Разработка моделей и методов численного моделирования структуры полимеризующихся оксидных расплавов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 05.13.18, кандидат технических наук Григорьева, Мария Александровна

• Григорьева, Мария Александровна
• кандидат технических наук
• 2010

Оглавление диссертации кандидат технических наук Григорьева, Мария Александровна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОСНОВЫ КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ СВОЙСТВ И СТРУКТУРЫ ПОЛИМЕРИЗУЮЩИХСЯ СИСТЕМ.

1.1. Уровни приближений при моделирования свойств полимеризующихся оксидных систем.

1.2. Методы моделирования полимеризующихся систем на молекулярном уровне.

1.2.1. Неэмпирические методы.

1.2.2. Полуэмпирические методы.

1.2.3. Метод молекулярной механики.

1.3. Методы моделирования полимеризующихся систем на уровне многоатомных кластеров.

1.3.1. Молекулярно-статистические методы.

1.3.2. Метод молекулярной динамики.

1.3.3. Модели оксидных систем с разными потенциалами.

1.4. Методы статистико-геометрического моделирования структуры многочастичных систем.

1.3.1. Метод Вор оного-Дел оне.

1.3.2. Экспериментальные основания применения полимерной теории при исследовании полимеризующихся систем.

1.5. Обзор программных комплексов для моделирования методом молекулярной динамики.

1.6. Выводы.

ГЛАВА 2. МОДЕЛИ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ СТРУКТУРЫ И СТРУКТУРОЧУВСТВИТЕЛЬНЫХ СВОЙСТВ ПОЛИМЕРИЗУЮЩИХСЯ МНОГОКОМПОНЕНТНЫХ ОКСИДНЫХ СИСТЕМ.

2.1. Классы математических моделей полимеризующихся систем в прогрммном комплексе «МЕ)8ЬАОМЕЬТ».

2.1.1.Модели межчастичного взаимодействия в оксидном расплаве.

2.1.2.Молекулярно-динамическая модель.

2.1.3.Модели физико-химических свойств.

2.2. Модели структуры полимеризующегося оксидного расплава.

2.2.1. Построение множеств вершин на основе неоднородного дескриптора.

2.2.2. Выделение звезд характеристических вершин.

2.2.3. Формирование связных графов «второго уровня».

2.2.4. Поиск плоскостных колец в связных графах «второго уровня».

2.2.5. Разработка алгоритмов для моделирования структуры полимериузющегося оксидного расплава.

2.2.6. Модель структурочувствительных свойств.

2.3. Выводы.

ГЛАВА 3. РАЗРАБОТКА ПРОГРАММНОГО КОМПЛЕКСА ДЛЯ АВТОМАТИЗАЦИИ ПРОВЕДЕНИЯ КОМПЬЮТЕРНЫХ ЭКСПЕРИМЕНТОВ И МОДЕЛИРОВАНИЯ СТРУКТУРЫ.

1.1. Требования к архитеюуре программного комплекса «MDSLAGMELT» . 69 3.1.2. Компоненты программного комплекса и их назначение.

3.2. Разработка модуля «STRUCTURE» для моделирования структуры оксидного расплава.

3.3. Разработка модели удаленного взаимодействия для программного комплекса.

3.3.1. Обзор инструментов разработки web-приложений, поддерживающих технологию «continuations».

3.3.2. Архитектура среды публикации динамического XML-контента Apache Cocoon 2.1.

3.4. Реализация web-приложения для программного комплекса.

3.4.1. Блоки информационных ресурсов web-приложения.

3.4.2. Разработка модуля ввода начальных условий эксперимента.

3.4.3. Разработка модуля формирования отчетов по компьютерным экспериментам.95

3.4.4. Реализация системы аутентификации пользователей на основе технологии Cocoon Authentication Framework.

3.5. Разработка информационной модели оксидного расплава.

3.5.1. Формирование отчета для исследования свойств состава при изменении температуры.

3.5.2. Формирование отчета для анализа изменения свойств конкретного состава в рамках заданного температурного диапазона.

3.6. Выводы.

ГЛАВА 4. РЕЗУЛЬТАТЫ МОДЕЛИРОВАНИЯ ДВУХКОМПОНЕНТНОЙ СИСТЕМЫ SI02-NA20.

4.1. Параметры потенциальных функций для объектов исследования.

4.2. Параметры молекулярно-динамического моделирования.

4.3. Термодинамические параметры и кинетические коэффициенты.

4.4. Параметры моделирования структуры.

4.5. Структурные характеристики ближнего порядка.

4.6.1. Возможности дальнейшего развития исследования структуры по среднему фактору связности структурного каркаса.

4.7. Выводы.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка моделей и методов численного моделирования структуры полимеризующихся оксидных расплавов»

Вычислительный (компьютерный) эксперимент (КЭ) наряду с теорией и натурным экспериментом является одним из трех «китов», на которых в настоящее время стоит мировая наука. Значение КЭ особенно велико в тех областях, где имеется большой разрыв между возможностями теории и эксперимента, в том числе в физической химии и металлургии, где он часто оказывается единственным способом изучения рассматриваемых процессов.

