Получение, детекция и характеристика некультивируемых клеток бактерий тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Пахомов, Юрий Дмитриевич
- Специальность ВАК РФ03.02.03
- Количество страниц 142
Оглавление диссертации кандидат наук Пахомов, Юрий Дмитриевич
Оглавление
Введение
Глава 1. Обзор литературы
1.1 Понятие и виды покоя, его роль в жизненном цикле бактериальной клетки
1.2 Общие свойства клеточных форм переживания неблагоприятных условий
1.3 Теории, объясняющие жизнеспособное, но некультивируемое состояние микроорганизмов
1.4 Образование и свойства некультивируемых форм микроорганизмов
1.5 Специализированные анабиотические покоящиеся формы микроорганизмов
1.6 Покоящиеся формы неспорообразующих бактерий
1.7 Условия образования и структура цистоподобных покоящихся клеток неспорообразующих микроорганизмов
1.8 Регуляция образования цистоподобных покоящихся клеток аутоиндукторами анабиоза
1.9 Фенотипическая вариабельность в популяции микроорганизмов и ее роль в поддержании гомеостаза популяции
1.10 Связь покоящегося состояния и фенотипической диссоциации
1.11 Выход микроорганизмов из состояния покоя
1.12 Детекция некультивируемых форм микроорганизмов
Заключение к литературному обзору
Экспериментальная часть
Глава 2 Материалы и методы
2.1 Штаммы, питательные среды, реагенты и биологические препараты
2.2 Выращивание микроорганизмов для получения некультивируемых форм
2.3 Количественное определение общей численности бактерий, жизнеспособных клеток, колониеобразующих единиц, оптической плотности
суспензий
2.4 Определение активности низина
2.5 Процедуры, использованные для реанимации некультивируемых форм микроорганизмов
2.6 Статистическая обработка результатов
Глава 3. Получение некультивируемых клеток условно патогенных и
сапротрофных микроорганизмов
Глава 4. Получение некультивируемых клеток Lactococcus lactis ssp. lactis, характеристика их жизнеспособности и бактериоцинпродуцирующей активности
4.1 Получение некультивируемых форм и изучение динамики сохранения жизнеспособности лактококков
4.2 Низинпродуцирующая активность популяции лактококков в условиях стресса
Глава 5. Обнаружение некультивируемых клеток бактерий в коммерческих пробиотических препаратах
5.1 Изучение жизнеспособности пробиотических бактерий в коммерческих препаратах
5.2 Сравнительный анализ определения жизнеспособности клеток в пробиотических препаратах методами люминесцентной микроскопии и проточной цитометрии
Глава 6. Поиск факторов, способствующих переходу некультивируемых
клеток в вегетативное состояние
Заключение
Выводы
Список использованной литературы
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК
Покоящиеся формы неспорообразующих бактерий: свойства, разнообразие, диагностика2010 год, доктор биологических наук Мулюкин, Андрей Львович
Особенности биохимии и физиологии покоящихся микобактерий2021 год, доктор наук Шлеева Маргарита Олеговна
Роль системы токсин-антитоксин vapBC в формировании состояния покоя Mycobacterium smegmatis2014 год, кандидат наук Демидёнок, Оксана Игоревна
Покоящиеся формы бактерий рода Mycobacterium: получение, биохимические факторы реактивации2004 год, кандидат биологических наук Шлеева, Маргарита Олеговна
Реактивация гетеротрофных бактерий микробных сообществ мерзлых подпочвенных отложений и погребенных почв2013 год, кандидат биологических наук Кряжевских, Наталья Александровна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Получение, детекция и характеристика некультивируемых клеток бактерий»
Введение
Актуальность проблемы. Известно, что в неблагоприятных условиях естественной или искусственной среды обитания (исчерпание источников питания и энергии, неоптимальные уровни температурного воздействия, аэрации, влияние химических веществ, токсинов органической природы и т.д.) неспоро-образующие микроорганизмы подвергаются стрессу, результатом которого является образование клетками некультивируемых и покоящихся форм (Романова Ю.М., Гинцбург А.Л., 1993; Литвин В.Ю. и др., 1998; Oliver J.D. 1995; 2010; Mukamolova G.V. et al., 1998; Бухарин O.B. и др., 2005; Ganesan В. et al., 2007; Lahtinen S.J. et al., 2008; Мулюкин А.Л., 2010b; Романова Ю.М., 2010; Hoefman S. et al., 2012; Ушакова H.A. и др. 2012). При этом, выходя из пролиферативно-го цикла, клетки сохраняют потенциальную возможность вернуться к активному росту и размножению. За таким состоянием обратимой потери культивируемое™ закрепился термин «жизнеспособное, но некультивируемое» (viable but поп culturable - VBNC) (Oliver J.D. 1995; 2005; 2010) (ЖНС). Выявление микроорганизмов, находящихся в некультивируемом состоянии (НС), в окружающей среде, организме человека и животных, в пищевых продуктах и др. является важным направлением микробиологических исследований. Некоторые микроорганизмы образуют некультивируемые формы (НФ) только под воздействием специфического комплекса стрессов. Каждый из них или их последовательное действие обусловливает принципиально другие результаты (Chen S.Y. et al., 2008, Lai С J. et al.,2009).
Некультивируемое состояние разделяют по степени его глубины. Так, при некоторых стрессовых воздействиях метаболизм тормозится, но его можно выявить, или он полностью прекращается. Например, в стационарной фазе в условиях пролиферативного покоя клетка сохраняет метаболическую активность (Бухарин О.В. и др., 2005). При другом виде покоя происходит постепенное торможение обменных процессов (Бухарин О.В. и др., 2005, 2010, Мулюкин А.Л., 20106). При аметаболизме (анабиоз, криптобиоз, абиоз) (Sussman A.S.,
НаКюгеоп Н.О., 1966) обменные процессы в клетке прекращаются. Однако метаболизм при благоприятных условиях может быть восстановлен.
Некультивируемые и покоящиеся клетки обладают повышенной устойчивостью к действию поражающих факторов. Такие клетки не теряют генетических особенностей микроорганизмов, обеспечивая сохранение вида при длительных стрессах. Однако при реверсии покоящихся форм к метаболической активности реализуется только тот клеточный вариант (серотип, клон и т.д.), который оказался наиболее адаптированным к изменившимся условиям его пребывания. Сохранение свойства жизнеспособности и возможность возврата к состоянию активного деления может исчисляться миллионами лет (Бухарин О.В. и др., 2005). Однако существует предположение, что образование некуль-тивируемых форм и потеря способности формировать колонии - это этап отмирания культуры (КуБ^бт Т. 2001). Следует отметить, что клетки, не способные образовать колонии на стандартных питательных средах, часто обнаруживают при микроскопировании структурную целостность.
В зависимости от факторов, индуцирующих переход в состояние покоя, его классифицируют как эндогенный и экзогенный вид покоя (Зшзтап А.8., На1у0ГБ0п Н.О. 1966). Эндогенный покой является частью естественного цикла и обусловлен внутренними механизмами клетки как ответ на стрессовое воздействие факторов среды обитания и является частью естественного цикла развития. К покоящимся клеткам такого типа принадлежат эндо- и экзоспоры бактерий, грибов и др. (ЗшБгпап А.Б., На1уогзоп Н.О. 1966). Экзогенный покой связан с воздействием внешних факторов, таких как: консервирование в растворах осмотически активных веществ (осмобиоз), солей, сахарозы и др., замораживание (криобиоз), обезвоживание (ангидробиоз). По нашему мнению, к этому типу покоя следует отнести лиофильное высушивание, сочетающее криобиоз и ангидробиоз, воздействие низких и высоких температур.
При изучении различных видов микроорганизмов следует также учитывать, что возможность образования некультивируемых форм и скорость этого
процесса зависят от штамма. Такие данные опубликованы в отношении Campylobacter jejuni, Escherichia coli, Lactococcus lactis и др. (Tholozan J.L. et al., 1999, Asakura H., et al., 2008 ,Ganesan B. et al., 2007). Например, для E. coli показано, что в зависимости от условий выделения и культивирования микроорганизм может приобретать или терять способность к переходу в некультивируе-мое состояние (Asakura Н., et al., 2008). Наличие у микроорганизмов некульти-вируемого состояния объясняет трудности при поиске и выделении возбудителей во время вспышек инфекционных заболеваний человека и животных с использованием культуральных методик (del Mar Lleo М. et al., 2000). Аналогичные затруднения возникают при оценке микробной загрязнённости объектов окружающей среды и пищевых продуктов. Кроме того, изучение условий образования некультивируемых форм промышленных микроорганизмов поможет лучше понять процессы созревания ферментированных продуктов питания (Ganesan В. et al., 2007, Lahtinen S.J. et al., 2008).
Поскольку известно, что колонии микроорганизмов могут формироваться более чем одной клеткой, биологическая активность препаратов, связанная с живыми бактериями (пробиотики, вакцины, БАДы), по количеству колониеоб-разующих единиц (КОЕ/мл) оказывается заниженной. Живые, но некультиви-руемые, клетки могут также существенно уменьшать количественные показатели.
Поэтому вопрос изучения жизнеспособности клеток микроорганизмов, которые могут переходить в некультивируемое состояние под действием различных стрессовых факторов, является актуальным. Новая информация о некультивируемых формах имеет также теоретическую значимость.
Цель работы
Целью исследования является выявление особенностей образования, детекции и восстановления некультивируемых клеток, малоизученных и неизученных у микроорганизмов разных таксономических групп.
Задачи исследования
1. Изучение динамики жизнеспособности и образования некультивируемых форм условно патогенных и сапротрофных микроорганизмов в условиях лимита по азоту и дисбаланса азот/углерод.
