Структурно-функциональная и антигенная характеристика высококонсервативных фрагментов оболочечных белков Е1 и Е2 вируса гепатита С тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Фарафонова, Татьяна Евгеньевна

• Фарафонова, Татьяна Евгеньевна
• кандидат биологических наук
• 2007

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Фарафонова, Татьяна Евгеньевна

1 Введение.

2 Оболочечные белки вируса гепатита С и перспективы создания вакцины

2.1 .Строение генома и организация вирусной частицы гепатита С.

2.2.Экспериментальные модели для изучения вируса гепатита С.

2.3.Молекулы на поверхности клетки-хозяина - предполагаемые рецепторы для вируса гепатита С.

2.3.1. Липопротеины низкой и очень низкой плотности и их рецепторы.

2.3.2. SR-B1 и CD81 в качестве рецепторов для вируса гепатита С.

2.3.3. Асиалогликопротеиновый рецептор.

2.3.4. Лектины DC-SIGN и L-SIGN.

2.3.5. Гликозаминогликаны.

2.4.Структура и функции оболочечных белков Е1 и Е2 вируса гепатита С

2.4.1. Общая характеристика структуры оболочечных белков.

2.4.2. Вариабельность оболочечных белков.

2.4.3. Структура и функции трансмембранных доменов оболочечных белков Е1 и Е2.

2.4.4. Образование дисульфидных связей и фолдинг оболочечных белков Е1 и Е2.

2.4.5. Влияние гликозилирования оболочечных белков на их структуру и функции.

2.4.6. Гетеродимер Е1Е2.

2.4.7. Образование вириона и высвобождение вирусной частицы во внеклеточное пространство.

2.4.8. Участки оболочечных белков, ответственные за распознавание возможных рецепторов вируса гепатита С.

2.4.9. Влияние оболочечных белков на регуляцию биосинтеза белков клетки-хозяина.

2.5.Антигенные свойства оболочечных белков вируса гепатита С.

2.6.Перспективы создания вакцины против вируса гепатита С.

2.7.3аключение.

3 Материалы и методы.

3.1 Химические реагенты и биологические препараты.

3.2 Растворители.

3.3 Оборудование и программное обеспечение

3.4 Методы.

3.4.1 Синтез пептидов.

3.4.1.1 Снятие Fmoc-защиты с N-концевой аминогруппы.

3.4.1.2 Присоединение Fmoc-защищенных аминокислот к свободным аминогруппам на иглах.

3.4.1.3 Ацетилирование N-концевых а-аминогрупп пептидов.

3.4.1.4 Биотинилирование N-концевых а-аминогрупп пептидов.

3.4.1.5 Снятие защит с боковых групп аминокислотных остатков пептида и снятие пептида в раствор пептидов с полимерного носителя.

3.4.1.6 Восстановление сульфоксидных групп пептида.

3.4.2 Тестирование биотинилированных пептидов на взаимодействие с гепарином

3.4.3 Конъюгация пептидов с белками-носителями.

3.4.3.1 Получение конъюгата пептида с белком-носителем с использованием глутарового альдегида.

3.4.3.2 Получение конъюгата пептида с белком-носителем с использованием N- гидроксисукцинимидного эфира 3-малеимидобензойной кислоты

3.4.3.3 Получение конъюгата пептида с белком-носителем с использованием диметилсуберимидата.

3.4.3.4 Получение конъюгата пептида с белком-носителем с использованием 1-этил-3'(3'-диметиламинопропил)карбодиимид.

3.4.3.5 Качественная и количественная характеристика конъюгатов.

3.4.4 Получение сывороток и препаратов иммуноглобулинов от иммунизированных животных.

3.4.5 Тестирование сывороток методом иммуноферментного анализа

3.4.5.1 ИФА с использованием в качестве антигена на поверхности планшета синтетических пептидов или конъюгатов пептидов.

3.4.5.2 ИФА с использованием на поверхности планшета в качестве антигена синтетических биотинилированных пептидов.

3.4.5.3 ИФА с использованием в качестве антигена пептида, ковалентно связанного с поверхностью планшет.

3.4.5.4 ИФА с использованием в качестве антигена на поверхности планшета оболочечного белка Е2 и гетеродимера Е1Е2.

3.4.5.5 Конкурентный иммуноферментный анализ.

4 Результаты и их обсуждение.

4.1 Составление структурно-функциональной карты оболочечных белков

4.2 Поиск гликозаминогликан-связывающих участков в высококонсервативных фрагментах оболочечных белков ВГС.

4.3 Изучение антигенных свойств высококонсервативных фрагментов оболочечных белков ВГС.

4.3.1 Выбор высококонсервативных фрагментов оболочечных белков ВГС для изучения антигенной активности и синтез соответствующих им пептидов.

4.3.2 Получение синтетических конструкций, включающих ВКФ для иммунизации животных.

4.3.3 Получение антипептидных антител к фрагментам CR3, CR4, CR5 и CHR у кроликов.

4.3.4 Получение антипептидных антител к фрагментам CR1, CR5 и CHR у мышей.

4.3.5 Определение специфичности антипептидных антител к препаратам оболочечных белков ВГС.

4.4 Получение синтетических пептидных Т-В эпитопных конструкции на основе высококонсервативных фрагментов оболочечных белков ВГС.

4.4.1. Синтез Т-В эпитопных конструкций.

4.4.2. Получение антител к Т-В-эпитопным конструкциям и определение их специфичности.

4.4.3. Взаимодействие анти Т-В-эпитопных антител с препаратами оболочечных белков ВГС.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структурно-функциональная и антигенная характеристика высококонсервативных фрагментов оболочечных белков Е1 и Е2 вируса гепатита С»

Актуальность проблемы

Вирус гепатита С (ВГС) является основной причиной парентерального (трансфузионного) гепатита, ранее называвшегося гепатитом ни А ни В. У большинства инфицированных (80%) гепатит С протекает в хронической форме и может вызывать цирроз и первичный рак печени. В настоящее время вакцина, предотвращающая заражение вирусом гепатита С, не разработана, а лечение а-интерфероном (в комбинации с рибавирином или без него) эффективно только лишь для ~40% больных хроническим гепатитом С и имеет в большинстве случаев серьезные побочные эффекты (Bartenschlager et al., 2000).

Оболочечные белки ВГС играют важную роль на ранних стадиях жизненного цикла вируса. Эти белки отвечают за взаимодействие с рецепторами, они участвуют в слиянии вирусной оболочки и клеточной мембраны, в сборке вирусной частицы в клетке и высвобождении из клетки. Несмотря на накопленные сведения об оболочечных белках и возможных рецепторах для ВГС, механизмы связывания вируса с поверхностью клеток, проникновения вирусной частицы в клетку-хозяина, а также сборки и высвобождения вирусной частицы из клетки все еще не установлены, точно не определены и участки оболочечных белков ВГС, ответственных за эти процессы. По этой причине изучение функциональных свойств оболочечных белков ВГС остается актуальной проблемой.

