Предикторная роль β-дефензина-2 в развитии воспалительных заболеваний пародонта тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Тихомирова Екатерина Александровна

• Тихомирова Екатерина Александровна
• кандидат наук
• 2023

Оглавление диссертации кандидат наук Тихомирова Екатерина Александровна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Современные представления об этиологии и патогенезе воспалительных заболеваний пародонта

1.2 ß-дефензин-2 как потенциальный предиктор развития воспалительных заболеваний пародонта

1.2.1 Особенности структурной организации кластеров дефензиновых генов

1.2.2 Влияние вариаций числа копий гена DEFB4A на уровень продукции ß-дефензина-2

1.2.3 Идентификация однонуклеотидных вариаций в пределах генов ß-дефензинов, являющихся маркерами воспалительных заболеваний пародонта

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Постановка диагноза и формирование групп пациентов в соответствие с Международной классификацией заболеваний и состояний пародонта и тканей вокруг имплантатов AAP и EFP 2017 года

2.2 Клиническая характеристика пациентов

2.3 Клинические методы исследования

2.3.1 Проведение опроса пациентов

2.3.2 Методы определения состояния твердых тканей зубов и пародонта

2.3.3 Рентгенологические методы обследования

2.4 Лабораторные методы исследования

2.4.1 Забор клинического материала

2.4.2 Определение концентрации ß-дефензина-2 методом иммуноферментного анализа

2.4.3 Выделение ДНК

2.4.4 Детекция пародонтопатогенов

2.4.5 Генетический анализ последовательности гена DEFB4A

2.5 Статистический анализ

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1 Данные опроса пациентов

3.2 Клиническая оценка стоматологического статуса пациентов

3.3 Анализ состава пародонтопатогенной микрофлоры содержимого зубодесневой борозды и пародонтальных карманов

3.3.1 Определение количественного разнообразия видов пародонтопатогенов

в составе бактериальных комплексов

3.3.2 Характеристика видового разнообразия пародонтопатогенов в обследуемых группах

3.3.3 Анализ распределения пародонтопатогенов вне консорциумов с изучаемыми видами, а также бактериальных комплексов в обследуемых группах пациентов

3.4 Результаты иммуноферментного анализа уровня в-дефензина-2 в десневой жидкости

3.4.1 Определение концентрации в-дефензина-2 в клиническом материале исследуемых групп

3.4.2 Исследование колебаний уровня в-дефензина-2 в десневой жидкости у представителей контрольной группы

3.4.3 Определение порогового значения концентрации в-дефензина-2 при расчете риска развития воспалительных заболеваний пародонта

3.4.4 Определение корреляции между концентрацией в-дефензина-2 и составом пародонтопатогенов в содержимом зубодесневой борозды или пародонтального кармана

3.5 Выявление мутационных изменений в нуклеотидной последовательности

гена DEFB4A у лиц с хроническим генерализованным пародонтитом

3.5.1 Конструирование праймеров для амплификации фрагментов гена БЕБВ4Л

3.5.2 Анализ распределения частот однонуклеотидных вариаций в пределах секвенированных фрагментов гена БЕБВ4Л

3.6 Прогнозирование развития воспалительных заболеваний пародонта

ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Предикторная роль β-дефензина-2 в развитии воспалительных заболеваний пародонта»

Актуальность темы исследования

Распространенность воспалительных заболеваний пародонта (ВЗП) как в развитых, так и в развивающихся странах за последние десятилетия достигла таких масштабов, что по статистическим критериям уже подходит под понятие пандемии [116; 193]. По данным ВОЗ, тяжелые формы пародонтита выявляются у 5-20% взрослых людей среднего возраста (35-44 года) и у ~40% людей пожилого возраста (65-74 года) [138; 232]. Проведенные в последние годы на территории Российской Федерации эпидемиологические исследования показали, что первые признаки воспаления десны диагностируются у 45% обследованных раннего возраста (15 лет), а клинически здоровый пародонт к 35 годам сохраняется лишь у 4-5% людей [19]. Более того, наблюдается неуклонный рост числа воспалительных заболеваний пародонта, имеющих агрессивное и практически непрерывно рецидивирующее течение. Очевидно, что переломить сложившуюся негативную тенденцию позволит проведение профилактических и лечебных мероприятий на максимально ранних этапах проявления патологического процесса в тканях пародонта. В связи с этим перед исследователями и клиницистами крайне остро встает вопрос о поиске надежных предикторов развития ВЗП, необходимых для разработки новых неинвазивных диагностических тест-систем на основе методов иммуноферментного анализа (ИФА), полимеразной цепной реакции (ПЦР) и др., которые позволили бы на максимально ранних этапах предсказывать развитие заболевания для осуществления интенсивных профилактических мероприятий.

Среди множества факторов, способствующих инициации, а в последующем прогрессированию и хронизации ВЗП, ключевая роль отводится патогенным и условно-патогенным микроорганизмам, и, в частности, таким видам грамнегативных протеолитических бактерий, как Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis), Tannerella forsythia (T. forsythia), Treponema denticola (T. denticola), Prevotella intermedia (P. intermedia), Aggregatibacter actinomycetemcomitans (A. actinomycetemcomitans) [43; 142; 149; 168; 172; 200; 215; 242]. Указанные

пародонтопатогены обладают богатым набором факторов патогенности, который позволяет им не только успешно преодолевать защитные механизмы местного иммунитета хозяина, но и вступать в конкурентные отношения с нормофлорой полости рта и кардинально менять состав полимикробного сообщества при формировании биопленки на поверхности зуба [5; 18; 25; 54; 71; 236; 242]. За счет этого достигается ряд преимуществ: метаболическое взаимодействие, сопротивление антибактериальным препаратам [11], обеспечивается эффективный обмен ДНК и др. [30; 34; 172]. Таким образом, достигается полимикробная синергия - явление, когда два или более видов бактерий совместно взаимодействуют для получения результата, который не достигается за счет отдельных видов [34; 149; 188]. Развивающийся на фоне плохой гигиены полости рта видовой дисбаланс в пользу патогенных микроорганизмов (дисбиоз) является ключевой причиной начала воспаления мягких тканей пародонта.

Тем не менее ряд исследователей отмечает присутствие пародонтопатогенов у лиц с клинически здоровым пародонтом, однако развития выраженного воспаления при этом не происходит [41; 203; 212; 215; 219; 233; 248]. Данный факт указывает на то, что ВЗП не являются классическими инфекционными нозологиями. Воспалительные заболевания пародонта - это сложные дисбиотические заболевания, связанные с изменением числа или влияния отдельных видов бактерий в полимикробном сообществе [171; 172], а также нарушением баланса между факторами микробной агрессии и иммунным ответом человека [20; 35; 73; 168]. Кроме того, для реализации неблагоприятного исхода требуется наличие целого ряда дополнительных внешних (курение, травма, скученность зубов и др.) и/или внутренних (генетическая предрасположенность, наличие соматической патологии, снижение иммунного статуса, гормональный дисбаланс и др.) факторов риска [14; 15; 22; 177; 193; 246; 267].

В настоящее время большое внимание отводится изучению факторов иммунной защиты организма человека, как важнейшего патогенетического звена в развитии ВЗП. Наибольший интерес представляют антимикробные белки первой линии иммунной защиты, в частности, в-дефензины (ИВБ). в-дефензины - это

небольшие (18-45 аминокислот), амфифильные, богатые цистеином катионные пептиды с тремя или четырьмя высококонсервативными дисульфидными связями [8; 21; 108]. Из 6 обнаруженных изоформ НВБ наиболее глубоко изучены в-дефензин-1 (НВБ-1), в-дефензин-2 (НВБ-2) и в-дефензин-3 (НВБ-3) [42]. Экспериментально доказана их высокая микробицидная активность в отношении грамотрицательных и грамположительных бактерий, вирусов, грибов и паразитов [75; 82; 104; 264], а также селективная хемотаксическая активность в отношении эффекторов иммунной системы хозяина (тучных и незрелых дендритных клеток) [8; 147; 156; 257]. Основными продуцентами НВБ в полости рта являются гингивальные кератиноциты, эпителиоциты слизистых оболочек протоков слюнных желез, макрофаги, моноциты и дендритные клетки [114; 122]. Известно, что секреция НВБ-2 и НВБ-3 индуцибельна и эти дефензины продуцируются в ответ на воздействие микробных антигенов и цитокинов воспаления, в отличие от НВБ-1, который экспрессируется эпителиальными клетками десны постоянно [1; 233]. В отношении изменения экспрессии НВБ-2 у пациентов с ВЗП и влияния пародонтопатогенов на уровень этих белков получено много противоречивой информации, что требует дальнейшего изучения. Настоящее исследование посвящено определению роли НВБ-2 в поддержании здоровья десны и перспектив использования этого антибактериального белка в качестве предиктора развития ВЗП.

Нами было высказано предположение, что сбои в экспрессии НВБ-2 будут создавать благоприятные условия для нарастания численности пародонтопатогенных бактерий в биопленке, формирования дисбиоза и развития аберрантной воспалительной реакции в тканях пародонта. Одной из причин изменения экспрессии НВБ-2 могут быть различные мутации, в том числе однонуклеотидные варианты (БКУ) в пределах гена ВЕБВ4Л, который кодирует последовательность этого белка [170]. В ряде эпидемиологических исследований было показано, что у более молодых пациентов среди всех причинных факторов развития ВЗП генетический вклад может достигать 50%, в то время как у пожилых пациентов он составляет не более 25% [177].

Ген ВЕББ4Л расположен на 8-й хромосоме в крайне вариабельной области -8р23.1. Скорость возникновения мутаций в этом участке чрезвычайно высока (~0,7% на гамету), что указывает на высокий уровень пластичности данного региона генома [51]. Наиболее успешное исследование, касающееся поиска генетического маркера ВЗП в пределах последовательности гена ВЕББ4Л, было проведено Б. КиЛ-Баугакёаг с соавт. (2020) среди 185 жителей Черноморского региона Турции [170]. В результате секвенирования фрагментов гена и фланкирующих его последовательность участков ДНК была выявлена нуклеотидная замена Т^О (гб1339258595), которая показала статистически значимую ассоциацию (р=0,0004) с хроническим генерализованным пародонтитом (ХГП). Однако данный БКУ расположен крайне далеко за пределами последовательности гена, что предполагает его возможное влияние на функционирование энхансеров и других регуляторов транскрипции DEFB4А. Кроме того, авторы не проводили изучение уровня экспрессии НБВ-2.

В настоящей работе впервые была предпринята попытка оценки взаимосвязи между клиническими проявлениями заболевания, бактериальным составом биопленки, уровнем продукции НБВ-2 и наличием генетических изменений в пределах последовательности гена ВЕББ4Л у лиц с клинически здоровым пародонтом и у пациентов с ВЗП различной тяжести течения. Полученные данные внесут значимый вклад в понимание этиологии и патогенеза ВЗП и могут быть полезны при создании новых тест-систем для раннего выявления признаков воспаления десны, а также помогут отслеживать прогрессирование болезни, что необходимо для объективной оценки эффективности симптоматической или протективной терапии.

Степень разработанности темы исследования

На данный момент многочисленные зарубежные исследовательские группы достаточно далеко продвинулись в изучении влияния уровня экспрессии ИБВ-1 на прогрессирование целого ряда болезней человека [61; 62; 79; 103; 125; 137; 161; 180; 206], чего нельзя сказать о других видах в-дефензинов, в том числе и о ИБВ-2.

