Роль внешнемембранных везикул в секреции бактериолитических ферментов Lysobacter sp. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.04, кандидат биологических наук Васильева, Наталья Валерьевна

• Васильева, Наталья Валерьевна
• кандидат биологических наук
• 2010

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Васильева, Наталья Валерьевна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 БАКТЕРИОЛИТИЧЕСКИЕ ФЕРМЕНТЫ.

Внутриклеточные бактериолитические (автолитические) ферменты бактерий.

Внеклеточные бактериолитические ферменты бактерий.

1.2 КЛЕТОЧНАЯ ОБОЛОЧКА БАКТЕРИЙ.

Клеточная стенка грамположительных бактерий.

Строение клеточной оболочки грамотрицательных бактерий.

1.3 ПЕПТИДОГЛИКАН - СУБСТРАТ БАКТЕРИОЛОГИЧЕСКИХ ФЕРМЕНТОВ.

Структура пептидогликана.

Специфичность действия бактериолитических ферментов.

1.4 СЕКРЕЦИЯ БЕЛКОВ У БАКТЕРИЙ.

Одностадийные способы секреции.

Двухстадийные способы секреции.

ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1 БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ШТАММЫ И УСЛОВИЯ ВЫРАЩИВАНИЯ.

2.2 СУБКЛЕТОЧНОЕ ФРАКЦИОНИРОВАНИЕ.

2.3 ФРАКЦИОНИРОВАНИЕ МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ.

2.4 ПОЛУЧЕНИЕ ВЕЗИКУЛ.

2.5 ЭЛЕКТРОННАЯ МИКРОСКОПИЯ.

2.6 ОПРЕДЕЛЕНИЕ ЛИТИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ ВЕЗИКУЛ.

2.7 ЭЛЕКТРОФОРЕЗ БЕЛКОВ.

2.8 ИММУНОБЛОТТИНГ БЕЛКОВ.

2.9 ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОНЦЕНТРАЦИИ БЕЛКА.

2.10 ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ 2-КЕТ0-3-ДЕ30КСИ-0-МАННООКТОНАТА.:.

2.11 ЭКСТРАКЦИЯ ТЕЙХОЕВОЙ КИСЛОТЫ ИЗ КЛЕТОЧНЫХ СТЕНОК S. AUREUS 209Р.

2.12 АНАЛИЗ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ АКТИВНОСТЕЙ.

Определение общей бактериолитической активности.

Определение протеазной активности.

Определение активности циклической фосфодиэстеразы.

Определение активности глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназы.

Определение активности N-ацетилмурамоил

L-ал анинамидазы.

Определение мурамидазной активности.

2.13 ВЫДЕЛЕНИЕ БАКТЕРИОЛИТИЧЕСКОГО ФЕРМЕНТА Л5 LYSOBACTER SP. XL1.

Получение белков культуральной жидкости.

Ионообменная хроматография на DEAE-сефадексе и СМсефадексе.

Гельфильтрация на Superdex 75.

Ионообменная хроматография на monoS.

2.14 ХАРАКТЕРИСТИКА ФЕРМЕНТА Л5 LYSOBACTER SP. XL1.

Определение N-концевой аминокислотной последовательности фермента Л5.

Определение оптимального значения рН для реакции лизиса клеток S. aureus 209Р ферментом Л5.

Определение оптимального значения концентрации буфера для реакции лизиса клеток S. aureus 209Р ферментом Л5.

Определение оптимальной температуры реакции лизиса клеток S. aureus 209Р ферментом Л5.

Определение температуры полуинактивации фермента Л5.

Определение действии ингибиторов.

Определение спектра литического действия фермента JI5.

Определение действия фермента JI5 на клеточные стенки некоторых бактерий.

ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ОБСУЖДЕНИЕ.

3.1 НОВЫЙ БАКТЕРИОЛИТИЧЕСКИЙ ФЕРМЕНТ LYSOBACTER SP. XL1.

Выделение бактериолитического фермента Л5.

Определение некоторых свойств фермента Л5.

Определение спектра литического действия фермента Л5.

3.2 ИЗУЧЕНИЕ МЕХАНИЗМА СЕКРЕЦИИ

БАКТЕРИОЛИТИЧЕСКИХ ФЕРМЕНТОВ LYSOBACTER SP.

Обнаружение и характеристика внеклеточных везикул

Lysobacter sp.

Обнаружение литической активности в везикулах

Lysobacter sp.

Секреция бактериолитических протеаз Л1 и Л

Lysobacter sp. XL1.

Биологическая роль способа секреции бактериолитических ферментов посредством везикул.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Роль внешнемембранных везикул в секреции бактериолитических ферментов Lysobacter sp.»

Актуальность проблемы

Многие живые организмы - вирусы, бактерии, растения, животные -продуцируют бактериолитические ферменты, разрушающие клеточные стенки различных бактерий. Они используют такие ферменты либо для борьбы с конкурентными или болезнетворными бактериями, либо для проникновения в бактерию-хозяина и выхода из нее.

Бактерии, характеризующиеся сильно выраженной способностью лизировать различные микроорганизмы, объединены в род Lysobacter. Представители этого рода интересны не только с точки зрения изучения взаимоотношений внутри различных биоценозов, но также с биотехнологической точки зрения. К настоящему моменту в медицине сложилась весьма неблагоприятная ситуация в терапии инфекционных заболеваний из-за появления патогенных микроорганизмов, устойчивых к большинству используемых антибиотиков. Поэтому одно из актуальных направлений современных биомедицинских исследований в рамках решения данной проблемы связано с исследованием и использованием естественных механизмов антагонизма среди микробов. Продукция бактериолитических ферментов - один из примеров микробного антагонизма. Важным преимуществом бактериолитических ферментов является отсутствие у микроорганизмов устойчивости к их действию.

Грамотрицательная бактерия Lysobacter sp. XL1 при выращивании в специально подобранных условиях секретирует в окружающую среду бактериолитические ферменты. На основе культуральной жидкости Lysobacter sp. XL1 получен антимикробный препарат широкого спектра действия - лизоамидаза (Кулаев и др., 2002). Ранее из культуральной жидкости Lysobacter sp. XL1 были выделены и охарактеризованы четыре бактериолитических фермента (JI1 — JI4). При длительном культивировании Lysobacter sp. XL1 на среде, способствующей секреции бактериолитических ферментов, в культуре появляются и со временем накапливаются клетки малоактивного штамма Lysobacter sp. XL2, которые способны продуцировать только два бактериолитических фермента - JI2 и JI3 (Степная и др., 1996в). По специфичности действия на бактериальные пептидогликаны литические ферменты этой бактерии являются эндопептидазами (JI1 и JI4) (Степная и др., 19966, 2005), амидазами (Л1 и Л2) (Степная и др., 1986, 1992, 19966), мурамидазой (JI3) (Степная и др., 1996а). При изучении генома Lysobacter sp. XL1 была установлена нуклеотидная последовательность гена, кодирующая бактериолитический фермент JI1 и гомологичная ей последовательность (60% гомологии), кодирующая неизвестный ранее белок, который был обозначен как бактериолитический фермент JI5. Обе последовательности в разной степени гомологичны а-литической протеазе Lysobacter enzymogenes (78% и 56% гомологии соответственно) (Кулаев и др., 2005).

Бактериолитический фермент JI5 Lysobacter sp. XL1 ранее не был выделен в чистом виде и не были охарактеризованы его свойства. Совершенно никакой информации не имеется относительно путей секреции бактериолитических ферментов бактерий рода Lysobacter. При изучении структуры генов, кодирующих ферменты JI1 и J15, предсказано, что синтезируются они в виде препробелков. Следовательно, секреция этих белков из цитозоля бактерии в окружающую среду должна проходить по одинаковой схеме, в два этапа. Первый этап заключается в секреции через цитоплазматическую мембрану в периплазму. Наличие пре-части (сигнальная последовательность) позволяет предположить участие в этом процессе See-зависимого секреторного пути. Второй этап, т.е. секреция из периплазмы в окружающую среду, может осуществляться несколькими путями, в том числе посредством внешнемембранных везикул, которые образуют многие грамотрицательные бактерии. О способности бактерий рода Lysobacter образовывать везикулы ранее не было известно.

Целью настоящего исследования было установить, образует ли бактерия Lysobacter sp. (штаммы XL1 и XL2) внешнемембранные везикулы и если да, то исследовать их роль в секреции бактериолитических ферментов. В соответствии с поставленной целью были сформулированы следующие задачи:

1. Исследовать способность клеток Lysobacter sp. XL1 и XL2 образовывать везикулы.

2. Выделить и охарактеризовать везикулы Lysobacter sp. XL1 и XL2.

3. Выделить и охарактеризовать бактериолитический фермент JI5 Lysobacter sp. XL1.

4. Исследовать клетки Lysobacter sp. XL1 на присутствие в них белка SecA — компонента See-зависимого механизма секреции белков через цитоплазматическую мембрану.

5. Установить, попадают ли бактериолитические ферменты Lysobacter sp. в окружающую среду при помощи везикул.

6. Исследовать литическое действие везикул Lysobacter sp. XL1 по отношению к различным микроорганизмам.

