Структурно-функциональный анализ новых антимикробных пептидов семян ежовника обыкновенного: Echinochloa crus-galli тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.10, кандидат наук Рогожин, Евгений Александрович
- Специальность ВАК РФ02.00.10
- Количество страниц 130
Оглавление диссертации кандидат наук Рогожин, Евгений Александрович
СОДЕРЖАНИЕ
1 .ВВЕДЕНИЕ
1.1. Актуальность темы
1.2. Научная новизна исследований
1.3. Практическая значимость
1.4. Цели и задачи исследования 8 Глава I. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
1. Характеристика антимикробных пептидов растений
2. Классификация антимикробных пептидов растений
2.1.Тионины
2.2. Дефензины
2.2.1. Классификация дефензинов
2.2.2. Структурные особенности дефензинов
2.2.3. Биологическая активность растительных дефензинов
2.3. Неспецифические липид-переносящие белки
2.4. Гевеин-подобные пептиды
2.5. Ноттин-подобные пептиды
2.6. Циклотиды
2.7. Снекины
2.8. Четырех-цистеиновые антимикробные пептиды 28 2.8.1 Антимикробные пептиды из нута {Macadamia integrifolia) и 28 кукурузы {Zea mays)
2.8.2. Антимикробные пептиды из недотроги {Impatiens balsamina)
3. Общие принципы действия антимикробных пептидов
3.1. Механизмы антибактериального действия АМП растений
3.2. Механизмы антифунгального действия АМП растений
3.3. Механизмы действия дефензинов растений
3.4. Механизмы действия тионинов
3.5. Механизмы действия липид-переносящих белков
3.6. Механизмы действия гевеино-подобных пептидов
4. Применение антимикробных пептидов растений
4.1. Возможность клинического применения АМП растений
4.2. Возможность применения АМП растений в пищевой 39 промышленности
4.3. Использование АМП растений в сельском хозяйстве
4.3.1. Создание трансгенных культур, экспрессирующих гены АМП 41 растений
4.3.2. Перспективы применения АМП растений в качестве 44 биопестицидов
Глава II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
1. Оборудование
2. Реактивы
3. Биологический материал
3.1. Ежовник обыкновенный
3.2. Микроорганизмы
3.2.1. Грибы
3.2.2. Оомицеты
3.2.3. Бактерии
4. Выделение АМП из семян ежовника
4.1. Экстракция
4.2. Обессоливание тотального ацетонового осадка
4.3. Хроматографическое разделение обессоленного ацетонового 49 осадка
5. Методы структурного анализа АМП семян ежовника
5.1. Восстановление и алкилирование
5.2. Матричная ассоциированная лазерная десорбция/ионизация 51 (МАЛДИ) времяпролетная масс-спектрометрия
5.3. Гидролиз эндопротеиназой С1и-С
5.4. Установление аминокислотной последовательности
6. Аналитические методы исследования АМП семян ежовника
6.1. Гидролиз трипсином 5
6.2. Определение концентрации АМП спектрофотометрическим 52 методом
6.3. Получение флуоресцентной производной АМП из семян 52 ежовника
7. Методы исследования функциональной активности АМП 53 семян ежовника
7.1. Определение антифунгальной активности
7.2. Определение антибактериальной активности
7.3. Сканирующая лазерная конфокальная флуоресцентная 54 микроскопия
7.4. Сканирующая лазерная двухфотонная флуоресцентная (4-pi) 54 микроскопия
7.5. Сканирующая зондовая (атомно-силовая) микроскопия (АСМ) 55 Глава III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
1. Выбор объекта исследований
2. Оптимизация метода выделения АМП из семян ежовника
3. Выделение АМП из семян ежовника
3.1. Выделение Ec-AMP-D 1 и Ее-AMP-D2
3.2. Выделение ЕсАМР 1
4. Структурная характеристика АМП семян ежовника
4.1. Установление первичных структур Ec-AMP-D 1 и Ec-AMP-D2 64 4.1.1. Сравнение первичных структур Ec-AMP-Dl и Ec-AMP-D2 с 66 гомологами
4.2. Определение первичной структуры ЕсАМР 1 68 4.2.1. Сравнение первичной структуры EcAMPl с гомологами
4.3. Определение пространственной структуры EcAMPl 70 4.3.1. Сравнение третичной структуры ЕсАМР 1 с другими 71 пептидами
5. Функциональная характеристика АМП семян ежовника
5.1. Биологическая активность Ec-AMP-Dl и Ec-AMP-D2
5.2. Биологическая активность Ее AMP 1 8 О
5.3. Изучение взаимодействия EcAMPl с фитопатогенным грибом на 82 клеточном уровне
5.3.1. Получение флуоресцентного производного пептида ЕсАМР 1
5.3.2. Исследование взаимодействия EcAMPl со спорами гриба 83 Fusarium solani методами сканирующей флуоресцентной микроскопии
5.3.3. Исследование взаимодействия EcAMPl со спорами гриба 89 Fusarium solani методом атомно-силовой микроскопии (АСМ)
6. Заключение
ВЫВОДЫ
БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биоорганическая химия», 02.00.10 шифр ВАК
Антимикробные пептиды сорного растения Stellaria media и их гены: экспрессия и устойчивость к фитопатогенным грибам2011 год, кандидат биологических наук Шукуров, Рахим Рахманкулыевич
α-Гарпинины - защитные пептиды растений2014 год, кандидат наук Опарин, Петр Борисович
Биологическая активность новых антимикробных пептидов - эмерициллипсинов и разработка биотехнологии их получения2023 год, кандидат наук Гаврюшина Ирина Александровна
Структурно-функциональные особенности запасных и защитных белков растений и их использование в генетических исследованиях2010 год, доктор биологических наук Одинцова, Татьяна Игоревна
Создание векторных конструкций, содержащих гены фунгицидно-бактерицидных пептидов, и анализ полученных с их помощью трансгенных растений2002 год, кандидат биологических наук Сердобинский, Леонид Александрович
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структурно-функциональный анализ новых антимикробных пептидов семян ежовника обыкновенного: Echinochloa crus-galli»
1. Введение
1.1. Актуальность темы
В последнее время значительное внимание уделяется поиску в растениях органических веществ, обладающих биологической активностью, при этом основной упор делается на соединения, проявляющие бактерицидную или фунгицидную активность. Среди таких соединений наиболее представлены различные полифенолы, фенольные гликозиды, сапонины, ненасыщенные лактоны, диены и пигменты. Остается открытым вопрос о возможности их применения в защите культурных растений от болезней, поскольку все они являются низкомолекулярными вторичными метаболитами и внедрение их в будущем может привести всего лишь к замещению используемых в настоящее время пестицидов на аналогичные.
На этом фоне наиболее актуальными становятся проблемы поиска и изучения защитных пептидов растений, к которым относят антимикробные пептиды (АМП) и ингибиторы гидролаз насекомых. Эти молекулы, являясь компонентами иммунитета растений, способны действовать против патогенов в достаточно низких концентрациях, что часто коррелирует с их небольшим содержанием в растениях. Подобные пептиды могут образовывать семейства гомологичных молекул.
Важным направлением исследований в данной области является изучение АМП, выделенных из культурных и дикорастущих (в том числе сорных) растений сочетанием методов протеомики и геномики. В настоящее время считается, что относительная степень устойчивости дикорастущих растений к фитопатогенам обусловлена наличием АМП со специфическими структурами, которые могут действовать как индивидуально, так и в комплексе. Молекулярные и клеточные механизмы действия АМП растений также являются предметом активного изучения (Fant et al., 2000; van der Weerden et al., 2008; 2010; Lay et al., 2012).
АМП с широким спектром активности являются ключевыми факторами, обеспечивающими реализацию иммунной системы растений. Эти
молекулы способны активно действовать в ответ на внедрение патогенного микроорганизма в растение. Семена являются богатым источником различных пептидов, в том числе антимикробных. АМП растений представляют особый большой интерес для создания устойчивых к патогенам форм растений, поскольку их гены могут быть непосредственно встроены в геном с использованием методов генетической трансформации. Помимо этого, АМП рассматриваются в качестве альтернативы используемым пестицидам, что в перспективе может позволить сократить количество обработок агрохимикатами. Кроме того, применение таких соединений может способствовать активному подавлению патогенных организмов, обладающих резистентностью к используемым химическим средствам защиты растений.
1.2. Цели и задачи исследования
Цель данной работы заключалась в выделении и структурно-функциональном исследовании ряда новых антимикробных пептидов семян ежовника (ЕсЫпосЫоа сгш^аШ).
В процессе данной работы были поставлены следующие экспериментальные задачи:
1. Оптимизировать метод выделения АМП из семян ежовника.
2. Выделить и установить структуры новых антимикробных пептидов семян ежовника.
3. Проверить наличие антимикробной активности выделенных соединений.
4. Изучить взаимодействие АМП семян ежовника с фитопатогенным микроорганизмом на клеточном уровне.
1.3. Научная новизна исследований
Предложен метод выделения антимикробных пептидов из семян ежовника, сочетающий их кислотную экстракцию с последующим
фракционированием методами жидкостной хроматографии. Впервые из семян растения семейства Злаковые выделены дефензины, обладающие антифунгальной активностью на широкий спектр видов фитопатогенов, определены их полные первичные структуры. Показано, что замена Ala на His в С-концевом фрагменте молекулы дефензина достоверно приводит к снижению его антифунгальной активности. Из семян ежовника выделен новый пептид с уникальным расположением остатков цистеина, обладающий антифунгальной активностью широкого спектра. Для этого пептида установлена пространственная структура, представляющая собой новый тип укладки полипептидной цепи растительных антимикробных пептидов. Изучено взаимодействие пептида с фитопатогенным грибом на клеточном уровне и показано, что данная молекула обладает фунгистатическим действием и способна связываться с оболочкой спор гриба с последующей интернализацией в цитоплазму без нарушения целостности плазматической мембраны.
1.4. Практическая значимость
Выделенные в данной работе АМП семян ежовника могут быть использованы в для получения генетических конструкций с целью создания культурных растений с трансформированным геномом, обладающих повышенной устойчивостью к грибным фитопатогенам.
ГЛАВА I. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
1. Характеристика антимикробных пептидов растений
Антимикробные пептиды являются важными компонентами врождённой системы защиты от патогенов всех живых организмов. Большинство АМП обладают широким спектром действия и могут рассматриваться как новый класс перспективных антимикробных агентов. По сравнению с традиционными антибиотиками антимикробные пептиды проявляют высокую селективность по отношению к патогенным микроорганизмам и в большинстве случаев не токсичны для животных и человека. В отличие от животных, растения не имеют характерной иммунной системы, поэтому антимикробные пептиды составляют основу их защиты от широкого спектра патогенов. Таким образом, всестороннее изучение данных соединений является перспективным направлением в области создания растений с трансформированных геномом с повышенной устойчивостью в стрессовым факторам биотической природы.
В последнее время подобные исследования стали особенно актуальны благодаря высокому развитию методов генной инженерии. Известны случаи применения антимикробных пептидов для создания трансгенных животных. Однако до сих пор точно не выяснена взаимосвязь между структурой и антимикробными свойствами защитных пептидов. Много неясного остаётся в клеточных и молекулярных механизмах их действия.
2. Классификация антимикробных пептидов растений
Ген - кодируемые антимикробные пептиды - это древние компоненты конститутивных защитных систем многоклеточных организмов для борьбы с патогенами (Thomma et al., 2002; Ganz, 2003). В настоящее время известно более 1000 АМП, обладающих различной структурой, аминокислотным составом и механизмом действия. Многие из них обладают широким спектром антимикробной активности. Общей чертой большинства таких
пептидов является неспецифическое взаимодействие с цитоплазматической мембраной, приводящее к разрушению липидного слоя и лизису атакуемой клетки. Полагают, что некоторые АМП проявляют высокую рецептор-независимую специфичность к патогенам, другие - взаимодействуют с определенными рецепторами на поверхности мембраны клетки патогена или с внутриклеточными мишенями (Garcia-Olmedo et al., 1998). В настоящее время АМП представляют собой полипептидные соединения длиной не более чем 100 аминокислотных остатков (Thomma et al., 2002; Ganz, 2003).
АМП обладают рядом общих для них свойств: небольшим размером, сумарным положительным зарядом молекулы, а также амфифильностью структуры, что позволяет им непосредственно или с участием рецепторов взаимодействовать с мембранами микроорганизмов, приводя к нарушению ее проницаемости.
Из разных видов растений, преимущественно из семян, выделены более тысячи АМП. В настоящее время в растениях обнаружено 7 основных семейств антимикробных пептидов, размеры которых варьируют в среднем от 20 до 90 аминокислот. К ним относятся тионины, дефензины, гевеин- и ноттин-подобные пептиды, циклотиды (макроциклические пептиды), неспецифические липид-переносящие белки и снекины (Hancock and Chappie, 1999; Garcia-Olmedo et al., 1998; Garcia-Olmedo et al., 2001) (табл. 1).
Кроме того, из ряда растений выделены АМП, не относящиеся ни к одному из известных семейств: АМП МВР-1 зерна кукурузы (Zea mays) (Duvick et al., 1992), пять АМП (MiAMPl, MiAMP2a, b, с, d) из нута (Macadamia integrifolia) (Marcus et al., 1997, 1999) и четыре гомологичных АМП (Ib-AMPl-4) семян недотроги мелкоцветковой (Impatiens balsamina) (Tailor et al., 1997).
