Полиморфизм генов, контролирующих скорость развития у культурных форм Brassica тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Мартынов, Виктор Викторович

• Мартынов, Виктор Викторович
• кандидат биологических наук
• 2005

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Мартынов, Виктор Викторович

Сокращения.

ВВЕДЕНИЕ.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Введение.

1.2. Строение и функции генов, принимающих участие в регуляции скорости развития растений арабидопсиса.

1.2.1. Гены, управляющие формированием и поддержанием меристем.

1.2.2. Строение и функции генов, принимающих участие в индукции цветения у арабидопсиса.

1.3. Гомологи генов скорости развития у других растений.

1.4. Гомологи генов, определяющих скорость развития у растений рода Brassica.

1.5. Патенты, основанные на использовании генов, контролирующих скорость развития растения.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Полиморфизм генов, контролирующих скорость развития у культурных форм Brassica»

Общая характеристика работы. Развитие живого организма можно рассматривать как возникновение, усложнение или редукцию различных органов и тканей и изучать этот процесс как изменения во времени методами морфологии, биохимии или молекулярной генетики.

У высших животных подавляющее большинство органов, присущих взрослому организму, формируется на стадии эмбриогенеза. Органы взрослого растения формируются уже на стадии постэмбрионального развития, и источником этих органов служат апикальная меристема побега и корня. Способность меристем постоянно продуцировать новые органы в течение всей жизни растения позволяет растительному организму гибко изменять свое строение в зависимости от условий внешней среды. Благодаря тому, что меристемы являются источником всех органов взрослого растения и способны постоянно продуцировать эти органы, их роль в развитии растительного организма очень высока. Поэтому, говоря о развитии растений вообще и о скорости развития в частности, необходимо помнить, что все эти процессы напрямую связаны с состоянием и функциональной активностью меристем.

Апикальная меристема побега (shoot apical meristem, SAM) состоит из группы стволовых клеток, которые постоянно делятся и дают начало латеральным органам. Постоянная дифференцировка стволовых клеток и превращение их в клетки латеральных органов требуют непрерывного возобновления этих клеток путем деления. Поддержание баланса между клеточными делениями и клеточной дифференцировкой служит залогом правильного функционирования SAM. На стадии вегетативного развития растения SAM дает начало фитомерам, повторяющимся структурным единицам побега. Каждый фитомер состоит, как правило, из одних и тех же элементов: узла, к которому прикрепляется лист, междоузлия и придаточной почки у основания листа, однако размеры этих элементов могут значительно варьировать в зависимости от расположения фитомера на стебле. Временной интервал между формированием отдельных фитомеров, который называют пластохроном, часто используют как показатель скорости развития (Howell, 1998). Меристемы придаточных почек по своему строению сходны с апикальной меристемой и могут служить источником боковых побегов.

В определенный момент времени растение переходит от вегетативного к репродуктивному развитию, то есть начинает продуцировать генеративные органы. Этот переход также осуществляется на уровне SAM, которая дает начало флоральным меристемам (FM). Эти меристемы отличаются от SAM тем, что в них блокируется процесс возобновления недифференцированных стволовых клеток путем деления; конечного числа этих клеток в FM достаточно только для того, чтобы сформировать органы цветка, после чего она прекращает свое существование.

Таким образом, вегетативное и репродуктивное развитие растения связано с активностью недетерминированных и детерминированных меристем (SAM и FM), а продолжительность вегетативной фазы и время перехода к цветению определяют общую скорость развития.

Процессы, связанные со скоростью развития, регулируются на генетическом уровне (Лутова и др., 2000; Howell, 1998). Избирательное «включение» одних и «выключение» других генов в определенные моменты времени обеспечивает на стадии вегетативного развития постоянство структуры SAM, а при переходе к цветению активирует формирование и дифференциацию FM. Многие гены, принимающие участие в этих процессах, были идентифицированы у модельного растения Arabidopsis thaliana и еще нескольких видов растений (рис, кукуруза, томаты и т.п.). Однако у подавляющего большинства хозяйственно ценных растений процесс идентификации генов, определяющих скорость развития, и изучение их строения и конкретного места в процессах развития находится еще в самом начале.

