Распространение различных субтипов ВИЧ на территории Российской Федерации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.00.30, кандидат биологических наук Ладная, Наталья Николаевна

• Ладная, Наталья Николаевна
• кандидат биологических наук
• 2000

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Ладная, Наталья Николаевна

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. Эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции

1.1. Основные особенности передачи ВИЧ-инфекции

1.1.1. Распространенность инфекции, вызываемой ВИЧ и основные факторы риска заражения ВИЧ в мире

1.1.1.1. Африка и Средний Восток

1.1.1.2. Азия и Океания

1.1.1.3. Северная Америка

1.1.1.4. Западная и Восточная Европа

1.1.1.5. Страны Карибского бассейна и Южная Америка

1.1.1.6. Австралия и Новая Зеландия

1.2 Пути и факторы передачи ВИЧ-инфекции

1.3 Методы идентификации субтипов вируса иммунодефицита человека

1.4 Распространенность субтипов ВИЧ-1 в мире

1.4.1 Разнообразие субтипов вируса иммунодефицита человека

1.4.2 Распространенность субтипов ВИЧ-1 в странах мира

1.4.3 Распространенность субтипов ВИЧ среди основных континген- 50 тов населения, пораженных ВИЧ-инфекцией

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Материалы исследования

2.2 Методы исследования

2.2.1 Анализ данных о заболеваемости ВИЧ-инфекцией в Российской Федерации

2.2.2 Эпидемиологическое расследование

2.2.3 Сравнительный анализ электрофоретической подвижности гетеродуплексов и секвенирование как методы генотипирования ВИЧ-1.

Глава 3. Оценка распространенности ВИЧ-инфекции среди населения России

3.1 Распространенность ВИЧ-инфекции на территории Российской

Федерации в разные периоды времени.

3.2 Частота выявления ВИЧ-инфекции на разных территориях России

3.3 Демографическая характеристика зараженных ВИЧ российских граждан

Глава 4. Пути передачи ВИЧ в России

4.1 Половая передача ВИЧ в России

4.2 Передача ВИЧ во время беременности, родов и кормления грудью

4.3 Передача ВИЧ при переливании крови и ее компонентов

4.4 Передача ВИЧ во внутрибольничных очагах

4.5 Передача ВИЧ в среде наркоманов

Глава 5. Оценка распространенности различных субтипов ВИЧ-1 среди населения России

5.1 Распространенность различных субтипов ВИЧ-1 на территории Российской Федерации в разные периоды времени

5.2 Частота выявления различных субтипов ВИЧ-1 на территориях России

Глава 6. Проникновение различных субтипов ВИЧ-1 на территорию России из-за рубежа

Глава 7. Распространение субтипов ВИЧ-1 различными путями

Глава 8. Использование генотипирования ВИЧ, осуществляемого с помощью сравнительного анализа электрофоретической подвижности гетеродуплексов, для целей эпидемиологического расследования в очагах ВИЧ-инфекции. 118 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 124 ВЫВОДЫ 130 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Распространение различных субтипов ВИЧ на территории Российской Федерации»

Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), являющийся этиологическим агентом синдрома приобретенного иммунного дефицита (СПИД), - самый значительный инфекционный агент из обнаруженных в двадцатом столетии

- продолжает распространяться во всем мире. В некоторых районах Африки он уже является главной причиной смерти взрослого населения в возрасте 15-49 лет, и продолжает внедряться в мало затронутые эпидемией регионы. На конец 1999 года по оценкам Программы Организации Объединенных Наций по ВИЧ/СПИД (ШТАГОВ) во всем мире более 33.6 миллионов человек жили с ВИЧ-инфекцией или СПИДом, и уже умерли от СПИД не менее 16,3 миллионов человек. В некоторых странах африканского континента до 32% населения поражены ВИЧ-инфекцией.

Несмотря на установление путей передачи ВИЧ-инфекции остается не вполне ясным, почему в разных регионах мира отмечается неравномерность, как в уровне заболеваемости, так и в структуре заболевших. Ряд стран оказались мало затронуты пандемией. Наиболее пораженными являются такие регионы, как Африка южнее Сахары, на которую приходится 23,3 млн. людей, живущих с ВИЧ-инфекцией, Южная и Юго-Восточная Азия, где по оценкам 6 млн. ВИЧ-инфицированных, и Латинская Америка

- 1,3 млн. Вместе с тем, в разных странах мира ВИЧ-инфекция обнаруживается в различных группах населения: в странах Африки, Южной и Юго-восточной Азии преимущественно среди гетеросексуалов, в Северной Америке, Австралии и большинстве стран Западной Европы - среди гомосексуальных мужчин. Во многих странах Восточной Азии, Северной Африки и Восточной Европы, и отдельных странах других регионов ВИЧ-инфекция чаще выявляется у лиц, вводящих наркотики внутривенно.

В России ВИЧ-инфекция обнаруживается у иностранцев с 1985 г., а у российских граждан - с 1987 г. Основные эпидемиологические особенности раннего периода эпидемии были описаны В.В. Покровским в 1996 г. ('). В 1996-99 гг. произошел заметный рост числа новых случаев заболевания, и произошли существенные изменения в характере распространения ВИЧ на российской территории.