Стремительное развитие современной техники требует от исследователей и технологов создания новых материалов с заданным и управляемым комплексом свойств, а также улучшения эксплуатационных характеристик уже существующих. Эффективный путь решения этой задачи заключается в создании теоретического фундамента, который аккумулирует информацию об условиях образования фаз и температурно-концентрационных интервалах их термодинамической и термической стабильности, а также о влиянии химического и фазового состава и внешних условий на структуру и уровень эксплуатационных характеристик материалов. Создание этого фундамента является первоочередной задачей физической химии. Для этих целей создаются автоматизированные информационные системы (АИС) и программные комплексы, обеспечивающие исследователей в областях металлургии, материаловедения и физической химии инструментами, которые расширяют границы исследований, оптимизируя научную работу и ускоряя проведение исследований. В основе автоматизированных систем научной информации (АСНИ), в том числе систем автоматизации вычислительного эксперимента (САВЭ), лежат методы компьютерного моделирования, позволяющие с различной степенью адекватности описывать свойства реальных физических объектов. В России разработка АСНИ является одним из основных направлений федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технического комплекса России на 2007-2012 гг.» [45].

Одним из приоритетных направлений в физической химии и технологии неорганических материалов является создание новых металлических материалов с заранее заданными свойствами. Эти свойства во многом определяются характеристиками расплава, его жидких фаз - металла и шлака и закономерностями обменных взаимодействий на границе их раздела. Основа большинства металлургических шлаков - оксидные расплавы, относятся к типу неупорядоченных сильновзаимодействующих полимеризующихся систем, большинство свойств которых является сфуктурочувствительными. Поэтому исследования взаимосвязей структуры и физико-химических свойств указанных объектов являются крайне аюуальными.

Исследование свойств оксидов является чрезмерно трудоемкими, либо принципиально невозможно из-за высокой агрессивности сред по отношению к измерительным ячейкам, химического взаимодействия между расплавами и остальной средой, высокими температурами плавления и т. д.

В этой связи создание и использование математических моделей для прогнозирования свойств материалов является одним из основных путей интенсификации научных исследований и может внести большой вклад в исследование оксидных расплавов.

Рядом авторов (В .1.АЫег[72], А.Н.Лагарьковым[50], Ь.Уег1е1[133], Б.Веешап[76], Ы.\У.Носкпеу[67] и др.) предложены методы моделирования сильновзаимодействующих систем. Применение этих методов в наукоемких разработках (Т.Р.8ои1ез[126], 8.К.Мйга[112], Д.К.Белащенко[7], Л.И. Вороновой[17], П.Ф.Зильбермана, и др.) позволяет исследовать системы 103-104 частиц. Однако соответствующие программные пакеты малодоступны для широкого круга исследователей. Такие МД-пакеты как 8а§еМ02[122], НурегСИет[102], ХМБ[143] и др. позволяют осуществлять моделирование систем 106 частиц. Большая часть программ обеспечивают высокоскоростные параллельные вычисления.

Как правило, в результате МД-эксперимента получают файлы координат и скоростей, размером в несколько гигабайт, по которым, путем статистической обработки строят функции радиального распределения, а также рассчитывают термодинамические параметры (температура, давление, теплоемкость) и коэффициенты диффузии.

Однако, для реальных нужд, существенно более важными являются транспортные свойства, которые относятся к классу структурочувствительных. При моделировании оксидных расплавов необходимо учитывать, что их специфические особенности (большие значения вязкости, характер электро- и теплопроводности, экспоненциальная зависимость коэффициентов переноса от температуры), связаны со структурной неоднородностью среднего порядка и медленно развивающимися процессами, происходящими между полианионными комплексами, объединяющими от нескольких до сотен или тысяч частиц с ионно-ковалентными связями.

Для теоретического обоснования и предсказания поведения и свойств полимеризующихся сильновзаимодейстующих оксидных систем на основе данных МД-эксперимента необходимо создание моделей, описывающих структуру среднего порядка (наностуктуру) расплава, что требует разработки математического формализма, обобщающего уже существующие модели на неоднородный уровень, совокупности специфических вычислительных методов и алгоритмов высокого уровня сложности. При этом важен обоснованный выбор, формулировка и оценка параметров модели, особенно учитывая сложность объектов и обилие параметров, определяющих ход, а также трудности управления процессами.

Широкое применение математических методов и компьютерных технологий в решении задач моделирования связи между строением вещества и его физико-химическими свойствами включает несколько основных аспектов:

- разработка методов количественного описания структуры вещества, т.е. методов преобразования структуры в набор численных дескрипторов, связанных с определенными свойствами;

- разработка математических моделей установления количественной связи между этими дескрипторами и физико-химическими свойствами;

- программные средства, реализующие используемые модели;

- базы данных, содержащие экспериментальные данные для проверки эффективности тех или иных моделей и выбранного способа описания, а также для исследования теоретических значимых корреляций «структура-свойство»^].