Научная новизна работы

Выделен, очищен и частично охарактеризован новый бактериолитический фермент J15 Lysobacter sp. XL1. Впервые для бактерии рода Lysobacter показано наличие SecA белка - компонента Sec экспортного механизма секреции белков через цитоплазматическую мембрану в периплазму. Впервые установлена способность клеток Lysobacter sp. XL1 и XL2 образовывать внешнемембранные везикулы. Показано, что JI2 фермент Lysobacter sp. XL2 и ферменты JI2 и JI5 Lysobacter sp. XL1 попадают в окружающую среду при помощи везикул. Везикулы Lysobacter sp. XL1 имеют широкий спектр литического действия по отношению к различным видам микроорганизмов.

Научно-практическое значение

Полученные в работе новые данные расширяют представление о роли внешнемембранных везикул в секреции белков у бактерий и межбактериальных взаимодействиях. Характеристика нового бактериолитического фермента JI5 дополняет знания о структуре антибактериального комплекса лизоамидаза. Результаты работы указывают на возможность применения препарата везикул и очищенного фермента JI5 для лечения и профилактики инфекционных заболеваний, вызванных патогенными для животных и растений микроорганизмами. В Государственном научном центре прикладной микробиологии и биотехнологии (г. Оболенск) было проверено лечебное действие везикул Lysobacter sp. XL1 и очищенного фермента JI5 на моделях сибиреязвенной инфекции у беспородных белых мышей. Показано, что очищенный фермент JI5 не обладает лечебным действием, в то время как везикулы, содержащие этот же фермент, оказывают лечебный эффект в 100% случаев. Эти результаты позволяют считать целесообразной разработку в дальнейшем методов «упаковки» отдельных бактериолитических ферментов в искуственные везикулярные структуры для получения эффективных лекарственных средств.

Апробация работы и публикации

Материалы диссертации были представлены на российских и международных конференциях: Международная школа-конференция, посвященная 100-летию со дня рождения С.И. Алиханяна «Генетика микроорганизмов и биотехнология» (Москва-Пущино, 2006), The Fourth International Conference on «Science and Business» NanoBio and Related New and Perspective Biotechnologies (Pushchino, 2007), VI симпозиум «Химия протеолитических ферментов» (Москва, 2007), IV Российский симпозиум «Белки и пептиды» (Казань, 2009). По материалам диссертации опубликовано две статьи, подано две заявки на патенты.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов и обсуждения, заключения, выводов и списка литературы. Работа изложена на 126 страницах, содержит 6 таблиц и 19 рисунков. Библиографический указатель содержит 293 источника литературы.

Заключение диссертации по теме «Биохимия», Васильева, Наталья Валерьевна

ВЫВОДЫ

1. Выделен, очищен и частично охарактеризован не изученный ранее бактериолитический фермент JI5 Lysobacter sp. XL1. Новый фермент является бактериолитической сериновой протеазой.

2. В клетках Lysobacter sp. XL1 выявлен SecA-подобный белок. Это демонстрирует наличие у бактерии Sec экспортного пути секреции белков через цитоплазматическую мембрану.

3. Показана способность клеток Lysobacter sp. XL1 и Lysobacter sp. XL2 образовывать везикулы. Везикулы имеют внешнемембранную природу, захватывают в процессе своего образования компоненты периплазмы и обладают литическим действием.

4. Установлено, что внеклеточные бактериолитические ферменты JI2 и JI5 Lysobacter sp. XL1 и фермент JI2 Lysobacter sp. XL2 попадают в окружающую среду посредством внешнемембранных везикул.

5. Показано, что везикулы Lysobacter sp. XL1 имеют широкий спектр литического действия по отношению к различным видам микроорганизмов, в том числе представляющим потенциальную опасность для растений, животных и человека.

ГЛАВА 4 ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В настоящей работе впервые охарактеризован бактериолитический фермент Л5 Lysobacter sp. XL1. Показано, что фермент лизирует автоклавированные клетки S. aureus 209Р при концентрации буфера Трис-HCl равной ЮмМ, при рН равном 7.5 и при температуре реакции равной 80°С. Температура полуинактивации фермента составила 75°С. Помимо автоклавированных клеток S. aureus фермент Л5 гидролизовал автоклавированные клетки P. fluoresceins 1472, P. putida, P. vulgaris Н-19, Р. mirabilis N2, Е. coli К12, Е. caratovora В15, A. faecalis, В. subtilis W23, В. cereus 217, М. roseus В1236, М. luteus В1819, С. xerosis, R. tritici, L. monocytogenes n766, Т. delbrueckii ВКМ Y-706, С. utilis ВКМ Y-74, С. boidinii ВКМ Y-34, С. guilliermondii ВКМ Y-41, S.cerevisiae M660, P. fusiformata BKM Y-2821; живые клетки P. putida, P. vulgaris H-19, P. mirabilis N2, E. coli К12, A. faecalis, B. subtilis W23, M. roseus В1236, M. luteus В1819, С. utilis BKM Y-74, C. boidinii BKM Y-34, C. guilliermondii BKM Y-41; клеточные стенки S. aureus 209P, B. subtilis W23 и E. coli К12. Фермент способен также гидролизовать казеин и синтетический пептид. Активность фермента полностью подавляется ФМСФ. Таким образом, выделенный фермент является бактериолитической сериновой протеазой.

При изучении механизма секреции внеклеточных бактериолитических ферментов в клетках Lysobacter sp. XL1 был обнаружен белок SecA -компонент Sec экспортного механизма секреции белков через цитоплазматическую мембрану в периплазму. Ранее бактерии рода Lysobacter не были охарактеризованы относительно наличия подобного экспортного пути.

В представленной работе впервые показана способность клеток Lysobacter sp. XL1 и XL2 образовывать везикулы. Количество везикул, образуемых штаммом XL1, больше, чем штаммом XL2. Установлено, что везикулы обоих штаммов имеют внешнемембранную природу, в процессе своего образования захватывают компоненты периплазмы и обладают бактериолитической активностью. Литическая активность везикул Lysobacter sp. XL2 обусловлена присутствием в них амидазы Л2, а литическая активность везикул Lysobacter sp. XL1 обусловлена присутствием в них амидазы Л2 и протеазы Л5. Таким образом, везикулы Lysobacter sp. являются естественным транспортным средством, обеспечивающим выход некоторых белков за пределы клетки.

Показано, что везикулы Lysobacter sp. XL1 имеют широкий спектр литического действия по отношению к различным микроорганизмам, патогенные виды которых могут представлять потенциальную опасность для растений, животных и человека. Везикулы лизируют живые клетки Р. fluorescens 1472, P. putida, P. vulgaris Н-19, P. mirabilis N2, Е. coli К12, Е. caratovora В15, A. faecalis, В. subtilis W23, В. cereus 217, М. roseus В1236, М. luteus В1819, С. xerosis, S. aureus 209Р, R. tritici, С. utilis BKM Y-74, C. boidinii BKM Y-34, C. guilliermondii BKM Y-41, P. fusiformata и F. sporotrichiella. Установлено, что везикулы обладают более выраженным литическим действием на живые клетки выбранных тест-культур, чем очищенный фермент Л5.

Таким образом, секреция бактериолитических ферментов посредством везикул имеет для Lysobacter sp. XL1 и XL2 важное биологическое значение в условиях окружающей среды. При помощи такого механизма секреции значительно расширяется спектр микроорганизмов, с которыми эта бактерия может конкурировать в природе.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Васильева, Наталья Валерьевна, 2010 год

1. Бегунова Е.А., Степная О. А., Лысанская В .Я., Кулаев И.С. (2003). Специфичность действия ферментов препарата лизоамидаза на клеточные стенки Staphylococcus aureus 209 Р. Биохимия. Т. 68. С. 896 -901.

2. Бухарин О.Б., Усвяцов Б .Я. (1981). Лизоцимная активность микроорганизмов. Антибиотики. Т. 10. С. 782 793.

3. Головина И.Г. (1973). Литические ферменты микроорганизмов. Успехи микробиологии. Т. 8. С. 108 — 136.

4. Головина И.Г., Гужова Э.П., Богданова Т.И., Логинова Л.Г. (1972). О литических ферментах, образуемых термофильным актиномицетом Mictomonospora vulgaris DA II-4. Микробиология. Т. 42. С. 620 624.

5. Захарова И .Я., Павлова И.Н. (1985). Литические ферменты микроорганизмов. Наукова думка, Киев. 216 с.

6. Звягинцева И.С. (1981). Внеклеточные гидролазы грамотрицательных и грамположительных микроорганизмов. Успехи микробиологии. Т. 16. С. 81 103.

7. Клесов А.А. (1984). Ферментативный катализ. МГУ, Москва. 216 с.

8. Клячко Н.Л., Дмитриева Н.Ф., Ещина А.С., Игнатенко О.В., Филатова Ю.В., Рейнина Е.И., Казаров А.К., Левашов А.В. (2008). Ферменты бактериофагов для профилактики и лечения бактериальных инфекции: стабильность и стабилизация фермента, лизирующего клетки

9. Streptococcus pyogenes. Биоорганическая химия. Т. 34. №3. С. 416 -421.

10. Кузнецов В.Д., Гуреева М.Н., Шпокенс А.П., Уискуренас А.П. (1982). Образование литических ферментов актиномицетами. Изв. АН СССР. Биология. Т. 3. С. 440 443.

