Роль положительно заряженных остатков аминокислот во взаимодействии аминоацил-тРНК-синтетаз с субстратами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Смоленцева, Ирина Ивановна

• Смоленцева, Ирина Ивановна
• кандидат биологических наук
• 1983

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Смоленцева, Ирина Ивановна

Оглавление

Принятые сокращения.

Введение

Глава I (Обзор литературы).

Роль электростатических сил в белково-нуклеиновых взаимодействиях.

1.1. Количественная оценка электростатических взаимодействий в системе белок - нуклеиновая кислота

1.2. Химическая модификация - метод идентификации функциональных групп белков.

1.2.1. Типы реакций и реагенты, используемые для модификации положительно заряженных остатков аминокислот.

1.2.2. Механизм и специфичность действия о^-ди-карбонильных соединений

1.3. Положительно заряженные остатки аминокислот в анион-евязыващих центрах белков

1.4. Роль электростатических контактов во взаимодействии аминоацил-тРНК-синтетаз с субстратами.

Глава 2. Экспериментальная часть. Материалы и методы.

Глава 3. Исследование роли остатков аргинина во взаимодействии фенилаланил-тРНК-синтетазы из Е.СОй МКЕ -600 с субстратами.

3.1. Модификация остатков аргинина с помощью 2,4-пен-тандиона.

3.2. Влияние модификации остатков аргинина на кинетические параметры взаимодействия фермента с субстратами и комплексообразование его с р4С] фе-нилаланил-тРИЕС.

3.3. Влияние субстратов на глубину модификации и степень инактивации фермента в реакциях обмена АТР

3*Т]пирофосфат и аминоацилирования тРНК.

Глава 4. Исследование роли остатков лизина во взаимодействии фенилаланил-тРНК-синтетазы из E.coil MRE -600 с субстратами.

4.1. Исследование влияния модификации остатков лизина с помощью 2,4-пентандиона на функционирование фермента.

4.1.1. Модификация остатков лизина с помощью 2,4-пентанддаона.

4.1.2. Влияние низкомолекулярных лигандов на глубину модификации и степень инактивации фермента. Влияние модификации остатков лизина на кинетические параметры взаимодействия фермента с низкомолекулярными субстратами

4.1.3. Влияние модификации остатков лизина на взаимодействие фермента с TPHKPfie.

4.2. Модификация остатков лизина с помощью пиридок-саль-5*-фосфата и аналогов субстратов - АТР и L -фенилаланиниладенилата, окисленных по рибозе.

Глава 5. Модификация валил-, тирозил-тРНК-синтетаз из E.coil MRE-600 и фенилаланил-тРБК-синтетазы из Bacillus stearothermopflilus по остаткам лизина с помощью 2,4пентандиона. -£

Обсуждение результатов.

Выводы.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Роль положительно заряженных остатков аминокислот во взаимодействии аминоацил-тРНК-синтетаз с субстратами»

Специфическое узнавание нуклеотидных структур белками является ключевой стадией на многих этапах реализации генетической информации. Существенный вклад в этот процесс могут вносить электростатические взаимодействия между положительно заряженными остатками аминокислот (аргинина, лизина, гистидина) и отрицательно заряженными фосфатными группами нуклеотидов, часто функционирувдими в форме комплексов с металлами. Существует несколько подходов для изучения таких взаимодействий. Один из подходов, дающий количественную оценку электростатических контактов в системе белок - нуклеиновая кислота, основан на исследовании влияния ионной силы раствора на взаимодействие этих биологических макромолекул [I, 2]. Другим подходом, позволяющим идентифицировать химические группы, участвующие в таких взаимодействиях, является метод химической модификации [ 3].

Одним из наиболее интересных объектов для изучения бел-ково-нуклеиновых взаимодействий являются аминоацил-тРНК-син-тетазы [АРСазы (К.Ф.6.1.1)] , катализирующие реакцию активации каждой из 20 кодируемых аминокислот с последующим переносом аминоацильного остатка на специфическую тРНК. Поскольку АРСаза взаимодействует с мономерным нуклеотидом АТР и с долину клеотидом тЕНК, содержащимиотрицательно заряженные фосфатные группы, можно ожидать, что часть положительно заряженных остатков аминокислот в составе фермента существенна для узнавания и каталитической активности.

Предположение о существенной роли электростатических контактов во взаимодействии аминоацил-тРНК-синтетаз с тРНК было подтверждено в ряде исследований по изучению влияния ионной силы раствора на характер взаимодействия ферментов с субстратами и в ряде случаев оценено число ионных пар в комплексе АРСаза.тРНК. Вместе с тем к началу нашей работы данных об участии конкретных остатков аминокислот в подобных взаимодействиях получено не было.

Для исследования роли положительно заряженных остатков аминокислот во взаимодействии аминоацил-тЕНК-синтетаз с субстратами в настоящей работе был использован метод химической модификации. С помощью этого метода можно идентифицировать точки контакта фермента с субстратами двумя разными способами.

Первый способ основан на определении природы аминокислотных остатков, защищаемых в составе комплекса фермента с субстратом от модификации, второй - на определении аминокислотных остатков, модификация которых приводит к изменению кинетических параметров взаимодействия фермента с субстратами.