Большинство методов идентификации новых генов у этих растений основаны на том, что многие гены очень медленно изменяются в процессе эволюции. Такой консерватизм структуры позволяет использовать уже исследованные у других растений гены для анализа геномных библиотек или искать сходные нуклеотидные последовательности в генетических базах данных и судить о функции генов по аналогии с уже изученными генами. Такой подход получил название концепции генов-кандидатов (Хавкин, 1998). Эта концепция широко применяется и для идентификации генов развития. Однако сложность состоит в том, что фенотипические проявления скорости развития складываются в результате сложных взаимодействия многих генов друг с другом и факторами внешней среды и являются, как правило, количественными признаками. Генов-кандидатов на ключевую роль в формировании такого признака может быть несколько, и для того чтобы определить вклад конкретного гена в формирование количественного признака в определенных условиях роста растения необходимо соотнести фенотипический полиморфизм по этому признаку с^полиморф1т геномной организации. Результатом такого соотнесения является обнаружение в геноме локусов количественных признаков (quantitative trait loci, QTL). Эти локусы картируют, соответствующие QTL фрагменты генома клонируют и секвенируют, и в полученных последовательностях идентифицируют гены-кандидаты. Решающим фактором успеха такой стратегии является наличие как можно более насыщенных генетических карт, поэтому использование фрагментов предполагаемых генов-кандидатов в качестве ДНК маркеров позволяет наиболее точно картировать QTL, а в случае высокой степени косегрегации такого ДНК маркера с QTL доказать роль этого гена в формировании признака без клонирования и секвенирования.

Генетические и молекулярно-генетические исследования скорости развития культурных растений очень важны для практической селекции, поскольку с этими генами связан такой важный агрономический признак, как ранне/позднеспелость.

Цели и задачи исследования. Целью настоящей работы являлось выделение и сравнительный анализ фрагментов генома растений семейства Brassicaceae, гомологичных важнейшим генам, определяющим скорость развития у A. thaliana, и использование полученных фрагментов для изучения полиморфизма этих генов у широкого круга хозяйственно ценных форм рода Brassica, чтобы установить связь структурного полиморфизма генов с фенотипическим полиморфизмом форм Brassica по признакам скорости развития. В процессе работы предстояло решить следующие задачи:

1. выбрать гены-кандидаты, гомологичные генам, определяющим скорость развития у A. thaliana, получить эти гомологи путем прямой амплификации геномной ДНК растений Brassica методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) со специфическими праймерами и клонировать полученные фрагменты генома;

2. идентифицировать эти фрагменты генома как гомологи генов развития A. thaliana путем анализа их нуклеотидных и производных аминокислотных последовательностей;

3. сравнить полученные гомологи с уже известными генами развития цветковых растений путем компьютерного анализа с использованием генетических баз данных;

4. изучить возможность использовать полученные гомологи генов развития в качестве гибридизационных зондов в RFLP анализе;

5. провести RFLP анализ разнообразия генов развития у хозяйственно ценных форм растений рода Brassica.

6. сопоставить полиморфизм генов развития с фенотипическими проявлениями скорости развития исследуемых форм Brassica.

Научная новизна. Из растений Brassica и Camelina клонированы и охарактеризованы 13 новых гомологов генов развития A. thaliana, которые принадлежат к четырем структурным классам генов. Получены новые данные о структурном полиморфизме этих генов у растений Brassicaceae, в частности, ранее отсутствовавшие сведения о строении интронов Brassicaceae за пределами A. thaliana. Для гомологов генов CONSTANS, FLOWERING LOCUS С и LEAFY показана связь структурного полиморфизма этих генов со временем перехода растений к цветению

Практическая значимость. Доказана пригодность полученных гомологов генов развития как гибридизационных зондов для RFLP анализа в функциональных и систематических исследованиях растений рода Brassica. Показана принципиальная возможность создания на основе полученных гомологов ДНК маркеров признака ранне/позднеспелости сельскохозяйственных растений.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Мартынов, Виктор Викторович

ВЫВОДЫ

1. Методом прямой амплификации геномной ДНК В. rapa, В. napus, В. juncea и С. sativa получены фрагменты структурных гомологов генов CLAVATA1, CONSTANS-UKE1, FLOWERING LOCUS С, LEAFY, SUPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS1 и SHORT VEGETATIVE PHASE, которые определяют скорость развития у растений арабидопсиса. Сходство охарактеризованных гомологов с генами арабидопсиса составляет 81-95%.