11. Кулаев И.С., Северин А.И., Абрамочкин Р.В. (1984). Бактериолитические ферменты микробного происхождения в биологии и медицине. Вестн. АМН СССР. Т. 8. С. 64 69.

12. Кулаев И.С., Степная О.А., Цфасман И.М., Черменская Т.С., Ледова Л.А., Зубрицкая Л.Г., Акименко В.К. (2002). Патент РФ № 2193063 «Бактериолитический комплекс, способ его получения и штамм для осуществления способа». Бюллетень №32.

13. Мирошников К.А., Чертков О.В., Назаров П.А., Месянжинов В.В. (2006). Петидогликанлизирующие ферменты бактериофагов -перспективные противобактериальные агенты. Успехи биол. химии. Т. 46. С. 65 98.

14. Наумова А.Б., Шашков А.С. (1997). Анионные полимеры клеточных стенок грамположительных бактерий. Биохимия. Т. 62. С. 947 — 982.

15. Наумова И.Б. (1978). Тейхоевые кислоты в регуляции биохимических процессов у микроорганизмов. Биохимия. Т. 43. С. 195 — 207.

16. Потехина Н.В. (2006). Тейхоевые кислоты актиномицетов и других грамположительных бактерий. Успехи биол. химии. Т. 46. С. 225 278.

17. Ситкин Б.В., Лысанская В.Я., Цфасман И.М., Степная О.А., Кулаев И.С. (2003в). Структура пептидогликана бактерии Lysobacter sp.продуцента внеклеточных бактериолитических ферментов. Микробиология. Т.72. С. 136 — 137.

18. Ситкин Б.В., Цфасман И.М., Степная О.А., Кулаев И.С. (2003а). Внутриклеточные пептидогликангидролазы бактерии Xanthomonas campestris XL1. Биохимия. Т. 68. С. 562 569.

19. Ситкин Б.В., Цфасман И.М., Степная О.А., Кулаев И.С. (20036). Могут ли автолизины бактерий являться предшественниками внеклеточных автолитических ферментов? Доклады Академии Наук. Т. 392. С. 406 — 409.

20. Степная О.А., Бегунова Е.А., Цфасман И,М., Кулаев И.С. (1996а). Бактериолитический ферментный препарат лизоамидаза: выделение и некоторые физико-химические свойства внеклеточной мурамидазы бактерии Xanthomonas sp. Биохимия. Т. 61. С. 648 — 655.

21. Степная О.А., Ледова Л.А., Кулаев И.С. (1999). Бактериолитические ферменты. Успехи биологической химии. Т. 39. С. 327 354.

22. Степная О.А., Северин А.И., Кулаев И.С. (1986). Некоторые физико-химические свойства литической протеиназы Л2 ферментного препарата, выделенного из бактерии семейства Pseudomonadaceae. Биохимия. Т. 51. С. 909 915.

23. Степная О.А., Цфасман И.М., Ледова Л.А., Петрикевич С.Б., Бегунова Е.А., Кулаев И.С. (19966). Бактериолитический ферментный препарат лизоамидаза. Очистка и некоторые свойства бактериолитической пептидазы Л1. Биохимия. Т. 61. С. 656 — 663.

24. Степная О.А., Цфасман И.М., Логвина И.А., Рязанова Л.П., Муранова Т.А., Кулаев И.С. (2005). Выделение и характеристика новой внеклеточной эндопептидазы Lysobacetr sp. XL1. Биохимия. Т. 70. С. 1250- 1257.

25. Стрешинская Г.М., Наумова И.Б., Панина Л.И. (1979). Химический состав клеточной стенки Streptomyces chrysomallus, образующего антибиотик аурантин. Микробиология. Т. 48. С. 814 819.

26. Akita М., Sasaki S., Matsuyama S., Mizushima S. (1990). SecA interaction with secretory proteins by recognizing the positive charge at the amino terminus of the signal peptide in Escherichia coli. Biol Chem. Vol. 265. P. 8164-8169.

27. Allan N.D. and Beveridge T.J. (2003). Gentamicin delivery to Burkholderia cepacia group Ilia strains via membrane vesicles from Pseudomonas aeruginosa PAOl. Antimicrob Agents Chemother. Vol. 47. P. 2962 2965.

28. Altman E., Kumamoto C., Emr S. (1991). Heat-shock proteins can substitute for SecB function during protein export in Escherichia coli. Vol. 10. P. 239 -245.

29. Ames G.F., Spudich E.N. and Nikaido H. (1974). Protein composition of the outer membrane of Salmonella typhnnurium: Effect of lipopolysaccharide mutations. J Bacteriol. Vol. 117. P. 406 416.

30. Archibald A.R. (1974). The structure, biosynthesis and function of teichoic acid. Adv Microb Physiol. Vol. 11. P. 53 59.

31. Archibald A.R. (1980). Phage receptors in gram-positive bacteria. In: Virus receptors, part 1, Receptors and Recognition. (Cuatrecasas P., Greaves M. F. eds.). Chapman and Hall, London. Series B. Vol. 7. P. 5 26.

32. Archibald A.R., Amstrong J.J., Baddiley J., Hay J.B. (1961). Teichoic acids and the structure of bacterial cell wall. Nature. Vol. 191. P. 570 572.

33. Archibald A.R., Hancock I.C., Harwood C.R. (1993). Cell wall structure, synthesis and turnover. In: Bacillus subtilis and other gram-positive bacteria. (Hoch J.A., Losick R. eds.). American Society for Microbiology, Washington. P. 381 -410.

34. Armstrong J.J., Baddiley J. and Buchanan J.G. (1960). Structure of the ribitol teichoic acid from the walls of Bacillus subtilis. Bichemistry. Vol. 76. P. 610-621.

35. Atrih A., Foster S.J. (1999). The roles of peptidoglycan structure and structural dynamics during dormancy and germination. Antonie van Leeuwenhoek. Vol. 75. P. 299 307.

36. Baddiley J. (1988). The function of teichoic acids in walls and membranes of bacteria. In: The Roots of Modern Biochemistry (Kleinkauf von Dohren, Jaenicke S., eds.). Walter de Gruyter and C°, Berlin-New York. P. 223 -229.

37. Ballardie F.W., Capon B. (1972). 3,4-Dinitrophenyl tetra-N-acetyl-p-D-chitotetraoside a good chromophoric substrate for hen's egg-white lysozyme. J Chem Soc Commun. Vol. 14. P. 828 829.

38. Beacham I.R. (1979). Periplasmic enzymes in gram-negative bacteria. Int J Biochem. Vol.10. P.877 881.

39. Benz R. (1994). Uptake of solutes through bacterial outer membranes. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.M., Hakenbeck R. eds). Elsevier Science B.V., Amsterdam. P. 397 — 424.

40. Berks В., Sargent F., Palmer T. (2000). The Tat protein export pathway. Mol Microbiol. Vol. 35. P. 260 274.

41. Bernadac A., Gavioli M., Lazzaroni J.C., Raina S. and Lloubes R. (1998). Escherichia coli tol-pal mutants form outer membrane vesicles. J Bacteriol. Vol. 180. P. 4872-4878.

42. Bernhardt T.G., Wang I.-N., Struck D.K., Young R. (2002). Breaking free: "Protein antibiotics" and phage lysis. Research in Microbiology Vol. 53. P. 493-501.

43. Beukes M., Bierbaum G., Sahl H.-G., Hastings J.W. (2000). Purification and partical characterization of a murein hydrolase, millericin B, produced by Streptococcus milleri NMSCC 061. Appl Anviron Microbiol. Vol. 66. P. 23 -28.

44. Beveridge T.J. (1981). Ultrastructure, chemistry, and function of the bacterial wall. Int Rev Cytol. Vol. 72. P. 229 317.

45. Beveridge T.J. (1999). Structures of Gram-negative cell walls and their derived membrane vesicles. J Bacteriol. Vol. 181. P. 4725 4733.

46. Beveridge T.J., Makin S.A., Kadurugamuwa J.L. and Li Z. (1997). Interactions between biofilms and the environment. FEMS Microbiol Rev. Vol. 20. P. 291 -303

47. Binet R., Le'toffe' S., Ghigo J., Delepelaire P. and Wandersman C. (1997). Protein secretion by Gram negative bacterial ABC exporters — a review. Gene. Vol. 192. P.7-11.

48. Bitter W., Koster M., Latijnhouwers M., De Cock H. and Tommassen J. (1998). Formation of oligomeric rings by XcpQ and PilQ, which are involved in protein transport across the outer membrane of Pseudomonas aeruginosa. Mol Microbiol. Vol. 27. P. 209 219.

49. Blackman S.A., Smith T.J, Foster S.J. (1998). The role of autolysins during vegetative growth of Bacillus subtilis 168. Microbiology. Vol. 144.P. 73 — 82.

50. Blaser M.J, Hopkins J.A, Berka R.M., Vasil M.L. and Wang W.L. (1983). Identification and characterization of Campylobacter jejuni outer membrane proteins. Infect Immun. Vol. 42. P. 276 284.