Для модификации положительно заряженных остатков аминокислот (лизина, аргинина) в составе аминоацил-тРНК-синтетаз был применен специфический реагент на остатки лизина и аргинина -2,4-пентандион. В связи с тем, что некоторые остатки лизина, существенные для функционирования ферментов, могли оказаться недоступными для действия 2,4-пентандиона, была сделана попытка локализовать эти аминокислотные остатки с помощью пи-ридоксаль-5'-фосфата, имеющего фосфатную группировку и ароматическое кольцо и способного, по-видимому, взаимодействовать с нуклеотид-связывающими центрами ферментов. Для выявления функциональной роли остатков лизина были использованы также аналоги субстратов - АТР и L-аминоалкиладенилат, окисленные по рибозе дерйодатом натрия. Основное исследование роли положительно заряженных остатков аминокислот было проведено с фенилала-нил-тРНК-синтетазой из Е.СоЦ МЯЕ -600.

С целью выявления общности структурно-функциональной организации аминоацил-тРНК-синтетаз исследовано влияние модификации остатков лизина на взаимодействие других АРСаз с субстратами.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Смоленцева, Ирина Ивановна

ВЫВОДЫ

1. Остатки аргинина фенилаланил-тРЖ-синтетазы из E.coLi ГШ-600 участвуют во взаимодействии с АТР. Модификация фермента с помощью 2,4-пентандиона приводит к его инактивации как в реакции обмена АТР- [32Р]пирофосфат, так и в реакции амино-ацилирования тРЖ. Увеличивается величина ïm для АТР. Mg АТР защищает фермент от модификации и инактивации. Величины \im и Kj дяя тРНК^е практически не изменяются.

2. Остатки лизина существенны как для комплексообразования фе-нилаланил-тРЖ-синтетазы из E.coli с тРЖР^е, так и для её ами-ноацилирования. Модификация остатков лизина с помощью 2,4-жн-тандиона и пиридоксаль-5'-фосфата изменяет параметры взаимодействия фермента с тРЖ^е : увеличивается величина К^ компр. лекса с аминоацил-тРЖ и уменьшается величина Кт для тРЖ ев

Phe реакции аминоацилирования. тРЖ защищает фермент от модификации под действием лизин-специфических реагентов.

3. Остатки лизина не существенны для взаимодействия фенилаланил-тРЖ-синтетазы с АТР и образования фенилаланиладенилата. Модификация остатков лизина 2,4-пентандионом, пиридоксаль-5 фосфатом, оАТР и аналогом промежуточного соединения реакции-оL-фенилаланиниладенилатом не приводит к инактивации фермента в реакции обмена АТР- [32Р]пирофосфат. Величины Кт для L-Phe и АТР, найденные в реакции аминоацилирования, не изменяются при модификации фермента.

Показано отсутствие остатков лизина, важных для узнавания АТР, в случае фенилаланил-тРЖ-синтетазы из Bacillus stearothermophiliis.

4. Отсутствие остатков лизина, существенных для взаимодействия с АТР и формирования аминоациладенилата, не является общей чертой бактериальных АРСаз. Модификация тирозил- и валил-тРНК-синтетаз из E.coli МКЕ-600 2,4-пентандионом ингибирует как реакцию активации соответствующих аминокислот, так и реакцию аминоацилирования специфических тРНК. тРНК защищают данные ферменты от инактивации. Такое же действие оказывает Мд АТР

5. Совокупность результатов указывает на важную роль положительно заряженных остатков аминокислот во взаимодействии ами-ноацил-тРНК-синтетаз с субстратами нуклеотидной природы и в катализе реакции аминоацилирования тРНК.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Смоленцева, Ирина Ивановна, 1983 год

1. Record М.Т.,Ir,Lohman T.M.,Haseth P. Ion effects on ligand -nucleic acid interactions. J.Mol.Biol.,1976,v.107,H 1, p.145-158.

2. Daune M.P. Interactions proteines-acides nucleiques. -Europ.J.Biochem.,1972,v.26,U 2,p.207-211.

3. Северин E.C., Курочкин C.H., Кочетков С.Н. Изучение ферментов и их активных центров методом химической модификации. В кн. : Успехи биологической химии, М.,1974,т.15, с.65-83.

4. Riggs A.D.,Suzuki Н.»Bourgeois S. Lac repressor operator interaction. - J.Mol.Biol.,1970,v.48,IT 1,p.67-83.

5. Riggs A.D.»Bourgeois S.,Cohn M. The lac repressor operator interaction.Kinetic studies. - J.Mol.Biol.,1970,v.53, N 3,p.401-407.

6. Latt S.,Sober H.A. Protein nucleic acid interactions.Oly-gopeptide - polyribonucleotide binding studies. - Biochemistry, 1967,v.6,N 10,p.3293-3306.

7. Poliakow M.C.»Champagne M.H.,Daune M.P. Interactions proteines acides nucleiques. - Europ.J.Biochem.,1972»v.26, N 2,p.212-219.

8. Yamamoto K.R.»Alberts B. On the specificity of the binding of the estradiol receptor protein to deoxyribonucleic acid. J.Biol.Chem.»1974»v.249, IT 22»p.7076-7086.

9. Jensen D.E.,Kelly R.C.,Hippel P.H. ША "melting" proteins. Effects of bacteriophage T4 gene 32-protein binding on the conformation and stability of nucleic acid structures.