Оболочечные белки ВГС играют важную роль на ранних стадиях жизненного цикла вируса. Эти белки отвечают за взаимодействие с рецепторами и участвуют в процессах слияния вирусной оболочки и клеточной мембраны, сборки вирусной частицы в клетке и высвобождения из клетки. Несмотря на накопленные сведения о свойствах и функциях оболочечных белков и возможных рецепторах для ВГС, механизмы связывания вируса с поверхностью клетки, проникновения вирусной частицы в клетку-хозяина, а также сборки и высвобождения вирусной частицы из клетки все еще не установлены. Имеется крайне мало информации об участках оболочечных белков ВГС, ответственных за эти процессы. По этой причине изучение структуры и функций оболочечных белков ВГС и их фрагментов остается актуальной проблемой.

Особенностью ВГС является чрезвычайно высокая вариабельность его оболочечных белков. Выделяют два гипервариабельных участка обо-лочечного белка Е2, которые являются иммунодоминантными; антитела против них способны нейтрализовать проникновение вируса в клетку. Однако эти антитела специфичны лишь к одному или нескольким квазивидам вируса и не обеспечивают защиту организма от иных генетических вариантов ВГС. Существование эпитопов вируснейтрализующих антител вне гипервариабельных участков подтверждают многочисленные экспериментальные данные (Farci et al., 1996; Shimizu et al., 1994; Mario et al., 1996; Rodda et al., 1996), однако ни в одной работе структуры таких эпитопов не были определены. По этой причине необходим поиск эпитопов оболочечных белков ВГС вне гипервариабельных участков.

Наибольший интерес представляют участки оболочечных белков, являющиеся консервативными для большинства квазивидов вируса. Такие участки могут быть ответственными за взаимодействие вируса с клеточными рецепторами и проникновение вируса внутрь клетки, и потому могут вызвать выработку вируснейтрализующих антител для различных генетических вариантов ВГС.

Таким образом, структурно-функциональная и антигенная характеристика высококонсервативных фрагментов оболочечных белков ВГС является актуальной задачей. Информация о функционально значимых и антигенно активных фрагментах оболочечных белков ВГС необходима для разработки иммуногенных конструкций, способных вызывать выработку вируснейтра-лизующих антител.

Цель работы - структурная характеристика функционально значимых участков оболочечных белков ВГС и определение антигенности высококонсервативных участков этих белков в составе искусственных конструкций.

Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи:

1. провести поиск и анализ описанных в литературе функционально значимых участков оболочечных белков и составить структурно-функциональную карту оболочечных белков ВГС;

2. выявить высококонсервативные фрагменты оболочечных белков ВГС, способные взаимодействовать с гепарином - предполагаемым рецептором ВГС;

3. синтезировать пептиды, соответствующие высококонсервативным участкам оболочечных белков ВГС, и получить пептидные иммуногенные конструкции;

4. получить антипептидные антитела и тестировать их на взаимодействие с обол очечным белком Е2 и гетеродимером Е1Е2.

Научная новизна. В работе впервые:

• проведен поиск и анализ структурно- и функционально значимых аминокислотных остатков и целых фрагментов оболочечных белков ВГС и составлена структурно-функциональная карта оболочечных белков ВГС;

• картированы сайты специфического взаимодействия с гепарином в составе четырех высококонсервативных участков оболочечного белка Е2 ВГС;

• показана антигенность четырех (CR1, CR4, CR5 и CHR) высококонсервативных фрагментов оболочечных белков ВГС в составе конъюгатов с белками-носителями и одного фрагмента (CR5), конъюгированного с полимером - полиосидонием, получены гипериммунные сыворотки, содержащие антипептидные антитела против этих фрагментов;

• показана способность антипептидных антител, специфичных к фрагментам CHR и CR5, взаимодействовать с обол очечным белком Е2 и гетеродимером Е1Е2 ВГС;

• получены высокоантигенные синтетические Т-В-эпитопные пептидные конструкции, содержащие в своем составе высококонсервативные фрагменты оболочечного белка Е2 ВГС и способные вызывать образование антител, взаимодействующих с полноразмерным оболочечным белком Е2 и гетеродимером Е1Е2 ВГС.

Практическая значимость исследования

Составленная структурно-функциональная карта может быть использована при изучении структурно-функциональных взаимоотношений оболочечных белков ВГС, взаимодействия оболочечных белков с молекулами поверхности клетки, эпитопном картировании, конструировании синтетических вакцинных конструкций. Карта позволяет установить функциональную значимость того или иного фрагмента или аминокислотного остатка (а.к.о.) для жизнедеятельности ВГС, его консервативность, возможные аминокислотные замены в пределах данного фрагмента (позиции), а также функции и консервативность близлежащих а.к.о. или участков оболочечных белков.

Картированные в оболочечных белках ВГС участки взаимодействия с гепарином могут быть использованы для поиска лигандов, блокирующих взаимодействие вирусной частицы ВГС с клеткой-хозяином, и разработки терапевтических средств против ВГС.

Обладающие антигенностью высококонсервативные фрагменты (ВКФ) оболочечных белков, исследованные в данной работе, могут быть использованы в разработке синтетической пептидной конструкции для кандидатной вакцины против ВГС. Проявление антигенных свойств у фрагмента CR5 в конъюгате с полиоксидонием свидетельствует о возможности применения синтетических фрагментов оболочечного белка ВГС и полиоксидония (в качестве эффективного адъюванта) в разработке вакцины против ВГС.

Апробация работы

Основные результаты диссертационной работы были доложены на следующих симпозиумах и конференциях: 5-ой научной конференции с международным участием «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге 2001» (Санкт-Петербург, 2001), 6-ой Пущинской школе-конференции молодых ученых «Биология - наука XXI века» (Пущино, 2002), 3rd International and 28th European Peptide Symposium «Bridges Between Disciplines» (Prague, 2004), International Conference "Genomics, Proteomics and Bioinformatics for Medicine" (Moscow, 2004). Апробация диссертации состоялась на межлабораторном семинаре ГУ НИИ БМХ РАМН 5 апреля 2007 года.

Публикации

Материалы диссертационной работы опубликованы в 4 статьях и 6 публикациях сборников докладов научных конференций.

Структура и объем диссертации

Материалы диссертации изложены на 178 страницах машинописного текста. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, собственных результатов, их обсуждения, выводов, списка цитированной литературы, включающего 272 источника, приложения. Работа иллюстрирована 5 таблицами и 15 рисунками.

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Фарафонова, Татьяна Евгеньевна

5 Выводы

1. Составлена структурно-функциональная карта оболочечных белков вируса гепатита С.

2. Определены четыре линейные высококонсервативные фрагменты оболочечного белка Е2, ответственные за его взаимодействие с гепарином - возможным рецептором ВГС.

3. Показано, что высококонсервативные фрагменты оболочечных белков ВГС, включенные в состав искусственных иммуногенных конструкций, проявляют антигенные свойства и способны вызывать образование специфических антител, взаимодействующих с оболочечным белком Е2 и гетеродимером Е1Е2 ВГС.

4. Получены высокоантигенные синтетические Т-В-эпитопные пептидные конструкции, содержащие в своем составе высококонсервативные фрагменты оболочечного белка Е2 ВГС и способные вызывать образование антител, взаимодействующих с полноразмерным оболочечным белком Е2 и гетеродимером Е1Е2 ВГС.

