Структурно-функциональное исследование каталитического антиидиотипического антитела к ацетилхолинэстеразе эритроцитов человека тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Александрова, Елена Сергеевна

• Александрова, Елена Сергеевна
• кандидат биологических наук
• 2001

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Александрова, Елена Сергеевна

Список сокращений

Введение

Обзор литературы

1 Искусственные каталитические антитела

1.1 Каталитические антитела, полученные иммунизацией аналогами переходных состояний

1.2 Использование антител, содержащих кофакторы в связывающем центре

1.3 Ввод каталитичесой группы в связывающий центр антитела методом химической модификации или сайт направленного мутагенеза

1.4 Создание антител для катализа энергетически невыгодных превращений

2. Природные каталитические антитела

3. Антиидиотипические антитела

3.1 Антиидиотипические антитела к рецепторам

3.2 Антиидиотипические вакцины

3.3 Структурные исследования антиидиотипических антител

3.4 Каталитические антиидиотипические антитела

3.4.1 Антиидиотипическое антитело 9G4H9, обладающее р-лактамазной активностью

3.4.2 Антиидиотипическое антитело 9А8, обладающее ацетилхолинэстеразной активностью

3.4.2.1. Строение активного центра и свойства ацетилхолинэстеразы

3.4.2.2 Идиотипическое антитело АЕ2

3.4.2.3 Антиидиотипическое антитело 9А8

4. Строение активных центров эстеролитических антител

4.1 Эстеролитическое антитело 17Е8

4.2 Эстеролитическое антитело CNJ206 и сравнение его с эстеролитическим антителом 17Е8

4.3 Сравнение активных центров трех эстеролитических антител, полученных на один аналог переходного состояния реакции

Результаты и их обсуждение

1. Разработка методики выделения антител, проявляющих ацетилхолинэстеразную активность

2. Исследование взаимодействия идиотип-антиидиотип

3. Клонирование, определение первичной структуры и функциональная экспрессия Fab-фрагмента антитела 9А8

3.1 Клонирование и определение первичной структуры антиидиотипического антитела 9А8

3.2 Функциональная экспрессия Fab-фрагмента антитела 9А8

4. Идентификация каталитически активных аминокислотных остатков и моделирование активного центра антитела 9А8

4.1 Сравнительный анализ первичной структуры антитела 9А8

4.2 Взаимодействие антитела 9А8 с фосфонатными ингибиторами эстераз

4.3 Масс-спектрометрический анализ пептидных фрагментов антитела 9А8

4.4 Моделирование активного центра антитела 9А8 - 78 Материалы и методы

1 Материалы

2 Методы

2.1 Наработка моноклональных антител

2.2 Гель-фильтрация

2.3 Ионообменная хроматография

2.4 Аффинная хроматография

2.5 Денатурирующий электрофорез в ПААГ

2.6 Иммуноблоттинг

2.7 Исследование взаимодействия идиотип-антиидиотип методом поверхностного плазмонного резонанса

2.8 Экспрессия Fab-фрагмента в Е. Coli

2.9 Выделение экспрессируемых фрагментов методом металл-хелатной хроматографии

2.10 Амплифицированный фермент-зависимый иммуносорбционный анализ

2.11 Определение каталитической активности методом Эллмана

2.12 Подготовка белков к гидролизу

2.13 Триптический гидролиз белка для масс-спектрометрического анализа

2.14 Приготовление образцов для масс-спектрометрического анализа

2.15 Масс-спектрометрический анализ методом MALDI

2.16 Взаимодействие антитела 9А8 со специфическими фосфонатными ингибиторами сериновых гидролаз

2.17 Выделение модифицированного пептида методом аффинной вытеснительной хроматографии

Выводы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структурно-функциональное исследование каталитического антиидиотипического антитела к ацетилхолинэстеразе эритроцитов человека»

Сложные химические превращения, регулирующие жизненно важные процессы, в большинстве своем являются каталитическими и происходят при участии высокоспецифичных и эффективных молекул - ферментов. В последние годы с помощью методов генетической инженерии и направленной химической модификации удалось создать ферменты с измененными свойствами. На этом поиск новых биокатализаторов не прекратился. В ряду каталитически активных молекул особое место занимают рибозимы -каталитические РНК, и абзимы - каталитические антитела.