10. J.Biol.Chem.,1976,v.25122,p.7215-7228.

11. Manning G.S. On the application of polyelectrolyte "limiting laws" to the helix -coil transition of DUA. Biopolymers,1972,v.115,p.937-949.

12. Schellman J.A. Macromolecular binding. Biopolymers,1975» v.14,N 5,p.999-1018.

13. Revsin A.,Hippel P.H. Direct measurement of association constants for the binding of E.coli lac repressor to nonoperator DITA. Biochemistry,1977,v.16,N 22,p.4769-4782.

14. Haseth P.L.,Lohman T.M.,Burgess R.R.,Record M.T.,Ir. Nonspecific interactions of E.coli RNA-polymerase with native and denatured DNA : differences in the binding behavior of core and holoenzyme. Biochemistry,1978,v.17,N9, p.1612-1622.

15. Kadesch T.R.»Williams R.C.,Chamberlin M.J. Electron microscopic studies of the binding of E.coli RNA polymerase to DNA. J.Mol.Biol., 1980,v.136,11 1,p.65-78.

16. Kadesch T.R.»Williams R.C.,Chamberlin M.J. Electron microscopic studies of the binding of E.coli RITA polymerase to DNA. J.Mol.Biol., 1980,v. 136,IT 1,p.79-93.

17. Giacomoni P.U. A re-interpretation of the dissociation kinetics of the DTTA RITA polymerase complex measured by the filter retention assay. - FEBS Letters,1976,v.72, N 1,p. 83-86.

18. Giacomoni P.U. Purification and ША binding properties of RITA polymerase from Baci-^llus subtilus. - Europ.J.Bio-chem.,1980,v.106,N 2,p.579-591.

19. Helene C. Protein nucleic acid interactions. - Acta Bio-chim. et Biophys.Acad.Sci.Hung.,1977,v.12,N 2,p.173-174.

20. Антонов И.В.,Дудкин С.М.,Карпейский М.Я.,Платонов А.Л., Протасевич И.И.Яковлев Г.И.,Чернавский Д.С. Термодинамические характеристики связывания РНКазы А с аналогами субстратов. Биоорган.химия,1978,т.4,№ 3,с. 388-396.

21. Krauss G.,Riesner D.,Maass G. Mechanism of discrimination between cognate and non-cognate tRHAs by phenylalanyl-tRNA synthetase from yeast. Europ.J.Biochem.,1976,v.68, IT 1,p.81-93.

22. Lam S.S.M.,Schimmel P.R. Equilibrium measurements of cognate and noncognate interactions between aminoacyl transfer RITA synthetasees and transfer RNAs. Biochemistry, 1975,v. 14,IT 12,p.2775-2779.

23. Lauffer M.A. Polymerization depolymerization of Tobacco

24. Mosaic virus protein. Biochemistry,v.5,U 7,p.2440-2446, 1966.

25. Bonnet J.,Renaud M.,Raffin J.P.,Remy P. Quantitative study of the ionic interactions between yeast tRlTAVal and tR!TA^e and their cognate aminoacyl-tRNA ligases. PEBS Letters, 1975,v.53,N 2,p.154-158.

26. Cotton P.A.,Day V.W.,Hazen E.E.,Larsen S. Structure of me-thylguanidinium dihydrogenorthophosphate.A model compound for arginine phosphate hydrogen bonding. - J.Amer.Chem. Soc.,1973,v.95»N 15,p.4834-4840.

27. Уэстли,Дж. Ферментативный катализ. M.: Мир, 1972.-269 с.

28. Patthy L.,Phesz J. Origin of the selectivity of o6-dicarbo-nyl reagents for arginyl residues of anion-binding sites.-Europ.J.Biochem.,1980,v.Ю5,Ж 2,p.387-393.

29. Riordan J.P. Functional arginyl residues in carboxypeptida-se A.Modification with butanedione. Biochemistry,1973, v.12,N 20,p.3913-3923.

30. Takahashi K. The reaction of phenylglyoxal with arginine residues in proteins. J.Biol.Chem.,1968,v.243,N 23,p. 6171-6179.

31. Smith E.L. Reversible blocking at arginine by cyclogexan-dione. In :Meth.Enzymol. Enzyme Struct. Part E.,liew York, 1977,v.47,p.156-161.

32. Patthy L.»Smith E.L. Reversible modification of arginine residues. J.Biol.Chem.,1975,v.250,N 2,p.557-564.

33. Gilbert H.P.,0'Leary M.H. Modification of arginine and lysine in proteins with 2,4-pentanedione. Biochemistry, 1975,v.14,W 23,p.5194-5198.

34. Makoff A.J.,Malcolm A.D.B. Identification of class of lysines within the non-specific ША-binding site of UNA polymerase core enzyme from E.coli. Europ.J.Biochem.,1980, v.106,N 1,p.313-320.

35. Pedarco R.M.,Switzer R.L. Inactivation of Salmonella phos-phoribosylpyrophosphate synthetase by specific chemical modification of a lysine residue. Arch.Biochem. and Bio• phys.,1978,v.185,N 2,p.391-399.