4.5 Заключение

Составленная нами структурно-функциональная карта оболочечных белков El, Е2 и р7 ВГС содержит обобщенную информацию об аминокислотных последовательностях этих белков и их вариациях в разных генетических вариантах вируса, а также об известных из публикаций функционально важных участках. Данная карта позволяет установить функциональную значимость того или иного фрагмента или а.к.о. для жизнедеятельности ВГС, его консервативность, возможные аминокислотные замены в пределах данного фрагмента (позиции) а также функции и консервативность близлежащих а.к.о. или участков оболочечных белков. Нами, в частности, были выявлены новые вариабельные участки в составе этих белков и были отмечены некоторые особенности первичной структуры в областях неконсервативных сайтов гликозилирования, которые, возможно, заинтересуют исследователей, изучающих структурно-функциональные взаимоотношения в оболочечных белках ВГС с использованием метода точечного мутагенеза. Карта всегда может быть дополнена новыми данными, а также усовершенствована путем разграничения структурных и функциональных особенностей различных генотипов. Для этого необходим более тщательный анализ литературных данных и составление консенсусных последовательностей для каждого генотипа в отдельности. Карта может быть полезна при изучении структурно-функциональных свойств оболочечных белков ВГС, взаимодействия оболочечных белков с молекулами поверхности клетки, эпитопном картировании, конструировании синтетических вакцинных конструкций.

Впервые были картированы сайты специфического взаимодействия с гепарином в составе четырех высококонсервативных участков белка Е2 ВГС. Структуры этих сайтов отличаются от паттернов, соответствующих известным из литературы гепарин-связывающим мотивам белков, однако имеют с ними некоторые общие свойства: обогащенность положительно заряженными а.к.о. и присутствие в двух гепарин-связывающих сайтах белка Е2 ВГС более одного остатка Туг. Нами было высказано предположение о том, что выявленные нами участки взаимодействия с гепарином образуют в результате пространственной укладки полипептидной цепи белка Е2 единый сайт, который может быть ответственным за специфическое связывание ВГС с корецептором - гепарансульфатом клеточной мембраны гепатоцитов. Это предположение косвенно подтверждается в работе Barth et al. (2006), авторы которой показали, что в формировании сайта взаимодействия с гепарансульфатами могут участвовать различные сегменты а.к. последовательности белка Е2.

К сожалению, не удалось получить антипептидных антител к одному из участков связывания гепарина, CR3. Антитела же к наиболее активно взаимодействовавшему с гепарином участку CR4 не связывались с оболо-чечным белком Е2 и гетеродимером Е1Е2. Также не взаимодействовали с гетеродимером Е1Е2 и антитела к ВКФ белка Е1. По-видимому, использованные конъюгаты пептидов не являлись адекватными моделями соответствующих фрагментов в составе оболочечных белков ВГС. Однако из-за присутствия в этих фрагментах довольно большого количества а.к.о. с боковыми функциональными группами подобрать подходящий способ конъюгации было весьма сложно. В то же время среди полученных нами антисывороток к конъюгатам фрагмента CHR и N-концевой части CR5 с белком-носителем, а также к конъюгату CR5 с полиоксидонием оказались такие, которые содержали антитела, взаимодействовавшие с оболочечны-ми белками ВГС. Это говорит о принципиальной возможности использования синтетических фрагментов оболочечных белков ВГС, конъюгиро-ванных с носителями, обладающими Т-эпитопной активностью либо иммуностимулирующими свойствами, вызывать В-клеточный иммунный ответ против оболочечных белков ВГС, а, значит, и против самого вируса. Экспериментально подтверждена и принципиальная возможность создания полностью синтетических пептидных антигенных конструкций из отдельных фрагментов оболочечных белков ВГС. Полученные конструкции, содержали в своем составе предполагаемый В-эпитоп и предсказанный нами Т-хелперный эпитоп с широкой специфичностью в отношении различных аллельных вариантов МНС II. Эти конструкции обладали высокой имму-ногенностью в отсутствие белкового носителя, и что более важно, были способны вызывать образование антител специфичных к полноразмерным белкам ВГС. Использование консервативных фрагментов оболочечных белков в составе этих пептидных конструкций и в составе конъюгатов пептидов с белками позволяет полагать, что антитела вырабатываемые в ответ на них антитела будут взаимодействовать с самыми различными изолята-ми ВГС.

Полученные в работе данные могут послужить основой для разработки иммуногенных конструкций для синтетических и рекомбинантных искусственных вакцин против гепатита С, а также для поиска терапевтических средств, направленных на блокирование взаимодействия ВГС с рецепторами клеток-мишеней.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Фарафонова, Татьяна Евгеньевна, 2007 год

1. Вольпина О.М., Титова М.А., Жмак М.Н. и др. Предсказание структуры пептидов, способных индуцировать образование антител у мышей // Биоорганическая химия. 2002. - Т. 28. - С 387-395.

2. Куприянова М.А., Жмак М.Н., Короев Д.О. и др. Синтетические пептидные конструкции на основе иммуноактивных фрагментов белка VPJ1} вируса ящура штамма А{22} // Биоорган, хим. 2000. - Т. 12. - С. 926-933.

3. Николаева Л.И., Оленина Л.В., Колесанова Е.Ф. Иммунитет при разных формах гепатита С // Russian J. of immunology. 1999. - Т. 4. № 2. - С. 91112.

4. Рамзаев В.П. Электронно-микроскопическое исследование процесса поглощения липопротеидов низкой плотности перикардиальными макрофагами больных атеросклерозом // Бюлл. эксп. биол. мед. 1982. - Т. 93. №3.-С. 113-115.

5. Ройт А., Бростофф Дж., Мейл Д. Иммунология. Пер. с англ. М.: Мир. -2000.-С. 551.

6. Соболев Б.Н., Поройков В.В., Оленина Л.В., Колесанова Е.Ф., Арчаков А.И. Анализ белков вируса гепатита С на основе аминокислотных последовательностей и литературных данных // Биофизика. 2002. - Т. 47. № 2.-С. 204-210.

7. Хаитов Р. М., Пинегин Б. В. Иммуномодуляторы: механизм действия и клиническое применение // Иммунология. 2003. №3. - С. 196-202.

8. Ahn K., Szczesna-Skorupa E., Kemper B. The amino-terminal 29 amino acids of cytochrome P450 2C1 are sufficient for retention in the endoplasmic reticulum // The Journal of biological chemistry. 1993. - V. 268. № 25. - P. 18726-18733.

9. Akula S.M., Pramod N.P., Wang F.Z., Chandran B. Human herpesvirus 8 envelope-associated glycoprotein В interacts with heparin sulfate-like moieties // Virology. 2001. V. 284. №2. - P. 235-249.

10. Allander Т., Forns X., Emerson S.U., Purcell R.H., Bukh J. Hepatitis С virus envelope protein E2 binds to CD81 of tamarins // Virology. 2000. - V. 277. №2.- P. 358-367.

11. Alvarez C.P., Lasala F., Carrillo J., Muniz O., Corbi A.L., Delgado R. C-type lectins DC-SIGN and L-SIGN mediate cellular entry by Ebola virus in cis and in trans // Journal of Virology. 2002. - Vol. 76. P. 6841-6844.

12. Atherton E., Sheppard R.C. Solid phase peptide synthesis: a practical approach. // Oxford-New York-Tokyo: IRL Press. Oxford University Press -1989.