Табл. 1. Классификация АМП растений
Семейство АМП
Биологическое действие
Структурные особенности
Литературны й источник
Тионины
Дефензины
Липид-
переносящие
белки
Гевеин-подобные
Ноттин-подобные
Циклотиды
Снекины
Антимикробное, ингибирование роста растительных и животных клеток
Фунгицидное,
бактерицидное
действие на
грамположительные
бактерии
Перенос
фосфолипидов,
фунгицидная и
бактерицидная
активность
Фунгицидное действие, в меньшей степени
антибактериальное на
грамположительные бактерии
Фунгицидное действие
Гемолитическая, бактерицидная и фунгицидная активность
Фунгицидное и бактерицидное действие
45-47 а.к.о., две а-спирали, образующие длинную ветвь, и короткая В-складка, образующая короткую ветвь, стабилизированную 3-4 8-8 мостами 35-54 а.к.о., одна а-спираль и 3 участка В-структуры, стабилизированные 4 8-8 мостами
90-93 а.к.о., 4 8-8 моста, 4 а-спиральных участка, соединенных петлями
29-41 а.к.о, 3-5 8-8 моста
Трехмерная структура представлена антипараллельным В-листом и В-поворотами
28-38 а.к.о., 3 8-8 моста
29-31 а.к.о., 3 В-складки, 3 S-S моста
63 а.к.о., 6 S-S мостов
Florack and Stiekema, 1994; Stec, 2006
Térras et al., 1995b;
Broekaert et al., 1995
Nielsen et al., 1996
Broekaert et al, 1992b; Martins et al., 1996; Odintsova et al., 2009
Broekaert et al., 1992a;
Broekaert et al., 1996
Craik et al., 1999, 2010; Ireland et al., 2006
Segura et al., 1999; Berrocal-Lobo et al., 2002
Все эти молекулы являются положительно заряженными при физиологических значениях рН, цистеин-богатыми, имеющими компактную
структуру, стабилизированную дисульфидными связями, число которых составляет от двух до десяти (рис. 1).
Рис. 1. Пространственные структуры различных семейств АМП растений: А -дефензии семян редиса (Brassica napus) (PDB ID: 1AYJ, Fant et al., 1998); Б - ß-пуротионин зерновок пшеницы (Triticum aestivum) (PDB ID: 1BHP, Stec et al.,
1995); В - неспецифический липид-переносящий белок зерновок пшеницы (Triticum aestivum) (PDB ID: 1GH1, Gincel et al., 1994); Г - гевеиноподобный пептид семян амаранта (Amaranthus caudatus) (PDB ID: 1MMC, Martins et al.,
1996); Д - циклический пептид из Chassalia parvifolia (PDB ID: 1BH4, Daly et al., 1999); E - ноттиноподобный пептид из Phytolacca americana (PDB ID: 1DKC, Gao et al., 2001). a-спирали выделены красно-желтым цветом, ß-тяжи - светло-синим.
Большинство таких пептидов несут гидрофобный и заряженный домены. Данная структура называется амфифильной и обеспечивает взаимодействие пептида с мембраной микроорганизма (Garcia-Olmedo et al., 2001). Все растительные АМП, для которых известна их пространственная организация, содержат ß-складки, ассоциированные с а-спиралью/спиралями (Hancock and Chappie, 1999).
Тионины представляют собой первые АМП, выделенные из растений. Представители этого семейства обнаружены в различных органах (семенах,
Д ^ Е
2.1. Тионины
стеблях, корнях, листьях) разных растений. Установлено, что тионины локализованы в вакуолях (Romero et al., 1997). В настоящее время известно более 100 последовательностей тионинов из 15 видов растений (Stec, 2006). Все они являются высокоосновными или нейтральными пептидами длиной в среднем 45-47 аминокислотных остатков (а.к.о.), соединенных 3-4 дисульфидными связями.
Тионины синтезируются в виде предшественников с молекулярной массой около 18 кДа, содержащих сигнальный и зрелый пептиды, а также С-концевой пропептид (Epple et al., 1995); в пределах одного вида растения С-концевые пропептиды могут быть высоко консервативны (Schräder-Fischer, Apel, 1993, 1994). Удаление С-концевого пропептида происходит в результате посттрансляционной модификации молекулы предшественника тионинов. Предполагается, что функция С-концевого пропептида состоит в нейтрализации токсического действия зрелого пептида до момента поступления предшественника в межклеточное пространство или в вакуоли (Florack and Stiekema, 1994; Bohlmann, 1994).
Пространственная структура тионинов (рис. 1Б) образована двумя параллельными a-спиралями и короткой ß-складкой. С-концевой участок тионинов образует петлю (Majewski J, Stec В., 2009).
Антимикробная активность данных пептидов показана по отношению к грамположительным и грамотрицательным бактериям, грибам, дрожжам, а также для культур эукариотических клеток. Они ингибируют рост бактерий, а также фитопатогенных грибов и оомицетов при ингибирующей концентрации, вызывающей 50% эффект (ИК50) в диапазоне 1-15 мкг/мл (Stec, 2006; Loeza-Ángeles et al., 2008). Антифунгальная активность тионинов сильно снижается при наличии в среде ионов Ca в концентрациях более 5 мМ и одновалентными катионами при концентрации менее 50 мМ.
Как было отмечено выше, тионины действуют на культуры эукариотических клеток (млекопитающих и насекомых), а также изменяют
проницаемость растительных протопластов (Florack and Stiekema, 1994, Stec, 2006; Loeza-Angeles et al., 2008).
Тионины участвуют не только в пассивном, но и в активном иммунитете растений; они активно синтезируются в ответ на проникновение в растение бактериальных патогенов и входят в состав класса PR-13 защитных белков растений (Bohlmann et al., 1998; Bergey et al., 1996; Vignutelli et al., 1998).
2.2. Дефензины
Дефензины - защитные пептиды, обнаруженные у растений семейств Крестоцветные (Cruciferae) (Broekaert et al., 1995), Бобовые (Fabaceae) (Lobo et al., 2007; Graham et al., 2004), Маревые (Chenopodiaceae) (Kristensen et al., 1999), Сложноцветные (Compositae) (de Zelicourt et al., 2007), Пасленовые (Solanaceae) (Do et al., 2004; Meyer et al., 1996), Лилейные (Liliaceae) (Fujimura et al., 2004), Конскокаштановые (Hippocostanaceae) (Osborn et al., 1995), Гингковые (Gingkoceae) (Shen et al., 2005), Розовые (Rosaceae) (Wisniewski et al., 2003), Амарантовые (Amaranthaceae) (Segura et al., 1998), Тыквенные (Cucurbitaceae) (Da-Hui et al., 2007), Злаковые (Gramineae) (Bloch and Richardson, 1991; Mendez et al., 1990, 1996), и у некоторых хвойных (Pinophyta) (Sharma and Lonneborg, 1996).
Большинство дефензинов выделено из семян растений (Wong and Ng, 2003, 2005), некоторые из них также были обнаружены в листьях (Terras et al., 1995; Kragh et al., 1995), цветках (Karunanandaa et al., 1994; Lay et al., 2003), клубнях (Moreno et al., 1994), стручках (Almeida et al., 2000) и мякоти фруктов (Meyer et al., 1996; Oh et al., 1999).
Дефензины растений представляют собой пептиды с молекулярной массой в среднем 5-5,5 кДа, которые содержат 8 остатков цистеина, образующих 4 дисульфидные связи (Broekaert et al., 1995; Thomma et al., 2002; Lay, Anderson, 2005; Pelegrini, Franco, 2005; Carvalho, Gomes, 2009). В качестве исключения можно отметить дефензины, выделенные из цветков
некоторых растений семейства Пасленовые, в молекулах которых 10 остатков цистеина (Lay et al., 2003).
Впервые дефензины были выделены из зерновок ячменя и пшеницы, поэтому первоначально считалось, что они представляют собой подсемейство тионинов, из-за чего получили название "у-тионины" (Colilla et al., 1990, Mendez et al., 1990). В дальнейшем было показано, у-тионины структурно отличаются от тионинов и обладают гомологией с дефензинами млекопитающих и насекомых, на основании чего были выделены в отдельное семейство "растительных дефензинов" (Broekaert et al., 1995; Terras et al., 1995).
2.2.1. Классификация дефензинов
Дефензины растений, состоящие из 45-54 а.к.о., имеют суммарный положительный заряд и синтезируются тканеспецифично. Известно несколько семейств дефензинов растений, которые объединяют в четыре группы (Thomma, 2002; Marcus et al., 1999): 1) действующие на грамотрицательные и грамположительные бактерии; 2) действующие на грамположительные бактерии и грибы; 3) действующие только на грибы; 4) действующие на грамотрицательные и грамположительные бактерии и грибы.
2.2.2. Структурные особенности дефензинов
Большинство дефензинов синтезируется в виде предшественников, содержащих сигнальный и зрелый пептиды. Некоторые дефензины цветков имеют С-концевой домен (Lay et al., 2003). Помимо транспорта в межклеточное пространство вместе с сигналным пептидом, роль С-концевого домена пептида, по аналогии с дефензинами млекопитающих, вероятно, заключается в лимитировании токсического действия зрелой молекулы дефензина (Michaelson et al., 1992). Сравнение аминокислотных последовательностей дефензинов растений, установленных путем белкового
секвенирования или по структуре кДНК, выявило высокую вариабельность структуры. Консервативными являются 8 остатков цистеина, образующих характерный для этого семейства цистеиновый мотив. В молекуле дефензинов нет свободных тиольных группировок, все остатки цистеина замкнуты с образованием дисульфидных связей.
Пространственная структура была установлена для ряда дефензинов (Carvalho and Gomes, 2009). Основу их компактной структуры составляет а-спираль и параллельно расположенные три тяжа (3-структуры.
Рис. 2. Пространственные структуры дефензинов некоторых живых организмов: А - u-дефензин человека (PDB ID: 3HJD); Б - ß-дефензин человека (PDB ID: 1IJV, Hoover et al., 2001); В - 0-дефензин обезьяны Rhesus macaque (PDB ID: 1HVZ, Trabi et al., 2001); Г - дефензин цветков Nicotiana alafa (PDB ID: 1MR4, Lay et al., 2003); Д - хелиомицин совки Heliothis virescens (PDB ID: 1I2U, Lamberty et al., 2001); E - дефензин из мидии (PDB ID: 1FJN, Jang et al., 2000). a-спирали выделены красно/желтым цветом, ß-тяжи - светло-синим.
Основным структурным элементом такого типа структур является цистеин-стабилизированный мотив CSaß, в котором единственная a-спираль соединена двумя дисульфидными мостами со вторым из трех ß-тяжей, а
В
Е
остаток цистеина первого из трех ß-тяжей образует дисульфидную связь с остатком цистеина N-концевой петли молекулы (рис. 1А) (Shaaper et al., 2000).
На рисунке 2 представлено сравнение пространственных структур дефезинов различных живых организмов. Важно отметить, что такой же мотив есть у дефензинов насекомых и нейротоксинов скорпионов (Bontems et al., 1991; Cornet et al., 1995). При этом подобное дефензинам растений расположение элементов вторичной структуры наблюдается также у моллюсков, что может свидетельствовать о древности и общности происхождения. Эта гипотеза основывается на большем структурном сходстве между ß-дефензинами позвоночных и дефензинами насекомых, чем между а- и ß-дефензинами позвоночных. Помимо структурного подобия между дефензинами, принадлежащими к различным царствам живого мира, есть и функциональное сходство (Aerts et al., 2008).
У некоторых дефензинов обнаружены уникальные структурные особенности. Так, у дефензина VrDl из золотистой фасоли (Vigna radiata) присутствует спираль 310 (Liu et al., 2006), у дефензина PhDl из петунии (Petunia hybrida) дополнительная дисульфидная связь соединяет петлю между первой ß-складкой и а-спиралью (Janssen et al., 2003). Кроме того, известно, что некоторые дефензины могут образовывать димеры in vitro (Terras et al., 1992; Lay et al., 2012).
2.2.3. Биологическая активность растительных дефензинов
У дефензинов растений обнаружена разнообразная биологическая активность, Они способны ингибировать трансляцию в бесклеточной системе (Mendez et al., 1990, 1996; Chen et al., 2004), некоторые дефензины обладают свойствами ингибиторов ферментов - а-амилаз и протеиназ (Bloch, Richardson, 1991; Mendez et al., 1996; Wijaya et al., 2000; Melo et al., 2002), a также являются ингибиторами натриевых каналов (Kushmerick et al., 1998). Считается, что дефензины - ингибиторы гидролаз насекомых - участвуют в
защите от вредителей. Исследование дефензинов, обладающих способностью ингибировать сериновые трипсино-подобные протеазы, позволило идентифицировать аминокислотные остатки, ответственные за реализацию данной активности (Melo et al., 2002).
Наибольший массив данных по антимикробной активности дефензинов - антифунгальной и антибактериальной. Первыми дефензинами, для которых была показана антифунгальная активность, были пептиды семян редиса (Raphanus sativus) Rs-AFPl и Rs-AFP2 (Terras et al., 1992). При этом экспериментально было установлено, что эти пептиды выделяются в окружающую среду при прорастании семян, защищая проростки от грибной инфекции в почве (Terras et al., 1995). Дефензины, обладающие антимикробной активностью, были выделены из большого числа преимущественно двудольных растений (Lay and Anderson, 2005; Pelegrini and Franco, 2005; Carvalho and Gomes, 2009).
По действию на грибы дефензины растений делятся на две группы: морфогенетические дефензины ингибируют удлинение гиф, стимулируют их боковое ветвление и вызывают различные изменения грибных структур, и неморфогенетические, способные только подавлять рост мицелия, но не вызывают морфологических нарушений (Broekaert et al., 1995; Osborn et al., 1995). Гены, кодирующие дефензины у некоторых растений, способны экспрессироваться в ответ на заражение патогенами, стрессовые факторы абиотической природы (засуху, солевой стресс и низкие температуры) то есть участвуют в индуцированном иммунитете (Terras et al., 1995а; Penninckx et al., 1996; Koike et al., 2002). На основании этих данных, дефензины растений были включены в класс PR-12 защитных белков растений (Terras et al., 1995а).
Активность дефензинов в большей степени обусловлена структурными особенностями самой молекулы, хотя также зависит и от вида фитопатогенного гриба. К примеру, в среде, содержащей 1 мМ СаС12 и 50 mM KCl, дефензин из конского каштана (Aesculus hippocästanum) Ah-AMPI
активен против гриба Leptosphaeria maculans при действующей концентрации ИК50 равной 6 мкг/мл, но неактивен в отношении Fusarium culmorum. Тогда как дефензин из гейхеры кроваво-красной (Heuchera sanguínea) Hs-AFPl был неактивен в отношении первого гриба, но ингибировал второй при концентрации ИК50 равной 3 мкг/мл (Osborn et al., 1995). В ряде опытов показано, что антифунгальная активность дефензинов растений снижается при увеличении ионной силы раствора, причем двувалентные катионы оказывают более сильное действие, чем одновалентные (Osborn et al., 1995). В ряде работ были идентифицированы участки полипептидной цепи дефензинов растений и аминокислотные остатки, ответственные за антифунгальную активность (De Samblanx et al., 1997; Almeida et al., 2002).
