Разработка диагностических панелей нокаутных клеток для функциональной классификации энтеровирусов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.03, кандидат наук Ле Тхи Хоа

• Ле Тхи Хоа
• кандидат наук
• 2020

Оглавление диссертации кандидат наук Ле Тхи Хоа

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

АКТУАЛЬНОСТЬ

ЦЕЛЬ РАБОТЫ

ЗАДАЧИ

НАУЧНАЯ НОВИЗНА

ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ

СТРУКТУРА И ОБЪЕМ ДИССЕРТАЦИИ

ВКЛАД АВТОРА

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

ПУБЛИКАЦИИ

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Вирусный онколиз

1.2. Онколитические энтеровирусы человека

1.2.1 Общая характеристика и классификация

1.2.2 Организация генома энтеровирусов

1.2.3 Репликация энтеровирусов

1.3 Онколитические свойства энтеровирусов

1.4 Онколитические энтеровирусы

1.4.1 Энтеровирусы группы ЕСНО

1.4.2 Вирусы группы Коксаки

1.4.3 Полиовирусы как онколитики

1.5 Клеточные рецепторы необходимые для проникновения онколитических

энтеровирусов клетку

1.5.1 Рецептор полиовируса PVR/CD155

1.5.2 Белок межклеточной адгезии 1 (ICAM-1)

1.5.3 Скавенджер-рецептор B2, SCARB2

1.5.4 а-Р интегрины

1.5.5 Рецептор вирусов Коксаки и аденовирусов (CAR)

1.5.6 Фактор ускорения распада DAF/CD55

1.5.7 Рецепторы иммуноглобулинов: неонатальный Fc рецептор БсЯл

1.5.8 Рецептор KREMEN1 (Krm1)

1.6 Механизмы проникновения энтеровирусов в клетки

1.6.1 Клатрин-опосредованный эндоцитоз

1.6.2 Кавеолин - опосредованный эндоцитоз

1.6.3 Макропиноцитоз и фагоцитоз

1.7 Системы противовирусной защиты клетки, в частности система интерферона

1.7.1 Паттерн-распознающие рецепторы

1.7.2 Активация интерферон-индуцируемых генов

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Материалы

2.2 Методы

2.2.1 Культивирование клеток

2.2.2 Подсчет клеток

2.2.3 Криоконсервация культур опухолевых клеток

2.2.4 Определение титра энтеровирусных штаммов методом бляшек

2.2.5 Наращивание вирусных стоков

2.2.6 Определение чувствительности опухолевых клеток к онколитическим вирусам

2.2.7 Определение титра вируса методом Рида-Менча

2.2.8 Оценка жизнеспособности (МТТ-тест)

2.2.9 Наработка плазмидной ДНК в Echerichia Coli, штамм 10-beta. Трансформация клеток E.coli

2.2.10 Создание плазмид pCas-Guide-2A-RFP для выключения генов

2.2.11 Проведение ПЦР

2.2.12 Трансфекция клеток плазмидной ДНК pCas-Guide-2A-RFP

2.2.13 Получение моноклональных сублиний клеток после трансфекции плазмиды pCas-Guide-2A-RFP

2.2.14 Выделение геномной ДНК

2.2.15 Подготовка образцов для секвенирования по методу Сэнгера

2.2.17 Оценка экспрессии поверхностных белков с помощью проточной цитометрии

2.2.18 Определение первичной последовательности геномов энтеровирусов

2.2.19 Проведение филогенетического анализа энтеровирусного генома

2.2.20 Анализ и статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Анализ геномов непатогенных штаммов онколитических энтеровирусов

Echovirus E6 isolate RA/E6/Ahvaz/Iran/2011 (GenBank: KX619440.1)

3.2 Оценка цитолитических свойств штаммов энтеровирусов на моделях in vitro

3.2.1 Линии клеток рака толстого кишечника человека существенно различаются по чувствительности и способности реплицировать онколитические штаммы энтеровирусов

3.2.2 Линии клеток рака толстого кишечника могут существенно различаться по чувствительности к противовирусному действию интерферона 1 типа

3.3 Изучение зависимости онколитической активности непатогенных штаммов энтеровирусов человека от состояния сигнальных путей интерферонового ответа на клетки

3.3.1 Получение линии клеток с нокаутом генов IFNAR1 и STAT2 с помощью системы CRISPR/Cas9

3.3.2 Влияние обработки клеток НЕК293Т с нокаутом генов IFNAR1 и STAT2 интерфероном-альфа на литическую активность онколитических энтеровирусов

3.3.3 Влияние состояния клеточной системы врожденного противовирусного иммунитета на чувствительность клеток к действию онколитических энтеровирусов

3.4.1 Получение культур клеток с нокаутом отдельных рецепторов проникновения для энтеровирусов

3.4.2 Разделение штаммов эховируса 11 и вируса Коксаки А10 из смеси с помощью клеток нокаутных по рецепторам FCGRT и SCARB2

3.4.3 Исследование потребности в поверхностных рецепторах PVR, CXADR, CD55, ITGA2, SCARB2, ICAM1, FCGRT и KRM1 для различных штаммов энтеровирусов

3.4.4 Установление зависимости используемых вирусами рецепторов клетки от эволюционной близости вирусных штаммов

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ADAR1 (adenosine deaminase, RNA specific, ADAR) - аденозин-дезаминаза РНК CXADR (coxsackievirus and adenovirus receptor, CAR) - Коксаки-аденовирусный рецептор

DAF (decay accelerating factor, CD55) - фактор, ускоряющий инактивацию комплемента

dNTPs - дезоксинуклеозидтрифосфаты

DMEM (Dulbecco modified Eagle's medium) - модифицированная по способу Дульбекко среда Игла

ECHO (enteric cytopathic human orphan) - эховирусы, РНК-содержащие вирусы, принадлежащие к роду Enterovirus EV (enterovirus) - энетровирус

FBS (fetal bovine serum) - эмбриональная телячья сыворотка

FcRn (The Neonatal Fc Receptor) - неонатальный Fc рецептор

FDA (Food and Drug Administration) - центр по исследованию безопасности

продуктов питания и лекарств США

HRV2 (human rhinovirus 2) - риновирус 2-го типа человека

IC50 (the half maximal inhibitory concentration) - концентрация полумаксимального ингибирования

ICAM-1 (inter-cellular adhesion molecule 1, CD54) - молекула межклеточной адгезии 1 типа

IFN (interferon) - интерферон IFNAR (interferon-a/p receptor) IkB (inhibitor of kappa B) IKK (IkB kinase) IKKs (IkB kinase epsilon)

IRAK-4 (interleukin-1 receptor-associated kinase 4)

IRF (interferon regulatory factor)

ISGF (interferon-stimulated genes factor)

IRES (internal ribosome entry site) - участок внутренней посадки рибосом ISG (interferon-stimulated gene) - гены, стимулируемые интерфероном Jak1 (Janus kinase 1)

LIMP-II (lysosomal integral membrane protein II, SCARB2 (scavenger receptor class B

member 2), CD36) - лизосомный мембранный сиалогликопротеин II типа

LGP2 (laboratory of genetics and physiology 2)

KRM1 (KREMEH1) - рецептор кремен 1типа

MOI (multiplicity of infection)- множественность заражения

N-конец - амино-конец

MAM (mitochondria associated membrane) - участок эндоплазматического

ретикулума, ассоциированный с митохондриальными мембранами

PBS (phosphate buffered saline) - фосфатно-солевой буфер

PDGF (Platelet-derived growth factor) - тромбоцитарный фактор роста

PTEN (phosphatase and tensin homolog) - гомолог фосфатазы и тензина

PVR (Poliovirus Receptor, CD155) - полиовирусный рецептор

TCID50 (50% tissue culture infective dose) - 50%-тканевая цитопатическая доза

TICAM1 (toll like receptor adaptor molecule 1) - адапторная молекула toll-

подобного рецептора молекула

UTR (untranslated region) - нетранслируемая область

VLA-2 (Very Late Antigen-2) - интегрин а2р1

VP - вирионный белок

VSV - вирус везикулярного стоматита

БОЕ - бляшкообразующая единица

БСА - бычий сывороточный альбумин

ВОЗ (WHO) - Всемирная организация здравоохранения в.ч. - вирусная частица

ГТФазы - семейство ферментов гидролаз, которые связывают и гидролизуют

гуанозинтрифосфат

ДМСО -диметилсульфоксид

е.а. - единица активности

ЖЭВ (LEV) - живая энтеровирусная вакцина-

ИФН - интерферон

и.е. - инфекционная единица

ОРВИ - острая респираторная вирусная инфекция

ОРТ - открытая рамка трансляции

ПААГ - полиакриламидный гель

п.н. - пара нуклеотидов

ПЦР - полимеразная цепная реакция

РФ - Российская Федерация

ТБС - трис-буфер

т.н. - тысяча нуклеотидов

т.п.н. - тысяча пар нуклеотидов

ЦНС - центральная нервная система

ЦПД - цитопатическое действие

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка диагностических панелей нокаутных клеток для функциональной классификации энтеровирусов»

АКТУАЛЬНОСТЬ

Несмотря на достижения современной медицины, онкологические заболевания являются одной из основных причин смертей во всем мире. До начала прошлого века основным средством противораковой терапии было хирургическое удаление опухоли. С конца 1940-х годов стали развиваться методы лечения метастатических видов рака, основанные на химиотерапевтических и таргетных препаратах. Однако они, как правило, приводят лишь к кратковременным ремиссиям, вызывают быстрое приобретение резистентности, что ведет к прогрессированию заболевания в дальнейшем [1,2]. Химиотерапия также часто сопровождается многочисленными побочными эффектами, ухудшающими качество жизни пациента, подавляет естественный противоопухолевый иммунитет и способствует селекции устойчивых к терапии типов раковых клеток [3-7]. В последние годы большие надежды связаны с разработкой химиотерапевтических препаратов и антител, которые направлены на отдельные специфические рецепторы опухолевых клеток [8-10]. В качестве альтернативного подхода также исследуются возможности использования онколитических вирусов для терапии рака [11].

Онколитические вирусы способны селективно реплицироваться в раковых клетках, вызывая их гибель. Помимо прямого цитолитического действия, вирусы обладают способностью выраженно стимулировать естественный противоопухолевый иммунитет. Они привлекают компоненты иммунной системы для распознавания и уничтожения раковых клеток. Были проведены исследования онколитической активности вирусов на животных моделях, а также ряд клинических испытаний, которые продемонстрировали возможность применения вирусов для лечения злокачественных опухолей и эффективность данного вида терапии рака. В 1920-х годах на мышиной модели после успешного заражения онколитическими вирусами, удалось продемонстрировать возможность лизиса

экспериментальной опухоли [12]. В 1950-х годах появились публикации, демонстрирующие разрушение опухолей мышей вирусами гриппа и болезни Ньюкасла (МОУ). Также в конце 1940-х - начале 1950-х годов началось исследование онколитических свойств вирусов для лечения злокачественных заболеваний человека. В итоге в 1956 году была показана возможность терапии рака шейки матки с использованием аденовирусов. При этом после перенесения вирусной инфекции регрессия опухоли наблюдалась у более чем половины пациенток, а сама терапия не имела токсического эффекта [12]. В течение 19501970-х годов проводились дальнейшие исследования вирусного онколиза [13]. В последние годы началось активное развитие подходов с использованием методов биоинженерии с целью создания рекомбинантных вирусов на основе, например, аденовируса и вируса простого герпеса, которые специфически распознают и инфицируют опухолевые клетки, а также индуцируют синтез в зараженных клетках ряда веществ, способствующих регрессии опухолей [14].

Виротерапия отличается от химиотерапии практически полным отсутствием токсичности и минимумом побочных эффектов. В основе вирусной терапии рака лежат присущие злокачественным клеткам нарушения нормальных механизмов противовирусной защиты и адаптации к стрессу. Клетки опухоли физически более доступны для проникновения вирусов в сравнении с клетками здоровых тканей за счет дезорганизованной структуры опухоли с нарушенными тканевыми барьерами и межклеточными контактами [15], которыми препятствуют распространению вируса от клетки к клетке. Так кровоснабжение новообразований обеспечивается быстро растущими сосудами с хорошо проницаемыми, в том числе и для вирусов, стенками. В связи с этим вирусу может быстрее распространяться в опухоли, чем в нормальных тканях. Известно, что в злокачественных опухолях по мере их прогрессии накапливаются мутации, приводящие к повреждению интерфероновой системы, осуществляющей противовирусную защиту. В результате раковые клетки теряют способность к индукции интерферонов, становятся устойчивыми к их антипролиферативной активности и при этом чувствительными к вирусным инфекциям [16-22].

Очевидно, что наличие дефектов в интерфероновой системе является важной особенностью опухолевых клеток, обуславливающей селективность и эффективность действия онколитических вирусов и, тем самым, и эффективность виротерапии. Так, уровни экспрессии различных компонентов интерфероновой системы можно использовать в качестве потенциальных маркеров чувствительности раковых клеток к терапии с использованием онколитических вирусов. Кроме того, в большинстве опухолевых клеток нарушены функции опухолевого супрессора р53. В результате различных повреждений ДНК, а также при заражении вирусами, клетки способны избегать апоптоза и продолжать функционировать [23], что может лежать в основе репликативной селективности многих вирусов в отношении опухолей.

