Структурные изменения молекулы ДНК, индуцированные ее взаимодействием с ионами металлов и металлоорганическими соединениями тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.06, кандидат физико-математических наук Богданов, Алексей Александрович

• Богданов, Алексей Александрович
• кандидат физико-математических наук
• 2004

Оглавление диссертации кандидат физико-математических наук Богданов, Алексей Александрович

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА

СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ О ВЗАИМОДЕЙСТВИИ МОЛЕКУЛЫ ДНК С КООРДИНАЦИОННЫМИ СОЕДИНЕНИЯМИ ПЛАТИНЫ И ДВУХВАЛЕНТНЫМИ ИОНАМИ В РАСТВОРЕ

§1.1 Структура молекулы ДНК.

§1.2 Взаимодействие молекулы ДНК с двухвалентными ионами металлов.

§ 1.3 Взаимодействие молекулы ДНК с координационными соединениями платины.

§1.4 Разветвленные структуры нуклеиновых кислот.

ГЛАВА 2 МЕТОДЫ И МАТЕРИАЛЫ

§ 2.1 Низкоградиентная вискозиметрия.

§ 2.2 Динамическое двойное лучепреломление.

§ 2.3 Атомная силовая микроскопия.

§ 2.4 Динамическое рассеяние света.

§ 2.5 Флуоресцентная микроскопия.

§ 2.6 Спектральные методы.

§2.7 Материалы.

ГЛАВА

СПЕЦИФИКА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С ДНК РАЗЛИЧНЫХ ИЗОМЕРОВ И МОДИФИКАЦИЙ КООРДИНАЦИОННЫХ СОЕДИНЕНИЙ

ПЛАТИНЫ

§ 3.1 Применение методов прямого наблюдения для изучения конформационных изменений молекулы ДНК в результате ее комплексообразования с цис-ДДП и транс-ДДП в растворе.

§ 3.2 Исследование комплексов молекулы ДНК с двуядерными соединениями двухвалентной платины.

ГЛАВА

ИЗУЧЕНИЕ ДИНАМИКИ МИГРАЦИИ ВЕТВЕЙ РАЗВЕТВЛЕННЫХ СТРУКТУР НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

§4.1 Структурные особенности четырехсторонних разветвлений ДНК в присутствии двухвалентных ионов.

§4.2 Динамика поведения и миграции ветвей подвижных четырехсторонних разветвлений ДНК в реальном времени.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структурные изменения молекулы ДНК, индуцированные ее взаимодействием с ионами металлов и металлоорганическими соединениями»

Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) является универсальным носителем генетической информации высших организмов. В настоящее время известно, что механизм действия ряда лекарственных препаратов обусловлен их взаимодействием с молекулой ДНК в клетке. К таким соединениям, например, относятся некоторые противоопухолевые препараты. Наиболее широко используемым в медицинской практике неорганическим противоопухолевым препаратом является цис-дихлордиамминплатина (цис-ДДП). Однако чрезвычайно высокая противоопухолевая активность препарата, обусловленная блокированием процессов деления клетки, сопровождается серьезными побочными эффектами, существенно ограничивающими клиническое использование цис-ДДП. Поиск аналогов цис-ДЦП из числа координационных соединений платины на основе анализа влияния их структурных особенностей на характер взаимодействия с молекулой ДНК, определяющий противоопухолевые свойства препаратов этого класса, является актуальной задачей. Изучение подобных взаимодействий в условиях реальных биологических систем весьма затруднено. Поэтому, несмотря на значительный прогресс, достигнутый в последнее время в понимании механизма действия цис-ДДП, окончательно вопрос о причинах противоопухолевой активности препаратов платины не решен. Проводимые в работе исследования комплексообразования координационных соединений платины с ДНК в модельных системах, представляющих собой водно-солевые растворы, могут служить простым и эффективным способом изучения молекулярных основ терапевтического действия противоопухолевых препаратов этого класса. Результаты, полученные при сравнении модификации ДНК в растворе новыми соединениями платины с результатом действия известных противоопухолевых препаратов и их неактивных аналогов могут быть использованы для первоначального отбора перспективных соединений.

Электростатические взаимодействия играют важную роль в определении конформации молекулы ДНК и оказывают существенное влияние на характер ее взаимодействия с биологически активными лигандами. Хотя некоторые платиновые комплексы не являются электролитами, в результате реакции акватации' они могут приобретать положительный заряд. В связи с этим сравнение конформационных изменений ДНК, обусловленных ее взаимодействием с комплексными ионами платины, с результатом влияния точечных двухвалентных ионов металлов, может дать дополнительную информацию о роли электростатических сил в процессе формирования комплексов. Исследование структурных изменений ДНК, индуцированных присутствием ионов Mn2+, Mg2+ и Zn2+, представляет значительный интерес также в связи с исследованием роли этих ионов в важнейших биологических процессах (репликации, транскрипции и гомологичной генетической рекомбинации). В работе изучается влияние этих ионов на процесс образования и стабильность разветвленных структур нуклеиновых кислот. Интересно отметить, что действие противоопухолевых соединений платины основано именно на подавлении процесса репликации.

Сказанное выше свидетельствует об актуальности темы предлагаемой работы и практической значимости выполненных исследований.

Используемые в работе соединения платины были синтезированы в Санкт-Петербургской химико-фармацевтической академии. В СПбХФА на протяжении многих лет проводятся работы по синтезу новых потенциальных противоопухолевых препаратов на основе платины. В последнее время большой интерес вызывают двуядерные комплексы платины триаминового типа. Они показывают хорошую эффективность в предварительных биологических экспериментах. Важным обстоятельством является возможность их применения после курса лечения цис-ДДП. В работе исследованы комплексы ДНК с рядом новых двуядерных соединений платины, содержащих общий ароматический лиганд.

Целью диссертационной работы является определение конформационных изменений молекулы ДНК при ее взаимодействии с новыми двуядерными и моноядерными координационными соединениями двухвалентной платины, сравнение их действия на уровне модельных систем с результатами, полученными для известных противоопухолевых препаратов и их неактивных аналогов, для изучения влияния структурных особенностей соединений платины и выявления роли определенных атомных групп в процессе формирования биологически значимых комплексов; анализ влияния ионов двухвалентных металлов на структуру и стабильность образующихся при репликации, транскрипции и гомологичной генетической рекомбинации четырехсторонних разветвлений ДНК.

Научная новизна работы состоит в том, что в работе впервые исследуются новые двуядерные соединения двухвалентной платины, содержащие пиразин и цитозин, проводится сравнение их действия с аналогичными моноядерными комплексами. Впервые применяются методы флуоресцентной микроскопии и динамического рассеяния света для определения конформационных изменений молекулы ДНК, вызванных ее взаимодействием с координационными соединениями платины. Впервые используется метод атомной силовой микроскопии в применении к подвижным четырехсторонним разветвлениям ДНК при изучении динамики их поведения в реальном времени.

