Получение рекомбинантных белков западносибирских изолятов Borrelia burgdorferi sensu lato и изучение их антигенных свойств тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Рябченко, Александр Владимирович
- Специальность ВАК РФ03.00.04
- Количество страниц 160
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Рябченко, Александр Владимирович
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ.
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1. Спирохеты Borrelia burgdorferi sensu lato как возбудитель иксодового клещевого боррелиоза (ИКБ).
1.1.1. История открытия возбудителя ИКБ.
1.1.2. Эпидемиология иксодового клещевого боррелиоза.
1.1.2.1. Географическое распространение возбудителя ИКБ.
1.1.2.2. Пути передачи Borrelia burgdorferi sensu lato.
1.1.3 Патогенез и клиника ИКБ.
1.1.4. Механизмы уклонения спирохет Borrelia burgdorferi sensu lato от иммунной системы хозяина.
1.2. Морфологические и генетические особенности спирохет комплекса Borrelia burgdorferi sensu lato.
1.3. Антигены спирохет комплекса Borrelia burgdorferi sensu lato.
1.3.1. Семейство внешних поверхностных протеинов (Osp).
1.3.2. Декорин-связываюхцие белки (Dbp).
1.3.3. Флагеллярные белки (Fla).
1.3.4. Белок Р83.
1.3.5. Белок Р66.
1.3.6. Семейство основных мембранных белков (Вмр).
1.3.7. Белок РЗ5.
1.4. Диагностика ИКБ.
1.4.1. Обнаружение спирохет Borrelia burgdorferi sensu lato в биологических образцах методом культивирования на питательных средах.
1.4.2. ДНК-диагностика ИКБ.
1.4.3. Серодиагностика ИКБ.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.
2.1. Реактивы, реагенты и прочие материалы.
2.2. Методы работы с ДНК.
2.2.1. Получение суммарного препарата ДНК из клещей.
2.2.2. Получение суммарного препарата ДНК из культур боррелий.
2.2.3. Выделение плазмидной ДНК из E.coli.
2.2.4. Быстрое выделение плазмидной ДНК из колоний E.coli.
2.2.5. Электрофорез ДНК в агарозных и полиакриламидных гелях.
2.2.6. Выделение ДНК из агарозного геля методом сорбции на мелкодисперсном оксиде кремния «Силика».
2.2.7. Гидролиз ДНК эндонуклеазами рестрикции.
2.2.8. Лигирование фрагментов ДНК с использованием ДНК-лигазы бактериофага Т4.
2.2.9. Амплификация ДНК в системе ПЦР.
2.3. Методы работы с бактериями.
2.3.1. Используемые среды и общие приемы.
2.3.2. Изоляция спирохет В. burgdorferi s.l. из клещей.
2.3.3. Изоляция спирохет В.burgdorferi s.l. с помощью заражения мышей.
2.3.4. Обнаружение ДНК боррелий в культуре и генотипирование изолятов с помощью ПЦР.
2.3.5. Обнаружение ДНК боррелий в клещах и генотипирование изолятов с помощью ПЦР.
2.3.6. Трансформация компетентных клеток E.coli.
2.4. Индукция экспрессии клонированных генов боррелий в клетках E.coli.
2.4.1. Индукция экспрессии генов, клонированных в составе вектора pREB-SAT, либо в его производных.
2.5. Анализ белков методом электрофореза в ПААГ.
2.6. Очистка рекомбинантных белков аффинной хроматографией на никель-хелатном сорбенте.
2.7. Исследование антигенных свойств рекомбинантных белков боррелий.
2.7.1. Используемые сыворотки.
2.7.2. Твёрдофазный иммуноферментный анализ.
2.8. Определение первичной структуры фрагментов ДНК, сравнение аминокислотных последовательностей.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ.
3.1. Получение изолятов Borrelia burgdorferi s.l. и определение их геновидовой принадлежности.
3.1.1. Культивирование спирохет Borrelia burgdorferi s.l., выделенных из клещей.
3.1.2. Культивирование спирохет Borrelia burgdorferi s.l. с помощью заражения лабораторных мышей.:.
3.2. Оценка зараженности клещей Ixodespersulcatus, населяющих рекреационную зону Новосибирского научного центра, спирохетами
В.burgdorferi s.l.
3.3. Конструирование векторов для экспрессии рекомбинантных белков клетках E.coli.
3.3.1. Клонирование гена gfp в E.coli в составе вектора pREB.
3.3.2. Конструирование плазмиды pREB3.
3.3.3. Конструирование плазмиды pRAC.
3.3.4. Конструирование вектора pRAC3.
3.4. Выбор генов спирохет Borrelia burgdorferi s.l. для клонирования в E.coli в составе экспрессирующих векторов.
3.5. Амплификация кодирующих областей генов ospC, ospA,flaA,flaQ и dbpB B.garinii 20047х и ospC B.afzelii, подготовка к клонированию.
3.6. Клонирование генов ospC и ospA в составе вектора pRAC3.
3.7. Модификация коммерческого вектора рЕТ36Ь(+).
3.8. Клонирование кодирующих областей геновflaA,flaB и dbpB в составе вектора рЕТш.
3.9. Переклонирование кодирующих областей генов ospA, ospC и flaA в составе вектора рЕТт.
3.10. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей полученных рекомбинантных белков FlaA, FlaB, DbpB, OspA, OspC
B.garinii группы 20047 и OspC B.afzelii.
3.10.1. Сравнительный анализ последовательностей антигена FlaA.
3.10.2. Сравнительный анализ последовательностей антигена FlaB.
3.10.3. Сравнительный анализ последовательностей антигена DbpB.
3.10.4. Сравнительный анализ последовательностей антигена OspA.
3.10.5. Сравнительный анализ последовательностей антигена OspC
B.afzelii (изолят NSK-05-06).
3.10.6 Сравнительный анализ последоваетльностей антигена OspC
В.garinii группа 20047т (изолят NSK-10-06).
3.11. Получение и очистка рекомбинантных белков.
3.12. Оценка иммунореактивности рекомбинантных белков в ИФА с сыворотками больных иксодовым клещевым боррелиозом.
3.12.1. Определение оптимальной концентрации антигена.
3.12.2. Анализ иммунореактивности рекомбинантных антигенов боррелий в ИФА с сыворотками больных ИКБ.
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК
Разработка иммуноферментной тест-системы для диагностики раннего иксодового клещевого боррелиоза2003 год, кандидат биологических наук Иванов, Игорь Диадорович
Изучение антигенной структуры поверхностного белка А (OspA) спирохеты Borrelia burgdorferi как основа для разработки новых иммунохимических методов диагностики болезни Лайма2001 год, кандидат биологических наук Садыкбекова, Роза Куанышкалиевна
Генетическая гетерогенность Borrelia spp. Западной Сибири2008 год, кандидат биологических наук Фоменко, Наталия Владимировна
Геновидовая характеристика возбудителя клещевого боррелиоза на территории Иркутской области0 год, кандидат биологических наук Хаснатинов, Максим Анатольевич
Экологические связи таежного клеща и его хозяев с возбудителями иксодовых клещевых боррелиозов: На примере природного лесостепного очага Приобья2004 год, кандидат биологических наук Ливанова, Наталья Николаевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Получение рекомбинантных белков западносибирских изолятов Borrelia burgdorferi sensu lato и изучение их антигенных свойств»
По морфологическим и генетическим признакам различают 13 геновидов спирохет комплекса Borrelia burgdorferi sensu lato (s.l.) (Baranton et al, 1998), относящихся к семейству SPIROCHAETACAE. Этиологическая роль спирохет этого комплекса как инфекционных агентов, переносимых клещами рода Ixodes была установлена в 1982 г. американскими исследователями и была названа «болезнью Лайма» (Steere, 2006). В нашей стране это природноочаговое трансмиссивное заболевание получило название «иксодового клещевого боррелиоза» (ИКБ). Три геновида этого комплекса являются патогенными для человека (Wang et al, 1999) и три условнопатогенными (Richter et al, 2006; Hofmann, 2005; Stanek and Strle, 2003; Hengge et al, 2003). По широте распространения и уровню заболеваемости ИКБ занимает одно из ведущих мест среди природно-очаговых заболеваний. Ареал инфекции простирается по всей Северной Америке, Европе, России, Японии, Китае (Stanek, 2003).
Отличия в генетической структуре патогенных геновидов боррелий, обусловливают полиморфизм клинических проявлений и органных поражений человека. Основные симптомы ИКБ сходны во всем мире, но есть и региональные отличия. В первую очередь между болезнью, обнаруженной в Америке и вызываемой исключительно геновидом B.burgdorferi sensu stricto (s.s.) с характерными проявлениями артрита, и болезнью, обнаруженной в Европе. В Европе болезнь вызывается, прежде всего, геновидами B.garinii -возбудителем, характеризующимся нейротропностью и B.afzelii, поражающим часто только кожу с развитием акродерматитов. При отсутствии своевременного лечения, инфекции переходят в хроническую форму.