2. Получение некультивируемых клеток ЬаМососст \actis ээр. ЬсШ и характеристика бактериоцинпродуцирующей активности лактококков в условиях трофического стресса.
3. Выявление некультивируемых клеток в лиофилизированных препаратах пробиотиков.
4. Поиск факторов для восстановления некультивируемых клеток в вегетативное состояние.
Научная новизна работы
Экспериментально получены некультивируемые формы у выбранных малоизученных и неизученных по формированию некультивируемых клеток условно патогенных, сапротрофных и пробиотических микроорганизмов в условиях трофического стресса и исследована динамика жизнеспособности и колониеобразующей активности культур при длительной инкубации.
Показана сукцессионная смена периодов размножения и отмирания с формированием некультивируемых форм в течение одного года инкубации. Впервые показано влияние комплекса метаболитов лактококков, содержащихся в культуральной жидкости, на образование некультивируемых клеток.
Впервые проведены исследования по определению содержания бакте-риоцина, низина, в культуральной жидкости лактококков, перешедших в некультивируемое состояние, и оценена продуктивность штаммов, отличающаяся от уровня образования низина в оптимальных условиях. Впервые обнару-
жены некультивируемые формы в лиофилизированных препаратах пробиоти-ков.
Охарактеризован уровень жизнеспособности клеток в пробиотических препаратах различных производителей с разными сроками годности (до 30 лет после окончания срока годности).
Произведён сравнительный анализ оценки жизнеспособности бактерий с использованием люминесцентной микроскопии и проточной цитометрии, показавший высокую степень корреляции результатов.
Осуществлён поиск факторов, способствующих переходу некультиви-руемых клеток микроорганизмов в вегетативное состояние, среди которых наиболее эффективным оказался кровезаменитель Аминопептид.
Практическая значимость исследования
Разработана методика получения некультивируемых клеток лактококков в условиях углеводного голодания.
На модели лиофилизированных пробиотических препаратов апробирована методика количественного определения некультивируемых клеток в биологических препаратах, содержащих живые бактерии (вакцины, пробиотики, БАДы, посевные культуры, музейные штаммы), клиническом материале, пищевых продуктах, объектах окружающей среды.
Высокий уровень жизнеспособности бактерий, выявленный в препаратах пробиотиков, в том числе, хранившихся с превышением срока годности до 30 лет, которые содержали некультивируемые клетки, может служить основанием для производителей к рассмотрению вопроса об увеличении сроков годности препаратов, содержащих лиофильно высушенные живые бактерии.
Сравнение двух экспресс-методов учёта живых и мёртвых клеток микроорганизмов: люминесцентной микроскопии и проточной цитометрии показало равноценность их применения.
Минимальная среда, разработанная для создания форм покоя АгоэричИгип ЬгаяИете, пригодна для экспериментального получения некультивируемых
клеток условно патогенных и сапротрофных микроорганизмов, а среда Эллике-ра, рекомендуемая для выращивания лактобацилл, может использоваться для выращивания бифидобактерий. Апробация работы
Основные результаты работы были представлены на следующих конференциях:
1. Всероссийская научная конференция «Проблемы современной эпидемиологии. Перспективные средства и методы лабораторной диагностики профилактики актуальных инфекций. Санкт-Петербург, 19-20 ноября 2009.
2. Всероссийский симпозиум с международным участием «Современные проблемы физиологии экологии и биотехнологии микроорганизмов». Москва 14 декабря 2009.
3. Международная конференция «Биотехнология: экология крупных городов». Москва, 15-17 марта 2010
4. Всероссийская научно-практическая конференция «Вакцинология-2010. Совершенствование иммунобиологических средств профилактики, диагностики и лечения инфекционных болезней». Москва, 9-10 ноября 2010г.
5. Всероссийский симпозиум с международным участием «Биологически активные вещества микроорганизмов. Прошлое, настоящее, будущее». Москва, Макс-Пресс, МГУ, 27-29 января 2011г.
6. Международная конференция «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва - 21-25 марта 2011.
7. Международная научно-практическая конференция «Фармацевтические и медицинские биотехнологии». Москва, 20-22 марта 2012.
В. IV Всероссийский конгресс по инфекционным болезням. Москва, 26-28 марта 2012.
9. X съезд ВНПОЭМП «Итоги и перспективы эпидемиологического благополучия населения РФ». Москва, 12-13 апреля 2012.
10. Международная конференция «Биология - наука XXI века». Москва, 24 мая 2012.
11. 3 съезд микологов России. Москва, 9-12 октября - 2012 в
12. VII Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 19-22 - марта 2013.
13. International Yakult Symposium - London, Great Britain, April 22-23 - 2013.
14. Functional Food Conference at Kyoto University, Japan. May 11-12 -2013
15. World Forum for Nutrition Research Conference "Mediterranean Foods on Health and Disease". Reus, Spain. May 20-21, 2013.
16. Proceedings of 5th Congress of European Microbiologists - FEMS. Leipzig, Germany, July 21-25, 2013
Публикации
По результатам работы опубликовано 25 печатных работы, в том числе 8 в рецензируемых, рекомендованных ВАК журналах и в международной печати, а также 17 тезисов в изданиях российских и зарубежных конференций.
Глава 1. Обзор литературы
1.1 Понятие и виды покоя, его роль в жизненном цикле бактериальной клетки.
В цикле развития любого организма период активного роста и размножения сменяется их отсутствием (покоем) с сохранением способности вернуться в активное состояние. Такой цикл развития рассматривается как непременный показатель «живого», обеспечивая гомеостаз организма и популяции в изменяющихся условиях (Бухарин О.В. и др., 2005).
Клетки, которые, оставаясь жизнеспособными (то есть сохранившими способность вернуться к активному росту и размножению), выходят из проли-феративного цикла на неопределенный срок, называют покоящимися. Это определение подходит для организмов любой сложности. В частности, покоящиеся клетки микроорганизмов характеризуются особым физиологическим состоянием, обеспечивающим способность к переживанию условий недостатка питательных веществ и энергии, а также устойчивость к различным неблагоприятным факторам окружающей среды.
Один вид покоя - пролиферативный покой, при котором клетка сохраняет метаболическую активность, но прекращает деление. Данное состояние характерно для клеток стационарной фазы роста культуры. (Бухарин О.В. и др., 2005). Другой вид покоя связан с замедлением или полным торможением остальных обменных процессов. Покоящееся состояние можно разделить по степени глубины. У некоторых при переходе в эту фазу метаболизм тормозится, но остается на измеряемом уровне. Такое состояние называется гипометабо-лизмом и примером его может служить зимняя спячка животных. Аметаболизм (абиоз, анабиоз, криптобиоз) - состояние при котором клетка обратимо приостанавливает обменные процессы. Этот вид покоя характерен для спор микроорганизмов, семян растений, «спячки» коловраток и т.д. В зависимости от фак-
торов, вызывающих переход в состояние покоя, его разделяют на экзогенный и эндогенный. (Бухарин О.В. и др., 2005; ЭиБэтап А.Б., На1уогзоп Н.О., 1996).
Эндогенный покой регулируется внутренними механизмами клетки и является естественной реакцией организма на неблагоприятные факторы среды. Эндогенный покой - часть естественного цикла развития клетки. Примерами таких покоящихся клеток могут служить эндо- и экзоспоры, цисты бактерий, конидии актиномицетов, споры грибов (ЗизБгпап А.8., На1уогзоп Н.О., 1996).
Экзогенный покой вызывается воздействием внешних факторов, таких как: обезвоживание (ангидробиоз), замораживание (криобиоз) или консервирование в растворах осмотически активных веществ, солей или сахарозы (осмо-биоз). Методы перевода организмов в состояние экзогенного покоя составляют основу стандартных способов сохранения генетического материала и получения сухих препаратов бактерий и дрожжей.
Эндогенный покой в жизни любых организмов также важен, как и состояние активного метаболизма (Эль-Регистан Г.И. и др., 2006), поскольку прекращение процессов клеточного деления и переход клеток в покоящееся состояние влияет на численность популяции микроорганизмов и координирует рост тканей у многоклеточных. Прекращение пролиферации клеток в состоянии покоя сопряжено с их цитодифференцировкой (специализацией) в онтогенезе организмов; сохранение покоящимися клетками пролиферативного потенциала и повышенная устойчивость к повреждающим факторам обеспечивает сохранение клеток и вида в целом при неблагоприятных условиях; состояние покоя сопряжено с популяционной адаптивностью живых организмов, так как при реверсии покоящихся форм к метаболической активности, реализуется только тот вариант (серотип, клон и т.д.), который наиболее приспособлен к изменившимся условиям окружающей среды.
1.2 Общие свойства клеточных форм переживания неблагоприятных условий.
В цикле развития микробной культуры покоящиеся формы являются частью ее онтогенеза. Образование специализированных покоящихся форм, таких как споры бацилл, сопряжено с цитодифференцировкой. Это происходит под действием генетических программ, и в итоге возникают клетки, имеющие в своей структуре более глубокие различия, чем между клетками различных фаз роста. Общим свойством также является резкое снижение метаболической активности вплоть до уровня, не выявляемого экспериментально (Sussman A.S., Halvorson Н.О., 1996). Также все покоящееся формы обладают повышенной устойчивостью к действию неблагоприятных факторов окружающей среды: высокая температура, повышенная или пониженная концентрация ионов водорода, воздействие литических ферментов, спиртов, ксенобиотиков и токсичных веществ, ионизирующей радиации и др. При этом степень устойчивости варьирует в зависимости от вида и способа цитодифференцировки (Калакуцкий JI.B., Агре Н.С., 1997, Nowakowska J, Oliver J.D., 2013), а также от стратегии роста, реализуемой тем или иным микроорганизмом (Лойко Н.Г. и др., 1997). Важным свойством является также длительное (вероятно, вплоть до миллионов лет) сохранение жизнеспособности и возможности возврата в активно делящееся состояние (Бухарин О.В. и др., 2005). При переходе в покоящееся состояние клетки претерпевают те или иные структурные изменения (Бухарин О.В. и др., 2005). Особенно это заметно на примере эндоспор бацилл и клостридий. Покоящиеся формы полностью сохраняют все генетические особенности и, следовательно, являются источником биоразнообразия и неким способом приспособления к меняющимся условиям окружающей среды, так как при возврате в активное состояние выживают только те клетки, которые наиболее приспособлены к новым условиям среды.