Сведения о характере экспрессии ИБВ-2 у лиц с клинически здоровым пародонтом и у пациентов с ВЗП носят крайне противоречивый характер. Так, одни авторы отмечают, что при ВЗП происходит увеличение продукции ИБВ-2 [114; 157; 212; 254]; другие утверждают, что, наоборот, наблюдается снижение уровня ИБВ-2 [36; 123; 152; 154; 212; 233]; третьи не выявили какие-либо статистически значимые различия в концентрации этого белка у лиц с клинически здоровым пародонтом и у пациентов с ВЗП [152; 254]. Причинами таких разногласий могут быть как различия в использованных методических приемах, так и откровенные просчеты при планировании эксперимента. Например, для изучения уровня продукции ИБВ-2 авторы использовали слюну, десневую жидкость, сыворотку крови и биоптаты десны, в которых концентрация антимикробных белков может существенно разниться. Отдельные авторы исследовали экспрессию мРНК ИБВ-2, что имеет косвенное отношение к продукции самого белка. Кроме того, нередко существенно различался по возрасту состав групп контроля и пациентов с ВЗП. Среди отечественных публикаций не было выявлено ни одного исследования, касающегося изучения концентрации ИБВ-2 в биологическом материале при ВЗП.

В отношении поиска генетического маркера ВЗП в пределах последовательности гена ВЕББ4Л на данный момент известна лишь одна успешная работа, выполненная в 2020 году группой турецких ученых, в которой вариация гб1339258595 показала статистически значимую ассоциацию с ХГП [170]. Другие исследовательские коллективы изучали влияние числа копий гена ВЕББ4Л на продукцию белка и предрасположенность к ВЗП. В частности, Б. 1агаёа1 с соавт. (2013) показали, что низкая копийность гена DEFB4А увеличивает риск развития тяжелой формы хронического пародонтита примерно в 3 раза, при этом наблюдалась слабая линейная корреляция между уровнем ИБВ-2 в сыворотке крови и количеством копий гена DEFB4А [76]. Противоположные результаты были получены Я. К. МеЫо1ха с соавт. (2016), которые не обнаружили какой-либо связи между количеством копий гена DEFB4А и уровнем обсемененности тканей пародонта патогенными бактериями или клиническими показателями ВЗП у ВИЧ-позитивных представителей европеоидной расы (п=38) и у афроамериканцев

(п=69) [68]. Большинство же работ касаются поиска ассоциации между БКУ гена БЕБВ1, продукцией НВБ-1 и риском развития ВЗП [77; 161]. В научной печати на данный момент отсутствуют какие-либо сведения о проведении аналогичных исследований в РФ.

Таким образом, выполненный анализ научной литературы продемонстрировал необходимость более глубокого изучения связи между уровнем продукции НВБ-2 и развитием воспалительного процесса в десне, а также показал важность проработки вопроса о перспективах использования этого белка в качестве предиктора развития ВЗП.

Цель исследования

Повышение эффективности ранней диагностики и профилактики осложненного течения воспалительных заболеваний пародонта путем оценки предикторной роли в-дефензина-2.

Задачи исследования

1. Установить частоту встречаемости ДНК пяти основных пародонтопатогенных видов бактерий и их комплексов в содержимом зубодесневой борозды и пародонтальных карманов у лиц с разным пародонтологическим статусом.

2. Определить концентрацию в-дефензина-2 в десневой жидкости в зависимости от клинического диагноза и бактериального профиля.

3. Рассчитать пороговые значения уровня в-дефензина-2, относительно которых прогнозируется развитие воспалительных заболеваний пародонта.

4. Идентифицировать однонуклеотидные варианты в гене ВЕБВ4Л и оценить их связь с различными клиническими формами проявления воспалительных заболеваний пародонта.

5. На основании полученных результатов разработать прогностические модели определения риска развития воспалительных заболеваний пародонта.

Научная новизна исследования

1. Впервые показано, что сочетанная колонизация видов P. gingivalis и T. forsythia имеет определяющую роль в развитии хронического генерализованного пародонтита стадии III-IV степеней В и С.

2. Впервые определена концентрация в-дефензина-2 в десневой жидкости у представителей смешанной российской популяции с гингивитом, ассоциированным с микробной биопленкой, хроническим генерализованным пародонтитом стадии III-IV степени B, хроническим генерализованным пародонтитом стадии III-IV степени С и у лиц без клинических признаков воспалительных заболеваний пародонта, а также приведены результаты сравнения полученных значений между исследуемыми группами.

3. Впервые у лиц без клинических проявлений воспалительных заболеваний пародонта разных возрастных групп была определена концентрация в-дефензина-2 в десневой жидкости и установлены ее референсные значения.

4. Впервые рассчитаны пороговые уровни в-дефензина-2, относительно которых прогнозируется развитие разных форм воспалительных заболеваний пародонта.

5. Определена новая группа биологических маркеров (присутствие пародонтопатогенов и уровень в-дефензина-2 в десневой жидкости) для ранней диагностики воспалительных заболеваний пародонта и предложена прогностическая модель, включающая данные показатели.

6. Также впервые построена прогностическая модель, определяющая риск развития хронического генерализованного пародонтита стадии III-IV степеней B и C исходя из значений концентрации в-дефензина-2 в десневой жидкости, индекса зубного налета и числа видов пародонтопатогенов в содержимом зубодесневой борозды.

7. Впервые обнаружена ассоциация мутации в CCAAT-блоке (rs2740086) с развитием хронического генерализованного пародонтита стадии III-IV степеней B и С.

Теоретическая и практическая значимость работы

Теоретическая значимость работы заключается в клинико-экспериментальном доказательстве целесообразности использования концентрации белка HBD-2 в десневой жидкости в качестве предиктора развития ВЗП. Кроме того, расширены и дополнены знания об этиологии и патогенезе ВЗП, в частности, уточнена значимость сочетанной колонизации P. gingivalis и T. forsythia для развития тяжелых форм пародонтита. Также была показана сильная корреляционная зависимость между концентрацией HBD-2 в десневой жидкости, присутствием пародонтопатогенов в биопленке и тяжестью течения ВЗП, что дает основание предположить крайне высокую значимость HBD-2 как естественного защитного барьера на пути болезнетворных бактерий. Выявленная связь между наличием однонуклеотидной замены Т^С (rs2740086) в промоторной области гена DEFВ4A и развитием тяжелых форм пародонтита подтвердила важную роль генетического компонента в патогенезе ВЗП.

Практическая значимость работы заключается в том, что был предложен предиктор воспалительных заболеваний пародонта, удобный для создания неинвазивных диагностических тест-систем на основе метода ИФА, а также были разработаны прогностические модели, определяющие вероятность развития ВЗП, которые могут быть использованы для выявления групп риска на доклиническом этапе.

Методология и методы исследования

Дизайн исследования: одномоментное (поперечное) клиническое описательное исследование пациентов обоего пола в возрасте от 18 до 68 лет с ВЗП и без клинических признаков ВЗП, которое являлось открытым, наблюдательным и не предполагающим никакие вмешательства в лечение и тактику ведения больных.

Диссертационное исследование проходило в два этапа. При реализации первого (клинического) этапа было проведено стоматологическое и рентгенологическое обследование 348 пациентов, включающее оценку

клинического состояния тканей пародонта. На основании клинических данных, в соответствии с критериями включения, невключения и исключения все пациенты были разделены на 2 группы: 188 человек вошли в группу пациентов с ВЗП, а 160 человек составили группу пациентов без клинических признаков ВЗП (Контроль). В группе ВЗП было выявлено 54 человека с признаками гингивита, ассоциированного с микробной биопленкой (ГАБ), 73 человека с проявлениями хронического генерализованного пародонтита стадии III-IV степени В (ПстВ) и 61 человек с проявлениями хронического генерализованного пародонтита стадии III-IV степени С (ПстС). Из общей контрольной группы было сформировано 3 подгруппы, которые соответствовали возрастным особенностям групп исследования: в подгруппу Контроль 1 вошли 159 человек, в подгруппу Контроль 2 - 33 человека, в подгруппу Контроль 3 - 80 человек. В первое посещение после обследования сразу проводился забор биологического материала. Для этого у лиц без клинических признаков ВЗП (контрольная группа) и у пациентов с ГАБ с помощью стерильных кюрет Грейси собирали содержимое зубодесневой борозды, а у пациентов с ПстВ и ПстС - содержимое пародонтальных карманов. После изоляции от слюны и подсушивания зубов и десны собирали десневую жидкость путем пропитывания стерильных бумажных штифтов в зубодесневой борозде или пародонтальном кармане в области 8 зубов обеих челюстей в течение 1 минуты. Забор цельной крови, необходимой для последующего генетического исследования, осуществляла медицинская сестра отделения из лучевой вены в объеме 2 мл в стерильные вакуумные пробирки Improvacuter с ЭДТА К3. Полученные образцы хранили при температуре -18°C без размораживания. Второй (лабораторный) этап заключался в проведении: - молекулярно-генетического анализа содержимого десневой борозды и пародонтальных карманов методом одноступенчатой мультиплексной ПЦР с использованием набора «Мультидент-5» (ООО «НПФ Генлаб», г. Москва) для идентификации ДНК пяти основных пародонтопатогенных видов: P. gingivalis, T. forsythia, P. intermedia, A. actinomycetemcomitans и T. denticola;

- иммуноферментного анализа десневой жидкости с целью определения в ней концентрации белка ß-дефензина-2 с помощью набора реагентов ELISA Kit for Defensin Beta 2 (Cloud-Clone Corp., США);

- секвенирования по Сэнгеру фрагментов гена DEFB4A и анализа последовательности нуклеотидов с целью выявления однонуклеотидных вариантов (SNV).

Статистическую обработку полученных данных осуществляли методами параметрического и непараметрического анализа с использованием пакетов прикладных программ Jamovi 1.1.9.0 и IBM SPSS Statistics 26.0. Выявленные взаимосвязи и зависимости были положены в основу формулировки клинических рекомендаций.

Основные положения, выносимые на защиту

1. P. gingivalis и комплексы бактерий, содержащие P. gingivalis и другие пародонтопатогены, за исключением T. forsythia, повышают вероятность развития гингивита, ассоциированного с микробной биопленкой, в 2,95 раза; совместное присутствие P. gingivalis и T. forsythia в составе микробных комплексов имеет определяющую роль в развитии хронического генерализованного пародонтита стадии III-IV степеней В и С, повышая вероятность их развития в 13,6 раз и 16,5 раз, соответственно.

2. У пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта статистически значимо снижается концентрация ß-дефензина-2 в десневой жидкости по мере утяжеления клинических проявлений.

3. Однонуклеотидная замена Т^С (rs2740086) в промоторной области гена DEFB4A ассоциирована с предрасположенностью к хроническому генерализованному пародонтиту стадии III-IV степеней В и С. Аллель С повышает вероятность развития этого заболевания в 3,21 раза, а генотип С/С+Т/С - в 29 раз.

Степень достоверности и апробация результатов

В данной работе приняло участие 348 пациентов, что явилось достаточным для формирования отдельных групп исследования и контрольных групп. Был осуществлен забор более 1000 проб биологического материала четырех видов (содержимое зубодесневой борозды - 160 образцов; содержимое пародонтальных карманов - 188 образцов; десневая жидкость - 348 образцов; венозная кровь -348 образцов) и проведены исследования с использованием высокотехнологичных материалов нового поколения и апробированных методов (ПЦР, ИФА, секвенирование), позволяющих получить репрезентативные показатели. Анализ результатов осуществлялся с опорой на данные исследований отечественных и зарубежных научных групп, полученные за последние 5 лет. При анализе применялся широкий арсенал методов параметрической и непараметрической статистики, позволяющий выявить корреляционную зависимость между отдельными данными клинических и лабораторных исследований, построить прогностические модели, определяющие вероятность развития ВЗП.