Ряд дефензинов растений обладают также и антибактериальной активностью. Показано, что дефензин Ct-AMP1 из клитории тройчатой (Clitoria ternatea) активен против Bacillus subtilis (Osborn et al., 1995), дефензины, выделенные из клубней картофеля {Solanum tuberosum) и листьев шпината {Spinacea oleráceo) подавляют рост колоний Pseudomonas solanacearum и Clavibacter michiganense (Moreno et al., 1994, Segura et al., 1998), а а дефензин TAD1 из твердой пшеницы {Triticum aestivum) действует на Pseudomonas cichoriii (Koike et al., 2002).
На антимикробную роль дефензинов in vivo, помимо тестов биологической активности in vitro, указывает их локализация в периферических слоях клеток (Almeida et al., 2000; Chen et al., 2002).
Установлено, что гены дефензинов могут индуцироваться сигнальными молекулами (метилжасмонатом, салициловой кислотой, этиленом, абсцизовой кислотой, перекисью водорода), а также поранением. При этом регуляция экспрессии генов дефензинов зависит от самого вида растения. Например, у арабидопсиса {Arabodopsis thaliana), гены дефензинов индуцируются грибной инфекцией, метилжасмонатом и этиленом, а поранение и повышение концентрации салициловой кислота не вызывают
активации этих генов (Penninckx et al., 1996; Terras et al., 1998). У перца (Capsicum аппиит) экспрессия гена дефензина CADEF1 возрастала под действием салициловой кислоты, метилжасмоната, перекиси водорода и абсцизовой кислоты, но была не чувствительна к этилену (Do et al., 2004).
Некоторые дефензины растений связаны с устойчивостью к стрессовым факторам абиотической природы: низким температурам (Коеке et al., 2002) и повышенным концентрациям Zn (Mirouze et al., 2006) и при развитии растений (Stotz et al., 2009).
Кроме того, также установлены факты токсичности некоторых дефензинов для клеток растений и животных (Anaya-Lopez et al., 2006; de Zélicourt et al., 2007). Показано ингибирующее действие некоторых растительных дефензинов на культуры раковых клеток человека (Anaya-lopez et al., 2006; Wang, Ng, 2007; Wang et al., 2008). Разнообразие биологической активности, обнаруженной у дефензинов, а также их способность ингибировать патогены человека делают их чрезвычайно перспективными для разработки лекарственных препаратов нового поколения (Thevissen et al., 2007).
2.3. Неспецифические липид-переносящие белки
Липид-переносящие белки (ЛПБ) являются одним из семейств АМП растений и представляют собой цистеин-богатые катионные белки, связывающие липиды. Эти молекулы широко распространены среди растений (Kader, 1996; Marion et al., 2007).
ЛПБ могут осуществлять перенос фосфолипидов, жирных кислот или ацил-СоА между искусственными мембранами in vitro или из липосом в митохондрии. Эти белки не обладают специфичностью в отношении переносящих фосфолипидов, поэтому они низываются неспецифическими липид-переносящими белками. Помимо переноса фосфолипидов между мембранами для этих молекул показан целый ряд других функций: участие в образовании кутина, эмбриогенезе, симбиозе, а также роли в устойчивости
растений к абиотическим условиям окружающей среды и в защите от патогенов (Garcia-Olmedo et al., 1995; Kader, 1996; Broekaert et al., 1997; Douliez et al., 2000). Кроме того, некоторые из них способны ингибировать активность а-амилаз животных (Campos, Richardson, 1984; Bernhard, Somerville, 1989).
Для всех ЛПБ характерен одинаковый цистеиновый мотив и высокое значение изоэлектрической точки, однако, несмотря на это, они подразделены на два подсемейства - с молекулярной массой около 9-10 и 7-8 кДа (рис. 3).
Рис. 3. Пространственные структуры липид-переносящих белков злаков: А -9-кДа ЛПБ ячменя (Hordeum vulgare) (PDB ID: ÍLIP, Heinemann et al., 1996); Б -7-кДа ЛПБ овса (Oryza sativa) (PDB ID: 1L6H, Samuel et al., 2002). a-спирали выделены красным цветом, ß-участки - желтым.
Пространственная структура представителей обоих подсемейств имеет схожее строение: в молекулах этих белков содержится гидрофобная полость, образованная 4 a-спиральными участками, стабилизированными 4 дисульфидными мостами (Yeats, Rose, 2008). Установлено, что в этой полости диаметром около 5 Á и длиной около 15 Á могут разместиться 12 атомов углерода ацильной цепи жирной кислоты (Gomar et al., 1996).
Все растительные ЛПБ синтезируются в клетке в виде пробелков (Kader et al., 1996) за исключением белка Асе-AMPI из семян лука (Allium
сера), предшественник которого представляет собой препробелок с С-концевым пропептидом (Cammue et al., 1995).
Методами ЯМР-спектроскопии и рентгеноструктурного анализа определена пространственная структура некоторых ЛПБ одно- и двудольных растений (Yeats and Rose, 2008). Помимо консервативных остатков цистеина, в молекулах этих белков есть консервативные остатки (lie, Val, Leu, Ala), которые участвуют в связывании липидов (рис. 1В, ЗА). Структура белков второго подсемейства изучена значительно меньше и установлена только для белков из риса (Oryza sativa) (Samuel et al., 2002) и пшеницы (Triticum aestivum) (Höh et al., 2005). У белков этого семейства также имеется четыре a-спиральных участка, удерживаемых четырьмя дисульфидными мостами, вокруг гидрофобной полости, связывающей липиды (рис.ЗБ).
Похожие диссертационные работы по специальности «Биоорганическая химия», 02.00.10 шифр ВАК
Антимикробные пептиды секрета слюнных клеток медицинской пиявки Hirudo medicinalis2021 год, кандидат наук Графская Екатерина Николаевна
Биологическая активность антимикробных пептидов из яда паука Lachesana tarabaevi на модели инфекции Chlamydia trachomatis2015 год, кандидат наук ПОЛИНА НАДЕЖДА ФЕДОРОВНА
Антимикробные факторы в контроле внешней и внутренней среды мясных мух: Diptera, Calliphoridae2014 год, кандидат наук Кругликова, Анастасия Анатольевна
Значение антимикробных пептидов в формировании патологии полости рта у детей с атопическим дерматитом2014 год, кандидат наук Кулакова, Елена Владимировна
Модуляция системы комплемента антимикробными пептидами2018 год, кандидат наук Умнякова Екатерина Сергеевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Рогожин, Евгений Александрович, 2013 год
Библиографический список
1. Белозерская Т.А. Гидрофобины грибов: структура и функция // Микология и фитопатология, 2001, Т. 35, № 11, С. 3-11.
2. Валуева Т.А., Мосолов В.В. Роль ингибиторов протеолитических ферментов в защите растений // Успехи биол. химии, 2002, Т. 42, С. 193-216.
3. Калебина Т.С., Кулаев И.С. Роль белков в формировании молекулярной структуры клеточной стенки дрожжей // Успехи биол. химии, 2001, Т. 41, С. 105-130.
4. Ляпкова Н.С., Лоскутова Н.А., Майсурян А.Н. и др. Получение генетически модифицированных растений картофеля несущих ген защитного пептида амаранта // Прикладная биохимия и микробиология, 2001, Т.37, №3, С. 349-354.
5. Мосолов В.В., Валуева Т.А. Ингибиторы протеиназ и их функции у растений (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология, 2005, Т. 43, № 3, С. 261-282.
6. Озерецковая О.Л., Ильинская Л.И., Васюкова Н.И. Механизмы индуцирования устойчивости растений к болезням // Физиология растений, 1994, Т. 41, №4, С. 626-633.
7. Сотченков Д.В., Голденкова И.В. Антимикробные белки и пептиды, учавствующие в защите растений от грибных и бактериальных патогенов // Успехи современной биологии, 2003, Т. 123, №4, С. 323-335.
8. Цыбина Т.А., Дунаевский Я.Е., Мусолямов А.Х., Егоров Ц.А., Белозерский М.А. (2001) Катионные ингибиторы сериновых протеиназ семян гречихи // Биохимия, 2001, Т. 66, С. 1157-1164.
9. Aerts A.M., Francois I.E.J.A., Meert E.M.K., Li Q., Cammue B.P.A., Thevissen K. The antifungal activity of RsAFP2, a plant defensin from Raphanus sativus, involves the induction of reactive oxygen species in Candida albicans II J. Mol. Microbiol. Biotechnol., 2007, V. 13, P. 243-247.
10. Aerts A.M., François I.E., Cammue B.P., Thevissen K. The mode of antifungal action of plant, insect and human defensins // Cell Mol. Life Sei., 2008, V. 65 (13), P. 2069-79.
11. Almasia N.I., Bazzini A.A., Hopp H.E., Vazquez-Rovere C. Overexpression of snaking ß-1 gene enhances resistance to Rhizoctonia solani and Erwinia carotovora in transgenic potato plants // Mol. Plant Pathol., 2008, V. 9, P. 329338.
12. Almeida M.S., Cabrai K.S. Characterization of two novel defense peptides from pea Pisum sativum II Arch. Biochem. Biophys., 2000, V. 378 (2), P. 278-286.
I
13. Anaya-Lopez J.L., Lopez-Meza J.E., Baizabal-Aguirre V.M., Cano-Camacho H., Ochoa-Zarzosa A. Fungicidal and cytotoxic activity of a Capsicum Chinese defensin expressed by endothelial cells // Biotechnol. Lett., 2006, V. 28, P. 11011108.
14. Andersen N.H., Cao B., Rodriguez-Romero, Arreguin B. Hevein: NMR assignment and assessment of solution-state folding for the agglutinin-toxin motif. // Biochemistry, 1993, V. 32, P. 1407-1422.
15. Andreev Y.A., Korostyleva T.V., Slavokhotova A.A., Rogozhin E.A., Utkina L.L., Vassilesski A.A., Grishin E.V., Egorov T.A., Odintsova T.I. Genes encoding hevein-like defense peptides in wheat: Distribution, evolution, and role in stress response // Biochemie, 2012, V. 94, P. 1009-1016.
16. Antoniw J.F., Ritter C.E., Pierpoint W.S, Van Loon L.C. Comparison of three pathogenesis-related proteins from plants of two cultivars of tobacco infected with TMV // J. Gen. Virol, 1980, V. 47, P. 79-87.
17. Ayabe T. Secretion of microbicidal a-defensins by intestinal Paneth cells in response to bacteria //Nature Immunol, 2000, V. 1, P. 113-118.
18. Bakan B, Hamber M, Perracheau L, Maume D, Rogniaux H, Tranquet O, Rondeau C, Blein J.P, Ponchet M, Mation D. Specific adduction of plant lipid transfer protein by an aliéné oxide generated by 9-lipoxygenase and aliéné oxide synthase // J. Biol. Chem, 2006, V. 281, P. 38981-38988.
19. Barnham K. J., Dyke T. R, Kem W. R., and Norton R. S. Structure of neurotoxin B-IV from the marine worm Cerebratulus lacteus: a helical hairpin cross-linked by disulphide bonding // J. Mol. Biol., 1997, V. 268, 886-902.
20. Barthe P., Rochette S., Vita C., Roumestand C. Synthesis and NMR solution structure of an alpha-helical hairpin stapled with two disulfide bridges // Protein Sci, 2000, V. 9 (5), P. 942-55.
21. Beintema J.J. Structural features of plant chitinases and chitin-binding proteins // FEBS Lett, 1994, V. 350, P. 159-163.
22. Bergey D.R, Howe G.A, Ryan C.A. Polypeptide signaling for plant defensive genes exhibit analogies to defense signaling in animals // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1996, V. 93, P. 12053-12058.
23. Bernhard W.R. and Somerville C.R. Coidentity of putative amylase inhibitors from barley and finger millet with phospholipids transfer proteins inferred from amino acid sequence homology // Arch. Biochem. Biophys, 1989, V. 269, P. 695697.
24. Bernier F. and Berna A. Germins and germin-like proteins: plant do-all proteins. But what do they do exactly? // Plant Physiol. Biochem, 2001, V. 39, P. 545-554.
25. Berrocal-Lobo M, Segura A, Moreno M, López G, García-Olmedo F. and Molina A. Snakin-2, an antimicrobial peptide from potato whose gene is locally induced by wounding and responds to pathogen infection // Plant Physiol, 2002, V. 128 (3), P. 951-961.
26. Berrocal-Lobo, M, and Molina, A. Arabidopsis defense response against Fusarium oxysporum II Trends Plant Sci, 2007, V. 13, P. 145-150.
27. Bhunia A, Domadia P. N, Torres J, Hallock K. J, Ramamoorthy A, and Bhattacharjya S. NMR structure of pardaxin, a pore-forming antimicrobial peptide, in lipopolysaccharide micelles: mechanism of outer membrane permeabilization // J. Biol. Chem, 2010, V. 285, P. 3883-3895.
28. Bhunia A, Ramamoorthy A, and Bhattacharjya S. Helical hairpin structure of a potent antimicrobial peptide MSI-594 in lipopolysaccharide micelles by NMR spectroscopy // Chemistry, 2009, V. 15, P. 2036-2040.
29. Blein J.-P, Coutos-Thevenot P, Marion D, Ponchet M. From elicitins to lipid-transfer proteins: a new insight in cell signaling involved in plant defence mechanisms // Trends Plant Sci, 2002, V. 7 (7), P. 293-296.
30. Bloch C.J, Richardson M. A new family of small (5 kDa) protein inhibitors of insect a-amylases from seeds of sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moebch.) have sequence homologies with wheat y-purothionins // FEBS J, 1991, V. 279 (1), P. 101-104.
31. Bohlmann H. The role of thionins in plant protection // Crit. Rev. Plant Sci, 1994, V. 13, P. 1-16.
32. Bohlmann H, Vignutelli A, Hilpert B, Miersch O, Wasternack C, Apel K. Wounding and chemicals induce expression of the Arabidopsis thaliana gene Thi2.1, encoding a fungal defense thionin, via the octadecanoid pathway // FEBS Lett, 1998, V. 437, P. 281-286.
