Совершенствование методических подходов для идентификации штаммов Vibrio parahaemolyticus тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Полеева Марина Владимировна

• Полеева Марина Владимировна
• кандидат наук
• 2022

Оглавление диссертации кандидат наук Полеева Марина Владимировна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ В РАБОТЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Vibrio parahaemolyticus - pacnpocrpaHeH^ в природе и их роль в патологии человека

1.2 Термостабильный прямой гемолизин (TDH) - основной фактор патогенности парагемолитических вибрионов

1.3 Методы детекции микроорганизмов вида V. parahaemolyticus

1.4 Использование масс-спектрометрического анализ для детекции бактериальных

токсинов

ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Бактериальные штаммы

2.2 Питательные среды и культивирование

2.3 Методы исследований

2.3.1 Феномен Канагава

2.3.2 Методика постановки реакции гемолиза в планшете

2.3.3 Метод определения цитотоксической активности на модели культуры клеток

2.3.4 Выделение и очистка препарата TDH-токсина

2.3.5 Выделение фракции, обладающей гемолитической активностью, с помощью гель-фильтрации

2.3.6 Электрофорез белков

2.3.7 Биологические методы

2.3.8 Метод постановки дот-ИФА

2.3.9 Методика получения биопленки

2.3.10 Микроскопия биопленки

2.3.11 Метод Real-Time PCR

2.3.12 Секвенирование штаммов

2.3.13 Метод MALDI-ToF масс-спектрометрии

2.4 Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3 РАЗРАБОТКА СПОСОБА ИДЕНТИФИКАЦИИ V. PARAHAEMOLYTICUS С

ПОМОЩЬЮ ПЦР В РЕЖИМЕ «РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ»

3.1 Выбор и конструирование праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для выявления

V. parahaemolyticus в Real-Time ПЦР

3.2 Подбор оптимальных условий проведения полимеразной цепной реакции в режиме «реального времени»

3.3 Определение диагностической чувствительности и специфичности выбранных олигонуклеотидных праймеров и зонда для выявления V. parahaemolyticus

3.4 Разработка диагностического набора реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)»

3.5 Изучение диагностических характеристик испытуемого набора (чувствительности и специфичности) «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)»

3.6 Определение прецизионности набора реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)» в условиях повторяемости и

воспроизводимости

ГЛАВА 4 ПОЛУЧЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА ПРЕПАРАТА ТЕРМОСТАБИЛЬНОГО ПРЯМОГО ГЕМОЛИЗИНА (TDH) VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS

4.1 Получение штамма Vibrio parahaemolyticus - продуцента прямого термостабильного гемолизина

4.2 Подбор оптимальных условий для продукции TDH V. parahaemolyticus

4.3 Селекция штамма V. parahaemolyticus - продуцента TDH

4.4 Масс-спектрометрический анализ штамма V. parahaemolyticus - продуцента термостабильного прямого гемолизина

4.5 Полногеномное секвенирование последовательностей ДНК штаммов Vibrio parahaemolyticus 14810 и 14810/1 - продуцента прямого термостабильного гемолизина TDH

4.6 Получение и характеристика препарата термостабильного прямого гемолизина TDH

4.6.1 Выделение препарата термостабильного прямого гемолизина

4.6.2 MALDI-ToF масс-спектрометрический анализ препарата прямого термостабильного гемолизина (TDH) V. parahaemolyticus

4.7 Получение и оценка серологической активности иммунных сывороток к TDH V. parahaemolyticus

ГЛАВА 5 РАЗРАБОТКА АЛГОРИТМА ИССЛЕДОВАНИЙ ОБЪЕКТОВ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НА НАЛИЧИЕ V. PARAHAEMOLYTICUS С УЧЕТОМ ИХ БИОЛОГИЧЕСКИХ СВОЙСТВ

5.1 Изучение особенностей формирования парагемолитическими вибрионами биопленки

на поверхностях биотических объектов методом Real-Time ПЦР

5.2 Изучение биопленок парагемолитических вибрионов методом MALDI-^F масс-спектрометрии

5.3 Изучение возможности использования набора реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)» в пробах, искусственно контаминированных V. parahaemolyticus

5.4 Использование сконструированных праймеров и зонда в коллекционной деятельности

для подтверждения видовой принадлежности

5.5 Схема исследования объектов окружающей среды на наличие V. parahaemolyticus

с использованием молекулярно-генетических методов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ В РАБОТЕ

TDH - thermostable direct hemolysin / прямой термостабильный гемолизин V. parahaemolyticus ПТИ - пищевые токсикоинфекции ПЦР/PCR- полимеразная цепная реакция ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

MALDI-ToF - Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization / времяпролентая матрично активированная лазерная десорбция/ионизация м.кл./мл - микробных клеток в миллилитре

ГКПБ - Государственная коллекция патогенных бактерий ФКУЗ «Микроб» vppC - ген металлопротеазы (коллагеназы) ООИ - особо опасные инфекции

tdh - ген, кодирующий прямой термостабильный гемолизин V. parahaemolyticus trh - ген, кодирующий TDH-родственный гемолизин V. parahaemolyticus toxR - регуляторный ген КР / КП - феномен Канагава

FL-клетки - клетки амниотическоймембраны человека

Сасо-2 - клеточная линия клеток колоректальной аденокарциномы человека

IEC-6 - клетки тонкого кишечника эпителия крысы

КОЕ - колониеобразующая единица

tlh - термолабильный гемолизин V. parahaemolyticus

gyrB - ген гиразы

VvhA - цитолитический гемолизин V. vulnificus ompW - ген, кодирующий белок внешней мембраны hsp - ген, кодирующий белок теплового шока sodB - ген супероксиддисмутазы

prtV - ген, кодирующий металлопротеазу V. parahaemolyticus

hlyA - ген, кодирующий гемолизин V. cholerae

groEL - ген, кодирующий шаперонин GroEL

МС / MS - масс-спектрометрический анализ

STX - шига-токсин

SEB - стафилококковые энтеротоксины

ТФУ/TFA - трифторуксусная кислота

L-929 - культура клеток мышечных фибробластов

FPLS - fast protein liquid chromatography / быстрая жидкостная хроматография белков СА - сульфат аммония

ХОФ - хроматография в обращенной фазе

дот-ИФА - точечный иммуноферментный анализ

НЦМ - нитроцеллюлозная мембрана

ДАБ - 3,3-диаминобензидин 4-гидроксихлорид

OS - стандартный раствор для масс-спектрометрического анализа

НССА - a-Cyano-4-hydroxycinnamic acid / а-циано-4-гидроксикоричная кислота

VPal 1-7 - острова патогенности

ureC- ген уреазы

Т3ТSS2 - система секреции 2-го типа

orf8 - ген филаментозного профага, кодирующий предполагаемый фактор адгезии CCI - композитный индекс корреляции С - цитозин Т - тимин

CalR - регуляторный белок, репрессор роевой подвижности и экспрессии гена Т3ТSS1-4 V.

parahaemolyticus

QS - кворум-сенсинг

Lux - кворум-зависимые системы с лактонами гомосерина tcpA - ген токсинкоррегулируемых пилей адгезии

wbeT - ген, определяющий принадлежность к V. cholerae к О1 серогруппе wbefR - ген, определяющий принадлежность к V. cholerae к О139 серогруппе п.в. - пептонная вода ЭС - элективная среда ПУС - полиуглеводные среды

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Совершенствование методических подходов для идентификации штаммов Vibrio parahaemolyticus»

ВВЕДЕНИЕ

Бактерии вида V. parahaemolyticus являются основной причиной пищевых токсикоинфекций, связанных с употреблением в пищу морепродуктов, в приморских населенных пунктах. Средой обитания V. parahaemolyticus является морская вода [Joseph S.W. et al., 1982], а основным фактором передачи человеку служат инфицированные ими гидробионты [Baker-Austin C. et al., 2018; Matsuda S. et al., 2020]. Имеются единичные сообщения о присутствии этих вибрионов в речной воде и воде сточных каналов [Chakraborty S. et al., 1997]. Опасность заражения V. parahaemolyticus существует везде, где население использует в питании продукты моря и контактирует с морской водой. Употребление человеком в пищу морепродуктов, контаминированных патогенными парагемолитическими вибрионами, ведет к возникновению острого кишечного заболевания по типу острого гастроэнтерита, характеризующегося диареей, рвотой, спазмами в животе и всегда связанного с употреблением в пищу зараженной сырой рыбы или других морепродуктов [Nair G. B. еt al., 2007; Bonnin-Jusserand M. et al., 2017; Li L. et al., 2019]. В особо тяжелых случаях инфицирование может приводить к распространению заболевания, вызывать сепсис и приводить к летальному исходу [Li L. et al., 2019]. V. parahaemolyticus также может вызывать поражение кожи, заболевание ушей, раневые инфекции [Baker-Austin C. et al., 2018]. Заболеваемость увеличивается в связи с появлением возбудителя серотипа О3:К6, несущего основной фактор патогенности парагемолитических вибрионов - гены прямого термостабильного гемолизина - TDH [Nishibuchi M. et al., 1995; Park K.S. et al., 2004; Nair G.B. et al., 2005; Hurley С.С. et al., 2006; Gonzales-Escalona N. et al., 2006; Nair G.B. et al., 2007; Guin S. et al., 2019; Yan W. et al., 2020]. Поэтому для практического здравоохранения важно быстро и достоверно определить, как наличие возбудителя в исследуемом материале, так и его вирулентность [Bonnin-Jusserand M. et al., 2017; Xu D. et al., 2018].

Исследование воды открытых водоемов, обитающих в них и свежевыловленных гидробионтов в местах их организованной и неорганизованной реализации проводят при выявлении в прибрежных морских зонах спорадических или групповых случаев заболевания, обусловленных парагемолитическими вибрионами, а также при возникновении неблагоприятной экологической ситуации [МУК 4.2.2046-06]. Исследование клинического материала на различные виды патогенных вибрионов проводят при возникновении спорадических или групповых острых кишечных заболеваний по типу пищевых токсикоинфекций (ПТИ), связанных с употреблением в пищу морепродуктов, ловлей и обработкой рыбы или купанием в море; при выявлении больных септицемией, менингитом, пневмонией, с инфицированными ранами мягких тканей особенно среди лиц групп риска, к которым относятся рыбаки, работники рыбообрабатывающих предприятий, жители

7

прибрежных районов умеренного и жаркого климата [МУК 4.2.1793-03]. Исследование рыбы и морских беспозвоночных на присутствие парагемолитических вибрионов проводят в порядке текущего надзора (контроля) на этапах производства и реализации, по эпидемическим показаниям, а также в случае возникновения неблагоприятной экологической ситуации в регионе лова рыбы, моллюсков и ракообразных.

Традиционными и основными на сегодняшний день методами идентификации V. parahaemolyticus являются бактериологические методы - культивирование и выделение чистой культуры микроорганизма; серотипирование (реакция агглютинации с диагностическими О- и К- сыворотками), а также биохимические тесты, основанные на определении ферментативной активности бактерий по отношению к различным углеводам и многоатомным спиртам [МУК 4.2.1793-03; West P.A. et al., 1984]. Сложность идентификации и дифференциации парагемолитических от других близкородственных видов вибрионов традиционными методами обусловлена их большим фенотипическим сходством, вариабельностью признаков и как следствие относительной диагностической ценностью отдельных таксономических тестов [Thompson F.L. et al., 2004]. В связи с этим весьма перспективен метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) с видоспецифичными праймерами, позволяющий определить в геноме бактерий участки молекулы ДНК, специфичные для каждого вида микроорганизма [Tebbs R.S. et al., 2011; Escalante-Maldonado O. et al., 2015; Xu D. et al., 2018]. Данный метод обладает рядом преимуществ по сравнению с традиционными бактериологическими и серологическими методами, так как сочетает в себе быстроту и простоту исполнения, а также потенциально высокую специфичность и чувствительность при выявлении патогенных микроорганизмов [Ребриков Д.В. с соавт., 2009]. Однако имеется ряд недостатков, которые усложняют использование метода ПЦР с учетом результатов с помощью электрофореза в геле. В последние годы широкое распространение во многих странах получил метод идентификации микроорганизмов с помощью полимеразной цепной реакции с детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени (Real-Time PCR) [Panicker G. et al., 2004]. Основными преимуществами Real-Time PCR является объединение этапов амплификации и детекции, что, помимо упрощения процедуры анализа, снижает риск перекрестной контаминации, возможность проведения количественного анализа, высокая специфичность и чувствительность. В нашей стране отсутствуют зарегистрированные ПЦР тест-системы для быстрой идентификации галофильных вибрионов, в том числе и V. parahaemolyticus.

Ведущую роль в патогенезе заболеваний, вызываемых V. parahaemolyticus, играет прямой термостабильный гемолизин, а метод определения гемолитической активности является ведущим для оценки вирулентности штаммов парагемолитических вибрионов. Развитие современных молекулярно-биологических технологий позволяет дать расширенную

8

характеристику факторов патогенности микроорганизмов, а также выявить маркеры вирулентности у возбудителей инфекционных заболеваний [Janik E. et al., 2019]. Mетод MALDI-ToF-масс-спектрометрического анализа широко используется в лабораторной практике для идентификации микроорганизмов различных видов [Sauer S. et al., 2008; Oberkmann S. et al., 2014; Kann S. et al., 2020], в том числе и V. parahaemolyticus, однако его использование для определения гемолизинов парагемолитических вибрионов ранее не предлагалось. В связи с этим для прикладных целей, связанных с лабораторной диагностикой необходимо наличие препаратов токсинов парагемолических вибрионов и, следовательно, их продуценты.

В отечественной литературе мы не встретили данных о штамме-продуценте прямого термостабильного гемолизина V. parahaemolyticus. Зарубежными авторами Bechlars S. et al., 2013, был создан рекомбинантный штамм E. coli К12 DH5a, содержащий плазмиду pJET2-TDH2 с генами штамма V. parahaemolyticus О3:К6 и продуцирующий термостабильный гемолизин парагемолитических вибрионов [Bechlars S. et al., 2013].

Кроме получения препаратов бактериальных токсинов немаловажным фактором является качество бактериальных антигенов (степень очистки от балластных белков, концентрация, стабильность). Единого подхода при характеристике полученных антигенов не существует, выбор методов анализа зависит от химических и физико-химических параметров, структурных особенностей молекулы. Для характеристики белковых антигенов могут быть использованы, например, электрофорез в полиакриламидном геле, капиллярный электрофорез, изоэлектрическое фокусирование, высокоэффективная жидкостная хроматографию, пептидное картирование, в том числе в сочетании с масс-спектрометрией и др. [Rajkovic A. et al., 2020].

Все вышеперечисленное свидетельствует о необходимости разработки и внедрения новых препаратов, позволяющих повысить эффективность выявления и оценку вирулентности парагемолитических вибрионов.

Цель работы: Совершенствование лабораторной диагностики микроорганизмов вида Vibrio parahaemolyticus с использованием молекулярно-биологических методов, разработка новых методических подходов для выявления и ускоренной дифференциации парагемолитических вибрионов.

Задачи исследования:

1. Провести анализ нуклеотидных последовательностей генома штаммов микроорганизмов вида V. parahaemolyticus для получения праймеров и зондов, разработать способ идентификации V. parahaemolyticus на основе метода полимеразной цепной реакции с детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени (Real-Time PCR).

2. Создать набор реагентов, позволяющий выявлять ДНК парагемолитических вибрионов, выделенных из объектов окружающей среды, методом Real-Time ПЦР; определить его диагностическую эффективность.