Материалы диссертационной работы были доложены и обсуждены на Аспирантской сессии 2021 в рамках Всероссийского стоматологического форума (Москва, 2021 г.); XVI Международной (XXV Всероссийской) Пироговской научной медицинской конференции студентов и молодых ученых (Москва, 2021 г.); XLIII (43) Итоговой научной конференции общества молодых ученых МГМСУ им. А.И. Евдокимова (Москва, 2021 г.); XXVIII Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 2021 г.); V Всероссийском открытом конкурсе молодых ученых и студентов на лучший научный доклад в области стоматологии и челюстно-лицевой хирургии (Москва, 2021 г.); XVIII Международной научной конференции студентов, молодых ученых и специалистов «Актуальные вопросы современной медицины» (Харьков, 2021 г.); V Всероссийской научно-практической конференции с международным участием молодых ученых, аспирантов и студентов «Актуальные проблемы медико-биологических дисциплин» (Саранск, 2021 г.); Всероссийской межвузовской научно-практической конференции молодых ученых с международным участием

«Актуальные вопросы стоматологии» (Москва, 2021 г.); Научно-практической конференции молодежной секции РПА «Междисциплинарный подход к решению стоматологических проблем» в рамках XLV Всероссийской научно-практической конференции «Стоматология XXI века» (Москва, 2021 г.); 95-ой Всероссийской научно-практической конференции студенческого научного общества с международным участием «Мечниковские чтения-2022» (Санкт-Петербург, 2022 г.).

Диссертация доложена, обсуждена и одобрена на совместном заседании сотрудников кафедры микробиологии, вирусологии, иммунологии и кафедры пародонтологии стоматологического факультета ФГБОУ ВО МГМСУ им. А.И. Евдокимова Минздрава России 8 сентября 2022 года, г. Москва.

Личный вклад автора

Автором сформулированы рабочая гипотеза, методология и дизайн диссертационного исследования, проанализированы отечественные и зарубежные научные публикации, обоснована актуальность выбранной темы. Диссертантом самостоятельно проведено клиническое стоматологическое, в том числе пародонтологическое, обследование 348 пациентов с ГАБ, ПстВ, ПстС и лиц без клинических проявлений ВЗП. Диссертантом самостоятельно осуществлен забор образцов десневой жидкости, а также содержимого зубодесневой борозды и пародонтальных карманов. Автор принимала непосредственное участие во всех экспериментальных исследованиях: в подборе праймеров, выделении ДНК из биологического материала, постановке ПЦР с набором реактивов «Мультидент-5», проведении ИФА с помощью набора реактивов ELISA Kit for Defensin Beta 2 (Cloud-Clone Corp., США), в подготовке ПЦР-продуктов для секвенирования, в выравнивании и анализе секвенированных фрагментов ДНК с помощью программного пакета MEGA 5. Диссертантом самостоятельно проведена статистическая обработка данных, сформулированы выводы и практические рекомендации, составлены прогностические модели, определяющие вероятность

развития ВЗП, а результаты исследования изложены в тексте диссертации и представлены в виде публикаций в открытой печати.

Внедрение результатов исследования

Основные научные положения, выводы и рекомендации диссертационного исследования внедрены в лечебную работу отделения пародонтологии №2 и профилактики стоматологических заболеваний «Клинического центра стоматологии» ФГБОУ ВО МГМСУ им. А.И. Евдокимова Минздрава России (г. Москва), а также в учебный процесс у студентов 4, 5-го курсов, у клинических ординаторов в рамках лекционных и практических занятий, у слушателей циклов последипломного образования на кафедре пародонтологии стоматологического факультета ФГБОУ ВО МГМСУ им. А.И. Евдокимова Минздрава России.

Список опубликованных работ по теме диссертации

По материалам диссертационного исследования опубликовано 16 печатных работ, из которых 7 - в журналах, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ.

Объем и структура диссертации

Диссертационная работа изложена на 193 страницах машинописного текста, включает следующие главы и разделы: введение, обзор литературы, материалы и методы исследования, результаты собственных исследований, обсуждение результатов исследования, заключение, выводы, практические рекомендации, список сокращений и условных обозначений, список литературы. Работа иллюстрирована 22 рисунками, 11 диаграммами и 18 таблицами. Список литературы включает 270 наименований, из них 45 отечественных и 225 зарубежных источников.

Автор выражает искреннюю благодарность научному консультанту кандидату биологических наук, PhD Зудиной Ирине Витальевне за безмерную помощь, ценные рекомендации и поддержку в выполнении диссертационного исследования.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Современные представления об этиологии и патогенезе воспалительных

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Тихомирова Екатерина Александровна, 2023 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Абатуров, А. Е. Катионные антимикробные пептиды системы неспецифической защиты респираторного тракта: дефензины и кателицидины. Дефензины - молекулы, переживающие ренессанс (часть 2) / А. Е. Абатуров // Здоровье ребенка. - 2011. - Т. 8, № 35. - С. 137-142.

2. Ассоциация аллелей генов цитокинов со степенью тяжести воспалительных заболеваний пародонта у человека / А. В. Сафонова, А. Н. Петрин, С. Д. Арутюнов [и др.] // Acta Naturae (русскоязычная версия). - 2011. - Т. 3, № 1 (8). - С. 123-129.

3. Ассоциация полиморфных маркеров в генах врожденного иммунитета у больных пародонтитом и воспалительными заболеваниями верхних дыхательных путей / Н. Г. Саркисян, Л. В. Ганковская, И. А. Тузанкина [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2016. - № 1. - С. 67-71.

4. Атрушкевич, В. Г. Особенности микробиоценоза зубного налета у пациентов с агрессивным и хроническим генерализованным пародонтитом / В. Г. Атрушкевич, Е. А. Тихомирова, И. В. Зудина // Кремлевская медицина. Клинический вестник. - 2018. - Т. 1, № 2. - С. 88-97.

5. Бактериальная биопленка пародонтальных карманов: переосмысление опыта пародонтологии / А. М. Ковалевский, А. В. Ушакова, В. А. Ковалевский, Е. Ю. Прожерина // Пародонтология. - 2018. - Т. 23, № 2 (87). - С. 15-21.

6. Балмасова, И. П. Медицинская иммунология и аллергология : учебное пособие / И. П. Балмасова, В. Н. Царев, Е. Н. Николаева. - Москва : ООО «Практическая медицина», 2022. - 200 с.

7. Балмасова, И. П. Современные методы лабораторной диагностики и биомаркеры инфекционно-воспалительных заболеваний полости рта на примере хронического пародонтита / И. П. Балмасова, И. В. Шестакова, Н. Д. Ющук // Российская стоматология. - 2013. - Т. 6, № 2. - С. 35-41.

8. Будихина, А. С. Дефензины - мультифункциональные катионные пептиды человека / А. С. Будихина, Б. В. Пинегин // Иммунопатология,

аллергология, инфектология. - 2008. - Т. 2. - С. 31-40.

9. Вавилова, Т. П. Антимикробные пептиды — многофункциональная защита тканей полости рта / Т. П. Вавилова, Н. И. Деркачева, И. Г. Островская // Российская стоматология. - 2015. - Т. 8, № 3. - С. 3-12.

10. Волков, А. Н. Апробация тест-системы для одновременного ПЦР-анализа пяти пародонтопатогенных микроорганизмов в биологическом образце / А. Н. Волков // Медицина в Кузбассе. - 2014. - Т. 13, № 4. - С. 14-18.

11. Генетические маркеры резистентности к антибиотикам штаммов анаэробных бактерий биоплёнки / В. Н. Царев, Е. В. Ипполитов, Е. Н. Николаева, А. А. Лабазанов // Dental Forum. - 2017. - № 1. - С. 24-26.

12. Генетические параллели в мультифакторных моделях пародонтита с агрессивным течением и остеопороза / А. И. Зиновьева, В. Г. Атрушкевич, А. В. Поляков, О. А. Щагина // Российская стоматология. - 2011. - Т. 4, № 6. -С. 34-40.

13. Гринев, В. В. Введение в технику полимеразной цепной реакции : метод. пособие к лабораторным занятиям по специальному практикуму для студентов биол. фак. / В. В. Гринев. - Минск: БГУ, 2008. - 48 с.

14. Заболевания пародонта и «системные болезни»: известное прошлое, многообещающее будущее / С. Д. Арутюнов, Н. В. Плескановская, А. В. Наумов [и др.] // Пародонтология. - 2009. - № 1 (50). - С. 3-6.

15. Изменение микроциркуляции тканей пародонта у лиц молодого возраста под влиянием табакокурения / Л. Ю. Орехова, Е. В. Косова, А. А. Петров, С. А. Косов // Пародонтология. - 2018. - Т. 23, № 1 (86). - С. 15-18.

16. Изучение корреляционной связи между клиническими проявлениями воспалительных заболеваний пародонта и микробиомом пародонтопатогенной микрофлоры у молодых представителей смешанной популяции европейского региона / Е. А. Тихомирова, И. В. Зудина, Е. С. Слажнева [и др.] // Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук. - 2021. - Т. 18, № 4. - С. 433-444.

17. Ипполитов, Е. В. Особенности морфологии биопленки пародонта при

воспалительных заболеваниях десен (хронический катаральный гингивит, хронический пародонтит, кандида-ассоциированный пародонтит) по данным электронной микроскопии / Е. В. Ипполитов, Л. В. Диденко, В. Н. Царев // Клиническая лабораторная диагностика. - 2015. - Т. 60, № 12. - С. 59-64.

18. Ипполитов, Е. В. Биопленка полости рта — индукторы сигнальных систем врожденного иммунитета / Е. В. Ипполитов, Е. Н. Николаева, В. Н. Царев // Стоматология. - 2017. - Т. 96, № 4. - С. 58-62.

19. Кузьмина, Э. М. Стоматологическая заболеваемость населения России / Э. М. Кузьмина, О. О. Янушевич, И. Н. Кузьмина. - Москва : ООО «Практическая медицина», 2019. - 304 с.

20. Кулаков, А. А. Роль защитных факторов организма в патогенезе воспалительных заболеваний пародонта / А. А. Кулаков, О. А. Зорина, О. А. Борискина // Стоматология. - 2010. - № 6. - С. 72-77.

21. Мамчур, В. И. Дефензины-эндогенные пептиды с антиинфекционными и противоопухолевыми свойствами (обзор литературы) / В. И. Мамчур, А. Э. Левых // Таврический медико-биологический вестник. - 2012. - Т. 15, № 2. - С. 315-321.

22. Медицинская генетика : учебник для медицинских училищ и колледжей : для студентов средних образовательных учреждений и факультетов среднего профессионального образования медицинских вузов, обучающихся по специальностям 060101.52 «Лечебное дело», 060102.51 и 060102.52 «Акушерское дело», 060109.51 «Сестринское дело» по дисциплине «Медицинская генетика» / Л. В. Акуленко, И. В. Угаров, О. О. Янушевич, С. Д. Арутюнов ; под ред. О. О. Янушевича, С. Д. Арутюнова. - Москва : ООО «ГЭОТАР-Медиа», 2012. -203 с.

23. Механизмы адгезивно-коадгезивного взаимодействия бактерий при формировании биопленки / Б. Г. Андрюков, Р. В. Ромашко, Т. А. Ефимов [и др.] // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2020. - Т. 38, № 4. -С. 155-161.

24. Микробиология, вирусология, иммунология полости рта : учебник / М. М. Давыдова, Е. В. Ипполитов, Е. Н. Николаева [и др.] ; под редакцией

В.Н. Царева. - 2-е издание, переработанное и дополненное. - Москва : ООО «ГЭОТАР-Медиа», 2019. - 720 с.

25. Микробиоценоз и учение о биоплёнках : рекомендовано в качестве учебного пособия УМО Минздрава РФ для студентов медицинских вузов России /

B. Н. Царев, А. С. Носик, Л. А. Горелова, Е. В. Ипполитов. - Москва : МГМСУ им. А.И. Евдокимова Минздрава РФ, 2017. - 70 с.

26. Микробные биопленки и хронические воспалительные заболевания пародонта (обзор литературы) / Л. М. Цепов, А. И. Николаев, Д. А. Наконечный, М. М. Нестерова // Пародонтология. - 2015. - Т. 20, № 3 (76). - С. 3-6.

27. Микроэкология пародонта: взаимосвязь локальных и системных эффектов / И. П. Балмасова, В. Н. Царев, О. О. Янушевич [и др.]. - Москва : ООО «Практическая медицина», 2021. - 264 с.