1.3 Теории, объясняющие жизнеспособное, но некультивируемое состояние микроорганизмов.
Бактерии после деления материнской клетки одинаковы по возрасту, что не совсем верно для физического возраста их полюсов и цепей ДНК (Nyström Т., 2003) в силу равномерного распределения веществ по цитоплазме. Однако при голодании они переходят в стационарную фазу, а при длительном голодании отмирают. Фаза отмирания широко изучалась в последние 50 лет, и потеря способности к образованию колоний считалась состоянием наиболее близким к смерти (Nyström Т., 2001). Например, клетки культуры Е. coli, не способные давать колонии на стандартных средах, обнаруживают структурную целостность при микроскопировании. При некоторых условиях снова они обретают способность давать колонии (Aersten A., Michielis C.W., 2004). Такое состояние обратимой потери культивируемости в данное время и при данных условиях было названо "жизнеспособным, но некультивируемым" (viable but non-culturable -VBNC) (Kell D.B., Young M., 2000). До сих пор не ясно, является ли это состояние адаптацией к переживанию неблагоприятных условий (в течение определённых временных рамок) или же этапом отмирания культуры. На этот счет существует три точки зрения: 1) теория, согласно которой клетки, теряющие способность давать колонии, подвергаются спонтанному разрушению; 2) теория программируемой смерти клеток; 3) теория формирования VBNC клеток как механизм переживания неблагоприятных условий, сравнимый со спорообразованием и покоем у Micrococcus Intens (Mukamolova G.V. et al., 2003).
Теория спонтанной клеточной смерти. Nyström Т. (Nyström Т., 2003) обозначил это состояние как "обусловленное внешними факторами старение бактерий". У Е. coli выявлено несколько генов, активирующихся в стационарной фазе и замедляющих процесс старения. Многие из этих генов отвечают за устойчивость к тепловому и окислительному стрессам (Kolter R. et al., 1993; Hengge-Aronis R., 2002). Экспрессия этих генов по большей части связана с
S 70 т?
сигма-фактором а , хотя существуют ио -, о - и а "-зависимые гены, которые
необходимы для максимального выживания клеток Е. coli, прекративших рост. В стационарной фазе происходит координация распределения ресурсов между поддержанием роста и развития и сохранением и репарацией клеточных компонентов (Nystróm Т., 2003). Феномен координации был позднее связан с активностью гена rpoS, кодирующего gs субъединицу PIiK-полимеразы, являющуюся фактором транскрипции большинства генов устойчивости к стрессам.
S 70
Причем в экспрессии сигма-факторов а и а наблюдается антагонизм: избыточная экспрессия одного из них ведет к снижению другого (Farewell A. et al., 1998). Этот антагонизм регулируется качеством окружающей среды и нуклео-тидом ppGpp, который необходим для активации фактора as и генов, экспрес-
о
сируемых с его помощью, поскольку помогает а конкурировать за РНК поли-меразу. При этом низкий уровень ppGpp ведет к экспрессии генов, регулируемых a70, a повышенный (в ответ на ухудшение внешних условий) позволяет альтернативному о-фактору конкурировать с ростовым (Nystróm Т., 2003а). Однако существуют гены стрессового ответа, находящиеся под контролем о70, например, uspA, (Nystróm Т., Neidhardt F., 1994) и уровень их экспрессии не зависит от доступности этой субъединицы (Magnusson L. et al, 2003).
Эта модель конкуренции между субъединицами РНК-полимеразы, согласно данной теории, объясняет неспособность клеток полностью противостоять таким повреждениям, как окисление клеточных компонентов. Следует заметить, что окислению в стационарной фазе роста популяции подвергаются, в основном, белки, полученные в результате ошибочной транскрипции или трансляции. В таких белках за счет неправильного формирования вторичной и третичной структур оказываются доступными для окислителей группы наиболее подверженные окислению, которые в норме скрыты (Nystróm Т., 2001; Dukan S. et al., 2001; Nystróm Т., 2003a; Nystróm Т., 2003b). Данный тип окислительных повреждений не вызывает увеличения количества белков окислительного стресса, а отсутствие неправильно транслированных белков при наличии сверхточных рибосом не замедляет старение (Ballesteros М. et al., 2001). Исходя
из этого сделано предположение, что повышение количества окисленных белков не всегда связано с увеличением количества активных форм кислорода и эффективностью систем борьбы с ними (Dukan S. et al., 2001). Однако постепенное усиление окислительных повреждений белков компенсируется постепенным накоплением as, поскольку в rpoS мутантах оно выражено гораздо сильнее (Dukan S., Nyström Т., 1999). Все вышесказанное справедливо лишь для аэробных условий. В анаэробных культурах для Salmonella показано, что даже
с г
при отсутствии в клетках о и о' субъединиц, необходимых для подержания жизнеспособности в аэробных культурах, клетки в течение длительного времени остаются жизнеспособными, в то время как при наличии кислорода полностью теряют способность к образованию колоний уже через 24 часа (Testerman T.L. et al., 2002).
Теория программируемой клеточной смерти. Обнаружено, что в клетках присутствуют локусы, с парой генов, продукт одного из которых охарактеризован как «токсин», а второго как «антитоксин». Молекула «антитоксина» нейтрализует соответствующий «токсин» путем белок-белковых взаимодействий. Эти локусы присутствуют как на плазмидах, так и в хромосоме. Например, хромосома Е. coli несет пять таких локусов (Nyström Т., 2003b). Они стабильны, поскольку происходит селективное отмирание клеток, лишенных эпи-сом с данными генами (Gerdes К. et al., 1997). Это связано с тем, что молекула «токсина» стабильнее соответствующего «антитоксина», и, следовательно, клетка зависит от «антитоксина» (Gerdes К. et al., 1997). Предполагается, что именно эти локусы регулируют программируемую клеточную смерть, так как, например, суперпродукция «токсина» (белок MazF из пары «токсин»-«антитоксин» MazEF) вызывает значительное снижение числа КОЕ. Кроме того, повышение концентрации сигнальной молекулы ppGpp снижает уровень транскрипции mazEF оперона, что дает возможность более стабильному токсичному компоненту осуществить киллерную функцию (Nyström Т., 2003а; Nyström Т., 2003b; Aizenman Е. et al., 1996). Aizenman E. et al. (Aizenman E. et
al., 1996) предположили, что такой механизм, регулирующий смерть большей части популяции, необходим, чтобы оставшиеся имели шанс пережить неблагоприятные условия. При этом транскрипция mazEF оперона индуцируется в экспоненциальной фазе роста культуры в условиях необходимости экстренного ответа. Исходя из этого, было сделано предположение, что ТА-пары не убивают клетки, а регулируют процессы (например, репликацию или трансляцию) в клетках с заблокированными ростовыми функциями (Nystrom Т., 2003а; Nystrom Т., 2003b). Показано, что токсины MazF и RelA оказывают не киллер-ный, а бактериостатический эффект, переводя клетки в состояние, в котором они не способны давать колонии. Этот эффект полностью нейтрализуется при увеличении экспрессии соответствующих антитоксинов. В связи с этим предполагается, что «токсин»-«антитоксин» -модули существуют как резервная система глобальной регуляции клеточных процессов независимо от ppGpp (Pendersen К. et al., 2002).
Теория формирования некультивируемых клеток для переживания неблагоприятных условий. Данная теория рассматривает переход в некультивируе-мое состояние как стратегию, реализуемую микроорганизмами в ответ на неблагоприятные условия окружающей среды (например, стресс голодания, культивирование вне допустимых температурных пределов, осмотический или окислительный шок) (Curras М. et al., 2002). Это состояние сравнимо со спорообразованием (Roszak D.B., Colwell R.R., 1987а; Roszak D.B., Colwell R.R., 1987b) и покоем у Micrococcus luteus (Mukamolova G.V. et al., 2003). Как указано ранее, жизнеспособными, но некультивируемыми называются клетки, неспособные размножаться на стандартных средах, но сохраняющие структурную целостность и незначительную метаболическую активность, а после реанимации восстанавливающие способность расти, размножаться, формировать колонии. Образование некультивируемых форм показано для многих видов (Oliver J.D., 2005; 2010).
1.4 Образование и свойства некультивируемых форм микроорганизмов.