К настоящему времени онколитические свойства выявлены у вирусов многих семейств [24, 25], в том числе среди представителей семейства рабдовирусов [26], парамиксовирусов [27], парвовирусов [28], аденовирусов [29], реовирусов [30], герпесвирусов [31], альфавирусов [32] и в некоторых других. Каждый из онколитических вирусов имеет свои характерные особенности, в частности энтеровирусы обладают высокой репликативной стопосбностью, а за счет того, чо их геном представлен молекулой РНК положительной полярности и репликация происходит в цитоплазе, исключена вероятность интеграции вируса в геном клетки-хозяина, что обеспечивает их безопасность. Хотя многие детали процесса проникновения энтеровирусов в клетку остаются невыясненными, для нескольких представителей энтеровирусов установлены белки, взаимодействие с которыми необходимо для этого. Ряд исследователей разделяет эти белки на собственно рецепторы и корецепторы, предполагая, что последние играют второстепенную роль. Если рецепторы необходимы для проникновения вируса, то корецепторы, обладая способностью связывать вирус, повышают локальную концентрацию вирусных частиц на поверхности клетки, облегчая взаимодействие с рецептором. Однако, в связи с неполнотой знаний о конкретной роли рецепторных белков в индукции последующего захвата вирусов клеткой далее все белки, участвующие в связывании вирусов на поверхности клетки, мы будем

именовать рецепторами. Рецепторные белки чаще всего представляют собой гликоконъюгаты (гликопротеины, гликолипиды, протеогликаны), причем углеводные компоненты могут также играть роль в связывании вируса [33]. Уровни экспрессии этих рецепторов могут отличаться в опухолевых клетках, что является одним из факторов эффективности лечения пациентов тем или иным вирусным штаммом. Также, вероятно, существуют альтернативные, не идентифицированные пока рецепторы. Вопрос об установлении потребности онколитических вирусов в том или ином рецепторе важен для предсказания чувствительности опухоли пациента к определенному набору вирусных штаммов.

Исследования онколитических свойств вирусов направлены на разработку отдельных специфических штаммов онколитических вирусов, тестирование их эффективности и установление механизмов онколитического действия. Однако, одной из наиболее серьезных проблем онколитической виротерапии является непредсказуемость терапевтического действия вирусного препарата. Злокачественные опухоли крайне разнообразны по степени чувствительности к конкретному вирусному штамму. При этом отсутствие чувствительности к одному штамму не означает, что та же опухоль окажется устойчивой к действию другого вирусного препарата. Способность вирусов реплицироваться в опухолевых клетках может зависеть от множества различных факторов. Для проникновения в клетки вирус использует специфический рецептор, и если он отсутствует, вирусная инфекция невозможна. Помимо рецептора в проникновении в клетку участвуют дополнительные факторы, которые действуют после связывания вируса с рецептором. Это могут быть компоненты системы эндоцитоза и ряда других процессов, состояние которых может варьироваться в различных опухолях. Кроме того, хотя опухолевые клетки, как правило, имеют дефекты в системе противовирусной интерфероновой защиты, индивидуальные вирусные штаммы обладают различиями в способности преодолевать частично поврежденные интерфероновые механизмы. Вследствие этого, для индивидуального подбора наиболее эффективного вирусного препарата требуется наличие широкого арсенала вирусных штаммов, различающихся по потребностям

в клеточных факторах. Для этого необходима предварительная характеристика вирусных штаммов по их путям проникновения в клетку и по способности преодолевать интерфероновую защиту. С этой целью мы поставили задачу создания диагностических панелей на основе чувствительных к энтеровирусам клеток, состоящих из сублиний, в которых с помощью генномного редактирования внесены делеции в гены каждого из известных рецепторов, используемых энтеровирусами для проникновения в клетку. В панель также входят сублинии клеток с нарушенными системами индукции интерферона и интерфероного ответа. Эти панели сублиний клеток предназначены для испытания непатогенных энтеровирусных штаммов, выделенных из фекалий здоровых людей, с целью их классификации по признаку потребности в определенных клеточных рецепторах, а также по различиям в способности преодолевать интерфероновую защиту опухолевых клеток. Вирусы, относящиеся к различным серотипам и различающиеся по указанным параметрам, могут быть использованы для формирования терапевтических панелей, которые в дальнейшем будут использоваться для терапии онкологических заболеваний, что позволит увеличить эффективность лечения. Панели нокаутных клеток могут также быть полезны для идентификации новых, ранее неизвестных, белков на поверхности клеток, способных функционировать в качестве рецепторов для некоторых энтеровирусов. Выдвинутая в диссертационном проекте постановка задачи является инновационной, поскольку она концентрируется в основном на выявлении характерных факторов, определяющих восприимчивость опухолевых клеток пациента к онколитическим штаммам энтеровирусов.

ЦЕЛЬ РАБОТЫ

Получить с помощью технологии генных нокаутов CRISPR/Cas9 сублинии клеток человека с нарушенной экспрессией каждого из известных поверхностных белков, используемых энтеровирусами для проникновения в клетку. С помощью панели полученных сублиний определить потребность в клеточных рецепторах для нескольких энтеровирусов человека, выделенных ранее от здоровых людей и

не обладающих патогенными свойствами. Получить также сублинии клеток с нокаутом ключевых генов, участвующих в сигнальных путях индукции интерферона и реакции клеток на обработку интерферонами первого типа. Используя эти сублинии определить влияние интерфероновых механизмов на ограничение репликации каждого из испытыуемых штаммов непатогенных энтеровирусов.

ЗАДАЧИ

1. Оценить индивидуальные спектры чувствительности линий клеток рака толстого кишечника к нескольким штаммам непатогенных онколитических энтеровирусов.

2. На основе нескольких линий клеток, обладающих высокой чувствительностью ко многим штаммам энтеровирусов (НЕК293Т, HeLa, C33A), с помощью технологии CRISPR/Cas9 получить стабильные сублинии клеток с нокаутом генов, кодирующих белки на поверхности плазматической мембраны клетки, используемые энтеровирусами в качестве рецепторов, а именно: PVR, CXADR, CD55, ITGA2, SCARB2, ICAM1, FCGRT и KRM1.

3. На основе линии клеток HEK293T, не имеющей повреждений в системе противовирусной защиты клеток, получить сублинии с нокаутом генов интерферонового рецептора IFNAR1 и ключевого компонента сигнального пути интерферонового ответа STAT2.

4. Подтвердить генетические изменения в нокаутных сублиниях секвенированием таргетируемых участков генов и оценить изменения уровней продуктов экспрессии соответствующих генов с помощью иммуноблоттинга и/или проточной цитометрии.

5. Сравнить чувствительность нокаутных и контрольных линий клеток к цитопатическому действию нескольких энтеровирусных штаммов, а также

определить репликативную способность вирусов при заражении ими нокаутных и контрольных клеток.

6. Сравнить необходимость клеточных рецепторов для репликации нескольких штаммов энтеровирусов в трех клеточных моделях, которые были использованы для получения линий с нокаутом.

7. Провести оценку влияния структурных особенностей белков капсида исследуемых вирусных штаммов на спектр клеточных белков, используемых в качестве рецепторов. Оценить возможность предсказания используемых рецепторов на основании анализа аминокислотных последовательностей структурных белков вирусов.

8. Определить влияние обработки клеток НЕК293Т с нокаутом генов IFNAR1 и STAT2 интерфероном альфа на литическую активность энтеровирусов и оценить различия в чувствительности к обработке интерфероном для пяти штаммов онколитических энтеровирусов.

9. Оценить вклад неповрежденной интерфероновой системы в ограничение репликации энтеровирусов в отсутствии обработки клеток экзогенным интерфероном.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА

Впервые была получена диагностическая панель клеток, с помощью которой возможно определять необходимость рецепторов на поверхности клеток для проникновения в них для различных штаммов энтеровирусов. С помощью технологии генного нокаутирования CRISPR/Cas9 получены клоны клеток HEK293T, HeLa и C33A с нокаутом каждого из генов, кодирующих рецепторы PVR, CXADR, CD55, ITGA2, SCARB2, ICAM1, и KRM1, а также ключевых компонентов сигнального пути реакции клеток на обработку интерферонами -IFNAR1 и STAT2. Установлены существенные различия в потребности отдельных штаммов энтеровирусов в клеточных рецепторах, а также различия в способности отдельных штаммов энтеровирусов преодолевать подавляющее действие интерферона. Разработана система для виртуального предсказания используемых

вирусом клеточных рецепторов на основании анализа первичной структуры участков, кодирующих белки вириона.

ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ

Полученные при выполнении работы панели клеток с нокаутом генов отдельных поверхностных рецепторов для энтеровирусов позволяют проводить быструю идентификацию потребности новых выделяемых штаммов энтеровирусов в определенном клеточном рецепторе для проникновения в клетку и инициирования вирусной репликации. Такие панели имеют практическую ценность для функциональной классификации новых непатогенных энтеровирусов, используемых в качестве онколитических терапевтических штаммов. Панели нокаутных клеток также могут быть использованы для разделения отдельных вирусных штаммов из смесей вирусов, получаемых в процессе первичного выделения вирусов из биоматериала. Результаты работы вносят вклад в понимание механизмов онколитического действия непатогенных энтеровирусов человека. Панели клеток также позволяют выявить вирусные штаммы, которые не используют известные в настоящее время клеточные рецепторы, а, следовательно, для таких штаммов потребуется идентификация новых поверхностных рецепторов. По результатам функциональной классификации энтеровирусных штаммов, проведенной с помощью созданных панелей нокаутных клеток, возможно формирование терапевтических панелей вирусов, совокупное применение которых позволит подбирать эффективные препараты для каждого больного. Предварительный анализ образца опухоли пациента позволит подобрать персонифицированный набор вирусных штаммов, который окажется эффективным для данного пациента. Поэтому вопрос об установлении необходимость того или иного клеточного рецептора для каждого вируса имеет не только фундаментальное, но и важное практическое значение.

СТРУКТУРА И ОБЪЕМ ДИССЕРТАЦИИ

Диссертационная работа изложена на 163 страницах машинописного текста и включает введение, обзор литературы, собственные исследования, заключение, выводы и список используемой литературы (307 источников). Работа содержит 17 таблиц и 36 рисунков.

ВКЛАД АВТОРА

Соискатель непосредственно участвовала в разработке и корректировке выполненного исследования. Самостоятельно проведен анализ специальной современной российской и зарубежной литературы в области заявленной проблемы. Соискатель участвовала в проведении всех экспериментальных исследований in vitro, лично проводила статистическую обработку результатов. По результатам проведенной работы был выполнен анализ полученных данных и сформулированы достоверно обоснованные выводы. Высокопроизводительное секвенирование на платформе Illumina выполнялось на оборудовании ЦКП «Геном» ИМБ РАН.

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Основные положения диссертации были представлены и обсуждены на следующих конференциях: 61-я Всероссийская научная конференция МФТИ (Москва 19 - 25 ноября 2018); 62-я Всероссийская научная конференция МФТИ (Москва 18 - 23 ноября 2019); Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019» (Москва 8 - 12 апреля 2019); FEBS Congress 2019 (Краков, Польша, 6-11 июля 2019).

Апробация диссертации была проведена на совместном заседании лаборатории пролиферации клеток ФБГУН Института молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта Российской академии наук.

ПУБЛИКАЦИИ

По теме научного исследования было опубликовано 9 научных работ в том числе 5 статей и 4 тезиса. Статьи в рецензируемых журналах:

1. А. О. Желтухин, А. В. Соболева, А. О. Сосновцева, Т. Х. Ле, Г. В. Ильинская, Д. В. Кочетков, А. В. Липатова, П. М. Чумаков. Энтеровирусы человека проявляют избирательную онколитическую активность на модели ксенотрансплантатов мультиформной глиобластомы человека в иммунодефицитных мышах // Вестник РГМУ. -2018 . -Т.2. - С.42 -48.

2. А. В. Липатова, Т. Х. Ле, А. О. Сосновцева,Ф. Э. Бабаева, Д. В. Кочетков, П. М. Чумаков. Влияние рецепторов клетки на чувствительность опухолевых клеток к онколитическим энтеровирусам // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. -2018. -Т. 166. -№ 7. -С. 66 -70

3. А. С. Сидоренко, А. О. Желтухин, Т. Х. Ле, А. В. Соболева, А. В. Липатова, Д. А. Гольбин, П. М. Чумаков. Персистирование онколитического энтеровируса Коксаки А7 в подкожных мышиных ксенотрансплантатах глиобластом человека при экспериментальной терапию.// Вестник РГМУ -2018. -Т.3. -С. 41 -45

4. Т. Х. Ле, П. М. Чумаков. Клеточные трансмембранные белки, используемые энтеровирусами для проникновения в клетки // Естественные и технические науки. -2019 -Т. 9 -С. 52 -64

5. Т. Х. Ле, А. В. Липатова, М. А. Вольская, О. А. Тихонова, П. М. Чумаков. Состояние сигнального пути ЖК/БТЛТ влияет на чувствительность опухолевых клеток к онколитическим энтеровирусам // Молекулярная биология. -2020. -Т.53 №4, С.

Тезисы конференций:

6. Т. Х. Ле, П. М. Чумаков. Влияния уровней экспрессии СВ155/РУЯ на чувствительность опухолевых клеток человека к энтеровирусов. Материалы конференции "61 -я Всероссийская научная конференция МФТИ" -Москва, 2018.

7. Т. Х. Ле. Получение культур клеток с нокаутом отдельных рецепторов проникновения вирусов для формирования панели онколитических энтеровирусов, имеющих различающиеся спектры воздействия на опухолевые клетки человека. Материалы международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов -2019», Москва, 2019.

