Сообщества микроорганизмов, ассоциированных с лососевидными рыбами озера Байкал тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.08, кандидат биологических наук Суханова, Елена Викторовна

• Суханова, Елена Викторовна
• кандидат биологических наук
• 2012

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Суханова, Елена Викторовна

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Микрофлора кишечного тракта рыб

1.1.1. Разнообразие кишечной микрофлоры рыб

1.1.2. Роль симбионтной микрофлоры, населяющей кишечный тракт рыб

1.1.3. Микроорганизмы с неустановленным функциональным значением

1.2. Микроорганизмы - возбудители инфекционных заболеваний внешних покровов рыб

1.2.1. Инфекционные заболевания рыб Байкала и озёр Забайкалья

1.2.2. Сочетанные инфекции внешних покровов рыб

1.3. Особенности экологии лососевидных рыб

ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Характеристика объектов исследования и пробоподготовка

2.2. Методы исследования

2.2.1. Молекулярно-генетические методы

2.2.2. Методы микроскопического анализа

2.2.3. Культивирование на селективных питательных средах

2.2.4. Серологические методы

ГЛАВА 3. ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КИШЕЧНОЙ МИКРОФЛОРЫ БАЙКАЛЬСКОГО ОМУЛЯ И ХАРИУСА

(:ТНУМАЬШ5)

3.1. Разнообразие кишечной микрофлоры байкальского омуля

3.2. Разнообразие кишечной микрофлоры рыб рода ТЪутаПш

3.3. Сравнительная характеристика кишечной микрофлоры

лососевидных рыб

ГЛАВА 4. МИКОПЛАЗМЫ - СПЕЦИФИЧНЫЕ ПРЕДСТАВИТЕЛИ

МИКРОФЛОРЫ РЫБ РОДА THYMALL US

4.1. Детекция и распространение генотипа Mycoplasma

4.2. Филогенетический анализ генотипа Mycoplasma

4.3. Культуральные и морфологические особенности Mycoplasma

4.4. Количественная оценка распределения байкальского генотипа Mycoplasma

ГЛАВА 5. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ СОСТАВА СООБЩЕСТВ МИКРООРГАНИЗМОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ЯЗВЕННЫМИ ПОРАЖЕНИЯМИ

ВНЕШНИХ ПОКРОВОВ РЫБ

5.1. Сообщества микроорганизмов язв рыб в аквариумных экспозициях

5.2. Сообщества микроорганизмов язв рыб озера Байкал

5.3. Сообщества микроорганизмов язв рыб озера Арахлей

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ 1

ПРИЛОЖЕНИЕ 2

ПРИЛОЖЕНИЕ 3

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Сообщества микроорганизмов, ассоциированных с лососевидными рыбами озера Байкал»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы. Согласно многочисленным исследованиям в области микробной экологии, большинство бактерий в природных экосистемах существуют в сообществах, так как это облегчает доступ питательных веществ, способствует метаболической кооперации организмов и защищает клетки от негативного воздействия окружающей среды. Ассоциированная микрофлора присутствует в различных органах и тканях рыб, а ее качественные и количественные характеристики часто отражают характерные особенности окружающей среды.

В последнее время усилился интерес исследователей к микрофлоре кишечного тракта (КТ) рыб [19, 31, 38, 74 и др.]. Благодаря этим работам утвердилось представление, что она является жизненно необходимым компонентом КТ, зависящим от возраста, типа питания и экологических условий местообитания рыб. Исследование разнообразия кишечной микрофлоры рыб позволяет классифицировать микроорганизмы как автохтонные или собственные, и как аллохтонные или транзиторные. Специфичная кишечная микрофлора состоит из аэробных, факультативных и облигатных анаэробных бактерий.

Филогенетическая идентификация отдельных микроорганизмов в сообществах без культивирования является мощным инструментом в комплексном изучении микрофлоры рыб, так как с помощью этих методов можно получить характеристику видового состава всей ассоциированной микрофлоры, включая и некультивируемые бактерии. В настоящее время молекулярными методами получены нуклеотидные последовательности фрагментов гена малой субъединицы рибосомной РНК (16S рРНК) представителей рода Mycoplasma непосредственно из КТ различных видов рыб [82, 99, 140, 155, 174]. Функциональное значение этих прокариотических организмов пока не установлено, но авторы

предполагают, что микоплазмы могут являться составной и неотъемлемой частью кишечной микрофлоры рыб.

Микрофлора рыб и разнообразие ихтиопатогенов водоемов и водотоков Восточной Сибири недостаточно изучены. Известно, что районными ветеринарными станциями проводятся микробиологические исследования, основная задача которых - определить основные этиологические агенты инфекционных болезней рыб [55, 57]. В последнее время периодически возникают вспышки заболеваний рыб в заливах Байкала, озерах Республики Бурятия и Ивано-Арахлейской водной системы, которые приводят к их массовой гибели [16, 35].

Цель и задачи. Цель работы - изучить состав, структуру и разнообразие микробных сообществ, ассоциированных с лососевидными рыбами озера Байкал и некоторых водоемов Байкальского региона. Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

1. Определить доминирующие генотипы микроорганизмов и провести

сравнительный молекулярно-генетический анализ разнообразия кишечной микрофлоры лососевидных рыб с разной пищевой стратегией на примере байкальского омуля и представителей рода Thymallus.

2. Охарактеризовать Mycoplasma sp. как специфического представителя

микробного сообщества кишечника черного байкальского хариуса, с помощью комплекса молекулярно-генетических, микроскопических и серологических методов и оценить распространение этого микроорганизма в различных видах лососевидных рыб.

3. Определить доминирующие генотипы и генетическое разнообразие

сообществ микроорганизмов, ассоциированных с язвенными поражениями внешних покровов рыб в аквариумных экспозициях и естественных водоемах Восточной Сибири.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Состав аллохтонной микрофлоры кишечника рыб специфичен для мест обитания и в значительной степени определяется разнообразием сообществ микроорганизмов воды. Автохтонная микрофлора кишечника рыб более видоспецифична.

2. Mycoplasma sp. - специфичный представитель автохтонной микрофлоры некоторых видов лососевидных рыб Байкальского региона.

3. Использование молекулярно-генетических методов для определения

состава сообществ микроорганизмов, ассоциированных с язвенными поражениями внешних покровов рыб, является решением проблемы детекции инфекционных агентов, вызывающих эти заболевания.

Научная новизна. Впервые определён спектр доминирующих генотипов в кишечной микрофлоре байкальского омуля и черного байкальского хариуса, среди которых присутствуют бактерии, относящиеся как к автохтонной, так и аллохтонной микрофлоре. Показано, что основной состав таксономических групп у омуля и хариуса одинаков, однако у рыб рода Thymallus дополнительно детектируются представители филы Spirochaetes и Mycoplasma sp.

Впервые в составе кишечной микрофлоры черного байкальского и ленского хариусов определены генотипы Brevinema sp. и Mycoplasma sp.

Установлено, что заболевания внешних покровов рыб из аквариумных экспозиций и естественных водоемов Восточной Сибири вызваны ассоциациями микроорганизмов, определены генотипы доминирующих ихтиопатогенов.

Степень обоснованности и достоверности полученных научных результатов подтверждена использованием в качестве теоретической и методической базы трудов отечественных и зарубежных исследователей. Микробные сообщества внешних покровов исследовали у разных видов

рыб: сиг-пыжьян Coregonus lavaretus pidschian (аквариумная экспозиция Байкальский музей ИНЦ СО РАН); байкальский омуль Coregonus migratorius (Баргузинский залив, оз. Байкал); окунь Perca fluviatilis (оз. Арахлей). Материалом для сравнительного анализа кишечной микрофлоры послужили лососевидные рыбы из разных мест обитания: черный байкальский хариус (Thymallus baicalensis) (оз. Байкал, р. Ангара, БМ ИНЦ СО РАН, оз. Тухурен-Нур) и байкальский омуль (Малое море, дельта реки Селенга, Баргузинский залив и др.). Проанализирована большая выборка рыб родов Thymallus, Coregonus, Prosopium и Brachymystax на детекцию генотипа Mycoplasma sp., которая составила 54 экземпляра. Для исследования использованы современные методы, основанные на анализе рибосомных генов микроорганизмов: выделение ДНК проводили тремя методами; использовали видо- и групп-специфичную ПЦР, а лигирование, трансформацию и секвенирование последовательностей осуществляли по стандартным методам. Автором получено большое количество (199 шт.) нуклеотидных последовательностей фрагментов гена малой субъединицы рибосомной РНК (16S и 18S) и нетранскрибируемого межгенного спейсера рРНК (ITS), которые зарегистрированы в международной базе данных. Исследование выполнено с использованием бесплатных серверов и стандартных пакетов программ для работы с последовательностями: FASTA, BLAST, Pintail, Clustal W 2.0.10, Seaview v.4, BioEdit v. 7.0.8.0, Mega v3.1, Mega v.5.0, MrBayes 3.1.2.

Практическая значимость полученных результатов. Разработан комплекс методов, позволяющих быстро и корректно проводить идентификацию и детекцию микроорганизмов, ассоциированных как с внешними покровами, так и с внутренними органами рыб.

Изучено разнообразие ассоциированной микрофлоры некоторых представителей подотряда лососевидных рыб (Salmonoidei), в который входят ценные промысловые виды, использующиеся для акклиматизации в различных водоемах и являющиеся объектами искусственного

воспроизводства. Результаты исследования могут быть использованы для контроля и коррекции питания рыб в аквакультуре.