В настоящее время научной группой под руководством профессора Вороновой Л.И. ведется разработка программного комплекса с удаленным доступом «МО8ЬАОМЕЬТ», обеспечивающего компьютерное моделирование свойств и структуры многокомпонентных оксидных расплавов большой размерности и включающего классы математических моделей оксидного расплава, их реализацию в виде блоков программных модулей, а также централизованное хранение результатов КЭ в базе данных[14, 15].

Целью диссертационной работы является разработка моделей, методов и инструментальных средств, для численного моделирования структуры полимеризующихся многокомпонентных оксидных систем.

Для достижения указанной цели были решены следующие задачи:

- Выработаны обоснования к моделям и методам математического моделирования структуры среднего порядка на основе анализа научной литературы.

- Разработан формализм математической модели на основе неоднородного обобщения дескрипторов в рамках теоретико-графового описания структуры многокомпонентной ионно-ковалентной оксидной системы.

- Разработаны, исследованы и реализованы численные методы моделирования структуры в форме программного средства с удаленным доступом.

- Разработана реляционная база данных для хранения начальных условий и результатов КЭ, содержащая блок хранимых процедур и функций, обеспечивающих сложную многомерную обработку больших массивов данных.

- Разработана модель удаленного доступа к базе модельных результатов и управлению численным экспериментом.

- Разработан программный комплекс с удаленным доступом, интегрирующий унаследованное вычислительное приложение по методу молекулярной динамики, приложение исследования наноструктуры, средства формирования отчетов и научной визуализации.

- Проведено тестирование программного комплекса, продемонстрирована работоспособность выработанных решений на примере комплексного моделирования свойств и структуры многокомпонентного оксидного расплава Si02-Na20.

На защиту выносятся следующие результаты:

1. Метод моделирования неоднородной структуры среднего порядка оксидного расплава на основе модели обобщенных дескрипторов и ускоренного алгоритма поиска ближайших соседей по областям Шлегеля.

2. Результаты численного моделирования системы Si02-Na20 полученные в рамках разработанного программного комплекса, интегрирующего авторские и унаследованные приложения: рассчитаны параметры ближнего и среднего порядка, дескрипторное распределение полианионов, доли кислорода различного типа, параметры полимеризованности.

Поставленные в диссертационной работе задачи решаются на основе методов инженерии программного обеспечения, математической статистики, дискретной математики и теории графов.

Для решения задач диссертационного исследования применялось программное обеспечение: СУБД PostgreSQL; системы проектирования AllFusion Erwin Data Modeller, Microsoft Visio 2007, языки программирования Fortran, Java, JavaScript; платформа Eclipse; среда публикации динамического XML-контента Apache Cocoon и др.

В работе получены следующие новые результаты:

Разработанный метод моделирования неоднородной структуры оксидных расплавов на основе обобщенных дескрипторов в связной графовой сети вносит вклад в развитие методов численного моделирования многокомпонентных систем.

Разработанный формализм метода в графовом представлении порождает новый алгоритм разбиения трехмерного пространства в модельном кубе и поиска ближайших соседей, существенно ускоряющий поиск особенностей графовой сети.

Ряд результатов структурного моделирования системы 8Ю2^а20 обладает научной новизной и является теоретически значимой основной для построения феноменологических коэффициентов уравнений состояний оксидных расплавов.

Практическая значимость работы.

Разработан расширяемый программный комплекс с удаленным доступом, обеспечивающий моделирование свойств и структуры многокомпонентных полимеризующихся оксидных систем большого числа частиц (порядка 10б).

Централизованное хранение результатов моделирования в БД позволило реализовать многомерный анализ модельных данных и статистическую обработку в удаленном режиме, что обеспечивает автоматизацию и интенсификацию работы исследователя.

Разработанный метод организации многопользовательского удаленного доступа к КЭ позволяет сформулировать рекомендации по быстрому проектированию и реализации систем автоматизации вычислительного эксперимента с удаленным доступом.

С помощью разработанного программного комплекса проведено комплексное моделирование системы 8Ю2-Ка20 в диапазоне шести составов и получены практически значимые результаты, часть из которых обладает научной новизной. Результаты могут быть использованы для прогнозирования состава шлаков. Расхождение между модельными результатами и частично имеющимися экспериментальными данными-менее 12%.

Заключение диссертации по теме «Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ», Григорьева, Мария Александровна

4.7. Выводы

1. С целью проверки адекватности разработанных моделей и тестирования модуля «STRUCTURE» проведена серия компьютерных экспериментов по моделированию структуры в рамках программного комплекса. В качестве объекта исследования выбрана бинарная оксидная система Si02-Na20, имеющая большое практическое значение в металлургической и стекольной промышленности.