8. Le T. H., Chumakov P. M. A diagnostic panel of HEK293T cell sublines with knockouts of the genes for virus -entry receptors and its use for the development of sets of oncolytic enteroviruses // FEBS Open Bio. - 2019. - V. 9. - P. 399 - 400.

9. Т. Х. Ле. Изучение зависимости онколитической активности непатогенных штаммов энтеровирусов человека от состояния сигнальных путей интерферонового ответа на клетки. Материалы конференции "62 -я Всероссийская научная конференция МФТИ" -Москва, 2019

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Охарактеризованы семь новых штаммов непатогенных энтеровирусов человека, обнаруживающих высокую онколитическую активность на моделях in vitro. По результатам секвенирования генома установлена степень их родства с прототипными штаммами энтеровирусов.

2. Модельные линии рака толстого кишечника демонстрируют дифференциальную чувствительность к различным непатогенным энтеровирусным штаммам, варьирующуюся в широких пределах.

3. На основе трех линий клеток чувствительных к энтеровирусам получены панели нокаутных клеток с экспериментально подтвержденными нарушениями экспрессии генов каждого из известных рецепторов для энтеровирусов.

4. С помощью панелей нокаутных клеток определены потребности в клеточных рецепторах для нескольких новых энтеровирусных штаммов, изолированных от здоровых детей.

5. С помощью клеток нокаутных по отдельным рецепторам продемонстрирована возможность успешного разделения энтеровирусных штаммов из их смесей.

6. На основании анализа структурного родства капсидных белков энтеровирусв с результатами тестирования потребности в рецепторах разработан подход, с помощью которого возможно проводить предсказания использования рецепторов для новых штаммов энтеровирусов.

7. Установлено, что в клетках с нокаутом ключевых генов ответа на обработку интерфероном (IFNAR1 и STAT2) даже в отсутствии интерферона повышена продуктивность энтеровирусной инфекции, а энтеровирусные штаммы обладают варьирующейся способностью преодолевать подавляющее действие интерфероновой системы.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1 Вирусный онколиз

Проблема метастатазирования злокачественных заболеваний по-прежнему остается нерешенной. До 1900-х годов противоопухолевая сводилась к хирургическому удалению опухоли. В начале XX века стали появляться альтернативные методы лечения, такие как радиотерапия, химиотерапия, а затем и иммунотерапия [34]. Несмотря на значительный прогресс в борьбе с злокачественными новообразованиями, актуальным является поиск эффективных, менее токсичных и более точных методов лечения.

Вирусный онколиз — это новый подход к терапии онкологических заболеваний, основанный на использовании природных непатогеных штаммов вирусов или генетически модифицированных вирусов, которые способны селективно реплицироваться в опухолевых клетках и вызывать гибель преимущественно злокачественных клеток, при этом не повреждая нормальные ткани [35-37]. В России исследования онколитических вирусов были начаты в период 1960-1970-х годов профессором М. К. Ворошиловой (Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов АМН СССР), но сама идея использования вирусов в борьбе с онкологическими заболеваниями человека зародилась еще задолго до этого [36]. Ещё в начале прошлого века было замечено, что после перенесенных вирусных инфекций у некоторых пациентов наблюдалась спонтанная ремиссия онкологических заболеваний [34]. Дальнейшее исследование онколитических свойств вирусов продолжалось параллельно с изучением биологии вирусов и механизмов злокачественной трансформации клеток. Первые обзорные работы онколитических свойств вирусов появились в 50-е годы [38, 39, 40], однако в 70-80-х годах исследования были приостановлены и возобновились лишь в 90-е годы с развитием методов генной инженерии и улучшением понимания молекулярных основ биологических процессов [34].

В настоящее время, основными требованиями, предъявляемыми к онколитическим вирусам, являются эффективность в отношении гетерогенной и постоянно меняющейся популяции опухолевых клеток, безопасность и неспособность повреждать нормальные ткани. Под эффективностью понимается способность вируса проникать в злокачественные клетки, реплицироваться в клетках с высоким уровнем амплиферации и максимально полно и быстро лизировать их, несмотря на наличие противовирусного иммунного ответа. Кроме того, одним из самых важных направлений является возможность создания рекомбинантных вирусов с целью получения штаммов с программируемыми свойствами. Например, популярным подходом к увеличению селективности является создание рекомбинантных вирусов, нацеленных на конкретные мишени, специфичные для опухоли. С этой целью участки генома вирусов подвергают различным модификациям, таким как делеция в конкретном гене, вставка опухолеспецифических промоторов, псевдотипирование, инсерция последовательностей, кодирующих малые интерферирующие РНК [40]. Благодаря развитию методов генной инженерии в последние несколько лет появились новые методы редактирования генома, такие как, например, CRISPR/Cas9, ZFN и TALEN, с помощью которых можно не только нокаутировать ген, но и вставить новый участок ДНК. Данные методы предоставляют ученым возможность найти новые подходы к усовершенствованию онколитического потенциала вирусов.

Онколитические вирусы представляют собой перспективный класс противоопухолевых агентов, благодаря способности селективно инфицировать и разрушать клетки опухоли [41]. В значительной степени действие онколитических вирусов основано на том, что опухолевые клетки являются более восприимчивыми к инфекциям по целому ряду причин, которые будут описаны ниже.

1. Увеличение физической доступности опухолевых клеток для вирусов по сравнению с клетками нормальных тканей. Опухоль обладает дезорганизованной структурой с нарушением тканевых барьеров и межклеточных контактов [15]. Кровоснабжение новообразований обеспечивают быстро растущие сосуды с

хорошо проницаемыми стенками. В связи с этим вирусу проще распространяться между клетками опухоли, чем по здоровым тканям.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Ле Тхи Хоа, 2020 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Holohan C., Van Schaeybroeck S., Longley D.B., Johnston P.G. Cancer drug resistance: an eVving paradigm // Nat Rev Cancer. -2013. -V. 13. -P. 714 -726.

2. Peeper D.S. Cancer drug resistance: old concept, novel solutions required // Molecular oncology. -2014. -V. 8. -P. 1064 -1066.

3. Unger F.T., Witte I., David K.A. Prediction of individual response to anticancer therapy: historical and future perspectives // Cellular and molecular life sciences: CMLS. -2014. -V. -P.

4. Siddiqui F., Liu A.K., Watkins -Bruner D., Movsas B. Patient -reported outcomes and survivorship in radiation oncology: overcoming the cons // J Clin Oncol. -2014. -V. 32. -P. 2920 -2927.

5. Seretis C., Youssef H. Quality of life after cytoreductive surgery and intraoperative hyperthermic intraperitoneal chemotherapy for peritoneal surface malignancies: A systematic review // European journal of surgical oncology: the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology. -2014. -V. 40. -P. 1605 -1613.

6. Mols F., Beijers T., Vreugdenhil G., van de Poll -Franse L. Chemotherapy -induced peripheral neuropathy and its association with quality of life: a systematic review // Supportive care in cancer: official journal of the Multinational Association of Supportive Care in Cancer. -2014. -V. 22. -P. 2261 -2269.

7. Miltenburg N.C., Boogerd W. Chemotherapy -induced neuropathy: A comprehensive survey // Cancer Treat Rev. -2014. -V. 40. -P. 872 -882.

8. Bianchini C., Ciorba A., Pelucchi S., Piva R., Pastore A. Targeted therapy in head and neck cancer // Tumori. -2011.-V. 97.-P. 137 -141.

9. Litzow M.R. Pharmacotherapeutic advances in the treatment of acute lymphoblastic leukaemia in adults // Drugs.- 2011.- V. 71.-P. 415 -442.

10. Samant R.S., Shevde L.A. Recent advances in anti -angiogenic therapy of cancer // Oncotarget.- 2011.- V. 2.-P. 122 -134.

11. Sze D.Y., Reid T.R., Rose S.C. Oncolytic virotherapy // Journal of vascular and interventional radiology : JVIR. -2013. -V. 24. -P. 1115 -1122.

12. Mullen, J. T. and Tanabe, K. K. (2002) Viral oncolysis. The Oncologist, 7: 106 -119.

13. Suskind R.G., Huebner R.J., Rowe W.P., Love R. Viral agents oncolytic for human tumors in heterologous host; oncolytic effect of Coxsackie B viruses.Proc. Soc. Exp. Biol. Med.- 1957.-V. 94.-P. 309-318

14. Everts B., van der Poel H.G. Replication selective oncolytic viruses in the treatment of cancer // Cancer Gene Ther.- 2005.-V. 12.-P. 141-161.

15. Dudley A.C. Tumor endothelial cells // Cold Spring Harb Perspect Med-2012. -V.2.- №3. -P.a006536.

16. Heiber J.F.,Barber G.N. Evaluation of innate immune signaling pathways in transformed cells // Methods Mol Biol. -2012. -V. 797. -P. 217 -238.

17. Li Q.,Tainsky M.A. Epigenetic silencing of IRF7 and/or IRF5 in lung cancer cells leads to increased sensitivity to oncolytic viruses // PLoS One. -2011. -V. 6. -P. e28683.

18. Naik S.,Russell S.J. Engineering oncolytic viruses to exploit tumor specific defects in innate immune signaling pathways // Expert Opin Biol Ther. -2009. -V.9. -P. 1163 -1176.

19. Zhu H., Nelson D.R., Crawford J.M., Liu C. Defective Jak -Stat activation in hepatoma cells is associated with hepatitis C viral IFN -alpha resistance // J Interferon Cytokine Res. -2005. -V. 25. -P. 528 -539.

20. Balachandran S.,Barber G.N. Defective translational control facilitates vesicular stomatitis virus oncolysis // Cancer cell. -2004. -V. 5. -P. 51 -65.

21. Cascallo M., Capella G., Mazo A., Alemany R. Ras -dependent oncolysis with an adenovirus VAI mutant // Cancer Res. -2003. -V. 63. -P. 5544 -5550.

22. Stojdl D.F., Lichty B., Knowles S., Marius R., Atkins H., Sonenberg N., Bell J.C. Exploiting tumor -specific defects in the interferon pathway with a previously unknown oncolytic virus // Nat Med. -2000. -V. 6. -P. 821 -825.

23. Muller P.A., Vousden K.H. Mutant p53 in cancer: new functions and therapeutic opportunities // Cancer Cell. -2014. -V. 25.- №3. -P. 304 -17.

24. Vaha-Koskela M., Hinkkanen A. Tumor Restrictions to Oncolytic Virus // Biomedicines. - 2014. - V. 2.- № 2. - P. 163-194.

25. Lawler S. E. et al. Oncolytic viruses in cancer treatment: a review //JAMA oncology. - 2017. - V. 3. - №. 6. - P. 841-849

26. Pack G. T. Note on the experimental use of rabies vaccine for melanomatosis // AMA Arch Derm Syphilol. - 1950. - V. 62.- № 5. - P. 694-5.

27. Matveeva O. V., Guo Z.S., Shabalina S. V., Chumakov P. M. Oncolysis by paramyxoviruses: multiple mechanisms contribute to therapeutic efficacy // Molecular Therapy - oncolytics. - 2015. - V. 2. - P. 1-11.

28. Marchini A., Bonifati S., Scott E. M., Angelova A. L., Rommelaere J. Oncolytic parvoviruses: from basic virology to clinical applications // Virol J. - 2015. - V. 12.- № 1. - P. 6.

29. Heise C., Kirn D. H. Replication-selective adenoviruses as oncolytic agents // J Clin Invest. - 2000. - V. 105.- № 7. - P. 847-51.

30. Thirukkumaran C., Morris D. G. Oncolytic Viral Therapy Using Reovirus // Methods Mol Biol. - 2015. - V. 1317. - P. 187-223.

31. Kohlhapp F. J., Zloza A., Kaufman H. L. Talimogene laherparepvec (T-VEC) as cancer immunotherapy // Drugs Today (Barc). - 2015. - V. 51.- № 9. - P. 549-58.

32. Lundstrom K. Oncolytic Alphaviruses in Cancer Immunotherapy // Vaccines (Basel). - 2017. - V. 5.- № 2.

33. Mercer J., Schelhaas M., Helenius A. Virus entry by endocytosis // Annu Rev Biochem. - 2010. - V. 79. - P. 803-33.

34. Kelly E., Russell S. J. History of oncolytic viruses: genesis to genetic engineer ing // Mol Ther. -2007. -V.15.- №4. -P.651 -9.

35. Kaufman H. L., Frederick J. K., Andrew Z. Oncolytic Viruses: A New Class of Immunotherapy Drugs // Nature reviews. Drug discovery. -2015. -V.14.(9). -P.642-662

36. Voroshilova M. K. Potential use of nonpathogenic enteroviruses for control of human disease // Prog Med Virol-1989. -V.36. -P.191 -202.

37. Chiocca E. A., Rabkin S. D. Oncolytic viruses and their application to cancer immunotherapy. //Cancer immunology research. - 2014. - V. 2. - №. 4. - P. 295-300.

38. Higgins G. K., Pack G. T. Virus therapy in the treatment of tumors // Bull Hosp Joint Dis. -1951. -V.12.-№2.-P. 379 -382.

39. Svejda J. Viruses and tumors // Lek List. -1950. -V.5.- №23. -P.688 -9

40. Wong H. H., Lemoine N. R., Wang Y. Oncolytic Viruses for Cancer Therapy: Overcoming the Obstacles // Viruses. -2010. -V.2.- №1. -P.78 -106.

