatitis C / P. Anatol, F. Robert, P. Danuta // World J. Gastroenterol. - 2005. - Vol. 11, No 12. - P. 1854-1858.

17. Andersen, E.S. Macrophage-related serum biomarkers soluble CD163 (sCD163) and soluble mannose receptor (sMR) to differentiate mild liver fibrosis from cirrhosis in patients with chronic hepatitis C: a pilot study / E.S. Andersen, S. Rodgaard-Hansen, B. Moessner et al. // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 33, No 1. - P. 117-122.

18. Anthony, K.B. Incomplete CD4 T cell recovery in HIV-1 infection after 12 months of highly active antiretroviral therapy is associated with ongoing increased CD4 T cell activation and turnover / K.B. Anthony, C. Yoder, J.A. Metcalf et al. // - 2003. - Vol. 33, No 2. - P. 125-133.

19. Antonelli, A. Chemokine (C-X-C motif) ligand (CXCL)10 in autoimmune diseases / A. Antonelli, S.M. Ferrari, D. Giuggioli et al. // Autoimmun. Rev. - 2014. - Vol. 13, No 3. - P. 272-280.

20. Antoniak, S. Protease-activated receptors and myocardial infarction / S. Antoniak, R. Pawlinski, N. Mackman // IUBMB Life. - 2011. - Vol. 63, No 6. - P. 383-389.

21. Apetrei, C. Immunovirological analyses of chronically simian immunodeficiency virus SIVmnd-1-and SIVmnd-2-infected mandrills (Mandrillus sphinx) / C. Apetrei, B. Sumpter, S. Souquiere et al. // J. Virol. - 2011. - Vol. 85, No 24. - P. 13077-13087.

22. Apolinario, A. Gene expression profile of T-cell-specific chemokines in human hepatocyte-derived cells: evidence for a synergistic inducer effect of cytokines and hepatitis C virus proteins / A. Apolinario, P.L. Majano, R. Lorente et al. // J. Viral Hepat. - 2005. - Vol. 12, No 1. - P. 27-37.

23. Appay, V. Immune activation and immune aging in HIV infection / V. Appay, A.D. Kelleher // Curr. Opin. HIV AIDS. - 2016. - Vol. 11, No 2. -P. 242-249.

24. Armah, K.A. HIV status, burden of comorbid disease, and biomarkers of inflammation, altered coagulation, and monocyte activation / K.A. Armah, K. Mcginnis, J. Baker et al. // Clin. Infect. Dis. - 2012. - Vol. 55, No 1. -P. 126-136.

25. Armah, K.A. Human immunodeficiency virus, hepatitis C, and inflammatory biomarkers in individuals with alcohol problems: a cross-sectional study / K.A. Armah, E.K. Quinn, D. M. Cheng et al. // BMC Infect. Dis. - 2013. - Vol. 13. - 399.

26. Arnaud, N. Hepatitis C virus reveals a novel early control in acute immune response / N. Arnaud, S. Dabo, D. Akazawa et al. // PLoS Pathog. - 2011. - Vol. 7. - e1002289.

27. Arron, S.T. Impact of thymectomy on the peripheral T cell pool in rhesus macaques before and after infection with simian immunodeficiency virus / S.T. Arron, R.M.Ribeiro, A. Gettie et al. // Eur. J. Immunol. - 2005. - Vol. 35, No 1. - P. 46-55.

28. Aukrust, P. Activation of tumor necrosis factor alpha system in HIV-1 infection: association with markers of immune activation / P. Aukrust, N.B. Liabakk, F. Muller, T. Espevik // Infection. - 1995. - Vol. 23, No 1. - P. 915.

29. Aukrust, P. Serum levels of tumor necrosis factor-alpha (TNF alpha) and soluble TNF receptors in human immunodeficiency virus type 1 infection-correlations to clinical, immunologic, and virologic parameters / P. Aukrust, N.B. Liabakk, F. Muller et al. // J. Infect. Dis. - 1994. - Vol. 169, No 2. - P. 420-424.

30. Autran, B. Positive effects of combined antiretroviral therapy on CD4(+) T cell homeostasis and function in advanced HIV disease / B. Autran, G. Carcelain, T.S. Li et al. // Science. - 1997. - Vol. 277, No 5322. - P. 112116.

31. Autran, B., Carcelaint G., Li T.S. et al. Restoration of the immune system with anti-retroviral therapy / B. Autran, G. Carcelain, T.S. Li et al. // Immunol. Lett. - 1999. - Vol. 66, No 1-3. - P. 207-211.

32. Bai, F. Reduced CD127 expression on peripheral CD4+ T cells impairs immunological recovery in course of suppressive highly active antiretroviral therapy / F. Bai, G.M. Bellistri, C. Tincati et al. // AIDS. -2010. - Vol. 24, No 16. - P. 2590-2593.

33. Baker, J. High-density lipoprotein particles and markers of inflammation and thrombotic activity in patients with untreated HIV infection / J. Baker,

W. Ayenew, H. Quick et al. // J. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 201, No 2. - P. 285-292.

34. Balagopal, A. Human immunodeficiency virus-related microbial translocation and progression of hepatitis C / A. Balagopal, F.H. Philp, J. Astemborski et al. // Gastroenterology. - 2008. - Vol. 135, No 1. - P. 226233.

35. Bandera, A. CD4+ T cell depletion, immune activation and increased production of regulatory T cells in the thymus of HIV-infected individuals / A. Bandera, G. Ferrario, M. Saresella et al. // Plos One. - 2010. - Vol. 5. -e10788.

36. Barber, D.L. Restoring function in exhausted CD8 T cells during chronic viral infection / D.L. Barber, E.J. Wherry, D. Masopust et al. // Nature. -2006. - Vol. 439, No 7077. - P. 682-687.

37. Barrett, L. Enhanced IL-10 production in response to hepatitis C virus proteins by peripheral blood mononuclear cells from human immunodeficiency virus-monoinfected individuals / L. Barrett, M. Gallant, C. Howley et al. // BMC Immunol. - 2008. - Vol. 9. - 28.

38. Barrett, L. Hepatic compartmentalization of exhausted and regulatory cells in HIV/HCV-coinfected patients / L. Barrett, N. Trehanpati, S. Poonia et al. // J. Viral Hepat. - 2015. - Vol. 22, No 3. - P. 281-288.

39. Bas, S. CD14 is an acute-phase protein / S. Bas, B.R. Gauthier, U. Spenato et al. // J. Immunol. - 2004. - Vol. 172, No 7. - P. 4470-4479.

40. Bastidas, S. CD8+ T cells are activated in an antigen-independent manner in HIV-infected individuals / S. Bastidas, F. Graw, M.Z. Smith et al. // J. Immunol. - 2014. - Vol. 192, No 4. - P. 1732-1744.

41. Bazdar, D.A. Interleukin-7 enhances proliferation responses to T-cell receptor stimulation in naive CD4+ T cells from human immunodeficiency virus-infected persons / D.A. Bazard, S.F. Sieg // - 2007. - Vol. 81, No 22. - P. 12670-12674.

42. Bazil, V. Shedding as a mechanism of down-modulation of CD14 on stimulated human monocytes / V. Bazil, J.L. Strominger // J. Immunol. -1991. - Vol. 147, No 5. - P. 1567-1574.

43. Beebe, A.M. The role of interleukin-10 in autoimmune disease: systemic lupus erythematosus (SLE) and multiple sclerosis (MS) / A.M. Beebe, D.J. Cua, R. De Waal Malefyt // Cytokine Growth Factor Rev. - 2002. - Vol. 13, No 4-5. - P. 403-412.

44. Beignon, A.S. Endocytosis of HIV-1 activates plasmacytoid dendritic cells via toll-like receptor-viral RNA interactions / A.S. Beignon, K. Mckenna, M. Skoberne et al. // J. Clin. Invest. - 2005. - Vol. 115, No 11. - P. 32653275.

45. Beld, M. Evidence that both HIV and HIV-induced immunodeficiency enhance HCV replication among HCV seroconverters / M. Beld, M. Penning, V. Lukashov et al. // Virology. - 1998. - Vol. 244, No 2. - P. 504-512.

46. Bellistri, G.M. Increased bone marrow interleukin-7 (IL-7)/IL-7R levels but reduced IL-7 responsiveness in HIV-positive patients lacking CD4+ gain on antiviral therapy / G.M. Bellistri, A. Casabianca, E. Merlini et al. // PLoS One. - 2010. - Vol. 5. - e15663.

47. Beltran, L.M. Reduced sTWEAK and increased sCD163 levels in HIV-infected patients: modulation by antiretroviral treatment, HIV replication and HCV co-infection / L.M. Beltran, R. Munoz Hernandez, R.S. De Pablo Bernal et al. // PLoS One. - 2014. - Vol. 9. - e90541.

48. Benhamou, Y. Liver fibrosis progression in human immunodeficiency virus and hepatitis C virus coinfected patients. The Multivirc Group / Y. Benhamou, M. Bochet, V. Di Martino et al. // Hepatology. - 1999. - Vol. 30, No 4. - P. 1054-1058.

49. Benito, J.M. Differential upregulation of CD38 on different T-cell subsets may influence the ability to reconstitute CD4+ T cells under successful highly active antiretroviral therapy / J.M. Benito, M. Lopez, S. Lozano et

al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2005. - Vol. 38, No 4. - P. 373381.

50. Benveniste, O. Mechanisms involved in the low-level regeneration of CD4+ cells in HIV-1-infected patients receiving highly active antiretroviral therapy who have prolonged undetectable plasma viral loads / O. Benveniste, A. Flahault, F. Rollot et al. // J. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 191, No 10. - P. 1670-1679.

51. Beq, S. HIV infection: pre-highly active antiretroviral therapy IL-7 plasma levels correlate with long-term CD4 cell count increase after treatment / S. Beq, M.T. Rannou, A. Fontanet et al. // - 2004. - Vol. 18, No 3. - P. 563565.

52. Berdowska, A. Neopterin measurement in clinical diagnosis / A. Berdowska, K. Zwirska-Korczala // J. Clin. Pharm. Ther. - 2001. - Vol. 26, No 5. - P. 319-329.

53. Betts, M.R. Analysis of total human immunodeficiency virus (HIV)-specific CD4(+) and CD8(+) T-cell responses: relationship to viral load in untreated HIV infection / M.R. Betts, D.R. Ambrozak, D.C. Douek et al. // J. Virol. - 2001. - Vol. 75, No 24. - P. 11983-11991.

54. Beyersdorf, N. CD28 co-stimulation in T-cell homeostasis: a recent perspective / N. Beyersdorf, T. Kerkau, T. Hunig // Immunotargets Ther. -2015. - Vol. 4. - 111-122.

55. Biancotto, A. Abnormal activation and cytokine spectra in lymph nodes of people chronically infected with HIV-1 / A. Biancotto, J.C. Grivel, S.J. Iglehart et al. // Blood. - 2007. - Vol. 109, No 10. - P. 4272-4279.

56. Bonacini, M. Patients co-infected with human immunodeficiency virus and hepatitis C virus demonstrate higher levels of hepatic HCV RNA / M. Bonacini, S. Govindarajan, L.M. Blatt et al. // J. Viral. Hepat. - 1999. -Vol. 6, No 3. - P. 203-208.

57. Bonecchi, R. Differential expression of chemokine receptors and chemotactic responsiveness of type 1 T helper cells (Th1s) and Th2s / R.

Bonecchi, G. Bianchi, P.P. Bordignon et al. // J. Exp. Med. - 1998. - Vol. 187, No 1. - P. 129-134.

58. Borges, A.H. Factors Associated With Plasma IL-6 Levels During HIV Infection / A.H. Borges, J.L. O'connor, A.N. Phillips et al. // J. Infect. Dis. - 2015. - Vol. 212, No 4. - P. 585-595.

59. Boulougoura, A. HIV infection and immune activation: the role of coinfections / A. Boulougoura, I. Sereti // Curr. Opin. HIV AIDS. - 2016. -Vol. 11, No 2. - P. 191-200.

60. Bourgeois, C. Ablation of thymic export causes accelerated decay of naive CD4 T cells in the periphery because of activation by environmental antigen / C. Bourgeois, Z. Hao, K. Rajewsky et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. - 2008. - Vol. 105, No 25. - P. 8691-8696.