2. На первом этапе проведено молекулярно-динамическое моделирование исследуемой системы, с привлечением унаследованного приложения «MDMELT», интегрированного в программную среду комплекса -«MDSLAGMELT».

3. Результаты МД-эксперимента использованы для моделирования структуры полимеризующейся оксидной системы с помощью разработанного автором модуля «STRUCTURE», который реализует модель обобщеных дескрипторов неоднородной графовой сети.

4. В результате структурного эксперимента системы Si02-Na20 в диапазоне шести составов (0.4-0.6, 0.43-0.67, 0.5-0.5, 0.63-0.37, 0.74-0.26, 0.8-0.2):

- определены структурные характеристики ближнего порядка -средние расстояния между атомами, валентные углы, координационные числа;

- проведено исследование структуры среднего порядка на основе метода обобщенных дескрипторов неоднородной графовой сети: получены функций распределения полианионных комплексов по значениям ряда дескрипторов и по времени жизни;

- получены структурочувствительные характеристики исследуемых систем - доли плоскостных колец в комплексах; средняя длина колец; относительные доли атомов мостикового, концевого и свободного кислорода; степень и константа полимеризации; активности оксидов; средний фактор разветвленности структурного каркаса.

5. Проанализированы концентрационные зависимости полученных структурных характеристик исследуемой системы. Проведено сравнение модельных данных с экспериментом. Ряд характеристик, для которых есть данные натурного эксперимента (валентные углы, средние длины связей, координационные числа), показывает удовлетворительное согласие с экспериментальными данными. Погрешность не превышает 12%.

6. Характеристики функций распределения полианионных комплексов имеют самостоятельную практическую значимость и обладают научной новизной, поскольку экспериментальные данные для них\ отсутствуют.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Для обеспечения решения задач исследования структуры полимериузющихся оксидных систем в диссертационном исследовании:

1. Разработан метод моделирования неоднородной структуры многокомпонентных полимеризующихся оксидных расплавов. Метод основан на модели обобщенных дескрипторов в неоднородной графовой сети.

2. Разработана модель структурочувствительных свойств оксидных расплавов, позволяющая рассчитывать функции распределения комплексных анионов и скалярные структурные характеристики.

3. В рамках разработанного метода предложен и реализован ускоряющий алоритм построения звезд графовых вершин, основанный на поиске ближайших соседей в областях Шлегеля.

4. Разработан программный комплекс «MDSLAGMELT» с удаленным доступом, для моделирирования физико-химических свойств и структуры полимеризующихся оксидных систем, интегрирующий унаследованное. МД-приложения MDMELT, и разработанный автором модуль «STRUCTURE» для моделирования структуры.

5. Разработана база данных для централизованного хранения начальных условий и результатов КЭ, реализована сложная бизнес-логика, обеспечивающая обработку больших массивов данных о свойствах и структуре исследуемых полимеризующихся систем.

6. Для обеспечения удаленного доступа к программному комплексу разработана модель организации удаленного взаимодействия исследователя с программным комплексов.

7. Для бинарной оксидной системы Si02-Na20 в диапазоне шести составов проведено численное моделирование структуры. Определены: параметры ближнего порядка, функции распределения полианионных комплексов, конфигурационное время жизни комплексов, доли кислорода различного типа, получены структурочувствительные характеристики полимеризованных расплавов (степень и константа полимеризации, активности сеткообразующего и модифицирующего оксидов, средний фактор связности). Получены и проанализированы концентрационные зависимости состав-структура-свойство. Расхождение между модельными и данными натурного эксперимента составляет не более 12%.

Список литературы диссертационного исследования кандидат технических наук Григорьева, Мария Александровна, 2010 год

1. Андерсон, Д. Дискретная математика и комбинаторика : пер. с англ. / Джеймс А. Андерсон. М.: Издательский дом «Вильяме», 2003. - 960 с.

2. Андреев Н.С., Мазурин О.В., Порай-Кошиц Е.А., Роскова Г.П. Явление ликвации в стеклах. Д.: Наука, 1974.

3. Аппен A.A. Химия стекла.- JL: Химия, 1974.-351 с.

4. Атлас шлаков. Справ.изд. Пер.с нем./Под редакцией Куликова И.С., М:Металлургия, 1985, 208с.

5. Байдов В. В. Ультраакустические исследования и микроструктура силикатных расплавов.- В кн.: Свойства и структура шлаковых расплавов.-М.: Наука, 1970, с. 23-38.

6. Белащенко Д.К. Компьютерное моделирование структуры и свойств некристаллических оксидов. Успехи химии 66(9), 1997, с.811-844

7. Д.К.Белащенко, Компьютерное моделирование некристаллических веществ методом молекулярной динамики // Соросовский образовательный журнал. 2001. №8. С.44-50.

8. Белоусов, А. И. Дискретная математика / А. И. Белоусов, С. Б. Ткачев; под редакцией В. С. Зарубина, А. П. Крищенко. М. : Издательство МГТУ им. Н. Э. Баумана, 2004. - 744 с.