Антитела представляют собой белковые молекулы, способные взаимодействовать с высокой специфичностью практически со всеми природными или синтетическими антигенами. Количество последних, в отличие от ферментов, практически не лимитировано. В 1948 году J1. Полинг [1] предположил, что принципиальное различие между антителами и ферментами заключается в том, что первые наиболее специфично взаимодействуют с антигеном в его стабильной конформации (низкоэнергетическом состоянии). Наоборот, ферменты проявляют максимальную специфичность к высокоэнергетическому переходному состоянию реакции. Таким образом, антитела, узнающие переходное состояние реакции могут проявлять каталитическую активность. В 1969 году Дженкс предложил использовать стабильные аналоги переходных состояний реакций в качестве иммуногенов для получения каталитических антител [2].

Новая эра в этом направлении была открыта с введением в иммунологическую практику техники получения моноклональных антител [3].

Количество реакций, катализируемых антителами, равно как и методик их получения, неуклонно растет. Современная абзимология включает в себя синтез новых аналогов переходных состояний, введение кофакторов и каталитических групп в уже существующие антитела, сайт-направленный мутагенез. Большинство известных каталитических антител было получено данными методами, однако, развивается и альтернативный подход. Он опирается на свойства имунной системы образовывать антитела "внутреннего образа" и на идиотипическую гипотезу, высказанную в 1974 году Н. Ерни [4]. Первым удачным примером каталитического антитела, полученного данным методом, является моноклональное антитело 9А8, созданное на активный центр ацетилхолинэстеразы и проявляющее функции исходного антигена, то есть обладающее ацетилхолинэстеразной активностью [5].

Детальное изучение действия каталитического антитела, как и любого фермента, невозможно без определения его структуры и механизма действия, что и являлось целью данной работы. Сравнение структуры активных центров исследуемого антитела и изученных эстеролитических антител (полученных на аналог переходного состояния реакции) будет способствовать лучшему пониманию причин возникновения и эволюции катализа альтернативными биокатализаторами - антителами.

Обзор литературы

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Александрова, Елена Сергеевна

Выводы

1. Оптимизирована методика выделения моноклонального антиидиотипического антитела 9А8, проявляющего эстеразную активность.

2. Методом поверхностного плазмонного резонанса исследовано взаимодействие идиотип-антиидиотип и определена константа связывания, которая составила ^ = 2.26-109М"1.

3. Изучено взаимодействие антитела 9А8 с фосфонатными ингибиторами эстераз и определена константа скорости модификации.

4. Показано, что специфическое взаимодействие экспрессированных фрагментов MA 9А8 со своим антигеном и их каталитическая активность ассоциациирована только с Fab-фрагментом антитела.

5. С помощью MALDI-масс-спектрометрического анализа определены структурные характеристики пептидов активного центра. Доказано наличие остатка Ser в активном центре абзима.

6. Высказано предположение о существовании каталитической диады Ser99-His35, подтвержденное компьютерным моделированием. Проведено сравнение полученной трехмерной модели 9А8 с данными рентгено-структурного анализа эстеролитического антитела 17Е8. Показано, что активные центры рассматриваемых антител практически совпадают.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Александрова, Елена Сергеевна, 2001 год

1. Pauling L. (1948) Chemical achi evement and hope for the future. Am. Sci. 36, 51-58.

2. Jencks W. P. (1969) Catalysis in chemistry and enzymology. Mc Graw-Hill, NY, 1969, 836 p.

3. Kohler G., Milstein C. (1975) Continuous cultures of fused cells screening antibody of predefined specificity. Nature, 256, 495-497.

4. Jerne N. К. (1974) Toward a network theory of the immune system. Ann. Immunol, 125, 373-378.

5. Raso. W., Stollar B. D. (1975) The antibody-enzyme analogy. Biochemistry, 14, 591-599.

6. Kohen F., Kim J. В., Barnard G., Lindner H. R. (1980) Antibody-enhanced hydrolysis of steroid esters. Biochim. Biophys. Acta., 629, 328-337.