36. Pujiyoshi T.,Uakayama J.,Anai M. Inhibitory effect of py-ridoxal-5' -phosphate on the DITA binding site of ATP-depen-dent deoxyribonuclease from Bacillus laterosporus. J. Biochem., 1981,v.89,H 4,p. 1137-1142.

37. Cooperman B.S.,Ning Yu Ghiu. Yeast inorganic pyrophosphatase. Active-site mapping by electrophilic reagents and binding measurements. Biochemistry, 1973,v. 12,11 9,p.1677-1682.

38. Nakaya K.,Horinishi H.,Shibata K. States of amino acid residues in proteins.Glyoxal as a reagent for discrimination of arginine residues. J.Biochemistry,1967,v.613,p. 345-351.

39. Belfort M.,Maley G.,Maley P. A single functional arginyl residue involved in the catalysis promoted by Lactobacillus casei thymidilate synthetase. Arch.Biochem. and

40. Bi ophys.,1980,v.204,N 1,p.340-349.

41. Richards P.M.»Wyckoff H.W. Three-dimensional structure of bovine pancreatic ribonuclease. In: The enzymes, Acad. Press,Hew York,1971,v.4,p.654-669.

42. Richards P.M.,Wyckoff H.W. Chemical modification of functional groups. In: The enzymes,Acad.Press,Hew York,1971, v.4,p.674-705.

43. Borders C.L.,Riordan J.P. An essential arginyl residue at the nucleotide binding site of creatine kinase. Biochemistry, 1975, v. 14,H 21,p.4699-4704.

44. Patthy L. Hole of nascent c^-ketoaldehyde in substate-de-pendent oxidative inactivation of aldolase. Europ.J.Bio-chem.,1978,v.88,N 1,p.191-196.

45. Riordan J.P. Arginyl residues and anion binding sites in proteins. Mol. and Cell.biochem.,1979,v.26,N 2,p.71-92.

46. Philips M.,Dang B.A.,Pradel L.A. An essential arginyl residues in yeast hexokinase. Biochim.et Biophys.Acta, 1979, v.566,N2,p.296-304.

47. Nagradova N.K.,Asryants R.A.,Benkevich N.V. The role of arginine residues in the function of D-glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. Biochim.et Biophys.Acta,1978, v.527,N 2,p.319-326.

48. Soo-Se Chen,Engel P.C. The equilibrium position of the reaction of bovine liver glutamate dehydrogenase with py-ridoxal-5f-phosphate. Biochem.J.,1975,v.147,N 2,p.351-358.

49. Shan S.Wong,Lee-Jun СЛ/ong. Evidence for an essential a--rginine residue at the active site of E.coli acetate kinase. Biochim.et Biophys.Acta,1981,v.660,N 1,p.142^147.

50. Мирзабеков А.Д.,Рич А. Возможная нейтрализация ДНК гисто-нами при сворачивании нуклеосомной ДНК. Докл.АН СССР, 1978,т.243,$ 6,c.I58I-I584.54» Elgin S.C.R.,Weintraub Н. Chromosomal proteins and chromatin structure. Annu.Rev.Biochem.,1975»v.44,p.725-774.

51. Olins D.E.,01ins A.L. Model nucleoidstones: the interaction of F1 and F2al histones with native T7 DNA. J.Mol. Biol.,1971,v.573,p.437-455.

52. Malchy B.,Kaplan H. Reactive properties of the amino acid groups of histones in calf thymus chromatin. J.Mol.Biol., 1974,v.82,N 4,p.537-545.

53. Tack L.O.,Simpson R.T. Location of hystone lysyl residues modified by in vitro acetylation of chromatin. Biochemistry, 1979,v.18,F 14,p.3110-3118.

54. Beyreuther K.,Adler K.,Panning E.»Murray C., Klemm C., Klemm A.,Geisler N. Amino-acid sequence of lac-repressor from E.coli. Europ.J.Biochem.,1975,v.59,11 2,p.491-509.

55. Schlotmann M.»Beyreuther K.,Geisler N.,Muller-Hill B. Mutant lac repressors of E.coli with altered deoxyribonucleic acid-binding properties. Biochem.Soc.Trans.,1975, v.3,N 6,p.1123-1124.

56. Piatt T.,Piles J.G.,Weber K. Specific proteolytic destruction of the HH^ -terminal region of lac-repressor of the deoxyribonucleic acid-binding activity. J.Biol.Chem., 1973,v.248,U 1,p.110-121.

57. Anderson R.A.,Nakashima Y.,Coleman J.E. Chemical modification of functional residues of fd gene 5 DFA-bindingprotein. -Biochemistry,1975,v.14,N 5,p.907-917.

58. Karpel R.L.,Merkler D.J.,Flowers B.K.,Delahunty M.D. Involvement of basic amino acids in the activity of a nucleic acid helix-destabilizing protein. Biochim.et Biophys.

59. Acta,1981,v.654,N 1,p.42-51.

60. Modak M.J. Observations on the pyridoxal-51-phosphate inhibition of MA polymerases. Biochemistry,1976,v.15,N 16,p.3620-3626.

61. Srivaatava A.,Modak M.J. Phenylglyoxal as a template site-specific reagent for Шк and RITA polymerases. J.Biol. Ghem.,1980,v.255,N 3,p.917-921.