41. Park G. T., Choi K. C. Advanced new strategies for metastatic cancer treatment by therapeutic stem cells and oncolytic virotherapy // Oncotarget. -2016. -V. 7.- № 36 -P.58684 -58695.

42. Donina S. et al. Adapted ECHO -7 virus Rigvir immunotherapy (oncolytic virotherapy) prolongs survival in melanoma patients after surgical excision of the tumour in a retrospective study // Melanoma Res.-2015.-V.25.- №5. -P.421 -6.

43. Alberts P. et al. Long -term treatment with the oncolytic ECHO -7 virus Rigvir of a melanoma stage IV M1c patient, a small cell lung cancer stage IIIA patient, and a histiocytic sarcoma stage IV patient -three case reports // APMIS.-2016-V.124.-№10. -P.896 -904.

44. Garber K. China approves world's first oncolytic virus therapy for cancer treatment // J Natl Cancer Inst. -2006. -V.98.- №5. -P.298 -300.

45. Andtbacka R.H. et al. Talimogene Laherparepvec Improves Durable Response Rate in Patients With Advanced Melanoma // J Clin Oncol. -2015. -V.33.- №25. -P.2780 -8.

46. Hyypia T. et al. Classification of enteroviruses based on molecular and biological properties // J Gen Virol. -1997. -V.78.- №1. -P.1 -11.

47. Oberste M.S. et al. Molecular eVution of the human enteroviruses: correlation of serotype with VP1 sequence and application to picornavirus classification // J Virol.-1999. -V.73.-№3. -P.1941 -8.

48. Ostrom Q.T. et al. American Brain Tumor Association Adolescent and Young Adult Primary Brain and Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2008 -2012 // Neuro Oncol. -2016. -V.18.-№1. -P.il -i50.

49. Wang S.M., Liu C.C. Enterovirus 71: epidemiology, pathogenesis and management // Expert Rev Anti Infect Ther. -2009. -V.7.- №6. -P.735 -42.

50. Jarvis T.C., Kirkegaard K. Poliovirus RNA recombination: mechanistic studies in the absence of selection // EMBO J. -1992. -V.ll.-№8. -P.3135 -45.

51. Bouslama L., Nasri D., Chollet L., Belguith K., Bourlet T., Aouni M., Pozzetto

B., Pillet S. Natural recombination event within the capsid genomic region leading to a chimeric strain of human enterovirus B // J. Virol. -2007. -V.81. -P. 8944-8952.

52. Gharbi, J., Hiar R., M'hadheb M. B., Jaidane H., Bouslama L., N'saibia S., Aouni M. Nucleotide sequences of IRES domains IV and V of natural ECHO virus type 11 isolates with different replicative capacity phenotypes // Virus Genes. -2006. -V. 32. -P.269 -76

53. Patel D. D., Kapoor A., Ayyagari A., Dhole T. N. Development of a simple restriction fragment length polymorphism assay for subtyping of coxsackie B viruses // J Virol Methods. -2004. -V. 120. -P. 167-172.

54. Чумаков П.М., Морозова В.В., Бабкин И.В., Байков И.К., Нетесов С.В., Тикунова Н.В. Онколитические энтеровирусы // Мол. биол. -2012. -Т. 46. -№ 5. -

C. 712 -725.

55. Rohll J. B., Percy N., Ley R., Evans D. J., Almond J . W., Barclay W. S. The 5' -untranslated regions of picornavirus RNAs contain independent functional domains essential for RNA replication and translation // J Virol. -1994. -V.68. N. 7. -P. 4384 -4391

56. Mirmomeni M. H., Hughes P. J. Stanway G. An RNA tertiary structure in the 3' untranslated region of enteroviruses is necessary for efficient replication // J Virol. -1997. -V.71. N. 3. -P. 2363 -2370.

57. Flanegan J. B., Petterson R. F., Ambros V., Hewlett N. J., Baltimore D. Covalent linkage of a protein to a defined nucleotide sequence at the 5' -terminus of virion and

replicative intermediate RNAs of poliovirus // Proc Natl Acad Sci U S A. -1977. -V. 74 -P. 961 -965.

58. Lee Y.F., Nomoto A., Detjen B.M., Wimmer E. A protein covalently linked to poliovirus genome RNA // Proc Natl Acad Sci U S A. -1977. -V. 74. -P. 59 -63.

59. Racaniello V. R. Picornaviridae: The viruses and their replication // in H. P. Knipe DM, Griffin DE, Lamb RA, Martin MA, Roizman B, Strauss SE,, eds.Fields Virology. USA, 5th ed Lippincott Williams & Wilkins. -2007. -P. 795 -38.

60. Rueckert R. R. Picornaviridae: the viruses and their replication //In: Fields B.N., Knipe D.M., Howley P.M., eds. Fields Virology. Philadelphia PA: LippincottRaven. Press. -1996. -P. 609 -654.

61. Gabor R., Akos B., Zoltan T., Phan T. G., Delwart E., and Pankovics P. highly divergent picornavirus in an amphibian, the smooth newt (Lissotriton vulgaris) // Journal of General Virology. -2015. -V.96. -P.2607 -2613.

62. Ehrenfeld E, Domingo E, Roos RP, Microbiology AS for. The Picornaviruses. ASM Press, 2010.

63. Kräusslich H. G., Nicklin M. J. H., Toyoda H., Etchison D., and Wimmer E. Poliovirus proteinase 2A induces cleavage of eukaryotic initiation factor 4F polypeptide p220 // J. Virol.- 1987.-V. 61.-P.2711-2718.

64. Jore J., De Geus B., Jackson R. J., Pouwels P. H. and Enger-Valk B. E. Poliovirus protein 3CD is the active protease for processing of the precursor protein P1 in vitro // J Gen Virol. -1988.-V. 69.-P.1627-36.

65. Kimura M. A simple method for estimating eVutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences // J. Mol. -1980.- V. 16. -P.111 -120.

66. Bopegamage S., Borsanyiova M., Vargova A., Petrovicova A., Benkovicova M., and Gomolcak P. Coxsackievirus infection of mice. I. Viral kinetics and histopathological changes in mice experimentally infected with coxsackieviruses B3 and B4 by oral route //Arch Virol. -2003. -V. 47. -P. 245-251

67. Summers D. F., Maizel J. V. Evidence for large precursor proteins in poliovirus synthesis // Proc Natl Acad Sci U S A. -1968. -V. 5. -P. 966 -971.

68. Au G. G., Beagley L. G., Haley E. S., Barry R. D., Shafren D. R. Oncolysis of malignant human melanoma tumors by Coxsackieviruses A13, A15 and A18 // Virol J. - 2011. -V. 8. -P. 22.

69. Taylor M. W., Cordell B., Souhrada M., Prather S. Viruses as an aid to cancer therapy: regression of solid and ascites tumors in rodents after treatment with bovine enterovirus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1971. -V. 68. -P. 836-840.

70. Haley E. S., Au G. G., Carlton B. R., Barry R. D., Shafren D. R. Regional administration of oncolytic ECHOvirus 1 as a novel therapy for the peritoneal dissemination of gastric cancer // J Mol Med. - 2009. -V. 87. -P. 385-399.

71. Berry L. J., Au G. G., Barry R. D., Shafren D. R. Potent oncolytic activity of human enteroviruses against human prostate cancer // The Prostate. - 2008. -V. 68. -P. 577-587.

72. Gromeier M., Lachmann S., Rosenfeld M. R., Gutin P. H., Wimmer E. Intergeneric poliovirus recombinants for the treatment of malignant glioma // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2000. -V. 97. -P. 6803-6808.

73. Toyoda H., Wimmer E., Cello J. Oncolytic poliovirus therapy and immunization with poliovirus-infected cell lysate induces potent antitumor immunity against neuroblastoma in vivo // International Journal of Oncology. - 2011. -V. 38. -P. 81-87.

74. Skelding K.A., Barry R.D., Shafren D.R. Systemic targeting of metastatic human breast tumor xenografts by Coxsackievirus A21 // Breast Cancer Res Treat. - 2009. -V. 113. -P. 21-30.

75. Au G.G., Lindberg A.M., Barry R.D., Shafren D.R. Oncolysis of vascular malignant human melanoma tumors by Coxsackievirus A21 // Int J Oncol. - 2005. -V. 26. -P. 1471-1476.

76. Goetz C., Gromeier M. Preparing an oncolytic poliovirus recombinant for clinical application against glioblastoma multiforme // Cytokine Growth Factor Rev-2010. -V.21.- №2-3. -P.197-203.

77. Shafren D. R., Sylvester D., Johansson E. S., Campbell I. G., Barry R. D. Oncolysis of human ovarian cancers by ECHOvirus type 1 // Int J Cancer -2005. -V. 115. -P. 320-328.

78. Au G.G., Lincz L.F., Enno A., Shafren D.R. Oncolytic Coxsackievirus A21 as a novel therapy for multiple myeloma // Br J Haematol. - 2007. -V. 137. -P. 133-141.

79. Shafren D.R., Bates R.C., Agrez M.V., Herd R.L., Burns G.F., Barry R.D. Coxsackieviruses B1, B3, and B5 use decay accelerating factor as a receptor for cell attachment // J Virol. - 1995. -V. 69. -P. 3873-3877.

80. Shafren D.R. Viral cell entry induced by cross-linked decay-accelerating factor // J Virol. - 1998. -V. 72. -P. 9407-9412.

81. Shafren D.R., Au G.G., Nguyen T., Newcombe N.G., Haley E.S., Beagley L., Johansson E.S., Hersey P., Barry R.D. Systemic therapy of malignant human melanoma tumors by a common cold-producing enterovirus, coxsackievirus a21 // Clin Cancer Res. - 2004. -V. 10. -P. 53-60.

82. Dobrikova E.Y., Broadt T., Poiley-Nelson J., Yang X., Soman G., Giardina S., Harris R., Gromeier M. Recombinant oncolytic poliovirus eliminates glioma in vivo without genetic adaptation to a pathogenic phenotype // Mol Ther. - 2008. -V. 16. -P. 1865-1872.

83. Skelding K.A., Barry R.D., Shafren D.R. Enhanced oncolysis mediated by Coxsackievirus A21 in combination with doxorubicin hydrochloride // Invest New Drugs. - 2010. -V. 21. -P. 21.

84. Wodarz D. Viruses as antitumor weapons: defining conditions for tumor remission // Cancer Res. - 2001. -V. 61. -P. 3501-3507.

85. Bais S., Bartee E., Rahman M.M., McFadden G., Cogle C.R. Oncolytic virotherapy or hematological malignancies // Adv Virol. - 2012. -V. 186512. -P. 29.

86. Bradley S., Jakes A.D., Harrington K., Pandha H., Melcher A., ErringtonMais F. Applications of coxsackievirus A21 in oncology // Oncolytic virotherapy. - 2014. -V. 3. -P. 47-55.

87. Dobrikova E., Florez P., Bradrick S., Gromeier M. Activity of a type 1 picornavirus internal ribosomal entry site is determined by sequences within the 3' nontranslated region // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2003. -V. 100. -P. 15125-15130.

88. Toyoda H., Ido M., Hayashi T., Gabazza E.C., Suzuki K., Kisenge R.R., Kang J., Hori H., Komada Y. Experimental treatment of human neuroblastoma using liveattenuated poliovirus // International Journal of Oncology. - 2004. -V. 24. -P. 4958

89. Toyoda H., Yin J., Mueller S., Wimmer E., Cello J. Oncolytic treatment and cure of neuroblastoma by a novel attenuated poliovirus in a novel poliovirus-susceptible animal model // Cancer Research. - 2007. -V. 67. -P. 2857-2864.

90. Mendelsohn C.L., Wimmer E., Racaniello V.R. Cellular receptor for poliovirus: molecular cloning, nucleotide sequence, and expression of a new member of the immunoglobulin superfamily // Cell. - 1989. -V. 56. -P. 855-865

91. Ansardi D.C., Porter D.C., Jackson C.A., Gillespie G.Y., Morrow C.D. RNA replicons derived from poliovirus are directly oncolytic for human tumor cells of diverse origins // Cancer Research. - 2001. -V. 61. -P. 8470-8479

92. Ochiai H., Campbell S.A., Archer G.E., Chewning T.A., Dragunsky E., Ivanov A., Gromeier M., Sampson J.H. Targeted therapy for glioblastoma multiforme neoplastic meningitis with intrathecal delivery of an oncolytic recombinant poliovirus // Clin Cancer Res. - 2006. -V. 12. -P. 1349-1354.

93. Mercer J., et al. Virus entry by endocytosis // Annual Review of Biochemistry. 2010 -V. 79. -P. 803 -33.

94. Hynes R. O. Integrins: versatility, modulation, and signaling in cell adhesion // Cell. -1992. -.V. 69. -P. 11 -25.

95. Barczyk M., et al. Integrins // Cell Tissue Res. -2010. -V. 339. -P. 269-280.

96. Xing L., Huhtala M., Pietiainen V., Kapyla J., Vuorinen K., Marjomaki V., Heino J., Johnson M. S., Hyypia T., Cheng R. H. Structural and functional analysis of integrin alpha2I domain interaction with ECHOvirus 1 // J Biol Chem. - 2004. - V. 279.- № 12. - P. 11632-8.

97. Pietiainen V., Marjomaki V., Upla P., Pelkmans L., Helenius A., Hyypia T. ECHOvirus 1 endocytosis into caveosomes requires lipid rafts, dynamin II, and signaling events // Mol Biol Cell. - 2004. - V. 15.- № 11. - P. 4911-25.

