Совершенствование алгоритмов антимикробной фармакотерапии и специфической профилактики пневмококковой инфекции у пациентов старше 18 лет в Российской Федерации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Куркова Анастасия Алексеевна

• Куркова Анастасия Алексеевна
• кандидат наук
• 2022

Оглавление диссертации кандидат наук Куркова Анастасия Алексеевна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Характеристика S. pneumoniae

1.2 Эпидемиология пневмококковой инфекции

1.3 Антимикробная резистентность S. pneumoniae

1.4 Специфическая вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции

1.4.1 Новые разработанные пневмококковые вакцины

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Микробиологические методы исследования

2.2 Молекулярное определение серотиповой принадлежности S. pneumoniae

2.3 Обработка данных и статистический анализ

ГЛАВА 3. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1 Изоляты S. pneumoniae, включенные в исследование

3.2 Эпидемиология серотипов S. pneumoniae, циркулирующих среди лиц старше 18 лет в Российской Федерации

3.3 Оценка уровня антимикробной резистентности серотипов S. pneumoniae, циркулирующих среди лиц старше 18 лет в Российской Федерации

3.4 Оценка перекрываемости пневмококковыми вакцинами серотипов S. pneumoniae, циркулирующих среди лиц старше 18 лет в Российской Федерации

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Совершенствование алгоритмов антимикробной фармакотерапии и специфической профилактики пневмококковой инфекции у пациентов старше 18 лет в Российской Федерации»

Актуальность темы исследования

Пневмококковая инфекция (ПИ) является одной из наиболее часто возникающих бактериальных инфекций человека и остается глобальной проблемой современного здравоохранения [103].

Показатель заболеваемости ПИ на территории Российской Федерации в 2016 году в среднем составлял 44,2 на 100 000 населения [60]. Однако получить достоверные данные о заболеваемости данной инфекцией в нашей стране, даже на уровне отдельных лечебно-профилактических учреждений, зачастую крайне сложно в силу того, что ПИ часто принимается за другие нозологические формы, например грипп и ОРВИ, которые и отражаются в статистике заболеваемости [34].

Согласно данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) до начала массовой иммунизации ПИ приводила к гибели более 1,6 млн человек ежегодно, при этом более 90% летальных исходов приходилось на развивающиеся страны, в группу которых в настоящее время отнесена и Российская Федерация [71, 108]. Что касается развитых стран, то гибель от ПИ наиболее характерна для пациентов старшего возраста, уровень летальности от пневмококковой пневмонии у которых достигает 60% [50].

Высокая рекомбинационная изменчивость определяет большое разнообразие серотипового состава S. pneumoniae [195]. Так, биохимические и генетические различия в структуре капсулы обуславливают выделение около 97 серотипов пневмококка [136]. При этом лишь 20-25 из них ответственны за развитие 90% всех инвазивных пневмококковых инфекций (ИПИ) [71]. Встречаемость различных серотипов и уровень их антимикробной резистентности (АМР) варьирует в зависимости от региона и у разных категорий пациентов [55].

Главная роль в распространении ПИ принадлежит здоровым детям младше 5 лет, поэтому частота носительства в детских дошкольных учреждениях может достигать 80%. Кроме того, взрослые, проживающие совместно с детьми, имеют более высокий уровень носоглоточного носительства, чем проживающие без детей [4, 8, 152].

Ежегодно в мире регистрируется около 20 млн случаев пневмококковой пневмонии с летальным исходом - 5-10% [33]. При этом в возрасте от 40 до 80 лет значительно возрастает риск возникновения пневмонии с бактериемией, который после 65 лет увеличивается более, чем в 2 раза. Намного выше уровень летальных исходов у пациентов с хроническими заболеваниями (ХОБЛ, ИБС, ХСН, сахарный диабет) [40].

По данным российских исследователей пневмококковые бактериемии в России среди взрослых 18-25 лет выявлялись в среднем в 0,29 случаях на 10 тыс. населения, а среди лиц старше 55 лет - с частотой 0,42 на 10 тыс. [67]. Летальность от пневмококковой бактериемии в РФ составляла до 60% у лиц пожилого возраста, а от пневмококкового менингита колебалась в пределах от 20% до 40% [33].

Рост заболеваемости ПИ связан с увеличением распространенности серотипов с АМР [177]. Чаще всего устойчивые штаммы пневмококка циркулируют среди детей младшего возраста и среди пожилых, особенно в организованных коллективах [2]. Устойчивость к антимикробным препаратам (АМП) затрудняет проведение антимикробной терапии, что, в свою очередь, усложняет лечение пациентов с заболеваниями пневмококковой этиологии, увеличивая продолжительность госпитализации, временной нетрудоспособности и расходы на лечение [12, 62]. Поэтому в настоящее время предпочтение отдается специфической профилактике ПИ с использованием зарегистрированных в России конъюгированных (ПКВ-10, ПКВ-13) и полисахаридной вакцин (ППВ-23) [36, 74]. Из них у взрослого населения применяют только 13-валентную конъюгированную и 23-валентную полисахаридную вакцины [62].

После включения пневмококковых конъюгированных вакцин в Национальный календарь профилактических прививок было отмечено не только снижение частоты развития ПИ у детей и взрослых, но и изменение циркулирующего серотипового состава, а также уменьшение распространенности в популяции АМР [106, 154]. Вакцинация против ПИ представляет особую актуальность для пациентов с хронической патологией [116]. Она позволяет

значительно уменьшить частоту обострений, вероятность летального исхода и экономические затраты на лечение сопутствующего заболевания [29].

Однако наряду с вакцин-опосредованным снижением заболеваемости ПИ, отмечается увеличение случаев инфекции, ассоциированной с невакцинными серотипами S. pneumoniae [178]. Данный феномен подчеркивает необходимость разработки новых вакцин, содержащих в своем составе наиболее типичные на данный момент серотипы пневмококка, что определяет актуальность постоянного мониторинга эпидемиологии серотипов пневмококка и оценку эффективности проводимой специфической профилактики [106, 113].

Степень разработанности темы

В связи с ведущей ролью S. pneumoniae в структуре бактериальных инфекций верхних и нижних дыхательных путей и инвазивных инфекций человека, заболевания пневмококковой этиологии являются актуальной проблемой современности [32]. Поскольку эпидемиология преобладающих серотипов пневмококка, показатели заболеваемости ПИ и графики вакцинации различаются в зависимости от страны и региона, крайне важным является мониторинг распределения серотипов, показателей заболеваемости и охвата вакцинацией населения [106].

Подавляющее большинство эпидемиологических пневмококковых исследований, равно как и оценка эффективности вакцинопрофилактики ПИ, проводятся в детской популяции [2, 58, 61]. Исследования среди пациентов во взрослой популяции лимитированы отдельными нозологиями и ограниченной территорией мониторинга [8, 17, 46]. При этом количество собранных штаммов S. pneumoniae в рамках эпидемиологических надзоров не позволяет достоверно оценить динамику серотипового состава ПИ, что обуславливает необходимость дальнейшего наблюдения [41].

Таким образом, вышеуказанные факторы подчеркивают значимость достоверных данных по эпидемиологии серотипового состава S. pneumoniae у пациентов старше 18 лет на территории Российской Федерации как при

назофаренгеальном носительстве, так и при различных клинических формах ПИ, а также АМР циркулирующих штаммов пневмококка, потенциальной перекрываемости зарегистрированных в России пневмококковых вакцин и ожидаемой перекрываемости разрабатываемых вакцин, что и определяет актуальность проведения данного исследования.

Цель исследования

Оптимизировать алгоритмы антимикробной фармакотерапии и специфической вакцинопрофилактики пневмококковой инфекции у пациентов старше 18 лет на основе многоцентрового микробиологического исследования серотипов S. pneumoniae, циркулирующих у здоровых носителей и пациентов с неинвазивной и инвазивной ПИ на территории Российской Федерации.

Задачи исследования

1. Провести масштабное многоцентровое микробиологическое исследование по определению серотипового разнообразия S. pneumoniae, циркулирующих среди пациентов старше 18 лет на территории Российской Федерации: у здоровых носителей и пациентов с неинвазивной и инвазивной ПИ;

2. Изучить эпидемиологию серотипов S. pneumoniae, циркулирующих среди пациентов старше 18 лет на территории Российской Федерации: у здоровых носителей и пациентов с неинвазивной и инвазивной ПИ;

3. Оценить фармакодинамические характеристики препаратов, используемых для эмпирической и этиотропной фармакотерапии разных форм ПИ у пациентов старше 18 лет на территории Российской Федерации;

4. Проанализировать потенциальную перекрываемость зарегистрированных на территории Российской Федерации пневмококковых вакцин (ПКВ-13, ППВ-23), используемых для специфической профилактики ПИ у пациентов старше 18 лет;

5. Изучить ожидаемую перекрываемость пневмококковых вакцин,

находящихся на стадии клинических исследований (ПКВ-15, ПКВ-20) и

используемых для специфической вакцинопрофилактики ПИ.

Научная новизна

Впервые в Российской Федерации проведено масштабное многоцентровое микробиологическое исследование по определению спектра серотипов S. pneumoniae, циркулирующих у пациентов старше 18 лет: здоровых носителей, пациентов с неинвазивной и инвазивной ПИ, с определением эпидемиологии серотипов пневмококка, фармакодинамических показателей основных антимикробных препаратов, используемых в стандартах эмпирической и этиотропной фармакотерапии ПИ в России, и оценкой потенциальной перекрываемости пневмококковых вакцин, зарегистрированных на территории Российской Федерации, и ожидаемой перекрываемости новых разработанных пневмококковых конъюгированных вакцин. На основании результатов, полученных в ходе данного многоцентрового микробиологического исследования, разработаны практические рекомендации по совершенствованию алгоритмов антимикробной фармакотерапии и специфической профилактики ПИ у пациентов старше 18 лет.

Теоретическая и практическая значимость работы

Определение и последующая оценка эпидемиологии серотипов S. pneumoniae, выделенных у лиц старше 18 лет, и уровня их АМР позволяет оптимизировать назначение АМП, используемых для эмпирической и этиотропной фармакотерапии различных форм ПИ, а также снизить циркуляцию серотипов, резистентных к данным АМП, а значит и существенно уменьшить продолжительность госпитализации пациентов с ПИ и, как следствие, снизить экономические затраты государства на лечение данной нозологии.