33. Bolshakova, A.V, Kiselyova, O.I, and Yaminsky, I.V. Microbial surfaces investigated using atomic force microscopy // Biotechnol. Prog, 2004, V. 20, P. 1615-1622.
34. Boman, H. G. Antibacterial peptides: basic facts and emerging concepts // J. Intern. Med, 2003, V. 254, P. 197-215.
35. Bontems F, Roumestand C, Boyot P, Gilquin B, Doljansky Y, Menez A, et al. Three-dimensional structure of natural charybdotoxin in aqueous solution by 'H-NMR. Charybdotoxin possesses a structural motif found in other scorpion toxins // Eur. J. Biochem, 1991, V. 196, P. 19-28.
36. Broekaert W.F, Marien W, Terras F.R.G, De Bolle M.F.C, Proost P, Van Damme J, Dillen L, Claeys M, Rees S.B, Vanderleyden J, Cammue B.P.A. Antimicrobial peptides from Amaranthus caudatus seeds with sequence homology to the cysteine-glycine-rich domain of chitin-binding proteins // Biochemistry, 1992, V. 31, P. 4308-4314.
37. Broekaert W.F, Terras F.R.G, Cammue B.P. and Osborn R.W. Plant defensins: novel antimicrobial peptides as components of the host defense system //Plant Physiol, 1995, V. 108, P. 1353-1358.
38. Broekaert W.F, Cammue B.P.A, De Bolle M.F.C, Thevissen K, De Samblanx G.W, Osborn R.W. Antimicrobial peptides from plants // Crit. Rev. Plant Sci, 1997, V. 16, P. 297-323.
39. Broekaert W.F, Terras F.R.G, Cammue B.P.A. Induced and preformed antimicrobial proteins. In: Mechanisms of resistance to plant diseases. Slusarenko A.J, Fraser R.S.S, van Loon L.C, eds. Kluwer Academic Publishers, 2000, P. 371-479.
40. Brown K.L, Hancock R.E.W. Cationic host defense (antimicrobial) peptides // Curr. Opin. Immunol, 2006, V. 18 (1), P. 24-30.
41. Bruix M, Jimenez M.A, Santoro J, Gonzalez C, Colilla F.J, Mendez E. and Rico M. Solution structure of gamma 1-H and gamma 1-P thionins from barley and wheat endosperm determined by 'H-NMR: a structural motif common to toxic arthropod proteins // Biochemistry, 1993, V. 32 (2), P. 715-724.
42. Bufe A, Spangfort M.D, Kahlert H, Schlaak M, Becker W.-M. The major birch pollen allergen, Bet vl, shows ribonuclease activity // Planta, 1996, V. 199, P. 413-415.
43. Buhot N, Douliez J.-P, Jacquemard A, Marion D, Tran V, Maume B.F, Milat M.-L, Ponchet M, Mikes V, Kader J.-C, Blein J.-P. A lipid transfer protein binds to a receptor involved in the control of plant defence responses // FEBS Lett, 2001, V. 509, P. 27-30.
44. Buhot N, Gomes E, Milat M.L, Ponchet M, Marion D, Lequeu J, Delrot S, Coutos-Thevenot P, Blein J.P. Modulation of the biological activity of a tobacco LTP1 by lipid complexation // Mol. Biol. Cell, 2004, V. 15, P. 5047-5052.
45. Buhtz A, Kolasa A, Arlt K, Walz C, Kehr J. Xylem sap protein composition is conserved among different plant species // Planta, 2004, V. 219, P. 610-618.
46. Bussing A, Vervecken W, Wagner M, Pfuller U, Schietzel M. Expression of mitochondrial Apo2.7 molecules and caspase-3 activation in human lymphocytes
treated with the ribosome-inhibiting mistletoe lectins and the cell membrane permeabilizing viscotoxins // Cytometry, 1999, V. 37, P. 133-139.
47. Caaveiro J.M.M, Molina A, Rodriguez-Palenzuela P, Goni F.M, Gonzales-Manas J.M. Interaction of wheat a-thionin with large unilamellar vesicles // Protein Sci., 1998, V. 7, P. 2567-2577.
48. Cammue B.P.A, De Bolle M.F.C, Terras F.R.G, Proost P, Van Damme J, Rees S.B, Vanderleyden J, Broekaert W.F. Isolation and characterization of a novel class of plant antimicrobial peptides from Mirabilis jalapa L. seeds // J. Biol. Chem, 1992, V. 267, P. 2228-2233.
49. Cammue B.P.A, Thevissen K, Hendriks M, Eggermont K, Goderis I.J, Proost P, Van Damme J, Osborn R.W, Guerbette F, Kader J.-C.. A potent antimicrobial protein from onion seeds showing sequence homology to plant lipid transfer proteins // Plant Physiol, 1995, V. 109 (2), P. 445-455.
50. Campos F.A.P. and Richardson M. The complete amino acid sequence of the a-amylase inhibitor 1-2 from seeds of ragi (Indian finger millet, Eleusine coracana Gaertn.) // FEBS Lett, 1984, V. 167, P. 221-225.
51. Carlini C.R. and Grossi-de-Sa M.F. Plant toxic proteins with insecticidal properties. A review on their potentialities as bioinsecticides // Toxicon, 2002, V. 40, P. 1515- 1539.
52. Carmona M.J, Molina A, Fernandez J.A, Lopez-Fando J.J, Garcia-Olmedo F. Expression of the a-thionin gene from barley in tobacco confers enhanced resistance to bacterial pathogens // Plant J, 1993, V. 3, P. 457-462.
53. Carvalho A.O. and Gomes V.M. Plant defensins - prospects for the biological functions and biotechnological properties // Peptides, 2009, V. 30, P. 1007-1020.
54. Casacuberta J.M, Puigdomenech P, San-Segundo B. A gene coding for a basic pathogenesis-related (PR-like) protein from Zea mays. Molecular cloning and induction by a fungus (Fusarium monliforme) in germinating maize seeds // Plant Mol. Biol, 1991, V. 16, P. 527-536.
55. Chagolla-Lopez A, Blanco-Labra A, Patthy A, Sanchez R, Pongor S. A novel a-amylase inhibitor from amaranth {Amaranthus hypocondricus) seeds // J. Biol. Chem., 1994, V. 269, P. 23475-23680.
56. Chagot B, Pimentel C, Dai L, Pil J, Tytgat J, Nakajima T, Corzo G, Darbon H, and Ferrat G. An unusual fold for potassium channel blockers: NMR structure of three toxins from the scorpion Opisthacanthus madagascariensis II Biochem. J, 2005, V. 388, P. 26-271.
57. Charity J.A, Hughes P, Anderson M.A, Bittisnich D.J, Whitecross M, Higgins T.J. Pest and disease protection conferred by expression of a barley hordothionin and Nicotiana alata proteinase inhibitor genes in transgenic tobacco // Func. Plant Biol, 2005, V. 32, P. 35-44.
58. Chassot C, Nawrath C, Metraux J.P. Cuticular defects lead to full immunityto a major plant pathogen // Plant J, 2007, V. 49, P. 972-980.
59. Chen K-C, Lin C-Y, Kuan C-C, Sung H-Y, Chen C-S. A novel defensin encoded by a mungbean cDNA exhibits insecticidal activity against bruchid // J. Agric. Food Chem, 2002, V. 50, P. 7258-7263.
60. Chen J, Chen G-H, Hsu H-C, Li S-S, Chen C-S. Cloning and functional expression of a mungbean defensin VrDl in Pichia pastoris II J. Agric. Food Chem, 2004, V. 52, P. 2256-2261.
61. Christensen A.B, Ho Cho B, Naesby M, Gregersen P.L, Brandt J, et al. The molecular characterization of two barley proteins establishes the novel PR-17 family of pathogenesis-related proteins // Mol. Plant Pathol, 2002, V. 3, P. 135144.
62. Cleveland J, Montville T. J, Nes I. F, Chikindas M. L. Bacteriocins: safe, natural antimicrobials for food preservation // J. Food Microbiol, 2001, V. 71, P. 1-20.
63. Colilla F.J, Rocher A, Mendez E. Gamma-purothionins: amino acid sequence of two polypeptides of a new family of thionins from wheat endosperm // FEBS Lett, 1990, V. 270, P. 191-194.
64. Conners R, Konarev A.V, Forsyth J, Lovegrove A, Marsh J, Joseph-Horne T, Shewry P, Brady R.L. An unusual helix-turn-helix protease inhibitory motif in a novel trypsin inhibitor from seeds of veronica (Veronica hederifolia L.) // J. Biol. Chem, 2007, V. 38, P. 27760-27768.
65. Cornet B, Bonmatin J-M, Hetru C, Hoffmann J.A, Ptak M, Vovelle F. Refined three-dimensional solution structure of insect defensin A // Structure, 1995, V. 3, P. 435-448.
66. Craig D.J, Clark R.J, Daly N.L. Potential therapeutic applications of the cyclotides and related cystine knot mini-proteins // Expert Opin. Investig. Drugs, 2007, V. 16, P. 595-604.
67. Craik D.J, Daly N.L, Bond T. and Waine C. Plant cyclotides: A unique family of cyclic and knotted proteins that defines the cyclic cystine knot structural motif // J. Mol. Biol, 1999, V. 294 (5), P. 1327-1336.
68. Craik D.J. Circling the enemy: cyclic proteins in plant defence // Trends Plant Sci, 2009, V. 14 (6), P. 328-335.
69. Craik D.J, Mylne J.S, Daly N.L. Cyclotides: macrocyclic peptides with applications in drug design and agriculture // Cell Mol. Life Sci, 2010, V. 67 (1), P. 9-16.
70. Czymmek K.J, Bourett T.M, DeZwaan T.M, Sweigard J.A, and Howard R.J. Utility of cytoplasmic fl uorescent proteins for live-cell imaging of Magnaporthe grisea in planta II Mycologia, 2002, V. 94, P. 280-289.
71. Da-Hui L, Gui-Liang J, Ying-Tao Z, Tie-Min A. Bacterial expression of a Trichosanthes lirilowii defensin (TDEF1) and its antifungal activity on Fusarium oxysporum II Appl. Microbiol. Biotechnol, 2007,V. 28, P. 62-75.
72. Daly N.L, Koltay A, Gustafson K.R, Boyd M.R, Casas-Finet J.R, Craik D.J. Solution structure by NMR of circulin A: a macrocyclic knotted peptide having anti-HIV activity // J. Mol. Biol, 1999, V. 285, P. 333-345.
73. Datta S.K, Muthukrishnan S. Pathogenesis-related proteins in plants // CRC Press. Boca Raton, FL, 1999.
74. De Bolle M.F.C, Terras F.R.G, Cammue B.P.A, Rees S.B, Broekaert W.F. Mirabilis jalapa antimicrobial peptides and Raphanus sativus antifungal proteins: a comparative study of their structure and biological activities. In: Mechanisms of Plant Defense Responses, B. Fritig and M. Legrand M, eds. Kluwer Academic Publishers, 1993, P. 433-436.
75. De Bolle M.F.C, Osborn R.W, Goderis I.J, Noe L, Acland D, Hart C.A, Torrekens S, Van Leuven F, Broekaert W.F. Antimicrobial peptides from Mirabilis jalapa and Amaranthus caudatus: expression, processing, localization and biological activity in transgenic tobacco // Plant Mol. Biol, 1996, V. 31, P. 993-1008.
76. De Lucca A.J, Bland J.M, Jacks T.J, Grimm C, Walsh T.J. Fungicidal and binding properties of the natural peptides cecropin B and dermaseptin // Med. Mycol, 1998, V. 36 (5), P. 291-298.
77. Delvas M, Ceriani M.F, Collavita M, Butzonich I, Hopp H.E. Analysis of transgenic potato plants expressing potatao leaf-roll virus coat protein gene // Plant Physiol, 1993, V. 102, P. 174-180.
78. Do H.M, Lee S.C, Jung H.W, Sohn K.H, Hwang B.K. Differential expression and in sutu localization of a pepper defensin (CADEF1) gene in response to pathogen infection, abiotic elicitors and environmental stresses in Capsicum anuum II Plant Sci, 2004, V. 166, P. 1297-1305.
79. Donaldson P.A, Anderson T, Lane B.G, Davidson A.L. Simmonds D.H. Soybean plants expressing an active oligomeric oxalate oxidase from the wheat gf-2.8 (germin) gene are resistant to the oxalate-secreting pathogen Sclerotina sclerotiorum II Physiol. Mol. Plant Pathol, 2001, V. 59, P. 297-307.
80. Douliez J.P, Michon T, Elmorjani K, Marion D. Structure, biological and technological functions of lipid transfer proteins and indolines, the major lipid-binding proteins from cereal kernels // J. Cereal Sci, 2000, V. 32, P. 1-20.
81. Dowd P.F. Indirect reduction of ear molds and associated mycotoxins in Bacillus thuringiensis corn under controlled and open field conditions: utility and limitations II J. Econ. Entomol, 2000, V. 93, P. 1669-1679.
82. Dowd P.F. Biotic and abiotic factors limiting efficacy of Bt corn in indirectly reducing mycotoxin levels in commercial fields // J. Econ. Entomol, 2001, V. 94, P. 1067-1074.
83. Dubovskii P.V, Vassilevski A.A, Slavokhotova A.A, Odintsova T.I, Grishin E.V, Egorov T.A, Arseniev A.S. Solution structure of a defense peptide from wheat with a 10-cysteine motif // Biochem. Biophys. Res. Commun, 2011, V. 411 (1),P. 14-18.
84. Duvick J.P, Rood T, Rao A.G, Marshak D.R. Purification and characterisation of a novel antimicrobial peptide from maize (Zea mays L.) kernels // J. Biol. Chem, 1992, V. 267 (15), P. 18814-18820.
85. Egorov T.A, Odintsova T.I, Pukhalsky V.A, Grishin E.V. Diversity of wheat antimicrobial peptides // Peptides, 2005, V. 26 (11), P. 2064-73.
