Первичная структура повторяющейся последовательности В2 генома мыши тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, Маркушева, Татьяна Вячеславовна

• Маркушева, Татьяна Вячеславовна
• 1983

Оглавление диссертации Маркушева, Татьяна Вячеславовна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1. Высокоповторяющиеся последовательности генома эукариот (сателлитная ДНК).

2. Умеренно повторяющиеся последовательности генома эукариот.

2а) длинные повторяющиеся последовательности.

26) короткие повторяющиеся последовательности.

3. Уникальные последовательности генома эукариот.

4. Прерывистое строение генов эукариот.

5. Транскрипция эукариотических генов.

Процессинг и сплайсинг мРНК.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

1. Клоны E.colt, содержащие рекомбинантные плазмиды ДНК.

2. Клетки.

3. Выделение рекомбинантной ДНК.

4. Обработка ДНК рестрикционными эндонуклеазами.

5. Фракционирование ДНК в агарозном и полиакриламид-ном гелях.

6. Элюция ДНК из геля.

7. Фракционирование ДНК седиментацией в градиенте сахарозы.

8. Реклонирование фрагмента клона Мм 98.

9. Картирование последовательности В2 в клонированных фрагментах генома мыши.

10. Разделение цепей ДНК электрофорезом в агарозном геле с помощью поли(и&).

11. Приготовление диазобензилоксилметил-бумаги (ДБМ-. бумаги).

12. Посадка ДНК на ДБМ-бумагу.

13. Введение метки Vi vo

14. Выделение цитоплазматической и ядерной РНК.

15. Выделение поли(А)-содержащей РНК на полиСО)-сефа-розе.

16. Гибридизация [ PJ РЖ с иммобилизованной на ДБМ-бумаге рекомбинантной ДНК.

17. Гибридизация [ 3^Р] РНК-В2 с иммобилизованными на нитроцеллкшозный фильтр цепями ДНК.

18. Определение первичной структуры ДНК.

19. Авторадиография.

20. Просчет радиоактивности в пробах.

21. Реактивы и материалы.

Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛВДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.

1. Картирование и секвенирование клонированных копий последовательности в2.

2. Первичная структура повтора В2.

3. Сравнение последовательностей BI и В2.

4. Изучение транскрипции последовательности В2 с использованием разделенных цепей ДНК.

5. Возможная биологическая роль последовательностей

BI и В2.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Первичная структура повторяющейся последовательности В2 генома мыши»

Проблема структурно-функциональной организации генетического аппарата высших организмов является одной из центральных в современной биологии. Решение отдельных вопросов этой проблемы часто составляет необходимый этап в изучении клеточной дифференцировки, морфогенеза, наследственных заболеваний, злокачественного роста, эволюционных процессов. Современные методы физико-химической биологии и генной инженерии позволяют на новом уровне исследовать молекулярную организацию отдельных генов и генома в целом. Традиционный и все возрастающий интерес представляют повторяющиеся последовательности эукариотического генома в связи с их возможным участием в регуляции генной активности и жизнедеятельности клеток и организмов. Сейчас становится очевидным, что повторяющиеся элементы у эукариот существуют в виде различных семейств гомологичных последовательностей, различающихся по своей структурной организации и функции. Так, некоторые из них рассеяны (диспергированы) по геному, а другие сгруппированы в кластеры. Известны нетранскриби-рующиеся и транскрибционно активные повторяющиеся элементы генома.

Особый интерес представляют повторяющиеся последовательности генома мыши, активно транскрибирующиеся в составе ядерных предшественников мРНК (про-мРНК), в том числе в составе ядерных двух-цепочечных РНК (дсРНК) типа А и типа В. Последние были использованы для получения клонов, содержащих повторяющиеся элементы типа А и В. Подробное изучение повторяющихся элементов типа В позволило выделить среди них два главных семейства гомологичных последовательностей генома мыши, обозначенных как BI и В2. Определение первичной структуры последовательности BI обнаружило целый ряд примечательных особенностей в ее строении. Кроме того, оказалось, что эволюционно родственный гомолог повтора BI, обозначенный как AIu -последовательность, составляет в геноме человека один из основных классов повторяющихся элементов. Эти работы в значительной мере способствовали резкому повышению интереса и к другим, еще не охарактеризованным семействам повторяющихся последовательностей.

В настоящей работе определена первичная структура трех геномных копий повторяющегося элемента В2 мыши. Длина их составляет 186-199 п.н. Определены также и прилежащие к ним последовательности. Показано, что повтор В2 содержит в своем составе: вариабельный АТ-богатый участок на одном из своих концов, последовательности, предполагаемые как промотор и терминатор транскрипции для РНК-полимера-зы Ш, ААТАААА-последовательности, аналогичные по структуре сигналам полиаденилирования генов, кодирующих белки, участки, имеющие высокую гомологию с ядерной 4,5 S PHKI, области, частично гомологичные с зонами границ между интронами и экзонами. Путем гибридизации низкомолекулярной поли(А)-содержащей В2 РНК с разделенными цепями ДНК элемента В2 показано, что она образуется путем асимметричной транскрипции и не является побочным продуктом сплайсинга про-мРНК. Анализ общих закономерностей повторяющихся элементов BI и В2 показал, что они представляют собой новый тип мобильных элементов эука-риот.

