Состав, фенотипические и генотипические свойства микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Зубарева Владлена Дмитриевна

• Зубарева Владлена Дмитриевна
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Зубарева Владлена Дмитриевна

ВВЕДЕНИЕ

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Бактериальная инфекция как причина возникновения воспалительных заболеваний

репродуктивной системы и молочной железы коров

1.2 Патогенность и вирулентность бактерий, доминирующих в этиологии заболеваний

репродуктивного тракта и молочной железы коров

1.2.1 Гены вирулентности бактерий, ассоциированные с воспалением молочной железы

крупного рогатого скота

1.2.2 Гены вирулентности микроорганизмов, ассоциированные с воспалением

репродуктивного тракта крупного рогатого скота

1.3 Проблема антибиотикорезистентности в ветеринарной репродуктологии

1.3.1 Механизмы формирования антибиотикорезистентности

1.3.2 Гены антибиотикорезистентности бактерий, ассоциированные с воспалением молочной

железы крупного рогатого скота

1.3.3 Гены антибиотикорезистентности микроорганизмов, ассоциированные с воспалением

репродуктивного тракта крупного рогатого скота

1.4 Контроль и сдерживание распространения антибиотикорезистентности в

животноводстве

1.5 Заключение по обзору литературы

2 СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1.1 Материалы исследований

2.1.2 Проведение микробиологических исследований для изучения состава и фенотипических свойств микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы крупного рогатого скота

2.1.3 Определение состава микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров

методами ПЦР и секвенирования гена 16S рРНК

2.1.4 Поиск взаимосвязи микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта крупного рогатого скота

2.1.5 Определение антибиотикочувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам

2.1.6 Молекулярно-генетическая идентификация детерминант антибиотикорезистентности и вирулентности этиологически значимых микроорганизмов

2.1.7 Разработка тест-систем для детекцииfimA иfimH- факторов адгезии E. coli

2.2 РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.2.1 Уровень распространения воспалительных заболеваний молочной железы и

репродуктивного тракта коров

2.2.2 Изучение состава микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров

культуральным методом

2.2.3 Изучение состава микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров

методами ПЦР и секвенирования регионов V3 и V4 16S рРНК

2.2.4 Поиск взаимосвязи микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта крупного

рогатого скота

2.2.5 Фенотипические свойства микроорганизмов репродуктивного тракта и молочной железы

коров

2.2.5.1 Определение антибиотикочувствительности микроорганизмов к антибактериальным

препаратам

2.2.5.2 Динамика антибиотикорезистентности микроорганизмов, выделенных из

репродуктивного тракта и молочной железы коров

2.2.6 Распространение генетических детерминант антибиотикорезистентности

микроорганизмов

2.2.7 Распространение генетических детерминант вирулентности микроорганизмов

2.2.7.1 Разработка тест-систем для детекции факторов адгезии и биопленкообразования у

изолятов E. coli, выделенных из репродуктивного тракта и молочной железы коров . 88 2.2.8 Анализ комбинаций генов антибиотикорезистентности и вирулентности у изолятов микроорганизмов репродуктивного тракта и молочной железы коров при

воспалительном процессе

2.2.9 Расчет экономической эффективности разработанных тест-систем для ПЦР

2.2.10 Рекомендации по рациональной антибиотикотерапии воспалительных заболеваний

молочной железы и репродуктивного тракта коров

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

Практические предложения

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Приложение А

Приложение Б

Приложение В

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Состав, фенотипические и генотипические свойства микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Воспалительные заболевания молочной железы и репродуктивного тракта являются одними из наиболее частых причин преждевременной выбраковки коров молочных стад, на их долю приходится более 30% (Liang D., 2017; Джавадов Э.Д., 2021; Семиволос А.М., 2021) [7, 32, 240]. Проблема сохранения репродуктивного и продуктивного здоровья сельскохозяйственных животных обусловлена особенностями высокопродуктивных коров, связанными с нарушением обменных процессов (Plemyashov K., 2019) [306], повышением функциональной нагрузки на органы, снижением фертильности, иммунной реактивности (Петрова О.Г., 2016) [27]. На этом фоне могут возникать бактериальные инфекции, приводящие к снижению удоев и качества молока, увеличению интервалов между отелами, затрат на терапию, к изоляции и возможной выбраковке высокопродуктивных животных (Донник И.М., 2017; Шкуратова И.А., 2022) [8, 40]. В этой связи представляется интересным изучить состав, фенотипические и генотипические свойства микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта коров (Соколова О.В., 2021; Fursova K., 2020). [35, 146].

Одним из аспектов данного направления является изучение развития и распространения антибиотикорезистентности микроорганизмов, играющих важную роль в этиологии и патогенезе воспалительных заболеваний. Антибиотикорезистентность - одна из приоритетных проблем в области медицины и агропродовольственной сферы, и многие страны признают ее серьезной угрозой глобальному здравоохранению, продовольственной безопасности и устойчивому развитию общества (Charani E., 2021; Kostyanev T., 2015; Krockow E.M., 2019) [94, 224, 229]. Антибиотики, применяемые у сельскохозяйственных животных, тесно связаны с теми, что используются в медицине, в результате существуют риски появления устойчивости к ним, межвидовой передачи резистентных бактерий или генетических детерминант резистентности от животных к человеку (Иванова О.Е., 2021; Данилова Н.В., 2019) [6, 12].

Существуют различные пути решения проблемы антибиотикорезистентности. Значительное количество публикаций отечественных авторов посвящено ветеринарному мониторингу антибиотикорезистентности среди изолятов микроорганизмов, вызывающих заболевания у крупного рогатого скота, в том числе изучающих многолетнюю динамику развития антибиотикорезистентности отдельных штаммов микроорганизмов (Плешакова В.И., 2023; Глотова Т.И., 2023; Makarov D.A., 2022; Джавадов Э.Д., 2021; Макавчик С.А., 2021; Bezborodova N.A., 2020; Исакова М.Н., 2022; Бородкина И.В., 2019; Артемьева О.А., 2016; Andriyanov P.A., 2021) [1, 2, 4, 7, 14, 21, 30, 59, 73, 262]. Локальный и региональный мониторинг антибиотикорезистентности имеет решающее значение для понимания путей распространения и отбора резистентных микроорганизмов, а также рисков для здоровья человека, связанных с

распространением устойчивых микроорганизмов в окружающей среде (Кротова А.Л.; Bengtsson-Palme J., 2023; Koba I.S., 2021) [19, 72, 221].

Многие авторы в качестве решения проблемы предлагают применять альтернативные средства терапии, например интерфероны (Шабунин С.В., 2022; Скориков В.Н., 2020) [33, 37], противомаститные вакцины (Agoltsov V.A., 2019; Исакова М.Н., 2020) [13, 48], пробиотические препараты (Algburi, A., 2021; Шахов А.Г., 2018; Самуйленко А.Я., 2019; Малков С.В., 2020; Korostylev N., 2020; Popov I.V., 2024) [23, 31, 39, 53, 223, 310], фитобиотики (Krivonogova A.S., 2021; Poryvaeva A.P., 2023) [227, 311] и бактериофаги (Кривоногова А.С., 2023) [18], а также антибиотики в комбинации с альтернативными средствами (Шантыз А.Х., 2020) [38].

В Российской Федерации утверждены Стратегия предупреждения распространения антимикробной резистентности в РФ на период до 2030 г. (Распоряжение Правительства РФ от 25.09.2017 г. № 2045-р) и Приказ Минсельхоза России от 18.11.2021 №771 «Об ограничении использования антибактериальных препаратов для лечения сельскохозяйственных животных», которые определяют важность проведения микробиологического мониторинга, включающего изучение фенотипических и молекулярно-генетических свойств микроорганизмов, в том числе резистентности к антимикробным препаратам и разработку рекомендаций по рациональной антибиотикотерапии, что является ключевой проблемой, лежащей в центре настоящего исследования.

Степень научной разработанности проблемы. Выбор темы исследования обусловлен ее актуальностью и необходимостью решения данной проблемы. Анализ литературных данных показал, что на сегодняшний день достаточно подробно изучены этиология и патогенез маститов и эндометритов у коров с использованием классических микробиологических методов исследований (Захарова О.И., 2018), механизмы формирования антибиотикорезистентности и вирулентности у возбудителей (Egorov A.M., 2018) [10, 123]. Практически отсутствуют данные отечественных исследований об особенностях вирулома приоритетных микроорганизмов, вызывающих воспалительные заболевания молочной железы и репродуктивного тракта коров, включая гены, обуславливающие адгезию к клеткам эпителия, биопленкообразование, инвазию, экзо- и эндотоксинообразование. Следует отметить недостаточное количество исследований резистома микробиоты репродуктивного тракта коров. Отсутствуют данные о применении метагеномного анализа для поиска взаимосвязи между микробиотой молочной железы и репродуктивного тракта коров и изучения общей бактериальной этиологии заболеваний. Необходимо решение вопроса доступности средств диагностики антибиотикорезистентности и вирулентности микроорганизмов в животноводстве.

Таким образом, проблематика работы соответствует актуальным направлениям современной ветеринарной медицины, приоритетному направлению предупреждения распространения антимикробной резистентности.

Вышеизложенное определило цель и задачи настоящего исследования.

Цель и задачи. Целью исследований являлось изучение состава, фенотипических и генотипических свойств микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров.

Задачи. Для достижения цели были поставлены следующие задачи:

1. Изучить состав микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров на основании методов микробиологии и молекулярно-генетических методов исследования (ПЦР, секвенирование гена 16S рРНК).

2. Провести поиск взаимосвязи микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта коров.

3. Определить фенотипические свойства микроорганизмов репродуктивного тракта и молочной железы коров и их устойчивость к антимикробным препаратам.

4. Изучить уровень распространения генетических детерминант антибиотикорезистентности и вирулентности, в том числе их комбинаций, у микроорганизмов, выделенных из репродуктивного тракта и молочной железы коров.

5. Разработать и оптимизировать тест-системы для детекции генов антибиотикорезистентности и вирулентности у клинически значимых в патогенезе воспалений репродуктивного тракта и молочной железы микроорганизмов.

Научная новизна. Получены новые данные о составе микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров. Впервые при помощи секвенирования 16S рРНК изучена взаимосвязь между микробиотой молочной железы и репродуктивного тракта коров при воспалительном процессе. Определена степень распространения антибиотикорезистентности микроорганизмов в сельскохозяйственных организациях Свердловской области, результаты по исследованию антибиотикочувствительности выделенных изолятов являются частью метаданных многоцентровых исследований и представлены на онлайн платформе AMRcloud.net, предназначенной для использования ветеринарными специалистами. Подана заявка на регистрацию базы данных «База данных генетических детерминант антибиотикорезистентности бактерий микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта крупного рогатого скота» (Дата подачи заявки в Роспатент: 07.02.2025 г.).

Впервые дана оценка и проведено картирование распространения генетических детерминант антибиотикорезистентности изолятов и культур микроорганизмов, выделенных из репродуктивного тракта и молочной железы коров Свердловской области. Разработаны и оптимизированы тест-системы для детекции генов антибиотикорезистентности и вирулентности

микроорганизмов, участвующих в патогенезе мастита и воспалительных заболеваний репродуктивного тракта.

Теоретическая и практическая значимость работы. Теоретическая значимость работы определяется получением новых знаний о составе микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта коров и определении ее взаимосвязи при воспалительном процессе на основе комплексных микробиологических исследований. Изучены фенотипические и молекулярно-генетические особенности Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Streptococcus spp., Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis, Enterobacter spp., Pseudomonas aeruginosa, Bacillus spp., циркулирующих в сельскохозяйственных организациях Свердловской области. Расширено современное представление о распространении генов, детерминирующих факторы вирулентности и антибиотикорезистентности микроорганизмов, наиболее часто ассоциированных с заболеваниями молочной железы и репродуктивного тракта крупного рогатого скота. Изучение механизмов действия значимых генов вирулентности и антибиотикорезистентности возбудителей воспалительных заболеваний молочной железы и репродуктивного тракта могут послужить основой для разработки профилактических мер, рационального выбора противомикробных препаратов и разработки альтернативных методов терапии.

Научно-практическая значимость работы определяется разработкой и оптимизацией тест-систем для детекции генов антибиотикорезистентности и вирулентности бактерий, имеющих ключевое значение в патогенезе заболеваний животных, а также результатами мониторинга, размещенными на онлайн-платформе AMR.cloud.net, которые могут использоваться при разработке стратегии противомикробной терапии.

В практическом плане результаты работы могут быть востребованы практикующими ветеринарными врачами, преподавателями и учащимися ВУЗов, научными работниками для решения задач по предотвращению распространения антибиотикорезистентности микроорганизмов, разработки рациональной антибиотикотерапии, привлечения внимания общественности к данной проблеме.

Методология и методы исследований. Исследования проводили в 2021-2024 гг., в отделе геномных исследований и селекции животных и отделе ветеринарно-лабораторной диагностики с испытательной лабораторией в Уральском НИВИ - структурном подразделении ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН. Проведен ретроспективный анализ динамики антибиотикорезистентности (2019 - 2023 гг.). Для достижения цели и решения поставленных задач использованы микробиологические, молекулярно-генетические, биоинформатические и статистические методы исследований.

Научные положения, выносимые на защиту.

1. Состав микробиоты репродуктивного тракта и молочной железы коров при воспалении характеризуется снижением видового разнообразия по сравнению со здоровыми животными и имеет взаимосвязь между относительным содержанием некоторых микроорганизмов.

2. Среди изолятов микроорганизмов, выделенных из репродуктивного тракта и молочной железы коров, широкое распространение имеют бактерии с фенотипической антибиотикорезистентностью, в том числе мультирезистентностью к нескольким группам антибактериальных средств.

3. Микроорганизмы, этиологически значимые в индуцировании воспалительного процесса молочной железы и репродуктивного тракта коров, характеризуются наличием генов антибиотикорезистентности, расположенных на мобильных генетических элементах, что способствует их дальнейшему распространению.

4. Высокая частота встречаемости генов вирулентности fimA, fimH у E. coli и fnbA, fnbB, luks-PV, lukED, seg у S. aureus свидетельствует о важной роли факторов адгезии, инвазии, токсиногенности в развитии патологического процесса и персистировании возбудителей инфекции.

5. Разработанные и оптимизированные ПЦР-тест-системы для диагностики генетических детерминант антибиотикорезистентности и вирулентности показали высокую чувствительность и эффективность при определении молекулярно-генетических свойств микроорганизмов, циркулирующих на животноводческих предприятиях.

Степень достоверности и апробация результатов. Достоверность результатов работы, обоснованность основных положений и выводов подтверждается использованием достаточного числа объектов (животных) и предметов исследований (проб), всесторонним изучением выполненных ранее научно-исследовательских работ, использованием современных методов статистической обработки данных с применением MS Ехсе1 2013, Usearch v.10.0, SINTAX, 16S RDP v.16, BLAST+ 2.12.0, STATISTICA v.12, выполнением научных исследований в испытательной лаборатории, имеющей лицензию на осуществление деятельности в области использования возбудителей инфекционных заболеваний человека и животных и генно-инженерно-модифицированных организмов III и IV степени потенциальной опасности (лицензия №66.01.35.001.Л000003.03.12 от 11.03.2012).

Результаты исследований вошли в отчеты о научно-исследовательской работе Уральского НИВИ - структурного подразделения ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН в рамках выполнения Государственного задания Минобрнауки России № 0532-2021-0004 «Разработка методологических подходов к мониторингу, контролю и сдерживанию

антибиотикорезистентности оппортунистических микроорганизмов в животноводстве» (2021 -2024), Проекта РФФИ и Свердловской области № 20-416-660004 «Молекулярно-генетическая и фенотипическая характеристика микробиоты репродуктивной системы крупного рогатого скота» (2021-2022), представлены и одобрены на конференциях различного уровня: «Veterinary science - sustainable cooperation» (Монголия, 2021), «Наука, техника и развитие инновационных технологий» (Ашхабад, Туркменистан, 2021), «Наука, техника и инновационные технологии в период Возрождения новой эпохи могущественного государства» (Ашхабад, Туркменистан, 2022), «От модернизации к опережающему развитию: обеспечение конкурентоспособности и научного лидерства АПК» (Екатеринбург, 2022), «Научно -технический и социально-экономический потенциал развития АПК РФ» (Нальчик, 2022), «Научные достижения генетики и биотехнологии в ветеринарной медицине и животноводстве» (Екатеринбург, 2023), «Научные достижения в ветеринарии и животноводстве: от теории к практике» (Екатеринбург, 2024), «Антибиотики в ветеринарии» (Барнаул, 2024). Результаты работы используются в учебном процессе Учебного центра повышения квалификации ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН для специалистов аграрного сектора и научно-исследовательских учреждений и в образовательных программах по направлениям 36.05.01 «Ветеринария» и 36.03.02 «Зоотехния» в ФГБОУ ВО «Уральский ГАУ» (Приложение А).

Личный вклад автора. Планирование научных исследований, постановка целей и задач проводились совместно с научным руководителем, доктором ветеринарных наук, Соколовой О.В. Автором лично проанализированы данные литературы, освоены методы работы, выполнены отбор образцов для исследований и лабораторные эксперименты, проведены анализ и статистическая обработка полученных результатов, сформулированы выводы. Обсуждение и подготовка статей к публикации проводились совместно с научным руководителем. Доля участия соискателя при выполнении диссертационной работы составляет 80%.

Микробиологические исследования проводили совместно со старшим научным сотруднико отдела ветеринарно-лабораторной диагностики с испытательной лабораторией ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН Лысовой Я.Ю., молекулярно-генетические исследования проводили совместно со старшим научным сотрудником отдела геномных исследований и селекции животных ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН, к.в.н. Безбородовой Н.А. и научным сотрудником отдела ветеринарно-лабораторной диагностики с испытательной лабораторией Кожуховской В.В. Секвенирование ДНК выполнено сотрудниками ЦКП «Геномика» Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (Новосибирск). Статистическая обработка данных, сравнение относительной численности бактериальных таксонов на уровне филумов, семейств и ОТЕ в парном тесте Манна-Уитни для непараметрических данных по несвязанным измерениям, подсчет индексов Р-биоразнообразия с применением коэффициента

Жаккарда Kj выполнены совместно с младшим научным сотрудником отдела геномных исследований и селекции животных ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН Бытовым М.В.

Публикация результатов исследования. По теме диссертации опубликовано 16 научных работ, в том числе научных статей в изданиях, рекомендованных ВАК РФ - 7 (журналы: «Труды Кубанского государственного аграрного университета» - 3, «Ветеринарный фармакологический вестник» - 1, «Ветеринария сегодня» - 2, «Пермский аграрный вестник» - 1); 4 публикации в изданиях, индексируемых в международных базах данных Web of Science и Scopus; 1 методические рекомендации.

Объем и структура диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, заключения, материалов и методов исследования, результатов исследования, обсуждения результатов, выводов и списка литературы и приложений. Текст изложен на 158 страницах, проиллюстрирован 22 рисунками, включает 23 таблицы, список литературы содержит 419 библиографических источников, в том числе 378 иностранных.

Благодарности. Автор выражает глубокую признательность своему научному руководителю, д.в.н. Соколовой О.В. за поддержку и всестороннюю помощь при подготовке диссертационной работы; члену-корреспонденту РАН, д.с.-х.н., профессору Зезину Никите Николаевичу; академику РАН, д.б.н., профессору Донник И.М. и члену-корреспонденту РАН, д.в.н., профессору Шкуратовой И.А. за содействие в проведении исследований; к.б.н. Кабилову М.Р. за возможность проведения секвенирования на базе ЦКП «Геномика».