3. Провести подбор штамма V. parahaemolyticus - продуцента термостабильного прямого гемолизина TDH; разработать метод получения, очистки и контроля стабильности препарата термостабильного прямого гемолизина.

4. Охарактеризовать иммунохимические и биологические свойства препарата TDH in vitro; получить специфические иммунные сыворотки к нему и оценить их специфическую активность.

5. Изучить особенности идентификации V. parahaemolyticus, формирующих биопленки на биотических объектах.

6. Оценить эффективность использования метода ПЦР на разных этапах лабораторной диагностики парагемолитических вибрионов. Провести испытания разработанного набора реагентов.

7. Разработать алгоритм лабораторной диагностики V. parahaemolyticus с использованием молекулярно-биологических методов.

Научная новизна работы

Выявлены нуклеотидные последовательности гена металлопротеазы (коллагеназы), позволяющие проводить дифференциацию V. parahaemolyticus, получены праймеры и зонды к нему. Показана высокая диагностическая чувствительность - не менее 1*105 м.к./мл и специфичность - 100% праймеров и зондов при исследовании культур микроорганизмов, проб биологического материала и объектов окружающей среды.

Получен патент №2668805 от 02.10.2018 г. Чемисова О.С., Полеева М.В., Рыковская О.А., Сагакянц М.М. «Штамм Vibrio parahaemolyticus, используемый в качестве продуцента прямого термостабильного гемолизина (TDH)».

С использованием сконструированных олигонуклеотидов разработана «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)» и получены доказательства её высокой диагностической эффективности при исследовании чистых культур микроорганизмов рода Vibrio, проб биологического материала и объектов окружающей среды, искусственно контаминированных штаммами V. parahaemolyticus. Диагностическая чувствительность набора составила от 1*105 м.к./мл, специфичность - 100%, воспроизводимость - 100%.

Путем селекции штаммов отобран штамм V. parahaemolyticus 14810/1 (КМ 2027) -продуцент прямого термостабильного гемолизина (TDH) парагемолитических вибрионов.

10

Разработан способ выделения и очистки препарата термостабильного гемолизина методом высокоаффинной хроматографии, оптимизированы условия получения очищенного препарата с высокой гемолитической активностью.

Получен патент № 2644232 от 08.02.2018 г. Чемисова О.С., Трухачёв А.Л., Рыковская О.А., Полеева М.В. «Способ идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)».

Получены новые данные о масс-спектрометрическом профиле термостабильного прямого гемолизина. Методом MALDI-ToF масс-спектрометрического анализа определен спектр масс-пиков препарата прямого термостабильного гемолизина V. parahaemolyticus и выявлены специфичные пики со значением m/z, равным 2452±5, 4911±7, 4946±5. Метод MALDI-ToF масс-спектрометрии предложен для оценки стабильности препарата TDH.

Разработаны схемы получения иммунных сывороток к TDH-гемолизину парагемолитических вибрионов. Из предлогаемых схем наиболее эффективной является четырехкратная иммунизация подкожно с интервалом в 7 дней и стимуляцией иммунного ответа иммуностимулирующими препаратами (иммунофан, полиоксидоний). Проведена оценка специфичности и чувствительности полученных сывороток.

Разработан алгоритм исследования проб с использованием метода Real - Time PCR после предварительного накопления культуры V. parahaemolyticus. Предварительное обогащение проб в 1% пептонной воде с 2% NaCl в течение 8 часов позволяет выявлять бактерии V. parahaemolyticus методом Real-Time PCR при исходной концентрации их в пробе 101 м.кл./мл.

Практическая значимость

Сконструированы праймеры и зонды, позволяющие проводить идентификацию штаммов V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real -Time PCR).

Разработан методический подход на основе полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени, позволяющий за короткий срок выявлять ДНК V. parahaemolyticus в пробах чистых культур объектах окружающей среды.

Разработаны и одобрены Ученым советом и утверждены директором института Технические условия и инструкция по применению на набор реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)» (протокол №12 от 14.12.2017 г.). Авторы-разработчики: Чемисова О.С., Полеева М.В., Трухачев А.Л., Рыковская О.А.

Депонирован штамм V. parahaemolyticus Р-14810/1 - охраноспособный штамм -продуцент TDH V. parahaemolyticus КМ 2027. Штамм принят в ГКПБ 17.02.2017 года. Авторы: Чемисова О.С., Рыковская О.А., Сагакянц М.М., Полеева М.В.

Депонированы нуклеотидные последовательности в Международную базу данных GEN BANK, 26.07.2021 г. V. parahaemolyticus strain 14810/1. Авторы: Полеева М.В. Чемисова О.С., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Сагакянц М.М., Цырулина О.А.

Депонированы нуклеотидные последовательности в Международную базу данных GEN BANK, 22.09.2020 г. V. parahaemolyticus strain 14810. Авторы: Полеева М.В. Чемисова О.С., Писанов Р.В., Водопьянов А.С., Сагакянц М.М., Цырулина О.А.

Одобрены Ученым советом и утверждены директором института методические рекомендации учрежденческого уровня «Получение и очистка препарата прямого термостабильного гемолизина (TDH) V. parahaemolyticus» (протокол №12 от 14.12.2017 г.). Авторы: Полеева М.В., Чемисова О.С., Писанов Р.В., Рыковская О.А.

Сконструированные праймеры и зонды к гену металлопротеазы (коллагеназы) (vppC) V. parahaemolyticus для полимеразной цепной реакции в режиме реального времени используются в номенклатурной ревизии штаммов вибрионов из коллекции Музея живых культур с центром патогенных для человека вибрионов ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора (акт внедрения от 20.04.2021 г.).

Разработанный набор реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (RealTime PCR)» применяется в работе сотрудников Референс-центра по мониторингу за возбудителем холеры ФКУЗ Ростовский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора (акт внедрения от 01.06.2021 г.), а также в других подразделениях института: лаборатории бактериофагов (акт внедрения от 10.06.2021 г.), в лаборатории биохимии микробов (акт внедрения от 01.06.2021 г.).

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Штамм-продуцент V. parahaemolyticus 14810/1 (КМ 2027) может быть использован для получения стандартных препаратов термостабильного прямого гемолизина (TDH) парагемолитических вибрионов при разработке диагностических тест-систем, а также иммунных сывороток к нему. Методом MALDI-ToF-масс-спектрометрического анализа установлено, что препарату прямого термостабильного гемолизина соответствуют пики со значением m/z 2452±5, 4911±7, 4946±5, поэтому он может быть применён для оценки стабильности препаратов токсина в процессе их хранения.

2. Сконструированные праймеры и зонд к ДНК гена металлопротеазы (коллагеназы) V. parahaemolyticus характеризуются диагностической чувствительностью - не менее 1*105

12

м.к./мл и 100% специфичностью при исследовании культур микроорганизмов, проб биологического материала и объектов окружающей среды. Использование предлагаемого способа выявления специфического участка ДНК гена металлопротеазы (коллагеназы) V. parahaemolyticus с помощью ПЦР в режиме «реального времени» позволяет быстро, точно и эффективно проводить идентификацию представителей вида V. parahaemolyticus и дифференцировать их от близкородственных видов.

3. Набор реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)», является качественным и эффективным изделием для диагностики in vitro с достаточными диагностическими чувствительностью и специфичностью, отвечает требованиям, предъявляемым к диагностическим тест-системам, что позволяет использовать его в лабораторной практике для выявления гена vppC (V. parahaemolyticus) у штаммов, выделенных из ООС методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией.

4. Предложенная схема проведения исследований по выявлению парагемолитических вибрионов в пробах воды, гидробионтах, в том числе с учетом их способности к образованию биопленок на биотических поверхностях, с использованием набора реагентов «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)» дает возможность сократить время исследования с 4-5 дней до 24-48 часов и повысить эффективность и точность лабораторной диагностики V. parahaemolyticus, а также позволяет в короткие сроки выявить источник заражения.

Личный вклад автора в исследования

Личный вклад автора состоит в анализе источников литературы отечественных и зарубежных ученых по теме научно-исследовательской работы, обсуждении актуальности и цели работы, выборе путей решения поставленных задач, реализации задач в соответствии с поставленной целью, направленной на совершенствование методов лабораторной диагностики парагемолитических вибрионов, включая молекулярно-генетические, в подготовке публикаций; написании диссертации и автореферата. Основная часть экспериментальной работы (бактериологические, биохимические, биологические, молекулярно-генетические и серологические исследования) автором выполнена самостоятельно. Секвенирование и биоинформационный анализ штаммов V. parahaemolyticus 14810 и 14810/1 - продуцента прямого гемолизина TDH проводили совместно с ведущим научным сотрудником, и.о. зав. лабораторией диагностики ООИ, к. б. н. Писановым Р.В. и старшим научным сотрудником лаборатории диагностики ООИ, к. м. н. Водопьяновым А.С. Получение и характеристику препарата термостабильного прямого гемолизина TDH проводили совместно с ведущим научным сотрудником, и.о. зав. лабораторией диагностики ООИ, к. б. н. Писановым Р.В.

13

Разработку и изучение эффективности набора реагентов для идентификации V. parahaemolyticus «Тест-система для идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-Time PCR)» проводили совместно с ведущим научным сотрудником, и.о. зав. лабораторией чумы и других иерсиниозов, к. м. н. Трухачевым А.Л. Экспериментальные результаты, представленные в диссертации, получены лично автором в соавторстве с Чемисовой О.С., Писановым Р.В., Трухачевым А.Л., Водопьяновым А.С. На защиту вынесены только те положения и результаты, в которых роль соискателя была определяющей.

Работа выполнена в Музее живых культур с центром патогенных для человека вибрионов ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора в рамках государственных тем: № 01201352136 от 30.01.2013 «Получение и характеристика термостабильного прямого гемолизина Vibrioparahaemolyticus»; № 115032660002 от 26.03.2015 «Изучение вибриопейзажа и санитарно-гигиенических характеристик поверхностных водоёмов города Ростова-на-Дону»; № АААА-А17-117041010027-6 от 10.04.2017 «Контроль качества лабораторной диагностики холеры»; № АААА-А18-118022690029-8 от 26.02.2018 «Экспериментальная оценка роли некоторых экологических факторов в адаптации и персистенции холерных вибрионов, выделяемых в процессе мониторинговых исследований»; Федеральной целевой программы «Национальная система химической и биологической безопасности Российской Федерации (2015 - 2020 годы) в 2018-2020 году в рамках государственного контракта № 10-Д от 28.08.2018 (Лот 1. «Разработка и оптимизация средств и методов идентификации и дифференциации возбудителей особо опасных инфекций на основе данных о разнообразии геномов»).

Степень достоверности и апробация результатов

Экспериментальная часть исследования выполнена на прошедшем метрологическую поверку оборудовании. Степень достоверности результатов всех исследований подтверждена результатами трех независимых экспериментов. Использованные коммерческие сертифицированные диагностические препараты и тест-системы имели действующий срок годности.

Материалы диссертации представлены на научных конференциях и съездах:

1. Конференция молодых учёных ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора, г. Ростов-на-Дону, 2017 г., 2019 г.

2. Проблемная комиссия «Холера и патогенные для человека вибрионы» в рамках Координационного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации, г. Ростов-на-Дону, 2016 г., 2017 г.

3. IX ежегодный Всероссийский конгресс по инфекционным болезням с международным участием «Инфекционные болезни», г. Москва, 2017 г.

4. IX Всероссийская научно-практическая конференция молодых учёных и специалистов Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека «Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены», г. Иркутск, 2017 г.

5. X Всероссийская научно-практическая конференция молодых учёных и специалистов Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека «Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены», г. Москва, 2018 г.

6. X ежегодный Всероссийский конгресс по инфекционным болезням с международным участием «Инфекционные болезни», г. Москва, 2018 г.

7. XIV Межгосударственная научно-практическая конференция «Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия в государствах-участниках СНГ, в том числе на территории трансграничных природных очагов чумы», посвященная 100-летию ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб», г. Саратов, 2018 г.

8. Международная научно-практическая конференция «Молекулярная диагностика 2018», г. Минск, 2018 г.

9. II региональная научно-практическая конференция студентов и молодых ученых «Актуальные вопросы медицинской микробиологии на современном этапе», ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Ростов-на-Дону, 2018 г.

10. Оп-Нпе семинар-конференция «Масс-спектрометрия и перспективы ее применения в области микробиологии и эпидемиологии», 2019 г.

11. XII Всероссийская научно-практическая конференция молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены», г. Ростов-на-Дону, 2020 г.

Публикации. Материалы исследований отражены в 18 научных работах, из них 7 в периодических изданиях из «Перечня ведущих рецензируемых научных журналов, утвержденных ВАК Министерства образования и науки Российской Федерации». Получено 2 патента на изобретение.

План диссертационной работы утвержден на заседании Ученого совета ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора (протокол № 12 от 14.12.2017

г.)

Структура диссертации. Диссертация построена по традиционному плану, изложена на 165 страницах, состоит из введения, одной главы обзора литературы, материалов и методов, трех глав собственных исследований, заключения и выводов. Иллюстрирована 15 таблицами и

15

36 рисунками. Библиография включает ссылки на 296 публикаций, в том числе 73 отечественных и 223 зарубежных.

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Vibrio parahaemolyticus - распространение в природе и роль в патологии человека

Бактерии рода Vibrio широко распространены в водной среде и являются автохтонными микроорганизмами морских и эстуарных вод. Некоторые виды вибрионов могут также вызывать инфекции у людей и быть изолированы из различных кишечных и внекишечных эпитопов [Blake P.A., 1980; Janda J.M. et al., 1988]. Чаще всего заболевания встречаются в прибрежных странах, что связано с употреблением в пищу морепродуктов.

Морепродукты признаны питательным и здоровым продуктом питания и в большом количестве употребляются в пищу во всем мире [Hellberg R.S. et al., 2012; Bonnin-Jusserand M. et al., 2019]. Каждый год, вылавливается и потребляется более 100,2 миллиона тонн морепродуктов [Cisneros-Montemayor C. et al., 2016]. Однако основными проблемами их употребления являются высокая склонность к порче и риск для здоровья из-за загрязнения патогенами [Reyhanath P.V et al., 2014]. Поэтому безопасность и переработка морепродуктов является необходимой для поддержания здоровья населения [Jahan S, 2012; Machado H. et al., 2015].

Наиболее распространенным патогеном, встречающимся на морепродуктах (креветки, рыба, моллюски) и способным вызвать серьезные заболевания у людей являются, парагемолитические вибрионы [Lee К.К. et al. 2003; Беленева И.А. с соавт., 2004; Lin С. et al., 2004; Park K S. et al. 2004; Su C. et al., 2020; Тарасенко Т.Т. с соавт., 2016; Yeung P.S. et al., 2004; Hou C.C. et al., 2011; Elmahdi S. et al., 2016; Baker-Austin C. et al., 2018; Osei-Adjei G. et al., 2018; Li L. et al., 2019; Rezny B.R. et al., 2020]. Первая вспышка гастроэнтерита пищевого происхождения из-за V. parаhaemоlytiсus была зарегистрирована в 1951 году в Осаке (Япония), где люди часто потребляют сырые или недостаточно термически обработанные морепродукты [Fujino T. et al., 1953]. Во время вспышки было зарегистрировано 272 заболевших с 20 смертельными случаями. С тех пор V. parаhaemоlytiсus является причиной многих вспышек болезней пищевого происхождения (Китай, Австралия, Индонезия, Россия, США), протекающих по типу пищевой токоткоинфекции.

