Разработка тест-систем на основе полимеразной цепной реакции для мониторинга вируса гриппа А тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Киреев, Дмитрий Евгеньевич

• Киреев, Дмитрий Евгеньевич
• кандидат биологических наук
• 2007

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Киреев, Дмитрий Евгеньевич

ВВЕДЕНИЕ

I. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

1.1. Характеристика вирусов гриппа

1.1.1. Классификация

1.1.2. Организация вириона и функции вирусных белков

1.1.3. Клинические признаки и патогенез

1.1.4. Эпизоотология и эпидемиология гриппа А

1.2. Диагностика гриппа А

1.2.1. Вирусологичекая диагностика

1.2.2. Серологическая диагностика

1.2.3. Обнаружение вирусного антигена

1.2.4. Молекулярная диагностика

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка тест-систем на основе полимеразной цепной реакции для мониторинга вируса гриппа А»

Актуальность темы.

Вирусы гриппа А распространены по всему миру, заражают многие виды диких и домашних птиц, большое количество различных видов млекопитающих и человека. Вследствие особенностей генома вирусам гриппа А свойственна чрезвычайно высокая изменчивость. Это позволяет им вызывать сезонные эпидемии среди людей, вспышки с высоким процентом смертности среди животных и птиц и иногда являться причиной пандемий [107].

Вирусы гриппа А согласно номенклатуре представлены сочетаниями 16 подтипов гемагглютинина (НА) и 9 подтипов нейраминидазы (NA) [34]. Естественным резервуаром вирусов гриппа А считаются птицы водного и околоводного комплексов. От птиц изолированы вирусы со всеми известными сочетаниями поверхностных белков: НА и NA. Среди людей обычно циркулируют вирусы с 3 подтипами гемагглютинина (Н1-НЗ) и двумя нейраминидазы (N1, N2). Иногда возникают случаи заражения вирусами гриппа А других подтипов (H5N1, H7N3, H7N7, H9N2) [108].

В настоящее время существует серьезная угроза возникновения новой пандемии среди людей, которая может быть вызвана вирусом гриппа А подтипа H5N1. В 1997 году в период вспыхнувшей эпизоотии в Гонконге впервые были зафиксированы случаи заражения человека вирусом гриппа подтипа H5N1, сопровождаемые высоким уровнем летальности: из 18 зараженных погибло 5 человек. Этот вирус, так называемый вирус "птичьего гриппа", в 2004 году стал причиной новых случаев заболевания в странах Азии, гибели 60 человек во Вьетнаме, Таиланде, Камбодже, Индонезии, и уничтожения 150 миллионов домашних птиц. В 2005 во время миграции диких птиц он распространился в северный Китай, Монголию, Тибет, Казахстан и Россию. В настоящее время вирус "птичьего гриппа" обнаруживается в странах Европы (Румыния, Греция), Ближнего Востока, Кавказского региона [108].

Необходимость мониторинга вируса гриппа А у птиц, человека и животных чрезвычайно велика. Вирусологические методы обнаружения вируса гриппа А (пассирование на куриных эмбрионах или на культуре клеток с последующей идентификацией в реакции гемагглютинации (РГА) или реакции торможения гемагглютинации (РТГА)) надежны и чувствительны, однако они довольно трудоемки и на их выполнение требуется от 1 до 2 недель [112].

За последнее десятилетие широкое распространение получили молекулярные методы диагностики гриппа А. Наиболее известные и эффективные - это методы полимеразной цепной реакции (ПЦР) и полимеразной цепной реакции в реальном времени. Принцип их работы основан на многократном умножении части генома инфекционного агента с последующей его идентификацией. Время анализа инфекционного материала такими методами снижается до одного дня, их чувствительность не уступает чувствительности традиционных методов [75]. В рекомендациях Всемирной Организации Здравоохранения о диагностике гриппа А метод полимеразной цепной реакции приравнен к традиционным методам и рекомендован для использования [113].

В настоящее время в мире существует ряд диагностических систем для обнаружения и типирования вирусов гриппа типа А на основе метода полимеразной цепной реакции. Недавно и в России начали появляться подобные наборы [7]. Однако вариабельность генома вируса гриппа вызывает серьезные проблемы при диагностике и иногда является причиной появления ложно отрицательных результатов. В связи с этим увеличение количества разработанных диагностикумов для обнаружения РНК вируса гриппа А увеличивает вероятность правильной и надежной диагностики.