Использование потенциальной перекрываемости зарегистрированных пневмококковых вакцин и ожидаемой перекрываемости разработанных вакцин, с

последующим их внедрением в практику, позволит не только уменьшить частоту заболеваемости ПИ, но и косвенно снизить циркуляцию серотипов S. pneumoniae, устойчивых к АМП, используемых для эмпирической и этиотропной фармакотерапии ПИ в рутинной практике.

Методология и методы исследования

В исследование было включено 500 изолятов S. pneumoniae, полученных от здоровых носителей и пациентов с неинвазивной и инвазивной ПИ старше 18 лет в России. Исследование проводилось на базе Научно-исследовательского института антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации в соответствии с принципами доказательной медицины. Решение поставленных задач осуществлялось с использованием эпидемиологического, микробиологического, молекулярного и статистического методов исследования.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Согласно результатам данного исследования, наиболее активными антимикробными препаратами в отношении S. pneumoniae при остром среднем отите/синусите во взрослой популяции в России являются пенициллин, ампициллин, цефтриаксон, цефтаролин, эртапенем, левофлоксацин, моксифлоксацин, хлорамфеникол, ванкомицин, линезолид; при инфекции нижних дыхательных путей - пенициллин, цефтриаксон, цефтаролин, эртапенем, левофлоксацин, моксифлоксацин, хлорамфеникол, линезолид, ванкомицин; при инвазивной инфекции (менингит) -пенициллин, ампициллин, цефтриаксон, цефтаролин, эртапенем, эритромицин1, кларитромицин1, азитромицин1, клиндамицин, левофлоксацин, моксифлоксацин, хлорамфеникол, ванкомицин, линезолид (1 - в настоящее время не используются для фармакотерапии пневмококкового менингита).

2. На основании полученных данных выявлена высокая активность цефтаролина, ванкомицина и линезолида в отношении S. pneumoniae при неинвазивной и инвазивной пневмококковой инфекции в России.

3. Выявлен высокий уровень устойчивости респираторных изолятов S. pneumoniae к азитромицину во взрослой популяции на территории Российской Федерации.

4. Для специфической вакцинопрофилактики пневмококковой инфекции во взрослой популяции на территории Российской Федерации предпочтительно использование 23-валентной полисахаридной вакцины, продемонстрировавшей наибольшие показатели потенциальной перекрываемости.

5. Из вакцин, находящихся на стадии клинических исследований, наибольшую ожидаемую перекрываемость с возможностью дальнейшего внедрения в рутинную практику для специфической вакцинопрофилактики пневмококковой инфекции в Российской Федерации показала 20-валентная пневмококковая конъюгированная вакцина.

Публикации по теме научно-исследовательской работы

Материалы диссертационного исследования изложены в 10 научных работах. Из них 3 - в рецензируемом научном журнале, входящем в перечень рекомендуемых Высшей аттестационной комиссией, и индексируемом в базе данных SCOPUS, 3 - в зарубежной печати.

Степень достоверности и апробация результатов

Результаты научно-исследовательской работы соотносятся с поставленными в работе целями и задачами, что подтверждает их достоверность с позиции доказательной медицины. Полученные результаты диссертации, а также сформулированные выводы и рекомендации наглядно представлены в приведенных в работе таблицах и рисунках. Статистический анализ данных

проводился с использованием современных средств и методов статистической обработки и анализа информации.

Основные положения и материалы диссертационного исследования были представлены на Евразийском конгрессе по антимикробной терапии и клинической микробиологии (Республика Башкортостан, г. Уфа, 2019 г.), симпозиуме в рамках World Health Summit (Берлин, 2019 г.), сертификационном цикле по специальности «Бактериология» (Смоленск, 2019 г.), XI-й Всероссийской научно-практической конференции «Аллергические и иммунологические заболевания - проблема XXI века» (Санкт-Петербург, 2019 г.), совещании Экспертов «Иммунизация на протяжении всей жизни: нерешенные вопросы» (Новосибирск, 2019 г.), научно-практической конференции «Школа респираторной медицины. Кашель» (Казань, 2020 г.; Саратов, 2020 г.; Республика Башкортостан, г. Уфа, 2020 г.; Владивосток, 2020 г.; Челябинск, 2020 г.; Ростов-на-Дону, 2020 г., Самара, 2020 г., Иркутск, 2020 г.,), VIII-й Всероссийской (заочной) научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы науки XXI века» (Смоленск,

2020 г.), 30-м Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным болезням (ECCMID, 2020 г.), цикле вебинаров для специалистов здравоохранения, посвященных тематике профилактики, диагностики и терапии пневмококковых инфекций и общим вопросам вакцинации пациентов из групп риска, в том числе иммунокомпрометированных пациентов (Смоленск, 2020 г.), X-й Юбилейной всеармейской научно-практической конференции по болезням органов дыхания «Актуальные вопросы пульмонологии» (Москва, 2020 г.), 4-й Евро-Азиатском саммите специалистов по пневмококковой инфекции (Санкт-Петербург, 2020 г.), Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы эпидемиологии инфекционных и неинфекционных болезней» (online, 2020 г.), XXX Национальном конгрессе по болезням органов дыхания с международным участием» (Москва, 2020 г.), I международном научно-практическом онлайн-семинаре в рамках международного сотрудничества «Молодежная наука ГРГМУ-СГМУ - 2021» (Гродно-Смоленск,

2021 г.), Региональной научно-практической конференции «Школа респираторной

медицины» (Нижний Новгород, 2021 г.; Санкт-Петербург, 2021 г.; Владивосток, 2021 г.), на сессии в рамках International Young Scientists Conference on Molecular and Cell Biology (Варшава, 2021 г.), IX-й Всероссийской научно-практической конференция с международным участием «Актуальные проблемы науки XXI века» (Смоленск, 2021 г.), II-й научно-практической конференции «Актуальные вопросы антимикробной терапии и вакцинопрофилактики» (Москва, 2021 г.), Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Эпидемиологическая безопасность медицинской деятельности» (Уфа, 2021 г.), XXXI Национальном конгрессе по болезням органов дыхания с международным участием (Москва, 2021 г.), XXIII-м международном конгрессе МАКМАХ по антимикробной терапии и клинической микробиологии (Москва, 2021 г.), XI-ой Всеармейской научно-практической конференции по болезням органов дыхания «Актуальные вопросы пульмонологии» (Москва, 2021 г.), VI Центрально-российской конференции МАКМАХ по антимикробной терапии и клинической микробиологии (Смоленск, 2022 г.).

Внедрение полученных результатов

Ключевые положения научно-исследовательской работы включены в программу лекций и семинарских занятий со студентами, ординаторами, аспирантами на кафедре микробиологии Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, сертификационных циклов по специальности «Бактериология», проводимых на базе Научно-исследовательского института антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России, внедрены в лечебную работу ОГБУЗ «Поликлиника №4» города Смоленска, ОГБУЗ «Смоленская областная клиническая больница», ОГБУЗ «Клиническая больница №1» города Смоленска, ЧУЗ «Клиническая больница «РЖД-Медицина» города Смоленск».

Личный вклад автора

Личный вклад автора состоит в участии в выполнении всех этапов научно-исследовательской работы: анализе данных литературы, разработке дизайна исследования, формировании исследуемых групп пациентов, проведении микробиологического исследования, включая повторную идентификацию, определение чувствительности микроорганизма к исследуемым антимикробным препаратам и определение серотиповой принадлежности пневмококка, а также статистической обработке полученных данных и анализе результатов, представлении материалов исследования.

Объем и структура научно-исследовательской работы

Научно-исследовательская работа изложена на 141 странице машинописного текста. Состоит из введения, разделов: обзор литературы, материалы и методы, обсуждение результатов исследования, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка сокращений и списка литературы, который включает 198 источников - 75 отечественных и 123 зарубежных. Диссертация иллюстрирована 44 рисунками и 14 таблицами.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Характеристика S. pneumoniae

Еще в 1875 г. пневмококк был обнаружен Э. Клебсом и Р. Кохом в ткани легкого и плевральной жидкости пациентов с пневмонией, однако идентифицирован данный микроорганизм был лишь в конце 1880 г. Л. Пастером во Франции и Дж. Стернбергом в Соединенных Штатах во время изучения механизма передачи бешенства на зараженных кроликах. В 1882 г. Карл Фридлендер предположил этиологическую роль пневмококка в развитии долевой пневмонии, а в 1884 г. микроорганизм был выделен А. Френкелем у пациента, умершего от пневмонии [33, 85, 92, 169, 198]. На основании морфологии микроорганизма при окраске по Граму в 1926 г. пневмококк получил название Diplococcus pneumoniae, а в 1974 г. из-за характерного роста в жидкой среде был переименован в Streptococcus pneumoniae [135].

Согласно таксономической классификации в настоящее время S. pneumoniae относят к типу Firmicutes, классу Bacilli, порядку Lactobacillales, семейству Streptococcaceae, роду Streptococcus [112].

Пневмококк является грамположительным микроорганизмом, факультативным анаэробом и оппортунистическим патогеном человека, колонизирующим слизистую верхних дыхательных путей [83, 92, 125, 189]. Типичным для S. pneumoniae является рост короткими цепочками в жидкой среде, однако, встречается рост и единичными клетками и ланцетовидными парами (диплококк) [83, 135, 168]. На кровяном и шоколадном агарах бактерии формируют сероватые выпуклые колонии 1-2 мм в диаметре [115, 128, 169].

Пневмококк продуцирует пневмолизин (^-гемолизин), который, превращая гемоглобин в пигмент зеленого цвета, обеспечивает соответствующее окрашивание вокруг колоний на кровяном агаре - !-гемолиз [135].

Данный микроорганизм растет в диапазоне роста 25-40°C, но лучше всего -при 37°C в присутствии 5-10% CO2 [115, 135]. Для роста на искусственных питательных средах S. pneumoniae необходимо высокое содержание нативного

животного белка и аминного азота, что можно обеспечить добавлением сыворотки крови [43].

Идентификация пневмококка зависит и от других основных фенотипических характеристик: чувствительности к оптохину (селективное подавление роста), каталазо-, оксидазонегативности и ингибирования роста при добавлении желчных кислот [43, 115, 168, 169].

Геном S. pneumoniae представлен одной кольцевой цепочкой ДНК, состоящей из 2-2,2 млн пар оснований и содержащей 2043 кодирующих и 73 некодирующих гена. Среди них выделяют гены и локусы, кодирующие различные факторы вирулентности микроорганизма. При этом для различных штаммов S. pneumoniae характерны разные гены вирулентности [122, 125, 155].