В виду разнообразия клинических проявлений заболевания, для подтверждения диагноза используют дополнительные лабораторные методы, среди которых широкое распространение получили методы, основанные на выявление антител к возбудителю. Основным методом, позволяющим быстро и относительно достоверно диагностировать ИКБ, является имунноферментный анализ, однако и он не дает 100% надежности результатов. Поэтому в Европе и
США диагностику иксодового клещевого боррелиоза (болезнь Лайма) осуществляют в 2 стадии: скрининговый ИФА с последующим подтверждающим иммуноблотом. Этот вариант представляется трудоемким и протяженным во времени, требует специально оборудованных лабораторий для постановки иммуноблотов и соответствующего персонала. Однако генетическое разнообразие В.burgdorferi s.l., обусловливающее характер течения болезни и различные клинические проявления ставит перед исследователями задачу распознавания конкретного геновида возбудителя. Зачастую, чтобы назначить адекватное лечение пациентам, также необходимо знать стадию болезни. Все это предполагает наличие богатого арсенала информативных методов диагностики заболевания.
Актуальность исследования
Используемые для серологической диагностики белки североамериканских и западноевропейских изолятов боррелий, такие как внешние поверхностные липопротеины, флагеллярные белки, основные мембранные белки, декорин-связывающие белки и некоторые другие хорошо изучены и описаны. Однако, практически отсутствует информация об аминокислотных последовательностях и иммунохимических свойствах антигенов спирохет комплекса В. burgdorferi s.l. распространенных на территории азиатской части России. Генетическое и антигенное разнообразие изолятов боррелий на меж- и внутривидовом уровнях, вследствие сравнительно высокой вариабельности антигенов, затрудняет разработку эффективных методов серодиагностики ИКБ. Большая протяженность территории России с запада на восток позволяет предполагать, значительное отличие антигенов в изолятах циркулирующих на этой территории. Можно предположить, что такие отличия аминокислотных последовательностей антигенов будут обусловливать и их иммунохимические свойства. Все эти причины сдерживают развитие работ по созданию высокоспецифичных и чувствительных методов диагностики иксодового клещевого боррелиоза, что, в свою очередь, остается важной задачей здравоохранения.
Цель работы — получение рекомбинантных иммунодоминантных белков западносибирских изолятов В. burgdorferi s.l. и сравнительное исследование их первичных структур и антигенных свойств.
Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи:
1. Оценить зараженность клещей Ixodes persulcatus Shulze, населяющих рекреационную зону Новосибирского Научного Центра, различными геновидами спирохет B.burgdorferi s.l.
2. Получить культуры западносибирских изолятов В. burgdorferi s.l.
3. На основе анализа литературных данных выбрать в качестве объектов исследования белки спирохет B.burgdorferi s.l. наиболее перспективные для создания средств серодиагностики ИКБ.
4. Сконструировать экспрессирующие плазмидные векторы, пригодные для получения в клетках E.coli рекомбинантных белков боррелий и их последующей аффинной очистки.
5. Клонировать кодирующие области генов выбранных иммунодоминантных белков B.burgdorferi s.l. в клетках E.coli в составе экспрессирующих векторов.
6. Определить нуклеотидные последовательности клонированных генов спирохет B.burgdorferi s.l. и исследовать гомологию соответствующих им белков с опубликованными в базе данных GeneBank аналогичными белками боррелий.
7. Получить очищенные рекомбинантные белки западносибирских изолятов B.burgdorferi s.l. и исследовать их антигенные свойства методом ИФА на сыворотках больных ИКБ.
8. Оценить пригодность каждого из рекомбинантных антигенов боррелий для серодиагностики локализованной и диссеминированной стадий ИКБ.
Научная новизна работы
Исследована зараженность клещей Ixodes persulcatus Shulze, отловленных в рекреационной зоне ННЦ в 2003, 2005, 2006 и 2008 годах, различными геновидами спирохет В.burgdorferi s.l. Отмечены зависимые от года наблюдений колебания в количестве инфицированных спирохетами особей (20% - 32%). Установлено, что только два геновида боррелий циркулировали до 2006 г. в популяции иксодовых клещей на обследованной терриртории — B.garinii и B.afzelii, с доминирующим преобладанием первого (70%-80%), включающего представителей двух геномных групп: NT29 и 20047. В 2006 и 2008 г.г. в нескольких особях клещей обнаружены спирохеты геновида В. japonic а.
Сконструированы оригинальные бактериальные экспрессирующие вектора pRAC и pRAC3, содержащие химерные регуляторные районы, полилинкер для клонирования генов и участки, кодирующие олигогистидиновые последовательности в С-концевой области рекомбинантных белков. Штаммы E.coli, несущие полученные векторы обеспечивают трёхкратное увеличение синтеза белка GFP по сравнению с клетками, содержащими исходный экспрессирующий вектор pREB.
Определены нуклеотидные последовательности кодирующих областей генов flaA, flaB, ospC, ospA и dbpB западносибирского изолята B.garinii, группы 200471 и гена ospC западносибирского изолята B.afzelii; выведены соответствующие этим генам аминокислотные последовательности белков. Нуклеотидные последовательности выше названных генов депонированы в электронную международную базу данных генетической информации GenBank под инвентарными номерами: EU979631.1, EU979630.1, EU979629.1, EU979628.1, EU979626.1 иЕШ79627.1.
На основе сравнения аминокислотных последовательностей антигенов FlaA, FlaB, OspC, OspA и DbpB спирохет В. burgdorferi s.l., представленных в базе данных GeneBank (декабрь 2008 г.) и установленных в настоящей работе, т показано, что западносибирский изолят B.garinii группа 200471 (NSK-10-06, музейный штамм №10) филогенетически близок изолятам B.garinii, выделенным в Европе.
Исследованы антигенные свойства рекомбинантных белков FlaA, FlaB, OspC, OspA и DbpB методом ИФА в экспериментах с сыворотками от больных ИКБ и здоровых доноров. Продемонстрирована перспективность использования названных рекомбинантных белков для серодиагностики ИКБ. Предложена комбинация рекомбинантных антигенов для выявления антител к возбудителям ИКБ в крови больных, как с локализованной, так и с диссеминированной стадиями заболевания.
Практическая значимость работы
Полученные в настоящей работе данные о зараженности клещей Ixodes persulcatus, отловленных в рекреационной зоне ННЦ в 2003, 2005, 2006 и 2008 годах, различными геновидами спирохет B.burgdorferi s.l. могут быть использованы для прогнозирования эпидемической ситуации по ИКБ и возможных клинических проявлений заболеваний.
Создана музейная коллекция западносибирских изолятов B.burgdorferi s.l. распространенных на территории Новосибирской области и определена их геновидовая принадлежность. Коллекция включает 2 изолята B.afzelii, 14 изолятов В.garinii, 7 образцов смеси изолятов B.afzelii и В.garinii. Культуры полученных изолятов боррелий могут быть использованы в качестве посевного материала для культивирования и наработки биомассы спирохет и решения исследовательских и прикладных задач.
Сконструированы векторы pRAC и pRAC3 пригодные для клонирования и эффективной индуцируемой экспрессии генов в клетках E.coli. Штаммы E.coli, содержащие в составе этих векторов экспрессируемые гены флюоресцирующих белков, могут применяться в химической, фармацевтической, пищевой промышленности и в экологическом мониторинге окружающей среды в качестве цельноклеточных биосенсоров для обнаружения генотоксикантов в исследуемых образцах.
Сконструированные штаммы E.coli - продуценты рекомбинантных белков FlaA, OspC, OspA, DbpB и FlaB, специфичных для геновидов В.garinii (группа 200471), и OspC B.afzelii, могут быть использованы в качестве источников получения соответствующих антигенов боррелий. Разработана технология получения рекомбинантных белков В. burgdorferi s.l. с помощью экспрессии соответствующих им генов в составе сконструированного вектора pRAC3 и модифицированного в настоящей работе лектора рЕТ36Ь(+) (рЕТт) в клетках E.coli (шт. BL21(DE3) и Rosetta 2) и последующей аффинной очистки рекомбинантных полипептидов на металло-хелатных сорбентах.
Полученные в настоящей работе рекомбинантные антигены FlaA, FlaB, OspC, OspA и DbpB могут быть использованы в серодиагностике ИКБ, вызываемого спирохетами B.burgdorferi s.l., циркулирующими на азиатской территории России.
Положения, выносимые на защиту
1. В рекреационной зоне Новосибирского научного центра в период с 2003 по 2008 г.г. в популяции клещей Ixodes persulcatus Schulze циркулировали только три геновида боррелий — B.garinii, B.afzelii и B.japonica с доминирующим преобладанием B.garinii (более 75%). Заражённость иксодовых клещей боррелиями составляла, в зависимости от года наблюдений, 20% - 32%. т
2. Западносибирский изолят B.garinii группы 200471 (NSK10-06, музейный штамм №10) филогенетически близок боррелиям, изолированным на территории Европы.