2. Получены новые данные о структуре генов развития: впервые получены сведения о нуклеотидной последовательности гомологов гена CLV1 у растений семейства Brassicaceae за пределами арабидопсиса; у растений В. juncea был идентифицирован новый структурный гомолог гена FLC; впервые охарактеризованы интроны генов SUPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS1 и SHORT VEGETATIVE PHASE у видов Brassica и Camelina и интроны гена FLOWERING LOCUS С у В. juncea', у гомологов гена CONSTANS-LIKE1 из В. rapa был найден полиморфный микросателлитный мотив, ранее идентифицированный только у В. nigra.

3. Использование полученных фрагментов ДНК в качестве гибридизационных зондов при RPLP анализе позволило выявить мультилокусную природу гомологов исследованных генов, которая хорошо соотносится с плоидностью исследованных форм Brassica, и идентифицировать локусы, специфичные для А, В и С геномов.

4. RFLP анализ локусов генов CONSTANS-LIKE, FLOWERING LOCUS С и LEAFY у шести видов Brassica позволил связать рестрикционный полиморфизм с проявлениями фенотипического полиморфизма: временем перехода к цветению и фотопериодической реакцией растений. Такая связь открывает возможность использовать специфически гибридизующиеся фрагменты гомологов генов развития для создания ДНК маркеров ранне/позднеспелости.

5. Результаты RFLP анализа шести исследованных видов Brassica полностью соответствуют ботанической и цитогенетической классификации этих видов и могут быть использованы для решения задач молекулярной систематики рода Brassica.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Мы выделили и охарактеризовали тринадцать новых гомологов генов, принимающих участие в регуляции скорости развития растительного организма, из геномной ДНК видов В. гара, В. napus, В. juncea и С. sativa. Охарактеризованные последовательности принадлежат к четырем различным структурным классам генов. Анализируя выделенные последовательности, мы получили новые данные о структуре генов развития у растений Brassicaceae, существенно расширяют представления о полиморфизме их строения за пределами арабидопсиса. На основе этих данных в дальнейшем могут быть созданы ДНК маркеры для молекулярной селекции и генотипирования Brassica.

Мы показали, что полученные гомологи обладают способностью к Саузерн-гибридизации. Это позволяет использовать их в качестве зондов при изучении рестрикционного полиморфизма и генетическом картировании. В результате RFLP анализа была показана мультилокусная природа генов развития у Brassica, что согласуется с современными представлениями об эволюции этого рода. Выявленный рестрикционный полиморфизм обладает ярковыраженной видоспецифичностью, но в тоже время внутривидовой полиморфизм также имеет место. Идентификация разных аллелей одного гена в двух популяциях одного вида может быть связана с различными климатическими условиями, существующими в ареалах распространения этих популяций. При адаптации растения к этим условиям действие одного аллеля может играть положительную роль, а другого - отрицательную, и поэтому один аллель подхватывается отбором, в то время как другой отсекается им. В случае генов развития такое развитие событий вполне вероятно, особенно если учесть роль этих генов в регуляции времени перехода к цветению, а также то обстоятельство, что время перехода к цветению является одним из самых важных спсобов приспособления растения к условиям окружающей среды.

Данные результаты показывают пригодность полученных гомологов для целей генотипирования различных видов и форм рода Brassica с использованием RFLP анализа, и, на наш взгляд, свидетельствуют о высокой разрешающей способности RFLP анализа при использовании функционально значимых гибридизационных зондов.

По необходимости, шесть видов Brassica представлены в нашей работе ограниченными выборками генотипов. Поэтому выявленный полиморфизм генов у геномов А, В и С не исчерпывает всего разнообразия аллелей и локусов у шести видов Brassica.