Кроме этого, парaгемoлитические вибрионы могут быть причиной заболеваний у людей не только пищевого характера. В редких случаях V. parahaemolyticus вызывает раневую инфекцию, ушную инфекцию или септицемию, которые могут представлять угрозу для жизни лиц с уже существующими медицинскими патологиям [Ryan W.J., 1976; Mertens A. et al., 1979; Blake P.A., 1980; Бойко А.В. с соавт., 1994; Daniels N.A. et al., 2000; Deepanjali A. et al., 2005; Zhang L. et al., 2013; Shaw K.S., 2014; Elmahdi S. et al., 2016; Baker-Austin C. et al., 2018; Guillod

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Полеева Марина Владимировна, 2022 год

Список литературы

1. Автономов, Д.М. Создание базы данных точных массово-временных меток для качественного и количественного подхода в исследовании протеома мочи человека с использованием изотопного мечения / Д.М. Автономов, И.А. Агрон, А.С. Кононихин, Е.Н. Николаев // Труды МФТИ. - 2009. - Т.1. - №1. - С.24-29.

2. Аллам, А.Ю. Разработка технологии получения хитозана из панциря креветки Penaeus semisulcalcatus и изучение возможности его использования в качестве пищевых покрытий и добавок: Автореферат дисс. ... канд. тех. наук по специальности 05.18.04 -технология мясных, молочных и рыбных продуктов и холодильных производств / Аллам Айман Юнес Фатхи. - Астрахань. - 2018. - 20 с.

3. Антипова, Л.В. Чешуя прудовых рыб - источник пищевого продукта [Электронный ресурс] / Л.В. Антипова, Ву Тхи Лоан. - 2009. - Режим доступа: http://www.tstu.ru/ education/elib/pdf/st/2009/antipova.

4. Ашмарин, И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях /И.П. Ашмарин, А.А. Воробьев. - Л.: Медгиз,1962. - 180 с.

5. Баранов, А.А. Новая эпоха в медицинской микробиологии / А.А. Баранов, А.Н. Маянский, И.В. Чеботарь, Н.А. Маянский // Вестник РАН. - 2015. - Т.85. - №11. - С.1011-1018

6. Баранцевич, Е.П. Применение MALDI-TOF масс-спектрометрии в клинической микробиологии / Е.П. Баранцевич, Н.Е. Баранцевич //Трансляционная медицина. - 2014. - № 3. - С.23-28.

7. Бахир, В.М. Микробные биопленки: механизмы образования и взаимодействия с окружающей средой, новые подходы к разрушению биопленок - / В.М. Бахир, Л.Г. Ипатова, О.А. Суворов, А.Г. Погорелов // Матер. XIII международ. науч.-практ. конф. «Пища. Экология. Качество», Красноярск. - 2016. - C.125-130.

8. Беленева, И.А. Физиолого-биохимические свойства галофильных вибрионов Vibrio parahaemolyticus и V. alginolyticus, изолированных из гидробионтов залива Петра Великого Японского моря / И.А. Беленева, Э.Ф. Масленникова, Т.Ю. Магарламов // Биология моря. - Т. 30. - № 30. - 2004. - С.114-119.

9. Белькова, Н.Л. Молекулярно-генетический мониторинг Ассоциированной микрофлоры лососевидных рыб: разнообразие и физиологический статус / Н.Л. Белькова, Е.В. Суханова, Н.Н. Деникина, О.Т. Русинек, Е.В. Дзюба // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. -Т. 12. - №1(4). - 2010. - С.1108-1114.

10. Беризовская, Е.И. Методы обработки масс-спектрометрических данных при идентификации пептидов и белков / Е.И. Беризовская, А.А. Ихалайнен, А.М. Антохин, В.Ф.

Таранченко, В.М. Гончаров, Д.А. Митрофанов, А.В. Удинцев, А.В. Аксенов, О.А. Шевлякова, И.А. Родин, О.А. Шпигун // Вестн. Моск. Ун-та. Сер. 2. Химия. - 2015. - № 5. - С.266-278.

11. Блажевич, О.В. Культивирование клеток: Курс лекций / О.В. Блажевич - Мн.: БГУ, 2004. - 78 с.

12. Бойко, А.В. Факторы персистенции микроорганизмов / А.В. Бойко // Эпидемиология, клиника, диагностика, лечение и профилактика важнейших инфекционных болезней. Мат. конф. Тамбов-Астрахань. - 1994. - С.33.

13. Бойко, А.В. Эколого-эпидемиологические аспекты распространенности Vibrio parahaemolyticus в пресноводном регионе / А.В. Бойко, Н.П. Погорелова, Т.М. Жигарева // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 1994. - № 3. - С.49-51.

14. Бочарова, Ю.А. Возможности, проблемы и перспективы масс-спектрометрических технологий в медицинской микробиологии (обзор литературы) / Ю.А. Бочарова, И.В. Чеботарь, Н.А. Маянский // Клин. лаб. диагностика. - 2016. - Т. 61. - № 4. -С.249-256. doi 10.18821/0869-2084-2016-61-4-249-256.

15. Водопьянов, С.О. Изучение межвидовой конкуренции Vibrio cholerae в биопленках / С.О. Водопьянов, С.В. Титова, А.С. Водопьянов, Л.М. Веркина, И.П. Олейников, Р.В. Писанов, Л.К. Лысова, Н.А. Селянская, О.А. Рыковская // ЗНиСО. - 2017. - № 3 (288). -С.51-54.

16. Водопьянов, С.О. Патент на изобретение №2685878 «Способ моделирования биоплёнок, формируемых Vibrio cholerae 01 серогруппы на поверхности хитина» / С.О. Водопьянов, А.С. Водопьянов, Е.А. Меньшикова, Е.М. Курбатова, С.В. Титова // Заявка: 2018103604, 30.01.2018. Опубликовано: 23.04.2019 Бюл. № 12.

17. Воронина, Е.А. Разнообразие паразитов и микроорганизмов каспийских сельдевых рыб / Е.А. Воронина, В.В. Володина, С.А. Дьякова, А.В. Конькова // Российский паразитологический журнал. - М. - 2017. - Т. 42. - Вып. 4. - С.339-344.

18. Воронок, В.М. Анализ групповой и вспышечной заболеваемости в Приморском крае / В.М. Воронок // Здоровье. Медицинская экология. Наука. - 3 (66) - 2016. - С.78-84.

19. Гальцева, Г.В. Проблема выявления вибриофлоры при заболеваниях людей и объектах окружающей среды / Г.В. Гальцева, Л.В. Пономарева, О.Х. Христенко, О.П. Малый // Холера и патогенные для человека вибрионы. - Ростов-на-Дону. - 2015. - Вып. 28. - С.53-56.

20. Германчук, В.Г. Индикация холерного токсина с помощью MALDI масс-спектрометрии / В.Г. Германчук, Д.В. Уткин, А.Н. Спицын, М.Н. Киреев, Н.Е. Щербакова // ЗНиСО. - 2015. -№ 3 (264). - С.27-31.

21. Германчук, В.Г. Применение методов спектроскопического анализа для выявления холерного токсина / В.Г. Германчук, Д.В. Уткин, А.Н. Спицын, Е.А. Михеева, Н.А. Осина // Здоровье населения и среда обитания. - 2016. - № 6 (279). - С.40-43.

22. Гришин, И.Д. Времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией для анализа высокомолекулярных и металлоорганических соединений [Электронный ресурс] / И.Д. Гришин Электронное учебно-методическое пособие. -Нижний Новгород. - 2014. - 49 с. Режим доступа: http://www.unn.ru/books/met_files/MALDI.doc

23. Дубровский, А.Я. Определение токсинов пептидной природы методом MALDI-MS (обзор) / Я.А. Дубровский, Е.П. Подольская // Научное приборостроение. -2010. - № 4. -С.21-35.

24. Евдокимова, В.В. Разработка препаратов моноклональных антител для идентификации и дифференциации холерных вибрионов О1, О139 серогрупп иммуноферментными методами: Автореферат дисс. ... канд. биол. наук по специальности 03.02.03 - микробиология / Евдокимова Вероника Вячеславовна - Ростов-на-Дону, 2018. - 24 с.

25. Ильина, Е.Н. Молекулярные средства измерения в современной микробиологической лаборатории / Е.Н. Ильина // Клин. лаб. диагностика. -2013. - № 9. - С.70.

26. Као, Т.Х. Чешуя рыб как источник получения пищевого желатина / Т.Х. Као, Т.М. Нгуен, М.Ю. Карапун // Молодой ученый. - 2016. - № 23. - С.113-115.

27. Карбышев, Г.Л. Эпидемиологические особенности пищевых токсикоинфекций, вызываемых морскими галофильными парагемолитическими вибрионами: Автореферат дисс. ... канд. мед. наук по специальности 14.00.30 - эпидемиология / Карбышев Гериард Львович -Саратов, 1988. - 22 с.

28. Краснов, Н.В. Масс-спектрометрия с мягкими методами ионизации в протеомном анализе / Н.В. Краснов, Я.И. Лютвинский, Е.П. Подольская // Научное приборостроение. - 2010.

- № 4. - С.5-20.

29. Курова, В.С. Масс-спектрометрический мониторинг белкового состава конденсата выдыхаемого воздуха больного, перенесшего трансплантацию легких / В.С. Курова, Э.Х. Анаев, А.С. Кононихин, И.А. Попов Текст] / Известия Академии наук. Серия химическая.

- 2009. - № 12. - С.284-288.

30. Лабинская, А.С. Практикум по микробиологическим методам исследования / А.С. Лабинская // М.: Медгиз, 1963. - 443 с.

31. Лаженцева, Л.А. Распространенность галофильных вибрионов в морских промысловых объектах и продуктах из них. Обзор / Л.А. Лаженцева // Исследования водных биологических ресурсов Камчатки и северо-западной части Тихого океана. - 2012. - Вып. 26. -С.33-52.

32. Лебедев, А.Т. Задачи и достижения современной масс-спектрометрии [Текст] / А.Т. Лебедев, В.Г. Заикин // Заводская лаборатория. Диагностика материалов. - 2007. - №2. - Т. 73. - С.21-29.

33. Либинзон, А.Е. Парагемолитические вибрионы и родственные галофильные микроорганизмы Черного моря / А.Е. Либинзон, И.В. Домарадский, З.И. Ус, А.И, Демина, А.Ф. Нагорная, Г.М. Сухнова, Р.Б. Кривцова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1974. - №5. - С.80-84.

34. Либинзон, А.Е. Галофильные вибрионы Черного моря и их роль в патологии человека / А.Е. Либинзон, Р.А. Брудный, А.Ф, Нагорная, А.И. Демина, Н.В, Краснова, И.В, Павлова, Г.М. Сухнова, Е.Ф. Кутишевская, З.И. Ус, Р.Б. Кривцова, В.Г. Щека, А.А, Шемякина, Б.В. Стрельцын // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1981. - №2. -С.97-101.

35. Либинзон,А.Е. Галофильные вибрионы - возбудители острых кишечных инфекций, встречающихся на побережье Черного и Азовского морей / А.Е, Либинзон, И.В, Павлова, А.Ф. Нагорная, З.И. Ус, А.И. Демина, Г.М, Сухнова, Е.Ф, Кутишевская, Э.И. Лунева, Е.И, Сахно, Г.М. Голклвский, В.А. Шикулов // Тезисы докладов областной научно-практической конференции по проблеме «Холера», Ростов-на-Дону. - 1984. - 107-109.

36. Либинзон, А.Е. Парагемолитические вибрионы - возбудители пищевых токсикоинфекций на побережье Азовского моря / А.Е. Либинзон, Г.Л. Карбышев, А.Г. Лобода, Ю.А, Рябченко, Н.В. Гордиенко, В.А. Шикулов // Сб. тезисов областной конференции «Проблемы медицинской и санитарной микробиологии города», Ростов-на-Дону. - 1987. - С. 12-14.

37. Ломинадзе, Г.Г. Использование метода MALDI-TOF масс-спектрометрии для ускорения идентификации микроорганизмов в гемокультурах пациентов с подозрением на сепсис / Г.Г. Ломинадзе, Е.А. Семенова, О.В. Мотузова, А.Н. Калакуцкая, А.В. Лазарева // Лаборатория ЛПУ. - № 4. - 2014. - С .17-20.

38. Маслов, Д.В. Вспышка галофилеза среди населения г. Владивостока Приморского края / Д.В. Маслов // Здоровье населения и среда обитания. - 1997. - №12 (57). - С.17-18.

39. Меньшикова, Е. А. Гемолитическая активность токсигенных и нетоксигенных штаммов холерных вибрионов различных серогрупп: Автореферат дисс. ... канд. биол. наук по специальности 03.00.07 - микробиология / Меньшикова Елена Аркадьевна. - Саратов, 2003. -19 с.

40. Методические указания по контролю в рыбных продуктах парагемолитических вибрионов - возбудителей пищевых токсикоинфекций: МУ 5780-91 (утв. Заместителем

министра рыбного хозяйства СССР 17.11.1990). Ленинград: Министерство Здравоохранения СССРб Министерство Рыбного хозяйства СССР, 1991. - 20 с.

41. Методические указания: Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемолитическими и другими патогенными для человека вибрионами: МУК 4.2.1793-03 (утв. Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 02.11.2003). М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2003. - 39 с.

42. Методические указания: Методы выявления и определения парагемолитических вибрионов в рыбе, нерыбных объектах промысла, продуктах, вырабатываемых из них, воде поверхностных водоемов и других объектах: МУК 4.2.2046—06 (утв. Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 30.01.2006). М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2006. - 26 с.

43. Методические указания: Лабораторная диагностика холеры: МУК 4.2.2218-07 (утв. Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 31.05.2007) М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2007. - 87 с.

44. Методические указания: Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы Г-ГУ групп патогенности: МУ 1.3.2569-09 (утв. Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 22.12.2009). М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. - 51 а

45. Методические рекомендации. Использование метода времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-ToF MS) для индикации и идентификации возбудителей I—II групп патогенности: МР 4.2.0089-14 (утв. руководителем Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 24.04.2014). М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2015. - 19 с.

46. Миронова, А.В. Влияние сред культивирования на экспрессию биологических свойств холерных вибрионов / А.В. Миронова, Е.А. Меньшикова, Л.С. Подосинникова // Пробл. комиссия: «Холера и патогенные для человека вибрионы». - Ростов н/Д. - 2002. - Вып. 15. -С.65.

47. Муравьев, А. А. Растворы смесей целлюлозы и хитина в ионных жидкостях и композиционные материалы на их основе: Автореферат дисс. ... канд. хим. наук по специальности 02.00.06 - высокомолекулярные соединения; 02.00.04 - физическая химия / Муравьев Антон Алексееевич. - Санкт-Петербург, 2017. - 24 с.

48. Нитяга, И.М. Верификация метода выделения Vibrio parahaemolyticus из морской рыбы и рыбной продукции / И.М. Нитяга, Б.В. Уша, О.В. Простова // Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. - 2019. - №2. - С.138-143.

49. Онищенко, Г.Г. Биологическая безопасность / Г.Г. Онищенко, М.А. Пальцев, В.В. Зверев, А.А. Иванов, В.И. Киселев, С.В. Нетесов, С.Е. Северин, Б.Ф. Семенов, В.П. Сергиев, С.Н. Щелкунов. - М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2006. - 304 с.