Поставлены методы детекции байкальского генотипа Mycoplasma на разработанных генотип-специфичных праймерах на ген 16S рРНК и район ITS. Полученные результаты могут быть востребованы при выявлении генотипа Mycoplasma в гидробионтах.

Определены генотипы региональных ихтиопатогенов, детекция которых необходима для профилактики и терапии заболеваний рыб, особенно в условиях аквакультуры. Полученные нуклеотидные последовательности фрагментов рибосомных генов могут быть использованы для разработки групп- и видо-специфичных праймеров и зондов для быстрой детекции бактерий, вызывающих заболевания внешних покровов рыб естественных и искусственных популяций.

Реализация и внедрение результатов исследования. Теоретические положения, результаты исследований и рекомендации использованы при подготовке научно-исследовательских отчетов по следующим проектам: бюджетной теме № VI.51.1.9 (рук. В.В. Парфенова, гос. per. № 01201052128); гранта РФФИ-Байкал № 05-04-97221 (рук. Е.В. Дзюба); Программе РАН № 27.13 (рук. Е.В. Дзюба); инновационному проекту СО РАН (рук. H.JI. Белькова) и Государственному контракту № 16.512.11.2075 (рук. Е.В. Дзюба).

Апробация работы. Основные результаты диссертационной работы представлены на международных и российских конференциях и симпозиумах: Всероссийской конференции молодых ученых «Экология в современном мире: взгляд научной молодежи» (Улан-Удэ, апрель 2007 г.); молодёжной научной конференции «Молодёжь и наука Забайкалья» (Чита, декабрь 2008 г.); II Всероссийском конгрессе студентов и аспирантов-биологов «Симбиоз Россия - 2009» (Пермь, май 2009 г., диплом I степени); The 13th Symposium for Biology Student of Europe «SymBioSe 2009» (Kazan, July—August 2009); Всероссийской конференции молодых ученых,

посвященной 90-летию со дня рождения академика П.Л. Горчаковского «Экология: от южных гор до северных морей» (Екатеринбург, апрель 2010 г.); III Всероссийском конгрессе студентов и аспирантов-биологов «Симбиоз Россия - 2010» (Нижний Новгород, май 2010 г.); Всероссийской конференции с международным участием «V Верещагинской байкальской конференции» (Иркутск, октябрь 2010 г., диплом I степени); IV Всероссийском с международным участием конгрессе студентов и аспирантов-биологов «Симбиоз Россия - 2011» (Воронеж, май 2011 г., диплом I степени).

Публикации. По результатам исследования опубликована 31 научная работа, из них 7 - статьи, из которых 6 из списка ВАК, 1 - глава в монографии, 1 - методическое пособие и 22 - тезисы конференций.

Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, 5 глав, заключения, выводов, списка литературы и приложений. Работа изложена на 138 страницах, содержит 5 таблиц и 18 рисунков. Список литературы включает 232 наименования, из которых 57 - российских и 175 - зарубежных изданий.

Благодарности. Автор выражает глубокую признательность научному руководителю к.б.н., доценту Н.Л. Бельковой и научному консультанту к.б.н. Е.В. Дзюба за помощь в организации и проведении исследований. За оказанную помощь при выполнении работ и обсуждении результатов благодарю сотрудников отдела микробиологии, лабораторий ихтиологии, аналитической биоорганической химии, геносистематики и отдела ультраструктуры клетки Лимнологического института СО РАН. Отдельную благодарность выражаю заведующей Центром лабораторной диагностики «Мечников» (ИГМУ, Иркутск) Г.Ю. Коган и сотруднику Т.И. Никифоровой, а также заведующей центром по микоплазмозам д.б.н. И.В. Раковской и сотрудникам центра ФГБУ «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи» (г. Москва) за оказанную помощь в работе по изучению микоплазм. Выражаю благодарность H.A. Докучаеву

(с. Петропавловское, Киренский район) и главному ветеринарному врачу Киренского района Х.Х. Эрбиеву за помощь в сборе материала на реке Чечуй (бассейн реки Лена). Особую благодарность приношу своим родным за моральную и финансовую поддержку.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АБП - антибактериальный препарат

Аг - антиген

Ат - антитело

вл. м. - влажная масса

ДМСО - диметилсульфоксид

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

ДСН - додецилсульфат натрия

КМ - клетки микоплазм

КТ - кишечный тракт

МЭГ - морфо-экологическая группа

ОП - оптическая плотность

п. н. - пара нуклеотидов

пМФА - прямой метод флуоресцирующих антител

ПДАФ - полиморфизм длин амплифицированных фрагментов

ПЦР - полимеразная цепная реакция

PATA - реакция агрегат-гемагглютинации

рДНК - рибосомная дезоксирибонуклеиновая кислота

РНК - рибонуклеиновая кислота

рРНК - рибосомная рибонуклеиновая кислота

сем. - семейство

син. - синонимичное название вида или рода ТБ-буфер - буфер для трансформации ТЕ-буфер - буфер трис-ЭДТА

трис-НС1 - трис-оксиметиламинометана гидрохлорид ТСБ - трис-солевой буфер

ТЭМ - трансмиссионная электронная микроскопия

ЦОЕ - цвето-образующие единицы

ЦТАБ - цетилтриметиламмония бромид, цетавлон

ЭДТА - этилендиаминтетраацетат

экз. - экземпляр

ЭМА - этидиум моноазид

MOPS - 3-(М-морфолино) пропансульфоновая кислота ITS - нетранскрибируемый межгенный спейсер рРНК

Заключение диссертации по теме «Экология (по отраслям)», Суханова, Елена Викторовна

100 выводы

1. Для изучения сообществ микроорганизмов, ассоциированных с рыбами, разработан и применен комплекс молекулярно-генетических методов, включающий видо- и групп-специфичную ПЦР и клонирование целевых ампликонов, который позволяет детектировать широкий спектр микроорганизмов.

2. В составе кишечной микрофлоры байкальского омуля и рыб рода Thymallus определены представители аллохтонной и автохтонной микрофлоры. К аллохтонной отнесены строгие аэробы, представители филы Proteobacteria: Azospirillum, Bradyrhizobium, Comamonas, Collimonas, Pseudomonas, Pseudoalter omonas, Quatrionicoccus, Stenotrophomonas, некультивируемые бактерии фил Bacteroidetes и Actinobacteria, широко распространенные в водных экосистемах.

3. Состав собственной микрофлоры байкальского омуля и рыб рода Thymallus включает представителей родов Acinetobacter, Aeromonas, Brevinema, Caulobacter, Clostridium, Deefgea, Delftia, Enterobacter, Escherichia, Flavobacterium, Mycoplasma, Plesiomonas, Pseudomonas, Salmonella, Spironema, Sphingomonas и некультивируемые Deltaproteobacteria, среди которых преимущественно описаны факультативные и облигатные анаэробы, являющиеся типичными представителями кишечной микрофлоры гомойотермных и пойкилотермных животных.

4. Исследование кишечной микрофлоры байкальского омуля разных МЭГ показало, что при смене спектра питания увеличивается разнообразие доминирующих микроорганизмов, а стабильность питания ведет к формированию устойчивого микробного сообщества с небольшим числом таксономических единиц.

5. Специфичными представителями микрофлоры черного байкальского хариуса из разных мест обитания определены представители филы Spirochaetes и Mycoplasma sp.

6. Mycoplasma sp. является специфичным для лососевидных рыб представителем кишечной микрофлоры. Определена зараженность рыб: род Thymallus - 100%; Coregonus migratorius — 60%; Coregonus lavaretus pidschian - 50%; Prosopium cilindraceum - 15%; Brachymystax lenok - 40%. Филогенетический анализ выявил принадлежность байкальской Mycoplasma sp. к группе hominis, что подтверждено культуральными и серологическими методами.

7. Язвенные заболевания внешних покровов рыб имеют комплексную этиологию. Кроме типичных представителей ихтиопатогенов родов Flavobacterium, Aeromonas и Yersinia, детектированы паразитические грибы Saprolegnia parasitica и S. ferax.

8. В качестве ключевых видов индикаторных микроорганизмов для мониторинга состояния среды обитания и оценки эпизоотологической ситуации в водоемах и водотоках Восточной Сибири определены Flavobacterium psychrophilum, Aeromonas allosaccharophila, A. salmonicida, A. veronii и Yersinia ruckeri.

102

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В работе проведено исследование состава, структуры и разнообразия сообществ микроорганизмов, ассоциированных с лососевидными рыбами из разных водоемов Восточной Сибири. Комплексное использование молекулярно-генетических подходов, микроскопического анализа и методов культивирования на селективных средах позволило определить спектр доминирующих генотипов в кишечной микрофлоре байкальского омуля и представителей рода Thymallus, идентифицировать новый генотип Mycoplasma sp. и охарактеризовать микоплазм как специфичных представителей кишечной микрофлоры некоторых лососевидных рыб, а также выявить патогенные микроорганизмы, вызывающие язвенные заболевания рыб в искусственных и естественных водоемах.