Заключение диссертации по теме «Другие cпециальности», Маркушева, Татьяна Вячеславовна

ВЫВОДЫ

1. Определена первичная структура трех копий последовательности повторяющегося элемента В2 генома мыши. Длина копий составляет 186 - 199 пар нуклеотидов.

2. Показано,что повтор В2 содержит в своем составе: а) вариабельный АТ-богатый участок на одном из концов; б) последовательности, предполагаемые как промотор и терминатор транскрипции для РНК-полимеразы III; в) ААТААА-последовательности,аналогичные по структуре сигналам полиаденилирования генов,кодирующих белки; г) участки,имеющие высокую гомологию с ядерной 4,5S РНК I.

3. Показано,что все копии повтора В2 обужены совершенными прямыми повторами, специфичными для каждой копии. На основании этого предположено,что последовательность В2 представляет собой мобильный элемент генома мыши. Анализ общих закономерностей организации повторяющихся элементов В1иВ2 позволил сделать вывод о том, они представляют собой новый тип мобильных элементов эукариот.

4. Путем гибридизаций низкомолекулярной поли (А)-содержащей В2 РНК с разделенными цепями ДНК элемента В2 показано,что она образуется путем асимметричной транскрипции и не является побочным продуктом сплайсинга про-мРНК.

БЛАГОДАРНОСТИ

Автор выражает глубокую благодарность член-корреспонденту АН СССР Георгиеву Г.П., доктору биологических наук Рыскову А.П. и кандидату биологических наук Крамерову Д.А. за предоставленную тему и повседневное руководство работой. Автор признателен кандидату биологических наук Краеву А.С., в совместной работе с которым получены отдельные результаты данной работы. Автор выражает глубокую благодарность всему коллективу сотрудников Лаборатории биосинтеза нуклеиновых кислот за доброжелательное отношение и интерес к работе.

Список литературы диссертационного исследования Маркушева, Татьяна Вячеславовна, 1983 год

1. Britten R.J., Kohne D.E. Repeated sequences in DNA. Science, 1968, v. 161, No. 3841, 529-540.

2. Eden F.C., Hendrick J.P. Unusual organization of ША sequences in the chicken. Biochemistry, 1978, v. 17, No. 26, 5838-5844.

3. Газарян К.Г., Гольцов В.А., Тарантул В.З., Кузнецова Е.Д., Попов Л .С. Размер и организация повторяющихся последовательностей в геноме голубя. Биохимия, 1982, т. 47, № I, 71-80.

4. Benz R.D., Burki H.J. The distribution of moderately repeated DNA sequences among Chinese hamster chromosomes. Exp. Cell. Res., 1978, v. 112, No. 1, 155-165.

5. Deininger P.L., Schmid C.W. A study of the evolution of repeated DNA sequences in primates and the existence of a new class of repeatitive sequence in primates. J. Mol. Biol., 1979, v. 127, No. 4, 437-460.

6. Goldberg R.B., Crain W.R., Ruderman J.V., Moore G.P., Bar-nett J.R., Higgins R.C., Gelfand K.A., Galau G.A., Britten R.J., Davidson E.H. DNA sequence organization in the genomes of five murine invertebrates. Chromosoma, 1975, v. 51, No. 3, 225-253.

7. Flavell R.B., Rinpau J., Smith D.B. Repeated sequence DNA relationships in four cereal genomes. Chromosoma, 1977, v. 63, No. 3, 205-222.

8. Cordatas J., Olofsson В., Meunier-Rotival M., Macaya G., Bernardi G. The ША components of the chicken genome. -Eur. J. Biochem., 1979, v. 99, No. 1, 179-186.

9. Salser W., Bowen S., Browne D., Adli F.E. , Fedoroff N., Pry K., Heindell H., Paddock R.P., Wallase В., Whitcome P. Investigation of the mamalian chromosomes at the DNA sequence level. Fed. Proc., 1976, v. 35, No. 4, 23-35.

10. Wu J., Manueldis L. Sequence definition and organization of a human repeated DNA. J. Mol. Biol., 1980, v. 142, No. 3, 363-386.

11. Musich P.R., Brown F.L., Maio J.J., Highly repetitive component cL and related alphoid in man and monkey. Chromosoma,1980, -v. 80, No. 3, 331-338.

12. Stephenson E.G., Erba H.P., Gall J.G. Histone gene clusters of the newt Notophtalmus are separated by long tracts of satellite ША. Cell, 1981, v. 24, No. 3, 639-647.

13. Holmquist G.P., Dancis R. Telomere replication, kinetochore organizers and satellite DNA evolution. Proc. Nat. Acad. Sci., USA, 1979, v. 76, No. 9, 4566-4570.