Результаты работы докладывались и обсуждались на конференциях и симпозиумах: международных конференциях "DNA Conformation, Modification and Recognition in Biomedicine", 2000 (Брно, Чехия); "Фармация в XXI веке: инновации и традиции", 1999 (С.-Петербург); Европейском биофизическом конгрессе, 2000 (Мюнхен, Германия); 2 съезде биофизиков России, 1999 (Москва); VII Международном Черняевском совещании по химии, анализу и технологии платиновых металлов, 2001 (Москва); III Всероссийской Каргинской конференции «Полимеры-2004», 2004 (Москва).

Структура и объем работы. Диссертация состоит из введения, трех глав, заключения и списка цитируемой литературы. Работа изложена на 198 страницах, содержит 96 рисунков, 6 таблиц. Список цитируемой литературы состоит из 258 наименований.

Заключение диссертации по теме «Высокомолекулярные соединения», Богданов, Алексей Александрович

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В диссертации проведено исследование структурных изменений молекулы ДНК, вызванных ее взаимодействием с новыми координационными соединениями платины и ионами металлов. Используемые в работе новые препараты платины являются биологически активными и могут рассматриваться в качестве потенциальных противоопухолевых агентов. В работе выполнен анализ влияния природы общего лиганда, цис- и трансрасположения NH3 групп на характер конформационных изменений ДНК при связывании. Проводится сравнение влияния моно- и биядерных соединений платины с одинаковым ароматическим лигандом на процесс комплексообразования. Исследование разветвленных структур нуклеиновых кислот, выполненное методом атомной силовой микроскопии в режиме реального времени, впервые позволило получить информацию о динамике изменений холидеевских структур и влиянии ионов металлов на их стабильность. В заключение можно сформулировать основные результаты работы:

1. Методы прямого наблюдения (атомная силовая и флуоресцентная микроскопия), а также метод динамического светорассеяния, используемые для подобных систем впервые, позволили зафиксировать уменьшение размеров ДНК при образовании ее комплексов с цис-ДДП и транс-ДДП без изменения формы молекулярного клубка в растворе. Вместе с тем, зафиксировано различие локальных структурных изменений ДНК при комплексообразовании с этими препаратами.

2. Все исследованные в работе двуядерные координационные соединения двухвалентной платины образуют координационную связь с молекулой ДНК по позиции N7 гуанина, при этом наиболее существенные конформационные изменения наблюдаются при связывании ДНК с соединением Ptl, содержащим пиразин.

3. В связывании препаратов PtlO, Ptl 1, Ptl2 с ДНК в растворе участвует только один атом платины из двух, входящих в состав координационного соединения, при этом структурные изменения ДНК при образовании комплексов с PtlO и Ptl 1 имеют много общего с наблюдаемыми при комплексообразовании ДНК с цис-ДДП.

4. Характер комплексообразования соединений платины с ДНК в значительной степени зависит от цис- или транс- расположения лигандов в первой координационной сфере платины, а также от суммарного заряда комплексного иона, вступающего во взаимодействие с макромолекулой.

5. Сопоставление данных, полученных при изучении связывания ДНК в растворе с двуядерным и аналогичным моноядерным координационными соединениями платины цис-конформации, в состав которых входит цитозин, показало, что в обоих случаях реализуется одна координационная связь платины с ДНК, вместе с тем, в эксперименте фиксируется разный характер изменения параметров ДНК. В случае моноядерного препарата его взаимодействие с ДНК осуществляется с участием цитозинового лиганда.

6. Показано, что для неподвижных четырехсторонних разветвлений ДНК в присутствии ионов Mg2+ и Мп2+ преимущественно реализуется антипараллельная Х-структура.

7. Опыт показал, что ионы Mg2+, Мп2+ и Zn сходным образом влияют на структуру подвижных четырехсторонних разветвлений и способствуют формированию Х-структур при используемых в работе концентрациях.

8. Присутствие двухвалентных ионов в растворе понижает скорость миграции точки ветвления подвижных разветвленных структур.

9. Показано, что при наблюдении в реальном времени за динамикой подвижных разветвленных структур в растворах, содержащих ионы Mg2+, происходят спонтанные переходы из цис-конформации в транс- и обратно.

174

Список литературы диссертационного исследования кандидат физико-математических наук Богданов, Алексей Александрович, 2004 год

1. Watson J.D., Crick F.H.C., A structure of deoxyribose nucleic acid.// Nature, 1953, 171,737-738

2. Crick F.H.C., Watson J.D., The complementary structure of deoxyribonucleic acid.// Proc. Roy. Soc. (London), 1954, Ser.A, 223, 80-96

3. Zamenhof S., Brawermann G., Chargaff E., On the desoxypentose nucleic acids from several microorganisms.// Biochim. Biophys. Acta, 1952,9,402-405

4. Leslie A.G.W., Arnott S., Chandrasekaran R., Ratliff R.L. Polymorphism of DNA double helices.//J. Mol Biol., 1980, 143, 49-72

5. Зенгер В., Принципы структурной организации нуклеиновых кислот.// Москва, Мир, 1987

6. Lewitt M., How many base-pair per turn does DNA have in solution and in chromatin? Some theoretical calculations.// Proc. Nat. Acad. Sci., USA, 1978, 75, 640-644

7. Calladine C.R., Mechanism of sequence-dependent stacking of bases in B-DNA.// J. Mol. Biol., 1982,161,343-352

8. Кантор Ч., Шиммел П., Биофизическая химия.// т. 1, Москва, Мир, 1984

9. И. Hoogsteen К., The crystal and molecular structure of a hydrogen-bonded complex between 1-methylthymine and 9-methyladenine.// Acta Crystallogr., 1963,16, 907-916

10. Eichhorn G.L., Inorganic Biochemistry.// Elsevier, Amsterdam, 1973

11. Sissoeff L., Grisvard S., Guille E., Studies on metal ions-DNA interactions: Specific behaviour of reviterative DNA sequensces.// Prog. Biophys. Mol. Biol., 1973,31, 165-199

12. Pezzano H., Podo F., Structure of binary complexes of mono- and polynucleotides with metal ions of the first transition group.// Chem. Rev., 1980, 365-401

13. Mildvan A.S., Loeb L.A., The role of metal ions in the mechanism of DNA and RNA polymerases.// CRC Crit. Rev. Biochem., 1979, 6, 219-244

14. Sissoeff I., Grisvald J., Guite E., Studies on metal ions DNA interactions: specific behaviour of reiterative DNA sequences.// Progr. Biophys. and Mol. Biol., 1976,31(2), 165-199

15. Clement R.M., Sturm J., Daune M.P., Interaction of metallic cations with DNA. VI. Specific binding of Mg2+ and Mn2+.// Biopolymers, 1973, 12(2), 405-421

16. Daune M., Interactions of metal ions with nucleic acids.// Metal Ions in Biol. Syst., N.Y., Marcel Dekker, 1979, 3, 1-43

17. Mathieson A.R., Olayemi I.Y., The interaction of calcium and magnesium ions with deoxyribonucleic acids.//Arch. Biochem. Biophys. 1975, 169(1), 237-243