Основной спектр таксономических групп кишечной микрофлоры проанализированных лососевидных рыб включает представителей Proteobacteria (классы Alpha и Beta), Actinobacteria, Bacteroidetes, Planctomycetes и Firmicutes, среди которых можно выделить автохтонные и аллохтонные микроорганизмы. Наибольшее разнообразие выявлено среди представителей филы Proteobacteria класс Gammaproteobacteria {Acinetobacter, Aeromonas, Enterobacter sp., Escherichia, Plesiomonas, Pseudomonas sp., Pseudoalteromonas sp., Stenotrophomonas sp., Salmonella sp.), что согласуется с данными литературы. К автохтонной микрофлоре отнесены бактерии группы кишечной палочки {Enterobacter, Escherichia, Salmonella) и факультативные и облигатные анаэробы, а к аллохтонной -широко распространенные аэробные бактерии (Comamonas, Pseudoalteromonas, Quatrionicoccus, Stenotrophomonas, некультивируемые бактерии сем. Chitinophagaceae и Rubrobacteraceae).

Впервые идентифицированы новые генотипы в кишечной микрофлоре черного байкальского хариуса - это представители филы Spirochaetes и байкальский генотип Mycoplasma. Филогенетический анализ показал их отличие от известных культивируемых штаммов. Благодаря использованию современных молекулярных методов проведена оценка численности клеток микоплазм в разных отделах кишечника хариусов, которая варьировала от 4,7х104до 1,5хЮ12 кл./мкг выделенной ДНК. С использованием культуральных методов определен титр клеток микоплазм и показана их устойчивость к широкому спектру антибиотиков. Наличие в составе кишечной микрофлоры рыб родов Thymallus, Coregonus, Prosopium и Brachymystax микоплазм исследуемого генотипа позволяет констатировать существование космополитной фантомной группы неопределенного таксономического уровня, представленной комменсалами кишечного тракта холодноводных рыб.

Результаты проведенных исследований по изучению микрофлоры, ассоциированной с внешними покровами рыб, показали, что в состав микробного сообщества язвенных проявлений, детектируемых на рыбах как в условиях искусственного содержания, так и из ествественных водоемов входят представители Alphaproteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes, Planctomycetes и Spirochaetes. Наряду с типичными представителями сапрофитной микрофлоры детектированы известные ихтиопатогены - Yersinia ruckeri, Aeromonas allosaccharophila, A. hydrophila, A. salmonicida, Flavobacterium psychrophilum, Saprolegnia parasitica и S. ferax.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Суханова, Елена Викторовна, 2012 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Анализ соотношений изотопов углерода и азота у байкальского омуля Coregonus autumnalis migratorius (Georgi) в Баргузинском заливе озера Байкал / Е. В. Дзюба [и др.] // Сиб. экол. журн. - 1999. - Т. 6. - С. 659662.

2. Бактерии семейства Spirochetaceae в кристаллическом стебельке переднежаберного моллюска Benedictia baicalensis (Gastropoda: Hydrobioydea) эндемика озера Байкал / Т. Я. Ситникова [и др.] // материалы пятой верещагинской байкальской конференции, 4-9 октября 2010 г. - Иркутск : Из-во ОАО «Иркутская областная типография №1», 2010. - 298 с.

3. Белькова Н. Л. Исследование микрофлоры желудочно-кишечного

тракта рыб озера Байкал: разработка эффективных методов выделения суммарной ДНК / Н. Л. Белькова, Т. А. Ханаева, Е. В. Дзюба // 1-я Международная научно-практическая конференция "Повышение эффективности использования водных биологических ресурсов": Материалы конференции. - Москва : Изд-во ВНИРО, 2006. - С. 132— 133.

4. Белькова Н. Л. Таксономическое разнообразие микробного сообщества

водной толщи озера Байкал: Дис. ... канд. биол. наук : 03.00.16; 03.00.07 / Н. Л. Белькова ; ДВГУ. - Владивосток, 2004. - 20 с.

5. Биоразнообразие бактерий на различных глубинах южной котловины

озера Байкал, выявленное по последовательностям 16S рРНК / Л. Я. Денисова [и др.] // Микробиология. - 1999. - Т. 68. - № 4. - С. 475^183.

6. Вокин А. И. Экология хариусовых рыб (Thymallidae) горных водоемов

Байкальской рифтовой зоны: Автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.00.16 / А. И. Вокин ; Бурят, гос. ун-т. - Улан-Удэ, 2008. - 23 с.

7. Волерман И. Б. Биологические сообщества рыб и нерпы в Байкале / И. Б.

Волерман, В. В. Конторин. - Новосибирск : Изд-во СО АН СССР, 1983.-248 с.

8. Гаевская А. В. Паразиты и болезни морских и океанических рыб в

природных и искусственных условиях / А. В. Гаевская - Севастополь : ЭКОСИ-Гидрофизика, 2004. - 237 с.

9. Гаранкина В. П. Деструкция органического вещества в прибрежной

зоне залива Посольский Сор оз. Байкал / В. П. Гаранкина, О. П. Дагурова // Известия Иркутского госуниверситета. Сер. Науки о Земле.

- 2009. - Т. 2. - № 2. - С. 65-71.

10.Гидроакустический учет ресурсов байкальского омуля / В. И. Кудрявцев, Е. В. Дзюба // Справочники и определители по фауне и флоре озера Байкал. - Новосибирск : Наука, 2009. - 244 с.

11. Гидрохимическая характеристика заливов восточной части озера

Байкал / Б. Б. Намсараев [и др.] // Вестник Бурятского госуниверситета. Сер. Химия, физика. - 2008. - № 3. - С. 38-40.

12. Грачев М. А. Метод выделения высокоочищенной ДНК для

использования в полимеразной цепной реакции / М. А. Грачев, С. Ю. Кузнецова, Т. А. Щербакова // Молекулярная биология. - 2006. - Т. 40.

- № 1.-С. 180-183.

13.Грищенко Л. И. Болезни рыб и основы рыбоводства / Л. И. Грищенко, М. Ш. Акбаев, Г. В. Васильков. - М. : Колос, 1999. - 456 с.

14.Гурова Л. А., Пастухов В.Д. Питание и пищевые взаимоотношения пелагических рыб и нерпы Байкала / Л. А. Гурова, В. Д. Пастухов. -Новосибирск : Наука. Сиб. отд-ние, 1974. - 186 с.

15.Егоров А. Г. Рыбы водоемов юга Восточной Сибири / А. Г. Егоров -Иркутск : Изд-во Иркутского университета, 1985. - 362 с.

16.Елизов В. И. Аэромоноз в регионе Байкала / В. И. Елизов // Биоразнообразие экосистем Внутренней Азии: Тез. Всеросс. конф. с межд. уч. - Улан-Удэ : БНЦ СО РАН, 2006. - Т. 2. - С. 151-154.

17.Енгашев В. Г. Новое в борьбе с краснухой карпов / В. Г. Енгашев, В. Т. Орлов, В. И. Просинюк // Интернет-версия журнала «Рыбное хозяйство». - 2005. - № 2.

18.Заика В. Е. Паразитофауна рыб озера Байкал / В. Е. Заика - М. : Наука, 1965.- 107 с.

19.Извекова Г. И. Симбионтная микрофлора рыб различных экологических групп / Г. И. Извекова, Е. И. Извеков, А. О. Плотников // Известия РАН. Сер. Биологическая. - 2007. - № 6. - С. 1-10.

20.Изучение видового состава культивируемых гетеротрофных микроорганизмов озера Байкал / В. В. Парфенова [и др.] // Биология внутренних вод. - 2006. - № 1. - С. 8-15.

21.Ихтиопатология / Н. А. Головина [и др.] // Учебники и учеб. пособия для студентов высших учебных заведений. - Под ред. Н. А. Головиной, О. Н. Бауера. - М. : Мир, 2003. - 448 с.

22.Каплина Г. С. Макрозообентос каменистых грунтов литорали оз. Байкал и его сезонная динамика (данные 1963-1968 гг., район Больших Котов) / Г. С. Каплина // Продуктивность Байкала и антропогенные изменения его природы. - Иркутск : Изд. БГНИИ при ИГУ, 1974. - С. 126-137.

23.Качество воды озера Байкал, проблемы и перспективы ее использования / В. В. Парфенова [и др.] // Производственно-технический и научно-практический журнал. Водоочистка. Водоподготовка. Водоснабжение. -2009.-Т. 1.-С. 48-54.

24.Квасников Е. И. Молочнокислые бактерии пресноводных рыб / Е. И. Квасников, Н. К. Коваленко, Л. Г. Материнская // Микробиология. -1977. - Т. ХЬУ1. - С. 755-760.

25.К вопросу о систематическом положении хариусов бассейна озера Байкал / И. Б. Книжин [и др.] // Тр. каф. зоол. позвоноч. - 2001. - Т. 1. -С. 147-151.

26.Книжин И. Б. Хариусы бассейна озера Байкал (Thymallus, Thymallidae): разнообразие форм и их таксономический статус / И. Б. Книжин, С. Дж. Вайс, С. Сушник // Вопр. ихтиологии. - 2006. - Т. 46. - № 4. - С. 442-459.

27.Коваленко Я. Р. Африканская чума свиней / Я. Р. Коваленко, М. А. Сидоров, Л. Г. Бурба. - М. : Колос, 1972. - 200 с.

28.Кожов М. М. К вопросу о питании промысловых рыб на Байкале / М. М. Кожов // Изв. Биол.-геогр. НИИ при Иркутском ун-те. - 1931. - Т. 5. -№ 1. - С. 1-171.

29.Кожов М. М. Очерки по Байкаловедению / М. М. Кожов. - Иркутск : Вост.-Сиб. кн. изд-во, 1972. - 234 с.