В результате исследований в области вариабельности генома ВИЧ было выяснено, что в различных странах мира выделяются разные варианты вируса. Эволюционное развитие ВИЧ, являющегося этиологическим агентом СПИД, шло по пути быстрого накопления мутаций и рекомбинаций, и оба процесса способствовали большому генетическому разнообразию вируса. Существует два типа ВИЧ: первого и второго типа (ВИЧ-1 и ВИЧ-2). ВИЧ-1 преобладает во всем мире, а ВИЧ-2 до сих пор циркулирует преимущественно в отдельных районах Западной Африки, а также в некоторых других странах, преимущественно там, где проживают выходцы из этого региона. Типы ВИЧ отличаются по происхождению; имеются некоторые различия в эпидемиологии и течении вызываемых ими инфекций (2). Геном ВИЧ характеризуется высокой степенью генетической изменчивости, которая достигает 40% в его наиболее вариабельной области, гене епу. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей геномов ВИЧ-1 позволяет выявить три группы вирусов: главную М, отдаленную О и новую Ы, равноотстоящую от О я М. Всемирная эпидемия вызвана ВИЧ-1 группы М, вирус этой группы имеют более 90% всех ВИЧ-инфицированых. Большинство известных в настоящее время изолятов ВИЧ-1 относится к группе М, которая, в свою очередь, может быть подразделена, как минимум, на 9 субтипов, обозначаемых буквами А-Н, 3. В группу О входят два субтипа. ВИЧ-2 также разделяют на субтипы.

Все субтипы ВИЧ-1 представлены в Африке. Однако, в результате исследований вариабельности генома ВИЧ-1 было выяснено, что в различных странах мира могут доминировать разные субтипы вируса. По данным ТЖАГОБ, больше всего случаев ВИЧ-1-инфекции в мире вызвано вариантами субтипа С, связанными с крупномасшатбными эпидемиями в Индии и Южной Африке. Широкое распространение в Северной и Южной Америке, Западной Европе и Австралии получил субтип В. В других географических регионах чаще обнаруживались более редкие субтипы: ^ в Бразилии (3) и Румынии (4), Е в Таиланде (5). Большой вклад в гетерогенность ВИЧ вносит рекомбинация, которая может происходит между представителями разных субтипов и групп. Рядом авторов была отмечена связь отдельных субтипов ВИЧ-1 с определенными контингентами населения, пораженными ВИЧ. Более того, на основании этих данных некоторые исследователи делали вывод о наличии биологических различий, обеспечивающих преимущественное распространение того или иного субтипа в определенной группе риска (2). Однако экспериментального подтверждения эти гипотезы пока не получили.

В России до настоящего времени циркулируют преимущественно варианты ВИЧ-1 группы М. Представители групп N и О в нашей стране пока не выявлялись, а ВИЧ-2 было обнаружено всего 3 случая. В России исследователи обнаруживали 7 субтипов ВИЧ-1 (б,7), однако эти исследования носили фрагментарный характер, так как в них различные контингенты зараженных были представлены непропорционально их доли среди всех зараженных ВИЧ.

Изучение разнообразия субтипов ВИЧ, циркулирующих на определенных территориях, и определение той роли, которую они играют в эпидемическом процессе, необходимы для выявления закономерностей развития эпидемии, совершенствования диагностики ВИЧ-инфекции, а так же для разработки вакцин.

Целью настоящего исследования явилось изучение эпидемиологической ситуации по ВИЧ-инфекции в России и определение роли различных субтипов ВИЧ в эпидемическом процессе.

Для достижения поставленных целей были сформулированы следующие задачи:

Изучить современное распространение ВИЧ-инфекции на территории России;

Определить значимость различных путей передачи ВИЧ, действующих на территории России;

Исследовать распространенность различных субтипов ВИЧ на разных территориях России в разных группах населения в отдельные периоды эпидемии ВИЧ-инфекции в Российской Федерации;

Изучить особенности передачи отдельных субтипов ВИЧ.

Рассмотреть возможность использования генотипирования ВИЧ, осуществляемого с помощью сравнительного анализа электрофоретической подвижности гетеродуплексов, для целей эпидемиологического расследования в очагах ВИЧ-инфекции

В диссертации впервые проведен анализ эпидемической ситуации по ВИЧ-инфекции в России с учетом распространения отдельных субтипов ВИЧ. Впервые изучена взаимосвязь субтипов вируса, выделенных у ВИЧ-инфицированных лиц из различных территорий России, с особенностями передачи ВИЧ в разные периоды эпидемии в России.

Проведено типирование вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории России и СНГ, и показано, что вспышка ВИЧ-инфекции среди наркоманов в Калининградской области вызвана новой рекомбинантным вариантом вируса envB/gagA, а в той же популяции на других территориях -субтипом А.

Получены новые данные о распространении ВИЧ-инфекции в России в 1996-99 гг., необходимые для организации и проведения профилактических и противоэпидемических мероприятий.

Показана высокая ценность генотипирования ВИЧ, осуществляемого с помощью сравнительного анализа электрофоретической подвижности ге-теродуплексов для целей эпидемиологического расследования в очагах ВИЧ-инфекции.

Сделано изобретение (патент на изобретение № 2121502, получен 10 ноября 1998 г.): получен штамм ВИЧ-1 (1Ш 1295) субтипа В, являющийся удобной природной моделью, которая может быть использована для получения диагностических и экспериментальных вакцинных препаратов.

Изучение современной эпидемиологической ситуации по ВИЧ-инфекции с учетом распространения генетически разнообразных вариантов ВИЧ представляет значительный интерес, как для теоретической, так и для практической эпидемиологии.

В работе были использованы материалы собственных исследований и данные литературы по эпидемиологии ВИЧ-инфекции: сведения об особенностях передачи ВИЧ-инфекции и распространенности ВИЧ-инфекции в мире; данные о распространенности субтипов ВИЧ, выявленных в мире среди различных групп населения.