13. Bahraoui E.M., Granier C., Van Rietschoten J., Rochat H., el Ayeb M. Specificity and neutralizing capacity of antibodies elicited by a synthetic peptide of scorpion toxin// J. Immunol. 1986. -V. 136. №9. - P. 3371-3377.

14. Bartenschlager R., Ahlborn-Laake L., Mous J., Jacobsen H. Kinetic and structural analyses of hepatitis С virus polyprotein processing // Journal of Virology. 1994. - Vol. 68. - P. 5045-5055.

15. Bartenschlager R., Lohmann V. Novel cell culture systems for the hepatitis С virus // Antiviral Research. 2001. - Vol. 52. - P. 1-17.

16. Bartosch В., Dubuisson J., Cosse, F.-L. Infectious hepatitis С virus pseudo-particles containing functional E1-E2 envelope protein complexes // Journal of Experimental Medicine. 2003a. - Vol. 197. - P. 633-642.

17. Behrens S.E., Tomei L., De Francesco R. Identification and properties of the RNA-dependent RNA polymerase of hepatitis С virus // The EMBO journal. -1996.-Vol. 15. № l.-P. 12-22.

18. Blanchard E., Brand D., Trassard S., Goudeau A., Roingeard P. Hepatitis С virus-like particle morphogenesis // Journal of Virology. 2002. - Vol. 76. - P. 4073-4079.

19. Blight K.J., McKeating J.A., Marcotrigiano J., Rice C.M. Efficient replication of hepatitis С virus genotype la RNAs in cell culture // Journal of Virology. -2003. Vol. 77. № 5. p. 3181-3190.

20. BLOSUM Matrices, Henikoff S., Henikoff J.G. Amino acid substitution matrices from protein blocks // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1992.-V. 89. №22.-P. 10915-10919.

21. Branch A.D. Replication of Hepatitis С Virus: Catching It in the Act // Hepatology, 1996. - Vol. 23. № 2. - P. 372-375.

22. Brazzoli M., Helenius A., Foung S.K., Houghton M., Abrignani S., Merola M. Folding and dimerization of hepatitis С virus El and E2 glycoproteins in stably transfected CHO cells // Virology. 2005. - Vol. 332. № 1. - P. 438-453.

23. Cardin A.D., Hirose N., Blankenship D.T. et al. Binding of high reactive heparin to human apolipoprotein E: identification of two heparin-binding domains // Biochem Biophys Res Com. 1986. - V. 134. - P. 783-789.

24. Cardin A.D., Weintraub H.J. Molecular modeling of protein-glycosaminoglycan interactions // Arteriosclerosis. 1989. - V. 9. №1. - P. 21-32.

25. Carrere-Kremer S., Montpellier-Pala C., Cocquerel L., Wychowski C., Penin F., Dubuisson J. Subcellular localization and topology of the p7 polypeptide of hepatitis С virus // Journal of Virology. 2002. - Vol. 76. № 8. - P. 3720-3730.

26. Castet V., Moradpour D. A model for the study of hepatitis С virus entry // Hepatology. 2003. - Vol. 38. № 3. - P. 771-774.

27. Chan S.W., Egan P.A. Hepatitis С virus envelope proteins regulate CHOP via induction of the unfolded protein response // FASEB J. 2005. - V. 19. №11.- P. 1510-1512.

28. Chang K.-M., Rehermann В., McHutchison J., et al. Immunological significance of cytotoxic T lymphocyte epitope variants in patients chronically infected by the hepatitis С virus // J. Clin. Invest. 1997. - V. 100. - P. 23762385.

29. Chen Y., Maguire Т., Hileman R.E., Fromm J.R., Esko J.D., Linhardt R.J., Marks R.M. Dengue virus infectivity depends on envelope protein binding to target cell heparan sulfate // Nat Med. 1997. - V.3. №8. - P. 866-871.

30. Choo Q.-L., Kuo G., Weiner A.J., Overby L.R., Bradley D.W., Houghton M. Isolation of a cDNA clone derived from a blood-borne non-A, non-B viral hepatitis genome // Science. 1989. - Vol. 244. - P. 359-362.

31. Choukhi A., Pillez A., Drobecq H., Sergheraert C., Wychowski C., Dubuisson J. Characterization of aggregates of hepatitis С virus glycoproteins // Journal of General Virology . 1999. - V. 80. №Pt 12. - P. 3099-30107.

32. Choukhi A., Ung S., Wychowski C., Dubuisson J. Involvement of endoplasmic reticulum chaperones in the folding of hepatitis С virus glycoproteins // Journal of Virology. 1998. - Vol. 72. № 5. - P. 3851-3858.

33. Clarke B. Molecular virology of hepatitis С virus // Journal of General Virology . 1997. - V. 78. - P. 2397-2410.

34. Clayton R.F., Owsianka A., Aitken J., Graham S., Bhella D., Patel A.H. Analysis of antigenicity and topolgy of E2 glycoprotein present on recombinant hepatitis С virus-like particles // Journal of Virology. 2002. - Vol. 76. № 15. - P. 7672-7682.

35. Cormier E. G., Tsamis F., Kajumo F., Durso R. J., Gardner J. P., Dragic T. CD81 is an entry coreceptor for hepatitis С virus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2004a - Vol. 101. - P. 7270-7274.

36. Dash S., Halim A.B., Tsuji H., Hiramatsu N., Gerber M.A. Transfection of HepG2 cells with infectious hepatitis С virus genome // American journal of pathology. 1997. - Vol. 151. - P. 363-373.

37. De Francesco R., Steinkuhler C. Structure and function of the hepatitis С virus NS3-NS4A serine proteinase // Current topics in microbiology and immunology. 2000. - Vol. 42. - P. 149-169.

38. Deleersnyder V., Pillez A., Wychowski C., Blight K., Xu J.,Hahn Y.S., Rice C.M., Dubuisson J. Formation of native hepatitis С virus glycoprotein complexes // Journal of Virology. 1997. - Vol. 71. - P. 697-704.

39. Drummer H.E., Boo I., Maerz A.L., Poumbourios P. A conserved Gly436-Trp-Leu-Ala-Gly-Leu-Phe-Tyr motif in hepatitis С virus glycoprotein E2 is a determinant of CD81 binding and viral entry // J Virol. 2006. - V. 80. №16. - P. 7844-7853.

40. Dubuisson J., Penin F., Moradpour D. Interaction of hepatitis С virus proteins with host cell membranes and lipids // Trends in cell biology. -2002. Vol. 12. № 11.-P. 517-523.

41. Dubuisson J., Rice C.M. Hepatitis С virus glycoprotein folding: disulfide bond formation and association with calnexin // Journal of Virology. 1996. -Vol. 70. №2.-P. 778-786.

42. Eren R., Landstein D., Terkieltaub D., Nussbaum O., Zauberman A., Ben-Porath J., Gopher J., Buchnick R., Kovjazin R., Rosenthal-Galili Z., Aviel S., Ilan

43. Fearon DT, Carter RH. The CD 19/CR2/TAPA-1 complex of В lymphocytes: linking natural to acquired immunity. Annu Rev Immunol. 1995. - V. 13. -P.127-149.