Цель и задачи исследования.

Целью работы являлась разработка на основе полимеразной цепной реакции и полимеразной цепной реакции в реальном времени диагностических наборов для обнаружения и типирования вируса гриппа А и апробация их с образцами, полученными от различных видов птиц, животных и человека. Для достижения поставленной цели было необходимо решить следующие задачи:

1. Разработать детекционную систему ОТ-ПЦР для обнаружения вируса гриппа А на основе анализа нуклеотидных последовательностей гена нуклеопротеина.

2. Разработать детекционную систему ОТ-ПЦР для обнаружения и дифференциации вируса гриппа А подтипов Н5 и Н7 на основе анализа нуклеотидных последовательностей гена гемагглютинина.

3. Разработать систему ОТ-ПЦР для обнаружения вируса гриппа А подтипа Н5 с режимом получения результатов в реальном времени.

4. Сравнить чувствительность разработанных детекционных систем с традиционными методами обнаружения вируса гриппа и провести их тестирование с использованием имеющихся эталонных штаммов вируса гриппа А и полевых образцов от птиц.

5. С помощью разработанных тест-систем выявить распространенность вируса гриппа А на территории Российской Федерации в период с 2003 по 2006 гг.

Научная новизна и практическая значимость.

1. Разработана и внедрена детекционная система на основе ПЦР (ТУ 9388-004-42418073-05 от 06 декабря 2005 г.), позволяющая обнаруживать вирусы гриппа А любого подтипа и дифференцировать их от вирусов гриппа В и С, а также от других патогенов.

2. Разработана и внедрена детекционная система на основе множественной дифференцирующей ПЦР, позволяющая обнаруживать вирусы гриппа А подтипов Н5 и Н7 (ТУ 9388-002-42418073-05 от 06 декабря 2005 г.).

3. Разработана и внедрена детекционная система на основе ПЦР в реальном времени, позволяющая обнаруживать вирусы гриппа А подтипа Н5 (ТУ 9388-003-42418073-05 от 06 декабря 2005 г.).

4. Сравнительные результаты использования тестов для обнаружения вируса гриппа А методом ПЦР с вирусологическими методами свидетельствуют о возможности использования разработанных тест-систем для быстрого обнаружения вирусов гриппа А как в культуральном материале, так и в полевых образцах от птиц.

5. Выявлена распространенность вируса гриппа А на территории Российской Федерации и определена доля вирусов гриппа подтипов Н5 и Н7 в период с 2003 по 2006 гг.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Возможность обнаружения вируса гриппа А с помощью разработанного теста на основе ПЦР.

2. Возможность обнаружения вируса гриппа А подтипов Н5 и Н7 и одновременной их дифференциации с помощью разработанного теста на основе ПЦР.

3. Возможность обнаружения вируса гриппа А подтипа Н5 с помощью разработанного теста на основе ПЦР в реальном времени; повышение экспрессности метода по сравнению с "гнездовой" ПЦР при сохранении достаточной чувствительности для детекции вируса в образцах от клинически больных птиц.

4. Чувствительность разработанных тестов на основе ПЦР соответствует чувствительности методов изоляции вируса гриппа; возможность применения разработанных тестов для обнаружения вируса гриппа А в образцах от диких и домашних птиц.

5. Возможность использования детекционных систем на основе "гнездовой" ПЦР для мониторинга вируса гриппа А с определением доли вирусов гриппа подтипов Н5 и Н7.

Апробация работы.

Результаты диссертационной работы были доложены и обсуждены на совместном заседании отдела молекулярной биологии и апробационного совета ГУ НИИ вирусологии им. Д. И. Ивановского РАМН 21 июня 2007 г.

Публикации.

По материалам диссертации опубликовано 6 статей и 4 тезисов.

Объем и структура диссертации.