61. Brau, N. Presentation and outcome of hepatocellular carcinoma in HIV-infected patients: a U.S.-Canadian multicenter study / N. Brau, R.K. Fox, P. Xiao et al. // J. Hepatol. - 2007. - Vol. 47, No 4. - P. 527-537.

62. Breit, T.M. Human T cell leukemias with continuous V(D)J recombinase activity for TCR-delta gene deletion / T.M. Breit, M.C.M. Verschuren, I.L.M. Wolvers-Tettero et al. // J. Immunol. - 1997. - Vol. 159, No 9. - P. 4341-4349.

63. Brenchley, J.M. HIV infection and the gastrointestinal immune system / J.M. Brenchley, D.C. Douek // Mucosal Immunol. - 2008. - Vol. 1, No 1. -P. 23-30.

64. Brenchley, J.M. T-Cell Subsets That Harbor Human Immunodeficiency Virus (HIV) In Vivo: Implications for HIV Pathogenesis / J.M. Brenchley, B.J. Hill, D.R. Ambrozak et al. // J. Virol. - 2004a. - Vol. 78, No 3. - P. 1160-1168.

65. Brenchley, J.M. Differential Th17 CD4 T-cell depletion in pathogenic and nonpathogenic lentiviral infections / J.M. Brenchley, M. Paiardini, K.S. Knox et al. // Blood. - 2008. - Vol. 112, No 7. - P. 2826-2835.

66. Brenchley, J.M. Microbial translocation is a cause of systemic immune activation in chronic HIV infection / J.M. Brenchley, D.A. Price, T.W. Schacker et al. // Nat. Med. - 2006. - Vol. 12, No 12. - P. 1365-1371.

67. Brenchley, J.M. CD4(+) T cell depletion during all stages of HIV disease occurs predominantly in the gastrointestinal tract / J.M. Brenchley, T.W. Schacker, L.E. Ruff et al. // J. Exp. Med. - 2004b. - Vol. 200, No 6. - P. 749-759.

68. Brenner, D. Concepts of activated T cell death / D. Brenner, P.H. Krammer, R. Arnold // Crit. Rev. Oncol. Hematol. - 2008. - Vol. 66, No 1. - P. 52-64.

69. Bucy, R.P. Initial increase in blood CD4(+) lymphocytes after HIV antiretroviral therapy reflects redistribution from lymphoid tissues / R.P. Bucy, R.D. Hockett, C.A. Derdeyn et al. // J. Clin. Invest. - 1999. - Vol. 103, No 10. - P. 1391-1398.

70. Budd, R.C. Activation-induced cell death / R.C. Budd // Curr. Opin. Immunol. - 2001. - Vol. 13, No 3. - P. 356-362.

71. Bui, J.K. Reversal of T-cell exhaustion as a strategy to improve immune control of HIV-1 / J.K. Bui, J.W. Mellors // AIDS. - 2015. - Vol. 29, No 15. - P. 1911-1915.

72. Bukh, A.R. Endotoxemia Is Associated with Altered Innate and Adaptive Immune Responses in Untreated HIV-1 Infected Individuals / A.R. Bukh, J. Melchjorsen, R. Offersen et al. // PloS One. - 2011. - Vol. 6. - e21275.

73. Burdo, T.H. Soluble CD163 made by monocyte/macrophages is a novel marker of HIV activity in early and chronic infection prior to and after antiretroviral therapy / T.H. Burdo, M.R. Lentz, P. Autissier et al. // J. Infect. Dis. - 2011. - Vol. 204, No 1. - P. 154-163.

74. Burgio, V.L. Expression of co-stimulatory molecules by Kupffer cells in chronic hepatitis of hepatitis C virus etiology / V.L. Burgio, G. Ballardini, M. Artini et al. // Hepatology. - 1998. - Vol. 27, No 6. - P. 1600-1606.

75. Calmy, A. HIV increases markers of cardiovascular risk: results from a randomized, treatment interruption trial / A. Calmy, A. Gayet-Ageron, F. Montecucco et al. // AIDS. - 2009. - Vol. 23, No 8. - P. 929-939.

76. Capitini, C.M. Modulating T-cell homeostasis with IL-7: preclinical and clinical studies / C.M. Capitini, A.A. Chisti, C.L. Mackall // J. Intern. Med. - 2009. - Vol. 266, No 2. - P. 141-153.

77. Caradonna, L. Enteric bacteria, lipopolysaccharides and related cytokines in inflammatory bowel disease: biological and clinical significance / L. Caradonna, L. Amati, T. Magrone et al. // J. Endotoxin Res. - 2000. - Vol. 6, No 3. - P. 205-214.

78. Caradonna, L. Biological and clinical significance of endotoxemia in the course of hepatitis C virus infection / L. Caradonna, M.L. Mastronardi, T. Magrone et al. // Curr. Pharm. Des. - 2002. - Vol. 8, No 11. - P. 995-1005.

79. Carrette, F. IL-7 signaling and CD127 receptor regulation in the control of T cell homeostasis / F. Carrette, C.D. Surh // Semin. Immunol. - 2012. -Vol. 24, No 3. - P. 209-217.

80. Catalfamo, M. HIV infection-associated immune activation occurs by two distinct pathways that differentially affect CD4 and CD8 T cells / M. Catalfamo, M. Di Mascio, Z. Hu et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. -2008. - Vol. 105, No 50. - P. 19851-19856.

81. Catalfamo, M. CD4 and CD8 T cell immune activation during chronic HIV infection: roles of homeostasis, HIV, type I IFN, and IL-7 / M. Catalfamo, C. Wilhelm, L. Tcheung et al. // J. Immunol. - 2011. - Vol. 186, No 4. - P. 2106-2116.

82. Chadha, S. Utility of serum neopterin and serum IL-2 receptor levels to predict absolute CD4 T lymphocyte count in HIV infected cases / S. Chadha, P. Bhalla, H. Gautam et al. // Interdiscip. Perspect. Infect. Dis. -2013. - Vol. 2013, No - P. 143648.

83. Chagan-Yasutan, H. Persistent elevation of plasma osteopontin levels in HIV patients despite highly active antiretroviral therapy / H. Chagan-

Yasutan, H. Saitoh, Y. Ashino et al. // Tohoku J. Exp. Med. - 2009. - Vol. 218, No 4. - P. 285-292.

84. Chahroudi, A. Natural SIV Hosts: Showing AIDS the Door / A. Chahroudi, S.E. Bosinger, T.H. Vanderford et al. // Science. - 2012. - Vol. 335, No 6073. - P. 1188-1193.

85. Chahroudi, A. T memory stem cells and HIV: a long-term relationship / A. Chahroudi, G. Silvestri, M. Lichterfeld // Curr. HIV/AIDS Rep. - 2015. -Vol. 12, No 1. - P. 33-40.

86. Chakir, H. 'Bystander polarization' of CD4+ T cells: activation with highdose IL-2 renders naive T cells responsive to IL-12 and/or IL-18 in the absence of TCR ligation / H. Chakir, D.K.Y. Lam, A.M. Lemay, J.R. Webb // Eur. J. Immunol. - 2003. - Vol. 33, No 7. - P. 1788-1798.

87. Chalasani, G. Recall and propagation of allospecific memory T cells independent of secondary lymphoid organs / G. Chalasani, Z.H. Dai, B.T. Konieczny et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. - 2002. - Vol. 99, No 9. -P. 6175-6180.

88. Chapman, T.J. Antigen-specific and non-specific CD4(+) T cell recruitment and proliferation during influenza infection / T.J. Chapman, M.R. Castrucci, R.C. Padnick et al. // Virology. - 2005. - Vol. 340, No 2. -P. 296-306.

89. Chastain, D.B. Epidemiology and management of antiretroviral-associated cardiovascular disease / D.B. Chastain, H. Henderson, K.R. Stover // Open AIDS J. - 2015. - Vol. 9, No - P. 23-37.

90. Chege, D. Effect of raltegravir intensification on HIV proviral DNA in the blood and gut mucosa of men on long-term therapy: a randomized controlled trial / D. Chege, C. Kovacs, C. La Porte et al. // AIDS. - 2012. -Vol. 26, No 2. - P. 167-174.

91. Chen, A.M. Virus-specific and bystander CD8 T cells recruited during virus-induced encephalomyelitis / A.M. Chen, N. Khanna, S.A. Stohlman, C.C. Bergmann // J. Virol. - 2005. - Vol. 79, No 8. - P. 4700-4708.

92. Chen, L.J. CXC chemokine IP-10: a key actor in liver disease? / L.J. Chen, J. Lv, X.Y. Wen, J.Q. Niu // Hepatol. Int. - 2013. - Vol. 7, No 3. - P. 798804.

93. Chen, T.Y. Meta-analysis: increased mortality associated with hepatitis C in HIV-infected persons is unrelated to HIV disease progression / T.Y. Chen, E.L. Ding, G.R. Seage Iii, A.Y. Kim // Clin. Infect. Dis. - 2009. -Vol. 49, No 10. - P. 1605-1615.

94. Chou, C.S. Highly purified CD25(-) resting T cells cannot be infected de novo with HIV-1 / C.S. Chou, O. Ramilo, E.S. Vitetta // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. - 1997. - Vol. 94, No 4. - P. 1361-1365.

95. Chou, J.P. T cell replicative senescence in human aging / J.P. Chou, R.B. Effros // Curr. Pharm. Des. - 2013. - Vol. 19, No 9. - P. 1680-1698.

96. Christie, J.M. Clinical outcome of hypogammaglobulinaemic patients following outbreak of acute hepatitis C: 2 year follow up / J.M. Christie, C.J. Healey, J. Watson et al. // Clin. Exp. Immunol. - 1997. - Vol. 110, No 1. - P. 4-8.

97. Chun, T.W. Persistence of HIV in gut-associated lymphoid tissue despite long-term antiretroviral therapy / T.W. Chun, D.C. Nickle, J.S. Justement et al. // J. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 197, No 5. - P. 714-720.

98. Ciccaglione, A.R. Microarray analysis identifies a common set of cellular genes modulated by different HCV replicon clones / A.R. Ciccaglione, C. Marcantonio, E. Tritarelli et al. // Bmc Genomics. - 2008. - Vol. 9, No - P. 309.

99. Ciuffreda, D. Polyfunctional HCV-specific T-cell responses are associated with effective control of HCV replication / D. Ciuffreda, D. Comte, M. Cavassini et al. // Eur. J. Immunol. - 2008. - Vol. 38, No 10. - P. 26652677.

100. Clark, D.R. T-cell progenitor function during progressive human immunodeficiency virus-1 infection and after antiretroviral therapy / D.R.

Clark, S. Repping, N.G. Pakker et al. // Blood. - 2000. - Vol. 96, No 1. -P. 242-249.

101. Clayton, F. Gastrointestinal pathology in HIV-infected patients / F. Clayton, C.H. Clayton // Gastroenterol. Clin. North Am. - 1997. - Vol. 26, No 2. - P. 191-240.

102. Cohen, M.S. Acute HIV-1 Infection / M.S. Cohen, G.M. Shaw, A.J. Mcmichael, B.F. Haynes // New Engl. J. Med. - 2011. - Vol. 364, No 20. -P. 1943-1954.

103. Colle, J.H. Regulatory dysfunction of the interleukin-7 receptor in CD4 and CD8 lymphocytes from HIV-infected patients - effects of antiretroviral therapy / J.H. Colle, J.L. Moreau, A. Fontanet et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2006. - Vol. 42, No 3. - P. 277-285.

104. Corbeau, P. Immune reconstitution under antiretroviral therapy: the new challenge in HIV-1 infection / P. Corbeau, J. Reynes // Blood. - 2011. -Vol. 117, No 21. - P. 5582-5590.

105. Costiniuk, C.T. Human immunodeficiency virus and the gastrointestinal immune system: does highly active antiretroviral therapy restore gut immunity? / C.T. Costiniuk, J.B. Angel // Mucosal Immunol. - 2012. -Vol. 5, No 6. - P. 596-604.