44. Feinberg H., Mitchell D.A., Drickamer K., Weis W.I. Structural basis for selective recognition of oligosaccharides by DC-SIGN and DC-SIGNR // Science. 2001. - Vol. 294. №5549. - P. 2163-2166.

45. Feitelson M.A. Hepatitis С virus: From laboratory to clinic. Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2002. - P. 3-11.

46. Feitelson M.A., Larkin J.D. New animal models of hepatitis В and С // Institute of Laboratory Animal Resources journal. 2001. - Vol. 42. № 2. - P. 127-138.

47. Flint M., Dubuisson J., Maidens C., Harrop R., Guile G.R., Borrow P., McKeating J.A. Functional characterization of intracellular and secreted forms of a truncated hepatitis С virus E2 glycoprotein // J Virol. 2000. - V. 74. №2. -P.702-709.

48. Flint M., McKeating J.A. The C-terminal region of the hepatitis С virus El glycoprotein confers localization within the endoplasmic reticulum // Journal of General Virology. 1999. - Vol. 80. - P. 1943-1947.

49. Flint M., von Hahn Т., Zhang J., Farquhar M., Jones C.T., Balfe P., Rice C.M., McKeating J.A. Diverse CD81 proteins support hepatitis С virus infection // Journal of Virology. 2006. - V. 80. №22. - P. 11331-11342.

50. Forns X., Purcell R.H., Bukh J. Quasispecies in viral persistence and pathogenesis of hepatitis С virus // Trends Microbiol. 1999. - V. 7. - P. 402-410.

51. Friebe P., Bartenschlager R. Genetic analysis of sequences in the 3' nontranslated region of hepatitis С virus that are important for RNA replication // Journal of Virology. 2002. - Vol. 76. - P. 5326-5338.

52. Friebe P., Lohmann V.F., Krieger N.F., Bartenschlager R. Sequences in the 5' nontranslated region of hepatitis С virus required for RNA replication // Journal of Virology. 2001. - Vol. 75. - P. 12047-12057.

53. Garson J.A., Lubach D., Passas J., Whitby K., Grant PR. Suramin blocks hepatitis С binding to human hepatoma cells in vitro // Journal of medical virology. 1999. - V. 57. №3. - P. 238-242.

54. Gaudy C., Lambele M., Moreau A., Veillon P., Lunel F., Goudeau A. Mutations within the hepatitis С virus genotype lb E2-PePHD domain do not correlate with treatment outcome // Journal of clinical microbiology. 2005. - V. 43.№2.-P. 750-754.

55. Gavel Y., von Heijne G. Sequence differences between glycosylated and non-glycosylated Asn-X-Thr/Ser acceptor sites: implications for protein engineering // Protein Eng. 1990. - V. 3. №5. - P.433-442.

56. Georgopoulou U., Caravokiri K., Mavromara P. Suppression of the ERK1/2 signaling pathway from HCV NS5A protein expressed by herpes simplex recombinant viruses //Archives of virology. 2003. - Vol. 148. № 2. - P. 237-251.

57. Ghosh A.K., Majumder M., Steele R., Meyer K., Ray R., Ray R.B. Hepatitis С virus NS5A protein protects against TNF-alpha mediated apoptotic cell death // Virus research. 2000. - Vol. 67.-P. 173-178.

58. Ghosh A.K., Steele R., Meyer K., Ray R., Ray R.B. Hepatitis С virus NS5A protein modulates cell cycle regulatory genes and promotes cell growth // The Journal of General virology. 1999.-Vol. 80.-P. 1179-1183.

59. Goffard A., Callens N., Bartosch В., Wychowski C., Cosset FL., Montpellier C, Dubuisson J. Role of N-linked glycans in the functions of hepatitis С virus envelope glycoproteins // J Virol. 2005. - V. 79. №3. - P. 8400-8409.

60. Goffard A., Dubuisson J. Glycosylation of hepatitis С virus envelope proteins // Biochimie. 2003. - V. 85. №3-4. - P.295-301.

61. Grakoui A., Wychowski C., Lin C., Feinstone S.M., Rice C.M. Expression and identification of hepatitis С virus polyprotein cleavage products // J Virol. -1993. V. 67. №3. - P. 1385-1395.

62. Harada Т., Tautz N., Thiel H.J. E2-p7 region of the bovine viral diarrhea virus polyprotein: processing and functional studies // Journal of Virology. 2000. -Vol. 74. № 20. - P. 9498-9506.

63. Heo Т.Н., Lee S.M., Bartosch В., Cosset F.L., Kang C.Y. Hepatitis С virus E2 links soluble human CD81 and SR-B1 protein // Virus Res. 2006. - V. 121. №1.-P. 58-64.

64. HijikataM., Kato N., Ootsuyama Y., Nakagawa M., Ohkoshi S., Shimotohno K. Hypervariable regions in the putative glycoprotein of hepatitis С virus // Biochem Biophys Res Commun. 1991. - V. 175. №1. - P. 220-228.

65. Hijikata M., Shimizu Y.K., Kato H., Iwamoto A., Shih J.W., Alter H.J., Purcell R.H., Yoshikura H. Equilibrium centrifugation studies of hepatitis С virus: evidence for circulating immune complexes // Journal of Virology. 1993. - Vol. 67.-P. 1953-1958.

66. Hilgard P., Stockert R. Heparan sulfate proteoglycans initiate dengue virus infection of hepatocytes // Hepatology. 2000. - V. 32. №5. - P. 1069-1077.

67. Hofmann W.P., Zeuzem S., Sarrazin C. Hepatitis С virus-related resistance mechanisms to interferon alpha-based antiviral therapy // Journal of clinical virology. 2005. - V. 32. №2. - P. 86-91.

68. Hugle Т., Fehrmann F., Bieck E., Kohara M., Krausslich H.G., Rice C.M., Blum H.E., Moradpour D. The hepatitis С virus nonstructural protein 4B is an integral endoplasmic reticulum membrane protein // Virology. 2001. - V. 284. №1. - P. 70-81.

69. Jin L., Peterson D.L. Expression, isolation, and characterization of the hepatitis С virus ATPase/RNA helicase // Archives of biochemistry and biophysics. 1995. - Vol. 323. - P. 47-53.

70. Kalkeri G, Khalap N, Garry RF, Fermin CD, Dash S. Hepatitis С virus protein expression induces apoptosis in HepG2 cells // Virology. 2001. - V. 282. №1. - P. 26-37.

71. Kao C.C., Yang X., Kline A., Wang Q.M., Barket D., Heinz B.A. Template requirements for RNA synthesis by a recombinant hepatitis С virus RNA-dependent RNA polymerase // Journal of Virology. 2000. - V. 74. №23. - P. 11121-11128.

72. Kato N., Ootsuyama J., Sekiya H., Ohkoshi S., Nakazawa Т., Hijikata M., Shimotohno K. Genetic drift in hypervariable region 1 of the viral genome in persistent hepatitis С virus infection // Journal of Virology. 1994. - Vol. 68. - P. 4776-4784.

73. Kato N., Shimotohno K. Systems to culture hepatitis С virus // Current topics in microbiology and immunology. 2000. - Vol. 242. - P. 261-278. 2000a.