Материалы диссертации изложены на 115 страницах машинописного тескта. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, изложения собственных результатов и их обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы, включающего 119 источников. Работа содержит 10 таблиц и 12 рисунков.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Киреев, Дмитрий Евгеньевич

V. ВЫВОДЫ

1. Показана эффективность разработанного теста на основе "гнездовой" ПЦР для выявления вируса гриппа А в образцах диких и домашних птиц. При исследовании полевых образцов от птиц, собранных с 2003 по 2006 гг. в девяти областях Российской Федерации, процент положительных проб составил 19,1% в отсутствие и 38,4% во время эпизоотий, вызванных вирусами гриппа А.

2. Установлена эффективность разработанного теста на основе "гнездовой" ПЦР для обнаружения и дифференциации вирусов гриппа А подтипов Н5 и Н7. Распространенность вирусов гриппа А подтипов Н5 и Н7 в отсутствие эпизоотий за период исследования составила 9,4% и 7,4% соответственно. Во время возникновения эпизоотических вспышек, вызванных вирусами гриппа А/Н5 положительные пробы составили 51,9% от общего числа исследованных.

3. Установлено, что чувствительность разработанных тестов на основе "гнездовой" ПЦР соответствует чувствительности вирусологических методов.

4. Разработан тест для выявления вирусов гриппа А подтипа Н5 методом ПЦР в реальном времени; повышена экспрессность проведения анализа в сравнении с "гнездовой" ПЦР.

5. Чувствительность теста на основе ПЦР в реальном времени уступает чувствительности тестов на основе "гнездовой" ПЦР, однако достаточна для обнаружения вируса в образцах от клинически больных птиц.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Киреев, Дмитрий Евгеньевич, 2007 год

1. Всемирная Организация Здравоохранения. Грипп // Информационный бюллетень №211, пересмотренный бюллетень за март 2003 г. Документ доступен по адресу http://www.who.int/rnediacentre/factsheets/fs211/ги/.

2. Грипп птиц: происхождение инфекционных биокатастроф / сб. статей. / Рос. акад. мед. наук; [редкол.: акад. РАМН В. И. Покровский и др.]. Препринт. СПб.: Росток, 2006. - 270 е.: ил. - (Эпидемии XXI века).

3. Грипп: Руководство для врачей / под ред. Г. И. Карпухина. СПб.: Гиппократ, 2001. - 360 с.

4. Деева Э. Г., Еропкин М. Ю., Григорьева В. А. и др. Эпизоотии гриппа птиц как манифестация пандемии // Журн. микробиол. 2006. - №1. - С. 81-87.

5. Каверин Н. В., Смирнов Ю. А. Межвидовая трансмиссия вирусов гриппа А и проблема пандемий // Вопросы вирусологии. 2003. - № 3. - С. 4-10.

6. Сюрин В. Н., Самуйленко А. Я., Соловьев Б. В., Фомина Н. В. Вирусные болезни животных // Москва, ВНИТИБП, 928 с, ил.

7. Шипулин Г. А., Обухов И. JI., Панин А. Н. Разработака и апробация ПЦР-тест-систем для выявления вируов гриппа птиц // Рос. Мед. Вести. -2006.-№1.-С. 60-61.

8. Avian Influenza A (H5N1) Infection in Humans. The Writing committee of the WHO Cunsultqtion on Human Influenza A/H5 // The New England J. of Medicine. September 29, 2005. - Vol. 353. - P. 1374-1385.

9. Banks J., Speidel E. C., McCauley J. W., and Alexander D. J. Phylogenetic analysis of influenza H7 haemagglutinin subtype influenza A viruses // Archives of Virology.- 2000. -Vol. 145.-P. 1047-1058.

10. Banks J., Speidel E. S., Moore E., et al. Changes in the haemagglutinin and the neuraminidase genes prior to the emrgence of highly pathogenic H7N1 avian influenza viruses in Italy // Arch, of Virol. 2001. - Vol. 146. - P. 963-973.

11. Bean W. J., Kawaoka Y., Wood J. M. et al. Characterization of virulent and avirulent A/Chicken/Pensylvania/83 influenza A viruses: potential role of defective interfering RNAs in nature // J. Virol. 1985. - Vol. 54. - P. 151-160.

12. Beare A. S. and Webster R. G. Replication of avian influenza viruses in humans // Archives of Virology. 1991. - Vol. 119. - P. 37-42.

13. Beattie K. L. Microfabricated, flowthrough porous apparatus for discrete detection of binding reactions // U.S. patent 5,843,767. 1998.