Многие патогенные и сапротрофные микроорганизмы, находясь в природных и искусственных системах (например, организм человека и животных, почва, природные водоёмы, водопровод и др.), переходят в некультивируемое состояние (НС). Это может быть вызвано различными стрессовыми факторами и в некоторых случаях является штаммоспецифичным свойством. Переходя в НС, микроорганизмы уменьшаются в размерах. Палочковидные микроорганизмы имеют тенденцию к округлению или укорачиванию. Метаболизм претерпевает серьезные изменения - снижается уровень трансмембранного транспорта, дыхания и синтеза макромолекул (Bode G. et al., 1993; Cellini L. et al., 1994; Porter J. et al., 1995; Heidelberg J. F. et al., 1997; Романова IO.M. и др., 1998; Federighi, M. et al., 1998; Tholozan J. et al., 1999; Солохина JT.B. и др., 2001; Saux, M.F.-L. et al., 2002; Николеишвили Jl.P., Подосинникова JI.C., 2004; Oliver J.D. 2005; Smith В., Oliver J.D. 2006; Aulet O. et al., 2007; Dong-Geun L. et al., 2007; Ganesan B. et al., 2007). Показано, что патогенные микроорганизмы -Vibrio cholerae, Yersinia enterocolitica, Aeromonas hydrophila, Shigella dysenteriae, энтеропатогенные штаммы E. coli и др. сохраняют активность факторов вирулентности при переходе в НС. Несмотря на неспособность к образованию колоний клетки могут синтезировать токсины, некоторые виды сохраняют способность к адгезии на клетках человека в культуре ткани с последующим возвратом в культивируемое состояние (Rahman I. et al., 1996; Signoretto, С. et al., 2002; Currés M. et al., 2002; Maalej S. et al., 2004; Vora G.J. et al., 2005; Haque M.M. et al., 2007).
Похожие диссертационные работы по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК
Биоразнообразие покоящихся форм микроорганизмов2002 год, кандидат биологических наук Дорошенко, Елена Владимировна
Анализ биотехнологического потенциала бактерий Azospirillum brasilense - природных симбионтов пшеницы, с учетом их взаимодействия с лектином растения-хозяина2015 год, кандидат наук Ханадеева, Марина Алексеевна
Транскриптомика Mycobacterium tuberculosis в состоянии покоя и подходы к инактивации покоящихся клеток2020 год, доктор наук Салина Елена Геннадьевна
Образование покоящихся форм у неспорообразующих микроорганизмов1998 год, кандидат биологических наук Мулюкин, Андрей Львович
Ассоциация Yersinia pseudotuberculosis с цианобактериями: Популяционный и ультраструктурный анализ2002 год, кандидат биологических наук Солохина, Людмила Владимировна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Пахомов, Юрий Дмитриевич, 2013 год
Список использованной литературы
1. Беспалов М.М. Функции аутоиндукторов анабиоза при создании метаболического блока в клетке. / Беспалов М.М., Колпаков А.И., Лойко Н.Г. и соавт. // Микробиология. - 2000. - Т. 69. - С. 217-223.
2. Бондаренко В.М. Дисбиозы и препараты с пробиотической функцией /В.М. Бондаренко, A.A. Воробьев // Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. - 2004. -№ 1. - С. 84-92.
3. Блинкова Л.П. Антагонистическая активность свежевыделенных штаммов бактерий рода Bacillus / Л.П. Блинкова, С.А. Семёнов, Л.Г. Бутова, Г.В. Матюша и др. // Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. - 1994-№6-С. 22-23.
4. Блинкова Л.П. Бактериоцины: критерии, классификация, свойства, методы выделения. / Л.П. Блинкова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2003. - Т 6. - С. 109-113
5. Блинкова Л.П. Молекулярные основы продукции и действия бак-териоцинов /Л.П. Блинкова, М.Л. Альтшулер, Е.С. Дорофеева, О.Б. Горобец // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - - 2007. - Т. 2 -С.97-104.
6. Бухарин О.В. Механизмы выживания бактерий. / О.В. Бухарин (и др.) // М.: Медицина. 2005. - 367 с.
7. Вахитов Т.Я. Регуляторные функции бактериальных экзометаболи-тов на внутрипопуляционном и межвидовом уровнях. Автореф. дисс. док. биол. наук: 03.00.23. / Вахитов, Тимур Яшэрович СПб, 2007, 40 с.
8. Гоголев Ю.В. Выявление и характеристика некультивируемых форм Envinia carotovora в длительно инкубируемых культурах. / Гоголев Ю.В., Горшков В.Ю., Петрова O.E., и соавт. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2009. - Т. 4. - С. 77-80.
9. Головлев Е.Л. Другое состояние неспорулирующих бактерий. / Го-ловлев Е.Л. // Микробиология. - 1998. - Т 67. - С. 725-735.
10. Грошев А.Г. Консервирование биопрепаратов высушиванием. Вак-цинно-сывороточное дело. Состояние и перспективы развития. - Московский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова; отв. ред. Б.Ф. Семёнов - М.: НИИВС им. И.И. Мечникова, 1979. 150 с. (труды Московского научно-исследовательского института им. И.И. Мечникова) с. 120 - 124.
11. Давыдова O.K. О механизмах взаимодействия ДНК с химическими аналогами микробных аутоиндукторов анабиоза. / Давыдова O.K., Дерябин Д.Г., Никиян А.Н., Эль-Регистан Г.И. // Микробиология. - 2005. - Т. 74. - С. 616-625.
12. Давыдова O.K. Длительное сохранение ДНК в водных растворах в присутствии химических аналогов микробных ауторегуляторов. / Давыдова O.K., Дерябин Д.Г., Эль-Регистан Г.И. // Микробиология. - 2006 - Т. 75. - С. 662-669.
13. Демкина Е.В. Образование покоящихся форм Arthrobacter globiformis в автолизирующихся суспензиях. / Демкина Е.В., Соина B.C., Эль-Регистан Г.И. // Микробиология. - 2000а. - Т 69. С. 383-388.
14. Демкина Е.В. Репродуктивные покоящиеся формы Arthrobacter globiformis. / Е.В. Демкина, B.C. Соина, Г.И. Эль-Регистан, Д.Г. Звягинцев // Микробиология. 20006. - Т 69. С. 377-382.
15. Дмитриев В.В. Ультраструктурные особенности природных форм микроорганизмов изолированных из грунтов вечной мерзлоты Восточной Сибири методом низкотемпературного фракционирования. / В.В. Дмитриев, Н.Е. Сузина, Т.Г. Русакова и соавт. // Доклады Академии Наук. - 2001. - Т 378. С. 846-849.
16. Дмитриев В.В. Электронно-микроскопическое изучение ультраструктуры микробных клеток in situ в экстремальных биотопах. / Дмитриев
B.В., Сузина Н.Е., Баринова Е.С., и соавт. // Микробиология. - 2004. - Т. 73. -
C. 832-840.
17. Дорошенко E.B. Характеристика диссоциантов Bacillus cereus. / E.B. Дорошенко, Н.Г Лойко, О.Н. Ильинская и соавт. // Микробиология. - 2001. -Т. 70.-С. 811-819.
18. Ильинская О.Н. Влияние аутоиндукторов анабиоза бактерий на геном микробной клетки. / О.Н. Ильинская, А.И. Колпаков, П.В. Зеленихин и соавт. // Микробиология. - 2002а. - Т. 71. - С. 194-199.
19. Ильинская О.Н. Роль бактериальных ауторегуляторов роста группы алкилоксибензолов в ответе стафилококков на стрессовые воздействия. / О.Н. Ильинская, А.И. Колпаков, М.А. Шмидт и соавт. // Микробиология. -20026.-Т. 71.-С. 23-29.
20. Калакуцкий Л.В. Развитие актиномицетов. / Л.В. Калакуцкий, Н.С. Агре. -М.: Наука, 1977. 97 с.
21. Капрельянц A.C. Структурно-функциональные изменения в бактериальных и модельных мембранах под действием фенольных липидов. / A.C. Капрельянц, М.И. Сулейменова, А.Д. Сорокина и соавт. // Биологические мембраны. - 1987.-Т 4. - С. 254-261.
22. Литвин В.Ю. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий. / В.Ю. Литвин, А.Л. Гинцбург, В.И. Пушкарева и др // М., Фармарус Принт, 1998, с. 256.
23. Литвин В.Ю. Эколого-генетические механизмы перехода Salmonella typhimurium в покоящееся состояние в окружающей среде. / Литвин В.Ю., Пушкарева В.И., Солохина и соавт. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2001. - Т 6. - С. 32-36.
24. Лойко Н.Г. Образование покоящихся форм хемолитоавтотрофных бактерий Thioalkalivibrio versutus и Thioalkalimicrobium aerophilum. II Н.Г. Лойко, B.C. Соина, Д.Ю. Сорокин и соавт. // Микробиология. - 2003. - Т. 72. - С. 328-337.
25. Милько Е.С. Гетерогенность популяции бактерий и процесс диссоциации. / Е.С. Милько, Н.С. Егоров-М.: Изд-во МГУ, 1991. 142 с.
26. Мулюкин A.JI. Образование покоящихся форм Bacillus cereus и Micrococcus luteiis. / А.Л. Мулюкин, К.А. Луста, М.Н. Грязнова и соавт. // Микробиология 1996; 65:782-789.
27. Мулюкин А.Л. Синтез аутоиндукторов анабиоза у неспорообразу-ющих бактерий как механизм регуляции их активности в почве и подпочвенных осадочных породах. / Мулюкин А.Л., Демкина Е.В., Козлова А.Н. и соавт. // Микробиология. - 2001. - Т. 70. - С. 620-628.
28. Мулюкин А.Л. Применение метода рентгеновского анализа для выявления и предварительной оценки физиологического состояния микроорганизмов в объектах окружающей среды. / А.Л. Мулюкин, В.В. Сорокин, Е.А. Воробьева и соавт. // Микробиология. - 2002а. - Т. 71. - С. 836-848.
29. Мулюкин А.Л. Сравнительное изучение элементного состава вегетативных и покоящихся клеток микроорганизмов. / А.Л. Мулюкин, В.В. Сорокин, Н.Г. Лойко и соавт. // Микробиология. - 20026. - Т. 72. - С. 37^48.