Автор выражает признательность всем сотрудникам отдела геномных исследований и селекции животных, а также сотрудникам отдела ветеринарно-лабораторной диагностики с испытательной лабораторией ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН д.б.н. Кривоноговой А.С., к.в.н. Лысову А.В., старшему научному сотруднику Лысовой Я.Ю. и научному сотруднику Кожуховской В.В. за участие в проведении исследований и доброжелательную рабочую атмосферу.

Автор благодарит коллектив Свердловской областной ветеринарной станции по борьбе с болезнями животных, руководителей, зоотехнических и ветеринарных специалистов сельскохозяйственных предприятий, на базе которых проведены исследования.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Бактериальная инфекция как причина возникновения воспалительных заболеваний репродуктивной системы и молочной железы коров

В первые 30 дней лактации коровы подвержены высокому риску возникновения как инфекционных заболеваний (метрит, мастит), так и нарушению обмена веществ (гипокальциемия, кетоз). Данные заболевания, возникающие в раннем послеродовом периоде, наносят значительный экономический ущерб молочному скотоводству, так как уменьшают производство молока, увеличивают затраты на лечение, негативно влияют на репродуктивную функцию и увеличивают риск выбраковки животных [240].

Мастит, проявляющийся воспалением молочной железы, является одним из самых распространенных заболеваний молочного скота [192].

По этиологическому происхождению маститы можно разделить на 3 типа:

- колиформные, возбудителями которых являются E. coli, Enterobacter aerogenes, Klebsiella pneumoniae, Serratia marcescens. Резервуаром колиформного мастита является окружающая среда, в основном данный мастит имеет клиническую форму проявления;

- инфекционный (контагиозный), возникновение которого связано с патогенными микроорганизмами, передающимися от одной коровы к другой через доильные установки или руки операторов машинного доения - S. aureus, Streptococcus agalactiae, Streptococcus uberis, Corynebacterium bovis, Streptococcus dysgalactiae. Данный мастит чаще протекает в хронической форме [232];

- мастит, вызванный микоплазмой (Mycoplasma bovis) или водорослями (Prototheca) [70,

141].

Мастит крупного рогатого скота можно разделить на 3 типа в зависимости от формы проявления, а именно клинический, субклинический и хронический мастит. Для клинического мастита крупного рогатого скота характерны следующие клинические признаки: покраснение, отек вымени, гипертермия, в секрете молочной железы обнаруживаются хлопья и сгустки. Клинический мастит можно разделить на сверхострый, острый и подострый в зависимости от степени воспаления. Тяжелые случаи клинического мастита также могут приводить к неблагоприятному исходу. В отличие от клинического мастита, субклинический мастит протекает без видимых клинических признаков, однако снижается удой и качество молока. Хронический мастит представляет собой воспалительный процесс, длящийся несколько месяцев, с клиническими обострениями, возникающими через нерегулярные промежутки времени [97].

Клиническую форму мастита можно подразделить на следующие виды в зависимости от характера секрета молочной железы и тяжести течения заболевания:

1. Серозный мастит - чаще возникает после отела, характеризуется снижением продуктивности, отечностью и покраснением вымени, секрет молочной железы водянистый, голубоватого оттенка, иногда с примесью хлопьев [287].

2. Катаральный мастит - поражается одна иди две доли вымени, при этом продуктивность обычно не снижается, однако изменяются биохимические и физические показатели молока. Возбудителями данной формы мастита чаще всего являются S. agalactiae, M. bovis.

3. Гнойный мастит - у животного наблюдается воспалительный отек пораженной доли, хромота со стороны воспаления, лихорадка. С возникновением гнойного мастита обычно связаны следующие патогены: S. agalactiae, S. uberis, S. dysgalactiae, S. aureus, M. bovis.

4. Гнойно-катаральный мастит проявляется лихорадкой, угнетением, снижением молочной продуктивности, воспалительным отеком пораженных долей вымени. Характер экссудата из пораженной доли вымени - слизисто-гнойный, содержит сгустки казеина, хлопья гноя белого, желтоватого или красноватого цвета [256].

5. Фибринозный мастит часто возникает как осложнение катарального мастита и связан c S. aureus. Золотистый стафилококк вырабатывает фермент коагулазу, обеспечивающую преобразование фибриногена в фибрин. Фибрин обильно откладывается в пораженной ткани молочной железы [54].

6. Геморрагический мастит - наиболее часто возникает в результате технологических нарушений доения, травмирования вымени, а также на фоне дефицита витамина D. Возбудители, ассоциированные с данным заболеванием: Pasteurella multocida, S. aureus, S. agalactiae, Bacillus cereus и Bacillus subtilis [353].

7. Острый гангренозный мастит - заболевание, связанное с патогенными биологическими агентами - S. aureus, Clostridiumperfringens и E. coli. Зачастую пораженные доли вымени некротизируются [296].

Еще одной формой воспаления молочной железы коров является субклинический мастит, который встречается в 15-40 раз чаще, чем клинический, а инфицированные коровы становятся основным источником инфекции для всего стада [330]. Распространение инфекции происходит, когда не соблюдаются профилактические меры, такие как использование перчаток во время доения или несоблюдение очередности доения коров, так как доение больных маститом коров должно осуществляться в последнюю очередь [43, 284]. Чаще данная форма мастита ассоциирована с S. aureus и Streptococcus spp. [285].

Хронический мастит - воспалительный процесс молочной железы коров, длящийся несколько месяцев, с клиническими обострениями, возникающими через неравные промежутки времени [97]. Чаще всего ассоциирован с S. aureus и S. uberis.

Сравнительно недавно молочная железа считалась стерильным органом, однако применение генетических методов количественного определения и секвенирования бактериальной ДНК позволило идентифицировать в данном локусе комменсальные микробные сообщества. Таким образом, мастит рассматривается не только как заболевание, вызванное патогенным агентом, но и обусловленное развитием дисбактериоза, то есть дисбаланса микробиоты молочной железы. Особенно это касается бактерий родов Staphylococcus, Streptococcus, Pseudomonas, Corynebacterium и Burkholderia, которые входят в состав нормофлоры молочной железы коров, но при нарушении разнообразия микробиоты могут вызывать мастит [318].

Основными возбудителями мастита, выделяемыми при помощи культуральных методов, являются S. aureus, E. coli, Klebsiella spp., Streptococcus spp., Mycoplasma spp., Enterobacter spp., Bacillus spp. и Corynebacterium [150, 182]. Секвенирование нового поколения и биоинформатический анализ позволили перейти от классической микробиологии к геномной характеристике микробиома, связанного с инфекционными заболеваниями, в том числе маститом. Для изучения микробиома молочной железы при мастите используется метод секвенирования гена 16S рРНК, который позволяет идентифицировать более 90% изолятов на уровне рода [170]. В исследовании Hoque M.N. при помощи полногеномного секвенирования обнаружены различные штаммы Escherichia, Aeromonas, Klebsiella, Shigella, Enterobacter, Salmonella, Pantoea, Citrobacter, Shewanella, Lactococcus и Cronobacter, связанные с колонизацией молочной железы и вызывающие различные формы мастита [183]. Например, для клинического и хронического мастита было характерно более высокое содержание штаммов Pseudomonas, которые потенциально могут вызывать оппортунистические инфекции. Помимо этого, в пробах молока от коров с субклиническим маститом отмечалось существенно более низкое содержание различных штаммов Acinetobacter и Pseudomonas по сравнению с образцами молока от коров с клиническими формами мастита. В образцах молока от коров с субклиническим маститом преобладали различные штаммы Lactococcus, Chryseobacterium, Ralstonia, Serratia, Riemerella, Streptococcus и Pedobacter. Метагеном молока от коров с субклиническим маститом показал взаимосвязь с пятью филумами бактерий (Deinococcus, Acidobacteria, Chrysiogenetes, Deferribacteres и Chloroflexi), а два типичных филума бактерий (Thermotogae и Verrucomicrobia) присутствовали только в образцах молока от коров без признаков воспаления молочной железы. Бактериальные филумы (Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria и Bacteroidetes) были общими для субклинического, клинического, хронического

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Зубарева Владлена Дмитриевна, 2025 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Артемьева, О.А. Антибиотикорезистентность штаммов Staphylococcus aureus, выделенных из молока высокопродуктивных коров / О.А. Артемьева, Д.А. Никанова, Е.Н. Котковская, Е.А. Гладырь, А.В. Доцев, Н.А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. - 2016. - Т. 51. - № 6. - С. 867-874. - DOI: 10.15389/agrobiology.2016.6.867rus.

2. Бородкина, И.В. Биологические свойства изолятов Staphylococcus aureus, выделенных из молока и молочной продукции, произведенных на территории республики Крым / И.В. Бородкина // Ветеринария сегодня. - 2019. - № 4. - С. 13-19. - DOI: 10.29326/2304-196X-2019-4-31-13-18.

3. Галеева, Г.З. О значении полирезистентных штаммов патогенных микроорганизмов в офтальмологической практике / Г.З. Галеева, А.Н. Самойлов, А.Ю. Расческов // Вестник офтальмологии. - 2015. - Т. 131. - № 2. - С. 110-114. - DOI: 10.17116/oftalma20151312110-114.

4. Глотова, Т.И. Устойчивость возбудителей мастита у коров к антибактериальным препаратам / Т.И. Глотова, С.В. Котенева, Т.Е. Судоргина, А.В. Нефедченко, А.Г. Глотов // Зоотехния и ветеринария. - 2023. - № 3. - С. 95-100. - DOI: 10.36718/1819-4036-2023-3-95-100.

5. ГОСТ 32901-2014 «Межгосударственный стандарт. Молоко и молочная продукция. Методы микробиологического анализа». - М.: Межгосударственный Совет по стандартизации, метрологии и сертификации, 2014. - 24 с.

6. Данилова, Н.В. Распространение антибиотикорезистентности в почве при ее обработке компостами, содержащими окситетрациклин и гены устойчивости к нему / Н.В. Данилова, П.А. Курынцева, М.Ш. Тагиров, П.Ю. Галицкая, С.Ю. Селивановская // Ученые записки Казанского университета. - 2019. - Т. 161. - № 3. - С. 395-407. - DOI: 10.26907/2542-064X.2019.3.395-407.

7. Джавадов, Э.Д. Микрофлора, выделяемая при мастите и определение ее чувствительности к антибактериальным препаратам / Э.Д. Джавадов, А.А. Стекольников, М.А. Ладанова, О.Б. Новикова // Международный вестник ветеринарии. - 2021. - № 1. - С. 13-17. -DOI: 10.17238/issn2072-2419.2021.1.13.

8. Донник, И.М. Молекулярно-генетические и иммунно-биохимические маркёры оценки здоровья сельскохозяйственных животных / И.М. Донник, И.А. Шкуратова // Вестник Российской академии наук. - 2017. - Т. 87. - № 4. - С. 362-366. - DOI: 10.7868/S0869587317040132.

9. Дьячкова, В.С. Механизмы резистентности микроорганизмов к Р-лактамным антибиотикам / В.С. Дьячкова, Т.А. Бажукова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2014. - № 4. - С. 101-109.

10. Захарова, О.И. Антибиотикорезистентность: Эволюционные предпосылки, механизмы, последствия / О.И. Захарова, Е.А. Лискова, Т.В. Михалева, А.А. Блохин // Аграрная наука Евро -Северо-Востока. - 2018. - Т. 64. - № 3. - С. 13-21. - DOI: 10.30766/2072-9081.2018.64.3.13-21.

11. Зубарева, В.Д. Молекулярные механизмы и генетические детерминанты устойчивости к антибактериальным препаратам у микроорганизмов (обзор) / В.Д. Зубарева, О.В. Соколова, Н.А. Безбородова, И.А. Шкуратова, А.С. Кривоногова, М.В. Бытов // Сельскохозяйственная биология. - 2022. - Т. 57. - № 2. - С. 237-256. - doi: 10.15389/agrobiology.2022.2.237rus.

12. Иванова, О.Е. Ветеринарный мониторинг антимикробной резистентности в Российской Федерации / О.Е. Иванова, А.Н. Панин, С.Ю. Карабанов, Д.А. Макаров, А.А. Ахметзянова, М.А. Гергель // Аграрная Наука. - 2021. - № 4S. - С. 7-11. - DOI: 10.32634/0869-8155-2021-347-4-7-11.

13. Исакова, М.Н. Показатели качества молока высокопродуктивных коров на фоне применения противомаститной вакцины / М.Н. Исакова, У.В. Сивкова, М.В. Ряпосова, И.А. Шкуратова, А.В. Лысов // Ветеринария сегодня. - 2020. -№ 4. - С. 255-260. - DOI: 10.29326/2304-196X-2020-4-35-255-260.

14. Исакова, М.Н. Антибиотикорезистентность клинических изолятов Escherichia coli, выделенных от животных / М.Н. Исакова, О.В. Соколова, Н.А. Безбородова, А.С. Кривоногова, А.Г. Исаева, В.Д. Зубарева // Ветеринария сегодня. - 2022. - Vol. 11. - № 1. - C. 14-19. - DOI: 10.29326/2304- 196X-2022-11-1-14-19.

15. Калюк, А.Н. Методические рекомендации. Методы бактериологического исследования условно-патогенных микроорганизмов в клинической микробиологии. РСФСР: Министерство здравоохранения, 1991. - 34 c.

16. Клинические рекомендации. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Рекомендации МАКМАХ, 2021. - 222 c.

17. Коба, И.С. Клиническая картина и гистологические изменения при хроническом эндометрите у коров / И.С. Коба, М.С. Дубовикова, Е.Н. Новикова // Ученые записки казанской государственной академии ветеринарной медицины имени Н.Э. Баумана. - 2019. - Т. 239. - № 3.

- С. 141-145. - DOI: 10.31588/2413-4201-1883-239-3-141-145.

18. Кривоногова, А.С. Влияние препарата бактериофага на условно-патогенную микрофлору бройлеров / А.С. Кривоногова, А.Г. Исаева, И.М. Донник, Е.А. Логинов, Н.Б. Мусихина // Ветеринария Кубани. - 2023. - № 2. - C. 37-40. - DOI: 10.33861/2071-8020-2023-237-40.

19. Кротова, А.Л. Практическое применение онлайн-платформы AMRcloud для ветеринарного мониторинга антибиотикорезистентности возбудителей болезней зоонозного происхождения / А.Л. Кротова, С.А. Макавчик, А.А. Сухинин // Антибиотики и Химиотерапия.

- 2023. - Т. 68. - № 5-6. - С. 19-23. - DOI: 10.37489/0235-2990-2023-68-5-6-19-23.

20. Макавчик, С.А. Антибиотикорезистентность Klebsiella pneumoniae и практическое значение для ветеринарной медицины / С.А. Макавчик, М.С. Борисова // Нормативно-правовое регулирование в ветеринарии. - 2023. - № 1. - C. 26-30. - DOI: 10.52419/issn2782-6252.2023.1.26.

21. Макавчик, С.А. Антибиотикорезистентность микроорганизмов Staphylococcus aureus, изолированных от животных / С.А. Макавчик, А.Л. Кротова // Международный вестник ветеринарии. - 2021. - № 3. - С. 103-107. - DOI: 10.17238/issn2072-2419.2021.3.103.

22. Макаров Д.А., Иванова О.Е., Виноградова А.Г., Кузьменков А.Ю., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность зоонозных и индикаторных бактерий, выделяемых от продуктивных животных. Практическое руководство. - Смоленск: СГМУ, 2023. - 80 с.

23. Малков, С.В. Кормовая добавка на основе эндо- и экзометаболитов Bacillus subtilis -стимулятор молочной продуктивности коров / С.В. Малков, А.С. Красноперов, А.П. Порываева, Н А. Верещак, О.Ю. Опарина // Ветеринария Кубани. - 2020. - № 4. - С. 14-17. - DOI: 10.33861/2071 -8020-2020-4-19-22.

24. Манзенюк, О.Ю. Молекулярные системы регулирования формирования биопленок бактерий Pseudomonas aeruginosa / Манзенюк О.Ю., Фирстова В.В., Мухина Т.Н., Шемякин И.Г. // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2018. - Т. 73. - № 4. - С. 244-251. - DOI: 10.15690/vramn1010.

25. МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: Методические указания». М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. - 91 с.

26. МУК 13-7-2/2117 «Методические указания по бактериологической диагностике колибактериоза (эшерихиоза) животных». М.: Департамент ветеринарии Министерства сельского хозяйства, 2000. - 17 с.

27. Петрова, О.Г. Показатели иммунной и метаболической системы у коров / О.Г. Петрова, М.И. Барашкин // Аграрный вестник Урала. - 2016. - Т. 9. - № 151. - С. 47-50.

28. Племяшов, К.В. Клиника, морфология и эхография острого послеродового метрита у коров на высокотехнологичном молочном предприятии / К.В. Племяшов, В.С. Авдеенко, Г.С. Никитин, С.О. Лощинин // Генетика и разведение животных. - 2022. - № 4. - С. 124-131. - DOI: 10.31043/2410-2733 -2022-4-124-131.

29. Плешакова, В.И. Фенотипические и молекулярно-генетические методы определения антибиотикорезистентности микроорганизмов в ветеринарии / В.И. Плешакова, Н.А. Лещёва, И.Н. Кошкин // Вестник Красноярского государственного аграрного университета. - 2023. - Т. 8. - № 197. - С. 106-115. - DOI: 10.36718/1819-4036-2023-8-106-115.

30. Плешакова, В.И. Фенотипическая оценка резистентности культур микроорганизмов, выделенных от сельскохозяйственных животных с помощью метода MALDI-TOF MS / В.И.

Плешакова, Н.А. Лещёва, И.Н. Кошкин, Е.Н. Ручко // Зоотехния и ветеринария. - 2023. - Т. 2. -№ 42. - С. 128-133. - DOI: 10.47737I2307-2873_2023_42_128.

31. Самуйленко, А.Я. Комплексное применение пробиотиков и антибиотиков в лечении желудочно-кишечных заболеваний телят / А.Я. Самуйленко, Л.А. Неминущая, О.В. Провоторова, Д.Н. Филимонов, С.В. Енгашев, П.П. Красочко, И.В. Павленко // Ветеринария и кормление. -2019. - № 2. - С. 4-5. - DOI: 10.30917IATT-VK-1814-9588-2019-2-1.

32. Семиволос, A.M. Микрофлора содержимого матки коров при остром послеродовом гнойно-катаральном эндометрите и ее чувствительность к антибактериальным препаратам / A.M. Семиволос, В.А. Агольцов, А.А. Брюханова // Аграрный научный журнал. - 2021. - № 7. - С. 7173. - DOI: 10.28983Iasj.y2021i7pp71-73.

33. Скориков, В.Н. Рекомбинантные а- и у-интерфероны в многокомпонентной терапии коров при послеродовом эндометрите / В.Н. Скориков, А.Г. Нежданов, В.И. Михалев, В.А. Прокулевич, М.И. Потапович // Ветеринария. - 2020. - № 6. - С. 10-13. - DOI: 10.30896I0042-4846.2020.23.6.10-13.

34. Соколова, О.В. ПЦР-детекция генетических маркеров антибиотикорезистентности микроорганизмов, выделенных из молока больных маститом коров / О.В. Соколова, М.Н. Исакова, Н.А. Безбородова, М.В. Ряпосова // Ветеринария Кубани. - 2018. -№ 2. - С. 15-17.

35. Соколова, О.В. Антибиотикорезистентность микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта коров / О.В. Соколова, И.А. Шкуратова, Н.А. Безбородова, В.В. Кожуховская // Ветеринария. - 2021. - № 9. - С. 10-15. - DOI: 10.30896I0042-4846.2021.24.9.10-15.

36. Тищенко, А.С. Экзотоксины патогенных Escherichia coli / А.С. Тищенко, А.В. Степаненко, В.И. Терехов // Ветеринария Кубани. - 2020. - № 5. - С. 3-7. - DOI: 10.33861I2071-8020-2020-5-3-7.