14. Bellau-Pujol S., Vabret A., Legrand L., et al. Development of three multiplex RT-PCR assays for the detection of 12 respiratory RNA viruses // J. of Virol. Methods. 2005. - Vol. 126. - P. 53-63.

15. Brown I. H. Advances in molecular diagnostics for avian influenza // Dev. Biol. (Basel). 2006. - Vol. 124. - P. 93-97.

16. Bui M., Whittaker G. and Helenius A. Effect of Ml protein and low pH on nuclear transport of iinfluenza virus ribonucleoproteins // J. Virol. 1996. - Vol. 70.-P. 8391-8401.

17. Campbell С. H., Webster R. G. and Breese S. S. Fowl plague virus from man // J. of Infect. Diseases. 1970. - Vol. 122. - P. 513-516.

18. Capua I., and Alexander D. J. Avian influenza: recent developments // Av. Pathol. 2004. - Vol. 33. - P. 393-404.

19. Cattoli G., Drago A., Maniero S., et al. Comparison of three rapid detection systems for type A influenza virus on tracheal swabs of experimentally and naturally infected birds // Avian Pathology. August 2004. - Vol. 33(4). - P. 432-437.

20. Chan К. H., Maildeis N., Pope W., et al. Evaluation of the Directigen Flu A+B test for rapid diagnosis of influenza virus type A and В infections // J. Clin. Microbiol. 2002. - Vol. 40(5). - P. 1675-1680.

21. Chan P. К. Outbreak of avian influenza A(H5N1) virus infection in Hong Kong in 1997 // Clin. Infect. Dis. 2002. - Vol. 34, suppl. 2. - P. S58-S64.

22. Chizhikov V., Wagner M., Ivshina A., et al. Detection and genotyping of human group A rotaviruses by oligonucleotide microarray hybridization // J. Clin. Microbiol. 2002. - Vol. 40. - P. 2398-2407.

23. Chotpitayasunondh Т., Ungchusak K., Hanshaoworakul W., et al. Human disease from influenza A (H5N1), Thailand, 2004 // Emerg. Infect. Dis. 2005. -Vol. 11.-P. 201-209.

24. Cross K. J., Burleigh L. M., Steinhauer D. A. Mechanism of cell entry by influenza viruses // Expert review in molecular medicine. http://www-ermm.cbcu.cam.ac.uk.

25. Donofrio J. C., Coonrod J. D., Davidson J. N., and Betts R. F. Detection of influenza A and В in respiratory secretion with the polymerase chain reaction // PCR Methods Appl. 1992. - Vol. 1. - P. 262-268.

26. Ellis J. S., Zambon M. C. Combined PCR-Heteroduplex Mobility Assay for Detection and Differentiation of Influenza A Viruses from Different Animal Species // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39(11). - P. 4097-4102.

27. Ellis J. S., Zambon M. C. Molecular diagnosis of influenza // Rev. Med. Virol. 2002. - Vol. 12. - P. 375-389.

28. Englund L., Klingeborn В., Mejerland Т. Avian influenza A virus causing an outbreak of contagious interstitial pneumonia in mink // Acta Vet. Scand. -1986. Vol. 27(4). - P. 497-504.

29. Fauquet С. M., Mayo M. A., Maniloff J., et al. Virus taxonomy, eighth report // Elsevier. 2005. - P. 681-693.

30. Fouchier R. A. M., Bestebroer Т. M., Herfst S., et al. Detection of influenza A viruses from different species by PCR amplification of conserved sequences in the matrix gene // J. Clin. Microbiol. 2000. - Vol. 38. - P. 40964101.

31. Fouchier R. A. M., Munster V., Wallensten A., et al. Characterization of a novel influenza A virus hemagglutinin subtype (HI6) obtained from black-headed gulls // J. Virol. 2005. - Vol. 79. - P. 2814-2822.

32. Garcia M., Crawford J. M., Latimer J. W., et al. Heterogeneity in the haemagglutinin gene and emergence of the highly pathogenic phenotype among recent H5N2 avian influenza viruses from Mexico // J. of Gen. Virol. 1996. -Vol. 77.-P. 1493-1504.