14. Нейфах А.А., Тимофеева М.Я. Проблемы регуляции в молекулярной биологии. М., Наука, 1978, 268-304.

15. Hatch Р.Т., Bodner A.J., Mazrimas J.А., Moore D.H. Satellite DNA and cytogenetic evolution DNA quantity, satellite DNA and karyotypic variations in kangaroo rats (Genus Dipodomys). Chromosoma, 1976, v. 58, No. 2, ;155-168.

16. Wobus U., Baumlein R., Panitz K., Serfling E., Kafatos P.O. Periodicities and tandem repeats in a Balbiani ring gene.- Cell, 1980, v. 22, No. 1, 127-135.

17. Kedes L.H. Histone genes and histone messenger. Ann. Rev. Biochem., 1979, v. 48, 837-870.

18. Fedoroff N.V. On spacers. Cell, 1979, v. 16, No. 4, 697710.29* Long E.O., Dawid I.B. Repeated genes in eucaryotes. Ann. Rev. Biochem., 1980, v. 49, 727-764.

19. Selker E.V., Yanofsky G., Driftmier K., Metzenberg R.L., Alzner«De Werd В., Raj-Bhandary H.L. Dispersed 5S RNA genes in N.crassa: structure, expression and evolution. Cell, 1981, v. 24, No. 3, 819-828.

20. Busslinger M., Portmann R., Birnstiel M.L. A regulatory sequence near the З'-end of sea urlihin histone genes. Nucl. Acids Res., 1979» v. 6, No. 9, 2997-3008.

21. Heintz N., Zernik M., Roeder R.G. The structure of the human histone genes: clustered but not tandemly repeated. Cell, 1981, v. 24, No. 3, 661-668.kpt»

22. Page G.S., Hall B.D. Characterization of the yeast tRNAg gene family: genomic organization and DNA sequence. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, No. 4, 921-934.

23. Daildson E.H., Hough B.K., Amenson C.S. , Britten R.J. General interspersion of repetitive with non-repetitive sequence elements in the DNA of Xenopus. J. Mol. Biol., 1973, v. 77,1. No. 1, 1-23.

24. Davidson E.H., Graham D.E., Neufeld B.R., Chamberlin M.E., Amenson G.S., Hough B.R., Britten R.J. Arrangement and characterization of repetitive sequence elements in animal DNAs. Gold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 1974, v. 38, 295-301.

25. Seshardi M., Ranjekar P.K. Denaturation and reassociation properties of the genome of Phaseolus vulgaris. Hoppe-Seyler's Z. Phys. Chem., 1980, v. 361 , No. 7, Ю41-Ю49.

26. Sechardi M., Ranjekar P.M. An unusual pattern of genome organization in two Phaseolus plant species. Biochim. Bio-phys. Acta, 1980, v. 610, No. 2, 211-220.

27. Murray M.G., Palmer J.D., Cuellar R.E., Thompson W.F. Deoxyribonucleic acid sequence organization in the mung bean.- Chromosoma, 1979, v. 18, No. 23, 5259-5266.

28. Baldary C.T., Amaldi P. Length and interspersion of repetitive DNA sequences in four amphibian species with different genome sizes. Chromosoma, 1977, v. 61, Ho. 4, 359-368.

29. Bozzoni J., Beccari E. Clustered and interspersed repetitive DNA sequences in four amphibian species with different genome size. Biochim. Biophys. Acta, 1978, v. 520, No. 2, 245-252.

30. Hutchinson J., Narayan E.K.J., Rees H. Constraints upon the composition of supplementary DNA. Chromosoma, 1980, v. 78, No. 2, 137-145.

31. Ильин Ю.В. Мобильные диспергированные гены эукариот. Итоги науки и техники, М., 1982, т. 18, вып. 2, 5-48-.

32. Tchurikov N.A., Zelentsova E.S., Georgiev G.P. Clusters containing different mobile dispersed genes in the genome of Drosophila melanogaster. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8,1. No. 6, 1243-1248.

33. Cameron J.R., Loh E.J., Davis R.W. Evidence for transposition of dispersed repetitive DNA families in yeast. Cell, 1979, v. 16, No. 4, 739-751.

34. Farabough P.J., Fink G.R. Insertion of the eukaryotic trans-posable element Ту 1 creates a 5-base pair duplication. -Nature, 1980, v. 286, No. 5771, 352-355.

35. Георгиев Г.П., Ильин Ю.В., Рысков А .П., Крамеров Д.А. Мобильные диспергированные генетические элементы эукариот и их возможное отношение к канцерогенезу. Генетика, 1981, т.17, № 2, 222-232.

36. Temin Н. Origin of retroviruses from cellular moveable genetic elements. Cell, 1980, v. 21, Ho. 3, 599-601.

37. Ilyin Y.V., Chmeliauskaite V.G., Georgiev G.P. Double-stranded sequences in RHA of Drosophila melano&aster: relation to mobile dispersed genes. Hucl. Acids Res., 1980, v. 8,1. Ho. 5, 3439-3457.