106. Coughlin, S.R. Thrombin signalling and protease-activated receptors / S.R. Coughlin // Nature. - 2000. - Vol. 407, No 6801. - P. 258-264.

107. D'amico, R. Lower CD4+ T lymphocyte nadirs may indicate limited immune reconstitution in HIV-1 infected individuals on potent antiretroviral therapy: analysis of immunophenotypic marker results of AACTG 5067 / R. D'amico, Y. Yang, D. Mildvan et al. // J. Clin. Immunol. - 2005. - Vol. 25, No 2. - P. 106-115.

108. Damsker, J.M. Th1 and Th17 cells: adversaries and collaborators / J.M. Damsker, A.M. Hansen, R.R. Caspi // Ann. N. Y. Acad. Sci. - 2010. - Vol. 1183, No - P. 211-221.

109. Damtie, D. Common opportunistic infections and their CD4 cell correlates among HIV-infected patients attending at antiretroviral therapy clinic of Gondar University Hospital, Northwest Ethiopia / D. Damtie, G. Yismaw, D. Woldeyohannes, B. Anagaw // BMC Res. Notes. - 2013. - Vol. 6, No -P. 534.

110. Day, C.L. PD-1 expression on HIV-specific T cells is associated with T-cell exhaustion and disease progression / C.L. Day, D.E. Kaufmann, P. Kiepiela et al. // Nature. - 2006. - Vol. 443, No 7109. - P. 350-354.

111. De Oca Arjona, M.M. Bacterial translocation in HIV-infected patients with HCV cirrhosis: implication in hemodynamic alterations and mortality / M.M. De Oca Arjona, M. Marquez, M.J. Soto et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2011. - Vol. 56, No 5. - P. 420-427.

112. De Ridder, G.G. Actions of thrombin in the interstitium / G.G. De Ridder, R.L. Lundblad, S.V. Pizzo // J. Thromb. Haemost. - 2016. - Vol. 14, No 1.

- p. 40-47.

113. Deeks, S.G. HIV infection, inflammation, immunosenescence, and aging / S.G. Deeks // Annu. Rev. Med. - 2011. - Vol. 62, No - P. 141-155.

114. Deeks, S.G. Immune activation set point during early HIV infection predicts subsequent CD4+ T-cell changes independent of viral load / S.G. Deeks, C.M. Kitchen, L. Liu et al. // Blood. - 2004. - Vol. 104, No 4. - P. 942-947.

115. Deeks, S.G. Systemic effects of inflammation on health during chronic HIV infection / S.G. Deeks, R. Tracy, D.C. Douek // Immunity. - 2013. -Vol. 39, No 4. - P. 633-645.

116. Deffur, A. Co-infection with Mycobacterium tuberculosis and human immunodeficiency virus: an overview and motivation for systems approaches / A. Deffur, N.J. Mulder, R.J. Wilkinson // Pathog. Dis. - 2013.

- Vol. 69, No 2. - P. 101-113.

117. Den Braber, I. Maintenance of peripheral naive T cells is sustained by thymus output in mice but not humans / I. Den Braber, T. Mugwagwa, N. Vrisekoop et al. // Immunity. - 2012. - Vol. 36, No 2. - P. 288-297.

118. Deng, L.P. Impact of human immunodeficiency virus infection on the course of hepatitis C virus infection: a meta-analysis / L.P. Deng, X.E. Gui, Y.X. Zhang et al. // World J. Gastroenterol. - 2009. - Vol. 15, No 8. - P. 996-1003.

119. Devadas, K. Analysis of Host Gene Expression Profile in HIV-1 and HIV-2 Infected T-Cells / K. Devadas, S. Biswas, M. Haleyurgirisetty et al. // PloS One. - 2016. - Vol. 11. - e0147421.

120. Di Mascio, M. Naive T-cell dynamics in human immunodeficiency virus type 1 infection: effects of highly active antiretroviral therapy provide insights into the mechanisms of naive T-cell depletion / M. Di Mascio, I. Sereti, L.T. Matthews et al. // J. Virol. - 2006. - Vol. 80, No 6. - P. 26652674.

121. Dichamp, I. Cellular activation and intracellular HCV load in peripheral blood monocytes isolated from HCV monoinfected and HIV-HCV coinfected patients / I. Dichamp, W. Abbas, A. Kumar et al. // PLoS One. -2014. - Vol. 9. - e96907.

122. Diehl, S. The two faces of IL-6 on Th1/Th2 differentiation / S. Diehl, M. Rincon // Mol Immunol. - 2002. - Vol. 39, No 9. - P. 531-536.

123. Diepolder, H.M. Possible mechanism involving T-lymphocyte response to non-structural protein 3 in viral clearance in acute hepatitis C virus infection / H.M. Diepolder, R. Zachoval, R.M. Hoffmann et al. // Lancet. -1995. - Vol. 346, No 8981. - P. 1006-1007.

124. Diez-Ruiz, A. Soluble receptors for tumour necrosis factor in clinical laboratory diagnosis / A. Diez-Ruiz, G.P. Tilz, R. Zangerle et al. // Eur. J. Haematol. - 1995. - Vol. 54, No 1. - P. 1-8.

125. Dill, M.T. Interferon-induced gene expression is a stronger predictor of treatment response than IL28B genotype in patients with hepatitis C / M.T.

Dill, F.H. Duong, J.E. Vogt et al. // Gastroenterology. - 2011. - Vol. 140, No 3. - P. 1021-1031.

126. Dillon, S.M. The gut microbiome and HIV-1 pathogenesis: a two-way street / S.M. Dillon, D.N. Frank, C.C. Wilson // AIDS. - 2016. - Vol. 30, No 18. - P. 2737-2751.

127. Dinh, D.M. Intestinal microbiota, microbial translocation, and systemic inflammation in chronic HIV infection / D.M. Dinh, G.E. Volpe, C. Duffalo et al. // J. Infect. Dis. - 2015. - Vol. 211, No 1. - P. 19-27.

128. Dion, M.L. Slow disease progression and robust therapy-mediated CD4+ T-cell recovery are associated with efficient thymopoiesis during HIV-1 infection / M.L. Dion, R. Bordi, J. Zeidan et al. // Blood. - 2007. - Vol. 109, No 7. - P. 2912-2920.

129. Dion, M.L. HIV infection rapidly induces and maintains a substantial suppression of thymocyte proliferation / M.L. Dion, J.F. Poulin, R. Bordi et al. // Immunity. - 2004. - Vol. 21, No 6. - P. 757-768.

130. Doisne, J.M. CD8+ T cells specific for EBV, cytomegalovirus, and influenza virus are activated during primary HIV infection / J.M. Doisne, A. Urrutia, C. Lacabaratz-Porret et al. // J. Immunol. - 2004. - Vol. 173, No 4. - P. 2410-2418.

131. Doitsh, G. Abortive HIV infection mediates CD4 T cell depletion and inflammation in human lymphoid tissue / G. Doitsh, M. Cavrois, K.G. Lassen et al. // Cell. - 2010. - Vol. 143, No 5. - P. 789-801.

132. Doitsh, G. Cell death by pyroptosis drives CD4 T-cell depletion in HIV-1 infection / G. Doitsh, N.L.K. Galloway, X. Geng et al. // Nature. - 2014. -Vol. 505, No 7484. - P. 509-514.

133. Dolganiuc, A. Viral and host factors induce macrophage activation and loss of toll-like receptor tolerance in chronic HCV infection // A. Dolganiuc, O. Norkina, K. Kodys et al. / Gastroenterology. - 2007. - Vol. 133, No 5. - P. 1627-1636.

134. Douek, D.C. Evidence for increased T cell turnover and decreased thymic output in HIV infection / D.C. Douek, M.R. Betts, B.J. Hill et al. // J. Immunol. - 2001a. - Vol. 167, No 11. - P. 6663-6668.

135. Douek, D.C., Betts M.R., Hill B.J. et al. Evidence for increased T cell turnover and decreased thymic output in HIV infection / D.C. Douek, M.R. Betts, B.J. Hill et al. // J. Immunol. - 2001b. - Vol. 167, No 11. - P. 66636668.

136. Douek, D.C. Changes in thymic function with age and during the treatment of HIV infection / D.C. Douek, R.D. Mcfarland, P.H. Keiser et al. // Nature. - 1998. - Vol. 396, No 6712. - P. 690-695.

137. Dowd, K.A. Selection pressure from neutralizing antibodies drives sequence evolution during acute infection with hepatitis C virus / K.A. Dowd, D.M. Netski, X.H. Wang et al. // Gastroenterology. - 2009. - Vol. 136, No 7. - P. 2377-2386.

138. Dukes, C.S. Neopterin production by HIV-1-infected mononuclear phagocytes / C.S. Dukes, T.J. Matthews, E.D. Rivadeneira, J.B. Weinberg // J. Leuk. Biol. - 1994. - Vol. 56, No 5. - P. 650-653.

139. Dultz, G. The macrophage activation marker CD163 is associated with IL28B genotype and hepatic inflammation in chronic hepatitis C virus infected patients / G. Dultz, L. Gerber, S. Zeuzem et al. // J. Viral Hepat. -2016. - Vol. 23, No 4. - P. 267-273.

140. Duprez, D.A. Lipoprotein particle subclasses, cardiovascular disease and HIV infection / D.A. Duprez, L.H. Kuller, R. Tracy et al. // Atherosclerosis. - 2009. - Vol. 207, No 2. - P. 524-529.

141. Duprez, D.A. Inflammation, Coagulation and Cardiovascular Disease in HIV-Infected Individuals / D.A. Duprez, J. Neuhaus, L.H. Kuller et al. // PloS One. - 2012. - Vol. 7. - e44454.

142. Durand, M. Association Between HIV Infection, Antiretroviral Therapy, and Risk of Acute Myocardial Infarction: A Cohort and Nested Case-Control Study Using Quebec's Public Health Insurance Database / M.

Durand, O. Sheehy, J.G. Baril et al. // JAIDS. - 2011. - Vol. 57, No 3. - P. 245-253.

143. Durudas, A. Elevated levels of innate immune modulators in lymph nodes and blood are associated with more-rapid disease progression in simian immunodeficiency virus-infected monkeys / A. Durudas, J.M. Milush, H.L. Chen et al. // J. Virol. - 2009. - Vol. 83, No 23. - P. 12229-12240.

144. Dutertre, C.A. Pivotal role of M-DC8(+) monocytes from viremic HIV-infected patients in TNF alpha overproduction in response to microbial products / C.A. Dutertre, S. Amraoui, A. Derosa et al. // Blood. - 2012. -Vol. 120, No 11. - P. 2259-2268.

145. Effros, R.B. The silent war of CMV in aging and HIV infection / R.B. Effros // Mech. Ageing Dev. - 2016. - Vol. 158. - P. 46-52.

146. Eggena, M.P. T cell activation in HIV-seropositive Ugandans: Differential associations with viral load, CD4(+) T cell depletion, and coinfection / M.P. Eggena, B. Barugahare, M. Okello et al. // J. Infect. Dis. - 2005. -Vol. 191, No 5. - P. 694-701.

147. El-Bassiouni, N.E. Role of fibrogenic markers in chronic hepatitis C and associated hepatocellular carcinoma / N.E. El-Bassiouni, M.M. Nosseir, M.E. Madkour et al. // Mol. Biol. Rep. - 2012. - Vol. 39, No 6. - P. 68436850.

148. Engelberts, I. Evaluation of measurement of human TNF in plasma by ELISA / I. Engelberts, A. Moller, G.J.M. Schoen et al. // Lymphokine Cytok. Res. - 1991. - Vol. 10, No 1-2. - P. 69-76.

149. Engsig, F.N. Long-term mortality in HIV patients virally suppressed for more than three years with incomplete CD4 recovery: a cohort study / F.N. Engsig, J. Gerstoft, G. Kronborg et al. // BMC Infect. Dis. - 2010. - Vol. 10, No - P. 318.

150. Erikstrup, C. T-cell dysfunction in HIV-1-infected patients with impaired recovery of CD4 cells despite suppression of viral replication / C.

Erikstrup, G. Kronborg, N. Lohse et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr.

- 2010. - Vol. 53, No 3. - P. 303-310.