3. Сконструированные плазмидные векторы pRAC, pRAC3 и модифицированный в настоящей работе вектор рЕТ36Ь(+) (рЕТт) являются эффективными системами для экспрессии клонируемых в их составе генов в клетках E.coli.
4. Штамм E.coli, содержащий в составе плазмиду pRAC может применяться в качестве цельноклеточного биосенсора для обнаружения генотоксикантов.
5. По результатам исследований антигенных свойств рекомбинантных белков FlaA, FlaB, OspC, OspA и DbpB, данные белки могут быть рекомендованы для серодиагностики ИКБ.
Апробация работы и публикации
Материалы диссертации изложены в 13-ти публикациях и одном патентном документе, доложены на ученом совете НИИ биохимии СО РАМН.
1. Рябченко А.В., Ивлева И.Н., Беклемишев А.Б. Комплексная оценка зараженности клещей Ixodes persulcatus, распространённых в рекреационной зоне новосибирского научного центра, спирохетами Borrelia burgdorferi s.l. // Журнал инфекционной патологии. - 2004. - Т. 11. - № 3-4. - С. 107-110.
2. Рябченко А.В., Терехова Д.В., Ивлева И.В., Бирюков А.Ю., Беклемишев А.Б. Выделение и типирование западно-сибирских изолятов боррелий, возбудителей иксодового клещевого боррелиоза // Тезисы докладов Международного мультидисциплинарного конгресса «Прогресс в фундаментальных и прикладных науках для здоровья человека». - 2004. — Судак, Украина. — С. 141-142.
3. Рябченко А.В. Получение западно-сибирских культур Borrelia burgdorferi s.l. // Аспирантский сборник НГПУ 2004. - Новосибирск: Изд. НГПУ. - 2004. - Ч. 2.-С. 160-168.
4. Рябченко А.В., Караваев B.C., Ивлева И.Н., Терехова Д.В., Беклемишев А.Б. Оценка пригодности ряда антигенов сибирских изолятов Borrelia burgdorferi sensu lato для диагностики иксодового клещевого боррелиоза // Тезисы докладов Международной конференции «Развитие международного сотрудничества в области изучения инфекционных заболеваний». — 2004. — Новосибирск, Россия. — С. 272.
5. Рябченко А.В., Беклемишев А.Б. Оценка зараженности клещей Ixodes persulcatus, отловленных весной 2005 г. в рекреационной зоне Новосибирского научного центра, спирохетами Borrelia burgdorferi s.l. // Журнал инфекционной патологии.-2005.-Т. 12.-№3-4.-С. 109-110.
6. Рябченко А.В., Беклемишев А.Б., Ивлева И.Н. Конструирование вектора для эффективной экспрессии генов в клетках E.coli II Материалы третьего Московского международного конгресса "Биотехнология: состояние и перспективы развития". - М: ЗАО "Экспо-биохим-технология", РХТУ им. Д.И. Менделеева.-2005.-Ч. 1.-С. 99-100.
7. Рябченко А.В., Караваев B.C., Беклемишев А.Б. Получение рекомбинантных форм некоторых иммунодоминантных белков западносибирских изолятов возбудителя Лайм-боррелиоза и оценка их диагностической значимости // Материалы московской международной конференции «Биотехнология и медицина». - М.: ЗАО «Экспо-биохим-технология», РХТУ им. Д.И. Менделеева. - 2006. - С. 55.
8. Лавриненко И.А., Лавриненко В.А., Рябченко А.В., Беклемишев А.Б. Создание биосенсорной тест-системы для детекции повреждений ДНК путем использования репортерного белка GFP // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2006. - Т. 141.-№ 1.-С. 38-40.
9. Рябченко А.В., Беклемишев А.Б. Мониторинг заражённости клещей рекреационной зоны г. Новосибирска возбудителями Лайм-боррелиоза // Вестник НГУ. - 2007. - Т. 5. - С. 106-110.
10. Лавриненко И.А., Рябченко А.В., Беклемишев А.Б. Создание цельно-клеточной биосенсорной тест-системы для обнаружения генотоксических воздействий на клетку // Вестник НГУ. - 2007. - Т. 5. - С. 95-99.
11. Рябченко А.В., Лавриненко И.А., Беклемишев А.Б. Рекомбинантная плазмидная ДНК для обнаружения агентов, повреждающих генетический аппарат клетки (варианты) // Патент РФ № 2311459 от 27.11.2007.
12. Караваев B.C., Иванов И.Д., Рябченко А.В. Оценка иммунореактивности рекомбинантных белков OspC и фрагмента FlaB (f-FlaB) Borrelia garinii NT29 в экспериментах с сыворотками больных Лайм-боррелиозом // Бюллетень СО РАМН. - 2007. - № 5. - С. 53-57.
13. Рябченко А.В., Мамаев А.Л. Инфицированность клещей Ixodes persulcatus, отловленных весной 2006г. в лесопарковой зоне новосибирского академгородка // Бюллетень СО РАМН. - 2007. - № 5. - С. 58-61.
14. Караваев B.C., Иванов И.Д., Рябченко А.В., Беклемишев А.Б. Получение рекомбинантных белков OspC и фрагмента FlaB (f-FlaB) западно-сибирских изолятов Borrelia garinii NT29 и исследование их свойств // Мол. генетика, микробиол. и вирусол. — 2008. — № 1. — С. 18-22.
Похожие диссертационные работы по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК
Клинико-патогенетическая характеристика иксодового клещевого боррелиоза у детей2013 год, кандидат медицинских наук Балинова, Александра Александровна
Возможность трансовариальной передачи боррелий у таежного клеща (Ixodes Persulcatus Schulze) в природных очагах2003 год, кандидат биологических наук Нефедова, Валентина Валерьевна
Использование методов молекулярной биологии и генной инженерии для конструирования вакцинных и диагностических препаратов2004 год, доктор биологических наук Беклемишев, Анатолий Борисович
Распространение возбудителя Лайм-боррелиоза в Ставропольском крае и совершенствование методов его индикации2009 год, кандидат биологических наук Орлова, Татьяна Николаевна
Смешанные инфекции, передающиеся иксодовыми клещами в Северо-западном регионе России (клиника, диагностика, лечение)2005 год, Усков, Александр Николаевич
Заключение диссертации по теме «Биохимия», Рябченко, Александр Владимирович
ВЫВОДЫ
1. Зараженность клещей Ixodes persulcatus Schulze, отловленных в рекреационной зоне ННЦ в весенние периоды с 2003 по 2008 г.г., спирохетами Borrelia burgdorferi s.l., колебалась в зависимости от года наблюдений в пределах 20% - 32%.
2. В популяции исследованных клещей Новосибирской области выявлены только три геновида боррелий - Borrelia garinii (группы NT29 и 20047т), Borrelia afzelii и Borrelia japonica с явным преобладанием первого (—75%).
3. Сконструированные плазмидные векторы pRAC3 и рЕТт, обеспечивают эффективную экспрессию клонируемых в их составе генов в клетках E.coli шт. BL21(DE3) и шт. Rosetta2 и последующую аффинную очистку рекомбинантных белков.
4. Штамм E.coli, содержащий вектор pRAC, может применяться в качестве цельноклеточного биосенсора для обнаружения мутагенов химичечской и физической природы в исследуемых образцах.
5. Штаммы E.coli BL21(DE3) и Rosetta2, несущие экспрессирующий вектор рЕТт со встроенными в него кодирующими областями генов flaA, flaB, ospC, ospA и dbpB B.garinii 200471 и ospC B.afzelii обеспечивают эффективный синтез соответствующих зтим генам рекомбинантных белков.
6. Полученные в настоящей работе рекомбинантные антигены FlaA, FlaB, OspC, OspA и DbpB могут быть использованы для конструирования тест-систем серодиагностики локализованной и диссеменированной стадий ИКБ.
7. Западносибирский изолят B.garinii 200471 (Nsk-10-06) филогенетически близок изолятам этого геновида, выделенным на территории Европы.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В настоящей работе была определена зараженность и геновидовой состав спирохет Borrelia burgdorferi s.l. в клещах Ixodes persulcatus Schulze, обитающих на территории Новосибирского научного центра и отловленных в весенние периоды 2003, 2005, 2006 и 2008 г.г. Впервые на территории Новосибирской области в клещах Ixodes persulcatus методом ПДРФ-анализа были обнаружены спирохеты геновида Borrelia japonica (2006 и 2008 г.г.). В работе были получены культуры спирохет B.garinii и B.afzelii, циркулирующих в популяции иксодовых клещей, населяющих рекреационную зону ННЦ. Были проклонированы в клетках E.coli в составе экспрессирующих векторов pRAC3 и рЕТт кодирующие области генов внешних поверхностных липопротеинов (OspA и OspC), флагеллярных белков (FlaA и FlaB) и декоринсвязывающего белка В (DbpB) изолята B.garinii группы 20047 и белка OspC изолята B.afzelii.