38. Ильин Ю.В., Хмеляускайте В.Г., Кульгускин В.В. Множественныерассеянные по хромосомам гены Drosophila melanogaster с варьирующей локализацией. Сообщение УП# Транскрипция мобильных диспергированных генов I и 3. Генетика, 1981, т. 17, № 2, 2II-22I.

39. Georgiev G.P., Ilyin Y.V., Ryskov A.P., Kramerov D.A. Mobile dispersed genetic elements and their possible relation to carcinogenesis. Mol. Biol. Rep., 1980, v. 6, 249-251.

40. Ананьев Е.В., Ильин 10.В., Чуриков Н.А. Множественные рассеянные по хромосомам гены Drosophila melanogasterс варьирующей локализацией. Сообщение Ш. Определение сайтов локализации фрагментов Dm II8A и Dm II8B. Генетика, 1979, т. 15, № 8, 1360-1369.

41. Colos М.Р., Miller J.H. Transposable elements.,- Cell, 1980, v. 20, No. 5, 579-595.

42. Levis R., Dunsmuir P., Rubin G.M. Terminal repeats of the Drosophila transposable element copia: nucleotide sequence and genomic organisation. Cell, 1980, v. 21, No. 2, 581588.

43. Ballario P., Filetici P., Junakovic N., Pedone P. Ту 1 extra-chromosomal circular copies in Saccharomyces cerevisiae. -FEBS Letters, 1983, v. 155, No. 2, 225-229.

44. Canaoni E., Aaronson S.A. Restriction enzyme analysis of mouse cellular type С viral DNA; emergence of new viral sequences in spontaneous AKR/J Imphomas. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1979, v. 76, No. 4, 1677-1681.

45. Крамеров Д.А. Организация генома и единиц транскрипции у высших организмов. Итоги науки и техники. М., 1982, т. 16, 4-56.

46. Hare К.О., Rubin G.M. Structure of P transposable element and their sites of insertion and excision in the Drosophila melanogaster genome» Cell, 1983, v. 34, No. 1, 25-35.

47. Dawid J.B., Long E.D., Di Nocera P.P., Pardue M.L. Ribosomal insertion like elements in Drosophila melanogaster are interspersed with mobile sequences. Cell, 1981, v. 25, No. 2, 399-408.

48. Potter S., Truett M., Phillips M., Maher A. Eucaryotic transposable genetic elements with inverted terminal repeats. -Cell, 1980, v. 20, No. 3, 639-647.

49. Collins M., Rubin G.M. High-frequency precise excission of the Drosophila fold back trasposable element. Nature, 1983,v. 303, No. 5914, 259-260.

50. Adams J.W., Kaufman R.E., Kretschmer P.J., Harrison M., Nien-huis A.W. A family of long reiterated DNA sequence one copy of which is next to the human beta globin gene. Nucl. Acids Res. 1980, v. 8, No. 24, 6113-6128.

51. Schmeckpeper B.J., Willard H.F., Smith K.D. Isolation and characterization of cloned human DNA fragments carrying repeats ed sequences common to both autosomes and X chromosome. -Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, No. 8, 1853-1872.

52. Lerman M.L., Thayer R.E., Singer M.P. Kpn I family of long interspersed repeated DNA sequences in primates: polymorphism of family members and evidence for transcription. Proc. Nat. Acad, Sci. USA, 1983, v. 80, No. 13, 3966-3970.

53. Thayer R.E., Singer M.P. Interruption of an ^-satellite array by a short member of the KpnI-family of interspersed highly repeated monkey DNA sequences. Mol. and Cell. Biol., 1983, v. 3, No. 6, 967-973.

54. Majo J.J., Brown P.L., McKenna W.G. , Musich P.K. Toward a molecular paleontology of primate genomes. II. The Kpnl families of alphoid DNA. Chromosoma, 1981, v.' 83, No. 1, 127-144.

55. Kole L.B., Haynes S.R., Jelinek W.R. Discrete and heterogeneous high molecular weight RNAs complementary to a long dispersed repeat family (a possible transposon) of human DNA. J. Mol. Biol., 1983, v. 165, No. 2, 257-286.

56. Shafit-Zagardo В., Brown P.L., Zavodny P.J,, Maio J.J. Transcription of the Kpnl families of long interspersed DNAs from human cells. Nature, 1983, v. 304, No. 5924, 277-280.

57. Panming F.G. Size and structure of the highly repetitive Bam HI element in mice. Nucl. Acids Res., 1983, v. 11, No. 15, 5073-5091.

58. Singer M., Thayer R.E., Grimaldi G., Lerman M.J., Panming P.G. Homology between the Крп I primate and Bam HI (MIP-1) rodent families of long interspersed repeated sequences. -Nucl. Acids Res., 1983, v. 11, No. 16, 5739-5745.

59. Palkenthal S., Lenguel J.A. Structure, translation and metabolism of the cytoplasmic copia ribonucleic acid of Drosophila melanogaster. Biochemistry, 1980, v. 19, No. 25, 58425850.