Пневмококк обладает высокой генетической изменчивостью благодаря способности захватывать и включать в свой геном участки ДНК близкородственных видов. Такая пластичность генетического материала обеспечивает селективные преимущества данного микроорганизма, в том числе и антимикробную резистентность [26, 92, 155].

К основным факторам вирулентности пневмококка относят полисахаридную капсулу (CpsA), поверхностные белки, пневмолизин (Ply) и аутолизин (LytA) [59, 65, 83, 87, 125, 155].

Наиболее значимым фактором вирулентности пневмококка является полисахаридная капсула [92, 115]. Она образуется в результате полимеризации олигосахаридов, связанных с бактериальной клеточной стенкой, что контролируется рядом генов. При этом, благодаря высокой изменчивости генома S. pneumoniae, свойства пневмококковой капсулы могут изменяться [115, 195]. Мутации в отдельных локусах или генах синтеза капсулы приводят к появлению штаммов, лишенных данного фактора вирулентности [26, 92, 195]. Тем не менее, бескапсульные пневмококки также могут вызывать инфекции, особенно у иммунокомпрометированных лиц, за счет наличия у таких микроорганизмов иных генов (pspK, aliC, aliD) в локусе биосинтеза полисахаридной капсулы. Считается, что данные гены отвечают за синтез новых белков, компенсирующих функции

отсутствующей пневмококковой капсулы [91, 134]. Играя важную роль в колонизации носоглотки человека, полисахаридная капсула препятствует распознаванию бактерий рецепторами иммуноглобулинов и факторами комплемента хозяина, а также фагоцитозу за счет отрицательного заряда капсулы и электростатического отталкивания [59, 65, 115, 128, 167, 195].

На основании биохимических и генетических различий в строении капсулы выделяют около 97 серотипов S. pneumoniae, которые по антигенному сходству сгруппированы в 48 серогрупп (табл. 1) [108, 120, 136]. Считается, что именно от структуры капсулы зависит развившаяся форма ПИ, а также тяжесть клинических проявлений и летальность при заболевании [24, 59, 65, 136].

Таблица 1 - Номенклатура S. pneumoniae согласно американской и датской

системам [120]

Серогруппа Серотип Серогруппа Серотип

Датская Американская Датская Американская

номенклатура номенклатура номенклатура номенклатура

1 1 1 7 7C 50

2 2 2 8 8 8

3 3 3 9A 33

4 4 4 9 9L 49

5 5 5 9N 9

6A 6 9V 68

6B 26 10F 10

6C 6C 10 10A 34

6 6D 6D 10B НД

6E НД 10C НД

6F 6F 11F 11

6G 6G 11A 43

6H 6H 11 11B 76

7F 51 11C 53

7 7A 7 11D НД

7B 48 11E НД

Продолжение таблицы 1

Серогруппа Серотип Серогруппа Серотип

Датская номенклатура Американская номенклатура Датская номенклатура Американская номенклатура

12 12F 12 24 24F 24

12A 83 24A 65

12B НД 24B 60

13 13 13 25 25F 25

14 14 14 25A 27

15 15F 15 27 27 27

15A 30 28 28F 28

15B 54 28A 79

15C 77 29 29 29

16 16F 16 31 31 31

16A НД 32 32F 32

17 17F 17 32A 67

17A 78 33 33F 70

18 18F 18 33A 40

18A 44 33B 42

18B 55 33C 39

18C 56 33D НД

19 19F 19 33E НД

19A 57 34 34 41

19B 58 35 35F 35

19C 59 35A 47/62

20 20A 20 35B 66

20B НД 35C 61

21 21 21 36 36 36

22 22F 22 37 37 37

22A 63 38 38 71

23 23F 23 39 39 69

23A 46 40 40 45

23B 64 41 41F 38

Продолжение таблицы 1

Серогруппа Серотип Серогруппа Серотип

Датская Американская Датская Американская

номенклатура номенклатура номенклатура номенклатура

41 41A 74 46 46 73

42 42 80 47 47F 52

43 43 75 47A 84

44 44 81 48 48 82

45 45 72

Примечание: НД- нет данных;

Пневмолизин (пневмококковый экзотоксин) (Ply) относится к группе холестерин-зависимых цитолизинов и действует как порообразующий токсин. За счет способности образовывать поры в клеточных мембранах, экзотоксин вызывает лизис клеток бронхиального эпителия и поражает эндотелий легочных артерий. Благодаря провоспалительным свойствам токсин способен регулировать выработку цито- и хемокинов и активировать систему комплемента по классическому пути [65, 87, 92, 115, 169].

У S. pneumoniae выделяют еще три основных литических фермента. Первым был обнаружен холин-связывающий протеин - аутолизин (LytA). Основное действие данного фермента заключается в лизисе бактериальной клеточной стенки и высвобождении пневмолизина, пептидогликана и тейхоевых кислот, повреждающих клеточную стенку клеток хозяина. Продукты клеточного лизиса способны ингибировать продукцию цитокинов, что блокирует активацию фагоцитов и системы комплемента. Кроме аутолизина, к настоящему времени известны еще два литических фермента - LytB и LytC. Их функции до конца не ясны, однако считается, что они способствуют адгезии микроорганизма к эпителиальным клеткам носоглотки хозяина тем самым способствуя формированию бессимптомного бактерионосительства [65, 92, 115].

Кроме вышеперечисленных факторов вирулентности для пневмококка характерны и поверхностные протеины: белки, связывающие холин, липопротеины, белки с LPxTG мотивом и неклассические белки [92, 130, 155].

Холин-связывающие белки (CBP) уникальны для S. pneumoniae, они связываются с холином на поверхности бактериальной клетки. При этом количество экспрессируемых протеинов зависит от штамма пневмококка. Кроме группы литических ферментов к группе холин-связывающих белков относят пневмококковый поверхностный антиген A (PspA), пневмококковый поверхностный белок C (PspC), белки CbpD, CbpG и другие. PspA влияет на систему комплемента, препятствуя ее активации, и предотвращает фагоцитоз бактериальных клеток, а PspC действует как адгезин, связываясь с рецепторами на поверхности эпителиальных клеток носоглотки. Остальные поверхностные белки также принимают участие в прикреплении пневмококка к эпителию верхних дыхательных путей человека [92, 115, 128, 130, 155, 189].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Куркова Анастасия Алексеевна, 2022 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Министерство здравоохранения Российской Федерации. Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации (Минздрав России) от 21 марта 2014 г. № 125н г. Москва «Об утверждении национального календаря профилактических прививок и календаря профилактических прививок по эпидемическим показаниям». Москва. - 2014.

2. Баранов, А.А. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у детей [Текст] / А.А. Баранов, Л.С. Намазова-Баранова, Н.И. Брико [и др.] // Педиатрическая Фармакология. - 2015. - Т. 12, № 5. - C. 550-558.

3. Баранов, А.А. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у детей [Текст] / А.А. Баранов, Л.С. Намазова-Баранова, Н.И. Брико [и др.] // Педиатрическая Фармакология. - 2018. - Т. 15, № 3. - C. 200-211.

4. Баязитова, Л.Т. Внебольничные пневмонии пневмококковой этиологии и микробиологические аспекты назофарингеального носительства Streptococcus pneumoniae у детей в Республике Татарстан [Текст] / Л.Т. Баязитова, О.Ф. Тюпкина, Т.А. Чазова [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2017. - Т. 7, № 3. -C. 271-278.

5. Белоцерковская, Ю.Г. Пневмококковая вакцина у взрослых снижает риск инфекций, вызванных Streptococcus pneumoniae [Текст] / Ю.Г. Белоцерковская, А.Г. Романовских, Е.А. Стырт // Клиническая медицина. -2016. - Т. 94, № 1. - C. 61-66.

6. Белошицкий, Г.В. Серотиповый пейзаж пневмококков, выделенных при пневмококковом менингите, в Российской Федерации [Текст] / Г.В. Белошицкий, И.С. Королева, М.А. Королева // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2015. - Т. 14, № 2. - C. 19-25.

7. Бережной, В.В. Новые возможности вакцинопрофилактики: инвазивные пневмококковые заболевания, пневмонии, отиты у детей можно предупредить [Текст] / В.В. Бережной, В.Г. Козачук // Здоровье ребенка. - 2014. - Т. 2, № 53. - C. 69-75.

8. Бондаренко, А.П. Эпидемиология назофарингеального носительства

пневмококков в семейных очагах [Текст] / А.П. Бондаренко, В.А. Шмыленко, О.Е. Троценко // Тихоокеанский медицинский журнал. - 2018. - № 3. - C. 54-57.

9. Боронина, Л.Г. Динамика антибиотикорезистентности у Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis, вызывающих ЛОР-патологию и внебольничные бронхолегочные заболевания у детей на Среднем Урале [Текст] / Л.Г. Боронина, Е.В. Саматова, С.М. Блинова // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2017. - Т. 19, № 2. - C. 168-175.

10. Брико, Н.И. Вакцинопрофилактика взрослого населения против пневмококковой инфекции [Тескт] / Н.И. Брико, И.В. Фельдблюм, А.В. Бикмиева [и др.] // Антибиотики и химиотерапия. - 2019. - Т. 64, № 1-2. - C. 37-43.

11. Бугайчук, О.В. Этиология острого среднего гнойного отита у детей дошкольного возраста [Текст] / О.В. Богайчук, Е.Ю. Радциг // Вестник РГМУ. -2015. - № 1. - C. 38-40.

12. Всемирная организация здравоохранения. Возрастающая угроза развития антимикробной резистентности. Возможные меры. [Текст] / Всемирная организация здравоохранения, под ред. Всемирная организация здравохранения, Женева. - 2013. - 120 с.

13. Всемирная организация здравоохранения. Пневмококковые конъюгированные вакцины для младенцев и детей в возрасте до 5 лет: документ по позиции ВОЗ, февраль 2019 года. Еженедельный эпидемиологический бюллетень [Электронный ресурс]. Режим доступа: http://www.who.int/wer (дата обращения: 18.11.2019).

14. Всемирная орагнизация здравоохранения. Устойчивость к противомикробным препаратам // Устойчивость к противомикробным препаратам [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.who.int/ru/ news-room/fact-sheets/detail/antimicrobial-resistance (дата обращения: 18.11.2019).

15. Всемирная организация здравоохранения. Устойчивость к противомикробным препаратам [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.who.int/antimicrobial-resistance/ru/ (дата обращения: 18.11.2019).