18. Blagoi Yu.P., Sorokin V.A., Valeev V.A., Magnesium ion effect on the helix-coil transition of DNA.//Biopolymers, 1978, 17(5), 1103-1118

19. Dove W.F., Davidson N., Cation effects on the denaturation of DNA.// J.Mol.Biol., 1962, 5(1), 467-478

20. Record M.T., Effect of Na and Mg ions on the helix-coil transition of DNA.// Biopolymers, 1975, 14(9), 2137-2158

21. Lyons J.W., Kotin L., The effect of magnesium ion on the secondary structure of deoxyribonucleic acid.//J. Am. Chem. Soc., 1965, 87(8), 1781-1785

22. Chang K.Y., Carr Ch.W., The binding of calcium with deoxyribonucleic acid and deoxyribonucleic acid-protein complexes.// Biochim. Biophys. Acta., 1968, 157(1), 127-129

23. Reuben J., Gabbay E.J., Binding of manganese (II) to DNA and the competitive effects of metal ions and organic cations. An electron paramagnetic resonance study.//Biochemistry 1975, 15(6), 1230-1235

24. Eichorn G.L., The effect of metal ions on the structure and function of nucleic acids. // Metal Ions Genet. Inf. Transfer, N.Y., 1981, 1-46

25. Касьяненко H.A., Дьяконова H.E., Фрисман Э.В., Исследование молекулярного механизма взаимодействия ДНК с двухвалентными ионами металлов.//Молек. биология, 1989, 23(4), 835-841

26. Zimer С., Luck G., Triebel Н., Conformation and reactivity of DNA. IV. Base binding ability of transition metal ions to native DNA and effect of helic conformation with specific reference to DNA-Zn(II) complex.// Biopolymers, 1974, 13(2), 425-453

27. Dix D.E., Strauss D.B., DNA helix stability. I. Differential stabilization by counter cations.//Arch. Biochem. Biophys, 1972,152(1), 299-310

28. Hanlon S., Wolf В., Berman S., The conformational sensitivity of DNA to ionic interactions in aqueous solutions. // Metal-ligand interactions in organic chemistry and biochemistry, Dordrecht: Holland D. Reidel Publ., 1977, 1, 77106

29. Воскобойник А.Д., Монаселидзе Д.Р., Исследование плавления ДНК в области инверсии относительной стабильности ГЦ- и АТ-пар.// Молек. Биология, 1975,9(5), 783-789

30. Rosenberg В., Van Camp L., Krigas Т., Inhibition of cell division in escherichia coli by electrolysis products from a platinum electrode.// Nature, 1965, 205, 698-699

31. Rosenberg В., Van Camp L., Trosko J.E., Mansour V.N., Platinum compounds: a new class of potent antitumour agents.// Nature, 1969, 222, 385-386

32. Giaccone, G., Clinical perspectives on platinum resistance.// Drugs, 2000, 59, 917

33. Wong, E., Giandomenico, C.M., Current status of platinum-based antitumor drugs.// Chem. Rev., 1999, 99,2451-2466

34. Weiss, R.B., Christian, M.C., New cisplatin analogs in development: a review.// Drugs, 1993,46,360-377

35. Gale G.R., Morris C.R., Atkins L.M., Smith A.B., Binding of an antitumor platinum compound to cells as influenced by physical factors and pharmacologically active agents.// Cancer Res., 1973,33, 813-818

36. Binks S.P., Dobrota M., Kinetics and mechanism of uptake of platinum-based pharmaceuticals by the rat small intestine.// Biochem. Pharmacol., 1990, 40, 1329-1336

37. Hromas R.A., North J.A., Burns C.P., Decreased cisplatin uptake by resistant L1210 leukemia cells.// Cancer Lett., 1987,32(2), 197-201

38. Mann S.C., Andrews P.A., Howell S.B., Short-term cis-diamminedichloroplatinum(II) accumulation in sensitive and resistant human ovarian carcinoma cells.// Cancer Chemother. Pharmacol., 1990,25,236-240

39. Andrews P.A., Mann S.C., Velury S., Howell S.B., Platinum and other metal coordination compounds in cancer chemotherapy.// Nicolini M. (ed.), Martinus Nijoff Publishing, Boston, 1988, 248-254

40. Witkin E.M., The radiation sensitivity of Escherichia coli B: a hypothesis relating filament formation and prophage induction.// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1967,57, 1275-1279

41. Adler H.I., Hardigree A.A., Postirradiation growth, division, and recovery in bacteria.// Radiat. Res., 1965,25, 92-102

42. Reslova S., The induction of lysogenic strains of Escherichia coli by cis-dichloro-diammineplatinum (II).// Chem. Biol. Interact., 1971, 4(1), 66-70

43. Harder H.C., Rosenberg В., Inhibitory effects of anti-tumor platinum compounds on DNA, RNA and protein syntheses in mammalian cells in virtro.// Int. J. Cancer, 1970, 6(2), 207-216

44. Howie J.A., Gale G.R.// Biochem. Pharmacol., 1970, 19,2757-2762

45. Akaboshi M., Kawai K., Maki H., Akuta K., Ujeno Y., Miyahara Т., The number of platinum atoms binding to DNA, RNA and protein molecules of HeLa cells treated with cisplatin at its mean lethal concentration.// Jpn. J. Cancer Res., 1992, 83(5), 522-526

46. Beck D.J., Brubaker R.R., Effect of cis-platinum(II)diamminodichloride on wild type and deoxyribonucleic acid repair deficient mutants of Escherichia coli.// J. Bacteriology, 1973,116(3), 1247-1252

47. Drobnik J., Urbankova M., Krekulova A., The effect of cis-dichlorodiammineplatinum(II) on Escherichia coli B. The role of fil, exr and her markers.//Mutat. Res., 1973, 17(1), 13-20

48. Markham B.E., Brubaker R.R., Influence of chromosome integrity on Escherichia coli cell division.//J. Bacteriology, 1980, 143(1), 455-462

49. Brouwer J., van de Putte P., Fichtinger-Schepman A.M., Reedijk J., Base-pair substitution hotspots in GAG and GCG nucleotide sequences in Escherichia coli

50. К-12 induced by cis-diamminedichloroplatinum (II).// Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A., 1981,78(11), 7010-7014

51. Beck D.J., Popoff S., Sancar A., Rupp W.D., Reactions of the UVRABC excision nuclease with DNA damaged by diamminedichloroplatinum(II).// Nucl. Acids Res., 1985, 13(20), 7395-7412

52. Fram R.J., Cusick P.S., Wilson J.M., Marinus M.G., Mismatch repair of cis-diamminedichloroplatinum(II)- induced DNA damage.// Mol. Pharmacol., 1985, 28(1), 51-55

53. Popoff S.C., Beck D.J., Rupp W.D., Repair of plasmid DNA damaged in vitro with cis- or trans- diamminedichloroplatinum(II) in Escherichia coli.// Mutat. Res., 1987,183(2), 129-137