30. Мулюкин А.Л. Влияние микробных аутоиндукторов анабиоза - ал-килоксибензолов - на структурную организацию ДНК Pseudomonas aurantiaca и индукцию фенотипической диссоциации. / А.Л. Мулюкин, М.А. Вахрушев, Н.Б. Стражевская и соавт. // Микробиология. - 2005. - Т. 74. С. 157-165.
31. Мулюкин А.Л. Видонеспецифичность действия низкомолекулярных ауторегуляторов - неацилированного лактона гомосерина и гексилрезор-цина - на рост и развитие бактерий. / А.Л. Мулюкин, С.Н. Филлипова, А.Н. Козлова и соавт. // Микробиология. - 2006. - Т 75. - С. 472-482.
32. Мулюкин А.Л. структурное и физиологическое разнообразие ци-стоподобных покоящихся клеток бактерий рода Pseudomonas./ А.Л. Мулюкин, Н.Е. Сузина, В.И. Дуда, Г.И. Эль-Регистан // Микробиология. - Т. 77(4) - С512-523.
33. Мулюкин А.Л. - Покоящиеся формы Micrococcus luteus и Arthro-bacter globiformis, не прорастающие на стандартных средах. / Мулюкин А.Л.,
Дёмкина Е.В., Кряжевских Н.А., и соавт. // Микробиология. - 2009. - Т. 78(4). -С. 456^168.
34. Мулюкин A.JI. Покоящиеся формы неспорообразующих бактерий. Свойства, разнообразие, диагностика: автореф. дис. д-ра. биол наук: 03.02.03 / Мулюкин Андрей Львович; институт микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН. - М.: институт микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН. - 2010а. - 50 с.
35. Мулюкин А.Л. Внутривидовое разнообразие покоящихся форм Mycobacterium smegmatis. / Мулюкин А.Л., Кудыкина Ю.К., Шлеева М.О. и соавт. // Микробиология. - 2010b. - Т. 79(4). - С. 486-497.
36. Николеишвили Л.Р. Переход холерных вибрионов в некультиви-руемое состояние под влиянием некоторых абиотических факторов. / Л.Р. Николеишвили, Л.С. Подосинникова // Фундаментальные исследования. - 2004. -Т. 2.-С. 18-21.
37. Петров Л.Н. Регуляторные функции экзометаболитов бактерий. / Л.Н. Петров // Микробиология. - 2006. - Т. 75(4). - С. 483 - 488.
38. Пушкарева В.И. Экспериментальная оценка взаимодействий Yersinia pestis EV с почвенными инфузориями и возможности длительного сохранения бактерий в цистах простейших. / В.И. Пушкарева // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2004. - Т 4. - С. 40-44.
39. Романова Ю.М. Есть ли сходство в механизмах образования «некультивируемых форм» у грамотрицательных бактерий и спор у бацилл? / Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // Мол. генетика, микробиол., вирусол. - 1993. -Т. 6. - С. 34-37.
40. Романова Ю.М. Некультивируемое состояние у патогенных бактерий: известные и возможные факторы индукции обратимого процесса. / Ю.М. Романова, Е.В. Чегаева, А.Л. Гинцбург // Мол. генет., микробиол. и вирусол. -1998.-Т. З.-С. 3-8.
41. Романова Ю.М. Влияние фактора некроза опухолей на рост вегетативных и некультивируемых форм Salmonella. / Ю.М. Романова, Н.В. Алексеева, Т.В. Степанова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - - 2002. - Т. 4 - С. 20-25.
42. Романова Ю.М. Некультивируемые формы бактерий: феномен и способы их выявления в объектах окружающей среды. / Ю.М. Романова // Руководство по медицинской микробиологии. Ю.М. Романова. - М., 2010. - С. 37-46.
43. Светличный В.А. Органотрофный рост и синтез ауторегуляторно-го фактора у Pseudomonas carboxydoflava. / В.А. Светличный, Н.Д. Савельева, В.К. Некрасова и соавт. // Микробиология. - 1982. - Т. 51. - С. 606-610.
44. Светличный В.А. Характеристика ауторегуляторного фактора d2 вызывающего автолиз клеток Pseudomonas carboxydoflava и Bacillus cereus. /
B.А. Светличный, Г.И. Эль-Регистан, А.К. Романова, В.И. Дуда // Микробиология. - 1983. - Т. 52. -С. 33-38.
45. Солохина JI.B, Образование покоящихся форм и изменчивость Yersinia pseudotuberculosis под воздействием сине-зеленых водорослей (циа-нобактерий) и их экзометаболитов. / JI.B. Солохина, В.И. Пушкарева, В.Ю. Литвин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2001. -Т. З.-С. 17-22.
46. Сомова Л. М. Адаптивные изменения почвенных бактерий Yersinia pseudotuberculosis. / Л.М. Сомова, Л.С. Бузолева, А.С. Исаченко, Г.П. Сомов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - - 2006. - Т. 3. —
C. 36-40 .
47. Степаненко И.Ю. Роль алкилоксибензолов в адаптации Micrococcus luteus к температурному шоку. / Степаненко И.Ю., Мулюкин А.Л., Козлова А.Н., и соавт. // Микробиология. - 2005. - Т. 74. - С. 26-33.
48. Стоянова Л. Г. Выделение и идентификация новых низинобразу-ющих штаммов Lactococcus lactis subsp. lactis из молока. / Стоянова Л. Г., Суль-
тимова Т.Д., Ботина С.Г. , А.И. Нетрусов // Прикладная биохимия и микробиология. - 2006. - Т. 429(5). - С. 560-568.
49. Стоянова Л.Г. Антимикробные метаболиты молочнокислых бактерий: разнообразие и свойства (обзор). / Л.Г.Стоянова Е. А. Устюгова, А.И. Нетрусов // Прикладная биохимия и микробиология. - 2012 - Т. 48(3) С. 259-275.
50. Сузина Н.Е. Тонкая структура мумифицированных клеток микроорганизмов, образующихся под влиянием химического аналога аутоиндуктора анабиоза. / Н.Е. Сузина, А.Л. Мулюкин, Н.Г. Лойко и соавт. // Микробиология. -2001.-Т. 70.-С. 776-787.
51. Сузина Н.Е. Тонкое строение покоящихся клеток некоторых неспоро образующих бактерий. / Н.Е. Сузина, А.Л. Мулюкин, А.Н. Козлова и соавт. // Микробиология. - 2004. - Т. 73. - С. 516-529.
52. Телков М.В. Белки семейства Rpf (Resuscitation promoting factor) являются пептидогликангилролазами. / M.B. Телков, Г.Р. Демина, С.А. Волошин и соавт. // Биохимия. - 2006 - Т. 71. - С. 514-524.
53. Ушакова Н. А. Образование некультивируемых форм Lactobacillus plantarum 8R-A3 при твердофазном культивировании на пшеничных отрубях. / Н. А. Ушакова, В. М. Абрамов, В. С. Хлебников и др. // Известия РАН. Серия биологическая - 2012 - № 6 - С. 612-621.
54. Хабибуллин С.С. Ауторегуляция фенотипической диссоциации у Bacillus cereus. / С.С. Хабибуллин, Ю.А. Николаев, Н.Г. Лойко и соавт. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - - 2006. - Т. 6. - С. 913.
55. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание/ Б.А. Шендеров// Москва.2001. - Том 3. - С.288.
56. Шлеева М.О. - Образование "некультивируемых" клеток Mycobacterium tuberculosis и их оживление. / Шлеева М.О., Мукамолова Г.В., Телков М.В. и соавт. // Микробиология. - 2003. - Т. 72(1). С. 76-83.
57. Эль-Регистан Г.И. Изменение конструктивного метаболизма и ультраструктурной организации клеток Bacillus cereus под влиянием специфического ауторегуляторного фактора. / Г.И. Эль-Регистан, В.И. Дуда, А.Н. Козлова, и соавт. // Микробиология. - 1979. - Т. 48. - с. 240-244.
58. Эль-Регистан Г.И. Адаптогенные функции внеклеточных ауторе-гуляторов микроорганизмов. / Г.И. Эль-Регистан, A.JI. Мулюкин, Ю.А. Николаев, и соавт. // Микробиология. - 2006. - Т. 75. - с. 1-11.
59. Aertsen A. Stress and how bacteria cope with death and survival. / A. Aertsen, C.W. Michiels // Crit. Rev. Microbiol. - 2004. - Vol. 30(4). - P. 263-273.
60. Aertsen A. Diversify or die: Generation of diversity in response to stress. / A. Aertsen, C.W. Michiels // Crit. Rev. Microbiol. - 2005. - Vol. 31(2). - P. 69-78.
61. Aizenman E. An Escherichia coli chromosomal "addiction module" regulated by 3', 5'-bisphosphate: a model for programmed bacterial cell death. / E. Aizenman, H. Engelberg-Kulka, G. Glaser // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1996. -Vol. 93(12).-P. 6059-6063.
62. Alam M. Viable but nonculturable Vibrio cholerae 01 in biofilms in the aquatic environment and their role in cholera transmission. / M. Alam, M. Sultana, G.B.Nairetal.//PNAS.-2007.-Vol. 104(45).-P. 17801-17806.
63. Albertini M.C. Use of multiparameter analysis for Vibrio alginolyticus viable but nonculturable state determination. / M. Alam, M. Sultana, G.B. Nair et al. // Cytometry A. - 2006. -Vol. 69A(4). - P. 260-265.
64. Albertson H.N. - Starvation-induced modulations in binding protein-dependent glucose transport by the marine Vibrio sp. SI4. / Albertson H.N., Nystrom N., Kjelleberg S. // FEMS Microbiology Letters. - 2005. - Vol. 70(2). - P. 205-209.