16. Галицкая, М.Г. Распространенность пневмококковой инфекции в странах Западной Европы. Международный опыт использования 7-валентной

пневмококковой конъюгированной вакцины [Текст] / М.Г. Галицкая, Л.С. Намазова // Педиатрическая фармакология. - 2008. - Т. 5, № 2. - C. 51-53.

17. Гучев, И.А. Вакцинопрофилактика пневмококковых инфекций нижних дыхательных путей у взрослых без иммуносупрессии [Текст] / И.А. Гучев // Антибиотики и химиотерапия. - 2016. - Т. 61, № 7-8. - C. 48-57.

18. Гучев, И.А. Профилактика вспышек внебольничной пневмонии полисахаридной пневмококковой вакциной: анализ перспектив применения в силовых структурах России [Текст] / И.А. Гучев, О.И. Клочков, А.И. Синопальников // Антибиотики и химиотерапия. - 2016. - Т. 61, № 1-2. - C. 43-52.

19. Давыдов, А.В. Чувствительность к антибиотикам и связь с серотипами штаммов Streptococcus pneumoniae у детей с острым средним отитом и острым синуситом в Беларуси [Текст] / А.В. Давыдов, Л.П. Титов, Н.Л. Клюйко [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2018. - Т.20, № 3. - C. 206-215.

20. Давыдов, А.В. Чувствительность к антибиотикам штаммов Streptococcus pneumoniae, выделенных от пациентов с пневмонией в Беларуси [Текст] / А.В. Давыдов, Л.П. Титов, Н.Л. Клюйко // Медицинские новости. - 2017. - № 12. - C. 74-82.

21. Даминов, Т.А. Эффективность вакцинации против пневмококковой инфекции в Узбекистане : предварительная оценка и прогноз [Текст] / Т.А. Даминов, Л.Н. Туйчиев, Н.У. Таджиева [и др.] // Детские инфекции. - 2018. - Т. 17, № 4. - C. 3437.

22. Елистратова, Т.А. Пневмококковый менингит у взрослых: клинико-эпидемиологические и диагностические аспекты [Текст] / Т.А. Елистратова, Е.П. Тихонова, И.Н. Протасова [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. -2018. - Т. 17, № 3. - C. 63-67.

23. Ералиева, Л.Т. Характеристика клинико-биохимических критериев пневмококкового менингита у детей [Текст] / Л.Т. Ералиева, А.Т. Мусаев, А.К. Ешманова [и др.] // Вестник КазНМУ. - 2014. - № 4. - C. 246-250.

24. Зайцев, А.А. Вакцинопрофилактика пневмококковых инфекций у взрослых [Текст] / А.А. Зайцев, Д.Н. Антипушина // Медицинский совет. - 2017. - № 18. - C.

25. Зарипова, А.З. Диагностика пневмококковых инфекций респираторного тракта [Текст] / А.З. Зарипова, Р.И. Валиева, Л.Т. Баязитова [и др.] // Практическая пульмонология. - 2018. - № 4. - C. 74-80.

26. Зарипова, А.З. Фенотипические и генотипические свойства Streptococcus pneumoniae при бактерионосительстве [Текст] / А.З. Зарипова, Л.Т. Баязитова, О.Ф. Тюпкина [и др.] // Практическая медицина. - 2018. - Т. 16, № 9. - C. 106-112.

27. Иванчик, Н.В. Антибиотикорезистентность клинических штаммов Streptococcus pneumoniae в России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «ПеГАС 2014-2017» [Текст] / Н.В. Иванчик, А.Н. Чагарян, М.В. Сухорукова [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2019. - Т. 21, № 3. - C. 230-237.

28. Игнатова, Г.Л. Анализ влияния вакцинации против пневмококковой инфекции на течение коморбидной патологии у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких и хронической сердечной недостаточностью [Текст] / Г.Л. Игнатова, В.Н. Антонова // Терапевтический архив. - 2018. - № 8. - C. 53-62.

29. Игнатова, Г.Л. Пятилетний анализ эффективности вакцинации пневмококковой инфекции у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких [Текст] / Г.Л. Игнатова, В.Н. Антонов // Пульмонология. - 2018. - Т. 28, № 2. - C. 185-192.

30. Инструкция по применению лекарственного препарата для медицинского применения «Синфлорикс» (Вакцина 10-валентная пневмококковая полисахаридная, конъюгированная с D-протеином нетипируемой Haemophilus influenzaе, столбнячным и дифтерийным анатоксинами [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://gskpro.com/content/dam/global/hcpportal/ru_RU/ synflorix/ synflorix_pil_gds_v1 5_2017_04_26_aw_2017_06_09.pdf (дата обращения: 16.11.2019).

31. Ковтун, О.П. Эффективность пневмококковых конъюгированных вакцин следующего поколения в разных регионах мира [Текст] / О.П. Ковтун, В.В. Романенко // Вопросы современной педиатрии.- 2014. - Т. 13, № 1. - C. 18-25.

32. Козлов, Р.С. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у взрослых

[Текст] / Р.С. Козлов, Н.И. Брико, Т.Н. Биличенко [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2018. - Т. 20, № 1. - C. 5-8.

33. Козлов, Р.С. Пневмококки: уроки прошлого - взгляд в будущее [Текст] / Р.С. Козлов, Смоленск: МАКМАХ. - 2010. - 127 с.

34. Козлов, Р.С. Проблема антибиотикорезистентности в педиатрии [Текст] / Р.С. Козлов // Русский медицинский журнал. - 2014. - Т. 3. - C. 238.

35. Козлов, Р.С. Резистентность к антимикробным препаратам как реальная угроза национальной безопасности [Текст] / Р.С. Козлов // Русский медицинский журнал. - 2010. - C. 321.

36. Козлов, Р.С. Результаты исследования распространенности в России внебольничной пневмонии и острого среднего отита у детей в возрасте до 5 лет (PAPIRUS). Роль S. pneumoniae и H. Influenzae в этиологии данных заболеваний [Текст] / Р.С. Козлов, О.И. Кречикова, А.А. Муравьев // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2013. - Т. 4, № 15. - C. 246-260.

37. Козянова, Ю.А. Распространенность носительства Streptococcus pneumoniae среди организованных коллективов города Барнаула с оценкой антибиотикорезистентности и дезинфектантоустойчивости [Текст] / Ю.А. Козянова, Т.В. Сафьянова, Ю.В. Винникова [и др.] // Медицинский альманах. -2018. - Т. 4, № 55. - C. 90-94.

38. Колоскова, Е.А. Современная эпидемиологическая и микробиологическая характеристика пневмококковой инфекции [Текст] / Е.А. Колоскова, Б.А. Рамазанова, К.К. Мустафина // Вестник КазНМУ. - 2016. - № 2. - C. 49-56.

39. Королева, И.С. Пневмококковая инфекция в России - эпидемиологическая ситуация [Текст] / И.С. Королева, С.М. Харит, А.А. Рулева [и др.] // Педиатрическая фармакология. - 2010. - Т. 7, № 4. - C. 12-18.

40. Костинов, М.П. Инновационная вакцина против пневмококковой инфекции в профилактике обострений хронических заболеваний у взрослых [Текст] / М.П. Костинов, А.Г. Чучалин, Е.С. Коровкина // Здравоохранение Российской Федерации. - 2015. - Т.59, № 5. - C. 49-53.

41. Костинов, М.П. Ожидаемые эпидемиологические и клинический эффекты

вакцинации против пневмококковой инфекции в России [Текст] / М.П. Костинов, Т.Н. Елагина, Н.Н. Филатова [и др.] // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. - 2018. - Т. 7, № 2. - C. 107-114.

42. Костинов, М.П. Эффективность и безопасность вакцины Превенар у детей и взрослых групп риска [Текст] / М.П. Костинов, Д.В. Пахомов // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2010. - Т. 3, № 52. - C. 68-71.

43. Кречикова, О.И. Выделение, идентификация и определение чувствительности к антибиотикам Streptococcus pneumoniae [Текст] / О.И. Кречикова, Р.С. Козлов, Т.М. Богданович [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2000. - Т. 2, № 1. - C. 88-98.

44. Лазарева, М.А. Этиологическая роль Streptococcus pneumoniae при респираторных инфекциях, его носительство и чувствительность к антибиотикам у детей младшего возраста: автореф... дис. кан. наук. - М.: 2015. - 28 c.

45. Лобзин, Ю.В. Серотипы Streptococcus pneumoniae, вызывающих ведущие нозологические формы пневмококковых инфекций [Текст] / Ю.В. Лобзин, С.В. Сидоренко, С.М. Харит [и др.] // Журнал инфектологии. - 2013. - Т. 5, № 2. - C. 3541.

46. Мартынова, А.В. Молекулярно-эпидемиологический мониторинг штаммов Streptococcus pneumoniae, выделенных у пациентов пожилого возраста с внебольничными пневмониями [Текст] / А.В. Мартынова, Л.А. Балабанова, О.А. Чулакова [и др.] // Современные технологии в медицине. - 2014. - Т. 6, № 3. - C. 91-96.

47. Маянский, Н.А. Антибиотикорезистентность и клональная эволюция Streptococcus pneumoniae серотипа 19А в России, 2002-2013 гг. [Текст] / Н.А. Маянский, Т.А. Савинова, Н.М. Алябьева [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2017. - Т. 19, № 2. - C. 145-151.

48. Маянский, Н.А. Серотиповое разнообразие и резистентность пневмококков [Текст] / Н.А. Маянский, Н.М. Алябьева, А.В. Лазарева [и др.] // Вестник РАМН. -2014. - № 7-8. - C. 38-45.

49. Муравьев, А.А. Эпидемиология серотипов S. pneumoniae на территории

Российской Федерации [Текст] / А.А. Муравьев, Р.С. Козлов, Н.Н. Лебедева // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2017. - Т. 19, № 3. - C. 200-206.

50. Намазова, Л.С. Конъюгированная пневмококковая вакцина для иммунизации детей - рекомендации ВОЗ [Текст] / Л.С. Намазова // Педиатрическая фармакология. - 2007. - Т. 4, № 5. - C. 6-10.

51. Никитюк, Н.Ф. Пневмококковые инфекции: современное состояние заболеваемости и вакцинопрофилактики [Текст] / Н.Ф. Никитюк, Т.И. Немировская, Ю.И. Обухов [и др.] // БИОпрепараты. - 2014. - Т. 2, № 50. - C. 4-12.