7. Kohen F., Kim J. В., Lindner H. R., Eshhar Z., Green B. (1980) Monoclonal immunoglobulin G augments hydrolysis of an ester of the homologous hapten: an esterase-like activity of the antibody-containing site? FEBS Lett., Ill, 427-431.

8. Pollack S. J., Jacobs J. W., Schultz P. G. (1986) Selective chemical catalysis by an antibody. Science, 234, 1570-1573.

9. Tramontano A., Janda K. D., Lerner R. A. (1986) Catalytic antibodies . Science, 234, 1566-1570.

10. Tramontano A. Ammann A. A., Lerner R. A. (1988) Antibody catalysis approaching the activity of enzymes. J. Am. Chem. Soc., 110, 2282-2286.

11. Shokat К. M., Schultz P. G. (1990) Catalytic Antibodies. Ann. Rev. Immun., 8, 335-363.

12. Schultz P. G. (1988) The interplay between chemistry and biology in the design of enzymatic catalysts. Science, 240, 426-433.

13. Napper A. D., Bencovic S. J., Tramontano A., Lerner R. (1987) A stereospecific cyclisation catalyzed by and antibody. Science, 237, 1041-1043.

14. Jackson D. Y., Jacobs H. W., Sugasawara R., Reich S. H., Bartlett P. A., Schultz P.G. (1988) An Antibody-catalyzed Claisen Rearrangement. J. Am. Chem. Soc., 110, 4941-4942.

15. Hilvert D., Nared K. D. (1988) Stereospecific Claisen Rearragement Catalyzed by an Antibody. J. Am. Chem. Soc., 110, 5593-5594.

16. Bencovic S. J., Napper A. D., Lerner R. A. (1988) Catalysis of a Stereospecific Bimolecular Amide Synthesis by an Antibody. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 85, 5355-5358.

17. Hilvert D., Hill K. W., Nared K. D., Auditor M. Т. M. (1989) Antibody Catalysis ofaDiels-Alder Reaction. J. Am. Chem. Soc., Ill, 9261-9262.

18. Braisted A. C., Schultz P.G. (1990) An Antibody-catalyzed Bimolecular Diels-Alder Reaction . J. Am. Chem. Soc., 112, 7430-7431.

19. Romesberg F. E., Spiller В., Schultz P. G., Stevens R. C. (1998) Immunological Origins of Binding and Catalysis in a Diels-Alderase Antibody. Science, 279, 1929-1933.

20. Xu J., Deng Q., Chen J., Houk K. N., Bartek J., Hilvert D., Wilson I. A. (1999) Evolution of shape complementarity and catalytic efficiency from a primordial antibody template. Science 286(5448), 2345-2348.

21. Braisted A. C., Schultz P. G. (1994) An antibody catalyzed oxy-Cope rearragement. J. Am. Chem. Soc., 116, 2211-2212.

22. E. C. Mundorff, M. A. Hanson, A. Varvak, H. Ulrich, P. G. Schultz, R. C. Stevens. (2000) Conformational effects in biological catalysis: an antibody-catalyzed oxy-cope rearrangement. Biochemistry, 39(4), 627-632.

23. Quinn D. M. (1987) Acetylcholinesterase: Enzyme structure, reaction dynamics and virtual transition states. Chem. Rev., 87, 955-979.

24. Pollack S. J., Jacobs J. W., Schultz P. G. (1986) Selective Chemical Catalysis by an Antibody. Science, 234, 1570-1573.

25. Tawfik D. S., Lindner А. В., Chap R., Eshhar Z. Green B. S. (1997) Efficient and Selective p-nitrophenyl-ester-hydrolysing Antibodies Elicited by a p-nitrophenyl Phosphonate hapten. Eur. J. Biochem. 244, 619-626.

