Структурное исследование О-антигенных полисахаридов отдельных представителей морских грамотрицательных бактерий методом спектроскопии ЯМР тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.10, кандидат наук Кокоулин, Максим Сергеевич

• Кокоулин, Максим Сергеевич
• кандидат наук
• 2014

Оглавление диссертации кандидат наук Кокоулин, Максим Сергеевич

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

1 ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1Л Общая характеристика липополисахаридов

1.2 Структуры О-антигенов морских грамотрицательных бактерий

1.2.1 Класс Gammaproteobacteria

1.2.1.1 Семейство Vibrionaceae

1.2.1.2 Семейство Pseudoalteromonadaceae

1.2.1.3 Семейство Shewanellaceae

1.2.1.4 Семейства Moraxellaceae, Idiomarinaceae, Alteromonadaceae, Oceanospiriüaceae

1.2.2 Класс Flavobacteriia

1.2.3 Класс Alphaproíeobacteria

1.3 Спектроскопия ЯМР в исследовании углеводов

1.3.1 Одномерная спектроскопия ЯМР

1.3.2 Двумерная спектроскопия ЯМР

1.4 Липополисахариды морских грамотрицательных бактерий как антагонисты эндотоксинов

2 РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

2.1 Структурное исследование О-специфического полисахарида Cobetiapacifica КММ 3879т

2.2 Структурное исследование О-специфического полисахарида Cobetia pacifica КММ 3 878

2.3 Структурное исследование О-специфического полисахарида Rheinheimera pacifica КММ 1406т

2.4 Структурное исследование О-специфического полисахарида

т

Idiomarina abyssalis КММ 227

2.5 Структурное исследование О-специфического полисахарида

т

Litorimonas taeanensis G5

2.6 Структурное исследование О-специфического полисахарида Echinicola vietnamensis КММ 6221х

2.7 Цитокин-индуцирующая активность липополисахаридов

3 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

3.1 Приборы и материалы

3.2 Микроорганизмы и условия их культивирования, удаление капсульного материала и обезжиривание бактериальной биомассы

3.3 Выделение липополисахаридов

3.4 Электрофорез в полиакриламидном геле

3.5 Выделение О-специфических полисахаридов

3.6 Компонентный анализ

3.7 Химические методы модификации и расщепления полисахаридов

3.8 Спектроскопия ЯМР

3.9 Цитокин-индуцирующая и цитотоксическая активности

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ

ГЖХ - газожидкостная хроматография

ДСН - додецилсульфат натрия

ИЛ - интерлейкин

КПС - капсульный полисахарид

КССВ - константа спин-спинового взаимодействия

ЛПС - липополисахарид

ЛСБ - липополисахарид-связывающий белок

МС - масс-спектрометрия

ОПС - О-специфический полисахарид

ПААГ - полиакриламидный гель

ФНО - фактор некроза опухоли

ЭПС - экзополисахарид

ЯМР - ядерный магнитный резонанс

ЯЭО - ядерный эффект Оверхаузера

2S,8S-AlaLys - 2-[(8)-1-карбоксиэтил]амино-Ь-лизин (аланинолизин) 2,4НОЗ ,3,4МеРго-5-охо - 2,4-дигидрокси-3,3,4-триметил-5-оксопролин 4eLeg - 5,7-диамино-3,5,7,9-тетрадезокси-В-гли^е/»о-В-/иало-нон-2-улозоновая кислота

6dxylHexN-4-ulo - 2-ацетиламино-2,6-дидезокси-?ссмло-гексоз-4-улоза 6dTal4Ac - 4-0-ацетил-6-дезокси-талоза

8eLeg - 8-0-ацетил-5,7-диамино-3,557,9-тетрадезокси-Ь-277мг/е/70-В-2£гла/стс>-нон-2-

улозоновая кислота

Ас — ацетат

Ala - аланин

Аш - ацетимидат

Ara - арабиноза

Ara4N - 4-амино-4-дезокси-арабиноза

Ara2,3,4N - 2,3,4-триамино-2,3,4-тридезокси-арабиноза

Col - 3,6-дидезокси-Ь-ксш7<э-гексоза (колитоза) COSY - Correlation Spectroscopy

DEPT - Distortionless Enhancement by Polarization Transfer DQF - Double Quantum Filtering Fo — формиат

FucN - 2-амино-2,6-дидезокси-галактоза Fuc3N — 3-амино-3,6-дидезокси-галактоза Fuc4N - 4-амино-4,6-дидезокси-галактоза FucN4N - 2,4-диамино-2,4,6-тридезокси-галактоза Gal - галактоза

GalA - галактуроновая кислота

GalNA - 2-амино-2-дезокси- галактуроновая кислота

GD - Gated Decoupling

Glc - глюкоза

GlcN - 2-амино-2-дезокси-глюкоза

GlcN3N - 2,3-диамино-2,3-Дидезокси-глюкоза

GlcN3NA - 2,3-Диамино-2,3-Дидезокси-глюкуроновая кислота

Gly - глицин

Gro - глицерин

GroN - 2-амино-1,3-пропандиол (2-аминоглицерин) GulN3NA - 2,3-диамино-2,3-ДИДезокси-гулуроновая кислота Н2ВС - Heteronuclear 2 Bond Correlation Hb - гидроксибутират Hep - гептоза

HMBC - Heteronuclear Multiple Bond Correlation HMQC - Heteronuclear Multiple-Quantum Correlation HSQC - Heteronuclear Single-Quantum Coherense IdoA - идуроновая кислота

Kdo - З-дезокси-О-лшнно-октулозоновая кислота

Man - манноза

ManNA - 2-амино-2-дезокси-маннуроновая кислота ManN3NA- 2,3-диамино-2,3-дидезокси-маннуроновая кислота Mai - малонат

МТРА - а-метокси-а-трифторметил-а-фенилацетилхлорид

Neu - 5-амино-3,5-дидезокси-В-2/ш^е/?о-В-г&лак>720-нон-2-улозоновая кислота

NOESY - Nuclear Overhauser Effect Spectroscopy

Pp - пропионат

Pse — 5,7-диамино-3,5,7,9-тетрадезокси-Ь-гли^еро-Ь-лшняо-нон-2-улозоновая

кислота

Руг - пиру ват

QuiN - 2-амино-2,6-дидезокси-глюкоза Qui3N - 3-амино-3,6-дезокси-глюкоза Qui4N - 4-амино-4,6-дидезокси-глюкоза QuiN4N - 2,4-диамино-2,4,6-тридезокси-глюкоза Rha - рамноза

RhaN3N - 2,3-диамино-2,3,6-тридезокси-манноза Rib-ol — рибит

ROESY - Rotating-frame nuclear Overhauser Effect Spectroscopy Ser - серии

She - 2-ацетиламино-2,6-дидезокси-4-С-(3'-карбоксамид-2',2'-дигидроксипропил)-D-галактоза

S-2HOGlt - (8)-2-гидроксиглутаровая кислота Thr - треонин

TOCSY - Total Correlation Spectroscopy

Yer - 3,6-дидезокси-4-С-(1-гидроксиэтил)-В-ксшо-гексоза (иерсиниоза)

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структурное исследование О-антигенных полисахаридов отдельных представителей морских грамотрицательных бактерий методом спектроскопии ЯМР»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы. Химическое изучение биополимеров, образующих поверхность бактериальной клетки, является одной из важнейших проблем современного естествознания, которая состоит в изучении молекулярных основ взаимодействия живых клеток друг с другом и с окружающей средой. Решение этой проблемы представляет не только теоретический интерес, но является также актуальной практической задачей, потому что имеет прямое отношение к познанию таких биологических явлений как иммунитет к инфекционным возбудителям, тканевая несовместимость, злокачественный рост ткани, проникновение вируса в живую клетку и т.д.

Липополисахариды (ЛПС) или эндотоксины являются одними из основных компонентов внешней мембраны клеточной стенки грамотрицательных бактерий и представляют собой специфический класс биополимеров, которые обладают широким спектром биологического действия [1]. Они являются антигенами бактериальной клетки; играют важную роль в определении специфичности каналов, ответственных за транспорт необходимых для роста клетки веществ; защищают ее от летального действия детергентов, ядов, некоторых антибиотиков; являются рецепторами для ряда специфических бактериофагов и бактериоцинов; играют ключевую роль в процессах межклеточного узнавания. Многие патофизиологические проявления грамотрицательных инфекций, в том числе септический шок, ассоциированы с уникальными, эпдотоксическими свойствами этих углеводсодержащих биополимеров [2, 3].

Биологические свойства молекулы ЛПС определяются своеобразной химической структурой составляющих его компонентов: О-специфического полисахарида (ОПС), олигосахарида кора и липида А. Тонкие вариации в структуре О-специфических полисахаридных цепей определяют серологическую специфичность грамотрицательных бактерий и могут использоваться в качестве молекулярной основы при создании внутривидовых классификационных схем микроорганизмов. Липид А является эндотоксическим центром молекулы ЛПС и

отвечает за большинство физиологических и патофизиологический реакций, обусловленных воспалительным процессом, вызванным грамотрицательными микроорганизмами, таких как летальная токсичность, пирогенность, адъювантность, митогенная стимуляция и др.

Несмотря на значительный прогресс в области структурного анализа полисахаридов, антигены грамотрицательных бактерий исследованы крайне неравномерно. Наряду с довольно хорошо изученными полисахаридными антигенами патогенных и условно-патогенных бактерий, существуют менее изученные и совсем неизученные роды микроорганизмов. К последним можно отнести практически все микроорганизмы морского происхождения, хотя по количеству и разнообразию они не уступают наземным формам бактерий.

Микробные ценозы океана, как древнейшие на земле, включают особые, иногда лишь им присущие таксоны микроорганизмов, которые формировались на протяжении длительного периода эволюции. Микроорганизмы, находясь в весьма специфических условиях обитания, таких как открытые воды морей и океанов (низкая температура, высокое гидростатическое давление, соленость, циркуляция водных масс, низкие концентрации органических веществ) или морской шельф (резкие изменения температуры и солености, активное перемешивание, влияние приливных волн, наземных стоков и радиации), отличаются от наземных форм рядом приспособительных особенностей. Прежде всего, это относится к клеточной стенке бактерий, которая играет определяющую роль во взаимодействии микроорганизма с окружающей средой. Кроме того, они способны синтезировать физиологически активные соединения, отличные от тех, которые синтезируют наземные бактерии [4].