51. Blobel G, Dobberstein B. (1975). Transfer of proteins across membranes. I. Presence of proteolytically processed and unprocessed nascent immunoglobulin light chains on membrane-bound ribosomes of murine myeloma. J.Cell Biol. Vol. 67. P. 835 851.

52. Boland F.M., Atrin A, Chirakkal H, Foster S.J, Moir A. (2000). Complete spore-cortex hydrolysis during germination of Bacillus subtilis 168 requires SleB and YpeB. Microbiology. Vol. 146. P. 57-64.

53. Bone R, Silen J.L, Agard D.A. (1989). Structural plasticity broadens the specificity of an engineered protease. Nature. Vol. 339. P. 191 195.

54. Braun V, Wu H.C. (1994). Lipoproteins, structure, function, biosynthesis and model to protein export. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.M, Hakenbeck R. eds), Elsevier Science B.V, Amsterdam. P. 319 342.

55. Briggs M, Gierash L.M. (1986). Molecular mechanisms of protein secretion: the role of the signal sequence. Adv Protein Chem. Vol. 38. P. 109 -180.

56. Bronneke V, Fiedler P. (1994). Prodaction of bacteriolytic enzymes by Streptomyces globisporus regulated by exogenous bacterial cell walls. Appl Env Microbiol. Vol. 60. P. 785-791.

57. Burge R.E., Fowler A.G., Reaveley D.A. (1977). Structure of the peptidoglican of bacterial cell walls. I. J Mol Biol. 1977. Vol.117. P. 927 -953.

58. Caldentey J., Bamford D.H. (1992). The lytic enzyme of the Pseudomonas phage phi 6. Purification and biochemical characterization. Biochim Biophys Acta. Vol. 1159. P. 44 50.

59. Cascales E. and Christie P.J. (2004). Definition of a bacterial type IV secretion pathway for a DNA substrate. Science. Vol. 304. P. 1170 1173.

60. Cascales E., Bernadac A., Gavioli M., Lazzaroni J.C. and Lloubes R. (2002). Pal lipoprotein of Escherichia coli plays a major role in outer membrane integrity. J Bacteriol. Vol. 184. P. 754 759

61. Chatterjee S.N. and Das J. (1967). Electron microscopic observations on the excretion of cell-wall material by Vibrio cholerae. J Gen Microbiol. Vol. 49. P. 1 11.

62. Cheng X., Zhang X., Pflugrath J.W., Studier F.W. (1994). The structure of bacteriophage T7 lysozyme, a zinc amidase and an inhibitor of T7 RNA polymerase. Proc Natl Acad Sci USA. Vol. 91. P. 4034 4038.

63. Christensen P., Cook F.D. (1978). Lysobacter, a new genus of nonfruiting, gliding bacteria with a high base ratio. Int J Syst Bacteriol. Vol. 28. P. 367 -393.

64. Christie PJ. (2001). Type IV secretion: intercellular transfer of macromolecules by systems ancestrally related to conjugation machines. Mol Microbiol. Vol. 40. P. 294 305.

65. Ciofu O., Beveridge T.J., Kadurugamuwa J., Walther-Rasmussen J. and Hoiby N. (2000). Chromosomal 3-lactamase is packaged into membrane vesicles and secreted from Pseudomonas aeruginosa. J Antimicrob Chemother. Vol. 45. P. 9 13.

66. Cornelis G.R., van Gijsegem F. (2000). Assembly and function of type III secretory systems. Annu Rev Microbiol. Vol. 54. P. 735 774.

67. Costerton J.W., Ingram J.M., Cheng L. (1974). Structural and function of the cell envelope of gram-negative bacteriae. Bacteriol Rev. Vol. 81. P. 87 — 110.

68. Croux C., Canard В., Goma G., Soucaille P. (1992). Purification and characterization of an extracellular muramidase of ClosMdium acetobutylicum ATCC-824 that acts on non-N-acetylated peptidoglycan. Appl Env Microbiol. Vol. 58. P. 1075 1081.

69. Croux C., Ronda C., Lopez R., Garcia J.L. (1993). Role of the C-terminal domain of the lysozyme of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 in a chimeric pneumococcal-clostridial cell wall lytic enzyme. FEBS. Vol. 336. P. Ill 114.

70. Das A. and Xie Y.H. (2000). The Agrobacterium T-DNA transport pore proteins VirB8, VirB9, and VirBlO interact with one another. J Bacteriol. Vol. 182. P. 758-763.

71. De Boer P.A., Cook W.R., Rothfield L.I. (1990). Bacterial cell divisioin. Annu Rev Genet. Vol. 24. P. 249 274.

72. Dijkstra A.J., Keck W. (1996). Peptidoglycan as barrier to transenvelope transport. J Bacteriol. Vol. 178. P. 5555 5562.

73. Dorward D.W. and Garon C.F. (1989). DNA-binding proteins in cells and membrane blebs of Neisseria gonorrhoeae. J Bacteriol. Vol. 171. P. 4196 -4201.

74. Dorward D.W., Garon C.F. and Judd R.C. (1989). Export and intercellular transfer of DNA via membrane blebs of Neisseria gonorrhoeae. J Bacteriol. Vol. 171. P. 2499-2505.

75. Driessen A. (1993). SecA, the peripheral subunit of the Escherichia coli precursor protein translocase, is functional as a dimer. Bichemistry. Vol. 32. P. 13190- 13197.

76. Duong F., Eichler J., Price A., Leonard M.R., Wickner W. (1997a). Biogenesis of the Gram-negative bacterial envelope. Cell. Vol. 91. P. 567 -573.

77. Duong F., Wickner W. (1997b). Distinct catalytic roles of the SecYE SecG and SecDFyajC subunits of preprotein tranlocase holoenzyme. EMBO J. Vol. 16. P. 2756-2768.

78. Duong F., Wickner W. (1997c). The SecDFyajC domain of preprotein translocase controls preprotein movement by regulating SecA membrane cycling. EMBO J. Vol. 16. P. 4871 4879.

79. Economou A. (1999). Following the leader: bacterial protein export through the Sec pathway. Trends Microbiol. Vol. 7. P. 315 320.

80. Eggert U.S., Ruiz N., Falcone B.V., Branstrom A.A., Goldman R.C., Silhavy T.J. and Kahne D. (2001). Genetic basis for activity differences between vancomycin and glycolipid derivatives of vancomycin. Science. Vol. 294. P. 361-364.

81. Epstein D.M., Wensink P.C. (1988). The a-lytic protease gene of Lysobacter enzymogenes. J. Biol. Chem. Vol. 263. P. 16586 16590.

82. Evrard C., Declercq J.P., Fastrez J. (1997). Crystallization and preliminary X-ray analysis of bacteriophage lambda lysozyme in which all tryptophans have been replaced by aza-tryptophans. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. Vol. 53. P. 217-219.

83. Fan D.P., Beckman M.M. (1973). Micrococcus lysodeikticus bacterial wall as a substrate specific for the autolytic glycosidase of Bacillus subtilis. J Bacteriol. Vol. 114. P. 804 813.

84. Fekkes P., Driessen A. (1999). Protein targeting to the bacterial cytoplasmic membrane. Microbiol Mol Biol Rev. Vol. 63. P. 161 173.

85. Fermor T.R., Wood D.A. (1981). Degradation of bacteria by Agaricus bisporus and other fungi. J Gen Microbiol. Vol. 126. P. 377 388.

86. Filloux A., Bally M., Ball G., Akrin M., Tommassen J., Lazdunski A. (1990). Protein secretion in Gram negative bacteria: transport across the outer membrane involved common mechanism in different bacteria. J EMBO. Vol. 9. P. 4323 - 4329.

87. Fischer W. (1994). Lypoteichoic acids and lipoglycans. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam. P. 199-216.

88. Fives-Taylor P.M., Meyer D.H., Mintz K.P. and Brissette C. (2000). Virulence factors of Actinobacillus actinomycetemcomitans. Periodontal. Vol. 20. P. 136- 167.

89. Fleming A. (1922). Proc. R. Soc., London. Ser. B. Vol. 93. P. 306-317.

90. Formanek M. (1985). Three-dimensional model of the carbohydrate moieties of murein and pseudomurein. Z Naturforsch. Vol. 40. P. 555 — 561.

91. Galan J.E, Collmer A. (1999). Type III secretion machines: bacterial devices for protein delivery into host cells. Science. Vol. 284. P. 1322 — 1328.

92. Gamazo C. and Moriyon I. (1987). Release of outer membrane fragments by exponentially growing Brucella melitensis cells. Infect Immun. Vol. 55. P. 609-615.

93. Gankema H., Wensink J., Guinee P.A., Jansen W.H. and Witholt B. (1980). Some characteristics of the outer membrane material released by growing enterotoxigenic Escherichia coli. Infect Immun. Vol. 29. P. 704 713.

94. Geller В. (1991). Energy requirements for protein translocation across the Escherichia coli inner membrane. Mol Microbiol. Vol. 5. P. 2093 2098.

95. Genin S. and Boucher C.A. (1994) A superfamily of proteins involved in different secretion pathways in gram-negative bacteria: modular structure and specificity of the N- terminal domain. Mol Gen Genet. Vol. 243. P. 112 118.