9. Бернал Дж., Кинг С. Экспериментальное моделирование простых жидкостей. М.: Мир, 1971. с. 116-135.

10. Близнюк A.A., Войтюк A.A. Программа поиска полуэмпирических параметров метода МПДП- Ж.структ.хим., 1987, т.28, №2, с.172-173.

11. Бобылев И.Б., Анфилогов В.Н. Особенности кристаллизации силикатных расплавов и расчет кривых ликвидуса в бинарных системах.- В кн.: Исследование структуры магматических расплавов.- Свердловск: УНЦ АН СССР, 1981, с. 52-61.

12. Ватолин H.A., Пастухов Э.А. Дифракционные исследования строения высокотемпературных расплавов. М.: Наука, 1980. - 189 с.

13. Вигерс К. Разработка требований к программному обеспечению/Пер. с англ.-М.: Издательско-торговый дом «Русская редакция»,2004.

14. Воронов В.И. Методы исследования структуры сильновзаимодейст вующих систем. В сб. науч. трудов «Математическое и программное обеспечение научных исследований и обучения», Курган: изд-во Курганского гос.ун-та, 2000г., с.58-65.

15. Воронова Л.И., Бухтояров О.И. Прогнозирование физико- химических свойств борного ангидрида методом молекулярной динамики.- Физика и химия стекла, 1987, т.13, N 6, с.818-823.

16. Воронова Л.И., Глубокий Я.В., Воронов В.И., Гроховецкий Р.В. Расчет са мосогласованного набора потенциальных параметров для МИБО-МО моделирования бинарных оксидных расплавов.-Расплавы, 1999, №2, с.66-74.

17. Воронова Л.И., Григорьева М.А. Реализация \уеЬ-приложения для ИИС «Шлаковые расплавы» // Международный журнал "Программные продукты и системы", № 1 за 2010 год , с.109-112

18. Гельчинский Б.Р., Мирзоев А.А., Вяткин Г.П. Структурное моделирование бинарных аморфных и жидких сплавов // Тезисы IX Всероссийской конференции. Челябинск: ЮУРГУ, 1988, Т.1, с. 6-8.

19. Гиллеспи Р. Геометрия молекул. М.: Мир, 1975.

20. Григорьева М.А., Воронова Л.И. Оптимизация взаимодействия \veb-приложения с базой данных в информационно-исследовательской системы «Шлаковые расплавы» // Ежемесячный научный журнал «Молодой ученый». 2009. - №10. - с. 85-88

21. Гуськов А.Е. О Модели цифровых информационных систем // Вычислит. Технологии. Т. 10. Спец. Выпуск: Труды IX рабочего совещания по электронным публикациям «El-Publ2004». Новосибирск, 23-25 сентября 2004. С. 58-70.

22. Дейт К. Дж. Введение в системы баз данных, 8-е издание. -М.: Издательский дом «Вильяме», 2005. 1328 с.

23. Денисов В.М., Белоусова Н.В., Истомин С.А. и др. Строение и свойства расплавленных оксидов. Екатеринбург: УрО РАН, 1999. - 499с.

24. Дунаев, С. Б. Технологии Интернет-программирования Текст. / С. Б. Дунаев. спб.: БХВ-Петербург, 2001 . - 472 с.

25. Евсеев A.M. Уравнения движения в квантовой молекулярной динамике. -Журн.физ.хим., т. LXII, № 4, 1988, с.972-977.

26. Египко В.М. Об особенностях информационного обеспечения систем автоматизации экспериментальных исследований // Средства получения и обработки цифровой информации. Киев: Ин-т кибернетики им. В.М. Глушкова HAH Украины, 1993. - С. 64-68.

27. Египко В.М., Зинченко В.П., Белоусов Б.Н., Горин Ф.Н. Системы автоматизации экспериментальных исследований в аэродинамических трубах. Киев: Наук. Думка, 1992. -264 с.

28. Есин O.A. О полимерной модели расплавленных силикатов и других окислов. Сталь, 1979, № 7, с. 497-500.

29. Есин O.A. Уравнения полимерной модели расплавленных силикатов в при ближении регулярных растворов. -ЖФХ, 1974, т. 48, вып. 8, с. 2108-2110.

30. Ермоленко Н. Н. Химическое строение и некоторые свойства оксидных стекол // Стеклообразное состояние: Тр. 8-го Всесоюз. сов. JL: Наука, 1988.-С. 132-139.

31. Жидомиров З.М., Багатурьянц A.A., Абронин H.A. Прикладная квантовая химия. М.:Химия, 1979. -295с.

32. Комолкин A.B., Эльц Е.Э. Молекулярная динамика: от модели к визуализации // Компьютерные инструменты в образовании. СПб.: Изд-во ЦПО "Информатизация образования", 2004, №3, С.5-14.