30.Корнева Ж. В. Симбионтная микрофлора, колонизирующая тегумент Triaenophorus nodulosus (Cestoda) и кишечник его хозяина — щуки / Ж.

B. Корнева, А. О. Плотников // Паразитология. - 2006. - Т. 40. - № 6. -

C. 535-546.

31.Кузьмина В. В. Физиолого-биохимические основы экзотрофии рыб / В. В. Кузьмина. - М. : Наука, 2005. - 300 с.

32.Матвеев А. Н. Круглоротые (Cyclostomata) и рыбы (Pisces) водоемов бассейна реки Ангара / А. Н. Матвеев, В. П. Самусенок // Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна: в 2 т. - Новосибирск : Наука, 2009. - Т. 2: Озеро Байкал, кн. 1-С. 396-416.

33.Микробиологический мониторинг мелководных участков озера Байкал / О. П. Дагурова [и др.] // Вестник Бурятского университета. Сер. Биология. - 2002. - № 4. - С. 124-127.

34.Миронов А. А. Методы электронной микроскопии в биологии и медицине / А. А. Миронов, Я. Ю. Комиссарчик, В. А. Миронов. - СПб. : Наука, 1994. - 399 с.

35. Михеев И. Е. Факторы риска для популяции окуня Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край) / И. Е. Михеев, Е. Б. Матюгина //

Известия Самарского научного центра РАН. - 2010. - Т. 12. - № 1. - С. 1317-1320.

36. Особенности распространения бактерий рода Pseudomonas в озере

Байкал / О. Н. Павлова [и др.] // Сиб. экол. журнал. - 2003. - № 3. - С. 267-272.

37.Первые сведения о бактериях семейства Spirochaetacea пищеварительного тракта эндемичных брюхоногих моллюсков озера Байкал / Ю. Р. Тулупова [и др.] // Микробиология. - 2012 (в печати).

38.Перетрухина А. Т. Микробиология сырья и продуктов водного происхождения / А. Т. Перетрухина, И. В. Перетрухина. - СПб : ГИОРД, 2005. - 320 с.

39.Пищевые взаимоотношения лососевидных рыб реки Чечуй / И. А. Небесных [и др.] // Материалы 1-ой Международной научно-практической конференции, посвященной 75-летию со дня рождения М. А. Козлова «Современные зоологические исследования в России и сопредельных странах». - Чебоксары, 2011. - С. 112-114.

40.Попов П. А. Рыбы Сибири: распространение, экология, вылов / П. А. Попов - Новосибирск: Новосиб. гос. ун-т., 2007. - 526 с.

41.Правдин И. Ф. Руководство по изучению рыб (преимущественно пресноводных) / И. Ф. Правдин - М. : Пищевая промышленность, 1966. - 376 с.

42.Пронин Н. М. Об экологических последствиях акклиматизационных работ в бассейне озера Байкал / Н. М. Пронин // Биологические ресурсы Забайкалья и их охрана. - Улан-Удэ : Изд-во БФ СО АН СССР, 1982.-С. 3-18.

43.Пронин Н. М. Паразитофауна щуки озера Гусиное / Н. М. Пронин, С. Ш. Шигаев // Тр. Бурят, ин-та естеств. наук. - Улан-Удэ, 1977. - Вып. 18: Сер. зоол. Фауна, морфология и экология паразитов позвоночных животных Забайкалья. - С. 45-54.

44.Пронин М. Н. Паразиты и болезни омуля / М. Н. Пронин // Экология, болезни и разведение байкальского омуля. - Новосибирск : Наука, 1981.-С. 114-159.

45.Пронин Н. М. Полимастиготы (МаБ1^ор1юга: Polymastigota) / Н. М. Пронин // Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна: в 2 т. - Новосибирск : Наука, 2001. - Т. 1: Озеро Байкал, кн. 1. - С. 129.

46.Русинек О. Т. Паразиты рыб озера Байкал (фауна, сообщества, зоогеография, история формирования) / О. Т. Русинек - М. : Товарищество научных изданий КМК, 2007. - 571 с.

47.Савичева А. М. Современные представления о генитальных микоплазмах / А. М. Савичева // Русский медицинский журнал. Мать и дитя. Акушерство и гинекология. - 2010. - Т. 18. - № 4. - С. 183-188.

48.Скрябин А. Г. Сиговые рыбы юга Сибири / А. Г. Скрябин -Новосибирск : Наука, 1979. - 229 с.

49.Спорообразующие бактерии в организме карпа и радужной форели, выращиваемых в сбросных водах теплоэлектростанции / А. Н. Котляр [и др.] // Микробиологический журнал. - 1984. - Т. 46. - № 2. - С. 610.

50.Сравнительная экология и Паразитофауна экзотических вселенцев в Великие озера мира: ротана-головешки (РегсоПт §1еппг) в озеро Байкал и ерша (ОутпосерИа1иБ сетиш) в оз. Верхнее / Н. М. Пронин [и др.] // Сиб. экол. журнал. - 1998. - Т. 5. - № 5. - С. 397-406.

51. Таксономическое и экологическое разнообразие микроорганизмов озера

Байкал / О. П. Дагурова [и др.] // Байкал: природа и люди: энциклопедический справочник. - 2009. - Т. 2. - С. 77-79.

52. Тугарина П. Я. Питание и пищевые взаимоотношения рыб Байкало-

Ангарского бассейна / П. Я. Тугарина, Е. С. Купчинская -Новосибирск: Наука, 1977. - 103 с.

53.Тугарина П. Я. Хариусы Байкала / П. Я. Тугарина. - Новосибирск : Наука, 1981.-280 с.

54.Уголев А. М. Пищеварительные процессы и адаптации у рыб / А. М. Уголев, В. В. Кузьмина. - СПб : Гидрометеоиздат, 1993. - 238 с.

55.Хандажапова Б. Б. Микробиологический мониторинг промысловых рыб озера Байкал / Б. Б. Хандажапова, В. Ц. Цыдыпов, В. Р. Филиппова // Материалы международного ветеринарного конгресса. - 2005. - С. 164-165.

5 6. Характеристика биоразнообразия микробного сообщества водной толщи озера Байкал / Н. JI. Белькова [и др.] // Микробиология. - 2003. -Т. 72.-№2.-С. 239-249.

57.Цыбиков М-Ж. Ц. Эпизоотологическая и иммунологическая оценка аэромоноза рыб в системе Еравно-Хоргинских озер республики Бурятия / М.-Ж. Ц. Цыбиков, В. Ц. Цыдыпов, Г. А. Новокшонова // Труды Кубанского государственного аграрного университета. - 2009. -№ 5.-С. 259-262.

58.Acute stress causes skin ulceration in stripped bass and hybrid bass (Morone) / E. J. Noga [et al.] II Vet. Pathol. - 1998. - Vol. 35. - P. 102-107.

59.Allen D. A. Numerical taxonomy of bacterial isolates associated with a freshwater fishery / D. A. Allen, B. Austin, R. R. Colwell // J. Gen. Microbiol. - 1983. - Vol. 129. - P. 2043-2062.

60. An antibacterial effect of Lactococcus lactis isolated from the intestinal tract

of the Amur catfish, Silurus asotus Linnaeus / H. Sugita [et al.] II Aquae. Res. - 2007. - Vol. 38. - P. 1002-1004.

61.An epizootic of Edwardsiella tarda in largemouth bass (Micropterus salmoides) / R. Francis-Floyd // J. Wildl. Dis. - 1993. - Vol. 29. - No. 2. -P. 334-336.

62. A new species of Henneguya, a gill parasite of a freshwater fish Anabas

testudineus (Bloch) affected with ulcerative disease syndrome from

Manipur, India / Th. Hemanand [et al.] // Turkiye Parazitoloji Derg. — 2008. -Vol. 32.-No. l.-P. 82-85.

63. Antibacterial abilities of intestinal bacteria from larval and juvenile Japanese

flounder against fish pathogens / H. Sugita [et al.] // Fish. Sci. - 2002. -Vol. 68.-P. 1004-1011.

64. Antibiotic resistance found in wild rodents / M. A. Gilliver [et al.] II Nature.

- 1999. - Vol. 401. - P. 233-234.

65.Antimicrobial activity in bacteria isolated from Senegalese sole, Solea senegalensis, fed with natural prey / P. Makridis [et al.] // Aquae. Res. -2005. - Vol. 36. - P. 1619-1627.

66.Aphanomyces as a cause of ulcerative skin lesions of menhaden from Chesapeake Bay tributaries / V. S. Blazer [et al.] II J. Aquat. Anim. Health.

- 1999. - Vol. 11. - P. 340-349.

67.A phylogenetic analysis of the mycoplasmas: basis for their classification / W. G. Weisburg [et al.] II J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171. - P. 6455-6467.

68. Application of a suite of 16S rRNA-specific oligonucleotide probes designed

to investigate bacteria of the phylum cytophaga-flavobacter-bacteroides in the natural environment / W. Manz [et al.] II Microbiology. - 1996. - Vol. 142.-No. 5.-P. 1097-1106.

69.Asfie M. Characterization of the goldfish fecal microflora by the fluorescent in situ hybridization method / M. As fie, T. Yoshojima, H. Sugita // Fish. Sci. - 2003. - Vol. 69. - P. 21-26.

70.Atlantic salmon bath challenged with Moritella vzscosa-pathogen invasion and host response / M. Lovoll [et al.] II Fish Shellfish Immunol. - 2009. -Vol. 26. - No. 6. - P. 877-884.