96. Gentschev I, Dietrich G. and Goebel W. (2002). The E. coli alpha-hemolysin secretion system and its use in vaccine development. Trends Microbiol. Vol. 10. P. 39 45.

97. Ghuysen J.M, Brasseur J.L, Joris B, Shockman G.D. (1994). Binding siteshaped repeated sequences of bacterial wall peptidoglycan hydrolases. FEBS'i1.tt. Vol. 342. P. 23 28.

98. Glauner B, Holtje J,V, Schwarz U. (1988). Composition of the murein of Escherichia coli. J Biol Chem. Vol. 263. P. 10088 10095.

99. Gombas D.E, LabbeR.G. (1981). Extraction of spore-lytic enzyme from Clostridiumperfingens spores. J Gen Microbiol. Vol. 126. P. 37 — 44.

100. Goodell E.W. (1985). Recycling of murein by Escherichia coli. J Bacteriol. Vol. 163. P. 305-310.

101. Grass S. and St. Geme J.W. III. (2000). Maturation and secretion of the non-typable Haemophilus influenzae HMW1 adhesin: roles of the N-terminal and C-terminal domains. Mol Microbiol. Vol. 36. P. 55 — 67.

102. Grenier D. and Mayrand D. (1987). Functional characterization of extracellular vesicles produced by Bacteroides gingivalis. Infect Immun. Vol. 55. P. 111-117.

103. Hacker J., Kaper J.B. (2000). Pathogenicty islands and the evolution of microbes. Annu Rev Microbiol. Vol. 54. P. 641 79.

104. Hara S., Matsushima I. (1972). Studies on the substrate specificity of egg white lysozyme. A comparative study of the substrate specificity of lysozyme from different sources. Bichemistry. Vol. 72. P. 993 1000.

105. Hash J.H., Wishnick M., Miller P.A. (1964). Formation of «protoplasts» of Staphylococcus aureus with a fungal N-acetylhexosaminidase. J Bacteriol. Vol. 87. P. 432-437.

106. Haska I. (1972). Purification and properties of lytic enzymes from Myxococcus virescenens. Physiol Plant. Vol. 27. P. 139 142.

107. Henderson I.R. and Nataro J.P. (2001). Virulence functions of autotransporter proteins. Infection and Immunity. Vol. 69. P. 1231 1243.

108. Hoekstra D., van der Laan J.W., de Leij L. and Witholt B. (1976). Release of outer membrane fragments from normally growing Escherichia coli. Biochim Biophys Acta. Vol. 455. P. 889 899.

109. Holtje J.V. (1975). Novel type of murein transglycosylase in Escherichia coli. J Bacteriol. Vol. 124. P. 1067 1076.

110. Holtje J.V. and Tuomanen E.I. (1991). The murein hydrolases of Escherichia coli: properties, function and impact on the course of infection in vivo. J Gen Microbiol. Vol. 137. P. 441 454.

111. Horstman A.L. and Kuehn M.J. (2000). Enterotoxigenic Escherichia coli secretes active heat-labile enterotoxin via outer membrane vesicles. J Biol Chem. Vol. 275. P. 12489 12496.

112. Huang J., Schell M.A. (1990). Evidence that extracellular export of the endoglucanase encoded by egl of Pseudomonas solanacearum occurs by a two-step process involving a lipoprotein intermediate. J Biol Chem. Vol. 265. P. 11628- 11632.

113. Hull M.E. (1974). Studies on milk proteins. II. Colorimetric determination of the partial hydrolysis of the proteins in milk. J Diary Sci. Vol. 30. P. 881 -884.

114. Imoto Т., Jonson L.N., North A.C.T., Phillips D.C., Rupley J.A. (1972). Vertebrate lysozyme. In: The enzymes (Boyer P.D. ed). Acad Press, New York, London. Vol. 7. P. 665 868.

115. Ishikawa S., Hara Y., Ohnishi R., Sekiguchi J. (1998). Regulation of a new cell wall hydrolase gene cwlF, which affects cell separation in Bacillus subtilis. J Bacteriol. Vol. 180. P. 2549 2555.

116. Iversen O.J., Grov A. (1973). Studies of lysostaphin. Separation and characterization on three enzymes. Eur J Biochem. Vol. 38. P. 293 300.

117. Jacob-Dubuisson F., Locht C., Antoine R. (2001). Two-partner secretion in Gram-negative bacteria: a thrifty, specific partway for large virulence proteins. Mol Microbiol. Vol. 40. P. 306 313.

118. Kadurugamuwa J.L. and Beveridge T.J. (1996). Bacteriolytic effect of membrane vesicles from Pseudomonas aeruginosa on other bacteria including pathogens: Conceptually new antibiotics. J Bacteriol. Vol. 178. P. 2767 2774.

119. Kadurugamuwa J.L. and Beveridge T.J. (1997). Natural release of virulence factors in membrane vesicles by Pseudomonas aeruginosa and the effect of aminoglycoside antibiotics on their release. J Antimicrob Chemother. Vol. 40. P. 615-621.

120. Kadurugamuwa J.L. and Beveridge T.J. (1998). Delivery of the non-membrane-permeative antibiotic gentamicin into mammalian cells by using Shigella flexneri membrane vesicles. Antimicrob Agents Chemother. Vol. 42. P. 1476- 1483.

121. Kadurugamuwa J.L. and Beveridge T.J. (1999). Membrane vesicles derived from Pseudomonas aeruginosa and Shigella flexneri can be integrated into the surfaces of other Gram-negative bacteria. Microbiology. Vol. 145. P. 2051 -2060.

122. Kadurugamuwa J.L., Mayer A., Messner P., Sara M., Sleytr U.B. and Beveridge T.J. (1998). S-layered Aneurinibacillus and Bacillus spp. are susceptible to the lytic action of Pseudomonas aeruginosa membrane vesicles. J Bacteriol. Vol. 180. P. 2306-2311.

123. Kamamura Т., Shockman G.D. (1983). Purification and some properties of the endogenous, autolytic N-acetylmuramylhydrolase of Streptococcus faecium, a bacterial glycoenzyme. J Biol Chem. Vol. 258. P. 9514 — 9521.

124. Karkhanis Y.D., Zeltner J.Y., Jackson J.J. and Carlo D.J. (1978). A new and improved microassay to determine 2-keto-3-deoxyoctonate in lipopolysaccharide of gram-negative bacteria. Anal Biochem. Vol. 85. P. 595-601.

125. Kato К., Matsubara Т., Mori J., Kotani S. (1960). «Protoplasts» formation in Staphylococcus aureus using the lytic enzyme produced by a Flavobacterium. Biken'S J. Vol. 3. P. 201 203.

126. Kato S., Kowashi Y. and Demuth D.R. (2002). Outer membrane-like vesicles secreted by Actinobacillus actinomycetemcomitans are enriched in leukotoxin. Microb Pathog. Vol. 32. P. 1 13.

127. Kawata S., Takemura Т., Takase Y., Yokogawa K. (1984). Purification and characterization of N-acetyl-muramyl-L-alanine amidase from Streptomyces globisporus 1829. Agr Biol Chem. Vol. 48. P. 261 269.

128. Keck W., van Leeuwen A.M., Leuber M., Goodell E.W. (1990). Cloning and characterization of mepA, the structural gene of the penicillin-insensitive murein hydrolase from Escherichia coli. Mol Microbiol. Vol. 4. P. 209-219.

129. Keenan J., Day Т., Neal S., Cook В., Perez-Perez G., Allardyce R. and Bagshaw P. (2000). A role for the bacterial outer membrane in the pathogenesis of Helicobacter pylori infection. FEMS Microbiol Lett. Vol. 182. P. 259-264.

130. Kehoe M.A. (1994). Cell-wall-associated proteins in Gram-positive bacteria. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell-wall (Ghuysen J.M., HakenbeckR., eds). Elsevier Science B.V., Amsterdam. P. 217 — 261.

131. Kesty N.C. and Kuehn M.J. (2004). Incorporation of heterologous outer membrane and periplasmic proteins into Escherichia coli outer membrane vesicles. J Biol Chem. Vol. 279. P. 2069 2076.

132. Kesty N.C., Mason K.M., Reedy M., Miller S.E. and Kuehn M.J. (2004). Enterotoxigenic Escherichia coli vesicles target toxin delivery into mammalian cells. EMBO J. Vol. 23. P. 4538 4549.

133. Khandelwal P. and Banerjee-Bhatnagar N. (2003). Insecticidal activity associated with the outer membrane vesicles of Xenorhabdus nematophilus. Appl Environ Microbiol. Vol. 69. P. 2032 2037.

134. Kim S.Y., Ohk S.H., Bai D.H., Yu J.H. (1999). Purification and properties of bacteriolytic enzymes from Bacillus licheniformis YS-1005 against Streptococcus mutants. Bioscience biotechnology and biochemistry. Vol. 63. P. 73 77.

135. Klauser Т., Pohlner J., Meyer T.F. (1992). Selective extracellular release of cholera toxin В subunit by Escherichia coli: dessection of Neisseria Ig Ab-mediated outer membrane transport. J EMBO. Vol.11. P. 2327 2335.