60. Flavell H.J., Ruby S.W., Toole J.J., Roberts B.E., Rubin G.M. Translation and developmental regulation of RNA encoded by the eukaryotic trasposable element copia. Proc. Hat. Acad. Sci. USA, 1980, v. 77, No. 12, 7107-7111.

61. Doolitle W.F., Sapienza C. Selfish genes the phenotype paradigm and gehome evolution. Nature, 1980, v. 284, No. 12, 5736, 601-603.

62. Orgel L.E., Crick F.H.C. Selfish DNA: the ultimate parasite. Nature, 1980, v. 284, No. 5736, 604-607.

63. Errede В., Cardillo T.S. , Sherman F., Dubois E., Descamps J., Wiame J.M. Mating signals control expression of mutations resulting from insertion of a transposable repetitive element adjacent to diverse yeast genes. Cell, 1980, v. 22, No. 2, 427-436.

64. Schnieke A., Harbess K., Jaenisch R. Embryonic lethal mutation in mice induced by retrovirus insertion into the oil(I) collagen gene. Nature, 1983, v. 304, No. 5924, 315-319.

65. Хесин Р.Б. Непостоянство генома. Молек. биол., 1980, т. 14, вып. 6, 1205-1233.

66. Ryskov А.Р., Saunders G.F., Farashyan V.R., Georgiev G.P. Double-helical regions in the nuclear precursor of mRNA (pre-mPNA). Biochem. et Biophys. Acta, 1973, v. 312, No. 2, 152-164.

67. Krayev A.S., Kramerov D.A., Skryabin K.G., Ryskov A.P., Bayev A.A., Georgiev G.P. The nucleotide sequence of the ubiquitous repetitive DNA sequence B1 complementary to the most abundant class of mouse fold-back RNA. Nucl. Acids

68. Res., 1980, v. 8, No. 6, 1201-1215.

69. Крамеров Д.А., Ломидзе И.В. "Парадоксальная" эволюция индивидуальной транскрибируемой повторяющейся последовательности ДНК (BI) у грызунов. Докл. АН СССР, 1980, т. 255, № 4, 1005-1009.

70. Jelikek W.R., Schmid C.W. Repetitive sequences in eukaryo-tic DNA and their expression. Ann. Rev. Biochem., 1982, v. 51» 813-844.

71. Rubin C.M., Houck C.M., Deiminger P.L., Friedman Т., Schmid C.W. Partial nucleotide sequence of the 300-nucleo-tide interspersed repeated human DNA sequences. Nature, 1980, v. 284, No. 5734, 372-374.

72. Rinehart P.P. , Rich Т., Deininger P.L., Schmid C.Y\T. Rena-turation rate studies of a single family of interspersed repeat sequences in human deoxyribonucleic acid. Biochemistry, 1981, v. 20, No. 11, 3003-3010.

73. Deininger P.L., Schmid C.W. An electron microscope study of the DNA sequence organization of the human genome. -J. Mol. Biol., 1976, v. 106, No. 5, 773-790.

74. Duncan C.H., Jugadeeswaran P., Wang R.R.C., Weissman S.M. Structure analysis of templates and RNA polymerase III transcripts of Alu family sequences interspersed among the human ^3-like globin genes. Gene, 1981, v. 13, No. 2, 185-196.

75. Bell G.J., Pictet R., Rutter W.J., Analysis of the regions flanking the human insulin gene and sequence of the family member. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, No. 18, 4091-4109.

76. Delia Fovira R., Gelman E.P., Gallo R.C., Wong-Stall P.

77. A human one gene homologous to the transforming gene (v-sis) of simian sarcoma virus. Nature, 1981, v. 292, 31-35»

78. Крамеров Д.А., Краев А.С., Рысков А.П., Скрябин К.Г. Первичная структура высокоповторяющейся последовательности ДНК мыши, гомологичной двуспиральным участкам про-мРНК. Докл. АН СССР, 1980, т. 252, вып. I, 241-244.

79. Krolewski J.J., Bertelsen A.H., Humayun M.Z., Rush M.G. Members of the family of interspersed repetitive ША sequence are in the small circular ША population of monkey growth in culture. J. Mol. Biol., 1982, v. 154, No. 4, 399-415.

80. Bertelsen A.H., Humayun M.Z., Karfopoulos S.G., Rush M.G. Molecular characterization of small polydisperse circular deoxyribonucleic acid from an African monkey cell line. -Biochemistry, 1982, v. 21, No. 9, 2076-2085.

81. Jagadeeswaren P., Forget B.G., Weissman S.M. Short interspersed repetitive DNA elements in eucaryotes: transposable DNA elements generated by reverse transcription of RNA

82. Pol III transcripts? Cell, 1981, v. 26, No. 2, 141-142.

83. Van Arsdell S.W., Denison R.A., Bernstein L.B., Weiner A.M., Manser Т., Gesteland R.F. Direct repeats flank three small nuclear RNA pseudogenes in the human genome. Cell, 1981,v. 26, No. 1, 11-17.