54. Eastman A., The formation, isolation and characterization of DNA adducts produced by anticancer platinum complexes.// Pharmacol. Ther., 1987, 34(2), 155-166

55. Bruhn S.L., Toney J.H., Lippard S J., Biological processing of DNA modified by platinum compounds.// In Progress in Inorganic Chemistry: Bioinorganic Chemistry, Lippard S.J. (ed.), John Wiley and Sons Inc., 1990,38,477-516

56. Reedijk J., The relevance of hydrogen bonding in the mechanism of action of platinum antitumor compounds. Inorg. Chim. Acta, 1992,198, 873-881

57. Sip M., Leng M., DNA, cis-platinum and intercalators: Catalytic activity of the DNA double helix.// Nucleic Acids and Molecular Biology, Eckstein F. and Lilley D.MJ. (ed)., Springer Berlin,1993, 7, 1-15

58. Mello J.M., Lippard S.J., Essigman J.E., DNA adducts of cis-diamminedichloroplatinum(II) and its trans isomer inhibit RNA polymerase II differentially in vivo.//Biochemistry, 1995,34(45), 14783-14791

59. Pinto A.L., Lippard S.J., Binding of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum(II) (cisplatin) to DNA.// Biochim. Biophys. Acta, 1985, 780(3), 167-180

60. Zamble D.B., Mu D., Reardon J.T., Sancar A., Lippard S.J., Repair of cisplatin-DNA adducts by the mammalian excision nuclease.// Biochemistry, 1996, 35(31), 10004-10013

61. Fichtinger-Schepman A.M., van der Veer J.L., den Hartog J.H., Lohman P.H.M., Reedijk J., Adducts of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum(II) with DNA: formation, identification, and quantitation.//Biochemistry, 1985, 24(3), 707-713

62. Eastman A., Reevaluation of interaction of cis-dichloro(ethylenediamine)platinum(II) with DNA.// Biochemistry, 1986, 25(13), 3912-3915

63. Roberts J.J., Pascoe J.M., Cross-linking of complementary strands of DNA in mammalian cells by antitumour platinum compounds.// Nature, 1972, 235(5336), 282-284

64. Jamieson E.R., Lippard S.J., Structure, Recognition, and Processing of Cisplatin-DNA Adducts.// Chem. Rev., 1999,99(9), 2467-2498

65. Van de Vaart P.J.M., Belderbos J., de Jong D., Sneeuw K.C.A., Majoor D., Bartelink H., Begg A.C., DNA-adduct levels as a predictor of outcome for NSCLC patients receiving daily cisplatin and radiotherapy.// Int. J. Cancer, 2000, 89, 160-166

66. Brabec V., Chemistry and structural biology of 1,2-interstrand adducts of cisplatin.// Kelland, L.R., Farrell, N.P. (Eds.), Platinumbased Drugs in Cancer Therapy. Humana Press Inc., Totowa, NJ, 2000, 37-61

67. Perez C., Leng M., Malinge J.M., Rearrangement of interstrand cross-links into intrastrand cross-links in cis-diamminedichloroplatinum(II)-modified DNA.// Nucleic Acids Res., 1997,25(4), 896-903

68. Brabec, V., Kleinwachter, V., Butour, J.L., Johnson, N.P., Biophysical studies of the modification of DNA by antitumour platinum coordination complexes.// Biophys. Chem. 1990,35, 129-141

69. Касьяненко H.A., Богданов A.A., Дефрене С. Взаимодействие молекулы ДНК с координационными соединениями платины и кобальта в растворе.// Биофизика, 2002, 47(3), 449

70. Brabec V., Leng М., DNA interstrand cross-links of trans-diamminedichloroplatinum (II) are preferentially formed between guanine and complementary cytosine residues.// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1993, 90, 5345-5349

71. Eastman A., Jennerwein M.M., Nagel D.L., Characterization of bifunctional adducts produced in DNA by trans-diamminedichloroplatinum(II).// Chem. Biol. Interact., 1988, 67(1-2), 71-80

72. Arpalahti J., Mikola M., Mauristo S., Kinetics and mechanism of the complexation of cis-diammindichloroplatinum(II) with the purine nucleoside inosine in aqueous solution.//Inorg. Chem., 1993, 32(15), 3327-3332

73. Bancroft D.P., Lepre C.A., Lippard S.J., Pt-195 NMR kinetic and mechanistic studies of cis- diamminedichloroplatinum and trans-diamminedichloroplatinum (II) binding to DNA.// J. Am. Chem. Soc., 1990,112, 6860-6871

74. Johnson N.P., Hoeschele J.D., Rohn R.O., Kinetic analysis of the in vitro binding of radioactive cis- and trans-dichlorodiammineplatinum(II) to DNA.// Chem. Biol. Interact., 1980, 30(2), 151-169

75. Barnham K.J., Bernens-Price S.J., Frenkiel T.A., Frey U., Sadler P.J., Platination Pathways for Reactions of Cisplatin with GG Single-Stranded and Double-Stranded Decanucleotides.// Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1995, 34(17), 1874-1877

76. Horacek P., Drobnik J., Interaction of cis-dichlorodiammineplatinum (II) with DNA.// Biochim. Biophys. Acta, 1971,254(2), 341-347

77. Bodenner D.L., Dedon P.C., Keng P.C., Borch R.F., Effect of diethyldithiocarbamate on cis-diamminedichloroplatinum(II)-induced cytotoxicity, DNA cross-linking, and gamma-glutamyl transpeptidase inhibition.// Cancer Res., 1986,46(6), 2745-2750

78. Malinge J. M., Leng M., Reactivity of monofunctional cis-platinum adducts as a function of DNA sequence.//Nucleic Acids Res. 1988, 16(15), 7663-7672

79. Eastman A., Barry M.A., Interaction of trans-diamminedichloroplatinum(II) with DNA: formation of monofunctional adducts and their reaction with glutathione.//Biochemistry, 1987, 26(12), 3303-3307

80. Bernal-Mendez E., Boundvillain M., Gonzales-Vilchez F., Leng M., Chemical versatility of transplatin monofunctional adducts within multiple site-specifically platinated DNA.// Biochemistry, 1997,36(24), 7281-7287

81. Reedijk J., Improved understanding in platinium antitumour chemistry.// Chem. Commun., 1996, 7, 801-806

82. Cohen G.L., Bauer W.R., Barton J.K., Lippard S.J., Binding of cis- and trans-dichlorodiammineplatinum(II) to DNA: evidence for unwinding and shortening of the double helix.// Science, 1979,203(4384), 1014-1016

83. Macquet J.P., Butour J.I., Biochimie.//1978, 60,901-914

84. Scovell W.M., Kroos L.R., Cis-diamminedichloroplatinum (II) modification of SV40 DNA occurs preferentially in (G+C) rich regions: implications into the mechanism of action.// Biochem. Biophys. Res. Commun., 1982,108(1), 16-23

85. Maeda Y., Nunomura K., Ohtsubo E., Cis-diamminedichloroplatinum (II) modification of SV40 DNA occurs preferentially in (G+C) rich regions: implications into the mechanism of action.// J. Mol. Biol., 1990,215(2), 321-329