50. Осовская, И.И. Хитин-глюкановые комплексы. Физико-химические свойства и молекулярные характеристики [Электронный ресурс] / И.И. Осовская, Д.Л. Будилина, Е.Б. Тарабукина, Л.А. Нудьга // Уч. пособие под. ред. Г. М. Полторацкого. - Санкт-Петербург: ГОУВПО СПбГТУРП, 2010. - 52 с. Режим доступа: http://www.nizrp.narod.ru/hitozany.pdf

51. Подволоцкая, А.Б. Бактериальные биопленки, характерные для пищевой промышленности и общественного питания / А.Б. Подволоцкая, Е.С. Фищенко, Л.А. Балабанов, И.М. Сон, Л.А Текутьева // Соврем. проблемы товароведения, экономики и индустрии питания. Сб. статей по итогам 1 заочной Международ. науч.-практ. конф., Саратов. - 2016. - С.154-156.

52. Подойницына, О. А. Генотипическая характеристика штаммов V. parahaemolyticus, циркулирующих на территориях России и сопредельных государств: Автореферат дисс. ... канд. биол. наук по специальности 03.02.03 - микробиология / Подойницына Оксана Андреевна. - Ростов-на-Дону, 2013. - 23 с.

53. Полунина, Т.А. Масс-спектрометрия в медицине и биотехнологии [Текст] / Т.А. Полунина, М.Н. Киреев, Т.А. Храмченкова, А.Н. Спицын, Г.В. Григорьева // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунолог. - 2013. - № 5. - С.112-118.

54. Поляк, М.С. Питательные среды для медицинской микробиологии / М.С. Поляк, В.И. Сухаревич, М.Э. Сухаревич // Санкт-Петербург, 2002. - 80 с.

55. Ребриков, Д.В. ПЦР в реальном времени / Д.В. Ребриков, Г.А. Саматов, Д.Ю. Трофимов, П.А. Семёнов, А.М. Савилова, И.А. Кофиади, Д.Д Абрамов // М: Бином. Лаборатория знаний, 2009. - 226 с.

56. Рыковская, О.А. Дифференциация представителей Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus / О.А. Рыковская, О.С. Чемисова, Л.М. Смоликова и др.// Клин. лаб. диагностика. -2014. - Том. - 5 9. - №. 12. - С.50 - 55.

57. Рыковская О.А. Молекулярно-биологическая характеристика и совершенствование идентификации и дифференциации Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus: Автореферат дисс. ... канд. биол. наук по специальности 03.02.03 -микробиология / Рыковская Оксанв Алексеевна. - Ростов-на-Дону, 2016. - 25 с.

58. Сергевнин, В.Н. Выживаемость галофильных вибрионов в замороженной красной рыбе / В.Н. Сергевнин, Ю.И. Ладейщикова, Л.А. Галямова, С.А. Лукьянцева // ЗНиСО. - 2014. -№ 1. - С.33-34.

59. Скитович, Г.С. Vibrio parahaemolyticus: распространение, выявление и методы идентификации / Г.С. Скитович, Н.Б. Шадрова, О.В. Прунтова // Ветеринария сегодня. - 2015. -№ 3 (14). - С.66-70.

60. Смоликова, Л.М. Галофильные вибрионы, обусловившие вспышку пищевой токсикоинфекции во Владивостоке / Л.М. Смоликова, Ю.М. Ломов, Т.В. Хоменко, Г.П. Мурначев, Т.А. Кудрякова, О.П. Фецайлова, Е.М. Санамянц, Л.Д. Македонова, Г.В. Качкина, Е.Н. Голенищева. // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2001. - №6. - С.3-7.

61. Соколова, Т.Н. Микробные биопленки и способы их обнаружения / Т.Н. Соколова // Журнал Гродненского государственного медицинского университета. - 2014. - № 4. - С.12-15.

62. Супотницкий, М.В. Бактериальные токсины. Их природа, механизмы действия, возможности конструирования гибридных и модифицированных токсинов / М.В. Супотницкий // Биопрепараты. Профилактика. Диагностика. Лечение. - 2011. - № 1. - 6-16.

63. Тарасенко, Т.Т. Заболеваемость прочими кишечными инфекциями в Приморском крае / Т.Т. Тарасенко, Е.В. Косенок, В.А. Кривоногова, Ф.Н. Шевердина // Здоровье. Медицинская экология. Наука. - 2016. - Т.3. - №66. - С.127-134.

64. Тартаковский, А.Д. Питательные среды для культивирования клеток млекопитающих / А.Д. Тартаковский // Методы культивирования клеток. - Л.: Наука, 1988. - С. 44-63.

65. Титова, С.В. Моделирование биопленок холерного вибриона на твердых поверхностях (стекло и пластик) и визуализация их в световом и люминисцентном микроскопах / С.В. Титова, Л.М. Веркина // Клиническая и лабораторная диагностика. - 2016. - Т. 61. - № 4.

- С.238-241.

66. Тюрин, Ю.А. Масс-спектрометрическая идентификация стафилококковых пептидгидролаз / Ю.А. Тюрин, Р.З. Хайруллин, И.И. Салафутдинов // Вестник технологического университета. - 2015. - № 16. - С.287-289.

67. Хоменко, Т.В. Галофилез во Владивостоке / Т.В. Хоменко, Г.П. Мурначев // Противочумные учреждения России и их роль в обеспечении эпидемиологического благополучия населения страны: Матер. конф., посвящ. 70-лет. Противочумного центра. - М., 2004. - С.123-124.

68. Хотько, Н.И. Водный фактор в передаче инфекций / Н.И. Хотько, А.П. Дмитриев.

- Пенза, 2002. - 232 с.

69. Чемисова, О.С. Характеристика штаммов Vibrio parahaemolyticus и других галофильных вибрионов, выделенных из балластных вод судов, прибывающих в международные порты Ростовской области / О.С. Чемисова, О.А. Рыковская, Р.Р. Даликова, Н.Б. Непомнящая, И.А. Чайка, С.Ю. Водяницкая, А.В. Гавринева // ЗНиСО. - 2014. - № 7(256). - С.42-45.

70. Шалу, О.А. Эффективность экспрессии гена tdh Vibrio parahaemolyticus зависит от двух точковых мутаций в его промоторной области / О.А. Шалу, Р.В. Писанов, Е.В. Монахова // Генетика. - 2012. - № 48 (12). - С.1364 - 1371.

71. Шварц, Т.А. Биопленки как микробное сообщество / Т.А. Шварц // Вестник Курганского гос. университета. - 2015. - № 1. - Вып. 7. - С.41-44.

72. Якубова, О.С. Чешуя как источник получения ихтиожелатина / О.С. Якубова, А.Л. Котенко // Вестн. Астрахан. Гос. Тех. Ун-та. - № 2 (21). - 2004. - С.130-134.

73. Ярец, Ю.И. Новый метод анализа бактериальной биопленки / Ю.И. Ярец, Н.И. Шевченко // Наука и инновации. - 2016. - № 10 (164). - С.64-68.

74. Abd El-Aziz, T.M. Advances in venomics: Modern separation techniques and mass spectrometry / T.M. Abd El-Aziz, A.G. Soares, J.D. Stockand // J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci. - 2020. - Vol.1160:1223-52.

75. Ahmed, H.A. Molecular characterization, antibiotic resistance pattern and biofilm formation of Vibrio parahaemolyticus and V. cholerae isolated from crustaceans and humans / H.A. Ahmed, R.M. El Bayomi, M.A. Hussein, M.H.E. Khedr, EM. Abo Remela, A.M.M. El-Ashram // International Journal of Food Microbiology. - 2018. - Vol. 274. - P.31-37.

76. Alaboudi, A.R. Detection, identification, and prevalence of Vibrio parahaemolyticus in fish and coastal environment in Jordan / A.R. Alaboudi, M. Ababnen, T. M. Osaili, K.A. Shloul // J. Food Sci. - 2016. - Vol. 81(1). - P.130-134.

77. Alam, M. Environmental investigation of potentially pathogenic Vibrio parahaemolyticus in the SetoInland Sea, Japan / M. Alam, K. Tomochika, S. Miyoshi, S. Shinoda // FEMS Microbiol. Lett. - 2002. - Vol. 208. - P.83-87.

78. Alipour, M. Isolation and identification of Vibrio parahaemolyticus from seawater and sediment samples in the southern of the Caspian Sea / M. Alipour, K. Issazadeh, J. Soleimani // Comp. Clin. Path. - 2012. - Vol. 23. - P.129-133.

79. Allegrucci, M. Phenotypic characterization of Streptococcus pneumoniae biofilm development / M. Allegrucci, F.Z. Hu, K. Shen, J. Hayes, G.D. Ehrlich, J.C. Post, K. Sauer // J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188(7). - P.2325-2335.

80. Ashrafudoulla, M. Genetic relationship, virulence factors, drug resistance profile and biofilm formation ability of Vibrio parahaemolyticus isolated from mussel [Электронный ресурс] /

144

M. Ashrafudoulla, M. Furkanur, R. Mizan, H. Park, K.-H. Byun, N. Lee, S.H. Park, S.-D. Ha // Front. Microbiol. - 2019. - Vol. 10:513. Режим доступа:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6435529/pdf/fmicb-10-00513.pdf

81. Baker-Austin C. Vibrio spp. infections / C. Baker-Austin, J.D. Oliver, M. Alam, A. Ali, M.K. Waldor, F. Qadri, J. Martinez-Urtaza // Nat Rev Dis Primers. - 2018. - Vol. 4. - P.1-19

82. Banerjee, S.K. Detection, enumeration and isolation of Vibrio parahaemolyticus and V. vulnificus from seafood: development of a multidisciplinary protocol [Электронный ресурс] / S.K. Banerjee, J.M. Farber // J AOAC International. - 2017. - Vol. 100, Issue 2. - P. 445-453. Режим доступа: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28118133/

83. Banerjee, S.K. Diversity and Dynamics of the Canadian Coastal Vibrio Community: An Emerging Trend Detected in the Temperate Regions [Электронный ресурс] / S.K. Banerjee, R. Rutley, J. Bussey // J. Bacteriol. - 2018. - Vol. 200, Issue 15. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6040189/pdf/e00787-17.pdf

84. Barr J. R. Botulinum neurotoxin detection and differentiation by mass spectrometry / J R. Barr, H. Moura, A.E. Boyer, A.R. Woolfitt, S R. Kalb, A. Pavlopoulos, L.G McWilliams, J.G. Schmidt, R.A. Martinez, D.L. Ashley // Emerg. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 10. - P.224-234.

85. Bechlars, S. Cell-free synthesis of functional thermostable direct hemolysins of Vibrio parahaemolyticus / S. Bechlars, D.A. Wustenhagen, K. Dragert, R. Dieckmann, E. Strauch, S. Kubick // Toxicon. - 2013. - Vol. 76. - Р. 132-142.

86. Bechlars, S. Characterization of trh2 harbouring Vibrio parahaemolyticus strains isolated in Germany [Электронный ресурс] / S. Bechlars, C. Jackel, S. Diescher, D.A. Wustenhagen, S. Kubick, R. Dieckmann, E. Strauch // PLoS One. - 2015. - Vol. 10(3):e0118559. Режимдоступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4370738/pdf/pone.0118559.pdf

87. Begley, M. The interaction between bacteria and bile / M. Begley, C.G. Gahan, C. Hill // FEMS Microbiol. Rev. - 2005. - Vol.29, Issue 4. - Р. 625-651.

88. Bergey' s Manual of Determinative Bacteriology / 9 ed. - Baltimore, 1994. - P. 432.

89. Bhat, R.V. Outbreak of trichothecene mycotoxicosis associated with consumption of mould-damaged wheat production in Kashmir Valley, India / R.V. Bhat, S.R. Beedu, Y. Ramakrishna, K.L. Munshi // Lancet. - 1989. - Vol. 1(8628). - P.35-37.

90. Bhowmik, S.K. Phylogenetic and in silico functional analyses of thermostable-direct hemolysin and tdh-related encoding genes in Vibrio parahaemolyticus and other gram-negative bacteria [Электронный ресурс] / S.K. Bhowmik, G.P. Pazhani, T. Ramamurthy // BioMed Research International. - 2014. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4119642/pdf/BMRI2014-576528.pdf

91. Bilitewski, U. Bioresponse-linked instrumental analysis / U. Bilitewski, G. BrennerWeiss, P.-D. Hansen, B. Hock // TrAC Trends in Analytical Chemistry. 2000. - Vol. 19(7). - Р. 428433.

92. Blake, P.A. Diseases of humans (other than cholera) caused by vibrios / P.A. Blake //Ann. Rev. Microbiol. - 1980. - Vol. 34. - Р.341-367

93. Bocanek, O. Evaluation of sample preparation protocols for spider venom profiling by MALDI-TOFMS / O. Bocanek, O. Sedo, S. Pekar, Z. Zdrahal // Toxicon. - 2017. - Vol. 133. - Р. 825.

94. Bolger, A.M. Trimmomatic: A flexible trimmer for Illumina Sequence Data / A.M. Bolger, M. Lohse, B. Usadel // Bioinformatics. - 2014. - Vol. 30(15). - Р. 2114-2120.

95. Bonnin-Jusserand, M. Vibrio species involved in seafood-borne outbreaks (Vibrio cholerae, V. parahaemolyticus and V. vulnificus): Review of microbiological versus recent molecular detection methods in seafood products / M. Bonnin-Jusserand, S. Copin, C. Le Bris, T. Brauge, M. Gay, A. Brisabois, T. Grard, G. Midelet-Bourdin // Crit. Rev. Food Sci. Nutr. - 2019. - Vol. 59(4). -Р. 597-610.

96. Broberg, C.A. Vibrio parahaemolyticus cell biology and pathogenicity determinants / C.A. Broberg, T.J. Calder, K. Orth // Microbes Infect. - 2011. - Vol. 13. - Р.992-1001.

97. Brooun, A. A dose-response study of antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa biofilms / A. Brooun, S. Liu, K. Lewis // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2000. - Vol. 44(3). - P. 640-646.

98. Buller, N.B. Bacteria from fish and other aquatic animals: a practical identification manual / Buller N.B. // Oxfordshire: CABI publishing. - 2004. - 361 p.

99. Cai, Q. Structure, function and regulation of the thermostable direct hemolysin (TDH) in pandemic Vibrio parahaemolyticus / Q. Cai, Y. Zhang // Microbial Pathogenesis. - 2018. - Vol. 123. - P. 242-245.

100. Carda-Dieguez, M. Wild eel microbiome reveals that skin mucus of fish could be a natural niche for aquatic mucosal pathogen evolution [Электронный ресурс] / M. Carda-Dieguez, R. Ghai, F. Rodriguez-Valera, C. Amaro // Microbiome. - 2017. - Vol. 5(1): 162. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5740887/pdf/40168_2017_Article_376.pdf

101. Ceccarelli, D. Distribution and dynamics of epidemic and pandemic Vibrio parahaemolyticus virulence factors [Электронный ресурс] / D. Ceccarelli, N.A. Hasan, A. Huq, R.R. Colwell // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 2013. - Vol. 3:97. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3858888/pdf/fcimb-03-00097.pdf

102. Chakraborty, S. Pathogenic vibrios in the natural aquatic environment / S. Chakraborty, G.B. Nair, S. Shinoda // Rev. Environ. Health. - 1997. - Vol. 12(2). - P.63-80.

146

103. Champion, O.L. Galleria mellonella as a model host for microbiological and toxin research [Электронный ресурс] / O.L. Champion, S. Wagley, R.W. Titball // Virulence. - 2016. -Vol. 7, №7. - Р. 840-845. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5029293/pdf/kvir-07-07-1203486.pdf

104. Chanda, A. Mass spectrometric analysis to unravel the venom proteome composition of Indian snakes: opening new avenues in clinical research / A. Chanda, A.K. Mukherjee // Expert Rev Proteomics. - 2020. - Vol. 17(5). - Р. 411-423.