84. Shimizy Y., Yoshida K., Ren C.S., Pujinaga K., Rajagopalan S., Chinadurai G. Hinf family: a novel repeated DNA family of the human genome. Nature, 1983, v. 302, No. 5909, 587590.

85. Gebhard W., Meitinger Т., Hochtl J., Zachau H. A new family of interspersed repetitive DNA sequences in the mouse genome. J. Mol. Biol., 1982, v. 157, No. 2, 453-471.

86. Perler P., Efstratiadis A., Lomedico P., Gibbert W., Kolod-ner R., Dodson J. The evolution of genes: the chicken pre-proinsulin gene. Cell, 1980, v. 20, No. 3, 555-566.

87. Bouchard R.A., Swift H. Nature of the heterogeneity in mis-pairing of reannealed middle-repetitive ferm DNA. Chromosoma, 1977, v. 61, No. 4, 317-333.

88. Fritsch E.F., Lawn К.И., Maniatis T. Molecular cloning and characterization of the human j3-like globin gene cluster.- Cell, 1980, v. 19, No. 5, 959-972.

89. Shen C.K.J., Maniatis T. The organization of repetitive sequences in a cluster of rabbit j2>-like globin genes. -Cell, 1980, v. 19, No. 2, 379-391.

90. Fyrberg E.A., Kindle K.Z., Davidson N. The actin gene of Drosophila: a dispersed multigene family. Cell, 1980, v. 19, No. 2, 365-378.

91. Tilgman S.M., Tiemeir D.C., Seidmaman J.G., Peterlin Б.М., Sullivan M., Maizel J.V., Leder P. Intervening sequences of human DNA identified in the structural portion of a mouse j3-globin gene. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1978, v. 75, No. 2, 725-729.

92. Jeffreys A.J., Flavell R.A. The rabbit ^уЗ-globin gene contains a large insert in the coding sequence. Cell, 1977, v. 12, No. 4, 1097-1108.

93. Brethmach R., Mandel J.L., Chambon P. Ovalbumin gene is split in chicken DNA. Nature, 1977, v. 270, No. 5626, 314-319.

94. Brack C., Tonegawa S. Variable and constant parts of the immunoglobin light chain gene of a mouse myeloma cell are 1250 nontranslated bases apart. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1977, v. 74, No. 12, 5652-5656.

95. Rabbit T.M., Forster A. Evidence for noncontiguous variable and constant region genes in both germ line and myeloma DNA.- Cell, 1978, v. 13, No. 2, 319-327.

96. Gilbert W. Why genes in pieces? Nature, 1978, v. 271, No. 5645, 501.

97. Cochet M., Gonnon P., Hen R., Maroteaux L., Perrin P., Chambon P. Organization and sequence studies of the 17-piece chicken conalbumin gene. Nature, 1979, v. 282, No. 5739, 567-574.

98. Heiling R., Perrin P., Gannon P., Mandel J.L., Chambon P. The ovalbumin gene family: structure of the X gene and evolution of duplicated split genes. Cell, 1980, v. 20, No. 5, 625-637.

99. Shapiro S.G., Schon E.A., Townes T.M., Lingrel J.B. Sequence and linkage of the goat Б1 and Би ^/3-globin genes. -J. Mol. Biol., 1983, v. 169, No. 1, 31-52.

100. Schon E.A., Cleary M.L., Haynes J.R., Lingrel J.B. Strucл с Ature and evolution of goat y, Jb -and jt> -globin genes: three gene-inserted elements. Cell, 1981, v. 27, No. 2, 359-369.

101. Naora H., Deacon N.J. Relationship between the total size of exons and introns in protein -coding genes of higher eukaryotes. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1982, v. 76, No. 5. 6196-6200.

102. Gross K., Probst E., Schaffner W., Bernstiel M. Molecular analysis of the histone gene cluster of Psammechinus milia-ris: III. Polarity and asymmetry of the histone-coding sequences. Cell, 1976, v. 9, No. 4, 479-484.

103. Ashburner M., Bonner J.J. The induction of gene activity in Drosophila by heat shock. Cell, 1979, v. 17, No. 2, 241-254.

104. Kimmel A.R., Pirter R.A. Intervening sequences in a Dictio-stelium gene that encodes a low abundance class mRNA. -Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, No. 23, 5599-5610.

105. Petes T.D. Molecular genetics of yeast. Ann. Rev. Biochem., 1980, v. 49, 845-876.

106. Halbreich A., Pajot P., Poucher M., Grandepamp C., Slonim-ski P. A pathway of cytochrome 6 mRNA processing in yeast mitochondria: Specific splicing steps and an intron-derived circular RNA. Cell, 1980, v. 19, Ho. 2, 321-329.

107. Goodman H.M., Olson M.V., Hall B.D. Nucleotide sequence of a mutant eukaryotic gene: the Yeast tyronine-inserting ochre suppression SUPK-o. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1977, v. 74, No. 2, 5453-5457.