71.Austin B. Bacterial fish pathogens, disease of farmed and wild fish / B. Austin, D. A. Austin. - Ellis Horwood, Chichester, 1987.

72.Austin B. Bacterial fish pathogens: disease of farmed and wild fish Jointly published with Praxis Publishing / B. Austin, D. A. Austin. - UK 4th ed., 2007. - Vol. XXVIII. - 552 p.

73.Austin B. Taxonomy of bacterial fish pathogens / B. Austin // Vet. Res. -2011.-Vol. 42. -P. 20.

74. Austin B. The bacterial microflora of fish / B. Austin // The Scientific World

J. - 2002. - Vol. 2. - P. 558-572.

75.Blackwood C. B. Phylum- and class-specific PCR primers for general microbial community analysis / C. B. Blackwood, A. Oaks, J. S. Buyer // Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71. - P. 6193-6198.

76.Bosakowski T. A survey of trout fin erosion, water quality, and rearing conditions at state fish hatcheries in Utah / T. Bosakowski, E. J. Wagner // J. W. Aquae. Society. - 1994. - Vol. 25. -P. 308-316.

77.Buller N. B. Bacteria from fish and other aquatic animals: a practical identification manual / N. B. Buller. - Oxfordshire : CABI, 2004. - 361 p.

78.Busch S. Concomitant exposure of rainbow trout fry to Gyrodactylus derjavini and Flavobacterium psychrophilum: effects on infection and mortality of host / S. Busch, I. Dalsgaard, K. Buchmann // Vet. Parasitol. -2003.-Vol. 117.-P. 117-122.

79.Bowman J. P. Salmonid gill bacteria and their relationship to amoebic gill disease / J. P. Bowman, B. Nowak // J. Fish Dis. - 2004. - Vol. 27. - P. 483-492.

80.Cahill M. M. Bacterial flora of fishes: a review / M. M. Cahill // Microb. Ecol.- 1990.-Vol. 19.-P. 21-41.

81. "Candidates Hepatoplasma crinochetorum", a new, stalk-forming lineage of

Mollicutes colonizing the midgut glands of a terrestrial isopod / Y. Wang [et al] II Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - Vol. 70. - No. 10. - P. 61666172.

82.Characterization of the intestinal microbiota of two Antarctic notothenioid fish species / N. L. Ward [et al.] II Extremophiles. - 2009. - Vol. 13. - P. 679-685.

83.Characterization of the microbial diversity in a permafrost sample from the Canadian high Arctic using culture-dependent and culture-independent

methods / B. Steven [et al.] II FEMS Microbiol. Ecol. - 2007. - Vol. 59. -P. 513-523.

84.Characterization of vanA-containing Enterococcus faecium isolates carrying Tn5397-like and Tn916/Tnl545-like transposons in wild boars (Sus Scrofa) / P. Poeta [et al.} II Microb. Drug. Resist. - 2007. - Vol. 13. - P. 151-156.

85.Clayton R. D. Fin erosion in intensively cultured Walleyes and Hybrid Walleyes / R. D. Clayton, T. L. Stevenson, R. C. Summerfelt II The Progressive fish-culturist. - 1998. - Vol. 60. - P. 114-118.

86. Clements K. D. An unusual symbiont from the gut of surgeonfishes may be

the largest known prokaryote / K. D. Clements, S. Bullivant // Appl. Environ. Microbiol. - 1991. - Vol. 173. - No. 17. - P. 5359-5362.

87.Collins M. D. Aeromonas enteropelogenes and Aeromonas ichthiosmia are identical to Aeromonas trota and Aeromonas veronii, respectively, as revealed by small-subunit rRNA sequence analysis / M. D. Collins, A. J. Martinez-Murcia, J. Cai // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1993. - Vol. 43. - P. 855-856.

88.Comparative genome analysis of Mollicutes / T. Dandekar [et al.] II Molecular biology and pathogenicity of mycoplasmas. - USA: Kluwer Academic/Plenum, 2002. - P. 255-278.

89.Comparative studies of piscine and amphibian iridoviruses / A. D. Hyatt [et al.} II Arch. Virol. - 2000. - Vol. 145. - P. 301-331.

90.Complete genome sequence of lymphocystis disease virus (LCDV-C) isolated from China / Q. Y. Zhang [et al.] II J. Virol. - 2004. - Vol. 78. -No. 13.-P. 6982-6994.

91 .Delftia lacustris sp. nov., a peptidoglycan-degrading bacterium from freshwater and emended description of D. tsuruhatensis as a peptidoglycan-degrading bacterium / N. O. G. Jorgensen [et al.] II Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2009. - Vol. 59. - No. 9. - P. 2195-2199. 92.DeLong E. F. Archaea in coastal marine environments / E. F. DeLong // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. - 1992. - Vol. 89. - No. 12. - P. 5685-5689.

93.Detection of methanogenic archaea in seawater particles and the digestive tract of a marine fish species / M. J. E. C Van der Maarel [et al.] II FEMS Microbiol. Lett. - 1999. - Vol. 173. - P. 189-194.

94.Detection of the aerolysin gene in Aeromonas hydrophila by the polymerase chain reaction / D. Pollard [et al.] II J. Clin. Microb. - 1990. - Vol. 28. - P. 2477-2481.

95.Development of a group-specific PCR combined with ARDRA for the identification of Bacillus species of environmental significance / H. Y. Wu [et al.] 11 J. Microbiol. Methods. - 2004. - Vol. 64. - P. 107-119.

96.Development of a real-time PCR method for quantification of the three genera Dehalobacter, Dehalococcoides, and Desulfitobacterium in microbial communities / T. H. M. Smits [et al.] II J. Microbiol. Methods. -2004. - Vol. 57. - P. 369-378.

97.Diversity and seasonal changes in lactic acid bacteria in the intestinal tract of cultured freshwater fish / T. Hagi [et al.] II Aquaculture. - 2004. - Vol. 234. -P. 335-346.

98.Diversity of the human intestinal microbial flora / P. B. Eckburg [et al.] I I Science. - 2005. - Vol. 308. - P. 1635-1638.

99.Dominance of Mycoplasma in the guts of the long-jawed mudsucker, Gillichthys mirabilis, from five California salt marshes / N. Bano [et al.] II Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 9. - P. 2636-2641.

100. Ectoparasites communities from Oreochromis niloticus cultivated in the State of Santa Catarina, Brazil / L. Ghiraldelli [et al.] II J. Fish. Aquat. Sci. -2006.-Vol. 1. - No. 2.-P. 181-190.

101. Electron microscopy of the intestinal microflora of fish / E. Ringo [et al.] II Aquaculture. - 2003. - Vol. 227. - P. 395^115.

102. Emerging mycoplasmoses in wildlife / D. R. Brown [et al.] II In Mycoplasmas: molecular biology, pathogenicity and strategies for control -Norwich, UK : Horizon Bioscience, 2005. - P. 383^114.

103. Environmental and climatic factors associated with epizootic ulcerative syndrome (EUS) in fish from the Zambezi floodplains, Zambia / K. Choongo [et al.] II Bull. Environ. Contam. Toxicol. - 2009. - Vol. 83. - No. 4. _ p. 474^178.

104. Epidemic trichodinosis associated with severe epidermal hyperplasia in largemouth bass, Micropterus salmoides from North Carolina, USA / M. D. Huh [et al.] II J. Wildl. Dis. - 2005. - Vol. 41. - No. 3. - P. 647-653.

105. Epitheliumassociated bacteria in the gastrointestinal tract of Arctic charr (Salvelinus alpinus L.). An electron microscopical study / E. Ringo [et al.] II J. Appl. Microbiol. - 2001. - Vol. 90. - P. 294-300.

106. Epizootic ulcerative syndrome affecting fish in the Zambezi river system in southern Africa / T. G. Andrew [et al.] II Vet. Ree. - 2008. - Vol. 163. -No. 21.-P. 629-631.

107. Etiology of ulcerative lesions of Atlantic menhaden (Brevoortia tyrannus) from James River / S. R. Webb [et al.] II Virginia Parasitol. Res. - 2005. -Vol. 97.-P. 358-366.

108. Evidence of enhanced bacterial invasion during Diplostomum spathaceum infection in European grayling, Thymallus thymallus (L.) / P. Pylkko [et al] II J. Fish Dis. - 2006. - Vol. 29. - P. 79-86.

109. First record of Trichodina heterodentata (Ciliophora: Trichodinidae) from channel catfish, Ictalurus punctatus cultivated in Brazil / M. L. Martins [et al.] II Braz. J. Biol. - 2010. - Vol. 70. - No. 3. - P. 637-644.

110. Fish histology and histopathology manual / S. Mumford [et al.] - USFWS-NCTC, 2007. - 357 p.

111. Fraune S. Host-specificity of environmentally transmitted Mycoplasma-\\k& isopod symbionts / S. Fraune, M. Zimmer // Environ. Microbiol. - 2008. -Vol. 10. - No. 10. - P. 2497-2504.

112. Frerichs G. N. Viruses associated with the epizootic ulcerative syndrome (EUS) offish in South-East Asia / G. N. Frerichs // Vet. Res. - 1995. - Vol. 26.-No. 5-6.-P. 449-454.

113. Gene organization and primary structure of a ribosomal RNA operon from Escherichia coli / J. Brosius [et al.] II J. Mol. Biol. - 1981. - Vol. 148. - P. 107-127.