Полученные данные о связи рестрикционного и фенотипического полиморфизма доказывают принципиальную возможность использования поученных нами гомологов генов развития для создания ДНК маркеров хозяйственно полезных признаков на основе RFLP анализа. Такие маркеры будут способствовать ускорению селекции, в частности, переносу перспективного материала генома В в растения рапса и капусты, а также молекулярно-систематическим исследованиям рода Brassica.

Наши данные о функции полученных гомологов были бы существенно более полными, если бы мы получили сведения о паттернах экспрессии этих генов. С этой целью мы провели анализ экспрессии генов SUPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS1, CONSTANS-LIKE1, FLOWERING LOCUS С и LEAFY методом дот гибридизации с препаратами тотальной РНК из разновозрастных растений В. гара (от 3-дневных проростков до дня перехода к цветению (10 дней)) и 14-дневных проростков озимой и яровой форм В. napus. Результаты этого эксперимента приведены в приложении 2. Мы показали наличие экспрессии указанных генов, но нам не удалось выявить ожидаемых различий в ее уровне, связанных с жизненными формами или возрастом растений. Это может быть объяснено тем, что выбранный нами метод оказался, с одной стороны, слишком чувствительным, и мы получали сигнал при «фоновом» уровне экспрессии, а с другой, не слишком избирательным, и по этой причине сигнал мог быть получен в результате гибридизации зонда с транскриптами других генов, гомологичных по структуре. Исходя из этих результатов, целесообразно в дальнейшем оптимизировать условия эксперимента для повышения специфичности данного метода.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Мартынов, Виктор Викторович, 2005 год

1. Jlymoea JI.A., Тиходеев О.Н., Тихонович И.А., Проворов Н.А., Шишкова С.О., Ходжайова Л. Т. Генетика развития растений // JI. Наука. 2000.

2. Хавкин Э.Е. Генетическая регуляция морфогенеза растений // Физиол. растений. 1998. Т. 45. С. 676-690.

3. Холл М.А., Новикова Г.В., Мошков И.Е., Дж. Мур Л.А., Смит А.Р. Протеинкиназы растений в трансдукции абиотических и биотических сигналов // Физиол. растений. 2002. Т. 49. С. 121-135.

4. Achard P., HerrA., Baulcombe D. С., Harberd N. P. Modulation of floral development by gibberellin-regulated microRNA // Development. 2004. V. 131. P. 3357-3365.

5. Ahearn K.P., Johnson H. A., Weigel D., Wagner D. R. NFL1, a Nicotiana tabacum LEAFY-Like Gene, Controls Meristem Initiation and Floral Strucure // Plant Cell Physiol. 2001. V. 42. P. 1130-1139.

6. Axelsson Т., Shavorskaya O., Lagercrantz U. Multiple flowering time QTLs within several Brassica species could be the result of duplicated copies of one ancestral gene // Genome. 2001. V. 44. P. 856-864.

7. Blazquez M.A., Soowal L. N., Lee I., Weigel D. LEAFY expression and flower initiation in Arabidopsis // Development. 1997. V. 124. P. 3835-3844.

8. Bolle C. The role of GRAS proteins in plant signal transduction and development // Planta. 2004. V. 218. P. 683-692.

9. Bomblies K., WangR-L., Ambrose В. A., Schmidt R. J., MeeleyR. В., DoebleyJ. Duplicate FLORICAULA!LEAFYhomologs zfll and zfl2 control inflorescence architecture and flower pattering in maize // Development. 2003. V. 130. P. 23852395.

10. Bommert P., Lunde C., Nardmann J., Vollbrecht E., Running M., Jackson D., Hake S., Werr W. Thick tassel dwarf encodes a putative maize ortholog of the

11. Arabidopsis CLAVATA1 leucine-rich repeat receptor-like kinase // Development. 2005. V. 132. P. 1235-1245.

12. Brill E. M., Watson J. M. Ectopic expression of a Eucalyptus grandis SVP orthologue alters the flowering time of Arabidopsis thaliana II Functional Plant Biol. 2004. V. 31. P. 217-224.