98. Triantafilou K., Triantafilou M. Lipid raft microdomains: key sites for Coxsackievirus A9 infectious cycle // Virology. - 2003. - V. 317.- № 1. - P. 128-35.

99. Koike S., Horie H., Ise I., Okitsu A., Yoshida M., Iizuka N., Takeuchi K., Takegami T., Nomoto A. The poliovirus receptor protein is produced both as membrane-bound and secreted forms // Embo j. - 1990. - V. 9.- № 10. - P. 3217-24

100. Solecki D., Bernhardt G., Lipp M., Wimmer E. Identification of a nuclear respiratory factor-1 binding site within the core promoter of the human polio virus receptor/CD155 gene // J Biol Chem. - 2000. - V. 275.- № 17. - P. 12453-62.

101. Staunton D. E., Marlin S. D., Stratowa C., Dustin M. L., Springer T. A. Primary structure of ICAM-1 demonstrates interaction between members of the immunoglobulin and integrin supergene families // Cell. - 1988. - V. 52.- № 6. - P. 925-33.

102. Grant R. A., Hiremath C. N., Filman D. J., Syed R., Andries K., Hogle J. M. Structures of poliovirus complexes with anti-viral drugs: implications for viral stability and drug design // Curr Biol. - 1994. - V. 4.- № 9. - P. 784-97.

103. Strauss M., Filman D. J., Belnap D. M., Cheng N., Noel R. T., Hogle J. M. Nectin-like interactions between poliovirus and its receptor trigger conformational changes associated with cell entry // J Virol. - 2015. - V. 89.- № 8. - P. 4143-57.

104. Bergelson J. M., Coyne C. B. Picornavirus entry // Adv Exp Med Biol. - 2013. -V. 790. - P. 24-41.

105. Brandenburg B., Lee L. Y., Lakadamyali M., Rust M. J., Zhuang X., Hogle J. M. Imaging poliovirus entry in live cells // PLoS Biol. - 2007. - V. 5.- № 7. - P. e183.

106. Vaha-Koskela M., Hinkkanen A. Tumor Restrictions to Oncolytic Virus // Biomedicines. - 2014. - V. 2.- № 2. - P. 163-194.

107. Staunton D. E., Marlin S. D., Stratowa C., Dustin M. L., Springer T. A. Primary structure of ICAM-1 demonstrates interaction between members of the

immunoglobulin and integrin supergene families // Cell. - 1988. - V. 52.- № 6. - P. 925-33.

108. Languino L. R., Plescia J., Duperray A., Brian A. A., Plow E. F., Geltosky J. E., Altieri D. C. Fibrinogen mediates leukocyte adhesion to vascular endothelium through an ICAM-1 -dependent pathway // Cell. - 1993. - V. 73.- № 7. - P. 1423-34.

109. Newcombe N. G., Andersson P., Johansson E. S., Au G. G., Lindberg A. M., Barry R. D., Shafren D. R. Cellular receptor interactions of C-cluster human group A coxsackieviruses // J Gen Virol. - 2003. - V. 84.- № Pt 11. - P. 3041-50.

110. Languino L. R., Duperray A., Joganic K. J., Fornaro M., Thornton G. B., Altieri D. C. Regulation of leukocyte-endothelium interaction and leukocyte transendothelial migration by intercellular adhesion molecule 1-fibrinogen recognition // Proc Natl Acad Sci U S A. - 1995. - V. 92.- № 5. - P. 1505-9.

111. Staunton D.E., Dustin M.L., Erickson H.P., and Springer T.A. The arrangement of the immunoglobulin-like domains of ICAM-1 and the binding sites for LFA-1 and rhinovirus // Cell.-1990.- V. 61.-P. 243-254.

112. Springer, T.A. Adhesion receptors of the immune system // Nature.-1990.-V. 346.-P. 425-434

113. Yang Y., Jun C.D., Liu J., Zhang R., and et al. Structural Basis for Dimerization of ICAM-1 on the Cell Surface // Molecular Cell.-2004.- V. 14.-P. 269-276.

114. Stanley P., McDowall A., Bates P. A., Brashaw J., and Hogg N. The second domain of intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1) maintains the structural integrity of the leucocyte function-associated antigen-1 (LFA-1) ligand-binding site in the first domain //Biochem. J.-2000.-V. 351.-P. 79-86.

115. Diamond M.S., Staunton D.E., de Fougerolles A.R. et al. ICAM-1 (CD54): a counterreceptor for Mac-1 (CD11b/CD18) // J Cell Biol. - 1990. - V. 111. - №6. - P. 3129-3139.

116. Carpen O., Pallai P., Staunton D.E., Springer T.A. Association of Intercellular Adhesion Moleculeq (ICAM-1) with Actin-containing Cytoskeleton and -actinin // The Journal of Cell Biology.-1992.-V.18.-P. 1223-1234.

117. Heiska L., Alfthan K., Gronholm M., Vilja P., Vaheri A., and Carpen O. Association of ezrin with intercellular adhesion molecule-land -2 (ICAM-1 and ICAM-2). Regulation by phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate // J. Biol. Chem.-1998.-V. 273.-P. 21893-21900.

118. Burns L. J., Pooley J. C., Walsh D. J., Vercellotti G. M., Weber M. L., Kovacs A. Intercellular adhesion molecule-1 expression in endothelial cells is activated by cytomegalovirus immediate early proteins // Transplantation. - 1999. - V. 67.- № 1. -P. 137-44.

119. Minami T., Aird W. C. Endothelial cell gene regulation // Trends Cardiovasc Med. - 2005. - V. 15.- № 5. - P. 174-84.

120. Quagliaro L., Piconi L., Assaloni R., Da Ros R., Maier A., Zuodar G., Ceriello A. Intermittent high glucose enhances ICAM-1, VCAM-1 and E-selectin expression in human umbilical vein endothelial cells in culture: the distinct role of protein kinase C and mitochondrial superoxide production // Atherosclerosis. - 2005. - V. 183.- № 2. -P. 259-67.

121. Jahnke A., Johnson J.P. Intercellular adhesion molecule 1 (ICAM-1) is synergistically activated by TNF-alpha and IFN-gamma responsive sites // Immunobiol.-1995.-V. 193.-P. 305-314.

122. Dustin, M.L., R. Rothlein, A.K. Bhan, C.A. Dinarek, and T.A. Springer. Induction by IL1 and interfemy Tissue distribution, biochedistry, and function of a natuml adheience mdecule (ICAM-1) // J. Imrnud. -1986.-V.137.-P. 245-254.

123. Kolatkar P. R., Bella J., Olson N. H., Bator C. M., Baker T. S., Rossmann M. G. Structural studies of two rhinovirus serotypes complexed with fragments of their cellular receptor // Embo j. - 1999. - V. 18.- № 22. - P. 6249-59

124. Yamayoshi S., Iizuka S., Yamashita T., Minagawa H., Mizuta K., Okamoto M., Nishimura H., Sanjoh K., Katsushima N., Itagaki T., Nagai Y., Fujii K., Koike S. Human SCARB2-dependent infection by coxsackievirus A7, A14, and A16 and enterovirus 71 // J Virol. - 2012. - V. 86.- № 10. - P. 5686-96.

125. Yamayoshi S., Yamashita Y., Li J., Hanagata N., Minowa T., Takemura T., Koike S. Scavenger receptor B2 is a cellular receptor for enterovirus 71 // Nat Med. -2009. - V. 15.- № 7. - P. 798-801.

126. Yamayoshi S., Koike S. Identification of a human SCARB2 region that is important for enterovirus 71 binding and infection // J Virol. - 2011. - V. 85.- № 10. -P. 4937-46.

127. Kuronita T., Eskelinen E. L., Fujita H., Saftig P., Himeno M., Tanaka Y. A role for the lysosomal membrane protein LGP85 in the biogenesis and maintenance of endosomal and lysosomal morphology // J Cell Sci. - 2002. - V. 115.- № Pt 21. - P. 4117-31.

128. Eskelinen E. L., Tanaka Y., Saftig P. At the acidic edge: emerging functions for lysosomal membrane proteins // Trends Cell Biol. - 2003. - V. 13.- № 3. - P. 137-45.

129. Fujita H., Takata Y., Kono A., Tanaka Y., Takahashi T., Himeno M., Kato K. Isolation and sequencing of a cDNA clone encoding the 85 kDa human lysosomal sialoglycoprotein (hLGP85) in human metastatic pancreas islet tumor cells // Biochem Biophys Res Commun. - 1992. - V. 184.- № 2. - P. 604-11.

130. Dang M., Wang X., Wang Q., Wang Y., Lin J., Sun Y., Li X., Zhang L., Lou Z., Wang J., Rao Z. Molecular mechanism of SCARB2-mediated attachment and uncoating of EV71 // Protein Cell. - 2014. - V. 5.- № 9. - P. 692-703.

131. Hynes R. O. Integrins: versatility, modulation, and signaling in cell adhesion // Cell. - 1992. - V. 69.- № 1. - P. 11-25.

132. Barczyk M., Carracedo S., Gullberg D. Integrins // Cell Tissue Res. - 2010. - V. 339.- № 1. - P. 269-80.

133. Arnaout M. A., Goodman S. L., Xiong J. P. Structure and mechanics of integrin-based cell adhesion // Curr Opin Cell Biol. - 2007. - V. 19.- № 5. - P. 495-507.

134. Campbell I. D., Humphries M. J. Integrin structure, activation, and interactions // Cold Spring Harb Perspect Biol. - 2011. - V. 3.- № 3.

135. Giancotti F. G., Ruoslahti E. Integrin signaling // Science. - 1999. - V. 285.- № 5430. - P. 1028-32.

136. Ruoslahti E. Integrin signaling and matrix assembly // Tumour Biol. - 1996. - V. 17.- № 2. - P. 117-24.

137. Kawamura T., Endo Y., Yonemura Y., Nojima N., . Fujita H, Fujimura T., Obata T., Yamaguchi T., and Sasaki T. Significance of integrin alpha2/beta1 in peritoneal disseminationof a human gastric cancer xenograft model // Int J Oncol.- 2001.-V.18.-P.809-1

138. Sanders M. A., and Basson M. D. Collagen IV regulates Caco2 migration and ERK activation via alpha1beta1- and alpha2beta1-integrin-ependent Src kinase activation // Am J Physiol Gastro in test Liver Physiol.- 2004.-V. 286.-P.G547-57.

139. Sawhney R. S., Cookson M. M., Omar Y., Hauser J., and Brattain M. G. Integrin alpha 2-mediated ERK and calpain activation play a critical role in cell adhesion and motility via FAKsignaling- identification of a novel signaling pathway // J Biol Chem.-2006.-V.281.-P.8497-8510.

140. Yang C., Zeisberg M., Lively J. C., Nyberg P., Afdhal N., and Kalluri R. Integrin alpha1beta1 and alpha2beta1 are the key regulators of hepatocarcinoma cell invasion across the fibrotic matrix microenvironment // Cancer Res.-2003.-V.63.-P.8312-7.

141. Senger D. R., Claffey K. P., Benes J. E., Perruzzi C. A., Sergiou A. P., and Detmar M. Angiogenesis promoted by vascular endothelial growth factor: regulation through alpha1beta1 and alpha 2 beta1 integrins // Proc Natl Acad Sci U S A. - 1997.-V.94.-P.13612-7.

142. Detmar M. The alpha(1)beta(1) and alpha(2)beta(1) integrins provide critical support for vascular endothelial growth factor signaling, endothelial cell migration, and tumor angiogenesis // Am J Pathol.- 2002-.V.160.-P.195-204.

143. Brooks P.C., Clark R.A., Cheresh D.A. Requirement of vascular integrin alpha v beta 3 for angiogenesis // Science. -1994.-V.264.-P.569-571.

144. Merilahti P., Koskinen S., Heikkila O., Karelehto E., Susi P. Endocytosis of integrin-binding human picornaviruses // Adv Virol. - 2012. - V. 2012. - P. 547530.

145. Williams C. H., Kajander T., Hyypia T., Jackson T., Sheppard D., Stanway G. Integrin alpha v beta 6 is an RGD-dependent receptor for coxsackievirus A9 // J Virol. - 2004. - V. 78.- № 13. - P. 6967-73.

146. Triantafilou M., Wilson K. M., Triantafilou K. Identification of ECHOvirus 1 and coxsackievirus A9 receptor molecules via a novel flow cytometric quantification method // Cytometry. - 2001. - V. 43.- № 4. - P. 279-89.

147. King S. L., Kamata T., Cunningham J. A., Emsley J., Liddington R. C., Takada Y., Bergelson J. M. ECHOvirus 1 interaction with the human very late antigen-2 (integrin alpha2beta1) I domain. Identification of two independent virus contact sites distinct from the metal ion-dependent adhesion site // J Biol Chem. - 1997. - V. 272.-№ 45. - P. 28518-22.

148. Ylipaasto P., Eskelinen M., Salmela K., Hovi T., Roivainen M. Vitronectin receptors, alpha v integrins, are recognized by several non-RGD-containing ECHOviruses in a continuous laboratory cell line and also in primary human Langerhans' islets and endothelial cells // J Gen Virol. - 2010. - V. 91.- № Pt 1. - P. 155-65.