65. Anderson R.P. Tandem duplications in phage and bacteria. / R.P. Anderson, J.R. Roth // Annu. Rev. Microbiol. - 1977. - Vol. 31. - P. 473-505.
66. Anuchin A.M. Dormant forms of Mycobacterium smegmatis with distinct morphology. / A.M. Anuchin, A.L. Mulyukin, N.E. Suzina, et al. // Microbiology. - 2009. - Vol. 155(4).-P. 1071-1079.
67. Asakura H. Role of in vivo passage on the environmental adaptation of enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7: Cross-induction of the viable but non-culturable state by osmotic and oxidative stresses. / H. Asakura, S. Igimi, K. Kawamoto et al. // FEMS Microbiology Letters. - 2005. - Vol. 253(2). - P. 243-249.
68. Asakura H. Differential expression of the outer membrane protein W (OmpW) stress response in enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7 corresponds to the viable but non-culturable state. / H. Asakura, K. Kawamoto, Y. Haishima // Research in Microbiology. - 2008. - Vol. 159(9-10). - P. 709-717
69. Aulet O. Detection of viable and viable nonculturable Vibrio cholerae Ol through cultures and immunofluorescence in the Tucuman rivers, Argentina. / O. Aulet, C. Silva, S.G. Fraga et al. // Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical. - 2007. - 40(4). - P. 385-390.
70. Awais R. A Recombinant Bacteriophage-Based Assay for the Discriminative Detection of Culturable and Viable but Nonculturable Escherichia coli 0157:H7. A106 / R. Awais, H. Fukudomi, K. Miyanaga et al. // Biotechnol. Prog. -2006. - Vol. 22(3). - P. 853-859.
71. Bakken L.R. The relationship between cell size and viability of soil bacteria. / L.R. Bakken, R.A. Olsen // Appl. Environ. Microbiol. - 1987. - Vol. 13(2). -P. 103-114.
72. Ballesteros M. Bacterial senescence: protein oxidation in non-proliferating cells is dictated by the accuracy of the ribosomes. / M. Ballesteros, Ä. Fredricsson, J. Henricsson, T. Nyström II EMBO J. - 2001. - Vol. 20. - P. 52805289.
73. Bates T.C. The viable but nonculturable state of Kanagawa positive and negative strains of Vibrio parahaemolyticus. / T.C. Bates, J.D. Oliver // J. Microbiol. - 2004. - Vol. 42(2). - P. 74-79.
74. Binsztcin N. Viable but Nonculturable Vibrio choleras 01 in the Aquatic Environment of Argentina. / N. Binsztein, M.C. Costagliola, M. Pichel, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - Vol. 70(12). - P. 7481-7486.
75. Bode G. The Coccoid Forms of Helicobacter pylori. Criteria for Their Viability. / G. Bode, F. Mauch, P. Malfertheiner // Epidemiology and Infection. -1993.-Vol. 111(3).-P. 483-490.
76. Bogosian G. Recovery of hydrogen peroxide-sensitive culturable cells of Vibrio vulnificus gives appearance of resuscitation from a viable but nonculturable state. / G. Bogosian, N.D. Aardema, E.V. Bourneuf et al. // J. Microbiol. - 2000. -Vol. 182(18).-P. 5070-5075.
77. Booth I.R. Stress in single cell: Intrapopulation diversity is a mechanism to ensure survival upon exposure to stress. / I.R. Booth // Int. J. Food Microbiol. -2002. - Vol. 78(1-2). - P. 19-30.
78. Bovill R.A. Resuscitation of'non-culturable' cells from aged cultures of Campylobacter jejuni. / R.A. Bovill, B.M. Mackey // Microbiology. - 1997. - Vol. 143(5).-P. 1575-1581.
79. Buck A. Survival of spinach-associated Helicobacter pylori in the viable but nonculturable state. / A. Buck, J.D. Oliver // Food Control - 2010 - Vol. 21 - P. 1150-1154.
80. Byrd J.J. Viable but Nonculturable Bacteria in Drinking Water. / J.J. Byrd, H-S Xu, R.R. Colwell // Appl. Environ. Microbiol. - 1991. - Vol. 57(3). - P. 875-878.
81. Cappelier J.M. Recovery in embryonated eggs of viable but nonculturable Campylobacter jejuni cells and maintenance of ability to adhere to HeLa cells after resuscitation. / J.M. Cappelier, J. Minet, C. Magras, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1999.-Vol. 65(11).-P. 5154-5157.
82. Cappelier J.M. Avirulence of viable but non-culturable Listeria monocytogenes cells demonstrated by in vitro and in vivo models. / J.M. Cappelier, V. Besnard, S.M. Roche, et al. // Vet. Res. - 2005. - Vol. 36(4). - P. 589-599.
83. Cappelier J.M. Avirulent Viable But Non Culturable cells of Listeria monocytogenes need the presence of an embryo to be recovered in egg yolk and regain virulence after recovery. / J.M. Cappelier, V. Besnard, S.M. Roche et al. // Vet. Res. - 2007. - Vol. 38(4). - P. 573-583
84. Cellini L. Coccoid Helicobacter pylori Not Culturable in Vitro Reverts in Mice. / L. Cellini, N. Allocati, D. Angelucci, et al. // Microbiol. Immunol. - 1994. -Vol. 38(11).-P. 843-850.
85. Chen S.Y. Morphological changes of Vibrio parahaemolyticus under cold and starvation stresses. / S.Y. Chen, W.N. Jane, Y.S. Chen et al. // International Journal of Food Microbiology. -2009. -Vol. 129(12).-P. 157-165.
86. Curras M. Dormancy as a survival strategy of fish pathogen Streptococcus parauberis in the marine environment. / Curras M., Maraginos B., Toranzo A.E., Romalde J.L. // Dis. Aquat. Org. - 2002. - Vol. 52. - P. 129-136.
87. Day A.P. Changes in Membrane Fatty Acid Composition during Entry of Vibrio vulnificus into the Viable But Nonculturable State. / A.P. Day, J.D. Oliver // J. Microbiol. - 2004. - Vol. 42(2). - P. 69-73.
88. del Mar Lied M. mRNA Detection by reverse transcription-PCR for monitoring viability over time in an Enterococcus faecalis viable but nonculturable population maintained in a laboratory microcosm. / M. del Mar Lleo, Pierobon S., Tafi M.C., et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66(10). - P. 4564^567.
89. Diaper J.P. The use of fluorogenic esters to detect viable bacteria by flow cytometry. / J.P. Diaper, C. Edwards // J. Appl. Bacteriol. - 1994. - Vol. 77(2). -P. 221-228.
90. Dong-Geun L. Influence of Pipe Materials and VBNC Cells on Culturable Bacteria in a Chlorinated Drinking Water Model System. / L. Dong-Geun, S.J. Park, S-J Kim. //J. Microbiol. Biotechnol. - 2007. - Vol. 17(9). - P. 1558-1562.
91. Downing K.J. Mutants of Mycobacterium tuberculosis lacking three of five rpf-Y\kQ genes are defective for growth in vivo and for resuscitation in vitro. /
K.J. Downing, V.V. Mischenko, M.O. Shleeva et al. // Infection and Immunity. -2005. - Vol. 73(5). - P. 3038-3043.
92. Du M. Retention of virulence in a viable but nonculturable Edwardsiella tarda isolate. / M. Du, J. Chen, X. Zhang et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2007. -Vol. 73(4).-P. 1349-1354.
93. Dukan S. Oxidative stress defense deterioration of growth-arrested Escherichia coli cells. / S. Dukan, T. Nystrom // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274. -P. 26027-26032.
94. El-Registan G.I. The role of low-molecular-weight autoregulatory factors (alkylhydroxybenzenes) in resistance to radiation and heat shock. / G.I. El-Registan, A.L. Mulyukin, Yu.A. Nikolaev, et al. // Advances in Space Research. -2005.-Vol. 36(9).-P. 1718-1728.
95. Farewell A. Negative regulation by RpoS: a case of sigma factor competition. / A. Farewell, K. Kvint, T. Nystrom // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29(4). -P. 1039-1052.
96. Federighi, M. Evidence of non-coccoid viable but non-culturable Campylobacter jejuni cells in microcosm water by direct viable count, CTC-DAPI double staining, and scanning electron microscopy. / M. Federighi, J.L. Tholozan, J.M. Cap-pelier et al.// Food Microbiol. - 1998. -Vol. 15(5).-P. 539-550.
97. Finkel S.E. - Long-term survival during stationary phase: evolution and the GASP phenotype. / S.E. Finkel / Nature reviews microbiology - 2006. - Vol. 4. -P. 113-120.
98. Forsman M. Francisella tularensis does not manifest virulence in viable but non-culturable state. / M. Forsman, E.W. Henningson, E. Larsson et al. // FEMS Microbiology Ecology. - 2000. - Vol. 31(3). - P. 217-224.
99. Ganesan B. Carbohydrate Starvation Causes a Metabolically Active but Nonculturable State in Lactococcus lactis. / Ganesan B., Stuart M.R., Weimer B.C. // Appl. Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73(8). - P. 2498-2512.
100. Gerdes K. Plasmid stabilization by post-seggregational killing. / K. Gerdes, J.S. Jacobsen, T. Franch // Genet. Eng. - 1997. - Vol. 19. - P. 49-61.
101. Gonzales-Pastor J.E. Cannibalism by sporulating bacteria. / J.E. Gonzales-Pastor, E.C. Hobbs, R. Losik // Science. - 2003. - Vol. 305(5362). - P. 510513.
102. Gunasekera T.S. Inducible gene expression by nonculturable bacteria in milk after pasteurization. / T.S. Gunasekera, A. Sorenen, P.V. Attfield, D.A. Veal // Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - Vol. 68(4). - P. 1988-1993.