37. Шабунин, С.В. Интерфероны-а и -у в клинической ветеринарной практике при профилактике и лечении инфекционных заболеваний у крупного рогатого скота и свиней (обзор) / С.В. Шабунин, Г.А. Востроилова, Н.А. Григорьева, М.С. Жуков, В.А. Грицюк // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. - 2022. - Vol. 23. - № 1. - С. 16-35. - DOI: 10.30766I2072-9081.2022.23.1.16-35.

38. Шантыз, А.Х. Разработка антибактериального препарата для лечения послеродовых эндометритов у коров / А.Х. Шантыз, И.С. Коба, Е.Н. Новикова, Г.А. Бурменская, А.О. Одех // Ветеринария и кормление. - 2020. - № 6. - С. 58-61. - DOI: 10.30917IATT-VK-1814-9588-2020-6-17.

39. Шахов, А.Г. Коррекция биоценоза влагалища у глубокостельных коров с использованием пробиотиков гипролам и симбитер-2 / А.Г. Шахов, Л.Ю. Сашнина, Т. А. Ерина //

Сельскохозяйственная биология. - 2018. - Vol. 53. - № 2. - С. 414-421. - DOI: 10.15389/agrobiology.2018.2.414rus.

40. Шкуратова, И.А. Биохимический профиль высокопродуктивных коров голштинской породы при первичном кетозе / И.А. Шкуратова, А.И. Белоусов, А.С. Красноперов, С.В. Малков // Ветеринария Кубани. - 2022. - № 4. - P. 7-9. - DOI: 10.33861/2071-8020-2022-4-7-9.

41. Abboud, Z. Molecular characterization of antimicrobial resistance and virulence genes of bacterial pathogens from bovine and caprine mastitis in Northern Lebanon / Z. Abboud, L. Galuppo, M. Tolone, M. Vitale, R. Puleio, M. Osman, G.R. Loria, M. Hamze // Microorganisms. - 2021. - Vol. 9. -№ 6. - P. 1148. - DOI: 10.3390/microorganisms9061148.

42. Abd El-Aziz, N. Virulence factors of Escherichia coli isolated from recurrent cases of clinical and subclinical mastitis in buffaloes / N. Abd El-Aziz, A. Lameay, A. Ammar, E. Zaki, B. Moshref, M. Refai // International Journal of Microbiological Research. - 2013. - Vol. 4. - P. 86-94. - DOI: 10.5829/idosi.ijmr.2013.4.1.71103.

43. Abebe, R. Bovine mastitis: Prevalence, risk factors and isolation of Staphylococcus aureus in dairy herds at Hawassa milk shed, South Ethiopia / R. Abebe, H. Hatiya, M. Abera, B. Megersa, K. Asmare // BMC Veterinary Research. - 2016. - Vol. 12. - № 1. - P. 270. -DOI: 10.1186/s12917-016-0905-3.

44. Achard, A. Emergence of macrolide resistance gene mph(B) in Streptococcus uberis and cooperative effects with rdmC-like gene / A. Achard, V. Guerin-Faublee, V. Pichereau, C. Villers, R. Leclercq //Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2008. - Vol. 52. - № 8. - P. 2767-2770. - DOI: 10.1128/AAC.00481-08.

45. Adame-Gómez, R. Genetic diversity and virulence factors of Staphylococcus aureus strains isolated from bovine udder skin / R. Adame-Gómez, J. Toribio-Jimenez, N. Castro-Alarcón, K. Talavera-Alarcón, J. Flores-Gavilan, S.-A. Pineda-Rodríguez, A. Ramírez-Peralta // Revista mexicana de ciencias pecuarias. - 2021. - Vol. 12. - № 3. - P. 655-680. - DOI: 10.22319/rmcp.v12i3.5646.

46. Addis, M.F. The bovine milk microbiota: Insights and perspectives from -omics studies / M.F. Addis, A. Tanca, S. Uzzau, G. Oikonomou, R.C. Bicalho, P. Moroni // Molecular BioSystems. - 2016.

- Vol. 12. - № 8. - P. 2359-2372. - DOI: 10.1039/c6mb00217j.

47. Adnane, M. A review of the diversity of the genital tract microbiome and implications for fertility of cattle / M. Adnane, A. Chapwanya // Animals (Basel). - 2022. - Vol. 12. - № 4. - P. - 1-14.

- DOI: 10.3390/ani12040460.

48. Agoltsov, V.A. Results of pre-clinical and clinical tests of organic hydroxyapatite as adjuvant of bacterial vaccine / V.A. Agoltsov, O.M. Popova, S.Y. Veselovsky, A.A. Chastov, A.M. Semivolos, N.V. Solotova // Advances in Animal and Veterinary Sciences. - 2019. - Vol. 7. - № 7. - P. 583-592. -DOI: 10.17582/journal.aavs/2019/7.7.583.592.

49. Ahmadi, E. Molecular detection and antimicrobial resistance patterns of shiga toxigenic Escherichia coli isolated from bovine subclinical mastitis milk samples in Kurdistan, Iran / E. Ahmadi, K. Mardani, A. Amiri // Archives of Razi Institute. - 2020. - Vol. 75. - № 2. - P. 169-177. - DOI: 10.22092/ari.2019.124238.1278.

50. Ahmed, A.M. Molecular characterization of antimicrobial resistance in gram-negative bacteria isolated from bovine mastitis in Egypt / A.M. Ahmed, T. Shimamoto // Microbiology and immunology. - 2011. - Vol. 55. - № 5. - P. 318-327. - DOI: 10.1111/j.1348-0421.2011.00323.x.

51. Aklilu, E. First mecC and mecA positive livestock-associated methicillin resistant Staphylococcus aureus (mecC MRSA/LA-MRSA) from dairy cattle in Malaysia / E. Aklilu, C. Hui Ying // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8. - № 2. - P. 147. - DOI: 10.3390/microorganisms8020147.

52. Alawneh, J.I. Survey and sequence characterization of bovine mastitis-associated Escherichia coli in dairy herds / J.I. Alawneh, B. Vezina, H.R. Ramay, H. Al-Harbi, A.S. James, M. Soust, R.J. Moore, T.W.J. Olchowy // Frontiers in veterinary science. - 2020. - Vol. 7. - P. 1-16. - DOI: 10.3389/fvets.2020.582297.

53. Algburi, A. Antimicrobial activity of Bacillus subtilis KATMIRA1933 and Bacillus amyloliquefaciens B-1895 against Staphylococcus aureus biofilms isolated from wound infection / A. Algburi, H.M. Al-Hasani, T.K. Ismael, A. Abdelhameed, R. Weeks, A.M. Ermakov, M.L. Chikindas // Probiotics and antimicrobial proteins. - 2021. - Vol. 13. - № 1. - P. 125-134. - DOI: 10.1007/s12602-020-09673-4.

54. Algharib, S.A. Nanoparticles for treatment of bovine Staphylococcus aureus mastitis / S.A. Algharib, A. Dawood, S. Xie // Drug delivery. - 2020. - Vol. 27. - № 1. - P. 292-308. - DOI: 10.1080/10717544.2020.1724209.

55. Ali, T. ESBL-producing Escherichia coli from cows suffering mastitis in China contain clinical class 1 integrons with CTX-M linked to ISCR1 / T. Ali, S. Ur Rahman, L. Zhang, M. Shahid, S. Zhang, G. Liu, J. Gao, B.Han // Frontiers in Microbiology. - 2016. - Vol. 7. - P. 1931. - DOI: 10.3389/fmicb.2016.01931.

56. Alonzo 3rd, F. The bicomponent pore-forming leucocidins of Staphylococcus aureus / F. Alonzo3rd, V.J. Torres // Microbiology and molecular biology reviews. - 2014. - Vol. 78. - № 2. - P. 199-230. - DOI: 10.1128/MMBR.00055-13.

57. Andrade, G.I. Identification of virulence factors by multiplex PCR in Escherichia coli isolated from calves in Minas Gerais, Brazil / G.I. Andrade, F.M. Coura, E.L. Santos, M.G. Ferreira, G.C. Galinari, E.J. Facury Filho, A.U. de Carvalho, A.P. Lage, M.B. Heinemann // Tropical animal health and production. - 2012. - Vol. 44. - № 7. - P. 1783-1790. - DOI: 10.1007/s11250-012-0139-8.

58. Andreoletti, O. Scientific opinion on the public health risks of bacterial strains producing extended-spectrum ß-lactamases and/or AMPC ß-lactamases in food and food-producing animals / O.

Andreoletti, H. Budka, S. Buncic, J.D. Collins, J. Griffin, T. Haid, AH. Havelaar, J. Hope, G. Klein, K. Koutsumanis, J. McLauchlin, C. Müller-Graf, C. Nguyen-The, B. Noerrung, L. Peixe, M.P. Maradona, A. Ricci, J. Sofos, J. Threlfall, I. Vägsholm, E. Vanopdenbosch // EFSA Journal. - 2011. - Vol. 9. - № 8. - P. 2322. - DOI: 10.2903/j.efsa.2011.2322.

59. Andriyanov, P.A. Antimicrobial resistance of Listeria monocytogenes strains isolated from humans, animals, and food products in Russia in 1950-1980, 2000-2005, and 2018-2021 / P.A. Andriyanov, P.A. Zhurilov, E.A. Liskova, T.I. Karpova, E.V. Sokolova, Y.K. Yushina, E.V. Zaiko, D.S. Bataeva, O.L. Voronina, E.K. Psareva, I.S. Tartakovsky, D.V. Kolbasov, S.A. Ermolaeva // Antibiotics (Basel). - 2021. - Vol. 10. - № 10. - P. - DOI: 10.3390/antibiotics10101206.

60. Aniba, R. Characterization of biofilm formation in uropathogenic Staphylococcus aureus and their association with antibiotic resistance / R. Aniba, A. Dihmane, H. Raqraq, A. Ressmi, K. Nayme, M. Timinouni, B. Hicham, A. Khalil, A. Barguigua // The Microbe. - 2024. - Vol. 2. - P. 100029. -DOI: 10.1016/j.microb.2023.100029.

61. Antok, F.I. Characterization of antibiotic and biocide resistance genes and virulence factors of Staphylococcus species associated with bovine mastitis in Rwanda / F.I. Antok, R. Mayrhofer, H. Marbach, J.C. Masengesho, H. Keinprecht, V. Nyirimbuga, O. Fischer, S. Lepuschitz, W. Ruppitsch, M. Ehling-Schulz, A.T. Fessler, S. Schwarz, S. Monecke, R. Ehricht, T. Grunert, J. Spergser, I. Loncaric // Antibiotics (Basel). - 2019. - Vol. 9. - № 1. - P. 1-17 - DOI: 10.3390/antibiotics9010001.

62. Arnold, R.S. Emergence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase-producing bacteria / R.S. Arnold, K.A. Thom, S. Sharma, M. Phillips, J. Kristie Johnson, D.J. Morgan // Southern medical journal. - 2011. - Vol. 104. - № 1. - P. 40-45. - DOI: 10.1097/SMJ.0b013e3181fd7d5a.

63. Ashraf, S. Clumping factor A of Staphylococcus aureus interacts with AnnexinA2 on mammary epithelial cells / S. Ashraf, J. Cheng, X. Zhao // Scientific Reports. - 2017. - Vol. 7. - P. 40608. - DOI: 10.1038/srep40608.

64. Aslam, N. Phylogenetic genotyping, virulence genes and antimicrobial susceptibility of Escherichia coli isolates from cases of bovine mastitis / N. Aslam, S.U. Khan, T. Usman, T. Ali // The Journal of dairy research. - 2021. - Vol. 88. - № 1. - P. 78-79. - DOI: 10.1017/S002202992100011X.

65. Atac, N. Fimbria targeting superparamagnetic iron oxide nanoparticles enhance the antimicrobial and antibiofilm activity of ciprofloxacin against quinolone-resistant E. coli / N. Atac, K. Onbasli, I. Koc, H. Yagci Acar, F. Can // Microbial biotechnology. - 2023. - Vol. 16. - № 11. - P. 20722081. - DOI: 10.1111/1751-7915.14327.

66. Baig, S. Novel SCCmec type XIII (9A) identified in an ST152 methicillin-resistant Staphylococcus aureus / S. Baig, T.B. Johannesen, S. Overballe-Petersen, J. Larsen, A.R. Larsen, M. Stegger // Infection, genetics and evolution. - 2018. - Vol. 61. - P. 74-76. - DOI: 10.1016/j.meegid.2018.03.013.

67. Baker, S.J. Technologies to address antimicrobial resistance / S.J. Baker, D.J. Payne, R. Rappuoli, E. De Gregorio // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2018. - Vol. 115. - № 51. - P. 12887-12895. - DOI: 10.1073/pnas.1717160115.

68. Balakrishnan, S. Genetic characterization of fluoroquinolone-resistant Escherichia coli associated with bovine mastitis in India / S. Balakrishnan, P.X. Antony, H.K. Mukhopadhyay, R.M. Pillai, J. Thanislass, V. Padmanaban, M.V. Srinivas // Veterinary world. - 2016. - Vol. 9. - № 7. - P. 705-709. - DOI: 10.14202/vetworld.2016.705-709.

69. Ballhausen, B. The mecA homolog mecC confers resistance against beta-lactams in Staphylococcus aureus irrespective of the genetic strain background / B. Ballhausen, A. Kriegeskorte, N. Schleimer, G. Peters, K. Becker // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2014. - Vol. 58. - № 7. - P. 3791-3798. - DOI: 10.1128/AAC.02731-13.

70. Barkema, H.W. Incidence of clinical mastitis in dairy herds grouped in three categories by bulk milk somatic cell counts / H.W. Barkema, Y.H. Schukken, T.J. Lam, M.L. Beiboer, H. Wilmink, G. Benedictus, A. Brand // Journal of dairy science. - 1998. - Vol. 81. - № 2. - P. 411-419. - DOI: 10.3168/jds.S0022-0302(98)75591-2.

71. Bendary, M.M. What is behind the correlation analysis of diarrheagenic E. coli pathotypes? / MM. Bendary, M.I. Abd El-Hamid, M. Alhomrani, A.S. Alamri, R. Elshimy, R.A. Mosbah, M.M. Bahnass, N.N. Omar, M.M. Al-Sanea, A.R. Elmanakhly, N.A. Safwat, W.A. Alshareef // Biology (Basel). - 2022. - Vol. 11. - № 7. - P. 1-15. - DOI: 10.3390/biology11071004.

72. Bengtsson-Palme, J. Towards monitoring of antimicrobial resistance in the environment: For what reasons, how to implement it, and what are the data needs? / J. Bengtsson-Palme, A. Abramova, T.U. Berendonk, L.P. Coelho, S.K. Forslund, R. Gschwind, A. Heikinheimo, V.H. Jarquin-Diaz, A.A. Khan, U. Klümper, U. Löber, M. Nekoro, A.D. Osinska, S. Ugarcina Perovic, T. Pitkänen, E. K. R0dland, E. Ruppé, Y. Wasteson, A.L. Wester, R. Zahra // Environment international. - 2023. - Vol. 178. - P. 108089. - DOI: 10.1016/j.envint.2023.108089.

73. Bezborodova, N.A. Sensitivity and resistance of the microbiota of reproductive organs and mammary gland of cows to anti-microbial agents in cases of inflammation / N.A. Bezborodova, O.V. Sokolova, I.A. Shkuratova, M.V. Ryaposova, Y.Y. Lysova, M.N. Isakova, V.V. Kozhukhovskaya // International Journal of Biology and Biomedical Engineering. - 2020. - Vol. 14. - P. 49-54. - DOI: 10.46300/91011.2020.14.8.

74. Bicalho, M.L. Association between virulence factors of Escherichia coli, Fusobacterium necrophorum, and Arcanobacterium pyogenes and uterine diseases of dairy cows / M.L. Bicalho, V.S. Machado, G. Oikonomou, R.O. Gilbert, R.C. Bicalho // Veterinary microbiology. - 2012. - Vol. 157. -№ 1-2. - P. 125-131. - DOI: 10.1016/j.vetmic.2011.11.034.

75. Bicalho, M.L.S. Genetic and functional analysis of the bovine uterine microbiota. Part II: Purulent vaginal discharge versus healthy cows / M.L.S. Bicalho, S. Lima, C.H. Higgins, V.S. Machado, F.S. Lima, R.C. Bicalho // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 5. - P. 3863-3874. - DOI: 10.3168/jds.2016-12061.

76. Bicalho, M.L.S. Dynamics of the microbiota found in the vaginas of dairy cows during the transition period: Associations with uterine diseases and reproductive outcome / M.L.S. Bicalho, T. Santin, M.X. Rodrigues, C.E. Marques, S.F. Lima, R.C. Bicalho // Journal of dairy science. - 2017. -Vol. 100. - № 4. - P. 3043-3058. - DOI: 10.3168/jds.2016-11623.

77. Bicalho, R.C. Molecular and epidemiological characterization of bovine intrauterine Escherichia coli / R.C. Bicalho, V.S. Machado, M.L. Bicalho, R.O. Gilbert, A.G. Teixeira, L.S. Caixeta, R.V. Pereira // Journal of dairy science. - 2010. - Vol. 93. - № 12. - P. 5818-5830. - DOI: 10.3168/jds.2010-3550.

78. Blazquez, B. Regulation of the expression of the beta-lactam antibiotic-resistance determinants in methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) / B. Blazquez, L.I. Llarrull, J.R. Luque-Ortega, C. Alfonso, B. Boggess, S. Mobashery // Biochemistry. - 2014. - Vol. 53. - № 10. - P. 1548-1550. -DOI: 10.1021/bi500074w.

79. Boireau, C. Antimicrobial resistance in bacteria isolated from mastitis in dairy cattle in France, 2006-2016 / C. Boireau, G. Cazeau, N. Jarrige, D. Calavas, J.Y. Madec, A. Leblond, M. Haenni, E. Gay // Journal of dairy science. - 2018. - Vol. 101. - № 10. - P. 9451-9462. - DOI: 10.3168/jds.2018-14835.

80. Bolte, J. In vitro susceptibility of mastitis pathogens isolated from clinical mastitis cases on Northern German dairy farms / J. Bolte, Y. Zhang, N. Wente, V. Kromker // Veterinary Sciences. -2020. - Vol. 7. - № 1. - P. 1-16. - DOI: 10.3390/vetsci7010010.

81. Bolte, J. Comparison of phenotypic and genotypic antimicrobial resistance patterns associated with Staphylococcus aureus mastitis in German and Danish dairy cows / J. Bolte, Y. Zhang, N. Wente, Y.S. Mahmmod, L. Svennesen, V. Kromker // Journal of dairy science. - 2020. - Vol. 103. - № 4. - P. 3554-3564. - DOI: 10.3168/jds.2019-17765.

82. Boonyayatra, S. Virulence-associated genes and molecular typing of Streptococcus uberis associated with bovine mastitis in Northern Thailand / S. Boonyayatra, P. Tharavichitkul // Turkish journal of veterinary and animal sciences. - 2018. - Vol. 42. - № 1. - P. 73-81. - DOI: 10.3906/vet-1704-75.

83. Breslauer, K.J. Predicting DNA duplex stability from the base sequence / K.J. Breslauer, R. Frank, H. Blocker, L.A. Marky // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1986. - Vol. 83. - № 11. - P. 3746-3750. - DOI: 10.1073/pnas.83.11.3746.

84. Bryan, J.D. Streptococcus agalactiae CspA is a serine protease that inactivates chemokines / J.D. Bryan, D.W. Shelver // Journal of bacteriology. - 2009. - Vol. 191. - № 6. - P. 1847-1854. - DOI: 10.1128/JB.01124-08.

85. Bulock, L.L. Interplay of cody and ccpa in regulating central metabolism and biofilm formation in Staphylococcus aureus / L.L. Bulock, J. Ahn, D. Shinde, S. Pandey, C. Sarmiento, V.C. Thomas, C. Guda, K.W. Bayles, MR. Sadykov // Journal of bacteriology. - 2022. - Vol. 204. - № 7. - P. e0061721.