33. Т. Коннолли, К. Бегг. Базы данных. Проектирование, реализация и сопровождение. Теория и практика.-М.: Издательский дом «Вильяме», 2003

34. Кривцов А. М., Кривцова Н. В. Метод частиц и его использование в механике деформируемого твердого тела // Дальневосточный математический журнал. 2002. Т. 3, №2, с. 254—276.

35. Кубо Р. Статистическая механика.-М.:Мир, 1967. 323 с.

36. Купряков Ю.П. Шлаки медеплавильного производства и их переработка. М.: Металлургия, 1987, 200с.

37. Курняван Б. Создание web-приложений на языке Java с помощью сервлетов, JSP и EJB. М.: Издательство «ЛОРИ», 2005.

38. Лагарьков А. Н., Сергеев В.М. Метод молекулярной динамики в статистической физике // УФН, 1978, Т. 125, вып. 3, с. 409-448

39. Лебедев A.M. Моделирование в научно-технических исследованиях. М.: Радио и связь, 1989.

40. Макконнелл С. Совершенный код. Мастер-класс. М.: Издательство «Русская Редакция»; СПб.: Питер, 2007

41. Мак-Лахлин Б. Java и XML. СПб.: Символ-Плюс, 2002. 544 с.

42. Медведев H.H., Метод Вороного Делоне в исследовании структуры некристаллических упаковок: Учебное пособие. Новосибирск, НГУ, 1994.

43. Медведев H.H., Лучников В.А., Наберухин Ю.И. Области «совершенной» структуры в аморфном аргоне.- ЖСХ. 1994. т. 35(1). С. 53-63.

44. Молчанова О. С. О свойствах тройной системы: окись натрия—борный ангидрид—кремнезём. — Строение стекла. Труды по строению стекла. Ленинград, 23—27 ноября 1953 — М.—Л.: Издательство АН СССР. 1955. С. 141

45. Немухин A.B. Компьютерное моделирование в химии // Соросовский образовательный журнал, 1998, 6, с. 48-52.

46. Новиков, Ф. А. Дискретная математика для программистов : учебник для вузов / Ф. А. Новиков. 2-е изд. - СПб.: Питер, 2005. - 364 с.

47. Роусон Г. Неорганические стеклообразующие системы. М.: Мир, 1970, 302 с.

48. Самарский А. А., Гулин А. В. Численные методы: Учебное пособие. М.: Наука, 1989.

49. Собчук А. Продолжение всемирной паутиныhttp://www.smalltalk.ru/articles/web-continuations.html

50. Спенсер П. XML. Проектирование и реализация. М.: ЛОРИ, 2001. - 510 с

51. Сокольский В.Э., Казимиров В.П., Баталин Г.И. и др. Некоторые закономерности строения расплавов бинарных силикатных систем, составляющих основу сварочных шлаков.- Изв. вузов, Черная металлургия, 1986, №3, с. 4-9.

52. Фролов А.В., Фролов Г.В. Базы данных в Интернете: практическое руководство по созданию Web-приложений с базами данных. Изд. 2-ое, испр. -М.: издательско-торговый дом "Русская редакция", 2000. -448 е.: ил.

53. Федотов A.M., Гуськов А.Е. Информация в Интернете: публикация, поиск и анализ // Международный научно-практический журнал «Информационные технологии в высшем образовании». КазНУ им. Аль-Фараби, 2004. Т.1, №4, С.17-35.

54. Хеерман Д.В., Методы компьютерного эксперимента в теоретической физике: М: Наука, 1990

55. Хокни Р. Методы расчета потенциала и их предложения.- В кн.: Вычислительные методы в физике плазмы, под ред. Б.Олдера, С. Фернбаха и М. Ротенберга.- М.: Мир, 1974, с. 143.

56. Хокни Р., Иствуд Дж. Численное моделирование методом частиц М.:Мир, 1987,638 с.

57. Шенк Г. Физико-химия металлургических процессов. Ч. 2. Производство стали. К.: ГНТИУ, 193, 306с.

58. Шульц М.М., Мазурин О.В. Современные представления о строении стекол и их свойствах. Л.: Наука, 1988.

59. Шульц М.М. Стекло: Структура, свойства, применение // Соросовский Образовательный Журнал. 1996. № 3. С. 49-55.

60. Alder В. J., Wainwright Т. Е. Studies in Molecular Dynamics. I. General Method // J. Chem. Phys., 1959, Vol.31, N 2, p.459-466.

61. Amini M., Mitra S.K., Hockney R.W. J.Phys.C, Solid State Phys., 14, 3689 (1981)

62. Angell C.A., Clarke J.H.R., Woodcock L.V. Interaction potentials and glass formation: a survey of computer experiments Adv.Chem.Phys., 1981, V.48, p.397-453.

63. Barker J.A., Henderson D. What is "liquid" Understanding the states of matter. -Rev.Mod.Phys., 1976, v.48, N4, p.587-671.