Работа выполнена в специализированной научно-исследовательской лаборатории эпидемиологии СПИД Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии Министерства Здравоохранения Российской Федерации и лаборатории вирусов лейкозов НИИ Вирусологии имени Д.И. Ивановского Российской академии медицинских наук.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ Глава 1 ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ

Заключение диссертации по теме «Эпидемиология», Ладная, Наталья Николаевна

ВЫВОДЫ

1. С 1996 г. ВИЧ быстрыми темпами распространяется в России преимущественно среди лиц, потребляющих внутривенно психотропные вещества в немедицинских целях; эпидемия с течением времени переходит на новые административные территории.

2. Распространение ВИЧ-инфекции среди наркоманов сопровождается его переходом в другие группы населения, преимущественно при гетеросексуальных контактах; увеличивается значение передачи ВИЧ от матери ребенку; возрастает риск передачи ВИЧ при переливании крови; снизилось значение передачи ВИЧ в среде мужчин, имеющих половые контакты с мужчинами.

3. С начала 80-х годов в Россию из-за рубежа были неоднократно завезены несколько различных субтипов ВИЧ-1 (А, В, С, Б, Е, О ), которые в настоящее время неравномерно распространены среди зараженных ВИЧ граждан России; обнаружен так же рекомбинант субтипов А и В, который мог образоваться на территории Калининградской области.

4. Частота выделения того или иного субтипа определяется преобладанием среди инфицированных той группы населения, в которой этот субтип преимущественно распространяется в данный период времени. Наиболее часто встречается субтип А и рекомбинант субтипов А/В, которые распространяются среди потребителей наркотиков и вследствие этого начинают преобладать в гетеросексуальном населении; среди мужчин-гомосексуалистов преобладает субтип В; все обнаруженные субтипы циркулируют среди гетеросексуального населения; у лиц, зараженных во время внутрибольничных вспышек 1988-89 гг., выявлен субтип в.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Таким образом, мы можем сделать заключение, что до 1996 года ВИЧ-инфекция распространялась на территориях Российской Федерации с невысокой скоростью. Подавляющее большинство случаев ВИЧ-инфекции было зарегистрировано на территориях Российской Федерации, где осуществлялась в 1988-89 гг. внутрибольничная передача инфекции и в столичных городах: Москве и Санкт-Петербурге, где доминировала сексуальная передача вируса. Вирус неоднократно завозился из зарубежных стран, преимущественно из стран Африки в популяцию гетеросексуалов, и из стран Западной Европы и Америки - в среду мужчин, имеющих секс с мужчинами. Практика депортации иностранцев, зараженных ВИЧ, позволила задержать начало эпидемии.

Наиболее затронута эпидемией была группа мужчин, имеющих секс с мужчинами. Случаи ВИЧ-инфекции среди этой группы населения регистрировали ежегодно с момента выявления первого случая ВИЧ-инфекции в 1987 г.

Наиболее крупная вспышка ВИЧ-инфекции в период 1987-1996 гг. была выявлена на юге России, где передача вируса осуществлялась при парентеральных медицинских процедурах, выполненных нестерильным медицинским инструментарием. В этот период еще не началось распространение инфекции ВИЧ в популяции внутривенных наркоманов. С 1996 г. ВИЧ быстрыми темпами распространяется в России преимущественно среди лиц, потребляющих внутривенно психотропные вещества в немедицинских целях; эпидемия с течением времени переходит на новые административные территории, практически все территории России уже были поражены к октябрю 1999 г.

Районом, из которого наиболее вероятно был занесен ВИЧ в Россию в популяцию наркоманов, была Украина, где заболевание распространилось на 1 год раньше. В России в 1999 г. был инфицирован, по меньшей мере, 1% всех потребителей психотропных веществ. Процент зараженных ВИЧ в этой группе даже в уже пораженных районах еще не достиг возможного максимума. Необходимо учитывать, и то, что перенос ВИЧ из одного города в другой происходит не столь быстро. Что касается вида употребляемого наркотика, то заражение ВИЧ почти во всех районах до 1999 года было связано в основном с употреблением растворов опия, приготовленных из маковой соломки, и лишь в Новороссийске с эфедрин-содержащим препаратом. Но уже в 1999 году наибольшее количество новых случаев ВИЧ-инфекции было связано с употреблением героина в Москве, Московской области и Иркутской области. При увеличении общего числа зарегистрированных случаев ВИЧ-инфекции, преимущественно за счет группы потребителей наркотиков, наблюдается переход вируса и активная передача в других группах населения, особенно среди основного гетеросексуального населения страны.

Снижение числа новых случаев ВИЧ-инфекции наблюдается только в популяции мужчин, имеющих секс с мужчинами. Этот феномен наблюдается в большинстве стран и свидетельствует о эффективности профилактических программ, которые проводятся в этой группе много лет. Увеличивается число случаев передачи ВИЧ от матери ребенку; возрастает риск передачи ВИЧ при переливании крови и такие случаи регистрируются ежегодно.

Несомненный интерес представляет прогнозирование развития эпидемии в России в ближайшие годы. Уже имеется большой резервуар ВИЧ-инфекции в лице нескольких тысяч инфицированных наркоманов. Можно ожидать, что эпидемия среди наркоманов будет идти несколько более медленными темпами, чем это могло показаться первоначально. В то же время, значение гетеросексуальной передачи ВИЧ может пропорционально возрастать достаточно быстро. Весьма вероятно также появление большого количества инфицированных ВИЧ детей.