Имеющиеся на данный момент в мировой литературе результаты структурных исследований показывают, что клеточные стенки морских грамотрицательных бактерий различных родов и видов продуцируют антигены уникального строения. Эти биополимеры содержат необычные кислые моносахариды, М-ациламино- и 1Ч-ацилдиаминосахара, кетосахара, высшие моносахариды, а также различные заместители неуглеводной природы, как

распространенные в природе, так и не найденные в других источниках [5-8].

Изучение липополисахаридов направлено на решение таких фундаментальных задач, как классификация бактерий, выяснение взаимосвязи между структурой и функцией липополисахаридов, в том числе механизмов иммунного ответа к ним. Структура О-антигенов может служить в качестве одного из хемотаксонамических критериев, позволяющих устанавливать филогенетическое родство и прослеживать пути эволюции микроорганизмов. Знание строения ЛПС имеет важное практическое значение для создания искусственных вакцин и антибактериальных средств, включая препараты, изменяющие чувствительность бактерий к антибиотикам. Особое место в решении этих задач занимают ЛПС морских грамотрицательных бактерий, которые, в отличие от ЛПС наземных бактерий, часто проявляют низкую токсичность и могут быть потенциально активными субстанциями при разработке новых эффективных иммуномодуляторов и лекарственных средств, направленных на предотвращение септического шока [9, 10].

Таким образом, структурные исследования О-антигенов морских грамотрицательных бактерий являются одной из актуальных проблем современной биоорганической химии. Необходимость ее решения стимулирует создание новых эффективных методов, совершенствующих арсенал инструментов структурного анализа сложных углеводов, что позволяет открывать новые биологически важные моносахариды и их производные.

Цели и задачи исследования. Цель исследования: установить строение О-антигенов отдельных представителей ранее неизученных морских грамотрицательных бактерий родов Cobetia, Rheinheimera, Idiomarina (класс Gammaproteobacterid), Litorimonas (класс Alphaproteobacteria) и Echinicola (тип Bacteriodetes) и оценить биологическую активность ЛПС из указанных выше морских микроорганизмов. Для реализации цели в ходе исследования было необходимо решить следующие задачи:

1. Выделить ЛПС из 6 штаммов 5 родов ранее неизученных микроорганизмов: Cobetia pacifica КММ 3879т, С. pacifica КММ 3878, Rheinheimera pacifica

КММ 1406х, Idiomarina abyssalis КММ 227г, Litorimonas taeanensis G5X,

т

Echinicola vietnamensis КММ 6221 .

2. Выделить О-антигенные полисахариды и определить их моносахаридный состав.

3. Установить полную структуру повторяющихся звеньев О-антигенных полисахаридов для всех исследуемых микроорганизмов.

4. Оценить цитотоксическую и цитокин-индуцирующую активности выделенных ЛПС.

Научная новизна и практическая значимость работы. Впервые

выделены и установлены полные структуры ОПС из 6 штаммов 5 родов морских

т

грамотрицательных бактерий: С. pacifica КММ 3879 , С. pacifica КММ 3878, R.

pacifica КММ 1406т, I. abyssalis КММ 227т, L. taeanensis G5 и Е. vietnamensis

т

КММ 62211. Среди них обнаружены три новых сульфатированных ОПС из морских бактерий С. pacifica КММ 3879т, С. pacifica КММ 3878 и I. abyssalis КММ 227х. В составе ОПС С. pacifica КММ 3878 идентифицирован дисульфатированный моносахарид - 2,3-0-дисульфат-Б-галактоза; ОПС I. abyssalis КММ 227 содержит 3-(4-гидроксибутаноил)-амино-3,6-дидезокси-0-глюкозу, сульфатированную по второму положению. Оба производных моносахаридов впервые обнаружены в природе.

ОПС L. taeanensis G5T содержит моносахарид 2-ацетиламино-2,6-дидезокси-Ь-гексоз-4-улозу, впервые обнаруженный в природе, и редкий для бактериальных полисахаридов компонент - (38,58)-3,5-дигидроксигексановую кислоту. Для установления конфигурации асимметрических центров (3S,5S)-3,5-дигидроксигексановой кислоты был применен метод Мошера, который впервые использован в структурной химии углеводов.

Впервые изучена иммуностимулирующая активность ЛПС С. pacifica КММ

3879х, С. pacifica КММ 3878, R. pacifica КММ 1406х, I. abyssalis КММ 227х, L.

т т

taeanensis G5 и Е. vietnamensis КММ 6221 . Установлено, что все исследованные

ЛПС не токсичны в диапазоне концентраций от 0.01 до 100 мкг/мл. Показано, что

ЛПС всех бактерий являются слабыми индукторами провоспалительных

цитокинов, таких как ФНО-а и ИЛ-6 и представляют интерес с точки зрения изучения их антагонистических свойств. В дальнейшем, возможно, они могут быть использованы в качестве потенциально активных субстанций при разработке новых эффективных иммуномодуляторов и лекарственных средств, направленных на предотвращение септического шока.

Апробация работы. Результаты исследований, изложенные в диссертации, представлены на 5-й Балтийской конференции по микробным углеводам (Суздаль, Россия, 2012), 1-м Симпозиуме по морским ферментам и полисахаридам (Нячанг, Вьетнам, 2012), 2-й Всероссийской конференции «Фундаментальная гликобиология» (Саратов, Россия, 2014), 6-м Международном симпозиуме «Химия и химическое образование» (Владивосток, Россия, 2014).

Личный вклад соискателя. Автор лично участвовал в планировании экспериментов, обсуждении полученных результатов, формулировании выводов и подготовке публикаций. Выделение и очистка ЛПС и ОПС, химические анализы, запись и интерпретация ЯМР-спектров проводились автором лично или при его непосредственном участии.

Основные положения диссертации, выносимые на защиту.

т

1. Морские грамотрицательные бактерии С. pacifica КММ 3879 и С. pacifica КММ 3878, (класс Gammaproteobacteria) продуцируют различные по структуре сульфатировагшые ОПС. В составе О-антигенного полисахарида С. pacifica КММ 3878 впервые обнаружен в природе остаток 2,3-0-дисульфат-Б-галактозы, а также остаток 3,4-0-[(8-карбоксиэтиледен)]-Б-галактозы — редкий для бактериальных гликанов компонент.

2. Глубоководные морские грамотрицательные бактерии R. pacifica КММ

т т

1406 и I. abyssalis КММ 227 , (класс Gammaproteobacteria) продуцируют

высокоаминированные кислые О-антигенные полисахариды. В составе ОПС

R. pacifica КММ 1406т одновременно присутствуют D- и L- изомеры 2-

ацетиламино-2-дезокси-галактуроновой кислоты. ОПС I. abyssalis КММ

227 содержит впервые обнаруженный в природе остаток 3-(4-

гидроксибутаноил)-амино-3,6-дидезокси-0-глюкозы, сульфатированный по второму положению.

3. В составе О-антигенного полисахарида морской грамотрицательной

т

бактерии L. taeanensis G5 , (класс Alphaproteobacteriá), впервые идентифицирован остаток 2-ацетиламино-2,6-дидезокси-Ь-гексоз-4-улозы, а также обнаружен редкий моносахарид - 2-ацетиламино-4-[(38,58)-дигидроксигексаноил]-амино-2,4,6-тридезокси-В-глкжоза.

4. ОПС морской бактерии Е. vietnamensis КММ 6221Т, (тип Bacteroidetes), построен из разветвленных тетрасахаридных повторяющихся звеньев, содержащих в своем составе остатки 2-ацетиламино-2-дезокси4)-глюкозы, D-глюкуроновой кислоты, D-галактозы и остаток редкого моносахарида -колитозы.

5. ЛПС С. pacifica КММ 3879х, С. pacifica КММ 3878, R. pacifica КММ 1406х, I. abyssalis КММ 227г, L. taeanensis G5X и Е. vietnamensis КММ 6221х не обладают цитотоксической активностью в диапазоне концентраций от 0.01 до 100 мкг/мл. и являются слабыми индукторами провоспалительных цитокинов, таких как ФНО-а и ИЛ-6.

Публикации. По теме диссертации опубликовано 11 работ, в том числе 4 статьи в зарубежных рецензируемых журналах и 7 тезисов в материалах научных конференций.

1 ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР 1.1 Общая характеристика липополисахаридов

ЛПС представляют собой уникальный класс биополимеров, являющихся специфическими компонентами клеточной оболочки грамотрицательных бактерий. В комплексе с белками и фосфолипидами они располагаются на внешней поверхности наружной мембраны, способствуя сохранению ее целостности и стабильности, и принимают непосредственное участие во взаимодействии бактерий с окружающей средой. ЛПС обладают широким спектром биологических свойств, из которых наибольшее внимание исследователей привлекают токсичность и антигенность, поэтому их часто называют, в зависимости от контекста, бактериальными эндотоксинами или соматическими антигенами [11].

ЛПС грамотрицательных бактерий имеют целый ряд общих особенностей. Молекула полностью достроенного ЛПС (Б-форма) содержит гидрофобную часть, называемую липидом А, к которой через олигосахарид кора присоединяется ОПС, построенный из повторяющихся олигосахаридных звеньев. Такая структура ЛПС характерна для большинства встречающихся в природе диких штаммов бактерий, образующих колонии гладкой формы. Потеря в процессе биосинтеза ОПС приводит к появлению шероховатых колоний, и их ЛПС (Я-форма) содержит только липид А и олигосахарид кора. На поверхности клеточной стенки гладких штаммов бактерий, наряду с молекулами ЛПС 8-формы, присутствуют также и молекулы ЛПС К-формы. Кроме того, часть молекул ЛПС 8-формы имеет О-антиген, который представлен только одним олигосахаридным фрагментом (811-форма). Такого рода гетерогенность имеет биологическое значение, так как благодаря именно этому достигается более плотная упаковка молекул ЛПС на клеточной поверхности, обеспечивая защиту бактериальной клетки от проникновения вредных для ее жизнедеятельности веществ. Еще одной возможной причиной гетерогенности ЛПС является присутствие некоторых компонентов в нестехиометрическом количестве, таких, например, как О-

ацетильные или фосфатные группы или моносахаридные остатки, присоединенные в виде боковых цепей [12, 13].