74. Keck Z.Y., Xia J., Cai Z., Li Т.К., Owsianka A.M., Patel A.H., Luo G., Foung S.K. Immunogenic and functional organization of hepatitis С virus (HCV) glycoprotein E2 on infectious HCV virions // Journal of Virology. 2007. - V. 81. №2.-P. 1043-1047.

75. Kim D.W., Gwack Y., Han J.H., Choe J. C-terminal domain of the hepatitis С virus NS3 protein contains an RNA helicase activity // Biochemical and biophysical research communications. 1995.-Vol. 215.-P. 160-166.

76. Knaus H.G., Scheffauer F., Romanin C., Schindler H.G., Glossmann H. Heparin binds with high affinity to voltagedependent L-type Ca2+ channels // The Journal of biological chemistry. 1990. - V. 265. - P. 11156-11166.

77. Koike K., Moriya K., Ishibashi K., Matsuura Y., Suzuki Т., Saito I., lino S., Kurokawa K., Miyamura T. Expression of hepatitis С virus envelope proteins in transgenic mice // Journal of General Virology. 1995. - V. 76. № Pt 12. - P. 3031-3038.

78. Kolykhalov A.A., Agapov E.V., Blight K.J., Mihalik K., Feinstone S.M., Rice C.M. Transmission of hepatitis С by intrahepatic inoculation with transcribed RNA // Science. 1997. - Vol. 277. - P. 570-574.

79. Kornfeld R., Kornfeld S. Assembly of asparagine-linked oligosaccharides // Annual review of biochemistry. 1985. - V. 54. - P. 631-664.

80. Koutsoudakis G., Herrmann E., Kallis S., Bartenschlager R., Pietschmann T. The level of CD81 cell surface expression is a key determinant for productiveentry of hepatitis С virus into host cells // Journal of Virology. 2007. - V. 81. №2.-P. 588-598.

81. Kroschewski H, Allison SL, Heinz FX, Mandl CW. Role of heparan sulfate for attachment and entry of tick-borne encephalitis virus // Virology. 2003. - V. 308. №1.- P. 92-100.

82. Hl.Laemmli U. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature. 1970. - V. 15. №227(259). - P. 680-685.

83. Lan K.H., Sheu M.L., Hwang S.J., Yen S.H, Chen S.Y, Wu J.C., Wang Y.J., Kato N., Omata M., Chang F. Y., Lee S.D. HCV NS5A interacts with p53 and inhibits p53-mediated apoptosis // Oncogene. 2002. - Vol. 21. - P. 4801-4811.

84. Lawal Z., Petrik J., Wong V.S., Alexander G.J., Allain J.P. Hepatitis С virus genomic variability in untreated and immunosuppressed patients // Virology. -1997. Vol. 228. № 1. - P. 107-111.

85. Lawler J., Duquette M., Ferro P. Cloning and sequencing of chicken trombospondin // The Journal of biological chemistry. 1991. - V. 266. - P. 8039— 8043.

86. Lechman M., Murata K., Satoi J., Vergalla J., Baumert T.F., Liang T.J. Hepatitis С virus-like particles induce virus-specific humoral and cellular immune response in mice // Hepatology. 2001. - Vol. 34. - P. 417^123.

87. Lesk A. Introduction to protein architecture, 1/Ed. Oxford University Press. -New York. 2001.

88. Levy S, Shoham T. The tetraspanin web modulates immune-signalling complexes // Nat Rev Immunol. 2005. - V. 5. №2. - P. 136-148.

89. Levy S., Todd S.C., Maecker H.T. CD81 (TAPA-1): a molecule involved in signal transduction and cell adhesion in the immune system // Annual review of immunology. 1998.-Vol. 16.-P. 89-109.

90. Liberman E., Fong Y.L., Selby M.J., Choo Q.L., Cousens L., Houghton M, Yen T.S. Activation of the grp78 and grp94 promoters by hepatitis С virus E2 envelope protein//Journal of Virology 1999.-V. 73. №5.-P. 3718-3722.

91. Lin G., Simmons G., Pohlmann S., Baribaud F., Ni H., Leslie G.J., Haggarty

92. Lindenbach B.D., Evans M.J., Syder A.J., Wolk В., Tellinghuisen T.L., Liu

93. C.C., Maruyama Т., Hynes R.O, Burton D.R., McKeating J.A., Rice C.M. Complete replication of hepatitis С virus in cell culture // Science. 2005. - Vol. 309. №5734.-P. 623-626.

94. Linhardt R.J., Toida T. Characterization of glycosaminoglycans by capillary electrophoresis // Methods Mol Biol. 2003. - V. 213. - P. 131-144.

95. Lo S., Lin H.H. Variations within hepatitis С virus E2 protein and response to interferon treatment // Virus Res. 2001. - V. 75. №2. - P. 107-112.

96. Lo S.Y., Selby M.J. Ou J.H. Interaction between Hepatitis С Virus Core Protein and El Envelope Protein // Journal of Virology. 1996. - Vol. 70. № 8. -P. 5177-5182.

97. Lowry O.H, Rosebrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J Biol Chem. 1951. - V. 193. №1. - P. 265-275.

98. Ludwig I.S., Lekkerkerker A.N., Depla E., Bosman F., Musters R.J., Depraetere S., van Kooyk Y., Geij'tenbeek T.B. Hepatitis С virus targets DC-SIGN and L-SIGN to escape lysosomal degradation // Journal of Virology. 2004. - V. 78. №15.-P. 8322-8332.

99. Lundin M., Monne M., Widell A., Von Heijne G., Persson M.A. Topology of the membrane-associated hepatitis С virus protein NS4B // Journal of Virology. -2003. Vol. 77. № 9. - P. 5428-5438.

100. Luo G., Hamatake R.K., Mathis D.M., Racela J., Rigat K.L., Lemm J., Colonno R.J. De novo initiation of RNA synthesis by the RNA-dependent RNA polymerase (NS5B) of hepatitis С virus // Journal of Virology. 2000. - Vol. 74. №2.-P. 851-863.

101. Lyon M, Deakin JA, Gallagher JT. Liver heparan sulfate structure. A novel molecular design // The Journal of biological chemistry. 1994. - V. 269. №15. -P. 11208-11215.

102. Mackenzie J.M., Westway E.G. Assembly and maturation of the Flavivirus Kunjiin virus appear to the rough endoplasmic reticulum and along the secretory pathway, respectively // Journal of Virology. 2001. - Vol. 71. - P. 697-704.

103. Majumder M., Ghosh A.K., Steele R., Ray R., Ray, R.B. Hepatitis С virus NS5A physically associates with p53 and regulates p21/wafl gene expression in a p53-dependent manner//Journal of Virology.- 2001. -Vol. 75.-P. 1401-1407.

104. Majumder M., Ghosh A.K., Steele R., Zhou X.Y., Phillips N.J., Ray R., Ray, R. B. Hepatitis С virus NS5A protein impairs TNF-mediated hepatic apoptosis, but not by an anti-FAS antibody, in transgenic mice // Virology. 2002. - Vol. 294. -P. 94-105.

105. Margalit H., Fischer N., Ben-Sasson S.A. Comparative analysis of structurally defined heparin binding sequences reveals a distinct spatial distribution of basic residues // J Biol Chem. 1993. - V. 268. №>26. - P. 19228-19231.