В процессе исследований для математической и статистической обработки данных была разработана оригинальная компьютерная система "автоматизированная система обработки данных обследования населения СССР на СПИД" с кодовой аббревиатурой "АСОДОС". Эта система впервые была разработана на языке СУБД DATATRIEVE для компьютера Micro Vax II в конце 1987 г. Более чем за 10 лет, прошедших с момента создания первой база данных произошли многие изменения. Устарела технически аппаратура и программное обеспечение, изменилась системы учета инфицированных ВИЧ, а также обследованных на антитела к ВИЧ и резко увеличилось число инфицированных ВИЧ с 1996 г. Все это потребовало разработки новых информационно-компьютерных систем для сбора, обработки и анализа данных по ВИЧ-инфекции в России. Под сохраненным названием "АСОДОС" создана к.т.н. В.П. Арзамасцевым совместно с автором данной работы принципиально новая система. Для новой системы было выбрано современное компьютерное оборудование. Функционирование созданной базы данных "АСОДОС" в 1999 г. показало ее высокую эффективность для накопления всей информации о ВИЧ-инфицированных и обследованных на антитела к ВИЧ, а также для получения статистической информации в целях эпиднадзора за ВИЧ-инфекцией.

Начиная с 80-х годов до последнего времени, происходил завоз ВИЧ в Россию, что подтверждает разнообразие субтипов ВИЧ-1, выявляемых у лиц, заразившихся ВИЧ в разные периоды эпидемии. Обнаружение на территории Калининградской области рекомбинантной формы ВИЧ, не встречающейся где-либо на других территориях, свидетельствует о возможности формирования новых штаммов ВИЧ непосредственно в России. Разнообразие выделяемых в России субтипов ВИЧ может привести к формированию и распространению и других новых генетических вариантов ВИЧ.

По суммарным итогам нашего исследования, к настоящему времени среди всех российских граждан, обследованных на субтипы ВИЧ, субтип А обнаружен в 33% случаев, В - 29%, О - 21%, рекомбинантная форма А/В в 11%, субтипы С, Б и Е суммарно в 6% случаев (Рисунок 30).

Однако в пересчете на число инфицированных разными путями мы можем говорить о том, что субтипом А заражено около 80 % всех ВИЧ-инфицированных, так как он распространяется среди наиболее пораженной группы- зараженных при внутривенном введении наркотиков, за исключением проживающих в Калининградской области.

А/В 11%

3% АВВШСПОВЕЕЮ ИА/В Субтипы ВИЧ-1 в России в 1987-1999 гг.

Рисунок 30

Наибольшее значение в эпидемическом процессе ВИЧ-инфекции играет субтип А и рекомбинант gagAenvB, которые наиболее распространены в популяции внутривенных потребителей психоактивных веществ. Субтип В наиболее часто встречается среди инфицированных мужчин, имевших гомосексуальные связи; субтипы А, В, С, О, Е, О обнаруживаются у гетеро-сексуалов обоих полов; субтип О обнаруживался преимущественно у лиц, пострадавших во время внутрибольничных вспышек в 1988-89 гг. Эти данные вполне репрезентативны для того, чтобы утверждать о большом генетическом разнообразии ВИЧ на территории России, что может иметь в будущем большое значение для диагностики и вакцинопрофилактики.

Количественное преобладание случаев заражения тем или иным субтипом ВИЧ менялось по мере развития эпидемии в зависимости от того, какой субтип распространялся в России наиболее интенсивным путем передачи. Так, во время внутрибольничных вспышек в конце 80-х годов, доминировал субтип О, завезенный из Конго; среди мужчин-гомосексуалов все годы преобладал субтип В, видимо приобретенный у гомосексуалов США и Западной Европы; во время вспышки среди наркоманов в конце 90-х годов основное значение приобрел субтип А, занесенный из Украины.

В то же время нам не удалось установить связи отдельных субтипов ВИЧ с определенными путями передачи. По нашим данным, большая часть субтипов ВИЧ может передаваться несколькими путями. Участие того или иного субтипа ВИЧ в передаче тем или иным путем, вероятно, носит случайный характер. Высокая скорость распространения и значительный уровень пораженности субтипом А ВИЧ-1 практически на всех территориях России в 1996-98 гг. и рекомбинантом gagAenvB в Калининградской области объясняется попаданием этих вариантов в популяцию потребителей психоактивных веществ в 1995-96 гг. Учитывая особенности потребления наркотиков в России можно предполагать, что в ближайшее время в России будут доминировать эти два генетических варианта ВИЧ-1, но не исключено появление новых рекомбинантных форм и возрастание роли других вариантов вируса.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Ладная, Наталья Николаевна, 2000 год

1. Покровский В.В./ Эпидемиология и профилактика ВИЧ-инфекции и СПИД// М.- «Медицина»- 1996-248 с.

2. Dale J. Ни, Timothy J., Mark A., et al. The emerging genetic diversity of HIV// JAMA.- 1996.- V.275,N3.- P.210-216.

3. Louwagie J., McCutchan F. E., Peeters M. et. al. Phylogenetic analysis of gag genes from 70 international HIV-1 isolates provides evidence for multiple genotypes. //AIDS.-1993.- 7.-P.769-780.

4. Dumitresku O., Kalish M. L., Kliks S. C. et al. Identification of an F subtype in Romania. //J. Infect. Dis.-1994. V169. - P.281-288.

5. Ou C.Y., Takebe Y., Luo C.,et al.Wide distribution of two subtypes of HIV-1 in Thailand. //AIDS Res. Human Retroviruses.-1992. 8. - 1887-1895.