52. Оганесян, А.Н. Серотиповая характеристика пневмококков, выявленных у больных менингитом в ряде стран европейского и азиатского регионов [Текст] / А.Н. Оганесян, Е.А. Воропаева, А.А. Мельникова [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2017. - Т. 3, № 94. - C. 39-49.

53. Перова, А.Л. Вакцинация против пневмококковой инфекции [Текст] / А.Л. Перова, А.А. Рулева // Лечение и профилактика. - 2013. - Т. 4, № 8. - C. 43-53.

54. Правительство Российской Федераци. Распоряжение Правительства Российской Федерации от 25 сентября 2017 г. Ко2045-р «СТРАТЕГИЯ предупреждения растпространения антимикробной резистентности в Российской Федерации на период до 2030 года» [Текст]. - Москва. - 2017.

55. Протасова, И.Н. Смена серотипов Streptococcus pneumoniae у детей, вакцинированных 7-валентной конъюгированной вакциной [Текст] / И.Н. Протасова, Н.В. Бахарева, О.В. Перьянова [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2014. - Т. 5, № 78. - C. 67-71.

56. Райчева, М.В. Клинико эпидемиологические особенности пневмонии у мужчин молодого возраста в организованных коллективах [Текст] / М.В. Райчева, Т.Н. Биличенко, А.Г. Чучалин // Пульмонология. - 2016. - Т. 26, № 1. - C. 29-37.

57. Рачина, С.А. Антибактериальная терапия тяжелой внебольничной пневмонии у взрослых: обзор рекомендаций и клинические примеры [Текст] / С.А. Рачина, Р.С. Козлов, Н.Н Дехнич [и др.] // Архивъ внутренней медицины. - 2015. - Т. 3, № 23. -C. 63-74.

58. Романенко, В.В. Серологическая характеристика пневмококков, выделенных у детей с диагнозом « Острый средний отит », в Свердловской области [Текст] / В.В. Романенко, Я.Б. Бейкин, А.В. Сомова [и др.] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2017. - Т. 3, № 94. - C. 33-38.

59. Сергеева, Е.В. Внебольничная пневмония у детей. Современные особенности [Текст] / Е.В. Сергеева, С.И. Петрова // Педиатр. - 2016. - Т. 7, № 3. - C. 5-10.

60. Смирнова, А.О. Методы идентификации Streptococcus pneumoniae и характеристика его серотиповой принадлежности [Текст] /А.О. Смирнова, // Успехи в химии и химической технологии. - 2017. - Т. 31, № 9. - C. 8-10.

61. Сомова, А.В. Эпидемиология S. pneumoniae-ассоциированных пневмоний и анализ эффективности вакцинации против пневмококковой инфекции у детей до 6 лет [Текст] / А.В. Сомова, В.В. Романенко, А.А. Голубкова // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2018. - Т. 1, № 98. - C. 25-32.

62. Союз педиатров России. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у детей [Электронный ресурс]. - 2018. - Режим доступа: https://www.pediatr-russia.ru/sites/default/files/file/kr_vacpnev2018.pdf (дата обращения: 16.11.2019).

63. Сперанская, Е.В. Оценка этиологической структуры внебольничной пневмонии у военнослужащих [Текст] / Е.В. Сперанская, Н.Ф. Бруснигина, Е.И. Ефимов [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2018. - Т. 20, № 2. - C. 150-155.

64. Таточенко, В.К. 13-валентная пневмококковая конъюгированная вакцина [Текст] / В.К. Таточенко, Л.С. Намазова-Баранова // Вопросы современной педиатрии. - 2012. - Т. 11, № 2. - C. 44-47.

65. Урбан, Ю.Н. Молекулярно-генетическая, фенотипическая и филогенетическая характеристики штаммов Streptococcus pneumoniae в оценке их эпидемиологической роли [Текст] / Ю.Н. Урбан, Е.А. Воропаева, С.С. Афанасьева [и др.] // Астраханский медицинский журнал. - 2014. - Т. 9, № 1. - C. 83-93.

66. Федосеенко, М.В. Эпоха конъюгированных вакцин: международный опыт успешного применения [Текст] / М.В. Федосеенко, М.Г. Галицкая, Л.С. Намазова // Педиатрическая фармакология. - 2008. - Т. 5, № 6. - C. 8-14.

67. Харит, С.М. Современные подходы к профилактике пневмококковой инфекции [Текст] / С.М. Харит, А.Л. Перова // Медицинский совет. - 2015. -№ 16. - C. 64-67.

68. Холодок, Г.Н. Поствакцинальная динамика молекулярно-генетических вариантов изолятов S. pneumoniae у детей Приамурья в период 2013-2015 гг. [Текст] / Г.Н. Холодок, А.П. Бондаренко, Н.М. Ивахнишина [и др.] // Дальневойсточный медицинский журнал. - 2016. - № 2. - C. 63-66.

69. Цветкова, И.А. SNP-полиморфизм в геномах изолятов Streptococcus pneumoniae CC320, устойчивых к бета-лактамным антибиотикам [Текст] / И.А. Цветкова, М.О. Волкова, О.С. Калиногорская [и др.] // Антибиотики и химиотерапия. - 2016. - Т. 61, № 11-12. - C. 21-27.

70. Чернышова, Л.И. Назофарингеальное носительство Streptococcus pneumoniae у воспитанников домов ребенка: серотипический резервуар и чувствительность к антимикробным препаратам [Текст] / Л.И. Чернышова, А.М. Гильфанова, А.В. Бондаренко [и др.] // Здоровье ребенка. - 2014. - Т. 6, № 57. - C. 9-14.

71. Чучалин, А.Г. Федеральные клинические рекомендации по вакцинопрофилактике пневмококковой инфекции у взрослых [Текст] / А.Г. Чучалин, Н.И. Брико, С.Н. Авдеев [и др.] // Пульмонология. - 2019. - Т. 29, № 1. -C. 19-34.

72. Шадыев, Т.Х. Острый синусит [Электронный ресурс] / Т.Х. Шадыев, Г.Н. Изотова, А.А. Сединкин // Русский медицинский журнал. - 2013. - № 11. - C. 9-12. - Режим доступа: https://www.rmj.ru/articles/otorinolaringologiya/Ostryy_sinusit/ (дата обращения: 16.11.2019).

73. Резолюция заседания Экспертного совета по пневмококковой инфекции и вакцинации в России [Текст] // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. - 2017. -Т. 1, № 92. - C. 47-50.

74. Федеральные клинические рекомендации «Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у взрослых». - Москва, 2017. - C. 17.

75. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2019 году: Государственный доклад. - М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека,

2020. - C. 299.

76. Aenishaenslin, C. Evidence needed for antimicrobial resistance surveillance systems [Text] / C. Aenishaenslin, B. Häsler, A. Ravel [et al.] // Bulletin of the World Health Organization. - 2019. - Vol. 97, № 4. - P. 283-289.

77. Aliberti, S. International prevalence and risk factors evaluation for drug-resistant Streptococcus pneumoniae pneumonia [Text] / S. Aliberti, G.S. Cook, B.L. Babu [et al.] // Journal of Infection. - 2019. - Vol. 79, № 4. - P. 300-311.

78. Almeida, S.T. Dynamics of pneumococcal carriage in adults: a new look at an old paradigm [Text] / S.T. Almeida, A.C. Paulo, F. Froes [et al.] // The Journal of Infectious Diseases. - 2020. - XX. - 1-11.

79. Almeida, S.T. Re-evaluation of Streptococcus pneumoniae carriage in Portuguese elderly by qPCR increases carriage estimates and unveils an expanded pool of serotypes [Text] / S.T. Almeida, T. Pedro, A.C. Paulo [et al.] // Scientific Reports. - 2020. - Vol. 10, № 8373. - P. 1-7.

80. Alonso, M. Dynamics of Streptococcus pneumoniae serotypes causing acute otitis media isolated from children with spontaneous middle-ear drainage over a 12-year period (1999-2010) in a region of Northern Spain [Text] / M. Alonso, J. M. Marimon, M. Ercibengoa [et al.] // PLoS ONE. - 2013. - Vol. 8, № 1. - P. 1-10.

81. Alvares, J.R. Prevalence of pneumococcal serotypes and resistance to antimicrobial agents in patients with meningitis: ten-year analysis [Text] / J.R. Alvares, O.C. Mantese, A. de Paula [et al.] // Brazilian Journal of Infectious Diseases. - 2011. - Vol. 15, № 1. -P. 22-27.

82. Amanda, G. Pneumococcal pneumonia and invasive pneumococcal disease: immunopathogenesis and diagnosis [Text] / G. Amanda, D.K. Surtoyo, E. Burhan // Pneumologia. - 2019. - Vol. 68, № 1. - P. 8-14.

83. Ampofo, K. 123 - Streptococcus pneumoniae [Text] / K. Ampofo, C.L. Byington. -Principles and Practice of Pediatric Infectious Diseases (Fifth Edition): Elsevier. - 2012. - P. 737-746.e4.

84. Aslam, B. Antibiotic resistance: a rundown of a global crisis [Text] / B. Aslam, W. Wang, M.I. Arshad // Infection and Drug Resistance. - 2018. - № 11. - P. 1645-1658.

85. Austrian, R. Pneumococcus: The first one hundred years [Text] / R. Austrian // Reviews of Infectious Diseases. - 1981. - Vol. 3, № 2. - P. 183-189.

86. Beg, M. Community-acquired pneumonia secondary to Legionella pneumophila and Streptococcus pneumoniae: A rare co-infection [Text] / M. Beg, H. Arif, T. Walsh // Cureus. - 2019. - Vol. 11, № 2. - P. 5, e4080.

87. Benton, A.H. The role of pneumococcal virulence factors in ocular infectious diseases [Text] / A.H. Benton, M.E. Marquart // Interdisciplinary Perspectives on Infectious Diseases. - 2018. - Vol. 2. - P. 1-9.

88. Boelsen, L.K. The challenges of using oropharyngeal samples to measure pneumococcal carriage in adults [Text] / L.K. Boelsen, E.M. Dunne, K.A. Gould [et al.] // mSphere. - 2020. - Vol. 5, № 4. - P. 1-15.

89. Bonnave, C. Adult vaccination for pneumococcal disease: a comparison of the national guidelines in Europe [Text] / C. Bonnave, D. Mertens, W. Peetermans [et al.]// European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 38, № 4. - P. 785-791.

90. Bonten, M.J.M. Polysaccharide conjugate vaccine against pneumococcal pneumonia in adults [Text] / M.J.M. Bonten, S.M. Huijts, M. Bolkenbaas [et al.] // New England Journal of Medicine. - 2015. - Vol. 372, № 12. - P. 1114-1125.