28. Николаева, Е. Н. Пародонтопатогенные бактерии - индикаторы риска возникновения и развития пародонтита (часть I) / Е. Н. Николаева, В. Н. Царев, Е. В. Ипполитов // Стоматология для всех. - 2011. - № 3. - С. 4-9.

29. Николаева, Е. Н. Основы современной иммунологии : учебное пособие для студентов медицинских вузов и слушателей системы последипломного образования. Лабораторным практикумом / Е. Н. Николаева, В. Н. Царев, Л. Я. Плахтий. - 5-е изд., перераб. и доп. - Москва : МГМСУ им. А.И. Евдокимова Минздрава РФ, 2017. - 88 с.

30. Окулич, В. К. Особенности течения хронического периодонтита, ассоциированного с биопленкообразующими микроорганизмами / В. К. Окулич, Н. Э. Колчанова, Ю. П. Чернявский // Пародонтология. - 2018. - Т. 23, № 4 (89). -

C. 9-14.

31. Основные изменения нормальной микрофлоры пародонта при хроническом генерализованном пародонтите, выявленные с помощью метагеномного секвенирования / О. А. Зорина, Н. К. Аймадинова, О. А. Борискина [и др.] // Российская стоматология. - 2017. - Т. 10, № 2. - С. 41-48.

32. Особенности микрофлоры полости рта у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта / Г. С. Пашкова, Д. Т. Галиева, К. Е. Исаджанян [и др.] //

Лечение и профилактика. - 2013. - № 4 (8). - С. 74-80.

33. Противовоспалительный эффект аскорбата хитозана в комплексной терапии заболеваний пародонта / И. В. Зудина, Н. В. Булкина, П. В. Иванов [и др.] // Российский стоматологический журнал. - 2013. - Т. 17, № 2. - С. 16-19.

34. Слажнева, Е. С. Пародонтопатогены: новый взгляд. Систематический обзор. Часть 1 / Е. С. Слажнева, Е. А. Тихомирова, В. Г. Атрушкевич // Стоматология детского возраста и профилактика. - 2020. - Т. 20, № 1 (73). - С. 7076.

35. Слажнева, Е. С. Пародонтопатогены: новый взгляд. Систематический обзор. Часть 2 / Е. С. Слажнева, Е. А. Тихомирова, В. Г. Атрушкевич // Стоматология детского возраста и профилактика. - 2020. - Т. 20, № 2 (74). - С. 160167.

36. Снижение уровня в-дефензина-2 в десневой жидкости как потенциальный предиктор развития воспалительных заболеваний пародонта / Е. А. Тихомирова, В. Г. Атрушкевич, Е. В. Линник [и др.] // Инфекция и иммунитет. -2022. - Т. 12, № 2. - С. 288-298.

37. Современный подход к лечению воспалительных заболеваний пародонта у женщин с гинекологической патологией / Э. Ю. Забалуева, В. Г. Атрушкевич, Е. В. Несяева [и др.] // Лечение и профилактика. - 2014. - Т. 2, № 10. - С. 54-61.

38. Состояние пародонта в глобальном аспекте [Электронный ресурс]. -Режим доступа: https://e-stomatology.ru/fdi/parodont.php (дата обращения: 19.06.2022).

39. Теблоева, Л. М. Иммунная реакция - ключевой фактор резорбции костной ткани при заболеваниях пародонта / Л. М. Теблоева, Л. А. Дмитриева, К. Г. Гуревич // Системный анализ и управление в биомедицинских системах. -2011. - Т. 10, № 3. - С. 677-679.

40. Тихомирова, Е. А. Генетические предикторы развития пародонтита: проблемы и перспективы (обзор литературы) / Е. А. Тихомирова // Пародонтология. - 2022. - Т. 27, № 1. - С. 32-60.

41. Тихомирова, Е. А. Выявление ДНК пародонтопатогенов в содержимом зубодесневой борозды у лиц без клинических признаков воспалительных заболеваний пародонта / Е. А. Тихомирова, И. В. Зудина, В. Г. Атрушкевич // Российская стоматология. - 2021. - Т. 14, № 1. - С. 70-72.

42. Тихомирова, Е. А. ß-дефензины и воспалительные заболевания пародонта: систематический обзор / Е. А. Тихомирова, Е. С. Слажнева, В. Г. Атрушкевич // Пародонтология. - 2020. - Т. 25, № 4. - С. 276-286.

43. Царев, В. Н. Пародонтопатогенные бактерии - основной фактор возникновения и развития пародонтита / В. Н. Царев, Е. Н. Николаева, Е. В. Ипполитов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2017. - № 5. - С. 101-112.

44. Ширинский, В. С. Полиморбидность, старение иммунной системы и системное вялотекущее воспаление - вызов современной медицине / В. С. Ширинский, И. В. Ширинский // Медицинская иммунология. - 2020. - Т. 22, № 4. - С. 609-624.

45. Янушевич, О. О. Влияние окклюзионной травмы на развитие заболеваний пародонта / О. О. Янушевич, Г. С. Рунова, А. Д. Гочаренко // Российская стоматология. - 2009. - № 3. - С. 16-19.

46. 8p23 beta-defensin copy number determination by single-locus pseudogene-based paralog ratio tests risk bias due to low-frequency sequence variations / X. Zhang, S. Müller, M. Möller [et al.] // BMC genomics. - 2014. - Vol. 15. - P. 64.

47. A 3' UTR transition within DEFB1 is associated with chronic and aggressive periodontitis / A. S. Schaefer, G. M. Richter, M. Nothnagel [et al.] // Genes and immunity. - 2010. - Vol. 11, № 1. - P. 45-54.

48. A chromosome 8 gene-cluster polymorphism with low human beta-defensin 2 gene copy number predisposes to Crohn disease of the colon / K. Fellermann, D. E. Stange, E. Schaeffeler [et al.] // American journal of human genetics. - 2006. -Vol. 79, № 3. - P. 439-448.

49. A new classification scheme for periodontal and peri-implant diseases and conditions - Introduction and key changes from the 1999 classification / J. G. Caton,

G. Armitage, T. Berglundh [et al.] // Journal of clinical periodontology. - 2018. - Vol. 45, Suppl 20. - P. S1-S8.

50. A novel -72 (T^A) в-promoter mutation causing slightly elevated HbA(2) in a Vietnamese heterozygote / M. Pirastru, P. Mereu, C. Q. Nguyen [et al.] // BioMed research international. - 2017. - P. 4537409.

51. Abu Bakar, S. Allelic recombination between distinct genomic locations generates copy number diversity in human beta-defensins / S. Abu Bakar, E. J. Hollox, J. A. Armour // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2009. - Vol. 106, № 3. - P. 853-858.

52. Advancing antimicrobial strategies for managing oral biofilm infections / Y. Jiao, F. R. Tay, L.-N. Niu, J.-H. Chen // International journal of oral science. - 2019. - Vol. 11, № 3. - P. 28.

53. Age and periodontal health - immunological view / J. L. Ebersole, D. A. 3rd Dawson, P. Emecen Huja [et al.] // Current oral health reports. - 2018. - Vol. 5, № 4. - P. 229-241.

54. Aggregatibacter actinomycetemcomitans H-NS promotes biofilm formation and alters protein dynamics of other species within a polymicrobial oral biofilm / K. Bao, N. Bostanci, T. Thurnheer [et al.] // NPJ biofilms and microbiomes. - 2018. - Vol. 4. -P. 12.

55. Albandar, J. M. Manifestations of systemic diseases and conditions that affect the periodontal attachment apparatus: Case definitions and diagnostic considerations / J. M. Albandar, C. Susin, F. J. Hughes // Journal of clinical periodontology. - 2018. - Vol. 45, Suppl 20. - P. S171-S189.

56. ALFA: allele frequency aggregator [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/docs/gsr/alfa (дата обращения: 19.06.2022).

57. Antimicrobial peptides: classification, design, application and research progress in multiple fields / Y. Huan, Q. Kong, H. Mou, H. Yi // Frontiers in microbiology. - 2020. - Vol. 11. - P. 582779.

58. Armitage, G. C. Development of a classification system for periodontal

diseases and conditions / G. C. Armitage // Annals of periodontology. - 1999. - Vol. 4, № 1. - P. 1-6.

59. Array-based comparative genomic hybridization for genome-wide screening of DNA copy number in bladder tumors / J. A. Veltman, J. Fridlyand, S. Pejavar [et al.] // Cancer research. - 2003. - Vol. 63, № 11. - P. 2872-2880.

60. Association of a genetic polymorphism (-44 C/G SNP) in the human DEFB1 gene with expression and inducibility of multiple beta-defensins in gingival keratinocytes / A. A. Kalus, L. P. Fredericks, B. M. Hacker [et al.] // BMC oral health. - 2009. - Vol. 9.

- P. 21.

61. Association of beta-defensin 1 single nucleotide polymorphisms with atopic dermatitis / E. Prado-Montes de Oca, A. García-Vargas, R. Lozano-Inocencio [et al.] // International archives of allergy and immunology. - 2007. - Vol. 142, №2 3. - P. 211-218.

62. Association of beta-defensin 1 single nucleotide polymorphisms with Crohn's disease / A. K. Kocsis, P. L. Lakatos, F. Somogyvári [et al.] // Scandinavian journal of gastroenterology. - 2008. - Vol. 43, № 3. - P. 299-307.

63. Association of cytokines, high sensitive C-reactive protein, VEGF and beta-defensin-1 gene polymorphisms and their protein expressions with chronic periodontitis in the Chinese population / Y. Tian, J. Li, L. Hao [et al.] // The International journal of biological markers. - 2013. - Vol. 28, № 1. - P. 100-107.

64. Association of higher DEFB4 genomic copy number with Crohn's disease / R. W. Bentley, J. Pearson, R. B. Gearry [et al.] // The American journal of gastroenterology. - 2010. - Vol. 105, № 2. - P. 354-359.

65. Association of IL-10 -1082A>G, -819C>T, and -592C>A polymorphisms with susceptibility to chronic and aggressive periodontitis: a systematic review and metaanalysis / F. Mashhadiabbas, S. A. Dastgheib, A. Hashemzehi [et al.] // Inflammation research. - 2021. - Vol. 70, № 5. - P. 509-524.

66. Association of matrix metalloproteinase (MMP)-1, 3, 9, interleukin (IL)-2, 8 and cyclooxygenase (COX)-2 gene polymorphisms with chronic periodontitis in a Chinese population / G. Li, Y. Yue, Y. Tian [et al.] // Cytokine. - 2012. - Vol. 60, № 2.

- P. 552-560.

67. Association of periodontal status, number of teeth, and obesity: a cross-sectional study in Japan / N. Aoyama, T. Fujii, S. Kida [et al.] // Journal of clinical medicine. - 2021. - Vol. 10, № 2. - P. 208.

68. Associations of Toll-like receptor and P-defensin polymorphisms with measures of periodontal disease (PD) in HIV+ North American adults: an exploratory study / R. K. Mehlotra, N. B. Hall, B. Willie [et al.] // PloS one. - 2016. - Vol. 11, № 10.

- P. e0164075.

69. Atrushkevich, V. Assessment of microbial association role in development and course of generalized periodontitis / V. Atrushkevich, E. Tikhomirova // Journal of Clinical Periodontology. - 2018. - Vol. 45, № S19. - P. 121.

70. Bacterial adhesion to collagens: implications for biofilm formation and disease progression in the oral cavity / S. Alvarez, C. Leiva-Sabadini, C. M. A. P. Schuh, S. Aguayo // Critical reviews in microbiology. - 2022. - Vol. 48, № 1. - P. 83-95.

71. Bacterial interactions in pathogenic subgingival plaque / H. M. Ng, L. X. Kin, S. G. Dashper [et al.] // Microbial pathogenesis. - 2016. - Vol. 94. - P. 60-69.