105. Characklis, W.G. Physiological ecology in biofilm systems / W.G. Characklis, G.A. McFeters, K.C. Marshall // In: Characklis W.G., Marshall K.C., editors. Biofilms. New York: John Wiley & Sons, 1990. - P. 341-394.

106. Chen, L. ToxR Is Required for Biofilm Formation and Motility of Vibrio parahaemolyticus [Электронный ресурс] / L. Chen, Y. Qiu, H. Tang, L.F. Hu, W.H. Yang, X.J. Zhu, X.X. Huang, T. Wang, Y.Q. Zhang// Biomed Environ. Sci. - 2018. - Vol.31(11). - Р. 848-850. Режим доступа:file:///C:/Users/mjk1/Downloads/ToxR+Is+Required+for+Biofilm+Formation+and+Motility +of+Vibrio+Parahaemolyticus.pdf

107. Cheng, K. Recent development of mass spectrometry and proteomics applications in identification and typing of bacteria [Электронный ресурс] / K. Cheng, H. Chui, L. Domish, D. Hernandez, G. Wang // Proteomics Clin. Appl. - 2016. - Vol. 10. - Р.346-357. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5067657/pdf/PRCA-10-346.pdf

108. Chien, S.C. Spontaneous small bowel perforation secondary to Vibrio parahaemolyticus infection: A case report [Электронный ресурс] / S.C. Chien, C.C. Chang, S.C. Chien // World J. Clin. Cases. - 2021. - Vol.9, Issue 5. - Р.1210-1214. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7896667/pdf/WJCC-9-1210.pdf

109. Chonsin, K. Characterization of Vibrio parahaemolyticus strains isolated from clinically asymptomatic seafood workers / K. Chonsin, N. Supha, C. Nakajima, Y. Suzuki, O. Suthienkul // FEMS Microbiol. Lett. - 2021. - Vol.368, Issue 1. - Р. 209-214

110. Chowdhury, G. Isolation and characterization of pandemic and nonpandemic strains of Vibrio parahaemolyticus from an outbreak of diarrhea in North 24 Parganas, West Bengal, India [Электронный ресурс] / G. Chowdhury, S. Ghosh, G.P. Pazhani, B.K. Paul, D. Maji, A.K. Mukhopadhyay, T. Ramamurthy // Foodborne Pathog. Dis. - 2013. - Vol. 10 (4). - Р. 338-342. Режим доступа: http://ousar.lib.okayama-u.ac.jp/files/public/5/56685/20190523172658156681/Foodborne_Pathog_Dis_10_4_338.pdf

111. Christensen, W.B. An agar base for the preparation of Christensen's medium to detect rapid urease activity of the Proteae and non-rapid urease activity of some Enterobacteriaceae / W.B. Christensen //J. Bact. - 1946. - Vol. 52. - P. 461-466.

147

112. Chung, C.-H. Influence of oxyR on Growth, Biofilm Formation, and Mobility of Vibrio parahaemolyticus [Электронный ресурс] / C.-H. Chung, S. Fen, S.-C. Yu, H. Wong // Appl. Environ. Microbiol. - 2016. - Vol.82, №3. - Р.788 -796. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4725280/pdf/zam788.pdf

113. Cisneros-Montemayor, A.M. A global estimate of seafood consumption by coastal indigenous peoples [Электронный ресурс] / A.M. Cisneros-Montemayor, D. Pauly, L.V. Weatherdon, Y. Ota // PLoS One. - 2016. - Vol. 11(12). Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5137875/pdf/pone.0166681.pdf

114. Clark, R.F. A review of selected seafood poisonings / R.F. Clark, S.R. Williams, S.P. Nordt, A.S. Manoguerra // Undersea Hyperb Med. - 1999. - Vol. 26(3). - P.175-184.

115. Clifton, K.F. Top-down proteomic identification of furin-cleaved a-subunit of Shiga toxin 2 from Escherichia coli O157:H7 using MALDI-TOF-TOF-MS/MS [Электронный ресурс] / K.F. Clifton, O. Sultan // Journal of Biomedicine and Biotechnology. - 2010. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3038467/pdf/JBB2010-123460.pdf

116. Clifton, K.F. Bacteriophage cell lysis of Shiga toxin-producing Escherichia coli for top-down proteomic identification of Shiga toxins 1 & 2 using matrix-assisted laser desorption/ionization tandem time-of-flight mass spectrometry [Электронный ресурс] / Clifton K.F., Zaragoz J.W. // Rapid Commun. Mass Spectrom. - 2016. - Vol.30. - Р. 671-80. Режим доступа: https://analyticalsciencejournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/rcm.7507

117. Coutinho, F.H. Genomic basis of antibiotic resistance in Vibrio parahaemolyticus strain JPA1 [Электронный ресурс] / Coutinho F.H., Tschoeke D.A., Clementino M.M., Thompson C.C., Thompson F.L. // Mem. Inst. Oswaldo Cruz. - 2019. - Vol. 114. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6484505/pdf/1678-8060-mioc-114-e190053.pdf

118. Crawford, J.A. / Membrane localization of the ToxR winged-helix domain is required for TcpP-mediated virulence gene activation in Vibrio cholerae / J.A. Crawford, E.S. Krukonis, V.J. DiRita // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol.47(5). - P. 1459-73.

119. Croci, L. Comparison of different biochemical and molecular methods for the identification of Vibrio parahaemolyticus [Электронный ресурс] / L. Croci, E. Suffredini, L. Cozzi, L. Toti, D. Ottaviani, C. Pruzzo, P. Serratore, R. Fischetti, E. Goffredo, G. Loffredo, R. Mioni // J. Appl. Microbiol. - 2007. - Vol. 102. - Р. 229-237. Режим доступа: https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/j.1365-2672.2006.03046.x

120. Daniels, N.A. Emergence of a new Vibrio parahaemolyticus serotype in raw oysters: A prevention quandary / N.A. Daniels, B. Ray, A. Easton, N. Marano // J. Am. Med. Assoc. - 2000. -Vol. 284(12). - P.1541-1545.

121. Deepanjali, A. Seasonal variation in abundance of total and pathogenic Vibrio parahaemolyticus bacteria in oysters along the southwest coast of India / A. Deepanjali, H.S. Kumar, I. Karunasagar, I. Karunasagar // Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - Vol.71(7). - P.3575-3580.

122. Di Pinto, A. A collagenase-targeted multiplex PCR assay for identification of Vibrio alginolyticus, Vibrio cholerae, and Vibrio parahaemolyticus / A. Di Pinto, G. Ciccarese, G. Tantillo, D. Catalano // J. of Food Protection. - 2005. - Vol.68(1). - P.150-153.

123. Donlan M R. Biofilms: Microbial Life on Surface // Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8, №9. - Р. 881-890.

124. Edwards, A.D. Protection of live bacteria from bile acid toxicity using bile acid adsorbing resins / A.D. Edwards, N.K. Slater // Vaccine. - 2009. - Vol. 27(29). - Р. 3897-3903.

125. Elmahdi, S. Antibiotic resistance of Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus in various countries: A review / S. Elmahdi, L.V. DaSilva, S. Parveen. // Food Microbiol. - 2016. -Vol.57. - P. 128-34.

126. Enos-Berlage, J.L. Genetic determinants of biofilm development of opaque and translucent Vibrio parahaemolyticus [Электронный ресурс] / J.L. Enos-Berlage, Z.T. Guvener, C.E. Keenan, L.L. McCarter // Molecular Microbiology. - 2005. - Vol.55(4). - Р. 1160-1182. Режим доступа: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/j.1365-2958.2004.04453.x

127. Escalante-Maldonado, O. Improvement of the quantitation method for the tdh+ Vibrio parahaemolyticus in molluscan shellfish based on most-probable-number, immunomagnetic separation, and loop-mediated isothermal amplification [Электронный ресурс] / O. Escalante-Maldonado, A.Y. Kayali, W. Yamazaki, V. Vuddhakul, Y. Nakaguchi, M .Nishibuchi // Front Microbiol. - 2015. - Vol.6: 270. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4391040/pdf/fmicb-06-00270.pdf

128. Espejo, R.T. Insight Into the Origin and Evolution of the Vibrio parahaemolyticus Pandemic Strain [Электронный ресурс] / R.T. Espejo, K. Garcia, N. Plaza // Front Microbiol. - 2017. - Vol. 8:1397. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5523582/pdf/fmicb-08-01397.pdf

129. Esteves, K. Rapid proliferation of Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus, and Vibrio cholerae during freshwater flash floods in French Mediterranean coastal lagoons / K. Esteves, D. Hervio-Heath, T. Mosser, C. Rodier, M.G. Tournoud, E. Jumas-Bilak, R.R. Colwell, P. Monfort // Appl Environ Microbiol. - 2015. - Vol.81(21). - Р. 7600-7609.

130. Fabbri, A. Vibrio parahaemolyticus Thermostable Direct Hemolysin Modulates Cytoskeletal Organization and Calcium Homeostasis in Intestinal Cultured Cells / A. Fabbri, L. Falzano, C. Frank, G. Donelli // Infection and Immunity. - 1999. - Vol.67(3). - Р. 1139-1148.

131. Fagerquist, K.C. Bacteriophage cell lysis of Shiga toxin-producing Escherichia coli for top-down proteomic identification of Shiga toxins 1 & 2 using matrix-assisted laser desorption/ionization tandem time-of-flight mass spectrometry [Электронный ресурс] / K.C. Fagerquist, J.W. Zaragoz // Rapid Commun. Mass Spectrom. - 2016. - Vol.30. - Р. 671-80. Режим доступа: https://analyticalsciencejournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/rcm.7507

132. Ferreira, L. Direct identification of urinary tract pathogens from urine samples by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry / L. Ferreira, S.-J. Fernando, M. González-Ávila, D. Cembrero-Fuciños, A. Herrero-Hernández, J.M. González-Buitrago, J.L. Muñoz-Bellido // J. Clin. Microbiol. - 2010. - Vol. 48 (6). - P. 2110-2115.

133. Fichi, G. Bacterial and viral pathogens detected in sea turtles standed along the coast of Tuscany, Italy / G. Fichi, G. Gardeti, A. Cersini, C. Mancusi, M. Guarducci, G. Di Guardo, G. Terracciano // Vet. Microbiol. - 2016. - Vol.185. - Р. 56-61.

134. Finlay, B. Common themes in microbial pathogenicity / B. Finlay, S. Falkow // Microbiol. Rev. - 1997. - Vol.2. - Р. 210-230.

135. Fishman, J.B. Ammonium Sulfate Fractionation of Antibodies [Электронный ресурс] / J.B. Fishman, E.A. Berg // Cold Spring Harb Protoc. - 2018. - Режим доступа:http://cshprotocols.cshlp.org/content/2018/6/pdb.prot099119.long

136. Freitas, C. The release of a distinct cell type from swarm colonies facilitates dissemination of Vibrio parahaemolyticus in the environment / C. Freitas, T. Glatter, S. Ringgaard // ISME J. - 2020. - Vol. 14(1). - Р. 230-244.

137. Fujino, T. On the bacteriological examination of shirasu food poisoning / T. Fujino, Y. Okuno, D. Nakada, A. Aoyoma, K. Fukai, T. Mukai, T. Ueho // Med. J. Osaka Univ. - 1953. - Vol.4. - Р. 299-304.

138. Gagnaire, J. Detection of Staphylococcus aureus Delta-Toxin Production by Whole-Cell MALDI-TOF Mass Spectrometry [Электронный ресурс] / J. Gagnaire, O. Dauwalder, S. Boisset, D. Khau, A.-M. Freydiere, F. Ader, M. Bes, G. Lina, A. Tristan, M.-E. Reverdy, A. Marchand, T. Geissmann, Y. Benito, G. Durand, J.-P. Charrier, J. Etienne, M. Welker, A. Van Belkum, F. Vandenesch // PLoS ONE. - 2012. - Vol.7(7):c40660 Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3391297/pdf/pone.0040660.pdf

139. Gonzalez-Escalona, N. Characterization of a Vibrio alginolyticus strain, isolated from Alaskan oysters, carrying a hemolysin gene similar to the thermostable direc themolysin-related hemolysin gene (trh) of Vibrio parahaemolyticus / N. Gonzalez-Escalona, G.M. Blackstone, A. DePaola // Appl. Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72. - Р. 7925-7929.

140. Gotoh, K. Bile acid-induced virulence gene expression of Vibrio parahaemolyticus reveals a novel therapeutic potential for bile acid sequestrants / K. Gotoh, T. Kodama, H. Hiyoshi, K.

150

Izutsu, K.S. Park, R. Dryselius, Y. Akeda, T. Honda, T. Iida // PLoS ONE. - 2010. - Vol. 5, Issue 10:e13365. Режим доступа:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2954181/pdf/pone.0013365.pdf

141. Grodzki, A.C. Antibody purification: ammonium sulfate fractionation or gel filtration / A C. Grodzki, E. Berenstein // Methods Mol. Biol. - 2010. - Vol. 588. - Р. 15-26.

142. Guan, H. Evaluation of PCR Based Assays for the Improvement of Proportion Estimation of Bacterial and Viral Pathogens in Diarrheal Surveillance [Электронный ресурс] / H. Guan, J. Zhang, Y. Xiao, D. Sha, X. Ling, B. Kan // Front Microbiol. - 2016. - Vol. 7: 386. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4811922/pdf/fmicb-07-00386.pdf

143. Guin, S. Pathogenic Vibrio parahaemolyticus indiarrhoeal patients, fish and aquatic environments and their potential for inter-source transmission [Электронный ресурс] / S. Guin, M. Saravanan, Anjay, G. Chowdhury, G.P. Pazhani, T. Ramamurthy, S. Chandra Das // Heliyon. - 2019. - Vol. 5(5):e01743. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6526242/pdf/main.pdf

144. Guillod, C. Vibrio parahaemolyticus Induced Cellulitis and Septic Shock after a Sea Beach Holiday in a Patient with Leg Ulcer [Электронный ресурс] / C. Guillod, F. Ghitti, C. Mainetti // Case Rep. Dermatol. - 2019. - Vol.11(1) - Р. 94-100. doi: 10.1159/000499478.

145. Guo, M. Regulation of Thermostable Direct Hemolysin and Biofilm Formation of Vibrio parahaemolyticus by Quorum-Sensing Genes luxM and luxS / M. Guo, Z. Fang, L. Sun, D. Sun, Y. Wang, C. Li, R. Wang, Y. Liu, H. Hu, Y. Liu, D. Xu, R. Gooneratne // Curr Microbiol. - 2018. -Vol. 75(9). - Р. 1190-1197.

146. Haendigenes, J. A nonautochthonous US strain of Vibrio parahaemolyticus isolated from Chesapeake Bay oysters caused the outbreak in Maryland in 2010 / J. Haendigenes, J. Jones, R.A. Myers, C.S. Mitchell, E. Butler, M. Toro, N. Gonzalez-Escalona // Appl. Environ. Microbiol. 2016. - Vol.82, №11. - Р. 3208-3216.