6. Bobkov A., Chengsong-Popov R., Garaev N., et al. Identification of an env G subtype and heterogenety of HIV-1 strains in the Russian Federation and Belarus.//AIDS. -1994,- 8.- P. 1649-1655.

7. Mann J. Global AIDS into the 1990s //Geneva. 1989. - 8p.

8. Centers for Disease Control, Update : AIDS Europe// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1984,- V.33.-P.607-609.

9. BigbJerg I.e., AIDS in Danish surgeon (Zaire. 1976)// Lancet. 1983,- V. 1. -P.925.

10. Vanderepitte J., Verwillghen R., Zachee P. AIDS and cryptococcosis (Zaire, 1977) //Ibid. -P.925-926.

11. Georges A.J., Gonsales J.B., McCormiok A.B. Antibodies to LAV/HTLV-III in Central African Republic// III International conference on AIDS. Paris. -1986.-P. 130.

12. Van de Perre P., Clumeck N., Garael M. et al. Female prostitutes a risk group for infection with HTLV-II/LAV// Lancet. 1985. - V. 2. - P.62-65.

13. Epidemiology of HIV infection: new and emerging epidemics / Abdool Karim.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva. Switzerland. 1998. -N. 160.

14. Desmyter J., Goubou R., Charmarets M., Montagnier L. Anti-LAV/HTLV-III in Kinshasa Mothers//Ibid. P. 104.

15. Kumagai F., Morio S., Jano H. Epidemiological aspects of AIDS in Japan// Ibid.-P. 154.

16. Leon E.K., Li P.C.K., Chang W.K. et al. Epidemiology of LAV/HTLV-III antibodies in Hong Kong// Ibid. P. 127.

17. Weniger B.G., Wasi C., Traisura H. Prevalence of HTLV/LAV antibodies in Thailand//Ibid.-P. 127.

18. Yi Z. Seroepidemiological studies on HIV-antibody in Chine// Second workshop on epidemiology and control of AIDS. Tokio. - 1990.- P. 15.

19. S.N. Mishra N.C. Bhargava S.K. Satpathy et al. HIV/AIDS in India Need for a National STD Surveillance System // Conference record 12th World AIDS Conference Geneva 1998. - P. 144.

20. Dwip Kitayaporn, S. Vanichseni T.D., Mastro et al.// IV-1 incidence, subtypes, and follow up in a prospective cohort of injecting drug users (IDUs) in Bangkok, Thailand// Conference record 12th World AIDS Conference Geneva 1998.-P. 110.

21. World Health Organization/ Global AIDS surveilance PI Wer -1997-V.72-p.357-360.

22. F.F. Hamers, A.M. Downs, A. Infuso, J.B. Brunei Diversity of the HIV/AIDS epidemic in Europe // AIDS. 1998. V.12(suppl A) - p.63-70.

23. Hersch BS, Popovici F, Apetrei RC, et al/ Acquired immunodeficiency virus in Romania// Lancet -1991-V. 338 p. 645-649.

24. Pape J.W., Liantand B., Thomas F., et al. The AIDS in Haiti//Annual Intern. Medicine. 1985,- V. 103. - P.674-678.

25. Vineron-Meleder H., Pradinand R., Joly F. et al. AIDS in French Gaiana// Ibid. P. 127.

26. Haseltine W.A., Slient HIV infection (editorial)//New. Engl. Journal of Medicine.- 1989.-V.320. -N22.- P.1457.

27. Whyte B.M., Gold J., Dobson A.J., Cooper D.A. Epidemiology of AIDS in Australia// Med. Journ. Austr. 1987. - V.146. - P.65-69.

28. Assessing the current incidence and prevalence of the AIDS epidemic in Australia/ John M. Kaldor J. Cui M.G. Law A.M. McDonald// Conference record 12th World AIDS Conference Geneva 1998. P. 1087.

29. Centers for Disease Control. Pneumocystis Pneumonia Los Angeles// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1981.- V.30.-P.305-307.

30. Centers for Disease Control. Persistent, generalized lymphadenopathy among homosexual males// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1982.- V.31.1. P. 249-252.

31. Centers for Disease Control. Update on Kaposi's sarcoma and opportunistic infections in previously healthy persons// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1982.- V.31.-P.294-301.

32. Centers for Disease Control. Pneumocystis carinii pneumonia among person with hemophilia // Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1982.- V.31.-P.365-367.

33. Centers for Disease Control. Possible transfusion-associated AIDS. California// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1982.- Y.31.-P.652-654.

34. Centers for Disease Control. Immunodeficiency among female sexual partners of males with AIDS.- New-York// Morbidity and Mortality Weekly Report.-1983,- V.31.-P.697-698.

35. Centers for Disease Control. The safety of hepatitis В virus volume // Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1983,- V.32.-P.134-136.

36. Centers for Disease Control. Update : AIDS Europe// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1984.- У.ЗЗ.-Р.607-609.

37. AIDS in Infants / Scott G.B., Buck B.E., Leterman J.G. et al.// New England Journal of Medicine.- 1984. V. 310.- P.76-79.

38. Barre-Sinoussi F., Cherman J.C., Rey F. et al. Isolation of T-lymphotropic retrovirus from patient at risk for AIDS// Science. 1983. - V.220, - P.868-871.

39. Галло P. Вирус синдрома приобретенного иммунного дефицита//В мире науки.- 1987. -С.З.- С.27-37.

40. Gallo R.C. Frequent detection and isolation of cytopathic retroviruses (HTLV-III) from patients with AIDS and at risk for AIDS//Science.-1984.-V.224.-P.500-503.