Липид А является наиболее консервативной частью молекулы ЛПС. У большинства изученных на сегодняшний день бактерий, гидрофильная основа липида А представлена Р-(1—>6)-связанным дисахаридом 2-амино-2-дезокси-0-глюкозы (p-D-GlcN-(l—>6)-a-D-GlcN, диаминогенциобиоза), фосфорилированного в положения 0-1 восстанавливающего остатка a-D-GlcN и 0-4' невосстанавливающего остатка (З-D-GlcN. Первый моносахарид кора - 3-дезокси-D-маино-октул озоновая кислота (Kdo) или его 3-гидроксилированное производное присоединяется к невосстанавливающему остатку (З-D-GlcN в положение О-б'. Один или оба остатка GlcN могут быть заменены 2,3-диамино-2,3-дидезокси-Б-глюкозой (D-GlcN3N) [1-3,12-14]. В литературе также имеется информация о структурах липида А, углеводный остов которых представлен три-, тетра- и пентасахаридами, в составе которых были обнаружены, помимо вышеназванных моносахаридов, D-галактуроновая кислота (D-GalA), D-манноза (D-Man) и гептоза (Hep) [15, 16]. Липофильные свойства липиду А придают остатки жирных кислот, ацилирующие аминогруппы и некоторые гидроксильные группы углеводного остова. Среди кислот, N-ацилирующих моносахариды, наиболеее часто встречаются (К)-3-гидрокси-, 3-оксо- и (К)-3-ацилоксиалкановые кислоты. Еще большее разнообразие наблюдается среди О-ацилирующих кислот: обычно это неразветвленные насыщенные кислоты, реже разветвленные насыщенные или неразветвленные ненасыщенные алкановые кислоты, содержащие от 10 до 22 атомов углерода, а также их (S)-2-okch-, (R)-3-okch- и (R)-3-ацилоксипроизводные. Кроме того, в составе липида А присутствуют «необязательные» компоненты, такие как 4-амино-4-дезокси-Ь-арабиноза (L-Ara4N), D-GlcN, D-Man, D-арабиноза (D-Ara), 2-аминоэтилфосфат и некоторые другие [14-16].

Липид А играет важную роль в организации и функционировании внешней мембраны. Он имеет жесткую конформацию, при которой цепи жирных кислот находятся по одну сторону дисахаридной основы. Эти цепи ориентированны

перпендикулярно внешней мембране клеточной стенки и образуют ее наружный слой, удерживаемый за счет гидрофобных взаимодействий с внутренним фосфолипидным слоем [12].

Липид А ответственен за целый ряд патофизиологических процессов, вызываемых ЛПС в организме млекопитающих, в частности, за его токсические свойства, такие как пирогенность, летальная токсичность, опухолевый некроз, способность вызывать локальную реакцию Шварцмана и эндотоксинную толерантность. Кроме того, липид А обладает адъювантной и митогенной активностями, стимулирует пролиферацию и секрецию иммуноглобулинов, усиливает фагоцитоз, активируя комплемент и макрофаги [2, 3, 12, 14].

Исследования синтетических аналогов липида А показали, что для проявления большинства токсических свойств (летальная токсичность, митогенная и гемолитическая активности, способность вызывать эндотоксинную толерантность) достаточно присутствия диаминогенциобиозы, ацилированной (К)-3-окситетрадекановой кислотой в положения N-2, N-2', 0-3 и 0-3', а фосфатные группы и их «необязательные» заместители не являются необходимыми. Пирогенность и способность вызывать локальную реакцию Шварцмана связаны с негидроксилированными кислотами, О-ацилирующими 3-оксиалкановые кислоты, а антикомплементарная активность в значительной степени зависит от аггрегации липидных молекул. Для проявления максимальной эндотоксической активности важным является наличие дисахаридного углеводного остова, фосфорилированного в положения 0-1 и 0-4' и ацилированного шестью остатками жирных кислот с длиной цепи 12-14 атомов углерода (гексаацилированный липид А) [17].

Кор выполняет роль связующего звена между липидом А и ОПС и представляет собой довольно большой олигосахарид. Образующие кор моносахариды группируются в два участка: гексозный, удаленный от липида А, и внутренний, построенный из гептоз и Кс1о. У многих бактерий внутренний участок кора представлен тетрасахаридом Ь-а-0-Нер-(1—»3)-Ь-а-В-Нер-(1—>5)-[а-Кс1о-(2—>4)]-а-Кс1о, в котором моносахаридные остатки могут быть замещены

другими сахарами, остатками фосфорной кислоты, ацетильными группами, этаноламином или аминокислотами. Некоторые ЛПС включают биосинтетический предшественник Ь,Б-Нер - *0-глгщеро-Т)-манпо-гептозу Нер). Другие могут содержать только БД^-Нер либо не содержать гептоз вообще. Фосфатные группы и этаноламин необязательно присутствуют в стехиометрическом количестве. Внутренняя область кора за счет присутствия Кс1о и фосфатных групп концентрирует на себе отрицательный заряд, что позволяет молекулам ЛПС через двухвалентные катионы и полиамины связываться с другими компонентами наружной мембраны, обеспечивая ее целостность и стабильность. Мутации бактерий, сопровождающиеся снижением содержания фосфатных групп, приводят к потере способности внешней мембраны служить барьером для антибиотиков [18, 19].

Моносахаридный состав внешней области кора более разнообразен, чаще всего она включает такие распространенные сахара как Б-глюкоза (Б-01с), Б-галактоза (Б-Оа1), 2-ацетиламино-2-дезокси-В-глюкоза (В-01сЫАс) а иногда и другие моносахариды. Следует отметить, что разделение кора на две области в соответствии с моносахаридным составом не является абсолютно строгим. Так Ь,В-Нер может входить не только во внутреннюю, но и во внешнюю область кора, и, напротив, во внутренней области обнаруживают, кроме гептоз и Кёо, также и другие моносахариды, например, В-вк, В-Оа1, Ь-рамнозу (Ь-ИЬа), В-С1сМ, Ь-Ага4И, присутствующих в виде боковых ответвлений [18, 19].

Кор ЛПС также играет важную роль в жизнедеятельности бактерий. Наличие кора, представленного хотя бы одним моносахаридом, является необходимым условием жизнеспособности микроорганизма. Оно существенно для проявления некоторых биологических свойств липида А, в частности, митогенности. Это связано с увеличением подвижности углеводородных цепей липида А в присутствии кора, что облегчает принятие ими биологически активной конформации, и стабилизацией этой активной конформации. В Я-мутантных бактериях, у которых О-специфическая полисахаридная цепь ЛПС отсутствует, кор принимает на себя функции соматического антигена. Антитела,

полученные к Ы-штаммам бактерий, специфичны также к соответствующим Б-штаммам благодаря присутствию, как уже говорилось ранее, на поверхности клетки наряду с Б-формами и Я-форм ЛПС [19].

Структурная вариабильность кора, как правило, выше вариабельности липида А, но по сравнению с О-антигеном, эта область ЛПС может рассматриваться как довольно консервативная.

С точки зрения состава и структуры ОПС является наиболее вариабельным компонентом ЛПС. Повторяющиеся звенья ОПС представляют собой линейные или разветвленные олигосахариды, чаще всего включающие от двух до восьми моносахаридов, хотя известны и большие по величине звенья, а также полисахариды с моносахаридным повторяющимся звеном (гомополимеры). Длина полисахаридной цепи может варьироваться от одного повторяющегося звена до 50 и более звеньев.

Моносахаридный состав ОПС чрезвычайно разнообразен. Среди них нейтральные сахара, амино- и диаминосахара, уроновые кислоты, дезокси- и дидезоксисахара, высшие и разветвленные моносахариды, как распространенные в природе, так и не найденные в других источниках. Кроме того, полисахаридные цепи ЛПС часто содержат неуглеводные заместители, присоединенные простой эфирной, сложноэфирной или ацетальной связями по гидроксильным группам и аминогруппам моносахаридов, а также связанные амидной связью с карбоксильной группой уроновых кислот. Природа, последовательность, аномерная конфигурация и тип замещения индивидуальных моносахаридных остатков внутри повторяющейся единицы является характерным и уникальным для каждого ЛПС. В силу разнообразия компонентов и их связей возможно существование большого количества структур О-специфических цепей, что находит свое подтверждение в природе [1, 12, 13, 20, 21].

Полисахаридная цепь ЛПС является носителем иммунологической специфичности бактериальной клетки, иными словами, каждому, серологически отличному от другого, Э-штамму бактерий соответствует О-специфический полисахарид со своей собственной уникальной структурой. Согласно

современным представлениям иммунологические детерминанты (О-факторы) определяются небольшими олигосахаридными фрагментами, в которых выделяется иммунодоминантный моносахарид, обладающий наибольшим сродством к активному центру специфического О-антитела. Благодаря регулярной структуре полисахарида иммунодетерминантные участки многократно повторяются вдоль полимерной цепи, образуя поливалентный антиген. В процессе эволюции происходит изменение состава и структуры О-цепей ЛПС, что приводит к развитию все новых О-специфических активностей на клеточной поверхности бактерий. Необходимые для роста и размножения бактерии липид А и присоединенная к нему зона внутреннего кора оказываются недоступными для узнавания клетками хозяина [1-3, 13].

Химическое строение ОПС имеет большое значение, поскольку именно они играют особо важную роль в процессе взаимодействия, как с вирусом, так и с организмом человека, обуславливая специфичность антигенных и фагоцитарных свойств микроорганизмов. Олигосахаридные детерминанты внутри повторяющихся единиц функционируют как рецепторы для бактериофагов, которые могут разрушать полисахарид посредством индуцированных или связанных с фагом ферментов [2, 3, 13].

Большое разнообразие О-антигенов является результатом генетических вариаций в структуре генных кластеров, участвующих в процессе биосинтеза ОПС, а также за счет различных генов профага, которые вызывают дополнительные изменения, такие как гликозилирование боковыми моносахаридами или О-ацетилирование. При биосинтезе полисахаридов сначала образуется так называемое «биологическое» повторяющееся звено, а затем происходит полимеризация всей цепи. В случае гомогликанов и некоторых гетерогликанов (состоящих из дисахаридных повторяющихся звеньев) возможен альтернативный путь биосинтеза, при котором происходит постепенное наращивание полисахаридной цепи путем переноса отдельных моносахаридных единиц. В последнее время было показано, что во многих гетерогликанах первый моносахарид повторяющегося звена ОПС, который переносится на липидный

носитель, тем самым инициируя биосинтез О-антигена, является производным 2-амино-2-дезоксигексозы или 2-амино-2,6-дидезоксигексозы имеющей Т>-глюко-или Б-гаш/аяо-конфигурацию [20]. Большинство структурных исследований посвящено определению только «химического» повторяющегося звена, которое может совпадать с «биологическим» или отличаться от него в результате циклических перестановок моносахаридных компонентов.

1.2 Структуры О-антигснов морских грамотрицательных бактерий

Грамотрицательные бактерии являются важнейшим компонентом морских экосистем, ареалы их обитания весьма разнообразны и охватывают прибрежные и открытые акватории океанов, глубоководные и гидротермальные впадины, грунты; помимо свободноживущих форм микроорганизмов, некоторые виды бактерий способны колонизировать внешние оболочки и внутренние поверхности морских животных и растений. Отдельные группы микроорганизмов образуют высоко специфические симбиотические взаимосвязи с организмом хозяина [4].