62. Fujiki H.,Zurek G. The subunits of ША-dependent RITA polymerase from E.coli:amino acid analysis and primary structure of the IT-terminal regions. FEBS Letters, 1975,v.55, N 1,p.242-244.

63. Алахов Ю.Б. Рибосомные белки E.coli.Особенности первичной ' и пространственной сттзуктуры. Биохимия,1980,т.45,№ 4,с.579-593.

64. Amons R.,Moller W.»Schiltz E.,Reinbolt J. Studies on the bindings sites of protein S4 to 16S RNA in E.coli riboso-mes. FEBS Letters,1974,v.411,p.135-138.

65. Ehresmann B.,Reinbolt J.,Ebel J.P. Studies of the binding of E.coli ribosomal protein S4 to 16S rRNA after UV irradiation of the S4 16S rRNA complex. - FEBS Letters,1977, v.58,IT 1,p.106-111.

66. Daya-Grosjean L.,Reinbolt I.,Pongs 0.,Garrett R.A. A study of the regions of ribosomal proteins S4,S8,S15 and S20 that interact with 16S RITA of E.coli. FEBS Letters, 1974, v.44,N 3,p.253-256.

67. Markus P. Essential arginyl residues in fructose -1,6diphosphatase. Biochemistry,1976,v.15,N 16,p.3505-3509.75* Takahashi K. Specific modification of arginine residues in proteins with ninhydrin. J.Biochem.,1976,v.80,N 5,p. 1173-1176.

68. Borders C.L.,Johansen J.T. Identification of Arg-143 as the essential arginyl residue in yeast Cu, Zn superoxide-dismutase by use of a chromophoric arginine reagent. -Biochem. and Biophys.Res.Commun .,1980,v.96,N 3,p.1071-1078.

69. Riordan J.F.»McElvany K.D.,Borders C.L.,Ir. Arginyl residues: anion recognition sites in enzymes. Science,1977» v.195,И 4281,p.884-885.

70. Patthy L.,Smith E.L. Identification of functional argini-ne residues in ribonuclease A and lysozyme. J.Biol.Chem., 1975,v.250,N 2,p.565-569.

71. Brygier J.,Bruin S.H.DE.,Hoof P.M.K.B.»Rollema H.S. The interaction of organic phosphates with human and chicken hemoglobin. Europ.J.Biochem.,1975,v.60,U 2,p.379-383.

72. Hoi W.G.J.,van Duijnen P.T.»Beredsen H.J.C. The oL-helix dipole and the properties of proteins. Hature,1978,v. 273,N 5660,p.443-446.85* Norne J.-E.»Hjalmarsson S.-G.,Lindman B.,Zeppezauer M.

73. Anion binding properties of human serum albumin from hali-de i-on guadrupole relaxation. Biochemistry,1975,v.14, N 15,p.3401-3408.

74. Goldstein L.,Levin Y.,Katchalski E. A water insoluble polyanionic derivative of trypsin.Effect of the polyelec-trolyte carrier on the kinetic behavior of the bound trypsin. - Biochemistry,1964,v.3,N 12,p.1913-1919.

75. Молекулярные основы биосинтеза белков/ Л.Л.Киселёв,В.Г. Никифоров,О.Б.Астраурова,Б.П.Готтих,А.А.Краевский М.: Наука,1971, с.123-144.

76. Loftfield R.B.,Eigner Е.А. Ionic strength effects in the aminoacylation of valine transfer ribonucleic acid. J. Biol.Chem.,1967,v.242,П 22,p.5355-5359.

77. Lovgren T. The effect of monovalent cations on isoleucyl -transfer-RNA synthetase reaction from baker's yeast. -Acta Chemica Scandinavica,1976,v.B 30,N 10,p.911-914.

78. Svenson I. Studies of methionyl tRITA synthetase.Effectsof divalent and monovalent cations on methionyl-tRNA synthetase from Saccharomyces cerevisiae. Biochim. et . Bi ophys.Acta, 1967,v. 132,11 2,p.239-252.

79. Smith D.W.E. The effect of salt solutions on the acceptance of amino acids by transfer ribonucleic acid. J.Biol. Chem.,1969, .244,11 4,p.896-901.

80. Sein K.T.»Bearevic A. The effects of NaCl on the amino acid acceptor activity of rat liver tRNA. Arch.Biochem. and Biophys.,1971,v.145,N 1,p.164-168.

81. Dillep IT.,Deobagkar D.U,,Gopinathan K.P. Influence of monovalent cations on aminoacylation of transfer RITA. -Indian J.Biochem. and Biophys.,1976,v.13,N 1,p.24-30.

82. Pingout A.,Riesner D.,Boehme D.,Maass G. Kinetic studies1. S eron the interaction of seryl-tRNA synthetase with tRNA and Ser-tRNASer from E.coli. FEBS Letters,1973,v.30, IT 1,p.1-5.

83. Yarus M. Binding of isoleucyl transfer ribonucleic acid by isoleucyl transfer ribonucleic acid synthetase: solvents, the strength of interaction,and proposed source of specificity. Biochemistry,1972,v.1111,p.2050-2060.

84. Giege R.,Kern D.,Ebel J.P. Incorrect aminoacylations catalysed by E.coli valyl-tRNA synthetase. Biochimie,1972 v.54,H 10,p.1245-1255.