86. Nunomura K., Maeda Y., Ohtsubo E., The interaction of platinum complexes with DNA studied by differential scanning calorimetry.// J. Gen. Appl. Microbiol., 1991, 37, 207-214

87. Kagemoto A., Takagi H., Naruse K., Baba Y., Thermochim. Acta.// 1991, 190, 191-201

88. Sherman S.E., Gibson D., Wang A.H. J., Lippard S.J., X-ray structure of the major adduct of the anticancer drug cisplatin with DNA: cis-Pt(NH3 )2(d(pGpG)).// Science, 1985,230(4724), 412-417

89. Sherman S.E., Gibson D., Wang A.H.J., Lippard S.J., Crystal and Molecular Structure of Сis-(Pt(NH3)2 {d(pGpG)}), the Principal Adduct Formed by Cisdiamminedichloroplatinium(II) with DNA.// J. Am. Chem. Soc., 1988, 110, 7368-7381

90. Takahara P.M., Rosenzweig A.C., Frederick C.A., Lippard S.J., Crystal structure of double-stranded DNA containing the major adduct of the anticancer drug cisplatin.// Nature, 1995, 377(6550), 649-652

91. Takahara P.M., Frederick C.A., Lippard S.J., Crystal structure of the anticancer drug cisplatin bound to duplex DNA.// J.Am. Chem. Soc., 1996, 118, 1230912321

92. Gelasco A., Lippard S.J., NMR solution structure of a DNA dodecamer duplex containing a cis- diammineplatinum(II) d(GpG) intrastrand cross-link, the major adduct of the anticancer drug cisplatin.// Biochemistry, 1998, 37(26), 9230-9239

93. Huang H., Zhu L., Reid B.R., Drobny G.P., Hopkins P.B., Solution structure of a cisplatin-induced DNA interstrand cross-link.// Science, 1995, 270(5243), 1842-1845

94. Paquet F., Perez C., Leng M., Lancelot G., Malinge J.M., NMR solution structure of a DNA decamer containing an interstrand cross-link of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II).// J. Biomol. Struct. Dyn. 1996, 14, 67-77

95. Bellon S.F., Lippard S.J., Bending studies of DNA site-specifically modified by cisplatin, trans- diamminedichloroplatinum(II) and cis-Pt(NH3)2(N3-cytosine)Cl.+.// Biophys. Chem., 1990, 35(2-3), 179-188

96. Bellon S.F., Coleman J.H., Lippard S.J., DNA unwinding produced by site-specific intrastrand cross-links of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum(II).//Biochemistry, 1991, 30(32), 8026-8035

97. Sip M., Schwartz A., Vovelle F., Ptak M., Leng M., Distortions induced in DNA by cis-platinum interstrand adducts.// Biochemistry, 1992,31(9), 2508-2513

98. Malinge J.M., Perez C., Leng M., Base sequence-independent distorsions induced by interstrand cross-links in cis- diamminedichloroplatinum (II)-modified DNA.// Nucl. Acids Res., 1994,22(19), 3834-3839

99. Brabec V., Kasparkova J., Molecular aspects of resistance to antitumor platinum drugs.// Drug Resistance Updates 5,2002, 147-161

100. Kartalou M., Essigmann J.M., Recognition of cisplatin adducts by cellular proteins.// Mut. Res., 2001,478, 1-21

101. Cohen S.M., Lippard S.J., Cisplatin: from DNA damage to cancer chemotherapy.// Prog. Nucl. Acid Res. Mol. Biol., 2001, 67, 93-130

102. Jordan P., Carmo-Fonseca M., Molecular mechanisms involved in cisplatin cytotoxicity.// Cell. Mol. Life Sci. 2000, 57, 1229-1235

103. Kelland L.R., Preclinical perspectives on platinum resistance.// Drugs, 2000, 59, 1-8

104. Johnson S.W., Ferry K.V., Hamilton T.C., Recent insights into platinum drug resistance in cancer.//Drug Resist. Updates 1, 1998,243-254

105. Pinto A.L., Lippard S.J., Sequence-dependent termination of in vitro DNA synthesis by cis- and trans-diamminedichloroplatinum(II).// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1985, 82,4616-4620

106. Sorenson C.M., Eastman A., Mechanism of cis-diamminedichloroplatinum(II)-induced cytotoxicity role of G2 arrest and DNA doublestrand breaks.// Cancer Res., 1988,48,4484-4488

107. Chu G., Cellular responses to cisplatin: the roles of DNA-binding proteins and DNA repair.// J. Biol. Chem., 1994, 269, 787-790

108. Allday M.J., Inman G.J., Crawford D.H., Farrell P.J., DNA damage in human В cells can induce apoptosis, proceeding from Gl/S when p53 is transactivation competent and G2/M when it is transactivation defective.// EMBO J., 1995, 14, 4994-5005

109. Gonzalez V.M., Fuertes M.A., Alonso C., Perez J.M., Is cisplatininduced cell death always produced by apoptosis?// Mol. Pharmacol., 2001, 59, 657-663

110. Lilley D.M.J., Structures of helical junctions in nucleic acids.// Quarterly Reviews of Biophysics, 2000, 33,2, 109-159

111. Lilley D. M. J., Clegg R. M., Diekmann S., Seeman N. C., von Kitzing E., Hagerman P., Nomenclature Committee of the International Union of

112. Biochemistry: A nomenclature of junctions and branchpoints in nucleic acids. Recommendations 1994.// Eur. J. Biochem., 1995,230, 1-2

113. Holliday R., A mechanism for gene conversion in fungi.// Genet. Res., 1964, 5, 282-304

114. Broker T. R., Lehman I. R., Branched DNA molecules: intermediates in T4 recombination.//J. Molec. Biol., 1971, 60, 131-149

115. Sherratt D. J., Wigley D. B. Conserved themes but novel activities in recombinases and topoisomerases. // Cell, 1998, 93, 149-152.