26. Suzuki H., Mukouyama E. В., Wada C., Kawamura-Konishi Y., Wada Y., Ono M. (1998) A Catalytic antibody that Accelerates the Hydrolysis of carbonate esters. Prediction of the binding-site structure of the substrate. J.Protein Chem. 17, 273-278.

27. Janda K. D., Schloeder D., Benkovic S. J., Lerner R. A. (1988) Induction of an antibody that catalyzes the hydrolysis of an amide bond. Science, 241, 1188-1191.

28. Blackburn G. M., Kang A. S., Kingsbury G. A., Burton D. R. (1989) Catalytic antibodies. J. Biochem., 262, 381-390.

29. М. М. Thayer, Е. Н. Olender, A. S. Arvai, С. К. Koike, I. L. Canestrelli, J. D. Stewart, S. J. Benkovic, E. D. Getzoff, V. A. Roberts. (1999) Structural basis for amide hydrolysis catalyzed by the 43C9 antibody. JMolBiol, 291(2), 329-345.

30. Janda K. D., Weinhouse M. I., Schloeder D. M., Lerner R. A. (1990) Bait and Switch strategy for obtaining catalytic antibodies with acyl transfer capabilities. J. Am. Chem. Soc., 112, 1274-1275.

31. Wentworth P., Liu Y., Wentworth A. D., Fan P., Foley M. J., Janda K. D. (1998) A bait and switch strategy generates catalytic antibodies for phosphodiester hydrolysis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 5971-5975.

32. Iverson B. L., Lemer R. A. (1989) Sequence specific peptide cleavage catalyzed by an antibody. Science, 243, 1184-1188.

33. Hsieh L. C., Stephans J. C., Schultz P. G. (1994) An efficient antibody catalysed oxygenation reaction. J. Am. Chem. Soc., 116, 2167-2168.

34. Hsieh L. C., Yonkovich S., Kochersperger L., Schultz P. G. (1993) Controlling chemical reactivity with antibodies. Science, 260, 337-339.

35. Baldwin E., Schultz P. G. (1989) Generation of a catalytic antibody by site-directed mutagenesis. Science, 245, 1104-1107.

36. Pollack S. J., Nakayama G. R., Schultz P. G. (1988) Introduction of nucleophiles and spectroscopic probes into combining sites. Science, 242, 1038-1040.

37. Iverson B. L., Iverson S. A., Roberts V. A., Getzoff E. D., Tainer J. A., Benkovic S. J., Lerner R. A. (1990) Metalloantibodies. Science, 249, 659-662.

38. Stewart J. D., Roberts V. A., Crowder M. W., Getzoff E. D., Benkovic S. J. (1994) Creation of a novel biosensor for Zn(II). J. Am. Chem. Soc., 116, 415-416.

39. Ding L., Liu Z., Zhu Z., Luo G., Zhao D., Ni J. (1998) Biochemical characterisation of selenium-containing antibody as a cytosolic glutathione peroxidase mimic. Biochemistry, 332, 251-255.

40. Fletcher M. C., Kuderova A., Cygler M., Lee J. S. (1998) Creation of ribonuclease abzyme through site-directed mutagenesis. Nat. Biotechnol., 161, 1065-1067.

41. Janda K. D., Schloeder D., Lerner R. A. (1993) Antibody catalysis of a disfavored chemical transformation. Science, 259,490-493.

42. Gruber K, Zhou B, Houk KN, Lerner RA, Shevlin CG, Wilson I A. (1999) Structural basis for antibody catalysis of a disfavored ring closure reaction. Biochemistry, 38(22), 7062-7074.

43. Shabat D., Itzhaky H., Reymond J.-L., Keinan E. (1995) Antibody catalysis of a reaction otherwise strongly disfavored in water. Nature, 374,143-146.

44. Sinha S.C., Keinan E. (1995) Catalytic antibodies in organic synthesis. Asymmetric synthesis of (-)-a-multistriatin. J. Am. Chem. Soc. 117, 3653-3654.

45. Miyashita H., Karaki Y., Kikuchi M., Fujii I. (1993) Prodrug activation via catalytic antibodies. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5337-5340.