- DOI: 10.1128/jb.00617-21.

86. Bush, K. Past and present perspectives on beta-lactamases / K. Bush // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2018. - Vol. 62. - № 10. - P. 1-20. - DOI: 10.1128/AAC.01076-18.

87. Calle, M.L. Statistical analysis of metagenomics data / M.L. Calle // Genomics & informatics.

- 2019. - Vol. 17. - № 1. - P. e6. - DOI: 10.5808/GI.2019.17.1.e6.

88. Camacho-Silvas, L. Multi-resistance, extended and pan-resistance to antimicrobials at the north of México / L. Camacho-Silvas, J. Portillo Gallo, A. Rivera-Cisneros, J.M. Gonzalez, R. Cendejas, J. Duque-Rodríguez, G. Velo-Méndez, C. Ishida // Cirugía y Cirujanos (English Edition). - 2023. - Vol. 89. - P. - 415-423. - doi: 10.24875/cirue.m23000348.

89. Camacho, C. Blast+: Architecture and applications / C. Camacho, G. Coulouris, V. Avagyan, N.Ma, J. Papadopoulos, K. Bealer, T.L. Madden // BMC Bioinformatics. - 2009. - Vol. 10. - P. 421. -DOI: 10.1186/1471-2105-10-421.

90. Campos, B. Diversity and pathogenesis of Staphylococcus aureus from bovine mastitis: Current understanding and future perspectives / B. Campos, A.C. Pickering, L.S. Rocha, A.P. Aguilar, M.H. Fabres-Klein, T.A. de Oliveira Mendes, J.R. Fitzgerald, A. de Oliveira Barros Ribon // BMC veterinary research. - 2022. - Vol. 18. - № 1. - P. 115. - DOI: 10.1186/s12917-022-03197-5.

91. Casadevall, A. Host-pathogen interactions: The attributes of virulence / A. Casadevall, L. Pirofski // The Journal of infectious diseases. - 2001. - Vol. 184. - № 3. - P. 337-344. - DOI: 10.1086/322044.

92. Cengiz, M. Treatment of E. coli HB101 and the tetM gene by Fenton's reagent and ozone in cow manure / M. Cengiz, M.O. Uslu, I. Balcioglu // Journal of environmental management. - 2010. -Vol. 91. - № 12. - P. 2590-2593. - DOI: 10.1016/j.jenvman.2010.07.005.

93. Chai, M. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus from Peninsular Malaysian animal handlers: Molecular profile, antimicrobial resistance, immune evasion cluster and genotypic categorization / M. Chai, M.Z. Sukiman, A.H. Kamarun Baharin, I. Ramlan, L.Z. Lai, Y. Liew, P. Malayandy, N.M. Mohamad, S. Choong, S.M.Z. Ariffin, M.F. Ghazali // Antibiotics (Basel). - 2022. -Vol. 11. - № 1. - P. - 1-16. - DOI: 10.3390/antibiotics11010103.

94. Charani, E. Navigating sociocultural disparities in relation to infection and antibiotic resistance-the need for an intersectional approach / E. Charani, M. Mendelson, D. Ashiru-Oredope, E.

Hutchinson, M. Kaur, M. McKee, M. Mpundu, J.R. Price, N. Shafiq, A. Holmes // JAC Antimicrobial Resistance. - 2021. - Vol. 3. - № 4. - P. 1-7. - DOI: 10.1093/jacamr/dlab123.

95. Chaudhry, T.H. Emergence of bla (NDM-1) harboring Klebsiella pneumoniae ST29 and ST11 in veterinary settings and waste of Pakistan / T.H. Chaudhry, B. Aslam, M.I. Arshad, R.F. Alvi, S. Muzammil, N. Yasmeen, M.A. Aslam, M. Khurshid, M.H. Rasool, Z. Baloch // Infection and drug resistance. - 2020. - Vol. 13. - P. 3033-3043. - DOI: 10.2147/IDR.S248091.

96. Chen, C. Effect of Staphylococcus aureus tet38 native efflux pump on in vivo response to tetracycline in a murine subcutaneous abscess model / C. Chen, D.C. Hooper // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2018. - Vol. 73. - № 3. - P. 720-723. - DOI: 10.1093/jac/dkx432.

97. Cheng. W.N. Bovine mastitis: Risk factors, therapeutic strategies, and alternative treatments -A review / W.N. Cheng, S.G. Han // Asian-Australasian journal of animal sciences. - 2020. - Vol. 33.

- № 11. - P. 1699-1713. - DOI: 10.5713/ajas.20.0156.

98. Chesneau, O. Resistance phenotypes conferred by macrolide phosphotransferases / O. Chesneau, K. Tsvetkova, P. Courvalin // FEMS microbiology letters. - 2007. - Vol. 269. - № 2. - P. 317-322. - DOI: 10.1111/j.1574-6968.2007.00643.x.

99. Church, D.L. Comparison of automated repetitive-sequence-based polymerase chain reaction and spa typing versus pulsed-field gel electrophoresis for molecular typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus / D.L. Church, B.L. Chow, T. Lloyd, D.B. Gregson // Diagnostic microbiology and infectious disease. - 2011. - Vol. 69. - № 1. - P. 30-37. - doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2010.09.010.

100. Classification of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec): Guidelines for reporting novel SCCmec elements. Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2009. - Vol. 53. - № 12.

- P. 4961-4967. - DOI: 10.1128/AAC.00579-09.

101. CLSI VET06.2017 Methods for antimicrobial susceptibility testing of infrequently isolated or fastidious bacteria isolated from animals // Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standarts Institute. -2017. - Vol. 37. - № 4. - P. - 1-101.

102. Cote-Gravel, J. Symposium review: Features of Staphylococcus aureus mastitis pathogenesis that guide vaccine development strategies / J. Cote-Gravel, F. Malouin // Journal of dairy science. -2019. - Vol. 102. - № 5. - P. 4727-4740. - DOI: 10.3168/jds.2018-15272.

103. Cruz-Soto, A.S. Genetic relationships, biofilm formation, motility and virulence of Escherichia coli isolated from bovine mastitis / A.S. Cruz-Soto, V. Toro-Castillo, C.O. Munguía-Magdaleno, J.E. Torres-Flores, L.E. Flores-Pantoja, P.D. Loeza-Lara, R. Jiménez-Mejía // Revista mexicana de ciencias pecuarias. - 2020. - Vol. 11. - № 1. - P. 167-182. - DOI: 10.22319/rmcp.v11i1.4998.

104. Cunha, F. Quantifying known and emerging uterine pathogens, and evaluating their association with metritis and fever in dairy cows / F. Cunha, S.J. Jeon, R. Daetz, A. Vieira-Neto, J.

Laporta, K.C. Jeong, A.F. Barbet, C.A. Risco, K.N. Galvao // Theriogenology. - 2018. - Vol. 114. - P. 25-33. - DOI: 10.1016/j.theriogenology.2018.03.016.

105. D'Costa, V.M. Sampling the antibiotic resistome / V.M. D'Costa, KM. McGrann, D.W. Hughes, G.D. Wright // Science. - 2006. - Vol. 311. - № 5759. - P. 374-377. - DOI: 10.1126/science. 1120800.

106. Dahmen, S. Characterization of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-carrying plasmids and clones of Enterobacteriaceae causing cattle mastitis in France / S. Dahmen, V. Metayer,

E. Gay, J.Y. Madec, M. Haenni // Veterinary microbiology. - 2013. - Vol. 162. - № 2-4. - P. 793-799.

- DOI: 10.1016/j.vetmic.2012.10.015.

107. Danish Ministry of Health. One health strategy against antibiotic resistance // Danish Ministry of Food Agriculture and Fisheries. - 2017. - P. 1-10.

108. Davin-Regli, A. Enterobacter spp.: Update on taxonomy, clinical aspects, and emerging antimicrobial resistance / A. Davin-Regli, J.P. Lavigne, J.M. Pages // Clinical microbiology reviews. -2019. - Vol. 32. - № 4. - P. e00002-00019. - DOI: 10.1128/CMR.00002-19.

109. Delano, M. Biology and diseases of ruminants: Sheep, goats, and cattle / M. Delano, S. Mischler, W. Underwood // Laboratory Animal Medicine. - 2002. - P. 519-614. - DOI: 10.1016/b978-012263951-7/50017-x.

110. Deng, F. The vaginal and fecal microbiomes are related to pregnancy status in beef heifers /

F. Deng, M. McClure, R. Rorie, X. Wang, J. Chai, X. Wei, S. Lai, J. Zhao // Journal of animal science and biotechnology. - 2019. - Vol. 10. - P. 92. - DOI: 10.1186/s40104-019-0401-2.

111. Dewanckele, L. Identifying and exploring biohydrogenating rumen bacteria with emphasis on pathways including trans-10 intermediates / L. Dewanckele, J. Jeyanathan, B. Vlaeminck, V. Fievez // BMC microbiology. - 2020. - Vol. 20. - № 1. - P. 198. - DOI: 10.1186/s12866-020-01876-7.

112. Diard, M. Evolution of bacterial virulence / M. Diard, W.D. Hardt // FEMS microbiology reviews. - 2017. - Vol. 41. - № 5. - P. 679-697. - DOI: 10.1093/femsre/fux023.

113. Dinos, G.P. The macrolide antibiotic renaissance / G.P. Dinos // British journal of pharmacology. - 2017. - Vol. 174. - № 18. - P. 2967-2983. - DOI: 10.1111/bph.13936.

114. Dobos, A. Infertility in dairy cows - possible bacterial and viral causes / A. Dobos, I. Fodor, Z. Kreizinger, L. Makrai, B. Denes, I. Kiss, D. Buricic, M. Kovacic, L. Szeredi // Veterinarska Stanica.

- 2022 - Vol. 53. - № 1. - P. 35-43. - DOI: 10.46419/vs.53.1.8.

115. Donohue-Rolfe, A. Shiga toxin: Purification, structure, and function / A. Donohue-Rolfe, D.W. Acheson, G.T. Keusch // Reviews of infectious diseases. - 1991. - Vol. 13 Suppl 4. - P. S293-S297. - DOI: 10.1093/clinids/13.supplement_4.s293.

116. Dreno, B. Cutibacterium acnes (Propionibacterium acnes) and acne vulgaris: A brief look at the latest updates / B. Dreno, S. Pecastaings, S. Corvec, S. Veraldi, A. Khammari, C. Roques // Journal

of the European Academy of Dermatology and Venereology. - 2018. - Vol. 32 Suppl 2. - P. 5-14. -DOI: 10.1111/jdv. 15043.

117. Drlica, K. DNA gyrase, topoisomerase IV, and the 4-quinolones / K. Drlica, X. Zhao // Microbiology and molecular biology reviews. - 1997. - Vol. 61. - № 3. - P. 377-392. - DOI: 10.1128/mmbr.61.3.377-392.1997.

118. Drozdz, K. The frequency of occurrence of resistance and genes involved in the process of adhesion and accumulation of biofilm in Staphylococcus aureus strains isolated from tracheostomy tubes / K. Drozdz, D. Ochonska, L. Scibik, M. Golda-Cepa, K. Biegun, M. Brzychczy-Wloch // Microorganisms. - 2022. - Vol. 10. - № 6. - P. - 1-15. - DOI: 10.3390/microorganisms10061210.

119. Duarte, R.S. Distribution of antimicrobial resistance and virulence-related genes among Brazilian group B streptococci recovered from bovine and human sources / Duarte R.S., Bellei B.C., Miranda O.P., Brito M.A., Teixeira L.M. // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2005. - Vol. 49.

- № 1. - P. 97-103. - DOI: 10.1128/AAC.49.1.97-103.2005.

120. Duse, A. Microbial aetiology, antibiotic susceptibility and pathogen-specific risk factors for udder pathogens from clinical mastitis in dairy cows / A. Duse, K. Persson-Waller, K. Pedersen // Animals (Basel). - 2021. - Vol. 11. - № 7. - P. - 2113. - DOI: 10.3390/ani11072113.

121. Edgar, R.C. Sintax: A simple non-bayesian taxonomy classifier for 16s and its sequences / R.C. Edgar // bioRxiv. - 2016.

122. Edgar, R.C. Uparse: Highly accurate OTU sequences from microbial amplicon reads / R.C. Edgar // Nature methods. - 2013. - Vol. 10. - № 10. - P. 996-998. - DOI: 10.1038/nmeth.2604.

123. Egorov, A.M. Bacterial enzymes and antibiotic resistance / A.M. Egorov, M.M. Ulyashova, MY. Rubtsova // Acta Naturae. - 2018. - Vol. 10. - № 4. - P. 33-48. - DOI: 10.32607/20758251-201810-4-33-48.

124. El-Rahman, A.M.A. Molecular detection of integron in Staphylococcus aureus isolated from ruminants / A.M.A. El-Rahman, H.A. Torky, S.K. Ebied // Alexandria Journal of Veterinary Sciences.

- 2021. - Vol. 68. - № 1. - P. 90-96. - DOI: 10.5455/ajvs.23030.

125. El Moujaber, G. Molecular mechanisms and epidemiology of resistance in Streptococcus pneumoniae in the Middle East region / G. El Moujaber, M. Osman, R. Rafei, F. Dabboussi, M. Hamze // Journal of medical microbiology. - 2017. - Vol. 66. - № 7. - P. 847-858. - DOI: 10.1099/jmm.0.000503.

126. Elhawy, M.I. The phosphoarginine phosphatase PtpB from Staphylococcus aureus is involved in bacterial stress adaptation during infection / M.I. Elhawy, S. Huc-Brandt, L. Patzold, L. Gannoun-Zaki, A.M.M. Abdrabou, M. Bischoff, V. Molle // Cells. - 2021. - Vol. 10. - № 3. - P. 1-17.

- DOI: 10.3390/cells10030645.

127. Entorf, M. Comparative erythromycin and tylosin susceptibility testing of streptococci from bovine mastitis / M. Entorf, A.T. Fessler, H. Kaspar, K. Kadlec, T. Peters, S. Schwarz // Veterinary microbiology. - 2016. - Vol. 194. - P. 36-42. - DOI: 10.1016/j.vetmic.2015.12.003.

128. Erhardt, M. Strategies to block bacterial pathogenesis by interference with motility and chemotaxis / M. Erhardt // Current topics in microbiology and immunology. - 2016. - Vol. 398. - P. 185-205. - DOI: 10.1007/82_2016_493.

129. Eriksen, J. Exploring the One Health perspective in Sweden's policies for containing antibiotic resistance / J. Eriksen, I. Bjorkman, M. Roing, S.Y. Essack, C. Stalsby Lundborg // Antibiotics (Basel). - 2021. - Vol. 10. - № 5. - P. - 1-13. - DOI: 10.3390/antibiotics10050526.

130. Eslami, M. Detection of Amp-C type producing Escherichia coli using the clavulanic acid and boronic acid inhibitor and multiplex PCR method / M. Eslami, A. Nourizadeh, A. Salek Farrokhi, S. Fallahi // Life Science Journal. - 2013. - Vol. 10. - P. 278-283.

131. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Expert rules. Intrinsic resistance and unusual phenotypes [Электронный ресурс] // 2020. - version 3.2. - Режим доступа -http://www.eucast.org/expert_rules_and_intrinsic_resistance/.

132. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of mics and zone diameters [Электронный ресурс] // 2022. - Vol. 12,0. - Режим доступа

- https://www.eucast.org/clinical_breakpoints.

133. Evans, B.A. OXA beta-lactamases / B.A. Evans, S.G. Amyes // Clinical microbiology reviews. - 2014. - Vol. 27. - № 2. - P. 241-263. - DOI: 10.1128/CMR.00117-13.

134. Fazel, F. Phenotypic and genotypic study on antimicrobial resistance patterns of E. coli isolates from bovine mastitis / F. Fazel, A. Jamshidi, B. Khoramian // Microbial pathogenesis. - 2019.

- Vol. 132. - P. 355-361. - DOI: 10.1016/j.micpath.2019.05.018.

135. Fergestad, M.E. Penicillin-binding protein PBP2a provides variable levels of protection toward different beta-lactams in Staphylococcus aureus RN4220 / M.E. Fergestad, G.A. Stamsas, D. Morales Angeles, Z. Salehian, Y. Wasteson, M. Kjos // Microbiologyopen. - 2020. - Vol. 9. - № 8. -P. e1057. - DOI: 10.1002/mbo3.1057.

136. Ferreira, M.R. Distribution of the stxl and stx2 genes in Escherichia coli isolated from milk cattle according to season, age, and production scale in Southwestern region of Goias, Brazil / M.R. Ferreira, A.E. Stella, E. Freitas-Filho, T D. Silva, K.A. Nascimento, J.F.N. Pinto, M. Dias, C.N. Moreira // Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinaria e Zootecnia. - 2018. - Vol. 70. - P. 1807-1813. - DOI: 10.1590/1678-4162-9861.

137. Fessler, A. Characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus ST398 from cases of bovine mastitis / A. Fessler, C. Scott, K. Kadlec, R. Ehricht, S. Monecke, S. Schwarz // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2010. - Vol. 65. - № 4. - P. 619-625. - DOI: 10.1093/jac/dkq021.

138. Filioussis, G. Short communication: Bovine mastitis caused by a multidrug-resistant, mcr-1-positive (colistin-resistant), extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli clone on a Greek dairy farm / G. Filioussis, M. Kachrimanidou, G. Christodoulopoulos, M. Kyritsi, C. Hadjichristodoulou, M. Adamopoulou, A. Tzivara, S.K. Kritas, A. Grinberg // Journal of dairy science.

- 2020. - Vol. 103. - № 1. - P. 852-857. - DOI: 10.3168/jds.2019-17320.

139. Folgori, L. Antibiotic susceptibility, virulome, and clinical outcomes in European infants with bloodstream infections caused by Enterobacterales / L. Folgori, D. Di Carlo, F. Comandatore, A. Piazza, A.A. Witney, I. Bresesti, Y. Hsia, K. Laing, I. Monahan, J. Bielicki, A. Alvaro, G.V. Zuccotti, T. Planche, P.T. Heath, M. Sharland // Antibiotics (Basel). - 2021. - Vol. 10. - № 6. - P. 1-17. - DOI: 10.3390/antibiotics10060706.

140. Forouzani-Moghaddam, M.J. Rapid detection of major enterotoxin genes and antibiotic resistance of Staphylococcus aureus isolated from raw milk in the Yazd province, Iran / M.J. Forouzani-Moghaddam, S. Habibi, A. Hosseini-Safa, K. Khanaliha, R. Mokarinejad, F. Akhoundzadeh, M. Oshaghi // Veterinary medicine and science. - 2024. - Vol. 10. - № 3. - P. e1407. - DOI: 10.1002/vms3.1407.

141. Fox, L.K. Mycoplasma mastitis: A review of transmission and control / L.K. Fox, J.H. Kirk, A. Britten // Journal of veterinary medicine. B, Infectious diseases and veterinary public health. - 2005.

- Vol. 52. - № 4. - P. 153-160. - DOI: 10.1111/j.1439-0450.2005.00845.x.

142. Francis, A.M. Draft genome sequences of two Fusobacterium necrophorum strains isolated from the uterus of dairy cows with metritis / A.M. Francis, S.J. Jeon, F. Cunha, K.C. Jeong, K.N. Galvao // Microbiology resource announcements. - 2019. - Vol. 8. - № 17. - P. - 1-2. - DOI: 10.1128/MRA.00201-19.

143. Freitag, C. Detection of plasmid-borne extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) genes in Escherichia coli isolates from bovine mastitis / C. Freitag, G.B. Michael, K. Kadlec, M. Hassel, S. Schwarz // Veterinary microbiology. - 2017. - Vol. 200. -P. 151-156. - DOI: 10.1016/j.vetmic.2016.08.010.