91. Bradshaw, J.L. Mucosal infections and invasive potential of nonencapsulated streptococcus pneumoniae are enhanced by oligopeptide binding proteins AliC and AliD [Text] / J.L. Bradshaw, H.R. Pipkins, L.E. Keller [et al.] // mBio. - 2018. - Vol. 9, № 1.

- P. 1-18.

92. Brooks, L.R.K. Streptococcus pneumoniae's virulence and host immunity: aging, diagnostics and prevention [Text] / L.R.K. Brooks, G.I. Mias // Frontiers in Immunology.

- 2018. - Vol. 9, № 1366. - P. 1-29.

93. Buchwald, U. Safety and immunogenicity of 15-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV-15) compared with PCV-13 in healthy older adults previously vaccinated with 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccine (PPV23) [Text] / U. Buchwald, J. Peterson, H. Stacey [et al.]// OFID. - 2018. - № 5 (Suppl 1) - P. S572.

94. CDC. Immunology and Vaccine-Preventable Diseases [Electronic resource] // Pink

Book - Pneumococcal Disease. URL:

https://www.cdc.gov/vaccines/pubs/pinkbook/downloads/pneumo.pdf (accessed:

18.11.2019).

95. Centre for Disease Control and Prevention (CBC). Antibiotic resistance threats in the United States [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/drugresistance/biggest_threats.html (accessed: 18.11.2019).

96. Centre for Disease Control and Prevention (CDC). Generic protocol on enhanced surveillance for invasive pneumococcal disease at the EU/EEA level [Text]. - Stockholm: ECDC. - 2018. - P. 24.

97. Centre for Disease Control and Prevention (CDC). PCV13 pneumococcal conjugate vaccine in adults [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/vaccines/vpd/pneumo/hcp/PCV13-adults.html (accessed: 18.11.2019).

98. Centre for Disease Control and Prevention (CDC). Pneumococcal clinical features [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/pneumococcal/clinicians/clinical-features.html (accessed: 18.11.2019).

99. Centre for Disease Control and Prevention (CDC). Pneumococcal Disease. Transmission and Those at High Risk [Electronic resource]. URL: http://www.cdc.gov/pneumococcal/about/risk-transmission.html (accessed: 18.11.2019).

100. Ceyssens, P.J. Molecular analysis of rising fluoroquinolone resistance in Belgian non-invasive Streptococcus pneumoniae isolates (1995-2014) [Text] / P.J. Ceyssens, F.V. Bambeke, W. Mattheus [et al.] // PLoS ONE. - 2016. - Vol. 11, № 5. - P. 1-17.

101. Cherazard, R. Antimicrobial resistant Streptococcus pneumoniae: prevalence, mechanisms, and clinical implications [Text] / R. Cherazard, M. Epstein, T.L. Doan [et al.] // American Journal of Therapeutics. - 2017. - Vol. 24, № 3. - P. e361-e369.

102. Cilveti, R. Epidemiology of otitis media with spontaneous perforation of the tympanic membrane in young children and association with bacterial nasopharyngeal carriage, recurrences and pneumococcal vaccination in Catalonia, Spain - the prospective HERMES study [Text] / R. Cilveti, M. Olmo, J. Perez-Jove [et al.] // PLoS ONE. - 2017. - Vol. 2, № 12. - P. e0170316.

103. Ciruela, P. Indirect effects of paediatric conjugate vaccines on invasive pneumococcal disease in older adults [Text] / P. Ciruela, S. Broner, C. Izquierdo [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 86. P. 122-130.

104. Cohen, C. Streptococcus pneumoniae serotypes and mortality in adults and adolescents in South Africa: analysis of national surveillance data, 2003-2008 [Text] / C. Cohen, N. Naidoo, S. Meiring [et al.] // PLoS ONE. - 2015. - Vol. 10, № 10. - P. 122130.

105. Cohen, O. Pneumococcal conjugate vaccine (PCV) product assessment [Electronic resource] // The International Vaccine Access Center at Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health. - 2017. - P. 162. URL: https://www.gavi.org/library/publications/other-publishers/other/pneumococcal-conjugate-vaccine-(pcv)-product-assessment/ (assecced: 18.11.2019).

106. Corcoran, M. The epidemiology of invasive pneumococcal disease in older adults in the post-PCV era. Has there been a herd effect? [Text] / M. Corcoran, I. Vickers, J. Mereckiene [et al.] // Epidemiology and Infection. - 2017. - Vol. 145, № 11. - P. 23902399.

107. Davydov, A. Antibiotic resistance, serotypes and vaccine coverage of Streptococcus pneumoniae in patients with meningitis and pneumonia in Belarus [Text] / A. Davydov, L. Titov // 29th ECCMID Abstract Book. - 2019. № P0364.

108. Demczuk, W.H.B. Phylogenetic analysis of emergent Streptococcus pneumoniae serotype 22F causing invasive pneumococcal disease using whole genome sequencing [Text] / W.H.B. Demczuk, I. Martin, L. Hoang [et al.] // PLoS ONE. - 2017. - Vol. 12, № 5. - P. 1-15.

109. Echaniz-Aviles, G. Clinical and microbiological characteristics of community-acquired pneumonia associated with Streptococcus pneumoniae in adult patients in Mexico [Text] / G. Echaniz-Aviles, E. Garza-Gonzalez, A.L. Roman-Mancha [et al.] // Revista Argentina de Microbiologia. - 2019. - Vol. 51, № 3. - P. 234-240.

110. Ermlich, S.J. Safety and immunogenicity of 15-valent pneumococcal conjugate vaccine in pneumococcal vaccine-naive adults >50 years of age [Text] / S.J. Ermlich, C.P. Andrews, S. Folkerth [et al.] // Vaccine. - 2018. - Vol. 36, № 45. - P. 6875-6882.

111. Esposito, S. Impact of Streptococcus pneumoniae in acute otitis media (AOM) with spontaneous tympanic membrane perforation (sTMP): serotype distribution 4 years after 13-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV13) [Text] // OFID. - 2016. - № 1 (Suppl 1) - P. S201.

112. Facklam, R. What happened to the streptococci: overview of taxonomic and nomenclature changes [Text] / R. Facklam // Clinical Microbiology Reviews. - 2002. -Vol. 15, № 4. - P. 613-630.

113. Falkenhorst, G. Background paper to the updated pneumococcal vaccination recommendation for older adults in Germany [Text] / G. Falkenhorst, C. Remschmidt, Y. Harder [et al.] // Bundesgesundheitsblatt, Gesundheitsforschung, Gesundheitsschutz. -2016. - Vol. 59, № 12. - P. 1623-1657.

114. Falup-Pecurariu, O. Pneumococcal acute otitis media in infants and children in central Romania, 2009 - 2011: microbiological characteristics and potential coverage by pneumococcal conjugate vaccines [Text] / O. Falup-Pecurariu, E. Leibovitz, A. Mercas [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2013. - Vol. 17, № 9. - P. e702-e706.

115. French, N. 26 - Pneumococcal Disease [Electronic resource] / N. French // Manson's Tropical Infectious Diseases (twenty-third edition): Elsivier. - 2014. - P. 349-360.e1. URL:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B97807020510120002737via%3Dihu b (assecced: 18.11.2019).

116. Froes, F. Pneumococcal vaccination and chronic respiratory diseases [Text] / F. Froes, N. Roche, F. Blasi // International Journal of COPD. - 2017. - № 12. - P. 34573468.

117. Fu, J. Etiology of acute otitis media and phenotypic-molecular characterization of Streptococcus pneumoniae isolated from children in Liuzhou, China [Text] / J. Fu, L. Li, Z. Liang [et al.] // BMC Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 19, № 1. - P. 1-9.

118. Fukusumi, M. Invasive pneumococcal disease among adults in Japan, April 2013 to March 2015: disease characteristics and serotype distribution [Text] / M. Fukusumi, B. Chang, Y. Tanabe [et al.] // BMC Infectious Diseases. - 2017. - Vol. 17, № 2. - P. 1-7.

119. Gene, A. Pneumococcal serotypes causing acute otitis media among children in Barcelona (1992-2011): emergence of the multiresistant clone ST320 of serotype 19A [Text] / A. Gene, E. del Amo, M. Iñigo [et al.] // Pediatric Infectious Disease Journal. -2013. - Vol. 32, № 4. - P. 128-133.

120. Geno, K.A. Pneumococcal capsules and their types: past, present, and future [Text] / K.A. Geno, G.L. Gilbert, L.Y. Song [et al.]// Clinical Microbiology Reviews. - 2015. -Vol. 28, № 3. - P. 871-899.

121. Golden, A.R. Comparison of antimicrobial resistance patterns in Streptococcus pneumoniae from respiratory and blood cultures in Canadian hospitals from 2007-16 [Text] / A.R. Golden, M.R. Baxter, R.J. Davidson [et al.] // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2019. - Vol. 74, № Suppl 4. - P. iv39-iv47.

122. Gómez-Mejia, A. Streptococcus pneumoniae two-component regulatory systems: The interplay of the pneumococcus with its environment [Text] / A. Gómez-Mejia, G. Gámez, S. Hammerschmidt // International Journal of Medical Microbiology. - 2018. -Vol. 308., № 6. - P. 722-737.

123. González, A. Emerging non-PCV13 serotypes causing adult invasive pneumococcal disease in the late-PCV13 period in Spain [Text] / A. González, J. Cámara, M. Ercibengoa [et al.] // Clinical Microbiology and Infection. - 2020. - Vol. 26, № 6. - P. 753-759.

124. Greenberg, D. Safety and immunogenicity of 15-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV15) in healthy infants [Text] / D. Greenberg, P.A. Hoover, T. Vesikari [et al.] // Vaccine. - 2018. - Vol. 36, № 45. - P. 6883-6891.

125. Han, C. Genetic diversity and antigenicity analysis of Streptococcus pneumoniae pneumolysin isolated from children with pneumococcal infection [Text] / C. Han, M. Zhang // International Journal of Infectious Diseases. - 2019. - № 86. - P. 57-64.

126. Hanquet, G. Effect of childhood pneumococcal conjugate vaccination on invasive disease in older adults of 10 European countries: implications for adult vaccination [Text] / G. Hanquet, P. Krizova, P. Valentiner-Branth [et al.] // Thorax. - 2019. - Vol. 74, № 5. - P. 473-482.