151. Ershler, W.B. Interleukin-6 and aging: blood levels and mononuclear cell production increase with advancing age and in vitro production is modifiable by dietary restriction / W.B. Ershler, W.H. Sun, N. Binkley et al. // Lymphokine Cytok. Res. - 1993. - Vol. 12, No 4. - P. 225-230.

152. Esensten, J.H. CD28 costimulation: from mechanism to therapy / J.H. Esensten, Y.A. Helou, G. Chopra et al. // Immunity. - 2016. - Vol. 44, No 5. - P. 973-988.

153. Estes, J.D. Damaged intestinal epithelial integrity linked to microbial translocation in pathogenic simian immunodeficiency virus infections / J.D. Estes, L.D. Harris, N.R. Klatt et al. // PloS Pathog. - 2010. - Vol. 6. -e1001052.

154. Estes, J.D. Premature induction of an immunosuppressive regulatory T cell response during acute simian immunodeficiency virus infection / J.D. Estes, Q. Li, M.R. Reynolds et al. // J. Infect. Dis. - 2006. - Vol. 193, No 5. - P. 703-712.

155. Estes, J.D. Simian immunodeficiency virus-induced lymphatic tissue fibrosis is mediated by transforming growth factor beta 1-positive regulatory T cells and begins in early infection / J.D. Estes, S. Wietgrefe, T. Schacker et al. // J. Infect. Dis. - 2007. - Vol. 195, No 4. - P. 551-561.

156. Etzerodt, A. CD163 and inflammation: biological, diagnostic, and therapeutic aspects / A. Etzerodt, S.K. Moestrup // Antioxid. Redox Signal.

- 2013. - Vol. 18, No 17. - P. 2352-2363.

157. Evans, T.G. Highly active antiretroviral therapy results in a decrease in CD8(+) T cell activation and preferential reconstitution of the peripheral CD4(+) T cell population with memory rather than naive cells / T.G. Evans, W. Bonnez, H.R. Soucier et al. // Antivir. Res. - 1998. - Vol. 39, No 3. - P. 163-173.

158. Eyster, M.E. Increasing hepatitis C virus RNA levels in hemophiliacs: relationship to human immunodeficiency virus infection and liver disease. Multicenter Hemophilia Cohort Study / M.E. Eyster, M.W. Fried, A.M. Di Bisceglie, J.J. Goedert // Blood. - 1994. - Vol. 84, No 4. - P. 1020-1023.

159. Falconer, K. Spontaneous HCV clearance in HCV/HIV-1 coinfection associated with normalized CD4 counts, low level of chronic immune activation and high level of T cell function / K. Falconer, V.D. Gonzalez, O. Reichard et al. // J. Clin. Virol. - 2008. - Vol. 41, No 2. - P. 160-163.

160. Farci, P. Prevention of hepatitis C virus infection in chimpanzees by hyperimmune serum against the hypervariable region 1 of the envelope 2 protein / P. Farci, A. Shimoda, D. Wong et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. - 1996. - Vol. 93, No 26. - P. 15394-15399.

161. Fernandez-Real, J.M. Circulating soluble CD14 monocyte receptor is associated with increased alanine aminotransferase / J.M. Fernandez-Real, A. Lopez-Bermejo, M. Broch et al. // Clin. Chem. - 2004. - Vol. 50, No 8. - P. 1456-1458.

162. Fernandez, S. Immunosenescent CD57(+)CD4(+) T-cells accumulate and contribute to interferon-gamma responses in HIV patients responding stably to ART / S. Fernandez, M.A. French, P. Price // Dis Markers. -2011. - Vol. 31, No 6. - P. 337-342.

163. Ferri, C. International diagnostic guidelines for patients with HCV-related extrahepatic manifestations. A multidisciplinary expert statement / C. Ferri, M. Ramos-Casals, A.L. Zignego et al. // Autoimmun. Rev. - 2016. - Vol. 15, No 12. - P. 1145-1160.

164. Feuth, T. Complementary role of HCV and HIV in T-cell activation and exhaustion in HIV/HCV coinfection / T. Feuth, J.E. Arends, J.H. Fransen et al. // PLoS One. - 2013. - Vol. 8. - e59302.

165. Finkel, T.H. Apoptosis occurs predominantly in bystander cells and not in productively infected cells of HIV-infected and SIV-infected lymph nodes /

T.H. Finkel, G. Tudorwilliams, N.K. Banda et al. // Nat. Med. - 1995. -Vol. 1, No 2. - P. 129-134.

166. Fitch, K.V. Noncalcified coronary atherosclerotic plaque and immune activation in HIV-infected women / K.V. Fitch, S. Srinivasa, S. Abbara et al. // J. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 208, No 11. - P. 1737-1746.

167. Florence, E. Factors associated with a reduced CD4 lymphocyte count response to HAART despite full viral suppression in the EuroSIDA study / E. Florence, J. Lundgren, C. Dreezen et al. // HIV Med. - 2003. - Vol. 4, No 3. - P. 255-262.

168. Floridia, M. Gender differences in the treatment of HIV infection / M. Floridia, M. Giuliano, L. Palmisano, S. Vella // Pharmacol. Res. - 2008. -Vol. 58, No 3-4. - P. 173-182.

169. Flynn, J.K. Early IL-10 predominant responses are associated with progression to chronic hepatitis C virus infection in injecting drug users / J.K. Flynn, G.J. Dore, M. Hellard et al. // J. Viral Hepat. - 2011. - Vol. 18, No 8. - P. 549-561.

170. Flynn, J.K. Maintenance of Th1 hepatitis C virus (HCV)-specific responses in individuals with acute HCV who achieve sustained virological clearance after treatment / J.K. Flynn, G.J. Dore, M. Hellard et al. // J. Gastroenterol. Hepatol. - 2013. - Vol. 28, No 11. - P. 1770-1781.

171. Flynn, J.K. Stem memory T cells (TSCM)-their role in cancer and HIV immunotherapies / J.K. Flynn, P.R. Gorry // Clin Transl Immunology. -2014. - Vol. 3. - e20.

172. Focosi, D. CD57+ T lymphocytes and functional immune deficiency / D. Focosi, M. Bestagno, O. Burrone, M. Petrini // J. Leuk. Biol. - 2010. - Vol. 87, No 1. - P. 107-116.

173. Fogli, M. Significant NK cell activation associated with decreased cytolytic function in peripheral blood of HIV-1-infected patients / M. Fogli, P. Costa, G. Murdaca et al. // Eur. J. Immunol. - 2004. - Vol. 34, No 8. - P. 2313-2321.

174. Foley, J.H. Cross talk pathways between coagulation and inflammation / J.H. Foley, E.M. Conway // Circ. Res. - 2016. - Vol. 118, No 9. - P. 13921408.

175. Foxall, R.B. Memory and naive-like regulatory CD4+ T cells expand during HIV-2 infection in direct association with CD4+ T-cell depletion irrespectively of viremia / R.B. Foxall, A.S. Albuquerque, R.S. Soares et al. // AIDS. - 2011. - Vol. 25, No 16. - P. 1961-1970.

176. Franco, J.M. CD4+ and CD8+ T lymphocyte regeneration after antiretroviral therapy in HIV-1-infected children and adult patients / J.M. Franco, J.A. Leon-Leal, M. Leal et al. // Clin. Exp. Immunol. - 2000. -Vol. 119, No 3. - P. 493-498.

177. Franco, J.M. T-cell repopulation and thymic volume in HIV-1-infected adult patients after highly active antiretroviral therapy / J.M. Franco, A. Rubio, M. Martinez-Moya et al. // Blood. - 2002. - Vol. 99, No 10. - P. 3702-3706.

178. Frese, M. Interferon-gamma inhibits replication of subgenomic and genomic hepatitis C virus RNAs / M. Frese, V. Schwarzle, K. Barth et al. // Hepatology. - 2002. - Vol. 35, No 3. - P. 694-703.

179. Friedman, S.L. Hepatic stellate cells: protean, multifunctional, and enigmatic cells of the liver / S.L. Friedman // Physiol. Rev. - 2008. - Vol. 88, No 1. - P. 125-172.

180. Frings, W. Only the soluble form of the scavenger receptor CD163 acts inhibitory on phorbol ester-activated T-lymphocytes, whereas membrane-bound protein has no effect / W. Frings, J. Dreier, C. Sorg // FEBS Lett. -2002. - Vol. 526, No 1-3. - P. 93-96.

181. Fry, T.J. A potential role for interleukin-7 in T-cell homeostasis / T.J. Fry, E. Connick, J. Falloon et al. // - 2001. - Vol. 97, No 10. - P. 2983-2990.

182. Fry, T.J. The many faces of IL-7: from lymphopoiesis to peripheral T cell maintenance / T.J. Fry, C.L. Mackall // J. Immunol. - 2005. - Vol. 174, No 11. - P. 6571-6576.

183. Fuchs, D. Increased serum neopterin in patients with HIV-1 infection is correlated with reduced in vitro interleukin-2 production / D. Fuchs, G.M. Shearer, R.N. Boswell et al. // Clin. Exp. Immunol. - 1990. - Vol. 80, No 1. - p. 44-48.

184. Fuertes Marraco, S.A. Inhibitory Receptors Beyond T Cell Exhaustion / S.A. Fuertes Marraco, N.J. Neubert, G. Verdeil, D.E. Speiser // Front. Immunol. - 2015. - Vol. 6, No - P. 310.

185. Funderburg, N. Toll-like receptor ligands induce human T cell activation and death, a model for HIV pathogenesis / N. Funderburg, A.A. Luciano, W. Jiang et al. // PLoS One. - 2008. - Vol. 3. - e1915.

186. Funderburg, N.T. Coagulation and morbidity in treated HIV infection / N.T. Funderburg, M.M. Lederman // Thromb. Res. - 2014. - Vol. 133 Suppl 1, No - P. S21-24.

187. Funderburg, N.T. Increased tissue factor expression on circulating monocytes in chronic HIV infection: relationship to in vivo coagulation and immune activation / N.T. Funderburg, E. Mayne, S.F. Sieg et al. // Blood. - 2010. - Vol. 115, No 2. - P. 161-167.

188. Funderburg, N.T. Shared monocyte subset phenotypes in HIV-1 infection and in uninfected subjects with acute coronary syndrome / N.T. Funderburg, D.A. Zidar, C. Shive et al. // Blood. - 2012. - Vol. 120, No 23. - P. 4599-4608.

189. Gaardbo, J.C. Incomplete immune recovery in HIV infection: mechanisms, relevance for clinical care, and possible solutions / J.C. Gaardbo, H.J. Hartling, J. Gerstoftt, S.D. Nielsen // Clin. Dev. Immunol. - 2012. - Vol. 2012, No - P. 670957.

190. Gandhi, R.T. Effect of baseline- and treatment-related factors on immunologic recovery after initiation of antiretroviral therapy in HIV-1-positive subjects: results from ACTG 384 / R.T. Gandhi, J. Spritzler, E. Chan et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2006. - Vol. 42, No 4. - P. 426-434.

191. Ganusov, V.V. Do most lymphocytes in humans really reside in the gut? / V.V. Ganusov, R.J. De Boer // Trends Immunol. - 2007. - Vol. 28, No 12. - P. 514-518.

192. Garcia-Samaniego, J. Hepatocellular carcinoma in HIV-infected patients with chronic hepatitis C / J. Garcia-Samaniego, M. Rodriguez, J. Berenguer et al. // Am. J. Gastroenterol. - 2001. - Vol. 96, No 1. - P. 179-183.

193. Gattinoni, L. A human memory T cell subset with stem cell-like properties / L. Gattinoni, E. Lugli, Y. Ji et al. // Nat. Med. - 2011. - Vol. 17, No 10. -P. 1290-U1325.

194. Gattinoni, L. T memory stem cells in health and disease / L. Gattinoni, D.E. Speiser, M. Lichterfeld, C. Bonini // Nat. Med. - 2017. - Vol. 23, No 1. -P. 18-27.

195. Gaulton, G.N. HIV-1 and the thymus / G.N. Gaulton, J.V. Scobie, M. Rosenzweig // AIDS. - 1997. - Vol. 11, No 4. - P. 403-414.