72. Baelum, V. Oral hygiene, gingivitis and periodontal breakdown in adult Tanzanians / V. Baelum, O. Fejerskov, T. Karring // Journal of periodontal research. -1986. - Vol. 21, № 3. - P. 221-232.

73. Bartold, P. M. Host modulation: controlling the inflammation to control the infection / P. M. Bartold, T. E. Van Dyke // Periodontology 2000. - 2017. - Vol. 75, № 1.

- P. 317-329.

74. Bartold, P. M. Periodontitis: a host-mediated disruption of microbial homeostasis. Unlearning learned concepts / P. M. Bartold, T. E. Van Dyke // Periodontology 2000. - 2013. - Vol. 62, № 1. - P. 203-217.

75. Bechinger, B. Antimicrobial peptides: mechanisms of action and resistance / B. Bechinger, S.-U. Gorr // Journal of dental research. - 2017. - Vol. 96, № 3. - P. 254260.

76. Beta-defensin-2 genomic copy number variation and chronic periodontitis / S. W. Jaradat, C. Hoder-Przyrembel, S. Cubillos [et al.] // Journal of dental research. -2013. - Vol. 92, № 11. - P. 1035-1040.

77. Beta-defensin 1 gene polymorphisms in the pathologies of the oral cavity-Data from meta-analysis: Association only with rs1047031 not with rs1800972, rs1799946, and rs11362 / Z. Slebioda, T. Wozniak, B. Dorocka-Bobkowska [et al.] // Journal of oral pathology & medicine. - 2021. - Vol. 50, № 1. - P. 22-31.

78. Beta-defensin genomic copy number is not a modifier locus for cystic fibrosis / E. J. Hollox, J. Davies, U. Griesenbach [et al.] // Journal of negative results in biomedicine. - 2005. - Vol. 4. - P. 9.

79. Beta defensin-1, parvalbumin, and vimentin: a panel of diagnostic immunohistochemical markers for renal tumors derived from gene expression profiling studies using cDNA microarrays / A. N. Young, P. G. de Oliveira Salles, S. D. Lim [et al.] // The American journal of surgical pathology. - 2003. - Vol. 27, № 2. - P. 199-205.

80. Biofilms: an emergent form of bacterial life / H.-C. Flemming, J. Wingender, U. Szewzyk [et al.] // Nature reviews. Microbiology. - 2016. - Vol. 14, № 9. - P. 563575.

81. Both copy number and sequence variations affect expression of human DEFB4 / M. Groth, C. Wiegand, K. Szafranski [et al.] // Genes and immunity. - 2010. -Vol. 11, № 6. - P. 458-466.

82. Brice, D. C. Antiviral activities of human host defense peptides / D. C. Brice, G. Diamond // Current medicinal chemistry. - 2020. - Vol. 27, № 9. - P. 1420-1443.

83. Cancer-specific loss of beta-defensin 1 in renal and prostatic carcinomas / C. D. Donald, C. Q. Sun, S. D. Lim [et al.] // Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology. - 2003. - Vol. 83, № 4. - P. 501-505.

84. Candida species detection in patients with chronic periodontitis: A systematic review and meta-analysis / E. Slazhneva, E. Tikhomirova, V. Tsarev [ et al.] // Clinical and experimental dental research. - 2022. - P. 1-22.

85. Cantsilieris, S. Correlating multiallelic copy number polymorphisms with disease susceptibility / S. Cantsilieris, S. J. White // Human mutation. - 2013. - Vol. 34, № 1. - P. 1-13.

86. Carlisle, M. D. Degradation of human alpha- and beta-defensins by culture supernatants of Porphyromonas gingivalis strain 381 / M. D. Carlisle, R. N. Srikantha,

K. A. Brogden // Journal of innate immunity. - 2009. - Vol. 1, № 2. - P. 118-122.

87. Chopra, A. Porphyromonas gingivalis adopts intricate and unique molecular mechanisms to survive and persist within the host: a critical update / A. Chopra, S. G. Bhat, K. Sivaraman // Journal of oral microbiology. - 2020. - Vol. 12, № 1. -P. 1801090.

88. Clinical application of human в-defensin and CD14 gene polymorphism in evaluating the status of chronic inflammation / W. T. Y. Loo, L. Bai, C. Fan [et al.] // Journal of translational medicine. - 2012. - Vol. 10, Suppl 1. - P. S9.

89. Clinvar [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar (дата обращения: 19.06.2022).

90. Commensal and pathogenic bacterial-derived extracellular vesicles in host-bacterial and interbacterial dialogues: two sides of the same coin / S. Tarashi, M. S. Zamani, M. D. Omrani [et al.] // Journal of immunology research. - 2022. -P. 8092170.

91. Commensal oral microbiota induces osteoimmunomodulatory effects separate from systemic microbiome in mice / J. D. Hathaway-Schrader, J. D. Aartun, N. A. Poulides [et al.] // JCI insight. - 2022. - Vol. 7, № 4. - P. e140738.

92. Community-wide transcriptome of the oral microbiome in subjects with and without periodontitis / A. E. Duran-Pinedo, T. Chen, R. Teles [et al.] // The ISME journal. - 2014. - Vol. 8, № 8. - P. 1659-1672.

93. Comparison of multiplex ligation-dependent probe amplification and realtime PCR accuracy for gene copy number quantification using the beta-defensin locus / A. Perne, X. Zhang, L. Lehmann [et al.] // BioTechniques. - 2009. - Vol. 47, № 6. -P. 1023-1028.

94. Complex SNP-related sequence variation in segmental genome duplications / D. Fredman, S. J. White, S. Potter [et al.] // Nature genetics. - 2004. - Vol. 36, № 8. -P. 861-866.

95. Conceptual perspectives: bacterial antimicrobial peptide induction as a novel strategy for symbiosis with the human host / S. K. Ghosh, Z. Feng, H. Fujioka [et al.] // Frontiers in microbiology. - 2018. - Vol. 9. - P. 302.

96. Conrad, B. Gene duplication: a drive for phenotypic diversity and cause of human disease / B. Conrad, S. E. Antonarakis // Annual review of genomics and human genetics. - 2007. - Vol. 8. - P. 17-35.

97. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms / D. Botstein, R. L. White, M. Skolnick, R. W. Davis // American journal of human genetics. - 1980. - Vol. 32, № 3. - P. 314-331.

98. Copy number variation of the beta-defensin genes in europeans: no supporting evidence for association with lung function, chronic obstructive pulmonary disease or asthma / L. V Wain, L. Odenthal-Hesse, R. Abujaber [et al.] // PloS one. -2014. - Vol. 9, № 1. - P. e84192.

99. Cornish-Bowden, A. Nomenclature for incompletely specified bases in nucleic acid sequences: recommendations 1984 / A. Cornish-Bowden // Nucleic acids research. - 1985. - Vol. 13, № 9. - P. 3021-3030.

100. COX-2 is associated with periodontitis in Europeans / A. S. Schaefer, G. M. Richter, M. Nothnagel [et al.] // Journal of dental research. - 2010. - Vol. 89, № 4. - P. 384-388.

101. Dale, B. A. Antimicrobial peptides in the oral environment: expression and function in health and disease / B. A. Dale, L. P. Fredericks // Current issues in molecular biology. - 2005. - Vol. 7, № 2. - P. 119-133.

102. Database of single nucleotide polymorphisms (dbSNP) Support Center [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/ (дата обращения: 19.06.2022).

103. DEFB1 polymorphisms and salivary hBD-1 concentration in Oral Lichen Planus patients and healthy subjects / V. Polesello, L. Zupin, R. Di Lenarda [et al.] // Archives of oral biology. - 2017. - Vol. 73. - P. 161-165.

104. Defensins: the natural peptide antibiotic / X. Gao, J. Ding, C. Liao [et al.] // Advanced drug delivery reviews. - 2021. - Vol. 179. - P. 114008.

105. Defensins and inflammation: the role of defensins in inflammatory bowel disease / M. Ramasundara, S. T. Leach, D. A. Lemberg, A. S. Day // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2009. - Vol. 24, № 2. - P. 202-208.

106. Defensins and the dynamic genome: what we can learn from structural variation at human chromosome band 8p23.1 / E. J. Hollox, J. C. K. Barber, A. J. Brookes, J. A. L. Armour // Genome research. - 2008. - Vol. 18, № 11. - P. 1686-1697.

107. Dental plaque-induced gingival conditions / S. Murakami, B. L. Mealey, A. Mariotti, I. L. C. Chapple // Journal of periodontology. - 2018. - Vol. 89, Suppl 1. -P. S17-S27.

108. Deptula, J. Defensins in humans and animals / J. Deptula, B. Tokarz-Deptula, W. Deptula // Post<?py higieny i medycyny doswiadczalnej. - 2019. - Vol. 73. -P. 152-158.

109. Differential gene expression of human beta-defensins (hBD-1, -2, -3) in inflammatory gingival diseases / H. Dommisch, Y. A?il, A. Dunsche [et al.] // Oral microbiology and immunology. - 2005. - Vol. 20, № 3. - P. 186-190.

110. Differential induction of human beta-defensin expression by periodontal commensals and pathogens in periodontal pocket epithelial cells / A. Vankeerberghen, H. Nuytten, K. Dierickx [et al.] // Journal of periodontology. - 2005. - Vol. 76, № 8. -P. 1293-1303.

111. Differential modulation of human beta-defensins expression in human gingival epithelia by Porphyromonas gingivalis lipopolysaccharide with tetra- and penta-acylated lipid A structures / Q. Lu, R. P. Darveau, L. P. Samaranayake [et al.] // Innate immunity. - 2009. - Vol. 15, № 6. - P. 325-335.

112. Discovery, validation, and diagnostic ability of multiple protein-based biomarkers in saliva and gingival crevicular fluid to distinguish between health and periodontal diseases / M. M. Grant, J. J. Taylor, K. Jaedicke [et al.] // Journal of clinical periodontology. - 2022. - Vol. 49, № 7. - P. 622-632.

113. Diversity of Treponema denticola and other oral Treponeme lineages in subjects with periodontitis and gingivitis / H. Zeng, Y. Chan, W. Gao [et al.] // Microbiology spectrum. - 2021. - Vol. 9, № 2. - P. e0070121.

114. Dommisch, H. Diverse functions of defensins and other antimicrobial peptides in periodontal tissues / H. Dommisch, S. Jepsen // Periodontology 2000. - 2015. - Vol. 69, № 1. - P. 96-110.

115. Embryonic epigenetic reprogramming by a pioneer transcription factor in plants / Z. Tao, L. Shen, X. Gu [et al.] // Nature. - 2017. - Vol. 551, № 7678. - P. 124128.

116. Epidemiology of oral and maxillofacial infections / A. B. Rajendra Santosh, O. E. Ogle, D. Williams, E. F. Woodbine // Dental Clinics of North America. - 2017. -Vol. 61, № 2. - P. 217-233.

117. Epigenetic regulation of TNFA expression in periodontal disease / S. Zhang, S. P. Barros, A. J. Moretti [et al.] // Journal of periodontology. - 2013. - Vol. 84, № 11.

- P. 1606-1616.

118. Establishing chromatin regulatory landscape during mouse preimplantation development / F. Lu, Y. Liu, A. Inoue [et al.] // Cell. - 2016. - Vol. 165, № 6. - P. 13751388.

119. Evaluation of DEFB1 polymorphisms in individuals with chronic periodontitis and diabetes mellitus type 2 in a population of northeastern Brazil / R. Soraia Aguiar de Melo Dias, R. Carlos Mouräo Pinho, F. R. de Almeida [et al.] // Special care in dentistry. - 2018. - Vol. 38, № 4. - P. 227-233.

120. Evaluation of gingival crevicular fluid adrenomedullin and human neutrophil peptide 1-3 levels of patients with different periodontal diseases / O. Türkoglu, G. Emingil, N. Kütük5üler, G. Atilla // Journal of periodontology. - 2010. - Vol. 81, № 2.

- P. 284-291.