46. Landry D.W., Zhao K., Yang G.X., Glickman M., Georgiadis T.M. (1993) Antibody-catalyzed degradation of cocaine. Science, 259, 1899-1901.

47. De Prada P., Wigner G., Landry D. W. (2000)Application of artificial enzymes to the problem of cocaine. Ann. NY Acad. Sci.,909, 159-169.

48. Stewart J.D., Benkovich S.J. (1995) Transition-state stabilization as a measure of the efficiency of antibody catalysis. Nature, 375, 388-391.

49. Hilvert D. (2000) Critical analysis of antibody catalysis. Annual Rev. Biochem., 69,751-793.

50. Paul S., Voile D.J., Beach C.M., Johnson D.R., Powell M.J., Massey R.J. (1989) Catalytic hydrolysis of vasoactive intestinal peptide by human autoantibody. Science, 244, 1158-1162.

51. Sun M., Gao Q.S., Li L., Paul S. (1994) Proteolytic activity of an antibody light chain. J. Immunol., 153, 5121-5126.

52. Gao Q.S., Sun M., Tyutyulkova S., Webster D., Rees A., Tramontano A., Massey R.J., Paul S. (1994) Molecular cloning of a proteolytic antibody light chain. J. Biol. Chem., 269, 32389- 32393.

53. Gao Q. S. and Paul S. (1995) Site-directed mutagenesis of proteolytic antibody light chain. J. Mol. Biol., 253, 658-664.

54. Sun M. and Paul S. (1997) Altered cleavage site preference of a proteolytic antibody light chain induced by denaturation. FEBSLett., 407, 289-290.

55. Гололобов Г. В., Шустер А. М., Квашук Щ. А., Габибов А. Г. (1991) Антиидиотипические и каталитически активные антитела. Молекулярная Биология, 25, 593-602.

56. Shuster А. М., Gololobov G. V., Kvashuk О. A., Bogomolova А. Е., Smirnov I. V., Gabibov A. G. (1992) DNA-hydrolyzing autoantibodies. Science, 256, 665667.

57. Gabibov A. G., Gololobov G. V., Makarevich О. I., Shourov D. V., Chernova E. A., Yadav R. P. (1994) DNA-hydrolyzing autoantibodies. Appl. Biochem. Biotechnol., 47, 293-303.

58. Li L., Paul S., Tyutyulkova S., Kazatchkine M. D., Kaveru S. (1995) Catalytic activity of anti-thyroglobulin antibodies. J. Immunol., 154, 3328-3332.

59. Rose N. R., Burec C. L. (2000) Autoantibodies to thyroglobulin in health and disease. Appl. Biochem.Biotechnol, 83(1-3), 245-251.

60. Oudin J. and Michel M. (1963) Une nouvelle forme d'allotypie des globulines у du serum de lapin, apparemment liee a la fonction et la specificite des anticorps. C. R. Acad. Sci., 257, 805-808.

61. Pan Y., Yuhasz S. C., Amzel L. M. (1995) Anti-idiotypic antibodies: biological function and structural studies. FASEB J., 9, 43-49.

62. Strosberg A. D. (1989) Interaction of anti-idiotypic antibodies with membrane receptors: practical considerations. Methods Enzymol., 178, 179-191.

63. McNamara M. K., Ward R. E., Kohler H. (1984) Monoclonal idiotope vaccine against Streptpcpccus pmeumonie infection. Science, 226, 1325-1326.

64. Kennedy R., Eichberg J., Lanford R., Dreesman G. (1986) Antiidiotype antibody vaccine for type В viral hepatitis in chimpanzees. Science, 232, 220-223.

65. Rimmelzwann G. F., Bunschoten E. J., Uytdehaag F. G. С. M., Osterhaus A. D. M. E. (1989) Monoclonal anti-idiotypic antibody vaccines against poliovirus, canine parvovirus and rabies virus. Methods Enzymol, 178, 375-390.

66. Fleuridor R., Zhong Z., Pirofski L. (1998) A human IgM monoclonal antibody prolongs survival of mice with lethalcryptococcosis. J. Infect. Dis., 178, 12131216.