103. Gupte A.R. Induction and resuscitation of viable but nonculturable Salmonella enterica serovar Typhimurium DTI04. / A.R. Gupte, C. L. E. de Rezende, S.W. Joseph // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - Vol. 69(11). - P. 6669-6675.
104. Haque M.M. Influence of some physicochemical stresses on the survival of Vibrio cholerae 01 at non-culturable state. / M.M. Haque, S.I. Khan, C.R Ah-san. // Bangladesh J Microbiol. - 2007. - Vol. 24. - P. 133-136.
105. Hara K. Bacterial abundance and viability in long-range transported dust. / K. Hara, D. Zhang // Atmospheric Environment - 2012 - Vol. 47 - P. 20-25
106. Heidelberg J. F. Effect of aerosolization on culturability and viability of gram-negative bacteria. / J. F. Heidelberg, M. Shahamat, M. Levin et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1997. - Vol. 63(9). - P. 3585-3588.
107. Hengge-Aronis R. Signal Transduction and Regulatory Mechanisms Involved in Control of the as (RpoS) Subunit of RNA Polymerase . / R. Hengge-Aronis // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2002. -Vol. 66(3). - P. 373-395.
108. Hirst A. Nisin / A. Hirst // Advances in Applied Microbiology - 1981 -V. 27-P. 85-123.
109. Hoefman S. Survival or Revival: long-term preservation induces a reversible viable but non-culturable state in methane-oxidizing bacteria. / S. Hoefman, K. Van Hoorde, N. Boon et al. // Plos One. - 2012. - Vol. 7(4). - P. 2-16.
110. Holmstrom K. Physiological states of individual Salmonella typhimuri-um cells monitored by in situ reverse transcription-PCR. / K. Holmstrom, T. Tolker-Nielsen, S.Molin//J. Bacteriol. - 1999.-Vol. 181(6).-P. 1733-1738.
111. Islam M.S. Use of the polymerase chain reaction and fluorescent-antibody methods for detecting viable but nonculturable Shigella dysenteriae Type 1 in laboratory microcosms. / M.S. Islam, M. K. Hasan, M. A. Miah et al., // Appl. Environ. Microbiol. - 1993. - Vol. 59(2). - P. 536-540.
112. Jensen P.R. Minimal requirements for exponential growth of Lactococ-cus lactis. / P.R. Jensen, K. Hammer // Appl. Environ. Microbiol. - 1993. - Vol. 59(12).-P. 4363^4366.
113. Juillard V. Specificity of Milk Peptide Utilization by Lactococcus lactis / V. Juillard, A. Guillot, D. Le Bars, J-C Gripon // Appl. Environ. Microbiol. - 1998. -Vol. 64(4).-P. 1230-1236
114. Kana B.D. The resuscitation-promoting factors of Mycobacterium tuberculosis are required for virulence and resuscitation from dormancy but are collectively dispensable for growth in vitro. / Kana B.D. Gordhan B.G., Downing K.J., et al. // Mol Microbiol. - 2008. - Vol. 67(3). - P. 672-684.
115. Kaprelyants A.S. Dormancy in stationary-phase cultures of Micrococcus luteus: flow cytometric analysis of starvation and resuscitation. / A.S. Kaprelyants, D.B. Kell // Appl Environ Microbiol. - 1993. - Vol. 59(10). - P. 31873196.
116. Keep N.H. Wake up! Peptidoglycan lysis and bacterial non-growth state. / N.H. Keep, J.M. Ward, M. Cohen-Gonsaud, B. Henderson // Trends Microbiol. - 2006. - Vol. 14(6). - P. 271-276.
117. Kell D.B. Bacterial dormancy and culturability: the role of autocrine growth factors. / D.B. Kell, M. Young // Curr. Opin. Microbiol. - 2000. - Vol. 3. - P. 238-243.
118. Kolter R. The stationary phase of the bacterial life cycle. / R. Kolter, D.A. Siegele, A. Tormo // Annu. Rev. Microbiol. - 1993. - Vol. 47. - P. 855-874.
119. Kong I.-S. The role of reactive oxygen species in the viable but noncul-turable state in Vibrio vulnificus. / I.S. Kong, A. Hulsmann, T.C. Bates, J.D. Oliver // FEMS Microbiol. Ecol.-2004.-Vol. 50.-P. 133-142.
120. Lai C.J. Change of protein profiles in the induction of the viable but nonculturable state of Vibrio parahaemolyticus. / C.J. Lai, S.Y. Chen, I.H. Lin et. al. // International Journal of Food Microbiology. - 2009. - Vol. 135(2). - P. 118-124.
121. Lathtinen S.J. Degradation of 16S rRNA and attributes of viability of viable but nonculturable bacteria. / S.J. Lathtinen, H. Ahokoski, J.P. Reinikainen et al. // Letters in Applied Microbiology. - 2008. - Vol. 46(6). - P. 693-698.
122. Maalej S. Maintenance of pathogenicity during entry into and resuscitation from viable but nonculturable state in Aeromonas hydrophila exposed to natural seawater at low temperature. / S. Maalej, R. Gdoura, S. Dukan et al. // Journal of Applied Microbiology. - 2004. - Vol. 97(3). - P. 557-565.
7ft
123. Magnusson L. Underproduction of o mimics a stringent response: a proteome approach. / L. Magnusson, T. Nystrom, A. Farewell // J. Biol. Chem. -
2003. - Vol. 298. - P. 968-973.
124. Makino S.-I. Does Enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7 Enter the Viable but Nonculturable State in Salted Salmon Roe? / S.-I. Makino, T. Kii, H. Asakura // Appl. Environ. Microbiol. - 2000 - Vol. 66(12) - P. 5536-5539.
125. Makinoshima H. Fractionation of Escherichia coli cell populations at different stages during growth transition to stationary phase. / H. Makinoshima, A. Nishimura, A. Ishihama // Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 43(2). - P. 269-279.
126. Masuda Y. Resuscitation of Tenacibaculum sp., the causative bacterium of spotting disease of sea urchin Strongylocentroutus intermedins from viable but non-culturable state. / Y. Masuda, K. Tajima, Y. Ezura Y. // Fisheries Science. -
2004. - Vol. 70(2). - P. 277-284.
127. McDougald D. Nonculpability: adaptation or debilitation. / D. McDougald, S.A. Rice, D. Weichart, S. Kjelleberg // FEMS Microbiol. Ecol. - 1998. -Vol. 25(1).-P. 1-9.
128. Miura M. et al. Enhancer of proliferation of lactic acid bacterium and agent for improvement of survivability of lactic acid bacterium. Patent № US 2009/0317892 USA M. Miura (et al.). Assignee: Snow brand milk products co., ltd. Pub. date 24/12/2009. - 1 Op.
129. Mizunoe Y. Restoration of culturability of starvation-stressed and low-temperature-stressed Escherichia coli 0157 cells by using H2O2 degrading compounds. / Y. Mizunoe, S.N. Wai, A. Takade, S. Yoshida // Arch. Microbiol. - 1999. -Vol. 172(1).-P. 63-67.
130. Muela A. Changes in Escherichia coli outer membrane subproteome under environmental conditions inducing the viable but nonculturable state. / A. Muela, C. Seco, E. Camafeita et al. // FEMS Microbiol Ecol. - 2008. - Vol. 64(1). -P. 28-36
131. Mukamolova G.V. A bacterial cytokine. / G.V. Mukamolova, A.S. Kaprelyants, D.L. Young et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1998a. - Vol. 95(15). -P. 8916-8921.
132. Mukamolova G.V. On resuscitation from the dormant state of Micrococcus luteus. / G.V. Mukamolova, N.D. Yasnopolskaya, D.B. Kell, A.S. Kaprelyants // Antonie van Leeuwenhoek. - 1998b. - Vol. 73(3). - P. 237-243.
133. Mukamolova G.V. Stimulation of multiplication of Micrococcus luteus by autocrine growth factor. / G.V. Mukamolova, S.S. Kormer, D.B. Kell, A.S. Kaprelyants // Arch. Microbiol. - 1999. - Vol. 172(1). - P. 9-14.
134. Mukamolova G.V. Adoption of the transiently non-culturable state a bacterial survival strategy? / G.V. Mukamolova, A.S. Kaprelyants, D.B. Kell, M. Young // Adv. Microb. Physiol. - 2003. - Vol. 47. - P. 65-129.
135. Mulyukin A.L. Diverse morphological types of dormant cells and conditions for their formation in Azospirillum brasilense. / A.L. Mulyukin, N.E. Suzina, A.Yu. Pogorelova et al. // Microbiology. - 2009. - Vol. 78(1). - P. 33^1.
136. Murga R. Role of biofilms in the survival of Legionella pneumophila in a model potable-water system. / R. Murga, T.S. Forster, E. Brown et al. // Microbiology. - 2001. - Vol. 147(11). - P. 3121-3126.
137. Nowakowska J. Resistance to environmental stresses by Vibrio vulnificus. / J. Nowakowska, J.D. Oliver // FEMS Microbiology Ecology. - 2013. - Vol. 84(1).-P. 213-222.
138. Nystrom T. Expression and role of the universal stress protein. UspA, of Escherichia coli during growth arrest. / T. Nystrom, F. Neidhardt // Mol. Microbiol. -1994.-Vol. 11(3).-P. 537-544.
139. Nystrom T. Not-quite dead enough: on bacterial life, culturability, senescence, and death. / T. Nystrom // Arch. Microbiol. - 2001. - Vol. 176(3). - P. 159-164.
140. Nystrom T. Conditional senescence in bacteria: death of the immortals. / T. Nystrom // Mol. Microbiol. - 2003a. - Vol. 48(1). - P. 17-23.