136. Kobayashi H., Uematsu K., Hirayama H. and Horikoshi K. (2000). Novel toluene elimination system in a toluene-tolerant microorganism. J Bacteriol. Vol. 182. P. 6451 -6455.

137. Koch A.L. (1995). Bacterial growth and form. Chapmen and Hall, New York. 385 p.

138. Koebnik R., Locher K.P. and van Gelder P. (2000) Structure and function of bacterial outer membrane proteins: barrels in a nutshell. Mol Microbiol. Vol. 37. P. 239-253

139. Kolling G.L. and Matthews K.R. (1999). Export of virulence genes and Shiga toxin by membrane vesicles of Escherichia coli 0157:H7. Appl Environ Microbiol. Vol. 65. P. 1843 1848.

140. Komatsuzawa H., Sugai M., Nakashima S., Suginaka H. (1995). Alteration of bacteriolytic enzymes profile of Staphylococcus aureus during growth. Microbiol Immunol. Vol. 39. P. 629 633.

141. Kondo K., Takade A. and Amako K. (1993). Release of the outer membrane vesicles from Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus. Microbiol Immunol. Vol. 37. P. 149 152.

142. Kornberg A., Horecker B.L. (1955). Glucose-6-phosphate dehydrogenase. In: Methods in Enzymology (Colowick S.P., Kaplan N.O. eds). Acad Press, New York. P. 323-325.

143. Koronakis V, Koronakis E, Hughes C. (1989). Isolation and analysis of the C-terminal signal directing export of Escherichia coli hemolysin protein across both bacterial membranes. EMBO J. Vol. 8. P. 595 — 605.

144. Kostakioti M., Newman C.L., Thanassi D.G. and Stathopoulos C. (2005). Mechanisms of Protein Export across the Bacterial Outer Membrane. J Bacteriol. Vol. 187. P. 4306 4314.

145. Kuehn M.J. and Nicole C. Kesty N.C. (2005). Bacterial outer membrane vesicles and the host-pathogen interaction. Genes and Develop. Vol. 19. P. 2645 2655.

146. Kumamoto C., Beckwith J. (1985). Evidence for specificity at an early step in protein export in Escherichia coli. J Bacteriol. Vol. 163. P. 267 — 274.

147. Kuroda A., Sugimoto Y., Funahashi Т., Sekiguchi J. (1992). Genetic structure, isolation and characterization of a Bacillus licheniformis cell wall hydrolases. Mol Gen Genet. Vol. 234. P. 129 137.

148. Kusukawa N., Yura Т., Ueguchi C., Akiyama Y., Ito K. (1989). Effects of mutations in heat-shock genes groES and groEL on protein export in Escherichia coli. EMBO J. Vol. 8. P. 3517 3521.

149. Labischinski H., Maidhof H. (1994). Bacterial peptidoglycan: overview and evolving concepts. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell-wall (Ghuysen J.M., Hakenbeck R., eds). Elsevier Science B.V., Amsterdam. P. 23 28.

150. Ladant D. and Ullmann A. (1999). Bordetella pertussis adenylate cyclase: a toxin with multiple talents. Trends Microbiol. Vol. 7. P. 172 176

151. Laemmli U.K. (1970). Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T-4. Nature. Vol. 277. P. 680 685.

152. Lai E.M. and Kado C.I. (2000). The T-pilus of Agrobacterium tumefaciens. Trends Microbiol. Vol. 8. P. 361 369.

153. Lambert P.A. (1998). Enterobacteriaceae: composition, structure and function of cell envelope. J Appl Bacteriol. Vol. 65. P. 21S 34S.

154. Lambert-Buisine C, Willery E, Locht C, Jacob-Dubuisson F. (1998). N-terminal characterization of the Bordetella pertussis filamentous haemagglutinin. Mol Microbiol. Vol. 28. P. 1283 1293.

155. Lederer E, Adam A, Ciorbaru R, Petit J.F, Wietzerbin J. (1975). Cell walls of mycobacteria and related organisms: chemistry and immunostimulant properties. Mol Cell Biochem. Vol. 7. P. 87 104.

156. Lee V.T. and Schneewind O. (2001). Protein secretion and the pathogenesis of bacterial infections. Genes Dev. Vol. 15. P. 1725 — 1752.

157. Leyh-Bouille M, Ghuysen J.M., Tripper D.J, Strominger J.L. (1966). Structure of the cell wall of Micrococcus lysodeikticus I. Study of the structure of the glycan. Bichemistry. Vol. 10. P. 3079 3090.

158. Li Z, Clarke A. and Beveridge T.J. (1996). A major autolysin of Pseudomonas aeruginosa: Subcellular distribution, potential role in cell growth and division and secretion in surface membrane vesicles. J Bacteriol. Vol. 178. P. 2479-2488.

159. Li Z, Clarke A. and Beveridge T.J. (1998). Gram-negative bacteria produce membrane vesicles which are capable of killing other bacteria. J Bacteriol. Vol. 180. P. 5478-5483

160. Lindeberg M, Collmer A. (1992). Analysis of eight out genes required for pectic enzyme secretion by Erwinia chrysanthemi: protein sequence comparison with secretion genes from other gram- negative bacteria. J Bacteriol. Vol. 174. P. 7385 7397.

161. Linderoth N.A., Simon M.N. and Russel M. (1997). The filamentous phage plV multimer visualized by scanning transmission electron microscopy. Science. Vol. 278. P. 1635 1638.

162. Lindsay В., Glaser L. (1976). Characterization of the N-acetylmuramic acid L-alanine amidase from Bacillus subtilis. J Bacteriol. Vol. 127. P. 803 — 811.

163. Loeb M.R. and Kilner J. (1978). Release of a special fraction of the outer membrane from both growing and phage T4-infected Escherichia coli B. Biochim Biophys Acta. Vol. 514. P. 117 127.

164. Logan S.M. and Trust T.J. (1982). Outer membrane characteristics of Campylobacter jejuni. Infect Immun. Vol. 38. P. 898 906.

165. Lopez R., Garcia E., Garcia O., Garcia J.P. (1997). The pneumococcal cell wall degrading enzymes: a modular design to create new lysins? Microb Drug Resist. Vol. 2. P. 199 211.

166. Lowry O.H., Rosebrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. (1951). Protein measurement with the Folin-phenol reagent. J Biol Chem. Vol. 193. P. 265 -275.

167. Makino S., Ito N., Inoue Т., Miyata S., Moriyama R. (1994). A spore-lytic enzyme released from Bacillus cereus spores during germination. Microbiology. Vol. 140. P. 1403 1410.

168. Margot P., Pagni M., Karamata D. (1999). Bacillus subtilis 168 gene lytF encodes a y-D-glutamate-meso-diaminopimelate muropeptidase expressed by the alternative gevetative sigma factor, aD. Microbiology. Vol. 145. P. 57 -65.

169. Mauk K., Chan L., Glaser L. (1971). Turnover of the cell wall of gram-positive bacteria. J Biol Chem. Vol. 246. P. 1820 1827.

170. Mayrand D. and Grenier D. (1989). Biological activities of outer membrane vesicles. Can J Microbiol. Vol. 35. P. 607 613.

171. McLaughlan A.M., Foster S.J. (1998). Molecular characterization of an autolytic amidase of Listeria monocytogenes EGD. Micribiol. Vol. 144. P. 1359- 1367.

172. Meadow P.M., Wells P.L., Salkinoja-Salonen M. and Nurmiaho E.L. (1978). The effect of lipopolysaccharide composition on the ultrastructure of Pseudomonas aeruginosa. J Gen Microbiol. Vol. 105. P. 23 28.

173. Model P., Pussel M. (1990). Procariotic secretion. Cell. Vol. 61. P. 739-741.

174. Mollner S., Braun V. (1984). Murein hydrolase (N-acetylmuramyl-L-alanine amidase) in human serum. Arch Microbiol. Vol. 140. P. 171 — 177.

175. Mori H., Ito K. (2001). The Sec protein-translocation pathway. Trends Microbiol. Vol. 9. P. 494 500.

176. Mug-Opstelten D. and Witholt B. (1978). Preferential release of new outer membrane fragments by exponentially growing Escherichia coli. Biochim Biophys Acta. Vol. 508. P. 287 295.

177. Munoz E., Ghuysen J.M., Leyh-Bouille M., Petit J.F., Tinelli R. (1966). Structural variation in bacterial cell wall peptidoglycans studied with Streptomyces F1 endo-N-acetylmuramidase. Bichemistry. Vol. 5. P. 3091 -3098.

178. Murao S., Takahara G. (1973). Lytic enzymes for gram-negative bacteria prodused by Bacillus subtilis YT-25. Agr Biol Chem. Vol. 37. P. 2671 — 2673.

179. Narayanan S.K., Nagaraja T.G., Chengappa M.M. and Stewart G.C. (2002). Leukotoxins of gram-negative bacteria. Vet Microbiol. Vol. 84. P. 337 -356.

180. Naumova I.B. (1988). The teichoic acids of actinomycetes. Microbiol Sci. Vol. 5. P. 275 279.

181. Navarre W.W., Schneewind O. (1999). Surface proteins of gram-positive bacteria and mechanisms of their targeting to the cell wall envelope. Microbiol Mol Biol Rev. Vol. 63. P. 174 229.