13. Carmona M-J., Ortega N., Garcia-Maroto F. Isolation and molecular characterization of a new vegetative MADS-box gene from Solanum tuberosum L. //Planta. 1998. V. 207. P. 181-188.

14. ClarkS.E. Cell signalling at the shoot meristem //Nature Rev. Mol. Cell Biol. 2001. V. 2. P. 276-284.

15. Clark S.E., Running M.P., Meyerowitz E.M. С LA VATA1, a regulator of meristem and flower development m Arabidopsis// Development. 1993. V. 119. P. 397-418.

16. ClarkS. E., WilliamsR. W., MeyerowitzE. M. The CLAVATA1 gene encodes a putative receptor kinase that controls shoot and floral meristem size in arabidopsis //Cell. 1997. V. 89. P. 575-585.

17. CoenE., Romero J., Doyle S., Elliot A., Murphy G., Carpenter R. Floricaula: a homeotic gene required for flower development in Antirrhinum majus // Cell. 1990. V. 63. P. 1311-1322.

18. DanylukJ., KaneN.A., Breton G., LiminA.E., Fowler D. В., SarhanF. TaVRT-1, a putative transcription factor associated with vegetative to reproductive transition in cereals // Plant Physiol. 2003. V. 132. P. 1849-1860.

19. DeYoung B. J., Clark S.E. Signaling through the CLAVATA1 receptor complex// Plant Mol. Biol. 2001. V. 46. P. 505-513.

20. Doonan J. Social controls on cell proliferation in plants // Curr. Opin. Plant Biol. 2000. V. 3. P. 482-487.

21. Dornelas M.C., Neves do Amaral W.A., Rodriguez A.P.M. EgLFY, the Eucalyptus grandis homolog of the Arabidopsis gene LEAFY is expressed in reproductive and vegetative tissues //Braz. J. Plant Physiol. 2004. V. 16. P. 105-114.

22. Fletcher J. C. Shoot and floral meristem maintenance in arabidopsis // Annu. Rev. Plant Biol. 2002. V. 53. P. 45-66.

23. Gale M.D., Devos KM. Plant compartive genetics after 10 years // Science. 1998. V. 282. P. 656-659.

24. Garcia-Maroto F., Carmona M-J., Garrido J-A., Vilches-Ferron M., Rodriguez-Ruiz J., Lopez Alonso D. New roles for MADS-box genes in higher plants // Biologia Plantarum. 2003. V. 46. P. 321-330.

25. Garcia-Maroto F., Ortega N., Lozano R.t Carmona M-J. Characterization of the potato MADS-box gene STMADS16 and expression analysis in tobacco transgenic plants // Plant Mol. Biol. 2000. V. 42. P. 499-513.

26. Grofi-Hardt R., Laux T. Shoots and buds // Encyclopedia of Life Sciences. Macmillan. 2001. P. 1-4.

27. Hall A. E., FiebigA., Preuss D. Beyond the arabidopsis genome: opportunities for comparative genomics // Plant Physiol. 2002. V. 129. P. 1439-1447.

28. Hartmann U., Hohmann S., Nettesheim K, WismanE., Saedler H., Huijser P. Molecular cloning of SVP: a negative regulator of the floral transition in Arabidopsis // Plant J. 2000. V. 21. P. 351-360.

29. Hayama R., Coupland G. The molecular basis of diversity in the photoperiodic flowering responses of arabidopsis and rice // Plant Physiol. 2004. V. 135. P. 677684.

30. He Y., Amasino R.M. Role of chromatin modification in flowering-time control // Trends Plant Sci. 2005. V. 10. P. 30-35.

31. Henderson I.R., Shindo C., Dean C. The need for winter in the switch to flowering//Annu. Rev. Genet. 2003. V. 37. P. 371-392.

32. Hepworth S., Valverde F., Ravenscroft D., Mouradov A., Coupland G. Antagonistic regulation of flowering-time gene SOC1 by CONSTANS and FLC via separate promoter motifs// EMBO J. 2002. V. 21. P. 4327-4337.