86. Eisenhauer P. B. and Lehrer R.I. Mouse neutrophils lack defensins // Infect Immun, 1992, V. 60, P. 3446-3447.
87. Epple P, Apel K, Bohlmann H. An Arabidopsis thaliana thionin gene is inducible via a signal transduction pathway different from that for pathogenesis-related proteins // Plant Physiol, 1995, V. 109, P. 813,820.
88. Epple P, Apel K, Bohlmann H. Overexpression of an endogeneous thionin enhances resistance of Arabidopsis against Fusarium oxysporum II Plant Cell, 1997, V. 9, P. 509-520.
89. Evans I.J, Greenland A.J. Trnsgenic approaches to disease protection: applications of antifungal proteins // Pestic. Sci, 1998, V. 54, P. 353-359.
90. Fang E.F, Wong J.H, Bah C.S, Lin P, Tsao S.W, Ng T.B. Bauhinia variegata var. variegata trypsin inhibitor: from isolation to potential medicinal applications II Biochem. Biophys Res Commun, 2010a, V. 396 (4), P. 806-811.
91. Fang E.F, Wong J.H, Lin P, Ng T.B. Biochemical characterization of the RNA-hydrolytic activity of a pumpkin 2S albumin // FEBS Lett, 2010b, V. 584 (18), P. 4089-4096.
92. Fant F, Vranken W, Broekaert W.F, Borremans F. Determination of the three-dimensional solution structure of Raphanus sativus antifungal protein 1 by 'H NMR // J. Mol. Biol., 1998, V. 279 (1). P. 257-270.
93. Fazal A, Beg O.U, Shafqat J, Zaidi Z.H, Jornvall H. Characterization of two different peptides from the venom of the scorpion Buthus sindicus II FEBS Lett, 1989, V. 257, P. 260-262.
94. Feldman M.L, Oliva C.R, Casalongue C.A, Daleo GR. Induction of a proteinase K inhibitor in a potato cultivar with a high degree of field resistance against Phytophthora infestans II Physiol. Plant, 2000, V. 109 (1), P. 14-20.
95. Ferreira S.A, Pitz K.Y, Manshardt R, Zee F, Fitch M, Gonsalves D. Virus coat protein transgenic papaya provides practical control of papaya ringspot virus in Hawaii // Plant Dis, 2002, V. 86, P. 101-106.
96. Florack D.E, Stiekema W.J. Thionins: properties, possible biological roles and mechanisms of action // Plant Mol. Biol, 1994, V. 26 (1), P. 25-37.
97. Fuji G, Selsted M. E. and Eisenberg D. Defensins promote fusion and lysis of negatively charged membranes // Protein Sci, 1993, V. 2, P. 1301-1312.
98. Fujiumura M, Ideguchi M, Minami Y, Watanabe K, Tadera K. Purification, characterization and sequencing of novel antimicrobial peptides Tu-AMP 1 and Tu-AMP2 from bulbs of tulip (Tulipa gesneriana L.) // Biosci. Biotechnol. Biochem, 2004, V. 63 (3), P. 571-577.
99. Games P.D, Dos Santos I.S, Mello E.O, Diz M.S., Carvalho A.O, de Souza-Filho G.A, Da Cunha M, Vasconcelos I.M, Ferreira Bdos S, Gomes V.M. Isolation, characterization and cloning of a cDNA encoding a new antifungal defensin from Phaseolus vulgaris L. seeds // Peptides, 2008, V. 29 (12), P. 20902100.
100. Ganz T. Defensins: antimicrobial peptides of innative immunity // Nature Rev. Immunol, 2003, V. 3, P. 710-720.
101. Gao G.H, Liu W, Dai J.X, Wang J.F, Hu Z, Zhang Y, Wang D.C. Solution structure of PAFP-S: a new knottin-type antifungal peptide from the seeds of Phytolacca americana II Biochemistry, 2001, V. 40, P. 10973-10978.
102. Garcia-Olmedo F, Molina A, Segura A, Moreno M. The defensive role of non-specific lipid-transfer proteins in plants // Trends Microbiol, 1995, V. 3, P. 72-74.
103. Garcia-Olmedo F, Molina A, Alamillo J.M, Rodriguez-Palenzuela P. Plant defense peptides // Peptide Sci, 1998, V. 47, P. 479-491.
104. Garcia-Olmedo F, Rodriguez-Palenzuela P, Molina A, Alamillo J.M, Lopez-Solanilla E, Berrocal-Lobo M, Poza-Carrion C. Antibiotic activities of peptides, hydrogen peroxide and peroxynitrite in plant defense // FEBS Lett, 2001, V. 498, P. 219-222.
105. Gatehouse T.A, Gatehouse M.R, Bown D.P. Recombinant protease inhibitors in plants. In Ed. nf. D. Michaud. Georgetown: Landes Biosci, 1999, P. 9-26.
106. Gincel E, Simorre J.P, Caille A, Marion D, Ptak M, Vovelle F. Three-dimensional structure in solution of a wheat lipid-transfer protein from multidimensional 'H-NMR data. A new folding for lipid carriers // Eur. J. Biochem, 1994, V. 226, P. 413-422.
107. Glenn A.E, Richardson E.A, Bacon C.W. Genetic and morphological characterization of a Fusarium verticillioides conidiation mutant // Mycologia, 2004, V. 96 (5), P. 968-980.
108. Gomar J, Petit M-C, Sodano P, Sy D, Marion D, Kader J-C, Vovelle F, Ptak M. Solution structure and lipid binding of a nonspecific lipid transfer protein extracted from maize seeds // Protein Sci, 1996, V. 5, P. 565-577.
109. Graham M.A, Silverstein K.A, Cannon S.B, VandenBosch K.A. Computational identification and characterization of novel genes from legumes // Plant Physiol, 2004, V. 135 (3), P. 1179-1197.
110. Green T.R, Ryan C.A, Wound-induced proteinase inhibitor in plant leaves: a possible defense mechanism against insects // Science, 1972, V. 175, P. 776-777.
111. Gruber C.W, Elliott A.G, IrelandD.C, Delprete P.G, Dessein S, Goransson U, Trabi M, Wang C.K, Kinghorn A.B, Robbrecht E, Craik D.J. Distribution
and evolution of circular miniproteins in flowering plants // Plant Cell, 2008, V. 20 (9), P. 2471-2483.
112. Grunwald I, Rupprecht I, Schuster G, Kloppstech K. Identification of guttation fluid proteins: the presence of pathogenesis-related proteins in non-infected barley plants // Physiol. Plant, 2003, V. 119, P. 192-202.
113. Gugel H, Bewersdorf J, Jakobs S, Engelhardt J, Storz R, Hell S. W. Cooperative 4Pi excitation and detection yields sevenfold sharper optical sections in live-cell microscopy // Biophys. J, 2004, V. 87, P. 4146-4152.
114. Guihard G, Benedetti H, Besnard M, Letellier L. Phosphate efflux through the channels formed by colicins and phague T5 in Escherichia coli cells is responsible for the fall in cytoplasmic ATP // J. Biol. Chem, 1993, V. 269, P. 17775-17780.
115. Hamza A, Derbalah A. and El-Nady M. Identification and mechanism of Echinochloa crus-galli resistance to fenoxaprop-p-ethyl with respect to physiological and anatomical differences // The Scientific World Journal, 2012, doi:10.1100/2012/893204.
116. Han K.H, Park K.H., Yoo H.J, Cha H, Suh S.W., Thomas F, et al. Determination of the three-dimensional structure of hordothionin-alpha by nuclear magnetic resonance // Biochem. J, 1996, V. 313, P. 885-892.
117. Hahlbrock K, Scheel D. Biochemical responses of plant to pathogens in: Innovate Approaches to Plant Disease Control (Chet, I, Ed.), Jonh Wiley and Sons, New York, 1987, P. 229-254.
118. Hancock R.E.W, Chappie D.S. Peptide antibiotics // Antimicrob. Agents and Chemotherapy, 1999, V. 43 (6), P. 1317-1323.
119. Heath M.C. Advances in imaging the cell biology of plant-microbe interactions // Ann. Rev. Phytopathol, 2000, V. 38, P. 443^159.
120. Heinemann B, Andersen K.V, Nielsen P.R, Bech L.M, Poulsen F.M. Structure in solution of a four-helix lipid binding protein // Protein Sei, 1996, V. 5 (1), P. 13-23.
121. Heitz T, Fritig B, Legrand M. Local and systemic accumulation of pathogenesis-related proteins in tobacco plants infected with tobacco mosaic virus // Mol. Plant-Microbe Interact, 1994, V. 7, P. 776-779.
122. Hennig J, Deweg R.E, Cutt J.R, Klessig D.F. Pathogen, salicylic acid and developmental dependent expression of a ß-l,3-glucanase/GUS gene fusion in transgenic tobacco plants // Plant J, 1993, V. 4, P. 481-493.
123. Higgins T.J.V, Chandler P.M., Randall P.J, Spencer D, Beach L.R, Blagrove R.J, Kortt R.J, Inglis A.S. Gene structure, protein structure, and regulation of the synthesis of a sulphur-rich protein in pea seeds // J. Biol. Chem, 1986, V. 261, P. 11124-11130.
124. Hoover D.M., Chertov O, Lubkowski J. The structure of human beta-defensin-1: new insights into structural properties of beta-defensins // J. Biol. Chem, 2001, V. 276, P. 39021-39026.
125. Huckelhoven, R. Cell wall-associated mechanisms of disease resistance and susceptibility // Ann. Rev. Phytopathol, 2007, V. 45, P. 101-127.
126. Huang H. W. Action of antimicrobial peptides: two-state model // Biochemistry, 2000, V. 39, P. 8347-8352.
127. Huang R-H, Xiang Y, Liu X-Z, Zhang Y, Hu Z, Wang D-C. Two novel antifungal peptides distinct with a five-disulfide motif from the bark of Eucommia ulmoides Oliv. // FEBS Lett, 2002, V. 521, P. 87-90.
128. Huang R-H, Xiang Y, Tu G-Z, Zhang Y, Wang D-C. Solution structure of Eucommia antifungal peptide: a novel structural model distinct with a five-disulfide motif// Biochemistry, 2004, V. 43, P. 6005-6012.
129. Im Y.J, Idkowiak-Baldys J, Thevissen K, Cammue B.P, Takemoto J.Y. IPT1-independent sphingolipid biosynthesis and yeast inhibition by syringomycin E and plant defensin DmAMPl // FEMS Microbiol. Lett, 2003, V. 223 (2), P. 199-203.
130. Ireland D.C, Colgrave M.L, Craik D.J. A novel suite of cyclotides from Viola odorata: sequence variation and the implications for structure, function and stability // Biochem. J, 2006, V. 400 (1),P. 1-12.
131. Itoh T, Tanaka T, Barrero R.A, Yamasaki C, Fujii Y, Hilton P.B, Antonio B.A, Aono H, Apweiler R, Bruskiewich R. et al. Curated genome annotation of Oryza sativa ssp. japónica and comparative genome analysis with Arabidopsis thaliana II Genome Res, 2007, V. 17 (2), P. 175-183.
132. Jakab G, Manrique A, Zimmerli L, Métraux J-P, Mauch-Mani B. Molecular characterization of a novel lipase-like pathogen-inducible gene family of Arabidopsis II Plant Physiol, 2003, V. 132, P. 2230-39.
133. Jang C.S, Lee H.I, Chang S.I, Seo Y.W. Expression and promoter analysis of the TaLTPl gene induced by drought and salt stress in wheat (Triticum aestivum L.) // Plant Sci, 2004, V. 167, P. 995-1001.
134. Janssen B.J.C, Schirra H.J, Lay F.T, Anderson M.A, and Craik D.J. Structure of Petunia hybrida defensin 1, a novel plant defensin with five disulfide bonds // Biochemistry, 2003, V. 42, P. 8214-8222.
135. Jung H.W, Kim W, Hwang B.K. Three pathogen-inducible genes encoding lipid transfer protein from pepper are differentially activated by pathogens, abiotic, and environmental stresses // Plant Cell Environ, 2003, V. 26, P. 915-928.
136. Kader J.-C. Lipid-transfer proteins in plants // Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol, 1996, V. 47, P. 627-654.
137. Kamei K, Takano R, Miyasaka A, Imoto T, Hara S. Amino acid sequence of sweet-taste-suppressing peptide (gurmarin) from the leaves of Gymnera sylvestre II J. Biochem, 1992, V. 111, P. 109-112.
138. Karunanandaa B, Singh A, Kao T.H. Characterization of a predominantly pistil-expressed gene encoding a gamm-thionin-like protein of Petunia Ínflala II Plant Mol. Biol, 1994, V. 26 (1), P. 459-464.
139. Kehr J, Buhtz A, Giavalisco P. Analysis of xylem sap proteins from Brassica napus II BMC Plant Biol, 2005, V. 5. P. 11-16.
140. Kitajima S, Sato F. Plant pathogenesis-related proteins: molecular mechanisms of gene expression and protein function // J. Biochem, 1999, V. 125 (1), P. 1-8.
141. Koide T, Tsunasawa S, Ikenaka T. The amino acid sequence of soybean trypsin inhibitor (Kunitz) // J. Biochem., 1972, V. 71 (1), P. 165-167.
142. Koike M, Okamoto T, Tsuda S, Imai R. A novel plant defensin-like gene of winter wheat is specifically induced during cold acclimation // Biochem. Biophys. Res. Commun, 2002, V. 298, P. 46-53.
143. Koo J.C., Lee S.Y, Chun H.J, Cheong Y.H., Choi J.S, Kawabata S-I, Miyagi M, Tsunasawa S, Ha K.S, Bae D.W, Han C-D, Lee B.L, Cho M.J. Two hevein homologs isolated from the seed of Pharbitis nil L. exhibit potent antifungal activity // Biochim. Biophys. Acta, 1998, V. 1382, P. 80-90.
144. Koo J.C, Chun H.J, Park H.C, Kim M.C, Koo Y.D, Koo S.C, Ok H.M, Park S.J, Lee S-H, Yun D-J, Lim C.O, Bahk J.D, Lee S.Y, Cho M.J. Overexpression of a seed hevein-like antimicrobial peptide from Pharbitis nil enhances resistance to a fungal pathogen in transgenic tobacco plants // Plant Mol. Biol, 2002, V. 50, P. 441-452.