Экстремальные условия морской среды обитания находят свое отражение в устройстве клеточной стенки грамотрицательных бактерий, в частности, в таком ее важном компоненте, как ЛПС. У большинства изученных морских грамотрицательных бактерий сохраняется общая архитектура молекулы ЛПС, т.е., как и в случае наземных микроорганизмов, молекула ЛПС построена из липида А, олигосахарида кора и О-специфической цепи. Отличительной особенностью молекул липида А морских бактерий является их низкая степень ацилирования и фосфорилирования, низкое содержание жирных кислот, характерных для липида А наземных бактерий, присутствие в некоторых случаях разветвленных 3-гидрокси- и ненасыщенных жирных кислот [10]. Немногочисленная информация о структурах олигосахарида кора морских микроорганизмов свидетельствует о том, что они также отличаются от таковых для наземных бактерий. Для них характерны более короткие олигосахаридные цепи с большим суммарным отрицательным зарядом [6, 7].

Общей особенностью большинства О-антигенных полисахаридов морских грамотрицательных бактерий является их кислый характер, присутствие редко встречающихся моносахаридов и их этерифицированных или амидированных производных. Анионный характер ОПС морских бактерий, скорее всего, связан с процессом адаптации к морской окружающей среде, поскольку наличие отрицательно заряженных участков в полисахаридной цепи способствует ионному взаимодействию с катионами двухвалентных металлов. Эти ионные мостики делают более компактной общую упаковку мембраны, обеспечивая тем самым большую устойчивость бактериальной клетки к внешним факторам морской среды [6, 7].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Кокоулин, Максим Сергеевич, 2014 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Wilkinson S.G. Bacterial lipopolysaccharides - themes and variations // Progr. Lipid Res. 1996. V. 35, N 3. P. 283-313.

2. Raetz C.R.H., Whitfield C. Lipopolysaccharide endotoxins // Annu. Rev. Biochem. 2002. V. 71. P. 635-700.

3. Alexander C., Rietschel E.T. Bacterial lipopolysaccharides and innate immunity // J. Endotoxin Res. 2001. V. 7, N 3. P. 167-202.

4. Rothschild L.J., Mancinelli R.L. Life in extreme environments // Nature. 2001. V. 409, N6823. P. 1092-1100.

5. Nazarenko E.L., Komandrova N.A., Gorshkova R.P., Tomshich S.V., Zubkov V.A., Kilcoyne M., Savage A.V. Structures of polysaccharides and oligosaccharides of some Gram-negative marine Proteobacteria II Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N 23. P. 2449-2457.

6. Leone S., Silipo A., Nazarenko E.L., Lanzetta R., Parrilli M., Molinaro A. Molecular structure of endotoxins from gram-negative marine bacteria: An update // Mar. Drugs. 2007. V 5, N3. P. 85-112.

7. Nazarenko E. L., Crawford R. J., Ivanova E. P. The structural diversity of carbohydrate antigens of selected gram-negative marine bacteria // Mar. Drugs. 2011. V. 9, N10. P. 1914-1954.

8. Anwar M.A., Choi S. Gram-negative marine bacteria: Structural features of lipopolysaccharides and their relevance for economically important diseases // Mar. Drugs. 2014. V. 12, N 5. P. 2485-2514.

9. Maaetoft-Udsen K., Vynne N., Heegaard P. M. H., Gram L., Frokiaer H. Pseudoalteromonas strains are potent immunomodulators owing to low-stimulatory LPS // Innate Immun. 2013. V. 19, N 2. P. 160-173.

lO.Solov'eva T.F., Davydova V.N., Krasikova I.N., Yermak I.M. Marine compounds with therapeutic potential in gram-negative sepsis // Mar. Drugs. 2013. V. 11, N 6. P. 2216-2229.

1 l.Westphal O. Bacterial endotoxins // Trans. Colleg. Int. Allergol. 1975. V. 49, N 1. P. 1-43.

12.Erridge C., Bennett-Guerrero E., Poxton I. R. Structure and function of lipopolysaccharides. // Microbes. Infect. 2002. V. 4, N 8. P. 837 - 851.

13.Caroff M., Karibian D. Structure of bacterial lipopolysaccharides // Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N 23. P. 2431-2447.

H.Alexander C., Zahringer U. Chemical structure of lipid A - The primary immunomodulatory center of bacterial lipopolysaccharides // Trends. Glycosci. Glyc. 2001. V. 7, N76. P. 69-86. 15.Hoist O., Molinaro A. Core oligosaccharide and lipid A components of lipopolysaccharides // In: Moran A., Brennan P., Hoist O., von Itszstein M (Eds.) Microbial glycobiology: structures relevance and applications. Elsevier, San Diego. 2009. P. 29-56.

16.Silipo A, Molinaro A. Lipid A Structure // In: Knirel Y.A., Valvano M.A. (Eds.) Bacterial Lipopolysaccharides. SpringerWienNewYork. 2011. P. 1-20.

17.Raetz C.R.H. Bacterial lipopolysaccharides: a remarkable family of bioactive macroamphiphiles // In: Neidhardt F.C., Curtiss R. Ill, Ingraham J.L., Lin E.C.C, Low K.B., Magasanik B., Reznikoff W.S., Riley M., Schaechter M., Umbarger H.E. (Eds.) Escherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology, 2nd ed. Washington, D.C.: ASM Press. 1996. P. 1035-1063.

18.Hoist O. The structures of core regions from enterobacterial lipopolysaccharides - an update // FEMS Microbiol. Lett. 2007. V. 271, N 1. P. 3-11.

19. Frirdich E, Whitfield C. Lipopolysaccharide inner core oligosaccharide structure and outer membrane stability in human pathogens belonging to the Enterobacteriaceae II J. Endotoxin Res. 2005. V. 11, N 3. P. 133-144.

20.Knirel Y.A. Structure of O-Antigens // In: Knirel Y.A., Valvano M.A. (Eds.) Bacterial Lipopolysaccharides. Springer Wien New York. 2011. P. 41-115.

21.Knirel Y.A. O-Specific polysaccharides of Gram-negative bacteria // In: Moran A, Brennan P, Hoist O, von Itzstein M (Eds.) Microbial glycobiology: structures, relevance and applications. Elsevier, Amsterdam. 2009. P. 41-115.

22.Bisharat N., Agmon V., Finkelstein R., Raz R., Ben-Dror G., Lerner L., Soboh S., Colodner R., Cameron D.N., Wykstra D.L., Swerdlow D.L., Farmer III J. J. Clinical, epidemiological, and microbiological features of Vibrio vulnificus biogroup 3 causing outbreaks of wound infection and bacteraemia in Israel // Lancet. 1999. V. 354, N9188. P. 1421-1424.

23.Dalsgaard I., Hoi L., Siebeling R.J., Dalsgaard A. Indole-positive Vibrio vulnificus isolated from disease outbreaks on a Danish eel farm // Dis. Aquat.Org. 1999. V. 26, N 3. P.187-194.

24.Fouz B., Larsen J.L., Amaro C.J. Vibrio vulnificus serovar A: An emerging pathogen in European anguilliculture // Fish Dis. 2006. V. 29, N 5. P. 285-291.

25.Senchenkova S.N., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Esteve C., Alcaide E., Merino S., Tomas J.M. Structure of a polysaccharide from the lipopolysaccharide of Vibrio vulnificus clinical isolate YJ016 containing 2-acetimidoylamino-2-deoxy-L-galacturonic acid// Carbohyd. Res. 2009. V. 344. P. 1009-1013.

26.Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Chizhov A.O., Knirel Y.A., Esteve C., Alcaide E., Merino S., Tomas J.M. Structure of a polysaccharide from the lipopolysaccharides of Vibrio vulnificus strains CECT 5198 and S3-I2-36, which is remarkably similar to the O-polysaccharide of Pseudoalteromonas rubra ATCC 29570 // Carbohyd. Res. 2009. V. 344. P.2005-2009.

27.Kilcoyne M., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Gorshkova R.P., Nazarenko E.L., Ivanova E.P., Gorshkova N.M., Senchenkova S.N., Savage A.V. The structure of the O-polysaccharide of the Pseudoalteromonas rubra ATCC 29570T lipopolysaccharide containing a keto sugar // Carbohydr. Res. 2005. V.340. P. 2369-2375.

28.Knirel Y.A., Senchenkova S.N., Shashkov A.S., Esteve C., Alcaide E., Merino S., Tomas J.M. Structure of a polysaccharide from the lipopolysaccharide of Vibrio vulnificus CECT4602 containing 2-acetamido-2,3,6-trideoxy-3-[(S)- and (R)-3-hydroxybutanoylamino]-L-mannose // Carbohyd. Res. 2009. V. 344. P.479-483.

29.Arbatsky N.P., Shashkov A.S., Toukach F.V., Moll H., Zych K., Knirel Y.A., Zahringer U., Sidorczyk Z. Structure of the O-specific polysaccharide of a serologically separate strain Proteus penneri 2 from a new proposed serogroup 066

// Eur. J. Biochem. 1999. V. 261, N 2. P.392-397.

30.Whittaker D.V., Parolis L.A.S., Parolis H. Structural elucidation of the capsular polysaccharide produced by Escherichia coli 020:K84:H26 // Carbohyd. Res. 1994. V. 262, N2. P.323-334.

31.Smith P.D. // In: A.E. Ellis (Eds.). Fish Vaccination. Academic Press, London. 1988. P. 67-84.

32.Sadovskaya I., Brisson J.R., Khieu N.H., Mutharia L.M., Altman E. Structural characterization of the lipopolysaccharide O-antigen and capsular polysaccharide of Vibrio ordalii serotype 0:2 // Eur. J. Biochem. 1998. V. 253, N 1. P.319-327.

33.Sadovskaya I., Brisson J., Altman E., Mutharia L.M. Structural studies of the lipopolysaccharide O-antigen and capsular polysaccharide of Vibrio anguillarum serotype 0:2 // Carbohyd. Res. 1996. V. 283. P.l 11-127.

34.Kocharova N.A., Perepelov A.V., Zatonsky G.V., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Jansson P., Weintraub A. Structural studies of the O-specific polysaccharide of Vibrio cholerae 08 using solvolysis with triflic acid // Carbohydr. Res. 2001. V. 330, N 1. P.83-92.