33. Hofer J., Turner L., Hellens R., Ambrose M., Matthews P., Michael A., Ellis N. UNIFOLIATA, regulates leaf and flower morphogenesis in pea // Curr. Biol. 1997. V. 7. P. 581-587.

34. HongR.L., Hamaguchi L., Busch M.A., Weigel D. Regulatory elements of floral homeotic gene AGAMOUS identified by phylogenetic footprinting and shadowing //Plant Cell. 2003. V. 15. P. 1296-1309.

35. Johanson U., West J., Lister C., Michaels S. D., Amasino R. M, Dean C. Molecular analysis of FRIGIDA, a major determinant of natural variation in Arabidopsis flowering time // Science. 2000. V. 290. P. 344-347.

36. Kayes J.M., Clark S.E. CLAVATA2, a regulator of meristem and organ development in Arabidopsis II Development. 1998. V. 125. P. 3843-3851.

37. Kelly A. J., Bonnlander M.B., Meeks-Wagner D.R. NFL, the tobacco homolog of FLORICAULA and LEAFY, is transcriptionally expressed in both vegetative and floral meristems // Plant Cell. 1995. V. 7. P. 225-234.

38. Kim C.H., Jeong D.H., An G.H. Molecular cloning and characterization of OsLRKl encoding a putative receptor-like protein kinase from Oryza sativa II Plant Sci. 2000. V. 152. P. 17-26.

39. Kim S-H., MizunoK, Fujimura T. Isolation of MADS-box genes from sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) expressed specifically in vegetative tissues // Plant Cell Physiol. 2002. V. 43. P. 314-322.

40. Meyerowitz E.M. Genetic control of cell division patterns in developing plants // Cell. 1997. V. 88. P. 299-308.

41. Michaels S.D., Amasino R.M. FLOWERING LOCUS С encodes a novel MADS domain protein that acts as a repressor of flowering // Plant Cell. 1999. V. 11 P. 949-956.

42. Michaels S.D., Amasino R.M. Memories of winter: vernalization and competence to flower // Plant, Cell and Environment. 2000. V. 23. P. 1145-1153.

43. Michaels S.D., Amasino R.M. Loss of FLOWERING LOCUS С activity eliminates the late-flowering phenotype of FRIGIDA and autonomous pathway mutations but not responsiveness to vernalization // Plant Cell. 2001. V. 13 P. 935-941.

44. Michaels S.D., Ditta G., Gustafson-Brown C., PelazS., Yanofsky M, Amasino R.M. AGL24 acts as promoter of flowering in Arabidopsis and is positively regulated by vernalization // Plant J. 2003 V. 33. P. 867-874.

45. Molinero-Rosales N. Jamilena M., ZuritaS., Gomez P., CapelJ., Lozano R. FALSIFLORA, the tomato orthologue of FLORICA ULA and LEAFY, controls flowering time and floral meristem identity // Plant J. 1999. V. 20. 685-693.

46. Moon J., Suh S., Lee H., Choi K., Hong С. В., Раек N., Kim S. The SOC1 MADS-box gene integrates vernalization and gibberellin signals for flowering in Arabidopsis II Plant J. 2003. V. 35. P. 613-623.

47. Mouradov A., Cremer F., Coupland G. Control of flowering time: interacting pathways as a basis for diversity // Plant Cell. 2002. Supplement. P. SI 11-S130.

48. MuraiK., Miyamae M., Kato H., TakumiS., Ogihara Y. WAP1, a weat APETALA1 homolog, plays a central role in the phase transition from vegetative to reproductive growth // Plant Cell Physiol. 2003. V. 44. P. 1255-1265.

49. Murren C.J., Pendleton N., Pigliucci M. Evolution ofphenotypic integration in Brassica (Brassicaceae) // Am. J. Bot. 2002. V. 89. P. 655-663.

50. Oh S-H., Potter D. Phylogenetic utility of the second intron of LEAFY in Neillia and Stephanandra (Rosaceae) and implications for the origin of Stephanandra II Mol. Phylogenet. Evol. 2003. V. 29. P. 203-215.