67. Tripathi P. К., Qin H., Deng S., Xu C., Battacharya-Chatterejee M., Foon K. A., Chatterejee S. K. (1998) Antigen mimicry by an anti-idiotypic antibody single chain variable fragment. Mol. Immunol., 35, 853-863.

68. Nisonoff A. (1991) Idiotypes: Concepts and applications. J. Immunol., 147, 24292438.

69. Gaulton G. N., Green M. I. (1986) Idiotypic mimicry of biological receptors. Ann. Rev. Immunol., 4, 253-280.

70. Bentley G. A., Boulot G., Riottot M. M., Poljak R. J. (1990) Three-dimesional structure of an idiotope-antiidioitope complex. Nature, 348, 254-257.

71. Ban N., Escobar C., Garcia R., Hasel K., Day J., Greenwood A., McPherson A. (1994) Crystal structure of and anti-idiotype Fab-complex. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 911604-1608.

72. Garcia К. C., Ronco P. M., Verroust P. J., Brunger А. Т., Amzel L. M. (1992) The three dimensional structure of an angiotensin II-Fab complex at 3 A: hormone recognition by an anti-idiotypic antibody. Science, 257, 502-507.

73. Bronstein I. В., Shuster A. M., Gololobov G. V., Gromova 1.1., Kvashuk O. A., Belostotskaya К. M., Alekberova Z. S., Prokaeva Т. В., Gabibov A. G. (1992)

74. DNA-specific antiidiotype antibodies in sera of patients with autoimmune diseases. FEBSLett., 314, 259-263.

75. Avalle В., Thomas D., Friboulet A. (1998) Functional mimicry: elicitation of a monoclonal anti-idiotypic antibody hydrolysing P-lactams. FASEB J., 12, 10551060.

76. Lamotte-Brasseur J., Dive G., Dideberg O., Charlier P., Frere J. M., Ghuysen J. M. (1991) Mechanism of acyl transfer by the class A serine p-lactamase of Streptomyces albus G. Biochem J., 279, 213-221.

77. Avalle В., Debat H., Friboulet F., Thomas D. (2000) Catalytic mechanism of an abzyme displaying a p-lactamase-like activity. Appl. Biochem. Bio techno!., 83, 163-169.

78. Sussman J. L., Harel M., Frolow F., Oefner C., Goldman A., Torer L., Silman I. (1991) Atomic structure of acetylcholinesterase from Torpedo californica: a prototypic acetylcholine-binding protein. Science, 253, 872-879.

79. Rippol D. R., Faerman С. H., Axelsen P. H., Silman I., Sussman J. L. (1993) An electrostatic mechanism for substrate guidance down the aromatic gorge of acetylcholinesterase. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5128-5132.

80. Radic Z., Reiner E., Taylor P. (1991) Role of the peripheral anionic site on acetylcholineserase: inhibition by substrates and coumarin derivatives. Mol. Pharmacol. 39, 98-104.

81. Gibney G., Camp S., Dionne M., MacPhee-Quigney K., Taylor P. (1990) Mutagenesis of essential functional residues in acetylcholinesterase. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 87, 7546-7550.

82. Duval N. Bon S., Silman I., Sussman J., Massoulix J. (1992) Site-directed mutagenesis of active-site-related residues in Torpedo acetylcholinesterase. FEBS Lett., 309, 421-423.

83. Gilson M. K., Straatsma T. P., McCammon J. A., Ripoll D. R., Faerman С. H., Axelsen P. H., Silman I., Sussman J. L. (1994) Open "Back door" in a molecular dynamics simulation of acetylcholinesterase. Science, 263, 1276-1278.

84. Bartolucci C., Perola E., Cellai L., Brufani M., lamba D. (1999) "Back door" opening implied by the crystal structure of a carbamoilated acetylcholineserase. Biochemistry, 38, 5714-5719.