145. Koo J.C, Lee B, Young M.E, Koo S.C, Cooper J.A, Baek D, Lim C.O, Lee S.Y, Yun D.-J, Cho M.J. Pn-AMPl, a plant defense protein, induces actin depolarization in yeasts // Plant and Cell Physiology, 2004, V. 45, P. 1669-1680.
146. Kragh K.M, Nielsen J.E, Nielsen K.K, Dreboldt S, Mikkelsen J.D. Characterization and localization of a new antifungal cysteine-rich proteins from Beta vulgaris II Mol. Plant Microbe Interact, 1995, V. 8 (3), P. 424-434.
147. Kristensen A.K, Brunstedt J, Nielsen J.E, Mikkelsen J.D, Roepstorff P, Nielsen K.K. Processing, disulfide pattern, and biological activity of a sugar beet defensin, AX2, expressed in Pichia pastoris II Protein Expr. Purif, 1999, V. 16 (3), P. 377-387.
148. Kumamoto C.A. Molecular mechanisms of mechanosensing and their roles in fungal contact sensing // Nat. Rev. Microbiol, 2008, V. 6, P. 667-673.
149. Kushmerick C, Castro M.D, Cruz J.S, Bloch C, Beirao P.S.L. Functional and structural features of gamma-zeathionins, a new class of sodium channel blockers // FEBS Lett, 1998, V. 440, P. 302-306.
150. Lagrimini L.M, Burkhart W, Moyer M, Rothstein S. Molecular cloning of complementary DNA encoding the lignin-forming peroxidase from tobacco: molecular analysis and tissue-specific expression // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, 1987, V. 84, P. 7542-7546.
151. Lam S.K, Ng T.B. Acaconin, a chitinase-like antifungal protein with cytotoxic and anti-HIV-1 reverse transcriptase activities from Acacia confusa seeds // Acta Biochim. Pol, 2010. V. 57 (3), P. 299-304.
152. Lamberty M, Caille A, Landon C, Tassin-Moindrot S, Hetru C, Bulet P, Vovelle F. Solution structures of the antifungal heliomicin and a selected variant with both antibacterial and anfifungal activities // Biochemistry, 2001, V. 40, P. 11995-12003.
153. Lay F.T, Schirra H.J, Scanlon M.J, Anderson M.A, Craik D.J. The three-dimensional solution structure of NaDl, a new floral defensin form Nicotiana alata and its application to a homology model of the crop defense protein alAFP // J. Mol. Biol, 2003, V. 325, P. 175-188.
154. Lay F.T, Anderson M.A. Defensins - components of the innate immune system in plants. // Curr. Protein Pept. Sci, 2005, V. 6 (1), P. 85-101.
155. Lay F.T, Mills G.D, Poon I.K, Cowieson N.P, Kirby N, Baxter A.A, van der Weerden N.L, Dogovski C, Perugini M.A, Anderson M.A, Kvansakul M, Hulett M.D. Dimerization of plant defensin NaDl enhances its antifungal activity // J. Biol. Chem, 2012, V. 287 (24), P. 19961-19972.
156. Lee T.T.T, Wang M.M.C, Hou R.C.W, Chen L-J, Su R.C, Wang C.S, Tzen J.T.C. Enhanced methionine and cysteine levels in transgenic rice seeds by the accumulation of sesame 2S albumin // Biosci. Biotechnol. Biochem, 2003, V. 67, P. 1699-1711.
157. Leistner L, Gorris L. G. M. Food preservation by hurdle technology // Trends Food Sci. Technol, 1995, V. 6, P. 41-46.
158. Le-Nguyen D.L, Heitz A, Chiche L, Castro B, Baigegrain F, Favel A, Coletti-Previero A. Molecular recognition between serine proteases and new
bioactive microproteins with a knotted structure // Biochimie, 1990, V. 72, P. 431435.
159. Leslie J.F. and Summerell B.A. The Fusarium Laboratory Manual // Blackwell Publishing, 2006, 399 pp.
160. Li S-S, Claeson P. Cys/Gly-rich proteins with a putative single chitin-binding domain from oat {Avena sativa) seeds // Phytochemistry, 2003, V. 63, P. 249-255.
161. Li F, Yang X. X, Xia H. C, Zeng R, Hu W. G, Li Z. and Zhang Z. C. Purification and characterization of Luffm PI, a ribosome-inactivating peptide from the seeds of Luffa cylindrica .// Peptides, 2003, V. 24, P. 799-805.
162. Linthorst J.M. Patogenesis-related proteins of plant // Critical Rev. in Plant Sci, 1991, V. 10, P. 123-150.
163. Lipkin A, Anisimova V, Nikonorova A, Babakov A, Krause E, Bienert M, Grishin E, Egorov T. An antimicrobial peptide Ar-AMP from amaranth {Amaranthus retroflexus L.) seeds // Phytochemistry, 2005, V. 66, P. 2426-2431.
164. Liu Y-J, Cheng C-S, Lai S-M, Hsu M-P, Chen C-S, Lyu P-C. Solution structure of the plant defensin VrDl from mung bean and its possible role in insecticidal activity against bruchids // Proteins, 2006, V. 63, P. 777-786.
165. Lobo D.S, Pereira I.B, Fragel-Madeira L, Medeiros L.N, Cabral L.M, Faria J, Bellio M, Campos R.C, Linden R, Kurtenbach E. Antifungal Pisum sativum defensin 1 interacts with Neurospora crassa cyclin F related to the cell cycle // Biochemistry, 2007, V. 46 (4), P. 987-996.
166. Loeza-Angeles H, Sagrero-Cisneros E, Lara-Zarate L, Villagomes-Gomez E, Lopez-Meza J.E, Ochoa-Zarzosa A. Thionin Thi2.1 from Arabidopsis thaliana expressed in endothelial cells shows antibacterial, antifungal and cytotoxic activity //Biotechnol Lett, 2008, V. 10, P. 1713-1719.
167. Majeau N, Trudel J, Asselin A. Diversity of cucumber isoforms and characterization of one seed basic chitinase with lysozyme activity, Plant Sci, 1990, V. 68, P. 9-16.
168. Majewski J, Stec B. X-ray scattering studies of model lipid membrane interacting with purothionin provide support for a previously proposed mechanism of membrane lysis // Eur. Biophys. J, 2009, doi: 10.1007/s00249-009-0568-0.
169. Maldonado A.M., Doerner P, Dixonk R.A, Lamb C.J, Cameron R.K. A putative lipid transfer protein involved in systemic resistance signaling in Arabidopsis //Nature, 2002, V. 419, P. 399-403.
170. Marcus J.P, Goulter K.C, Green J.L, Harrison S.J, Manners J.M. Purification, characterization and cDNA cloning of an antimicrobial peptide from Macadamia integrifolia II Eur. J. Biochem, 1997, V. 244, P. 743-749.
171. Marcus J.P, Green J.L, Gouther K.C. and Manners J.M. A family of antimicrobial peptides is produced by processing of a 7S globulin protein in Macadamia integrifolia kernels // Plant J, 1999, V. 19 (6), P. 699-710.
172. Marchant R. Fine structure and spore germination in Fusarium culmorum II Ann. Bot, 1966, V. 30, P. 441-445.
173. Marion D, Bakan B, Elmorjani K. Plant lipid-transfer proteins: properties and applications // Biotechnol Adv., 2007, V. 25 (2), P. 195-197.
174. Martins J.C, Maes D, Loris R, Pepermans H.A, Wyns L, Willem R, Verheyden P. !H NMR study of the solution structure of Ac-AMP2, a sugar binding antimicrobial protein isolated from Amaranthus caudatus II J. Mol. Biol, 1996, V. 258 (2), P. 322-33.
175. Matsumoto T, Wu J, Kanamori H, Katayose Y, Fujisawa M, Namiki N, Mizuno H, Yamamoto K, Antonio B.A, Baba T. et al The map-based sequence of the rice genome // Nature, 2005, V. 436 (7052), 793-800.
176. Melchers L.S, Apotheker-de Groot M, Van der Knaap J.A, Ponstein A.S, Sela-Buurlage M.B, Bol J.F, Cornelissen B.J.C, Van den Elzen P.J.M, Linthorst H.J.M. A new class of tobacco chitinases homologous to bacterial exo-chitinases displays antifungal activity // Plant J, 1994, V. 5, P. 469-480.
177. Melo F.R, Ridgen D.J, Franco O.L, Mello L.V, Ary M.B, Grossi-de-Sa M.F, et al. Inhibition of trypsin by cow-pea thionin: characterization, molecular modeling, and docking // Proteins, 2002, V. 48, P. 311-319.
178. Mendez E, Moreno A, Colilla F, Pelaez F, Limas G.G., Mendez R. Primary structure and inhibition of protein synthesis in eukaryotic cell-free system of a novel thionin, y—hordothionin, from barley endosperm // Eur. J. Biochem, 1990, V. 194, P. 533-539.
179. Mendez E, Rocher A, Calero M, Girbes T, Citores L, Soriano F. Primary structure of co- hordothionin, a member of a novel family of thionins from barley endosperm, and its inhibition of protein synthesis in eukaryotic and prokaryotic cell-free systems // Eur. J. Biochem, 1996, V. 239, P. 67-73.
180. Meitraux J.P, Streit L, Staub T. A pathogenesis-related protein in cucumber is a chitinase // Physiol. Mol. Plant Pathol, 1988, V. 33, P. 1-9.
181. Meyer B, Houlne G, Pozueta-Romero J, Schantz M.L, Schantz R. Fruit-specific expression of a defensine-type gene family in bell pepper. Upregulation during ripering and upon wounding // Plant Physiol, 1996, V. 112 (2), P. 615-622.
182. Michaelson D, Rayner J, Couto M, Ganz T. Cationic defensins arise from charge-neutralized propeptides: a mechanism for avoiding leukocyte autocytotoxicity? // J. Leukoc. Biol, 1992, V. 51, P. 634-639.
183. Michaud D. Recombinant protease inhibitors in plants. In Ed. D. Michaud. Georgetown: Landes Biosci, 1999, 241 pp.
184. Mirouze M, Sels J, Richard O, Czernic P, Loubet S, Jacquier A, Francois I.E.J.A, Cammue B.P.A, Lebrun M, Berthomieu P, Marques L. A putative novel role for plant defensins: a defensin from zinc hyper-accumulating plant, Arabidopsis halleri, confers zinc tolerance // Plant J, 2006, V. 47 (3), P. 329-342.
185. Möller C, Rahmankhah S, Lauer-Fields J, Bubis J, Fields G. B, and
Mari F. A novel conotoxin framework with a helix-loop-helix (Cs alpha/alpha) fold // Biochemistry, 2005, V. 44, P. 15986-15996.
186. Molina A, Segura A, Garcia-Olmedo F. Lipid-transfer proteins (nsLTPs) from barley and maize leaves are potent inhibitors of bacterial and fungal plant pathogens // FEBS Lett, 1993a, V. 316, P. 119-22.
187. Molina A, Garcia-Olmedo F. Developmental and pathogen induced expression of three barley genes encoding lipid transfer proteins // Plant J, 1993b, V. 4, P. 983-91.
188. Molina A, Garcia-Olmedo F. Enhanced tolerance to bacterial pathogens caused by the transgenic expression of barley lipid transfer protein LTP2 // Plant J, 1997, V. 12, P. 669-675.
189. Montesinos E. Antimicrobial peptides and plant disease control // FEMS Microbial Lett, 2007, V. 270, P. 1-11.
190. Montville T. J, Winkowski K. Biologically-based preservation systems and probiotic bacteria. In: Doyle MP, Beuchat LR, Montville TJ (eds) Food microbiology: fundamentals and frontiers. American Society for Microbiology Press, Washington D.C, 1997, P. 557-577.
191. Moreno M, Segura A, Garcia-Olmedo F. Pseudothionin-Stl, a potato peptide active against potato pathogens // Eur. J. Biochem, 1994, V. 223, P. 135-139.
192. Nagorni M. and Hell S. W. Coherent use of opposing lenses for axial resolution increase in fluorescence microscopy. Power and limitation of nonlinear image restoration // J. Opt. Soc. Am, 2001, V. 18, P. 49-54.
193. Nicastro G, Orsomando G, Ferrari E, Manconi L, Desario F, Amici
A, Naso A, Carpaneto A, Pertinhez T. A, Ruggieri S, and Spisni A. Solution structure of the phytotoxic protein PcF: the first characterized member of the Phytophthora PcF toxin family // Protein Sci, 2009, V. 8, P. 1786-1791.
194. Nielsen K.K, Nielsen J.E, Madrid S.M. and Mikkelsen J.D. New antifungal proteins from sugar beet (Beta vulgaris L.) showing homology to non-specific lipid transfer proteins // Plant Mol. Biol, 1996, V.31 (3), P. 539-552.
195. Nielsen K.K, Nielsen J.E, Madrid S.M, Mikkelsen J.D. Characterization of a new antifungal chitin-binding peptide from sugar beet leave // Plant Physiol, 1997, V. 113, P. 83-91.
196. Ng Y. M, Yang Y, Sze K. H, Zhang X, Zheng Y. T. and Shaw P. C. Structural characterization and anti-HIV-1 activities of arginine/glutamate-rich
polypeptide Luffin PI from the seeds of sponge gourd (Luffa cylindrica) II J. Struct. Biol, 2011, V. 174, P. 164-172.
197. Ng T.B, Wong J.H, Fang E.F. Defensins and other biocidal proteins from bean seeds with medicinal activities // Curr. Med. Chem, 2011, V. 18 (36), P. 5644-5654.
198. Ng T.B, Cheung R.C, Wong J.H, Ye X. Lipid-transfer proteins // Biopolymers, 2012, V. 98 (4), P. 268-79.
199. Odintsova T.I, Egorov T.A, Musolyamov A.Kh, Odintsova M.S., Pukhalsky V.A, Grishin E.V. Seed defensins from T. kiharae and related species: genome localization of defensin-encoding genes // Biochimie, 2007, V. 89 (5), P. 605-12.