121. Evidence of a substantial genetic basis for risk of adult periodontitis / B. S. Michalowicz, S. R. Diehl, J. C. Gunsolley [et al.] // Journal of periodontology. -2000. - Vol. 71, № 11. - P. 1699-1707.

122. Expression and function of host defense peptides at inflammation sites / S. V. Prasad, K. Fiedoruk, T. Daniluk [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2019. - Vol. 21, № 1. - P. 104.

123. Expression of beta-defensins in gingival health and in periodontal disease / J. Bissell, S. Joly, G. K. Johnson [et al.] // Journal of oral pathology & medicine. - 2004.

- Vol. 33, № 5. - P. 278-285.

124. Expression of human beta-defensin-3 in gingival epithelia / Q. Lu,

L. P. Samaranayake, R. P. Darveau, L. Jin // Journal of periodontal research. - 2005. -Vol. 40, № 6. - P. 474-481.

125. Expression of human beta defensin (HBD-1 and HBD-2) mRNA in nasal epithelia of adult cystic fibrosis patients, healthy individuals, and individuals with acute cold / N. Dauletbaev, R. Gropp, M. Frye [et al.] // Respiration; international review of thoracic diseases. - 2002. - Vol. 69, № 1. - P. 46-51.

126. Expression of virulence factors under different environmental conditions in Aggregatibacter actinomycetemcomitans / A. Fujita, Y. Oogai, M. Kawada-Matsuo [et al.] // Microbiology and immunology. - 2021. - Vol. 65, № 3. - P. 101-114.

127. Fenno, J. C. Treponema denticola interactions with host proteins / J. C. Fenno // Journal of oral microbiology. - 2012. - Vol. 4.

128. Fine, D. H. Classification and diagnosis of aggressive periodontitis / D. H. Fine, A. G. Patil, B. G. Loos // Journal of periodontology. - 2018. - Vol. 89, Suppl 1. - P. S103-S119.

129. Gene polymorphism of ß-defensin-1 is associated with susceptibility to periodontitis in Japanese / T. Ikuta, Y. Inagaki, K. Tanaka [et al.] // Odontology. - 2015.

- Vol. 103, № 1. - P. 66-74.

130. Genetic association analysis of copy-number variation (CNV) in human disease pathogenesis / I. Ionita-Laza, A. J. Rogers, C. Lange [et al.] // Genomics. - 2009.

- Vol. 93, № 1. - P. 22-26.

131. Genetic association with subgingival bacterial colonization in chronic periodontitis / F. Cavalla, C. C. Biguetti, J. L. Melchiades [et al.] // Genes. - 2018. -Vol. 9, № 6. - P. 271.

132. Genetic susceptibility to periodontal disease: new insights and challenges / A. S. Schäfer, U. Van der Velden, M. L. Laine, B. G. Loos // Clinical periodontology and implant dentistry / editors N. P. Lang, J. Lindhe. - Chichester : Wiley Blackwell, 2015. -Vol. 1. - P. 290-310.

133. Genetic variants in mRNA untranslated regions / M. Steri, M. L. Idda, M. B. Whalen, V. Orru // Wiley interdisciplinary reviews. RNA. - 2018. - Vol. 9, № 4.

- P. e1474.

134. Genome-wide detection of segmental duplications and potential assembly errors in the human genome sequence / J. Cheung, X. Estivill, R. Khaja [et al.] // Genome biology. - 2003. - Vol. 4, № 4. - P. R25.

135. Genomic copy number determines functional expression of beta-defensin 2 in airway epithelial cells and associates with chronic obstructive pulmonary disease / W. Janssens, H. Nuytten, L. J. Dupont [et al.] // American journal of respiratory and critical care medicine. - 2010. - Vol. 182, № 2. - P. 163-169.

136. Gingival crevicular fluid as a source of biomarkers for periodontitis / S. P. Barros, R. Williams, S. Offenbacher, T. Morelli // Periodontology 2000. - 2016. -Vol. 70, № 1. - P. 53-64.

137. Gingival crevicular fluid levels of human beta-defensin 1 in individuals with and without chronic periodontitis / L. C. M. Costa, K. R. Soldati, D. C. Fonseca [et al.] // Journal of periodontal research. - 2018. - Vol. 53, № 5. - P. 736-742.

138. Global burden of severe periodontitis in 1990-2010: a systematic review and meta-regression / N. J. Kassebaum, E. Bernabé, M. Dahiya [et al.] // Journal of dental research. - 2014. - Vol. 93, № 11. - P. 1045-1053.

139. Global variation in copy number in the human genome / R. Redon, S. Ishikawa, K. R. Fitch [et al.] // Nature. - 2006. - Vol. 444, № 7118. - P. 444-454.

140. Hajishengallis, G. Immunomicrobial pathogenesis of periodontitis: keystones, pathobionts, and host response / G. Hajishengallis // Trends in immunology. -2014. - Vol. 35, № 1. - P. 3-11.

141. Hajishengallis, G. Periodontitis: from microbial immune subversion to systemic inflammation / G. Hajishengallis // Nature reviews. Immunology. - 2015. -Vol. 15, № 1. - P. 30-44.

142. Hajishengallis, G. Beyond the red complex and into more complexity: the polymicrobial synergy and dysbiosis (PSD) model of periodontal disease etiology / G. Hajishengallis, R. J. Lamont // Molecular oral microbiology. - 2012. - Vol. 27, № 6. - p. 409-419.

143. High-resolution mapping of the 8p23.1 beta-defensin cluster reveals strictly concordant copy number variation of all genes / M. Groth, K. Szafranski, S. Taudien

[et al.] // Human mutation. - 2008. - Vol. 29, № 10. - P. 1247-1254.

144. Hinnebusch, A. G. Translational control by 5'-untranslated regions of eukaryotic mRNAs / A. G. Hinnebusch, I. P. Ivanov, N. Sonenberg // Science. - 2016. -Vol. 352, № 6292. - P. 1413-1416.

145. Histone-fold domain protein NF-Y promotes chromatin accessibility for cell type-specific master transcription factors / A. J. Oldfield, P. Yang, A. E. Conway [et al.] // Molecular cell. - 2014. - Vol. 55, № 5. - P. 708-722.

146. Hodge, P. J. Failure to detect an association with IL1 genotypes in European Caucasians with generalised early onset periodontitis / P. J. Hodge, M. P. Riggio, D. F. Kinane // Journal of clinical periodontology. - 2001. - Vol. 28, № 5. - P. 430-436.

147. Hollox, E. J. Copy number variation of beta-defensins and relevance to disease / E. J. Hollox // Cytogenetic and genome research. - 2008. - Vol. 123, № 1-4. -P. 148-155.

148. Hollox, E. J. Extensive normal copy number variation of a beta-defensin antimicrobial-gene cluster / E. J. Hollox, J. A. Armour, J. C. Barber // American journal of human genetics. - 2003. - Vol. 73, № 3. - P. 591-600.

149. Holt, S. C. Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, and Tannerella forsythia: the «red complex», a prototype polybacterial pathogenic consortium in periodontitis / S. C. Holt, J. L. Ebersole // Periodontology 2000. - 2005. - Vol. 38. -P. 72-122.

150. Host-defense peptides and their potential use as biomarkers in human diseases / O. N. Silva, W. F. Porto, S. M. Ribeiro [et al.] // Drug discovery today. - 2018. - Vol. 23, № 9. - P. 1666-1671.

151. How, K. Y. Porphyromonas gingivalis: an overview of periodontopathic pathogen below the gum line / K. Y. How, K. P. Song, K. G. Chan // Frontiers in microbiology. - 2016. - Vol. 7. - P. 53.

152. Human beta-defensin-1 and -2 and matrix metalloproteinase-25 and -26 expression in chronic and aggressive periodontitis and in peri-implantitis / H. Kuula, T. Salo, E. Pirilä [et al.] // Archives of oral biology. - 2008. - Vol. 53, № 2. - P. 175-186.

153. Human beta-defensin 2 induces a vigorous cytokine response in peripheral

blood mononuclear cells / M. Boniotto, W. J. Jordan, J. Eskdale [et al.] // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2006. - Vol. 50, № 4. - P. 1433-1441.

154. Human beta defensin-1 and -2 expression in the gingiva of patients with specific periodontal diseases / S. Vardar-Sengul, T. Demirci, B. H. Sen [et al.] // Journal of periodontal research. - 2007. - Vol. 42, № 5. - P. 429-437.

155. Human beta defensin (HBD) gene copy number affects HBD2 protein levels: impact on cervical bactericidal immunity in pregnancy / C. P. James, M. Bajaj-Elliott, R. Abujaber [et al.] // European journal of human genetics. - 2018. - Vol. 26, № 3. -P. 434-439.

156. Human P-defensin 2 and its postulated role in modulation of the immune response / M. Cieslik, N. Baginska, A. Gorski, E. Jonczyk-Matysiak // Cells. - 2021. -Vol. 10, № 11. - P. 2991.

157. Human P-defensin 2 and protease activated receptor-2 expression in patients with chronic periodontitis / A. L. Pereira, M. Holzhausen, G. C. N. Franco [et al.] // Archives of oral biology. - 2012. - Vol. 57, № 12. - P. 1609-1614.

158. Humoral immune responses to periodontal pathogens in the elderly / U. Shet, H.-K. Oh, H.-J. Chung [et al.] // Journal of periodontal & implant science. - 2015. -Vol. 45, № 5. - P. 178-183.

159. Hyperactivity and reactivity of peripheral blood neutrophils in chronic periodontitis / J. B. Matthews, H. J. Wright, A. Roberts [et al.] // Clinical and experimental immunology. - 2007. - Vol. 147, № 2. - P. 255-264.

160. Identification of misclassified ClinVar variants via disease population prevalence / N. Shah, Y.-C. C. Hou, H.-C. Yu [et al.] // American journal of human genetics. - 2018. - Vol. 102, № 4. - P. 609-619.

161. Impact of DEFB1 gene regulatory polymorphisms on hBD-1 salivary concentration / V. Polesello, L. Zupin, R. Di Lenarda [et al.] // Archives of oral biology. - 2015. - Vol. 60, № 7. - P. 1054-1058.

162. Induction of osteoclastogenesis and matrix metalloproteinase expression by the lipooligosaccharide of Treponema denticola / B.-K. Choi, H. J. Lee, J. H. Kang [et al.] // Infection and immunity. - 2003. - Vol. 71, № 1. - P. 226-233.

163. Influence of chitosan ascorbate chirality on the gelation kinetics and properties of silicon-chitosan-containing glycerohydrogels / N. O. Gegel, Y. Y. Zhuravleva, A. B. Shipovskaya [et al.] // Polymers. - 2018. - Vol. 10, № 3. -P. 259.

164. Innate immune peptide LL-37 displays distinct expression pattern from beta-defensins in inflamed gingival tissue / I. Hosokawa, Y. Hosokawa, H. Komatsuzawa [et al.] // Clinical and experimental immunology. - 2006. - Vol. 146, № 2. - P. 218-225.

165. Innate phagocyte polarization in the oral cavity / S. Metcalfe, N. Anselmi, A. Escobar [et al.] // Frontiers in immunology. - 2022. - Vol. 12. - P. 768479.

166. Kiatsurayanon, C. Opposing roles of antimicrobial peptides in skin cancers / C. Kiatsurayanon, G. Peng, F. Niyonsaba // Current pharmaceutical design. - 2022. -Vol. 28, № 3. - P. 248-258.

167. Kinane, D. F. Environmental and other modifying factors of the periodontal diseases / D. F. Kinane, M. Peterson, P. G. Stathopoulou // Periodontology 2000. - 2006.

- Vol. 40. - P. 107-119.

168. Kinane, D. F. Periodontal diseases / D. F. Kinane, P. G. Stathopoulou, P. N. Papapanou // Nature reviews. Disease primers. - 2017. - Vol. 3. - P. 17038.