127. Harimurti, K. Nasopharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae in adults infected with human immunodeficiency virus in Jakarta, Indonesia [Text] / K. Harimurti,

S.R.F. Saldi, E. Dewiasty [et al.] // Journal of Infection and Public Health. - 2016. - Vol. 9, № 5. - P. 633-638.

128. Henriques-Normark, B. The pneumococcus: epidemiology, microbiology, and pathogenesis [Text] / B. Henriques-Normark, E.I. Tuomanen // Cold Spring Harb Perspect Med. - 2013. - Vol. 3, № 7. - P. a010215.

129. Highlights of prescribing information of Pneumovax® 23 (pneumococcal vaccine polyvalent) [Electronic resource]. URL: https://www.merck.com/product/usa/pi_circulars/p/pneumovax_23/pneumovax_pi.pdf (accessed: 18.11.2019).

130. Hilleringmann, M. Pneumococcal Pili and Adhesins [Text] / M. Hilleringmann, S. Kohler, G. Gamez [et al.] // Streptococcus pneumoniae: Molecular Mechanisms of Host-Pathogen Interactions: Elsivier. - 2015. - P. 309-346.

131. Houri, H. Distribution of capsular types and drug resistance patterns of invasive pediatric Streptococcus pneumoniae isolates in Teheran, Iran [Text] / H. Houri, A. Karimi, Y. Saee [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2017. - № 57. -P. 21-26.

132. Hu, T. Health and economic burden associated with 15-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV15) serotypes in children in the United States [Text] / T. Hu, T. Petigara, E. Elbasha // Value in Health. - 2019 - № PIN 41. - P. S201.

133. Huang, S. Serotype distribution and antibiotic resistance of Streptococcus pneumoniae isolates collected at a Chinese hospital from 2011 to 2013 [Text] / S. Huang, X. Liu, W. Lao [et al.] // BMC Infectious Diseases. - 2015. - Vol. 15, № 1. - P. 1-10.

134. J Jang, A.Y. Molecular characterization of pneumococcal surface protein K, a potential pneumococcal vaccine antigen [Text] / A-Y. Jang, H.S. Seo, S. Lim [et al.] // Virulence. - 2017. - Vol 6. № 8. - P. 875-890.

135. Janoff, E.N. 201 - Streptococcus pneumoniae [Text] / E.N. Janoff, D.M. Musher // Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases: Elsevier. - 2015. - P. 2310-2327.e5.

136. Jauneikaite, E. Current methods for capsular typing of Streptococcus pneumoniae

[Text] / E. Jauneikaite, A.S. Tocheva, J.M.C. Jefferies [et al.] // Journal of Microbiological Methods. - 2015. - Vol. 113. - P. 41-49.

137. Jayaraman, R. Invasive pneumococcal disease in Indian adults: 11 years' experience [Text] / R. Jayaraman, R. Varghese, J.L. Kumar [et al.] // Journal of Microbiology, Immunology and Infection. - 2018. - Vol. 52, № 5. - P. 736-742.

138. Kastrin, T. Lack of correlation between reduced outpatient consumption of macrolides and macrolide resistance of invasive Streptococcus pneumoniae isolates in Slovenia during 1997-2017 [Text] / T. Kastrin, M. Paragi, V. Erculj [et al.] // Journal of Global Antimicrobial Resistance. - 2019. - Vol. 16. - P. 242-248.

139. Kenig, A. Hospital-onset adult invasive pneumococcal disease in Israel: Sicker patients, different pathogens [Text] / A. Kenig, G. Regev-Yochay, S. Khakshoor [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 85. - P. 195-202.

140. Kim, J.H. Adult invasive pneumococcal disease in the Republic of Korea: Risk medical conditions and mortality stratified by age group [Text] / J.H. Kim, S.H.Baik, B.C. Chun [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2018. - Vol. 74. - P. 136144.

141. Kim, L. Biological and epidemiological features of antibiotic-resistant Streptococcus pneumoniae in pre- and post-conjugate vaccine eras: a United States perspective [Text] / L. Kim, L. McGee, S. Tomczyk [et al.] // Clinical Microbiology Reviews. - 2016. - Vol. 29, № 3. - P. 525-552.

142. Kolditz, M. Community-acquired pneumonia in adults [Text] / M. Kolditz, S. Ewig // Deutsches Arzteblatt International. - 2017. - Vol. 114, № 49. - P. 838-848.

143. Kolsek-Sustersic, M. Nasopharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae and serotypes indentified among nursing home residents in comparison to the elderly and patients younger than 65 years living in domestic environment [Text] / M. Kolsek-Sustersic, A. Beg Krasnic, V. Mioc [et al.] // Zdravstveno Varstvo. - 2017. - Vol. 56, № 3. - P. 172-178.

144. Kovacs, E. Vaccine-driven serotype-rearrangement is seen with latency in clinical isolates: Comparison of carried and clinical pneumococcal isolates from the same time period in Hungary [Text] / E. Kovacs, J. Sahin-Toth, A. Tothpal [et al.] // Vaccine. -

2019. - Vol. 37, № 1. - P. 99-108.

145. Lee, H. Invasive pneumococcal disease caused by ceftriaxone-resistant Streptococcus pneumoniae in Taiwan [Text] / H.-Y. Lee, T.-L. Wu, L.-H. Su [et al.] // Journal of Microbiology, Immunology and Infection. - 2017. - Vol. 51, № 4. - P. 500509.

146. Leeds, I.L. Treating wisely: the surgeon's role in antibiotic stewardship [Text] / I.L. Leeds, A. Fabrizio, S.E. Cosgrove [et al.] // Annals of Surgery. - 2017. - Vol. 265, № 5. - P. 871-873.

147. Linares, J. Changes in antimicrobial resistance, serotypes and genotypes in Streptococcus pneumoniae over a 30-year period [Text] / J. Linares, C. Ardanuy, R. Pallares [et al.] // Clinical Microbiology and Infection. - 2010. - Vol. 16, № 5. - P. 401410.

148. Linden, van der M. Limited indirect effects of an infant pneumococcal vaccination program in an aging population [Text] / M. van der Linden, M. Imöhl, S. Perniciaro // Plos One. - 2019. - Vol. 14, № 8. - P. e0220453.

149. Lopez-Enriquez, C. Middle-ear fluid Streptococcus pneumoniae susceptibility and serotype and distribution in Mexican children with acute otitis media [Text] / C. Lopez-Enriquez, A. Blanco-Montero, L.E. Espinosa-Monteros [et al.] // Pediatrics. - 2008. -Vol. 121, № Supplement 2. - P. S129.

150. Malfroot, A. A cross-sectional survey of the prevalence of Streptococcus pneumoniae nasopharyngeal carriage in Belgian infants attending day care centres [Text] / A. Malfroot, J. Verhaegen, J.-M. Dubru [et al.] // Clinical Microbiology and Infection. - 2004. - Vol. 10, № 9. - P. 797-803.

151. Maraki, S. The evolving epidemiology of serotype distribution and antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae strains isolated from adults in Crete, Greece, 2009-2016 [Text] / S. Maraki, V.E. Mavromanolaki, D. Stafylaki [et al.] // Infection and Chemotherapy. - 2018. - Vol. 50, № 4. - P. 328-339.

152. Mayanskiy, N. Serotypes and antibiotic resistance of non-invasive Streptococcus pneumoniae circulating in pediatric hospitals in Moscow, Russia [Text] / N. Mayanskiy, N. Alyabieva, O. Ponomarenko [et al.] // International Journal of

Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 20, № 1. - P. 58-62.

153. McKee, G. Outbreak of invasive Streptococcus pneumoniae among an inner-city population in Victoria, British Columbia, 2016-2017 [Text] / G. McKee, A. Choi, C. Madill [et al.] // Canada Communicable Disease Report. - 2018. - Vol. 44, № 12. - P. 317-323.

154. Milucky, J. Streptococcus pneumoniae colonization after introduction of 13-valent pneumococcal conjugate vaccine for US adults 65 years of age and older, 2015-2016 [Text] / J. Milucky, M. de G. Carvalho, N. Rouphael [et al.] // Vaccine. - 2019. - Vol. 37, № 8. - P. 1094-1100.

155. Mitchell, A.M. Streptococcus pneumoniae: Virulence factors and variation [Text] / A.M. Mitchell, T.J. Mitchell // Clinical Microbiology and Infection. - 2010. - Vol. 16, № 5. - P. 411-418.

156. Modi, A.R. Community-acquired pneumonia: Strategies for triage and treatment [Text] / A.R. Modi, C.S. Kovacs // Cleveland Clinic Journal of Medicine. - 2020. - Vol. 87, № 3. - P. 145-151.

157. Moghnieh, R. Epidemiology of invasive and non-invasive pneumococcal infections in hospitalised adult patients in a Lebanese medical centre, 2006-2015 [Text] / R. Moghnieh, H. Tamim, L. Awad [et al.] // Journal of Infection and Public Health. - 2020. - Vol. 13, № 12. - P. 2092-2100.

158. Morales, M. Changes in the serotype distribution of Streptococcus pneumoniae causing otitis media after PCV13 introduction in Spain [Text] / M. Morales, G. Ludwig, M. Ercibengoa [et al.] // PLoS ONE. - 2018. - Vol. 13, № 12. - P. 1-12.

159. Moujaber, G.E. Molecular mechanisms and epidemiology of resistance in Streptococcus pneumoniae in the Middle East region [Text] / G.E. Moujaber, M. Osman, R. Raferi [et al.] // Journal of Medical Microbiology. - 2017. - Vol. 66, № 7. - P. 847858.

160. Nagai, K. Antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Moraxella catarrhalis clinical isolates from children with acute otitis media in Japan from 2014 to 2017 [Text] / K. Nagai, O. Kimura, H. Domon [et al.] // Journal of Infection and Chemotherapy. - 2019. - Vol. 25, № 3. - P. 229-232.

161. Nakanishi, N. Assessment of the local clonal spread of Streptococcus pneumoniae serotype 12F caused invasive pneumococcal diseases among children and adults [Text] / N. Nakanishi, T. Yonezawa, S. Tanaka [et al.] // Journal of Infection and Public Health.

- 2019. - Vol. 16, № 6, P. 867-872.

162. Neves, F.P.G. Nasopharyngeal carriage, serotype distribution and antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae among children from Brazil before the introduction of the 10-valent conjugate vaccine [Text] / F.P.G. Neves, T.C.A. Pinto, M.A. Correa [et al.] // BMC Infectious Diseases. - 2013. - Vol. 13, № 1. - P. 1-7.