В работе были получены высоко очищенные рекомбинантные белки боррелий OspC-Bg, OspC-Ba, OspA, FlaA, FlaB и DbpB и исследованы их антигенные свойства методом ИФА на сыворотках больных ИКБ. По результатам ИФА можно сделать вывод о пригодности полученных в данной работе рекомбинантных антигенов OspC, FlaA и FlaB B.garinii и OspC B.afzelii для серодиагностики инфекций ранней и диссеминированной стадий. Рекомбинантные белки OspA и DbpB могут быть использованы для серодиагностики диссеминированной и хронической стадий ИКБ. Результаты ИФА свидетельствуют о необходимости использования композиций антигенов для увеличения чувствительности методов серодиагностики ИКБ. На примере рекомбинантных белков OspC изолятов B.garinii и B.afzelii показана необходимость использования для серодиагностики гомологичных вариабельных антигенов, всех патогенных изолятов боррелий циркулирующих на территории Новосибирской области.
По данным сравнения аминокислотных последовательностей, полученных в настоящей работе рекомбинантных белков, с первичными структурами аналогичных белков боррелий, представленных в базе данных
GenBank, изолят B.garinii 200471 (Nsk-10-06) филогенетически близок изолятам этого геновида, выделенным на территории Европы.
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Рябченко, Александр Владимирович, 2009 год
1. Алексеев А.Н., Арумова ЕА. Буренкова JI.A. Чунихин С.П. Об особенностях распространения возбудителя болезни Лайма и поведения зараженных им клещей poji^ Ixodes // Паразитология. 1993. - Т. 27. - С. 389-398.
2. Алексеев А.Н., Дубинина Е.В., Вашукова М.А., Волкова Л.И. Боррелии как вероятные антагонисты вируса клещевого энцефалита: паразитологический и клинический аспекты проблемы // Медиц. паразитол. 2001. - № 3. - С. 3-11.
3. Ананьева Л.П. Лаймская болезнь // В кн. Руководство по внутренним болезням. Ревматические болезни. М. Медицина. - 1997. - С. 344 - 352.
4. Ананьева Л.П. Лайм-боррелиоз или иксодовые клещевые боррелиозы. Часть 1. Этиология, клиника, диагностика // Инфекции и антимикробная терапия. -2002. Т. 4. - № 2. - С. 42-45.
5. Баранова Н.С., Лесняк О.М., Образцова Р.Г. Особенности поражения периферической нервной системы при Лайм-боррелиозе // Терапевт, архив. — 1997. -№ 5. -С. 20-25.
6. Беклемишев А.Б., Иванов И.Д. Рекомбинантная плазмидная ДНК, обеспечивающая синтез иммунодоминантного белка Borrelia garinii NT29, используемого для диагностики Лайм-боррелиоза (варианты). // Патент РФ на изобретение № 2260047 от 10.09.2005 г.
7. Беклемишев А.Б., Тлеулиева Р., Номоконова Н.Ю., Беляев Н.Н. Исследование гемолитических и антигенных свойств рекомбинантных форм альфа-токсина S.aureus//Бюллетень СО РАМН. 2008. - Т. 131.-№2.-С. 5-11.
8. Васильева И. С. и Наумов Р. Л. Паразитарная система болезни Лайма, состояние вопроса. Сообщение 1. Возбудители и переносчики // Acarina. —1996. -Т. 4. -№ 1-2.-С. 53-75.
9. Воробьева Н.Н. Клиника, лечение и профилактика иксодовых клещевых боррелиозов. Пермь: Урал-Пресс, 1998. - 136 с.
10. Ю.Горелова Н.Б., Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. и др. Изоляция боррелий от клещей Ixodes trianguliceps (Ixodidae) и возможное значение этого вида в эпизоотологии иксодовых клещевых боррелиозов // Паразитология. — 1996. — Т.30. № 1.-С. 13-18.
11. П.Горелова Н.Б., Коренберг Э.И., Филлипова Н.А., Постик Д. Первая изоляция патогенных для человека боррелий от клещей Ixodes pavlovskyi Pom. // Докл. Академии наук. 2001. - Т. 378. - № 4. - С. 1-2.
12. Камынина Т.П., Беклемишев А.Б. Секреция рекомбинантного белка альфа-токсина S.aureus в культуральную среду из клеток E.coli // Тезисы докладов Второго съезда биохимического общества РАН, 19-23 мая, Россия, Пущино. — 1997.-С. 502.
13. Коренберг Э.И. Инфекции группы Лайм-боррелиоза иксодовые клещевые боррелиозы в России // Мед. паразитология и паразитар. болезни. - 1996. — № 3. -С. 14-18.
14. Коренберг Э.И., Горелова Н.Б., Постик Д., Котти Б.К. Новые для России виды боррелий — возможные возбудители иксодовых клещевых боррелиозов в России // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. 1999. —№ 2. -С. 3-5.
15. Коренберг Э.И., Крючечников В.Н., Деконенко Е.П. Серологические выявления болезни Лайма в СССР // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1986. -№ 6. - С. 111-113.
16. Коренберг Э.И., Нефедова В.В., Фадеева И.А., Горелова Н.Б. Основные итоги генотипирования боррелий в России // Журн. Бюллетень сибирской медицины. 2006. - Приложение 1. - С. 87-92.
17. Коренберг Э.И., Щербаков С.В., Крючечников В.Н. Материалы по распространению болезни Лайма в СССР // Мед. паразитология и паразитар. болезни. 1987. - № 2.-С. 71-73.
18. Кузнецов А. В., Сиденко В.П., Пономаренко А.Н. Концептуально-аналитические аспекты экологии природноочаговых болезней // Annals of Mechnicov Institute. 2008. -N. 2. - P. 5-11.
19. Куфко И.Т., Лесняк O.M., Мельников В.Г., Баранова Н.С., Рябицева О.Ф., Соколова З.И. Сравнительная клинико-лабораторная характеристика Лайм-артрита и реактивного артрита // Терапевт, архив. — 1997. — № 5. — С. 12-15.
20. Лавриненко И.А., Лавриненко В.А., Рябчзнко А.В., Беклемишев А.Б. Создание биосенсорной тест-системы для детекции повреждений ДНК путёмиспользования репортёрного белка GFP // Бюл. эксп. биол. мед. 2006. - Т. 141. -№ 1.-С. 33-35.
21. Масузава Т., Наумов Р.Л., Кудекен М., Харитоненков И.Г. Обнаружение Borrelia burgdorferi sensu stricto в Московской области, Россия. // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. — 2001. — № 2. — С. 52.
22. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. /7 Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 1984. - 480с.
23. Офицеров В.И. Лайм-боррелиоз и его диагностика // Информационный бюллетень: Новости «Вектор-Бест». 2003. -Т 28. - № 2. - С. 4-7.
24. Розанов А.С., Загребельный С.Н., Беклемишев А.Б. Клонирование гена ксилозо(глюкозо)изомеразы Escherichia coli К12 и изучение каталитических свойств продукта его экспрессии // Прикладная биохимия и микробиология. -2009.-Т. 45. -№ 1.-С. 38-44.
25. Фоменко Н.В., Мельникова О.В., Черноусова Н.Я., Епихина Т.И. Выявление антител к боррелиям комплекса Borrelia burgdorferi sensu lato // Бюллетень сибирской медицины. 2008. - Прил. 1. - С. 78-84.
26. Aberer Е. Lyme borreliosis an update // .JDDG. - 2007. - № 5. - P. 406-413.
27. Alekseev A.N., Dubinina H.V., van de Pol I., Schouls L. Identification of Ehrlichia spp. and Borrelia burgdorferi in Ixodes ticks in the Baltic regions of Russia // J. Clin. Microbiol. 2001. - V. 39. - P. 2237-2242.
28. Al-Robaiy S, Knauer J, Straubinger RK. Borrelia burgdorferi organisms lacking plasmids 25 and 28-1 are internalized by human blood phagocytes at a rate identical to that of the wild-type strain // Infect. Immun. 2005. - V. 73. - P. 5547-5553.
29. Anderson J.F. Epizootiology of Lyme borreliosis // Scand. J. Infect. Dis. 1991. - V. 77.-P. 23-34.
30. Anderson J.F., Duray P.H., Magnarelli L.A. Borrelia burgdorferi and Ixodes damminii prevalence in the greater Philadelphia area. // J. Infect. Dis. 1990. - V. 161.-P. 181-182.
31. Anguita J., Hedrick M.N., Fikrig E. Adaptation of Borrelia burgdorferi in the tick and the mammalian host // FEMS Microbiol. Rev. 2003. - V. 27. - P. 493-504.
32. Arnez M., Ruzic-Sabljic E., Ahcan J., Radsel-Medvescek A., Pleterski-Rigler D., Strle F. Isolation of Borrelia burgdorferi sensu lato from blood of children with solitary erythema migrans // Pediatr. Infect. Dis. J. 2001. - V. 20. - P. 251-255.