200. Odintsova T.I, Vassilevski A.A, Slavokhotova A.A, Musolyamov A.K, Finkina E.I, Khadeeva N.V, Rogozhin E.A, Korostyleva T.V, Pukhalsky V.A, Grishin E.V, Egorov T.A. A novel antifungal hevein-type peptide from Triticum kiharae seeds with a unique 10-cysteine motif // FEBS J, 2009, V. 276 (15), P. 4266-4275.
201. Oeke E.C, Dehne H.W, Schonbeck F, Weber A. Crop production and crop protection: estimated losses in major food and cash crops. Elsevier, Amsterdam, 1994.
202. Oh B.J, Ko M.K, Kostenyuk I, Shin B, Kim K.S. Coexpression of a defensin gene and thionin-like via different signal transduction pathways in pepper and Colletotrichum gloeosporioides interactions // Plant Mol. Biol, 1999, V. 41 (3), P. 313-319.
203. Onaderra M, Monsalve R.J, Manche J.M, Villalba M, Martinez del Pozo A, Gavilalanes J.G, Rodriguez R. Food mustard allergen interaction with phospholipid vesicles // Eur. J. Biochem, 1994, V. 225, P. 609-615.
204. Oparin P.B, Mineev K.S, Dunaevsky Y.E, Arseniev A.S, Belozersky M.A, Grishin E.V, Egorov T.A, Vassilevski A.A. Buckwheat trypsin inhibitor with helical hairpin structure belongs to a new family of plant defense peptides // Biochem. J, 2012, V. 446 (1), P. 69-77.
205. Osborn R.W, De Samblanx G.W, Thevissen K, Goderis I, Torrekens S, Van Leuven F. Isolation and characterization of plant defensins from seeds of Asteraceae, Fabaceae, Hippocastanaceae and Saxifragaceae // FEBS Lett, 1995, V. 368, P. 257-262.
206. Park S.S, Abe K, Kimura M, Urisu A. and Yamasaki N. Primary structure and allergenic activity of trypsin inhibitors from the seeds of buckwheat {Fagopyrum esculentum Moench) // FEBS Lett, 1997, V. 400, P. 103-107.
207. Park C.J, Park C.B, Hong S-S, Lee H-S, Lee S.Y, Kim S.C. Characterization and cDNA cloning of two glycine- and histidine-rich antimicrobial peptides from the roots of shepherds's purse, Capsella bursapastoris II Plant Mol. Biol, 2000, V. 44, P. 187-197.
208. Park C.-J, Kim K-J, Shin R, Park J.M, Shin Y-C, Paek K-H. Pathogenesis-related protein 10 isolated from hot pepper functions as a ribonuclease in an antiviral pathway // Plant J, 2004, V. 37, P. 186-198.
209. Passardi F, Penel C, Dunand C. Performing the paradoxical: How plant peroxidases modify the cell wall // Trends Plant Sci, 2004,. V. 9, P. 562-570.
210. Patel S.U, Osborn R, Rees S, Thornton J.M. Structural studies of Impatiens balsamina antimicrobial protein (Ib-AMPl) // Biochemistry, 1998, V. 37, P. 983990.
211. Paterson A.H, Bowers J.E, Bruggmann R, Dubchak I, Grimwood J, Gundlach H, Haberer G, Hellsten U, Mitros T, Poliakov A. et al. The Sorghum bicolor genome and the diversification of grasses // Nature, 2009, V. 457 (7229), P. 551-556.
212. Pelegrini P.B. and Franco O.L. Plant y-thionins: Novel insights on the mechanism of action of a multi-functional class of defense proteins // Int. J. Biochem. Cell Biol, 2005, V. 37, P. 2239-2253.
213. Penninckx I.A.M.A, Thomma B.P.H.J, Buchala A, Metraux J-P, Broekaert W.F. Concominant activation of jasmonate and ethylene response pathways is required for induction of a plant defensin gene in Arabidopsis II Plant Cell, 1998, V. 10, P. 2103-2114.
214. Peumans W.J, Hao Q, Van Damme E.J.M. Ribosome-inactivating proteins from plants: more than RNA N-glycosidases? // FASEB J, 2001, V. 15, P. 14931506.
215. Plaine A, Walker L, Da Costa G, Mora-Montes H.M, McKinnon A, Gow N, Gaillardin C, Munro C.A, and Mathias R.L. Functional analysis of Candida albicans GPI-anchored proteins: Roles in cell wall integrity and caspofungin sensitivity // Fungal Genet. Biol, 2008, V. 45, P. 1404-1414.
216. Porcelli F, Buck B, Lee D. K, Hallock K. J, Ramamoorthy A, and Veglia G. Structure and orientation of pardaxin determined by NMR experiments in model membranes // J. Biol. Chem, 2004, V. 279, P. 45815-45823.
217. Porcelli F, Buck-Koehntop B. A, Thennarasu S, Ramamoorthy A, and Veglia G. Structures of the dimeric and monomeric variants of magainin antimicrobial peptides (MSI-78 and MSI-594) in micelles and bilayers, determined by NMR spectroscopy // Biochemistry, 2006, V. 45, P. 5793-5799.
218. Raikhel N.V, Lee H.-I. Structure and function of chitin-binding proteins // Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol, 1993, V. 44, P. 591-615.
219. Rep M, Dekker H.L, Vossen J.H, de Boer A.D., Houterman P.M., Speijer D, Back J.W, de Koster C.G, Cornelissen B.J. Mass spectrometric identification of isoforms of PR proteins in xylem sap of fungus-infected tomato // Plant Physiol, 2002, V. 130, P. 904-917.
220. Rep M, Dekker H.L, Vossen J.H, De Boer A.D., Houterman P.M., et al. A tomato xylem sap protein represents a new family of small cysteine-rich proteins with structural similarity to lipid-transfer proteins // FEBS Lett, 2003, V. 534, P. 82-86.
221. Rivillas-Acevedo L.A. and Soriana-Garcia M. Isolation and biochemical characterization of an antifungal peptide from Amaranthus hypochondriacus seeds // J. Agric. Food Chem, 2007, V. 55, P. 10156-10161.
222. Rossi L. M, Rangasamy P, Zhang J, Qui X, Wu G. Y. Research advances in the development of peptide antibiotics // J. Pharm. Sei, 2008, V. 97 (3), P. 1060-1070.
223. Roy-Barman S, Sautter C, Chatto B. B. Expression of the lipid transfer protein Ace-AMP 1 in transgenic wheat enhances antifungal activity and defense responses // Transgenic Res, 2006, V. 15, P. 435-446.
224. Ryan C.A. Protease inhibitors in plants: genes for improving defenses against insects and pathogens // Annu. Rev. Phytopathol, 1990, V. 28, P.425-449.
225. Samuel D, Liu Y.J, Cheng C.S, Lyu P.C. Solution structure of plant nonspecific lipid transfer protein-2 from rice (Oryza sativa) // J. Biol. Chem, 2002, V. 277, P. 35267-35273.
226. Salerno M. and Bykov I. Tutorial: mapping adhesion forces and calculating elasticity in contact-mode AFM, Microscopy and Analysis, 2006, V. 20, pp. S5-S8.
227. Seetharamam K, Waniska R.D, Rooney L.W. Physiological changes in sorghum antifungal proteins // J. Agric. Food Chem, 1996, V. 44, P. 2435-2441.
228. Segura A, Moreno M, Molina A, Garcia-Olmedo F. Novel defensin subfamily from spinach (Spinacea oleracea) II FEBS Lett, 1998, V. 435, P. 159162.
229. Segura A, Moreno M, Madueno F, Molina A. and Garcia-Olmedo F. Snakin-1, a peptide from potato that is active against plant pathogens // Mol. Plant Mocrob. Interac, 1999, V. 12 (1), P. 16-23.
230. Selitrennikoff P.C. Antifungal proteins // Appl. Environ. Microbiol, 2001, V. 67, P. 2883-2894.
231. Sels J, Mathys J, De Coninck B.M, Cammue B.P, De Bolle M.F. Plant pathogenesis-related (PR) proteins: a focus on PR peptides // Plant Physiol. Biochem, 2008, V. 46 (11), P. 941-950.
232. Selsted M.E. and Ouellette A.J. Mammalian defensins in the antimicrobial immune response //Nat. Immunol, 2005, V.6 (6), P. 551-557.
233. Schrader-Fischer G. and Apel K. cDNA-derived identification of novel thionin precursors in Viscum album that contain highly divergent thionin domains but conserved signal and acidic polypeptide domains // Plant Mol. Biol, 1993, V. 23, P. 1233-1242.
234. Schrader-Fischer G. and Apel K. Organ-specific expression of highly divergent thionin variants that are distinct from the seed-specific crambin in the crucifer Crambe abyssinica. II Mol. Gen. Genet, 1994, V. 245, P. 380-389.
235. Schoffelmeer E. A, Klis F. M, Sietsma J. H, and Cornelissen B. J. The cell wall of Fusarium oxysporum II Fungal Genet. Biol, 1999, V. 27, P. 275-282.
236. Schuler T.N, Poppy G.M, Kerry B.R, Denholm I. Insect-resistant transgenic plants // Trends Biotechnol, 1998, V. 16 (4), P. 168-175.
237. Shaaper W.M.M, Posthuma G.A, Plasman H.H, Sijtsma L, Fant F, Borremans F.A.M, Thevissen K, Broekaert W.F, Meloen R.H, van Amerongen A. Syntetic peptides derived from the 132-133 loop of Raphanus sativus antifungal protein 2 that mimic the active site // J. Peptide Res, 2000, V. 57, P. 409-418.
238. Sharma P. and Lonneborg A. Isolation and characterization of a cDNA encoding a plant defensin-like protein from roots of Norway spruce // Plant Mol. Biol, 1996, V. 31 (3), P. 707-712.
239. Shen G, Pang Y, Wu W, Miao Z, Qian H, Zhao L. Molecular cloning, characterization and expression of a novel jasmonat-dependent defensin gene from Ginkgo biloba. II J. Plant Physiol, 2005, V. 162, P. 1160-1168.
240. Shi Z, Shen S, Zhou W, Wang F, Fan Y. Fusarium graminearum growth inhibition due to glucose starvation caused by osthol // Int. J. Mol. Sci, 2008, V. 9, P. 371-382.
241. Shukurov R.R, Voblikova V.D, Nikonorova A.K, Kopmakhin R.A, Komakhina V.V, Egorov T.A, Grishin E.V, Babakov A.V. Transformation of tobacco and Arabidopsis plants with Stellaria media genes encoding novel hevein-like peptides increases their resistance to fungal pathogens // Transgenic Res, 2012, V. 21 (2), P. 313-325.
242. Silverstein K.A.T, Graham M.A, Paape T.D, VandenBosch K.A. Genome organization of more than 300 defensin-like genes in Arabidopsis II Plant Physiol, 2005, V. 138, P. 600-610. V
243. Skinner W.S, Adams M.E, Quistad G.B, Kataoka H, Cesarin B.J, Enderlin F.E, Schooley D.A. Purification and characterization of two classes of neurotoxins
from the funnel web spider Agelenopsis aperta II J. Biol. Chem, 1989, V. 264, P. 2150-2155.
244. Somssich I.E., Schmelzer E, Bollmann J, Hahlbrock K. Rapid activation by fungal elicitor of genes encoding "pathogenesis-related" proteins in cultured parsley cells // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, 1986, V. 83, P. 2427-2430.
245. Spelbrink R.G, Dilmac N, Allen A, Smith T.J, Hockerman G.H. Differential antifungal and calcium channel-blocking activity among structurally related plant defensins // Plant Physiol, 2004, V. 135, P. 2055-2067.
246. Srinivasan K. N, Sivaraja V, Huys I, Sasaki T, Cheng B, Kumar T. K, Sato K, Tytgat J, Yu C, San B. C, Ranganathan S, Bowie H. J, Kini
R. M, and Gopalakrishnakone P. k-Hefiitoxinl, a novel toxin from the scorpion Heterometrus fulvipes with unique structure and function: importance of the functional diad in potassium channel selectivity // J. Biol. Chem, 2002, V. 277 (30), P. 30040-30047.
247. Stec B, Rao U, Teeter M.M. Refinement of purothionins reveals the solute particles important for the lattice formation and toxicity. Part 1: Structure of [3-putothionin at 1.7A resolution // Acta Cryst, 1995, V. 51, P. 914-924.
248. Stec B. Plant thionins - the structural perspective // Cell Mol. Life Sci, 2006, V. 63, P. 1370-1385.
249. Stein G.M, Pfuller U, Schietzel M, Bussing A. Toxic proteins from European mistletoe (Viscum album L.): increase of intracellular IL-4 but decrease of IFN-gamma in apoptoticcells // Anticancer Res, 2000, V. 20, P. 1673-1678.
250. Stotz H.U, Spence B, Wang Y. A defensin from tomato with dual function in defense and development // Plant Mol. Biol, 2009, V. 71. P. 131-143.
251. Strobl S, Muhhuhn P, Bernstein R, Wiltscheck R, Mascos K, Wunderlich M, Huber R, Glockshuber R, Holak T.A. Determination of the three-dimensional structure of the Afunctional alpha-amylase / trypsin inhibitor from ragi seeds by NMR spectroscopy // Biochemistry, 1995, V. 34 (26), P. 8281-8293.
252. Suribade M, Salesse C, Marion D, Pezolet M. Interaction of a nonspecific wheat lipid transfer protein with phospholipids monolayers imaged by
fluorescence microscopy and studied by infrared spectroscopy // Biophys. J, 1995, V. 69, P. 974-988.
253. Tailor R.H, Acland D.P, Attenborough S, Cammue B.P, Evans I.J, Osborn R.W, Ray J.A, Rees S.B, Broekaert W.F. A novel family of small cysteine-rich antimicrobial peptides from seed of Impatiens balsamina is derived from a single precursor protein // J. Biol. Chem, 1997, V. 272 (39), P. 24480-24487.
254. Tanaka T, Antonio B.A, Kikuchi S, Matsumoto T, Nagamura Y, Numa H, Sakai H, Wu J, Itoh T, Sasaki T. et al. The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update // Nucleic Acids Res, 2008, V. 36 (Database issue), P. 1028-1033.