85. Peterkofsky A,,Gee S.J.,Jesensky C. The effect of sodium chloride on esterification of leucine to transfer ribonucleic acid by heterologous aminoacyl transfer ribonucleic acid synthetases. Biochemistry,1966,v.5,IT 9,p. 2789-2799.

86. Bonnet J.,Ebel J.P. Influence of various factors on the recognition specificity of tRNA- by yeast valyl-tRJTA- 138 synthetase. Europ.J.Biochem.,1975,v.58,N 1,p.193-201.

87. Pachmann U.,Cronvall E.,Rigler R.,Hirsch R.»Wintermeyer W., Zachau H.G. Specificity of interactions between transfer ribonucleic acids and aminoacyl-tRNA synthetases. Europ. J.Biochem.,1973,v.391,p.265-273.

88. Loftfield R.B. The mechanism of aminoacylation of transfer RNA. In: Progr.lTucl. Acids Res.Mol.Biol. ,N.Y., 1972,v. 12, p. Ю5-Ю7.

89. Kim S.H.,Suddath F.L.,Quigley G.J.,McPherson A.,Sussman J.I*, Wang A.H.J.,Seeman IT.C.,Rich A. Three-dimensional tertiary structure of yeast phenylalanine transfer RNA. Science, 1974,v.185,N 4149,p.435-440.

90. ЮЗ. Klug A.,Robertus J.D.,Ladner J.E.,Brown R.S.,Finch J.T.

91. Conservation of the molecular structure of yeast phenylalanine transfer RNA in two crystal forms. Proc.Nat.Acad. Sci.USA,1974,v.71,U 9,p.3711-3715.

92. Горпкова И.И.,Лаврик О.й. Влияние модификации фенилаланил-тРНК-синтетазы по остаткам лизина и аргинина на ионные1. Pheвзаимодействия фермента с тЕНК . Мол.биол.,1979,т.13,№ 4, с.788-797.

93. Hennecke Н.,Bock A. Modification of phenylalanyl-tRNA synthetase from E.coli by histidine-specific reagents.Effects on structure and function. Europ.J.Biochem.,1974,v.50,1. N 1,p.157-166.

94. Bruton C.J.,Hartley B.S. Chemical studies on methionyltRITA synthetase from E.coli. J.Mol.Biol.,1970,v.52,IT 1, p.165-178.

95. Favorova 0.0.,Madoyan I.A.,Kisselev L.L. Evidence for essential histidine residues in tryptophanyl-tRNA synthe-tase. Europ.J.Biochem.,1978,v.86,И" 1,p.193-202.

96. Raffin J.-P.,Remy P. Yeast phenylalanyl-tRNA synthetase properties of the histidjrl residues. Biochim. et Biophys, Acta, 1978,v.520,IT 1,p.164-174.

97. Holler E.,Schwarze G.,Scheibl R.,Hammer-Raber B. Catalytic mechanism of isoleucyl-tRNA synthetase of E.coli К Ю. Effect of pH and chemical modification. Biochemistry, 1980,v.19,IT 23,p.5403-5411.

98. Краевский A.A. .Киселев JI.JI. ,Готтих Б.П. Аминоацил-тРНК-синтетазы: химическая модель каталитического механизма сучастием имидазола. Мол.биол.,1973,т.7,$ 5,с.769-775.

99. Bosshard H.R.,Koch G.L.E.,Hartley В.S. The aminoacyl-tRITA synthetase tRITA complex: detection by differential labelling of lysine residues involved in complex formation. - J.Mol.Biol.,1978,v.119,Ж 3,p.377-389.

100. Piszkiewicz D.,Duval J.,Rostas S. Specific modification of isoleucyl transfer ribonucleic acid synthetase by py-ridoxal-5f-phosphate. Biochemistry,1977,v.16,IT 16,p. 3538-3543.

101. Baltzinger M.,Pasiolo P.,Remy P. Yeast phenylalanyl-tRNA synthetase.Affinity and photoaffinity labelling of the stereospecific binding sites. Europ.J.Biochem.,1979, v.97,IT 2,p.481-494.

102. Gerlo E.,Charlier J. Irreversible inactivation of argi-nyl-tRNA lygase by periodate-oxidized tRITA. PEBS Letters, 1979,v.99,IT 1,p.25-28.

103. Fayat G. »Hountondji C.,Blanquet S. Methionyl-tRITA synthetase from E.coli.Inactivation and labeling by periodate -treated initiator tRHA. Europ.J.Biochem.,1979,v.96,N 1, p.87-92.

104. Fayat G.,Fromant M.,Blanquet S. Aminoacyl-tRNA synthetases: affinity labeling of the ATP binding site by 2'»З'-ПЪове-oxidized ATP. Proc .Hat .Acad.Sci.USA,1978,v.75,H 5,p.2088-2092.

105. Лаьрик О.И.,Moop H.A.»Невинский Г.А. Синтез аналогов (L-фе-нилаланинил)аденилата и исследование их взаимодействия с фенилаланил-тРНК-синтетазой из E.coli . Биоорган.химия, 1978,т.4,В II,c.I480-I487.