35.Wang Z., Vinogradov E.V., Li J., Lund V., Altman E. Structural characterization of the lipopolysaccharide O-antigen from atypical isolate of Vibrio anguillarum strain 1282 // Carbohydr. Res. 2009. V. 344, N 1. P. 1371-1375.

36.Banoub J., Chon F., Hodder H.J. Structural elucidation of the O-specific polysaccharide of the phenol-phase soluble lipopolysaccharide of Vibrio anguillarum II Biochem. Cell Biol. 1987. V. 65. P. 19-26.

37.Eguchi H., Kaya S., Araki Y., Kojima N., Yokota S.I. Structure of the O-polysaccharide chain of the lipopolysaccharide of Vibrio anguillarum V-123 // Carbohydr. Res. 1992. V. 231. P. 159-161.

38. Yokota S.I., Kaya S., Kawamura T., Araki Y., Ito E. The structure of the O-specific chain of lipopolysaccharide from Pseudomonas aeruginosa IID 1008 (ATCC 27584) // J. Biochem. 1986. V. 99. P. 1551-1561.

39.McFall-Ngai M.J., Ruby E.G. Symbiont recognition and subsequent morphogenesis as early events in an animal-bacterial mutualism // Science. 1991. V. 254 P. 1491-

40.Nyholm S.V., Stabb E.V., Ruby E.G., McFall-Ngai MJ. Establishment of an animal-bacterial association. Recruiting symbiotic Vibrios from the environment // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000. V. 97. P. 10231-10235.

41.Post D.M., Yu L., Krasity B.C., Choudhury B., Mandel M.J., Brennan C.A., Ruby E.G., McFall-Ngai M.J., Gibson B.W., Apicella M.A. The O-antigen and core carbohydrate of Vibrio fischeri lipopolysaccharide: Composition and analysis of their role in Euprymna scolopes light organ colonization // J. Biol. Chem. 2012. V. 287, N 11. P. 8515-8530.

42.Holst O. Lipopolysaccharides of Yersinia. An overview // Adv. Exp.Med. Biol. 2003. V. 529. P. 219-228.

43.Zahringer U., Knirel Y.A., Lindner B., Helbig J.H., Sonesson A., Marre R., Rietschel E.Th. The lipopolysaccharide of Legionella pneumophila serogroupl (strain Philadelphia 1) // Prog. Clin. Biol. Res. 1995. V. 392. P. 113-139.

44.Jensen P.R., Fenical W. Strategies for the discovery of secondary metabolites from marine bacteria: ecological perspectives // Annu. Rev. Microbiol. 1994. V. 48. P. 559-584.

45. Holmstrom C., Kjelleberg S. Marine Pseudoalteromonas species are associated with higher organisms and produce biologically active extracellular agents // FEMS Microbiol. Ecology. 1999. V. 30, P. 285-293.

46.Muldoon J., Perepelov A.V., Shashkov A.S., Gorshkova R.P., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Ivanova E.P., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of a colitose-containing O-specific polysaccharide of the marine bacterium Pseudoalteromonas tetraodonis IAM 14160T// Carbohydr. Res. 2001. V. 333, N 1. P. 41-46.

47.Silipo A., Molinaro A., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Lanzetta R., Parrilli M. The O-chain structure from the LPS of marine halophilic bacterium Pseudoalteromonas carrageenovora-type strain IAM 126627 // Carbohydr Res. 2005. V. 340. 2693-2697. 48.Knirel Y.A., Senchenkova S.N., Jansson P.-E., Weintraub A., Ansaruzzaman M., Albert M.J. Structure of the O-specific polysaccharide of an Aeromonas trota strain

cross-reactive with Vibrio cholerae 0139 Bengal // Eur. J. Biochem. 1996. V. 238. P. 160-165.

49.Knirel Y.A., Paredes L., Jansson P.-E., Weintraub A., Widmalm G., Albert M.J. Structure of the capsular polysaccharide of Vibrio cholerae 0139 synonym Bengal containing D-galactose-4,6-cyclophosphate // Eur. J. Biochem. 1995. V. 232. P. 391396.

50.Овчинникова О.Г., Рожальски А., Лю Б., Кпирель Ю.А. О-аптигены бактерий рода Providencia: структура, серология, генетика и биосинтез // Биохимия. 2013. Т. 78, N7. Р. 1023-1045.

51.Perepelov A.V., Shashkov A.S., Torgov V.l., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Gorshkova N.M., Widmalm G. Structure of an acidic polysaccharide from the agar-decomposing marine bacterium Pseadoalteromonas atlantica strain IAM 14165 containing 5,7-diacetamido-3,5,7,9-tetradeoxy-L-g/ycero-L-/77a/7/7o-non-2-ulosonic acid // Carbohydr. Res. 2005. V. 340. P. 69-74.

52.Muldoon J., Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Romanenko L.A., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of an acidic polysaccharide

T • "

from a marine bacterium Pseudoalteromonas distincta KMM 638 containing 5-acetamido-3,5,7,9-tetradeoxy-7-formamido-L-glycero-L-manno-nonulosonic acid // Carbohydr. Res. 2001. V. 330, N 2. P. 231-239. 53.Ivanova E.P., Gorshkova N.M., Zhukova N.V., Lysenko A.M., Zelcpuga E.A., Prokofeva N.G., Mikhailov V.V., Nicolau D.V., Christen R.. Characterization of Pseudoalteromonas distincta-like sea water isolates and description of Pseudoalteromonas aliena sp. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. — Vol.54. — P. 1431-1437.

54.Nordmark E.L., Perepelov A.V., Shashkov A.S., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Widmalm G. Structure of an acidic polysaccharide from the marine bacterium Pseudoalteromonas aliena type strain KMM 3562T containing two residues of L-serine in the repeating unit // Carbohydr. Res. 2005. V. 340, N 8. P.1483-1487.

55.0vchinnikova O.G., Kocharova N.A., Parkhomchuk A.A., Bialczalc-Kokot M.,

Shashkov A.S., Knirel Y.A., Rozalski A. Structure of the O-polysaccharide from the lipopolysaccharide of Providencia alcalifaciens 060 // Carbohydr. Res. 2011. V. 346, N2. P. 377-380.

56.Dengler Т., Jann В., Jann K. Structure of the serine-containing capsular polysaccharide K40 antigen from Escherichia coli 08:K40:H9 // Carbohydr. Res. 1986. V.150. P. 233-240.

57.Jann В., Kochanowski H., Jann K. Structure of the capsular K96 polysaccharide (K96 antigen) from Escherichia coli 077:K96:H- and comparison with the capsular K54 polysaccharide (K54 antigen) from Escherichia coli 06:K54:H10 // Carbohydr. Res. 1994. V.253. P. 323-327.

58.Командрова H.A., Томшич C.B., Шевченко JI.C., Перепелов А.В., Сенченкова С.Н., Шашков А.С., Книрель Ю.А. Структура кислого О-специфического полисахарида морской бактерии Pseudoalteromonas sp. КММ 634 // Биохимия. 2000. Т. 65, № 9. С. 1253-1261.

59.Hanniffy О.М., Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Romanenko L.A., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of a highly acidic O-specific polysaccharide of lipopolysaccharide of Pseudoalteromonas haloplanktis KMM 223 (44-1) containing L-iduronic acid and D-QuiNHb4NHb // Carbohydr. Res. 1998. V. 307, N 3-4. P. 291-298.

60.Liu В., Knirel Y.A., Feng L., Perepelov A.V., Senchenkova S.N., Wang Q., Reeves P., Wang L. Structure and genetics of Shigella О antigens // FEMS Microbiol. Rev. 2008. V. 32, N4. P. 627-653.

61.Perepelov A.V., Liu В., Senchenkova S.N., Shashkov A.S., Feng L., Knirel Y.A., Wang L. Structure of the O-polysaccharide of Escherichia coli 0112ab containing L-iduronic acid // Carbohydr. Res. 2008. V. 343, N 3. P. 571-575.

62.Andersson M., Ratnayake S., Kenne L., Ericsson L., Stack R.J. Structural studies of the- extracellular polysaccharide from Butyrivibrio fibrisolvens strain X6C61 // Carbohydr. Res. 1993. V. 246. P. 291-301.

63.Lee L., Cherniak R. Identification of iduronic acid as a constituent of the «type— specific» polysaccharide of Clostridium perfi-ingens Hobbs 10 // Carbohydr. Res.

1974. V. 33, N2. P. 387-390.

64.Hanniffy O., Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Romanenko L.A., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of an acidic O-specific polysaccharide of Pseudoalteromonas haloplanktis type strain ATCC14393 containing 2-acetamido-2-deoxy-D- and -L-galacturonic acids and 3-(N-acetyl-D-alanyl)amino-3,6-dideoxy-D-glucose // Carbohydr. Res. 1999. V. 321, N 1-2. P. 132138.

65.Vinogradov E.V., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Kochetkov N.K., Sidorczyk Z., Swierzko A. The structure of Proteus penneri strain 14 O-specific polysaccharide containing D- and L-alanine // Carbohydr. Res. 1991. V. 219. P. 1-3.

66.Muldoon J., Perepelov A.V., Shashkov A.S., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Gorshkova N.M., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of an acidic polysaccharide from the marine bacterium Pseudoalteromonas flavipulchra NCIMB 2033T // Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N 5. P. 459-462.

67.Kocharova N.A., Ovchinnikova O.G., Torzewska A., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Rozalski A. The structure of the O-polysaccharide from the lipopolysaccharide of Providencia alcalifaciens 036 containing 3-deoxy-D-manno-oct-2-ulosonic acid // Carbohydr. Res. 2007. V. 342, N 3-4. P. 665-670.

68.Vanhaverbeke C, Heyraud A, Achouak W, Heulin T. Structural analysis of the exopolysaccharide from Burkholderia caribensis strain MWAP71 // Carbohyd. Res. 2001. V. 334, N2. P. 127-133.

69.Gorshkova R.P., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Paramonov N.A., Meshkov S.V., Ivanova E.P. Structure of the capsular polysaccharide from Alteromonas nigrifaciens IAM 13010T containing 2-acetamido-2,6-dideoxy-L-talose and 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid // Carbohydr. Res. 1997. V. 299, N1-2. P. 69-76.

70.Горшкова Р.П., Назаренко E.Jl., Зубков B.A., Иванова Е.П., Горшкова Н.М., Исаков В.В. Структура О-специфического полисахарида Pseudoalteromonas nigrifaciens КММ 161 //Биохимия. 2002. Т. 67, № 6. С. 810-814.