147. Haley, B.J. Molecular diversity and predictability of Vibrio parahaemolyticus along the Georgian coastal zone of the Black Sea [Электронный ресурс] / B.J. Haley, T. Kokashvili, A. Tskshvediani, N. Janelidze, N. Mitaishvili, C.J. Grim, G.C. de Magny, A.J. Chen, E. Taviani, T. Eliashvili, M. Tediashvili, C.A. Whitehouse, R.R. Colwell, A. Huq // Front Microbiol. - 2014; 5:45. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3918589/pdf/fmicb-05-00045.pdf

148. Hamada, D. Tetrameric structure of thermostable direct hemolysin from Vibrio parahaemolyticus revealed by ultracentrifugation, small-angle X-ray scattering and electron microscopy / D. Hamada, T. Higurashi, K. Mayanagi, T. Miyata, T. Fukui, T. Iida, T. Honda, I. Yanagihara // J. Mol. Biol. - 2007. - Vol. 365(1). - Р. 187-195.

149. Han, D. Challenges in Vibrio parahaemolyticus infections caused by the pandemic clone / D. Han, F. Yu, X. Chen, R. Zhang, J. Li // Future Microbiol. - 2019. - Vol.14. - P. 437-450.

150. Hara-Kudo Y. Decontamination of Vibrio parahaemolyticus in fish by washing with hygienic seawater and impacts of the high level contamination in the gills and viscera / Y. Hara-Kudo, S. Kumagai, H. Konuma, N. Miwa, T. Masuda, K. Ozawa, T. Nishina // J. Vet. Med. - 2013. - Vol. 75 (5). - P. 589-96.

151. Hellberg, R.S. Risk-benefit analysis of seafood consumption: a review / R.S. Hellberg, CAM. Dewitt, M.T. Morrissey // Compr. Rev.Food Sci. Food Safety. - 2012. - Vol. 11(5). - P. 490517.

152. Hillenkamp, F. Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry of biopolymers / F. Hillenkamp, M. Karas //Anal. Chem. - 1991. - Vol.24. - P. 1193A-1202A.

153. Hiroshi H. Characterization of Vibrio cholerae Neuraminidase by a Novel Mechanism-Based Fluorescent labeling Reagent / H. Hiroshi, M. Kurogochi, H. Shimizu, S.-I. Nishimura // Biochemistry. - 2005. - Vol. 35. - P. 11669-11675.

154. Hjem0, K. Interpretation of Tandem Mass Spectrometry (MSMS) Spectra for Peptide Analysis / Hjern0 K., P. H0jrup // Methods in molecular biology. - 2015. - Vol. 1348. - P. 83-102.

155. Hoashi, K. Pathogenesis of Vibrio parahaemolyticus: intraperitoneal and orogastric challenge experiments in mice / K. Hoashi, K. Ogata, H. Taniguchi, H. Yamashita, K. Tsuji, Y. Mizuguchi, N. Ohtomo // Microbiol. Immunol. - 1990. - Vol.34. - P. 355-366.

156. Honda, T. Purification and Characterization of a Hemolysin Produced by a Clinical Isolate of Kanagawa Phenomenon - Negative Vibrio parahaemolyticus and Related to the Thermostable Direct Hemolysin / T. Honda, Y. Ni, T. Miwatani // Infect. Immun. - 1988. - Vol. 56, № 4. - P. 961 - 965.

157. Honda T. Purification of a TDH-related hemolysin produced by a Kanagawa phenomenon-negative clinical isolate of Vibrio parahaemolyticus 06:K46 / T. Honda, Y. Ni, T. Miwatani //FEMS Microbiology Letters. - 1989. - Vol. 57, Issue 2. - P. 241-245.

158. Honda, T. The thermostable direct hemolysin of Vibrio parahaemolyticus is a pore-forming toxin / T. Honda, Y. Ni, T. Miwatani, T. Adachi, J. Kim // Can. J. Microbiol. - 1992. -Vol.38 (11). - P. 1175-1180.

159. Hou, C.C. Clinical manifestation and prognostic factors of non-cholerae Vibrio infections / C.C. Hou, C. Lai, W.L. Liu, C M. Chao, Y.H. Chiu, P R. Hsueh // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2011. - Vol.30(6). - P. 819-824.

160. Hubbard, T.P. Genetic analysis of Vibrio parahaemolyticus intestinal colonization / T.P. Hubbard, M.C. Chao, S. Abel, C.J Blondel, P. Abel Zur Wiesch, X. Zhou, B.M. Davis, M.K. Waldor // Proc Natl Acad Sci USA. - 2016. -Vol. 113(22). - P. 6283-6288.

152

161. Huehn, S. Pathogenic vibrios in environmental, seafood and clinical sources in Germany / S. Huehn, C. Eichhorn, S. Urmersbach, J. Breidendenbach, N. Bier, T. Alter, E. Bartelt, C. Frank, B. Oberheitmann, F. Gunzer, N. Brennholt, S. Boer, B. Appel, R. Dieckmann, E. Strauch // Int. J. Med. Microbiol. - 2014. - Vol. 304(7). - P. 843-850.

162. Hung, D.T. Bile acids induce cholera toxin expression in Vibrio cholerae in a ToxT-independent manner / D.T. Hung, J.J. Mekalanos // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. - 2005. - Vol. 102(8). - P. 3028-3033.

163. Hurley, C.C. Four genomic islands that mark post-1995 pandemic Vibrio parahaemolyticus isolates / C.C. Hurley, А.М. Quirke, F.J. Reen, E.F. Boyd // BMC Genomics. -2006. - Vol. 7. - P. 104-125.

164. Iadarola, P. Special Issue: Mass Spectrometric Proteomics [Электронный ресурс] / P. Iadarola // Molecules. - 2019. - Vol.24(6):1133. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6472213/pdf/molecules-24-01133.pdf

165. Jahan, S. Epidemiology of foodborne illness in Scientific, Health and Social Aspects of the Food Industry [Электронный ресурс], ed. B. Valdez (London: Intech Open). - 2012. Режим доступа: https://cdn.intechopen.com/pdfs/27392.pdf

166. Janda, J.M. Current perspectives on the epidemiology and pathogenesis of clinically significant Vibrio spp. / J.M. Janda, C. Powers, R.G. Bryant, S.L. Abbott // Clin. Microbiol. Rev. -1988. - Vol. - Р. 245-267.

167. Janik E. Biological Toxins as the Potential Tools for Bioterrorism [Электронный ресурс] / E. Janik, M. Ceremuga, J. Saluk-Bijak, M. Bijak // Int. J. Mol. Sci. - 2019. - Vol. 20(5):1181. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6429496/pdf/ijms-20-01181.pdf

168. Jiang, Y. Antimicrobial resistance, virulence and genetic relationship of Vibrio parahaemolyticus in seafood from coasts of Bohai Sea and Yellow Sea, China [Электронный ресурс] / Y. Jiang, Y. Chu, G. Xie, F. Li, L. Wang, J. Huang, Y. Zhai, L. Yao // Int. J. Food Microbiol. - 2019. - Vol.290. - P. 116-124. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6429496/pdf/ijms-20-01181.pdf

169. Jiao L.F. Vibrio parahaemolyticus infection impaired intestinal barrier function and nutrient absorption in Litopenaeus vannamei / L.F. Jiao, T.M. Dai, S.Q. Zhong, M. Jin, P. Sun, Q.C. Zhou // Fish Shellfish Immunol. - 2020. - Vol.99. - Р. 184-189.

170. Jones, E.N. Vibrio infection and surveillance in Maryland, 2002-2008 / E.N. Jones, K.A. Feldman, A. Palmer, E. Butler, D. Blythe, C.S. Mitchell // Public Health Rep. - 2013 - Vol.128 (6). - Р. 537-545.

171. Jones, J.L. Biochemical, serological, and virulence characterization of clinical and oysterr Vibrio parahaemolyticus isolates / J. L. Jones, C.H.M. Ludeke, J.C. Bowers, N. Garrett, M. Fischer, MB. Parsons, C.A. Bopp, A. DePaola // J. Clin. Microbiol. - 2012. - Vol. 50. - P. 23432352.

172. Joseph, S.W. Vibrio parahaemolyticus and related halophilic Vibrios / S.W. Joseph, R.R. Colwell, J.B. Kaper // Crit. Rev. Microbiol. - 1982. - Vol. 10, №1. - P. 77-124.

173. Kalb, S.R. Mass spectrometric Detection of Bacterial Protein Toxins and Their Enzymatic Activity / S.R. Kalb, A.E. Boyer, J R. Barr// Toxins. - 2015. - Vol.7. - Р. 3497 - 3511.

174. Kann, S. MALDI-TOF mass spectrometry for sub-typing of Streptococcus pneumonia [Электронный ресурс] / S. Kann, S. Sao, C. Phoeung, Y. By, J. Bryant, F. Komurian-Pradel, V.Saphonn, M. Chou, P. Turner // BMC Microbiol. - 2020. - 20: 367. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7709296/pdf/12866_2020_Article_2052.pdf

175. Karas, M. Matrix-assisted ultraviolet-laser desorption of nonvolatile compounds / M. Karas, D. Bachmann, D. Bahr, F. Hillenkamp // Int. J. Mass Spectrom. Ion Proc. - 1987. - 78. - Р. 5368.

176. Karas, M. Ionization in matrix-assisted laser desorption/ionization: singly charged molecular ions are the lucky survivors / M. Karas, M. Gliickmann, J. Schefer // J. Mass Spectrom. -2000. - Vol. 35, Issue 1. - Р. 1-12.

177. Kato, T. Grouping of V. parahaemolyticus with a hemolysis reaction [in Japanese] / T. Kato, Y. Obara, H. Ichinoe, K. Nagashima, S. Akiyama, K. Takizawa, A. Matsushima, S. Yamai, Y. Miyamoto // Shokuhin Eisei Kenkyu. - 1965. - Vol. 15. - Р. 83-86.

178. Kim, H.J. Multiplex PCR for detection of the Vibrio genus and five pathogenic Vibrio species with primer sets designed using comparative genomic [Электронный ресурс] / H.J. Kim, J.O. Ryu, S.Y. Lee, H.Y. Kim // BMC Microbiol. - 2015. - Vol.15(1). - Р. 239. Режим доступа:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4624192/pdf/12866_2015_Article_577.pdf

179. Kim, S.-K. Cloning and sequence analysis of a novel metalloprotease gene from Vibrio parahaemolyticus 04 / S.-K. Kim, J.-Y. Yang, J. Cha. // Gene. - 2002. - Vol. 283, Issues 1-2. - P. 277-286.

180. Kim, Y.B. Identification of Vibrio parahaemolyticus strains at the species level by PCR targeted to the toxR gene / Y.B. Kim, J. Okuda, C. Matsumoto, N. Takahashi, S. Hashimoto, M. Nishibuchi // J. Clin. Microbiol. - 1999. - Vol.37(4). - Р. 1173-1177.

181. Klein, S.L. Genes similar to the Vibrio parahaemolyticus virulence-related genes tdh, tlh and vscC2 occurin other Vibrionaceae species isolated from apristine estuary [Электронный ресурс] / Klein S.L., C.K. Gutierrez West, D.M. Mejia, C.R. Lovell // Appl. Environ. Microbiol. -

2014. - Vol.80, №2. - Р. 595-602. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3911104/pdf/zam595.pdf

182. Krukonis, E.S. From motility to virulence: sensing and responding to environmental signals in Vibrio cholerae / E.S. Krukonis, V.J. DiRita // Curr. Opin. Microbiol. - 2003. - Vol. 6 (2). -Р.186-190.

183. Kuhns, M. Rapid discrimination of Salmonella enterica serovar Typhi from other serovars by MALDI-TOF mass spectrometry [Электронный ресурс] / M. Kuhns, A.E. Zautner, W. Rabsch, O. Zimmermann, M. Weig, O. Bader, U. Groß // PLoS One. - 2012. - Vol.7(6): e40004. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3386914/

184. Kull, S. Multiplex Detection of Microbial and Plant Toxins by Immunoaffinity Enrichment and Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry / S. Kull, D. Pauly, B. Stormann, S. Kirchner, M. Stommler, B.D. Dorner, P. Lasch, D. Naumann, B.G. Dorner // Anal. Chem. - 2010. - Vol. 82(7). - P. 2910-2924.

185. Kumar, D. S. Cell-free production of pore forming toxins: Functional analysis of thermostable direct hemolysin from Vibrio parahaemolyticus / D.S. Kumar, D.A. Wüstenhagen, E. Strauch, S. Kubick // Eng Life Sci. - 2018. - Vol.18(2). - P.140-148.

186. Laemmli, U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 / U.K. Laemmli // Nature. - 1970. - Vol. 227(5259). - P. 680-685.

187. Lee, K.K. Vibrio parahaemolyticus infectious for both humans and edible mollusk abalone / K.K. Lee, P.C. Liu, C.Y. Huang // Microbes Infect. - 2003. - Vol. 5. - P. 481-485.

188. Letchumanan, V. Bile sensing: the activation of Vibrio parahaemolyticus virulence [Электронный ресурс] / V. Letchumanan, K.G. Chan, T.M. Khan, S.I. Bukhari, N.S. Ab Mutalib, B.H. Goh, L.-H. Lee // Front. Microbiol. - 2017. - Vol. 8:728. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5399080/pdf/fmicb-08-00728.pdf

189. Li, L. Molecular mechanisms of Vibrio parahaemolyticus pathogenesis / Li L., Meng H., Gu D., Li Y., Jia M. // Microbiol Res. - 2019. - Vol.222. - Р. 43-51.

190. Li, P. MALDI-TOF mass spectrometry-based serotyping of V. parahaemolyticus isolated from the Zhejiang province of China [Электронный ресурс] / P. Li, W. Xin, S. Xia, Y. Luo, Z. Chen, D. Jin, S. Gao, H. Yang, B. Ji, H. Wang, Y. Yan, L. Kang, J. Wang // BMC Microbiology. -2018. - Vol. 18:185. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6234682/pdf/12866_2018_Article_1328.pdf

191. Li, R. A Novel PCR-Based Approach for Accurate Identification of Vibrio parahaemolyticus [Электронный ресурс] / R. Li, J. Chiou, E.W.-C. Chan, S. Chen // Front Microbiol. - 2016. - Vol. 7: 44. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4729947/pdf/fmicb-07-00044.pdf

155

192. Li, W. Analysis of molecular features of clinical Vibrio parahaemolyticus strains in China / W. Li, L. Mei, Z. Tang, X. Yang, X.M. Li, G. Wang, P. Fu, Y. Wu, Y. Guo // Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi. - 2014. - Vol. 48(1). - Р. 44-52.

193. Li, Y. Vibrio parahaemolyticus, Southern coastal region of China, 2007-2012 [Электронный ресурс] / Y. Li, X. Xie, X. Shi, Y. Lin, Y. Qiu, J. Mou, Q. Chen, Y. Lu, L. Zhou, M. Jiang, H. Ma, J. Cheng, Q. Hu // Emerg. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 20(4). - Р. 685-688. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3966377/pdf/13-0744.pdf

194. Lin, C. Susceptibility of Vibrio parahaemolyticus to various environmental stresses after cold shock treatment / C. Lin, R.C. Yu, C.C. Chou // Int. J. Food Microbiol. - 2004. - Vol. 92(2). - P. 207-215.

195. Lin, Z. / Vibrio parahaemolyticus has a homolog of the Vibrio cholerae toxRS operon that mediates environmentally induced regulation of the thermostable direct hemolysin gene / Z. Lin, K. Kumagai, K. Baba, J.J. Mekalanos, M. Nishibuchi // J. Bacteriol. - 1993. -Vol. 175(12). - P. 384455.

196. Luan, X.-Y. Comparison of different primers for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus using the polymerase chain reaction / X.-Y. Luan, J.-X. Chen, X.-H. Zhang, J.-T. Jia, F.-R. Sun, Y.Li // Lett. Appl. Microbiol. - 2007. - Vol. 44 (3). - P. 242-247.