114. Giebel J. Isolation of Mycoplasma moatsii from the intestine of wild Norway rats {Rattus norvegicus) / J. Giebel, A. Binder, H. Kirchhoff// Vet. Microbiol. - 1990. - Vol. 22. - P. 23-29.

115. Gillespie N. C. A numerical taxonomic study of Pseudomonas-like bacteria isolated from fish in southeastern Queensland and their association with spoilage / N. C. Gillespie // J. Appl. Bacteriol. - 1981. - Vol. 50. - P. 2944.

116. Haematological changes in Nile tilapia experimentally infected with Enterococcus sp. / M. L. Martins [et al.] II Braz. J. Biol. - 2008. - Vol. 68. -P. 631-637.

117. Hansen G. H. Effect of different holding regimens on the intestinal microflora of herring {Clupea harengus) larvae / G. H. Hansen, E. Strom, J. A. Olafsen // Appl. Environ. Microbiol. - 1992. - Vol. 58. - P. 461-470.

118. Harishi R. Prevalence of opportunistic pathogens in Paddy Cum Shrimp Farms Adjoining Vembanadu Lake, Kerala, India / R. Harishi, K. S. Nishai, A. A. Mohamed // Asian Fish. Sci. - 2003. - Vol. 16. - P. 185-194.

119. Haygood M. G. Light organ symbioses in fishes / M. G. Haygood // Crit. Rev. Microbiol. - 1993. - Vol. 19. - P. 191-216.

120. Haygood M. G. Polymerase chain-reaction and 16S-ribosomal-RNA gene-sequences from the luminous bacterial symbionts of 2 deep-sea anglerfishes / M. G. Haygood, D. L. Distel, P. J. Herring // J. Mar. Biol. Assoc. U.K. -1992.-Vol. 72.-P. 149-159.

121.Hellberg H. The anatomy of the oesophagus, stomach and intestine in common wolffish (Anarhichas lupus L.): a basis for diagnostic work and research / H. Hellberg, I. Bjerkas // Acta Vet. Scand. - 2000. - Vol. 41. - P. 283-297.

122. High prevalence of multidrug-tolerant bacteria and associated antimicrobial resistance genes isolated from ornamental fish and their carriage Water David / W. Verner-Jeffreys [et al.] // PLoS ONE. - 2009. - Vol. 4. - No. 12.

- e8388.

123. High-resolution genotypic analysis of the genus Aeromonas by AFLP fingerprinting / G. Huys [et al.] // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1996. - Vol. 46.

- P. 572-580.

124. Hongoh Y. Molecular analysis of bacterial microbiota in the gut of the termite Reticulitermes speratus (Isoptera; Rhinotermitidae) / Y. Hongoh, M. Ohkuma, T. Kudo // FEMS Microbiol. Ecol. - 2003. - Vol. 44. - P. 231242.

125. Horsley R. W. The bacterial flora of the Atlantic salmon (<Salmo salar L.) in relation to its environment / R. W. Horsley // J. Appl. Bacteriol. — 1973. -Vol. 36.-P. 377-386.

126. Huys G. New DNA-DNA hybridization and phenotypic data on the species Aeromonas ichthiosmia and Aeromonas allosaccharophila: A. ichthiosmia Schubert et al. 1990 is a later synonym of A. veronii Hickman-Brenner et al. 1987 / G. Huys, P. Kampfer, J. Swings // Syst. Appl. Microbiol. - 2001. -Vol. 24.-P. 177-182.

127. Identification and characterization of Carnobacteria isolated from fish intestine / E. Ringo [et al.] II Syst. Appl. Microbiol. - 2001. - Vol. 24. - P. 183-191.

128. Identification of and Spatio-Temporal differences between microbial assemblages from two neighboring Sulfurous lakes: comparison by microscopy and denaturing gradient gel electrophoresis / E. O. Casamayor [et al.] II Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66. - No. 2. - P. 499508.

129. Ileal symbiont intracellularis, an obligate intracellular bacterium of porcine intestines showing a relationship to Desulfovibrio species / C. J. Gebhart [et al.] II Int. J. Syst. Bacteriol. - 1993. - Vol. 43. - No. 3. - P. 533-538.

130. Influence of natural Trichodina sp. parasitism on experimental Streptococcus iniae or Streptococcus agalactiae and survival of young channel catfish Ictalurus punctatus (Rafinesque) / J. J. Evans [et al.] // Aquae. Res. - 2007. - Vol. 38. - P. 664-667.

131. Influence of raceway substrate and design on fin erosion and hatchery performance of rainbow trout / R. E. Arndt [et al.] II N. Am. J. Aquae. -2001.-Vol. 63.-P. 312-320.

132. Intra- and interspecific comparisons of bacterial diversity and community structure support coevolution of gut microbiota and termite host / Y. Hongoh [et al.] II Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71. - P. 65906599.

133. Izumi S. Detection and identification of Flavobacterium psychrophilum from gill washings and benthic diatoms by PCR-based sequencing analysis / S. Izumi, H. Fujii, F. Aranishi // J. Fish Dis. - 2005. - Vol. 28. - P. 559564.

134. Jorgensen A. Phylogeny of Spironucleus (Eopharyngia: Diplomonadida:Hexamitinae) / A. Jorgensen, E. Sterud // Protist. - 2007. -Vol. 158.-P. 247-254.

135. Jorgensen A. SSU rRNA gene sequence reveals two genotypes of Spironucleus barkhanus (Diplomonadida) from farmed and wild Arctic charr Salvelinus alpinus / A. Jorgensen, E. Sterud // Dis. Aquat. Org. -2004.-Vol. 62.-P. 93-96.

136. Jorgensen A. The marine pathogenic genotype of Spironucleus barkhanus from farmed salmonids redescribed as Spironucleus salmonicida n. sp. / A. Jorgensen, E. Sterud // J. Eukaryot. Microbiol. - 2006. - Vol. 53. - No. 6. -P. 531-541.

137. Keeling P. J. Widespread and ancient distribution of a noncanonical genetic code in Diplomonads / P. J. Keeling, W. F. Doolittle // Mol. Biol. Evol. -1997.-Vol. 14.-No. 9.-P. 895-901.

138. Khan R. A. Mortality in captive atlantic cod, Gadus morhua, associated with fin rot disease / R. A. Khan, J. Campbell, H. Lern // J. Wildl. Dis. -1981.-Vol. 17.-No. 4.-P. 521-527.

139. Kibbe W. A. OligoCalc: an online oligonucleotide properties calculator / W. A. Kibbe // Nucleic Acids Res. - 2007. - Vol. 35 (webserver issue): W43-W46. doi: 10.1093/nar/gkm234.

140. Kim D.-H. Microbial diversity of intestinal contents and mucus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) / D.-H. Kim, J. Brunt, B. Austin // J. Appl. Microbiol.-2007.-Vol. 102.-P. 1654-1664.

141.Kindschi G. A. Method for quantifying degree of fin erosion / G. A. Kindschi // The Progressive fish-culturist. - 1987. - Vol. 49. - P. 314-315.

142. Lactic acid bacteria associated with the digestive tract of Atlantic salmon (Salmo solar L.) / E. Ringo [et al.} II J. Appl. Microbiol. - 2000. - Vol. 89. -P. 317-322.

143. La myxobactéiose viscérale de la truite arcenciel Salmo gairdneri R: Une forme nouvelle de la maladie de l'eau froide à Cytophagapsychrophila / F. Baudin-Laurencin [et al.] Il Bull. Acad. Vét. de France. - 1989. - Vol. 62. -P. 147-157.

144. Lane D. 16s/23s rRNA sequencing / D. Lane - Ed. E. Stackebrandt, M. Goodfellow, Nucleic acid techniques in bacterial systematics. UK : J. Wiley & Sons, West Sussex, 1991. - P. 115-175.

145. Law M. Differential diagnosis of ulcerative lesions in fish / M. Law // Environ. Health Perspect. - 2001. - Vol. 109. - No. 5. - P. 681-686.

146. Li H. W. Study on the pathogen of the largemouth bass ulcer disease / H. W. Li, X. L. Chen, W. M. Zou // Aquae. Pearl River. - 1994. - Vol. 20. - P. 89-94.

147. Lilley J. H. Pathogenicity and culture studies comparing the Aphanomyces in Epizootic Ulcerative Syndrome (EUS) with other similar fungi / J. H. Lilley, R. J. Roberts // J. Fish Dis. - 1997. - Vol. 20. - P. 135-144.

148. Long-term cultivation of primmorphs from freshwater Baikal sponges Lubomirskia baikalensis / L. I. Chernogor [et al.] // Mar. Biotechnol. -2011.-Vol. 13.-P. 782-792.

149. Lonnstrom L.-G. Flavobacterium psychrophilum associated with mortality of farmed perch, Perca fluviatilis L. / L.-G. Lonnstrom, M. L. Hoffren, T. Wiklund // J. Fish Dis. - 2008. - Vol. 31. - P. 793-797.

150. Ludwig W. The Firmicutes / W. Ludwig, K.-H. Schleifer, W. B. Whitman-In Bergey's manual of systematic bacteriology, 2nd Edn, Vol. 3. - Springer : Dordrecht, 2009. - P. 15-17.

151.Madsen H. C. K. Association between trichodiniasis in eel (Anguilla anguilla) and water quality in recirculation systems / H. C. K. Madsen, K. Buchmann, S. Mellergaard // Aquaculture. - 2000. - Vol. 187. - No. 3-4. -P. 275-281.