33. Gavin P. J., Thompson R. B. Jr. Review of Rapid Diagnostic Tests for Influenza// Clin. And Appl. Immunol. Reviews. -2003. Vol. 4. - P. 151-172.

34. Geraci J. R., St. Aubin D. J., Barker I. K., et al. Mass mortality of harbor seals: pneumonia associated with influenza A virus // Science. 1982 Feb. 26. -Vol. 215(4536).-P. 1129-1131.

35. Guo Y., Wang M., Kawaoka Y., et al. Characterization of a new avian-like influenza A virus from horses in China // Virology. 1992 May. - Vol. 188(1). -P. 245-255.

36. Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucl. Acids. Symp. Ser. 1999. -Vol. 41.-P. 95-98.

37. Heid C.A. Real-time quantitative PCR // Genome Res. 1996. - Vol. 6. -P. 986-994.

38. Hien Т. Т., Liem N. Т., Dung N. Т., et al. Avian influenza A (H5N1) in 10 patients in Vietnam // The new England J. of Medicine. 2004. - Vol. 350. - P. 1179-1188.

39. Hinshaw V. S., Bean W. J., Geraci J, et al. Characterization of two influenza A viruses from a pilot whale // J. Virol. 1986 May. - Vol. 58(2). - P. 655-656.

40. Horimoto Т., Rivera E., Pearson J., et al. Origin and molecular changes associated with emergence of a highly pathogenic H5N2 influenza virus in Mexico//Virology.- 1995 Okt. 20.-Vol. 213(1).-P. 223-230.

41. Huang X., Liu Т., Muller J., et al. Effect of influenza virus matrix protein and viral RNA on ribonucleoprotein formation and nuclear export // Virology. -2001.-Vol. 287.-P. 405-416.

42. Hughes M. Т., McGregor M., Suzuki Т., et al. Adaptation of influenza A viruses to cells expressing low levels of sialic acid leads to loss of neuraminidase activity // J. Virol. 2001. - Vol. 75. - P. 3766-3770.

43. Imai M., Ninomiya A., Minekawa H., et al. Development of H5-RT-LAMP (loop-mediated isothermal amplification) system for rapid diagnosis of H5 avian influenza virus infection // Vaccine. 2006. - Vol. 24. - P. 6679-6682.

44. Ito M., Watanabe M., Nakaqawa N., et al. Rapid detection and typing of influenza A and В by loop-mediated isothermal amplification: comparison with immunochromatography and virus isolation // J. Virol. Methods. 2006. - Vol. 135.-P. 272-275.

45. Keawcharoen J., Oraveerakul K., Kuiken Т., et al. Avian influenza H5N1 in tigers and leopards // Emerg. Infect. Dis. 2004. - Vol. 10. - P. 2189-2191.

46. Kessler N., Ferraris O., Palmer K., et al. Use of the DNA Flow-Thru chip, a three-dimensional biochip, for typing and subtyping of influenza viruses // J. Clin. Microbiol. -2004.-Vol. 32.-P. 2173-2185.

47. Klopfleisch R., Werner O., Mundt E., et al. Neurotropism of highly pathogenic avian influenza virus A/chicken/Indonesia/2003(H5Nl) in experimentally infected pigeons (Columbia livia f. domestica) // Vet. Pathology. 2006. - Vol. 43. - P. 463-470.

48. Koopmans M., Fouchier R., Wilbrink В., et al. Update on human infections with highly pathogenic avian influenza virus A/H7N7 during an outbreak in poultry in The Netherlands // Eurosurveillance Weekly. 2003. -Vol. 7.-P. 1-5.

49. Koopmans M., Wilbrink В., Conyn M., et al. Transmission of H7N7 avian influenza A virus to human beings during a large outbreak in commercial poultry farms in the Netherlands // Lancet. 2004. - Vol. 363. - P. 582-583.

50. Kurtz J., Manvell R. J. and Banks J. Avian influenza virus isolated from a woman with conjunctivitis // Lancet. 1996. - Vol. 348. - P. 901-902.

51. Lau L. Т., Banks J., Aherne R., et al. Nucleic acid sequence-based amplification methods to detect avian influenza virus // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004. - Vol. 313. - P. 336-342.