33. Asbrink E., Hovmark A. Early and late cutaneous manifestations in Ixodes-borne borreliosis (erythema migrans borreliosis, Lyme borreliosis) // Ann. N.Y. Acad. Sci. 1988.-V. 539.-P. 4-15.
34. Baranton G., Ras N.M., Postic D. Molecular epidemiology of the aetiological agents of Lyme borreliosis // Wien. Klin. Wocheschr. 1998. - V. 110. - P. 850 - 855.
35. Baranton G., Seinost G., Theodore G., Postic D., Dykhuizen D. Distinct levels of genetic diversity of Borrelia burgdorferi are associated with different aspects of pathogenicity//Res. Microbiol.-2001.-V. 152.-P. 149-156.
36. Barbour, A. G. Isolation and cultivation of Lyme disease spirochetes // Yale J. Biol. Med. 1984. -V. 57. - P. 521-525.
37. Barbour A.G, Fish D. The biological and social phenomenon of Lyme disease // Science. 1993.-V. 260.-P. 1610-1616.
38. Batsford S., Rust C. and Neubert U. Analysis of antibody response to the outer surface protein family in Lyme borreliosis patients // The Journal of Infections Diseases. -1998. V. 178. - P. 1676-1683.
39. Berger B.W. Current aspects of Lyme disease and other Borrelia burgdorferi infections // Dermatol. Clin. 1997. - V. 15. - P. 247-255.
40. Bergstrom S., Bundoc V.G. and Barbour A.G. Molecular analysis of linear plasmid-encoded major surface proteins, ospA and ospB, of Lyme-disease spirochete Borrelia burgdorferi // Molecular Microbilogy. 1989. - V. 4. - P. 479-486.
41. Berland R., Fikrig E., Rahn D., Hardin J. and FlaVell R. Molecular characterization of the humoral response to the 41-kilodalton flagellar antigen of Borrelia burgdorferi, the Lyme disease agent // Infection and Immunity. 1991. — V. 59. — P. 3531-3535.
42. Brettschneider S., Bruckbauer H., Klugbauer N., Hofmann H. Diagnostic value of PCR for detection of Borrelia burgdorferi in skin biopsy and urine samples from patients with skin borreliosis // J. Clin. Microbiol. 1998. - V. 36. - P. 2658-2665.
43. Bruckbauer H., Preac-Mursic V., Fuchs R., Wilske B. Cross-reactive proteins of Borrelia burgdorferi II Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1992. - V. 11. - P. 224232.
44. Bunkis J., Luke C. J., Bunikiene E., Bergstrom S., Barbour A.G. A surface-exposed region of a novel outer membrane protein (p66) of Borrelia spp. is a variable in size and sequence//Journal of Bacteriology. 1998.-V. 180. -P. 1618-1623.
45. Bunkis J., Olsen В., Westman G. and Bergstrum S. Variable serum immunoglobulin responses against different Borrelia burgdorferi sensu lato species in population at risk for patients with Lyme disease // J. Clin. Microbiol. 1995. - V. 33. - P. 14731478.
46. Bunkis J., Rosier D., Munchhoff P. and Wilske B. Molecular polymorphism of Lyme disease agent Borrelia garinii in northern Europe is influenced by noVel enzootic Borrelia focus in North Atlantic // J. Clin. Microbiol. 1996. - V. 34 . - P. 364-368.
47. Burgdorfer W., Barbur A.G., Hayes S.F., Benach J.L., Grunwaldt E., Davis J.P. Lyme disease-a tick-borne spirochetosis? // Science. 1982. - V. 216. - P. 1317 — 1319.
48. Cabello F.C., Godfrey H.P., Newman S.A. Hidden in plain sight: Borrelia burgdorferi and the extracellular matrix // Trends Microbiol. 2007. - V. 15. - P. 350-354.
49. Carriero M.M., Laux D.C., Nelson D.R. Characterization of the heat shock response and identification of heat shock protein antigens of Borrelia burgdorferi И Infect. Immun. 1990. - V. 58. - P. 2186-2191.
50. Casati S., Bernasconi M.V., Gern L., Piffaretti J.C. Diversity within Borrelia burgdorferi sensu lato genospecies in Switzerland by recA gene sequence // FEMS Microbiol. Lett. 2004. - V. 238. -P. 115-123.
51. Cassatt D.R., Patel N.K., Ulbrandt N.D., Hanson M.S. DbpA, but not OspA, is expressed by Borrelia burgdorferi during spirochetemia and is a target for protective antibodies // Infect. Immun. 1998. - V. 66. - P. 5379-5387.
52. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Recommendations for test performance and interpretation from the Second National Conference on Serologic Diagnosis of Lyme Disease // MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 1995. - V. 44 -P. 590-591.
53. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction // Anal. Biochem. 1987. -V. 162.-P. 156-159.
54. Coleman J.L., Gebbia J.A., Piesman J., Degen J.L., Bugge Т.Н., Benach J.L. Plasminogen is required for efficient dissemination of Borrelia burgdorferi in ticks and for enhancement of spirochetemia in mice // Cell. 1997. - V. 89. - P. 11111119.
55. Coleman J.L., Roemer E.J., Benach J.L. Plasmin-coated Borrelia burgdorferi degrades soluble and insoluble components of the mammalian extracellular matrix // Infect. Immun. 1999. - V. 67. - P. 3929-3936.
56. Coleman J.L., Rogers R.C., Rosa P.A., Benach J.L. Variation in the ospB gene of Borrelia burgdorferi result in differences in monoclonal antibody reactivity and in production of escape Variants // Inf. Immunity. 1994. - V. 62. - P. 303-307.
57. Chao L.L., Wu W.J., Shih C.M. First detection and molecular identification of Borrelia burgdorferi-like spirochetes in Ixodes granulatus ticks collected on Kinmen Island of Taiwan // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2009. - V. 80. - P. 389-394.
58. Coburn J., Cugini C. Targeted mutation of the outer membrane protein P66 disrupts attachment of the Lyme disease agent, Borrelia burgdorferi, to integrin alphavbeta3 // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. - V. 100. - P. 7301-7306.
59. Coburn J., Fischer J.R., Leong J.M. Solving a sticky problem: new genetic approaches to host cell adhesion by the Lyme disease spirochete // Mol. Microbiol. -2005.-V. 57.-P. 1182-1195.
60. Coburn J., Magoun L., Bodary S.C., Leong J.M. Integrins a vP 3 and a 5p 1 mediate attachment of Lyme disease spirochetes to human cells // Infect. Immun. — 1998. — V. 66.-P. 1946-1952.
61. Crippa M., Rais O., Gern L. Investigations on the mode and dynamics of transmission and infectivity of Borrelia burgdorferi sensu s trie to and Borrelia afzelii in Ixodes ricinus ticks // Vector Borne Zoonotic Dis. 2002. - V. 2. - P. 3-9.
62. Cutler SJ., Moss J., Fukunaga M., Wright D.J., Fekade D., Warrell D. Borrelia recurrentis characterization and comparison with relapsing-fever, Lyme-associated, and other Borrelia spp II Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. - V. 47. - P. 958-968.
63. Derdakova M., Lencakova D. Association of genetic variability within the Borrelia burgdorferi sensu lato with the ecology, epidemiology of Lyme borreliosis in Europe // Ann. Agric. Environ. Med. 2005. - V. 12. - P. 165-172.
64. Dressier F., Ackermann R., Steere A.C. Antibody responses to the three genomic groups of Borrelia burgdorferi in European Lyme borreliosis // J. Infect. Dis. 1994. -V. 169. — P. 313-318.
65. Dumler J.S. Molecular methods for ehrlichiosis and Lyme disease // Clin. Lab. Med. 2003. - V. 23. - P. 867-884.
66. Dunn J.J., Buchstein S.R., Butler L.L., Fisenne S., Polin D.S., Lade B.N., Luft B.J. // Complete nucleotide sequence of a Circular plasmid from the Lyme disease spirochete, Borrelia burgdorferi // J. Bacteriol. 1994. - V. 176. - P. 2706-2717.
67. Eiffert H., Ohlenbusch A., Christen H.J., Thomssen R., Spielman A., Matuschka F.R. Nondifferentiation between Lyme disease spirochetes from vector ticks and human cerebrospinal fluid // J. Infect. Dis. 1995. - V. 171. - P. 476-479.
68. Eiffert H., Karsten A., Thomssen R., Christen HJ. Characterization of Borrelia burgdorferi strains in Lyme arthritis // Scand. J. Infect. Dis. 1998. - V. 30. - P. 265-268.
69. Embers M.E., Ramamoorthy R., Philipp M.T. Survival strategies of Borrelia burgdorferi, the etiologic agent of Lyme disease // Microbes Infect. 2004. - V. 6. -P. 312-318.
70. Fikrig E., Berland R., Chen M., Williams S., Sigal L.H., Flavell R.A. Serologic response to the Borrelia burgdorferi flagellin demonstrates an epitope common to a neuroblastoma cell line//PNAS. 1993. - V. 90.-P. 183-187.