182. Neu H, Heppel LA (1965). The release of enzymes from Escherichia coli by osmotic shock and during the formation of spheroplasts. J Biol Chem. Vol. 240. P. 3685-3692.

183. Nguyen T.T., Saxena A. and Beveridge T.J. (2003). Effect of surface lipopolysaccharide on the nature of membrane vesicles liberated from the Gram-negative bacterium Pseudomonas aeruginosa. J Electron Microsc (Tokyo). Vol. 52'. P. 465 469.

184. Nossal N.G., Heppel L.A. (1966). The release of enzymes by osmotic shock from Escherichia coli in exponential phase. J Biol Chem. Vol. 241. P. 3055 3062.

185. Nouwen N., Ranson N., Saibil H., Wolpensinger B.,,Engel A., Ghazi A. and Pugsley A.P. (1999). Secretin PulD; association with pilot PulS, structure, and ion-conducting channel formation. Proc Natl Acad Sci USA. Vol. 96. P. 8173 -8177.

186. Nowotny A., Behling U.H., Hammond В., Lai C.H., Listgarten M., Pham P.H. and Sanavi F. (1982). Release of toxic microvesicles by Actinobacillus actinomycetemcomitans. Infect Immun. Vol. 37. P. 151 — 154.

187. Ohnishi R., Ishikawa S., Sekiguchi J. (1999). Peptidoglycan hydrolase LytF plays a role in cell separation with CwlF during vegetative growth of Bacillus subtilis. J Bacteriol. Vol. 181. P. 3178 3184.

188. Ohta H., Нага H., Fukui K., Kurihara H., Murayama Y. and Kato K. (1993). Association of Actinobacillus actinomycetemcomitans leukotoxin with nucleic acids on the bacterial cell surface. Infect Immun. Vol. 61. P. 4878 -4884.

189. Oliver D.B., Beckwith J. (1982). Regulation of a membrane component required for protein secretion in Escherichia coli. Cell. Vol. 30. P. 311 — 319.

190. Paetzel M., Dalbey R. E., Stiynadka N. (2000). The structure and mechanism of bacterial type I signal peptidases. A novel antibiotic target. Pharmacology and Therapy. Vol. 87. P. 27 — 49.

191. Paton J.C., Andrew P.W., Boulnois G.J., Mitchell T.J. (1993). Molecular analysis of the pathogenicity of Streptococcus pneumoniae: the role of pneumococcal proteins. Annu Rev Microbiol. Vol. 47. P. 89 — 115.

192. Pettit R.K. and Judd R.C. (1992). The interaction of naturally elaborated blebs from serum-susceptible and serum-resistant strains of Neisseria gonorrhoeae with normal human serum. Mol Microbiol. Vol. 6. P. 729 — 734.

193. Pink D., Moeller J., Quinn В., Jericho M., Beveridge T.J. (2000). On the architecture of the gram-negative bacterial murein sacculus. J Bacteriol. Vol. 182. P. 5925-5930.

194. Pohlner J., Langenberg U., Wolk U., Beck S.C. and Meyer T.F. (1995).к

195. Uptake and nuclear transport of Neisseria IgAl protease-associated alphaproteins in human cells. Mol Microbiol. Vol. 17. P. 1073 108.

196. Pooley H., Karamata D. (1984). Flagellation and the control of autolysins in Bacillus subtilis. In: Microbial cell wall synthesis and autolysis (Nombela C., ed.). Elsevier Sciense B.V., Amsterdam. P. 13 19.

197. Possot O., d'Enfert C., Reyss I., Pugsley A.P. (1992). Pullulanase secretion in Escherichia coli K12 requires a cytoplasmic membrane protein and putative polytopic cytoplasmic membrane protein. Mol Microbiol. Vol. 6. P. 95- 105.

198. Poulsen K., Brandt J., Hjorth J.P., Thogersen H.C. and Kilian M. (1989). Cloning and sequencing of the immunoglobulin Al protease gene (iga) of Haemophilus influenzae serotype b. Infect Immun. Vol. 57. P. 3097 — 3105.

199. Pugsley A. P. (1993). The complete general secretory pathway in gram-negative bacteria. Microbiol Rev. Vol. 57. P. 50 108.

200. Pugsley A.P., Scwarts M. (1985). Export and secretion of proteins by bacteria. FEMS Microbiol Rev. Vol. 32. P. 3 38.

201. Reevers P. (1994). Biosynthesis and assembly of lipopolysaccharide. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.M., Hakenbeck R, eds). Elsevier Science B.V., Amsterdam. P. 281 318.

202. Renelli M., Matias V., Lo R.Y. and Beveridge T.J. (2004). DNA-containing membrane vesicles of Pseudomonas aeruginosa PAOl and their genetic transformation potential. Microbiology. Vol. 150. P. 2161 2169.

203. Reynolds E.S. (1963). The use of lead citrate at high pH as an electron-opaque stain in electron microscopy. J Cell Biol. Vol. 17. P. 208 213.

204. Rivas В., Garcia J.L., Lopez R., Garcia P. (2002). Purification and polar localization of pneumococcal LytB, a putative endo-P-N-acetylglucosaminidasa: the chaine-dispersing murein hydrolase. J Bacteriol. Vol. 184. P. 4988-5000.

205. Robinnson J.M., Hardman J.K., Sloan G.L. (1980). The characteristics of extracellular protein secretion by Staphylococcus staphylolyticus. J Gen Microbiol. Vol. 118. P. 529 533.

206. Rogers H.J., Taylor C., Rayter S., Ward J.B. (1984). Purification and properties of an autolytic endo-p-glucosaminidase and the N-acetylmuramyl-L-alanine amidase from Bacillus subtilis strain 168. J Gen Microbiol. Vol. 130. P. 2395 2402.

207. Sabra W., Lunsdorf H. and Zeng A.P. (2003). Alterations in the formation of lipopolysaccharide and membrane vesicles on the surface of Pseudomonas aeruginosa PAOl under oxygen stress conditions. Microbiology. Vol. 149. P. 2789-2795.

208. Sado S., Dworkin M. (1972). Bacteriolytic enzymes produced Myxococcus xanthus. J Bacteriol. Vol. 110. P. 236 245.

209. Salmond G.P.C. (1994). Secretion of extracellular virulence factors by plant pathogenic bacteria. Annu Rev Phytopathol. Vol. 32. P. 181 200.

210. Salton M.R. (1952). The nature of the cell walls of some Gram-positive and Gram-negative bacteria. Biochim Biophys Acta. Vol. 9. P. 334 335.

211. Salton M.R. 1952. The nature of the cell walls of some Gram-positive and Gram-negative bacteria. Biochim Biophys Acta. Vol. 9. P. 334 335.

212. Salton M.R.J. (1994). The bacterial cell envelope a historical perspective. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial cell wall (Ghuysen J.M., Hakenbeck R., eds), Elsevier Science B.V., Amsterdam. P. 1 — 22.

213. Sanz J.M., Diaz E., Garcia J.L. (1992). Studies on the structure and function of the N-terminal domain of the pneumococcal murein hydrolases. Mo 1 Microbiol. Vol. 6. P. 921 931.

214. Saunders N.B., Shoemaker D.R., Brandt B.L., Moran, E.E., Larsen T. and Zollinger W.D. (1999). Immunogenicity of intranasally administered meningococcal native outer membrane vesicles in mice. Infect Immun. Vol. 67. P. 113-119.

215. Schiebel E., Schwarz H., Braun V. (1989). Subcellular location and unique secretion of the hemolysin of Serratia marcescens. J Cell Biol. Vol. 264. P. 16311- 16320.

216. Schindler C.A., Schuhardt V.T. (1964). Lysostaphin: a new bacteriolytic agent for the staphylococcus. Proc Natl Acad Sci USA. Vol. 51. P. 414 -421.

217. Schleifer K.N., Kandler O. (1972). Peptidoglycan types of bacterial cell wallsand their taxonomic implications. Bact Rev. Vol. 36. P. 407 — 477.

218. Schmelzer E., Weckesser J., Warth R., Mayer M. (1982). Peptidoglycan of Rhodopseudomonas viridis: partial lack of N-acetyl substitutionof glucosamine. J Bacteriol. Vol. 88. P. 815-816.

219. Schnaitman C.A. (1971) Solubilisation of cytoplasmic membrane of Escherichia coli by Tryton X-100. J Bacteriol. Vol. 108. P. 545 552.

220. Schnaitman C.A. and Klena J.D. (1993). Genetics of lipopolysaccharide biosynthesis in enteric bacteria. Microbiol Rev. Vol. 57. P. 655 — 682.

221. Sekiguchi J., Akeo K., Yamamoto H., Khasov F.K., Alonso J.C., Kuroda A. (1995). Nucleotide sequence and regulation of a new putative cell wall hydrolase gen, cw/D, which affects germination in Bacillus subtilis. J Bacterilogy. Vol. 177. P. 5582 5589.

222. Shaw D., Mirelman D., Chatterjee N.N., Park J.T. (1970). Ribitol teichoic acid synthesis in bacteriophage resistant mutant of Staphylococcus aureus H. J Mol Biol. Vol. 245. P. 5101 5106.