196. Giorgi, J.V. T-cell subset alterations in HIV-infected homosexual men: NIAID Multicenter AIDS cohort study / J.V. Giorgi, R. Detels // Clin. Immunol. Immunopathol. - 1989. - Vol. 52, No 1. - P. 10-18.

197. Giorgi, J.V. Shorter survival in advanced human immunodeficiency virus type 1 infection is more closely associated with T lymphocyte activation than with plasma virus burden or virus chemokine coreceptor usage / J.V. Giorgi, L.E. Hultin, J.A. Mckeating et al. // J. Infect. Dis. - 1999. - Vol. 179, No 4. - P. 859-870.

198. Gjaerde, L.I. Trends in Incidences and Risk Factors for Hepatocellular Carcinoma and Other Liver Events in HIV and Hepatitis C Virus-coinfected Individuals From 2001 to 2014: A Multicohort Study / L.I. Gjaerde, L. Shepherd, E. Jablonowska et al. // Clin. Infect. Dis. - 2016. -Vol. 63, No 6. - P. 821-829.

199. Glassner, A. Impaired CD4(+) T cell stimulation of NK cell anti-fibrotic activity may contribute to accelerated liver fibrosis progression in

HIV/HCV patients / A. Glassner, M. Eisenhardt, P. Kokordelis et al. // J. Hepatol. - 2013. - Vol. 59, No 3. - P. 427-433.

200. Glässner, A. NK cells from HCV-infected patients effectively induce apoptosis of activated primary human hepatic stellate cells in a TRAIL-, FasL- and NKG2D-dependent manner / A. Glässner, M. Eisenhardt, B. Krämer et al. // Lab. Invest. - 2012. - Vol. 92, No 7. - P. 967-977.

201. Godfried, M.H. Soluble Receptors for Tumor-Necrosis-Factor - a Putative Marker of Disease Progression in Hiv-Infection / M.H. Godfried, T. Vanderpoll, J. Jansen et al. // AIDS. - 1993. - Vol. 7, No 1. - P. 33-36.

202. Godfried, M.H. Soluble Receptors for Tumor-Necrosis-Factor as Predictors of Progression to Aids in Asymptomatic Human-Immunodeficiency-Virus Type-1 Infection / M.H. Godfried, T. Vanderpoll, G.J. Weverling et al. // J. Infect. Dis. - 1994. - Vol. 169, No 4. - P. 739-745.

203. Goeser, F. HIV mono-infection is associated with an impaired anti-hepatitis C virus activity of natural killer cells / F. Goeser, A. Glassner, P. Kokordelis et al. // AIDS. - 2016. - Vol. 30, No 3. - P. 355-363.

204. Goldrath, A.W. Low-affinity ligands for the TCR drive proliferation of mature CD8(+) T cells in lymphopenic hosts / A.W. Goldrath, M.J. Bevan // Immunity. - 1999. - Vol. 11, No 2. - P. 183-190.

205. Gonzalez, S.M. Role of regulatory T cells and inhibitory molecules in the development of immune exhaustion during human immunodeficiency virus type 1 infection / S.M. Gonzalez, W. Zapata, M.T. Rugeles // Viral Immunol. - 2016. - Vol. 29, No 1. - P. 2-10.

206. Gonzalez, V.D. High levels of chronic immune activation in the T-cell compartments of patients coinfected with hepatitis C virus and human immunodeficiency virus type 1 and on highly active antiretroviral therapy are reverted by alpha interferon and ribavirin treatment / V.D. Gonzalez, K. Falconer, K.G. Blom et al. // J. Virol. - 2009. - Vol. 83, No 21. - P. 1140711411.

207. Gootenberg, D.B. HIV-associated changes in the enteric microbial community: potential role in loss of homeostasis and development of systemic inflammation / D.B. Gootenberg, J.M. Paer, J.M. Luevano, D.S. Kwon // Curr. Opin. Infect. Dis. - 2017. - Vol. 30, No 1. - P. 31-43.

208. Gordon, S.N. Disruption of intestinal CD4+ T cell homeostasis is a key marker of systemic CD4+ T cell activation in HIV-infected individuals / S.N. Gordon, B. Cervasi, P. Odorizzi et al. // J. Immunol. - 2010. - Vol. 185, No 9. - P. 5169-5179.

209. Gorochov, G. Perturbation of CD4+ and CD8+ T-cell repertoires during progression to AIDS and regulation of the CD4+ repertoire during antiviral therapy / G. Gorochov, A.U. Neumann, A. Kereveur et al. // - 1998. - Vol. 4, No 2. - P. 215-221.

210. Grabar, S. Clinical outcome of patients with HIV-1 infection according to immunologic and virologic response after 6 months of highly active antiretroviral therapy / S. Grabar, V. Le Moing, C. Goujard et al. // Ann. Intern. Med. - 2000. - Vol. 133, No 6. - P. 401-410.

211. Grabmeier-Pfistershammer, K. Identification of PD-1 as a unique marker for failing immune reconstitution in HIV-1-infected patients on treatment / K. Grabmeier-Pfistershammer, P. Steinberger, A. Rieger et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2011. - Vol. 56, No 2. - P. 118-124.

212. Graham, C.S. Comparison of HCV-specific intrahepatic CD4+ T cells in HIV/HCV versus HCV /C.S. Graham, M. Curry, Q. He et al. // Hepatology. - 2004. - Vol. 40, No 1. - P. 125-132.

213. Grakoui, A. HCV persistence and immune evasion in the absence of memory T cell help / A. Grakoui, N.H. Shoukry, D.J. Woollard et al. // Science. - 2003. - Vol. 302, No 5645. - P. 659-662.

214. Gray, C.M. Plasma interferon-gamma-inducible protein 10 can be used to predict viral load in HIV-1-infected individuals / C.M. Gray, H.A. Hong, K. Young et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2013. - Vol. 63, No 3. - P. e115-116.

215. Green, D.R. Activation-induced cell death in T cells / D.R. Green, N. Droin, M. Pinkoski // Immunol. Rev. - 2003. - Vol. 193, No - P. 70-81.

216. Greub, G. Clinical progression, survival, and immune recovery during antiretroviral therapy in patients with HIV-1 and hepatitis C virus coinfection: the Swiss HIV Cohort Study / G. Greub, B. Ledergerber, M. Battegay et al. // Lancet. - 2000. - Vol. 356, No 9244. - P. 1800-1805.

217. Greuter, T. Hepatic sinusoids in liver injury, inflammation, and fibrosis: new pathophysiological insights / T. Greuter, V.H. Shah // J. Gastroenterol.

- 2016. - Vol. 51, No 6. - P. 511-519.

218. Groom, J.R. CXCR3 in T cell function / J.R. Groom, A.D. Luster // Exp. Cell. Res. - 2011. - Vol. 317, No 5. - P. 620-631.

219. Grootjans, J. Non-invasive assessment of barrier integrity and function of the human gut / J. Grootjans, G. Thuijls, F. Verdam et al. // World J. Gastrointest. Surg. - 2010. - Vol. 2, No 3. - P. 61-69.

220. Grossman, Z. Pathogenesis of HIV infection: what the virus spares is as important as what it destroys / Z. Grossman, M. Meier-Schellersheim, W.E. Paul, L.J. Picker // Nat. Med. - 2006. - Vol. 12, No 3. - P. 289-295.

221. Grossman, Z. CD4+ T-cell depletion in HIV infection: are we closer to understanding the cause? / Z. Grossman, M. Meier-Schellersheim, A.E. Sousa et al. // Nat. Med. - 2002. - Vol. 8, No 4. - P. 319-323.

222. Guadalupe, M. Severe CD4+ T-cell depletion in gut lymphoid tissue during primary human immunodeficiency virus type 1 infection and substantial delay in restoration following highly active antiretroviral therapy / M. Guadalupe, E. Reay, S. Sankaran et al. // J. Virol. - 2003. - Vol. 77, No 21.

- P. 11708-11717.

223. Guihot, A. Immune reconstitution after a decade of combined antiretroviral therapies for human immunodeficiency virus / A. Guihot, A. Bourgarit, G. Carcelain, B. Autran // Trends Immunol. - 2011. - Vol. 32, No 3. - P. 131137.

224. Guihot, A. Residual immune activation in combined antiretroviral therapy-treated patients with maximally suppressed viremia / A. Guihot, C. Dentone, L. Assoumou et al. // AIDS. - 2016. - Vol. 30, No 2. - P. 327330.

225. Gulick, R.M. Treatment with indinavir, zidovudine, and lamivudine in adults with human immunodeficiency virus infection and prior antiretroviral therapy / R.M. Gulick, J.W. Mellors, D. Havlir et al. // New Engl. J. Med. - 1997. - Vol. 337, No 11. - P. 734-739.

226. Guo, J. Functional linkage of cirrhosis-predictive single nucleotide polymorphisms of Toll-like receptor 4 to hepatic stellate cell responses / J. Guo, J. Loke, F. Zheng et al. // Hepatology. - 2009. - Vol. 49, No 3. - P. 960-968.

227. Haase, A.T. Population biology of HIV-1 infection: viral and CD4+ T cell demographics and dynamics in lymphatic tissues / A.T. Haase // Annu. Rev. Immunol. - 1999. - Vol. 17, No - P. 625-656.

228. Hammer, S.M. A controlled trial of two nucleoside analogues plus indinavir in persons with human immunodeficiency virus infection and CD4 cell counts of 200 per cubic millimeter or less / S.M. Hammer, K.E. Squires, M.D. Hughes et al. // New Engl. J. Med. - 1997. - Vol. 337, No 11. - P. 725-733.

229. Hanson, A. Distinct profile of T cell activation in HIV type 2 compared to HIV type 1 infection: Differential mechanism for immunoprotection / A. Hanson, A.D. Sarr, A. Shea et al. // AIDS Res. Hum. Retrov. - 2005. -Vol. 21, No 9. - P. 791-798.

230. Harris, J.M. Multiparameter evaluation of human thymic function: interpretations and caveats / J.M. Harris, M.D. Hazenberg, J.F. Poulin et al. // Clin. Immunol. - 2005. - Vol. 115, No 2. - P. 138-146.

231. Hartling, H.J. Reduced IL-7R T cell expression and increased plasma sCD127 in late presenting HIV-infected individuals / H.J. Hartling, S.

Jespersen, J.C. Gaardbo et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2016. -Vol., 10.1097/QAI.0000000000001153, No - P.

232. Hasegawa, A. The level of monocyte turnover predicts disease progression in the macaque model of AIDS / A. Hasegawa, H.N. Liu, B.H. Ling et al. // Blood. - 2009. - Vol. 114, No 14. - P. 2917-2925.

233. Hata, H. Distinct contribution of IL-6, TNF-alpha, IL-1, and IL-10 to T cell-mediated spontaneous autoimmune arthritis in mice / H. Hata, N. Sakaguchi, H. Yoshitomi et al. // J. Clin. Invest. - 2004. - Vol. 114, No 4. - P. 582-588.

234. Hattab, S. Soluble biomarkers of immune activation and inflammation in HIV infection: impact of 2 years of effective first-line combination antiretroviral therapy / S. Hattab, M. Guiguet, G. Carcelain et al. // Hiv Med. - 2015. - Vol. 16, No 9. - P. 553-562.

235. Haynes, B.F. Analysis of the adult thymus in reconstitution of T lymphocytes in HIV-1 infection / B.F. Haynes, L.P. Hale, K.J. Weinhold et al. // J. Clin. Invest. - 1999. - Vol. 103, No 4. - P. 453-460.

236. Haynes, B.F. The role of the thymus in immune reconstitution in aging, bone marrow transplantation, and HIV-1 infection / B.F. Haynes, M.L. Markert, G.D. Sempowski et al. // Annu. Rev. Immunol. - 2000. - Vol. 18, No - P. 529-560.

237. Hazenberg, M.D. Thymic output: a bad TREC record / M.D. Hazenberg, J.A. Borghans, R.J. De Boer, F. Miedema // Nat. Immunol. - 2003a. - Vol. 4, No 2. - P. 97-99.