149. Xing L., Huhtala M., Pietiainen V., Kapyla J., Vuorinen K., Marjomaki V., Heino J., Johnson M. S., Hyypia T., Cheng R. H. Structural and functional analysis of integrin alpha2I domain interaction with ECHOvirus 1 // J Biol Chem. - 2004. - V. 279.- № 12. - P. 11632-8.

150. Pietiainen V., Marjomaki V., Upla P., Pelkmans L., Helenius A., Hyypia T. ECHOvirus 1 endocytosis into caveosomes requires lipid rafts, dynamin II, and signaling events // Mol Biol Cell. - 2004. - V. 15.- № 11. - P. 4911-25.

151. Triantafilou K., Triantafilou M. Lipid raft microdomains: key sites for Coxsackievirus A9 infectious cycle // Virology. - 2003. - V. 317.- № 1. - P. 128-35.

152. Coyne C. B., Bergelson J. M. CAR: a virus receptor within the tight junction // Adv Drug Deliv Rev. - 2005. - V. 57.- № 6. - P. 869-82.

153. Bergelson J. M., Cunningham J. A., Droguett G., Kurt-Jones E. A., Krithivas A., Hong J. S., Horwitz M. S., Crowell R. L., Finberg R. W. Isolation of a common receptor for Coxsackie B viruses and adenoviruses 2 and 5 // Science. - 1997. - V. 275.- № 5304. - P. 1320-3.

154. Carson S. D., Chapman N. N., Tracy S. M. Purification of the putative coxsackievirus B receptor from HeLa cells // Biochem Biophys Res Commun. - 1997. -V. 233.- № 2. - P. 325-8.

155. Tomko R. P., Xu R., Philipson L. HCAR and MCAR: the human and mouse cellular receptors for subgroup C adenoviruses and group B coxsackieviruses // Proc Natl Acad Sci U S A. - 1997. - V. 94.- № 7. - P. 3352-6.

156. Tomko R. P., Xu R., Philipson L. HCAR and MCAR: the human and mouse cellular receptors for subgroup C adenoviruses and group B coxsackieviruses // Proc Natl Acad Sci U S A. - 1997. - V. 94.- № 7. - P. 3352-6.

157. Raschperger E., Engstrom U., Pettersson R. F., Fuxe J. CLMP, a novel member of the CTX family and a new component of epithelial tight junctions // J Biol Chem. -2004. - V. 279.- № 1. - P. 796-804.

158. Raschperger E., Thyberg J., Pettersson S., Philipson L., Fuxe J., Pettersson R. F. The coxsackie- and adenovirus receptor (CAR) is an in vivo marker for epithelial tight junctions, with a potential role in regulating permeability and tissue homeostasis // Exp Cell Res. - 2006. - V. 312.- № 9. - P. 1566-80.

159. Cohen C.J., Shieh J.T., Pickles R.J., Okegawa T., Hsie J.T., Bergelson J.M. The coxsackievirus and adenovirus receptor is a transmembrane component of the tight junction // Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.-2001 .-V.98.-P.15191-15196.

160. Honda T., Saitoh H., Masuko M., Katagiri-Abe T., Tominaga K., Kozakai I., Kobayashi K., Kumanishi T., Watanabe Y. G., Odani S., Kuwano R. The coxsackievirus-adenovirus receptor protein as a cell adhesion molecule in the developing mouse brain // Brain Res Mol Brain Res. - 2000. - V. 77.- № 1. - P. 19-28.

161. Hotta Y., Honda T., Naito M., Kuwano R. Developmental distribution of coxsackie virus and adenovirus receptor localized in the nervous system // Brain Res Dev Brain Res. - 2003. - V. 143.- № 1. - P. 1-13.

162. Nalbantoglu J., Pari G., Karpati G., Holland P. C. Expression of the primary coxsackie and adenovirus receptor is downregulated during skeletal muscle maturation and limits the efficacy of adenovirus-mediated gene delivery to muscle cells // Hum Gene Ther. - 1999. - V. 10.- № 6. - P. 1009-19.

163. He Y., Chipman P. R., Howitt J., Bator C. M., Whitt M. A., Baker T. S., Kuhn R. J., Anderson C. W., Freimuth P., Rossmann M. G. Interaction of coxsackievirus B3 with the full length coxsackievirus-adenovirus receptor // Nat Struct Biol. - 2001. - V. 8.- № 10. - P. 874-8.

164. Milstone A. M., Petrella J., Sanchez M. D., Mahmud M., Whitbeck J. C., Bergelson J. M. Interaction with coxsackievirus and adenovirus receptor, but not with decay-accelerating factor (DAF), induces A-particle formation in a DAF-binding coxsackievirus B3 isolate // J Virol. - 2005. - V. 79.- № 1. - P. 655-60.

165. Chung S. K., Kim J. Y., Kim I. B., Park S. I., Paek K. H., Nam J. H. Internalization and trafficking mechanisms of coxsackievirus B3 in HeLa cells // Virology. - 2005. - V. 333.- № 1. - P. 31-40.

166. Triantafilou K., Triantafilou M. Lipid-raft-dependent Coxsackievirus B4 internalization and rapid targeting to the Golgi //Virology. - 2004. - V. 326. -№ 1. - P. 6-19.

167. Clarkson N. A., Kaufman R., Lublin D. M., Ward T., Pipkin P. A., Minor P. D., Evans D. J., Almond J. W. Characterization of the ECHOvirus 7 receptor: domains of CD55 critical for virus binding // J Virol. - 1995. - V. 69.- № 9. - P. 5497-501.

168. He Y., Lin F., Chipman P. R., Bator C. M., Baker T. S., Shoham M., Kuhn R. J., Medof M. E., Rossmann M. G. Structure of decay-accelerating factor bound to ECHOvirus 7: a virus-receptor complex // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2002. - V. 99.-№ 16. - P. 10325-9.

169. Newcombe N. G., Beagley L. G., Christiansen D., Loveland B. E., Johansson E. S., Beagley K. W., Barry R. D., Shafren D. R. Novel role for decay-accelerating factor in coxsackievirus A21-mediated cell infectivity // J Virol. - 2004. - V. 78.- № 22. - P. 12677-82.

170. Shafren D. R., Dorahy D. J., Ingham R. A., Burns G. F., Barry R. D. Coxsackievirus A21 binds to decay-accelerating factor but requires intercellular adhesion molecule 1 for cell entry // Journal of Virology. - 1997. - V. 71.- № 6. - P. 4736-4743.

171. Shafren D. R., Bates R. C., Agrez M. V., Herd R. L., Burns G. F., Barry R. D. Coxsackieviruses B1, B3, and B5 use decay accelerating factor as a receptor for cell attachment // J Virol. - 1995. - V. 69.- № 6. - P. 3873-7.

172. Shafren D. R. Viral cell entry induced by cross-linked decay-accelerating factor // J Virol. - 1998. - V. 72.- № 11. - P. 9407-12.

173. Lublin D. M., Atkinson J. P. Decay-accelerating factor: biochemistry, molecular biology, and function // Annu Rev Immunol. - 1989. - V. 7. - P. 35-58.

174. Nicholson-Weller A., Burge J., Fearon D. T., Weller P. F., Austen K. F. Isolation of a human erythrocyte membrane glycoprotein with decay-accelerating activity for C3 convertases of the complement system // J Immunol. - 1982. - V. 129.- № 1. - P. 1849.

175. Lukacik P., Roversi P., White J., Esser D., Smith G. P., Billington J., Williams P. A., Rudd P. M., Wormald M. R., Harvey D. J., Crispin M. D., Radcliffe C. M., Dwek R. A., Evans D. J., Morgan B. P., Smith R. A., Lea S. M. Complement regulation at the molecular level: the structure of decay-accelerating factor // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2004. - V. 101.- № 5. - P. 1279-84.

176. Low M. G. Biochemistry of the glycosyl-phosphatidylinositol membrane protein anchors // Biochem J. - 1987. - V. 244.- № 1. - P. 1-13.

177. Koretz K., Bruderlein S., Henne C., Moller P. Decay-accelerating factor (DAF, CD55) in normal colorectal mucosa, adenomas and carcinomas // Br J Cancer. - 1992. -V. 66.- № 5. - P. 810-4.

178. Plevka P., Hafenstein S., Harris K. G., Cifuente J. O., Zhang Y., Bowman V. D., Chipman P. R., Bator C. M., Lin F., Medof M. E., Rossmann M. G. Interaction of decay-accelerating factor with ECHOvirus 7 // J Virol. - 2010. - V. 84.- № 24. - P. 12665-74.

179. Coyne C. B., Bergelson J. M. Virus-induced Abl and Fyn kinase signals permit coxsackievirus entry through epithelial tight junctions // Cell. - 2006. - V. 124.- № 1. -P. 119-31.

180. Zhao X., Zhang G., Liu S., Chen X., Peng R., Dai L., Qu X., Li S., Song H., Gao Z., Yuan P., Liu Z., Li C., Shang Z., Li Y., Zhang M., Qi J., Wang H., Du N., Wu Y., Bi

Y., Gao S., Shi Y., Yan J., Zhang Y., Xie Z., Wei W., Gao G. F. Human Neonatal Fc Receptor Is the Cellular Uncoating Receptor for Enterovirus B // Cell. - 2019.-V.177.-P. 1553-1565.e16

181. Morosky S., Evans A., Lemon K, Schmus S, Bakkenist Christopher J. Coyne C. B. The neonatal Fc receptor is a pan-ECHOvirus receptor // Proc Natl Acad Sci U S A. -2019.- V.116.-P. 3758-3763

182. Brambell F.W., Hemmings W.A., Morris I.G. A theoretical model of gammaglobulin catabolism // Nature.-1964.-V.203.- P. 1352-1354.

183. Craig M. S., Joanna E.M., Neil E. S. A major histocompatibility complex class I-like Fc receptor cloned from human placenta: possible role in transfer of immunoglobulin G from mother to fetus // J Exp Med.-1994 .-V. 180.-P. 2377-2381.

184. Kandil E., Egashira M., Miyoshi O., Niikawa N., Ishibashi T., Kasahara M.The human gene encoding the heavy chain of the major histocompatibility complex class I-like Fc receptor (FCGRT) maps to 19q13.3 // Cytogenet Cell Genet.- 1996.-V.73. -P.97-8.

185. Brambell F.W. The transmission of immune globulins from the mother to the foetal and newborn young // Proc Nutr Soc.-1969.-V.28.- p. 35-41

186. Simister N.E., Mostov K.E. An Fc receptor structurally related to MHC class I antigens // Nature.-1989.-V. 337.-P. 184-187

187. Raghavan M., Bjorkman P.J. Fc receptors and their interactions with immunoglobulins // Ann. Rev. Cell Biol. -1996-P.181-220.

188. Gastinel L.N. , Simister N.E. , Bjorkman P.J. Expression and crystallization of a soluble and functional form of an Fc receptor related to class I histocompatibility molecules // Proc Natl Acad Sci U S A.-1992.- V.89.-P. 638-642.

189. Kuo K.T., Baker K. , Yoshida M. , Qiao S.W. , Aveson V.G. , Lencer W.I., et a/.Neonatal Fc receptor: From immunity to therapeutics // J Clin Immunol.-2010.-V.30.-P. 777-789

190. Andersen J.T., Dalhus B., Cameron J., Daba M.B. , Plumridge A., Evans L., et a/. Structure-based mutagenesis reveals the albumin-binding site of the neonatal Fc receptor // Nat Commun.-2012.-V. 3.-P. 610

191. Anderson C.L., Chaudhury C., Kim J., Bronson C.L. , Wani M.A. , Mohanty S. Perspective—FcRn transports albumin: Relevance to immunology and medicine // Trends Immunol.-2006.-V.27.- P. 343-348

192. Sanchez, L. M., Penny, D. M., and Bjorkman, P. J. Stoichiometry of the interaction between the major histocompatibility complex-related Fc receptor and its Fc ligand // Biochemistry.-1999.-V. 38.-P. 9471-9476.

193. Huber, A. H., Kelley, R. F., Gastinel, L. N., and Bjorkman, P. J. Crystallization and stoichiometry of binding of a complex between a rat intestinal Fc receptor and Fc // J. Mol. Biol..-1993.-V. 230.-P. 1077-1083.

194. Goebl, N. A., Babbey, C. M., tta-Mannan, A., Witcher, D. R., Wroblewski, V. J., and Dunn, K. W. Neonatal Fc receptor mediates internalization of Fc in transfected human endothelial cells // Mol. Biol. Cell.-2008.-V.19.-P. 5490-5505.

195. Vaughn D.E, Bjorkman P.J. Structural basis of pH-dependent antibody binding by the neonatal Fc receptor // Structure.- 1998.-V. 6.-P. 63-73

196. Tian Z., Sutton B.J., Zhang X. Distribution of rat neonatal Fc receptor in the principal organs of neonatal and pubertal rats //J Recept Signal Transduct Res.-2014.-V. 9893.-P. 1-6

197. Akilesh S., Christianson G. J., Roopenian D. C., and Shaw A. S. Neonatal FcR expression in bone marrow-derived cells functions to protect serum IgG from catabolism // J. Immunol.-2007-V. 179.-P- 4580-4588.

198. Blumberg R. S., Koss T., Story C. M., Barisani D., Polischuk J., Lipin A., Pablo L., Green R., and Simister N. E. A major histocompatibility complex class I-related Fc receptor for IgG on rat hepatocytes // J. Clin. Invest.-1995.-V. 95.-P. 2397-2402.