223. Shindler C.A., Schuhard V.T., (1964). Lysostaphin: a new bacteriolytic agent for staphylococcus. Proc Natl Acad Sci USA. Vol. 51. P. 414 421.

224. Shoberg R.J. and Thomas D.D. (1993). Specific adherence of Borrelia burgdorferi extracellular vesicles to human endothelial cells in culture. Infect Immun. Vol. 61. P. 3892 3900.

225. Shockman G.D. (1992). The autolytic (suicide) system of Enterococcus hirae: from lysine depletion autolysis to biochemical and molecular studies of the two muramidase of Enterococcus hirae ATCC 9790. FEMS Microbiol Lett. Vol. 79. P. 261 267.

226. Shockman G.D. and Holtje J.V. (1994). Microbial peptidoglycan (murein) hydrolases. In: New Comprehensive Biochemistry. Bacterial Cell Wall (Ghuysen J.M. and Hakenbeck R. eds). Elsevier Sciense B.V, Amsterdam. P. 131 165.

227. Silen J.L. Frank D, Fujishige A, Bone R, Agard D.A. (1989). Analysis of prepro-a-lytic protease expression in Escherichia coli reveals that the pro region is required for activity. J Bacteriol. Vol. 171. P. 1320 1325.

228. Silen J.L, Agard D.A. (1989). The я-lytic protease pro-region does not require a physical linkage to activate the protease domain in vivo. Nature. Vol. 341. P. 462-464.

229. Simonen M, Palva I. (1993). Protein secretion in Bacillus sp. Microbiol Rev. Vol. 57. P. 109-137

230. Sinha R.K, Rosental R.S. (1980). Release of soluble peptidoglycan from growing gonococci: demonstration of anhydromuramyl-containing fragments. Infect Immun. Vol. 29. P. 914 925.

231. Sleytr U.B. (1997). Basic and applied S-layer research: an overview . FEMS Microbiol Rev. Vol. 20. P. 5 12.

232. Smit J, Kamio Y. and Nikaido H. (1975). Outer membrane of Salmonella typhimurium: Chemical analysis and freeze-fracture studies with lipopolysaccharide mutants. J Bacteriol. Vol. 124. P. 942 958.

233. Smith T.J, Blackman S.A, Foster S.J. (2000). Autolysins of Bacillus subtilis: multiple enzymes with multiple function. Microbiology. Vol. 146. P. 249 262.

234. Sohl J.L., Jaswal S.S., Agard D.A. (1998). Unfolded conformations of a-lytic protease are more stable than its native state. Nature. Vol. 395. P. 817 — 819.

235. St Geme J.W. Ill and Grass S. (1998) Secretion of the Haemophilus influenzae HMW1 and HMW2 adhesins involves a periplasmic intermediate and requires the HMWB and HMWC proteins. Mol Microbiol. Vol. 27. P. 617-630.

236. Stephens D.S., Edwards K.M., Morris F. and McGee Z.A. (1982). Pili and outer membrane appendages on Neisseria meningitidis in the cerebrospinal fluid of an infant. J Infect Dis. Vol. 146. P. 568.

237. Stevens L. (1996). Egg proteins: what are their functions? Vol. 79. P. 65-87.

238. Strominger J.L., Ghuysen J.M. (1967). Mechanisms of enzymatic bacteriolysis. Science. Vol. 156. P. 213 -221.

239. Strominger J.L., Tipper D.J. (1974). Structure of bacterial cell wall: the lysozyme substrate. In: Lysozyme (Osserman E.F.,Canfield R.E., Beychok S. eds). Acad. Press, NewYork-London. P. 169 184.

240. Strominger J.L., Tipper D.J. (1974). Structure of bacterial cell wall: the lysozyme substrate. In: Lysozyme (Osserman E.F.,Canfield R.E., Beychok S. eds). Acad. Press, NewYork-London. P. 169 184.

241. Strynadka, N.C.J.; James, M.N.G. (1991). Lysozyme Revisited: Crystallographic Evidence for Distortion of an N-Acetylmuramic Acid Residue Bound in Site D. Journal of Molecular Biology. Vol. 220. P. 401 -424.

242. Sugai M., Akiyama Т., Komatsuzawa H., Miyake Y., Suginaka H. (1990). Characterization of sodium dodecyl sulfate-stable Staphylococcus aureus bacteriolytic enzymes by polyacrylamide gell electrophoresis. J Bacteriol. Vol. 172. P. 6494 6498.

243. Tanaka J., Suzuki Т., Mimuro H. and Sasakawa C. (2003). Structural definition on the surface of Helicobacter pylori type IV secretion apparatus. Cell Microbiol. Vol. 5. P. 395 404.

244. Taylor P.W. (1983). Bactericidal and bacteriolytic activity of serum against gram-negative bacteria. Microbiol Rev. Vol. 47. P. 46 83.

245. Thanassi D.G. and Hultgren S. J. (2000). Multiple pathways allow protein secretion across the bacterial outer membrane. Current Opinion in Cell Biology. Vol. 12. P. 420 430.

246. Tripper D.J., Ghuysen J.M., Strominger J.L. (1965). Structure of the cell wall of Staphylococcus aureus, strain Copenhagen. III. Further studies of the disaccharides. Bichemistry. Vol. 4. P. 468 473.

247. Tsugita A. (1971). Phage lysozyme and other lytic enzymes. In: The enzymes (Boyer P.D. ed). Acad Press, New York-London. Vol. 5. P. 343 -413.

248. Uchido K., Aido K. (1979). Taxonomic significance of cell-wall acyl type in Corynebacterium-Micobacterium-Nocardia group by a glycolate test. J Gen Apll Microbiol. Vol. 25. P. 169 183.

249. Valence F., Lortal S. (1995). Zymogram and preliminary characterization of Lactobacillus helveticus autolysins. Appl Environ Microbiol. Vol. 61. P. 3391 3399.

250. Vallinger Z., Ladesic В., Tomasic J. (1982). Partial purification and characterization of N-acetylmuramyl-L-alanine amidase from human and mouse serum. Biochim Biophis Acta. Vol. 701. P. 63 71.

251. Vrontou E., Economou A. (2004). Structure and function of SecA, the preprotein translocase nanomotor. Biochim Biophys Acta. Vol. 1694. P. 67 -80.

252. Wandersman C. (1989). Secretion, processing and activation of bacterial extracellular proteases. Mol Microbiol. Vol. 3. P. 1825 1831.

253. Ward J.B. (1981). Teichoic and teichuronic acids: Biosynthesis, assembly and location. Microbiol Rev. Vol. 45. P. 211 243.

254. Ward J.B., Perkins H.R (1968). The purification and properties of two staphylolytic enzymes from Streptomyces griseus. Bichemistry. Vol. 106. P. 69-76.

255. Ward J.B., Williamson R. (1984). Bacterial autolysins: specificity and function. In: Microbial cell wall synthesis and autolysis (Nombela C., ed.). Elsevier Sciense B.V., Amsterdam. P. 159 166.

256. Weibull C. (1953). The isolation of protoplasts from Bacillus megaterium by controlled treatment with lysozyme. J Bacteriol. Vol. 66. P. 688 695.

257. White D. (1995). The Physiology and Biochemistry of Prokaryotes. Oxford University Press, N.Y. 378 p.

258. Wild J., Altman E., Yura Т., Cross C. (1996). Involvement of the DnaK-DnaJ-GroE chaperone team in protein export in Escherichia coli. Genes Dev. Vol. 6. P. 1165- 1172.

259. Wren B.V. (1991). A family of clostridial and streptococcal ligand-binding proteins with conserved C-terminal repeat sequences. Mol Microbiol. Vol. 5. P. 797 803.

260. Yaron S, Kolling G.L, Simon L. and Matthews K.R. (2000). Vesicle-mediated transfer of virulence genes from Escherichia coli 0157:H7 to other enteric bacteria. Appl Environ Microbiol. Vol. 66. P. 4414 4420.

261. Yem D.W, Wu H.C. (1976). Purification and properties of p-D-acetylglucosaminides from Escherichia coli. J Bacteriol. Vol. 125. P. 324 -331.

262. Yokogawa K, Kawata S, Takemura T, Yoshimura Y. (1975). Purification and properties of lytic enzymes from Streptomyces globisporus 1829. Agr Biol Chem. Vol. 39. P. 1533 1543.

263. Yokogawa K, Kawata S, Yoshimura Y. (1973). Lytic enzyme from Streptomyces globisporus 1829. Agr Biol Chem. Vol. 37. P. 799 808.

264. Yoshimoto T, Tsuru D. (1972). Studies on bacteriolytic Enzymes. II. Purification and some properties of two types of staphylolytic enzymes from Streptomyces griseus. Bichemistry. Vol. 72. P. 379 390.

265. Yoshino S, Ogata S, Hayashida S. (1982). Some properties of autolysins of Clostridium saccharoperbutylacetonicum. Agr Biol Chem. Vol. 46. P. 1243 1248.

266. Zhou L, Srisatjaluk R, Justus D.E. and Doyle R.J. (1998). On the origin of membrane vesicles in Gram-negative bacteria. FEMS Microbiol Lett. Vol. 163. P. 223-228.