169. Kriauciunas, A. Periodontitis association with IL-8 gene polymorphisms / A. Kriauciunas, G. Zekonis, R. Liutkeviciene // Biomedical papers of the Medical Faculty of the University Palacky. - 2022. - Vol. 166, № 1. - P. 28-39.

170. Kurt-Bayrakdar, S. DEFB4A promoter polymorphism is associated with chronic periodontitis: a case-control study / S. Kurt-Bayrakdar, A. Ozturk, N. Kara // Genetic testing and molecular biomarkers. - 2020. - Vol. 24, № 3. - P. 113-119.

171. Lamont, R. J. Polymicrobial synergy and dysbiosis in inflammatory disease / R. J. Lamont, G. Hajishengallis // Trends in molecular medicine. - 2015. - Vol. 21, № 3.

- P. 172-183.

172. Lamont, R. J. The oral microbiota: dynamic communities and host interactions / R. J. Lamont, H. Koo, G. Hajishengallis // Nature reviews. Microbiology. -2018. - Vol. 16, № 12. - P. 745-759.

173. Lang, N. P. Periodontal health / N. P. Lang, P. M. Bartold // Journal of

periodontology. - 2018. - Vol. 89, Suppl 1. - P. S9-S16.

174. Leal, S. M. Detection of genotyping errors and pseudo-SNPs via deviations from Hardy-Weinberg equilibrium / S. M. Leal // Genetic epidemiology. - 2005. -Vol. 29, № 3. - P. 204-214.

175. Li, M. Assessing departure from Hardy-Weinberg equilibrium in the presence of disease association / M. Li, C. Li // Genetic epidemiology. - 2008. - Vol. 32, № 7. - P. 589-599.

176. Linzmeier, R. M. Human defensin gene copy number polymorphisms: comprehensive analysis of independent variation in alpha- and beta-defensin regions at 8p22-p23 / R. M. Linzmeier, T. Ganz // Genomics. - 2005. - Vol. 86, № 4. - P. 423-430.

177. Loos, B. G. The role of inflammation and genetics in periodontal disease / B. G. Loos, T. E. Van Dyke // Periodontology 2000. - 2020. - Vol. 83, № 1. - P. 26-39.

178. Low-abundance biofilm species orchestrates inflammatory periodontal disease through the commensal microbiota and complement / G. Hajishengallis, S. Liang, M. A. Payne [et al.] // Cell host & microbe. - 2011. - Vol. 10, № 5. - P. 497-506.

179. LTF and DEFB1 polymorphisms are associated with susceptibility toward chronic periodontitis development / L. Zupin, A. Robino, C. O. Navarra [et al.] // Oral diseases. - 2017. - Vol. 23, № 7. - P. 1001-1008.

180. Ma, X. Correlation of DEFB1 polymorphisms with chronic periodontitis in Henan Han population / X. Ma, H. Li, H. Chou // Chinese journal of medical genetics. -2019. - Vol. 36, № 4. - P. 371-375.

181. Machado, L. R. An evolutionary history of defensins: a role for copy number variation in maximizing host innate and adaptive immune responses / L. R. Machado, B. Ottolini // Frontiers in immunology. - 2015. - Vol. 6. - P. 115.

182. Marsh, P. D. Dental biofilm: ecological interactions in health and disease / P. D. Marsh, E. Zaura // Journal of clinical periodontology. - 2017. - Vol. 44, Suppl 18. - P. S12-S22.

183. Measurement methods and accuracy in copy number variation: failure to replicate associations of beta-defensin copy number with Crohn's disease / M. C. Aldhous, S. Abu Bakar, N. J. Prescott [et al.] // Human molecular genetics. - 2010.

- Vol. 19, № 24. - P. 4930-4938.

184. Mefford, H. C. Duplication hotspots, rare genomic disorders and common disease / H. C. Mefford, E. E. Eichler // Current opinion in genetics & development. -2009. - Vol. 19, № 3. - P. 196-204.

185. Metabolomics of gingival crevicular fluid to identify biomarkers for periodontitis: A systematic review with meta-analysis / G. Baima, M. Corana, G. Iaderosa [et al.] // Journal of periodontal research. - 2021. - Vol. 56, № 4. - P. 633-645.

186. Michalowicz, B. S. Genetic and heritable risk factors in periodontal disease / B. S. Michalowicz // Journal of periodontology. - 1994. - Vol. 65, Suppl 5 - P. 479488.

187. Microbial signatures of health, gingivitis, and periodontitis / L. Abusleme, A. Hoare, B.-Y. Hong, P. I. Diaz // Periodontology 2000. - 2021. - Vol. 86, № 1. - P. 5778.

188. Mira, A. Role of microbial communities in the pathogenesis of periodontal diseases and caries / A. Mira, A. Simon-Soro, M. A. Curtis // Journal of clinical periodontology. - 2017. - Vol. 44, Suppl 18. - P. S23-S38.

189. Nardone, V. Structural determinants for NF-Y/DNA interaction at the CCAAT box / V. Nardone, A. Chaves-Sanjuan, M. Nardini // Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms. - 2017. - Vol. 1860, № 5. - P. 571-580.

190. Narrowing down the distal border of the copy number variable beta-defensin gene cluster on human 8p23 / S. Taudien, K. Huse, M. Groth, M. Platzer // BMC research notes. - 2014. - Vol. 7. - P. 93.

191. Nath, S. G. «What is there in a name?»: A literature review on chronic and aggressive periodontitis / S. G. Nath, R. Raveendran // Journal of Indian Society of Periodontology. - 2011. - Vol. 15, № 4. - P. 318-322.

192. Natural history of periodontal disease in man. Rapid, moderate and no loss of attachment in Sri Lankan laborers 14 to 46 years of age / H. Loe, A. Anerud, H. Boysen, E. Morrison // Journal of clinical periodontology. - 1986. - Vol. 13, № 5. - P. 431-445.

193. Nazir, M. A. Prevalence of periodontal disease, its association with systemic diseases and prevention / M. A. Nazir // International journal of health sciences. - 2017.

- Vol. 11, № 2. - P. 72-80.

194. NCBI Reference Sequence: NC_060932.1. Homo sapiens isolate CHM13 chromosome 8, alternate assembly T2T-CHM13v2.0 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_060932.1?from=12040687&to=12 042691&report=fasta (дата обращения: 19.06.2022).

195. Nerlov, C. The C/EBP family of transcription factors: a paradigm for interaction between gene expression and proliferation control / C. Nerlov // Trends in cell biology. - 2007. - Vol. 17, № 7. - P. 318-324.

196. NF-Y coassociates with FOS at promoters, enhancers, repetitive elements, and inactive chromatin regions, and is stereo-positioned with growth-controlling transcription factors / J. D. Fleming, G. Pavesi, P. Benatti [et al.] // Genome research. -2013. - Vol. 23, № 8. - P. 1195-1209.

197. NF-Y controls fidelity of transcription initiation at gene promoters through maintenance of the nucleosome-depleted region / A. J. Oldfield, T. Henriques, D. Kumar [et al.] // Nature communications. - 2019. - Vol. 10, № 1. - P. 3072.

198. Nicu, E. A. Polymorphonuclear neutrophils in periodontitis and their possible modulation as a therapeutic approach / E. A. Nicu, B. G. Loos // Periodontology 2000. - 2016. - Vol. 71, № 1. - P. 140-163.

199. No association between selected candidate gene polymorphisms and severe chronic periodontitis / J. C. Wohlfahrt, T. Wu, J. S. Hodges [et al.] // Journal of periodontology. - 2006. - Vol. 77, № 3. - P. 426-436.

200. Nucleases from Prevotella intermedia can degrade neutrophil extracellular traps / M. Doke, H. Fukamachi, H. Morisaki [et al.] // Molecular oral microbiology. -2017. - Vol. 32, № 4. - P. 288-300.

201. Oral biofilms: pathogens, matrix, and polymicrobial interactions in microenvironments / W. H. Bowen, R. A. Burne, H. Wu, H. Koo // Trends in microbiology. - 2018. - Vol. 26, № 3. - P. 229-242.

202. Oral microbiome: getting to know and befriend neighbors, a biological approach / C. Bacali, R. Vulturar, S. Buduru [et al.] // Biomedicines. - 2022. - Vol. 10, № 3. - P. 671.

203. Oral microflora and periodontal disease: new technology for diagnosis in dentistry / F. Carinci, L. Scapoli, A. Girardi [et al.] // Annali di stomatologia. - 2013. -Vol. 4, № 2. - P. 170-173.

204. Origins and functional impact of copy number variation in the human genome / D. F. Conrad, D. Pinto, R. Redon [et al.] // Nature. - 2010. - Vol. 464, № 7289. - P. 704-712.

205. Overview on osteoporosis, periodontitis and oral dysbiosis: the emerging role of oral microbiota / M. Contaldo, A. Itro, C. Lajolo [et al.] // Applied sciences. -2020. - Vol. 10, № 17. - P. 6000.

206. Ozturk, A. The antimicrobial peptide DEFB1 is associated with caries / A. Ozturk, P. Famili, A. R. Vieira // Journal of dental research. - 2010. - Vol. 89, № 6. -P. 631-636.

207. Periasamy, S. Aggregatibacter actinomycetemcomitans builds mutualistic biofilm communities with Fusobacterium nucleatum and Veillonella species in saliva / S. Periasamy, P. E. Kolenbrander // Infection and immunity. - 2009. - Vol. 77, № 9. -P. 3542-3551.

208. Periodontal findings in adult twins / B. S. Michalowicz, D. Aeppli, J. G. Virag [et al.] // Journal of periodontology. - 1991. - Vol. 62, № 5. - P. 293-299.

209. Periodontal infectogenomics: systematic review of associations between host genetic variants and subgingival microbial detection / L. Nibali, A. Di Iorio, O. Onabolu, G.-H. Lin // Journal of clinical periodontology. - 2016. - Vol. 43, № 11. -P. 889-900.

210. Periodontal infectogenomics / G. Kaur, V. Grover, N. Bhaskar [et al.] // Inflammation and regeneration. - 2018. - Vol. 38. - P. 8.

211. Periodontitis: Consensus report of workgroup 2 of the 2017 World Workshop on the classification of periodontal and peri-implant diseases and conditions / P. N. Papapanou, M. Sanz, N. Buduneli [et al.] // Journal of periodontology. - 2018. -Vol. 89, Suppl 1. - P. S173-S182.

212. Periodontopathogens and human P-defensin-2 expression in gingival crevicular fluid from patients with periodontal disease in Guangxi, China / X. Yong,

Y. Chen, R. Tao [et al.] // Journal of periodontal research. - 2015. - Vol. 50, № 3. -P. 403-410.

213. Plaque-induced gingivitis: Case definition and diagnostic considerations / L. Trombelli, R. Farina, C. O. Silva, D. N. Tatakis // Journal of clinical periodontology. - 2018. - Vol. 45, Suppl 20. - P. S44-S67.

214. Polymorphic segmental duplications at 8p23.1 challenge the determination of individual defensin gene repertoires and the assembly of a contiguous human reference sequence / S. Taudien, P. Galgoczy, K. Huse [et al.] // BMC genomics. - 2004. - Vol. 5, № 1. - P. 92.

215. Porphyromonas gingivalis, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, and Treponema denticola / Prevotella intermedia co-infection are associated with severe periodontitis in a Thai population / K. Torrungruang, S. Jitpakdeebordin, O. Charatkulangkun, Y. Gleebbua // PloS one. - 2015. - Vol. 10, № 8. - P. e0136646.

216. Porphyromonas gingivalis: keeping the pathos out of the biont / C. Cugini, V. Klepac-Ceraj, E. Rackaityte [et al.] // Journal of oral microbiology. - 2013. - Vol. 5.

217. Potential prebiotic substrates modulate composition, metabolism, virulence and inflammatory potential of an in vitro multi-species oral biofilm / T. Verspecht, W. Van Holm, N. Boon [et al.] // Journal of oral microbiology. - 2021. - Vol. 13, № 1. -P.1910462.