144. Frey, Y. Genetic characterization of antimicrobial resistance in coagulase-negative staphylococci from bovine mastitis milk / Y. Frey, J.P. Rodriguez, A. Thomann, S. Schwendener, V. Perreten // Journal of dairy science. - 2013. - Vol. 96. - № 4. - P. 2247-2257. - DOI: 10.3168/jds.2012-6091.

145. Fu, Y. Differential expression of bla(SHV) related to susceptibility to ampicillin in Klebsiella pneumoniae / Y. Fu, F. Zhang, W. Zhang, X. Chen, Y. Zhao, J. Ma, L. Bao, W. Song, T. Ohsugi, T. Urano, S. Liu // International journal of antimicrobial agents. - 2007. - Vol. 29. - № 3. - P. 344-347. -DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2006.10.015.

146. Fursova, K. Virulence factors and phylogeny of Staphylococcus aureus associated with bovine mastitis in Russia based on genome sequences / K. Fursova, A. Sorokin, S. Sokolov, T. Dzhelyadin, I. Shulcheva, M. Shchannikova, D. Nikanova, O. Artem'eva, N. Zinovieva, F. Brovko // Frontiers in veterinary science. - 2020. - Vol. 7. - P. 135. - DOI: 10.3389/fvets.2020.00135.

147. Gadou, V. Molecular detection of the arr-2 gene in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae resistant to rifampicin in Abidjan, Cote D'Ivoire / V. Gadou, N. Guessennd, A. Toty, K. Fernique, M. Ouattara, M. Dosso, D. Seydina, J. Djaman, J.-M. Rolain // Microbiology Research Journal International. - 2018. - Vol. 23. - P. 1-8. - DOI: 10.9734/mrji/2018/40552.

148. Galvao, K.N. Symposium review: The uterine microbiome associated with the development of uterine disease in dairy cows / K.N. Galvao, R.C. Bicalho, S.J. Jeon // Journal of dairy science. -2019. - Vol. 102. - № 12. - P. 11786-11797. - DOI: 10.3168/jds.2019-17106.

149. Gan, T. Antimicrobial resistance and genotyping of Staphylococcus aureus obtained from food animals in Sichuan Province, China / T. Gan, G. Shu, H. Fu, Q. Yan, W. Zhang, H. Tang, L. Yin, L. Zhao, J. Lin // BMC Veterinary Research. - 2021. - Vol. 17. - № 1. - P. 177. - DOI: 10.1186/s12917-021-02884-z.

150. Gao, J. Incidence of clinical mastitis and distribution of pathogens on large Chinese dairy farms / J. Gao, H.W. Barkema, L. Zhang, G. Liu, Z. Deng, L. Cai, R. Shan, S. Zhang, J. Zou, J.P. Kastelic, B. Han // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 6. - P. 4797-4806. - DOI: 10.3168/jds.2016-12334.

151. Gao, X. Enterococcal isolates from bovine subclinical and clinical mastitis: Antimicrobial resistance and integron-gene cassette distribution / X. Gao, C. Fan, Z. Zhang, S. Li, C. Xu, Y. Zhao, L. Han, D. Zhang, M. Liu // Microbial pathogenesis. - 2019. - Vol. 129. - P. 82-87. - DOI: 10.1016/j.micpath.2019.01.031.

152. Gartner, M.A. Detection and characterisation of Lactobacillus spp. in the bovine uterus and their influence on bovine endometrial epithelial cells in vitro / M.A. Gartner, A. Bondzio, N. Braun, M. Jung, R. Einspanier, C. Gabler // PLoS One. - 2015. - Vol. 10. - № 3. - P. e0119793. - DOI: 10.1371/journal.pone.0119793.

153. Garvey, M.I. The efflux pump inhibitor reserpine selects multidrug-resistant Streptococcus pneumoniae strains that overexpress the ABC transporters PatA and PatB / M.I. Garvey, L.J. Piddock // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2008. - Vol. 52. - № 5. - P. 1677-1685. - DOI: 10.1128/AAC.01644-07.

154. Gentry, D.R. Genetic characterization of Vga ABC proteins conferring reduced susceptibility to pleuromutilins in Staphylococcus aureus / D.R. Gentry, L. McCloskey, M.N. Gwynn, S.F. Rittenhouse, N. Scangarella, R. Shawar, D.J. Holmes // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2008. - Vol. 52. - № 12. - P. 4507-4509. - DOI: 10.1128/AAC.00915-08.

155. Geser, N. Occurrence and characteristics of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae in food producing animals, minced meat and raw milk / N. Geser, R. Stephan, H. Hachler // BMC Veterinary Research. - 2012. - Vol. 8. - P. 21. - DOI: 10.1186/1746-61488-21.

156. Ghatak, S. Detection of New Delhi metallo-beta-lactamase and extended-spectrum beta-lactamase genes in Escherichia coli isolated from mastitic milk samples / S. Ghatak, A. Singha, A. Sen, C. Guha, A. Ahuja, U. Bhattacharjee, S. Das, NR. Pradhan, K. Puro, C. Jana, T.K. Dey, KL. Prashantkumar, A. Das, I. Shakuntala, U. Biswas, P.S. Jana // Transboundary and emerging diseases. -2013. - Vol. 60. - № 5. - P. 385-389. - DOI: 10.1111/tbed.12119.

157. Gholamzad, M. Detection of Staphylococcus enterotoxin B (SEB) using an immunochromatographic test strip / M. Gholamzad, M.R. Khatami, S. Ghassemi, Z. Vaise Malekshahi, M.B. Shooshtari // Jundishapur journal of microbiology. - 2015. - Vol. 8. - № 9. - P. e26793. - DOI: 10.5812/jjm.26793.

158. Gilbert, R.O. Management of reproductive disease in dairy cows / R.O. Gilbert // The Veterinary clinics of North America. Food animal practice. - 2016. - Vol. 32. - № 2. - P. 387-410. -DOI: 10.1016/j.cvfa.2016.01.009.

159. Gilbert, R.O. 9 - Reproductive diseases / R.O. Gilbert, T.J. Divers // Rebhun's Diseases of Dairy Cattle. - 2018. - P. 466-507. - DOI: 10.1016/B978-0-323-39055-2.00009-7.

160. Golpayegani, A. Real-time polymerase chain reaction assays for rapid detection and virulence evaluation of the environmental Pseudomonas aeruginosa isolates / A. Golpayegani, R.N. Nodehi, F. Rezaei, M. Alimohammadi, M. Douraghi // Molecular biology reports. - 2019. - Vol. 46. - № 4. - P. 4049-4061. - DOI: 10.1007/s11033-019-04855-y.

161. Gomes, F. Bovine mastitis disease/pathogenicity: Evidence of the potential role of microbial biofilms / F. Gomes, M.J. Saavedra, M. Henriques // Pathogens and disease. - 2016. - Vol. 74. - № 3. - P. - 1-7. - DOI: 10.1093/femspd/ftw006.

162. Gonzalez, A.G.M. Shiga toxin-producing Escherichia coli in the animal reservoir and food in Brazil / A.G.M. Gonzalez, A.F. Cerqueira // Journal of applied microbiology. - 2020. - Vol. 128. -№ 6. - P. 1568-1582. - DOI: 10.1111/jam.14500.

163. Gonzalez Moreno, C. Vaginal microbial communities from synchronized heifers and cows with reproductive disorders / C. Gonzalez Moreno, C. Fontana, P.S. Cocconcelli, M.L. Callegari, M.C. Otero // Journal of applied microbiology. - 2016. - Vol. 121. - № 5. - P. 1232-1241. - DOI: 10.1111/jam.13239.

164. Gonzalez Moreno, C. Characterization of native Escherichia coli populations from bovine vagina of healthy heifers and cows with postpartum uterine disease / C. Gonzalez Moreno, A. Torres

Luque, R. Oliszewski, R.J. Rosa, M.C. Otero // PLoS One. - 2020. - Vol. 15. - № 6. - P. e0228294. -DOI: 10.1371/journal.pone.0228294.

165. Goulart, D.B. Escherichia coli mastitis in dairy cattle: Etiology, diagnosis, and treatment challenges / D.B. Goulart, M. Mellata // Frontiers in microbiology. - 2022. - Vol. 13. - P. 928346. -DOI: 10.3389/fmicb.2022.928346.

166. Greene, S.E. Human urine decreases function and expression of type 1 pili in uropathogenic Escherichia coli / S.E. Greene, M.E. Hibbing, J. Janetka, S.L. Chen, S.J. Hultgren // mBio. - 2015. -Vol. 6. - № 4. - P. e00820. - DOI: 10.1128/mBio.00820-15.

167. Griffin, J.F. Non-specific uterine infection and bovine fertility. I. Infection patterns and endometritis during the first seven weeks post-partum / J.F. Griffin, P.J. Hartigan, W.R. Nunn // Theriogenology. - 1974. - Vol. 1. - № 3. - P. 91-106. - DOI: 10.1016/0093-691x(74)90052-1.

168. Grunert, T. Distinct phenotypic traits of Staphylococcus aureus are associated with persistent, contagious bovine intramammary infections / T. Grunert, B. Stessl, F. Wolf, D.O. Sordelli, F.R. Buzzola, M. Ehling-Schulz // Scientific reports. - 2018. - Vol. 8. - № 1. - P. 15968. - DOI: 10.1038/s41598-018-34371-1.

169. Gruninger, R.J. Invited review: Application of meta-omics to understand the dynamic nature of the rumen microbiome and how it responds to diet in ruminants / R.J. Gruninger, G.O. Ribeiro, A. Cameron, T.A. McAllister // Animal: an international journal of animal bioscience. - 2019. - Vol. 13. -№ 9. - P. 1843-1854. - DOI: 10.1017/S1751731119000752.

170. Gryaznova, M.V. Microbiota of cow's milk with udder pathologies / M.V. Gryaznova, M.Y. Syromyatnikov, Y.D. Dvoretskaya, S.A. Solodskikh, N.T. Klimov, V.I. Mikhalev, V.I. Zimnikov, E.V. Mikhaylov, V.N. Popov // Microorganisms. - 2021. - Vol. 9. - № 9. - P. - 1-11. - DOI: 10.3390/microorganisms9091974.

171. Guerra, S.T. Short communication: Investigation of extra-intestinal pathogenic Escherichia coli virulence genes, bacterial motility, and multidrug resistance pattern of strains isolated from dairy cows with different severity scores of clinical mastitis / S.T. Guerra, H. Orsi, S.F. Joaquim, F.F. Guimaraes, B.C. Lopes, F.M. Dalanezi, D.S. Leite, H. Langoni, J.C.F. Pantoja, V.L.M. Rall, R.T. Hernandes, S.B. Lucheis, M.G. Ribeiro // Journal of dairy science. - 2020. - Vol. 103. - № 4. - P. 36063614. - DOI: 10.3168/jds.2019-17477.

172. Haenni, M. Antimicrobial resistance in Streptococcus spp. / M. Haenni, A. Lupo, J.Y. Madec // Microbiology Spectrum. - 2018. - Vol. 6. - № 2. - P. - 1-25. - DOI: 10.1128/microbiolspec.ARBA-0008-2017.

173. Haenni, M. ERMB-mediated erythromycin resistance in Streptococcus uberis from bovine mastitis / M. Haenni, E. Saras, S. Chaussiere, M. Treilles, J.Y. Madec // Veterinary journal. - 2011. -Vol. 189. - № 3. - P. 356-358. - DOI: 10.1016/j.tvjl.2010.06.021.

174. Haimerl, P. Antibiotic treatment of metritis in dairy cows-a meta-analysis / P. Haimerl, S. Arlt, S. Borchardt, W. Heuwieser // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 5. - P. 3783-3795.

- DOI: 10.3168/jds.2016-11834.

175. Hair, P.S. Clumping factor A interaction with complement factor I increases C3B cleavage on the bacterial surface of Staphylococcus aureus and decreases complement-mediated phagocytosis / P.S. Hair, C.G. Echague, A.M. Sholl, J A. Watkins, J A. Geoghegan, T.J. Foster, K.M. Cunnion // Infection and immunity. - 2010. - Vol. 78. - № 4. - P. 1717-1727. - DOI: 10.1128/IAI.01065-09.

176. Haveri, M. Virulence genes of bovine Staphylococcus aureus from persistent and nonpersistent intramammary infections with different clinical characteristics / M. Haveri, A. Roslof, L. Rantala, S. Pyorala // Journal of applied microbiology. - 2007. - Vol. 103. - № 4. - P. 993-1000. - DOI: 10.1111/j.1365-2672.2007.03356.x.

177. He, C. Leukotoxin and pyrogenic toxin superantigen gene backgrounds in bloodstream and wound Staphylococcus aureus isolates from Eastern region of China / C. He, S. Xu, H. Zhao, F. Hu, X. Xu, S. Jin, H. Yang, F. Gong, Q. Liu // BMC infectious diseases. - 2018. - Vol. 18. - № 1. - P. 395. -DOI: 10.1186/s12879-018-3297-0.

178. He, T. Occurrence and characterization of blaNDM-5-positive Klebsiella pneumoniae isolates from dairy cows in Jiangsu, China / T. He, Y. Wang, L. Sun, M. Pang, L. Zhang, R. Wang // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2017. - Vol. 72. - № 1. - P. 90-94. - DOI: 10.1093/jac/dkw357.

179. He, Y. Antibiotic resistance genes from livestock waste: Occurrence, dissemination, and treatment / Y. He, Q. Yuan, J. Mathieu, L. Stadler, N. Senehi, R. Sun, P. Alvarez // npj Clean Water. -2020. - Vol. 3. - P. 4. - DOI: 10.1038/s41545-020-0051-0.

180. Heap, R.B. The relationship between ovarian hormones and uterine infection in the rabbit. A possible mode of action / R.B. Heap, D.W. Robinson, G.E. Lamming // The Journal of endocrinology.

- 1962. - Vol. 23. - P. 351-356. - DOI: 10.1677/joe.0.0230351.

181. Hernandez, L. Multidrug resistance and molecular characterization of Streptococcus agalactiae isolates from dairy cattle with mastitis / L. Hernandez, E. Bottini, J. Cadona, C. Cacciato, C. Monteavaro, A. Bustamante, A.M. Sanso // Frontiers in cellular and infection microbiology. - 2021. -Vol. 11. - P. 647324. - DOI: 10.3389/fcimb.2021.647324.

182. Hoque, M.N. Molecular characterization of Staphylococcus aureus strains in bovine mastitis milk in Bangladesh / M.N. Hoque, Z.C. Das, A. Rahman, M.G. Haider, M.A. Islam // International journal of veterinary science and medicine. - 2018. - Vol. 6. - № 1. - P. 53-60. - DOI: 10.1016/j.ijvsm.2018.03.008.

183. Hoque, M.N. Microbiome dynamics and genomic determinants of bovine mastitis / M.N. Hoque, A. Istiaq, M.S. Rahman, MR. Islam, A. Anwar, A. Siddiki, M. Sultana, K.A. Crandall, M.A. Hossain // Genomics. - 2020. - Vol. 112. - № 6. - P. 5188-5203. - DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.09.039.

184. Hot, C. Characterization of sal(A), a novel gene responsible for lincosamide and streptogramin a resistance in Staphylococcus sciuri / C. Hot, N. Berthet, O. Chesneau // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2014. - Vol. 58. - № 6. - P. 3335-3341. - DOI: 10.1128/AAC.02797-13.

185. Hu, X. Gut/rumen-mammary gland axis in mastitis: Gut/rumen microbiota-mediated "gastroenterogenic mastitis" / X. Hu, Z. He, C. Zhao, Y. He, M. Qiu, K. Xiang, N. Zhang, Y. Fu // Journal of advanced research. - 2024. - Vol. 55. - P. 159-171. - DOI: 10.1016/j.jare.2023.02.009.

186. Huma, Z.I. Phenotypic and molecular characterization of bovine mastitis milk origin bacteria and linkage of intramammary infection with milk quality / Z.I. Huma, N. Sharma, S. Kour, S.J. Lee // Frontiers in veterinary science. - 2022. - Vol. 9. - P. 885134. - DOI: 10.3389/fvets.2022.885134.

187. Hynes, W.L. Hyaluronidases of gram-positive bacteria / W.L. Hynes, S.L. Walton // FEMS microbiology letters. - 2000. - Vol. 183. - № 2. - P. 201-207. - DOI: 10.1111/j.1574-6968.2000.tb08958.x.

188. Ingale, A.M. Isolation, PCR detection, pathotyping and antibiogram profiling of Escherichia coli associated with endometritis in buffaloes / A.M. Ingale, R.B. Rai, M. Saminathan, P. Vadhana, S.S. Hingade, K. Dhama, A.A.P. Milton, R. Singh // Journal of Animal and Plant Sciences. - 2016. - Vol. 26. - P. 1247-1254.

189. Ingti, B. Occurrence of bla (DHA-1) mediated cephalosporin resistance in Escherichia coli and their transcriptional response against cephalosporin stress: A report from India / B. Ingti, D. Paul, A.P. Maurya, D. Bora, D.D. Chanda, A. Chakravarty, A. Bhattacharjee // Annals of clinical microbiology and antimicrobials. - 2017. - Vol. 16. - № 1. - P. 13. - DOI: 10.1186/s12941-017-0189-x.

190. Ismail, Z.B. Molecular characterization of antimicrobial resistance and virulence genes of Escherichia coli isolates from bovine mastitis / Z.B. Ismail, S.M. Abutarbush // Veterinary world. -2020. - Vol. 13. - № 8. - P. 1588-1593. - DOI: 10.14202/vetworld.2020.1588-1593.

191. Jacoby, G.A. The new beta-lactamases / G.A. Jacoby, L.S. Munoz-Price // The New England journal of medicine. - 2005. - Vol. 352. - № 4. - P. 380-391. - DOI: 10.1056/NEJMra041359.

192. Jamali, H. Invited review: Incidence, risk factors, and effects of clinical mastitis recurrence in dairy cows / H. Jamali, H.W. Barkema, M. Jacques, E.M. Lavallee-Bourget, F. Malouin, V. Saini, H. Stryhn, S. Dufour // Journal of dairy science. - 2018. - Vol. 101. - № 6. - P. 4729-4746. - DOI: 10.3168/jds.2017-13730.

193. Jarraud, S. Relationships between Staphylococcus aureus genetic background, virulence factors, agr groups (alleles), and human disease / S. Jarraud, C. Mougel, J. Thioulouse, G. Lina, H.

Meugnier, F. Forey, X. Nesme, J. Etienne, F. Vandenesch // Infection and immunity. - 2002. - Vol. 70.

- № 2. - P. 631-641. - DOI: 10.1128/IAI.70.2.631-641.2002.

194. Jeon, S.J. Blood as a route of transmission of uterine pathogens from the gut to the uterus in cows / S.J. Jeon, F. Cunha, A. Vieira-Neto, R.C. Bicalho, S. Lima, ML. Bicalho, K.N. Galvao // Microbiome. - 2017. - Vol. 5. - № 1. - P. 109. - DOI: 10.1186/s40168-017-0328-9.

195. Jimenez Velasquez, S.D.C. Profile of antimicrobial resistance in isolates of Staphylococcus spp. obtained from bovine milk in Colombia / S.D.C. Jimenez Velasquez, L.D. Torres Higuera, J.L. Parra Arango, J.L. Rodriguez Bautista, F.E. Garcia Castro, R.E. Patino Burbano // Revista Argentina de microbiologia. - 2020. - Vol. 52. - № 2. - P. 121-130. - DOI: 10.1016/j.ram.2019.05.004.

196. Jinneman, K.C. Multiplex real-time PCR method to identify shiga toxin genes stxl and stx2 and Escherichia coli O157:H7/H- serotype / K.C. Jinneman, K.J. Yoshitomi, S.D. Weagant // Applied and environmental microbiology. - 2003. - Vol. 69. - № 10. - P. 6327-6333. - DOI: 10.1128/AEM.69.10.6327-6333.2003.