238. Hazenberg, M.D. Increased cell division but not thymic dysfunction rapidly affects the T-cell receptor excision circle content of the naive T cell population in HIV-1 infection / M.D. Hazenberg, S.A. Otto, J.W. Cohen Stuart et al. // Nat. Med. - 2000. - Vol. 6, No 9. - P. 1036-1042.

239. Hazenberg, M.D. Persistent immune activation in HIV-1 infection is associated with progression to AIDS / M.D. Hazenberg, S.A. Otto, B.H. Van Benthem et al. // AIDS. - 2003b. - Vol. 17, No 13. - P. 1881-1888.

240. Hearps, A.C. Aging is associated with chronic innate immune activation and dysregulation of monocyte phenotype and function / A.C. Hearps, G.E. Martin, T.A. Angelovich et al. // Aging Cell. - 2012. - Vol. 11, No 5. - P. 867-875.

241. Hel, Z. Dysregulation of systemic and mucosal humoral responses to microbial and food antigens as a factor contributing to microbial translocation and chronic inflammation in HIV-1 infection / Z. Hel, J. Xu, W.L. Denning et al. // PLoS Pathog. - 2017. - Vol. 13. - e1006087.

242. Hellerstein, M. Directly measured kinetics of circulating T lymphocytes in normal and HIV-1-infected humans / M. Hellerstein, M.B. Hanley, D. Cesar et al. // Nat. Med. - 1999. - Vol. 5, No 1. - P. 83-89.

243. Herbeuval J.P. CD4(+) T-cell death induced by infectious and noninfectious HIV-1: role of type 1 interferon-dependent, TRAEL/DR5-mediated apoptosis / J.P. Herbeuval, J.C. Grivel, A. Boasso et al. // Blood. - 2005. - Vol. 106, No 10. - P. 3524-3531.

244. Hernandez-Gea, V. Pathogenesis of liver fibrosis / V. Hernandez-Gea, S.L. Friedman // Annu. Rev. Pathol. - 2011. - Vol. 6, No - P. 425-456.

245. Hernandez, M.D. HIV/hepatitis C coinfection natural history and disease progression / M.D. Hernandez, K.E. Sherman // Curr. Opin. HIV AIDS. -2011. - Vol. 6, No 6. - P. 478-482.

246. Hernando, V. All-cause mortality in the cohorts of the Spanish AIDS Research Network (RIS) compared with the general population: 1997-2010 / V. Hernando, B. Alejos, S. Monge et al. // BMC Infect. Dis. - 2013. -Vol. 13, No - P. 382.

247. Heron, S.E. HIV infection and compromised mucosal immunity: oral manifestations and systemic inflammation / S.E. Heron, S. Elahi // Front. Immunol. - 2017. - Vol. 8, No - P. 241.

248. Heumann, D. Initial responses to endotoxins and Gram-negative bacteria / D. Heumann, T. Roger // Clin. Chim. Acta. - 2002. - Vol. 323, No 1-2. -P. 59-72.

249. Hiet, M.S. Control of temporal activation of hepatitis C virus-induced interferon response by domain 2 of nonstructural protein 5A / M.S. Hiet, O. Bauhofer, M. Zayas et al. // J. Hepatol. - 2015. - Vol. 63, No 4. - P. 829837.

250. Hintz, K.A. Endotoxin induces rapid metalloproteinase-mediated shedding followed by up-regulation of the monocyte hemoglobin scavenger receptor CD163 / K.A. Hintz, A.J. Rassias, K. et al. // J. Leuk. Biol. - 2002. - Vol. 72, No 4. - P. 711-717.

251. Hiramatsu, M. Cecal ligation and puncture (CLP) induces apoptosis in thymus, spleen, lung, and gut by an endotoxin and TNF-independent pathway / M. Hiramatsu, R.S. Hotchkiss, I.E. Karl, T.G. Buchman // Shock. - 1997. - Vol. 7, No 4. - P. 247-253.

252. Hiraoka, A. Expression of CD163 in the liver of patients with viral hepatitis / A. Hiraoka, N. Horiike, S.M. Akbar et al. // Pathol. Res. Pract. -2005. - Vol. 201, No 5. - P. 379-384.

253. Ho, J.E. The association of CD4+ T-cell counts and cardiovascular risk in treated HIV disease / J.E. Ho, R. Scherzer, F.M. Hecht et al. // AIDS. -2012. - Vol. 26, No 9. - P. 1115-1120.

254. Hober, D. High plasma level of soluble tumor necrosis factor receptor type II (sTNFRII) in asymptomatic HIV-1-infected patients / D. Hober, S. Benyoucef, A.S. Delannoy et al. // Infection. - 1996. - Vol. 24, No 3. - P. 213-217.

255. Hodge, J.N. Decreases in IL-7 levels during antiretroviral treatment of HIV infection suggest a primary mechanism of receptor-mediated clearance / J.N. Hodge, S. Srinivasula, Z. Hu et al. // Blood. - 2011. - Vol. 118, No 12. - P. 3244-3253.

256. Hodowanec, A.C. Characterization of CD4(+) T-cell immune activation and interleukin 10 levels among HIV, hepatitis C virus, and HIV/HCV-coinfected patients / A.C. Hodowanec, K.E. Brady, W. Gao et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2013. - Vol. 64, No 3. - P. 232-240.

257. Hodowanec, A.C. A matched cross-sectional study of the association between circulating tissue factor activity, immune activation and advanced liver fibrosis in hepatitis C infection / A.C. Hodowanec, R.D. Lee, K.E. Brady et al. // BMC Infect. Dis. - 2015. - Vol. 15. - 190.

258. Hoffmann, G. Potential role of immune system activation-associated production of neopterin derivatives in humans / G. Hoffmann, B. Wirleitner, D. Fuchs // Inflamm. Res. - 2003. - Vol. 52, No 8. - P. 313321.

259. Hogg, R. Life expectancy of individuals on combination antiretroviral therapy in high-income countries: a collaborative analysis of 14 cohort studies / R. Hogg, V. Lima, J. Sterne et al. // Lancet. - 2008. - Vol. 372, No 9635. - P. 293-299.

260. Hogger, P. Identification of the integral membrane protein RM3/1 on human monocytes as a glucocorticoid-inducible member of the scavenger receptor cysteine-rich family (CD163) / P. Hogger, J. Dreier, A. Droste et al. // J. Immunol. - 1998. - Vol. 161, No 4. - P. 1883-1890.

261. Hogger, P. Soluble CD163 inhibits phorbol ester-induced lymphocyte proliferation / P. Hogger, C. Sorg // Biochem. Biophys. Res. Commun. -2001. - Vol. 288, No 4. - P. 841-843.

262. Holder, K.A. Hepatitis C virus-infected cells downregulate NKp30 and inhibit ex vivo NK cell functions / K.A. Holder, S.N. Stapleton, M.E. Gallant et al. // J. Immunol. - 2013. - Vol. 191, No 6. - P. 3308-3318.

263. Hoshino, S. HIV-1 Vpr induces TLR4/MyD88-mediated IL-6 production and reactivates viral production from latency / S. Hoshino, M. Konishi, M. Mori et al. // J. Leuk. Biol. - 2010. - Vol. 87, No 6. - P. 1133-1143.

264. Houston, E.G. Jr. Homeostatic signals do not drive post-thymic T cell maturation / E.G. Houston Jr., T.E. Boursalian, P.J. Fink // Cell. Immunol. - 2012. - Vol. 274, No 1-2. - P. 39-45.

265. Houston, E.G. Jr. Recent thymic emigrants are preferentially incorporated only into the depleted T-cell pool / E.G. Houston Jr., L.E. Higdon, P.J. Fink // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. - 2011. - Vol. 108, No 13. - P. 5366-5371.

266. Hu S. HIV-1 coinfection profoundly alters intrahepatic chemokine but not inflammatory cytokine profiles in HCV-infected subjects / S. Hu, M. Ghabril, T. Amet et al. // PLoS One. - 2014. - Vol. 9. - e86964.

267. Hua, W. Central memory CD4 cells are an early indicator of immune reconstitution in HIV/AIDS patients with anti-retroviral treatment / W. Hua, Y. Jiao, H. Zhang et al. // Immunol. Invest. - 2012. - Vol. 41, No 1. -P. 1-14.

268. Huang, A. Cytokine-stimulated GTP cyclohydrolase I expression in endothelial cells requires coordinated activation of nuclear factor-kappaB and Stat1/Stat3 / A. Huang, Y.Y. Zhang, K. Chen et al. // Circ. Res. - 2005. - Vol. 96, No 2. - P. 164-171.

269. Huang, Y.X. The role of a mutant CCR5 allele in HIV-1 transmission and disease progression / Y.X. Huang, W.A. Paxton, S.M. Wolinsky et al. // Nat. Med. - 1996. - Vol. 2, No 11. - P. 1240-1243.

270. Hui, A.Y. Molecular basis of hepatic fibrosis / A.Y. Hui, S.L. Friedman // Expert Rev. Mol. Med. - 2003. - Vol. 5, No 5. - P. 1-23.

271. Hunt, P.W. Relationship between T cell activation and CD4(+) T cell count in HIV-seropositive individuals with undetectable plasma HIV RNA levels in the absence of therapy / P.W. Hunt, J. Brenchley, E. Sinclair et al. // J. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 197, No 1. - P. 126-133.

272. Hunt, P.W. T cell activation is associated with lower CD4+ T cell gains in human immunodeficiency virus-infected patients with sustained viral suppression during antiretroviral therapy / P.W. Hunt, J.N. Martin, E. Sinclair et al. // J. Infect. Dis. - 2003. - Vol. 187, No 10. - P. 1534-1543.

273. Hunt, P.W. Valganciclovir reduces T cell activation in HIV-infected individuals with incomplete CD4(+) T cell recovery on antiretroviral

therapy / P.W. Hunt, J.N. Martin, E. Sinclair et al. // J. Infect. Dis. - 2011. - Vol. 203, No 10. - P. 1474-1483.

274. Hurley, A. Enhanced effector function of CD8+ T cells from healthy controls and HIV-infected patients occurs through thrombin activation of protease-activated receptor 1 / A. Hurley, M. Smith, T. Karpova et al. // J. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 207, No 4. - P. 638-650.

275. Isgro, A. Altered clonogenic capability and stromal cell function characterize bone marrow of HIV-infected subjects with low CD4+ T cell counts despite viral suppression during HAART / A. Isgro, W. Leti, W. De Santis et al. // Clin. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 46, No 12. - P. 1902-1910.

276. Jain, M.K. Acute and chronic immune biomarker changes during interferon/ribavirin treatment in HIV/HCV co-infected patients / M.K. Jain, B. Adams-Huet, D. Terekhova et al. // J. Viral Hepat. - 2015. - Vol. 22, No 1. - P. 25-36.

277. Jalbert, E. IL-1ß enriched monocytes mount massive IL-6 responses to common inflammatory triggers among chronically HIV-1 infected adults on stable anti-retroviral therapy at risk for cardiovascular disease / E. Jalbert, T.Q. Crawford, M.L. D'antoni et al. // PloS One. - 2013. - Vol. 8. -e75500.

278. Jaleco, S. Homeostasis of naive and memory CD4+ T cells: IL-2 and IL-7 differentially regulate the balance between proliferation and Fas-mediated apoptosis / S. Jaleco, L. Swainson, V. Dardalhon et al. // J. Immunol. -2003. - Vol. 171, No 1. - P. 61-68.

279. Janatpour, M.J. Tumor necrosis factor-dependent segmental control of MIG expression by high endothelial venules in inflamed lymph nodes regulates monocyte recruitment / M.J. Janatpour, S. Hudak, M. Sathe et al. // J. Exp. Med. - 2001. - Vol. 194, No 9. - P. 1375-1384.

280. Jansen, J. Inhibition of the Release of Soluble Tumor-Necrosis-Factor Receptors in Experimental Endotoxemia by an Antitumor Necrosis Factor-

Alpha Antibody / J. Jansen, T. Vanderpoll, M. Levi et al. // J. Clin. Immunol. - 1995. - Vol. 15, No 1. - P. 45-50.

281. Jiang, W. Plasma levels of bacterial DNA correlate with immune activation and the magnitude of immune restoration in persons with antiretroviral-treated HIV infection / W. Jiang, M.M. Lederman, P. Hunt et al. // J. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 199, No 8. - P. 1177-1185.