71.Назаренко Е.Л., Зубков В.А., Шашков А.С., Книрель Ю.А., Горшкова Р.П.,

Иванова Е.П., Оводов Ю.С. Структура повторяющего звена кислого полисахарида Alteromonas macleodii 2ММ6 // Биоорган, химия. 1993. Т. 19, № 7. С. 740-751.

72.Горшкова Р.П., Назаренко E.JL, Зубков В.А., Иванова Е.П., Оводов Ю.С., Шашков А.С., Книрель Ю.А. Структура повторяющегося звена кислого полисахарида Alteromonas haloplanktis KMM 156 II Биоорган, химия. 1993. T. 19, №3. С. 327-336.

73.Knirel Y.A., Kaca W., Paramonov N.A., Cedzynski M., Vinogradov E.V., Ziolkowski A., Shashkov A.S., Rozalski A. Structure of the O-specific polysaccharide of Proteus vulgaris 025 containing 3-0-[(R)-l-carboxyethyl]-D-glucose // Eur. J. Biochem. 1997. V. 247, N 1. P.951-954.

74.Parolis L.A.S, Parolis H., Dutton G.G.S., Wing P.L., Skura B.J. Structure of the glycocalyx polysaccharide of Pseudomonas fragi ATCC 4973 // Carbohydr. Res. 1991. V. 216. P.495-504.

75.Osman S.F., Fett W.F. Structure of the acidic exopolysaccharide of Pseudomonas marginalia Strain ATCC 10844 // Carbohydr. Res. 1993. V. 242. P.271-275.

76.Gorshkova R.P., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Shashkov A.S., Ivanova E.P., Gorshkova N.M. Structure of the O-specific polysaccharide from Pseudoalteromonas elyakovii sp. nov. CMM 162 // Carbohydr. Res. 1998. V. 313, N l.P. 61-64.

77.Bartelt M., Shashkov A.S., Kochanowski H., Jann В., Jann K. Structure of the O-specific polysaccharide of the 022-antigen (LPS) from Escherichia coli 022:K13 // Carbohydr. Res. 1994. V. 254. P. 203-212.

78.Katzenellenbogen E., Kocharova N.A., Zatonsky G.V., Korzeniowska-Kowal A., Shashkov A.S., Knirel Y.A. Structure of the O-specific polysaccharide from the lipopolysaccharide of Hafnia alvei strain PCM1546 // Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N20. P. 2153-2158.

79.Katzenellenbogen E., Kocharova N.A., Zatonsky G.V., Shashkov A.S., Bogulska M., Knirel YA. Structures of the biological repeating units in the O-chain polysaccharides of Hafnia alvei strains having a typical lipopolysaccharide outer

core region // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2005. V. 45, N 2. P. 269-278.

80.Romanenko L.A., Zhukova N.V., Rhode M., Lysenko A.M., Mikhailov V.V., Stackebrandt E. Pseudoalteromonas agarivorans sp. nov., a novel marine agarolytic bacterium // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. P. 125-131.

81.Командрова H.A., Томшич C.B., Исаков B.B., Романенко JI.А. Структура сульфатированного О-специфического полисахарида морской бактерии Pseudoalteromonas marinoglutinosa КММ 232 // Биохимия. 1998. Т.63, №10. С. 98-103.

82.Командрова Н.А., Исаков В.В., Томшич С.В., Романенко Л.А., Перепелов А.В., Шашков А.С. Структура кислого О-специфического полисахарида R-формы морской бактерии Pseudoalteromonas agarivorans КММ 232 // Биохимия. 2010. Т. 75, № 5. С. 727-734.

83.Командрова Н.А., Томшич С.В., Исаков В.В., Романенко Л.А. О-специфический полисахарид морской бактерии "Alteromonas marinoglutinosa" NCIMB 1770 //Биохимия. 2001. Т.66, №8. С. 894-897.

84.Горшкова Р.П., Назаренко Е.Л., Исаков В.В., Зубков В.А., Горшкова Н.М., Романенко Л.А., Иванова Е.П. Структура глицерофосфатсодержащего О-специфического полисахарида Pseudoalteromonas sp. КММ 639 // Биоорган, химия. 1998. Т. 24, № 11. С. 839-841.

85.Назаренко Е.Л., Зубков В.А., Шашков А.С., Книрель Ю.А., Горшкова Р.П., Иванова Е.П., Оводов Ю.С. Структура повторяющегося звена кислого полисахарида Alteromonas sp. 4МС17 // Биоорган, химия. 1993. Т. 19, № 7. С. 733-739.

86.Vinogradov E.V., Korenevsky A., Beveridge T.J. The structure of the O-specific polysaccharide chain of the Shewanella algae BrY lipopolysaccharide // Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N 3. P. 385-388.

87.Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Gorshkova N. M., Knirel Y.A., Gorshkova R.P. Structure of the acidic polysaccharide chain of the lipopolysaccharide of Shewanella algae 48055 // Carbohydr. Res. 1998. V. 309, N 1. P. 103-108.

88.Vinogradov E.V., Holst O., Thomas-Oates J.E., Broady K.W., Brade H. The structure of the O-antigenic polysaccharide from lipopolysaccharide of Vibrio cholerae strain Hl 1 (non Ol) // Eur. J. Biochem. 1992. V. 210. P. 491-498.

89.Shashkov A.S., Torgov V.l., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Gorshkova N.M., Gorshkova R.P., Widmalm G. Structure of the phenol-soluble polysaccharide from Shewanella putrefaciens strain A6 // Carbohydr. Res. 2002. V. 337, N 12. P. 11191127.

90.Kilcoyne M., Shashkov A.S., Senchenkova S.A., Knirel Y.A., Vinogradov E.V., Radziejewska-Lebrecht J., Galimska-Stypa R., Savage A.V. Structural investigation of the O-specific polysaccharides of Morganella morganii consisting of two higher sugars // Carbohydr. Res. 2002. V. 337, N. 18. P. 1697-1702.

91.Shashkov A.S_., Senchenkova S.N., Nazarenko E.L., Zubkov V.A., Gorshkova N.M., Knirel Y.A., Gorshkova R.P. Structure of a phosphorylated polysaccharide from Shewanella putrefaciens strain S 29 // Carbohydr. Res. 1997. V. 303, N 3. P. 333338.

92.Kenne L., Lindberg B. Bacterial polysaccharides // In: Aspinall G.O. (Ed.) Polysaccharides. New York: Academic Press. 1983. V. 2. P. 287-363.

93.Kilcoyne M., Perepelov A.V., Shashkov A.S., Nazarenko E.L., Ivanova E.P., Gorshkova N.M., Gorshkova R.P. Savage A.V. Structure of an acidic O-specific polysaccharide from marine bacterium Shewanella fidelis KMM 3582T containing Afe-KS)- l-carboxyethyl]-Mx-(Dgalacturonoyl)-L-lysine // Carbohydr. Res. 2004. V. 339, N9. P. 1655-1661.

94.Kocharova N.A., Zatonsky G.V., Torzewska A., Macieja Z., Bystrova O.V., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Rozalski A. Structure of the O-specific polysaccharide of Providencia rustigianii 014 containing Ns-[(S)-1 -carboxyethyl]-Na-(D-galacturonoyl)-L- lysine. Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N 9. P. 1009-1016.

95.Kilcoyne M., Shashkov A.S., Perepelov A.V., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Widmalm G., Savage A.V. Structure of the O-specific polysaccharide from Shewanella japónica type strain KMM 3299T containing the rare amino sugar Fuc4NAc // Carbohydr. Res. 2005. V. 340, N 8. P. 1557-1561.

96.Назаренко Е.Л., Перепелов А.В., Шевченко Л.С., Даева Е.Д., Иванова Е.П., Шашков А.С., Видмальм Г. Структура О-специфического полисахарида Shewanella japónica КММ 3601, содержащего 5,7-диацетамино-3,5,7,9-тетрадезокси-0-глицеро-0-тало-нон-2-улозоновую кислоту // Биохимия. 2011. Т. 76, N7. Р. 969-975.

97.Книрель Ю.А., Сенченкова С.Н., Кочарова Н.А., Шашков А.С., Хельбиг Ю.Г., Цэрингер У. Идентификация гомополимера 5-ацетамидино-7-ацетамидо-3,5,7,9-тетрадезокси-0-глицеро-0-тало-нонулозоновой кислоты в липополисахаридах бактерий Legionella pneumophila, не входящих в серогруппу 1 //Биохимия. 2001. Т. 66. Р. 1271-1279.

98.Knirel Y.A., Shashkov A.S., Tsvetkov Y.E., Jansson P-E., Zahringer U. 5,7-Diamino-3,5,7,9-tetradeoxynon-2-iilosonic acids in bacterial glycopolymers: chemistry and biochemistry //Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. 2003. V. 58. P.371-417.

99.Kondakova A.N., Novototskaya-Vlasova K.A., Drutskaya M.S., Senchenkova S.N., Shcherbakova V.A., Shashkov A.S., Gilichinsky D.A., Nedospasov S.A., Knirel Y.A. Structure of the O-polysaccharide chain of the lipopolysaccharide of Psychrobacter muricolla 2pST isolated from overcooled water brines within permafrost // Carbohydr. Res. 2012. V. 349. P. 78-81.

100. Molinaro A., Bedini E., Ferrara R., Lanzetta R., Parrilli M., Evidente A., Lo C.P., Iacobellis N.S. Structural determination of the O-specific chain of the lipopolysaccharide from the mushrooms pathogenic bacterium Pseudomonas tolaasii //Carbohydr. Res. 2003. V. 338, N 11. P. 1251-1257.

101.Kondakova A.N., Novototskaya-Vlasova K.A., Shashkov A.S., Drutskaya M.S., Senchenkova S.N., Shcherbakova V.A., Gilichinsky D.A., Nedospasov S.A., Knirel Y.A. Structure of an acidic polysaccharide isolated from Psychrobacter maritimus 3pS containing a bacillosamine derivative // Carbohydr. Res. 2012. V. 359. P. 7-10.

102. Veremeychenko S.N., Zdorovenko G.M. Peculiarity of the structure of the lipopolysaccharide of Pseudomonas fluorescens IMV 247 (biovar II) // Mikrobiol. 2000. V. 69, N3. P. 362-369.

103. Kondakova A.N., Novototskaya-Vlasova K.A., Arbatsky N.P., Drutskaya M.S., Shcherbakova V.A., Shashkov A.S., Gilichinsky D.A., Nedospasov S.A., Knirel Y.A. Structure of the O-specific polysaccharide from the lipopolysaccharide of Psychrobacter ciyohalolentis K5T containing a 2,3,4-triacetamido-2,3,4-trideoxy-L-arabinose moiety // J. Nat. Prod. 2012. V. 75, N 12. P. 2236-2240.