199. Cianga C., Cianga P., Plamadeala P., and Amalinei C. Nonclassical major histocompatibility complex I-like Fc neonatal receptor (FcRn) expression in neonatal human tissues // Hum. Immunol.-2011 .-V. 72.-P. 1176-1187.

200. Kim H., Fariss R. N., Zhang C., Robinson S. B., Thill M., and Csaky K. G. Mapping of the neonatal Fc receptor in the rodent eye // Invest Ophthalmol. Vis. Sci.-2008.-V. 49.-P. 2025-2029.

201. Schlachetzk F., Zhu C., and Pardridge W. M. Expression of the neonatal Fc receptor (FcRn) at the blood-brain barrier // J. Neurochem.-2002.-V. 81.-P. 203-206.

202. Kacskovics I. Fc receptors in livestock species // Vet Immunol Immunopathol.-2004.-V. 102.-P. 351-62

203. Cianga P., Cianga C., Cozma L., Ward E.S., Carasevici E. The MHC class I related Fc receptor, FcRn, is expressed in the epithelial cells of the human mammary gland // Hum Immunol.-2003.-V. 64.-P. 1152-9.

204. Ghetie V., and Ward E. S. Transcytosis and catabolism of antibody // Immunol. Res.-2002.-V. 25.-P. 97-113.

205. Schlothauer T., Rueger P., Stracke J. O., Hertenberger H., Fingas F., Kling L., Emrich T., Drabner G., Seeber S., Auer J., Koch S., and Papadimitriou A. Analytical FcRn affinity chromatography for functional characterization of monoclonal antibodies. MAbs.-2013.-V. 5.-P. 576-586.

206. Vaccaro C., Zhou J., Ober R. J., and Ward E. S. Engineering the Fc region of immunoglobulin G to modulate in vivo antibody levels // Nat. Biotechnol.-2005.-V.23.-P. 1283-1288.

207. Jones E. A., Waldmann T. A. The mechanism of intestinal uptake and transcellular transport of IgG in the neonatal rat // J. Clin. Invest.-1972.-V. 51.-P. 2916-2927.

208. Firan M., Bawdon R., Radu C., Ober R.J. The MHC class I-related receptor, FcRn, plays an essential role in the maternofetal transfer of y-globulin in humans // Int Immunol.-2001.- V.13.-P.993-1002.

209. David R. M., Genevieve G. F., Xinxia Peng, Margaret E. A., Sallie R. P. Noncanonical placental Fc receptors: What is their role in modulating transplacental transfer of maternal IgG? // PLOS Pathogens.-2018.-V.14 :e1007161

210. Zhu X., Meng G., Dickinson B. L., Li X., Mizoguchi E., Miao L., Wang Y., Robert C., Wu B., Smith P. D., Lencer W. I., and Blumberg R. S. MHC class I-related neonatal Fc receptor for IgG is functionally expressed in monocytes, intestinal macrophages, and dendritic cells // J. Immunol.-2001.-V.166.-P. 3266-3276.

211. Qiao S. W., Kobayashi K., Johansen F. E., Sollid L. M., Andersen J. T., Milford E., Roopenian, D. C., Lencer W. I., and Blumberg R. S. Dependence of antibody-mediated presentation of antigen on FcRn // Proc.Addendum Natl. Acad. Sci. U. S. A.-2008.-V. 105.-P. 9337-9342.

212. Nakamura T., Aoki S., Kitajima K., Takahashi T., Matsumoto K., Nakamura T. Molecular cloning and characterization of Kremen, a novel kringle- containing transmembrane protein. //Biochim Biophys Acta. 2001.-V. 1518.-P. 63-72.

213. Mao B., Wu W, Davidson G., Marhold J., Li M., Mechler B.M., Delius H., Hoppe D., Stannek P., Walter C., Glinka A., Niehrs C. Kremens are novel Dickkopf receptors that regulate Wnt/beta-catenin signalling // Nature. -2002.-V. 417.-P.664-7.

214. Mao B., Niehrs C. Kremen2 modulates Dickkopf2 activity during Wnt/LRP6 signaling // Gene.- 2003.-V.302.-P.179-83.

215. Nusse R. Wnt signaling and stem cell control //Cell Research.- 2008.-V.18.- P. 523-527.

216. Dravid G., Ye Z., Hammond H., Chen G., Pyle A., Donovan P., Yu X., Cheng L.Defining the Role of Wnt/ beta-catenin signaling in the survival, proliferation,and self-renewal of human embryonic stem cells // Stem Cells.- 2005.-V.23.- P.1489-1501.

217. Гребенникова Т.А., Белая Ж.Е., Рожинская Л.Я., Мельниченко Г.А.Канонический сигнальный путь Wnt/p-катенин: от истории открытия доклинического применения // Терапевтический архив. - 2016. - Т. 88. - № 10.- С. 74-81.

218. Nakamura T, Nishizawa T, Hagiya M, Seki T, Shimonishi M, Sugimura A, Tashiro K, Shimizu S. Molecular cloning and expression of human hepatocyte growth factor. Nature. -1989.-V. 342.-P. 440-3.

219. Oishi I., Sugiyama S., Liu Z.J., Yamamura H., Nishida Y., Minami Y. A novel Drosophila receptor tyrosine kinase expressed specifically in the nervous system. Unique structural features and implication in developmental signaling // J Biol Chem.-1997.-V. 272.-P.11916-23.

220. Bork P., Beckmann G. The CUB domain. A wide-spread module in developmentally regulated proteins // J Mol Biol.- 1993.-V.231.-P.539-45.

221. Varela P.F., Romero A., Sanz L., Romao M.J, Topfer-Petersen E., Calvete J.J. The 2.4 Ä resolution crystal structure of boar seminal plasma PSP-I/PSP-II: a zona pellucida-binding glycoprotein heterodimer of the spermadhesin family built by a CUB domain architecture // J Mol Biol.- 1997.-V.274.-P.635-49.

222. He Z., Tessier-Lavigne M. Neuropilin is a receptor for the axonal chemorepellent Semaphorin III // Cell.- 1997.-V. 90.-P.739-51.

223. Kolodkin A.L, Levengood D.V., Rowe E.G., Tai Y.T., Giger R.J., Ginty D.D. Neuropilin is a semaphorin III receptor // Cell.- 1997.- V.90.-P.753-62.

224. Verna J., Lodder A., Lee K., Vagts A., Ballester R. A family of genes required for maintenance of cell wall integrity and for the stress response in Saccharomyces cerevisiae // Proc Natl Acad Sci USA.- 1997.-V.94.-V.13804-9.

225. Davidson G., Mao B., Del Barco Barrantes I., Niehrs C. Kremen proteins interact with Dickkopf1 to regulate anteroposterior CNS patterning // Development.- 2002.-V. 129.-P. 5587-96.

226. Van Raay T.J., Vetter M.L. Wnt/frizzled signaling during vertebrate retinal development // Dev Neurosci.- 2004.-V.26.-P.352-8.

227. De Langhe S.P., Sala F.G., Del Moral P.M., Fairbanks T.J., Yamada K.M., Warburton D., Burns R.C., Bellusci S. Dickkopf-1 (DKK1) reveals that fibronectin is a major target of Wnt signaling in branching morpho-genesis of the mouse embryonic lung // Dev Biol.- 2005.-V.277.-P. 316-31.

228. Mercer J. and Helenius A. Virus entry by macropinocytosis // Nature Cell Biology.-2009-.V.11.-P. 510-520.

229. Heikkilä O., Susi, P., Tevaluoto T., Härmä H., Marjomäki V., Hyypiä T. and Kiljunen S. Internalization of coxsackievirus A9 is mediated by ß2-microglobulin, dynamin, and arf6 but not by caveolin-1 or clathrin // Journal of Virology.-2010.-V. 84.-P. 3666-3681.

230. Sieczkarski S.B., Whittaker G. R. Dissecting virus entry via endocytosis // The Journal of General Virology.-2002.-V. 83.-P.1535-1545.

231. Merilahti P., Koskinen S., Heikkilâ O., Karelehto E., Susi P. Endocytosis of integrin-binding human picornaviruses. Advances in Virology, 2012

232. Takei K., and Haucke V. Clathrin-mediated endocytosis: membrane factors pull the trigger // Trends Cell Biol-2001-V. 11-P. 385-391.

233. Hinshaw J. E. Dynamin and its role in membrane fission // Annu Rev Cell Dev Biol - 2000.-V. 16.-P.483-519.

234. Damke H., Baba T., Warnock D. E. and Schmid S. L. Induction of mutant dynamin specifically blocks endocytic coated vesicle formation // J Cell Biol.-1994-V.127-P.915-34.

235. Doherty G. J., and McMahon H. T. Mechanisms of endocytosis // The Annu Rev Biochem.- 2009.-V. 78-P.857-902.

236. Conner S. D. and Schmid S. L. Regulated portals of entry into the cell // Nature.-2003.-V.422.-P.37-44.

237. Johns H. L., Berryman S., Monaghan P., Belsham G. J., and T. Jackson. A dominant negative mutant of rab5 inhibits infection of cells by foot-and-mouth disease virus; implications for virus entry // J Virol.- 2009-V.83-P.6247-6256.

238. Prchla E., Kuechler E., Blaas D., Fuchs R. Uncoating of human rhinovirus serotype 2 from late endosomes // J Virol.- 1994-V.68-P.3713-3723.

239. Lin Y.W., Lin H.Y., Tsou Y.L., Chitra E., Hsiao K.N., Shao H.Y., Liu C.C., Sia C., Chong P., Chow Y.H. Human SCARB2-mediated entry and endocytosis of EV71 // PLoS ONE.-2012.-V. 7:e30507

240. Kim C. and J. M. Bergelson. ECHOvirus7 entry into polarized intestinal epithelial cells requires clathrin and Rab7 // Mbio.- 2012.-V.3-P. E00304-11.

241. Yamada E. The fine structure of the gall bladder epithelium of the mouse // J Biophys Biochem Cytol.- 1955-V.1-P.445-458.

242. Mercer J., Schelhaas M., and A. HeleniusVirus entry by endocytosis // Annu Rev Biochem. -2010.- V.79.-P.803-33.

243. Parton R. G., Simons K. The multiple faces of caveolae // Nat Rev.-2007-V.8-P.185-194.

244. Pelkmans L., Burli T., Zerial M., Helenius A. Caveolin-stabilized membrane domains as multifunctional transport and sorting devices in endocytic membrane traffic // Cell. - 2004. -V. 118. -P. 767-780.

245. Scherer P.E., P.E. Scherer, R.Y. Lewis, D. Vonte, J.A. Engelman, F. Galbiati, J. Couet, D.S. Kohtz, E. van Donselaar, P. Peters, M.P. Lisanti. Cell-type and tissue-specific expression of caveolin-2. Caveolins 1 and 2 co-localize and form a stable hetero-oligomeric complex in vivo // J Biol Chem. - 1997. - V. 272. - № 46. - P. 29337-29346.

246. O'Donnell V., Larocco M., and B. Baxt. Heparan sulfate-binding foot-and-mouth disease virus enters cells via caveola-mediated endocytosis // J Virol.-2008-V.82.-P.9075-9085.

247. Pietiäinen V., Marjomäki V., Upla P., Pelkmans L., Helenius A., and T. Hyypiä. ECHOvirus 1 endocytosis into caveosomes requires lipid rafts, dynamin II, and signaling events // Mol Biol Cell.- 2004-V.15.-P.4911-25.

248. Hayer A., Stoeber M., Ritz D., Engel S., H.Meyer H., and A. Helenius. Caveolin-1 is ubiquitinated and targeted to intralumenal vesicles in endolysosomes for degradation // J Cell Biol.-2010.-V 191.-P.615-629.

249. Karjalainen M., Kakkonen E., Upla P., Paloranta H., Kankaanpaa P., Liberali P., Renkema G.H., Hyypia T., Heino J., and V.Marjomaki. A Raft-derived, Pak1-regulated entry participates in a2b1 integrin-dependent sorting to caveosomes // Mol Biol Cell.-2008.-V.19-P.2857-69.

250. Liberali P., Kakkonen E., Turacchio G., Valente A., Spaar G., Perinetti R., Bockmann A., Corda D., Colanzi A., Marjomaki V., and A. Luini. The closure of Pak1-dependent macropinosomes requires the phosphorylation of CtBP1/BARS // The EMBO J.- 2008.-V.27.-P.970-81.

251. Karjalainen M., Rintanen N., Lehkonen M., Kallio K., Maki A., Hellstrom K., Siljamaki V., Upla P., and V. Marjomaki. ECHOvirus1 infection depends on biogenesis of novel multivesicular bodies // Cell Microbiol.- 2011.-V.13-.P.1975-95

252. Mercer J., and A. Helenius. Gulping rather than sipping: macropinocytosis as a way of virus entry // Curr Opin Microbiol.- 2012.-V.15.-P.490-9.

253. Schelhaas M. Come in and take your coat off - how host cells provide endocytosis for virus entry // Cell Microbiol.- 2010.-V.12.-P.1378-88.

254. Swanson J. A. Shaping cups into phagosomes and macropinosomes //Nat Rev Mol Cell Biol.-2008.-V.9-P.639-649.

255. Mercer J., and A. Helenius. Virus entry by macropinocytosis // Nat Cell Biol.-2009.-V.11.-P.510-20

256. Coyne C. B., Shen L., Turner J. R., and J. M.Bergelson. Coxsackievirus entry across epithelial tight junctions requires occludin and the small GTPases Rab34 and Rab5 // Cell Host Microbe.- 2007.-V.2-P.181-192.