282. Jiang, W. Toll-like receptor 3 ligand attenuates LPS-induced liver injury by down-regulation of toll-like receptor 4 expression on macrophages / W. Jiang, R. Sun, H. Wei, Z. Tian // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. - 2005. -Vol. 102, No 47. - P. 17077-17082.

283. Jirillo, E. The role of the liver in the response to LPS: experimental and clinical findings / E. Jirillo, D. Caccavo, T. Magrone et al. // J. Endotoxin Res. - 2002. - Vol. 8, No 5. - P. 319-327.

284. Jong, E. The hemostatic balance in HIV-infected patients with and without antiretroviral therapy: partial restoration with antiretroviral therapy / E. Jong, S. Louw, J.C.M. Meijers et al. // AIDS Patient Care Stds. - 2009. -Vol. 23, No 12. - P. 1001-1007.

285. Judge, A.D. Interleukin 15 controls both proliferation and survival of a subset of memory-phenotype CD8(+) T cells / A.D. Judge, X.H. Zhang, H. Fujii et al. // J. Exp. Med. - 2002. - Vol. 196, No 7. - P. 935-946.

286. Junge, S. Correlation between recent thymic emigrants and CD31(+) (PECAM-1) CD4(+) T cells in normal individuals during aging and in lymphopenic children / S. Junge, B. Kloeckener-Gruissem, R. Zufferey et al. // Eur. J. Immunol. - 2007. - Vol. 37, No 11. - P. 3270-3280.

287. Kahan, S.M. T cell exhaustion during persistent viral infections / S.M. Kahan, E.J. Wherry, A.J. Zajac // Virology. - 2015. - Vol. 479-480, No -P. 180-193.

288. Kalinkovich, A. Elevated serum levels of soluble tumor necrosis factor receptors (sTNF-R) in patients with HIV-infection / A. Kalinkovich, H.

Engelmann, N. Harpaz et al. // Clin. Exp. Immunol. - 1992. - Vol. 89, No 3. - P. 351-355.

289. Kamat, A. Monocyte activation markers in cerebrospinal fluid associated with impaired neurocognitive testing in advanced HIV infection / A. Kamat, J.L. Lyons, V. Misra et al. // JAIDS. - 2012. - Vol. 60, No 3. - P. 234-243.

290. Kamath, A.T. Dendritic cells and NK cells stimulate bystander T cell activation in response to TLR agonists through secretion of IFN-alpha beta and IFN-gamma / A.T. Kamath, C.E. Sheasby, D.F. Tough // J. Immunol. -2005. - Vol. 174, No 2. - P. 767-776.

291. Kanda, T. Intestinal fatty acid-binding protein is a useful diagnostic marker for mesenteric infarction in humans / T. Kanda, H. Fujii, T. Tani et al. // Gastroenterology. - 1996. - Vol. 110, No 2. - P. 339-343.

292. Kaplan, R.C. Low CD4+ T-cell count as a major atherosclerosis risk factor in HIV-infected women and men / R.C. Kaplan, L.A. Kingsley, S.J. Gange et al. // AIDS. - 2008. - Vol. 22, No 13. - P. 1615-1624.

293. Kared, H. Galectin-9 and IL-21 mediate cross-regulation between Th17 and Treg cells during acute hepatitis C / H. Kared, T. Fabre, N. Bedard et al. // PLoS Pathog. - 2013. - Vol. 9. - e1003422.

294. Katsikis, P.D. Fas Antigen Stimulation Induces Marked Apoptosis of T-Lymphocytes in Human Immunodeficiency Virus-Infected Individuals / P.D. Katsikis, E.S. Wunderlich, C.A. Smith et al. // J. Exp. Med. - 1995. -Vol. 181, No 6. - P. 2029-2036.

295. Kaufmann, G.R. CD4 T-lymphocyte recovery in individuals with advanced HIV-1 infection receiving potent antiretroviral therapy for 4 years: the Swiss HIV Cohort Study / G.R. Kaufmann, L. Perrin, G. Pantaleo et al. // Arch. Intern. Med. - 2003. - Vol. 163, No 18. - P. 2187-2195.

296. Kazankov, K. Soluble CD163, a macrophage activation marker, is independently associated with fibrosis in patients with chronic viral

hepatitis B and C / K. Kazankov, F. Barrera, H.J. Moller et al. // Hepatology. - 2014. - Vol. 60, No 2. - P. 521-530.

297. Keating, S.M. The effect of HIV infection and HAART on inflammatory biomarkers in a population-based cohort of women / S.M. Keating, E.T. Golub, M. Nowicki et al. // AIDS. - 2011. - Vol. 25, No 15. - P. 18231832.

298. Kelesidis, T. Biomarkers of Microbial Translocation and Macrophage Activation: Association With Progression of Subclinical Atherosclerosis in HIV-1 Infection / T. Kelesidis, M.A. Kendall, O.O. Yang et al. // J. Infect. Dis. - 2012. - Vol. 206, No 10. - P. 1558-1567.

299. Kelly, C. Discordant immune response with antiretroviral therapy in HIV-1: A systematic review of clinical outcomes / C. Kelly, K.M. Gaskell, M. Richardson et al. // PLoS One. - 2016. - Vol. 11. - e0156099.

300. Khakoo, S.I. Lymphocyte and macrophage phenotypes in chronic hepatitis C infection. Correlation with disease activity / S.I. Khakoo, P.N. Soni, K. Savage et al. // Am. J. Pathol. - 1997. - Vol. 150, No 3. - P. 963-970.

301. Kieper, W.C. Cutting edge: Recent immune status determines the source of antigens that drive homeostatic T cell expansion / W.C. Kieper, A. Troy, J.T. Burghardt et al. // J. Immunol. - 2005. - Vol. 174, No 6. - P. 31583163.

302. Kilpatrick, R.D. Homeostasis of the naive CD4(+) T cell compartment, during aging / R.D. Kilpatrick, T. Rickabaugh, L.E. Hultin et al. // J. Immunol. - 2008. - Vol. 180, No 3. - P. 1499-1507.

303. Kim, A.Y. Coinfection with HIV-1 and HCV--a one-two punch / A.Y. Kim, R.T. Chung // Gastroenterology. - 2009. - Vol. 137, No 3. - P. 795814.

304. Kimmig, S. Two subsets of naive T helper cells with distinct T cell receptor excision circle content in human adult peripheral blood / S. Kimmig, G.K. Przybylski, C.A. Schmidt et al. // J. Exp. Med. - 2002. - Vol. 195, No 6. -P. 789-794.

305. Kipp, W. Gender differences in antiretroviral treatment outcomes of HIV patients in rural Uganda / W. Kipp, A. Alibhai, L.D. Saunders et al. // AIDS Care. - 2010. - Vol. 22, No 3. - P. 271-278.

306. Kitchens, R.L. Plasma CD14 decreases monocyte responses to LPS by transferring cell-bound LPS to plasma lipoproteins / R.L. Kitchens, P.A. Thompson, S. Viriyakosol et al. // J. Clin. Invest. - 2001. - Vol. 108, No 3.

- P. 485-493.

307. Klatt, N.R. Loss of mucosal CD103+ DCs and IL-17+ and IL-22+ lymphocytes is associated with mucosal damage in SIV infection / N.R. Klatt, J.D. Estes, X. Sun et al. // Mucosal Immunol. - 2012. - Vol. 5, No 6.

- P. 646-657.

308. Klatt, N.R. Microbial translocation, immune activation, and HIV disease / N.R. Klatt, N.T. Funderburg, J.M. Brenchley // Trends Microbiol. - 2013. -Vol. 21, No 1. - P. 6-13.

309. Klenerman, P. T cell responses in hepatitis C: the good, the bad and the unconventional / P. Klenerman, R. Thimme // Gut. - 2012. - Vol. 61, No 8.

- P. 1226-1234.

310. Kohler, S. Life after the thymus: CD31+ and CD31- human naive CD4+ T-cell subsets / S. Kohler, A. Thiel // Blood. - 2009. - Vol. 113, No 4. - P. 769-774.

311. Kohler, S. Post-thymic in vivo proliferation of naive CD4(+) T cells constrains the TCR repertoire in healthy human adults / S. Kohler, U. Wagner, M. Pierer et al. // Eur. J. Immunol. - 2005. - Vol. 35, No 6. - P. 1987-1994.

312. Kong, L. Low-level HIV infection of hepatocytes / L. Kong, W. Cardona Maya, M.E. Moreno-Fernandez et al. // Virol. J. - 2012. - Vol. 9, No - P. 157.

313. Kooij, K.W. Liver fibrosis in HIV-infected individuals on long-term antiretroviral therapy: associated with immune activation,

immunodeficiency and prior use of didanosine / K.W. Kooij, F.W. Wit, R.A. Van Zoest et al. // AIDS. - 2016. - Vol. 30, No 11. - P. 1771-1780.

314. Kopydlowski, K.M. Regulation of macrophage chemokine expression by lipopolysaccharide in vitro and in vivo / K.M. Kopydlowski, C.A. Salkowski, M.J. Cody et al. // - 1999. - Vol. 163, No 3. - P. 1537-1544.

315. Körner, C. Effects of HCV co-infection on apoptosis of CD4+ T-cells in HIV-positive patients / C. Körner, B. Krämer, D. Schulte et al. // Clin. Sci. (Lond.). - 2009. - Vol. 116, No 12. - P. 861-870.

316. Körner, C. Hepatitis C coinfection enhances sensitization of CD4(+) T-cells towards Fas-induced apoptosis in viraemic and HAART-controlled HIV-1-positive patients / C. Körner, F. Tolksdorf, K. Riesner et al. // Antivir. Ther. - 2011. - Vol. 16, No 7. - P. 1047-1055.

317. Kovacs, A. CD8(+) T cell activation in women coinfected with human immunodeficiency virus type 1 and hepatitis C virus / A. Kovacs, L. Al-Harthi, S. Christensen et al. // J. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 197, No 10. - P. 1402-1407.

318. Kovacs, A. Activation of CD8 T Cells Predicts Progression of HIV Infection in Women Coinfected with Hepatitis C Virus / A. Kovacs, R. Karim, W.J. Mack et al. // J. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 201, No 6. - P. 823-834.

319. Kovacs, J.A. Identification of dynamically distinct subpopulations of T lymphocytes that are differentially affected by HIV / J.A. Kovacs, R.A. Lempicki, I.A. Sidorov et al. // J. Exp. Med. - 2001. - Vol. 194, No 12. -P. 1731-1741.

320. Kristiansen, M. Identification of the haemoglobin scavenger receptor / M. Kristiansen, J.H. Graversen, C. Jacobsen et al. // Nature. - 2001. - Vol. 409, No 6817. - P. 198-201.

321. Kuller, L.H. Inflammatory and coagulation biomarkers and mortality in patients with HIV infection / L.H. Kuller, R. Tracy, W. Belloso et al. // PLoS Med. - 2008. - Vol. 5. - e203.

322. Kuri-Cervantes, L. Activation of NK cells is associated with HIV-1 disease progression / L. Kuri-Cervantes, G.S.M. De Oca, S. Avila-Rios et al. // J. Leuk. Biol. - 2014. - Vol. 96, No 1. - P. 7-16.

323. Kozlov, A.P. HIV incidence and factors associated with HIV acquisition among injection drug users in St Petersburg, Russia / A.P. Kozlov, A.V. Shaboltas, O.V. Toussova et al. // AIDS. - 2006. - Vol. 20, No 6. - P. 901906.

324. Lackner, A.A. HIV pathogenesis: the host / A.A. Lackner, M.M. Lederman, B. Rodriguez // Cold Spring Harb Perspect Med. - 2012. - Vol. 2. - a007005.

325. Lanford, R.E. Lack of response to exogenous interferon-alpha in the liver of chimpanzees chronically infected with hepatitis C virus / R.E. Lanford, B. Guerra, C.B. Bigger et al. // Hepatology. - 2007. - Vol. 46, No 4. - P. 999-1008.