116. Potter H., Dressier D., On the mechanism of genetic recombination: electron microscopic observation of recombination intermediates.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73,3000-3004

117. Potter H., Dressier D. In vitro system from Escherichia coli that catalyses generalised genetic recombination.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1978, 75, 3698-3702

118. Orr-Weaver T.L., Szostak J.W., Rothstein R. J., Yeast transformation : a model system for the study of recombination.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, 78, 6354-6358

119. Schwacha A., Kleckner N., Identification of double Holliday junctions as intermediates in meiotic recombination.// Cell, 1995, 83, 783-791

120. Hoess R., Wierzbicki A., Abremski K., Isolation and characterisation of intermediates in sitespecific recombination.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 84,6840-6844

121. Nunes-Duby S. E., Matsomoto L., Landy A. Site-specific recombination intermediates trapped with suicide substrates.// Cell, 1987, 50, 779-788

122. Kitts P.A., Nash H.A. Homologydependent interactions in phage к site-specific recombination.//Nature, 1987, 329,346-348

123. Jayaram M., Crain K.L., Parsons R.L., Harshey R.M., Holliday junctions in FLP recombination: resolution by step-arrest mutants of FLP protein.// Proc. natn. Acad. Sci. USA, 1988, 85, 7902-7906

124. McCulloch R., Coggins L.W., Colloms S.D., Sherratt D.J. Xer-mediated site-specific recombination at cer generates Holliday junctions in vivo.// EMBO J., 1994, 13, 1844-1855

125. Kemper В., Janz E., Function of gene 49 of bacteriophage T4. 1. Isolation and biochemical characterisation of very fast sedimenting DNA.// J. Virol., 1976,18, 992-999

126. Lee C.S., Davis R.W., Davidson N., A physical study by electron microscopy of the terminally repetitious, circularly permuted DNA from the coliphage particles of Escherichia coli 15.//J. Molec. Biol., 1970,48,1-22

127. Benbow R.M., Zuccarelli A.J., Sinsheimer R.L., Recombinant DNA molecules of bacteriophage фХ174.//Ргос. Natl. Acad. Sci. USA, 1975, 72,235-239

128. Thompson B.J., Camien M.N., Warner R.C., Kinetics of branch migration in doublestranded DNA.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73, 2299-2303

129. Thompson В J., Escarmis C., Parker В., Slater W.C., Doniger J., Tessman I., Warner R.C., Figure-8 cofiguration of dimers of S13 and phiX174 replicative form DNA.// J. Molec. Biol., 1976,91,409-419

130. Lilley D.M.J., Kemper В., Cruciformresolvase interactions in supercoiled DNA.// Cell, 1984,36,413-422

131. Mizuuchi K., Kemper В., Hays J., Weisberg R.A., T4 endonuclease VII cleaves Holliday structures.// Cell, 1982, 29, 357-365

132. Mizuuchi K., Mizuuchi M., Gellert M., Cruciform structures in palindromic DNA are favored by DNA supercoiling.// J. Molec. Biol., 1982,156,229-243

133. Courey A.J., Wang J.C. Cruciform formation in negatively supercoiled DNA may be kinetically forbidden under physiological conditions.// Cell, 1983, 33, 817-829

134. Lilley D.M.J., Hallam L. R., Thermodynamics of the ColEl cruciform. Comparisons between probing and topological experiments using single topoisomers.//J. Molec. Biol., 1984, 180, 179-200

135. Greaves D.R., Patient R.K., Lilley D.M.J. Facile cruciform formation by an (AT) sequence from a Xenopus globin gene.// J. Molec. Biol., 1985,185,461-478

136. Gellert M., Mizuuchi K., O'Dea M.H., Ohmori H., Tomizawa J., DNA gyrase and DNA supercoiling.// Cold Spring Harbor Symp. quant. Biol., 1979, 43, 3540

137. Lilley D.M.J., The inverted repeat as a recognisable structural feature in supercoiled DNA molecules.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1980, 77, 6468-6472

138. Panayotatos N., Wells R.D., Cruciform structures in supercoiled DNA.// Nature, 1981,289, 466-470

139. Giraud-Panis M.J.E., Lilley D.M.J., Near-simultaneous DNA cleavage by the subunits of the junction-resolving enzyme T4 endonuclease VII.// EMBO J., 1997, 16, 2528-2534

140. Kallenbach N. R., Ma R.I., Seeman N.C., An immobile nucleic acid junction constructed from oligonucleotides.//Nature, 1983, 305, 829-831

141. Hsu P.L., Landy A., Resolution of synthetic att-site Holliday structures by the integrase protein of bacteriophage k.//Nature, 1984, 311, 721-726

142. Gough G.W., Lilley D.M.J., DNA bending induced by cruciform formation.// Nature, 1985,313,154-156

143. Duckett D.R., Murchie A.I.H., Lilley D.M.J., The global folding of four-way helical junctions in RNA, including that in U1 snRNA.// Cell, 1995, 83, 10271036

144. Walter F., Murchie A.I.H., Duckett D.R., Lilley D.M.J., Global structure of four-way RNA junctions studied using fluorescence resonance energy transfer.// RNA, 1998,4,719-728

145. Lilley D.M.J., Analysis of the global conformation of branched RNA species by a combined electrophoresis and fluorescence approach.// Method. Enzymol., 2000,317,368-393

146. Altona C., Classification of nucleic acid junctions.// J. Molec. Biol., 1996, 263, 568-581

147. Cooper J. P., Hagerman P.J., Gel electrophoretic analysis of the geometry of a DNA four-way junction.// J. Molec. Biol., 1987, 198, 711-719

148. Duckett D.R., Murchie A.I.H., Diekmann S., von Kitzing E., Kemper В., Lilley D.M.J., The structure of the Holliday junction and its resolution.// Cell, 1988, 55, 79-89

149. Murchie A.I.H., Clegg R.M., von Kitzing E., Duckett D.R., Diekmann S., Lilley D.M.J., Fluorescence energy transfer shows that the four-way DNA junction is a right-handed cross of antiparallel molecules.//Nature, 1989, 341, 763-766

150. Cooper J.P., Hagerman P.J., Geometry of a branched DNA structure in solution.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86, 7336-7340

151. Clegg R.M., Murchie A.I.H., Zechel A., Carlberg C., Diekmann S., Lilley D.M.J., Fluorescence resonance energy transfer analysis of the structure of the four-way DNA junction.// Biochemistry, 1992, 31, 4846-4856

152. Chen J.H., Churchill M.E.A., Tullius T.D., Kallenbach N.R., Seeman N.C., Construction and analysis of monomobile DNA junctions.// Biochemistry, 1988, 27, 6032-6038

153. Sigal N., Alberts В., Genetic recombination: the nature of crossed strand-exchange between two homologous DNA molecules.// J. Molec. Biol., 1972, 71, 789-793

154. Lushnikov A.Y., Bogdanov A., Lyubchenko Y.L., DNA recombination: Holliday junctions dynamics and branch migration. // J. Biol. Chem., 2003, 278(44), 43130-43134

155. Nowakowski J., Shim P.J., Prasad G.S., Stout C.D. Joyce G.F., Crystal structure of an 82 nucleotide RNA-DNA complex formed by the 10-23 DNA enzyme.// Nature Struct. Biol., 1999, 6,151-156

156. Ortiz-Lombardi!a M., Gonzalez A., Erijta R., Aymami J., Azorin F., Coll M., Crystal structure of a DNA Holliday junction.// Nature Struct. Biol., 1999, 6, 913-917

157. Eichman B.F., Vargason J.M., Mooers B.H.M., Ho P.S., The Holliday junction in an inverted repeat DNA sequence: sequence effects on the structure of four-way junctions.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, 97, 3971-3976

158. Shlyakhtenko L.S., Potaman V.N., Sinden R.R., Lyubchenko Y.L., Structure and dynamics of supercoil-stabilized DNA cruciforms.// J. Mol. Biol., 1998, 280(1), 61-72