41. Myers G., Korber В., Wain-Hobson S. et al. Human retroviruses and AIDS.//Los Alamos National Laboratory.- Los Alamos.- 1994.

42. Connor S. Research shows how HIV exhausts the Body// Brit. Med. J. -1995,- Y.310.- P/6973-7145.

43. AIDS-associated virus can productively intect other cells/Levy J.M., Shi-mabucuro J., Hugh Thomas et al.//Virology.-1985,-V. 147, N2.-P.441-448

44. Ho D.D., Rota T.R., Hirsch M.S. Infection of monocyte/macrophages by human t-lymhotropic virus type III//J. Clin. Invest.- 1986.-V77,N5.-P.726-731.

45. Selective tropism of Lymphadenopathy- associated virus (LAV) for helper-induser T-lymphocytes/Klatzmann D., Barre-Sinousi F., Negyere M., et al.// Science.-1987.-V.225.-P.59-63.

46. The T4 gene encodes the AIDS Virus receptor and is expressed in the immune system and the brain/ Maddon P.J., Dalgleish A., McDougal J.S. et al.//Cell.-1986.-Vol.47.,N3.-P.333-348.

47. Relation between sexual practices and T-cell subsets in homosexually active men/ Detels R., Fahey J.L., Schwarts R., Creen R.S.//Lancet. 1983.- V.l. -P.609-611.

48. Seroepidemiology of HTLV-III in Southern Africa/ Lyons S/F/. Schoub B.D., McGillivray, Sher R.// South African Medical Journal. 1987. - V.67. - P/961962.

49. Variation in HTLV-III antibodies in homosexual men/ Biggar R.V., Melbye M., Ebbesen P. et al.// British Medical Journal. 1985. - V.291. - P/997-998.

50. Loss of HIV-I antibodies with evidence of viral infection in asymptomatic homosexual men/ Farzadegan H., Polis M., Wolinsky S.M. et al // Annual of Internal Medicine. 1988,- V. 108. P.785-790.

51. Blattner W.A., Biggar R.G., Weiss S.H. et al. Epidemiology of HTLV-III and risk of the AIDS//Annal of Internal Medicine.- 1985.- V.103.-P.665-670.

52. Risk factors for HIV infection in homosexual men in Sydney, Australia/ Andrew Grulich G. Prestige J. Cui P. Et al. // Conference record 12th World AIDS Conference Geneva -1998. - P.366.

53. To characterize risk behaviors associated with incident HIV infection in San Francisco/ Beth A. Dillon F.M. Hecht J.A. Kahn.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva 1998. P.361.

54. HIV-infection and pregnancies in sexual partners of HIV-seropositive hemophilic men US.// MMWR.- 1987,- 11;36(35). P/593-595.

55. Heterosexual and perinatal transmission of HIV-1: Associations with bacterial vaginosis (BV)/Taha Taha, N. Kumwenda, G. Liomba.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva 1998. P-410.

56. Mann J., Quinn T.C., Piot P. et al Condome use and HIV infection among prostitute in Zaire// New Eng. J. Med. 1987,- V.316.-P345-349.

57. Centers for Disease Control. Antibody to HIV in female prostitute// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1987.- V.36.-P.157-161.

58. Rogers M.F., Thomas P., Stradier T. et al. National surveillance for AIDS in Children// II international conference on AIDS. Paris, 1986. - P99.

59. Thomas P., Desjarlais D., Odonell R., Deren S. The epidemiology of maternally transmitted AIDS in children in New York// Ibid.- p. 123.

60. Placebo control trials of short-course antiretroviral regimens to reduce mother-to-child HIV transmission are essential to establish standard of care in Africa./JamesG. Kahn, E. Marcelle.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva 1998. P-813.

61. Relevance of current trials to breast-feeding policy and practice/ Van de Perre.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva 1998. №85.

62. Ziegler J.B., Cooper D.A., Johnson R.O. et al. Postnatal transmission of AIDS-associated retrovirus from a mother to an infant// Lancet. 1985. - V. 1. - P.896-897.

63. Breastfeeding and transmission of HIV from mother to infant. / Zeigler J.B., Stewart G.J., Penny R., et al.// IV International Conference on AIDS. Stok-holm.-1988.-Abstr.5100.

64. The global burden of mother-to-child transmission of HIV-1/ Phillip Nieburg, K.A. Stanecki.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva 1998. -№13591.

65. Treatment of HIV infection in pregnancy/ Squires.// Update CD-ROM 12th World AIDS Conference Geneva 1998. №387.

66. HTLV-III/LAV antibody and immune status of household contacts and sexual partners of persons with hemophilia/Jason J.M., McDougal J.S., Dixon G. et al.// Ibid. -1986.-V.255.-P.212-215.

67. Lifson A.R. Do alternative modes for transmission of HIV exist?// Journal of American Medical Association.-1988.-V.259.-P. 1353-1356.

68. Peterman T.A., Stoneburner R.L., Allen J.R. Risk of HTLV-III/LAV transmission to household contacts of persons with transfusion-associated HTLV-III/LAV infection// II international conference on AIDS. Paris, 1986. - P107.

69. Mann J.M., Quinn T.C., Francis H. et al. Prevalence of HTLV-III/LAV to household contacts of adults with AIDS//J. Amer. Med. Assoc. 1987.- V.257.-P.640-644.

70. Marmor M. Risk Factors// AIDS. Basic guide for clinicians.-Copenhagen.-Munksguard, 1984.-1.-P.312.

71. Centers for Disease Control. HIV-infection transmitted from an organ donor screened for HIV-antibody. North Carolina // Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1987.- V.36.-P.306-308.