255. Tassin S, Broekaert W.F, Marion D, Acland D.P, Ptak M, Vovelle F. Sodano P. Solution structure of Ace-AMPl, a potent antimicrobial protein extracted from onion seeds. Structural analogies with plant non-specific lipid transfer proteins // Biochemistry. 1998. Vol. 37. P. 3623-3637.
256. Terras F.R.G, Schofs H.M.E, de Bolle M.F.C, Van Leuven F, Rees S.B. In vitro antifungal activity of a radish (Raphanus sativus L.) seed protein homologous to nonspecific lipid lipid transfer proteins // Plant Physiol, 1992, V. 100, P. 10551058.
257. Terras F.R.G, Schoofs H.M.E, Thevissen K, Osborn R.W, Vanderleyden J, Cammue B.P.A, Broekaer W.F. Synergistic enchancement of the antifungal activity of wheat and barley thionins by radish and oilseed rape 2S albumins and barley trypsin inhibitors//Plant Physiol, 1993, V. 103, P. 1311-1319.
258. Terras F.R.G, Eggermont K, Kovakva V, Raikhel N.V, Osborn R.W, Kester A, Rees S.B, Torrekens S, Leuven F.V, Vanderleyden J, Cammue B.P.A. and Broekaert W.F. Small cysteine-rich antifungal proteins from radish: their role in host defense // Plant Cell, 1995a, V. 7 (5), P. 573-588.
259. Terras F.R.G, Torrekens S, Van Leuven F, Osborn R.W, Vanderleyden J, Cammue B.P.A, Broekaert W.F. A new fanily of basic cysteine-rich plant antifungal proteins from Brassicaceae-species // FEBS Lett, 1995b, V. 316. P. 233-240.
260. Terras F.R.G, Penninckx I.A.M.A, Goderis I.J, Broekaert W.F. Evidence that the role of plant defensins in radish defense responsec is independent of salicylic acid // Planta, 1998, V. 206, P. 117-124.
261. Theis T, Stahl U. Antifungal proteins: targets, mechanisms and prospective applications // Cell Mol. Life Sci, 2004, V. 61, P. 437-455.
262. Thevissen K, Ghazi A, De Samblanx G.W, Brownlee C, Osborn R.W, Broekaert W.F. Fungal membrane responses induced by plant defensins and thionins // J. Biol. Chem, 1996, V. 271, P. 15018-15025.
263. Thevissen K, Osborn R.W, Acland D.P, Broekaert W.F. Specific binding sites for an antifungal plant defensin from Dahlia {Dahlia merckii) on fungal cells are required for antifungal activity // Mol Plant Microbe Interact, 2000, V. 13, P. 54-61.
264. Thevissen K, Cammue B.P, Lemaire K, Winderickx J, Dickson R.C, Lester R.L, Ferket K.K, Van Even F, Parret A.H.A, Broekaert W.F. A gene encoding a sphingolipid biosynthesis enzyme determines the sensitivity of Saccaromyces cereviseae to an antifungal plant defensin from dahlia {Dahlia merckii) // Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A, 2003a, V. 97, P. 9531-9536.
265. Thevissen K, Ferket K.K, François I.E., Cammue B.P. Interactions of antifungal plant defensins with fungal membrane components // Peptides, 2003b, V. 24, P. 1705-1712.
266. Thevissen K, Warnecke D.C, Francois I.E., Leipelt M, Heinz E, Ott C, Zahringer U, Thomma B.P, Ferket K.K, Cammue B.P. Defensins from insects and plants interact with fungal glucosylceramides // J. Biol. Chem, 2004, V. 279, P. 3900-3905.
267. Thevissen K, François I.E., Sijtsma L, van Amerongen A, Schaaper W.M, Meloen R, Posthuma-Trumpie T, Broekaert W.F, Cammue B.P.. Antifungal activity of synthetic peptides derived from Impatiens balsamina antimicrobial peptides Ib-AMP1 and Ib-AMP4 // Peptides, 2005, V. 26 (7), P. 1113-1139.
268. Thevissen K, Kristensen H-H, Thomma B.P.H.J, Cammue B.P.A, Francois I.E.J.A. Therapeutic potential of antifungal plant and insect defensins // Drug Discovery Today, 2007, V. 12, P. 966-971.
269. Thomma B.P.H.J, Cammue B.P.A, Thevissen K. Plant defensins // Planta, 2002, V. 216, P. 193-202.
270. Thomma B.P, Cammue B.P, Thevissen K. Mode of action of plant defensins suggests therapeutic potential // Curr. Drug Targets Infect. Disord, 2003, V. 3 (1), P. 1-8.
271. Tossi A, Sandry L. Molecular diversity in gene-encoded, cationic antimicrobial polypeptides // Current Pharmaceutical Design, 2002, V. 8, P. 743761.
272. Trabi M, Schirra H.J, Craik D.J. Three-dimensional structure of RTD-1, a cyclic antimicrobial defensin from Rhesus macaque leucocytes // Biochemistry, 2001, V. 40, P. 4211-4221.
273. Turner N.E, Hwang D.J, Bonness M. A nontoxic C-termional deletion mutant of pokeweed antiviral protein inhibits viral infection // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, V. 94, P. 3866-3871.
274. van den Bergh K.P.B, Rouge P, Proost P, Coosemans J, Krouglova T, Engelborghs Y, Peumans W.J, Van Damme E.J.M. Synergistic antifungal activity of two chitin-binding proteins from spindle tree (Euonymus europaeus L.) // Planta, 2004, V. 219, P. 221-232.
275. van der Weerden N.L, Lay F.T, Anderson M.A. The plant defensin, NaDl, enters the cytoplasm of Fusarium oxysporum hyphae // J. Biol. Chem, 2008, V. 283 (21), P. 14445-144452.
276. van der Weerden N.L, Hancock R.E, Anderson M.A. Permeabilization of fungal hyphae by the plant defensin NaDl occurs through a cell wall-dependent process // J. Biol. Chem, 2010, V. 285 (48), P. 37513-37520.
277. van Loon L.C. Regulation of changes in proteins and enzymes associated with active defense against virus infection, in: R.K.S. Wood (Ed.). Active Defense Mechanisms in Plants. Plenum Press, New York, 1982, P. 247-273.
278. van Loon L.C, Van Strien E.A. The families of pathogenesis-related proteins, their activities, and comparative analysis of PR-1 type proteins // Physiol. Mol. Plant Pathol, 1999, V. 55 (2), P. 85-97.
279. van Loon L.C, Rep M, Pieterse C.M. Significance of inducible defense-related proteins in infected plants // Annu. Rev. Phytopathol, 2006, V. 44, P. 135162.
280. van Parijs J, Broekaert W.F, Goldstein I.J, Peumans W.J. Hevein: an antifungal protein from rubber-tree (Hevea brasiliensis) latex 11 Planta, 1991, V. 183, P. 258-264.
281. Vazquez-Padron R. I, Moreno-Fierros L, Neri-Bazan L, de la Riva G. A, Lopez-Revilla R. Intragastric and intraperitoneal administration of Cry 1 Ac protoxin from Bacillus thuringiensis induces systemic and mucosal antibody responses in mice // Life Sci, 1999, V. 64, P. 1897-1912.
282. Vera P, Conejero V. Pathogenesis-related proteins of tomato P-69 as an alkaline endoproteinase // Plant Physiol, 1998, V. 87, P. 58-63.
283. Vignutelli A, Wasternack C, Apel K, Bohlmann H. Systemic and local induction of an Arabidopsis thionin gene by wounding and pathogens // Plant J, 1998, V. 14, P. 285-295.
284. Vila-Perellor, M, Sarnchez-Vallet, A, Garcia-Olmedo, F, Molina, A, and Andreu, D. Structural dissection of a highly knotted peptide reveals minimal motif with antimicrobial activity // J. Biol. Chem, 2005, V. 280, P. 1661-1668.
285. Vógeli-Lange R, Fründt C, Hart C.M, Nagy F, Meins F. Developmental, hormonal and pathogenesis-related regulation of the tobacco class I (3-1,3-glucanase B promoter // Plant Mol. Biol, 1994, V. 25, P. 299-311.
286. Walton I.D. Deconstructing the cell wall // Plant Physiol, 1994, V. 104 (4), P. 1113-1118.
287. Wang Z, Xie W, Chi F, Li C. Identification of nonspecific lipid transfer protein-1 as a calmodulin-binding protein in Arabidopsis II FEBS Lett,. 2005, V. 579, P. 1683-1687.
288. Wang H.X. and Ng T.B. Isolation and characterization of an antifungal peptide with antiproliferative activity from seeds of Phaseolus vulgaris cv. "Spotted Bean" // Appl. Microbiol. Biotechnol, 2007, V. 74, P. 125-130.
289. Wang G, Li X, Wang Z. APD2: the updated antimicrobial peptide database and its application in peptide design // Nucl. Acids Res, 2008, doi: 10.1093/nar/gkn823.
290. Wieczorek M, Otlewski I, Cook f. Parks K, Leluk I, Wielmowska-Pelc A, Poanowski A, Wilusz T, Laskowski M.. The squash family of serine proteinase inhibitors. Amino acid sequences and association equilibrium constants of inhibitors from squash, summer squash, zucchini, and cucumber seeds // Biochem. Biophys. Res. Commun, 1985, V. 126 (2), P. 646-652.
291. Wijaya R, Neumann G.M, Condron R, Hughes A.B., Polya G.M. Defense proteins from seed of Cassia fistula include a lipid transfer protein homologue and a protease inhibitory plant defensin // Plant Sei, 2000, V. 159, P. 243-255.
292. Wisniewski M.E, Bassett C.L, Artlip T.S, Webb R.P, Janisiewicz W.J, Norelli J.L. Characterization of a defensin from bark and fruit tissues of peach and antimicrobial activity of a recombinant defensin in the yeast, Pichia pastoris II Physiol. Plant, 2003, V. 119, P. 563-572.
293. Wong J.H, Ng T.B. Gymnin, a potent defensin-like antifungal peptide from the Yunnan bean (Gymnocladus chinensis Baill) // Peptides, 2003, V. 24 (7), P. 963-968.
294. Wong J.H, Ng T.B. Sesquin, a potent defensin-like antimicrobial peptide from ground beans with inhibitory activities toward tumor cells and HIV-1 reverse transcriptase // Peptides, 2005, V. 25 (7), P. 1120-1126.
295. Wong J.H, Ng T.B, Cheung R.C, Ye X.J, Wang H.X, Lam S.K, Lin P, Chan Y.S, Fang E.F, Ngai P.H, Xia L.X, Ye X.Y, Jiang Y, Liu F. Proteins with antifungal properties and other medicinal applications from plants and mushrooms // Appl. Microbiol. Biotechnol, 2010, V. 87 (4), P. 1221-35.
296. Wösten H.A.B. Hydrophobins: multipuprose proteins // Ann. Rev. Microbiol, 2001, V. 55, P. 625-646.
297. Wu Y., Wang H, Ng T.B. Purification and characterization of a lectin with antiproliferative activity toward cancer cells from the dried fruit bodies of Lactarius flavidulus II Carbohydr Res, 2011, V. 346 (16), P. 2576-2581.
298. Xiang Y, Huang R.-H, Liu X.-Z, Zhang Y, Wang D.-C. Crystal structure of a novel antifungal protein distinct with five disulfide bridges from Eucommia ulmoides Oliver at an atomic resolution // J. Structural Biology, 2004, V. 148, P. 86-97.
299. Xuan T.D, Chung I.M, Khanh T.D, Tawata S. Identification of phytotoxic substances from early growth of barnyard grass {Echinochloa crusgalli) root exudates // J. Chem. Ecol, 2006, V. 32, P. 895-906.
300. Yanagawa Y, Abe T, Satake M, Odani S, Suzuki J, Ishikawa K. A novel sodium channel inhibitor from Conus geographicus: purification, structure and pharmacological properties // Biochemistry, 1988, V. 27, P. 6256-6262.
301. Yang Y.S, Mitta G, Chavanieu A, Calas B, Sanchez J.F, Roch P, Aumelas A. Solution structure and activity of the syntetic four-disulfide bond Mediterranean mussel defensin (MGD-1) // Biochemistry, 2000, V. 39, P. 14436-14447.
302. Yamada K, Shimada T, Kondo M, Nishimura M. and Hara-Nishimura I. Multiple functional proteins are produced by cleaving Asn-Gln bonds of a single precursor by vacuolar processing enzyme // J. Biol. Chem, 1999, V. 274, P. 25632570.
303. Yang X, Wang X, Li X, Zhang B, Xiao Y, Li D, Xie C, Pei Y. Characterization and expression of an nsLTPs-like antimicrobial protein gene from motherwort (Leonurus japonicus) 11 Plant Cell Rep, 2008, V. 27, P. 759-766.
304. Yeats T.H. and Rose J.K.C. The biochemistry and biology of extracellular plant lipid-transfer proeteins (LTPs) // Protein Sci, 2008, V. 17, P. 191-198.
305. Yang Y.S, Mitta G, Chavanieu A, Calas B, Sanchez J.F, Roch, P, Aumelas, A. Solution structure and activity of the synthetic four-disulfide bond mediterranean mussel defensin (MGD-1) // Biochemistry, 2000, V. 39 (47), P. 14436-14447.
306. Yeaman M. R. and Yount N. Y. Mechanisms of antimicrobial peptide action and resistance // Pharmacol. Rev, 2003, V. 55, P. 27-55.
307. Yoshikawa M, Yokota K, Hiraki K. Purification and some properties of a subtilisin inhibitor from adzuki beans // Agric. Biol. Chem, 1985, V. 49 (2), P. 367-371.
308. Zasloff M. Antimicrobial peptides of multicellular organisms // Nature, 2002, V. 415 (6870), P. 389-395.
309. de Zelicourt A, Letousey P, Thoiron S, Campion C, Simoneau P, Elmorjani K, Marion D, Simier P, Delavault P. Ha-DEFl, a sunflower defensin, induces cell death in Orobanche parasitic plants // Planta, 2007, V. 226 (3), P. 591600.
310. Zhu M.J, Zhang G.Q, Wang H.X, Ng T.B. Isolation and characterization of a Kunitz-type trypsin inhibitor with antiproliferative activity from Gymnocladus chinensis (Yunnan bean) seeds // Protein J, 2011, V. 240-246.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.