152. Mo T. A. Systematic hexamitosis in saltwater reared Atlantic salmon (Salmo salar L.) / T. A. Mo, T. T. Poppe, L. Iversen // Bull. Eur. Ass. Fish Pathol. - 1990. - Vol. 10. - P. 69.

153. Molecular identification of intestinal microflora in Takifugu niphobles / A. Shiina [et al.} II Com. Biochem. Physiol. - 2006. - Vol. 1. - P. 128-132.

154. Monitoring a widespread bacterial group: in situ detection of planctomycetes with 16S rRNA-targeted probes / A. Neef [et al.] II Microbiology. - 1998. - Vol. 144. - P. 3257-3266.

155. Moran D. Ontogenetic development of the gastrointestinal microbiota in the marine herbivorous fish Kyphosus sydneyanus / D. Moran, S. J. Turner, K. D. Clements // Microb. Ecol. - 2005. - Vol. 49. - P. 590-597.

156. Moriarty D. J. W. Probiotics in aquaculture / D. J. W. Moriarty, O. Decamp, P. Lavens // AQUA culture Asia Pacific Magazine. - 2005. - P. 14-16.

157. Mork J. Lower prevalence of fin erosion in mature than in immature Atlantic salmon {Salmo salar) parr / J. Mork, T. Jarvi, L. P. Hansen // Aquaculture. - 1989. - Vol. 80. - No. 3-4. - P. 223-229.

158. Morphological and physiological characteristics of Saprolegnia spp. strains pathogenic to Atlantic Salmon, Salmo salar L. / S. Stueland [et al.] II J. Fish Dis. - 2005. - Vol. 28. - P. 445-453.

159. Muroga K. The isolation of intestinal microflora of farmed red seabream {Pagrus major) and black seabream {Acanthopagrus schlegeli) at larval and juvenile stages / K. Muroga, M. Higashi, H. Keitoku // Aquaculture. - 1987. -Vol. 65.-P. 79-88.

160.Mycoplasma iguanae sp. nov., from a green iguana {Iguana iguana) with vertebral disease / D. R. Brown [et al.] II Int. J. Syst. Evol. Microbiol. -2006. - Vol. 56. - P. 761-764.

161. Mycoplasma moatsii, a new species isolated from recently imported grivit monkeys (Cercopithecus aethiops) / D. L. Madden [et al.] II Int. J. Syst. Bacteriol. - 1974. - Vol. 24. - P. 459-464.

162. Mycoplasma mobile sp. nov., a new species from fish / H. Kirchhoff [et al.] II Int. J. Syst. Bacteriol. - 1987. - Vol. 37. - P. 192-197.

163. Mycoplasma testudineum sp. nov., from a desert tortoise (Gopherus agassizii) with upper respiratory tract disease / D. R. Brown [et al.] I I Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54. - P. 1527-1529.

164.Navarrete P. Molecular analysis of microbiota along the digestive tract of juvenile atlantic salmon {Salmo salar L.) / P. Navarrete, R. T. Espejo, J. Romero // Microb. Ecol. - 2009 - Vol. 57. - P. 550-561.

165. New insights into animal pathogenic oomycetes / A. J. Phillips [et al.] II Trends in Microbiol. - 2007. - Vol. 16. - No. 1. - P. 13-19.

166.Nieto T. P. Comparison between the bacterial flora associated with fingerling rainbow trout cultured in two different hatcheries in the northwest of Spain / T. P. Nieto, A. E. Toranzo, J. L. Barja // Aquaculture. -1984.-Vol. 42.-P. 193-206.

167.Noga E. J. Water mold infections of freshwater fish: recent advances / E. J. Noga // Annu. Rev. Fish Dis. - 1993. - Vol. 3. - P. 291-304.

168. Nubel U. PCR primers to amplify 16S rRNA genes from Cyanobacteria / U. Nubel, F. Garcia-Pichel, G. Muyzer // Appl. Environ. Microbiol. - 1997. -Vol. 63. - No. 8. - P. 3327-3332.

169. Olafsen J. A. Interactions between fish larvae and bacteria in marine aquaculture / J. A. Olafsen // Aquaculture. - 2001. - Vol. 200. - P. 223-247.

170. Overmann J. Specific detection of different phylogenetic groups of chemocline bacteria based on PCR and denaturing gradient gel electrophoresis of 16S rRNA gene fragments / J. Overmann, M. J. L. Coolen, C. Tuschak // Arch. Microbiol. - 1999. - Vol. 172. - P. 83-94.

171. Pettersson B. Phylogeny of some mycoplasmas from ruminants based on 16S pPHK sequences and definition of a new cluster within the hominis group / B. Pettersson, M. Uhlen, K.-E. Johansson // Int. J. Syst. Bacteriol. -1996. - Vol. 46. - P. 1093-1098.

172. Phylogenetic analysis and in situ identification of the intestinal microbial community of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) / I. Huber [et al.] II J. Appl. Microbiol. - 2004. - Vol. 96. - P. 117-132.

173. Phylogenetic analysis of Hemoplasma species: an international study / S. Tasker [et al.} II J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41. - P. 3877-3880.

174. Phylogenetic analysis of intestinal microflora indicates a novel Mycoplasma phylotype in farmed and wild salmon / W. E. Holben [et al.] II Microb. Ecol. - 2002. - Vol. 44. - P. 175-185.

175. Phylogenetic analysis of Mycoplasma suis isolates based on 16S pPHK gene sequence in China / R.-Q. Zhou [et al.] II Vet. Res. Commun. - 2009. -Vol. 33.-P. 855-863.

176. Phylogeny of not-yet-cultured spirochetes from termite guts / B. J. Paster [et al.] II Appl. Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62. - No. 2. - P. 347352.

177. Phylogenetic oligodeoxynucleotide probes for the major subclasses of proteobacteria: problems and solutions / W. Manz [et al.] II Syst. Appl. Microbiol. - 1992. - Vol. 15. - P. 593-600.

178. Phylogenetic position of the spirochetal genus Cristispira / B. J. Paster [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62. - No. 3. - P. 942-946.

179. Piscine gill epithelial cell necrosis due to Mycoplasma mobile strain 163 K: comparison of in-vivo and in-vitro infection / C. T. K.-H.Stadtlander [et al] II J. Comp. Path. - 1995. - Vol. 112. - P. 351-359.

180. Poynton S. L. Guidelines for species descriptions of diplomonad flagellates from fish / S. L. Poynton, E. Sterud // J. Fish Dis. - 2002. - Vol. 25. - P. 15-31.

181. Poynton S. L. Morphology of diplomonad flagellates: Spironucleus torosa n. sp. from atlantic cod Gadus morhua L., and haddock Melanogrammus aeglefinus (L.) and Hexamita salmonis moore from brook trout Salvelinus fontinalis (Mitchill) / S. L. Poynton, C. M. Morrison // J. Eukaryot. Microbiol. - 1990. - Vol. 37. - No. 5. - P. 369-383.

182. Preliminary evaluation of COBRA, an automated Deft instrument, for the rapid enumeration of microorganisms in cultures, raw-milk, meat and fish / G. L. Pettipher // Lett. Appl. Microbiol. - 1992. - Vol. 14. - P. 206-209.

183. Prevalence, risk factor analysis, and follow-up of infections caused by three feline Hemoplasma species in cats in Switzerland / B. Willi [et al.] II J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - P. 961-969.

184.Probiotic bacteria as biological control agents in aquaculture / L. Verschuere [et al.] II Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2000. - Vol. 64. - No. 4. -P. 655-671.

185. Production of antibacterial substances by bifidobacterial isolates from infant stool active against Listeria monocytogenes / R. Toure [et al.] II J. Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 95. - P. 1058-1069.

186. Ramaiah N. A review on fungal diseases of algae, marine fishes, shrimps and corals / N. Ramaiah // Ind. J. Mar. Sci. - 2006. - Vol. 35. - P. 380-387.

187. Ramesh A. Cellulolytic activity of luminous bacteria / A. Ramesh, V. K. Venugopalan // MIRCEN J. Appl. Microbiol. Biotechnol. - 1988. - Vol. 4. -P. 227-230.

188.Ramesh A. Role of luminous bacteria in chitin degradation in the intestine of fish / A. Ramesh, V. K. Venugopalan // MIRCEN J. Appl. Microbiol. Biotechnol. - 1989. - Vol. 5. - P. 55-59.

189. Ramirez R. F. Enzyme production by obligate intestinal anaerobic bacteria isolated from oscars (Astronotus ocellatus), angelfish (Pterophyllum scalare) and southern flounder (.Paralichthys lethostigma) / R. F. Ramirez, B. A. Dixon // Aquaculture. - 2003. - Vol. 227. - P. 417-426.

190. Razin S. Molecular biology and pathogenicity of mycoplasmas / S. Razin, D. Yogev, Y. Naot // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 1998. - Vol. 62. - No. 4. -P. 1094-1156.

191. Razin S. The minimal cellular genome of mycoplasma / S. Razin // Indian J. Biochem. Biophys. - 1997. - Vol. 34. - No. 1-2. - P. 124-130.

192. Real-time PCR detection of Moritella viscosa, the likely causal agent of winter-ulcer in Atlantic salmon Salmo salar and rainbow trout Oncorhynchus mykiss / S. Grove [et al] II Dis. Aquat. Org. - 2008. - Vol. 82.-No. 2.-P. 105-109.