218. Prevalence of Porphyromonas gingivalis and periodontal health status / A. L. Griffen, M. R. Becker, S. R. Lyons [et al.] // Journal of clinical microbiology. -1998. - Vol. 36, № 11. - P. 3239-3242.

219. Prevalence of Treponema denticola and Porphyromonas gingivalis in plaque from periodontally-healthy and periodontally-diseased sites / M. Wilson, D. Lopatin, G. Osborne, J. B. Kieser // Journal of medical microbiology. - 1993. - Vol. 38, № 6. -P. 406-410.

220. Proteomics disclose the potential of gingival crevicular fluid (GCF) as a source of biomarkers for severe periodontitis / E. Bellei, C. Bertoldi, E. Monari, S. Bergamini // Materials. - 2022. - Vol. 15, № 6. - P. 2161.

221. Psoriasis is associated with increased beta-defensin genomic copy number /

E. J. Hollox, U. Huffmeier, P. L. J. M. Zeeuwen [et al.] // Nature genetics. - 2008. -Vol. 40, № 1. - P. 23-25.

222. Red complex: polymicrobial conglomerate in oral flora: a review / R. Mohanty, S. J. Asopa, M. D. Joseph [et al.] // Journal of family medicine and primary care. - 2019. - Vol. 8, № 11. - P. 3480-3486.

223. Reduced human beta defensin 3 in individuals with periodontal disease /

F. L. Brancatisano, G. Maisetta, F. Barsotti [et al.] // Journal of dental research. - 2011. - Vol. 90, № 2. - P. 241-245.

224. Reference SNP (rs) Report. rs1047031 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs1047031 (дата обращения: 19.06.2022).

225. Reference SNP (rs) Report. rs11362 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs11362 (дата обращения: 19.06.2022).

226. Reference SNP (rs) Report. rs1339258595 [Электронный ресурс]. -Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs1339258595 (дата обращения: 19.06.2022).

227. Reference SNP (rs) Report. rs1800972 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs545477125 (дата обращения: 19.06.2022).

228. Reference SNP (rs) Report. rs2293958 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs2293958 (дата обращения: 19.06.2022).

229. Reference SNP (rs) Report. rs3762040 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs3762040 (дата обращения: 19.06.2022).

230. Reference SNP (rs) Report. rs545477125 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs545477125 (дата обращения: 19.06.2022).

231. Reference SNP (rs) Report. rs5743401 [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs5743401 (дата обращения: 19.06.2022).

232. Regional office for Europe. Data and statistics [Электронный ресурс]. -Режим доступа: https://www.euro.who.int/en/health-topics/disease-prevention/oral-health/data-and-statistics (дата обращения: 03.03.2021).

233. Relationship between expression of human gingival beta-defensins and levels of periodontopathogens in subgingival plaque / P. Wang, D. Duan, X. Zhou [et al.] // Journal of periodontal research. - 2015. - Vol. 50, № 1. - P. 113-122.

234. Replication of gene polymorphisms associated with periodontitis-related traits in an elderly cohort: the Washington Heights/Inwood Community Aging Project ancillary study of oral health / T. Yang, B. Cheng, J. M. Noble [et al.] // Journal of clinical periodontology. - 2022. - Vol. 49, № 5. - P. 414-427.

235. Restoration of the CCAAT box or insertion of the CACCC motif activates [corrected] delta-globin gene expression / D. C. Tang, D. Ebb, R. C. Hardison, G. P. Rodgers // Blood. - 1997. - Vol. 90, № 1. - P. 421-427.

236. Roberts, F. A. Microbial protection and virulence in periodontal tissue as a function of polymicrobial communities: symbiosis and dysbiosis / F. A. Roberts, R. P. Darveau // Periodontology 2000. - 2015. - Vol. 69, № 1. - P. 18-27.

237. Schaefer, A. S. Genetics of periodontitis: discovery, biology, and clinical impact / A. S. Schaefer // Periodontology 2000. - 2018. - Vol. 78, № 1. - P. 162-173.

238. Schäfer, A. S. Periodontal genetics: a decade of genetic association studies mandates better study designs / A. S. Schäfer, S. Jepsen, B. G. Loos // Journal of clinical periodontology. - 2011. - Vol. 38, № 2. - P. 103-107.

239. Semple, F. ß-defensins: multifunctional modulators of infection, inflammation and more? / F. Semple, J. R. Dorin // Journal of innate immunity. - 2012.

- Vol. 4, № 4. - P. 337-348.

240. Sequence-specific transcription factor NF-Y displays histone-like DNA binding and H2B-like ubiquitination / M. Nardini, N. Gnesutta, G. Donati [et al.] // Cell.

- 2013. - Vol. 152, № 1-2. - P. 132-143.

241. Serotypes of Aggregatibacter actinomycetemcomitans in relation to periodontal status and geographic origin of individuals-a review of the literature / J.-A. Brigido, V.-R. da Silveira, R.-O. Rego, N.-A. Nogueira // Medicina oral, patologia oral y cirugia bucal. - 2014. - Vol. 19, № 2. - P. e184-191.

242. Sharma, A. Virulence mechanisms of Tannerella forsythia / A. Sharma // Periodontology 2000. - 2010. - Vol. 54, № 1. - P. 106-116.

243. Sidharthan, S. Gingival crevicular fluid levels of interleukin-22 (IL-22) and human P defensin-2 (hBD-2) in periodontal health and disease: A correlative study / S. Sidharthan, G. Dharmarajan, A. Kulloli // Journal of oral biology and craniofacial research. - 2020. - Vol. 10, № 4. - P. 498-503.

244. Single-nucleotide polymorphism (SNP) in P-defensin 2 in a Japanese population and an effect of - 1029 SNP on promoter activity / K. Kusano, Y. Abiko, M. Nishimura [et al.] // Oral science international. - 2005. - Vol. 2, № 2. - P. 80-84.

245. Single-nucleotide polymorphisms and haplotype analysis in beta-defensin genes in different ethnic populations / R. J. Jurevic, P. Chrisman, L. Mancl [et al.] // Genetic testing. - 2002. - Vol. 6, № 4. - P. 261-269.

246. Stabholz, A. Genetic and environmental risk factors for chronic periodontitis and aggressive periodontitis / A. Stabholz, W. A. Soskolne, L. Shapira // Periodontology 2000. - 2010. - Vol. 53. - P. 138-153.

247. Stover, C. M. Editorial: antimicrobial peptides and complement -maximising the inflammatory response / C. M. Stover // Frontiers in immunology. - 2015. - Vol. 6. - P. 491.

248. Subgingival microbiota in individuals with severe chronic periodontitis / C.-Y. Tsai, C. Y. Tang, T.-S. Tan [et al.] // Journal of microbiology, immunology, and infection. - 2018. - Vol. 51, № 2. - P. 226-234.

249. Succession of oral bacterial colonizers on dental implant materials: An in vitro biofilm model / D. A. Siddiqui, A. B. Fidai, S. G. Natarajan, D. C. Rodrigues // Dental materials. - 2022. - Vol. 38, № 2. - P. 384-396.

250. Taba, M. J. Periodontal disease: a genetic perspective / M. J. Taba, S. L. de Souza, V. C. Mariguela // Brazilian oral research. - 2012. - Vol. 26, Suppl 1. -P. 32-38.

251. The chymotrypsin-like protease complex of Treponema denticola ATCC 35405 mediates fibrinogen adherence and degradation / C. V Bamford, J. C. Fenno, H. F. Jenkinson, D. Dymock // Infection and immunity. - 2007. - Vol. 75, № 9. -P. 4364-4372.

252. The DNA-encoded nucleosome organization of a eukaryotic genome /

N. Kaplan, I. K. Moore, Y. Fondufe-Mittendorf [et al.] // Nature. - 2009. - Vol. 458, № 7236. - P. 362-366.

253. The expression of hBDs in the gingival tissue and keratinocytes from healthy subjects and periodontitis patients / J. Liu, J. Chen, X. Du [et al.] // Archives of oral biology. - 2014. - Vol. 59, № 2. - P. 193-198.

254. The expression of human P-defensins (hBD-1, hBD-2, hBD-3, hBD-4) in gingival epithelia / X. Li, D. Duan, J. Yang [et al.] // Archives of oral biology. - 2016. -Vol. 66. - P. 15-21.

255. The guardians of the periodontium-sequential and differential expression of antimicrobial peptides during gingival inflammation. Results from in vivo and in vitro studies / H. Dommisch, P. Skora, J. Hirschfeld [et al.] // Journal of clinical periodontology. - 2019. - Vol. 46, № 3. - P. 276-285.

256. The periodontal war: microbes and immunity / J. L. Ebersole, D. 3rd Dawson, P. Emecen-Huja [et al.] // Periodontology 2000. - 2017. - Vol. 75, № 1. - P. 52-115.

257. The potential impact of salivary peptides in periodontitis / C. Hirtz, R. O'Flynn, P. M. Voisin [et al.] // Critical reviews in clinical laboratory sciences. - 2021. - Vol. 58, № 7. - P. 479-492.

258. The sequence of the human genome / J. C. Venter, M. D. Adams, E. W. Myers [et al.] // Science. - 2001. - Vol. 291. - P. 1304-1351.

259. The structure, function and evolution of a complete human chromosome 8 / G. A. Logsdon, M. R. Vollger, P. Hsieh [et al.] // Nature. - 2021. - Vol. 593, № 7857. -P. 101-107.

260. The use of chronic gingivitis as reference status increases the power and odds of periodontitis genetic studies: a proposal based in the exposure concept and clearer resistance and susceptibility phenotypes definition / G. P. Garlet, A. P. F. Trombone, R. Menezes [et al.] // Journal of clinical periodontology. - 2012. - Vol. 39, № 4. - P. 323332.

261. The yin and yang of human beta-defensins in health and disease / A. Weinberg, G. Jin, S. Sieg, T. S. McCormick // Frontiers in immunology. - 2012. -Vol. 3. - P. 294.

262. Tonetti, M. S. Staging and grading of periodontitis: framework and proposal of a new classification and case definition / M. S. Tonetti, H. Greenwell, K. S. Kornman // Journal of periodontology. - 2018. - Vol. 89, Suppl 1. - P. S159-S172.

263. Treponema denticola invasion into human gingival epithelial cells / S. Inagaki, R. Kimizuka, E. Kokubu [et al.] // Microbial pathogenesis. - 2016. - Vol. 94.

- P. 104-111.

264. Use of defensins to develop eco-friendly alternatives to synthetic fungicides to control phytopathogenic fungi and their mycotoxins / V. Leannec-Rialland, V. Atanasova, S. Chereau [et al.] // Journal of fungi. - 2022. - Vol. 8, № 3. - P. 229.

265. Van Dyke, T. E. Inflammation and factors that may regulate inflammatory response / T. E. Van Dyke, K. S. Kornman // Journal of periodontology. - 2008. - Vol. 79, Suppl 8. - P. 1503-1507.

266. Vasudevan, R. Biofilms: microbial cities of scientific significance / R. Vasudevan // Journal of microbiology & experimentation. - 2014. - Vol. 1, № 3. -P. 00014.

267. What is the contribution of genetics to periodontal risk? / B. G. Loos, G. Papantonopoulos, S. Jepsen, M. L. Laine // Dental clinics of North America. - 2015.

- Vol. 59, № 4. - P. 761-780.

268. Xu, D. Defensins: a double-edged sword in host immunity / D. Xu, W. Lu // Frontiers in immunology. - 2020. - Vol. 11. - P. 764.

269. Zheng, D. Asymmetric histone modifications between the original and derived loci of human segmental duplications / D. Zheng // Genome biology. - 2008. -Vol. 9, № 7. - P. R105.

270. Zhu, W. Surface interactions between two of the main periodontal pathogens: Porphyromonas gingivalis and Tannerella forsythia / W. Zhu, S.-W. Lee // Journal of periodontal & implant science. - 2016. - Vol. 46, № 1. - P. 2-9.