197. MacFaddin, J. Biochemical Tests for Identification of Medical Bacteria / J. MacFaddin // 2nd ed. - Williams and Wilkins, Baltimore, 1980. - 527 р.

198. Machado, H. The fur gene as a new phylogenetic marker for Vibrionaceae species identification / H. Machado, L. Gram // Appl. Environ. Microbiol. - 2015. - Vol. 81. - Р.2745-2752.

199. Mahoney, J.C. Comparison of the pathogenic potentials of environmental and clinical Vibrio parahaemolyticus strains indicates a role for temperature regulationin virulence / J.C. Mahoney, M.J. Gerding, S.H. Jones, C.A. Whistler // Appl. Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76. - Р. 74597465.

200. Makino, K. / Genome sequence of Vibrio parahaemolyticus: a pathogenic mechanism distinct from that of V. cholerae / K. Makino, K. Oshima, K. Kurokawa, K. Yokoyama, T. Uda, K. Tagomori, Y. Iijima, M. Najima, M. Nakano, A. Yamashita, Y. Kubota, S. Kimura, T.Yasunaga, T. Honda, H. Shinagawa, M. Hattori, T. Iida // Lancet. - 2003. - 361(9359). - P.743-749

201. Martinez-Urtaza, J. Epidemic Dynamics of Vibrio parahaemolyticus Illness in a Hotspot of Disease Emergence, Galicia, Spain / J. Martinez-Urtaza, J. Trinanes, M. Abanto, A. Lozano-Leon, J. Llovo-Taboada, M. Garcia-Campello, A. Pousa, A. Powell, C. Baker-Austin, N. Gonzalez-Escalona // Emerg. Infect. Dis. - 2018. - Vol.24(5). - Р. 852-859.

202. Martinez-Urtaza, J. Vibrio parahaemolyticus / J. Martinez-Urtaza, C. Baker-Austin // Trends Microbiol. - 2020. - Vol.28(10). - P. 867-868.

203. Matsuda, S. Association of Vibrioparahaemolyticus thermostable direct hemolysin with lipid rafts is essential for cytotoxicity but not hemolytic activity / S. Matsuda, T. Kodama, N. Okada, K. Okayama, T. Honda, T. Iida // Infect. Immun. - 2010. - Vol.78. - P. 603-610.

204. Matsuda, S. Advances on Vibrio parahaemolyticus research in the postgenomic era / S. Matsuda, H. Hiyoshi, S. Tandhavanant, T. Kodama // Microbiol Immunol. - 2020. - Vol.64(3). - P. 167-181.

205. Matysiak, J. Proteomic analysis of Apis Mellifera venom determined by liquid chromatography (LC) coupled with NANO-LC-MALDI-TOF/TOF MS / J. Matysiak, J. Hajduk, A. Swiatly, N. Naskret, Z.J. Kokot // Acta Pol. Pharm. - 2017. - Vol.74(1). - P. 53-65.

206. Meador, C.E. Virulence gene and pandemic group-specific marker profiling of clinical Vibrio parahaemolyticus isolates / C.E. Meador, M.M. Bird, C.A. Bopp, P. Gerner-Smidt, J.A. Painter, G.J. Vora // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol.45, №.4. - P.1133-1139.

207. Mertens, A. Halophilic, lactose-positive Vibrio in a case of fatal septicemia / A. Mertens, J. Nagler, W. Hansen, E. Gepts-Friedenreich. // J. Clin. Microbiol. - 1979. - Vol. 9. - P. 233-235.

208. Miwatani, T. Effect of heat (Arrhenius effect) on crude hemolysin of Vibrio parahaemolyticus / T. Miwatani, Y. Takeda, J. Sakurai, A. Yoshihara, S. Taga // Infect. Immun. -1972. - Vol. 6(6). - P. 1031-1033.

209. Miyamoto, Y. In vitro hemolytic characteristic of Vibrio parahaemolyticus: its close correlation with human pathogenicity / Y. Miyamoto, T. Kato, Y. Obara, S. Akiyama, K. Takizawa, S. Yamai / J. Bacteriol. - 1969. - Vol.100. - P.1147-1149.

210. Miyamoto, Y. Simplified purification and biophysicochemical characteristics of Kanagawa phenomenon-associated hemolysin of Vibrio parahaemolyticus / Y. Miyamoto, Y. Obara, T. Nikkawa, S. Yamai, T. Kato, Y. Yamada, M. Ohashi // Infect Immun. - 1980. - Vol.28(2). -P.567-576.

211. Miyoshi, S. Differential gene expression and extracellular secretion of the collagenolytic enzymes by the pathogen Vibrio parahaemolyticus / S. Miyoshi, Y. Nitanda, K. Fujii, K. Kawahara, T. Li, Y. Maehara, T. Ramamurthy, Y. Takeda, S. Shinoda // FEMS Microbiol Lett. -2008. - Vol. 283(2). - P. 176-181.

212. Mizan, M.F.R. Effects of NaCl, glucose, and their combinations on biofilm formation on black tiger shrimp (Penaeus monodon) surfaces by Vibrio parahaemolyticus / M.F.R. Mizan, M. Ashrafudoulla, M. Sadekuzzaman, I. Kang, S.-D. Ha // Food Control. - 2017. - Vol. 89. - P. 203209.

213. Mlaga, K.D. Using MALDI-TOF MS typing method to decipher outbreak: the case of Staphylococcus saprophyticus causing urinary tract infections (UTIs) in Marseille, France / K.D. Mlaga, G. Dubourg, C. Abat, H. Chaudet, L. Lotte, S.M. Diene, D. Raoult, R. Ruimy, J.M. Rolain // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2017. - Vol.36(12). - P.2371-2377.

214. Morton, D.B. Reactions of hemocytes of immune and non-immune Galleria mellonella larvae to Proteus mirabilis / D.B. Morton, G.B. Dunphy, J.S. Chadwick // Developmental and comparative immunology. - 1987. - Vol. 11. - P. 47-55.

215. Nair, G.B. The Vibrioparahaemolyticus pandemic / Nair G.B., Hormazabal J.C. // Rev. Chilena Infectol. - 2005. - Vol.22(2). - P. 125-130.

216. Nair G.B. Global dissemination of Vibrio parahaemolyticus serotype O3:K6 and its serovariants / G.B. Nair, T. Ramamurthy, S.K. Bhattacharya, B. Dutta, Y. Takeda, D.A. Sack // Clin. Microbiol. Rev. - 2007. - Vol.20, №1. - P. 39-48.

217. Nakaguchi, Y. The urease gene cluster of Vibrio parahaemolyticus does not influence the expression of the Thermostable Direct Hemolysin Gene / Y. Nakaguchi, J. Okuda, T. Iida, M. Nishibuchi et al. // Micribiol. Immunol. - 2003. - Vol. 47, № 3. - P. 233 - 239.

218. Nakaguchi Y. Contamination by Vibrio parahaemolyticus and its virulent strains in seafood marketed in Thailand, Vietnam, Malaysia, and Indonesia / Y. Nakaguchi // Trop. Med. Health.

- 2013. - Vol.41(3). - P. 95-102.

219. Nedelkov, D. Multitoxin biosensor-mass spectrometry analysis: a new approach for rapid, real-time, sensitive analysis of staphylococcal toxins in food / D. Nedelkov, A. Rasooly, R.W. Nelson // Int. J. Food Microbiol. - 2000. - Vol.60, (1). - P. 1-13.

220. Nedelkov, D. Detection of Staphylococcal Enterotoxin B via biomolecular interaction analysis mass spectrometry / D. Nedelkov, R.W. Nelson // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - Vol.69, № 9. - P. 5212-5215.

221. Nidhi, K. Disulphide bond restrains the C-terminal region of thermostable direct hemolysin during folding to promote oligomerization / K. Nidhi, S. Tichkule, S.B. Pandit, K. Chattopadhyay // Biochemical Journal. - 2017. - Vol.474 (2). - P. 317-331.

222. Nishibuchi, M. Defection of the thermostable direct hemolysin gene and related DNA sequences by the DNA colony hybridization test / M. Nishibuchi, M. Ishibashi, Y. Takeda et al. // Infect. Immun. - 1985. - № 49. - P. 481 - 486.

223. Nishibuchi, M. Isolation from a coastal fich of Vibrio hollisae capable of producing a hemolysin similar to the thermostable direct hemilysin of Vibrio parahaemolyticus / M. Nishibuchi, S. Doke, S. Toizumi, T. Umeda, M. Yoh, T. Miwatani // Appl. Environ. Microbiol. -1988. - Vol.54, №8.

- P.2144-2146.

224. Nishibuchi, M. Enterotoxigenicity of Vibrio parahaemolyticus with and without genes encoding thermostable direct hemolysin / M. Nishibuchi, A. Fasano, R.G. Russell, J.B. Kaper // Infect. Immun. - 1992. - Vol.60. - Р. 3539-3545.

225. Nishibuchi, M. Thermostable direct hemolysin gene of Vibrio parahaemolyticus: a virulence gene acquired by a marine bacterium / M. Nishibuchi, J.B. Kaper // Infect. Immun. - 1995, Vol.63. - Р. 2093-2099.

226. Oberbeckmann, S. A polyphasic approach for the differentiation of environmental Vibrio isolates from temperate waters / S. Oberbeckmann, A. Wichels, T. Maier, M. Kostrzewa, S. Raffelberg, G. Gerdts // Fems Microbiol. Ecol. - 2014. - Vol. 75, №1. - P. 145-162.

227. Ohnishi, K. Relationship between heat-induced fibrillogenicity and hemolytic activity of thermostable direct hemolysin and a related hemolysin of Vibrio parahaemolyticus / K. Ohnishi, K. Nakahira, S. Unzai // FEMS Microbiol. Lett. - 2011. - Vol. 318, № 1. - P. 10-17.

228. Okoh A.I. Prevalence and characterization of non-cholera Vibrio spp. in final effluents of wastewater treatment facilities in two districts of the Eastern Cape Province of South Africa: implications for public health / A.I. Okoh, T. Sibanda, V. Nongogo, M. Adefisoye, O.O. Olayemi, N. Nontongana // Environ. Sci. Pollut. Res. Int. - 2015. - Vol. 22(3). - Р. 2008-2017.

229. Osei-Adjei, G. / Regulatory actions of ToxR and CalR on their own genes and type III secretion system 1 in Vibrio parahaemolyticus // G. Osei-Adjei, H. Gao, Y. Zhang, L. Zhang, W. Yang, H. Yang, Z. Yin, X. Huang, Y. Zhang, D. Zhou // Oncotarget. - 2017. - Vol. 8(39). P. 6580965822

230. Osei-Adjei, G. The extracellular proteases produced by Vibrio parahaemolyticus / G. Osei-Adjei, X. Huang, Y. Zhang // World J. Microbiol. Biotechnol. - 2018. - Vol.34(5). - Р. 68.

231. Ouchterlony, O. Gel diffusion techniques / O. Ouchterlony // Immunochemie - Berlin, Heidelberg, New-York. - 1965. - P.13-35.

232. Paauw, A. OmpU as a biomarker for rapid discrimination between toxigenic and epidemic Vibrio cholerae O1/O139 and non- epidemic Vibrio cholerae in a modified MALDI TOF MS assay [Электронный ресурс] / A. Paauw, H. Trip, M. Niemcewicz, R. Sellek, J.M.E. Heng, R.H.Mars-Groenendijk, A.L. de Jong, J.A. Majchrzykiewicz-Koehorst, J.S. Olsen, E. Tsivtsivadze // BMC Microbiol. - 2014. - Vol. 14(1): 158. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4078931/pdf/1471-2180-14-158.pdf

233. Panicker, G. Detection of Pathogenic Vibrio spp. in Shellfish by Using Multiplex PCR and DNA Microarrays [Электронный ресурс] / G. Panicker, D.R. Call, M.J. Krug, A.K. Bej // Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - Vol.70, №12. - Р. 7436-7444. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC535186/pdf/0991-04.pdf

234. Pappas M.G. Recent applications of dot-ELISA in Immunoparasitology // Vet. Parasitl. - 1988. - V. 29, № 1. - P. 105-129.

235. Pappin, D.J. Rapid identification of proteins by peptide-mass fingerprinting / D.J. Pappin, P.N. Hojrup, A.J. Bleasby // Curr. Biol. - 1993. - Vol.6. - Р. 327-332.

236. Park, A.J. A temporal examination of the planktonic and biofilm proteome of whole cell Pseudomonas aeruginosa PA O1 using quantitative mass spectrometry / A.J. Park, K. Murphy, J.R. Krieger, D. Brewer, P. Taylor, M. Habash, C M. Khursigara // Mol. Cell. Proteomics. - 2014. Vol. 13(4). - P. 1095-105.

237. Park, J.Y. Multiplex real-time polymerase chain reaction assays for simultaneous detection of Vibrio cholerac, Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus / J.Y. Park, S. Jeon, J.Y. Kim, M. Park, S. Kim // Osong Public Health Res. Perspect. - 2013. - Vol.4(3). - Р. 133-139.

238. Park, K.S. Functional characterization of two type III secretion systems of Vibrio parahaemolyticus / K.S. Park, T. Ono, M. Rokuda, M.H. Jang, K. Okada, T. Iida, T. Honda // Infect. Immun. - 2004. - Vol. 72(11). - P. 6659-6665.

239. Parthasarathy, S. Occurrence of pathogenic Vibrio parahaemolyticus in crustacean shellfishes in coastal parts of Eastern India [Электронный ресурс] / S. Parthasarathy, S.C. Das, A. Kumar // Vet. World. - 2016. - Vol. 9(3). - Р. 330-336. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4823298/pdf/VetWorld-9-330.pdf

240. Pazhani, G.P. Trends in the epidemiology of pandemic and non-pandemic strains of Vibrio parahaemolyticus isolated from diarrheal patients in Kolkata, India [Электронный ресурс] / G.P. Pazhani, S.K. Bhowmik, S. Ghosh, S. Guin, S. Dutta, K. Rajendran, D R. Saha, R.K. Nandy, M.K. Bhattacharya, A.K. Mukhopadhyay, T. Ramamurthy // PLoS Negl. Trop. Dis. - 2014. -Vol.8:2815. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4006737/pdf/pntd.0002815.pdf

241. Pupo, E. Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight-mass spectromtetry of lipopolysaccharide species separated by slabpolyacrilamide gel electrophoresis: high-resolution separation and molecular weight determination of lipooligosaccharides from Vibrio fisheri strain HMK / E. Pupo, N.J. Phillips, B.W. Gibson, M. A Apicella, E. Hardy // Electrophoresis. - 2004. -Vol.25(14). - Р. 2156-2164.

242. Raghunath, P. Clinical isolates of Aeromonas veronii biovar veronii harbor a nonfunctional gene similar to the thermostable direct hemolysin-related hemolysin (trh) gene of Vibrio parahaemolyticus / P. Raghunath, B. Maiti, M. Shekar, M. Shekar, I. Karunasagar, I. Karunasagar // FEMS Microbiol. Lett. - 2010. - Vol.307, No.2. - P.151-157.

243. Raimondi, F. Enterotoxicity and cytotoxicity of Vibrio parahaemolyticus thermostable direct hemolysin in in vitro systems / F. Raimondi, J. P. Y. Kao, C. Fiorentini et al. // Infect. Immun. -2000. - Vol. 68. - P. 3180 - 3185.

244. Rajkovic, A. Detection of toxins involved in foodborne diseases caused by Grampositive bacteria / A. Rajkovic, J. Jovanovic, S. Monteiro, M. Decleer, M. Andjelkovic, A. Foubert, N. Beloglazova, V. Tsilla, B. Sas, A. Madder, S. De Saeger, M. Uyttendaele // Compr. Rev. Food Sci. Food Saf. - 2020. - Vol.19(4). - Р. 605-1657.