141. Nystrom T. Nonculturable bacteria: programmed survival forms or cells at death's door? / T. Nystrom // BioEssays. 2003b. - Vol. 25(3). - P. 204-211.
142. Oliver J.D. The viable but nonculturable state in the human pathogen, Vibrio vulnificus. / J.D. Oliver // FEMS Microbial. Lett. - 1995. - Vol. 133(3). - P. 203-208.
143. Oliver J.D. The Viable but Nonculturable State in Bacteria / J.D. Oliver // J. Microbiol. - 2005. - Vol. 43(S). - P. 93-100.
144. Oliver J.D. Induction of Escherichia coli and Salmonella typhimurium into viable but nonculturable state following chlorination of wastewater. / J.D. Oliver M. Dagher, K. Linden // J. Water Health. - 2005. - Vol. 3. - P. 249-57.
145. Oliver J.D. Recent findings on the viable but nonculturable state in pathogenic bacteria. / J.D Oliver // FEMS Microbial Rev. - 2010. - Vol. 34(4). - P. 415^125.
146. Osborne M. Long-term Sampling Reveals the Beneficial Role of Fungi in Allergic Sensitization of Children. / M. Osborne. B.A., Bellarmine University, 2005. 56 p.
147. Pasquaroli S. Antibiotic pressure can induce the viable but non-culturable state in Staphylococcus aureus growing in biofilms / S. Pasquaroli, G. Zandri, C. Vignaroli, et al. // J. Antimicrob. Chemother. 2013. - Vol. 68(8). - P. 1812-1817
148. Pendersen K. Rapid induction and reversal of a bacteriostatic condition controlled by expression of toxins and antitoxins. / Pendersen K., Christensen S.K., Gerdes K. // Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 45(2). - P. 501-510.
149. Pommepuy M. M. Retention of Enteropathogenicity by Viable but Nonculturable Escherichia coli Exposed to Seawater and Sunlight. / M. M. Pommepuy M. Butin, A. Derrien, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62(12).-P. 4621-4626.
150. Porter J. Rapid assessment of physiological status in Escherichia coli using fluorescent probes. / J. Porter, C. Edwards, R.W. Pickup // J. Appl. Bacteriol. -1995. - Vol.79(4). - P. 399- 408.
151. Postgate J.R. - Accelerated death of Aerobacter aerogenes starved in the presence of growth -limiting substrates. / J.R. Postgate, J.R. Hunter // J . Gen. Microbiol. - 1964. - Vol. 34(3). - P. 459-473.
152. Rahman I. Potential virulence of viable but nonculturable Shigella dys-enteriae Type I. /1. Rahman, M. Shahamat, M.A. Choudhury, R.R. Colwell // Appl. Environ. Microbiol. - 1996.-Vol. 62(1).-P. 115-120.
153. Reichert-Schwillinsky F. Stress- and Growth Rate-Related Differences between Plate Count and Real-Time PCR Data during Growth of Listeria monocytogenes. / F. Reichert-Schwillinsky, C. Pin, M. Dzieciol et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2009. - Vol. 75(7). - P. 2132-2138.
154. Roszak D.B. Metabolic activity of bacterial cells enumerated by direct viable count. / D.B. Roszak, R.R. Colwell // Appl Environ Microbiol. - 1987a. - Vol. 53(12).-P. 2889-2893.
155. Roszak D.B. Survival strategies of bacteria in the natural environment. / D.B. Roszak, R.R. Colwell // Microbiol. Rev. - 19876. - Vol. 51(3). - P. 365-379.
156. Sachidanandham R. A dormancy state in nonspore-forming bacteria / R. Sachidanandham, K. Yew-Hoong Gin // Appl Microbiol Biotechnol. - 2009. -Vol. 81(5).-P. 927-941.
157. Saux, M.F.-L. Detection of cytotoxin-hemolysin mRNA in noncultura-ble populations of environmental and clinical Vibrio vulnificus strains in artificial seawater. / M.F.-L. Saux, D. Hervio-Heath, S. Loaec, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - Vol. 68(11). - P. 5641-5646.
158. Senoh M. Conversion of viable but nonculturable Vibrio cholerae to the culturable state by co-culture with eukaryotic cells. / M. Senoh, J. Ghosh-Banerjee, T. Ramamurthy, et al. // Microbiology and Immunology. - 2010. - Vol. 54(9). - P. 502-507.
159. Serebrennikov V. M. Production of diacetyl and acetoin by industrial strains of Lactococcus under various growth conditions / V. M. Serebrennikov, Yu.S. Kisrieva, N.A. Zagustina et al.// Applied biochemistry and microbiology. - 1998 -Vol. 34(3)-P. 251-254
160. Shen Y. Bacterial viability in starved and revitalized biofilms: comparison of viability staining and direct culture. / Y. Shen, S. Stojicic, M. Haapasalo // Journal of Endodontics. - 2010. - Vol. 36(11). - P. 1820-1823
161. Shleeva M. Formation and resuscitation of'non-culturable' cells oiRho-dococcus rhodochrous and Mycobacterium tuberculosis in prolonged stationary phase. / M. Shleeva, K. Bagramyan, M.V. Telkov et al. // Microbiology. - 2002. -Vol. 148(5).-P. 1581-1591.
162. Shleeva M. Formation of 'non-culturable' cells of Mycobacterium smegmatis in stationary phase in response to growth under suboptimal conditions and
their Rpf-mediated resuscitation. / M. Shleeva, G.V. Mukamolova, M. Young et al. // Microbiology. - 2004. - Vol. 150(6).-P. 1687-1697.
163. Signoretto, C. Cell wall chemical composition of Enterococcus faecalis in the viable but nonculturable state. / C. Signoretto, M. del Mar Lleó, M.C. Tafi, P. Canepari // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. V. 66(5). - P. 1953-1959.
164. Signoretto, C. Modification of the peptidoglycan of Escherichia coli in the viable but nonculturable state. / C. Signoretto, M. del Mar Lleó, P. Canepari // Curr. Microbiol. - 2002. - Vol. 44(2). - P. 125-131.
165. Smith B. In situ and in vitro gene expression by Vibrio vulnificus during entry into, persistence within, and resuscitation from the viable but nonculturable state. / B. Smith, J.D. Oliver // Appl. Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72(2). - P.
1445-1451.
166. Soina V.S. The structure of resting bacterial populations in soil and subsoil permafrost. / V.S. Soina, A.L. Mulyukin, E.V. Demkina, et al. // Astrobiology. -2004. - Vol. 4(3). - P. 345-358.
167. Steen H.B. Flow cytometry of bacteria: glimpses from the past with a view to the future./ H.B. Steen III. Microbiol. Methods - 2000 -Vol. 42(1) - P. 6574.
168. Steinert M. Resuscitation of Viable but Nonculturable Legionella pneumophila Philadelphia JR32 by Acanthamoeba castellanii. / M. Steinert, L. Emódy, R. Amann, J. Hacker // Appl. Environ. Microbiol. - 1997. - Vol. 63(5). - P. 2047-2053.
169. Strange R.E. ' Substrate- accelerated death' of Aerobacter aerogenes. / R.E. Strange, F.A. Dark // J. Gen. Microbiol. - 1965. - Vol. 39(2). - P. 215-228.
170. Su C-P. Changes of ultrastructure and stress tolerance of Vibrio para-haemolyticus upon entering viable but nonculturable state. / C-P. Su, W-N. Jane, H-C. Wong // International Journal of Food Microbiology. - 2013. - Vol. 160(3). - P. 360-366.
171. Sussman A.S. Spores. Their donnancy and germination / A.S. Sussman, H.O. Halvorson // Harper and Row, New York - 1966 - 354 P.
172. Suzina N.E. The structural bases of log-term anabiosis in non-spore-forming bacteria. / N.E. Suzina, A.L. Mulyukin, V.V. Dmitriev et al. // Advances in Space Research.-2005.-Vol. 38(6).-P. 1209-1219.
173. Testerman T.L. The alternative sigma factor sigmaE controls antioxidant defenses required for Salmonella virulence and stationary phase survival. / T.L. Testerman, A. Vazquez-Torres, Y. Xu, et al. // Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 43(3). -P. 237-242.
174. Tholozan J. L. Physiological characterization of viable-but-nonculturable Campylobacter jejuni cells. / J.L. Tholozan, J.M. Cappelier, J.P. Tissi-er, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1999. - Vol. 65(3). - P. 1110-1116.
175. Veeh R.H. Detection of Staphylococcus aureus biofilm on tampons and menses components. / R.H. Veeh, M.E. Shirtliff, J.R. Petik, et al. // J. Infect. Dis. -2003.-Vol. 188(4).-P. 519-530.
176. Vora G.J. Microarray-based detection of genetic heterogeneity, antimicrobial resistance, and the viable but nonculturable state in human pathogenic Vibrio spp. / G.J. Vora, C.E. Meador, M.M. Bird et al. // PNAS. - 2005. - Vol. 102(52). - P. 19109-19114.
177. Vulic M. - Evolutionary cheating in Escherichia coli Stationary phase cultures. / M. Vulic, R. Kolter // Genetics. - 2001. - Vol. 158(2). - P. 519-526.
178. Ying L. Differential expression of ATP-dependent RNA-helicase gene in viable but nonculturable Salmonella pullorum /L. Ying, Q.-F. Meng W.-L. Wang, X.-Y. Sun // Afr. J. Biotechnol. - 2012 - Vol. 11(11) - P. 2625-2630.
179. Whitesides M.D. Resuscitation of Vibrio vulnificus from the viable but nonculturable state. / M.D Whitesides., J.D. Oliver // Appl. Environ. Microbiol. -1997.-Vol. 63(3).-P. 1002-1005.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.