64. Beeman, D. Some multistep methods for use in molecular dynamics calculations, J. Comput. Phys., 1976, vol. 20, pp. 130-139.

65. Bernal J.G. A geometrical approach to the structure of liquids.- Nature. 1959. V. 183 (4655). P. 141-147.

66. Birznieks G. Web Application Technologies Surveying The Landscape // http://www.extropia.com/presentations/birznieks/pdf/ webapplicationtechnologies.pdf

67. BORGES. http://borges.rubyforge.org/

68. Brawer S.A., WeberM.J. Molecular dynamics simulations of the structure of rare-earth doped beryllium-fluoride glasses J.Chem.Phys., 1981, V.75, N 7, p.3522-3541.

69. Buneman O. Time-reversible difference procedures, J. Comput. Phys., vol. 1, pp. 517-537.

70. Byrd W. Web Programming with Continuations // Chris Double's Homepage, http://double.co.nz/pdf/continuations.pdf, 2002

71. Car R., Parrinello M. Unified approach for molecular dynamics and density -functional theory. -Phys.Rev.Lett., v.55, 1985, p.2471-2474.

72. Catlow C.A., Freeman C.M., Islam M.S. and others Philos.Mag. A,58, 123 (1988)

73. Cocoon 2.1. http://cocoon.apache.org

74. Cocoon Authentication Framework. http://c0c00n.apache.0rg/2.l/devel0ping/webapps/authenticati0n.html

75. CForms documentation, http://c0c00n.apache.0rg/2.l/userd0cs/index.html

76. CHARMM. http://www.charmm.org/

77. Dewar M.J.S., Thiel W. Ground States of Molecules. 38. The MNDO Method. Approximations and Parameters. // J.Am.Chem.Soc., 1977, v.99, N 15, p.4899-4907.

78. DLPOLY. http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg/software/DLPOLY/

79. Eastwood J.W., Hockney R.W., Lawrence D.N. P3M3DP the three-dimentional periodic particle-particle / particle-mesh program. - Comp.Phys.Comm., 1980, v.19, N.2, p.215-261.

80. FlowScript API. http://c0c00n.apache.0rg/2.l/userd0cs/fl0w/api.html

81. Ford N. Cocoon as a web framework // TheServerSide.com, 2004, http://www.theserverside.com/news/1364928/Cocoon-as-a-Web-Framework

82. Fumi, F. G., and Tosi M. P. Ionic Sizes and born repulsion parameters in the NaCl type alkali halides -1.- J. Phys. Chem. Solids, 1964, vol. 25, pp. 31-43.

83. Gaskell D.R. Thermodynamic models of liquid silicates.- Canad. Met. Quart., 1981, 20, N 1, p. 3-19.

84. Graunke P., Krishnamurthi Sh, Hoeven and Felleisen. «Programming the Webwith High-Level Programming Languages».Proceedings of ESOP 2001. 2001.

85. Graunke P., Findler K., Krishnamurthi Sh., Felleisen M. «Automatically Restructuring Programs for the Web». Automated Software Engineering 2001. 2001.

86. GROMACS. http://www.gromacs.org/

87. Green M.S. Statistical aspect of the reaction . J. Chem . Phus 1962 , vol, 20 ,p . 1281-1283 .

88. Hirao K., Soga N. Molecular dynamics studies of structure and atomic motion of BeF2 glass // J.Non-Cryst.Solids, 1983, V.57, N.l, p. 109-117.

89. HyperChem. http://www.hyper.com/103. JXTemplates.http://c0c00n.apache.0rg/2.l/apid0cs/0rg/apache/c0c00n/generati0n/JXTempiateG enerator.html

90. Inoue H„ Aoki N., Yasui N. J.Am.Ceram.Soc., 70,622 (1987)

91. Kawamura K. In Molecular Dynamics Simulations. Springer Series in Solid-State Sciences. Vol.103. (Ed.F.Yonezawa). Springer-Verlag, Berlin, 1990, p.88

92. Kubicki J.D., Lasaga A.C. Am.J.Sci., 292, 159 (1992)

93. LAMMPS. http://lammps.sandia.gov/

94. Langham M., Ziegeler C. Cocoon: Building XML Applications // New Riders Publishing, 2002, 504 pages

95. Lewis J. W. E., Singer K., Woodcock L. V. Thermodynamic and structural properties of liquid ionoc salt obtained by Monte-Carlo computation.- J. Chem. Soc., Faraday 11,1975, v. 71, pp. 301-312.

96. Masson C. R., Smith I. B., Whitemay S.G. Molecular size distribution in muttichain polymers: application of polymer theory of to silicate melts. Can. J. Chem., 1970, v. 48, p. 201-202.

97. Masson C.R. Anionic constitution of glassforming melts.-J. Non-Cryst. Solids, 1977, 25, N 1, p. 1-41.

98. Mitra S.K. Molecular dynamics simulation of silicon dioxide glass. Phyl.Mag., B, 1982, v.45, N 5, p.529-548.

99. Mulliken R.S. Magic formula, structure of bond energies and isovalent hybridization. J.Phys.Chem., 1952, v.56, l3, p.295-317.