52. Lee C. W., Suarez D. L. Application of real-time RT-PCR for the quantitation and competitive replication study of H5 and H7 subtype avian influenza virus//J. Virol. Methods. 2004. - Vol. 119.-P. 151-158.

53. Leonardi G. P., Leib H., Birkhead G. S., et al. Comparison of rapid detection methods for influenza A virus and their value in health-care management of institutionalized geriatric patients // J. Clin. Microbiol. 1994. -Vol. 32(1).-P. 70-74.

54. Li J., Chen S., and Evans D. H. Typing and subtyping influenza virus using DNA microarrays and multiplex reverse transcriptase PCR // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39. - P. 696-704.

55. Lipshutz R. J., Fodor S. P., Ginderas T. R., and Lockhart D. J. High density synthetic oligonucleotide arrays // Nat. Genet. 1999. - Vol. 21. - P. 2024.

56. Li S., Orlich M. A. and Rott R. Generation of seal influenza virus variants pathogenic for chickens, because of hemagglutinin cleavage site changes // J. of Virol. 1990. - Vol. 64. - P.3297-3303.

57. Lodes M. J., Suciu D., Elliott M., et al. Use of semiconductor-based oligonucleotide microarrays for influenza A virus subtype identification and sequencing // J. Clin. Microbiol. 2006. - Vol. 44. - P. 1209-1218.

58. Martin K., and Helenius A. Nuclear transport of influenza virus nucleoproteins. The viral matrix protein (Ml) promotes export and inhibits import // Cell. 1991. - Vol. 67. - P. 117-130.

59. Momose F., Basler C. F., O'Neill R. E., et al. Cellular splicing factor RAF-2p48/NPI-5/BATl/UAP56 interacts with the influenza virus nucleoprotein and enhances virus RNA synthesis // J. Virol. 2001. - Vol. 75. - P. 1899-1908.

60. Moore C., Hibbitts S., Owen N., et al. Development and evaluation of a real-time nucleic acid sequence based amplification assay for rapid detection of influenza A // J. Med. Virol. 2004. - Vol. 74. - P. 619-628.

61. Mosley V. M., and Wycoff R. W. G. Electron microscopy of the virus of influenza//Nature. 1946.-Vol. 157.-P. 263.

62. Munch M., Nielsen L. P., Handberg K. J., and Jorgensen P. H. Detection and subtyping (H5 and H7) of avian type A influenza virus by reverse transcription-PCR and PCR-ELISA // Arch. Virol. 2001. - Vol. 146. - P. 8797.

63. Nicholson K. G., Wood J. M., Zambon M. Influenza // Lancet. 2003. -Vol. 362.-P. 1733-1745.

64. Onodera K., and Melcher U. VirOligo: a database of virus-specific oligonucleotides //Nucl. Ac. Res. 2002. - Vol. 30. - P. 203-204.

65. Oxburgh L., Hagstrom A. A PCR based method for the identification of equine influenza virus from clinical samples // Vet. Microbiol. 1999. - Vol. 67. -P. 161-174.

66. Patterson S., Gross J., and Oxford J. S. The intercellular distribution of influenza virus matrix protein and nucleoprotein in infected cells and their relationship to hemagglutinin in the plasma membrane // J. Gen. Virol. 1988. -Vol. 69.-P. 1859-1872.

67. Peiris M., Yam Y. C., Chan К. H., et al. Influenza A H9N2: aspects of laboratory diagnosis // J. of Clin. Microbiol. 1999. - Vol. 37. - P. 3426-3427.

68. Poon L. L. M., Leung C. S. W., Chan К. H., et al. Detection of human influenza A viruses by loop-mediated isothermal amplification // J. Clin. Microbiol. 2005. - Vol. 43. - P. 427-430.

69. Puppe W., Weigl J. A. I., Aron G., et al. Evaluation of a multiplex reverse transcriptase PCR ELISA for the detection of nine respiratory tract pathogens // J. of Clin. Virol. 2004. - Vol. 30. - P. 165-174.

70. Quilivan M., Cullinane A., Nelly M., et al. Comparison of Sensitivities of Virus Isolation, Antigen Detection and Nucleic Acid Amplification for Detection of Equine Influenza Virus // J. Clin. Microbiol. 2000. - Vol. 42. - P. 759-763.