71. Fikrig E., Feng W., Barthold S. W., Telford S.R., Flavell R.A. Arthopod- and host-specific Borrelia burgdorferi bbk32 expression and inhibition of spirochete transmission // J. Immunol. 2000. - V. 164. - P. 5344-5351.
72. Fischer J.R., LeBlanc K.T., Leong J.M. Fibronectin binding protein BBK32 of the Lyme disease spirochete promotes bacterial attachment to glycosaminoglycans // Infect. Immun. -2006. V. 74. - P. 435-441.
73. Fuchs H., Simon M.M., Wallich R., Bechtel M., Kramer M.D. Borrelia burgdorferi induces secretion of pro-urokinase-type plasminogen activator by human monocytes // Infect. Immun. 1996. - V. 64. - P. 4307-^1312.
74. Fukunaga M., Hamase A. Outer surface protein С gene sequence analysis of Borrelia burgdorferi sensu lato isolates from Japan I I J. Clin. Microbiol. 1995. — V. 33. - P. 2415-2420.
75. Ge Y. and Charon N.W. FlaA, a putative flagellar outer sheath protein, is not an immunodominant antigen associated with Lyme disease // Infect. Immun. — 1997. -V. 65.-P. 2992-2995.
76. Ge Y., Li C., Corum L., Slaughter C.A., Charon N.W. Structure and expression of the flaA periplasmic flagellar protein of Borrelia burgdorferi // Journal of Bacteriology. -1998. -V. 180.-P. 2418-2425.
77. Georgilis K., Steere A.C., Klempner M.S. Infectivity of Borrelia burgdorferi correlates with resistance to elimination by phagocytic cells // J. Infect. Dis. — 1991. — V. 163.-P. 150-155.
78. Gern L., Estrada-Pena A., Frandsen F., Gray J.S., Jaenson T.G., Jongejan F., Kahl O., Korenberg E., Mehl R., Nuttall P.A. European reservoir hosts of Borrelia burgdorferi sensu lato // Zentralbl. Bakteriol. 1998. -V. 28. - P. 196-204.
79. Gern L., Ни C.M., Kocinova E., Vyrostekova V., Rehacek J. Genetic diversity of Borrelia burgdorferi sensu lato isolates obtained from Ixodes ricinus ticks collected in Slovakia // Eur. J. Epidemiol. 1999. - V. 15. - P. 665-669.
80. Gern L., Rais O. Efficient transmission of Borrelia burgdorferi between со feeding Ixodes ricinus ticks (Acari: Ixodidae) // J. Med. Entomol. — 1996. — V. 33. — P. 189-192.
81. Gorbacheva V.Y., Godrey H.P., Cabello F.C. Analysis of bmp gene family in Borrelia burgdorferi sensy lato // Journal of Bacteriology. 2000. - V. 182. - P. 20372042.
82. Giambartolomei G.H., Dennis V.A., Philipp M.T. Borrelia burgdorferi stimulates the production of interleukin-10 in peripheral blood mononuclear cells from uninfected humans and rhesus monkeys // Infect. Immun. 1998. - V. 66. - P. 26912697.
83. Gilbert M.A., Morton E.A., Bundle S.F., Samuels D.S. Artificial regulation of ospC expression in Borrelia burgdorferi II Mol. Microbiol. 2007. - V. 63. - P. 1259-1273.
84. Gorelova N.B., Korenberg E.I., Postik D., Iunicheva lu.V., Riabova Т.Е. The first isolation of Borrelia burgdorferi sensu stricto in Russia // Zh. Mikrobiol. Epidemiol. Immunobiol. -2001. Vol. 4. - P. 10-12.
85. Guo B.P., Brown E.L., Dorward D.W., Rosenberg L.C., Hook M. Decorin-binding adhesins from Borrelia burgdorferi II Mol. Microbiol. 1998. — V. 30. - P. 711-723.
86. Guo B.P., Norris S.J., Rosenberg L.C., Hook M. Adherence of Borrelia burgdorferi to the proteoglycan decorin // Infect. Immun. 1995. - V. 63. - P. 346772.
87. Hanincova K. Ecological aspects of Borrelia burgdorferi sensu lato // PhD Thesis. Institute of Zoology, Slovak Academy of Sciences, Bratislava. 2002.
88. Hanincova K., Schafer S.M., Etti S., Sewll H.S., Taragel'ova V., Ziak D., Labuda M., Kurtenbach K. Association of Borrelia afzelii with rodents in Europe // Parasitology. 2003. - V. 126. - P. 11-20.
89. Hanincova K., Taragel'ova V., Koci J., Schafer S.M., Hails R., Ullmann A.J., Piesman J., Labuda M., Kurtenbach K. Association of Borrelia garinii and B.valaisiana with songbirds in Slovakia // Appl. Environ. Microbiol. 2003. - V. 69. -P. 2825-2830.
90. Hansen K., Asbrink E. Serodiagnosis of erythema migrans and acrodermatitis chronica atrophicans by the Borrelia burgdorferi flagellum enzyme-linked immunosorbent assay // J. Clin. Microbiol. 1989. - V. 27. - P. 545-551.
91. Hansen K., Hindersson P., Pedersen N.S. Measurement of antibodies to the Borrelia burgdorferi flagellum improves serodiagnosis in Lyme disease // J. Clin. Microbiol. 1988. - V. 26. - P. 338-346.
92. Hauser U., Lehnert G., Wilske B. Validity of interpretation criteria for standardized Western blots (immunoblots) for serodiagnosis of Lyme borreliosis based on sera collected throughout Europe // J. Clin. Microbiol. 1999. - V. 37. — P. 2241-2247.
93. Heikkila Т., Seppala I., Saxen H., Panelius J., Peltomaa M., Julin Т., Carlsson S.T., Lahdenne P. Recombinant BBK32 protein in serodiagnosis of early and late Lyme borreliosis // J. Clin. Microbiol. 2002. - V. 40. - P. 1174-1180.
94. Hengge U.R., Tannapfel A., Tyring S.K., Erbel R., Arendt G., Ruzicka T. Lyme borreliosis // Lancet. Infect. Dis. 2003. - V. 3. - P. 489-500.
95. Schwan T.G., Piesman J., Golde W.T., Dolan M.C., Rosa P.A. Induction of an outer surface protein on Borrelia burgdorferi during tick feeding // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995.-V. 92.-P. 2909-2913.
96. Hirschfeld M., Kirschning C.J., Schwandner R., Wesche H., Weis J.H., Wooten R.M., Weis J.J. Cutting edge: inflammatory signaling by Borrelia burgdorferi lipoproteins is mediated by Toll-like receptor 2 // J. Immunol. 1999. - V. 163. — P. 2382-2386.
97. Hofmann H. Lyme borreliosis Cutaneous manifestation // Hautarzt. — 2005. — V. 56.-P. 783-796.
98. Hoppa E., Bachur R. Lyme disease update // Curr. Opin. Pediatr. 2007. — V.19. - P. 275-280
99. Hubalek Z., Halouzka J. Distribution of Borrelia burgdorferi sensu lato genomic groups in Europe, a review // Eur. J. Epidemiol. 1997. - V. 13. - P. 951-957.
100. Humair P.F., Gern L. The wild hidden face of Lyme borreliosis in Europe // Microbes. Infect. 2000. - V. 2. - P. 915-922.
101. Indest K.J., Philipp M.T. DNA-Binding proteins possibly involved in regulation of the post-logarithmic-phase expression of lipoprotein P35 in Borrelia burgdorferi // J. Bacteriol. 2000. - V. 182 - P. 522-525.
102. Johnson S.E., Klein G.C., Schmid G.P., Bowen G.S., Feeley J.C., Schulze T. Lyme disease: a selective medium for isolation of the suspected etiological agent, a spirochete//J. Clin. Microbiol. 1984. - V. 19.-P. 81-82.
103. Johnson R.C., Schmid G.P., Hyde F.W., Steigerwalt A.G., Berenner D.J. Borrelia burgdorferi sp. nov.: etiologic agent of Lyme disease //Int. J. Syst. Bacteriol. 1984. - V. 34. - P. 496-497.
104. Kampen H., Rotzel D.C., Kurtenbach K., Maier W.A., Seitz H.M. Substantial rise in the prevalence of Lyme borreliosis spirochetes in a region of western Germany over a 10-year period // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - V. 70. - P. 1576-1582.
105. Korenberg E.I., GorelovaN.B., Kovalevsky Yu.V. Ecology of Borrelia burgdorferi sensu lato in Russia // Lyme Borreliosis Epidemiology and Control. Oxford.-2002.-P. 175-200.
106. Kosik-Bogacka D., Kuzna-Grygiel W., Bukowska K. The prevalence of spirochete Borrelia burgdorferi sensu lato in ticks Ixodes ricinus and mosquitoes
107. Aedes spp. within a selected recreational area in the city of Szczecin // Ann. Agric. Environ. Med. 2004. - V. 11. - P. 105-108.