85. Fambrough D. M., Engel A.G., Rosenberry T. L. (1982) Acetylcholinesterase of human erythrocytes and neuromuscular junctions: homologies revealed by monoclonal antibodies. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79, 1078-1082.

86. Sorensen K., Brodbek U., Rasmussen A. G., Norgaard-Pederson B. (1987) An inhibitory monoclonal antibody to human acetylcholinesterase. Biochem. Biophys. Acta, 912, 56-62.

87. Joron L., Izadyar L., Friboulet A., Remy M. E., Pancino G., Roseto A., Thomas D. (1992) Antiidiotypic antibodies exibiting an acetylcholinesterase abzyme activity.

88. Ellman G. L., Courtney K. D., Andres V., Featherstone R. M. (1961) A new and rapid colorimetric determination of acetylcholinesterase activity. Biochem. Pharmacol., 7, 88-95.

89. Zhou W. G., Guo J., Huang W., Fletterick R. J., Scanlan T. S. (1994) Crystal structure of a catalytic antibody with a serine protease active site. Science, 265, 1059-1064.

90. Charbonnier J. В., Golinelli-Pimpaneau В., Gigant В., Tawfik D. S., Chap R., Schindler D. G., Kim S. H., Green B. S., Eshhar Z., Knossow M. (1997) Structural convergence in the active site of a family of catalytic antibodies. Science, 275, 1140-1142.

91. Guo J., Huang W., Zhou G. W., Fletterick R. J., Scanlan T. S. (1995) Mechanistically different catalytic antibodies obtained from immunization with a single transition-state analog. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 1694-1698.

92. Patten P. A., Gray N. S., Yang P. L., Marks С. В., Wedemayer G. J., Boniface J. J, Stevens R. C., Schultz P. G. (1996) The immunological evolution of catalysis. Science, 111, 1086-1091.

93. Laemmli U, К. (1970) Cleavage of structural proteins during the assembly of the head off bacteriophage T4. Nature, 227, 680 -685.

94. Brigham-Burke M., Edwards J.R., O'Shannessy D. J. (1992) Detection of receptor-ligand interaction using surface plasmon resonance: model studies employing the HIV-1 gpl20/CD4 interactions. Anal. Biochem., 205, 125-131.

95. R. L. Rich, D. G. Myszka. (2000) Advances in surface plasmon resonance biosensor analysis. Curr Opin Biotechnol. 11(1), 54-61.

96. U. Jonsson, L. Fagerstam, B. Ivarsson, B. Johnsson, R. Karlsson, et al,. (1991) Real-time biospecific interaction analysis using surface plasmon resonance and a sensor chip technology. Biotechniques 11(5), 620-627

97. Kabat E. A., Wu Т. Т., Perry H. M., Gottesman K. S., Foeller C. Sequences of proteins of immunological interest. 1991. 5-th ed., Public health service, National Institute of Health, USA.

98. Tramontano A., Ivanov В., Gololobov G. V., Paul S. (2000) Inhibition and labeling of enzymes and abzymes by phosphonate diesters. Appl. Biochem. Biotechnol., 83, 233-243.

99. Harlow E., Lane D. Antibodies: a Laboratory Manual. New York.: Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, 1988, 726.

100. F. Hillenkamp, M. Karas. (1991) Mass spectrometry of peptides and proteins by matrix-assisted ultraviolet laser desorption/ionization. Methods Enzymol., 193, 280-295.

101. R. A. Kohanski, M. D. Lane, (1990) . Monovalent avidin affinity columns. Meth. Enzymol., 184, 194-200.

102. M. C. Peitsch, (1996) ProMod and Swiss-Model: Internet-based tools for automated comparative protein modelling. Biochem Soc Trans., 24 274-279.

103. N. Guex and M. C. Peitsch, (1997) SWISS-MODEL and the Swiss-PdbViewer: an environment for comparative protein modeling. Electrophoresis., 18 27142723.

104. Porath J, Carlsson J, Olsson I, Belfrage G. (1975) Metal chelate affinity chromatography, a new approach to protein fractionation. Nature, 258(5536) 598599-Ibir.lOTLJ.vM ,1Я26С- О!