106. Сандахчиев Л.С.,Старостина Б.К.»Стефанович Л.Е.,Чучаев В.М. Применение сорбции на аминоэтилцеллюлозе для выделения тРНК из водного слоя после фенольной экстракции. Мол. биол.,1967,т.4,с.463-466.

107. Stulberg М.Р. The isolation and properties of phenylala-nyl ribonucleic acid synthetase from E.coli B. J.Biol. Chem., 1967,v.242,N 5,рИ060-Ю64.

108. Horz W. »Zachau H. Complex of aminoacyl-tRNA synthetases with tRNAs as studied by partial nuclease digestion. -Europ. J.Biochem., 1973,v.32,IT 1,p.1-14.

109. Fayat G.,Blanquet S.,Dessen P.,Batelier G.,Waller J.-P. -The molecular weight and subunit composition of phenylala-nyl-tRITA synthetase from E.coli K-12. Biochimie, 1974, v.56,N 1,p.35-41.

110. Hanke T.,Bartmann P.,Hennecke H. ,Kosakowski H.M., Jaenicke R.»Holler E.,Bock A. L-phenylalanyl-tRNA synthetase of E.coli К-Ю.А reinvestigation of molecular weight and subunit structure. Europ.J.Biochem., 1974,v.3,p.601-607.

111. Диск-электрофорез. Теория и практика электрофореза в по-лиакриламидном геле./ Г.Маурер М.: Мир,1971, -247 с,

112. Easterbrook-Smith S.В.,Wallace I.C.,Keech D.B. Pyruvate carboxylase.Affinity labelling of magnesium adenosine triphosphate binding. Europ.J.Biochem., 1976,v.62,IT 1, p.125-130.

113. Bartmann P.,Hanke Т.,Holler E. Active site stoichiometry of L-phenylalanine : tRUA ligase from E.coli K-10. -J.Biol.Chem.,1975,v.250,N 19,p.7668-7674.

114. Yarus M.,Berg P. On the properties and filter assay in the study of isoleucyl-tRNA synthetase. Anal.Biochem.,1970, v.35,H 2,p.450-465.

115. Farrelly J.G.,Longworth J.M.»Stulberg M.P. The interaction of phenylalanyl transfer ribonucleic acid synthetase and phenylalanine transfer ribonucleic acid. J.Biol• Chem.,1971,v.246,N 5,p.1266-1270.

116. Schreier A.A.»Schimmel P.R. Transfer ribonucleic acid synthetase catalyzed deacylation of aminoacyl transfer ribonucleic acid in the absence of adenosine monophosphate and pyrophosphate. Biochemistry,1972,v.119,p.1582-1594.

117. Lemoine P.,Waller J.-P.»Rapenbusch R. Studies on methi-onyl transfer RITA synthetase.Purification and some properties of methionyl transfer RITA synthetase from E.coli. Europ.J.Biochem.,1968,v.4,N 2,p.213-221.

118. Ингибиторы ферментов и метаболизма.Общие принципы торможения./ Л.Уэбб М.: Мир,1966. -862 с.

119. ФавороЕа 0.0.,Парин А.В.,Лаврик О.И, Аминоацил-тИЖ-син-тетазы. В кн.: Итоги науки и техники.сер."биофизика",

120. M.»ВИНИТИ,1972,т.2,с. 6- 100.

121. Действие радиации на живые клетки./ Д.Б.Ли М. :Госатом~ издат,1963. - 288 с.

122. Ray W.J, ,Ir,Koshland D.E, A method for characterizing the,, type and numbers of groups involved in enzyme action, J. Biol. Chem,, 1961, v. 236,IT 7,p.121-127.

123. Horiike K.»McCormick D.B. Correlations between biological activity and the number of functional groups chemically modified. J.Theor.Biol,,1979,v,79,N 3»p.403-414.

124. Kitz R.,Wilson I.B. esters of methanesulfonic acid as irreversible inhibitors of acetylcholinesterase, J.Biol, Chem,,1962,v,237,N 10,p.3245-3249.

125. Knorre D.G, Stepwise tRITA recognition mechanism and kinetic consequences, FEBS Letters, 1975,v,58,11 1,p.50-52,

126. Krauss G.,Riesner D,,Maass G. Mechanism of tRïïA synthetase recognition :role of terminal A, Nucl.Acids Res., 1977,v.4,H 7,p.2253-2262.

127. Krauss G.,Von der Haar F.,Maass G. Conformational transitions of a tRNA aminoacyl tRITA synthetase complex induced by tRNAs bearing different modifications in the 3'-tenninus, - Biochemistry, 1979,v. 18,11 21,p.4755-4761.

128. Kosakowski M.H.,Bock A. The subunit structure of phenyl-alanyl-tRHA synthetase of E.coli. Europ.J.Biochem., 1970,v.12,rr 1, p. 67-73.

129. Irwin M.J.,Hyborg J.,Reid B.R. ,Blow D.M. The crystal structure of tyrosyl-transfer RUA synthetase at 2,7 A resolution. J.Mol.Biol.,1976,v.105,IT 4,p.577-586.

130. Bhat T.N.,Blow D.M.»Brick P.,Nyborg J. Tyrosyl-tRNA synthetase forms a mononucleotide binding fold. - J.Mol. Biol.,1982,v.158,H 4,p.699-709.