257. Akira, S. TLR signaling //Curr Top Microbiol Immunol.- 2006.-V. 311. №. P. 116.

258. Melchjorsen J., Jensen S.B., Malmgaard L., Rasmussen S.B., Weber F., Bowie A.G., Matikainen S., and Paludan S.R. Activation of innate defense against a paramyxovirus is mediated by RIG-I and TLR7 and TLR8 in a cell-type-specific manner //J Virol.- 2005.- V. 79. № 20. P. 12944-12951.

259. Diebold S.S., Kaisho T., Hemmi H., Akira S., Reis E., Sousa C. Innate antiviral responses by means of TLR7-mediated recognition of single-stranded RNA Science.-2004.-V. 303.-P. 1529-1531.

260. Heil F., Hemmi H., Hochrein H., Ampenberger F., Kirschning C., Akira S., Lipford G., Wagner H., Bauer S. Species-specific recognition of single-stranded RNA via Toll-like receptor 7 and 8. Science.-2004.-V. 303.-P. 1526-1529.

261. O'Neill, L.A., Fitzgerald, K.A., and Bowie, A.G., The Toll-IL-1 receptor adaptor family grows to five members // Trends Immunol.- 2003.-V. 24.- № 6.- P. 286-290

262. Deng L., Wang C., Spencer E., Yang L., Braun A., You J., Slaughter C., Pickart C., and Chen Z.J. Activation of the IkappaB kinase complex by TRAF6 requires a dimeric ubiquitin-conjugating enzyme complex and a unique polyubiquitin chain // Cell.- 2000.-V. 103. № 2. P. 351-361.

263. Wang C., Deng L., Hong M., Akkaraju G.R., Inoue J., and Chen Z.J. TAK1 is a ubiquitin-dependent kinase of MKK and IKK // Nature.- 2001.- V. 412. № 6844. P. 346-351.

264. Li S., Strelow A., Fontana E.J., and Wesche H. IRAK-4: a novel member of the IRAK family with the properties of an IRAK-kinase // Proc Natl Acad Sci U S A. -2002.-V. 99. № 8. P. 5567-5572.

265. Hayden M.S. and Ghosh S. Shared principles in NF-kappaB signaling // Cell.-2008.- V. 132. № 3. P. 344-362.

266. Honda K., Ohba Y., Yanai H., Negishi H., Mizutani T., Takaoka A., Taya C., and Taniguchi T. Spatiotemporal regulation of MyD88-IRF-7 signalling for robust type-I interferon induction // Nature. - 2005.-V. 434. № 7036. P. 1035-1040.

267. Takaoka A., Yanai H., Kondo S., Duncan G., Negish H., Mizutani T., Kano S., Honda K., Ohba Y., Mak T.W., and Taniguchi T. Integral role of IRF-5 in the gene induction programme activated by Toll-like receptors // Nature.- 2005.-V. 434. № 7030. P. 243-249.

268. Yoneyama M., Onomoto K., Jogi M., Akaboshi T., and Fujita T., Viral RNA detection by RIG-I-like receptors //Curr Opin Immunol. -2015.-V. 32. №. P. 48-53.

269. Yoneyama M. and Fujita T. Recognition of viral nucleic acids in innate immunity // Rev Med Virol. -2010.-V. 20. № 1. P. 4-22.

270. Hornung V., Ellegast J., Kim S., Brzozka K., Jung A., Kato H., Poeck H., Akira S., Conzelmann K.K., Schlee M., Endres S., Hartmann G. 5'-Triphosphate RNA is the ligand for RIG-I // Science. - 2006. -V. 314. -P. 994-997.

271. Goubau D., Deddouche S., Reis e Sousa C. Cytosolic sensing of viruses // Immunity. - 2013. -V. 38. -P. 855-869.

272. Wu B., Peisley A., Richards C., Yao H., Zeng X., Lin C., Chu F., Walz T., Hur S. Structural basis for dsRNA recognition, filament formation, and antiviral signal activation by MDA5 // Cell. - 2013. -V. 152. -P. 276-289.

273. Corby M.J., Stoneman M.R., Biener G., Paprocki J.D., Kolli R., Raicu V., Frick D.N. Quantitative microspectroscopic imaging reveals viral and cellular RNA helicase interactions in live cells // J Biol Chem. - 2017. -V. 292. -P. 11165-11177.

274. Weber M., Gawanbacht A., Habjan M., Rang A., Borner C., Schmidt A.M., Veitinger S., Jacob R., Devignot S., Kochs G., Garcia-Sastre A., and Weber F., Incoming RNA virus nucleocapsids containing a 5'-triphosphorylated genome activate RIG-I and antiviral signaling // Cell Host Microbe. -2013.- V. 13.-№ 3.- P. 336-346.

275. Jiang F., Ramanathan A., Miller M.T., Tang G.Q., Gale M., Jr. Patel S.S., and Marcotrigiano J. Structural basis of RNA recognition and activation by innate immune receptor RIG-I // Nature.- 2011.-V. 479.- № 7373.- P. 423-427.

276. Kowalinski E., Lunardi T., McCarthy A.A., Louber J., Brunel J., Grigorov B., Gerlier D., and Cusack S. Structural basis for the activation of innate immune pattern-recognition receptor RIG-I by viral RNA // Cell.- 2011.-V. 147.-№ 2.- P. 423-435.

277. Gack M.U., Shin Y.C., Joo C.H., Urano T., Liang C., Sun L., Takeuchi O., Akira S., Chen Z., Inoue S., and Jung J.U. TRIM25 RING-finger E3 ubiquitin ligase is essential for RIG-I-mediated antiviral activity // Nature. - 2007.- V. 446. -№ 7138.- P. 916-920.

278. Chan Y.K. and Gack M.U. RIG-I-like receptor regulation in virus infection and immunity // Curr Opin Virol. -2015.-V. 12. - P. 7-14.

279. Liu, H.M., Loo, Y.M., Horner, S.M., Zornetzer, G.A., Katze, M.G., and Gale, M., Jr., 2012. The mitochondrial targeting chaperone 14-3-3epsilon regulates a RIG-I translocon that mediates membrane association and innate antiviral immunity // Cell Host Microbe. V. 11. № 5. P. 528-537.

280. Jiang, X., Kinch, L.N., Brautigam, C.A., Chen, X., Du, F., Grishin, N.V., and Chen, Z.J., 2012. Ubiquitin-induced oligomerization of the RNA sensors RIG-I and MDA5 activates antiviral innate immune response // Immunity. V. 36. № 6. P. 959-973.

281. Kato H., Takeuchi O., Mikamo-Satoh E., Hirai R., Kawai T., Matsushita K., Hiiragi A., Dermody T.S., Fujita T., and Akira S. Length-dependent recognition of double-stranded ribonucleic acids by retinoic acid-inducible gene-I and melanoma differentiation-associated gene 5 // J Exp Med. -V. 205.- № 7.- P. 1601-1610.

282. Runge S., Sparrer K.M., Lassig C., Hembach K., Baum A., Garcia-Sastre A., Soding J., Conzelmann K.K., and Hopfner K.P. In vivo ligands of MDA5 and RIG -I in measles virus-infected cells // PLoS Pathog.- 2014.-V. 10.- № 4.- P. e1004081.

283. Berke I.C., Yu X., Modis Y., and Egelman E.H. MDA5 assembles into a polar helical filament on dsRNA // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2012.- V. 109.- № 45.- P. 18437-18441.

284. Satoh T., Kato H., Kumagai Y., Yoneyama M., Sato S., Matsushita K., Tsujimura T., Fujita T., Akira S., and Takeuchi O. LGP2 is a positive regulator of RIGI- and MDA5-mediated antiviral responses // Proc Natl Acad Sci U S A. -2010.-V. 107. -№ 4. -P. 1512-1517.57.

285. Bruns A.M., Leser G.P., Lamb R.A., and Horvath C.M. The innate immune sensor LGP2 activates antiviral signaling by regulating MDA5-RNA interaction and filament assembly // Mol Cell.- 2014.- V. 55.- № 5. -P. 771-781.

286. Meylan E., Curran J., Hofmann K., Moradpour D., Binder M., Bartenschlager R., and Tschopp J. Cardif is an adaptor protein in the RIG-I antiviral pathway and is targeted by hepatitis C virus // Nature.- 2005.-V. 437. -№ 7062. -P. 1167-1172.

287. Seth R.B., Sun L., Ea C.K., and Chen Z.J. Identification and characterization of MAVS, a mitochondrial antiviral signaling protein that activates NF-kappaB and IRF 3 // Cell.- 2005.-V. 122.- № 5. -P. 669-682.

288. Kawai, T., Takahashi, K., Sato, S., Coban, C., Kumar, H., Kato, H., Ishii, K.J., Takeuchi, O., and Akira, S . IPS-1, an adaptor triggering RIG-I- and Mda5-mediated type I interferon induction // Nat Immunol.- 2005.-V. 6. -№ 10. -P. 981-988.

289. Xu L.G., Wang Y.Y., Han K.J., Li L.Y., Zhai Z., and Shu H.B. VISA is anadapter protein required for virus-triggered IFN-beta signaling // Mol Cell. -2005.-V. 19.- № 6.- P. 727-740.

290. Hou F., Sun, L., Zheng H., Skaug B., Jiang Q.X., and Chen Z.J. MAVS forms functional prion-like aggregates to activate and propagate antiviral innate immune response // Cell. -2011.-V. 146.- № 3.- P. 448-461.

291. Takamatsu S., Onoguchi K., Onomoto K., Narita R., Takahasi K., Ishidate, F., Fujiwara, T.K., Yoneyama, M., Kato, H., and Fujita, T. Functional characterization of domains of IPS-1 using an inducible oligomerization system // PLoS One.- 2013.-V. 8.- № 1. -P. e53578

292. Xu H., He X., Zheng H., Huang L.J., Hou F., Yu Z., de la Cruz M.J., Borkowski B., Zhang X., Chen Z.J., and Jiang Q.X. Structural basis for the prion-like MAVS filaments in antiviral innate immunity // Elife.- 2014.-V. 3.- P. e01489

293. Yoneyama M. and FujitaT. RNA recognition and signal transduction by RIGI-like receptors // Immunol Rev.- 2009.-V. 227.- № 1.- P. 54-65.

294. Michallet M.C., Meylan E., Ermolaeva M.A., Vazquez J., Rebsamen M., Curran J., Poeck H., Bscheide M., Hartmann G., Konig M., Kalinke U., Pasparakis M., and Tschopp J. TRADD protein is an essential component of the RIG-like helicase antiviral pathway // Immunity.- 2008.-V. 28.- № 5.- P. 651-661.

295. Rajput A., Kovalenko A., Bogdanov K., Yang S.H., Kang T.B., Kim J.C., Du J., and Wallach, D., 2011. RIG-I RNA helicase activation of IRF3 transcription factor is negatively regulated by caspase-8-mediated cleavage of the RIP1 protein // Immunity. V. 34. № 3. P. 340-351.

296. Cantell K., Hirvonen S., Kauppinen H.L., and Myllyla G. Production of interferon in human leukocytes from normal donors with the use of Sendai virus // Methods Enzymol.-1981.-V. 78.- P. 29-38.

297. Platanias L.C. Mechanisms of type-I- and type-II-interferon-mediated signalling // Nat Rev Immunol. -2005.- V. 5.- № 5.- P. 375-386.

298. Hoffmann H.H., Schneider W.M., and Rice C.M. Interferons and viruses: an eVutionary arms race of molecular interactions // Trends Immunol.- 2015.-V. 36.- № 3.- P. 124-138.

299. Andersen J., VanScoy S., Cheng T.F., Gomez D., and Reich N.C. IRF-3-dependent and augmented target genes during viral infection // Genes Immun. -2008.-V. 9. № 2. P. 168-175.

300. Elco C.P., Guenther J.M., Williams B.R., and Sen G.C. Analysis of genes induced by Sendai virus infection of mutant cell lines reveals essential roles of interferon regulatory factor 3, NF-kappaB, and interferon but not toll-like receptor 3 // J Virol.- 2005.-V. 79.- № 7. -P. 3920-3929.

301. Sadler A.J. and Williams, B.R., 2008. Interferon-inducible antiviral effectors // Nat Rev Immunol. V. 8. № 7. P. 559-568.

302. Samuel C.E. Antiviral actions of interferons // Clin Microbiol Rev. -2001.-V. 14.- № 4.-P. 778-809

303. Silverman R.H. Viral encounters with 2',5'-oligoadenylate synthetase and RNase L during the interferon antiviral response // J Virol. - 2007.-V. 81.- № 23.- P. 1272012729.

304. Malathi K., Dong B., Gale M., Jr., and Silverman R.H. Small self-RNA generated by RNase L amplifies antiviral innate immunity // Nature.- 2007.-V. 448.-№ 7155. -P. 816-819.

305. Haller O., Kochs G., and Weber F. Interferon, Mx, and viral countermeasures // Cytokine Growth Factor Rev.-2007.-V. 18. -№ 5-6. -P. 425-433.

306. Jones D. T., Taylor W. R., Thornton J. M. The rapid generation of mutation data matrices from protein sequences //Bioinformatics. - 1992. - V. 8. - №. 3. - P. 275-282.

307. Kumar S. et al. MEGA X: molecular eVutionary genetics analysis across computing platforms //Molecular biology and eVution. - 2018. - V. 35. - №. 6. - P.

1547-1549.