72. Clark J .A. HIV transmission and skin draft// Lancet. 1985. - V.l.- P.983.

73. Stewart G.L., Tyler J.P.R., Cunningham A.L. et al. Transmission of HTLV-III/LAV by artificial incemination by donor// Lancet. 1985.- V.2.- P.581-584.

74. Oksenhendler E., Harzik M., Le Roux K. et al. HIV-infection with seroconversion after a superficial needle stick injury to a finger// New Engl. J. Med. -1986.-V.315.-P.582.

75. Neisson-Vernant C., Arfis T., Mathez D., et al. Needlestick HIV seroconversion in a nurse// Lancet. 1986. - V.2. - P.814.

76. Centers for Disease Control. Possible transmission of HIV to a patient during an invasive dental procedure// Morbidity and Mortality Weekly Report.- 1990.-V.39.-P.489-493.

77. Friedland M.D., Harris C., Butkas-Small C. et al. Intravenous drug abusers and AIDS//Archive of International Medicine.- 1985.-V.145,- P. 145-149.

78. Rutherford G.W. Long-term survival in HIV-infection// Brit. Med. J.- 1994,-V.309, N6950.- P.283-284.

79. Fausi A.S. Impact of biomedical research on the AIDS epidemic// Science challenging AIDS.- Karger.-Basel.- 1992.-P.1-14.

80. Pau C.P., Kai M., Holloman-Candal D.L. et al. Antigenic variation and se-rotiping of HIV type 1 from four World Health Organization -sponsored HIV vaccine sites. //AIDS Res. Hum. Retroviruses 1994.- 10.-1369-1377.

81. Cheingsong-Popov R., Lister S., Callow D., et al. Serotyping HIV type 1 by antibody binding to the V3 loop: relationship to viral genotype.// AIDS Res. Hum. Retroviruses 1994.- 10.-1379-1386.

82. Pau C.P., Lee-Thomas S., Auwanit W., et al. Highly specific V3 peptide enzyme immunoassay for serotyping HIV type 1 specimens from Thailand.// AIDS.- 1993.- 7- 337-340.

83. Delaporte E., Dupont A., Merlin M. et al/ Seroepidemiological survey of HIV-1 and HIV-2 antibodies in Gabon.//AIDS.- 1988.- 2.- 136-137.

84. Smith J.D., Bruce C.B., Featherstone A.S.R., et al. Reactions of Ugandian antisera with peptides encoded by V3 loop epitopes of human immunodeficiency virus type 1.//AIDS Res. Hum. Retroviruses 1994.- 10.-577-583.

85. Ou C.Y., Kwok S., Mitchell S.W., et al. DNA amplification for direct detection of HIV-1 in DNA of peripheral Blood mononuclear cells.// Science.- 1988.239.- P/295-297.

86. Ou C.Y., McDonough S.H., Cabanas D., et al. Rapid and quantitative detection of anzymatically amplified HIV-1 DNA using chemiluminescent oligonucleotide probes.// AIDS Res Human Retroviruses. -1990.- 6.- P. 1323-1329.

87. Delwart E.L ., Shpaer E.G., Louwagie J. et al. Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay: analysis of HIV-1 env genes.// Science.-1993,- 262,- P. 1257-1261.

88. Pieniazek D., Janini L.M., Ramos A., et al. HIV-1 patients may harbor viruses of different phylogenetic subtypes: implications for the evolution of the HIV/AIDS pandemic. //Emerging Infectious disease. -1995,- 1,- P. 86-88.

89. Shpaer E.G., Mullins J.I. Rates of amino acid change in the envelope protein correlate with pathogenicity of primate lint ¡viruses.// J. Mol. Evol.- 1993.-37.-P.57-65.

90. Chakrabarti L., Guyader M., Alizon M., et al. Sequence of simian immunodeficiency virus from macaque and its relationship to other human and simian retroviruses.// Nature. 1987.- 328.- P.543-547.

91. Peeters M., Honore C., Huet T., et al. Isolation and partial characterization of an HIV-related virus occurring naturally in chimpanzees in Gabon.// AIDS.-1989.-339.- P.625-630.

92. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees.// Molecular biology Evol. 1987.- 4.- P.406-425.

93. Li W.H. A statistical test of phylogenies estimated from sequence data.// Mol. Biol. Evol. 1989. - 6. - P.424-435.

94. M.E. Quinones-Mateu, E.J. Arts. Recombination in HIV-1: Update and implications//AIDS Reviews.-1999.- 1.-P.89-100.

95. Korber B., Hahn B., Foley B. et al. Human retrovirus and AIDS, 1997: a compilation and analisis of nucleic acid and amino acid sequences. Theoretical biology and biophysics group, Los Alamos national Laboratory, Los Alamos, NM -1997.

96. Louwagie J., McCutchan F.E., Peeters M. et. al. Phylogenetic analysis of gag genes from 70 international HIV-1 isolates provides evidence for multiple genotypes. //AIDS.-1993.- 7.-P.769-780.

97. Loussert-Ajaka I., Chaix ML., Korber B., et al. Variability of human immunodeficiency virus type 1 group O strains isolated from Cameroonian patients living in France.// Journal of Virology.- 1995. 69.-5640-9.

98. McCutchan F.E., Salminen MO, Carr JK, Burke DS. HIV Genetic diversity. Abstracts XI International Conference on AIDS Vancouver, Canada- 1996 -Mo.02.-P-2.

99. Robertson D.L., Sharp P.M., McCutchan F.E. et al.// Nature. 1995.-V.374.-P. 124-126.

100. Sharp P.M., Roberson D.L., Gao F., Hahn B.N.Origins and diversity of human immunodeficiency viruses.//AIDS.- 1994.- 8 (suppl l).-P.27-42.