197. Jinnerot, T. The prevalence and genomic context of shiga toxin 2a genes in E. coli found in cattle / T. Jinnerot, A.T.P. Tomaselli, G.S. Johannessen, R. Soderlund, A.M. Urdahl, A. Aspan, C. Sekse // PLoS One. - 2020. - Vol. 15. - № 8. - P. e0232305. - DOI: 10.1371/journal.pone.0232305.

198. Jung, H.R. Characterization of virulence factors in enterotoxin-producing Staphylococcus aureus from bulk tank milk / H.R. Jung, Y.J. Lee // Animals (Basel). - 2022. - Vol. 12. - № 3. - P. - 117. - DOI: 10.3390/ani12030301.

199. Kaczorek, E. Phenotypic and genotypic antimicrobial susceptibility pattern of Streptococcus spp. isolated from cases of clinical mastitis in dairy cattle in Poland / E. Kaczorek, J. Malaczewska, R. Wojcik, W. Rekawek, A.K. Siwicki // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 8. - P. 64426453. - DOI: 10.3168/jds.2017-12660.

200. Kadlec, K. Occurrence and characteristics of livestock-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus in quarter milk samples from dairy cows in Germany / K. Kadlec, M. Entorf, T. Peters // Frontiers in microbiology. - 2019. - Vol. 10. -P. 1295. - DOI: 10.3389/fmicb.2019.01295.

201. Kadlec, K. Small plasmids carrying vga(A) or vga(C) genes mediate resistance to lincosamides, pleuromutilins and streptogramin a antibiotics in methicillin-resistant Staphylococcus aureus ST398 from swine / K. Kadlec, C.F. Pomba, N. Couto, S. Schwarz // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2010. - Vol. 65. - № 12. - P. 2692-2693. - DOI: 10.1093/jac/dkq365.

202. Kalendar, R. FastPCR: An in silico tool for fast primer and probe design and advanced sequence analysis / R. Kalendar, B. Khassenov, Y. Ramankulov, O. Samuilova, K.I. Ivanov // Genomics.

- 2017. - Vol. 109. - № 3-4. - P. 312-319. - DOI: 10.1016/j.ygeno.2017.05.005.

203. Kalendar, R. Java web tools for PCR, in silico PCR, and oligonucleotide assembly and analysis / R. Kalendar, D. Lee, AH. Schulman // Genomics. - 2011. - Vol. 98. - № 2. - P. 137-144. -DOI: 10.1016/j.ygeno.2011.04.009.

204. Kano, R. Next-generation sequencing analysis of bacterial flora in bovine prototheca mastitic milk / R. Kano, Y. Kobayashi, A. Nishikawa, R. Murata, T. Itou, T. Ito, K. Suzuki, H. Kamata // Medical mycology journal. - 2018. - Vol. 59. - № 3. - P. E41-E46. - DOI: 10.3314/mmj.18-00004.

205. Kanoe, M. Isolation of obligate anaerobic bacteria from bovine abscesses in sites other than the liver / M. Kanoe, K. Nouka, M. Toda // Journal of medical microbiology. - 1984. - Vol. 18. - № 3. - P. 365-369. - DOI: 10.1099/00222615-18-3-365.

206. Karami, Y. Computational and biochemical analysis of type IV pilus dynamics and stability / Y. Karami, A. Lopez-Castilla, A. Ori, J.L. Thomassin, B. Bardiaux, T. Malliavin, N. Izadi-Pruneyre, O. Francetic, M. Nilges // Structure. - 2021. - Vol. 29. - № 12. - P. 1397-1409. - DOI: 10.1016/j.str.2021.07.008.

207. Karstrup, C.C. Presence of bacteria in the endometrium and placentomes of pregnant cows / C.C. Karstrup, K. Klitgaard, T.K. Jensen, J.S. Agerholm, H.G. Pedersen // Theriogenology. - 2017. -Vol. 99. - P. 41-47. - DOI: 10.1016/j.theriogenology.2017.05.013.

208. Kasimanickam, V.R. Detection of genes encoding multidrug resistance and biofilm virulence factor in uterine pathogenic bacteria in postpartum dairy cows / V.R. Kasimanickam, K. Owen, R.K. Kasimanickam // Theriogenology. - 2016. - Vol. 85. - № 2. - P. 173-179. - DOI: 10.1016/j .theriogenology.2015.10.014.

209. Kasse, F.N. Relationship between Escherichia coli virulence factors and postpartum metritis in dairy cows / Kasse F.N., Fairbrother J.M., Dubuc J. // J Dairy Sci. - 2016. - Vol. 99. - № 6. - P. 4656-4667. - doi: 10.3168/jds.2015-10094.

210. Keane, O.M. Genetic diversity, the virulence gene profile and antimicrobial resistance of clinical mastitis-associated Escherichia coli / O.M. Keane // Research in microbiology. - 2016. - Vol. 167. - № 8. - P. 678-684. - DOI: 10.1016/j.resmic.2016.06.011.

211. Keane, O.M. Pathogen profile of clinical mastitis in Irish milk-recording herds reveals a complex aetiology / O.M. Keane, K.E. Budd, J. Flynn, F. McCoy // The Veterinary record. - 2013. -Vol. 173. - № 1. - P. 17. - DOI: 10.1136/vr.101308.

212. Keykhaei, N. Frequency of k99, stxl, and stx2 virulence factors in Escherichia coli isolated from diarrheic and clinically healthy suckling calves in Sistan and Baluchistan Province, Iran / N. Keykhaei, S. Salari, A. Rashki // Archives of Razi Institute. - 2021. - Vol. 76. - № 2. - P. 283-291. -DOI: 10.22092/ari.2019.124040.1268.

213. Khalifeh, O.M. Urinary tract virulence genes in extended-spectrum beta-lactamase E. coli from dairy cows, beef cattle, and small ruminants / O.M. Khalifeh, M.M. Obaidat // Acta tropica. - 2022.

- Vol. 234. - P. 106611. - DOI: 10.1016/j.actatropica.2022.106611.

214. Khalil, A. Healthy cattle microbiome and dysbiosis in diseased phenotypes / A. Khalil, A. Batool, S. Arif // Ruminants. - 2022. - Vol. 2. - № 1. - P. 134-156. - DOI: 10.3390/ruminants2010009.

215. Kim, D.W. Antibiotic resistome from the One-Health perspective: Understanding and controlling antimicrobial resistance transmission / D.W. Kim, C.J. Cha // Experimental & molecular medicine. - 2021. - Vol. 53. - № 3. - P. 301-309. - DOI: 10.1038/s12276-021-00569-z.

216. Kim, Y.T. Identification of strain harboring both aac(6')-ib and aac(6')-ib-cr variant simultaneously in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae / Y.T. Kim, J.H. Jang, H.C. Kim, H. Kim, K R. Lee, K S. Park, H.J. Lee, Y.J. Kim // BMB reports. - 2011. - Vol. 44. - № 4. - P. 262-266. - DOI: 10.5483/BMBRep.2011.44.4.262.

217. Klieve, A.V. Ruminococcus bromii, identification and isolation as a dominant community member in the rumen of cattle fed a barley diet / A.V. Klieve, M.N. O'Leary, L. McMillen, D. Ouwerkerk // Journal of applied microbiology. - 2007. - Vol. 103. - № 6. - P. 2065-2073. - DOI: 10.1111/j.1365-2672.2007.03492.x.

218. Klobucar, K. New potentiators of ineffective antibiotics: Targeting the gram-negative outer membrane to overcome intrinsic resistance / K. Klobucar, E.D. Brown // Current opinion in chemical biology. - 2022. - Vol. 66. - P. 102099. - DOI: 10.1016/j.cbpa.2021.102099.

219. Klotz, M. Detection of Staphylococcus aureus enterotoxins A to D by real-time fluorescence PCR assay / M. Klotz, S. Opper, K. Heeg, S. Zimmermann // Journal of clinical microbiology. - 2003.

- Vol. 41. - № 10. - P. 4683-4687. - DOI: 10.1128/JCM.41.10.4683-4687.2003.

220. Kluj, R.M. Recovery of the peptidoglycan turnover product released by the autolysin Atl in Staphylococcus aureus involves the phosphotransferase system transporter murP and the novel 6-phospho-N-acetylmuramidase mupG / R.M. Kluj, P. Ebner, M. Adamek, N. Ziemert, C. Mayer, M. Borisova // Frontiers in microbiology. - 2018. - Vol. 9. - P. 2725. - DOI: 10.3389/fmicb.2018.02725.

221. Koba, I.S. Advanced training of veterinary specialists on the spread of antibiotic resistance and the implementation of measures to contain it / I.S. Koba, V.V. Stepanishin, T.E. Denisenko, S.Y. Filippov, G.V. Kondratov // Scientific library. - 2021. - № 11. - DOI: https://doi.org/10.36871/vet.zoo.bio.202111002

222. Korochkina, E.A. PSVI-41 the comparative analysis of vaginal flora of high-productive cows in the postpartum period by real-time PCR / E.A. Korochkina, A. Nechaev, A. Stekolnikov, A. Nezhdanov // Journal of Animal Science. - 2019. - Vol. 97. - № Supplement_3. - P. 199-200. - DOI: 10.1093/jas/skz258.411.

223. Korostylev, N. Genetic basis of the probiotic properties of Lactobacillus / N. Korostylev, E. Prazdnova, M. Mazanko, B. Meskhi, D. Rudoy, A. Ermakov, A. Olshevskaya, A. Chistyakov, V. Zharov // Industrial Ecology and Biotechnology of Food Production. - 2020. - Vol. 203. - P. 04016. - DOI: 10.1051/e3sconf/202020304016.

224. Kostyanev, T. Innovative medicines initiative and antibiotic resistance / T. Kostyanev, M.J.M. Bonten, S. O'Brien, H. Goossens // The Lancet Infectious Diseases. - 2015. - Vol. 15. - № 12.

- P. 1373-1375. - DOI: 10.1016/S1473-3099(15)00407-7.

225. Kot, B. Virulence gene profiles in Staphylococcus aureus isolated from cows with subclinical mastitis in Eastern Poland / B. Kot, P. Szweda, A. Frankowska-Maciejewska, M. Piechota, K. Wolska // The Journal of dairy research. - 2016. - Vol. 83. - № 2. - P. 228-235. - DOI: 10.1017/S002202991600008X.

226. Krishnamoorthy, P. An understanding of the global status of major bacterial pathogens of milk concerning bovine mastitis: A systematic review and meta-analysis (scientometrics) / P. Krishnamoorthy, K.P. Suresh, K.S. Jayamma, B.R. Shome, S.S. Patil, R.G. Amachawadi // Pathogens.

- 2021. - Vol. 10. - № 5. - P. - 1-31. - DOI: 10.3390/pathogens10050545.

227. Krivonogova, A.S. Efficiency of phytobiotics in poultry farming / A.S. Krivonogova, I.M. Donnik, A G. Isaeva, E.A. Loginov, K.V. Moiseeva // BIO Web of Conferences. - 2022. - Vol. 53. - P. 02005. - DOI: 10.1051/bioconf/20225302005.

228. Krivonogova, A.S. Methodology for compiling a microbial resistance passport for dairy farms / A.S. Krivonogova, I.M. Donnik, A.G. Isaeva, K.V. Moiseeva // Agrarian Bulletin of the Urals. - 2020.

- Vol. 09. - № 200. - P. 42-47. - DOI: 10.32417/1997-4868-2020-200- 9-42-47.

229. Krockow, E.M. The international dimensions of antimicrobial resistance: Contextual factors shape distinct ethical challenges in South Africa, Sri Lanka and the United Kingdom / E.M. Krockow, C. Tarrant // Bioethics. - 2019. - Vol. 33. - № 7. - P. 756-765. - DOI: 10.1111/bioe.12604.

230. Kumar, H. Compositional and functional characteristics of swine slurry microbes through 16S rRNA metagenomic sequencing approach / H. Kumar, Y.N. Jang, K. Kim, J. Park, M.W. Jung, J.E. Park // Animals (Basel). - 2020. - Vol. 10. - № 8. - P. 1-15. - DOI: 10.3390/ani10081372.

231. Kumarasamy, K.K. Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: A molecular, biological, and epidemiological study / K.K. Kumarasamy, M.A. Toleman, T.R. Walsh, J. Bagaria, F. Butt, R. Balakrishnan, U. Chaudhary, M. Doumith, C.G. Giske, S. Irfan, P. Krishnan, A.V. Kumar, S. Maharjan, S. Mushtaq, T. Noorie, D.L. Paterson, A. Pearson, C. Perry, R. Pike, B. Rao, U. Ray, J.B. Sarma, M. Sharma, E. Sheridan, M.A. Thirunarayan, J. Turton, S. Upadhyay, M. Warner, W. Welfare, D.M. Livermore, N. Woodford // The Lancet. Infectious diseases. - 2010. -Vol. 10. - № 9. - P. 597-602. - DOI: 10.1016/S1473-3099(10)70143-2.

232. Kurt, S. Pathogen isolation and antibiogram analysis in dairy cows with clinical mastitis in Adana Region, Turkey / S. Kurt, F. E§ki // Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi. - 2021. - Vol. 32. -№ 1. - P. 20-26. - DOI: 10.35864/evmd.906990.

233. Kutzer, P. Helcococcus ovis, an emerging pathogen in bovine valvular endocarditis / P. Kutzer, C. Schulze, A. Engelhardt, L.H. Wieler, M. Nordhoff // Journal of clinical microbiology. - 2008.

- Vol. 46. - № 10. - P. 3291-3295. - DOI: 10.1128/JCM.00867-08.

234. Laguardia-Nascimento, M. Vaginal microbiome characterization of nellore cattle using metagenomic analysis / M. Laguardia-Nascimento, K.M. Branco, M.R. Gasparini, S. Giannattasio-Ferraz, L.R. Leite, F.M. Araujo, A.C. Salim, J.R. Nicoli, G.C. de Oliveira, E.F. Barbosa-Stancioli // PLoS One. - 2015. - Vol. 10. - № 11. - P. e0143294. - DOI: 10.1371/journal.pone.0143294.

235. Leclercq, R. Eucast expert rules in antimicrobial susceptibility testing / R. Leclercq, R. Canton, D.F. Brown, C.G. Giske, P. Heisig, A.P. MacGowan, J.W. Mouton, P. Nordmann, A.C. Rodloff, G.M. Rossolini, C.J. Soussy, M. Steinbakk, T.G. Winstanley, G. Kahlmeter // Clinical microbiology and infection. - 2013. - Vol. 19. - № 2. - P. 141-160. - DOI: 10.1111/j.1469-0691.2011.03703.x.

236. Lee, S.I. Development of multiplex polymerase chain reaction assays for detecting enterotoxigenic Escherichia coli and their application to field isolates from piglets with diarrhea / S.I. Lee, S.G. Kang, M.L. Kang, H.S. Yoo // Journal of veterinary diagnostic investigation. - 2008. - Vol. 20. - № 4. - P. 492-496. - DOI: 10.1177/104063870802000413.

237. Lee, Y.D. Expression of enterotoxin genes in Staphylococcus aureus isolates based on mRNA analysis / Y.D. Lee, B.Y. Moon, J.H. Park, H.I. Chang, W.J. Kim // Journal of microbiology and biotechnology. - 2007. - Vol. 17. - № 3. - P. 461-467.

238. Levchenko, A. Evaluation of bacteria isolated from different animal species and antibiotic resistance in the veterinary diagnostic laboratory / A. Levchenko, E. Aytek, M. Kaplan, C. Oz // - 2023.

- Vol. 1. - № 1. - P. 14-25.

239. Li, L. Characterization of the resistance class 1 integrons in Staphylococcus aureus isolates from milk of lactating dairy cattle in Northwestern China / L. Li, X. Zhao // BMC veterinary research.

- 2018. - Vol. 14. - № 1. - P. 59. - DOI: 10.1186/s12917-018-1376-5.

240. Liang, D. Estimating us dairy clinical disease costs with a stochastic simulation model / D. Liang, L.M. Arnold, C.J. Stowe, R.J. Harmon, J.M. Bewley // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 2. - P. 1472-1486. - DOI: 10.3168/jds.2016-11565.

241. Liu, B. VFDB 2022: A general classification scheme for bacterial virulence factors / B. Liu, D. Zheng, S. Zhou, L. Chen, J. Yang // Nucleic Acids Res. - 2022. - Vol. 50. - № D1. - P. D912-D917.

- DOI: 10.1093/nar/gkab 1107.

242. Liu, G. Co-occurrence of plasmid-mediated colistin resistance (MCR-1) and extended-spectrum beta-lactamase encoding genes in Escherichia coli from bovine mastitic milk in China / G.

Liu, T. Ali, J. Gao, S. Ur Rahman, D. Yu, H.W. Barkema, W. Huo, S. Xu, Y. Shi, J.P. Kastelic, B. Han // Microbial drug resistance. - 2020. - Vol. 26. - № 6. - P. 685-696. - DOI: 10.1089/mdr.2019.0333.

243. Liu, H. Prevalence, antimicrobial susceptibility, and molecular characterization of Staphylococcus aureus isolated from dairy herds in Northern China / H. Liu, S. Li, L. Meng, L. Dong, S. Zhao, X. Lan, J. Wang, N. Zheng // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 11. - P. 87968803. - DOI: 10.3168/jds.2017-13370.

244. Liu, J. Microbiota characterization of the cow mammary gland microenvironment and its association with somatic cell count / J. Liu, H. Liu, G. Cao, Y. Cui, H. Wang, X. Chen, F. Xu, X. Li // Veterinary sciences. - 2023. - Vol. 10. - № 12. - P. - 1-12. - DOI: 10.3390/vetsci10120699.

245. Liu, K. Biological characteristics and pathogenicity of Helcococcus ovis isolated from clinical bovine mastitis in a Chinese dairy herd / K. Liu, Z. Deng, L. Zhang, X. Gu, G. Liu, Y. Liu, P. Chen, J. Gao, B. Han, W. Qu // Frontiers in veterinary science. - 2021. - Vol. 8. - P. 756438. - DOI: 10.3389/fvets.2021.756438.

246. Liu, K. The first report and biological characteristics of Helcococcus ovis isolated from clinical bovine mastitis in a Chinese dairy herd / K. Liu, Z. Deng, L. Zhang, X. Gu, G. Liu, Y. Liu, P. Chen, J. Gao, W. Qu // bioRxiv. - 2021. - DOI: 10.1101/2021.04.08.439114.

247. Liu, M. Lactobacillus rhamnosus GR-1 limits Escherichia coli-induced inflammatory responses via attenuating MyD88-dependent and MyD88-independent pathway activation in bovine endometrial epithelial cells / M. Liu, Q. Wu, M. Wang, Y. Fu, J. Wang // Inflammation. - 2016. - Vol. 39. - № 4. - P. 1483-1494. - DOI: 10.1007/s10753-016-0382-7.

248. Liu, M.C. Identification, susceptibility, and detection of integron-gene cassettes of Arcanobacterium pyogenes in bovine endometritis / M.C. Liu, C.M. Wu, Y.C. Liu, J.C. Zhao, Y.L. Yang, J.Z. Shen // Journal of dairy science. - 2009. - Vol. 92. - № 8. - P. 3659-3666. - DOI: 10.3168/jds.2008-1756.

249. Llarrull, L.I. Dissection of events in the resistance to beta-lactam antibiotics mediated by the protein BlaR1 from Staphylococcus aureus / L.I. Llarrull, S. Mobashery // Biochemistry. - 2012. - Vol. 51. - № 23. - P. 4642-4649. - DOI: 10.1021/bi300429p.

250. Locatelli, C. Helcococcus kunzii and Helcococcus ovis isolated in dairy cows with puerperal metritis / C. Locatelli, L. Scaccabarozzi, G. Pisoni, V. Bronzo, A. Casula, F. Testa, S. Allodi, C. Pollera, F. Toni, P. Moroni // The Journal of general and applied microbiology. - 2013. - Vol. 59. - № 5. - P. 371-374. - DOI: 10.2323/jgam.59.371.