245. Reham, A.A. Specific Detection of Pathogenic Vibrio species in shellfish by using multiplex polymerase chain reaction [Электронный ресурс] / A.A. Reham, M.S. Amani // J. Global Veterinaria. - 2012. - Vol. 8, №5. - P. 525-531. Режим доступа: https://www.idosi.org/gv/GV8(5)12/17.pdf

246. Revilla-Castellanos, V.J. Pathogenic Vibrio parahaemolyticus isolated from biofouling on commercial vessels and harbor structures / V.J. Revilla-Castellanos, A. Guerrero, B. Gomez-Gil, E. Navarro-Barrón, M.L. Lizárraga-Partida // Biofouling. - 2015. - Vol.31(3). - Р. 275-282.

247. Reyhanath, P.V. Incidence of multidrug resistant Vibrio parahaemolyticus isolated from Ponnani, South India / P.V. Reyhanath, R. Kutty // Iran. J. Microbiol. - 2014. - Vol. 6, №2. P. 60-67.

248. Rezny, B.R. Vibrio parahaemolyticus. In: StatPearls. [Электронный ресурс] / Rezny B.R., Evans D.S Treasure Island (FL): StatPearls Publishing. - 2020. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK459164/

249. Roy-Lachapelle, A. Detection of Cyanotoxins in Algae Dietary Supplements / Roy-Lachapelle A., Solliec M., Bouchard M.F., S. Sauvé [Электронный ресурс] // Toxins (Basel). - 2017. - Vol. 9(3): E76. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5371831/pdf/toxins-09-00076.pdf

250. Ryan, W.J. Marine Vibrios associated with superficial septic lesions [Электронный ресурс] / W.J. Ryan // J. Clin. Pathol. - 1976. - Vol. 29. - Р. 1014-1015. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC476264/pdf/jclinpath00157-0056.pdf

251. Sakazaki, R. Studies of the enteropathogenic, facultatively halophilic bacteria, Vibrio parahaemolyticus. III. Enteropathogenicity / R. Sakazaki, K. Tamura, T. Kato, Y. Obara, S. Yamai, K. Hobo. // Jpn. J. Med. Sci. Biol. - 1968. - Vol.21. - Р. 325-331.

252. Sakurai, J. Purification and characterization of thermostable direct hemolysin of Vibrio parahaemolyticus [Электронный ресурс]/ J. Sakurai, A. Matsuzaki, T. Miwatani. // Infect. Immun. -1973. - Vol.8, №5. - Р.775-780. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC422926/pdf/iai00263-0091.pdf

253. Sakurai, J. Cytotoxic effect of the thermostable direct hemolysin produced by Vibrio parahaemolyticus on FL cells / J. Sakurai, T. Honda, Y. Jinguji, M. Arita, T. Miwatani // Infect Immun. - 1976. - Vol.13(3). - Р. 876-83.

254. Sauer, S. Classification and identification of bacteria by mass spectrometry and computational analysis [Электронный ресурс] / S. Sauer, A. Freiwald, T. Maier, M. Kube, R. Reinhardt, M. Kostrzewa, K. Geider // PLoS ONE. - 2008. - Vol. 3, №7. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2475672/pdf/pone.0002843.pdf

255. Schubert, S. MALDI-TOFMS in the Microbiology Laboratory: Current Trends / S. Schubert, M. Kostrzewa // Curr. Issues Mol. Biol. - 2017. - Vol.23. - Р. 17-20.

256. Senachai, P. Application of tetraplex PCR for detection V. cholerae, V. parahaemolyticus, V. vulnificus and V. mimicus in cockle / P. Senachai, C. Chomvarin, W. Namwat, S. Wongwajana, W. Tangkanakul // Southeast Asian J. Trop. Med. Public Health. - 2013; Vol.44(2). -Р.249-258.

257. Shaw, K.S. Antimicrobial susceptibility of V. vulnificus and V. parahaemolyticus recovered from recreational and commercial areas of Chesapeake Bay and Mareland coastal bays [Электронный ресурс] / K.S. Shaw, R.E. Rosenberg Goldstein, X. He, J.M. Jacobs, B.C. Crump, A.R. Sarkota // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, Issue 2. e89616. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3934932/pdf/pone.0089616.pdf

258. Shevchenko, A. Mass spectrometric sequencing of proteins silver-stained polyacrylamide gels / A. Shevchenko, M. Wilm, O. Vorm, M. Mann // Anal. Chem. - 1996. - Vol. 5. -Р. 850-858.

259. Shin, J.H. Proteomic analysis of Acinetobacter baumannii in biofilm and planktonic growth mode / J.H. Shin, H.W. Lee, S.M. Kim, J. Kim // J. Microbiol. - 2009. - Vol. 47(6). - P. 728735.

260. Shinoda, S. Sixty years from the discovery of Vibrio parahaemolyticus and some recollections / S. Shinoda // Biocontrol Sci. - 2011. - Vol. 16. - Р.129-137.

261. Shirai, H. Molecular epidemiologic evidence for association of thermostable direct hemolysin (TDH) and TDH-related hemolysin of Vibrio parahaemolyticus with gastroenteritis / H. Shirai, H. Ito, T. Hirayama // Infect. Immun. - 1990. - Vol.58, №.11. - P.3568-3573.

262. Song, X., Ma, Y., Fu, J., Zhao, A., Guo, Z., Malakar, P. K., et al. Effect of temperature on pathogenic and non-pathogenic Vibrio parahaemolyticus biofilmformation. Food Control. - 2017. -7. - P. 485-491. doi:10.1016/j.foodcont.2016.08.041

263. Spanggaard, B. The microflora of rainbow trout intestine: a comparison of traditional and molecular identification / B. Spanggaard, I. Huber, J. Nielsen, T. Nielsen // Aquaculture. - 2000. -V. 182. - P. 1-15.

264. Stoebner, J.A. Iron-Regulated Hemolysin Production and Utilization of Heme and Hemoglobin by Vibrio cholerae / J.A. Stoebner, S.M. Payne // Infect. Immun. - 1988. - Vol. 56, №11.

- p. 2891-2895.

265. Su, C. Virulence, resistance, and genetic diversity of Vibrioparahaemolyticus recovered from commonly consumed aquatic products in Shanghai, China / C. Su, L. Chen // Marine Pollution Bull. - 2020. - Vol. 160: 111554.

266. Switzar, L. Protein digestion: an overview of the available techniques and recent developments / L. Switzar, M. Giera, W. Niessen // J. Proteome Res. - 2013. - Vol. 12, №3. - Р.1067-1077.

267. Tamayo, R. Growth in a Biofilm Induces a Hyperinfectious Phenotype in Vibrio cholerae [Электронный ресурс] / R. Tamayo, B. Patimalla, A. Camilli. // Infect. Immun. - 2010. -Vol. 78, №8. - Р. 3560-3569. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2916270/pdf/0048-10.pdf

268. Tebbs, R.S. Design and validation of a novel multiplex real-time PCR assay for Vibrio pathogen detection / R.S. Tebbs, P.M. Brzoska, M.R. Furtado, O.V. Petrauskene // J. Food Prot. -2011. - Vol. 74 (6). - P. 939 - 948.

269. Thevis, M. Mass spectrometric characterization of transferrins and their fragments derived by reduction of disulfide bonds / M. Thevis, R.R. Loo, J.A. Loo // J. Am. Soc. Mass Spectrom.

- 2003. - Vol.6. Р. 635-647.

270. Thomas, D.P. Proteomics for the analysis of the Candida albicans biofilm lifestyle / D P. Thomas, S.P. Bachmann, J.L. Lopez-Ribot // Proteomics. - 2006. - Vol. 6(21). P. 5795-5804.

271. Thompson, F.L. Biodiversity of Vibrios / F.L. Thompson, T. Iida, J. Swings // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2004. - Vol.68, № 3. - Р. 403-31.

272. Tsai, C.J. Galleria mellonella infection models for the study of bacterial diseases and for antimicrobial drug testing / C.J. Tsai, J.M. Loh, T. Proft // Virulence. - 2016. - Vol.7. - Р.214-29.

273. Tsilia, V. Application of MALDI-TOF mass spectrometry for the detection of enterotoxins produced by pathogenic strains of the Bacillus cereus group / V. Tsilia, B. Devreese, I. de Baenst, B. Mesuere, A. Rajkovic, M. Uyttendaele, T. Van de Wiele, M. Heyndrickx // Analytical and Bioanalytical Chemistry. - 2012. - Vol. 404. - P. 1691-1702.

274. Tsuchida, S. Current Status of Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) in Clinical Diagnostic Microbiology [Электронный ресурс] / S. Tsuchida, H. Umemura, T. Nakayama // Molecules. - 2020. - Vol.25(20):4775. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7587594/pdf/molecules-25-04775.pdf

275. Tüzün, G.Z. Multiple Regulators Control Capsular Polysaccharide Production in Vibrio parahaemolyticus / G.Z. Tüzün, L.L. McCarter // Journal of Bacteriology. - 2003. - Vol. 185, №18. -Р. 5431-5441.

276. Van Baar, B.L.M. Characterisation of cholera toxin by liquid chromatography-electrospray mass spectrometry / B.L.M. Van Baar, A.G. Hulst, E.R.J. Wils // Toxicon. - 1999. -Vol.1. - Р. 85-108.

277. Van Baar, B.L.M. Characterization of tetanus toxin, neat and in culture supernatant, by electrospray mass spectrometry / B.L.M. Van Baar, A.G. Hulst, B. Roberts, E.R.J. Wils // Analytical Biochemistry. - 2002. - Vol. 2. Р. 278-289.

278. Velazquez-Roman, J. Pandemic Vibrio parahaemolyticus O3:K6 on American continent [Электронный ресурс] / J. Velazquez-Roman, N. Leon-Sicairos, L. de Jesus Hernandez-Diaz, A. Canizales-Roman // Front Cell. Infect. - Microbiol. - 2014. - Vol.3:110. eCollection 2014. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3878053/pdf/fcimb-03-00110.pdf

279. Vila, J. Future applications of mass spectrometry in microbiology / J. Vila, Y. Zboromyrska, A. Burillo, E. Bouza // Enferm. Infecc. Microbiol. Clin. - 2016. - Vol.2. Р. 53-58.

280. Wagley, S. Galleria mellonella as an infection model to investigate virulence of Vibrio parahaemolyticus / S. Wagley, R. Borne, J. Harrison, C. Baker-Austin, D. Ottaviani, F. Leoni, V. Vuddhakule, R.W. Titball // Virulence. - 2018. - 9. - Р. 197-207.

281. Wang, R. Vibrio parahaemolyticus Infection in Mice Reduces Protective Gut Microbiota, Augmenting Disease Pathways [Электронный ресурс] / R. Wang, Y. Deng, Q. Deng, D. Sun, Z. Fang, L. Sun, Y. Wang, R. Gooneratne // Format: AbstractSend to Front Microbiol. - 2020. -Vol. 11:73. Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7002474/pdf/fmicb-11-00073.pdf

282. Wei, S. Multiplex PCR assay for the detection of V. alginolyticus, V. parahaemolyticus, V. vulnificus and V. cholerae with an internal amplification control / S. Wei, H. Zhao, Y. Xian, M.A. Hussain, X. Wu // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2014. - Vol.79(2). - Р. 115-118.

283. West, P.A. Identification and classification overview. Vibrios in the environment / P.A. West, R.R. Colwell // New York, N.Y: John Wiley, Sons, Inc. - 1984. - P. 285-363.

284. Xu, D. Detection and differentiation of Vibrio parahaemolyticus by multiplexed realtime PCR / D. Xu, L. Ji, X. Wu, W. Yan, L. Chen. // Canadian Journal of Microbiology, 2018. -Vol.64(11). - Р. 809-815.

285. Yan W. Molecular characterization of clinical and environmental Vibrio parahaemolyticus isolates in Huzhou, China [Электронный ресурс] / W. Yan, L. Ji, D. Xu, L. Chen, X. Wu // PLoS One. - 2020. - Vol.15(10): e0240143. doi: 10.1371/journal.pone.0240143. eCollection

2020. Режим доступа:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7531842/pdf/pone.0240143.pdf

286. Yanagihara, I. Structure and Functional Characterization of Vibrio parahaemolyticus Thermostable Direct Hemolysin / I. Yanagihara, K. Nakahira, T. Yamane, S. Kaieda, K. Mayanagi, D. Hamada, T. Fukui, K. Ohnishi, S. Kajiyama, T. Shimizu, M. Sato, T. Ikegami, M. Ikeguchi, T. Honda, H. Hashimoto // J. Biol Chem. - 2010. - 285(21). Р. 16267-16274

287. Yeung, P.S. Epidemiology, pathogenesis, and prevention of foodborne Vibrio parahaemolyticus infections / P.S. Yeung, K.J. Boor // Foodborne Pathog. Dis. - 2004. - Vol.1(2). - Р. 74-88.

288. Yildiz, F.H. Vibrio biofilms: so much the same yet so different / F.H. Yildiz, K.L. Visick. // Trends Microbiol. - 2009. - Vol.17(3). - Р. 109-118.

289. Yoh, M. Evaluation of two assay kits for thermostable direct hemolysin (TDH) as an indicator of TDH-related hemolysin (TRH) produced by Vibrio parahaemolyticus / M. Yoh, N. Kawakami, Y. Funakoshi, K. Okada, T. Honda // Microbiol Immunol. - 1995. - Vol. - 39(2). - 157159.

290. Yoon, J.H. Characteristics of viable-but-nonculturable Vibrio parahaemolyticus induced by nutrient-deficiency at cold temperature / J.H. Yoon, S.Y. Lee // Crit. Rev. Food Sci. Nutr. - 2020. -Vol.60(8). - Р. 1302-1320.

291. Yu, M.S. Metal content and biochemical analyses of a recombinant collagenase PrtV from Vibrio parahaemolyticus / M.S. Yu, M.N. Yap, C.Y. Lee // Microbiol Immunol. - 2000. - Vol. 44(10). - P. 805-13.

292. Zerbino, D.R. Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs / D.R. Zerbino, E. Birney // Genome Research. - 2008. - V. 18, №. 5. -P. 821-829.

293. Zhang, H. Comparison of Different Methods to Identify tdh-Positive Pathogenic Vibrio parahaemolyticus Isolates / H. Zhang, M. Chen // Curr. Microbiol. - 2018. - Vol.75(1):1-5.

294. Zhang, L. Virulence determinants for Vibrio parahaemolyticus infection / L. Zhang, K. Orth // Curr. Opin. Microbiol. - 2013. - Vol. 16, № 1. - P. 70-77.

295. Zhang, Y. QsvR integrates into quorum sensing circuit to control Vibrio parahaemolyticus virulence, / Y. Zhang, L. Hu, Y. Qiu, G. Osei-Adjei, H. Tang, Y. Zhang, R. Zhang, X. Sheng, S. Xu, W. Yang, H. Yang, Z. Yin, R. Yang, X. Huang, D. Zhou // Environ Microbiol. - 2019. - Vol. - 21(3). - P.1054-1067.

296. Zimmerman, G.L. Diagnosis of ovine fascioliasis by a dot enzyme-linked immunosorbent assay: a rapid microdiagnostic technique / G.L. Zimmerman, M.J. Nelson, C.R.B. Clark // Amer. J. Vet. Res. - 1985. - V. 46, № 7. - P. 1513-1515