104. Kilcoyne M., Perepelov A.V., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Shashkov A.S., Romanenko L.A., Knirel Y.A., Savage A.V. Structure of the O-polysaccharide of Idiomarina zobellii KMM 23IT containing two unusual amino sugars with the free amino group, 4-amino-4,6-dideoxy-D-glucose and 2-amino-2-deoxy-L-guluronic acid // Carbohydr. Res. 2004. V. 339, N 3. P. 477-482.

105. Горшкова Р.П., Исаков, B.B. Денисенко В.А., Назаренк E.JI. о, Иванова Е.П., Шевченко JI.C.. Структура повторяющегося звена О-специфического полисахарида Alteromonas addita типового штамма КММ 3600т // Химия природных соединений. 2008. № 5. С. 445-447.

106. Горшкова Р. П., Исаков В. В., Недашковская О. И., Назаренко Е. JI. Строение углеводных антигенов из Microbulbifer sp. KMM 6242 // Химия природных соединений. 2010. N 6. С. 711-713.

107. Зубков В.А., Назаренко Е.Л., Иванова Е.П., Горшкова Н.М., Горшкова Р.П. Структура повторяющегося звена О-специфического полисахарида Marinomonas communis штамма АТСС 27118(Т) // Биоорган, химия. 1999. Т. 25, N 4. С. 290-292.

108. Stenutz R., Weintraub A., Widmalm G. The structures of Escherichia coli O-polysaccharide antigens // FEMS Microbiol. Rev. 2006. V. 30, N 3. P. 382-403.

109. Gajdus J., Glosnicka R., Szafranek J. Primary structure of Salmonella spp. O-antigens // Wiadomosci Chemiczne (Polish) 2006. V. 60, N 9-10. P. 621-653.

110.Handlinger J., Soltani M., Percival S. The pathology of Flexibacter maritimus in aquaculture species in Tasmania, Australia // J. Fish Dis. 1997. V. 20. P. 159-169.

111. Soltani M., Munday B.L., Burke C.M. The relative susceptibility of fish to infections by Flexibacter columnaris and Flexibacter maritimus II Aquaculture. 1996. V. 410. P. 259-264.

112. Vinogradov E.V., MacLean L.L., Crump E.M., Perry M.B., Kay, W.W. Structure of the polysaccharide chain of the lipopolysaccharide from Flexibacter maritimus II Eur. J. Biochem. 2003. V. 270. P. 1810-1815.

113.Perepelov A.V., Shashkov A.S., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Nedashkovskaya O.I. A pseudoaminic acid-containing O-specific polysaccharide from a marine bacterium Celliilophaga fucicola II Carbohydr. Res. 2007. V. 342, N 10. P. 1378-1381.

114. Staaf M., Weintraub A., Widmalm G. Structure determination of the O-antigenic polysaccharide from the enteroinvasive Escherichia coli 0136 // Eur. J. Biochem. 1999. V. 263, N3. P. 656-661.

115. Томшич C.B., Командрова H.A., Перепелов A.B., Видмальм Г., Недашковская О.И., Шашков A.C. Структура кислого О-специфического полисахарида Celliilophaga baltica II Биоорган, химия. 2007. Т. 33, N 1. С. 91-95.

116. Perepelov A.V., Shashkov A.S., Tomshich S.V., Komandrova N.A., Nedashkovskaya O.I. Structure of the O-specific polysaccharide from a marine bacterium Celliilophaga pacifica containing rarely occurred sugars, Fuc4NAc and ManNAcA // Carbohydr. Res. 2013. V. 372. P. 69-72.

117. Erbel P.J., Barr К., Gao N., Gerwig G.J., Rick P.D., Gardner K.H. Identification and biosynthesis of cyclic enterobacterial common antigen in Escherichia coli II J. Bacteriol. 2003. V. 185, N. 6. P. 1995-2004.

118. Vinogradov E.V., Knirel Y.A., Thomas-Oates J.E., Shashkov A.S., L'vov V.L. The structure of the cyclic enterobacterial common antigen (ECA) from Yersinia pest is II Carbohydr. Res. 1994. V. 258. P.223-232.

119. Томшич С. В., Исаков В. В., Командрова Н. А., Шевченко JI. С. Структура О-специфического полисахарида морской бактерии Arenibacter Palladensis КММ 3961 , содержащего 2-ацетамидо-2-дезокси-Е-галактуроновую кислоту // Биохимия. 2012. Т. 77, N 1. Р. 110-115.

120. Горшкова Р.П., Исаков В.В., Шевченко JI.C., Иванова Е.П., Денисенко В.А., Назаренко E.JI. Структура тейхоевой кислоты из морской протеобактерии Sulßtobacter brevis КММ 6006 // Химия природных соединений. 2007. N 6. Р.

533-536.

121.Bubb W.A. NMR spectroscopy in the study of carbohydrates: Characterizing the structural complexity // Concept, magn. reson. A. 2003. V. 19, N 1. P. 1-19.

122. Чижов O.C., Шашков A.C. Масс-спектрометрия и ЯМР-спектроскопия в установлении структуры полисахаридов // Ред. Торгов И.В. Прогресс химии углеводов. Москва: Наука. 1985. С. 30-54.

123.Варбанец Л.Д., Здоровенко Г.М., Книрель Ю.А. Методы структурного анализа липополисахаридов // Ред. B.C. Подгорский. Методы исследования эндотоксинов. Киев: Наукова думка. 2006. С. 105-183.

124. Воск К., Th0gersen Н. Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy in the Study of Mono- and Oligosaccharides // Annu. Rep. NMR Spectrosc. 1983. V. 13, N С. P. 157

125.Angyal, S.J. Hudson's rules of isorotation as applied to füranosides, and the conformations of methyl aldofuranosides // Carbohydr. Res. 1979. V. 77, N 1. P. 3750.

126. Шашков A.C. Спектры ЯМР 13C родоначальных гексопираноз // Изв. АН СССР. Сер. Хим. 1983. Т. 6. С. 1328-1336.

127. Шашков A.C., Чижов О.С. Спектроскопия 13С-ЯМР в химии углеводов и родственных соединений // Биоорган, химия. 1976. Т.2, N 4. С. 437-497.

128. Altona С., Haasnoot C.A.G. Prediction of anti and gauche vicinal proton-proton coupling-constants in carbohydrates - a simple additivity rule for pyranose rings // Org. Magn. Reson. 1980. V. 13, N 6. P. 417-429.

129. Vliegenthart J.F.G., Dorland L., van Haibeek H. High-resolution, 'H-nuclear magnetic resonance spectroscopy as a tool in the structural analysis of carbohydrates related to glycoproteins // Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. 1983. V. 41. P. 209374.

130. Block K., Lundt I., Pederson C. Assignment of anomeric structure to carbohydrates through geminal 13C-H coupling constants // Tetrahedr. Letter. 1973. V. 14, N 13. P. 1037-1040.

131.Lipkind G.M., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Vinogradov E.V., Kochetkov N. A

computer-assisted structural analysis of regular polysaccharides on the basis of C-N.M.R. data // Carbohydr. Res. 1988. V. 175, N 1. P. 59-75. 132.Breitmaier E. Structure Elucidation by NMR in Organic Chemestry // In:

Breitmaier E. (Ed.) Wiley, New York. 2002. 133-Duus J.O., Gotfredsen C.H., Bock K. Carbohydrate structural determination by NMR spectroscopy: Modern methods and limitations // Chem. Rev. 2000. V. 100, N 12. P. 4589-4614.

134.Kogan G., Uhrin D. Current NMR methods in the structural elucidation of polysaccharides // in New Advances in Analytical Chemistry (ed Atta-ur-Rahman, Harwood Publishers, Australia). 2000. P. 73-134.

135. Hotchkiss R.S., Karl I.E. The pathophysiology and treatment of sepsis // N. Engl. J. Med. 2003. V. 148, N 1. P. 138-150.

136. Opal S.M. The host response to endotoxine, anti-lipopolysaccharide stategies, and the management of severe sepsis // Int. J. Med. Microbiol. 2007. V. 297, N 5. P. 365377.

137. Opal S.M., DePalo V.A. Anti-inflamatory cytokines // Chest. 2000. V. 117, N 4. P. 1162-1172.

138. Morrison D.C., Danner R.L., Dinarello C.A., Munfond R.S., Natanson C., Pollack M., Spitzer J.J., Ulevitch R.J., Vogel S.N., McSweegan E. Bacterial endotoxins and pathogenesis of Gram-negative infections: current status and future directions // J. Endotoxin Res. 1994. V. 1, N 1. P. 71-83.

139. Morrison D.C., Bucklin S.E. Evidence for antibiotic-mediated endotoxin release as a contributing factor to lethality in experimental gram-negative sepsis // Scand. J. Infect. Dis. Suppl. 1996. V. 101. P. 3-8.

140. Blease K., Seybold J., Adcock I.M., Hellewell P.G., Burke-Gaffney A. Interleukin-4 and lipopolysaccharide synergize to induce vascular cell adhesion molecule-1 expression in human lung microvascular endothelial cells // Am. J. Respir. Cell. Mol. Biol. 1998. V. 18, N 5. P. 620-630.

141. Dinarello C.A., Cytokine as mediators in the pathogenesis of septic shock // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1996. V. 216, N 2. P. 133-165.

142. Hesse D.G., Tracey К.J., Fong Y., Manogue K.R., Palladino Jr. M.A., Cerami A., Shires G.T., Lowry S.F. Cytokine appearance in human endotoxemia and primate bacteremia // Surg. General Obstet. 1988. V. 166, N 1. P. 147-153.

143.Kirkland T.N., Finley F., Leturq D., Moriarty A., Lee J.D., Ulevitch R.J., Tobias P.S. Analysis of lipopolysaccharide binding by CD14 // J. Biol. Chem. 1993. V. 268, N33. P. 24818-24823.

144.Ziegler-Heitbrock H.W., Ulevitch R.J. CD14: cell surface receptor and differentiation marker//Immunol. Today. 1993. V. 14, N 3. P. 121-125.

145.Gegner J.A., Ulevitch R.J., Tobias P.S. Lipopolysaccharide (LPS) signal transduction and clearance. Dual roles for LPS binding protein and membrane CD 14 // J. Biol. Chem. 1995. V. 270, N 10. P. 5320-5325.

146. Viriyakosol S., Mathison J.C., Tobias P.S., Kirkland T.N. Structure-function analysis of CD 14 as a soluble receptor for lipopolysaccharide // J. Biol. Chem. 2000. V. 275, N5. P. 3144-3149.