51. Oh S-H., Potter D. Molecular phylogenetic systematics and biogeography of tribe Neillieae (Rosaceae) using DNA sequences of cpDNA, rDNA, and LEAFY II Am. J. Bot. 2005. V. 92. P. 179-192.

52. Osborn T.C. The contribution of polyploidy to variation in Brassica species // Physiol. Plant. 2004. V. 121. P. 531-536.

53. Osborn T.C., Kole C., Parkin I.A.P., SharpeA.G., Kuiper M., LydiateD.J., Trick M. Comparison of flowering time genes in Brassica гара, B. napus and Arabidopsis thaliana II Genetics. 1997. V. 146. P. 1123-1129.

54. Osterberg K.M., Shavorskaya O., Lascoux M., Lagercrantz U. Naturally occurring indel variation in the Brassica nigra COL1 gene is associated with in flowering time//Genetics. 2002. V. 161. P. 299-306.

55. Pires J.C., Zhao J., Schranz M.E., Leon E.J., Quijada P.A., Lukens L.N., Osborn T.C. Flowering time divergence and genomic rearrangements in resynthesized Brassica polyploids (Brassicaceae) // Biol. J. Linn. Soc. 2004. V. 82. P. 675-688.

56. Prasad K., Kushalappa K., Vijayraghavan U. Mechanism underlying regulated expression of RFL, a conserved transcription factor, in the developing rice inflorescence//Mechanisms of Development. 2003. V. 120. P. 491-502.

57. Putterill J., Laurie R., Macknight R. It's time to flower: the genetic control of flowering time // BioEssays. V. 26 P.363-373.

58. Ratcliffe O.J., Kumimoto R.W., Wong B. J., Riechmann J.L. Analysis of the Arabidopsis MADS AFFECTING FLOWERING gene family: MAF2 prevents vernalization by short periods of cold 11 Plant Cell. 2003. V. 15. P. 1159-1169.

59. Robert L.S., RobsonF., SharpeA., LydiateD., Coupland G. Conserved structure and function of the Arabidopsis flowering time gene CONSTANS in Brassica napus I/ Plant Mol. Biol. 1998. V. 37. P. 763-772.

60. Sagai Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R.A., AllardR. W. Ribosomal DNA Spacer-Length Polymorphism in Barley: Mendelian Inheritance, Chromosomal Location, and Population Dynamics // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1984. V. 81. P. 8014—8018.

61. Sambrook, Russel Molecular cloning. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

62. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. V. 74. P. 5463-5467.

63. Schlappi M. RNA levels and activity of FLOWERING LOCUS С are modified in mixed genetic backgrounds of Arabidopsis thaliana II Int. J. Plant Sci. 2001. V. 162. P. 527-537.

64. SchoofH., LenhardM., Haecker A., Mayer K., Jurgens G., Laux T. The stem cell population of arabidopsis shoot meristems is maintained by a regulatory loop between the CLAVATA and WUSCHEL genes // Cell. 2000. V. 100. P. 635-644.

65. Schranz M.E., Osborn T.C. De novo variation in life-history traits and responses to growth conditions of resynthesized polyploids Brassica napus (Brassicaceae) // Am. J. Bot. 2004. V. 91. P. 174-183.

66. Schranz M.E., Quijada PA., SungS-B., Lukens L.N., Amasino R.M., Osborn T.C. ф Characterization and effects the replicated flowering time gene FLC in Brassicaгара II Genetics. 2002. V. 162. P. 1457-1468.

67. Scortecci K.C. Michaels S.D., Amasino R.M. Identification of a MADS-box gene, FLOWERING LOCUS M, that represses flowering II Plant J. 2001. V. 26. P. 229236.

68. Searle I.R., MenA.E., Laniya T.S., Buzas D.M., Iturbe-Ormaetxe I., Carroll B.J., GresshoffP.M. Long-distance signaling in nodulation directed by a CLAVATA 1-like receptor kinase // Science. 2003. V. 299. P. 109-112.