108. Kostrzynska M., Leung K.T., Lee H., Trevors J.T. Green fluorescent protein-based biosensor for detecting SOS-inducing activity of genotoxic compounds // J. Microbiol. Methods. 2002. - V. 48. - P. 43-51.
109. Kraiczy P., Skerka C., Kirschfink M., Zipfel P.F., Brade V. Immune evasion of Borrelia burgdorferi: insufficient killing of the pathogens by complement and antibody//Int. J. Med. Microbiol. -2002. -V. 291. Suppl. 33. - P. 141-146.
110. Kraiczy P., Wurzner R. Complement escape of human pathogenic bacteria by acquisition of complement regulators // Mol. Immunol. 2006. - V. 43. - P. 31^44.
111. Kurtenbach K., De Michelis S., Etti S., Schafer S.M., Sewell H.S., Brade V., Kraiczy P. Host association of Borrelia burgdorferi sensu lato the key role of host complement // Trends. Microbiol. - 2002. - V. 10. - P. 74-79.
112. Kuhlow С J., Garcia-Monco J.C., Coleman J.L., Benach J.L. Murine microglia are effective phagocytes for Borrelia burgdorfer i II J. Neuroimmunol. 2005. — V. 168. -P. 183-187.
113. Labuda M., Jones L.D., Williams Т., Nuttall P.A. Enhancement of tick-borne encephalitis virus transmission by tick salivary gland extracts // Med. Vet. Entomol. — 1993a.-V. 2.-P. 193-196.
114. Labuda M., Nuttal P.A., Kozuch O., Elekova E., Williams Т., Zuffova E., Sabo A. Non-viraemic transmission of tick-borne encephalitis virus: a mechanism for arbovirus survival in nature // Experientia. — 1993. -V. 49. P. 802-805.
115. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature. 1970. - V. 227. - P. 680-685.
116. Lazarus J.J., Meadows M.J., Lintner R.E., Wooten R.M. IL-10 deficiency promotes increased Borrelia burgdorferi clearance predominantly through enhanced innate immune responses // J. Immunol. 2006. - V. 177. - P. 7076-7085.
117. Liang F.T., Brown E.L., Wang Т., Iozzo R.V., Fikrig E. Protective niche for Borrelia burgdorferi to evade humoral immunity П Am. J. Pathol. 2004. - V. 165. — P. 977-985.
118. Liang F.T., Jacobs M.B., Bowers L.C., Philipp M.T. An immune evasion mechanism for spirochetal persistence in Lyme borreliosis // J. Exp. Med. — 2002. — V. 195.-P. 415-422.
119. Livey I., Gibbs C.P., Schuster R., Dorner F. Evidence for lateral transfer and recombination in OspC variation in Lyme disease Borrelia // Mol. Microbiol. — 1995. -V. 18.-P. 257-269.
120. Lowry O.H., Rosebrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. Protein measurement with the Folinphenol reagent//J. Biol. Chem. 1951. - V. 193.-P. 265-275.
121. Ltinemann J.D., Krause A. Heterogeneity of Borrelia burgdorferi: etiopathogenetic relevance and clinical implications // Z. Rheumatol. — 2003. V. 62. -P. 148-154.
122. Lyme disease: United States, 2001-2002 / Centers for Disease Control and Prevention (CDC) // MMWR. Morb. Mortal. Wkly. Rep. 2004. - V. 53. - P. 365369.
123. Magnarelli L.A., Miller J.N., Anderson J.F., Riviere G.R. Cross-reactivity of nonspecific treponemal antibody in serologic tests for Lyme disease // J. Clin. Microbiol. 1990. - V. 28. - P. 1276-1279.
124. Masuzawa T. Terrestrial distribution of the Lyme borreliosis agent Borrelia burgdorferi sensu lato in East Asia // Jpn. J. Infect. Dis. 2004. — V. 57. — P. 229235.
125. Masuzawa Т., Wilske В., Komikado Т., et al. Comparison of ospA for Borrelia burgdorferi sensu lato fron Japan, Europe and North America // Microbiological Immunology. 1996. - V. 40. - P. 539-545.
126. Montgomery R.R., Lusitani D., de Boisfleury C.A., Malawista S.E. Human phagocytic cells in the early innate immune response to Borrelia burgdorferi И J. Infect. Dis.-2002.-V. 185. -P.1773-1779.
127. Morrison T.B., Weis J.H., Weis J.J. Borrelia burgdorferi outer surface protein A (OspA) activates and primes human neutrophils // J. Immunol. 1997. - V. 158. — P. 4838-4845.
128. Nardelli D.T., Callister S.M., Schell R.F. Lyme Arthritis: Current Concepts and a Change in Paradigm // Clin. Vaccine Immunol. 2008. - V.l5. - P. 21-34.
129. Norris S.J. Antigenic variation with a twist: the Borrelia story // Mol. Microbiol. -2006.-V. 60.-P. 1319-1322.
130. Nuttall P.A., Paesen G.C., Lawrie C.H., Wang H. Vector-host interactions in disease transmission // J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2000. - V. 2. - P. 381-386.
131. Obonyo M., Munderloh U.G., Fingerle V., Wilske В., Kurtti T.J. Borrelia burgdorferi in tick cell culture modulates expression of outer surface proteins A and С in response to temperature // J. Clin. Microbiol. 1999. - V. 37. - P. 2137-2141.
132. Ohnishi J., Piesman J., de Silva A.M. Antigenic and genetic heterogeneity of Borrelia burgdorferi populations transmitted by ticks // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2001.-V. 98.-P. 670-675.
133. Olsen В., Duffy D.C., Jaenson T.G., Gylfe A., Bonnedahl J., Bergstrom S. Transhemispheric exchange of Lyme disease spirochetes by seabirds // J. Clin. Microbiol. 1995. - V. 33. - P. 3270-3274.
134. Oschmann P., Kaiser R. Clinical cymptoms. / In: Lyme borreliosis and tick-borne encephalitis. Ed. Oschmann P, Kraiczy P, Halperin J, Brade V. (Hrsg). // I. Auflage-Bremen. UNI-MED. 1999. - P. 57 - 66.
135. Pachner A.R., Dail D., Bai Y., Sondey M., Рак L., Narayan K., Cadavid D. Genotype determines phenotype in experimental Lyme borreliosis // Ann. Neurol. — 2004.-V. 56.-P. 361-370.
136. Padula S.J., Sampiere A., Dias F., Szczepanski A., Ryan R.W. Molecular characterization and expres.s.ion of p23 (ospC) from a north american strain of Borrelia burgdorferi //Inf. and Immun. 1993. -V. 61. - P. 5097-5105.
137. Pal U., Yang X., Chen M., Bockenstedt L.K., Anderson J.F., Flavell R.A., Norgard M.V., Fikrig E. OspC facilitates Borrelia burgdorferi invasion of Ixodes scapularis salivary glands // J. Clin. Invest. 2004. - V. 113. - P. 220-230.
138. Pal U., Wang P., Bao F., Yang X., Samanta S., Schoen R., Wormser G.P., Schwartz I., Fikrig E. Borrelia burgdorferi basic membrane proteins A and В participate in the genesis of Lyme arthritis // J. Exp. Med. 2008. - V. 205. - P. 133141.
139. Panelius J., Lahdenne P., Heikkila Т., Peltomaa M., Oksi J., Seppala I. Recombinant OspC from Borrelia burgdorferi sensu stricto, B.afzelii and B.garinii in the serodiagnosis of Lyme borreliosis // J. Med. Microbiol. 2002. - V. 51. — P. 731— 739.
140. Parveen N., Leong J.M. Identification of a candidate glycosaminoglycan-binding adhesin of the Lyme disease spirochete Borrelia burgdorferi II Mol. Microbiol. -2000.-V. 35.-P. 1220-1234.
141. Pechova J., Stepanova G., Kovar L., Kopecky J. Tick salivary gland extract-activated transmission of Borrelia afzelii spirochetes // Folia. Parasit. 2002. - V. 49. -P. 153-159.
142. Pet'ko В., Stefancikova A., Tresova G., Peterkova J., Skardova I., Prokopekova H., Cislakova L. Ixodes ricinus as a source of human and canine Lyme boreliosis infection // Slov. Vet. J. 1996. -V. 21. - P. 313-318.
143. Pfister H.W., Rupprecht T.A. Clinical aspects of neuroborreliosis and post-Lyme disease syndrome in adult patients // Int. J. Med. Microbiol. 2006. - V. 9. - P. 1116.
144. Piesman J., Dolan M.C., Happ C.M., Luft B.J., Rooney S.E., Mather T.N., Golde W.T. Duration of immunity to reinfection with tick-transmitted Borrelia burgdorferi in naturally infected mice // Infect. Immun. 1997. - V. 65. - P. 4043-4047.