71. Ray C. G., Minnich L. L. Efficiency of immunofluorescence for rapid detection of common respiratory viruses // J. Clin. Microbiol. 1987. - Vol. 25(2).-P. 355-357.

72. Roberts P. C., Lamb R. A., and Compans R. W. The Ml and M2 proteins of influenza A virus important determinants in filamentous particle formation // Virology. 1998.-Vol. 240.-P. 127-137.

73. Rohm С., HorimotoT., Kawaoka Y., et al. Do hemagglutinin genes of highly pathogenic avian influenza viruses constitute unique phylogenetic lineages? // Virology. 1995. - Vol. 209. - P. 664-670.

74. Rott R. The pathogenic determinan of influenza virus // Vet. Microbiol. -1992.-Vol. 33.-P. 303-310.

75. Ruigrok R. W., Barge A., Durrer P., et al. Membrane interaction of influenza virus Ml protein // Virology. 2000. - Vol. 267. - P. 289-298.

76. Saunders N.A. Quantitative real-time PCR // In: Edwards, K., Logan, J., Saunders, N. (Eds.), Real-Time PCR, An Essential Guide, Horizon Bioscence, Wymondham. 2004.

77. Scholtissek C., Bachmann P. A., Hannoun C. Genetic relatedness of hemagglutinins of the HI subtype of influenza A viruses isolated from swine and birds // Virology. 1983. - Vol. 129. - P. 521-533.

78. Sengupta S., Onodera K., Lai A., and Melcher U. Molecular detection and identification of influenza viruses by* oligonucleotide microarray hybridization // J. Clin. Microbiol. 2003. - Vol. 41. - P. 4542-4550.

79. Senne D. A., Suarez D. L., Stallnecht D. E., et al. Ecology and epidemiology of avian influenza in Northand South America // OIE/FAO Int. Scient. Conf. on Av. Infl., Basel, Karger. 2006. - Vol. 124. - P. 37-44.

80. Soares P. В. M., Demetrio C., Sanfilippo L., et al. Standardization of a duplex RT-PCR for the detection of influenza A and Newcastle disease virases in migratory birds//J. of Virol. Methods.-2005.-Vol. 123.-P. 125-130.

81. Spackman E., Senne D. A., Myers T. J., et al. Development of a Real-Time Reverse Transcriptase PCR Assay for Type A Influenza Virus and the Avian H5 and H7 Hemagglutinin Subtypes // J. Clin. Microbiol. 2002. - Vol. 40(9). - P. 3256-3260.

82. Stallknecht E. D. Ecology and epidemiology of avian influenza virus in wild bird populations: waterfowl, shorebirds, pelicans, cormorants, etc. // Proc.4th intern, symp. on avian influenza. May 29-31, 1997, Athens, USA. - P. 6167.

83. Stamboulian D., Bonvehi P. E., Nacinovich F. M., Cox N. Influenza // Infect. Dis. Clin. North. Am. 2000 March. - Vol. 14. - P. 141-166.

84. Steinhauer D. A., Skehel J. J. Genetics of influenza viruses // Annu. Rev. Genet. 2002. - Vol. 36. - P. 305-332.

85. Stieneke-Grober A., Vey M., Angliker H., et al. Influenza virus hemagglutinin with multibasic cleavage site is activated by furin, a subtilisin-like endoprotease // EMBO Journal. 1992. - Vol. 11. - P. 2407-2414.

86. Stone В., Burrows J., Schepetuik S., et al. Rapid detection and simultaneous subtype differentiation of influenza A viruses by real time PCR // J. Virol. Methods.-2004.-Vol. 117.-P. 103-112.

87. Sugrue R. J., Bahadur G., Zambon M. C., et al. Specific structural alteration of the influenza haemagglutinin by amantadine // EMBO J. 1990. -Vol. 9.-P. 3469-3476.

88. Takao S., Shimazu Y., Fukuda S., et al. Neuraminidase subtyping of human influenza A virusesby RT-PCR and its application to clinical isolates // Jpn. J. Infect. Dis. 2002. - Vol. 55. P. 204-205.

89. Tam J. S. Influenza A (H5N1) in Hong Kong: an overview // Vaccine. -2002. Vol. 20 suppl. 2. - P. S77-S81.

90. Taylor H. R. and Turner A. J. A case report of fowl plague keratoconjunctivitis // British J. of Ophthalmology. 1977. - Vol. 61. - P. 86-88.