69. Sharma V.K., Fletcher J.C. Maintenance of Shoot and Floral Meristem Cell

70. Proliferation and Fate // Plant Physiol. 2002. V. 129. P. 31-39.

71. Shavorskaya O.A. Identification of genes affecting flowering time variation in Brassica species // PhD dissertation. 2004. Swedish University of Agricultural Sciences. Uppsala

72. Sheldon C.C., ConnA.B., Dennis E.S., Peacock W.J. Different regulatory regions are required for the vernalization-induced repression of FLOWERING LOCUS С and for the epigenetic maintenance of repression // Plant Cell. 2002. V. 14. P. 2527-2537.

73. Simpson G.G., Dean C. Arabidopsis, the ftosetta Stone of flowering time? //

74. Science. 2002. V. 296. P. 285-289.

75. Souer E., van der Krol A., Kloos D., Spelt С., BliekM., Mol J., Koes R. Genetic control of branching pattern and floral identity during Petunia inflorescence development//Development. 1998. V. 125. P. 733-742.

76. Stone J.M., TrotochaudA.E., Walker J.C., ClarkS.E. Control ofmeristem development by CLAVATA1 receptor kinase and kinase-associated phosphatase interactions // Plant Physiol. 1998. V. 117. P. 1217-1225.

77. Sung S., Amasino R. M. Vernalization and epigenetics: how plants rememberwinter // Curr. Opin. Plant Biol. 2004. V. 7. P. 4-10.

78. TadegeM., Shaldon C.C., Helliwell C.A., StoutjesdijkP., Dennis E.S., Peacock W.J. Control of flowering time by FLC orthologues in Brassica napus II Plant J. 2001. V. 28. P. 545-553.

79. Tadege M., Shaldon C.C., Helliwell C.A., Upadhyaya N.M., Dennis E.S., Peacock W.J Reciprocal control of flowering time by OsSOCl in transgenic Arabidopsis and by FLC in transgenic rice // Plant Biotech. J. 2003. V. 1. P. 361-369.

80. Taguchi-Shiobara F., Yuan Z, Hake S., Jackson D. The facsiated ear2 gene encodes a leucine-rich repeat receptor-like protein that regulates shoot meristem proliferation in maize // Genes Dev. 2001. V. 15. P. 2755-2766.

81. Trevaskis В., Bagnall D.J., Ellis M.H., Peacock W.J., Dennis E.S. MADS box genes control vernalization-induced flowering in in cereals // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. V. 100. P. 13099-13104.

82. UN. Genome analysis in Brassica with special reference to the experimental formation of B. napus and peculiar mode of fertilization // Jpn. J. Bot. 1935. V. 7. P. 389-452.

83. Van de Peer Y, de Wachter R. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the microsoft windows environment//Сотр. Appl. BioSci. 1994. V. 10. P. 569-570.

84. Waites R., Simon R. Signaling cell fate in plant meristems: three clubs on one tousle // Cell. 2000. V. 103. P. 835-838.

85. Westman A.L., Kresovich S. Simple sequence repeat (SSR)-based marker variation in Brassica nigra genebank accessions and weed populations // Euphytica. 1999. V. 109. P. 85-92.

86. Yamamoto E., Karakaya H.C., Knap H. T. Molecular characterization of two soybean homologs of Arabidopsis thaliana CLA VATA1 from the wild type and fasciation mutant // Biochim. Biophys. Acta. 2000. V. 1491. P. 333-340.

87. Yamamoto E., KnapH.T. Soybean receptor-like protein kinase genes: paralogous divergence of a gene family // Mol. Biol. Evol. 2001. V. 18. P. 1522-1531.

88. Yan L., Loukoianov A., Tranquilli G., Helguera M, Fahima Т., Dubkovsky J. Positional cloning of the weat vernalization gene VRN1II Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2003. V. 100. P. 6263-6268.

89. Yanovsky M, Kay S. Living by the calendar: how plants know when to flower // Nature Rev. Mol. Cell Biol. 2003. V. 4. P. 265-275.

90. YuK, Ito Т., Wellmer F., Meyerowitz E.M. Repression of AGAMOUS-LIKE 24 is a crucial step in promoting flower development // Nature Genet. 2004. V. 36. P. 157-161.