145. Postic D., Korenberg E., Gorelova N., Kovalevski Y.V., Bellenger E., Baranton G. Borrelia burgdorferi sensu lato in Russia and neighbouring countries: high incedence of mixed isolates // Res. Microbiol. 1997. - V. 148. - P. 691-702.
146. Preac-Mursic V., Wilske В., Reinhardt S. Culture of Borrelia burgdorferi on six solid media // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1991. - V. 10. - P. 1076-1079.
147. Probert W.S., Johnson B.J.B. Identification of a 47kDa fibronectin-binding protein expressed by Borrelia burgdorferi isolate B31 // Mol. Microbiol. 1998. - V. 30.-P. 1003-1015.
148. Purser J.E., Norris S. Correlation between plasmid content and infectivity in Borrelia burgdorferi // PNAS. 2000. - V. 97. - P. 13865-13870.
149. Randolph S.E., Gern L., Nuttall P.A. Co-feeding ticks: epidemiological significance for tick-borne pathogen transmission // Parasitol. Today. 1996. - V. 12. - P. 472-479.
150. Rasiah C., Schiltz E., Reighert J. and Vogt. A. Purification and characterization of trypsic peptide of Borrelia burgdorferi flagellin, which reduced cross-reactivity in immunoblots and ELISA // J. Gen. Microbiol. 1992. - V. 138. - P. 147-154.
151. Rauer S., Spohn N., Rasiah C., Neubert U., Vogt A. Enzyme-linked immunosorbent as.s.ay using recombinant ospC and internal 14-kDa flagellin fragment for serodiagnosis of early Lyme disease // J. Clinical Microbiology. -1998. -V. 36.-P. 857-861.
152. Robertson J., Guy E., Andrews N. A European multicenter study of immunoblotting in serodiagnosis of Lyme borreliosis // J. Clin. Microbiol. 2000. -V. 38.-P. 2097-2102.
153. Roessler D., Hauser U., Wilske B. Heterogeneity of BmpA (P39) among European isolates of Borrelia burgdorferi sensu lato and influence of interspecies variability on serodiagnosis // J. Clin. Microbiol. 1997. - V. 35 - P. 2752-2758.
154. Rupprecht ТА., Kirschning C.J., Рорр В., Kastenbauer S., Fingerle V., Pfister H.W., Koedel U. Borrelia garinii induces CXCL13 production in human monocytes through TLR2 // Infect. Immun. 2007. - V. 75. - P. 4351-4356.
155. Rupprecht T.A., Koedel U., Fingerle V., Pfister H.W. The Pathogenesis of Lyme Neuroborreliosis: From Infection to Inflammation // Mol. Med. 2008. - V. 14. - P. 205-212.
156. Rosa P.A. Microbiology of Borrelia burgdorferi II Semin. Neurol. 1997. - V. 17.-P. 5-10.
157. Sadziene A., Barbour A. Experimental immunization against Lyme Borreliosis with recombinant Osp proteins: an overview // Infection. 1996. - V. 24. - P. 195202.
158. Schmidt B.L. PCR in laboratory diagnosis of human Borrelia burgdorferi infections // Clin. Microbiol. Rev. 1997. - V. 10. - P. 185-201.
159. Schwan T.G., Piesman J. Temporal changes in outer surface proteins A and С of the Lyme disease-associated spirochete, Borrelia burgdorferi, during the chain of infection in ticks and mice // J. Clin. Microbiol. 2000. - V. 38. - P. 382-388.
160. Singh S.K., Girschick H.J. Lyme borreliosis: from infection to autoimmunity // Clin. Microbiol. Infect. 2004. - V. 10. - P. 598-614.
161. Stanek G., Strle F. Lyme borreliosis // Lancet. 2003. - V. 362. - P. 1639-1647.
162. Steere A.C., Malawista S.E., Smydman D.R., Shope R.E., Andiman W.A., Ross M.R., Steele F.M. Lyme arthritis: an epidemic of oligoarticular arthritis in children and adults in three Connecticut communities // Arthr. Pheum. 1977. - V. 20. - P. 717.
163. Steere A.C. Lyme disease //N. Engl. J. Med. 1989. -V. 321. - P. 586-596.
164. Steere A.C. Lyme disease // N. Engl. J. Med. 2001. - V. 345. - P. 115-125.
165. Steere A.C. Lyme borreliosis in 2005, 30 years after initial observations in Lyme Connecticut // Wien. Klin. Wochenschr. 2006. - V. 118. - P. 625-633.
166. Steere A.C., Dhar A., Hernandez J., Fischer P.A., Sikand V.K., Schoen R.T., Nowakowski J., McHugh G., Persing D.H. Systemic symptoms without erythema migrans as the presenting picture of early Lyme disease // Am. J. Med. — 2003. — V. 114.-P. 58-62.
167. Steere A.C., Glickstein L. Elucidation of Lyme arthritis // Nat. Rev. Immunol. -2004.-V. 4.-P. 143-152.
168. Steere A.C., Coburn J., Glickstein L. The emergence of Lyme disease // J. Clin. Invest.-2004.-V. 113.-P. 1093-1101.
169. Steere A.C., Klitz W., Drouin E.E., Falk B.A., Kwok W.W., Nepom G.T., Baxter-Lowe L.A. Antibiotic-refractory Lyme arthritis is associated with HLA-DR molecules that bind a Borrelia burgdorferi peptide // J. Exp. Med. 2006. - V. 203. -P. 961-971.
170. Strle F. Principles of the diagnosis and antibiotic treatment of Lyme borreliosis // Wien. Klin. Wochenschr. 1999. - V. 111. - P. 911-915.
171. Suhonen J., Komi J., Soukka J., Lassila O., Viljanen M.K. Interaction between Borrelia burgdorferi and immature human dendritic cells // Scand. J. Immunol. -2003.-V. 58.-P. 67-75.
172. Swanson S.J., Neitzel D., Reed K.D., Belongia E.A. Coinfections acquired from ixodes ticks // Clin. Microbiol. Rev. 2006. - V. 19. - P. 708-727.
173. Tilly K., Bestor A., Jewett M.W., Rosa P. Rapid clearance of Lyme disease spirochetes lacking OspC from skin // Infect. Immun. 2007. - V. 75. - P. 1517— 1519.
174. Wang G., van Dam A.P., Schwartz I., Dankert J. Molecular typing of Borrelia burgdorferi sensu lato: taxonomic, epidemiological, and clinical implications // J. Clin. Microbiol. 1999. -V. 12. - P. 633-653.
175. Wang G., van Dam A.P., Dankert J. Phenotypic and genetic characterization of a novel Borrelia burgdorferi sensu lato isolate from a patient with Lyme borreliosis // J. Clin. Microbiol. 1999a. - V. 37. - P. 3025-3028.
176. Wang I.N., Dykhuezen D.E., Qiu W., Dunn J.J., Bosler E.M., Luft B.J. Genetic diversity of ospC in local population of Borrelia burgdorferi sensu stricto // Genetics. -1999c.- V. 151.- P. 15-30.
177. Weber K. Aspects of Lyme borreliosis in Europe // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.-2001.-V. 20.-P. 6-13.
178. Wilske В., Preac-Mursic V., Schierz G. Kuhbeck R., Barbour A.G., Kramer M. Antigenic variability of Borrelia burgdorferi II Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988. — V. 539.-P. 126-143.
179. Wilske В., Busch U., Fingerle V., Jauris-Heipke S., Preac Mursic V., Rossler D., Will G. Immunological and molecular variability of ospA and ospC . Implication for Borrelia vaccine development // Infection. 1996. - V. 24. - P. 208-212.
180. Wilske В., Fingerle V., Schulte-Spechtel U. Microbiological and serological diagnosis of Lymeborreliosis // FEMS. Immunol. Med. Microbiol. 2007. - V. 49. -P. 13-21.
181. Wittenbrink M.M., Reuter C., Manz M.L., Krauss H. Primary culture of Borrelia burgdorferi from Ixodes ricinus ticks // Zentralbl. Bakteriol. 1996. - V. 285. - P. 20-28.
182. Wodecka В., Skotarczak B. First isolation of Borrelia lusitaniae DNA from Ixodes ricinus ticks in Poland // Scand. J. Infect. Dis. 2005. - V. 37. - P. 27-34.
183. Wormser G.P., McKenna D., Carlin J., Nadelman R.B., Cavaliere L.F., Holmgren D., Byrne D.W., Nowakowski J. Brief communication: hematogenous dissemination in early Lyme disease // Ann. Intern. Med. 2005. - V. 142. - P. 751-755.
184. Zambrano M.C., Beklemisheva A.A., Bryksin A.V., Newman S.A., Cabello F.C. Borrelia burgdorferi binds to, invades, and colonizes native type I collagen lattices // Infect. Immun. 2004. - V. 72. - P. 3138-3146.
185. Zhou J. and Blair D. F. Residues of the cytoplasmic domain of motA essential for torque generation in the bacterial flagellar motor // Journal Molecular Biology. -1997.-V. 273.-P. 428-439.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.