101. Weniger B.G., Takebe Y., Ou C.Y., Yamazaki S. The molecular epidemiology of HIV in Asia.// AIDS.- 1994.-8(suppl2). P. 13-28.

102. MacCutchan Overview of molecular epidemiology// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.- №428.

103. McCutchan Francine E., Salminen MO, Carr JK, Burke DS.

104. HIV Genetic diversity.// Mo.02 Abstracts XI International Conference on AIDS Vancouver, 1996

105. U1G. Myers, B. Korber, S. Wain-Hobson, et al. Human retrovirus and AIDS, IV. A compilation and analisis of nucleic acid and amino acid sequences. Los Alamos national Laboratory, Los Alamos, NM -1993.

106. Simon F., Mauclere P., et al. Identification of new human immunodeficiency virus type 1 distinct from group M and group O.II Nature Med.- 1998.- 4.1. P/l032-7.

107. Zekeng L., Gurtler L., Afane Z. E., et al. Prevalence if HIV-1 Subtype Oin-fection in Cameroon: preliminary results.//AIDS.- 1994.- 8 -1626-1628.

108. M. Peeters, E. Esu-William2, E. Nzila, Molecular epidemiology of HIV-1 genetic subtypes in West and Central Africa// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.- №430/11163.

109. Janssens W., Buve A., Nkengasong J.N. The puzzle of HIV-1 subtypes in Africa.//AIDS.- 1997.-11,- P.705-12.

110. Rajae El Aquad Elmir El Harti S. Amzazi HIV1 variability in Morocco// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,-1998.- №11203.

111. DeLeys R., Vanderborght B.,Vander Haesevelde M., et al. Isolation and partial characterization of an unusual human immunodeficiency retrovirus from West- Central African origin.// Journal Virology.- 1990.- 64.-1207-1216.

112. Luo C.C., Tian C., HuD.J.,et al. HIV-1 subtype C in China.// Lancet. -1995.-345.- P. 1051-1052.

113. D. Gadkar,. T.C. Quinn R.R,. Gangakhedkar Shedding of HIV-1 DNA subtypes C and A in genital ulcers in patients attending STD Clinics in Pune, India// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.-.№23353.

114. Ou C.Y., Takebe Y., Luo C.,et al.Wide distribution of two subtypes of HIV-1 in Thailand. //AIDS Res. Human Retroviruses.-1992. 8. - P.1887-1895.

115. D. Kitayaporn S. Vanichseni T.D. Mastro Similar Risk Factors for New Infection with HIV-1 Subtypes B and E among Injecting Drug Users (IDUs) in Bangkok, Thailand // Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.- №13144.

116. M. L. Santiago E.G. Santiago J.C. Hafalla The molecular epidemiology of HIV-1 infection in the Philippines, 1985-1997// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.- 13137.

117. Y. Shao, L. Su, F. Zhao Genetic recombination of HIV-1 strains identified in China // Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.-№429/11179.

118. Patrick Sullivan A.N. Do R. Lai C. Tetteh Surveillance for Group O HIV-1 infections among African-born HIV infected persons in the United States, 19951997 //Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.-№l3103.

119. B. Stephanie, R. A. Shaffer, M.J. Starkey. The association of epidemiologic risk factors and HIV-1 subtype in recent military seroconverters// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.60908.

120. Damond F., Simon F., Loussert-Ajaka I., et al. Diversity of HIV-1 infection in North Area of Paris, France.// Abstracts XI International Conference on AIDS Vancouver, 1996. Mo.C. 1455. P. 134.

121. Marcia Kalish Thomas Stoeckli I. Steffen Molecular Epidemiology of HIV-1 in Switzerland // Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.-№13207.

122. Molguin B. Rodes V. Soriano Circulating HIV-1 and HIV-2 genetic subtypes in Spain. // Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.-№60681.

123. Gao F., Robertson D., Carruthers C. et al. An isolate of human immunodeficiency virus type 1 originally classified as subtype 1 represents a complex mosaic comprising three different group M subtypes (A, G, and I)// J. Virology 1998.- 12.- 10234-41.

124. M.Serban, L. Gurtler, R.Costa, et al. Mo.C. 1461 Identification of HIV-1 clusters from children in Romania. Abstracts XI International Conference on

125. AIDS Vancouver, 1996-P.135.

126. Bobkov A., Chengsong-Popov R., Garaev N., et al. Identification of an env G subtype and heterogenety of HIV-1 strains in the Russian Federation and Belarus.//AIDS. -1994.- 8.- P.1649-1655.

127. Leitner T, Korovina G, Marquina S, Smolskaya T, Albert J Molecular epidemiology and MT-2 cell tropism of Russian HIV type 1 variant. // AIDS Res Hum Retroviruses. 1996. - N12(17). - P. 1595-1603.

128. L. F.M. Brigido, M. Rossini, I. Santos HIV-1 subtypes circulating in Sro Paulo, Brazil// Update CD-Rom Conference record 12th World AIDS Conference Geneva,- 1998.-№434/13162.

129. Chequer Pedro, Castilho E., Gomes M.R.O., et al. Mo.C.1439 Fifteen years of AIDS epidemic in Brazil: trends over time and perspectives.// Abstracts XI International Conference on AIDS Vancouver, 1996 P. 131.

130. G.Stimson, D.C.D. Jarlais and A.Ball Drug injecting and HIV infection // editors WHO. UCL Press Limited . London. 1998. p. 294.