91. Townsend M. В., Dawson E. D., Mehlmann M., et al. Experimental Evaluation of the FluChip Diagnostic Microarray for Influenza Virus Surveillance // J. Clin. Microbiol. 2006. - Vol. 44(8). - P. 2863-2871.

92. Ungchusak K., Auewarakul P., Dowell S. F., et al. Probable person-to-person transmission of avian influenza A (H5N1) // The New England J. of Madicine. 2005. - Vol. 352. - P. 333-340.

93. Wang D., Coscoy L., Zylberberg M, et al. Microarray-based detection and genotyping of viral pathogens // Proc. Natl. Acad. Sci USA. 2002. - Vol. 99. -P. 15687-15692.

94. Webster R. G., Geraci J. R., Petursson G., and Skirnisson K. Conjunctivitis in human being caused by influenza A virus of seals // New England J. of Medicine. -1981.- Vol. 304. P. 911.

95. Webster R. G. Influenza: an emerging disease // Emerg. Infect. Dis. -1998.-Vol. 4.-P. 436-441.

96. Webster R. G., Yahno M. A., Hinshaw V. S. et al. Intestinal influenza: replication and characterization of influenza viruses in ducks // Virology. 1978. -Vol. 84.-P. 268-278.

97. Webster R. Influenza: an emerging disease. http://www.cdc.ncidod/eid/vol4no3/Webster.html.

98. Wong S. S. Y., and Yuen K. Y. Avian influenza virus infections in humans //Chest.-2006.-Vol. 129.-P. 156-168.

99. Woolcock P. R., Mcfarland M. D., Lai S., and Chin R. P. Enchanced recovery of avian influenza virus isolates by a combination of chicken embryo inoculation methods // Avian Dis. 2001. - Vol. 45. - P. 1030-1035.

100. World Health Organization. Avian influenza: assessing the pandemic threat // WHO, January, document 2005-WHO/CDS/2005.29 available at http://www.who.int/csr/disease/avianinfluenza/Assessing pandemic threat RU S.pdf.

101. World Health Organization. Cumulative Number of Confirmed Human Cases of Avian Influenza A/(H5N1) Reported to WHO // 12 January 2007, document available at http://www.who.int/csr/disease/avian influenza/country/casestable200701l 2/en/index.html.

102. World Health Organization. Recommended laboratory tests to identify avian influenza A virus in specimens from humans // WHO, Geneva, June 2005, document available at http://www.who.int/csr/disease/avian influenza/guidelines/avian Iabtests2.pdf.

103. World Health Organization. WHO inter-country consultation: influenza A/H5N1 in humans in Asia // WHO, Manilla, Philippines, 6-7 May 2005, document available at http://www.who.int/csr/resources/publications/influenza/WHOCDS CSR GIP 2005 7 04.pdf.

104. Wright К. E., Wilson G. A. R., Novosad D. Typing and subtyping of influenza viruses in clinical samples by PCR // J. of Clin. Microbiol. 1995. -Vol. 33.-P. 1180-1184.

105. Yang P., Bansal A., Liu C., et al. Hemagglutinn specificity and neuraminidase coding capacity of neuraminidase-deficient influenza viruses // Virology. 1997. - Vol. 229. - P. 155-165.

106. Yuen K. Y., Chan P. K., Peiris M., et al. Clinical features and rapid viral diagnosis of human disease associated with avian influenza A H5N1 virus // Lancet. 1998. - Vol. 351. - P. 467-471.

107. Zambon M. C. Epidemiology and pathogenesis of influenza // J. of Antimicrobial Chemotherapy. 1999. - Vol. 44. - P. 3-9.

108. Zammatteo N., Hamels S., De Longueville F., et al. New chips for molecular biology and diagnostics // Biotechnol. Annu. Rev. 2002. - Vol. 8. -P. 85-101.

109. Zhirnov O. P. Isolation of matrix protein Ml from influenza viruses by acid-dependent extraction with nonionic detergent // Virology. 1992. - Vol. 186.-P. 324-330.

110. Переплетено ООО «Цифровичок» [phone]; [phone] www.cfr.ru [e-mail]