326. Lantz, M. Infusion of tumor necrosis factor (TNF) causes an increase in circulating TNF-binding protein in humans / M. Lantz, S. Malik, M.L. Slevin, I. Olsson // Cytokine. - 1990. - Vol. 2, No 6. - P. 402-406.

327. Larbi, A. From "truly naive" to "exhausted senescent" T cells: when markers predict functionality / A. Larbi, T. Fulop // Cytometry A. - 2014. -Vol. 85, No 1. - P. 25-35.

328. Lario, M. Defective thymopoiesis and poor peripheral homeostatic replenishment of T-helper cells cause T-cell lymphopenia in cirrhosis / M. Lario, L. Munoz, M. Ubeda et al. // J. Hepatol. - 2013. - Vol. 59, No 4. -P. 723-730.

329. Larrubia, J.R. The role of CCR5/CXCR3 expressing CD8+ cells in liver damage and viral control during persistent hepatitis C virus infection / J.R. Larrubia, M. Calvino, S. Benito et al. // J. Hepatol. - 2007. - Vol. 47, No 5. - P. 632-641.

330. Laskus, T. The presence of active hepatitis C virus replication in lymphoid tissue in patients coinfected with human immunodeficiency virus type 1 /

T. Laskus, M. Radkowski, L.F. Wang et al. // J. Infect. Dis. - 1998. - Vol. 178, No 4. - P. 1189-1192.

331. Lauer, G.M. Hepatitis C virus infection / G.M. Lauer, B.D. Walker // N. Engl. J. Med. - 2001. - Vol. 345, No 1. - P. 41-52.

332. Laurent-Crawford, A.G. Membrane Expression of Hiv Envelope Glycoproteins Triggers Apoptosis in Cd4 Cells / A.G. Laurent-Crawford, B. Krust, Y. Riviere et al. // AIDS Res. Hum. Retrov. - 1993. - Vol. 9, No 8. - P. 761-773.

333. Law, M. Broadly neutralizing antibodies protect against hepatitis C virus quasispecies challenge / M. Law, T. Maruyama, J. Lewis et al. // Nat. Med. - 2008. - Vol. 14, No 1. - P. 25-27.

334. Le Moing, V. Predictors of long-term increase in CD4(+) cell counts in human immunodeficiency virus-infected patients receiving a protease inhibitor-containing antiretroviral regimen / V. Le Moing, R. Thiebaut, G. Chene et al. // J. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 185, No 4. - P. 471-480.

335. Lech, M. Macrophages and fibrosis: How resident and infiltrating mononuclear phagocytes orchestrate all phases of tissue injury and repair / M. Lech, H.J. Anders // Biochim. Biophys. Acta. - 2013. - Vol. 1832, No 7. - P. 989-997.

336. Lederman, M.M. Immunologic failure despite suppressive antiretroviral therapy is related to activation and turnover of memory CD4 cells / M.M. Lederman, L. Calabrese, N.T. Funderburg et al. // J. Infect. Dis. - 2011. -Vol. 204, No 8. - P. 1217-1226.

337. Lee, S. Interferon-inducible protein 10 (IP-10) is associated with viremia of early HIV-1 infection in Korean patients / S. Lee, Y.S. Chung, C.H. Yoon et al. // J. Med. Virol. - 2015. - Vol. 87, No 5. - P. 782-789.

338. Lee, U.E. Mechanisms of hepatic fibrogenesis / U.E. Lee, S.L. Friedman // Best Pract. Res. Clin. Gastroenterol. - 2011. - Vol. 25, No 2. - P. 195-206.

339. Lelievre, J.D. Initiation of c-ART in HIV-1 Infected Patients Is Associated With a Decrease of the Metabolic Activity of the Thymus Evaluated Using

FDG-PET/Computed Tomography / J.D. Lelievre, G. Melica, E. Itti et al. // Jaids-J Acq Imm Def. - 2012. - Vol. 61, No 1. - P. 56-63.

340. Leon, A. Association of microbial translocation biomarkers with clinical outcome in controllers HIV-infected patients / A. Leon, L. Leal, B. Torres et al. // AIDS. - 2015. - Vol. 29, No 6. - P. 675-681.

341. Letvin, N.L. Preserved CD4+ central memory T cells and survival in vaccinated SIV-challenged monkeys / N.L. Letvin, J.R. Mascola, Y. Sun et al. // Science. - 2006. - Vol. 312, No 5779. - P. 1530-1533.

342. Li, K. Activation of chemokine and inflammatory cytokine response in hepatitis C virus-infected hepatocytes depends on Toll-like receptor 3 sensing of hepatitis C virus double-stranded RNA intermediates / K. Li, N.L. Li, D. Wei et al. // Hepatology. - 2012. - Vol. 55, No 3. - P. 666-675.

343. Li, Q.S. Peak SIV replication in resting memory CD4(+) T cells depletes gut lamina propria CD4(+) T cells / Q.S. Li, L.J. Duan, J.D. Estes et al. // Nature. - 2005. - Vol. 434, No 7037. - P. 1148-1152.

344. Li, T. Induction of IL-6 release from human T cells by PAR-1 and PAR-2 agonists / T. Li, S. He // Immunol. Cell Biol. - 2006. - Vol. 84, No 5. - P. 461-466.

345. Li, T. Reduced thymic output is a major mechanism of immune reconstitution failure in HIV-infected patients after long-term antiretroviral therapy / T. Li, N. Wu, Y. Dai et al. // Clin. Infect. Dis. - 2011. - Vol. 53, No 9. - P. 944-951.

346. Lien, E. Elevated levels of serum-soluble CD14 in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection: Correlation to disease progression and clinical events / E. Lien, P. Aukrust, A. Sundan et al. // Blood. - 1998. - Vol. 92, No 6. - P. 2084-2092.

347. Lin, W. HIV increases HCV replication in a TGF-beta1-dependent manner / W. Lin, E.M. Weinberg, A.W. Tai et al. // Gastroenterology. - 2008. -Vol. 134, No 3. - P. 803-811.

348. Link, A. Fibroblastic reticular cells in lymph nodes regulate the homeostasis of naive T cells / A. Link, T.K. Vogt, S. Favre et al. // Nat. Immunol. - 2007. - Vol. 8, No 11. - P. 1255-1265.

349. Liu, M., Guo S., Hibbert J.M. et al. CXCL10/IP-10 in infectious diseases pathogenesis and potential therapeutic implications / M. Liu, S. Guo, J.M. Hibbert et al. // Cytokine Growth Factor Rev. - 2011. - Vol. 22, No 3. - P. 121-130.

350. Liu, R. Homozygous defect in HIV-1 coreceptor accounts for resistance of some multiply-exposed individuals to HIV-1 infection / R. Liu, W.A. Paxton, S. Choe et al. // Cell. - 1996. - Vol. 86, No 3. - P. 367-377.

351. Liu, Z. CD8(+) T-lymphocyte activation in HIV-1 disease reflects an aspect of pathogenesis distinct from viral burden and immunodeficiency / Z. Liu, W.G. Cumberland, L.E. Hultin et al. // J. Acq. Immun. Def. Synd. -1998. - Vol. 18, No 4. - P. 332-340.

352. Livak, F. T-cell receptor alpha locus V(D)J recombination by-products are abundant in thymocytes and mature T cells / F. Livak, D.G. Schatz // Mol. Cell. Biol. - 1996. - Vol. 16, No 2. - P. 609-618.

353. Loetscher, M. Chemokine receptor specific for IP10 and mig: structure, function, and expression in activated T-lymphocytes / M. Loetscher, B. Gerber, P. Loetscher et al. // J. Exp. Med. - 1996. - Vol. 184, No 3. - P. 963-969.

354. Lok, J.J. Long-term increase in CD4(+) T-cell counts during combination antiretroviral therapy for HIV-1 infection / J.J. Lok, R.J. Bosch, C.A. Benson et al. // AIDS. - 2010. - Vol. 24, No 12. - P. 1867-1876.

355. Longenecker, C.T. Soluble CD14 is independently associated with coronary calcification and extent of subclinical vascular disease in treated HIV infection / C.T. Longenecker, Y. Jiang, C.E. Orringer et al. // AIDS. -2014. - Vol. 28, No 7. - P. 969-977.

356. Lopez, M.L. Expression pattern of protease activated receptors in lymphoid cells / M.L. Lopez, N. Soriano-Sarabia, G. Bruges et al. // Cell. Immunol. -2014. - Vol. 288, No 1-2. - P. 47-52.

357. Lumsden, A.B. Endotoxin levels measured by a chromogenic assay in portal, hepatic and peripheral venous blood in patients with cirrhosis / A.B. Lumsden, J.M. Henderson, M.H. Kutner // Hepatology. - 1988. - Vol. 8, No 2. - P. 232-236.

358. Luster, A.D. Biochemical characterization of a gamma interferon-inducible cytokine (IP-10) / A.D. Luster, J.V. Ravetch // J. Exp. Med. - 1987. - Vol. 166, No 4. - P. 1084-1097.

359. Macal, M. Effective CD4+ T-cell restoration in gut-associated lymphoid tissue of HIV-infected patients is associated with enhanced Th17 cells and polyfunctional HIV-specific T-cell responses / M. Macal, S. Sankaran, T. Chun et al. // Mucosal Immunol. - 2008. - Vol. 1, No - P. 475-488.

360. Macias, J. Fast fibrosis progression between repeated liver biopsies in patients coinfected with human immunodeficiency virus/hepatitis C virus / J. Macias, J. Berenguer, M.A. Japon et al. // Hepatology. - 2009. - Vol. 50, No 4. - P. 1056-1063.

361. Mahnke, Y.D. The who's who of T-cell differentiation: human memory T-cell subsets / Y.D. Mahnke, T.M. Brodie, F. Sallusto et al. // Eur. J. Immunol. - 2013. - Vol. 43, No 11. - P. 2797-2809.

362. Major, M.E. Previously infected and recovered chimpanzees exhibit rapid responses that control hepatitis C virus replication upon rechallenge / M.E. Major, K. Mihalik, M. Puig et al. // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, No 13. - P. 6586-6595.

363. Mandorfer, M. Revisiting liver disease progression in HIV/HCV-coinfected patients: the influence of vitamin D, insulin resistance, immune status, IL28B and PNPLA3 / M. Mandorfer, B.A. Payer, P. Schwabl et al. // Liver Int. - 2015. - Vol. 35, No 3. - P. 876-885.

364. Mandorfer, M. Advances in the management of HIV/HCV coinfection / M. Mandorfer, P. Schwabl, S. Steiner et al. // Hepatol. Int. - 2016. - Vol. 10, No 3. - P. 424-435.

365. Manel, N. A cryptic sensor for HIV-1 activates antiviral innate immunity in dendritic cells / N. Manel, B. Hogstad, Y. Wang et al. // Nature. - 2010. -Vol. 467, No 7312. - P. 214-217.

366. Marandin, A. Loss of primitive hematopoietic progenitors in patients with human immunodeficiency virus infection / A. Marandin, A. Katz, E. Oksenhendler et al. // Blood. - 1996. - Vol. 88, No 12. - P. 4568-4578.

367. Marchetti, G. Microbial translocation is associated with sustained failure in CD4+ T-cell reconstitution in HIV-infected patients on long-term highly active antiretroviral therapy / G. Marchetti, G.M. Bellistri, E. Borghi et al. // AIDS. - 2008. - Vol. 22, No 15. - P. 2035-2038.

368. Marchetti, G. Microbial translocation predicts disease progression of HIV-infected antiretroviral-naive patients with high CD4(+) cell count / G. Marchetti, A. Cozzi-Lepri, E. Merlini et al. // AIDS. - 2011. - Vol. 25, No 11. - P. 1385-1394.

369. Marchetti, G. Immune activation and microbial translocation in liver disease progression in HIV/hepatitis co-infected patients: results from the Icona Foundation study / G. Marchetti, A. Cozzi-Lepri, C. Tincati et al. // BMC Infect. Dis. - 2014. - Vol. 14. - 79.

370. Marchetti, G. Comparative analysis of T-cell turnover and homeostatic parameters in HIV-infected patients with discordant immune-virological responses to HAART / G. Marchetti, A. Gori, A. Casabianca et al. // AIDS. - 2006. - Vol. 20, No 13. - P. 1727-1736.