106. Meier M., Bider M.D., Malashkevich V.N., Spiess M., Burkhard P. Crystal structure of the carbohydrate recognition domain of the HI subunit of the asialoglycoprotein receptor // J Mol Biol. 2000. - V. 300. №4. - P. 857-865.

107. Merola M., Brazzoli M., Cocchiarella F., Heile J.M., Helenius A., Weiner A.J., Houghton M., Abrignani S. Folding of hepatitis С virus El glycoprotein in a cell-free system //Journal of Virology.- 2001. Vol. 75. № 22. - P. 11205-11217.

108. Meurs E., Chong K., Galabru J., Thomas N.S., Kerr I.M., Williams B.R., Hovanessian A.G. Molecular cloning and characterization of the human double-stranded RNA-activated protein kinase induced by interferon // Cell. 1990. - V. 62. №2. -P.379-390.

109. Michalak J.P., Wychowski C., Choukhi A., Meunier J.C., Ung S., Rice C.M., Dubuisson J. Characterization of truncated forms of hepatitis С virus glycoproteins // Journal of General Virology. 1997. - Vol. 78. -P. 2299-2306.

110. Mink M.A, Benichou S., Madaule P., Tiollais P., Prince A.M., Inchauspe G. Characterization and mapping of a B-cell immunogenic domain in hepatitis С virus E2 glycoprotein using a yeast peptide library // Virology. 1994. - V. 200. №1. -.P.246-255.

111. Muller S., Plaue S., Couppez M., Van Regenmortel M.H. Comparison of different methods for localizing antigenic regions in histone H2A // Mol Immunol. 1986. - V. 23. №6. - P. 593-601.

112. Netski D.M., Mosbruger Т., Depla E., Maertens G., Ray S.C., Hamilton R.G., Roundtree S., Thomas D.L., McKeating J., Cox A. Humoral immune response inacute hepatitis С virus infection // Clin Infect Dis. 2005. - V. 41. №5. - P. 667675.

113. O'Farrell D., Trowbridge R., Rowlands D., Jager J. Substrate complexes of hepatitis С virus RNA polymerase (HC-J4): structural evidence for nucleotide import and de-novo initiation // J Mol Biol. 2003. - V. 326. №4. - P. 1025-1035.

114. Op De Beeck A., Cocquerel L., Dubuisson J. Biogenesis of hepatitis С virus envelope glycoproteins // Journal of General Virology. 2001. Vol. 82. - P. 25892595.

115. Pavio N., Lai M.M. The hepatitis С virus persistence: how to evade the immune system? // J Biosci. 2003. - V. 28. №3. - P. 287-304.

116. Pavlovic D., Neville D.C.A., Argaud O., Blumberg В., Dwek R.A., Fischer W.B., Zitzmann N. The hepatitis С virus p7 protein forms an ion channel that is inhibited by long-alkyl-chain iminosugar derivatives // Proceedings of the National

117. Academy of Sciences of the United States of America. 2003. - Vol. 100. № 10. -P. 6104-6108.

118. Pawlotsky J.M. Hepatitis С virus genetic variability: pathogenic and clinical implications // Clin Liver Dis. 2003. - V. 7. №1. - P. 45-66.

119. Penin F., Dubuisson J., Rey F.A., Moradpour D., Pawlotsky J.M. Structural Biology of Hepatitis С Virus // Hepatology. 2004. - Vol. 39. № 1. - P. 5-19.

120. Pileri P., Uematsu Y., Campagnoli S., Galli G., Falugi F., Petracca R., Weiner A.J., Houghton M., Rosa D., Grandi G., Abrignani S. Binding of hepatitis С virus to CD 81 // Science. 1998. - Vol. 282. - P. 938-941.

121. Pohlmann S., Zhang J., Baribaud F., Chen Z., Leslie G.J., Lin G., Granelli-Piperno A., Doms R.W., Rice C.M., McKeating J.A. Hepatitis С virus glycoproteins interact with DC-SIGN and DC-SIGNR // Journal of Virology. -2003. -V. 77. №7. P. 4070-4080.

122. Prince A.M., Huima-Byron Т., Parker T.S., Levine D.M. Visualization of hepatitis С virions and putative defective interfering particles isolated from low-density lipoproteins // Journal of viral hepatitis. 1996. - Vol. 3. № 1. - P. 11-7.

123. Rey F.A., Heinz F.X., Mandl C., Kunz C., Harrison S.C. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2 A resolution // Nature. 1995. -V. 375. №6529.-P.291-298.

124. Roingeard F., Hourioux C., Blanchard E., Brand D., Ait-Goughoulte M. Hepatitis С virus ultrastructure and morphogenesis // Biology of the Cell. 2004. -Vol. 96.-P. 103-108.

125. Rosenberg S. Recent advances in the molecular biology of hepatitis С virus // Journal of molecular biology. 2001. - Vol. 313. - P. 451-464.

126. Santolini E., Migliaccio G., La Monica N. Biosynthesis and biochemical properties of the hepatitis С virus core protein // Journal of Virology. 1994. Vol. 68. №6.-P. 3631-3641.

127. Sato Т., Sakaguchi M., Mihara K., Omura T. The amino-terminal structures that determine topological orientation of cytochrome P-450 in microsomal membrane // EMBO J. - 1990. - V.9. - P.2391-2397.

128. Scarselli M., Facchiano G., Russo A., Molinari H., Ragona L., Zetta L., Niccolai N. The design of a specific ligand of HIV gpl20 // J. of Peptide Science. 1997. - V. 3. №5. P.383-390.

129. Schulz-Utermoehl Т., Edwards R.J., Boobis A.R. Affinity and potency of proinhibitory antipeptide antibodies against CYP2D6 is enhanced using cyclicpeptides as immunogens // Drug.Metab. Dispos. 2000. - V. 28. №5. - P. 544551.

130. Selby M.J., Glazer E., Masiarz F., Houghton M. Complex processing and protein:protein interactions in the E2:NS2 region of HCV // Virology. 1994.-Vol. 204.-P. 114-122.

131. Shi L., Liu S., Fan G.X., Sheng L., Ren H.X., Yuan Y.K. Effective induction of type 1 cytotoxic T cell responses in mice with DNA vaccine encoding two hepatitis С virus cytotoxic T lymphocyte epitopes // Viral Immunol. 2006. - V. 19. №4.-P. 702-711.

132. Shimizu Y.K., Feinstone S.M., Kohara M., Purcell R.H., Yoshikura H. Hepatitis С Virus: Detection of intracellular virus particles by electron microscopy // Hepatology. 1996. - Vol. 23. № 2. - P. 205-209.

133. Shukla D., Spear P.G. Herpesviruses and heparan sulfate: an intimate relationship in aid of viral entry // J Clin Invest. 2001. - V. 108. №4. - P. 503510.

134. Shukla D.D., Hoyne P.A., Ward C.W. Evaluation of complete genome sequences and sequences of individual gene products for the classification of hepatitis С viruses // Archives of virology. 1995. -Vol. 140. №» 10. - P. 17471761.

135. Silberstein S., Gilmore R. Biochemistry, molecular biology, and genetics of the oligosaccharyltransferase // The FASEB journal: official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. 1996. - Vol. 10. № 8.-P. 849-858.