147. Cantrell D., O'Neill L., Welham M. Signal transduction during innate and adaptive immunity // Biochem. Society Transact. 2001. V. 29. N 5. P. 853-859.

148. Yang H., Young D.W., Gusovsky F., Chow J.C. Cellular events mediated by lipopolysaccharide-stimulated Toll-like receptor 4 // J. Biol. Chem. 2000. V. 275, N 27. P.20861-20866.

149. Faure E.O., Equils P.A., Sieling L., Thomas F.X., Zhang C.J., Kirschning N., Polentarutti M., Muzio M. Bacterial lipopolysaccharide activates NF-kappaB through toll-like receptor 4 (TLR-4) in cultured human dermal endothelial cells. Differential expression of TLR-4 and TLR-2 in endothelial cells // J. Biol. Chem. 2000. V. 275, N 15. P. 11058-11063.

150. Воробьева E.B., Красикова И.Н., Соловьева Т.Ф. Влияние липополисахаридов и липидов А из некоторых морских бактерий на индукцию спонтанного и индуцированного липополисахаридом из Escherichia coli синтеза фактора некроза опухоли альфа клетками периферической крови человека // Биохимия. 2006. Т. 71, N7. Р. 936-944.

151. Romanenko L.A., Tanaka N., Svetashev V.I., Falsen E. Description of Cobetia

amphilecti sp. nov., Cobetia litoralis sp. nov. and Cobetia pacifica sp. nov., classification of Halomonas halodurans as a later heterotypic synonym of Cobetia marina and emended descriptions of the genus Cobetia and Cobetia marina II Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2013. V. 63, N 1 P. 288-297.

152.Romanenko L.A., Uchino M., Falsen E., Zhukova N.V., Mikhailov V.V., Uchimura T. Rheinheimerapacifica sp. nov., a novel halotolerant bacterium isolated from deep sea water of the Pacific // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53, N 6. P. 1973-1977.

153. Ivanova E.P., Romanenko L.A., Chun J., Matte M.H., Matte G.R., Mikhailov V.V., Svetashev V.l., Huq A., Maugel T., Colwell R.R. Idiomarina gen. nov., comprising novel indigenous deep-sea bacteria from the Pacific Ocean, including descriptions of two species, Idiomarina abyssalis sp. nov. and Idiomarina zobellii sp. nov // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2000. V. 50, N 2. P. 901-907.

154. Jung J.Y., Kim J.M., Jin H.M., Kim S.Y., Park W., Jeon C.O. Litorimonas taeanensis gen. nov., sp. nov., isolated from a sandy beach // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011. Vol. 61, N7. P. 1534-1538.

155.Nedashkovskaya O.I., Kim S.B., Hoste B., Shin D.S., Beleneva I.A., Vancanneyt M., Mikhailov V.V. Echinicola vietnamensis sp. nov., a member of the phylum Bacteroidetes isolated from seawater // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. V. 57, N 4. P. 761-763.

156. Youschimizu M., Kimura T. Study of intenstial microflora of salmonids // Fish Pathol. 1976. V. 10, N 2. P. 243-259.

157. Honda S., Yuki H., Takiura K. Fourier-transform 13C nuclear magnetic resonance spectra of D-glucose 3- and 6-sulfates // Carbohydr. Res. 1973. V. 28, N 1. P. 150153.

158.Rashid A., Mackie W., Colquhoun I.J., Lamba D. Novel Synthesis of monosulphated methyl a-D-galactopyranosides // Can. J. Chem. 1990. V. 68, N 7. P. 1122-1127.

159.Jansson P.-E., Kenne L. Schweda E. Nuclear magnetic resonance and conformational studies on monoacetylated methyl D-gluco- and D-galacto-

pyranosides // J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1987. V. 1. P. 377-383. 160. Sato H., Kajihaza Y. 2D Selective-TOCSY-DQFCOSY Experiment for Idenification of Individual Sugar Components in Oligosaccharides // J. Carb. Chem. 2003. V. 22, N5. P. 339-345. löl.Matsuda M., Hasui M., Okutani K. Structural Analysis of a Sulfated Polysaccharide from a Marine Pseudomonas // Nippon Suisan Gakkaishi. 1993. V. 59, N3. P. 535-538.

162. Worawattanamateekul W., Matsuda M., Okutani K. Structural Analysis of a Rhamnose-Containing Sulfated Polysaccharide from a Marine Pseudomonas II Nippon Suisan Gakkaishi. 1993. V. 59, N 5. P. 875-878.

163.Rougeaux H., Guezennec J., Carlson R. W., Kervarec N., Pichon R., Talaga P. Structural determination of the exopolysaccharide of Pseudoalteromonas strain HYD 721 isolated from a deep-sea hydrothermal vent // Carbohydr. Res. 1999. V. 28, N3-4. P. 273-285.

164.Rogera O., Kervarecb N., Ratiskola J., Colliec-Jouaulta S., Chevolot L. Structural studies of the main exopolysaccharide produced by the deep- sea bacterium Alteromonas infernus II Carbohydr. Res. 2004. V. 339, N 14. P. 2371-2380.

165. Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Vinogradov E.V., Zatonsky G.V., Knirel Y.A., Literacka E., Kaca W. Full structure of the O-specific polysaccharide of Proteus mirabilis 024 containing 3,4-0-[(S)-l-carboxyethylidene]-D-galactose // Carbohydr. Res. 2000. V. 329, N2. P. 453-457.

166. Garegg P.J., Jansson P.-E., Lindberg B., Lindh F., Lonngren J., Kvarnstrom I., Nimmich W. Configuration of the acetal carbon atom of pyruvic acid acetals in some bacterial polysaccharides galactose // Carbohydr. Res. 1980. V. 78, N 1. P. 127-132.

167. Niemann H., Frank N., Stirm S. Klebsiella serotype-13 capsular polysaccharide primary structure and depolymerization by a bacteriophage-borne glycanase // Carbohydr. Res. 1977. V. 59, N 1. P. 165-177.

168. Lindberg B., Lindh F., Lonngren J., Sutherland I.W. Structural studies of the capsular polysaccharide of Klebsiella type 30 // Carbohydr. Res. 1979. V. 76, N 1. P. 281-284.

169.Lindberg B., Lindh F., Lonngren J., Nimmich W. Structural studies of the capsular polysaccharide of Klebsiella type 33 // Carbohydr. Res. 1979. V. 70, N 1. P. 135144.

170.Jansson P.E., Kenne L., Widmalm G. Computer-assisted structural analysis of polysaccharides with an extended version of casper using 'H- and 13C-n.m.r. data // Carbohydr. Res. 1989. V. 188, N 1. P. 169-191.

171.Kocharova N.A., Torzewska A., Zatonsky G.V., Blaszczyk A., Bystrova O.V., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Rozalski A. Structure of the O-polysaccharide of Providencia stuartii 04 containing 4-(N-acetyl-l-aspart-4-yl)amino-4,6-dideoxy-d-glucose // Carbohydr. Res. 2004. V. 339, N 2. P. 195-200.

172. MacLean L.L., Vinogradov E.V., Crump E.M., Perry M.B., Kay W.W. The structure of the lipopolysaccharide O-antigen produced by Flavobacterium psychrophilum (259-93) //Eur. J. Biochem. 2001. V. 268. P. 2710-2716.

173.Zubkov V.V., Nazarenko E.L., Gorshkova R.P., Ivanova E.P., Shashkov A.S., Knirel Y.A., Paramonov N.A., Ovodov Y.S. Structure of the capsular polysaccharide from Alteromonas sp. CMM 155 // Carbohydr. Res. 1995. V. 275, N 1. P. 147-154.

174. Itakura Y., Komori T. Biologically Active Glycosides from Asteroidea, IX. Steroid Oligoglycosides from the Starfish Asterias amurensis [cf.] versicolor Sladen, 2. Structure Elucidation of Two New Oligoglycoside Sulfates, Versicoside B and Versicoside C // Liebigs. Ann. Chem. 1986. V. 1986, N 2. P.359-373.

175. Dale J.A. Mosher H.S. Nuclear magnetic resonance enantiomer reagents. Configurational correlations via nuclear magnetic resonance chemical shifts of diastereomeric mandelate, O-methylmandelate, and a-methoxy-a-trifluoromethylphenylacetate (MTPA) esters // J. Am. Chem. Soc. 1973. V. 95, N 2. P. 512-519.

176.Freire F., Seco J.M., Quinoa E., Riguera R. Determining the absolute stereochemistry of secondary/secondary diols by NMR: Basis and applications // J. Org. Chem. 2005. V. 70, N 10. P. 3778-3790.

177. MacLean L.L., Perry M.B., Crump E.M., Kay W.W. Structural characterization of the lipopolysaccharide O-polysaccharide antigen produced by Flavobacterium

columnare ATCC 43622 // Eur. J. Biochem. 2003. V. 270, N 16. P. 3440-3446.

178. Jansson P.-E., Lindberg B., Lindquist U. Structural studies of the capsular polysaccharide from Streptococcus pneumoniae type 5 // Carbohydr. Res. 1985. V. 140, N l.P. 101-110.

179. Park S., Kelley K.A., Vinogradov E.V., Solinga R., Weidenmaier C., Misawa Y., Lee J.C. Characterization of the structure and biological functions of a capsular polysaccharide produced by Staphylococcus saprophyticus II J. Bacteriol. 2010. V. 192, N 18. P. 4618-4626.

180. Westphal O. Jann K. Bacterial lipopolysacharides. Extraction with phenol-water and further applications of the procedure // Meth. Carbohydr. Chem. 1965. V. 5. P. 83-91.

181. Hitchcock P.J., Brown T.M. Morphological heterogeneity among Salmonella lipopolysaccharide chemotypes in silver-stain Polyacrylamide gels // J. Bacteriol. 1983. V. 154, N l.P. 269-277.

182. Tsai C.M., Frasch C.E. A sensitive silver stain for detecting lipopolysaccharides in Polyacrylamide gels//Anal. Biochem. 1982. V. 119,N 1. P. 115-119.

183.Aldrich. 1992-1993. P. 1192.

184. Perry M.B. Daoust V. A synthesis of 2-amino-2,6-dideoxy-L-mannose (L-rhamnosamine) and 2-amino-2,6-dideoxy-L-glucose (L-quinovosamine) // Carbohydr. Res. 1973. V. 27, N 2. P. 460-463.

185. Bienvenu J., Doche C., Gutowski M., Lenoble M., Pedrix J. Production of proinflammatory cytokines and cytokines involved in the TH1/TH2 balance is modulated by pentoxifylline // J. Cardiovascul. Pharmacol. 1995. V. 25. P. 80-84.