100. Mysen B.O., Fingert L.W., Seifert F.A., Virdo D. Curve fitting off Raman spectra of amorphous materials.-American Miner., 1982, 67,' p. 686-696.

101. Nelayev V., K.Dovzhik and V.Lyskouski, Quantum effects in biomolecular structures // Rev. Adv. Mater. Sci. 142007, p. 14-19. '

102. Nelayev V., K.Dovzhik Biomolecular structures in quantum computation. Ab-initio research // Proc. of 1st Int. Scientific Conf. "Nanostructured Materials -2008: Belarus Russia - Ukraine (NANO - 2008)"2008, p. 665.

103. Poornachandra Sarang, Pro Apache XML // Apress, 2006, p'279-326

104. PostgreSQL. http://www.postgresql.org/

105. Queinnec C. "Inverting back the inversion of control or, continuations versus page-centric programming". Technical Report7, LIP6,May ¿001.

106. Queinnec C. "The influence of browsers on evaluators or, continuations to program web servers". ICFP '2000 International Conference on Functional Programming pp. 23-33, Montreal (Canada), September 2000.

107. Rahman A., Fowler R. H., Narten A.H. Structure and motion in liquid BeF2, LiBeF3 and LiF from molecular dynamics calculations.- J. Chem. Phys., 1972, vol.57, pp. 3010-3011.

108. SAGE MD2. http://www.sagemd.com/htmls/aboutsagemd.htm

109. Sangster M.J.L., Dixon M. Interionic potentials in alkali halides and their useisimilation of molten salts. Adv. Phys., 1976, v.25, N3, p.247 - 342.

110. Sconnard A., Gudgin M. Essential XML Quick Reference: a programmer's reference to XML, XPath, XSLT, XML Schema, SOAP and more/ Addison-Wesley.

111. Seaside web-framework, http://www.seaside.st/

112. Soules T.F. and Arun K.Varshneya Molecular Dynamic Calculations of A Sodium Borosilicate Glass Structure. J.Amer.Ceram.Soc., v.64, N.3, 1981, p.145-150.

113. Spruit S. A guide to learning Cocoon // Center for Content and Knowledge Engineering, 2005, http://www.informationscience.nl

114. Soules T.F. Molecular dynamics calculations of glass structure and diffusion in glass J. Non-Cryst. Solids, 1982, V.49, N 1-3, p.29-52.

115. Thiel W. The MNDOC Method, a Correlated Version of the MNDO Model -J.Am.Chem.Soc., 1981, v.103, p.1413-1420.I

116. Toop G. W., Samis C. S. Activities of ions in silicate melts.- Trans. Met. Soc. AIME, 1962, v. 229, p. 878-887.

117. UnCommon Web. http://common-lisp.net/project/ucw/

118. Vashishta P., Kalia R.K. Electron transport in disordered systems: Anonequilibrium quantum-molecular-dynamics approach. Phys.Rev.B, v.43, no. 13, 1991, p.10928-10932.

119. Verlet, L. Computer experiments on classical fluids. I. Thermodynamic properties of Lennard-Jones molecules.- Phys. Rev., 1967, vol. 159, pp 98-103.

120. Voronov V.I. The analysis of complex-forming process in molecular-dynamic simulation of oxide systems. Eight Asian Chemical Congress (8ACC), Taipei, Taiwan, 1999.

121. Wallez S. Advanced Cocoon Forms, 2004, ftp://mirror.nyi.net/apache//cocoon/events/gt2004/presentations/SylvainAdvance dCocoonForms .pdf

122. Waseda Y. The structure of non crystalline materials. Liquid and amorphous solids. New-York: Mc. Graws-Hill International book Co, 1980.-350 p.

123. WDialog (dialog-centric web applications), http://wdialog.sourceforge.net/

124. Whiteside R.A., Frish M.J., Binkley J.S, DeFreees, Schlegel H.B., Raghavachari K., Pople J.A. Carnegie-Melton Quantum Chemistry Archive, 2nd Ed. Carnegie-Melton University, Pittsburg, 1981.

125. Woodcock L.V., Angell K.A., Cheeseman P. Molecular dynamics studies of the vitreous state: simple ionic system and silica.- J. Chem. Phys., 1976, v.65, N.4, p.1565-1577.

126. Xinhuai Z. Three Leading Molecular Dynamics Simulation Packages // National University of Singapore, SVU/Academic Computing, Compute Centre, 2006, http://www.nus.edu.sg/comcen/svu/publications/hpcnus/jun2006/mdsoftware.pdf

127. XMD (Molecular Dynamics for Metals and Ceramics), http://xmd.sourceforge.net/

128. XSP (extensible Server Pages). http://cocoon.apache.Org/2.l/userdocs/xsp/logicsheet-concepts.html