159. Shlyakhtenko L.S., Hsieh P., Grigoriev M., Potaman V.N., Sinden R.R., Lyubchenko Y.L., A cruciform structural transition provides a molecular switch for chromosome structure and dynamics.// J. Mol. Biol.,2000, 296(5), 11691173

160. Duckett D.R., Murchie A.I.H., Lilley D.M.J., The role of metal ions in the conformation of the four-way junction.// EMBO J., 1990, 9, 583-590

161. Clegg R.M., Murchie A.I.H., Zechel A., Lilley D.M.J., The solution structure of the four-way DNA junction at low salt concentration; a fluorescence resonance energy transfer analysis.// Biophys. J. (1994). 66,99-109

162. Hsieh P., Panyutin I.G., DNA branch migration.// Nucleic Acids Res. and Molec. Biol., Eckstein F., Lilley D.M.J, (eds.), Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, 1995, 9,42-65

163. Radding C.M., Beattie K.L., Holloman W.K., Wiegand R.C., Uptake of homologous single-stranded fragments by superhelical DNA. IV. Branch migration.//J. Molec. Biol., 1977, 116, 825-839

164. Green C., Tibbetts C., Reassociation rate limited displacement of DNA strands by branch migration.//Nucleic Acids Res., 1981, 9, 1905-1918

165. Meselson M., Formation of hybrid DNA by rotary diffusion during genetic recombination.//J. Molec. Biol., 1972, 71, 795-798

166. Thompson B.J., Camien M.N., Warner R.C., Kinetics of branch migration in doublestranded DNA.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73, 2299-2303

167. Warner R.C., Fishel R.A., Wheeler F.C., Branch migration in recombination.// Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 1979, 43, 957-968

168. Gellert M., O'Dea M.H., Mizuuchi K., Slow cruciform transitions in palindromic DNA.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1983, 80, 5545-5549

169. Sinden R.R., Pettijohn D.E., Cruciform transitions in DNA.// J. Biol. Chem., 1984, 259, 6593-6600

170. Panyutin I.G., Hsieh P., Formation of a single base mismatch impedes spontaneous DNA branch migration.// J. Molec. Biol., 1993,230,413-424

171. Panyutin I.G., Hsieh P., The kinetics of spontaneous DNA branch migration.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1994, 91, 2021-2025

172. Panyutin I.G., Biswas I., Hsieh P., A pivotal role for the structure of the Holliday junction in DNA branch migration.//EMBO J., 1995,14, 1819-1826

173. Mulrooney S.B., Fishel R.A., Hejna J. A., Warner R.C., Preparation of Figure 8 and cruciform DNAs and their use in studies of the kinetics of branch migration.// J. Biol. Chem., 1996,271, 9648-9659

174. Johnson R.D., Symington L.S., Crossed stranded DNA structures for investigating the molecular dynamics of the Holliday junction.// J. Molec. Biol., 1993,229,812-820

175. Huggins M., The viscosity of dilute solutions of long chain molecules. IV. Dependence on concentration.// J. Am. Chem. Soc., 1942, 64,11.

176. Цветков B.H., Эскин B.E., Френкель С.Я. Структура макромолекул в растворах//М., Наука, 1964

177. Птицын О.Б., Эйзнер Ю.Е., Гидродинамика растворов полимеров. IV. О влиянии объемных эффектов на рассеяние света и константу трения макромолекул в растворе.// Высокомол. соед., 1959,1(7), 966-977

178. Птицын О.Б., Эйзнер Ю.Е., Гидродинамика растворов полимеров. II. Гидродинамические свойства макромолекул в хороших растворителях.// Журнал Тех. Физ., 1959,29, 1117-1134

179. Yamakawa Н., Fujii М., Intrinsic viscosity of wormlike chains determination of the salt factor.//Macromol., 1974, 7(1), 128-135

180. Цветков B.H., Фрисман Э.В., Геометрическая форма и оптические свойства цепных макромолекул в растворе.// ДАН СССР, 1954,47(4), 647-650

181. Frisman E.V., Tsvetkov V.N., The effects of shape in streaming birefrigence of polymer solutions.//J. Polym. Sci., 1958,30(121), 297-314

182. Peterlin A., Viscosity and streaming birefrigence in the non-linear concentration range of macromolecular solutions.// J. Polym. Sci., 1954, 12, 45-51

183. Фрисман Э.В., Сибилева M.A., Красноперова A.B., Гидродинамические и оптические свойства растворов полимеров в области больших концентраций.//Высокомол. соед., 1959, 1(4), 597-606

184. Цветков В.Н., Жесткоцепные полимерные молекулы.// JI-д, Наука, 1986, 380

185. Фрисман Э.В., Исследование оптического и гидродинамического поведения макромолекул в растворах синтетических и биологических полимеров.// Докт. дисс., Jl-д, 1964

186. Фрисман Э.В., Щагина Л.В., Воробьев В.И., Стеклянный ротационный вискозиметр.//Коллоид, журн., 1965,27(2), 130-134

187. Shlyakhtenko L.S., Potaman V.N., Sinden R.R., Gall A.A., Lyubchenko Y.L., Structure and dynamics of three- way DNA junctions: atomic force microscopy studies.//Nucleic Acids Res., 2000, 28(18), 3472-3477

188. Berne B.J., Pecora R., Dynamic Light Scattering With Applications to Chemistry, Biology, and Physics.// Dover Ed., Mineola, New York, 2000

189. Seils J., Pecora R., Dynamics of a 2311 Base Pair Superhelical DNA in Dilute and Semidilute Solutions.// Macromolecules, 1995,28,661-673

190. Stepanek P., Dynamic Light Scattering: Method and Some Applications.// Ed. by W.Brown, Oxford: Clarendron Press, 1993

191. Веллюз П., Легран M., Грожан М., Оптический круговой дихроизм.// М., Мир, 1969

192. Снатцке Г., Дисперсия оптического вращения и круговой дихроизм в органической химии.// М., Мир, 1970.

193. Кантор Ч., Шиммел П., Биофизическая химия.// М., Мир, 2,1984

194. Спирин А.С., Спектрофотометрическое определение суммарного количества нуклеиновых кислот. // Биохимия,1958, 23(5), 656-662

195. Lyubchenko Y.L., Shlyakhtenko L.S., Potaman V.N., Sinden R.R., Global and Local DNA Structure and Dynamics. Single molecule studies with AFM.// Microscopy and Microanalysis, 2002, 8,170-171

196. Prestayko A.W., Crooke S.T., Carter S., Cisplatin: Current Status and New Development.// K. N. Y.: Acad. Press., 1980, 527

197. Tulub A.A., Stefanov V.E., Cisplatin stops tubulin assembly into microtubules. A new insight into the mechanism of antitumor activity of platinum complexes.// Int. J. of Biol. Macromol., 2001,28, 191-198

198. Kartalou M., Essigmann J.M., Recognition of cisplatin adducts by cellular proteins.// Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 2001,478,1-21