136. Simmonds P. Genetic diversity and evolution of hepatitis С virus-15 years on // Journal of General Virology. 2004. - V. 85. № 11. - P. 3173-3188.

137. Sobel M., Soler D.F., Kermode J.C., Harris R.B. Localization and characterization of a heparin binding domain peptide of human von Willebrand factor // J Biol Chem. 1992. - V. 267. №13. - P. 8857-8862.

138. Soilleux E.J., Morris L.S., Lee В., Pohlmann S., Trowsdale J., Doms R.W., Coleman N. Placental expression of DC-SIGN may mediate intrauterine vertical transmission of HIV // The Journal of pathology. 2001. - Vol. 195. № 5. - P. 586-592.

139. Stockert R.J. The asialoglycoprotein receptor: relationships between structure, function, and expression // Physiol Rev. 1995. - V. 75. №3. - P. 591-609.

140. Strickland D.K., Gonias S.L., Argraves W.S. Diverse roles for the LDL receptor family // Trends Endocrinol Metab. 2002. - V. 13. №2. - P. 66-74.

141. Sun X.L., Johnson R.B., Hockman M.A., Wang Q.M. De novo RNA synthesis catalyzed by HCV RNA-dependent RNA polymerase // Biochem Biophys Res Commun. 2000. - V. 268. №3. - P. 798-803.

142. Tailleux L., Schwartz O., Herrmann J.L., Pivert E., Jackson M., Amara A., Legres L., Dreher D., Nicod L.P., Gluckman J.C., Lagrange P.H., Gicquel В.,

143. Neyrolles О. DC-SIGN is the major Mycobacterium tuberculosis receptor on human dendritic cells // The Journal of experimental medicine. 2003. - Vol. 197. №1. - P. 121-127.

144. Takikawa S., Ishii K., Aizaki H., Suzuki Т., Asakura H., Matsuura Y., Miyamura T. Cell fusion activity of hepatitis С virus envelope proteins // Journal of Virology. 2000. - V. 74. №11. - P. 5066-5074.

145. Tam J.P. Immunization with peptide-carrier complexes: traditional and multiple-antigen peptide systems // In: Peptide antigen: a practical approach. IRL Press, Oxford. 1994. - P. 83-115.

146. Taylor D.R., Shi S.T., Romano P.R., Barber G.N., Lai M.M.C. Inhibition of the interferon-inducible protein kinase PKR by HCV E2 protein // Science. 1999. -Vol. 285.-P. 107-110.

147. Thomssen R., Bonk S., Propfe C., Heermann K.H., Kochel H.G., Uy A. Association of hepatitis С virus in human sera with beta-lipoprotein // Medical microbiology and immunology. 1992. - Vol. 181. - P. 293-300.

148. Thomssen R., Bonk S., Thiele A. Density heterogeneities of hepatitis С virus in human sera due to the binding of beta-lipoproteins and immunoglobulins // Medical microbiology and immunology. 1993. - Vol. 182. № 6. - P. 329-334.

149. Turnbull J., Powell A., Guimond S. Heparan sulfate: decoding a dynamic multifunctional cell regulator // Trends Cell Biol. 2001. - V. 11. №2. - P. 75-82.

150. Van Doom L.J. Molecular biology of the hepatitis С virus // Journal of medical virology. 1994. - V. 43. - P. 345-356

151. Van Regenmortel M.H. and Muller S. Synthetic peptides as antigens. -Amsterdam: Elsevier Science. 1999. - 382 p.

152. Viral hepatitis: diagnosis, therapy and prevention / Edited by Specter S. -Totowa N.J, Humana Press Inc., 1999. 402 p.

153. Vives R.R., Imberty A., Sattentau Q.J., Lortat-Jacob H. Heparan sulfate targets the HIV-1 envelope glycoprotein gpl20 coreceptorbinding site // The Journal of biological chemistry. 2005. - V. 280. №22. - P. 21353-21357.

154. Vyas J., Elia A., Clemens M.J. Inhibition of the protein kinase PKR by the internal ribosome entry site of hepatitis С virus genomic RNA // RNA. 2003. -V. 9.-P. 858-870.

155. Wellnitz S., Klumpp В., Barth H., Ito S, Depla E, Dubuisson J, Blum HE, Baumert TF. Binding of hepatitis С virus-like particles derived from infectious clone H77C to defined human cell lines // Journal of Virology. 2002. - V. 76. -P. 1181-1193.

156. Xie Z.C., Riezu-Boj J.I., Lasarte J.J., Guillen J., Su J.H., Civeira M.P., Prieto J. Transmission of hepatitis С virus infection to tree shrews // Virology. 1998. -Vol.244.-P. 513-520.

157. Yagnik A.T., Lahm A., Meola A., Roccasecca R.M., Ercole B.B., Nicosia A., Tramontana A. A model for the hepatitis С virus envelope glycoprotein E2 // Proteins: Structure, Function, and Genetics. 2000. - Vol. 40. - P. 355-366.

158. Yang S.S., Lai M.Y., Chen D.S., Chen G.H., Kao J.H. Mutations in the NS5A and E2-PePHD regions of hepatitis С virus genotype lb and response to combination therapy of interferon plus ribavirin // Liver Int. 2003. V. 23. №6. -P.426-433.

159. Yasui K., Wakita Т., Tsukiyama-Kohara K., Funahashi S.I., Ichikawa M., Kajita Т., Moradpour D., Wands J.R., Kohara M. The native form and maturationprocess of hepatitis С virus core protein // Journal of Virology. 1998. - Vol. 72. -P. 6048-6055.

160. Zhang J., Randall G., Higginbottom A., Monk P., Rice С. M., McKeating J. A. CD81 is required for hepatitis С virus glycoprotein-mediated viral infection // Journal of Virology. 2004. - V. 78. - P. 1448-1455.

161. Zhang Z.X., Sonnenborg A. and Sallberg M. Antigenic structure of the hepatitis С virus envelope 2 protein // Clin. Exp. Immunol. 1994. - V. 98. - P. 382-387

162. Zhao W., Liao G.Y., Jiang Y.J., Jiang S.D. Expression and self-assembly of HCV structural proteins into virus-like particles and their immunogenicity // Chinese medical journal.-2004.-Vol. 117 №8. -P. 1217-1222.

163. Zhong W., Uss A.S., Ferrari E., Lau J.Y., Hong Z. De novo initiation of RNA synthesis by hepatitis С virus nonstructural protein 5B polymerase // Journal of Virology. 2000. - Vol. 74. № 4. - P. 2017-2022.

164. Zhu L.X., Liu J., Li Y.C., Kong Y.Y., Staib C., Sutter G., Wang Y., Li G.D. Full-length core sequence dependent complex-type glycosylation of hepatitis С virus E2 glycoprotein // World J Gastroenterol. 2002. - V. 8. №3. - P. 499-504.

165. Zibert A, Kraas W, Ross RS, Meisel H, Lechner S, Jung G, Roggendorf M Immunodominant B-cell domains of hepatitis С virus envelope proteins El and E2 identified during early and late time points of infection // J Hepatol. 1999. - V. 30. №2.-P. 177-184.

166. Zibert A., Schreier E., Roggendorf M. Antibodies in human sera specific to hypervariable region 1 of hepatitis С virus can block viral attachment // Virology. 1995. -V. 208. - P. 653-661.t