131. Monteilhet C.,Blow D.M. Binding of tyrosine,adenosine triphosphate and analogues to crystalline tyrosyl transfer RUA synthetase. J.Mol.Biol., 1978, v. 122,11 4,P.407-417.

132. Rubin J.,Blow D.M. Aminoacid activation in crystalline tyrosyl-tRHA synthetase from B.stearothermophilus.- J. M01.Biol.,1981,v.145,H 3,p.489-500.

133. Zelwer C.,Risler J.L.»Monteilhet C. A low -resolution model of crystalline methionyl-transfer RUA synthetase from E.coli. J.Mol.Biol.,1976,v.102,H 1 ,p.93-101.

134. Zelwer C.,Risler J.L.,Brunie S. Crystal Structure of E. coli methionyl-tRNA synthetase at 2,5 1 resolution. -J.Mol.Biol.,1982,v.155,H 1,p.63-81.

135. Dietrich A.,Giege R.,Comarmond M.B.»Thierry J.C.,Moras D. Crystallographic studies on the aspartyl-tRNA synthetase -tR!TAasp system from yeast.The crystalline aminoacyl -tRNA synthetase. J.Mol.Biol.,1980,v.138,IT 1,p.129-135.

136. Barker D.G.,Winter G. Conserved cysteine and histidine residues in the structures of the tyrosyl and methionyl-tRNA -synthetases. FEBS Letters,1982,v.145,N 2,p.191-193.

137. Keng T.,Webster T.A.,Sauer R.T.,Schimmel P. Gene for E. coli glycyl-tRNA synthetase has tandem subunit coding regions in the same reading frame. J.Biol.Chem.,1982,v. 257,IT 21,p. 12503-12508.

138. Putney S.D.,Royal H.J.,Vegvar H.U. ,Herlihy W.C.,Biemann K, Schimmel P. Primary structure of a large aminoacyl-tRNA synthetase. Science,1981,v.213,IT 4515,p.1497-1501.

139. Potier S.,Walter P.,Reinbolt J.,Boulanger Y. Structural studies on yeast aspartyl-tRITA synthetase:a comparison with other synthetases containing repeated sequences. -In: EMBO FEBS tRUA workshop,abstracts,Strasbourg,France, 1980.

140. Kanda M.,Hori K.,Kurotsu T.,Yamada Y.,Miura S.,Saito Y. Essential arginine residues in gramicidin S synthetase 1of Bacillus brevis. J.Biochein. ,1982,v.91 3,p.939-943.

141. Горшкова И.И.,Лаврик 0.И.Филиппов Б.В. Роль карбоксильных групп во взаимодействии фенилаланил-тРНК-синтетазы с субстратами. Молек.биол.,1981,т.15,^ I,с.62-70.

142. Kanda M.,Hori K.,Miura S.,Yamada Y.,Saito Y. A comparative study of essential arginine residues in gramicidin S Synthetase 2 and iBoleucyl-tRUA-synthetase. J.Biochem., 1982,v.92,N 6,p.1951-1957.

143. Mehler A.H.,Kim J.P.,01sen A.A. Specificity in the inac-tivation of enzymes by periodate-oxidized nucleotides. -Arch.Biochem.and Biopys.,1981,v.212,IT 2,p.475-482.

144. Власов В .В.,Лаврик 0 .И.,Мамаев С .В.,Ходырева С .Н ♦,Чижиков В,Е. .Швалье А.Ф. Модификация фенилаланил-тРНК-синте1. Pheтазы (E.coli)производными тРНК »несущими реакционноспо-собные группы на остатках гуанозина. Молек.биол.,1980, т.14,$ 3,с.531.

145. Безнедельная Н.И.,Горшкова И.И.,Лаврик О.И. Додарева С.Н. Аффинная модификация фенилаланил-тРНК-синтетазы из E.coli MRE-600 с помощью тРНК . - Биоорган. хим., I98I,t.7,J£ 6,с.876-883.

146. Renaud M.,Fasiolo P.,Baltzinger M.,Boulanger Y.,Remy P.

147. Bams R.J.,Keeoh D.B. The essential thiol group of sheep kidney mitochondrial phosphoenolpyruvate carboxykinase.-Biochim.et Biophys.Acta,1968,v.159,H 3,p.514-526.

148. Choong Y.S.»Shepherd M.G.»Sullivan P.A. Modification of lactate oxidase with diethylpyrocarbonate. Biochem.J., 1977,v.165,N 2,p.385-393.

149. Borders C.L.,Ir,Woolall M.L.»George A.L.,Ir. Essential arginyl residues in yeast enolase. Biochem.and Biophys. Res.Commun.,1978,v.82»N3,p.901-906.

150. Evelyn S.,Colman R.P. Chemical modification of enzymes: critical evaluation of the graphical correlation between residual enzyme activity and number of groups modifica-fied. Bull.Math.Biol,,1980,v.42,N 2,p.239-255.

151. Биосинтез белка: аминоацил-тРНК-синтетазы и тРНК./ Л.Л.Киселев ,0.0 .Фаворова »0 .И.Лаврик. M. :Наука,1984.

152. Hartley В.S. Structural studies of aminoacyl-tRNA synthetases. In : Transfer RNA : structure, properties and recognition. Cold Spring Harbor Laboratory,1979,p.223-234.