108. Knapp G., Beckmann J.S., Jonson P.E., Puhrman S.A., Alelson J. Transcription and processing of intervening sequencesin yeast tRNA genes. Cell, 1978, v. 14, No. 2, 221-236.

109. Bos J.L., Heyting C., Borst P., Arnberg A.C., Van Bruggen E.P.J. An insert in the single gene for the large ribosomal RNA in yeast mitochondrial DNA. Nature, 1978, v. 275,1. No. 5678, 336-338.

110. Hahn V., Lazarus C.M., Lunsdorf H., Kuntzel H. Split gene for mitochondrial 28S ribosomal RNA of Neurospora crassa. Cell, 1979, v. 17, No. 1, 191-200.

111. Zang A.J., Cech T.R. In vitro splicing of the ribosomal

112. RNA precursor in nuclei of Tetrahymena. Cell, 1980, v. 19, No. 2, 331-338.

113. Wellaur P.K., Dawid J.B. The structural organization ofribosomal ША in Drosophila melanogaster. Cell, 1977, v. 10, No. 2, 193-212.141» Crick F. Split genes and RITA splicing. Science, 1979, v. 204, No. 4390, 264-271.

114. Lomedico P., Rosental N., Efstratiadis A., Gilbert W., Kolodner R., Tizard R. The structure and evolution of the two nonallelic rat preproinsulin genes. Cell, 1979, v. 18, No. 2, 545-558.

115. Riffel G.U., Wyler Т., Muellener P., Weber R. Identification organization and processing intermediates of the putative precursors of Xenopus vitello genin messenger RNA. Cell, 1980, v. 19, No. 1, 53-62.

116. Tilghman S .M., Curtis P.J., Tiemeier D.C., Leder P., Weiss-man S.W. The intervening sequence of a mouse j6-globin gene is transcribed within the 155 ^-globin mRNA precursor. -Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1978, v. 75, No. 3, 1309-1313.

117. Acad. Sci. USA, 1978, v. 75, No. 10, 4853-4857.

118. Сatterail J.P., O'Malley B.W., Robertson M.A., Staden K. Tanaka Y., Brownlee G.G. Nucleotide sequence homology at 12 intron-exon junctions in the chick ovalbumin gene. -Nature, 1978, v. 275, No. 5680, 510-513.

119. Lozovska J., Jacq G., Slonimski P.P. Sequence of introns amd flanking exons in wild-type box 3 mutants of cytochrome b reveals an interlaced splicing protein coded by an intron. Cell, 1980, v. 22, No. 2, 333-348.

120. Khoury G., Gruss P., Dhar R., Lai Ch.-J. Processing arid expression of early SV40 mRNA: a role of RNA conformation in splicing. Cell, 1979, v. 18, No. 1, 85-92.

121. Murrey V., Holliday R. Mechanism for splicing of gene transcripts. PEBS Letters, 1979, v. 106, No. 1, 5-7.

122. Lerner M.R., Boyle J.A., Mount S.M., Wolin S.L., Steitz J.A. Are sn RNAs involved in splicing? Nature, 1980, v. 283, No. 5743, 220-224.

123. Rogers J., Wall R. A mechanism for RNA splicing. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1980, v. 77, No. 4, 1877-1879.

124. Moustein H.-J., Westin G., Philipson L., Petterson V. A candidate gene for human VI RNA. The EMBO Journal, 1982,v. 1, No. 1, 133-137.

125. D.A., Ryskov A.P. Sequences hybridizing to mRNA oligo(dT) and dsRNA from pre-mRNA are contiguous in the cloned mouse DNA-fragments. Nucl. Acids Res., 1980, v. 8, No. 3, 425-440.

126. Крамеров Д.А., Григорян А.А., Рысков А.П., Георгиев Г.П. Клонирование в клетках E.coli фрагментов ДНК мыши, гомологичных двум основным видам длинных шпилечных участков пре-мРНК. Мол. биол., 1980, т. 14, вып. 3, 650-660.

127. Токарская О.Н., Иванов II.Л., Маркушева Т.В., Рысков А.П. Некоторые свойства транскрибирующихся фрагментов генома мыши, клонированных в составе плазмиды рВР 322. Генетика, 1980, т. 16, Ш 10, I74I-I752.

128. Bolivar Р., Rodriguez R.C., Greene P.J., Betlach N.G., Heymeker H.G., Boyer H.W., Grosa J.N., Palkov S. Construction and characterization of new cloning vehicles. II.

129. A multipurpose cloning system . Gene, 1977, v. 2, No. 2, 95-113.

130. Grunstein M.G., Hogness D.S. Colony hybridization: a method colony isolation of cloned DNAs that contain a specific gene. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1975, v. 72, No. 10, 3961-3965.

131. Denchardt D.T. A membrane-filter technique for detection of complementary DNA. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1966, v. 23, No. 5, 641-652.