251. Locatelli, C. CTX-M1 ESBL-producing Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae isolated from cases of bovine mastitis / C. Locatelli, L. Scaccabarozzi, G. Pisoni, P. Moroni // Journal of clinical microbiology. - 2010. - Vol. 48. - № 10. - P. 3822-3823. - DOI: 10.1128/JCM.00941-10.

252. Lodder, G. Molecular analysis of naturally occuring ERMC-encoding plasmids in staphylococci isolated from animals with and without previous contact with macrolide/lincosamide antibiotics / G. Lodder, C. Werckenthin, S. Schwarz, K. Dyke // FEMS immunology and medical microbiology. - 1997. - Vol. 18. - № 1. - P. 7-15. - DOI: 10.1111/j.1574-695X.1997.tb01022.x.

253. Long, M.M. Dilution reduces sample matrix effects for rapid, direct, and miniaturised phenotypic antibiotic susceptibility tests for bovine mastitis / M.M. Long, S.H. Needs, A.D. Edwards // Antibiotics (Basel). - 2023. - Vol. 12. - № 9. - P. 1-16. - DOI: 10.3390/antibiotics12091363.

254. Lubna. Antimicrobial usage and detection of multidrug-resistant Staphylococcus aureus: Methicillin- and tetracycline-resistant strains in raw milk of lactating dairy cattle / Lubna, T. Hussain, A. Shami, N. Rafiq, S. Khan, M. Kabir, N.U. Khan, I. Khattak, M. Kamal, T. Usman // Antibiotics (Basel). - 2023. - Vol. 12. - № 4. - P. 673. - DOI: 10.3390/antibiotics12040673.

255. Ma, Z. Genomic and virulence characterization of intrauterine pathogenic Escherichia coli with multi-drug resistance isolated from cow uteri with metritis / Z. Ma, A. Ginn, M. Kang, K.N. Galvao, K.C. Jeong // Frontiers in microbiology. - 2018. - Vol. 9. - P. 3137. - DOI: 10.3389/fmicb.2018.03137.

256. Machado, G. Mastitis in small ruminants / G. Machado // Animal Husbandry, Dairy and Veterinary Science. - 2018. - Vol. 2. - P. 1-9. - DOI: 10.15761/ahdvs.1000144.

257. Machado, V.S. Investigation of postpartum dairy cows' uterine microbial diversity using metagenomic pyrosequencing of the 16S rRNA gene / V.S. Machado, G. Oikonomou, M.L. Bicalho, W A. Knauer, R. Gilbert, R.C. Bicalho // Veterinary microbiology. - 2012. - Vol. 159. - № 3-4. - P. 460-469. - doi: 10.1016/j.vetmic.2012.04.033.

258. Mackie, R.I. Ecology of uncultivated Oscillospira species in the rumen of cattle, sheep, and reindeer as assessed by microscopy and molecular approaches / R.I. Mackie, R.I. Aminov, W. Hu, A.V. Klieve, D. Ouwerkerk, M.A. Sundset, Y. Kamagata // Applied and environmental microbiology. - 2003.

- Vol. 69. - № 11. - P. 6808-6815. - DOI: 10.1128/AEM.69.11.6808-6815.2003.

259. Magiorakos, A.P. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: An international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance / A.P. Magiorakos, A. Srinivasan, R.B. Carey, Y. Carmeli, M.E. Falagas, C.G. Giske, S. Harbarth, J.F. Hindler, G. Kahlmeter, B. Olsson-Liljequist, D.L. Paterson, L.B. Rice, J. Stelling, M.J. Struelens, A. Vatopoulos, J.T. Weber, D.L. Monnet // Clinical microbiology and infection. - 2012. - Vol. 18. - № 3. - P. 268-281.

- DOI: 10.1111/j.1469-0691.2011.03570.x.

260. Mahmoud, S.F. Genetic diversity, biofilm formation, and antibiotic resistance of Pseudomonas aeruginosa isolated from cow, camel, and mare with clinical endometritis / S.F. Mahmoud, M. Fayez, A.A. Swelum, A.S. Alswat, M. Alkafafy, O.M. Alzahrani, S.J. Alsunaini, A. Almuslem, A.S. Al Amer, S. Yusuf // Vet Sci. - 2022. - Vol. 9. - № 5. - P. 239. - DOI: 10.3390/vetsci9050239.

261. Majumder, S. Prevalence and mechanisms of antibiotic resistance in Escherichia coli isolated from mastitic dairy cattle in Canada / S. Majumder, D. Jung, J. Ronholm, S. George // BMC microbiology. - 2021. - Vol. 21. - № 1. - P. 222. - DOI: 10.1186/s12866-021-02280-5.

262. Makarov, D.A. Antimicrobial resistance of commensal Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from food-producing animals in Russia / D.A. Makarov, O.E. Ivanova, A.V. Pomazkova, M.A. Egoreva, O.V. Prasolova, S.V. Lenev, M.A. Gergel, N.K. Bukova, S.Y. Karabanov // Veterinary World. - 2022. - Vol. 15. - № 3. - P. 611-621. - DOI: 10.14202/vetworld.2022.611-621.

263. Marshall, B.. Inter- and intraspecies spread of Escherichia coli in a farm environment in the absence of antibiotic usage / B. Marshall, D. Petrowski, S.B. Levy // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1990. - Vol. 87. - № 17. - P. 6609-6613. -DOI: 10.1073/pnas.87.17.6609.

264. Martinez, J.L. General principles of antibiotic resistance in bacteria / J.L. Martinez // Drug discovery today. Technologies. - 2014. - Vol. 11. - P. 33-39. - DOI: 10.1016/j.ddtec.2014.02.001.

265. Masse, J. Characterization of Klebsiella isolates obtained from clinical mastitis cases in dairy cattle / J. Masse, S. Dufour, M. Archambault // Journal of dairy science. - 2020. - Vol. 103. - № 4. - P. 3392-3400. - DOI: 10.3168/jds.2019-17324.

266. Mbindyo, C.M. Antimicrobial resistance profiles and genes of staphylococci isolated from mastitic cow's milk in Kenya / C.M. Mbindyo, G.C. Gitao, P.J. Plummer, B.W. Kulohoma, C.M. Mulei, R. Bett // Antibiotics (Basel). - 2021. - Vol. 10. - № 7. - P. - 772. - DOI: 10.3390/antibiotics10070772.

267. McDougall, S. Mechanisms of beta-lactam resistance of Streptococcus uberis isolated from bovine mastitis cases / S. McDougall, L. Clausen, H.J. Ha, I. Gibson, M. Bryan, N. Hadjirin, E. Lay, C. Raisen, X. Ba, O. Restif, J. Parkhill, M.A. Holmes // Veterinary microbiology. - 2020. - Vol. 242. - P. 108592. - DOI: 10.1016/j.vetmic.2020.108592.

268. Melton-Celsa, A.R. Shiga toxin (STX) classification, structure, and function / A.R. Melton-Celsa // Microbiology spectrum. - 2014. - Vol. 2. - № 4. - P. EHEC-0024-2013. - DOI: 10.1128/microbiolspec.EHEC-0024-2013.

269. Middleton, J.R. Staphylococcus aureus antigens and challenges in vaccine development / J.R. Middleton // Expert review of vaccines. - 2008. - Vol. 7. - № 6. - P. 805-815. - DOI: 10.1586/14760584.7.6.805.

270. Mihailovskaya, V.S. Virulence potential of faecal Escherichia coli strains isolated from healthy cows and calves on farms in Perm Krai / V.S. Mihailovskaya, N.B. Remezovskaya, I.N. Zhdanova, M. Starcic Erjavec, M.V. Kuznetsova // Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii. - 2022. - Vol. 26. - № 5. - P. 486-494. - DOI: 10.18699/VJGB-22-59.

271. Miklasinska-Majdanik, M. Mechanisms of resistance to macrolide antibiotics among Staphylococcus aureus / M. Miklasinska-Majdanik // Antibiotics (Basel). - 2021. - Vol. 10. - № 11. -P. 1406. - DOI: 10.3390/antibiotics10111406.

272. Miura, A. Next-generation sequencing analysis of bacterial flora in bovine protothecal mastitic milk and feces / A. Miura, T. Kurumisawa, R. Kano, T. Ito, K. Suzuki, H. Kamata // The Journal of veterinary medical science. - 2019. - Vol. 81. - № 11. - P. 1547-1551. - DOI: 10.1292/jvms.18-0649.

273. Moawad, A.A. Whole genome sequence-based analysis of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis in Thuringia, Germany / A.A. Moawad, H. El-Adawy, J. Linde, I. Jost, G. Tanja, H. Katja, D. Karsten, H. Neubauer, S. Monecke, H. Tomaso // Frontiers in microbiology. - 2023. - Vol. 14. - P. 1216850. - DOI: 10.3389/fmicb.2023.1216850.

274. Mojtaba, S. Detection of sea, seb, sec, seq genes in Staphylococcus aureus isolated from nasal carriers in Tehran Province, Iran, by multiplex PCR / S. Mojtaba, B. Babak, D. Mohammad, S. Hadi, H. Mehrdad, H. Mostafa, S.C. Reza, B.M. Khalil, H. Saeid, I. Saber // Journal of paramedical sciences. -2011. - Vol. 2. - P. 34-40. - DOI: 10.22037/JPS.V2I2.2329.

275. Molineri, A.I. Antimicrobial resistance of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis: Systematic review and meta-analysis / A.I. Molineri, C. Camussone, M.V. Zbrun, G. Suarez Archilla, M. Cristiani, V. Neder, L. Calvinho, M. Signorini // Preventive veterinary medicine. - 2021. -Vol. 188. - P. 105261. - DOI: 10.1016/j.prevetmed.2021.105261.

276. Monistero, V. Different distribution of antimicrobial resistance genes and virulence profiles of Staphylococcus aureus strains isolated from clinical mastitis in six countries / V. Monistero, A. Barberio, F. Biscarini, P. Cremonesi, B. Castiglioni, H.U. Graber, E. Bottini, A. Ceballos-Marquez, V. Kroemker, I.M. Petzer, C. Pollera, C. Santisteban, M. Veiga Dos Santos, V. Bronzo, R. Piccinini, G. Re, M. Cocchi, P. Moroni // Journal of dairy science. - 2020. - Vol. 103. - № 4. - P. 3431-3446. - DOI: 10.3168/jds.2019-17141.

277. Monistero, V. Staphylococcus aureus isolates from bovine mastitis in eight countries: Genotypes, detection of genes encoding different toxins and other virulence genes / V. Monistero, H.U. Graber, C. Pollera, P. Cremonesi, B. Castiglioni, E. Bottini, A. Ceballos-Marquez, L. Lasso-Rojas, V. Kroemker, N. Wente, I.M. Petzer, C. Santisteban, J. Runyan, M. Veiga Dos Santos, B.G. Alves, R. Piccinini, V. Bronzo, M.S. Abbassi, MB. Said, P. Moroni // Toxins (Basel). - 2018. - Vol. 10. - № 6. - P. - 247. - DOI: 10.3390/toxins10060247.

278. Mostafa, M. Variability in gene cassette patterns of class 1 and 2 integrons associated with multi drug resistance patterns in Staphylococcus aureus clinical isolates in Tehran-Iran / M. Mostafa, S.D. Siadat, F. Shahcheraghi, F. Vaziri, A. Japoni-Nejad, J. Vand Yousefi, B. Rajaei, E. Harifi Mood,

N. Ebrahim zadeh, A. Moshiri, S.A. Seyed Siamdoust, M. Rahbar // BMC Microbiology. - 2015. - Vol. 15. - P. 152. - DOI: 10.1186/s12866-015-0488-3.

279. Murai, M. Variation and association of fibronectin-binding protein genes fnbA andfnbB in Staphylococcus aureus Japanese isolates / M. Murai, H. Moriyama, E. Hata, F. Takeuchi, J. Amemura-Maekawa // Microbiology and immunology. - 2016. - Vol. 60. - № 5. - P. 312-325. - DOI: 10.1111/1348-0421.12377.

280. Murinda, S.E. Shiga toxin-producing Escherichia coli in mastitis: An international perspective / S.E. Murinda, A.M. Ibekwe, N.G. Rodriguez, K.L. Quiroz, A.P. Mujica, K. Osmon // Foodborne pathogens and disease. - 2019. - Vol. 16. - № 4. - P. 229-243. - DOI: 10.1089/fpd.2018.2491.

281. Naranjo-Lucena, A. Invited review: Antimicrobial resistance in bovine mastitis pathogens: A review of genetic determinants and prevalence of resistance in European countries / A. Naranjo-Lucena, R. Slowey // Journal of dairy science. - 2023. - Vol. 106. - № 1. - P. 1-23. - DOI: 10.3168/jds.2022-22267.

282. Narasanna, R. PCR detection of blaIMP gene in metallo-ß-lactamase resistant E. coli isolated from clinical samples / R. Narasanna, S. Surwonse, M. Chavadi, C. Kelmani // International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences. - 2019. - Vol. 8. - P. 2696-2701. - DOI: 10.20546/ijcmas.2019.802.315.

283. Ndahetuye, J.B. Genetic characterization of Staphylococcus aureus from subclinical mastitis cases in dairy cows in Rwanda / J.B. Ndahetuye, M. Leijon, R. Bage, K. Artursson, Y. Persson // Frontiers in veterinary science. - 2021. - Vol. 8. - P. 751229. - DOI: 10.3389/fvets.2021.751229.

284. Ndahetuye, J.B. Aetiology and prevalence of subclinical mastitis in dairy herds in peri-urban areas of Kigali in Rwanda / J.B. Ndahetuye, Y. Persson, A.K. Nyman, M. Tukei, M.P. Ongol, R.B age // Tropical animal health and production. - 2019. - Vol. 51. - № 7. - P. 2037-2044. - DOI: 10.1007/s11250-019-01905-2.

285. Neculai-Valeanu, A.S. Udder health monitoring for prevention of bovine mastitis and improvement of milk quality / A.S. Neculai-Valeanu, A.M. Ariton // Bioengineering (Basel). - 2022. -Vol. 9. - № 11. - P. - 608. - DOI: 10.3390/bioengineering9110608.

286. Neelam. Virulence and antimicrobial resistance gene profiles of Staphylococcus aureus associated with clinical mastitis in cattle / Neelam, V.K. Jain, M. Singh, V.G. Joshi, R. Chhabra, K. Singh, Y.S. Rana // PLoS One. - 2022. - Vol. 17. - № 5. - P. e0264762. - DOI: 10.1371/j ournal.pone.0264762.

287. Nefedova, E.V. Effect of silver nanoparticles on morphological, biochemical, and immunological parameters of cow blood with a serous form of mastitis / E.V. Nefedova, N.N. Shkil //

Russian Agricultural Sciences. - 2021. - Vol. 47. - № 1. - P. S97-S100. - DOI: 10.3103/s1068367422010128.

288. Nesse, L.L. Evolution of antimicrobial resistance in E. coli biofilm treated with high doses of ciprofloxacin / L.L. Nesse, A.M. Osland, B. Asal, S.S. Mo // Frontiers in microbiology. - 2023. - Vol. 14. - № - P. 1246895. - DOI: 10.3389/fmicb.2023.1246895.

289. Noakes, D.E. Bacterial flora of the uterus of cows after calving on two hygienically contrasting farms / D.E. Noakes, L. Wallace, G.R. Smith // The Veterinary record. - 1991. - Vol. 128. - № 19. - P. 440-442. - DOI: 10.1136/vr.128.19.440.

290. Nobrega, D.B. Molecular characterization of antimicrobial resistance in Klebsiella pneumoniae isolated from Brazilian dairy herds / D.B. Nobrega, A.P. Calarga, L.C. Nascimento, C.G. Chande Vasconcelos, E.M. de Lima, H. Langoni, M. Brocchi // Journal of dairy science. - 2021. - Vol. 104. - № 6. - P. 7210-7224. - DOI: 10.3168/jds.2020-19569.

291. Nobrega, D.B. Antimicrobial resistance in non-aureus staphylococci isolated from milk is associated with systemic but not intramammary administration of antimicrobials in dairy cattle / D.B. Nobrega, J. De Buck, H.W. Barkema // Journal of dairy science. - 2018. - Vol. 101. - № 8. - P. 74257436. - DOI: 10.3168/jds.2018-14540.

292. Nobrega, D.B. Prevalence and genetic basis of antimicrobial resistance in non-aureus staphylococci isolated from canadian dairy herds / D.B. Nobrega, S. Naushad, S.A. Naqvi, L.A.Z. Condas, V. Saini, J.P. Kastelic, C. Luby, J. De Buck, H.W. Barkema // Frontiers in microbiology. -2018. - Vol. 9. - P. 256. - DOI: 10.3389/fmicb.2018.00256.

293. Ohnishi, M. Genetic characteristics of CTX-M-type extended-spectrum-beta-lactamase (ESBL)-producing enterobacteriaceae involved in mastitis cases on Japanese dairy farms, 2007 to 2011 / M. Ohnishi, A.T. Okatani, K. Harada, T. Sawada, K. Marumo, M. Murakami, R. Sato, H. Esaki, K. Shimura, H. Kato, N. Uchida, T. Takahashi // Journal of clinical microbiology. - 2013. - Vol. 51. - № 9. - P. 3117-3122. - DOI: 10.1128/JCM.00920-13.

294. Ong, C.T. Adaptive sampling during sequencing reveals the origins of the bovine reproductive tract microbiome across reproductive stages and sexes / C.T. Ong, E.M. Ross, G. Boe-Hansen, C. Turni, B.J. Hayes, G. Fordyce, A.E. Tabor // Scientific reports. - 2022. - Vol. 12. - № 1. -P. 15075. - DOI: 10.1038/s41598-022-19022-w.

295. Ong, C.T. Interrogating the bovine reproductive tract metagenomes using culture-independent approaches: A systematic review / C.T. Ong, C. Turni, P.J. Blackall, G. Boe-Hansen, B.J. Hayes, A.E. Tabor // Animal Microbiome. - 2021. - Vol. 3. - № 1. - P. 41. - DOI: 10.1186/s42523-021-00106-3.

296. Ortega-Pacheco, A. Total mastectomy in a cow with gangrenous mastitis / A. Ortega-Pacheco, A.J. Aguilar-Caballero, M. Jimenez-Coello, R. Tzab, E. Gutierrez-Blanco // Veterinary Record Case Reports. - 2017. - Vol. 4. - № 2. - P. e000333. - DOI: 10.1136/vetreccr-2016-000333.

297. Ote, I. Genotypic characterization by polymerase chain reaction of Staphylococcus aureus isolates associated with bovine mastitis / I. Ote, B. Taminiau, J.N. Duprez, I. Dizier, J.G. Mainil // Veterinary microbiology. - 2011. - Vol. 153. - № 3-4. - P. 285-292. - DOI: 10.1016/j.vetmic.2011.05.042.

298. Owczarzy, R. IDT SciTools: A suite for analysis and design of nucleic acid oligomers / R. Owczarzy, A.V. Tataurov, Y. Wu, J.A. Manthey, K.A. McQuisten, H.G. Almabrazi, K.F. Pedersen, Y. Lin, J. Garretson, N.O. McEntaggart, C.A. Sailor, R.B. Dawson, A.S. Peek // Nucleic acids research. -2008. - Vol. 36. - № Web Server issue. - P. W163-169. - DOI: 10.1093/nar/gkn198.

299. Pakbin, B. Virulence factors of enteric pathogenic Escherichia coli: A review / B. Pakbin, W.M. Bruck, J.W.A. Rossen // International journal of molecular sciences. - 2021. - Vol. 22. - № 18. -P. - DOI: 10.3390/ijms22189922.