163. Ngo, C.C. Predominant bacteria detected from the middle ear fluid of children experiencing otitis media: A systematic review [Text] / C.C. Ngo, H.M. Massa, R.B. Thornton [et al.] // PLoS ONE. - 2016. - Vol. 11, № 3. - P. 1-26.

164. Ousmane, S. Genetic determinants of tetracycline resistance in clinical Streptococcus pneumoniae serotype 1 isolates from niger [Text] / S. Ousmane, B.A. Diallo, R. Ouedraogo // Antibiotics. - 2018. - Vol. 7, № 1. - P. 1-9.

165. Pelfrene, E. Antimicrobial multidrug resistance in the era of COVID-19: a forgotten plight? [Text] / E. Pelfrene, R. Botgros, M. Calvaleri // Antimicrobial Resistance and Infection Control. - 2021. - Vol. 10, № 1. - P. 1-6.

166. Pfizer. 20-valent pneumococcal conjugate vaccine [Electronic resource] // Investor news-Press release. URL: https://investors.pfizer.com/investor-news/press-release-details/2019/Pfizer-Announces-Positive-Preliminary-Results-from-a-Proof-of-Concept-Phase-2-Study-B7471003-of-its-20-Valent-Pneumococcal-Conjugate-Vaccine-Candidate-Being-Investigated-for-the-Prevent (accessed: 18.11.2019).

167. Protasova, I.N. Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae, particularly serotype19A/ST320, which emerged in Krasnoyarsk, Russia [Text] / I.N. Protasova, T.-W. Wan, N.V. Bakhareva [et al.] // Microbiology and Immunology. - 2017.

- Vol. 61, № 9. - P. 359-370.

168. Ramirez, M. Molecular Epidemiology of Streptococcus pneumoniae [Text] / M. Ramirez, J.A. Carri5o, M. van der Linder [et al.] // Streptococcus Pneumoniae: Molecular Mechanisms of Host-Pathogen Interactions: Elsivier. - 2015. - P. 3-19.

169. Ramirez, M. Streptococcus pneumoniae [Text] / M. Ramirez // Molecular Medical

Microbiology: Elsivier. - 2015. - P. 1529-1546.

170. Richter, L. Invasive pneumococcal diseases in children and adults before and after introduction of the 10-valent pneumococcal conjugate vaccine into the Austrian national immunization program [Text] / L. Richter, D. Schmid, E.E. Kanitz [et al.] // PLoS ONE. - 2019. - Vol. 14, № 2. - P. 1-21.

171. Roland, M. Handbook of microbiological media / by Roland M. Atlas. - 2nd ed.: CRS Press. - 1997. - P. 1720.

172. Rosenblut, A. Etiology of acute otitis media and serotype distribution of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae in Chilean children <5 years of age [Text] / A. Rosenblut, C. Napolitano, A. Pereira [et al.] // Medicine. - 2017. - Vol. 96, № 6. - P. 6-11.

173. Sader, H.S. Antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae from North America, Europe, Latin America, and the Asia-Pacific Region: Results from 20 years of the SENTRY antimicrobial surveillance program (1997-2016) [Text] / H.S. Sader, R.E. Mendes, J. Le [et al.] // Open Forum Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 6, № Suppl 1. -P. S14-S22.

174. S Said, W.F. Serotype distribution and antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae isolates from adult patients in Jakarta, Indonesia [Text] / W.F. Said, E. Sukoto, M.M. Khoeri [et al.] // Journal of Infection and Public Health. - 2017. -Vol. 10, № 6. - P. 833-835.

175. Setchanova, L. Serotype changes and antimicrobial nonsusceptibility rates of invasive and non-invasive Streptococcus pneumoniae isolates after implementation of 10-valent pneumococcal nontypeable Haemophilus influenzae protein D conjugate vaccine (PHiD-CV) in Bulgaria [Text] / L. Setchanova, m. Murdjeva, I. Stancheva [et al.] // Brazilian Journal of Infectious Diseases. - 2017. - Vol. 21, № 4. - P. 433-440.

176. Sidorenko, S. Multicenter study of serotype distribution of Streptococcus pneumoniae nasopharyngeal isolates from healthy children in the Russian Federation after introduction of PCV13 into the National Vaccination Calendar [Text] / S. Sidorenko, W. Rennert, Y. Lobzin [et al] // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. - 2019. - Vol. 96, № 1. - P. 114914.

177. Song, J.H. Advances in pneumococcal antibiotic resistance [Text] / J.H. Song // Expert Review of Respiratory Medicine. - 2013. - Vol. 7, № 5. - P. 491-498.

178. Stacey, H.L. Safety and immunogenicity of 15-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV-15) compared to PCV-13 in healthy older adults [Text] / H.L. Stacey, J. Rosen, J.T. Peterson [et al.] // Human Vaccines and Immunotherapeutics. - 2019. - Vol. 15, № 3. - P. 530-539.

179. Suaya, J.A. Streptococcus pneumoniae serotype distribution and antimicrobial nonsusceptibility trends among adults with pneumonia in the United States, 2009 - 2017 [Text] / J.A. Suaya, R.E. Mendes, H.L. Sings [et al.] // Journal of Infection. - 2020. -Vol. 81, № 4. - P. 557-566.

180. Sundaram, N. Cost-effectiveness of 13-valent pneumococcal conjugate vaccination in Mongolia [Text] / N. Sundaram, C. Chen, J. Yoong [et al.] // Vaccine. - 2017. - Vol. 35, № 7. - P. 1055-1063.

181. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 11.0, 2021 [Electronic resource]. URL: https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Brea kpoint_tables/v_11.0_Breakpoint_Tables.pdf (assessed: 18.11.2019).

182. Thompson, A. Phase 1 trial of a 20-valent pneumococcal conjugate vaccine in healthy adults [Text] / A. Thompson, E. Lamberth, J. Severs [et al.] // Vaccine. - 2019. -Vol. 37, № 42. - P. 6201-6207.

183. Torres, A. Which individuals are at increased risk of pneumococcal disease and why? Impact of COPD, asthma, smoking, diabetes, and/or chronic heart disease on community-acquired pneumonia and invasive pneumococcal disease [Text] / A. Torres, F. Blasi, N. Dartois [et al.] // Thorax. - 2015. - Vol. 70, № 10. - P. 984-989.

184. Vadlamudi, N.K. Impact of 13-pneumococcal conjugate vaccine among adults: a systematic review and meta-analysis [Text] / N.K. Vladlamudi, A. Chen, F. Marra // Clinical infectious diseases: an official publication of the Infectious Diseases Society of America. - 2018. - Vol. 69, № 1. - P. 34-49.

185. Walters, J.A.E. Pneumococcal vaccines for preventing pneumonia in chronic obstructive pulmonary disease (Review) [Text] / J. A.E. Walters, J.N.Q. Tang, P. Poole

[et al.] // Cochrane Database of Systematic Reviews. - 2017. - P. 89.

186. Warda, K. Antibiotic resistance and serotype distribution of nasopharyngeal isolates of Streptococcus pneumoniae from children in Marrakech region (Morocco) [Text] / K. Warda, K. Oufdou, K. Zahlane [et al.] // Journal of Infection and Public Health. - 2013.

- Vol. 6, № 6. - P. 473-481.

187. Wattal, C. Prevalence of pneumococcal serotypes in adults >50 years of age [Text] / C. Wattal, N. Goel, S.P. Byotra // Indian Journal of Medical Microbiology. - 2017. -Vol. 35, № 1. - P. 95-100.

188. Weinberger, D.M. Pneumococcal vaccines for adults: What's next? [Text] / D.M. Weinberger, E.D. Shapiro // Clinical Infectious Diseases. - 2019. - Vol. 70, № 12. - P. 2493-2495.

189. Weiser, J.N. Streptococcus pneumoniae: transmission, colonization and invasion [Text] / J.N. Weiser, D.M. Ferreira, J.C. Paton // Nature Reviews Microbiology. - 2018.

- Vol. 16, № 6. - P. 355-367.

190. World Health Organization. Antibiotic resistance. // WHO. - 2018. [Electronic resource]. - URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/antibiotic-resistance (accessed: 18.11.2019).

191. World Health Organization. Antimicrobial resistance: global report on surveillance [Text] / World Health Organization // WHO Library Cataloguing-in-Publication Data. -2014. - P. 256.

192. World Health Organization. Tackling antimicrobial resistance in the COVID-19 pandemic [Text] / World Health Organization // Bulletin of the World Health Organization. - 2020. - Vol. 98, № 7. - P. 441-508.

193. Wyeth Pharmaceutical Division of Wyeth Holdings LLC. PREVNAR 13-pneumococcal 13-valent conjugate vaccine injection, suspension [Electronic resource]. / Wyeth Pharmaceutical Division of Wyeth Holdings LLC. URL: http://labeling.pfizer.com/showlabeling.aspx?id=501#section-9 (accessed: 16.11.2019).

194. Yanagihara, K. Serotype distribution and antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae associated with invasive pneumococcal disease among adults in Japan [Text] / K. Yanagihara, K. Kosai, H. Mikamo [et al.] // International Journal of

Infectious Diseases. - 2021. - Vol. 102. - P. 260-268.

195. Zafar, M.A. Capsule type and amount affect shedding and transmission of Streptococcus pneumoniae [Text] / M.A. Zafar, S. Hamaguchi, T. Zangari [et al.] // mBio. - 2017. - Vol. 8, № 4. - P. 1-12.

196. Zhang, C. Systematic analysis of supervised machine learning as an effective approach to predicate ß-lactam resistance phenotype in Streptococcus pneumoniae [Text] / C. Zhang, Y. Ju, N. Tang [et al.] // Briefings in Bioinformatics. - 2019. - Vol. 00, № 00. - P. 1-9.

197. Zintgraff, J. Distribution of PCV13 and PPSV23 Streptococcus pneumoniae serotypes in Argentinean adults with invasive disease, 2013-2017 [Text] / J. Zingraff, S. Fossati, C.S. Pereira [et al.] // Revista Argentina de Microbiologia. - 2020. - Vol. 52, № 3. - C. 189-194.

198. Zivich, P.N. Streptococcus pneumoniae outbreaks and implications for transmission and control: a systematic review [Text] / P.N. Zivich, J.D. Grabenstein, S.I. Becker-Dreps [et al.] // Pneumonia. - 2018. - Vol. 10, № 11.- P. 1-15.