132. Leibowitz P., Seigel W. , Sklar J. Haemophilus aegupticus restriction cleavage map of simian virus 40 genome.- J. Mol. Biol., 1974, v. 83, No. 1, 105-123.

133. Southern E.M. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J. Mol. Biol., 1975, v. 98, No. 3, 503-507.

134. Goldbach R.N., Evers R.P., Borst P, Electrophoretic strand separation of long DNA's with poly(VG) in agarose gels. -Nucl. Acids Res., 1978, v. 5, No. 6, 2743-2754.

135. Galli G., Hostetter H., Birstiel М.Ъ. Two conserved sequence blocks within eucaryotic tRNA genes are major promoter elements. Nature, 1981, v. 294, No. 5842, 626-631.

136. Ciliberto G., Raugei G., Costanzo F., Dente L., Cortese R. Common and interchangeable elements in the promoters of genes transcribed by tRNA polymerase III. Cell, 1983,v. 32, No. 3, 725-733.

137. Ro-Choi T.S., Reddy R., Henning D., Takano Т., Taylor C.W., Bush L. Nucleotide sequence of 4,5 S ribonucleic acid I of Novikoff hepatoma cell nuclei. J. Biol. Chem., 1972,v. 247, No. 10, 3205-3222.

138. Page G.S., Smith S., Goodman H. DNA sequence of the rat growth hormone gene: location of the 5' terminus of the growth hormone mRNA and identification of an internal transposon-like element. Nucl.Acids Res., 1981, v. 9, No. 9, 2-87-2104.

139. Oshima Y., Okada N., Tani Т., Itoh Y., Itoh M. Nucleotide sequences of mouse loci including a gene or pseudogene for V6 (4,8S) nuclear RNA. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9,1. No. 19, 5145-5156.

140. Haynes S.R., Jelinek W.J. Low molecular weight RNAs transcribed in vitro by RITA polymerase III from Alu-type dispersed repeats in Chinese hamster DNA are also found in vivo. -Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1981, v. 78, No. 10, 613o-6134.

141. Mount S.M. A catalogue of splice junction sequences. -Nucl. Acids Res., 1982, v. 10, No. 2, 459-472.

142. Lewin Б. Alternatives for splicing: recognizing the ends of introns. Cell, 1980, v. 20, No. 2, 324-326.

143. Yang R.C.A. , Wu R. BK virus DNA': complete nucleotide sequence of a Human Tumor Virus. Science, 1979, v. 206, No. 4417, 456-462.

144. Reddy V.B., Thimmappaya В., Dhar R., Subramanian K.N., Zain B.S., Pan J., Chash P.K., Celma M.L., Weissman S.M. The genome of Simian virus 40. Science, 1978, v. 200, No. 43-51, 494-502.

145. Крамеров Д.А., Рысков А.П. Последовательности мРНК, комплементарные двуспиральным участкам про-мРНК. Гибридизация с использованием меркурированной РНК и хроматография на

146. SH-сефарозе. Мол. биол., 1979, т. 13, вып. 3, 60I-6II.

147. Рысков А.П., Иванов П.Л., Крамеров Д.А., Георгиев Г.11. Повторяющиеся последовательности типа BI и В2 в клонах комплементарной ДНК, полученной на цитоплазматической поли(А)+РНК печени мыши. Докл. АН СССР, 1982, т. 263, № 997-1000.

148. Kramerov D.A., bekakh I.V., Samarina 0.P., Ryskov А.Г. The sequences homologous to major interspersed repeats are present in mRNA and small cytoplasmic poly(A)+ RNA. -Nucl. Acids Res., 1982, v. 10, No. 23, 7477-7491.

149. Леках И.В., Крамеров Д.А., Маркушева Т.Е., Рысков А.П. Биосинтез малой цитоплазматической поли(А)+ РНК, гомологичной повторяющейся последовательности В2 генома мыши,осуществляется РНК-полимеразой I. Докл. АН СССР, в печати.

150. Grimaldi G., Queen С., Singer M.F. Interspersed repeated sequences in the African green monkey genome that are homologous to the human Alu family. Nucl. Acids Res., 1981, v. 9, No. 21, 5553-5568.

151. Grimaldi G., Singer M.P. A monkey Alu sequence is flanked "by 13 base-pair direct repeats of an interrupted ^-satellite ША sequence. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1982,v. 79, No. 5, 1497-1500.

152. Calabretta В., Robberson D.L., Barrera-Saldana H.A., Lam-brou T.P., Saunders G.F. Genome instability in a region of human DNA enriched in the repeat sequences. Nature, 1982, v. 296, 5854, 219-225.

153. Тиллиб С.В., Крамеров Д.А. Малая цитоплазматическая поли(А)+РНК, гомологичная повторяющейся последовательности В2 генома мыши, входит в состав рибонуклеопротеидов. -Докл. АН СССР, в печати.

154. Thimmappaya В., Weiberger С., Schneider R.J., Shenk Т. Adenovirus VA1 RNA is required for efficient translation of viral mRNA at late times after infection. Cell, 1982, v. 31, No. 2, 543-551.