199. Касьяненко H.A., Фрисман, Э.В., Валуева C.B., Сморыго Н.А., Дьяченко С.А., Исследование взаимодействия молекулы ДНК с координационными соединениями двухвалентной платины I. Взаимодействие цис-ДДП с молекулой ДНК.//Молек. биол., 1995,29,345

200. Horacek P., Drobnick J. Interaction of cis-dichlorodiammineplatinum (II) with DNA.//Biochem. Biophys. Acta., 1971,254,341

201. Касьяненко Н.А., Сэльман Х.С.Г., Уверский В.Н., Фрисман Э.В., Исследование влияния ионов магния и марганца на конформацию молекулы ДНК в растворе.// Молек. биол., 1987,20,140-146

202. Kasyanenko N.A., Zanina A.V., Simonenkov A.A., Defrenne S., Nazarova O.V., Panarin E.F., Study of the DNA Packing Caused by Charged Compounds of Different Nature in solution.// Macromol. Symp., 1998,136,25-31

203. Галлямов M.O., Яминский И.В., Нуклеиновые кислоты.// Сканирующая зондовая микроскопия биополимеров, Под ред. Яминского И.В., М.: Научный мир, 1997,25

204. Iwamoto М., Mukundan S.Jr., Marzilli L.G.// J. Am. Chem. Soc., 1994, 116, 6238

205. Chao C.C., Huang S.L., Lee L.Y., Lin-Chao S., Identification of inducible damage-recognition proteins that are overexpressed in HeLa cells resistant to cis-diamminedichloroplatinum (II).// Biochem. J., 1991, 277, 875-878

206. Calsou P., Frit P., Salles В., Repair synthesis by human cell extracts in cisplatin-damaged DNA is preferentially determined by minor adducts.// Nucleic Acids Res. 1992,20(23), 6363-6368

207. Chu G., Cellular responses to cisplatin. //J. Biol. Chem., 1994, 269, 787-790

208. Herman F., Kozelka J., Stoven V., Guittet E., Girault J.P., Huynh-Dinh Т., Igolen J., Lallemand J.Y., Chottard J.C., A d(GpG)-Platinated Decanucleotide Duplex Is Kinked An Extended NMR and Molecular Mechanics Study.// Eur. J. Biochem, 1990,194,119-133

209. Bellon S.F, Coleman J.H, Lippard S.J, DNA unwinding produced by site-specific intrastrand cross-links of the anti-tumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II).// Biochem, 1991, 30, 8026-8035

210. Rampiro J.N.// Biochem. and Biophys. Res. Commun, 1992, 182(1), 201

211. Kuhn W. // Kolloid. Z, 1939, 87, 3

212. Goinga H.T, Pecora R.// Macromol, 1991, 24,6128

213. Newman J, Tracy J, Pecora R.// Macromol, 1994, 27, 6808

214. Стеценко А.И., Преснов М.А., Коновалова A.JL// Успехи химии, 1981, 50, 4, 665-692

215. Преснов М.А., Коновалова A.JL, Горбунова В.А.// Вестн. АН СССР, 1986, № 12,79-89

216. Harrap K.R.// Cancer Chemotherapy, 1983, 1, 171-217

217. Keppler В.К.// New J. Chem., 1990,14, 6(7), 389-403

218. Стеценко А.И., Яковлев К.И., Алексеева Г.М., Коновалова A.JL, Комплексы платины (И) триаминового типа и их противоопухолевые свойства.// Теор. и экспер. химия, 1991, 3,354-361

219. Яцимирский К.Б., Стеценко А.И., Сидорик Е.П.// Докл. АН СССР, 1979, 245,2,385-387

220. Стеценко А.И., Волченкова И.И., Дмитриева Е.С.// Коорд. химия, 1980, 6(9), 1455-1462

221. Beck W., Purucker B.U., Girth MM Naturforsch, 1976, 31, 932-945

222. Mollis S.L., Doran S.L., Amundsen A.R., Stern E.W., Platinum and other metal coordination compounds in cancer chemotherapy.// Proc. Of the 5th Intern. Symp., Padua, Italy, 1987, 538-554

223. Passini A., Zinino F.// Angew. Chem., 1987, 99, 632-641

224. Drobnick J., Platinum and other metal coordination compounds in cancer chemotherapy,.//Proc. Of the 5th Intern. Symp., Padua, Italy, 1987,62-66

225. Грутенко E.B., Николин В.П., Матвиенко M.A.// Докл. АН СССР, 1982, 265(1), 225-228

226. Иванов В.Б., Быстрова Е.М., Ларина Л.П.// Изв. АН СССР, Сер. биол., 1988,5,746-751

227. Hollis S.L., Amundsen A.R., Stern E.W., Platinum triamine antitumour agents.// Eur. Pat. Bull., 1986,44

228. Яковлев К.И., Стеценко А.И., Алексеева Г.М., Имсырова А.Ф., Коновалова A.JL, Камалетдинов Н.С., Глазкова Т.Ю., Новый тип противоопухолевых комплексов платины (2+).// Хим-фарм. журнал, 1991,4,48-50

229. Коновалова A.J1 ^Яковлев К.И., Стеценко А.И., Рожкова Н.Д., Герасимова Г.К., Иванова Т.И., Камалетдинов Н.С., Синдицкий В.П., противоопухолевая активность биядерных катионных комплексов платины (II).//Хим-фарм. журнал, 1994, 1, 17-20

230. Rosenberg В., Some biological effects of platinum compounds. New agents for the control of tumoure.// Plat. Met. Rev., 1971, 15,42-51

231. Lippard S.J., Chemistry and molecular biology of platinum anticancer drugs.// Pure and Appl. Chem., 1987, 59, 731-742

232. Касьяненко H.A., Айа Э.Э.Ф., Богданов A.A., Космотынская Ю.В., Яковлев К.И., Сравнение комплексообразования ДНК с противоопухолевым препаратом цис-ДДП и биядерным соединением двухвалентной платины, содержащим пиразин.//Молек. биол., 2002, 36(4), 1-8

233. Courtois Y., Fromageot P., Gushlbauer W., Protonated polynucleotide structures. III. An optic rotatory dispersion study of the protonation of DNA.// Eur. J. Biochem., 1968, 6,493-501

234. Касьяненко H.A., Бартошевич С.Ф., Фрисман Э.В., Исследование влияния рН среды на конформацию молекулы ДНК.// Молек. биол., 1985, 19, 13861393

235. Reinert К.Е.,Aspects of specific DNA protein interaction; local bending of DNA molecules by in - register binding of the oligopeptide antibiotic distamycin.//Biophys. Chem., 1981, 13,1-14

236. Kasyanenko N., Arikainen N., Frisman E., Investigation of DNA complexes with iron ions in solution.//Biophys. Chem., 1998, 70, 93-100

237. Kasyanenko N.A., Zanina A.V., Nazarova O.V., Panarin E. F., DNA interaction with complex ions in solution.// Langmuir, 1999, 15, 7912-7917

238. Seeman N.C., Kallenbach N.R., DNA branched junctions.//Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1994, 23, 53-86