193.Rehulka J. Aeromonas causes severe skin lesions in rainbow trout {Oncorhynchus mykiss): clinical pathology / J. Rehulka // Haematology and biochemistry. Acta Vet. Brno. - 2002. - Vol. 71. - P. 351-360.

194. Resident microbiota of the gypsy moth midgut harbors antibiotic resistance determinants / H. K. Allen [et al] IIDNA Cell Biol. - 2009. - Vol. 28. - P. 109-117.

195. Ringo E. Intestinal microflora of salmonids: a review / E. Ringo, E. Strom, J.-A. Tabachek // Aquae. Res. - 1995. - Vol. 26. - P. 773-789.

196. Ringo E. Lactic acid bacteria in fish: a review / E. Ringo, F.-J. Gatesoupe // Aquaculture. - 1998. - Vol. 160. - P. 177-203.

197. Ringo E. The effect of diet on aerobic bacterial flora associated with intestine of Arctic charr {Salvelinus alpinus L.) / E. Ringo, R. E. Olsen // J. Appl. Microbiol. - 1999. - Vol. 86. - P. 22-28.

198. Romero J. 16S rDNA-based analysis of dominant bacterial populations associated with early life stages of coho salmon (Oncorhynchus kisutch) / J. Romero, P. Navarrete // Microb. Ecol. - 2006. - Vol. 51. - No. 4. - P. 422430.

199. Sambrook J. Molecular Coning. A laboratory Manual / J. Sambrook, E. F. Fritsch, T. Maniatis. Vol. 2. - Cold Spring Harbor : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. - 345 p.

200. Schneider R. Bacteria associated with fin rot disease in hatchery-reared Atlantic salmon (Salmo salar) / R. Schneider, B. L. Nicholson // Can. J. Fish. Aquat. Sci. - 1980. - Vol. 37. - No. 10. - P. 1505-1513.

201. Seagulls of the Berlengas natural reserve of Portugal as carriers of fecal Escherichia coli harboring CTX-M and TEM extended spectrum beta-lactamases / P. Poeta [et al.] II Appl. Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74. -P. 7439-7441.

202. Sequencing of the intergenic 16S-23S rRNA spacer (ITS) regionof Mollicutes species and their identification usingmicroarray-based assay and DNA sequencing / D. V. Volokhov [et al.] II Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2006. - Vol. 71. - P. 680-698.

203. Siikavuopio S. I. Domestication effects on fin nipping, survival and growth in hatchery-reared arctic charr, Salvelinus alpinus (L.), in competition with wild conspecifics / S. I. Siikavuopio, B. M. Baardvik, M. Jobling // Aquae. Res. - 1996. - Vol. 27. - No. 3. - P. 205-211.

204. Skrodenyte-Arbaciauskiena V. Antibacterial abilities of intestinal microflora in cultured and wild Atlantic salmon (Salmo salar L.) fry / V. Skrodenyte-Arbaciauskiena // Acta Zool. Litu. - 2005. - Vol. 15. - No. 4. -P. 355-360.

205. Skrodenyte-Arbaciauskiena V. Proteolytic activity of the roach (Rutilus rutilus L.) intestinal microflora / V. Skrodenyte-Arbaciauskiena // Acta Zool. Litu. - 2000. - Vol. 10. - No. 3. - P. 69-77.

206. Social network analysis of behavioural interactions influencing fin damage development in Atlantic salmon {Salmo salar) during feed-restriction / H. A. C. Jones [et al.] // Appl. Anim. Behav. Sci. - 2010. - Vol. 127. - No. 3-4. -P. 139-151.

207. Stable isotope analyses of the pelagic food web in Lake Baikal / K. Yoshii [et al.] H Limnol. Oceanogr. - 1999. - Vol. 44. - No. 3. - P. 502-511.

208. Sterud E. Systematic spironucleosis in seafarmed Atlantic salmon Salmo salar, caused by Spironucleus barkhanus transmitted from feral Arctic charr Salvelinus alpinusl / E. Sterud, T. A. Mo, T. T. Poppe // Dis. Aquat. Org. - 1998. - Vol. 33. - P. 63-66.

209. Studies of fish fusarium I. studies on Fusarium fusarioides isolated from Micropterus salmoides / W. F. Huang [et al.] II Acta Hydrobiologica. Sin. -1996.-Vol. 20.-P. 345-351.

210. Sugita H. Identification of intestinal bacteria from Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) and their ability to digest chitin / H. Sugita, Y. Ito // Lett. Appl. Microbiol. - 2006. - Vol. 43. - P. 336-342.

211. Sugita H. The vitamin Bi2-producing ability of the intestinal microflora of freshwater fish / H. Sugita, C. Miyajima, Y. Deguchi // Aquaculture. - 1991. -Vol. 92.-P. 267-216.

212. Systematic hexamitid (Protozoa, Diplomonadida) infection in seawater pen-reared Chinook salmon Oncorhynchus tshawytscha / M. L. Kent [et al.] II Dis. Aquat. Org. - 1992. - Vol. 14. - P. 81-89.

213. Tall B. D. Scanning electron microscopy of Cristispira species in Chesapeake bay oysters / B. D. Tall, R. K. Nauman // Appl. Environ. Microbiol. - 1981. - Vol. 42. - No. 2. - P. 336-343.

214. The complete genome and proteome of Mycoplasma mobile / J. D. Jaffe [et al.} II Genome Res. - 2004. - Vol. 14. - P. 1447-1461.

215. The effect of dietary inulin on aerobic bacteria associated with hindgut of Arctic charr {Salvelinus alpinus L.) / E. Ringo [et al.] II Aquae. Res. — 2006. - Vol. 37. - No. 9. - P. 891-897.

216. The growth, feed conversion ratio and fin damage of rainbow trout Oncorhynchus mykiss under self-feeding and hand-feeding regimes / Suzuki K. [et al.] II Fish. Sei. - 2008. - Vol. 74. -P. 941-943.

217. The health situation in farmed salmonids 2008 / R. Johansen [et al.] II Norwegian National Veterinary Institute, Oslo, 2009. -31 p.

218. The microflora of rainbow trout intestine: a comparison of traditional and molecular identification / B. Spanggaard [et al.] Il Aquaculture. - 2000. -Vol. 182.-P. 1-15.

219. The minimal gene complement of Mycoplasma genitalium / C. M. Fraser [et al.] II Science. - 1995. - Vol. 270. - P. 397-404.

220. The motility symbiont of the termite gut flagellate Caduceia versatilis is a member of the "Synergistes" group / Y. Hongoh [et al.] II Appl. Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73. - P. 6270-6276.

221. The viability of probiotic bacteria as a factor influencing the immune response in rainbow trout Oncorhynchus mykiss / A. Panigrahi [et al.] II Aquaculture. - 2005. - Vol. 243. - P. 241-254.

222. Ultrastructure of Spironucleus salmonis n. comb, (formerly Octomitus salmonis sensu Moore 1922, Davis 1926, and Hexamita salmonis sensu Ferguson 1979), with a guide to Spironucleus species / S. L. Poynton [et al] H Dis. Aquat. Org. - 2004. - Vol. 60. - P. 49-64.

223. Urdaci M. C. Identification by in situ hybridization of segmented filamentous bacteria in the intestine of diarrheic rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) / M. C. Urdaci, B. Regnault, P. A. Grimont // Res. Microbiol. - 2001. - Vol. 152. - No. 1. - P. 67-73.

224. Use of Carnobacterium sp. as a probiotic for atlantic salmon (Salmo salar L.) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) / P. A. W. Robertson [et al.] Il Aquaculture. - 2000. - Vol. 185. - P. 235-243.

225. Wild boars as reservoirs of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing Escherichia coli of different phylogenetic groups / P. Poeta [et al.] II J. Basic Microbiol. - 2009. - Vol. 49. - P. 584-588.

226. Wilson B. The diversity of bacterial communities associated with atlantic cod Gadus morhua / B. Wilson, B. S. Danilowicz, W. G. Meijer // Microb. Ecol. - 2008. - Vol. 55. - P. 425-434.

227. Wright G. D. "Antibiotic resistance in the environment: a link to the clinic?" / G. D. Wright // Curr. Opin. Microbiol. - 2010. - Vol. 13. - No. 5. -P. 589-594.

228. Xu D. H. Enhanced mortality in Nile tilapia Oreochromis niloticus following coinfections with ichthyophthiriasis and streptococcosis / D. H. Xu, C. A. Shoemaker, P. H. Klesius // Dis. Aquat. Org. - 2009. - Vol. 85. -P. 187-192.

229. Xu D. H. Evaluation of the link between gyrodactylosis and streptococcosis of Nile tilapia, Oreochromis niloticus (L.) / D. H. Xu, C. A. Shoemaker, P. H. Klesius // J. Fish Dis. - 2007. - Vol. 30. - P. 233-238.

230. Yamada Y. Identification of fish-pathogenic strains belonging to the genus Edwardsiella by sequence analysis of sodB / Y. Yamada, H. Wakabayashi // Fish Pathol. - 1999. - Vol. 34. - P. 145-150.

231. Yoshii K. Stable isotope analyses of benthic organisms in Lake Baikal / K. Yoshii // Hydrobiologia. - 1999. - Vol. 411. - P. 145-159.

232. Zbinden M. Occurrence of Deferribacterales and Entomoplasmatales in the deep-sea Alvinocarid shrimp Rimicaris exoculata gut / M. Zbinden, M.-A. Cambon-Bonavita // FEMS Microbiol. Ecol. - 2003. - Vol. 46. - P. 23-30.