300. Patel, K. Prevalence, antibiotic resistance, virulence and genetic diversity of Staphylococcus aureus isolated from bulk tank milk samples of U.S. dairy herds / K. Patel, S.M. Godden, E.E. Royster, B.A. Crooker, T.J. Johnson, E.A. Smith, S. Sreevatsan // BMC Genomics. - 2021. - Vol. 22. - № 1. -P. 367. - DOI: 10.1186/s12864-021-07603-4.

301. Pena, R.T. Relationship between quorum sensing and secretion systems / R.T. Pena, L. Blasco, A. Ambroa, B. Gonzalez-Pedrajo, L. Fernandez-Garcia, M. Lopez, I. Bleriot, G. Bou, R. Garcia-Contreras, T.K. Wood, M. Tomas // Frontiers in microbiology. - 2019. - Vol. 10. - P. 1100. - DOI: 10.3389/fmicb.2019.01100.

302. Peton, V. Staphylococcus aureus in veterinary medicine / V. Peton, Y. Le Loir // Infection, genetics and evolution. - 2014. - Vol. 21. - P. 602-615. - DOI: 10.1016/j.meegid.2013.08.011.

303. Petri, R.M. Changes in rumen microbial profiles and subcutaneous fat composition when feeding extruded flaxseed mixed with or before hay / R.M. Petri, P. Vahmani, H.E. Yang, M.E.R. Dugan, T.A. McAllister // Frontiers in microbiology. - 2018. - Vol. 9. - P. 1055. - DOI: 10.3389/fmicb.2018.01055.

304. Philippon, A. Plasmid-determined AMPC-type beta-lactamases / A. Philippon, G. Arlet, G.A. Jacoby // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2002. - Vol. 46. - № 1. - P. 1-11. - DOI: 10.1128/AAC.46.1.1-11.2002.

305. Pinto Jimenez, C.E. Biosecurity and water, sanitation, and hygiene (wash) interventions in animal agricultural settings for reducing infection burden, antibiotic use, and antibiotic resistance: A one health systematic review / C.E. Pinto Jimenez, S. Keestra, P. Tandon, O. Cumming, A.J. Pickering, A.

Moodley, C.I.R. Chandler // Lancet Planet Health. - 2023. - Vol. 7. - № 5. - P. e418-e434. - DOI: 10.1016/S2542-5196(23)00049-9.

306. Plemyashov, K. Hematological status of newly-calved cows with mineral metabolism disturbance / K. Plemyashov, G. Nikitin, A. Nikitin, S. Kovalev, V. Trushkin, P. Anipchenko, A. Votinceva, A. Batrakov // The FASEB journal. - 2019. - Vol. 33. - № S1. - P. lb374-lb374. - DOI: 10.1096/fasebj.2019.33.1_supplement.lb374.

307. Podolsky, S. The evolving response to antibiotic resistance (1945-2018) / S. Podolsky // Palgrave Communications. - 2018. - Vol. 4. - P. 1-8. - DOI: 10.1057/s41599-018-0181-x.

308. Poirel, L. Antimicrobial resistance in Escherichia coli / L. Poirel, J.Y. Madec, A. Lupo, A.K. Schink, N. Kieffer, P. Nordmann, S. Schwarz // Microbiology spectrum. - 2018. - Vol. 6. - № 4. - P. 1-27. - DOI: 10.1128/microbiolspec.ARBA-0026-2017.

309. Polveiro, R.C. Effects of enrofloxacin treatment on the bacterial microbiota of milk from goats with persistent mastitis / R.C. Polveiro, P.M.P. Vidigal, T.A.O. Mendes, R.S. Yamatogi, M.C. Lima, M.A.S. Moreira // Scientific reports. - 2020. - Vol. 10. - № 1. - P. 4421. - DOI: 10.1038/s41598-020-61407-2.

310. Popov I.V. Effects of spore-forming bacillus probiotics on growth performance, intestinal morphology, and immune system of broilers housed on deep litter / I.V. Popov, V.S. Skripkin, M.S. Mazanko, E.E. Epimakhova, E.V. Prazdnova, O.V. Dilekova, S.P. Dannikov, I.V. Popov, V.I. Trukhachev, E.I. Rastovarov, T.N. Derezina, N.A. Kochetkova, R.M. Weeks, A.M. Ermakov, M.L. Chikindas // Journal of Applied Poultry Research. - 2024. - Vol. 33. - № 2. - P. 100396. - DOI: 10.1016/j.japr.2023.100396.

311. Poryvaeva, A.P. Management of compensatory shift of immunohematological parameters in poultry of industrial crosses in the presence of feed antibiotics in the diets / A.P. Poryvaeva, A.G. Isaeva, A.S. Krivonogova, I.A. Shkuratova // BIO Web of Conferences. - 2023. - Vol. 66. - P. 09001. - DOI: 10.1051/bioconf/20236609001.

312. Poutrel, B.. Prevalence of mastitis pathogens in France: Antimicrobial susceptibility of Staphylococcus aureus, Streptococcus uberis and Escherichia coli / B. Poutrel, S. Bareille, G. Lequeux, F. Leboeuf // Journal of Veterinary Science & Technology. - 2018. - Vol. 9. - № 2. - P. 1-3. - DOI: 10.4172/2157-7579.1000522.

313. Pu, W. High incidence of oxacillin-susceptible mecA-positive Staphylococcus aureus (OS-MRSA) associated with bovine mastitis in China / W. Pu, Y. Su, J. Li, C. Li, Z. Yang, H. Deng, C. Ni // PLoS One. - 2014. - Vol. 9. - № 2. - P. e88134. - DOI: 10.1371/journal.pone.0088134.

314. Purwanasari, H.N. Multiplex PCR detection of the classical enterotoxin genes of Staphylococcus aureus in humans and animal isolates / H.N. Purwanasari, N. Fitria, D. Kusuma, F. Aziz,

R. Widayanti, S.I.O. Salasia // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. - 2023. - Vol. 1174 - P. 1-7. - DOI: 10.1088/1755-1315/1174/1/012010.

315. Qu Y. Molecular epidemiology and distribution of antimicrobial resistance genes of Staphylococcus species isolated from Chinese dairy cows with clinical mastitis / Y. Qu, H. Zhao, D.B. Nobrega, E.R. Cobo, B. Han, Z. Zhao, S. Li, M. Li, H.W. Barkema, J. Gao // Journal of Dairy Science. - 2019. - Vol. 102. - № 2. - P. 1571-1583. - DOI: 10.3168/jds.2018-15136.

316. Raetz, C.R. Lipopolysaccharide endotoxins / C.R. Raetz, C. Whitfield // Annual review of biochemistry. - 2002. - Vol. 71. - P. 635-700. - DOI: 10.1146/annurev.biochem.71.110601.135414.

317. Raheel, I. Biofilm forming potentiality of Escherichia coli isolated from bovine endometritis and their antibiotic resistance profiles / I. Raheel, W.H. Hassan, S.S.R. Salem, H.S.H. Salam // Journal of advanced veterinary animal research. - 2020. - Vol. 7. - № 3. - P. 442-451. - DOI: 10.5455/javar.2020.g440.

318. Rainard, P. Mammary microbiota of dairy ruminants: Fact or fiction? / P. Rainard // Veterinary research. - 2017. - Vol. 48. - № 1. - P. 25. - DOI: 10.1186/s13567-017-0429-2.

319. Rappuoli, R. Deploy vaccines to fight superbugs / R. Rappuoli, D.E. Bloom, S. Black // Nature. - 2017. - Vol. 552. - № 7684. - P. 165-167. - DOI: 10.1038/d41586-017-08323-0.

320. Rato, M.G. Antimicrobial resistance and molecular epidemiology of streptococci from bovine mastitis / M.G. Rato, R. Bexiga, C. Florindo, L.M. Cavaco, C.L. Vilela, I. Santos-Sanches // Veterinary microbiology. - 2013. - Vol. 161. - № 3-4. - P. 286-294. - DOI: 10.1016/j.vetmic.2012.07.043.

321. Ravel, J. Vaginal microbiome of reproductive-age women / J. Ravel, P. Gajer, Z. Abdo, G.M. Schneider, S.S. Koenig, S.L. McCulle, S. Karlebach, R. Gorle, J. Russell, C O. Tacket, R.M. Brotman, C.C. Davis, K. Ault, L. Peralta, L.J. Forney // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2011. - Vol. 108 Suppl 1. - № Suppl 1. - P. 4680-4687. - DOI: 10.1073/pnas.1002611107.

322. Reygaert, W.C. An overview of the antimicrobial resistance mechanisms of bacteria / W.C. Reygaert // AIMS Microbiology. - 2018. - Vol. 4. - № 3. - P. 482-501. - DOI: 10.3934/microbiol.2018.3.482.

323. Rezanejad, M. Phenotypic and molecular characterization of antimicrobial resistance in Trueperellapyogenes strains isolated from bovine mastitis and metritis / M. Rezanejad, S. Karimi, H. Momtaz // BMC Microbiology. - 2019. - Vol. 19. - № 1. - P. 305. - DOI: 10.1186/s12866-019-1630-4.

324. Richardson, E.J. Gene exchange drives the ecological success of a multi-host bacterial pathogen / E.J. Richardson, R. Bacigalupe, E.M. Harrison, L.A. Weinert, S. Lycett, M. Vrieling, K. Robb, P.A. Hoskisson, M.T.G. Holden, E.J. Feil, G.K. Paterson, S.Y.C. Tong, A. Shittu, W. van Wamel,

D.M. Aanensen, J. Parkhill, S.J. Peacock, J. Corander, M. Holmes, J.R. Fitzgerald // Nature Ecology & Evolution. - 2018. - Vol. 2. - № 9. - P. 1468-1478. - DOI: 10.1038/s41559-018-0617-0.

325. Risseti, R.M. Virulence markers associated with Trueperellapyogenes infections in livestock and companion animals / R.M. Risseti, E. Zastempowska, M. Twaruzek, H. Lassa, J.C.F. Pantoja, A.P.C. de Vargas, S T. Guerra, C.A.D. Bolanos, C.L. de Paula, A.C. Alves, B S. Colhado, F.V.R. Portilho, C. Tasca, G.H.B. Lara, M.G. Ribeiro // Letters in applied microbiology. - 2017. - Vol. 65. - № 2. - P. 125132. - DOI: 10.1111/lam.12757.

326. Rivera, A.M. Current concepts in antimicrobial therapy against select gram-positive organisms: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, penicillin-resistant pneumococci, and vancomycin-resistant enterococci / A.M. Rivera, H.W. Boucher // Mayo Clinic Proceedings. - 2011. -Vol. 86. - № 12. - P. 1230-1243. - DOI: 10.4065/mcp.2011.0514.

327. Rodrigues, N.F. Qualitative analysis of the vaginal microbiota of healthy cattle and cattle with genital-tract disease / N.F. Rodrigues, J. Kastle, T.J. Coutinho, A.T. Amorim, G.B. Campos, V.M. Santos, L.M. Marques, J. Timenetsky, S.T. de Farias // Genetics and Molecular Research. - 2015. - Vol. 14. - № 2. - P. 6518-6528. - DOI: 10.4238/2015.June.12.4.

328. Rodrigues, R.A. Comparative genomics study of Staphylococcus aureus isolated from cattle and humans reveals virulence patterns exclusively associated with bovine clinical mastitis strains / R.A. Rodrigues, L.J.L. Pizauro, A.M. Varani, C.C. de Almeida, S.R. Silva, M.V. Cardozo, J.I. MacInnes, A.M. Kropinski, P.C. Melo, F A. Avila // Frontiers in microbiology. - 2022. - Vol. 13. - P. 1033675. -DOI: 10.3389/fmicb.2022.1033675.

329. Ruder, C.A., Uterine infections in the postpartum cow: II. Possible synergistic effect of Fusobacterium necrophorum and Corynebacterium pyogenes / C.A. Ruder, R.G. Sasser, R.J. Williams, J.K. Ely, R.C. Bull, J.E. Butler // Theriogenology. - 1981. - Vol. 15. - № 6. - P. 573-580. - DOI: https://doi.org/10.1016/0093 -691X(81)90060-1.

330. Ruegg, P.L. A 100-year review: Mastitis detection, management, and prevention / P.L. Ruegg // Journal of dairy science. - 2017. - Vol. 100. - № 12. - P. 10381-10397. - DOI: 10.3168/jds.2017-13023.

331. Ruter, C. 'Drugs from bugs': Bacterial effector proteins as promising biological immune-therapeutics / C. Ruter, P R. Hardwidge // FEMS microbiology letters. - 2014. - Vol. 351. - № 2. - P. 126-132. - DOI: 10.1111/1574-6968.12333.

332. Rzewuska, M. Pathogenicity and virulence of Trueperella pyogenes: A review / M. Rzewuska, E. Kwiecien, D. Chrobak-Chmiel, M. Kizerwetter-Swida, I. Stefanska, M. Gierynska // International journal of molecular sciences. - 2019. - Vol. 20. - № 11. - P. 2737. - DOI: 10.3390/ijms20112737.

333. Saed, H. Antimicrobial profile of multidrug-resistant Streptococcus spp. isolated from dairy cows with clinical mastitis / H. Saed, H.M.M. Ibrahim // Journal of advanced veterinary and animal research. - 2020. - Vol. 7. - № 2. - P. 186-197. - DOI: 10.5455/javar.2020.g409.

334. Saidani, M. Epidemiology, antimicrobial resistance, and extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae in clinical bovine mastitis in Tunisia / M. Saidani, L. Messadi, A. Soudani, M. Daaloul-Jedidi, P. Chatre, F. Ben Chehida, A. Mamlouk, W. Mahjoub, J.Y. Madec, M. Haenni // Microbial drug resistance. - 2018. - Vol. 24. - № 8. - P. 1242-1248. - DOI: 10.1089/mdr.2018.0049.

335. Santos Junior, M.N. A review of Ureaplasma diversum: A representative of the mollicute class associated with reproductive and respiratory disorders in cattle / M.N. Santos Junior, N.S. de Macedo Neres, G.B. Campos, B.L. Bastos, J. Timenetsky, L.M. Marques // Frontiers of veterinary sciences. - 2021. - Vol. 8. - P. 572171. - DOI: 10.3389/fvets.2021.572171.

336. Santos, T.M. Metagenomic analysis of the uterine bacterial microbiota in healthy and metritic postpartum dairy cows / T.M. Santos, R.O. Gilbert, R.C. Bicalho // Journal of dairy science. - 2011. -Vol. 94. - № 1. - P. 291-302. - DOI: 10.3168/jds.2010-3668.

337. Schmidt, T. Molecular characterization of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis and close human contacts in South African dairy herds: Genetic diversity and inter-species host transmission / T. Schmidt, M.M. Kock, M.M. Ehlers // Frontiers in microbiology. - 2017. - Vol. 8. - P. 511. - DOI: 10.3389/fmicb.2017.00511.

338. Schroeder, K. Molecular characterization of a novel Staphylococcus aureus surface protein (SASC) involved in cell aggregation and biofilm accumulation / K. Schroeder, M. Jularic, S.M. Horsburgh, N. Hirschhausen, C. Neumann, A. Bertling, A. Schulte, S. Foster, B.E. Kehrel, G. Peters, C. Heilmann // PLoS One. - 2009. - Vol. 4. - № 10. - P. e7567. - DOI: 10.1371/journal.pone.0007567.

339. Schwaiger, K. Hot topic: Bovine milk samples yielding negative or nonspecific results in bacterial culturing - the possible role of pcr-single strand conformation polymorphism in mastitis diagnosis / K. Schwaiger, M. Wimmer, R. Huber-Schlenstedt, K. Fehlings, C.S. Holzel, J. Bauer // Journal of dairy sciences. - 2012. - Vol. 95. - № 1. - P. 98-101. - DOI: 10.3168/jds.2011-4700.

340. Schwarz, S. Antimicrobial resistance among staphylococci of animal origin / S. Schwarz, A.T. Fessler, I. Loncaric, C. Wu, K. Kadlec, Y. Wang, J. Shen // Microbiology spectrum. - 2018. - Vol. 6. - № 4. - P. 1-29. - DOI: 10.1128/microbiolspec.ARBA-0010-2017.

341. Selim, A. Prevalence, antimicrobial susceptibilities and risk factors of methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in dairy bovines / A. Selim, K. Kelis, M.D.F. AlKahtani, F.M. Albohairy, K.A. Attia // BMC Veterinary Research. - 2022. - Vol. 18. - № 1. - P. 293. - DOI: 10.1186/s12917-022-03389-z.

342. Semivolos, A. Fertility recovery in cows with clinical endometritis / A. Semivolos, A. Bryukhanova, I. Pankov // BIO Web of Conferences. - 2022. - Vol. 43. - P. 03036. -DOI: 10.1051/bioconf/20224303036.

343. Shafique, L. Evidence-based tracking of MDR E. coli from bovine endometritis and its elimination by effective novel therapeutics / L. Shafique, S. Wu, A.I. Aqib, M.M. Ali, M. Ijaz, M.A. Naseer, Z. Sarwar, R. Ahmed, A. Saleem, Qudratullah, A.S. Ahmad, H. Pan, Q. Liu // Antibiotics (Basel). - 2021. - Vol. 10. - № 8. - P. 997. - DOI: 10.3390/antibiotics10080997.

344. Shahmoradi, M. Determining the biofilm forming gene profile of Staphylococcus aureus clinical isolates via multiplex colony PCR method / M. Shahmoradi, P. Faridifar, R. Shapouri, S.F. Mousavi, M. Ezzedin, B. Mirzaei // Reports of biochemistry & molecular biology. - 2019. - Vol. 7. -№ 2. - P. 181-188.

345. Shams, Z. Detection of enterotoxigenic K99 (F5) and F41 from fecal sample of calves by molecular and serological methods / Z. Shams, Y. Tahamtan, A. Pourbakhsh, M.H. Hosseiny, M. Kargar, M. Hayati // Comparative clinical pathology. - 2012. - Vol. 21. - № 4. - P. 475-478. - DOI: 10.1007/s00580-010-1122-2.

346. Shapiro-Ilan, D.I. Definitions of pathogenicity and virulence in invertebrate pathology / D.I. Shapiro-Ilan, J.R. Fuxa, L.A. Lacey, D.W. Onstad, H.K. Kaya // Journal of invertebrate pathology. -2005. - Vol. 88. - № 1. - P. 1-7. - DOI: 10.1016/j.jip.2004.10.003.

347. Sharif, Z. Irrational use of antibiotics in Iran from the perspective of complex adaptive systems: Redefining the challenge / Z. Sharif, F. Peiravian, J. Salamzadeh, N.K. Mohammadi, A. Jalalimanesh // BMC Public Health. - 2021. - Vol. 21. - № 1. - P. 778. - DOI: 10.1186/s12889-021-10619-w.

348. Sheet, O. Molecular detection of stxl and stx2 genes of E. coli isolated from sub- clinical bovine mastitis in Mosul city / O. Sheet, O. Al-Mahmood, Z. Taha, R. Alsanjary, A. Abdulmawjood // Iraqi Journal of Veterinary Sciences. - 2023. - Vol. 37. - P. 413-418. - DOI: 10.33899/ijvs.2022.134833.2410.

349. Sheet, O.H. Characterisation of mecA gene negative Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis milk from Northern Germany / O.H. Sheet, N.T. Grabowski, G. Klein, F. Reich, A. Abdulmawjood // Folia microbiologica (Praha). - 2019. - Vol. 64. - № 6. - P. 845-855. - DOI: 10.1007/s12223-019-00698-z.

350. Sheldon, I.M. Genes and environmental factors that influence disease resistance to microbes in the female reproductive tract of dairy cattle / I.M. Sheldon // eproduction, fertility, and development. - 2014. - Vol. 27. - № 1. - P. 72-81. - DOI: 10.1071/RD14305.

351. Sheldon, I.M. Tolerance and innate immunity shape the development of postpartum uterine disease and the impact of endometritis in dairy cattle / I.M. Sheldon, J.G. Cronin, J.J. Bromfield // nnual